INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 948921 T/C 1 1279 1226 2505 591.054337031815 659.438141359651 -68.3838043278361 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.00641773700893275 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_948803_948956:ISG15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 2780 2408 5188 1284.69980996751 1295.20966100656 -10.5098510390474 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.770006081096609 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 2274 2456 4730 1050.86595966407 1321.0277937841 -270.161834120026 A:T:G A G 10 0.537877766198737 4.04336360433753e-15 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1153099 G/A 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1152311_1153184:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1152311_1153184:SDF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1153137 G/A 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 A:G G A 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1152311_1153184:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1152311_1153184:SDF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1154110 T/C 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 T:C T C 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000078808:ENST00000478938:exon_1153838_1155673:SDF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1164031 A/G 1 89 94 183 41.1288788083124 50.5605100226813 -9.43163121436886 A:G A G 10 0.537877766198737 0.181914906774954 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1245176 C/T 1 21 23 44 9.70456690982652 12.3711886225709 -2.66662171274443 T:C C T 10 0.537877766198737 0.451925051404609 ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000470520:exon_1245086_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000463758:exon_1244466_1245220:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1244834_1245194:PUSL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1262276 C/T 1 13 6 19 6.00758903941642 3.22726659719242 2.780322442224 T:C C T 10 0.537877766198737 0.252313312370768 ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262216_1262412:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000488011:exon_1262216_1262412:GLTPD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1262819 G/A 1 19 25 44 8.780322442224 13.4469441549684 -4.66662171274443 A:G G A 10 0.537877766198737 0.174899698772878 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000488011:exon_1262621_1262851:GLTPD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 33 16 49 15.2500337154417 8.60604425917979 6.64398945626189 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0627414358954588 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 20 18 38 9.24244467602526 9.68179979157727 -0.439355115552004 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1342572 C/A 1 661 639 1300 305.462796542635 343.703892600993 -38.241096058358 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0345016728364599 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1398064 C/T 1 18 28 46 8.31820020842273 15.0605774535646 -6.7423772451419 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0541203558404377 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1397980_1398088:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1397980_1398088:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1397863_1398088:ATAD3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1398065 G/A 1 28 18 46 12.9394225464354 9.68179979157727 3.2576227548581 A:G G A 10 0.537877766198737 0.376679449205041 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1397980_1398088:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1397980_1398088:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1397863_1398088:ATAD3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1469412 C/T 1 110 105 215 50.8334457181389 56.4771654508674 -5.64371973272845 T:C C T 10 0.537877766198737 0.452357208249398 ENSG00000197785:ENST00000378756:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378759:exon_1469306_1470064:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378755:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000339113:exon_1469306_1470065:ATAD3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1563985 C/T 1 4 14 18 1.84848893520505 7.53028872678232 -5.68179979157727 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00842674134138563 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1563653_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000473511:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000464570:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000483015:exon_1563869_1564102:MIB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1572125 A/G 1 106 7 113 48.9849567829339 3.76514436339116 45.2198124195427 A:G A G 10 0.537877766198737 9.39360271132276e-21 ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000340677:exon_1572044_1572160:CDK11A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1635344 G/A 1 20 17 37 9.24244467602526 9.14392202537853 0.0985226506467338 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635263_1635434:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635307_1635434:CDK11A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 26 33 59 12.0151780788328 17.7499662845583 -5.73478820572548 A:C C A 10 0.537877766198737 0.151212993938412 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 1735946 G/A 1 83 90 173 38.3561454055048 48.4089989578863 -10.0528535523815 A:G G A 10 0.537877766198737 0.127874020664162 ENSG00000078369:ENST00000378609:exon_1735858_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000455156:exon_1735858_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000378606:exon_1735858_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000471354:exon_1735858_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000439272:exon_1735847_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000434686:exon_1735847_1736020:GNB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 31 54 85 14.3257892478392 29.0453993747318 -14.7196101268926 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00150935691712081 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 2491306 G/A 1 102 89 191 47.1364678477288 47.8711211916876 -0.734653343958755 A:G G A 10 0.537877766198737 0.942207488579777 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2490791_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2489782_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2489782_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000471768:exon_2491019_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2491210_2491417:TNFRSF14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 3644715 C/T 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3644693_3644781:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3644693_3644781:TP73 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 3697700 G/A 1 60 45 105 27.7273340280758 24.2044994789432 3.52283454913262 A:G G A 10 0.537877766198737 0.557253642770421 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3696784_3697900:LRRC47;ENSG00000130764:ENST00000462356:exon_3697699_3697900:LRRC47 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 3806623 C/T 1 51 23 74 23.5682339238644 12.3711886225709 11.1970453012935 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00997139296341737 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3805689_3806637:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3805689_3806637:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3805689_3806637:C1orf174 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 3807388 G/A 1 21 13 34 9.70456690982652 6.99241096058358 2.71215594924294 A:G G A 10 0.537877766198737 0.392917828575735 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 6142308 T/C 1 9 16 25 4.15910010421137 8.60604425917979 -4.44694415496842 T:C T C 10 0.537877766198737 0.106745724142528 ENSG00000069424:ENST00000378111:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000428161:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000389632:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000458166:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378087:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000435937:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000472700:exon_6142255_6142334:KCNAB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 11 13 24 5.08334457181389 6.99241096058358 -1.90906638876969 A:G A G 10 0.537877766198737 0.54016131683339 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 6649302 C/A 1 21 17 38 9.70456690982652 9.14392202537853 0.560644884447996 A:C C A 10 0.537877766198737 0.872546949127018 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 6694826 C/T 1 53 43 96 24.4924783914669 23.1287439465457 1.36373444492125 T:C C T 10 0.537877766198737 0.838029241415586 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000349363:exon_6694586_6694844:DNAJC11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 9804558 C/T 1 7 13 20 3.23485563660884 6.99241096058358 -3.75755532397474 T:C C T 10 0.537877766198737 0.116261430676894 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 10521629 G/A 1 46 55 101 21.2576227548581 29.5832771409305 -8.32565438607243 A:G G A 10 0.537877766198737 0.110081334220557 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10516579_10521759:DFFA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 10521649 C/T 1 54 36 90 24.9546006252682 19.3635995831545 5.59100104211367 T:C C T 10 0.537877766198737 0.246680669613036 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10516579_10521759:DFFA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 14 12 26 6.46971127321768 6.45453319438484 0.0151780788328386 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 10708026 A/G 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G A G 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 10708028 G/A 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G G A 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 10713854 C/T 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 11008102 G/A 1 15 7 22 6.93183350701895 3.76514436339116 3.16668914362779 A:G G A 10 0.537877766198737 0.203542575036699 ENSG00000175262:ENST00000476357:exon_11007700_11009808:C1orf127;ENSG00000175262:ENST00000418570:exon_11007700_11008901:C1orf127;ENSG00000175262:ENST00000377008:exon_11007700_11008901:C1orf127;ENSG00000175262:ENST00000520253:exon_11007700_11008901:C1orf127;ENSG00000175262:ENST00000518410:exon_11007700_11008898:C1orf127;ENSG00000175262:ENST00000445141:exon_11007700_11008901:C1orf127;ENSG00000175262:ENST00000377004:exon_11007700_11008901:C1orf127 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 11141187 C/G 1 49 36 85 22.6439894562619 19.3635995831545 3.28038987310736 C:G C G 10 0.537877766198737 0.514835326286527 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 11181327 C/T 1 9 2 11 4.15910010421137 1.07575553239747 3.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.07378362995951 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11181303_11181425:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000376838:exon_11181303_11181425:MTOR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 11346029 C/T 1 28 52 80 12.9394225464354 27.9696438423343 -15.030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00101790071141765 ENSG00000120942:ENST00000376810:exon_11345701_11348491:UBIAD1;ENSG00000120942:ENST00000400896:exon_11345701_11348491:UBIAD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 11733791 T/C 1 43 56 99 19.8712560534543 30.1211549071293 -10.249898853675 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0435589850947539 ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11733672_11734407:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11733672_11734411:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11733672_11734087:FBXO6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 12034805 T/C 1 60 56 116 27.7273340280758 30.1211549071293 -2.39382087905349 T:C T C 10 0.537877766198737 0.709742343478246 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 12049384 C/T 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000484391:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000497302:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000412236:exon_12049222_12049400:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12049222_12049400:MFN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 12082244 C/T 1 56 39 95 25.8788450928707 20.9772328817507 4.90161221111999 T:C C T 10 0.537877766198737 0.354640057947446 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 12091880 G/A 1 160 118 278 73.9395574082021 63.469576411451 10.4699809967511 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.228927602104066 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12091779_12092102:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12091779_12092100:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12091779_12092032:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12091779_12092100:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12091598_12092082:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478299:exon_12091779_12092096:MIIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 6 10 16 2.77273340280758 5.37877766198737 -2.60604425917979 T:G T G 10 0.537877766198737 0.216741911044158 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 12638964 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000162496:ENST00000376223:exon_12638746_12638984:DHRS3;ENSG00000162496:ENST00000430996:exon_12638746_12638984:DHRS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 24 42 66 11.0909336112303 22.590866180347 -11.4999325691166 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00617228105290421 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 14 16 30 6.46971127321768 8.60604425917979 -2.13633298596211 A:G A G 10 0.537877766198737 0.46777080604343 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 14143003 A/G 1 9 1 10 4.15910010421137 0.537877766198737 3.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0250555914428584 ENSG00000116731:ENST00000376048:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000503842:exon_14142922_14143065:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000505823:exon_14142922_14143065:PRDM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 15844615 A/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000132906:ENST00000333868:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000348549:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375890:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000375874:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000400777:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000447522:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000474305:exon_15844605_15844890:CASP9;ENSG00000132906:ENST00000440484:exon_15844605_15844890:CASP9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 15892415 A/C 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000116138:ENST00000375847:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375838:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000475133:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000472665:exon_15892414_15892494:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000479655:exon_15892313_15892494:DNAJC16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 15909744 C/T 1 12 9 21 5.54546680561516 4.84089989578863 0.704566909826523 T:C C T 10 0.537877766198737 0.82918998973449 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15909688_15909890:AGMAT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 16060340 T/C 1 40 38 78 18.4848893520505 20.439355115552 -1.95446576350148 T:C T C 10 0.537877766198737 0.733599440024223 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16060292_16061262:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16060292_16061264:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16060292_16061264:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16060292_16060610:PLEKHM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 16060480 C/T 1 50 48 98 23.1061116900632 25.8181327775394 -2.71202108747622 T:C C T 10 0.537877766198737 0.613169738018977 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16060292_16061262:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16060292_16061264:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16060292_16061264:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16060292_16060610:PLEKHM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 17 14 31 7.85607797462147 7.53028872678232 0.325789247839154 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 11 5 16 5.08334457181389 2.68938883099368 2.39395574082021 A:G A G 10 0.537877766198737 0.317107876818811 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 61 62 123 28.189456261877 33.3484215043217 -5.15896524244465 T:C C T 10 0.537877766198737 0.366674955293174 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 23 40 63 10.6288113774291 21.5151106479495 -10.8862992705204 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00751406634040634 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 11 27 38 5.08334457181389 14.5226996873659 -9.439355115552 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00289555392984322 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 16 12 28 7.39395574082021 6.45453319438484 0.939422546435365 A:G G A 10 0.537877766198737 0.850219934863149 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 17380507 G/C 1 43 45 88 19.8712560534543 24.2044994789432 -4.33324342548885 C:G G C 10 0.537877766198737 0.392727663008001 ENSG00000117118:ENST00000375499:exon_17380443_17380665:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000466613:exon_17380443_17380526:SDHB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 55 41 96 25.4167228590695 22.0529884141482 3.36373444492125 T:C C T 10 0.537877766198737 0.539584178217375 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 188 156 344 86.8789799546375 83.908931527003 2.9700484276345 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.786935389329144 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 237 240 477 109.522969410899 129.090663887697 -19.5676944767975 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0734368487557491 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 19634964 C/G 1 15 27 42 6.93183350701895 14.5226996873659 -7.59086618034695 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0203297857659761 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634949_19634999:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 19652063 G/A 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19651989_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652020_19652076:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19651989_19652076:PQLC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 20020993 A/G 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 20971057 C/A 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:C C A 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20970983_20971165:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20970983_20971165:PINK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 20975452 G/A 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 A:G G A 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20974998_20975724:PINK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 20975456 A/G 1 12 10 22 5.54546680561516 5.37877766198737 0.166689143627787 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20974998_20975724:PINK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 20975741 C/T 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 T:C C T 10 0.537877766198737 0.468328425798145 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 20977043 G/A 1 11 14 25 5.08334457181389 7.53028872678232 -2.44694415496842 A:G G A 10 0.537877766198737 0.422995539711509 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 20980231 G/A 1 142 148 290 65.6213571997794 79.6059093974131 -13.9845521976337 A:G G A 10 0.537877766198737 0.111659859818564 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20979991_20980267:DDOST HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 21180139 G/A 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21180053_21180170:EIF4G3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 21560080 A/G 1 18 12 30 8.31820020842273 6.45453319438484 1.86366701403789 A:G A G 10 0.537877766198737 0.584282394893276 ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000526194:exon_21559598_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000470394:exon_21560063_21560154:ECE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 23419261 G/A 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 23419383 C/T 1 6 9 15 2.77273340280758 4.84089989578863 -2.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.310767806906123 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 23419806 A/C 1 10 15 25 4.62122233801263 8.06816649298105 -3.44694415496842 A:C A C 10 0.537877766198737 0.228164098691797 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 23885893 C/T 1 50 54 104 23.1061116900632 29.0453993747318 -5.93928768466864 T:C C T 10 0.537877766198737 0.279306113579401 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885618_23886285:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23885618_23885934:ID3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 24077554 T/C 1 25 29 54 11.5530558450316 15.5984552197634 -4.0453993747318 T:C T C 10 0.537877766198737 0.278090001273473 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 17 19 36 7.85607797462147 10.219677557776 -2.36359958315453 T:C C T 10 0.537877766198737 0.504572022125103 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 24981439 A/G 1 47 45 92 21.7197449886594 24.2044994789432 -2.4847544902838 A:G A G 10 0.537877766198737 0.603180606559952 ENSG00000133226:ENST00000323848:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000447431:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000374389:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000479034:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000470243:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000496882:exon_24981346_24981614:SRRM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 25893529 C/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000157978:ENST00000374338:exon_25893339_25895377:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000488127:exon_25893339_25895375:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000474283:exon_25893339_25894061:LDLRAP1;ENSG00000157978:ENST00000470950:exon_25893339_25894127:LDLRAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 26608922 G/A 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 A:G G A 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26607819_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26608772_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26608773_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26608775_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26608892_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26608790_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26608796_26609060:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26608872_26609060:UBXN11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 34 17 51 15.7121559492429 9.14392202537853 6.56823392386442 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0688438904089958 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 26885401 G/A 1 29 28 57 13.4015447802366 15.0605774535646 -1.65903267332801 A:G G A 10 0.537877766198737 0.691570116495075 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26885298_26885428:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26885298_26885428:RPS6KA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 30 26 56 13.8636670140379 13.9848219211672 -0.121154907129268 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 26898685 C/T 1 81 85 166 37.4319009379023 45.7196101268926 -8.28770918899033 T:C C T 10 0.537877766198737 0.213054013168464 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26898667_26898784:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26898667_26898784:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26898667_26898784:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26898667_26898784:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26898667_26898784:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26898340_26898724:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26898667_26898784:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26898667_26898784:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26898667_26898784:RPS6KA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 26900708 G/A 1 97 115 212 44.8258566787225 61.8559431128547 -17.0300864341322 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0227998377351394 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 27223880 G/T 1 9 12 21 4.15910010421137 6.45453319438484 -2.29543309017348 T:G G T 10 0.537877766198737 0.383260377366473 ENSG00000198746:ENST00000361720:exon_27223792_27224216:GPATCH3;ENSG00000198746:ENST00000374122:exon_27223792_27224216:GPATCH3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 16 51 67 7.39395574082021 27.4317660761356 -20.0378103353154 A:G G A 10 0.537877766198737 8.73051309369249e-07 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 32 85 117 14.7879114816404 45.7196101268926 -30.9316986452522 A:G G A 10 0.537877766198737 7.8414050147144e-09 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 46 74 120 21.2576227548581 39.8029546987065 -18.5453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.000903015860400529 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28206348 T/C 1 38 23 61 17.560644884448 12.3711886225709 5.18945626187705 T:C T C 10 0.537877766198737 0.200309625475653 ENSG00000130775:ENST00000373925:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373919:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000427466:exon_28206155_28206459:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000466068:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28206242_28206565:C1orf38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28206588 T/C 1 1 9 10 0.462122233801263 4.84089989578863 -4.37877766198737 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0076411641167297 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28211835 C/T 1 72 53 125 33.2728008336909 28.5075216085331 4.76527922515788 T:C C T 10 0.537877766198737 0.420116837503219 ENSG00000130775:ENST00000373925:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373919:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373927:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28211806_28211928:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28211806_28211962:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000492877:exon_28209909_28211962:C1orf38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28212450 G/A 1 136 132 268 62.8486237969718 70.9998651382333 -8.1512413412615 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.32738202552213 ENSG00000130775:ENST00000373925:exon_28212378_28213196:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28212378_28213196:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373919:exon_28212378_28213196:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373927:exon_28212378_28213044:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28212378_28213184:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28212378_28213184:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000492877:exon_28212378_28213184:C1orf38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28240972 G/A 1 24 21 45 11.0909336112303 11.2954330901735 -0.204499478943164 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000117748:ENST00000373912:exon_28240945_28241254:RPA2;ENSG00000117748:ENST00000313433:exon_28240574_28241024:RPA2;ENSG00000117748:ENST00000444045:exon_28240933_28241099:RPA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28315037 A/G 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 A:G A G 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000158161:ENST00000495923:exon_28314984_28315167:EYA3;ENSG00000158161:ENST00000471498:exon_28314990_28315167:EYA3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28661220 C/T 1 98 55 153 45.2879789125238 29.5832771409305 15.7047017715932 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0117781191539152 ENSG00000130772:ENST00000479574:exon_28660928_28661527:MED18;ENSG00000130772:ENST00000373842:exon_28660928_28662476:MED18;ENSG00000130772:ENST00000398997:exon_28660928_28661589:MED18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 17 12 29 7.85607797462147 6.45453319438484 1.40154478023663 A:G G A 10 0.537877766198737 0.710601451134831 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28864435 A/G 1 34 33 67 15.7121559492429 17.7499662845583 -2.03781033531538 A:G A G 10 0.537877766198737 0.626277263201133 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28864344_28865607:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28864344_28865607:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28864344_28865607:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28864344_28865502:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28864344_28865495:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28864344_28865607:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28864344_28864676:RCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 28906984 T/G 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 T:G T G 10 0.537877766198737 0.40386381071133 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 29543113 T/C 1 11 19 30 5.08334457181389 10.219677557776 -5.13633298596211 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0677854810254729 ENSG00000116353:ENST00000373791:exon_29543100_29543324:MECR;ENSG00000116353:ENST00000398820:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000373792:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000263702:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000473030:exon_29543100_29543125:MECR;ENSG00000116353:ENST00000478505:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000490529:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000463052:exon_29543100_29543324:MECR;ENSG00000116353:ENST00000489248:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000475861:exon_29543100_29543324:MECR;ENSG00000116353:ENST00000472630:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000474946:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000464915:exon_29543100_29543197:MECR;ENSG00000116353:ENST00000482610:exon_29543100_29543324:MECR;ENSG00000116353:ENST00000484012:exon_29543113_29543324:MECR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 32110446 C/G 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 C:G C G 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32110442_32110488:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32110442_32110497:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000440872:exon_32110442_32110477:PEF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 32669457 A/G 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 32687472 G/C 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160055:ENST00000491434:exon_32687468_32687619:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000489170:exon_32687468_32687619:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000461402:exon_32687468_32687619:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000483001:exon_32687468_32687619:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000309777:exon_32687468_32687619:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000373593:exon_32687468_32687619:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000344461:exon_32687468_32687619:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000487174:exon_32687468_32687920:C1orf91 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 33134865 A/C 1 30 42 72 13.8636670140379 22.590866180347 -8.72719916630906 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0442371311373921 ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000526193:exon_33134832_33134868:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000492348:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000463378:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000460669:exon_33134832_33134958:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000482190:exon_33134857_33134958:RBBP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 35320991 G/A 1 87 72 159 40.2046343407099 38.7271991663091 1.47743517440082 A:G G A 10 0.537877766198737 0.873684594037966 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 38478457 T/C 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 T:C T C 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000183520:ENST00000483182:exon_38478386_38478537:UTP11L;ENSG00000183520:ENST00000486563:exon_38478406_38478537:UTP11L;ENSG00000183520:ENST00000373014:exon_38478414_38478537:UTP11L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 39919502 A/G 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G A G 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39919379_39919522:MACF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 40705726 A/T 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 A:T A T 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 40768344 C/T 1 59 49 108 27.2652117942745 26.3560105437381 0.909201250536409 T:C C T 10 0.537877766198737 0.923203121119376 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000427563:exon_40768293_40768481:COL9A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 22 11 33 10.1666891436278 5.91665542818611 4.25003371544168 T:C T C 10 0.537877766198737 0.163296960793547 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 4 11 15 1.84848893520505 5.91665542818611 -4.06816649298105 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0400137374002459 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 40980757 A/G 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 41976217 G/A 1 34 33 67 15.7121559492429 17.7499662845583 -2.03781033531538 A:G G A 10 0.537877766198737 0.626277263201133 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 41976575 A/G 1 22 20 42 10.1666891436278 10.7575553239747 -0.590866180346952 A:G A G 10 0.537877766198737 0.878047078026096 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 41976665 G/A 1 15 19 34 6.93183350701895 10.219677557776 -3.28784405075706 A:G G A 10 0.537877766198737 0.303022928947373 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 43215930 C/T 1 20 13 33 9.24244467602526 6.99241096058358 2.25003371544168 T:C C T 10 0.537877766198737 0.48765452803568 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 44132744 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000066135:ENST00000439179:exon_44132625_44132762:KDM4A;ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44132625_44132762:KDM4A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 44680474 A/G 1 38 51 89 17.560644884448 27.4317660761356 -9.87112119168759 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0428845995315426 ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000440641:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000436069:exon_44680375_44680552:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000437511:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000475794:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000471829:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000487922:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372290:exon_44680375_44680570:DMAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 44684736 G/A 1 117 112 229 54.0683013547478 60.2423098142585 -6.17400845951077 A:G G A 10 0.537877766198737 0.426871763509278 ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000437511:exon_44684728_44684786:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000488433:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000483741:exon_44684728_44684913:DMAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 45110683 G/A 1 30 34 64 13.8636670140379 18.2878440507571 -4.42417703671916 A:G G A 10 0.537877766198737 0.315948363546867 ENSG00000187147:ENST00000355387:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000416840:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000361799:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000453887:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372247:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000443020:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372248:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000440132:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000335497:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474064:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000471494:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000444372:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000497469:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000475378:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000484745:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474394:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000480686:exon_45110667_45110753:RNF220 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 15 7 22 6.93183350701895 3.76514436339116 3.16668914362779 A:T A T 10 0.537877766198737 0.203542575036699 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 45340401 C/T 1 67 86 153 30.9621896646846 46.2574878930914 -15.2952982284068 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0148053534834802 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000439363:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000486491:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45340199_45340498:EIF2B3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 30 33 63 13.8636670140379 17.7499662845583 -3.88629927052043 T:C C T 10 0.537877766198737 0.37669397303739 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 21 11 32 9.70456690982652 5.91665542818611 3.78791148164042 A:G G A 10 0.537877766198737 0.215505526509378 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 99 72 171 45.750101146325 38.7271991663091 7.02290198001598 A:G A G 10 0.537877766198737 0.31876150359555 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 45480502 A/G 1 299 236 535 138.174547906578 126.939152822902 11.2353950836757 A:G A G 10 0.537877766198737 0.340301043806239 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372139:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000472254:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000466193:exon_45480211_45480678:UROD;ENSG00000126088:ENST00000465678:exon_45480219_45480508:UROD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 32 41 73 14.7879114816404 22.0529884141482 -7.2650769325078 C:G C G 10 0.537877766198737 0.100149635830573 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 10 14 24 4.62122233801263 7.53028872678232 -2.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.306179082005434 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 46500613 T/C 1 12 14 26 5.54546680561516 7.53028872678232 -1.98482192116716 T:C T C 10 0.537877766198737 0.440230707582908 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 46501599 G/A 1 85 79 164 39.2803898731074 42.4923435297002 -3.21195365659286 A:G G A 10 0.537877766198737 0.638839330015444 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000468212:exon_46501486_46501896:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46501171_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46501567_46501795:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 51826921 T/C 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 T:C T C 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51826843_51827027:EPS15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 22 17 39 10.1666891436278 9.14392202537853 1.02276711824926 A:T A T 10 0.537877766198737 0.872685127159421 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 52499362 C/G 1 2 10 12 0.924244467602526 5.37877766198737 -4.45453319438484 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0165336864510135 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 52861899 T/G 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 T:G T G 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000085840:ENST00000371568:exon_52861718_52862036:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000371566:exon_52861718_52862036:ORC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 52876825 C/T 1 45 35 80 20.7955005210568 18.8257218169558 1.96977870410105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.736848025782442 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52876787_52876872:PRPF38A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 52882406 A/G 1 38 68 106 17.560644884448 36.5756881015141 -19.0150432170661 A:G A G 10 0.537877766198737 0.000273768353557212 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52882320_52883992:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52882320_52882694:PRPF38A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 52991569 T/C 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 T:C T C 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371541:exon_52991235_52991602:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 7 11 18 3.23485563660884 5.91665542818611 -2.68179979157727 A:G G A 10 0.537877766198737 0.241050465666398 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 53679229 A/G 1 43 52 95 19.8712560534543 27.9696438423343 -8.09838778888001 A:G A G 10 0.537877766198737 0.100323842179585 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 53681699 T/G 1 62 78 140 28.6515784956783 41.9544657635015 -13.3028872678232 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0272902851945564 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 54432019 G/A 1 76 60 136 35.121289768896 32.2726659719242 2.84862379697177 A:G G A 10 0.537877766198737 0.667523596814736 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 55183264 G/A 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G G A 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55183165_55183326:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55183165_55183326:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55183165_55183326:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55183165_55183326:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55183165_55183440:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55183165_55183326:TTC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 55223524 G/C 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 C:G G C 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000162396:ENST00000371279:exon_55222571_55224863:PARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 55538462 C/T 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 T:C C T 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000162402:ENST00000294383:exon_55538459_55538534:USP24;ENSG00000162402:ENST00000407756:exon_55538459_55538534:USP24;ENSG00000162402:ENST00000484447:exon_55538459_55538534:USP24;ENSG00000162402:ENST00000480962:exon_55538459_55538665:USP24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:C C A 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 71538191 A/G 1 86 72 158 39.7425121069086 38.7271991663091 1.01531294059956 A:G A G 10 0.537877766198737 0.936441456847591 ENSG00000132485:ENST00000370920:exon_71538155_71538231:ZRANB2;ENSG00000132485:ENST00000254821:exon_71538155_71538231:ZRANB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 20 23 43 9.24244467602526 12.3711886225709 -3.12874394654569 T:C T C 10 0.537877766198737 0.361597067830681 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 69 55 124 31.8864341322871 29.5832771409305 2.30315699135662 A:G A G 10 0.537877766198737 0.719055149155702 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 76199277 A/C 1 21 26 47 9.70456690982652 13.9848219211672 -4.28025501134064 A:C A C 10 0.537877766198737 0.242369022002609 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76199213_76199313:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76199213_76199313:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76199213_76199313:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000532509:exon_76199213_76199313:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76199213_76199313:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76199213_76199313:ACADM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 79093910 G/A 0 0 12 12 0 6.45453319438484 -6.45453319438484 A G A 10 0.537877766198737 9.48598355804819e-05 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 84944998 G/T 1 46 38 84 21.2576227548581 20.439355115552 0.818267639306097 T:G G T 10 0.537877766198737 0.913050638889097 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 84948644 A/T 1 44 23 67 20.3333782872556 12.3711886225709 7.96218966468462 A:T A T 10 0.537877766198737 0.065278415482814 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84948598_84949013:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84948598_84948678:RPF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 19 25 44 8.780322442224 13.4469441549684 -4.66662171274443 A:G G A 10 0.537877766198737 0.174899698772878 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 89448607 C/T 0 66 0 66 30.5000674308834 0 30.5000674308834 C C 10 0.537877766198737 1.90246546143807e-18 ENSG00000213516:ENST00000321792:exon_89445139_89449749:RBMXL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 90482903 A/G 1 29 26 55 13.4015447802366 13.9848219211672 -0.583277140930532 A:G A G 10 0.537877766198737 0.893142666161473 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90482876_90483023:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90482876_90483023:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90482876_90483023:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90482876_90483023:ZNF326 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 92732031 T/C 1 5 8 13 2.31061116900632 4.3030221295899 -1.99241096058358 T:C T C 10 0.537877766198737 0.282359568582401 ENSG00000174842:ENST00000370360:exon_92731976_92732049:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495106:exon_92731976_92732049:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495852:exon_92731976_92732049:GLMN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 92852626 A/G 1 17 16 33 7.85607797462147 8.60604425917979 -0.74996628455832 A:G A G 10 0.537877766198737 0.862119553352529 ENSG00000122484:ENST00000370343:exon_92852568_92853730:RPAP2;ENSG00000122484:ENST00000477322:exon_92852568_92852790:RPAP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 93646348 G/A 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000448243:exon_93646273_93646409:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000479653:exon_93646316_93646409:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 93646433 T/C 1 14 7 21 6.46971127321768 3.76514436339116 2.70456690982652 T:C T C 10 0.537877766198737 0.278190405615872 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 37 22 59 17.0985226506467 11.8333108563722 5.26521179427452 T:C C T 10 0.537877766198737 0.192182814919146 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 26 13 39 12.0151780788328 6.99241096058358 5.02276711824926 C:G C G 10 0.537877766198737 0.111370496383565 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 121 120 241 55.9167902899528 64.5453319438484 -8.62854165389561 A:G A G 10 0.537877766198737 0.272555889718649 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 60 50 110 27.7273340280758 26.8938883099368 0.833445718138936 A:C C A 10 0.537877766198737 0.923935673883184 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 101487246 C/T 1 10 15 25 4.62122233801263 8.06816649298105 -3.44694415496842 T:C C T 10 0.537877766198737 0.228164098691797 ENSG00000117543:ENST00000370105:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000370109:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000492067:exon_101487197_101487276:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000488789:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000481871:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000464270:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000342173:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000466807:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000477293:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000498372:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000479661:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000488176:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000490732:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000370106:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000434818:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000427040:exon_101487197_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000422396:exon_101487203_101487321:DPH5;ENSG00000117543:ENST00000476507:exon_101487197_101487321:DPH5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 110034074 G/A 1 15 16 31 6.93183350701895 8.60604425917979 -1.67421075216085 A:G G A 10 0.537877766198737 0.591678302083193 ENSG00000162650:ENST00000463678:exon_110033544_110034339:ATXN7L2;ENSG00000162650:ENST00000369870:exon_110033544_110034339:ATXN7L2;ENSG00000162650:ENST00000497545:exon_110033544_110034726:ATXN7L2;ENSG00000162650:ENST00000369869:exon_110033544_110034339:ATXN7L2;ENSG00000162650:ENST00000459635:exon_110033638_110034339:ATXN7L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 110091282 C/T 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:C C T 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 111726098 G/A 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000483427:exon_111726084_111726173:CEPT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 111738589 A/T 1 16 12 28 7.39395574082021 6.45453319438484 0.939422546435365 A:T A T 10 0.537877766198737 0.850219934863149 ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111738538_111738678:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111738538_111738678:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000473682:exon_111738538_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000463713:exon_111738536_111738678:DENND2D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 111783981 G/A 1 450 307 757 207.955005210568 165.128474223012 42.8265309875561 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00192750517390270 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 111957245 G/A 1 6 12 18 2.77273340280758 6.45453319438484 -3.68179979157727 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0990055908664937 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 111992143 C/G 1 42 40 82 19.409133819653 21.5151106479495 -2.10597682829643 C:G C G 10 0.537877766198737 0.659026621988552 ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000483994:exon_111992106_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000468818:exon_111992107_111992203:ATP5F1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 112308900 C/T 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 112309123 C/A 1 20 19 39 9.24244467602526 10.219677557776 -0.977232881750741 A:C C A 10 0.537877766198737 0.751442400848155 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 112309331 T/C 1 20 23 43 9.24244467602526 12.3711886225709 -3.12874394654569 T:C T C 10 0.537877766198737 0.361597067830681 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 8 14 22 3.6969778704101 7.53028872678232 -3.83331085637221 A:G A G 10 0.537877766198737 0.133495761886537 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 41 34 75 18.9470115858518 18.2878440507571 0.659167535094731 T:C T C 10 0.537877766198737 0.908258053631135 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 107 79 186 49.4470790167351 42.4923435297002 6.95473548703492 T:C C T 10 0.537877766198737 0.33913715232679 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 27 24 51 12.4773003126341 12.9090663887697 -0.431766076135585 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 115260738 G/C 1 216 236 452 99.8184025010728 126.939152822902 -27.1207503218291 T:C:G G C 10 0.537877766198737 0.0108393028270529 ENSG00000009307:ENST00000339438:exon_115259534_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000438362:exon_115259537_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000358528:exon_115259538_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369533:exon_115259538_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000261443:exon_115259916_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000530886:exon_115259926_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369530:exon_115259933_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000483407:exon_115260423_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000534699:exon_115260578_115260837:CSDE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 115316860 T/C 1 16 22 38 7.39395574082021 11.8333108563722 -4.439355115552 T:C T C 10 0.537877766198737 0.192443423144632 ENSG00000052723:ENST00000369528:exon_115312100_115316993:SIKE1;ENSG00000052723:ENST00000060969:exon_115315396_115316993:SIKE1;ENSG00000052723:ENST00000369524:exon_115316763_115316993:SIKE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 116947051 G/A 1 730 588 1318 337.349230674922 316.272126524857 21.0771041500647 A:G G A 10 0.537877766198737 0.246088934851874 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116947038_116947394:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116947038_116947396:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116947038_116947396:ATP1A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 117078729 A/G 1 38 57 95 17.560644884448 30.659032673328 -13.09838778888 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.00740228182013748 ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117078587_117078850:CD58 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 117618064 G/A 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 A:G G A 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 T:C C T 10 0.537877766198737 0.80945734873112 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 118491102 G/A 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 G G 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118491028_118491129:WDR3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 118495153 T/G 1 17 27 44 7.85607797462147 14.5226996873659 -6.66662171274443 A:T:G T G 10 0.537877766198737 0.049342531404486 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 C C 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 50 50 0 26.8938883099368 -26.8938883099368 C T C 10 0.537877766198737 1.72919192248298e-17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 38 38 0 20.439355115552 -20.439355115552 T:C G T 10 0.537877766198737 1.82289154509011e-13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 41 41 0 22.0529884141482 -22.0529884141482 A C A 10 0.537877766198737 1.79900107347554e-14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 68 0 68 31.4243118984859 0 31.4243118984859 G G 10 0.537877766198737 5.36413456960313e-19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 1 2 45 47 0.924244467602526 24.2044994789432 -23.2802550113406 T:C T C 10 0.537877766198737 4.86208641285394e-13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 1 2 54 56 0.924244467602526 29.0453993747318 -28.1211549071293 T:C C T 10 0.537877766198737 3.6251085721347e-16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 45 50 95 20.7955005210568 26.8938883099368 -6.09838778888001 C:G C G 10 0.537877766198737 0.218140642154436 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 26 25 51 12.0151780788328 13.4469441549684 -1.43176607613558 A:G G A 10 0.537877766198737 0.779149398181291 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 149871738 G/C 1 24 16 40 11.0909336112303 8.60604425917979 2.48488935205052 C:G G C 10 0.537877766198737 0.526473678584899 ENSG00000178096:ENST00000369153:exon_149871396_149872044:BOLA1;ENSG00000178096:ENST00000369152:exon_149871563_149872345:BOLA1;ENSG00000178096:ENST00000476344:exon_149871676_149872351:BOLA1;ENSG00000178096:ENST00000369150:exon_149871396_149872101:BOLA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 150129593 G/A 1 284 283 567 131.242714399559 152.219407834243 -20.9766934346839 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0841121393695539 ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150129566_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000485470:exon_150129211_150129680:PLEKHO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 150131342 G/A 1 749 645 1394 346.129553117146 346.931159198185 -0.801606081039324 A:G G A 10 0.537877766198737 0.978572834200273 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 150460348 C/T 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369053:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000479372:exon_150460334_150461108:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150460346_150460530:TARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 150724302 A/G 1 25 44 69 11.5530558450316 23.6666217127444 -12.1135658677129 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00365506692375443 ENSG00000163131:ENST00000448301:exon_150724257_150724484:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150724257_150724484:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000483930:exon_150724257_150724310:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150724257_150724484:CTSS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 1 21 22 43 9.70456690982652 11.8333108563722 -2.12874394654569 A:G G A 10 0.537877766198737 0.543327744285282 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 150935530 G/A 1 16 19 35 7.39395574082021 10.219677557776 -2.82572181695579 A:G G A 10 0.537877766198737 0.397562623528634 ENSG00000143379:ENST00000271640:exon_150935450_150935615:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368969:exon_150935450_150935615:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000498193:exon_150935450_150935615:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000497314:exon_150935450_150936217:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000528749:exon_150935063_150935558:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000533529:exon_150935450_150935615:SETDB1;ENSG00000143418:ENST00000482825:exon_150935434_150935620:LASS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151021096 T/G 0 0 9 9 0 4.84089989578863 -4.84089989578863 G T G 10 0.537877766198737 0.00096119560348139 ENSG00000143443:ENST00000368926:exon_151020216_151021328:C1orf56;ENSG00000143443:ENST00000433087:exon_151021010_151021328:C1orf56;ENSG00000143443:ENST00000465135:exon_151021045_151021328:C1orf56 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151089888 A/C 1 13 11 24 6.00758903941642 5.91665542818611 0.0909336112303132 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000143458:ENST00000368918:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368917:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368916:exon_151089868_151089992:GABPB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151139822 A/G 1 280 299 579 129.394225464354 160.825452093422 -31.4312266290687 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00970756230816933 ENSG00000163156:ENST00000461862:exon_151139802_151140455:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368905:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368902:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000497147:exon_151139802_151139890:SCNM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151149487 A/G 1 74 61 135 34.1970453012935 32.810543738123 1.38650156317051 A:G A G 10 0.537877766198737 0.863069505852861 ENSG00000163159:ENST00000491094:exon_151146867_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000368892:exon_151148780_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000354473:exon_151148938_151149540:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000496809:exon_151149207_151149507:VPS72 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151158034 C/T 1 56 64 120 25.8788450928707 34.4241770367192 -8.54533194384843 T:C C T 10 0.537877766198737 0.120494171337523 ENSG00000163159:ENST00000491094:exon_151157982_151158096:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000368892:exon_151157982_151158096:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000354473:exon_151157982_151158096:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000496809:exon_151157982_151158096:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000471423:exon_151157998_151158426:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000463470:exon_151158016_151158096:VPS72 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151237908 G/A 1 135 109 244 62.3865015631705 58.6286765156623 3.75782504750818 A:G G A 10 0.537877766198737 0.653420038730869 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000462970:exon_151237870_151238064:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000437736:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000491857:exon_151237720_151238085:PSMD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151239720 G/A 1 963 755 1718 445.023711150616 406.097713480046 38.9259976705699 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0624221052821604 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151239649_151239955:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151239649_151239935:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151239649_151239942:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239649_151239936:PSMD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151262977 C/T 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:C C T 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151262847_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151262847_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000436614:exon_151262927_151263049:ZNF687 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 A:G G A 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 151400447 T/C 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151400299_151400517:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151400299_151400517:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151400299_151400517:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151400299_151400517:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151400299_151400517:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151400299_151400490:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151400299_151400490:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151400299_151400517:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000441516:exon_151400299_151400456:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000485040:exon_151398665_151400517:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000437847:exon_151400285_151400517:POGZ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 152770533 G/A 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 G G 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000172155:ENST00000326233:exon_152770249_152771396:LCE1D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 153507176 C/T 1 91 40 131 42.0531232759149 21.5151106479495 20.5380126279655 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000300930130580632 ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 153516358 G/A 1 145 59 204 67.0077239011831 31.7347882057255 35.2729356954577 A:G G A 10 0.537877766198737 4.99953328431499e-07 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153516089_153516415:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153516097_153516399:S100A4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 153598846 C/T 1 17 12 29 7.85607797462147 6.45453319438484 1.40154478023663 T:C C T 10 0.537877766198737 0.710601451134831 ENSG00000189171:ENST00000476133:exon_153598796_153599009:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000339556:exon_153598796_153599018:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000368699:exon_153598796_153599009:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000440685:exon_153598796_153599009:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000392623:exon_153598796_153599009:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000392622:exon_153598796_153599009:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000491177:exon_153598796_153600074:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000497086:exon_153598808_153599009:S100A13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 74 72 146 34.1970453012935 38.7271991663091 -4.5301538650156 C:G G C 10 0.537877766198737 0.456370322912831 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 153751267 C/T 1 7 9 16 3.23485563660884 4.84089989578863 -1.60604425917979 T:C C T 10 0.537877766198737 0.460334234664264 ENSG00000143554:ENST00000271857:exon_153751163_153751361:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000368661:exon_153751163_153751361:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000484014:exon_153751163_153751361:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000468403:exon_153749538_153752632:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000483574:exon_153750637_153751949:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000458027:exon_153751163_153751361:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000531251:exon_153750939_153751272:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000524676:exon_153751234_153751361:SLC27A3;ENSG00000143554:ENST00000468044:exon_153751116_153751361:SLC27A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 153949683 G/A 1 529 612 1141 244.462661680868 329.181192913627 -84.7185312327588 A:G G A 10 0.537877766198737 5.83306458727613e-07 ENSG00000143543:ENST00000271843:exon_153949646_153950164:JTB;ENSG00000143543:ENST00000356648:exon_153949646_153949865:JTB;ENSG00000143543:ENST00000368589:exon_153949646_153950136:JTB;ENSG00000143543:ENST00000461365:exon_153949646_153949865:JTB;ENSG00000143543:ENST00000471173:exon_153949646_153950102:JTB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 T:C C T 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 9 8 17 4.15910010421137 4.3030221295899 -0.143922025378528 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 31 20 51 14.3257892478392 10.7575553239747 3.56823392386442 C:G C G 10 0.537877766198737 0.329598071356323 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 22 11 33 10.1666891436278 5.91665542818611 4.25003371544168 A:G A G 10 0.537877766198737 0.163296960793547 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 23 18 41 10.6288113774291 9.68179979157727 0.947011585851785 T:C C T 10 0.537877766198737 0.87583843917238 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 154938662 T/C 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 T:C T C 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000414115:exon_154938638_154938707:SHC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 155030557 A/C 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:C A C 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 155033918 C/T 1 6 16 22 2.77273340280758 8.60604425917979 -5.83331085637221 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0169939987707011 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155033891_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155033891_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155033891_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155033891_155034234:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155033891_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000498481:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461234:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000462116:exon_155033891_155033922:ADAM15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 156437754 C/A 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:C C A 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 6 13 19 2.77273340280758 6.99241096058358 -4.219677557776 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0651269816126054 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 156499969 T/C 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 T:C T C 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000183856:ENST00000361170:exon_156499897_156500109:IQGAP3;ENSG00000183856:ENST00000491900:exon_156499897_156500109:IQGAP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 156564998 T/G 1 570 589 1159 263.40967326672 316.810004291056 -53.4003310243361 A:T:C:G T G 10 0.537877766198737 0.0017817999587971 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156564779_156565048:GPATCH4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 156784840 G/A 1 7 14 21 3.23485563660884 7.53028872678232 -4.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0786738247503462 ENSG00000027869:ENST00000368199:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000368198:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000392306:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000486350:exon_156784829_156785203:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000495306:exon_156784290_156785013:SH2D2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 158261899 G/A 1 42 20 62 19.409133819653 10.7575553239747 8.65157849567831 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0301097370401227 ENSG00000158481:ENST00000368169:exon_158261874_158262155:CD1C;ENSG00000158481:ENST00000368170:exon_158261874_158262155:CD1C;ENSG00000158481:ENST00000443761:exon_158261874_158262155:CD1C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 158815472 A/G 1 60 68 128 27.7273340280758 36.5756881015141 -8.84835407343833 A:G A G 10 0.537877766198737 0.131624112759643 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158815377_158815793:MNDA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 160719757 C/T 1 32 44 76 14.7879114816404 23.6666217127444 -8.87871023110401 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0498834178183322 ENSG00000026751:ENST00000466792:exon_160719611_160719856:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368043:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368042:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000435517:exon_160719611_160719922:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458602:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458104:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000359331:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000495334:exon_160719611_160719883:SLAMF7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 161695639 G/T 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 T:G G T 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161695611_161695877:FCRLB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 T:C C T 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 161821608 C/T 1 20 8 28 9.24244467602526 4.3030221295899 4.93942254643537 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0862901941391867 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161821512_161821625:ATF6;ENSG00000118217:ENST00000476437:exon_161821512_161821625:ATF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 162535963 A/G 1 9 11 20 4.15910010421137 5.91665542818611 -1.75755532397474 A:G A G 10 0.537877766198737 0.504000237806629 ENSG00000117143:ENST00000412525:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367926:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000271469:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000414807:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367925:exon_162535827_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367924:exon_162535827_162536138:UAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 162773302 C/T 1 37 30 67 17.0985226506467 16.1363329859621 0.962189664684622 T:C C T 10 0.537877766198737 0.902621251144875 ENSG00000132196:ENST00000485405:exon_162773221_162773325:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000254521:exon_162773221_162773325:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000494450:exon_162773221_162773325:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000488656:exon_162772708_162773325:HSD17B7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 165648709 C/T 1 10 10 20 4.62122233801263 5.37877766198737 -0.757555323974739 T:C C T 10 0.537877766198737 0.823990074103612 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165648679_165648819:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165648679_165648819:ALDH9A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 165649851 C/G 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 C:G C G 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165649724_165649920:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165649724_165649872:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165649724_165649920:ALDH9A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 167663486 C/T 1 13 11 24 6.00758903941642 5.91665542818611 0.0909336112303132 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000198771:ENST00000367854:exon_167663336_167663539:RCSD1;ENSG00000198771:ENST00000361496:exon_167663336_167663539:RCSD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 169677679 A/G 1 27 50 77 12.4773003126341 26.8938883099368 -14.4165879973027 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00123310196913044 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 169677709 A/G 1 62 33 95 28.6515784956783 17.7499662845583 10.90161221112 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0301868829087765 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 169761884 C/T 1 20 27 47 9.24244467602526 14.5226996873659 -5.28025501134064 T:C C T 10 0.537877766198737 0.143431018688365 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 169822077 G/A 1 55 45 100 25.4167228590695 24.2044994789432 1.2122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.841485355772187 ENSG00000000460:ENST00000498289:exon_169821931_169822226:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000359326:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000459772:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000286031:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000413811:exon_169821931_169822229:C1orf112;ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169821804_169822913:SCYL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 171496968 G/A 1 668 528 1196 308.697652179244 283.999460552933 24.6981916263106 A:G G A 10 0.537877766198737 0.155368298272899 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171496930_171496983:BAT2L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 171509327 G/A 1 92 76 168 42.5152455097162 40.878710231104 1.63653527861219 A:G G A 10 0.537877766198737 0.816871433785247 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 171509415 C/T 1 83 72 155 38.3561454055048 38.7271991663091 -0.37105376080423 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 171553294 G/A 1 13 12 25 6.00758903941642 6.45453319438484 -0.446944154968424 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171553095_171553326:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171553095_171553326:BAT2L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 13 12 25 6.00758903941642 6.45453319438484 -0.446944154968424 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 22 27 49 10.1666891436278 14.5226996873659 -4.35601054373811 A:G G A 10 0.537877766198737 0.251766137913348 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 16 13 29 7.39395574082021 6.99241096058358 0.401544780236629 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 175958578 T/C 1 21 16 37 9.70456690982652 8.60604425917979 1.09852265064673 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.744644784635273 ENSG00000143207:ENST00000461830:exon_175957424_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367667:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367669:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000314478:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367666:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367665:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000308769:exon_175958498_175958615:RFWD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 180165699 A/C 1 17 27 44 7.85607797462147 14.5226996873659 -6.66662171274443 A:C A C 10 0.537877766198737 0.049342531404486 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180165397_180165734:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180165397_180165734:QSOX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 181019202 C/T 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 T:C C T 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181019147_181019481:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181019147_181020409:MR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 181019253 T/C 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181019147_181019481:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181019147_181020409:MR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 43 22 65 19.8712560534543 11.8333108563722 8.0379451970821 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0470971507683237 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 6 9 15 2.77273340280758 4.84089989578863 -2.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.310767806906123 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 183099605 C/T 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183099479_183099684:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183099479_183099684:LAMC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 183101582 A/G 1 12 8 20 5.54546680561516 4.3030221295899 1.24244467602526 A:G A G 10 0.537877766198737 0.657647615348739 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183101535_183101672:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183101535_183101672:LAMC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 183102541 G/A 1 24 15 39 11.0909336112303 8.06816649298105 3.02276711824926 A:G G A 10 0.537877766198737 0.422369773357453 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183102541_183102685:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183102541_183102673:LAMC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 183103848 C/T 1 18 21 39 8.31820020842273 11.2954330901735 -2.97723288175074 T:C C T 10 0.537877766198737 0.341434287698833 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183103795_183103944:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183103825_183103944:LAMC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 186287683 T/C 1 174 160 334 80.4092686814198 86.0604425917979 -5.65117391037813 T:C T C 10 0.537877766198737 0.546392959687347 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186287579_186287735:TPR;ENSG00000047410:ENST00000467810:exon_186287637_186287735:TPR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 186330788 C/T 1 11 13 24 5.08334457181389 6.99241096058358 -1.90906638876969 T:C C T 10 0.537877766198737 0.54016131683339 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186330754_186330841:TPR;ENSG00000047410:ENST00000474852:exon_186330754_186330841:TPR;ENSG00000047410:ENST00000367472:exon_186330754_186330841:TPR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 197070815 T/C 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 198725169 T/C 1 89 80 169 41.1288788083124 43.030221295899 -1.90134248758654 T:C T C 10 0.537877766198737 0.817068045067999 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198725035_198726412:PTPRC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 200376239 C/G 1 25 34 59 11.5530558450316 18.2878440507571 -6.73478820572548 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0895277315610521 ENSG00000162702:ENST00000294740:exon_200375827_200378847:ZNF281;ENSG00000162702:ENST00000367353:exon_200375836_200378851:ZNF281;ENSG00000162702:ENST00000367352:exon_200375858_200378580:ZNF281 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 200618238 T/C 1 14 13 27 6.46971127321768 6.99241096058358 -0.522699687365898 T:C T C 10 0.537877766198737 0.84951872158194 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000452560:exon_200618202_200618277:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000413408:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000429498:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000433235:exon_200618202_200618354:DDX59 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 200618340 A/G 1 5 14 19 2.31061116900632 7.53028872678232 -5.219677557776 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0201938430142730 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000413408:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000429498:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000433235:exon_200618202_200618354:DDX59 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 37 27 64 17.0985226506467 14.5226996873659 2.57582296328084 A:G A G 10 0.537877766198737 0.533786730184038 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 202123390 G/A 1 15 3 18 6.93183350701895 1.61363329859621 5.31820020842274 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0157755110756416 ENSG00000143851:ENST00000309017:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000367279:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000308986:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000495688:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000496197:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000480836:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000477554:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000492977:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000477625:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000479092:exon_202123314_202123451:PTPN7;ENSG00000143851:ENST00000476061:exon_202123367_202123451:PTPN7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 202128336 G/T 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:G G T 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000143851:ENST00000468385:exon_202127586_202128582:PTPN7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 202858209 C/T 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000183155:ENST00000367262:exon_202858101_202858263:RABIF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 202933779 G/T 1 17 26 43 7.85607797462147 13.9848219211672 -6.12874394654569 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0670061206791823 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202933740_202933823:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000497655:exon_202932770_202934512:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202933740_202933823:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000446185:exon_202933740_202933823:CYB5R1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 7 9 16 3.23485563660884 4.84089989578863 -1.60604425917979 A:C C A 10 0.537877766198737 0.460334234664264 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 14 8 22 6.46971127321768 4.3030221295899 2.16668914362779 T:C C T 10 0.537877766198737 0.398552823157135 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 206628392 C/T 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 T:C C T 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000163486:ENST00000419187:exon_206628224_206629505:SRGAP2;ENSG00000163486:ENST00000439126:exon_206628224_206629507:SRGAP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 206647787 T/C 1 38 21 59 17.560644884448 11.2954330901735 6.26521179427452 T:C T C 10 0.537877766198737 0.117135409444470 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206647674_206647814:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206647674_206647814:IKBKE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 37 16 53 17.0985226506467 8.60604425917979 8.49247839146694 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0193638002503037 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 206757857 C/A 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 A:C C A 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 206766975 T/C 1 228 202 430 105.363869306688 108.651308772145 -3.28743946545688 T:C T C 10 0.537877766198737 0.771749418768424 ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206766968_206767142:LGTN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 207653364 A/G 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 21 28 49 9.70456690982652 15.0605774535646 -5.35601054373811 A:G A G 10 0.537877766198737 0.151491737422591 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 43 50 93 19.8712560534543 26.8938883099368 -7.02263225648254 A:G A G 10 0.537877766198737 0.146897539167111 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 65 44 109 30.0379451970821 23.6666217127444 6.37132348433767 T:C C T 10 0.537877766198737 0.249102946276413 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 210012259 G/A 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210012254_210012473:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000457820:exon_210012150_210012473:C1orf107 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 35 25 60 16.1742781830442 13.4469441549684 2.72733402807578 T:C T C 10 0.537877766198737 0.519037944003545 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 2 10 12 0.924244467602526 5.37877766198737 -4.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0165336864510135 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 212273639 C/T 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 360 356 716 166.364004168455 191.48448476675 -25.1204805982956 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0609657112037812 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 212870410 G/A 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000123685:ENST00000478275:exon_212870303_212872097:BATF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 213032568 T/A 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:T T A 10 0.537877766198737 0.318265975852943 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 214787130 G/A 1 17 13 30 7.85607797462147 6.99241096058358 0.863667014037891 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 0.855400861350958 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000464322:exon_214787057_214787259:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000495259:exon_214787057_214787236:CENPF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 214795454 C/T 1 28 13 41 12.9394225464354 6.99241096058358 5.94701158585178 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0836800437519024 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214795422_214795624:CENPF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 214811244 C/G 1 28 30 58 12.9394225464354 16.1363329859621 -3.19691043952674 C:G C G 10 0.537877766198737 0.430893743173673 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 214819420 C/T 1 15 5 20 6.93183350701895 2.68938883099368 4.24244467602526 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0719987060582597 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 214828589 C/T 1 30 45 75 13.8636670140379 24.2044994789432 -10.3408324649053 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0200519564868543 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214828584_214828746:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214828491_214828746:CENPF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 74 66 140 34.1970453012935 35.4999325691166 -1.30288726782317 A:G A G 10 0.537877766198737 0.865513721672503 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 220162029 G/T 1 119 119 238 54.9925458223503 64.0074541776497 -9.01490835529939 T:G G T 10 0.537877766198737 0.242742025548082 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220161932_220162165:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220161932_220162165:EPRS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 220298664 A/G 1 5 12 17 2.31061116900632 6.45453319438484 -4.14392202537853 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0521612914229826 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000490891:exon_220298579_220298681:IARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 220928438 C/T 1 3 13 16 1.38636670140379 6.99241096058358 -5.60604425917979 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00533214334062272 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220928314_220928462:MOSC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 220935013 G/T 1 4 19 23 1.84848893520505 10.219677557776 -8.37118862257095 T:G G T 10 0.537877766198737 0.00051070812521471 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000496078:exon_220935000_220935106:MOSC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 220936372 G/A 1 4 27 31 1.84848893520505 14.5226996873659 -12.6742107521608 A:G G A 10 0.537877766198737 4.31408804945607e-06 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220936252_220936392:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220936252_220936392:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220936252_220936392:MOSC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 24 3 27 11.0909336112303 1.61363329859621 9.4773003126341 T:C T C 10 0.537877766198737 0.000147576470618211 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 225600169 C/T 1 7 9 16 3.23485563660884 4.84089989578863 -1.60604425917979 T:C C T 10 0.537877766198737 0.460334234664264 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225600156_225600347:LBR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 226034858 C/T 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000482753:exon_226034840_226034914:TMEM63A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 226034909 G/A 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000482753:exon_226034840_226034914:TMEM63A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 226109699 T/C 1 105 79 184 48.5228345491326 42.4923435297002 6.0304910194324 T:C T C 10 0.537877766198737 0.376301956336759 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226109558_226111471:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000446534:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000489681:exon_226109558_226109779:PYCR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 43 48 91 19.8712560534543 25.8181327775394 -5.94687672408507 T:G T G 10 0.537877766198737 0.247360245818034 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 226553690 T/C 1 215 163 378 99.3562802672716 87.6740758903941 11.6822043768774 T:C T C 10 0.537877766198737 0.235703643069424 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226553655_226553753:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226553655_226553753:PARP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 181 183 364 83.6441243180286 98.4316312143689 -14.7875068963402 A:G G A 10 0.537877766198737 0.127379885447398 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 226924064 C/T 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 88 102 190 40.6667565745111 54.8635321522712 -14.19677557776 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0415636911149444 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 13 13 26 6.00758903941642 6.99241096058358 -0.98482192116716 A:C A C 10 0.537877766198737 0.699848188249655 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 5 8 13 2.31061116900632 4.3030221295899 -1.99241096058358 A:G A G 10 0.537877766198737 0.282359568582401 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 8 16 24 3.6969778704101 8.60604425917979 -4.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0633085169542399 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 228295527 G/A 1 123 120 243 56.8410347575554 64.5453319438484 -7.70429718629308 A:G G A 10 0.537877766198737 0.334831172077172 ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228295369_228295561:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000457264:exon_228295368_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000463898:exon_228295468_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000497758:exon_228295486_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000464148:exon_228295525_228295570:MRPL55 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 228363245 G/A 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000181873:ENST00000366711:exon_228362823_228369958:C1orf69;ENSG00000181873:ENST00000484749:exon_228362823_228369958:C1orf69 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 229773659 A/T 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:T A T 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 27 41 68 12.4773003126341 22.0529884141482 -9.57568810151411 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0209401160932443 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 15 24 39 6.93183350701895 12.9090663887697 -5.97723288175074 T:C T C 10 0.537877766198737 0.075946433315072 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 234743492 C/T 1 59 43 102 27.2652117942745 23.1287439465457 4.13646784772883 T:C C T 10 0.537877766198737 0.428503382192825 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 234743528 G/A 1 56 43 99 25.8788450928707 23.1287439465457 2.75010114632504 A:G G A 10 0.537877766198737 0.615083947060625 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 70 82 152 32.3485563660884 44.1059768282964 -11.757420462208 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0612072672370551 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 63 52 115 29.1137007294796 27.9696438423343 1.14405688714525 T:C T C 10 0.537877766198737 0.852126146824528 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 14 12 26 6.46971127321768 6.45453319438484 0.0151780788328386 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 26 22 48 12.0151780788328 11.8333108563722 0.181867222460626 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 42 51 93 19.409133819653 27.4317660761356 -8.02263225648254 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0972188278048906 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 243468065 A/G 1 11 15 26 5.08334457181389 8.06816649298105 -2.98482192116716 A:G A G 10 0.537877766198737 0.246211435647614 ENSG00000054282:ENST00000448231:exon_243468015_243468079:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000343783:exon_243468015_243468079:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243468018_243468079:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000391846:exon_243468015_243468079:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243468015_243468079:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000482234:exon_243468015_243468079:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000476722:exon_243468015_243468079:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000435549:exon_243468015_243468079:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000496361:exon_243468015_243468859:SDCCAG8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 245862248 C/T 1 9 14 23 4.15910010421137 7.53028872678232 -3.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 0.209145102213295 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245862189_245862339:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245862189_245862339:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245862189_245862339:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245862189_245862339:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245862189_245862339:KIF26B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 40 45 85 18.4848893520505 24.2044994789432 -5.71961012689264 T:C T C 10 0.537877766198737 0.232022880373310 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 246518360 G/A 1 27 13 40 12.4773003126341 6.99241096058358 5.48488935205052 A:G G A 10 0.537877766198737 0.111656347368297 ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246518333_246518396:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246518333_246518383:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000453676:exon_246518333_246518396:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000462422:exon_246518333_246518396:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000403792:exon_246518333_246518396:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470863:exon_246518333_246518396:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000455277:exon_246518333_246518396:SMYD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 246729356 C/T 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246729128_246729626:TFB2M HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 247006035 G/A 1 17 13 30 7.85607797462147 6.99241096058358 0.863667014037891 A:G G A 10 0.537877766198737 0.855400861350958 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 247463983 G/A 1 9 13 22 4.15910010421137 6.99241096058358 -2.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.285712862815016 ENSG00000162714:ENST00000462139:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000461277:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000294753:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000366498:exon_247463623_247464578:ZNF496 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 1 247473106 C/T 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000162714:ENST00000462139:exon_247471777_247477154:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000461277:exon_247473001_247473108:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000294753:exon_247473001_247473108:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000366498:exon_247473001_247473108:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000465126:exon_247472081_247473108:ZNF496 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 858817 C/T 1 11 12 23 5.08334457181389 6.45453319438484 -1.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 0.676956493327354 ENSG00000107929:ENST00000316157:exon_855484_859153:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000448368:exon_858446_859153:LARP4B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 860990 G/A 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 A:G G A 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000107929:ENST00000316157:exon_860886_861010:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000448368:exon_860886_861010:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000263154:exon_860886_861010:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000440895:exon_860886_861010:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000469487:exon_860886_861655:LARP4B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 1065787 A/G 1 12 21 33 5.54546680561516 11.2954330901735 -5.74996628455832 A:G A G 10 0.537877766198737 0.05412091999447 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 1088565 T/C 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 T:C T C 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000067064:ENST00000427898:exon_1088489_1088702:IDI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 3154461 G/A 1 70 43 113 32.3485563660884 23.1287439465457 9.21981241954273 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.0894748268448015 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3154414_3154478:PFKP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 77 75 152 35.5834120026973 40.3408324649053 -4.75742046220802 T:C C T 10 0.537877766198737 0.4644805361803 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 159 118 277 73.4774351744008 63.469576411451 10.0078587629499 A:T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.252207866014649 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 115 129 244 53.1440568871453 69.3862318396371 -16.2421749524918 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0398287218914947 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 3197856 C/G 1 27 25 52 12.4773003126341 13.4469441549684 -0.969643842334321 C:G C G 10 0.537877766198737 0.78318800688673 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3197783_3197921:PITRM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 3207705 G/C 1 2 17 19 0.924244467602526 9.14392202537853 -8.219677557776 C:G G C 10 0.537877766198737 0.000116414706677510 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3207605_3207719:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3207605_3207719:PITRM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 6002407 T/C 0 11 0 11 5.08334457181389 0 5.08334457181389 T T 10 0.537877766198737 0.00129550349960007 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 6060057 G/A 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 A:G G A 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000397240:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000379954:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6060016_6060082:IL2RA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 6067969 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6067797_6067988:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000397240:exon_6067797_6067988:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000379954:exon_6067797_6067988:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6067797_6067988:IL2RA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 8006836 G/A 1 28 19 47 12.9394225464354 10.219677557776 2.71974498865936 A:G G A 10 0.537877766198737 0.466730923878796 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 12143105 C/G 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 C:G C G 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 12206396 T/C 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000065665:ENST00000379033:exon_12206267_12207403:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000298428:exon_12206267_12206826:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000379041:exon_12206267_12206826:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000379020:exon_12206267_12207362:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000419021:exon_12206267_12206546:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000426560:exon_12206267_12206410:SEC61A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 12209752 T/C 1 165 203 368 76.2501685772084 109.189186538344 -32.9390179611352 T:C T C 10 0.537877766198737 0.000659604297610946 ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 13154485 C/A 1 66 88 154 30.5000674308834 47.3332434254889 -16.8331759946055 A:C C A 10 0.537877766198737 0.00749061681487372 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13154453_13154635:OPTN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 13228228 C/G 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 C:G C G 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13228164_13228280:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13228164_13228280:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13228164_13228280:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13228164_13228280:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13228164_13228280:MCM10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 13243515 G/A 1 14 10 24 6.46971127321768 5.37877766198737 1.09093361123031 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.687960904025668 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13243421_13243534:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13243421_13243534:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13243421_13243534:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13243421_13243534:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13243421_13243534:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000481292:exon_13243421_13243872:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000485659:exon_13243421_13243534:MCM10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 13 15 28 6.00758903941642 8.06816649298105 -2.06057745356464 T:C T C 10 0.537877766198737 0.454321487587661 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 13336521 C/T 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000479604:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000464049:exon_13336428_13336987:PHYH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 18 14 32 8.31820020842273 7.53028872678232 0.787911481640417 T:C T C 10 0.537877766198737 0.860177309642916 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 24 24 48 11.0909336112303 12.9090663887697 -1.81813277753938 A:G A G 10 0.537877766198737 0.66482440830302 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 13735947 A/G 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 14976727 G/C 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 C:G G C 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378241:exon_14976702_14976774:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000456122:exon_14976722_14976774:DCLRE1C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 15820986 A/G 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 A:G A G 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000148481:ENST00000277632:exon_15820169_15821140:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000477891:exon_15820169_15821140:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000378036:exon_15820169_15821140:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000378033:exon_15820169_15821140:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000476912:exon_15820853_15821140:FAM188A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 15821078 A/G 1 2 14 16 0.924244467602526 7.53028872678232 -6.60604425917979 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00151201427325421 ENSG00000148481:ENST00000277632:exon_15820169_15821140:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000477891:exon_15820169_15821140:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000378036:exon_15820169_15821140:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000378033:exon_15820169_15821140:FAM188A;ENSG00000148481:ENST00000476912:exon_15820853_15821140:FAM188A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 16547058 A/G 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 A:G A G 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000165983:ENST00000343656:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000378000:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000298942:exon_16547019_16547159:PTER HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 22862282 T/C 1 21 9 30 9.70456690982652 4.84089989578863 4.86366701403789 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0981747568114646 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000422321:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_22862240_22862386:PIP4K2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 23003226 A/G 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:G A G 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 27326228 G/C 1 27 20 47 12.4773003126341 10.7575553239747 1.71974498865936 C:G G C 10 0.537877766198737 0.66256491473273 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27326115_27326252:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27326115_27326252:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27326115_27326252:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27326115_27326252:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27326115_27326252:ANKRD26 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 27337797 G/C 1 34 11 45 15.7121559492429 5.91665542818611 9.79550052105684 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00400209487548653 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27337730_27337908:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27337730_27337908:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27337730_27337908:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27337730_27337908:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27337730_27337908:ANKRD26 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 27352953 C/T 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27352917_27353010:ANKRD26 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 27403528 A/G 1 143 171 314 66.0834794335806 91.977098019984 -25.8936185864034 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00383365274480267 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27403450_27403536:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27403450_27403536:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27403450_27403536:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27403450_27403536:YME1L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 13 5 18 6.00758903941642 2.68938883099368 3.31820020842274 T:C T C 10 0.537877766198737 0.155963033480451 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 30629226 G/A 1 37 24 61 17.0985226506467 12.9090663887697 4.18945626187704 A:G G A 10 0.537877766198737 0.306052310231901 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 30638090 C/A 1 81 68 149 37.4319009379023 36.5756881015141 0.856212836388195 A:C:G C A 10 0.537877766198737 0.934584833051387 ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30638048_30638248:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30638048_30638090:MTPAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 34408636 T/C 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C T C 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34408541_34408668:PARD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 35426755 A/G 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000095794:ENST00000482646:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000466251:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000496019:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000354759:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000427847:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000345491:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395895:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374728:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000337656:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374734:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395897:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000439705:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000333809:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000362092:exon_35426710_35426807:CREM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 12 5 17 5.54546680561516 2.68938883099368 2.85607797462147 A:G G A 10 0.537877766198737 0.224394873418676 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 43292451 G/C 1 17 28 45 7.85607797462147 15.0605774535646 -7.20449947894316 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0359764214359315 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 43882088 G/A 1 296 363 659 136.788181205174 195.249629130141 -58.4614479249676 A:G G A 10 0.537877766198737 5.5680571131921e-06 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 50678317 C/G 1 13 1 14 6.00758903941642 0.537877766198737 5.46971127321768 C:G C G 10 0.537877766198737 0.00256068292358197 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000465653:exon_50678228_50678327:ERCC6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 51584624 C/T 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 T:C C T 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000498586:exon_51584616_51584817:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000431200:exon_51584616_51584947:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 84 90 174 38.8182676393061 48.4089989578863 -9.59073131858023 T:C T C 10 0.537877766198737 0.149114084398117 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 25 19 44 11.5530558450316 10.219677557776 1.33337828725557 A:C C A 10 0.537877766198737 0.763193680581 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 61552774 C/T 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 T:C C T 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 64911911 A/G 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 64913739 G/A 1 44 25 69 20.3333782872556 13.4469441549684 6.88643413228715 A:G G A 10 0.537877766198737 0.116021020243957 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64913271_64914783:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64913271_64914783:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64913522_64913978:NRBF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G G A 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 70775329 G/A 1 15 8 23 6.93183350701895 4.3030221295899 2.62881137742905 A:G G A 10 0.537877766198737 0.302209397783681 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70775297_70776738:KIAA1279 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 273 129 402 126.159369827745 69.3862318396371 56.7731379881077 A:G G A 10 0.537877766198737 9.62448438907785e-09 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 70856853 G/C 1 272 129 401 125.697247593944 69.3862318396371 56.3110157543065 C:G G C 10 0.537877766198737 1.24047810805327e-08 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 70940191 C/T 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000156502:ENST00000359655:exon_70939988_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000395093:exon_70939993_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000471069:exon_70940006_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000483572:exon_70940037_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000422378:exon_70940044_70940318:SUPV3L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 32 29 61 14.7879114816404 15.5984552197634 -0.810543738122954 A:G G A 10 0.537877766198737 0.8980402125448 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 71151885 C/T 1 28 27 55 12.9394225464354 14.5226996873659 -1.58327714093053 T:C C T 10 0.537877766198737 0.686909120719414 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000467710:exon_71151881_71151918:HK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 71905695 A/G 1 7 17 24 3.23485563660884 9.14392202537853 -5.90906638876969 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0224011279801509 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 71906150 T/C 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 T:C T C 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 71969017 A/T 1 349 357 706 161.280659596641 192.022362532949 -30.7417029363083 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0212776291641275 ENSG00000180817:ENST00000373232:exon_71968961_71969046:PPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 14 20 34 6.46971127321768 10.7575553239747 -4.28784405075706 T:C C T 10 0.537877766198737 0.168884268594466 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 73521578 G/A 1 15 16 31 6.93183350701895 8.60604425917979 -1.67421075216085 A:G G A 10 0.537877766198737 0.591678302083193 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 73594225 G/A 1 19 20 39 8.780322442224 10.7575553239747 -1.97723288175074 A:G G A 10 0.537877766198737 0.526240071250459 ENSG00000197746:ENST00000394936:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000373120:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000357471:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394934:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394940:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000402059:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394929:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000404083:exon_73594129_73594262:PSAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 73972957 C/T 1 13 28 41 6.00758903941642 15.0605774535646 -9.05298841414822 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00697508797905927 ENSG00000138303:ENST00000394919:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000342444:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317168:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000373101:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317126:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000394915:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000531048:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000530461:exon_73972945_73973035:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000527593:exon_73972945_73973109:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000524829:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000532011:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000526751:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000492502:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000533958:exon_73972945_73973089:ASCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 74767998 C/G 1 7 12 19 3.23485563660884 6.45453319438484 -3.219677557776 C:G C G 10 0.537877766198737 0.168962527098265 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74766975_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000373008:exon_74766975_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74766982_74768050:P4HA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 97 129 226 44.8258566787225 69.3862318396371 -24.5603751609145 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00131234112361954 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 66 51 117 30.5000674308834 27.4317660761356 3.06830135474778 T:C T C 10 0.537877766198737 0.579599965644863 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:T T A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 75006804 A/G 1 45 40 85 20.7955005210568 21.5151106479495 -0.71961012689264 A:G A G 10 0.537877766198737 0.913580632809286 ENSG00000213551:ENST00000372950:exon_75006768_75008620:DNAJC9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 62 57 119 28.6515784956783 30.659032673328 -2.0074541776497 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.714191856805904 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 A:G G A 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 86237331 G/A 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86237331_86237420:FAM190B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 95266799 A/G 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 A:G A G 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95266767_95266813:CEP55 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 96094425 T/C 1 13 6 19 6.00758903941642 3.22726659719242 2.780322442224 T:C T C 10 0.537877766198737 0.252313312370768 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96094391_96094475:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96094391_96094475:NOC3L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 96116958 T/C 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 T:C T C 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96116931_96117088:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96116931_96117088:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96116931_96117972:NOC3L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 96121606 T/G 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:G T G 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96121422_96121629:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000461562:exon_96121422_96121629:NOC3L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 41 40 81 18.9470115858518 21.5151106479495 -2.56809906209769 A:C A C 10 0.537877766198737 0.579170429812207 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 57 59 116 26.340967326672 31.7347882057255 -5.39382087905349 A:G A G 10 0.537877766198737 0.351867680245231 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 98006805 C/T 1 31 33 64 14.3257892478392 17.7499662845583 -3.42417703671916 T:C C T 10 0.537877766198737 0.452236444664944 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393898:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000495266:exon_98006740_98006805:BLNK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 98386558 G/A 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:G G A 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98386465_98386662:PIK3AP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:C C A 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 99125950 G/A 1 84 95 179 38.8182676393061 51.09838778888 -12.2801201495739 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0718740522401756 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 25 20 45 11.5530558450316 10.7575553239747 0.795500521056837 T:C T C 10 0.537877766198737 0.88167877845652 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 A:G A G 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 100144782 C/T 1 10 2 12 4.62122233801263 1.07575553239747 3.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0451025910853133 ENSG00000119943:ENST00000370575:exon_100144704_100144824:PYROXD2;ENSG00000119943:ENST00000483923:exon_100144704_100144824:PYROXD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 102749069 G/A 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000107815:ENST00000311916:exon_102747783_102749210:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102747783_102749210:C10orf2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 103361062 C/T 1 20 14 34 9.24244467602526 7.53028872678232 1.71215594924294 T:C C T 10 0.537877766198737 0.608714683105822 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370149:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000434727:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103360960_103361093:DPCD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 103432801 A/G 1 30 27 57 13.8636670140379 14.5226996873659 -0.659032673328005 A:G A G 10 0.537877766198737 0.894810441701016 ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000457105:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000431477:exon_103432672_103432804:FBXW4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 103558701 G/A 1 16 20 36 7.39395574082021 10.7575553239747 -3.36359958315453 A:G G A 10 0.537877766198737 0.316250584154210 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000482611:exon_103558599_103559089:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103558599_103559212:MGEA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 103922063 G/C 1 125 103 228 57.7652792251579 55.4014099184699 2.36386930668797 C:G G C 10 0.537877766198737 0.790615689550813 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103921868_103923627:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103921868_103923627:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103921868_103923623:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103921868_103922356:NOLC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 104140023 G/A 1 59 47 106 27.2652117942745 25.2802550113406 1.98495678293389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.770284591813222 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140006_104140119:GBF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 104160058 C/A 1 136 119 255 62.8486237969718 64.0074541776497 -1.15883038067792 A:C C A 10 0.537877766198737 0.900147359000688 ENSG00000077150:ENST00000454143:exon_104160035_104160248:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000428099:exon_104160035_104160248:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000369966:exon_104160035_104160248:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000336486:exon_104160035_104160248:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000189444:exon_104160035_104160248:NFKB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 106027165 G/A 1 279 264 543 128.932103230552 141.999730276467 -13.0676270459142 A:G G A 10 0.537877766198737 0.263424919621540 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 112266722 C/T 1 21 14 35 9.70456690982652 7.53028872678232 2.17427818304421 T:C C T 10 0.537877766198737 0.501418703087631 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 112266822 G/A 1 20 25 45 9.24244467602526 13.4469441549684 -4.20449947894316 A:G G A 10 0.537877766198737 0.23289640646611 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 112266823 C/T 1 20 25 45 9.24244467602526 13.4469441549684 -4.20449947894316 T:C C T 10 0.537877766198737 0.23289640646611 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 114185224 C/T 1 48 66 114 22.1818672224606 35.4999325691166 -13.318065346656 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0143207113108419 ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114185096_114185239:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114185096_114185239:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114185096_114185239:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114185096_114185239:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114185096_114185239:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114185096_114185239:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000496328:exon_114185096_114185239:ACSL5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 26 24 50 12.0151780788328 12.9090663887697 -0.893888309936848 T:G G T 10 0.537877766198737 0.887419668261733 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 120795626 A/T 1 384 381 765 177.454937779685 204.931428921719 -27.4764911420338 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0501587176153022 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120794356_120795780:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120795334_120795780:EIF3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 120921900 T/C 1 17 23 40 7.85607797462147 12.3711886225709 -4.51511064794948 T:C T C 10 0.537877766198737 0.157271703479637 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000330036:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000466218:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000419372:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000462913:exon_120921852_120921926:SFXN4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 25 17 42 11.5530558450316 9.14392202537853 2.40913381965305 A:G G A 10 0.537877766198737 0.536728232859706 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 121335157 T/C 1 210 199 409 97.0456690982652 107.037675473549 -9.99200637528342 T:C T C 10 0.537877766198737 0.321854628736264 ENSG00000151923:ENST00000369093:exon_121334199_121335303:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000463089:exon_121334858_121335303:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000489822:exon_121334911_121335303:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000497671:exon_121334924_121335303:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000470781:exon_121334937_121335303:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000436547:exon_121334949_121335303:TIAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 121436362 A/G 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 A:G A G 10 0.537877766198737 0.80945734873112 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 121551581 A/C 1 20 5 25 9.24244467602526 2.68938883099368 6.55305584503158 A:C A C 10 0.537877766198737 0.00860665022753294 ENSG00000198825:ENST00000453198:exon_121551381_121551596:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369081:exon_121551381_121551717:INPP5F HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 121551648 T/C 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:C T C 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000198825:ENST00000369081:exon_121551381_121551717:INPP5F HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 A:G A G 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 122663585 G/A 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 A:G G A 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 124742858 G/A 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 1 11 12 0.462122233801263 5.91665542818611 -5.45453319438484 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00200619428330241 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 126186625 C/T 1 17 18 35 7.85607797462147 9.68179979157727 -1.82572181695579 T:C C T 10 0.537877766198737 0.61209834318284 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126186605_126186697:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126186605_126186697:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126186605_126186697:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000481452:exon_126186605_126186697:LHPP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 126670356 G/A 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 127442311 A/G 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 A:G A G 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127442263_127442414:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127442263_127442414:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127442263_127442414:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127442263_127442414:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127442263_127442414:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127442263_127442414:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127442263_127442414:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000527655:exon_127442263_127442414:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127442263_127442414:C10orf137 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 520 501 1021 240.303561576657 269.476760865567 -29.1731992889104 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0687059326175706 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 595 578 1173 274.962729111752 310.89334886287 -35.9306197511185 T:C:G G C 10 0.537877766198737 0.0375720764106205 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129899922 T/C 1 219 199 418 101.204769202477 107.037675473549 -5.83290627107205 T:C T C 10 0.537877766198737 0.589570642112567 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 198 155 353 91.5002022926501 83.3710537608042 8.12914853184586 T:C T C 10 0.537877766198737 0.39353605198172 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129901570 C/T 1 165 140 305 76.2501685772084 75.3028872678232 0.947281309385232 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.95422146906292 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 107 57 164 49.4470790167351 30.659032673328 18.7880463434071 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00363778283393072 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 112 70 182 51.7576901857415 37.6514436339116 14.1062465518299 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0373949026205789 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 95 84 179 43.90161221112 45.1817323606939 -1.28012014957392 T:G T G 10 0.537877766198737 0.880926363190057 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 99 93 192 45.750101146325 50.0226322564825 -4.27253111015749 T:C C T 10 0.537877766198737 0.562842655223768 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 96 82 178 44.3637344449212 44.1059768282964 0.257757616624822 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 31 24 55 14.3257892478392 12.9090663887697 1.41672285906947 T:C T C 10 0.537877766198737 0.787211070986638 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129905523 G/A 1 17 7 24 7.85607797462147 3.76514436339116 4.09093361123031 A:G G A 10 0.537877766198737 0.104435394710996 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 T:C C T 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 27 18 45 12.4773003126341 9.68179979157727 2.79550052105684 C:G G C 10 0.537877766198737 0.456244389623114 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 54 45 99 24.9546006252682 24.2044994789432 0.750101146325044 C:G G C 10 0.537877766198737 0.919914138907767 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 134145146 A/C 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 A A 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 88 71 159 40.6667565745111 38.1893214001103 2.47743517440082 A:C C A 10 0.537877766198737 0.750505235900187 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 56 35 91 25.8788450928707 18.8257218169558 7.05312327591494 T:C T C 10 0.537877766198737 0.142478370979271 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135082340 C/A 1 21 16 37 9.70456690982652 8.60604425917979 1.09852265064673 A:C C A 10 0.537877766198737 0.744644784635273 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 17 21 38 7.85607797462147 11.2954330901735 -3.43935511555201 A:G A G 10 0.537877766198737 0.329086913970063 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 T:C C T 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 60 60 120 27.7273340280758 32.2726659719242 -4.54533194384843 A:G A G 10 0.537877766198737 0.411480202042315 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 64 41 105 29.5758229632808 22.0529884141482 7.52283454913262 A:G G A 10 0.537877766198737 0.143534853702551 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135106014 G/A 1 39 37 76 18.0227671182493 19.9014773493533 -1.87871023110401 A:G G A 10 0.537877766198737 0.730305732480007 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135106003_135106192:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135106003_135106192:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135106003_135106192:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135106003_135106192:TUBGCP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 T:C C T 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135122507 G/A 1 21 18 39 9.70456690982652 9.68179979157727 0.0227671182492575 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135122327_135122644:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135122327_135122638:TUBGCP2;ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135121979_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122445_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122453_135122600:ZNF511 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 10 135169204 A/G 1 12 3 15 5.54546680561516 1.61363329859621 3.93183350701895 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0663458133820393 ENSG00000148803:ENST00000478895:exon_135169024_135169315:C10orf125 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 290891 T/C 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C T C 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 294101 G/A 1 32 32 64 14.7879114816404 17.2120885183596 -2.42417703671916 A:G G A 10 0.537877766198737 0.616422487735037 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294099_294196:ATHL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 294120 G/A 1 30 30 60 13.8636670140379 16.1363329859621 -2.27266597192422 A:G G A 10 0.537877766198737 0.605349390701158 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294099_294196:ATHL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 433867 G/A 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_433815_433937:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_433815_433937:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_433815_433937:ANO9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 460247 G/A 1 14 7 21 6.46971127321768 3.76514436339116 2.70456690982652 A:G G A 10 0.537877766198737 0.278190405615872 ENSG00000174915:ENST00000532614:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531520:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000528617:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000525727:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000525059:exon_460187_461051:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000527479:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_458674_460288:PTDSS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 451 513 964 208.41712744437 275.931294059952 -67.5141666155824 C:G G C 10 0.537877766198737 1.45964693132172e-05 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 499059 C/T 1 325 322 647 150.18972598541 173.196640715993 -23.0069147305828 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0698611265025614 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 40 41 81 18.4848893520505 22.0529884141482 -3.56809906209769 A:G A G 10 0.537877766198737 0.437386923228301 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 556063 C/T 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000185522:ENST00000469990:exon_555996_556115:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000329451:exon_555996_556115:C11orf35 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 587425 C/A 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:C C A 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_587259_587464:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_587259_588497:PHRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 607175 G/A 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 A:G G A 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 608593 G/A 1 32 7 39 14.7879114816404 3.76514436339116 11.0227671182493 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000310022363616170 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 609068 G/A 1 13 18 31 6.00758903941642 9.68179979157727 -3.67421075216085 A:G G A 10 0.537877766198737 0.209426615101637 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 609353 G/A 1 36 28 64 16.6364004168455 15.0605774535646 1.57582296328083 A:G G A 10 0.537877766198737 0.709007875540661 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 612584 C/T 1 228 224 452 105.363869306688 120.484619628517 -15.1207503218291 T:C C T 10 0.537877766198737 0.157194441093532 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_612553_612800:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_612555_612800:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_612555_612800:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_612555_612800:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_612555_612800:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_612559_612800:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_612561_612800:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000528413:exon_612583_612800:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_612583_612800:IRF7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 612967 A/G 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G A G 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 613165 G/C 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 613192 A/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 613208 T/C 1 374 322 696 172.833715441672 173.196640715993 -0.362925274320929 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 613297 T/G 1 352 428 780 162.667026298045 230.211683933059 -67.5446576350148 T:G T G 10 0.537877766198737 1.41555119017257e-06 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 614318 T/C 1 166 173 339 76.7122908110097 93.0528535523815 -16.3405627413718 T:C T C 10 0.537877766198737 0.081222811959156 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 674492 G/A 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 12 10 22 5.54546680561516 5.37877766198737 0.166689143627787 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 799358 G/C 1 74 55 129 34.1970453012935 29.5832771409305 4.61376816036293 C:G G C 10 0.537877766198737 0.42814471642223 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_799184_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_799184_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_799185_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_799185_800244:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_799185_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527812:exon_799326_799474:LRDD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 800556 G/A 1 27 21 48 12.4773003126341 11.2954330901735 1.18186722246063 A:G G A 10 0.537877766198737 0.773700676968778 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_800543_800666:LRDD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 802270 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 802705 G/A 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 A:G G A 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802682_803647:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802682_802750:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000528122:exon_802682_803149:LRDD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 829539 A/G 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000177685:ENST00000528542:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000450448:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000321883:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000327417:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000525077:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000530688:exon_829297_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000527763:exon_829305_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000528694:exon_829307_831295:EFCAB4A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 865560 C/T 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:C C T 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000214063:ENST00000397397:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397411:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000399778:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397396:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000421676:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397408:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525334:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397406:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409543:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525201:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397404:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000532375:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000464987:exon_864437_865825:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409531:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000527644:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000468468:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000529566:exon_865513_865614:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000494815:exon_865513_865825:TSPAN4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 64 104 168 29.5758229632808 55.9392876846686 -26.3634647213878 A:G G A 10 0.537877766198737 5.11576032406439e-05 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 904712 C/T 1 28 29 57 12.9394225464354 15.5984552197634 -2.65903267332801 T:C C T 10 0.537877766198737 0.508337857517748 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_904706_904816:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_904706_904864:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000531859:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534254:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528426:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533056:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533059:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000530939:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525225:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525840:exon_904701_904859:CHID1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 39 27 66 18.0227671182493 14.5226996873659 3.50006743088336 T:C C T 10 0.537877766198737 0.459156685185821 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 1782593 C/T 1 33 34 67 15.2500337154417 18.2878440507571 -3.03781033531537 T:C C T 10 0.537877766198737 0.464988495333288 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1782539_1782770:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1782539_1782698:CTSD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 2356805 G/A 1 324 1 325 149.727603751609 0.537877766198737 149.18972598541 A:G G A 10 0.537877766198737 1.30252569160785e-85 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 2417893 C/T 1 440 312 752 203.333782872556 167.817863054006 35.5159198185498 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00940671320389848 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 2417935 T/C 1 451 330 781 208.41712744437 177.499662845583 30.9174645987864 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0285301205493264 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 2424541 C/G 1 96 137 233 44.3637344449212 73.689253969227 -29.3255195243057 C:G C G 10 0.537877766198737 0.000130188173232258 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 2424647 G/A 1 109 81 190 50.3713234843377 43.5680990620977 6.80322442223998 A:G G A 10 0.537877766198737 0.344504699256003 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 3380343 T/C 1 28 8 36 12.9394225464354 4.3030221295899 8.63640041684547 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00401203376143167 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/T 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 T:G G T 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 12 5 17 5.54546680561516 2.68938883099368 2.85607797462147 T:C C T 10 0.537877766198737 0.224394873418676 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 3733905 C/T 1 12 15 27 5.54546680561516 8.06816649298105 -2.5226996873659 T:C C T 10 0.537877766198737 0.341878737583407 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397004:exon_3732783_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397007:exon_3733065_3733958:NUP98 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 4156386 C/T 1 76 43 119 35.121289768896 23.1287439465457 11.9925458223503 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0275436618095136 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4156312_4156500:RRM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 34 42 76 15.7121559492429 22.590866180347 -6.87871023110401 T:C C T 10 0.537877766198737 0.134371943081197 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 4621485 C/G 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 C:G C G 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000167333:ENST00000300747:exon_4619902_4622056:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000531101:exon_4620010_4622056:TRIM68 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 4 18 22 1.84848893520505 9.68179979157727 -7.83331085637221 A:C C A 10 0.537877766198737 0.000908635878637377 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 81 90 171 37.4319009379023 48.4089989578863 -10.977098019984 T:C T C 10 0.537877766198737 0.107003052435905 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 106 151 257 48.9849567829339 81.2195426960093 -32.2345859130754 T:C T C 10 0.537877766198737 5.87495836960194e-05 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 140 118 258 64.6971127321768 63.469576411451 1.22753632072587 C:G G C 10 0.537877766198737 0.900728595336288 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 5719756 C/T 1 110 99 209 50.8334457181389 53.249898853675 -2.41645313553602 T:C C T 10 0.537877766198737 0.781490569831351 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6239356 G/C 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6340416 G/A 1 31 16 47 14.3257892478392 8.60604425917979 5.71974498865936 A:G G A 10 0.537877766198737 0.107813199769027 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6413009 A/G 1 5 10 15 2.31061116900632 5.37877766198737 -3.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.126399812708836 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6412617_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6412614_6413386:SMPD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 62 51 113 28.6515784956783 27.4317660761356 1.21981241954272 T:C C T 10 0.537877766198737 0.850706625308186 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 76 67 143 35.121289768896 36.0378103353154 -0.916520566419386 A:G G A 10 0.537877766198737 0.933203623662098 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 99 106 205 45.750101146325 57.0150432170661 -11.2649420707411 T:C C T 10 0.537877766198737 0.123298614698106 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 1081 980 2061 499.554134739165 527.120210874762 -27.5660761355968 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.224437405875598 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 21 25 46 9.70456690982652 13.4469441549684 -3.7423772451419 A:T T A 10 0.537877766198737 0.301715580043597 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 6638599 T/C 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:C T C 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6638532_6638646:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528571:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000428886:exon_6638221_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000534644:exon_6638532_6638659:TPP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 7694013 T/G 1 14 31 45 6.46971127321768 16.6742107521608 -10.2044994789432 T:G T G 10 0.537877766198737 0.00254978533400933 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7693979_7694686:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7693979_7694121:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000527542:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532920:exon_7693979_7694037:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000524608:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000436351:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000525307:exon_7693859_7694122:CYB5R2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 45 44 89 20.7955005210568 23.6666217127444 -2.87112119168759 T:C C T 10 0.537877766198737 0.595372365896973 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 10821185 G/A 1 62 63 125 28.6515784956783 33.8862992705204 -5.23472077484212 A:G G A 10 0.537877766198737 0.370206768363987 ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 10 12 22 4.62122233801263 6.45453319438484 -1.83331085637221 T:C T C 10 0.537877766198737 0.522885386896646 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 34 32 66 15.7121559492429 17.2120885183596 -1.49993256911664 A:G G A 10 0.537877766198737 0.713214600053885 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 14482822 A/G 1 57 65 122 26.340967326672 34.9620548029179 -8.62108747624591 A:G A G 10 0.537877766198737 0.123189015223652 ENSG00000129083:ENST00000437479:exon_14482732_14482877:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000249923:exon_14482732_14482877:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000439561:exon_14482732_14482877:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000526527:exon_14482732_14482887:COPB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 17332542 T/C 1 158 102 260 73.0153129405996 54.8635321522712 18.1517807883284 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0250797478136081 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17332372_17332557:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17332372_17332557:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17332372_17332557:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17332372_17332557:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17332372_17332557:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17332372_17332557:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17332467_17332557:NUCB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 18010240 A/G 1 28 31 59 12.9394225464354 16.6742107521608 -3.73478820572548 A:G A G 10 0.537877766198737 0.361772163818037 ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_18010144_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_18010144_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_18010144_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_18010144_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_18010144_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000532546:exon_18010144_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000532265:exon_18010144_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_18010144_18010304:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_18010144_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000530613:exon_18010152_18010302:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000532389:exon_18010234_18010302:SERGEF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 18124837 C/T 1 11 8 19 5.08334457181389 4.3030221295899 0.780322442223998 T:C C T 10 0.537877766198737 0.82002331137955 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18124804_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000533851:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530180:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530736:exon_18124780_18124893:SAAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 20529892 A/G 1 11 8 19 5.08334457181389 4.3030221295899 0.780322442223998 A:G A G 10 0.537877766198737 0.82002331137955 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 T:C T C 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 33 53 86 15.2500337154417 28.5075216085331 -13.2574878930914 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00472910454282206 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 21 20 41 9.70456690982652 10.7575553239747 -1.05298841414822 A:G A G 10 0.537877766198737 0.75645621742903 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 T:C C T 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 34492985 G/C 1 16 18 34 7.39395574082021 9.68179979157727 -2.28784405075706 C:G G C 10 0.537877766198737 0.492863737684191 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34492915_34493609:CAT;ENSG00000121691:ENST00000534710:exon_34492915_34493606:CAT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 38 28 66 17.560644884448 15.0605774535646 2.50006743088336 T:G T G 10 0.537877766198737 0.621803353108514 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 34979119 C/T 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 T:C C T 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34978931_34979130:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34978931_34979130:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34978931_34979130:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34978931_34979130:PDHX HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 34988343 T/C 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 T:C T C 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34988187_34988361:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34988187_34988361:PDHX HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 43702450 C/T 1 8 8 16 3.6969778704101 4.3030221295899 -0.606044259179791 T:C C T 10 0.537877766198737 0.805966639450967 ENSG00000149084:ENST00000531185:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43702259_43702537:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43702331_43702537:HSD17B12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 20 8 28 9.24244467602526 4.3030221295899 4.93942254643537 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0862901941391867 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 43940602 C/G 1 88 79 167 40.6667565745111 42.4923435297002 -1.82558695518907 C:G C G 10 0.537877766198737 0.81602904646983 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 83 88 171 38.3561454055048 47.3332434254889 -8.97709801998402 T:G G T 10 0.537877766198737 0.192155524148648 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 10 15 25 4.62122233801263 8.06816649298105 -3.44694415496842 T:C C T 10 0.537877766198737 0.228164098691797 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 44626657 G/A 1 103 112 215 47.5985900815301 60.2423098142585 -12.6437197327284 A:G G A 10 0.537877766198737 0.08741840771156 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44626608_44626732:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44626608_44626732:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44626608_44626732:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44626608_44626732:CD82;ENSG00000085117:ENST00000532544:exon_44626608_44626732:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44626608_44626979:CD82;ENSG00000085117:ENST00000527737:exon_44626608_44626732:CD82;ENSG00000085117:ENST00000524704:exon_44626608_44626675:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525813:exon_44626608_44626732:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44626608_44626732:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44626608_44626732:CD82 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 83 93 176 38.3561454055048 50.0226322564825 -11.6664868509777 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0821818765218052 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 46700548 G/A 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 A:G G A 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000175220:ENST00000311956:exon_46698630_46700775:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000526423:exon_46700273_46700775:ARHGAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 46724289 C/G 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 C:G C G 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000175213:ENST00000311764:exon_46724254_46724315:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000526410:exon_46724254_46724445:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000534481:exon_46724254_46724313:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000527008:exon_46724265_46724793:ZNF408 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 46811713 A/G 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G A G 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46811626_46811736:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46811626_46811736:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46811626_46811736:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46811626_46811736:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46811626_46811736:CKAP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 47179463 C/T 1 16 18 34 7.39395574082021 9.68179979157727 -2.28784405075706 T:C C T 10 0.537877766198737 0.492863737684191 ENSG00000149179:ENST00000528488:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000278460:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527234:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000378618:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000395460:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000378615:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000525895:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527784:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527268:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000534249:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000526827:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000525953:exon_47179364_47179530:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000534581:exon_47179364_47179473:C11orf49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 47290208 C/G 1 21 14 35 9.70456690982652 7.53028872678232 2.17427818304421 C:G C G 10 0.537877766198737 0.501418703087631 ENSG00000025434:ENST00000529540:exon_47290101_47290389:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000298843:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000395397:exon_47290101_47290363:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000405576:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000481020:exon_47290101_47290382:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000481889:exon_47290101_47290382:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000532630:exon_47290101_47290367:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000407404:exon_47290101_47290332:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000441012:exon_47290101_47290335:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000467728:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000514400:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000518032:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000528825:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000405853:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000344715:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000527949:exon_47290101_47290368:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000462051:exon_47290101_47290395:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000494018:exon_47290101_47290395:NR1H3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 47436681 C/T 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000165915:ENST00000533076:exon_47436611_47436710:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000441589:exon_47436611_47436710:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000362021:exon_47436590_47436710:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000354884:exon_47436611_47436710:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524928:exon_47435148_47438045:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000527829:exon_47436611_47436967:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524886:exon_47436413_47436710:SLC39A13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 57076646 C/G 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 C:G C G 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 57077109 C/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:C C A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 57102096 A/G 1 39 44 83 18.0227671182493 23.6666217127444 -5.64385459449517 A:G A G 10 0.537877766198737 0.226987421683536 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57101937_57102122:SSRP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 57193653 A/G 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 A:G A G 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193462_57193952:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526125:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193462_57193845:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526621:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530316:exon_57193513_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529748:exon_57193580_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532278:exon_57193641_57193825:SLC43A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 57427074 A/G 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000172409:ENST00000529773:exon_57426927_57427224:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000529430:exon_57426927_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000533682:exon_57426927_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000533905:exon_57426902_57427345:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000525602:exon_57426936_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000302731:exon_57426927_57427362:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000438099:exon_57426949_57427362:CLP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 57463500 T/C 1 4 12 16 1.84848893520505 6.45453319438484 -4.60604425917979 T:C T C 10 0.537877766198737 0.024130575151832 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529447:exon_57463392_57463515:ZDHHC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 59577364 C/T 1 98 73 171 45.2879789125238 39.2650769325078 6.02290198001598 T:C C T 10 0.537877766198737 0.398946890881649 ENSG00000166902:ENST00000300151:exon_59577328_59577393:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000534340:exon_59577328_59577393:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000525470:exon_59577328_59577495:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000531802:exon_59577007_59577393:MRPL16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 43 48 91 19.8712560534543 25.8181327775394 -5.94687672408507 C:G G C 10 0.537877766198737 0.247360245818034 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 60615418 C/T 1 69 68 137 31.8864341322871 36.5756881015141 -4.68925396922696 T:C C T 10 0.537877766198737 0.441258958845286 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60615397_60615526:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60615397_60615526:CCDC86 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 60617715 A/C 1 119 115 234 54.9925458223503 61.8559431128547 -6.86339729050444 A:C A C 10 0.537877766198737 0.394145446202852 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 114 121 235 52.681934653344 65.0832097100472 -12.4012750567032 A:C C A 10 0.537877766198737 0.116224511150109 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 60689445 T/C 1 24 25 49 11.0909336112303 13.4469441549684 -2.35601054373811 T:C T C 10 0.537877766198737 0.567230293798627 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 60703562 G/A 1 9 2 11 4.15910010421137 1.07575553239747 3.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.07378362995951 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 T:C C T 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 60711249 G/T 1 72 78 150 33.2728008336909 41.9544657635015 -8.68166492981054 T:G G T 10 0.537877766198737 0.164208882306254 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 61111400 T/G 1 33 31 64 15.2500337154417 16.6742107521608 -1.42417703671916 T:G T G 10 0.537877766198737 0.802275470897469 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61111328_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61111328_61111437:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534370:exon_61111328_61111438:DAK;ENSG00000149476:ENST00000528061:exon_61111088_61111447:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61111393_61111447:DAK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 61165750 G/C 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165733_61166323:TMEM216 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 61732226 G/A 1 4230 3645 7875 1954.77704897934 1960.5644577944 -5.7874088150536 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 0.90106908178059 ENSG00000167995:ENST00000449131:exon_61729727_61732987:BEST1;ENSG00000167996:ENST00000273550:exon_61731757_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000532829:exon_61732038_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000534180:exon_61732038_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000406545:exon_61732038_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000526640:exon_61732057_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000532601:exon_61732073_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000534719:exon_61732219_61732584:FTH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 61732397 G/C 1 16 7 23 7.39395574082021 3.76514436339116 3.62881137742905 C:G G C 10 0.537877766198737 0.146761352954381 ENSG00000167995:ENST00000449131:exon_61729727_61732987:BEST1;ENSG00000167996:ENST00000534719:exon_61732219_61732584:FTH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 61897281 C/T 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 61912501 C/T 1 31 21 52 14.3257892478392 11.2954330901735 3.03035615766568 T:C C T 10 0.537877766198737 0.408742892251697 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61912454_61912563:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61912454_61912563:INCENP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 73 36 109 33.7349230674922 19.3635995831545 14.3713234843377 A:C:G A C 10 0.537877766198737 0.00688001855077942 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 62285441 A/G 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 3431 1621 5052 1585.54138417213 871.899859008153 713.641525163981 A:T:C:G G C 10 0.537877766198737 1.16864432903061e-92 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 62372605 G/A 1 59 33 92 27.2652117942745 17.7499662845583 9.5152455097162 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0474525781154601 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000460939:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000531557:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000533165:exon_62372585_62372701:EML3;ENSG00000149499:ENST00000483199:exon_62372585_62372652:EML3;ENSG00000149499:ENST00000524518:exon_62372180_62372652:EML3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 62563772 C/T 1 60 52 112 27.7273340280758 27.9696438423343 -0.242309814258537 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563759_62563817:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62563759_62563814:NXF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 63742219 C/T 1 804 648 1452 371.546275976215 348.544792496782 23.0014834794339 T:C C T 10 0.537877766198737 0.236264362133992 ENSG00000176340:ENST00000314133:exon_63742079_63742266:COX8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 63764302 G/C 1 14 10 24 6.46971127321768 5.37877766198737 1.09093361123031 C:G G C 10 0.537877766198737 0.687960904025668 ENSG00000167770:ENST00000428192:exon_63764002_63764413:OTUB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 63767186 A/G 1 23 17 40 10.6288113774291 9.14392202537853 1.48488935205052 A:G A G 10 0.537877766198737 0.751627972797071 ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 63994230 G/T 1 121 80 201 55.9167902899528 43.030221295899 12.8865689940539 T:G G T 10 0.537877766198737 0.076758131112331 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63994107_63994604:NUDT22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 63996730 G/A 1 127 102 229 58.6895236927604 54.8635321522712 3.82599154048924 A:G G A 10 0.537877766198737 0.642935346705508 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63996719_63996816:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63996719_63996816:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63996719_63996816:NUDT22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 T:G T G 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64109594 G/C 1 14 17 31 6.46971127321768 9.14392202537853 -2.67421075216085 C:G G C 10 0.537877766198737 0.370779292856988 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109466_64109611:CCDC88B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64124528 C/A 1 433 310 743 200.098927235947 166.742107521608 33.3568197143384 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0151172516504142 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 14 28 42 6.46971127321768 15.0605774535646 -8.59086618034695 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00839790007464128 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64662423 C/T 1 34 44 78 15.7121559492429 23.6666217127444 -7.95446576350148 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0878650593770165 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662019_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662019_64662681:ATG2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64662834 C/A 1 26 18 44 12.0151780788328 9.68179979157727 2.33337828725557 A:C C A 10 0.537877766198737 0.546556667922406 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662762_64662914:ATG2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64665585 C/G 1 14 12 26 6.46971127321768 6.45453319438484 0.0151780788328386 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665558_64665642:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665558_64665642:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665558_64665642:ATG2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64811755 G/A 1 37 31 68 17.0985226506467 16.6742107521608 0.424311898485886 A:C:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000168061:ENST00000531072:exon_64811697_64812271:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000398846:exon_64811697_64812299:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000533017:exon_64811697_64812145:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000528109:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000530213:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000301885:exon_64811697_64812199:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000529996:exon_64811697_64812300:SAC3D1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64812173 A/G 1 59 36 95 27.2652117942745 19.3635995831545 7.90161221111999 A:G A G 10 0.537877766198737 0.122359181080356 ENSG00000168061:ENST00000531072:exon_64811697_64812271:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000398846:exon_64811697_64812299:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000528109:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000530213:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000301885:exon_64811697_64812199:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000529996:exon_64811697_64812300:SAC3D1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64813918 C/T 0 0 13 13 0 6.99241096058358 -6.99241096058358 T C T 10 0.537877766198737 4.38368391164729e-05 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531174:exon_64813471_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529685:exon_64813661_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000453486:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530139:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000524445:exon_64813854_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000427272:exon_64813861_64813998:NAALADL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64814965 A/G 0 0 11 11 0 5.91665542818611 -5.91665542818611 G A G 10 0.537877766198737 0.000205270010058154 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529685:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000453486:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530139:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000427272:exon_64814947_64815037:NAALADL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64815138 C/T 0 0 10 10 0 5.37877766198737 -5.37877766198737 T C T 10 0.537877766198737 0.000444189859400774 ENSG00000168060:ENST00000532450:exon_64815119_64815204:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64815119_64815409:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64815119_64815358:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000533842:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000533340:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531746:exon_64815119_64815328:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528884:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531174:exon_64815119_64815359:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529685:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000453486:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530139:exon_64815119_64815405:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000524445:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000427272:exon_64815119_64815210:NAALADL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 42 31 73 19.409133819653 16.6742107521608 2.7349230674922 T:C C T 10 0.537877766198737 0.558531662804906 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64884936 G/A 1 18 13 31 8.31820020842273 6.99241096058358 1.32578924783915 A:G G A 10 0.537877766198737 0.720072184144253 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64898229 T/C 1 22 14 36 10.1666891436278 7.53028872678232 2.63640041684547 T:C T C 10 0.537877766198737 0.407660926829512 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64976820 A/G 1 133 191 324 61.462257095568 102.734653343959 -41.2723962483908 A:G A G 10 0.537877766198737 4.50436780750148e-06 ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64976794_64976858:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64976794_64976858:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64976794_64976858:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64976794_64976858:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64976794_64976858:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64976794_64976858:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000525013:exon_64976794_64976854:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528165:exon_64975949_64977388:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533704:exon_64976421_64976858:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530567:exon_64976615_64976858:CAPN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 64978769 G/T 1 166 166 332 76.7122908110097 89.2877091889903 -12.5754183779807 T:G G T 10 0.537877766198737 0.169156022893622 ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64978731_64979477:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64978731_64979329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64978731_64979472:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64978731_64979476:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64978731_64979476:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64978731_64979458:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528165:exon_64978285_64979476:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530567:exon_64978731_64979477:CAPN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65113459 G/T 1 22 15 37 10.1666891436278 8.06816649298105 2.09852265064673 T:G G T 10 0.537877766198737 0.514401734567125 ENSG00000133884:ENST00000528416:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000252268:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000524666:exon_65113401_65116402:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532264:exon_65113401_65113500:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000530973:exon_65113137_65113590:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532052:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000531989:exon_65113401_65113529:DPF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65143993 C/T 1 14 12 26 6.46971127321768 6.45453319438484 0.0151780788328386 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65142666_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65143665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65143699_65144115:SLC25A45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65144075 T/C 1 13 18 31 6.00758903941642 9.68179979157727 -3.67421075216085 T:C T C 10 0.537877766198737 0.209426615101637 ENSG00000162241:ENST00000534338:exon_65144007_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65142666_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65143665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65143699_65144115:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000533629:exon_65144028_65144146:SLC25A45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65144421 G/A 1 15 9 24 6.93183350701895 4.84089989578863 2.09093361123031 A:G G A 10 0.537877766198737 0.420864629088441 ENSG00000162241:ENST00000534338:exon_65144289_65145496:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65144289_65147409:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000533629:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526259:exon_65144382_65144547:SLC25A45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65149445 T/C 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C T C 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65149386_65149478:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65149386_65149844:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65147603_65150117:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526259:exon_65149346_65149449:SLC25A45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65156866 G/A 1 11 4 15 5.08334457181389 2.15151106479495 2.93183350701895 A:G G A 10 0.537877766198737 0.194270090333408 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65156832_65156999:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65156832_65156999:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65156832_65156999:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000526201:exon_65156856_65156999:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000525156:exon_65156832_65156999:FRMD8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65164357 C/T 1 7 11 18 3.23485563660884 5.91665542818611 -2.68179979157727 T:C C T 10 0.537877766198737 0.241050465666398 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65164270_65164408:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000531151:exon_65164270_65164491:FRMD8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65268781 A/G 1 557 670 1227 257.402084227304 360.378103353154 -102.97601912585 A:C:G A G 10 0.537877766198737 4.07758533548529e-09 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65338034 A/G 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 A:G A G 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65347431 G/A 1 27 7 34 12.4773003126341 3.76514436339116 8.71215594924294 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00292880281565315 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65347407_65347460:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65347407_65347460:EHBP1L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65349063 G/A 1 13 21 34 6.00758903941642 11.2954330901735 -5.28784405075706 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0847433737366514 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 15 18 33 6.93183350701895 9.68179979157727 -2.74996628455832 A:G G A 10 0.537877766198737 0.384427877209256 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65418048 G/A 1 318 301 619 146.954870348802 161.90120762582 -14.9463372770182 A:G G A 10 0.537877766198737 0.242393452848915 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65418040_65418401:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65418040_65418351:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65418040_65418389:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65418040_65418058:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000528699:exon_65418040_65418389:SIPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 3781 3935 7716 1747.28416600258 2116.54900999203 -369.264843989454 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 4.1249601627259e-17 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 0 18 0 18 8.31820020842273 0 8.31820020842273 T T 10 0.537877766198737 1.51244306797136e-05 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 0 20 0 20 9.24244467602526 0 9.24244467602526 G G 10 0.537877766198737 4.30569641229719e-06 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 23 14 37 10.6288113774291 7.53028872678232 3.09852265064673 T:C C T 10 0.537877766198737 0.327351119017456 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 19 18 37 8.780322442224 9.68179979157727 -0.901477349353268 A:G G A 10 0.537877766198737 0.869358162481527 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 32 28 60 14.7879114816404 15.0605774535646 -0.272665971924217 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65650883 A/G 1 12 4 16 5.54546680561516 2.15151106479495 3.39395574082021 A:G A G 10 0.537877766198737 0.130604015019631 ENSG00000172543:ENST00000307886:exon_65650686_65650895:CTSW;ENSG00000172543:ENST00000528419:exon_65650686_65651212:CTSW HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65685225 T/C 1 40 23 63 18.4848893520505 12.3711886225709 6.11370072947957 T:C T C 10 0.537877766198737 0.130715671843554 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 120 97 217 55.4546680561516 52.1741433212775 3.28052473487408 T:C C T 10 0.537877766198737 0.683195685132863 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65733685 C/T 1 176 148 324 81.3335131490223 79.6059093974131 1.72760375160922 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.867364909780427 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733547_65733689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733547_65734027:SART1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65766092 C/T 1 49 57 106 22.6439894562619 30.659032673328 -8.01504321706612 T:C C T 10 0.537877766198737 0.120284847353932 ENSG00000175376:ENST00000526451:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000312234:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000525767:exon_65765860_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529964:exon_65765904_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000533544:exon_65765964_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000527249:exon_65766038_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529973:exon_65766085_65766214:EIF1AD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 65984043 A/C 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000175115:ENST00000527224:exon_65983991_65984082:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_65983991_65984082:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000531298:exon_65983991_65984082:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000524784:exon_65984014_65984082:PACS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 66001386 A/C 1 11 21 32 5.08334457181389 11.2954330901735 -6.21208851835958 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0327770145443476 ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529757:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000528935:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529795:exon_66001291_66001410:PACS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 17 16 33 7.85607797462147 8.60604425917979 -0.74996628455832 T:C C T 10 0.537877766198737 0.862119553352529 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 66260191 C/T 1 49 54 103 22.6439894562619 29.0453993747318 -6.40140991846991 T:C C T 10 0.537877766198737 0.235595391088094 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533799:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000525738:exon_66260187_66260381:DPP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 66288733 G/C 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 C:G G C 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 66612357 C/T 1 11 11 22 5.08334457181389 5.91665542818611 -0.833310856372213 T:C C T 10 0.537877766198737 0.831562670929007 ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000309657:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000524506:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000524849:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000532775:exon_66612340_66612479:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000525356:exon_66612340_66612507:RCE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 67196049 G/A 1 15 10 25 6.93183350701895 5.37877766198737 1.55305584503158 A:G G A 10 0.537877766198737 0.555492392718307 ENSG00000175634:ENST00000530623:exon_67195931_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524934:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524814:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000420069:exon_67195969_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67195972_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67195975_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67195976_67196711:RPS6KB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 97 115 212 44.8258566787225 61.8559431128547 -17.0300864341322 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0227998377351394 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 67257823 C/A 1 413 387 800 190.856482559922 208.158695518911 -17.3022129589896 A:C:G C A 10 0.537877766198737 0.228006541559080 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257787_67257929:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257787_67258124:AIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 67258478 C/A 1 498 406 904 230.136872433029 218.378373076687 11.7584993563418 A:T:C C A 10 0.537877766198737 0.443069901669624 ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67258259_67258574:AIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 4437 3404 7841 2050.4363513762 1830.9359161405 219.500435235704 A:T:C:G T C 10 0.537877766198737 6.58678043045841e-07 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 33 35 68 15.2500337154417 18.8257218169558 -3.57568810151411 T:C C T 10 0.537877766198737 0.396918670188165 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 67412290 C/T 1 111 123 234 51.2955679519402 66.1589652424447 -14.8633972905045 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0570780145951655 ENSG00000132744:ENST00000255082:exon_67412231_67412340:ACY3;ENSG00000132744:ENST00000529256:exon_67412231_67412340:ACY3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 67812452 C/T 1 49 26 75 22.6439894562619 13.9848219211672 8.65916753509473 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0489205332433343 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000528981:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67812425_67812569:TCIRG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 7 9 16 3.23485563660884 4.84089989578863 -1.60604425917979 T:C C T 10 0.537877766198737 0.460334234664264 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 68704480 G/A 1 14 4 18 6.46971127321768 2.15151106479495 4.31820020842273 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0563618316166793 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 70279759 G/A 1 4 14 18 1.84848893520505 7.53028872678232 -5.68179979157727 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00842674134138563 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 71208552 G/A 1 123 105 228 56.8410347575554 56.4771654508674 0.363869306687974 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71208529_71208625:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530831:exon_71207481_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525593:exon_71208551_71208657:NADSYN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 72004419 T/C 1 52 56 108 24.0303561576657 30.1211549071293 -6.09079874946359 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.248045749357592 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72003474_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72004347_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72004347_72004659:CLPB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 72012940 C/T 1 30 11 41 13.8636670140379 5.91665542818611 7.94701158585179 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0176851177628442 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72012847_72013008:CLPB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 72145307 C/G 1 7 12 19 3.23485563660884 6.45453319438484 -3.219677557776 C:G C G 10 0.537877766198737 0.168962527098265 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72145116_72145568:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72145116_72145571:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72145116_72145571:CLPB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 72421603 G/T 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72421430_72421632:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72421430_72421632:ARAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 73570975 T/C 1 73 74 147 33.7349230674922 39.8029546987065 -6.06803163121433 T:C T C 10 0.537877766198737 0.321997592401100 ENSG00000175581:ENST00000310614:exon_73570952_73571054:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000411840:exon_73570952_73571054:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000398483:exon_73570952_73571054:MRPL48 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 73689099 C/T 1 169 244 413 78.0986575124135 131.242174952492 -53.1435174400784 T:C C T 10 0.537877766198737 1.90139797855680e-07 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 74345735 G/A 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74345628_74345740:POLD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 74347298 C/T 0 14 0 14 6.46971127321768 0 6.46971127321768 C C 10 0.537877766198737 0.000189914397118796 ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74347242_74347320:POLD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 74347299 C/G 0 14 0 14 6.46971127321768 0 6.46971127321768 C C 10 0.537877766198737 0.000189914397118796 ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74347242_74347320:POLD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 75277376 C/T 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277361_75277436:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277361_75277511:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 C:G C G 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 5 11 16 2.31061116900632 5.91665542818611 -3.60604425917979 T:C C T 10 0.537877766198737 0.081929463926307 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 25 16 41 11.5530558450316 8.60604425917979 2.94701158585178 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.434084649266836 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 77378229 A/G 1 31 38 69 14.3257892478392 20.439355115552 -6.11356586771285 A:G A G 10 0.537877766198737 0.148508570018507 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 77553578 G/C 1 20 24 44 9.24244467602526 12.9090663887697 -3.66662171274443 C:G G C 10 0.537877766198737 0.291894073384424 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 19 6 25 8.780322442224 3.22726659719242 5.55305584503158 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0275662971345872 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 93468359 C/G 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 C:G C G 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93465410_93469014:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529435:exon_93467791_93468404:TAF1D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 93488481 A/C 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000182919:ENST00000528288:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000331239:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000528099:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000354421:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000530620:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000524485:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527363:exon_93488376_93488559:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000526335:exon_93488376_93488492:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000533154:exon_93488039_93488552:C11orf54 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 93540717 G/A 1 14 14 28 6.46971127321768 7.53028872678232 -1.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.708574000555236 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525613:exon_93540684_93540801:MED17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 96117873 A/G 1 3 15 18 1.38636670140379 8.06816649298105 -6.68179979157727 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00163434897045431 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96117126_96117925:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96117126_96118154:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96117126_96117933:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530203:exon_96117822_96117925:CCDC82 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 102195501 A/G 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 A:G A G 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102195187_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102192568_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102195192_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102195186_102196093:BIRC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 26 16 42 12.0151780788328 8.60604425917979 3.40913381965305 C:G G C 10 0.537877766198737 0.353613899338721 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 113614537 T/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 T:C T C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000086827:ENST00000200135:exon_113614524_113614762:ZW10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C C T 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 116633862 G/A 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:G G A 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 1 24 25 0.462122233801263 12.9090663887697 -12.4469441549684 C:G G C 10 0.537877766198737 1.25159181735942e-07 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 15 28 43 6.93183350701895 15.0605774535646 -8.12874394654569 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0142100377826018 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117095474 G/A 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117095417_117097592:PCSK7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117096652 G/A 1 10 11 21 4.62122233801263 5.91665542818611 -1.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.663514294637069 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117096647_117096737:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117095417_117097592:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117096647_117096737:PCSK7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117097952 C/T 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 T:C C T 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117097873_117098038:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117097873_117098038:PCSK7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 30 39 69 13.8636670140379 20.9772328817507 -7.11356586771285 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0916394516628137 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117232691 G/A 1 12 13 25 5.54546680561516 6.99241096058358 -1.44694415496842 A:G G A 10 0.537877766198737 0.689173717549893 ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000375253:exon_117232551_117232709:CEP164 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117241991 C/T 1 22 15 37 10.1666891436278 8.06816649298105 2.09852265064673 T:C C T 10 0.537877766198737 0.514401734567125 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000375253:exon_117241796_117242182:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117241796_117242182:CEP164 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 15 5 20 6.93183350701895 2.68938883099368 4.24244467602526 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0719987060582597 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 6 41 47 2.77273340280758 22.0529884141482 -19.2802550113406 A:T:G G A 10 0.537877766198737 7.75935617553924e-09 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 118244239 C/G 1 2 9 11 0.924244467602526 4.84089989578863 -3.91665542818611 C:G C G 10 0.537877766198737 0.029521862649748 ENSG00000110344:ENST00000252108:exon_118244209_118244400:UBE4A;ENSG00000110344:ENST00000431736:exon_118244209_118244400:UBE4A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 29 50 79 13.4015447802366 26.8938883099368 -13.4923435297002 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00309813297056037 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 17 25 42 7.85607797462147 13.4469441549684 -5.59086618034695 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0900476169524938 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 83 71 154 38.3561454055048 38.1893214001103 0.16682400539451 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 2 9 11 0.924244467602526 4.84089989578863 -3.91665542818611 T:C C T 10 0.537877766198737 0.029521862649748 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 69 56 125 31.8864341322871 30.1211549071293 1.76527922515788 A:G A G 10 0.537877766198737 0.788222823439612 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 89 68 157 41.1288788083124 36.5756881015141 4.5531907067983 T:C T C 10 0.537877766198737 0.472714533863796 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 13 12 25 6.00758903941642 6.45453319438484 -0.446944154968424 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 17 20 37 7.85607797462147 10.7575553239747 -2.90147734935327 A:C C A 10 0.537877766198737 0.410202946917988 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 119053975 C/T 1 17 23 40 7.85607797462147 12.3711886225709 -4.51511064794948 T:C C T 10 0.537877766198737 0.157271703479637 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119053827_119054720:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119053827_119054721:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119053827_119054723:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119053827_119054725:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119053827_119054214:NLRX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 23 26 49 10.6288113774291 13.9848219211672 -3.35601054373811 A:T T A 10 0.537877766198737 0.390470469611026 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 1 43 10 53 19.8712560534543 5.37877766198737 14.4924783914669 A:T A T 10 0.537877766198737 4.45337210928961e-05 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 27 43 70 12.4773003126341 23.1287439465457 -10.6514436339116 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0116550162468797 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 125465862 T/C 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 T:C T C 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000134910:ENST00000527606:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525652:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529886:exon_125465776_125465898:STT3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 125476252 C/G 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 C:G C G 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526213:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000527456:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525431:exon_125476105_125476360:STT3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 30 25 55 13.8636670140379 13.4469441549684 0.416722859069468 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 314 275 589 145.106381413597 147.916385704653 -2.81000429105606 T:C C T 10 0.537877766198737 0.836344641257682 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 A:C C A 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 126139100 T/C 1 5 8 13 2.31061116900632 4.3030221295899 -1.99241096058358 T:C T C 10 0.537877766198737 0.282359568582401 ENSG00000110074:ENST00000533839:exon_126138950_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126139028_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126139030_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000442061:exon_126139041_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000529802:exon_126139052_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526525:exon_126139066_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126139066_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126139085_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526366:exon_126139087_126139186:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000524751:exon_126139089_126139310:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532101:exon_126139096_126139186:FOXRED1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 126162862 C/T 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000150455:ENST00000392679:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000279992:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000438974:exon_126162372_126163012:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392678:exon_126162372_126163139:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000392680:exon_126162372_126162950:TIRAP;ENSG00000150455:ENST00000479770:exon_126162372_126162950:TIRAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 18 17 35 8.31820020842273 9.14392202537853 -0.825721816955793 T:C T C 10 0.537877766198737 0.86584201833544 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 128350261 T/C 1 4 15 19 1.84848893520505 8.06816649298105 -6.219677557776 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00489475911116191 ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128350086_128350346:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128350086_128350346:ETS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 128651893 A/G 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 A:G A G 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128651853_128651918:FLI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 11 134029817 A/G 1 27 19 46 12.4773003126341 10.219677557776 2.2576227548581 A:G A G 10 0.537877766198737 0.555985307319487 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525977:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000527944:exon_134029785_134029969:NCAPD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 461374 G/C 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 C:G G C 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_461371_461490:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_461371_461490:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_461371_461490:KDM5A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 968489 T/C 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 T:C T C 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_968411_968630:WNK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 1017197 C/T 1 22 14 36 10.1666891436278 7.53028872678232 2.63640041684547 T:C C T 10 0.537877766198737 0.407660926829512 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_1017013_1017200:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_1017013_1017200:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_1017013_1017200:WNK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 2997355 T/A 1 35 59 94 16.1742781830442 31.7347882057255 -15.5605100226813 A:T T A 10 0.537877766198737 0.00176018444382676 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 53 21 74 24.4924783914669 11.2954330901735 13.1970453012935 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00224069696725103 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 3782701 C/T 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 4719349 C/T 1 43 39 82 19.8712560534543 20.9772328817507 -1.10597682829643 T:C C T 10 0.537877766198737 0.825401390070368 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4719321_4719450:DYRK4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 6334609 C/T 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000010278:ENST00000382518:exon_6334592_6334700:CD9;ENSG00000010278:ENST00000425469:exon_6334592_6334700:CD9;ENSG00000010278:ENST00000382519:exon_6334592_6334700:CD9;ENSG00000010278:ENST00000009180:exon_6334592_6334700:CD9;ENSG00000010278:ENST00000382515:exon_6334592_6334700:CD9;ENSG00000010278:ENST00000481267:exon_6334592_6334700:CD9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 6554628 G/A 1 147 229 376 67.9319683687857 123.174008459511 -55.2420400907251 A:C:G G A 10 0.537877766198737 1.37244296998395e-08 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 6572048 A/G 1 5 19 24 2.31061116900632 10.219677557776 -7.90906638876969 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00154373766225308 ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6571406_6573652:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 6884660 A/G 0 0 15 15 0 8.06816649298105 -8.06816649298105 G A G 10 0.537877766198737 9.36166205272318e-06 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6884439_6884714:LAG3;ENSG00000089692:ENST00000441671:exon_6884439_6884740:LAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 6887020 T/C 1 1 11 12 0.462122233801263 5.91665542818611 -5.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00200619428330241 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6886957_6887087:LAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 7066939 G/A 1 757 740 1497 349.826530987556 398.029546987065 -48.2030159995092 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0128215476362603 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7066817_7066948:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7066817_7066948:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000447931:exon_7066817_7066948:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000318974:exon_7066817_7066948:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000456013:exon_7066817_7066948:PTPN6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 7188562 G/T 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000159403:ENST00000290575:exon_7187836_7188605:C1R;ENSG00000159403:ENST00000458061:exon_7187845_7188605:C1R HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 9833530 T/C 1 50 41 91 23.1061116900632 22.0529884141482 1.05312327591494 T:C T C 10 0.537877766198737 0.834448461204575 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 10659584 C/T 1 270 1 271 124.773003126341 0.537877766198737 124.235125360142 T:C C T 10 0.537877766198737 3.33911697789396e-71 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 344 297 641 158.970048427634 159.749696561025 -0.779648133390396 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 0.96841020614254 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 12814818 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000183150:ENST00000332427:exon_12813995_12815404:GPR19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 10 16 26 4.62122233801263 8.60604425917979 -3.98482192116716 T:G T G 10 0.537877766198737 0.167355175634413 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 14924028 A/G 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G A G 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000197837:ENST00000358064:exon_14923613_14924065:HIST4H4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 14927825 C/G 1 151 100 251 69.7804573039907 53.7877766198737 15.992680684117 A:C:G C G 10 0.537877766198737 0.042990523569057 ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 15095442 A/C 1 3903 3929 7832 1803.66307852633 2113.32174339484 -309.658664868508 A:T:C:G A C 10 0.537877766198737 2.44236317634818e-12 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 21797029 A/G 1 678 647 1325 313.318874517256 348.006914730583 -34.6880402133265 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.0572940855061315 ENSG00000111716:ENST00000350669:exon_21796869_21797042:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000396076:exon_21796869_21797042:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000396075:exon_21796869_21797042:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000470280:exon_21796479_21797042:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000450584:exon_21796880_21797042:LDHB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 79 63 142 36.5076564702998 33.8862992705204 2.62135719977935 C:G C G 10 0.537877766198737 0.67479064170289 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 91 81 172 42.0531232759149 43.5680990620977 -1.51497578618276 T:C:G G C 10 0.537877766198737 0.819048839075994 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 27064232 C/T 1 80 93 173 36.969778704101 50.0226322564825 -13.0528535523815 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0476566555270922 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 31253995 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31253961_31254064:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31253961_31254064:DDX11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 31945064 C/T 0 42 0 42 19.409133819653 0 19.409133819653 C C 10 0.537877766198737 5.29799520914816e-12 ENSG00000188375:ENST00000340398:exon_31944119_31945175:H3F3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 29 19 48 13.4015447802366 10.219677557776 3.18186722246063 C:G G C 10 0.537877766198737 0.387692971131785 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 26 19 45 12.0151780788328 10.219677557776 1.79550052105684 A:T A T 10 0.537877766198737 0.655097818899925 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 32908237 C/A 1 20 21 41 9.24244467602526 11.2954330901735 -2.05298841414822 A:C C A 10 0.537877766198737 0.534899936393599 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 32908518 G/A 1 9 12 21 4.15910010421137 6.45453319438484 -2.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.383260377366473 ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 45567192 G/A 1 2 11 13 0.924244467602526 5.91665542818611 -4.99241096058358 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00917767827565757 ENSG00000134297:ENST00000256692:exon_45566847_45568425:PLEKHA9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 46321417 G/A 1 13 16 29 6.00758903941642 8.60604425917979 -2.59845521976337 A:G G A 10 0.537877766198737 0.356600248883326 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 47629897 G/T 1 16 15 31 7.39395574082021 8.06816649298105 -0.674210752160846 T:G G T 10 0.537877766198737 0.858171969857937 ENSG00000179715:ENST00000321382:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000432328:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000330951:exon_47629880_47630155:FAM113B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 48060812 T/C 1 28 25 53 12.9394225464354 13.4469441549684 -0.507521608533059 T:C T C 10 0.537877766198737 0.891440285734021 ENSG00000005175:ENST00000432584:exon_48060763_48060863:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000380650:exon_48060763_48060863:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000005386:exon_48060763_48060863:RPAP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 19 15 34 8.780322442224 8.06816649298105 0.712155949242943 T:C C T 10 0.537877766198737 0.864600057495229 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 49227081 C/T 1 26 64 90 12.0151780788328 34.4241770367192 -22.4089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 2.18260922221391e-06 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49227060_49227302:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49227060_49227302:DDX23 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 49237746 C/G 1 19 24 43 8.780322442224 12.9090663887697 -4.12874394654569 C:G C G 10 0.537877766198737 0.223361625575660 ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49237723_49237833:DDX23 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 49722793 C/T 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 T:C C T 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49722710_49722838:TROAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 49957260 A/G 1 41 31 72 18.9470115858518 16.6742107521608 2.27280083369094 A:G A G 10 0.537877766198737 0.637327778605419 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49957221_49957329:MCRS1;ENSG00000187778:ENST00000357123:exon_49957221_49957329:MCRS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 50045987 A/G 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50045716_50045995:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50045716_50045995:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000293590:exon_50045716_50045995:FMNL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 236 212 448 109.060847177098 114.030086434132 -4.96923925703415 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.636049852092938 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 51681967 A/C 1 60 71 131 27.7273340280758 38.1893214001103 -10.4619873720345 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0793000413019908 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 51696500 G/A 1 12 8 20 5.54546680561516 4.3030221295899 1.24244467602526 A:G G A 10 0.537877766198737 0.657647615348739 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51696470_51696564:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51696470_51696564:BIN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 51707626 C/T 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51707607_51707687:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51707607_51707687:BIN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 53585754 G/A 1 647 488 1135 298.993085269417 262.484349904984 36.5087353644336 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.0297933867567260 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53585643_53585803:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53585643_53585803:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53585643_53585803:ITGB7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 53586198 G/T 1 697 524 1221 322.09919695948 281.847949488138 40.2512474713422 A:T:C:G G T 10 0.537877766198737 0.0216446338071988 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586114_53586322:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53586114_53586322:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586114_53586322:ITGB7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 53605545 G/A 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000172819:ENST00000425354:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000327550:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000394426:exon_53604354_53605647:RARG;ENSG00000172819:ENST00000338561:exon_53604354_53605647:RARG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 53715205 T/G 1 35 23 58 16.1742781830442 12.3711886225709 3.80308956047326 A:T:G T G 10 0.537877766198737 0.357574630318126 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53715127_53715374:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53715127_53715412:AAAS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 53900640 A/G 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 A:G A G 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000139574:ENST00000267017:exon_53900474_53900677:NPFF;ENSG00000139574:ENST00000448979:exon_53900474_53900677:NPFF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 8 21 29 3.6969778704101 11.2954330901735 -7.59845521976337 A:G A G 10 0.537877766198737 0.004981929247687 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 54115357 T/C 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 T:C T C 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54115251_54115399:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54115251_54115399:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54115251_54115399:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54115251_54115399:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54115251_54115399:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54115251_54115399:CALCOCO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 56295734 A/G 1 145 144 289 67.0077239011831 77.4543983326181 -10.446674431435 A:G A G 10 0.537877766198737 0.238002625036218 ENSG00000170473:ENST00000408946:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000398213:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000302533:exon_56295198_56296139:WIBG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 56345408 T/G 1 24 21 45 11.0909336112303 11.2954330901735 -0.204499478943164 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000065357:ENST00000331886:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394145:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394147:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000402956:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000412897:exon_56345407_56345567:DGKA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 56531040 G/T 1 20 24 44 9.24244467602526 12.9090663887697 -3.66662171274443 T:G G T 10 0.537877766198737 0.291894073384424 ENSG00000139641:ENST00000394048:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000267113:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000402331:exon_56531002_56531157:ESYT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 56601998 G/A 1 3 11 14 1.38636670140379 5.91665542818611 -4.53028872678232 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0280815187175553 ENSG00000181852:ENST00000345093:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000448057:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000394013:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000352641:exon_56601947_56602082:RNF41 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 56815717 T/C 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 T:C T C 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56815683_56815765:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815683_56815800:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815683_56815800:TIMELESS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 10 11 21 4.62122233801263 5.91665542818611 -1.29543309017348 T:C C T 10 0.537877766198737 0.663514294637069 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 56994170 C/T 1 8 13 21 3.6969778704101 6.99241096058358 -3.29543309017348 T:C C T 10 0.537877766198737 0.189398501979991 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56993985_56994274:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56993985_56994274:BAZ2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2933 2831 5764 1355.4045117391 1522.73195610862 -167.32744436952 A:T:G A G 10 0.537877766198737 1.01971796176361e-05 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 25 21 46 11.5530558450316 11.2954330901735 0.257622754858099 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 57500038 G/T 1 6 19 25 2.77273340280758 10.219677557776 -7.44694415496842 T:G G T 10 0.537877766198737 0.00400624606789888 ENSG00000166888:ENST00000300134:exon_57499974_57500122:STAT6;ENSG00000166888:ENST00000454075:exon_57499974_57500122:STAT6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 57624701 C/T 1 124 105 229 57.3031569913566 56.4771654508674 0.825991540489234 T:C C T 10 0.537877766198737 0.947200574696713 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57624586_57624783:SHMT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 57884360 A/G 1 20 16 36 9.24244467602526 8.60604425917979 0.63640041684547 A:G A G 10 0.537877766198737 0.868711417524269 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57884321_57884427:MARS;ENSG00000166986:ENST00000447721:exon_57884321_57884427:MARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 57884403 C/T 1 29 21 50 13.4015447802366 11.2954330901735 2.10611169006315 T:C C T 10 0.537877766198737 0.57373960642381 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57884321_57884427:MARS;ENSG00000166986:ENST00000447721:exon_57884321_57884427:MARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 26 28 54 12.0151780788328 15.0605774535646 -3.0453993747318 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.416223078815333 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 52 59 111 24.0303561576657 31.7347882057255 -7.7044320480598 A:G A G 10 0.537877766198737 0.153608065243368 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 58335626 A/T 1 15 8 23 6.93183350701895 4.3030221295899 2.62881137742905 A:T A T 10 0.537877766198737 0.302209397783681 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58335360_58335671:XRCC6BP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 58345606 T/C 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 T:C T C 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 20 23 43 9.24244467602526 12.3711886225709 -3.12874394654569 A:G G A 10 0.537877766198737 0.361597067830681 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 70194051 G/A 1 7 11 18 3.23485563660884 5.91665542818611 -2.68179979157727 A:G G A 10 0.537877766198737 0.241050465666398 ENSG00000127328:ENST00000247833:exon_70193989_70194117:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000483530:exon_70193989_70194117:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000362025:exon_70193989_70194117:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325555:exon_70193989_70194117:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000378809:exon_70193989_70194117:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325596:exon_70193989_70194117:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000526994:exon_70193989_70194117:RAB3IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 72094627 C/G 1 33 23 56 15.2500337154417 12.3711886225709 2.87884509287073 C:G C G 10 0.537877766198737 0.503518682417103 ENSG00000139291:ENST00000266673:exon_72094612_72097840:TMEM19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 10 19 29 4.62122233801263 10.219677557776 -5.59845521976337 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0410698812984898 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 72176401 C/T 1 33 24 57 15.2500337154417 12.9090663887697 2.34096732667199 T:C C T 10 0.537877766198737 0.596053192679481 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72176350_72176438:RAB21 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 79986405 C/A 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 A:C C A 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000177425:ENST00000328827:exon_79985747_79986473:PAWR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 80214618 C/T 1 27 20 47 12.4773003126341 10.7575553239747 1.71974498865936 T:C C T 10 0.537877766198737 0.66256491473273 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80214554_80214711:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80214554_80214711:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80214554_80214711:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80214554_80214711:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80214554_80214711:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80214554_80214711:PPP1R12A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 82752521 G/C 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 14 13 27 6.46971127321768 6.99241096058358 -0.522699687365898 C:G G C 10 0.537877766198737 0.84951872158194 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 95694111 T/G 1 80 90 170 36.969778704101 48.4089989578863 -11.4392202537853 T:G T G 10 0.537877766198737 0.090323431068857 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 100732327 C/T 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 T:C C T 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100732306_100733912:SCYL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 104341397 T/A 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 A:T T A 10 0.537877766198737 0.127189578589256 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 2 9 11 0.924244467602526 4.84089989578863 -3.91665542818611 A:T T A 10 0.537877766198737 0.029521862649748 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 105380143 G/A 1 28 30 58 12.9394225464354 16.1363329859621 -3.19691043952674 A:G G A 10 0.537877766198737 0.430893743173673 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 106633048 G/A 1 35 28 63 16.1742781830442 15.0605774535646 1.11370072947957 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.801843334000558 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 106633348 G/A 1 28 16 44 12.9394225464354 8.60604425917979 4.33337828725557 A:G G A 10 0.537877766198737 0.226790377000010 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 106898000 T/C 1 14 9 23 6.46971127321768 4.84089989578863 1.62881137742905 T:C T C 10 0.537877766198737 0.537125438968325 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106897859_106898032:POLR3B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 108096769 G/C 1 42 40 82 19.409133819653 21.5151106479495 -2.10597682829643 C:G G C 10 0.537877766198737 0.659026621988552 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 108954823 C/T 1 3 15 18 1.38636670140379 8.06816649298105 -6.68179979157727 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00163434897045431 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 108962663 C/G 1 332 328 660 153.424581622019 176.423907313186 -22.9993256911664 T:C:G C G 10 0.537877766198737 0.078893709954537 ENSG00000136003:ENST00000311893:exon_108962607_108963158:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000392807:exon_108962607_108963158:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000338291:exon_108962607_108963143:ISCU HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 109017614 G/A 1 34 21 55 15.7121559492429 11.2954330901735 4.41672285906947 A:G G A 10 0.537877766198737 0.279401071654638 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 236 184 420 109.060847177098 98.9695089805676 10.0913381965305 A:T A T 10 0.537877766198737 0.328160887694061 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 32 12 44 14.7879114816404 6.45453319438484 8.33337828725557 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0146631387234422 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 32 12 44 14.7879114816404 6.45453319438484 8.33337828725557 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0146631387234422 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 110348893 C/T 1 13 9 22 6.00758903941642 4.84089989578863 1.16668914362779 T:C C T 10 0.537877766198737 0.673692463929978 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110348868_110349040:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110348868_110349040:TCHP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 50 39 89 23.1061116900632 20.9772328817507 2.12887880831241 A:G G A 10 0.537877766198737 0.672060938643548 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 20 13 33 9.24244467602526 6.99241096058358 2.25003371544168 A:G G A 10 0.537877766198737 0.48765452803568 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 779 646 1425 359.993220131184 347.469036964384 12.5241831667998 A:T:C:G T G 10 0.537877766198737 0.523742928852484 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 112460195 G/T 1 981 931 1912 453.341911359039 500.764200331024 -47.422288971985 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0310641460342508 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 112471090 G/T 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 T:G G T 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112471037_112471183:NAA25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 112843848 G/A 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.246004363634176 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 112888239 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000179295:ENST00000392597:exon_112888122_112888316:PTPN11;ENSG00000179295:ENST00000351677:exon_112888122_112888316:PTPN11;ENSG00000179295:ENST00000392596:exon_112888122_112888316:PTPN11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 142 131 273 65.6213571997794 70.4619873720345 -4.84063017225519 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.584998731756577 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 2 16 18 0.924244467602526 8.60604425917979 -7.68179979157726 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000225980600876398 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 113444285 C/T 1 25 30 55 11.5530558450316 16.1363329859621 -4.58327714093053 T:C C T 10 0.537877766198737 0.225906651218679 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113444218_113444405:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113444218_113444405:OAS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 113826442 C/G 1 10 15 25 4.62122233801263 8.06816649298105 -3.44694415496842 C:G C G 10 0.537877766198737 0.228164098691797 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 62 31 93 28.6515784956783 16.6742107521608 11.9773677435175 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0125890907315703 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 8 14 22 3.6969778704101 7.53028872678232 -3.83331085637221 C:G G C 10 0.537877766198737 0.133495761886537 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 117013861 C/T 0 109 0 109 50.3713234843377 0 50.3713234843377 C C 10 0.537877766198737 7.44270692538773e-30 ENSG00000171471:ENST00000306985:exon_117013647_117014425:MAP1LC3B2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 117187907 T/C 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 T:C T C 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000135119:ENST00000257575:exon_117187646_117188112:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000407967:exon_117187646_117188112:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000319176:exon_117187646_117188112:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117187646_117188112:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000403793:exon_117187646_117188112:RNFT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 118465820 T/C 1 12 15 27 5.54546680561516 8.06816649298105 -2.5226996873659 T:C T C 10 0.537877766198737 0.341878737583407 ENSG00000111445:ENST00000229043:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000454402:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000392542:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000449641:exon_118465758_118465835:RFC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 118473027 T/G 1 12 12 24 5.54546680561516 6.45453319438484 -0.909066388769688 T:G T G 10 0.537877766198737 0.838384934353366 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 120118143 G/T 1 13 11 24 6.00758903941642 5.91665542818611 0.0909336112303132 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000111725:ENST00000229328:exon_120118053_120119416:PRKAB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 121177256 G/A 1 47 37 84 21.7197449886594 19.9014773493533 1.8182676393061 A:G G A 10 0.537877766198737 0.743206958147844 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 121205285 G/A 1 17 22 39 7.85607797462147 11.8333108563722 -3.97723288175074 A:G G A 10 0.537877766198737 0.260692389589246 ENSG00000157837:ENST00000353487:exon_121205197_121205396:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000405631:exon_121205197_121205396:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000392495:exon_121205197_121205396:AC069214.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C T C 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 121691096 G/A 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 121891070 T/C 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121890923_121891147:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121890923_121891147:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121890923_121891147:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121890923_121891147:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397478:exon_121890923_121891147:KDM2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 121947730 G/A 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121947370_121947842:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121947370_121947842:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121947370_121947842:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121947370_121947842:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397478:exon_121947370_121947842:KDM2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 70 61 131 32.3485563660884 32.810543738123 -0.461987372034535 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 122617919 C/A 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 A:C C A 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 122618244 C/T 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 T:C C T 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 122825466 A/G 1 7 12 19 3.23485563660884 6.45453319438484 -3.219677557776 A:G A G 10 0.537877766198737 0.168962527098265 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122825300_122826244:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122825300_122826244:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122825300_122826244:CLIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 122958095 C/T 1 43 50 93 19.8712560534543 26.8938883099368 -7.02263225648254 T:C C T 10 0.537877766198737 0.146897539167111 ENSG00000033030:ENST00000336229:exon_122957437_122958822:ZCCHC8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 123089121 G/A 1 9 13 22 4.15910010421137 6.99241096058358 -2.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.285712862815016 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123089111_123089184:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000436959:exon_123089111_123089184:KNTC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 123099564 T/C 1 21 10 31 9.70456690982652 5.37877766198737 4.32578924783915 T:C T C 10 0.537877766198737 0.149321603256598 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123099538_123099633:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123099538_123099633:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000436959:exon_123099538_123099633:KNTC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 123099573 C/T 1 17 6 23 7.85607797462147 3.22726659719242 4.62881137742905 T:C C T 10 0.537877766198737 0.060442691234244 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123099538_123099633:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123099538_123099633:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000436959:exon_123099538_123099633:KNTC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 123344021 G/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000130787:ENST00000253083:exon_123343973_123344083:HIP1R HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 123345736 C/G 1 16 4 20 7.39395574082021 2.15151106479495 5.24244467602526 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0231661214610183 ENSG00000130787:ENST00000253083:exon_123345678_123345739:HIP1R HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 123801856 T/C 1 37 34 71 17.0985226506467 18.2878440507571 -1.18932140011032 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.812439703032757 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123801768_123801903:SBNO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 124090655 C/T 1 2 13 15 0.924244467602526 6.99241096058358 -6.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00277175810739690 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124090620_124090706:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124090620_124090706:DDX55 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 124102329 C/G 1 57 30 87 26.340967326672 16.1363329859621 10.2046343407099 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0312198950035688 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124102305_124102419:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124102305_124102419:DDX55 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 124104642 C/T 1 59 79 138 27.2652117942745 42.4923435297002 -15.2271317354257 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0102851509689364 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 38 27 65 17.560644884448 14.5226996873659 3.0379451970821 A:G A G 10 0.537877766198737 0.459069915894567 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 17 26 43 7.85607797462147 13.9848219211672 -6.12874394654569 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0670061206791823 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125437019 T/C 1 10 9 19 4.62122233801263 4.84089989578863 -0.219677557776002 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125441194 G/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 12 18 30 5.54546680561516 9.68179979157727 -4.13633298596211 T:C T C 10 0.537877766198737 0.145035454783885 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 9 9 18 4.15910010421137 4.84089989578863 -0.681799791577266 T:C C T 10 0.537877766198737 0.815520419865837 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125451405 T/G 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 T:G T G 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125451339_125451424:DHX37 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125561151 A/G 1 4 10 14 1.84848893520505 5.37877766198737 -3.53028872678232 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0652981523722034 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 125626720 C/T 1 37 34 71 17.0985226506467 18.2878440507571 -1.18932140011032 T:C C T 10 0.537877766198737 0.812439703032757 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 14 31 45 6.46971127321768 16.6742107521608 -10.2044994789432 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00254978533400933 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 17 10 27 7.85607797462147 5.37877766198737 2.4773003126341 T:C C T 10 0.537877766198737 0.440811686990866 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 132210063 T/C 1 24 16 40 11.0909336112303 8.60604425917979 2.48488935205052 T:C T C 10 0.537877766198737 0.526473678584899 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132209950_132210175:SFSWAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 132284053 G/A 1 72 82 154 33.2728008336909 44.1059768282964 -10.8331759946055 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0894587046760806 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 132426042 G/A 1 62 64 126 28.6515784956783 34.4241770367192 -5.77259854104086 A:G G A 10 0.537877766198737 0.326033564134527 ENSG00000177192:ENST00000443358:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000440818:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000376649:exon_132425837_132426528:PUS1;ENSG00000177192:ENST00000322060:exon_132425837_132426528:PUS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 132626413 T/G 1 12 12 24 5.54546680561516 6.45453319438484 -0.909066388769688 T:G T G 10 0.537877766198737 0.838384934353366 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 16 19 35 7.39395574082021 10.219677557776 -2.82572181695579 T:C T C 10 0.537877766198737 0.397562623528634 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 133272521 T/C 1 26 29 55 12.0151780788328 15.5984552197634 -3.58327714093053 T:C T C 10 0.537877766198737 0.346581895649197 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133272470_133272632:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133272470_133272632:PGAM5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 133306780 A/G 1 24 30 54 11.0909336112303 16.1363329859621 -5.0453993747318 A:G A G 10 0.537877766198737 0.174847889738701 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 133378440 C/T 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133378353_133378555:GOLGA3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 133423662 C/T 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 T:C C T 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 12 133682829 C/T 1 14 4 18 6.46971127321768 2.15151106479495 4.31820020842273 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0563618316166793 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 19271676 A/T 0 118 0 118 54.530423588549 0 54.530423588549 A A 10 0.537877766198737 2.06308643108888e-32 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 20413021 T/C 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20412840_20413125:ZMYM5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 20425911 C/A 0 12 0 12 5.54546680561516 0 5.54546680561516 C C 10 0.537877766198737 0.000681272189570339 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 368 3 371 170.060982038865 1.61363329859621 168.447348740269 A:T:C:G T C 10 0.537877766198737 7.08993665686548e-94 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 23929189 C/G 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 C:G C G 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 24411772 T/C 1 9 19 28 4.15910010421137 10.219677557776 -6.06057745356464 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0233787858218337 ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24411691_24411895:MIPEP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 25479706 T/A 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 A:T T A 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 392 442 834 181.151915650095 237.741972659842 -56.5900570097466 C:G G C 10 0.537877766198737 9.82232275058092e-05 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 28009846 C/T 1 34 28 62 15.7121559492429 15.0605774535646 0.651578495678308 T:C C T 10 0.537877766198737 0.899265211942232 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 255 232 487 117.841169619322 124.787641758107 -6.9464721387849 A:G G A 10 0.537877766198737 0.554708530821058 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 31036681 A/G 1 192 99 291 88.7274688898425 53.249898853675 35.4775700361675 A:G A G 10 0.537877766198737 2.77856237641046e-05 ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 31309719 C/T 1 25 27 52 11.5530558450316 14.5226996873659 -2.96964384233432 T:C C T 10 0.537877766198737 0.487184243096721 ENSG00000132965:ENST00000380490:exon_31309645_31309812:ALOX5AP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 36878564 C/T 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 T:C C T 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36875775_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36877856_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36878459_36878769:SPG20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 37393848 G/C 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 C:G G C 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000133111:ENST00000255476:exon_37393361_37394094:RFXAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 39612800 A/C 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:C A C 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000188811:ENST00000473371:exon_39612443_39613425:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379600:exon_39612455_39612860:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000482323:exon_39612455_39612860:NHLRC3;ENSG00000188811:ENST00000379599:exon_39612528_39612860:NHLRC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 41134107 A/G 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000150907:ENST00000379561:exon_41133646_41134997:FOXO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 41827134 A/G 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000480434:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41827085_41827166:MTRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 41834644 C/G 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 C:G C G 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000480434:exon_41834629_41834722:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 43181024 T/C 1 9 1 10 4.15910010421137 0.537877766198737 3.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0250555914428584 ENSG00000120659:ENST00000358545:exon_43180633_43181310:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000405262:exon_43180633_43182149:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43180633_43182144:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43180633_43182149:TNFSF11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 45594482 G/A 1 22 25 47 10.1666891436278 13.4469441549684 -3.28025501134064 A:G G A 10 0.537877766198737 0.381036391165649 ENSG00000133114:ENST00000379151:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000497558:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000361121:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000357537:exon_45594465_45594563:KIAA1704 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 46039313 G/A 1 61 43 104 28.189456261877 23.1287439465457 5.06071231533135 A:G G A 10 0.537877766198737 0.327433104323963 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46039060_46039345:COG3;ENSG00000136152:ENST00000476702:exon_46039199_46039345:COG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 46577381 T/C 1 52 64 116 24.0303561576657 34.4241770367192 -10.3938208790535 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0621434500604475 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000470308:exon_46577274_46577471:ZC3H13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 46933676 C/T 1 13 18 31 6.00758903941642 9.68179979157727 -3.67421075216085 T:C C T 10 0.537877766198737 0.209426615101637 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000409879:exon_46933621_46933766:C13orf18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 228 239 467 105.363869306688 128.552786121498 -23.1889168148102 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0327507211424663 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 A:T A T 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 49085908 T/G 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000136161:ENST00000344532:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000450343:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000452987:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000430805:exon_49085906_49086013:RCBTB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 119 114 233 54.9925458223503 61.318065346656 -6.32551952430571 A:G G A 10 0.537877766198737 0.430597923542906 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 19 11 30 8.780322442224 5.91665542818611 2.86366701403789 A:G G A 10 0.537877766198737 0.361034480301865 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 73293132 T/A 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 A:T T A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000204899:ENST00000377818:exon_73293090_73293235:MZT1;ENSG00000204899:ENST00000427549:exon_73293090_73293235:MZT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 73335555 T/C 1 14 14 28 6.46971127321768 7.53028872678232 -1.06057745356464 T:C T C 10 0.537877766198737 0.708574000555236 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73335501_73335659:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73335501_73335659:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73335501_73335659:DIS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 73505348 G/A 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 A:G G A 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73505303_73505405:PIBF1;ENSG00000083535:ENST00000326314:exon_73505303_73505405:PIBF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 75861001 A/G 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G A G 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75858808_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75858809_75861161:TBC1D4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 76378459 T/C 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000533305:exon_76378425_76378471:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000534657:exon_76378425_76378499:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000497947:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526371:exon_76378310_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526528:exon_76378314_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000489941:exon_76378363_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525373:exon_76378366_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76378456_76378677:LMO7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 76393554 G/A 1 14 8 22 6.46971127321768 4.3030221295899 2.16668914362779 A:G G A 10 0.537877766198737 0.398552823157135 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000489941:exon_76393529_76393662:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525373:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76393529_76393671:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532785:exon_76393529_76393634:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532377:exon_76393414_76393671:LMO7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 76427347 C/A 1 16 7 23 7.39395574082021 3.76514436339116 3.62881137742905 A:C C A 10 0.537877766198737 0.146761352954381 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 76427403 G/A 1 17 7 24 7.85607797462147 3.76514436339116 4.09093361123031 A:G G A 10 0.537877766198737 0.104435394710996 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 76427410 C/G 1 16 8 24 7.39395574082021 4.3030221295899 3.09093361123031 C:G C G 10 0.537877766198737 0.225647485929066 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 98116738 G/A 1 6 9 15 2.77273340280758 4.84089989578863 -2.06816649298105 A:G G A 10 0.537877766198737 0.310767806906123 ENSG00000125249:ENST00000245304:exon_98116459_98120244:RAP2A;ENSG00000125249:ENST00000476869:exon_98116459_98116964:RAP2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 99100547 T/C 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 T:C T C 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99100490_99102016:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99100490_99102023:FARP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 39 45 84 18.0227671182493 24.2044994789432 -6.1817323606939 A:G G A 10 0.537877766198737 0.189795858042672 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 99112656 T/C 1 37 45 82 17.0985226506467 24.2044994789432 -7.10597682829643 T:C T C 10 0.537877766198737 0.121846549755393 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99112626_99112694:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99112626_99112694:STK24;ENSG00000102572:ENST00000418038:exon_99112626_99112694:STK24;ENSG00000102572:ENST00000444574:exon_99112626_99112694:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376533:exon_99112626_99112694:STK24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 99948097 A/G 1 25 13 38 11.5530558450316 6.99241096058358 4.560644884448 A:G A G 10 0.537877766198737 0.146447136460388 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 13 19 32 6.00758903941642 10.219677557776 -4.21208851835958 A:C C A 10 0.537877766198737 0.156978957494065 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 T:C T C 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 103316022 C/T 1 15 10 25 6.93183350701895 5.37877766198737 1.55305584503158 T:C C T 10 0.537877766198737 0.555492392718307 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103315998_103316094:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103315998_103316094:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103315998_103316094:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000482393:exon_103315998_103316094:TPP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 103527931 G/A 1 132 71 203 61.0001348617667 38.1893214001103 22.8108134616564 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00147677656826509 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 153 182 335 70.7047017715932 97.8937534481701 -27.1890516765769 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00305654139241482 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 17 26 43 7.85607797462147 13.9848219211672 -6.12874394654569 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0670061206791823 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 111563052 C/T 1 13 6 19 6.00758903941642 3.22726659719242 2.780322442224 T:C C T 10 0.537877766198737 0.252313312370768 ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000310847:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000465753:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000489973:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000494859:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000375758:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000460846:exon_111562965_111563117:ANKRD10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 113883851 G/A 1 7 12 19 3.23485563660884 6.45453319438484 -3.219677557776 A:G G A 10 0.537877766198737 0.168962527098265 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 T:C C T 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 113899321 G/T 1 2 10 12 0.924244467602526 5.37877766198737 -4.45453319438484 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0165336864510135 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000470067:exon_113899263_113899373:CUL4A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 113973832 C/T 1 41 41 82 18.9470115858518 22.0529884141482 -3.10597682829643 T:C C T 10 0.537877766198737 0.507962489219664 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113973784_113973971:LAMP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 113974761 C/T 1 41 50 91 18.9470115858518 26.8938883099368 -7.94687672408506 T:C C T 10 0.537877766198737 0.114317426300747 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113974660_113974785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113974660_113974785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 T:C T C 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 18 7 25 8.31820020842273 3.76514436339116 4.55305584503158 T:C C T 10 0.537877766198737 0.073439514689785 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 T:C T C 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 122 151 273 56.3789125237541 81.2195426960093 -24.8406301722552 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.00288056781540974 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 115064444 A/G 1 39 19 58 18.0227671182493 10.219677557776 7.80308956047326 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0475505745545014 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000474056:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000493727:exon_115064315_115064475:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115064315_115064475:UPF3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 115070418 G/T 1 22 64 86 10.1666891436278 34.4241770367192 -24.2574878930914 A:T:G G T 10 0.537877766198737 1.77785276848770e-07 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115070264_115071283:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115070264_115071283:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000480362:exon_115070264_115070424:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115070264_115071283:UPF3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 115090193 G/A 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G G A 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 13 115091399 T/C 1 14 16 30 6.46971127321768 8.60604425917979 -2.13633298596211 T:C T C 10 0.537877766198737 0.46777080604343 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 20757804 C/A 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 A:C C A 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 20825875 T/C 1 43 51 94 19.8712560534543 27.4317660761356 -7.56051002268127 T:C T C 10 0.537877766198737 0.1217738023662 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 30 32 62 13.8636670140379 17.2120885183596 -3.34842150432169 A:C A C 10 0.537877766198737 0.445217087709494 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 20839656 A/C 1 13 5 18 6.00758903941642 2.68938883099368 3.31820020842274 A:C A C 10 0.537877766198737 0.155963033480451 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20839648_20839791:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20839648_20839791:TEP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 19 15 34 8.780322442224 8.06816649298105 0.712155949242943 T:C T C 10 0.537877766198737 0.864600057495229 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 20926796 C/G 1 21 16 37 9.70456690982652 8.60604425917979 1.09852265064673 C:G C G 10 0.537877766198737 0.744644784635273 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20926012_20926861:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20926017_20926861:TMEM55B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 21162053 T/G 1 27 17 44 12.4773003126341 9.14392202537853 3.33337828725558 T:G T G 10 0.537877766198737 0.365323769081569 ENSG00000214274:ENST00000336811:exon_21161706_21162222:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397990:exon_21161706_21162338:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397987:exon_21161706_21162233:ANG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 21829129 C/G 1 25 18 43 11.5530558450316 9.68179979157727 1.87125605345431 C:G C G 10 0.537877766198737 0.647289435959162 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21829005_21829131:SUPT16H HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 21829404 T/C 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.483970581787651 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 21831052 T/C 1 21 17 38 9.70456690982652 9.14392202537853 0.560644884447996 T:C T C 10 0.537877766198737 0.872546949127018 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 21831419 C/T 1 33 26 59 15.2500337154417 13.9848219211672 1.26521179427452 T:C C T 10 0.537877766198737 0.794760911649898 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21831392_21831487:SUPT16H HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 21841524 A/G 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 A:G A G 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21841497_21841589:SUPT16H HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23000926 G/A 1 10 17 27 4.62122233801263 9.14392202537853 -4.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0857071363554688 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23016457 C/G 1 90 82 172 41.5910010421137 44.1059768282964 -2.51497578618275 T:C:G C G 10 0.537877766198737 0.702985596084674 ENSG00000229164:ENST00000446346:exon_23016447_23016484:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23016446_23016719:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000480299:exon_23016446_23016719:AE000661.28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23016696 A/C 1 197 175 372 91.0380800588488 94.128609084779 -3.09052902593015 A:C A C 10 0.537877766198737 0.755278866063023 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23016446_23016719:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000480299:exon_23016446_23016719:AE000661.28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 255 241 496 117.841169619322 129.628541653896 -11.7873720345735 T:C T C 10 0.537877766198737 0.300400540199793 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23020706 C/A 1 318 259 577 146.954870348802 139.310341445473 7.64452890332879 A:C:G C A 10 0.537877766198737 0.531396419289 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 330 279 609 152.500337154417 150.067896769448 2.4324403849692 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.870889943791653 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23020920 G/A 1 289 335 624 133.553325568565 180.189051676577 -46.6357261080119 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.000215697143633890 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 301 227 528 139.09879237418 122.098252927113 17.0005394470669 T:G G T 10 0.537877766198737 0.149717541531399 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23237212 G/A 1 80 56 136 36.969778704101 30.1211549071293 6.84862379697178 A:G G A 10 0.537877766198737 0.263721047850714 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23237167_23237831:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000442110:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23237167_23237380:OXA1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23240328 T/A 1 533 616 1149 246.311150616073 331.332703978422 -85.0215533623488 A:T:C T A 10 0.537877766198737 5.49121779468107e-07 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23299242 C/G 1 19 21 40 8.780322442224 11.2954330901735 -2.51511064794948 C:G C G 10 0.537877766198737 0.43296846001902 ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000461594:exon_23299138_23299319:MRPL52 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23346290 C/G 1 102 97 199 47.1364678477288 52.1741433212775 -5.03767547354865 C:G C G 10 0.537877766198737 0.478043038554674 ENSG00000197324:ENST00000359591:exon_23346149_23350789:LRP10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23532186 G/C 1 49 72 121 22.6439894562619 38.7271991663091 -16.0832097100472 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00348589498265945 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23532138_23532283:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000473758:exon_23532138_23532283:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000338631:exon_23532138_23532283:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000357481:exon_23532138_23532283:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23532138_23532283:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000397341:exon_23532138_23532283:ACIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 23745016 T/C 1 38 31 69 17.560644884448 16.6742107521608 0.88643413228715 T:C T C 10 0.537877766198737 0.904079607337361 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24026336 A/C 1 10 14 24 4.62122233801263 7.53028872678232 -2.90906638876969 A:C A C 10 0.537877766198737 0.306179082005434 ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24029062 A/C 1 8 17 25 3.6969778704101 9.14392202537853 -5.44694415496842 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0427155797751566 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24033279 C/T 1 37 49 86 17.0985226506467 26.3560105437381 -9.25748789309138 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0512912137056791 ENSG00000213983:ENST00000308724:exon_24033255_24033368:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000397120:exon_24033255_24033368:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000460049:exon_24033255_24033430:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24114483 T/C 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000100867:ENST00000250383:exon_24114351_24114848:DHRS2;ENSG00000100867:ENST00000344777:exon_24114351_24114846:DHRS2;ENSG00000100867:ENST00000456214:exon_24114351_24114846:DHRS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24114490 G/A 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:G G A 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000100867:ENST00000250383:exon_24114351_24114848:DHRS2;ENSG00000100867:ENST00000344777:exon_24114351_24114846:DHRS2;ENSG00000100867:ENST00000456214:exon_24114351_24114846:DHRS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 30 29 59 13.8636670140379 15.5984552197634 -1.73478820572548 A:T A T 10 0.537877766198737 0.69614297682599 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24459486 C/T 1 28 19 47 12.9394225464354 10.219677557776 2.71974498865936 T:C C T 10 0.537877766198737 0.466730923878796 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24459391_24459568:DHRS4L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24634106 G/A 1 65 94 159 30.0379451970821 50.5605100226813 -20.5225648255992 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00138949638882716 ENSG00000213928:ENST00000396864:exon_24633823_24634164:IRF9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24635409 C/T 1 221 168 389 102.129013670079 90.3634647213878 11.7655489486913 T:C C T 10 0.537877766198737 0.242318242773918 ENSG00000213928:ENST00000396864:exon_24635331_24635774:IRF9;ENSG00000213928:ENST00000324076:exon_24635331_24635433:IRF9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24650967 C/T 1 58 62 120 26.8030895604733 33.3484215043217 -6.54533194384843 T:C C T 10 0.537877766198737 0.235323913908236 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24650917_24651049:IPO4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 20 14 34 9.24244467602526 7.53028872678232 1.71215594924294 T:C T C 10 0.537877766198737 0.608714683105822 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24806902 G/A 1 13 15 28 6.00758903941642 8.06816649298105 -2.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.454321487587661 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24806901_24806968:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24806901_24806968:RIPK3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24807221 G/A 1 9 8 17 4.15910010421137 4.3030221295899 -0.143922025378528 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24807079_24807246:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24807079_24807246:RIPK3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 24808388 A/G 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G A G 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24808221_24808530:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24808221_24808530:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000357715:exon_24808221_24808530:RIPK3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 16 6 22 7.39395574082021 3.22726659719242 4.16668914362779 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0881117846100238 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 14 10 24 6.46971127321768 5.37877766198737 1.09093361123031 A:T A T 10 0.537877766198737 0.687960904025668 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 34985506 G/C 1 17 24 41 7.85607797462147 12.9090663887697 -5.05298841414822 C:G G C 10 0.537877766198737 0.119691488782499 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 14 6 20 6.46971127321768 3.22726659719242 3.24244467602526 A:G G A 10 0.537877766198737 0.180307908095872 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 562 632 1194 259.71269539631 339.938748237602 -80.226052841292 A:C:G G A 10 0.537877766198737 3.81293554564625e-06 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 162 216 378 74.8638018758046 116.181597498927 -41.3177956231226 A:G G A 10 0.537877766198737 2.20844605598724e-05 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 44 58 102 20.3333782872556 31.1969104395267 -10.8635321522712 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0366031602694421 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 45693250 C/A 1 7 9 16 3.23485563660884 4.84089989578863 -1.60604425917979 A:C C A 10 0.537877766198737 0.460334234664264 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45693121_45693949:C14orf106 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 45700352 T/C 1 24 12 36 11.0909336112303 6.45453319438484 4.63640041684547 T:C T C 10 0.537877766198737 0.134388009948809 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45700344_45700501:C14orf106 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 50074122 T/A 1 17 6 23 7.85607797462147 3.22726659719242 4.62881137742905 A:T T A 10 0.537877766198737 0.060442691234244 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 50074520 C/T 1 18 26 44 8.31820020842273 13.9848219211672 -5.66662171274443 T:C C T 10 0.537877766198737 0.096829648376984 ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 50085571 G/A 1 4217 3744 7961 1948.76945993993 2013.81435664807 -65.044896708145 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 0.143975974397979 ENSG00000165502:ENST00000298289:exon_50085407_50085858:RPL36AL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 50100374 C/T 1 31 24 55 14.3257892478392 12.9090663887697 1.41672285906947 T:C C T 10 0.537877766198737 0.787211070986638 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 50298962 T/A 1 22 25 47 10.1666891436278 13.4469441549684 -3.28025501134064 A:T T A 10 0.537877766198737 0.381036391165649 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 50789387 C/T 1 34 23 57 15.7121559492429 12.3711886225709 3.34096732667199 T:C C T 10 0.537877766198737 0.426273684255048 ENSG00000125375:ENST00000311459:exon_50789229_50789437:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000245448:exon_50789229_50789437:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000426751:exon_50789229_50789743:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000358473:exon_50789229_50789437:ATP5S HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 55408294 C/T 1 20 18 38 9.24244467602526 9.68179979157727 -0.439355115552004 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55405668_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55406942_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000475379:exon_55407989_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55408208_55408408:WDHD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 71 35 106 32.8106785998897 18.8257218169558 13.9849567829339 A:C C A 10 0.537877766198737 0.00632201388562827 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 55609418 G/A 1 138 194 332 63.7728682645743 104.348286642555 -40.5754183779807 A:G G A 10 0.537877766198737 9.70693855963222e-06 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55609302_55609467:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55609302_55609467:LGALS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 56096731 A/G 1 81 106 187 37.4319009379023 57.0150432170661 -19.5831422791638 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00420611093619429 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56096675_56096815:KTN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 56105908 C/T 1 35 21 56 16.1742781830442 11.2954330901735 4.87884509287073 T:C C T 10 0.537877766198737 0.22777379179429 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56105903_56105940:KTN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 56107666 G/C 1 37 13 50 17.0985226506467 6.99241096058358 10.1061116900632 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00424827892771337 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56107651_56107688:KTN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 56146357 G/A 1 46 26 72 21.2576227548581 13.9848219211672 7.27280083369094 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0978035779434885 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56146283_56146403:KTN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 22 16 38 10.1666891436278 8.60604425917979 1.560644884448 A:G A G 10 0.537877766198737 0.63012725628382 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 60616254 C/T 1 95 92 187 43.90161221112 49.4847544902838 -5.58314227916381 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.420645080576621 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60616071_60616286:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60616116_60616286:DHRS7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 61924237 G/C 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 62213674 G/A 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 A:G G A 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62213652_62214976:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62213652_62214976:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62213652_62214976:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62213652_62214976:HIF1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 13 12 25 6.00758903941642 6.45453319438484 -0.446944154968424 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 64916165 C/T 1 249 179 428 115.068436216514 96.2801201495739 18.7883160669406 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0728074827466231 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64916163_64916340:MTHFD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 69257187 C/G 1 12 17 29 5.54546680561516 9.14392202537853 -3.59845521976337 C:G C G 10 0.537877766198737 0.196037430426041 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69254375_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69256244_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69256691_69257209:ZFP36L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 69259662 C/A 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 A:C C A 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69259599_69259785:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69259599_69261453:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69259599_69261453:ZFP36L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 71109153 C/G 1 14 13 27 6.46971127321768 6.99241096058358 -0.522699687365898 C:G C G 10 0.537877766198737 0.84951872158194 ENSG00000133985:ENST00000256367:exon_71108504_71109252:TTC9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 72152139 A/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72152079_72152348:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72152079_72152348:SIPA1L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 72945012 T/C 1 8 8 16 3.6969778704101 4.3030221295899 -0.606044259179791 T:C T C 10 0.537877766198737 0.805966639450967 ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 75265038 A/G 1 9 8 17 4.15910010421137 4.3030221295899 -0.143922025378528 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75264283_75266400:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75264283_75266400:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75264283_75266400:YLPM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 75279461 G/A 1 50 31 81 23.1061116900632 16.6742107521608 6.43190093790231 A:G G A 10 0.537877766198737 0.180878118431108 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 75475814 A/T 1 43 25 68 19.8712560534543 13.4469441549684 6.42431189848589 A:T A T 10 0.537877766198737 0.143974785523670 ENSG00000119718:ENST00000266126:exon_75475734_75476292:EIF2B2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 75475894 G/C 1 72 44 116 33.2728008336909 23.6666217127444 9.60617912094651 C:G G C 10 0.537877766198737 0.077192989976532 ENSG00000119718:ENST00000266126:exon_75475734_75476292:EIF2B2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 75904659 C/T 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 76012864 A/G 1 245 293 538 113.219947281309 157.59818549623 -44.3782382149205 A:G A G 10 0.537877766198737 0.000137892624876094 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 76012939 C/G 1 348 359 707 160.81853736284 193.098118065347 -32.279580702507 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0157420277941912 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 5 18 23 2.31061116900632 9.68179979157727 -7.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00262839996957296 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 76368547 T/C 1 10 2 12 4.62122233801263 1.07575553239747 3.54546680561516 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0451025910853133 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 76662248 A/G 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000089916:ENST00000261530:exon_76662221_76662315:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000312858:exon_76662221_76662315:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000336993:exon_76662221_76662315:C14orf118 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 17 22 39 7.85607797462147 11.8333108563722 -3.97723288175074 A:G G A 10 0.537877766198737 0.260692389589246 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 77797452 A/G 1 87 82 169 40.2046343407099 44.1059768282964 -3.90134248758654 A:G A G 10 0.537877766198737 0.589333369046159 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77797412_77797830:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77797412_77797830:GSTZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 99 82 181 45.750101146325 44.1059768282964 1.64412431802862 A:G A G 10 0.537877766198737 0.823417052872373 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 77978621 A/C 1 66 55 121 30.5000674308834 29.5832771409305 0.916790289952829 A:C A C 10 0.537877766198737 0.927423148228262 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_77973272_77978746:SPTLC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 78140329 G/A 1 14 9 23 6.46971127321768 4.84089989578863 1.62881137742905 A:G G A 10 0.537877766198737 0.537125438968325 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 78140355 T/A 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:T T A 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 110 103 213 50.8334457181389 55.4014099184699 -4.56796420033098 T:C C T 10 0.537877766198737 0.536986951000695 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 78221364 T/G 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78221310_78221463:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78221310_78221463:SNW1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 22 7 29 10.1666891436278 3.76514436339116 6.40154478023663 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0237359325843663 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 8 22 30 3.6969778704101 11.8333108563722 -8.13633298596211 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00310943086788137 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 31 40 71 14.3257892478392 21.5151106479495 -7.18932140011032 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0958455814679873 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 91773494 G/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 91808707 C/G 1 13 57 70 6.00758903941642 30.659032673328 -24.6514436339116 C:G C G 10 0.537877766198737 1.8964319131729e-09 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 19 13 32 8.780322442224 6.99241096058358 1.78791148164042 T:C C T 10 0.537877766198737 0.596919535098297 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 92454633 C/T 1 20 9 29 9.24244467602526 4.84089989578863 4.40154478023663 T:C C T 10 0.537877766198737 0.135195478390590 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92454628_92454727:TRIP11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 92470462 C/T 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 18 14 32 8.31820020842273 7.53028872678232 0.787911481640417 T:C C T 10 0.537877766198737 0.860177309642916 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 11 13 24 5.08334457181389 6.99241096058358 -1.90906638876969 T:C C T 10 0.537877766198737 0.54016131683339 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 93118834 C/T 1 10 12 22 4.62122233801263 6.45453319438484 -1.83331085637221 T:C C T 10 0.537877766198737 0.522885386896646 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 93119407 C/T 1 18 21 39 8.31820020842273 11.2954330901735 -2.97723288175074 T:C C T 10 0.537877766198737 0.341434287698833 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 93170661 T/A 1 317 277 594 146.492748115 148.99214123705 -2.49939312204975 A:T:G T A 10 0.537877766198737 0.837128853690348 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170157_93170706:LGMN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 93185114 C/T 1 77 34 111 35.5834120026973 18.2878440507571 17.2955679519402 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0011151722423084 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93185092_93185189:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93185092_93185189:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93185092_93185189:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93185092_93185189:LGMN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 94526812 C/T 1 128 154 282 59.1516459265617 82.8331759946055 -23.6815300680438 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00495795729960669 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94526444_94526959:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94526444_94526959:DDX24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 94528572 C/T 1 88 77 165 40.6667565745111 41.4165879973027 -0.749831422791601 T:C C T 10 0.537877766198737 0.93783365526327 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94528443_94528967:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94528443_94528967:DDX24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 94745001 G/A 0 10 0 10 4.62122233801263 0 4.62122233801263 G G 10 0.537877766198737 0.00247110667592352 ENSG00000119698:ENST00000304338:exon_94744956_94746072:PPP4R4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 94847285 A/G 1 4 45 49 1.84848893520505 24.2044994789432 -22.3560105437381 A:G A G 10 0.537877766198737 1.84405674693866e-11 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94846988_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000402629:exon_94847208_94847478:SERPINA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 94935985 T/C 1 14 2 16 6.46971127321768 1.07575553239747 5.39395574082021 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00967990041271147 ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94935550_94936004:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94935962_94936194:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94935550_94936194:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94935962_94936177:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94935550_94936196:SERPINA9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 95560348 C/T 1 9 16 25 4.15910010421137 8.60604425917979 -4.44694415496842 T:C C T 10 0.537877766198737 0.106745724142528 ENSG00000100697:ENST00000343455:exon_95560225_95560493:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000526495:exon_95560225_95560493:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000393063:exon_95560225_95560493:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000527414:exon_95560225_95560493:DICER1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 95910933 T/C 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 T:C T C 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95910822_95910965:C14orf49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 95912388 G/A 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 95912426 T/C 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 T:C T C 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 96756104 A/G 1 10 1 11 4.62122233801263 0.537877766198737 4.08334457181389 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0142271384391581 ENSG00000066739:ENST00000359933:exon_96755993_96756142:ATG2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 99927643 A/G 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 A:G A G 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000436070:exon_99927529_99927677:SETD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 100563943 G/A 1 115 100 215 53.1440568871453 53.7877766198737 -0.643719732728442 A:G G A 10 0.537877766198737 0.945542510695952 ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100563818_100563995:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100563818_100563995:EVL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 100610021 C/T 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 T:C C T 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 100995452 G/A 1 15 18 33 6.93183350701895 9.68179979157727 -2.74996628455832 A:G G A 10 0.537877766198737 0.384427877209256 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100995405_100995545:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100995405_100995545:WDR25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 102505540 G/A 1 5 16 21 2.31061116900632 8.60604425917979 -6.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00743298250531806 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102505338_102505591:DYNC1H1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 103934484 G/A 1 22 29 51 10.1666891436278 15.5984552197634 -5.43176607613558 A:G G A 10 0.537877766198737 0.159597396241829 ENSG00000075413:ENST00000416682:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000216288:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000335102:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000454698:exon_103934418_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000440884:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000429436:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000303622:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000411530:exon_103934370_103934523:MARK3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 103986270 C/T 1 25 41 66 11.5530558450316 22.0529884141482 -10.4999325691166 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0129422063099397 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 104165747 C/T 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 T:C C T 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000126215:ENST00000445556:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000352127:exon_104165701_104165913:XRCC3;ENSG00000126215:ENST00000440302:exon_104165701_104165913:XRCC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 274 252 526 126.621492061546 135.545197082082 -8.92370502053562 T:C T C 10 0.537877766198737 0.457290705006481 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 105178851 C/T 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 T:C C T 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105178770_105178894:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105178770_105178894:INF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 105180633 G/A 1 16 12 28 7.39395574082021 6.45453319438484 0.939422546435365 A:G G A 10 0.537877766198737 0.850219934863149 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 105181673 G/A 1 27 22 49 12.4773003126341 11.8333108563722 0.64398945626189 A:G G A 10 0.537877766198737 0.886975474802947 ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105181618_105181676:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105181621_105181677:INF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 105477699 C/T 1 46 36 82 21.2576227548581 19.3635995831545 1.89402317170357 T:C C T 10 0.537877766198737 0.7400507029299 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106066690 A/C 1 14 2 16 6.46971127321768 1.07575553239747 5.39395574082021 A:C A C 10 0.537877766198737 0.00967990041271147 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106067298 T/C 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 T T 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106091555 C/T 0 30 0 30 13.8636670140379 0 13.8636670140379 C C 10 0.537877766198737 1.14752379362079e-08 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106091697 T/C 0 30 0 30 13.8636670140379 0 13.8636670140379 T T 10 0.537877766198737 1.14752379362079e-08 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106135198 A/G 1 23 14 37 10.6288113774291 7.53028872678232 3.09852265064673 A:G A G 10 0.537877766198737 0.327351119017456 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106174123 G/A 1 6152 3 6155 2842.97598234537 1.61363329859621 2841.36234904677 A:C:G G A 10 0.537877766198737 4.94065645841247e-324 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106174796 C/T 1 2 6142 6144 0.924244467602526 3303.64523999264 -3302.72099552504 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106209419 G/A 1 2 24 26 0.924244467602526 12.9090663887697 -11.9848219211672 A:G G A 10 0.537877766198737 1.00565165228180e-06 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106209423 T/C 0 0 24 24 0 12.9090663887697 -12.9090663887697 C T C 10 0.537877766198737 8.99838840635607e-09 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106452817 A/G 0 0 47 47 0 25.2802550113406 -25.2802550113406 G A G 10 0.537877766198737 1.75215533876401e-16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106667707 A/T 0 0 149 149 0 80.1437871636118 -80.1437871636118 T A T 10 0.537877766198737 1.11885222668345e-50 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106667708 C/T 0 0 145 145 0 77.9922760988169 -77.9922760988169 T C T 10 0.537877766198737 2.45326958537336e-49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106667756 G/A 0 0 303 303 0 162.976963158217 -162.976963158217 A G A 10 0.537877766198737 2.63833404031855e-102 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 106667796 A/G 1 1 629 630 0.462122233801263 338.325114939006 -337.862992705204 A:G A G 10 0.537877766198737 4.59921209490225e-209 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 1 52 1 53 24.0303561576657 0.537877766198737 23.4924783914669 T:C:G C T 10 0.537877766198737 3.14079370789111e-13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 23000272 A/G 1 2 10 12 0.924244467602526 5.37877766198737 -4.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0165336864510135 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 23052632 T/C 1 10 1 11 4.62122233801263 0.537877766198737 4.08334457181389 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0142271384391581 ENSG00000170113:ENST00000337435:exon_23052595_23052755:NIPA1;ENSG00000170113:ENST00000437912:exon_23052595_23052755:NIPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 25602024 T/C 1 51 29 80 23.5682339238644 15.5984552197634 7.96977870410104 T:C T C 10 0.537877766198737 0.091965271262778 ENSG00000114062:ENST00000232165:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000397954:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000438097:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000428984:exon_25601838_25602043:UBE3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 28357086 C/T 1 27 21 48 12.4773003126341 11.2954330901735 1.18186722246063 T:C C T 10 0.537877766198737 0.773700676968778 ENSG00000128731:ENST00000261609:exon_28356186_28357181:HERC2;ENSG00000128731:ENST00000429795:exon_28356186_28357181:HERC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 28361865 G/A 1 10 11 21 4.62122233801263 5.91665542818611 -1.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.663514294637069 ENSG00000128731:ENST00000261609:exon_28361811_28362005:HERC2;ENSG00000128731:ENST00000429795:exon_28361811_28362005:HERC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 28369255 C/T 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000128731:ENST00000261609:exon_28369183_28369380:HERC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 4 12 16 1.84848893520505 6.45453319438484 -4.60604425917979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.024130575151832 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 35159799 A/G 1 31 23 54 14.3257892478392 12.3711886225709 1.9546006252682 A:G A G 10 0.537877766198737 0.682689085161486 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35159725_35159810:AQR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 35189858 C/T 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35189760_35189906:AQR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 407 345 752 188.083749157114 185.567829338564 2.5159198185498 T:G T G 10 0.537877766198737 0.883708523784494 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 472 357 829 218.121694354196 192.022362532949 26.0993318212471 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0701458406099923 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 40462780 G/A 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40462738_40462831:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40462738_40462882:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40462738_40462882:BUB1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 40488857 G/C 1 21 14 35 9.70456690982652 7.53028872678232 2.17427818304421 C:G G C 10 0.537877766198737 0.501418703087631 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 41247573 C/T 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000128965:ENST00000446533:exon_41247571_41248717:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000444189:exon_41247571_41247612:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000397434:exon_41247571_41247612:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000249798:exon_41247571_41248709:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000487220:exon_41247571_41248365:CHAC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 41624579 C/G 1 10 12 22 4.62122233801263 6.45453319438484 -1.83331085637221 C:G C G 10 0.537877766198737 0.522885386896646 ENSG00000104147:ENST00000220514:exon_41624438_41624819:OIP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 41624591 C/T 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 T:C C T 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000104147:ENST00000220514:exon_41624438_41624819:OIP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 41663828 G/A 1 70 25 95 32.3485563660884 13.4469441549684 18.90161221112 A:T:G G A 10 0.537877766198737 7.96316885942042e-05 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41663725_41663882:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41663725_41663882:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450592:exon_41663725_41663882:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41663725_41663882:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41663725_41663882:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41663725_41663882:NUSAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 41688700 T/C 1 66 65 131 30.5000674308834 34.9620548029179 -4.46198737203454 T:C T C 10 0.537877766198737 0.483454980667361 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 43481408 G/A 1 17 19 36 7.85607797462147 10.219677557776 -2.36359958315453 A:G G A 10 0.537877766198737 0.504572022125103 ENSG00000166946:ENST00000300213:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000407066:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000356633:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000444658:exon_43481397_43481478:CCNDBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 43714295 C/T 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43714053_43714324:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43714053_43714324:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43714053_43714324:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43714053_43714324:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43714053_43714324:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43714053_43714324:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000417342:exon_43714053_43714324:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000467474:exon_43713870_43714324:TP53BP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 44046013 C/T 1 12 7 19 5.54546680561516 3.76514436339116 1.780322442224 T:C C T 10 0.537877766198737 0.494001923393957 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 44066826 G/A 1 28 21 49 12.9394225464354 11.2954330901735 1.64398945626189 A:G G A 10 0.537877766198737 0.669714011117111 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44066794_44066971:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000467869:exon_44066794_44066971:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497465:exon_44066794_44066971:ELL3;ENSG00000184716:ENST00000417761:exon_44066794_44066971:SERINC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 44092856 G/A 1 652 690 1342 301.303696438424 371.135658677129 -69.831962238705 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000140124521934480 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44091556_44092982:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44092693_44092982:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44092693_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000498605:exon_44092509_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44092621_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44092797_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44092825_44092982:C15orf63 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 44093758 G/A 1 480 439 919 221.818672224606 236.128339361246 -14.3096671366392 A:G G A 10 0.537877766198737 0.35432506025464 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093716_44093767:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093716_44093767:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093716_44093767:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000498605:exon_44093330_44093788:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093716_44093767:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093716_44093767:C15orf63 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 464 401 865 214.424716483786 215.688984245694 -1.26426776190746 T:C T C 10 0.537877766198737 0.94563804185995 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 45047134 G/A 1 18 1 19 8.31820020842273 0.537877766198737 7.780322442224 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000241099971341087 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 30 20 50 13.8636670140379 10.7575553239747 3.10611169006315 T:C C T 10 0.537877766198737 0.398376657888533 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 45361180 A/T 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 A:T A T 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 45965832 C/T 1 23 19 42 10.6288113774291 10.219677557776 0.409133819653048 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000137767:ENST00000260324:exon_45965805_45965999:SQRDL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 49031280 A/G 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49030136_49031485:CEP152 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 49048128 A/G 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49048100_49048750:CEP152 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 52015787 T/C 1 46 38 84 21.2576227548581 20.439355115552 0.818267639306097 T:C T C 10 0.537877766198737 0.913050638889097 ENSG00000140280:ENST00000267838:exon_52015208_52015846:LYSMD2;ENSG00000140280:ENST00000454181:exon_52015262_52015846:LYSMD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 52416739 G/A 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000069966:ENST00000261837:exon_52416670_52416836:GNB5;ENSG00000069966:ENST00000358784:exon_52416670_52416836:GNB5;ENSG00000069966:ENST00000396335:exon_52416670_52416836:GNB5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 5 16 21 2.31061116900632 8.60604425917979 -6.29543309017348 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00743298250531806 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 53 72 125 24.4924783914669 38.7271991663091 -14.2347207748421 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0118413055851382 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 22 37 59 10.1666891436278 19.9014773493533 -9.73478820572548 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0127255863351011 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 95 27 122 43.90161221112 14.5226996873659 29.3789125237541 A:G G A 10 0.537877766198737 4.72639896350962e-08 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 55647492 C/T 1 33 16 49 15.2500337154417 8.60604425917979 6.64398945626189 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0627414358954588 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55647484_55647845:PIGB;ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 55652719 A/G 1 41 51 92 18.9470115858518 27.4317660761356 -8.4847544902838 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0937956528560757 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 55652845 A/G 1 25 37 62 11.5530558450316 19.9014773493533 -8.34842150432169 A:G A G 10 0.537877766198737 0.040864667414643 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 59180619 A/C 1 175 184 359 80.871390915221 98.9695089805676 -18.0981180653466 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0567971261596306 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59180584_59180754:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000432750:exon_59180584_59180754:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000492526:exon_59180584_59180754:SLTM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 59397443 G/A 1 32 48 80 14.7879114816404 25.8181327775394 -11.030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0179735896520703 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59397277_59397491:CCNB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 18 11 29 8.31820020842273 5.91665542818611 2.40154478023663 A:G G A 10 0.537877766198737 0.457449401187867 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 46 34 80 21.2576227548581 18.2878440507571 2.96977870410105 A:G G A 10 0.537877766198737 0.575361539685868 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 12 10 22 5.54546680561516 5.37877766198737 0.166689143627787 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 65112209 C/A 1 5 11 16 2.31061116900632 5.91665542818611 -3.60604425917979 A:C C A 10 0.537877766198737 0.081929463926307 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 65459122 T/C 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000166855:ENST00000300107:exon_65458969_65459123:CLPX HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 65472485 G/A 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 A:G G A 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000166855:ENST00000300107:exon_65472382_65472542:CLPX HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 66618342 A/G 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 A:G A G 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 66774172 C/T 1 20 21 41 9.24244467602526 11.2954330901735 -2.05298841414822 T:C C T 10 0.537877766198737 0.534899936393599 ENSG00000169032:ENST00000307102:exon_66774093_66774217:MAP2K1;ENSG00000169032:ENST00000425818:exon_66774093_66774217:MAP2K1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 66793795 G/A 1 577 891 1468 266.644528903329 479.249089683075 -212.604560779746 A:T:G G A 10 0.537877766198737 9.86174238102042e-29 ENSG00000174444:ENST00000307961:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000432669:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000436058:exon_66793713_66793842:RPL4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 67500957 A/G 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67500900_67500996:AAGAB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 71634028 C/G 0 195 0 195 90.1138355912463 0 90.1138355912463 C C 10 0.537877766198737 5.46159249205532e-53 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 72638892 T/C 1 83 95 178 38.3561454055048 51.09838778888 -12.7422423833752 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0601072666578698 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72638868_72639051:HEXA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 74277146 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277000_74277212:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277000_74277212:STOML1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 74277795 T/C 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C T C 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277659_74277854:STOML1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 63 55 118 29.1137007294796 29.5832771409305 -0.469576411450962 A:G A G 10 0.537877766198737 0.926793220749975 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 58 61 119 26.8030895604733 32.810543738123 -6.0074541776497 A:T:G G T 10 0.537877766198737 0.271642302905526 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 74702894 C/T 1 71 87 158 32.8106785998897 46.7953656592901 -13.9846870594004 T:C C T 10 0.537877766198737 0.030898262281487 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 39 48 87 18.0227671182493 25.8181327775394 -7.79536565929012 A:G G A 10 0.537877766198737 0.106561853963730 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 15 14 29 6.93183350701895 7.53028872678232 -0.598455219763371 A:G G A 10 0.537877766198737 0.85397889757185 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75091727 C/T 1 191 169 360 88.2653466560412 90.9013424875865 -2.6359958315453 T:C C T 10 0.537877766198737 0.791726476829987 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75091613_75091832:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75091613_75091832:CSK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75094871 G/A 1 773 748 1521 357.220486728376 402.332569116655 -45.1120823882789 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0206476121848323 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75094672_75095539:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75094672_75095537:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75094672_75095537:CSK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75131959 A/G 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131899_75132054:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131899_75132054:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131899_75132054:ULK3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 72 111 183 33.2728008336909 59.7044320480598 -26.4316312143689 A:G A G 10 0.537877766198737 0.000105282284757698 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 20 36 56 9.24244467602526 19.3635995831545 -10.1211549071293 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00719937916506495 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 24 18 42 11.0909336112303 9.68179979157727 1.40913381965305 A:C C A 10 0.537877766198737 0.757553660558082 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 9 9 18 4.15910010421137 4.84089989578863 -0.681799791577266 A:G G A 10 0.537877766198737 0.815520419865837 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75499927 G/A 1 14 9 23 6.46971127321768 4.84089989578863 1.62881137742905 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.537125438968325 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75646540 G/A 1 13 2 15 6.00758903941642 1.07575553239747 4.93183350701895 A:G G A 10 0.537877766198737 0.016561054837906 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75761101 G/A 1 8 18 26 3.6969778704101 9.68179979157727 -5.98482192116716 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0284786937655123 ENSG00000169410:ENST00000306726:exon_75759462_75761324:PTPN9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 75890689 G/T 1 104 86 190 48.0607123153314 46.2574878930914 1.80322442223998 T:G G T 10 0.537877766198737 0.82738686929094 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75890424_75891022:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75890424_75891022:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75890424_75891022:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75890424_75891022:SNUPN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 76222298 T/C 1 34 18 52 15.7121559492429 9.68179979157727 6.03035615766568 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0970549984460707 ENSG00000167196:ENST00000308275:exon_76222225_76222390:FBXO22;ENSG00000167196:ENST00000453211:exon_76222225_76223313:FBXO22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 76222300 A/T 1 35 19 54 16.1742781830442 10.219677557776 5.95460062526821 A:T A T 10 0.537877766198737 0.132574758538027 ENSG00000167196:ENST00000308275:exon_76222225_76222390:FBXO22;ENSG00000167196:ENST00000453211:exon_76222225_76223313:FBXO22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 76998276 T/C 1 23 25 48 10.6288113774291 13.4469441549684 -2.81813277753937 T:C T C 10 0.537877766198737 0.469995448763208 ENSG00000140386:ENST00000324767:exon_76998244_76998325:SCAPER;ENSG00000140386:ENST00000303521:exon_76998244_76998325:SCAPER HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 77323530 C/T 1 13 19 32 6.00758903941642 10.219677557776 -4.21208851835958 T:C C T 10 0.537877766198737 0.156978957494065 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77323521_77323619:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77323521_77323619:PSTPIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 77324696 A/G 1 24 29 53 11.0909336112303 15.5984552197634 -4.50752160853306 A:G A G 10 0.537877766198737 0.218552703322232 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77324639_77324735:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77324639_77324769:PSTPIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 828 1124 1952 382.637209587446 604.57460920738 -221.937399619935 A:T:C T C 10 0.537877766198737 8.93711236815242e-24 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 78885614 A/G 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000169684:ENST00000299565:exon_78885434_78887611:CHRNA5;ENSG00000169684:ENST00000394802:exon_78885434_78887611:CHRNA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 319 569 888 147.416992582603 306.052448967081 -158.635456384478 T:C:G C T 10 0.537877766198737 1.24937225653446e-26 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 79603726 G/A 1 42 73 115 19.409133819653 39.2650769325078 -19.8559431128547 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000236755069660695 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79603404_79603759:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79603485_79603759:TMED3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 79606137 G/A 1 77 61 138 35.5834120026973 32.810543738123 2.7728682645743 A:G G A 10 0.537877766198737 0.669947735780898 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79606099_79606347:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79606099_79606347:TMED3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 378 340 718 174.682204376877 182.878440507571 -8.19623613069314 A:C A C 10 0.537877766198737 0.549393009830416 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 80415082 T/G 1 56 38 94 25.8788450928707 20.439355115552 5.43948997731873 T:G T G 10 0.537877766198737 0.300991199392719 ENSG00000086666:ENST00000261749:exon_80415042_80415142:ZFAND6;ENSG00000086666:ENST00000396790:exon_80415042_80415142:ZFAND6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 80452172 G/C 1 36 17 53 16.6364004168455 9.14392202537853 7.49247839146694 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0395799201539901 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80452098_80452219:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80452098_80452219:FAH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 80472561 C/T 1 105 110 215 48.5228345491326 59.1665542818611 -10.6437197327284 T:C C T 10 0.537877766198737 0.151193409208537 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80472466_80472567:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80472466_80472567:FAH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 81592473 C/G 1 50 50 100 23.1061116900632 26.8938883099368 -3.7877766198737 C:G C G 10 0.537877766198737 0.483134622314651 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 87 59 146 40.2046343407099 31.7347882057255 8.46984613498441 A:G A G 10 0.537877766198737 0.183998260472924 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 27 30 57 12.4773003126341 16.1363329859621 -3.65903267332801 A:G G A 10 0.537877766198737 0.354206993434648 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 86273754 C/A 1 19 23 42 8.780322442224 12.3711886225709 -3.59086618034695 A:C C A 10 0.537877766198737 0.281946305235054 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86273744_86273938:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86273744_86273938:AKAP13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 86278275 G/A 1 6 11 17 2.77273340280758 5.91665542818611 -3.14392202537853 A:G G A 10 0.537877766198737 0.147916659664906 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86278223_86278381:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86278223_86278381:AKAP13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 86284585 G/A 1 27 30 57 12.4773003126341 16.1363329859621 -3.65903267332801 A:G G A 10 0.537877766198737 0.354206993434648 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 89008072 T/G 1 108 110 218 49.9092012505364 59.1665542818611 -9.25735303132466 T:G T G 10 0.537877766198737 0.221591909081086 ENSG00000173867:ENST00000312475:exon_89007934_89008107:MRPL46;ENSG00000173867:ENST00000445432:exon_89007911_89008107:MRPL46 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 89008917 G/A 1 75 84 159 34.6591675350947 45.1817323606939 -10.5225648255992 A:G G A 10 0.537877766198737 0.095506361329886 ENSG00000173867:ENST00000312475:exon_89008818_89009004:MRPL46;ENSG00000173867:ENST00000445432:exon_89008818_89009004:MRPL46 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 89010976 C/T 1 61 74 135 28.189456261877 39.8029546987065 -11.6134984368295 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0472355406934173 ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89010684_89011013:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89010939_89011013:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000353598:exon_89010949_89011013:MRPS11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 89015930 T/C 1 147 209 356 67.9319683687857 112.416453135536 -44.4844847667503 T:C T C 10 0.537877766198737 2.61281009611805e-06 ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89015858_89015956:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89015858_89015956:MRPS11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 806 682 1488 372.470520443818 366.832636547539 5.63788389627945 A:G A G 10 0.537877766198737 0.774948845670499 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 89182693 C/T 1 977 811 1788 451.493422423834 436.218868387176 15.2745540366583 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.476804270876283 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 815 845 1660 376.629620548029 454.506712437933 -77.8770918899033 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.000134771198620025 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 201 179 380 92.8865689940539 96.2801201495739 -3.39355115552004 T:C T C 10 0.537877766198737 0.75761617188983 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:T T A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 90617539 C/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 90628591 G/A 1 222 91 313 102.59113590388 48.9468767240851 53.6442591797953 A:G G A 10 0.537877766198737 6.50124182246647e-10 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 90628594 C/T 1 216 81 297 99.8184025010728 43.5680990620977 56.2503034389751 T:C C T 10 0.537877766198737 2.80877091194705e-11 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 90774259 G/C 1 19 22 41 8.780322442224 11.8333108563722 -3.05298841414822 C:G G C 10 0.537877766198737 0.351601869199007 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 91010776 T/C 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C T C 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 91029318 A/G 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91029262_91029364:IQGAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 31 14 45 14.3257892478392 7.53028872678232 6.79550052105684 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0511179320722494 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 91337479 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91337397_91337587:BLM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 91430436 T/C 1 6 13 19 2.77273340280758 6.99241096058358 -4.219677557776 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0651269816126054 ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000497945:exon_91430417_91430605:FES HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 2 13 15 0.924244467602526 6.99241096058358 -6.06816649298105 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00277175810739690 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 91504819 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 91550232 G/A 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91550180_91550276:VPS33B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 93162649 A/G 1 5 17 22 2.31061116900632 9.14392202537853 -6.83331085637221 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00443978512860853 ENSG00000185442:ENST00000327355:exon_93160678_93162689:FAM174B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 93173503 C/T 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000185442:ENST00000327355:exon_93173444_93173575:FAM174B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:C A C 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 99926317 A/G 1 23 28 51 10.6288113774291 15.0605774535646 -4.43176607613558 A:G A G 10 0.537877766198737 0.261076500218689 ENSG00000168904:ENST00000301981:exon_99926235_99930934:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000331450:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000422500:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000447360:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000450058:exon_99926235_99926496:LRRC28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 101110303 T/C 1 6 12 18 2.77273340280758 6.45453319438484 -3.68179979157727 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0990055908664937 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 101112191 C/T 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 C C 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101112099_101112270:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101112099_101112270:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101112099_101112270:LINS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 A:G A G 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 101598200 G/A 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101598195_101598346:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525395:exon_101598195_101598346:LRRK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 101608975 C/T 1 6 14 20 2.77273340280758 7.53028872678232 -4.75755532397474 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0421804686420244 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101608876_101610315:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101608876_101610315:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101608876_101609053:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101608876_101609273:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101608876_101609273:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101608876_101610317:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101608876_101610308:LRRK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 101821912 T/C 1 288 303 591 133.091203334764 162.976963158217 -29.8857598234536 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.0148732442538845 ENSG00000131876:ENST00000254193:exon_101821715_101821987:SNRPA1;ENSG00000131876:ENST00000394082:exon_101821720_101821987:SNRPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 13 4 17 6.00758903941642 2.15151106479495 3.85607797462147 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0863979298704946 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 15 102264476 C/A 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:C C A 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 139784 G/C 1 34 37 71 15.7121559492429 19.9014773493533 -4.18932140011032 C:G G C 10 0.537877766198737 0.342162023845144 ENSG00000103148:ENST00000463178:exon_138697_141084:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_139711_139900:NPRL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 313335 C/A 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 A:C C A 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_313261_313401:ITFG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 314829 C/T 0 17 0 17 7.85607797462147 0 7.85607797462147 C C 10 0.537877766198737 2.84002904419782e-05 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_314810_316124:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_314810_314907:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_314810_316119:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_314810_314907:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_314810_316090:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_314810_315089:ITFG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 339494 C/T 1 22 24 46 10.1666891436278 12.9090663887697 -2.7423772451419 T:C C T 10 0.537877766198737 0.461071434223992 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_339440_339607:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_339440_343718:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_339440_339607:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000457798:exon_339440_339607:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_339440_339607:AXIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 343691 G/A 1 12 14 26 5.54546680561516 7.53028872678232 -1.98482192116716 A:G G A 10 0.537877766198737 0.440230707582908 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_343488_343718:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_339440_343718:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_343488_343718:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_343488_343718:AXIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 347184 A/G 1 9 19 28 4.15910010421137 10.219677557776 -6.06057745356464 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0233787858218337 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 420220 G/A 1 100 83 183 46.2122233801263 44.6438545944952 1.56836878563114 A:G G A 10 0.537877766198737 0.824488351824598 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 426146 C/T 1 25 17 42 11.5530558450316 9.14392202537853 2.40913381965305 T:C C T 10 0.537877766198737 0.536728232859706 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 426184 G/A 1 17 9 26 7.85607797462147 4.84089989578863 3.01517807883284 A:G G A 10 0.537877766198737 0.325501784463922 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 14 5 19 6.46971127321768 2.68938883099368 3.780322442224 T:C T C 10 0.537877766198737 0.106704602900475 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C T C 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 17 17 34 7.85607797462147 9.14392202537853 -1.28784405075706 A:G A G 10 0.537877766198737 0.731887630866931 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 632283 G/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_631761_632309:PIGQ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 633375 G/C 1 26 9 35 12.0151780788328 4.84089989578863 7.17427818304421 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0169000798490824 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 19 12 31 8.780322442224 6.45453319438484 2.32578924783915 C:G C G 10 0.537877766198737 0.473028702728117 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 720152 T/C 1 16 14 30 7.39395574082021 7.53028872678232 -0.136332985962109 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720123_720175:RHOT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 720321 C/G 1 11 17 28 5.08334457181389 9.14392202537853 -4.06057745356463 C:G C G 10 0.537877766198737 0.133096330653293 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720249_720357:RHOT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 732049 T/C 1 478 417 895 220.894427757004 224.295028504873 -3.40060074786956 T:C T C 10 0.537877766198737 0.840607434117824 ENSG00000103266:ENST00000219548:exon_732020_732076:STUB1;ENSG00000161999:ENST00000412368:exon_731667_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000454700:exon_731676_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000293882:exon_731676_732874:JMJD8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 778024 T/C 1 19 14 33 8.780322442224 7.53028872678232 1.25003371544168 T:C T C 10 0.537877766198737 0.728850756969449 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_777965_778029:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_777965_778029:HAGHL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 41 42 83 18.9470115858518 22.590866180347 -3.64385459449517 A:G A G 10 0.537877766198737 0.44231450961649 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 780517 T/C 1 30 26 56 13.8636670140379 13.9848219211672 -0.121154907129268 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 780545 C/T 1 30 29 59 13.8636670140379 15.5984552197634 -1.73478820572548 T:C C T 10 0.537877766198737 0.69614297682599 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 918997 G/A 1 11 8 19 5.08334457181389 4.3030221295899 0.780322442223998 A:G G A 10 0.537877766198737 0.82002331137955 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_918944_919056:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_918944_919056:LMF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 920869 C/T 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_920729_920882:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_920729_920882:LMF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 929711 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_929570_929737:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_929570_929737:LMF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 1547477 T/C 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 T:C T C 10 0.537877766198737 0.80945734873112 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1547362_1547509:TELO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 1551442 C/T 1 12 22 34 5.54546680561516 11.8333108563722 -6.28784405075706 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0380255243717969 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1551421_1551500:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1551421_1551500:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1551421_1551500:TELO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 1551750 C/T 1 23 12 35 10.6288113774291 6.45453319438484 4.17427818304421 T:C C T 10 0.537877766198737 0.177077556401069 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1551664_1551774:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1551664_1551774:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1551664_1551774:TELO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 58 47 105 26.8030895604733 25.2802550113406 1.52283454913262 T:C T C 10 0.537877766198737 0.844928150733657 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 C:G G C 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 75 87 162 34.6591675350947 46.7953656592901 -12.1361981241954 A:T T A 10 0.537877766198737 0.0587100666263624 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 1821107 A/C 1 71 71 142 32.8106785998897 38.1893214001103 -5.37864280022065 A:C A C 10 0.537877766198737 0.400144979214352 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1821071_1821172:NME3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 1838037 C/G 1 142 121 263 65.6213571997794 65.0832097100472 0.538147489732182 C:G C G 10 0.537877766198737 0.950798953704665 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2009578 G/A 1 118 103 221 54.530423588549 55.4014099184699 -0.870986329920868 A:G G A 10 0.537877766198737 0.946238465463283 ENSG00000140990:ENST00000268668:exon_2009519_2009755:NDUFB10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2011233 G/A 1 310 313 623 143.257892478392 168.355740820205 -25.0978483418131 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0445702021902618 ENSG00000140990:ENST00000268668:exon_2011154_2011292:NDUFB10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2012277 A/G 1 69 609 678 31.8864341322871 327.567559615031 -295.681125482744 A:T:C:G A G 10 0.537877766198737 1.14365871571452e-127 ENSG00000140988:ENST00000526586:exon_2012062_2012657:RPS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2012708 G/A 1 88 34 122 40.6667565745111 18.2878440507571 22.3789125237541 A:G G A 10 0.537877766198737 3.81628453829285e-05 ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2012498_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2012498_2012910:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2012375_2012910:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2012644_2012910:RPS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2014489 T/C 1 926 471 1397 427.92518849997 253.340427879605 174.584760620364 T:C T C 10 0.537877766198737 2.87256555297015e-21 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014450_2014582:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 975 566 1541 450.569177956231 304.438815668485 146.130362287746 A:T:C C T 10 0.537877766198737 6.016605009018e-14 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 18 25 43 8.31820020842273 13.4469441549684 -5.12874394654569 A:C A C 10 0.537877766198737 0.127512394036644 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2025354 G/A 1 17 26 43 7.85607797462147 13.9848219211672 -6.12874394654569 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0670061206791823 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2025393 G/A 1 35 19 54 16.1742781830442 10.219677557776 5.95460062526821 A:G G A 10 0.537877766198737 0.132574758538027 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2025602 A/G 1 51 19 70 23.5682339238644 10.219677557776 13.3485563660884 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00163008810726773 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2027704 G/A 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G G A 10 0.537877766198737 0.732785595108735 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 170 189 359 78.5607797462147 101.658897811561 -23.0981180653466 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0148930693736797 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 137 114 251 63.310746030773 61.318065346656 1.99268068411703 T:C T C 10 0.537877766198737 0.84943349252064 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2049842 T/C 1 15 26 41 6.93183350701895 13.9848219211672 -7.05298841414821 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0288086479769350 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2049891 C/G 1 28 19 47 12.9394225464354 10.219677557776 2.71974498865936 C:G C G 10 0.537877766198737 0.466730923878796 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2138508 G/C 1 110 102 212 50.8334457181389 54.8635321522712 -4.03008643413224 C:G G C 10 0.537877766198737 0.582395216598263 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2499297 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2499283_2499463:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2499283_2499463:CCNF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2499415 C/T 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2499283_2499463:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2499283_2499463:CCNF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2506801 T/G 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2506546_2508859:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2506546_2508855:CCNF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2512238 G/A 1 20 14 34 9.24244467602526 7.53028872678232 1.71215594924294 A:G G A 10 0.537877766198737 0.608714683105822 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2512150_2512240:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2512150_2512240:C16orf59 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2580912 T/C 1 14 12 26 6.46971127321768 6.45453319438484 0.0151780788328386 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2581080 G/A 1 12 16 28 5.54546680561516 8.60604425917979 -3.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.26098376921595 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2818170 A/G 1 139 157 296 64.2349904983756 84.4468092932017 -20.2118187948261 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0196487623121494 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2817857_2818262:SRRM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 634 586 1220 292.985496230001 315.19637099246 -22.2108747624591 A:T:G G T 10 0.537877766198737 0.206500374227452 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 26 7 33 12.0151780788328 3.76514436339116 8.25003371544168 T:G G T 10 0.537877766198737 0.00451625235344188 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 74 80 154 34.1970453012935 43.030221295899 -8.83317599460549 T:C C T 10 0.537877766198737 0.169408286863921 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 0 0 13 13 0 6.99241096058358 -6.99241096058358 T C T 10 0.537877766198737 4.38368391164729e-05 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 3708137 C/T 1 362 381 743 167.288248636057 204.931428921719 -37.6431802856615 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00577676340694154 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 3713468 G/A 1 340 253 593 157.121559492429 136.08307484828 21.038484644149 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0838188436194096 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3713425_3713563:TRAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 3724352 G/A 1 314 228 542 145.106381413597 122.636130693312 22.4702507202846 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0579372300087209 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 199 158 357 91.9623245264513 84.9846870594004 6.9776374670509 A:T:C:G G C 10 0.537877766198737 0.490242422334297 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 3778337 G/A 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 A:G G A 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 4415038 G/A 1 33 26 59 15.2500337154417 13.9848219211672 1.26521179427452 A:G G A 10 0.537877766198737 0.794760911649898 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4415004_4415061:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4415004_4415061:CORO7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 4438038 G/A 1 5 14 19 2.31061116900632 7.53028872678232 -5.219677557776 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0201938430142730 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4437987_4438069:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4437987_4438069:CORO7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 4748033 C/G 1 12 9 21 5.54546680561516 4.84089989578863 0.704566909826523 C:G C G 10 0.537877766198737 0.82918998973449 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747978_4748063:ANKS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 23 12 35 10.6288113774291 6.45453319438484 4.17427818304421 T:C C T 10 0.537877766198737 0.177077556401069 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 4751124 A/G 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 4802386 G/T 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 T:G G T 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4800815_4803059:ZNF500 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 4882064 A/G 1 21 14 35 9.70456690982652 7.53028872678232 2.17427818304421 A:G A G 10 0.537877766198737 0.501418703087631 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4881980_4882222:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4881980_4882222:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4881980_4882222:GLYR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 5075449 G/C 1 35 15 50 16.1742781830442 8.06816649298105 8.10611169006315 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0230263117510954 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 5075469 G/A 1 35 15 50 16.1742781830442 8.06816649298105 8.10611169006315 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0230263117510954 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 5075633 G/A 1 17 15 32 7.85607797462147 8.06816649298105 -0.212088518359583 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 5077379 C/G 1 8 17 25 3.6969778704101 9.14392202537853 -5.44694415496842 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0427155797751566 ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5077279_5077380:NAGPA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 5128001 C/T 1 44 19 63 20.3333782872556 10.219677557776 10.1137007294796 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0112123604340852 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 10868997 G/A 1 4 22 26 1.84848893520505 11.8333108563722 -9.98482192116716 A:G G A 10 0.537877766198737 8.76998438808303e-05 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11002904 G/A 1 15 13 28 6.93183350701895 6.99241096058358 -0.0605774535646342 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11002927 A/G 1 14 9 23 6.46971127321768 4.84089989578863 1.62881137742905 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.537125438968325 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11035888 C/A 1 20 12 32 9.24244467602526 6.45453319438484 2.78791148164042 A:C C A 10 0.537877766198737 0.377397020068676 ENSG00000182108:ENST00000331808:exon_11035426_11036317:DEXI;ENSG00000182108:ENST00000469379:exon_11035426_11035988:DEXI HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11114174 A/G 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 A:G A G 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000494853:exon_11114050_11114182:CLEC16A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11260440 A/G 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 A:G A G 10 0.537877766198737 0.782307425548562 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11444572 A/C 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:C A C 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000175643:ENST00000381820:exon_11444499_11445585:C16orf75;ENSG00000175643:ENST00000312499:exon_11444499_11445619:C16orf75 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 28 41 69 12.9394225464354 22.0529884141482 -9.11356586771285 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0298169350271531 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 7 13 20 3.23485563660884 6.99241096058358 -3.75755532397474 T:C C T 10 0.537877766198737 0.116261430676894 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 10 21 31 4.62122233801263 11.2954330901735 -6.67421075216085 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0187176047897125 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 172 130 302 79.4850242138172 69.9241096058358 9.56091460798143 C:G C G 10 0.537877766198737 0.273520736193425 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 88 69 157 40.6667565745111 37.1135658677129 3.5531907067983 C:G G C 10 0.537877766198737 0.576557302463301 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 12009781 G/A 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 A:G G A 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 12060163 A/G 1 238 295 533 109.985091644701 158.673941028627 -48.6888493839268 A:G A G 10 0.537877766198737 2.43360516840338e-05 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12060052_12060198:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12060052_12060198:TNFRSF17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 12371875 C/T 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 T:C C T 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12371790_12371893:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12371790_12371893:SNX29 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 12618598 A/G 1 4 10 14 1.84848893520505 5.37877766198737 -3.53028872678232 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0652981523722034 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12618559_12618698:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12618559_12618698:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000219090:exon_12618559_12618698:SNX29 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 15790607 C/T 1 47 40 87 21.7197449886594 21.5151106479495 0.204634340709887 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15790566_15790717:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15790566_15790717:NDE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 15793615 C/T 1 48 75 123 22.1818672224606 40.3408324649053 -18.1589652424446 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.00108786409847096 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 15818653 G/A 1 42 18 60 19.409133819653 9.68179979157727 9.72733402807578 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0133862468625875 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 19721873 G/A 1 83 85 168 38.3561454055048 45.7196101268926 -7.36346472138781 A:G G A 10 0.537877766198737 0.278731239585756 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19721831_19721908:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19721831_19721908:C16orf88 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 19726093 G/C 1 101 104 205 46.6743456139276 55.9392876846686 -9.26494207074107 C:G G C 10 0.537877766198737 0.207478602768097 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 20855309 A/G 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 A:G A G 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000005189:ENST00000261377:exon_20855256_20855348:AC004381.6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 20931480 G/A 1 17 5 22 7.85607797462147 2.68938883099368 5.16668914362779 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0316468528607518 ENSG00000102897:ENST00000439021:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000412082:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000219168:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000396052:exon_20931444_20931536:LYRM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 9 13 22 4.15910010421137 6.99241096058358 -2.83331085637221 C:G G C 10 0.537877766198737 0.285712862815016 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 21979966 G/A 1 89 72 161 41.1288788083124 38.7271991663091 2.40167964200335 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.752051117542863 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21979949_21980006:UQCRC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 23400253 A/G 1 51 71 122 23.5682339238644 38.1893214001103 -14.6210874762459 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.00839066932406685 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23399814_23400407:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23399816_23400407:COG7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 23403744 A/G 1 32 31 63 14.7879114816404 16.6742107521608 -1.88629927052043 A:G A G 10 0.537877766198737 0.705019698755851 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 23421636 G/A 1 9 12 21 4.15910010421137 6.45453319438484 -2.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.383260377366473 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23421616_23421681:COG7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 23489711 C/G 1 21 17 38 9.70456690982652 9.14392202537853 0.560644884447996 C:G C G 10 0.537877766198737 0.872546949127018 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 23536684 T/C 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23536565_23536700:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23536448_23536700:EARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 23540883 C/G 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 C:G C G 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23540823_23540953:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23540823_23540953:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000422821:exon_23540823_23540953:EARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 218 206 424 100.742646968675 110.80281983694 -10.0601728682645 C:G G C 10 0.537877766198737 0.330409691709051 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 23698923 G/A 1 120 112 232 55.4546680561516 60.2423098142585 -4.78764175810697 A:G G A 10 0.537877766198737 0.553660653283896 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23698790_23698945:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23698790_23698945:PLK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 24046861 T/C 1 21 17 38 9.70456690982652 9.14392202537853 0.560644884447996 T:C T C 10 0.537877766198737 0.872546949127018 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24046740_24046868:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24046740_24046868:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000486868:exon_24046740_24046868:PRKCB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 8 14 22 3.6969778704101 7.53028872678232 -3.83331085637221 T:C T C 10 0.537877766198737 0.133495761886537 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 284 264 548 131.242714399559 141.999730276467 -10.7570158769078 A:G A G 10 0.537877766198737 0.368394383894056 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 24942712 G/A 1 88 67 155 40.6667565745111 36.0378103353154 4.62894623919577 A:G G A 10 0.537877766198737 0.469505030191104 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 24946807 C/T 1 69 64 133 31.8864341322871 34.4241770367192 -2.53774290443202 T:C C T 10 0.537877766198737 0.664725948291926 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24946791_24946960:ARHGAP17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 27231905 G/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000155666:ENST00000380948:exon_27231887_27233089:JMJD5;ENSG00000155666:ENST00000286096:exon_27231887_27233089:JMJD5;ENSG00000155666:ENST00000441782:exon_27231887_27233089:JMJD5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 173 157 330 79.9471464476185 84.4468092932017 -4.49966284558319 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.619813436375453 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 27373972 T/C 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:C T C 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 27374180 T/C 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 27374432 A/T 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 27375159 T/C 1 14 18 32 6.46971127321768 9.68179979157727 -3.21208851835958 T:C T C 10 0.537877766198737 0.289400725386081 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 27455886 A/G 1 53 75 128 24.4924783914669 40.3408324649053 -15.8483540734383 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0058148643561158 ENSG00000103522:ENST00000337929:exon_27455863_27456040:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395755:exon_27455863_27456040:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395754:exon_27455863_27456040:IL21R HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 28502866 G/A 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 A:G G A 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28502803_28502881:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28502803_28502881:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28502803_28502881:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28502803_28502881:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28502803_28502881:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28502803_28502881:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28502803_28502881:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28502803_28502881:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357076:exon_28502803_28502881:CLN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 28506428 C/T 1 10 1 11 4.62122233801263 0.537877766198737 4.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0142271384391581 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 28846866 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:C:G G C 10 0.537877766198737 0.760887200836927 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 5 12 17 2.31061116900632 6.45453319438484 -4.14392202537853 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0521612914229826 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 28922249 C/T 1 35 21 56 16.1742781830442 11.2954330901735 4.87884509287073 T:C C T 10 0.537877766198737 0.22777379179429 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28922209_28922307:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28922209_28922307:RABEP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 28948783 C/T 1 324 298 622 149.727603751609 160.287574327224 -10.5599705756144 T:C C T 10 0.537877766198737 0.398692354183198 ENSG00000177455:ENST00000380673:exon_28948776_28948844:CD19;ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28948776_28948844:CD19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 29755576 A/G 1 15 28 43 6.93183350701895 15.0605774535646 -8.12874394654569 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0142100377826018 ENSG00000185905:ENST00000329410:exon_29753784_29756272:C16orf54 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30012758 A/C 1 52 46 98 24.0303561576657 24.7423772451419 -0.71202108747622 A:C A C 10 0.537877766198737 0.919476689276376 ENSG00000169592:ENST00000304516:exon_30012735_30012851:INO80E HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30198319 G/C 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 C:G G C 10 0.537877766198737 0.119462602034709 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30199584 G/A 1 18 11 29 8.31820020842273 5.91665542818611 2.40154478023663 A:G G A 10 0.537877766198737 0.457449401187867 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30390513 G/A 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:G G A 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30408765 C/T 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30516565 C/A 1 5 12 17 2.31061116900632 6.45453319438484 -4.14392202537853 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0521612914229826 ENSG00000005844:ENST00000356798:exon_30516565_30516621:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000454514:exon_30516565_30516621:ITGAL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 17 10 27 7.85607797462147 5.37877766198737 2.4773003126341 C:G C G 10 0.537877766198737 0.440811686990866 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30582888 C/A 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 A:C C A 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000229809:ENST00000223459:exon_30582755_30584055:ZNF688 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30666119 G/C 1 29 7 36 13.4015447802366 3.76514436339116 9.63640041684547 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00121033098498015 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30666367 C/T 1 75 41 116 34.6591675350947 22.0529884141482 12.6061791209465 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0198030720392054 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30666480 A/G 1 72 92 164 33.2728008336909 49.4847544902838 -16.2119536565929 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0120915256713380 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 30733600 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000080603:ENST00000262518:exon_30733443_30733607:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000395059:exon_30733443_30733607:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000344771:exon_30733443_30733607:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000437252:exon_30733443_30733607:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000380361:exon_30733443_30733607:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000483083:exon_30733443_30733607:SRCAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 31475730 C/T 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 T:C C T 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31475715_31476208:ARMC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 31477460 G/A 1 21 17 38 9.70456690982652 9.14392202537853 0.560644884447996 A:G G A 10 0.537877766198737 0.872546949127018 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 48385533 G/A 1 47 27 74 21.7197449886594 14.5226996873659 7.19704530129347 A:G G A 10 0.537877766198737 0.102876494909118 ENSG00000102910:ENST00000285737:exon_48385492_48389415:LONP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 48396190 C/T 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000196470:ENST00000356721:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000394725:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000380006:exon_48394442_48397793:SIAH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 50707782 C/T 1 14 8 22 6.46971127321768 4.3030221295899 2.16668914362779 T:C C T 10 0.537877766198737 0.398552823157135 ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50705536_50707985:SNX20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 76 52 128 35.121289768896 27.9696438423343 7.15164592656167 T:C C T 10 0.537877766198737 0.215407358004298 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 74920191 G/A 1 22 15 37 10.1666891436278 8.06816649298105 2.09852265064673 A:G G A 10 0.537877766198737 0.514401734567125 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74920168_74920294:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74920168_74920294:WDR59 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 75269267 A/G 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 75661803 G/C 1 663 609 1272 306.387041010237 327.567559615031 -21.1805186047934 A:T:C:G G C 10 0.537877766198737 0.237650090027415 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75661628_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75661628_75661891:KARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 75669628 T/G 1 199 159 358 91.9623245264513 85.5225648255992 6.43975970085216 T:G T G 10 0.537877766198737 0.52482113482996 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75669578_75669703:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75669578_75669703:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75669578_75669703:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75669578_75669703:KARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 81047748 G/A 1 48 55 103 22.1818672224606 29.5832771409305 -7.40140991846991 A:G G A 10 0.537877766198737 0.166268694853029 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81047741_81047786:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81047741_81047786:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81047741_81047786:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81047741_81047786:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81047741_81047786:CENPN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 4 18 22 1.84848893520505 9.68179979157727 -7.83331085637221 T:G T G 10 0.537877766198737 0.000908635878637377 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 81929527 C/G 1 32 47 79 14.7879114816404 25.2802550113406 -10.4923435297002 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0234118421598039 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 83933139 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83932730_83933277:MLYCD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 83933193 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83932730_83933277:MLYCD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 84522897 G/C 1 3 10 13 1.38636670140379 5.37877766198737 -3.99241096058358 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0471072143657378 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84522884_84523028:KIAA1609 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 84531562 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84531540_84531717:KIAA1609 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 85697113 C/G 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 C:G C G 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85696950_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85695897_85697220:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85696972_85697220:KIAA0182 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 85702029 A/C 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85701746_85702030:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85701746_85702030:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85701746_85702030:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85701746_85702030:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85701746_85702030:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85701746_85702030:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85701746_85702030:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85701746_85702030:KIAA0182 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 85722496 A/C 1 21 16 37 9.70456690982652 8.60604425917979 1.09852265064673 A:C A C 10 0.537877766198737 0.744644784635273 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85722415_85722605:GINS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 896 984 1880 414.061521485932 529.271721939557 -115.210200453626 A:G G A 10 0.537877766198737 1.13875290278484e-07 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 85945231 C/T 1 40 24 64 18.4848893520505 12.9090663887697 5.57582296328084 T:C C T 10 0.537877766198737 0.169970451272792 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85945176_85945264:IRF8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 86565874 C/A 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:C C A 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 87445270 T/C 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C T C 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000140948:ENST00000268616:exon_87445122_87446582:ZCCHC14;ENSG00000140948:ENST00000412336:exon_87445027_87446582:ZCCHC14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 87743072 C/T 1 113 85 198 52.2198124195427 45.7196101268926 6.50020229265009 T:C C T 10 0.537877766198737 0.39246061369918 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87742871_87743273:KLHDC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 20 17 37 9.24244467602526 9.14392202537853 0.0985226506467338 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88052161 C/A 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:C C A 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88061150 C/T 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88061089_88061256:BANP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 12 7 19 5.54546680561516 3.76514436339116 1.780322442224 T:C C T 10 0.537877766198737 0.494001923393957 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88105725 G/A 1 7 17 24 3.23485563660884 9.14392202537853 -5.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0224011279801509 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000466847:exon_88105675_88105818:BANP;ENSG00000172530:ENST00000481948:exon_88105675_88105818:BANP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88601231 G/A 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88599556_88601389:ZFPM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88871253 G/A 1 21 43 64 9.70456690982652 23.1287439465457 -13.4241770367192 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000968012869503709 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871170_88871306:CDT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88872464 C/A 1 52 51 103 24.0303561576657 27.4317660761356 -3.40140991846991 A:C C A 10 0.537877766198737 0.553484618801155 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872429_88872529:CDT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88873780 A/C 1 44 59 103 20.3333782872556 31.7347882057255 -11.4014099184699 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0292525771236039 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873689_88873890:CDT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88874545 G/T 1 79 70 149 36.5076564702998 37.6514436339116 -1.1437871636118 T:G G T 10 0.537877766198737 0.869725981471223 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88874655 C/T 1 71 34 105 32.8106785998897 18.2878440507571 14.5228345491326 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00443789820588583 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88874692 G/C 1 85 92 177 39.2803898731074 49.4847544902838 -10.2043646171764 C:G G C 10 0.537877766198737 0.131774174422582 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88876103 T/C 1 530 544 1074 244.924783914669 292.605504812113 -47.6807208974435 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00363689693421389 ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88884521 G/A 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000141012:ENST00000268695:exon_88884415_88884532:GALNS;ENSG00000141012:ENST00000439266:exon_88884415_88884532:GALNS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 88958850 T/C 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000129993:ENST00000327483:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268679:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268683:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000448839:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000436887:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000360302:exon_88958652_88958893:CBFA2T3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89167476 T/C 1 9 13 22 4.15910010421137 6.99241096058358 -2.83331085637221 T:C T C 10 0.537877766198737 0.285712862815016 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 58 22 80 26.8030895604733 11.8333108563722 14.969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00070856075037087 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89294044 A/G 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 215 156 371 99.3562802672716 83.908931527003 15.4473487402686 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.118170853698661 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89598917 C/T 1 20 11 31 9.24244467602526 5.91665542818611 3.32578924783915 T:C C T 10 0.537877766198737 0.280833286523908 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89598871_89599044:SPG7;ENSG00000197912:ENST00000341316:exon_89598871_89599044:SPG7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89603356 G/T 1 10 2 12 4.62122233801263 1.07575553239747 3.54546680561516 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0451025910853133 ENSG00000197912:ENST00000341316:exon_89603173_89604129:SPG7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89627460 T/G 1 4156 2260 6416 1920.58000367805 1215.60375160915 704.976252068904 T:G T G 10 0.537877766198737 5.37879934469235e-71 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627119_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89789898 T/C 1 7 11 18 3.23485563660884 5.91665542818611 -2.68179979157727 T:C T C 10 0.537877766198737 0.241050465666398 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89805977 G/A 1 20 12 32 9.24244467602526 6.45453319438484 2.78791148164042 A:G G A 10 0.537877766198737 0.377397020068676 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89866043 T/C 1 11 10 21 5.08334457181389 5.37877766198737 -0.295433090173476 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89866013_89866046:FANCA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89940232 A/C 1 157 102 259 72.5531907067983 54.8635321522712 17.6896585545271 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0290853459176103 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89939970_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000310554:exon_89940019_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89940019_89940267:TCF25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 89967217 T/C 1 9 8 17 4.15910010421137 4.3030221295899 -0.143922025378528 T:C T C 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 16 90075206 G/A 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 263589 C/T 1 1 9 10 0.462122233801263 4.84089989578863 -4.37877766198737 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0076411641167297 ENSG00000187624:ENST00000360127:exon_262939_264367:C17orf97 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 648193 G/A 1 143 106 249 66.0834794335806 57.0150432170661 9.06843621651451 A:G G A 10 0.537877766198737 0.253360737440079 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 29 23 52 13.4015447802366 12.3711886225709 1.03035615766568 T:C C T 10 0.537877766198737 0.889564874949669 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 58 80 138 26.8030895604733 43.030221295899 -16.2271317354257 A:C C A 10 0.537877766198737 0.00617398751587378 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 1377943 A/G 1 9 11 20 4.15910010421137 5.91665542818611 -1.75755532397474 A:G A G 10 0.537877766198737 0.504000237806629 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 1538302 C/A 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 A:C C A 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 1637449 T/C 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 1684605 G/T 1 9 9 18 4.15910010421137 4.84089989578863 -0.681799791577266 T:G G T 10 0.537877766198737 0.815520419865837 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 28 38 66 12.9394225464354 20.439355115552 -7.49993256911664 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0831496626514557 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:G T G 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 2203221 T/C 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 13 11 24 6.00758903941642 5.91665542818611 0.0909336112303132 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 2224588 A/G 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 A:G A G 10 0.537877766198737 0.782307425548562 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 128 110 238 59.1516459265617 59.1665542818611 -0.0149083552993972 A:T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 A:G A G 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 3627521 C/T 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 3631241 A/G 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 A:G A G 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000083457:ENST00000263087:exon_3631213_3631320:ITGAE;ENSG00000083457:ENST00000397107:exon_3631213_3631320:ITGAE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 20 24 44 9.24244467602526 12.9090663887697 -3.66662171274443 T:C T C 10 0.537877766198737 0.291894073384424 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 3833708 G/T 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:G G T 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3833595_3833728:ATP2A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 19 13 32 8.780322442224 6.99241096058358 1.78791148164042 A:G A G 10 0.537877766198737 0.596919535098297 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 3916823 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3916743_3916908:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3916743_3916908:ZZEF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 4575740 A/G 1 77 85 162 35.5834120026973 45.7196101268926 -10.1361981241954 A:G A G 10 0.537877766198737 0.115347602064679 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4575409_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 4575910 G/A 1 78 77 155 36.0455342364985 41.4165879973027 -5.37105376080423 A:G G A 10 0.537877766198737 0.420654243382913 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4575409_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 4576620 C/T 1 75 75 150 34.6591675350947 40.3408324649053 -5.68166492981054 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.368316236480229 ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4576545_4576751:PELP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 4594228 C/T 1 6 11 17 2.77273340280758 5.91665542818611 -3.14392202537853 T:C C T 10 0.537877766198737 0.147916659664906 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4594183_4594288:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4594183_4594288:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4594183_4594288:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4594183_4594288:PELP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 102 72 174 47.1364678477288 38.7271991663091 8.40926868141977 A:G G A 10 0.537877766198737 0.223765959333248 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 32 31 63 14.7879114816404 16.6742107521608 -1.88629927052043 A:G A G 10 0.537877766198737 0.705019698755851 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 5241493 C/G 1 14 34 48 6.46971127321768 18.2878440507571 -11.8181327775394 C:G C G 10 0.537877766198737 0.00072416812236622 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 T:C T C 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 13 10 23 6.00758903941642 5.37877766198737 0.62881137742905 A:G A G 10 0.537877766198737 0.837246490944224 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 11 8 19 5.08334457181389 4.3030221295899 0.780322442223998 T:C T C 10 0.537877766198737 0.82002331137955 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 261 214 475 120.61390302213 115.10584196653 5.50806105559995 T:C T C 10 0.537877766198737 0.645451362670968 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 90 69 159 41.5910010421137 37.1135658677129 4.47743517440082 A:T T A 10 0.537877766198737 0.524742795582305 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 6544354 C/G 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6544078_6544547:TXNDC17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 6544465 G/A 1 161 192 353 74.4016796420033 103.272531110158 -28.8708514681542 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.00230514383516742 ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6544078_6544547:TXNDC17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 6663914 G/A 1 14 7 21 6.46971127321768 3.76514436339116 2.70456690982652 A:G G A 10 0.537877766198737 0.278190405615872 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 7210352 G/C 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 C:G G C 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000132507:ENST00000336452:exon_7210318_7210434:EIF5A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 7216402 G/A 1 178 213 391 82.2577576166248 114.567964200331 -32.3102065837061 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00114889251841550 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216348_7216443:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216348_7216443:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216348_7216443:GPS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 17494909 A/G 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G A G 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17494845_17495014:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17494845_17495022:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17494845_17495022:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17494845_17494964:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17494845_17495014:PEMT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 17719989 C/T 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17719839_17720032:SREBF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 17720391 A/G 1 10 10 20 4.62122233801263 5.37877766198737 -0.757555323974739 A:G A G 10 0.537877766198737 0.823990074103612 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17720272_17720450:SREBF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 18088094 C/T 1 18 5 23 8.31820020842273 2.68938883099368 5.62881137742905 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0206709904709336 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 228 201 429 105.363869306688 108.113431005946 -2.74956169925815 A:G G A 10 0.537877766198737 0.808777762126611 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 18148944 C/G 1 136 172 308 62.8486237969718 92.5149757861828 -29.666351989211 C:G C G 10 0.537877766198737 0.000733225665698547 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 18152653 G/A 1 15 10 25 6.93183350701895 5.37877766198737 1.55305584503158 A:G G A 10 0.537877766198737 0.555492392718307 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18152640_18152722:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18152640_18152722:FLII;ENSG00000177731:ENST00000496727:exon_18152640_18152722:FLII HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 18155793 T/A 1 10 17 27 4.62122233801263 9.14392202537853 -4.5226996873659 A:T T A 10 0.537877766198737 0.0857071363554688 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000488221:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000488932:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000461110:exon_18155786_18155870:FLII HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 32 20 52 14.7879114816404 10.7575553239747 4.03035615766568 A:G A G 10 0.537877766198737 0.270160662420085 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 19261216 G/A 1 17 10 27 7.85607797462147 5.37877766198737 2.4773003126341 A:G G A 10 0.537877766198737 0.440811686990866 ENSG00000108641:ENST00000461069:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000428319:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000261499:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000477478:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000395615:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000395616:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000447606:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000268841:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000440841:exon_19261153_19261264:B9D1;ENSG00000108641:ENST00000477683:exon_19261153_19261264:B9D1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21101780 G/A 1 29 38 67 13.4015447802366 20.439355115552 -7.03781033531538 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0875358301923557 ENSG00000178307:ENST00000317635:exon_21101263_21102153:TMEM11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 32 0 32 14.7879114816404 0 14.7879114816404 T T 10 0.537877766198737 3.12503002051732e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 37 0 37 17.0985226506467 0 17.0985226506467 G G 10 0.537877766198737 1.25847901735876e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 36 0 36 16.6364004168455 0 16.6364004168455 C C 10 0.537877766198737 2.38275233592584e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 44 0 44 20.3333782872556 0 20.3333782872556 C C 10 0.537877766198737 1.50549152956210e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 62 0 62 28.6515784956783 0 28.6515784956783 C C 10 0.537877766198737 2.43845445957469e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 68 0 68 31.4243118984859 0 31.4243118984859 C C 10 0.537877766198737 5.36413456960313e-19 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 56 2 58 25.8788450928707 1.07575553239747 24.8030895604733 T:C C T 10 0.537877766198737 3.34483238267102e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 58 0 58 26.8030895604733 0 26.8030895604733 C C 10 0.537877766198737 3.22695509742218e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 60 0 60 27.7273340280758 0 27.7273340280758 G G 10 0.537877766198737 8.83069807904537e-17 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 88 0 88 40.6667565745111 0 40.6667565745111 G G 10 0.537877766198737 2.55807537796951e-24 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 65 58 123 30.0379451970821 31.1969104395267 -1.15896524244464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.856786692397277 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 19 44 63 8.780322442224 23.6666217127444 -14.8862992705204 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.000197974691035393 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 26206492 G/A 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 A:G G A 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000232859:ENST00000460380:exon_26205386_26207392:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000379103:exon_26205396_26206516:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000508862:exon_26206077_26206516:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000379102:exon_26206320_26206516:C17orf108 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 26874393 C/T 1 49 85 134 22.6439894562619 45.7196101268926 -23.0756206706308 T:C C T 10 0.537877766198737 8.3433973544781e-05 ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26873725_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000484980:exon_26873726_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26873726_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000470125:exon_26873729_26874867:UNC119 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 26879511 C/A 1 28 24 52 12.9394225464354 12.9090663887697 0.0303561576656772 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26879356_26879659:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26879356_26879578:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000444148:exon_26879356_26879627:UNC119 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 27207832 C/T 1 59 39 98 27.2652117942745 20.9772328817507 6.28797891252378 T:C C T 10 0.537877766198737 0.224422349553164 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27207731_27207880:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27207731_27207880:FLOT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 28511782 C/T 1 190 168 358 87.80322442224 90.3634647213878 -2.56024029914784 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.791223101767844 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 281 258 539 129.856347698155 138.772463679274 -8.91611598111922 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.462769163905257 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 29097001 G/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 C:G G C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 29111204 T/C 1 15 9 24 6.93183350701895 4.84089989578863 2.09093361123031 T:C T C 10 0.537877766198737 0.420864629088441 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 30213044 C/T 1 21 17 38 9.70456690982652 9.14392202537853 0.560644884447996 T:C C T 10 0.537877766198737 0.872546949127018 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30212999_30213080:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30212999_30213080:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30212999_30213080:UTP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 30226738 T/C 1 3 14 17 1.38636670140379 7.53028872678232 -6.14392202537853 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00296557260302104 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30226665_30226749:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30226665_30226749:UTP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 30228656 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 33288882 T/G 1 20 21 41 9.24244467602526 11.2954330901735 -2.05298841414822 T:G T G 10 0.537877766198737 0.534899936393599 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 33591403 A/G 1 13 10 23 6.00758903941642 5.37877766198737 0.62881137742905 A:G A G 10 0.537877766198737 0.837246490944224 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33591202_33591922:SLFN5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 33592591 C/T 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 34417380 C/A 1 336 278 614 155.273070557224 149.530019003249 5.7430515539755 A:C:G C A 10 0.537877766198737 0.656296970860612 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34417332_34417487:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34417332_34417506:CCL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 34849843 G/T 1 57 49 106 26.340967326672 26.3560105437381 -0.0150432170661183 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34849770_34849850:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34849770_34849850:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000434102:exon_34849770_34849850:ZNHIT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 34854913 A/T 1 8 15 23 3.6969778704101 8.06816649298105 -4.37118862257095 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0926012068362168 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 47 81 128 21.7197449886594 43.5680990620977 -21.8483540734383 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0001224729189678 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 272 216 488 125.697247593944 116.181597498927 9.51565009501637 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.413856378673017 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 36916813 C/T 1 1146 1103 2249 529.592079936248 593.279176117207 -63.6870961809593 A:T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.00723110346851565 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36916684_36916861:PSMB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 36963226 G/T 1 58 60 118 26.8030895604733 32.2726659719242 -5.46957641145096 T:G G T 10 0.537877766198737 0.355933831293954 ENSG00000108296:ENST00000225428:exon_36963018_36963229:CWC25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 37071324 G/A 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37071296_37071388:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37071296_37071399:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37071296_37071394:LASP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 37074869 C/T 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 T:C C T 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 37819092 C/T 1 65 60 125 30.0379451970821 32.2726659719242 -2.23472077484212 T:C C T 10 0.537877766198737 0.720121995100051 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37819057_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37819057_37819687:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37819057_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37818504_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37819057_37819722:STARD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 37822311 A/C 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000173991:ENST00000309889:exon_37821969_37822808:TCAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38031536 G/A 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000186075:ENST00000348931:exon_38031507_38031687:ZPBP2;ENSG00000186075:ENST00000377940:exon_38031507_38031687:ZPBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38142899 T/C 1 49 55 104 22.6439894562619 29.5832771409305 -6.93928768466865 T:C T C 10 0.537877766198737 0.200878071070128 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38142828_38142965:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38142828_38142965:PSMD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 59 66 125 27.2652117942745 35.4999325691166 -8.23472077484212 A:G G A 10 0.537877766198737 0.151354396905234 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38545824 C/A 1 108 126 234 49.9092012505364 67.7725985410408 -17.8633972905044 A:C:G C A 10 0.537877766198737 0.0215835484917409 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38544768_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38544795_38545899:TOP2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38547868 C/T 1 165 127 292 76.2501685772084 68.3104763072396 7.9396922699688 T:C C T 10 0.537877766198737 0.378729466555322 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38547758_38547892:TOP2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38548586 T/G 1 269 219 488 124.31088089254 117.795230797523 6.51565009501637 A:T:G T G 10 0.537877766198737 0.585949046318283 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38548466_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38548470_38548593:TOP2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 34 20 54 15.7121559492429 10.7575553239747 4.9546006252682 T:C T C 10 0.537877766198737 0.219046460710421 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 56 25 81 25.8788450928707 13.4469441549684 12.4319009379023 A:T:C T A 10 0.537877766198737 0.00710342004978934 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 38991237 C/T 1 25 33 58 11.5530558450316 17.7499662845583 -6.19691043952674 T:C C T 10 0.537877766198737 0.114371433805023 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40125648 G/A 1 63 39 102 29.1137007294796 20.9772328817507 8.13646784772883 A:G G A 10 0.537877766198737 0.112619552900776 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40142302 T/C 1 83 87 170 38.3561454055048 46.7953656592901 -8.43922025378528 T:C T C 10 0.537877766198737 0.218330566536278 ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000426588:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40142282_40142400:DNAJC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 23 13 36 10.6288113774291 6.99241096058358 3.63640041684547 T:C C T 10 0.537877766198737 0.245477894791285 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 14 10 24 6.46971127321768 5.37877766198737 1.09093361123031 T:C T C 10 0.537877766198737 0.687960904025668 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40344643 T/G 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 T:G T G 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40353783 A/G 1 12 6 18 5.54546680561516 3.22726659719242 2.31820020842273 A:G A G 10 0.537877766198737 0.347077314597466 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40351186_40353882:STAT5B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40458441 C/T 1 29 28 57 13.4015447802366 15.0605774535646 -1.65903267332801 T:C C T 10 0.537877766198737 0.691570116495075 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40458259_40458465:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40458259_40458465:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40458132_40458465:STAT5A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40815452 C/T 1 7 12 19 3.23485563660884 6.45453319438484 -3.219677557776 T:C C T 10 0.537877766198737 0.168962527098265 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40815395_40815521:TUBG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40818268 C/A 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 A:C C A 10 0.537877766198737 0.528961805209039 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 71 14 85 32.8106785998897 7.53028872678232 25.2803898731074 A:G G A 10 0.537877766198737 1.06642923170714e-08 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 41197659 G/C 1 13 9 22 6.00758903941642 4.84089989578863 1.16668914362779 C:G G C 10 0.537877766198737 0.673692463929978 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41196312_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41196822_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41197646_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41197646_41197819:BRCA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 17 10 27 7.85607797462147 5.37877766198737 2.4773003126341 T:C T C 10 0.537877766198737 0.440811686990866 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 41245381 T/C 1 14 9 23 6.46971127321768 4.84089989578863 1.62881137742905 T:C T C 10 0.537877766198737 0.537125438968325 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 12 16 28 5.54546680561516 8.60604425917979 -3.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.26098376921595 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 C:G C G 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 110 136 246 50.8334457181389 73.1513762030282 -22.3179304848893 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00482120786634416 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 42426574 G/A 1 153 75 228 70.7047017715932 40.3408324649053 30.363869306688 A:G G A 10 0.537877766198737 4.75934609075747e-05 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42426526_42426670:GRN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 42426587 C/T 1 77 169 246 35.5834120026973 90.9013424875865 -55.3179304848893 T:C C T 10 0.537877766198737 1.38000189113394e-12 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42426526_42426670:GRN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 42476878 G/A 1 23 23 46 10.6288113774291 12.3711886225709 -1.7423772451419 A:G G A 10 0.537877766198737 0.658482350366384 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 42476922 T/C 1 19 22 41 8.780322442224 11.8333108563722 -3.05298841414822 T:C T C 10 0.537877766198737 0.351601869199007 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 42477807 G/A 1 25 22 47 11.5530558450316 11.8333108563722 -0.280255011340637 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 49 66 115 22.6439894562619 35.4999325691166 -12.8559431128547 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0190547638794482 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 14 21 35 6.46971127321768 11.2954330901735 -4.82572181695579 A:G G A 10 0.537877766198737 0.126471062134439 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 59 73 132 27.2652117942745 39.2650769325078 -11.9998651382333 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0442640345264483 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 11 16 27 5.08334457181389 8.60604425917979 -3.5226996873659 T:C T C 10 0.537877766198737 0.182472148809709 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 46103760 A/G 1 9 8 17 4.15910010421137 4.3030221295899 -0.143922025378528 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000005243:ENST00000006101:exon_46103535_46103841:COPZ2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 24 44 68 11.0909336112303 23.6666217127444 -12.5756881015141 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00320661342469749 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 52 51 103 24.0303561576657 27.4317660761356 -3.40140991846991 T:C C T 10 0.537877766198737 0.553484618801155 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 68 74 142 31.4243118984859 39.8029546987065 -8.37864280022065 C:G C G 10 0.537877766198737 0.177978054542223 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 47007801 C/G 1 182 198 380 84.1062465518299 106.49979770735 -22.39355115552 C:G C G 10 0.537877766198737 0.023480757484126 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 98 106 204 45.2879789125238 57.0150432170661 -11.7270643045423 T:C C T 10 0.537877766198737 0.106332185803907 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48174908 C/T 1 9 11 20 4.15910010421137 5.91665542818611 -1.75755532397474 T:C C T 10 0.537877766198737 0.504000237806629 ENSG00000005882:ENST00000007708:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508030:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503176:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503614:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000442211:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508960:exon_48174787_48175160:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505897:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505440:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000512238:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000515040:exon_48174877_48174928:PDK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48216944 C/T 1 98 89 187 45.2879789125238 47.8711211916876 -2.58314227916381 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.714378294866646 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48221079 G/A 1 30 33 63 13.8636670140379 17.7499662845583 -3.88629927052043 A:G G A 10 0.537877766198737 0.37669397303739 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48433306 C/T 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 T:C C T 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433142_48433358:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433142_48433358:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433142_48433358:XYLT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48447918 T/C 1 92 92 184 42.5152455097162 49.4847544902838 -6.9695089805676 T:C T C 10 0.537877766198737 0.336497016095528 ENSG00000108826:ENST00000507088:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000508200:exon_48447816_48447934:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000511860:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48447596_48447947:MRPL27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48450536 T/G 1 25 20 45 11.5530558450316 10.7575553239747 0.795500521056837 T:G T G 10 0.537877766198737 0.88167877845652 ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48452756 T/C 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 T:C T C 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511711:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511519:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48452546_48452873:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48452546_48453344:EME1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48456251 C/T 1 11 10 21 5.08334457181389 5.37877766198737 -0.295433090173476 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000514211:exon_48456244_48456585:EME1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48470190 T/C 1 31 29 60 14.3257892478392 15.5984552197634 -1.27266597192422 T:C T C 10 0.537877766198737 0.796176937230307 ENSG00000108829:ENST00000225972:exon_48470100_48470258:LRRC59 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48538090 G/A 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538038_48538233:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504945:exon_48538038_48538409:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503408:exon_48538038_48538233:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538038_48538233:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538038_48538233:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538038_48538233:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48538038_48538233:ACSF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48559742 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000515221:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000504284:exon_48559452_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48559458_48559817:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000509398:exon_48559725_48560067:RSAD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48625928 C/G 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 C:G C G 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505085:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000502911:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505456:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508598:exon_48625915_48625942:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515526:exon_48625644_48626064:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511845:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505336:exon_48625915_48626175:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512416:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48625915_48625979:SPATA20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48628092 A/G 1 10 17 27 4.62122233801263 9.14392202537853 -4.5226996873659 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0857071363554688 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 11 11 22 5.08334457181389 5.91665542818611 -0.833310856372213 A:T T A 10 0.537877766198737 0.831562670929007 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 12 9 21 5.54546680561516 4.84089989578863 0.704566909826523 T:C T C 10 0.537877766198737 0.82918998973449 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 49043640 T/C 1 18 13 31 8.31820020842273 6.99241096058358 1.32578924783915 T:C T C 10 0.537877766198737 0.720072184144253 ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49042436_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49042988_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49043005_49043748:SPAG9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 53851228 C/T 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 54969229 C/T 1 10 12 22 4.62122233801263 6.45453319438484 -1.83331085637221 T:C C T 10 0.537877766198737 0.522885386896646 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54965270_54969590:TRIM25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 55191876 C/T 1 21 12 33 9.70456690982652 6.45453319438484 3.25003371544168 T:C C T 10 0.537877766198737 0.296985391299108 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55191820_55191997:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55191820_55191997:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55191820_55191997:AKAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 56769981 C/A 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 58120967 G/A 1 35 38 73 16.1742781830442 20.439355115552 -4.2650769325078 A:G G A 10 0.537877766198737 0.348349103242496 ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58120562_58121495:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58120562_58121495:HEATR6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 58125708 C/T 1 5 12 17 2.31061116900632 6.45453319438484 -4.14392202537853 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0521612914229826 ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58125625_58125749:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58125625_58125749:HEATR6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 504 517 1021 232.909605835837 278.082805124747 -45.1731992889104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00472033450851271 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 206 144 350 95.1971801630602 77.4543983326181 17.7427818304421 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0605611929939854 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 62007552 G/A 1 203 164 367 93.8108134616564 88.2119536565929 5.59885980506354 A:G G A 10 0.537877766198737 0.565176537108289 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 62084040 G/A 1 79 58 137 36.5076564702998 31.1969104395267 5.31074603077304 A:G G A 10 0.537877766198737 0.391946369915453 ENSG00000108622:ENST00000412356:exon_62083991_62084095:ICAM2;ENSG00000108622:ENST00000418105:exon_62083991_62084095:ICAM2;ENSG00000108622:ENST00000425257:exon_62083991_62084095:ICAM2;ENSG00000108622:ENST00000225760:exon_62083991_62084095:ICAM2;ENSG00000108622:ENST00000449662:exon_62083991_62084283:ICAM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 62476429 G/A 1 11 12 23 5.08334457181389 6.45453319438484 -1.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 0.676956493327354 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 65908769 C/T 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 T:C C T 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 67513003 C/A 1 16 8 24 7.39395574082021 4.3030221295899 3.09093361123031 A:C C A 10 0.537877766198737 0.225647485929066 ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67512996_67513044:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67512996_67513044:MAP2K6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 71197688 C/T 1 16 17 33 7.39395574082021 9.14392202537853 -1.74996628455832 T:C C T 10 0.537877766198737 0.602153542032476 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 C:G G C 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 71241322 G/A 1 3 16 19 1.38636670140379 8.60604425917979 -7.219677557776 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000893455546379514 ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71241307_71241483:C17orf80 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 72462879 C/G 1 18 14 32 8.31820020842273 7.53028872678232 0.787911481640417 C:G C G 10 0.537877766198737 0.860177309642916 ENSG00000167851:ENST00000361933:exon_72462522_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000360141:exon_72462555_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000392625:exon_72462797_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000310828:exon_72462814_72462882:CD300A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 72745252 G/A 1 36 32 68 16.6364004168455 17.2120885183596 -0.575688101514114 A:G G A 10 0.537877766198737 0.903737979842142 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72744763_72745426:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72745190_72745426:SLC9A3R1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 72769739 A/G 1 16 9 25 7.39395574082021 4.84089989578863 2.55305584503158 A:G A G 10 0.537877766198737 0.324549732879746 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72769715_72769827:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72769715_72769824:NAT9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73016489 C/T 1 115 81 196 53.1440568871453 43.5680990620977 9.57595782504756 T:C C T 10 0.537877766198737 0.174185739172940 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016408_73016490:ICT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 94 119 213 43.4394899773187 64.0074541776497 -20.567964200331 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00482351101603836 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73124798 A/C 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:C A C 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 4 11 15 1.84848893520505 5.91665542818611 -4.06816649298105 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0400137374002459 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73230856 C/T 1 92 71 163 42.5152455097162 38.1893214001103 4.32592410960588 T:C C T 10 0.537877766198737 0.530073877827508 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73261851 G/T 1 169 148 317 78.0986575124135 79.6059093974131 -1.50725188499962 T:G G T 10 0.537877766198737 0.86601803877355 ENSG00000125445:ENST00000245539:exon_73261783_73262456:MRPS7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73269530 A/G 1 120 121 241 55.4546680561516 65.0832097100472 -9.6285416538956 A:G A G 10 0.537877766198737 0.220056509748250 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73760144 C/T 1 15 17 32 6.93183350701895 9.14392202537853 -2.21208851835958 T:C C T 10 0.537877766198737 0.480607594927203 ENSG00000108479:ENST00000225614:exon_73759978_73760167:GALK1;ENSG00000108479:ENST00000437911:exon_73759978_73760167:GALK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73823982 G/A 1 53 55 108 24.4924783914669 29.5832771409305 -5.09079874946359 A:G G A 10 0.537877766198737 0.335869265048647 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73830744 G/A 1 23 17 40 10.6288113774291 9.14392202537853 1.48488935205052 A:G G A 10 0.537877766198737 0.751627972797071 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73830699_73830797:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73830699_73830797:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73830699_73830797:UNC13D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 73831594 G/A 1 9 17 26 4.15910010421137 9.14392202537853 -4.98482192116716 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0746328411676265 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73831490_73831610:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73831490_73831610:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73831490_73831610:UNC13D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74039945 T/C 1 61 65 126 28.189456261877 34.9620548029179 -6.77259854104086 T:C T C 10 0.537877766198737 0.245656748454388 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74039910_74040039:SRP68 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74060168 T/C 1 23 23 46 10.6288113774291 12.3711886225709 -1.7423772451419 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.658482350366384 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74060057_74060252:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74060057_74060252:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74060057_74060252:SRP68 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74081829 C/T 1 20 9 29 9.24244467602526 4.84089989578863 4.40154478023663 T:C C T 10 0.537877766198737 0.135195478390590 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467929:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467586:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000411744:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000494787:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000460476:exon_74081758_74081878:EXOC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74082174 T/C 1 5 16 21 2.31061116900632 8.60604425917979 -6.29543309017348 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00743298250531806 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467929:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467586:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000411744:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000494787:exon_74082161_74082226:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000460476:exon_74082161_74082226:EXOC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74266322 T/C 1 282 342 624 130.318469931956 183.954196039968 -53.6357261080119 T:C T C 10 0.537877766198737 1.99488834704340e-05 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74270258 C/A 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000129646:ENST00000262765:exon_74270130_74270324:QRICH2;ENSG00000129646:ENST00000447564:exon_74270132_74270324:QRICH2;ENSG00000129646:ENST00000301613:exon_74270132_74270324:QRICH2;ENSG00000129646:ENST00000524722:exon_74270212_74270324:QRICH2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 11 12 23 5.08334457181389 6.45453319438484 -1.37118862257095 T:C T C 10 0.537877766198737 0.676956493327354 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74467664 C/G 1 38 38 76 17.560644884448 20.439355115552 -2.87871023110401 C:G C G 10 0.537877766198737 0.565522423537183 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74466976_74468134:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74466979_74468921:RHBDF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 74477473 T/G 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74477457_74477791:RHBDF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 A:G G A 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76115353 T/C 1 11 10 21 5.08334457181389 5.37877766198737 -0.295433090173476 T:C T C 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76178748 T/C 1 121 100 221 55.9167902899528 53.7877766198737 2.12901367007913 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.787664496229696 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 1 55 68 123 25.4167228590695 36.5756881015141 -11.1589652424446 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0466602882655291 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76419968 G/C 1 7 15 22 3.23485563660884 8.06816649298105 -4.83331085637221 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0524426011647104 ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76419778_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76419778_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76419783_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000374939:exon_76419783_76420234:DNAH17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76799550 G/A 1 82 68 150 37.8940231717036 36.5756881015141 1.31833507018946 A:G G A 10 0.537877766198737 0.870063769306204 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76799467_76799714:USP36 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76799808 C/T 1 31 44 75 14.3257892478392 23.6666217127444 -9.34083246490527 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0365592849787544 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 26 29 55 12.0151780788328 15.5984552197634 -3.58327714093053 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.346581895649197 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 23 30 53 10.6288113774291 16.1363329859621 -5.50752160853306 A:G A G 10 0.537877766198737 0.132309473555798 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 11 17 28 5.08334457181389 9.14392202537853 -4.06057745356463 A:G G A 10 0.537877766198737 0.133096330653293 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 1 14 15 0.462122233801263 7.53028872678232 -7.06816649298105 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000264060817219911 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 78091513 G/A 1 2 12 14 0.924244467602526 6.45453319438484 -5.53028872678232 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00505809924159925 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 78092585 C/T 1 9 11 20 4.15910010421137 5.91665542818611 -1.75755532397474 T:C C T 10 0.537877766198737 0.504000237806629 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78092452_78092604:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78092452_78092604:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78092452_78092604:GAA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 78093133 G/A 1 6 21 27 2.77273340280758 11.2954330901735 -8.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00146602075713132 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78093071_78093678:GAA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 78184423 T/C 0 10 0 10 4.62122233801263 0 4.62122233801263 T T 10 0.537877766198737 0.00247110667592352 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 78184578 C/A 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 A:C C A 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 78363054 G/A 1 26 13 39 12.0151780788328 6.99241096058358 5.02276711824926 A:G G A 10 0.537877766198737 0.111370496383565 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78362973_78363167:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78362973_78363167:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78362973_78363167:RNF213 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 78367225 A/C 1 33 37 70 15.2500337154417 19.9014773493533 -4.65144363391159 A:C A C 10 0.537877766198737 0.282031712920121 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78367145_78369112:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78367145_78370085:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78367145_78370085:RNF213 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79171590 C/T 1 21 8 29 9.70456690982652 4.3030221295899 5.40154478023663 T:C C T 10 0.537877766198737 0.060797957701146 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79171512_79171688:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79171512_79171688:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79171512_79171688:AZI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79171967 A/G 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 A:G A G 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79171915_79172097:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79171915_79172097:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79171906_79172097:AZI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79173184 T/C 1 8 14 22 3.6969778704101 7.53028872678232 -3.83331085637221 T:C T C 10 0.537877766198737 0.133495761886537 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79176071 G/A 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79176040_79176198:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79176040_79176198:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79176040_79176198:AZI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79219621 G/A 1 61 61 122 28.189456261877 32.810543738123 -4.62108747624591 A:G G A 10 0.537877766198737 0.414868691916276 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79224985 C/T 1 24 13 37 11.0909336112303 6.99241096058358 4.09852265064673 T:C C T 10 0.537877766198737 0.190631218214199 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79478019 G/A 1 4216 3648 7864 1948.30733770613 1962.17809109299 -13.8707533868674 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 0.760105570670464 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79508395 C/G 1 44 36 80 20.3333782872556 19.3635995831545 0.969778704101042 C:G C G 10 0.537877766198737 0.910825100957537 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79508335_79508421:C17orf70 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 26 29 55 12.0151780788328 15.5984552197634 -3.58327714093053 A:G A G 10 0.537877766198737 0.346581895649197 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79514028 C/G 1 12 8 20 5.54546680561516 4.3030221295899 1.24244467602526 A:C:G C G 10 0.537877766198737 0.657647615348739 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79513935_79514112:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79564304 G/T 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79564271_79564342:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79564271_79564342:NPLOC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79580457 C/A 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 A:C C A 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79580344_79580520:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79580344_79580520:NPLOC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 11 5 16 5.08334457181389 2.68938883099368 2.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.317107876818811 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 21 15 36 9.70456690982652 8.06816649298105 1.63640041684547 T:C C T 10 0.537877766198737 0.619758110476252 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 37 28 65 17.0985226506467 15.0605774535646 2.0379451970821 T:C T C 10 0.537877766198737 0.621774172630898 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 27 19 46 12.4773003126341 10.219677557776 2.2576227548581 T:C T C 10 0.537877766198737 0.555985307319487 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 111 76 187 51.2955679519402 40.878710231104 10.4168577208362 T:G G T 10 0.537877766198737 0.142269362400138 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79668552 C/T 1 110 87 197 50.8334457181389 46.7953656592901 4.03808005884882 T:C C T 10 0.537877766198737 0.568656007560119 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668538_79669143:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668538_79669149:HGS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 801 735 1536 370.159909274812 395.340158156072 -25.18024888126 A:T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.200775458460044 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79673989 C/T 1 869 770 1639 401.584221173298 414.165879973027 -12.5816587997299 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.535806052881186 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79673936_79674070:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79673936_79674049:MRPL12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79682766 C/T 1 20 16 36 9.24244467602526 8.60604425917979 0.63640041684547 T:C C T 10 0.537877766198737 0.868711417524269 ENSG00000183048:ENST00000331531:exon_79682723_79682771:SLC25A10;ENSG00000183048:ENST00000350690:exon_79682723_79682771:SLC25A10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79801977 C/T 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79846216 G/A 1 1112 826 1938 513.879923987005 444.287034880157 69.5928891068478 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.00153773713600444 ENSG00000183684:ENST00000505490:exon_79846117_79846294:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000331204:exon_79846117_79846294:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000504015:exon_79846161_79846294:THOC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79864754 G/A 1 39 27 66 18.0227671182493 14.5226996873659 3.50006743088336 A:G G A 10 0.537877766198737 0.459156685185821 ENSG00000185813:ENST00000331285:exon_79864636_79864774:PCYT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79872224 C/T 1 34 19 53 15.7121559492429 10.219677557776 5.49247839146694 T:C C T 10 0.537877766198737 0.167732657950075 ENSG00000187531:ENST00000328666:exon_79872170_79872406:SIRT7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 62 67 129 28.6515784956783 36.0378103353154 -7.38623183963707 T:C T C 10 0.537877766198737 0.216291886875825 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79974973 G/A 1 34 33 67 15.7121559492429 17.7499662845583 -2.03781033531538 A:G G A 10 0.537877766198737 0.626277263201133 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974817_79974989:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974817_79974989:ASPSCR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79975221 A/G 1 25 31 56 11.5530558450316 16.6742107521608 -5.12115490712927 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.181736256805186 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79975185_79975280:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79975185_79975280:ASPSCR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79994026 G/A 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.155505383598726 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79994600 C/T 1 144 165 309 66.5456016673819 88.7498314227916 -22.2042297554097 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0120030297842209 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79994597_79994639:DCXR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 79995535 G/A 1 17 30 47 7.85607797462147 16.1363329859621 -8.28025501134064 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.0186013134722946 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79995507_79995573:DCXR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80006957 A/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80006958 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 48 63 111 22.1818672224606 33.8862992705204 -11.7044320480598 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0284038453796047 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 177 173 350 81.7956353828236 93.0528535523815 -11.2572181695579 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.238350366771669 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80085633 A/G 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 A:G A G 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392346:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000419322:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000324808:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000412801:exon_80085368_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000483145:exon_80085581_80085784:CCDC57 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80193882 G/A 1 14 25 39 6.46971127321768 13.4469441549684 -6.97723288175074 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0354501968054603 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80191563_80194107:SLC16A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 68 65 133 31.4243118984859 34.9620548029179 -3.53774290443202 A:G G A 10 0.537877766198737 0.543978851772623 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80352234 G/A 1 26 26 52 12.0151780788328 13.9848219211672 -1.96964384233432 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.581996003182115 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80352303 G/A 1 25 16 41 11.5530558450316 8.60604425917979 2.94701158585178 A:G G A 10 0.537877766198737 0.434084649266836 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80436695 G/A 1 23 11 34 10.6288113774291 5.91665542818611 4.71215594924294 A:G G A 10 0.537877766198737 0.122289279917255 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80436676_80436794:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80436676_80436794:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80436676_80436794:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80436676_80436794:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80436676_80436794:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80436676_80436794:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80436676_80436794:NARF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 68 53 121 31.4243118984859 28.5075216085331 2.91679028995283 T:C T C 10 0.537877766198737 0.648746541931516 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80763847 C/T 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 T:C C T 10 0.537877766198737 0.80945734873112 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80763751_80763887:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80763751_80763887:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80763751_80763887:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80763751_80763887:TBCD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 10 17 27 4.62122233801263 9.14392202537853 -4.5226996873659 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0857071363554688 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80885172 C/T 1 41 43 84 18.9470115858518 23.1287439465457 -4.1817323606939 T:C C T 10 0.537877766198737 0.382422744362337 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80885062_80885199:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80885062_80885199:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80885062_80885199:TBCD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80887346 C/T 1 65 58 123 30.0379451970821 31.1969104395267 -1.15896524244464 T:C C T 10 0.537877766198737 0.856786692397277 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 87 75 162 40.2046343407099 40.3408324649053 -0.136198124195381 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 80904844 C/T 1 8 8 16 3.6969778704101 4.3030221295899 -0.606044259179791 T:C C T 10 0.537877766198737 0.805966639450967 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80904755_80904859:B3GNTL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 17 81052326 T/C 1 30 8 38 13.8636670140379 4.3030221295899 9.560644884448 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00173052474133385 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81052001_81052585:METRNL;ENSG00000176845:ENST00000400683:exon_81052001_81052481:METRNL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 163408 C/T 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_163308_163453:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_163308_163453:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_163308_163453:USP14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 670888 T/C 1 13 2 15 6.00758903941642 1.07575553239747 4.93183350701895 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.016561054837906 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 140 140 280 64.6971127321768 75.3028872678232 -10.6057745356463 T:C C T 10 0.537877766198737 0.208552484126648 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 A:G A G 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 9117867 T/C 1 47 30 77 21.7197449886594 16.1363329859621 5.58341200269725 T:C T C 10 0.537877766198737 0.210642669069885 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 9255327 A/T 1 152 158 310 70.242579537792 84.9846870594004 -14.7421075216085 A:T:C:G A T 10 0.537877766198737 0.098550019973692 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 9255572 T/C 1 166 141 307 76.7122908110097 75.8407650340219 0.871525776987752 T:C T C 10 0.537877766198737 0.954376371560558 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 9255959 C/T 1 292 269 561 134.939692269969 144.68911910746 -9.74942683749143 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.421216553585419 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 137 145 282 63.310746030773 77.9922760988169 -14.6815300680438 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0833289366935818 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 65 46 111 30.0379451970821 24.7423772451419 5.2955679519402 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.341646095379063 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 41 18 59 18.9470115858518 9.68179979157727 9.26521179427452 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0181568952066876 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 13645161 A/C 1 15 25 40 6.93183350701895 13.4469441549684 -6.51511064794948 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0556683083745819 ENSG00000168675:ENST00000361205:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399848:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000359446:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399847:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000361303:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000435606:exon_13645126_13652753:C18orf1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 13666602 C/A 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 A:C C A 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000177150:ENST00000322247:exon_13663346_13666712:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000457610:exon_13663350_13666712:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000402563:exon_13663350_13666712:C18orf19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 13681750 C/T 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 T:C C T 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000177150:ENST00000322247:exon_13681604_13682104:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000457610:exon_13681604_13682111:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000402563:exon_13681604_13682104:C18orf19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 20577669 G/A 1 51 38 89 23.5682339238644 20.439355115552 3.12887880831241 A:G G A 10 0.537877766198737 0.525332427907496 ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20577583_20577697:RBBP8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 21112206 C/T 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 23612484 C/G 1 11 10 21 5.08334457181389 5.37877766198737 -0.295433090173476 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000141380:ENST00000415083:exon_23612363_23612496:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269137:exon_23612363_23612496:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269138:exon_23612363_23612496:SS18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 32887591 A/G 1 17 23 40 7.85607797462147 12.3711886225709 -4.51511064794948 A:G A G 10 0.537877766198737 0.157271703479637 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 43668207 T/C 1 538 515 1053 248.62176178508 277.00704959235 -28.38528780727 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0834621164701861 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43668075_43668223:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43668075_43668223:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43668075_43668223:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000490226:exon_43668102_43668223:ATP5A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 47796157 C/T 1 70 58 128 32.3485563660884 31.1969104395267 1.15164592656167 T:C C T 10 0.537877766198737 0.859694149040968 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47795211_47796188:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47795217_47796188:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47795217_47796188:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47795217_47796188:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47795217_47796188:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47795217_47796188:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47795217_47796188:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47795217_47796188:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47796046_47796181:MBD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 T:G G T 10 0.537877766198737 0.104317293815455 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 154 114 268 71.1668240053945 61.318065346656 9.84875865873849 A:G A G 10 0.537877766198737 0.244491746974683 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 48458662 G/A 1 26 30 56 12.0151780788328 16.1363329859621 -4.12115490712927 A:G G A 10 0.537877766198737 0.285725863039844 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 120 127 247 55.4546680561516 68.3104763072396 -12.855808251088 T:C T C 10 0.537877766198737 0.110511874384922 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 31 39 70 14.3257892478392 20.9772328817507 -6.65144363391159 T:C C T 10 0.537877766198737 0.119766974380205 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 55269007 G/A 1 46 30 76 21.2576227548581 16.1363329859621 5.12128976889599 A:G G A 10 0.537877766198737 0.251815508497883 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 56056403 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000049759:ENST00000256830:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000400345:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000382850:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000356462:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000456986:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000357895:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000435432:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000456173:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000256832:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000431212:exon_56056317_56056424:NEDD4L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 56149048 A/G 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 56819930 T/C 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 T:C T C 10 0.537877766198737 0.80945734873112 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 1 9 10 0.462122233801263 4.84089989578863 -4.37877766198737 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0076411641167297 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 53 42 95 24.4924783914669 22.590866180347 1.90161221111999 A:G A G 10 0.537877766198737 0.75783963875239 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 4 11 15 1.84848893520505 5.91665542818611 -4.06816649298105 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0400137374002459 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 77211764 T/C 1 12 18 30 5.54546680561516 9.68179979157727 -4.13633298596211 T:C T C 10 0.537877766198737 0.145035454783885 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77211676_77211816:NFATC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 20 26 46 9.24244467602526 13.9848219211672 -4.7423772451419 A:G A G 10 0.537877766198737 0.183753393346675 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 77473086 G/A 1 8 8 16 3.6969778704101 4.3030221295899 -0.606044259179791 A:G G A 10 0.537877766198737 0.805966639450967 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 77474921 G/A 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 A:G G A 10 0.537877766198737 0.80945734873112 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 77513721 T/C 1 46 46 92 21.2576227548581 24.7423772451419 -3.4847544902838 T:C T C 10 0.537877766198737 0.466683973583596 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 77513804 G/T 1 31 28 59 14.3257892478392 15.0605774535646 -0.734788205725481 A:T:G G T 10 0.537877766198737 0.896443026201235 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 80 66 146 36.969778704101 35.4999325691166 1.46984613498441 A:C A C 10 0.537877766198737 0.868238140783497 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 571513 G/A 1 27 23 50 12.4773003126341 12.3711886225709 0.106111690063154 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_571325_571579:BSG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 619664 C/T 1 29 39 68 13.4015447802366 20.9772328817507 -7.57568810151411 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0688172587491975 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_619586_619765:POLRMT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 621629 G/A 1 8 16 24 3.6969778704101 8.60604425917979 -4.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0633085169542399 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 651852 C/T 1 51 67 118 23.5682339238644 36.0378103353154 -12.469576411451 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0262901874934201 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 804079 T/C 1 30 33 63 13.8636670140379 17.7499662845583 -3.88629927052043 T:C T C 10 0.537877766198737 0.37669397303739 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804036_804208:PTBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 808631 C/T 1 67 75 142 30.9621896646846 40.3408324649053 -9.37864280022064 T:C C T 10 0.537877766198737 0.129573210328528 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 111 133 244 51.2955679519402 71.537742904432 -20.2421749524918 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0101363677711151 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 871987 G/A 1 73 86 159 33.7349230674922 46.2574878930914 -12.5225648255992 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0470965952680291 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 875389 G/A 1 43 53 96 19.8712560534543 28.5075216085331 -8.63626555507875 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0821528525376161 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_875244_875454:MED16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 880035 T/A 1 29 15 44 13.4015447802366 8.06816649298105 5.33337828725557 A:T T A 10 0.537877766198737 0.130152185501220 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 880078 G/T 1 24 17 41 11.0909336112303 9.14392202537853 1.94701158585178 T:G G T 10 0.537877766198737 0.6391143163645 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 29 17 46 13.4015447802366 9.14392202537853 4.2576227548581 A:G A G 10 0.537877766198737 0.237910222632014 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 929678 G/A 1 13 15 28 6.00758903941642 8.06816649298105 -2.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.454321487587661 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 984533 T/C 1 142 56 198 65.6213571997794 30.1211549071293 35.5002022926501 T:C T C 10 0.537877766198737 3.16520622834221e-07 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 984554 C/G 1 128 55 183 59.1516459265617 29.5832771409305 29.5683687856311 C:G C G 10 0.537877766198737 1.03730377149759e-05 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1010691 A/G 1 114 106 220 52.681934653344 57.0150432170661 -4.33310856372213 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.588723904405814 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1065018 G/T 1 19 9 28 8.780322442224 4.84089989578863 3.93942254643536 T:G G T 10 0.537877766198737 0.183805115444036 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064930_1065170:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524383:exon_1064930_1065170:ABCA7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 T:C T C 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 A:G G A 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1085849 C/T 1 224 187 411 103.515380371483 100.583142279164 2.93223809231911 T:C C T 10 0.537877766198737 0.804689078680805 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1093976 C/T 1 226 204 430 104.439624839085 109.727064304542 -5.28743946545688 T:C C T 10 0.537877766198737 0.628746818568628 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1093903_1094077:POLR2E HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1257302 C/T 1 18 25 43 8.31820020842273 13.4469441549684 -5.12874394654569 T:C C T 10 0.537877766198737 0.127512394036644 ENSG00000167470:ENST00000300952:exon_1256994_1259139:MIDN;ENSG00000167470:ENST00000395622:exon_1256994_1259078:MIDN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 408 478 886 188.545871390915 257.105572242996 -68.559700852081 T:C T C 10 0.537877766198737 4.41944041398372e-06 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 82 51 133 37.8940231717036 27.4317660761356 10.462257095568 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0816073607156516 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1619339 T/C 1 76 48 124 35.121289768896 25.8181327775394 9.30315699135662 T:C T C 10 0.537877766198737 0.104836578980080 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1619350 C/T 1 54 68 122 24.9546006252682 36.5756881015141 -11.6210874762459 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0368185395102101 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1622116 G/A 1 29 26 55 13.4015447802366 13.9848219211672 -0.583277140930532 A:G G A 10 0.537877766198737 0.893142666161473 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1622053_1622222:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1622053_1622222:TCF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1827387 C/T 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1827735 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1912900 A/C 1 26 15 41 12.0151780788328 8.06816649298105 3.94701158585178 A:C A C 10 0.537877766198737 0.272859771989168 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 31 21 52 14.3257892478392 11.2954330901735 3.03035615766568 T:C T C 10 0.537877766198737 0.408742892251697 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1969882 G/T 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1969507_1969958:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1969507_1969958:CSNK1G2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1979386 C/T 1 21 31 52 9.70456690982652 16.6742107521608 -6.96964384233432 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0695755211659867 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979318_1979402:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979318_1979402:CSNK1G2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1979811 A/G 1 27 36 63 12.4773003126341 19.3635995831545 -6.88629927052043 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0998234602121666 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979751_1979834:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979751_1979819:CSNK1G2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 16 5 21 7.39395574082021 2.68938883099368 4.70456690982652 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0479916409880059 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2041917 G/A 1 86 84 170 39.7425121069086 45.1817323606939 -5.43922025378529 A:G G A 10 0.537877766198737 0.441881810584593 ENSG00000099875:ENST00000309340:exon_2041839_2042033:MKNK2;ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2041839_2042033:MKNK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2223327 G/A 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 A:G G A 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2223280_2223485:DOT1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2226311 G/C 1 18 27 45 8.31820020842273 14.5226996873659 -6.20449947894316 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0727564764987215 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2248020 G/A 1 209 164 373 96.583546864464 88.2119536565929 8.37159320787113 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.406159273572673 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2255311 C/G 1 29 23 52 13.4015447802366 12.3711886225709 1.03035615766568 C:G C G 10 0.537877766198737 0.889564874949669 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2255205_2255346:JSRP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2273146 C/T 1 2652 3058 5710 1225.54816404095 1644.83020903574 -419.282044994788 A:T:C C T 10 0.537877766198737 1.23064448119025e-28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2339856 C/T 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2339823_2339965:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2339823_2339964:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2339823_2339965:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2339823_2339965:AC004410.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2340151 G/T 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 T:G G T 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2340075_2340159:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2340075_2340154:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2340075_2340154:AC004410.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2344637 C/T 1 10 12 22 4.62122233801263 6.45453319438484 -1.83331085637221 T:C C T 10 0.537877766198737 0.522885386896646 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2344551_2344650:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2344551_2344650:AC004410.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2353148 T/C 1 24 25 49 11.0909336112303 13.4469441549684 -2.35601054373811 T:C T C 10 0.537877766198737 0.567230293798627 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 23 42 65 10.6288113774291 22.590866180347 -11.9620548029179 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00387967134722785 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2438119 C/T 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.357765318101588 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2810738 G/A 1 237 222 459 109.522969410899 119.40886409612 -9.88589468522026 A:G G A 10 0.537877766198737 0.373819903176427 ENSG00000172009:ENST00000307741:exon_2810638_2810766:THOP1;ENSG00000172009:ENST00000395212:exon_2810638_2810766:THOP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2917186 T/C 1 11 4 15 5.08334457181389 2.15151106479495 2.93183350701895 T:C T C 10 0.537877766198737 0.194270090333408 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 A:C C A 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 T:C T C 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2994072 G/A 0 16 0 16 7.39395574082021 0 7.39395574082021 G G 10 0.537877766198737 5.34099534678049e-05 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994017_2994093:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994017_2994093:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994017_2994093:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994017_2994093:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000360309:exon_2994017_2994098:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994017_2994093:TLE6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 A:G G A 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 100 118 218 46.2122233801263 63.469576411451 -17.2573530313247 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0207938066568136 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3452637 C/T 1 14 5 19 6.46971127321768 2.68938883099368 3.780322442224 T:C C T 10 0.537877766198737 0.106704602900475 ENSG00000141905:ENST00000443272:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000395111:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000346156:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000341919:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000343825:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000269778:exon_3452480_3452664:NFIC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3496833 G/A 1 43 13 56 19.8712560534543 6.99241096058358 12.8788450928707 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000441651952274222 ENSG00000129932:ENST00000250937:exon_3496539_3496884:DOHH;ENSG00000129932:ENST00000427575:exon_3496539_3496884:DOHH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3544892 C/T 1 30 40 70 13.8636670140379 21.5151106479495 -7.65144363391158 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0724201430246794 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3546340 G/A 1 18 45 63 8.31820020842273 24.2044994789432 -15.8862992705204 A:G G A 10 0.537877766198737 6.66559011452268e-05 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3546253_3546423:C19orf28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3547955 C/T 1 35 6 41 16.1742781830442 3.22726659719242 12.9470115858518 T:C C T 10 0.537877766198737 2.73654233639766e-05 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3547846_3548028:C19orf28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3548168 T/C 1 28 8 36 12.9394225464354 4.3030221295899 8.63640041684547 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00401203376143167 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3548121_3548265:C19orf28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3614538 C/T 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 T:C C T 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3614395_3614587:C19orf29 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 21 14 35 9.70456690982652 7.53028872678232 2.17427818304421 A:G A G 10 0.537877766198737 0.501418703087631 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 16 35 51 7.39395574082021 18.8257218169558 -11.4317660761356 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00173093756153829 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 285 326 611 131.70483663336 175.348151780788 -43.6433151474283 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000411310213864859 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3979372 G/T 1 1796 1474 3270 829.971531907068 792.831827376938 37.1397045301302 A:T:G G T 10 0.537877766198737 0.194387096128858 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3979327_3979434:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3979327_3979386:EEF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 3983184 A/G 1 290 282 572 134.015447802366 151.681530068044 -17.6660822656775 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.142279540354266 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4013322 T/C 1 7 11 18 3.23485563660884 5.91665542818611 -2.68179979157727 T:C T C 10 0.537877766198737 0.241050465666398 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4054208 C/T 1 46 57 103 21.2576227548581 30.659032673328 -9.40140991846991 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0748251816193512 ENSG00000178951:ENST00000322357:exon_4053969_4055245:ZBTB7A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 48 43 91 22.1818672224606 23.1287439465457 -0.946876724085065 T:C T C 10 0.537877766198737 0.916347596787368 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4251084 G/A 1 43 46 89 19.8712560534543 24.7423772451419 -4.87112119168759 A:G G A 10 0.537877766198737 0.338841734503176 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 71 41 112 32.8106785998897 22.0529884141482 10.7576901857415 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0463051964034984 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4262036 C/T 1 63 57 120 29.1137007294796 30.659032673328 -1.54533194384843 T:C C T 10 0.537877766198737 0.784331039281872 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4261991_4262111:CCDC94 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4327210 G/C 1 24 34 58 11.0909336112303 18.2878440507571 -7.19691043952674 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0651882322620193 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4327121_4327223:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4327121_4327223:STAP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 27 36 63 12.4773003126341 19.3635995831545 -6.88629927052043 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0998234602121666 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 49 35 84 22.6439894562619 18.8257218169558 3.8182676393061 T:C C T 10 0.537877766198737 0.44437152054568 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4538124 C/T 1 14 17 31 6.46971127321768 9.14392202537853 -2.67421075216085 T:C C T 10 0.537877766198737 0.370779292856988 ENSG00000171236:ENST00000306390:exon_4537227_4538963:LRG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4538831 G/A 1 5 11 16 2.31061116900632 5.91665542818611 -3.60604425917979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.081929463926307 ENSG00000171236:ENST00000306390:exon_4537227_4538963:LRG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4670236 C/G 1 207 194 401 95.6593023968614 104.348286642555 -8.68898424569352 T:C:G C G 10 0.537877766198737 0.394768531585921 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4670313 C/G 1 151 158 309 69.7804573039907 84.9846870594004 -15.2042297554097 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0869896132409973 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4816241 G/A 1 61 67 128 28.189456261877 36.0378103353154 -7.84835407343833 A:G G A 10 0.537877766198737 0.18353630976461 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 32 31 63 14.7879114816404 16.6742107521608 -1.88629927052043 A:G G A 10 0.537877766198737 0.705019698755851 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4847713 A/G 1 61 56 117 28.189456261877 30.1211549071293 -1.93169864525223 A:G A G 10 0.537877766198737 0.781039880431198 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4847874 A/G 1 45 27 72 20.7955005210568 14.5226996873659 6.27280083369094 A:G A G 10 0.537877766198737 0.156278624634683 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4852106 A/G 1 31 38 69 14.3257892478392 20.439355115552 -6.11356586771285 A:G A G 10 0.537877766198737 0.148508570018507 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 37 32 69 17.0985226506467 17.2120885183596 -0.11356586771285 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 48 32 80 22.1818672224606 17.2120885183596 4.96977870410104 T:C T C 10 0.537877766198737 0.312934896499442 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 5783161 G/A 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 5915026 G/A 1 15 14 29 6.93183350701895 7.53028872678232 -0.598455219763371 A:G G A 10 0.537877766198737 0.85397889757185 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914951_5915076:CAPS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 5915098 G/A 1 15 14 29 6.93183350701895 7.53028872678232 -0.598455219763371 A:G G A 10 0.537877766198737 0.85397889757185 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 5915151 C/T 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6230692 G/A 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6230581_6230724:MLLT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6452386 G/A 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6452323_6452490:SLC25A23 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6458240 G/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 C:G G C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6468331 T/C 1 115 169 284 53.1440568871453 90.9013424875865 -37.7572856004413 T:C T C 10 0.537877766198737 7.39702284993658e-06 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 14 13 27 6.46971127321768 6.99241096058358 -0.522699687365898 T:G G T 10 0.537877766198737 0.84951872158194 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6477425 G/T 1 15 14 29 6.93183350701895 7.53028872678232 -0.598455219763371 T:G G T 10 0.537877766198737 0.85397889757185 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477389_6477469:DENND1C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6495736 A/G 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 A:G A G 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000104833:ENST00000264071:exon_6494331_6496232:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000411712:exon_6495175_6495767:TUBB4;ENSG00000104833:ENST00000412858:exon_6495175_6495861:TUBB4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6669934 G/A 1 11 8 19 5.08334457181389 4.3030221295899 0.780322442223998 A:G G A 10 0.537877766198737 0.82002331137955 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 97 79 176 44.8258566787225 42.4923435297002 2.33351314902229 T:C T C 10 0.537877766198737 0.762568175512926 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6736667 G/A 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6736603_6736722:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6736603_6736722:GPR108 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 6755219 C/T 1 6 12 18 2.77273340280758 6.45453319438484 -3.68179979157727 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0990055908664937 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7142843 C/G 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7142827_7143101:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7142827_7143101:INSR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7142921 C/T 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7142827_7143101:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7142827_7143101:INSR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7524855 C/T 1 8 1 9 3.6969778704101 0.537877766198737 3.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0439369935612285 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7585762 G/C 1 36 40 76 16.6364004168455 21.5151106479495 -4.87871023110401 C:G G C 10 0.537877766198737 0.30058283984691 ENSG00000198816:ENST00000361576:exon_7584091_7585912:ZNF358;ENSG00000198816:ENST00000394341:exon_7584088_7585911:ZNF358 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7594052 C/T 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 T:C C T 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000090674:ENST00000264079:exon_7593987_7594088:MCOLN1;ENSG00000090674:ENST00000394321:exon_7593987_7594088:MCOLN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7705825 G/A 1 10 12 22 4.62122233801263 6.45453319438484 -1.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.522885386896646 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7705786_7705889:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7705786_7705889:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7705786_7705889:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000320400:exon_7705786_7706087:STXBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 165 100 265 76.2501685772084 53.7877766198737 22.4623919573347 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00554779167254386 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 1122 1068 2190 518.501146325017 574.453454300251 -55.952307975234 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0173515759222113 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7763248 G/A 1 1415 1023 2438 653.902960828787 550.248954821308 103.654006007479 A:T:G G A 10 0.537877766198737 2.59104605265933e-05 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7916620 A/G 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 A:G A G 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7916567_7916656:EVI5L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7975975 C/T 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975865_7976044:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975865_7975990:MAP2K7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7992052 A/C 1 124 127 251 57.3031569913566 68.3104763072396 -11.007319315883 A:C A C 10 0.537877766198737 0.164372341127808 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 7992126 G/A 1 100 75 175 46.2122233801263 40.3408324649053 5.87139091522103 A:G G A 10 0.537877766198737 0.404525651827888 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 251 213 464 115.992680684117 114.567964200331 1.42471648378604 A:G A G 10 0.537877766198737 0.925829008214237 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8121360 A/G 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 A:G A G 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8121250_8121383:CCL25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8319455 C/T 1 15 27 42 6.93183350701895 14.5226996873659 -7.59086618034695 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0203297857659761 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8320555 G/A 1 10 22 32 4.62122233801263 11.8333108563722 -7.21208851835958 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0124279050145696 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8320491_8320609:LASS4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8495733 C/T 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8495542_8495751:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8495542_8495751:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8495542_8495751:MARCH2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8550911 G/C 1 560 461 1021 258.788450928707 247.961650217618 10.8268007110896 C:G G C 10 0.537877766198737 0.509880757751479 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8551094 T/C 1 557 535 1092 257.402084227304 287.764604916324 -30.3625206890208 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.0685802664949044 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8553630 C/T 1 796 675 1471 367.849298105805 363.067492184147 4.78180592165791 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.81397479688796 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8553575_8553885:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8553575_8553885:HNRNPM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8578000 G/A 1 42 40 82 19.409133819653 21.5151106479495 -2.10597682829643 A:G G A 10 0.537877766198737 0.659026621988552 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8578118 A/G 1 28 25 53 12.9394225464354 13.4469441549684 -0.507521608533059 A:G A G 10 0.537877766198737 0.891440285734021 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 22 27 49 10.1666891436278 14.5226996873659 -4.35601054373811 T:C T C 10 0.537877766198737 0.251766137913348 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 8587553 T/C 1 14 24 38 6.46971127321768 12.9090663887697 -6.43935511555201 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0494985939768452 ENSG00000142347:ENST00000446661:exon_8587518_8587713:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000305795:exon_8587518_8587617:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000338257:exon_8587518_8587713:MYO1F HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 16 20 36 7.39395574082021 10.7575553239747 -3.36359958315453 A:G A G 10 0.537877766198737 0.316250584154210 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 15 10 25 6.93183350701895 5.37877766198737 1.55305584503158 A:T A T 10 0.537877766198737 0.555492392718307 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 9949152 G/A 1 237 192 429 109.522969410899 103.272531110158 6.25043830074183 A:G G A 10 0.537877766198737 0.561412672674976 ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 172 176 348 79.4850242138172 94.6664868509777 -15.1814626371605 C:G C G 10 0.537877766198737 0.106849338051321 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 25 22 47 11.5530558450316 11.8333108563722 -0.280255011340637 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 17 29 46 7.85607797462147 15.5984552197634 -7.7423772451419 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0259849500697539 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10225177 G/A 1 56 55 111 25.8788450928707 29.5832771409305 -3.7044320480598 A:G G A 10 0.537877766198737 0.505908757360139 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 851 786 1637 393.266020964875 422.771924232207 -29.5059032673324 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.143712310598546 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10267077 T/C 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 T:C T C 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10267067_10267185:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10267067_10267185:DNMT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10270593 G/A 1 37 37 74 17.0985226506467 19.9014773493533 -2.80295469870654 A:G G A 10 0.537877766198737 0.560523206000881 ENSG00000130816:ENST00000340748:exon_10270518_10270598:DNMT1;ENSG00000130816:ENST00000359526:exon_10270518_10270598:DNMT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 10 10 20 4.62122233801263 5.37877766198737 -0.757555323974739 C:G C G 10 0.537877766198737 0.823990074103612 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10395208 C/T 1 24 18 42 11.0909336112303 9.68179979157727 1.40913381965305 T:C C T 10 0.537877766198737 0.757553660558082 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395079_10395333:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395079_10395333:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395079_10395333:ICAM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 28 41 69 12.9394225464354 22.0529884141482 -9.11356586771285 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0298169350271531 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10444603 C/G 1 960 972 1932 443.637344449213 522.817188745172 -79.1798442959598 A:C:G C G 10 0.537877766198737 0.000310816082632358 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10472502 G/T 1 34 26 60 15.7121559492429 13.9848219211672 1.72733402807578 T:G G T 10 0.537877766198737 0.698957145683894 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10472446_10472631:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10472446_10472631:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10472446_10472631:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10472446_10472631:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000533334:exon_10472446_10472581:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000531620:exon_10472446_10472631:TYK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 A:C C A 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10477206 G/A 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 A:G G A 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10610236 A/G 1 17 17 34 7.85607797462147 9.14392202537853 -1.28784405075706 A:G A G 10 0.537877766198737 0.731887630866931 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10610071_10610756:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10610071_10610756:KEAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10659659 C/T 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000130734:ENST00000309469:exon_10659580_10659710:ATG4D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 112 93 205 51.7576901857415 50.0226322564825 1.73505792925892 A:G A G 10 0.537877766198737 0.833773119834381 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10664909 G/A 1 95 34 129 43.90161221112 18.2878440507571 25.6137681603629 A:G G A 10 0.537877766198737 5.08532690243043e-06 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10664910 G/C 1 92 39 131 42.5152455097162 20.9772328817507 21.5380126279655 C:G G C 10 0.537877766198737 0.000147760845231993 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10747211 G/A 1 16 9 25 7.39395574082021 4.84089989578863 2.55305584503158 A:G G A 10 0.537877766198737 0.324549732879746 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10746999_10747261:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10746999_10747261:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000407327:exon_10747119_10747232:SLC44A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 10795569 C/T 1 57 46 103 26.340967326672 24.7423772451419 1.59859008153009 T:C C T 10 0.537877766198737 0.767893492117858 ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10795535_10796443:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10795092_10796443:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10795092_10796443:ILF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 11034039 T/A 1 51 44 95 23.5682339238644 23.6666217127444 -0.0983877888800109 A:T T A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11033948_11034083:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11033948_11034083:YIPF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 11034813 C/A 1 16 10 26 7.39395574082021 5.37877766198737 2.01517807883284 A:C C A 10 0.537877766198737 0.556039763483853 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 11034837 A/G 1 14 9 23 6.46971127321768 4.84089989578863 1.62881137742905 A:G A G 10 0.537877766198737 0.537125438968325 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 11222296 G/A 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 A:G G A 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11222190_11222315:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11222190_11222315:LDLR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 11557935 A/G 1 181 238 419 83.6441243180286 128.014908355299 -44.3707840372708 A:G A G 10 0.537877766198737 1.52806324698637e-05 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11557889_11557975:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11557889_11557975:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11557889_11557975:PRKCSH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 11598240 G/A 1 20 17 37 9.24244467602526 9.14392202537853 0.0985226506467338 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 11598483 T/C 1 15 6 21 6.93183350701895 3.22726659719242 3.70456690982652 T:C T C 10 0.537877766198737 0.126902671440171 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12738766 T/C 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 T T 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000173875:ENST00000446165:exon_12738535_12740461:ZNF791;ENSG00000173875:ENST00000343325:exon_12738535_12742735:ZNF791 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12767849 C/A 1 37 32 69 17.0985226506467 17.2120885183596 -0.11356586771285 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000433513:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000495617:exon_12767763_12767870:MAN2B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12772090 C/T 1 51 42 93 23.5682339238644 22.590866180347 0.977367743517462 T:C C T 10 0.537877766198737 0.917253202474885 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 32 22 54 14.7879114816404 11.8333108563722 2.9546006252682 A:G G A 10 0.537877766198737 0.495455997108938 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12800851 G/A 1 15 6 21 6.93183350701895 3.22726659719242 3.70456690982652 A:G G A 10 0.537877766198737 0.126902671440171 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800776_12800924:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800776_12801014:FBXW9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12805431 T/C 1 11 14 25 5.08334457181389 7.53028872678232 -2.44694415496842 T:C T C 10 0.537877766198737 0.422995539711509 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12805525 G/C 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12807066 G/C 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 C:G G C 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12807187 C/T 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12812169 A/G 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 A A 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12813683 T/C 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12813637_12813732:TNPO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 12814544 A/G 1 13 9 22 6.00758903941642 4.84089989578863 1.16668914362779 A:G A G 10 0.537877766198737 0.673692463929978 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12814528_12814615:TNPO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 13869942 G/A 1 18 23 41 8.31820020842273 12.3711886225709 -4.05298841414822 A:G G A 10 0.537877766198737 0.213780293414108 ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13869914_13870086:CCDC130 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 261 212 473 120.61390302213 114.030086434132 6.58381658799743 T:C C T 10 0.537877766198737 0.549250608492617 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 651 677 1328 300.841574204622 364.143247716545 -63.3016735119227 A:G A G 10 0.537877766198737 0.000521534852092685 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 13889020 G/C 1 1128 1115 2243 521.273879727825 599.733709311592 -78.459829583767 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00095126477902647 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13888866_13889582:C19orf53 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14065341 T/C 1 6 13 19 2.77273340280758 6.99241096058358 -4.219677557776 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0651269816126054 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14070085 T/C 1 9 18 27 4.15910010421137 9.68179979157727 -5.5226996873659 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0350997761105223 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14069857_14070291:DCAF15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 56 47 103 25.8788450928707 25.2802550113406 0.598590081530094 T:C C T 10 0.537877766198737 0.921638996633513 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 50 47 97 23.1061116900632 25.2802550113406 -2.17414332127748 T:C:G C G 10 0.537877766198737 0.68451051192639 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14277727 T/G 1 6 10 16 2.77273340280758 5.37877766198737 -2.60604425917979 T:G T G 10 0.537877766198737 0.216741911044158 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14512502 C/T 1 43 28 71 19.8712560534543 15.0605774535646 4.81067859988968 T:C C T 10 0.537877766198737 0.284616967212988 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14518913 G/A 1 273 201 474 126.159369827745 108.113431005946 18.0459388217987 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0974491037654224 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14518904_14519531:CD97 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14518951 C/T 1 264 183 447 122.000269723533 98.4316312143689 23.5686385091646 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0257845683751266 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14518904_14519531:CD97 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14520713 G/A 1 26 22 48 12.0151780788328 11.8333108563722 0.181867222460626 A:G G A 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14552020 C/T 1 20 12 32 9.24244467602526 6.45453319438484 2.78791148164042 T:C C T 10 0.537877766198737 0.377397020068676 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14551955_14552255:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14551955_14552255:PKN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14554346 G/A 1 24 24 48 11.0909336112303 12.9090663887697 -1.81813277753938 A:G G A 10 0.537877766198737 0.66482440830302 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14554282_14554433:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14554282_14554433:PKN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14580195 G/A 1 158 145 303 73.0153129405996 77.9922760988169 -4.9769631582173 A:G G A 10 0.537877766198737 0.565206994136843 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14580246 C/T 1 162 149 311 74.8638018758046 80.1437871636118 -5.27998528780719 T:C C T 10 0.537877766198737 0.56972617713237 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14582584 C/T 1 357 305 662 164.977637467051 164.052718690615 0.92491877643613 T:C C T 10 0.537877766198737 0.968912868786063 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 14593648 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14593501_14593820:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14593501_14593818:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14593501_14593818:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14593501_14593818:GIPC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 15226084 G/A 1 98 77 175 45.2879789125238 41.4165879973027 3.87139091522103 A:G G A 10 0.537877766198737 0.59587899388691 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15225795_15226732:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15225798_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15225827_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000269733:exon_15225965_15226133:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226083_15226241:ILVBL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 44 52 96 20.3333782872556 27.9696438423343 -7.63626555507875 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.125246595426387 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 12 16 28 5.54546680561516 8.60604425917979 -3.06057745356464 A:C C A 10 0.537877766198737 0.26098376921595 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 15367036 C/T 1 373 405 778 172.371593207871 217.840495310488 -45.4689021026174 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00119889536475225 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000371835:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000392878:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000360016:exon_15366875_15367074:BRD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 15473003 T/C 1 31 15 46 14.3257892478392 8.06816649298105 6.2576227548581 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0755785239101389 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15472921_15473062:AKAP8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 15508540 C/T 1 95 55 150 43.90161221112 29.5832771409305 14.3183350701895 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0215850789314949 ENSG00000011243:ENST00000397410:exon_15508525_15508666:AKAP8L;ENSG00000011243:ENST00000263378:exon_15508525_15508666:AKAP8L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 15571929 C/T 1 37 47 84 17.0985226506467 25.2802550113406 -8.1817323606939 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0800931716252858 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15571871_15571932:RASAL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 66 70 136 30.5000674308834 37.6514436339116 -7.15137620302822 T:C C T 10 0.537877766198737 0.229219162517577 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 32 44 76 14.7879114816404 23.6666217127444 -8.87871023110401 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0498834178183322 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 16640544 C/T 1 8 11 19 3.6969778704101 5.91665542818611 -2.219677557776 T:C C T 10 0.537877766198737 0.361009077515707 ENSG00000085872:ENST00000198939:exon_16640459_16640711:CHERP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 26 28 54 12.0151780788328 15.0605774535646 -3.0453993747318 T:C C T 10 0.537877766198737 0.416223078815333 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17286484 C/T 1 6 10 16 2.77273340280758 5.37877766198737 -2.60604425917979 T:C C T 10 0.537877766198737 0.216741911044158 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17286472_17286550:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17286472_17286550:MYO9B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 T:C T C 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17305781 T/G 1 14 11 25 6.46971127321768 5.91665542818611 0.553055845031576 T:G T G 10 0.537877766198737 0.844404343432166 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 17 22 39 7.85607797462147 11.8333108563722 -3.97723288175074 T:C C T 10 0.537877766198737 0.260692389589246 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17316136 C/T 1 38 23 61 17.560644884448 12.3711886225709 5.18945626187705 T:C C T 10 0.537877766198737 0.200309625475653 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316072_17316145:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316072_17316145:MYO9B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17322804 G/A 1 65 77 142 30.0379451970821 41.4165879973027 -11.3786428002206 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0637694604467713 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17322704_17324103:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17322704_17324103:MYO9B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17337928 C/T 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 T:C C T 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 210 154 364 97.0456690982652 82.8331759946055 14.2124931036597 A:G G A 10 0.537877766198737 0.141153726552195 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17394981 G/A 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 A:G G A 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17395038 G/A 1 8 1 9 3.6969778704101 0.537877766198737 3.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0439369935612285 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17396333 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17396240_17396399:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17396240_17396399:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17396240_17396399:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17396240_17396399:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17396240_17396399:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17396240_17396399:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17396240_17396399:ANKLE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17397381 C/A 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:C C A 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17397189_17398454:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17397189_17398455:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17397189_17398455:ANKLE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17643125 C/T 1 11 21 32 5.08334457181389 11.2954330901735 -6.21208851835958 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0327770145443476 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17643072_17643197:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17643072_17643197:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17643072_17643197:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17643072_17643197:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17643072_17643197:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17643072_17643197:FAM129C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17643251 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17644434 C/T 1 18 16 34 8.31820020842273 8.60604425917979 -0.287844050757057 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17644396_17644510:FAM129C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17652968 G/A 1 57 22 79 26.340967326672 11.8333108563722 14.5076564702998 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000987241746312008 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17652945_17653103:FAM129C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17835962 G/C 1 6 22 28 2.77273340280758 11.8333108563722 -9.06057745356464 C:G G C 10 0.537877766198737 0.000877997546884977 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17835858_17835998:MAP1S HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17837425 C/G 1 13 13 26 6.00758903941642 6.99241096058358 -0.98482192116716 C:G C G 10 0.537877766198737 0.699848188249655 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17837981 A/G 1 21 20 41 9.70456690982652 10.7575553239747 -1.05298841414822 A:G A G 10 0.537877766198737 0.75645621742903 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17885270 A/G 1 3 10 13 1.38636670140379 5.37877766198737 -3.99241096058358 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0471072143657378 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17885203_17885287:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17885203_17885287:FCHO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 11 16 27 5.08334457181389 8.60604425917979 -3.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.182472148809709 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17972927 G/A 1 287 1520 1807 132.629081100963 817.57420462208 -684.945123521118 A:C:G G A 10 0.537877766198737 1.657130137967e-245 ENSG00000105640:ENST00000420197:exon_17972903_17972962:RPL18A;ENSG00000105640:ENST00000222247:exon_17972903_17973032:RPL18A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 17973329 A/G 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.246004363634176 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 T:C T C 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 18245512 C/T 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 18466755 G/A 1 4 11 15 1.84848893520505 5.91665542818611 -4.06816649298105 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0400137374002459 ENSG00000130517:ENST00000252813:exon_18466705_18466821:PGPEP1;ENSG00000130517:ENST00000269919:exon_18466705_18466821:PGPEP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 18679351 C/T 1 43 44 87 19.8712560534543 23.6666217127444 -3.79536565929012 T:C C T 10 0.537877766198737 0.452163246771891 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19017862 G/A 1 497 520 1017 229.674750199228 279.696438423343 -50.0216882241155 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00183607610256873 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19017769_19017921:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19017769_19017921:COPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 338 350 688 156.197315024827 188.257218169558 -32.059903144731 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0144103775624716 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19032680 T/C 1 39 28 67 18.0227671182493 15.0605774535646 2.96218966468462 T:C T C 10 0.537877766198737 0.540510827885743 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19032652_19032773:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19032652_19032773:DDX49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19038598 G/A 1 201 147 348 92.8865689940539 79.0680316312143 13.8185373628395 A:G G A 10 0.537877766198737 0.146611170762864 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19038575_19038663:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19038575_19038663:DDX49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19042387 A/G 1 1 9 10 0.462122233801263 4.84089989578863 -4.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0076411641167297 ENSG00000051128:ENST00000221222:exon_19042318_19042434:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000433218:exon_19042318_19042434:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000355887:exon_19042318_19042434:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000392351:exon_19042318_19042434:HOMER3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19162577 T/C 1 42 18 60 19.409133819653 9.68179979157727 9.72733402807578 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0133862468625875 ENSG00000105676:ENST00000392335:exon_19162431_19163004:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000269932:exon_19162431_19163004:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000392336:exon_19162431_19163004:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000379532:exon_19162509_19163004:ARMC6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19217048 C/T 0 9 0 9 4.15910010421137 0 4.15910010421137 C C 10 0.537877766198737 0.00472955515261702 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19217081 C/A 0 11 0 11 5.08334457181389 0 5.08334457181389 C C 10 0.537877766198737 0.00129550349960007 ENSG00000181035:ENST00000318596:exon_19217078_19217194:SLC25A42;ENSG00000181035:ENST00000454460:exon_19217078_19217194:SLC25A42 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19231972 C/T 1 18 37 55 8.31820020842273 19.9014773493533 -11.5832771409305 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00258759170064279 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19231801_19231975:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19231801_19231975:TMEM161A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19257680 C/T 1 209 150 359 96.583546864464 80.6816649298105 15.9018819346534 T:C C T 10 0.537877766198737 0.100715549199095 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19257551_19257684:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000475290:exon_19257593_19257992:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19257551_19257684:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19257551_19257684:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19257551_19257684:AC002126.6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19390185 G/A 1 106 82 188 48.9849567829339 44.1059768282964 4.87897995463746 A:G G A 10 0.537877766198737 0.510565082452491 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19390022_19390199:SUGP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19407883 C/A 1 39 48 87 18.0227671182493 25.8181327775394 -7.79536565929012 A:C C A 10 0.537877766198737 0.106561853963730 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19407798_19408153:SUGP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19674395 C/T 1 23 19 42 10.6288113774291 10.219677557776 0.409133819653048 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000105717:ENST00000251203:exon_19674318_19674424:PBX4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19745960 C/G 1 19 34 53 8.780322442224 18.2878440507571 -9.50752160853306 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0123980075803038 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19745834_19746022:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19745834_19746022:GMIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 19746499 C/T 1 25 22 47 11.5530558450316 11.8333108563722 -0.280255011340637 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19746453_19746530:GMIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 21132751 A/T 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:T A T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 23543351 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 23545447 A/G 1 4 14 18 1.84848893520505 7.53028872678232 -5.68179979157727 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00842674134138563 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 23557502 G/A 0 0 8 8 0 4.3030221295899 -4.3030221295899 A G A 10 0.537877766198737 0.00207995965823786 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23557440_23557566:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23557440_23557566:ZNF91 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 23837365 A/C 1 17 12 29 7.85607797462147 6.45453319438484 1.40154478023663 A:C A C 10 0.537877766198737 0.710601451134831 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 30496611 T/C 1 16 24 40 7.39395574082021 12.9090663887697 -5.51511064794948 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0834284719416832 ENSG00000105176:ENST00000360605:exon_30496558_30496615:C19orf2;ENSG00000105176:ENST00000392271:exon_30496558_30496615:C19orf2;ENSG00000105176:ENST00000312051:exon_30496558_30496615:C19orf2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 18 15 33 8.31820020842273 8.06816649298105 0.250033715441679 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 8 14 22 3.6969778704101 7.53028872678232 -3.83331085637221 A:G A G 10 0.537877766198737 0.133495761886537 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 46 52 98 21.2576227548581 27.9696438423343 -6.71202108747622 A:G A G 10 0.537877766198737 0.188230611372564 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 443 413 856 204.72014957396 222.143517440078 -17.4233678661188 A:G A G 10 0.537877766198737 0.243824652894535 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35176333 G/T 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 T:G G T 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35501006 C/T 1 21 18 39 9.70456690982652 9.68179979157727 0.0227671182492575 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 31 27 58 14.3257892478392 14.5226996873659 -0.196910439526743 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 58 18 76 26.8030895604733 9.68179979157727 17.121289768896 A:G G A 10 0.537877766198737 7.10455294620135e-05 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 75 52 127 34.6591675350947 27.9696438423343 6.68952369276041 C:G G C 10 0.537877766198737 0.248030248156014 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 20 39 59 9.24244467602526 20.9772328817507 -11.7347882057255 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00247594565383768 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 17 4 21 7.85607797462147 2.15151106479495 5.70456690982652 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0146392882568983 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 171 175 346 79.022901980016 94.128609084779 -15.105707104763 A:G A G 10 0.537877766198737 0.105948757334307 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35831986 C/T 1 153 115 268 70.7047017715932 61.8559431128547 8.8487586587385 T:C C T 10 0.537877766198737 0.297770227713823 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35831784_35832041:CD22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35832825 T/A 1 215 217 432 99.3562802672716 116.719475265126 -17.3631949978544 A:T T A 10 0.537877766198737 0.100807556964861 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35832605_35832868:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35832605_35832868:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35832605_35832868:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35832605_35832868:CD22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35991441 G/A 1 11 1 12 5.08334457181389 0.537877766198737 4.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00805204790992705 ENSG00000161249:ENST00000402589:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000460327:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000472252:exon_35991435_35991487:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000339686:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000462721:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000434389:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000408915:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000488762:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000490622:exon_35990860_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000437474:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000379073:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000392207:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000379075:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000379074:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000436012:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000467532:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000414866:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000480502:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000467637:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000419602:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000429837:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000462126:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000443857:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000443640:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000488542:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000460051:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000498211:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000483855:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000493979:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000464709:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000463292:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000465927:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000493517:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000464894:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000492341:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000466587:exon_35991280_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000482321:exon_35990987_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000476246:exon_35991109_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000471786:exon_35991170_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000486450:exon_35991183_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000498593:exon_35991347_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000471017:exon_35991360_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000498269:exon_35991440_35991482:DMKN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 35991445 C/A 0 11 0 11 5.08334457181389 0 5.08334457181389 C C 10 0.537877766198737 0.00129550349960007 ENSG00000161249:ENST00000402589:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000460327:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000472252:exon_35991435_35991487:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000339686:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000462721:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000434389:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000408915:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000488762:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000490622:exon_35990860_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000437474:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000379073:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000392207:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000379075:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000379074:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000436012:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000467532:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000414866:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000480502:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000467637:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000419602:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000429837:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000462126:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000443857:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000443640:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000488542:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000460051:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000498211:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000483855:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000493979:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000464709:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000463292:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000465927:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000493517:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000464894:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000492341:exon_35991435_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000466587:exon_35991280_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000482321:exon_35990987_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000476246:exon_35991109_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000471786:exon_35991170_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000486450:exon_35991183_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000498593:exon_35991347_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000471017:exon_35991360_35991482:DMKN;ENSG00000161249:ENST00000498269:exon_35991440_35991482:DMKN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 47 72 119 21.7197449886594 38.7271991663091 -17.0074541776497 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00227624290954437 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 36109312 C/A 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 A:C C A 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36109304_36109367:HAUS5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 36279349 C/T 1 10 20 30 4.62122233801263 10.7575553239747 -6.13633298596211 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0278876834422395 ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36278070_36279724:ARHGAP33 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 36394272 T/C 1 251 117 368 115.992680684117 62.9316986452522 53.0609820388648 A:T:C:G T C 10 0.537877766198737 2.40520948796661e-08 ENSG00000126264:ENST00000246551:exon_36394253_36394318:HCST;ENSG00000126264:ENST00000437550:exon_36394253_36394318:HCST HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 36394678 T/C 1 351 182 533 162.204904064243 97.8937534481701 64.3111506160732 T:C T C 10 0.537877766198737 1.81493204967463e-08 ENSG00000126264:ENST00000246551:exon_36394674_36394805:HCST;ENSG00000126264:ENST00000437550:exon_36394674_36394805:HCST HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 9 11 20 4.15910010421137 5.91665542818611 -1.75755532397474 A:G G A 10 0.537877766198737 0.504000237806629 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 36727441 G/A 1 10 11 21 4.62122233801263 5.91665542818611 -1.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.663514294637069 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 37314685 A/G 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37314569_37314692:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000528994:exon_37314569_37314692:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000525288:exon_37314569_37314692:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000527645:exon_37314569_37314692:ZNF790 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 37854580 C/T 1 23 10 33 10.6288113774291 5.37877766198737 5.25003371544168 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0804066168345998 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 169 156 325 78.0986575124135 83.908931527003 -5.81027401458951 T:C T C 10 0.537877766198737 0.540709112664172 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 38817363 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000099337:ENST00000263372:exon_38817233_38817628:KCNK6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 38817486 T/C 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000099337:ENST00000263372:exon_38817233_38817628:KCNK6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 38899548 G/A 1 18 25 43 8.31820020842273 13.4469441549684 -5.12874394654569 A:G G A 10 0.537877766198737 0.127512394036644 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 9 12 21 4.15910010421137 6.45453319438484 -2.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.383260377366473 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39191323 C/T 1 11 14 25 5.08334457181389 7.53028872678232 -2.44694415496842 T:C C T 10 0.537877766198737 0.422995539711509 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39191240_39191344:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39191240_39191354:ACTN4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39423001 T/C 1 191 176 367 88.2653466560412 94.6664868509777 -6.40114019493646 T:C T C 10 0.537877766198737 0.529937291831338 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39913558 A/G 1 13 5 18 6.00758903941642 2.68938883099368 3.31820020842274 A:G A G 10 0.537877766198737 0.155963033480451 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:G G A 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39914028 G/A 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39914644 G/A 1 16 10 26 7.39395574082021 5.37877766198737 2.01517807883284 A:G G A 10 0.537877766198737 0.556039763483853 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 17 10 27 7.85607797462147 5.37877766198737 2.4773003126341 A:G G A 10 0.537877766198737 0.440811686990866 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 30 39 69 13.8636670140379 20.9772328817507 -7.11356586771285 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0916394516628137 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 34 35 69 15.7121559492429 18.8257218169558 -3.11356586771285 C:G C G 10 0.537877766198737 0.470694950518387 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39923985 G/A 1 4070 3714 7784 1880.83749157114 1997.67802366211 -116.840532090969 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 0.00808096656630522 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 39998477 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000090932:ENST00000356433:exon_39998470_39998554:DLL3;ENSG00000090932:ENST00000205143:exon_39998470_39999118:DLL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 40029986 C/T 1 34 24 58 15.7121559492429 12.9090663887697 2.80308956047326 T:C C T 10 0.537877766198737 0.511377491856428 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 40197267 G/A 1 80 100 180 36.969778704101 53.7877766198737 -16.8179979157727 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0134614506560992 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197237_40197313:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197237_40197313:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197237_40197313:LGALS14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 40480501 C/T 1 190 198 388 87.80322442224 106.49979770735 -18.6965732851099 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0595772708712019 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 40486606 T/C 1 454 363 817 209.803494145773 195.249629130141 14.5538650156319 T:C T C 10 0.537877766198737 0.309174155551096 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40486569_40486624:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40486569_40486624:PSMC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 40739522 C/T 1 30 31 61 13.8636670140379 16.6742107521608 -2.81054373812295 T:C C T 10 0.537877766198737 0.521521874443383 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 40964312 G/A 1 83 52 135 38.3561454055048 27.9696438423343 10.3865015631705 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0839690869579715 ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 12 2 14 5.54546680561516 1.07575553239747 4.46971127321768 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0164542511926511 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 41 31 72 18.9470115858518 16.6742107521608 2.27280083369094 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.637327778605419 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41201897 G/A 1 14 21 35 6.46971127321768 11.2954330901735 -4.82572181695579 A:G G A 10 0.537877766198737 0.126471062134439 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41201894_41201959:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41201894_41201959:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41201894_41201959:ADCK4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41209477 C/T 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:C C T 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 T:C T C 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41235120 A/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000086544:ENST00000263370:exon_41235107_41235320:ITPKC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 327 230 557 151.113970453013 123.711886225709 27.4020842273035 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0216706646693810 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 522 449 971 241.227806044259 241.507117023233 -0.279310978973569 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41916547 C/T 1 18 12 30 8.31820020842273 6.45453319438484 1.86366701403789 T:C C T 10 0.537877766198737 0.584282394893276 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41916542_41916721:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41916542_41916721:BCKDHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41925140 C/T 1 57 43 100 26.340967326672 23.1287439465457 3.2122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.548391053348878 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41925040_41925201:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41925040_41925201:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41925040_41925201:BCKDHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 41930435 C/T 1 117 97 214 54.0683013547478 52.1741433212775 1.89415803347029 T:C C T 10 0.537877766198737 0.837141002949324 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 42085873 A/G 1 17 2 19 7.85607797462147 1.07575553239747 6.780322442224 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00185757514723377 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 42585344 C/T 1 29 42 71 13.4015447802366 22.590866180347 -9.18932140011032 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0319618328391685 ENSG00000105732:ENST00000222339:exon_42582739_42585717:ZNF574;ENSG00000105732:ENST00000359044:exon_42582739_42585717:ZNF574 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 42719311 T/C 1 12 10 22 5.54546680561516 5.37877766198737 0.166689143627787 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42719300_42719404:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42719285_42719404:DEDD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 10 9 19 4.62122233801263 4.84089989578863 -0.219677557776002 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 42906914 G/T 1 29 31 60 13.4015447802366 16.6742107521608 -3.27266597192422 T:G G T 10 0.537877766198737 0.438101548013636 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42906759_42907183:LIPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 43998926 G/A 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43998854_43998967:PHLDB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44047825 T/G 1 66 36 102 30.5000674308834 19.3635995831545 11.1364678477288 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0287845340917296 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44047764_44047839:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44047764_44047839:XRCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 31 26 57 14.3257892478392 13.9848219211672 0.340967326671993 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44079611 G/A 1 9 9 18 4.15910010421137 4.84089989578863 -0.681799791577266 A:G G A 10 0.537877766198737 0.815520419865837 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44079560_44079730:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44079560_44079730:XRCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44680990 C/T 1 10 11 21 4.62122233801263 5.91665542818611 -1.29543309017348 T:C C T 10 0.537877766198737 0.663514294637069 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44739751 G/A 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 A:G G A 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44739479_44740195:ZNF227 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 21 17 38 9.70456690982652 9.14392202537853 0.560644884447996 A:G G A 10 0.537877766198737 0.872546949127018 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 44981516 C/T 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 13 6 19 6.00758903941642 3.22726659719242 2.780322442224 T:C T C 10 0.537877766198737 0.252313312370768 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45493804 C/T 1 12 10 22 5.54546680561516 5.37877766198737 0.166689143627787 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45493653_45493843:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45493653_45493843:CLPTM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45495915 C/T 1 77 68 145 35.5834120026973 36.5756881015141 -0.992276098816859 T:C C T 10 0.537877766198737 0.868180162257164 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45561032 C/A 1 22 12 34 10.1666891436278 6.45453319438484 3.71215594924294 A:C C A 10 0.537877766198737 0.230711877620546 ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45561008_45561156:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45561008_45561156:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45561008_45561156:CLASRP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45575762 G/A 1 39 46 85 18.0227671182493 24.7423772451419 -6.71961012689264 A:G G A 10 0.537877766198737 0.157617184666856 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45668213 C/G 1 116 154 270 53.6061791209465 82.8331759946055 -29.226996873659 C:G C G 10 0.537877766198737 0.000387221693491708 ENSG00000007255:ENST00000006275:exon_45668111_45668228:TRAPPC6A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45681398 G/T 1 109 106 215 50.3713234843377 57.0150432170661 -6.64371973272844 T:G G T 10 0.537877766198737 0.37443979871362 ENSG00000007255:ENST00000006275:exon_45681351_45681485:TRAPPC6A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45683154 G/A 1 17 33 50 7.85607797462147 17.7499662845583 -9.89388830993685 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00649691024610489 ENSG00000189114:ENST00000433642:exon_45682546_45685057:BLOC1S3;ENSG00000189114:ENST00000341054:exon_45682483_45683212:BLOC1S3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 45 54 99 20.7955005210568 29.0453993747318 -8.24989885367496 T:G T G 10 0.537877766198737 0.106757279870737 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45860917 C/T 1 34 27 61 15.7121559492429 14.5226996873659 1.18945626187705 T:C C T 10 0.537877766198737 0.798357893084026 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45860888_45860957:ERCC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 50 34 84 23.1061116900632 18.2878440507571 4.8182676393061 A:C A C 10 0.537877766198737 0.325224747056684 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 66 63 129 30.5000674308834 33.8862992705204 -3.38623183963706 A:G A G 10 0.537877766198737 0.596458990210767 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 30 40 70 13.8636670140379 21.5151106479495 -7.65144363391158 A:T:C C A 10 0.537877766198737 0.0724201430246794 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 45923632 G/A 1 88 82 170 40.6667565745111 44.1059768282964 -3.43922025378528 A:G G A 10 0.537877766198737 0.644563979745863 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46124461 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.760887200836927 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46133251 C/T 1 35 6 41 16.1742781830442 3.22726659719242 12.9470115858518 T:C C T 10 0.537877766198737 2.73654233639766e-05 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46133256 G/A 1 35 5 40 16.1742781830442 2.68938883099368 13.4848893520505 A:G G A 10 0.537877766198737 8.68958998554606e-06 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46268714 C/T 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 T:C C T 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46268715 G/A 1 13 9 22 6.00758903941642 4.84089989578863 1.16668914362779 A:G G A 10 0.537877766198737 0.673692463929978 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46268806 G/A 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46318946 C/G 1 292 254 546 134.939692269969 136.620952614479 -1.68126034451038 A:C:G C G 10 0.537877766198737 0.897593600965631 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46318693_46318955:SYMPK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46387344 G/A 1 58 41 99 26.8030895604733 22.0529884141482 4.75010114632504 A:G G A 10 0.537877766198737 0.365147744268757 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 33 25 58 15.2500337154417 13.4469441549684 1.80308956047326 T:C T C 10 0.537877766198737 0.693700159622077 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46387860 C/T 1 26 29 55 12.0151780788328 15.5984552197634 -3.58327714093053 T:C C T 10 0.537877766198737 0.346581895649197 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46511421 C/T 1 19 17 36 8.780322442224 9.14392202537853 -0.36359958315453 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46511398_46511559:CCDC61 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 46850394 C/A 1 15 9 24 6.93183350701895 4.84089989578863 2.09093361123031 A:C C A 10 0.537877766198737 0.420864629088441 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46850251_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46850354_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46850358_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46850365_46850474:PPP5C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47124579 C/T 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 T:C C T 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47124626 C/T 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 T:C C T 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47124742 G/C 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 C:G G C 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47223949 G/A 1 22 28 50 10.1666891436278 15.0605774535646 -4.89388830993685 A:G G A 10 0.537877766198737 0.2014529584387 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47223793_47224028:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47223793_47224028:STRN4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47280648 G/T 1 124 139 263 57.3031569913566 74.7650095016244 -17.4618525102678 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0353053845711424 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47280468_47280662:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47280468_47280662:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47280468_47280662:SLC1A5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 92 77 169 42.5152455097162 41.4165879973027 1.09865751241345 A:G G A 10 0.537877766198737 0.877716684902228 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 A:G A G 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47879279 G/A 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47879181_47879354:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47879181_47879354:DHX34 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47880419 A/C 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 A:C A C 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47880357_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47880357_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47880357_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47880357_47880463:DHX34 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 47979915 G/A 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47979789_47979971:KPTN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48018093 T/A 1 5 15 20 2.31061116900632 8.06816649298105 -5.75755532397474 A:T T A 10 0.537877766198737 0.0123203932097094 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48253454 C/G 1 745 907 1652 344.281064181941 487.855133942254 -143.574069760313 T:C:G C G 10 0.537877766198737 1.79400499072215e-12 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48253435_48253543:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48253435_48253543:GLTSCR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48254792 C/G 1 706 731 1437 326.258297063692 393.188647091277 -66.930350027585 A:T:C:G C G 10 0.537877766198737 0.000430257002080954 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48254777_48254847:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254777_48254847:GLTSCR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 18 4 22 8.31820020842273 2.15151106479495 6.16668914362779 A:T A T 10 0.537877766198737 0.00917725491108139 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48602948 T/C 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48626218 G/A 1 51 82 133 23.5682339238644 44.1059768282964 -20.537742904432 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000459593998380705 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48626191_48626273:LIG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48631258 G/A 1 60 58 118 27.7273340280758 31.1969104395267 -3.46957641145096 A:G G A 10 0.537877766198737 0.5200363019594 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48631167_48631277:LIG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48668816 C/T 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 T:C C T 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48848444 C/G 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48848417_48848611:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48848417_48848611:TMEM143 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48977189 C/T 1 33 32 65 15.2500337154417 17.2120885183596 -1.9620548029179 T:C C T 10 0.537877766198737 0.70932313881813 ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48976979_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48975978_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000474209:exon_48977162_48977266:CYTH2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 48977479 C/T 1 30 43 73 13.8636670140379 23.1287439465457 -9.2650769325078 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0342092916335514 ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48977439_48977532:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48977439_48977587:CYTH2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49340543 G/A 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49340355_49340808:PLEKHA4;ENSG00000105559:ENST00000355496:exon_49340355_49340808:PLEKHA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49340661 C/A 1 1 16 17 0.462122233801263 8.60604425917979 -8.14392202537853 A:C C A 10 0.537877766198737 6.79590201586392e-05 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49340355_49340808:PLEKHA4;ENSG00000105559:ENST00000355496:exon_49340355_49340808:PLEKHA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49340746 T/C 1 2 16 18 0.924244467602526 8.60604425917979 -7.68179979157726 T:C T C 10 0.537877766198737 0.000225980600876398 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49340355_49340808:PLEKHA4;ENSG00000105559:ENST00000355496:exon_49340355_49340808:PLEKHA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49340772 C/G 1 16 2 18 7.39395574082021 1.07575553239747 6.31820020842274 C:G C G 10 0.537877766198737 0.00323812101921639 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49340355_49340808:PLEKHA4;ENSG00000105559:ENST00000355496:exon_49340355_49340808:PLEKHA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49344482 C/T 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49344406_49344567:PLEKHA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 141 118 259 65.1592349659781 63.469576411451 1.68965855452713 A:G G A 10 0.537877766198737 0.851883278753844 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 126 118 244 58.2274014589591 63.469576411451 -5.24217495249182 C:G G C 10 0.537877766198737 0.521108854125901 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49378875 G/A 1 223 171 394 103.053258137682 91.977098019984 11.0761601176977 A:G G A 10 0.537877766198737 0.266796254171168 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 243 203 446 112.295702813707 109.189186538344 3.10651627536332 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.775918733462743 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 283 180 463 130.780592165757 96.8179979157727 33.9625942499848 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00151504720323126 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 289 178 467 133.553325568565 95.7422423833752 37.8110831851898 C:G G C 10 0.537877766198737 0.000487523064015179 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49513317 C/T 1 390 341 731 180.227671182493 183.416318273769 -3.18864709127669 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.823933993212546 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49967924 T/A 1 22 27 49 10.1666891436278 14.5226996873659 -4.35601054373811 A:T T A 10 0.537877766198737 0.251766137913348 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49994470 T/A 1 5 10 15 2.31061116900632 5.37877766198737 -3.06816649298105 A:T T A 10 0.537877766198737 0.126399812708836 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 49994476 T/C 1 7 9 16 3.23485563660884 4.84089989578863 -1.60604425917979 T:C T C 10 0.537877766198737 0.460334234664264 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 33 20 53 15.2500337154417 10.7575553239747 4.49247839146694 A:G G A 10 0.537877766198737 0.270290721920311 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 50322482 C/G 1 8 11 19 3.6969778704101 5.91665542818611 -2.219677557776 C:G C G 10 0.537877766198737 0.361009077515707 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50322429_50322553:MED25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 74 84 158 34.1970453012935 45.1817323606939 -10.9846870594004 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0935203927581139 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 50365536 C/T 1 55 72 127 25.4167228590695 38.7271991663091 -13.3104763072396 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0204086625742726 ENSG00000039650:ENST00000322344:exon_50365442_50365538:PNKP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 51871178 A/G 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000160318:ENST00000291715:exon_51871140_51871280:CLDND2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 51875079 G/A 1 35 25 60 16.1742781830442 13.4469441549684 2.72733402807578 A:G G A 10 0.537877766198737 0.519037944003545 ENSG00000105374:ENST00000221978:exon_51874874_51875089:NKG7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 51916979 G/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:G G T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000357375:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000442846:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51916966_51917077:SIGLEC10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 53269933 T/C 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:C T C 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 53432603 G/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:G G T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000221874:ENST00000313956:exon_53430388_53432667:ZNF321 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 54376927 C/T 1 20 7 27 9.24244467602526 3.76514436339116 5.4773003126341 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0515206980703081 ENSG00000179820:ENST00000421337:exon_54376782_54377510:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000336967:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391770:exon_54376782_54379691:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000448420:exon_54376782_54377348:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000439000:exon_54376782_54377561:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391771:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391769:exon_54376782_54379689:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391768:exon_54376782_54377873:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000414489:exon_54376782_54377223:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000415619:exon_54376784_54377098:MYADM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 54610170 C/T 1 568 617 1185 262.485428799117 331.870581744621 -69.3851529455033 T:C C T 10 0.537877766198737 5.71713404464303e-05 ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 54657628 C/T 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54657452_54659418:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000489953:exon_54657452_54659419:CNOT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 20 24 44 9.24244467602526 12.9090663887697 -3.66662171274443 A:G G A 10 0.537877766198737 0.291894073384424 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 43 49 92 19.8712560534543 26.3560105437381 -6.4847544902838 T:G T G 10 0.537877766198737 0.209345782960127 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 54968038 A/G 1 15 12 27 6.93183350701895 6.45453319438484 0.477300312634102 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54967815_54968100:LENG8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 54974084 C/T 1 6 9 15 2.77273340280758 4.84089989578863 -2.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.310767806906123 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55143078 A/T 1 19 30 49 8.780322442224 16.1363329859621 -7.35601054373811 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0439712762611753 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 17 29 46 7.85607797462147 15.5984552197634 -7.7423772451419 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.0259849500697539 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55143187 G/C 1 23 1 24 10.6288113774291 0.537877766198737 10.0909336112303 C:G G C 10 0.537877766198737 1.10595203647696e-05 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 11 13 24 5.08334457181389 6.99241096058358 -1.90906638876969 T:C T C 10 0.537877766198737 0.54016131683339 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55144556 G/A 1 26 19 45 12.0151780788328 10.219677557776 1.79550052105684 A:G G A 10 0.537877766198737 0.655097818899925 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55145454 G/A 1 9 21 30 4.15910010421137 11.2954330901735 -7.13633298596211 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0100139921956524 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145422_55145634:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145422_55145472:LILRB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 130 50 180 60.0758903941642 26.8938883099368 33.1820020842273 T:C C T 10 0.537877766198737 6.04227683608922e-07 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 T:C T C 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55175295 A/G 1 16 19 35 7.39395574082021 10.219677557776 -2.82572181695579 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.397562623528634 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55175212_55175413:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175292_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175212_55175496:LILRB4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55175928 T/C 1 40 4 44 18.4848893520505 2.15151106479495 16.3333782872556 T:C T C 10 0.537877766198737 1.53168579910380e-07 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 39 4 43 18.0227671182493 2.15151106479495 15.8712560534543 A:G A G 10 0.537877766198737 2.66111461326143e-07 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 28 53 81 12.9394225464354 28.5075216085331 -15.5680990620977 A:G A G 10 0.537877766198737 0.000725084891699987 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 40 54 94 18.4848893520505 29.0453993747318 -10.5605100226813 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0300393190023594 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55604575 C/T 1 46 37 83 21.2576227548581 19.9014773493533 1.35614540550483 T:C C T 10 0.537877766198737 0.826043946282058 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55604521_55604601:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55604563_55604601:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55604521_55604601:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55604521_55604601:PPP1R12C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55606897 A/T 1 12 17 29 5.54546680561516 9.14392202537853 -3.59845521976337 A:T A T 10 0.537877766198737 0.196037430426041 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55606813_55606968:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55606813_55606971:PPP1R12C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 7 12 19 3.23485563660884 6.45453319438484 -3.219677557776 T:C T C 10 0.537877766198737 0.168962527098265 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55858733 C/T 1 11 10 21 5.08334457181389 5.37877766198737 -0.295433090173476 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000133247:ENST00000255613:exon_55858324_55859488:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000445196:exon_55858324_55859488:SUV420H2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 13 12 25 6.00758903941642 6.45453319438484 -0.446944154968424 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55994894 C/T 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 T:C C T 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 55994975 G/T 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 T:G G T 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 30 25 55 13.8636670140379 13.4469441549684 0.416722859069468 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 70 54 124 32.3485563660884 29.0453993747318 3.30315699135662 A:G G A 10 0.537877766198737 0.589438561949478 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 56160641 T/C 1 37 94 131 17.0985226506467 50.5605100226813 -33.4619873720345 T:C T C 10 0.537877766198737 3.73856332443916e-09 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56160571_56160675:CCDC106 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 91 109 200 42.0531232759149 58.6286765156623 -16.5755532397474 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0192993514683329 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 56163803 C/T 1 91 134 225 42.0531232759149 72.0756206706308 -30.0224973947158 T:C C T 10 0.537877766198737 7.31164696878736e-05 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56163796_56164527:CCDC106 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 340 324 664 157.121559492429 174.272396248391 -17.1508367559613 T:C C T 10 0.537877766198737 0.185854543132579 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 56599518 C/T 1 45 59 104 20.7955005210568 31.7347882057255 -10.9392876846686 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0384101894486877 ENSG00000142409:ENST00000270459:exon_56598732_56600461:ZNF787 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 57840498 T/C 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57839072_57842144:ZNF543 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 57956828 T/G 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:G T G 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57954659_57957191:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57954659_57956853:ZNF749 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 A:G A G 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58132216 A/G 1 6 10 16 2.77273340280758 5.37877766198737 -2.60604425917979 A:G A G 10 0.537877766198737 0.216741911044158 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58152361 T/A 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:T T A 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 T:C C T 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 C:G G C 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 T:C T C 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58596701 G/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:G G T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58595210_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58595212_58596743:ZSCAN18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 12 12 24 5.54546680561516 6.45453319438484 -0.909066388769688 A:G G A 10 0.537877766198737 0.838384934353366 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58772579 C/G 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 C:G C G 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 13 6 19 6.00758903941642 3.22726659719242 2.780322442224 A:G G A 10 0.537877766198737 0.252313312370768 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 0 19 0 19 8.780322442224 0 8.780322442224 A A 10 0.537877766198737 8.06510468081411e-06 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 0 17 0 17 7.85607797462147 0 7.85607797462147 A A 10 0.537877766198737 2.84002904419782e-05 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 13 6 19 6.00758903941642 3.22726659719242 2.780322442224 A:C A C 10 0.537877766198737 0.252313312370768 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 58991900 G/A 1 18 11 29 8.31820020842273 5.91665542818611 2.40154478023663 A:G G A 10 0.537877766198737 0.457449401187867 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.56465358229863 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 19 59061357 C/T 1 662 753 1415 305.924918776436 405.021957947649 -99.0970391712128 T:C C T 10 0.537877766198737 1.43952464328416e-07 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 264985 G/T 1 82 51 133 37.8940231717036 27.4317660761356 10.462257095568 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0816073607156516 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_264869_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_264872_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_264893_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_264900_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_264900_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_264916_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_264919_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_264926_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000480874:exon_264936_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_264963_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_264965_265007:ACP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 3391452 C/A 1 27 24 51 12.4773003126341 12.9090663887697 -0.431766076135585 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 40 73 113 18.4848893520505 39.2650769325078 -20.7801875804573 C:G G C 10 0.537877766198737 9.62615879419073e-05 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 59 68 127 27.2652117942745 36.5756881015141 -9.31047630723959 A:G A G 10 0.537877766198737 0.109008476495622 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 3502803 C/T 1 47 72 119 21.7197449886594 38.7271991663091 -17.0074541776497 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.00227624290954437 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 33 33 66 15.2500337154417 17.7499662845583 -2.49993256911664 T:C T C 10 0.537877766198737 0.540073332828691 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 3628383 C/A 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 A:C C A 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 9588338 T/C 1 79 76 155 36.5076564702998 40.878710231104 -4.37105376080423 T:C T C 10 0.537877766198737 0.519476280939078 ENSG00000119203:ENST00000238112:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000427001:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000460593:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000489629:exon_9588327_9588479:CPSF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 10074012 C/A 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10073912_10074489:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10073912_10074489:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10073912_10074537:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10073912_10074075:TAF1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 337 298 635 155.735192791026 160.287574327224 -4.55238153619797 A:G G A 10 0.537877766198737 0.720379473392991 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 178 202 380 82.2577576166248 108.651308772145 -26.39355115552 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00739449940004518 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 33 26 59 15.2500337154417 13.9848219211672 1.26521179427452 T:C C T 10 0.537877766198737 0.794760911649898 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 10942702 G/A 1 29 32 61 13.4015447802366 17.2120885183596 -3.81054373812295 A:G G A 10 0.537877766198737 0.369269902188401 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 11955322 G/C 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000134324:ENST00000396099:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000256720:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000449576:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000425416:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000396097:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000404113:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000453987:exon_11955214_11955366:LPIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 15307171 C/T 1 71 45 116 32.8106785998897 24.2044994789432 8.60617912094651 T:C C T 10 0.537877766198737 0.114037472776236 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15307032_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15307033_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15307038_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15307040_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000433283:exon_15307040_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000485694:exon_15307041_15307447:NBAS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 15307225 G/C 1 60 53 113 27.7273340280758 28.5075216085331 -0.780187580457273 T:C:G G C 10 0.537877766198737 0.924934550925 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15307032_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15307033_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15307038_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15307040_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000433283:exon_15307040_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000485694:exon_15307041_15307447:NBAS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 16 30 46 7.39395574082021 16.1363329859621 -8.7423772451419 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0114433974788266 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 18736438 G/C 1 13 33 46 6.00758903941642 17.7499662845583 -11.7423772451419 C:G G C 10 0.537877766198737 0.000560717687890338 ENSG00000240857:ENST00000381249:exon_18735989_18737074:RDH14;ENSG00000240857:ENST00000468071:exon_18736388_18737074:RDH14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 20096846 C/G 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20096404_20096887:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20096514_20096887:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000495698:exon_20096787_20096887:TTC32 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 24974945 T/G 1 12 20 32 5.54546680561516 10.7575553239747 -5.21208851835958 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0761381535055481 ENSG00000084676:ENST00000406961:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000405141:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000407230:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000348332:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000288599:exon_24974851_24975025:NCOA1;ENSG00000084676:ENST00000395856:exon_24974851_24975025:NCOA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 25042846 A/G 1 19 15 34 8.780322442224 8.06816649298105 0.712155949242943 A:G A G 10 0.537877766198737 0.864600057495229 ENSG00000138092:ENST00000380834:exon_25042223_25045245:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000473706:exon_25042223_25045245:CENPO;ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25042038_25042983:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25042041_25042983:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25042041_25042983:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25042041_25042983:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000498288:exon_25042238_25042983:ADCY3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 25053486 G/C 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 C:G G C 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 27262944 G/A 1 100 101 201 46.2122233801263 54.3256543860724 -8.11343100594613 A:G G A 10 0.537877766198737 0.258289765353991 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000434544:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460665:exon_27262229_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000469445:exon_27262788_27263364:TMEM214 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 27290525 A/G 1 6 9 15 2.77273340280758 4.84089989578863 -2.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.310767806906123 ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 27315296 G/A 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000138030:ENST00000260599:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000260598:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000490823:exon_27315200_27315316:KHK;ENSG00000138030:ENST00000429697:exon_27315200_27315316:KHK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 27322538 A/G 1 12 8 20 5.54546680561516 4.3030221295899 1.24244467602526 A:G A G 10 0.537877766198737 0.657647615348739 ENSG00000138030:ENST00000260599:exon_27322533_27323619:KHK;ENSG00000138030:ENST00000260598:exon_27322533_27323640:KHK;ENSG00000138030:ENST00000490823:exon_27322533_27322769:KHK;ENSG00000138030:ENST00000464371:exon_27322533_27322837:KHK;ENSG00000138028:ENST00000440612:exon_27321757_27322708:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000402550:exon_27321757_27322708:CGREF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 15 27 42 6.93183350701895 14.5226996873659 -7.59086618034695 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0203297857659761 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 29073249 T/C 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 T:C T C 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000163806:ENST00000379579:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000334056:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000439646:exon_29072716_29073300:SPDYA;ENSG00000171103:ENST00000419999:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29073194_29073271:TRMT61B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 155 174 329 71.6289462391958 93.5907313185802 -21.9617850793845 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.0173000411952632 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 30480464 G/A 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 A:G G A 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000213626:ENST00000395323:exon_30480299_30482894:LBH;ENSG00000213626:ENST00000406087:exon_30480299_30480522:LBH;ENSG00000213626:ENST00000401506:exon_30480299_30480626:LBH;ENSG00000213626:ENST00000467242:exon_30480299_30480906:LBH;ENSG00000213626:ENST00000407930:exon_30480299_30481189:LBH;ENSG00000213626:ENST00000484150:exon_30480299_30480566:LBH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 32800422 C/G 1 12 5 17 5.54546680561516 2.68938883099368 2.85607797462147 C:G C G 10 0.537877766198737 0.224394873418676 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32800223_32800433:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000470250:exon_32800358_32800433:BIRC6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 32961858 A/G 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 A:G A G 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32961761_32961883:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32961852_32961883:TTC27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 3 13 16 1.38636670140379 6.99241096058358 -5.60604425917979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00533214334062272 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 37227797 C/G 1 12 3 15 5.54546680561516 1.61363329859621 3.93183350701895 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0663458133820393 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37227729_37227956:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37227729_37227956:HEATR5B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 37474732 A/G 1 27 25 52 12.4773003126341 13.4469441549684 -0.969643842334321 A:G A G 10 0.537877766198737 0.78318800688673 ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000419278:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000441905:exon_37474599_37474772:C2orf56 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 37475489 A/G 1 17 21 38 7.85607797462147 11.2954330901735 -3.43935511555201 A:G A G 10 0.537877766198737 0.329086913970063 ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37475278_37475563:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000419278:exon_37475278_37475530:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000441905:exon_37475401_37475569:C2orf56 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 38525597 A/C 1 12 2 14 5.54546680561516 1.07575553239747 4.46971127321768 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0164542511926511 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000477642:exon_38525073_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000489896:exon_38525360_38525717:ATL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 43015684 G/A 1 15 7 22 6.93183350701895 3.76514436339116 3.16668914362779 A:G G A 10 0.537877766198737 0.203542575036699 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 43015717 G/A 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 43518843 A/G 1 14 20 34 6.46971127321768 10.7575553239747 -4.28784405075706 A:G A G 10 0.537877766198737 0.168884268594466 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43518835_43519361:THADA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 43625184 T/A 1 11 13 24 5.08334457181389 6.99241096058358 -1.90906638876969 A:T:C T A 10 0.537877766198737 0.54016131683339 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000473004:exon_43625110_43625197:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485353:exon_43625110_43625278:THADA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 14 18 32 6.46971127321768 9.68179979157727 -3.21208851835958 T:C T C 10 0.537877766198737 0.289400725386081 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 18 18 36 8.31820020842273 9.68179979157727 -1.36359958315453 T:C T C 10 0.537877766198737 0.738822345632434 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 45640334 T/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 T:C T C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 16 10 26 7.39395574082021 5.37877766198737 2.01517807883284 A:G G A 10 0.537877766198737 0.556039763483853 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 8 12 20 3.6969778704101 6.45453319438484 -2.75755532397474 T:C T C 10 0.537877766198737 0.264025791085066 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 48026991 C/T 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:C C T 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48025750_48028294:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48025750_48028294:MSH6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 53955883 G/C 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 54093956 G/A 1 43 31 74 19.8712560534543 16.6742107521608 3.19704530129346 A:G G A 10 0.537877766198737 0.485814088446065 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000476586:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000488687:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000466539:exon_54093884_54094017:PSME4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 A:G A G 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:T A T 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 54882291 C/A 1 25 18 43 11.5530558450316 9.68179979157727 1.87125605345431 A:C C A 10 0.537877766198737 0.647289435959162 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54882207_54882345:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54882207_54882345:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54882207_54882345:SPTBN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 40 33 73 18.4848893520505 17.7499662845583 0.734923067492204 T:C C T 10 0.537877766198737 0.906897242128515 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 58390168 A/G 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 A:G A G 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000115392:ENST00000403295:exon_58390164_58390209:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000233741:exon_58390164_58390209:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000402135:exon_58390164_58390209:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000403676:exon_58390164_58390209:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000449070:exon_58390164_58390209:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000446381:exon_58390164_58390209:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000470506:exon_58390000_58390652:FANCL;ENSG00000115392:ENST00000427708:exon_58390164_58390209:FANCL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 61175312 T/C 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000162927:ENST00000316752:exon_61175178_61175320:PUS10;ENSG00000162927:ENST00000407787:exon_61175178_61175320:PUS10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 64685594 G/A 1 1 15 16 0.462122233801263 8.06816649298105 -7.60604425917979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000133976831433024 ENSG00000119862:ENST00000238875:exon_64685419_64688515:AC008074.1;ENSG00000119862:ENST00000409537:exon_64685419_64688515:AC008074.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 65217089 G/C 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 67631800 A/G 1 11 8 19 5.08334457181389 4.3030221295899 0.780322442223998 A:G A G 10 0.537877766198737 0.82002331137955 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 29 22 51 13.4015447802366 11.8333108563722 1.56823392386442 A:G G A 10 0.537877766198737 0.676566409146657 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 68622990 T/C 1 56 45 101 25.8788450928707 24.2044994789432 1.67434561392757 T:C T C 10 0.537877766198737 0.765419739578338 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 71351648 G/A 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000494660:exon_71351477_71351673:MCEE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 71360356 G/A 1 53 41 94 24.4924783914669 22.0529884141482 2.43948997731873 A:G G A 10 0.537877766198737 0.679332198496604 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 41 38 79 18.9470115858518 20.439355115552 -1.49234352970022 A:G G A 10 0.537877766198737 0.736648717157499 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 71654450 A/G 1 48 39 87 22.1818672224606 20.9772328817507 1.20463434070988 A:G A G 10 0.537877766198737 0.830313375388699 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 71658541 C/T 1 94 77 171 43.4394899773187 41.4165879973027 2.02290198001598 T:C C T 10 0.537877766198737 0.818113692769151 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 73455600 C/T 1 30 24 54 13.8636670140379 12.9090663887697 0.954600625268204 T:C C T 10 0.537877766198737 0.891637427459973 ENSG00000135617:ENST00000258083:exon_73455134_73455702:C2orf7;ENSG00000135617:ENST00000480093:exon_73455459_73455702:C2orf7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 73466786 C/T 1 83 95 178 38.3561454055048 51.09838778888 -12.7422423833752 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0601072666578698 ENSG00000135624:ENST00000471927:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000469844:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473197:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000492253:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73466771_73467275:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000482064:exon_73466771_73466924:CCT7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 73477527 C/T 1 531 542 1073 245.386906148471 291.529749279715 -46.1428431312447 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00484319665457727 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74057995 T/C 1 21 20 41 9.70456690982652 10.7575553239747 -1.05298841414822 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.75645621742903 ENSG00000124356:ENST00000339566:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000409707:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000452725:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000432295:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000424659:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394073:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394070:exon_74057972_74058186:STAMBP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74394161 T/C 1 23 15 38 10.6288113774291 8.06816649298105 2.560644884448 T:C T C 10 0.537877766198737 0.421685001942702 ENSG00000114978:ENST00000493755:exon_74394141_74394234:MOBKL1B;ENSG00000114978:ENST00000396049:exon_74394141_74394234:MOBKL1B;ENSG00000114978:ENST00000264089:exon_74394141_74394234:MOBKL1B;ENSG00000114978:ENST00000497054:exon_74394141_74394234:MOBKL1B;ENSG00000114978:ENST00000495286:exon_74394141_74394234:MOBKL1B;ENSG00000114978:ENST00000463975:exon_74394141_74394234:MOBKL1B;ENSG00000114978:ENST00000409969:exon_74394141_74394234:MOBKL1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74596321 T/C 1 19 19 38 8.780322442224 10.219677557776 -1.439355115552 T:C T C 10 0.537877766198737 0.745392905794243 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74596225_74596341:DCTN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74597937 G/T 1 17 25 42 7.85607797462147 13.4469441549684 -5.59086618034695 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0900476169524938 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74597748_74597952:DCTN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74688884 G/A 1 60 52 112 27.7273340280758 27.9696438423343 -0.242309814258537 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 26 13 39 12.0151780788328 6.99241096058358 5.02276711824926 A:G G A 10 0.537877766198737 0.111370496383565 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 14 18 32 6.46971127321768 9.68179979157727 -3.21208851835958 T:C C T 10 0.537877766198737 0.289400725386081 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 164 113 277 75.7880463434071 60.7801875804573 15.0078587629499 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0709441745811074 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 4 10 14 1.84848893520505 5.37877766198737 -3.53028872678232 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0652981523722034 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 74781871 C/G 1 6 9 15 2.77273340280758 4.84089989578863 -2.06816649298105 C:G C G 10 0.537877766198737 0.310767806906123 ENSG00000115325:ENST00000233668:exon_74781213_74781941:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000488613:exon_74781849_74781941:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000340004:exon_74781858_74781941:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000489958:exon_74781861_74781941:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000482206:exon_74781865_74781986:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000474924:exon_74781865_74781941:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000480318:exon_74781865_74781941:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000496966:exon_74781869_74781941:DOK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 75185856 G/T 1 123 126 249 56.8410347575554 67.7725985410408 -10.9315637834855 T:G G T 10 0.537877766198737 0.181880589131132 ENSG00000115350:ENST00000483063:exon_75185619_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000393918:exon_75185775_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000485527:exon_75185832_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000459636:exon_75185833_75186019:POLE4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 75893101 G/C 1 15 15 30 6.93183350701895 8.06816649298105 -1.13633298596211 C:G G C 10 0.537877766198737 0.716798206541668 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000427862:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75893055_75893179:C2orf3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 18 17 35 8.31820020842273 9.14392202537853 -0.825721816955793 T:C C T 10 0.537877766198737 0.86584201833544 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 85554080 G/A 1 16 9 25 7.39395574082021 4.84089989578863 2.55305584503158 A:G G A 10 0.537877766198737 0.324549732879746 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 85811592 C/T 1 53 61 114 24.4924783914669 32.810543738123 -8.31806534665601 T:C C T 10 0.537877766198737 0.132715093459559 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85811531_85811616:VAMP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 86344237 A/G 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409326:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409783:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000418628:exon_86344178_86344243:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86344178_86344282:PTCD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 86385668 T/C 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 86385812 T/C 1 19 20 39 8.780322442224 10.7575553239747 -1.97723288175074 T:C T C 10 0.537877766198737 0.526240071250459 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 86979093 G/A 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000153561:ENST00000283632:exon_86979019_86979153:RMND5A;ENSG00000153561:ENST00000466417:exon_86979019_86979153:RMND5A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 6365 1307 7672 2941.40801814504 703.006240421749 2238.40177772329 A:T:C:G C G 10 0.537877766198737 0 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 89160122 G/A 1 10 2 12 4.62122233801263 1.07575553239747 3.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0451025910853133 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 89160377 G/C 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 89160403 A/C 1 2376 6 2382 1098.0024275118 3.22726659719242 1094.77516091461 A:C A C 10 0.537877766198737 0 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 89160739 T/C 1 1221 11 1232 564.251247471342 5.91665542818611 558.334592043156 T:C T C 10 0.537877766198737 1.40889553200819e-306 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 96861159 C/G 1 8 12 20 3.6969778704101 6.45453319438484 -2.75755532397474 C:G C G 10 0.537877766198737 0.264025791085066 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000462501:exon_96861079_96861252:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96861079_96861287:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000488084:exon_96860941_96861287:STARD7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 20 14 34 9.24244467602526 7.53028872678232 1.71215594924294 T:C C T 10 0.537877766198737 0.608714683105822 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 22 11 33 10.1666891436278 5.91665542818611 4.25003371544168 A:G A G 10 0.537877766198737 0.163296960793547 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 27 48 75 12.4773003126341 25.8181327775394 -13.3408324649053 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00240990709558277 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 30 14 44 13.8636670140379 7.53028872678232 6.33337828725557 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0687350757590677 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 98277090 T/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 T:C T C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98277034_98277109:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98277034_98277109:ACTR1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 8 15 23 3.6969778704101 8.06816649298105 -4.37118862257095 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0926012068362168 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 15 8 23 6.93183350701895 4.3030221295899 2.62881137742905 T:C T C 10 0.537877766198737 0.302209397783681 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 99804642 T/C 1 30 23 53 13.8636670140379 12.3711886225709 1.49247839146694 T:C T C 10 0.537877766198737 0.783247089175858 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99804640_99804720:MRPL30 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 60 56 116 27.7273340280758 30.1211549071293 -2.39382087905349 A:G G A 10 0.537877766198737 0.709742343478246 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 99936138 T/C 1 19 3 22 8.780322442224 1.61363329859621 7.16668914362779 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00206949514356664 ENSG00000115514:ENST00000264255:exon_99935445_99936262:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000422767:exon_99935971_99936262:TXNDC9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 100055112 C/A 1 20 9 29 9.24244467602526 4.84089989578863 4.40154478023663 A:C C A 10 0.537877766198737 0.135195478390590 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000491752:exon_100055063_100055142:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 100055158 T/C 1 14 23 37 6.46971127321768 12.3711886225709 -5.90147734935327 T:C T C 10 0.537877766198737 0.068419212170936 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 7 19 26 3.23485563660884 10.219677557776 -6.98482192116716 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00915395185824377 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 103334969 G/A 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:G G A 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000135953:ENST00000258436:exon_103332299_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000438943:exon_103333497_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000437075:exon_103334030_103335666:MFSD9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 103334983 G/C 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 C:G G C 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000135953:ENST00000258436:exon_103332299_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000438943:exon_103333497_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000437075:exon_103334030_103335666:MFSD9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 26 36 62 12.0151780788328 19.3635995831545 -7.34842150432169 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0739208250642772 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 105705507 C/T 1 56 24 80 25.8788450928707 12.9090663887697 12.969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00346572645523129 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105705442_105705527:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105705476_105705527:MRPS9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 105713697 A/G 1 160 149 309 73.9395574082021 80.1437871636118 -6.20422975540971 A:G A G 10 0.537877766198737 0.49383646343999 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105713613_105713782:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000413583:exon_105713613_105713746:MRPS9;ENSG00000135972:ENST00000472220:exon_105713613_105713782:MRPS9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 109400267 C/T 1 44 20 64 20.3333782872556 10.7575553239747 9.57582296328084 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.0170694388206662 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109400052_109402267:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109400052_109400561:RANBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 5 8 13 2.31061116900632 4.3030221295899 -1.99241096058358 A:G A G 10 0.537877766198737 0.282359568582401 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 248 175 423 114.606313982713 94.128609084779 20.4777048979343 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0509898932274141 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 120078731 A/G 1 10 26 36 4.62122233801263 13.9848219211672 -9.36359958315453 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00220040458043384 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 370 429 799 170.985226506467 230.749561699258 -59.7643351927908 A:T:C A C 10 0.537877766198737 2.36163559150571e-05 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 128393800 T/C 1 15 18 33 6.93183350701895 9.68179979157727 -2.74996628455832 T:C T C 10 0.537877766198737 0.384427877209256 ENSG00000169994:ENST00000428314:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000272666:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000389524:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409816:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000496841:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409090:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000491278:exon_128393783_128393899:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000494959:exon_128393783_128393899:MYO7B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 128397903 G/A 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000072163:ENST00000494613:exon_128397845_128397978:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000484252:exon_128397845_128398563:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000466410:exon_128397845_128398563:LIMS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 128471545 G/T 1 28 22 50 12.9394225464354 11.8333108563722 1.10611169006315 T:G G T 10 0.537877766198737 0.77860478064009 ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128471157_128471595:WDR33 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 6 13 19 2.77273340280758 6.99241096058358 -4.219677557776 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0651269816126054 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 14 10 24 6.46971127321768 5.37877766198737 1.09093361123031 A:G G A 10 0.537877766198737 0.687960904025668 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 128945152 C/T 1 34 36 70 15.7121559492429 19.3635995831545 -3.65144363391159 T:C C T 10 0.537877766198737 0.402963049385292 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000418197:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000465836:exon_128945023_128945188:UGGT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 130948224 T/C 1 1186 1419 2605 548.076969288298 763.248550236008 -215.17158094771 T:C T C 10 0.537877766198737 3.49628464416373e-17 ENSG00000152082:ENST00000425361:exon_130948042_130948286:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000457492:exon_130948042_130948268:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000281871:exon_130948042_130948300:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000409255:exon_130948042_130948285:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000455239:exon_130948042_130948302:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000480182:exon_130948042_130948300:MZT2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 131103479 C/T 1 222 231 453 102.59113590388 124.249763991908 -21.6586280880278 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0427469014862837 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103140_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460100:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462357:exon_131103352_131103685:IMP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 131130435 G/C 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 C:G G C 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000072135:ENST00000462321:exon_131130181_131130520:PTPN18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 132241666 G/A 1 448 201 649 207.030760742966 108.113431005946 98.9173297370197 A:G G A 10 0.537877766198737 2.91655350970444e-15 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 132241704 C/T 1 495 232 727 228.750505731625 124.787641758107 103.962863973518 T:C C T 10 0.537877766198737 5.01136690645602e-15 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 132241731 T/C 1 678 372 1050 313.318874517256 200.09052902593 113.228345491326 T:C T C 10 0.537877766198737 1.75508209051527e-12 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 132290464 G/A 1 150 132 282 69.3183350701895 70.9998651382333 -1.68153006804381 A:G G A 10 0.537877766198737 0.857928762649584 ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132290437_132290514:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290437_132290510:CCDC74A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 132290957 C/G 1 184 189 373 85.0304910194324 101.658897811561 -16.6284067921289 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0866973112546303 ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290842_132291239:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290842_132291239:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290842_132291239:CCDC74A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 17 18 35 7.85607797462147 9.68179979157727 -1.82572181695579 A:G A G 10 0.537877766198737 0.61209834318284 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 136519421 A/G 1 200 170 370 92.4244467602526 91.4392202537853 0.985226506467328 A:G A G 10 0.537877766198737 0.958429033306445 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136519388_136519481:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000426921:exon_136519388_136519451:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136519388_136519481:UBXN4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 136624155 G/A 1 12 21 33 5.54546680561516 11.2954330901735 -5.74996628455832 A:G G A 10 0.537877766198737 0.05412091999447 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136624133_136624298:MCM6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 136664975 A/G 1 413 405 818 190.856482559922 217.840495310488 -26.9840127505668 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0630396521511234 ENSG00000115866:ENST00000264161:exon_136664247_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000478212:exon_136664394_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000489964:exon_136664814_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000422708:exon_136664830_136664977:DARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 144461081 G/A 1 174 165 339 80.4092686814198 88.7498314227916 -8.34056274137183 A:G G A 10 0.537877766198737 0.383552451427836 ENSG00000075884:ENST00000295095:exon_144460988_144461093:ARHGAP15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 152132130 A/G 1 117 129 246 54.0683013547478 69.3862318396371 -15.3179304848893 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0549284515324426 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 23 36 59 10.6288113774291 19.3635995831545 -8.73478820572548 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0260266962594989 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 13 5 18 6.00758903941642 2.68938883099368 3.31820020842274 A:G G A 10 0.537877766198737 0.155963033480451 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 27 12 39 12.4773003126341 6.45453319438484 6.02276711824926 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0553022161255149 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 153575381 C/A 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000177917:ENST00000326446:exon_153574428_153575538:ARL6IP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 159537137 G/A 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 A:G G A 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000144283:ENST00000426248:exon_159536941_159537564:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000389757:exon_159536941_159539391:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000389759:exon_159536941_159537941:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000428353:exon_159536941_159537941:PKP4;ENSG00000144283:ENST00000480171:exon_159536941_159537938:PKP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 160104896 C/A 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 A:C C A 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 162087555 T/C 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000468831:exon_162087482_162087686:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162087482_162088062:TANK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 162087835 G/A 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000439442:exon_162087697_162088062:TANK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 170402778 T/C 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 T:C T C 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 170403106 G/A 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 A:G G A 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 170428176 A/G 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000438035:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000445210:exon_170428163_170428681:FASTKD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 170428198 G/A 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000438035:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000445210:exon_170428163_170428681:FASTKD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 170493480 G/A 1 854 776 1630 394.652387666279 417.39314657022 -22.7407589039412 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 0.26367398096086 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 4 11 15 1.84848893520505 5.91665542818611 -4.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0400137374002459 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 174946760 T/C 1 6 20 26 2.77273340280758 10.7575553239747 -7.98482192116716 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00243220826011707 ENSG00000138430:ENST00000284719:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000344357:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000409546:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000449400:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000392560:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000462000:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000429575:exon_174946738_174946792:OLA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 175439951 G/C 1 51 42 93 23.5682339238644 22.590866180347 0.977367743517462 C:G G C 10 0.537877766198737 0.917253202474885 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175439932_175440108:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392548:exon_175439932_175440108:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175439932_175440108:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175439932_175440108:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175439932_175440108:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175439932_175440108:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175439932_175440108:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175439932_175440108:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000455428:exon_175439932_175440099:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000410117:exon_175439932_175440108:WIPF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 176829147 C/T 1 10 1 11 4.62122233801263 0.537877766198737 4.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0142271384391581 ENSG00000144320:ENST00000272748:exon_176829100_176829151:KIAA1715;ENSG00000144320:ENST00000409660:exon_176829100_176829151:KIAA1715 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 177191606 A/G 1 16 14 30 7.39395574082021 7.53028872678232 -0.136332985962109 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000128654:ENST00000420864:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000392529:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000249442:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000423461:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000443241:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000452865:exon_177191553_177191629:MTX2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 121 106 227 55.9167902899528 57.0150432170661 -1.09825292711329 T:C C T 10 0.537877766198737 0.894253237749115 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 180810358 C/T 1 106 123 229 48.9849567829339 66.1589652424447 -17.1740084595108 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0241844981728130 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 3 12 15 1.38636670140379 6.45453319438484 -5.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00948828165941395 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 16 21 37 7.39395574082021 11.2954330901735 -3.90147734935327 T:C T C 10 0.537877766198737 0.248255429267492 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 76 37 113 35.121289768896 19.9014773493533 15.2198124195427 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00446904172844177 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 190329873 A/G 1 14 11 25 6.46971127321768 5.91665542818611 0.553055845031576 A:G A G 10 0.537877766198737 0.844404343432166 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190329805_190329980:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190329805_190329980:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190329805_190329980:WDR75 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 190788123 G/T 0 417 1 418 192.704971495127 0.537877766198737 192.167093728928 A:G G A 10 0.537877766198737 1.22910960588335e-110 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 32 65 97 14.7879114816404 34.9620548029179 -20.1741433212775 T:C C T 10 0.537877766198737 5.69218316220352e-05 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 191114381 T/G 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191114366_191114452:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191114366_191114452:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191114366_191114452:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000410045:exon_191114366_191114452:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409820:exon_191114366_191114452:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392333:exon_191114366_191114452:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000485992:exon_191114366_191114452:HIBCH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 191839658 A/C 1 49 63 112 22.6439894562619 33.8862992705204 -11.2423098142585 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0368660475864024 ENSG00000115415:ENST00000415035:exon_191839556_191839661:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000423282:exon_191839556_191839658:STAT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 197637812 T/C 1 5 15 20 2.31061116900632 8.06816649298105 -5.75755532397474 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0123203932097094 ENSG00000119041:ENST00000263956:exon_197637640_197637877:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000416690:exon_197637731_197637877:GTF3C3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 87 87 174 40.2046343407099 46.7953656592901 -6.59073131858023 A:G A G 10 0.537877766198737 0.323795317343986 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201354922 G/C 1 15 14 29 6.93183350701895 7.53028872678232 -0.598455219763371 C:G G C 10 0.537877766198737 0.85397889757185 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 14 15 29 6.46971127321768 8.06816649298105 -1.59845521976337 C:G C G 10 0.537877766198737 0.580633347407564 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201354955 C/G 1 15 13 28 6.93183350701895 6.99241096058358 -0.0605774535646342 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201436154 A/C 1 30 34 64 13.8636670140379 18.2878440507571 -4.42417703671916 A:C A C 10 0.537877766198737 0.315948363546867 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201736112 T/C 1 17 13 30 7.85607797462147 6.99241096058358 0.863667014037891 T:C T C 10 0.537877766198737 0.855400861350958 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201736166 A/C 1 12 10 22 5.54546680561516 5.37877766198737 0.166689143627787 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 23 39 62 10.6288113774291 20.9772328817507 -10.3484215043217 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0103582090787982 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 201928671 G/T 0 212 0 212 97.9699135658678 0 97.9699135658678 G G 10 0.537877766198737 8.90719926291937e-58 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 202025442 G/C 1 51 38 89 23.5682339238644 20.439355115552 3.12887880831241 C:G G C 10 0.537877766198737 0.525332427907496 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 203103206 A/C 1 2 12 14 0.924244467602526 6.45453319438484 -5.53028872678232 A:C A C 10 0.537877766198737 0.00505809924159925 ENSG00000116030:ENST00000392246:exon_203103163_203103331:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000392245:exon_203103163_203103322:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000409368:exon_203103163_203103317:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000392244:exon_203103163_203103289:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000264281:exon_203103163_203103289:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000409712:exon_203103163_203103299:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000409181:exon_203103163_203103292:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000409498:exon_203103163_203103309:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000409627:exon_203103163_203103289:SUMO1;ENSG00000116030:ENST00000421569:exon_203103163_203103331:SUMO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 204103767 C/T 1 12 9 21 5.54546680561516 4.84089989578863 0.704566909826523 T:C C T 10 0.537877766198737 0.82918998973449 ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204103663_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204103700_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204103705_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204103705_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204103732_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000463131:exon_204103734_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000489360:exon_204103744_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000428265:exon_204103744_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204103750_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000443941:exon_204103758_204103857:CYP20A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 207656535 T/C 1 39 42 81 18.0227671182493 22.590866180347 -4.56809906209769 T:C T C 10 0.537877766198737 0.317888091034849 ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207656407_207657233:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207656407_207656613:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207653543_207656670:FASTKD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 5 8 13 2.31061116900632 4.3030221295899 -1.99241096058358 A:G A G 10 0.537877766198737 0.282359568582401 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 209106860 C/T 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 T:C C T 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000138413:ENST00000345146:exon_209106718_209106869:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000423977:exon_209106718_209106869:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000446179:exon_209106718_209106869:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415913:exon_209106718_209106869:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000441842:exon_209106718_209106869:IDH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 217012901 A/G 1 314 305 619 145.106381413597 164.052718690615 -18.9463372770182 A:G A G 10 0.537877766198737 0.135781961285227 ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 219266423 C/A 1 28 19 47 12.9394225464354 10.219677557776 2.71974498865936 A:C C A 10 0.537877766198737 0.466730923878796 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 219501133 G/A 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 G G 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000115556:ENST00000396797:exon_219500966_219501300:PLCD4;ENSG00000115556:ENST00000459791:exon_219500966_219501907:PLCD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 219503113 C/T 1 41 30 71 18.9470115858518 16.1363329859621 2.81067859988968 T:C C T 10 0.537877766198737 0.552632141033643 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219502644_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219502868_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219502868_219503531:ZNF142 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 219507012 G/A 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 A:G G A 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 219507302 C/T 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219506751_219509787:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219506751_219509787:ZNF142 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 219613607 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219613559_219613657:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219613559_219613657:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219613559_219613657:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219613559_219613657:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417196:exon_219613559_219613620:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000467841:exon_219613559_219613657:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000480472:exon_219613559_219613657:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000465558:exon_219613559_219613657:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000434241:exon_219613559_219613642:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000448224:exon_219613559_219613657:TTLL4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 220045902 C/T 1 24 24 48 11.0909336112303 12.9090663887697 -1.81813277753938 T:C C T 10 0.537877766198737 0.66482440830302 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045784_220046185:FAM134A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 220047098 C/G 1 30 16 46 13.8636670140379 8.60604425917979 5.2576227548581 C:G C G 10 0.537877766198737 0.139476579262336 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 220085847 T/C 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 T:C T C 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 220472863 G/A 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 A:C:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220472769_220473152:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000426736:exon_220472769_220473152:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000475396:exon_220472769_220473152:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220472769_220473152:STK11IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 220476533 A/G 1 12 9 21 5.54546680561516 4.84089989578863 0.704566909826523 A:G A G 10 0.537877766198737 0.82918998973449 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220476326_220476556:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220476326_220476556:STK11IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 223423362 A/G 1 38 30 68 17.560644884448 16.1363329859621 1.42431189848589 A:G A G 10 0.537877766198737 0.808111099332525 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 223436607 C/T 1 385 422 807 177.917060013486 226.984417335867 -49.0673573223807 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000607545480569855 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 223489486 A/G 1 46 59 105 21.2576227548581 31.7347882057255 -10.4771654508674 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0497757684784168 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223489433_223489494:FARSB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 224824484 C/T 1 65 72 137 30.0379451970821 38.7271991663091 -8.68925396922696 T:C C T 10 0.537877766198737 0.145478058754267 ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 177 214 391 81.7956353828236 115.10584196653 -33.3102065837061 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.000798608420734261 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231048348 T/G 1 341 212 553 157.583681726231 114.030086434132 43.5535952920985 T:G T G 10 0.537877766198737 0.000202228646200341 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231048288_231048356:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231048288_231048356:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231048288_231048356:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231048288_231048356:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231048288_231048356:SP110 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 217 120 337 100.280524734874 64.5453319438484 35.7351927910256 T:C C T 10 0.537877766198737 9.9320532133991e-05 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231077618 T/C 1 104 161 265 48.0607123153314 86.5983203579967 -38.5376080426653 T:C T C 10 0.537877766198737 2.44766533828151e-06 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077476_231077620:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231118041 A/C 1 15 34 49 6.93183350701895 18.2878440507571 -11.3560105437381 A:C A C 10 0.537877766198737 0.00139352139186277 ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231120241 G/C 1 35 30 65 16.1742781830442 16.1363329859621 0.0379451970820988 A:C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231120167_231120247:SP140 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231222655 G/T 1 13 13 26 6.00758903941642 6.99241096058358 -0.98482192116716 T:G G T 10 0.537877766198737 0.699848188249655 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231256812 A/G 1 9 13 22 4.15910010421137 6.99241096058358 -2.83331085637221 A:G A G 10 0.537877766198737 0.285712862815016 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231256802_231256944:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231256802_231256944:SP140L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231258150 C/T 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 T:C C T 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231258129_231258176:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231258129_231258176:SP140L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231325944 C/G 1 6 15 21 2.77273340280758 8.06816649298105 -5.29543309017348 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0269410218878813 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231326148 G/A 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 A:G G A 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231738168 G/A 1 20 29 49 9.24244467602526 15.5984552197634 -6.35601054373811 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0847738627875016 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231738263 C/T 1 59 33 92 27.2652117942745 17.7499662845583 9.5152455097162 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0474525781154601 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231738269 G/A 1 54 1 55 24.9546006252682 0.537877766198737 24.4167228590695 A:G G A 10 0.537877766198737 9.01568369908442e-14 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 231742198 G/T 1 101 119 220 46.6743456139276 64.0074541776497 -17.3331085637221 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0213425177893239 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000335005:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231742115_231742265:ITM2C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 232952286 A/G 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000144535:ENST00000273009:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000360410:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409401:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000445090:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000464554:exon_232952197_232952554:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000470087:exon_232952197_232952431:DIS3L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 234749722 T/G 1 66 46 112 30.5000674308834 24.7423772451419 5.75769018574146 T:G T G 10 0.537877766198737 0.297806605012017 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 238671499 C/T 1 193 140 333 89.1895911236438 75.3028872678232 13.8867038558206 T:C C T 10 0.537877766198737 0.137762257362696 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 238671536 A/G 1 150 211 361 69.3183350701895 113.492208667933 -44.173873597744 A:G A G 10 0.537877766198737 3.95130146465453e-06 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 238671889 G/A 1 508 435 943 234.758094771042 233.976828296451 0.781266474591064 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 0.973952961379973 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 238672453 T/A 1 210 310 520 97.0456690982652 166.742107521608 -69.6964384233432 A:T T A 10 0.537877766198737 1.03645619855593e-09 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 238672691 A/G 1 193 164 357 89.1895911236438 88.2119536565929 0.977637467050911 A:G A G 10 0.537877766198737 0.957680171066136 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 238896627 T/C 1 23 26 49 10.6288113774291 13.9848219211672 -3.35601054373811 T:C T C 10 0.537877766198737 0.390470469611026 ENSG00000184182:ENST00000440223:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000441728:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000512459:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000518380:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434002:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000272930:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433568:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000448502:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409633:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000470484:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000455999:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000417231:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000445676:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439338:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439780:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000454786:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433241:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409953:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409332:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434655:exon_238896605_238896634:UBE2F HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 238991938 T/C 1 8 24 32 3.6969778704101 12.9090663887697 -9.21208851835958 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00117987308075415 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238991889_238991995:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238991889_238991944:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238991887_238991995:SCLY HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 23 23 46 10.6288113774291 12.3711886225709 -1.7423772451419 T:C T C 10 0.537877766198737 0.658482350366384 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 239353001 C/T 1 14 14 28 6.46971127321768 7.53028872678232 -1.06057745356464 T:C C T 10 0.537877766198737 0.708574000555236 ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239352983_239353016:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000409297:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239352983_239353115:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000468122:exon_239352983_239353368:ASB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 21 15 36 9.70456690982652 8.06816649298105 1.63640041684547 A:G G A 10 0.537877766198737 0.619758110476252 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 241570006 C/T 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 242195719 C/G 1 24 20 44 11.0909336112303 10.7575553239747 0.333378287255574 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470710:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000435952:exon_242195599_242195814:HDLBP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 59 51 110 27.2652117942745 27.4317660761356 -0.166554281861064 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 6 19 25 2.77273340280758 10.219677557776 -7.44694415496842 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00400624606789888 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 270204 T/C 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_270200_270317:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_270200_270317:C20orf96 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 54 39 93 24.9546006252682 20.9772328817507 3.97736774351747 T:C C T 10 0.537877766198737 0.466851312129286 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 825678 T/C 1 8 13 21 3.6969778704101 6.99241096058358 -3.29543309017348 T:C T C 10 0.537877766198737 0.189398501979991 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 37 45 82 17.0985226506467 24.2044994789432 -7.10597682829643 A:T:G T G 10 0.537877766198737 0.121846549755393 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 2635157 C/T 1 82 63 145 37.8940231717036 33.8862992705204 4.00772390118315 T:C C T 10 0.537877766198737 0.560046953517314 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 2774797 A/C 1 36 70 106 16.6364004168455 37.6514436339116 -21.0150432170661 A:T:C A C 10 0.537877766198737 5.3053770850853e-05 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 2776905 G/T 1 46 8 54 21.2576227548581 4.3030221295899 16.9546006252682 T:G G T 10 0.537877766198737 1.60105936053901e-06 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2776893_2777089:CPXM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 2844911 C/T 1 30 20 50 13.8636670140379 10.7575553239747 3.10611169006315 T:C C T 10 0.537877766198737 0.398376657888533 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2844595_2844933:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2844830_2844933:PTPRA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 3129557 T/C 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 3739276 T/C 1 55 60 115 25.4167228590695 32.2726659719242 -6.85594311285475 T:C T C 10 0.537877766198737 0.224038919868753 ENSG00000101220:ENST00000379772:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000217195:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000487464:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399683:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399672:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000405186:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000379765:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399673:exon_3739183_3739325:C20orf27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 29 20 49 13.4015447802366 10.7575553239747 2.64398945626189 T:C C T 10 0.537877766198737 0.476848420122396 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 12 7 19 5.54546680561516 3.76514436339116 1.780322442224 T:C T C 10 0.537877766198737 0.494001923393957 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 5939214 A/C 1 10 1 11 4.62122233801263 0.537877766198737 4.08334457181389 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0142271384391581 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5939174_5939372:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5939174_5939372:MCM8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 6195823 G/C 0 55 0 55 25.4167228590695 0 25.4167228590695 G G 10 0.537877766198737 2.29714179839242e-15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 17 28 45 7.85607797462147 15.0605774535646 -7.20449947894316 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0359764214359315 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 13782191 A/G 1 26 14 40 12.0151780788328 7.53028872678232 4.48488935205052 A:G A G 10 0.537877766198737 0.204043838209720 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000485738:exon_13782154_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000481249:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000464269:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479716:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000487478:exon_13782189_13782329:C20orf7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 17610535 C/T 1 76 86 162 35.121289768896 46.2574878930914 -11.1361981241954 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0831969630000429 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17610468_17610606:RRBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 17928202 C/T 1 198 127 325 91.5002022926501 68.3104763072396 23.1897259854105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0104206588331334 ENSG00000089006:ENST00000377768:exon_17928130_17928289:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000490175:exon_17928130_17928289:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377759:exon_17928130_17928289:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000483485:exon_17928130_17928289:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000377739:exon_17928130_17928289:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000491090:exon_17928130_17928265:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000476648:exon_17928130_17928289:SNX5;ENSG00000089006:ENST00000463050:exon_17927851_17928289:SNX5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 21195214 C/T 1 10 10 20 4.62122233801263 5.37877766198737 -0.757555323974739 T:C C T 10 0.537877766198737 0.823990074103612 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 23345844 A/C 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:C A C 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 24950835 C/T 1 19 18 37 8.780322442224 9.68179979157727 -0.901477349353268 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.869358162481527 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24950833_24951007:C20orf3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 24950874 T/C 1 16 18 34 7.39395574082021 9.68179979157727 -2.28784405075706 T:C T C 10 0.537877766198737 0.492863737684191 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24950833_24951007:C20orf3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 24994293 G/A 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 25187902 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25187712_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25187712_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25187715_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25187712_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25187712_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25187715_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000417467:exon_25187715_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25187715_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25187712_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25187712_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25187715_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000418890:exon_25187712_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25187715_25188033:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25187712_25188033:ENTPD6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 25264814 T/C 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 25276297 G/A 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 58 56 114 26.8030895604733 30.1211549071293 -3.31806534665601 A:G A G 10 0.537877766198737 0.573381576621452 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 30659537 C/T 1 29 27 56 13.4015447802366 14.5226996873659 -1.12115490712927 T:C C T 10 0.537877766198737 0.78981265506685 ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000470092:exon_30659465_30660392:HCK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 30816111 A/G 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000101346:ENST00000375749:exon_30816066_30816258:POFUT1;ENSG00000101346:ENST00000486717:exon_30816066_30816258:POFUT1;ENSG00000101346:ENST00000465791:exon_30816066_30816258:POFUT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 30825610 G/T 1 41 40 81 18.9470115858518 21.5151106479495 -2.56809906209769 T:G G T 10 0.537877766198737 0.579170429812207 ENSG00000101346:ENST00000375749:exon_30822276_30826470:POFUT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 31024488 C/T 1 87 78 165 40.2046343407099 41.9544657635015 -1.74983142279159 T:C C T 10 0.537877766198737 0.814997483396187 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 45 62 107 20.7955005210568 33.3484215043217 -12.5529209832649 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0154161184103199 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 31967273 A/G 1 39 22 61 18.0227671182493 11.8333108563722 6.18945626187705 A:G A G 10 0.537877766198737 0.123892739650034 ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000498525:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000496381:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000471264:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473791:exon_31967267_31967394:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 32678375 G/A 1 29 137 166 13.4015447802366 73.689253969227 -60.2877091889903 A:G G A 10 0.537877766198737 5.33513783478984e-22 ENSG00000125977:ENST00000374980:exon_32678323_32678408:EIF2S2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 33513983 G/C 1 11 13 24 5.08334457181389 6.99241096058358 -1.90906638876969 C:G G C 10 0.537877766198737 0.54016131683339 ENSG00000131069:ENST00000336325:exon_33513908_33514084:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481284:exon_33513908_33514084:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000360596:exon_33513908_33514084:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000374693:exon_33513908_33514084:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000477932:exon_33513908_33514084:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480978:exon_33513908_33514084:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000253382:exon_33513908_33514084:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000491533:exon_33513908_33514079:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000494727:exon_33513908_33514084:ACSS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 33706509 G/A 1 35 38 73 16.1742781830442 20.439355115552 -4.2650769325078 A:G G A 10 0.537877766198737 0.348349103242496 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33706401_33706522:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33706401_33706522:EDEM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 5 15 20 2.31061116900632 8.06816649298105 -5.75755532397474 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0123203932097094 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 34091675 G/A 1 18 19 37 8.31820020842273 10.219677557776 -1.90147734935327 A:G G A 10 0.537877766198737 0.621550288340803 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 538 470 1008 248.62176178508 252.802550113406 -4.18078832832686 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.800543889252998 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 34220129 G/A 1 105 25 130 48.5228345491326 13.4469441549684 35.0758903941642 A:G G A 10 0.537877766198737 1.58182371181472e-10 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220085_34220307:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220085_34220170:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220085_34220156:CPNE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 34515789 C/A 1 25 37 62 11.5530558450316 19.9014773493533 -8.34842150432169 A:C C A 10 0.537877766198737 0.040864667414643 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34515702_34515801:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34515702_34515801:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34515702_34515801:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000413965:exon_34515702_34515801:PHF20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 34843689 C/T 1 24 13 37 11.0909336112303 6.99241096058358 4.09852265064673 T:C C T 10 0.537877766198737 0.190631218214199 ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34843500_34844855:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34843500_34844855:C20orf4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 35154259 T/C 1 45 42 87 20.7955005210568 22.590866180347 -1.79536565929012 T:C T C 10 0.537877766198737 0.747393837028239 ENSG00000080845:ENST00000373913:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000373907:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000401952:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000339266:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000475894:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000340491:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000489701:exon_35154254_35154480:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000478910:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000497862:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000483381:exon_35154254_35154409:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000477195:exon_35154254_35154480:DLGAP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 35521419 G/A 1 53 57 110 24.4924783914669 30.659032673328 -6.16655428186106 A:G G A 10 0.537877766198737 0.251917566163305 ENSG00000101342:ENST00000217320:exon_35521265_35522638:C20orf118;ENSG00000101342:ENST00000436941:exon_35521265_35522638:C20orf118;ENSG00000101347:ENST00000262878:exon_35518632_35521469:SAMHD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 835 908 1743 385.872065224055 488.393011708453 -102.520946484399 T:C:G C T 10 0.537877766198737 9.31895502456519e-07 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 36634717 T/C 1 9 16 25 4.15910010421137 8.60604425917979 -4.44694415496842 T:C T C 10 0.537877766198737 0.106745724142528 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36634599_36634799:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36634599_36634799:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36634599_36634799:TTI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 37383756 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37383600_37383817:ACTR5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 37396120 A/G 1 11 14 25 5.08334457181389 7.53028872678232 -2.44694415496842 A:G A G 10 0.537877766198737 0.422995539711509 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 37400375 G/A 1 25 15 40 11.5530558450316 8.06816649298105 3.48488935205052 A:G G A 10 0.537877766198737 0.341538414137271 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 27 4 31 12.4773003126341 2.15151106479495 10.3257892478392 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000182716386153576 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 37400506 C/T 1 25 3 28 11.5530558450316 1.61363329859621 9.93942254643536 A:T:C C T 10 0.537877766198737 8.63180233298703e-05 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 39750353 A/G 1 29 47 76 13.4015447802366 25.2802550113406 -11.878710231104 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00777159345507502 ENSG00000198900:ENST00000361337:exon_39750336_39750430:TOP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 42086724 C/T 1 27 45 72 12.4773003126341 24.2044994789432 -11.7271991663091 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00631797260874884 ENSG00000124193:ENST00000328748:exon_42086504_42086780:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42086568_42086780:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42086568_42086780:SRSF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 42320881 C/T 1 32 55 87 14.7879114816404 29.5832771409305 -14.7953656592901 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00169555516659352 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42320797_42320959:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42320797_42320959:MYBL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 42331457 A/G 1 81 132 213 37.4319009379023 70.9998651382333 -33.567964200331 A:G A G 10 0.537877766198737 4.86993173501217e-06 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 42680175 T/C 1 38 56 94 17.560644884448 30.1211549071293 -12.5605100226813 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00970711852518252 ENSG00000124191:ENST00000341197:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000442881:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000423191:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372992:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372999:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000358131:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000348077:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000421416:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000435864:exon_42679946_42680185:TOX2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 43252915 T/C 1 57 74 131 26.340967326672 39.8029546987065 -13.4619873720345 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0223575487545982 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43252843_43252970:ADA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 43530216 C/T 1 129 114 243 59.6137681603629 61.318065346656 -1.70429718629308 T:C C T 10 0.537877766198737 0.847087443413855 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 120 105 225 55.4546680561516 56.4771654508674 -1.02249739471581 A:C A C 10 0.537877766198737 0.893845794513025 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 43572217 T/C 1 78 54 132 36.0455342364985 29.0453993747318 7.00013486176672 A:T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.256384719763164 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 44520579 C/G 1 18 11 29 8.31820020842273 5.91665542818611 2.40154478023663 C:G C G 10 0.537877766198737 0.457449401187867 ENSG00000064601:ENST00000372471:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372484:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000354880:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000191018:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000419493:exon_44520555_44520666:CTSA;ENSG00000064601:ENST00000372459:exon_44520555_44520666:CTSA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 44574459 C/T 1 13 12 25 6.00758903941642 6.45453319438484 -0.446944154968424 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100982:ENST00000372409:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000443130:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000479348:exon_44574350_44574522:PCIF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 44578674 T/A 1 20 28 48 9.24244467602526 15.0605774535646 -5.81813277753937 A:T T A 10 0.537877766198737 0.110811771276721 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578605_44578708:ZNF335 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 44642406 G/C 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 C:G G C 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000100985:ENST00000372330:exon_44642296_44642435:MMP9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 44642833 A/C 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100985:ENST00000372330:exon_44642763_44642913:MMP9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 44751363 C/T 1 136 161 297 62.8486237969718 86.5983203579967 -23.7496965610249 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00617451227043166 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44751249_44751395:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44751249_44751395:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44751249_44752940:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44751249_44751395:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44751249_44751395:CD40;ENSG00000101017:ENST00000477696:exon_44751249_44751395:CD40;ENSG00000101017:ENST00000461171:exon_44751249_44751395:CD40 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 45315351 A/G 1 26 37 63 12.0151780788328 19.9014773493533 -7.88629927052043 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0572953266811566 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 45317882 C/A 1 17 25 42 7.85607797462147 13.4469441549684 -5.59086618034695 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0900476169524938 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 19 11 30 8.780322442224 5.91665542818611 2.86366701403789 C:G C G 10 0.537877766198737 0.361034480301865 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 46268557 C/A 1 5 12 17 2.31061116900632 6.45453319438484 -4.14392202537853 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0521612914229826 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 47261017 T/C 1 14 18 32 6.46971127321768 9.68179979157727 -3.21208851835958 T:C T C 10 0.537877766198737 0.289400725386081 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 47262549 C/T 1 10 9 19 4.62122233801263 4.84089989578863 -0.219677557776002 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47262389_47262595:PREX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 47267940 G/A 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G G A 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 47741041 C/T 1 5 14 19 2.31061116900632 7.53028872678232 -5.219677557776 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0201938430142730 ENSG00000124214:ENST00000396163:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000433926:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371828:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000340954:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371856:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000360426:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000347458:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371805:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371802:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371792:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371830:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000437404:exon_47740912_47741142:STAU1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 17 11 28 7.85607797462147 5.91665542818611 1.93942254643536 A:G G A 10 0.537877766198737 0.57069741814659 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 49508320 T/C 1 15 26 41 6.93183350701895 13.9848219211672 -7.05298841414821 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0288086479769350 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 49508881 T/C 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 T:C T C 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 50769225 C/A 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 A:C C A 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 52573971 T/G 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 T:G T G 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52573971_52574036:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52573971_52574036:BCAS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 52611552 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52611551_52611595:BCAS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 54945209 G/A 1 84 81 165 38.8182676393061 43.5680990620977 -4.7498314227916 A:G G A 10 0.537877766198737 0.482624861649018 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54944445_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54944445_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54944446_54945396:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54944721_54945715:AURKA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 56185209 G/A 1 15 16 31 6.93183350701895 8.60604425917979 -1.67421075216085 A:G G A 10 0.537877766198737 0.591678302083193 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 56185241 C/T 1 11 12 23 5.08334457181389 6.45453319438484 -1.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 0.676956493327354 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 56190634 C/T 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 T:C C T 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56190568_56193137:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56190568_56190636:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56190568_56191524:ZBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 56195283 C/G 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 C:G C G 10 0.537877766198737 0.519014071195724 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 56227532 T/C 1 3 14 17 1.38636670140379 7.53028872678232 -6.14392202537853 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00296557260302104 ENSG00000124225:ENST00000341744:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000347215:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395816:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395821:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000265626:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395814:exon_56227093_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000414037:exon_56227264_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395819:exon_56227463_56227654:PMEPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 56227589 C/G 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 C:G C G 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000124225:ENST00000341744:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000347215:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395816:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395821:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000265626:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395814:exon_56227093_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000414037:exon_56227264_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395819:exon_56227463_56227654:PMEPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 57484241 C/T 1 1204 938 2142 556.395169496721 504.529344694415 51.8658248023054 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0255992580236165 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57484217_57484243:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000479025:exon_57483971_57484271:GNAS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 57569134 G/A 1 15 9 24 6.93183350701895 4.84089989578863 2.09093361123031 A:G G A 10 0.537877766198737 0.420864629088441 ENSG00000101158:ENST00000474543:exon_57568679_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57568679_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000486263:exon_57568978_57569294:TH1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 57572674 C/T 1 481 186 667 222.280794458408 100.045264512965 122.235529945442 T:C C T 10 0.537877766198737 4.19667762046835e-22 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57572658_57572808:CTSZ;ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 38 38 76 17.560644884448 20.439355115552 -2.87871023110401 A:C C A 10 0.537877766198737 0.565522423537183 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 60713311 G/A 1 1123 653 1776 518.963268558818 351.234181327775 167.729087231043 A:G G A 10 0.537877766198737 8.85699012379043e-16 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 980 605 1585 452.879789125238 325.416048550236 127.463740575002 A:T:C:G A G 10 0.537877766198737 1.21599119407578e-10 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 60838714 C/T 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000130703:ENST00000358053:exon_60838672_60838747:OSBPL2;ENSG00000130703:ENST00000313733:exon_60838672_60838747:OSBPL2;ENSG00000130703:ENST00000439951:exon_60838672_60838747:OSBPL2;ENSG00000130703:ENST00000253000:exon_60838672_60838747:OSBPL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 60962943 T/C 1 3517 3407 6924 1625.28389627904 1832.5495494391 -207.265653160055 A:T:C:G T C 10 0.537877766198737 6.38977336345202e-07 ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370592:exon_60962899_60963171:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60962899_60962970:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000450116:exon_60962899_60963057:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000337102:exon_60962900_60962970:RPS21 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61443871 C/T 1 93 103 196 42.9773677435175 55.4014099184699 -12.4240421749524 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0853263022108646 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61471961 C/T 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466532:exon_61471894_61472010:COL9A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 1 17 6 23 7.85607797462147 3.22726659719242 4.62881137742905 A:C C A 10 0.537877766198737 0.060442691234244 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 0 0 8 8 0 4.3030221295899 -4.3030221295899 C T C 10 0.537877766198737 0.00207995965823786 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61538659 A/G 1 20 35 55 9.24244467602526 18.8257218169558 -9.58327714093053 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0101297512515123 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61538499_61538711:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61538499_61538711:DIDO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61542733 G/A 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 A:G G A 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61542126_61542966:DIDO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61833801 G/A 1 45 22 67 20.7955005210568 11.8333108563722 8.96218966468462 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0364594050559609 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61834169 G/A 1 21 20 41 9.70456690982652 10.7575553239747 -1.05298841414822 A:G G A 10 0.537877766198737 0.75645621742903 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000342761:exon_61834146_61834508:YTHDF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 5 8 13 2.31061116900632 4.3030221295899 -1.99241096058358 A:G G A 10 0.537877766198737 0.282359568582401 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61867496 G/A 1 11 17 28 5.08334457181389 9.14392202537853 -4.06057745356463 A:G G A 10 0.537877766198737 0.133096330653293 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61867235_61867797:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61867235_61867797:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61867235_61867797:BIRC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61869331 G/A 1 11 20 31 5.08334457181389 10.7575553239747 -5.67421075216085 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0474215212412797 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61869255_61869354:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61869255_61869354:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61869255_61869354:BIRC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 61907859 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000101199:ENST00000523114:exon_61907832_61907899:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522959:exon_61907832_61908094:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370283:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000353546:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370275:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519604:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520485:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000524192:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519531:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518601:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522403:exon_61907832_61908003:ARFGAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62153190 C/T 1 852 1164 2016 393.728143198676 626.08971985533 -232.361576656654 T:C C T 10 0.537877766198737 3.65278983499438e-25 ENSG00000125534:ENST00000370179:exon_62153021_62153559:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000370177:exon_62152865_62153291:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000473620:exon_62153021_62153302:PPDPF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 5 16 21 2.31061116900632 8.60604425917979 -6.29543309017348 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00743298250531806 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62221610 T/C 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62227081 A/G 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:G A G 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62226963_62227120:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62226963_62227120:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62226963_62227120:GMEB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62366581 G/T 1 88 116 204 40.6667565745111 62.3938208790535 -21.7270643045423 T:G G T 10 0.537877766198737 0.00247987197950439 ENSG00000197114:ENST00000448100:exon_62366511_62366916:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000355969:exon_62366511_62366916:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000477340:exon_62366511_62366916:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62366511_62366916:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000357119:exon_62366511_62366916:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000369967:exon_62366511_62366916:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000328969:exon_62366511_62366916:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62366511_62366916:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000484569:exon_62366511_62366588:ZGPAT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62571827 C/T 1 45 64 109 20.7955005210568 34.4241770367192 -13.6286765156623 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.00941221363476777 ENSG00000198276:ENST00000354216:exon_62571731_62571838:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369892:exon_62571731_62571838:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369908:exon_62571731_62571838:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000358711:exon_62571731_62571838:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000430743:exon_62571731_62571838:UCKL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62614448 A/G 1 70 70 140 32.3485563660884 37.6514436339116 -5.30288726782317 A:G A G 10 0.537877766198737 0.396932445446576 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62614400_62614568:PRPF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62630427 C/T 1 123 122 245 56.8410347575554 65.6210874762459 -8.78005271869055 T:C C T 10 0.537877766198737 0.276175529321357 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62630398_62630492:PRPF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62664353 G/A 1 264 342 606 122.000269723533 183.954196039968 -61.9539263164346 A:G G A 10 0.537877766198737 5.00672864602274e-07 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62664194_62664453:PRPF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62669827 G/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:G G T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 20 62670294 G/A 1 29 70 99 13.4015447802366 37.6514436339116 -24.249898853675 A:G G A 10 0.537877766198737 1.35656819361900e-06 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 15889304 C/G 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15889213_15889362:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15889213_15889362:SAMSN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 27264097 G/T 1 16 13 29 7.39395574082021 6.99241096058358 0.401544780236629 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000142192:ENST00000346798:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000354192:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000348990:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000357903:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000358918:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000359726:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000452232:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000440126:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000448388:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000439274:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000456209:exon_27264030_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000464867:exon_27264034_27264180:APP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 27264121 G/A 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000142192:ENST00000346798:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000354192:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000348990:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000357903:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000358918:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000359726:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000452232:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000440126:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000448388:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000439274:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000456209:exon_27264030_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000464867:exon_27264034_27264180:APP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 33065686 A/G 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33065607_33065797:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33065607_33065797:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33065607_33065797:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33065607_33065797:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33065607_33065797:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33065607_33065797:SFRS15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 34922544 C/T 1 132 123 255 61.0001348617667 66.1589652424447 -5.15883038067793 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.5303713734815 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34921782_34923769:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34921782_34923595:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34922117_34922545:SON HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 35169852 C/G 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 C:G C G 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000205726:ENST00000399353:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000381318:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000381291:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000381288:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000399338:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000399367:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000399352:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000399355:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000399349:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000381285:exon_35169683_35169912:ITSN1;ENSG00000205726:ENST00000399326:exon_35169683_35169912:ITSN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 36088720 G/A 1 12 3 15 5.54546680561516 1.61363329859621 3.93183350701895 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0663458133820393 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36088619_36090525:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36088619_36090525:CLIC6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 37445012 C/A 1 172 129 301 79.4850242138172 69.3862318396371 10.0987923741802 A:C C A 10 0.537877766198737 0.248155053990638 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 24 19 43 11.0909336112303 10.219677557776 0.87125605345431 C:G G C 10 0.537877766198737 0.878832113049481 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 40604205 T/C 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40604103_40604210:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000446924:exon_40604103_40604210:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40604103_40604210:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40604103_40604210:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40604103_40604210:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40604103_40604210:BRWD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 42752030 G/A 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42751944_42752078:MX2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 188 200 388 86.8789799546375 107.575553239747 -20.6965732851099 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0368095518826794 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 443 466 909 204.72014957396 250.651039048611 -45.9308894746519 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00245265962295388 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 411 481 892 189.932238092319 258.719205541592 -68.7869674492734 T:C T C 10 0.537877766198737 4.08437709045131e-06 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 763 606 1369 352.599264390364 325.953926316435 26.6453380739291 A:G A G 10 0.537877766198737 0.150896330802914 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 44270229 C/T 1 40 42 82 18.4848893520505 22.590866180347 -4.10597682829643 T:C C T 10 0.537877766198737 0.377278139839438 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 44273858 G/A 1 17 13 30 7.85607797462147 6.99241096058358 0.863667014037891 A:G G A 10 0.537877766198737 0.855400861350958 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44273679_44273862:WDR4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 36 24 60 16.6364004168455 12.9090663887697 3.72733402807578 A:G G A 10 0.537877766198737 0.366338441843198 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 44473980 G/T 1 8 19 27 3.6969778704101 10.219677557776 -6.5226996873659 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0187822384975350 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44473301_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44473972_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44473301_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44473301_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000461686:exon_44473301_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44473303_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000451248:exon_44473865_44474093:CBS;ENSG00000160200:ENST00000462349:exon_44473899_44474093:CBS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45096206 G/A 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45107766 G/A 1 18 18 36 8.31820020842273 9.68179979157727 -1.36359958315453 A:G G A 10 0.537877766198737 0.738822345632434 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45107892 A/C 1 21 18 39 9.70456690982652 9.68179979157727 0.0227671182492575 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 105 83 188 48.5228345491326 44.6438545944952 3.87897995463745 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.6088591877158 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 90 105 195 41.5910010421137 56.4771654508674 -14.8861644087537 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0370353979273052 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45220483 A/G 1 125 115 240 57.7652792251579 61.8559431128547 -4.09066388769686 A:G A G 10 0.537877766198737 0.605051517532357 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 10 9 19 4.62122233801263 4.84089989578863 -0.219677557776002 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 34 20 54 15.7121559492429 10.7575553239747 4.9546006252682 A:G A G 10 0.537877766198737 0.219046460710421 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 50 51 101 23.1061116900632 27.4317660761356 -4.32565438607243 T:C T C 10 0.537877766198737 0.425008133402037 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45550493 A/G 1 108 89 197 49.9092012505364 47.8711211916876 2.03808005884883 A:G A G 10 0.537877766198737 0.775661188317351 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45550479_45551063:PWP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 41 46 87 18.9470115858518 24.7423772451419 -5.79536565929011 T:C T C 10 0.537877766198737 0.237100300077732 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 73 70 143 33.7349230674922 37.6514436339116 -3.91652056641938 T:C T C 10 0.537877766198737 0.557326882311886 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45750713 C/T 1 58 66 124 26.8030895604733 35.4999325691166 -8.69684300864338 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.125943333518577 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45750706_45750802:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45750706_45750802:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45750706_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45750346_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45750706_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45750346_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45750706_45750802:C21orf2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45833795 A/T 0 12 0 12 5.54546680561516 0 5.54546680561516 A A 10 0.537877766198737 0.000681272189570339 ENSG00000142185:ENST00000300482:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397928:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397932:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000300481:exon_45833774_45833957:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000498430:exon_45833774_45833957:TRPM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 45845568 C/A 1 5 11 16 2.31061116900632 5.91665542818611 -3.60604425917979 A:C C A 10 0.537877766198737 0.081929463926307 ENSG00000142185:ENST00000300482:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397928:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397932:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000300481:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000498430:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000490982:exon_45845439_45845710:TRPM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 46313442 G/T 1 90 83 173 41.5910010421137 44.6438545944952 -3.05285355238149 T:G G T 10 0.537877766198737 0.648089775736543 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46313319_46313942:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46313319_46313459:ITGB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 46314967 G/A 1 57 57 114 26.340967326672 30.659032673328 -4.31806534665601 A:G G A 10 0.537877766198737 0.452716012910862 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46314886_46314975:ITGB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 46945782 G/T 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:G G T 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000173638:ENST00000417954:exon_46945731_46945872:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46945731_46945872:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000485649:exon_46945731_46945872:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46945731_46945872:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46945731_46945872:SLC19A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 47581423 C/T 0 0 89 89 0 47.8711211916876 -47.8711211916876 T C T 10 0.537877766198737 1.45666904967426e-30 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 47685268 C/T 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685235_47685437:MCM3AP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 47845862 T/C 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 T:C T C 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47845745_47845885:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47845745_47845885:PCNT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 47848459 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47848309_47848504:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47848309_47848504:PCNT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 C:G G C 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 48063476 C/G 1 61 51 112 28.189456261877 27.4317660761356 0.75769018574146 C:G C G 10 0.537877766198737 0.924663075652512 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000334494:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397628:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397634:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000451211:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000482508:exon_48063198_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000481861:exon_48063447_48063551:PRMT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 21 48084282 G/A 1 30 15 45 13.8636670140379 8.06816649298105 5.79550052105684 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0996416542474097 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48084207_48084863:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48084207_48084863:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48084207_48084863:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48084207_48084834:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48084207_48084834:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48084207_48085036:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000486520:exon_48084207_48084863:PRMT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 17690409 G/A 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 39 38 77 18.0227671182493 20.439355115552 -2.41658799730275 T:C T C 10 0.537877766198737 0.647858004123254 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 21 11 32 9.70456690982652 5.91665542818611 3.78791148164042 T:G T G 10 0.537877766198737 0.215505526509378 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 18185048 G/C 1 29 18 47 13.4015447802366 9.68179979157727 3.71974498865936 C:G G C 10 0.537877766198737 0.307717495417716 ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18185009_18185194:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18185009_18185152:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18185009_18185152:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18185009_18186499:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18185009_18185152:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18185009_18185152:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000479296:exon_18185009_18185129:BCL2L13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 18226612 A/G 1 203 145 348 93.8108134616564 77.9922760988169 15.8185373628395 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0955225296252904 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 18226764 T/C 1 165 113 278 76.2501685772084 60.7801875804573 15.4699809967511 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.0709653338094071 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 18644702 T/C 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000184979:ENST00000215794:exon_18644557_18644702:USP18;ENSG00000184979:ENST00000441683:exon_18644557_18644702:USP18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 336 305 641 155.273070557224 164.052718690615 -8.7796481333904 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.500772955580382 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19467717 C/T 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C C T 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000093009:ENST00000407835:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000438587:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000455750:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000491520:exon_19467261_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000444382:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000437685:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000263201:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000483431:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000404724:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000435353:exon_19467681_19467740:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000487669:exon_19467673_19467740:CDC45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19776106 G/A 1 33 21 54 15.2500337154417 11.2954330901735 3.9546006252682 A:G G A 10 0.537877766198737 0.339571029428604 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19770747_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19775938_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000405009:exon_19775941_19776149:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19775987_19776483:GNB1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 29 22 51 13.4015447802366 11.8333108563722 1.56823392386442 A:T:G T G 10 0.537877766198737 0.676566409146657 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19906511 G/A 1 15 18 33 6.93183350701895 9.68179979157727 -2.74996628455832 A:G G A 10 0.537877766198737 0.384427877209256 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19906383_19906527:TXNRD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 19 21 40 8.780322442224 11.2954330901735 -2.51511064794948 A:C C A 10 0.537877766198737 0.43296846001902 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19907118 G/A 1 21 18 39 9.70456690982652 9.68179979157727 0.0227671182492575 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 104 104 208 48.0607123153314 55.9392876846686 -7.87857536933728 T:C C T 10 0.537877766198737 0.296943351934286 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19951237 C/T 1 182 150 332 84.1062465518299 80.6816649298105 3.42458162201933 T:C C T 10 0.537877766198737 0.741290823068044 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 192 210 402 88.7274688898425 112.954330901735 -24.2268620118923 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0162976870736582 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 20050883 G/A 1 3 12 15 1.38636670140379 6.45453319438484 -5.06816649298105 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00948828165941395 ENSG00000183597:ENST00000401886:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000398042:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000399807:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000450019:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000327374:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000432883:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000430807:exon_20050861_20050944:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000401833:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000434168:exon_20050861_20050934:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000444651:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000485715:exon_20050861_20050906:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420290:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420446:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000447208:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000456048:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000490583:exon_20050861_20050965:C22orf25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 20052089 T/G 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:G T G 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000183597:ENST00000401886:exon_20052065_20052881:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000398042:exon_20052065_20053449:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000399807:exon_20052065_20053385:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000450019:exon_20052065_20052787:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000327374:exon_20052065_20053449:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000432883:exon_20052065_20053447:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000401833:exon_20052065_20052887:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000444651:exon_20052065_20052430:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420290:exon_20052065_20052187:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420446:exon_20052065_20053447:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000447208:exon_20052065_20053447:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000456048:exon_20052065_20053447:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000490583:exon_20052065_20052482:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000476940:exon_20052065_20052452:C22orf25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 20130626 C/T 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000480335:exon_20130553_20131103:ZDHHC8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 20131055 C/T 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 T:C C T 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000480335:exon_20130553_20131103:ZDHHC8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 20761063 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000185252:ENST00000400451:exon_20759667_20761968:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000403682:exon_20759667_20761697:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000357502:exon_20759667_20761971:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000493734:exon_20759667_20761970:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000356671:exon_20759667_20762752:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000437275:exon_20759667_20762745:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000405993:exon_20759667_20761258:ZNF74;ENSG00000185252:ENST00000476678:exon_20759667_20761683:ZNF74 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 20939400 G/A 1 23 19 42 10.6288113774291 10.219677557776 0.409133819653048 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20939388_20939554:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15;ENSG00000099917:ENST00000436496:exon_20939388_20939710:MED15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 21968927 G/A 0 19 0 19 8.780322442224 0 8.780322442224 G G 10 0.537877766198737 8.06510468081411e-06 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 21982809 G/T 1 87 107 194 40.2046343407099 57.5529209832649 -17.348286642555 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0141859064021213 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 48 34 82 22.1818672224606 18.2878440507571 3.89402317170357 A:G A G 10 0.537877766198737 0.438583580796933 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 21984259 A/G 1 37 41 78 17.0985226506467 22.0529884141482 -4.95446576350148 A:G A G 10 0.537877766198737 0.306764232671299 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 23223340 C/G 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 C C 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 23223523 C/G 0 14 0 14 6.46971127321768 0 6.46971127321768 C C 10 0.537877766198737 0.000189914397118796 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 23223530 T/A 0 14 0 14 6.46971127321768 0 6.46971127321768 T T 10 0.537877766198737 0.000189914397118796 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 23261995 G/A 0 139 2 141 64.2349904983756 1.07575553239747 63.1592349659781 T:G G T 10 0.537877766198737 1.39147569362705e-34 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 24095105 G/A 1 233 123 356 107.674480475694 66.1589652424447 41.5155152332496 A:T:G G A 10 0.537877766198737 9.45332919453825e-06 ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24095082_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24094930_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000398465:exon_24094930_24095337:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24094937_24095385:VPREB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 24095296 C/T 1 261 114 375 120.61390302213 61.318065346656 59.2958376754736 T:C C T 10 0.537877766198737 5.1809164108952e-10 ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24095082_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24094930_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000398465:exon_24094930_24095337:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24094937_24095385:VPREB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 24224974 G/A 1 32 26 58 14.7879114816404 13.9848219211672 0.803089560473257 A:G G A 10 0.537877766198737 0.895577586966135 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224946_24225140:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224946_24225139:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224946_24225138:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224946_24226211:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224946_24225329:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000482576:exon_24224946_24225139:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24224946_24225494:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000421180:exon_24224946_24225056:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224946_24225056:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224946_24225056:AP000350.10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 31 33 64 14.3257892478392 17.7499662845583 -3.42417703671916 T:C T C 10 0.537877766198737 0.452236444664944 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 24921765 G/A 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 A:G G A 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000100024:ENST00000415388:exon_24921679_24922636:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000326010:exon_24921679_24922553:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000413389:exon_24921679_24922552:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000498140:exon_24921679_24924358:UPB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 948 879 1827 438.091877643597 472.79455648869 -34.7026788450925 A:T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.105467647938710 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 25753387 C/T 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 26853881 G/A 1 10 2 12 4.62122233801263 1.07575553239747 3.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0451025910853133 ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 26888033 G/A 1 89 63 152 41.1288788083124 33.8862992705204 7.24257953779199 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.255183986238882 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26887191_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000492137:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000412662:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26887952_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26887952_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26887977_26888334:TFIP11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 26894930 A/G 1 15 31 46 6.93183350701895 16.6742107521608 -9.7423772451419 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00460553547386061 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26894835_26894941:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26894669_26894941:TFIP11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 19 24 43 8.780322442224 12.9090663887697 -4.12874394654569 A:G G A 10 0.537877766198737 0.223361625575660 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 29130458 T/C 0 0 10 10 0 5.37877766198737 -5.37877766198737 C T C 10 0.537877766198737 0.000444189859400774 ENSG00000183765:ENST00000416671:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000348295:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382578:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382565:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382566:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000328354:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000404276:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000405598:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382580:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433028:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000448511:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000417588:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433728:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000403642:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000402731:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000447421:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000439200:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000398017:exon_29130391_29130715:CHEK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 1 11 16 27 5.08334457181389 8.60604425917979 -3.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.182472148809709 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 29724792 T/C 1 121 104 225 55.9167902899528 55.9392876846686 -0.0224973947158134 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29723669_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29724727_29724884:AP1B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 42 40 82 19.409133819653 21.5151106479495 -2.10597682829643 T:C C T 10 0.537877766198737 0.659026621988552 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 29736660 A/G 1 33 23 56 15.2500337154417 12.3711886225709 2.87884509287073 A:G A G 10 0.537877766198737 0.503518682417103 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29736645_29736846:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29736645_29736826:AP1B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 29956742 G/A 1 22 21 43 10.1666891436278 11.2954330901735 -1.12874394654569 A:G G A 10 0.537877766198737 0.76130636697167 ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29956723_29956817:NIPSNAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 29957570 G/A 1 22 25 47 10.1666891436278 13.4469441549684 -3.28025501134064 A:G G A 10 0.537877766198737 0.381036391165649 ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000437094:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000415100:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 12 9 21 5.54546680561516 4.84089989578863 0.704566909826523 T:G T G 10 0.537877766198737 0.82918998973449 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 50 30 80 23.1061116900632 16.1363329859621 6.96977870410104 A:C C A 10 0.537877766198737 0.144477285421739 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 58 66 124 26.8030895604733 35.4999325691166 -8.69684300864338 T:C T C 10 0.537877766198737 0.125943333518577 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 30977058 G/A 1 98 106 204 45.2879789125238 57.0150432170661 -11.7270643045423 A:G G A 10 0.537877766198737 0.106332185803907 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30976999_30977088:PES1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 30977353 T/A 1 117 81 198 54.0683013547478 43.5680990620977 10.5002022926501 A:T T A 10 0.537877766198737 0.153848572483359 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30977321_30977395:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30977321_30977395:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30977321_30977395:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30977321_30977395:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30977321_30977395:PES1;ENSG00000100029:ENST00000406208:exon_30977307_30977395:PES1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 31006860 A/G 1 13 2 15 6.00758903941642 1.07575553239747 4.93183350701895 A:G A G 10 0.537877766198737 0.016561054837906 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000423350:exon_31006858_31007101:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31006858_31007050:TCN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 31013419 C/T 1 15 1 16 6.93183350701895 0.537877766198737 6.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000808707942485218 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31013317_31013482:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31013317_31013482:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31013317_31013482:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31013317_31013482:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000471659:exon_31013317_31013704:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31013317_31013482:TCN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 15 10 25 6.93183350701895 5.37877766198737 1.55305584503158 T:C T C 10 0.537877766198737 0.555492392718307 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 C:G G C 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 31673111 A/G 1 7 11 18 3.23485563660884 5.91665542818611 -2.68179979157727 A:G A G 10 0.537877766198737 0.241050465666398 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 31673116 A/G 1 7 13 20 3.23485563660884 6.99241096058358 -3.75755532397474 A:G A G 10 0.537877766198737 0.116261430676894 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 31722886 T/G 1 10 9 19 4.62122233801263 4.84089989578863 -0.219677557776002 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31721790_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31721795_31723295:PATZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 31850238 G/A 1 30 27 57 13.8636670140379 14.5226996873659 -0.659032673328005 A:G G A 10 0.537877766198737 0.894810441701016 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31850166_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000418321:exon_31850130_31850362:EIF4ENIF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 32808078 G/A 1 7 9 16 3.23485563660884 4.84089989578863 -1.60604425917979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.460334234664264 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32808051_32808242:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000487704:exon_32808051_32808228:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000454663:exon_32808051_32808235:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000463455:exon_32808051_32808235:C22orf28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 35661486 G/A 1 48 56 104 22.1818672224606 30.1211549071293 -7.93928768466865 A:G G A 10 0.537877766198737 0.139819739249344 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 35713931 C/T 1 10 11 21 4.62122233801263 5.91665542818611 -1.29543309017348 T:C C T 10 0.537877766198737 0.663514294637069 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000456128:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000450839:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000465529:exon_35713870_35714309:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000487670:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000439512:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000395736:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000334040:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449508:exon_35713870_35713954:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000443206:exon_35713870_35713954:TOM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 37 56 93 17.0985226506467 30.1211549071293 -13.0226322564825 T:G T G 10 0.537877766198737 0.00895684402367826 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 35743124 G/C 1 31 39 70 14.3257892478392 20.9772328817507 -6.65144363391159 C:G G C 10 0.537877766198737 0.119766974380205 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 35806815 T/C 1 59 54 113 27.2652117942745 29.0453993747318 -1.78018758045727 T:C T C 10 0.537877766198737 0.77742780488266 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35806737_35806865:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000464908:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35806402_35806903:MCM5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 35815880 G/A 1 280 259 539 129.394225464354 139.310341445473 -9.91611598111919 A:G G A 10 0.537877766198737 0.411817829137209 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36538053 G/A 1 3 12 15 1.38636670140379 6.45453319438484 -5.06816649298105 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00948828165941395 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000534251:exon_36537911_36538106:APOL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36556729 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36556717_36556819:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36556717_36556837:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36556717_36556837:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36556717_36556803:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36556717_36556802:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000531195:exon_36556717_36556802:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487783:exon_36556717_36556803:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000530895:exon_36556717_36556803:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000472303:exon_36556717_36556803:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000531095:exon_36556717_36556831:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000347595:exon_36556717_36556831:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000533061:exon_36556717_36556803:APOL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36657740 G/A 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000439680:exon_36657642_36657745:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36657642_36657768:APOL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 11 13 24 5.08334457181389 6.99241096058358 -1.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.54016131683339 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36661691 G/A 1 27 20 47 12.4773003126341 10.7575553239747 1.71974498865936 A:G G A 10 0.537877766198737 0.66256491473273 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36661891 G/A 1 30 30 60 13.8636670140379 16.1363329859621 -2.27266597192422 A:G G A 10 0.537877766198737 0.605349390701158 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36710271 C/T 1 14 20 34 6.46971127321768 10.7575553239747 -4.28784405075706 T:C C T 10 0.537877766198737 0.168884268594466 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36710190_36710363:MYH9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36718564 G/A 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36718474_36718566:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36718474_36718566:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36718474_36718566:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36718474_36718566:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000463027:exon_36718474_36718566:MYH9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 T:C T C 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 36922067 G/A 1 119 77 196 54.9925458223503 41.4165879973027 13.5759578250476 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0532365713034314 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 114 87 201 52.681934653344 46.7953656592901 5.88656899405387 T:C C T 10 0.537877766198737 0.43666682746986 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 125 93 218 57.7652792251579 50.0226322564825 7.74264696867534 A:G G A 10 0.537877766198737 0.308615658531041 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 37273805 C/T 1 142 180 322 65.6213571997794 96.8179979157727 -31.1966407159933 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000517927074067836 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 37414528 G/A 1 9 15 24 4.15910010421137 8.06816649298105 -3.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.150561662807680 ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37414179_37415508:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000413912:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000438203:exon_37414402_37414794:TST HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 37524092 G/A 1 12 12 24 5.54546680561516 6.45453319438484 -0.909066388769688 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.838384934353366 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 37524356 A/G 1 11 5 16 5.08334457181389 2.68938883099368 2.39395574082021 A:G A G 10 0.537877766198737 0.317107876818811 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 38028073 A/G 1 25 35 60 11.5530558450316 18.8257218169558 -7.27266597192422 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0694892212564507 ENSG00000100083:ENST00000343632:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000381756:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000325180:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000337437:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000406772:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000460957:exon_38028003_38028172:GGA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 38061877 G/A 1 13 15 28 6.00758903941642 8.06816649298105 -2.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.454321487587661 ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38061562_38061878:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38061562_38062939:SH3BP1;ENSG00000241360:ENST00000215904:exon_38061562_38062941:PDXP;ENSG00000241360:ENST00000403251:exon_38061562_38062939:PDXP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 38151170 G/A 1 11 20 31 5.08334457181389 10.7575553239747 -5.67421075216085 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0474215212412797 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38151108_38151197:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000331103:exon_38151108_38151517:TRIOBP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 694 688 1382 320.712830258077 370.059903144731 -49.3470728866545 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.00817962911441444 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 38323611 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 38470837 C/G 1 2 9 11 0.924244467602526 4.84089989578863 -3.91665542818611 C:G C G 10 0.537877766198737 0.029521862649748 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 T:C T C 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 30 27 57 13.8636670140379 14.5226996873659 -0.659032673328005 T:C T C 10 0.537877766198737 0.894810441701016 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39135933 G/A 1 16 16 32 7.39395574082021 8.60604425917979 -1.21208851835958 A:G G A 10 0.537877766198737 0.724557498021263 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000477262:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000469086:exon_39135727_39135948:SUN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39382414 T/C 1 41 47 88 18.9470115858518 25.2802550113406 -6.33324342548885 T:C T C 10 0.537877766198737 0.199476681679554 ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000335760:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39382303_39382417:APOBEC3B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39477566 A/G 1 47 81 128 21.7197449886594 43.5680990620977 -21.8483540734383 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0001224729189678 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39482371 C/G 1 95 102 197 43.90161221112 54.8635321522712 -10.9619199411512 C:G C G 10 0.537877766198737 0.133277580628637 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39482284_39482572:APOBEC3G HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 C:G G C 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39770500 G/A 1 1 9 10 0.462122233801263 4.84089989578863 -4.37877766198737 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0076411641167297 ENSG00000100321:ENST00000318801:exon_39770321_39770558:SYNGR1;ENSG00000100321:ENST00000216155:exon_39770321_39770558:SYNGR1;ENSG00000100321:ENST00000415332:exon_39770321_39770665:SYNGR1;ENSG00000100321:ENST00000406293:exon_39770321_39770558:SYNGR1;ENSG00000100321:ENST00000328933:exon_39770321_39770558:SYNGR1;ENSG00000100321:ENST00000489206:exon_39770321_39772215:SYNGR1;ENSG00000100321:ENST00000381535:exon_39770321_39770558:SYNGR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 39822851 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000100324:ENST00000216160:exon_39822708_39822930:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000331454:exon_39822708_39822930:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000473491:exon_39822708_39822930:TAB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 40814594 C/T 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 T:C C T 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 12 6 18 5.54546680561516 3.22726659719242 2.31820020842273 T:C C T 10 0.537877766198737 0.347077314597466 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 40819629 G/C 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 C:G G C 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40819540_40819689:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40819540_40819689:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40819540_40819689:MKL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 41616778 C/T 1 6 14 20 2.77273340280758 7.53028872678232 -4.75755532397474 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0421804686420244 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41616738_41616872:L3MBTL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 67 84 151 30.9621896646846 45.1817323606939 -14.2195426960093 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0221563515958763 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 41648966 A/G 1 70 54 124 32.3485563660884 29.0453993747318 3.30315699135662 A:G A G 10 0.537877766198737 0.589438561949478 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41648876_41649036:RANGAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 41652030 G/C 1 9 16 25 4.15910010421137 8.60604425917979 -4.44694415496842 C:G G C 10 0.537877766198737 0.106745724142528 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000446258:exon_41652025_41652109:RANGAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 41907933 C/T 1 7 16 23 3.23485563660884 8.60604425917979 -5.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0344856208568877 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41907880_41907972:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41907880_41907972:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41907880_41907970:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000482208:exon_41907880_41908291:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000478010:exon_41907880_41907972:ACO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 65 42 107 30.0379451970821 22.590866180347 7.44707901673515 A:C C A 10 0.537877766198737 0.174422349946198 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 142 85 227 65.6213571997794 45.7196101268926 19.9017470728867 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00928184485362546 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 42221714 A/G 1 9 12 21 4.15910010421137 6.45453319438484 -2.29543309017348 A:G A G 10 0.537877766198737 0.383260377366473 ENSG00000100147:ENST00000402061:exon_42221702_42221897:CCDC134;ENSG00000100147:ENST00000255784:exon_42221702_42222303:CCDC134;ENSG00000100147:ENST00000415110:exon_42221702_42221829:CCDC134 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 25 34 59 11.5530558450316 18.2878440507571 -6.73478820572548 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0895277315610521 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 21 16 37 9.70456690982652 8.60604425917979 1.09852265064673 T:C C T 10 0.537877766198737 0.744644784635273 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 253 336 589 116.91692515172 180.726929442776 -63.8100042910561 A:T:G G A 10 0.537877766198737 1.7287841660235e-07 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 42912106 C/T 1 133 206 339 61.462257095568 110.80281983694 -49.3405627413718 T:C C T 10 0.537877766198737 7.98120122281083e-08 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 43193590 A/G 1 13 22 35 6.00758903941642 11.8333108563722 -5.82572181695579 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0611322290019452 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43192508_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43192538_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43193420_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43193556_43193611:ARFGAP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 43195147 A/G 1 14 18 32 6.46971127321768 9.68179979157727 -3.21208851835958 A:G A G 10 0.537877766198737 0.289400725386081 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43195045_43195166:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43195045_43195166:ARFGAP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 43213266 T/A 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:T T A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43213148_43213270:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43213148_43213270:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43213148_43213270:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43213148_43213270:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43213148_43213270:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43213148_43213270:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43213148_43213270:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43213148_43213270:ARFGAP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 44514995 C/T 1 202 168 370 93.3486912278551 90.3634647213878 2.98522650646733 T:C C T 10 0.537877766198737 0.794378362513312 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44514918_44515020:PARVB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 44564507 C/T 1 480 470 950 221.818672224606 252.802550113406 -30.9838778888001 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.0471088157307453 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44564482_44564803:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44564482_44565064:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477438:exon_44564482_44564807:PARVB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 44602229 A/C 1 323 362 685 149.265481517808 194.711751363943 -45.4462698461348 A:T:C A C 10 0.537877766198737 0.000554434591774194 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 8 11 19 3.6969778704101 5.91665542818611 -2.219677557776 T:C T C 10 0.537877766198737 0.361009077515707 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 45593765 G/A 1 35 35 70 16.1742781830442 18.8257218169558 -2.65144363391158 A:G G A 10 0.537877766198737 0.550380400141697 ENSG00000100364:ENST00000336156:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000528169:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000391627:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000251993:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000423262:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000443310:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000488038:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000483374:exon_45593671_45593914:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000498418:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000474515:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000493003:exon_45593671_45593829:C22orf9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 C:G G C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 A:G G A 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 46671154 G/A 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000075234:ENST00000417709:exon_46671145_46671182:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46671145_46671318:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000421359:exon_46671145_46671318:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000422713:exon_46671145_46671318:TTC38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 46722426 C/T 1 23 30 53 10.6288113774291 16.1363329859621 -5.50752160853306 T:C C T 10 0.537877766198737 0.132309473555798 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 46725288 G/A 1 51 69 120 23.5682339238644 37.1135658677129 -13.5453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0134885231432305 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000491863:exon_46724820_46725464:GTSE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 46746261 C/T 1 7 20 27 3.23485563660884 10.7575553239747 -7.5226996873659 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0057705609160772 ENSG00000100416:ENST00000486620:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46746247_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000424260:exon_46746243_46746265:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46746247_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000496831:exon_46746243_46746317:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485175:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000463785:exon_46746242_46746360:TRMU HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 46751367 G/T 1 31 27 58 14.3257892478392 14.5226996873659 -0.196910439526743 T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46749414_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46750607_46751969:TRMU HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 46752813 G/A 1 39 38 77 18.0227671182493 20.439355115552 -2.41658799730275 A:G G A 10 0.537877766198737 0.647858004123254 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46752739_46753232:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46752739_46753237:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46752739_46753081:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46752739_46753236:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46752739_46753235:TRMU HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50297888 T/C 1 30 19 49 13.8636670140379 10.219677557776 3.64398945626189 T:C T C 10 0.537877766198737 0.318791375929864 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50297827_50297902:ALG12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 113 98 211 52.2198124195427 52.7120210874762 -0.492208667933497 T:C T C 10 0.537877766198737 0.945093203732908 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50313810 C/T 1 113 116 229 52.2198124195427 62.3938208790535 -10.1740084595108 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.185269583221656 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313804_50313895:CRELD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50315303 C/T 1 117 95 212 54.0683013547478 51.09838778888 2.96991356586776 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.730651109887612 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000498354:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000462253:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50315232_50315409:CRELD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50315363 C/A 1 162 160 322 74.8638018758046 86.0604425917979 -11.1966407159933 A:C C A 10 0.537877766198737 0.219036284140847 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000498354:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000462253:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50315232_50315409:CRELD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50317989 C/T 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 T:C C T 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50320943 C/T 1 551 331 882 254.629350824496 178.037540611782 76.591810212714 T:C C T 10 0.537877766198737 2.22798605516907e-07 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50320903_50321188:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50320903_50321176:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50320903_50321176:CRELD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 127 136 263 58.6895236927604 73.1513762030282 -14.4618525102678 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0831617884520163 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 A:T T A 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50716068 C/T 1 62 40 102 28.6515784956783 21.5151106479495 7.13646784772883 T:C C T 10 0.537877766198737 0.165324127540901 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 18 14 32 8.31820020842273 7.53028872678232 0.787911481640417 A:G A G 10 0.537877766198737 0.860177309642916 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50720430 G/C 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 C:G G C 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000492578:exon_50719995_50720435:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000427829:exon_50720283_50720510:PLXNB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 62 67 129 28.6515784956783 36.0378103353154 -7.38623183963707 A:G A G 10 0.537877766198737 0.216291886875825 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50894711 G/A 1 13 4 17 6.00758903941642 2.15151106479495 3.85607797462147 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0863979298704946 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894645_50894824:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894645_50894824:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894645_50894824:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894645_50894824:SBF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50941985 T/C 1 47 41 88 21.7197449886594 22.0529884141482 -0.333243425488849 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 13 6 19 6.00758903941642 3.22726659719242 2.780322442224 A:G G A 10 0.537877766198737 0.252313312370768 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 11 5 16 5.08334457181389 2.68938883099368 2.39395574082021 A:G G A 10 0.537877766198737 0.317107876818811 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 50988193 A/G 1 10 18 28 4.62122233801263 9.68179979157727 -5.06057745356464 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0597305381592232 ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 1 9 10 0.462122233801263 4.84089989578863 -4.37877766198737 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0076411641167297 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 51012775 C/T 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51012764_51012848:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51012764_51012848:CTA-384D8.32 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 38 26 64 17.560644884448 13.9848219211672 3.57582296328084 C:G G C 10 0.537877766198737 0.383390665000250 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 4810319 T/G 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000479831:exon_4809951_4810448:ITPR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 5229991 C/T 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000134109:ENST00000434243:exon_5229866_5229999:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000419550:exon_5229350_5229999:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000256497:exon_5229358_5229999:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000465369:exon_5229405_5229999:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000443790:exon_5229449_5229999:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000465187:exon_5229491_5229999:EDEM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 6 16 22 2.77273340280758 8.60604425917979 -5.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0169939987707011 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 T:G T G 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9874910 C/T 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9874788_9874957:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9874788_9874929:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9874788_9874929:TTLL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9876919 G/A 1 48 35 83 22.1818672224606 18.8257218169558 3.35614540550483 A:G G A 10 0.537877766198737 0.509498521259755 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9876778_9877016:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9877127 T/C 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C T C 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9879820 G/T 1 111 67 178 51.2955679519402 36.0378103353154 15.2577576166248 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0239285315127994 ENSG00000156990:ENST00000423108:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9879534_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000464783:exon_9879566_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000466141:exon_9879578_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9879704_9879891:RPUSD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 C:G G C 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 C:G C G 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 A:G A G 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 10028318 A/C 1 68 66 134 31.4243118984859 35.4999325691166 -4.07562067063075 A:C A C 10 0.537877766198737 0.48939313917749 ENSG00000125037:ENST00000245046:exon_10028191_10028804:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000487465:exon_10028191_10028522:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000429759:exon_10028191_10028366:TMEM111;ENSG00000125037:ENST00000470827:exon_10028191_10028586:TMEM111 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 12 6 18 5.54546680561516 3.22726659719242 2.31820020842273 A:G A G 10 0.537877766198737 0.347077314597466 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 12 6 18 5.54546680561516 3.22726659719242 2.31820020842273 T:C T C 10 0.537877766198737 0.347077314597466 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 24 16 40 11.0909336112303 8.60604425917979 2.48488935205052 T:G T G 10 0.537877766198737 0.526473678584899 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 6 10 16 2.77273340280758 5.37877766198737 -2.60604425917979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.216741911044158 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 10312113 T/C 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 T:C T C 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 10312534 G/A 1 14 7 21 6.46971127321768 3.76514436339116 2.70456690982652 A:G G A 10 0.537877766198737 0.278190405615872 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 12626072 G/C 1 80 61 141 36.969778704101 32.810543738123 4.15923496597809 C:G G C 10 0.537877766198737 0.500237042147163 ENSG00000132155:ENST00000251849:exon_12625100_12626156:RAF1;ENSG00000132155:ENST00000442415:exon_12625297_12626156:RAF1;ENSG00000132155:ENST00000432427:exon_12625766_12626156:RAF1;ENSG00000132155:ENST00000423275:exon_12625832_12626156:RAF1;ENSG00000132155:ENST00000471449:exon_12625845_12626156:RAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 81 34 115 37.4319009379023 18.2878440507571 19.1440568871453 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000341435816011073 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 14223074 C/T 1 114 54 168 52.681934653344 29.0453993747318 23.6365352786122 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.000255184546495998 ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14223060_14223170:LSM3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 65 88 153 30.0379451970821 47.3332434254889 -17.2952982284068 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00570536489871475 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 15080696 G/A 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 A:G G A 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000177463:ENST00000425241:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000323373:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000475707:exon_15079507_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000393102:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000383792:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000396874:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000478572:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000439011:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000413194:exon_15080629_15080734:NR2C2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 15311325 A/G 1 13 3 16 6.00758903941642 1.61363329859621 4.39395574082021 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0415624991007089 ENSG00000131370:ENST00000448619:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000383791:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000426925:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000253688:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000408919:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000366391:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000450625:exon_15311220_15311384:SH3BP5;ENSG00000131370:ENST00000417936:exon_15311220_15311384:SH3BP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 15624436 C/T 1 14 16 30 6.46971127321768 8.60604425917979 -2.13633298596211 T:C C T 10 0.537877766198737 0.46777080604343 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000421993:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000414979:exon_15624385_15624496:HACL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 15686647 C/T 0 0 11 11 0 5.91665542818611 -5.91665542818611 T C T 10 0.537877766198737 0.000205270010058154 ENSG00000169814:ENST00000449107:exon_15685823_15687089:BTD;ENSG00000169814:ENST00000303498:exon_15685823_15687329:BTD;ENSG00000169814:ENST00000437172:exon_15685823_15687222:BTD;ENSG00000169814:ENST00000383778:exon_15685823_15687324:BTD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 A:G A G 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 25833228 T/C 1 14 11 25 6.46971127321768 5.91665542818611 0.553055845031576 T:C T C 10 0.537877766198737 0.844404343432166 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25832481_25833488:OXSM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 31666442 C/T 1 32 19 51 14.7879114816404 10.219677557776 4.56823392386442 T:C C T 10 0.537877766198737 0.209443826098671 ENSG00000163527:ENST00000295770:exon_31666406_31666577:STT3B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 33038531 T/C 1 21 27 48 9.70456690982652 14.5226996873659 -4.81813277753937 T:C T C 10 0.537877766198737 0.192609695866395 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33038221_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33038226_33038836:GLB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 33055688 T/C 1 10 8 18 4.62122233801263 4.3030221295899 0.318200208422735 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33055548_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33055548_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33055548_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33055548_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000461475:exon_33055565_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000497796:exon_33055635_33055802:GLB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 37053550 G/A 1 23 13 36 10.6288113774291 6.99241096058358 3.63640041684547 A:G G A 10 0.537877766198737 0.245477894791285 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 37367889 C/T 1 49 33 82 22.6439894562619 17.7499662845583 4.89402317170357 T:C C T 10 0.537877766198737 0.31908988927812 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 19 13 32 8.780322442224 6.99241096058358 1.78791148164042 C:G G C 10 0.537877766198737 0.596919535098297 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 T:C T C 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 39180219 C/T 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 39180263 G/A 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 129 35 164 59.6137681603629 18.8257218169558 40.7880463434071 T:C T C 10 0.537877766198737 5.23627622981272e-11 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 41275350 C/T 1 89 81 170 41.1288788083124 43.5680990620977 -2.43922025378528 T:C C T 10 0.537877766198737 0.758437151197314 ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41275020_41275358:CTNNB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 42236415 A/G 1 6 14 20 2.77273340280758 7.53028872678232 -4.75755532397474 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0421804686420244 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42236296_42236433:TRAK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 42243957 C/T 1 13 10 23 6.00758903941642 5.37877766198737 0.62881137742905 T:C C T 10 0.537877766198737 0.837246490944224 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42243928_42244244:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42243928_42244398:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42243928_42244244:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42243928_42245681:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42243928_42244244:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42243928_42244244:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42243928_42244246:TRAK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 42264866 G/A 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 A:G G A 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 42264948 G/A 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 A:G G A 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 45559519 T/C 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 T:C T C 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45559455_45559564:LARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 47453317 G/T 1 17 21 38 7.85607797462147 11.2954330901735 -3.43935511555201 T:G G T 10 0.537877766198737 0.329086913970063 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47453273_47453457:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47453273_47453457:PTPN23 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A 1 58 32 90 26.8030895604733 17.2120885183596 9.59100104211367 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.0447266212460542 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 47454418 C/A 1 55 51 106 25.4167228590695 27.4317660761356 -2.01504321706612 A:C C A 10 0.537877766198737 0.698090052778522 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 47456434 G/A 1 38 33 71 17.560644884448 17.7499662845583 -0.189321400110323 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47456317_47456483:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000339815:exon_47456317_47456483:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47456317_47456483:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47456317_47456483:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47456317_47456483:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47456317_47456483:SCAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 47676777 C/T 1 92 135 227 42.5152455097162 72.6134984368295 -30.0982529271133 T:C C T 10 0.537877766198737 7.86213087779617e-05 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47676680_47676834:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47676680_47676834:SMARCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 48473953 C/G 1 32 44 76 14.7879114816404 23.6666217127444 -8.87871023110401 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0498834178183322 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 48491568 A/C 1 8 1 9 3.6969778704101 0.537877766198737 3.15910010421137 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0439369935612285 ENSG00000164053:ENST00000421175:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000454733:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48491443_48491576:ATRIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 48501819 G/A 1 22 13 35 10.1666891436278 6.99241096058358 3.17427818304421 A:G G A 10 0.537877766198737 0.312480889992981 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 48501920 C/T 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 48638537 A/G 1 259 277 536 119.689658554527 148.99214123705 -29.302482682523 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0119371513499767 ENSG00000010256:ENST00000471189:exon_48638113_48638551:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000203407:exon_48638408_48638551:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000415995:exon_48638408_48638551:UQCRC1;ENSG00000010256:ENST00000460105:exon_48638408_48638551:UQCRC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 48666134 C/G 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 C:G C G 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000225697:ENST00000420764:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000395550:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000383733:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000307364:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000337000:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000480524:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000455886:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000358747:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000462009:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000469693:exon_48666055_48666147:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000496469:exon_48666055_48666147:SLC26A6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 49059608 T/C 1 182 157 339 84.1062465518299 84.4468092932017 -0.340562741371826 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000178149:ENST00000496568:exon_49059441_49059726:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000492585:exon_49059441_49059724:DALRD3;ENSG00000178057:ENST00000326925:exon_49058444_49059654:NDUFAF3;ENSG00000178057:ENST00000395457:exon_49059524_49059654:NDUFAF3;ENSG00000178057:ENST00000496152:exon_49059546_49059971:NDUFAF3;ENSG00000178057:ENST00000480392:exon_49059554_49059654:NDUFAF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 49136792 G/T 1 204 234 438 94.2729356954577 125.863397290504 -31.5904615950468 T:G G T 10 0.537877766198737 0.00252483470737408 ENSG00000172053:ENST00000453392:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000445471:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000420147:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49136777_49136864:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482468:exon_49136775_49136864:QARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 49714225 T/C 1 54 40 94 24.9546006252682 21.5151106479495 3.43948997731873 T:C T C 10 0.537877766198737 0.535134920317379 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 49721532 G/A 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 A:G G A 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:C C A 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 8 1 9 3.6969778704101 0.537877766198737 3.15910010421137 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0439369935612285 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 49866584 T/G 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 T:G T G 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 50334802 C/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:C C A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000450489:exon_50334636_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000442620:exon_50334724_50335514:NAT6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 50614965 G/A 1 7 15 22 3.23485563660884 8.06816649298105 -4.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0524426011647104 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000482974:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000443894:exon_50614940_50615004:HEMK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 51430207 G/A 1 20 18 38 9.24244467602526 9.68179979157727 -0.439355115552004 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 75 73 148 34.6591675350947 39.2650769325078 -4.60590939741306 A:C A C 10 0.537877766198737 0.459043567171628 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 51696509 C/T 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000164080:ENST00000487093:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000409535:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000296477:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000432863:exon_51696442_51697473:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000461680:exon_51696442_51697610:RAD54L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 51737852 C/T 1 149 111 260 68.8562128363882 59.7044320480598 9.1517807883284 T:C C T 10 0.537877766198737 0.263378214177886 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 106 93 199 48.9849567829339 50.0226322564825 -1.03767547354865 A:G G A 10 0.537877766198737 0.887183096445214 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 51737995 T/C 1 139 92 231 64.2349904983756 49.4847544902838 14.7502360080918 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0555622378708177 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 52011906 T/G 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 T:G T G 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000248487:ENST00000497864:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000494478:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000360889:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000452452:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000273596:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000474575:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000491470:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000114786:ENST00000486081:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 52012000 C/G 1 3 11 14 1.38636670140379 5.91665542818611 -4.53028872678232 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0280815187175553 ENSG00000248487:ENST00000497864:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000494478:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000360889:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000452452:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000273596:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000474575:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000491470:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000114786:ENST00000486081:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000458031:exon_52011963_52012098:RP11-155D18.11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 75 74 149 34.6591675350947 39.8029546987065 -5.1437871636118 T:C C T 10 0.537877766198737 0.412061578748054 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 52264907 T/C 1 187 184 371 86.4168577208362 98.9695089805676 -12.5526512597314 T:C T C 10 0.537877766198737 0.193403084816805 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 52266074 G/A 1 45 62 107 20.7955005210568 33.3484215043217 -12.5529209832649 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0154161184103199 ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52265960_52266138:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52265960_52266138:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000472755:exon_52265960_52266244:TWF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 52437206 G/A 1 18 21 39 8.31820020842273 11.2954330901735 -2.97723288175074 A:G G A 10 0.537877766198737 0.341434287698833 ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000478368:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000466093:exon_52436795_52437314:BAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 52440269 C/T 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52440269_52440392:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52440269_52440338:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000471532:exon_52440269_52440923:BAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 53898789 T/C 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53898773_53898918:IL17RB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 22 24 46 10.1666891436278 12.9090663887697 -2.7423772451419 T:C C T 10 0.537877766198737 0.461071434223992 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 73 64 137 33.7349230674922 34.4241770367192 -0.689253969226961 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.931833818994216 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 53906513 G/A 1 40 29 69 18.4848893520505 15.5984552197634 2.88643413228715 A:G G A 10 0.537877766198737 0.546625381633863 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 42 26 68 19.409133819653 13.9848219211672 5.42431189848589 T:C C T 10 0.537877766198737 0.223763546412299 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 56628050 G/A 1 11 4 15 5.08334457181389 2.15151106479495 2.93183350701895 A:G G A 10 0.537877766198737 0.194270090333408 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56627972_56628056:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000468108:exon_56627972_56628056:CCDC66 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 56653424 A/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:T A T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000480884:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000476142:exon_56651129_56653555:CCDC66 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 67 47 114 30.9621896646846 25.2802550113406 5.68193465334399 T:C C T 10 0.537877766198737 0.302474319187174 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 36 9 45 16.6364004168455 4.84089989578863 11.7955005210568 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000440924552179928 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 39 29 68 18.0227671182493 15.5984552197634 2.42431189848589 T:C C T 10 0.537877766198737 0.6270806256561 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 67451197 G/A 1 5 16 21 2.31061116900632 8.60604425917979 -6.29543309017348 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00743298250531806 ENSG00000172340:ENST00000493112:exon_67451155_67451275:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67451155_67451275:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67451155_67451275:SUCLG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 69072391 G/A 1 13 6 19 6.00758903941642 3.22726659719242 2.780322442224 A:G G A 10 0.537877766198737 0.252313312370768 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69068978_69072471:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69068980_69072471:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69072228_69072471:TMF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 69096513 C/T 1 4 12 16 1.84848893520505 6.45453319438484 -4.60604425917979 T:C C T 10 0.537877766198737 0.024130575151832 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 69134184 C/G 1 6 9 15 2.77273340280758 4.84089989578863 -2.06816649298105 C:G C G 10 0.537877766198737 0.310767806906123 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69134095_69134374:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69134095_69134374:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69134095_69134374:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69134166_69134374:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000478935:exon_69134172_69134374:ARL6IP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 69151014 C/A 1 34 37 71 15.7121559492429 19.9014773493533 -4.18932140011032 A:C:G C A 10 0.537877766198737 0.342162023845144 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69150990_69151068:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000485444:exon_69150990_69151045:ARL6IP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 21 16 37 9.70456690982652 8.60604425917979 1.09852265064673 T:C C T 10 0.537877766198737 0.744644784635273 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 2 9 11 0.924244467602526 4.84089989578863 -3.91665542818611 T:C T C 10 0.537877766198737 0.029521862649748 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 93845062 A/G 1 8 1 9 3.6969778704101 0.537877766198737 3.15910010421137 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0439369935612285 ENSG00000178694:ENST00000314622:exon_93845055_93847389:NSUN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 40 53 93 18.4848893520505 28.5075216085331 -10.0226322564825 A:G G A 10 0.537877766198737 0.03797175576028 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 61 48 109 28.189456261877 25.8181327775394 2.37132348433767 T:C T C 10 0.537877766198737 0.70112992511216 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 100467117 G/A 1 68 66 134 31.4243118984859 35.4999325691166 -4.07562067063075 A:G G A 10 0.537877766198737 0.48939313917749 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 100467413 A/G 1 102 100 202 47.1364678477288 53.7877766198737 -6.65130877214487 A:G A G 10 0.537877766198737 0.359499601740576 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 25 9 34 11.5530558450316 4.84089989578863 6.71215594924294 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0244762771917893 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 107941008 G/C 1 20 23 43 9.24244467602526 12.3711886225709 -3.12874394654569 C:G G C 10 0.537877766198737 0.361597067830681 ENSG00000114446:ENST00000264538:exon_107940958_107941417:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000457963:exon_107940865_107941169:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000478157:exon_107940958_107941282:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000465024:exon_107940958_107941207:IFT57;ENSG00000114446:ENST00000492106:exon_107940865_107941222:IFT57 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 108279609 A/C 1 13 13 26 6.00758903941642 6.99241096058358 -0.98482192116716 A:C A C 10 0.537877766198737 0.699848188249655 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108279582_108279688:KIAA1524 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 113169205 C/T 1 12 4 16 5.54546680561516 2.15151106479495 3.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.130604015019631 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113169183_113169363:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113167682_113169363:SPICE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 113392214 G/A 1 8 16 24 3.6969778704101 8.60604425917979 -4.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0633085169542399 ENSG00000176542:ENST00000491165:exon_113392195_113392223:KIAA2018;ENSG00000176542:ENST00000316407:exon_113392195_113392223:KIAA2018;ENSG00000176542:ENST00000478658:exon_113392195_113392223:KIAA2018 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 114026972 T/A 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 A:T T A 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000181847:ENST00000481065:exon_114026742_114027137:TIGIT;ENSG00000181847:ENST00000486257:exon_114026742_114029135:TIGIT;ENSG00000181847:ENST00000383671:exon_114026742_114028348:TIGIT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 8 15 23 3.6969778704101 8.06816649298105 -4.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0926012068362168 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 118948845 G/A 1 18 13 31 8.31820020842273 6.99241096058358 1.32578924783915 A:G G A 10 0.537877766198737 0.720072184144253 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000470111:exon_118948783_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000493932:exon_118948822_118949091:B4GALT4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 119219573 A/G 1 29 20 49 13.4015447802366 10.7575553239747 2.64398945626189 A:G A G 10 0.537877766198737 0.476848420122396 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000469324:exon_119219221_119219707:C3orf1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 119236179 G/A 1 12 13 25 5.54546680561516 6.99241096058358 -1.44694415496842 A:G G A 10 0.537877766198737 0.689173717549893 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121151812 G/C 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121151765_121151883:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121151765_121151880:POLQ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121154974 T/C 1 7 13 20 3.23485563660884 6.99241096058358 -3.75755532397474 T:C T C 10 0.537877766198737 0.116261430676894 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 512 390 902 236.606583706247 209.772328817507 26.8342548887393 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0767203346152868 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 508 361 869 234.758094771042 194.173873597744 40.5842211732976 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00584060424815574 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 188 179 367 86.8789799546375 96.2801201495739 -9.40114019493646 A:G G A 10 0.537877766198737 0.346062518707753 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 29 33 62 13.4015447802366 17.7499662845583 -4.34842150432169 T:C C T 10 0.537877766198737 0.308457808804538 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 20 11 31 9.24244467602526 5.91665542818611 3.32578924783915 T:C T C 10 0.537877766198737 0.280833286523908 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 18 27 45 8.31820020842273 14.5226996873659 -6.20449947894316 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0727564764987215 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121659860 C/T 1 13 4 17 6.00758903941642 2.15151106479495 3.85607797462147 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0863979298704946 ENSG00000163406:ENST00000489711:exon_121659678_121662949:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000295605:exon_121659678_121660099:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000436799:exon_121659678_121660457:SLC15A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 121712051 A/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:C A C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 122354822 A/G 1 35 40 75 16.1742781830442 21.5151106479495 -5.34083246490527 A:G A G 10 0.537877766198737 0.246907251426490 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 122811206 G/A 1 18 20 38 8.31820020842273 10.7575553239747 -2.439355115552 A:G G A 10 0.537877766198737 0.51576488707779 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000484644:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000393573:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000495004:exon_122811202_122811289:PDIA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 122811250 C/T 1 20 18 38 9.24244467602526 9.68179979157727 -0.439355115552004 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000484644:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000393573:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000495004:exon_122811202_122811289:PDIA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 35 29 64 16.1742781830442 15.5984552197634 0.575822963280837 A:G G A 10 0.537877766198737 0.901021632782252 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 124746049 A/G 1 8 1 9 3.6969778704101 0.537877766198737 3.15910010421137 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0439369935612285 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 124746182 C/A 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:C C A 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 143 115 258 66.0834794335806 61.8559431128547 4.22753632072587 A:G A G 10 0.537877766198737 0.617773211208112 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 113 59 172 52.2198124195427 31.7347882057255 20.4850242138172 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.00167698975933508 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 110 61 171 50.8334457181389 32.810543738123 18.022901980016 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00570486271551599 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 125648343 G/A 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 125648356 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 126676271 G/A 1 34 24 58 15.7121559492429 12.9090663887697 2.80308956047326 A:G G A 10 0.537877766198737 0.511377491856428 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126676259_126676676:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126676259_126676776:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126676268_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504084:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504973:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000510044:exon_126676259_126676394:CHCHD6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 127340002 A/G 1 73 78 151 33.7349230674922 41.9544657635015 -8.21954269600928 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.191849609619288 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127339916_127340071:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127339916_127340071:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127339916_127340071:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127339916_127340071:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468414:exon_127339916_127340071:MCM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 127340583 C/T 1 99 83 182 45.750101146325 44.6438545944952 1.10624655182988 T:C C T 10 0.537877766198737 0.882100301988284 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127340506_127341276:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127340506_127340672:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127340506_127340672:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127340506_127340950:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468414:exon_127340506_127340619:MCM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 127387388 C/T 1 15 8 23 6.93183350701895 4.3030221295899 2.62881137742905 T:C C T 10 0.537877766198737 0.302209397783681 ENSG00000114631:ENST00000342480:exon_127387284_127387440:PODXL2;ENSG00000114631:ENST00000302192:exon_127387308_127387440:PODXL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 127396042 G/C 1 14 25 39 6.46971127321768 13.4469441549684 -6.97723288175074 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0354501968054603 ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127395379_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000478298:exon_127395810_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000474129:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000497162:exon_127396020_127396129:ABTB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 127396588 C/T 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 T:C C T 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127396308_127399028:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000478298:exon_127396308_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000474129:exon_127396308_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000497162:exon_127396519_127396686:ABTB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 127831744 G/A 1 116 102 218 53.6061791209465 54.8635321522712 -1.25735303132466 A:G G A 10 0.537877766198737 0.892022942060215 ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127831731_127831863:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127831731_127831863:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127831731_127831863:RUVBL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 128339335 C/T 1 844 671 1515 390.031165328266 360.915981119352 29.1151842089135 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.135120497315606 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128338817_128339436:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128339002_128339436:RPN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 333 308 641 153.886703855821 165.666351989211 -11.7796481333904 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.362327107476681 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 43 50 93 19.8712560534543 26.8938883099368 -7.02263225648254 C:G C G 10 0.537877766198737 0.146897539167111 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 117 141 258 54.0683013547478 75.8407650340219 -21.7724636792741 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00717553447677663 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 129152089 G/A 1 131 80 211 60.5380126279655 43.030221295899 17.5077913320665 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0156784191218572 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000393278:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000509828:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000511009:exon_129151941_129152396:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000515266:exon_129151941_129152090:MBD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 129155463 A/G 1 52 71 123 24.0303561576657 38.1893214001103 -14.1589652424446 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0112368037768806 ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 133356790 G/A 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 A:G G A 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133356720_133357006:TOPBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 137880872 C/T 1 19 15 34 8.780322442224 8.06816649298105 0.712155949242943 T:C C T 10 0.537877766198737 0.864600057495229 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 141164107 T/C 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 142841192 A/G 1 54 61 115 24.9546006252682 32.810543738123 -7.85594311285475 A:G A G 10 0.537877766198737 0.160504261042218 ENSG00000175040:ENST00000309575:exon_142839486_142841800:CHST2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 148714662 A/T 1 8 8 16 3.6969778704101 4.3030221295899 -0.606044259179791 A:T A T 10 0.537877766198737 0.805966639450967 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148714529_148714691:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148714529_148714691:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148714529_148714691:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000431995:exon_148714529_148714679:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000483267:exon_148714529_148714679:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148714529_148714691:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000492285:exon_148714529_148714679:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148714529_148714679:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148714618_148714691:GYG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 T:C C T 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 167728055 C/T 1 20 16 36 9.24244467602526 8.60604425917979 0.63640041684547 T:C C T 10 0.537877766198737 0.868711417524269 ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167726465_167728206:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167728023_167728206:GOLIM4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 170805168 A/G 1 8 16 24 3.6969778704101 8.60604425917979 -4.90906638876969 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0633085169542399 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170805131_170805295:TNIK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 A:G A G 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 3 17 20 1.38636670140379 9.14392202537853 -7.75755532397474 T:C T C 10 0.537877766198737 0.000484948153882119 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 178785549 G/A 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 A:G G A 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178785271_178785598:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178785271_178785597:ZMAT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 178978103 A/G 1 7 15 22 3.23485563660884 8.06816649298105 -4.83331085637221 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0524426011647104 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 180693946 A/G 1 225 225 450 103.977502605284 121.022497394716 -17.0449947894316 A:G A G 10 0.537877766198737 0.108181201205267 ENSG00000114416:ENST00000357559:exon_180693910_180694950:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392639:exon_180693910_180694950:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000305586:exon_180693910_180694943:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000475315:exon_180693910_180694367:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392637:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445400:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000491062:exon_180693910_180694206:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000468861:exon_180693910_180694333:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445140:exon_180693910_180694943:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000472339:exon_180693910_180694341:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000480918:exon_180693910_180694166:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000454764:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000482125:exon_180693910_180694070:FXR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 182631792 C/A 1 2 10 12 0.924244467602526 5.37877766198737 -4.45453319438484 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0165336864510135 ENSG00000058063:ENST00000490303:exon_182631649_182631891:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000491699:exon_182631649_182632393:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000484691:exon_182631649_182631884:ATP11B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 182789054 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182788998_182789132:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000490284:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000487634:exon_182788998_182789145:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000466650:exon_182788998_182789145:MCCC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 183508590 A/G 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000432781:exon_183508585_183508768:YEATS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 184040948 C/T 1 23 25 48 10.6288113774291 13.4469441549684 -2.81813277753937 T:C C T 10 0.537877766198737 0.469995448763208 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184040871_184041029:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184040871_184041029:EIF4G1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 12 12 24 5.54546680561516 6.45453319438484 -0.909066388769688 A:C C A 10 0.537877766198737 0.838384934353366 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 10 11 21 4.62122233801263 5.91665542818611 -1.29543309017348 T:C T C 10 0.537877766198737 0.663514294637069 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 185331165 C/A 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000163904:ENST00000296257:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000427465:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000437107:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000413407:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000473760:exon_185331133_185331299:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000478001:exon_185331133_185331196:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000476011:exon_185331133_185331432:SENP2;ENSG00000163904:ENST00000444509:exon_185331143_185331196:SENP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 292 296 588 134.939692269969 159.211818794826 -24.2721265248573 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.0470733416102374 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 186761055 G/A 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 A:G G A 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186760804_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000464827:exon_186760896_186761098:ST6GAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 186791979 C/T 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000427315:exon_186791947_186791992:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000442023:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186791193_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186791947_186792121:ST6GAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 186793423 C/T 1 12 12 24 5.54546680561516 6.45453319438484 -0.909066388769688 T:C C T 10 0.537877766198737 0.838384934353366 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186793350_186793640:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186793350_186796341:ST6GAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 194408821 G/C 1 18 13 31 8.31820020842273 6.99241096058358 1.32578924783915 C:G G C 10 0.537877766198737 0.720072184144253 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 195965667 G/C 1 24 18 42 11.0909336112303 9.68179979157727 1.40913381965305 C:G G C 10 0.537877766198737 0.757553660558082 ENSG00000161217:ENST00000419333:exon_195965579_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000292823:exon_195961239_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000431016:exon_195965422_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000460827:exon_195965662_195965765:PCYT1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 195968858 C/T 1 36 18 54 16.6364004168455 9.68179979157727 6.9546006252682 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0750599897991075 ENSG00000161217:ENST00000419333:exon_195968819_195968961:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000292823:exon_195968819_195968961:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000431016:exon_195968819_195968961:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000411591:exon_195968819_195968961:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000433733:exon_195968819_195968961:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000430755:exon_195968531_195968961:PCYT1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 11 12 23 5.08334457181389 6.45453319438484 -1.37118862257095 T:G G T 10 0.537877766198737 0.676956493327354 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 196771487 T/A 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:T T A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000469371:exon_196769904_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196770502_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196771131_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196771202_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196771422_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196771431_196771600:DLG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 197241286 G/C 1 33 21 54 15.2500337154417 11.2954330901735 3.9546006252682 C:G G C 10 0.537877766198737 0.339571029428604 ENSG00000161267:ENST00000392378:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000358186:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000392379:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000441275:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000479425:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000446746:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000477015:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000434143:exon_197241134_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000483920:exon_197241134_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000432819:exon_197241137_197241287:BDH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 32 28 60 14.7879114816404 15.0605774535646 -0.272665971924217 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 197402018 C/T 1 32 58 90 14.7879114816404 31.1969104395267 -16.4089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000639998222268009 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 197427557 A/G 1 21 17 38 9.70456690982652 9.14392202537853 0.560644884447996 A:G A G 10 0.537877766198737 0.872546949127018 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 197427696 C/T 1 19 14 33 8.780322442224 7.53028872678232 1.25003371544168 T:C C T 10 0.537877766198737 0.728850756969449 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 197427706 C/T 1 19 21 40 8.780322442224 11.2954330901735 -2.51511064794948 T:C C T 10 0.537877766198737 0.43296846001902 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 A:G G A 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 3 197597044 C/T 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197597031_197597047:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000471667:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000483442:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000473177:exon_197597031_197597149:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000428136:exon_197597031_197597149:LRCH3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 515489 G/A 1 17 2 19 7.85607797462147 1.07575553239747 6.780322442224 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00185757514723377 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_515449_515750:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_515449_516631:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_515449_515641:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_515449_516632:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506898:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000507493:exon_515449_515730:PIGG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 T:C T C 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 10 18 28 4.62122233801263 9.68179979157727 -5.06057745356464 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0597305381592232 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 7 28 35 3.23485563660884 15.0605774535646 -11.8257218169558 T:C T C 10 0.537877766198737 5.73068268734715e-05 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 18 18 36 8.31820020842273 9.68179979157727 -1.36359958315453 A:G A G 10 0.537877766198737 0.738822345632434 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 871501 C/T 1 12 15 27 5.54546680561516 8.06816649298105 -2.5226996873659 T:C C T 10 0.537877766198737 0.341878737583407 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_871403_871597:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_871403_871597:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_871403_871597:GAK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 882643 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504435:exon_879571_882758:GAK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 1305799 C/T 1 27 22 49 12.4773003126341 11.8333108563722 0.64398945626189 T:C C T 10 0.537877766198737 0.886975474802947 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000513301:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512308:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509254:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000502558:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000508634:exon_1305767_1306374:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503693:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512842:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1305767_1305949:MAEA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/G 1 169 150 319 78.0986575124135 80.6816649298105 -2.58300741739708 C:G C G 10 0.537877766198737 0.779146231354257 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 170 112 282 78.5607797462147 60.2423098142585 18.3184699319562 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0314063161005500 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 1818594 C/T 1 97 90 187 44.8258566787225 48.4089989578863 -3.58314227916381 T:C C T 10 0.537877766198737 0.608372663812542 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1818454_1818641:LETM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 1985668 G/A 1 50 37 87 23.1061116900632 19.9014773493533 3.20463434070988 A:G G A 10 0.537877766198737 0.520113714752013 ENSG00000185049:ENST00000382882:exon_1985575_1985840:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000467661:exon_1985575_1985840:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000333877:exon_1985575_1985840:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000416258:exon_1985575_1985840:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000463820:exon_1985575_1985840:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000411638:exon_1985575_1985840:WHSC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 2702066 G/C 1 48 37 85 22.1818672224606 19.9014773493533 2.28038987310736 C:G G C 10 0.537877766198737 0.664214123648839 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2701407_2702228:FAM193A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 98 76 174 45.2879789125238 40.878710231104 4.40926868141977 T:C T C 10 0.537877766198737 0.543227641932013 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 85 73 158 39.2803898731074 39.2650769325078 0.0153129405995642 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 3123074 C/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3122955_3123159:HTT;ENSG00000197386:ENST00000506137:exon_3122955_3123439:HTT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 T:C T C 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 26 12 38 12.0151780788328 6.45453319438484 5.560644884448 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0750503206827911 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 4322665 T/C 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 4322770 T/C 1 6 11 17 2.77273340280758 5.91665542818611 -3.14392202537853 T:C T C 10 0.537877766198737 0.147916659664906 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4322367_4323512:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4322367_4323125:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4322367_4323513:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4322367_4323513:ZBTB49 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 4436517 A/T 1 22 38 60 10.1666891436278 20.439355115552 -10.2726659719242 A:T A T 10 0.537877766198737 0.00921284645775267 ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000503861:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512195:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000507908:exon_4436497_4436585:STX18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 4440183 T/G 1 21 24 45 9.70456690982652 12.9090663887697 -3.20449947894316 T:G T G 10 0.537877766198737 0.371410652115834 ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000503861:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512195:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000507908:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512780:exon_4440166_4440236:STX18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 6055825 G/A 1 48 14 62 22.1818672224606 7.53028872678232 14.6515784956783 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000172097310009912 ENSG00000152969:ENST00000409021:exon_6055777_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409371:exon_6055777_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000282924:exon_6055484_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000473053:exon_6055484_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409831:exon_6055486_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000429819:exon_6055486_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000410077:exon_6055529_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000418227:exon_6055702_6055875:JAKMIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 6114610 C/T 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C C T 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000152969:ENST00000409021:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409371:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000425341:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000282924:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000473053:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409831:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000410077:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000418227:exon_6114449_6114724:JAKMIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 6302680 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 6304144 C/T 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 T:C C T 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 6304249 A/G 1 11 1 12 5.08334457181389 0.537877766198737 4.54546680561516 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00805204790992705 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 6612964 C/T 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C C T 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6612813_6613005:MAN2B2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 8237255 G/A 1 9 20 29 4.15910010421137 10.7575553239747 -6.59845521976337 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0153860806182445 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000511002:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508183:exon_8237160_8238156:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000513495:exon_8237160_8237317:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8237160_8239397:SH3TC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 13579081 C/T 1 11 15 26 5.08334457181389 8.06816649298105 -2.98482192116716 T:C C T 10 0.537877766198737 0.246211435647614 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13579027_13579111:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000507943:exon_13579027_13579111:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000505343:exon_13579027_13579111:BOD1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 9 2 11 4.15910010421137 1.07575553239747 3.08334457181389 T:C T C 10 0.537877766198737 0.07378362995951 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C:G G C 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 116 99 215 53.6061791209465 53.249898853675 0.356280267271558 A:T A T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 82 78 160 37.8940231717036 41.9544657635015 -4.06044259179791 A:G G A 10 0.537877766198737 0.526881732914251 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 30 20 50 13.8636670140379 10.7575553239747 3.10611169006315 T:C C T 10 0.537877766198737 0.398376657888533 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 17586703 T/C 1 174 166 340 80.4092686814198 89.2877091889903 -8.87844050757056 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.355207905380665 ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 24578097 C/T 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 25125703 C/G 1 11 3 14 5.08334457181389 1.61363329859621 3.46971127321768 C:G C G 10 0.537877766198737 0.104462553857524 ENSG00000109618:ENST00000382103:exon_25121636_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000302922:exon_25122624_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000358971:exon_25123877_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000514585:exon_25125472_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000503150:exon_25125703_25125847:SEPSECS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 25253995 C/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000038210:ENST00000512921:exon_25253943_25254097:PI4K2B;ENSG00000038210:ENST00000264864:exon_25253943_25254097:PI4K2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 35 37 72 16.1742781830442 19.9014773493533 -3.72719916630906 T:C T C 10 0.537877766198737 0.408985715864203 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 38775694 A/C 1 14 11 25 6.46971127321768 5.91665542818611 0.553055845031576 A:C A C 10 0.537877766198737 0.844404343432166 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 38879949 G/A 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000197712:ENST00000510213:exon_38879692_38880047:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000358869:exon_38879692_38880047:FAM114A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 39000475 T/C 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_39000260_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_39000344_39000529:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000372489:exon_39000243_39000529:TMEM156 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 39278661 A/G 1 4 11 15 1.84848893520505 5.91665542818611 -4.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0400137374002459 ENSG00000157796:ENST00000399820:exon_39278640_39278763:WDR19;ENSG00000157796:ENST00000288634:exon_39278640_39278763:WDR19;ENSG00000157796:ENST00000506869:exon_39278640_39278763:WDR19;ENSG00000157796:ENST00000512534:exon_39278640_39278763:WDR19;ENSG00000157796:ENST00000512588:exon_39278582_39278763:WDR19;ENSG00000157796:ENST00000503733:exon_39278584_39278778:WDR19 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 39306504 C/G 1 19 23 42 8.780322442224 12.3711886225709 -3.59086618034695 C:G C G 10 0.537877766198737 0.281946305235054 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39306434_39306548:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39306434_39306548:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000504554:exon_39306434_39306548:RFC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 28 1 29 12.9394225464354 0.537877766198737 12.4015447802366 A:G A G 10 0.537877766198737 5.12124244003576e-07 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 39459899 A/T 1 29 36 65 13.4015447802366 19.3635995831545 -5.9620548029179 A:T A T 10 0.537877766198737 0.170731201100269 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39459814_39459929:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39459814_39460061:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39459814_39459929:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39459814_39459929:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39459814_39459929:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39459814_39459929:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39459814_39459929:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39459814_39459929:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39459814_39460060:RPL9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 40146415 C/G 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 C:G C G 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40146252_40146420:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40146252_40146420:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40146252_40146420:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40146252_40146420:N4BP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 40245006 G/A 1 63 40 103 29.1137007294796 21.5151106479495 7.59859008153009 A:G G A 10 0.537877766198737 0.139190925297018 ENSG00000168421:ENST00000505618:exon_40244798_40245615:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000507851:exon_40244798_40245333:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000508513:exon_40244798_40245054:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000503941:exon_40244798_40245315:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000381799:exon_40244798_40246281:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000511121:exon_40244798_40245025:RHOH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 42022464 C/A 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 A:C C A 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42022433_42022532:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42022433_42022532:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_42022433_42022792:SLC30A9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 56770633 A/T 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 A:T A T 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56770509_56771179:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56770509_56771200:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56770509_56771200:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56770509_56771173:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000506936:exon_56770509_56770743:EXOC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 57797227 C/T 1 10 9 19 4.62122233801263 4.84089989578863 -0.219677557776002 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 57797982 C/A 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 15 11 26 6.93183350701895 5.91665542818611 1.01517807883284 A:G G A 10 0.537877766198737 0.844573032227983 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 57887084 C/T 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 T:C C T 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57887065_57887161:POLR2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 78 73 151 36.0455342364985 39.2650769325078 -3.21954269600928 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.624779833612726 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 68374707 G/T 1 8 8 16 3.6969778704101 4.3030221295899 -0.606044259179791 T:G G T 10 0.537877766198737 0.805966639450967 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 A:G G A 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 73991006 T/C 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:C T C 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000514252:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000254802:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000411811:exon_73990918_73991029:ANKRD17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 1 8 9 0.462122233801263 4.3030221295899 -3.84089989578863 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0147984316454252 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 41 45 86 18.9470115858518 24.2044994789432 -5.25748789309138 A:G G A 10 0.537877766198737 0.279957456347623 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 77087424 G/C 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 C:G G C 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000138760:ENST00000264896:exon_77087403_77087454:SCARB2;ENSG00000138760:ENST00000452464:exon_77087403_77087454:SCARB2;ENSG00000138760:ENST00000511129:exon_77087403_77088017:SCARB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 79800080 G/A 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 83765643 G/A 1 44 32 76 20.3333782872556 17.2120885183596 3.12128976889599 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.492219427469468 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000264405:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000511338:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83764838_83765662:SEC31A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 88036378 C/T 1 11 8 19 5.08334457181389 4.3030221295899 0.780322442223998 T:C C T 10 0.537877766198737 0.82002331137955 ENSG00000172493:ENST00000395146:exon_88035519_88036451:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000307808:exon_88035519_88036451:AFF1;ENSG00000172493:ENST00000503369:exon_88036095_88036451:AFF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 88293887 G/A 1 4 12 16 1.84848893520505 6.45453319438484 -4.60604425917979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.024130575151832 ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507518:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000502576:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507286:exon_88293861_88293967:HSD17B11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 88814907 C/T 0 11 0 11 5.08334457181389 0 5.08334457181389 C C 10 0.537877766198737 0.00129550349960007 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 89198355 T/C 1 15 10 25 6.93183350701895 5.37877766198737 1.55305584503158 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.555492392718307 ENSG00000163644:ENST00000513546:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000508256:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000510548:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000511506:exon_89198295_89198719:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000506423:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000315194:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000514204:exon_89196297_89198395:PPM1K HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 103517423 G/T 1 34 20 54 15.7121559492429 10.7575553239747 4.9546006252682 T:G G T 10 0.537877766198737 0.219046460710421 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103517295_103517489:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103517295_103517489:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103517295_103517489:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000504044:exon_103517295_103517464:NFKB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 103518735 C/T 1 17 16 33 7.85607797462147 8.60604425917979 -0.74996628455832 T:C C T 10 0.537877766198737 0.862119553352529 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103518677_103518818:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103518677_103518818:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103518677_103518818:NFKB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 8 11 19 3.6969778704101 5.91665542818611 -2.219677557776 A:G A G 10 0.537877766198737 0.361009077515707 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 103947512 T/G 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000164038:ENST00000394785:exon_103946647_103947748:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503103:exon_103947113_103947748:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503230:exon_103947321_103947748:NHEDC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 103947631 T/C 1 11 11 22 5.08334457181389 5.91665542818611 -0.833310856372213 T:C T C 10 0.537877766198737 0.831562670929007 ENSG00000164038:ENST00000362026:exon_103947525_103947748:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000394785:exon_103946647_103947748:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503103:exon_103947113_103947748:NHEDC2;ENSG00000164038:ENST00000503230:exon_103947321_103947748:NHEDC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 104032060 A/T 1 17 12 29 7.85607797462147 6.45453319438484 1.40154478023663 A:T A T 10 0.537877766198737 0.710601451134831 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104031985_104032168:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104031985_104032168:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104031985_104032168:CENPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 16 24 40 7.39395574082021 12.9090663887697 -5.51511064794948 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0834284719416832 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 104066348 G/A 1 27 50 77 12.4773003126341 26.8938883099368 -14.4165879973027 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00123310196913044 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 104067195 T/C 1 24 26 50 11.0909336112303 13.9848219211672 -2.89388830993685 T:C T C 10 0.537877766198737 0.478698722039311 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 104068553 T/A 1 27 22 49 12.4773003126341 11.8333108563722 0.64398945626189 A:T T A 10 0.537877766198737 0.886975474802947 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104068513_104068803:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104068513_104068803:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104068513_104068803:CENPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 104081924 T/C 1 14 28 42 6.46971127321768 15.0605774535646 -8.59086618034695 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00839790007464128 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104081782_104081936:CENPE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 7 10 17 3.23485563660884 5.37877766198737 -2.14392202537853 A:G G A 10 0.537877766198737 0.336914616944167 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 108911051 T/C 1 5 21 26 2.31061116900632 11.2954330901735 -8.98482192116716 T:C T C 10 0.537877766198737 0.000521772436796535 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108910870_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108910912_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108910940_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000511742:exon_108911011_108911220:HADH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 108931039 T/C 1 80 52 132 36.969778704101 27.9696438423343 9.00013486176672 T:C T C 10 0.537877766198737 0.137523578107467 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108930915_108931043:HADH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 71 82 153 32.8106785998897 44.1059768282964 -11.2952982284068 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.0742819096353981 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 1 14 15 0.462122233801263 7.53028872678232 -7.06816649298105 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000264060817219911 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 113353052 C/T 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 T:C C T 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 1 10 11 0.462122233801263 5.37877766198737 -4.91665542818611 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00392362184236888 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 9 8 17 4.15910010421137 4.3030221295899 -0.143922025378528 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 122735142 A/G 1 318 296 614 146.954870348802 159.211818794826 -12.2569484460245 A:T:C:G A G 10 0.537877766198737 0.331449500930048 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000509980:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122735021_122737602:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000511132:exon_122735021_122735202:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503139:exon_122734910_122735782:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122734910_122735202:EXOSC9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 122737965 G/C 1 249 247 496 115.068436216514 132.855808251088 -17.7873720345735 C:G G C 10 0.537877766198737 0.114978489485531 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122737927_122738176:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122737927_122738066:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122737927_122737995:EXOSC9;ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122737599_122738841:CCNA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 122741807 C/T 1 19 13 32 8.780322442224 6.99241096058358 1.78791148164042 T:C C T 10 0.537877766198737 0.596919535098297 ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122741697_122741920:CCNA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 T:C C T 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 123838758 A/G 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000513517:exon_123838656_123843752:NUDT6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 129792787 A/G 1 9 1 10 4.15910010421137 0.537877766198737 3.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0250555914428584 ENSG00000077684:ENST00000226319:exon_129792510_129796379:PHF17;ENSG00000077684:ENST00000452328:exon_129792510_129796379:PHF17;ENSG00000077684:ENST00000512960:exon_129792510_129793489:PHF17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 129792873 A/G 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000077684:ENST00000226319:exon_129792510_129796379:PHF17;ENSG00000077684:ENST00000452328:exon_129792510_129796379:PHF17;ENSG00000077684:ENST00000512960:exon_129792510_129793489:PHF17 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 129880770 G/A 1 13 15 28 6.00758903941642 8.06816649298105 -2.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.454321487587661 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 1062 4 1066 490.773812296941 2.15151106479495 488.622301232146 A:G G A 10 0.537877766198737 2.70489558986796e-277 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 140262082 C/A 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:C C A 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000164134:ENST00000296543:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000398947:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000482087:exon_140262066_140262227:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000480277:exon_140262066_140262223:NAA15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 146572227 G/A 1 19 7 26 8.780322442224 3.76514436339116 5.01517807883284 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0510928389496495 ENSG00000151611:ENST00000281317:exon_146572214_146572299:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000503730:exon_146572071_146572299:MMAA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 148796198 G/A 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 A:G G A 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148796172_148796301:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148796172_148796301:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148796172_148796301:ARHGAP10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 151199145 C/T 1 13 18 31 6.00758903941642 9.68179979157727 -3.67421075216085 T:C C T 10 0.537877766198737 0.209426615101637 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151199005_151199156:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151199005_151199156:LRBA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 152638163 C/T 1 24 22 46 11.0909336112303 11.8333108563722 -0.742377245141901 T:C C T 10 0.537877766198737 0.882898068018608 ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152638028_152638226:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152638028_152638226:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515564:exon_152638028_152638226:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000512306:exon_152638028_152638226:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515490:exon_152638028_152638483:PET112L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 154276856 A/G 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000503967:exon_154276806_154276961:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000508731:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154276806_154276863:MND1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 47 17 64 21.7197449886594 9.14392202537853 12.5758229632808 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00157429723688710 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 156281371 T/C 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:C T C 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156281320_156281567:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156281320_156281495:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156281320_156281567:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156281320_156281567:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156281320_156281567:MAP9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 156289803 G/T 1 5 13 18 2.31061116900632 6.99241096058358 -4.68179979157726 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0326852402605774 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156289738_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156289318_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156289654_156289961:MAP9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 156289900 C/T 1 13 2 15 6.00758903941642 1.07575553239747 4.93183350701895 T:C C T 10 0.537877766198737 0.016561054837906 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156289738_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156289318_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156289654_156289961:MAP9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 T:C T C 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 118 140 258 54.530423588549 75.3028872678232 -20.7724636792741 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0103748970198911 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 20 17 37 9.24244467602526 9.14392202537853 0.0985226506467338 A:T:G G T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 170429402 T/C 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 T:C T C 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000137601:ENST00000439128:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000379072:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000511633:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000510533:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000507142:exon_170429399_170429482:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000512193:exon_170429399_170429482:NEK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 170634408 A/G 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 170674892 G/A 1 17 11 28 7.85607797462147 5.91665542818611 1.93942254643536 A:G G A 10 0.537877766198737 0.57069741814659 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170674827_170674986:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170674827_170674986:C4orf27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 170678993 T/C 1 23 7 30 10.6288113774291 3.76514436339116 6.86366701403789 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0158720787916886 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 23 15 38 10.6288113774291 8.06816649298105 2.560644884448 A:G A G 10 0.537877766198737 0.421685001942702 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 183815748 C/G 1 36 24 60 16.6364004168455 12.9090663887697 3.72733402807578 C:G C G 10 0.537877766198737 0.366338441843198 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000514754:exon_183815707_183815758:DCTD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 184629643 A/G 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 A:G A G 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000511955:exon_184629560_184629727:C4orf41 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 64 46 110 29.5758229632808 24.7423772451419 4.83344571813894 T:C C T 10 0.537877766198737 0.389882509545832 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 A:C C A 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 T:G T G 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 185623529 T/C 1 20 18 38 9.24244467602526 9.68179979157727 -0.439355115552004 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185623517_185623595:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185623517_185623595:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000508095:exon_185623243_185623635:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185623517_185623595:MLF1IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 27 17 44 12.4773003126341 9.14392202537853 3.33337828725558 T:C T C 10 0.537877766198737 0.365323769081569 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 29 14 43 13.4015447802366 7.53028872678232 5.87125605345431 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0915882658496596 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 185650154 G/A 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185650072_185650189:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185650072_185650189:MLF1IP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 A:G A G 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 15 5 20 6.93183350701895 2.68938883099368 4.24244467602526 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0719987060582597 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 13 10 23 6.00758903941642 5.37877766198737 0.62881137742905 A:G A G 10 0.537877766198737 0.837246490944224 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 186324675 A/G 1 113 111 224 52.2198124195427 59.7044320480598 -7.48461962851707 A:G A G 10 0.537877766198737 0.315877004413947 ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186324648_186324772:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000264689:exon_186324648_186324772:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510206:exon_186324648_186324772:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510755:exon_186324648_186324772:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000511485:exon_186324648_186324772:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000509180:exon_186324648_186324772:UFSP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 190862151 A/C 1 149 153 302 68.8562128363882 82.2952982284068 -13.4390853920186 A:C A C 10 0.537877766198737 0.133368966037076 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 4 190862182 C/T 1 125 138 263 57.7652792251579 74.2271317354257 -16.4618525102678 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0476234063263266 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190862179_190862226:FRG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 205574 G/A 1 40 19 59 18.4848893520505 10.219677557776 8.26521179427452 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0360961990920995 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 226160 A/C 1 47 41 88 21.7197449886594 22.0529884141482 -0.333243425488849 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 228362 T/C 1 37 42 79 17.0985226506467 22.590866180347 -5.49234352970022 T:C T C 10 0.537877766198737 0.217064799834267 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 233734 C/G 1 74 84 158 34.1970453012935 45.1817323606939 -10.9846870594004 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0935203927581139 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 235364 C/T 1 92 63 155 42.5152455097162 33.8862992705204 8.62894623919578 T:C C T 10 0.537877766198737 0.171489977311322 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_235259_235379:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_235259_235639:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_234536_236714:SDHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 256472 G/A 1 272 217 489 125.697247593944 116.719475265126 8.97777232881762 A:G G A 10 0.537877766198737 0.440752618844078 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 434430 G/A 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000511487:exon_433968_434524:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 9 12 21 4.15910010421137 6.45453319438484 -2.29543309017348 C:G G C 10 0.537877766198737 0.383260377366473 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 442933 G/A 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 13 23 36 6.00758903941642 12.3711886225709 -6.36359958315453 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0436083692067447 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 479905 A/C 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 A:C A C 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 480033 C/T 1 14 6 20 6.46971127321768 3.22726659719242 3.24244467602526 T:C C T 10 0.537877766198737 0.180307908095872 ENSG00000066230:ENST00000264938:exon_479951_480080:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000514375:exon_479951_480080:SLC9A3;ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 647984 C/T 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000112877:ENST00000264935:exon_647920_648031:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000444221:exon_647920_648031:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000512038:exon_647920_648031:CEP72 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 653145 C/G 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 C:G C G 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000112877:ENST00000264935:exon_653103_653668:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000444221:exon_653103_653664:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000512038:exon_653103_653358:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000499639:exon_653141_653306:CEP72 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 653209 A/G 1 12 6 18 5.54546680561516 3.22726659719242 2.31820020842273 A:G A G 10 0.537877766198737 0.347077314597466 ENSG00000112877:ENST00000264935:exon_653103_653668:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000444221:exon_653103_653664:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000512038:exon_653103_653358:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000499639:exon_653141_653306:CEP72 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 864579 A/G 1 17 19 36 7.85607797462147 10.219677557776 -2.36359958315453 A:G A G 10 0.537877766198737 0.504572022125103 ENSG00000028310:ENST00000497410:exon_863856_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483234:exon_863856_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_863856_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_863856_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_863856_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_863856_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_863856_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323547:exon_863856_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_863860_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_863860_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_863860_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_863860_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_864238_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_864388_864683:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519112:exon_864538_864683:BRD9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 870619 A/G 1 13 20 33 6.00758903941642 10.7575553239747 -4.74996628455832 A:G A G 10 0.537877766198737 0.116076750485698 ENSG00000028310:ENST00000483234:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323547:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519112:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518250:exon_870588_870668:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000523139:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518251:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000475706:exon_870403_870690:BRD9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 1463806 G/A 1 18 10 28 8.31820020842273 5.37877766198737 2.93942254643536 A:G G A 10 0.537877766198737 0.343760844063762 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1461955_1463950:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1461538_1463950:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1461544_1463950:LPCAT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 1470980 C/T 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:C C T 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1470941_1471039:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1470941_1471039:LPCAT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 1815950 T/C 1 4 11 15 1.84848893520505 5.91665542818611 -4.06816649298105 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0400137374002459 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 7897283 G/A 1 12 12 24 5.54546680561516 6.45453319438484 -0.909066388769688 A:G G A 10 0.537877766198737 0.838384934353366 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 10 14 24 4.62122233801263 7.53028872678232 -2.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.306179082005434 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 10262770 C/T 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 14291253 G/A 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14290825_14291337:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14290825_14291337:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14290825_14291337:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14291086_14291337:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000504606:exon_14291086_14291337:TRIO HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 17275364 T/C 1 265 142 407 122.462391957335 76.3786428002206 46.0837491571141 T:C T C 10 0.537877766198737 4.39627799443386e-06 ENSG00000176788:ENST00000322611:exon_17275317_17276943:BASP1;ENSG00000176788:ENST00000447228:exon_17275326_17275588:BASP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 17275957 C/T 1 202 155 357 93.3486912278551 83.3710537608042 9.97763746705091 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.313223453522826 ENSG00000176788:ENST00000322611:exon_17275317_17276943:BASP1;ENSG00000176788:ENST00000447228:exon_17275751_17276009:BASP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 31451688 A/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31451640_31451747:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31451640_31451747:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31451640_31451747:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31451640_31451747:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31451640_31451747:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000508905:exon_31451640_31451747:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31451640_31451747:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000505601:exon_31451640_31451747:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000507174:exon_31451640_31451747:DROSHA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 32126441 G/A 1 11 19 30 5.08334457181389 10.219677557776 -5.13633298596211 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0677854810254729 ENSG00000113384:ENST00000265070:exon_32124810_32126742:GOLPH3;ENSG00000113384:ENST00000499354:exon_32124827_32126742:GOLPH3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 32395291 T/C 1 39 28 67 18.0227671182493 15.0605774535646 2.96218966468462 T:C T C 10 0.537877766198737 0.540510827885743 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32395265_32395410:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32395265_32395410:ZFR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 71 54 125 32.8106785998897 29.0453993747318 3.76527922515788 A:G G A 10 0.537877766198737 0.530702509615167 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 33751626 C/G 1 13 3 16 6.00758903941642 1.61363329859621 4.39395574082021 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0415624991007089 ENSG00000151388:ENST00000504830:exon_33751509_33751653:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000352040:exon_33751509_33751653:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000504582:exon_33751509_33751653:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000515401:exon_33751303_33751653:ADAMTS12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 37291961 A/G 1 23 13 36 10.6288113774291 6.99241096058358 3.63640041684547 A:G A G 10 0.537877766198737 0.245477894791285 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37288239_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000508182:exon_37291735_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000502533:exon_37291940_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37291941_37292140:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37291941_37292140:NUP155 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 42801268 C/T 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000507920:exon_42800921_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000509276:exon_42801030_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000514218:exon_42801036_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000513303:exon_42801207_42801433:SEPP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 43039593 G/A 1 27 19 46 12.4773003126341 10.219677557776 2.2576227548581 A:G G A 10 0.537877766198737 0.555985307319487 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 8 15 23 3.6969778704101 8.06816649298105 -4.37118862257095 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0926012068362168 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 44813282 A/G 1 34 44 78 15.7121559492429 23.6666217127444 -7.95446576350148 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0878650593770165 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44813208_44813384:MRPS30;ENSG00000112996:ENST00000515647:exon_44813208_44813384:MRPS30;ENSG00000112996:ENST00000508129:exon_44813208_44813731:MRPS30 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 13 15 28 6.00758903941642 8.06816649298105 -2.06057745356464 T:C T C 10 0.537877766198737 0.454321487587661 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 22 25 47 10.1666891436278 13.4469441549684 -3.28025501134064 A:G A G 10 0.537877766198737 0.381036391165649 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 66479189 G/A 1 20 18 38 9.24244467602526 9.68179979157727 -0.439355115552004 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 66479206 T/C 1 16 23 39 7.39395574082021 12.3711886225709 -4.97723288175074 T:C T C 10 0.537877766198737 0.147413120871146 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 68425303 A/G 1 20 29 49 9.24244467602526 15.5984552197634 -6.35601054373811 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0847738627875016 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68425274_68426896:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68425274_68426892:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000511158:exon_68425274_68425953:SLC30A5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 108 75 183 49.9092012505364 40.3408324649053 9.56836878563114 A:G G A 10 0.537877766198737 0.159677285081213 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 68616225 G/C 1 5 10 15 2.31061116900632 5.37877766198737 -3.06816649298105 C:G G C 10 0.537877766198737 0.126399812708836 ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68616064_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000453797:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000383374:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000512045:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000513172:exon_68616064_68616407:CCDC125 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 70786830 G/T 1 5 10 15 2.31061116900632 5.37877766198737 -3.06816649298105 T:G G T 10 0.537877766198737 0.126399812708836 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70786811_70786958:BDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 70805984 G/A 1 22 24 46 10.1666891436278 12.9090663887697 -2.7423772451419 A:G G A 10 0.537877766198737 0.461071434223992 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 27 37 64 12.4773003126341 19.9014773493533 -7.42417703671916 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0784765604290013 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 26 16 42 12.0151780788328 8.60604425917979 3.40913381965305 A:T T A 10 0.537877766198737 0.353613899338721 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 23 24 47 10.6288113774291 12.9090663887697 -2.28025501134064 C:G C G 10 0.537877766198737 0.559489658756723 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 24 19 43 11.0909336112303 10.219677557776 0.87125605345431 T:C C T 10 0.537877766198737 0.878832113049481 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 71521947 T/C 1 12 18 30 5.54546680561516 9.68179979157727 -4.13633298596211 T:C T C 10 0.537877766198737 0.145035454783885 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71521884_71522063:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71521920_71522026:MRPS27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 72189341 A/G 1 14 13 27 6.46971127321768 6.99241096058358 -0.522699687365898 A:G A G 10 0.537877766198737 0.84951872158194 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72189204_72189362:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72189204_72189362:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72189204_72189362:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72189204_72189362:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72189289_72189362:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72189204_72189362:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72189204_72189362:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72189204_72189362:TNPO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 74017499 C/T 1 10 12 22 4.62122233801263 6.45453319438484 -1.83331085637221 T:C C T 10 0.537877766198737 0.522885386896646 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74017029_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74017031_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74017083_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000515125:exon_74017098_74017608:GFM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 74064872 G/A 1 225 264 489 103.977502605284 141.999730276467 -38.0222276711824 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000655599205534014 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74064756_74064943:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74064756_74064943:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74064756_74064943:NSA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 74077474 C/T 0 0 8 8 0 4.3030221295899 -4.3030221295899 T C T 10 0.537877766198737 0.00207995965823786 ENSG00000198780:ENST00000389156:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000514215:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510496:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510609:exon_74073401_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000380515:exon_74076956_74077833:FAM169A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 75001590 T/A 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 A:T T A 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75001064_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75001398_75001612:POC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 11 15 26 5.08334457181389 8.06816649298105 -2.98482192116716 T:C T C 10 0.537877766198737 0.246211435647614 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 41 33 74 18.9470115858518 17.7499662845583 1.19704530129347 T:C C T 10 0.537877766198737 0.81638904354987 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 27 38 65 12.4773003126341 20.439355115552 -7.9620548029179 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0612239841738683 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 78596521 C/T 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000152409:ENST00000282259:exon_78596499_78596686:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396135:exon_78596499_78596686:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396137:exon_78596499_78596686:JMY HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 78596580 C/T 0 11 0 11 5.08334457181389 0 5.08334457181389 C C 10 0.537877766198737 0.00129550349960007 ENSG00000152409:ENST00000282259:exon_78596499_78596686:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396135:exon_78596499_78596686:JMY;ENSG00000152409:ENST00000396137:exon_78596499_78596686:JMY HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 80149981 A/G 1 13 12 25 6.00758903941642 6.45453319438484 -0.446944154968424 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80149949_80150135:MSH3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 13 15 28 6.00758903941642 8.06816649298105 -2.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.454321487587661 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 80600619 C/G 1 29 31 60 13.4015447802366 16.6742107521608 -3.27266597192422 C:G C G 10 0.537877766198737 0.438101548013636 ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80597422_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80600560_80600960:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80600560_80600960:ZCCHC9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 80604430 C/T 1 63 38 101 29.1137007294796 20.439355115552 8.67434561392757 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.0899835859835369 ENSG00000131732:ENST00000507402:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000506458:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000504502:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000505860:exon_80604226_80604530:ZCCHC9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 80736444 A/G 1 4 13 17 1.84848893520505 6.99241096058358 -5.14392202537853 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0143486832929105 ENSG00000145687:ENST00000320672:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000509053:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000514493:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504985:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000512923:exon_80736357_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000510060:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000505980:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000515395:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000380182:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504136:exon_80736377_80736455:SSBP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 81549240 C/A 1 4 10 14 1.84848893520505 5.37877766198737 -3.53028872678232 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0652981523722034 ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 14 1 15 6.46971127321768 0.537877766198737 5.93183350701895 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00144009086784243 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 9 3 12 4.15910010421137 1.61363329859621 2.54546680561516 A:C A C 10 0.537877766198737 0.159826746582100 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 15 5 20 6.93183350701895 2.68938883099368 4.24244467602526 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0719987060582597 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 9 9 18 4.15910010421137 4.84089989578863 -0.681799791577266 T:C C T 10 0.537877766198737 0.815520419865837 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 96082087 T/A 1 54 71 125 24.9546006252682 38.1893214001103 -13.2347207748421 A:T:G T A 10 0.537877766198737 0.0194947003633167 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511097:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000503828:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96082046_96082129:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512191:exon_96082046_96082129:CAST HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 A:C A C 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 85 85 170 39.2803898731074 45.7196101268926 -6.43922025378528 C:G G C 10 0.537877766198737 0.356038787710299 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 118844846 T/C 1 13 15 28 6.00758903941642 8.06816649298105 -2.06057745356464 T:C T C 10 0.537877766198737 0.454321487587661 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000520244:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118844836_118844939:HSD17B4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 118877660 A/G 1 120 93 213 55.4546680561516 50.0226322564825 5.43203579966903 A:G A G 10 0.537877766198737 0.492106972776888 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 118877677 C/T 1 112 86 198 51.7576901857415 46.2574878930914 5.50020229265008 T:C C T 10 0.537877766198737 0.47611331034537 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 123976967 C/T 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C C T 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000168916:ENST00000513985:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000395398:exon_123976945_123977098:ZNF608 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 208 209 417 96.1214246306627 112.416453135536 -16.2950285048733 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.116011689866991 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 151 163 314 69.7804573039907 87.6740758903941 -17.8936185864034 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0474522373726152 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 10 14 24 4.62122233801263 7.53028872678232 -2.90906638876969 A:G G A 10 0.537877766198737 0.306179082005434 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 137759907 G/T 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 T:G G T 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137759764_137760030:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137759764_137760030:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137759764_137760030:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137759764_137760030:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000505756:exon_137759824_137760030:KDM3B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 138378368 T/G 1 77 79 156 35.5834120026973 42.4923435297002 -6.90893152700297 T:G T G 10 0.537877766198737 0.29656254629987 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000503732:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505945:exon_138378309_138378371:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138378309_138378408:SIL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 62 38 100 28.6515784956783 20.439355115552 8.2122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.10871970161539 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 139060486 G/A 1 49 31 80 22.6439894562619 16.6742107521608 5.96977870410104 A:G G A 10 0.537877766198737 0.217203616715871 ENSG00000171604:ENST00000302517:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504844:exon_139059949_139060591:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000520967:exon_139059949_139060521:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511048:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502716:exon_139059949_139060651:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511457:exon_139059949_139060698:CXXC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 48 59 107 22.1818672224606 31.7347882057255 -9.55292098326485 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0659896216325138 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 139928823 C/T 1 128 100 228 59.1516459265617 53.7877766198737 5.36386930668797 T:C C T 10 0.537877766198737 0.506768758729286 ENSG00000131503:ENST00000422011:exon_139928819_139929163:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000253810:exon_139928819_139929163:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000297183:exon_139928819_139929154:ANKHD1;ENSG00000254996:ENST00000532219:exon_139928819_139929154:ANKHD1-EIF4EBP3;ENSG00000254996:ENST00000474060:exon_139928819_139929154:ANKHD1-EIF4EBP3;ENSG00000254996:ENST00000437495:exon_139928819_139929154:ANKHD1-EIF4EBP3;ENSG00000243056:ENST00000310331:exon_139928819_139929163:EIF4EBP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 162 103 265 74.8638018758046 55.4014099184699 19.4623919573347 A:T:G G T 10 0.537877766198737 0.0190576100193313 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 139936835 G/A 1 90 100 190 41.5910010421137 53.7877766198737 -12.19677557776 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0808024494202178 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 140896472 C/T 1 19 24 43 8.780322442224 12.9090663887697 -4.12874394654569 T:C C T 10 0.537877766198737 0.223361625575660 ENSG00000131504:ENST00000476339:exon_140894583_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140894583_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140894583_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140894589_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140894589_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140894589_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140894589_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000448451:exon_140894724_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140895542_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000468119:exon_140896139_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140896366_140896575:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140896366_140896575:DIAPH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 141001090 T/C 1 136 110 246 62.8486237969718 59.1665542818611 3.6820695151107 T:C T C 10 0.537877766198737 0.654863664976324 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141000443_141001104:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141000443_141001104:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000469207:exon_141000492_141001104:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000459727:exon_141001052_141001104:HDAC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 141304989 G/A 1 28 21 49 12.9394225464354 11.2954330901735 1.64398945626189 A:G G A 10 0.537877766198737 0.669714011117111 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141304975_141305092:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141304975_141305092:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141304975_141305092:KIAA0141 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 141307833 T/C 1 34 20 54 15.7121559492429 10.7575553239747 4.9546006252682 T:C T C 10 0.537877766198737 0.219046460710421 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141307716_141307863:KIAA0141 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 141312988 T/C 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 T:C T C 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000081791:ENST00000506775:exon_141312824_141313447:KIAA0141 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 141318368 C/T 1 16 10 26 7.39395574082021 5.37877766198737 2.01517807883284 T:C C T 10 0.537877766198737 0.556039763483853 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141318086_141321612:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000509110:exon_141318086_141318513:KIAA0141 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 145887453 G/A 1 24 23 47 11.0909336112303 12.3711886225709 -1.28025501134064 A:G G A 10 0.537877766198737 0.770529555821643 ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000503741:exon_145887436_145887519:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000511077:exon_145886934_145887519:TCERG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 145890028 A/G 1 26 47 73 12.0151780788328 25.2802550113406 -13.2650769325078 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00211598114280743 ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145890004_145891524:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145890004_145890586:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145890004_145891071:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000511077:exon_145890004_145891068:TCERG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149753934 C/G 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 C:G C G 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149753737_149753949:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149753737_149753949:TCOF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 16 16 32 7.39395574082021 8.60604425917979 -1.21208851835958 T:C C T 10 0.537877766198737 0.724557498021263 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149786496 A/G 1 6027 1593 7620 2785.21070312021 856.839281554588 1928.37142156562 A:T:C:G A G 10 0.537877766198737 4.94065645841247e-324 ENSG00000019582:ENST00000377795:exon_149786444_149786523:CD74;ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149786444_149786523:CD74;ENSG00000019582:ENST00000518797:exon_149786444_149786523:CD74;ENSG00000019582:ENST00000524315:exon_149786444_149786523:CD74;ENSG00000019582:ENST00000009530:exon_149786444_149786523:CD74;ENSG00000019582:ENST00000523208:exon_149786444_149786523:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517752:exon_149786444_149786523:CD74;ENSG00000019582:ENST00000523836:exon_149786444_149786523:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149786444_149786887:CD74;ENSG00000019582:ENST00000522153:exon_149786268_149786523:CD74 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149792113 G/A 0 16 0 16 7.39395574082021 0 7.39395574082021 G G 10 0.537877766198737 5.34099534678049e-05 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149792126 A/G 1 14 1 15 6.46971127321768 0.537877766198737 5.93183350701895 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00144009086784243 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149792135 G/A 1 13 1 14 6.00758903941642 0.537877766198737 5.46971127321768 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00256068292358197 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149792337 C/T 1 24 28 52 11.0909336112303 15.0605774535646 -3.96964384233432 T:C C T 10 0.537877766198737 0.330333475160261 ENSG00000019582:ENST00000353334:exon_149792188_149792492:CD74;ENSG00000019582:ENST00000517791:exon_149792188_149792475:CD74 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 4326 3656 7982 1999.14078342426 1966.48111322258 32.6596702016816 A:T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.465629241833306 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 150425467 G/A 1 116 104 220 53.6061791209465 55.9392876846686 -2.33310856372213 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.786912274711128 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 150443277 C/T 1 70 54 124 32.3485563660884 29.0453993747318 3.30315699135662 T:C C T 10 0.537877766198737 0.589438561949478 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000520695:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521001:exon_150443174_150443308:TNIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 150578592 C/T 1 18 16 34 8.31820020842273 8.60604425917979 -0.287844050757057 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 150639439 A/G 1 15 6 21 6.93183350701895 3.22726659719242 3.70456690982652 A:C:G A G 10 0.537877766198737 0.126902671440171 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 154268902 C/T 1 53 48 101 24.4924783914669 25.8181327775394 -1.32565438607243 T:C C T 10 0.537877766198737 0.84198854224299 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154268881_154268977:GEMIN5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 154271948 G/A 1 23 17 40 10.6288113774291 9.14392202537853 1.48488935205052 A:G G A 10 0.537877766198737 0.751627972797071 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154271947_154272109:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000522075:exon_154271947_154272210:GEMIN5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 T:C C T 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 154346325 G/A 1 180 166 346 83.1820020842273 89.2877091889903 -6.10570710476298 A:G G A 10 0.537877766198737 0.518017248549589 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 156565975 G/A 1 52 38 90 24.0303561576657 20.439355115552 3.59100104211367 A:G G A 10 0.537877766198737 0.461422002565869 ENSG00000155868:ENST00000286317:exon_156564423_156566459:MED7;ENSG00000155868:ENST00000420343:exon_156565453_156566459:MED7;ENSG00000155868:ENST00000524289:exon_156565857_156566459:MED7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 21 18 39 9.70456690982652 9.68179979157727 0.0227671182492575 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 159437621 C/G 1 99 134 233 45.750101146325 72.0756206706308 -26.3255195243057 C:G C G 10 0.537877766198737 0.000609489012004072 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159437507_159437865:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159437507_159437865:TTC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 159463719 C/T 1 88 77 165 40.6667565745111 41.4165879973027 -0.749831422791601 T:C C T 10 0.537877766198737 0.93783365526327 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159463698_159463810:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159463698_159463810:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522073:exon_159463513_159463810:TTC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 38 48 86 17.560644884448 25.8181327775394 -8.25748789309138 A:G A G 10 0.537877766198737 0.083394556183924 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 162901156 G/A 1 5 17 22 2.31061116900632 9.14392202537853 -6.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00443978512860853 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162901063_162901211:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162901063_162901211:HMMR HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 7 19 26 3.23485563660884 10.219677557776 -6.98482192116716 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00915395185824377 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 19 15 34 8.780322442224 8.06816649298105 0.712155949242943 T:C T C 10 0.537877766198737 0.864600057495229 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 19 14 33 8.780322442224 7.53028872678232 1.25003371544168 T:C T C 10 0.537877766198737 0.728850756969449 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 15 19 34 6.93183350701895 10.219677557776 -3.28784405075706 T:G G T 10 0.537877766198737 0.303022928947373 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 169129422 A/G 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G A G 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 90 104 194 41.5910010421137 55.9392876846686 -14.348286642555 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0435699074063566 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 169509853 G/A 1 248 231 479 114.606313982713 124.249763991908 -9.64345000919501 A:G G A 10 0.537877766198737 0.384187068556963 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169509800_169510386:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169509800_169509938:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169509800_169510383:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169509800_169510381:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169509800_169510381:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169509800_169510381:DOCK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 37 53 90 17.0985226506467 28.5075216085331 -11.4089989578863 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0195602601107571 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 A:G G A 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 176395667 C/T 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 T:C C T 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176395556_176395890:UIMC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 33 14 47 15.2500337154417 7.53028872678232 7.71974498865936 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0275699859092323 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 176936590 T/C 1 14 13 27 6.46971127321768 6.99241096058358 -0.522699687365898 T:C T C 10 0.537877766198737 0.84951872158194 ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000509310:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502380:exon_176935785_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936167_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510389:exon_176936503_176936658:DOK3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 176951276 A/G 1 40 29 69 18.4848893520505 15.5984552197634 2.88643413228715 A:G A G 10 0.537877766198737 0.546625381633863 ENSG00000146067:ENST00000514747:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000505569:exon_176951186_176952488:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000398118:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000507212:exon_176951186_176951495:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000505241:exon_176951186_176951422:FAM193B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 176952178 T/G 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 T:G T G 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000146067:ENST00000514747:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000505569:exon_176951186_176952488:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000398118:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000513502:exon_176952055_176952206:FAM193B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 1 1629 4 1633 752.797118862258 2.15151106479495 750.645607797463 A:T:C:G T C 10 0.537877766198737 0 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 1 12 1 13 5.54546680561516 0.537877766198737 5.00758903941642 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00454547839059184 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 177548914 G/A 1 69 82 151 31.8864341322871 44.1059768282964 -12.2195426960093 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0500399498554451 ENSG00000145911:ENST00000274605:exon_177548475_177553088:N4BP3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 177569978 C/T 1 22 14 36 10.1666891436278 7.53028872678232 2.63640041684547 T:C C T 10 0.537877766198737 0.407660926829512 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177569584_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507457:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000512811:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177569853_177569993:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177568673_177569993:RMND5B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 177574561 T/C 1 44 51 95 20.3333782872556 27.4317660761356 -7.09838778888001 T:C T C 10 0.537877766198737 0.150642681473552 ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507937:exon_177572971_177574636:RMND5B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 177576710 C/T 1 476 361 837 219.970183289401 194.173873597744 25.7963096916572 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0770433671157892 ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177574970_177577566:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177574970_177576992:RMND5B;ENSG00000145912:ENST00000274606:exon_177576461_177576839:NHP2;ENSG00000145912:ENST00000314397:exon_177576483_177576839:NHP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 177652392 T/C 1 16 10 26 7.39395574082021 5.37877766198737 2.01517807883284 T:C T C 10 0.537877766198737 0.556039763483853 ENSG00000175309:ENST00000308158:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000481436:exon_177652356_177653080:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000489262:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000493197:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000494126:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000510913:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000514424:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000323594:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000506001:exon_177652356_177652430:AGXT2L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 179023642 G/A 1 58 59 117 26.8030895604733 31.7347882057255 -4.93169864525222 A:G G A 10 0.537877766198737 0.404137861632365 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179023563_179023682:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179023636_179023682:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179023563_179023682:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179023563_179023682:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179023563_179023682:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179023563_179023682:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179023563_179023682:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502531:exon_179023561_179023682:RUFY1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 179028961 C/T 1 68 50 118 31.4243118984859 26.8938883099368 4.53042358854904 T:C C T 10 0.537877766198737 0.40810857885042 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179028893_179028987:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179028893_179028987:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179028893_179028987:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393448:exon_179028893_179029572:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179028893_179028987:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179028893_179028987:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502434:exon_179028893_179028987:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000502531:exon_179028893_179028987:RUFY1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 165 169 334 76.2501685772084 90.9013424875865 -14.6511739103781 A:G G A 10 0.537877766198737 0.111637453151935 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 179260219 C/T 1 190 179 369 87.80322442224 96.2801201495739 -8.47689572733394 T:C C T 10 0.537877766198737 0.37544885610719 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 179269011 G/C 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 C:G G C 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179269000_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520900:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179268907_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521675:exon_179268458_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000524068:exon_179268908_179269064:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522157:exon_179269008_179269064:C5orf45 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 21 7 28 9.70456690982652 3.76514436339116 5.93942254643536 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0351553842520382 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 179297262 T/C 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 T:C T C 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 14 8 22 6.46971127321768 4.3030221295899 2.16668914362779 T:C C T 10 0.537877766198737 0.398552823157135 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 180666049 C/T 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 T:C C T 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000204628:ENST00000514183:exon_180665206_180666177:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502548:exon_180666038_180666582:GNB2L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 5 180669275 C/T 1 2614 2747 5361 1207.9875191565 1477.55022374793 -269.562704591429 A:T:C:G C T 10 0.537877766198737 1.81973102816062e-13 ENSG00000204628:ENST00000511473:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000504325:exon_180669170_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000389599:exon_180669179_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000511566:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000512805:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000508682:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000511900:exon_180669170_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000512968:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000441597:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000510199:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502844:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000507000:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000514183:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502548:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000503494:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000503081:exon_180669170_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000515417:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000513027:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000456394:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000505461:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000507261:exon_180669170_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000508963:exon_180669174_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000503170:exon_180669250_180669345:GNB2L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 60 68 128 27.7273340280758 36.5756881015141 -8.84835407343833 A:G G A 10 0.537877766198737 0.131624112759643 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 2766144 T/C 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C T C 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2765648_2766678:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2765648_2766678:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000415856:exon_2765666_2766678:WRNIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 28 23 51 12.9394225464354 12.3711886225709 0.568233923864415 A:G G A 10 0.537877766198737 0.889445016931927 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 3015865 C/T 1 28 11 39 12.9394225464354 5.91665542818611 7.02276711824926 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0248082044842627 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 3127492 T/C 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 T:C T C 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000488487:exon_3127030_3127642:BPHL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 3129323 G/A 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000488487:exon_3129279_3129432:BPHL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 4126380 G/A 1 56 24 80 25.8788450928707 12.9090663887697 12.969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00346572645523129 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4125484_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4125484_4126471:PECI HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 4943846 T/C 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000153046:ENST00000328908:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397588:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000472453:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397586:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000449732:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000343762:exon_4943780_4943990:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000469671:exon_4943780_4944047:CDYL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 4995464 C/T 1 12 6 18 5.54546680561516 3.22726659719242 2.31820020842273 T:C C T 10 0.537877766198737 0.347077314597466 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4994966_4995510:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4995281_4995510:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4995283_4995510:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4995312_4995510:RPP40 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 4996611 T/G 1 22 15 37 10.1666891436278 8.06816649298105 2.09852265064673 T:G T G 10 0.537877766198737 0.514401734567125 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4996456_4996654:RPP40 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 16 9 25 7.39395574082021 4.84089989578863 2.55305584503158 A:G A G 10 0.537877766198737 0.324549732879746 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 4999011 A/G 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 5369142 C/T 1 12 6 18 5.54546680561516 3.22726659719242 2.31820020842273 T:C C T 10 0.537877766198737 0.347077314597466 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5368783_5369415:FARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 5404783 T/G 1 27 13 40 12.4773003126341 6.99241096058358 5.48488935205052 T:G T G 10 0.537877766198737 0.111656347368297 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5404775_5404934:FARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 5431340 A/G 1 12 14 26 5.54546680561516 7.53028872678232 -1.98482192116716 A:G A G 10 0.537877766198737 0.440230707582908 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 6006964 C/T 0 0 18 18 0 9.68179979157727 -9.68179979157727 T C T 10 0.537877766198737 9.23896988151956e-07 ENSG00000124785:ENST00000244766:exon_6006928_6007200:NRN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 6654794 G/T 1 267 282 549 123.386636424937 151.681530068044 -28.2948936431066 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0164780678386098 ENSG00000112799:ENST00000379953:exon_6654777_6655216:LY86;ENSG00000112799:ENST00000230568:exon_6654777_6655214:LY86 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 27 26 53 12.4773003126341 13.9848219211672 -1.50752160853306 A:G A G 10 0.537877766198737 0.682162393677448 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 7 9 16 3.23485563660884 4.84089989578863 -1.60604425917979 A:G A G 10 0.537877766198737 0.460334234664264 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 10702690 A/G 1 33 35 68 15.2500337154417 18.8257218169558 -3.57568810151411 A:G A G 10 0.537877766198737 0.396918670188165 ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702602_10702722:PAK1IP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 10751379 C/T 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000137210:ENST00000472062:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000379542:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000491103:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000480194:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000475942:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000467317:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000478732:exon_10751366_10751467:TMEM14B;ENSG00000137210:ENST00000486421:exon_10751366_10751467:TMEM14B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 11 12 23 5.08334457181389 6.45453319438484 -1.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 0.676956493327354 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 13321179 C/T 1 27 45 72 12.4773003126341 24.2044994789432 -11.7271991663091 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00631797260874884 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13321140_13321301:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000428109:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000416436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379291:exon_13321140_13321327:TBC1D7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 13592018 G/A 1 10 10 20 4.62122233801263 5.37877766198737 -0.757555323974739 A:G G A 10 0.537877766198737 0.823990074103612 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13591901_13592126:SIRT5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 16306866 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16299343_16307090:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16306534_16307090:ATXN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 20109879 C/T 1 11 11 22 5.08334457181389 5.91665542818611 -0.833310856372213 T:C C T 10 0.537877766198737 0.831562670929007 ENSG00000172197:ENST00000324607:exon_20109829_20109980:MBOAT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 21065449 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 24843527 C/T 1 27 29 56 12.4773003126341 15.5984552197634 -3.12115490712927 T:C C T 10 0.537877766198737 0.423598760807013 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 25969599 G/T 1 20 7 27 9.24244467602526 3.76514436339116 5.4773003126341 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0515206980703081 ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25969553_25969648:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25969553_25969648:TRIM38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 25969600 A/T 1 20 7 27 9.24244467602526 3.76514436339116 5.4773003126341 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0515206980703081 ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25969553_25969648:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25969553_25969648:TRIM38 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26104187 C/T 1 15 18 33 6.93183350701895 9.68179979157727 -2.74996628455832 T:C C T 10 0.537877766198737 0.384427877209256 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26184082 C/G 1 22 20 42 10.1666891436278 10.7575553239747 -0.590866180346952 C:G C G 10 0.537877766198737 0.878047078026096 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26197493 C/A 1 13 13 26 6.00758903941642 6.99241096058358 -0.98482192116716 A:C C A 10 0.537877766198737 0.699848188249655 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26197012_26197497:HIST1H3D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26199222 G/A 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 A:G G A 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26216656 T/C 1 18 10 28 8.31820020842273 5.37877766198737 2.93942254643536 T:C T C 10 0.537877766198737 0.343760844063762 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 9 6 15 4.15910010421137 3.22726659719242 0.931833507018945 A:G A G 10 0.537877766198737 0.797084445263156 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26252148 C/T 1 39 27 66 18.0227671182493 14.5226996873659 3.50006743088336 T:C C T 10 0.537877766198737 0.459156685185821 ENSG00000197459:ENST00000356350:exon_26251879_26252303:HIST1H2BH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 22 13 35 10.1666891436278 6.99241096058358 3.17427818304421 A:G A G 10 0.537877766198737 0.312480889992981 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 27834702 C/T 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 T:C C T 10 0.537877766198737 0.80945734873112 ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 27861484 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000196331:ENST00000303806:exon_27861203_27861669:HIST1H2BO HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 28244361 C/A 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:C C A 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 11 1 12 5.08334457181389 0.537877766198737 4.54546680561516 A:C C A 10 0.537877766198737 0.00805204790992705 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 27 6 33 12.4773003126341 3.22726659719242 9.25003371544168 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00129550683516462 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 28 4 32 12.9394225464354 2.15151106479495 10.7879114816404 A:G A G 10 0.537877766198737 0.000107349846600363 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 A:G A G 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 209 223 432 96.583546864464 119.946741862318 -23.3631949978544 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.0263516629186523 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 T:C C T 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 11 3 14 5.08334457181389 1.61363329859621 3.46971127321768 A:T A T 10 0.537877766198737 0.104462553857524 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 29910679 G/A 1 7 72 79 3.23485563660884 38.7271991663091 -35.4923435297002 A:G G A 10 0.537877766198737 5.77483135127468e-17 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 30029343 G/T 1 68 66 134 31.4243118984859 35.4999325691166 -4.07562067063075 T:G G T 10 0.537877766198737 0.48939313917749 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30026676_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30029031_30029446:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30029292_30029446:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30029292_30029446:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30029292_30029446:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30029292_30029446:ZNRD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 30673422 A/G 1 5 10 15 2.31061116900632 5.37877766198737 -3.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.126399812708836 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 30673489 G/C 0 0 10 10 0 5.37877766198737 -5.37877766198737 C G C 10 0.537877766198737 0.000444189859400774 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31322340 G/T 1 4 14 18 1.84848893520505 7.53028872678232 -5.68179979157727 T:G G T 10 0.537877766198737 0.00842674134138563 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 23 4 27 10.6288113774291 2.15151106479495 8.4773003126341 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000812435749247036 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2261 1302 3563 1044.85837062466 700.316851590756 344.5415190339 T:C:G C T 10 0.537877766198737 1.96694644737903e-31 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31323321 G/A 1 1626 861 2487 751.410752160854 463.112756697113 288.297995463741 A:T:C:G G A 10 0.537877766198737 1.06185321182365e-31 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31498184 G/A 1 426 360 786 196.864071599338 193.635995831545 3.22807576779275 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.83011352318593 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31497996_31498227:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000474961:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000484566:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000415382:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462421:exon_31498020_31498526:BAT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31526080 G/A 1 68 68 136 31.4243118984859 36.5756881015141 -5.15137620302822 A:G G A 10 0.537877766198737 0.390595550284454 ENSG00000204498:ENST00000376146:exon_31525799_31526606:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376148:exon_31525799_31526606:NFKBIL1;ENSG00000204498:ENST00000376145:exon_31525799_31526606:NFKBIL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 123 103 226 56.8410347575554 55.4014099184699 1.43962483908545 T:C T C 10 0.537877766198737 0.893906683456731 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 120 165 285 55.4546680561516 88.7498314227916 -33.29516336664 A:C C A 10 0.537877766198737 8.35678299186554e-05 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31543476 T/A 1 17 23 40 7.85607797462147 12.3711886225709 -4.51511064794948 A:T T A 10 0.537877766198737 0.157271703479637 ENSG00000232810:ENST00000449264:exon_31543344_31543704:TNF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31557791 G/A 1 30 32 62 13.8636670140379 17.2120885183596 -3.34842150432169 A:G G A 10 0.537877766198737 0.445217087709494 ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557752_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31601344 T/C 1 28 33 61 12.9394225464354 17.7499662845583 -4.81054373812295 T:C T C 10 0.537877766198737 0.248040047940781 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 74 78 152 34.1970453012935 41.9544657635015 -7.75742046220802 A:G G A 10 0.537877766198737 0.222577356482734 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 52 44 96 24.0303561576657 23.6666217127444 0.363734444921253 A:C:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31627449 C/G 1 26 29 55 12.0151780788328 15.5984552197634 -3.58327714093053 C:G C G 10 0.537877766198737 0.346581895649197 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31627523 C/T 1 25 31 56 11.5530558450316 16.6742107521608 -5.12115490712927 T:C C T 10 0.537877766198737 0.181736256805186 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 81 130 211 37.4319009379023 69.9241096058358 -32.4922086679335 T:C C T 10 0.537877766198737 8.58283249424942e-06 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 461 524 985 213.038349782382 281.847949488138 -68.8095997057559 T:C:G T C 10 0.537877766198737 1.16968031442988e-05 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31657413 T/C 1 14 14 28 6.46971127321768 7.53028872678232 -1.06057745356464 T:C T C 10 0.537877766198737 0.708574000555236 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31657358_31657481:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 A:G A G 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 161 112 273 74.4016796420033 60.2423098142585 14.1593698277448 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0893095262875397 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31762843 G/C 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 C:G G C 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31762844 G/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:G G T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 29 29 58 13.4015447802366 15.5984552197634 -2.19691043952674 T:C C T 10 0.537877766198737 0.599658480255403 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 64 50 114 29.5758229632808 26.8938883099368 2.68193465334399 T:C C T 10 0.537877766198737 0.639533624774898 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 8 11 19 3.6969778704101 5.91665542818611 -2.219677557776 A:G A G 10 0.537877766198737 0.361009077515707 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 151 156 307 69.7804573039907 83.908931527003 -14.1284742230122 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.109169238108533 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 607 640 1247 280.508195917367 344.241770367192 -63.733574449825 A:T:C C A 10 0.537877766198737 0.000307610497447739 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 3151 2954 6105 1456.14715870778 1588.89092135107 -132.743762643289 A:T:C A C 10 0.537877766198737 0.000669664223034797 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32411573 C/T 1 3289 2662 5951 1519.92002697235 1431.83061362104 88.0894133513164 A:T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.0221326103123562 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32782112 C/T 1 90 67 157 41.5910010421137 36.0378103353154 5.5531907067983 T:C C T 10 0.537877766198737 0.380055889994885 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32782097_32782378:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32782097_32782378:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32784676 C/T 1 71 35 106 32.8106785998897 18.8257218169558 13.9849567829339 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00632201388562827 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 69 101 170 31.8864341322871 54.3256543860724 -22.4392202537853 A:T:C T C 10 0.537877766198737 0.00067121903430156 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32797809 C/T 1 73 48 121 33.7349230674922 25.8181327775394 7.91679028995283 T:C C T 10 0.537877766198737 0.171251867280614 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797707_32797866:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 50 38 88 23.1061116900632 20.439355115552 2.66675657451115 T:C C T 10 0.537877766198737 0.594350984611349 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32800450 T/C 1 34 46 80 15.7121559492429 24.7423772451419 -9.03022129589896 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0441215400701900 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32814942 C/T 1 370 351 721 170.985226506467 188.795095935757 -17.8098694292893 T:C C T 10 0.537877766198737 0.191136049372269 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 392 371 763 181.151915650095 199.552651259731 -18.4007356096363 T:C T C 10 0.537877766198737 0.191170292870837 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32816772 C/A 1 228 188 416 105.363869306688 101.121020045363 4.24284926132543 A:T:C C A 10 0.537877766198737 0.694220164552335 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32816429_32817919:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32816767_32816895:TAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 79 94 173 36.5076564702998 50.5605100226813 -14.0528535523815 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0329063739949289 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 225 244 469 103.977502605284 131.242174952492 -27.2646723472076 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0123418778092299 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32908593 C/T 1 63 47 110 29.1137007294796 25.2802550113406 3.83344571813894 T:C C T 10 0.537877766198737 0.503756549193728 ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32908530_32908761:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32908530_32908798:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32908530_32908847:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32908530_32908817:HLA-DMB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32917544 C/T 1 1028 862 1890 475.061656347698 463.650634463311 11.4110218843872 A:T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.611816597563752 ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32946034 T/C 1 485 498 983 224.129283393613 267.863127566971 -43.7338441733584 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.00537152086771792 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32948031 G/A 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 A:G G A 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32947319_32948241:BRD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32948343 C/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33036384 A/G 1 37 126 163 17.0985226506467 67.7725985410408 -50.6740758903941 A:G A G 10 0.537877766198737 8.17221054096908e-16 ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 1927 1852 3779 890.509544535034 996.149623000061 -105.640078465027 A:T:C:G G C 10 0.537877766198737 0.000575975309771272 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33036980 G/C 1 1272 1375 2647 587.819481395207 739.581928523263 -151.762447128057 T:C:G G C 10 0.537877766198737 3.79209960760487e-09 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33037474 A/G 1 1055 1021 2076 487.538956660333 549.17319928891 -61.6342426285779 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.00677798003374719 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33037639 G/A 1 745 7 752 344.281064181941 3.76514436339116 340.51591981855 A:G G A 10 0.537877766198737 4.49451887733232e-187 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33037640 C/T 1 753 7 760 347.978042052351 3.76514436339116 344.21289768896 T:C C T 10 0.537877766198737 2.60823066153979e-189 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33048417 C/A 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 A:C C A 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 1907 861 2768 881.267099859009 463.112756697113 418.154343161896 T:C:G T C 10 0.537877766198737 7.09357626816411e-59 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 2075 979 3054 958.903635137621 526.582333108563 432.321302029057 T:C C T 10 0.537877766198737 4.99491232358776e-57 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 1843 694 2537 851.691276895728 373.287169741923 478.404107153804 T:C:G T C 10 0.537877766198737 1.62093839436143e-84 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33053609 G/A 1 2261 983 3244 1044.85837062466 528.733844173358 516.124526451297 A:T:G G A 10 0.537877766198737 3.19893117873195e-76 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33163451 G/A 1 8 11 19 3.6969778704101 5.91665542818611 -2.219677557776 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.361009077515707 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33170149 T/C 1 87 93 180 40.2046343407099 50.0226322564825 -9.81799791577265 T:C T C 10 0.537877766198737 0.155465546790868 ENSG00000112473:ENST00000444757:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000445037:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000463972:exon_33170032_33170204:SLC39A7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33248547 G/T 1 197 205 402 91.0380800588488 110.264942070741 -19.2268620118923 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0572988972613039 ENSG00000227057:ENST00000473611:exon_33248451_33248628:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33248451_33248764:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33248205_33248764:WDR46 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33248617 G/A 1 191 124 315 88.2653466560412 66.6968430086434 21.5685036473979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0150768685075357 ENSG00000227057:ENST00000473611:exon_33248451_33248628:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000461951:exon_33248592_33248688:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33248451_33248764:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33248205_33248764:WDR46 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 11 8 19 5.08334457181389 4.3030221295899 0.780322442223998 A:G G A 10 0.537877766198737 0.82002331137955 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33258619 C/A 1 147 65 212 67.9319683687857 34.9620548029179 32.9699135658678 A:C:G C A 10 0.537877766198737 4.68299393744323e-06 ENSG00000204220:ENST00000395131:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374606:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374610:exon_33258493_33258639:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374607:exon_33258493_33258698:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33260275 T/C 1 11 14 25 5.08334457181389 7.53028872678232 -2.44694415496842 T:C T C 10 0.537877766198737 0.422995539711509 ENSG00000237441:ENST00000491168:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000483151:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000437840:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000466866:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000497454:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000421215:exon_33260207_33260321:RGL2;ENSG00000237441:ENST00000471319:exon_33260207_33260321:RGL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33272181 G/A 1 133 199 332 61.462257095568 107.037675473549 -45.5754183779807 A:T:G G A 10 0.537877766198737 6.27408564980224e-07 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272045_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272045_33272415:TAPBP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33372934 C/T 1 58 51 109 26.8030895604733 27.4317660761356 -0.628676515662328 T:C C T 10 0.537877766198737 0.923686451367719 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33372629_33373408:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33372629_33373408:KIFC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 33679428 G/C 1 75 68 143 34.6591675350947 36.5756881015141 -1.91652056641938 C:G G C 10 0.537877766198737 0.801464162470582 ENSG00000137288:ENST00000374231:exon_33679326_33679504:C6orf125;ENSG00000137288:ENST00000374214:exon_33679326_33679504:C6orf125 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 55 57 112 25.4167228590695 30.659032673328 -5.24230981425854 C:G C G 10 0.537877766198737 0.343808230673443 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 35260720 G/A 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260658_35260821:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260658_35260821:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260658_35260821:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260658_35260821:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260658_35260821:ZNF76 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 35287755 G/A 1 130 129 259 60.0758903941642 69.3862318396371 -9.31034144547287 A:G G A 10 0.537877766198737 0.262055545148965 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35287596_35287794:DEF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 35288696 C/T 1 128 102 230 59.1516459265617 54.8635321522712 4.2881137742905 T:C C T 10 0.537877766198737 0.597076028200855 ENSG00000023892:ENST00000316637:exon_35288661_35288751:DEF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 35544942 G/A 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 A:G G A 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000096060:ENST00000357266:exon_35544771_35545010:FKBP5;ENSG00000096060:ENST00000337746:exon_35544771_35545010:FKBP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 11 13 24 5.08334457181389 6.99241096058358 -1.90906638876969 A:C C A 10 0.537877766198737 0.54016131683339 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 36341234 C/T 1 20 21 41 9.24244467602526 11.2954330901735 -2.05298841414822 T:C C T 10 0.537877766198737 0.534899936393599 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36341230_36341355:ETV7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 1 8 1 9 3.6969778704101 0.537877766198737 3.15910010421137 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0439369935612285 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 42 51 93 19.409133819653 27.4317660761356 -8.02263225648254 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0972188278048906 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 36652147 G/A 1 40 40 80 18.4848893520505 21.5151106479495 -3.03022129589895 A:G G A 10 0.537877766198737 0.503388133000012 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 36 23 59 16.6364004168455 12.3711886225709 4.26521179427452 T:C C T 10 0.537877766198737 0.297286320573689 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 55 47 102 25.4167228590695 25.2802550113406 0.136467847728831 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 125 127 252 57.7652792251579 68.3104763072396 -10.5451970820817 T:C T C 10 0.537877766198737 0.185173465489460 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 12 13 25 5.54546680561516 6.99241096058358 -1.44694415496842 A:G A G 10 0.537877766198737 0.689173717549893 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 35 33 68 16.1742781830442 17.7499662845583 -1.57568810151411 A:T T A 10 0.537877766198737 0.716708236732511 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 41248752 A/G 1 2 8 10 0.924244467602526 4.3030221295899 -3.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0521347154232717 ENSG00000124731:ENST00000244709:exon_41248699_41248891:TREM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 165 169 334 76.2501685772084 90.9013424875865 -14.6511739103781 T:C T C 10 0.537877766198737 0.111637453151935 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 22 30 52 10.1666891436278 16.1363329859621 -5.96964384233432 T:C C T 10 0.537877766198737 0.125236665560353 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 36 39 75 16.6364004168455 20.9772328817507 -4.34083246490527 A:C A C 10 0.537877766198737 0.354521242720918 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 A:C A C 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 42196212 A/G 1 15 24 39 6.93183350701895 12.9090663887697 -5.97723288175074 A:G A G 10 0.537877766198737 0.075946433315072 ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42192963_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42195866_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42195887_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42195887_42196407:TRERF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 6 12 18 2.77273340280758 6.45453319438484 -3.68179979157727 A:T T A 10 0.537877766198737 0.0990055908664937 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 56 72 128 25.8788450928707 38.7271991663091 -12.8483540734383 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.0263675454101082 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 42985360 C/T 1 14 18 32 6.46971127321768 9.68179979157727 -3.21208851835958 T:C C T 10 0.537877766198737 0.289400725386081 ENSG00000124702:ENST00000326974:exon_42985257_42985433:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000432243:exon_42985257_42985433:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000394096:exon_42985257_42985433:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000244670:exon_42985257_42985433:KLHDC3;ENSG00000124702:ENST00000426116:exon_42985257_42985433:KLHDC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 43193759 T/G 1 13 12 25 6.00758903941642 6.45453319438484 -0.446944154968424 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000112667:ENST00000393987:exon_43193373_43193881:C6orf108 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 43306201 A/G 1 12 5 17 5.54546680561516 2.68938883099368 2.85607797462147 A:G A G 10 0.537877766198737 0.224394873418676 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 43581897 C/T 1 34 32 66 15.7121559492429 17.2120885183596 -1.49993256911664 T:C C T 10 0.537877766198737 0.713214600053885 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 43970748 C/A 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 A:C C A 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 133 98 231 61.462257095568 52.7120210874762 8.75023600809176 T:C C T 10 0.537877766198737 0.262230986132437 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 44198565 C/T 1 21 19 40 9.70456690982652 10.219677557776 -0.515110647949479 T:C C T 10 0.537877766198737 0.875491201077515 ENSG00000112759:ENST00000393844:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000427851:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000313248:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371755:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371740:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371731:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000393841:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371724:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371713:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000371708:exon_44198548_44198626:SLC29A1;ENSG00000112759:ENST00000472176:exon_44198548_44198626:SLC29A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 44219500 C/T 1 1238 1264 2502 572.107325445964 679.877496475204 -107.77017102924 A:T:C C T 10 0.537877766198737 1.61361085429406e-05 ENSG00000096384:ENST00000371646:exon_44219474_44219621:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000353801:exon_44219474_44219621:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371565:exon_44219474_44219621:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371556:exon_44219474_44219621:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371562:exon_44219474_44219621:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371554:exon_44219474_44219621:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000435812:exon_44219474_44219621:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000415133:exon_44219474_44219621:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000428822:exon_44219474_44219621:HSP90AB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 44371690 T/C 1 28 38 66 12.9394225464354 20.439355115552 -7.49993256911664 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0831496626514557 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 44390498 C/T 1 20 21 41 9.24244467602526 11.2954330901735 -2.05298841414822 T:C C T 10 0.537877766198737 0.534899936393599 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44390384_44390546:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44390384_44390546:CDC5L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 10 0 10 4.62122233801263 0 4.62122233801263 G G 10 0.537877766198737 0.00247110667592352 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 8 8 0 4.3030221295899 -4.3030221295899 G A G 10 0.537877766198737 0.00207995965823786 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 57499035 T/C 0 20 0 20 9.24244467602526 0 9.24244467602526 T T 10 0.537877766198737 4.30569641229719e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57498967_57499035:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57498967_57499035:PRIM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 18 18 0 9.68179979157727 -9.68179979157727 A G A 10 0.537877766198737 9.23896988151956e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 12 0 12 5.54546680561516 0 5.54546680561516 C C 10 0.537877766198737 0.000681272189570339 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 16 16 0 8.60604425917979 -8.60604425917979 C T C 10 0.537877766198737 4.32623217989695e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 71569962 C/T 1 31 21 52 14.3257892478392 11.2954330901735 3.03035615766568 T:C C T 10 0.537877766198737 0.408742892251697 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71569903_71570869:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71569903_71570869:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71569903_71571718:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71569903_71570207:SMAP1;ENSG00000112309:ENST00000230053:exon_71566382_71571452:B3GAT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 82882103 C/T 1 19 6 25 8.780322442224 3.22726659719242 5.55305584503158 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0275662971345872 ENSG00000005700:ENST00000306270:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000505222:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000508381:exon_82882097_82883295:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000445419:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000451512:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503400:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503631:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000510291:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000471036:exon_82882097_82882229:IBTK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 88279282 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88279235_88279308:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88279235_88279308:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88279235_88279308:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000451155:exon_88279235_88279308:RARS2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 88362943 C/T 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000135336:ENST00000392844:exon_88362834_88362967:ORC3;ENSG00000135336:ENST00000452292:exon_88362834_88362967:ORC3;ENSG00000135336:ENST00000257789:exon_88362834_88362967:ORC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 89793686 C/T 1 39 32 71 18.0227671182493 17.2120885183596 0.810678599889677 T:C C T 10 0.537877766198737 0.905504689429044 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 90371202 G/A 1 35 14 49 16.1742781830442 7.53028872678232 8.64398945626189 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0144254802499232 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 99817601 A/G 1 38 46 84 17.560644884448 24.7423772451419 -7.1817323606939 A:G A G 10 0.537877766198737 0.125896229629123 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99817280_99817696:COQ3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 99819379 T/C 1 9 22 31 4.15910010421137 11.8333108563722 -7.67421075216085 T:C T C 10 0.537877766198737 0.00645083721340179 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99819304_99819463:COQ3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 15 12 27 6.93183350701895 6.45453319438484 0.477300312634102 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 100960621 T/A 1 30 24 54 13.8636670140379 12.9090663887697 0.954600625268204 A:T T A 10 0.537877766198737 0.891637427459973 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100960585_100960794:ASCC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 105776866 A/C 1 12 3 15 5.54546680561516 1.61363329859621 3.93183350701895 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0663458133820393 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 106555025 G/A 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 107040074 A/G 1 28 21 49 12.9394225464354 11.2954330901735 1.64398945626189 A:G A G 10 0.537877766198737 0.669714011117111 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107040039_107040175:RTN4IP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 107076783 A/T 1 6 6 12 2.77273340280758 3.22726659719242 -0.454533194384844 A:T A T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 107100397 T/C 1 25 10 35 11.5530558450316 5.37877766198737 6.17427818304421 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0415111245219455 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107100342_107100457:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107100342_107101698:QRSL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 35 31 66 16.1742781830442 16.6742107521608 -0.499932569116638 A:G G A 10 0.537877766198737 0.902502334389094 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 109762600 A/C 1 11 10 21 5.08334457181389 5.37877766198737 -0.295433090173476 A:C A C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109762560_109762656:SMPD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 30 33 63 13.8636670140379 17.7499662845583 -3.88629927052043 T:G G T 10 0.537877766198737 0.37669397303739 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 70 81 151 32.3485563660884 43.5680990620977 -11.2195426960093 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0725241893752863 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 51 89 140 23.5682339238644 47.8711211916876 -24.3028872678232 A:G G A 10 0.537877766198737 4.14212410395783e-05 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 T:C C T 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 14 3 17 6.46971127321768 1.61363329859621 4.85607797462147 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0257341228172575 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 111346806 C/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 111346808 G/A 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 A:G G A 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 114181711 C/T 1 103 76 179 47.5985900815301 40.878710231104 6.71987985042608 T:C C T 10 0.537877766198737 0.330340952772368 ENSG00000155130:ENST00000368635:exon_114180859_114184648:MARCKS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 116600453 C/T 1 15 11 26 6.93183350701895 5.91665542818611 1.01517807883284 T:C C T 10 0.537877766198737 0.844573032227983 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 131190838 G/A 1 12 19 31 5.54546680561516 10.219677557776 -4.67421075216085 A:G G A 10 0.537877766198737 0.105786567226141 ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:C T C 10 0.537877766198737 0.592273295345338 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 135606755 C/G 1 1 9 10 0.462122233801263 4.84089989578863 -4.37877766198737 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0076411641167297 ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135604670_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135605110_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135605124_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000475846:exon_135606034_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000498558:exon_135606323_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367799:exon_135606430_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000527681:exon_135606433_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135606434_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000487135:exon_135606519_135606785:AHI1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 209 0 209 96.583546864464 0 96.583546864464 T T 10 0.537877766198737 5.96277623180253e-57 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 214 0 214 98.8941580334703 0 98.8941580334703 A A 10 0.537877766198737 2.52360262367958e-58 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 215 0 215 99.3562802672716 0 99.3562802672716 A A 10 0.537877766198737 1.34537653235873e-58 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 15 0 15 6.93183350701895 0 6.93183350701895 G G 10 0.537877766198737 0.000100616077781393 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 18 0 18 8.31820020842273 0 8.31820020842273 T T 10 0.537877766198737 1.51244306797136e-05 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 139097232 C/T 1 12 26 38 5.54546680561516 13.9848219211672 -8.439355115552 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00837237863011673 ENSG00000024862:ENST00000026464:exon_139097216_139097415:CCDC28A;ENSG00000024862:ENST00000332797:exon_139097216_139097415:CCDC28A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 139266501 T/G 1 9 5 14 4.15910010421137 2.68938883099368 1.46971127321768 T:G T G 10 0.537877766198737 0.593887850013122 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139266356_139266509:REPS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 139695061 G/T 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 T:G G T 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000164442:ENST00000367651:exon_139693393_139695089:CITED2;ENSG00000164442:ENST00000392312:exon_139694608_139695081:CITED2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 144181619 A/G 1 24 15 39 11.0909336112303 8.06816649298105 3.02276711824926 A:G A G 10 0.537877766198737 0.422369773357453 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144181563_144181690:LTV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 13 8 21 6.00758903941642 4.3030221295899 1.70456690982652 T:C C T 10 0.537877766198737 0.516761429097821 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 79 65 144 36.5076564702998 34.9620548029179 1.54560166738187 A:G G A 10 0.537877766198737 0.802783994035748 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 50 55 105 23.1061116900632 29.5832771409305 -6.47716545086738 C:G G C 10 0.537877766198737 0.240064523689191 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 152464839 A/G 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152464758_152468898:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152464758_152464900:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152464758_152464900:SYNE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 152469188 C/G 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 C:G C G 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 152469331 C/T 1 8 6 14 3.6969778704101 3.22726659719242 0.469711273217682 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 153296370 G/A 1 15 12 27 6.93183350701895 6.45453319438484 0.477300312634102 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 155574094 C/T 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 T:C C T 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155574082_155574187:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155574082_155574187:TIAM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 A:C A C 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 157739948 T/C 1 11 7 18 5.08334457181389 3.76514436339116 1.31820020842273 T:C T C 10 0.537877766198737 0.639412428588257 ENSG00000215712:ENST00000400788:exon_157739814_157739951:C6orf35;ENSG00000215712:ENST00000367144:exon_157739299_157739951:C6orf35 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 159058891 T/C 1 59 49 108 27.2652117942745 26.3560105437381 0.909201250536409 T:C T C 10 0.537877766198737 0.923203121119376 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159058803_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367088:exon_159057506_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159058252_159058926:DYNLT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 159178409 C/A 1 5 10 15 2.31061116900632 5.37877766198737 -3.06816649298105 A:C C A 10 0.537877766198737 0.126399812708836 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 160174540 G/A 1 38 25 63 17.560644884448 13.4469441549684 4.11370072947957 A:G G A 10 0.537877766198737 0.314696291369386 ENSG00000146457:ENST00000358372:exon_160174492_160174646:WTAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 12 14 26 5.54546680561516 7.53028872678232 -1.98482192116716 T:C C T 10 0.537877766198737 0.440230707582908 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 166580188 G/A 1 14 17 31 6.46971127321768 9.14392202537853 -2.67421075216085 A:G G A 10 0.537877766198737 0.370779292856988 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166580080_166580344:T HGDP00456_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 36 45 81 16.6364004168455 24.2044994789432 -7.56809906209769 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0955237420692466 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 590148 G/A 1 49 27 76 22.6439894562619 14.5226996873659 8.12128976889599 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0659627875296497 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 31 24 55 14.3257892478392 12.9090663887697 1.41672285906947 A:G A G 10 0.537877766198737 0.787211070986638 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 590229 T/C 1 43 32 75 19.8712560534543 17.2120885183596 2.65916753509473 T:C T C 10 0.537877766198737 0.564324848585737 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 751025 T/C 1 27 37 64 12.4773003126341 19.9014773493533 -7.42417703671916 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0784765604290013 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000417852:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000488474:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000456696:exon_750967_751164:PRKAR1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 810139 C/G 1 9 12 21 4.15910010421137 6.45453319438484 -2.29543309017348 C:G C G 10 0.537877766198737 0.383260377366473 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 814788 G/A 1 9 11 20 4.15910010421137 5.91665542818611 -1.75755532397474 A:G G A 10 0.537877766198737 0.504000237806629 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 930611 C/T 1 37 58 95 17.0985226506467 31.1969104395267 -14.09838778888 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00389746761618851 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 1131412 A/G 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 1132075 T/C 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 T:C:G T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 1522342 G/A 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 A:G G A 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1522182_1522343:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1522182_1522343:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1522182_1522343:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000468115:exon_1521914_1523489:INTS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 2290643 C/T 1 201 159 360 92.8865689940539 85.5225648255992 7.3640041684547 T:C C T 10 0.537877766198737 0.459420066405685 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 2317738 G/A 1 50 78 128 23.1061116900632 41.9544657635015 -18.8483540734383 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000973690842916982 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435060:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000457286:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435336:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000494722:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000447136:exon_2317735_2317940:SNX8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 2577960 G/A 1 56 50 106 25.8788450928707 26.8938883099368 -1.01504321706612 A:G G A 10 0.537877766198737 0.846224785594163 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 2581047 G/A 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 A:G G A 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2580932_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2580932_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2580932_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2579178_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2580932_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2581002_2581118:C7orf27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 2623881 C/G 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 C:G C G 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000470731:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000476665:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000497572:exon_2623870_2624300:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000427817:exon_2623870_2623919:IQCE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 2649704 T/G 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:G T G 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2649678_2649796:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2649678_2649796:IQCE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 157 143 300 72.5531907067983 76.9165205664194 -4.36332985962108 T:C T C 10 0.537877766198737 0.643306454431748 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 4820890 C/T 1 17 12 29 7.85607797462147 6.45453319438484 1.40154478023663 T:C C T 10 0.537877766198737 0.710601451134831 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4820806_4820943:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4820806_4820943:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4820806_4820943:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000482480:exon_4820806_4820931:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4820806_4820943:KIAA0415 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 4824648 C/T 1 19 14 33 8.780322442224 7.53028872678232 1.25003371544168 T:C C T 10 0.537877766198737 0.728850756969449 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4824539_4824679:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4824539_4824679:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4824539_4824679:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4824539_4824679:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4824539_4824679:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4824539_4824679:KIAA0415 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 5352949 G/C 1 2 11 13 0.924244467602526 5.91665542818611 -4.99241096058358 C:G G C 10 0.537877766198737 0.00917767827565757 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 5391702 C/G 1 27 16 43 12.4773003126341 8.60604425917979 3.87125605345431 C:G C G 10 0.537877766198737 0.284753530512277 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5390919_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5391633_5391725:TNRC18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 5410501 C/T 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 5567677 C/T 1 3969 4007 7976 1834.16314595721 2155.27620915834 -321.113063201126 A:T:C:G C T 10 0.537877766198737 6.44809031893194e-13 ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000464611:exon_5567635_5567729:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567635_5568350:ACTB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 7636042 G/A 1 76 25 101 35.121289768896 13.4469441549684 21.6743456139276 A:G G A 10 0.537877766198737 1.3236215732535e-05 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7635888_7636092:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7635888_7636092:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7635888_7636092:MIOS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 7645667 C/T 1 47 45 92 21.7197449886594 24.2044994789432 -2.4847544902838 T:C C T 10 0.537877766198737 0.603180606559952 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7645573_7645702:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7644749_7645702:MIOS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 7646720 A/G 1 95 66 161 43.90161221112 35.4999325691166 8.40167964200335 A:G A G 10 0.537877766198737 0.205941207316904 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 19744417 T/C 1 26 29 55 12.0151780788328 15.5984552197634 -3.58327714093053 T:C T C 10 0.537877766198737 0.346581895649197 ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 21940823 A/G 1 134 85 219 61.9243793293693 45.7196101268926 16.2047692024766 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0299917962231802 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 22985219 A/G 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000122591:ENST00000432176:exon_22980878_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000440481:exon_22980888_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000242158:exon_22983260_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000409923:exon_22984128_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000457703:exon_22984192_22985782:FAM126A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 22985494 G/T 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 T:G G T 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000122591:ENST00000432176:exon_22980878_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000440481:exon_22980888_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000242158:exon_22983260_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000409923:exon_22984128_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000457703:exon_22984192_22985782:FAM126A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 24705275 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24705207_24705306:MPP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 24742388 C/T 1 132 51 183 61.0001348617667 27.4317660761356 33.5683687856311 T:C C T 10 0.537877766198737 5.10194495764841e-07 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 50 22 72 23.1061116900632 11.8333108563722 11.2728008336909 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00890014392469564 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 24758795 T/C 1 42 18 60 19.409133819653 9.68179979157727 9.72733402807578 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0133862468625875 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 44 21 65 20.3333782872556 11.2954330901735 9.0379451970821 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0252525255450084 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 24846451 A/G 1 16 15 31 7.39395574082021 8.06816649298105 -0.674210752160846 A:G A G 10 0.537877766198737 0.858171969857937 ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24846395_24846521:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000459987:exon_24846439_24846521:OSBPL3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 26237238 A/G 0 0 11 11 0 5.91665542818611 -5.91665542818611 T A T 10 0.537877766198737 0.000205270010058154 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 27669003 G/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 C:G G C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000106049:ENST00000265395:exon_27668990_27669111:HIBADH;ENSG00000106049:ENST00000428288:exon_27668990_27669111:HIBADH;ENSG00000106049:ENST00000425715:exon_27668990_27669111:HIBADH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 29980471 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000136193:ENST00000242059:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000416113:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000426154:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000425819:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000409497:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000434476:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000421434:exon_29980300_29980492:SCRN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 40 41 81 18.4848893520505 22.0529884141482 -3.56809906209769 A:G G A 10 0.537877766198737 0.437386923228301 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 30831082 C/T 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000254959:ENST00000458257:exon_30830781_30831190:RP4-740D2.1;ENSG00000240583:ENST00000434909:exon_30830781_30831190:AQP1;ENSG00000106125:ENST00000265299:exon_30830781_30831190:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000381693:exon_30830781_30831190:FAM188B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 30831144 C/T 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000254959:ENST00000458257:exon_30830781_30831190:RP4-740D2.1;ENSG00000240583:ENST00000434909:exon_30830781_30831190:AQP1;ENSG00000106125:ENST00000265299:exon_30830781_30831190:FAM188B;ENSG00000106125:ENST00000381693:exon_30830781_30831190:FAM188B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 58 47 105 26.8030895604733 25.2802550113406 1.52283454913262 C:G G C 10 0.537877766198737 0.844928150733657 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 9 19 28 4.15910010421137 10.219677557776 -6.06057745356464 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0233787858218337 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 37272769 C/T 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37272710_37272799:ELMO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 10 4 14 4.62122233801263 2.15151106479495 2.46971127321768 T:C C T 10 0.537877766198737 0.283630814027187 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 38829465 C/T 1 5 7 12 2.31061116900632 3.76514436339116 -1.45453319438484 T:C C T 10 0.537877766198737 0.56465358229863 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38829401_38829467:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38829401_38829467:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000466017:exon_38829401_38829467:VPS41 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 38860809 G/T 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:G G T 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000413141:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000265745:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000414632:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000418457:exon_38860803_38860865:VPS41 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 39606107 G/A 1 14 5 19 6.46971127321768 2.68938883099368 3.780322442224 A:G G A 10 0.537877766198737 0.106704602900475 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39605975_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39605984_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39605993_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39606009_39606146:C7orf36 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 39610177 A/G 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 A:G A G 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39610105_39610601:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000469737:exon_39610105_39610179:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000485025:exon_39609853_39610226:C7orf36 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 40133979 T/C 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40133729_40136733:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40133729_40135154:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000465643:exon_40133729_40135131:CDK13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 42949945 G/A 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000106588:ENST00000442788:exon_42948872_42950520:PSMA2;ENSG00000136197:ENST00000350427:exon_42948872_42950520:C7orf25;ENSG00000136197:ENST00000447342:exon_42948874_42950515:C7orf25;ENSG00000136197:ENST00000431882:exon_42949052_42950520:C7orf25;ENSG00000136197:ENST00000438029:exon_42949221_42950520:C7orf25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 424 341 765 195.939827131736 183.416318273769 12.5235088579662 A:G G A 10 0.537877766198737 0.384190179185853 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 18 14 32 8.31820020842273 7.53028872678232 0.787911481640417 T:C T C 10 0.537877766198737 0.860177309642916 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 43680203 C/T 1 60 74 134 27.7273340280758 39.8029546987065 -12.0756206706308 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0377526404118051 ENSG00000106603:ENST00000415076:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000446330:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000446564:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000438444:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000490251:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000310564:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000395879:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000488813:exon_43680172_43680668:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000395880:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000223336:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000415798:exon_43680172_43680248:C7orf44 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 85 61 146 39.2803898731074 32.810543738123 6.46984613498441 T:C T C 10 0.537877766198737 0.319273328944741 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 43906544 C/T 1 291 326 617 134.477570036168 175.348151780788 -40.8705817446207 A:T:C C T 10 0.537877766198737 0.00105992199383655 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 43916782 G/A 1 12 11 23 5.54546680561516 5.91665542818611 -0.37118862257095 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 43917256 C/A 1 7 13 20 3.23485563660884 6.99241096058358 -3.75755532397474 A:C C A 10 0.537877766198737 0.116261430676894 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 43917334 C/T 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 44733561 C/T 1 15 6 21 6.93183350701895 3.22726659719242 3.70456690982652 T:C C T 10 0.537877766198737 0.126902671440171 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44733424_44733603:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44733424_44733603:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44733424_44733603:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44733424_44733603:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44733424_44733603:OGDH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 99 90 189 45.750101146325 48.4089989578863 -2.65889781156128 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.715672399032232 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 45141667 C/T 1 94 94 188 43.4394899773187 50.5605100226813 -7.12102004536254 T:C C T 10 0.537877766198737 0.306470226424642 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000483615:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482482:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478116:exon_45141373_45141669:TBRG4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 45141997 C/T 1 55 53 108 25.4167228590695 28.5075216085331 -3.09079874946359 T:C C T 10 0.537877766198737 0.563795839226627 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45141946_45142090:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45141946_45142090:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45141946_45142090:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45141946_45142090:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45141946_45142090:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45141946_45142090:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45141946_45142090:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000483615:exon_45141880_45142090:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482482:exon_45141946_45142170:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478116:exon_45141946_45142289:TBRG4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 13 9 22 6.00758903941642 4.84089989578863 1.16668914362779 T:C C T 10 0.537877766198737 0.673692463929978 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 65429359 G/A 1 143 122 265 66.0834794335806 65.6210874762459 0.462391957334717 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65429310_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65429133_65429445:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65429317_65429445:GUSB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 72985531 T/C 1 58 43 101 26.8030895604733 23.1287439465457 3.67434561392757 T:C T C 10 0.537877766198737 0.48613051820952 ENSG00000106638:ENST00000459913:exon_72985519_72985671:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000424598:exon_72985519_72985671:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000450285:exon_72985519_72985671:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000305632:exon_72985519_72985671:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000417008:exon_72985519_72985671:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000432538:exon_72985519_72985671:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000433464:exon_72985519_72985671:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000488915:exon_72985519_72985724:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000426966:exon_72985519_72985671:TBL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 72992847 C/T 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000106638:ENST00000424598:exon_72992750_72992906:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000450285:exon_72992750_72992920:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000305632:exon_72992750_72993121:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000417008:exon_72992750_72992884:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000433464:exon_72992750_72992929:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000426966:exon_72992750_72992949:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000452475:exon_72992750_72992964:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000435792:exon_72992750_72993006:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000496056:exon_72992750_72992906:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000458466:exon_72992750_72992929:TBL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 73151643 C/T 1 15 4 19 6.93183350701895 2.15151106479495 4.780322442224 T:C C T 10 0.537877766198737 0.036324984969379 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 73249165 T/A 0 8 0 8 3.6969778704101 0 3.6969778704101 T T 10 0.537877766198737 0.00908593719801829 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 73521469 G/A 1 11 5 16 5.08334457181389 2.68938883099368 2.39395574082021 A:G G A 10 0.537877766198737 0.317107876818811 ENSG00000106683:ENST00000418310:exon_73521340_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000336180:exon_73521340_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000435201:exon_73521401_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000483414:exon_73521340_73521523:LIMK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 73654360 T/G 1 98 105 203 45.2879789125238 56.4771654508674 -11.1891865383436 T:G T G 10 0.537877766198737 0.121611711507958 ENSG00000049541:ENST00000352131:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000055077:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000493156:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000497430:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000470266:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000494019:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000480432:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000479105:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000491206:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000463194:exon_73654268_73654425:RFC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 73668615 G/A 1 22 26 48 10.1666891436278 13.9848219211672 -3.81813277753937 A:G G A 10 0.537877766198737 0.311400804790501 ENSG00000049541:ENST00000352131:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000055077:exon_73668601_73668774:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000493156:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000470266:exon_73668601_73668639:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000494019:exon_73668601_73668697:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000480432:exon_73668601_73668737:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000479105:exon_73668601_73668667:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000463194:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000473493:exon_73668601_73668706:RFC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 73771780 T/C 1 8 2 10 3.6969778704101 1.07575553239747 2.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.119462602034709 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73771610_73771807:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73771610_73771807:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73771610_73771807:CLIP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 75517337 C/T 1 29 28 57 13.4015447802366 15.0605774535646 -1.65903267332801 T:C C T 10 0.537877766198737 0.691570116495075 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75517310_75518244:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75517310_75518202:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75517310_75518223:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468304:exon_75517310_75517901:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75517310_75517586:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75517310_75517475:RHBDD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 75958912 G/A 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 75959242 G/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:G G T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 T:G T G 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 15 1 16 6.93183350701895 0.537877766198737 6.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000808707942485218 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 10 26 36 4.62122233801263 13.9848219211672 -9.36359958315453 A:C C A 10 0.537877766198737 0.00220040458043384 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 92764068 C/T 1 1 8 9 0.462122233801263 4.3030221295899 -3.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0147984316454252 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 94232658 T/G 0 22 0 22 10.1666891436278 0 10.1666891436278 T T 10 0.537877766198737 2.30969259605635e-06 ENSG00000127990:ENST00000379889:exon_94232602_94232764:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000265735:exon_94232602_94232764:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000445866:exon_94232602_94232764:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000437425:exon_94232602_94232764:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000447873:exon_94232602_94232764:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000428696:exon_94232602_94232764:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000415788:exon_94232602_94232764:SGCE;ENSG00000127990:ENST00000462731:exon_94232602_94232719:SGCE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 97498451 C/T 1 29 25 54 13.4015447802366 13.4469441549684 -0.0453993747317956 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000495255:exon_97498220_97498496:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437657:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000448127:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000451771:exon_97498371_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000414884:exon_97498384_97498491:ASNS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 97852317 C/T 1 8 4 12 3.6969778704101 2.15151106479495 1.54546680561516 T:C C T 10 0.537877766198737 0.404166089541516 ENSG00000205356:ENST00000447648:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000490842:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000379795:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000474915:exon_97852302_97852482:TECPR1;ENSG00000205356:ENST00000479975:exon_97852302_97852482:TECPR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 97911700 C/T 1 92 66 158 42.5152455097162 35.4999325691166 7.01531294059956 T:C C T 10 0.537877766198737 0.299616632778493 ENSG00000164713:ENST00000297290:exon_97911663_97911765:BRI3;ENSG00000164713:ENST00000474291:exon_97911663_97912018:BRI3;ENSG00000164713:ENST00000473967:exon_97911663_97911765:BRI3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 21 22 43 9.70456690982652 11.8333108563722 -2.12874394654569 T:C C T 10 0.537877766198737 0.543327744285282 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 98609987 G/A 1 39 38 77 18.0227671182493 20.439355115552 -2.41658799730275 A:G G A 10 0.537877766198737 0.647858004123254 ENSG00000196367:ENST00000359863:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000355540:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000446306:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000456197:exon_98609694_98610866:TRRAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 98984399 C/T 1 509 488 997 235.220217004843 262.484349904984 -27.2641329001407 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0863053224944808 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000461486:exon_98984375_98984437:ARPC1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 98988637 G/A 1 744 632 1376 343.81894194814 339.938748237602 3.88019371053792 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.849909775831125 ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98988516_98988722:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98988516_98988722:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98988516_98988722:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98988527_98988723:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98988516_98988722:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98988516_98988650:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000481997:exon_98988495_98988722:ARPC1B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99022785 G/A 1 11 5 16 5.08334457181389 2.68938883099368 2.39395574082021 A:G G A 10 0.537877766198737 0.317107876818811 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99022418_99023239:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99022418_99023239:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99022418_99023239:RP5-900K19.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99032458 C/T 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99050039 G/A 1 28 26 54 12.9394225464354 13.9848219211672 -1.0453993747318 A:G G A 10 0.537877766198737 0.78653208556457 ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99049991_99050232:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99049991_99050887:CPSF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99055940 T/C 1 1056 563 1619 488.001078894134 302.825182369889 185.175896524245 T:C:G T C 10 0.537877766198737 1.24706166392228e-20 ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99092152 C/T 1 36 30 66 16.6364004168455 16.1363329859621 0.500067430883359 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99092194 G/A 1 34 35 69 15.7121559492429 18.8257218169558 -3.11356586771285 A:G G A 10 0.537877766198737 0.470694950518387 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99669802 A/G 1 7 2 9 3.23485563660884 1.07575553239747 2.15910010421137 A:G A G 10 0.537877766198737 0.190953416854773 ENSG00000166526:ENST00000303915:exon_99669105_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000424697:exon_99667597_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000299667:exon_99667611_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000487620:exon_99667800_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000412947:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000428683:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000449785:exon_99669553_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000441298:exon_99669703_99669835:ZNF3;ENSG00000166526:ENST00000415068:exon_99669794_99669835:ZNF3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 79 40 119 36.5076564702998 21.5151106479495 14.9925458223503 A:T A T 10 0.537877766198737 0.00575186442273522 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 98 54 152 45.2879789125238 29.0453993747318 16.242579537792 A:G A G 10 0.537877766198737 0.00905606670560988 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 279 234 513 128.932103230552 125.863397290504 3.06870594004795 A:G G A 10 0.537877766198737 0.790699317389734 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 13 5 18 6.00758903941642 2.68938883099368 3.31820020842274 A:G A G 10 0.537877766198737 0.155963033480451 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99818180 C/G 1 9 72 81 4.15910010421137 38.7271991663091 -34.5680990620977 C:G C G 10 0.537877766198737 9.4742009655171e-16 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99818170_99818296:PVRIG HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 99821235 C/T 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99821193_99821247:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99821193_99821321:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99821193_99821321:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99821193_99821321:GATS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100028021 C/T 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100028484 T/C 1 14 15 29 6.46971127321768 8.06816649298105 -1.59845521976337 T:C T C 10 0.537877766198737 0.580633347407564 ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100072031 T/C 1 116 125 241 53.6061791209465 67.2347207748421 -13.6285416538956 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0812512241635545 ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100071411_100072063:TSC22D4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100179730 G/A 1 31 30 61 14.3257892478392 16.1363329859621 -1.81054373812296 A:G G A 10 0.537877766198737 0.700626348089273 ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100179664_100179790:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100179664_100179790:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100179664_100179790:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100179664_100179790:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000470184:exon_100179664_100180076:LRCH4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100210444 G/T 1 19 21 40 8.780322442224 11.2954330901735 -2.51511064794948 T:G G T 10 0.537877766198737 0.43296846001902 ENSG00000106330:ENST00000223054:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000462372:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000490309:exon_100210353_100210892:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000493970:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000379527:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393950:exon_100210133_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000424091:exon_100210179_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000497456:exon_100210438_100210619:MOSPD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100210597 A/C 1 17 24 41 7.85607797462147 12.9090663887697 -5.05298841414822 A:C:G A C 10 0.537877766198737 0.119691488782499 ENSG00000106330:ENST00000223054:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000462372:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000490309:exon_100210353_100210892:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000493970:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000379527:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393950:exon_100210133_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000424091:exon_100210179_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393953:exon_100210487_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000497456:exon_100210438_100210619:MOSPD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100463908 C/A 1 22 44 66 10.1666891436278 23.6666217127444 -13.4999325691166 A:C C A 10 0.537877766198737 0.00115863074169007 ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100463341_100464630:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100463341_100464631:SLC12A9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100732321 C/T 1 3 12 15 1.38636670140379 6.45453319438484 -5.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00948828165941395 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100850144 G/A 1 28 26 54 12.9394225464354 13.9848219211672 -1.0453993747318 A:G G A 10 0.537877766198737 0.78653208556457 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850060_100850185:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100850060_100850185:PLOD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100850908 G/A 1 19 20 39 8.780322442224 10.7575553239747 -1.97723288175074 A:G G A 10 0.537877766198737 0.526240071250459 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850859_100851005:PLOD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100853658 G/A 1 19 20 39 8.780322442224 10.7575553239747 -1.97723288175074 A:G G A 10 0.537877766198737 0.526240071250459 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000487563:exon_100853374_100853720:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853637_100853725:PLOD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100853714 G/A 1 18 14 32 8.31820020842273 7.53028872678232 0.787911481640417 A:G G A 10 0.537877766198737 0.860177309642916 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000487563:exon_100853374_100853720:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853637_100853725:PLOD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100855823 G/A 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100855877 G/A 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 A:G G A 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100855825_100855936:PLOD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100866042 C/T 1 330 368 698 152.500337154417 197.939017961135 -45.4386808067184 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000625100170570182 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100865885_100866055:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100865885_100866055:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000492315:exon_100865885_100866055:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000485387:exon_100863662_100866055:ZNHIT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100867240 G/A 1 431 395 826 199.174682768344 212.461717648501 -13.2870348801567 A:G G A 10 0.537877766198737 0.36431537372889 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100867218_100867471:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000485387:exon_100867218_100867471:ZNHIT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 T:G T G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 100888322 T/C 1 70 53 123 32.3485563660884 28.5075216085331 3.84103475755536 T:C T C 10 0.537877766198737 0.527154101023066 ENSG00000214253:ENST00000449367:exon_100888241_100888356:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000442303:exon_100888179_100888329:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000223136:exon_100888241_100888366:FIS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 13 16 29 6.00758903941642 8.60604425917979 -2.59845521976337 A:G G A 10 0.537877766198737 0.356600248883326 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 14 19 33 6.46971127321768 10.219677557776 -3.74996628455832 T:C T C 10 0.537877766198737 0.222607712071388 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 102106306 A/G 1 21 6 27 9.70456690982652 3.22726659719242 6.4773003126341 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0121414935226595 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000464107:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000476270:exon_102105979_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102106264_102106498:LRWD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 0 63 0 63 29.1137007294796 0 29.1137007294796 G G 10 0.537877766198737 1.28530287249730e-17 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 102113191 C/T 1 117 47 164 54.0683013547478 25.2802550113406 28.7880463434071 T:C C T 10 0.537877766198737 4.73356481053266e-06 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102113139_102113251:LRWD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 301 128 429 139.09879237418 68.8483540734383 70.2504383007418 T:C C T 10 0.537877766198737 5.60517945751463e-12 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 102944359 A/T 1 87 92 179 40.2046343407099 49.4847544902838 -9.28012014957391 A:T A T 10 0.537877766198737 0.177287097843190 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000443722:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000498530:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102944289_102944487:PMPCB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 108119692 C/T 1 16 14 30 7.39395574082021 7.53028872678232 -0.136332985962109 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453085:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000481225:exon_108119628_108119756:PNPLA8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 8 8 16 3.6969778704101 4.3030221295899 -0.606044259179791 A:G G A 10 0.537877766198737 0.805966639450967 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 111981015 C/T 1 24 30 54 11.0909336112303 16.1363329859621 -5.0453993747318 T:C C T 10 0.537877766198737 0.174847889738701 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 111981065 C/T 1 34 35 69 15.7121559492429 18.8257218169558 -3.11356586771285 T:C C T 10 0.537877766198737 0.470694950518387 ENSG00000198839:ENST00000361822:exon_111980927_111981101:ZNF277;ENSG00000198839:ENST00000361946:exon_111980927_111981101:ZNF277 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 2 9 11 0.924244467602526 4.84089989578863 -3.91665542818611 T:G T G 10 0.537877766198737 0.029521862649748 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 17 18 35 7.85607797462147 9.68179979157727 -1.82572181695579 A:G G A 10 0.537877766198737 0.61209834318284 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 127953243 T/C 1 48 37 85 22.1818672224606 19.9014773493533 2.28038987310736 T:C T C 10 0.537877766198737 0.664214123648839 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000481788:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000495327:exon_127953141_127953327:RBM28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 127954847 G/A 1 48 50 98 22.1818672224606 26.8938883099368 -4.71202108747622 A:G G A 10 0.537877766198737 0.362626185467903 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127954817_127955073:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000481788:exon_127954817_127955073:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127954817_127955073:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000495327:exon_127954817_127955024:RBM28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 127975953 C/G 1 45 27 72 20.7955005210568 14.5226996873659 6.27280083369094 C:G C G 10 0.537877766198737 0.156278624634683 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127975901_127976096:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127975901_127976096:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000487602:exon_127975901_127976096:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000478061:exon_127975901_127976096:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000488249:exon_127975601_127976096:RBM28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 28 11 39 12.9394225464354 5.91665542818611 7.02276711824926 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0248082044842627 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 131128450 T/C 1 11 20 31 5.08334457181389 10.7575553239747 -5.67421075216085 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0474215212412797 ENSG00000128585:ENST00000421797:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000352689:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000388758:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000494785:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000458153:exon_131128240_131128461:MKLN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 25 4 29 11.5530558450316 2.15151106479495 9.40154478023663 A:T A T 10 0.537877766198737 0.000298852550520356 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 29 4 33 13.4015447802366 2.15151106479495 11.2500337154417 T:C C T 10 0.537877766198737 6.2853250159041e-05 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 133979570 T/G 1 1 29 30 0.462122233801263 15.5984552197634 -15.1363329859621 T:G T G 10 0.537877766198737 3.14786954622699e-09 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 25 1 26 11.5530558450316 0.537877766198737 11.0151780788328 A:G A G 10 0.537877766198737 3.2280403851688e-06 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 12 5 17 5.54546680561516 2.68938883099368 2.85607797462147 A:G G A 10 0.537877766198737 0.224394873418676 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 138740037 G/C 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 C:G G C 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138739951_138740041:ZC3HAV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 34 14 48 15.7121559492429 7.53028872678232 8.18186722246062 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0200138302079528 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 T:C C T 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.61338933381628 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 C:G G C 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 139715637 C/T 1 15 8 23 6.93183350701895 4.3030221295899 2.62881137742905 T:C C T 10 0.537877766198737 0.302209397783681 ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139715523_139715660:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139715523_139715660:TBXAS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 19 13 32 8.780322442224 6.99241096058358 1.78791148164042 A:G G A 10 0.537877766198737 0.596919535098297 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 16 10 26 7.39395574082021 5.37877766198737 2.01517807883284 T:C C T 10 0.537877766198737 0.556039763483853 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 139734069 C/T 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 T:C C T 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139734035_139734131:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139734035_139734131:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139734035_139734131:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139734035_139734131:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139734035_139734131:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139734035_139734536:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000470515:exon_139734035_139734131:PARP12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 140710396 C/T 1 212 215 427 97.9699135658678 115.643719732728 -17.6738061668607 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0894243657327695 ENSG00000090263:ENST00000393008:exon_140710219_140710460:MRPS33;ENSG00000090263:ENST00000324787:exon_140710219_140710460:MRPS33;ENSG00000090263:ENST00000496958:exon_140710219_140710460:MRPS33;ENSG00000090263:ENST00000469351:exon_140710219_140710460:MRPS33;ENSG00000090263:ENST00000467334:exon_140710219_140710417:MRPS33;ENSG00000090263:ENST00000496641:exon_140709959_140710460:MRPS33;ENSG00000090263:ENST00000485202:exon_140710028_140710460:MRPS33 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 68 66 134 31.4243118984859 35.4999325691166 -4.07562067063075 A:G G A 10 0.537877766198737 0.48939313917749 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 148496375 C/T 1 138 119 257 63.7728682645743 64.0074541776497 -0.234585913075392 T:C:G C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000055130:ENST00000409469:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000325222:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000433865:exon_148496367_148496480:CUL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 148506363 T/G 1 4 10 14 1.84848893520505 5.37877766198737 -3.53028872678232 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0652981523722034 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 148708965 G/T 1 116 134 250 53.6061791209465 72.0756206706308 -18.4694415496842 A:T:C:G G T 10 0.537877766198737 0.0222191687750429 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148708938_148709096:PDIA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 148712118 G/A 1 76 64 140 35.121289768896 34.4241770367192 0.697112732176826 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.932604079044195 ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148711996_148712134:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148711996_148712134:PDIA4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 149129764 C/T 1 17 18 35 7.85607797462147 9.68179979157727 -1.82572181695579 T:C C T 10 0.537877766198737 0.61209834318284 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 149576735 C/T 1 24 47 71 11.0909336112303 25.2802550113406 -14.1893214001103 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000787225064839167 ENSG00000171130:ENST00000421974:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000456496:exon_149576424_149577782:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000425642:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000307445:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000429743:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000479613:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000471877:exon_149576424_149577783:ATP6V0E2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 9 10 19 4.15910010421137 5.37877766198737 -1.219677557776 T:C T C 10 0.537877766198737 0.64863041820091 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 13 11 24 6.00758903941642 5.91665542818611 0.0909336112303132 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:C T C 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 24 10 34 11.0909336112303 5.37877766198737 5.71215594924294 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0580550545625373 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150069393 C/T 1 44 30 74 20.3333782872556 16.1363329859621 4.19704530129346 T:C C T 10 0.537877766198737 0.352482653598748 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150269903 G/C 1 11 61 72 5.08334457181389 32.810543738123 -27.7271991663091 C:G G C 10 0.537877766198737 1.66004191280157e-11 ENSG00000133574:ENST00000255945:exon_150269217_150271041:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000461940:exon_150269217_150270602:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000412660:exon_150269566_150270148:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000494750:exon_150269217_150270026:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000466938:exon_150269564_150270308:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000430830:exon_150269217_150271040:GIMAP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 24 19 43 11.0909336112303 10.219677557776 0.87125605345431 A:G A G 10 0.537877766198737 0.878832113049481 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150418045 G/A 1 11 16 27 5.08334457181389 8.60604425917979 -3.5226996873659 A:G G A 10 0.537877766198737 0.182472148809709 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150437979 G/A 1 5 17 22 2.31061116900632 9.14392202537853 -6.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.00443978512860853 ENSG00000196329:ENST00000498181:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150434698_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000466347:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150437967_150438015:GIMAP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150439465 G/A 1 31 24 55 14.3257892478392 12.9090663887697 1.41672285906947 A:G G A 10 0.537877766198737 0.787211070986638 ENSG00000196329:ENST00000498181:exon_150439271_150439470:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150439554 G/A 1 22 20 42 10.1666891436278 10.7575553239747 -0.590866180346952 A:G G A 10 0.537877766198737 0.878047078026096 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150439874 G/A 1 41 45 86 18.9470115858518 24.2044994789432 -5.25748789309138 A:G G A 10 0.537877766198737 0.279957456347623 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150773385 C/T 1 133 102 235 61.462257095568 54.8635321522712 6.59872494329682 T:C C T 10 0.537877766198737 0.395853686699546 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150773374_150773613:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150773374_150773614:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150773374_150773609:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150773374_150773609:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150773374_150773610:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773374_150773611:SLC4A2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150773807 A/T 1 165 159 324 76.2501685772084 85.5225648255992 -9.27239624839078 A:T:G A T 10 0.537877766198737 0.316037234359252 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150773679_150773888:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150773711_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000465272:exon_150773713_150774114:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150773713_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150773716_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150773725_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150773733_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150773742_150773919:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150773803_150773919:FASTK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 150905101 G/C 1 3 6 9 1.38636670140379 3.22726659719242 -1.84089989578863 C:G G C 10 0.537877766198737 0.318265975852943 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150904923_150905193:ABCF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 156755731 G/A 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156755702_156755869:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000475176:exon_156755702_156756046:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000472491:exon_156755702_156755869:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000469271:exon_156755702_156756819:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000489850:exon_156755702_156756169:NOM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 157046665 C/T 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 T:C C T 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157046648_157046836:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000470408:exon_157046648_157046836:UBE3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 157049663 G/C 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 C:G G C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157049608_157049738:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000470408:exon_157049608_157049738:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000474153:exon_157049381_157049738:UBE3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158449358 G/A 1 8 8 16 3.6969778704101 4.3030221295899 -0.606044259179791 A:G G A 10 0.537877766198737 0.805966639450967 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000474940:exon_158449294_158449397:NCAPG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158457275 G/A 1 10 1 11 4.62122233801263 0.537877766198737 4.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0142271384391581 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000474940:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000475918:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000491792:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000472591:exon_158457220_158457442:NCAPG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 12 13 25 5.54546680561516 6.99241096058358 -1.44694415496842 A:G G A 10 0.537877766198737 0.689173717549893 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 14 4 18 6.46971127321768 2.15151106479495 4.31820020842273 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0563618316166793 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158528254 G/A 1 17 16 33 7.85607797462147 8.60604425917979 -0.74996628455832 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.862119553352529 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158528269 C/G 1 17 14 31 7.85607797462147 7.53028872678232 0.325789247839154 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 8 7 15 3.6969778704101 3.76514436339116 -0.0681664929810544 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 15 4 19 6.93183350701895 2.15151106479495 4.780322442224 A:G A G 10 0.537877766198737 0.036324984969379 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 12 12 24 5.54546680561516 6.45453319438484 -0.909066388769688 C:G C G 10 0.537877766198737 0.838384934353366 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 618647 T/G 1 53 55 108 24.4924783914669 29.5832771409305 -5.09079874946359 T:G T G 10 0.537877766198737 0.335869265048647 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 618728 A/G 1 52 56 108 24.0303561576657 30.1211549071293 -6.09079874946359 A:G A G 10 0.537877766198737 0.248045749357592 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 623748 C/T 1 128 125 253 59.1516459265617 67.2347207748421 -8.08307484828045 T:C C T 10 0.537877766198737 0.313649336315362 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 1719490 G/A 1 7 1 8 3.23485563660884 0.537877766198737 2.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0766073098486828 ENSG00000182372:ENST00000331222:exon_1719098_1719763:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000520991:exon_1719098_1719733:CLN8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 16 13 29 7.39395574082021 6.99241096058358 0.401544780236629 A:T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 8 11 19 3.6969778704101 5.91665542818611 -2.219677557776 T:C C T 10 0.537877766198737 0.361009077515707 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 22 23 45 10.1666891436278 12.3711886225709 -2.20449947894316 A:C C A 10 0.537877766198737 0.551523512026015 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 8176077 G/C 1 21 21 42 9.70456690982652 11.2954330901735 -1.59086618034695 C:G G C 10 0.537877766198737 0.645180835736561 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 8176540 C/T 1 23 29 52 10.6288113774291 15.5984552197634 -4.96964384233432 T:C C T 10 0.537877766198737 0.210269289287685 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 8185301 G/A 1 9 15 24 4.15910010421137 8.06816649298105 -3.90906638876969 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.150561662807680 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8185226_8185977:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8185226_8185977:AC068353.1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 154 139 293 71.1668240053945 74.7650095016244 -3.59818549622993 A:T T A 10 0.537877766198737 0.682061306428165 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 170 138 308 78.5607797462147 74.2271317354257 4.33364801078902 T:C T C 10 0.537877766198737 0.647714647100052 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 11640738 G/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11640121_11640908:NEIL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 9 21 30 4.15910010421137 11.2954330901735 -7.13633298596211 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0100139921956524 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 11660362 T/C 1 74 92 166 34.1970453012935 49.4847544902838 -15.2877091889903 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0193462284612079 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 11683653 T/C 1 161 176 337 74.4016796420033 94.6664868509777 -20.2648072089744 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0287849439051878 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 11696061 G/A 1 451 434 885 208.41712744437 233.438950530252 -25.0218230858822 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.0919877670373842 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11695897_11696818:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11695897_11696719:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11695897_11696292:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11695897_11696348:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11695897_11696414:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11695897_11696469:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11695897_11696349:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11695897_11696476:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11695897_11696623:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11695897_11696122:FDFT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:G T G 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 T:C T C 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 22 22 44 10.1666891436278 11.8333108563722 -1.66662171274443 T:C C T 10 0.537877766198737 0.651936185623735 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 11 14 25 5.08334457181389 7.53028872678232 -2.44694415496842 T:C C T 10 0.537877766198737 0.422995539711509 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 19677915 G/A 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G G A 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000104613:ENST00000397977:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000522114:exon_19677890_19678029:INTS10;ENSG00000104613:ENST00000523869:exon_19677890_19678029:INTS10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 21766900 G/A 1 36 50 86 16.6364004168455 26.8938883099368 -10.2574878930914 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0302192171170388 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 21766960 T/C 1 48 57 105 22.1818672224606 30.659032673328 -8.47716545086738 T:C T C 10 0.537877766198737 0.116932467800796 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 41 29 70 18.9470115858518 15.5984552197634 3.34855636608842 C:G C G 10 0.537877766198737 0.472692082244876 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 25 18 43 11.5530558450316 9.68179979157727 1.87125605345431 A:G A G 10 0.537877766198737 0.647289435959162 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 21 25 46 9.70456690982652 13.4469441549684 -3.7423772451419 T:C T C 10 0.537877766198737 0.301715580043597 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 22473224 T/C 1 22 26 48 10.1666891436278 13.9848219211672 -3.81813277753937 T:C T C 10 0.537877766198737 0.311400804790501 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 22473281 C/G 1 24 27 51 11.0909336112303 14.5226996873659 -3.43176607613558 C:G C G 10 0.537877766198737 0.399711004584218 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 22473347 C/T 1 32 22 54 14.7879114816404 11.8333108563722 2.9546006252682 T:C C T 10 0.537877766198737 0.495455997108938 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 51 50 101 23.5682339238644 26.8938883099368 -3.32565438607243 A:G A G 10 0.537877766198737 0.549709201218388 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 22887165 C/T 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22887123_22887234:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22887123_22887234:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22887123_22887234:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000518531:exon_22887123_22887234:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22887123_22887234:TNFRSF10B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 23059324 C/G 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000104689:ENST00000221132:exon_23059321_23059432:TNFRSF10A;ENSG00000104689:ENST00000524158:exon_23059321_23059432:TNFRSF10A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 4 9 13 1.84848893520505 4.84089989578863 -2.99241096058358 A:G A G 10 0.537877766198737 0.161841705776019 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 27903069 C/T 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000189233:ENST00000413272:exon_27903044_27903177:C8orf80;ENSG00000189233:ENST00000341513:exon_27903044_27903177:C8orf80 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 29195971 G/A 1 51 42 93 23.5682339238644 22.590866180347 0.977367743517462 A:G G A 10 0.537877766198737 0.917253202474885 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29195799_29196018:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29195799_29196018:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29195799_29196018:DUSP4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 29927300 C/G 1 30 31 61 13.8636670140379 16.6742107521608 -2.81054373812295 C:G C G 10 0.537877766198737 0.521521874443383 ENSG00000133872:ENST00000256255:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518174:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521265:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000520303:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000523127:exon_29927158_29927551:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518340:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518296:exon_29927158_29927465:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522794:exon_29927158_29927575:TMEM66 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 29931408 A/G 1 12 21 33 5.54546680561516 11.2954330901735 -5.74996628455832 A:G A G 10 0.537877766198737 0.05412091999447 ENSG00000133872:ENST00000256255:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518174:exon_29931393_29931567:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521265:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522794:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522055:exon_29931393_29931504:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000523761:exon_29931393_29931544:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000517569:exon_29931210_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521083:exon_29931395_29931571:TMEM66 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 31014918 T/G 1 5 14 19 2.31061116900632 7.53028872678232 -5.219677557776 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0201938430142730 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31014884_31015046:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31014884_31015046:WRN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 10 13 23 4.62122233801263 6.99241096058358 -2.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 0.40386381071133 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 11 11 22 5.08334457181389 5.91665542818611 -0.833310856372213 T:C T C 10 0.537877766198737 0.831562670929007 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 16 18 34 7.39395574082021 9.68179979157727 -2.28784405075706 A:G A G 10 0.537877766198737 0.492863737684191 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 3 9 12 1.38636670140379 4.84089989578863 -3.45453319438484 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0780093594573846 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 37602108 C/T 0 9 0 9 4.15910010421137 0 4.15910010421137 C C 10 0.537877766198737 0.00472955515261702 ENSG00000147475:ENST00000397228:exon_37602089_37602214:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000518526:exon_37602089_37602214:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000523887:exon_37602089_37604068:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000276461:exon_37602089_37602214:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000518586:exon_37602089_37604071:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000335171:exon_37602089_37602214:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000521644:exon_37602089_37602214:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000523107:exon_37602089_37602439:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000519638:exon_37602089_37602214:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000521993:exon_37602089_37602214:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000521771:exon_37602089_37602214:ERLIN2;ENSG00000147475:ENST00000524002:exon_37602089_37602220:ERLIN2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 15 24 39 6.93183350701895 12.9090663887697 -5.97723288175074 A:G A G 10 0.537877766198737 0.075946433315072 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 T:C T C 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 38704196 A/C 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 A:C A C 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000147526:ENST00000522548:exon_38703987_38704337:TACC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 44 34 78 20.3333782872556 18.2878440507571 2.04553423649852 T:C C T 10 0.537877766198737 0.651950671217598 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 41355096 C/T 1 6 17 23 2.77273340280758 9.14392202537853 -6.37118862257095 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0106002559260988 ENSG00000147533:ENST00000518270:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000520817:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000276530:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000405786:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000523420:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000357743:exon_41355028_41355180:GOLGA7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 56711656 G/A 1 16 8 24 7.39395574082021 4.3030221295899 3.09093361123031 A:G G A 10 0.537877766198737 0.225647485929066 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56711473_56711779:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56711473_56711779:TGS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 56711713 A/G 1 16 17 33 7.39395574082021 9.14392202537853 -1.74996628455832 A:G A G 10 0.537877766198737 0.602153542032476 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56711473_56711779:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56711473_56711779:TGS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 59508134 T/C 1 3 8 11 1.38636670140379 4.3030221295899 -2.91665542818611 T:C T C 10 0.537877766198737 0.127189578589256 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523177:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59508119_59508218:NSMAF HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 61654847 A/G 1 17 13 30 7.85607797462147 6.99241096058358 0.863667014037891 A:G A G 10 0.537877766198737 0.855400861350958 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61653924_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61653992_61655656:CHD7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 63938764 G/A 1 19 9 28 8.780322442224 4.84089989578863 3.93942254643536 A:G G A 10 0.537877766198737 0.183805115444036 ENSG00000137563:ENST00000518466:exon_63938717_63938792:GGH;ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518113:exon_63938717_63938855:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63938717_63938855:GGH HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 67341714 G/C 1 45 35 80 20.7955005210568 18.8257218169558 1.96977870410105 C:G G C 10 0.537877766198737 0.736848025782442 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 67342257 G/A 1 104 86 190 48.0607123153314 46.2574878930914 1.80322442223998 A:G G A 10 0.537877766198737 0.82738686929094 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 67971452 T/C 1 73 68 141 33.7349230674922 36.5756881015141 -2.84076503402191 T:C T C 10 0.537877766198737 0.673027678847264 ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 42 40 82 19.409133819653 21.5151106479495 -2.10597682829643 A:G G A 10 0.537877766198737 0.659026621988552 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 71550832 T/C 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 T:C T C 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000517601:exon_71550786_71550864:LACTB2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 74893419 C/G 1 38 32 70 17.560644884448 17.2120885183596 0.348556366088413 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 113 92 205 52.2198124195427 49.4847544902838 2.73505792925893 A:T:G A G 10 0.537877766198737 0.726497791805804 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 65 68 133 30.0379451970821 36.5756881015141 -6.53774290443201 C:G C G 10 0.537877766198737 0.259575105778844 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 77896391 C/T 1 45 33 78 20.7955005210568 17.7499662845583 3.04553423649852 T:C C T 10 0.537877766198737 0.498521406412899 ENSG00000164751:ENST00000357039:exon_77892494_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000419564:exon_77892496_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000520103:exon_77895170_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000522527:exon_77895193_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000518986:exon_77895876_77896431:PEX2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 80942321 C/G 1 96 83 179 44.3637344449212 44.6438545944952 -0.280120149573918 C:G C G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000147586:ENST00000276585:exon_80942271_80942506:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000521605:exon_80942271_80942524:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000518271:exon_80942289_80942467:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000522987:exon_80942289_80942489:MRPS28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 86389403 T/C 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C T C 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 87567193 C/T 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 T:C C T 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517354:exon_87567079_87567207:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87567079_87567212:CPNE3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 6 8 14 2.77273340280758 4.3030221295899 -1.53028872678232 A:C A C 10 0.537877766198737 0.434886531304986 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 24 25 49 11.0909336112303 13.4469441549684 -2.35601054373811 T:C C T 10 0.537877766198737 0.567230293798627 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 99148826 T/A 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 A:T T A 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99148710_99148966:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99148710_99148966:POP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 99168383 T/C 1 21 15 36 9.70456690982652 8.06816649298105 1.63640041684547 T:C T C 10 0.537877766198737 0.619758110476252 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000517435:exon_99168186_99168640:POP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 99169923 C/T 1 27 13 40 12.4773003126341 6.99241096058358 5.48488935205052 T:C C T 10 0.537877766198737 0.111656347368297 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 99169956 T/C 1 28 17 45 12.9394225464354 9.14392202537853 3.79550052105684 T:C T C 10 0.537877766198737 0.296372443296128 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 100899793 G/A 1 1083 1050 2133 500.478379206768 564.771654508674 -64.2932753019059 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.00543529534827213 ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 12 5 17 5.54546680561516 2.68938883099368 2.85607797462147 A:G G A 10 0.537877766198737 0.224394873418676 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 8 1 9 3.6969778704101 0.537877766198737 3.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0439369935612285 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 102731486 G/A 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 A:G G A 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000104490:ENST00000395923:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000454532:exon_102731480_102731918:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000395921:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000427074:exon_102731480_102731918:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000311028:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000220931:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000521599:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000519508:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000522951:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000522448:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000520690:exon_102731480_102731876:NCALD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 23 18 41 10.6288113774291 9.68179979157727 0.947011585851785 A:G A G 10 0.537877766198737 0.87583843917238 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 104432659 G/A 1 31 31 62 14.3257892478392 16.6742107521608 -2.34842150432169 A:G G A 10 0.537877766198737 0.610937736265745 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 104452460 T/C 1 181 152 333 83.6441243180286 81.757420462208 1.8867038558206 T:C T C 10 0.537877766198737 0.869092923801907 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104452364_104452499:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521999:exon_104452364_104452504:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104452364_104452499:DCAF13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 71 66 137 32.8106785998897 35.4999325691166 -2.68925396922696 A:T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.668849678446519 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 117868913 G/A 1 7 5 12 3.23485563660884 2.68938883099368 0.545466805615157 A:G G A 10 0.537877766198737 0.782071158324355 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117868885_117869010:RAD21 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 123964813 A/G 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G A G 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 123965365 G/A 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 A:G G A 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 C:G G C 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 202 135 337 93.3486912278551 72.6134984368295 20.7351927910257 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0250041744435673 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124031541 T/C 1 44 35 79 20.3333782872556 18.8257218169558 1.50765647029978 T:C T C 10 0.537877766198737 0.821639935008253 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124142489 T/C 1 5 10 15 2.31061116900632 5.37877766198737 -3.06816649298105 T:C T C 10 0.537877766198737 0.126399812708836 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124265676 C/T 1 30 17 47 13.8636670140379 9.14392202537853 4.71974498865936 T:C C T 10 0.537877766198737 0.189067633852999 ENSG00000165156:ENST00000297857:exon_124265562_124268411:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000395571:exon_124265562_124268411:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000520474:exon_124265562_124267240:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000522655:exon_124265562_124268411:ZHX1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124357253 G/A 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 A:G G A 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000156802:ENST00000517666:exon_124357124_124357309:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000287394:exon_124357124_124357309:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521903:exon_124357124_124357309:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000519124:exon_124357124_124357309:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521496:exon_124356753_124357309:ATAD2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124440174 A/G 1 5 3 8 2.31061116900632 1.61363329859621 0.696977870410104 A:G A G 10 0.537877766198737 0.732785595108735 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000522194:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124440164_124440263:WDYHV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 9 18 27 4.15910010421137 9.68179979157727 -5.5226996873659 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0350997761105223 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 11 16 27 5.08334457181389 8.60604425917979 -3.5226996873659 A:T T A 10 0.537877766198737 0.182472148809709 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 20 8 28 9.24244467602526 4.3030221295899 4.93942254643537 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.0862901941391867 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 124518695 G/A 1 9 1 10 4.15910010421137 0.537877766198737 3.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0250555914428584 ENSG00000156804:ENST00000517956:exon_124518632_124518814:FBXO32;ENSG00000156804:ENST00000524000:exon_124518632_124518865:FBXO32;ENSG00000156804:ENST00000287396:exon_124518632_124518814:FBXO32;ENSG00000156804:ENST00000443022:exon_124518632_124518814:FBXO32 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 133855002 C/T 1 15 23 38 6.93183350701895 12.3711886225709 -5.439355115552 T:C C T 10 0.537877766198737 0.102541172076398 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133854760_133855120:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133854760_133855120:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133854760_133855120:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133854760_133855120:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000477051:exon_133853798_133855120:PHF20L1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 122 90 212 56.3789125237541 48.4089989578863 7.96991356586776 T:G G T 10 0.537877766198737 0.301519700474932 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 141557608 G/C 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 C:G G C 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141557567_141557726:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141557567_141557726:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141557567_141557726:EIF2C2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 141559268 C/T 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 T:C C T 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 142200467 G/A 1 30 22 52 13.8636670140379 11.8333108563722 2.03035615766568 A:G G A 10 0.537877766198737 0.676920982161515 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 142204293 C/T 1 87 36 123 40.2046343407099 19.3635995831545 20.8410347575554 T:C C T 10 0.537877766198737 0.000183236567768257 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 38 66 104 17.560644884448 35.4999325691166 -17.9392876846686 C:G C G 10 0.537877766198737 0.00051823510066775 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 T:C C T 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 9 16 25 4.15910010421137 8.60604425917979 -4.44694415496842 A:G G A 10 0.537877766198737 0.106745724142528 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 113 115 228 52.2198124195427 61.8559431128547 -9.63613069331202 A:G G A 10 0.537877766198737 0.207350450646902 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 42 27 69 19.409133819653 14.5226996873659 4.88643413228715 C:G G C 10 0.537877766198737 0.277367244522724 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 29 22 51 13.4015447802366 11.8333108563722 1.56823392386442 T:C C T 10 0.537877766198737 0.676566409146657 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144413416 G/A 1 5 11 16 2.31061116900632 5.91665542818611 -3.60604425917979 A:G G A 10 0.537877766198737 0.081929463926307 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144642854 G/A 1 101 58 159 46.6743456139276 31.1969104395267 15.4774351744008 A:G G A 10 0.537877766198737 0.013705574194905 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533348:exon_144642773_144642856:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534018:exon_144642773_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 0 0 38 38 0 20.439355115552 -20.439355115552 A G A 10 0.537877766198737 1.82289154509011e-13 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144660046 G/A 1 1 23 24 0.462122233801263 12.3711886225709 -11.9090663887697 A:G G A 10 0.537877766198737 2.603621723431e-07 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144659827_144660085:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144660031_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000491904:exon_144659986_144660113:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 13 18 31 6.00758903941642 9.68179979157727 -3.67421075216085 A:C C A 10 0.537877766198737 0.209426615101637 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 15 11 26 6.93183350701895 5.91665542818611 1.01517807883284 T:G G T 10 0.537877766198737 0.844573032227983 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144689198 C/T 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 5 15 20 2.31061116900632 8.06816649298105 -5.75755532397474 A:C C A 10 0.537877766198737 0.0123203932097094 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 18 6 24 8.31820020842273 3.22726659719242 5.09093361123031 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0410167693556653 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144885580 A/G 1 38 27 65 17.560644884448 14.5226996873659 3.0379451970821 A:G A G 10 0.537877766198737 0.459069915894567 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 2 13 15 0.924244467602526 6.99241096058358 -6.06816649298105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00277175810739690 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144991428 G/A 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:G G A 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144997356 G/A 1 13 7 20 6.00758903941642 3.76514436339116 2.24244467602526 A:G G A 10 0.537877766198737 0.374077937025690 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 144998232 C/T 1 6 7 13 2.77273340280758 3.76514436339116 -0.992410960583581 T:C C T 10 0.537877766198737 0.592273295345338 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 145057699 G/A 1 40 26 66 18.4848893520505 13.9848219211672 4.50006743088336 A:G G A 10 0.537877766198737 0.323384154357092 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 145161798 G/A 1 200 149 349 92.4244467602526 80.1437871636118 12.2806595966408 A:G G A 10 0.537877766198737 0.197680054284796 ENSG00000179632:ENST00000322428:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534585:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000532522:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534811:exon_145161738_145162295:MAF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 145245829 A/G 1 2 7 9 0.924244467602526 3.76514436339116 -2.84089989578863 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0908148488120689 ENSG00000179832:ENST00000532255:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000525287:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000423230:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000534366:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000527552:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000528919:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000326134:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000398656:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000356585:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000420663:exon_145245687_145245838:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000534508:exon_145245687_145245838:HEATR7A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 145512914 C/T 1 49 28 77 22.6439894562619 15.0605774535646 7.58341200269725 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0872354076779241 ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 145617910 A/G 1 4 6 10 1.84848893520505 3.22726659719242 -1.37877766198737 A:G A G 10 0.537877766198737 0.528961805209039 ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145617660_145617912:ADCK5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 A:G G A 10 0.537877766198737 0.80945734873112 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 145649365 G/A 1 28 6 34 12.9394225464354 3.22726659719242 9.71215594924294 A:G G A 10 0.537877766198737 0.000811176727419338 ENSG00000160948:ENST00000529182:exon_145649000_145649515:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145649000_145650434:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000377348:exon_145649000_145649515:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000528142:exon_145649005_145649515:VPS28 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 145655869 A/C 1 15 23 38 6.93183350701895 12.3711886225709 -5.439355115552 A:C A C 10 0.537877766198737 0.102541172076398 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145655787_145655920:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145655787_145655920:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145655787_145655920:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145655787_145655920:NFKBIL2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 17 15 32 7.85607797462147 8.06816649298105 -0.212088518359583 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 214494 T/C 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 T:C T C 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000183784:ENST00000382387:exon_213108_215893:C9orf66 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 1 12 8 20 5.54546680561516 4.3030221295899 1.24244467602526 T:C C T 10 0.537877766198737 0.657647615348739 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 449874 G/C 1 20 24 44 9.24244467602526 12.9090663887697 -3.66662171274443 C:G G C 10 0.537877766198737 0.291894073384424 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 167 122 289 77.1744130448109 65.6210874762459 11.553325568565 C:G C G 10 0.537877766198737 0.175363179370959 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 4834188 C/T 1 20 14 34 9.24244467602526 7.53028872678232 1.71215594924294 T:C C T 10 0.537877766198737 0.608714683105822 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4834141_4834265:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000442869:exon_4834141_4834265:RCL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 51 65 116 23.5682339238644 34.9620548029179 -11.3938208790535 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0400902415337415 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 15 5 20 6.93183350701895 2.68938883099368 4.24244467602526 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0719987060582597 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 6533010 C/G 1 122 50 172 56.3789125237541 26.8938883099368 29.4850242138172 C:G C G 10 0.537877766198737 5.32652016003061e-06 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 6604607 T/G 1 10 3 13 4.62122233801263 1.61363329859621 3.00758903941642 T:G T G 10 0.537877766198737 0.104317293815455 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6604588_6604784:GLDC HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 9 13 22 4.15910010421137 6.99241096058358 -2.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.285712862815016 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 187 153 340 86.4168577208362 82.2952982284068 4.12155949242944 A:C C A 10 0.537877766198737 0.66386240430542 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 7799723 C/T 1 105 110 215 48.5228345491326 59.1665542818611 -10.6437197327284 T:C C T 10 0.537877766198737 0.151193409208537 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 14662278 T/C 1 5 10 15 2.31061116900632 5.37877766198737 -3.06816649298105 T:C T C 10 0.537877766198737 0.126399812708836 ENSG00000175893:ENST00000380916:exon_14662213_14662324:ZDHHC21 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 15459821 A/C 1 6 12 18 2.77273340280758 6.45453319438484 -3.68179979157727 A:C A C 10 0.537877766198737 0.0990055908664937 ENSG00000164975:ENST00000380821:exon_15459717_15464132:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000467062:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380807:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000490969:exon_15459717_15460311:SNAPC3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 17143294 A/G 1 6 5 11 2.77273340280758 2.68938883099368 0.0833445718138934 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17143286_17143374:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17143286_17143374:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17143286_17143374:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17143286_17143374:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17143286_17143374:CNTLN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 17366655 A/G 1 3 5 8 1.38636670140379 2.68938883099368 -1.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.483970581787651 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17366615_17366715:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17366615_17366715:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17366615_17366715:CNTLN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 17394852 G/A 1 11 9 20 5.08334457181389 4.84089989578863 0.242444676025261 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17394532_17395067:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17394532_17395067:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17394532_17395067:CNTLN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 17394886 A/G 1 14 11 25 6.46971127321768 5.91665542818611 0.553055845031576 A:G A G 10 0.537877766198737 0.844404343432166 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17394532_17395067:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17394532_17395067:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17394532_17395067:CNTLN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 19380238 C/T 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C C T 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19380188_19380252:RPS6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 20953049 A/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 17 21 38 7.85607797462147 11.2954330901735 -3.43935511555201 A:G A G 10 0.537877766198737 0.329086913970063 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 11 2 13 5.08334457181389 1.07575553239747 4.00758903941642 T:G T G 10 0.537877766198737 0.0273381802662707 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 32467865 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32467760_32467930:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32467760_32467930:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32467760_32467930:DDX58 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 34 38 72 15.7121559492429 20.439355115552 -4.72719916630906 A:G A G 10 0.537877766198737 0.288210262639345 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 32542499 C/T 1 10 33 43 4.62122233801263 17.7499662845583 -13.1287439465457 T:C C T 10 0.537877766198737 8.14794497989884e-05 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 33276531 C/T 1 111 79 190 51.2955679519402 42.4923435297002 8.80322442223998 T:C C T 10 0.537877766198737 0.216251873017229 ENSG00000086065:ENST00000223500:exon_33276454_33276562:CHMP5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 33464113 T/C 1 17 13 30 7.85607797462147 6.99241096058358 0.863667014037891 T:C T C 10 0.537877766198737 0.855400861350958 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379470:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33464035_33464159:NOL6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 11 5 16 5.08334457181389 2.68938883099368 2.39395574082021 A:C A C 10 0.537877766198737 0.317107876818811 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 33923224 C/T 1 13 11 24 6.00758903941642 5.91665542818611 0.0909336112303132 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33923184_33923291:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33923184_33923291:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33923184_33923291:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33923184_33923291:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33923184_33923291:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33923184_33923291:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379235:exon_33923184_33923291:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_33923184_33923291:UBAP2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 34251467 A/G 1 29 14 43 13.4015447802366 7.53028872678232 5.87125605345431 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0915882658496596 ENSG00000165006:ENST00000297661:exon_34251390_34252521:UBAP1;ENSG00000165006:ENST00000379186:exon_34251390_34252520:UBAP1;ENSG00000165006:ENST00000359544:exon_34251390_34252520:UBAP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 34996584 C/G 1 4 8 12 1.84848893520505 4.3030221295899 -2.45453319438484 C:G C G 10 0.537877766198737 0.246004363634176 ENSG00000137094:ENST00000335998:exon_34996262_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000378751:exon_34996262_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000312316:exon_34996262_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000469798:exon_34996392_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000453597:exon_34996262_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000454002:exon_34996262_34996863:DNAJB5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 13 5 18 6.00758903941642 2.68938883099368 3.31820020842274 A:G G A 10 0.537877766198737 0.155963033480451 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35404038 C/T 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 T:C C T 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000198722:ENST00000396787:exon_35403745_35404172:UNC13B;ENSG00000198722:ENST00000378495:exon_35403745_35405335:UNC13B;ENSG00000198722:ENST00000378496:exon_35403745_35405335:UNC13B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35660901 C/T 1 57 47 104 26.340967326672 25.2802550113406 1.06071231533136 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.84486506099403 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35660091_35660964:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35661057 C/G 1 48 50 98 22.1818672224606 26.8938883099368 -4.71202108747622 C:G C G 10 0.537877766198737 0.362626185467903 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35661088 G/A 1 58 42 100 26.8030895604733 22.590866180347 4.2122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.423448036481577 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35684289 G/A 1 2 27 29 0.924244467602526 14.5226996873659 -13.5984552197634 A:G G A 10 0.537877766198737 1.2638355285323e-07 ENSG00000198467:ENST00000378300:exon_35684243_35684312:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000378292:exon_35684243_35684312:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000329305:exon_35684243_35684312:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000360958:exon_35684243_35684312:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000471212:exon_35684248_35684312:TPM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35720126 A/G 1 7 7 14 3.23485563660884 3.76514436339116 -0.530288726782318 A:G A G 10 0.537877766198737 0.795089007588014 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35720036_35720216:TLN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35736496 G/A 1 69 68 137 31.8864341322871 36.5756881015141 -4.68925396922696 A:G G A 10 0.537877766198737 0.441258958845286 ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35736389_35737001:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35736389_35736857:CREB3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35846469 C/T 1 8 5 13 3.6969778704101 2.68938883099368 1.00758903941642 T:C C T 10 0.537877766198737 0.782307425548562 ENSG00000137103:ENST00000377996:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000439587:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000450762:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377991:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000358856:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377988:exon_35846466_35846608:TMEM8B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 35846541 G/A 1 8 12 20 3.6969778704101 6.45453319438484 -2.75755532397474 A:G G A 10 0.537877766198737 0.264025791085066 ENSG00000137103:ENST00000377996:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000439587:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000450762:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377991:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000358856:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377988:exon_35846466_35846608:TMEM8B HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 37126682 G/A 1 12 17 29 5.54546680561516 9.14392202537853 -3.59845521976337 A:G G A 10 0.537877766198737 0.196037430426041 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000322831:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37126309_37126939:ZCCHC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 37304280 T/C 1 20 17 37 9.24244467602526 9.14392202537853 0.0985226506467338 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37304185_37304310:ZCCHC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 37305603 C/A 1 18 26 44 8.31820020842273 13.9848219211672 -5.66662171274443 A:T:C C A 10 0.537877766198737 0.096829648376984 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37305541_37305711:ZCCHC7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 24 15 39 11.0909336112303 8.06816649298105 3.02276711824926 T:G G T 10 0.537877766198737 0.422369773357453 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 39 25 64 18.0227671182493 13.4469441549684 4.57582296328084 T:C C T 10 0.537877766198737 0.262017997160199 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 69 65 134 31.8864341322871 34.9620548029179 -3.07562067063076 T:C T C 10 0.537877766198737 0.604176095310352 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 121 90 211 55.9167902899528 48.4089989578863 7.5077913320665 A:G G A 10 0.537877766198737 0.333765613749984 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 37919839 G/A 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000107338:ENST00000377707:exon_37919131_37920001:SHB HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 72897434 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 74975136 T/C 1 19 8 27 8.780322442224 4.3030221295899 4.4773003126341 T:C T C 10 0.537877766198737 0.120977571452467 ENSG00000107372:ENST00000437241:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000237937:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000456474:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376960:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376962:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000488164:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000343431:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000471197:exon_74975026_74975201:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376956:exon_74975026_74975137:ZFAND5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 12 18 30 5.54546680561516 9.68179979157727 -4.13633298596211 A:C A C 10 0.537877766198737 0.145035454783885 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 80881519 T/C 1 34 30 64 15.7121559492429 16.1363329859621 -0.424177036719167 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80881358_80881769:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80881358_80881991:CEP78 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 88961238 T/C 1 4 7 11 1.84848893520505 3.76514436339116 -1.91665542818611 T:C T C 10 0.537877766198737 0.365594727585421 ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88961214_88961395:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375960:exon_88961214_88961395:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88961214_88961395:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88961214_88961395:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000427388:exon_88961214_88961395:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000432440:exon_88961214_88961395:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000449875:exon_88961214_88961395:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375947:exon_88961214_88961395:ZCCHC6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 93637015 C/T 1 41 33 74 18.9470115858518 17.7499662845583 1.19704530129347 T:C C T 10 0.537877766198737 0.81638904354987 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 22 20 42 10.1666891436278 10.7575553239747 -0.590866180346952 C:G G C 10 0.537877766198737 0.878047078026096 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 23 22 45 10.6288113774291 11.8333108563722 -1.20449947894316 A:C:G G A 10 0.537877766198737 0.765996013738755 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 29 20 49 13.4015447802366 10.7575553239747 2.64398945626189 T:C C T 10 0.537877766198737 0.476848420122396 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95018903 A/G 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95072500 C/T 1 50 41 91 23.1061116900632 22.0529884141482 1.05312327591494 T:C C T 10 0.537877766198737 0.834448461204575 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000432670:exon_95072453_95072543:NOL8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95076888 A/G 1 17 15 32 7.85607797462147 8.06816649298105 -0.212088518359583 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000432670:exon_95076549_95077098:NOL8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95077281 C/T 1 6 11 17 2.77273340280758 5.91665542818611 -3.14392202537853 T:C C T 10 0.537877766198737 0.147916659664906 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 2 9 11 0.924244467602526 4.84089989578863 -3.91665542818611 A:C C A 10 0.537877766198737 0.029521862649748 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95768324 C/T 1 5 6 11 2.31061116900632 3.22726659719242 -0.916655428186107 T:C C T 10 0.537877766198737 0.764208659813838 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95768306_95768462:FGD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 14 7 21 6.46971127321768 3.76514436339116 2.70456690982652 T:C C T 10 0.537877766198737 0.278190405615872 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 4 29 33 1.84848893520505 15.5984552197634 -13.7499662845583 C:G G C 10 0.537877766198737 1.27358907906647e-06 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 39 57 96 18.0227671182493 30.659032673328 -12.6362655550787 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0103937357623770 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 95887320 G/T 1 14 36 50 6.46971127321768 19.3635995831545 -12.8938883099368 T:G G T 10 0.537877766198737 0.000303162919169798 ENSG00000131669:ENST00000375446:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000489274:exon_95887181_95888472:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000470314:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000461162:exon_95887181_95887344:NINJ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 99538365 G/A 1 6 2 8 2.77273340280758 1.07575553239747 1.6969778704101 A:G G A 10 0.537877766198737 0.300306968301756 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99538282_99538527:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99538282_99538530:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99538282_99538527:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000374641:exon_99538282_99538527:ZNF510 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 99581916 C/G 0 9 0 9 4.15910010421137 0 4.15910010421137 C C 10 0.537877766198737 0.00472955515261702 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 137 101 238 63.310746030773 54.3256543860724 8.98509164470061 T:C C T 10 0.537877766198737 0.269071483165502 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 101984147 G/C 1 3 11 14 1.38636670140379 5.91665542818611 -4.53028872678232 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0280815187175553 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 102820138 T/C 1 25 29 54 11.5530558450316 15.5984552197634 -4.0453993747318 T:C T C 10 0.537877766198737 0.278090001273473 ENSG00000023318:ENST00000262455:exon_102820102_102820141:ERP44 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 103054655 A/G 1 9 11 20 4.15910010421137 5.91665542818611 -1.75755532397474 A:G A G 10 0.537877766198737 0.504000237806629 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS;ENSG00000119509:ENST00000262456:exon_103054608_103054718:INVS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 31 42 73 14.3257892478392 22.590866180347 -8.2650769325078 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0600327050744399 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 103070820 G/A 1 39 39 78 18.0227671182493 20.9772328817507 -2.95446576350148 A:G G A 10 0.537877766198737 0.570469335180692 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103070782_103070963:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103070782_103070963:TEX10 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 20 17 37 9.24244467602526 9.14392202537853 0.0985226506467338 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 111651620 A/T 1 4 13 17 1.84848893520505 6.99241096058358 -5.14392202537853 A:T A T 10 0.537877766198737 0.0143486832929105 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 111727676 C/T 1 29 34 63 13.4015447802366 18.2878440507571 -4.88629927052043 T:C C T 10 0.537877766198737 0.255408005800293 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 523 521 1044 241.689928278061 280.234316189542 -38.5443879114814 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0168593655719696 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 114146847 T/C 1 18 18 36 8.31820020842273 9.68179979157727 -1.36359958315453 T:C T C 10 0.537877766198737 0.738822345632434 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114146802_114146849:KIAA0368 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 1 9 7 16 4.15910010421137 3.76514436339116 0.393955740820208 A:C C A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 49 42 91 22.6439894562619 22.590866180347 0.0531232759149347 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 36 44 80 16.6364004168455 23.6666217127444 -7.03022129589896 A:G G A 10 0.537877766198737 0.117877488356067 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 115950706 A/C 1 7 3 10 3.23485563660884 1.61363329859621 1.62122233801263 A:C A C 10 0.537877766198737 0.357765318101588 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 116136091 T/C 1 20 26 46 9.24244467602526 13.9848219211672 -4.7423772451419 T:C T C 10 0.537877766198737 0.183753393346675 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 36 32 68 16.6364004168455 17.2120885183596 -0.575688101514114 T:C C T 10 0.537877766198737 0.903737979842142 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 116152891 A/G 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 116152940 G/A 1 4 4 8 1.84848893520505 2.15151106479495 -0.303022129589896 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000464749:exon_116152908_116153213:ALAD HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 116346118 G/A 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 116346236 G/A 1 3 11 14 1.38636670140379 5.91665542818611 -4.53028872678232 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0280815187175553 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 116346515 G/A 1 14 4 18 6.46971127321768 2.15151106479495 4.31820020842273 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0563618316166793 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000474719:exon_116346484_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000467805:exon_116346462_116346707:RGS3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 10 1 11 4.62122233801263 0.537877766198737 4.08334457181389 A:T T A 10 0.537877766198737 0.0142271384391581 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 124094825 G/A 1 5 25 30 2.31061116900632 13.4469441549684 -11.1363329859621 A:G G A 10 0.537877766198737 5.60413415767932e-05 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 125898732 T/C 1 72 69 141 33.2728008336909 37.1135658677129 -3.84076503402191 T:C T C 10 0.537877766198737 0.554620711222805 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000492885:exon_125898660_125898782:STRBP HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 0 0 8 8 0 4.3030221295899 -4.3030221295899 C T C 10 0.537877766198737 0.00207995965823786 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 127975654 C/T 1 38 37 75 17.560644884448 19.9014773493533 -2.34083246490527 T:C C T 10 0.537877766198737 0.643636111608888 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 134 115 249 61.9243793293693 61.8559431128547 0.068436216514506 A:T:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 128099784 C/T 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 T:C C T 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000265956:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000431329:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128099500_128099870:GAPVD1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130504070 G/A 1 60 40 100 27.7273340280758 21.5151106479495 6.21222338012631 A:T:G G A 10 0.537877766198737 0.229503887848849 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130504067_130504238:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130504067_130504238:SH2D3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130513469 A/G 1 19 13 32 8.780322442224 6.99241096058358 1.78791148164042 A:G A G 10 0.537877766198737 0.596919535098297 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000471939:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000414380:exon_130513451_130513579:SH2D3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130523904 T/C 1 11 6 17 5.08334457181389 3.22726659719242 1.85607797462147 T:C T C 10 0.537877766198737 0.468328425798145 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130523890_130523931:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130523890_130523929:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130523890_130523929:SH2D3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130540940 G/A 1 7 4 11 3.23485563660884 2.15151106479495 1.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.561626534867699 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130540875_130540974:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130540870_130541020:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130540875_130540989:SH2D3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130540942 G/A 1 3 7 10 1.38636670140379 3.76514436339116 -2.37877766198737 A:G G A 10 0.537877766198737 0.203511122256408 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130540875_130540974:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130540870_130541020:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130540875_130540989:SH2D3C HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 17 25 42 7.85607797462147 13.4469441549684 -5.59086618034695 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0900476169524938 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130630240 G/T 1 24 17 41 11.0909336112303 9.14392202537853 1.94701158585178 T:G G T 10 0.537877766198737 0.6391143163645 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130670652 A/G 1 209 219 428 96.583546864464 117.795230797523 -21.2116839330594 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0417119019064334 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130670165_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130670166_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000474282:exon_130670604_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130670597_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130670623_130670860:ST6GALNAC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130674948 G/T 1 56 41 97 25.8788450928707 22.0529884141482 3.82585667872252 T:G G T 10 0.537877766198737 0.476543860922233 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130674666_130674959:ST6GALNAC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 147 101 248 67.9319683687857 54.3256543860724 13.6063139827132 C:G G C 10 0.537877766198737 0.085719560110895 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 144 97 241 66.5456016673819 52.1741433212775 14.3714583461044 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0702885411879091 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130825847 G/A 1 10 15 25 4.62122233801263 8.06816649298105 -3.44694415496842 A:G G A 10 0.537877766198737 0.228164098691797 ENSG00000171169:ENST00000373078:exon_130823512_130826179:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000470245:exon_130825653_130826021:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000488519:exon_130824269_130826179:NAIF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130941070 C/T 1 26 27 53 12.0151780788328 14.5226996873659 -2.50752160853306 T:C C T 10 0.537877766198737 0.494764130480663 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130940988_130941183:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130940988_130941183:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130940988_130941183:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130940988_130941183:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000475471:exon_130940648_130941288:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130940988_130941183:CIZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130942757 C/T 1 13 14 27 6.00758903941642 7.53028872678232 -1.5226996873659 T:C C T 10 0.537877766198737 0.568978894368706 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130942727_130942802:CIZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 130943028 G/A 1 10 15 25 4.62122233801263 8.06816649298105 -3.44694415496842 A:G G A 10 0.537877766198737 0.228164098691797 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130943000_130943077:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130943000_130943093:CIZ1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131023505 T/C 1 22 23 45 10.1666891436278 12.3711886225709 -2.20449947894316 T:C T C 10 0.537877766198737 0.551523512026015 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000470630:exon_131023400_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131023451_131023538:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131023471_131023538:GOLGA2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131038643 C/A 1 28 23 51 12.9394225464354 12.3711886225709 0.568233923864415 A:C C A 10 0.537877766198737 0.889445016931927 ENSG00000175854:ENST00000320188:exon_131038425_131038681:C9orf119;ENSG00000175854:ENST00000419867:exon_131038521_131038681:C9orf119;ENSG00000175854:ENST00000418976:exon_131038523_131038681:C9orf119 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131085196 G/A 1 39 33 72 18.0227671182493 17.7499662845583 0.27280083369094 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131084815_131085207:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131085131_131085207:COQ4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131088076 G/A 1 34 26 60 15.7121559492429 13.9848219211672 1.72733402807578 A:G G A 10 0.537877766198737 0.698957145683894 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131088058_131088160:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131088058_131088679:COQ4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 5 9 14 2.31061116900632 4.84089989578863 -2.53028872678232 T:C C T 10 0.537877766198737 0.191097640037808 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131395568 C/T 1 288 320 608 133.091203334764 172.120885183596 -39.0296818488321 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00171527918599865 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131395488_131395937:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131395488_131395937:SPTAN1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 78 63 141 36.0455342364985 33.8862992705204 2.15923496597809 A:G G A 10 0.537877766198737 0.736135645189292 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131403096 A/G 1 46 64 110 21.2576227548581 34.4241770367192 -13.1665542818611 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0127852677362958 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131480651 A/G 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 A:G A G 10 0.537877766198737 1 ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131480604_131480666:PKN3;ENSG00000160447:ENST00000485301:exon_131480604_131480666:PKN3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131483935 C/T 1 76 69 145 35.121289768896 37.1135658677129 -1.99227609881686 T:C C T 10 0.537877766198737 0.739925334808747 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372672:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372664:exon_131483930_131484096:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000452105:exon_131483930_131484096:ZDHHC12 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C T C 10 0.537877766198737 1 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131584631 C/T 1 228 111 339 105.363869306688 59.7044320480598 45.6594372586282 T:C C T 10 0.537877766198737 6.15724136485128e-07 ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 39 16 55 18.0227671182493 8.60604425917979 9.41672285906947 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0141684919871678 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131670919 T/C 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 T:C T C 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131708689 G/A 1 9 13 22 4.15910010421137 6.99241096058358 -2.83331085637221 A:G G A 10 0.537877766198737 0.285712862815016 ENSG00000175283:ENST00000372586:exon_131707810_131710012:DOLK HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131755866 G/A 1 8 3 11 3.6969778704101 1.61363329859621 2.08334457181389 A:G G A 10 0.537877766198737 0.241273194235239 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131755804_131755973:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000411887:exon_131755804_131755973:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131755804_131755973:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000477069:exon_131755804_131755973:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000467044:exon_131755804_131755973:NUP188 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 131849036 C/T 1 11 10 21 5.08334457181389 5.37877766198737 -0.295433090173476 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000167130:ENST00000372546:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000406974:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000327812:exon_131848988_131849077:DOLPP1;ENSG00000167130:ENST00000412363:exon_131848988_131849077:DOLPP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 132637608 A/G 1 8 10 18 3.6969778704101 5.37877766198737 -1.68179979157726 A:G A G 10 0.537877766198737 0.483251518274145 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 198 202 400 91.5002022926501 108.651308772145 -17.1511064794948 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0882781051624267 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 132719666 G/A 1 54 46 100 24.9546006252682 24.7423772451419 0.212223380126307 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132719639_132719743:FNBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 54 59 113 24.9546006252682 31.7347882057255 -6.78018758045727 A:G A G 10 0.537877766198737 0.220177589461928 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 133355180 G/A 1 6 3 9 2.77273340280758 1.61363329859621 1.15910010421137 A:G G A 10 0.537877766198737 0.519014071195724 ENSG00000130707:ENST00000334909:exon_133355103_133355187:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000352480:exon_133355103_133355187:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372394:exon_133355103_133355187:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000344866:exon_133355103_133355187:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372393:exon_133355103_133355187:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000413709:exon_133355103_133355187:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000467695:exon_133355103_133355285:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000493984:exon_133355152_133355187:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000492400:exon_133355103_133355187:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000470849:exon_133355103_133355187:ASS1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 134073807 A/G 1 38 24 62 17.560644884448 12.9090663887697 4.65157849567831 A:G A G 10 0.537877766198737 0.253570420978799 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000531600:exon_134072603_134074035:NUP214 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 135201993 C/T 1 5 5 10 2.31061116900632 2.68938883099368 -0.378777661987369 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 135277130 C/A 1 94 94 188 43.4394899773187 50.5605100226813 -7.12102004536254 A:C C A 10 0.537877766198737 0.306470226424642 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 135521416 C/T 1 4 14 18 1.84848893520505 7.53028872678232 -5.68179979157727 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00842674134138563 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135521282_135521458:DDX31 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 37 23 60 17.0985226506467 12.3711886225709 4.72733402807578 C:G G C 10 0.537877766198737 0.245043168492218 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 37 25 62 17.0985226506467 13.4469441549684 3.65157849567831 A:G G A 10 0.537877766198737 0.374943524274375 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 136199092 C/T 1 71 46 117 32.8106785998897 24.7423772451419 8.06830135474778 T:C C T 10 0.537877766198737 0.138932292236129 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136197552_136199184:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136198642_136199184:SURF6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 136230585 A/G 1 29 21 50 13.4015447802366 11.2954330901735 2.10611169006315 A:G A G 10 0.537877766198737 0.57373960642381 ENSG00000148248:ENST00000371989:exon_136228325_136230635:SURF4;ENSG00000148248:ENST00000465565:exon_136230329_136230635:SURF4;ENSG00000148248:ENST00000467910:exon_136230431_136230635:SURF4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 136277482 T/C 1 18 21 39 8.31820020842273 11.2954330901735 -2.97723288175074 T:C T C 10 0.537877766198737 0.341434287698833 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277419_136277612:REXO4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 136279935 C/T 1 16 14 30 7.39395574082021 7.53028872678232 -0.136332985962109 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 136340134 C/T 1 17 20 37 7.85607797462147 10.7575553239747 -2.90147734935327 T:C C T 10 0.537877766198737 0.410202946917988 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 136343524 T/C 1 10 7 17 4.62122233801263 3.76514436339116 0.856077974621472 T:C T C 10 0.537877766198737 0.80945734873112 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136343376_136343538:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136343376_136344218:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136343376_136343538:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000432868:exon_136343376_136343538:SLC2A6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 137713948 C/T 1 1 8 9 0.462122233801263 4.3030221295899 -3.84089989578863 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0147984316454252 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137713943_137713996:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137713943_137713996:COL5A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 137726831 C/T 1 1 41 42 0.462122233801263 22.0529884141482 -21.5908661803469 T:C C T 10 0.537877766198737 4.14723509038718e-13 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137726817_137727050:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137726817_137727050:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000371820:exon_137726817_137727050:COL5A1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 138837014 G/T 1 34 37 71 15.7121559492429 19.9014773493533 -4.18932140011032 T:G G T 10 0.537877766198737 0.342162023845144 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138836874_138837096:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000465873:exon_138836874_138837519:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000471163:exon_138836874_138837096:UBAC1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139270806 G/A 1 87 58 145 40.2046343407099 31.1969104395267 9.00772390118314 A:G G A 10 0.537877766198737 0.156576114038779 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 51 57 108 23.5682339238644 30.659032673328 -7.09079874946359 A:G A G 10 0.537877766198737 0.177655145160087 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 24 25 49 11.0909336112303 13.4469441549684 -2.35601054373811 T:C T C 10 0.537877766198737 0.567230293798627 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 7 14 21 3.23485563660884 7.53028872678232 -4.29543309017348 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0786738247503462 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139276331 G/A 1 4 5 9 1.84848893520505 2.68938883099368 -0.840899895788632 A:G G A 10 0.537877766198737 0.741288363041731 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139276276_139276525:SNAPC4 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139297266 C/T 1 65 35 100 30.0379451970821 18.8257218169558 11.2122233801263 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0270708973886925 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139296932_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000481114:exon_139297096_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139297117_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139297134_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139297240_139297339:SDCCAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139298560 G/A 1 25 8 33 11.5530558450316 4.3030221295899 7.25003371544168 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0135109523882583 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000481114:exon_139298465_139298560:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139298589 T/C 0 15 0 15 6.93183350701895 0 6.93183350701895 T T 10 0.537877766198737 0.000100616077781393 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139298590 G/A 0 15 0 15 6.93183350701895 0 6.93183350701895 G G 10 0.537877766198737 0.000100616077781393 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 12 3 15 5.54546680561516 1.61363329859621 3.93183350701895 A:G A G 10 0.537877766198737 0.0663458133820393 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139301960 G/A 1 10 5 15 4.62122233801263 2.68938883099368 1.93183350701895 A:G G A 10 0.537877766198737 0.439052718100201 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 79 48 127 36.5076564702998 25.8181327775394 10.6895236927604 T:C C T 10 0.537877766198737 0.0615978992569552 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139311561 G/C 1 42 80 122 19.409133819653 43.030221295899 -23.6210874762459 C:G G C 10 0.537877766198737 2.37761617760011e-05 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139350552 C/A 1 12 7 19 5.54546680561516 3.76514436339116 1.780322442224 A:C C A 10 0.537877766198737 0.494001923393957 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139350505_139350618:SEC16A HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139390655 C/T 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 T:C C T 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139390853 C/T 1 10 6 16 4.62122233801263 3.22726659719242 1.39395574082021 T:C C T 10 0.537877766198737 0.618423060594942 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139731969 C/T 1 47 43 90 21.7197449886594 23.1287439465457 -1.40899895788633 T:C:G C T 10 0.537877766198737 0.832710076756182 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139732331 G/C 1 57 52 109 26.340967326672 27.9696438423343 -1.62867651566233 C:G G C 10 0.537877766198737 0.773816579094055 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139732314_139732432:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139743890 T/C 1 127 143 270 58.6895236927604 76.9165205664194 -18.226996873659 T:C:G T C 10 0.537877766198737 0.02792074708611 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139743563_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139743543_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139743546_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139743877_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139743878_139744042:PHPT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139811046 C/T 1 11 15 26 5.08334457181389 8.06816649298105 -2.98482192116716 T:C C T 10 0.537877766198737 0.246211435647614 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139810993_139811067:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139810993_139811067:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139810993_139811067:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000482854:exon_139810993_139811067:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000469701:exon_139810993_139811129:TRAF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 37 32 69 17.0985226506467 17.2120885183596 -0.11356586771285 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139835922 G/A 1 1 7 8 0.462122233801263 3.76514436339116 -3.3030221295899 A:G G A 10 0.537877766198737 0.0284533508029234 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139836000 C/T 1 43 44 87 19.8712560534543 23.6666217127444 -3.79536565929012 T:C C T 10 0.537877766198737 0.452163246771891 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139835989_139836136:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139835989_139836136:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139835989_139836136:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139835989_139836136:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139835989_139836136:FBXW5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 139837369 C/T 1 14 14 28 6.46971127321768 7.53028872678232 -1.06057745356464 T:C C T 10 0.537877766198737 0.708574000555236 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139837221_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139837221_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000491246:exon_139837221_139837455:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000428398:exon_139837221_139837425:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000443788:exon_139837359_139837395:FBXW5 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 282 224 506 130.318469931956 120.484619628517 9.83385030343909 C:G C G 10 0.537877766198737 0.397038021254397 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 30 22 52 13.8636670140379 11.8333108563722 2.03035615766568 A:G A G 10 0.537877766198737 0.676920982161515 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140075323 G/A 1 22 21 43 10.1666891436278 11.2954330901735 -1.12874394654569 A:G G A 10 0.537877766198737 0.76130636697167 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140075240_140075381:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140075240_140075381:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000471131:exon_140075298_140075381:ANAPC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140079522 G/A 1 13 13 26 6.00758903941642 6.99241096058358 -0.98482192116716 A:G G A 10 0.537877766198737 0.699848188249655 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140079365_140079539:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000495611:exon_140079365_140079539:ANAPC2 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140109282 T/G 1 8 9 17 3.6969778704101 4.84089989578863 -1.14392202537853 T:G T G 10 0.537877766198737 0.632034756812868 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140109250_140109470:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140109250_140109470:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140109250_140109470:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140109250_140109470:NDOR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140110737 A/G 1 9 4 13 4.15910010421137 2.15151106479495 2.00758903941642 A:G A G 10 0.537877766198737 0.405240878113435 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140110724_140111461:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140110724_140111461:NDOR1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 87 82 169 40.2046343407099 44.1059768282964 -3.90134248758654 A:G G A 10 0.537877766198737 0.589333369046159 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140267464 G/T 1 7 15 22 3.23485563660884 8.06816649298105 -4.83331085637221 T:G G T 10 0.537877766198737 0.0524426011647104 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140446806 C/T 1 534 470 1004 246.773272849874 252.802550113406 -6.0292772635319 T:C C T 10 0.537877766198737 0.704214047147074 ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140468828 C/T 1 11 3 14 5.08334457181389 1.61363329859621 3.46971127321768 T:C C T 10 0.537877766198737 0.104462553857524 ENSG00000148399:ENST00000479650:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000277540:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000475100:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000472113:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000485189:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000467768:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000477690:exon_140468660_140469821:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000470855:exon_140468659_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000481839:exon_140468667_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000476303:exon_140468716_140468832:WDR85 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140510427 C/T 1 15 10 25 6.93183350701895 5.37877766198737 1.55305584503158 T:C C T 10 0.537877766198737 0.555492392718307 ENSG00000203993:ENST00000371417:exon_140509784_140510651:C9orf37;ENSG00000203993:ENST00000496793:exon_140510201_140510651:C9orf37 HGDP00456_parsed_pileup.txt . 9 140611490 C/T 1 7 6 13 3.23485563660884 3.22726659719242 0.00758903941641931 T:C C T 10 0.537877766198737 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 221795 C/G 1 123 162 285 56.8410347575554 87.1361981241954 -30.29516336664 C:G C G 10 0.537877766198737 0.000351521509117822 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 221812 C/T 1 202 123 325 93.3486912278551 66.1589652424447 27.1897259854105 T:C C T 10 0.537877766198737 0.00261873249559415 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 228149 G/C 1 87 53 140 40.2046343407099 28.5075216085331 11.6971127321768 C:G G C 10 0.537877766198737 0.0511340131778771 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_228086_228294:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_228086_228294:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_228086_228294:GTPBP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 36 31 67 16.6364004168455 16.6742107521608 -0.0378103353153776 A:G G A 10 0.537877766198737 1 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 229564 C/T 1 37 35 72 17.0985226506467 18.8257218169558 -1.72719916630906 T:C C T 10 0.537877766198737 0.723587792490902 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 295135 G/A 1 52 6 58 24.0303561576657 3.22726659719242 20.8030895604733 A:G G A 10 0.537877766198737 6.24553632043835e-09 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 322161 A/G 1 7 8 15 3.23485563660884 4.3030221295899 -1.06816649298105 A:G A G 10 0.537877766198737 0.61338933381628 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 322257 G/A 1 6 4 10 2.77273340280758 2.15151106479495 0.62122233801263 A:G G A 10 0.537877766198737 0.760887200836927 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 1471160 C/G 1 5 4 9 2.31061116900632 2.15151106479495 0.159100104211368 C:G C G 10 0.537877766198737 1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 1585079 C/T 1 2 6 8 0.924244467602526 3.22726659719242 -2.3030221295899 T:C C T 10 0.537877766198737 0.155505383598726 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 2139224 G/T 1 19 20 39 8.780322442224 10.7575553239747 -1.97723288175074 T:G G T 10 0.537877766198737 0.526240071250459 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 2406655 G/T 1 17 11 28 7.85607797462147 5.91665542818611 1.93942254643536 T:G G T 10 0.537877766198737 0.57069741814659 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1 HGDP00456_parsed_pileup.txt . X 153186942 G/A 0 0 8 8 0 4.3030221295899 -4.3030221295899 A G A 10 0.537877766198737 0.00207995965823786 ENSG00000089820:ENST00000393721:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370028:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000420383:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000350060:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000370016:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000470209:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494302:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000404127:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000494813:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000461052:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000488269:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000442262:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000422091:exon_153186818_153186980:ARHGAP4;ENSG00000089820:ENST00000470979:exon_153186818_153186980:ARHGAP4