INDIVIDUAL	RSID	CHR	POS	ALLELES	BOTH_ALLELES_SEEN	REF_COUNT	NONREF_COUNT	TOTAL_COUNT	WEIGHTED_REF_COUNT	WEIGHTED_NONREF_COUNT	WRC_MINUS_WNC	ALLELES_SEEN	REF_ALLELE	ALT_ALLELE	MAQ_FILTER	REF_RATIO	PVALUE	EXON_INFO
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	887801	A/G	1	48	52	100	22.9022216465338	27.1892598829217	-4.28703823638789	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.423717232199325	ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_887792_887980:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_887792_887980:NOC2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	888639	T/C	1	18	12	30	8.58833311745018	6.27444458836655	2.31388852908363	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.466606982659409	ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_888555_888668:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_888555_888668:NOC2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	888659	T/C	1	19	14	33	9.0654627350863	7.32018535309431	1.74527738199199	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.603476938564334	ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_888555_888668:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_888555_888668:NOC2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	889403	T/A	1	20	13	33	9.54259235272242	6.79731497073043	2.745277381992	A:T:G	T	A	10	0.522870382363879	0.386037409230635	ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_889384_889462:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_889384_889903:NOC2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	900397	C/T	1	1	9	10	0.477129617636121	4.70583344127491	-4.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0088395297966988	ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	948921	T/C	1	1289	1797	3086	615.02007713296	939.598077107891	-324.57799997493	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1.26432882911628e-31	ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_948803_948956:ISG15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	948990	C/T	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	949654	A/G	1	2396	2921	5317	1143.20256385615	1527.30438688489	-384.101823028744	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	6.02084604675095e-26	ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	985826	G/A	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_985807_985971:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_985807_985971:AGRN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	990380	C/T	1	17	18	35	8.11120349981406	9.41166688254982	-1.30046338273576	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.736056008386851	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1139202	T/C	1	20	17	37	9.54259235272242	8.88879650018594	0.653795852536479	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.870508040497293	ENSG00000186891:ENST00000328596:exon_1138888_1139340:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1138891_1139348:TNFRSF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1147422	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1245176	C/T	1	15	18	33	7.15694426454182	9.41166688254982	-2.254722618008	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.487711537553837	ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000470520:exon_1245086_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000463758:exon_1244466_1245220:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1244834_1245194:PUSL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1262276	C/T	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262216_1262412:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000488011:exon_1262216_1262412:GLTPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1262966	C/T	1	15	9	24	7.15694426454182	4.70583344127491	2.45111082326691	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.414521773200192	ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1309458	G/A	1	585	530	1115	279.120826317131	277.121302652856	1.99952366427499	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.92834257245664	ENSG00000175756:ENST00000338370:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000338338:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000321751:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000470457:exon_1309380_1309706:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000378853:exon_1309380_1309825:AURKAIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1309567	G/A	1	394	359	753	187.989069348632	187.710467268633	0.278602079999132	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000175756:ENST00000338370:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000338338:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000321751:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000470457:exon_1309380_1309706:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000378853:exon_1309380_1309825:AURKAIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1322607	C/T	1	45	44	89	21.4708327936254	23.0062968240107	-1.53546403038523	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.751490994278611	ENSG00000221978:ENST00000480479:exon_1321091_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000482621:exon_1321862_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000463260:exon_1321875_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000400809:exon_1321875_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000496007:exon_1321879_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000400810:exon_1321879_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000482365:exon_1321882_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000481223:exon_1322088_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000408952:exon_1322088_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000418865:exon_1322093_1322962:CCNL2;ENSG00000221978:ENST00000505849:exon_1322502_1322962:CCNL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1469472	G/C	1	41	31	72	19.562314323081	16.2089818532802	3.35333246980072	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.479634217872591	ENSG00000197785:ENST00000378756:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378759:exon_1469306_1470064:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378755:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000339113:exon_1469306_1470065:ATAD3A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1479333	A/G	1	99	123	222	47.235832145976	64.3130570307571	-17.0772248847811	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0223735299462430	ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1551927	T/C	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1563985	C/T	1	22	8	30	10.4968515879947	4.18296305891103	6.31388852908363	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0268893224706540	ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1563653_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000473511:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000464570:exon_1563869_1564102:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000483015:exon_1563869_1564102:MIB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1635344	G/A	1	12	12	24	5.72555541163345	6.27444458836655	-0.548889176733095	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.841001758494376	ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1634915_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000478901:exon_1634527_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635263_1635434:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635263_1635379:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635307_1635434:CDK11A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1635565	C/T	1	15	10	25	7.15694426454182	5.22870382363879	1.92824044090303	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.549274934579923	ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1635749	C/A	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	1724719	G/A	1	142	108	250	67.7524057043292	56.4700012952989	11.2824044090303	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.163701123022469	ENSG00000078369:ENST00000378609:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000455156:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000378606:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000424622:exon_1724684_1724753:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000461893:exon_1724684_1725636:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000471354:exon_1724684_1724750:GNB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	2441358	T/C	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	2488145	C/T	1	41	11	52	19.562314323081	5.75157420600267	13.8107401170783	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000126067412731794	ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	3548832	G/C	1	13	12	25	6.20268502926957	6.27444458836655	-0.0717595590969733	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548777_3548902:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000471223:exon_3548450_3553662:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000424367:exon_3548777_3548902:WDR8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	3645989	G/A	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3645891_3646012:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3645891_3646012:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3645891_3646012:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3645891_3646012:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3645891_3646012:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3645891_3646012:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3645891_3646012:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3645891_3646012:TP73
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	3649421	T/C	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	3649562	G/A	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	3697700	G/A	1	34	37	71	16.2224069996281	19.3462041474635	-3.1237971478354	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.477795963549034	ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3696784_3697900:LRRC47;ENSG00000130764:ENST00000462356:exon_3697699_3697900:LRRC47
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	3746432	G/A	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3746355_3746561:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3746355_3746561:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000495701:exon_3746256_3746561:KIAA0562
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	6142308	T/C	1	15	7	22	7.15694426454182	3.66009267654715	3.49685158799466	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.199324971996938	ENSG00000069424:ENST00000378111:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000428161:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000389632:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000458166:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378087:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000435937:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000472700:exon_6142255_6142334:KCNAB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	6399593	C/A	1	41	29	70	19.562314323081	15.1632410885525	4.39907323452847	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.338716559920458	ENSG00000097021:ENST00000377855:exon_6399493_6399649:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377860:exon_6399493_6399649:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000418124:exon_6399493_6399649:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377845:exon_6399493_6399649:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377842:exon_6399493_6399649:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000361521:exon_6399493_6399649:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000473466:exon_6399493_6399649:ACOT7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	6704635	A/G	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6704618_6704734:DNAJC11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	8418542	G/A	1	14	8	22	6.67981464690569	4.18296305891103	2.49685158799466	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.393877834025079	ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	9658593	G/A	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000188807:ENST00000377376:exon_9658507_9658683:TMEM201;ENSG00000188807:ENST00000340381:exon_9658507_9658683:TMEM201;ENSG00000188807:ENST00000340305:exon_9658507_9658683:TMEM201;ENSG00000188807:ENST00000416541:exon_9658507_9658683:TMEM201
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	9778862	C/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9778752_9778973:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9778752_9778973:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9778752_9778973:PIK3CD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	9784423	C/T	1	14	12	26	6.67981464690569	6.27444458836655	0.405370058539147	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	9804558	C/T	1	8	12	20	3.81703694108897	6.27444458836655	-2.45740764727758	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.371138995758136	ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	9809657	C/T	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9809519_9809704:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9809519_9809704:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9809519_9809704:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9809519_9809704:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000464286:exon_9809546_9809704:CLSTN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	9811541	A/G	1	13	9	22	6.20268502926957	4.70583344127491	1.49685158799466	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.670537930867177	ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	10468164	A/C	1	100	66	166	47.7129617636121	34.509445236016	13.2035165275961	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0432565587912595	ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10468128_10468197:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10468128_10468197:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10468128_10468197:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10468128_10468197:PGD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	11708736	T/C	1	2	10	12	0.954259235272242	5.22870382363879	-4.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0179928301605514	ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12009911	G/A	1	7	14	21	3.33990732345285	7.32018535309431	-3.98027802964146	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.124227497168679	ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12034805	T/C	1	55	57	112	26.2421289699867	29.8036117947411	-3.56148282475444	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.50939077824006	ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12065841	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000376337:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000376320:exon_12065768_12065988:MFN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12198297	T/C	1	24	22	46	11.4511108232669	11.5031484120053	-0.0520375887384326	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12248942	A/G	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12252955	T/G	1	10	12	22	4.77129617636121	6.27444458836655	-1.50314841200534	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.531359102425708	ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12252988	G/A	1	10	13	23	4.77129617636121	6.79731497073043	-2.02601879436922	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.41269190582082	ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12253062	G/A	1	15	9	24	7.15694426454182	4.70583344127491	2.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.414521773200192	ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	12638964	T/C	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000162496:ENST00000376223:exon_12638746_12638984:DHRS3;ENSG00000162496:ENST00000430996:exon_12638746_12638984:DHRS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	14105298	G/A	1	5	15	20	2.38564808818061	7.84305573545818	-5.45740764727758	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0227002608973737	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	14105378	A/T	1	8	12	20	3.81703694108897	6.27444458836655	-2.45740764727758	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.371138995758136	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	14108712	C/T	1	16	6	22	7.63407388217794	3.13722229418327	4.49685158799466	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0578567641132185	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	14109114	A/G	1	10	13	23	4.77129617636121	6.79731497073043	-2.02601879436922	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.41269190582082	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	16577908	G/C	1	28	17	45	13.3596292938114	8.88879650018594	4.47083279362545	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.232228239659104	ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	17313654	C/T	1	18	20	38	8.58833311745018	10.4574076472776	-1.8690745298274	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.626949445873145	ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	17314702	C/T	1	24	15	39	11.4511108232669	7.84305573545818	3.60805508780872	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.265605990318471	ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	17380507	G/C	1	30	22	52	14.3138885290836	11.5031484120053	2.81074011707829	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.488717321749596	ENSG00000117118:ENST00000375499:exon_17380443_17380665:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000466613:exon_17380443_17380526:SDHB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19407866	T/A	1	86	76	162	41.0331471167064	39.7381490596548	1.29499805705161	A:T:C	T	A	10	0.522870382363879	0.875150224841098	ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19407843_19408067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375225:exon_19407843_19408734:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19407843_19408067:UBR4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19413261	T/A	1	28	28	56	13.3596292938114	14.6403707061886	-1.28074141237722	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.789623633937284	ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19415304	C/T	1	30	44	74	14.3138885290836	23.0062968240107	-8.69240829492704	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.047758452367701	ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19584004	G/A	1	79	62	141	37.6932397932536	32.4179637065605	5.27527608669307	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.399682438471962	ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19595194	A/G	0	11	0	11	5.24842579399733	0	5.24842579399733	A	A		10	0.522870382363879	0.00109035227886462	ENSG00000211454:ENST00000457194:exon_19595066_19595195:AKR7L;ENSG00000211454:ENST00000429712:exon_19595066_19595195:AKR7L;ENSG00000211454:ENST00000388886:exon_19595066_19595195:AKR7L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19634705	C/T	1	36	40	76	17.1766662349004	20.9148152945552	-3.7381490596548	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.422422978200833	ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634233_19634756:AKR7A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19634964	C/G	1	23	25	48	10.9739812056308	13.071759559097	-2.09777835346619	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.566100280837516	ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634949_19634999:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19652834	G/A	1	4	13	17	1.90851847054448	6.79731497073043	-4.88879650018594	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0260745260759215	ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19652739_19652881:PQLC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	19950062	T/C	1	106	153	259	50.5757394694288	79.9991685016735	-29.4234290322446	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.000293150111919401	ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	20977000	A/C	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	20977043	G/A	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	20980231	G/A	1	94	80	174	44.8501840577954	41.8296305891103	3.02055346868507	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.704472046703444	ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20979991_20980267:DDOST
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	21180139	G/A	1	2	9	11	0.954259235272242	4.70583344127491	-3.75157420600267	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0318932346368143	ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21180053_21180170:EIF4G3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	23419806	A/C	1	20	2	22	9.54259235272242	1.04574076472776	8.49685158799466	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.000161867964875270	ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	23885480	A/C	1	64	75	139	30.5362955287117	39.2152786772909	-8.67898314857917	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.149211397398090	ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24077554	T/C	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24123210	G/A	1	19	40	59	9.0654627350863	20.9148152945552	-11.8493525594689	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00245337264327349	ENSG00000117308:ENST00000481736:exon_24123187_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000426964:exon_24123187_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000313298:exon_24123187_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000374498:exon_24123187_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000374497:exon_24123187_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000456977:exon_24123187_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000459934:exon_24122999_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000469556:exon_24122494_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000429356:exon_24123187_24123272:GALE;ENSG00000117308:ENST00000418277:exon_24123187_24123272:GALE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24200969	T/C	1	16	1	17	7.63407388217794	0.522870382363879	7.11120349981406	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.000337042918951798	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24200983	C/T	1	16	1	17	7.63407388217794	0.522870382363879	7.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000337042918951798	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201094	G/C	1	24	12	36	11.4511108232669	6.27444458836655	5.17666623490036	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.095825393535382	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201109	C/T	1	25	9	34	11.928240440903	4.70583344127491	7.22240699962812	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0153705845731836	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201262	A/G	1	19	6	25	9.0654627350863	3.13722229418327	5.92824044090303	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0256184525792301	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201357	A/G	1	13	10	23	6.20268502926957	5.22870382363879	0.973981205630785	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.835286047198067	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201448	C/T	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201643	G/A	1	13	10	23	6.20268502926957	5.22870382363879	0.973981205630785	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.835286047198067	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201911	C/T	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201919	T/C	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	24201920	T/C	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	25554663	C/T	1	117	119	236	55.8241652634262	62.2215755013016	-6.39741023787543	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.43433308368103	ENSG00000117614:ENST00000236273:exon_25554609_25554726:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000354361:exon_25554609_25554726:SYF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	26150202	A/G	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000255054:ENST00000527604:exon_26150135_26150235:RP1-317E23.6;ENSG00000255054:ENST00000524937:exon_26150135_26150235:RP1-317E23.6;ENSG00000117640:ENST00000424294:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000336146:exon_26150112_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374303:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000432144:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000533762:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000529116:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000474295:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000488327:exon_26150112_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000472643:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000494293:exon_26149510_26150238:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000469815:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000526894:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000478284:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000524618:exon_26150112_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374307:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000528624:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000525713:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374301:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000464008:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000526158:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000530599:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374300:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000466284:exon_26150135_26150239:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000531361:exon_26150135_26150239:FAM54B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	26189652	C/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000182749:ENST00000374296:exon_26187701_26190352:PAQR7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	26609259	C/T	1	20	22	42	9.54259235272242	11.5031484120053	-1.96055605928292	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.643620805806273	ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	26786627	G/A	1	17	14	31	8.11120349981406	7.32018535309431	0.791018146719753	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.858174971305446	ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	26887592	T/C	1	26	25	51	12.4053700585391	13.071759559097	-0.666389500557825	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.889116033610246	ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	26900735	C/G	1	111	72	183	52.9613875576094	37.6466675301993	15.3147200274102	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0261959654419035	ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	27679797	A/G	1	24	12	36	11.4511108232669	6.27444458836655	5.17666623490036	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.095825393535382	ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	27680292	A/G	1	17	35	52	8.11120349981406	18.3004633827358	-10.1892598829217	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00520234055938179	ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	28206348	T/C	1	58	34	92	27.673517822895	17.7775930003719	9.89592482252314	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0468221308751909	ENSG00000130775:ENST00000373925:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373919:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000427466:exon_28206155_28206459:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000466068:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28206242_28206565:C1orf38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	28209305	A/G	1	72	62	134	34.3533324698007	32.4179637065605	1.93536876324023	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.795440860216941	ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	28209362	T/C	1	81	58	139	38.6474990285258	30.326482177105	8.32101685142083	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.174297018294062	ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	28833894	C/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	28861636	G/A	1	9	10	19	4.29416655872509	5.22870382363879	-0.9345372649137	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.819184206292418	ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	28864435	A/G	1	26	22	48	12.4053700585391	11.5031484120053	0.90222164653381	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.885381060616772	ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28864344_28865607:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28864344_28865607:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28864344_28865607:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28864344_28865502:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28864344_28865495:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28864344_28865607:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28864344_28864676:RCC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	31215364	T/C	1	305	279	584	145.524533379017	145.880836679522	-0.356303300505289	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	31897643	G/A	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31897530_31897720:SERINC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	32667609	C/T	1	161	155	316	76.8178684394155	81.0449092664012	-4.22704082698574	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.652543154084556	ENSG00000160050:ENST00000373602:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000469003:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000421922:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000461819:exon_32667514_32667700:CCDC28B;ENSG00000160050:ENST00000483009:exon_32667297_32667700:CCDC28B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	32800687	G/A	1	322	294	616	153.635736878831	153.72389241498	-0.0881555361494293	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000175130:ENST00000329421:exon_32799433_32800698:MARCKSL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	33099637	A/G	1	69	87	156	32.9219436168923	45.4897232656575	-12.5677796487651	A:T:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0452896821256751	ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000498691:exon_33099552_33099662:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473383:exon_33099552_33100123:ZBTB8OS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	35320991	G/A	1	37	39	76	17.6537958525365	20.3919449121913	-2.7381490596548	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.566754793298223	ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	35321242	A/C	1	47	40	87	22.4250920288977	20.9148152945552	1.51027673434253	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.830197220360013	ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	35658456	T/G	1	31	29	60	14.7910181467198	15.1632410885525	-0.372222941832737	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000116560:ENST00000357214:exon_35657823_35658749:SFPQ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	36557619	G/A	1	47	50	97	22.4250920288977	26.1435191181939	-3.71842708929626	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.477595610914102	ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	36752433	C/T	1	25	23	48	11.928240440903	12.0260187943692	-0.0977783534661896	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	36752687	A/G	1	17	28	45	8.11120349981406	14.6403707061886	-6.52916720637455	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0535757848125751	ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	36814305	G/A	1	10	3	13	4.77129617636121	1.56861114709164	3.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0966692698681595	ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36814301_36814416:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36814301_36814416:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36814301_36814416:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36814301_36814416:STK40;ENSG00000196182:ENST00000425273:exon_36814301_36814416:STK40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	38327982	G/T	1	21	23	44	10.0197219703585	12.0260187943692	-2.00629682401067	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.550605760658815	ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	38338795	A/G	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	38449910	T/C	1	32	28	60	15.2681477643559	14.6403707061886	0.627777058167263	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.897839155420436	ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000489537:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000461869:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000470585:exon_38449841_38449932:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000462258:exon_38449790_38449932:SF3A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	38464670	C/T	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38464646_38464820:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38464646_38464820:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38464646_38464820:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38464646_38464820:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000483132:exon_38464390_38464820:FHL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	40315888	A/T	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000469476:exon_40315795_40315933:TRIT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	40768855	G/A	1	25	17	42	11.928240440903	8.88879650018594	3.03944394071709	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.359371060490911	ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768803_40768857:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768803_40768857:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768803_40768857:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768803_40768857:COL9A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	40773119	G/T	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	40980731	G/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	41976217	G/A	1	30	29	59	14.3138885290836	15.1632410885525	-0.849352559468858	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.896510843758925	ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	41976575	A/G	1	17	11	28	8.11120349981406	5.75157420600267	2.35962929381139	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.450663887484502	ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	41976665	G/A	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	41979162	C/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	42880177	G/A	1	23	19	42	10.9739812056308	9.9345372649137	1.03944394071708	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.760367147756807	ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	42922558	T/G	1	22	13	35	10.4968515879947	6.79731497073043	3.69953661726424	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.238433136998935	ENSG00000127125:ENST00000372560:exon_42922210_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000472013:exon_42922215_42923021:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000435501:exon_42922215_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000372561:exon_42922230_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000471420:exon_42922472_42922744:PPCS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	43215930	C/T	1	21	13	34	10.0197219703585	6.79731497073043	3.22240699962812	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.305367459084132	ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	43392895	G/A	1	33	38	71	15.745277381992	19.8690745298274	-4.12379714783541	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.343717394763691	ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43391519_43392912:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43391519_43392912:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43391826_43392912:SLC2A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	43394612	T/C	1	26	29	55	12.4053700585391	15.1632410885525	-2.75787103001334	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.500866688341027	ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394603_43394704:SLC2A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	43394666	G/A	1	14	19	33	6.67981464690569	9.9345372649137	-3.25472261800801	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.297233008754451	ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394603_43394704:SLC2A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	43394887	G/A	1	11	16	27	5.24842579399733	8.36592611782206	-3.11750032382473	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.252042558114459	ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43394819_43394985:SLC2A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	44137291	G/A	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	44438237	T/C	1	9	19	28	4.29416655872509	9.9345372649137	-5.64037070618861	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0374013011231895	ENSG00000132768:ENST00000255108:exon_44438087_44439041:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000524776:exon_44438087_44438393:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000495421:exon_44438087_44439041:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000412950:exon_44438087_44439041:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000396758:exon_44438087_44439012:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000459879:exon_44438087_44438435:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000527319:exon_44438087_44438480:DPH2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	44680474	A/G	1	33	23	56	15.745277381992	12.0260187943692	3.71925858762278	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.350684392652844	ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000440641:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000436069:exon_44680375_44680552:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000437511:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000475794:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000471829:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000487922:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372290:exon_44680375_44680570:DMAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	44684736	G/A	1	57	62	119	27.1963882052589	32.4179637065605	-5.22157550130159	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.359404789632356	ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000437511:exon_44684728_44684786:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000488433:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000483741:exon_44684728_44684913:DMAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	45110683	G/A	1	25	17	42	11.928240440903	8.88879650018594	3.03944394071709	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.359371060490911	ENSG00000187147:ENST00000355387:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000416840:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000361799:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000453887:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372247:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000443020:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372248:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000440132:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000335497:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474064:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000471494:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000444372:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000497469:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000475378:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000484745:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474394:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000480686:exon_45110667_45110753:RNF220
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	45218895	A/T	1	14	16	30	6.67981464690569	8.36592611782206	-1.68611147091637	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.58637220827639	ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	45340401	C/T	1	26	25	51	12.4053700585391	13.071759559097	-0.666389500557825	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.889116033610246	ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000439363:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000486491:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45340199_45340498:EIF2B3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	45469155	C/T	1	19	22	41	9.0654627350863	11.5031484120053	-2.43768567691904	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.532306974462956	ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	45469586	G/A	1	11	21	32	5.24842579399733	10.9802780296415	-5.73185223564413	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0509697665085553	ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	45479709	A/G	1	68	72	140	32.4448139992562	37.6466675301993	-5.20185353094305	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.398141246384477	ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	45480502	A/G	1	175	142	317	83.4976830863212	74.2475942956708	9.25008879065038	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.311729856830494	ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372139:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000472254:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000466193:exon_45480211_45480678:UROD;ENSG00000126088:ENST00000465678:exon_45480219_45480508:UROD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	45797505	C/G	1	26	16	42	12.4053700585391	8.36592611782206	4.03944394071709	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.220976463724637	ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	46073489	G/A	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	46500613	T/C	1	6	14	20	2.86277770581673	7.32018535309431	-4.45740764727758	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0706835394284982	ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	46501599	G/A	1	51	45	96	24.3336104994422	23.5291672063746	0.804443293067621	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.918772797890426	ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000468212:exon_46501486_46501896:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46501171_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46501567_46501795:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	47119531	C/T	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000123472:ENST00000371937:exon_47119489_47119539:ATPAF1;ENSG00000123472:ENST00000526821:exon_47119489_47119539:ATPAF1;ENSG00000123472:ENST00000529214:exon_47119489_47119539:ATPAF1;ENSG00000123472:ENST00000329231:exon_47119489_47119539:ATPAF1;ENSG00000123472:ENST00000532925:exon_47119489_47119539:ATPAF1;ENSG00000123472:ENST00000474020:exon_47119489_47119539:ATPAF1;ENSG00000123472:ENST00000487193:exon_47119489_47119539:ATPAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	52271205	C/T	1	31	15	46	14.7910181467198	7.84305573545818	6.94796241126157	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0538383363542821	ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52271182_52271233:NRD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	52344087	G/A	1	15	20	35	7.15694426454182	10.4574076472776	-3.30046338273576	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.310917875200232	ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52343947_52344477:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52343947_52344477:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52343947_52344386:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000491410:exon_52343947_52344443:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000468722:exon_52343947_52344395:NRD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	52344245	T/G	1	17	15	32	8.11120349981406	7.84305573545818	0.268147764355874	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52343947_52344477:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52343947_52344477:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52343947_52344386:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000491410:exon_52343947_52344443:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000468722:exon_52343947_52344395:NRD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	52498861	A/T	1	16	29	45	7.63407388217794	15.1632410885525	-7.52916720637455	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.0256474693469816	ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	52499362	C/G	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	53153432	T/C	1	11	7	18	5.24842579399733	3.66009267654715	1.58833311745018	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.489005913678072	ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	53446142	C/T	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53446068_53446215:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000408941:exon_53446068_53446215:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53446068_53446215:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53446068_53446215:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53446068_53446215:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53446068_53446215:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371513:exon_53446068_53446215:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000473584:exon_53446068_53446215:SCP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	53516383	C/A	1	31	28	59	14.7910181467198	14.6403707061886	0.150647440531142	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53516281_53517375:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53516281_53517073:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53516281_53516575:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53516281_53516642:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53516281_53516932:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000430330:exon_53516281_53516798:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000484100:exon_53516281_53516690:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000533119:exon_53516281_53516734:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000435345:exon_53516281_53516785:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000488965:exon_53513530_53517282:SCP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	53676448	G/A	1	5	12	17	2.38564808818061	6.27444458836655	-3.88879650018594	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0866683893241667	ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	53679229	A/G	1	35	49	84	16.6995366172642	25.6206487358301	-8.92111211856583	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0627343280637954	ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	53681699	T/G	1	46	38	84	21.9479624112616	19.8690745298274	2.07888788143417	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.66391307921982	ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	54293811	T/C	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000058804:ENST00000371429:exon_54293672_54293846:TMEM48;ENSG00000058804:ENST00000360494:exon_54293672_54293846:TMEM48;ENSG00000058804:ENST00000234725:exon_54293672_54293846:TMEM48;ENSG00000058804:ENST00000480952:exon_54293672_54293846:TMEM48
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	54432019	G/A	1	40	30	70	19.0851847054448	15.6861114709164	3.39907323452847	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.473269234677975	ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	54670786	G/A	1	134	150	284	63.9353687632402	78.4305573545818	-14.4951885913416	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0960915933017927	ENSG00000116221:ENST00000487096:exon_54670691_54670874:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54670691_54670874:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000490670:exon_54670691_54670874:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54670691_54670874:MRPL37
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	54681920	G/C	1	200	188	388	95.4259235272242	98.2996318844092	-2.87370835718502	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.799466532123576	ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	54683856	C/G	1	321	363	684	153.158607261195	189.801948798088	-36.6433415368932	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.00518659979993673	ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	64034059	G/A	1	9	7	16	4.29416655872509	3.66009267654715	0.634073882177937	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.806882383309564	ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_64033981_64034190:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_64033981_64034190:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000460678:exon_64033981_64034190:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000461039:exon_64033981_64036799:EFCAB7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	64114301	T/C	1	49	73	122	23.3793512641699	38.1695379125632	-14.7901866483932	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.00837442219610688	ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	64120039	G/A	1	50	61	111	23.8564808818061	31.8950933241966	-8.03861244239056	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.129508845164079	ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000483707:exon_64120003_64120116:PGM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	67861520	C/A	1	29	10	39	13.8367589114475	5.22870382363879	8.60805508780872	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0060317459245078	ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	75175886	T/C	1	15	29	44	7.15694426454182	15.1632410885525	-8.00629682401067	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0224808235053412	ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	75214441	A/G	1	21	38	59	10.0197219703585	19.8690745298274	-9.84935255946886	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0126974349918949	ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	78163080	C/T	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78161672_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78161676_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78161676_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78161676_78163159:USP33
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	79093818	A/G	1	9	47	56	4.29416655872509	24.5749079711023	-20.2807414123772	A:G	A	G	10	0.522870382363879	2.4542176148607e-08	ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	79095581	T/C	1	57	132	189	27.1963882052589	69.018890472032	-41.8225022667731	T:C	T	C	10	0.522870382363879	8.68613677036418e-10	ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	79115961	C/G	1	37	34	71	17.6537958525365	17.7775930003719	-0.123797147835404	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	84961108	G/A	1	37	36	73	17.6537958525365	18.8233337650996	-1.16953791256316	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.815397312858432	ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84961056_84961138:RPF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	85029067	C/T	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	86818572	T/C	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	89426902	G/A	1	24	8	32	11.4511108232669	4.18296305891103	7.26814776435587	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0122153315931848	ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	93300404	T/C	1	1524	1907	3431	727.145537277449	997.113819167917	-269.968281890469	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	3.16582329951258e-20	ENSG00000122406:ENST00000432788:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000370321:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000470843:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000490963:exon_93300336_93300444:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000315741:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000461952:exon_93300336_93300470:RPL5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	93672688	C/T	1	18	14	32	8.58833311745018	7.32018535309431	1.26814776435587	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.725074190491161	ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	93672723	A/C	1	15	12	27	7.15694426454182	6.27444458836655	0.882499676175268	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.847915973483971	ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	93720070	C/G	1	18	6	24	8.58833311745018	3.13722229418327	5.45111082326691	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0387390654122716	ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	93720153	G/T	1	9	15	24	4.29416655872509	7.84305573545818	-3.54888917673309	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.157923377654149	ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93720074_93720171:CCDC18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	94342564	C/A	1	33	33	66	15.745277381992	17.254722618008	-1.50944523601601	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.713752347339611	ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	94343023	A/G	1	23	21	44	10.9739812056308	10.9802780296415	-0.00629682401067377	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	94344716	C/T	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	95709939	T/G	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000122481:ENST00000370202:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000263893:exon_95709767_95710271:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000429514:exon_95709767_95710207:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000492639:exon_95709767_95709967:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000495272:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000419345:exon_95709767_95710271:RWDD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	109461341	C/T	1	16	3	19	7.63407388217794	1.56861114709164	6.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00517941383531749	ENSG00000121957:ENST00000406462:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000264126:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000369987:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000431112:exon_109461235_109461411:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000441735:exon_109461235_109461411:GPSM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	109824361	A/C	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000134222:ENST00000369909:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369904:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000409267:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369907:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000438534:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000492431:exon_109824241_109825041:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000409138:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369903:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000429031:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000418914:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000474126:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000459765:exon_109824026_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000471740:exon_109824241_109824682:PSRC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	110091282	C/T	1	15	4	19	7.15694426454182	2.09148152945552	5.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0215503033329652	ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	110170896	T/C	1	23	8	31	10.9739812056308	4.18296305891103	6.79101814671975	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.018207423537365	ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	110173775	G/T	1	31	39	70	14.7910181467198	20.3919449121913	-5.60092676547153	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.189664047476084	ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	110888948	G/A	1	20	29	49	9.54259235272242	15.1632410885525	-5.62064873583007	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.116892902624054	ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	111738589	A/T	1	14	5	19	6.67981464690569	2.61435191181939	4.0654627350863	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.0687759392848526	ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111738538_111738678:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111738538_111738678:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000473682:exon_111738538_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000463713:exon_111738536_111738678:DENND2D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	111783981	G/A	1	45	823	868	21.4708327936254	430.322324685472	-408.851491891847	A:G	G	A	10	0.522870382363879	4.83275528611304e-202	ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	112002075	C/T	0	0	15	15	0	7.84305573545818	-7.84305573545818	A	C	A	10	0.522870382363879	1.51197858781195e-05	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	112002207	C/T	1	343	367	710	163.65545884919	191.893430327544	-28.237971478354	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0353564280466234	ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_112002079_112002258:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_112002079_112002258:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000483994:exon_112002079_112002258:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000468818:exon_112002079_112002258:ATP5F1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	112308900	C/T	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	112309123	C/A	1	16	16	32	7.63407388217794	8.36592611782206	-0.731852235644126	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.86041203391569	ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	112309331	T/C	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	113239382	G/A	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	114454598	G/A	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114453753_114456708:DCLRE1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	115260781	T/G	1	227	245	472	108.308423203399	128.10324367915	-19.7948204757509	A:T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0722743026717869	ENSG00000009307:ENST00000339438:exon_115259534_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000438362:exon_115259537_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000358528:exon_115259538_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369533:exon_115259538_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000261443:exon_115259916_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000530886:exon_115259926_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000369530:exon_115259933_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000483407:exon_115260423_115260837:CSDE1;ENSG00000009307:ENST00000534699:exon_115260578_115260837:CSDE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	115316860	T/C	1	13	15	28	6.20268502926957	7.84305573545818	-1.64037070618861	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.574266908162175	ENSG00000052723:ENST00000369528:exon_115312100_115316993:SIKE1;ENSG00000052723:ENST00000060969:exon_115315396_115316993:SIKE1;ENSG00000052723:ENST00000369524:exon_115316763_115316993:SIKE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	117078729	A/G	1	38	58	96	18.1309254701726	30.326482177105	-12.1955567069324	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0139961274145618	ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117078587_117078850:CD58
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	117618024	G/C	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	117635507	T/C	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117635353_117635523:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000492682:exon_117635409_117635523:TTF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	118491102	G/A	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118491028_118491129:WDR3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	118495153	T/G	1	22	8	30	10.4968515879947	4.18296305891103	6.31388852908363	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0268893224706540	ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	144909956	G/A	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	144912233	C/T	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	C	C		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	145103947	T/C	0	0	38	38	0	19.8690745298274	-19.8690745298274	C	T	C	10	0.522870382363879	6.14019678874199e-13	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	145109549	G/T	0	0	26	26	0	13.5946299414609	-13.5946299414609	T	G	T	10	0.522870382363879	4.41108856442101e-09	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	145109583	C/A	0	0	31	31	0	16.2089818532802	-16.2089818532802	A	C	A	10	0.522870382363879	1.09075611843924e-10	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	145109661	G/A	0	49	0	49	23.3793512641699	0	23.3793512641699	G	G		10	0.522870382363879	2.56950141049621e-14	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	145112414	T/C	0	0	34	34	0	17.7775930003719	-17.7775930003719	C	T	C	10	0.522870382363879	1.18477746727691e-11	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	145112485	C/T	0	0	52	52	0	27.1892598829217	-27.1892598829217	T	C	T	10	0.522870382363879	1.94577023231658e-17	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	145440096	G/A	1	13	8	21	6.20268502926957	4.18296305891103	2.01972197035854	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.393789904615872	ENSG00000117289:ENST00000369317:exon_145440038_145440140:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000425134:exon_145440038_145440140:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000488537:exon_145440038_145440788:TXNIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	145460212	C/T	1	23	17	40	10.9739812056308	8.88879650018594	2.08518470544484	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.531049635255258	ENSG00000121851:ENST00000369314:exon_145460097_145460263:POLR3GL;ENSG00000121851:ENST00000369313:exon_145460097_145460263:POLR3GL;ENSG00000121851:ENST00000471706:exon_145460097_145460263:POLR3GL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	146757031	A/G	1	44	36	80	20.9937031759893	18.8233337650996	2.17036941088968	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.655643892355536	ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146757001_146757164:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146757001_146757164:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146757001_146757164:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146757001_146757164:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146757001_146757052:CHD1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	146763171	T/A	1	23	27	50	10.9739812056308	14.1175003238247	-3.14351911819395	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.398040038374464	ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146763164_146763234:CHD1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	147096794	A/G	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147095643_147098017:BCL9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	147120171	C/A	1	10	24	34	4.77129617636121	12.5488891767331	-7.77759300037188	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.00924236479556765	ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147120048_147120213:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147120048_147120213:ACP6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	147124310	T/G	1	7	18	25	3.33990732345285	9.41166688254982	-6.07175955909697	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0162961408859962	ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147124252_147124352:ACP6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150129593	G/A	1	156	128	284	74.4322203512349	66.9274089425765	7.50481140865838	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.405667275910713	ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150129566_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000485470:exon_150129211_150129680:PLEKHO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150131342	G/A	1	311	240	551	148.387311084834	125.488891767331	22.8984193175027	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0548841712029799	ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150239478	T/G	1	81	97	178	38.6474990285258	50.7184270892963	-12.0709280607704	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0720354438294454	ENSG00000117362:ENST00000414276:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000452164:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000433443:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000369109:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000360244:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000461320:exon_150239475_150239654:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000236017:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000486308:exon_150239356_150239878:APH1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150280550	G/A	1	401	460	861	191.328976672085	240.520375887384	-49.1913992152998	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.000821138631690721	ENSG00000187145:ENST00000309092:exon_150280482_150281414:MRPS21;ENSG00000187145:ENST00000369084:exon_150280482_150281414:MRPS21
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150785747	T/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150785648_150785814:ARNT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150938616	G/A	1	38	36	74	18.1309254701726	18.8233337650996	-0.692408294927041	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.907663471275652	ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150937649_150938764:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150937649_150938764:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150937739_150938764:LASS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150939264	A/G	1	16	18	34	7.63407388217794	9.41166688254982	-1.77759300037188	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.608049526191679	ENSG00000143418:ENST00000482825:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496901:exon_150939232_150939427:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150939232_150939338:LASS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150939318	G/A	1	22	10	32	10.4968515879947	5.22870382363879	5.26814776435587	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0761276910981834	ENSG00000143418:ENST00000482825:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496901:exon_150939232_150939427:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496562:exon_150939272_150939678:LASS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	150970577	G/T	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000143409:ENST00000493834:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000361936:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000312210:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000361738:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000368945:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000497067:exon_150970558_150970646:FAM63A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151006539	C/A	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151089888	A/C	1	13	1	14	6.20268502926957	0.522870382363879	5.6798146469057	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.00209046197359406	ENSG00000143458:ENST00000368918:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368917:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368916:exon_151089868_151089992:GABPB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151139822	A/G	1	167	200	367	79.6806461452322	104.574076472776	-24.8934303275436	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0103632531221798	ENSG00000163156:ENST00000461862:exon_151139802_151140455:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368905:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368902:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000497147:exon_151139802_151139890:SCNM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151149487	A/G	1	58	60	118	27.673517822895	31.3722229418327	-3.69870511893772	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.519610278023573	ENSG00000163159:ENST00000491094:exon_151146867_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000368892:exon_151148780_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000354473:exon_151148938_151149540:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000496809:exon_151149207_151149507:VPS72
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151209063	C/T	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151237908	G/A	1	76	87	163	36.2618509403452	45.4897232656575	-9.22787232531227	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.158287946671456	ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000462970:exon_151237870_151238064:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000437736:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000491857:exon_151237720_151238085:PSMD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151239051	T/C	1	436	374	810	208.028513289349	195.553523004091	12.4749902852581	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.398597031129788	ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151239720	G/A	1	450	355	805	214.708327936254	185.618985739177	29.0893421970775	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.040733772967643	ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151239649_151239955:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151239649_151239935:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151239649_151239942:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239649_151239936:PSMD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151262977	C/T	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151262847_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151262847_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000436614:exon_151262927_151263049:ZNF687
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151316161	G/A	1	33	32	65	15.745277381992	16.7318522356441	-0.986574853652131	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.805520922968608	ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000436637:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452513:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151316157_151316358:RFX5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151735576	T/C	1	65	44	109	31.0134251463479	23.0062968240107	8.00712832233719	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.126329872806431	ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151955625	C/T	1	50	47	97	23.8564808818061	24.5749079711023	-0.718427089296256	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.919221256316432	ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	151955747	A/G	1	42	51	93	20.0394439407171	26.6663895005578	-6.62694555984074	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.178110756164359	ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000478574:exon_151955708_151955800:S100A10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	152009397	A/C	1	144	161	305	68.7066649396014	84.1821315605845	-15.4754666209831	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.085338840602111	ENSG00000163191:ENST00000271638:exon_152009389_152009511:S100A11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	153516358	G/A	1	141	163	304	67.2752760866931	85.2278723253123	-17.9525962386192	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.044310906247054	ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153516089_153516415:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153516097_153516399:S100A4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	153517172	T/C	1	107	99	206	51.052869087065	51.764167854024	-0.711298766959061	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.944455911494461	ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153517130_153517573:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153517130_153517285:S100A4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	153631198	T/C	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000143553:ENST00000368685:exon_153631130_153631362:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000474959:exon_153631188_153631660:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000462880:exon_153631190_153631362:SNAPIN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	153640968	C/T	1	52	24	76	24.8107401170783	12.5488891767331	12.2618509403452	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00554596487611374	ENSG00000143621:ENST00000361891:exon_153640929_153641033:ILF2;ENSG00000143621:ENST00000368684:exon_153640929_153641052:ILF2;ENSG00000143621:ENST00000368681:exon_153640929_153641033:ILF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	153744371	C/T	1	33	22	55	15.745277381992	11.5031484120053	4.24212896998666	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.281391466865713	ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153744272_153744439:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744272_153744439:INTS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	153745128	G/C	1	47	48	95	22.4250920288977	25.0977783534662	-2.6726863245685	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.608522899307981	ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	153920564	A/G	1	80	60	140	38.1703694108897	31.3722229418327	6.79814646905695	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.271655225365597	ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	153941514	C/T	1	5	12	17	2.38564808818061	6.27444458836655	-3.88879650018594	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0866683893241667	ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154209584	T/C	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000143569:ENST00000343815:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000271877:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000428931:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000368505:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000433006:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000456955:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000412596:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000368504:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000437652:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000456325:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000361546:exon_154209500_154209612:UBAP2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154573967	T/C	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154744807	C/G	1	22	25	47	10.4968515879947	13.071759559097	-2.57490797110231	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.468822079513507	ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154744852	A/G	1	25	20	45	11.928240440903	10.4574076472776	1.47083279362545	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.765776887066167	ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154904840	T/C	1	75	61	136	35.7847213227091	31.8950933241966	3.88962799851247	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.548181326285602	ENSG00000163344:ENST00000368467:exon_154904828_154904891:PMVK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154938235	G/C	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000490667:exon_154938115_154938238:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938019_154938257:SHC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154938662	T/C	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000414115:exon_154938638_154938707:SHC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154987526	C/T	1	1	8	9	0.477129617636121	4.18296305891103	-3.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0168420576576534	ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	154988957	A/G	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	155230131	C/T	1	67	67	134	31.9676843816201	35.0323156183799	-3.06463123675978	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.604945063974149	ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	155296891	C/T	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000160753:ENST00000368354:exon_155296689_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368352:exon_155296371_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000392405:exon_155296689_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000292253:exon_155296371_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000484664:exon_155296689_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368347:exon_155296371_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000462780:exon_155295655_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000368349:exon_155296371_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000490373:exon_155296371_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000479924:exon_155296689_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000471876:exon_155296689_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000292254:exon_155296371_155296923:RUSC1;ENSG00000160753:ENST00000485924:exon_155296401_155296923:RUSC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	155638484	A/G	1	23	17	40	10.9739812056308	8.88879650018594	2.08518470544484	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.531049635255258	ENSG00000163374:ENST00000359205:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000355499:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000311573:exon_155638418_155638508:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000347088:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361831:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368340:exon_155638418_155638508:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000295566:exon_155638418_155638508:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000436865:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000354691:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000442834:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368330:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000407221:exon_155638418_155638508:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000404643:exon_155638418_155638508:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361140:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368339:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000405763:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000488784:exon_155638418_155638568:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000477470:exon_155638418_155638508:YY1AP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	155708019	T/A	1	145	122	267	69.1837945572375	63.7901866483932	5.39360790884432	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.540247281644747	ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155707948_155708801:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155707948_155708317:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000421487:exon_155707948_155708317:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000477394:exon_155707948_155708217:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000475056:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000490249:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000463295:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000476444:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000491777:exon_155707948_155708088:DAP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	156105028	T/C	1	119	123	242	56.7784244986984	64.3130570307571	-7.5346325320587	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.335239711188129	ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	156230272	C/T	1	9	2	11	4.29416655872509	1.04574076472776	3.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0684680229761391	ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156230242_156230417:SMG5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	156450719	G/A	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	157494217	A/G	1	77	34	111	36.7389805579813	17.7775930003719	18.9613875576094	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.000283061693913591	ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	157514233	A/G	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157514052_157514336:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157514052_157514336:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157514052_157514336:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157514052_157514336:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000481082:exon_157514052_157514336:FCRL5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	158813819	A/G	1	61	28	89	29.1049066758034	14.6403707061886	14.4645359696148	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00203028339479209	ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	159002377	C/A	1	144	124	268	68.7066649396014	64.835927413121	3.87073752648045	A:T:C	C	A	10	0.522870382363879	0.668752922026755	ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	159002389	T/A	1	134	112	246	63.9353687632402	58.5614828247544	5.37388593848578	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.523469291099439	ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	159043041	C/T	1	27	5	32	12.8824996761753	2.61435191181939	10.2681477643559	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000253825873346813	ENSG00000163568:ENST00000368130:exon_159043028_159043309:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000481829:exon_159043028_159043055:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000411768:exon_159043028_159043309:AIM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	160063843	C/T	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000162729:ENST00000314485:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000368086:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000358475:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000448417:exon_160063500_160063961:IGSF8;ENSG00000162729:ENST00000460351:exon_160063550_160063961:IGSF8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	160466004	C/T	1	7	13	20	3.33990732345285	6.79731497073043	-3.45740764727758	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.177899741067494	ENSG00000162739:ENST00000368059:exon_160465851_160466183:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368057:exon_160465851_160466183:SLAMF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	160604370	A/G	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	160654758	C/G	1	905	941	1846	431.80230396069	492.02102980441	-60.2187258437206	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.00516678395404439	ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	160654792	C/T	1	843	783	1626	402.22026766725	409.407509390917	-7.18724172366717	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.728213854760307	ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	160719757	C/T	1	63	64	127	30.0591659110756	33.4637044712883	-3.40453856021263	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.594259424983415	ENSG00000026751:ENST00000466792:exon_160719611_160719856:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368043:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368042:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000435517:exon_160719611_160719922:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458602:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458104:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000359331:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000495334:exon_160719611_160719883:SLAMF7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	160990875	T/C	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	T	T		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160990800_160990968:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160990800_160990933:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160990800_160990956:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160990800_160990902:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160990800_160990902:F11R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161013121	C/T	1	21	11	32	10.0197219703585	5.75157420600267	4.26814776435587	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.157292477713881	ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161017556	C/T	1	98	118	216	46.7587025283399	61.6987051189377	-14.9400025905979	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0479944081685674	ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161019040	G/C	1	100	105	205	47.7129617636121	54.9013901482073	-7.18842838459518	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.328086764989822	ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161087802	G/A	1	150	147	297	71.5694426454182	76.8619462074902	-5.29250356207204	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.56149493275906	ENSG00000143256:ENST00000468311:exon_161087742_161087845:PFDN2;ENSG00000143256:ENST00000368010:exon_161087742_161087901:PFDN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161088583	T/G	1	17	20	37	8.11120349981406	10.4574076472776	-2.34620414746352	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.511328644277425	ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000453609:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000486962:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000492411:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000478277:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000496861:exon_161088010_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000491497:exon_161088171_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161088576_161088671:NIT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161094190	A/G	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161093931_161095235:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000479728:exon_161093931_161094601:NIT1;ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000458050:exon_161094130_161094252:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000473679:exon_161094130_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161093928_161094316:DEDD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161145005	C/T	1	9	11	20	4.29416655872509	5.75157420600267	-1.45740764727758	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.655558089529074	ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161144924_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000493164:exon_161144697_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000496313:exon_161144785_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000487004:exon_161144842_161145018:B4GALT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161681087	A/G	1	59	103	162	28.1506474405311	53.8556493834795	-25.7050019429484	A:G	A	G	10	0.522870382363879	5.45271893032688e-05	ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000465403:exon_161680998_161681262:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161681780	A/G	1	119	76	195	56.7784244986984	39.7381490596548	17.0402754390436	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0147799448546278	ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161719735	G/T	1	17	14	31	8.11120349981406	7.32018535309431	0.791018146719753	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.858174971305446	ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161719548_161719935:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161719560_161719935:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161719570_161719935:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000490591:exon_161719595_161719878:DUSP12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161719736	A/T	1	17	13	30	8.11120349981406	6.79731497073043	1.31388852908363	A:T:C	A	T	10	0.522870382363879	0.716174646304455	ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161719548_161719935:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161719560_161719935:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161719570_161719935:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000490591:exon_161719595_161719878:DUSP12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161721707	C/T	1	14	13	27	6.67981464690569	6.79731497073043	-0.117500323824731	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161753802	T/C	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161753841	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161753780_161753886:ATF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161761276	G/C	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161761312	C/T	1	9	14	23	4.29416655872509	7.32018535309431	-3.02601879436922	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.218027099892575	ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161821608	C/T	1	14	6	20	6.67981464690569	3.13722229418327	3.54259235272242	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.122889322650138	ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161821512_161821625:ATF6;ENSG00000118217:ENST00000476437:exon_161821512_161821625:ATF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161830056	T/G	1	21	10	31	10.0197219703585	5.22870382363879	4.79101814671975	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.105129666936405	ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161829997_161830067:ATF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	161928327	A/G	1	53	26	79	25.2878697347144	13.5946299414609	11.6932397932536	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0092875427918587	ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	165649851	C/G	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165649724_165649920:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165649724_165649872:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165649724_165649920:ALDH9A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	167653193	C/T	1	16	11	27	7.63407388217794	5.75157420600267	1.88249967617527	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.564694319892801	ENSG00000198771:ENST00000367854:exon_167653137_167653238:RCSD1;ENSG00000198771:ENST00000361496:exon_167653137_167653238:RCSD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	167893759	G/A	1	48	44	92	22.9022216465338	23.0062968240107	-0.104075177476865	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	169660939	T/C	1	9	25	34	4.29416655872509	13.071759559097	-8.77759300037188	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00303700205867370	ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169659808_169660943:SELL;ENSG00000188404:ENST00000497295:exon_169660822_169660943:SELL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	169677709	A/G	1	105	45	150	50.0986098517927	23.5291672063746	26.5694426454182	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1.23616057046996e-05	ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	169762807	T/G	1	6	12	18	2.86277770581673	6.27444458836655	-3.41166688254982	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.155279829553550	ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	169822077	G/A	1	25	21	46	11.928240440903	10.9802780296415	0.947962411261569	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.882900587401606	ENSG00000000460:ENST00000498289:exon_169821931_169822226:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000359326:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000459772:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000286031:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000413811:exon_169821931_169822229:C1orf112;ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169821804_169822913:SCYL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	169951997	C/T	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	170521376	G/A	1	8	13	21	3.81703694108897	6.79731497073043	-2.98027802964146	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.27445798442317	ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	171483718	G/T	1	82	89	171	39.1246286461619	46.5354640303852	-7.4108353842233	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.283838157214977	ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	171496968	G/A	1	289	252	541	137.890459496839	131.763336355698	6.12712314114148	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.605779809415086	ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171496930_171496983:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171496930_171496983:BAT2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	171509327	G/A	1	83	64	147	39.601758263798	33.4637044712883	6.13805379250979	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.322735756773844	ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	171509415	C/T	1	67	74	141	31.9676843816201	38.692408294927	-6.72472391330693	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.273511251238190	ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	171556165	G/C	1	15	17	32	7.15694426454182	8.88879650018594	-1.73185223564413	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.597599372848838	ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171556142_171556360:BAT2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	171751236	T/C	1	17	30	47	8.11120349981406	15.6861114709164	-7.57490797110231	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0287371483314137	ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	171753039	A/G	1	20	23	43	9.54259235272242	12.0260187943692	-2.4834264416468	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.450864840257985	ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	171755170	G/A	1	19	32	51	9.0654627350863	16.7318522356441	-7.66638950055783	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0353208662419187	ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	174188285	G/A	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	180165608	C/A	1	19	13	32	9.0654627350863	6.79731497073043	2.26814776435587	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.481365516472907	ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180165397_180165734:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180165397_180165734:QSOX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	182569445	G/A	1	90	60	150	42.9416655872509	31.3722229418327	11.5694426454182	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0603818898018085	ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182567758_182569648:RGS16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	182844020	C/T	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	183099605	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183099479_183099684:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183099479_183099684:LAMC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	183103848	C/T	1	16	13	29	7.63407388217794	6.79731497073043	0.836758911447511	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.853293027476038	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183103795_183103944:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183103825_183103944:LAMC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	183515428	G/A	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000116698:ENST00000367537:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000458370:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367539:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000392015:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000413782:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000508461:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000347615:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507469:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000515829:exon_183515101_183515472:SMG7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	183542387	T/C	1	18	9	27	8.58833311745018	4.70583344127491	3.88249967617527	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.176928027035863	ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	185109202	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000121486:ENST00000367504:exon_185109105_185109354:C1orf25;ENSG00000121486:ENST00000367506:exon_185109105_185109354:C1orf25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	185267114	A/G	1	29	47	76	13.8367589114475	24.5749079711023	-10.7381490596548	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.01555364665377	ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	186291512	T/C	1	74	79	153	35.307591705073	41.3067602067464	-5.99916850167348	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.332970653089423	ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186291450_186291544:TPR;ENSG00000047410:ENST00000467810:exon_186291450_186291544:TPR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	186301447	T/C	1	28	18	46	13.3596292938114	9.41166688254982	3.94796241126157	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.301573255723197	ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186301327_186301475:TPR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	193065767	T/C	1	17	23	40	8.11120349981406	12.0260187943692	-3.91481529455516	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.267794969957949	ENSG00000023572:ENST00000367439:exon_193065598_193065889:GLRX2;ENSG00000023572:ENST00000367440:exon_193065598_193065889:GLRX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	197070697	T/C	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.370794847578149	ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	197070707	G/A	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	198725169	T/C	1	57	56	113	27.1963882052589	29.2807414123772	-2.08435320711832	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.707351958938099	ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198725035_198726412:PTPRC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	200376239	C/G	1	18	17	35	8.58833311745018	8.88879650018594	-0.300463382735762	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000162702:ENST00000294740:exon_200375827_200378847:ZNF281;ENSG00000162702:ENST00000367353:exon_200375836_200378851:ZNF281;ENSG00000162702:ENST00000367352:exon_200375858_200378580:ZNF281
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	200522566	G/C	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	201112981	A/G	1	23	25	48	10.9739812056308	13.071759559097	-2.09777835346619	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.566100280837516	ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	210010460	T/C	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210010146_210010556:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210010146_210010556:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210010146_210010556:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210010146_210010556:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210010146_210010556:C1orf107
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	211836789	T/C	1	16	25	41	7.63407388217794	13.071759559097	-5.43768567691904	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.116939264065251	ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	211846876	A/G	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	212273639	C/T	1	11	2	13	5.24842579399733	1.04574076472776	4.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0242231410078916	ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214813487	A/G	1	9	19	28	4.29416655872509	9.9345372649137	-5.64037070618861	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0374013011231895	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214813782	A/G	1	13	22	35	6.20268502926957	11.5031484120053	-5.30046338273576	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.089917208580038	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214813941	C/G	1	10	22	32	4.77129617636121	11.5031484120053	-6.73185223564413	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0206018714858298	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214814125	G/A	1	13	9	22	6.20268502926957	4.70583344127491	1.49685158799466	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.670537930867177	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214814582	G/A	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214814733	T/G	1	6	8	14	2.86277770581673	4.18296305891103	-1.32018535309431	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.59563947353559	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214814778	G/A	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214814995	C/T	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214818215	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214818223	T/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214818846	A/G	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214818945	A/C	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214819044	C/T	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214819328	G/A	1	18	26	44	8.58833311745018	13.5946299414609	-5.00629682401067	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.13453360171572	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214819587	A/G	1	13	10	23	6.20268502926957	5.22870382363879	0.973981205630785	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.835286047198067	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214819980	C/T	1	18	15	33	8.58833311745018	7.84305573545818	0.745277381991995	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.862634297175903	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214820299	A/G	1	10	21	31	4.77129617636121	10.9802780296415	-6.20898185328025	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0302916580159521	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214820494	G/A	1	13	12	25	6.20268502926957	6.27444458836655	-0.0717595590969733	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214820524	T/C	1	13	14	27	6.20268502926957	7.32018535309431	-1.11750032382473	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.703474017247423	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214830617	A/G	1	74	66	140	35.307591705073	34.509445236016	0.798146469056945	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.9326644312378	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	214837110	C/G	1	81	103	184	38.6474990285258	53.8556493834795	-15.2081503549537	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0267174141075839	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	220154768	C/T	1	42	42	84	20.0394439407171	21.9605560592829	-1.92111211856583	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.743401726981702	ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	220156704	T/C	1	55	35	90	26.2421289699867	18.3004633827358	7.9416655872509	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.112992359075507	ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	220156729	C/T	1	56	38	94	26.7192585876228	19.8690745298274	6.85018405779538	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.179438980550469	ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	220162004	C/T	1	53	53	106	25.2878697347144	27.7121302652856	-2.42426053057117	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.697543115988512	ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220161932_220162165:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220161932_220162165:EPRS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	220267531	G/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220267444_220267825:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220267444_220267825:IARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	220298664	A/G	1	28	16	44	13.3596292938114	8.36592611782206	4.99370317598933	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.173712672368528	ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000490891:exon_220298579_220298681:IARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	222837438	A/G	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000450260:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000477519:exon_222837313_222837490:MIA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	224377560	A/G	1	13	25	38	6.20268502926957	13.071759559097	-6.8690745298274	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0335541135462109	ENSG00000143753:ENST00000415210:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000323699:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000391877:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000465848:exon_224377279_224377754:DEGS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	224377724	C/T	1	25	18	43	11.928240440903	9.41166688254982	2.51657355835321	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.541953811268653	ENSG00000143753:ENST00000415210:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000323699:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000391877:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000465848:exon_224377279_224377754:DEGS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	226046974	T/C	0	0	8	8	0	4.18296305891103	-4.18296305891103	C	T	C	10	0.522870382363879	0.0026859072312288	ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226046896_226047049:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000487971:exon_226046896_226047241:TMEM63A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	226108200	C/T	1	70	77	147	33.3990732345285	40.2610194420187	-6.86194620749021	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.283174857438072	ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226107578_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226107608_226108320:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226108155_226108313:PYCR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	226352498	T/G	1	19	9	28	9.0654627350863	4.70583344127491	4.35962929381139	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.129284672940695	ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	226570840	T/C	1	98	109	207	46.7587025283399	56.9928716776628	-10.2341691493229	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.164168880791832	ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	226589958	G/A	1	94	124	218	44.8501840577954	64.835927413121	-19.9857433553256	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00804264930107466	ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	226923264	G/A	1	10	19	29	4.77129617636121	9.9345372649137	-5.16324108855249	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0632900681634697	ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	227172290	C/T	1	9	16	25	4.29416655872509	8.36592611782206	-4.07175955909697	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.112558414985489	ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	227174210	T/C	1	23	27	50	10.9739812056308	14.1175003238247	-3.14351911819395	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.398040038374464	ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	227174318	C/T	1	35	22	57	16.6995366172642	11.5031484120053	5.1963882052589	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.185900679040673	ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	228295527	G/A	1	111	66	177	52.9613875576094	34.509445236016	18.4519423215934	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00658806259948669	ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228295369_228295561:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000457264:exon_228295368_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000463898:exon_228295468_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000497758:exon_228295486_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000464148:exon_228295525_228295570:MRPL55
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	228362682	G/A	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000181873:ENST00000366711:exon_228362393_228362730:C1orf69;ENSG00000181873:ENST00000484749:exon_228362393_228362730:C1orf69
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	228363245	G/A	0	12	0	12	5.72555541163345	0	5.72555541163345	G	G		10	0.522870382363879	0.000556768374497239	ENSG00000181873:ENST00000366711:exon_228362823_228369958:C1orf69;ENSG00000181873:ENST00000484749:exon_228362823_228369958:C1orf69
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	228588680	A/C	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	229773441	C/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	230415244	T/C	1	25	41	66	11.928240440903	21.437685676919	-9.50944523601601	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0257969547101140	ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	231374798	C/G	1	23	14	37	10.9739812056308	7.32018535309431	3.65379585253648	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.252297624739388	ENSG00000143633:ENST00000366649:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000318906:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366651:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366648:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000451322:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000421623:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000471936:exon_231372442_231374934:C1orf131
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	231377081	C/T	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	231377150	C/T	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	231509813	C/T	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000135766:ENST00000366641:exon_231509726_231509845:EGLN1;ENSG00000135766:ENST00000476717:exon_231509726_231509845:EGLN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236700807	T/A	1	25	7	32	11.928240440903	3.66009267654715	8.26814776435587	A:T:C	T	A	10	0.522870382363879	0.00396200000892908	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236700823	T/C	1	18	3	21	8.58833311745018	1.56861114709164	7.01972197035854	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00183208891376017	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236700857	C/T	0	20	0	20	9.54259235272242	0	9.54259235272242	C	C		10	0.522870382363879	2.70669387062441e-06	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236702209	C/T	1	17	6	23	8.11120349981406	3.13722229418327	4.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0578931252703766	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236702210	A/G	1	18	7	25	8.58833311745018	3.66009267654715	4.92824044090303	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0695066016090665	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236702374	G/A	1	19	26	45	9.0654627350863	13.5946299414609	-4.52916720637455	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.182745458776982	ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236706862	G/C	1	18	38	56	8.58833311745018	19.8690745298274	-11.2807414123772	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00297152377475808	ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236711323	T/C	1	22	25	47	10.4968515879947	13.071759559097	-2.57490797110231	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.468822079513507	ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236716900	G/A	1	51	31	82	24.3336104994422	16.2089818532802	8.12462864616193	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.077308028058622	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236716959	C/T	1	29	25	54	13.8367589114475	13.071759559097	0.764999352350538	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.892071253797457	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236717926	T/C	1	45	43	88	21.4708327936254	22.4834264416468	-1.01259364802135	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.831958157960343	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236718620	T/C	1	49	36	85	23.3793512641699	18.8233337650996	4.55601749907029	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.330890323313177	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236719135	T/C	1	29	20	49	13.8367589114475	10.4574076472776	3.37935126416993	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.391465872332255	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236719193	A/G	1	27	23	50	12.8824996761753	12.0260187943692	0.856480881806052	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.887728817114115	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236721610	G/A	1	30	20	50	14.3138885290836	10.4574076472776	3.85648088180605	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.322209737793613	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	236721660	T/C	1	22	13	35	10.4968515879947	6.79731497073043	3.69953661726424	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.238433136998935	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	241663825	G/A	1	87	91	178	41.5102767343425	47.581204795113	-6.07092806077045	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.368874720431086	ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241663737_241663890:FH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	241676972	G/A	1	47	49	96	22.4250920288977	25.6206487358301	-3.19555670693238	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.540768696426236	ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241676903_241677013:FH;ENSG00000091483:ENST00000497042:exon_241676903_241676976:FH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	242042545	A/G	1	13	14	27	6.20268502926957	7.32018535309431	-1.11750032382473	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.703474017247423	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	242042578	A/G	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	242048674	C/T	1	12	18	30	5.72555541163345	9.41166688254982	-3.68611147091637	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.202767215651943	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	245006439	C/T	1	55	27	82	26.2421289699867	14.1175003238247	12.1246286461619	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00776689113427855	ENSG00000203667:ENST00000411948:exon_245006343_245008359:FAM36A;ENSG00000203667:ENST00000366528:exon_245006343_245006554:FAM36A;ENSG00000203667:ENST00000391839:exon_245006343_245007182:FAM36A;ENSG00000203667:ENST00000498262:exon_245006343_245008359:FAM36A;ENSG00000203667:ENST00000464757:exon_245006343_245006582:FAM36A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	245027469	G/A	1	95	96	191	45.3273136754315	50.1955567069324	-4.86824303150088	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.514626569997269	ENSG00000153187:ENST00000427948:exon_245027286_245027609:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000444376:exon_245026976_245027844:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000283179:exon_245026919_245027773:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000476241:exon_245026976_245027793:HNRNPU
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	246021941	T/C	1	30	24	54	14.3138885290836	12.5488891767331	1.76499935235054	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.683896351339419	ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	246922390	A/G	1	35	28	63	16.6995366172642	14.6403707061886	2.05916591107563	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.616656025098647	ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	1	249141782	A/T	1	15	12	27	7.15694426454182	6.27444458836655	0.882499676175268	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.847915973483971	ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000306576:exon_249141474_249141854:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	3172121	C/T	1	189	151	340	90.1774977332269	78.9534277369457	11.2240699962811	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.23251281415035	ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	3172145	C/T	1	204	179	383	97.3344419977687	93.5937984431343	3.74064355463436	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.720461141636303	ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	3178814	T/A	1	411	428	839	196.100272848446	223.78852365174	-27.6882508032944	A:T:G	T	A	10	0.522870382363879	0.0573227624805945	ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	3189380	C/T	1	40	29	69	19.0851847054448	15.1632410885525	3.92194361689235	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.3991974884954	ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	3197856	C/G	1	21	12	33	10.0197219703585	6.27444458836655	3.745277381992	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.223985906232122	ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3197783_3197921:PITRM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	5967430	G/A	1	41	28	69	19.562314323081	14.6403707061886	4.92194361689235	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.278115864842038	ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5967330_5967455:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5967330_5967455:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5967330_5967455:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000461504:exon_5967330_5967455:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000485290:exon_5967330_5967455:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000496013:exon_5967227_5967455:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000479433:exon_5967374_5967455:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000470353:exon_5967374_5967455:FBXO18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	6154308	C/T	1	48	32	80	22.9022216465338	16.7318522356441	6.17036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.180145590900466	ENSG00000134453:ENST00000372795:exon_6154173_6154324:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000418869:exon_6154173_6154425:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000379888:exon_6154173_6154324:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000429138:exon_6154173_6154324:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000446108:exon_6154173_6154324:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000447032:exon_6154173_6154424:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000481147:exon_6154173_6154386:RBM17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	6262702	C/T	0	0	8	8	0	4.18296305891103	-4.18296305891103	T	C	T	10	0.522870382363879	0.0026859072312288	ENSG00000170525:ENST00000379784:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379789:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379781:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000490474:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000467491:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000477914:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379785:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000461744:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000317350:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379782:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000360521:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379775:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000358499:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000444592:exon_6262621_6262828:PFKFB3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	7816817	G/A	1	22	11	33	10.4968515879947	5.75157420600267	4.74527738199199	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.116953965896256	ENSG00000151657:ENST00000379562:exon_7816794_7816854:KIN;ENSG00000151657:ENST00000460089:exon_7816794_7816841:KIN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	7820834	C/T	1	18	14	32	8.58833311745018	7.32018535309431	1.26814776435587	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.725074190491161	ENSG00000151657:ENST00000379562:exon_7820801_7820982:KIN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	8006798	A/G	1	12	13	25	5.72555541163345	6.79731497073043	-1.07175955909697	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.693496363330912	ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	11356160	C/T	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	11505358	G/C	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	12143105	C/G	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	12160868	C/T	1	19	22	41	9.0654627350863	11.5031484120053	-2.43768567691904	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.532306974462956	ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12160748_12160917:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000479283:exon_12160778_12160917:DHTKD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	12292344	A/G	1	176	142	318	83.9748127039573	74.2475942956708	9.72721840828649	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.286391903822404	ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	13364980	G/A	1	49	45	94	23.3793512641699	23.5291672063746	-0.149815942204622	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13364835_13365047:SEPHS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	13375906	T/C	1	26	10	36	12.4053700585391	5.22870382363879	7.17666623490036	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0188489599506940	ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	13653653	A/G	1	18	12	30	8.58833311745018	6.27444458836655	2.31388852908363	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.466606982659409	ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	14572426	A/G	1	6	11	17	2.86277770581673	5.75157420600267	-2.88879650018594	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.224343505781	ENSG00000065809:ENST00000378470:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000181796:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000468747:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000378467:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000487335:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000378465:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000378458:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000478076:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000378462:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000481209:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000378461:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000496330:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000492700:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000479731:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000468492:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000452706:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000489100:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000494865:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000475786:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000488576:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000474143:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000442012:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000482277:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000472095:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000471815:exon_14572331_14572514:FAM107B;ENSG00000065809:ENST00000464952:exon_14572331_14572514:FAM107B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	15145361	G/A	1	23	39	62	10.9739812056308	20.3919449121913	-9.41796370656049	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0213865712580799	ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	15145855	C/G	1	42	55	97	20.0394439407171	28.7578710300133	-8.71842708929626	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0839826904425517	ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	22862282	T/C	1	21	13	34	10.0197219703585	6.79731497073043	3.22240699962812	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.305367459084132	ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000422321:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_22862240_22862386:PIP4K2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	24813282	G/C	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	24813327	A/G	1	5	10	15	2.38564808818061	5.22870382363879	-2.84305573545818	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.195978503056267	ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	24813454	G/A	1	10	13	23	4.77129617636121	6.79731497073043	-2.02601879436922	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.41269190582082	ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	25313818	C/T	1	2	9	11	0.954259235272242	4.70583344127491	-3.75157420600267	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0318932346368143	ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	27317840	C/T	1	11	2	13	5.24842579399733	1.04574076472776	4.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0242231410078916	ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	27322226	C/T	1	14	2	16	6.67981464690569	1.04574076472776	5.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0047789111423261	ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27322154_27322306:ANKRD26
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	27400861	G/A	1	56	67	123	26.7192585876228	35.0323156183799	-8.31305703075711	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.148601265628742	ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27399383_27401049:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27399383_27401049:YME1L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	27434483	G/A	1	7	12	19	3.33990732345285	6.27444458836655	-2.9345372649137	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.250431561449006	ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	27459746	C/G	1	24	7	31	11.4511108232669	3.66009267654715	7.79101814671975	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.00612931231207819	ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	27497191	G/A	1	2	12	14	0.954259235272242	6.27444458836655	-5.32018535309431	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00555356960539268	ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27497175_27497374:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27497175_27497374:ACBD5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	30629226	G/A	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	30749705	C/T	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.273399026723903	ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30749635_30750762:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30749635_30750761:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30749635_30750762:MAP3K8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	43281089	T/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	43289407	G/A	1	19	12	31	9.0654627350863	6.27444458836655	2.79101814671975	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.370530485639912	ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	43292647	A/G	1	34	8	42	16.2224069996281	4.18296305891103	12.0394439407171	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.000153133335122006	ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	58118215	A/G	1	112	84	196	53.4385171752456	43.9211121185658	9.51740505667973	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.175192769765574	ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58117199_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58117206_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000478181:exon_58117948_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58118137_58118220:ZWINT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	69773841	G/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	69773931	A/G	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	70775329	G/A	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70775297_70776738:KIAA1279
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	71142420	G/A	1	46	38	84	21.9479624112616	19.8690745298274	2.07888788143417	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.66391307921982	ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	71160828	C/T	1	55	50	105	26.2421289699867	26.1435191181939	0.0986098517927125	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1;ENSG00000156515:ENST00000470050:exon_71160747_71160874:HK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	71160897	C/T	1	77	62	139	36.7389805579813	32.4179637065605	4.32101685142083	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.497354616350469	ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	71974321	T/C	1	12	40	52	5.72555541163345	20.9148152945552	-15.1892598829217	T:C	T	C	10	0.522870382363879	2.09128231822702e-05	ENSG00000180817:ENST00000373232:exon_71974256_71974342:PPA1;ENSG00000180817:ENST00000373230:exon_71974256_71974342:PPA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	72179746	C/T	1	13	16	29	6.20268502926957	8.36592611782206	-2.16324108855249	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.460857423634132	ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	72326470	C/T	1	11	13	24	5.24842579399733	6.79731497073043	-1.54888917673309	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.546918420888488	ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72326337_72328205:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72326337_72328205:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72326337_72326644:KIAA1274
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	73521578	G/A	1	15	9	24	7.15694426454182	4.70583344127491	2.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.414521773200192	ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	73992862	C/G	1	110	95	205	52.4842579399733	49.6726863245685	2.81157161540482	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.726859821749225	ENSG00000166295:ENST00000478193:exon_73992759_73993373:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000299381:exon_73992759_73993587:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000470481:exon_73992759_73993584:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000468144:exon_73992759_73992969:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000496924:exon_73992759_73993223:ANAPC16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	76285163	T/C	1	50	53	103	23.8564808818061	27.7121302652856	-3.85564938347953	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.490226126723981	ENSG00000156110:ENST00000286621:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000467840:exon_76285122_76285184:ADK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	86273249	T/C	1	6	11	17	2.86277770581673	5.75157420600267	-2.88879650018594	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.224343505781	ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	90771829	T/C	1	8	9	17	3.81703694108897	4.70583344127491	-0.888796500185942	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.809268533848644	ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90771756_90771838:FAS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	91066460	T/A	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	95276718	T/C	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	96997670	A/G	1	1793	1956	3749	855.493404421565	1022.73446790375	-167.241063482182	A:G	A	G	10	0.522870382363879	4.66773841688963e-08	ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	96997820	A/G	1	1063	1233	2296	507.188783547197	644.699181454663	-137.510397907466	A:T:C:G	A	G	10	0.522870382363879	1.00035599501622e-08	ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	97023630	T/C	1	545	454	999	260.035641611686	237.383153593201	22.6524880184849	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.154159398232758	ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	97607266	G/A	1	52	72	124	24.8107401170783	37.6466675301993	-12.835927413121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0242940605468513	ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97607203_97607463:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97607203_97607463:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97607203_97607288:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97607203_97607463:ENTPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	98369536	A/G	1	17	7	24	8.11120349981406	3.66009267654715	4.45111082326691	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.100175630412175	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	98380277	C/T	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	98386558	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98386465_98386662:PIK3AP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	98469507	C/A	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	99125950	G/A	1	21	33	54	10.0197219703585	17.254722618008	-7.23500064764946	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0561550344989478	ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	99219885	G/A	1	31	28	59	14.7910181467198	14.6403707061886	0.150647440531142	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000485400:exon_99219119_99220076:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99219803_99219989:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99219830_99219989:MMS19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	99220707	C/T	1	30	23	53	14.3138885290836	12.0260187943692	2.28786973471441	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.583497352113942	ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	99225846	C/T	1	14	9	23	6.67981464690569	4.70583344127491	1.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.532246706293347	ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99225816_99225913:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99225816_99225916:MMS19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	100182186	G/A	1	25	20	45	11.928240440903	10.4574076472776	1.47083279362545	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.765776887066167	ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100182126_100182270:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100182126_100182270:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100182126_100182270:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100182126_100182266:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100182126_100182266:HPS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	100202987	A/G	1	22	30	52	10.4968515879947	15.6861114709164	-5.18925988292171	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.165941797499576	ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000498219:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000465957:exon_100202881_100202997:HPS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	101514370	G/C	1	33	30	63	15.745277381992	15.6861114709164	0.0591659110756257	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101514286_101514391:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101514286_101514391:CUTC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	101636898	C/G	1	11	23	34	5.24842579399733	12.0260187943692	-6.77759300037189	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0246492511983624	ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101635334_101637093:DNMBP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	101639877	A/C	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	102762356	C/T	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	103340056	G/A	1	15	29	44	7.15694426454182	15.1632410885525	-8.00629682401067	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0224808235053412	ENSG00000166171:ENST00000470165:exon_103339817_103340065:DPCD;ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	103340144	A/G	1	10	39	49	4.77129617636121	20.3919449121913	-15.6206487358301	A:G	A	G	10	0.522870382363879	9.03448519964867e-06	ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	103361088	C/T	1	36	17	53	17.1766662349004	8.88879650018594	8.28786973471442	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0270752888717672	ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370149:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000434727:exon_103360960_103361093:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103360960_103361093:DPCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	103371041	C/G	1	31	41	72	14.7910181467198	21.437685676919	-6.64666753019929	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.125796125074191	ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103370423_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000470093:exon_103370423_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103370426_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103370426_103371167:FBXW4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	103558746	G/C	1	24	37	61	11.4511108232669	19.3462041474635	-7.89509332419662	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0537292417867908	ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103558599_103559212:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000482611:exon_103558599_103559089:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103558599_103559212:MGEA5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	103899871	A/G	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	104140355	C/T	1	28	27	55	13.3596292938114	14.1175003238247	-0.757871030013343	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.892972380561247	ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	104184081	G/A	1	163	105	268	77.7721276746877	54.9013901482073	22.8707375264804	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00582980259571501	ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000486762:exon_104184021_104184151:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104183788_104184151:CUEDC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	104184953	C/G	1	15	15	30	7.15694426454182	7.84305573545818	-0.686111470916369	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.856171129714278	ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	104572963	T/C	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000166272:ENST00000448841:exon_104572352_104575997:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000369889:exon_104572352_104576021:C10orf26;ENSG00000166272:ENST00000393281:exon_104572352_104576021:C10orf26
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	104836853	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000148842:ENST00000457502:exon_104836728_104838344:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000433628:exon_104836728_104838108:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000369878:exon_104836728_104838238:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000345419:exon_104836728_104838238:CNNM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	104849468	G/A	1	23	15	38	10.9739812056308	7.84305573545818	3.1309254701726	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.333716658993004	ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	105182770	C/T	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105182745_105182894:PDCD11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	105194086	C/T	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	105206874	T/C	1	20	22	42	9.54259235272242	11.5031484120053	-1.96055605928292	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.643620805806273	ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	105762591	G/A	1	9	7	16	4.29416655872509	3.66009267654715	0.634073882177937	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.806882383309564	ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	112771421	A/G	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000108061:ENST00000265277:exon_112771368_112773422:SHOC2;ENSG00000108061:ENST00000369452:exon_112771368_112773425:SHOC2;ENSG00000108061:ENST00000489390:exon_112771368_112771428:SHOC2;ENSG00000108061:ENST00000451838:exon_112771368_112773424:SHOC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	119043554	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000165650:ENST00000334464:exon_119040000_119044982:PDZD8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	120828969	A/G	1	13	7	20	6.20268502926957	3.66009267654715	2.54259235272242	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.273177370962394	ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	120933324	G/A	1	22	19	41	10.4968515879947	9.9345372649137	0.562314323080962	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.877266589083182	ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	121196264	C/T	1	12	2	14	5.72555541163345	1.04574076472776	4.67981464690569	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0142040982982489	ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000457057:exon_121196163_121196276:GRK5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	121602830	G/A	1	16	24	40	7.63407388217794	12.5488891767331	-4.91481529455516	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.153540179742736	ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121602760_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121602766_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121602766_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000495407:exon_121602294_121602938:C10orf119
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	122663585	G/A	1	11	7	18	5.24842579399733	3.66009267654715	1.58833311745018	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.489005913678072	ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122663559_122663654:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122663559_122663654:WDR11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	122665489	C/T	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	124742895	G/C	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	126523333	C/T	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000165660:ENST00000298492:exon_126523071_126525239:FAM175B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	126670356	G/A	1	9	10	19	4.29416655872509	5.22870382363879	-0.9345372649137	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.819184206292418	ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	127516195	G/A	1	27	19	46	12.8824996761753	9.9345372649137	2.94796241126157	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.461011405794112	ENSG00000107949:ENST00000278100:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000368759:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000392718:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000463330:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000478798:exon_127516127_127516207:BCCIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	129903592	G/A	1	18	17	35	8.58833311745018	8.88879650018594	-0.300463382735762	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	129904560	C/T	1	11	17	28	5.24842579399733	8.88879650018594	-3.64037070618861	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.188314219398843	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	129906903	C/T	1	22	29	51	10.4968515879947	15.1632410885525	-4.66638950055783	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.208528376663272	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	133769482	G/C	1	67	73	140	31.9676843816201	38.1695379125632	-6.20185353094305	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.310532743793221	ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	134013990	G/A	1	14	10	24	6.67981464690569	5.22870382363879	1.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.683821947854935	ENSG00000151640:ENST00000338492:exon_134013860_134014016:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368629:exon_134013860_134014016:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368627:exon_134013860_134014016:DPYSL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	134014449	A/G	1	14	12	26	6.67981464690569	6.27444458836655	0.405370058539147	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000151640:ENST00000338492:exon_134014346_134014487:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368629:exon_134014346_134014487:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368627:exon_134014346_134014487:DPYSL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	134145229	G/C	1	35	25	60	16.6995366172642	13.071759559097	3.62777705816726	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.368193673949209	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	134145288	C/A	1	20	22	42	9.54259235272242	11.5031484120053	-1.96055605928292	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.643620805806273	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	134145293	G/T	1	20	20	40	9.54259235272242	10.4574076472776	-0.914815294555158	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.874520561432744	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	134145314	A/G	1	6	12	18	2.86277770581673	6.27444458836655	-3.41166688254982	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.155279829553550	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	134145320	A/G	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135076523	C/A	1	106	60	166	50.5757394694288	31.3722229418327	19.2035165275961	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.00305819857559521	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135076596	T/C	1	77	49	126	36.7389805579813	25.6206487358301	11.1183318221513	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0498455353145832	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135082346	A/G	1	34	19	53	16.2224069996281	9.9345372649137	6.28786973471442	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0986004610576486	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135085321	C/T	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.273399026723903	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135085754	G/A	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.567981193465519	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135097434	A/G	1	29	46	75	13.8367589114475	24.0520375887384	-10.2152786772909	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0204781749741204	ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135098672	G/A	1	30	53	83	14.3138885290836	27.7121302652856	-13.398241736202	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00401802107848723	ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135204950	C/G	1	45	20	65	21.4708327936254	10.4574076472776	11.0134251463479	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.00619228970016489	ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368534:exon_135204866_135204999:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135204991	C/T	1	63	26	89	30.0591659110756	13.5946299414609	16.4645359696148	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000426906794439184	ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368534:exon_135204866_135204999:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	10	135205009	C/G	1	60	21	81	28.6277770581673	10.9802780296415	17.6474990285258	C:G	C	G	10	0.522870382363879	7.90889288893087e-05	ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	216672	T/C	1	18	23	41	8.58833311745018	12.0260187943692	-3.43768567691904	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.34842192319976	ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_215458_216718:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529937:exon_216145_216718:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_216179_216718:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_216206_216718:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_216391_216718:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_216525_216718:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_216611_216718:SIRT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	233059	G/A	1	12	19	31	5.72555541163345	9.9345372649137	-4.20898185328025	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.151304978564878	ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	233212	C/A	1	14	21	35	6.67981464690569	10.9802780296415	-4.30046338273576	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.175897503034529	ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525776:exon_233192_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_233209_233215:SIRT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	236091	G/A	1	9	5	14	4.29416655872509	2.61435191181939	1.6798146469057	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.430819213902139	ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_236048_236431:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_236048_236354:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_236048_236352:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_236048_236330:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_236048_236326:SIRT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	237087	A/G	1	32	56	88	15.2681477643559	29.2807414123772	-14.0125936480213	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00370975808151994	ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_236546_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_236966_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_236981_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_237000_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_237004_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_237026_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_237038_237144:PSMD13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	244197	T/C	1	39	18	57	18.6080550878087	9.41166688254982	9.1963882052589	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0165434566872833	ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_244041_244469:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_244161_244216:PSMD13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	292991	C/G	1	13	2	15	6.20268502926957	1.04574076472776	5.15694426454182	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.00826591843907033	ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_292886_292997:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_292886_292997:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_292886_292997:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_292886_292997:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_292886_292997:ATHL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	309127	A/G	1	595	471	1066	283.892122493492	246.271950093387	37.620172400105	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0214636551118747	ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	406954	G/A	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000185187:ENST00000431843:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000397632:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000332725:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527295:exon_406349_407164:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000527987:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000531205:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000382520:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000534145:exon_406427_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000528209:exon_406843_406993:SIGIRR;ENSG00000185187:ENST00000525299:exon_406876_406993:SIGIRR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	644529	C/A	1	60	54	114	28.6277770581673	28.2350006476495	0.392776410517797	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527658:exon_644234_644654:DEAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	771034	A/G	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	799358	G/C	1	79	50	129	37.6932397932536	26.1435191181939	11.5497206750596	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0428576871289789	ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_799180_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_799184_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_799184_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_799185_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_799185_800244:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_799185_799565:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527812:exon_799326_799474:LRDD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	800556	G/A	1	28	21	49	13.3596292938114	10.9802780296415	2.37935126416993	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.568073825954693	ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_800543_800666:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_800543_800666:LRDD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	802270	G/A	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.273399026723903	ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	802379	T/C	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	837582	G/A	1	32	38	70	15.2681477643559	19.8690745298274	-4.60092676547153	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.283502723158107	ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	840474	C/T	1	404	185	589	192.760365524993	96.7310207373176	96.0293447876753	T:C	C	T	10	0.522870382363879	9.98657096190112e-16	ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	840477	A/G	1	359	172	531	171.289532731367	89.9337057665872	81.3558269647803	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	9.64084439034211e-13	ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	904712	C/T	1	24	13	37	11.4511108232669	6.79731497073043	4.65379585253648	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.140185683636152	ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_904706_904816:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_904706_904864:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000531859:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534254:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528426:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533056:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533059:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000530939:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525225:exon_904706_904859:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525840:exon_904701_904859:CHID1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	993964	C/T	1	9	34	43	4.29416655872509	17.7775930003719	-13.4834264416468	T:C	C	T	10	0.522870382363879	4.17051133443223e-05	ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	1972143	G/A	1	70	79	149	33.3990732345285	41.3067602067464	-7.90768697221797	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.218553723484673	ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	1972205	G/A	1	137	135	272	65.3667576161486	70.5875016191237	-5.22074400297507	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.544144345439258	ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	2424713	C/G	1	41	61	102	19.562314323081	31.8950933241966	-12.3327790011157	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0170136076614096	ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	2924591	G/A	1	8	9	17	3.81703694108897	4.70583344127491	-0.888796500185942	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.809268533848644	ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	2924610	G/A	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2924606_2924719:SLC22A18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	2946406	G/A	1	38	13	51	18.1309254701726	6.79731497073043	11.3336104994422	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00175845347833014	ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2946240_2946476:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2946240_2946476:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2946240_2946457:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2946240_2946476:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2946240_2946476:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2946240_2946413:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2946240_2946470:SLC22A18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	3380343	T/C	1	19	9	28	9.0654627350863	4.70583344127491	4.35962929381139	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.129284672940695	ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	3381134	G/T	1	13	12	25	6.20268502926957	6.27444458836655	-0.0717595590969733	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	3381369	G/T	1	11	2	13	5.24842579399733	1.04574076472776	4.20268502926957	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0242231410078916	ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	3714489	C/T	1	9	2	11	4.29416655872509	1.04574076472776	3.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0684680229761391	ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	5655036	G/C	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5655034_5655129:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5655034_5655129:TRIM34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	5656057	G/A	1	14	6	20	6.67981464690569	3.13722229418327	3.54259235272242	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.122889322650138	ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5655861_5656091:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5655861_5656091:TRIM34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	5718517	G/A	1	80	88	168	38.1703694108897	46.0125936480214	-7.84222423713167	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.246702613959502	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	5719750	G/C	1	112	124	236	53.4385171752456	64.835927413121	-11.3974102378754	A:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.151570369777896	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	5719756	C/T	1	112	86	198	53.4385171752456	44.9668528832936	8.47166429195197	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.254959381325454	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6232653	C/T	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6232565_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6232565_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000529360:exon_6232575_6233097:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6232575_6233097:FAM160A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6413009	A/G	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6412617_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6412614_6413386:SMPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6413102	C/T	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000530395:exon_6413020_6413272:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6412617_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6412614_6413386:SMPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6415463	G/A	1	22	21	43	10.4968515879947	10.9802780296415	-0.483426441646795	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.880238254385161	ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6415428_6416221:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6415428_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531303:exon_6415408_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000526280:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531336:exon_6415126_6415603:SMPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6622714	G/A	1	32	46	78	15.2681477643559	24.0520375887384	-8.78388982438256	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0535941648211653	ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6629665	C/T	1	61	68	129	29.1049066758034	35.5551860007438	-6.45027932494038	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.290188158926812	ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6630833	G/A	1	92	95	187	43.8959248225231	49.6726863245685	-5.77676150204537	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.420961507101255	ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6631016	C/T	1	135	121	256	64.4124983808763	63.2673162660294	1.14518211484699	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.90056172187996	ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6632450	C/T	1	555	459	1014	264.806937788047	239.99750550502	24.8094322830268	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.123449897986628	ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	6636106	T/A	1	33	26	59	15.745277381992	13.5946299414609	2.15064744053114	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.604210368247008	ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	9608330	G/A	1	15	11	26	7.15694426454182	5.75157420600267	1.40537005853915	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.695710599168677	ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9608258_9608403:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9608258_9608403:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9608258_9608403:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9608258_9608403:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9608258_9608403:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000527848:exon_9608261_9608403:WEE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	9749645	A/C	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	9754221	C/T	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	9769562	C/G	1	26	44	70	12.4053700585391	23.0062968240107	-10.6009267654715	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0118798312737768	ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	10800287	G/T	1	46	40	86	21.9479624112616	20.9148152945552	1.03314711670641	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.830158324341903	ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10800226_10801290:CTR9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	10821185	G/A	1	51	52	103	24.3336104994422	27.1892598829217	-2.85564938347953	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.622202000502662	ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	11964541	A/C	1	16	16	32	7.63407388217794	8.36592611782206	-0.731852235644126	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.86041203391569	ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11963882_11964659:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11963882_11964659:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11963882_11964659:USP47;ENSG00000170242:ENST00000525078:exon_11963882_11964696:USP47;ENSG00000170242:ENST00000531513:exon_11964497_11964659:USP47
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	18124837	C/T	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18124804_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000533851:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530180:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530736:exon_18124780_18124893:SAAL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	28057957	T/C	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	33094021	A/G	1	22	18	40	10.4968515879947	9.41166688254982	1.08518470544484	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.754292955333073	ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33094020_33095109:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33094020_33094199:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33094020_33094199:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33094020_33094391:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33094020_33094394:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33094020_33095109:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528962:exon_33094020_33094199:TCP11L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	33881016	T/C	1	11	12	23	5.24842579399733	6.27444458836655	-1.02601879436922	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.682551462444228	ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	34135349	C/T	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34135263_34135385:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34135263_34135385:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34135263_34135385:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000527971:exon_34135263_34135385:NAT10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	34154641	C/T	1	16	20	36	7.63407388217794	10.4574076472776	-2.82333376509964	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.405180690722772	ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34154573_34154689:NAT10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	34910397	C/T	1	19	30	49	9.0654627350863	15.6861114709164	-6.62064873583007	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0634945841086963	ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	43876698	C/T	1	19	11	30	9.0654627350863	5.75157420600267	3.31388852908363	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.273871648112103	ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	43940644	G/T	1	54	54	108	25.7649993523505	28.2350006476495	-2.47000129529893	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.700201570622963	ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	44104981	C/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	44636839	C/T	1	192	162	354	91.6088865861352	84.7050019429484	6.90388464318686	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.489232562117559	ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	45935384	A/G	1	51	62	113	24.3336104994422	32.4179637065605	-8.08435320711832	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.132669944821156	ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	46338977	C/T	1	7	14	21	3.33990732345285	7.32018535309431	-3.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.124227497168679	ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000534616:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46338912_46339038:CREB3L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	46403649	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000110492:ENST00000405308:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000441869:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000490240:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405994:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000359803:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000533952:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395569:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395566:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000481047:exon_46403261_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405098:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000430827:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000489525:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000407067:exon_46403303_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395565:exon_46403607_46403683:MDK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	46784697	A/C	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526943:exon_46784696_46784729:CKAP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	47179463	C/T	1	20	6	26	9.54259235272242	3.13722229418327	6.40537005853915	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0167600685668967	ENSG00000149179:ENST00000528488:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000278460:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527234:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000378618:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000395460:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000378615:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000525895:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527784:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527268:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000534249:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000526827:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000525953:exon_47179364_47179530:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000534581:exon_47179364_47179473:C11orf49
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	47188411	C/T	1	41	44	85	19.562314323081	23.0062968240107	-3.44398250092971	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.514994615168316	ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	47587243	C/G	1	35	33	68	16.6995366172642	17.254722618008	-0.55518600074377	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.903993516626634	ENSG00000213619:ENST00000533507:exon_47586888_47587348:NDUFS3;ENSG00000110536:ENST00000527079:exon_47586888_47587348:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000426530:exon_47586982_47587538:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000534775:exon_47587010_47587538:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000526719:exon_47587151_47587538:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000326656:exon_47587151_47587348:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000326674:exon_47587153_47587348:PTPMT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	57077464	T/C	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	57101000	G/C	1	34	53	87	16.2224069996281	27.7121302652856	-11.4897232656575	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0177075269661099	ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57100909_57101014:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57100099_57101014:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57100909_57101014:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57100909_57101014:SSRP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	57193653	A/G	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57193462_57193952:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525474:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529112:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526125:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528187:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529494:exon_57193462_57193789:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533245:exon_57193462_57193845:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533235:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000524863:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532795:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533051:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529896:exon_57193462_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000526621:exon_57193462_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530316:exon_57193513_57193862:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529748:exon_57193580_57193825:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000532278:exon_57193641_57193825:SLC43A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	57427074	A/G	1	11	12	23	5.24842579399733	6.27444458836655	-1.02601879436922	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.682551462444228	ENSG00000172409:ENST00000529773:exon_57426927_57427224:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000529430:exon_57426927_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000533682:exon_57426927_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000533905:exon_57426902_57427345:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000525602:exon_57426936_57427554:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000302731:exon_57426927_57427362:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000438099:exon_57426949_57427362:CLP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	58318619	C/G	1	45	49	94	21.4708327936254	25.6206487358301	-4.14981594220462	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.410036247853744	ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	58919813	A/G	1	8	18	26	3.81703694108897	9.41166688254982	-5.59462994146085	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0310939758125288	ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	59577364	C/T	1	82	49	131	39.1246286461619	25.6206487358301	13.5039799103319	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0182658729017530	ENSG00000166902:ENST00000300151:exon_59577328_59577393:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000534340:exon_59577328_59577393:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000525470:exon_59577328_59577495:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000531802:exon_59577007_59577393:MRPL16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	60610056	G/C	1	14	20	34	6.67981464690569	10.4574076472776	-3.77759300037188	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.230189912021864	ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	60689445	T/C	1	27	25	52	12.8824996761753	13.071759559097	-0.189259882921705	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	60704213	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	60704214	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	60711249	G/T	1	49	50	99	23.3793512641699	26.1435191181939	-2.76416785402402	A:T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.615484590442365	ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	60714009	C/T	1	77	61	138	36.7389805579813	31.8950933241966	4.84388723378471	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.443436065825109	ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60714004_60714293:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60714004_60714241:SLC15A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61102172	A/T	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000149476:ENST00000530456:exon_61102092_61102203:DAK;ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61102092_61102203:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61102092_61102203:DAK;ENSG00000149476:ENST00000530057:exon_61102092_61102203:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525170:exon_61102092_61102203:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529620:exon_61102092_61102203:DAK;ENSG00000149476:ENST00000533393:exon_61102092_61102203:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524968:exon_61101814_61102203:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529269:exon_61101905_61102203:DAK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61106774	T/A	1	29	6	35	13.8367589114475	3.13722229418327	10.6995366172642	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.000256344873471676	ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61110860	G/A	1	37	14	51	17.6537958525365	7.32018535309431	10.3336104994422	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00458378140712342	ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61110814_61110930:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61110814_61110930:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61110814_61110930:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61110814_61110930:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534370:exon_61110682_61110930:DAK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61165280	G/A	1	9	2	11	4.29416655872509	1.04574076472776	3.24842579399733	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0684680229761391	ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61179285	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61607859	C/T	1	46	56	102	21.9479624112616	29.2807414123772	-7.33277900111565	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.165129679821821	ENSG00000134824:ENST00000257261:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000522056:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000518606:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000278840:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000517312:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000521849:exon_61607806_61608003:FADS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61630492	A/T	1	28	11	39	13.3596292938114	5.75157420600267	7.60805508780872	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.015841394068957	ENSG00000134824:ENST00000257261:exon_61630444_61630541:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000522056:exon_61630444_61630541:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000278840:exon_61630444_61630541:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000521849:exon_61630444_61630541:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000523235:exon_61630444_61630541:FADS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61895741	A/G	1	14	9	23	6.67981464690569	4.70583344127491	1.97398120563078	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.532246706293347	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61897353	C/T	1	16	13	29	7.63407388217794	6.79731497073043	0.836758911447511	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.853293027476038	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61897359	C/T	1	12	15	27	5.72555541163345	7.84305573545818	-2.11750032382473	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.445977489976173	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61897409	C/T	1	18	15	33	8.58833311745018	7.84305573545818	0.745277381991995	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.862634297175903	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	61908440	T/C	1	17	19	36	8.11120349981406	9.9345372649137	-1.82333376509964	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.617808462551922	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61908385_61908516:INCENP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	62285360	T/C	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	62383981	A/C	1	47	39	86	22.4250920288977	20.3919449121913	2.03314711670641	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.66787656957456	ENSG00000149541:ENST00000265471:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000531383:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000532585:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000534026:exon_62383978_62384268:B3GAT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	62439569	G/A	1	142	150	292	67.7524057043292	78.4305573545818	-10.6781516502526	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.218851149225974	ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	62519964	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000185670:ENST00000394807:exon_62518435_62521187:ZBTB3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	62559385	T/C	1	23	17	40	10.9739812056308	8.88879650018594	2.08518470544484	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.531049635255258	ENSG00000168569:ENST00000528367:exon_62559151_62559464:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000525631:exon_62559151_62559469:TMEM223;ENSG00000168569:ENST00000307366:exon_62559151_62559493:TMEM223
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	62575025	A/T	1	45	28	73	21.4708327936254	14.6403707061886	6.83046208743684	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.127469920039959	ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62574369_62575138:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62574369_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62574397_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62574408_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62574409_62575100:STX5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	62592961	T/C	1	30	29	59	14.3138885290836	15.1632410885525	-0.849352559468858	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.896510843758925	ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000431400:exon_62592895_62592998:STX5;ENSG00000162236:ENST00000488303:exon_62592959_62593011:STX5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	62602983	A/G	1	59	68	127	28.1506474405311	35.5551860007438	-7.40453856021263	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.213532749116374	ENSG00000133316:ENST00000311713:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000529106:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525239:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000278856:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525752:exon_62602903_62603004:WDR74
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	63742219	C/T	1	774	581	1355	369.298324050358	303.787692153414	65.510631896944	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.000365000110486423	ENSG00000176340:ENST00000314133:exon_63742079_63742266:COX8A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	63764302	G/C	1	18	8	26	8.58833311745018	4.18296305891103	4.40537005853915	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.114835835280271	ENSG00000167770:ENST00000428192:exon_63764002_63764413:OTUB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	63767186	A/G	0	0	13	13	0	6.79731497073043	-6.79731497073043	G	A	G	10	0.522870382363879	6.64160264124631e-05	ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	63987916	G/A	1	202	185	387	96.3801827624964	96.7310207373176	-0.350837974821161	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	63988102	C/T	1	275	237	512	131.210644849933	123.920280620239	7.29036422969398	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.535799433288199	ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	63991801	T/C	1	111	148	259	52.9613875576094	77.3848165898541	-24.4234290322446	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00276188950958888	ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64109594	G/C	1	11	9	20	5.24842579399733	4.70583344127491	0.542592352722421	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.82745485897146	ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109466_64109611:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109466_64109611:CCDC88B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64111928	T/C	1	27	22	49	12.8824996761753	11.5031484120053	1.37935126416993	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.775398548709281	ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64124528	C/A	1	169	184	353	80.6349053805045	96.2081503549537	-15.5732449744493	A:C:G	C	A	10	0.522870382363879	0.0988041646966387	ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64124511_64125006:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64124511_64124996:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64124511_64124958:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64124511_64124997:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64124511_64125005:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64124511_64125002:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64122666_64125000:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64124511_64124842:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000472524:exon_64124511_64125003:CCDC88B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64572018	T/C	1	33	23	56	15.745277381992	12.0260187943692	3.71925858762278	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.350684392652844	ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64572602	G/A	1	18	30	48	8.58833311745018	15.6861114709164	-7.09777835346619	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0434373006508829	ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64622869	G/C	1	79	64	143	37.6932397932536	33.4637044712883	4.22953532196531	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.503691524175014	ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64645871	A/G	1	24	44	68	11.4511108232669	23.0062968240107	-11.5551860007438	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00516525790988502	ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64662423	C/T	1	25	48	73	11.928240440903	25.0977783534662	-13.1695379125632	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00218549489398198	ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662019_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662019_64662681:ATG2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64698961	C/T	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000068971:ENST00000164133:exon_64698908_64698961:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000527441:exon_64698908_64698961:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000359279:exon_64698908_64698961:PPP2R5B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64789194	T/C	1	172	155	327	82.0662942334128	81.0449092664012	1.02138496701158	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.955864362081588	ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64802388	A/C	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64802319_64802434:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802319_64802434:SNX15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64854812	G/A	1	28	26	54	13.3596292938114	13.5946299414609	-0.235000647649462	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000162300:ENST00000294258:exon_64854788_64854905:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530744:exon_64854788_64854882:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000528123:exon_64854788_64854888:ZFPL1;ENSG00000187066:ENST00000528029:exon_64852451_64856579:AP003068.6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64879480	C/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64879317_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64879326_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528026:exon_64879344_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64879344_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64879344_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533646:exon_64879347_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64879350_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64879356_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64879361_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529414:exon_64879362_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526085:exon_64879363_64879539:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64879374_64880337:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530750:exon_64879470_64879539:TM7SF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64882441	G/A	1	46	44	90	21.9479624112616	23.0062968240107	-1.05833441274911	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.83364086605892	ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882185_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526085:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000524690:exon_64882385_64882507:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531029:exon_64882385_64882476:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882385_64882553:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64883547	G/A	1	103	121	224	49.1443506165205	63.2673162660294	-14.1229656495089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0611910886051036	ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64883365_64883828:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64883365_64883856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000345348:exon_64883365_64883707:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64883365_64883745:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64883365_64883702:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64883365_64883681:TM7SF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64884663	C/T	1	15	6	21	7.15694426454182	3.13722229418327	4.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0848568473104646	ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64884936	G/A	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64898226	C/T	1	16	17	33	7.63407388217794	8.88879650018594	-1.254722618008	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728825872976088	ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	64972308	T/A	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533079:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530495:exon_64972154_64972329:CAPN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65064706	G/A	1	56	42	98	26.7192585876228	21.9605560592829	4.75870252833986	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.363498377763778	ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65088702	G/A	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000149798:ENST00000279249:exon_65088015_65089900:CDC42EP2;ENSG00000149798:ENST00000533419:exon_65088015_65089092:CDC42EP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65164357	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65164270_65164408:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000531151:exon_65164270_65164491:FRMD8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65267796	G/A	1	677	615	1292	323.016751139654	321.565285153786	1.45146598586837	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.955584152178814	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65271832	C/T	1	28	33	61	13.3596292938114	17.254722618008	-3.89509332419662	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.369870909606691	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65272383	C/T	1	36	40	76	17.1766662349004	20.9148152945552	-3.7381490596548	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.422422978200833	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65294524	G/A	1	18	16	34	8.58833311745018	8.36592611782206	0.222406999628117	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000142186:ENST00000270176:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000525364:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000420247:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000533862:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527630:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000349495:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000279270:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000417543:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000524944:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527009:exon_65294433_65294588:SCYL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65307074	G/A	1	17	19	36	8.11120349981406	9.9345372649137	-1.82333376509964	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.617808462551922	ENSG00000168056:ENST00000301874:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000322147:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529582:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000301873:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000530785:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529189:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000532932:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000528516:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000526927:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000532661:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529371:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000530866:exon_65307019_65307099:LTBP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65351074	G/A	1	16	4	20	7.63407388217794	2.09148152945552	5.54259235272242	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.013538908020234	ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65359778	G/T	0	114	1	115	54.3927764105178	0.522870382363879	53.8699060281539	C:G	G	C	10	0.522870382363879	4.73666433424938e-31	ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65359674_65360121:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529099:exon_65359674_65359933:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529596:exon_65359674_65359949:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533364:exon_65359674_65359842:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000527214:exon_65359674_65359933:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529056:exon_65359674_65359951:EHBP1L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65408937	C/T	1	20	16	36	9.54259235272242	8.36592611782206	1.17666623490036	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.740793930979047	ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65418048	G/A	1	330	308	638	157.45277381992	161.044077768075	-3.59130394815477	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.781580578504999	ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65418040_65418401:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65418040_65418351:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65418040_65418389:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65418040_65418058:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000528699:exon_65418040_65418389:SIPA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65623519	G/A	1	2299	2343	4642	1096.92099094544	1225.08530587857	-128.164314933126	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.000168600923002658	ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65629932	T/C	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65629934	G/C	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65631167	C/T	1	2	12	14	0.954259235272242	6.27444458836655	-5.32018535309431	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00555356960539268	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65631973	G/A	1	10	17	27	4.77129617636121	8.88879650018594	-4.11750032382473	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.125677435528638	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65632262	G/T	1	18	18	36	8.58833311745018	9.41166688254982	-0.82333376509964	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.867968606269239	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65685225	T/C	1	30	32	62	14.3138885290836	16.7318522356441	-2.4179637065605	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.611484523246447	ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65685293	C/T	1	26	18	44	12.4053700585391	9.41166688254982	2.99370317598933	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.450910952260058	ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65685317	G/A	1	16	37	53	7.63407388217794	19.3462041474635	-11.7121302652856	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00139640898254764	ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65732651	G/A	1	36	39	75	17.1766662349004	20.3919449121913	-3.21527867729092	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.489035656379493	ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	65984225	C/G	1	13	6	19	6.20268502926957	3.13722229418327	3.0654627350863	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.175490139559428	ENSG00000175115:ENST00000527224:exon_65984166_65986168:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_65984166_65984246:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000531298:exon_65984166_65984246:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000524784:exon_65984166_65984246:PACS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	66006677	G/A	1	23	18	41	10.9739812056308	9.41166688254982	1.56231432308096	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.642997695404227	ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_66006613_66006748:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529757:exon_66006613_66006748:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000525798:exon_66006613_66006748:PACS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	66031402	G/A	1	4	11	15	1.90851847054448	5.75157420600267	-3.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.067722028140312	ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031322_66031423:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031322_66031423:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031322_66031423:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031322_66031423:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031322_66031423:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031322_66031423:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031322_66031423:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031322_66031423:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031322_66031423:KLC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	66249787	G/A	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66249651_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531272:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66249760_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531314:exon_66249664_66249941:DPP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	66249898	G/A	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66249651_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531272:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66249760_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531314:exon_66249664_66249941:DPP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	66260191	C/T	1	35	18	53	16.6995366172642	9.41166688254982	7.28786973471442	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0535744728250289	ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533799:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000525738:exon_66260187_66260381:DPP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	66288733	G/C	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.370794847578149	ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	66360730	A/T	1	14	18	32	6.67981464690569	9.41166688254982	-2.73185223564413	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.378432073331373	ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66360292_66360771:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66360624_66360771:CCS;ENSG00000173992:ENST00000526066:exon_66360661_66360771:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66360672_66360771:CCS;ENSG00000173992:ENST00000526058:exon_66360675_66360771:CCS;ENSG00000173992:ENST00000531990:exon_66360704_66360771:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66360712_66360771:CCS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	66610645	G/C	1	22	24	46	10.4968515879947	12.5488891767331	-2.05203758873843	A:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.558519211713761	ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	67069116	G/A	1	27	24	51	12.8824996761753	12.5488891767331	0.333610499442173	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068959_67069122:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068959_67069122:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068959_67069122:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068959_67069122:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068959_67069122:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068959_67069122:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068753_67069294:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068959_67069122:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000504236:exon_67068944_67069122:ANKRD13D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	67257556	C/T	1	277	244	521	132.164904085206	127.580373296786	4.58453078841907	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.69330962662647	ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257509_67257685:AIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	67352689	A/G	1	930	808	1738	443.730544401593	422.479268950014	21.2512754515784	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.313249050423185	ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	67353970	T/C	1	2133	1845	3978	1017.71747441785	964.695855461357	53.0216189564895	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.092517254839591	ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	67864499	G/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000110721:ENST00000265689:exon_67864486_67864597:CHKA;ENSG00000110721:ENST00000356135:exon_67864486_67864597:CHKA;ENSG00000110721:ENST00000531341:exon_67864486_67864597:CHKA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	68029103	C/T	1	108	114	222	51.5299987047011	59.6072235894822	-8.07722488478113	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.283082049934758	ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000531745:exon_68028931_68029270:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000533310:exon_68029077_68029193:C11orf24
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	68704028	C/T	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	70279759	G/A	1	25	26	51	11.928240440903	13.5946299414609	-1.66638950055783	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.675682622744877	ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	71152329	G/A	1	60	40	100	28.6277770581673	20.9148152945552	7.7129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.133468209127826	ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000534701:exon_71152273_71152393:DHCR7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	71169547	G/C	1	25	8	33	11.928240440903	4.18296305891103	7.745277381992	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00812522752709228	ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	71185443	C/T	1	21	19	40	10.0197219703585	9.9345372649137	0.085184705444842	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	71510615	G/A	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000158483:ENST00000346333:exon_71510607_71512280:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000426628:exon_71510607_71512273:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000510443:exon_71510607_71511770:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000359244:exon_71510607_71512282:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000528685:exon_71510607_71511145:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000393714:exon_71510607_71511145:FAM86C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	72004419	T/C	1	21	21	42	10.0197219703585	10.9802780296415	-0.960556059282915	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.877486638600646	ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72003474_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72004347_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72004347_72004659:CLPB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	72012940	C/T	1	15	17	32	7.15694426454182	8.88879650018594	-1.73185223564413	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.597599372848838	ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72012847_72013008:CLPB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	72145307	C/G	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72145116_72145568:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72145116_72145571:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72145116_72145571:CLPB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	73106237	A/C	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	73106294	A/C	1	14	6	20	6.67981464690569	3.13722229418327	3.54259235272242	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.122889322650138	ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	73620537	C/G	1	10	19	29	4.77129617636121	9.9345372649137	-5.16324108855249	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0632900681634697	ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	73686038	G/A	1	605	621	1226	288.663418669853	324.702507447969	-36.0390887781156	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0395739444329917	ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73685716_73686166:UCP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	73689112	G/A	1	163	203	366	77.7721276746877	106.142687619867	-28.3705599451797	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00333687860350461	ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	74345735	G/A	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74345628_74345740:POLD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	75277376	C/T	1	12	11	23	5.72555541163345	5.75157420600267	-0.0260187943692163	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277361_75277436:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277361_75277511:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	75277959	A/G	1	20	22	42	9.54259235272242	11.5031484120053	-1.96055605928292	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.643620805806273	ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	77348779	A/T	1	37	43	80	17.6537958525365	22.4834264416468	-4.82963058911032	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.314084537987872	ENSG00000074201:ENST00000525428:exon_77348635_77348850:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000263309:exon_77348635_77348796:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000525064:exon_77348635_77348817:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000532069:exon_77348635_77348839:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000527133:exon_77348635_77348827:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000528364:exon_77348635_77348821:CLNS1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	77411976	C/T	1	25	37	62	11.928240440903	19.3462041474635	-7.41796370656049	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0743047306676503	ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77411775_77412043:RSF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	85968623	C/T	1	10	16	26	4.77129617636121	8.36592611782206	-3.59462994146085	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.1733631823964	ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	87847163	T/C	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87846431_87847308:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87846632_87847308:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87846780_87847308:RAB38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	89935586	G/T	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	94231257	C/G	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	95569448	T/C	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95569312_95569488:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95569312_95569488:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95569312_95569488:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95569312_95569488:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95569312_95569488:MTMR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	96116444	T/C	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	102272277	G/T	1	36	38	74	17.1766662349004	19.8690745298274	-2.69240829492704	T:C:G	G	T	10	0.522870382363879	0.561834323660417	ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272270_102272423:TMEM123
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	102398672	T/G	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000137673:ENST00000260227:exon_102398488_102398714:MMP7;ENSG00000137673:ENST00000533366:exon_102398488_102398714:MMP7;ENSG00000137673:ENST00000531200:exon_102398488_102398714:MMP7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	104899901	T/C	1	4	15	19	1.90851847054448	7.84305573545818	-5.9345372649137	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00955973120753197	ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104899851_104899994:CASP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	107197606	G/C	1	9	5	14	4.29416655872509	2.61435191181939	1.6798146469057	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.430819213902139	ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	107197629	G/A	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	107207351	T/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107207284_107207439:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107207284_107207439:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107207284_107207439:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107207284_107207439:CWF19L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	108594124	G/A	1	42	47	89	20.0394439407171	24.5749079711023	-4.53546403038522	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.341799747949376	ENSG00000178105:ENST00000322536:exon_108593724_108594189:DDX10;ENSG00000178105:ENST00000456020:exon_108593724_108594189:DDX10;ENSG00000178105:ENST00000526794:exon_108593724_108594189:DDX10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	110104139	G/A	1	29	27	56	13.8367589114475	14.1175003238247	-0.280741412377221	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000137710:ENST00000530749:exon_110103962_110104204:RDX;ENSG00000137710:ENST00000528498:exon_110103962_110104204:RDX;ENSG00000137710:ENST00000405097:exon_110103962_110104204:RDX;ENSG00000137710:ENST00000528900:exon_110103962_110104204:RDX;ENSG00000137710:ENST00000527537:exon_110103962_110104204:RDX;ENSG00000137710:ENST00000532461:exon_110103962_110104204:RDX;ENSG00000137710:ENST00000343115:exon_110103962_110104204:RDX;ENSG00000137710:ENST00000533961:exon_110103962_110104248:RDX;ENSG00000137710:ENST00000530131:exon_110103962_110104204:RDX;ENSG00000137710:ENST00000530085:exon_110103962_110104204:RDX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	111953435	G/T	1	32	23	55	15.2681477643559	12.0260187943692	3.24212896998666	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.419541913925535	ENSG00000150776:ENST00000420986:exon_111953192_111954858:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000393048:exon_111953189_111955872:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000532163:exon_111953189_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000280352:exon_111953192_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000524989:exon_111953189_111953669:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000393047:exon_111953189_111955874:C11orf57;ENSG00000150776:ENST00000525785:exon_111953189_111953546:C11orf57
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	111959625	C/T	1	8	13	21	3.81703694108897	6.79731497073043	-2.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.27445798442317	ENSG00000204370:ENST00000375549:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528182:exon_111959591_111959728:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528021:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000526592:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000525291:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000530923:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000534010:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000255292:ENST00000531744:exon_111959591_111959735:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000532699:exon_111959591_111959735:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000525987:exon_111959591_111959735:AP002884.2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	116729196	T/C	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	117097952	C/T	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117097873_117098038:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117097873_117098038:PCSK7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	117163824	C/G	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	117222592	G/A	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	117267884	A/G	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	117691386	G/A	1	127	86	213	60.5954614397874	44.9668528832936	15.6286085564938	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0334479371256948	ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	117869670	A/G	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	118068752	T/C	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118067450_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118068683_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531530:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118068713_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118068324_118068806:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000414357:exon_118068683_118068806:AMICA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	118083136	C/T	1	3	11	14	1.43138885290836	5.75157420600267	-4.32018535309431	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0293845133860985	ENSG00000160593:ENST00000356289:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000292067:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000534294:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000533261:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526595:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000526620:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000529164:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000414357:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000531536:exon_118083122_118083185:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000524477:exon_118083122_118083276:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000527877:exon_118083122_118083184:AMICA1;ENSG00000160593:ENST00000525565:exon_118083122_118083276:AMICA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	118471423	T/C	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	118889016	G/A	1	422	345	767	201.348698642443	180.390281915538	20.9584167269049	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.138297485767475	ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118888992_118889040:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118888992_118889388:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118888992_118889400:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118888992_118889054:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118888072_118889401:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118888992_118889052:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000524864:exon_118888992_118889376:RPS25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	118919206	T/C	1	21	20	41	10.0197219703585	10.4574076472776	-0.437685676919036	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	118967758	T/C	1	32	30	62	15.2681477643559	15.6861114709164	-0.417963706560496	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	119005132	C/T	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	119052826	C/A	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	121475922	T/A	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	121489563	G/A	1	31	17	48	14.7910181467198	8.88879650018594	5.90222164653381	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.111173375700334	ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000528339:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534754:exon_121489483_121489602:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000524633:exon_121489483_121489602:SORL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	124967487	T/A	1	18	9	27	8.58833311745018	4.70583344127491	3.88249967617527	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.176928027035863	ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	128651893	A/G	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128651853_128651918:FLI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	11	128680613	C/T	1	15	18	33	7.15694426454182	9.41166688254982	-2.254722618008	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.487711537553837	ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128680354_128681291:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128680354_128683161:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128680354_128682311:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128680354_128681115:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128680354_128681398:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128680354_128683161:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000528790:exon_128680354_128682311:FLI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	550113	T/C	1	4	11	15	1.90851847054448	5.75157420600267	-3.84305573545818	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.067722028140312	ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_550010_550162:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_550010_550162:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_550010_550162:CCDC77
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	990912	A/C	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	994014	C/T	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	1893170	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	2062000	C/T	1	22	21	43	10.4968515879947	10.9802780296415	-0.483426441646795	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.880238254385161	ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	2968169	A/G	1	35	32	67	16.6995366172642	16.7318522356441	-0.0323156183798901	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	2973495	A/G	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	2973615	T/C	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	3147154	C/T	1	23	14	37	10.9739812056308	7.32018535309431	3.65379585253648	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.252297624739388	ENSG00000197905:ENST00000358409:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000359864:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000443986:exon_3147134_3147274:TEAD4;ENSG00000197905:ENST00000397122:exon_3147134_3147274:TEAD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	4383158	T/C	1	73	63	136	34.8304620874368	32.9408340889244	1.88962799851246	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.796944773796713	ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4382902_4383401:CCND2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	4459032	G/A	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	4614545	A/G	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000047621:ENST00000261250:exon_4614472_4614546:C12orf4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	4665547	C/T	1	13	4	17	6.20268502926957	2.09148152945552	4.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0530050628667056	ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4665519_4665668:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4665519_4665668:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4665519_4665716:RAD51AP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	4716513	C/T	1	20	23	43	9.54259235272242	12.0260187943692	-2.4834264416468	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.450864840257985	ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	6554628	G/A	1	167	118	285	79.6806461452322	61.6987051189377	17.9819410262945	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0377630692702214	ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6554590_6554721:CD27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	6647109	T/C	1	3917	4101	8018	1868.91671228069	2144.29143807427	-275.374725793582	A:T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	7.70731525632288e-10	ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	6760367	C/T	1	22	16	38	10.4968515879947	8.36592611782206	2.1309254701726	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.519828323691089	ENSG00000111653:ENST00000341550:exon_6759446_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000444704:exon_6759705_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000396807:exon_6759757_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000437127:exon_6759757_6760392:ING4;ENSG00000111653:ENST00000435449:exon_6759757_6760392:ING4;ENSG00000111653:ENST00000446105:exon_6759792_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000486287:exon_6759957_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000484795:exon_6759990_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000482489:exon_6760131_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000469749:exon_6760178_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000472002:exon_6760180_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000488381:exon_6760262_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000495771:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000493144:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000472810:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000466221:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000423703:exon_6760361_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000412586:exon_6760361_6760400:ING4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	6965194	A/G	1	12	12	24	5.72555541163345	6.27444458836655	-0.548889176733095	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.841001758494376	ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	7069043	C/G	1	14	6	20	6.67981464690569	3.13722229418327	3.54259235272242	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.122889322650138	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	7090193	A/G	1	13	5	18	6.20268502926957	2.61435191181939	3.58833311745018	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.102475160424192	ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	7242204	C/T	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000159403:ENST00000290575:exon_7242183_7242329:C1R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	8756842	A/G	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000111732:ENST00000229335:exon_8754762_8756933:AICDA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	8757971	G/A	1	21	22	43	10.0197219703585	11.5031484120053	-1.4834264416468	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.651176113496584	ENSG00000111732:ENST00000229335:exon_8757811_8758081:AICDA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	10854625	G/A	1	182	189	371	86.837590409774	98.8225022667731	-11.9849118569991	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.231903934239460	ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	10862589	C/T	1	41	51	92	19.562314323081	26.6663895005578	-7.10407517747687	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.144891479123809	ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10862507_10862713:CSDA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	12974935	C/T	1	27	13	40	12.8824996761753	6.79731497073043	6.08518470544484	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.058275124436428	ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12974899_12975017:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12974899_12975017:DDX47
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	14631339	G/A	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14631251_14631406:ATF7IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	14927825	C/G	1	98	71	169	46.7587025283399	37.1237971478354	9.63490538050446	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.143878328592315	ENSG00000111332:ENST00000389078:exon_14927349_14927957:H2AFJ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	16189694	T/A	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	25254189	C/T	1	61	46	107	29.1049066758034	24.0520375887384	5.05286908706495	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.335129184506509	ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25254112_25254259:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25254112_25254259:LRMP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	27064232	C/T	1	56	50	106	26.7192585876228	26.1435191181939	0.575739469428832	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.922893201850225	ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27064111_27064250:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27064111_27064250:C12orf11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	27143508	G/A	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000064115:ENST00000343028:exon_27143383_27143560:TM7SF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	28515383	C/G	1	7	14	21	3.33990732345285	7.32018535309431	-3.98027802964146	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.124227497168679	ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28515371_28515448:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28515371_28515448:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28515371_28515448:CCDC91
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	28603112	A/G	1	12	19	31	5.72555541163345	9.9345372649137	-4.20898185328025	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.151304978564878	ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	28605426	G/A	1	29	21	50	13.8367589114475	10.9802780296415	2.85648088180605	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.479883362830296	ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	31825294	A/G	1	3	9	12	1.43138885290836	4.70583344127491	-3.27444458836655	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0812439974911473	ENSG00000139160:ENST00000357721:exon_31820581_31826032:C12orf72;ENSG00000151743:ENST00000281471:exon_31824073_31825311:AMN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	32138082	A/C	1	13	9	22	6.20268502926957	4.70583344127491	1.49685158799466	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.670537930867177	ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	32906869	C/T	1	35	23	58	16.6995366172642	12.0260187943692	4.67351782289502	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.238406763912337	ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32906852_32907019:YARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	32908299	C/T	1	17	17	34	8.11120349981406	8.88879650018594	-0.777593000371883	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.864331580165732	ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32908030_32908874:YARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	48238757	A/G	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48235322_48238788:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48235322_48238788:VDR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	49065727	T/C	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.370794847578149	ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000357861:exon_49065582_49065745:C12orf41
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	49237746	C/G	1	16	10	26	7.63407388217794	5.22870382363879	2.40537005853915	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.433369160576612	ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49237723_49237833:DDX23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	49334762	G/C	1	60	36	96	28.6277770581673	18.8233337650996	9.80444329306762	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0518387360408094	ENSG00000134287:ENST00000256682:exon_49334731_49334971:ARF3;ENSG00000134287:ENST00000447318:exon_49334731_49334971:ARF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	49722793	C/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49722710_49722838:TROAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	49919968	C/T	1	57	75	132	27.1963882052589	39.2152786772909	-12.018890472032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.03680552748463	ENSG00000123352:ENST00000321898:exon_49919727_49921207:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000447889:exon_49919727_49921207:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000395063:exon_49919727_49921207:SPATS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	50045987	A/G	1	14	8	22	6.67981464690569	4.18296305891103	2.49685158799466	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.393877834025079	ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50045716_50045995:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50045716_50045995:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000293590:exon_50045716_50045995:FMNL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	50152193	G/A	1	136	137	273	64.8896279985125	71.6332423838514	-6.74361438533894	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.431163417005429	ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	50153060	A/G	1	94	123	217	44.8501840577954	64.3130570307571	-19.4628729729617	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0096561122958225	ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50153004_50153104:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50153004_50153104:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50153004_50153104:TMBIM6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	50384469	A/G	1	27	17	44	12.8824996761753	8.88879650018594	3.99370317598933	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.290708379087478	ENSG00000161800:ENST00000454520:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000434422:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000427314:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000312377:exon_50384467_50384575:RACGAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	50524371	C/T	1	33	24	57	15.745277381992	12.5488891767331	3.1963882052589	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.428223621523388	ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50523608_50524477:LASS5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	51203371	C/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	51495759	G/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000135457:ENST00000257915:exon_51495718_51495808:TFCP2;ENSG00000135457:ENST00000307660:exon_51495718_51495808:TFCP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	51681903	T/C	1	36	28	64	17.1766662349004	14.6403707061886	2.53629552871175	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.534848993708638	ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	51681967	A/C	1	30	38	68	14.3138885290836	19.8690745298274	-5.55518600074377	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.18378814031031	ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	51685831	T/C	1	29	28	57	13.8367589114475	14.6403707061886	-0.8036117947411	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.894778582579504	ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	52467406	A/G	1	36	43	79	17.1766662349004	22.4834264416468	-5.30676020674644	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.260310702164971	ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52467359_52467686:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52467359_52467686:C12orf44
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53433486	C/T	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53473126	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000167778:ENST00000301463:exon_53473095_53473170:SPRYD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53585754	G/A	1	231	165	396	110.216941673944	86.27361309004	23.9433285839039	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0179523374535525	ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53585643_53585803:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53585643_53585803:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53585643_53585803:ITGB7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53586198	G/T	1	270	175	445	128.824996761753	91.5023169136788	37.3226798480739	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.000433214077117091	ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586114_53586322:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53586114_53586322:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586114_53586322:ITGB7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53680102	C/T	0	0	8	8	0	4.18296305891103	-4.18296305891103	T	C	T	10	0.522870382363879	0.0026859072312288	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53679708_53680696:ESPL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53681883	A/T	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53681963	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53682326	G/A	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53686073	G/T	1	22	20	42	10.4968515879947	10.4574076472776	0.0394439407170832	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53686062_53686177:ESPL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53686703	G/A	1	34	33	67	16.2224069996281	17.254722618008	-1.03231561837989	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.808102177727052	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53686590_53686754:ESPL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53693532	A/G	1	15	15	30	7.15694426454182	7.84305573545818	-0.686111470916369	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.856171129714278	ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693470_53693737:C12orf10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53693533	A/C	1	15	16	31	7.15694426454182	8.36592611782206	-1.20898185328025	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.721038527279618	ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693470_53693737:C12orf10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53700848	C/T	1	145	88	233	69.1837945572375	46.0125936480214	23.1712009092162	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00249862383347242	ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53700750_53700965:C12orf10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53700860	A/G	1	129	72	201	61.5497206750596	37.6466675301993	23.9030531448603	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.000860244554196936	ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53700750_53700965:C12orf10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53703021	G/A	1	58	46	104	27.673517822895	24.0520375887384	3.62148023415659	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.493502041447362	ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53702941_53703065:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53702941_53703065:AAAS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	53900640	A/G	1	8	9	17	3.81703694108897	4.70583344127491	-0.888796500185942	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.809268533848644	ENSG00000139574:ENST00000267017:exon_53900474_53900677:NPFF;ENSG00000139574:ENST00000448979:exon_53900474_53900677:NPFF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	54576049	C/T	1	17	11	28	8.11120349981406	5.75157420600267	2.35962929381139	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.450663887484502	ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000401977:exon_54575738_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000511522:exon_54575882_54576407:SMUG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	56295734	A/G	1	82	60	142	39.1246286461619	31.3722229418327	7.75240570432918	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.207907405536289	ENSG00000170473:ENST00000408946:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000398213:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000302533:exon_56295198_56296139:WIBG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	56345408	T/G	1	15	12	27	7.15694426454182	6.27444458836655	0.882499676175268	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.847915973483971	ENSG00000065357:ENST00000331886:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394145:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394147:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000402956:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000412897:exon_56345407_56345567:DGKA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	56360876	G/A	1	18	19	37	8.58833311745018	9.9345372649137	-1.34620414746352	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.742792725647821	ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	56435929	C/G	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	56814653	G/A	1	18	22	40	8.58833311745018	11.5031484120053	-2.91481529455516	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.429199059498376	ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	56815922	C/T	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	56993078	C/T	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56992913_56993142:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56992913_56993142:BAZ2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	56994170	C/T	1	6	19	25	2.86277770581673	9.9345372649137	-7.07175955909697	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00479629727148017	ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56993985_56994274:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56993985_56994274:BAZ2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57003964	T/A	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_57003898_57003999:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_57003898_57003999:BAZ2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57032957	G/A	1	990	863	1853	472.35832145976	451.237139980028	21.1211814797323	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.328794094854771	ENSG00000110955:ENST00000262030:exon_57032890_57033091:ATP5B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57106660	A/T	1	3894	3661	7555	1857.94273107506	1914.22846983416	-56.2857387591055	A:T:C:G	A	T	10	0.522870382363879	0.197087470851448	ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57624701	C/T	1	104	84	188	49.6214802341566	43.9211121185658	5.70036811559076	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.422488935498178	ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57624586_57624783:SHMT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57627074	G/T	1	257	203	460	122.622311732483	106.142687619867	16.4796241126157	T:C:G	G	T	10	0.522870382363879	0.135201107173790	ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57627671	G/A	1	350	281	631	166.995366172642	146.92657744425	20.0687887283924	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.111067552385099	ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57627532_57627687:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57627532_57627687:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57627532_57627687:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57627532_57627687:SHMT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57869582	T/C	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	T	T		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57869559_57869714:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57869559_57869714:ARHGAP9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57870155	A/C	1	30	45	75	14.3138885290836	23.5291672063746	-9.21527867729092	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0371991055055868	ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57906577	T/C	1	48	56	104	22.9022216465338	29.2807414123772	-6.37851976584341	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.238786424327141	ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57906534_57906747:MARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57911160	G/A	1	28	17	45	13.3596292938114	8.88879650018594	4.47083279362545	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.232228239659104	ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57928925	G/A	1	57	88	145	27.1963882052589	46.0125936480214	-18.8162054427625	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00200928105383404	ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57928839_57928937:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57928839_57928937:DCTN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	57994776	C/T	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57994594_57994861:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57994594_57994861:PIP4K2C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	58162739	A/G	1	19	11	30	9.0654627350863	5.75157420600267	3.31388852908363	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.273871648112103	ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	58176614	T/C	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	58345606	T/C	1	11	6	17	5.24842579399733	3.13722229418327	2.11120349981406	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.340952760955587	ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	62784650	T/C	1	16	25	41	7.63407388217794	13.071759559097	-5.43768567691904	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.116939264065251	ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62784644_62784759:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62784644_62784759:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62784644_62784759:USP15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	64841925	C/T	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64841885_64842461:XPOT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	66546100	A/G	1	12	12	24	5.72555541163345	6.27444458836655	-0.548889176733095	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.841001758494376	ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	66725160	C/T	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	66725202	C/T	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	68052178	G/T	1	18	10	28	8.58833311745018	5.22870382363879	3.35962929381139	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.256783109761352	ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	68696569	A/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68696400_68696652:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68696400_68696652:MDM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	70188941	A/G	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000127328:ENST00000378815:exon_70188921_70190424:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000247833:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000417413:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000483530:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000362025:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325555:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000378809:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325596:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000526994:exon_70188921_70189124:RAB3IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	72312268	G/A	1	15	9	24	7.15694426454182	4.70583344127491	2.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.414521773200192	ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72312231_72312328:TBC1D15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	80190582	A/G	1	63	67	130	30.0591659110756	35.0323156183799	-4.97314970730426	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.429535242608697	ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	80190650	C/G	1	91	75	166	43.418795204887	39.2152786772909	4.2035165275961	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.534842575991449	ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	82752491	G/C	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	89814934	C/A	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000139323:ENST00000393179:exon_89813505_89815034:POC1B;ENSG00000139323:ENST00000378528:exon_89813505_89815034:POC1B;ENSG00000139323:ENST00000313546:exon_89813505_89815034:POC1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	90028901	T/C	1	19	18	37	9.0654627350863	9.41166688254982	-0.346204147463521	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000393164:exon_90028774_90029028:ATP2B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	93171893	A/G	1	18	9	27	8.58833311745018	4.70583344127491	3.88249967617527	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.176928027035863	ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93171717_93171955:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93171717_93171955:EEA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	93196422	T/G	1	11	1	12	5.24842579399733	0.522870382363879	4.72555541163345	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.00695977522690581	ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	93966693	A/G	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:T:G	A	G	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000120833:ENST00000340600:exon_93966461_93966812:SOCS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	96422844	G/A	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000111144:ENST00000228740:exon_96422833_96422963:LTA4H;ENSG00000111144:ENST00000413268:exon_96422833_96422963:LTA4H;ENSG00000111144:ENST00000393070:exon_96422833_96422963:LTA4H
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	100444901	T/C	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100444857_100444999:UHRF1BP1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	100732327	C/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100732306_100733912:SCYL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	102811624	G/T	1	13	15	28	6.20268502926957	7.84305573545818	-1.64037070618861	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.574266908162175	ENSG00000017427:ENST00000307046:exon_102811269_102811781:IGF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	103352649	C/G	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000139352:ENST00000266744:exon_103351452_103352780:ASCL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	106633048	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	106633348	G/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	106898000	T/C	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106897859_106898032:POLR3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	108096718	T/C	1	40	29	69	19.0851847054448	15.1632410885525	3.92194361689235	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.3991974884954	ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	108096769	G/C	1	12	30	42	5.72555541163345	15.6861114709164	-9.96055605928292	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00286604836033858	ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	108917318	C/T	1	46	37	83	21.9479624112616	19.3462041474635	2.60175826379805	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.584584943044077	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108915992_108917411:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108915992_108917411:SART3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	108918146	C/T	1	38	36	74	18.1309254701726	18.8233337650996	-0.692408294927041	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.907663471275652	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108918093_108918283:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108918093_108918283:SART3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	108923950	A/G	1	52	69	121	24.8107401170783	36.0780563831077	-11.2673162660294	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0450311097334496	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108923919_108924087:SART3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	109017264	T/C	1	50	12	62	23.8564808818061	6.27444458836655	17.5820362934395	T:C	T	C	10	0.522870382363879	4.99954372438712e-06	ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	109017266	G/A	1	51	12	63	24.3336104994422	6.27444458836655	18.0591659110756	A:G	G	A	10	0.522870382363879	3.15535828131625e-06	ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	109017898	C/T	1	18	22	40	8.58833311745018	11.5031484120053	-2.91481529455516	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.429199059498376	ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	109968427	C/T	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000151148:ENST00000342494:exon_109968352_109968463:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000434735:exon_109968352_109968463:UBE3B;ENSG00000151148:ENST00000449510:exon_109968352_109968463:UBE3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	109994870	A/T	1	134	90	224	63.9353687632402	47.0583344127491	16.8770343504911	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.0270916794260361	ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	110011229	G/T	1	19	7	26	9.0654627350863	3.66009267654715	5.40537005853915	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0476149367204734	ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	110011230	C/T	1	20	7	27	9.54259235272242	3.66009267654715	5.88249967617527	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0322375213971925	ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	110017618	G/A	1	25	17	42	11.928240440903	8.88879650018594	3.03944394071709	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.359371060490911	ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110017607_110017751:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110017607_110017751:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110017607_110017751:MVK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	110341933	A/G	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	111160003	G/A	1	61	33	94	29.1049066758034	17.254722618008	11.8501840577954	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0171308601247216	ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	112191641	G/A	1	12	11	23	5.72555541163345	5.75157420600267	-0.0260187943692163	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	112471090	G/T	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112471037_112471183:NAA25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	112580071	C/T	1	20	10	30	9.54259235272242	5.22870382363879	4.31388852908363	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.143452102098685	ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	113424893	C/G	1	23	20	43	10.9739812056308	10.4574076472776	0.516573558353205	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	113445605	G/A	1	39	14	53	18.6080550878087	7.32018535309431	11.2878697347144	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00218928949526992	ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113445510_113445748:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113445510_113445748:OAS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	113534591	C/T	1	6	14	20	2.86277770581673	7.32018535309431	-4.45740764727758	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0706835394284982	ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	113534633	C/T	1	6	15	21	2.86277770581673	7.84305573545818	-4.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0466412463418783	ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	114282592	C/G	1	26	22	48	12.4053700585391	11.5031484120053	0.90222164653381	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.885381060616772	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	114377885	G/C	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	117476896	C/A	1	12	36	48	5.72555541163345	18.8233337650996	-13.0977783534662	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.000138929558773594	ENSG00000088992:ENST00000470612:exon_117476728_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000335209:exon_117476729_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000392545:exon_117476729_117477015:TESC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	117513129	G/A	1	27	18	45	12.8824996761753	9.41166688254982	3.47083279362545	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.370832512223825	ENSG00000088992:ENST00000470612:exon_117513076_117513145:TESC;ENSG00000088992:ENST00000335209:exon_117513076_117513145:TESC;ENSG00000088992:ENST00000392545:exon_117513076_117513145:TESC;ENSG00000088992:ENST00000462502:exon_117513076_117513145:TESC;ENSG00000088992:ENST00000482176:exon_117513076_117513145:TESC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	118465820	T/C	1	8	12	20	3.81703694108897	6.27444458836655	-2.45740764727758	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.371138995758136	ENSG00000111445:ENST00000229043:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000454402:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000392542:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000449641:exon_118465758_118465835:RFC5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	120576637	G/A	1	5	12	17	2.38564808818061	6.27444458836655	-3.88879650018594	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0866683893241667	ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120576499_120576660:GCN1L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	120582755	G/A	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120582727_120582865:GCN1L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	120907271	G/T	1	151	161	312	72.0465722630543	84.1821315605845	-12.1355592975302	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.174031611010284	ENSG00000111786:ENST00000229390:exon_120907225_120907464:SRSF9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	121442199	T/A	1	6	13	19	2.86277770581673	6.79731497073043	-3.9345372649137	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.105598920841065	ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	121465587	G/A	1	18	14	32	8.58833311745018	7.32018535309431	1.26814776435587	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.725074190491161	ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121465379_121465620:OASL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	121660787	T/C	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	121666646	A/G	1	5	12	17	2.38564808818061	6.27444458836655	-3.88879650018594	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0866683893241667	ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121666528_121666669:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121666528_121666669:P2RX4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	121878659	C/T	1	15	13	28	7.15694426454182	6.79731497073043	0.359629293811389	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	121880520	G/A	1	13	18	31	6.20268502926957	9.41166688254982	-3.20898185328025	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.282888239737375	ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	121881848	G/A	1	11	13	24	5.24842579399733	6.79731497073043	-1.54888917673309	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.546918420888488	ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	122064893	C/T	1	17	18	35	8.11120349981406	9.41166688254982	-1.30046338273576	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.736056008386851	ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122064455_122064956:ORAI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	122079189	C/T	1	55	48	103	26.2421289699867	25.0977783534662	1.14435061652047	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.844161475110285	ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	122692958	C/T	1	77	61	138	36.7389805579813	31.8950933241966	4.84388723378471	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.443436065825109	ENSG00000184047:ENST00000413918:exon_122692210_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000353548:exon_122692216_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000443649:exon_122692216_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000464942:exon_122692314_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000342392:exon_122692321_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000267169:exon_122692323_122693124:DIABLO;ENSG00000184047:ENST00000439489:exon_122692863_122693124:DIABLO
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	122717402	G/A	1	20	13	33	9.54259235272242	6.79731497073043	2.745277381992	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.386037409230635	ENSG00000139719:ENST00000267199:exon_122717347_122717515:VPS33A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	122734427	T/G	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000139719:ENST00000267199:exon_122734418_122734592:VPS33A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	123463812	C/T	1	34	17	51	16.2224069996281	8.88879650018594	7.33361049944217	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.048861149744726	ENSG00000111325:ENST00000406539:exon_123463630_123463996:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000397389:exon_123463630_123464588:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000228922:exon_123463630_123463996:OGFOD2;ENSG00000111325:ENST00000454694:exon_123463630_123463996:OGFOD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	123466172	C/G	1	466	459	925	222.342401818432	239.99750550502	-17.655103686588	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.249420421809587	ENSG00000182196:ENST00000453766:exon_123466142_123466426:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000315580:exon_123466118_123466426:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392435:exon_123466142_123466426:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000454885:exon_123466118_123466426:ARL6IP4;ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	123799974	A/G	1	5	11	16	2.38564808818061	5.75157420600267	-3.36592611782206	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.131501130991483	ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	124097766	A/G	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124097717_124097799:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124097717_124097799:DDX55
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	124104049	A/G	1	41	33	74	19.562314323081	17.254722618008	2.30759170507296	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.642296539691888	ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	124104551	A/G	1	49	60	109	23.3793512641699	31.3722229418327	-7.99287167766281	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.150029192202823	ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	124104686	G/A	1	40	47	87	19.0851847054448	24.5749079711023	-5.48972326565747	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.240277425740218	ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	124144395	A/G	1	2	11	13	0.954259235272242	5.75157420600267	-4.79731497073043	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0100423055089113	ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	124826462	C/T	1	12	5	17	5.72555541163345	2.61435191181939	3.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.150562479720797	ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124826369_124826620:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000453428:exon_124826369_124826601:NCOR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	124829234	C/T	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124829143_124829497:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124829143_124829497:NCOR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	124856618	A/G	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	125348263	C/T	1	14	20	34	6.67981464690569	10.4574076472776	-3.77759300037188	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.230189912021864	ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125348141_125348519:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125348141_125348519:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125348141_125348393:SCARB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	125398039	G/C	1	1911	1539	3450	911.794699302627	804.69751845801	107.097180844618	A:T:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.000264228051752119	ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	125398319	G/A	1	940	631	1571	448.501840577954	329.931211271608	118.570629306346	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	2.01457682738036e-09	ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	125509706	G/T	1	29	25	54	13.8367589114475	13.071759559097	0.764999352350538	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.892071253797457	ENSG00000184992:ENST00000341446:exon_125509537_125511045:BRI3BP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	125509772	G/T	1	47	31	78	22.4250920288977	16.2089818532802	6.21611017561744	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.174338962696186	ENSG00000184992:ENST00000341446:exon_125509537_125511045:BRI3BP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	125561151	A/G	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	125587285	G/A	1	2	9	11	0.954259235272242	4.70583344127491	-3.75157420600267	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0318932346368143	ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125587225_125587339:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125587225_125587339:AACS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	125612781	C/T	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125612707_125612820:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125612707_125612820:AACS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	132325376	C/T	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000198598:ENST00000360564:exon_132325118_132325401:MMP17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	132335592	G/A	1	19	2	21	9.0654627350863	1.04574076472776	8.01972197035854	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.000287159891059459	ENSG00000198598:ENST00000360564:exon_132335470_132336316:MMP17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	132626425	G/A	1	14	18	32	6.67981464690569	9.41166688254982	-2.73185223564413	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.378432073331373	ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	12	133683261	T/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	19271676	A/T	0	69	1	70	32.9219436168923	0.522870382363879	32.3990732345285	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1.35312987892897e-18	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	21751005	G/C	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.317817109593722	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	23928912	C/T	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000476776:exon_23928658_23929029:SACS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	23929502	C/G	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	24380163	G/A	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24380089_24380208:MIPEP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	24465529	T/C	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000205863:ENST00000382145:exon_24465238_24465650:RP11-45B20.2;ENSG00000205863:ENST00000382137:exon_24465388_24466200:RP11-45B20.2;ENSG00000205863:ENST00000382140:exon_24465428_24466200:RP11-45B20.2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	25009297	G/T	1	34	28	62	16.2224069996281	14.6403707061886	1.58203629343951	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.704983511708848	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	25009441	C/G	1	19	22	41	9.0654627350863	11.5031484120053	-2.43768567691904	A:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.532306974462956	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	25009485	C/G	1	11	21	32	5.24842579399733	10.9802780296415	-5.73185223564413	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0509697665085553	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	25009532	T/C	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	25026574	G/A	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25026544_25026731:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25026110_25026731:PARP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	25479706	T/A	1	11	6	17	5.24842579399733	3.13722229418327	2.11120349981406	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.340952760955587	ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	25671104	C/T	0	20	0	20	9.54259235272242	0	9.54259235272242	C	C		10	0.522870382363879	2.70669387062441e-06	ENSG00000151846:ENST00000281589:exon_25670276_25672705:PABPC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	25671625	G/A	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	G	G		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	ENSG00000151846:ENST00000281589:exon_25670276_25672705:PABPC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	26788151	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	28009031	G/C	1	167	67	234	79.6806461452322	35.0323156183799	44.6483305268523	C:G	G	C	10	0.522870382363879	3.72678397495268e-09	ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	31717962	G/C	1	32	18	50	15.2681477643559	9.41166688254982	5.85648088180605	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.11885120619112	ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31717929_31718060:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31717929_31718060:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31717929_31718060:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31717929_31718060:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31717929_31718060:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31717929_31718060:HSPH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	39585600	T/C	1	43	29	72	20.5165735583532	15.1632410885525	5.35333246980072	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.238221736490182	ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39584002_39585624:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39584003_39585624:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39584003_39585624:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39584292_39585624:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39585513_39585624:C13orf23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	39586241	C/T	1	25	26	51	11.928240440903	13.5946299414609	-1.66638950055783	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.675682622744877	ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	39586850	A/T	1	20	18	38	9.54259235272242	9.41166688254982	0.130925470172601	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586828_39586915:C13orf23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	39586977	G/A	1	29	12	41	13.8367589114475	6.27444458836655	7.56231432308096	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0189414564423387	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	39587166	A/G	1	29	25	54	13.8367589114475	13.071759559097	0.764999352350538	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.892071253797457	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	41134107	A/G	1	2	13	15	0.954259235272242	6.79731497073043	-5.84305573545818	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00304695084835864	ENSG00000150907:ENST00000379561:exon_41133646_41134997:FOXO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	41517985	A/G	1	13	13	26	6.20268502926957	6.79731497073043	-0.594629941460852	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.846528826360866	ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	43181024	T/C	1	6	8	14	2.86277770581673	4.18296305891103	-1.32018535309431	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.59563947353559	ENSG00000120659:ENST00000358545:exon_43180633_43181310:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000405262:exon_43180633_43182149:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43180633_43182144:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43180633_43182149:TNFSF11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	46543342	T/C	1	37	39	76	17.6537958525365	20.3919449121913	-2.7381490596548	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.566754793298223	ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46542883_46544106:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46542883_46544106:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46542883_46544106:ZC3H13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	46946157	C/T	1	16	6	22	7.63407388217794	3.13722229418327	4.49685158799466	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0578567641132185	ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	47303011	A/G	1	17	7	24	8.11120349981406	3.66009267654715	4.45111082326691	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.100175630412175	ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47302982_47303119:LRCH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	47354100	T/C	1	159	158	317	75.8636092041432	82.6135204134929	-6.74991120934963	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.465034244682657	ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	49085908	T/G	1	6	12	18	2.86277770581673	6.27444458836655	-3.41166688254982	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.155279829553550	ENSG00000136161:ENST00000344532:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000450343:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000452987:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000430805:exon_49085906_49086013:RCBTB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	49085967	T/C	1	14	6	20	6.67981464690569	3.13722229418327	3.54259235272242	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.122889322650138	ENSG00000136161:ENST00000344532:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000450343:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000452987:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000430805:exon_49085906_49086013:RCBTB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	50057633	A/G	1	8	9	17	3.81703694108897	4.70583344127491	-0.888796500185942	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.809268533848644	ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	53035897	T/A	1	21	18	39	10.0197219703585	9.41166688254982	0.608055087808722	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.874009491702355	ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53035193_53036061:CKAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	53036553	A/G	1	18	18	36	8.58833311745018	9.41166688254982	-0.82333376509964	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.867968606269239	ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53036498_53036702:CKAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	53250409	G/A	1	59	76	135	28.1506474405311	39.7381490596548	-11.5875016191237	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0477021924675584	ENSG00000165416:ENST00000343788:exon_53250365_53250455:SUGT1;ENSG00000165416:ENST00000310528:exon_53250365_53250455:SUGT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	73293132	T/A	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:T	T	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000204899:ENST00000377818:exon_73293090_73293235:MZT1;ENSG00000204899:ENST00000427549:exon_73293090_73293235:MZT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	73505348	G/A	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73505303_73505405:PIBF1;ENSG00000083535:ENST00000326314:exon_73505303_73505405:PIBF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	75861001	A/G	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75858808_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75858809_75861161:TBC1D4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	76378447	G/A	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000533305:exon_76378425_76378471:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000534657:exon_76378425_76378499:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000497947:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526371:exon_76378310_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526528:exon_76378314_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000489941:exon_76378363_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525373:exon_76378366_76378677:LMO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	76397731	G/A	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76397701_76398009:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76397701_76398009:LMO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	76416085	C/T	1	12	15	27	5.72555541163345	7.84305573545818	-2.11750032382473	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.445977489976173	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76415764_76416119:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525914:exon_76415764_76416119:LMO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	76427231	C/T	1	38	14	52	18.1309254701726	7.32018535309431	10.8107401170783	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0031778343725246	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	76427347	C/A	1	20	27	47	9.54259235272242	14.1175003238247	-4.57490797110231	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.191480966634725	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	98645253	A/G	1	25	15	40	11.928240440903	7.84305573545818	4.08518470544484	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.20898953163402	ENSG00000065150:ENST00000261574:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000357602:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000490680:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000389591:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000469360:exon_98645146_98645268:IPO5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	98670888	G/A	1	94	92	186	44.8501840577954	48.1040751774769	-3.25389111968148	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.659933605970409	ENSG00000065150:ENST00000261574:exon_98670739_98670958:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000357602:exon_98670739_98670958:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000490680:exon_98670739_98670958:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000389591:exon_98670739_98670958:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000469360:exon_98670739_98670958:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000491555:exon_98670739_98670958:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000468620:exon_98670840_98670958:IPO5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	99948097	A/G	1	26	56	82	12.4053700585391	29.2807414123772	-16.8753713538381	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.000222025268103196	ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	99948178	C/A	1	20	58	78	9.54259235272242	30.326482177105	-20.7838898243826	A:C	C	A	10	0.522870382363879	2.10757443511003e-06	ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	103288732	G/A	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103288574_103288742:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103288574_103288742:TPP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	103328693	G/C	1	33	37	70	15.745277381992	19.3462041474635	-3.60092676547153	T:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.404411479093935	ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	111176316	T/C	1	16	10	26	7.63407388217794	5.22870382363879	2.40537005853915	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.433369160576612	ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	111287067	C/T	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111286893_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111287019_111287123:CARKD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	111290880	G/A	1	18	14	32	8.58833311745018	7.32018535309431	1.26814776435587	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.725074190491161	ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	111298323	C/T	1	37	21	58	17.6537958525365	10.9802780296415	6.67351782289502	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0877917435850857	ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	111319754	T/C	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	113897320	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	113909339	A/G	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	114203975	G/A	1	15	20	35	7.15694426454182	10.4574076472776	-3.30046338273576	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.310917875200232	ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114203740_114204510:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114203949_114204542:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000460039:exon_114203740_114204230:TMCO3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	115002305	G/A	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	115004935	T/C	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	13	115030714	T/C	1	57	84	141	27.1963882052589	43.9211121185658	-16.7247239133069	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00528044386229438	ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	20784431	G/A	1	73	69	142	34.8304620874368	36.0780563831077	-1.24759429567082	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.866747097652375	ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	20916958	T/C	1	29	49	78	13.8367589114475	25.6206487358301	-11.7838898243826	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00880683082737232	ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21162053	T/G	1	2	9	11	0.954259235272242	4.70583344127491	-3.75157420600267	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0318932346368143	ENSG00000214274:ENST00000336811:exon_21161706_21162222:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397990:exon_21161706_21162338:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397987:exon_21161706_21162233:ANG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21162086	A/T	1	1	15	16	0.477129617636121	7.84305573545818	-7.36592611782206	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.000164915893035424	ENSG00000214274:ENST00000336811:exon_21161706_21162222:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397990:exon_21161706_21162338:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397987:exon_21161706_21162233:ANG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21461287	G/A	1	20	21	41	9.54259235272242	10.9802780296415	-1.43768567691904	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.754994372586768	ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21461277_21461350:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21461277_21461350:METT11D1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21831052	T/C	1	31	29	60	14.7910181467198	15.1632410885525	-0.372222941832737	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21840087	C/T	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21840033_21840203:SUPT16H
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21945415	A/G	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21945281_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21945335_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21945341_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21945362_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000447695:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000457430:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000494242:exon_21945392_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455138:exon_21945397_21945443:TOX4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21960816	T/C	1	22	20	42	10.4968515879947	10.4574076472776	0.0394439407170832	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21960969	G/A	1	19	32	51	9.0654627350863	16.7318522356441	-7.66638950055783	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0353208662419187	ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	21967916	A/G	1	31	35	66	14.7910181467198	18.3004633827358	-3.50944523601601	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.391751543960053	ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23016457	C/G	1	74	55	129	35.307591705073	28.7578710300133	6.54972067505962	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.253367007821332	ENSG00000229164:ENST00000446346:exon_23016447_23016484:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23016446_23016719:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000480299:exon_23016446_23016719:AE000661.28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23016696	A/C	1	183	125	308	87.3147200274101	65.3587977954849	21.9559222319253	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0140464053441787	ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23016446_23016719:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000480299:exon_23016446_23016719:AE000661.28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23078810	A/T	1	8	14	22	3.81703694108897	7.32018535309431	-3.50314841200534	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.142018758895041	ENSG00000100439:ENST00000216327:exon_23078630_23078816:ABHD4;ENSG00000100439:ENST00000428304:exon_23078630_23078816:ABHD4;ENSG00000100439:ENST00000418446:exon_23078630_23078816:ABHD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23236524	C/T	1	41	42	83	19.562314323081	21.9605560592829	-2.39824173620195	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.660596752512532	ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23236457_23236623:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23236491_23236618:OXA1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23248112	A/G	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	A	A		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23248002_23248146:SLC7A7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23299242	C/G	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000461594:exon_23299138_23299319:MRPL52
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23549785	T/C	1	11	29	40	5.24842579399733	15.1632410885525	-9.91481529455516	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00221830070422702	ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23746269	C/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23777081	G/A	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	23944514	C/A	1	22	33	55	10.4968515879947	17.254722618008	-6.75787103001334	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0789936391373372	ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24026336	A/C	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24025198_24026513:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24025952_24026513:THTPA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24027964	C/T	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.273399026723903	ENSG00000157306:ENST00000288014:exon_24027904_24028787:THTPA;ENSG00000157306:ENST00000404535:exon_24027904_24028783:THTPA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24033279	C/T	1	29	40	69	13.8367589114475	20.9148152945552	-7.07805638310765	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.092518532548231	ENSG00000213983:ENST00000308724:exon_24033255_24033368:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000397120:exon_24033255_24033368:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000460049:exon_24033255_24033430:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000465445:exon_24032925_24033430:AP1G2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24422995	T/G	1	16	4	20	7.63407388217794	2.09148152945552	5.54259235272242	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.013538908020234	ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24423007	G/A	1	18	5	23	8.58833311745018	2.61435191181939	5.97398120563079	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0124600380850257	ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24424367	G/A	1	26	9	35	12.4053700585391	4.70583344127491	7.69953661726424	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0104175296951709	ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24458283	G/T	1	73	8	81	34.8304620874368	4.18296305891103	30.6474990285258	T:G	G	T	10	0.522870382363879	3.20976694606244e-13	ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24567508	T/C	1	17	20	37	8.11120349981406	10.4574076472776	-2.34620414746352	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.511328644277425	ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24567412_24567596:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24567412_24567596:PCK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24569418	A/G	1	47	34	81	22.4250920288977	17.7775930003719	4.64749902852581	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.318421452397943	ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24569204_24569422:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24569204_24569758:PCK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24587639	G/A	1	11	17	28	5.24842579399733	8.88879650018594	-3.64037070618861	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.188314219398843	ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24587667	C/T	1	11	12	23	5.24842579399733	6.27444458836655	-1.02601879436922	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.682551462444228	ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24607966	C/G	1	959	918	1877	457.56730331304	479.995011010041	-22.4277076970008	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.309316425178286	ENSG00000092010:ENST00000206451:exon_24607945_24608176:PSME1;ENSG00000092010:ENST00000382708:exon_24607683_24608175:PSME1;ENSG00000092010:ENST00000417992:exon_24607683_24608169:PSME1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24649911	G/T	1	59	52	111	28.1506474405311	27.1892598829217	0.961387557609438	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.924364243711222	ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649895_24649964:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649889_24649964:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649895_24649964:IPO4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24653523	G/C	1	26	14	40	12.4053700585391	7.32018535309431	5.08518470544484	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.115530211655240	ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24654489	T/C	1	20	17	37	9.54259235272242	8.88879650018594	0.653795852536479	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.870508040497293	ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24682579	A/T	1	13	3	16	6.20268502926957	1.56861114709164	4.63407388217794	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.0233762833916287	ENSG00000213920:ENST00000528804:exon_24681945_24683805:MDP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24685193	T/C	1	21	7	28	10.0197219703585	3.66009267654715	6.35962929381139	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0215917079938413	ENSG00000213920:ENST00000528804:exon_24685125_24685193:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000288087:exon_24685125_24685273:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000530222:exon_24684758_24685243:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000396833:exon_24685125_24685271:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000533536:exon_24685094_24685203:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000532742:exon_24685125_24685276:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000466422:exon_24684758_24685265:MDP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24739215	T/C	1	17	6	23	8.11120349981406	3.13722229418327	4.97398120563078	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0578931252703766	ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24739159_24739346:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24739159_24739346:RABGGTA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24770039	A/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24769614_24770063:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24769614_24770063:C14orf21
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24839165	C/T	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24845543	T/C	1	51	42	93	24.3336104994422	21.9605560592829	2.37305444015926	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.678355368876923	ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24845500_24845760:NFATC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24845841	T/C	1	26	33	59	12.4053700585391	17.254722618008	-4.84935255946886	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.240884832592415	ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24901388	G/A	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	24909586	G/A	1	63	49	112	30.0591659110756	25.6206487358301	4.43851717524556	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.449414419113482	ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	31578762	C/T	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	34985645	G/A	1	15	21	36	7.15694426454182	10.9802780296415	-3.82333376509964	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.243180149299305	ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	34985658	C/T	1	21	22	43	10.0197219703585	11.5031484120053	-1.4834264416468	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.651176113496584	ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	34993982	G/C	1	22	19	41	10.4968515879947	9.9345372649137	0.562314323080962	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.877266589083182	ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34993903_34994013:EAPP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	35222732	C/T	1	7	19	26	3.33990732345285	9.9345372649137	-6.59462994146085	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0104233996834733	ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35221938_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35221943_35222910:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35221943_35222910:BAZ1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	35242828	G/A	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	35591174	T/C	1	7	15	22	3.33990732345285	7.84305573545818	-4.50314841200534	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.085407955345524	ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	35592538	C/G	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	35871960	G/A	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.370794847578149	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	39650139	A/G	1	149	134	283	71.092313027782	70.0646312367598	1.02768179102226	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.905456066188058	ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	39650234	A/T	1	105	82	187	50.0986098517927	42.8753713538381	7.22323849795463	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.305861161741115	ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	39818028	A/G	1	14	15	29	6.67981464690569	7.84305573545818	-1.16324108855249	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.712618173126797	ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	45665611	T/C	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000187790:ENST00000267430:exon_45665375_45665750:FANCM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	45696037	T/G	1	4	10	14	1.90851847054448	5.22870382363879	-3.32018535309431	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.106707830503916	ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	50074122	T/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	50074241	A/G	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	50074520	C/T	1	16	13	29	7.63407388217794	6.79731497073043	0.836758911447511	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.853293027476038	ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50074118_50074839:PPIL5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	50085571	G/A	1	1595	1736	3331	761.021740129613	907.702983783694	-146.681243654081	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	3.68730983423814e-07	ENSG00000165502:ENST00000298289:exon_50085407_50085858:RPL36AL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	50100386	T/C	1	17	14	31	8.11120349981406	7.32018535309431	0.791018146719753	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.858174971305446	ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	50100683	C/G	1	4	12	16	1.90851847054448	6.27444458836655	-4.36592611782206	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0423121013377122	ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	50298962	T/A	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	51206038	G/C	1	49	47	96	23.3793512641699	24.5749079711023	-1.19555670693238	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.838485504789703	ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51206026_51206106:NIN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	51226902	T/C	1	25	33	58	11.928240440903	17.254722618008	-5.32648217710498	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.188647650084987	ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	51227000	A/G	1	29	25	54	13.8367589114475	13.071759559097	0.764999352350538	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.892071253797457	ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	51376678	A/G	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000100504:ENST00000532462:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000531889:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000216392:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000532107:exon_51376613_51376820:PYGL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	51376795	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000100504:ENST00000532462:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000531889:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000216392:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000532107:exon_51376613_51376820:PYGL;ENSG00000100504:ENST00000528757:exon_51376728_51376820:PYGL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	55251301	G/A	1	14	4	18	6.67981464690569	2.09148152945552	4.58833311745018	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0339781022676724	ENSG00000020577:ENST00000305831:exon_55251255_55251338:SAMD4A;ENSG00000020577:ENST00000357634:exon_55251255_55251338:SAMD4A;ENSG00000020577:ENST00000251091:exon_55251255_55251338:SAMD4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	55609418	G/A	1	203	179	382	96.8573123801326	93.5937984431343	3.26351393699824	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.75873658810028	ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55609302_55609467:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55609302_55609467:LGALS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	55619311	A/G	1	37	48	85	17.6537958525365	25.0977783534662	-7.44398250092971	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.128013714501317	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	55643908	A/G	1	12	18	30	5.72555541163345	9.41166688254982	-3.68611147091637	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.202767215651943	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	55655692	C/T	1	12	4	16	5.72555541163345	2.09148152945552	3.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0816984207649677	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	55818706	T/C	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	56094726	C/A	1	75	84	159	35.7847213227091	43.9211121185658	-8.13639079585675	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.20457300356017	ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56094630_56094746:KTN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	58838668	A/G	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	58979242	C/T	1	9	18	27	4.29416655872509	9.41166688254982	-5.11750032382473	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0547218480840686	ENSG00000100578:ENST00000354386:exon_58979240_58979345:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000423743:exon_58979240_58979345:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000261244:exon_58979240_58979345:KIAA0586
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	64491695	T/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	64681178	C/T	1	14	8	22	6.67981464690569	4.18296305891103	2.49685158799466	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.393877834025079	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64680912_64681188:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64680912_64681188:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64680912_64681188:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64680912_64681188:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64680912_64681188:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64680859_64681188:SYNE2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	64686125	G/T	1	34	21	55	16.2224069996281	10.9802780296415	5.24212896998666	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.177667414227881	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	64882380	A/G	1	14	17	31	6.67981464690569	8.88879650018594	-2.20898185328025	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.474733404783839	ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	64916165	C/T	1	141	142	283	67.2752760866931	74.2475942956708	-6.97231820897774	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.439233360316648	ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64916163_64916340:MTHFD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	68117421	T/C	1	2	12	14	0.954259235272242	6.27444458836655	-5.32018535309431	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00555356960539268	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	68118132	C/T	1	79	99	178	37.6932397932536	51.764167854024	-14.0709280607705	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0357569424262728	ENSG00000081181:ENST00000261783:exon_68117432_68118437:ARG2;ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68117869_68118198:VTI1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	68118186	G/A	1	92	77	169	43.8959248225231	40.2610194420187	3.63490538050446	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.590653072924645	ENSG00000081181:ENST00000261783:exon_68117432_68118437:ARG2;ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68117869_68118198:VTI1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	68126586	G/A	1	44	59	103	20.9937031759893	30.8493525594689	-9.85564938347953	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0604991748031325	ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68126448_68126639:VTI1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	68141105	C/T	1	52	37	89	24.8107401170783	19.3462041474635	5.46453596961478	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.288612568237926	ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68141092_68141548:VTI1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	70839735	A/C	1	19	12	31	9.0654627350863	6.27444458836655	2.79101814671975	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.370530485639912	ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	74036300	T/A	1	36	27	63	17.1766662349004	14.1175003238247	3.05916591107563	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.452500363967243	ENSG00000119673:ENST00000238651:exon_74035772_74036587:ACOT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	74428445	G/A	1	34	29	63	16.2224069996281	15.1632410885525	1.05916591107563	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.80241277843597	ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	75551321	T/G	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75548819_75551389:NEK9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	75904660	A/G	1	14	15	29	6.67981464690569	7.84305573545818	-1.16324108855249	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.712618173126797	ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	76330181	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	76662248	A/G	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000089916:ENST00000261530:exon_76662221_76662315:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000312858:exon_76662221_76662315:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000336993:exon_76662221_76662315:C14orf118
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	77793207	G/A	1	31	22	53	14.7910181467198	11.5031484120053	3.28786973471441	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.410535465354673	ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	77797452	A/G	1	84	93	177	40.0788878814342	48.6269455598407	-8.54805767840657	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.201706689950494	ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77797412_77797830:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77797412_77797830:GSTZ1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	77928525	A/G	1	50	63	113	23.8564808818061	32.9408340889244	-9.08435320711832	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.090598029638792	ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	77935520	G/A	1	218	221	439	104.014256644674	115.554354502417	-11.5400978577429	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.272236292739082	ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	77978621	A/C	1	53	33	86	25.2878697347144	17.254722618008	8.03314711670641	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.085128357094244	ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_77973272_77978746:SPTLC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	78174473	A/C	1	83	93	176	39.601758263798	48.6269455598407	-9.0251872960427	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.175285034321893	ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	78197365	C/T	1	83	73	156	39.601758263798	38.1695379125632	1.43222035123488	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.87272697181126	ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	88477882	A/C	1	17	10	27	8.11120349981406	5.22870382363879	2.88249967617527	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.336223488451435	ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	88892749	T/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000042317:ENST00000045347:exon_88892576_88893048:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000356583:exon_88892576_88893048:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000393545:exon_88892576_88893048:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000362040:exon_88892576_88893048:SPATA7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	89077198	A/G	1	23	11	34	10.9739812056308	5.75157420600267	5.22240699962811	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0859526937732973	ENSG00000100722:ENST00000302216:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000251038:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393514:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000406216:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000353091:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000380684:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393530:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000359301:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000336693:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000318308:exon_89077178_89077284:ZC3H14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	89078141	A/G	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000100722:ENST00000302216:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000251038:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393514:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000406216:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000353091:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000380684:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393530:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000359301:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000336693:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000318308:exon_89078089_89079852:ZC3H14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	90398907	G/A	1	3	13	16	1.43138885290836	6.79731497073043	-5.36592611782206	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0100956219995669	ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	90420961	G/A	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90420930_90421033:C14orf143
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	90429749	A/G	1	16	25	41	7.63407388217794	13.071759559097	-5.43768567691904	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.116939264065251	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	90429858	G/A	1	12	11	23	5.72555541163345	5.75157420600267	-0.0260187943692163	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	92441066	C/T	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	92548785	C/T	1	2	10	12	0.954259235272242	5.22870382363879	-4.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0179928301605514	ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	92588002	T/G	1	250	205	455	119.28240440903	107.188428384595	12.0939760244351	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.260376461449428	ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	93170993	C/T	1	366	540	906	174.62944005482	282.350006476495	-107.720566421674	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	8.67788328596141e-13	ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	93412743	G/A	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000100605:ENST00000354313:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000405174:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000267615:exon_93412676_93412838:ITPK1;ENSG00000100605:ENST00000311458:exon_93412676_93412838:ITPK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	94526812	C/T	1	158	128	286	75.3864795865071	66.9274089425765	8.45907064393062	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.343617130299111	ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94526444_94526959:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94526444_94526959:DDX24
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	94844975	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94844686_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94844710_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94844713_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94844726_94844977:SERPINA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	95921869	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95921714_95922061:C14orf49
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	97299853	A/G	1	27	34	61	12.8824996761753	17.7775930003719	-4.89509332419662	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.248611964926065	ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	99927643	A/G	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000436070:exon_99927529_99927677:SETD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	100563943	G/A	1	154	151	305	73.4779611159626	78.9534277369457	-5.47546662098308	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.566581260272985	ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100563818_100563995:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100563818_100563995:EVL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	102505540	G/A	1	15	18	33	7.15694426454182	9.41166688254982	-2.254722618008	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.487711537553837	ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102505338_102505591:DYNC1H1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	102508056	C/A	1	17	27	44	8.11120349981406	14.1175003238247	-6.00629682401067	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0720947608881344	ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102507911_102508071:DYNC1H1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	102514227	T/C	1	54	53	107	25.7649993523505	27.7121302652856	-1.94713091293505	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.771730850601877	ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	102550803	G/A	1	283	299	582	135.027681791022	156.3382443268	-21.3105625357776	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0813203729869479	ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	102805187	G/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102805153_102805290:ZNF839
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	102807671	C/T	1	13	4	17	6.20268502926957	2.09148152945552	4.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0530050628667056	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	102808273	C/A	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	102815042	C/T	1	106	111	217	50.5757394694288	58.0386124423906	-7.46287297296173	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.34143161086678	ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	103934484	G/A	1	28	16	44	13.3596292938114	8.36592611782206	4.99370317598933	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.173712672368528	ENSG00000075413:ENST00000416682:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000216288:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000335102:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000454698:exon_103934418_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000440884:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000429436:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000303622:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000411530:exon_103934370_103934523:MARK3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	104001137	C/T	1	5	10	15	2.38564808818061	5.22870382363879	-2.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.195978503056267	ENSG00000166166:ENST00000389749:exon_104000887_104003408:TRMT61A;ENSG00000166166:ENST00000299202:exon_104000887_104002352:TRMT61A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	104029378	C/G	1	18	41	59	8.58833311745018	21.437685676919	-12.8493525594689	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.000966236327050887	ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	104194196	C/G	1	3	16	19	1.43138885290836	8.36592611782206	-6.9345372649137	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.00189439714370626	ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000392675:exon_104193791_104194251:ZFYVE21
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	104199356	C/T	1	18	11	29	8.58833311745018	5.75157420600267	2.83675891144751	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.353965848768906	ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	105178851	C/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105178770_105178894:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105178770_105178894:INF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	105179184	G/A	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105179170_105179270:INF2;ENSG00000203485:ENST00000477497:exon_105179050_105179329:INF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	105180706	A/C,G	0	0	20	20	0	10.4574076472776	-10.4574076472776	C:G	A	C	10	0.522870382363879	3.73875942756426e-07	ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	105517492	C/G	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	105639445	G/A	1	13	10	23	6.20268502926957	5.22870382363879	0.973981205630785	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.835286047198067	ENSG00000183828:ENST00000339418:exon_105639275_105639598:NUDT14;ENSG00000183828:ENST00000392568:exon_105639276_105639598:NUDT14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	105833679	A/G	1	16	3	19	7.63407388217794	1.56861114709164	6.0654627350863	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00517941383531749	ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105833550_105833712:PACS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	106066701	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	106321590	C/A	1	159	3467	3626	75.8636092041432	1812.79161565557	-1736.92800645143	A:T:C:G	C	A	10	0.522870382363879	0	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	106321913	G/A	1	3473	141	3614	1657.07116205025	73.7247239133069	1583.34643813694	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	106552565	T/G	1	16	1	17	7.63407388217794	0.522870382363879	7.11120349981406	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.000337042918951798	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	107170005	T/C	1	2	497	499	0.954259235272242	259.866580034848	-258.912320799576	T:C	T	C	10	0.522870382363879	6.53068059987935e-156	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	107170077	C/T	1	3	430	433	1.43138885290836	224.834264416468	-223.40287556356	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.25858589413900e-132	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	107170128	C/T	0	336	0	336	160.315551525737	0	160.315551525737	C	C		10	0.522870382363879	2.75486754162063e-95	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	14	107170207	C/T	1	159	10	169	75.8636092041432	5.22870382363879	70.6349053805044	T:C	C	T	10	0.522870382363879	6.63066979139315e-33	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	22960868	G/C	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	25602024	T/C	1	25	22	47	11.928240440903	11.5031484120053	0.425092028897689	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000114062:ENST00000232165:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000397954:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000438097:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000428984:exon_25601838_25602043:UBE3A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	29560979	C/T	1	145	120	265	69.1837945572375	62.7444458836655	6.43934867357207	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.460644194847328	ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	34528948	G/A	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	34781816	G/T	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	G	G		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	ENSG00000215042:ENST00000399498:exon_34781808_34781937:AC027139.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	35182441	G/A	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35182416_35182525:AQR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	40269052	G/A	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	40313141	C/T	1	7	14	21	3.33990732345285	7.32018535309431	-3.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.124227497168679	ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	40328665	G/A	1	664	588	1252	316.814066110384	307.447784829961	9.36628128042355	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.610612918633962	ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	40330564	C/T	1	252	197	449	120.236663644303	103.005465325684	17.2311983186184	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.108233481188475	ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	40685850	A/G	1	18	20	38	8.58833311745018	10.4574076472776	-1.8690745298274	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.626949445873145	ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40685670_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40685394_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40685670_40686488:C15orf23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	40710476	C/T	1	16	11	27	7.63407388217794	5.75157420600267	1.88249967617527	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.564694319892801	ENSG00000128928:ENST00000249760:exon_40710329_40711063:IVD;ENSG00000128928:ENST00000479013:exon_40710329_40713505:IVD;ENSG00000128928:ENST00000487418:exon_40710329_40713512:IVD;ENSG00000128928:ENST00000497816:exon_40710329_40711356:IVD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	41146616	C/T	1	9	14	23	4.29416655872509	7.32018535309431	-3.02601879436922	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.218027099892575	ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41146595_41146720:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41146595_41146720:SPINT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	41148199	C/T	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	41149161	G/C	1	13	9	22	6.20268502926957	4.70583344127491	1.49685158799466	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.670537930867177	ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	41366676	G/T	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000128908:ENST00000361937:exon_41366568_41366763:INO80;ENSG00000128908:ENST00000401393:exon_41366568_41366763:INO80;ENSG00000128908:ENST00000263793:exon_41366568_41366763:INO80
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	41624579	C/G	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000104147:ENST00000220514:exon_41624438_41624819:OIP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	41688700	T/C	1	26	41	67	12.4053700585391	21.437685676919	-9.03231561837989	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0280470610815746	ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	42139863	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42139847_42140353:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000342159:exon_42139847_42140164:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42139847_42140345:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000446407:exon_42139847_42140345:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42139847_42140345:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42139847_42140338:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42139847_42140341:PLA2G4B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	42139875	A/G	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42139847_42140353:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000342159:exon_42139847_42140164:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42139847_42140345:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000446407:exon_42139847_42140345:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42139847_42140345:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42139847_42140338:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42139847_42140341:PLA2G4B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	42264540	A/G	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42264457_42264776:EHD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	42740369	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42740270_42740903:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42740270_42740903:ZFP106
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	43481408	G/A	1	19	17	36	9.0654627350863	8.88879650018594	0.176666234900358	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000166946:ENST00000300213:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000407066:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000356633:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000444658:exon_43481397_43481478:CCNDBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	44087277	G/T	1	12	4	16	5.72555541163345	2.09148152945552	3.63407388217794	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0816984207649677	ENSG00000184716:ENST00000319327:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000448553:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000457418:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000299969:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000412697:exon_44086428_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000396823:exon_44086478_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000249714:exon_44086478_44087411:SERINC4;ENSG00000140264:ENST00000445816:exon_44086572_44088287:SERF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	44092856	G/A	1	238	211	449	113.556848997397	110.325650678778	3.23119831861835	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.776947595218914	ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44091556_44092982:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44092693_44092982:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44092693_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000498605:exon_44092509_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44092621_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44092797_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44092825_44092982:C15orf63
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	44093758	G/A	1	183	122	305	87.3147200274101	63.7901866483932	23.5245333790169	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00703481353275849	ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093716_44093767:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093716_44093767:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093716_44093767:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000498605:exon_44093330_44093788:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093716_44093767:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093716_44093767:C15orf63
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	44093927	T/C	1	134	176	310	63.9353687632402	92.0251872960427	-28.0898185328025	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.00143583174926562	ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	44102010	A/C	1	38	47	85	18.1309254701726	24.5749079711023	-6.44398250092971	A:C:G	A	C	10	0.522870382363879	0.192310478341008	ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	44943757	A/G	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	45654327	A/G	1	34	57	91	16.2224069996281	29.8036117947411	-13.581204795113	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00452927526573915	ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	45661678	T/A	1	21	26	47	10.0197219703585	13.5946299414609	-3.57490797110231	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.310144685578375	ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	45981296	G/A	1	47	51	98	22.4250920288977	26.6663895005578	-4.24129747166014	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.419220933038217	ENSG00000137767:ENST00000260324:exon_45981237_45981415:SQRDL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	49031280	A/G	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49030136_49031485:CEP152
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	50776525	T/C	1	6	26	32	2.86277770581673	13.5946299414609	-10.7318522356441	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.000129709599179442	ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	50867082	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	52402010	T/A	1	25	2	27	11.928240440903	1.04574076472776	10.8824996761753	A:T	T	A	10	0.522870382363879	8.87560047275608e-06	ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52401460_52402170:BCL2L10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	52611451	A/G	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	55477604	A/G	1	32	44	76	15.2681477643559	23.0062968240107	-7.7381490596548	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0848800588340306	ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55477560_55477623:RSL24D1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	55653031	A/G	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	56686898	T/C	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000151575:ENST00000352903:exon_56686859_56687032:TEX9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	58001458	C/T	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000137878:ENST00000484300:exon_58001383_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000380557:exon_58001383_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	59408918	A/G	1	93	130	223	44.3730544401593	67.9731497073043	-23.600095267145	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00160252515702262	ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59408889_59409125:CCNB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	59409495	G/A	1	119	107	226	56.7784244986984	55.947130912935	0.831293585763362	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.946945756961765	ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59409427_59409567:CCNB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	59510189	G/A	1	8	14	22	3.81703694108897	7.32018535309431	-3.50314841200534	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.142018758895041	ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	63433785	G/A	1	37	41	78	17.6537958525365	21.437685676919	-3.78388982438256	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.428180446605201	ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	63922752	T/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:T	T	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63922665_63922834:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63922665_63922834:HERC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	64385851	T/C	1	108	96	204	51.5299987047011	50.1955567069324	1.33444199776869	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.888604684945072	ENSG00000166797:ENST00000300030:exon_64385844_64386217:FAM96A;ENSG00000166797:ENST00000380290:exon_64385844_64386207:FAM96A;ENSG00000166797:ENST00000419657:exon_64385844_64386007:FAM96A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	64418397	G/A	1	34	30	64	16.2224069996281	15.6861114709164	0.536295528711747	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.901271965200951	ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	64737225	G/A	1	14	15	29	6.67981464690569	7.84305573545818	-1.16324108855249	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.712618173126797	ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	64962630	A/C	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	65108479	T/C	1	16	18	34	7.63407388217794	9.41166688254982	-1.77759300037188	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.608049526191679	ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	65108795	C/T	1	26	19	45	12.4053700585391	9.9345372649137	2.47083279362545	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.551103683531036	ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65108773_65108964:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65108773_65108964:PIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	65114484	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65114465_65114590:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65114465_65114590:PIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	65262542	T/C	1	28	18	46	13.3596292938114	9.41166688254982	3.94796241126157	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.301573255723197	ENSG00000090487:ENST00000204566:exon_65262452_65262560:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000416889:exon_65262452_65262560:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000433215:exon_65262452_65262560:SPG21
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	65962190	A/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000174485:ENST00000431932:exon_65962117_65962263:DENND4A;ENSG00000174485:ENST00000308976:exon_65962117_65962263:DENND4A;ENSG00000174485:ENST00000443035:exon_65962117_65962263:DENND4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	66180201	A/G	1	181	172	353	86.3604607921379	89.9337057665872	-3.57324497444927	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.709490079214337	ENSG00000103769:ENST00000435304:exon_66180039_66181792:RAB11A;ENSG00000103769:ENST00000261890:exon_66180039_66184329:RAB11A;ENSG00000103769:ENST00000445947:exon_66180039_66181792:RAB11A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	68583382	C/T	1	15	10	25	7.15694426454182	5.22870382363879	1.92824044090303	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.549274934579923	ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68581945_68588203:FEM1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	69728530	A/C	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728477_69728600:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728477_69728600:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728477_69728600:KIF23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	70345626	C/T	1	18	15	33	8.58833311745018	7.84305573545818	0.745277381991995	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.862634297175903	ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	70346923	C/T	1	5	16	21	2.38564808818061	8.36592611782206	-5.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0141708466780634	ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	73052840	T/C	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	73052845	A/G	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	73855586	G/C	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000156642:ENST00000345330:exon_73855577_73855598:NPTN;ENSG00000156642:ENST00000351217:exon_73855577_73855598:NPTN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	74277795	T/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277659_74277854:STOML1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	74328116	A/G	1	63	28	91	30.0591659110756	14.6403707061886	15.418795204887	A:T:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00149882007939860	ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	74328141	G/T	1	61	40	101	29.1049066758034	20.9148152945552	8.19009138124823	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.111238946066769	ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	74702894	C/T	1	98	87	185	46.7587025283399	45.4897232656575	1.26897926268239	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.883108425313685	ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	74703022	G/A	1	52	65	117	24.8107401170783	33.9865748536521	-9.17583473657383	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0959143976367511	ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	74706943	G/A	1	25	26	51	11.928240440903	13.5946299414609	-1.66638950055783	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.675682622744877	ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	74709975	G/A	1	14	17	31	6.67981464690569	8.88879650018594	-2.20898185328025	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.474733404783839	ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	74710638	A/T	1	17	9	26	8.11120349981406	4.70583344127491	3.40537005853915	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.238708365748245	ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74710609_74710650:SEMA7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	75093890	A/C	1	307	271	578	146.478792614289	141.697873620611	4.78091899367797	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.707942020929696	ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093863_75093936:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093863_75093936:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093863_75093936:CSK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	75130093	T/C	0	19	0	19	9.0654627350863	0	9.0654627350863	T	T		10	0.522870382363879	5.24515473717109e-06	ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	75137868	C/A	1	105	62	167	50.0986098517927	32.4179637065605	17.6806461452322	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.00658241057162536	ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75137814_75137934:SCAMP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	75499602	C/A	1	27	24	51	12.8824996761753	12.5488891767331	0.333610499442173	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	75499619	T/C	1	27	27	54	12.8824996761753	14.1175003238247	-1.23500064764946	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.786031149025843	ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	75499861	G/A	1	31	24	55	14.7910181467198	12.5488891767331	2.24212896998666	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.590700867966642	ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	75499995	T/G	1	29	34	63	13.8367589114475	17.7775930003719	-3.94083408892437	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.377495978614941	ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	75932129	G/T	1	89	96	185	42.4645359696148	50.1955567069324	-7.73102073731761	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.269892964843074	ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	77325279	C/T	1	17	14	31	8.11120349981406	7.32018535309431	0.791018146719753	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.858174971305446	ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77325203_77325293:PSTPIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	79224747	C/T	1	184	256	440	87.7918496450463	133.854817885153	-46.0629682401067	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.31447975444278e-05	ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	79603726	G/A	1	53	43	96	25.2878697347144	22.4834264416468	2.80444329306762	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.610039164967304	ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79603404_79603759:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79603485_79603759:TMED3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	80191343	G/A	1	16	13	29	7.63407388217794	6.79731497073043	0.836758911447511	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.853293027476038	ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	80260014	T/C	1	14	34	48	6.67981464690569	17.7775930003719	-11.0977783534662	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00135997412343408	ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	81592746	T/A	1	38	64	102	18.1309254701726	33.4637044712883	-15.3327790011157	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.00278512748370465	ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	82443939	G/A	1	29	27	56	13.8367589114475	14.1175003238247	-0.280741412377221	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	83495581	T/C	1	2	10	12	0.954259235272242	5.22870382363879	-4.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0179928301605514	ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83495503_83495598:WHAMM;ENSG00000156232:ENST00000234505:exon_83495503_83495598:WHAMM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	83680287	A/G	1	13	12	25	6.20268502926957	6.27444458836655	-0.0717595590969733	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	83680313	T/G	1	7	10	17	3.33990732345285	5.22870382363879	-1.88879650018594	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.468009294351122	ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	83686759	T/C	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000064726:ENST00000261721:exon_83685174_83686977:BTBD1;ENSG00000064726:ENST00000379403:exon_83685185_83686977:BTBD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	85341859	G/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	86287867	G/A	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	89002870	C/T	1	43	30	73	20.5165735583532	15.6861114709164	4.83046208743684	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.292056652753181	ENSG00000173867:ENST00000312475:exon_89002707_89003094:MRPL46
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	89021114	C/T	1	62	53	115	29.5820362934395	27.7121302652856	1.86990602815392	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.77967396405031	ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89021103_89022222:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89021103_89021494:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000353598:exon_89021103_89021490:MRPS11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	89182596	A/G	1	423	402	825	201.825828260079	210.193893710279	-8.36806545020013	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.577133314089326	ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	89195526	A/G	1	383	329	712	182.740643554634	172.024355797716	10.7162877569182	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.430932695460401	ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	90293794	G/C	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000166823:ENST00000300057:exon_90293740_90294541:MESP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	90628537	G/A	1	248	200	448	118.328145173758	104.574076472776	13.7540687009822	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.201693029205222	ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	90628591	G/A	1	199	126	325	94.9487939095881	65.8816681778488	29.0671257317393	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00125694354254176	ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	90628594	C/T	1	200	110	310	95.4259235272242	57.5157420600267	37.9101814671975	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.45241923288088e-05	ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	91422763	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91422674_91422774:FURIN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	91433110	A/G	1	14	8	22	6.67981464690569	4.18296305891103	2.49685158799466	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.393877834025079	ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000494259:exon_91433070_91433169:FES;ENSG00000182511:ENST00000448367:exon_91433070_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000496379:exon_91433066_91433192:FES;ENSG00000182511:ENST00000462476:exon_91433079_91433192:FES
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	91436965	C/T	1	22	13	35	10.4968515879947	6.79731497073043	3.69953661726424	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.238433136998935	ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91436884_91437041:FES
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	91462903	A/G	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91462865_91463940:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91462865_91465814:MAN2A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	93162649	A/G	1	18	6	24	8.58833311745018	3.13722229418327	5.45111082326691	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0387390654122716	ENSG00000185442:ENST00000327355:exon_93160678_93162689:FAM174B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	93567864	A/C	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101109677	C/A	1	13	20	33	6.20268502926957	10.4574076472776	-4.254722618008	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.163741571847472	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101109794	C/G	1	17	13	30	8.11120349981406	6.79731497073043	1.31388852908363	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.716174646304455	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101109818	G/A	1	16	12	28	7.63407388217794	6.27444458836655	1.35962929381139	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.70643464471406	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101109893	C/A	1	16	17	33	7.63407388217794	8.88879650018594	-1.254722618008	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.728825872976088	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101110302	C/G	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101113950	A/G	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101464915	T/C	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101606294	C/T	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	101717680	G/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	102187087	A/C	1	25	28	53	11.928240440903	14.6403707061886	-2.71213026528558	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.493292962088555	ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102186928_102187102:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102186928_102187102:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102186928_102187102:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102186872_102187102:TM2D3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	102192540	T/G	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	102224341	G/A	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.370794847578149	ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	15	102264304	G/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	139784	G/C	1	52	47	99	24.8107401170783	24.5749079711023	0.235832145975987	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103148:ENST00000463178:exon_138697_141084:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_139711_139900:NPRL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	239186	G/A	1	30	63	93	14.3138885290836	32.9408340889244	-18.6269455598407	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.000107975260468332	ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_238968_240134:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000293872:exon_238968_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000426094:exon_238968_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_238970_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000490762:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000429378:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000468732:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000415507:exon_238992_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000464711:exon_239097_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000442701:exon_239114_239338:LUC7L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	313335	C/A	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_313261_313401:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_313261_313401:ITFG3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	339494	C/T	1	11	17	28	5.24842579399733	8.88879650018594	-3.64037070618861	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.188314219398843	ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_339440_339607:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_339440_343718:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_339440_339607:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000457798:exon_339440_339607:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_339440_339607:AXIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	343691	G/A	1	22	12	34	10.4968515879947	6.27444458836655	4.22240699962811	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.170777696588829	ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_343488_343718:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_339440_343718:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_343488_343718:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_343488_343718:AXIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	347184	A/G	1	11	18	29	5.24842579399733	9.41166688254982	-4.16324108855249	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.138607125827359	ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	348222	C/T	1	6	8	14	2.86277770581673	4.18296305891103	-1.32018535309431	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.59563947353559	ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000481769:exon_347844_348251:AXIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	417691	C/G	1	190	193	383	90.654627350863	100.913983796229	-10.2593564453656	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.306420265614065	ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_416927_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_417396_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_417398_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_417409_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_417427_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_417613_417782:MRPL28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	426146	C/T	1	21	17	38	10.0197219703585	8.88879650018594	1.1309254701726	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.747786832032409	ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	449027	G/A	1	76	56	132	36.2618509403452	29.2807414123772	6.98110952796798	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.257266304945994	ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000454619:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_448208_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_448990_449123:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	449399	C/T	1	124	97	221	59.164072586879	50.7184270892963	8.44564549758275	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.281290196048896	ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000454619:exon_449379_449474:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	602403	C/G	1	11	7	18	5.24842579399733	3.66009267654715	1.58833311745018	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.489005913678072	ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	603471	A/G	1	20	18	38	9.54259235272242	9.41166688254982	0.130925470172601	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	630902	C/G	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_630858_630972:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_630183_630972:PIGQ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	632283	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632248_632309:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_631761_632309:PIGQ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	633375	G/C	0	16	0	16	7.63407388217794	0	7.63407388217794	G	G		10	0.522870382363879	3.84248814617874e-05	ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	677629	T/C	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	718514	C/G	1	15	10	25	7.15694426454182	5.22870382363879	1.92824044090303	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.549274934579923	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	720152	T/C	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720123_720175:RHOT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	720321	C/G	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720249_720357:RHOT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	732049	T/C	1	241	287	528	114.988237850305	150.063799738433	-35.0755618881281	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00228095840657546	ENSG00000103266:ENST00000219548:exon_732020_732076:STUB1;ENSG00000161999:ENST00000412368:exon_731667_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000454700:exon_731676_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000293882:exon_731676_732874:JMJD8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	780517	T/C	1	33	27	60	15.745277381992	14.1175003238247	1.62777705816726	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.700048991366252	ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	780545	C/T	1	34	23	57	16.2224069996281	12.0260187943692	4.1963882052589	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.290441065783512	ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	836081	C/A	1	25	11	36	11.928240440903	5.75157420600267	6.17666623490036	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0449565692058279	ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	836149	A/G	1	25	8	33	11.928240440903	4.18296305891103	7.745277381992	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00812522752709228	ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	836199	G/A	1	21	37	58	10.0197219703585	19.3462041474635	-9.32648217710498	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0173597773899516	ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	836342	G/A	1	15	24	39	7.15694426454182	12.5488891767331	-5.39194491219128	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.107947290401252	ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	839269	G/A	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_839210_839362:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_838931_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_839210_839360:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_839214_839360:CHTF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	840190	A/C	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840177_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840177_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840177_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840177_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840007_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840177_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840177_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840177_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840177_840269:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000484349:exon_840177_840269:CHTF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	841166	C/T	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840525_842367:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840525_842347:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_841161_841370:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_841161_841370:CHTF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	844116	C/T	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_844054_844201:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_844054_844201:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_844054_844201:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_844054_844201:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_844054_844201:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000461268:exon_844040_844201:CHTF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	845744	G/A	1	15	23	38	7.15694426454182	12.0260187943692	-4.8690745298274	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.143201097850425	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	846031	C/T	1	19	15	34	9.0654627350863	7.84305573545818	1.22240699962811	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.733249089636175	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845947_846077:CHTF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	918997	G/A	1	13	12	25	6.20268502926957	6.27444458836655	-0.0717595590969733	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_918944_919056:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_918944_919056:LMF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	1020874	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1020788_1020982:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1020788_1020984:LMF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	1505792	C/T	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1505732_1505796:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1505732_1505796:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1505732_1505796:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1505732_1505796:CLCN7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	1557641	C/G	1	20	18	38	9.54259235272242	9.41166688254982	0.130925470172601	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1557602_1557717:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1557602_1557717:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1557602_1557717:TELO2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	1818503	G/C	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	1820992	T/A	1	98	117	215	46.7587025283399	61.1758347365738	-14.417132208234	A:T:C	T	A	10	0.522870382363879	0.055692793812779	ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	1821107	A/C	1	87	95	182	41.5102767343425	49.6726863245685	-8.16240959022597	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.235589331271891	ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1821071_1821172:NME3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	1838037	C/G	1	80	60	140	38.1703694108897	31.3722229418327	6.79814646905695	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.271655225365597	ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2049842	T/C	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2049891	C/G	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2050141	G/A	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2096337	C/T	1	28	27	55	13.3596292938114	14.1175003238247	-0.757871030013343	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.892972380561247	ENSG00000065057:ENST00000219066:exon_2096129_2096367:NTHL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2129192	G/C	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2129036_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000483020:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000471143:exon_2129036_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2128240_2129197:TSC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2285268	G/A	1	19	25	44	9.0654627350863	13.071759559097	-4.00629682401067	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.231823257801756	ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2580912	T/C	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2581080	G/A	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2812647	C/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2815237	A/C	1	18	24	42	8.58833311745018	12.5488891767331	-3.96055605928291	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.279455109928861	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2816943	C/G	1	78	63	141	37.2161101756174	32.9408340889244	4.27527608669307	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.500540171482548	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2819196	G/C	1	173	116	289	82.5434238510489	60.65296435421	21.890459496839	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0112148286647170	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2818998_2819285:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2818998_2819285:SRRM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2821608	A/G	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	2983483	C/G	0	11	0	11	5.24842579399733	0	5.24842579399733	C	C		10	0.522870382363879	0.00109035227886462	ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	3025552	G/A	1	31	16	47	14.7910181467198	8.36592611782206	6.42509202889769	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0786888102659429	ENSG00000127564:ENST00000431515:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000262300:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000440027:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000402679:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000382240:exon_3025320_3025813:PKMYT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	3076393	C/T	1	59	35	94	28.1506474405311	18.3004633827358	9.85018405779538	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0493083257373293	ENSG00000131652:ENST00000253952:exon_3076366_3076414:THOC6;ENSG00000131652:ENST00000326266:exon_3076366_3076414:THOC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	3349580	C/T	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000140993:ENST00000426381:exon_3349106_3350614:TIGD7;ENSG00000140993:ENST00000396862:exon_3348832_3352009:TIGD7;ENSG00000140993:ENST00000268674:exon_3348965_3350614:TIGD7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	3433146	G/A	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000140987:ENST00000304926:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396852:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396846:exon_3432483_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000439568:exon_3433056_3433332:ZNF434
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	4411224	C/T	1	39	26	65	18.6080550878087	13.5946299414609	5.01342514634787	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.217552185933718	ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4411163_4411249:CORO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	4438578	A/C	1	15	21	36	7.15694426454182	10.9802780296415	-3.82333376509964	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.243180149299305	ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4438546_4438632:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4438546_4438632:CORO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	4484396	A/T	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	4496973	T/A	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	4748825	C/T	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	5075494	G/A	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	5128001	C/T	1	9	25	34	4.29416655872509	13.071759559097	-8.77759300037188	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00303700205867370	ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8719543	G/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8719353_8719655:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8719353_8719655:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8719609	G/A	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8719353_8719655:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8719353_8719655:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8722642	A/G	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8722732	T/C	1	13	13	26	6.20268502926957	6.79731497073043	-0.594629941460852	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.846528826360866	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8729124	G/A	1	23	10	33	10.9739812056308	5.22870382363879	5.74527738199199	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0545131899192798	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8735990	A/G	1	25	18	43	11.928240440903	9.41166688254982	2.51657355835321	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.541953811268653	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8735984_8736064:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8735984_8736064:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8736028	T/C	1	15	18	33	7.15694426454182	9.41166688254982	-2.254722618008	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.487711537553837	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8735984_8736064:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8735984_8736064:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8738499	G/A	1	20	10	30	9.54259235272242	5.22870382363879	4.31388852908363	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.143452102098685	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8738414_8738582:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8738414_8738582:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8738579	A/G	1	18	10	28	8.58833311745018	5.22870382363879	3.35962929381139	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.256783109761352	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8738414_8738582:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8738414_8738582:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	8740015	A/C	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8739965_8740079:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8739965_8740072:C16orf68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	10862964	A/G	1	77	86	163	36.7389805579813	44.9668528832936	-8.22787232531227	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.209896987752516	ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	11000737	A/G	1	10	1	11	4.77129617636121	0.522870382363879	4.24842579399733	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0126233924286189	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	11002904	G/A	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	11002927	A/G	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	11769893	C/T	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	11773261	G/C	1	247	168	415	117.851015556122	87.8422242371317	30.0087913189902	T:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00317673432540057	ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	11969724	G/C	1	42	49	91	20.0394439407171	25.6206487358301	-5.58120479511298	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.249940028170735	ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	12009781	G/A	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	12060163	A/G	1	156	153	309	74.4322203512349	79.9991685016735	-5.56694815043859	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.531557640503881	ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12060052_12060198:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12060052_12060198:TNFRSF17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	12061677	G/C	1	271	258	529	129.302126379389	134.900558649881	-5.59843227049197	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.63233552592902	ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	15793615	C/T	1	27	30	57	12.8824996761753	15.6861114709164	-2.8036117947411	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.508175956072854	ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	15818141	A/C	1	3	14	17	1.43138885290836	7.32018535309431	-5.88879650018594	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.00582765753927055	ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	15818310	G/A	1	9	16	25	4.29416655872509	8.36592611782206	-4.07175955909697	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.112558414985489	ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	15818653	G/A	1	22	11	33	10.4968515879947	5.75157420600267	4.74527738199199	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.116953965896256	ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	19726295	C/G	1	83	52	135	39.601758263798	27.1892598829217	12.4124983808763	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0382834538173365	ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	20855309	A/G	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000005189:ENST00000261377:exon_20855256_20855348:AC004381.6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	20926998	C/T	1	12	15	27	5.72555541163345	7.84305573545818	-2.11750032382473	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.445977489976173	ENSG00000102897:ENST00000439021:exon_20926878_20927036:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000412082:exon_20926878_20927036:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000219168:exon_20926878_20927036:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000396052:exon_20926878_20927036:LYRM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	23400226	C/T	1	39	47	86	18.6080550878087	24.5749079711023	-5.96685288329359	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.234888257769604	ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23399814_23400407:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23399816_23400407:COG7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	24166130	T/C	1	29	25	54	13.8367589114475	13.071759559097	0.764999352350538	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.892071253797457	ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	24202458	C/T	1	68	60	128	32.4448139992562	31.3722229418327	1.07259105742349	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.860063977842099	ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	24231449	C/T	1	139	149	288	66.3210168514208	77.907686972218	-11.5866701207971	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.175259165517982	ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24231282_24231932:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	24583451	C/T	1	180	130	310	85.8833311745018	67.9731497073043	17.9101814671975	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0464305812514051	ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	24980078	C/T	1	17	12	29	8.11120349981406	6.27444458836655	1.83675891144751	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.578745144426162	ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24980024_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24979982_24980093:ARHGAP17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27268779	G/C	1	56	32	88	26.7192585876228	16.7318522356441	9.98740635197865	T:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0419908624178945	ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27268756_27268902:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27268756_27268902:NSMCE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27373773	C/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27373872	A/C	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27373915	G/T	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27373966	C/T	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27374148	C/T	1	7	22	29	3.33990732345285	11.5031484120053	-8.16324108855249	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00256813301260754	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27374180	T/C	1	23	10	33	10.9739812056308	5.22870382363879	5.74527738199199	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0545131899192798	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27374399	C/T	1	13	7	20	6.20268502926957	3.66009267654715	2.54259235272242	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.273177370962394	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27374701	G/A	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27374927	T/G	1	19	14	33	9.0654627350863	7.32018535309431	1.74527738199199	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.603476938564334	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27375029	T/C	1	19	18	37	9.0654627350863	9.41166688254982	-0.346204147463521	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27375157	T/C	1	28	34	62	13.3596292938114	17.7775930003719	-4.41796370656049	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.309176657418411	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	27375159	T/C	1	33	27	60	15.745277381992	14.1175003238247	1.62777705816726	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.700048991366252	ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28145165	T/A	1	12	6	18	5.72555541163345	3.13722229418327	2.58833311745018	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.246737118314006	ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28508069	C/T	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28844448	C/A	1	39	34	73	18.6080550878087	17.7775930003719	0.830462087436839	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.906929426754712	ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28844380_28844675:ATXN2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28845448	G/A	1	53	47	100	25.2878697347144	24.5749079711023	0.712961763612107	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.920478837520734	ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28845386_28845532:ATXN2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28846866	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28854372	T/C	1	526	461	987	250.9701788766	241.043246269748	9.92693260685147	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.544934737302896	ENSG00000178952:ENST00000313511:exon_28853732_28854469:TUFM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28883241	A/G	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28922249	C/T	1	15	26	41	7.15694426454182	13.5946299414609	-6.43768567691904	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0593620693177643	ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28922209_28922307:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28922209_28922307:RABEP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28925731	G/A	1	13	17	30	6.20268502926957	8.88879650018594	-2.68611147091637	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.363873653248518	ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28925557_28925907:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28925557_28925907:RABEP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28936427	C/A	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28936424_28937073:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28936424_28937073:RABEP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28948783	C/T	1	157	166	323	74.909349968871	86.7964834724039	-11.8871335035329	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.200114226669324	ENSG00000177455:ENST00000380673:exon_28948776_28948844:CD19;ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28948776_28948844:CD19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28962401	C/T	1	9	11	20	4.29416655872509	5.75157420600267	-1.45740764727758	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.655558089529074	ENSG00000176953:ENST00000426355:exon_28962313_28962719:NFATC2IP;ENSG00000176953:ENST00000320805:exon_28962315_28962719:NFATC2IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	28986542	A/G	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000334536:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000352260:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28986422_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28986509_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000434933:exon_28986122_28986713:SPNS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	29755576	A/G	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000185905:ENST00000329410:exon_29753784_29756272:C16orf54
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	29827807	T/C	1	3	11	14	1.43138885290836	5.75157420600267	-4.32018535309431	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0293845133860985	ENSG00000185928:ENST00000320330:exon_29827285_29828328:C16orf53
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	30080245	C/G	1	2732	2991	5723	1303.51811538188	1563.90531365036	-260.387198268479	A:T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	5.77518074034036e-12	ENSG00000149925:ENST00000395248:exon_30080139_30080299:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000338110:exon_30080139_30080299:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000436540:exon_30080139_30080299:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000412304:exon_30080139_30080299:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000395240:exon_30080139_30080299:ALDOA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	30116302	G/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000102886:ENST00000406256:exon_30116131_30116330:GDPD3;ENSG00000102886:ENST00000360688:exon_30116132_30116330:GDPD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	30376486	T/C	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	30522267	C/T	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000005844:ENST00000358164:exon_30522202_30522281:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000356798:exon_30522202_30522281:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000433423:exon_30522214_30522281:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000315171:exon_30522202_30522281:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000454514:exon_30522202_30522281:ITGAL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	30744746	A/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000080603:ENST00000262518:exon_30744601_30744770:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000395059:exon_30744601_30744770:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000344771:exon_30744601_30744770:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000380361:exon_30744601_30744770:SRCAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	31475730	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31475715_31476208:ARMC5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	31477442	T/C	1	14	13	27	6.67981464690569	6.79731497073043	-0.117500323824731	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	31477795	G/C	1	12	15	27	5.72555541163345	7.84305573545818	-2.11750032382473	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.445977489976173	ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	31501376	G/T	1	65	85	150	31.0134251463479	44.4439825009297	-13.4305573545818	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0332431972013714	ENSG00000140688:ENST00000327237:exon_31500810_31502253:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000452223:exon_31500815_31502253:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000436843:exon_31500815_31502253:C16orf58
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	46705743	C/T	1	40	24	64	19.0851847054448	12.5488891767331	6.53629552871175	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.105424507252772	ENSG00000069329:ENST00000299138:exon_46705617_46705772:VPS35
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	46729509	T/G	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000091651:ENST00000219097:exon_46729474_46729586:ORC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	47271876	T/C	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000129636:ENST00000320640:exon_47271876_47271919:ITFG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	47697618	A/G	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000102893:ENST00000455779:exon_47697588_47697645:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000299167:exon_47697588_47697645:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000323584:exon_47697588_47697645:PHKB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	50342203	C/A	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	50707782	C/T	1	5	11	16	2.38564808818061	5.75157420600267	-3.36592611782206	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.131501130991483	ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50705536_50707985:SNX20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	50711334	G/A	1	9	5	14	4.29416655872509	2.61435191181939	1.6798146469057	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.430819213902139	ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	50827518	C/T	1	28	32	60	13.3596292938114	16.7318522356441	-3.37222294183274	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.438542927840932	ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50827457_50827575:CYLD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	56857753	G/A	1	23	21	44	10.9739812056308	10.9802780296415	-0.00629682401067377	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56857619_56857758:NUP93
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	57016092	G/A	1	15	4	19	7.15694426454182	2.09148152945552	5.0654627350863	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0215503033329652	ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	57101340	T/C	1	9	7	16	4.29416655872509	3.66009267654715	0.634073882177937	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.806882383309564	ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57101299_57101382:NLRC5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	57261283	C/T	1	11	2	13	5.24842579399733	1.04574076472776	4.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0242231410078916	ENSG00000159579:ENST00000394420:exon_57261254_57261365:RSPRY1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	57261344	A/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000159579:ENST00000394420:exon_57261254_57261365:RSPRY1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	57552088	T/C	1	9	5	14	4.29416655872509	2.61435191181939	1.6798146469057	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.430819213902139	ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57551980_57552189:CCDC102A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	57788843	C/T	1	6	16	22	2.86277770581673	8.36592611782206	-5.50314841200534	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.030381781013492	ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57788842_57788909:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57788842_57788909:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57788842_57788909:KATNB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	57789288	T/C	1	14	12	26	6.67981464690569	6.27444458836655	0.405370058539147	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57789257_57789406:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57789257_57789406:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57789257_57789406:KATNB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	58575489	G/A	1	5	13	18	2.38564808818061	6.79731497073043	-4.41166688254982	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0562174762259916	ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	58616984	T/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58616960_58617086:CNOT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	67116169	C/T	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000067955:ENST00000290858:exon_67116116_67116242:CBFB;ENSG00000067955:ENST00000412916:exon_67116116_67116211:CBFB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	67203684	C/T	1	11	7	18	5.24842579399733	3.66009267654715	1.58833311745018	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.489005913678072	ENSG00000102878:ENST00000421453:exon_67203534_67203848:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000264009:exon_67203534_67203848:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000522295:exon_67203534_67203842:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000434833:exon_67203534_67203813:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521314:exon_67203534_67203832:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521624:exon_67203534_67203844:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000523562:exon_67203182_67203848:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000517685:exon_67203534_67203686:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521374:exon_67203534_67203724:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000519601:exon_67203534_67203684:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000520528:exon_67203534_67203806:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000520304:exon_67203631_67203844:HSF4;ENSG00000102878:ENST00000521916:exon_67203539_67203844:HSF4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	67265360	C/A	1	11	20	31	5.24842579399733	10.4574076472776	-5.20898185328025	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0720505832117271	ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	67266065	T/C	1	21	15	36	10.0197219703585	7.84305573545818	2.17666623490036	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.507866907513101	ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265942_67266097:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265942_67266097:FHOD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	67911517	T/C	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	67969531	A/G	1	362	386	748	172.720921584276	201.827967592457	-29.1070460081814	A:T:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0337694077878743	ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	67969930	A/G	1	421	438	859	200.871569024807	229.017227475379	-28.145658450572	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0557971419370305	ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	68024850	A/G	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000167261:ENST00000322384:exon_68024724_68024900:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000268795:exon_68024724_68024900:DPEP2;ENSG00000167261:ENST00000393847:exon_68024724_68024900:DPEP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	68389772	C/T	1	67	43	110	31.9676843816201	22.4834264416468	9.48425793997331	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.08532502242304	ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	68390697	C/T	1	53	81	134	25.2878697347144	42.3525009714742	-17.0646312367598	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00323716268451022	ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68390604_68390700:PRMT7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69177268	C/T	1	31	27	58	14.7910181467198	14.1175003238247	0.67351782289502	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.89600547248799	ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69177081_69177292:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000352319:exon_69177081_69177292:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69177081_69177292:CIRH1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69354963	A/G	1	24	17	41	11.4511108232669	8.88879650018594	2.56231432308096	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.439398616078477	ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69355155	G/A	1	13	30	43	6.20268502926957	15.6861114709164	-9.4834264416468	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00535625993965453	ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69356612	C/G	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.21775904956837	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69364030	G/A	1	13	6	19	6.20268502926957	3.13722229418327	3.0654627350863	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.175490139559428	ENSG00000213380:ENST00000288022:exon_69363900_69364498:COG8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69373414	T/C	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69402305	C/T	1	14	8	22	6.67981464690569	4.18296305891103	2.49685158799466	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.393877834025079	ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69402279_69402385:TERF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69786207	T/A	1	92	68	160	43.8959248225231	35.5551860007438	8.34073882177937	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.205449024000385	ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69786144_69786274:NOB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	69973825	G/A	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	71894383	A/G	1	20	40	60	9.54259235272242	20.9148152945552	-11.3722229418327	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00410773434379246	ENSG00000102984:ENST00000446827:exon_71893589_71894575:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000425432:exon_71893589_71894575:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000313565:exon_71893589_71894575:ZNF821
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	71895777	C/T	1	7	12	19	3.33990732345285	6.27444458836655	-2.9345372649137	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.250431561449006	ENSG00000102984:ENST00000446827:exon_71895679_71895845:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000425432:exon_71895679_71895845:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000313565:exon_71895679_71895845:ZNF821
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	72130203	C/G	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	72130815	C/A	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	72135014	T/C	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	72137561	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	72139184	C/A	1	18	18	36	8.58833311745018	9.41166688254982	-0.82333376509964	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.867968606269239	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	72141362	G/A	1	23	8	31	10.9739812056308	4.18296305891103	6.79101814671975	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.018207423537365	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72141239_72141447:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72141239_72141447:DHX38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	75018874	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_75018862_75019017:WDR59
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	77769881	G/C	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000140876:ENST00000268533:exon_77769725_77769883:NUDT7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	81010073	C/T	1	66	56	122	31.490554763984	29.2807414123772	2.20981335160677	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.717553882161302	ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	81061827	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	81737633	C/T	1	18	10	28	8.58833311745018	5.22870382363879	3.35962929381139	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.256783109761352	ENSG00000153815:ENST00000398040:exon_81737544_81737690:AC099480.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	81819768	T/C	1	19	22	41	9.0654627350863	11.5031484120053	-2.43768567691904	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.532306974462956	ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	81953194	C/T	1	71	86	157	33.8762028521646	44.9668528832936	-11.090650031129	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0791199599745317	ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81953089_81953269:PLCG2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	81954829	C/T	1	103	115	218	49.1443506165205	60.1300939718461	-10.9857433553256	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.154344253876382	ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81954803_81954874:PLCG2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	82182973	T/C	1	10	17	27	4.77129617636121	8.88879650018594	-4.11750032382473	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.125677435528638	ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82182914_82183008:MPHOSPH6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	83933193	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83932730_83933277:MLYCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	83945874	A/G	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83945823_83945972:MLYCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	83945949	A/C	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83945823_83945972:MLYCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	83945953	G/A	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83945823_83945972:MLYCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84088026	T/C	1	22	15	37	10.4968515879947	7.84305573545818	2.65379585253648	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.414284355859138	ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84088047	C/T	1	24	16	40	11.4511108232669	8.36592611782206	3.08518470544484	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.346855338449902	ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84212647	T/C	1	12	19	31	5.72555541163345	9.9345372649137	-4.20898185328025	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.151304978564878	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84212710	C/T	1	11	20	31	5.24842579399733	10.4574076472776	-5.20898185328025	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0720505832117271	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84212779	G/A	1	25	10	35	11.928240440903	5.22870382363879	6.69953661726424	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0271075991304383	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84212853	G/C	1	6	17	23	2.86277770581673	8.88879650018594	-6.02601879436922	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0195603276920325	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84212928	G/A	1	23	8	31	10.9739812056308	4.18296305891103	6.79101814671975	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.018207423537365	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84213434	A/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84778690	C/T	0	11	0	11	5.24842579399733	0	5.24842579399733	C	C		10	0.522870382363879	0.00109035227886462	ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	84778697	G/C	1	10	1	11	4.77129617636121	0.522870382363879	4.24842579399733	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0126233924286189	ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	85834818	G/A	1	588	608	1196	280.552215170039	317.905192477238	-37.3529773071992	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0321569243108126	ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	87760461	C/T	1	32	19	51	15.2681477643559	9.9345372649137	5.33361049944217	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.160834407096069	ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87760371_87760530:KLHDC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	87764187	G/T	1	20	11	31	9.54259235272242	5.75157420600267	3.79101814671975	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.208931501336605	ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87764158_87764250:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87764158_87764250:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87764158_87764250:KLHDC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	88779739	A/G	1	14	21	35	6.67981464690569	10.9802780296415	-4.30046338273576	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.175897503034529	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	88781125	T/C	1	29	34	63	13.8367589114475	17.7775930003719	-3.94083408892437	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.377495978614941	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89167395	C/T	1	21	4	25	10.0197219703585	2.09148152945552	7.92824044090303	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00196050797114572	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89167404	T/C	1	21	2	23	10.0197219703585	1.04574076472776	8.97398120563079	T:C	T	C	10	0.522870382363879	9.09889394113894e-05	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89167431	G/C	0	13	0	13	6.20268502926957	0	6.20268502926957	G	G		10	0.522870382363879	0.000284750618326613	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89167443	T/C	1	16	1	17	7.63407388217794	0.522870382363879	7.11120349981406	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.000337042918951798	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89167458	C/A	1	16	2	18	7.63407388217794	1.04574076472776	6.58833311745018	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.00157158363711235	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89167650	C/T	1	11	7	18	5.24842579399733	3.66009267654715	1.58833311745018	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.489005913678072	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89180883	G/A	1	17	22	39	8.11120349981406	11.5031484120053	-3.39194491219128	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.336473791826544	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89347537	C/T	1	9	10	19	4.29416655872509	5.22870382363879	-0.9345372649137	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.819184206292418	ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89347729	C/T	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89763973	A/G	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	89836323	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	16	90020745	C/G	1	14	11	25	6.67981464690569	5.75157420600267	0.928240440903026	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.84195256213668	ENSG00000140995:ENST00000418391:exon_90020651_90020784:DEF8;ENSG00000140995:ENST00000268676:exon_90020651_90020784:DEF8;ENSG00000140995:ENST00000455613:exon_90020651_90020784:DEF8;ENSG00000140995:ENST00000428717:exon_90020651_90020784:DEF8;ENSG00000140995:ENST00000430201:exon_90020651_90020784:DEF8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	263475	G/A	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000187624:ENST00000360127:exon_262939_264367:C17orf97
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	649232	C/T	1	22	28	50	10.4968515879947	14.6403707061886	-4.14351911819395	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.259427185339803	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	1370542	C/A	1	49	64	113	23.3793512641699	33.4637044712883	-10.0843532071183	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0599619293953467	ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	1371311	T/C	1	41	51	92	19.562314323081	26.6663895005578	-7.10407517747687	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.144891479123809	ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1371282_1371417:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1371282_1371417:MYO1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	1373518	T/C	1	23	20	43	10.9739812056308	10.4574076472776	0.516573558353205	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	1538302	C/A	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	1538628	C/G	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	1549771	G/C	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167705:ENST00000301336:exon_1549444_1549913:RILP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	1684605	G/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	1795180	T/C	1	35	27	62	16.6995366172642	14.1175003238247	2.5820362934395	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.527876134876598	ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	3566993	G/A	1	13	29	42	6.20268502926957	15.1632410885525	-8.96055605928291	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00786215924506374	ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3566196_3567179:TAX1BP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	3599260	A/T	1	22	4	26	10.4968515879947	2.09148152945552	8.40537005853915	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.00117304991149265	ENSG00000083454:ENST00000381833:exon_3599163_3599508:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000435558:exon_3599163_3599508:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3599163_3599649:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3599163_3599583:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000440619:exon_3599163_3599583:P2RX5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	3833708	G/T	1	7	10	17	3.33990732345285	5.22870382363879	-1.88879650018594	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.468009294351122	ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3833595_3833728:ATP2A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	3844787	C/G	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844730_3844948:ATP2A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	3920884	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3920665_3921024:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3920665_3921024:ZZEF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	5418368	C/T	1	15	2	17	7.15694426454182	1.04574076472776	6.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0027473058455026	ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	5425077	T/C	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	6663753	A/G	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7129840	T/C	1	17	15	32	8.11120349981406	7.84305573545818	0.268147764355874	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7130437	G/A	1	15	9	24	7.15694426454182	4.70583344127491	2.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.414521773200192	ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7130409_7130588:DVL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7133162	G/A	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7144146	C/A	1	531	544	1075	253.35582696478	284.44148800595	-31.0856610411699	A:C:G	C	A	10	0.522870382363879	0.0583943763257593	ENSG00000170296:ENST00000302386:exon_7143333_7144238:GABARAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7161971	C/T	1	53	61	114	25.2878697347144	31.8950933241966	-6.6072235894822	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.22392243353982	ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7161907_7163250:C17orf81
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7214824	C/T	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7216763	C/T	1	37	37	74	17.6537958525365	19.3462041474635	-1.69240829492704	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.727843028759624	ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216699_7216788:GPS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7217463	T/C	1	24	14	38	11.4511108232669	7.32018535309431	4.1309254701726	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.196629566341141	ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7221385	G/A	1	12	6	18	5.72555541163345	3.13722229418327	2.58833311745018	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.246737118314006	ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7245371	A/G	1	99	94	193	47.235832145976	49.1498159422046	-1.91398379622864	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.828930765125853	ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7604852	C/T	1	25	19	44	11.928240440903	9.9345372649137	1.99370317598933	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.651252856448512	ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7604745_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7604745_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000451908:exon_7604777_7604867:WRAP53
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7606350	T/C	1	46	36	82	21.9479624112616	18.8233337650996	3.12462864616193	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.509002652853759	ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7606401	C/T	1	63	45	108	30.0591659110756	23.5291672063746	6.52999870470108	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.212241704708445	ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7843053	C/T	1	16	18	34	7.63407388217794	9.41166688254982	-1.77759300037188	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.608049526191679	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7847955	C/A	1	23	15	38	10.9739812056308	7.84305573545818	3.1309254701726	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.333716658993004	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	7849087	C/G	1	15	17	32	7.15694426454182	8.88879650018594	-1.73185223564413	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.597599372848838	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	8025180	T/C	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8024299_8025340:HES7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	8046121	T/C	1	11	9	20	5.24842579399733	4.70583344127491	0.542592352722421	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.82745485897146	ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8045967_8046153:PER1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	8046664	C/T	1	15	4	19	7.15694426454182	2.09148152945552	5.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0215503033329652	ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	8108339	G/A	1	219	152	371	104.491386262311	79.4762981193096	25.0150881430009	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0093484302555664	ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	8416901	C/T	1	20	5	25	9.54259235272242	2.61435191181939	6.92824044090303	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0078611001045379	ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	8736384	G/T	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.293174373693898	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	8790850	G/A	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8790838_8791000:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8790838_8791000:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8790838_8791000:PIK3R5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	9395231	G/A	1	115	102	217	54.8699060281539	53.3327790011157	1.53712702703827	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.838861496078005	ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	9471711	T/G	1	19	34	53	9.0654627350863	17.7775930003719	-8.71213026528558	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0189782819576178	ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	10614442	A/G	1	34	23	57	16.2224069996281	12.0260187943692	4.1963882052589	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.290441065783512	ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	13977679	C/T	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13977640_13977773:COX10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	13980164	A/G	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	14005439	G/A	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_14005435_14005559:COX10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	15881406	C/T	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000214941:ENST00000399277:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000399280:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000490395:exon_15881358_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000476496:exon_15881358_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000497719:exon_15881358_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000472495:exon_15881358_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000491631:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000460315:exon_15881358_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000474716:exon_15881358_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486655:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000495825:exon_15881358_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486706:exon_15881089_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000497434:exon_15881358_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000460252:exon_15881205_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000475498:exon_15881239_15881477:ZSWIM7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	16323493	G/A	1	17	18	35	8.11120349981406	9.41166688254982	-1.30046338273576	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.736056008386851	ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16323429_16323562:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16323429_16323562:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16323429_16323562:TRPV2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	16326005	A/C	1	24	25	49	11.4511108232669	13.071759559097	-1.62064873583007	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.669961097803568	ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	16336992	C/G	1	71	96	167	33.8762028521646	50.1955567069324	-16.3193538547678	A:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0129906429081611	ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	16344601	G/C	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.744796714975245	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	16456614	T/G	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000141040:ENST00000268727:exon_16453631_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395825:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395824:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000498796:exon_16456424_16456740:ZNF287
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	17077320	G/A	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17077230_17077389:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17077230_17077389:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17077230_17077389:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17077230_17077389:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17077230_17077389:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000313485:exon_17077230_17077389:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000414263:exon_17077230_17077389:MPRIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	17168164	G/A	1	19	13	32	9.0654627350863	6.79731497073043	2.26814776435587	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.481365516472907	ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	17720391	A/G	1	7	13	20	3.33990732345285	6.79731497073043	-3.45740764727758	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.177899741067494	ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17720272_17720450:SREBF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	17750907	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	18004901	G/A	1	23	19	42	10.9739812056308	9.9345372649137	1.03944394071708	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.760367147756807	ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_18004807_18004904:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_18004807_18004904:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_18004807_18004904:DRG2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	18148485	G/A	1	130	143	273	62.0268502926957	74.7704646780347	-12.743614385339	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.129884800984847	ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	18775900	A/G	1	27	45	72	12.8824996761753	23.5291672063746	-10.6466675301993	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0130445361349121	ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	20108885	T/C	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	20109189	C/T	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	20209365	G/A	1	9	13	22	4.29416655872509	6.79731497073043	-2.50314841200534	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.295828349148920	ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20209336_20209395:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20209336_20209395:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20209336_20209395:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000492188:exon_20208965_20209395:SPECC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21203893	T/C	0	32	0	32	15.2681477643559	0	15.2681477643559	T	T		10	0.522870382363879	1.02615623082107e-09	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21203934	G/A	0	39	0	39	18.6080550878087	0	18.6080550878087	G	G		10	0.522870382363879	1.07009756668885e-11	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21203949	C/T	0	39	0	39	18.6080550878087	0	18.6080550878087	C	C		10	0.522870382363879	1.07009756668885e-11	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21207844	C/T	0	32	0	32	15.2681477643559	0	15.2681477643559	C	C		10	0.522870382363879	1.02615623082107e-09	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21208413	C/T	0	50	0	50	23.8564808818061	0	23.8564808818061	C	C		10	0.522870382363879	1.30806461073631e-14	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21215483	C/T	1	53	2	55	25.2878697347144	1.04574076472776	24.2421289699867	T:C	C	T	10	0.522870382363879	4.95181591447986e-13	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21215537	C/A	0	60	0	60	28.6277770581673	0	28.6277770581673	C	C		10	0.522870382363879	1.61838520843545e-17	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21215552	C/T	0	79	0	79	37.6932397932536	0	37.6932397932536	C	C		10	0.522870382363879	6.02270908236695e-23	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21215557	G/A	0	86	0	86	41.0331471167064	0	41.0331471167064	G	G		10	0.522870382363879	6.27141033256506e-25	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21216846	G/C	0	86	0	86	41.0331471167064	0	41.0331471167064	G	G		10	0.522870382363879	6.27141033256506e-25	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	21217543	G/A	1	46	51	97	21.9479624112616	26.6663895005578	-4.71842708929626	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.361076550610907	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21217459_21218552:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21217459_21218525:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21217459_21218525:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21217459_21218540:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21217459_21218277:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21217459_21217744:MAP2K3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	26879511	C/A	1	26	26	52	12.4053700585391	13.5946299414609	-1.1892598829217	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.782282148390827	ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26879356_26879659:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26879356_26879578:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000444148:exon_26879356_26879627:UNC119
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	27207832	C/T	1	25	18	43	11.928240440903	9.41166688254982	2.51657355835321	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.541953811268653	ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27207731_27207880:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27207731_27207880:FLOT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	27225586	A/T	1	17	23	40	8.11120349981406	12.0260187943692	-3.91481529455516	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.267794969957949	ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27224801_27225910:DHRS13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	27889578	T/C	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	27902100	T/G	1	20	31	51	9.54259235272242	16.2089818532802	-6.66638950055783	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0685902447858135	ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27902097_27902160:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27902097_27902160:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27902097_27902160:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27902097_27902160:GIT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	29097001	G/C	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.309395367009253	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	29111204	T/C	1	9	5	14	4.29416655872509	2.61435191181939	1.6798146469057	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.430819213902139	ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	30207624	A/G	1	33	27	60	15.745277381992	14.1175003238247	1.62777705816726	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.700048991366252	ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30207592_30207773:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30207592_30207773:UTP6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	30213044	C/T	1	19	25	44	9.0654627350863	13.071759559097	-4.00629682401067	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.231823257801756	ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30212999_30213080:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30212999_30213080:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30212999_30213080:UTP6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	30226738	T/C	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30226665_30226749:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30226665_30226749:UTP6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	33288882	T/G	1	7	13	20	3.33990732345285	6.79731497073043	-3.45740764727758	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.177899741067494	ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	33586538	G/A	0	0	17	17	0	8.88879650018594	-8.88879650018594	A	G	A	10	0.522870382363879	3.44205965560869e-06	ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33585670_33586721:SLFN5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	33591403	A/G	0	17	0	17	8.11120349981406	0	8.11120349981406	A	A		10	0.522870382363879	1.97612541186617e-05	ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33591202_33591922:SLFN5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	34416537	G/A	1	1271	768	2039	606.43174401551	401.564453655459	204.867290360051	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	7.50510128899154e-20	ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	34432663	A/G	1	476	202	678	227.113697994794	105.619817237504	121.49388075729	A:G	A	G	10	0.522870382363879	2.47623479856772e-21	ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	34432664	T/A	1	475	203	678	226.636568377157	106.142687619867	120.49388075729	A:T:G	T	A	10	0.522870382363879	5.30299888276493e-21	ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	34942595	G/A	1	51	64	115	24.3336104994422	33.4637044712883	-9.13009397184608	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0932461756353616	ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	34958290	C/T	1	1	9	10	0.477129617636121	4.70583344127491	-4.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0088395297966988	ENSG00000129282:ENST00000250156:exon_34958001_34958781:MRM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	35378245	A/G	1	121	99	220	57.7326837339706	51.764167854024	5.96851587994663	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.457933238801154	ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35378233_35378313:AATF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	35470031	T/G	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000132142:ENST00000353139:exon_35470023_35470200:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000360679:exon_35470023_35470200:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000394406:exon_35470023_35470200:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000452074:exon_35470023_35470200:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000361253:exon_35470023_35470200:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000394407:exon_35470023_35470200:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000335166:exon_35470023_35470200:ACACA;ENSG00000132142:ENST00000427330:exon_35470023_35470200:ACACA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	35902225	C/G	1	17	16	33	8.11120349981406	8.36592611782206	-0.254722618008005	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	35984410	T/C	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	35988672	C/T	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	36909061	A/G	1	194	196	390	92.5631458214075	102.48259494332	-9.91944912191279	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.335509326660335	ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	36963226	G/T	1	13	13	26	6.20268502926957	6.79731497073043	-0.594629941460852	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.846528826360866	ENSG00000108296:ENST00000225428:exon_36963018_36963229:CWC25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	37070658	A/G	1	6	23	29	2.86277770581673	12.0260187943692	-9.16324108855249	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.000636723288154252	ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	37682292	G/A	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000167258:ENST00000300647:exon_37682117_37682419:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000430627:exon_37682117_37682569:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000447079:exon_37682117_37682569:CDK12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	37816702	G/C	1	20	18	38	9.54259235272242	9.41166688254982	0.130925470172601	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37816684_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37816684_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37816684_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37815714_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37815714_37816779:STARD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38061054	G/A	1	18	16	34	8.58833311745018	8.36592611782206	0.222406999628117	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38060849_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38060850_38061217:GSDMB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38062196	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38062217	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38142899	T/C	1	52	43	95	24.8107401170783	22.4834264416468	2.3273136754315	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.681663533131644	ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38142828_38142965:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38142828_38142965:PSMD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38146154	T/C	1	150	114	264	71.5694426454182	59.6072235894822	11.962219055936	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.156346077072786	ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38145992_38146182:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38145992_38146182:PSMD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38179062	C/T	1	52	43	95	24.8107401170783	22.4834264416468	2.3273136754315	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.681663533131644	ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000422942:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38178898_38179079:MED24
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38282624	C/T	1	18	28	46	8.58833311745018	14.6403707061886	-6.05203758873843	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0779928968475031	ENSG00000188895:ENST00000339569:exon_38282436_38282659:MSL1;ENSG00000188895:ENST00000398532:exon_38282436_38282659:MSL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38447569	T/C	1	5	16	21	2.38564808818061	8.36592611782206	-5.98027802964146	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.0141708466780634	ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38447310_38447591:CDC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	38991237	C/T	1	27	29	56	12.8824996761753	15.1632410885525	-2.28074141237722	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.593510437262858	ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	39983808	G/C	1	63	26	89	30.0591659110756	13.5946299414609	16.4645359696148	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.000426906794439184	ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	39983820	G/A	1	61	25	86	29.1049066758034	13.071759559097	16.0331471167064	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.000502345303392191	ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40065774	T/G	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40065763_40065953:ACLY
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40142302	T/C	1	47	43	90	22.4250920288977	22.4834264416468	-0.0583344127491046	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000426588:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40142282_40142400:DNAJC7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40255812	C/T	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40280291	G/A	1	27	50	77	12.8824996761753	26.1435191181939	-13.2610194420187	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00282962806358188	ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40341880	G/A	1	50	32	82	23.8564808818061	16.7318522356441	7.12462864616193	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.122493584877876	ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40341108_40341939:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40341108_40341939:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40341108_40341939:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40341108_40341939:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40341108_40341939:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40341108_40341939:GHDC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40344690	C/T	1	14	10	24	6.67981464690569	5.22870382363879	1.45111082326691	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.683821947854935	ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40442037	C/T	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000469124:exon_40441884_40442197:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000444283:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000478897:exon_40441884_40442040:STAT5A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40459737	C/T	1	48	31	79	22.9022216465338	16.2089818532802	6.69323979325356	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.143669000724296	ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40872328	C/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000108799:ENST00000264646:exon_40872291_40872467:EZH1;ENSG00000108799:ENST00000415827:exon_40872291_40872467:EZH1;ENSG00000108799:ENST00000428826:exon_40872291_40872467:EZH1;ENSG00000108799:ENST00000435174:exon_40872291_40872467:EZH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40931054	T/C	1	88	120	208	41.9874063519786	62.7444458836655	-20.7570395316868	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00434690565989455	ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40930975_40931616:VPS25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	40970432	G/A	1	35	32	67	16.6995366172642	16.7318522356441	-0.0323156183798901	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000126581:ENST00000361523:exon_40970239_40970433:BECN1;ENSG00000126581:ENST00000438274:exon_40970239_40970433:BECN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	41102653	G/A	1	24	17	41	11.4511108232669	8.88879650018594	2.56231432308096	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.439398616078477	ENSG00000108825:ENST00000486493:exon_41102543_41102745:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000360221:exon_41102543_41102745:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000409399:exon_41102547_41102745:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000421990:exon_41102547_41102745:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000427569:exon_41102547_41102745:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000474578:exon_41102550_41102745:AARSD1;ENSG00000108825:ENST00000409103:exon_41102563_41102745:AARSD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	41197659	G/C	1	11	6	17	5.24842579399733	3.13722229418327	2.11120349981406	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.340952760955587	ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41196312_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41196822_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41197646_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41197646_41197819:BRCA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	41223094	T/C	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	41245466	G/A	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	42152103	G/A	1	11	14	25	5.24842579399733	7.32018535309431	-2.07175955909697	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.429970268760073	ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	42288440	G/A	1	13	32	45	6.20268502926957	16.7318522356441	-10.5291672063746	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00243152097637116	ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42288407_42288520:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42288407_42288520:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42288407_42288520:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42288407_42288520:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42288407_42288520:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42288407_42288520:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42288407_42288520:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42288407_42288520:UBTF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	42636579	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000180340:ENST00000315323:exon_42634925_42636907:FZD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	43342141	G/C	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45008570	G/A	1	43	32	75	20.5165735583532	16.7318522356441	3.78472132270908	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.419293449792086	ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45198343	C/T	1	18	34	52	8.58833311745018	17.7775930003719	-9.1892598829217	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.012095772185957	ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45195069_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000446365:exon_45195310_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45196583_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45197352_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45197621_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45198137_45198383:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45198246_45198383:CDC27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45214685	T/C	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.370794847578149	ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45214518_45214726:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45214518_45214726:CDC27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45735975	G/A	1	16	18	34	7.63407388217794	9.41166688254982	-1.77759300037188	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.608049526191679	ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45750468	T/C	1	50	47	97	23.8564808818061	24.5749079711023	-0.718427089296256	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.919221256316432	ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45904420	C/T	1	34	28	62	16.2224069996281	14.6403707061886	1.58203629343951	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.704983511708848	ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000466016:exon_45904261_45904570:MRPL10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45915395	T/C	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45917596	A/G	1	19	12	31	9.0654627350863	6.27444458836655	2.79101814671975	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.370530485639912	ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45917557_45917738:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45917557_45917738:SCRN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45994044	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	45994094	T/C	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	46054140	C/A	1	81	65	146	38.6474990285258	33.9865748536521	4.66092417487368	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.456796951599947	ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46054078_46054188:CDK5RAP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	46474118	G/T	1	38	22	60	18.1309254701726	11.5031484120053	6.62777705816726	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0936484202910434	ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46474042_46474147:SKAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	47000251	C/T	1	20	24	44	9.54259235272242	12.5488891767331	-3.00629682401067	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.370310186703707	ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	47785189	A/G	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47785092_47785317:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47785092_47785306:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47785092_47785452:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000435059:exon_47785092_47785282:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000515850:exon_47785092_47785311:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511763:exon_47785092_47785302:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000509781:exon_47785092_47785326:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508607:exon_47785092_47785282:SLC35B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48216944	C/T	1	92	64	156	43.8959248225231	33.4637044712883	10.4322203512349	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.108667602397677	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48262919	C/T	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000108821:ENST00000225964:exon_48260650_48263009:COL1A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48447918	T/C	1	36	61	97	17.1766662349004	31.8950933241966	-14.7184270892963	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00306610994361299	ENSG00000108826:ENST00000507088:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000508200:exon_48447816_48447934:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000511860:exon_48447816_48447947:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48447596_48447947:MRPL27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48450523	C/G	1	27	22	49	12.8824996761753	11.5031484120053	1.37935126416993	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.775398548709281	ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48450536	T/G	1	14	10	24	6.67981464690569	5.22870382363879	1.45111082326691	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.683821947854935	ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48456251	C/T	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000514211:exon_48456244_48456585:EME1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48470190	T/C	1	19	12	31	9.0654627350863	6.27444458836655	2.79101814671975	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.370530485639912	ENSG00000108829:ENST00000225972:exon_48470100_48470258:LRRC59
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48539035	T/C	1	11	13	24	5.24842579399733	6.79731497073043	-1.54888917673309	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.546918420888488	ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	48562277	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48562105_48563336:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48562105_48563335:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48562105_48562359:RSAD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	53851228	C/T	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	54978794	G/A	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	57105908	T/G	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000108395:ENST00000393066:exon_57105776_57106084:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000262294:exon_57105776_57106084:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000393065:exon_57105776_57106084:TRIM37;ENSG00000108395:ENST00000376149:exon_57105776_57106084:TRIM37
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	57272185	A/G	1	4	16	20	1.90851847054448	8.36592611782206	-6.45740764727758	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0057020142302503	ENSG00000068489:ENST00000262293:exon_57272118_57272216:PRR11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	57290502	C/T	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	58121264	C/T	1	13	14	27	6.20268502926957	7.32018535309431	-1.11750032382473	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.703474017247423	ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58120562_58121495:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58120562_58121495:HEATR6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	58121453	G/A	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58120562_58121495:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58120562_58121495:HEATR6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	59668091	C/T	0	0	10	10	0	5.22870382363879	-5.22870382363879	A	C	A	10	0.522870382363879	0.000611453958002094	ENSG00000253506:ENST00000521764:exon_59667794_59668563:NACA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	61895179	A/G	1	39	34	73	18.6080550878087	17.7775930003719	0.830462087436839	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.906929426754712	ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61895054_61896676:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61895054_61896676:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61895054_61896676:DDX42
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	61902042	C/T	1	22	21	43	10.4968515879947	10.9802780296415	-0.483426441646795	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.880238254385161	ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901997_61902097:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901997_61902097:FTSJ3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	62007498	A/G	1	100	126	226	47.7129617636121	65.8816681778488	-18.1687064142366	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0164499471248312	ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	62223615	A/G	1	57	58	115	27.1963882052589	30.326482177105	-3.13009397184608	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.576417460723668	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	65908769	C/T	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	66246444	A/G	1	32	18	50	15.2681477643559	9.41166688254982	5.85648088180605	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.11885120619112	ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	67513003	C/A	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67512996_67513044:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67512996_67513044:MAP2K6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	71027833	A/G	1	2	8	10	0.954259235272242	4.18296305891103	-3.22870382363879	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0558208850126612	ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_71027695_71027853:SLC39A11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	71208827	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71208817_71208879:FAM104A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	72439967	G/A	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000420926:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000262616:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392629:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392628:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000482723:exon_72439224_72440051:GPRC5C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	72443192	G/T	1	11	33	44	5.24842579399733	17.254722618008	-12.0062968240107	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.000383354985273767	ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	73269676	C/T	1	41	22	63	19.562314323081	11.5031484120053	8.05916591107562	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0439975899324401	ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	73488794	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	73519413	C/T	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	73624439	C/A	1	28	19	47	13.3596292938114	9.9345372649137	3.42509202889769	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.381357218662145	ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73624298_73624522:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73624298_73624522:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000443199:exon_73624298_73624522:RECQL5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	73814836	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73814723_73814897:UNK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	73816026	A/G	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73816001_73816189:UNK;ENSG00000178932:ENST00000326348:exon_73815663_73816134:AC087289.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	73900688	T/C	1	42	39	81	20.0394439407171	20.3919449121913	-0.352500971474193	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	74266322	T/C	1	326	287	613	155.544255349375	150.063799738433	5.48045561094222	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.686013079247323	ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	74394353	G/A	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000175931:ENST00000319380:exon_74394336_74394464:UBE2O
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	74733099	G/A	1	75	67	142	35.7847213227091	35.0323156183799	0.752405704329192	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.933159178994555	ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	77808961	G/A	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000141582:ENST00000269397:exon_77806955_77809194:CBX4;ENSG00000141582:ENST00000448310:exon_77808843_77809194:CBX4;ENSG00000141582:ENST00000495122:exon_77808942_77809319:CBX4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	78091405	G/A	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	78091513	G/A	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	78093133	G/A	1	23	25	48	10.9739812056308	13.071759559097	-2.09777835346619	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.566100280837516	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78093071_78093678:GAA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	78184393	C/T	1	12	12	24	5.72555541163345	6.27444458836655	-0.548889176733095	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.841001758494376	ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	78363054	G/A	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78362973_78363167:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78362973_78363167:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78362973_78363167:RNF213
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	78367225	A/C	1	28	38	66	13.3596292938114	19.8690745298274	-6.50944523601601	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.111045611880871	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78367145_78369112:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78367145_78370085:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78367145_78370085:RNF213
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	78968480	G/A	1	27	15	42	12.8824996761753	7.84305573545818	5.03944394071708	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.125293130297779	ENSG00000176108:ENST00000325167:exon_78968381_78968490:CHMP6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79165016	C/G	1	19	18	37	9.0654627350863	9.41166688254982	-0.346204147463521	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79164993_79165135:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79164993_79165135:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79164993_79165135:AZI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79166384	C/T	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79169641	G/A	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79169668	C/T	1	7	10	17	3.33990732345285	5.22870382363879	-1.88879650018594	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.468009294351122	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79170578	C/T	1	3	9	12	1.43138885290836	4.70583344127491	-3.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0812439974911473	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79202956	T/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79219452	G/C	1	69	52	121	32.9219436168923	27.1892598829217	5.73268373397065	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.317442670709345	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79219566	C/G	1	44	41	85	20.9937031759893	21.437685676919	-0.443982500929714	A:C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79219621	G/A	1	31	30	61	14.7910181467198	15.6861114709164	-0.895093324196617	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.898174072751753	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79255998	G/A	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79255989_79256132:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79255989_79256132:SLC38A10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79478019	G/A	1	4484	3447	7931	2139.44920548037	1802.33420800829	337.114997472076	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	3.16136705475916e-14	ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79826935	G/A	1	385	436	821	183.694902789907	227.971486710651	-44.2765839207446	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00209423092415271	ENSG00000141522:ENST00000269321:exon_79825598_79826951:ARHGDIA;ENSG00000141522:ENST00000400721:exon_79826924_79826951:ARHGDIA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79846216	G/A	1	386	373	759	184.172032407543	195.030652621727	-10.8586202141841	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.445472017343292	ENSG00000183684:ENST00000505490:exon_79846117_79846294:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000331204:exon_79846117_79846294:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000504015:exon_79846161_79846294:THOC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79870295	C/A	1	38	42	80	18.1309254701726	21.9605560592829	-3.82963058911032	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.433820605561907	ENSG00000187531:ENST00000328666:exon_79869815_79870490:SIRT7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79952700	G/A	1	14	18	32	6.67981464690569	9.41166688254982	-2.73185223564413	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.378432073331373	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79952697_79952754:ASPSCR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79974680	C/G	1	39	44	83	18.6080550878087	23.0062968240107	-4.39824173620195	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.37957712741358	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	79994561	C/G	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80006957	A/C	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80006958	T/C	1	8	12	20	3.81703694108897	6.27444458836655	-2.45740764727758	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.371138995758136	ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80043276	G/A	0	11	0	11	5.24842579399733	0	5.24842579399733	G	G		10	0.522870382363879	0.00109035227886462	ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80043114_80043278:FASN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80043739	A/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80043358_80043747:FASN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80195578	C/T	1	92	57	149	43.8959248225231	29.8036117947411	14.092313027782	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0216148893050891	ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80195014_80195769:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80195014_80195769:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80195014_80195769:SLC16A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80196816	C/T	1	474	332	806	226.159438759521	173.592966944808	52.5664718147136	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.000210474266344000	ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80196578_80197354:SLC16A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80274603	T/C	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000173762:ENST00000312648:exon_80274543_80274857:CD7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80350331	G/A	1	27	36	63	12.8824996761753	18.8233337650996	-5.94083408892437	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.164860633043401	ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80352234	G/A	1	17	10	27	8.11120349981406	5.22870382363879	2.88249967617527	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.336223488451435	ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80352303	G/A	1	13	10	23	6.20268502926957	5.22870382363879	0.973981205630785	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.835286047198067	ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80373452	C/T	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80442722	T/C	1	99	50	149	47.235832145976	26.1435191181939	21.092313027782	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.000539221495346416	ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80879412	C/T	1	34	15	49	16.2224069996281	7.84305573545818	8.37935126416993	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0212107673237443	ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80879377_80879453:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80879377_80879453:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80879377_80879453:TBCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80887244	T/C	1	137	45	182	65.3667576161486	23.5291672063746	41.837590409774	T:C	T	C	10	0.522870382363879	2.29681738976661e-10	ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80887346	C/T	1	36	91	127	17.1766662349004	47.581204795113	-30.4045385602126	T:C	C	T	10	0.522870382363879	5.76812109133384e-08	ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	80899281	G/A	1	47	104	151	22.4250920288977	54.3785197658434	-31.9534277369457	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1.93968515668945e-07	ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	17	81052326	T/C	1	10	20	30	4.77129617636121	10.4574076472776	-5.68611147091637	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0440462836435132	ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81052001_81052585:METRNL;ENSG00000176845:ENST00000400683:exon_81052001_81052481:METRNL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	163408	C/T	1	14	2	16	6.67981464690569	1.04574076472776	5.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0047789111423261	ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_163308_163453:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_163308_163453:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_163308_163453:USP14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	658001	G/A	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	658064	G/C	1	17	13	30	8.11120349981406	6.79731497073043	1.31388852908363	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.716174646304455	ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	3457608	G/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	9254399	G/A	1	28	19	47	13.3596292938114	9.9345372649137	3.42509202889769	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.381357218662145	ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000359158:exon_9254209_9255428:ANKRD12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	9255982	A/G	1	138	152	290	65.8438872337847	79.4762981193096	-13.6324108855249	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.112648546377633	ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	9944984	G/A	1	11	2	13	5.24842579399733	1.04574076472776	4.20268502926957	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0242231410078916	ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	11886563	C/G	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	12329536	C/G	1	71	86	157	33.8762028521646	44.9668528832936	-11.090650031129	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0791199599745317	ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	20573559	C/T	1	12	17	29	5.72555541163345	8.88879650018594	-3.16324108855249	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.267839709779781	ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20572711_20573602:RBBP8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	21100240	C/T	1	16	7	23	7.63407388217794	3.66009267654715	3.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.142382367953593	ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	21112206	C/T	1	5	11	16	2.38564808818061	5.75157420600267	-3.36592611782206	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.131501130991483	ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	21710321	C/T	1	8	14	22	3.81703694108897	7.32018535309431	-3.50314841200534	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.142018758895041	ENSG00000168234:ENST00000304621:exon_21710277_21710381:TTC39C;ENSG00000168234:ENST00000317571:exon_21710277_21710381:TTC39C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	21739725	T/C	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	34326982	G/A	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34326908_34327098:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34326908_34327098:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34326908_34327098:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34326908_34327098:FHOD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	34340651	C/T	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34340571_34340745:FHOD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	43565353	G/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	43675064	C/A	1	123	106	229	58.6869429692429	55.4242605305712	3.26268243867172	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.691697213764352	ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43675019_43675097:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43675019_43675097:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43674946_43675097:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000490226:exon_43675019_43675097:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000469552:exon_43675019_43675097:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43675019_43675097:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000487439:exon_43675019_43675097:ATP5A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	43685185	T/C	1	32	26	58	15.2681477643559	13.5946299414609	1.67351782289502	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.69490074924991	ENSG00000152240:ENST00000282058:exon_43685160_43685334:HAUS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	47911594	G/T	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	47918639	A/C	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	52895531	T/C	1	102	89	191	48.6672209988843	46.5354640303852	2.13175696849912	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.772462135430103	ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	54293658	T/C	1	68	68	136	32.4448139992562	35.5551860007438	-3.11037200148753	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.60740838036943	ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	55268866	C/T	1	29	20	49	13.8367589114475	10.4574076472776	3.37935126416993	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.391465872332255	ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	55269007	G/A	1	18	24	42	8.58833311745018	12.5488891767331	-3.96055605928291	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.279455109928861	ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56056403	C/T	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000049759:ENST00000256830:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000400345:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000382850:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000356462:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000456986:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000357895:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000435432:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000456173:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000256832:exon_56056317_56056424:NEDD4L;ENSG00000049759:ENST00000431212:exon_56056317_56056424:NEDD4L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56202120	G/A	1	12	4	16	5.72555541163345	2.09148152945552	3.63407388217794	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0816984207649677	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56202394	C/T	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56203447	A/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56203891	G/T	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56203898	T/G	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56204250	A/C	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56204644	T/G	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56204747	G/A	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	56204926	C/T	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	60795876	G/A	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60790579_60795992:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60790579_60795992:BCL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	60985530	A/G	1	44	37	81	20.9937031759893	19.3462041474635	1.6474990285258	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.739717639651833	ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	60985612	G/C	1	35	39	74	16.6995366172642	20.3919449121913	-3.69240829492704	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.416544712864057	ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	61585260	T/C	1	14	14	28	6.67981464690569	7.32018535309431	-0.640370706188611	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.851562231554368	ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	61597349	A/G	1	22	52	74	10.4968515879947	27.1892598829217	-16.692408294927	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.000101855515400560	ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61597279_61597421:SERPINB10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	61654297	A/G	1	18	28	46	8.58833311745018	14.6403707061886	-6.05203758873843	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0779928968475031	ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	74091448	G/C	1	5	10	15	2.38564808818061	5.22870382363879	-2.84305573545818	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.195978503056267	ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	74091457	G/A	1	5	10	15	2.38564808818061	5.22870382363879	-2.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.195978503056267	ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	77171061	T/G	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	77208922	C/T	1	5	12	17	2.38564808818061	6.27444458836655	-3.88879650018594	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0866683893241667	ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77208782_77208984:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77208782_77208984:NFATC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	77227476	A/G	1	11	7	18	5.24842579399733	3.66009267654715	1.58833311745018	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.489005913678072	ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	77513721	T/C	1	25	24	49	11.928240440903	12.5488891767331	-0.620648735830068	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.887053400599572	ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	77663940	G/A	1	39	22	61	18.6080550878087	11.5031484120053	7.10490667580338	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0733411988902091	ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	77805856	A/C	1	25	42	67	11.928240440903	21.9605560592829	-10.0323156183799	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0145419859251506	ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	18	77805949	A/C	1	77	63	140	36.7389805579813	32.9408340889244	3.79814646905695	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.554130669895145	ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	580665	T/C	1	232	268	500	110.69407129158	140.12926247352	-29.4351911819395	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00935041058826197	ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	621561	C/A	1	11	6	17	5.24842579399733	3.13722229418327	2.11120349981406	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.340952760955587	ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	652238	A/G	1	24	31	55	11.4511108232669	16.2089818532802	-4.75787103001334	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.224997571007683	ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_652233_652296:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_652233_652296:RNF126
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	804079	T/C	1	43	38	81	20.5165735583532	19.8690745298274	0.647499028525804	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.91183059938845	ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804036_804208:PTBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	868031	C/T	1	117	72	189	55.8241652634262	37.6466675301993	18.1774977332269	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00864366663678076	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	872089	A/G	1	44	72	116	20.9937031759893	37.6466675301993	-16.65296435421	A:T:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00208608382684506	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1074374	G/A	1	33	12	45	15.745277381992	6.27444458836655	9.47083279362545	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00447057680020161	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1074342_1074406:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1074342_1074406:HMHA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1095336	C/T	1	32	24	56	15.2681477643559	12.5488891767331	2.71925858762278	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.505316004296934	ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1106481	G/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1272040	T/C	1	256	246	502	122.145182114847	128.626114061514	-6.48093194666723	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.561788413251107	ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1360575	G/A	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1370742	G/C	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1370641_1371077:MUM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1388538	C/T	1	89	110	199	42.4645359696148	57.5157420600267	-15.0512060904119	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0333797652329604	ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1438865	C/T	1	1195	2964	4159	570.169893075165	1549.78781332654	-979.617920251373	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	5.79206215650671e-208	ENSG00000115268:ENST00000233609:exon_1438806_1438891:RPS15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1481919	G/A	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000115257:ENST00000300954:exon_1481427_1482206:PCSK4;ENSG00000115257:ENST00000441747:exon_1481427_1482206:PCSK4;ENSG00000115257:ENST00000433740:exon_1481427_1482206:PCSK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1619339	T/C	1	76	74	150	36.2618509403452	38.692408294927	-2.43055735458184	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.743842847688308	ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1819125	T/C	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1820042	C/T	1	9	2	11	4.29416655872509	1.04574076472776	3.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0684680229761391	ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819933_1820056:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819933_1820056:REXO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1854557	A/G	1	5	10	15	2.38564808818061	5.22870382363879	-2.84305573545818	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.195978503056267	ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1912817	C/T	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1912934	T/C	1	7	13	20	3.33990732345285	6.79731497073043	-3.45740764727758	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.177899741067494	ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1979386	C/T	1	16	20	36	7.63407388217794	10.4574076472776	-2.82333376509964	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.405180690722772	ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979318_1979402:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979318_1979402:CSNK1G2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1986455	A/G	1	81	76	157	38.6474990285258	39.7381490596548	-1.09065003112899	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.87335471371852	ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	1986520	G/A	1	81	71	152	38.6474990285258	37.1237971478354	1.5237018806904	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.80826304235874	ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2073354	C/A	1	37	28	65	17.6537958525365	14.6403707061886	3.01342514634787	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.535045411545011	ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2071037_2073423:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2073140_2073423:MOBKL2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2078221	G/C	1	51	46	97	24.3336104994422	24.0520375887384	0.281572910703741	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2098015	T/C	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2255311	C/G	0	0	27	27	0	14.1175003238247	-14.1175003238247	G	C	G	10	0.522870382363879	2.10466100010126e-09	ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2255205_2255346:JSRP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2732725	C/T	1	62	29	91	29.5820362934395	15.1632410885525	14.418795204887	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00308137097537087	ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2810738	G/A	1	147	128	275	70.1380537925098	66.9274089425765	3.21064484993329	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.71746960007626	ENSG00000172009:ENST00000307741:exon_2810638_2810766:THOP1;ENSG00000172009:ENST00000395212:exon_2810638_2810766:THOP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2813262	G/A	1	151	136	287	72.0465722630543	71.1103720014875	0.936200261566739	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.95289647433155	ENSG00000172009:ENST00000307741:exon_2813113_2813588:THOP1;ENSG00000172009:ENST00000395212:exon_2813113_2813588:THOP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2917287	C/A	1	9	5	14	4.29416655872509	2.61435191181939	1.6798146469057	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.430819213902139	ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2918176	C/T	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2933480	C/T	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2994903	T/C	1	16	9	25	7.63407388217794	4.70583344127491	2.92824044090303	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.31716605110325	ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	2994921	G/A	1	14	9	23	6.67981464690569	4.70583344127491	1.97398120563078	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.532246706293347	ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3179849	C/T	1	167	153	320	79.6806461452322	79.9991685016735	-0.318522356441264	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000125910:ENST00000246115:exon_3178766_3180329:S1PR4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3452637	C/T	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000141905:ENST00000443272:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000395111:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000346156:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000341919:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000343825:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000269778:exon_3452480_3452664:NFIC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3546340	G/A	1	18	16	34	8.58833311745018	8.36592611782206	0.222406999628117	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3546253_3546423:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3546253_3546423:C19orf28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3547955	C/T	1	16	11	27	7.63407388217794	5.75157420600267	1.88249967617527	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.564694319892801	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3547846_3548028:C19orf28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3548168	T/C	1	14	7	21	6.67981464690569	3.66009267654715	3.01972197035854	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.198954273329485	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3548121_3548265:C19orf28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3611972	G/A	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3613346	G/A	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3613056_3613363:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3613057_3613370:C19orf29OS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3752515	G/A	1	33	39	72	15.745277381992	20.3919449121913	-4.64666753019928	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.289809556542295	ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3753769	C/T	1	18	13	31	8.58833311745018	6.79731497073043	1.79101814671975	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.591620369367641	ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3762698	C/T	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3767265	C/T	1	145	202	347	69.1837945572375	105.619817237504	-36.436022680266	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000103656442656194	ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3977486	A/G	1	2718	2909	5627	1296.83830073498	1521.02994229652	-224.191641561547	A:T:C:G	A	G	10	0.522870382363879	2.39819713419759e-09	ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3977426_3977608:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3977426_3977608:EEF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	3979408	A/G	1	1473	1553	3026	702.811926778006	812.017703811104	-109.205777033098	A:G	A	G	10	0.522870382363879	7.23730263868133e-05	ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3979327_3979434:EEF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4013322	T/C	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4231323	C/T	1	25	12	37	11.928240440903	6.27444458836655	5.65379585253648	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0706171908083418	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4236996	G/A	1	318	162	480	151.727218408286	84.7050019429484	67.0222164653381	A:G	G	A	10	0.522870382363879	7.20724631233866e-10	ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4237067	A/G	1	423	360	783	201.825828260079	188.233337650996	13.5924906090828	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.334312711683984	ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4254375	C/T	1	35	36	71	16.6995366172642	18.8233337650996	-2.1237971478354	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.636141546452184	ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4262036	C/T	1	40	23	63	19.0851847054448	12.0260187943692	7.05916591107563	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.078450992318259	ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4261991_4262111:CCDC94
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4694657	G/A	1	8	14	22	3.81703694108897	7.32018535309431	-3.50314841200534	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.142018758895041	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4816241	G/A	1	65	57	122	31.0134251463479	29.8036117947411	1.20981335160677	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.856484149890761	ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4816719	G/A	1	34	29	63	16.2224069996281	15.1632410885525	1.05916591107563	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.80241277843597	ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4844785	G/A	1	63	55	118	30.0591659110756	28.7578710300133	1.30129488106229	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.853990603269155	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4844680_4844805:PLIN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4847874	A/G	1	50	49	99	23.8564808818061	25.6206487358301	-1.76416785402402	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.763171761624427	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4852106	A/G	1	50	50	100	23.8564808818061	26.1435191181939	-2.28703823638789	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.689270164706837	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	4852137	C/T	1	40	49	89	19.0851847054448	25.6206487358301	-6.53546403038523	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.169391465806851	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	5786815	G/A	1	13	14	27	6.20268502926957	7.32018535309431	-1.11750032382473	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.703474017247423	ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	5787138	C/T	1	9	15	24	4.29416655872509	7.84305573545818	-3.54888917673309	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.157923377654149	ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5787072_5787182:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5787072_5787182:DUS3L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	5908969	G/A	1	1	8	9	0.477129617636121	4.18296305891103	-3.70583344127491	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0168420576576534	ENSG00000187650:ENST00000339485:exon_5908835_5910864:VMAC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	5914625	G/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	5924893	G/A	1	25	17	42	11.928240440903	8.88879650018594	3.03944394071709	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.359371060490911	ENSG00000031823:ENST00000034275:exon_5924838_5924916:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000340578:exon_5924838_5924916:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000439268:exon_5924838_5924916:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000324807:exon_5924838_5924916:RANBP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6374496	C/T	1	115	195	310	54.8699060281539	101.959724560956	-47.0898185328025	T:C	C	T	10	0.522870382363879	9.99139594897298e-08	ENSG00000125652:ENST00000245812:exon_6374476_6374600:ALKBH7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6452386	G/A	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6452323_6452490:SLC25A23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6454440	C/T	1	13	13	26	6.20268502926957	6.79731497073043	-0.594629941460852	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.846528826360866	ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454334_6454486:SLC25A23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6468331	T/C	1	99	74	173	47.235832145976	38.692408294927	8.54342385104894	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.196702704555883	ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6534841	G/A	1	123	121	244	58.6869429692429	63.2673162660294	-4.58037329678646	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.564692289005958	ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6669934	G/A	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6731057	T/C	1	69	47	116	32.9219436168923	24.5749079711023	8.34703564579004	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.13681123913323	ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6736667	G/A	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.370794847578149	ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6736603_6736722:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6736603_6736722:GPR108
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6750386	C/T	1	103	109	212	49.1443506165205	56.9928716776628	-7.84852106114234	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.302480298533989	ENSG00000125733:ENST00000313285:exon_6750303_6750442:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000394404:exon_6750303_6750442:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000481339:exon_6750303_6750442:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000313244:exon_6750303_6750442:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000475024:exon_6750303_6750644:TRIP10;ENSG00000125733:ENST00000420690:exon_6750303_6750442:TRIP10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6755007	T/C	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6755155	T/C	1	4	11	15	1.90851847054448	5.75157420600267	-3.84305573545818	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.067722028140312	ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6755221	G/A	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6760974	T/C	1	1	9	10	0.477129617636121	4.70583344127491	-4.22870382363879	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0088395297966988	ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6760649_6760998:SH2D3A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6853067	A/G	1	64	87	151	30.5362955287117	45.4897232656575	-14.9534277369457	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0178658330263094	ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6852976_6853090:VAV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6854007	C/T	1	76	62	138	36.2618509403452	32.4179637065605	3.84388723378471	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.551173311408187	ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6853958_6854109:VAV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	6937658	C/T	1	23	9	32	10.9739812056308	4.70583344127491	6.26814776435587	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0325887096288649	ENSG00000174837:ENST00000312053:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000450315:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381407:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381404:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000250572:exon_6937555_6937659:EMR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	7125297	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7125294_7125538:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7125294_7125538:INSR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	7132218	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7132169_7132328:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7132169_7132328:INSR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	7166376	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	7533767	T/G	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7533711_7534017:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7533711_7534017:ARHGEF18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	7593589	C/T	1	10	3	13	4.77129617636121	1.56861114709164	3.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0966692698681595	ENSG00000090674:ENST00000264079:exon_7593483_7593589:MCOLN1;ENSG00000090674:ENST00000394321:exon_7593483_7593589:MCOLN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	7619522	G/A	1	16	7	23	7.63407388217794	3.66009267654715	3.97398120563078	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.142382367953593	ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7619441_7619609:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7619441_7619609:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7619441_7619609:PNPLA6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	7706950	C/T	1	37	35	72	17.6537958525365	18.3004633827358	-0.646667530199284	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.906476404033699	ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7706920_7707004:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7706920_7707004:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7706920_7707004:STXBP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	7754101	G/A	1	1860	1245	3105	887.461088803185	650.973626043029	236.487462760156	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	1.45616780119570e-17	ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7753663_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7753667_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7753667_7754316:FCER2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8028544	A/G	1	130	136	266	62.0268502926957	71.1103720014875	-9.0835217087918	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.269794388812011	ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8121122	G/A	1	12	5	17	5.72555541163345	2.61435191181939	3.11120349981406	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.150562479720797	ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8121036_8121153:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8121036_8121153:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000315626:exon_8121036_8121153:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8121036_8121153:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000458625:exon_8121036_8121153:CCL25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8121360	A/G	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8121250_8121383:CCL25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8367356	C/T	1	54	91	145	25.7649993523505	47.581204795113	-21.8162054427624	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000322824826802115	ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8367359	G/C	1	89	51	140	42.4645359696148	26.6663895005578	15.7981464690569	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00851453307846607	ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8367709	C/T	1	46	16	62	21.9479624112616	8.36592611782206	13.5820362934395	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000517345002702099	ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367661_8367722:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367661_8367864:CD320
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8373176	C/T	1	14	7	21	6.67981464690569	3.66009267654715	3.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.198954273329485	ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8381479	T/C	1	117	90	207	55.8241652634262	47.0583344127491	8.76583085067706	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.237080006634796	ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8381380_8381529:NDUFA7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8468337	C/T	1	139	156	295	66.3210168514208	81.5677796487651	-15.2467627973443	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0803332794723085	ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8468349	C/T	1	148	126	274	70.6151834101459	65.8816681778488	4.73351523229717	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.586554210085906	ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8578000	G/A	1	33	29	62	15.745277381992	15.1632410885525	0.582036293439506	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.899592724150972	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8578035	T/C	1	23	33	56	10.9739812056308	17.254722618008	-6.28074141237722	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.108196859974990	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8578118	A/G	1	26	19	45	12.4053700585391	9.9345372649137	2.47083279362545	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.551103683531036	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	8578199	T/C	1	30	12	42	14.3138885290836	6.27444458836655	8.03944394071708	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0133466834222510	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	9524272	T/C	1	21	10	31	10.0197219703585	5.22870382363879	4.79101814671975	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.105129666936405	ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524224_9525396:ZNF266
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	9721401	A/T	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	9940594	G/T	1	2	8	10	0.954259235272242	4.18296305891103	-3.22870382363879	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0558208850126612	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	9940602	G/T	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10221261	G/A	1	170	159	329	81.1120349981406	83.1363907958568	-2.02435579771618	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.825536356719458	ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10221161_10221290:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10221161_10221290:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000468881:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000444703:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10221642	A/G	1	225	146	371	107.354163968127	76.3390758251263	31.0150881430009	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00125575848976629	ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10221621_10221760:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10221621_10221698:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10221621_10221970:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10221621_10221750:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10221621_10221930:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000444703:exon_10221621_10221972:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221621_10222310:PPAN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10224548	G/A	1	11	16	27	5.24842579399733	8.36592611782206	-3.11750032382473	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.252042558114459	ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10226250	G/A	1	493	418	911	235.224901494608	218.559819828101	16.6650816665063	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.273861846422908	ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10226256	A/G	1	422	505	927	201.348698642443	264.049543093759	-62.7008444513158	A:G	A	G	10	0.522870382363879	3.88374012190252e-05	ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10226701	C/T	1	492	489	981	234.747771876972	255.683616975937	-20.9358450989652	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.190035592826609	ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226643_10226750:EIF3G
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10370444	A/C	1	249	245	494	118.805274791394	128.10324367915	-9.29796888775621	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.417624490534529	ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10426422	A/C	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10426628	T/C	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10431799	G/T	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10431724_10431935:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10431766_10431935:RAVER1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10444603	C/G	1	657	700	1357	313.474158786932	366.009267654715	-52.5351088677837	A:T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.00469294151676112	ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10463679	G/A	1	65	51	116	31.0134251463479	26.6663895005578	4.34703564579004	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.457517066260968	ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530220:exon_10463602_10463932:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000527481:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10463602_10463774:TYK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10464674	A/G	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10475649	C/T	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10477206	G/A	1	15	9	24	7.15694426454182	4.70583344127491	2.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.414521773200192	ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10574495	C/T	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000380686:exon_10574469_10574689:PDE4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10574549	C/T	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000380686:exon_10574469_10574689:PDE4A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10610236	A/G	1	13	13	26	6.20268502926957	6.79731497073043	-0.594629941460852	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.846528826360866	ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10610071_10610756:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10610071_10610756:KEAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10659659	C/T	1	11	3	14	5.24842579399733	1.56861114709164	3.67981464690569	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0609596309432481	ENSG00000130734:ENST00000309469:exon_10659580_10659710:ATG4D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10664632	A/G	1	36	29	65	17.1766662349004	15.1632410885525	2.01342514634787	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.709836719309662	ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10668452	A/G	1	26	32	58	12.4053700585391	16.7318522356441	-4.32648217710498	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.293359578965688	ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10670184	C/G	1	9	14	23	4.29416655872509	7.32018535309431	-3.02601879436922	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.218027099892575	ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10738639	C/T	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738596_10738680:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738596_10738680:SLC44A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10742170	A/G	1	11	15	26	5.24842579399733	7.84305573545818	-2.59462994146085	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.332000236694704	ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742151_10742211:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742151_10742211:SLC44A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10747150	C/T	1	38	27	65	18.1309254701726	14.1175003238247	4.01342514634787	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.384920239285079	ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10746999_10747261:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10746999_10747261:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000407327:exon_10747119_10747232:SLC44A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10793294	G/A	1	24	41	65	11.4511108232669	21.437685676919	-9.98657485365213	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0176294441162477	ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10793213_10793380:ILF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10794630	G/T	1	98	67	165	46.7587025283399	35.0323156183799	11.72638690996	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0730005701756487	ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	10939792	T/C	1	54	40	94	25.7649993523505	20.9148152945552	4.85018405779538	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.353102023431347	ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	11031582	G/A	1	33	22	55	15.745277381992	11.5031484120053	4.24212896998666	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.281391466865713	ENSG00000142453:ENST00000327064:exon_11031510_11031622:CARM1;ENSG00000142453:ENST00000344150:exon_11031510_11031622:CARM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	11034837	A/G	1	20	16	36	9.54259235272242	8.36592611782206	1.17666623490036	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.740793930979047	ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	11105608	T/C	1	82	76	158	39.1246286461619	39.7381490596548	-0.613520413492878	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.936663154224737	ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	11226800	C/T	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11226770_11226888:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11226770_11226888:LDLR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	11465316	G/C	1	22	6	28	10.4968515879947	3.13722229418327	7.35962929381139	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00696965228922923	ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	11489049	G/C	1	10	14	24	4.77129617636121	7.32018535309431	-2.54888917673309	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.31450311042178	ENSG00000187266:ENST00000222139:exon_11488475_11489271:EPOR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12767849	C/A	1	40	42	82	19.0851847054448	21.9605560592829	-2.87537135383807	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.580813953577653	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000433513:exon_12767763_12767870:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000495617:exon_12767763_12767870:MAN2B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12772090	C/T	1	53	53	106	25.2878697347144	27.7121302652856	-2.42426053057117	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.697543115988512	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12774192	C/T	1	21	24	45	10.0197219703585	12.5488891767331	-2.52916720637455	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.460021285620582	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12774131_12774232:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000486847:exon_12774122_12774276:MAN2B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12774533	G/A	1	7	14	21	3.33990732345285	7.32018535309431	-3.98027802964146	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.124227497168679	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12774517_12774649:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12774517_12774649:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12774517_12774649:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000486847:exon_12774517_12774649:MAN2B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12790506	C/G	1	116	108	224	55.34703564579	56.4700012952989	-1.12296564950888	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.893740838269355	ENSG00000095059:ENST00000351660:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000210060:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000393273:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000441196:exon_12790437_12790533:DHPS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12792377	G/A	1	88	50	138	41.9874063519786	26.1435191181939	15.8438872337847	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.008030597975159	ENSG00000095059:ENST00000351660:exon_12792374_12792682:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000425834:exon_12792374_12792682:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000210060:exon_12792374_12792682:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000393273:exon_12792374_12792682:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000441196:exon_12792374_12792682:DHPS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12800597	T/C	1	16	13	29	7.63407388217794	6.79731497073043	0.836758911447511	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.853293027476038	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800575_12800688:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800575_12800688:FBXW9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12805431	T/C	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12805525	G/C	1	5	15	20	2.38564808818061	7.84305573545818	-5.45740764727758	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0227002608973737	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12807187	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12812169	A/G	1	7	13	20	3.33990732345285	6.79731497073043	-3.45740764727758	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.177899741067494	ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12813683	T/C	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12813637_12813732:TNPO2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12917520	A/G	1	40	44	84	19.0851847054448	23.0062968240107	-3.92111211856583	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.444762533883053	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12917428_12917614:RNASEH2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12920935	G/A	1	106	118	224	50.5757394694288	61.6987051189377	-11.1229656495089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.141477626294528	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12920885_12921022:RNASEH2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12921186	T/C	1	102	126	228	48.6672209988843	65.8816681778488	-17.2144471789644	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0240926961030023	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	12989560	G/A	1	56	39	95	26.7192585876228	20.3919449121913	6.3273136754315	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.217895543525591	ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13033514	G/A	1	262	248	510	125.007959820664	129.671854826242	-4.66389500557825	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.690088431868973	ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13033284_13033700:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13033294_13033700:FARSA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13039658	A/G	1	129	107	236	61.5497206750596	55.947130912935	5.60258976212457	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.474229458306835	ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13039569_13039661:FARSA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13051170	C/T	1	474	433	907	226.159438759521	226.40287556356	-0.243436804038197	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13051057_13051266:CALR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13054781	G/T	1	370	484	854	176.537958525365	253.069265064117	-76.5313065387526	A:T:C:G	G	T	10	0.522870382363879	1.78988616087025e-07	ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13869799	G/A	1	14	6	20	6.67981464690569	3.13722229418327	3.54259235272242	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.122889322650138	ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13869682_13869824:CCDC130
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13869942	G/A	1	10	14	24	4.77129617636121	7.32018535309431	-2.54888917673309	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.31450311042178	ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13869914_13870086:CCDC130
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13873133	G/A	1	29	10	39	13.8367589114475	5.22870382363879	8.60805508780872	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0060317459245078	ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13873113_13873251:CCDC130
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13885309	C/T	1	70	72	142	33.3990732345285	37.6466675301993	-4.24759429567081	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.502017108356630	ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13885484	A/G	1	225	245	470	107.354163968127	128.10324367915	-20.7490797110231	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0582892375542585	ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	13889020	G/C	1	560	567	1127	267.192585876228	296.467506800319	-29.2749209240916	T:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.083701480992463	ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13888866_13889582:C19orf53
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	14029801	G/T	1	10	2	12	4.77129617636121	1.04574076472776	3.72555541163345	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0409414784371842	ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14029725_14029855:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14029725_14029855:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14029725_14029855:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14029725_14029855:CC2D1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	14065341	T/C	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	14070085	T/C	1	19	32	51	9.0654627350863	16.7318522356441	-7.66638950055783	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0353208662419187	ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14069857_14070291:DCAF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	14160023	C/T	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14159968_14160126:IL27RA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	14512488	C/T	1	27	41	68	12.8824996761753	21.437685676919	-8.55518600074377	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0394550402126287	ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	14523988	T/C	1	106	115	221	50.5757394694288	60.1300939718461	-9.55435450241725	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.201414328919670	ENSG00000123136:ENST00000242776:exon_14523825_14524036:DDX39;ENSG00000123136:ENST00000451994:exon_14523825_14524036:DDX39;ENSG00000123136:ENST00000324340:exon_14523825_14524036:DDX39;ENSG00000123136:ENST00000454233:exon_14523825_14524036:DDX39;ENSG00000123136:ENST00000455481:exon_14523363_14524036:DDX39
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	14629150	G/A	1	12	20	32	5.72555541163345	10.4574076472776	-4.73185223564413	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.111378265148618	ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	14629171	C/T	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	15226970	G/A	1	39	28	67	18.6080550878087	14.6403707061886	3.96768438162011	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.392151562368849	ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	15227120	C/T	1	28	24	52	13.3596292938114	12.5488891767331	0.810740117078295	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.889955469070118	ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	15229993	A/G	1	17	13	30	8.11120349981406	6.79731497073043	1.31388852908363	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.716174646304455	ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	15562591	G/A	1	125	137	262	59.6412022045151	71.6332423838514	-11.9920401793363	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.154764895047785	ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15562438_15562749:RASAL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	15565055	T/C	1	67	90	157	31.9676843816201	47.0583344127491	-15.090650031129	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0165222499918645	ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15564960_15565078:RASAL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	16631147	G/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16630905_16632163:C19orf44
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	16643423	G/A	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000085872:ENST00000198939:exon_16643409_16643560:CHERP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	16772135	A/G	1	6	15	21	2.86277770581673	7.84305573545818	-4.98027802964146	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0466412463418783	ENSG00000072954:ENST00000187762:exon_16771938_16772152:TMEM38A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	16790859	C/T	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000072954:ENST00000187762:exon_16790795_16790951:TMEM38A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17170885	C/T	1	16	23	39	7.63407388217794	12.0260187943692	-4.39194491219128	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.199325997989638	ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17173563	G/C	1	19	18	37	9.0654627350863	9.41166688254982	-0.346204147463521	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17173508_17173589:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17173508_17173589:HAUS8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17283657	C/T	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17283568_17283772:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17283568_17283772:MYO9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17291736	C/T	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17291736_17291849:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17291736_17291849:MYO9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17312992	C/T	1	17	19	36	8.11120349981406	9.9345372649137	-1.82333376509964	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.617808462551922	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17316782	T/C	1	28	36	64	13.3596292938114	18.8233337650996	-5.46370447128825	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.210496858952215	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17317955	A/G	1	32	41	73	15.2681477643559	21.437685676919	-6.16953791256316	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.160462694494832	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17321628	T/C	1	62	68	130	29.5820362934395	35.5551860007438	-5.97314970730426	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.334178875082917	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17321524_17321661:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17321524_17321657:MYO9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17652968	G/A	1	16	8	24	7.63407388217794	4.18296305891103	3.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.219577374631183	ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17652945_17653103:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17652945_17653103:FAM129C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17664418	G/A	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17690381	C/T	1	7	10	17	3.33990732345285	5.22870382363879	-1.88879650018594	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.468009294351122	ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17690291_17690418:GLT25D1;ENSG00000130309:ENST00000379714:exon_17690291_17690418:GLT25D1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17837806	C/A	1	26	28	54	12.4053700585391	14.6403707061886	-2.23500064764946	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.587058182565115	ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17844132	G/A	1	55	44	99	26.2421289699867	23.0062968240107	3.23583214597598	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.546943535372781	ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17844002_17844237:MAP1S
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17844227	G/A	1	109	86	195	52.0071283223372	44.9668528832936	7.0402754390436	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.316684233223631	ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17844002_17844237:MAP1S
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	17949240	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18047283	T/G	1	126	145	271	60.1183318221513	75.8162054427625	-15.6978736206112	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0593935758908668	ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18186575	G/A	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18186618	T/C	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18279638	T/C	1	28	8	36	13.3596292938114	4.18296305891103	9.17666623490036	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00228437240024637	ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000464016:exon_18279285_18279649:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000470732:exon_18279308_18279706:PIK3R2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18288642	A/G	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18305824	C/T	1	15	23	38	7.15694426454182	12.0260187943692	-4.8690745298274	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.143201097850425	ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18420570	C/T	1	169	108	277	80.6349053805045	56.4700012952989	24.1649040852055	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00383176625337207	ENSG00000130520:ENST00000252816:exon_18420488_18420671:LSM4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18497141	T/A	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	A:T	T	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18499151	C/T	1	11	1	12	5.24842579399733	0.522870382363879	4.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00695977522690581	ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18499238	G/T	1	3	10	13	1.43138885290836	5.22870382363879	-3.79731497073043	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0492215241656784	ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18572422	G/C	1	2	9	11	0.954259235272242	4.70583344127491	-3.75157420600267	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0318932346368143	ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18572388_18572662:ELL;ENSG00000105656:ENST00000392395:exon_18572388_18572662:ELL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	18679351	C/T	1	48	33	81	22.9022216465338	17.254722618008	5.6474990285258	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.222419653093290	ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19021842	G/A	1	228	212	440	108.785552821036	110.848521061142	-2.06296824010674	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.848753866712184	ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19021780_19021880:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19021780_19021880:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19021780_19021880:COPE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19023853	T/C	1	220	215	435	104.968515879947	112.417132208234	-7.44861632828734	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.501660794689019	ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19032680	T/C	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19032652_19032773:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19032652_19032773:DDX49
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19033442	G/A	1	28	30	58	13.3596292938114	15.6861114709164	-2.32648217710498	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.599722887947112	ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19033413_19033553:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19033413_19033553:DDX49
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19039080	G/A	1	43	57	100	20.5165735583532	29.8036117947411	-9.2870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0712908358510254	ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19038937_19039436:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19038937_19039438:DDX49
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19135801	T/C	1	18	8	26	8.58833311745018	4.18296305891103	4.40537005853915	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.114835835280271	ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19135428_19136265:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19136541	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19230868	A/G	1	30	42	72	14.3138885290836	21.9605560592829	-7.64666753019928	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.077092772200334	ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19390185	G/A	1	43	54	97	20.5165735583532	28.2350006476495	-7.71842708929626	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.127521337896519	ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19390022_19390199:SUGP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19416737	G/A	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19416658_19416885:SUGP1;ENSG00000105705:ENST00000334782:exon_19416658_19416885:SUGP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19735043	G/A	1	15	12	27	7.15694426454182	6.27444458836655	0.882499676175268	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.847915973483971	ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19734468_19735378:LPAR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	19740729	C/G	1	89	117	206	42.4645359696148	61.1758347365738	-18.7112987669591	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.00976464680891597	ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	20003576	C/G	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	21720616	T/C	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	30193721	G/A	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	33902621	C/T	1	11	7	18	5.24842579399733	3.66009267654715	1.58833311745018	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.489005913678072	ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33902578_33902655:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33902578_33902655:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33902578_33902655:PEPD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	34710309	T/C	1	29	49	78	13.8367589114475	25.6206487358301	-11.7838898243826	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00880683082737232	ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34710296_34710478:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34710296_34710478:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34710296_34710478:LSM14A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35175340	C/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000089335:ENST00000509528:exon_35175157_35175446:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505163:exon_35175157_35175369:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35175749	C/G	1	9	7	16	4.29416655872509	3.66009267654715	0.634073882177937	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.806882383309564	ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35233027	C/T	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35435589	C/T	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	C	C		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35648365	T/G	1	156	167	323	74.4322203512349	87.3193538547678	-12.8871335035329	T:C:G	T	G	10	0.522870382363879	0.163698261897404	ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35741456	T/C	1	7	14	21	3.33990732345285	7.32018535309431	-3.98027802964146	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.124227497168679	ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35757427	G/A	1	11	12	23	5.24842579399733	6.27444458836655	-1.02601879436922	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.682551462444228	ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35770056	G/A	1	15	3	18	7.15694426454182	1.56861114709164	5.58833311745018	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00862591688745386	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35770174	A/G	1	170	174	344	81.1120349981406	90.9794465313149	-9.86741153317436	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.30516679469268	ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	35831986	C/T	1	217	233	450	103.537127027038	121.828799090784	-18.2916720637455	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0892991987101106	ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35831784_35832041:CD22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	36109312	C/A	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	A:T:C	C	A	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36109304_36109367:HAUS5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	36124822	C/A	1	129	146	275	61.5497206750596	76.3390758251263	-14.7893551500667	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0799231888973665	ENSG00000126254:ENST00000262633:exon_36124589_36124921:RBM42;ENSG00000126254:ENST00000360475:exon_36124589_36124921:RBM42
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	36430798	A/G	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36430312_36431742:LRFN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	36435564	G/A	1	16	13	29	7.63407388217794	6.79731497073043	0.836758911447511	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.853293027476038	ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36435450_36436084:LRFN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	36530332	G/A	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000522483:exon_36530225_36530620:THAP8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	36530343	C/T	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000161277:ENST00000292894:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000392182:exon_36530225_36530620:THAP8;ENSG00000161277:ENST00000522483:exon_36530225_36530620:THAP8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	36633864	A/G	1	335	330	665	159.838421908101	172.54722618008	-12.7088042719795	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.331923800823095	ENSG00000126247:ENST00000457326:exon_36633811_36633868:CAPNS1;ENSG00000126247:ENST00000246533:exon_36633811_36633868:CAPNS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	37854235	G/T	1	13	18	31	6.20268502926957	9.41166688254982	-3.20898185328025	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.282888239737375	ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	38774301	C/T	1	14	19	33	6.67981464690569	9.9345372649137	-3.25472261800801	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.297233008754451	ENSG00000167642:ENST00000301244:exon_38774267_38774437:SPINT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	38800165	C/T	1	48	39	87	22.9022216465338	20.3919449121913	2.51027673434253	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.667956468776422	ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	39196736	G/A	1	27	34	61	12.8824996761753	17.7775930003719	-4.89509332419662	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.248611964926065	ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	39219780	T/C	1	316	322	638	150.772959173014	168.364263121169	-17.5913039481548	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.165568181223275	ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	39322087	T/G	1	239	208	447	114.033978615033	108.757039531687	5.27693908334612	A:T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.636009948540445	ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	39412170	G/A	1	7	15	22	3.33990732345285	7.84305573545818	-4.50314841200534	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.085407955345524	ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39412167_39412307:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39412167_39412307:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39412167_39412236:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39412167_39412307:FBXO17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	39421274	T/C	1	5	14	19	2.38564808818061	7.32018535309431	-4.9345372649137	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0359510330380218	ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39421110_39421536:FBXO17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	39421928	T/C	1	84	71	155	40.0788878814342	37.1237971478354	2.95509073359877	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.68781202631945	ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39421594_39421983:MRPS12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	39423001	T/C	1	120	127	247	57.2555541163345	66.4045385602126	-9.14898444387811	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.251971539465304	ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	39898680	C/T	1	91	80	171	43.418795204887	41.8296305891103	1.5891646157767	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.818832161458264	ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	40030654	G/C	1	5	12	17	2.38564808818061	6.27444458836655	-3.88879650018594	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0866683893241667	ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	40480501	C/T	1	111	85	196	52.9613875576094	44.4439825009297	8.51740505667972	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.225215202289644	ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40480431_40480540:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40480431_40480540:PSMC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	40928944	A/G	1	13	18	31	6.20268502926957	9.41166688254982	-3.20898185328025	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.282888239737375	ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	40964312	G/A	1	82	63	145	39.1246286461619	32.9408340889244	6.18379455723755	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.319213623770811	ENSG00000090013:ENST00000263368:exon_40964288_40964452:BLVRB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	41205990	A/G	1	15	13	28	7.15694426454182	6.79731497073043	0.359629293811389	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41205972_41206079:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41205972_41206079:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41205972_41206079:ADCK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	41209477	C/T	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.273399026723903	ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	41248532	G/A	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000188493:ENST00000378313:exon_41246761_41248675:C19orf54;ENSG00000188493:ENST00000469741:exon_41248420_41248675:C19orf54;ENSG00000188493:ENST00000470681:exon_41246761_41248675:C19orf54;ENSG00000188493:ENST00000420300:exon_41248482_41248675:C19orf54;ENSG00000188493:ENST00000339153:exon_41248457_41248675:C19orf54
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	41292601	A/T	1	98	89	187	46.7587025283399	46.5354640303852	0.223238497954632	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000167578:ENST00000357052:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000378307:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000419646:exon_41292570_41292665:RAB4B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	41307170	G/A	1	36	39	75	17.1766662349004	20.3919449121913	-3.21527867729092	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.489035656379493	ENSG00000171570:ENST00000303961:exon_41306244_41307320:EGLN2;ENSG00000171570:ENST00000406058:exon_41306181_41307320:EGLN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	41884327	T/C	1	36	29	65	17.1766662349004	15.1632410885525	2.01342514634787	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.709836719309662	ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000342187:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000413014:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000436170:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000447302:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41884186_41884424:TMEM91
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	41916547	C/G,T	0	0	34	34	0	17.7775930003719	-17.7775930003719	T:G	C	G	10	0.522870382363879	1.18477746727691e-11	ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41916542_41916721:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41916542_41916721:BCKDHA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	41920010	T/C	1	49	57	106	23.3793512641699	29.8036117947411	-6.42426053057117	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.243207195939488	ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41919954_41920062:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41919954_41920062:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41919954_41920062:BCKDHA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	42085701	C/T	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42085623_42085774:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	42392310	C/T	1	23	19	42	10.9739812056308	9.9345372649137	1.03944394071708	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.760367147756807	ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	42406443	G/A	1	49	60	109	23.3793512641699	31.3722229418327	-7.99287167766281	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.150029192202823	ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42406424_42406506:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42406424_42406506:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42406424_42406506:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42406424_42406506:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42406424_42406506:ARHGEF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	42408426	G/A	1	72	69	141	34.3533324698007	36.0780563831077	-1.72472391330693	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.800622429590602	ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42408368_42408535:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42408368_42408535:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42408368_42408535:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42408368_42408535:ARHGEF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	42463447	C/T	1	65	88	153	31.0134251463479	46.0125936480214	-14.9991685016735	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0186322395532406	ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	42703833	A/G	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	42753649	G/C	1	11	26	37	5.24842579399733	13.5946299414609	-8.34620414746352	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00768573830305089	ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	43979589	G/T	1	9	18	27	4.29416655872509	9.41166688254982	-5.11750032382473	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0547218480840686	ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	44001345	C/T	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_44001270_44001431:PHLDB3;ENSG00000176531:ENST00000314735:exon_44000186_44001431:PHLDB3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	44057227	T/C	1	33	34	67	15.745277381992	17.7775930003719	-2.03231561837989	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.627081691906714	ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	44159662	T/C	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000011422:ENST00000339082:exon_44159591_44159725:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44159591_44159725:PLAUR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	44417575	A/G	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	44418343	C/T	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	45395714	T/C	1	42	36	78	20.0394439407171	18.8233337650996	1.21611017561744	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.82126445611302	ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	45396144	C/T	1	29	44	73	13.8367589114475	23.0062968240107	-9.16953791256316	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.034810758747331	ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	45490570	A/G	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	45495915	C/T	1	48	40	88	22.9022216465338	20.9148152945552	1.98740635197865	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.749079862214211	ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	45668213	C/G	1	158	156	314	75.3864795865071	81.5677796487651	-6.18130006225799	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.498136067486336	ENSG00000007255:ENST00000006275:exon_45668111_45668228:TRAPPC6A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	45854919	T/G	1	22	12	34	10.4968515879947	6.27444458836655	4.22240699962811	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.170777696588829	ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	45860917	C/T	1	24	22	46	11.4511108232669	11.5031484120053	-0.0520375887384326	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45860888_45860957:ERCC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46215605	G/A	1	17	11	28	8.11120349981406	5.75157420600267	2.35962929381139	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.450663887484502	ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46268727	A/G	1	15	17	32	7.15694426454182	8.88879650018594	-1.73185223564413	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.597599372848838	ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46269076	G/A	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46341824	C/T	1	47	37	84	22.4250920288977	19.3462041474635	3.07888788143417	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.514432475461055	ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46352122	A/G	1	11	12	23	5.24842579399733	6.27444458836655	-1.02601879436922	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.682551462444228	ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46387503	T/C	1	5	12	17	2.38564808818061	6.27444458836655	-3.88879650018594	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0866683893241667	ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46388379	C/G	1	16	10	26	7.63407388217794	5.22870382363879	2.40537005853915	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.433369160576612	ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46519406	C/A	1	15	16	31	7.15694426454182	8.36592611782206	-1.20898185328025	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.721038527279618	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46520288	G/A	1	21	22	43	10.0197219703585	11.5031484120053	-1.4834264416468	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.651176113496584	ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46520249_46520327:CCDC61
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	46850394	C/A	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46850251_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46850354_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46850358_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46850365_46850474:PPP5C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47112207	C/T	1	899	818	1717	428.939526254873	427.707972773653	1.23155348121986	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.961469297255251	ENSG00000160014:ENST00000477244:exon_47112103_47112238:CALM3;ENSG00000160014:ENST00000291295:exon_47112103_47112238:CALM3;ENSG00000160014:ENST00000391918:exon_47112103_47112238:CALM3;ENSG00000160014:ENST00000482455:exon_47112103_47112238:CALM3;ENSG00000160014:ENST00000486500:exon_47111739_47112238:CALM3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47124579	C/T	1	11	13	24	5.24842579399733	6.79731497073043	-1.54888917673309	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.546918420888488	ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47124742	G/C	1	14	9	23	6.67981464690569	4.70583344127491	1.97398120563078	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.532246706293347	ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47226434	C/T	1	13	12	25	6.20268502926957	6.27444458836655	-0.0717595590969733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47226371_47226541:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47226371_47226541:STRN4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47226450	A/G	1	11	14	25	5.24842579399733	7.32018535309431	-2.07175955909697	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.429970268760073	ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47226371_47226541:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47226371_47226541:STRN4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47278859	C/G	1	113	128	241	53.9156467928817	66.9274089425765	-13.0117621496948	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0940687805422344	ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47282162	G/A	1	45	47	92	21.4708327936254	24.5749079711023	-3.10407517747686	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.532668991691401	ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47865848	C/T	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47878858	C/T	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47878723_47878965:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47878723_47878965:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47878723_47878965:DHX34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47879279	G/A	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47879181_47879354:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47879181_47879354:DHX34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47883086	T/G	1	14	14	28	6.67981464690569	7.32018535309431	-0.640370706188611	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.851562231554368	ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47882967_47883242:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47882967_47883242:DHX34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	47980158	G/A	1	12	11	23	5.72555541163345	5.75157420600267	-0.0260187943692163	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48205725	T/C	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48204585_48206534:GLTSCR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48254792	C/G	1	602	567	1169	287.232029816945	296.467506800319	-9.2354769833745	A:T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.598241550642361	ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48254777_48254847:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254777_48254847:GLTSCR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48551546	A/T	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48602933	T/C	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48608598	C/G	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48608590_48608701:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48608590_48608701:PLA2G4C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48621036	C/G	1	42	59	101	20.0394439407171	30.8493525594689	-10.8099086187518	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0360825271632215	ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48626218	G/A	1	42	52	94	20.0394439407171	27.1892598829217	-7.14981594220462	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.148943515691218	ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48626191_48626273:LIG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48654553	G/T	1	11	14	25	5.24842579399733	7.32018535309431	-2.07175955909697	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.429970268760073	ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48836673	G/T	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000161558:ENST00000435956:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000377431:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48835613_48836690:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48835613_48836690:TMEM143
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	48949286	G/T	1	11	13	24	5.24842579399733	6.79731497073043	-1.54888917673309	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.546918420888488	ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49376582	G/A	1	42	16	58	20.0394439407171	8.36592611782206	11.673517822895	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00227207055092279	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49376920	C/T	1	70	71	141	33.3990732345285	37.1237971478354	-3.72472391330693	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.555624281391602	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49377086	T/C	1	103	104	207	49.1443506165205	54.3785197658434	-5.23416914932294	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.486915035040937	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49377424	G/A	1	101	102	203	48.1900913812482	53.3327790011157	-5.14268761986743	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.482890245647763	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49407675	A/G	1	44	36	80	20.9937031759893	18.8233337650996	2.17036941088968	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.655643892355536	ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000452087:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000443560:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000411700:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000451312:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000424608:exon_49407604_49407711:NUCB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49425576	C/T	1	41	39	80	19.562314323081	20.3919449121913	-0.829630589110316	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.91102641282655	ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49425575_49426528:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49425575_49425722:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000485798:exon_49425575_49426201:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49425575_49426522:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000492367:exon_49425575_49426525:NUCB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49477474	T/C	1	40	22	62	19.0851847054448	11.5031484120053	7.5820362934395	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0570101199373787	ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49477470_49477596:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49477470_49477596:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000472004:exon_49477470_49477596:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000496048:exon_49477470_49477596:GYS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49513317	C/T	1	214	186	400	102.10573817413	97.2538911196815	4.85184705444843	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.65247077577541	ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49949589	A/T	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	A:T:G	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49967924	T/A	1	21	23	44	10.0197219703585	12.0260187943692	-2.00629682401067	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.550605760658815	ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49969069	G/A	1	15	15	30	7.15694426454182	7.84305573545818	-0.686111470916369	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.856171129714278	ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49978954	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49978948_49979058:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000344019:exon_49978948_49979058:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49978931_49979058:FLT3LG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	49983673	C/T	1	13	15	28	6.20268502926957	7.84305573545818	-1.64037070618861	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.574266908162175	ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50166481	C/T	1	91	80	171	43.418795204887	41.8296305891103	1.5891646157767	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.818832161458264	ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50166445_50166515:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50166445_50166515:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50166445_50166515:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50166445_50166515:IRF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50358133	T/G	1	59	70	129	28.1506474405311	36.6009267654715	-8.45027932494039	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.158225055293374	ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50361874	A/G	1	153	169	322	73.0008314983265	88.3650946194955	-15.364263121169	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0940943296483323	ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50361806_50361910:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50361806_50361910:PTOV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50365536	C/T	1	45	50	95	21.4708327936254	26.1435191181939	-4.6726863245685	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.356345858029969	ENSG00000039650:ENST00000322344:exon_50365442_50365538:PNKP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50386132	A/G	1	33	10	43	15.745277381992	5.22870382363879	10.5165735583532	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00119730935750399	ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50386021_50386149:TBC1D17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50393269	A/G	1	268	388	656	127.87073752648	202.873708357185	-75.0029708307046	A:G	A	G	10	0.522870382363879	4.9929408215056e-09	ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50393773	G/A	1	173	308	481	82.5434238510489	161.044077768075	-78.5006539170258	A:G	G	A	10	0.522870382363879	6.97344305342775e-13	ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50394269	G/A	1	162	222	384	77.2949980570516	116.077224884781	-38.7822268277295	A:G	G	A	10	0.522870382363879	8.0130756697486e-05	ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50394228_50394364:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50394228_50394364:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50394228_50394364:IL4I1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50434197	C/T	1	76	167	243	36.2618509403452	87.3193538547678	-51.0575029144226	T:C	C	T	10	0.522870382363879	4.70840967233932e-11	ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50433989_50434285:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50433989_50434285:ATF5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50435755	C/A	1	27	24	51	12.8824996761753	12.5488891767331	0.333610499442173	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50436371	G/A	1	157	137	294	74.909349968871	71.6332423838514	3.27610758501959	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.726291418124105	ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50550256	G/A	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50881482	T/C	1	17	20	37	8.11120349981406	10.4574076472776	-2.34620414746352	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.511328644277425	ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50881406_50881696:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50881406_50881696:NR1H2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50909471	C/T	1	36	37	73	17.1766662349004	19.3462041474635	-2.16953791256316	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.640489367235346	ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50909439_50909579:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50909439_50909579:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50909439_50909579:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50909439_50909579:POLD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	50984002	G/A	1	39	38	77	18.6080550878087	19.8690745298274	-1.26101944201868	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.819919717049148	ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	51301395	C/T	1	278	265	543	132.642033702842	138.560651326428	-5.91861762358627	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.636578806354281	ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	51301456	G/A	1	276	254	530	131.687774467569	132.809077120425	-1.12130265285586	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.9307427318504	ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	51323473	C/G	1	161	150	311	76.8178684394155	78.4305573545818	-1.61268891516634	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.864929134150139	ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	51381777	C/T	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	C	C		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	ENSG00000167751:ENST00000325321:exon_51381660_51383822:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000358049:exon_51381660_51383822:KLK2;ENSG00000167751:ENST00000391810:exon_51381660_51381860:KLK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	51850253	G/A	1	178	182	360	84.9290719392295	95.162409590226	-10.2333376509964	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.291492681132407	ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	51874998	C/A	1	47	10	57	22.4250920288977	5.22870382363879	17.1963882052589	A:C	C	A	10	0.522870382363879	3.2984309185055e-06	ENSG00000105374:ENST00000221978:exon_51874874_51875089:NKG7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	52471872	A/G	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	52714579	C/A	1	126	125	251	60.1183318221513	65.3587977954849	-5.24046597333362	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.527752027012442	ENSG00000105568:ENST00000454220:exon_52714513_52714591:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000322088:exon_52714513_52714745:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000490868:exon_52714513_52714736:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000468280:exon_52714513_52714947:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000462990:exon_52714513_52714745:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000473455:exon_52714513_52714747:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000444322:exon_52714513_52714745:PPP2R1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	54080780	C/T	1	20	1	21	9.54259235272242	0.522870382363879	9.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	2.88775975323053e-05	ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54080698_54080944:ZNF331
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	54080999	A/G	1	36	3	39	17.1766662349004	1.56861114709164	15.6080550878087	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1.17628692283041e-07	ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	54610170	C/T	1	330	303	633	157.45277381992	158.429725856255	-0.976952036335376	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.968266226417126	ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	54660566	G/A	1	39	43	82	18.6080550878087	22.4834264416468	-3.87537135383807	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.439346861326951	ENSG00000105617:ENST00000222224:exon_54660501_54660763:LENG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	54696167	C/A	1	18	27	45	8.58833311745018	14.1175003238247	-5.52916720637455	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.102969701811721	ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695967_54696206:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695967_54696224:TSEN34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	54711258	T/G	1	32	23	55	15.2681477643559	12.0260187943692	3.24212896998666	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.419541913925535	ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	54973280	C/G	1	17	18	35	8.11120349981406	9.41166688254982	-1.30046338273576	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.736056008386851	ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55098736	G/C	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55098668_55099027:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55098668_55099025:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55098668_55099027:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55098668_55098862:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000472992:exon_55098668_55099014:LILRA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55098742	G/T	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55098668_55099027:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55098668_55099025:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55098668_55099027:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55098668_55098862:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000472992:exon_55098668_55099014:LILRA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55143200	G/T	1	19	23	42	9.0654627350863	12.0260187943692	-2.96055605928292	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.440320270902642	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55143491	G/T	1	26	29	55	12.4053700585391	15.1632410885525	-2.75787103001334	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.500866688341027	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55145093	G/C	1	23	46	69	10.9739812056308	24.0520375887384	-13.0780563831076	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00164995370785438	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145089_55145139:LILRB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55145454	G/A	1	18	10	28	8.58833311745018	5.22870382363879	3.35962929381139	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.256783109761352	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145422_55145634:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145422_55145472:LILRB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55175336	C/T	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55175212_55175413:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175292_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175212_55175496:LILRB4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55175740	C/T	1	25	9	34	11.928240440903	4.70583344127491	7.22240699962812	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0153705845731836	ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55179364	A/G	1	27	13	40	12.8824996761753	6.79731497073043	6.08518470544484	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.058275124436428	ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55512137	C/A	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	C	C		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55512232	C/A	0	0	9	9	0	4.70583344127491	-4.70583344127491	A	C	A	10	0.522870382363879	0.00128152589024229	ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55598724	A/G	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000131037:ENST00000201647:exon_55598671_55598803:EPS8L1;ENSG00000131037:ENST00000245618:exon_55598671_55598803:EPS8L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55603909	G/A	1	32	23	55	15.2681477643559	12.0260187943692	3.24212896998666	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.419541913925535	ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55603810_55603912:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55603810_55603912:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55603810_55603912:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55603810_55603912:PPP1R12C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55604575	C/T	1	30	35	65	14.3138885290836	18.3004633827358	-3.98657485365213	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.324249016097710	ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55604521_55604601:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55604563_55604601:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55604521_55604601:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55604521_55604601:PPP1R12C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55606897	A/T	1	11	18	29	5.24842579399733	9.41166688254982	-4.16324108855249	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.138607125827359	ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55606813_55606968:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55606813_55606971:PPP1R12C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55614923	T/C	1	14	12	26	6.67981464690569	6.27444458836655	0.405370058539147	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55742176	T/C	1	105	70	175	50.0986098517927	36.6009267654715	13.4976830863212	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0412956364323206	ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55742142_55742252:PPP6R1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55751238	A/C	1	39	50	89	18.6080550878087	26.1435191181939	-7.53546403038522	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.112660995776393	ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55751194_55751279:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55751194_55751279:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55751194_55751279:PPP6R1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55753536	C/A	1	19	17	36	9.0654627350863	8.88879650018594	0.176666234900358	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55753534_55753647:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55753534_55753647:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55753534_55753647:PPP6R1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55756992	A/G	1	7	15	22	3.33990732345285	7.84305573545818	-4.50314841200534	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.085407955345524	ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55994240	C/T	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55995148	C/G	1	17	19	36	8.11120349981406	9.9345372649137	-1.82333376509964	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.617808462551922	ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	55998330	A/G	1	17	8	25	8.11120349981406	4.18296305891103	3.92824044090303	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.159965839946729	ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	56104136	T/C	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	56180968	C/T	1	250	238	488	119.28240440903	124.443151002603	-5.16074659357292	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.65061776074937	ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	58858814	G/A	1	45	75	120	21.4708327936254	39.2152786772909	-17.7444458836655	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00130809816096970	ENSG00000121410:ENST00000263100:exon_58858719_58859006:A1BG;ENSG00000121410:ENST00000453054:exon_58858719_58859006:A1BG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	58928309	C/T	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	58929052	G/A	1	11	2	13	5.24842579399733	1.04574076472776	4.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0242231410078916	ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	58929136	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	58929194	A/G	0	11	0	11	5.24842579399733	0	5.24842579399733	A	A		10	0.522870382363879	0.00109035227886462	ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	58929200	A/C	0	11	0	11	5.24842579399733	0	5.24842579399733	A	A		10	0.522870382363879	0.00109035227886462	ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	58989495	A/C	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	58991781	C/T	1	3	10	13	1.43138885290836	5.22870382363879	-3.79731497073043	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0492215241656784	ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	59010593	A/G	1	8	15	23	3.81703694108897	7.84305573545818	-4.02601879436922	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0993095182162473	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	59059729	G/A	1	189	200	389	90.1774977332269	104.574076472776	-14.3965787395489	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.155203447350686	ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	59073668	C/T	1	12	15	27	5.72555541163345	7.84305573545818	-2.11750032382473	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.445977489976173	ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	19	59074653	T/C	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	677342	G/A	1	8	27	35	3.81703694108897	14.1175003238247	-10.3004633827358	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.000533079704786521	ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	3391826	C/T	1	26	22	48	12.4053700585391	11.5031484120053	0.90222164653381	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.885381060616772	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	3392295	A/G	1	42	25	67	20.0394439407171	13.071759559097	6.96768438162011	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.111192262468851	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	3483205	C/T	1	60	74	134	28.6277770581673	38.692408294927	-10.0646312367598	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0842043925017175	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	3504687	A/G	1	18	20	38	8.58833311745018	10.4574076472776	-1.8690745298274	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.626949445873145	ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3504585_3504764:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3504585_3504764:ADI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	8871342	C/A	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	9770429	C/T	1	44	41	85	20.9937031759893	21.437685676919	-0.443982500929714	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000134308:ENST00000238081:exon_9770288_9770663:YWHAQ;ENSG00000134308:ENST00000381844:exon_9770288_9770745:YWHAQ;ENSG00000134308:ENST00000446619:exon_9770288_9770663:YWHAQ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	10263874	C/G	1	35	37	72	16.6995366172642	19.3462041474635	-2.64666753019928	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.556789160175212	ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498235:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10263863_10264244:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000474701:exon_10263863_10263979:RRM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	10566914	G/A	1	37	43	80	17.6537958525365	22.4834264416468	-4.82963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.314084537987872	ENSG00000115756:ENST00000307845:exon_10566850_10567735:HPCAL1;ENSG00000115756:ENST00000381765:exon_10566850_10567743:HPCAL1;ENSG00000115756:ENST00000419810:exon_10566850_10567478:HPCAL1;ENSG00000115756:ENST00000422133:exon_10566850_10567126:HPCAL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	10933294	C/T	1	115	74	189	54.8699060281539	38.692408294927	16.1774977332269	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0196795940736371	ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	10942702	G/A	1	21	19	40	10.0197219703585	9.9345372649137	0.085184705444842	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	11925038	A/C	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000134324:ENST00000396099:exon_11925012_11925202:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000256720:exon_11925012_11925202:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000449576:exon_11925012_11925202:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000425416:exon_11925012_11925202:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000396097:exon_11925012_11925202:LPIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	15372562	C/T	1	28	32	60	13.3596292938114	16.7318522356441	-3.37222294183274	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.438542927840932	ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	15378808	C/G	1	19	30	49	9.0654627350863	15.6861114709164	-6.62064873583007	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0634945841086963	ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	18736438	G/C	1	2	15	17	0.954259235272242	7.84305573545818	-6.88879650018594	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00089921934944216	ENSG00000240857:ENST00000381249:exon_18735989_18737074:RDH14;ENSG00000240857:ENST00000468071:exon_18736388_18737074:RDH14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	20101487	G/A	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20101467_20101717:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20101467_20101747:TTC32
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	20823759	C/T	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20823656_20823791:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20823656_20823791:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20823656_20823791:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20823656_20823791:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20821948_20823791:HS1BP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	20824498	C/T	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	26415208	C/T	1	189	176	365	90.1774977332269	92.0251872960427	-1.84768956281583	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.875132624552953	ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26415179_26415293:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000492433:exon_26415179_26415293:HADHA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27260469	G/A	1	21	56	77	10.0197219703585	29.2807414123772	-19.2610194420187	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1.03436812803992e-05	ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27261375	G/C	1	16	33	49	7.63407388217794	17.254722618008	-9.62064873583007	T:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00636697044266324	ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27261352_27261400:TMEM214
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27262944	G/A	1	70	58	128	33.3990732345285	30.326482177105	3.07259105742349	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.596821136344498	ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000434544:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460665:exon_27262229_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000469445:exon_27262788_27263364:TMEM214
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27322606	T/C	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000138030:ENST00000260599:exon_27322533_27323619:KHK;ENSG00000138030:ENST00000260598:exon_27322533_27323640:KHK;ENSG00000138030:ENST00000490823:exon_27322533_27322769:KHK;ENSG00000138030:ENST00000464371:exon_27322533_27322837:KHK;ENSG00000138028:ENST00000440612:exon_27321757_27322708:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000402550:exon_27321757_27322708:CGREF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27439751	G/T	1	129	153	282	61.5497206750596	79.9991685016735	-18.4494478266139	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0316929659508279	ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439712_27440024:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439712_27440046:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439712_27440025:C2orf28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27459364	T/C	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27459152_27459391:CAD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27461304	G/A	1	23	14	37	10.9739812056308	7.32018535309431	3.65379585253648	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.252297624739388	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461299_27461500:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461299_27461500:CAD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27462651	T/C	1	23	23	46	10.9739812056308	12.0260187943692	-1.05203758873843	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.769974298838628	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462565_27463090:CAD;ENSG00000084774:ENST00000491461:exon_27462565_27462666:CAD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27865325	A/G	1	15	10	25	7.15694426454182	5.22870382363879	1.92824044090303	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.549274934579923	ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27865296_27865386:ZNF512;ENSG00000198522:ENST00000515877:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000503738:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000424214:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000407583:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000461249:exon_27865296_27865386:GPN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27883958	C/T	1	20	9	29	9.54259235272242	4.70583344127491	4.83675891144751	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0932305923277212	ENSG00000119760:ENST00000337768:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000406540:exon_27883851_27885148:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000405491:exon_27883851_27884468:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000404798:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000464789:exon_27883629_27884468:SUPT7L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	27886820	G/T	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	32961858	A/G	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32961761_32961883:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32961852_32961883:TTC27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	33787859	G/A	1	78	80	158	37.2161101756174	41.8296305891103	-4.61352041349287	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.474395717894438	ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33787796_33789817:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33787796_33789817:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33787796_33789798:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33787796_33789672:RASGRP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	37349690	C/T	1	11	27	38	5.24842579399733	14.1175003238247	-8.8690745298274	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00511954165971093	ENSG00000055332:ENST00000233057:exon_37349649_37349807:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000395127:exon_37349649_37349807:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000343510:exon_37349649_37349807:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000405334:exon_37349649_37349807:EIF2AK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	37365716	G/C	1	5	11	16	2.38564808818061	5.75157420600267	-3.36592611782206	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.131501130991483	ENSG00000055332:ENST00000233057:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000395127:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000343510:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000405334:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000379156:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000496059:exon_37365652_37365728:EIF2AK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	37438154	C/G	1	67	67	134	31.9676843816201	35.0323156183799	-3.06463123675978	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.604945063974149	ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438142_37438225:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438142_37438225:CEBPZ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	37454998	A/G	1	16	11	27	7.63407388217794	5.75157420600267	1.88249967617527	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.564694319892801	ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	38525660	C/G	1	6	8	14	2.86277770581673	4.18296305891103	-1.32018535309431	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.59563947353559	ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000477642:exon_38525073_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000489896:exon_38525360_38525717:ATL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	42922934	T/C	0	26	0	26	12.4053700585391	0	12.4053700585391	T	T		10	0.522870382363879	5.20810825907395e-08	ENSG00000057935:ENST00000405592:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000406652:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000407270:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000282366:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000406911:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000454356:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000409019:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000405094:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000472767:exon_42922905_42922979:MTA3;ENSG00000057935:ENST00000475383:exon_42922905_42922979:MTA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	42990010	C/A	1	13	15	28	6.20268502926957	7.84305573545818	-1.64037070618861	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.574266908162175	ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	42990217	G/A	1	15	9	24	7.15694426454182	4.70583344127491	2.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.414521773200192	ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	43458097	G/C	1	15	10	25	7.15694426454182	5.22870382363879	1.92824044090303	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.549274934579923	ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43457975_43458482:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43457976_43458482:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43457976_43458482:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43457976_43458482:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43457990_43458482:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43457991_43458482:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43457991_43458482:THADA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	43519977	C/T	1	12	20	32	5.72555541163345	10.4574076472776	-4.73185223564413	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.111378265148618	ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43519973_43520205:THADA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	44016824	A/C	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44016772_44016861:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44016772_44016860:DYNC2LI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	44036922	T/C	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	46739157	A/G	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	46739720	C/T	1	1	8	9	0.477129617636121	4.18296305891103	-3.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0168420576576534	ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	47220622	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	47273457	G/A	1	20	10	30	9.54259235272242	5.22870382363879	4.31388852908363	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.143452102098685	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000496991:exon_47273453_47273570:TTC7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	47301029	A/G	1	42	35	77	20.0394439407171	18.3004633827358	1.73898055798132	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.73295152709095	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	53955850	C/T	1	12	5	17	5.72555541163345	2.61435191181939	3.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.150562479720797	ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	54035447	A/G	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	54093956	G/A	1	26	26	52	12.4053700585391	13.5946299414609	-1.1892598829217	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.782282148390827	ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000476586:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000488687:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000466539:exon_54093884_54094017:PSME4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	54115904	A/G	1	10	14	24	4.77129617636121	7.32018535309431	-2.54888917673309	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.31450311042178	ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	54120025	A/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	54858511	C/T	1	8	24	32	3.81703694108897	12.5488891767331	-8.73185223564413	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00223456697865281	ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	54886347	G/A	1	53	52	105	25.2878697347144	27.1892598829217	-1.90139014820729	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.769651616523592	ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	55490819	G/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	55573323	C/T	1	18	31	49	8.58833311745018	16.2089818532802	-7.62064873583007	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0319645807328617	ENSG00000115355:ENST00000336838:exon_55573311_55573469:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000263630:exon_55573311_55573469:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000436346:exon_55573311_55573469:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000413716:exon_55573311_55573469:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000422883:exon_55573311_55573469:CCDC88A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	55771161	A/G	1	34	28	62	16.2224069996281	14.6403707061886	1.58203629343951	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.704983511708848	ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	55883317	G/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	61415492	A/G	1	46	49	95	21.9479624112616	25.6206487358301	-3.6726863245685	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.473252869787957	ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	61417617	A/G	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.491122791101019	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	61715324	C/T	1	12	11	23	5.72555541163345	5.75157420600267	-0.0260187943692163	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000082898:ENST00000401558:exon_61715300_61715406:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000428210:exon_61715300_61715406:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000481073:exon_61715300_61715406:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000404992:exon_61715300_61715406:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000406957:exon_61715300_61715406:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000461407:exon_61715300_61715406:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000494468:exon_61715300_61715406:XPO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	62067322	C/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62066556_62067660:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000307507:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478822:exon_62066556_62067716:FAM161A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	62100380	G/T	1	73	78	151	34.8304620874368	40.7838898243826	-5.95342773694572	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.370254109194199	ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62100332_62100428:CCT4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	65245365	G/A	1	12	22	34	5.72555541163345	11.5031484120053	-5.77759300037189	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0581185693028152	ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	65299298	C/A	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	65299300	G/C	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	65299611	C/T	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	67631541	T/C	1	2	9	11	0.954259235272242	4.70583344127491	-3.75157420600267	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0318932346368143	ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	68364478	T/C	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	70033584	C/T	1	33	33	66	15.745277381992	17.254722618008	-1.50944523601601	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.713752347339611	ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	70037739	C/G	1	29	21	50	13.8367589114475	10.9802780296415	2.85648088180605	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.479883362830296	ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70035038_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70037726_70037752:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70037726_70037857:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000468815:exon_70037726_70038034:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000472124:exon_70037726_70037805:ANXA4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	70387821	G/C	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000115998:ENST00000264434:exon_70387757_70387919:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000420306:exon_70387757_70387919:C2orf42
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	71305660	C/T	1	59	13	72	28.1506474405311	6.79731497073043	21.3533324698007	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.91836174806903e-07	ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	71305661	C/A	1	65	17	82	31.0134251463479	8.88879650018594	22.1246286461619	A:C	C	A	10	0.522870382363879	6.21804451140186e-07	ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	71376999	G/A	1	25	45	70	11.928240440903	23.5291672063746	-11.6009267654715	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00579972074395617	ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	71417134	C/T	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000124374:ENST00000244221:exon_71416975_71417151:PAIP2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	71651029	G/A	1	16	9	25	7.63407388217794	4.70583344127491	2.92824044090303	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.31716605110325	ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71649944_71651168:ZNF638
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	71654450	A/G	1	41	44	85	19.562314323081	23.0062968240107	-3.44398250092971	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.514994615168316	ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	71658541	C/T	1	52	68	120	24.8107401170783	35.5551860007438	-10.7444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0547999235997183	ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	73829372	C/T	1	1	10	11	0.477129617636121	5.22870382363879	-4.75157420600267	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0046071750918677	ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73829312_73829495:ALMS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	74690039	G/A	1	13	8	21	6.20268502926957	4.18296305891103	2.01972197035854	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.393789904615872	ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	74690378	C/T	1	25	10	35	11.928240440903	5.22870382363879	6.69953661726424	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0271075991304383	ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	74699778	C/A	1	132	105	237	62.981109527968	54.9013901482073	8.07971937976069	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.298911222708278	ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	74710491	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	75107683	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75107392_75107696:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75107392_75107696:HK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	75115108	A/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	75921441	G/C	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000486016:exon_75921367_75921605:C2orf3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	75937801	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75937717_75938115:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75937717_75938018:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75937717_75938067:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000470503:exon_75937717_75938025:C2orf3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85051122	G/A	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	G	G		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	ENSG00000186854:ENST00000335459:exon_85051077_85051328:C2orf89;ENSG00000186854:ENST00000479944:exon_85051077_85051328:C2orf89;ENSG00000186854:ENST00000409520:exon_85051077_85051328:C2orf89;ENSG00000186854:ENST00000496500:exon_85051077_85051328:C2orf89
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85553784	C/T	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85571370	C/T	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85571362_85571444:RETSAT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85576622	C/G	1	12	5	17	5.72555541163345	2.61435191181939	3.11120349981406	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.150562479720797	ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85576507_85576704:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85576507_85576704:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85576507_85576704:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85576507_85576704:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85576507_85576704:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000409984:exon_85576555_85576704:RETSAT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85622008	G/A	1	173	43	216	82.5434238510489	22.4834264416468	60.0599974094021	A:G	G	A	10	0.522870382363879	2.46060377080726e-17	ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85625222	T/G	1	102	29	131	48.6672209988843	15.1632410885525	33.5039799103319	T:G	T	G	10	0.522870382363879	2.06934380516942e-09	ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85628983	C/T	1	82	38	120	39.1246286461619	19.8690745298274	19.2555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000467957565700404	ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628908_85629281:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000415012:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000491267:exon_85628768_85629281:CAPG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85786074	G/A	1	33	32	65	15.745277381992	16.7318522356441	-0.986574853652131	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.805520922968608	ENSG00000115486:ENST00000233838:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000430215:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000423570:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000428479:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000421496:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000481541:exon_85785707_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000496962:exon_85785848_85786198:GGCX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	85843348	C/T	1	8	13	21	3.81703694108897	6.79731497073043	-2.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.27445798442317	ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85843215_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85843266_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000455732:exon_85843275_85843579:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85843275_85843435:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85843292_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85843300_85843377:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85843309_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85843310_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85843317_85843586:USP39
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	86831407	C/T	1	18	21	39	8.58833311745018	10.9802780296415	-2.39194491219128	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.522116304886562	ENSG00000239305:ENST00000237455:exon_86830516_86832541:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000472030:exon_86830523_86832541:RNF103
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	89156948	C/G	1	7382	514	7896	3522.17083738985	268.755376535034	3253.41546085481	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	4.94065645841247e-324	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	89161039	T/C	1	55	77	132	26.2421289699867	40.2610194420187	-14.018890472032	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0183062720667696	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	96993691	G/A	1	15	6	21	7.15694426454182	3.13722229418327	4.01972197035854	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0848568473104646	ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	98274527	G/C	1	28	24	52	13.3596292938114	12.5488891767331	0.810740117078295	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.889955469070118	ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	98277090	T/C	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98277034_98277109:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98277034_98277109:ACTR1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	98354511	G/A	1	11	9	20	5.24842579399733	4.70583344127491	0.542592352722421	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.82745485897146	ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000451498:exon_98354458_98354570:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000489250:exon_98354458_98355040:ZAP70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	98355990	G/A	1	8	13	21	3.81703694108897	6.79731497073043	-2.98027802964146	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.27445798442317	ENSG00000115085:ENST00000264972:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000389518:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000463643:exon_98355838_98356325:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000442208:exon_98355838_98356323:ZAP70;ENSG00000115085:ENST00000487283:exon_98355838_98356322:ZAP70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	98409046	G/A	1	11	9	20	5.24842579399733	4.70583344127491	0.542592352722421	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.82745485897146	ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98408849_98409447:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98408849_98409447:TMEM131
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	99978048	G/A	1	288	277	565	137.413329879203	144.835095914794	-7.42176603559159	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.555500210016311	ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99977611_99978283:EIF5B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	100055506	A/G	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	101009848	C/T	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	101620766	C/G	1	12	2	14	5.72555541163345	1.04574076472776	4.67981464690569	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0142040982982489	ENSG00000071082:ENST00000409000:exon_101620620_101621066:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000419276:exon_101620620_101620823:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000409711:exon_101620620_101622829:RPL31
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	101624471	T/C	1	2	39	41	0.954259235272242	20.3919449121913	-19.437685676919	T:C	T	C	10	0.522870382363879	7.15869081204948e-11	ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101622395_101624492:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101624079_101624735:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101624079_101624735:TBC1D8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	101869768	G/A	1	15	15	30	7.15694426454182	7.84305573545818	-0.686111470916369	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.856171129714278	ENSG00000158435:ENST00000289382:exon_101869264_101869940:C2orf29
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	101898412	G/C	1	27	35	62	12.8824996761753	18.3004633827358	-5.4179637065605	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.20331283610316	ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	101925026	T/C	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101924591_101925163:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101924591_101925158:RNF149
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	106498343	C/T	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000071051:ENST00000233154:exon_106497784_106498505:NCK2;ENSG00000071051:ENST00000393349:exon_106497784_106498505:NCK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	113940280	G/A	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000125637:ENST00000465917:exon_113939923_113940621:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	113940681	T/C	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	113940839	G/C	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	113943470	A/G	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	118575215	C/G	1	111	88	199	52.9613875576094	46.0125936480214	6.94879390958808	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.35631364634634	ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	127453543	T/C	1	269	221	490	128.347867144117	115.554354502417	12.7935126416993	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.258307652904715	ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	127808060	G/A	1	95	91	186	45.3273136754315	47.581204795113	-2.25389111968148	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.769274830746444	ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000462958:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127807997_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127807958_127808098:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127807984_127808098:BIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	127808470	C/T	1	54	40	94	25.7649993523505	20.9148152945552	4.85018405779538	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.353102023431347	ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000462958:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000466111:exon_127808378_127808488:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000484253:exon_127808378_127808488:BIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	127826533	A/G	1	74	55	129	35.307591705073	28.7578710300133	6.54972067505962	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.253367007821332	ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	128249590	G/T	1	26	31	57	12.4053700585391	16.2089818532802	-3.8036117947411	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.353985212680962	ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000455721:exon_128249547_128249664:IWS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	128477084	G/C	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000136709:ENST00000322313:exon_128476839_128477927:WDR33
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	128522383	T/C	1	52	46	98	24.8107401170783	24.0520375887384	0.758702528339864	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.919635973478448	ENSG00000136709:ENST00000409658:exon_128520107_128522553:WDR33
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	128610648	T/C	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	131103834	C/T	1	212	218	430	101.151478938858	113.985743355326	-12.8342644164679	A:T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.227491612365388	ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103774_131103847:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131103774_131103847:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131103774_131103847:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103774_131103845:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103774_131103847:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103774_131103847:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103774_131103847:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103774_131103847:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462357:exon_131103774_131103914:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000475074:exon_131103774_131103847:IMP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	132287230	C/T	1	28	15	43	13.3596292938114	7.84305573545818	5.5165735583532	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0955642712962508	ENSG00000163040:ENST00000465939:exon_132287220_132287753:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132287220_132287264:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000454549:exon_132287220_132287264:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132287220_132287264:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000468650:exon_132287220_132287264:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000478665:exon_132287220_132287322:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132286754_132287264:CCDC74A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	132290464	G/A	1	132	143	275	62.981109527968	74.7704646780347	-11.7893551500667	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.165020003055606	ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132290437_132290514:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290437_132290510:CCDC74A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	132290948	C/T	1	214	150	364	102.10573817413	78.4305573545818	23.6751808195481	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.0135982276695340	ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290842_132291239:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290842_132291239:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290842_132291239:CCDC74A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	136409574	A/C	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	136537935	A/T	1	21	15	36	10.0197219703585	7.84305573545818	2.17666623490036	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.507866907513101	ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136537753_136537955:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136537753_136537955:UBXN4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	136537940	G/C	1	22	17	39	10.4968515879947	8.88879650018594	1.60805508780872	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.634121274063512	ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136537753_136537955:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000490163:exon_136537753_136537955:UBXN4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	148716428	T/C	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	152132130	A/G	1	122	89	211	58.2098133516068	46.5354640303852	11.6743493212215	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.113111331697160	ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	152138522	T/C	1	19	24	43	9.0654627350863	12.5488891767331	-3.4834264416468	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.359864059367908	ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	152320118	G/A	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	152322095	A/T	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.273399026723903	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	152695602	C/T	1	11	1	12	5.24842579399733	0.522870382363879	4.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00695977522690581	ENSG00000182389:ENST00000360283:exon_152689290_152695893:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000339254:exon_152694136_152695893:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000439467:exon_152695128_152695893:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000397327:exon_152695198_152695893:CACNB4;ENSG00000182389:ENST00000427385:exon_152695328_152695893:CACNB4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	153520719	T/C	1	10	15	25	4.77129617636121	7.84305573545818	-3.07175955909697	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.235452306649387	ENSG00000196504:ENST00000410080:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000440252:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000359961:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000356402:exon_153520652_153520766:PRPF40A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	160639970	T/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000241399:ENST00000429078:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000241399:ENST00000259053:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000241399:ENST00000480212:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160639870_160639980:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160639870_160639980:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160639870_160639980:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160639870_160639980:RP11-357L2.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	163123704	C/T	1	16	6	22	7.63407388217794	3.13722229418327	4.49685158799466	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0578567641132185	ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123589_163123889:IFIH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	163128824	T/C	1	62	53	115	29.5820362934395	27.7121302652856	1.86990602815392	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.77967396405031	ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	163128883	G/A	1	72	72	144	34.3533324698007	37.6466675301993	-3.29333506039856	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.617027567735763	ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	163137871	C/G	1	17	22	39	8.11120349981406	11.5031484120053	-3.39194491219128	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.336473791826544	ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	163137983	T/C	1	13	4	17	6.20268502926957	2.09148152945552	4.11120349981406	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0530050628667056	ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	169952233	T/C	1	9	11	20	4.29416655872509	5.75157420600267	-1.45740764727758	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.655558089529074	ENSG00000073737:ENST00000419279:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000327239:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000357546:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000428522:exon_169952054_169952672:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000421653:exon_169952054_169952277:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000432060:exon_169952054_169952430:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000436483:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000412271:exon_169952054_169952677:DHRS9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	170460536	A/C	1	40	56	96	19.0851847054448	29.2807414123772	-10.1955567069324	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0408685820878862	ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530152:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000462903:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000418888:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000414307:exon_170460536_170460612:PPIG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	170493103	T/A	1	265	248	513	126.439348673572	129.671854826242	-3.23250615266988	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.790946244931147	ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	171822466	C/T	1	63	58	121	30.0591659110756	30.326482177105	-0.267316266029351	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	174131426	A/C	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000091436:ENST00000409176:exon_174130778_174131511:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000375213:exon_174130778_174132738:AC013461.1;ENSG00000091436:ENST00000431503:exon_174130778_174131478:AC013461.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	174774873	T/G	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174771187_174774985:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174773258_174774985:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174773258_174774985:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174773259_174774985:SP3;ENSG00000172845:ENST00000465379:exon_174773260_174774985:SP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	174819674	T/C	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174819601_174820960:SP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	174946760	T/C	1	4	17	21	1.90851847054448	8.88879650018594	-6.98027802964146	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00337186906348073	ENSG00000138430:ENST00000284719:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000344357:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000409546:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000449400:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000392560:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000462000:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000429575:exon_174946738_174946792:OLA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	180810180	C/T	1	60	59	119	28.6277770581673	30.8493525594689	-2.2215755013016	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.71403964376967	ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	180810361	T/A	1	42	56	98	20.0394439407171	29.2807414123772	-9.24129747166014	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.068569487614707	ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	182374534	A/G	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	182399097	T/C	1	15	19	34	7.15694426454182	9.9345372649137	-2.77759300037189	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.392177937557364	ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	182543455	T/C	0	0	8	8	0	4.18296305891103	-4.18296305891103	C	T	C	10	0.522870382363879	0.0026859072312288	ENSG00000162992:ENST00000295108:exon_182541194_182543598:NEUROD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	190532214	G/A	1	26	30	56	12.4053700585391	15.6861114709164	-3.28074141237722	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.4231156485591	ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	190728507	A/G	1	20	2	22	9.54259235272242	1.04574076472776	8.49685158799466	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.000161867964875270	ENSG00000064933:ENST00000434338:exon_190728469_190728700:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000392338:exon_190728469_190728841:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190728469_190728954:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190728469_190728954:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190728469_190728954:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190728469_190728954:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190728469_190728700:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000421722:exon_190728469_190728840:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424307:exon_190728469_190728928:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424059:exon_190728469_190728700:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000483293:exon_190728469_190728954:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000452382:exon_190728469_190728954:PMS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	191064751	T/C	1	16	35	51	7.63407388217794	18.3004633827358	-10.6663895005578	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00302426966180743	ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	191064753	C/T	1	15	34	49	7.15694426454182	17.7775930003719	-10.6206487358301	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00250232924794486	ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	191839658	A/C	1	73	98	171	34.8304620874368	51.2412974716601	-16.4108353842233	A:T:C	A	C	10	0.522870382363879	0.014074378094535	ENSG00000115415:ENST00000415035:exon_191839556_191839661:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000423282:exon_191839556_191839658:STAT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	198362018	T/C	1	244	277	521	116.419626703214	144.835095914794	-28.4154692115809	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0139769223552932	ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000486181:exon_198361864_198362231:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198361864_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198361615_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198361892_198362116:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198362009_198362116:HSPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	198363429	G/A	1	275	279	554	131.210644849933	145.880836679522	-14.6701918295889	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.217565095308408	ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	198363504	A/G	1	73	61	134	34.8304620874368	31.8950933241966	2.93536876324022	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.665654390899046	ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	201436154	A/C	1	22	18	40	10.4968515879947	9.41166688254982	1.08518470544484	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.754292955333073	ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	202006096	G/A	1	2	11	13	0.954259235272242	5.75157420600267	-4.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0100423055089113	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	202025621	A/G	1	23	25	48	10.9739812056308	13.071759559097	-2.09777835346619	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.566100280837516	ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	202065255	C/T	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202065166_202065451:CASP10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	203764295	G/A	1	10	13	23	4.77129617636121	6.79731497073043	-2.02601879436922	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.41269190582082	ENSG00000138442:ENST00000261015:exon_203764254_203764360:WDR12;ENSG00000138442:ENST00000478869:exon_203764254_203764360:WDR12;ENSG00000138442:ENST00000477723:exon_203764280_203764360:WDR12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	204103767	C/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204103663_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204103700_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204103705_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204103705_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204103732_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000463131:exon_204103734_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000489360:exon_204103744_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000428265:exon_204103744_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204103750_204103857:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000443941:exon_204103758_204103857:CYP20A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	207008763	C/A	1	12	12	24	5.72555541163345	6.27444458836655	-0.548889176733095	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.841001758494376	ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	207026113	G/A	1	44	96	140	20.9937031759893	50.1955567069324	-29.2018535309431	A:G	G	A	10	0.522870382363879	6.95164279806807e-07	ENSG00000114942:ENST00000236957:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392221:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392222:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000445505:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000429769:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000415904:exon_207026045_207026191:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000435123:exon_207026070_207026178:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000455150:exon_207026070_207026196:EEF1B2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	207026131	G/A	1	46	89	135	21.9479624112616	46.5354640303852	-24.5875016191237	A:G	G	A	10	0.522870382363879	2.93202110303825e-05	ENSG00000114942:ENST00000236957:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392221:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392222:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000445505:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000429769:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000415904:exon_207026045_207026191:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000435123:exon_207026070_207026178:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000455150:exon_207026070_207026196:EEF1B2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	207636661	G/A	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207636618_207636741:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207636618_207636741:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207636618_207636741:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207636618_207636741:FASTKD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	208478055	A/G	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	208489101	C/A	1	9	7	16	4.29416655872509	3.66009267654715	0.634073882177937	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.806882383309564	ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	216190020	C/G	1	54	60	114	25.7649993523505	31.3722229418327	-5.6072235894822	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.303578270108897	ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	217012901	A/G	1	158	153	311	75.3864795865071	79.9991685016735	-4.61268891516636	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.609815810582086	ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	217329322	A/G	1	36	52	88	17.1766662349004	27.1892598829217	-10.0125936480213	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0332270477170664	ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217329320_217329390:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217329320_217329390:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217329320_217329390:SMARCAL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	219266385	G/A	1	9	19	28	4.29416655872509	9.9345372649137	-5.64037070618861	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0374013011231895	ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	219266423	C/A	1	24	11	35	11.4511108232669	5.75157420600267	5.69953661726424	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0624819813509364	ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	219526649	G/A	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000443791:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000471576:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219526389_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219526574_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219526641_219526676:BCS1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	219527866	T/C	1	22	9	31	10.4968515879947	4.70583344127491	5.79101814671975	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0467690493655172	ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	219528995	T/C	1	44	38	82	20.9937031759893	19.8690745298274	1.12462864616192	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.825846267920626	ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	219533378	T/C	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	219619080	A/T	1	16	24	40	7.63407388217794	12.5488891767331	-4.91481529455516	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.153540179742736	ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219618954_219619416:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219618857_219620139:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219618857_219619416:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219618857_219620139:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417855:exon_219618954_219619139:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000472527:exon_219618857_219619226:TTLL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	220045454	G/A	1	8	12	20	3.81703694108897	6.27444458836655	-2.45740764727758	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.371138995758136	ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	220250769	T/C	1	58	44	102	27.673517822895	23.0062968240107	4.66722099888435	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.373583587420254	ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000457935:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000521459:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000434339:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000430206:exon_220250704_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000520694:exon_220250760_220250820:DNPEP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	220404220	G/A	1	67	45	112	31.9676843816201	23.5291672063746	8.43851717524556	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.129826782838818	ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	220405321	T/C	1	17	8	25	8.11120349981406	4.18296305891103	3.92824044090303	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.159965839946729	ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	220476443	C/T	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220476326_220476556:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220476326_220476556:STK11IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	223386557	A/G	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223386486_223386665:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223386486_223386665:SGPP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	223386578	C/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223386486_223386665:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223386486_223386665:SGPP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	224743373	C/T	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	225630550	G/A	1	48	43	91	22.9022216465338	22.4834264416468	0.418795204887015	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225629807_225630554:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225629807_225630554:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409802:exon_225629807_225630554:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225629807_225630554:DOCK10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231042276	A/G	1	154	161	315	73.4779611159626	84.1821315605845	-10.7041704446219	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.236421713617473	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231067305	C/G	1	194	134	328	92.5631458214075	70.0646312367598	22.4985145846477	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0128773058840404	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231067295_231067438:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231067295_231067444:SP110
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231077112	G/A	1	102	112	214	48.6672209988843	58.5614828247544	-9.8942618258701	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.193458555684456	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231077618	T/C	1	109	113	222	52.0071283223372	59.0843532071183	-7.07722488478112	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.347647130640826	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077476_231077620:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231079732	T/C	1	52	68	120	24.8107401170783	35.5551860007438	-10.7444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0547999235997183	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231079665_231079833:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231079665_231079833:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231079665_231079833:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231079665_231079833:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231079665_231079833:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231079665_231079833:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231079665_231079833:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231079665_231079833:SP110;ENSG00000135899:ENST00000416610:exon_231079677_231079833:SP110
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231118041	A/C	1	9	23	32	4.29416655872509	12.0260187943692	-7.73185223564413	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0072893410356547	ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231120241	G/C	1	24	30	54	11.4511108232669	15.6861114709164	-4.23500064764946	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.276789558205130	ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231120167_231120247:SP140
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231738168	G/A	1	13	23	36	6.20268502926957	12.0260187943692	-5.82333376509964	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0654455144750857	ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231738263	C/T	1	64	12	76	30.5362955287117	6.27444458836655	24.2618509403452	T:C	C	T	10	0.522870382363879	6.27162314207e-09	ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	231738269	G/A	1	63	6	69	30.0591659110756	3.13722229418327	26.9219436168924	A:G	G	A	10	0.522870382363879	4.17134932221644e-12	ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231738132_231738272:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231738132_231738272:ITM2C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	232321442	G/A	1	660	582	1242	314.90554763984	304.310562535778	10.5949851040623	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.550971807612249	ENSG00000115053:ENST00000322723:exon_232321342_232321475:NCL;ENSG00000115053:ENST00000392033:exon_232321342_232321475:NCL;ENSG00000115053:ENST00000322732:exon_232321342_232321475:NCL;ENSG00000115053:ENST00000461347:exon_232321342_232321475:NCL;ENSG00000115053:ENST00000356936:exon_232321342_232321475:NCL;ENSG00000115053:ENST00000466274:exon_232321342_232321475:NCL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	234367022	A/G	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000471764:exon_234366885_234367043:DGKD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	234386134	A/G	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	234749780	G/C	1	43	58	101	20.5165735583532	30.326482177105	-9.80990861875177	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0580655905271155	ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	234761225	C/T	1	7	12	19	3.33990732345285	6.27444458836655	-2.9345372649137	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.250431561449006	ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234761211_234761266:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234761211_234761266:HJURP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	238990382	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238990350_238990477:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000413463:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000446202:exon_238990350_238990382:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000443532:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000482031:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000431487:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238990350_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238987206_238990477:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238990376_238990477:SCLY
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	238999883	T/C	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	239006879	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	239353001	C/T	1	12	16	28	5.72555541163345	8.36592611782206	-2.64037070618861	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.348425158129033	ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239352983_239353016:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000409297:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239352983_239353115:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000468122:exon_239352983_239353368:ASB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242036797	A/G	1	17	24	41	8.11120349981406	12.5488891767331	-4.43768567691904	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.210590819870381	ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000493169:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000414146:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000460915:exon_242036341_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242036602_242036842:MTERFD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242038942	T/G	1	17	20	37	8.11120349981406	10.4574076472776	-2.34620414746352	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.511328644277425	ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000495694:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000401626:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000475860:exon_242038583_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000434791:exon_242038814_242039309:MTERFD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242062162	C/T	1	5	10	15	2.38564808818061	5.22870382363879	-2.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.195978503056267	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242065624	A/G	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242065635	A/G	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242065781	G/A	1	12	12	24	5.72555541163345	6.27444458836655	-0.548889176733095	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.841001758494376	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242065798	T/C	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242066250	C/T	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	2	242066314	T/C	1	2	9	11	0.954259235272242	4.70583344127491	-3.75157420600267	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0318932346368143	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	825678	T/C	1	5	13	18	2.38564808818061	6.79731497073043	-4.41166688254982	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0562174762259916	ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	826206	G/A	1	16	14	30	7.63407388217794	7.32018535309431	0.313888529083632	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	2633936	T/C	1	22	27	49	10.4968515879947	14.1175003238247	-3.62064873583007	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.319422144588519	ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633925_2634466:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2633925_2634039:NOP56
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	2637807	G/A	1	414	351	765	197.531661701354	183.527504209722	14.0041574916326	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.328467385142568	ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637727_2637864:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637727_2637864:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637727_2637864:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637727_2637864:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637727_2637864:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637727_2637864:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2637727_2637864:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637727_2638095:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637420_2637871:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2637727_2637864:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2637595_2637864:NOP56
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	2644813	G/T	1	20	26	46	9.54259235272242	13.5946299414609	-4.05203758873843	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.241237354900669	ENSG00000101365:ENST00000474315:exon_2644799_2644835:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380851:exon_2644799_2644865:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380843:exon_2644799_2644865:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000488299:exon_2644799_2644834:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000462967:exon_2644799_2644861:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000491065:exon_2644799_2644855:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000341825:exon_2644799_2644843:IDH3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	2818931	G/A	1	23	25	48	10.9739812056308	13.071759559097	-2.09777835346619	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.566100280837516	ENSG00000132635:ENST00000356872:exon_2818878_2819124:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000360652:exon_2818878_2819124:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000474714:exon_2818878_2819012:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000478539:exon_2818927_2819124:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000434800:exon_2818927_2819124:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000436952:exon_2818878_2819124:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000448755:exon_2818878_2819124:FAM113A;ENSG00000132635:ENST00000439542:exon_2818878_2819124:FAM113A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	2845039	C/T	1	33	54	87	15.745277381992	28.2350006476495	-12.4897232656575	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00959762671992037	ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2845011_2845108:PTPRA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	2996497	C/T	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	3127579	T/C	1	24	24	48	11.4511108232669	12.5488891767331	-1.09777835346619	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.774267122644035	ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	3129557	T/C	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	3193978	G/A	1	45	57	102	21.4708327936254	29.8036117947411	-8.33277900111565	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.112503554060695	ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	5753579	C/T	1	22	15	37	10.4968515879947	7.84305573545818	2.65379585253648	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.414284355859138	ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	5844121	C/T	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	6195823	G/C	0	25	0	25	11.928240440903	0	11.928240440903	G	G		10	0.522870382363879	1.00414864088972e-07	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	10385913	A/G	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	10394046	G/A	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	13695498	G/A	1	7	13	20	3.33990732345285	6.79731497073043	-3.45740764727758	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.177899741067494	ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	17610536	G/A	1	26	14	40	12.4053700585391	7.32018535309431	5.08518470544484	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.115530211655240	ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17610468_17610606:RRBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	17950545	A/T	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17950444_17950773:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377704:exon_17950444_17951013:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17950503_17950773:C20orf72
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	18296473	C/T	1	12	4	16	5.72555541163345	2.09148152945552	3.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0816984207649677	ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	18297193	T/C	1	14	11	25	6.67981464690569	5.75157420600267	0.928240440903026	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.84195256213668	ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	18506558	T/C	1	21	16	37	10.0197219703585	8.36592611782206	1.65379585253648	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.624628738532786	ENSG00000101310:ENST00000450074:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18506432_18506576:SEC23B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	18523019	G/A	1	55	35	90	26.2421289699867	18.3004633827358	7.9416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.112992359075507	ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18523012_18523046:SEC23B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	18574445	G/A	1	56	44	100	26.7192585876228	23.0062968240107	3.7129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.484475093708993	ENSG00000125821:ENST00000377452:exon_18574375_18574465:DTD1;ENSG00000125821:ENST00000494921:exon_18574375_18574465:DTD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	21209746	C/A	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.612954984241467	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	24950874	T/C	1	19	17	36	9.0654627350863	8.88879650018594	0.176666234900358	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24950833_24951007:C20orf3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	24994289	C/T	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	24994614	C/T	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994597_24994709:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994597_24994703:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994597_24994709:ACSS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	25288632	G/A	1	29	25	54	13.8367589114475	13.071759559097	0.764999352350538	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.892071253797457	ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	30381758	G/C	1	61	56	117	29.1049066758034	29.2807414123772	-0.175834736573837	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	30659537	C/T	1	26	10	36	12.4053700585391	5.22870382363879	7.17666623490036	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0188489599506940	ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000470092:exon_30659465_30660392:HCK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	30785350	G/A	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000126003:ENST00000246229:exon_30780306_30785485:PLAGL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	30818753	G/A	1	6	8	14	2.86277770581673	4.18296305891103	-1.32018535309431	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.59563947353559	ENSG00000101346:ENST00000375749:exon_30818622_30818864:POFUT1;ENSG00000101346:ENST00000486717:exon_30818622_30818864:POFUT1;ENSG00000101346:ENST00000465791:exon_30818622_30819139:POFUT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	31024274	T/C	1	42	37	79	20.0394439407171	19.3462041474635	0.693239793253564	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.91066402909478	ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	31025163	A/G	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	31291841	G/A	1	26	25	51	12.4053700585391	13.071759559097	-0.666389500557825	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.889116033610246	ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31291825_31291873:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31291825_31291873:COMMD7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	34091675	G/A	1	11	17	28	5.24842579399733	8.88879650018594	-3.64037070618861	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.188314219398843	ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	34096816	G/A	1	11	6	17	5.24842579399733	3.13722229418327	2.11120349981406	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.340952760955587	ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34096772_34096873:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34096772_34096873:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34096772_34096873:CEP250
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	34144746	A/G	1	366	356	722	174.62944005482	186.141856121541	-11.5124160667206	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.391822429052112	ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	34843689	C/T	1	12	17	29	5.72555541163345	8.88879650018594	-3.16324108855249	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.267839709779781	ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34843500_34844855:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34843500_34844855:C20orf4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	37396120	A/G	1	2	11	13	0.954259235272242	5.75157420600267	-4.79731497073043	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0100423055089113	ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37396107_37396239:ACTR5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	39750353	A/G	1	24	41	65	11.4511108232669	21.437685676919	-9.98657485365213	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0176294441162477	ENSG00000198900:ENST00000361337:exon_39750336_39750430:TOP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	42320881	C/T	1	40	31	71	19.0851847054448	16.2089818532802	2.8762028521646	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.553042392455799	ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42320797_42320959:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42320797_42320959:MYBL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	42680175	T/C	1	42	31	73	20.0394439407171	16.2089818532802	3.83046208743684	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.412761690847929	ENSG00000124191:ENST00000341197:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000442881:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000423191:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372992:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372999:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000358131:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000348077:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000421416:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000435864:exon_42679946_42680185:TOX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	42825929	C/T	1	71	45	116	33.8762028521646	23.5291672063746	10.34703564579	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0626743642403852	ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	42826350	A/C	1	49	25	74	23.3793512641699	13.071759559097	10.307591705073	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0194217843908316	ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	43132545	G/A	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000132824:ENST00000411544:exon_43132456_43132636:SERINC3;ENSG00000132824:ENST00000255175:exon_43132456_43132636:SERINC3;ENSG00000132824:ENST00000342374:exon_43132456_43132636:SERINC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	43530216	C/T	1	66	69	135	31.490554763984	36.0780563831077	-4.58750161912366	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.439263897988899	ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	43572217	T/C	1	30	39	69	14.3138885290836	20.3919449121913	-6.07805638310765	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.149633576929920	ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	43629135	G/A	1	14	5	19	6.67981464690569	2.61435191181939	4.0654627350863	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0687759392848526	ENSG00000101109:ENST00000372806:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000396731:exon_43629033_43629161:STK4;ENSG00000101109:ENST00000372801:exon_43629033_43629161:STK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	44420637	G/A	0	14	0	14	6.67981464690569	0	6.67981464690569	G	G		10	0.522870382363879	0.000145849744844502	ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	44420682	T/C	1	12	11	23	5.72555541163345	5.75157420600267	-0.0260187943692163	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	44574459	C/T	1	14	10	24	6.67981464690569	5.22870382363879	1.45111082326691	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.683821947854935	ENSG00000100982:ENST00000372409:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000443130:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000479348:exon_44574350_44574522:PCIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	44578674	T/A	1	9	16	25	4.29416655872509	8.36592611782206	-4.07175955909697	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.112558414985489	ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578605_44578708:ZNF335
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	44578991	G/A	1	17	8	25	8.11120349981406	4.18296305891103	3.92824044090303	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.159965839946729	ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578858_44579012:ZNF335
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	44747004	T/G	1	45	30	75	21.4708327936254	15.6861114709164	5.78472132270908	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.203859027645407	ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44746987_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44746990_44747033:CD40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	46270989	T/C	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46270957_46271128:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46270957_46271128:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46270957_46271128:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46270957_46271128:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46270957_46271128:NCOA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	47253196	G/A	1	18	33	51	8.58833311745018	17.254722618008	-8.66638950055783	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0168616761471821	ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	47741041	C/T	1	11	24	35	5.24842579399733	12.5488891767331	-7.30046338273576	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0168737560729441	ENSG00000124214:ENST00000396163:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000433926:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371828:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000340954:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371856:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000360426:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000347458:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371805:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371802:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371792:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371830:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000437404:exon_47740912_47741142:STAU1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	47868135	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47868064_47868159:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47868064_47868159:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47868064_47868159:ZNFX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	48522330	G/A	1	13	5	18	6.20268502926957	2.61435191181939	3.58833311745018	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.102475160424192	ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	48522585	G/A	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	49508320	T/C	1	24	26	50	11.4511108232669	13.5946299414609	-2.14351911819395	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.573370737944223	ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	49508881	T/C	1	4	12	16	1.90851847054448	6.27444458836655	-4.36592611782206	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0423121013377122	ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	54961541	A/T	1	19	18	37	9.0654627350863	9.41166688254982	-0.346204147463521	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000420474:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000422322:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000456249:exon_54961313_54961589:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000451915:exon_54961393_54961589:AURKA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	56185209	G/A	1	11	30	41	5.24842579399733	15.6861114709164	-10.437685676919	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00144429047984573	ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	56185241	C/T	1	9	25	34	4.29416655872509	13.071759559097	-8.77759300037188	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00303700205867370	ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	56188385	T/C	1	30	11	41	14.3138885290836	5.75157420600267	8.56231432308096	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00758591191699338	ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56188219_56188386:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56187947_56188386:ZBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	56227532	T/C	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000124225:ENST00000341744:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000347215:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395816:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395821:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000265626:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395814:exon_56227093_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000414037:exon_56227264_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395819:exon_56227463_56227654:PMEPA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	57269495	G/A	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57269478_57269648:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000533788:exon_57269477_57269648:NPEPL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	57478807	C/T	1	394	339	733	187.989069348632	177.253059621355	10.7360097272767	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.437594351041058	ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	57484241	C/T	1	639	604	1243	304.885825669481	315.813710947783	-10.9278852783016	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.55101766901968	ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57484217_57484243:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000479025:exon_57483971_57484271:GNAS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	58519926	G/A	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000196227:ENST00000358293:exon_58518995_58523735:C20orf177;ENSG00000196227:ENST00000360816:exon_58518995_58523735:C20orf177;ENSG00000196227:ENST00000469084:exon_58519451_58520055:C20orf177
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	60713311	G/A	1	337	318	655	160.792681143373	166.272781591714	-5.48010044834072	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.667279268486028	ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61428568	C/T	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000101189:ENST00000370487:exon_61428462_61428583:C20orf20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61472039	C/T	1	22	10	32	10.4968515879947	5.22870382363879	5.26814776435587	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0761276910981834	ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61472073	C/A	0	40	0	40	19.0851847054448	0	19.0851847054448	C	C		10	0.522870382363879	5.58182270515427e-12	ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61472093	G/A	1	15	29	44	7.15694426454182	15.1632410885525	-8.00629682401067	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0224808235053412	ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61542374	G/A	1	18	17	35	8.58833311745018	8.88879650018594	-0.300463382735762	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61542126_61542966:DIDO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61828083	G/A	1	26	27	53	12.4053700585391	14.1175003238247	-1.71213026528558	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.681164767530241	ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61826781_61828086:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61826781_61828086:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370334:exon_61827719_61828086:YTHDF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61834169	G/A	1	14	11	25	6.67981464690569	5.75157420600267	0.928240440903026	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.84195256213668	ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000342761:exon_61834146_61834508:YTHDF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61869826	C/T	1	41	7	48	19.562314323081	3.66009267654715	15.9022216465338	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.78853502707982e-06	ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000395306:exon_61869554_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000426135:exon_61869560_61869829:BIRC7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61870727	G/C	1	14	25	39	6.67981464690569	13.071759559097	-6.39194491219128	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0531533446568484	ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61870710_61870962:BIRC7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61907859	G/A	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000101199:ENST00000523114:exon_61907832_61907899:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522959:exon_61907832_61908094:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370283:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000353546:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370275:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519604:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520485:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000524192:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519531:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518601:exon_61907832_61908003:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000522403:exon_61907832_61908003:ARFGAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	61918977	G/A	1	17	14	31	8.11120349981406	7.32018535309431	0.791018146719753	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.858174971305446	ENSG00000101199:ENST00000370283:exon_61918916_61921142:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000353546:exon_61918916_61921142:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370275:exon_61918916_61921142:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000523460:exon_61918916_61919196:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519604:exon_61918916_61919289:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520485:exon_61918916_61919544:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519273:exon_61918916_61920848:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000395285:exon_61918916_61919225:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519526:exon_61918916_61919094:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518794:exon_61918916_61921140:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000468975:exon_61918916_61921145:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518618:exon_61918916_61919586:ARFGAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	62191937	G/A	1	16	7	23	7.63407388217794	3.66009267654715	3.97398120563078	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.142382367953593	ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	62201829	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000130589:ENST00000479540:exon_62201479_62201964:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370082:exon_62201492_62201964:RP4-697K14.7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	20	62571827	C/T	1	35	34	69	16.6995366172642	17.7775930003719	-1.07805638310765	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.810606353176866	ENSG00000198276:ENST00000354216:exon_62571731_62571838:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369892:exon_62571731_62571838:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369908:exon_62571731_62571838:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000358711:exon_62571731_62571838:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000430743:exon_62571731_62571838:UCKL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	15858321	C/T	1	23	32	55	10.9739812056308	16.7318522356441	-5.75787103001334	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.137679060243114	ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15857549_15858435:SAMSN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	15889304	C/G	1	13	14	27	6.20268502926957	7.32018535309431	-1.11750032382473	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.703474017247423	ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15889213_15889362:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15889213_15889362:SAMSN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	17205826	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000155313:ENST00000285681:exon_17205667_17205867:USP25;ENSG00000155313:ENST00000285679:exon_17205667_17205867:USP25;ENSG00000155313:ENST00000400183:exon_17205667_17205867:USP25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	34721527	G/A	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34721397_34721596:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34721397_34721596:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34721397_34721596:IFNAR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	34903085	C/T	1	12	13	25	5.72555541163345	6.79731497073043	-1.07175955909697	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.693496363330912	ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000366093:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000466882:exon_34903065_34903588:GART;ENSG00000159131:ENST00000497313:exon_34903016_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000430874:exon_34903065_34903190:GART
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	34903131	C/T	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000366093:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000466882:exon_34903065_34903588:GART;ENSG00000159131:ENST00000497313:exon_34903016_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000430874:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000426819:exon_34903093_34903190:GART
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	34904697	G/C	1	10	15	25	4.77129617636121	7.84305573545818	-3.07175955909697	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.235452306649387	ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000366093:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000497313:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000430874:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000426819:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000476524:exon_34904651_34904762:GART;ENSG00000159131:ENST00000488791:exon_34904079_34904762:GART
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	34921942	A/G	1	188	202	390	89.7003681155908	105.619817237504	-15.9194491219128	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.115987456207618	ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34921782_34923769:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34921782_34923595:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	34924243	T/C	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	34926260	C/T	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	34945721	T/C	1	6	15	21	2.86277770581673	7.84305573545818	-4.98027802964146	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0466412463418783	ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	35757787	C/T	1	24	36	60	11.4511108232669	18.8233337650996	-7.37222294183274	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0696677308709229	ENSG00000205670:ENST00000481710:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399292:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000489469:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000495363:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000474455:exon_35757776_35758931:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399295:exon_35757776_35757942:FAM165B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	36042462	G/A	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	G	G		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36041688_36043061:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36041688_36043061:CLIC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	36042492	A/G	1	11	1	12	5.24842579399733	0.522870382363879	4.72555541163345	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00695977522690581	ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36041688_36043061:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36041688_36043061:CLIC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	36042749	T/C	1	25	21	46	11.928240440903	10.9802780296415	0.947962411261569	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.882900587401606	ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36041688_36043061:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36041688_36043061:CLIC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	36081794	G/T	1	11	27	38	5.24842579399733	14.1175003238247	-8.8690745298274	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.00511954165971093	ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36081655_36081836:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36081655_36081836:CLIC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	36088670	A/G	1	13	4	17	6.20268502926957	2.09148152945552	4.11120349981406	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0530050628667056	ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36088619_36090525:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36088619_36090525:CLIC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	37445012	C/A	1	66	66	132	31.490554763984	34.509445236016	-3.01889047203202	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.602458124113326	ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	38438006	T/C	1	27	40	67	12.8824996761753	20.9148152945552	-8.03231561837989	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0511162420580498	ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	38568308	C/T	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	40555351	G/C	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40555178_40555777:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40555178_40555414:PSMG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	42749081	T/C	1	13	19	32	6.20268502926957	9.9345372649137	-3.73185223564413	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.216723130875606	ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000436410:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000435611:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000418103:exon_42748763_42749082:MX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	42778676	G/A	1	29	26	55	13.8367589114475	13.5946299414609	0.242128969986659	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000481838:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000398632:exon_42778671_42778925:MX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	42821113	T/C	1	399	315	714	190.374717436812	164.704170444622	25.6705469921904	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.056048788197733	ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	42824661	A/G	1	488	545	1033	232.839253406427	284.964358388314	-52.125104981887	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00119312319792218	ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	43796722	G/A	1	2	11	13	0.954259235272242	5.75157420600267	-4.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0100423055089113	ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43796650_43796792:TMPRSS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	43979131	G/A	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43979068_43979199:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43979068_43979199:SLC37A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	44273858	G/A	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44273679_44273862:WDR4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	44323461	G/A	1	21	15	36	10.0197219703585	7.84305573545818	2.17666623490036	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.507866907513101	ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	45096206	G/A	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	45560126	C/T	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.162919183691695	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	45655435	G/A	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45655155_45655445:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45655155_45655445:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45655155_45655445:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45655155_45655445:ICOSLG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	45733867	A/T	1	71	74	145	33.8762028521646	38.692408294927	-4.81620544276245	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.45462795215818	ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45733796_45733904:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45733796_45733904:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45733796_45733904:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45733796_45736222:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45733796_45733904:PFKL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	45739281	C/T	1	81	71	152	38.6474990285258	37.1237971478354	1.5237018806904	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.80826304235874	ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45739234_45740030:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000474114:exon_45739234_45741758:PFKL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	45742848	C/T	1	137	101	238	65.3667576161486	52.8099086187518	12.5568489973968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.105141729561897	ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000474114:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000498841:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000460020:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000467315:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000460521:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000495274:exon_45742845_45742932:PFKL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	45750168	A/G	1	62	46	108	29.5820362934395	24.0520375887384	5.52999870470107	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.29138387438797	ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	45750713	C/T	1	27	45	72	12.8824996761753	23.5291672063746	-10.6466675301993	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0130445361349121	ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45750706_45750802:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45750706_45750802:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45750706_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45750346_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45750706_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45750346_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45750706_45750802:C21orf2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	47581423	C/T	1	32	64	96	15.2681477643559	33.4637044712883	-18.1955567069324	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000208843836574341	ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	47635178	G/C	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.370794847578149	ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635094_47635212:LSS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	47635627	C/G	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	47635653	C/T	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	21	47685268	C/T	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685235_47685437:MCM3AP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	17589209	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	17589246	G/A	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	17630486	C/A	1	16	23	39	7.63407388217794	12.0260187943692	-4.39194491219128	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.199325997989638	ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	17690409	G/A	1	11	3	14	5.24842579399733	1.56861114709164	3.67981464690569	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0609596309432481	ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	18075417	G/A	1	91	94	185	43.418795204887	49.1498159422046	-5.7310207373176	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.418568604318579	ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18074902_18075502:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18074935_18075502:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18075175_18075502:ATP6V1E1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	18077334	G/A	1	81	77	158	38.6474990285258	40.2610194420187	-1.61352041349287	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.811571615307853	ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000473248:exon_18077295_18078058:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18077305_18077382:ATP6V1E1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	18111431	T/C	1	25	26	51	11.928240440903	13.5946299414609	-1.66638950055783	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.675682622744877	ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	19951264	C/T	1	115	96	211	54.8699060281539	50.1955567069324	4.67434932122154	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.535664161613338	ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	20131055	C/T	1	6	11	17	2.86277770581673	5.75157420600267	-2.88879650018594	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.224343505781	ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000480335:exon_20130553_20131103:ZDHHC8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	20937482	G/A	1	31	38	69	14.7910181467198	19.8690745298274	-5.07805638310765	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.230174376919168	ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000478831:exon_20937400_20937514:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20936381_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000476187:exon_20937400_20937534:MED15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	21213380	C/T	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	21213416	A/G	1	19	18	37	9.0654627350863	9.41166688254982	-0.346204147463521	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	21998219	G/A	1	83	77	160	39.601758263798	40.2610194420187	-0.659261178220632	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.937033278953628	ENSG00000128228:ENST00000248958:exon_21998183_21998587:SDF2L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	22318671	G/A	1	12	1	13	5.72555541163345	0.522870382363879	5.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00382098144854475	ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	22550401	C/A	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	A:C:G	C	A	10	0.522870382363879	0.162919183691695	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	22677111	A/G	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	23631801	T/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	24108438	G/T	1	289	338	627	137.890459496839	176.730189238991	-38.8397297421521	T:C:G	G	T	10	0.522870382363879	0.00206054040477276	ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	24143206	A/G	1	72	65	137	34.3533324698007	33.9865748536521	0.36675761614859	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000099956:ENST00000417137:exon_24143131_24143322:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24143131_24143322:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24143131_24143268:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24143131_24143268:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000491967:exon_24143131_24143647:SMARCB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	24179132	G/A	1	25	32	57	11.928240440903	16.7318522356441	-4.8036117947411	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.233013733005956	ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	24837301	T/C	1	18	22	40	8.58833311745018	11.5031484120053	-2.91481529455516	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.429199059498376	ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	24921765	G/A	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000100024:ENST00000415388:exon_24921679_24922636:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000326010:exon_24921679_24922553:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000413389:exon_24921679_24922552:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000498140:exon_24921679_24924358:UPB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	24981990	G/A	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000178026:ENST00000318753:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000446942:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000491910:exon_24981603_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000404045:exon_24981617_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000460524:exon_24981630_24982379:C22orf36
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	26853905	C/A	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	26854441	G/A	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26854411_26854543:HPS4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	26859942	C/T	1	9	10	19	4.29416655872509	5.22870382363879	-0.9345372649137	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.819184206292418	ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	26884039	G/A	1	7	12	19	3.33990732345285	6.27444458836655	-2.9345372649137	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.250431561449006	ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	26895317	T/A	1	17	19	36	8.11120349981406	9.9345372649137	-1.82333376509964	A:T:C	T	A	10	0.522870382363879	0.617808462551922	ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	26895337	G/A	1	14	16	30	6.67981464690569	8.36592611782206	-1.68611147091637	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.58637220827639	ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	26895496	T/C	1	12	12	24	5.72555541163345	6.27444458836655	-0.548889176733095	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.841001758494376	ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000450493:exon_26895380_26895597:TFIP11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	26937087	C/A	1	20	36	56	9.54259235272242	18.8233337650996	-9.28074141237722	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0154987002427303	ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	29130458	T/C	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000183765:ENST00000416671:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000348295:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382578:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382565:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382566:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000328354:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000404276:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000405598:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382580:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433028:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000448511:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000417588:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433728:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000403642:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000402731:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000447421:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000439200:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000398017:exon_29130391_29130715:CHEK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	29630337	G/A	1	23	18	41	10.9739812056308	9.41166688254982	1.56231432308096	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.642997695404227	ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	29659960	C/T	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000496342:exon_29659824_29660390:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000414672:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000406335:exon_29659946_29660207:RHBDD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	29727866	C/T	1	38	29	67	18.1309254701726	15.1632410885525	2.96768438162011	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.541231972468407	ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	29755888	T/C	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	29886413	A/G	0	0	10	10	0	5.22870382363879	-5.22870382363879	G	A	G	10	0.522870382363879	0.000611453958002094	ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	30134381	C/T	1	38	18	56	18.1309254701726	9.41166688254982	8.71925858762278	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0224399172329020	ENSG00000100319:ENST00000344318:exon_30134319_30134430:ZMAT5;ENSG00000100319:ENST00000397781:exon_30134319_30134430:ZMAT5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	30200761	C/G	1	22	24	46	10.4968515879947	12.5488891767331	-2.05203758873843	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.558519211713761	ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30200627_30200813:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30200627_30200819:ASCC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	30221120	C/T	1	13	9	22	6.20268502926957	4.70583344127491	1.49685158799466	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.670537930867177	ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000431535:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495967:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000412689:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30221075_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000463203:exon_30221076_30221347:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495681:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000462454:exon_30221092_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000453160:exon_30221097_30221246:ASCC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	30688479	G/A	1	52	41	93	24.8107401170783	21.437685676919	3.37305444015926	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.53381754242861	ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30687979_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30687982_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30687997_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30687999_30688840:TBC1D10A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	30973025	G/A	1	77	90	167	36.7389805579813	47.0583344127491	-10.3193538547678	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.121193843796700	ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30972615_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30972615_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30972617_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30972619_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30972623_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30972652_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30972822_30973116:PES1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	30975861	C/T	1	121	117	238	57.7326837339706	61.1758347365738	-3.44315100260319	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.697120518750123	ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30975738_30975910:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30975738_30975922:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30975738_30975922:PES1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	30977058	G/A	1	57	40	97	27.1963882052589	20.9148152945552	6.28157291070374	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.222894004229460	ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30976999_30977088:PES1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	30987861	G/C	1	8	9	17	3.81703694108897	4.70583344127491	-0.888796500185942	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.809268533848644	ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	31019044	G/A	1	6	7	13	2.86277770581673	3.66009267654715	-0.797314970730426	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.783681414049234	ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31018955_31019283:TCN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	31971258	T/C	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476010:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000484806:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31971217_31971378:SFI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	32007153	G/A	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000466991:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000491973:exon_32007129_32007289:SFI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	32014365	C/T	1	30	53	83	14.3138885290836	27.7121302652856	-13.398241736202	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00401802107848723	ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32014300_32014537:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32014300_32014432:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32014300_32014572:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32014101_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32014300_32014534:SFI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	32014366	G/A	1	54	30	84	25.7649993523505	15.6861114709164	10.0788878814342	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0289604889222715	ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32014300_32014537:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32014300_32014432:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32014300_32014572:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32014101_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32014300_32014534:SFI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	32808060	G/A	1	12	18	30	5.72555541163345	9.41166688254982	-3.68611147091637	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.202767215651943	ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32808051_32808242:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000487704:exon_32808051_32808228:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000454663:exon_32808051_32808235:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000463455:exon_32808051_32808235:C22orf28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	32875190	G/A	1	46	25	71	21.9479624112616	13.071759559097	8.87620285216459	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0427319322377891	ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	32887150	C/T	1	84	56	140	40.0788878814342	29.2807414123772	10.7981464690569	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0754109082049535	ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	35742925	T/G	1	26	50	76	12.4053700585391	26.1435191181939	-13.7381490596548	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.00179272837357042	ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	35743124	G/C	1	23	38	61	10.9739812056308	19.8690745298274	-8.89509332419662	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0285713812180526	ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35743048_35743980:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35743048_35743985:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35743048_35743966:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35743048_35743952:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35743048_35743974:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35743048_35743976:TOM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	35815880	G/A	1	158	120	278	75.3864795865071	62.7444458836655	12.6420337028416	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.133586577017001	ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	35820198	G/A	1	350	94	444	166.995366172642	49.1498159422046	117.845550230438	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	6.81774877597094e-31	ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35820147_35820495:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35820147_35820494:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35820147_35820494:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35820147_35820470:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35820147_35820248:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35817311_35820494:MCM5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36537222	C/G	1	17	18	35	8.11120349981406	9.41166688254982	-1.30046338273576	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.736056008386851	ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36537893	A/G	1	18	11	29	8.58833311745018	5.75157420600267	2.83675891144751	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.353965848768906	ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36657740	G/A	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000439680:exon_36657642_36657745:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36657642_36657768:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36657642_36657768:APOL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36661536	C/A	1	15	37	52	7.15694426454182	19.3462041474635	-12.1892598829217	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.000750650138139117	ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36661566	G/A	1	16	29	45	7.63407388217794	15.1632410885525	-7.52916720637455	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0256474693469816	ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36661646	G/A	1	19	42	61	9.0654627350863	21.9605560592829	-12.8950933241966	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00117634739797213	ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36661842	G/A	1	19	33	52	9.0654627350863	17.254722618008	-8.18925988292171	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0259987650911656	ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36912630	A/G	1	385	400	785	183.694902789907	209.148152945552	-25.453250155645	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0739610737726208	ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	36922052	T/C	1	109	115	224	52.0071283223372	60.1300939718461	-8.12296564950888	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.285085015379101	ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	37271802	C/T	1	59	29	88	28.1506474405311	15.1632410885525	12.9874063519787	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00546948084027737	ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	37414468	T/G	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37414179_37415508:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000413912:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000438203:exon_37414402_37414794:TST
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	37414528	G/A	1	8	9	17	3.81703694108897	4.70583344127491	-0.888796500185942	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.809268533848644	ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37414179_37415508:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000413912:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000438203:exon_37414402_37414794:TST
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	37531436	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	37538508	G/A	1	2	8	10	0.954259235272242	4.18296305891103	-3.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0558208850126612	ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000453962:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000429622:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000461607:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000440958:exon_37538474_37538791:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445595:exon_37538490_37538552:IL2RB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	38035851	A/G	1	6	12	18	2.86277770581673	6.27444458836655	-3.41166688254982	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.155279829553550	ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38035057_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38035482_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38035684_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38035684_38035853:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38035700_38035853:SH3BP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	38051999	C/T	1	53	51	104	25.2878697347144	26.6663895005578	-1.37851976584341	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.844506153110461	ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	39138489	G/A	1	24	18	42	11.4511108232669	9.41166688254982	2.03944394071709	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.541604845172358	ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000464202:exon_39138306_39138583:SUN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	39381840	C/T	1	25	1	26	11.928240440903	0.522870382363879	11.4053700585391	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.30875940154479e-06	ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000335760:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39381817_39382096:APOBEC3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	39421655	G/A	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000243811:ENST00000216099:exon_39421562_39421676:APOBEC3D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	39448336	C/T	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448079_39448358:APOBEC3F
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	39498025	A/G	1	2	9	11	0.954259235272242	4.70583344127491	-3.75157420600267	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0318932346368143	ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	39498038	G/C	1	12	3	15	5.72555541163345	1.56861114709164	4.15694426454182	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0379568177349634	ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	40804923	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40804798_40805376:SGSM3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	40805011	C/T	1	65	83	148	31.0134251463479	43.398241736202	-12.3848165898541	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0479607153082405	ENSG00000100359:ENST00000248929:exon_40804937_40805022:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000454798:exon_40804937_40805022:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000485962:exon_40804937_40805022:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40804798_40805376:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000470518:exon_40804937_40805120:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000427834:exon_40804937_40805022:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000469719:exon_40804937_40805376:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000462457:exon_40804937_40805376:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000417424:exon_40804937_40805022:SGSM3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	41175065	T/C	1	15	11	26	7.15694426454182	5.75157420600267	1.40537005853915	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.695710599168677	ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000402844:exon_41175013_41176198:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000447566:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000430221:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000427084:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000458600:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000443810:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000412879:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000426396:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434193:exon_41175038_41175129:SLC25A17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	41616778	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000449635:exon_41616738_41616872:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41616738_41616872:L3MBTL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	41623324	G/T	1	26	18	44	12.4053700585391	9.41166688254982	2.99370317598933	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.450910952260058	ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41623093_41623327:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41623093_41623814:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41623093_41623873:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41623093_41623327:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41623093_41623873:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41623093_41623327:L3MBTL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	41864658	A/T	1	10	19	29	4.77129617636121	9.9345372649137	-5.16324108855249	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.0632900681634697	ENSG00000100410:ENST00000216252:exon_41864606_41864729:PHF5A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	41980567	C/T	1	30	10	40	14.3138885290836	5.22870382363879	9.08518470544484	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00406504593989301	ENSG00000100417:ENST00000216259:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000482178:exon_41980531_41981406:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000472620:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000485648:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000466645:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000478337:exon_41980010_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000414636:exon_41980531_41980607:PMM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	42072818	C/T	1	78	3	81	37.2161101756174	1.56861114709164	35.6474990285258	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.44782376204747e-18	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	42341308	A/G	1	90	93	183	42.9416655872509	48.6269455598407	-5.68527997258985	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.416167860685239	ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	42456271	T/G	1	34	34	68	16.2224069996281	17.7775930003719	-1.55518600074377	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.717428658951858	ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42454358_42456417:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42455800_42456417:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42455806_42456417:NAGA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	42486765	C/T	1	10	18	28	4.77129617636121	9.41166688254982	-4.64037070618861	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0897937435418933	ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	42912029	G/T	1	66	61	127	31.490554763984	31.8950933241966	-0.404538560212625	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43032742	C/T	1	56	53	109	26.7192585876228	27.7121302652856	-0.992871677662805	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.848679294539442	ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43032721_43032825:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43032721_43032896:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000466276:exon_43032721_43032852:CYB5R3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43203137	C/T	1	19	16	35	9.0654627350863	8.36592611782206	0.699536617264236	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.86672942677478	ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43203080_43203169:ARFGAP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43289473	G/A	1	19	26	45	9.0654627350863	13.5946299414609	-4.52916720637455	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.182745458776982	ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43289463_43289560:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000453643:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000418133:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000422336:exon_43289463_43289619:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000445706:exon_43289463_43289619:PACSIN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43435812	C/T	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43455531	C/T	1	12	6	18	5.72555541163345	3.13722229418327	2.58833311745018	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.246737118314006	ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43455390_43455533:TTLL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43459846	G/A	0	11	0	11	5.24842579399733	0	5.24842579399733	G	G		10	0.522870382363879	0.00109035227886462	ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43459819_43459927:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43459819_43459927:TTLL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43558972	G/A	1	331	339	670	157.929903437556	177.253059621355	-19.3231561837989	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.141645056600904	ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43568451	C/A	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	43568512	C/T	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	44359246	A/G	1	10	15	25	4.77129617636121	7.84305573545818	-3.07175955909697	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.235452306649387	ENSG00000100344:ENST00000406117:exon_44359166_44359276:PNPLA3;ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44359166_44359276:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44359166_44359276:SAMM50
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	44379822	T/C	1	74	50	124	35.307591705073	26.1435191181939	9.16407258687901	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.105899306256795	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	44489896	T/C	1	116	97	213	55.34703564579	50.7184270892963	4.62860855649379	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.537709689649547	ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	44514941	C/T	1	109	123	232	52.0071283223372	64.3130570307571	-12.3059287084199	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.114638091117602	ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44514918_44515020:PARVB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	44514995	C/T	1	191	163	354	91.1317569684991	85.2278723253123	5.90388464318686	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.5584662261792	ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44514918_44515020:PARVB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	44602229	A/C	1	190	224	414	90.654627350863	117.122965649509	-26.4683382986459	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0104318696994109	ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44602197_44602535:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44602197_44603034:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44602197_44602515:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44602197_44602502:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44602197_44602308:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44602197_44603038:PARVG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	46641077	T/C	1	2	10	12	0.954259235272242	5.22870382363879	-4.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0179928301605514	ENSG00000205643:ENST00000404583:exon_46639908_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000314567:exon_46639910_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000381037:exon_46639918_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000444576:exon_46639919_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000404744:exon_46639948_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000475605:exon_46640520_46641135:C22orf40;ENSG00000205643:ENST00000474256:exon_46640806_46641135:C22orf40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	46704243	C/T	1	16	8	24	7.63407388217794	4.18296305891103	3.45111082326691	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.219577374631183	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	46704337	C/T	1	8	13	21	3.81703694108897	6.79731497073043	-2.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.27445798442317	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	46704676	A/G	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	46709881	G/A	1	4	10	14	1.90851847054448	5.22870382363879	-3.32018535309431	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.106707830503916	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46709787_46709910:GTSE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	46719100	C/G	1	17	13	30	8.11120349981406	6.79731497073043	1.31388852908363	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.716174646304455	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46719087_46719159:GTSE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	46722414	C/G	1	17	14	31	8.11120349981406	7.32018535309431	0.791018146719753	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.858174971305446	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	47189630	C/T	1	23	29	52	10.9739812056308	15.1632410885525	-4.18925988292171	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.268209748542072	ENSG00000054611:ENST00000337137:exon_47189398_47189738:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000380995:exon_47189398_47189738:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000407381:exon_47189398_47189738:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000355704:exon_47189398_47189738:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000394449:exon_47189398_47189738:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000472791:exon_47189398_47189672:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000441162:exon_47189398_47189738:TBC1D22A;ENSG00000054611:ENST00000406733:exon_47189398_47189738:TBC1D22A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50301476	T/C	1	7	10	17	3.33990732345285	5.22870382363879	-1.88879650018594	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.468009294351122	ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50301369_50301592:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50301369_50301566:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50301369_50301592:ALG12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50303663	G/A	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50303542_50303736:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50303542_50303736:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50303542_50303736:ALG12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50307315	C/T	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50307252_50307491:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50307252_50307491:ALG12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50313438	T/C	1	26	8	34	12.4053700585391	4.18296305891103	8.22240699962812	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00536167124862156	ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50315363	C/A	1	39	14	53	18.6080550878087	7.32018535309431	11.2878697347144	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.00218928949526992	ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000498354:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000462253:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50315232_50315409:CRELD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50356302	C/T	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	C	C		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50686501	A/T	1	23	31	54	10.9739812056308	16.2089818532802	-5.23500064764946	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.173600500177575	ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496235:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000471375:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000475965:exon_50685567_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000476310:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470378:exon_50686337_50686721:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50686319_50686574:MAPK12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50696678	G/A	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50704661	T/C	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50716068	C/T	1	46	39	85	21.9479624112616	20.3919449121913	1.55601749907029	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.746091338795097	ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50716167	G/A	1	48	27	75	22.9022216465338	14.1175003238247	8.78472132270908	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0489431131350741	ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50876662	T/G	1	40	12	52	19.0851847054448	6.27444458836655	12.8107401170783	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.000406404492802242	ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50876603_50876727:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50876603_50876727:PPP6R2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50877166	G/C	1	27	33	60	12.8824996761753	17.254722618008	-4.37222294183274	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.301359682148721	ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50892962	G/A	1	28	13	41	13.3596292938114	6.79731497073043	6.56231432308096	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0426601378392108	ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50892941_50893171:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50892941_50893171:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50892941_50893171:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50892941_50893135:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50892941_50893171:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50892941_50893171:SBF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50942121	C/T	1	17	19	36	8.11120349981406	9.9345372649137	-1.82333376509964	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.617808462551922	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50943004	C/A	1	15	11	26	7.15694426454182	5.75157420600267	1.40537005853915	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.695710599168677	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50943010	G/A	1	14	10	24	6.67981464690569	5.22870382363879	1.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.683821947854935	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50943232	G/A	1	15	17	32	7.15694426454182	8.88879650018594	-1.73185223564413	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.597599372848838	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	50962208	T/G	1	144	127	271	68.7066649396014	66.4045385602126	2.30212637938881	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.807943382127512	ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	51063610	C/T	1	24	17	41	11.4511108232669	8.88879650018594	2.56231432308096	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.439398616078477	ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51063450_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51063456_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51063457_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51063461_51063892:ARSA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	22	51065600	G/A	1	26	22	48	12.4053700585391	11.5031484120053	0.90222164653381	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.885381060616772	ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51065594_51065834:ARSA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	5021403	C/T	1	31	54	85	14.7910181467198	28.2350006476495	-13.4439825009297	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00447705397833657	ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5020801_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000457655:exon_5021097_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5021122_5021483:BHLHE40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	5024771	T/C	1	80	64	144	38.1703694108897	33.4637044712883	4.70666493960143	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.453506161100809	ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	5164135	G/C	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000134108:ENST00000256496:exon_5163905_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000429403:exon_5163934_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000455168:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000444332:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000438743:exon_5164112_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000419534:exon_5163981_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000451374:exon_5163982_5164273:ARL8B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	9515133	A/G	1	16	12	28	7.63407388217794	6.27444458836655	1.35962929381139	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.70643464471406	ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000399686:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000486465:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000492939:exon_9514920_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000459941:exon_9515079_9515221:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000479538:exon_9515107_9515221:SETD5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	9796510	G/C	1	16	7	23	7.63407388217794	3.66009267654715	3.97398120563078	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.142382367953593	ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302036:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000457221:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000349503:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000359753:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000449570:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000302008:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000441094:exon_9796388_9796569:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000352937:exon_9796388_9796569:OGG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	9798768	C/T	1	18	17	35	8.58833311745018	8.88879650018594	-0.300463382735762	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	9876919	G/A	1	31	21	52	14.7910181467198	10.9802780296415	3.81074011707829	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.332015807024319	ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9876778_9877016:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	9934605	T/C	1	52	53	105	24.8107401170783	27.7121302652856	-2.90139014820729	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.62547295050391	ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	9934912	G/A	1	62	64	126	29.5820362934395	33.4637044712883	-3.88166817784875	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.532683861229658	ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	10067794	A/G	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.567981193465519	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	10119782	A/G	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10119765_10119881:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10119765_10119881:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10119765_10119881:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10119765_10119881:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10119765_10119881:FANCD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	10138069	T/G	1	20	12	32	9.54259235272242	6.27444458836655	3.26814776435587	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.290043986277668	ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	11596302	T/C	1	39	31	70	18.6080550878087	16.2089818532802	2.39907323452848	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.632690630139651	ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	11596348	C/T	1	33	39	72	15.745277381992	20.3919449121913	-4.64666753019928	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.289809556542295	ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	11606411	T/C	1	9	16	25	4.29416655872509	8.36592611782206	-4.07175955909697	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.112558414985489	ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000451674:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424529:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11606240_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11606322_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11606326_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11606366_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11606389_11606493:VGLL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	11684957	C/T	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	12475557	C/T	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000132170:ENST00000397010:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000309576:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397015:exon_12475397_12475810:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397012:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397026:exon_12475397_12475838:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397000:exon_12475397_12475715:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000287820:exon_12475397_12475855:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397023:exon_12475397_12475843:PPARG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	12877704	G/A	1	1076	6736	7812	513.391468576466	3522.05489560309	-3008.66342702662	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	4.94065645841247e-324	ENSG00000144713:ENST00000429711:exon_12875984_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12876445_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000273223:exon_12877546_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12877549_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12877559_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12877601_12877722:RPL32
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	13379400	C/T	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13379337_13379417:NUP210
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	14180706	C/T	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14180680_14180797:TMEM43
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	14193889	C/T	1	20	21	41	9.54259235272242	10.9802780296415	-1.43768567691904	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.754994372586768	ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14193835_14193916:XPC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	14223074	C/T	1	41	36	77	19.562314323081	18.8233337650996	0.738980557981321	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.909459747198013	ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14223060_14223170:LSM3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	14712473	G/A	1	33	40	73	15.745277381992	20.9148152945552	-5.16953791256316	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.242449181202012	ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	15609448	C/A	1	15	4	19	7.15694426454182	2.09148152945552	5.0654627350863	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0215503033329652	ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15609351_15609509:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000435217:exon_15609351_15609509:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15609351_15609509:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15609351_15609509:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15609351_15609509:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15609351_15609509:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15609351_15609509:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15609351_15609509:HACL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	15624436	C/T	1	8	14	22	3.81703694108897	7.32018535309431	-3.50314841200534	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.142018758895041	ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000421993:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000414979:exon_15624385_15624496:HACL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	16364954	C/T	1	74	71	145	35.307591705073	37.1237971478354	-1.81620544276245	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.803226484007562	ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	16419309	C/T	1	75	40	115	35.7847213227091	20.9148152945552	14.8699060281539	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00654042056666998	ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16419225_16419609:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16419225_16419609:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000451036:exon_16419226_16419609:RFTN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	17053499	A/G	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	20025234	A/G	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_20025200_20026667:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_20025200_20025639:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_20025200_20025942:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_20025200_20026402:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000473608:exon_20025200_20025613:RAB5A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	20216519	T/A	1	13	9	22	6.20268502926957	4.70583344127491	1.49685158799466	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.670537930867177	ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	23934772	G/A	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	25792611	C/A	1	13	13	26	6.20268502926957	6.79731497073043	-0.594629941460852	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.846528826360866	ENSG00000151092:ENST00000428257:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000422724:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000280700:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000493324:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000396649:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000308710:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000280699:exon_25792589_25792754:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000417874:exon_25792589_25792754:NGLY1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	25833320	A/G	1	14	6	20	6.67981464690569	3.13722229418327	3.54259235272242	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.122889322650138	ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25832481_25833488:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000448177:exon_25833261_25833488:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000449808:exon_25833261_25833332:OXSM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	25835983	T/C	0	0	11	11	0	5.75157420600267	-5.75157420600267	C	T	C	10	0.522870382363879	0.000291742793183632	ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25835583_25836025:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000448177:exon_25835583_25836014:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000420173:exon_25835583_25836025:OXSM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	27424710	T/C	1	11	1	12	5.24842579399733	0.522870382363879	4.72555541163345	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00695977522690581	ENSG00000033867:ENST00000419036:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000465487:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27424644_27424741:SLC4A7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	31666442	C/T	1	15	20	35	7.15694426454182	10.4574076472776	-3.30046338273576	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.310917875200232	ENSG00000163527:ENST00000295770:exon_31666406_31666577:STT3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	32571147	G/A	1	26	20	46	12.4053700585391	10.4574076472776	1.94796241126157	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.658472863997072	ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000432458:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000472985:exon_32571122_32571152:DYNC1LI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	33174156	T/G	1	23	18	41	10.9739812056308	9.41166688254982	1.56231432308096	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.642997695404227	ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	33174168	G/A	1	23	12	35	10.9739812056308	6.27444458836655	4.69953661726424	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.128651956980397	ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	33840298	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33839557_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33839844_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000435909:exon_33840103_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000430877:exon_33840113_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000413073:exon_33840115_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000477798:exon_33840122_33840429:PDCD6IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	33877706	C/T	0	0	14	14	0	7.32018535309431	-7.32018535309431	T	C	T	10	0.522870382363879	3.16890532870891e-05	ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	36872587	C/T	1	5	13	18	2.38564808818061	6.79731497073043	-4.41166688254982	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0562174762259916	ENSG00000168016:ENST00000428977:exon_36872364_36875410:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000429976:exon_36872364_36875410:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000301807:exon_36872364_36875410:TRANK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	36873229	C/T	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000168016:ENST00000428977:exon_36872364_36875410:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000429976:exon_36872364_36875410:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000301807:exon_36872364_36875410:TRANK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	37396643	C/G	1	10	12	22	4.77129617636121	6.27444458836655	-1.50314841200534	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.531359102425708	ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37396592_37396678:GOLGA4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	39139657	C/T	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	39184959	C/T	1	17	21	38	8.11120349981406	10.9802780296415	-2.8690745298274	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.417502504736714	ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	39449137	T/C	1	92	30	122	43.8959248225231	15.6861114709164	28.2098133516068	T:C	T	C	10	0.522870382363879	2.37049831669169e-07	ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	41275350	C/T	1	83	84	167	39.601758263798	43.9211121185658	-4.31935385476778	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.535701904675695	ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41275020_41275358:CTNNB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	42265099	A/G	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	42679160	T/C	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	42679497	C/T	1	16	5	21	7.63407388217794	2.61435191181939	5.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0298755460554367	ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	42679737	C/G	1	14	20	34	6.67981464690569	10.4574076472776	-3.77759300037188	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.230189912021864	ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	42680199	A/G	1	26	13	39	12.4053700585391	6.79731497073043	5.60805508780872	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.078869362586214	ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	42680634	C/G	1	12	6	18	5.72555541163345	3.13722229418327	2.58833311745018	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.246737118314006	ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	44856499	A/G	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000481166:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44856403_44856568:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44856463_44856568:KIF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	44867592	C/G	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000481166:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44867531_44867681:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44867531_44867681:KIF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	44882586	C/G	1	15	12	27	7.15694426454182	6.27444458836655	0.882499676175268	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.847915973483971	ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44882566_44882730:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44882566_44882730:KIF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	44884647	C/A	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	44893288	A/C	1	19	15	34	9.0654627350863	7.84305573545818	1.22240699962811	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.733249089636175	ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44893279_44893444:KIF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	46966953	C/T	1	109	107	216	52.0071283223372	55.947130912935	-3.94000259059785	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.633618285040794	ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_46966410_46967025:CCDC12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	46982510	C/T	1	76	66	142	36.2618509403452	34.509445236016	1.75240570432918	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.801333695327379	ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000460035:exon_46982105_46982555:CCDC12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47018214	T/C	1	29	14	43	13.8367589114475	7.32018535309431	6.51657355835321	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0482852807157964	ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_47018127_47018238:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_47018127_47018249:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_47018127_47018235:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000460035:exon_47018127_47018247:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000492819:exon_47017497_47018270:CCDC12
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47045739	C/G	1	13	13	26	6.20268502926957	6.79731497073043	-0.594629941460852	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.846528826360866	ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47125385	G/A	1	13	20	33	6.20268502926957	10.4574076472776	-4.254722618008	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.163741571847472	ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47449058	T/C	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448995_47449074:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448995_47449074:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448995_47449074:PTPN23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47452786	G/A	1	8	9	17	3.81703694108897	4.70583344127491	-0.888796500185942	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.809268533848644	ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47454399	G/A	1	60	33	93	28.6277770581673	17.254722618008	11.3730544401593	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0219116726188941	ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47555095	A/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000163832:ENST00000296149:exon_47555027_47555251:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000442215:exon_47555027_47555199:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000450051:exon_47555027_47555199:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000327410:exon_47555027_47555199:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000444949:exon_47555027_47555199:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000494161:exon_47555027_47555192:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000485029:exon_47555027_47555199:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000483205:exon_47555027_47555201:C3orf75
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47891226	C/T	1	70	89	159	33.3990732345285	46.5354640303852	-13.1363907958568	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0390164482410004	ENSG00000132153:ENST00000445061:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000395745:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000348968:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000446256:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000443212:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000457607:exon_47891120_47891259:DHX30
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	47956424	C/T	1	17	22	39	8.11120349981406	11.5031484120053	-3.39194491219128	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.336473791826544	ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	48474359	G/A	1	17	11	28	8.11120349981406	5.75157420600267	2.35962929381139	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.450663887484502	ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	48508585	C/T	1	157	157	314	74.909349968871	82.090650031129	-7.181300062258	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.429317191175594	ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	48508592	G/A	1	165	162	327	78.72638690996	84.7050019429484	-5.97861503298842	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.542629317793178	ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	48509036	T/C	1	35	34	69	16.6995366172642	17.7775930003719	-1.07805638310765	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.810606353176866	ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	48664473	C/T	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000225697:ENST00000420764:exon_48664309_48664485:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000489483:exon_48664309_48665974:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000395550:exon_48664309_48664488:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000383733:exon_48664309_48664505:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000307364:exon_48664309_48664505:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000337000:exon_48664309_48664485:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000480524:exon_48664309_48664488:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000455886:exon_48664309_48664488:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000358747:exon_48664309_48664488:SLC26A6;ENSG00000225697:ENST00000466257:exon_48664327_48664485:SLC26A6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	48727112	G/A	1	38	46	84	18.1309254701726	24.0520375887384	-5.92111211856583	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.229420026963238	ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	49052422	G/A	1	68	67	135	32.4448139992562	35.0323156183799	-2.58750161912366	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.667491299083842	ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49052258_49052791:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49052258_49052858:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49052258_49053022:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49052258_49052798:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49052258_49052780:WDR6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	49151428	C/T	1	25	10	35	11.928240440903	5.22870382363879	6.69953661726424	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0271075991304383	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49151425_49151526:USP19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	49154326	G/A	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000306026:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000464931:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000479073:exon_49154167_49154376:USP19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	49721432	C/T	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	49721532	G/A	1	13	21	34	6.20268502926957	10.9802780296415	-4.77759300037188	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.122095912167528	ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	49848072	T/G	1	22	38	60	10.4968515879947	19.8690745298274	-9.37222294183274	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0193234759235044	ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49847950_49848105:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000460516:exon_49847893_49848105:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000460703:exon_49847959_49848105:UBA7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	49946812	G/A	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000455683:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000486107:exon_49946308_49948317:MON1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	50005749	G/A	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50004903_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50004631_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50004631_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000425608:exon_50004903_50006181:RBM6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	50325697	C/T	1	39	21	60	18.6080550878087	10.9802780296415	7.62777705816726	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0527126220596687	ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50325163_50325702:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50325165_50325702:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50325174_50325702:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50325174_50325702:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50325188_50325702:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50325372_50325702:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50325562_50325935:IFRD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	50609624	T/G	1	6	14	20	2.86277770581673	7.32018535309431	-4.45740764727758	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0706835394284982	ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	51430207	G/A	1	17	7	24	8.11120349981406	3.66009267654715	4.45111082326691	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.100175630412175	ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	51430657	A/C	1	44	36	80	20.9937031759893	18.8233337650996	2.17036941088968	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.655643892355536	ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	51737852	C/T	1	71	72	143	33.8762028521646	37.6466675301993	-3.77046467803468	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.558278657934051	ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	51737965	G/A	1	58	51	109	27.673517822895	26.6663895005578	1.00712832233719	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.923671815124085	ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	51737995	T/C	1	77	46	123	36.7389805579813	24.0520375887384	12.6869429692429	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0238455495296114	ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52011906	T/G	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000248487:ENST00000497864:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000494478:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000360889:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000452452:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000273596:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000474575:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000491470:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000114786:ENST00000486081:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52012000	C/G	1	9	1	10	4.29416655872509	0.522870382363879	3.77129617636121	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0227769616190771	ENSG00000248487:ENST00000497864:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000494478:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000360889:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000452452:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000273596:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000474575:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000491470:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000114786:ENST00000486081:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000458031:exon_52011963_52012098:RP11-155D18.11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52237970	C/T	1	42	24	66	20.0394439407171	12.5488891767331	7.49055476398399	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0837289033025202	ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52245522	C/T	1	82	68	150	39.1246286461619	35.5551860007438	3.56944264541816	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.568416102314016	ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000493402:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000459884:exon_52245468_52245567:ALAS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52257585	G/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52257891	G/T	1	12	6	18	5.72555541163345	3.13722229418327	2.58833311745018	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.246737118314006	ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52526532	G/T	1	20	28	48	9.54259235272242	14.6403707061886	-5.09777835346619	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.150378489856867	ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52525888_52527084:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000433196:exon_52525888_52527087:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52525888_52527087:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52525888_52527084:NISCH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52563199	A/T	1	23	24	47	10.9739812056308	12.5488891767331	-1.57490797110231	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.663982653073631	ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000489316:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000471522:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000487779:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000490681:exon_52563166_52563350:NT5DC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52720080	A/C	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52727257	G/A	1	180	143	323	85.8833311745018	74.7704646780347	11.1128664964671	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.220820634658869	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52727736	A/G	1	266	243	509	126.916478291208	127.057502914423	-0.141024623214392	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727648_52727795:GNL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	52874446	C/T	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	53125922	T/C	1	79	59	138	37.6932397932536	30.8493525594689	6.8438872337847	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.268085251197408	ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	53222761	C/T	1	84	72	156	40.0788878814342	37.6466675301993	2.43222035123489	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.748661420868305	ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	53223927	C/G	1	133	105	238	63.4582391456041	54.9013901482073	8.55684899739681	A:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.270787148055953	ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53223889_53224017:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53223889_53224017:PRKCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	53224002	T/C	1	146	155	301	69.6609241748737	81.0449092664012	-11.3839850915276	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.204258801387937	ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53223889_53224017:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53223889_53224017:PRKCD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	53321631	A/C	1	29	32	61	13.8367589114475	16.7318522356441	-2.89509332419662	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.522058458946054	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	53853041	C/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53852965_53853067:CHDH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	53914093	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53913966_53914136:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53913966_53914099:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000498740:exon_53913966_53914136:ACTR8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	56658871	T/C	1	4	10	14	1.90851847054448	5.22870382363879	-3.32018535309431	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.106707830503916	ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	58394712	T/C	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000459676:exon_58394651_58394728:PXK;ENSG00000168297:ENST00000495557:exon_58394706_58394728:PXK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	58410554	C/T	1	11	2	13	5.24842579399733	1.04574076472776	4.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0242231410078916	ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	58416535	C/T	1	42	26	68	20.0394439407171	13.5946299414609	6.44481399925623	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.144678761608473	ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	63982082	G/A	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	66419956	C/T	1	42	26	68	20.0394439407171	13.5946299414609	6.44481399925623	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.144678761608473	ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	66433676	A/G	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66433406_66433825:LRIG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	81698130	T/C	1	9	2	11	4.29416655872509	1.04574076472776	3.24842579399733	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0684680229761391	ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	87295049	T/C	1	17	14	31	8.11120349981406	7.32018535309431	0.791018146719753	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.858174971305446	ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87294864_87295058:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87294864_87295058:CHMP2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	98250986	C/T	1	78	64	142	37.2161101756174	33.4637044712883	3.75240570432919	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.557053919705074	ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	98304467	T/C	1	6	11	17	2.86277770581673	5.75157420600267	-2.88879650018594	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.224343505781	ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	100084432	G/A	1	13	20	33	6.20268502926957	10.4574076472776	-4.254722618008	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.163741571847472	ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	100287764	T/C	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000181458:ENST00000323523:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000403410:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000485260:exon_100287666_100287811:TMEM45A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	101177848	T/G	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000138468:ENST00000394095:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394094:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000314261:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394091:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000358203:exon_101177799_101177896:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000348610:exon_101177799_101177896:SENP7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	105389119	T/C	1	8	13	21	3.81703694108897	6.79731497073043	-2.98027802964146	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.27445798442317	ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	112063850	C/A	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112063809_112064135:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112063809_112064135:CD200
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	112066562	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	112188609	T/G	1	55	46	101	26.2421289699867	24.0520375887384	2.19009138124823	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.691153401951068	ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000496584:exon_112188603_112188651:BTLA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	119134391	C/T	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	119236104	G/A	1	73	61	134	34.8304620874368	31.8950933241966	2.93536876324022	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.665654390899046	ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000493694:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000486418:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000466984:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119236052_119236162:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000498399:exon_119236052_119236162:C3orf1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	119255986	G/A	1	26	18	44	12.4053700585391	9.41166688254982	2.99370317598933	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.450910952260058	ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119255984_119256265:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119255984_119256265:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119255984_119256265:CD80
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	119263680	C/T	1	28	31	59	13.3596292938114	16.2089818532802	-2.84935255946886	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.515235356150455	ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	119336962	G/A	1	13	10	23	6.20268502926957	5.22870382363879	0.973981205630785	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.835286047198067	ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119336866_119337033:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119336866_119337033:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119336866_119337033:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119336866_119337033:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119336866_119337033:PLA1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	121361787	G/A	1	246	182	428	117.373885938486	95.162409590226	22.2114763482598	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0331916595659654	ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	121563355	T/C	1	44	45	89	20.9937031759893	23.5291672063746	-2.53546403038523	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.597594341387554	ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000451944:exon_121563300_121563394:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000490477:exon_121563300_121563394:EAF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	122145810	T/A	1	13	25	38	6.20268502926957	13.071759559097	-6.8690745298274	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.0335541135462109	ENSG00000114030:ENST00000344337:exon_122140796_122146019:KPNA1;ENSG00000114030:ENST00000470904:exon_122144527_122146019:KPNA1;ENSG00000114030:ENST00000466923:exon_122144951_122146019:KPNA1;ENSG00000114030:ENST00000485027:exon_122145801_122146019:KPNA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	122259606	T/C	1	19	41	60	9.0654627350863	21.437685676919	-12.3722229418327	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00170395660652537	ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	122259640	T/C	1	18	38	56	8.58833311745018	19.8690745298274	-11.2807414123772	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00297152377475808	ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	122351055	G/A	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	G	G		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122350933_122351066:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122350933_122351066:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122350933_122351066:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122350933_122351066:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122350933_122351066:PARP15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	122354037	A/G	1	28	13	41	13.3596292938114	6.79731497073043	6.56231432308096	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0426601378392108	ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	122354714	G/A	1	19	28	47	9.0654627350863	14.6403707061886	-5.57490797110231	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.109930710329276	ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	122459477	A/G	1	3	13	16	1.43138885290836	6.79731497073043	-5.36592611782206	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0100956219995669	ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	122864436	G/A	1	27	14	41	12.8824996761753	7.32018535309431	5.56231432308096	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.087196746339736	ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	123633820	T/C	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123632572_123633979:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	124952034	A/G	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000496732:exon_124951953_124952125:ZNF148
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	125648343	G/A	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	126676271	G/A	1	35	24	59	16.6995366172642	12.5488891767331	4.15064744053114	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.299249468855206	ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126676259_126676676:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126676259_126676776:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126676268_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504084:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504973:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000510044:exon_126676259_126676394:CHCHD6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	127323830	C/T	1	13	17	30	6.20268502926957	8.88879650018594	-2.68611147091637	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.363873653248518	ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	127340583	C/T	1	84	73	157	40.0788878814342	38.1695379125632	1.90934996887101	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.81070400495181	ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127340506_127341276:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127340506_127340672:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127340506_127340672:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127340506_127340950:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468414:exon_127340506_127340619:MCM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	127399503	G/A	1	30	29	59	14.3138885290836	15.1632410885525	-0.849352559468858	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.896510843758925	ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127399362_127399664:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127399112_127399762:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127399112_127399760:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127399112_127399763:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127399112_127399763:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127399112_127399756:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127399112_127399754:ABTB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	128356852	C/T	1	50	51	101	23.8564808818061	26.6663895005578	-2.80990861875177	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.618873052283604	ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	128890350	G/A	1	122	103	225	58.2098133516068	53.8556493834795	4.35416396812724	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.593604762875678	ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	128976396	T/C	1	43	44	87	20.5165735583532	23.0062968240107	-2.48972326565747	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.5938152997976	ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	129034758	A/G	1	34	78	112	16.2224069996281	40.7838898243826	-24.5614828247544	A:G	A	G	10	0.522870382363879	4.00689309587889e-06	ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	130672769	G/A	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000017260:ENST00000504381:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000505330:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000507488:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000510168:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000508532:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513801:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504948:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000328560:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000533801:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000428331:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000393221:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000422190:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000359644:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000347421:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000504612:exon_130672665_130672820:ATP2C1;ENSG00000017260:ENST00000513636:exon_130672683_130672820:ATP2C1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	133329943	G/A	1	13	19	32	6.20268502926957	9.9345372649137	-3.73185223564413	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.216723130875606	ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	133524717	G/C	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	136019925	C/G	1	23	12	35	10.9739812056308	6.27444458836655	4.69953661726424	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.128651956980397	ENSG00000114054:ENST00000251654:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000490504:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000483687:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000468777:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000462637:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000466072:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000484181:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000482086:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000471595:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000469217:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000474833:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000475214:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000473073:exon_136019872_136019953:PCCB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	138347957	G/A	1	5	10	15	2.38564808818061	5.22870382363879	-2.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.195978503056267	ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	138347988	T/C	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	141464146	G/A	1	139	96	235	66.3210168514208	50.1955567069324	16.1254601444884	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0366374923768264	ENSG00000114125:ENST00000273480:exon_141464001_141466402:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000480908:exon_141464001_141464542:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000393000:exon_141464001_141464544:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477012:exon_141464001_141464511:RNF7;ENSG00000114125:ENST00000477393:exon_141464001_141464359:RNF7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	145788467	T/C	1	10	3	13	4.77129617636121	1.56861114709164	3.20268502926957	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0966692698681595	ENSG00000152952:ENST00000282903:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000461497:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000360060:exon_145787231_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000494950:exon_145787968_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000495700:exon_145788028_145788659:PLOD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	146234853	C/T	1	30	22	52	14.3138885290836	11.5031484120053	2.81074011707829	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.488717321749596	ENSG00000188313:ENST00000342435:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000493432:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448205:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000463777:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000487389:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000468985:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448787:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000488253:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000489775:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000483300:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000484560:exon_146234810_146235181:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000478267:exon_146234690_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000470496:exon_146234799_146234954:PLSCR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	148714662	A/T	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148714529_148714691:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148714529_148714691:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148714529_148714691:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000431995:exon_148714529_148714679:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000483267:exon_148714529_148714679:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148714529_148714691:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000492285:exon_148714529_148714679:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148714529_148714679:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148714618_148714691:GYG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	150460138	G/T	1	53	49	102	25.2878697347144	25.6206487358301	-0.332779001115654	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000181788:ENST00000312960:exon_150458914_150460485:SIAH2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	156877707	A/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000163660:ENST00000461804:exon_156877581_156878549:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000295926:exon_156877581_156878002:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000475298:exon_156877581_156877944:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000470121:exon_156877581_156877883:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000476367:exon_156877581_156877899:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000477127:exon_156877581_156877967:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000417607:exon_156877581_156878482:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000479596:exon_156877581_156877924:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000465947:exon_156877581_156877925:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000295925:exon_156877581_156878482:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000471044:exon_156877581_156877947:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000466101:exon_156877581_156877926:CCNL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	158386791	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000079257:ENST00000482640:exon_158386785_158386921:LXN;ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158386785_158386921:LXN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	158388780	T/C	1	5	19	24	2.38564808818061	9.9345372649137	-7.54888917673309	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00325405796983754	ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	158409262	C/T	1	16	15	31	7.63407388217794	7.84305573545818	-0.208981853280248	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	160137183	C/T	1	109	74	183	52.0071283223372	38.692408294927	13.3147200274102	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0541426162176248	ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160137146_160137331:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160137146_160137331:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160137146_160137331:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469858:exon_160137146_160137331:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160137146_160137331:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160137146_160137331:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462668:exon_160137146_160137331:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000484799:exon_160137146_160137290:SMC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	167728054	C/T	1	12	7	19	5.72555541163345	3.66009267654715	2.0654627350863	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.368874796178996	ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167726465_167728206:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167728023_167728206:GOLIM4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	167728092	C/T	1	6	15	21	2.86277770581673	7.84305573545818	-4.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0466412463418783	ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167726465_167728206:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167728023_167728206:GOLIM4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	167728202	T/A	1	7	17	24	3.33990732345285	8.88879650018594	-5.54888917673309	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.0251889445298707	ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167726465_167728206:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167728023_167728206:GOLIM4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	170811667	G/A	1	11	12	23	5.24842579399733	6.27444458836655	-1.02601879436922	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.682551462444228	ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170811628_170811757:TNIK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	170843782	C/A	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170843701_170843940:TNIK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	170893070	G/A	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	171320907	C/T	1	13	1	14	6.20268502926957	0.522870382363879	5.6798146469057	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00209046197359406	ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171318195_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171318616_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171318620_171321092:PLD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	171321023	C/T	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171318195_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171318616_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171318620_171321092:PLD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	171338237	T/G	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000467432:exon_171338176_171338310:PLD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	172224303	A/G	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	174951756	T/C	1	7	10	17	3.33990732345285	5.22870382363879	-1.88879650018594	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.468009294351122	ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	179051922	C/T	1	9	7	16	4.29416655872509	3.66009267654715	0.634073882177937	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.806882383309564	ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	179066687	G/A	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000171109:ENST00000471841:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000280653:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000357390:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000467174:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000263969:exon_179066549_179066751:MFN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	179298999	C/T	1	28	18	46	13.3596292938114	9.41166688254982	3.94796241126157	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.301573255723197	ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	180327984	A/G	1	11	14	25	5.24842579399733	7.32018535309431	-2.07175955909697	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.429970268760073	ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180327418_180328766:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	180693935	G/T	1	186	176	362	88.7461088803185	92.0251872960427	-3.27907841572419	A:T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.752344552497118	ENSG00000114416:ENST00000357559:exon_180693910_180694950:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392639:exon_180693910_180694950:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000305586:exon_180693910_180694943:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000475315:exon_180693910_180694367:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392637:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445400:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000491062:exon_180693910_180694206:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000468861:exon_180693910_180694333:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445140:exon_180693910_180694943:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000472339:exon_180693910_180694341:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000480918:exon_180693910_180694166:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000454764:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000482125:exon_180693910_180694070:FXR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	182853670	T/C	1	25	15	40	11.928240440903	7.84305573545818	4.08518470544484	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.20898953163402	ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	183858328	C/G	1	35	24	59	16.6995366172642	12.5488891767331	4.15064744053114	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.299249468855206	ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183858206_183858518:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183858206_183858518:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183858206_183858518:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183858206_183858518:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000479833:exon_183858206_183858403:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000493740:exon_183858206_183858696:EIF2B5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	183861243	A/G	1	60	55	115	28.6277770581673	28.7578710300133	-0.13009397184608	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	183899832	C/T	1	185	165	350	88.2689792626824	86.27361309004	1.99536617264236	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.872497458997282	ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000432591:exon_183899700_183899842:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000476434:exon_183899700_183899868:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000463935:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000480260:exon_183899407_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000442686:exon_183899803_183899835:AP2M1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	183904031	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	183976108	T/C	1	12	14	26	5.72555541163345	7.32018535309431	-1.59462994146085	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.561163460149987	ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	184049766	C/T	1	135	110	245	64.4124983808763	57.5157420600267	6.89675632084966	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.40584701380957	ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000478291:exon_184049516_184049893:EIF4G1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	184429411	A/C	1	14	11	25	6.67981464690569	5.75157420600267	0.928240440903026	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.84195256213668	ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	185635457	A/G	1	47	33	80	22.4250920288977	17.254722618008	5.17036941088968	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.264335130721448	ENSG00000136527:ENST00000453386:exon_185633694_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000492417:exon_185634532_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000463328:exon_185634537_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000259043:exon_185634943_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000414862:exon_185635116_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000487615:exon_185635117_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000466832:exon_185635117_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000392502:exon_185635117_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000448735:exon_185635117_185635513:TRA2B;ENSG00000136527:ENST00000456380:exon_185635118_185635513:TRA2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	186509517	G/A	1	71	28	99	33.8762028521646	14.6403707061886	19.235832145976	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.000110125396366847	ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	187088812	C/T	1	12	18	30	5.72555541163345	9.41166688254982	-3.68611147091637	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.202767215651943	ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	187088903	C/A	1	26	22	48	12.4053700585391	11.5031484120053	0.90222164653381	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.885381060616772	ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	187088926	G/A	1	26	21	47	12.4053700585391	10.9802780296415	1.42509202889769	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.770719312648759	ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	189713100	G/A	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189713079_189713231:LEPREL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	193364872	A/C	1	7	10	17	3.33990732345285	5.22870382363879	-1.88879650018594	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.468009294351122	ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000483516:exon_193364854_193364969:OPA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	194337901	T/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000145014:ENST00000392432:exon_194337828_194337998:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000273580:exon_194337828_194337998:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000347147:exon_194337828_194337998:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000477651:exon_194337828_194338374:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000381975:exon_194337828_194337998:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000392431:exon_194337828_194337998:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000473092:exon_194337828_194337998:TMEM44;ENSG00000145014:ENST00000494894:exon_194337828_194337998:TMEM44
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	195594805	A/G	1	11	15	26	5.24842579399733	7.84305573545818	-2.59462994146085	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.332000236694704	ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	195595405	G/A	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195595404_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195595088_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195595094_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195595096_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195595227_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195595377_195595580:TNK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	195791240	C/T	1	14	3	17	6.67981464690569	1.56861114709164	5.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0142597358608358	ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195791180_195791299:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195791180_195791299:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195791180_195791299:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000464368:exon_195791180_195791299:TFRC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	196388621	C/T	1	98	76	174	46.7587025283399	39.7381490596548	7.02055346868506	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.289353344832162	ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	197401952	T/C	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	3	197579466	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	660382	C/T	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_660320_660403:PDE6B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	663836	A/G	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	871501	C/T	1	9	19	28	4.29416655872509	9.9345372649137	-5.64037070618861	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0374013011231895	ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_871403_871597:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_871403_871597:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_871403_871597:GAK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	882643	G/A	1	3	9	12	1.43138885290836	4.70583344127491	-3.27444458836655	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0812439974911473	ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504435:exon_879571_882758:GAK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	946226	T/C	1	6	13	19	2.86277770581673	6.79731497073043	-3.9345372649137	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.105598920841065	ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	952261	C/T	1	27	17	44	12.8824996761753	8.88879650018594	3.99370317598933	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.290708379087478	ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	1244803	A/G	1	6	4	10	2.86277770581673	2.09148152945552	0.771296176361211	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.756469908393313	ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	1330759	T/C	1	25	12	37	11.928240440903	6.27444458836655	5.65379585253648	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0706171908083418	ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	1389588	G/A	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000179979:ENST00000324803:exon_1388152_1389776:CRIPAK;ENSG00000179979:ENST00000382944:exon_1388967_1389640:CRIPAK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	1730215	C/G	1	119	88	207	56.7784244986984	46.0125936480214	10.7658308506771	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.144020441723433	ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	1730299	A/G	1	120	85	205	57.2555541163345	44.4439825009297	12.8115716154048	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.080330474869983	ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	1818594	C/T	1	27	26	53	12.8824996761753	13.5946299414609	-0.712130265285584	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.891086843710319	ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1818454_1818641:LETM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	1976712	C/T	1	25	21	46	11.928240440903	10.9802780296415	0.947962411261569	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.882900587401606	ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000482415:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382888:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000350915:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000515695:exon_1976514_1976731:WHSC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	2822467	G/T	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	2831383	T/G	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	2906707	G/T	1	42	37	79	20.0394439407171	19.3462041474635	0.693239793253564	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.91066402909478	ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	2916762	C/G	1	63	57	120	30.0591659110756	29.8036117947411	0.255554116334526	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	3222031	A/G	1	8	17	25	3.81703694108897	8.88879650018594	-5.07175955909697	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0464167301964124	ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3221909_3222035:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3221909_3222035:HTT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	3227419	A/G	1	23	12	35	10.9739812056308	6.27444458836655	4.69953661726424	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.128651956980397	ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	3514689	T/C	1	47	37	84	22.4250920288977	19.3462041474635	3.07888788143417	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.514432475461055	ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	3514695	A/G	1	49	38	87	23.3793512641699	19.8690745298274	3.51027673434253	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.519851545844287	ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	3526656	C/T	1	47	41	88	22.4250920288977	21.437685676919	0.987406351978652	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.915099724015334	ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	4440183	T/G	1	14	13	27	6.67981464690569	6.79731497073043	-0.117500323824731	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000503861:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512195:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000507908:exon_4440121_4440236:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512780:exon_4440166_4440236:STX18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	5830393	C/T	1	7	15	22	3.33990732345285	7.84305573545818	-4.50314841200534	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.085407955345524	ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000324989:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000397890:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000511535:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000512574:exon_5830216_5830395:CRMP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	7062894	C/T	1	56	83	139	26.7192585876228	43.398241736202	-16.6789831485792	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00497849688034805	ENSG00000109519:ENST00000264954:exon_7060633_7062935:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000429301:exon_7061782_7062935:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000504920:exon_7062256_7064193:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000509696:exon_7062415_7062935:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000514056:exon_7062865_7062935:GRPEL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	8394094	G/A	1	32	6	38	15.2681477643559	3.13722229418327	12.1309254701726	A:G	G	A	10	0.522870382363879	5.74123840550739e-05	ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000508302:exon_8394060_8394180:ACOX3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	10099340	T/C	1	82	76	158	39.1246286461619	39.7381490596548	-0.613520413492878	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.936663154224737	ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	13604117	T/G	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	17503382	C/T	1	14	9	23	6.67981464690569	4.70583344127491	1.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.532246706293347	ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	17586703	T/C	1	100	70	170	47.7129617636121	36.6009267654715	11.1120349981406	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0914850742184222	ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000509583:exon_17586595_17587079:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000508014:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17586595_17586759:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17586595_17586759:LAP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	22729262	G/C	0	279	0	279	133.119163320478	0	133.119163320478	G	G		10	0.522870382363879	3.18084477470003e-79	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	25419283	T/C	1	19	15	34	9.0654627350863	7.84305573545818	1.22240699962811	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.733249089636175	ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	37831634	A/G	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37831586_37831753:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37831586_37831753:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37831586_37831753:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37831586_37831753:PGM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	37847310	C/T	1	9	21	30	4.29416655872509	10.9802780296415	-6.68611147091637	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0168632025190011	ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37847254_37847351:PGM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	37851856	A/C	1	4	19	23	1.90851847054448	9.9345372649137	-8.02601879436922	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.00115302270510354	ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	38023279	G/C	1	2	8	10	0.954259235272242	4.18296305891103	-3.22870382363879	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0558208850126612	ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	38023294	G/A	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	38774755	C/A	1	67	82	149	31.9676843816201	42.8753713538381	-10.907686972218	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0847250535836206	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	38776491	T/G	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	38777173	A/T	1	16	16	32	7.63407388217794	8.36592611782206	-0.731852235644126	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.86041203391569	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	38777236	T/G	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	38798485	C/T	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	38995413	C/T	1	16	5	21	7.63407388217794	2.61435191181939	5.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0298755460554367	ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	56236226	C/G	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000128039:ENST00000264228:exon_56235999_56239263:SRD5A3;ENSG00000128039:ENST00000505210:exon_56235999_56236477:SRD5A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	56756531	T/C	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	57273840	C/G	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	57797100	G/T	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	57839419	A/G	1	18	3	21	8.58833311745018	1.56861114709164	7.01972197035854	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00183208891376017	ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57839314_57839519:C4orf14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	68374597	C/T	1	13	9	22	6.20268502926957	4.70583344127491	1.49685158799466	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.670537930867177	ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	68374626	C/T	1	7	13	20	3.33990732345285	6.79731497073043	-3.45740764727758	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.177899741067494	ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	68380215	G/A	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	69433714	C/T	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000197888:ENST00000317746:exon_69433479_69434245:UGT2B17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	73956736	G/A	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	73991006	T/C	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000514252:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000254802:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000411811:exon_73990918_73991029:ANKRD17
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	74451073	A/G	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74450897_74451081:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000335049:exon_74450897_74451081:RASSF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	75937971	C/T	1	16	2	18	7.63407388217794	1.04574076472776	6.58833311745018	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00157158363711235	ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	76722353	G/A	1	22	23	45	10.4968515879947	12.0260187943692	-1.52916720637455	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.657728038822936	ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	76877166	C/T	1	36	31	67	17.1766662349004	16.2089818532802	0.967684381620113	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.902792425235269	ENSG00000198301:ENST00000502543:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76877128_76877289:SDAD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	76878716	G/C	1	34	21	55	16.2224069996281	10.9802780296415	5.24212896998666	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.177667414227881	ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	77082799	G/C	1	9	17	26	4.29416655872509	8.88879650018594	-4.59462994146085	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0790310353455136	ENSG00000138760:ENST00000264896:exon_77079890_77082904:SCARB2;ENSG00000138760:ENST00000452464:exon_77082439_77082904:SCARB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	84191031	A/G	1	4	10	14	1.90851847054448	5.22870382363879	-3.32018535309431	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.106707830503916	ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	86921812	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000138639:ENST00000395184:exon_86921632_86923823:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000318116:exon_86921632_86921875:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000395183:exon_86921632_86922376:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000264343:exon_86921632_86923821:ARHGAP24
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	88293887	G/A	1	16	18	34	7.63407388217794	9.41166688254982	-1.77759300037188	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.608049526191679	ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507518:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000502576:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507286:exon_88293861_88293967:HSD17B11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	89198355	T/C	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000163644:ENST00000513546:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000508256:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000510548:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000511506:exon_89198295_89198719:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000506423:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000315194:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000514204:exon_89196297_89198395:PPM1K
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	103527655	G/A	1	17	10	27	8.11120349981406	5.22870382363879	2.88249967617527	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.336223488451435	ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103527653_103527854:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103527653_103527854:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103527653_103527854:NFKB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	103555992	A/G	1	24	28	52	11.4511108232669	14.6403707061886	-3.18925988292171	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.406673994559571	ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	103557077	G/A	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	104061993	C/G	1	26	19	45	12.4053700585391	9.9345372649137	2.47083279362545	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.551103683531036	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	104062223	C/T	1	11	9	20	5.24842579399733	4.70583344127491	0.542592352722421	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.82745485897146	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	104072514	T/C	1	17	23	40	8.11120349981406	12.0260187943692	-3.91481529455516	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.267794969957949	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104072376_104072534:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104072376_104072534:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104072376_104072534:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104072393_104072534:CENPE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	104082349	C/T	1	15	10	25	7.15694426454182	5.22870382363879	1.92824044090303	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.549274934579923	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	106395155	A/C	1	26	23	49	12.4053700585391	12.0260187943692	0.379351264169932	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106395051_106395171:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	106395156	G/T	1	26	23	49	12.4053700585391	12.0260187943692	0.379351264169932	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106395051_106395171:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	108575989	G/A	1	9	1	10	4.29416655872509	0.522870382363879	3.77129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0227769616190771	ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	108911051	T/C	1	17	19	36	8.11120349981406	9.9345372649137	-1.82333376509964	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.617808462551922	ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108910870_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108910912_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108910940_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000511742:exon_108911011_108911220:HADH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	108931039	T/C	1	75	73	148	35.7847213227091	38.1695379125632	-2.38481658985408	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.742202103029444	ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108930915_108931043:HADH
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	113352899	G/A	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	113353052	C/T	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	113353285	T/C	1	6	8	14	2.86277770581673	4.18296305891103	-1.32018535309431	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.59563947353559	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	113565835	G/A	1	112	87	199	53.4385171752456	45.4897232656575	7.94879390958809	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.287124488731946	ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000512589:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000508577:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000513553:exon_113565824_113565855:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505216:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000507443:exon_113565460_113566027:LARP7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	128807219	T/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	128814964	G/T	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	129012638	A/G	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	129880770	G/A	1	15	19	34	7.15694426454182	9.9345372649137	-2.77759300037189	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.392177937557364	ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	139964455	C/T	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	152638163	C/T	1	19	21	40	9.0654627350863	10.9802780296415	-1.91481529455516	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.635535426184754	ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152638028_152638226:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152638028_152638226:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515564:exon_152638028_152638226:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000512306:exon_152638028_152638226:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515490:exon_152638028_152638483:PET112L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	154276856	A/G	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000503967:exon_154276806_154276961:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000508731:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154276806_154276863:MND1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	154523749	G/A	1	13	18	31	6.20268502926957	9.41166688254982	-3.20898185328025	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.282888239737375	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154523694_154523879:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000497247:exon_154523694_154523879:KIAA0922
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	154524575	T/C	1	19	13	32	9.0654627350863	6.79731497073043	2.26814776435587	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.481365516472907	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524455_154524604:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524455_154524604:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524455_154524604:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524455_154524604:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524455_154524604:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524455_154524604:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000497247:exon_154524455_154524766:KIAA0922
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	154542905	A/G	1	83	46	129	39.601758263798	24.0520375887384	15.5497206750596	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00621060220341299	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154542835_154543001:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154542835_154543001:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154542835_154543001:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154542835_154543001:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154542835_154543001:KIAA0922
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	154542906	A/G	1	80	46	126	38.1703694108897	24.0520375887384	14.1183318221513	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0123937985268631	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154542835_154543001:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154542835_154543001:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154542835_154543001:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154542835_154543001:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154542835_154543001:KIAA0922
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	156721198	C/T	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000061918:ENST00000505154:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000502959:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000505764:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000507146:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000264424:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000503520:exon_156721029_156721226:GUCY1B3;ENSG00000061918:ENST00000513437:exon_156721029_156721226:GUCY1B3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	165118596	A/T	0	0	9	9	0	4.70583344127491	-4.70583344127491	T	A	T	10	0.522870382363879	0.00128152589024229	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	165118649	A/T	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	A	A		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	166000741	T/C	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_165997256_166000948:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_165999572_166000948:TMEM192
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	169158471	T/G	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169158437_169158578:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000507815:exon_169158437_169158639:DDX60
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	169928842	G/T	1	18	8	26	8.58833311745018	4.18296305891103	4.40537005853915	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.114835835280271	ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	170483300	C/T	1	13	12	25	6.20268502926957	6.27444458836655	-0.0717595590969733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000137601:ENST00000439128:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000379072:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000511633:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000510533:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000507142:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000512193:exon_170483288_170483347:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000509912:exon_170483288_170483347:NEK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	170674892	G/A	1	24	15	39	11.4511108232669	7.84305573545818	3.60805508780872	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.265605990318471	ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170674827_170674986:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170674827_170674986:C4orf27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	170678993	T/C	1	19	17	36	9.0654627350863	8.88879650018594	0.176666234900358	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	174253178	T/C	1	435	559	994	207.551383671713	292.284543741408	-84.7331600696957	T:C	T	C	10	0.522870382363879	7.604807416125e-08	ENSG00000164104:ENST00000296503:exon_174252846_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000446922:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000438704:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	174253422	T/A	1	3	10	13	1.43138885290836	5.22870382363879	-3.79731497073043	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.0492215241656784	ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	177243366	G/T	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177243321_177243396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177243321_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177241142_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000513139:exon_177243321_177243394:SPCS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	183815688	A/G	1	19	16	35	9.0654627350863	8.36592611782206	0.699536617264236	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.86672942677478	ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	183815748	C/G	1	19	21	40	9.0654627350863	10.9802780296415	-1.91481529455516	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.635535426184754	ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000514754:exon_183815707_183815758:DCTD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	185310218	C/T	1	66	69	135	31.490554763984	36.0780563831077	-4.58750161912366	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.439263897988899	ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	185634144	T/C	1	8	14	22	3.81703694108897	7.32018535309431	-3.50314841200534	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.142018758895041	ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	185637663	G/A	1	16	10	26	7.63407388217794	5.22870382363879	2.40537005853915	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.433369160576612	ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	185637699	A/G	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	185683627	C/T	1	10	12	22	4.77129617636121	6.27444458836655	-1.50314841200534	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.531359102425708	ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185683561_185683677:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185683561_185683647:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185683561_185683677:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185683561_185683647:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185683561_185683677:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185683561_185683677:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185683561_185683677:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185683561_185683677:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185683561_185683677:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185683561_185683677:ACSL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	186231836	A/G	1	38	24	62	18.1309254701726	12.5488891767331	5.5820362934395	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.163904033786529	ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000296779:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186231789_186231970:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000512853:exon_186231789_186231970:SNX25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	186244729	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000296779:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000512853:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186244682_186244954:SNX25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	186272616	A/C	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186272599_186272763:SNX25
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	186318414	T/G	1	223	182	405	106.399904732855	95.162409590226	11.237495142629	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.273969411999043	ENSG00000186352:ENST00000507479:exon_186318304_186318456:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186318304_186318456:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186318304_186318456:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511311:exon_186318304_186318861:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186318304_186318456:ANKRD37
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	187086562	C/A	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.273399026723903	ENSG00000109794:ENST00000503432:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000356371:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000450739:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000451202:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000515078:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000227065:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000389354:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000502970:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000514153:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000510843:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000512271:exon_187086498_187086618:FAM149A;ENSG00000109794:ENST00000514956:exon_187086562_187086618:FAM149A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	190862151	A/C	1	94	69	163	44.8501840577954	36.0780563831077	8.77212767468773	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.182680195631796	ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	4	190862155	T/G	1	68	86	154	32.4448139992562	44.9668528832936	-12.5220388840374	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0440279353273785	ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	205574	G/A	1	37	32	69	17.6537958525365	16.7318522356441	0.921943616892353	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.904220605076547	ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	226160	A/C	1	59	68	127	28.1506474405311	35.5551860007438	-7.40453856021263	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.213532749116374	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	228362	T/C	1	63	85	148	30.0591659110756	44.4439825009297	-14.3848165898541	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0209372756571786	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	233734	C/G	1	81	100	181	38.6474990285258	52.2870382363879	-13.6395392078621	A:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.044558450798754	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	235364	C/T	1	100	89	189	47.7129617636121	46.5354640303852	1.17749773322688	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.884406940902629	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_235259_235379:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_235259_235639:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_234536_236714:SDHA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	256472	G/A	1	245	202	447	116.89675632085	105.619817237504	11.2769390833461	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.297685908122482	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	434052	C/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_433968_434972:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000511487:exon_433968_434524:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	442933	G/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	453567	G/A	1	21	21	42	10.0197219703585	10.9802780296415	-0.960556059282915	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.877486638600646	ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	479905	A/C	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000066230:ENST00000507407:exon_479752_480080:SLC9A3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	865563	C/T	1	10	18	28	4.77129617636121	9.41166688254982	-4.64037070618861	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0897937435418933	ENSG00000028310:ENST00000497410:exon_865529_866616:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483234:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_865529_865691:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323547:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519112:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518250:exon_865529_865696:BRD9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	881238	G/A	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_881222_882660:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_881222_881297:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519838:exon_881222_881297:BRD9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	884059	G/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_883071_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000466684:exon_884053_884185:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489093:exon_884055_884185:BRD9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	886744	C/T	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_886707_886882:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_886707_886882:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_886707_886882:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000466684:exon_886707_886822:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000494422:exon_886707_886882:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489093:exon_886707_886882:BRD9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	887533	G/C	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000466684:exon_887476_887586:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489093:exon_887476_887586:BRD9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	1057615	A/G	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	6633779	C/G	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	7897319	G/A	1	4	7	11	1.90851847054448	3.66009267654715	-1.75157420600267	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.370794847578149	ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	10250430	G/A	1	9	7	16	4.29416655872509	3.66009267654715	0.634073882177937	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.806882383309564	ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	10250443	T/C	1	17	10	27	8.11120349981406	5.22870382363879	2.88249967617527	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.336223488451435	ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	10254817	A/G	1	92	85	177	43.8959248225231	44.4439825009297	-0.548057678406579	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.940173241817157	ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	10256161	T/C	1	89	95	184	42.4645359696148	49.6726863245685	-7.20815035495373	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.301910273885696	ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	10282396	A/G	1	12	14	26	5.72555541163345	7.32018535309431	-1.59462994146085	A:T:G	A	G	10	0.522870382363879	0.561163460149987	ENSG00000164237:ENST00000503834:exon_10282309_10282400:CMBL;ENSG00000164237:ENST00000296658:exon_10282309_10282400:CMBL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	32126441	G/A	1	21	19	40	10.0197219703585	9.9345372649137	0.085184705444842	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000113384:ENST00000265070:exon_32124810_32126742:GOLPH3;ENSG00000113384:ENST00000499354:exon_32124827_32126742:GOLPH3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	33462211	G/T	1	90	71	161	42.9416655872509	37.1237971478354	5.81786843941549	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.385782669226488	ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462204_33462308:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462204_33462308:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462204_33462308:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462204_33462308:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462204_33462308:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462204_33462308:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462204_33462308:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462204_33462308:TARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	37721219	T/C	1	14	21	35	6.67981464690569	10.9802780296415	-4.30046338273576	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.175897503034529	ENSG00000082068:ENST00000265107:exon_37721217_37721317:WDR70;ENSG00000082068:ENST00000511906:exon_37721217_37725152:WDR70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	39201957	G/C	0	10	0	10	4.77129617636121	0	4.77129617636121	G	G		10	0.522870382363879	0.00213881047429683	ENSG00000082074:ENST00000351578:exon_39201928_39203089:FYB;ENSG00000082074:ENST00000515010:exon_39201928_39203129:FYB;ENSG00000082074:ENST00000512982:exon_39201928_39203089:FYB;ENSG00000082074:ENST00000505428:exon_39201928_39203089:FYB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	43039593	G/A	1	13	22	35	6.20268502926957	11.5031484120053	-5.30046338273576	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.089917208580038	ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	43039793	T/C	1	15	14	29	7.15694426454182	7.32018535309431	-0.16324108855249	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	43556058	T/A	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000172239:ENST00000306846:exon_43555932_43556101:PAIP1;ENSG00000172239:ENST00000436644:exon_43555932_43556101:PAIP1;ENSG00000172239:ENST00000338972:exon_43555932_43556101:PAIP1;ENSG00000172239:ENST00000381546:exon_43555932_43556101:PAIP1;ENSG00000172239:ENST00000514514:exon_43555932_43556101:PAIP1;ENSG00000172239:ENST00000504639:exon_43555932_43556101:PAIP1;ENSG00000172239:ENST00000511321:exon_43555932_43556101:PAIP1;ENSG00000172239:ENST00000508537:exon_43555932_43556101:PAIP1;ENSG00000172239:ENST00000515338:exon_43555932_43556063:PAIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	43700242	A/G	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43700221_43700339:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43700221_43700339:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43700221_43700339:NNT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	54603822	T/C	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	54674296	A/G	1	13	4	17	6.20268502926957	2.09148152945552	4.11120349981406	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0530050628667056	ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54674142_54674314:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54674142_54674314:SKIV2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	56527090	A/G	1	36	42	78	17.1766662349004	21.9605560592829	-4.78388982438256	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.308156316788739	ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526925_56527148:GPBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	60241142	G/A	1	46	48	94	21.9479624112616	25.0977783534662	-3.14981594220462	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.536753343134155	ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	61688760	C/T	1	20	17	37	9.54259235272242	8.88879650018594	0.653795852536479	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.870508040497293	ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61688753_61688817:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61688753_61688817:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61688753_61688817:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61688639_61688817:DIMT1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	64020241	T/C	1	39	38	77	18.6080550878087	19.8690745298274	-1.26101944201868	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.819919717049148	ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	64097145	C/G	1	87	65	152	41.5102767343425	33.9865748536521	7.5237018806904	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.224577396214388	ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	64267595	T/C	1	49	61	110	23.3793512641699	31.8950933241966	-8.51574206002669	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.105715861639466	ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	65108215	A/G	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	65118738	C/T	1	9	11	20	4.29416655872509	5.75157420600267	-1.45740764727758	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.655558089529074	ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65118609_65119153:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65118609_65119156:NLN;ENSG00000123213:ENST00000515595:exon_65118609_65119065:NLN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	66478626	T/C	1	25	15	40	11.928240440903	7.84305573545818	4.08518470544484	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.20898953163402	ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	66478729	A/G	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	66479206	T/C	1	12	6	18	5.72555541163345	3.13722229418327	2.58833311745018	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.246737118314006	ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	68419054	A/T	1	5	14	19	2.38564808818061	7.32018535309431	-4.9345372649137	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.0359510330380218	ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	68425303	A/G	1	13	6	19	6.20268502926957	3.13722229418327	3.0654627350863	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.175490139559428	ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68425274_68426896:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68425274_68426892:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000511158:exon_68425274_68425953:SLC30A5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	68463014	G/T	1	36	44	80	17.1766662349004	23.0062968240107	-5.82963058911032	T:C:G	G	T	10	0.522870382363879	0.218320612564514	ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	68471247	G/A	1	79	75	154	37.6932397932536	39.2152786772909	-1.52203888403736	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.80937892137283	ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	70782445	A/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70782311_70782454:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70782311_70782454:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70782311_70782454:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70782311_70782454:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70782311_70782454:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70782311_70782454:BDP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	70806711	C/G	1	7	16	23	3.33990732345285	8.36592611782206	-5.02601879436922	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0384569686155362	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	70808068	A/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70808068_70808255:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70808068_70808255:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70808068_70808255:BDP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	71519664	C/T	1	34	21	55	16.2224069996281	10.9802780296415	5.24212896998666	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.177667414227881	ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	71521947	T/C	1	25	14	39	11.928240440903	7.32018535309431	4.60805508780872	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.15152770584947	ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71521884_71522063:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71521884_71522026:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71521920_71522026:MRPS27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	72798845	A/G	1	571	627	1198	272.441011670225	327.839729742152	-55.398718071927	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.00145603684867109	ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	74063154	C/G	1	49	93	142	23.3793512641699	48.6269455598407	-25.2475942956708	C:G	C	G	10	0.522870382363879	2.28679083570227e-05	ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	74069863	A/G	1	255	264	519	121.668052497211	138.037780944064	-16.3697284468532	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.159647742442723	ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	75469885	C/T	0	0	46	46	0	24.0520375887384	-24.0520375887384	T	C	T	10	0.522870382363879	1.649199895605e-15	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	76343999	T/C	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	76749694	C/T	1	25	11	36	11.928240440903	5.75157420600267	6.17666623490036	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0449565692058279	ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507452:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509892:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515321:exon_76749627_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000513417:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000514559:exon_76749642_76749735:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000503035:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511036:exon_76749642_76749753:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000504895:exon_76749691_76749753:WDR41
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	81549240	C/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	85913905	C/T	1	350	838	1188	166.995366172642	438.165380420931	-271.170014248288	T:C	C	T	10	0.522870382363879	5.23335188665202e-57	ENSG00000127184:ENST00000247655:exon_85913721_85913947:COX7C;ENSG00000127184:ENST00000509578:exon_85913773_85913947:COX7C;ENSG00000127184:ENST00000515763:exon_85913790_85913947:COX7C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	94856467	A/G	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94856420_94856522:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000507805:exon_94856420_94856522:TTC37
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	96121524	C/T	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	96124330	T/C	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	102345546	A/C	1	14	24	38	6.67981464690569	12.5488891767331	-5.8690745298274	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.0729091690237029	ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	108521932	C/T	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000151422:ENST00000281092:exon_108521901_108522023:FER;ENSG00000151422:ENST00000504143:exon_108521901_108522023:FER;ENSG00000151422:ENST00000438717:exon_108521901_108522023:FER;ENSG00000151422:ENST00000513777:exon_108521901_108522023:FER
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	110097362	G/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000447245:exon_110097147_110097964:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	111066697	T/C	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000134986:ENST00000379671:exon_111064509_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000257435:exon_111064993_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450857:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000447165:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000446294:exon_111065013_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000395634:exon_111065681_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000515855:exon_111066214_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000507742:exon_111066339_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509979:exon_111066355_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450761:exon_111066388_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000419114:exon_111066401_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509427:exon_111066421_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000453526:exon_111066444_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000455559:exon_111066503_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000508870:exon_111066565_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000513100:exon_111066629_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000504018:exon_111066651_111066743:C5orf13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	112197046	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000153037:ENST00000503445:exon_112196885_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000505459:exon_112196919_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000506997:exon_112196992_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000282999:exon_112197002_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000512790:exon_112197002_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000515463:exon_112197007_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000515755:exon_112197023_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000445150:exon_112197029_112197114:SRP19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	118582779	G/C	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118582690_118584822:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000505312:exon_118582690_118584833:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000514595:exon_118582690_118584815:DMXL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	118788244	G/C	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118788138_118788328:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000511186:exon_118788168_118788328:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118788192_118788328:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118788209_118788328:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118788233_118788328:HSD17B4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	118844846	T/C	1	24	24	48	11.4511108232669	12.5488891767331	-1.09777835346619	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.774267122644035	ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000520244:exon_118844836_118844939:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118844836_118844939:HSD17B4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	123976967	C/T	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000168916:ENST00000513985:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000395398:exon_123976945_123977098:ZNF608
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	126887569	G/A	1	12	18	30	5.72555541163345	9.41166688254982	-3.68611147091637	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.202767215651943	ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	130500842	A/G	1	896	882	1778	427.508137401964	461.171677244941	-33.6635398429768	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.111716223868694	ENSG00000169567:ENST00000304043:exon_130500788_130501178:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000511475:exon_130500788_130500933:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508495:exon_130500788_130500994:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513345:exon_130500753_130501026:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000504202:exon_130500753_130500913:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508488:exon_130500788_130501018:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506908:exon_130500788_130501034:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513012:exon_130500753_130500949:HINT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	132334252	A/G	1	2	11	13	0.954259235272242	5.75157420600267	-4.79731497073043	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0100423055089113	ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	133887780	G/A	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133887742_133887899:PHF15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	134223593	A/G	1	45	42	87	21.4708327936254	21.9605560592829	-0.489723265657467	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.91507425913704	ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	134670606	T/A	1	100	133	233	47.7129617636121	69.5417608543959	-21.8287990907838	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.00471313758623174	ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	134670656	A/G	1	154	101	255	73.4779611159626	52.8099086187518	20.6680524972109	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0100796123097213	ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	134670765	A/G	1	119	83	202	56.7784244986984	43.398241736202	13.3801827624965	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0668301626931285	ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	137766066	G/A	1	11	2	13	5.24842579399733	1.04574076472776	4.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0242231410078916	ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137765938_137766114:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137765938_137766114:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137765938_137766114:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137765938_137766114:KDM3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	138160440	C/T	1	23	32	55	10.9739812056308	16.7318522356441	-5.75787103001334	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.137679060243114	ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138160219_138160488:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138160219_138160488:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138160219_138160488:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138160219_138160488:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000523275:exon_138160366_138160488:CTNNA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	138266546	G/A	1	72	89	161	34.3533324698007	46.5354640303852	-12.1821315605845	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0582855433243689	ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	138856982	C/T	1	27	7	34	12.8824996761753	3.66009267654715	9.22240699962811	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00162051805753645	ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	138857925	C/G	1	23	16	39	10.9739812056308	8.36592611782206	2.60805508780872	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.427196507618391	ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	139060114	G/A	1	36	32	68	17.1766662349004	16.7318522356441	0.444813999256233	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171604:ENST00000502295:exon_139059949_139060314:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504944:exon_139059949_139060415:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000302517:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000507139:exon_139059949_139060141:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504844:exon_139059949_139060591:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502336:exon_139059949_139060350:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000520967:exon_139059949_139060521:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511048:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000512816:exon_139059949_139060328:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000509238:exon_139059949_139060403:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502716:exon_139059949_139060651:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000503511:exon_139059949_139060358:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511457:exon_139059949_139060698:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511591:exon_139059949_139060132:CXXC5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	139936835	G/A	1	49	43	92	23.3793512641699	22.4834264416468	0.895924822523135	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.916982156670249	ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	139946888	G/A	1	24	43	67	11.4511108232669	22.4834264416468	-11.0323156183799	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00968682143860905	ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	139946988	G/T	1	27	33	60	12.8824996761753	17.254722618008	-4.37222294183274	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.301359682148721	ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	139947135	T/C	1	32	21	53	15.2681477643559	10.9802780296415	4.28786973471442	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.272092075036767	ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	139947612	G/A	1	43	64	107	20.5165735583532	33.4637044712883	-12.947130912935	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0151630517568467	ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000432254:exon_139947402_139947830:SLC35A4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	140070513	G/T	1	52	42	94	24.8107401170783	21.9605560592829	2.85018405779538	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.606138598941233	ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000507746:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512396:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000518126:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000502888:exon_140070440_140070529:HARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	140078159	C/T	1	35	20	55	16.6995366172642	10.4574076472776	6.24212896998666	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.105286778567717	ENSG00000112855:ENST00000230771:exon_140078078_140078876:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000435019:exon_140078078_140078889:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000412045:exon_140078078_140078889:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000432671:exon_140078078_140078889:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000437649:exon_140078078_140078889:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000419246:exon_140078078_140078889:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000508522:exon_140078078_140078213:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000448069:exon_140078078_140078523:HARS2;ENSG00000112855:ENST00000427675:exon_140078078_140078523:HARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	141307833	T/C	1	11	33	44	5.24842579399733	17.254722618008	-12.0062968240107	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.000383354985273767	ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141307716_141307863:KIAA0141
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	141312988	T/C	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000081791:ENST00000506775:exon_141312824_141313447:KIAA0141
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	141318368	C/T	1	10	1	11	4.77129617636121	0.522870382363879	4.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0126233924286189	ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141318086_141321612:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000509110:exon_141318086_141318513:KIAA0141
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	142661490	A/G	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000361001:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142660685_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142660703_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142660727_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142661376_142661606:NR3C1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	145872524	C/G	1	23	22	45	10.9739812056308	11.5031484120053	-0.529167206374554	A:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.882622950190455	ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000515203:exon_145872483_145872528:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000505285:exon_145872432_145872601:TCERG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	147805120	T/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	147813013	G/A	1	9	5	14	4.29416655872509	2.61435191181939	1.6798146469057	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.430819213902139	ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000505399:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000504447:exon_147812796_147813087:FBXO38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	147820769	C/T	1	14	18	32	6.67981464690569	9.41166688254982	-2.73185223564413	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.378432073331373	ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147820687_147820800:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147820687_147820800:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147820687_147820800:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147820687_147820800:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000505399:exon_147820687_147820808:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000508176:exon_147820687_147821065:FBXO38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	149754991	C/T	1	15	10	25	7.15694426454182	5.22870382363879	1.92824044090303	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.549274934579923	ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	149755421	A/G	1	14	14	28	6.67981464690569	7.32018535309431	-0.640370706188611	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.851562231554368	ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	149759096	T/C	1	28	19	47	13.3596292938114	9.9345372649137	3.42509202889769	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.381357218662145	ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	149827189	G/C	1	3434	4460	7894	1638.46310696244	2332.0019053429	-693.53879838046	A:T:C:G	G	C	10	0.522870382363879	5.14861777389124e-55	ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	150425467	G/A	1	120	129	249	57.2555541163345	67.4502793249404	-10.1947252086059	A:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.204743685759541	ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	150443277	C/T	1	77	59	136	36.7389805579813	30.8493525594689	5.88962799851246	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.345197690420526	ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000520695:exon_150443174_150443308:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521001:exon_150443174_150443308:TNIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	150565008	C/T	1	10	12	22	4.77129617636121	6.27444458836655	-1.50314841200534	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.531359102425708	ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	150639409	A/G	1	16	22	38	7.63407388217794	11.5031484120053	-3.8690745298274	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.255709395696554	ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	151054227	T/C	1	13	3	16	6.20268502926957	1.56861114709164	4.63407388217794	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0233762833916287	ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000521327:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000522348:exon_151054173_151054235:SPARC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	153372515	A/C	1	12	11	23	5.72555541163345	5.75157420600267	-0.0260187943692163	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	153372525	G/A	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	153413390	C/T	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153413351_153413426:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153413351_153413437:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522395:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518900:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000523705:exon_153413351_153413443:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000519808:exon_153413377_153413443:FAM114A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	156747669	A/G	1	14	45	59	6.67981464690569	23.5291672063746	-16.8493525594689	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1.04355117673830e-05	ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	159840598	T/A	1	25	38	63	11.928240440903	19.8690745298274	-7.94083408892437	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.0576781576510903	ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159840463_159840627:SLU7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	167943822	G/A	1	54	31	85	25.7649993523505	16.2089818532802	9.55601749907029	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0393582911104821	ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167943783_167943955:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167943783_167943955:RARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	169021610	C/T	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	169028481	T/C	1	11	12	23	5.24842579399733	6.27444458836655	-1.02601879436922	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.682551462444228	ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	169031150	T/C	1	13	7	20	6.20268502926957	3.66009267654715	2.54259235272242	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.273177370962394	ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	169031218	G/T	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	169454941	C/G	1	25	43	68	11.928240440903	22.4834264416468	-10.5551860007438	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0107754681621559	ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	169461547	C/T	1	27	52	79	12.8824996761753	27.1892598829217	-14.3067602067464	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00147493904907111	ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	171533629	A/G	1	18	25	43	8.58833311745018	13.071759559097	-4.48342644164679	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.22155694930236	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	171533782	T/C	1	12	18	30	5.72555541163345	9.41166688254982	-3.68611147091637	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.202767215651943	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	172750392	G/A	1	21	11	32	10.0197219703585	5.75157420600267	4.26814776435587	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.157292477713881	ENSG00000113739:ENST00000265087:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520593:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520648:exon_172749972_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000518455:exon_172750313_172750433:STC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	174937193	C/T	1	6	8	14	2.86277770581673	4.18296305891103	-1.32018535309431	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.59563947353559	ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	174953743	G/A	1	25	18	43	11.928240440903	9.41166688254982	2.51657355835321	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.541953811268653	ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176335585	C/T	1	26	20	46	12.4053700585391	10.4574076472776	1.94796241126157	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.658472863997072	ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176335524_176335695:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176335524_176335695:UIMC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176370402	A/G	1	17	15	32	8.11120349981406	7.84305573545818	0.268147764355874	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176734855	G/C	1	11	8	19	5.24842579399733	4.18296305891103	1.0654627350863	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.654186200239302	ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176863090	G/A	1	38	47	85	18.1309254701726	24.5749079711023	-6.44398250092971	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.192310478341008	ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000508705:exon_176863074_176863122:GRK6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176867943	A/G	1	39	40	79	18.6080550878087	20.9148152945552	-2.30676020674644	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.652862548180956	ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176894759	C/T	0	12	0	12	5.72555541163345	0	5.72555541163345	C	C		10	0.522870382363879	0.000556768374497239	ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176916516	C/T	1	13	12	25	6.20268502926957	6.27444458836655	-0.0717595590969733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176936590	T/C	1	15	13	28	7.15694426454182	6.79731497073043	0.359629293811389	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000509310:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502380:exon_176935785_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936167_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510389:exon_176936503_176936658:DOK3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	176940384	G/A	1	75	70	145	35.7847213227091	36.6009267654715	-0.816205442762445	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.93380749429181	ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	177482786	C/T	0	1932	0	1932	921.814421272986	0	921.814421272986	C	C		10	0.522870382363879	0	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	177652392	T/C	1	7	12	19	3.33990732345285	6.27444458836655	-2.9345372649137	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.250431561449006	ENSG00000175309:ENST00000308158:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000481436:exon_177652356_177653080:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000489262:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000493197:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000494126:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000510913:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000514424:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000323594:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000506001:exon_177652356_177652430:AGXT2L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179226518	G/A	1	47	40	87	22.4250920288977	20.9148152945552	1.51027673434253	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.830197220360013	ENSG00000161013:ENST00000518778:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520969:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000522293:exon_179226506_179226576:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520875:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518867:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518702:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520822:exon_179226506_179227068:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179226512_179226636:MGAT4B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179228623	G/A	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228554_179228692:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228334_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228554_179228719:MGAT4B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179260153	C/T	1	154	108	262	73.4779611159626	56.4700012952989	17.0079598206637	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0356146510046688	ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179260213	G/A	1	227	134	361	108.308423203399	70.0646312367598	38.2437919666397	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	5.8745554560523e-05	ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179264731	T/C	1	34	40	74	16.2224069996281	20.9148152945552	-4.69240829492704	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.296020045283118	ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179290845	T/G	1	15	38	53	7.15694426454182	19.8690745298274	-12.7121302652856	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.000496060794174319	ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179297262	T/C	1	10	1	11	4.77129617636121	0.522870382363879	4.24842579399733	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0126233924286189	ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179297352	A/G	1	11	3	14	5.24842579399733	1.56861114709164	3.67981464690569	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0609596309432481	ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	179300131	T/C	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521669:exon_179300119_179300135:TBC1D9B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	180017632	C/T	1	5	22	27	2.38564808818061	11.5031484120053	-9.11750032382473	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000394183821250418	ENSG00000161055:ENST00000292641:exon_180017600_180017838:SCGB3A1;ENSG00000161055:ENST00000512120:exon_180017600_180018163:SCGB3A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	180218668	A/G	1	44	35	79	20.9937031759893	18.3004633827358	2.69323979325356	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.574658311921364	ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	180218820	C/A	1	33	23	56	15.745277381992	12.0260187943692	3.71925858762278	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.350684392652844	ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	180218831	G/A	1	26	20	46	12.4053700585391	10.4574076472776	1.94796241126157	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.658472863997072	ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	180651231	G/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	5	180657749	A/G	1	6	11	17	2.86277770581673	5.75157420600267	-2.88879650018594	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.224343505781	ENSG00000146063:ENST00000515499:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515834:exon_180651691_180657839:TRIM41
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	345906	G/A	1	98	28	126	46.7587025283399	14.6403707061886	32.1183318221512	A:G	G	A	10	0.522870382363879	5.28677945285038e-09	ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_345854_345928:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_345854_345928:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_345854_345928:DUSP22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	348195	G/A	1	99	26	125	47.235832145976	13.5946299414609	33.6412022045151	A:G	G	A	10	0.522870382363879	7.48214189116872e-10	ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	350829	G/A	1	79	69	148	37.6932397932536	36.0780563831077	1.61518341014591	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.805546825096998	ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	1742794	A/G	1	31	46	77	14.7910181467198	24.0520375887384	-9.26101944201868	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0396500396899153	ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	2948571	G/T	1	14	3	17	6.67981464690569	1.56861114709164	5.11120349981406	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0142597358608358	ENSG00000124570:ENST00000380524:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380520:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000335686:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380529:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380539:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380546:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380500:exon_2948393_2948832:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000316782:exon_2948395_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000440670:exon_2948532_2948831:SERPINB6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	3127492	T/C	1	2	10	12	0.954259235272242	5.22870382363879	-4.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0179928301605514	ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3127476_3127642:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000488487:exon_3127030_3127642:BPHL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	3129323	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3129279_3129432:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000488487:exon_3129279_3129432:BPHL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	4031998	A/G	1	39	55	94	18.6080550878087	28.7578710300133	-10.1498159422046	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0388937587683739	ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	4044214	A/G	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4044047_4044257:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4044047_4044257:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000481109:exon_4044047_4044257:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000490399:exon_4044047_4044460:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000463634:exon_4044047_4044257:PRPF4B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	4116262	G/A	1	50	37	87	23.8564808818061	19.3462041474635	4.51027673434253	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.390690423483291	ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	4133855	C/T	1	29	23	52	13.8367589114475	12.0260187943692	1.81074011707829	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.678002102507008	ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	4996611	T/G	1	12	6	18	5.72555541163345	3.13722229418327	2.58833311745018	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.246737118314006	ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4996456_4996654:RPP40
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	5369142	C/T	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5368783_5369415:FARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	5404783	T/G	1	15	13	28	7.15694426454182	6.79731497073043	0.359629293811389	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5404775_5404934:FARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	5431340	A/G	1	14	8	22	6.67981464690569	4.18296305891103	2.49685158799466	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.393877834025079	ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	7310259	A/G	1	19	9	28	9.0654627350863	4.70583344127491	4.35962929381139	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.129284672940695	ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	10702690	A/G	1	34	18	52	16.2224069996281	9.41166688254982	6.8107401170783	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0704775958664806	ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702602_10702722:PAK1IP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	10702805	G/T	1	17	26	43	8.11120349981406	13.5946299414609	-5.48342644164679	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.125882485987050	ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702798_10702872:PAK1IP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	11185533	G/A	1	20	8	28	9.54259235272242	4.18296305891103	5.35962929381139	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0568758557644017	ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	13616712	A/T	1	88	72	160	41.9874063519786	37.6466675301993	4.34073882177937	A:T:C	A	T	10	0.522870382363879	0.526951224022982	ENSG00000225921:ENST00000451315:exon_13616695_13616753:NOL7;ENSG00000225921:ENST00000420088:exon_13616695_13616753:NOL7;ENSG00000225921:ENST00000474485:exon_13616695_13616753:NOL7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	18237661	C/T	1	47	54	101	22.4250920288977	28.2350006476495	-5.80990861875177	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.273432116432663	ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	18264210	G/A	1	48	61	109	22.9022216465338	31.8950933241966	-8.99287167766281	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.102659306481145	ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	18264658	G/A	1	35	52	87	16.6995366172642	27.1892598829217	-10.4897232656575	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0312388045303337	ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264616_18265054:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264616_18264799:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264616_18264766:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264616_18264772:DEK;ENSG00000124795:ENST00000503715:exon_18264616_18264772:DEK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	24667074	C/A	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24666926_24667261:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24666926_24667158:TDP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	26104382	C/T	1	89	88	177	42.4645359696148	46.0125936480214	-3.54805767840658	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.599290565802295	ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	26216843	G/A	1	8	12	20	3.81703694108897	6.27444458836655	-2.45740764727758	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.371138995758136	ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	26285560	A/G	1	9	11	20	4.29416655872509	5.75157420600267	-1.45740764727758	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.655558089529074	ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	26393021	G/A	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	26545632	G/A	1	47	55	102	22.4250920288977	28.7578710300133	-6.33277900111565	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.234335976092109	ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	26598188	A/G	1	30	30	60	14.3138885290836	15.6861114709164	-1.37222294183274	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.796380252868649	ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	27114593	C/G	1	119	137	256	56.7784244986984	71.6332423838514	-14.854817885153	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.069454094076641	ENSG00000197903:ENST00000396891:exon_27114188_27114631:HIST1H2BK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	27833342	C/T	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	27834702	C/T	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	27834877	T/C	1	9	13	22	4.29416655872509	6.79731497073043	-2.50314841200534	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.295828349148920	ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	27839746	T/C	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	T	T		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	ENSG00000182572:ENST00000328488:exon_27839683_27840093:HIST1H3I
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	29693752	C/T	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.513306113115057	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	29693969	C/T	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	29694832	C/T	1	9	1	10	4.29416655872509	0.522870382363879	3.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0227769616190771	ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	29910679	G/A	1	1084	112	1196	517.208505517555	58.5614828247544	458.647022692801	A:G	G	A	10	0.522870382363879	8.80142557771311e-182	ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	29911326	A/G	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.113052711163905	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	29912315	A/C	1	1500	1	1501	715.694426454182	0.522870382363879	715.171556071818	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0	ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	30153845	G/A	1	21	16	37	10.0197219703585	8.36592611782206	1.65379585253648	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.624628738532786	ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	30166886	C/T	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	30313340	G/C	1	77	91	168	36.7389805579813	47.581204795113	-10.8422242371317	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.104644981194582	ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	30457671	C/T	1	589	549	1138	281.029344787675	287.05583991777	-6.02649513009425	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.721882627985375	ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	30672463	G/A	1	11	9	20	5.24842579399733	4.70583344127491	0.542592352722421	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.82745485897146	ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31237124	T/C	1	2083	1594	3677	993.86099353604	833.455389488023	160.405604048017	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	1.14522008337185e-07	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31237162	C/G	1	2308	873	3181	1101.21515750417	456.465843803666	644.749313700501	T:C:G	C	G	10	0.522870382363879	1.07061218867906e-120	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31237275	G/A	1	995	2223	3218	474.74396954794	1162.3408599949	-687.596890446963	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	2.70407778482605e-132	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237270_31237320:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237270_31237302:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31239378	T/G	1	968	1	969	461.861469871765	0.522870382363879	461.338599489401	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1.26437777840928e-270	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31239417	C/T	1	1005	22	1027	479.515265724302	11.5031484120053	468.012117312296	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.80865066914471e-245	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31239430	C/T	1	1011	28	1039	482.378043430118	14.6403707061886	467.73767272393	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1.6686831510456e-239	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31239449	C/G	1	33	1016	1049	15.745277381992	531.236308481701	-515.491031099709	C:G	C	G	10	0.522870382363879	6.21762591397379e-274	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31239518	C/T	1	976	21	997	465.678506812854	10.9802780296415	454.698228783213	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	5.40896291388357e-239	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31239601	C/T	0	623	1	624	297.251751787303	0.522870382363879	296.72888140494	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1.38563159762775e-173	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31322470	C/G	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31322888	A/G	1	3152	1739	4891	1503.91255478905	909.271594930785	594.640959858268	A:T:C:G	A	G	10	0.522870382363879	5.03876264521115e-66	ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31322911	C/T	1	3114	814	3928	1485.78162931888	425.616491244197	1060.16513807468	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	3.51218923798359e-270	ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31323353	G/A	1	3250	209	3459	1550.67125731739	109.279909914051	1441.39134740334	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0	ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31378928	C/T	0	0	8	8	0	4.18296305891103	-4.18296305891103	T	C	T	10	0.522870382363879	0.0026859072312288	ENSG00000204520:ENST00000484008:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000364810:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000458313:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000449934:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376219:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000468458:exon_31378640_31379136:AL645933.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31431820	C/T	1	27	21	48	12.8824996761753	10.9802780296415	1.90222164653381	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.665317059511809	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31540556	T/C	1	63	62	125	30.0591659110756	32.4179637065605	-2.35879779548486	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.72045127212357	ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31540784	C/A	1	79	73	152	37.6932397932536	38.1695379125632	-0.476298119309604	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31549357	G/A	1	97	104	201	46.2815729107037	54.3785197658434	-8.09694685513966	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.259253438399682	ENSG00000227507:ENST00000483972:exon_31549336_31549407:LTB;ENSG00000227507:ENST00000429299:exon_31549336_31549407:LTB;ENSG00000227507:ENST00000446745:exon_31549336_31549407:LTB;ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31549336_31550183:LTB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31556922	C/T	1	25	28	53	11.928240440903	14.6403707061886	-2.71213026528558	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.493292962088555	ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31556928	C/A	1	27	27	54	12.8824996761753	14.1175003238247	-1.23500064764946	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.786031149025843	ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31557791	G/A	1	23	12	35	10.9739812056308	6.27444458836655	4.69953661726424	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.128651956980397	ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557752_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31583312	G/A	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000497362:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583298_31583359:AIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31595882	C/A	1	4	14	18	1.90851847054448	7.32018535309431	-5.41166688254982	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.0158737278931644	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31600304	G/C	1	14	19	33	6.67981464690569	9.9345372649137	-3.25472261800801	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.297233008754451	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31601268	C/G	1	18	15	33	8.58833311745018	7.84305573545818	0.745277381991995	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.862634297175903	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31601344	T/C	1	35	18	53	16.6995366172642	9.41166688254982	7.28786973471442	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0535744728250289	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31602967	G/A	1	64	40	104	30.5362955287117	20.9148152945552	9.62148023415659	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0623613994476687	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31602994	C/T	1	69	42	111	32.9219436168923	21.9605560592829	10.9613875576094	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0455199389322098	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31605167	G/A	1	15	7	22	7.15694426454182	3.66009267654715	3.49685158799466	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.199324971996938	ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31605199	G/C	1	6	15	21	2.86277770581673	7.84305573545818	-4.98027802964146	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0466412463418783	ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31610686	A/G	1	64	45	109	30.5362955287117	23.5291672063746	7.00712832233719	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.212394542629669	ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31619535	C/T	1	19	17	36	9.0654627350863	8.88879650018594	0.176666234900358	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000435080:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000434444:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000452994:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000456622:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000428326:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000451898:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000433828:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000424480:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000424176:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000446826:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000441054:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000456286:exon_31619433_31619756:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000486692:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000454165:exon_31619433_31619553:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000474692:exon_31619433_31619553:BAT3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31627523	C/T	1	18	32	50	8.58833311745018	16.7318522356441	-8.14351911819395	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.0233146766451934	ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31630241	C/T	1	39	52	91	18.6080550878087	27.1892598829217	-8.58120479511298	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0749797917587895	ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31635710	T/C	1	269	299	568	128.347867144117	156.3382443268	-27.9903771826833	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0207975116294871	ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31639757	G/A	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31657413	T/C	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31657358_31657481:XXbac-BPG32J3.20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31732207	C/T	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31732043_31732628:MSH5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31748820	G/A	1	60	37	97	28.6277770581673	19.3462041474635	9.28157291070374	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0670262802486941	ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31759419	G/C	1	18	13	31	8.58833311745018	6.79731497073043	1.79101814671975	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.591620369367641	ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31759387_31759514:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31759387_31759514:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31759387_31759514:VARS;ENSG00000204394:ENST00000495010:exon_31759387_31759514:VARS;ENSG00000204394:ENST00000489979:exon_31759387_31759514:VARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31936679	C/T	1	53	37	90	25.2878697347144	19.3462041474635	5.9416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.245659333290439	ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31938412	G/T	1	11	15	26	5.24842579399733	7.84305573545818	-2.59462994146085	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.332000236694704	ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	31938451	T/C	1	17	20	37	8.11120349981406	10.4574076472776	-2.34620414746352	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.511328644277425	ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	32147657	A/G	1	37	1	38	17.6537958525365	0.522870382363879	17.1309254701726	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1.25471380690745e-09	ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	32407709	C/A	1	434	494	928	207.074254054077	258.297968887756	-51.2237148336797	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.000796276215971466	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	32411035	A/C	1	2750	2995	5745	1312.10644849933	1565.99679517982	-253.890346680485	A:T:C:G	A	C	10	0.522870382363879	2.08590441558702e-11	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	32411646	T/G	1	3335	2787	6122	1591.22727481646	1457.23975564813	133.987519168333	A:T:C:G	T	G	10	0.522870382363879	0.000605616426689138	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	32628045	C/G	0	27	0	27	12.8824996761753	0	12.8824996761753	C	C		10	0.522870382363879	2.70298890039262e-08	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	32800224	C/A	1	43	33	76	20.5165735583532	17.254722618008	3.2618509403452	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.491851382457153	ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	32904981	G/A	1	118	119	237	56.3012948810623	62.2215755013016	-5.92028062023931	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.474528027873335	ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	32946034	T/C	1	174	168	342	83.0205534686851	87.8422242371317	-4.82167076844659	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.626248607996681	ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33041299	C/T	1	69	72	141	32.9219436168923	37.6466675301993	-4.72472391330693	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.448551524146955	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33041248_33041446:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33041248_33041392:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33041248_33041378:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33041248_33041414:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33041248_33041549:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33041216_33041410:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000417724:exon_33041279_33041487:HLA-DPA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33048640	A/G	1	1161	287	1448	553.947486075537	150.063799738433	403.883686337103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	4.69507295979352e-108	ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33053559	C/T	1	1092	1285	2377	521.025542458644	671.888441337584	-150.86289887894	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	6.11213917526028e-10	ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33163451	G/A	1	20	13	33	9.54259235272242	6.79731497073043	2.745277381992	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.386037409230635	ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33170149	T/C	1	46	39	85	21.9479624112616	20.3919449121913	1.55601749907029	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.746091338795097	ENSG00000112473:ENST00000444757:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000445037:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000463972:exon_33170032_33170204:SLC39A7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33173842	G/A	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.728843691335987	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33256397	G/A	1	49	23	72	23.3793512641699	12.0260187943692	11.3533324698007	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00899432847158806	ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33287183	T/C	1	133	103	236	63.4582391456041	53.8556493834795	9.60258976212457	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.216246066388918	ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33382818	G/A	1	39	27	66	18.6080550878087	14.1175003238247	4.49055476398399	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.324281927247823	ENSG00000112511:ENST00000487667:exon_33382732_33382858:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374512:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374516:exon_33382732_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000439397:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000495509:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000486845:exon_33382502_33382921:PHF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33659472	C/G	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	33660597	C/T	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33660505_33660670:ITPR3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	34214322	C/G	1	45	46	91	21.4708327936254	24.0520375887384	-2.58120479511298	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.601304179801912	ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	34855748	G/C	1	18	18	36	8.58833311745018	9.41166688254982	-0.82333376509964	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.867968606269239	ENSG00000064995:ENST00000361288:exon_34855564_34855866:TAF11;ENSG00000064995:ENST00000420584:exon_34855564_34855819:TAF11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	36355372	T/C	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36355313_36356164:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36355313_36356164:ETV7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	36492183	T/G	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:G	T	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000112079:ENST00000229812:exon_36492118_36492240:STK38;ENSG00000112079:ENST00000407753:exon_36492118_36492240:STK38
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	36936697	T/C	1	126	103	229	60.1183318221513	53.8556493834795	6.26268243867172	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.427629390800989	ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	36988364	C/T	1	18	12	30	8.58833311745018	6.27444458836655	2.31388852908363	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.466606982659409	ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	37139086	G/C	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000137193:ENST00000373507:exon_37138901_37139267:PIM1;ENSG00000137193:ENST00000373509:exon_37138901_37139267:PIM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	38670837	G/A	1	13	10	23	6.20268502926957	5.22870382363879	0.973981205630785	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.835286047198067	ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	41652604	T/C	1	111	131	242	52.9613875576094	68.4960200896681	-15.5346325320587	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.046239090298504	ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	41655698	G/A	1	51	41	92	24.3336104994422	21.437685676919	2.89592482252313	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.602151999065241	ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000494822:exon_41655491_41655938:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41655648_41655766:TFEB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	41658889	C/T	1	18	22	40	8.58833311745018	11.5031484120053	-2.91481529455516	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.429199059498376	ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	42196212	A/G	1	15	22	37	7.15694426454182	11.5031484120053	-4.34620414746352	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.187760988075599	ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42192963_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42195866_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42195887_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42195887_42196407:TRERF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	42627434	G/A	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	42658949	T/A	1	16	10	26	7.63407388217794	5.22870382363879	2.40537005853915	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.433369160576612	ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	42906467	G/A	1	298	281	579	142.184626055564	146.92657744425	-4.74195138868589	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.708180472143733	ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906450_42906549:CNPY3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	42932202	C/T	1	51	46	97	24.3336104994422	24.0520375887384	0.281572910703741	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	43193759	T/G	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000112667:ENST00000393987:exon_43193373_43193881:C6orf108
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	43306920	T/C	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	43515420	G/C	1	17	12	29	8.11120349981406	6.27444458836655	1.83675891144751	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.578745144426162	ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43515345_43515444:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43515345_43515444:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43515345_43515444:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43515345_43515444:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43515345_43515444:XPO5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	44217200	C/T	1	209	213	422	99.7200900859493	111.371391443506	-11.6513013575569	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.262604883573722	ENSG00000096384:ENST00000371646:exon_44217114_44217320:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000353801:exon_44217114_44217320:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371565:exon_44217114_44217320:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371556:exon_44217114_44217320:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371562:exon_44217114_44217320:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371554:exon_44217114_44217320:HSP90AB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	44222584	A/G	1	51	58	109	24.3336104994422	30.326482177105	-5.99287167766281	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.251905202952675	ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222443_44222810:SLC35B2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	44268371	T/C	1	9	19	28	4.29416655872509	9.9345372649137	-5.64037070618861	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0374013011231895	ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44267391_44268448:AARS2;ENSG00000124608:ENST00000491573:exon_44268309_44269003:AARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	44269193	C/T	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	49439805	G/A	1	10	3	13	4.77129617636121	1.56861114709164	3.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0966692698681595	ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	52129514	G/A	1	144	185	329	68.7066649396014	96.7310207373176	-28.0243557977162	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00235159875134770	ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52128807_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000421471:exon_52129419_52129584:MCM3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	54173413	A/G	1	10	1	11	4.77129617636121	0.522870382363879	4.24842579399733	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0126233924286189	ENSG00000137251:ENST00000486436:exon_54173395_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54173395_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000339741:exon_54173203_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54173253_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370865:exon_54173349_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54173371_54173703:TINAG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	56328405	C/T	1	18	30	48	8.58833311745018	15.6861114709164	-7.09777835346619	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0434373006508829	ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000523292:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56328363_56329114:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56328363_56328562:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56328363_56328562:DST
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	56484758	C/T	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	57244780	G/A	0	12	0	12	5.72555541163345	0	5.72555541163345	G	G		10	0.522870382363879	0.000556768374497239	ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	57246884	A/G	0	8	0	8	3.81703694108897	0	3.81703694108897	A	A		10	0.522870382363879	0.00827256847091572	ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	57467175	A/G	0	0	12	12	0	6.27444458836655	-6.27444458836655	G	A	G	10	0.522870382363879	0.0001391991273598	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	57512476	G/A	0	0	13	13	0	6.79731497073043	-6.79731497073043	A	G	A	10	0.522870382363879	6.64160264124631e-05	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	57512529	C/A	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	C	C		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	57512565	T/C	0	0	9	9	0	4.70583344127491	-4.70583344127491	C	T	C	10	0.522870382363879	0.00128152589024229	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	71377711	C/T	1	8	10	18	3.81703694108897	5.22870382363879	-1.41166688254982	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.638482634624365	ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	71546702	C/T	1	33	27	60	15.745277381992	14.1175003238247	1.62777705816726	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.700048991366252	ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	74161801	G/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	74228049	A/G	1	10	8	18	4.77129617636121	4.18296305891103	0.588333117450179	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.817992736968054	ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	79679577	A/G	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	82882103	C/T	1	9	13	22	4.29416655872509	6.79731497073043	-2.50314841200534	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.295828349148920	ENSG00000005700:ENST00000306270:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000505222:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000508381:exon_82882097_82883295:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000445419:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000451512:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503400:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503631:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000510291:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000471036:exon_82882097_82882229:IBTK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	84856409	T/C	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000135315:ENST00000257766:exon_84856406_84856504:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000461137:exon_84856406_84856504:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000403245:exon_84856406_84856504:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000369671:exon_84856406_84856504:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000418491:exon_84856406_84856504:KIAA1009;ENSG00000135315:ENST00000487999:exon_84856406_84856504:KIAA1009
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	90371202	G/A	1	18	9	27	8.58833311745018	4.70583344127491	3.88249967617527	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.176928027035863	ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	99825348	T/C	1	6	11	17	2.86277770581673	5.75157420600267	-2.88879650018594	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.224343505781	ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	105726036	C/T	1	59	42	101	28.1506474405311	21.9605560592829	6.19009138124823	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.23276683828549	ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	105776792	G/A	1	9	16	25	4.29416655872509	8.36592611782206	-4.07175955909697	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.112558414985489	ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	106536131	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106536076_106536324:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000424894:exon_106536076_106536324:PRDM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	107113715	G/A	1	11	12	23	5.24842579399733	6.27444458836655	-1.02601879436922	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.682551462444228	ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	109480562	T/C	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000183137:ENST00000517392:exon_109480472_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000407272:exon_109480472_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000336977:exon_109480544_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000521522:exon_109480544_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000520610:exon_109480472_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000368968:exon_109480472_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000368970:exon_109480421_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000520883:exon_109480544_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000520761:exon_109480472_109480649:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000523787:exon_109480472_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000359793:exon_109480472_109480665:CEP57L1;ENSG00000183137:ENST00000523174:exon_109480472_109480665:CEP57L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	109764535	G/T	1	15	19	34	7.15694426454182	9.9345372649137	-2.77759300037189	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.392177937557364	ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	109765453	G/A	1	147	116	263	70.1380537925098	60.65296435421	9.48508943829984	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.266495956047672	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109765265_109765542:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109765265_109765542:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109765265_109765542:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109765268_109765542:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109765268_109765542:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109765268_109765542:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000335266:exon_109765268_109765542:MICAL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	109767930	G/T	1	62	2	64	29.5820362934395	1.04574076472776	28.5362955287117	T:G	G	T	10	0.522870382363879	1.80454765978820e-15	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	109767931	C/T	1	60	2	62	28.6277770581673	1.04574076472776	27.5820362934395	T:C	C	T	10	0.522870382363879	6.28505905112859e-15	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	109768295	G/A	1	60	33	93	28.6277770581673	17.254722618008	11.3730544401593	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0219116726188941	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	109775436	T/C	1	1	9	10	0.477129617636121	4.70583344127491	-4.22870382363879	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0088395297966988	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	109786980	T/C	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	116600774	C/G	1	4	13	17	1.90851847054448	6.79731497073043	-4.88879650018594	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0260745260759215	ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	131190760	G/A	1	21	18	39	10.0197219703585	9.41166688254982	0.608055087808722	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.874009491702355	ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	135606755	C/G	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135604670_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135605110_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135605124_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000475846:exon_135606034_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000498558:exon_135606323_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367799:exon_135606430_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000527681:exon_135606433_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135606434_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000487135:exon_135606519_135606785:AHI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	135786977	G/A	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000531788:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000327035:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000417892:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000524469:exon_135786952_135787511:AHI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	135787339	T/C	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000531788:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000327035:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000417892:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000524469:exon_135786952_135787511:AHI1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	136597174	G/A	0	85	0	85	40.5560174990703	0	40.5560174990703	G	G		10	0.522870382363879	1.20291591194202e-24	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	136597262	T/C	0	75	0	75	35.7847213227091	0	35.7847213227091	T	T		10	0.522870382363879	8.23532891176171e-22	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	136597281	A/T	0	79	0	79	37.6932397932536	0	37.6932397932536	A	A		10	0.522870382363879	6.02270908236695e-23	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	136597288	A/C	0	76	0	76	36.2618509403452	0	36.2618509403452	A	A		10	0.522870382363879	4.28007334236161e-22	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	136599393	G/C	0	24	0	24	11.4511108232669	0	11.4511108232669	G	G		10	0.522870382363879	1.93740473212658e-07	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	136599404	T/C	0	26	0	26	12.4053700585391	0	12.4053700585391	T	T		10	0.522870382363879	5.20810825907395e-08	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	136599458	C/T	0	23	0	23	10.9739812056308	0	10.9739812056308	C	C		10	0.522870382363879	3.740851039173e-07	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	136904783	G/A	1	15	11	26	7.15694426454182	5.75157420600267	1.40537005853915	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.695710599168677	ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000463140:exon_136904693_136904878:MAP3K5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	138725677	G/A	1	21	2	23	10.0197219703585	1.04574076472776	8.97398120563079	A:G	G	A	10	0.522870382363879	9.09889394113894e-05	ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138725356_138725734:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000367697:exon_138725384_138725734:HEBP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	143382110	T/C	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	144178951	A/G	1	9	9	18	4.29416655872509	4.70583344127491	-0.41166688254982	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144178889_144179144:LTV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	144183376	T/C	1	13	7	20	6.20268502926957	3.66009267654715	2.54259235272242	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.273177370962394	ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144183241_144183380:LTV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	149395144	C/T	1	21	7	28	10.0197219703585	3.66009267654715	6.35962929381139	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0215917079938413	ENSG00000111962:ENST00000367463:exon_149394969_149398126:UST;ENSG00000111962:ENST00000466695:exon_149394969_149395386:UST
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	149953981	C/T	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	150004779	A/G	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	151686905	C/T	1	4	11	15	1.90851847054448	5.75157420600267	-3.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.067722028140312	ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	151726300	G/C	1	34	28	62	16.2224069996281	14.6403707061886	1.58203629343951	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.704983511708848	ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	151766500	T/C	1	9	11	20	4.29416655872509	5.75157420600267	-1.45740764727758	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.655558089529074	ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	153296370	G/A	1	9	19	28	4.29416655872509	9.9345372649137	-5.64037070618861	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0374013011231895	ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	153603515	G/T	1	2	250	252	0.954259235272242	130.71759559097	-129.763336355698	T:C:G	G	T	10	0.522870382363879	3.97268453819913e-77	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	155141466	T/C	1	5	9	14	2.38564808818061	4.70583344127491	-2.3201853530943	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.286211209345659	ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155141311_155141467:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155141311_155141467:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155141311_155141467:RBM16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	155606325	C/T	1	36	37	73	17.1766662349004	19.3462041474635	-2.16953791256316	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.640489367235346	ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	157527639	A/G	1	13	11	24	6.20268502926957	5.75157420600267	0.451110823266905	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157527301_157530284:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157527301_157529495:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000445852:exon_157527301_157529204:ARID1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	157713975	G/T	1	30	44	74	14.3138885290836	23.0062968240107	-8.69240829492704	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.047758452367701	ENSG00000215712:ENST00000400788:exon_157712662_157714031:C6orf35
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	159178409	C/A	1	18	20	38	8.58833311745018	10.4574076472776	-1.8690745298274	A:C:G	C	A	10	0.522870382363879	0.626949445873145	ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	160113693	C/T	1	19	15	34	9.0654627350863	7.84305573545818	1.22240699962811	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.733249089636175	ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	160174540	G/A	1	15	11	26	7.15694426454182	5.75157420600267	1.40537005853915	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.695710599168677	ENSG00000146457:ENST00000358372:exon_160174492_160174646:WTAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	160211609	T/C	1	23	8	31	10.9739812056308	4.18296305891103	6.79101814671975	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.018207423537365	ENSG00000112110:ENST00000367034:exon_160211498_160211671:MRPL18;ENSG00000112110:ENST00000480842:exon_160211549_160211819:MRPL18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	160517481	C/T	1	21	20	41	10.0197219703585	10.4574076472776	-0.437685676919036	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	167343199	C/T	1	1476	1495	2971	704.243315630915	781.691221633999	-77.4479060030843	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.00467180088520419	ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167343004_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167343006_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167343013_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167343028_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167343033_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167343086_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167343121_167343279:RNASET2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	170058374	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170058372_170058454:WDR27
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	170627651	G/A	1	14	14	28	6.67981464690569	7.32018535309431	-0.640370706188611	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.851562231554368	ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	6	170862300	G/C	1	171	138	309	81.5891646157767	72.1561127662153	9.43305184956139	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.305349887869273	ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	751025	T/C	1	21	11	32	10.0197219703585	5.75157420600267	4.26814776435587	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.157292477713881	ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000417852:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000488474:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000456696:exon_750967_751164:PRKAR1B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	814788	G/A	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	925717	G/A	1	21	27	48	10.0197219703585	14.1175003238247	-4.09777835346619	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.250437633990828	ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_925693_925771:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_923180_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000441491:exon_925693_925771:GET4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	930611	C/T	1	19	19	38	9.0654627350863	9.9345372649137	-0.869074529827401	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.871355730281366	ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	931960	G/A	1	52	42	94	24.8107401170783	21.9605560592829	2.85018405779538	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.606138598941233	ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	938555	T/C	1	72	28	100	34.3533324698007	14.6403707061886	19.7129617636121	T:C	T	C	10	0.522870382363879	7.80696310103417e-05	ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_937538_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_937540_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_937546_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_937547_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_937582_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_938554_938586:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_938415_938586:COX19
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	1097672	G/A	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000164849:ENST00000444847:exon_1097128_1098097:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000397095:exon_1097128_1098894:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000297468:exon_1097141_1098897:GPR146
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	1097952	C/T	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000164849:ENST00000444847:exon_1097128_1098097:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000397095:exon_1097128_1098894:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000297468:exon_1097141_1098897:GPR146
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	1131411	C/T	1	3	9	12	1.43138885290836	4.70583344127491	-3.27444458836655	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0812439974911473	ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	1131412	A/G	1	9	3	12	4.29416655872509	1.56861114709164	2.72555541163345	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.151047656593004	ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	2279214	G/C	1	17	11	28	8.11120349981406	5.75157420600267	2.35962929381139	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.450663887484502	ENSG00000122687:ENST00000467199:exon_2279053_2279342:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000242257:exon_2279053_2279342:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000486040:exon_2279053_2279342:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000332565:exon_2279053_2279342:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000440306:exon_2279053_2279342:FTSJ2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	2317738	G/A	1	95	92	187	45.3273136754315	48.1040751774769	-2.77676150204537	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.714574162737695	ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435060:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000457286:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435336:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000494722:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000447136:exon_2317735_2317940:SNX8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	2623881	C/G	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000470731:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000476665:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2623870_2623919:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000497572:exon_2623870_2624300:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000427817:exon_2623870_2623919:IQCE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	2946461	T/C	1	132	108	240	62.981109527968	56.4700012952989	6.51110823266905	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.438161564911609	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	2957005	T/C	1	25	15	40	11.928240440903	7.84305573545818	4.08518470544484	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.20898953163402	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	2976752	C/T	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2976671_2976868:CARD11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	4801861	C/T	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4801815_4802171:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4801815_4811074:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4801815_4801891:KIAA0415
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	4823971	C/T	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	4825307	T/A	1	15	14	29	7.15694426454182	7.32018535309431	-0.16324108855249	A:T	T	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	4825314	C/T	1	15	14	29	7.15694426454182	7.32018535309431	-0.16324108855249	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	5254173	G/A	1	16	9	25	7.63407388217794	4.70583344127491	2.92824044090303	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.31716605110325	ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000485854:exon_5254166_5254333:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000496867:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000475309:exon_5253817_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5253900_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5254120_5254335:WIPI2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	5540245	T/C	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000297035:exon_5540119_5540514:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	5567484	G/A	1	3714	3611	7325	1772.05939990055	1888.08495071597	-116.025550815413	A:T:C:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00689123641355353	ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5566782_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000464611:exon_5567364_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567372_5567522:ACTB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	7646720	A/G	1	76	73	149	36.2618509403452	38.1695379125632	-1.90768697221797	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.805773886699239	ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	10979697	G/A	1	195	176	371	93.0402754390436	92.0251872960427	1.01508814300091	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.958560403647705	ENSG00000189043:ENST00000339600:exon_10979643_10979883:NDUFA4;ENSG00000189043:ENST00000486007:exon_10979643_10979706:NDUFA4;ENSG00000189043:ENST00000492822:exon_10979587_10979762:NDUFA4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	20193979	T/G	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20193816_20194004:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20193816_20194004:MACC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	21940823	A/G	1	80	62	142	38.1703694108897	32.4179637065605	5.75240570432919	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.355965347429944	ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	23164701	C/T	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164667_23164821:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000477076:exon_23164599_23164791:KLHL7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	23340618	C/T	1	61	64	125	29.1049066758034	33.4637044712883	-4.35879779548487	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.474061054702548	ENSG00000156928:ENST00000466681:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000287543:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000481564:exon_23340458_23340814:C7orf30
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	24854765	G/A	1	2	12	14	0.954259235272242	6.27444458836655	-5.32018535309431	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00555356960539268	ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24854732_24854822:OSBPL3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	26236235	T/C	1	821	862	1683	391.723416079255	450.714269597664	-58.9908535184082	A:T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.00429071919371516	ENSG00000122566:ENST00000354667:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000360787:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000463181:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000409814:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000356674:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000490912:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000495810:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	36492213	G/A	1	7	1	8	3.33990732345285	0.522870382363879	2.81703694108897	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0726032508192463	ENSG00000011426:ENST00000265748:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000396068:exon_36492086_36493400:ANLN;ENSG00000011426:ENST00000491782:exon_36492086_36493264:ANLN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	37272718	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37272710_37272799:ELMO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	37298914	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	39606074	G/T	0	0	9	9	0	4.70583344127491	-4.70583344127491	T	G	T	10	0.522870382363879	0.00128152589024229	ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39605975_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39605984_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39605993_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39606009_39606146:C7orf36
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	39612323	T/G	1	6	8	14	2.86277770581673	4.18296305891103	-1.32018535309431	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.59563947353559	ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39611876_39612480:C7orf36
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	43830888	T/C	1	82	66	148	39.1246286461619	34.509445236016	4.61518341014591	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.460055379609659	ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	43916413	G/A	1	21	9	30	10.0197219703585	4.70583344127491	5.31388852908363	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0664105883834234	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	43916727	T/G	1	12	17	29	5.72555541163345	8.88879650018594	-3.16324108855249	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.267839709779781	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	43917013	G/A	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	43917256	C/A	1	7	8	15	3.33990732345285	4.18296305891103	-0.843055735458184	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.797625624618302	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	43917789	C/T	1	13	8	21	6.20268502926957	4.18296305891103	2.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.393789904615872	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	44099664	T/C	1	150	160	310	71.5694426454182	83.6592611782206	-12.0898185328025	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.172745657305989	ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	44112873	G/T	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	44153780	A/G	1	11	3	14	5.24842579399733	1.56861114709164	3.67981464690569	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0609596309432481	ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	44612229	G/A	1	42	25	67	20.0394439407171	13.071759559097	6.96768438162011	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.111192262468851	ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	45113937	G/A	1	109	101	210	52.0071283223372	52.8099086187518	-0.802780296414582	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.94496441788814	ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113869_45114007:CCM2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	45139892	G/A	1	75	80	155	35.7847213227091	41.8296305891103	-6.04490926640123	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.33582913699908	ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	48004962	C/T	1	5	10	15	2.38564808818061	5.22870382363879	-2.84305573545818	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.195978503056267	ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	55840888	A/C	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.250421566177253	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	64291976	G/A	1	9	10	19	4.29416655872509	5.22870382363879	-0.9345372649137	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.819184206292418	ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	64291991	T/A	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	A:T	T	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	65425894	A/G	1	97	115	212	46.2815729107037	60.1300939718461	-13.8485210611423	A:C:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0632132333630246	ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	65551782	G/A	1	31	14	45	14.7910181467198	7.32018535309431	7.47083279362545	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0354990589936553	ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000487982:exon_65551731_65552147:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000362000:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65551731_65551808:ASL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	66459256	T/C	1	9	13	22	4.29416655872509	6.79731497073043	-2.50314841200534	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.295828349148920	ENSG00000126524:ENST00000246868:exon_66459199_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000414306:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000454667:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000490953:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000463579:exon_66459207_66459353:SBDS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	66785137	C/A	1	8	11	19	3.81703694108897	5.75157420600267	-1.9345372649137	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.49206349104277	ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	70255892	C/G	1	15	6	21	7.15694426454182	3.13722229418327	4.01972197035854	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0848568473104646	ENSG00000158321:ENST00000406775:exon_70254734_70257489:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000342771:exon_70254734_70258054:AUTS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	72717933	C/T	1	33	28	61	15.745277381992	14.6403707061886	1.10490667580338	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.799061344504768	ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	72717936	G/A	1	30	32	62	14.3138885290836	16.7318522356441	-2.4179637065605	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.611484523246447	ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	73151630	C/T	1	15	3	18	7.15694426454182	1.56861114709164	5.58833311745018	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.00862591688745386	ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	75614953	T/C	1	11	23	34	5.24842579399733	12.0260187943692	-6.77759300037189	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0246492511983624	ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	75621799	C/T	1	17	7	24	8.11120349981406	3.66009267654715	4.45111082326691	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.100175630412175	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	75630274	T/C	1	65	46	111	31.0134251463479	24.0520375887384	6.96138755760943	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.216595475066444	ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	75931984	C/T	1	59	39	98	28.1506474405311	20.3919449121913	7.75870252833986	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.129364899689205	ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	75931999	T/C	1	67	47	114	31.9676843816201	24.5749079711023	7.3927764105178	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.189191522815565	ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75931990_75932073:HSPB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	75959188	G/A	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	76112060	C/T	1	21	26	47	10.0197219703585	13.5946299414609	-3.57490797110231	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.310144685578375	ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	76132805	C/G	1	38	30	68	18.1309254701726	15.6861114709164	2.44481399925623	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.627652107694780	ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000465488:exon_76132684_76132904:DTX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	76240773	T/C	1	16	7	23	7.63407388217794	3.66009267654715	3.97398120563078	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.142382367953593	ENSG00000146707:ENST00000454656:exon_76240771_76240908:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000310842:exon_76240771_76240908:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000441393:exon_76240771_76240944:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000424818:exon_76240771_76240908:POMZP3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	77379234	C/T	1	16	11	27	7.63407388217794	5.75157420600267	1.88249967617527	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.564694319892801	ENSG00000187257:ENST00000334955:exon_77378741_77379381:RSBN1L;ENSG00000187257:ENST00000445288:exon_77378741_77379381:RSBN1L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	91503524	C/T	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	92760738	T/G	1	41	41	82	19.562314323081	21.437685676919	-1.87537135383808	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.740452353061761	ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	92764901	A/G	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	92985252	T/C	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	97922851	C/T	1	20	45	65	9.54259235272242	23.5291672063746	-13.9865748536521	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000676722040517767	ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	97933601	C/T	1	29	48	77	13.8367589114475	25.0977783534662	-11.2610194420187	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0117394799658833	ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	97937201	G/A	1	31	10	41	14.7910181467198	5.22870382363879	9.56231432308096	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00272138544396041	ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97937001_97937208:BAIAP2L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99022785	G/A	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99022418_99023239:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99022418_99023239:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99022418_99023239:RP5-900K19.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99050039	G/A	1	25	21	46	11.928240440903	10.9802780296415	0.947962411261569	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.882900587401606	ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99049991_99050232:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99049991_99050887:CPSF4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99055940	T/C	1	669	263	932	319.199714198565	137.5149105617	181.684803636865	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	7.4129992413042e-34	ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99092152	C/T	1	16	15	31	7.63407388217794	7.84305573545818	-0.208981853280248	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99092194	G/A	1	26	19	45	12.4053700585391	9.9345372649137	2.47083279362545	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.551103683531036	ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99500899	T/C	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99693078	G/A	1	191	161	352	91.1317569684991	84.1821315605845	6.94962540791461	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.48798026606277	ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99704796	A/T	1	34	11	45	16.2224069996281	5.75157420600267	10.4708327936254	A:T:G	A	T	10	0.522870382363879	0.00160196369390718	ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99704827	A/G	1	39	23	62	18.6080550878087	12.0260187943692	6.58203629343951	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.099529149224985	ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99709420	G/A	1	14	29	43	6.67981464690569	15.1632410885525	-8.4834264416468	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0136212036399332	ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99709351_99709452:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99709351_99709452:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99709351_99709452:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99709351_99709452:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99709351_99709452:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99709351_99709452:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99709351_99709452:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99709351_99709452:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99709351_99709452:TAF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99747130	G/A	1	194	142	336	92.5631458214075	74.2475942956708	18.3155515257367	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0491769162514894	ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	99997218	C/T	1	13	19	32	6.20268502926957	9.9345372649137	-3.73185223564413	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.216723130875606	ENSG00000085514:ENST00000198536:exon_99997204_99997235:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000453419:exon_99997204_99997235:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000394000:exon_99997204_99997235:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000350573:exon_99997204_99997235:PILRA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100028187	C/T	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100028484	T/C	1	14	7	21	6.67981464690569	3.66009267654715	3.01972197035854	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	0.198954273329485	ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100033148	A/G	1	88	98	186	41.9874063519786	51.2412974716601	-9.25389111968149	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.186549524982649	ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000476185:exon_100032906_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100032982_100033156:C7orf47
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100064719	A/G	1	161	165	326	76.8178684394155	86.27361309004	-9.45574465062454	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.318295050363792	ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100072031	T/C	1	78	90	168	37.2161101756174	47.0583344127491	-9.84222423713166	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.142141494544249	ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100071411_100072063:TSC22D4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100210597	A/C	1	15	14	29	7.15694426454182	7.32018535309431	-0.16324108855249	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000106330:ENST00000223054:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000462372:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000490309:exon_100210353_100210892:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000493970:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000379527:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393950:exon_100210133_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000424091:exon_100210179_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393953:exon_100210487_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000497456:exon_100210438_100210619:MOSPD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100464007	G/A	1	38	45	83	18.1309254701726	23.5291672063746	-5.39824173620195	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.271850169251487	ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100463341_100464630:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100463341_100464631:SLC12A9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100732321	C/T	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100850144	G/A	1	30	15	45	14.3138885290836	7.84305573545818	6.47083279362545	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.072154645674065	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850060_100850185:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100850060_100850185:PLOD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100850908	G/A	1	25	12	37	11.928240440903	6.27444458836655	5.65379585253648	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0706171908083418	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850859_100851005:PLOD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100853714	G/A	1	19	27	46	9.0654627350863	14.1175003238247	-5.05203758873843	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.142487083930268	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000487563:exon_100853374_100853720:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853637_100853725:PLOD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100855823	G/A	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.273399026723903	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100855877	G/A	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100855825_100855936:PLOD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100861452	T/C	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100861475	C/T	1	45	31	76	21.4708327936254	16.2089818532802	5.2618509403452	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.251477405333926	ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000492315:exon_100861462_100861498:ZNHIT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100875772	T/G	1	13	6	19	6.20268502926957	3.13722229418327	3.0654627350863	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.175490139559428	ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	100888256	A/G	1	107	78	185	51.052869087065	40.7838898243826	10.2689792626824	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.141061574690041	ENSG00000214253:ENST00000449367:exon_100888241_100888356:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000442303:exon_100888179_100888329:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000223136:exon_100888241_100888366:FIS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	101837149	G/A	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000360264:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000425244:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000393824:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000338990:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000292535:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000412016:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000415720:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000436903:exon_101837122_101837170:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000431850:exon_101837122_101837170:CUX1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	102079604	C/T	1	9	2	11	4.29416655872509	1.04574076472776	3.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0684680229761391	ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000498661:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102079391_102079628:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102079404_102079628:ORAI2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	102106306	A/G	1	12	3	15	5.72555541163345	1.56861114709164	4.15694426454182	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0379568177349634	ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000464107:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000476270:exon_102105979_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102106264_102106498:LRWD1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	103002455	C/T	1	22	23	45	10.4968515879947	12.0260187943692	-1.52916720637455	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.657728038822936	ENSG00000161057:ENST00000457587:exon_103002404_103002504:PSMC2;ENSG00000161057:ENST00000425206:exon_103002404_103002504:PSMC2;ENSG00000161057:ENST00000435765:exon_103002404_103002535:PSMC2;ENSG00000161057:ENST00000292644:exon_103002404_103002535:PSMC2;ENSG00000161057:ENST00000460021:exon_103002404_103002914:PSMC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	108119692	C/T	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453085:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000481225:exon_108119628_108119756:PNPLA8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	116759743	G/A	1	11	17	28	5.24842579399733	8.88879650018594	-3.64037070618861	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.188314219398843	ENSG00000004866:ENST00000393446:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000265437:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393451:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000438863:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000323984:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393449:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000446490:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000421345:exon_116759615_116759773:ST7;ENSG00000004866:ENST00000432298:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000422922:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000449366:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000487459:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393443:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000465133:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000477742:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393447:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393444:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000420755:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000490039:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000489293:exon_116759740_116759774:ST7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	127973408	C/T	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127973344_127973416:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127973344_127973416:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000487602:exon_127973344_127973416:RBM28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	127978324	A/T	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127978304_127978396:RBM28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	128140982	T/C	1	13	7	20	6.20268502926957	3.66009267654715	2.54259235272242	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.273177370962394	ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	133749164	G/A	1	13	13	26	6.20268502926957	6.79731497073043	-0.594629941460852	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.846528826360866	ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	133749260	C/T	1	15	13	28	7.15694426454182	6.79731497073043	0.359629293811389	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	133749340	G/A	1	4	14	18	1.90851847054448	7.32018535309431	-5.41166688254982	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0158737278931644	ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	133979545	A/T	1	17	3	20	8.11120349981406	1.56861114709164	6.54259235272242	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.00308954028908836	ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	133979552	C/T	1	17	6	23	8.11120349981406	3.13722229418327	4.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0578931252703766	ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	133979578	A/G	1	14	4	18	6.67981464690569	2.09148152945552	4.58833311745018	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0339781022676724	ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	134871775	C/T	1	17	28	45	8.11120349981406	14.6403707061886	-6.52916720637455	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0535757848125751	ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	134879830	G/A	1	18	10	28	8.58833311745018	5.22870382363879	3.35962929381139	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.256783109761352	ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	134889141	G/A	1	12	10	22	5.72555541163345	5.22870382363879	0.496851587994663	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	135329690	T/C	1	68	60	128	32.4448139992562	31.3722229418327	1.07259105742349	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.860063977842099	ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	138265310	A/G	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000122779:ENST00000343526:exon_138265307_138265439:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000415680:exon_138265307_138265439:TRIM24
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	138764245	T/G	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	138764534	G/A	1	5	12	17	2.38564808818061	6.27444458836655	-3.88879650018594	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0866683893241667	ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	139026152	T/G	1	43	36	79	20.5165735583532	18.8233337650996	1.69323979325356	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.736386160462584	ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	140158959	C/T	1	27	21	48	12.8824996761753	10.9802780296415	1.90222164653381	A:T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.665317059511809	ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140158891_140159033:MKRN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	142498813	G/A	1	109	79	188	52.0071283223372	41.3067602067464	10.7003681155908	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.125376167594991	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	149129764	C/T	1	13	20	33	6.20268502926957	10.4574076472776	-4.254722618008	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.163741571847472	ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	149576735	C/T	1	24	19	43	11.4511108232669	9.9345372649137	1.5165735583532	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.76054518814559	ENSG00000171130:ENST00000421974:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000456496:exon_149576424_149577782:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000425642:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000307445:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000429743:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000479613:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000471877:exon_149576424_149577783:ATP6V0E2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150034184	T/C	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150034378	A/G	1	11	7	18	5.24842579399733	3.66009267654715	1.58833311745018	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.489005913678072	ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150036077	G/T	0	10	0	10	4.77129617636121	0	4.77129617636121	G	G		10	0.522870382363879	0.00213881047429683	ENSG00000106538:ENST00000478771:exon_150036075_150036170:RARRES2;ENSG00000106538:ENST00000223271:exon_150036075_150036170:RARRES2;ENSG00000106538:ENST00000467793:exon_150036075_150036170:RARRES2;ENSG00000106538:ENST00000466675:exon_150036075_150036170:RARRES2;ENSG00000106538:ENST00000482669:exon_150036075_150036170:RARRES2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150068933	T/C	1	31	37	68	14.7910181467198	19.3462041474635	-4.55518600074377	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.277098632430446	ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150217089	G/A	1	9	4	13	4.29416655872509	2.09148152945552	2.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.273399026723903	ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150269903	G/C	1	18	14	32	8.58833311745018	7.32018535309431	1.26814776435587	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.725074190491161	ENSG00000133574:ENST00000255945:exon_150269217_150271041:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000461940:exon_150269217_150270602:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000412660:exon_150269566_150270148:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000494750:exon_150269217_150270026:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000466938:exon_150269564_150270308:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000430830:exon_150269217_150271040:GIMAP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150389856	A/G	1	25	20	45	11.928240440903	10.4574076472776	1.47083279362545	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.765776887066167	ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150418045	G/A	1	17	8	25	8.11120349981406	4.18296305891103	3.92824044090303	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.159965839946729	ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150437979	G/A	1	19	14	33	9.0654627350863	7.32018535309431	1.74527738199199	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.603476938564334	ENSG00000196329:ENST00000498181:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150434698_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000466347:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150437967_150438015:GIMAP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150439737	C/T	1	16	20	36	7.63407388217794	10.4574076472776	-2.82333376509964	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.405180690722772	ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150439824	G/A	1	28	33	61	13.3596292938114	17.254722618008	-3.89509332419662	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.369870909606691	ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	150440043	C/T	1	29	29	58	13.8367589114475	15.1632410885525	-1.32648217710498	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.793070135712111	ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	156742749	G/A	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	156742796	A/C	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	156742965	G/C	1	7	10	17	3.33990732345285	5.22870382363879	-1.88879650018594	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.468009294351122	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	156756646	A/G	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156756599_156756720:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000472491:exon_156756599_156756929:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000469271:exon_156755702_156756819:NOM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158449358	G/A	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158449244_158449397:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000474940:exon_158449294_158449397:NCAPG2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158526880	G/A	1	32	16	48	15.2681477643559	8.36592611782206	6.90222164653381	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0592829052615233	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158528233	A/G	1	29	29	58	13.8367589114475	15.1632410885525	-1.32648217710498	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.793070135712111	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158534381	G/C	1	7	23	30	3.33990732345285	12.0260187943692	-8.68611147091637	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.00158167646664828	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158536267	T/C	1	13	19	32	6.20268502926957	9.9345372649137	-3.73185223564413	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.216723130875606	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158536334	G/A	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158536345	A/G	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158552234	G/A	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158552177_158552272:ESYT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	7	158663879	A/G	1	39	40	79	18.6080550878087	20.9148152945552	-2.30676020674644	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.652862548180956	ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158663833_158664253:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158663833_158664253:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000397143:exon_158663833_158664190:WDR60
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	618647	T/G	1	26	31	57	12.4053700585391	16.2089818532802	-3.8036117947411	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.353985212680962	ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	618728	A/G	1	34	27	61	16.2224069996281	14.1175003238247	2.10490667580338	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.610557156296642	ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	623644	G/A	1	85	58	143	40.5560174990703	30.326482177105	10.2295353219653	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.094077922275534	ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	623748	C/T	1	49	66	115	23.3793512641699	34.509445236016	-11.1300939718461	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0400413268469693	ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	6479042	C/T	1	11	6	17	5.24842579399733	3.13722229418327	2.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.340952760955587	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	6479178	C/A	1	8	14	22	3.81703694108897	7.32018535309431	-3.50314841200534	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.142018758895041	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	8176554	C/T	1	28	29	57	13.3596292938114	15.1632410885525	-1.8036117947411	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.691473519003605	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	8176770	C/T	1	27	27	54	12.8824996761753	14.1175003238247	-1.23500064764946	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.786031149025843	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	8234077	G/C	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	8654898	C/T	1	25	16	41	11.928240440903	8.36592611782206	3.56231432308096	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.278385673039657	ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000521881:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520715:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520091:exon_8654875_8655001:MFHAS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11406593	T/C	1	11	49	60	5.24842579399733	25.6206487358301	-20.3722229418327	T:C	T	C	10	0.522870382363879	7.95666216049534e-08	ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11640784	A/G	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11640121_11640908:NEIL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11643803	C/T	1	24	19	43	11.4511108232669	9.9345372649137	1.5165735583532	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.76054518814559	ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11660362	T/C	1	126	117	243	60.1183318221513	61.1758347365738	-1.05750291442259	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.897986441808878	ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11683622	T/C	1	147	148	295	70.1380537925098	77.3848165898541	-7.24676279734429	A:T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.414738763288557	ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11696061	G/A	1	379	415	794	180.83212508409	216.99120868101	-36.1590835969199	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0105130367372142	ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11695897_11696818:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11695897_11696719:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11695897_11696292:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11695897_11696348:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11695897_11696414:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11695897_11696469:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11695897_11696349:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11695897_11696476:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11695897_11696623:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11695897_11696122:FDFT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11704650	C/T	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526481:exon_11704615_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530624:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11704602_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530290:exon_11704626_11704677:CTSB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11705282	G/A	1	22	23	45	10.4968515879947	12.0260187943692	-1.52916720637455	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.657728038822936	ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11705188_11705299:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526481:exon_11705188_11705340:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530290:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11705188_11705331:CTSB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	11706581	T/C	1	8	12	20	3.81703694108897	6.27444458836655	-2.45740764727758	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.371138995758136	ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	21766900	G/A	1	9	20	29	4.29416655872509	10.4574076472776	-6.16324108855249	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0252558215637282	ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	21996468	T/G	1	24	20	44	11.4511108232669	10.4574076472776	0.993703175989326	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.880274164796367	ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21996439_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000523293:exon_21996439_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000518664:exon_21996416_21996574:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21996420_21997042:REEP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	21996617	T/A	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000168476:ENST00000519074:exon_21996420_21997042:REEP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	22428488	G/A	1	23	18	41	10.9739812056308	9.41166688254982	1.56231432308096	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.642997695404227	ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523740:exon_22428423_22428584:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523900:exon_22428423_22428539:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517962:exon_22428457_22428734:SORBS3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	22472473	G/A	1	15	12	27	7.15694426454182	6.27444458836655	0.882499676175268	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.847915973483971	ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22472351_22472514:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22472351_22472514:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22472351_22472514:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22472351_22472514:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22472351_22472514:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	22473281	C/G	1	19	12	31	9.0654627350863	6.27444458836655	2.79101814671975	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.370530485639912	ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	22473347	C/T	1	9	18	27	4.29416655872509	9.41166688254982	-5.11750032382473	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0547218480840686	ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	22481449	A/G	1	35	32	67	16.6995366172642	16.7318522356441	-0.0323156183798901	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	22862115	C/T	1	9	2	11	4.29416655872509	1.04574076472776	3.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0684680229761391	ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22861938_22862139:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000524077:exon_22861938_22862139:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22861938_22862139:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22861938_22862139:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000517528:exon_22861938_22862357:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000523918:exon_22861938_22862139:RHOBTB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	22874892	A/G	1	29	46	75	13.8367589114475	24.0520375887384	-10.2152786772909	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0204781749741204	ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22874765_22875954:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22874765_22877705:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22874765_22877712:RHOBTB2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	23429329	T/C	1	25	16	41	11.928240440903	8.36592611782206	3.56231432308096	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.278385673039657	ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	25364834	A/T	1	43	46	89	20.5165735583532	24.0520375887384	-3.53546403038523	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.459808553792488	ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	25364960	A/G	1	37	42	79	17.6537958525365	21.9605560592829	-4.30676020674644	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.368056977971249	ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	25365278	G/A	1	18	18	36	8.58833311745018	9.41166688254982	-0.82333376509964	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.867968606269239	ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	26485420	G/C	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26485388_26485456:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26485388_26485456:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26485388_26485456:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26485388_26485456:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523093:exon_26485388_26485456:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000521983:exon_26485388_26485456:DPYSL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	26510792	T/C	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26510748_26510913:DPYSL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27255128	T/C	1	11	11	22	5.24842579399733	5.75157420600267	-0.503148412005338	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.834895518146905	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27255146	G/A	1	14	11	25	6.67981464690569	5.75157420600267	0.928240440903026	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.84195256213668	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27255263	A/G	1	14	21	35	6.67981464690569	10.9802780296415	-4.30046338273576	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.175897503034529	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27295389	C/T	1	85	60	145	40.5560174990703	31.3722229418327	9.18379455723755	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.134833715116818	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27295282_27295397:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27295282_27295397:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27295282_27295397:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27295282_27295397:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27295282_27295397:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27295282_27295397:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000495097:exon_27295282_27295509:PTK2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27308585	A/C	1	123	176	299	58.6869429692429	92.0251872960427	-33.3382443267998	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.000126079184228479	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27315876	A/G	1	205	127	332	97.8115716154048	66.4045385602126	31.4070330551922	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.000636779422113371	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27315900	A/G	1	209	148	357	99.7200900859493	77.3848165898541	22.3352734960952	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0196313754601568	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27362654	C/T	0	10	0	10	4.77129617636121	0	4.77129617636121	C	C		10	0.522870382363879	0.00213881047429683	ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27362473_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000520623:exon_27362473_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27362473_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27362473_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27362473_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27362461_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27362473_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000520666:exon_27362473_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521684:exon_27362473_27362663:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521924:exon_27362564_27362663:EPHX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27401964	A/C	1	6	11	17	2.86277770581673	5.75157420600267	-2.88879650018594	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.224343505781	ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	27667969	C/G	1	22	9	31	10.4968515879947	4.70583344127491	5.79101814671975	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0467690493655172	ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	28206695	C/T	1	64	46	110	30.5362955287117	24.0520375887384	6.48425793997331	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.251957691204832	ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28206642_28206745:FBXO16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	28206719	G/A	1	62	45	107	29.5820362934395	23.5291672063746	6.05286908706495	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.247259890498458	ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28206642_28206745:FBXO16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	28304769	C/T	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	29195971	G/A	1	79	62	141	37.6932397932536	32.4179637065605	5.27527608669307	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.399682438471962	ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29195799_29196018:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29195799_29196018:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29195799_29196018:DUSP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	29927300	C/G	1	45	57	102	21.4708327936254	29.8036117947411	-8.33277900111565	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.112503554060695	ENSG00000133872:ENST00000256255:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518174:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521265:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000520303:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000523127:exon_29927158_29927551:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518340:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518296:exon_29927158_29927465:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522794:exon_29927158_29927575:TMEM66
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	29931408	A/G	1	24	22	46	11.4511108232669	11.5031484120053	-0.0520375887384326	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000133872:ENST00000256255:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518174:exon_29931393_29931567:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521265:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522794:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522055:exon_29931393_29931504:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000523761:exon_29931393_29931544:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000517569:exon_29931210_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521083:exon_29931395_29931571:TMEM66
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	30038030	A/T	1	24	27	51	11.4511108232669	14.1175003238247	-2.66638950055783	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.485439084268527	ENSG00000104671:ENST00000221114:exon_30038004_30038146:DCTN6;ENSG00000104671:ENST00000522141:exon_30038004_30038146:DCTN6;ENSG00000104671:ENST00000520829:exon_30038004_30038537:DCTN6;ENSG00000104671:ENST00000523666:exon_30038004_30038146:DCTN6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	31024654	T/C	1	10	9	19	4.77129617636121	4.70583344127491	0.0654627350863004	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	33408901	C/G	1	8	16	24	3.81703694108897	8.36592611782206	-4.54888917673309	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0683805470074675	ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33408862_33408907:RNF122
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	37620247	G/A	1	17	13	30	8.11120349981406	6.79731497073043	1.31388852908363	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.716174646304455	ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37620111_37620276:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000520073:exon_37620113_37620276:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523358:exon_37620118_37620276:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000518036:exon_37620128_37620276:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523994:exon_37620173_37620276:PROSC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	37728019	T/G	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	37732275	C/A	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37732033_37732840:RAB11FIP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	38205461	T/C	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000147548:ENST00000433384:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000317025:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000527502:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000316985:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000419340:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000529223:exon_38205015_38205733:WHSC1L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	41525914	C/T	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41525785_41526082:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41525859_41526082:ANK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	42260882	T/C	1	64	79	143	30.5362955287117	41.3067602067464	-10.7704646780347	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0786117658891433	ENSG00000078668:ENST00000417062:exon_42260829_42260979:VDAC3;ENSG00000078668:ENST00000521158:exon_42260829_42260979:VDAC3;ENSG00000078668:ENST00000022615:exon_42260829_42260979:VDAC3;ENSG00000078668:ENST00000522010:exon_42260829_42260959:VDAC3;ENSG00000078668:ENST00000524291:exon_42260550_42260979:VDAC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	53537316	A/G	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	53555069	A/G	1	16	11	27	7.63407388217794	5.75157420600267	1.88249967617527	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.564694319892801	ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	54791988	G/A	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000147509:ENST00000297313:exon_54791818_54792162:RGS20
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	56686224	T/C	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56685701_56686278:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56686029_56686278:TGS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	56708701	T/C	1	3	7	10	1.43138885290836	3.66009267654715	-2.22870382363879	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.209617324333837	ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56708537_56708711:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56708537_56708711:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000519494:exon_56708537_56708711:TGS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	56711656	G/A	1	8	6	14	3.81703694108897	3.13722229418327	0.679814646905695	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.793575991595449	ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56711473_56711779:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56711473_56711779:TGS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	56866452	G/A	1	29	23	52	13.8367589114475	12.0260187943692	1.81074011707829	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.678002102507008	ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	59508134	T/C	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523177:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59508119_59508218:NSMAF
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	61707572	T/C	1	48	61	109	22.9022216465338	31.8950933241966	-8.99287167766281	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.102659306481145	ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527900:exon_61707545_61707686:CHD7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	61712973	G/A	1	25	44	69	11.928240440903	23.0062968240107	-11.0780563831076	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00793110534573201	ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61712947_61713084:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61712947_61713084:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61712947_61713084:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61712947_61713084:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527900:exon_61712947_61713085:CHD7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	67341714	G/C	1	7	16	23	3.33990732345285	8.36592611782206	-5.02601879436922	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0384569686155362	ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	67342257	G/A	1	42	31	73	20.0394439407171	16.2089818532802	3.83046208743684	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.412761690847929	ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	67971452	T/C	1	54	55	109	25.7649993523505	28.7578710300133	-2.99287167766281	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.566972812140884	ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	68074137	G/A	1	13	6	19	6.20268502926957	3.13722229418327	3.0654627350863	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.175490139559428	ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	71508553	T/C	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000067167:ENST00000521425:exon_71508498_71508556:TRAM1;ENSG00000067167:ENST00000262213:exon_71508498_71508556:TRAM1;ENSG00000067167:ENST00000520700:exon_71508498_71508556:TRAM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	74893419	C/G	1	19	23	42	9.0654627350863	12.0260187943692	-2.96055605928292	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.440320270902642	ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	74893821	A/G	1	35	32	67	16.6995366172642	16.7318522356441	-0.0323156183798901	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	74893850	C/G	1	21	23	44	10.0197219703585	12.0260187943692	-2.00629682401067	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.550605760658815	ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	77895682	C/T	1	40	38	78	19.0851847054448	19.8690745298274	-0.783889824382559	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.909936983050048	ENSG00000164751:ENST00000357039:exon_77892494_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000419564:exon_77892496_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000520103:exon_77895170_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000522527:exon_77895193_77896431:PEX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	87497176	G/A	1	49	30	79	23.3793512641699	15.6861114709164	7.69323979325356	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0912872047096262	ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	87519315	T/G	1	23	31	54	10.9739812056308	16.2089818532802	-5.23500064764946	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.173600500177575	ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	87540872	G/A	1	7	6	13	3.33990732345285	3.13722229418327	0.202685029269574	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87540754_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523001:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517771:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523469:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000522240:exon_87540764_87540905:CPNE3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	87558846	G/C	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87558823_87558909:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87558823_87558909:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517391:exon_87558823_87558909:CPNE3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	90926879	T/C	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000164823:ENST00000297438:exon_90926783_90926974:OSGIN2;ENSG00000164823:ENST00000451899:exon_90926783_90926974:OSGIN2;ENSG00000164823:ENST00000421531:exon_90926783_90926974:OSGIN2;ENSG00000164823:ENST00000520659:exon_90926783_90926974:OSGIN2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	90958422	T/C	1	19	25	44	9.0654627350863	13.071759559097	-4.00629682401067	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.231823257801756	ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	90967686	T/C	1	15	14	29	7.15694426454182	7.32018535309431	-0.16324108855249	T:C:G	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	94746373	G/T	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000517700:exon_94742492_94746416:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000329529:exon_94745633_94746416:RBM12B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	99146809	C/T	1	5	8	13	2.38564808818061	4.18296305891103	-1.79731497073043	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.408494179387309	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99146700_99146887:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99146700_99146887:POP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	99168383	T/C	1	12	8	20	5.72555541163345	4.18296305891103	1.54259235272242	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.5124209340039	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000517435:exon_99168186_99168640:POP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	99169923	C/T	1	7	28	35	3.33990732345285	14.6403707061886	-11.3004633827358	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.000125845985113265	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	99169956	T/C	1	6	33	39	2.86277770581673	17.254722618008	-14.3919449121913	T:C	T	C	10	0.522870382363879	2.63330769541823e-06	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	100899793	G/A	1	664	754	1418	316.814066110384	394.244268302365	-77.4302021919804	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	4.17565943268477e-05	ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	104432545	A/G	1	21	12	33	10.0197219703585	6.27444458836655	3.745277381992	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.223985906232122	ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	104432659	G/A	1	25	25	50	11.928240440903	13.071759559097	-1.14351911819395	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.778365054863745	ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	104452460	T/C	1	78	81	159	37.2161101756174	42.3525009714742	-5.13639079585675	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.428046638109405	ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104452364_104452499:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521999:exon_104452364_104452504:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104452364_104452499:DCAF13
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	110539186	G/A	0	0	10	10	0	5.22870382363879	-5.22870382363879	A	G	A	10	0.522870382363879	0.000611453958002094	ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	123964813	A/G	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	123966141	G/A	1	5	6	11	2.38564808818061	3.13722229418327	-0.751574206002668	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.766553101121585	ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	123966159	G/C	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	124031541	T/C	1	22	20	42	10.4968515879947	10.4574076472776	0.0394439407170832	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	124142489	T/C	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	126034052	C/T	1	23	19	42	10.9739812056308	9.9345372649137	1.03944394071708	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.760367147756807	ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	126448719	A/G	1	20	28	48	9.54259235272242	14.6403707061886	-5.09777835346619	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.150378489856867	ENSG00000173334:ENST00000311922:exon_126448248_126450647:TRIB1;ENSG00000173334:ENST00000520847:exon_126448248_126449170:TRIB1;ENSG00000173334:ENST00000519576:exon_126448248_126449433:TRIB1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	135602542	C/T	1	5	13	18	2.38564808818061	6.79731497073043	-4.41166688254982	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0562174762259916	ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	135612745	A/G	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	141524484	G/A	1	10	11	21	4.77129617636121	5.75157420600267	-0.980278029641458	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.6704746895189	ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141524468_141524594:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000518971:exon_141524468_141525284:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141524468_141524594:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141524393_141524594:CHRAC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	141525327	A/G	1	25	13	38	11.928240440903	6.79731497073043	5.1309254701726	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.105697432675973	ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141525225_141527236:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519533:exon_141525225_141526566:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141525225_141525864:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141525225_141525640:CHRAC1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	142146794	A/G	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000105339:ENST00000519291:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518347:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518198:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142146657_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000395213:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000395207:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142146608_142146890:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142146608_142146890:DENND3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	142161031	C/T	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	142161032	A/C	1	6	2	8	2.86277770581673	1.04574076472776	1.81703694108897	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.293174373693898	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	142200467	G/A	1	30	26	56	14.3138885290836	13.5946299414609	0.719258587622779	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.894085235562898	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142200383_142200516:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142200383_142200723:DENND3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	142204326	C/G	1	33	63	96	15.745277381992	32.9408340889244	-17.1955567069324	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.000468801525276059	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	143413136	C/T	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000171045:ENST00000524325:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000307180:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000445818:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000520166:exon_143413115_143413192:TSNARE1;ENSG00000171045:ENST00000519651:exon_143413115_143413192:TSNARE1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144391638	G/A	1	80	51	131	38.1703694108897	26.6663895005578	11.5039799103319	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0446217068530153	ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144391585_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144391494_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144391526_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144391526_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144391530_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144391547_144391713:TOP1MT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144403449	G/A	1	27	28	55	12.8824996761753	14.6403707061886	-1.75787103001334	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.686423529867018	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144403485	G/C	1	32	21	53	15.2681477643559	10.9802780296415	4.28786973471442	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.272092075036767	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144406705	C/T	1	29	23	52	13.8367589114475	12.0260187943692	1.81074011707829	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.678002102507008	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144407538	C/G	1	21	20	41	10.0197219703585	10.4574076472776	-0.437685676919036	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144407516_144407703:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144407516_144407703:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144407516_144407703:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144407516_144407703:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144407516_144407703:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144407516_144407648:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144407516_144407703:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144407516_144407703:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144407516_144407703:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522121:exon_144407525_144407703:TOP1MT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144413416	G/A	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144590053	G/A	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144589916_144590069:ZC3H3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144618530	G/A	1	7	3	10	3.33990732345285	1.56861114709164	1.77129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.348884468412418	ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144618427_144618623:ZC3H3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144620342	T/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144621015	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144642739	C/T	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144642210_144642941:GSDMD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144661963	C/T	1	1128	1120	2248	538.202208693545	585.614828247544	-47.4126195539999	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0471607055156407	ENSG00000104529:ENST00000532400:exon_144661892_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144661898_144661994:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144661898_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144661899_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144661899_144662000:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144661906_144662000:EEF1D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144671244	C/G	1	7	9	16	3.33990732345285	4.70583344127491	-1.36592611782206	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.618765819689155	ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144671685	G/C	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144671956	G/A	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144681777	G/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144687092	T/C	1	3	12	15	1.43138885290836	6.27444458836655	-4.84305573545818	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0173197004970994	ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144697041	A/G	1	25	15	40	11.928240440903	7.84305573545818	4.08518470544484	A:T:G	A	G	10	0.522870382363879	0.20898953163402	ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000526290:exon_144696991_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527006:exon_144697033_144697085:TSTA3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144885580	A/G	1	17	25	42	8.11120349981406	13.071759559097	-4.96055605928291	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.163714437818685	ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144890976	C/T	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144890779_144891195:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144890779_144891195:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144890779_144891195:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144890779_144891195:SCRIB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144896017	G/A	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144895988_144896066:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144895988_144896066:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144895988_144896066:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144895988_144896066:SCRIB
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144990528	A/G	1	8	12	20	3.81703694108897	6.27444458836655	-2.45740764727758	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.371138995758136	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144991176	T/C	1	7	11	18	3.33990732345285	5.75157420600267	-2.41166688254982	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.345937466818486	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144992361	T/C	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144996837	C/T	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	144998163	C/T	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	C	C		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145139727	C/T	1	52	72	124	24.8107401170783	37.6466675301993	-12.835927413121	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0242940605468513	ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139625_145139752:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139625_145139998:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139625_145140382:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000531593:exon_145139640_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145139696_145139778:GPAA1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145161823	G/A	1	148	149	297	70.6151834101459	77.907686972218	-7.29250356207204	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.416252303132737	ENSG00000179632:ENST00000322428:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534585:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000532522:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534811:exon_145161738_145162295:MAF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145512914	C/T	1	17	14	31	8.11120349981406	7.32018535309431	0.791018146719753	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.858174971305446	ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145579240	T/C	1	14	12	26	6.67981464690569	6.27444458836655	0.405370058539147	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000214597:ENST00000531225:exon_145578502_145579269:GS1-393G12.10;ENSG00000182325:ENST00000524492:exon_145579091_145579338:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000455319:exon_145579091_145579338:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000331890:exon_145579091_145579338:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530142:exon_145579091_145579338:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000526524:exon_145579175_145579338:FBXL6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145581377	C/G	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000182325:ENST00000524492:exon_145580468_145581633:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000455319:exon_145581288_145581446:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000331890:exon_145581288_145581446:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530142:exon_145581288_145582889:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000529279:exon_145581288_145581586:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530687:exon_145581090_145581446:FBXL6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145617910	A/G	1	10	6	16	4.77129617636121	3.13722229418327	1.63407388217794	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.462122562744058	ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145617660_145617912:ADCK5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145623963	G/A	1	12	1	13	5.72555541163345	0.522870382363879	5.20268502926957	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00382098144854475	ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145652344	G/C	1	43	49	92	20.5165735583532	25.6206487358301	-5.10407517747687	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.29812876803726	ENSG00000160948:ENST00000529182:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526054:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000292510:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000377348:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526204:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530983:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000528142:exon_145651409_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530836:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530804:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000532861:exon_145652292_145652381:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000533806:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531032:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531924:exon_145652292_145652677:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526734:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530790:exon_145652292_145652674:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000524521:exon_145651854_145652362:VPS28
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145659553	G/A	1	7	7	14	3.33990732345285	3.66009267654715	-0.320185353094305	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145659361_145659662:NFKBIL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145661402	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145661538	G/A	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145735080	C/T	1	7	5	12	3.33990732345285	2.61435191181939	0.725555411633453	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.777231140799608	ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145734457_145735398:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145734463_145735398:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735002_145735398:MFSD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145736086	C/A	1	18	19	37	8.58833311745018	9.9345372649137	-1.34620414746352	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.742792725647821	ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145738827	C/T	1	14	14	28	6.67981464690569	7.32018535309431	-0.640370706188611	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.851562231554368	ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145738601_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145738770_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145738773_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145738601_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534626:exon_145738800_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000533600:exon_145738604_145738864:RECQL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145741702	C/G	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145748075	T/G	1	4	8	12	1.90851847054448	4.18296305891103	-2.27444458836655	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.250421566177253	ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145746295_145750557:LRRC14;ENSG00000160959:ENST00000528528:exon_145747966_145748717:LRRC14;ENSG00000177021:ENST00000343593:exon_145747773_145748793:AC084125.1;ENSG00000254402:ENST00000529415:exon_145747788_145748793:LRRC24;ENSG00000254402:ENST00000533758:exon_145747823_145748793:LRRC24
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	145999080	G/A	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000196378:ENST00000527190:exon_145997611_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000343459:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000429371:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000527740:exon_145998505_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000449516:exon_145998508_145999990:ZNF34
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	146017553	C/T	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146017377_146017736:RPL8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	146156247	C/A	1	15	10	25	7.15694426454182	5.22870382363879	1.92824044090303	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.549274934579923	ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	8	146278127	C/T	1	21	21	42	10.0197219703585	10.9802780296415	-0.960556059282915	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.877486638600646	ENSG00000182307:ENST00000331434:exon_146277972_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000444534:exon_146277972_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000524395:exon_146277851_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000534350:exon_146277853_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000530455:exon_146277853_146278283:C8orf33
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	421032	C/G	1	10	4	14	4.77129617636121	2.09148152945552	2.67981464690569	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.185943367180438	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	439376	G/A	1	18	16	34	8.58833311745018	8.36592611782206	0.222406999628117	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_439245_439388:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_439245_439388:DOCK8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	2837218	T/C	1	22	36	58	10.4968515879947	18.8233337650996	-8.32648217710498	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0347561920866915	ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2837180_2837401:KIAA0020
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	4834188	C/T	1	14	15	29	6.67981464690569	7.84305573545818	-1.16324108855249	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.712618173126797	ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4834141_4834265:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000442869:exon_4834141_4834265:RCL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	4860300	A/G	1	33	24	57	15.745277381992	12.5488891767331	3.1963882052589	A:T:G	A	G	10	0.522870382363879	0.428223621523388	ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	5769043	T/C	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000107036:ENST00000251879:exon_5768970_5769454:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5768970_5769256:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000381532:exon_5768970_5769452:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5768970_5769256:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5768970_5769256:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000276898:exon_5768970_5769106:KIAA1432
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	5968416	A/G	1	29	35	64	13.8367589114475	18.3004633827358	-4.46370447128825	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.316815681136315	ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	5969307	C/T	1	10	3	13	4.77129617636121	1.56861114709164	3.20268502926957	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0966692698681595	ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	7013874	C/T	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_7013788_7014337:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7013788_7014001:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7013788_7014001:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7013788_7014001:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7013788_7014001:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7013788_7014001:KDM4C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	7799653	G/T	1	141	166	307	67.2752760866931	86.7964834724039	-19.5212073857108	T:G	G	T	10	0.522870382363879	0.0259446071443615	ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	7799723	C/T	1	118	146	264	56.3012948810623	76.3390758251263	-20.037780944064	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.013741195319484	ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	15453138	G/A	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000164975:ENST00000380821:exon_15453039_15453203:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000467062:exon_15453039_15453203:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380807:exon_15453039_15453203:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000490969:exon_15453039_15453203:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380799:exon_15453039_15453575:SNAPC3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	19360255	A/G	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000137145:ENST00000494124:exon_19360242_19360487:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19360242_19360487:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19360242_19360487:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19360242_19360487:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19360242_19360487:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380427:exon_19360242_19360487:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000361024:exon_19360242_19360487:DENND4C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	20953049	A/G	1	7	14	21	3.33990732345285	7.32018535309431	-3.98027802964146	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.124227497168679	ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	26842540	T/C	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26840683_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26842264_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26842392_26842645:C9orf82
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	32425910	A/G	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379921:exon_32425836_32425943:ACO1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	32542499	C/T	1	11	10	21	5.24842579399733	5.22870382363879	0.0197219703585416	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	32989838	T/G	1	11	5	16	5.24842579399733	2.61435191181939	2.63407388217794	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.21775904956837	ENSG00000137074:ENST00000379825:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000436040:exon_32989757_32989895:APTX;ENSG00000137074:ENST00000420767:exon_32989757_32989895:APTX;ENSG00000137074:ENST00000379824:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000309615:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000494649:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000397172:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000465003:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000485479:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000379817:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000467331:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000472896:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000483148:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000482687:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000460940:exon_32989757_32990086:APTX;ENSG00000137074:ENST00000397182:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000344355:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000379819:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000479656:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000468275:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000474658:exon_32989757_32989895:APTX;ENSG00000137074:ENST00000463596:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000476858:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000379813:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000379827:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000495360:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000379812:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000473221:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000464632:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000478279:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000480031:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000477119:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000460945:exon_32989757_32989893:APTX;ENSG00000137074:ENST00000494973:exon_32989757_32989893:APTX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	33264658	C/G	1	44	41	85	20.9937031759893	21.437685676919	-0.443982500929714	C:G	C	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000107262:ENST00000379700:exon_33264222_33264737:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379707:exon_33264222_33264675:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379704:exon_33264222_33264761:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000488499:exon_33264274_33264668:AL161445.1;ENSG00000254882:ENST00000472232:exon_33264222_33264672:BAG1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	33264685	T/A	1	27	17	44	12.8824996761753	8.88879650018594	3.99370317598933	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.290708379087478	ENSG00000107262:ENST00000379700:exon_33264222_33264737:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379704:exon_33264222_33264761:AL161445.1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	33276531	C/T	1	127	96	223	60.5954614397874	50.1955567069324	10.399904732855	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.179932918895210	ENSG00000086065:ENST00000223500:exon_33276454_33276562:CHMP5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	33464113	T/C	1	8	7	15	3.81703694108897	3.66009267654715	0.156944264541816	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379470:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33464035_33464159:NOL6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	34996830	C/T	1	6	9	15	2.86277770581673	4.70583344127491	-1.84305573545818	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.440463079438578	ENSG00000137094:ENST00000335998:exon_34996262_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000378751:exon_34996262_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000312316:exon_34996262_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000469798:exon_34996392_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000453597:exon_34996262_34996863:DNAJB5;ENSG00000137094:ENST00000454002:exon_34996262_34996863:DNAJB5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	35612978	G/A	1	14	20	34	6.67981464690569	10.4574076472776	-3.77759300037188	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.230189912021864	ENSG00000137101:ENST00000396757:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000396759:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000259633:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000490239:exon_35612845_35612990:CD72
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	35662251	T/C	1	9	10	19	4.29416655872509	5.22870382363879	-0.9345372649137	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.819184206292418	ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	35732769	A/G	1	28	27	55	13.3596292938114	14.1175003238247	-0.757871030013343	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.892972380561247	ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35732332_35732898:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35732595_35732898:CREB3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	35752857	A/G	1	8	3	11	3.81703694108897	1.56861114709164	2.24842579399733	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.231945212997948	ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35752648_35757908:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35752648_35758572:RGP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	35846469	C/T	1	18	15	33	8.58833311745018	7.84305573545818	0.745277381991995	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.862634297175903	ENSG00000137103:ENST00000377996:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000439587:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000450762:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377991:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000358856:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377988:exon_35846466_35846608:TMEM8B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	35846541	G/A	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000137103:ENST00000377996:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000439587:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000450762:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377991:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000358856:exon_35846466_35846608:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377988:exon_35846466_35846608:TMEM8B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	38396631	G/C	1	10	20	30	4.77129617636121	10.4574076472776	-5.68611147091637	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0440462836435132	ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	71862975	C/T	1	8	13	21	3.81703694108897	6.79731497073043	-2.98027802964146	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.27445798442317	ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	71862987	G/A	1	9	12	21	4.29416655872509	6.27444458836655	-1.98027802964146	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.513306113115057	ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	71864353	A/C	1	18	12	30	8.58833311745018	6.27444458836655	2.31388852908363	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.466606982659409	ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71864291_71864401:TJP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	72933774	A/G	1	13	4	17	6.20268502926957	2.09148152945552	4.11120349981406	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0530050628667056	ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72933710_72933879:SMC5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	74586457	T/C	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000155621:ENST00000479413:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000334731:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377031:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000473252:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377027:exon_74586421_74586534:C9orf85
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	77684690	A/C	1	8	8	16	3.81703694108897	4.18296305891103	-0.365926117822063	A:C	A	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	80881589	A/C	1	20	21	41	9.54259235272242	10.9802780296415	-1.43768567691904	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.754994372586768	ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80881358_80881769:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80881358_80881991:CEP78
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	82335161	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000106829:ENST00000376552:exon_82334961_82335208:TLE4;ENSG00000106829:ENST00000376520:exon_82334961_82335208:TLE4;ENSG00000106829:ENST00000470872:exon_82334961_82335208:TLE4;ENSG00000106829:ENST00000376537:exon_82334961_82335208:TLE4;ENSG00000106829:ENST00000462803:exon_82334961_82335208:TLE4;ENSG00000106829:ENST00000376534:exon_82334961_82335208:TLE4;ENSG00000106829:ENST00000376544:exon_82334961_82335208:TLE4;ENSG00000106829:ENST00000376540:exon_82334961_82335208:TLE4;ENSG00000106829:ENST00000265284:exon_82334961_82335208:TLE4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	86278817	C/A	1	30	16	46	14.3138885290836	8.36592611782206	5.94796241126157	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.103478405587005	ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	86322532	T/G	1	10	5	15	4.77129617636121	2.61435191181939	2.15694426454182	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.309395367009253	ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86322415_86323118:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86322415_86322849:UBQLN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	88636887	G/A	1	11	25	36	5.24842579399733	13.071759559097	-7.82333376509964	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0114399198133532	ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	88651420	G/A	1	4	13	17	1.90851847054448	6.79731497073043	-4.88879650018594	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0260745260759215	ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88651263_88651728:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88651263_88651422:GOLM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	88938209	C/T	1	10	10	20	4.77129617636121	5.22870382363879	-0.457407647277579	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88937788_88938875:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375960:exon_88937788_88938875:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88937788_88938875:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88937788_88938875:ZCCHC6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	90321583	C/T	1	11	6	17	5.24842579399733	3.13722229418327	2.11120349981406	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.340952760955587	ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	91953423	G/A	1	3	6	9	1.43138885290836	3.13722229418327	-1.70583344127491	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.325472817402161	ENSG00000187742:ENST00000375807:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000395669:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000339901:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000534113:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000425851:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000440898:exon_91953373_91953425:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000477484:exon_91953373_91953495:SECISBP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	91973048	C/T	1	23	16	39	10.9739812056308	8.36592611782206	2.60805508780872	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.427196507618391	ENSG00000187742:ENST00000375807:exon_91972914_91973106:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000395669:exon_91972914_91973106:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000339901:exon_91972914_91973106:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000534113:exon_91972914_91973106:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000496597:exon_91972914_91973068:SECISBP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	91993615	G/A	1	39	44	83	18.6080550878087	23.0062968240107	-4.39824173620195	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.37957712741358	ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95009786	A/G	1	50	46	96	23.8564808818061	24.0520375887384	-0.195556706932379	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95009659_95009833:IARS;ENSG00000196305:ENST00000449893:exon_95009659_95009833:IARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95019042	C/T	1	14	14	28	6.67981464690569	7.32018535309431	-0.640370706188611	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.851562231554368	ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95072500	C/T	1	27	10	37	12.8824996761753	5.22870382363879	7.65379585253648	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0129945087857822	ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000432670:exon_95072453_95072543:NOL8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95107992	A/G	1	8	1	9	3.81703694108897	0.522870382363879	3.29416655872509	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0408321115280427	ENSG00000188312:ENST00000375587:exon_95107981_95108069:CENPP;ENSG00000188312:ENST00000402724:exon_95107981_95108069:CENPP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95738781	C/A	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	A:C	C	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95768324	C/T	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95768306_95768462:FGD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95782667	C/T	1	12	9	21	5.72555541163345	4.70583344127491	1.01972197035854	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.827764216258447	ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95840256	A/G	1	48	40	88	22.9022216465338	20.9148152945552	1.98740635197865	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.749079862214211	ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95841847	G/A	1	52	39	91	24.8107401170783	20.3919449121913	4.41879520488702	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.401416138342382	ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95841753_95841884:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95841753_95841884:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95841753_95841884:SUSD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	95875381	G/C	1	14	20	34	6.67981464690569	10.4574076472776	-3.77759300037188	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.230189912021864	ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	96238578	C/T	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.162919183691695	ENSG00000048828:ENST00000437660:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000375389:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96238538_96238620:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000446420:exon_96238538_96238620:FAM120A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	99212909	G/C	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	C:G	G	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99212483_99212910:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99212487_99212910:HABP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	99250463	C/T	1	8	36	44	3.81703694108897	18.8233337650996	-15.0062968240107	T:C	C	T	10	0.522870382363879	5.28008939802314e-06	ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000466976:exon_99250371_99250556:HABP4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	100420976	G/A	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	100672338	C/T	1	5	5	10	2.38564808818061	2.61435191181939	-0.228703823638789	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	100819192	C/T	1	53	28	81	25.2878697347144	14.6403707061886	10.6474990285258	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0192742662847525	ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	101984147	G/C	1	3	9	12	1.43138885290836	4.70583344127491	-3.27444458836655	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.0812439974911473	ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	103070820	G/A	1	22	24	46	10.4968515879947	12.5488891767331	-2.05203758873843	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.558519211713761	ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103070782_103070963:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103070782_103070963:TEX10
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	106888978	C/T	1	28	16	44	13.3596292938114	8.36592611782206	4.99370317598933	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.173712672368528	ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	106901506	A/G	1	16	6	22	7.63407388217794	3.13722229418327	4.49685158799466	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0578567641132185	ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106901420_106903690:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106901420_106903698:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106901420_106901932:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106901420_106901933:SMC2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	111641825	G/A	1	15	18	33	7.15694426454182	9.41166688254982	-2.254722618008	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.487711537553837	ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	111651620	A/T	1	9	8	17	4.29416655872509	4.18296305891103	0.111203499814058	A:T	A	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	111659483	T/G	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	112899282	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	112900199	T/C	1	3	5	8	1.43138885290836	2.61435191181939	-1.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.491122791101019	ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	112900602	C/T	1	7	12	19	3.33990732345285	6.27444458836655	-2.9345372649137	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.250431561449006	ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	112900785	A/G	1	15	8	23	7.15694426454182	4.18296305891103	2.97398120563078	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.296636763085836	ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	115931703	G/A	1	51	51	102	24.3336104994422	26.6663895005578	-2.33277900111565	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.692078794255101	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	115931784	C/A	1	40	70	110	19.0851847054448	36.6009267654715	-17.5157420600267	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.00107780273568199	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	115950706	A/C	1	3	8	11	1.43138885290836	4.18296305891103	-2.75157420600267	A:C	A	C	10	0.522870382363879	0.131819548794695	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	116152940	G/A	1	8	2	10	3.81703694108897	1.04574076472776	2.77129617636121	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.113052711163905	ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000464749:exon_116152908_116153213:ALAD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	116153817	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000448137:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482001:exon_116153807_116153903:ALAD
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	117104339	C/T	1	59	53	112	28.1506474405311	27.7121302652856	0.438517175245558	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117104289_117104405:AKNA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	117129908	G/A	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.511918644404776	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117129823_117129977:AKNA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	117138949	T/C	1	5	7	12	2.38564808818061	3.66009267654715	-1.27444458836655	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.567981193465519	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117138746_117139340:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117138746_117139244:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117138746_117139915:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117138746_117139812:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394574:exon_117138387_117139812:AKNA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	123169432	C/G	1	25	11	36	11.928240440903	5.75157420600267	6.17666623490036	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.0449565692058279	ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	123170733	C/G	1	20	17	37	9.54259235272242	8.88879650018594	0.653795852536479	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.870508040497293	ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	123182202	C/T	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	123205912	C/G	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	123917020	T/A	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:T	T	A	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	124094800	T/C	1	16	17	33	7.63407388217794	8.88879650018594	-1.254722618008	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.728825872976088	ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN;ENSG00000148180:ENST00000477553:exon_124094712_124094867:GSN
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	124914613	C/T	1	54	49	103	25.7649993523505	25.6206487358301	0.144350616520466	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	125920376	G/A	1	18	16	34	8.58833311745018	8.36592611782206	0.222406999628117	A:G	G	A	10	0.522870382363879	1	ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	126219631	G/A	1	12	13	25	5.72555541163345	6.79731497073043	-1.07175955909697	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.693496363330912	ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000491650:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000497135:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000479305:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126219627_126219714:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000462245:exon_126219627_126219657:DENND1A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	127177161	A/G	1	134	111	245	63.9353687632402	58.0386124423906	5.89675632084965	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.481872313298427	ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	127920571	A/G	1	14	22	36	6.67981464690569	11.5031484120053	-4.82333376509964	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.13271271061072	ENSG00000119414:ENST00000373547:exon_127920520_127920661:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000373546:exon_127920520_127920661:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000415905:exon_127920520_127920661:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000451402:exon_127920520_127920661:PPP6C;ENSG00000119414:ENST00000456642:exon_127920520_127920661:PPP6C
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	127975654	C/T	1	26	11	37	12.4053700585391	5.75157420600267	6.65379585253648	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0320366247415925	ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	127996046	A/G	1	36	51	87	17.1766662349004	26.6663895005578	-9.48972326565747	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0527511635029802	ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	130206516	C/T	1	5	3	8	2.38564808818061	1.56861114709164	0.817036941088968	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.728843691335987	ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	130223492	G/A	1	6	10	16	2.86277770581673	5.22870382363879	-2.36592611782206	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.317817109593722	ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130223452_130223536:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130223452_130223536:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130223452_130223536:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130223452_130223536:LRSAM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	130230038	C/T	1	2	8	10	0.954259235272242	4.18296305891103	-3.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0558208850126612	ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130230019_130230109:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130230019_130230109:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130230019_130230109:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130230019_130230109:LRSAM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	130242166	A/G	1	6	5	11	2.86277770581673	2.61435191181939	0.248425793997332	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	130825847	G/A	1	14	15	29	6.67981464690569	7.84305573545818	-1.16324108855249	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.712618173126797	ENSG00000171169:ENST00000373078:exon_130823512_130826179:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000470245:exon_130825653_130826021:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000488519:exon_130824269_130826179:NAIF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	131346710	C/A	1	5	11	16	2.38564808818061	5.75157420600267	-3.36592611782206	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.131501130991483	ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131346561_131346804:SPTAN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	131395571	G/A	1	246	203	449	117.373885938486	106.142687619867	11.2311983186184	A:T:G	G	A	10	0.522870382363879	0.298815767781086	ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131395488_131395937:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131395488_131395937:SPTAN1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	131468044	A/G	1	3	10	13	1.43138885290836	5.22870382363879	-3.79731497073043	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0492215241656784	ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131468013_131468158:PKN3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	133346226	C/T	1	4	6	10	1.90851847054448	3.13722229418327	-1.22870382363879	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.534072843024293	ENSG00000130707:ENST00000334909:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000352480:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372394:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000344866:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372393:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000422569:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000443588:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000467695:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000493984:exon_133346221_133346291:ASS1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	134136515	A/G	1	17	19	36	8.11120349981406	9.9345372649137	-1.82333376509964	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.617808462551922	ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	134136677	A/G	1	4	5	9	1.90851847054448	2.61435191181939	-0.705833441274911	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.744796714975245	ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	134371286	C/T	1	16	20	36	7.63407388217794	10.4574076472776	-2.82333376509964	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.405180690722772	ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	134397464	C/T	1	9	6	15	4.29416655872509	3.13722229418327	1.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.612954984241467	ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372220:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000494883:exon_134397434_134397920:POMT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	134497321	C/T	1	7	2	9	3.33990732345285	1.04574076472776	2.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.183802238338459	ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134497183_134497385:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000419442:exon_134497183_134497385:RAPGEF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	135275596	C/T	1	35	24	59	16.6995366172642	12.5488891767331	4.15064744053114	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.299249468855206	ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135275422_135275645:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135275422_135275645:TTF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	135277341	C/A	1	56	66	122	26.7192585876228	34.509445236016	-7.79018664839323	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.174036126286530	ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	135470219	G/A	1	8	22	30	3.81703694108897	11.5031484120053	-7.68611147091637	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.00558626612020189	ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	135493797	C/T	0	10	0	10	4.77129617636121	0	4.77129617636121	C	C		10	0.522870382363879	0.00213881047429683	ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135493717_135493828:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135493717_135493828:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135493717_135493828:DDX31
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	135983504	T/C	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135983375_135983793:RALGDS
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	136199092	C/T	1	24	16	40	11.4511108232669	8.36592611782206	3.08518470544484	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.346855338449902	ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136197552_136199184:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136198642_136199184:SURF6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	136219564	G/C	1	134	125	259	63.9353687632402	65.3587977954849	-1.42342903224466	A:C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.901028584182193	ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136219549_136219621:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136219549_136219621:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136219549_136219585:SURF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	136221557	A/G	1	27	42	69	12.8824996761753	21.9605560592829	-9.07805638310765	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.0302322106225144	ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136221514_136221596:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136221514_136221596:SURF1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	136230585	A/G	1	20	21	41	9.54259235272242	10.9802780296415	-1.43768567691904	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.754994372586768	ENSG00000148248:ENST00000371989:exon_136228325_136230635:SURF4;ENSG00000148248:ENST00000465565:exon_136230329_136230635:SURF4;ENSG00000148248:ENST00000467910:exon_136230431_136230635:SURF4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	136277482	T/C	1	23	10	33	10.9739812056308	5.22870382363879	5.74527738199199	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.0545131899192798	ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277419_136277612:REXO4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	136279935	C/T	1	21	15	36	10.0197219703585	7.84305573545818	2.17666623490036	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.507866907513101	ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	136340200	T/G	1	2	7	9	0.954259235272242	3.66009267654715	-2.70583344127491	T:G	T	G	10	0.522870382363879	0.0962366341938895	ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	137005023	C/T	1	11	4	15	5.24842579399733	2.09148152945552	3.15694426454182	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.124217367266031	ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	138395969	A/G	1	168	149	317	80.1577757628683	77.907686972218	2.25008879065038	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.822184187924827	ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	138710285	G/A	1	1	7	8	0.477129617636121	3.66009267654715	-3.18296305891103	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0318197353467738	ENSG00000130559:ENST00000389532:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000389533:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000312405:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000483991:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000409386:exon_138710254_138710462:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000482664:exon_138710254_138710493:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000493088:exon_138710254_138710462:CAMSAP1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139266496	C/T	1	4	4	8	1.90851847054448	2.09148152945552	-0.182963058911032	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139272017	G/A	1	35	26	61	16.6995366172642	13.5946299414609	3.10490667580338	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.444686182457637	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139272058	A/G	1	26	24	50	12.4053700585391	12.5488891767331	-0.143519118193947	A:G	A	G	10	0.522870382363879	1	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139272502	T/C	1	6	6	12	2.86277770581673	3.13722229418327	-0.274444588366547	T:C	T	C	10	0.522870382363879	1	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139273288	C/T	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139275294	G/C	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139298593	A/G	1	13	19	32	6.20268502926957	9.9345372649137	-3.73185223564413	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.216723130875606	ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139301960	G/A	1	13	4	17	6.20268502926957	2.09148152945552	4.11120349981406	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0530050628667056	ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139311456	C/T	1	60	48	108	28.6277770581673	25.0977783534662	3.52999870470107	T:C:G	C	T	10	0.522870382363879	0.502208562878363	ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139568232	G/A	1	20	20	40	9.54259235272242	10.4574076472776	-0.914815294555158	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.874520561432744	ENSG00000169692:ENST00000371694:exon_139567595_139568379:AGPAT2;ENSG00000169692:ENST00000371696:exon_139567595_139568379:AGPAT2;ENSG00000169692:ENST00000472820:exon_139568161_139568379:AGPAT2
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139731969	C/T	1	26	37	63	12.4053700585391	19.3462041474635	-6.94083408892437	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.100362488575890	ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139732331	G/C	1	38	48	86	18.1309254701726	25.0977783534662	-6.96685288329359	C:G	G	C	10	0.522870382363879	0.160140475465150	ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139732314_139732432:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	139837125	G/A	1	12	27	39	5.72555541163345	14.1175003238247	-8.39194491219128	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.0094687178278561	ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836999_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836999_139837178:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000491246:exon_139836999_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000428398:exon_139837103_139837147:FBXW5
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	140006425	C/G	1	198	151	349	94.471664291952	78.9534277369457	15.5182365550062	C:G	C	G	10	0.522870382363879	0.096994646779575	ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	140006437	G/A	1	183	145	328	87.3147200274101	75.8162054427625	11.4985145846477	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.223920756185879	ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	140138158	T/C	1	3	14	17	1.43138885290836	7.32018535309431	-5.88879650018594	T:C	T	C	10	0.522870382363879	0.00582765753927055	ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140136948_140138159:TUBB2C;ENSG00000188163:ENST00000471784:exon_140138036_140138240:FAM166A;ENSG00000188163:ENST00000344774:exon_140138037_140138240:FAM166A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	140201604	C/T	1	5	4	9	2.38564808818061	2.09148152945552	0.294166558725089	T:C	C	T	10	0.522870382363879	1	ENSG00000187609:ENST00000491734:exon_140201348_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140201348_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140201357_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487745:exon_140201369_140201715:EXD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	140267455	C/A	1	7	4	11	3.33990732345285	2.09148152945552	1.24842579399733	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.553528165387741	ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	140446806	C/T	1	228	196	424	108.785552821036	102.48259494332	6.30295787771531	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.559774142982543	ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	9	140611490	C/T	1	8	4	12	3.81703694108897	2.09148152945552	1.72555541163345	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.393740325807836	ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	223989	A/G	1	2	6	8	0.954259235272242	3.13722229418327	-2.18296305891103	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.162919183691695	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	229557	C/T	1	16	22	38	7.63407388217794	11.5031484120053	-3.8690745298274	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.255709395696554	ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	295135	G/A	1	36	10	46	17.1766662349004	5.22870382363879	11.9479624112616	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.000335279235538886	ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	322161	A/G	1	8	5	13	3.81703694108897	2.61435191181939	1.20268502926957	A:G	A	G	10	0.522870382363879	0.586286404342129	ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	1471201	A/G	0	9	0	9	4.29416655872509	0	4.29416655872509	A	A		10	0.522870382363879	0.00420262558877486	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	1531648	C/T	1	84	103	187	40.0788878814342	53.8556493834795	-13.7767615020454	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.0479330797375643	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	1531700	A/T	1	74	90	164	35.307591705073	47.0583344127491	-11.7507427076761	A:T	A	T	10	0.522870382363879	0.0720902263888629	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	1537885	G/A	1	107	48	155	51.052869087065	25.0977783534662	25.9550907335988	A:G	G	A	10	0.522870382363879	2.56155605288449e-05	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	1540532	C/T	1	6	3	9	2.86277770581673	1.56861114709164	1.29416655872509	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.511918644404776	
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	1546993	C/A	1	57	49	106	27.1963882052589	25.6206487358301	1.57573946942883	A:C	C	A	10	0.522870382363879	0.771518171467272	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	1712853	C/T	1	18	11	29	8.58833311745018	5.75157420600267	2.83675891144751	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.353965848768906	ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	1713021	C/T	1	23	13	36	10.9739812056308	6.79731497073043	4.17666623490036	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.183892237146551	ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	2139187	G/A	1	10	7	17	4.77129617636121	3.66009267654715	1.11120349981406	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.63522227958473	ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	2407207	G/A	1	4	9	13	1.90851847054448	4.70583344127491	-2.79731497073043	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.165156498899072	ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	2656274	G/A	1	484	444	928	230.930734935883	232.154449769562	-1.22371483367968	A:G	G	A	10	0.522870382363879	0.94761105119697	ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99
HGDP00462_parsed_pileup.txt	.	X	7870176	C/T	1	48	48	96	22.9022216465338	25.0977783534662	-2.19555670693238	T:C	C	T	10	0.522870382363879	0.683492775996088	ENSG00000006757:ENST00000381042:exon_7870030_7870182:PNPLA4;ENSG00000006757:ENST00000444736:exon_7870030_7870182:PNPLA4;ENSG00000006757:ENST00000442940:exon_7870090_7870182:PNPLA4