INDIVIDUAL	RSID	CHR	POS	ALLELES	BOTH_ALLELES_SEEN	REF_COUNT	NONREF_COUNT	TOTAL_COUNT	WEIGHTED_REF_COUNT	WEIGHTED_NONREF_COUNT	WRC_MINUS_WNC	ALLELES_SEEN	REF_ALLELE	ALT_ALLELE	MAQ_FILTER	REF_RATIO	PVALUE	EXON_INFO
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	881589	G/A	1	48	59	107	23.5431593767242	30.0615332661099	-6.51837388938569	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.210492550906459	ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	949608	G/A	1	1285	979	2264	630.269995814387	498.81764521223	131.452350602157	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	3.14141492704719e-08	ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	949718	G/A	1	846	828	1674	414.948184014764	421.880500751508	-6.93231673674433	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.750653731830784	ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	980824	G/A	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_980739_980903:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_980739_980903:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000479707:exon_980779_980903:AGRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	981460	G/A	1	15	9	24	7.35723730522631	4.58565761686422	2.77157968836209	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.309571402085472	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_981344_981468:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_981344_981468:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000479707:exon_981344_981468:AGRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	981931	A/G	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_981777_982115:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_981777_982115:AGRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	982994	T/C	1	7	16	23	3.43337740910561	8.15228020775861	-4.718902798653	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0599524855651278	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000466223:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000478677:exon_982855_983067:AGRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	984302	T/C	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000492947:exon_983909_984439:AGRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	985826	G/A	1	23	25	48	11.281097201347	12.7379378246228	-1.45684062327582	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.773162848116751	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_985807_985971:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_985807_985971:AGRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	1469412	C/T	1	61	58	119	29.9194317079203	29.552015753125	0.367415954795351	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197785:ENST00000378756:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378759:exon_1469306_1470064:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378755:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000339113:exon_1469306_1470065:ATAD3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	1572125	A/G	1	70	18	88	34.3337740910561	9.17131523372843	25.1624588573277	A:G	A	G	10	0.509517512984913	4.2562615143923e-08	ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000340677:exon_1572044_1572160:CDK11A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	1635565	C/T	1	13	24	37	6.37627233119613	12.2284203116379	-5.85214798044178	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.069380370380613	ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	1650844	C/T	1	52	35	87	25.5050893247845	17.833112954472	7.67197637031257	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.108080594231735	ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1650767_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1650798_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1650798_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1650767_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1650767_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000467737:exon_1650767_1650869:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1650797_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1650767_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1650767_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1650767_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1650797_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1650797_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1650797_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1650767_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1650797_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1650797_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1650767_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000479362:exon_1650797_1650894:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000498810:exon_1650605_1650894:CDK11A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	1724719	G/A	1	144	124	268	70.6294781301725	63.1801716101292	7.44930652004332	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.392414229643557	ENSG00000078369:ENST00000378609:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000455156:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000378606:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000424622:exon_1724684_1724753:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000461893:exon_1724684_1725636:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000471354:exon_1724684_1724750:GNB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	1735946	G/A	1	60	57	117	29.4289492209052	29.04249824014	0.386450980765179	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000078369:ENST00000378609:exon_1735858_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000455156:exon_1735858_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000378606:exon_1735858_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000471354:exon_1735858_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000439272:exon_1735847_1736020:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000434686:exon_1735847_1736020:GNB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	2337194	C/T	1	12	16	28	5.88578984418104	8.15228020775861	-2.26649036357756	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.451877020800592	ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2336236_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2336258_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2336277_2337267:PEX10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	2340200	T/C	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	2488153	A/G	1	109	116	225	53.4625910846445	59.1040315062499	-5.64144042160542	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.463839471169555	ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	2491305	C/T	1	166	134	300	81.4200928445044	68.2753467399783	13.1447461045261	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.133452663866576	ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2490791_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2489782_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2489782_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000471768:exon_2491019_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2491210_2491417:TNFRSF14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	3544154	C/T	1	15	9	24	7.35723730522631	4.58565761686422	2.77157968836209	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.309571402085472	ENSG00000158109:ENST00000378344:exon_3544064_3544217:TPRG1L;ENSG00000158109:ENST00000344579:exon_3544064_3544217:TPRG1L;ENSG00000158109:ENST00000456805:exon_3544064_3544217:TPRG1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	3548008	G/A	1	17	15	32	8.33820227925648	7.64276269477369	0.695439584482783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.860859198749914	ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	3638674	C/T	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3638585_3638771:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3638585_3638771:TP73
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	3697700	G/A	1	41	44	85	20.1097819676186	22.4187705713362	-2.30898860371761	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.664831784387041	ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3696784_3697900:LRRC47;ENSG00000130764:ENST00000462356:exon_3697699_3697900:LRRC47
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	3701663	T/C	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	3731965	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3728645_3732081:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3731344_3732081:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000484420:exon_3731803_3732081:KIAA0562
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	3751605	C/T	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.112356383277526	ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3751489_3751656:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3751489_3751656:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000460038:exon_3751489_3751656:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3751489_3751656:KIAA0562
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	3800242	A/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000169598:ENST00000378209:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000491998:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000430539:exon_3800071_3801984:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000468793:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000477548:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000339350:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000378206:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000475969:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000448632:exon_3800071_3800305:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000461150:exon_3800071_3800364:DFFB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	6272078	G/A	1	2	9	11	0.980964974030174	4.58565761686422	-3.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0353326891625868	ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6271927_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000463453:exon_6271983_6272113:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6271927_6272113:RNF207
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	6272813	C/T	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6272742_6273243:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6272742_6272896:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6272798_6272963:RNF207
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	6278414	A/G	1	14	14	28	6.86675481821122	7.13324518178878	-0.266490363577564	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000158286:ENST00000377948:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000377939:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6278349_6278429:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6278349_6278429:RNF207
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	6649302	C/A	1	30	31	61	14.7144746104526	15.7950429025323	-1.08056829207969	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.799191518420947	ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	6705874	G/C	1	17	9	26	8.33820227925648	4.58565761686422	3.75254466239226	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.170643616094001	ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	8037698	A/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	8418331	C/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	8421434	C/T	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	9784423	C/T	1	59	54	113	28.9384667338901	27.5139457011853	1.42452103270483	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.850861776238072	ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	9804693	C/T	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	9811541	A/G	1	21	17	38	10.3001322273168	8.66179772074352	1.6383345065733	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.62948546500411	ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	10713854	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11087524	G/A	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11128160	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11128712	G/A	1	153	152	305	75.0438205133083	77.4466619737068	-2.40284146039845	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.818861316870986	ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11128702_11128763:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11128702_11128763:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11128702_11128763:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000490565:exon_11128702_11128981:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11128702_11128763:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11128711_11128763:EXOSC10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11137661	A/G	1	43	32	75	21.0907469416487	16.3045604155172	4.78618652613153	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.299197463767677	ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000470611:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000498576:exon_11137658_11137708:EXOSC10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11147900	T/C	1	21	29	50	10.3001322273168	14.7760078765625	-4.47587564924565	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.25761389068374	ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11147857_11147967:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11147857_11147967:EXOSC10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11150682	C/T	1	22	14	36	10.7906147143319	7.13324518178878	3.65736953254313	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.246062466304874	ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11150611_11150725:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11150611_11150725:EXOSC10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11159823	T/C	1	7	18	25	3.43337740910561	9.17131523372843	-5.73793782462282	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0266370371488721	ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11333542	T/G	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000120942:ENST00000376810:exon_11333263_11334117:UBIAD1;ENSG00000120942:ENST00000400896:exon_11333263_11334117:UBIAD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11854457	G/A	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	11907648	C/T	1	8	15	23	3.9238598961207	7.64276269477369	-3.718902798653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.145439852017206	ENSG00000175206:ENST00000376480:exon_11907619_11907840:NPPA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12009911	G/A	1	6	14	20	2.94289492209052	7.13324518178878	-4.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0737409706371382	ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12012753	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12012680_12012792:PLOD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12089760	C/T	1	46	31	77	22.562194402694	15.7950429025323	6.7671515001617	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.138466416956020	ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12157076	A/C	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.416017801627938	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12157172	C/A	1	23	19	42	11.281097201347	9.68083274671335	1.60026445463366	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.646500103260762	ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12157158_12157274:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12157158_12157274:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12157158_12157274:TNFRSF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12172049	G/A	1	39	30	69	19.1288169935884	15.2855253895474	3.843291604041	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.399852080022969	ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12171955_12172071:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12171955_12172071:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12171955_12172071:TNFRSF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12186058	A/G	1	17	27	44	8.33820227925648	13.7569728505926	-5.41877057133617	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.130780159310733	ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12185956_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000479933:exon_12185991_12186109:TNFRSF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12198297	T/C	1	53	46	99	25.9955718117996	23.437805597306	2.55776621449361	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.616906288367096	ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	12248942	A/G	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	14105298	G/A	1	31	35	66	15.2049570974677	17.833112954472	-2.62815585700426	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.540120111016193	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	14109114	A/G	1	46	31	77	22.562194402694	15.7950429025323	6.7671515001617	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.138466416956020	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	15987032	G/A	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000197312:ENST00000480945:exon_15986332_15995539:DDI2;ENSG00000197312:ENST00000320153:exon_15986332_15987552:DDI2;ENSG00000215695:ENST00000345034:exon_15986364_15988217:RSC1A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16257256	A/G	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16257645	T/C	1	19	19	38	9.31916725328665	9.68083274671335	-0.361665493426692	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16259143	G/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16260513	A/G	1	5	11	16	2.45241243507544	5.60469264283404	-3.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.136942032485751	ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16262356	C/T	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16262719	T/C	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16269737	C/T	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000116809:ENST00000488008:exon_16269559_16269879:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000471805:exon_16269735_16270014:ZBTB17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16272250	A/G	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16577908	G/C	1	19	12	31	9.31916725328665	6.11421015581896	3.2049570974677	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.283751645573885	ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	16719900	C/T	1	80	85	165	39.238598961207	43.3089886037176	-4.07038964251064	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.534347882253613	ENSG00000055070:ENST00000401088:exon_16719723_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000471507:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000401089:exon_16719723_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000486763:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000434120:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000375590:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000475554:exon_16719723_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000472351:exon_16719723_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000492354:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000472461:exon_16719726_16719977:C1orf144
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	17313654	C/T	1	10	21	31	4.90482487015087	10.6998677726832	-5.7950429025323	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0470059905587991	ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	17319011	G/A	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	17739586	G/A	1	30	32	62	14.7144746104526	16.3045604155172	-1.59008580506461	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.704931455048591	ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	19549989	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000486405:exon_19549890_19550000:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000494770:exon_19549890_19550063:KIAA0090
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	19550037	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000494770:exon_19549890_19550063:KIAA0090
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	19566822	G/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19566791_19567198:KIAA0090
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	19634705	C/T	1	22	20	42	10.7906147143319	10.1903502596983	0.600264454633654	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.878542192032311	ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634233_19634756:AKR7A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	19634747	C/T	1	10	4	14	4.90482487015087	2.03807005193965	2.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180671884464811	ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634233_19634756:AKR7A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	19652872	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19652739_19652881:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19652739_19652881:PQLC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	19950062	T/C	1	281	420	701	137.825578851239	213.997355453663	-76.171776602424	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	8.3520611079484e-09	ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	20020994	C/T	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000162542:ENST00000294543:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375127:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000489814:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000490234:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000375122:exon_20020927_20021044:TMCO4;ENSG00000162542:ENST00000494342:exon_20020985_20021044:TMCO4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	20971059	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20970983_20971165:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20970983_20971165:PINK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	20977000	A/C	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	21177800	A/T	1	31	28	59	15.2049570974677	14.2664903635776	0.938466733890134	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.8965620661743	ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21177751_21177971:EIF4G3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	21180098	G/A	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21180053_21180170:EIF4G3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	21183974	G/A	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21183896_21183990:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21183896_21183990:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21183896_21183990:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21183896_21183990:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21183896_21183990:EIF4G3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	21560080	A/G	1	11	6	17	5.39530735716596	3.05710507790948	2.33820227925648	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.333809869270413	ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21560051_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000526194:exon_21559598_21560154:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000470394:exon_21560063_21560154:ECE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	23419261	G/A	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	23419374	G/T	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	23419383	C/T	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	23419806	A/C	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	24077554	T/C	1	54	47	101	26.4860542988147	23.9473231102909	2.53873118852379	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.620504635212135	ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	24120560	C/G	1	1	11	12	0.490482487015087	5.60469264283404	-5.11421015581896	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.00291655716474975	ENSG00000011009:ENST00000374514:exon_24120553_24120626:LYPLA2;ENSG00000011009:ENST00000374506:exon_24120553_24120626:LYPLA2;ENSG00000011009:ENST00000420982:exon_24120553_24120626:LYPLA2;ENSG00000011009:ENST00000374503:exon_24120553_24120626:LYPLA2;ENSG00000011009:ENST00000495365:exon_24120553_24120626:LYPLA2;ENSG00000011009:ENST00000374502:exon_24120553_24120626:LYPLA2;ENSG00000011009:ENST00000492577:exon_24120553_24120626:LYPLA2;ENSG00000011009:ENST00000374501:exon_24120553_24120626:LYPLA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	24969782	C/T	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000133226:ENST00000323848:exon_24969594_24969838:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000447431:exon_24969594_24969838:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000466910:exon_24969763_24969838:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000467454:exon_24969764_24969838:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000468822:exon_24969766_24969838:SRRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	25573416	C/A	1	23	18	41	11.281097201347	9.17131523372843	2.10978196761857	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.535763623400263	ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25572935_25573520:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25573227_25573454:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000431849:exon_25572935_25573520:C1orf63
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	26627478	T/C	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26627417_26627515:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26627417_26627515:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26627417_26627515:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26627417_26627515:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26627417_26627515:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26627417_26627515:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374215:exon_26627417_26627544:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000423664:exon_26627417_26627544:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000421827:exon_26627417_26627515:UBXN11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	26900735	C/G	1	118	126	244	57.8769334677803	64.199206636099	-6.32227316831877	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.442445595162792	ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	27269463	G/A	1	251	197	448	123.111104240787	100.374950058028	22.736154182759	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0334039385609898	ENSG00000090273:ENST00000321265:exon_27269362_27269556:NUDC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	27679797	A/G	1	30	17	47	14.7144746104526	8.66179772074352	6.05267688970909	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0814819087737381	ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	27679954	G/A	1	48	40	88	23.5431593767242	20.3807005193965	3.16245885732766	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.523717935685591	ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	27680292	A/G	1	40	26	66	19.6192994806035	13.2474553376077	6.37184414299574	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.139194790724528	ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	27736478	T/C	1	22	19	41	10.7906147143319	9.68083274671335	1.10978196761857	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.756996336009118	ENSG00000158195:ENST00000430629:exon_27736186_27736700:WASF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	27942176	T/C	1	32	21	53	15.6954395844828	10.6998677726832	4.99557181179961	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.215915875661112	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	28206348	T/C	1	46	54	100	22.562194402694	27.5139457011853	-4.9517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.368130308215473	ENSG00000130775:ENST00000373925:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373919:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000427466:exon_28206155_28206459:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000466068:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28206242_28206565:C1orf38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	28206599	G/T	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.239422942006238	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	28209305	A/G	1	50	58	108	24.5241243507543	29.552015753125	-5.02789140237061	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.337801028645091	ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	28209362	T/C	1	59	59	118	28.9384667338901	30.0615332661099	-1.12306653221973	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.854325130507965	ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	28905336	A/G	1	34	52	86	16.676404558513	26.4949106752155	-9.81850611670252	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0399780866864674	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	31206719	T/C	1	864	610	1474	423.776868781035	310.805682920797	112.971185860238	T:C	T	C	10	0.509517512984913	3.69209156751686e-09	ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	31215364	T/C	1	335	323	658	164.311633150054	164.574156694127	-0.262523544072735	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	31426815	A/G	1	24	21	45	11.7715796883621	10.6998677726832	1.07171191567891	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.767850096057718	ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	31501691	C/G	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000526215:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525948:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000480602:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000524516:exon_31501605_31501711:PUM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	31532267	T/C	1	11	4	15	5.39530735716596	2.03807005193965	3.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.119465288012993	ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31532077_31532413:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000526215:exon_31532146_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525948:exon_31532146_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000480602:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000524516:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000531867:exon_31532126_31532424:PUM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	31732892	G/A	1	119	105	224	58.3674159547954	53.4993388634159	4.86807709137949	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.547708564294831	ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	31897587	G/A	1	17	14	31	8.33820227925648	7.13324518178878	1.2049570974677	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.721617530563431	ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31897530_31897720:SERINC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	31901869	C/T	1	20	21	41	9.80964974030174	10.6998677726832	-0.890218032381433	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.876185377477144	ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31901825_31901915:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31901825_31901915:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31901825_31901915:SERINC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	32669457	A/G	1	1	23	24	0.490482487015087	11.718902798653	-11.2284203116379	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1.06823599332933e-06	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	33138261	A/G	1	68	67	135	33.3528091170259	34.1376733699892	-0.78486425296326	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.931486246948187	ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000492348:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000463378:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000460669:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000482190:exon_33138243_33138300:RBBP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	33246707	T/A	1	110	97	207	53.9530735716596	49.4231987595366	4.52987481212301	A:T:G	T	A	10	0.509517512984913	0.532546665657498	ENSG00000134684:ENST00000469100:exon_33246649_33247704:YARS;ENSG00000134684:ENST00000373477:exon_33246649_33246746:YARS;ENSG00000134684:ENST00000487404:exon_33246649_33246746:YARS;ENSG00000134684:ENST00000478828:exon_33246649_33246746:YARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	33476350	C/T	1	159	135	294	77.9867154353988	68.7848642529633	9.20185118243558	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.294021325593409	ENSG00000004455:ENST00000373449:exon_33473585_33476434:AK2;ENSG00000004455:ENST00000482191:exon_33476120_33476434:AK2;ENSG00000004455:ENST00000491241:exon_33476232_33476434:AK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	35452986	C/T	1	25	24	49	12.2620621753772	12.2284203116379	0.0336418637392626	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35451766_35455912:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35452581_35454536:ZMYM6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	35477551	T/C	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000163867:ENST00000487874:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000373340:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000472971:exon_35477491_35477606:ZMYM6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	35658456	T/G	1	87	87	174	42.6719763703126	44.3280236296874	-1.65604725937486	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.82036525934635	ENSG00000116560:ENST00000357214:exon_35657823_35658749:SFPQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	35864571	A/G	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000146463:ENST00000314607:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000373297:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000457946:exon_35864465_35864644:ZMYM4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	36068863	T/C	1	434	330	764	212.869399364548	168.140779285021	44.7286200795265	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00126732330930926	ENSG00000126067:ENST00000373237:exon_36067185_36068975:PSMB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	36752433	C/T	1	55	56	111	26.9765367858298	28.5329807271551	-1.55644394132534	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.776686380131968	ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	36752687	A/G	1	43	50	93	21.0907469416487	25.4758756492457	-4.38512870759691	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.406954721757596	ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	38003318	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000163877:ENST00000296215:exon_38002142_38003613:SNIP1;ENSG00000163877:ENST00000436196:exon_38002145_38003613:SNIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	38327982	G/T	1	92	72	164	45.124388805388	36.6852609349137	8.43912787047427	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.211334163349179	ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	38338795	A/G	1	37	39	76	18.1478520195582	19.8711830064116	-1.72333098685339	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.73144423097702	ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	38353968	G/A	1	22	19	41	10.7906147143319	9.68083274671335	1.10978196761857	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.756996336009118	ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38353915_38354016:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38353915_38354016:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38353915_38354016:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38353915_38354016:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38353915_38354016:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38353915_38354016:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000467066:exon_38353915_38354016:INPP5B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	38463504	C/T	1	30	16	46	14.7144746104526	8.15228020775861	6.562194402694	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0560692327672394	ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	39798767	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	39908430	A/C	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	39908506	G/A	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	39919502	A/G	1	20	19	39	9.80964974030174	9.68083274671335	0.128816993588394	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39919379_39919522:MACF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	40315888	A/T	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:T	A	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40315791_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40315795_40315933:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000469476:exon_40315795_40315933:TRIT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	40349131	G/A	1	9	2	11	4.41434238313578	1.01903502596983	3.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.065955266796108	ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	40737589	T/C	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000084073:ENST00000372759:exon_40737566_40737707:ZMPSTE24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	40768344	C/T	1	57	64	121	27.95750175986	32.6091208310344	-4.65161907117447	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.414172924224406	ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000427563:exon_40768293_40768481:COL9A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	40980731	G/T	1	6	13	19	2.94289492209052	6.62372766880387	-3.68083274671335	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.109606452148716	ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	41976217	G/A	1	27	8	35	13.2430271494074	4.0761401038793	9.16688704552805	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00199966298440749	ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	42041277	C/T	1	14	5	19	6.86675481821122	2.54758756492456	4.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0644684770411915	ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42041215_42041360:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42041215_42041360:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42041215_42041360:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42041215_42041360:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_42041215_42041360:HIVEP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	43213103	A/C	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000117385:ENST00000472802:exon_43212924_43213247:LEPRE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	43215930	C/T	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	43630156	A/C	1	424	366	790	207.964574494397	186.483409752478	21.4811647419187	A:T:C:G	A	C	10	0.509517512984913	0.134977924670021	ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43629855_43630164:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43629993_43630164:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43630017_43630164:EBNA1BP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	43913331	A/G	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43913216_43913369:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43913216_43913369:KIAA0467
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	44415415	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44415089_44415825:IPO13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	44680474	A/G	1	23	27	50	11.281097201347	13.7569728505926	-2.47587564924565	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.571995303318193	ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000440641:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000436069:exon_44680375_44680552:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000437511:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000475794:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000471829:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000487922:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372290:exon_44680375_44680570:DMAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	45110683	G/A	1	45	44	89	22.0717119156789	22.4187705713362	-0.347058655657257	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000187147:ENST00000355387:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000416840:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000361799:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000453887:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372247:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000443020:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372248:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000440132:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000335497:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474064:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000471494:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000444372:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000497469:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000475378:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000484745:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474394:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000480686:exon_45110667_45110753:RNF220
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	45340401	C/T	1	37	42	79	18.1478520195582	21.3997355453663	-3.25188352580813	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500439825297124	ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000439363:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000486491:exon_45340350_45340498:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45340199_45340498:EIF2B3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	45469155	C/T	1	46	25	71	22.562194402694	12.7379378246228	9.82425657807118	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0235431856655459	ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	45469586	G/A	1	29	30	59	14.2239921234375	15.2855253895474	-1.06153326610987	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.79604223470444	ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	45472403	G/A	1	17	22	39	8.33820227925648	11.2093852856681	-2.87118300641161	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.423991835898429	ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000466423:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000487488:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000484564:exon_45472364_45472467:HECTD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	45479709	A/G	1	54	71	125	26.4860542988147	36.1757434219288	-9.68968912311412	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0892732788263572	ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	45480502	A/G	1	129	117	246	63.2722408249462	59.6135490192348	3.65869180571141	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.65572803477479	ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372139:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000472254:exon_45480408_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000466193:exon_45480211_45480678:UROD;ENSG00000126088:ENST00000465678:exon_45480219_45480508:UROD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	45974669	C/A	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45974468_45976739:MMACHC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	46496709	A/G	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	46496829	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	46500613	T/C	1	19	14	33	9.31916725328665	7.13324518178878	2.18592207149787	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.489468972263295	ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	46501599	G/A	1	71	59	130	34.8242565780712	30.0615332661099	4.76272331196131	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.430361044526969	ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000468212:exon_46501486_46501896:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46501171_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46501567_46501795:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	51826921	T/C	1	35	47	82	17.166887045528	23.9473231102909	-6.78043606476286	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.151069005958727	ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51826843_51827027:EPS15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	51873951	G/A	1	19	21	40	9.31916725328665	10.6998677726832	-1.38070051939652	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.752396006614917	ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51873807_51874004:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000493793:exon_51873807_51874004:EPS15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	52263882	C/T	1	1	9	10	0.490482487015087	4.58565761686422	-4.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0103558957396217	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	52266242	G/A	1	71	59	130	34.8242565780712	30.0615332661099	4.76272331196131	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.430361044526969	ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	52266350	C/T	1	65	49	114	31.8813616559807	24.9663581362607	6.91500351971992	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.223211329229868	ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	52290984	T/G	1	27	31	58	13.2430271494074	15.7950429025323	-2.55201575312495	A:T:C:G	T	G	10	0.509517512984913	0.514550560910101	ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	52498370	C/T	1	25	25	50	12.2620621753772	12.7379378246228	-0.475875649245651	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	52825460	G/C	1	13	4	17	6.37627233119613	2.03807005193965	4.33820227925648	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0497263576814836	ENSG00000154222:ENST00000441197:exon_52825377_52825555:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371586:exon_52825377_52825555:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000491136:exon_52825377_52825555:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000284376:exon_52825377_52825555:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438021:exon_52825377_52825555:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000460261:exon_52825377_52825508:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371573:exon_52825377_52825555:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000450942:exon_52825377_52825492:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438831:exon_52825377_52825555:CC2D1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	52975352	T/C	0	0	8	8	0	4.0761401038793	-4.0761401038793	C	T	C	10	0.509517512984913	0.00334956216154465	ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52975268_52975384:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52975268_52975384:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52975268_52975384:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52975268_52975384:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000484723:exon_52975268_52975384:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371541:exon_52975268_52975384:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52975268_52975384:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52975268_52975384:ZCCHC11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	53153432	T/C	1	46	37	83	22.562194402694	18.8521479804418	3.71004642225222	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.443360929292152	ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	53453714	G/T	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000408941:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371513:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000473584:exon_53453701_53453752:SCP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	54432019	G/A	1	41	52	93	20.1097819676186	26.4949106752155	-6.38512870759691	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.213188777898882	ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	54681920	G/C	1	135	148	283	66.2151357470367	75.4085919217671	-9.19345617473039	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.284824361156442	ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	54683856	C/G	1	356	367	723	174.611765377371	186.992927265463	-12.3811618880921	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.372028807597671	ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	55319902	A/G	1	19	24	43	9.31916725328665	12.2284203116379	-2.90925305835126	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.446224860236438	ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	59147926	T/C	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59147457_59148217:MYSM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	60314012	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000134709:ENST00000371208:exon_60313987_60314188:HOOK1;ENSG00000134709:ENST00000465876:exon_60313987_60314188:HOOK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	62579823	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	62676091	C/A	0	9	0	9	4.41434238313578	0	4.41434238313578	C	C		10	0.509517512984913	0.00395726759981203	ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	62677118	A/G	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	62923334	C/T	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_62923209_62923376:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_62923209_62923376:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_62923209_62923376:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_62923209_62923376:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000454575:exon_62923209_62923376:DOCK7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	63090966	T/G	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000116641:ENST00000371140:exon_63090930_63091072:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000395441:exon_63090930_63091072:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000251157:exon_63090930_63091072:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000340370:exon_63090930_63091072:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000404627:exon_63090930_63091072:DOCK7;ENSG00000116641:ENST00000464312:exon_63090769_63091072:DOCK7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	63300478	C/T	1	11	18	29	5.39530735716596	9.17131523372843	-3.77600787656248	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.194206386621495	ENSG00000125703:ENST00000317868:exon_63300447_63300523:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371120:exon_63300447_63300523:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000414558:exon_63300447_63300523:ATG4C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	64095111	A/G	1	24	34	58	11.7715796883621	17.323595441487	-5.55201575312496	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.150714094702722	ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	64120039	G/A	1	41	41	82	20.1097819676186	20.8902180323814	-0.780436064762867	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.912233982228856	ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000483707:exon_64120003_64120116:PGM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	66838194	C/G	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000184588:ENST00000329654:exon_66837996_66839961:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000341517:exon_66837996_66839187:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000371049:exon_66837996_66838361:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000423207:exon_66837996_66840256:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000371045:exon_66837996_66840259:PDE4B;ENSG00000184588:ENST00000480109:exon_66837996_66838421:PDE4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	67833527	G/C	1	19	5	24	9.31916725328665	2.54758756492456	6.77157968836209	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00683818195403182	ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67833508_67833708:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67833508_67833708:IL12RB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	67861520	C/A	1	10	4	14	4.90482487015087	2.03807005193965	2.86675481821122	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.180671884464811	ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	75175886	T/C	1	62	39	101	30.4099141949354	19.8711830064116	10.5387311885238	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0368776907125428	ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	75214441	A/G	1	90	48	138	44.1434238313578	24.4568406232758	19.686583208082	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000846618638245589	ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	76259927	T/C	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.218410376640568	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	77629563	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000359130:exon_77629531_77629627:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000478391:exon_77629531_77629627:PIGK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	85029067	C/T	1	16	13	29	7.84771979224139	6.62372766880387	1.22399212343752	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.712533292455687	ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	85113203	T/C	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	85405226	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	86822245	C/T	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86822196_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86822145_86822285:ODF2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	87207983	C/T	1	78	77	155	38.2576339871768	39.2328484998383	-0.975214512661509	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.936004224055424	ENSG00000097033:ENST00000212369:exon_87207891_87208119:SH3GLB1;ENSG00000097033:ENST00000482504:exon_87207891_87208119:SH3GLB1;ENSG00000097033:ENST00000370558:exon_87207891_87208119:SH3GLB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	89655783	T/C	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	T	T		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000162654:ENST00000355754:exon_89655721_89656001:GBP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	91403089	C/T	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000122482:ENST00000370440:exon_91403042_91403647:ZNF644;ENSG00000122482:ENST00000337393:exon_91403042_91403647:ZNF644
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	92941657	G/A	1	10	2	12	4.90482487015087	1.01903502596983	3.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0389831260229786	ENSG00000162676:ENST00000370332:exon_92940319_92941764:GFI1;ENSG00000162676:ENST00000427103:exon_92940319_92941764:GFI1;ENSG00000162676:ENST00000294702:exon_92940321_92941764:GFI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	93306317	G/A	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.446955104391855	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	93646433	T/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	93720153	G/T	1	29	13	42	14.2239921234375	6.62372766880387	7.60026445463365	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0204378646893196	ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93720074_93720171:CCDC18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	93744055	G/A	1	18	11	29	8.82868476627157	5.60469264283404	3.22399212343752	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.267449151143263	ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93744020_93744164:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93744020_93744287:CCDC18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	94944133	G/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000117528:ENST00000315713:exon_94944080_94944279:ABCD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	100571325	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100571323_100571459:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100571323_100571459:SASS6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	100613865	C/T	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000122435:ENST00000370141:exon_100613450_100613882:CCDC76
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	100614322	T/C	1	7	16	23	3.43337740910561	8.15228020775861	-4.718902798653	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0599524855651278	ENSG00000122435:ENST00000370141:exon_100614181_100616053:CCDC76
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	101440386	C/T	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000162695:ENST00000370112:exon_101440366_101440458:SLC30A7;ENSG00000162695:ENST00000357650:exon_101440366_101440554:SLC30A7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	109242672	A/G	1	121	114	235	59.3483809288255	58.0849964802801	1.26338444854544	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.8962685570321	ENSG00000134186:ENST00000370025:exon_109241784_109244425:PRPF38B;ENSG00000134186:ENST00000370021:exon_109241784_109244425:PRPF38B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	109351501	A/G	1	17	19	36	8.33820227925648	9.68083274671335	-1.34263046745687	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.739677666199833	ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	109479978	G/T	1	12	22	34	5.88578984418104	11.2093852856681	-5.32359544148704	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0853636762313795	ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109479699_109480040:CLCC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	109486196	A/G	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000482889:exon_109486097_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486140_109486237:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109486097_109486237:CLCC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	110034074	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000162650:ENST00000463678:exon_110033544_110034339:ATXN7L2;ENSG00000162650:ENST00000369870:exon_110033544_110034339:ATXN7L2;ENSG00000162650:ENST00000497545:exon_110033544_110034726:ATXN7L2;ENSG00000162650:ENST00000369869:exon_110033544_110034339:ATXN7L2;ENSG00000162650:ENST00000459635:exon_110033638_110034339:ATXN7L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	110091282	C/T	1	49	34	83	24.0336418637393	17.323595441487	6.71004642225222	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.153951528085182	ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	110466555	G/A	1	19	4	23	9.31916725328665	2.03807005193965	7.281097201347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00270162241391416	ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	110466810	C/A	1	16	19	35	7.84771979224139	9.68083274671335	-1.83311295447195	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.613187650868945	ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	110884342	G/A	1	5	11	16	2.45241243507544	5.60469264283404	-3.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.136942032485751	ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111441829	C/T	1	521	405	926	255.54137573486	206.35459275889	49.1867829759706	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00126764386071163	ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111726098	G/A	1	36	30	66	17.6573695325431	15.2855253895474	2.37184414299574	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.622935739109501	ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000483427:exon_111726084_111726173:CEPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111730901	C/T	1	39	51	90	19.1288169935884	25.9853931622306	-6.85657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.17035010558693	ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111730753_111730992:DENND2D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111738589	A/T	1	22	12	34	10.7906147143319	6.11421015581896	4.67640455851296	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.123738258699209	ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111738538_111738678:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111738538_111738678:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000473682:exon_111738538_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000463713:exon_111738536_111738678:DENND2D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111778325	C/T	1	397	49	446	194.72154734499	24.9663581362607	169.755189208729	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	4.29711561050659e-66	ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000528451:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000486561:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000474304:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000477185:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000467038:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497587:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111778261_111778385:CHI3L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111783981	G/A	1	36	289	325	17.6573695325431	147.25056125264	-129.593191720097	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1.69259491625403e-52	ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111957311	G/C	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111992095	C/T	1	18	13	31	8.82868476627157	6.62372766880387	2.2049570974677	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.475629809894747	ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	111992143	C/G	1	75	52	127	36.7861865261315	26.4949106752155	10.291275850916	A:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0756780391686598	ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000483994:exon_111992106_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000468818:exon_111992107_111992203:ATP5F1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	113197203	A/G	1	63	52	115	30.9003966819505	26.4949106752155	4.40548600673501	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.455813593985065	ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	113236681	C/T	1	17	7	24	8.33820227925648	3.56662259089439	4.77157968836209	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0650587674028206	ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	113237171	A/G	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	113239068	G/C	1	33	29	62	16.1859220714979	14.7760078765625	1.40991419493539	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.79977425088429	ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239059_113239156:MOV10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	113239382	G/A	1	23	32	55	11.281097201347	16.3045604155172	-5.02346321417021	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.180449494066129	ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	113241052	T/C	1	38	38	76	18.6383345065733	19.3616654934267	-0.723330986853384	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.908929318681244	ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	113243048	C/T	1	73	87	160	35.8052215521014	44.3280236296874	-8.52280207758608	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.179916310941556	ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	114372645	T/A	1	66	49	115	32.3718441429957	24.9663581362607	7.405486006735	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.191489998688081	ENSG00000134242:ENST00000359785:exon_114372571_114372651:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000528414:exon_114372571_114372651:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000532224:exon_114372571_114372651:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000420377:exon_114372571_114372651:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000525799:exon_114372571_114372651:PTPN22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	114380395	T/C	1	25	22	47	12.2620621753772	11.2093852856681	1.05267688970909	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.77276891537452	ENSG00000134242:ENST00000359785:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000528414:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000532224:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000420377:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000525799:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000484147:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000354605:exon_114380212_114381029:PTPN22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	114438951	A/G	1	21	43	64	10.3001322273168	21.9092530583513	-11.6091208310344	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00387280932764422	ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	114948309	A/G	1	22	34	56	10.7906147143319	17.323595441487	-6.53298072715513	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0837792491957367	ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	114973429	T/C	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	116931628	C/A	1	97	98	195	47.5768012404634	49.9327162725215	-2.35591503205804	A:C:G	C	A	10	0.509517512984913	0.774624206887838	ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000491156:exon_116931524_116931641:ATP1A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	116932771	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	116941697	C/T	1	299	254	553	146.654263617511	129.417448298168	17.2368153193431	A:T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.148189390412693	ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116941552_116941706:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116941552_116941706:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116941552_116941706:ATP1A1;ENSG00000203865:ENST00000493908:exon_116941622_116941936:AL136376.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	117078729	A/G	1	97	114	211	47.5768012404634	58.0849964802801	-10.5081952398166	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.148933380936665	ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117078587_117078850:CD58
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	117618024	G/C	1	21	25	46	10.3001322273168	12.7379378246228	-2.437805597306	A:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.555812495792938	ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	118008958	T/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198162:ENST00000356554:exon_118008956_118009049:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000369450:exon_118008956_118009049:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000413355:exon_118008956_118009049:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000329466:exon_118008956_118009049:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000449370:exon_118008956_118009049:MAN1A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	118035782	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000198162:ENST00000356554:exon_118035769_118035884:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000369450:exon_118035769_118035884:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000413355:exon_118035769_118035884:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000329466:exon_118035769_118035884:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000449370:exon_118035769_118035884:MAN1A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	118491102	G/A	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118491028_118491129:WDR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	118495153	T/G	1	16	32	48	7.84771979224139	16.3045604155172	-8.45684062327582	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0199325495207007	ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	144909956	G/A	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	144912233	C/T	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	144912262	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	145103928	G/A	1	35	35	70	17.166887045528	17.833112954472	-0.666225908943908	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.905238344778673	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	145103947	T/C	0	0	71	71	0	36.1757434219288	-36.1757434219288	C	T	C	10	0.509517512984913	1.08210367442911e-22	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	145109549	G/T	0	0	44	44	0	22.4187705713362	-22.4187705713362	T	G	T	10	0.509517512984913	2.44024948830578e-14	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	145109583	C/A	0	0	42	42	0	21.3997355453663	-21.3997355453663	A	C	A	10	0.509517512984913	1.01434856678302e-13	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	145109661	G/A	0	96	0	96	47.0863187534484	0	47.0863187534484	G	G		10	0.509517512984913	7.91338048135228e-29	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	145112414	T/C	0	0	85	85	0	43.3089886037176	-43.3089886037176	C	T	C	10	0.509517512984913	5.04658909662522e-27	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	145112485	C/T	0	0	140	140	0	71.3324518178878	-71.3324518178878	T	C	T	10	0.509517512984913	4.86732933939594e-44	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	145438826	G/A	1	62	64	126	30.4099141949354	32.6091208310344	-2.19920663609903	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.722045500864991	ENSG00000117289:ENST00000369317:exon_145438469_145439052:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000435917:exon_145438803_145438861:TXNIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	146714392	G/T	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146714334_146714480:CHD1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	146751782	A/C	1	38	29	67	18.6383345065733	14.7760078765625	3.86232663001083	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.392827450760282	ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146751699_146751864:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146751699_146751864:CHD1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	146763171	T/A	1	32	29	61	15.6954395844828	14.7760078765625	0.919431707920307	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.898267294342906	ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146763164_146763234:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146763164_146763234:CHD1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	146767149	G/T	1	101	92	193	49.5387311885238	46.875611194612	2.6631199939118	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.719301885002594	ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146767112_146767441:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146767112_146767443:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146767112_146767443:CHD1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	147096794	A/G	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000116128:ENST00000234739:exon_147095643_147098017:BCL9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	147119273	G/A	1	12	17	29	5.88578984418104	8.66179772074352	-2.77600787656248	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.354875496158188	ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	147121977	C/T	1	1	9	10	0.490482487015087	4.58565761686422	-4.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0103558957396217	ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147121946_147122485:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147121946_147122041:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000487562:exon_147121620_147122041:ACP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	149897801	G/T	1	36	36	72	17.6573695325431	18.3426304674569	-0.685260934913735	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.906516204643348	ENSG00000143368:ENST00000271628:exon_149897728_149897934:SF3B4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	150280550	G/A	1	486	489	975	238.374488689332	249.154063849622	-10.7795751602902	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.501223154421487	ENSG00000187145:ENST00000309092:exon_150280482_150281414:MRPS21;ENSG00000187145:ENST00000369084:exon_150280482_150281414:MRPS21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	150300880	C/T	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000117360:ENST00000324862:exon_150300779_150300925:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000496202:exon_150300779_150300925:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000467329:exon_150300234_150300925:PRPF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	150551419	T/C	1	40	30	70	19.6192994806035	15.2855253895474	4.33377409105609	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.339363003761524	ENSG00000143384:ENST00000369026:exon_150551319_150552066:MCL1;ENSG00000143384:ENST00000439749:exon_150551319_150551679:MCL1;ENSG00000143384:ENST00000307940:exon_150551319_150552006:MCL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	150785747	T/C	1	16	5	21	7.84771979224139	2.54758756492456	5.30013222731683	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0271669342424189	ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150785648_150785814:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150785648_150785814:ARNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	150938616	G/A	1	57	68	125	27.95750175986	34.6471908829741	-6.68968912311413	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.245437029714201	ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150937649_150938764:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150937649_150938764:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150937739_150938764:LASS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	150939318	G/A	1	17	10	27	8.33820227925648	5.09517512984913	3.24302714940735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.250108755096081	ENSG00000143418:ENST00000482825:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496901:exon_150939232_150939427:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496562:exon_150939272_150939678:LASS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	150970577	G/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000143409:ENST00000493834:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000361936:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000312210:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000361738:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000368945:exon_150970558_150970749:FAM63A;ENSG00000143409:ENST00000497067:exon_150970558_150970646:FAM63A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151026815	C/T	1	15	10	25	7.35723730522631	5.09517512984913	2.26206217537718	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.426470603476087	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151259451	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151261920	C/T	1	17	18	35	8.33820227925648	9.17131523372843	-0.833112954471956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.866252155786725	ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151261854_151262016:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151261854_151262016:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151261854_151262016:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151261854_151262016:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000459919:exon_151261571_151262015:ZNF687
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151288391	A/G	1	14	16	30	6.86675481821122	8.15228020775861	-1.28552538954739	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.716389941789618	ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151316161	G/A	1	42	40	82	20.6002644546337	20.3807005193965	0.219563935237133	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000436637:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452513:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151316157_151316358:RFX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151372131	G/A	1	199	122	321	97.6060149160023	62.1611365841594	35.4448783318429	A:G	G	A	10	0.509517512984913	8.76503139290112e-05	ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151372138	G/A	1	201	126	327	98.5869798900325	64.199206636099	34.3877732539335	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000160806643849079	ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151373200	T/C	1	32	26	58	15.6954395844828	13.2474553376077	2.44798424687505	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.599798455713731	ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372918_151373528:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372918_151373831:PSMB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151732700	A/G	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.293617974329767	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151735007	G/A	1	3	14	17	1.47144746104526	7.13324518178878	-5.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00661256511793458	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151735545	A/G	1	108	63	171	52.9721085976294	32.0996033180495	20.8725052795799	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00163669050420827	ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151748920	T/G	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000182134:ENST00000525790:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368827:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368825:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000440583:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368824:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368823:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368822:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000458431:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000526413:exon_151748915_151749075:TDRKH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	151955625	C/T	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	153507176	C/T	1	213	162	375	104.472769734214	82.5418371035559	21.9309326306576	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0262282144013971	ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	153516358	G/A	1	488	259	747	239.355453663362	131.965035863092	107.39041780027	A:G	G	A	10	0.509517512984913	2.39106839789907e-15	ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153516089_153516415:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153516097_153516399:S100A4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	153745128	G/C	1	67	59	126	32.8623266300108	30.0615332661099	2.80079336390096	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.656339859136	ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	154186406	C/T	1	101	97	198	49.5387311885238	49.4231987595366	0.11553242898723	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000143612:ENST00000350592:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368521:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368518:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368516:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000470180:exon_154186369_154186422:C1orf43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	155699032	G/T	1	109	111	220	53.4625910846445	56.5564439413253	-3.09385285668085	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.686296426251353	ENSG00000132676:ENST00000471214:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000421487:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000497826:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000463575:exon_155698999_155699082:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000479151:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000466384:exon_155698999_155699052:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000462978:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000477394:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000475056:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000490249:exon_155698999_155699157:DAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	155708019	T/A	1	257	245	502	126.053999162877	124.831790681304	1.22220848157367	A:T:G	T	A	10	0.509517512984913	0.928893957931784	ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155707948_155708801:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155707948_155708317:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000421487:exon_155707948_155708317:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000477394:exon_155707948_155708217:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000475056:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000490249:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000463295:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000476444:exon_155707948_155708320:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000491777:exon_155707948_155708088:DAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	155895914	A/G	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156106185	T/C	1	566	493	1059	277.613087650539	251.192133901562	26.4209537489771	A:T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.109956877366836	ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156106005_156106188:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000498722:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000508500:exon_156106005_156106227:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000459904:exon_156106084_156106819:LMNA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156106863	C/T	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156106712_156107023:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156106005_156107058:LMNA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156108574	A/G	1	17	7	24	8.33820227925648	3.56662259089439	4.77157968836209	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0650587674028206	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156146218	C/T	1	55	53	108	26.9765367858298	27.0044281882004	-0.0278914023706029	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156213635	A/G	1	16	21	37	7.84771979224139	10.6998677726832	-2.85214798044178	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.411868674227362	ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156222720	G/A	1	26	18	44	12.7525446623923	9.17131523372843	3.58122942866383	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.295065363445801	ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156222710_156222869:SMG5;ENSG00000198952:ENST00000420555:exon_156222710_156222735:SMG5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156261399	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000163472:ENST00000463670:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000295694:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000357501:exon_156261176_156261739:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000495881:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000416130:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000405535:exon_156261176_156262234:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000485135:exon_156261176_156261493:TMEM79;ENSG00000163472:ENST00000491392:exon_156261176_156261561:TMEM79
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156263940	T/C	1	32	12	44	15.6954395844828	6.11421015581896	9.58122942866383	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00392374151093578	ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156437754	C/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156438846	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156450719	G/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156706559	A/G	1	25	16	41	12.2620621753772	8.15228020775861	4.10978196761857	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.214414867597439	ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	156784982	T/C	1	18	9	27	8.82868476627157	4.58565761686422	4.24302714940735	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.123899416681013	ENSG00000027869:ENST00000368199:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000368198:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000392306:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000486350:exon_156784829_156785203:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000495306:exon_156784290_156785013:SH2D2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	157489535	G/A	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157489533_157489560:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000461387:exon_157489533_157489560:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157489533_157489560:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157489533_157489560:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157489533_157489560:FCRL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	157494106	C/T	1	111	111	222	54.4435560586747	56.5564439413253	-2.11288788265068	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.78864314994384	ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	157504422	C/T	1	16	10	26	7.84771979224139	5.09517512984913	2.75254466239226	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.329230577261424	ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	157504433	C/G	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157504404_157504682:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157501754_157504682:FCRL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	157508882	C/T	1	28	15	43	13.7335096364224	7.64276269477369	6.09074694164874	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0680926015639895	ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	157517011	T/G	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.623377837269659	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	158261015	C/T	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000158481:ENST00000368169:exon_158260924_158261190:CD1C;ENSG00000158481:ENST00000368170:exon_158260924_158261190:CD1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	158813819	A/G	1	15	10	25	7.35723730522631	5.09517512984913	2.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.426470603476087	ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	158990247	A/G	1	151	110	261	74.0628555392781	56.0469264283404	18.0159291109377	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0259024000349182	ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	159002353	A/T	1	166	43	209	81.4200928445044	21.9092530583513	59.5108397861532	A:T	A	T	10	0.509517512984913	2.31988053938517e-17	ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	159002377	C/A	1	121	29	150	59.3483809288255	14.7760078765625	44.572373052263	A:C	C	A	10	0.509517512984913	6.25667355278793e-14	ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	159002389	T/A	1	114	24	138	55.9150035197199	12.2284203116379	43.686583208082	A:T	T	A	10	0.509517512984913	1.47122195137666e-14	ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	160654758	C/G	1	1152	1082	2234	565.03582504138	551.297949049676	13.7378759917044	A:T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.567798730160507	ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	160654792	C/T	1	1014	1069	2083	497.349241833298	544.674221380872	-47.3249795475738	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0393814252352064	ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	160793442	A/G	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	160811488	T/C	1	13	3	16	6.37627233119613	1.52855253895474	4.84771979224139	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0216334111655343	ENSG00000122223:ENST00000368034:exon_160811374_160811691:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368033:exon_160811374_160811691:CD244;ENSG00000122223:ENST00000492063:exon_160811374_160811691:CD244;ENSG00000122223:ENST00000322302:exon_160811374_160811691:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368032:exon_160811374_160811691:CD244
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	161068836	A/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000162755:ENST00000490724:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000469647:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000444550:exon_161068154_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000452810:exon_161068154_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000471613:exon_161068456_161069208:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000368011:exon_161068184_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392192:exon_161068184_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392191:exon_161068456_161068852:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000494418:exon_161068456_161068852:KLHDC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	161070042	C/T	1	7	18	25	3.43337740910561	9.17131523372843	-5.73793782462282	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0266370371488721	ENSG00000162755:ENST00000490724:exon_161069851_161070088:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000469647:exon_161069851_161070133:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000452810:exon_161069851_161070134:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000368011:exon_161069851_161070136:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392192:exon_161069851_161070136:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000475934:exon_161069851_161070136:KLHDC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	161681087	A/G	1	64	41	105	31.3908791689656	20.8902180323814	10.5006611365841	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0408180980608315	ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000465403:exon_161680998_161681262:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	161681780	A/G	1	84	84	168	41.2005289092673	42.7994710907327	-1.59894218146539	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.817340646483754	ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	163309219	A/T	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	163313539	C/T	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	163313568	A/C	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	166833124	G/A	1	14	10	24	6.86675481821122	5.09517512984913	1.77157968836209	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.54303205531595	ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166833061_166833158:TADA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	167893759	G/A	1	93	88	181	45.6148712924031	44.8375411426723	0.777330149730751	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.940799912162648	ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	168014138	C/T	1	36	36	72	17.6573695325431	18.3426304674569	-0.685260934913735	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.906516204643348	ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168014138_168014465:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168014138_168014465:DCAF6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	169660939	T/C	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169659808_169660943:SELL;ENSG00000188404:ENST00000497295:exon_169660822_169660943:SELL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	169677709	A/G	1	12	24	36	5.88578984418104	12.2284203116379	-6.34263046745687	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0442484271514157	ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	169762807	T/G	1	19	19	38	9.31916725328665	9.68083274671335	-0.361665493426692	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	169822077	G/A	1	28	29	57	13.7335096364224	14.7760078765625	-1.04249824014004	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.792745225030573	ENSG00000000460:ENST00000498289:exon_169821931_169822226:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000359326:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000459772:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000286031:exon_169821931_169823221:C1orf112;ENSG00000000460:ENST00000413811:exon_169821931_169822229:C1orf112;ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169821804_169822913:SCYL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	169824981	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169824937_169825098:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169824937_169825098:SCYL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	169951997	C/T	1	17	27	44	8.33820227925648	13.7569728505926	-5.41877057133617	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.130780159310733	ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	171751236	T/C	1	26	36	62	12.7525446623923	18.3426304674569	-5.59008580506461	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.164049734434082	ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	171761191	C/T	1	30	19	49	14.7144746104526	9.68083274671335	5.03364186373926	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.156043211104239	ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171761157_171761375:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171761157_171761375:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171761157_171761375:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171761157_171761375:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171761157_171761375:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000466643:exon_171761157_171761375:METTL13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	173450457	C/G	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173450338_173450621:PRDX6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	174188285	G/A	1	26	7	33	12.7525446623923	3.56662259089439	9.18592207149787	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00140364678084206	ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	175958578	T/C	1	32	19	51	15.6954395844828	9.68083274671335	6.01460683776944	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0949084168335352	ENSG00000143207:ENST00000461830:exon_175957424_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367667:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367669:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000314478:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367666:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367665:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000308769:exon_175958498_175958615:RFWD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	179033551	C/T	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000116199:ENST00000263733:exon_179033440_179033631:FAM20B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	181024404	G/A	1	32	31	63	15.6954395844828	15.7950429025323	-0.0996033180495175	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	182569446	T/G	1	83	115	198	40.7100464222522	58.594513993265	-17.8844675710128	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0126710262004658	ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182567758_182569648:RGS16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183085755	A/G	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183085712_183085810:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000479499:exon_183085712_183085810:LAMC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183091058	G/A	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183090858_183091079:LAMC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183094547	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183094532_183094685:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000466964:exon_183094323_183094685:LAMC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183101582	A/G	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183101535_183101672:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183101535_183101672:LAMC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183105534	T/C	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183105711	T/A	1	17	18	35	8.33820227925648	9.17131523372843	-0.833112954471956	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.866252155786725	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183106956	A/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183106804_183106962:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183106804_183107040:LAMC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183515428	G/A	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000116698:ENST00000367537:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000458370:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000367539:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000392015:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000413782:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000508461:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000347615:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000507469:exon_183515101_183515472:SMG7;ENSG00000116698:ENST00000515829:exon_183515101_183515472:SMG7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	183542387	T/C	1	65	40	105	31.8813616559807	20.3807005193965	11.5006611365841	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0249751209846179	ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	184801065	T/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000461167:exon_184800981_184801096:FAM129A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	184868398	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184868312_184868442:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184868312_184868442:FAM129A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	185267114	A/G	1	135	154	289	66.2151357470367	78.4656969996766	-12.2505612526399	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.157999409477771	ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	192545099	G/A	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	197070464	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	197071028	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	200635550	T/C	1	17	15	32	8.33820227925648	7.64276269477369	0.695439584482783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.860859198749914	ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	200635560	T/C	1	18	9	27	8.82868476627157	4.58565761686422	4.24302714940735	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.123899416681013	ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200635065_200635879:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000436897:exon_200635387_200635879:DDX59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	201112981	A/G	1	31	35	66	15.2049570974677	17.833112954472	-2.62815585700426	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.540120111016193	ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	201355943	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	202104616	T/A	1	28	35	63	13.7335096364224	17.833112954472	-4.09960331804952	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.315789624211907	ENSG00000143862:ENST00000272217:exon_202104587_202104654:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000491358:exon_202104587_202104736:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000486225:exon_202104587_202104928:ARL8A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	202128336	G/T	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000143851:ENST00000468385:exon_202127586_202128582:PTPN7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	202710776	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202710495_202710850:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202710495_202710850:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202710495_202710850:KDM5B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	202858209	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000183155:ENST00000367262:exon_202858101_202858263:RABIF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	202911267	G/C	1	24	27	51	11.7715796883621	13.7569728505926	-1.98539316223056	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.674795330117832	ENSG00000159346:ENST00000340990:exon_202911153_202911346:ADIPOR1;ENSG00000159346:ENST00000495562:exon_202911153_202911346:ADIPOR1;ENSG00000159346:ENST00000436244:exon_202911153_202911346:ADIPOR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	202933779	G/T	1	18	23	41	8.82868476627157	11.718902798653	-2.89021803238143	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.435423128360254	ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202933740_202933823:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000497655:exon_202932770_202934512:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202933740_202933823:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000446185:exon_202933740_202933823:CYB5R1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	204379452	T/C	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000158615:ENST00000367188:exon_204378620_204380919:PPP1R15B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	205744122	T/G	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000117280:ENST00000367139:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000235932:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000528078:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000367140:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000446390:exon_205743961_205744361:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000414729:exon_205743961_205744587:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000492534:exon_205743961_205744279:RAB7L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	206239403	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196533:ENST00000331555:exon_206238872_206239579:C1orf186;ENSG00000196533:ENST00000421280:exon_206238872_206239579:C1orf186
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	206648378	G/A	1	22	10	32	10.7906147143319	5.09517512984913	5.69543958448278	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0514207061432888	ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	206766975	T/C	1	107	114	221	52.4816261106143	58.0849964802801	-5.60337036966578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.459945524348314	ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206766968_206767142:LGTN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	206776480	C/T	1	52	36	88	25.5050893247845	18.3426304674569	7.16245885732766	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.136099271061758	ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000437518:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000461334:exon_206776437_206776558:LGTN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	206821286	G/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000143479:ENST00000391931:exon_206820733_206822541:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367109:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367105:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367108:exon_206820733_206822542:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000441486:exon_206820733_206821334:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367106:exon_206820733_206822459:DYRK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	206905040	C/T	1	47	53	100	23.0526768897091	27.0044281882004	-3.9517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.484052667092705	ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	207653364	A/G	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	209950760	C/G	1	111	81	192	54.4435560586747	41.270918551778	13.1726375068967	A:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0605579887284692	ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	210001385	G/A	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210001352_210001515:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210001352_210001515:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210001352_210001515:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210001352_210001515:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210001376_210001515:C1orf107
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	210006603	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210006530_210006703:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210006530_210006703:C1orf107
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	210010460	T/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210010146_210010556:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210010146_210010556:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210010146_210010556:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210010146_210010556:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210010146_210010556:C1orf107
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	210015990	T/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000457820:exon_210015610_210017977:C1orf107
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	211451467	T/C	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	211836789	T/C	1	17	25	42	8.33820227925648	12.7379378246228	-4.39973554536635	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.216702035270024	ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	211846876	A/G	1	7	14	21	3.43337740910561	7.13324518178878	-3.69986777268317	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.127823723210135	ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	212273603	C/T	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	212273639	C/T	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	212965095	G/A	1	22	14	36	10.7906147143319	7.13324518178878	3.65736953254313	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.246062466304874	ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212964872_212965124:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000487995:exon_212964872_212965124:NSL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	213068595	C/T	1	34	28	62	16.676404558513	14.2664903635776	2.40991419493539	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.611865636678741	ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	214781685	C/T	0	12	0	12	5.88578984418104	0	5.88578984418104	C	C		10	0.509517512984913	0.000499989724588711	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	214811244	C/G	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	214818223	T/A	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	214828589	C/T	1	35	28	63	17.166887045528	14.2664903635776	2.90039668195048	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.529150638661668	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214828584_214828746:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214828491_214828746:CENPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	214837110	C/G	1	38	59	97	18.6383345065733	30.0615332661099	-11.4231987595366	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0249849922659766	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	217604492	C/T	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217600334_217604707:GPATCH2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	218458753	C/T	1	43	5	48	21.0907469416487	2.54758756492456	18.5431593767242	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.73192415298748e-08	ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218458629_218458797:RRP15;ENSG00000067533:ENST00000491428:exon_218458684_218458797:RRP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	220151963	A/G	1	67	72	139	32.8623266300108	36.6852609349137	-3.82293430490291	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.552937470538065	ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220151888_220152061:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220151888_220152061:EPRS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	220154768	C/T	1	29	41	70	14.2239921234375	20.8902180323814	-6.66622590894391	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.120713534444122	ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	220156616	C/T	1	51	70	121	25.0146068377694	35.6662259089439	-10.6516190711745	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0562570781716345	ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	220279330	G/A	1	20	19	39	9.80964974030174	9.68083274671335	0.128816993588394	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220279233_220279402:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220279233_220279402:IARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	222802981	A/G	1	9	2	11	4.41434238313578	1.01903502596983	3.39530735716596	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.065955266796108	ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	222823722	G/A	1	16	16	32	7.84771979224139	8.15228020775861	-0.304560415517216	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222823634_222823722:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222823634_222823722:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222823633_222823722:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222823634_222823722:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222823634_222823722:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222823634_222823722:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000495210:exon_222823634_222823722:MIA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	222837438	A/G	1	21	16	37	10.3001322273168	8.15228020775861	2.14785201955822	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.514219390998328	ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000340535:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000284471:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000450260:exon_222837340_222837490:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000477519:exon_222837313_222837490:MIA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	225605734	G/C	1	10	16	26	4.90482487015087	8.15228020775861	-3.24745533760774	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.240919067564399	ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225605686_225605882:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225605686_225605882:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225605686_225605882:LBR;ENSG00000143815:ENST00000487054:exon_225605252_225605882:LBR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	225607144	C/T	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	226034858	C/T	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000482753:exon_226034840_226034914:TMEM63A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	226046974	T/C	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226046896_226047049:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000487971:exon_226046896_226047241:TMEM63A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	226109699	T/C	1	74	88	162	36.2957040391164	44.8375411426723	-8.54183710355591	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.182523787186810	ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226109558_226111471:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000446534:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000489681:exon_226109558_226109779:PYCR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	226352498	T/G	1	12	18	30	5.88578984418104	9.17131523372843	-3.28552538954739	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.274405948978326	ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	226923264	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	227149203	G/A	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000489044:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227149087_227149263:ADCK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	227174210	T/C	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	227920189	G/A	1	69	38	107	33.843291604041	19.3616654934267	14.4816261106143	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00650781293484986	ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	227920357	C/T	1	50	39	89	24.5241243507543	19.8711830064116	4.65294134434274	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.341397584594485	ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	227935444	A/G	1	22	24	46	10.7906147143319	12.2284203116379	-1.437805597306	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.768453449487112	ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	227968302	C/T	1	24	17	41	11.7715796883621	8.66179772074352	3.10978196761857	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.352476605441437	ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227968228_227968927:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227968228_227968927:SNAP47
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	228295527	G/A	1	56	54	110	27.4670192728449	27.5139457011853	-0.0469264283404272	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228295369_228295561:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000457264:exon_228295368_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000463898:exon_228295468_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000497758:exon_228295486_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000464148:exon_228295525_228295570:MRPL55
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	228335125	C/T	1	336	345	681	164.802115637069	175.783541979795	-10.9814263427258	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.420916315644064	ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	228588680	A/C	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	229730452	G/A	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	229730782	T/C	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	231042732	T/A	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	231052016	G/A	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231051939_231052048:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231051939_231052045:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231051939_231052048:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000471302:exon_231051939_231052045:TTC13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	231374798	C/G	1	26	26	52	12.7525446623923	13.2474553376077	-0.494910675215475	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.890880168575511	ENSG00000143633:ENST00000366649:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000318906:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366651:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000366648:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000451322:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000421623:exon_231374603_231374934:C1orf131;ENSG00000143633:ENST00000471936:exon_231372442_231374934:C1orf131
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	231377081	C/T	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	231509813	C/T	1	10	3	13	4.90482487015087	1.52855253895474	3.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0930441887974304	ENSG00000135766:ENST00000366641:exon_231509726_231509845:EGLN1;ENSG00000135766:ENST00000476717:exon_231509726_231509845:EGLN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	233086456	T/C	1	21	36	57	10.3001322273168	18.3426304674569	-8.04249824014004	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0344689106301827	ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	235594073	T/C	1	5	11	16	2.45241243507544	5.60469264283404	-3.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.136942032485751	ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235594020_235594119:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235594020_235594119:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000482230:exon_235594020_235594119:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235594020_235594119:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000461651:exon_235594020_235594119:TBCE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	235600723	A/G	1	15	6	21	7.35723730522631	3.05710507790948	4.30013222731683	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0794791301761176	ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235600637_235600789:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235600637_235600789:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235600637_235600789:TBCE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	235600741	A/G	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235600637_235600789:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235600637_235600789:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235600637_235600789:TBCE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	235602193	A/G	1	21	12	33	10.3001322273168	6.11421015581896	4.18592207149787	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.165267760206332	ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235602084_235602237:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235602084_235602237:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235602084_235602237:TBCE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	235993565	T/G	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000143669:ENST00000389794:exon_235993526_235993724:LYST;ENSG00000143669:ENST00000389793:exon_235993526_235993724:LYST;ENSG00000143669:ENST00000489585:exon_235993526_235993724:LYST;ENSG00000143669:ENST00000465349:exon_235993526_235993724:LYST;ENSG00000143669:ENST00000468107:exon_235993526_235993724:LYST;ENSG00000143669:ENST00000468626:exon_235992708_235993724:LYST
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236381833	A/G	1	18	16	34	8.82868476627157	8.15228020775861	0.676404558512958	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.865000507651962	ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236378855_236381876:ERO1LB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236700807	T/A	1	34	13	47	16.676404558513	6.62372766880387	10.0526768897091	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.00333592058104707	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236700823	T/C	1	28	9	37	13.7335096364224	4.58565761686422	9.14785201955822	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00272959213754250	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236700857	C/T	1	23	1	24	11.281097201347	0.509517512984913	10.7715796883621	T:C	C	T	10	0.509517512984913	3.23341803269745e-06	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236702209	C/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236702210	A/G	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236702374	G/A	1	19	19	38	9.31916725328665	9.68083274671335	-0.361665493426692	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236706862	G/C	1	21	29	50	10.3001322273168	14.7760078765625	-4.47587564924565	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.25761389068374	ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236711323	T/C	1	63	44	107	30.9003966819505	22.4187705713362	8.48162611061431	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.121446968057161	ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236716959	C/T	1	42	53	95	20.6002644546337	27.0044281882004	-6.40416373356674	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.218049772240555	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236717926	T/C	1	40	29	69	19.6192994806035	14.7760078765625	4.843291604041	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.278787524279663	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236718620	T/C	1	55	41	96	26.9765367858298	20.8902180323814	6.08631875344835	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.222074851520225	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236719135	T/C	1	74	28	102	36.2957040391164	14.2664903635776	22.0292136755389	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1.03341851394998e-05	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236719193	A/G	1	52	27	79	25.5050893247845	13.7569728505926	11.7481164741919	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00931437207624432	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236721610	G/A	1	40	21	61	19.6192994806035	10.6998677726832	8.91943170792031	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0286685921137963	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236721660	T/C	1	27	16	43	13.2430271494074	8.15228020775861	5.09074694164874	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.129236673408955	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	236746443	C/T	1	10	3	13	4.90482487015087	1.52855253895474	3.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0930441887974304	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	237058828	C/T	1	1	8	9	0.490482487015087	4.0761401038793	-3.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0193172128390594	ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	242023958	A/G	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000469419:exon_242023819_242024006:EXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	242030151	A/G	1	10	3	13	4.90482487015087	1.52855253895474	3.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0930441887974304	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	242042545	A/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	242042578	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	242048674	C/T	1	2	14	16	0.980964974030174	7.13324518178878	-6.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00198899022078186	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	245850506	G/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	245862248	C/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245862189_245862339:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245862189_245862339:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245862189_245862339:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245862189_245862339:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245862189_245862339:KIF26B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	246021881	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	246021941	T/C	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	246707858	A/G	1	45	49	94	22.0717119156789	24.9663581362607	-2.89464622058182	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.60630130500016	ENSG00000162851:ENST00000366514:exon_246707823_246707983:TFB2M
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	1	247024399	T/C	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000153207:ENST00000470300:exon_247024201_247024597:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247024201_247024597:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247024201_247024597:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247024201_247024597:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247024201_247024597:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247024201_247024597:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000483900:exon_247024201_247024597:AHCTF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	1046712	G/A	1	60	44	104	29.4289492209052	22.4187705713362	7.01017864956905	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.171433228774737	ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	1065457	T/A	1	8	28	36	3.9238598961207	14.2664903635776	-10.3426304674569	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.000638584362578666	ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3150973	C/T	1	64	58	122	31.3908791689656	29.552015753125	1.83886341584061	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.786118775219019	ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3155620	A/G	1	58	48	106	28.447984246875	24.4568406232758	3.99114362359922	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.496678141688468	ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3171995	G/A	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3180227	T/C	1	71	78	149	34.8242565780712	39.7423660128232	-4.91810943475203	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.46100274137019	ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3180316	T/C	1	41	50	91	20.1097819676186	25.4758756492457	-5.36609368162708	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.294554498052869	ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3189380	C/T	1	25	32	57	12.2620621753772	16.3045604155172	-4.04249824014004	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.292590004172710	ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3197856	C/G	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3197783_3197921:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3197783_3197921:PITRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3200292	G/A	1	27	19	46	13.2430271494074	9.68083274671335	3.562194402694	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.306028163779747	ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3202065	T/C	1	37	22	59	18.1478520195582	11.2093852856681	6.93846673389013	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0896895126724525	ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	3206027	A/G	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.239422942006238	ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	5495496	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5495447_5495523:NET1;ENSG00000173848:ENST00000449083:exon_5495447_5495523:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5495447_5495523:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5495447_5495523:NET1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	5498752	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	5790404	A/G	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	5790616	A/G	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	6002368	T/G	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	6002407	T/C	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	6060057	G/A	1	18	8	26	8.82868476627157	4.0761401038793	4.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0768854939145154	ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000397240:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000379954:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6060016_6060082:IL2RA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	11299735	A/T	1	35	26	61	17.166887045528	13.2474553376077	3.91943170792031	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.370290475774054	ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	12257819	T/C	1	94	79	173	46.1053537794182	40.2518835258081	5.85347025361006	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.403090830164244	ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12257739_12257834:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12257739_12257834:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12257739_12257834:CDC123
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	12292344	A/G	1	251	208	459	123.111104240787	105.979642700862	17.1314615399249	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.112566553098338	ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	13167594	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	13330402	T/C	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	13336521	C/T	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000479604:exon_13336428_13336596:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000464049:exon_13336428_13336987:PHYH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	13375906	T/C	1	29	20	49	14.2239921234375	10.1903502596983	4.03364186373926	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.257082266142737	ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	13653653	A/G	1	33	20	53	16.1859220714979	10.1903502596983	5.99557181179961	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.129952887067754	ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	13735887	C/A	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	15183463	C/T	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15183421_15183556:NMT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	17275861	C/T	1	437	298	735	214.340846825593	151.836218869504	62.5046279560889	T:C	C	T	10	0.509517512984913	3.84080462386232e-06	ENSG00000026025:ENST00000224237:exon_17275769_17275930:VIM;ENSG00000026025:ENST00000487938:exon_17275769_17275930:VIM;ENSG00000026025:ENST00000469543:exon_17275769_17275930:VIM;ENSG00000026025:ENST00000421459:exon_17275769_17275930:VIM;ENSG00000026025:ENST00000495528:exon_17275769_17275930:VIM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	18937564	G/A	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000241058:ENST00000377304:exon_18937419_18937574:NSUN6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	21827796	G/A	1	9	15	24	4.41434238313578	7.64276269477369	-3.22842031163791	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.222587013753191	ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	22607271	T/C	1	14	17	31	6.86675481821122	8.66179772074352	-1.7950429025323	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.591606875195905	ENSG00000148444:ENST00000475460:exon_22607201_22607330:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000468179:exon_22607201_22607738:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000421135:exon_22607034_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000470045:exon_22606813_22607332:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000479958:exon_22607034_22607477:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000463688:exon_22607229_22607947:COMMD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	23003226	A/G	1	14	19	33	6.86675481821122	9.68083274671335	-2.81407792850213	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.385252830298031	ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_23003112_23003503:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_23003112_23003484:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_23003112_23003503:PIP4K2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	24874764	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24872538_24875035:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24872538_24875035:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24872543_24875035:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000447364:exon_24873316_24875035:ARHGAP21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	25313818	C/T	1	10	19	29	4.90482487015087	9.68083274671335	-4.77600787656248	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0940502509411912	ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	27335399	C/T	1	19	14	33	9.31916725328665	7.13324518178878	2.18592207149787	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.489468972263295	ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27335282_27335449:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27335282_27335449:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27335282_27335452:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27335282_27335452:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27335282_27335452:ANKRD26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	27353007	T/C	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27352917_27353010:ANKRD26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	27437964	T/C	1	52	67	119	25.5050893247845	34.1376733699892	-8.63258404520465	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.119536495448813	ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	27499771	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27499743_27500010:ACBD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	27499804	T/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27499743_27500010:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27499743_27500010:ACBD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	27506961	G/A	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000107897:ENST00000375889:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375897:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000396271:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375905:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375901:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000375888:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000476758:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000426079:exon_27506909_27507112:ACBD5;ENSG00000107897:ENST00000412279:exon_27506912_27507112:ACBD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	31815787	G/A	1	27	24	51	13.2430271494074	12.2284203116379	1.01460683776944	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.781754210005439	ENSG00000148516:ENST00000320985:exon_31815600_31817847:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000437844:exon_31815600_31818742:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000488625:exon_31815600_31818124:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000361642:exon_31815600_31818118:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000446923:exon_31815600_31818118:ZEB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	32573963	T/C	1	11	4	15	5.39530735716596	2.03807005193965	3.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.119465288012993	ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000479380:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32570787_32575943:EPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	33209266	G/T	1	11	13	24	5.39530735716596	6.62372766880387	-1.22842031163791	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.685634010557098	ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	34408636	T/C	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34408541_34408668:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34408541_34408668:PARD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	34806052	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34805907_34806087:PARD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	35426755	A/G	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000095794:ENST00000482646:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000466251:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000496019:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000354759:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000427847:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000345491:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395895:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374728:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000337656:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374734:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395897:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000439705:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000333809:exon_35426710_35426807:CREM;ENSG00000095794:ENST00000362092:exon_35426710_35426807:CREM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	38345455	A/G	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.112356383277526	ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	43281089	T/C	1	15	13	28	7.35723730522631	6.62372766880387	0.733509636422436	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.851310323683977	ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43280930_43281120:BMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	43289407	G/A	1	43	26	69	21.0907469416487	13.2474553376077	7.843291604041	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0703247943517464	ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	43650915	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43650345_43651258:CSGALNACT2;ENSG00000169826:ENST00000374464:exon_43650345_43651258:CSGALNACT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	43654194	A/G	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43654163_43654379:CSGALNACT2;ENSG00000169826:ENST00000374464:exon_43654163_43654379:CSGALNACT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	43883342	T/A	1	111	115	226	54.4435560586747	58.594513993265	-4.15095793459034	A:T:G	T	A	10	0.509517512984913	0.595028931666803	ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	45465678	C/T	1	27	24	51	13.2430271494074	12.2284203116379	1.01460683776944	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.781754210005439	ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45465613_45467296:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45465613_45465712:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45465613_45465712:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45465613_45465712:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45465613_45465712:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45465613_45465712:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45465613_45465712:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45465617_45465712:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45465672_45465712:RASSF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	45465737	C/T	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45465613_45467296:RASSF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	50376004	A/G	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000204161:ENST00000374156:exon_50375954_50376007:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374151:exon_50375954_50376007:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374153:exon_50375954_50376007:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000474718:exon_50375954_50376007:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000453436:exon_50375954_50376007:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374149:exon_50375954_50376007:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374148:exon_50375954_50376007:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000470884:exon_50375954_50376007:C10orf128
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	50723684	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000225830:ENST00000508005:exon_50723151_50725167:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50723247_50725167:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50723247_50725167:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50723247_50725167:ERCC6;ENSG00000243251:ENST00000374127:exon_50723151_50725167:PGBD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	50943376	C/T	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000197444:ENST00000374103:exon_50942689_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000419399:exon_50942690_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000432695:exon_50942690_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000490844:exon_50942692_50943397:OGDHL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	51584624	C/T	1	22	15	37	10.7906147143319	7.64276269477369	3.14785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.327260400458979	ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000498586:exon_51584616_51584817:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000431200:exon_51584616_51584947:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	51585348	G/A	1	23	21	44	11.281097201347	10.6998677726832	0.581229428663828	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.881345604651725	ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	51827763	A/G	1	1	9	10	0.490482487015087	4.58565761686422	-4.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0103558957396217	ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	52103707	A/G	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	53458047	A/G	1	35	55	90	17.166887045528	28.0234632141702	-10.8565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0263499926466781	ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	64573771	C/T	1	14	10	24	6.86675481821122	5.09517512984913	1.77157968836209	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.54303205531595	ENSG00000122877:ENST00000242480:exon_64571756_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000439032:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000437594:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000411732:exon_64571763_64574228:EGR2;ENSG00000122877:ENST00000432380:exon_64573759_64574228:EGR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	64949062	C/T	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64948928_64949206:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64948928_64949206:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64948928_64949206:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64948928_64949206:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000497922:exon_64949047_64949206:JMJD1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	70044031	T/C	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000108187:ENST00000336578:exon_70042417_70044046:PBLD;ENSG00000108187:ENST00000358769:exon_70042417_70044046:PBLD;ENSG00000108187:ENST00000395165:exon_70042417_70044046:PBLD;ENSG00000108187:ENST00000309049:exon_70042821_70044046:PBLD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	70716026	C/T	1	137	94	231	67.1961007210669	47.8946462205818	19.3014545004851	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.012256237701454	ENSG00000165732:ENST00000354185:exon_70715884_70716068:DDX21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	70733266	T/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	70734497	C/G	1	44	51	95	21.5812294286638	25.9853931622306	-4.40416373356673	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.411901244383958	ENSG00000165732:ENST00000354185:exon_70734426_70734499:DDX21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	70856852	G/A	1	783	401	1184	384.047787332813	204.31652270695	179.731264625863	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	5.43689976430887e-26	ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	70856853	G/C	1	779	392	1171	382.085857384753	199.730865090086	182.354992294667	C:G	G	C	10	0.509517512984913	5.58174954849503e-27	ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	71103597	C/G	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000464803:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000480047:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	71151885	C/T	1	42	53	95	20.6002644546337	27.0044281882004	-6.40416373356674	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.218049772240555	ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71151881_71152064:HK1;ENSG00000156515:ENST00000467710:exon_71151881_71151918:HK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	71905695	A/G	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	71906150	T/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000156521:ENST00000287078:exon_71905177_71906342:TYSND1;ENSG00000156521:ENST00000335494:exon_71905177_71906412:TYSND1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	71969017	A/T	1	250	253	503	122.620621753772	128.907930785183	-6.28730903141124	A:T:C	A	T	10	0.509517512984913	0.592650832827453	ENSG00000180817:ENST00000373232:exon_71968961_71969046:PPA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	73533177	A/G	1	23	4	27	11.281097201347	2.03807005193965	9.24302714940735	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000330510327364713	ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73533115_73533255:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73533115_73533196:C10orf54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	73887894	T/A	1	28	22	50	13.7335096364224	11.2093852856681	2.52412435075435	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.483871757529487	ENSG00000138303:ENST00000394919:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000342444:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317168:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000373101:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000534259:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000486689:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000530394:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317126:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000394915:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000525286:exon_73887840_73887925:ASCC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	73972957	C/T	1	20	23	43	9.80964974030174	11.718902798653	-1.90925305835126	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.647880369768207	ENSG00000138303:ENST00000394919:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000342444:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317168:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000373101:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317126:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000394915:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000531048:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000530461:exon_73972945_73973035:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000527593:exon_73972945_73973109:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000524829:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000532011:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000526751:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000492502:exon_73972945_73973089:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000533958:exon_73972945_73973089:ASCC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	75898009	T/C	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000185009:ENST00000425908:exon_75897865_75898146:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000355264:exon_75897865_75898140:AP3M1;ENSG00000185009:ENST00000372745:exon_75897865_75898140:AP3M1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	76990646	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	77807027	T/C	1	7	13	20	3.43337740910561	6.62372766880387	-3.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.182340866714798	ENSG00000148655:ENST00000354343:exon_77806922_77807061:C10orf11;ENSG00000148655:ENST00000372499:exon_77806922_77807061:C10orf11;ENSG00000148655:ENST00000496424:exon_77806637_77807061:C10orf11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	81065881	C/T	1	17	19	36	8.33820227925648	9.68083274671335	-1.34263046745687	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.739677666199833	ENSG00000108175:ENST00000334512:exon_81065857_81066101:ZMIZ1;ENSG00000108175:ENST00000360331:exon_81065857_81066101:ZMIZ1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	82269238	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000108219:ENST00000469149:exon_82269057_82269676:TSPAN14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	82280551	T/G	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000108219:ENST00000429989:exon_82277661_82282387:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372160:exon_82280347_82281515:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372164:exon_82277661_82282387:TSPAN14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	85908565	C/T	1	112	116	228	54.9340385456897	59.1040315062499	-4.16999296056017	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.596604291877409	ENSG00000165678:ENST00000372134:exon_85908486_85908594:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000339736:exon_85908486_85908594:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000436406:exon_85908486_85908594:GHITM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	86237331	G/A	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86237331_86237420:FAM190B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	86273249	T/C	1	12	15	27	5.88578984418104	7.64276269477369	-1.75697285059265	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.566049825319431	ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	88203068	T/C	1	26	32	58	12.7525446623923	16.3045604155172	-3.55201575312495	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.361258703800507	ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	88971927	G/A	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000237134:ENST00000449358:exon_88971898_88971947:AL157893.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	90342837	C/G	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	90762896	G/A	1	28	29	57	13.7335096364224	14.7760078765625	-1.04249824014004	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.792745225030573	ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90762786_90762951:FAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	90771829	T/C	1	60	68	128	29.4289492209052	34.6471908829741	-5.21824166206887	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.377304653460113	ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90771756_90771838:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90771756_90771838:FAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	91099657	A/G	1	110	80	190	53.9530735716596	40.761401038793	13.1916725328665	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0591828433406996	ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	91178000	C/T	1	18	16	34	8.82868476627157	8.15228020775861	0.676404558512958	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.865000507651962	ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	91518638	T/C	1	11	18	29	5.39530735716596	9.17131523372843	-3.77600787656248	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.194206386621495	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91518463_91518639:KIF20B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	95266799	A/G	1	13	10	23	6.37627233119613	5.09517512984913	1.281097201347	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.6789219768712	ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95266767_95266813:CEP55
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	95276692	G/A	1	25	29	54	12.2620621753772	14.7760078765625	-2.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500139310571228	ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	95430585	T/G	1	40	50	90	19.6192994806035	25.4758756492457	-5.85657616864217	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.246220093437082	ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000460752:exon_95430527_95435061:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000483229:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000462771:exon_95430532_95430605:FRA10AC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	95441272	G/A	1	40	17	57	19.6192994806035	8.66179772074352	10.95750175986	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00494236606506509	ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95441237_95441355:FRA10AC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	95454681	G/C	1	19	33	52	9.31916725328665	16.8140779285021	-7.49491067521548	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0511048861504986	ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	95458141	A/G	1	32	44	76	15.6954395844828	22.4187705713362	-6.72333098685339	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.136090325050878	ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	96117924	A/G	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96117840_96117972:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96117840_96117972:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96116931_96117972:NOC3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	97023630	T/C	1	352	268	620	172.649835429311	136.550693479957	36.0991419493539	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00380841286818712	ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	97413047	G/A	1	18	31	49	8.82868476627157	15.7950429025323	-6.96635813626074	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0621443311434071	ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97413047_97413162:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97413047_97413162:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000483788:exon_97413047_97413162:ALDH18A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	97917260	C/G	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	97983526	C/T	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289775626167224	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	97987144	C/G	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.258617102120622	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	97990583	A/G	1	73	75	148	35.8052215521014	38.2138134738685	-2.40859192176713	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.742411941306297	ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	98380277	C/T	1	17	9	26	8.33820227925648	4.58565761686422	3.75254466239226	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.170643616094001	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	98386558	G/A	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98386465_98386662:PIK3AP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	98469507	C/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	99160152	A/G	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160062_99160291:RRP12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	99160965	A/G	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160850_99161100:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160850_99161040:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160850_99161127:RRP12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	99205731	A/G	1	20	22	42	9.80964974030174	11.2093852856681	-1.39973554536635	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.758105820276018	ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	99220707	C/T	1	21	19	40	10.3001322273168	9.68083274671335	0.61929948060348	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.875534708687596	ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99220664_99220764:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480108:exon_99220664_99221123:MMS19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	99225846	C/T	1	15	19	34	7.35723730522631	9.68083274671335	-2.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.493953241174159	ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99225816_99225913:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99225816_99225916:MMS19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	99498381	C/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000155256:ENST00000393677:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370610:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000370613:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000337540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000497994:exon_99498234_99498406:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000356257:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000357540:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000453958:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000359980:exon_99498234_99498431:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000462887:exon_99498234_99498602:ZFYVE27;ENSG00000155256:ENST00000423811:exon_99498301_99498431:ZFYVE27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	100144782	C/T	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000119943:ENST00000370575:exon_100144704_100144824:PYROXD2;ENSG00000119943:ENST00000483923:exon_100144704_100144824:PYROXD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	100178012	C/T	1	28	24	52	13.7335096364224	12.2284203116379	1.50508932478452	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.781796812318336	ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100177909_100178014:HPS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	101455912	T/C	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	101514370	G/C	1	54	36	90	26.4860542988147	18.3426304674569	8.14342383135783	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.091999682768226	ENSG00000119929:ENST00000370476:exon_101514286_101514391:CUTC;ENSG00000119929:ENST00000471520:exon_101514286_101514391:CUTC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	102748351	C/T	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000107815:ENST00000311916:exon_102747783_102749210:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102747783_102749210:C10orf2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	102749069	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000107815:ENST00000311916:exon_102747783_102749210:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102747783_102749210:C10orf2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	102762517	C/T	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000459989:exon_102762462_102762703:LZTS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	104849468	G/A	1	44	40	84	21.5812294286638	20.3807005193965	1.20052890926731	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.827774546483994	ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105154013	A/G	1	15	34	49	7.35723730522631	17.323595441487	-9.96635813626074	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00604033973347701	ENSG00000173915:ENST00000369825:exon_105153956_105154151:USMG5;ENSG00000173915:ENST00000337003:exon_105153956_105154151:USMG5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105174869	G/A	1	18	8	26	8.82868476627157	4.0761401038793	4.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0768854939145154	ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105174762_105174908:PDCD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105182770	C/T	1	16	18	34	7.84771979224139	9.17131523372843	-1.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.732552886508093	ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105182745_105182894:PDCD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105194086	C/T	1	28	30	58	13.7335096364224	15.2855253895474	-1.55201575312495	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.695855915207732	ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105206874	T/C	1	38	39	77	18.6383345065733	19.8711830064116	-1.2328484998383	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.820163306594828	ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105361816	T/G	0	0	10	10	0	5.09517512984913	-5.09517512984913	G	T	G	10	0.509517512984913	0.000805814452588094	ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105657316	G/C	1	33	34	67	16.1859220714979	17.323595441487	-1.13767336998917	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.807855270024698	ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105659826	T/C	1	29	31	60	14.2239921234375	15.7950429025323	-1.57105077909478	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.700493201950742	ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105659820_105659981:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105659718_105659911:OBFC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105758670	A/G	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105758657_105758729:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105758657_105758729:SLK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105762591	G/A	1	23	25	48	11.281097201347	12.7379378246228	-1.45684062327582	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.773162848116751	ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105763026	C/T	1	21	20	41	10.3001322273168	10.1903502596983	0.109781967618567	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	105780285	A/G	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105780246_105780371:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105780246_105780371:SLK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	106027059	G/A	1	263	268	531	128.996894084968	136.550693479957	-7.5537993949888	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.515347644476188	ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	106027165	G/A	1	272	264	536	133.411236468104	134.512623428017	-1.10138695991338	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.931195824821219	ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	112266722	C/T	1	41	48	89	20.1097819676186	24.4568406232758	-4.34705865565726	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.396708083588661	ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	112266822	G/A	1	25	27	52	12.2620621753772	13.7569728505926	-1.49491067521548	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.680587313441794	ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	112266823	C/T	1	25	27	52	12.2620621753772	13.7569728505926	-1.49491067521548	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.680587313441794	ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	112349422	T/C	1	70	50	120	34.3337740910561	25.4758756492457	8.85789844181044	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.120388658295455	ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112349363_112349466:SMC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	112356331	G/A	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.541700480242972	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	114169425	A/T	1	11	18	29	5.39530735716596	9.17131523372843	-3.77600787656248	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.194206386621495	ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114169265_114169443:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000495539:exon_114169291_114169443:ACSL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	114200355	G/A	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000023041:ENST00000369405:exon_114200292_114200453:ZDHHC6;ENSG00000023041:ENST00000369404:exon_114200292_114200453:ZDHHC6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	114205234	T/C	1	14	24	38	6.86675481821122	12.2284203116379	-5.36166549342669	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.103795042786148	ENSG00000023041:ENST00000369405:exon_114204928_114205408:ZDHHC6;ENSG00000023041:ENST00000369404:exon_114204928_114205408:ZDHHC6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	115609915	C/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	115905320	C/T	1	17	9	26	8.33820227925648	4.58565761686422	3.75254466239226	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.170643616094001	ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115905308_115905520:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115905308_115905520:C10orf118
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	115910928	G/T	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	115922774	G/A	1	14	11	25	6.86675481821122	5.60469264283404	1.26206217537718	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.691382994021232	ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	120840191	T/C	1	24	23	47	11.7715796883621	11.718902798653	0.0526768897090903	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120840140_120840316:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000478852:exon_120840140_120840396:EIF3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	120920588	T/C	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	120921900	T/C	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000330036:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000466218:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000419372:exon_120921852_120921926:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000462913:exon_120921852_120921926:SFXN4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	121086097	A/T	1	25	35	60	12.2620621753772	17.833112954472	-5.57105077909478	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.157431451174388	ENSG00000198873:ENST00000369106:exon_121086028_121086123:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121086028_121086123:GRK5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	121259610	C/T	1	1088	1276	2364	533.644945872415	650.144346568749	-116.499400696334	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	1.78702447867388e-06	ENSG00000148908:ENST00000392865:exon_121259340_121259771:RGS10;ENSG00000148908:ENST00000369103:exon_121259437_121259771:RGS10;ENSG00000148908:ENST00000369101:exon_121259437_121259771:RGS10;ENSG00000148908:ENST00000469575:exon_121259592_121259771:RGS10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	121337166	C/T	1	98	92	190	48.0672837274785	46.875611194612	1.19167253286653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.88478573025696	ENSG00000151923:ENST00000369093:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000489822:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000497671:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000470781:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000436547:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000369087:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000369092:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000495821:exon_121337153_121337248:TIAL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	121551581	A/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000198825:ENST00000453198:exon_121551381_121551596:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369081:exon_121551381_121551717:INPP5F
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	121586827	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	121596498	C/T	1	33	29	62	16.1859220714979	14.7760078765625	1.40991419493539	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.79977425088429	ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121596408_121596541:C10orf119
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	121602830	G/A	1	13	13	26	6.37627233119613	6.62372766880387	-0.247455337607738	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121602760_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121602766_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121602766_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000495407:exon_121602294_121602938:C10orf119
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	122643355	C/G	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122643292_122643400:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122643292_122643400:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122643292_122643400:WDR11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	122649482	A/G	1	12	18	30	5.88578984418104	9.17131523372843	-3.28552538954739	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.274405948978326	ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000478567:exon_122649407_122649521:WDR11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	123503187	T/C	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	126186625	C/T	1	18	3	21	8.82868476627157	1.52855253895474	7.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00154778749540789	ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126186605_126186697:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126186605_126186697:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126186605_126186697:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000481452:exon_126186605_126186697:LHPP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129899578	T/C	1	201	210	411	98.5869798900325	106.998677726832	-8.41169783679923	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.429948862174729	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129899778	G/C	1	187	185	372	91.7202250718213	94.2607399022089	-2.54051483038762	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.79567483628028	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129899922	T/C	1	89	120	209	43.6529413443427	61.1421015581896	-17.4891602138468	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0184461335721268	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129901393	T/C	1	98	80	178	48.0672837274785	40.761401038793	7.30588268868549	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.294127693504891	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129901722	G/A	1	58	39	97	28.447984246875	19.8711830064116	8.57680124046344	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0848980348635943	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129901825	T/C	1	65	60	125	31.8813616559807	30.5710507790948	1.31031087688588	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.85818243412307	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129902281	G/A	1	63	65	128	30.9003966819505	33.1186383440193	-2.21824166206886	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.724084328719533	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129903016	T/C	1	53	31	84	25.9955718117996	15.7950429025323	10.2005289092673	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0287938501972023	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129903518	C/A	1	37	18	55	18.1478520195582	9.17131523372843	8.97653678582978	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0210021568451633	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129903592	G/A	1	23	21	44	11.281097201347	10.6998677726832	0.581229428663828	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.881345604651725	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129904376	C/A	1	17	26	43	8.33820227925648	13.2474553376077	-4.90925305835126	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.169265719213925	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129906468	C/T	1	6	15	21	2.94289492209052	7.64276269477369	-4.69986777268317	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0488848967390049	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129906903	C/T	1	26	18	44	12.7525446623923	9.17131523372843	3.58122942866383	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.295065363445801	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	129907544	G/C	1	16	15	31	7.84771979224139	7.64276269477369	0.204957097467697	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	131506192	C/T	1	66	66	132	32.3718441429957	33.6281558570043	-1.25631171400852	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.86197731557184	ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	131959150	C/T	1	45	61	106	22.0717119156789	31.0805682920797	-9.00885637640078	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0812480279621653	ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	133769482	G/C	1	69	77	146	33.843291604041	39.2328484998383	-5.38955689579729	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.407963280099533	ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	134145136	A/G	1	38	5	43	18.6383345065733	2.54758756492456	16.0907469416487	A:G	A	G	10	0.509517512984913	2.99489456624542e-07	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	134145138	C/G	1	40	5	45	19.6192994806035	2.54758756492456	17.0717119156789	C:G	C	G	10	0.509517512984913	9.64306834717752e-08	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	134145153	G/A	1	30	1	31	14.7144746104526	0.509517512984913	14.2049570974677	A:G	G	A	10	0.509517512984913	3.42888841239798e-08	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	134145166	T/C	1	25	17	42	12.2620621753772	8.66179772074352	3.60026445463365	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.283619813190237	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	134145288	C/A	1	27	19	46	13.2430271494074	9.68083274671335	3.562194402694	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.306028163779747	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	134145293	G/T	1	28	24	52	13.7335096364224	12.2284203116379	1.50508932478452	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.781796812318336	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	134145314	A/G	1	11	21	32	5.39530735716596	10.6998677726832	-5.30456041551722	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0761104169957889	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	134145336	G/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135076523	C/A	1	167	124	291	81.9105753315195	63.1801716101292	18.7304037213903	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0299583835919157	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135076596	T/C	1	111	92	203	54.4435560586747	46.875611194612	7.56794486406267	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.293239262506404	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135076758	T/C	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135082346	A/G	1	50	39	89	24.5241243507543	19.8711830064116	4.65294134434274	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.341397584594485	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135084322	A/G	1	1	10	11	0.490482487015087	5.09517512984913	-4.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00551240836678135	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135085302	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135085321	C/T	1	45	27	72	22.0717119156789	13.7569728505926	8.31473906508626	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0587818974538374	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135085754	G/A	1	67	50	117	32.8623266300108	25.4758756492457	7.38645098076518	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.195373470951913	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135089035	A/G	1	14	12	26	6.86675481821122	6.11421015581896	0.752544662392262	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.845747407952092	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135097434	A/G	1	34	32	66	16.676404558513	16.3045604155172	0.371844142995741	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135098672	G/A	1	22	23	45	10.7906147143319	11.718902798653	-0.928288084321084	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.881715558303643	ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135112940	C/T	1	22	19	41	10.7906147143319	9.68083274671335	1.10978196761857	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.756996336009118	ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135122507	G/A	1	16	13	29	7.84771979224139	6.62372766880387	1.22399212343752	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.712533292455687	ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135122327_135122644:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135122327_135122638:TUBGCP2;ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135121979_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122445_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122453_135122600:ZNF511
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	10	135209281	G/A	1	21	29	50	10.3001322273168	14.7760078765625	-4.47587564924565	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.25761389068374	ENSG00000254536:ENST00000468317:exon_135209217_135209281:RP11-108K14.8;ENSG00000148824:ENST00000477902:exon_135209217_135209281:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000317502:exon_135209217_135209281:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000432508:exon_135209217_135209281:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000498334:exon_135209217_135209281:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000460848:exon_135209217_135209281:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000495014:exon_135209217_135209281:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000498790:exon_135209217_135209281:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000473735:exon_135209217_135209281:MTG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	209425	G/C	1	23	28	51	11.281097201347	14.2664903635776	-2.98539316223056	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.484144797696808	ENSG00000177963:ENST00000526104:exon_209407_210000:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000325207:exon_209407_210000:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000531209:exon_209407_209551:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000526982:exon_209407_210000:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000532373:exon_209271_209788:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000530889:exon_209407_209811:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527696:exon_209069_210000:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527468:exon_209407_209738:RIC8A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	218904	G/A	1	27	26	53	13.2430271494074	13.2474553376077	-0.00442818820038759	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529937:exon_218778_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_218778_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_218832_219041:SIRT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	290891	T/C	1	16	22	38	7.84771979224139	11.2093852856681	-3.36166549342669	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.330832380517956	ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	290918	G/A	1	21	23	44	10.3001322273168	11.718902798653	-1.41877057133617	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.763445474056447	ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	308180	A/G	1	118	53	171	57.8769334677803	27.0044281882004	30.8725052795799	A:G	A	G	10	0.509517512984913	2.4178070629e-06	ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	320848	T/C	1	7	43	50	3.43337740910561	21.9092530583513	-18.4758756492456	T:C	T	C	10	0.509517512984913	8.53762288188864e-08	ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	431878	C/A	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_431694_433459:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_431694_431906:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_431848_431906:ANO9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	433867	G/A	1	25	11	36	12.2620621753772	5.60469264283404	6.65736953254313	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0298483097438721	ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_433815_433937:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_433815_433937:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_433815_433937:ANO9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	460247	G/A	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000174915:ENST00000532614:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531520:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000528617:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000525727:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000525059:exon_460187_461051:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000527479:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_458674_460288:PTDSS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	494942	G/C	1	133	141	274	65.2341707730066	71.8419693308727	-6.60779855786616	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.432710395155712	ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	499059	C/T	1	116	131	247	56.8959684937501	66.7467942010236	-9.85082570727351	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.226607605572671	ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	534242	A/G	1	34	56	90	16.676404558513	28.5329807271551	-11.8565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.01490137680973	ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	557584	G/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000185522:ENST00000329451:exon_557572_557640:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000441853:exon_557572_557640:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000486629:exon_557572_557640:C11orf35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	607819	C/A	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	609068	G/A	1	15	22	37	7.35723730522631	11.2093852856681	-3.85214798044178	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.249934710989812	ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	609353	G/A	1	40	39	79	19.6192994806035	19.8711830064116	-0.251883525808125	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	612967	A/G	1	14	3	17	6.86675481821122	1.52855253895474	5.33820227925648	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0129894276221653	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	613165	G/C	1	20	4	24	9.80964974030174	2.03807005193965	7.77157968836209	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00161305411388320	ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	613192	A/G	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	613208	T/C	1	173	177	350	84.8534702536101	90.1845997983296	-5.33112954471954	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.593030395471658	ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	613297	T/G	1	146	217	363	71.6104431042027	110.565300317726	-38.9548572135234	T:G	T	G	10	0.509517512984913	4.98171090158072e-05	ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	614318	T/C	1	103	140	243	50.519696162554	71.3324518178878	-20.8127556553339	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00841003332538169	ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	614864	C/T	1	112	154	266	54.9340385456897	78.4656969996766	-23.5316584539869	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.00392912168950302	ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	615010	G/T	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	615011	A/T	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	A:T	A	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	653968	T/C	1	39	35	74	19.1288169935884	17.833112954472	1.29570403911644	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.816537363940474	ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	674499	G/A	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	G	G		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	674546	T/C	1	29	32	61	14.2239921234375	16.3045604155172	-2.08056829207969	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.610813898203114	ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	688416	T/G	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	T:C:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_688331_688460:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_688331_688460:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_688331_688460:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_688331_688460:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000529717:exon_688331_688460:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525626:exon_688331_688460:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000528864:exon_688331_688460:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000524786:exon_688331_688460:DEAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	824789	T/C	1	29	29	58	14.2239921234375	14.7760078765625	-0.552015753124955	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.896342121076085	ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_824523_825573:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_824523_825219:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_824523_825218:PNPLA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	824805	C/T	1	35	39	74	17.166887045528	19.8711830064116	-2.70429596088356	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.562175342810006	ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_824523_825573:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_824523_825219:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000529255:exon_824523_825218:PNPLA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	837582	G/A	1	33	40	73	16.1859220714979	20.3807005193965	-4.19477844789865	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.350264779425146	ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	840363	C/T	1	257	208	465	126.053999162877	105.979642700862	20.0743564620155	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0636437813994703	ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	840477	A/G	1	458	346	804	224.64097905291	176.29305949278	48.34791956013	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000699350275713511	ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	870446	G/A	1	32	51	83	15.6954395844828	25.9853931622306	-10.2899535777478	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0276833205956642	ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	903039	G/A	1	18	17	35	8.82868476627157	8.66179772074352	0.166887045528044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000531859:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534254:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528426:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533056:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533059:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000530939:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525225:exon_902971_903111:CHID1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	985547	C/T	1	18	16	34	8.82868476627157	8.15228020775861	0.676404558512958	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.865000507651962	ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	1011490	G/A	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	1902793	A/T	1	554	528	1082	271.727297806358	269.025246856034	2.70205095032412	A:T:C:G	A	T	10	0.509517512984913	0.879191636554824	ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	2424541	C/G	1	60	54	114	29.4289492209052	27.5139457011853	1.91500351971992	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.778870272009342	ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	2924610	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2924606_2924719:SLC22A18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	2943681	G/A	1	1	9	10	0.490482487015087	4.58565761686422	-4.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0103558957396217	ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000463571:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2943666_2943786:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2943666_2943786:SLC22A18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	3381057	C/G	1	49	38	87	24.0336418637393	19.3616654934267	4.67197637031257	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.335785614219854	ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	3381369	G/C	1	15	22	37	7.35723730522631	11.2093852856681	-3.85214798044178	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.249934710989812	ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	3697789	C/T	1	28	16	44	13.7335096364224	8.15228020775861	5.58122942866383	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.098784751113416	ENSG00000110713:ENST00000533346:exon_3697739_3697850:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3697739_3697850:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3697739_3697850:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3697739_3697850:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000469881:exon_3697739_3697850:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000482690:exon_3697739_3697940:NUP98
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	3797112	G/A	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3797112_3797251:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3797112_3797251:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3797112_3797251:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397004:exon_3797112_3797251:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397007:exon_3797112_3797251:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397018:exon_3797112_3797251:NUP98
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	4156386	C/T	1	57	43	100	27.95750175986	21.9092530583513	6.0482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.231830868702960	ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4156312_4156500:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4156312_4156500:RRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	4411241	C/T	1	40	44	84	19.6192994806035	22.4187705713362	-2.79947109073269	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.585904905851441	ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	5653960	G/A	1	15	7	22	7.35723730522631	3.56662259089439	3.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.135346882910936	ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5653485_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5653467_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000491385:exon_5653511_5653984:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5653485_5653984:TRIM34
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	5700340	T/C	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	5717762	T/C	1	120	125	245	58.8578984418104	63.6896891231141	-4.83179068130368	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.565398286875003	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	5718517	G/A	1	114	118	232	55.9150035197199	60.1230665322197	-4.20806301249981	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.599707672050994	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	5730625	C/T	1	80	89	169	39.238598961207	45.3470586556573	-6.1084596944503	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.356757492198525	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5730283_5732093:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5730283_5732092:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5730283_5730677:TRIM22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6239344	G/A	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6340416	G/A	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6341684	C/G	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6520164	T/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:T	T	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6519953_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6588256	G/A	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6593198	C/T	1	17	35	52	8.33820227925648	17.833112954472	-9.49491067521548	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0117880323763426	ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6592866_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6591239_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6592866_6593249:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000532467:exon_6592866_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525889:exon_6592866_6593257:DNHD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6629665	C/T	1	97	112	209	47.5768012404634	57.0659614543103	-9.48916021384682	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.212917382823001	ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6630833	G/A	1	99	88	187	48.5577662144936	44.8375411426723	3.72022507182127	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.60909936898849	ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6631016	C/T	1	146	141	287	71.6104431042027	71.8419693308727	-0.231526226670027	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	6632450	C/T	1	497	482	979	243.769796046498	245.587441258728	-1.81764521222982	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.92361282009566	ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	7662732	C/T	1	12	15	27	5.88578984418104	7.64276269477369	-1.75697285059265	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.566049825319431	ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	8435077	C/T	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8435042_8435239:STK33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	8435078	A/C	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8435042_8435239:STK33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	8486310	C/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8486256_8489201:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396673:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000418597:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000422559:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000457885:exon_8486256_8486369:STK33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	10477939	G/T	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10477481_10477949:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10477733_10477949:AMPD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	10786142	C/T	1	14	26	40	6.86675481821122	13.2474553376077	-6.38070051939652	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0565460725064916	ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	10800287	G/T	1	57	48	105	27.95750175986	24.4568406232758	3.50066113658414	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.558322935458635	ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10800226_10801290:CTR9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	10821185	G/A	1	232	220	452	113.7919369875	112.093852856681	1.69808413081932	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.887832263109731	ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	11292645	G/A	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	11354346	T/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	11362372	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11362366_11362551:GALNTL4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	18108693	T/C	1	22	35	57	10.7906147143319	17.833112954472	-7.04249824014004	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0646665133243138	ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108690_18108772:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108690_18108772:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530436:exon_18108690_18108772:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108690_18108772:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108690_18108772:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108690_18108772:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108690_18108753:SAAL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	18124837	C/T	1	24	15	39	11.7715796883621	7.64276269477369	4.12881699358839	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.202767656010779	ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18124804_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000533851:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530180:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530736:exon_18124780_18124893:SAAL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	18472528	G/C	1	13	6	19	6.37627233119613	3.05710507790948	3.31916725328665	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.168530333768717	ENSG00000166796:ENST00000396215:exon_18472510_18472792:LDHC;ENSG00000166796:ENST00000280704:exon_18472510_18472792:LDHC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	18505447	T/C	1	114	79	193	55.9150035197199	40.2518835258081	15.6631199939118	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0255388227373309	ENSG00000074319:ENST00000357193:exon_18505417_18505619:TSG101;ENSG00000074319:ENST00000251968:exon_18505417_18505619:TSG101
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	18555901	C/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000151116:ENST00000396197:exon_18555877_18556000:UEVLD;ENSG00000151116:ENST00000379387:exon_18555877_18556000:UEVLD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	18633897	T/C	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	19184857	A/G	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000177054:ENST00000446113:exon_19184850_19184974:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000527094:exon_19184850_19184974:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000319776:exon_19184856_19184974:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000399351:exon_19184850_19184974:ZDHHC13;ENSG00000177054:ENST00000525490:exon_19184850_19184974:ZDHHC13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	20404613	T/G	1	70	84	154	34.3337740910561	42.7994710907327	-8.4656969996766	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.197052254877495	ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	20404757	T/C	1	133	130	263	65.2341707730066	66.2372766880387	-1.00310591503212	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.902038288700149	ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	20529892	A/G	1	17	15	32	8.33820227925648	7.64276269477369	0.695439584482783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.860859198749914	ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	27362288	G/A	1	25	24	49	12.2620621753772	12.2284203116379	0.0336418637392626	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	28057957	T/C	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	32124978	T/C	1	16	26	42	7.84771979224139	13.2474553376077	-5.39973554536635	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.121903536253002	ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	32956620	A/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000524678:exon_32956130_32956981:QSER1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	33065394	C/T	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	33076191	T/C	1	7	12	19	3.43337740910561	6.11421015581896	-2.68083274671335	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.255611251188563	ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	33094021	A/G	1	26	21	47	12.7525446623923	10.6998677726832	2.05267688970909	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.563413221735493	ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33094020_33095109:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33094020_33094199:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33094020_33094199:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33094020_33094391:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33094020_33094394:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33094020_33095109:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528962:exon_33094020_33094199:TCP11L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	33731826	C/T	1	147	191	338	72.1009255912178	97.3178449801184	-25.2169193889006	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00646868333092329	ENSG00000085063:ENST00000534312:exon_33731752_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000527926:exon_33731752_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000525763:exon_33731452_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000533181:exon_33731452_33731829:CD59;ENSG00000085063:ENST00000418830:exon_33724558_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000395850:exon_33730246_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000533403:exon_33730379_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000351554:exon_33730411_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000528987:exon_33730416_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000415002:exon_33730446_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000445143:exon_33731344_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000426650:exon_33731372_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000437761:exon_33731475_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000527577:exon_33731551_33731889:CD59;ENSG00000085063:ENST00000528700:exon_33731627_33731889:CD59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	33880947	G/A	1	27	36	63	13.2430271494074	18.3426304674569	-5.09960331804952	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.209546228212232	ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	34154641	C/T	1	20	11	31	9.80964974030174	5.60469264283404	4.2049570974677	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.151896927870573	ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34154573_34154689:NAT10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	34969150	C/T	1	24	13	37	11.7715796883621	6.62372766880387	5.14785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.101125363674257	ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	34988343	T/C	1	18	13	31	8.82868476627157	6.62372766880387	2.2049570974677	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.475629809894747	ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34988187_34988361:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34988187_34988361:PDHX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	34991826	G/A	1	14	13	27	6.86675481821122	6.62372766880387	0.243027149407349	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	43413028	A/C	1	16	13	29	7.84771979224139	6.62372766880387	1.22399212343752	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.712533292455687	ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000299240:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000534347:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000530469:exon_43413015_43413338:TTC17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	43876698	C/T	1	43	22	65	21.0907469416487	11.2093852856681	9.88136165598066	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0177713366621724	ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	43940644	G/T	1	38	30	68	18.6383345065733	15.2855253895474	3.35280911702592	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.467354612476931	ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	44101118	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44101081_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000531940:exon_44101081_44101157:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44098873_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000532122:exon_44100888_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000531190:exon_44100888_44101170:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527557:exon_44101079_44101170:ACCS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	44104981	C/T	1	14	20	34	6.86675481821122	10.1903502596983	-3.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.304187764558665	ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	44228381	G/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000151348:ENST00000533608:exon_44228343_44228509:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000395673:exon_44228343_44228509:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000358681:exon_44228343_44228509:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000343631:exon_44228343_44228509:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000531161:exon_44228343_44228509:EXT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	44636839	C/T	1	405	364	769	198.64540724111	185.464374726508	13.1810325146019	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.348510197140109	ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	45827350	A/G	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45825957_45827887:SLC35C1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	45832509	A/G	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000181830:ENST00000442528:exon_45832327_45833109:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000456334:exon_45832327_45834561:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000530670:exon_45832327_45832642:SLC35C1;ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45832327_45834566:SLC35C1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	46341946	C/T	1	9	30	39	4.41434238313578	15.2855253895474	-10.8711830064116	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0005786678279598	ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46341815_46342079:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46341815_46342080:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46341815_46342080:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46341815_46342079:CREB3L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	46700548	G/A	1	16	8	24	7.84771979224139	4.0761401038793	3.77157968836209	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.153367642666690	ENSG00000175220:ENST00000311956:exon_46698630_46700775:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000526423:exon_46700273_46700775:ARHGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	46723023	G/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000175213:ENST00000311764:exon_46722949_46723226:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000531866:exon_46722949_46723453:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000526410:exon_46722949_46723226:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000534481:exon_46722758_46723226:ZNF408
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	46724289	C/G	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	ENSG00000175213:ENST00000311764:exon_46724254_46724315:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000526410:exon_46724254_46724445:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000534481:exon_46724254_46724313:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000527008:exon_46724265_46724793:ZNF408
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	47188411	C/T	1	88	77	165	43.1624588573277	39.2328484998383	3.92961035748936	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.585883243797688	ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	47290208	C/G	1	7	17	24	3.43337740910561	8.66179772074352	-5.22842031163791	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0402116433714956	ENSG00000025434:ENST00000529540:exon_47290101_47290389:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000298843:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000395397:exon_47290101_47290363:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000405576:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000481020:exon_47290101_47290382:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000481889:exon_47290101_47290382:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000532630:exon_47290101_47290367:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000407404:exon_47290101_47290332:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000441012:exon_47290101_47290335:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000467728:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000514400:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000518032:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000528825:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000405853:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000344715:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000527949:exon_47290101_47290368:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000462051:exon_47290101_47290395:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000494018:exon_47290101_47290395:NR1H3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	57069615	C/A	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000427750:exon_57069548_57069698:TNKS1BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	57102096	A/G	1	76	84	160	37.2766690131466	42.7994710907327	-5.52280207758608	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.385790243675093	ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57101937_57102122:SSRP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	57157405	A/G	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	57176628	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	57509429	A/G	1	5	13	18	2.45241243507544	6.62372766880387	-4.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0593928969289689	ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	58919813	A/G	1	27	39	66	13.2430271494074	19.8711830064116	-6.62815585700426	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.110275617525125	ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	58920348	A/G	1	22	32	54	10.7906147143319	16.3045604155172	-5.5139457011853	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.136992323132609	ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	59369285	G/C	1	12	5	17	5.88578984418104	2.54758756492456	3.33820227925648	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.144694391340598	ENSG00000110048:ENST00000263847:exon_59369113_59369311:OSBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	59377903	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110048:ENST00000263847:exon_59377854_59378062:OSBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60154242	C/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000166927:ENST00000300184:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000358246:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000435979:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000534016:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000530614:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000528808:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000528215:exon_60154190_60154247:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000534310:exon_60153973_60154246:MS4A7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60609972	A/G	1	32	31	63	15.6954395844828	15.7950429025323	-0.0996033180495175	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60617834	C/A	1	59	51	110	28.9384667338901	25.9853931622306	2.95307357165957	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.633712856881426	ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60666070	G/A	1	136	76	212	66.7056182340518	38.7233309868534	27.9822872471984	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000113555920612061	ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666013_60666098:PRPF19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60673868	T/C	1	56	48	104	27.4670192728449	24.4568406232758	3.01017864956905	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.558310238644956	ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60689320	C/T	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60704213	C/T	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60711249	G/T	1	38	33	71	18.6383345065733	16.8140779285021	1.82425657807118	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.722300118582287	ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	60711251	G/A	1	32	38	70	15.6954395844828	19.3616654934267	-3.66622590894391	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.404300827653385	ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	61089037	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	61106799	G/A	1	25	15	40	12.2620621753772	7.64276269477369	4.61929948060348	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.156839441077429	ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	61724292	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	61895741	A/G	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	61897409	C/T	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62285236	T/C	1	45	43	88	22.0717119156789	21.9092530583513	0.162458857327657	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62288978	T/C	1	16	7	23	7.84771979224139	3.56662259089439	4.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.094495059157444	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62288935_62289055:AHNAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62290702	C/T	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62343130	G/C	1	47	47	94	23.0526768897091	23.9473231102909	-0.894646220581819	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.917924007766987	ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62342520_62343716:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000469480:exon_62342530_62344489:TUT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62365665	G/A	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000149480:ENST00000526844:exon_62365581_62365862:MTA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62415456	C/G	1	19	14	33	9.31916725328665	7.13324518178878	2.18592207149787	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.489468972263295	ENSG00000185085:ENST00000330574:exon_62414320_62417471:INTS5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62439176	C/T	1	28	39	67	13.7335096364224	19.8711830064116	-6.13767336998917	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.143545112419108	ENSG00000162194:ENST00000354588:exon_62439036_62439241:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000431002:exon_62437113_62439237:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000415855:exon_62439036_62439206:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000524759:exon_62439036_62439237:C11orf48;ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62438756_62439337:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439126_62439337:C11orf83
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62496519	T/C	1	95	79	174	46.5958362664333	40.2518835258081	6.34395274062514	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.363071807718291	ENSG00000162222:ENST00000530625:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000294161:exon_62496295_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000316461:exon_62496011_62496558:TTC9C;ENSG00000162222:ENST00000532583:exon_62496295_62496558:TTC9C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62564799	C/T	1	29	31	60	14.2239921234375	15.7950429025323	-1.57105077909478	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.700493201950742	ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62564790_62564858:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62564790_62564858:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62564790_62564858:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62564790_62564858:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531872:exon_62564790_62564858:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531579:exon_62564790_62564858:NXF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62575025	A/T	1	57	54	111	27.95750175986	27.5139457011853	0.443556058674659	A:T	A	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62574369_62575138:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62574369_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62574397_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62574408_62575100:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62574409_62575100:STX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62591982	G/A	1	64	51	115	31.3908791689656	25.9853931622306	5.40548600673501	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.3511232619332	ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62591931_62592037:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62591931_62592037:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62591931_62592037:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62591931_62592037:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62591931_62592037:STX5;ENSG00000162236:ENST00000431400:exon_62591931_62592037:STX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62592961	T/C	1	36	45	81	17.6573695325431	22.9282880843211	-5.27091855177795	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.266913430980116	ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000431400:exon_62592895_62592998:STX5;ENSG00000162236:ENST00000488303:exon_62592959_62593011:STX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62592979	C/A	1	53	40	93	25.9955718117996	20.3807005193965	5.61487129240309	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.255363476521400	ENSG00000162236:ENST00000377897:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000294179:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000394690:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000492066:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000491231:exon_62592895_62593011:STX5;ENSG00000162236:ENST00000431400:exon_62592895_62592998:STX5;ENSG00000162236:ENST00000488303:exon_62592959_62593011:STX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62602983	A/G	1	84	53	137	41.2005289092673	27.0044281882004	14.1961007210669	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0165516341537565	ENSG00000133316:ENST00000311713:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000529106:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525239:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000278856:exon_62602903_62603004:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525752:exon_62602903_62603004:WDR74
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62607068	A/G	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000133316:ENST00000529106:exon_62606979_62607131:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525239:exon_62606979_62607339:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000278856:exon_62606979_62607133:WDR74;ENSG00000133316:ENST00000525752:exon_62607013_62607339:WDR74
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62623019	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	62623051	T/C	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.601138673885629	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	63312097	G/A	1	36	38	74	17.6573695325431	19.3616654934267	-1.70429596088356	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.728074510388297	ENSG00000133321:ENST00000255688:exon_63312093_63312361:RARRES3;ENSG00000133321:ENST00000439013:exon_63312093_63312445:RARRES3;ENSG00000133321:ENST00000354445:exon_63312093_63312361:RARRES3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	63398550	C/T	1	36	32	68	17.6573695325431	16.3045604155172	1.35280911702592	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.808686533715203	ENSG00000184743:ENST00000332645:exon_63398512_63398943:ATL3;ENSG00000184743:ENST00000398868:exon_63398512_63398943:ATL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	63449125	C/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000133318:ENST00000341307:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000339997:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000356000:exon_63448922_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000377819:exon_63448990_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000354497:exon_63448990_63449250:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000338850:exon_63448990_63449250:RTN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	63764302	G/C	1	39	13	52	19.1288169935884	6.62372766880387	12.5050893247845	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00046006865788433	ENSG00000167770:ENST00000428192:exon_63764002_63764413:OTUB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	63988045	G/A	1	148	133	281	72.5914080782329	67.7658292269934	4.82557885123944	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.591439937968346	ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64026685	C/T	0	9	0	9	4.41434238313578	0	4.41434238313578	C	C		10	0.509517512984913	0.00395726759981203	ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64026530_64026716:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64026530_64026716:PLCB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64033454	G/A	1	21	22	43	10.3001322273168	11.2093852856681	-0.909253058351259	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.879043188605605	ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64033358_64033511:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64033358_64033511:PLCB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64496357	G/T	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000068831:ENST00000464324:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377494:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000421556:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000394432:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000377497:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000354024:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000488071:exon_64496335_64496514:RASGRP2;ENSG00000068831:ENST00000437237:exon_64496335_64496514:RASGRP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64622869	G/C	1	196	144	340	96.1345674549571	73.3705218698275	22.7640455851296	T:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0145595642315121	ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64645871	A/G	1	116	95	211	56.8959684937501	48.4041637335667	8.49180476018336	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.270559798516772	ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64662849	A/G	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662762_64662914:ATG2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64665358	T/G	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665311_64665446:ATG2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64665394	T/C	1	10	7	17	4.90482487015087	3.56662259089439	1.33820227925648	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.630132706769099	ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665311_64665446:ATG2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64799998	T/C	1	11	6	17	5.39530735716596	3.05710507790948	2.33820227925648	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.333809869270413	ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64882789	C/T	1	24	28	52	11.7715796883621	14.2664903635776	-2.49491067521548	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.492458191163607	ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	64884599	G/A	1	18	13	31	8.82868476627157	6.62372766880387	2.2049570974677	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.475629809894747	ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65064690	G/A	1	20	16	36	9.80964974030174	8.15228020775861	1.65736953254313	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.620024668135095	ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65064706	G/A	1	16	26	42	7.84771979224139	13.2474553376077	-5.39973554536635	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.121903536253002	ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65143993	C/T	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65142666_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65143665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65143699_65144115:SLC25A45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65268198	G/A	1	4032	3835	7867	1977.62538764483	1953.99966229714	23.6257253476895	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.596131719022152	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65270976	G/A	1	518	430	948	254.069928273815	219.092530583513	34.9773976903025	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0249474542141756	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65272383	C/T	1	841	971	1812	412.495771579688	494.741505108351	-82.2457335286624	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000115496824692719	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65307074	G/A	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000168056:ENST00000301874:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000322147:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529582:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000301873:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000530785:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529189:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000532932:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000528516:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000526927:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000532661:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000529371:exon_65307019_65307099:LTBP3;ENSG00000168056:ENST00000530866:exon_65307019_65307099:LTBP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65338034	A/G	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65349063	G/A	1	17	32	49	8.33820227925648	16.3045604155172	-7.96635813626074	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0310362960759548	ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65351686	C/T	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65402462	C/T	1	15	13	28	7.35723730522631	6.62372766880387	0.733509636422436	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.851310323683977	ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65402444_65402591:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65402444_65402591:PCNXL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65403215	G/A	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000197136:ENST00000355703:exon_65403000_65403274:PCNXL3;ENSG00000197136:ENST00000439247:exon_65403000_65403274:PCNXL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65412467	G/A	1	30	28	58	14.7144746104526	14.2664903635776	0.447984246875047	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65421852	G/A	1	19	29	48	9.31916725328665	14.7760078765625	-5.45684062327582	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.148109554043910	ENSG00000173039:ENST00000406246:exon_65421067_65422471:RELA;ENSG00000173039:ENST00000525693:exon_65421072_65423233:RELA;ENSG00000173039:ENST00000308639:exon_65421073_65422471:RELA;ENSG00000173039:ENST00000531484:exon_65421438_65422471:RELA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65486247	G/C	1	17	16	33	8.33820227925648	8.15228020775861	0.18592207149787	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000172922:ENST00000308418:exon_65485144_65487280:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000531596:exon_65486238_65486627:RNASEH2C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65623519	G/A	1	1964	2409	4373	963.307604497631	1227.42768878066	-264.120084283025	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	1.45991591419453e-15	ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65628334	G/A	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000172732:ENST00000529857:exon_65628146_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65627872_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65627876_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65628016_65628573:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65628331_65628359:MUS81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65629932	T/C	1	20	7	27	9.80964974030174	3.56662259089439	6.24302714940735	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0197338258149335	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65629934	G/C	1	18	7	25	8.82868476627157	3.56662259089439	5.26206217537718	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0442204327617449	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65631167	C/T	1	23	24	47	11.281097201347	12.2284203116379	-0.94732311029091	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.884221782888761	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65631973	G/A	1	31	27	58	15.2049570974677	13.7569728505926	1.44798424687505	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.793115915436422	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65632262	G/T	1	28	42	70	13.7335096364224	21.3997355453663	-7.66622590894391	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0731084931765937	ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65685225	T/C	1	25	21	46	12.2620621753772	10.6998677726832	1.562194402694	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.661409503864399	ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	65733393	C/T	1	82	88	170	40.2195639352371	44.8375411426723	-4.61797720743521	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.490771635028407	ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	66107674	A/G	1	69	58	127	33.843291604041	29.552015753125	4.29127585091605	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.478166140985194	ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66107592_66107684:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66107592_66107684:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66107592_66107684:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66107592_66107684:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66107592_66107684:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66107592_66107684:BRMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	66272142	A/G	1	27	43	70	13.2430271494074	21.9092530583513	-8.66622590894391	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0420286780758198	ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	66331458	A/G	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000174080:ENST00000310325:exon_66330934_66331478:CTSF;ENSG00000174080:ENST00000527141:exon_66330935_66331478:CTSF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	66626382	C/T	1	17	10	27	8.33820227925648	5.09517512984913	3.24302714940735	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.250108755096081	ENSG00000173621:ENST00000309602:exon_66624973_66626564:LRFN4;ENSG00000173621:ENST00000525479:exon_66624996_66626528:LRFN4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67068859	T/C	1	40	34	74	19.6192994806035	17.323595441487	2.29570403911644	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.64258433301022	ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068753_67069294:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068753_67068869:ANKRD13D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67160285	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67160961	A/G	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000172613:ENST00000530934:exon_67160353_67161081:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67160776_67161081:RAD9A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67164791	T/C	1	20	12	32	9.80964974030174	6.11421015581896	3.69543958448278	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.217990537202958	ENSG00000172613:ENST00000307980:exon_67164650_67164857:RAD9A;ENSG00000172613:ENST00000529100:exon_67164650_67164861:RAD9A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67171736	C/T	1	29	31	60	14.2239921234375	15.7950429025323	-1.57105077909478	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.700493201950742	ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67171662_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67171600_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67171658_67171825:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67171660_67171825:TBC1D10C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67200819	C/T	1	66	52	118	32.3718441429957	26.4949106752155	5.87693346778027	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.311279751495758	ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67202156	C/T	1	80	57	137	39.238598961207	29.04249824014	10.1961007210669	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0875046076284195	ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67205978	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67352256	C/A	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000489040:exon_67352156_67352535:GSTP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67352689	A/G	1	986	1070	2056	483.615732196876	545.183738893857	-61.5680066969811	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00666136247887247	ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67353842	G/A	1	14	93	107	6.86675481821122	47.3851287075969	-40.5183738893857	A:G	G	A	10	0.509517512984913	2.73760756081527e-16	ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67353844	C/T	1	84	12	96	41.2005289092673	6.11421015581896	35.0863187534484	T:C	C	T	10	0.509517512984913	5.11417892170105e-14	ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67353970	T/C	1	2384	2819	5203	1169.31024904397	1436.32986910447	-267.019620060502	A:T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	1.39399214424529e-13	ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67763239	C/G	1	22	24	46	10.7906147143319	12.2284203116379	-1.437805597306	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.768453449487112	ENSG00000110057:ENST00000530331:exon_67763082_67763355:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000227471:exon_67763082_67763355:UNC93B1;ENSG00000110057:ENST00000525368:exon_67763082_67763451:UNC93B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67799637	C/A	1	96	102	198	47.0863187534484	51.9707863244611	-4.88446757101277	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.522508619772667	ENSG00000110717:ENST00000432321:exon_67799619_67799676:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000313468:exon_67799619_67799676:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000531796:exon_67799619_67800152:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000453471:exon_67799619_67799676:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000526446:exon_67799619_67799676:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000532399:exon_67799619_67799676:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000531228:exon_67799619_67799676:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000526339:exon_67799619_67799676:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000525628:exon_67799619_67799676:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000529645:exon_67799628_67799676:NDUFS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	67926292	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000110066:ENST00000304363:exon_67922330_67926638:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000424360:exon_67923507_67926638:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000441488:exon_67925047_67926638:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000427752:exon_67925760_67926638:SUV420H1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	68029518	A/G	1	24	25	49	11.7715796883621	12.7379378246228	-0.966358136260737	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.886578458405135	ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	68171013	T/C	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68170951_68171167:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68170951_68171167:LRP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	68192630	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	68193558	G/A	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68193446_68193655:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68193446_68193655:LRP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	68377446	C/T	1	25	28	53	12.2620621753772	14.2664903635776	-2.00442818820039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.586388472211134	ENSG00000110075:ENST00000393800:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000534534:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000524845:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000265637:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000393799:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000524904:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000393801:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000265636:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000529710:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000527403:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000534190:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000526307:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000526593:exon_68377372_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000525152:exon_68377243_68377491:PPP6R3;ENSG00000110075:ENST00000530734:exon_68377419_68377491:PPP6R3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	68549340	A/G	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000110090:ENST00000376618:exon_68549239_68549427:CPT1A;ENSG00000110090:ENST00000265641:exon_68549239_68549427:CPT1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	68704028	C/T	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	69488005	A/G	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000149716:ENST00000376587:exon_69487984_69488089:ORAOV1;ENSG00000149716:ENST00000279147:exon_69487984_69488089:ORAOV1;ENSG00000149716:ENST00000441922:exon_69487984_69488089:ORAOV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	70218347	C/T	1	6	20	26	2.94289492209052	10.1903502596983	-7.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00522199894269276	ENSG00000131626:ENST00000253925:exon_70218321_70218496:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000389547:exon_70218321_70218496:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000532504:exon_70218321_70218496:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000526262:exon_70218318_70218496:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000530548:exon_70218321_70218496:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000525922:exon_70218321_70218496:PPFIA1;ENSG00000131626:ENST00000531657:exon_70217433_70218496:PPFIA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	71146577	G/A	1	33	39	72	16.1859220714979	19.8711830064116	-3.68526093491374	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.410715576581918	ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	71146691	A/G	1	29	37	66	14.2239921234375	18.8521479804418	-4.62815585700426	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.269663901038816	ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	71152329	G/A	1	35	37	72	17.166887045528	18.8521479804418	-1.68526093491374	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.724580036619648	ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000534701:exon_71152273_71152393:DHCR7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	71169547	G/C	1	16	13	29	7.84771979224139	6.62372766880387	1.22399212343752	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.712533292455687	ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	71185518	T/C	1	19	14	33	9.31916725328665	7.13324518178878	2.18592207149787	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.489468972263295	ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	71195379	C/T	1	44	39	83	21.5812294286638	19.8711830064116	1.71004642225222	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.742648226440179	ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71195358_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524450:exon_71195358_71195438:NADSYN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	71701751	A/G	1	17	8	25	8.33820227925648	4.0761401038793	4.26206217537717	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.109340228515106	ENSG00000137522:ENST00000361756:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530655:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000393713:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000490867:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000528683:exon_71701643_71701842:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000526549:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000525243:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530137:exon_71701643_71701763:RNF121
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	71717300	C/T	1	68	64	132	33.3528091170259	32.6091208310344	0.743688285991482	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.930745539274594	ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71717081_71717309:NUMA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	72012940	C/T	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72012847_72013008:CLPB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	72040784	T/C	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72040751_72040848:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72040751_72040848:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72040751_72040848:CLPB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	72552585	G/A	1	23	8	31	11.281097201347	4.0761401038793	7.2049570974677	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0111038252218164	ENSG00000137478:ENST00000311172:exon_72552499_72552628:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409418:exon_72552499_72552628:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409314:exon_72552499_72552628:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000432043:exon_72552499_72552628:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000458644:exon_72552499_72552628:FCHSD2;ENSG00000137478:ENST00000409263:exon_72552499_72552628:FCHSD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	73118660	C/T	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73118558_73118688:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73118558_73118688:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000450446:exon_73118558_73118688:FAM168A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	74329615	T/C	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	74717221	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000162139:ENST00000294064:exon_74716458_74718743:NEU3;ENSG00000162139:ENST00000531509:exon_74716458_74718129:NEU3;ENSG00000162139:ENST00000532963:exon_74716458_74717879:NEU3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	75277376	C/T	1	21	24	45	10.3001322273168	12.2284203116379	-1.92828808432109	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.655214756079902	ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277361_75277436:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277361_75277511:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	75277757	C/G	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.848425091361672	ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	75279846	C/T	1	13	8	21	6.37627233119613	4.0761401038793	2.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.385136200083102	ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	75282882	G/A	1	53	42	95	25.9955718117996	21.3997355453663	4.59583626643326	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.357494230049378	ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	75511572	T/C	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	77378388	T/C	1	45	26	71	22.0717119156789	13.2474553376077	8.82425657807118	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0430142200392014	ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	77378505	A/G	1	35	28	63	17.166887045528	14.2664903635776	2.90039668195048	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.529150638661668	ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	77409568	T/C	1	23	21	44	11.281097201347	10.6998677726832	0.581229428663828	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.881345604651725	ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	77553578	G/C	1	20	31	51	9.80964974030174	15.7950429025323	-5.98539316223056	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.122578447855602	ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	77553638	T/C	1	23	29	52	11.281097201347	14.7760078765625	-3.49491067521548	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.336249710848700	ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	78279744	T/C	1	32	8	40	15.6954395844828	4.0761401038793	11.6192994806035	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.000201052238823482	ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	78279790	T/G	1	23	9	32	11.281097201347	4.58565761686422	6.69543958448279	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0207707813181149	ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	78285508	C/G	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78285393_78285909:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78285393_78285563:NARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	78285560	G/T	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78285393_78285909:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78285393_78285563:NARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	82564294	T/G	1	11	17	28	5.39530735716596	8.66179772074352	-3.26649036357756	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.258164543515238	ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534631:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000527444:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531128:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534396:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000529671:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000528082:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532809:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000533126:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534264:exon_82564236_82564320:PRCP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	85374993	C/T	1	3	11	14	1.47144746104526	5.60469264283404	-4.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0321870224179764	ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000528561:exon_85374568_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527529:exon_85374859_85375148:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000398294:exon_85374859_85375269:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	93212161	A/G	1	31	25	56	15.2049570974677	12.7379378246228	2.46701927284487	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.593342378491199	ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	93212254	C/T	1	44	26	70	21.5812294286638	13.2474553376077	8.33377409105609	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0551930124072581	ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	93463678	G/A	1	34	27	61	16.676404558513	13.7569728505926	2.91943170792031	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.522432544371911	ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	93488481	A/C	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	ENSG00000182919:ENST00000528288:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000331239:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000528099:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000354421:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000530620:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000524485:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527363:exon_93488376_93488559:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000526335:exon_93488376_93488492:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000533154:exon_93488039_93488552:C11orf54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	93517874	C/G	1	15	4	19	7.35723730522631	2.03807005193965	5.31916725328665	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0196131994431373	ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	93517886	G/C	1	16	3	19	7.84771979224139	1.52855253895474	6.31916725328665	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00455398270631113	ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93517884_93517929:MED17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	94602633	A/G	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000166025:ENST00000317837:exon_94602363_94602638:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000317829:exon_94602363_94602638:AMOTL1;ENSG00000166025:ENST00000433060:exon_94602363_94602638:AMOTL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	95825941	G/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95825056_95826681:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95825056_95826684:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95825056_95826681:MAML2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	96117590	T/C	1	33	20	53	16.1859220714979	10.1903502596983	5.99557181179961	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.129952887067754	ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96117126_96117925:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96117126_96118154:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96117126_96117933:CCDC82
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	102195501	A/G	1	72	47	119	35.3147390650863	23.9473231102909	11.3674159547954	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.043289117884844	ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102195187_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102192568_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102195192_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102195186_102196093:BIRC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	102202015	A/G	1	13	6	19	6.37627233119613	3.05710507790948	3.31916725328665	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.168530333768717	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	102207851	G/A	1	52	63	115	25.5050893247845	32.0996033180495	-6.59451399326499	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.226469154975146	ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	107197629	G/A	1	20	10	30	9.80964974030174	5.09517512984913	4.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.100561877913583	ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	108594124	G/A	1	46	40	86	22.562194402694	20.3807005193965	2.18149388329748	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.667198759947378	ENSG00000178105:ENST00000322536:exon_108593724_108594189:DDX10;ENSG00000178105:ENST00000456020:exon_108593724_108594189:DDX10;ENSG00000178105:ENST00000526794:exon_108593724_108594189:DDX10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	110118459	T/C	1	36	49	85	17.6573695325431	24.9663581362607	-7.30898860371761	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.128648116709323	ENSG00000137710:ENST00000530749:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000528498:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000405097:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000528900:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000343115:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000530131:exon_110118428_110118558:RDX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	112014327	C/T	1	2	13	15	0.980964974030174	6.62372766880387	-5.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00359638427352979	ENSG00000150782:ENST00000280357:exon_112013974_112014540:IL18;ENSG00000150782:ENST00000524595:exon_112013976_112014540:IL18;ENSG00000150782:ENST00000525547:exon_112013980_112014540:IL18;ENSG00000150782:ENST00000528832:exon_112014319_112014540:IL18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	113215124	C/T	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113214994_113215162:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000478125:exon_113214994_113215162:TTC12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	116633825	C/T	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	116633862	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	116729196	T/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	117077034	A/G	1	40	54	94	19.6192994806035	27.5139457011853	-7.89464622058182	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.121387850206993	ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	117094846	G/A	1	15	6	21	7.35723730522631	3.05710507790948	4.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0794791301761176	ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117094794_117094932:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117093924_117094932:PCSK7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	117110540	A/G	1	24	19	43	11.7715796883621	9.68083274671335	2.09074694164874	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.545539155211247	ENSG00000167257:ENST00000529869:exon_117109317_117110576:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000531287:exon_117110517_117110576:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000531452:exon_117110517_117110576:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000530849:exon_117110517_117110576:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000300650:exon_117110517_117110576:RNF214;ENSG00000167257:ENST00000397945:exon_117110517_117110576:RNF214
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	117163824	C/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	117232691	G/A	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000375253:exon_117232551_117232709:CEP164
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	117266312	C/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	117267884	A/G	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	117389386	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000177103:ENST00000527706:exon_117389181_117389477:DSCAML1;ENSG00000177103:ENST00000321322:exon_117389181_117389477:DSCAML1;ENSG00000177103:ENST00000446508:exon_117389181_117389477:DSCAML1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118630697	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110367:ENST00000264018:exon_118630631_118630753:DDX6;ENSG00000110367:ENST00000526070:exon_118630631_118630753:DDX6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118764780	T/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000160683:ENST00000292174:exon_118764305_118768508:CXCR5;ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118769442	A/G	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118772670	G/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000392849:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118771328_118773617:BCL9L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118828942	A/G	1	6	15	21	2.94289492209052	7.64276269477369	-4.69986777268317	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0488848967390049	ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118886117	C/T	1	71	62	133	34.8242565780712	31.5900858050646	3.23417077300657	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.603389464934939	ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118886656	G/A	1	21	18	39	10.3001322273168	9.17131523372843	1.12881699358839	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.750979189113534	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118890022	C/T	1	61	100	161	29.9194317079203	50.9517512984913	-21.032319590571	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000906899742580607	ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118894000	A/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118919206	T/C	1	141	118	259	69.1580306691273	60.1230665322197	9.03496413690754	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.26405970627876	ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118925953	C/T	1	37	33	70	18.1478520195582	16.8140779285021	1.33377409105609	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.811410555540177	ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526571:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925897_118926130:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532421:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000533381:exon_118925735_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530467:exon_118925867_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000527038:exon_118925896_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529174:exon_118925914_118926051:HYOU1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118940957	C/G	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.264915529576399	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118952173	A/G	1	110	79	189	53.9530735716596	40.2518835258081	13.7011900458514	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0494172262521545	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118963061	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	118967758	T/C	1	37	30	67	18.1478520195582	15.2855253895474	2.86232663001083	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.541808742494316	ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	119050524	C/T	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	119050746	A/C	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	119050860	A/C	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	119050906	G/A	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	119206375	G/A	1	19	16	35	9.31916725328665	8.15228020775861	1.16688704552805	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.737500987101035	ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	119206829	C/T	1	30	17	47	14.7144746104526	8.66179772074352	6.05267688970909	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0814819087737381	ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	119207024	C/T	1	38	21	59	18.6383345065733	10.6998677726832	7.93846673389013	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0498950700876959	ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26;ENSG00000245385:ENST00000501918:exon_119206959_119207203:RP11-334E6.10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	121391480	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121391366_121391558:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532451:exon_121391366_121391558:SORL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	121475922	T/A	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	121491849	T/C	1	23	20	43	11.281097201347	10.1903502596983	1.09074694164874	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7626051935177	ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121491773_121491947:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121491773_121491947:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121491773_121491947:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121491773_121491947:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121491773_121491947:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000528339:exon_121491773_121491949:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534754:exon_121491773_121491943:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000524633:exon_121491773_121491947:SORL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	122929407	T/G	1	1465	1387	2852	718.556843477102	706.700790510074	11.8560529670282	A:T:C:G	T	G	10	0.509517512984913	0.666658062905712	ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	124506967	C/T	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000110013:ENST00000263593:exon_124503009_124507098:SIAE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	124624150	G/A	1	47	23	70	23.0526768897091	11.718902798653	11.3337740910561	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.008113198736492	ENSG00000149564:ENST00000442070:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000444566:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124624110_124624236:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000435477:exon_124624141_124624236:ESAM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	124955032	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000134955:ENST00000403796:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000407458:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000298280:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000526405:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000308074:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000525837:exon_124954962_124955035:SLC37A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	124972114	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124971097_124974937:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124972028_124972247:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124972028_124972198:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124972028_124972247:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124972028_124972213:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000524373:exon_124972028_124972705:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000533273:exon_124972028_124972705:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529530:exon_124972028_124972213:TMEM218
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	125763746	C/G	1	65	52	117	31.8813616559807	26.4949106752155	5.38645098076518	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.355310855383506	ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	125766204	G/C	1	12	1	13	5.88578984418104	0.509517512984913	5.37627233119613	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00348710510277128	ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	125766207	C/T	0	11	0	11	5.39530735716596	0	5.39530735716596	C	C		10	0.509517512984913	0.000996066032871514	ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	125769354	T/C	1	18	6	24	8.82868476627157	3.05710507790948	5.77157968836209	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0232323340630925	ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	126135711	G/A	1	63	48	111	30.9003966819505	24.4568406232758	6.44355605867466	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.254551048853545	ENSG00000182934:ENST00000332118:exon_126135632_126135718:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000532259:exon_126135632_126135718:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000527817:exon_126135632_126135718:SRPR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	128333503	T/C	1	30	26	56	14.7144746104526	13.2474553376077	1.46701927284487	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.789535529917192	ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	130131262	C/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000196323:ENST00000528448:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000525842:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000338191:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000397753:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000454539:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000445008:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000357899:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000530205:exon_130130751_130131784:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000529982:exon_130130751_130131329:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000527478:exon_130130751_130131757:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000529348:exon_130130751_130131826:ZBTB44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	130780015	C/T	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533318:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000528555:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000530356:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000524460:exon_130779913_130780032:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130779913_130780032:SNX19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	11	134047243	T/C	1	7	13	20	3.43337740910561	6.62372766880387	-3.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.182340866714798	ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	406292	G/A	1	24	17	41	11.7715796883621	8.66179772074352	3.10978196761857	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.352476605441437	ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	427575	A/G	1	15	10	25	7.35723730522631	5.09517512984913	2.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.426470603476087	ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	542467	A/G	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_542340_542488:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_542340_542488:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_542340_542488:CCDC77
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	547683	T/C	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	939302	A/G	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	968489	T/C	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_968411_968630:WNK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	990912	A/C	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	994014	C/T	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	1702645	G/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	1893170	C/T	1	13	10	23	6.37627233119613	5.09517512984913	1.281097201347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.6789219768712	ENSG00000006831:ENST00000357103:exon_1893046_1893239:ADIPOR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	2909061	A/T	1	156	136	292	76.5152679743536	69.2943817659482	7.2208862084054	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.41284419281873	ENSG00000004478:ENST00000001008:exon_2909016_2909106:FKBP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	2909710	G/C	1	67	73	140	32.8623266300108	37.1947784478986	-4.33245181788782	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.499180862961008	ENSG00000004478:ENST00000001008:exon_2909558_2909743:FKBP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	2975643	C/T	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2975559_2975687:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2975559_2975687:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2975559_2975687:FOXM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	2997355	T/A	1	45	34	79	22.0717119156789	17.323595441487	4.74811647419187	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.311982987617828	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	3782647	A/T	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	3782701	C/T	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3782612_3782758:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3782612_3782758:EFCAB4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	3788145	C/T	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3788081_3788264:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3788081_3788264:EFCAB4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	4459032	G/A	1	33	35	68	16.1859220714979	17.833112954472	-1.64719088297408	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.717184372117756	ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	4716513	C/T	1	26	47	73	12.7525446623923	23.9473231102909	-11.1947784478986	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00973449344548725	ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6562285	C/T	1	29	19	48	14.2239921234375	9.68083274671335	4.54315937672418	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.197283641732197	ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6562293	C/T	1	30	19	49	14.7144746104526	9.68083274671335	5.03364186373926	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.156043211104239	ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6562448	A/G	1	23	33	56	11.281097201347	16.8140779285021	-5.53298072715513	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.143899982123774	ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562233_6562463:TAPBPL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6562823	C/T	1	27	13	40	13.2430271494074	6.62372766880387	6.61929948060348	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0398714331376041	ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6567950	T/C	1	18	25	43	8.82868476627157	12.7379378246228	-3.90925305835126	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.28571853947306	ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6567811_6568113:TAPBPL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6573681	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6571406_6574107:VAMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6575044	G/T	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6635274	G/A	1	28	21	49	13.7335096364224	10.6998677726832	3.03364186373926	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.395811892156300	ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6635234_6635366:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6635234_6635366:NCAPD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6657538	T/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000010295:ENST00000488007:exon_6657231_6657711:IFFO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6658528	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6839913	C/T	1	48	46	94	23.5431593767242	23.437805597306	0.105353779418181	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6839835_6839986:COPS7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6840209	G/A	1	44	53	97	21.5812294286638	27.0044281882004	-5.42319875953656	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.309894502980959	ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	6879279	A/G	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	7066939	G/A	1	572	569	1141	280.55598257263	289.915464888415	-9.35948231578573	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.594080113658428	ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7066817_7066948:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7066817_7066948:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000447931:exon_7066817_7066948:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000318974:exon_7066817_7066948:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000456013:exon_7066817_7066948:PTPN6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	7075631	T/C	1	193	157	350	94.6631199939118	79.9942495386313	14.6688704552805	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.121158048293589	ENSG00000215021:ENST00000440277:exon_7075587_7075663:PHB2;ENSG00000215021:ENST00000399433:exon_7075585_7075663:PHB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	7076709	C/A	1	29	22	51	14.2239921234375	11.2093852856681	3.01460683776944	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.405417088730572	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	7249598	T/C	1	15	9	24	7.35723730522631	4.58565761686422	2.77157968836209	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.309571402085472	ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	7254669	A/C	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7254494_7254683:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7254494_7254683:C1RL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	7355269	T/C	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000139197:ENST00000455147:exon_7355208_7355300:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000434354:exon_7355208_7355300:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000420616:exon_7355208_7355300:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000266563:exon_7355208_7355300:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000412720:exon_7355208_7355300:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000266564:exon_7355208_7355300:PEX5;ENSG00000139197:ENST00000396637:exon_7355208_7355300:PEX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	7592035	G/T	0	47	0	47	23.0526768897091	0	23.0526768897091	G	G		10	0.509517512984913	2.01170839028866e-14	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	14587301	A/G	1	8	21	29	3.9238598961207	10.6998677726832	-6.77600787656248	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0146648868935977	ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	14923914	A/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000197837:ENST00000358064:exon_14923613_14924065:HIST4H4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	14976553	G/C	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	15095558	C/G	1	991	981	1972	486.068144631951	499.8366802382	-13.7685356062484	A:T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.543139242306193	ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	21797029	A/G	1	691	651	1342	338.923398527425	331.695900953178	7.2274975742468	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.702335562707152	ENSG00000111716:ENST00000350669:exon_21796869_21797042:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000396076:exon_21796869_21797042:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000396075:exon_21796869_21797042:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000470280:exon_21796479_21797042:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000450584:exon_21796880_21797042:LDHB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	25243115	G/C	1	159	96	255	77.9867154353988	48.9136812465516	29.0730341888472	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.000269483237624355	ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	26568309	A/G	1	15	8	23	7.35723730522631	4.0761401038793	3.281097201347	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.211944052448733	ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26568236_26568431:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26568236_26568431:ITPR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	26810816	T/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26810640_26810825:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26810640_26810825:ITPR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	27066530	T/A	1	58	52	110	28.447984246875	26.4949106752155	1.95307357165957	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.774975587288276	ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27066390_27066620:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27066390_27066620:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000261190:exon_27066479_27066620:C12orf11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	27148324	G/A	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000064115:ENST00000343028:exon_27148170_27148341:TM7SF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	27867706	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	27908321	G/T	1	96	131	227	47.0863187534484	66.7467942010236	-19.6604754475753	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0095525092033196	ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27908114_27909227:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27908114_27909227:MRPS35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	29486745	T/C	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	29521193	A/G	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000087502:ENST00000360150:exon_29521174_29521220:ERGIC2;ENSG00000087502:ENST00000201023:exon_29521174_29521220:ERGIC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	32137565	G/A	1	21	20	41	10.3001322273168	10.1903502596983	0.109781967618567	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	32137852	C/G	1	29	18	47	14.2239921234375	9.17131523372843	5.05267688970909	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.147272384019039	ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	32138188	G/A	1	33	26	59	16.1859220714979	13.2474553376077	2.93846673389013	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.515430822528257	ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	32145346	C/T	1	32	41	73	15.6954395844828	20.8902180323814	-5.19477844789865	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.242718355076022	ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32145312_32146031:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32145312_32146039:C12orf35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	32906869	C/T	1	43	28	71	21.0907469416487	14.2664903635776	6.82425657807118	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.122535825088128	ENSG00000139131:ENST00000324868:exon_32906852_32907019:YARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	42706822	T/C	1	391	376	767	191.778652422899	191.578584882327	0.200067540571752	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000139168:ENST00000266529:exon_42705888_42707000:ZCRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	42711691	G/T	1	86	55	141	42.1814938832975	28.0234632141702	14.1580306691273	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.018219892673209	ENSG00000139168:ENST00000266529:exon_42711589_42711700:ZCRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	45823017	A/G	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000177119:ENST00000320560:exon_45822888_45826124:ANO6;ENSG00000177119:ENST00000441606:exon_45822888_45826124:ANO6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	46321514	A/T	1	26	22	48	12.7525446623923	11.2093852856681	1.54315937672418	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.668204743201523	ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	47628882	G/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000179715:ENST00000321382:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000432328:exon_47628790_47630439:FAM113B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	48060812	T/C	1	42	45	87	20.6002644546337	22.9282880843211	-2.32802362968743	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.668417230280071	ENSG00000005175:ENST00000432584:exon_48060763_48060863:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000380650:exon_48060763_48060863:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000005386:exon_48060763_48060863:RPAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	48064054	A/G	1	18	27	45	8.82868476627157	13.7569728505926	-4.92828808432108	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.179089779093011	ENSG00000005175:ENST00000432584:exon_48063890_48064128:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000380650:exon_48063890_48064128:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000005386:exon_48063890_48064128:RPAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	48477422	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000079387:ENST00000004980:exon_48477374_48477545:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000448372:exon_48477374_48477545:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000339976:exon_48477374_48477545:SENP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	48526712	G/A	1	18	28	46	8.82868476627157	14.2664903635776	-5.437805597306	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139518785562104	ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48526651_48526840:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48526651_48526840:PFKM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49048738	G/T	1	27	17	44	13.2430271494074	8.66179772074352	4.58122942866383	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.177601491172458	ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49065727	T/C	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000357861:exon_49065582_49065745:C12orf41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49230035	T/G	1	43	29	72	21.0907469416487	14.7760078765625	6.31473906508626	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.15715724575722	ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49237746	C/G	1	30	50	80	14.7144746104526	25.4758756492457	-10.761401038793	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0184764642974686	ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49237723_49237833:DDX23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49255798	G/C	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000172602:ENST00000309739:exon_49255792_49255901:RND1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49334762	G/C	1	120	104	224	58.8578984418104	52.989821350431	5.86807709137949	T:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.462432924964710	ENSG00000134287:ENST00000256682:exon_49334731_49334971:ARF3;ENSG00000134287:ENST00000447318:exon_49334731_49334971:ARF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49422857	C/T	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49422844_49423019:MLL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49446040	C/T	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49444669_49446207:MLL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49666860	C/A	1	526	518	1044	257.993788169936	263.930071726185	-5.93628355624912	A:T:C	C	A	10	0.509517512984913	0.733497205354719	ENSG00000167553:ENST00000301072:exon_49666036_49667114:TUBA1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49717533	A/C	1	46	21	67	22.562194402694	10.6998677726832	11.8623266300108	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0045930016276354	ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000456139:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000380327:exon_49717387_49717535:TROAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49724664	C/T	1	14	15	29	6.86675481821122	7.64276269477369	-0.776007876562477	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.853530678106061	ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49723928_49724726:TROAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	49960551	C/A	1	37	29	66	18.1478520195582	14.7760078765625	3.37184414299574	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.460618660424323	ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49960505_49960624:MCRS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	50041555	G/A	1	60	41	101	29.4289492209052	20.8902180323814	8.53873118852379	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0915424128144744	ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50041486_50041587:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50041486_50041587:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000293590:exon_50041486_50041587:FMNL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	50190653	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	50232169	A/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	50384469	A/G	1	25	18	43	12.2620621753772	9.17131523372843	3.09074694164874	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.36412664614043	ENSG00000161800:ENST00000454520:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000434422:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000427314:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000312377:exon_50384467_50384575:RACGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	51173973	A/G	1	15	7	22	7.35723730522631	3.56662259089439	3.79061471433191	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.135346882910936	ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51173923_51174021:ATF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	51203371	C/T	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	51639899	A/G	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000183283:ENST00000425012:exon_51639845_51640501:DAZAP2;ENSG00000170545:ENST00000380103:exon_51639133_51639903:SMAGP;ENSG00000170545:ENST00000398453:exon_51639133_51639903:SMAGP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	51681903	T/C	1	34	33	67	16.676404558513	16.8140779285021	-0.137673369989173	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	51685681	C/A	1	35	50	85	17.166887045528	25.4758756492457	-8.30898860371761	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0822631644759522	ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	51685831	T/C	1	23	31	54	11.281097201347	15.7950429025323	-4.5139457011853	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.224198221243685	ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	51696500	G/A	1	14	20	34	6.86675481821122	10.1903502596983	-3.32359544148704	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.304187764558665	ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51696470_51696564:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51696470_51696564:BIN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	51707626	C/T	1	17	26	43	8.33820227925648	13.2474553376077	-4.90925305835126	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.169265719213925	ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51707607_51707687:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51707607_51707687:BIN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	52467406	A/G	1	58	54	112	28.447984246875	27.5139457011853	0.934038545689745	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.924769015764445	ENSG00000123395:ENST00000433776:exon_52467359_52467686:C12orf44;ENSG00000123395:ENST00000336854:exon_52467359_52467686:C12orf44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53416227	G/A	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.541700480242972	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53432157	C/T	1	43	165	208	21.0907469416487	84.0703896425106	-62.9796427008619	T:C	C	T	10	0.509517512984913	3.25023879272057e-19	ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53432140_53432195:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53432140_53432195:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53432140_53432195:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53432140_53432195:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53432140_53432195:EIF4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53680505	C/A	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53679708_53680696:ESPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53681883	A/T	1	18	10	28	8.82868476627157	5.09517512984913	3.73350963642244	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.187163218330294	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53682326	G/A	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.239422942006238	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53682457	G/A	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53682986	C/T	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682874_53683087:ESPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53689331	C/T	1	22	17	39	10.7906147143319	8.66179772074352	2.12881699358839	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.525347987196032	ENSG00000123349:ENST00000351500:exon_53689235_53689423:PFDN5;ENSG00000123349:ENST00000334478:exon_53689235_53689423:PFDN5;ENSG00000123349:ENST00000243040:exon_53689326_53689423:PFDN5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53693532	A/G	1	28	18	46	13.7335096364224	9.17131523372843	4.562194402694	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.187576840948389	ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693470_53693737:C12orf10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53693533	A/C	1	29	18	47	14.2239921234375	9.17131523372843	5.05267688970909	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.147272384019039	ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693470_53693737:C12orf10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53700860	A/G	1	115	103	218	56.405486006735	52.480303837446	3.92518216928897	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.63548997677594	ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53700750_53700965:C12orf10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53701357	A/G	1	67	56	123	32.8623266300108	28.5329807271551	4.3293459028557	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.470999140150266	ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53701241_53701497:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53701241_53701497:AAAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	53703021	G/A	1	46	43	89	22.562194402694	21.9092530583513	0.652941344342747	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.915884404417905	ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53702941_53703065:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53702941_53703065:AAAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	54109733	A/G	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	54741814	G/C	1	129	99	228	63.2722408249462	50.4422337855064	12.8300070394398	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0976008905265314	ENSG00000111481:ENST00000262061:exon_54741784_54741835:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000416254:exon_54741784_54741835:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000455864:exon_54741784_54741835:COPZ1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	54970454	T/C	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000123360:ENST00000243052:exon_54970355_54970485:PDE1B;ENSG00000123360:ENST00000394277:exon_54970355_54970485:PDE1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	55360191	T/G	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532757:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524959:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000526532:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533446:exon_55360172_55360208:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55360172_55360208:KIAA0748
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56360876	G/A	1	32	36	68	15.6954395844828	18.3426304674569	-2.64719088297408	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.545930430413017	ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56398454	G/C	1	7	13	20	3.43337740910561	6.62372766880387	-3.19035025969826	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.182340866714798	ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56435929	C/G	1	15	5	20	7.35723730522631	2.54758756492456	4.80964974030174	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0421132759377614	ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56437304	G/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56437305	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56437917	T/A	1	38	107	145	18.6383345065733	54.5183738893857	-35.8800393828124	A:T:C:G	T	A	10	0.509517512984913	1.76285222551507e-09	ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56437903_56438005:RPS26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56510637	A/G	1	267	242	509	130.958824033028	123.303238142349	7.65558589067929	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.506307341369097	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56531154	T/C	1	30	35	65	14.7144746104526	17.833112954472	-3.11863834401934	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.458855886571105	ENSG00000139641:ENST00000394048:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000267113:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000402331:exon_56531002_56531157:ESYT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56578682	T/C	1	17	15	32	8.33820227925648	7.64276269477369	0.695439584482783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.860859198749914	ENSG00000139613:ENST00000394023:exon_56578628_56578720:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000347471:exon_56578628_56578720:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000267064:exon_56578628_56578720:SMARCC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56601998	G/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000181852:ENST00000345093:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000448057:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000394013:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000352641:exon_56601947_56602082:RNF41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56604317	G/A	1	13	10	23	6.37627233119613	5.09517512984913	1.281097201347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.6789219768712	ENSG00000181852:ENST00000345093:exon_56604081_56604352:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000448057:exon_56604081_56604352:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000394013:exon_56604081_56604352:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000352641:exon_56604081_56604352:RNF41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56815717	T/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56815683_56815765:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815683_56815800:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815683_56815800:TIMELESS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56815922	C/T	1	19	11	30	9.31916725328665	5.60469264283404	3.71447461045261	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.202937463755726	ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56822378	T/A	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56822690	C/T	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822667_56822884:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822667_56822884:TIMELESS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	56827694	C/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56827557_56827710:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56827557_56827710:TIMELESS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	57066778	T/C	1	49	64	113	24.0336418637393	32.6091208310344	-8.57547896729517	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.110426587315928	ENSG00000110958:ENST00000262033:exon_57066736_57066849:PTGES3;ENSG00000110958:ENST00000456859:exon_57066736_57066849:PTGES3;ENSG00000110958:ENST00000448157:exon_57066736_57066849:PTGES3;ENSG00000110958:ENST00000414274:exon_57066736_57066849:PTGES3;ENSG00000110958:ENST00000436399:exon_57066736_57066849:PTGES3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	57492745	G/A	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.7705361912286	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	57493009	G/C	1	19	15	34	9.31916725328665	7.64276269477369	1.67640455851296	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.609816610836836	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	57624701	C/T	1	218	210	428	106.925182169289	106.998677726832	-0.0734955575427563	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57624586_57624783:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57624586_57624783:SHMT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58009372	G/A	1	14	14	28	6.86675481821122	7.13324518178878	-0.266490363577564	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58009295_58009495:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000300189:exon_58009295_58009488:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58009295_58009495:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58009295_58009495:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000469072:exon_58009295_58009495:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000466399:exon_58009295_58009495:ARHGEF25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58010163	A/G	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58112189	A/G	1	233	274	507	114.282419474515	139.607798557866	-25.3253790833509	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0262742572723406	ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58143088	C/T	1	125	122	247	61.3103108768859	62.1611365841594	-0.850825707273508	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.949281956365861	ENSG00000135446:ENST00000257904:exon_58142965_58143100:CDK4;ENSG00000135446:ENST00000312990:exon_58142965_58143100:CDK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58144781	T/C	1	137	135	272	67.1961007210669	68.7848642529633	-1.58876353189633	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.855845455818892	ENSG00000135446:ENST00000257904:exon_58144706_58144873:CDK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58176614	T/C	1	34	23	57	16.676404558513	11.718902798653	4.95750175985996	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.232906235773298	ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58190184	C/A	1	82	90	172	40.2195639352371	45.8565761686422	-5.63701223340504	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.402288870967327	ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58189960_58191334:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58189960_58190517:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000350762:exon_58189960_58190517:TSFM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58345606	T/C	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	58350631	C/T	1	34	36	70	16.676404558513	18.3426304674569	-1.66622590894391	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.720952876215328	ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	62696599	C/T	1	25	8	33	12.2620621753772	4.0761401038793	8.18592207149787	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00478678937300146	ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62696571_62696701:USP15;ENSG00000135655:ENST00000312635:exon_62696571_62696701:USP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	64587684	C/G	1	8	13	21	3.9238598961207	6.62372766880387	-2.69986777268317	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.278819956820526	ENSG00000174206:ENST00000311915:exon_64587627_64588438:C12orf66;ENSG00000174206:ENST00000398055:exon_64586421_64588438:C12orf66
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	64587895	G/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000174206:ENST00000311915:exon_64587627_64588438:C12orf66;ENSG00000174206:ENST00000398055:exon_64586421_64588438:C12orf66
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	64803798	A/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64803742_64803875:XPOT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	65004520	A/G	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000153179:ENST00000336061:exon_65004293_65004523:RASSF3;ENSG00000153179:ENST00000283172:exon_65004293_65004523:RASSF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	65088670	G/A	1	15	9	24	7.35723730522631	4.58565761686422	2.77157968836209	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.309571402085472	ENSG00000153179:ENST00000336061:exon_65088543_65089192:RASSF3;ENSG00000153179:ENST00000283172:exon_65088543_65089192:RASSF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	65088709	C/T	1	22	21	43	10.7906147143319	10.6998677726832	0.0907469416487405	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000153179:ENST00000336061:exon_65088543_65089192:RASSF3;ENSG00000153179:ENST00000283172:exon_65088543_65089192:RASSF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	66546100	A/G	1	28	31	59	13.7335096364224	15.7950429025323	-2.06153326610987	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.605100357886613	ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	66731864	C/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66731781_66732003:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66731781_66732003:HELB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	68052178	G/T	1	3	16	19	1.47144746104526	8.15228020775861	-6.68083274671335	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.00219491639118540	ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	68708761	C/T	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68708728_68709045:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68708728_68709045:MDM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	69203016	C/T	1	14	17	31	6.86675481821122	8.66179772074352	-1.7950429025323	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.591606875195905	ENSG00000135679:ENST00000462284:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000356290:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311440:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258149:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000350057:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393412:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393413:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000358483:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000493419:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258148:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311420:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000523991:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393416:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393415:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393417:exon_69202988_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000517852:exon_69202992_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393410:exon_69202992_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000496959:exon_69202992_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000299252:exon_69202992_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000481186:exon_69202992_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000360430:exon_69202992_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000348801:exon_69203007_69203072:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000478070:exon_69203007_69203072:MDM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	69986788	A/G	1	154	131	285	75.5343030003234	66.7467942010236	8.7875087992998	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.314011315804721	ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	69995039	C/A	1	20	23	43	9.80964974030174	11.718902798653	-1.90925305835126	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.647880369768207	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	72164395	C/T	1	52	59	111	25.5050893247845	30.0615332661099	-4.55644394132534	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.394602061286962	ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	72314552	T/A	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	A:T	T	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72314511_72314627:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72314511_72314627:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72314511_72314627:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72314511_72314627:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72314511_72314627:TBC1D15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	75889352	T/C	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.103192530786195	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	75902207	C/T	1	40	35	75	19.6192994806035	17.833112954472	1.78618652613153	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.729589140959435	ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	82747128	A/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	82752543	T/G	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	82752559	T/G	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	82792666	C/T	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	82792942	A/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	92539146	C/T	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	C	C		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	93246747	A/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:T	A	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93246688_93246801:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93246688_93246801:EEA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	93881368	A/C	1	48	45	93	23.5431593767242	22.9282880843211	0.614871292403091	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.917743465333467	ENSG00000198015:ENST00000393128:exon_93881273_93881436:MRPL42;ENSG00000198015:ENST00000358678:exon_93881273_93881436:MRPL42;ENSG00000198015:ENST00000393126:exon_93881273_93881436:MRPL42;ENSG00000198015:ENST00000361630:exon_93881273_93881436:MRPL42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	94975843	T/C	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	95228286	G/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000216306:ENST00000405395:exon_95228230_95228804:KRT19P2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	95879734	C/T	1	95	112	207	46.5958362664333	57.0659614543103	-10.470125187877	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.164267751898615	ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95879655_95879757:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95879655_95879757:METAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	98941567	A/G	1	55	72	127	26.9765367858298	36.6852609349137	-9.70872414908395	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0917814284312388	ENSG00000120802:ENST00000343315:exon_98941351_98942897:TMPO;ENSG00000120802:ENST00000261210:exon_98941351_98942897:TMPO;ENSG00000120802:ENST00000393053:exon_98941351_98942897:TMPO
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	100452832	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451807_100453311:UHRF1BP1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	100711589	A/G	1	4	11	15	1.96192994806035	5.60469264283404	-3.64276269477369	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0719999094721795	ENSG00000136021:ENST00000360820:exon_100711581_100711703:SCYL2;ENSG00000136021:ENST00000258506:exon_100711581_100711703:SCYL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	101764940	T/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101764836_101764946:UTP20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	102158764	G/A	1	10	4	14	4.90482487015087	2.03807005193965	2.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.180671884464811	ENSG00000111670:ENST00000299314:exon_102157980_102159082:GNPTAB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	102455729	G/A	1	40	22	62	19.6192994806035	11.2093852856681	8.40991419493539	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0412912661689515	ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	104337623	G/A	1	1115	983	2098	546.887973021822	500.855715264169	46.0322577576526	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0445631871623246	ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104337516_104337652:HSP90B1;ENSG00000166598:ENST00000421266:exon_104337516_104337652:HSP90B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	105380143	G/C	1	13	13	26	6.37627233119613	6.62372766880387	-0.247455337607738	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	106633048	G/A	1	25	22	47	12.2620621753772	11.2093852856681	1.05267688970909	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.77276891537452	ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	106633348	G/A	1	22	19	41	10.7906147143319	9.68083274671335	1.10978196761857	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.756996336009118	ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	108918146	C/T	1	55	34	89	26.9765367858298	17.323595441487	9.65294134434274	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0439269636306054	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108918093_108918283:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108918093_108918283:SART3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	108923950	A/G	1	62	74	136	30.4099141949354	37.7042959608836	-7.29438176594817	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.230016119063209	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108923919_108924087:SART3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	108926029	G/A	1	19	19	38	9.31916725328665	9.68083274671335	-0.361665493426692	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108925998_108926110:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108925998_108926110:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108925998_108926110:SART3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	108962663	C/G	1	416	379	795	204.040714598276	193.107137421282	10.9335771769942	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.456342374199563	ENSG00000136003:ENST00000311893:exon_108962607_108963158:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000392807:exon_108962607_108963158:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000338291:exon_108962607_108963143:ISCU
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	109017898	C/T	1	20	26	46	9.80964974030174	13.2474553376077	-3.437805597306	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.376533097076339	ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	110009465	G/A	1	17	20	37	8.33820227925648	10.1903502596983	-1.85214798044178	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.622791636127096	ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110009454_110009515:MMAB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	110011292	G/A	1	9	1	10	4.41434238313578	0.509517512984913	3.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0217074557551410	ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	110340852	G/A	1	10	12	22	4.90482487015087	6.11421015581896	-1.20938528566809	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.672962537607921	ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110340832_110341019:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110340832_110341019:TCHP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	110352361	G/A	1	15	13	28	7.35723730522631	6.62372766880387	0.733509636422436	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.851310323683977	ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110352247_110352432:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110352247_110352432:TCHP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	110783074	A/G	1	29	43	72	14.2239921234375	21.9092530583513	-7.68526093491374	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0771360983122904	ENSG00000174437:ENST00000308664:exon_110783054_110783187:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000377685:exon_110783054_110783187:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000313432:exon_110783054_110783187:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000395494:exon_110783054_110783187:ATP2A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	110784164	G/A	1	110	110	220	53.9530735716596	56.0469264283404	-2.09385285668085	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787738234488767	ENSG00000174437:ENST00000313432:exon_110784006_110788893:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000395494:exon_110784006_110788893:ATP2A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	112230406	T/C	1	37	32	69	18.1478520195582	16.3045604155172	1.843291604041	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.718435968751707	ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112230402_112230586:ALDH2;ENSG00000111275:ENST00000416293:exon_112230402_112230586:ALDH2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	112460147	T/G	1	317	252	569	155.482948383783	128.398413272198	27.0845351115845	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0235588744326393	ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	112471090	G/T	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112471037_112471183:NAA25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	113357193	G/A	1	7	34	41	3.43337740910561	17.323595441487	-13.8902180323814	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1.16837535970600e-05	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	113386779	C/G	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	113403684	C/T	1	14	6	20	6.86675481821122	3.05710507790948	3.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.116630612949195	ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	113407773	G/A	1	22	14	36	10.7906147143319	7.13324518178878	3.65736953254313	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.246062466304874	ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113407767_113411050:OAS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	113445605	G/A	1	22	26	48	10.7906147143319	13.2474553376077	-2.45684062327582	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.564122342437876	ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113445510_113445748:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113445510_113445748:OAS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	113534591	C/T	1	30	43	73	14.7144746104526	21.9092530583513	-7.19477844789865	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.101451565296428	ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	113534633	C/T	1	30	36	66	14.7144746104526	18.3426304674569	-3.62815585700426	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.390864929541609	ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	113826442	C/G	1	17	21	38	8.33820227925648	10.6998677726832	-2.3616654934267	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.517270941700297	ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	114358449	C/T	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114358416_114358495:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114358416_114358495:RBM19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	114374887	T/A	1	31	32	63	15.2049570974677	16.3045604155172	-1.09960331804952	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.802203819159938	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114374812_114374941:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114374812_114374941:RBM19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	114377835	A/G	1	21	14	35	10.3001322273168	7.13324518178878	3.16688704552804	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.313581243470769	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	114377877	T/C	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.848425091361672	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	114383651	C/T	1	19	14	33	9.31916725328665	7.13324518178878	2.18592207149787	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.489468972263295	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114383633_114383729:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114383633_114383729:RBM19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	114386639	A/G	1	39	36	75	19.1288169935884	18.3426304674569	0.786186526131527	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.908278640268904	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114386638_114386841:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114386638_114386841:RBM19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	114395651	T/C	1	36	52	88	17.6573695325431	26.4949106752155	-8.83754114267234	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0694654592269471	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	116972745	G/T	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.425144589490545	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	117476896	C/A	1	99	58	157	48.5577662144936	29.552015753125	19.0057504613687	A:C:G	C	A	10	0.509517512984913	0.00238230628816358	ENSG00000088992:ENST00000470612:exon_117476728_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000335209:exon_117476729_117477015:TESC;ENSG00000088992:ENST00000392545:exon_117476729_117477015:TESC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	117513129	G/A	1	88	135	223	43.1624588573277	68.7848642529633	-25.6224053956356	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000615771685800713	ENSG00000088992:ENST00000470612:exon_117513076_117513145:TESC;ENSG00000088992:ENST00000335209:exon_117513076_117513145:TESC;ENSG00000088992:ENST00000392545:exon_117513076_117513145:TESC;ENSG00000088992:ENST00000462502:exon_117513076_117513145:TESC;ENSG00000088992:ENST00000482176:exon_117513076_117513145:TESC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	118473027	T/G	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	118473054	T/C	1	16	18	34	7.84771979224139	9.17131523372843	-1.32359544148704	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.732552886508093	ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	120118143	G/T	1	21	31	52	10.3001322273168	15.7950429025323	-5.49491067521548	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.164822211037056	ENSG00000111725:ENST00000229328:exon_120118053_120119416:PRKAB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	120128210	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120127956_120128259:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120127956_120128259:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120127956_120128259:CIT;ENSG00000122966:ENST00000469414:exon_120128206_120128256:CIT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	120575452	G/C	1	54	48	102	26.4860542988147	24.4568406232758	2.02921367553888	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.693521433106403	ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120575349_120575618:GCN1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	120587780	G/A	1	13	6	19	6.37627233119613	3.05710507790948	3.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.168530333768717	ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120587726_120587847:GCN1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	120591143	A/G	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120591017_120591211:GCN1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	120608031	A/G	1	23	1	24	11.281097201347	0.509517512984913	10.7715796883621	A:G	A	G	10	0.509517512984913	3.23341803269745e-06	ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120607973_120608125:GCN1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	120634767	G/C	1	16	25	41	7.84771979224139	12.7379378246228	-4.89021803238143	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.159192167561288	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	121205285	G/A	1	4	11	15	1.96192994806035	5.60469264283404	-3.64276269477369	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0719999094721795	ENSG00000157837:ENST00000353487:exon_121205197_121205396:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000405631:exon_121205197_121205396:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000392495:exon_121205197_121205396:AC069214.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	121442199	T/A	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:T	T	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	121442833	C/T	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121442806_121442896:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121442806_121442896:C12orf43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	121454257	T/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121454133_121454300:C12orf43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	121877723	T/C	1	29	44	73	14.2239921234375	22.4187705713362	-8.19477844789865	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0609950959895403	ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121877660_121877878:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121877660_121877878:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121877660_121877884:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121877660_121877878:KDM2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	122079189	C/T	1	49	53	102	24.0336418637393	27.0044281882004	-2.97078632446113	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.620706759349407	ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	122497001	T/C	1	3	11	14	1.47144746104526	5.60469264283404	-4.13324518178878	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0321870224179764	ENSG00000110987:ENST00000261822:exon_122496998_122499950:BCL7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	122720423	G/A	1	30	35	65	14.7144746104526	17.833112954472	-3.11863834401934	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.458855886571105	ENSG00000139719:ENST00000267199:exon_122720333_122720470:VPS33A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	122991437	A/G	1	76	81	157	37.2766690131466	41.270918551778	-3.99424953863134	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.524529878263087	ENSG00000111011:ENST00000331738:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000354654:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000344591:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000392442:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000532695:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000433877:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527173:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000418773:exon_122991418_122991446:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000531389:exon_122991425_122991800:RSRC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	123105143	C/T	1	39	41	80	19.1288169935884	20.8902180323814	-1.76140103879304	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.737837973682816	ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	123738401	C/T	1	30	22	52	14.7144746104526	11.2093852856681	3.50508932478452	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.405546373800075	ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	123801856	T/C	1	29	12	41	14.2239921234375	6.11421015581896	8.10978196761857	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0121141804997066	ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123801768_123801903:SBNO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	124090655	C/T	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124090620_124090706:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124090620_124090706:DDX55
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	124102329	C/G	1	26	21	47	12.7525446623923	10.6998677726832	2.05267688970909	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.563413221735493	ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124102305_124102419:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124102305_124102419:DDX55
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	124104642	C/T	1	42	40	82	20.6002644546337	20.3807005193965	0.219563935237133	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	124209332	T/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124209201_124209338:ATP6V0A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	124821413	G/A	1	44	22	66	21.5812294286638	11.2093852856681	10.3718441429957	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0132326551014551	ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	124832825	C/T	1	18	19	37	8.82868476627157	9.68083274671335	-0.85214798044178	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.869819021756582	ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124832720_124832860:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124832720_124832860:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124832720_124832860:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124832720_124832860:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124832720_124832860:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124832720_124832860:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124832720_124832860:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124832720_124832860:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124832720_124832860:NCOR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	124856660	T/A	1	25	17	42	12.2620621753772	8.66179772074352	3.60026445463365	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.283619813190237	ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	125263039	C/T	1	80	57	137	39.238598961207	29.04249824014	10.1961007210669	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0875046076284195	ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125262186_125263132:SCARB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	125398319	G/A	1	1344	1161	2505	659.208462548277	591.549832575484	67.6586299727929	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00697311772922973	ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	125438712	C/A	1	12	15	27	5.88578984418104	7.64276269477369	-1.75697285059265	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.566049825319431	ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438633_125438757:DHX37
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	125448960	C/T	1	20	14	34	9.80964974030174	7.13324518178878	2.67640455851296	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.394457678652606	ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	125449032	G/A	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	125451405	T/G	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125451339_125451424:DHX37
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	125467158	C/T	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125467057_125467169:DHX37
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	131306278	T/C	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000111450:ENST00000261653:exon_131306234_131306333:STX2;ENSG00000111450:ENST00000344271:exon_131306234_131306333:STX2;ENSG00000111450:ENST00000392373:exon_131306234_131306333:STX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	132514288	C/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132514246_132514448:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132514246_132514448:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132514246_132514448:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132514246_132514448:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132514246_132514448:EP400
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	132547162	G/A	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132547011_132547246:EP400
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	132549287	G/A	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132549213_132549431:EP400
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	133354341	C/T	1	9	14	23	4.41434238313578	7.13324518178878	-2.718902798653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.300147215812102	ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133354252_133354391:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133354252_133354391:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133354252_133354391:GOLGA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	133357412	T/C	1	8	19	27	3.9238598961207	9.68083274671335	-5.75697285059265	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0330840074379835	ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	133358984	A/G	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133358882_133359079:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133358882_133359079:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133358882_133359079:GOLGA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	133398638	G/A	1	14	11	25	6.86675481821122	5.60469264283404	1.26206217537718	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.691382994021232	ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133398582_133398897:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133398582_133398897:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133398582_133398897:GOLGA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	133423662	C/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	12	133778796	C/T	1	21	9	30	10.3001322273168	4.58565761686422	5.71447461045261	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0438904046360645	ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	19271676	A/T	0	17	0	17	8.33820227925648	0	8.33820227925648	A	A		10	0.509517512984913	1.60154758852361e-05	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	20356941	T/A	1	104	87	191	51.010178649569	44.3280236296874	6.68215501988162	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.347355061482607	ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	20411701	C/T	1	20	19	39	9.80964974030174	9.68083274671335	0.128816993588394	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20411593_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20411605_20411961:ZMYM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	20413021	T/C	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20412840_20413125:ZMYM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	20425911	C/A	1	24	5	29	11.7715796883621	2.54758756492456	9.22399212343752	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.000580989685569463	ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	20425948	T/C	1	23	7	30	11.281097201347	3.56662259089439	7.71447461045261	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00546088837923888	ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	20600760	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000468677:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382870:exon_20600659_20600902:ZMYM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	20608465	T/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20608394_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20608394_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20608394_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20608394_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20608401_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20608401_20608544:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382870:exon_20608401_20608544:ZMYM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	21063524	A/G	1	24	9	33	11.7715796883621	4.58565761686422	7.18592207149787	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0140792736659961	ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	21535837	T/G	1	210	4	214	103.001322273168	2.03807005193965	100.963252221229	A:T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	2.5966239929399e-55	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	21720956	C/T	1	311	246	557	152.540053461692	125.341308194289	27.1987452674035	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0220671268859944	ENSG00000150459:ENST00000382533:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000425456:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000450573:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000467636:exon_21720944_21721066:SAP18;ENSG00000150459:ENST00000471009:exon_21720603_21721066:SAP18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25026506	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25026110_25026731:PARP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25027745	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25027725_25027792:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25027725_25027792:PARP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25029210	A/G	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25029295	C/T	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25033200	T/A	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25033182_25033260:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000480576:exon_25033182_25033260:PARP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25033227	A/G	1	11	17	28	5.39530735716596	8.66179772074352	-3.26649036357756	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.258164543515238	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25033182_25033260:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000480576:exon_25033182_25033260:PARP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25049676	G/A	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25049610_25049734:PARP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25074490	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25074454_25074520:PARP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25466955	T/C	1	13	5	18	6.37627233119613	2.54758756492456	3.82868476627157	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0973301160077784	ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25480616	T/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	25487001	G/C	1	1	8	9	0.490482487015087	4.0761401038793	-3.58565761686422	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0193172128390594	ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25486720_25487229:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25486720_25487229:CENPJ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	26788114	A/G	1	30	42	72	14.7144746104526	21.3997355453663	-6.68526093491374	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.125879601821311	ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	27827989	G/A	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.303085077368447	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	27829408	C/T	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000122026:ENST00000311549:exon_27829379_27829491:RPL21;ENSG00000122026:ENST00000461690:exon_27829379_27829486:RPL21;ENSG00000122026:ENST00000272274:exon_27829379_27829491:RPL21;ENSG00000122026:ENST00000319826:exon_27829379_27829491:RPL21;ENSG00000122026:ENST00000326092:exon_27829379_27829491:RPL21;ENSG00000122026:ENST00000493317:exon_27829379_27829491:RPL21;ENSG00000122026:ENST00000466550:exon_27829379_27829993:RPL21;ENSG00000122026:ENST00000483765:exon_27829379_27829491:RPL21;ENSG00000122026:ENST00000485756:exon_27829081_27829491:RPL21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	27830474	A/G	1	60	48	108	29.4289492209052	24.4568406232758	4.9721085976294	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.386496664151827	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	31036681	A/G	1	78	17	95	38.2576339871768	8.66179772074352	29.5958362664333	A:G	A	G	10	0.509517512984913	3.75022020379656e-10	ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	33016660	C/T	1	20	15	35	9.80964974030174	7.64276269477369	2.16688704552805	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.502292925561721	ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000446957:exon_33016525_33016685:N4BP2L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	33017158	G/T	1	22	22	44	10.7906147143319	11.2093852856681	-0.418770571336172	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	36878708	C/A	1	21	1	22	10.3001322273168	0.509517512984913	9.79061471433191	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1.17324449407574e-05	ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36875775_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36877856_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36878459_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36878588_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36878594_36878769:SPG20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	38933460	A/C	1	87	83	170	42.6719763703126	42.2899535777478	0.38202279256479	A:C:G	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000120686:ENST00000379649:exon_38933438_38933470:UFM1;ENSG00000120686:ENST00000448101:exon_38933438_38933523:UFM1;ENSG00000120686:ENST00000239878:exon_38933438_38933470:UFM1;ENSG00000120686:ENST00000437952:exon_38933438_38933918:UFM1;ENSG00000120686:ENST00000379641:exon_38933438_38933470:UFM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	39587677	A/G	1	16	8	24	7.84771979224139	4.0761401038793	3.77157968836209	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.153367642666690	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	39588093	G/C	1	16	13	29	7.84771979224139	6.62372766880387	1.22399212343752	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.712533292455687	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	39588117	T/A	1	17	13	30	8.33820227925648	6.62372766880387	1.71447461045261	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.586721038583829	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	39603508	A/G	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000436678:exon_39603418_39603512:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000418503:exon_39603418_39603512:C13orf23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	41134107	A/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000150907:ENST00000379561:exon_41133646_41134997:FOXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	41323397	C/T	1	73	66	139	35.8052215521014	33.6281558570043	2.17706569509709	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.734896341423593	ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41323274_41323749:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41323274_41323417:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41323274_41323417:MRPS31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	41835039	T/C	1	12	16	28	5.88578984418104	8.15228020775861	-2.26649036357756	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.451877020800592	ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	43181024	T/C	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000120659:ENST00000358545:exon_43180633_43181310:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000405262:exon_43180633_43182149:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43180633_43182144:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43180633_43182149:TNFSF11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	43639845	A/C	1	45	51	96	22.0717119156789	25.9853931622306	-3.91368124655165	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.475127617031299	ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	44543675	G/A	0	38	0	38	18.6383345065733	0	18.6383345065733	G	G		10	0.509517512984913	9.20075755214283e-12	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	45515395	G/A	1	17	15	32	8.33820227925648	7.64276269477369	0.695439584482783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.860859198749914	ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45513384_45515457:NUFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	45594482	G/A	1	36	24	60	17.6573695325431	12.2284203116379	5.42894922090522	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.196302506642594	ENSG00000133114:ENST00000379151:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000497558:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000361121:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000357537:exon_45594465_45594563:KIAA1704
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	45915228	G/A	1	3704	3268	6972	1816.74713190388	1665.1032324347	151.643899469187	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000283548054479894	ENSG00000133112:ENST00000379056:exon_45915177_45915347:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000490277:exon_45915177_45915290:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000530705:exon_45915177_45915505:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000448968:exon_45915177_45915318:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000379060:exon_45915173_45915257:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000379055:exon_45914847_45915293:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000527226:exon_45915177_45915293:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000442760:exon_45915177_45915318:TPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	46103935	A/G	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46103926_46104053:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46103926_46104053:COG3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	46559703	T/C	1	30	39	69	14.7144746104526	19.8711830064116	-5.156708395959	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.229858179426107	ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46559432_46559896:ZC3H13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	46577381	T/C	1	22	22	44	10.7906147143319	11.2093852856681	-0.418770571336172	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000470308:exon_46577274_46577471:ZC3H13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	46717449	G/A	1	385	296	681	188.835757500809	150.817183843534	38.0185736572743	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00357189891303846	ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46717425_46717539:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46717425_46717539:LCP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	46726863	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	46728924	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	46946157	C/T	1	25	31	56	12.2620621753772	15.7950429025323	-3.53298072715513	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.353213903754009	ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	47303011	A/G	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47302982_47303119:LRCH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	48547467	A/T	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	A:T:G	A	T	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	48571139	A/C	1	5	13	18	2.45241243507544	6.62372766880387	-4.17131523372843	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0593928969289689	ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48570978_48571158:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48570978_48571158:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000470760:exon_48570978_48571158:SUCLA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	49085908	T/G	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000136161:ENST00000344532:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000450343:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000452987:exon_49085906_49086013:RCBTB2;ENSG00000136161:ENST00000430805:exon_49085906_49086013:RCBTB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	50056903	A/T	1	19	25	44	9.31916725328665	12.7379378246228	-3.41877057133617	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.365936579209382	ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	50057633	A/G	1	18	5	23	8.82868476627157	2.54758756492456	6.281097201347	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.010936719981297	ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	50095127	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000136147:ENST00000482487:exon_50095030_50095169:PHF11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	50102810	G/A	1	178	174	352	87.3058826886855	88.6560472593749	-1.35016457068937	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.915120006887861	ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	50108252	T/C	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	50204880	G/A	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	50296115	C/T	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50296091_50296260:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50296091_50296260:KPNA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	50307126	T/C	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.190933578495351	ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50307093_50307182:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50307093_50307182:KPNA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	52593277	A/G	1	10	4	14	4.90482487015087	2.03807005193965	2.86675481821122	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.180671884464811	ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52593049_52593279:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52593049_52593279:ALG11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	52598668	C/A	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52598142_52599073:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52598142_52599073:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000519151:exon_52598142_52599073:ALG11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	73349359	G/C	1	16	18	34	7.84771979224139	9.17131523372843	-1.32359544148704	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.732552886508093	ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	73350079	T/C	1	23	15	38	11.281097201347	7.64276269477369	3.63833450657331	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.259152502858008	ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	73505348	G/A	1	6	14	20	2.94289492209052	7.13324518178878	-4.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0737409706371382	ENSG00000083535:ENST00000326291:exon_73505303_73505405:PIBF1;ENSG00000083535:ENST00000326314:exon_73505303_73505405:PIBF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	75861001	A/G	0	0	18	18	0	9.17131523372843	-9.17131523372843	G	A	G	10	0.509517512984913	2.69912559961489e-06	ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75858808_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75858809_75861161:TBC1D4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	76378459	T/C	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000533305:exon_76378425_76378471:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000534657:exon_76378425_76378499:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000497947:exon_76378425_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526371:exon_76378310_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526528:exon_76378314_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000489941:exon_76378363_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525373:exon_76378366_76378677:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76378456_76378677:LMO7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	76395464	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532377:exon_76395313_76395649:LMO7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	76427347	C/A	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	77653016	A/G	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.848425091361672	ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77652959_77653024:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77652959_77653024:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77652959_77653024:MYCBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	79940811	T/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	80094993	C/T	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000102471:ENST00000218652:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000377116:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000415404:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000487865:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000465762:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000494647:exon_80094945_80095113:NDFIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	95686955	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95686859_95686993:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95686859_95686993:ABCC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	95727780	T/C	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95727686_95727805:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000467685:exon_95727686_95728273:ABCC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	99092952	C/T	1	4	13	17	1.96192994806035	6.62372766880387	-4.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0282411534392039	ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99092924_99093090:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99092924_99093090:FARP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	99109508	C/T	1	45	63	108	22.0717119156789	32.0996033180495	-10.0278914023706	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0547522015264139	ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000418038:exon_99107675_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000444574:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376533:exon_99109422_99109558:STK24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	99947701	A/G	1	80	73	153	39.238598961207	37.1947784478986	2.04382051330831	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.747172604303088	ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	99948097	A/G	1	45	27	72	22.0717119156789	13.7569728505926	8.31473906508626	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0587818974538374	ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	99948178	C/A	1	38	40	78	18.6383345065733	20.3807005193965	-1.74236601282321	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.734696484024964	ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	100992428	A/T	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000175198:ENST00000376285:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376286:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376279:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376277:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000424527:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000443601:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376254:exon_100992411_100992513:PCCA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	103328693	G/C	1	87	66	153	42.6719763703126	33.6281558570043	9.04382051330831	T:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.146403059367464	ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	103527931	G/A	1	85	55	140	41.6910113962824	28.0234632141702	13.6675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0223349634595060	ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	108861048	C/T	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	108862810	G/A	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	111176316	T/C	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	111176393	A/G	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	111290880	G/A	1	33	35	68	16.1859220714979	17.833112954472	-1.64719088297408	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.717184372117756	ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	111319754	T/C	1	30	33	63	14.7144746104526	16.8140779285021	-2.09960331804952	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.61629520548466	ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	111532288	G/A	1	64	50	114	31.3908791689656	25.4758756492457	5.91500351971992	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.302859693431453	ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111530887_111532459:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000485844:exon_111532115_111532459:ANKRD10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	111563052	C/T	1	17	18	35	8.33820227925648	9.17131523372843	-0.833112954471956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.866252155786725	ENSG00000088448:ENST00000267339:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000310847:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000465753:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000489973:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000494859:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000375758:exon_111562965_111563117:ANKRD10;ENSG00000088448:ENST00000460846:exon_111562965_111563117:ANKRD10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	113883761	T/G	1	14	37	51	6.86675481821122	18.8521479804418	-11.9853931622306	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.00105894994130424	ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113883760_113883833:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113883760_113883833:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113883760_113883833:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000488558:exon_113883760_113883833:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113883760_113883833:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113883760_113883833:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000463426:exon_113883760_113883833:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000498562:exon_113883760_113883833:CUL4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	113909339	A/G	1	32	38	70	15.6954395844828	19.3616654934267	-3.66622590894391	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.404300827653385	ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	113973786	A/T	1	88	55	143	43.1624588573277	28.0234632141702	15.1389956431574	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.0119822996780118	ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113973784_113973971:LAMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	113974761	C/T	1	72	75	147	35.3147390650863	38.2138134738685	-2.89907440878221	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.680174828538483	ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113974660_113974785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113974660_113974785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	113975768	T/C	1	79	60	139	38.7481164741919	30.5710507790948	8.1770656950971	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.175116479799315	ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	114203814	G/A	1	22	15	37	10.7906147143319	7.64276269477369	3.14785201955822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.327260400458979	ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114203740_114204510:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000460039:exon_114203740_114204230:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000491166:exon_114203740_114203953:TMCO3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	114203844	C/T	1	22	12	34	10.7906147143319	6.11421015581896	4.67640455851296	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.123738258699209	ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114203740_114204510:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000460039:exon_114203740_114204230:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000491166:exon_114203740_114203953:TMCO3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	114203902	G/A	1	17	27	44	8.33820227925648	13.7569728505926	-5.41877057133617	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.130780159310733	ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114203740_114204510:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000460039:exon_114203740_114204230:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000491166:exon_114203740_114203953:TMCO3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	13	115090019	G/A	1	5	15	20	2.45241243507544	7.64276269477369	-5.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0242916211695007	ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	20837701	G/C	1	38	38	76	18.6383345065733	19.3616654934267	-0.723330986853384	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.908929318681244	ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	20845521	A/C	1	2	9	11	0.980964974030174	4.58565761686422	-3.60469264283404	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0353326891625868	ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20845439_20845651:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20845439_20845651:TEP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	20850212	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20850072_20850222:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20850072_20850222:TEP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	20916958	T/C	1	66	46	112	32.3718441429957	23.437805597306	8.93403854568975	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.107746347956815	ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	20920250	T/C	1	20	14	34	9.80964974030174	7.13324518178878	2.67640455851296	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.394457678652606	ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	20925154	T/G	1	271	243	514	132.920753981089	123.812755655334	9.10799832575472	T:C:G	T	G	10	0.509517512984913	0.427457845935082	ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	20928359	C/A	1	30	21	51	14.7144746104526	10.6998677726832	4.01460683776944	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.266846411813361	ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20928351_20928457:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20928351_20928457:TMEM55B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	20944569	G/A	1	166	145	311	81.4200928445044	73.8800393828124	7.54005346169205	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.395619568406565	ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20944543_20945253:PNP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	21464336	T/C	1	9	16	25	4.41434238313578	8.15228020775861	-3.73793782462282	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.162388493015305	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	21829129	C/G	1	56	45	101	27.4670192728449	22.9282880843211	4.53873118852379	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.372567917233755	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21829005_21829131:SUPT16H
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	21829404	T/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	21831052	T/C	1	35	36	71	17.166887045528	18.3426304674569	-1.17574342192882	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.813063535432136	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	21841524	A/G	1	26	23	49	12.7525446623923	11.718902798653	1.03364186373926	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.777394223546101	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21841497_21841589:SUPT16H
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	21971456	C/A	1	33	42	75	16.1859220714979	21.3997355453663	-5.21381347386848	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.24895308702092	ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21971316_21971720:METTL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23016457	C/G	1	360	348	708	176.573695325431	177.31209451875	-0.738399193318401	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.970024189461488	ENSG00000229164:ENST00000446346:exon_23016447_23016484:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23016446_23016719:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000480299:exon_23016446_23016719:AE000661.28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23016696	A/C	1	336	303	639	164.802115637069	154.383806434429	10.4183092026406	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.428784822930187	ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23016446_23016719:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000480299:exon_23016446_23016719:AE000661.28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23020638	T/C	1	266	247	513	130.468341546013	125.850825707274	4.61751583873962	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.691264177287852	ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23044004	C/T	1	623	94	717	305.570589410399	47.8946462205818	257.675943189817	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	1.79213819760588e-92	ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23058077	G/A	1	424	416	840	207.964574494397	211.959285401724	-3.99471090732692	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.782633058099825	ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23057853_23058175:DAD1;ENSG00000129562:ENST00000479564:exon_23057853_23058117:DAD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23078810	A/T	1	15	13	28	7.35723730522631	6.62372766880387	0.733509636422436	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.851310323683977	ENSG00000100439:ENST00000216327:exon_23078630_23078816:ABHD4;ENSG00000100439:ENST00000428304:exon_23078630_23078816:ABHD4;ENSG00000100439:ENST00000418446:exon_23078630_23078816:ABHD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23079773	G/A	1	14	12	26	6.86675481821122	6.11421015581896	0.752544662392262	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.845747407952092	ENSG00000100439:ENST00000216327:exon_23079765_23082121:ABHD4;ENSG00000100439:ENST00000428304:exon_23079765_23081257:ABHD4;ENSG00000100439:ENST00000418446:exon_23079765_23081257:ABHD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23240328	T/A	1	445	487	932	218.264706721714	248.135028823653	-29.8703221019389	A:T:C:G	T	A	10	0.509517512984913	0.0531917557080148	ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240227_23240389:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240227_23240389:OXA1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23242828	T/C	1	19	22	41	9.31916725328665	11.2093852856681	-1.89021803238143	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.64006932080354	ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23282449	C/T	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23282109_23282649:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000488800:exon_23282184_23282649:SLC7A7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23299181	G/A	1	16	19	35	7.84771979224139	9.68083274671335	-1.83311295447195	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.613187650868945	ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000461594:exon_23299138_23299319:MRPL52
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23299242	C/G	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000461594:exon_23299138_23299319:MRPL52
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23393350	G/A	1	97	76	173	47.5768012404634	38.7233309868534	8.85347025361006	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.196081566889041	ENSG00000100462:ENST00000324366:exon_23393217_23393392:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000397441:exon_23393217_23393392:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000397440:exon_23393217_23393392:PRMT5;ENSG00000100462:ENST00000216350:exon_23393217_23393392:PRMT5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23468235	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100802:ENST00000299088:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000341470:exon_23467636_23468611:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397382:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397380:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000397379:exon_23467636_23468365:C14orf93;ENSG00000100802:ENST00000406429:exon_23467636_23468365:C14orf93
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23745552	C/T	1	16	15	31	7.84771979224139	7.64276269477369	0.204957097467697	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23746269	C/G	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23777081	G/A	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23939281	G/T	1	46	27	73	22.562194402694	13.7569728505926	8.80522155210135	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0460592726225252	ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23939251_23939310:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23939251_23939310:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23939251_23939310:NGDN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	23946694	T/C	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.264915529576399	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24029195	C/T	1	121	123	244	59.3483809288255	62.6706540971443	-3.32227316831877	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.700994403869954	ENSG00000213983:ENST00000308724:exon_24029147_24029245:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000397120:exon_24029147_24029245:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000460049:exon_24029147_24029245:AP1G2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24032546	G/A	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.836405124181301	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24458211	A/T	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24566261	G/A	1	56	58	114	27.4670192728449	29.552015753125	-2.08499648028008	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.708859427678511	ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24566101_24566346:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24566101_24566346:PCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24572812	G/A	1	83	76	159	40.7100464222522	38.7233309868534	1.98671543539884	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.81200638614492	ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24614618	G/A	1	1497	1624	3121	734.252283061585	827.456441087499	-93.2041580259134	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000866336608482209	ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24614588_24614674:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24614588_24614674:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24614588_24614674:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000471700:exon_24614588_24614649:PSME2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24629060	C/T	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.375838660756910	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24629557	G/T	1	167	153	320	81.9105753315195	77.9561794866917	3.95439584482784	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.695583708508704	ENSG00000092098:ENST00000382682:exon_24629448_24629616:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000491351:exon_24629448_24629616:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24629448_24629616:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24629448_24629616:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000483895:exon_24629448_24629616:RNF31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24634106	G/A	1	82	88	170	40.2195639352371	44.8375411426723	-4.61797720743521	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.490771635028407	ENSG00000213928:ENST00000396864:exon_24633823_24634164:IRF9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24650967	C/T	1	38	28	66	18.6383345065733	14.2664903635776	4.37184414299574	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.324962923415472	ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24650917_24651049:IPO4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24654489	T/C	1	21	6	27	10.3001322273168	3.05710507790948	7.24302714940735	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00616040020798849	ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24685193	T/C	1	19	13	32	9.31916725328665	6.62372766880387	2.69543958448279	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.379864034731394	ENSG00000213920:ENST00000528804:exon_24685125_24685193:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000288087:exon_24685125_24685273:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000530222:exon_24684758_24685243:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000396833:exon_24685125_24685271:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000533536:exon_24685094_24685203:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000532742:exon_24685125_24685276:MDP1;ENSG00000213920:ENST00000466422:exon_24684758_24685265:MDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24702789	C/T	1	47	40	87	23.0526768897091	20.3807005193965	2.67197637031257	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.59306933340839	ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24718515	G/A	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000092295:ENST00000206765:exon_24718322_24718747:TGM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24736027	G/A	1	54	31	85	26.4860542988147	15.7950429025323	10.6910113962824	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0224458912455492	ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24737595	C/T	1	38	52	90	18.6383345065733	26.4949106752155	-7.85657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.113440217363644	ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24737575_24737626:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24737575_24737626:RABGGTA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24760808	C/T	1	58	49	107	28.447984246875	24.9663581362607	3.48162611061431	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.562026588925659	ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24771285	G/A	0	10	0	10	4.90482487015087	0	4.90482487015087	G	G		10	0.509517512984913	0.00198502447144214	ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24771171_24771312:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24771171_24771312:C14orf21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24773387	T/C	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24773247_24773483:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24773247_24773394:C14orf21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24806902	G/A	1	21	12	33	10.3001322273168	6.11421015581896	4.18592207149787	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.165267760206332	ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24806901_24806968:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24806901_24806968:RIPK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24807221	G/A	1	11	16	27	5.39530735716596	8.15228020775861	-2.75697285059265	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.337997616727118	ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24807079_24807246:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24807079_24807246:RIPK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24808388	A/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24808221_24808530:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24808221_24808530:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000357715:exon_24808221_24808530:RIPK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24845543	T/C	1	2	27	29	0.980964974030174	13.7569728505926	-12.7760078765625	T:C	T	C	10	0.509517512984913	5.93653643103521e-07	ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24845500_24845760:NFATC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24845841	T/C	1	1	8	9	0.490482487015087	4.0761401038793	-3.58565761686422	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0193172128390594	ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24898135	C/T	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000139899:ENST00000267406:exon_24897961_24898731:CBLN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24901167	T/A	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.848425091361672	ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	24909586	G/A	1	88	74	162	43.1624588573277	37.7042959608836	5.45816289644409	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.432081136658002	ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	31099738	A/G	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	31355096	C/G	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	31425437	T/C	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196792:ENST00000355683:exon_31425345_31425448:STRN3;ENSG00000196792:ENST00000357479:exon_31425345_31425448:STRN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	35242828	G/A	1	26	30	56	12.7525446623923	15.2855253895474	-2.53298072715513	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.50749609094596	ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	35591174	T/C	1	19	28	47	9.31916725328665	14.2664903635776	-4.94732311029091	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.188664102593338	ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	35592538	C/G	1	14	11	25	6.86675481821122	5.60469264283404	1.26206217537718	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.691382994021232	ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	35873770	G/A	1	312	367	679	153.030535948707	186.992927265463	-33.9623913167559	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0100690113572174	ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	39517910	A/G	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100934:ENST00000307712:exon_39517856_39517933:SEC23A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	39777722	A/G	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000382245:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39777653_39777791:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39777653_39777791:CTAGE5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	39818145	G/A	1	50	50	100	24.5241243507543	25.4758756492457	-0.951751298491303	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.920398653776889	ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	45687647	A/G	1	18	10	28	8.82868476627157	5.09517512984913	3.73350963642244	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.187163218330294	ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45687485_45687657:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000469020:exon_45687485_45687657:C14orf106
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	45693250	C/A	1	16	22	38	7.84771979224139	11.2093852856681	-3.36166549342669	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.330832380517956	ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45693121_45693949:C14orf106
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	45711594	T/C	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50065814	G/A	1	35	39	74	17.166887045528	19.8711830064116	-2.70429596088356	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.562175342810006	ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50088147	G/A	1	13	21	34	6.37627233119613	10.6998677726832	-4.32359544148704	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.169838425256551	ENSG00000168282:ENST00000305386:exon_50087489_50090198:MGAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50092471	T/C	1	17	17	34	8.33820227925648	8.66179772074352	-0.323595441487043	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50100386	T/C	1	19	21	40	9.31916725328665	10.6998677726832	-1.38070051939652	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.752396006614917	ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50244929	T/G	1	24	33	57	11.7715796883621	16.8140779285021	-5.04249824014004	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.187945322206216	ENSG00000165516:ENST00000298307:exon_50244896_50244977:KLHDC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50280743	A/T	1	22	33	55	10.7906147143319	16.8140779285021	-6.02346321417022	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.107609118173535	ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50280706_50280768:SDCCAG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50298962	T/A	1	26	16	42	12.7525446623923	8.15228020775861	4.60026445463365	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.167355504594337	ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50788213	C/T	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000125375:ENST00000311459:exon_50788201_50788312:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000245448:exon_50788201_50788312:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000426751:exon_50788201_50788312:ATP5S
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	50789387	C/T	1	26	24	50	12.7525446623923	12.2284203116379	0.52412435075435	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.888737440394932	ENSG00000125375:ENST00000311459:exon_50789229_50789437:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000245448:exon_50789229_50789437:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000426751:exon_50789229_50789743:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000358473:exon_50789229_50789437:ATP5S
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	51192571	G/C	1	13	10	23	6.37627233119613	5.09517512984913	1.281097201347	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.6789219768712	ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	51224658	T/A	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	51225132	G/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	51230590	C/T	1	11	16	27	5.39530735716596	8.15228020775861	-2.75697285059265	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.337997616727118	ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51230544_51230682:NIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	51237701	A/G	1	17	8	25	8.33820227925648	4.0761401038793	4.26206217537717	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.109340228515106	ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	54884648	C/T	1	88	94	182	43.1624588573277	47.8946462205818	-4.73218736325416	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.505039949825682	ENSG00000100526:ENST00000335183:exon_54884566_54884669:CDKN3;ENSG00000100526:ENST00000216414:exon_54884566_54884669:CDKN3;ENSG00000100526:ENST00000442975:exon_54884566_54884669:CDKN3;ENSG00000100526:ENST00000458126:exon_54884566_54884669:CDKN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	54996872	G/A	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000100532:ENST00000216420:exon_54996767_54996944:CGRRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	55310492	G/A	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	55433283	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55433193_55433324:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55433193_55433324:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55433193_55433324:WDHD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	55609418	G/A	1	267	321	588	130.958824033028	163.555121668157	-32.5962976351288	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00732250513115837	ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55609302_55609467:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55609302_55609467:LGALS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	55619311	A/G	1	48	48	96	23.5431593767242	24.4568406232758	-0.913681246551647	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.918773140303043	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	55625370	A/G	1	19	18	37	9.31916725328665	9.17131523372843	0.14785201955822	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55625240_55625459:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55625240_55625459:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55625240_55625459:DLGAP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	55636259	G/A	1	24	13	37	11.7715796883621	6.62372766880387	5.14785201955822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.101125363674257	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55636117_55636277:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55636117_55636277:DLGAP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	55643857	T/G	1	13	15	28	6.37627233119613	7.64276269477369	-1.26649036357756	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.707147525454052	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	55818514	C/T	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	56096686	A/C	1	84	80	164	41.2005289092673	40.761401038793	0.439127870474266	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56096675_56096815:KTN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	57676330	G/T	1	6	15	21	2.94289492209052	7.64276269477369	-4.69986777268317	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0488848967390049	ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57676285_57676500:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57676285_57676500:EXOC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	57741550	A/G	1	6	17	23	2.94289492209052	8.66179772074352	-5.718902798653	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0206563045334984	ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	57876265	G/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000139977:ENST00000298406:exon_57876097_57879466:NAA30;ENSG00000139977:ENST00000395257:exon_57876097_57879466:NAA30
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	59014522	G/A	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000100578:ENST00000354386:exon_59014499_59014838:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000423743:exon_59014499_59014838:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000261244:exon_59014499_59015546:KIAA0586
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	59797235	A/G	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	64497930	G/A	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	64520020	A/G	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	64637147	C/A	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	64686125	G/T	1	58	53	111	28.447984246875	27.0044281882004	1.44355605867466	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.849534656792957	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	64688376	C/T	1	28	18	46	13.7335096364224	9.17131523372843	4.562194402694	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.187576840948389	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64688252_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64688252_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64688252_64688422:SYNE2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	66096300	T/A	1	23	18	41	11.281097201347	9.17131523372843	2.10978196761857	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.535763623400263	ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	67843176	T/C	1	34	44	78	16.676404558513	22.4187705713362	-5.74236601282322	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.213350144413742	ENSG00000134001:ENST00000256383:exon_67843156_67843307:EIF2S1;ENSG00000134001:ENST00000466499:exon_67843156_67843307:EIF2S1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	68066780	C/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100564:ENST00000216452:exon_68066741_68067017:PIGH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	69257187	C/G	1	51	47	98	25.0146068377694	23.9473231102909	1.06728372747853	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.84061944140319	ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69254375_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69256244_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69256691_69257209:ZFP36L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	69259662	C/A	1	27	36	63	13.2430271494074	18.3426304674569	-5.09960331804952	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.209546228212232	ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69259599_69259785:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69259599_69261453:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69259599_69261453:ZFP36L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	69352171	C/T	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69352142_69352292:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000376839:exon_69352142_69352292:ACTN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	70839679	A/G	1	24	18	42	11.7715796883621	9.17131523372843	2.60026445463365	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.444285661776372	ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	72055468	A/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72054288_72056087:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72054288_72056087:SIPA1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	73425462	G/A	1	10	2	12	4.90482487015087	1.01903502596983	3.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0389831260229786	ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	73459917	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73459851_73460065:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73459851_73460065:ZFYVE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	73743367	A/G	1	52	65	117	25.5050893247845	33.1186383440193	-7.61354901923482	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.166226340530101	ENSG00000133961:ENST00000355058:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000359560:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000454166:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000356296:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000326018:exon_73741918_73744001:NUMB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	73958812	T/C	1	17	27	44	8.33820227925648	13.7569728505926	-5.41877057133617	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.130780159310733	ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	75248101	A/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:T	A	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	75279461	G/A	1	27	21	48	13.2430271494074	10.6998677726832	2.54315937672418	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.474743472802699	ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	75513969	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	75570528	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	75590822	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75590749_75590926:NEK9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	76330181	G/A	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	76368544	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	76368547	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	76662248	A/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000089916:ENST00000261530:exon_76662221_76662315:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000312858:exon_76662221_76662315:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000336993:exon_76662221_76662315:C14orf118
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	77796139	G/A	1	39	23	62	19.1288169935884	11.718902798653	7.4099141949354	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0745725737240812	ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77796098_77796150:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77796098_77796150:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77796098_77796150:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77796098_77796150:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77796098_77796150:GSTZ1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	77928525	A/G	1	135	96	231	66.2151357470367	48.9136812465516	17.3014545004851	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0250923719144181	ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	77934431	G/A	1	124	130	254	60.8198283898708	66.2372766880387	-5.4174482981679	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.530386165310862	ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77934426_77934527:AHSA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	77978621	A/C	1	42	53	95	20.6002644546337	27.0044281882004	-6.40416373356674	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.218049772240555	ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_77973272_77978746:SPTLC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	88431898	C/T	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000054983:ENST00000261304:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393568:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000393569:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000474294:exon_88431849_88431973:GALC;ENSG00000054983:ENST00000445021:exon_88431849_88431973:GALC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	88477882	A/C	1	22	38	60	10.7906147143319	19.3616654934267	-8.57105077909478	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0283144448020286	ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	90398907	G/A	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	90420288	T/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90420250_90420345:C14orf143
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	90429749	A/G	1	19	17	36	9.31916725328665	8.66179772074352	0.657369532543132	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.868798049474732	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	90429858	G/A	1	21	14	35	10.3001322273168	7.13324518178878	3.16688704552804	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.313581243470769	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	90451500	A/G	1	24	34	58	11.7715796883621	17.323595441487	-5.55201575312496	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.150714094702722	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90451476_90451554:TDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	90784412	G/A	1	26	8	34	12.7525446623923	4.0761401038793	8.67640455851296	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00310528962095464	ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90784349_90784457:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90784349_90784457:C14orf102
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	91671124	G/A	1	25	32	57	12.2620621753772	16.3045604155172	-4.04249824014004	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.292590004172710	ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	91770308	C/T	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91770045_91770322:CCDC88C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	91773568	T/C	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	91779728	G/T	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91779424_91780494:CCDC88C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	91780387	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91779424_91780494:CCDC88C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	91808707	C/G	1	7	26	33	3.43337740910561	13.2474553376077	-9.81407792850213	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.000693844031179945	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	92470147	G/A	1	22	22	44	10.7906147143319	11.2093852856681	-0.418770571336172	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	92549586	G/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92549470_92549602:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92549470_92549602:ATXN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	92559678	G/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	93652836	A/G	1	33	34	67	16.1859220714979	17.323595441487	-1.13767336998917	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.807855270024698	ENSG00000153485:ENST00000283534:exon_93652605_93653431:C14orf109;ENSG00000153485:ENST00000415050:exon_93652605_93653425:C14orf109
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	93673655	G/A	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93673401_93673786:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93673401_93673786:UBR7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	93685585	G/A	1	24	22	46	11.7715796883621	11.2093852856681	0.562194402694002	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.883967105723158	ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93685558_93685707:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93685558_93685707:UBR7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	94417421	G/A	1	58	34	92	28.447984246875	17.323595441487	11.124388805388	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0216640202083116	ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	94417586	G/A	1	62	31	93	30.4099141949354	15.7950429025323	14.6148712924031	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00251783316404362	ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	94582184	C/T	1	12	65	77	5.88578984418104	33.1186383440193	-27.2328484998383	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.30469625863795e-10	ENSG00000165949:ENST00000448882:exon_94582127_94582279:IFI27;ENSG00000165949:ENST00000444961:exon_94582130_94582279:IFI27;ENSG00000165949:ENST00000298902:exon_94582127_94582279:IFI27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	94642440	T/C	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000119698:ENST00000304338:exon_94642391_94642464:PPP4R4;ENSG00000119698:ENST00000328839:exon_94642391_94642464:PPP4R4;ENSG00000119698:ENST00000393098:exon_94642391_94642464:PPP4R4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	95669487	C/T	0	0	10	10	0	5.09517512984913	-5.09517512984913	T	C	T	10	0.509517512984913	0.000805814452588094	ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95669175_95670800:CLMN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	95912388	G/A	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	95912426	T/C	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	95918625	T/C	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95918584_95918720:C14orf49
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	95921869	G/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95921714_95922061:C14orf49
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	95999820	T/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	96986491	C/T	1	100	69	169	49.0482487015087	35.156708395959	13.8915403055497	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0374839414332867	ENSG00000090060:ENST00000216277:exon_96986392_96986565:PAPOLA;ENSG00000090060:ENST00000392990:exon_96986392_96986565:PAPOLA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	97299853	A/G	1	41	56	97	20.1097819676186	28.5329807271551	-8.42319875953656	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.103746881129473	ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	97319233	A/G	1	69	57	126	33.843291604041	29.04249824014	4.80079336390097	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.42302036798592	ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97319168_97319276:VRK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	99865109	C/G	1	88	69	157	43.1624588573277	35.156708395959	8.00575046136866	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.202820316601233	ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99864083_99865462:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000446066:exon_99864806_99865462:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000489770:exon_99865069_99865462:SETD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	99870572	A/G	1	47	45	92	23.0526768897091	22.9282880843211	0.124388805388005	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99870562_99870647:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000446066:exon_99870562_99870647:SETD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	99924727	G/A	1	15	18	33	7.35723730522631	9.17131523372843	-1.81407792850213	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.602827681047108	ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99924616_99924872:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000446066:exon_99924616_99924872:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000453764:exon_99924616_99924872:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99924616_99924872:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000436070:exon_99924616_99924872:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000357563:exon_99924616_99924872:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000453938:exon_99924636_99924872:SETD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	99932071	T/C	1	20	9	29	9.80964974030174	4.58565761686422	5.22399212343752	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0627808957285707	ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99932040_99932150:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000446066:exon_99932040_99932150:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000453764:exon_99932040_99932150:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99932040_99932150:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000436070:exon_99932040_99932150:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000357563:exon_99932040_99932150:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000453938:exon_99932040_99932150:SETD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	102500339	G/A	1	21	24	45	10.3001322273168	12.2284203116379	-1.92828808432109	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.655214756079902	ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102500313_102500525:DYNC1H1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	102675350	G/C	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	102792386	T/C	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	102792631	G/A	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	102802095	A/T	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102802026_102802175:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102802026_102802175:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102802026_102802175:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102802026_102802175:ZNF839
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	102807671	C/T	1	18	24	42	8.82868476627157	12.2284203116379	-3.39973554536635	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.354816492678567	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	102808273	C/A	1	24	23	47	11.7715796883621	11.718902798653	0.0526768897090903	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	103406169	C/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103406167_103406284:CDC42BPB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	103593950	C/G	1	29	14	43	14.2239921234375	7.13324518178878	7.09074694164874	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0328531584244651	ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103593342_103593966:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103593342_103593966:TNFAIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	103598021	C/A	1	20	18	38	9.80964974030174	9.17131523372843	0.638334506573306	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.872297020058223	ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103597976_103598099:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103597976_103598099:TNFAIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	103599847	C/T	1	35	44	79	17.166887045528	22.4187705713362	-5.25188352580813	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.261047476297133	ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103599699_103599854:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103599699_103599854:TNFAIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	103600021	C/T	1	34	46	80	16.676404558513	23.437805597306	-6.76140103879304	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.146123502706648	ENSG00000185215:ENST00000333007:exon_103600019_103600140:TNFAIP2;ENSG00000185215:ENST00000451723:exon_103600019_103600140:TNFAIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	104381502	T/C	1	292	170	462	143.220886208405	86.6179772074352	56.6029090009702	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1.28012427908328e-07	ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105180565	T/C	1	42	21	63	20.6002644546337	10.6998677726832	9.90039668195048	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0159952063613193	ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105180706	A/C,G	0	0	21	21	0	10.6998677726832	-10.6998677726832	C:G	A	G	10	0.509517512984913	3.18488393318032e-07	ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105238783	G/A	1	67	66	133	32.8623266300108	33.6281558570043	-0.765829226993432	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.930984030018744	ENSG00000142208:ENST00000349310:exon_105238702_105238789:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000407796:exon_105238702_105238789:AKT1;ENSG00000142208:ENST00000402615:exon_105238702_105238789:AKT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105393556	G/C	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000166428:ENST00000392593:exon_105393478_105393567:PLD4;ENSG00000166428:ENST00000472901:exon_105393478_105393567:PLD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105477507	G/A	1	40	30	70	19.6192994806035	15.2855253895474	4.33377409105609	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.339363003761524	ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105477613	T/C	1	37	34	71	18.1478520195582	17.323595441487	0.824256578071175	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.905714165851707	ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105478102	G/A	1	60	46	106	29.4289492209052	23.437805597306	5.99114362359922	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.285198314844475	ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105688082	C/T	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000185024:ENST00000327359:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000379937:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000446501:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000392557:exon_105687985_105688251:BRF1;ENSG00000185024:ENST00000440513:exon_105687985_105688251:BRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105716034	C/T	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105848891	T/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105848814_105848918:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105848814_105848918:PACS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105954682	C/G	1	304	1123	1427	149.106676052586	572.188167082057	-423.081491029471	A:C:G	C	G	10	0.509517512984913	1.96007902225033e-117	ENSG00000213145:ENST00000496700:exon_105952654_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000409393:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000392531:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000330233:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000460900:exon_105953534_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000461556:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000185347:ENST00000477724:exon_105954668_105954725:C14orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	105965289	T/C	1	29	31	60	14.2239921234375	15.7950429025323	-1.57105077909478	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.700493201950742	ENSG00000185347:ENST00000329886:exon_105964954_105965516:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392527:exon_105964954_105965523:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392528:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000334656:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392523:exon_105964954_105965585:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392522:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000334643:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000354560:exon_105964954_105965546:C14orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106174123	G/A	1	39	36	75	19.1288169935884	18.3426304674569	0.786186526131527	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.908278640268904	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106174188	T/C	1	69	34	103	33.843291604041	17.323595441487	16.519696162554	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00109566085496685	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106174796	C/T	1	33	40	73	16.1859220714979	20.3807005193965	-4.19477844789865	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.350264779425146	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106307418	G/A	1	258	946	1204	126.544481649892	482.003567283728	-355.459085633835	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	2.17504207321585e-98	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106307432	T/A	1	875	176	1051	429.172176138201	89.6750822853447	339.497093852856	A:T:C	T	A	10	0.509517512984913	1.91515609413951e-106	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106318248	A/T	1	1049	5652	6701	514.516128878826	2879.79298339073	-2365.2768545119	A:T:C:G	A	T	10	0.509517512984913	4.94065645841247e-324	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106329417	C/T	1	143	288	431	70.1389956431574	146.741043739655	-76.6020480964975	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.35303635967682e-13	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106385332	G/C	1	16	10	26	7.84771979224139	5.09517512984913	2.75254466239226	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.329230577261424	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106518848	T/C	0	233	1	234	114.282419474515	0.509517512984913	113.77290196153	A:T	T	A	10	0.509517512984913	6.87799669579799e-67	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106725662	T/C	1	22	12	34	10.7906147143319	6.11421015581896	4.67640455851296	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.123738258699209	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106829770	G/A	0	0	96	96	0	48.9136812465516	-48.9136812465516	A:T	G	A	10	0.509517512984913	1.99460315952169e-30	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	106829771	G/A	1	1	96	97	0.490482487015087	48.9136812465516	-48.4231987595366	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1.38861760498120e-28	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	107034981	G/C	0	0	34	34	0	17.323595441487	-17.323595441487	C	G	C	10	0.509517512984913	3.02830196265189e-11	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	107170005	T/C	0	0	18	18	0	9.17131523372843	-9.17131523372843	C	T	C	10	0.509517512984913	2.69912559961489e-06	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	14	107170077	C/T	0	0	9	9	0	4.58565761686422	-4.58565761686422	T	C	T	10	0.509517512984913	0.00164290157940605	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	21937964	A/G	0	12	0	12	5.88578984418104	0	5.88578984418104	A	A		10	0.509517512984913	0.000499989724588711	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	22939192	G/A	1	8	13	21	3.9238598961207	6.62372766880387	-2.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.278819956820526	ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22939175_22939266:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22939175_22939266:CYFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	22960868	G/C	1	14	17	31	6.86675481821122	8.66179772074352	-1.7950429025323	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.591606875195905	ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	25616844	T/A	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000114062:ENST00000232165:exon_25615713_25616959:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000397954:exon_25615713_25616959:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000438097:exon_25615713_25616959:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000428984:exon_25615713_25616959:UBE3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	28369255	C/T	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000128731:ENST00000261609:exon_28369183_28369380:HERC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	29560979	C/T	1	92	122	214	45.124388805388	62.1611365841594	-17.0367477787714	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0201370364089426	ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	34393879	T/C	1	44	45	89	21.5812294286638	22.9282880843211	-1.34705865565726	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.832303516620877	ENSG00000134153:ENST00000256545:exon_34393805_34394149:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000527822:exon_34393805_34394008:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000532113:exon_34393805_34394028:C15orf24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	34393961	G/A	1	26	29	55	12.7525446623923	14.7760078765625	-2.02346321417022	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.592907286061167	ENSG00000134153:ENST00000256545:exon_34393805_34394149:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000527822:exon_34393805_34394008:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000532113:exon_34393805_34394028:C15orf24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	34528948	G/A	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	34542872	C/G	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34542832_34542930:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34542832_34542930:SLC12A6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	35149048	G/A	1	51	53	104	25.0146068377694	27.0044281882004	-1.98982135043095	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.768750839509028	ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35147750_35149307:AQR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	35159799	A/G	1	19	26	45	9.31916725328665	13.2474553376077	-3.92828808432108	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.296665812621704	ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35159725_35159810:AQR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40259848	A/C	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40259545_40260080:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40259545_40260080:EIF2AK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40308859	G/T	1	9	14	23	4.41434238313578	7.13324518178878	-2.718902798653	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.300147215812102	ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40308703_40308873:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40308703_40308873:EIF2AK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40313141	C/T	1	14	16	30	6.86675481821122	8.15228020775861	-1.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.716389941789618	ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40327301	G/A	1	81	75	156	39.729081448222	38.2138134738685	1.51526797435357	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.8108215218788	ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40330518	T/G	1	267	241	508	130.958824033028	122.793720629364	8.1651034036642	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.477935045615781	ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40453430	G/T	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	T:C:G	G	T	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40453210_40453456:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40453210_40453456:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40453227_40453456:BUB1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40498503	T/C	1	27	20	47	13.2430271494074	10.1903502596983	3.05267688970909	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.38575279318474	ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40498385_40498659:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40498385_40498659:BUB1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40498593	C/T	1	21	27	48	10.3001322273168	13.7569728505926	-3.45684062327582	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.386644300426596	ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40498385_40498659:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40498385_40498659:BUB1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40504837	C/T	1	49	60	109	24.0336418637393	30.5710507790948	-6.53740891535552	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.214555409233539	ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40504700_40504849:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40504700_40504849:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40504700_40504849:BUB1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40849408	C/T	1	22	15	37	10.7906147143319	7.64276269477369	3.14785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.327260400458979	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40917393	A/G	1	1	8	9	0.490482487015087	4.0761401038793	-3.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0193172128390594	ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000526913:exon_40915330_40917838:CASC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	40993318	T/C	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000051180:ENST00000527860:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000423169:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000267868:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000382642:exon_40993262_40993403:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000435604:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000450111:exon_40993262_40993373:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000532743:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000382643:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000525066:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000526763:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000531277:exon_40993262_40993399:RAD51
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	41067324	T/A	1	2	23	25	0.980964974030174	11.718902798653	-10.7379378246228	A:T	T	A	10	0.509517512984913	7.66137841533374e-06	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	41068409	C/T	1	21	21	42	10.3001322273168	10.6998677726832	-0.399735545366347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104129:ENST00000220496:exon_41068394_41068490:DNAJC17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	41104874	G/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	41105926	T/G	1	27	15	42	13.2430271494074	7.64276269477369	5.60026445463366	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0908438841109536	ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	41148163	C/T	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	41366676	G/T	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000128908:ENST00000361937:exon_41366568_41366763:INO80;ENSG00000128908:ENST00000401393:exon_41366568_41366763:INO80;ENSG00000128908:ENST00000263793:exon_41366568_41366763:INO80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	41624579	C/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104147:ENST00000220514:exon_41624438_41624819:OIP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	42126956	C/G	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	C	C		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000243789:ENST00000397299:exon_42126938_42127091:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000335032:exon_42126938_42127091:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000431823:exon_42126938_42127091:JMJD7;ENSG00000243789:ENST00000405106:exon_42126938_42127003:JMJD7;ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42126938_42127091:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42126938_42127091:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42126938_42127421:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000342159:exon_42126938_42127091:JMJD7-PLA2G4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	42192826	G/A	1	54	43	97	26.4860542988147	21.9092530583513	4.57680124046344	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.362627284912786	ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42190570_42193379:EHD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	42211486	A/G	1	41	34	75	20.1097819676186	17.323595441487	2.78618652613152	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.564439191688515	ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	42564269	A/C	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000103978:ENST00000389834:exon_42564261_42564321:TMEM87A;ENSG00000103978:ENST00000307216:exon_42564261_42564321:TMEM87A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	42740369	C/T	1	10	7	17	4.90482487015087	3.56662259089439	1.33820227925648	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.630132706769099	ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42740270_42740903:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42740270_42740903:ZFP106
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	42804092	T/G	1	30	83	113	14.7144746104526	42.2899535777478	-27.5754789672952	T:G	T	G	10	0.509517512984913	2.18879288785632e-07	ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42804031_42804101:SNAP23;ENSG00000092531:ENST00000349777:exon_42804031_42804101:SNAP23;ENSG00000092531:ENST00000397138:exon_42804045_42804101:SNAP23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	42820589	G/A	1	57	113	170	27.95750175986	57.5754789672952	-29.6179772074352	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	5.10726080947529e-06	ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	43481408	G/A	1	21	25	46	10.3001322273168	12.7379378246228	-2.437805597306	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.555812495792938	ENSG00000166946:ENST00000300213:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000407066:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000356633:exon_43481397_43481478:CCNDBP1;ENSG00000166946:ENST00000444658:exon_43481397_43481478:CCNDBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	43527871	C/T	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43527667_43528035:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43527667_43528035:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43527667_43528035:TGM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	43621947	A/G	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000168806:ENST00000305641:exon_43619976_43622891:LCMT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	43653322	G/A	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	43654042	T/G	1	13	11	24	6.37627233119613	5.60469264283404	0.771579688362088	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.83951915689104	ENSG00000140265:ENST00000396976:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000396972:exon_43650370_43654139:ZSCAN29;ENSG00000140265:ENST00000267817:exon_43650370_43654139:ZSCAN29
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	44038899	C/T	1	50	99	149	24.5241243507543	50.4422337855064	-25.918109434752	T:C	C	T	10	0.509517512984913	2.46413533642911e-05	ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	44046013	C/T	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.351554313902114	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	44087277	G/T	1	24	20	44	11.7715796883621	10.1903502596983	1.58122942866383	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.654190035525763	ENSG00000184716:ENST00000319327:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000448553:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000457418:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000299969:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000412697:exon_44086428_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000396823:exon_44086478_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000249714:exon_44086478_44087411:SERINC4;ENSG00000140264:ENST00000445816:exon_44086572_44088287:SERF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	44092856	G/A	1	291	291	582	142.73040372139	148.26959627861	-5.53919255721934	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.64862314571698	ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44091556_44092982:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44092693_44092982:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44092693_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000498605:exon_44092509_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44092621_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44092797_44092982:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44092825_44092982:C15orf63
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	44093758	G/A	1	189	196	385	92.7011900458514	99.8654325450429	-7.1642424991915	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.475745980000539	ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093716_44093767:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093716_44093767:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093716_44093767:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000498605:exon_44093330_44093788:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093716_44093767:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093716_44093767:C15orf63
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	45047573	C/T	1	18	6	24	8.82868476627157	3.05710507790948	5.77157968836209	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0232323340630925	ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	45457106	G/T	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000137857:ENST00000389037:exon_45456977_45457774:DUOX1;ENSG00000137857:ENST00000321429:exon_45456977_45457774:DUOX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	48441554	T/C	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000104177:ENST00000267836:exon_48441360_48441568:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000324324:exon_48441360_48441568:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000454655:exon_48441360_48441568:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000396590:exon_48441360_48441568:MYEF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	48450982	T/C	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000104177:ENST00000267836:exon_48450966_48451119:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000324324:exon_48450966_48451119:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000454655:exon_48450966_48451119:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000396590:exon_48450966_48451119:MYEF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	49620200	C/T	1	39	33	72	19.1288169935884	16.8140779285021	2.31473906508626	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.637950674924835	ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	49917401	G/A	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000104047:ENST00000403028:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000329873:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000251250:exon_49917310_49917628:DTWD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	50867082	G/A	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	50867089	C/T	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	52069184	C/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000128872:ENST00000435126:exon_52069129_52069215:TMOD2;ENSG00000128872:ENST00000249700:exon_52069129_52069215:TMOD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	52258697	A/G	1	24	25	49	11.7715796883621	12.7379378246228	-0.966358136260737	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.886578458405135	ENSG00000166477:ENST00000299601:exon_52257946_52258701:LEO1;ENSG00000166477:ENST00000315141:exon_52257946_52258701:LEO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	52350879	T/C	1	7	14	21	3.43337740910561	7.13324518178878	-3.69986777268317	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.127823723210135	ENSG00000069956:ENST00000261845:exon_52350830_52350994:MAPK6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	52402010	T/A	1	28	7	35	13.7335096364224	3.56662259089439	10.166887045528	A:T:C	T	A	10	0.509517512984913	0.000548331445267798	ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52401460_52402170:BCL2L10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	52416739	G/A	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000069966:ENST00000261837:exon_52416670_52416836:GNB5;ENSG00000069966:ENST00000358784:exon_52416670_52416836:GNB5;ENSG00000069966:ENST00000396335:exon_52416670_52416836:GNB5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	56924103	C/T	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.264915529576399	ENSG00000137871:ENST00000267807:exon_56922379_56924320:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000455329:exon_56922379_56924320:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000396250:exon_56922379_56924320:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000260435:exon_56922379_56924320:ZNF280D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	57555365	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000140262:ENST00000267811:exon_57555310_57555472:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000438423:exon_57555310_57555472:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000452095:exon_57555310_57555472:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000333725:exon_57555310_57555472:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000343827:exon_57555310_57555472:TCF12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	58933027	G/T	1	7	14	21	3.43337740910561	7.13324518178878	-3.69986777268317	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.127823723210135	ENSG00000137845:ENST00000260408:exon_58932976_58933159:ADAM10;ENSG00000137845:ENST00000396140:exon_58932976_58933159:ADAM10;ENSG00000137845:ENST00000402627:exon_58932976_58933029:ADAM10;ENSG00000137845:ENST00000443434:exon_58932976_58933029:ADAM10;ENSG00000137845:ENST00000396136:exon_58932976_58933159:ADAM10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	60715800	T/G	1	39	53	92	19.1288169935884	27.0044281882004	-7.875611194612	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.117423260310374	ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	60741304	G/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60741047_60742040:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60741047_60742040:NARG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	62182540	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62182364_62182599:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62182364_62182599:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395898:exon_62182364_62182599:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000395896:exon_62182364_62182599:VPS13C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	63433766	G/A	1	170	142	312	83.3820227925648	72.3514868438576	11.0305359487072	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.213455387282402	ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	63433785	G/A	1	184	157	341	90.248777610776	79.9942495386313	10.2545280721447	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.278852230107326	ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	63548787	G/A	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	65108504	A/T	1	52	46	98	25.5050893247845	23.437805597306	2.06728372747853	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.687502757441925	ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	65112209	C/A	1	18	14	32	8.82868476627157	7.13324518178878	1.69543958448278	A:C:G	C	A	10	0.509517512984913	0.598757235104772	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	65114484	G/A	1	16	10	26	7.84771979224139	5.09517512984913	2.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.329230577261424	ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65114465_65114590:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65114465_65114590:PIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	65445894	C/A	1	38	28	66	18.6383345065733	14.2664903635776	4.37184414299574	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.324962923415472	ENSG00000166855:ENST00000300107:exon_65445885_65445977:CLPX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	65553246	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000138617:ENST00000261888:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000444347:exon_65553223_65553364:PARP16;ENSG00000138617:ENST00000432843:exon_65553223_65553364:PARP16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	65962190	A/G	1	17	17	34	8.33820227925648	8.66179772074352	-0.323595441487043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000174485:ENST00000431932:exon_65962117_65962263:DENND4A;ENSG00000174485:ENST00000308976:exon_65962117_65962263:DENND4A;ENSG00000174485:ENST00000443035:exon_65962117_65962263:DENND4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	66007805	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	66615250	A/G	1	1	8	9	0.490482487015087	4.0761401038793	-3.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0193172128390594	ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66615025_66615272:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000524795:exon_66615025_66615272:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66615025_66615272:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66615025_66615272:DIS3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	66618433	C/T	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	66629403	C/A	1	47	47	94	23.0526768897091	23.9473231102909	-0.894646220581819	A:T:C	C	A	10	0.509517512984913	0.917924007766987	ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	66793480	C/T	1	30	17	47	14.7144746104526	8.66179772074352	6.05267688970909	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0814819087737381	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	66838936	G/A	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000174442:ENST00000307897:exon_66838929_66839043:ZWILCH;ENSG00000174442:ENST00000446801:exon_66838929_66839043:ZWILCH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	68480086	A/G	1	52	45	97	25.5050893247845	22.9282880843211	2.57680124046344	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.61320920759994	ENSG00000033800:ENST00000249636:exon_68479880_68480402:PIAS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	68486353	T/C	1	26	40	66	12.7525446623923	20.3807005193965	-7.62815585700426	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0651081642980392	ENSG00000129007:ENST00000478113:exon_68483043_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000395465:exon_68483131_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000448060:exon_68484395_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000395463:exon_68486141_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467188:exon_68486142_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467889:exon_68486142_68486450:CALML4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	68492027	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000129007:ENST00000354678:exon_68491879_68492300:CALML4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	68492028	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000129007:ENST00000354678:exon_68491879_68492300:CALML4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	68504160	C/T	1	22	13	35	10.7906147143319	6.62372766880387	4.16688704552805	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.178202301062041	ENSG00000128973:ENST00000249806:exon_68504013_68504201:CLN6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	68582359	G/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68581945_68588203:FEM1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	69728949	A/G	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	69732736	C/T	1	18	9	27	8.82868476627157	4.58565761686422	4.24302714940735	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.123899416681013	ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	72502141	G/A	1	951	785	1736	466.448845151348	399.971247693157	66.4775974581911	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00140718543393665	ENSG00000067225:ENST00000319622:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000335181:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000419739:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000449901:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000438234:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000434220:exon_72502014_72502187:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000389093:exon_72502014_72502200:PKM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	73027478	T/C	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73027454_73027523:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73027454_73027523:BBS4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	73052840	T/C	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	73052845	A/G	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73052748_73052868:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73052748_73052868:ADPGK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	74328116	A/G	1	51	39	90	25.0146068377694	19.8711830064116	5.14342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.293116253873416	ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	74328141	G/T	1	42	46	88	20.6002644546337	23.437805597306	-2.83754114267234	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.594417946527115	ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	74703929	T/C	1	128	154	282	62.7817583379311	78.4656969996766	-15.6839386617455	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0648408901153624	ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	74709975	G/A	1	71	54	125	34.8242565780712	27.5139457011853	7.31031087688588	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.210519595031437	ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	74912388	G/A	1	21	21	42	10.3001322273168	10.6998677726832	-0.399735545366347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000179335:ENST00000345005:exon_74912350_74912566:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000483723:exon_74912350_74912566:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000395066:exon_74912350_74912566:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000454830:exon_74912350_74912566:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000352989:exon_74912350_74912566:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000348245:exon_74912350_74912566:CLK3;ENSG00000179335:ENST00000435375:exon_74912350_74912566:CLK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	74948110	T/C	1	17	12	29	8.33820227925648	6.11421015581896	2.22399212343752	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.460635236646915	ENSG00000179151:ENST00000315127:exon_74948074_74948409:EDC3;ENSG00000179151:ENST00000426797:exon_74948074_74948409:EDC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	75336729	A/G	1	22	10	32	10.7906147143319	5.09517512984913	5.69543958448278	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0514207061432888	ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	75499995	T/G	1	66	32	98	32.3718441429957	16.3045604155172	16.0672837274785	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.00115963347761059	ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	75503193	G/T	1	94	92	186	46.1053537794182	46.875611194612	-0.770257415193811	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.941594550077714	ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75503090_75504508:C15orf39
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	75932129	G/T	1	85	65	150	41.6910113962824	33.1186383440193	8.57237305226305	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.165878271496504	ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	77344793	T/A	1	41	57	98	20.1097819676186	29.04249824014	-8.93271627252147	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.0853820440947128	ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	78441769	T/C	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	78458638	C/T	1	76	78	154	37.2766690131466	39.7423660128232	-2.4656969996766	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.747280521333833	ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78458492_78458644:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78458492_78458644:IDH3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	79054773	G/A	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	G	G		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000136378:ENST00000258883:exon_79054745_79054907:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000388820:exon_79054745_79054907:ADAMTS7;ENSG00000136378:ENST00000438137:exon_79054745_79054907:ADAMTS7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	79224747	C/T	1	352	240	592	172.649835429311	122.284203116379	50.3656323129315	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	3.79029864885596e-05	ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	80137560	T/C	1	78	73	151	38.2576339871768	37.1947784478986	1.06285553927814	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.87109207907102	ENSG00000136371:ENST00000258874:exon_80137318_80137784:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000479961:exon_80137537_80137784:MTHFS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	80191488	C/T	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.258617102120622	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	80263111	C/A	1	424	485	909	207.964574494397	247.115993797683	-39.1514193032859	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0096484743771779	ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	80263217	C/T	1	526	372	898	257.993788169936	189.540514830388	68.4532733395482	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	4.68016309768801e-06	ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	81598783	G/A	1	117	100	217	57.3864509807652	50.9517512984913	6.43469968227388	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.415293129463575	ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598761_81598886:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598764_81598886:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598761_81598886:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598761_81598886:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598764_81598886:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598761_81598886:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598761_81598886:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598761_81598886:IL16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	82443939	G/A	1	27	15	42	13.2430271494074	7.64276269477369	5.60026445463366	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0908438841109536	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	82533686	T/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82533611_82533744:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82533611_82533744:EFTUD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	82533742	T/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82533611_82533744:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82533611_82533744:EFTUD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	89008072	T/G	1	52	54	106	25.5050893247845	27.5139457011853	-2.00885637640078	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.699028712647994	ENSG00000173867:ENST00000312475:exon_89007934_89008107:MRPL46;ENSG00000173867:ENST00000445432:exon_89007911_89008107:MRPL46
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	89008917	G/A	1	27	35	62	13.2430271494074	17.833112954472	-4.5900858050646	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.255266973393373	ENSG00000173867:ENST00000312475:exon_89008818_89009004:MRPL46;ENSG00000173867:ENST00000445432:exon_89008818_89009004:MRPL46
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	89010976	C/T	1	72	98	170	35.3147390650863	49.9327162725215	-14.6179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0260832774930325	ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89010684_89011013:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89010939_89011013:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000353598:exon_89010949_89011013:MRPS11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	89011226	G/C	1	82	52	134	40.2195639352371	26.4949106752155	13.7246532600217	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0194458942382394	ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89011139_89011255:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89011142_89011255:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000353598:exon_89011139_89011255:MRPS11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	89015930	T/C	1	148	190	338	72.5914080782329	96.8083274671335	-24.2169193889006	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00895558551585077	ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89015858_89015956:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89015858_89015956:MRPS11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90628591	G/A	1	63	46	109	30.9003966819505	23.437805597306	7.46259108464449	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.179605001846896	ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90628594	C/T	1	63	41	104	30.9003966819505	20.8902180323814	10.010178649569	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0503439997906272	ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90771722	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90774357	A/G	1	153	185	338	75.0438205133083	94.2607399022089	-19.2169193889006	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0386433101577833	ENSG00000185043:ENST00000328649:exon_90774327_90774445:CIB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90809628	A/C	1	36	38	74	17.6573695325431	19.3616654934267	-1.70429596088356	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.728074510388297	ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90808891_90809630:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90809520_90809630:NGRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90814944	A/G	1	88	60	148	43.1624588573277	30.5710507790948	12.5914080782329	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0399233526446533	ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90934057	G/A	1	27	26	53	13.2430271494074	13.2474553376077	-0.00442818820038759	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_90934006_90934105:IQGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90991863	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_90991805_90991968:IQGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	90996503	T/C	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_90996364_90996524:IQGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91010776	T/C	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91010682_91010824:IQGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91029318	A/G	1	30	24	54	14.7144746104526	12.2284203116379	2.4860542988147	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.586574359744793	ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91029262_91029364:IQGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91083353	G/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91354439	A/G	1	40	39	79	19.6192994806035	19.8711830064116	-0.251883525808125	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91354521	G/A	1	40	35	75	19.6192994806035	17.833112954472	1.78618652613153	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.729589140959435	ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91421399	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91421362_91421534:FURIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91428290	C/T	1	5	14	19	2.45241243507544	7.13324518178878	-4.68083274671335	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0382353432713789	ENSG00000182511:ENST00000416779:exon_91428267_91428402:FES;ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000470152:exon_91428267_91428643:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000481665:exon_91428267_91428759:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000452243:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000443697:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91428276_91428488:FES
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91430436	T/C	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91430417_91430600:FES;ENSG00000182511:ENST00000497945:exon_91430417_91430605:FES
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91435960	C/T	1	4	15	19	1.96192994806035	7.64276269477369	-5.68083274671335	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0105294628979665	ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91435937_91436055:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91435937_91436055:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91435937_91436055:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91435937_91436055:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91435937_91436055:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91435937_91436055:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91435937_91436055:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91435937_91436055:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91435937_91436055:FES
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91448626	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91448481_91448738:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91448481_91448738:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91448481_91448738:MAN2A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91454110	C/T	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91454077_91454191:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91454077_91454191:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91454077_91454191:MAN2A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91455321	C/T	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91455273_91455509:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91455273_91455509:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000430376:exon_91455273_91455509:MAN2A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	91459475	G/A	1	9	14	23	4.41434238313578	7.13324518178878	-2.718902798653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.300147215812102	ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91459353_91459486:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91459353_91459486:MAN2A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	93536197	C/T	1	42	24	66	20.6002644546337	12.2284203116379	8.37184414299574	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0481379502163813	ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	93567864	A/C	1	18	16	34	8.82868476627157	8.15228020775861	0.676404558512958	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.865000507651962	ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	100269781	G/A	1	10	12	22	4.90482487015087	6.11421015581896	-1.20938528566809	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.672962537607921	ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101110303	T/C	1	15	17	32	7.35723730522631	8.66179772074352	-1.30456041551722	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.724820906305913	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101113862	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101113950	A/G	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101169991	C/T	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000183475:ENST00000332783:exon_101169642_101170247:ASB7;ENSG00000183475:ENST00000343276:exon_101169642_101170414:ASB7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101464915	T/C	1	10	14	24	4.90482487015087	7.13324518178878	-2.22842031163791	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.417429937527804	ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101552312	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101552213_101552350:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101552213_101552350:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101552213_101552350:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101552213_101552350:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101552213_101552350:LRRK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101591923	A/G	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101605745	C/T	1	15	6	21	7.35723730522631	3.05710507790948	4.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0794791301761176	ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101608975	C/T	1	10	27	37	4.90482487015087	13.7569728505926	-8.85214798044178	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00455104044751332	ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101608876_101610315:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101608876_101610315:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101608876_101609053:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101608876_101609273:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101608876_101609273:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101608876_101610317:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101608876_101610308:LRRK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101718106	G/A	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101718190	C/T	1	5	11	16	2.45241243507544	5.60469264283404	-3.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.136942032485751	ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101718529	T/C	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	101718950	T/C	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	102182629	C/T	1	47	39	86	23.0526768897091	19.8711830064116	3.18149388329748	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.518833622893596	ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102182049_102182847:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102182051_102182847:TM2D3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	15	102182673	A/G	1	47	36	83	23.0526768897091	18.3426304674569	4.71004642225222	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.324165034094156	ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102182049_102182847:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102182051_102182847:TM2D3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	239186	G/A	1	94	87	181	46.1053537794182	44.3280236296874	1.77733014973075	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.823692552111339	ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_238968_240134:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000293872:exon_238968_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000426094:exon_238968_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_238970_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000490762:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000429378:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000468732:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000415507:exon_238992_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000464711:exon_239097_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000442701:exon_239114_239338:LUC7L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	348222	C/T	1	17	10	27	8.33820227925648	5.09517512984913	3.24302714940735	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.250108755096081	ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000481769:exon_347844_348251:AXIN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	396264	A/G	1	2	11	13	0.980964974030174	5.60469264283404	-4.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0114904474112339	ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	420220	G/A	1	106	113	219	51.9911436235992	57.5754789672952	-5.58433534369595	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.457971426284447	ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	427516	T/C	1	17	18	35	8.33820227925648	9.17131523372843	-0.833112954471956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.866252155786725	ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	449345	G/C	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	449659	G/A	1	118	133	251	57.8769334677803	67.7658292269934	-9.88889575921316	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.230313065519038	ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	570557	T/C	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	597266	C/G	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_596817_598287:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_596839_597901:SOLH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	597764	G/A	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_596817_598287:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_596839_597901:SOLH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	602313	C/A	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	624114	A/G	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000007541:ENST00000409527:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000409439:exon_624066_624592:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000422307:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000439574:exon_624066_624409:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000470411:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000420990:exon_624066_624763:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000443147:exon_624066_624763:PIGQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	633125	T/C	1	9	21	30	4.41434238313578	10.6998677726832	-6.28552538954739	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0272368818959994	ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	633353	T/C	1	18	21	39	8.82868476627157	10.6998677726832	-1.87118300641161	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.631727462430124	ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	633354	G/A	1	19	21	40	9.31916725328665	10.6998677726832	-1.38070051939652	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.752396006614917	ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	677629	T/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000197562:ENST00000248139:exon_677342_679272:RAB40C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	716038	G/A	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	718514	C/G	1	53	34	87	25.9955718117996	17.323595441487	8.67197637031257	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0683806879399621	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	720152	T/C	1	31	27	58	15.2049570974677	13.7569728505926	1.44798424687505	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.793115915436422	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720123_720175:RHOT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	720960	C/T	1	36	19	55	17.6573695325431	9.68083274671335	7.97653678582979	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0420899900678521	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	723010	C/T	1	43	38	81	21.0907469416487	19.3616654934267	1.72908144822205	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.739554694548267	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722928_723130:RHOT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	732049	T/C	1	176	175	351	86.3249177146553	89.1655647723598	-2.84064705770446	A:T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.789595887878472	ENSG00000103266:ENST00000219548:exon_732020_732076:STUB1;ENSG00000161999:ENST00000412368:exon_731667_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000454700:exon_731676_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000293882:exon_731676_732874:JMJD8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	836199	G/A	1	46	30	76	22.562194402694	15.2855253895474	7.27666901314661	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.108088897966262	ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	836342	G/A	1	33	22	55	16.1859220714979	11.2093852856681	4.97653678582978	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.224524905623429	ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	840378	A/G	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_840331_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000491530:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000426047:exon_840347_840399:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000484349:exon_840347_840399:CHTF18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	845819	A/G	1	21	16	37	10.3001322273168	8.15228020775861	2.14785201955822	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.514219390998328	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	846031	C/T	1	40	26	66	19.6192994806035	13.2474553376077	6.37184414299574	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.139194790724528	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845947_846077:CHTF18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	846738	C/T	1	30	41	71	14.7144746104526	20.8902180323814	-6.17574342192882	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.15503793693483	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_846717_846758:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_846615_846861:CHTF18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	918962	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_918944_919056:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_918944_919056:LMF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	920869	C/T	1	11	5	16	5.39530735716596	2.54758756492456	2.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.211441030609945	ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_920729_920882:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_920729_920882:LMF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1400108	C/T	1	98	102	200	48.0672837274785	51.9707863244611	-3.9035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.62069221752584	ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1400059_1400235:C16orf42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1400911	G/A	1	63	55	118	30.9003966819505	28.0234632141702	2.87693346778027	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.64553359528639	ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1400808_1401001:C16orf42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1502837	C/T	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1502756_1502894:CLCN7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1502857	C/T	0	13	0	13	6.37627233119613	0	6.37627233119613	C	C		10	0.509517512984913	0.000251063443073497	ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1502756_1502894:CLCN7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1502864	A/G	0	15	0	15	7.35723730522631	0	7.35723730522631	A	A		10	0.509517512984913	6.3368183847151e-05	ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1502756_1502894:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1502756_1502894:CLCN7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1544301	G/C	1	24	9	33	11.7715796883621	4.58565761686422	7.18592207149787	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0140792736659961	ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1544302	A/G	1	24	9	33	11.7715796883621	4.58565761686422	7.18592207149787	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0140792736659961	ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1547477	T/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1547362_1547509:TELO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1559838	T/C	1	27	22	49	13.2430271494074	11.2093852856681	2.03364186373926	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.57161404905055	ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1561126	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000187535:ENST00000397417:exon_1560428_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000426508:exon_1560431_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000458658:exon_1560431_1561151:IFT140;ENSG00000187535:ENST00000361339:exon_1560431_1561151:IFT140
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1814440	A/G	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1818503	G/C	1	36	13	49	17.6573695325431	6.62372766880387	11.0336418637393	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00153793322620048	ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1820992	T/A	1	138	95	233	67.686583208082	48.4041637335667	19.2824194745153	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.0126433820113430	ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1825289	C/T	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1825240_1825430:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1825042_1825409:EME2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1827836	T/C	1	36	26	62	17.6573695325431	13.2474553376077	4.40991419493539	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.309677322390736	ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1836796	C/A	1	61	54	115	29.9194317079203	27.5139457011853	2.40548600673501	A:C:G	C	A	10	0.509517512984913	0.709323732009578	ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	1838050	A/G	1	66	53	119	32.3718441429957	27.0044281882004	5.36741595479535	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.359427378350903	ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2009590	G/A	1	141	147	288	69.1580306691273	74.8990744087822	-5.74104373965494	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517045315234147	ENSG00000140990:ENST00000268668:exon_2009519_2009755:NDUFB10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2011430	A/G	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.289775626167224	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2012293	G/A	1	78	80	158	38.2576339871768	40.761401038793	-2.50376705161625	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.69174826404157	ENSG00000140988:ENST00000526586:exon_2012062_2012657:RPS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2012499	G/A	1	524	521	1045	257.012823195906	265.45862426514	-8.44580106923411	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.6205941081526	ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2012498_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526586:exon_2012062_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2012498_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2012498_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2012498_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2012498_2012698:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2012498_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2012498_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2012498_2012910:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2012498_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2012498_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2012375_2012910:RPS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2014489	T/C	1	938	302	1240	460.072572820152	153.874288921444	306.198283898708	T:C	T	C	10	0.509517512984913	4.24967668458991e-71	ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014450_2014582:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2014591	C/T	1	1121	315	1436	549.830867943912	160.498016590248	389.332851353665	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.36244629751132e-99	ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2025206	A/C	1	17	17	34	8.33820227925648	8.66179772074352	-0.323595441487043	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2025411	G/C	1	27	27	54	13.2430271494074	13.7569728505926	-0.5139457011853	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.892792650810575	ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2025602	A/G	1	37	34	71	18.1478520195582	17.323595441487	0.824256578071175	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.905714165851707	ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2026292	T/C	1	27	45	72	13.2430271494074	22.9282880843211	-9.68526093491374	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0248549259212122	ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026212_2026315:TBL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2026891	T/C	1	48	53	101	23.5431593767242	27.0044281882004	-3.46126881147621	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.55064336649416	ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026815_2026962:TBL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2027704	G/A	1	8	14	22	3.9238598961207	7.13324518178878	-3.20938528566809	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.203086029135577	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2028677	A/G	1	35	36	71	17.166887045528	18.3426304674569	-1.17574342192882	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.813063535432136	ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028553_2028751:TBL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2049003	A/T	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048966_2049122:ZNF598
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2105400	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2260567	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000182685:ENST00000328540:exon_2260523_2260651:C16orf79
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2285357	C/T	1	35	48	83	17.166887045528	24.4568406232758	-7.28995357774778	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.124177946695260	ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2294515	C/T	1	29	38	67	14.2239921234375	19.3616654934267	-5.13767336998917	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.223226636780026	ENSG00000167969:ENST00000301729:exon_2294407_2294553:DCI
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2313361	T/G	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.787003666689933	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2514705	G/A	1	17	13	30	8.33820227925648	6.62372766880387	1.71447461045261	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.586721038583829	ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2514523_2514964:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2514523_2514964:C16orf59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2578607	G/C	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2578453_2578719:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000413459:exon_2578453_2578719:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000429721:exon_2578453_2578719:AMDHD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2580912	T/C	1	14	26	40	6.86675481821122	13.2474553376077	-6.38070051939652	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0565460725064916	ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2581080	G/A	1	24	41	65	11.7715796883621	20.8902180323814	-9.11863834401935	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0254728870041746	ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2812890	A/G	1	56	55	111	27.4670192728449	28.0234632141702	-0.556443941325341	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.924678682971504	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2814162	G/A	1	65	80	145	31.8813616559807	40.761401038793	-8.88003938281238	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.157782717888688	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2815237	A/C	1	126	128	254	61.800793363901	65.2182416620689	-3.4174482981679	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.706605274506618	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2816943	C/G	1	161	127	288	78.967680409429	64.7087241490839	14.2589562603451	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0988678874198502	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2818280	T/G	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.455825155299284	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2819196	G/C	1	209	173	382	102.510839786153	88.1465297463899	14.3643100397632	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.151843788386896	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2818998_2819285:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2818998_2819285:SRRM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2821525	G/A	1	10	3	13	4.90482487015087	1.52855253895474	3.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0930441887974304	ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	2821544	C/G	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3076393	C/T	1	48	63	111	23.5431593767242	32.0996033180495	-8.55644394132534	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.107373761410649	ENSG00000131652:ENST00000253952:exon_3076366_3076414:THOC6;ENSG00000131652:ENST00000326266:exon_3076366_3076414:THOC6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3109032	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000008516:ENST00000336577:exon_3108828_3110727:MMP25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3117378	G/A	1	687	885	1572	336.961468579365	450.922998991648	-113.961530412283	A:G	G	A	10	0.509517512984913	9.69669533242849e-09	ENSG00000008517:ENST00000440815:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534507:exon_3117378_3117614:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382213:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000416912:exon_3117378_3117614:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382210:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396890:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000325568:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396887:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000531965:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000532086:exon_3117378_3117835:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529699:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529550:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000528163:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525643:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000526464:exon_3117378_3117650:IL32;ENSG00000008517:ENST00000533097:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000444393:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530890:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534748:exon_3117378_3117887:IL32;ENSG00000008517:ENST00000532247:exon_3117378_3118666:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525377:exon_3117378_3117614:IL32;ENSG00000008517:ENST00000008180:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525228:exon_3117378_3117416:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530538:exon_3117378_3117416:IL32
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3170188	C/T	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3433146	G/A	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000140987:ENST00000304926:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396852:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396846:exon_3432483_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000439568:exon_3433056_3433332:ZNF434
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3451936	C/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3451190_3452406:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3451420_3452406:ZNF174
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3534780	C/G	1	22	7	29	10.7906147143319	3.56662259089439	7.22399212343752	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.00845561148080782	ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3534700_3534855:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3534699_3535061:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3534699_3535083:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000421765:exon_3534691_3534926:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3534700_3534855:NAT15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3613924	C/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167984:ENST00000448023:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000301749:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000359128:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000419350:exon_3613010_3614759:NLRC3;ENSG00000167984:ENST00000324659:exon_3611703_3614613:NLRC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3707747	G/A	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	G	G		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3708137	C/T	1	185	146	331	90.7392600977911	74.3895568957973	16.3497032019938	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0784267458344087	ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3724465	G/C	1	75	100	175	36.7861865261315	50.9517512984913	-14.1655647723598	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0341989654576129	ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3727683	G/A	1	11	2	13	5.39530735716596	1.01903502596983	4.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0227648071906430	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	3824573	T/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3824570_3824694:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3824570_3824694:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3824570_3824694:CREBBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4407245	C/A	1	106	75	181	51.9911436235992	38.2138134738685	13.7773301497307	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0445370518094333	ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4407169_4407260:CORO7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4476089	T/C	1	22	20	42	10.7906147143319	10.1903502596983	0.600264454633654	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.878542192032311	ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4484396	A/T	1	21	18	39	10.3001322273168	9.17131523372843	1.12881699358839	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.750979189113534	ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4496973	T/A	1	24	18	42	11.7715796883621	9.17131523372843	2.60026445463365	A:T:C	T	A	10	0.509517512984913	0.444285661776372	ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4659770	C/T	1	22	16	38	10.7906147143319	8.15228020775861	2.63833450657331	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.420908759660315	ENSG00000153443:ENST00000283474:exon_4658885_4659984:FAM100A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4659825	C/T	1	21	14	35	10.3001322273168	7.13324518178878	3.16688704552804	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.313581243470769	ENSG00000153443:ENST00000283474:exon_4658885_4659984:FAM100A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4723451	A/G	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.293617974329767	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4747373	C/G	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747334_4747417:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747334_4747417:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747334_4747417:ANKS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4748033	C/G	1	19	7	26	9.31916725328665	3.56662259089439	5.75254466239226	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.029702627804958	ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747978_4748063:ANKS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4751045	C/T	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4751124	A/G	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4855279	A/G	1	63	58	121	30.9003966819505	29.552015753125	1.34838092882553	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.855856463178148	ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	4930100	C/T	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	5075449	G/C	1	15	7	22	7.35723730522631	3.56662259089439	3.79061471433191	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.135346882910936	ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	5075469	G/A	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.190933578495351	ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	5075542	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	5077379	C/G	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5077279_5077380:NAGPA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	5078913	G/A	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5078881_5079009:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5078881_5079009:NAGPA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	5139186	G/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	8729124	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	10525230	T/C	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10524468_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10524468_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10524452_10525312:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10524452_10525312:ATF7IP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	10574796	C/T	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	10574813	G/A	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.112356383277526	ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	10868997	G/A	1	11	3	14	5.39530735716596	1.52855253895474	3.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.057993110530478	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	10989551	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989526_10989621:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989526_10989621:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989526_10989621:CIITA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11002904	G/A	1	7	15	22	3.43337740910561	7.64276269477369	-4.20938528566809	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0881853706966197	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11002927	A/G	1	6	13	19	2.94289492209052	6.62372766880387	-3.68083274671335	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.109606452148716	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11016045	C/T	1	14	21	35	6.86675481821122	10.6998677726832	-3.83311295447196	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.236924406593258	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11016024_11016107:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11016024_11016107:CIITA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11017058	G/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11773662	C/G	1	86	93	179	42.1814938832975	47.3851287075969	-5.20363482429942	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.455232013515646	ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11781790	G/A	1	51	48	99	25.0146068377694	24.4568406232758	0.557766214493615	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.920323275374857	ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11781713_11781822:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11781713_11781822:TXNDC11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11845148	G/A	1	64	75	139	31.3908791689656	38.2138134738685	-6.82293430490291	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.27023648531669	ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11844442_11845362:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11844443_11845362:ZC3H7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11933760	G/A	1	332	355	687	162.840185689009	180.878717109644	-18.0385314206352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.169738736835533	ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11933552_11933842:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11933552_11933842:RSL1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	11945338	G/A	1	107	138	245	52.4816261106143	70.313416791918	-17.8317906813037	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0251573490719434	ENSG00000171490:ENST00000396503:exon_11945265_11945442:RSL1D1;ENSG00000171490:ENST00000355674:exon_11945265_11945401:RSL1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	12009781	G/A	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	12061677	G/C	1	301	308	609	147.635228591541	156.931393999353	-9.296165407812	A:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.465763000423225	ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	15102670	C/A	1	27	13	40	13.2430271494074	6.62372766880387	6.61929948060348	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0398714331376041	ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15102636_15102704:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15102636_15102704:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15102636_15102704:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15102636_15102704:PDXDC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	15116625	G/T	1	19	11	30	9.31916725328665	5.60469264283404	3.71447461045261	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.202937463755726	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	15126744	G/A	1	29	18	47	14.2239921234375	9.17131523372843	5.05267688970909	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.147272384019039	ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15126718_15126836:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15126718_15126836:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15126718_15126836:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15126718_15126836:PDXDC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	15128367	G/A	1	21	25	46	10.3001322273168	12.7379378246228	-2.437805597306	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.555812495792938	ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15128314_15128410:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15128314_15128410:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15128314_15128410:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15128314_15128410:PDXDC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	15793615	C/T	1	93	113	206	45.6148712924031	57.5754789672952	-11.9606076748921	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.108764010946298	ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	15818141	A/C	1	27	27	54	13.2430271494074	13.7569728505926	-0.5139457011853	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.892792650810575	ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	15818310	G/A	1	29	38	67	14.2239921234375	19.3616654934267	-5.13767336998917	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.223226636780026	ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	15818653	G/A	1	51	32	83	25.0146068377694	16.3045604155172	8.71004642225222	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0618670820361394	ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	16138322	T/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	16219729	C/T	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16219667_16219768:ABCC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	16225669	A/C	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16225646_16225792:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16225646_16225792:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16225646_16225792:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16225646_16225792:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16225646_16225792:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16225646_16225792:ABCC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	17228368	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000103489:ENST00000261381:exon_17228330_17228592:XYLT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	19554017	A/G	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19553943_19554082:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19553943_19554082:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19553943_19554082:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19553943_19554082:AC012621.2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	19680546	T/C	1	11	19	30	5.39530735716596	9.68083274671335	-4.28552538954739	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.144013561824245	ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	19726124	G/A	1	108	100	208	52.9721085976294	50.9517512984913	2.0203572991381	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.782039477176507	ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	20748331	C/A	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	20931480	G/A	1	43	13	56	21.0907469416487	6.62372766880387	14.4670192728449	A:G	G	A	10	0.509517512984913	8.54265650974718e-05	ENSG00000102897:ENST00000439021:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000412082:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000219168:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000396052:exon_20931444_20931536:LYRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	21272591	G/C	1	32	25	57	15.6954395844828	12.7379378246228	2.95750175985996	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.508124996976959	ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	24231449	C/T	1	163	170	333	79.9486453834592	86.6179772074352	-6.66933182397602	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.476470162582872	ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24231282_24231932:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	24572946	A/C	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24572933_24573036:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24572933_24573036:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24572933_24573036:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24572933_24573036:RBBP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	24583406	A/G	1	134	91	225	65.7246532600217	46.3660936816271	19.3585595783946	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0111315093760645	ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	24942272	T/A	1	72	75	147	35.3147390650863	38.2138134738685	-2.89907440878221	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.680174828538483	ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	24965975	C/G	1	24	21	45	11.7715796883621	10.6998677726832	1.07171191567891	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.767850096057718	ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24965924_24966051:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24965924_24966051:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24965924_24966051:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24965924_24966051:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24965924_24966051:ARHGAP17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28488944	G/T	1	21	23	44	10.3001322273168	11.718902798653	-1.41877057133617	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.763445474056447	ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28507858	G/A	1	5	15	20	2.45241243507544	7.64276269477369	-5.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0242916211695007	ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28508294	C/T	1	17	14	31	8.33820227925648	7.13324518178878	1.2049570974677	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.721617530563431	ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28601458	C/A	1	14	15	29	6.86675481821122	7.64276269477369	-0.776007876562477	A:T:C	C	A	10	0.509517512984913	0.853530678106061	ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28601417_28601546:CCDC101
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28844448	C/A	1	85	77	162	41.6910113962824	39.2328484998383	2.4581628964441	A:T:C	C	A	10	0.509517512984913	0.753392208297686	ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28844380_28844675:ATXN2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28845448	G/A	1	75	85	160	36.7861865261315	43.3089886037176	-6.52280207758608	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.30531074868575	ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28845386_28845532:ATXN2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28925731	G/A	1	35	20	55	17.166887045528	10.1903502596983	6.97653678582979	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0786153503126945	ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28925557_28925907:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28925557_28925907:RABEP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28936427	C/A	1	17	15	32	8.33820227925648	7.64276269477369	0.695439584482783	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.860859198749914	ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28936424_28937073:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28936424_28937073:RABEP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28962341	G/A	1	23	28	51	11.281097201347	14.2664903635776	-2.98539316223056	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.484144797696808	ENSG00000176953:ENST00000426355:exon_28962313_28962719:NFATC2IP;ENSG00000176953:ENST00000320805:exon_28962315_28962719:NFATC2IP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28962401	C/T	1	56	42	98	27.4670192728449	21.3997355453663	6.06728372747853	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.226989080261441	ENSG00000176953:ENST00000426355:exon_28962313_28962719:NFATC2IP;ENSG00000176953:ENST00000320805:exon_28962315_28962719:NFATC2IP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28986542	A/G	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000334536:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000352260:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28986422_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28986509_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000434933:exon_28986122_28986713:SPNS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	28990425	G/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	29675507	C/T	1	212	197	409	103.982287247198	100.374950058028	3.60733718917058	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.729451407088844	ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	29811319	C/T	1	66	65	131	32.3718441429957	33.1186383440193	-0.746794201023604	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.93047137000804	ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29811234_29811369:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29811234_29811369:KIF22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	29814234	G/A	1	77	61	138	37.7671515001617	31.0805682920797	6.68658320808201	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.269008534161995	ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29814090_29814258:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29814090_29814258:KIF22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	29819009	C/T	1	113	116	229	55.4245210327048	59.1040315062499	-3.67951047354508	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.643986356722175	ENSG00000103495:ENST00000322945:exon_29818299_29819149:MAZ;ENSG00000103495:ENST00000219782:exon_29818299_29819149:MAZ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	29819173	C/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	29979430	T/C	1	82	105	187	40.2195639352371	53.4993388634159	-13.2797749281787	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0570572253635858	ENSG00000149932:ENST00000414689:exon_29979346_29979575:TMEM219;ENSG00000149932:ENST00000279396:exon_29979346_29979575:TMEM219
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	29999225	G/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30004800	G/A	1	17	13	30	8.33820227925648	6.62372766880387	1.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.586721038583829	ENSG00000149929:ENST00000279392:exon_30004780_30004878:HIRIP3;ENSG00000149929:ENST00000352552:exon_30004780_30004878:HIRIP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30116302	G/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000102886:ENST00000406256:exon_30116131_30116330:GDPD3;ENSG00000102886:ENST00000360688:exon_30116132_30116330:GDPD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30390513	G/A	1	13	5	18	6.37627233119613	2.54758756492456	3.82868476627157	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0973301160077784	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30408765	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000528032:exon_30408651_30409012:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000524644:exon_30408651_30409001:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30435802	G/A	1	288	289	577	141.258956260345	147.25056125264	-5.99160499229478	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.617658947586299	ENSG00000179958:ENST00000319285:exon_30435019_30435854:DCTPP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30456782	C/T	1	20	21	41	9.80964974030174	10.6998677726832	-0.890218032381433	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.876185377477144	ENSG00000179918:ENST00000478753:exon_30454952_30457186:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000418751:exon_30454960_30456787:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000500504:exon_30455702_30457048:SEPHS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30495496	C/T	1	21	16	37	10.3001322273168	8.15228020775861	2.14785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.514219390998328	ENSG00000005844:ENST00000358164:exon_30495434_30495584:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000356798:exon_30495434_30495584:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000315171:exon_30495434_30495584:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000454514:exon_30495434_30495584:ITGAL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30516565	C/A	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000005844:ENST00000356798:exon_30516565_30516621:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000454514:exon_30516565_30516621:ITGAL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30522267	C/T	1	21	21	42	10.3001322273168	10.6998677726832	-0.399735545366347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000005844:ENST00000358164:exon_30522202_30522281:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000356798:exon_30522202_30522281:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000433423:exon_30522214_30522281:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000315171:exon_30522202_30522281:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000454514:exon_30522202_30522281:ITGAL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30536918	C/G	1	24	33	57	11.7715796883621	16.8140779285021	-5.04249824014004	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.187945322206216	ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30666119	G/C	1	28	9	37	13.7335096364224	4.58565761686422	9.14785201955822	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00272959213754250	ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30666480	A/G	1	49	60	109	24.0336418637393	30.5710507790948	-6.53740891535552	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.214555409233539	ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30715519	C/G	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000080603:ENST00000262518:exon_30715385_30715636:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000395059:exon_30715385_30715636:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000344771:exon_30715385_30715636:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000437252:exon_30715385_30715636:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000380361:exon_30715388_30715636:SRCAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30734934	A/G	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000080603:ENST00000262518:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000395059:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000344771:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000437252:exon_30734905_30736478:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000380361:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000483083:exon_30734905_30736689:SRCAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30773822	T/C	1	17	22	39	8.33820227925648	11.2093852856681	-2.87118300641161	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.423991835898429	ENSG00000103549:ENST00000324685:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000357890:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000380329:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000452273:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000402121:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000493683:exon_30773796_30773998:RNF40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30783466	C/T	1	60	44	104	29.4289492209052	22.4187705713362	7.01017864956905	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171433228774737	ENSG00000103549:ENST00000324685:exon_30783410_30783511:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000357890:exon_30783410_30783511:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000380329:exon_30783410_30783511:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000402121:exon_30783410_30783610:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000493683:exon_30783410_30783511:RNF40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30785254	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30980777	G/A	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000099381:ENST00000262519:exon_30980626_30980783:SETD1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	30992113	C/T	1	13	11	24	6.37627233119613	5.60469264283404	0.771579688362088	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.83951915689104	ENSG00000099381:ENST00000262519:exon_30992060_30992170:SETD1A;ENSG00000099381:ENST00000476837:exon_30992060_30992170:SETD1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	31073244	C/A	1	22	7	29	10.7906147143319	3.56662259089439	7.22399212343752	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.00845561148080782	ENSG00000232748:ENST00000417110:exon_31070902_31073948:AC135050.1;ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31072171_31073601:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31072171_31073601:ZNF668
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	31075364	G/A	1	13	6	19	6.37627233119613	3.05710507790948	3.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.168530333768717	ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	31075439	G/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	31093008	C/T	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	31193994	T/C	1	12	5	17	5.88578984418104	2.54758756492456	3.33820227925648	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.144694391340598	ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	31382464	G/C	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31382405_31382535:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31382405_31382535:ITGAX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	31504944	C/T	1	20	22	42	9.80964974030174	11.2093852856681	-1.39973554536635	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.758105820276018	ENSG00000140688:ENST00000327237:exon_31504924_31505108:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000452223:exon_31504924_31505108:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000430477:exon_31504871_31505108:C16orf58
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	31926142	A/G	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000185947:ENST00000300870:exon_31925797_31928622:ZNF267;ENSG00000185947:ENST00000394846:exon_31925797_31928622:ZNF267
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	47117344	A/T	1	31	31	62	15.2049570974677	15.7950429025323	-0.590085805064604	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.89957047184722	ENSG00000171208:ENST00000303155:exon_47115548_47117712:NETO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	47345182	C/T	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000129636:ENST00000320640:exon_47345151_47345323:ITFG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	48594916	T/C	1	21	21	42	10.3001322273168	10.6998677726832	-0.399735545366347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000102921:ENST00000262384:exon_48594665_48596355:N4BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	50349326	T/C	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000121281:ENST00000394697:exon_50349270_50352046:ADCY7;ENSG00000121281:ENST00000254235:exon_50349270_50352035:ADCY7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	50353831	C/T	1	52	77	129	25.5050893247845	39.2328484998383	-13.7277591750538	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0172212965852935	ENSG00000166164:ENST00000394688:exon_50353798_50353941:BRD7;ENSG00000166164:ENST00000394689:exon_50353798_50353941:BRD7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	50707782	C/T	1	16	3	19	7.84771979224139	1.52855253895474	6.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00455398270631113	ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50705536_50707985:SNX20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	50709792	C/T	1	15	6	21	7.35723730522631	3.05710507790948	4.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0794791301761176	ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50709681_50709832:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50709681_50709832:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50709681_50709832:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50709681_50709832:SNX20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	50745610	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	56396486	C/T	1	63	59	122	30.9003966819505	30.0615332661099	0.838863415840617	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.927931856676733	ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	56857753	G/A	1	19	18	37	9.31916725328665	9.17131523372843	0.14785201955822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56857619_56857758:NUP93
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	56970592	T/G	1	14	18	32	6.86675481821122	9.17131523372843	-2.30456041551722	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.480992424821392	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	56973132	T/C	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.842754230648848	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	57067595	A/T	1	11	5	16	5.39530735716596	2.54758756492456	2.84771979224139	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.211441030609945	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	57447859	G/T	1	15	10	25	7.35723730522631	5.09517512984913	2.26206217537718	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.426470603476087	ENSG00000102970:ENST00000219244:exon_57447786_57447914:CCL17;ENSG00000102970:ENST00000454860:exon_57447781_57447914:CCL17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	57552088	T/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57551980_57552189:CCDC102A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	57555076	C/T	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57554980_57555088:CCDC102A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	57595999	A/G	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57595968_57596069:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57595968_57596069:GPR114
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	57604429	G/C	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57604330_57604447:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57604330_57604447:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57604330_57604447:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57604330_57604447:GPR114
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	57608955	C/T	1	25	30	55	12.2620621753772	15.2855253895474	-3.02346321417022	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.422356697219694	ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	57789288	T/C	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57789257_57789406:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57789257_57789406:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57789257_57789406:KATNB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58030401	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000166188:ENST00000299237:exon_58028573_58032426:ZNF319
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58296392	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000103021:ENST00000443128:exon_58296289_58296444:CCDC113;ENSG00000103021:ENST00000219299:exon_58296289_58296444:CCDC113
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58314598	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000103021:ENST00000443128:exon_58313595_58317732:CCDC113;ENSG00000103021:ENST00000219299:exon_58313595_58317740:CCDC113;ENSG00000103023:ENST00000219301:exon_58313901_58314661:PRSS54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58549932	T/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58549695_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000470003:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000492050:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000468223:exon_58549434_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58549857_58550001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58549695_58550001:SETD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58552921	G/A	1	28	28	56	13.7335096364224	14.2664903635776	-0.532980727155127	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.894610793773664	ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58575489	G/A	1	23	16	39	11.281097201347	8.15228020775861	3.12881699358839	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.340205720200898	ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58587737	C/T	1	4	12	16	1.96192994806035	6.11421015581896	-4.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0454122101177686	ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58587686_58587764:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58587686_58587764:CNOT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58743366	G/A	1	36	42	78	17.6573695325431	21.3997355453663	-3.74236601282322	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.428859239470734	ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58750668	C/T	1	37	14	51	18.1478520195582	7.13324518178878	11.0146068377694	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0019402345595532	ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	58752466	C/T	1	47	27	74	23.0526768897091	13.7569728505926	9.29570403911644	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0358485889857785	ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58752431_58752588:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58752121_58752592:GOT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67214346	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67213944_67214569:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000394016:exon_67213944_67214569:KIAA0895L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67262775	C/T	1	97	80	177	47.5768012404634	40.761401038793	6.8154002016704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.328623290662014	ENSG00000168701:ENST00000304800:exon_67262700_67262784:TMEM208;ENSG00000168701:ENST00000404299:exon_67262741_67262784:TMEM208
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67264629	C/T	1	16	24	40	7.84771979224139	12.2284203116379	-4.38070051939652	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.205573186077484	ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67264504_67264694:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67264504_67264694:FHOD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67265360	C/A	1	35	33	68	17.166887045528	16.8140779285021	0.352809117025917	A:C:G	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67304915	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000135740:ENST00000299798:exon_67304641_67306093:SLC9A5;ENSG00000135740:ENST00000360183:exon_67304641_67304969:SLC9A5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67304990	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000135740:ENST00000299798:exon_67304641_67306093:SLC9A5;ENSG00000135740:ENST00000360183:exon_67304974_67305195:SLC9A5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67911517	T/C	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.264915529576399	ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67964361	G/A	1	6	13	19	2.94289492209052	6.62372766880387	-3.68083274671335	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.109606452148716	ENSG00000141086:ENST00000319955:exon_67964311_67964491:CTRL;ENSG00000141086:ENST00000432773:exon_67964311_67964491:CTRL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	67969930	A/G	1	246	242	488	120.658691805711	123.303238142349	-2.64454633663755	A:T:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.821020461271735	ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	68026126	T/C	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	68331194	T/C	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000103064:ENST00000219343:exon_68331137_68335722:SLC7A6;ENSG00000103064:ENST00000379152:exon_68331137_68335722:SLC7A6;ENSG00000103064:ENST00000433073:exon_68331137_68335722:SLC7A6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	68344696	C/T	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	68344760	C/T	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	68390697	C/T	1	50	54	104	24.5241243507543	27.5139457011853	-2.98982135043095	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.624080255765354	ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68390604_68390700:PRMT7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	68961901	C/G	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_68961471_68961986:TMCO7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69350012	C/T	1	30	40	70	14.7144746104526	20.3807005193965	-5.66622590894391	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.189509594965503	ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69349911_69350022:VPS4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69354658	G/A	1	88	80	168	43.1624588573277	40.761401038793	2.40105781853462	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.757716989239083	ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354591_69354672:VPS4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69354682	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69355155	G/A	1	59	71	130	28.9384667338901	36.1757434219288	-7.23727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.219731685475151	ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69356612	C/G	1	19	13	32	9.31916725328665	6.62372766880387	2.69543958448279	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.379864034731394	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69364030	G/A	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000213380:ENST00000288022:exon_69363900_69364498:COG8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69369240	G/A	1	14	22	36	6.86675481821122	11.2093852856681	-4.34263046745687	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.182149373957225	ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69368424_69369251:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69368424_69369251:COG8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69373414	T/C	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69373079_69373513:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69373079_69373460:COG8;ENSG00000132603:ENST00000254940:exon_69373343_69373788:NIP7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69400802	G/A	1	15	24	39	7.35723730522631	12.2284203116379	-4.87118300641161	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.148872323082175	ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69400710_69401102:TERF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	69402305	C/T	1	17	23	40	8.33820227925648	11.718902798653	-3.38070051939652	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.343130626071081	ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69402279_69402385:TERF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	70164334	A/G	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70164326_70164447:PDPR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	70190401	C/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	70303580	G/A	1	88	80	168	43.1624588573277	40.761401038793	2.40105781853462	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.757716989239083	ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	70316603	C/T	1	89	94	183	43.6529413443427	47.8946462205818	-4.24170487623908	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.554584068602527	ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70316523_70316687:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70316523_70316687:AARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	70422263	A/G	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.171917444065472	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	70509610	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70509551_70509670:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70509551_70509670:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70509551_70509670:FUK;ENSG00000157353:ENST00000498702:exon_70509551_70509670:FUK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	70515355	C/T	1	17	28	45	8.33820227925648	14.2664903635776	-5.92828808432109	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0999937632990255	ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	71483497	C/G	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167377:ENST00000393539:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000497160:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000357254:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000417828:exon_71481513_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000428724:exon_71481513_71483788:ZNF23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	71894390	T/C	1	18	14	32	8.82868476627157	7.13324518178878	1.69543958448278	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.598757235104772	ENSG00000102984:ENST00000446827:exon_71893589_71894575:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000425432:exon_71893589_71894575:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000313565:exon_71893589_71894575:ZNF821
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72042682	A/C	1	4	14	18	1.96192994806035	7.13324518178878	-5.17131523372843	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0173423926517503	ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72042643_72042684:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72042643_72042684:DHODH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72130203	C/G	1	29	25	54	14.2239921234375	12.7379378246228	1.4860542988147	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.785768149186664	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72130815	C/A	1	12	21	33	5.88578984418104	10.6998677726832	-4.81407792850213	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.116534180786067	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72134987	G/A	1	18	17	35	8.82868476627157	8.66179772074352	0.166887045528044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72135014	T/C	1	8	18	26	3.9238598961207	9.17131523372843	-5.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0488563641808063	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72137561	G/A	1	18	20	38	8.82868476627157	10.1903502596983	-1.36166549342669	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.746270992340417	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72139184	C/A	1	36	27	63	17.6573695325431	13.7569728505926	3.90039668195048	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.37806004523494	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72142806	G/A	1	27	36	63	13.2430271494074	18.3426304674569	-5.09960331804952	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.209546228212232	ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72142699_72142824:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72142699_72142824:DHX38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	72156842	T/G	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	T	T		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000118557:ENST00000237353:exon_72156813_72156887:PMFBP1;ENSG00000118557:ENST00000355636:exon_72156813_72156887:PMFBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	74425569	C/T	0	49	0	49	24.0336418637393	0	24.0336418637393	C	C		10	0.509517512984913	5.16774804956763e-15	ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	74537591	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74537429_74537644:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74537429_74537644:GLG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	75018874	G/A	1	15	16	31	7.35723730522631	8.15228020775861	-0.795042902532303	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.858159256514081	ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_75018862_75019017:WDR59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	75269095	C/T	1	18	18	36	8.82868476627157	9.17131523372843	-0.342630467456868	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	75276775	G/A	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75276368_75276988:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75276368_75276988:BCAR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	75481411	G/T	1	23	11	34	11.281097201347	5.60469264283404	5.67640455851296	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0591403634455354	ENSG00000166822:ENST00000357613:exon_75476952_75481586:TMEM170A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	75646508	T/C	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	81047748	G/A	1	48	42	90	23.5431593767242	21.3997355453663	2.14342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.67437967458792	ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81047741_81047786:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81047741_81047786:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81047741_81047786:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81047741_81047786:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81047741_81047786:CENPN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	81056441	T/G	1	6	13	19	2.94289492209052	6.62372766880387	-3.68083274671335	A:T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.109606452148716	ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	81077241	A/G	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	81077384	T/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	81078081	A/G	1	21	25	46	10.3001322273168	12.7379378246228	-2.437805597306	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.555812495792938	ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	83933193	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83932730_83933277:MLYCD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	83945953	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83945823_83945972:MLYCD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	84088047	C/T	1	31	31	62	15.2049570974677	15.7950429025323	-0.590085805064604	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.89957047184722	ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	84115483	G/A	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84115352_84115513:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84115352_84115513:MBTPS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	84212779	G/A	1	14	29	43	6.86675481821122	14.7760078765625	-7.90925305835126	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0210894856054386	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	84212853	G/C	1	21	26	47	10.3001322273168	13.2474553376077	-2.94732311029091	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.466153003590598	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	84212928	G/A	1	29	28	57	14.2239921234375	14.2664903635776	-0.0424982401400413	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	84213876	C/T	1	17	11	28	8.33820227925648	5.60469264283404	2.73350963642244	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.347388221006843	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84213776_84213950:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84213776_84213950:TAF1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	84215390	T/C	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84215352_84215664:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84215352_84215469:TAF1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	84531562	G/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84531540_84531717:KIAA1609
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	86565874	C/A	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88052161	C/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88061150	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88061089_88061256:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88061089_88061256:BANP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88066717	C/T	1	8	13	21	3.9238598961207	6.62372766880387	-2.69986777268317	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.278819956820526	ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88690393	C/A	1	12	15	27	5.88578984418104	7.64276269477369	-1.75697285059265	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.566049825319431	ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88690366_88690470:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88690366_88690470:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88690366_88690470:ZC3H18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88767769	G/C	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88767670_88767826:RNF166
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88776660	G/A	1	22	14	36	10.7906147143319	7.13324518178878	3.65736953254313	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.246062466304874	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88776631_88776690:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88776631_88776690:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88776631_88776690:CTU2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88779739	A/G	1	21	28	49	10.3001322273168	14.2664903635776	-3.96635813626074	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.317257767547375	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88781040	A/G	1	36	24	60	17.6573695325431	12.2284203116379	5.42894922090522	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.196302506642594	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88781614	G/C	1	24	23	47	11.7715796883621	11.718902798653	0.0526768897090903	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88871253	G/A	1	15	20	35	7.35723730522631	10.1903502596983	-2.83311295447195	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.398982697637708	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871170_88871306:CDT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88871908	A/G	1	17	17	34	8.33820227925648	8.66179772074352	-0.323595441487043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88873780	A/C	1	18	19	37	8.82868476627157	9.68083274671335	-0.85214798044178	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.869819021756582	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873689_88873890:CDT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88874655	C/T	1	34	12	46	16.676404558513	6.11421015581896	10.562194402694	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00178587527251205	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88874692	G/C	1	59	37	96	28.9384667338901	18.8521479804418	10.0863187534484	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0413432346643501	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88876103	T/C	1	416	391	807	204.040714598276	199.221347577101	4.81936702117522	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.751384221581576	ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88884466	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000141012:ENST00000268695:exon_88884415_88884532:GALNS;ENSG00000141012:ENST00000439266:exon_88884415_88884532:GALNS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88958850	T/C	1	10	17	27	4.90482487015087	8.66179772074352	-3.75697285059265	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.178644105608033	ENSG00000129993:ENST00000327483:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268679:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268683:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000448839:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000436887:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000360302:exon_88958652_88958893:CBFA2T3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	88968048	T/C	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000129993:ENST00000327483:exon_88967912_88968064:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268679:exon_88967912_88968064:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268683:exon_88967912_88968064:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000436887:exon_88967912_88968064:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000360302:exon_88967912_88968064:CBFA2T3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89167476	T/C	1	18	20	38	8.82868476627157	10.1903502596983	-1.36166549342669	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.746270992340417	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89294184	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89347397	G/A	1	20	7	27	9.80964974030174	3.56662259089439	6.24302714940735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0197338258149335	ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89347537	C/T	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89350038	G/A	1	63	46	109	30.9003966819505	23.437805597306	7.46259108464449	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.179605001846896	ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89627671	C/T	1	3264	3570	6834	1600.93483761724	1818.97752135614	-218.042683738895	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	1.40434308650750e-07	ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89724027	G/A	1	26	23	49	12.7525446623923	11.718902798653	1.03364186373926	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.777394223546101	ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89723990_89724129:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89723990_89724129:CHMP1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89760552	T/C	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000185324:ENST00000472018:exon_89759682_89760640:CDK10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89764696	G/A	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L;ENSG00000158792:ENST00000335360:exon_89764603_89764713:SPATA2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89789898	T/C	1	15	10	25	7.35723730522631	5.09517512984913	2.26206217537718	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.426470603476087	ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89805977	G/A	1	25	29	54	12.2620621753772	14.7760078765625	-2.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500139310571228	ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89836323	C/T	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89866043	T/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89866013_89866046:FANCA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89877371	G/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89877337_89877479:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89877337_89877479:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89877337_89877479:FANCA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89940232	A/C	1	133	155	288	65.2341707730066	78.9752145126615	-13.7410437396549	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.111553032931199	ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89939970_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000310554:exon_89940019_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89940019_89940267:TCF25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	16	89967217	T/C	1	18	14	32	8.82868476627157	7.13324518178878	1.69543958448278	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.598757235104772	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	648186	G/A	1	87	63	150	42.6719763703126	32.0996033180495	10.5723730522631	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0867839062595161	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	649067	A/G	1	19	30	49	9.31916725328665	15.2855253895474	-5.96635813626074	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.115119948295916	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	649239	C/T	1	39	33	72	19.1288169935884	16.8140779285021	2.31473906508626	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.637950674924835	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	649547	G/C	1	25	17	42	12.2620621753772	8.66179772074352	3.60026445463365	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.283619813190237	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	674575	G/A	1	90	74	164	44.1434238313578	37.7042959608836	6.43912787047427	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.348707601715089	ENSG00000167699:ENST00000301329:exon_674565_674701:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_674565_674701:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000301328:exon_674565_674701:GLOD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	900476	C/T	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000177370:ENST00000327158:exon_900357_900620:TIMM22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	902110	T/G	1	26	18	44	12.7525446623923	9.17131523372843	3.58122942866383	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.295065363445801	ENSG00000177370:ENST00000327158:exon_902019_902215:TIMM22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	995088	G/A	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_994905_995090:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_994905_995090:ABR;ENSG00000159842:ENST00000382259:exon_994905_995090:ABR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1370542	C/A	1	129	131	260	63.2722408249462	66.7467942010236	-3.47455337607738	A:T:C:G	C	A	10	0.509517512984913	0.709842503693654	ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1377943	A/G	1	54	36	90	26.4860542988147	18.3426304674569	8.14342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.091999682768226	ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1377904_1377984:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1377904_1377984:MYO1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1437435	G/A	1	83	65	148	40.7100464222522	33.1186383440193	7.59140807823287	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.218423780419487	ENSG00000174238:ENST00000313486:exon_1437393_1437515:PITPNA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1494567	G/A	1	24	31	55	11.7715796883621	15.7950429025323	-4.02346321417021	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.284379944811137	ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1538302	C/A	1	54	49	103	26.4860542988147	24.9663581362607	1.51969616255396	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.768706502410667	ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1538546	C/T	1	37	38	75	18.1478520195582	19.3616654934267	-1.21381347386847	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.817883889396564	ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1542153	G/A	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1542100_1542220:SCARF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1542190	G/A	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1542100_1542220:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1542100_1542220:SCARF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1554770	A/G	1	183	210	393	89.7582951237609	106.998677726832	-17.2403826030708	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0862529891296995	ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1554708_1554847:PRPF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1578939	C/T	1	19	12	31	9.31916725328665	6.11421015581896	3.2049570974677	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.283751645573885	ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1578914_1579106:PRPF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1579270	C/T	1	16	18	34	7.84771979224139	9.17131523372843	-1.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.732552886508093	ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1579222_1579348:PRPF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1585551	G/A	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1585423_1585587:PRPF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1636950	C/A	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000418841:exon_1636821_1636973:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1637074	A/G	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1637164	C/T	1	13	19	32	6.37627233119613	9.68083274671335	-3.30456041551721	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289722368345706	ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1637458	G/A	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1640793	C/T	1	26	14	40	12.7525446623923	7.13324518178878	5.61929948060348	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0828780684568382	ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1684575	G/A	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1704178	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1795180	T/C	1	28	42	70	13.7335096364224	21.3997355453663	-7.66622590894391	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0731084931765937	ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	1940289	T/C	1	4	12	16	1.96192994806035	6.11421015581896	-4.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0454122101177686	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	2186100	C/T	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	2202943	T/C	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	2203167	T/G	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	2203221	T/C	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	2203356	C/G	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	2203453	A/G	1	13	4	17	6.37627233119613	2.03807005193965	4.33820227925648	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0497263576814836	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	2291158	G/A	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000070444:ENST00000174618:exon_2291151_2291343:MNT;ENSG00000070444:ENST00000404961:exon_2291151_2291343:MNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3802853	A/G	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.726958585521877	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3845927	A/G	1	17	18	35	8.33820227925648	9.17131523372843	-0.833112954471956	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.866252155786725	ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3846802	A/G	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3846685_3846816:ATP2A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3848013	A/C	1	13	12	25	6.37627233119613	6.11421015581896	0.262062175377175	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3912964	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3912898_3913051:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3912802_3913051:ZZEF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3916823	G/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3916743_3916908:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3916743_3916908:ZZEF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3920884	C/T	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3920665_3921024:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3920665_3921024:ZZEF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3920977	C/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3920665_3921024:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3920665_3921024:ZZEF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3926110	C/G	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3926003_3926122:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3925940_3926122:ZZEF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	3947533	G/A	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3947518_3947668:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3947518_3947668:ZZEF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4391132	C/T	1	1	8	9	0.490482487015087	4.0761401038793	-3.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0193172128390594	ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4391153	A/G	0	0	8	8	0	4.0761401038793	-4.0761401038793	G	A	G	10	0.509517512984913	0.00334956216154465	ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4391201	A/G	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4448590	C/T	1	59	49	108	28.9384667338901	24.9663581362607	3.9721085976294	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500698479657131	ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4448554_4448640:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4448554_4448640:MYBBP1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4448940	G/A	1	41	53	94	20.1097819676186	27.0044281882004	-6.89464622058182	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.179680784209998	ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4448905_4449056:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4448905_4449056:MYBBP1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4622638	C/T	1	43	24	67	21.0907469416487	12.2284203116379	8.86232663001083	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0370817968512117	ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4624340	G/A	1	41	43	84	20.1097819676186	21.9092530583513	-1.79947109073269	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.74381291441874	ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4624241_4624795:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4624241_4624794:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4624241_4624794:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4624241_4624794:ARRB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4836381	C/T	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000185245:ENST00000438881:exon_4835894_4837179:GP1BA;ENSG00000185245:ENST00000329125:exon_4835900_4837150:GP1BA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	4857098	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4857007_4857520:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000517627:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519584:exon_4857007_4857140:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4857007_4857140:ENO3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5126674	A/G	1	79	88	167	38.7481164741919	44.8375411426723	-6.08942466848047	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.353988312066738	ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5241493	C/G	1	26	25	51	12.7525446623923	12.7379378246228	0.0146068377694366	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5286525	C/G	1	17	19	36	8.33820227925648	9.68083274671335	-1.34263046745687	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.739677666199833	ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5286417_5286720:RABEP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5326089	C/T	1	160	136	296	78.4771979224139	69.2943817659482	9.18281615646575	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.295696206885774	ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5326145	C/G	1	153	138	291	75.0438205133083	70.313416791918	4.73040372139033	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.597988641968195	ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5326178	C/T	0	9	0	9	4.41434238313578	0	4.41434238313578	C	C		10	0.509517512984913	0.00395726759981203	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5392161	C/T	1	12	17	29	5.88578984418104	8.66179772074352	-2.77600787656248	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.354875496158188	ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5392173	A/C	1	16	10	26	7.84771979224139	5.09517512984913	2.75254466239226	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.329230577261424	ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	5461871	A/G	1	15	19	34	7.35723730522631	9.68083274671335	-2.32359544148704	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.493953241174159	ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5461659_5463363:NLRP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	6661554	G/A	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.535123382758391	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	6663753	A/G	1	20	15	35	9.80964974030174	7.64276269477369	2.16688704552805	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.502292925561721	ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	6902179	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	6919093	T/C	1	300	310	610	147.144746104526	157.950429025323	-10.8056829207969	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.395164192842449	ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	6942108	C/T	1	13	8	21	6.37627233119613	4.0761401038793	2.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.385136200083102	ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6941471_6942208:SLC16A13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7124115	A/G	1	132	129	261	64.7436882859915	65.7277591750538	-0.984070889062295	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.950650531915733	ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7124085_7124149:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7124085_7124149:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7124085_7124149:ACADVL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7129840	T/C	1	20	11	31	9.80964974030174	5.60469264283404	4.2049570974677	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.151896927870573	ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7133162	G/A	1	17	9	26	8.33820227925648	4.58565761686422	3.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.170643616094001	ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7216763	C/T	1	70	60	130	34.3337740910561	30.5710507790948	3.76272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.539720790052901	ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216699_7216788:GPS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7222471	G/A	1	14	13	27	6.86675481821122	6.62372766880387	0.243027149407349	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7222369_7222527:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7222369_7222527:NEURL4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7293715	C/T	1	32	40	72	15.6954395844828	20.3807005193965	-4.68526093491374	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289969588064583	ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7297452	A/G	1	10	12	22	4.90482487015087	6.11421015581896	-1.20938528566809	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.672962537607921	ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7359154	T/C	1	9	17	26	4.41434238313578	8.66179772074352	-4.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.116679632873408	ENSG00000170175:ENST00000306071:exon_7359113_7359260:CHRNB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7366032	C/T	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000174282:ENST00000311403:exon_7362685_7367209:ZBTB4;ENSG00000174282:ENST00000380599:exon_7362688_7367209:ZBTB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7400137	T/C	1	9	18	27	4.41434238313578	9.17131523372843	-4.75697285059265	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.082656024899039	ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7400083_7400364:POLR2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7404107	T/C	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7403958_7404167:POLR2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7412349	G/A	1	43	25	68	21.0907469416487	12.7379378246228	8.35280911702592	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0516429194641869	ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7453505	C/A	1	14	21	35	6.86675481821122	10.6998677726832	-3.83311295447196	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.236924406593258	ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7453437_7453512:TNFSF12-TNFSF13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7481634	T/C	1	53	64	117	25.9955718117996	32.6091208310344	-6.61354901923482	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.230350261678652	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7484101	C/A	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7484812	G/A	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484696_7485431:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484696_7485428:CD68
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7490379	G/C	1	2	9	11	0.980964974030174	4.58565761686422	-3.60469264283404	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0353326891625868	ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7490810	G/A	1	90	68	158	44.1434238313578	34.6471908829741	9.49623294838374	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.151841966588138	ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7843053	C/T	1	19	17	36	9.31916725328665	8.66179772074352	0.657369532543132	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.868798049474732	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7847955	C/A	1	26	28	54	12.7525446623923	14.2664903635776	-1.5139457011853	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.685921034682845	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	7849087	C/G	1	31	26	57	15.2049570974677	13.2474553376077	1.95750175985996	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.691447229369019	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8025712	A/G	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8025661_8025748:HES7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8046772	C/G	1	19	7	26	9.31916725328665	3.56662259089439	5.75254466239226	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.029702627804958	ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8064083	T/G	1	40	62	102	19.6192994806035	31.5900858050646	-11.9707863244611	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0222764032797817	ENSG00000220205:ENST00000316509:exon_8062467_8064189:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8076715	A/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8076778	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8092694	T/G	1	13	19	32	6.37627233119613	9.68083274671335	-3.30456041551721	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.289722368345706	ENSG00000196544:ENST00000389017:exon_8091652_8093564:C17orf59;ENSG00000196544:ENST00000357939:exon_8092385_8093056:C17orf59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8108331	A/G	1	116	106	222	56.8959684937501	54.0088563764008	2.88711211734931	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.737261918986252	ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8141519	C/A	1	1	10	11	0.490482487015087	5.09517512984913	-4.60469264283404	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.00551240836678135	ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8141349_8141560:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8141349_8141560:C17orf68
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8161131	A/G	1	7	17	24	3.43337740910561	8.66179772074352	-5.22842031163791	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0402116433714956	ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8161149	C/T	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.264915529576399	ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8161125_8161256:PFAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8167600	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167530_8167655:PFAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8168224	T/C	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8168213_8168443:PFAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8354143	C/G	1	28	12	40	13.7335096364224	6.11421015581896	7.61929948060348	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0173648250442584	ENSG00000166579:ENST00000380025:exon_8354098_8354271:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000402554:exon_8354098_8354271:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000334527:exon_8354098_8354271:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000415727:exon_8354098_8354271:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000299734:exon_8354098_8354271:NDEL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8390840	T/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8390751_8390912:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8390751_8390912:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8390751_8390912:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8390751_8390912:MYH10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8416901	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8732218	C/G	1	26	20	46	12.7525446623923	10.1903502596983	2.562194402694	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.465132984664864	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8770873	C/T	1	21	17	38	10.3001322273168	8.66179772074352	1.6383345065733	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.62948546500411	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8790473	G/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8790413_8790538:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8790413_8790538:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8790413_8790538:PIK3R5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8790850	G/A	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8790838_8791000:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8790838_8791000:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8790838_8791000:PIK3R5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8792003	C/T	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8792093	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	8792171	T/C	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	T	T		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	9153925	G/A	1	144	100	244	70.6294781301725	50.9517512984913	19.6777268316812	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0124310276844026	ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9153789_9153962:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9153789_9153962:STX8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	9471711	T/G	1	35	45	80	17.166887045528	22.9282880843211	-5.76140103879304	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.219063419465938	ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	15341183	A/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000239704:ENST00000520956:exon_15339332_15341517:CDRT4;ENSG00000239704:ENST00000312177:exon_15339332_15341517:CDRT4;ENSG00000239704:ENST00000395926:exon_15339338_15341520:CDRT4;ENSG00000239704:ENST00000519354:exon_15341049_15341517:CDRT4;ENSG00000239704:ENST00000395924:exon_15341090_15341517:CDRT4;ENSG00000175106:ENST00000522212:exon_15339338_15341517:FAM18B2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	15611495	T/C	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	15881327	C/T	1	8	13	21	3.9238598961207	6.62372766880387	-2.69986777268317	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.278819956820526	ENSG00000214941:ENST00000399277:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000399280:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000491631:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486655:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486706:exon_15881089_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000460252:exon_15881205_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000475498:exon_15881239_15881477:ZSWIM7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	15968304	T/C	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000470782:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_15968184_15968333:NCOR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	16137315	A/G	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000108474:ENST00000225609:exon_16137285_16137384:PIGL;ENSG00000108474:ENST00000498772:exon_16137285_16137384:PIGL;ENSG00000108474:ENST00000395844:exon_16137285_16137384:PIGL;ENSG00000108474:ENST00000470116:exon_16137285_16137384:PIGL;ENSG00000108474:ENST00000477745:exon_16137285_16137384:PIGL;ENSG00000108474:ENST00000489009:exon_16137285_16137454:PIGL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	16325968	A/G	1	50	55	105	24.5241243507543	28.0234632141702	-3.49933886341586	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.496616487581108	ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	16326005	A/C	1	43	49	92	21.0907469416487	24.9663581362607	-3.875611194612	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.465756955019267	ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	16344600	T/C	1	18	23	41	8.82868476627157	11.718902798653	-2.89021803238143	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.435423128360254	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	16456614	T/G	1	19	18	37	9.31916725328665	9.17131523372843	0.14785201955822	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000141040:ENST00000268727:exon_16453631_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395825:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395824:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000498796:exon_16456424_16456740:ZNF287
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	16852027	T/G	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.821033698547823	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	17080575	C/T	1	40	55	95	19.6192994806035	28.0234632141702	-8.40416373356673	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.100175640615298	ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000313485:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000414263:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000462033:exon_17080566_17080726:MPRIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	17700792	C/T	1	9	2	11	4.41434238313578	1.01903502596983	3.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.065955266796108	ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17700698_17701668:RAI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18003648	G/A	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_18002947_18003749:DRG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18010454	C/G	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.416017801627938	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18088094	C/T	1	17	20	37	8.33820227925648	10.1903502596983	-1.85214798044178	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.622791636127096	ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18111575	G/A	1	37	33	70	18.1478520195582	16.8140779285021	1.33377409105609	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.811410555540177	ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18111533_18111681:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18111533_18113268:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000490106:exon_18111533_18113268:ALKBH5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18148485	G/A	1	139	131	270	68.1770656950971	66.7467942010236	1.43027149407349	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.903140276945032	ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18148944	C/G	1	137	120	257	67.1961007210669	61.1421015581896	6.05399916287737	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.454839851737971	ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18155793	T/A	1	34	21	55	16.676404558513	10.6998677726832	5.97653678582978	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.137235304563812	ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000488221:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000488932:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000461110:exon_18155786_18155870:FLII
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18232096	G/A	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.190933578495351	ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18243453	C/T	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18243357_18243569:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18243357_18243569:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18243357_18243569:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18243357_18243569:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18243357_18243569:SHMT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18775900	A/G	1	61	62	123	29.9194317079203	31.5900858050646	-1.6706540971443	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.787213761676277	ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	18881061	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18880897_18882163:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18880897_18882163:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000399096:exon_18877220_18882986:FAM83G
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	19284071	G/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000443215:exon_19283921_19284246:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000412231:exon_19283921_19285124:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000482850:exon_19283921_19284526:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	19285636	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	19812541	T/C	1	13	16	29	6.37627233119613	8.15228020775861	-1.77600787656248	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.579398877321146	ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	19861458	C/T	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	19871746	T/G	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19871727_19871774:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19871727_19871774:AKAP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	20108547	A/G	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	20109189	C/T	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	20135075	T/G	1	27	18	45	13.2430271494074	9.17131523372843	4.07171191567892	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.236502387335255	ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000472876:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000467722:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20135071_20135144:SPECC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	20924523	G/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21203893	T/C	0	43	0	43	21.0907469416487	0	21.0907469416487	T	T		10	0.509517512984913	3.05517536829615e-13	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21203934	G/A	0	49	0	49	24.0336418637393	0	24.0336418637393	G	G		10	0.509517512984913	5.16774804956763e-15	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21203949	C/T	0	55	0	55	26.9765367858298	0	26.9765367858298	C	C		10	0.509517512984913	8.79429188801832e-17	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21207844	C/T	0	51	0	51	25.0146068377694	0	25.0146068377694	C	C		10	0.509517512984913	1.32840347002505e-15	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21208413	C/T	0	71	0	71	34.8242565780712	0	34.8242565780712	C	C		10	0.509517512984913	1.72367419811428e-21	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21215483	C/T	0	66	0	66	32.3718441429957	0	32.3718441429957	C	C		10	0.509517512984913	5.08557066675964e-20	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21215537	C/A	0	45	0	45	22.0717119156789	0	22.0717119156789	C	C		10	0.509517512984913	7.83677950351805e-14	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21215552	C/T	0	53	0	53	25.9955718117996	0	25.9955718117996	C	C		10	0.509517512984913	3.4169215639546e-16	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21215557	G/A	0	56	1	57	27.4670192728449	0.509517512984913	26.95750175986	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1.27537962906721e-15	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	21216846	G/C	0	106	1	107	51.9911436235992	0.509517512984913	51.4816261106143	A:G	G	A	10	0.509517512984913	4.9086649623536e-30	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	25639432	A/G	1	103	99	202	50.519696162554	50.4422337855064	0.0774623770475742	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25639236_25640657:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25639236_25640657:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000348811:exon_25639236_25639913:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000452005:exon_25639236_25640645:WSB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	25975972	G/A	1	202	162	364	99.0774623770476	82.5418371035559	16.5356252734917	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0838588736431955	ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25975862_25976586:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25975862_25976586:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25975862_25976579:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25975862_25976579:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25975862_25976459:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25975862_25976567:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000481514:exon_25975862_25976580:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25975862_25976581:LGALS9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	26206492	G/A	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000232859:ENST00000460380:exon_26205386_26207392:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000379103:exon_26205396_26206516:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000508862:exon_26206077_26206516:C17orf108;ENSG00000232859:ENST00000379102:exon_26206320_26206516:C17orf108
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	26676135	C/T	1	143	125	268	70.1389956431574	63.6896891231141	6.44930652004332	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.463543501798791	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	26687811	G/A	1	25	17	42	12.2620621753772	8.66179772074352	3.60026445463365	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.283619813190237	ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26687758_26687870:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26687758_26687870:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26687758_26687870:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26687552_26687870:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26687758_26687870:TMEM199
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	27207571	C/T	1	60	58	118	29.4289492209052	29.552015753125	-0.123066532219735	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	27225586	A/T	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27224801_27225910:DHRS13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	27422053	C/T	1	20	17	37	9.80964974030174	8.66179772074352	1.14785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.744501464766585	ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	27438469	G/A	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	27438853	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438740_27438881:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27438804_27438881:MYO18A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	27441077	C/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441029_27441115:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533399:exon_27441029_27441286:MYO18A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	27898828	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	29097001	G/C	1	17	40	57	8.33820227925648	20.3807005193965	-12.04249824014	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00138753977492138	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	29111125	T/G	1	23	30	53	11.281097201347	15.2855253895474	-4.00442818820039	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.275913573218478	ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	29111204	T/C	1	25	23	48	12.2620621753772	11.718902798653	0.543159376724176	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.886425624258215	ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	29113016	A/G	1	11	19	30	5.39530735716596	9.68083274671335	-4.28552538954739	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.144013561824245	ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	29167653	A/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29167635_29167799:ATAD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	29214387	T/C	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29214210_29214390:ATAD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	29226228	T/C	1	41	14	55	20.1097819676186	7.13324518178878	12.9765367858298	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0004026829289589	ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	29646032	G/A	1	44	37	81	21.5812294286638	18.8521479804418	2.72908144822205	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.579450149110069	ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	30190348	A/G	1	323	281	604	158.425843305873	143.174421148761	15.2514221571126	A:T:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.222189425526536	ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	30228590	C/T	1	22	15	37	10.7906147143319	7.64276269477369	3.14785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.327260400458979	ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	30228656	G/A	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	30551707	A/G	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30551635_30552746:RHOT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	30696296	G/A	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.81513336080211	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	33288582	C/G	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	33288882	T/G	1	17	17	34	8.33820227925648	8.66179772074352	-0.323595441487043	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	33463390	G/T	1	11	16	27	5.39530735716596	8.15228020775861	-2.75697285059265	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.337997616727118	ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000479807:exon_33463377_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000473567:exon_33463386_33463516:NLE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	33749546	A/G	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	33749919	A/C	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	33768199	G/A	1	13	21	34	6.37627233119613	10.6998677726832	-4.32359544148704	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.169838425256551	ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	33998802	G/C	1	34	11	45	16.676404558513	5.60469264283404	11.0717119156789	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.000903109594642835	ENSG00000006125:ENST00000262325:exon_33998773_33998919:AP2B1;ENSG00000006125:ENST00000312678:exon_33998773_33998919:AP2B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	34842521	A/G	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	35376351	C/T	1	57	46	103	27.95750175986	23.437805597306	4.51969616255396	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.377382685049434	ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35376304_35376371:AATF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	35896123	T/C	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	36047328	A/C	1	35	32	67	17.166887045528	16.3045604155172	0.862326630010831	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.902930158740332	ENSG00000108753:ENST00000225893:exon_36046434_36047395:HNF1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	36474601	A/G	1	45	39	84	22.0717119156789	19.8711830064116	2.20052890926731	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.663433866213872	ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36474586_36474634:MRPL45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	36909061	A/G	1	275	233	508	134.882683929149	118.717580525485	16.1651034036642	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.155716738497702	ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	36963226	G/T	1	27	23	50	13.2430271494074	11.718902798653	1.52412435075435	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.674615869531795	ENSG00000108296:ENST00000225428:exon_36963018_36963229:CWC25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	37070658	A/G	1	28	26	54	13.7335096364224	13.2474553376077	0.486054298814699	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	37074869	C/T	1	33	31	64	16.1859220714979	15.7950429025323	0.390879168965569	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	37566347	C/G	1	3	9	12	1.47144746104526	4.58565761686422	-3.11421015581896	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0867923369694881	ENSG00000125686:ENST00000300651:exon_37562854_37566974:MED1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	37819092	C/T	1	48	44	92	23.5431593767242	22.4187705713362	1.124388805388	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.835460985037827	ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37819057_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37819057_37819687:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37819057_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37818504_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37819057_37819722:STARD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38142899	T/C	1	38	61	99	18.6383345065733	31.0805682920797	-12.4422337855064	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0154227930891357	ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38142828_38142965:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38142828_38142965:PSMD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38175907	G/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38175926	C/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38251883	G/A	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000126368:ENST00000246672:exon_38251697_38252340:NR1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38320278	C/A	1	19	18	37	9.31916725328665	9.17131523372843	0.14785201955822	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000108349:ENST00000418132:exon_38319734_38320419:CASC3;ENSG00000108349:ENST00000264645:exon_38319734_38320419:CASC3;ENSG00000108349:ENST00000394114:exon_38319734_38320419:CASC3;ENSG00000108349:ENST00000474190:exon_38320139_38320419:CASC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38510583	C/T	1	37	35	72	18.1478520195582	17.833112954472	0.314739065086265	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000131759:ENST00000254066:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000394089:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000425707:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000394086:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000394081:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000319149:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000475125:exon_38510554_38510661:RARA;ENSG00000131759:ENST00000420042:exon_38510554_38510758:RARA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38569071	T/C	1	16	14	30	7.84771979224139	7.13324518178878	0.71447461045261	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.856318725452094	ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38569011_38569223:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38569011_38569223:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38569011_38569223:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38569011_38569223:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38569011_38569223:TOP2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38711222	T/C	1	219	162	381	107.415664656304	82.5418371035559	24.8738275527482	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0119521373978358	ENSG00000126353:ENST00000246657:exon_38710021_38712070:CCR7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38991003	T/C	1	27	24	51	13.2430271494074	12.2284203116379	1.01460683776944	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.781754210005439	ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38991032	T/A	1	29	34	63	14.2239921234375	17.323595441487	-3.09960331804952	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.452079697811503	ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	38991237	C/T	1	30	33	63	14.7144746104526	16.8140779285021	-2.09960331804952	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.61629520548466	ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	39983644	A/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	39983808	G/C	1	83	41	124	40.7100464222522	20.8902180323814	19.8198283898708	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.000416917395489692	ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	39983820	G/A	1	92	49	141	45.124388805388	24.9663581362607	20.1580306691273	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000710378850747717	ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40065774	T/G	1	39	33	72	19.1288169935884	16.8140779285021	2.31473906508626	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.637950674924835	ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40065763_40065953:ACLY
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40169387	C/T	1	44	47	91	21.5812294286638	23.9473231102909	-2.36609368162708	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.675270852616082	ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40169358_40169671:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40169358_40169434:DNAJC7;ENSG00000168256:ENST00000307641:exon_40169038_40169644:NKIRAS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40255812	C/T	1	10	4	14	4.90482487015087	2.03807005193965	2.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180671884464811	ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40344643	T/G	1	11	22	33	5.39530735716596	11.2093852856681	-5.81407792850213	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0543260550919145	ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40442037	C/T	1	29	37	66	14.2239921234375	18.8521479804418	-4.62815585700426	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.269663901038816	ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000469124:exon_40441884_40442197:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000444283:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000478897:exon_40441884_40442040:STAT5A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40458441	C/T	1	71	47	118	34.8242565780712	23.9473231102909	10.8769334677803	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0527639014453161	ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40458259_40458465:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40458259_40458465:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40458132_40458465:STAT5A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40459737	C/T	1	100	68	168	49.0482487015087	34.6471908829741	14.4010578185346	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0304352910997715	ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40714804	C/A	1	26	22	48	12.7525446623923	11.2093852856681	1.54315937672418	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.668204743201523	ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40716520	A/G	1	57	90	147	27.95750175986	45.8565761686422	-17.8990744087822	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00374389798723729	ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40815452	C/T	1	30	18	48	14.7144746104526	9.17131523372843	5.54315937672418	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.114506387586281	ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40815395_40815521:TUBG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40818451	G/A	1	25	12	37	12.2620621753772	6.11421015581896	6.14785201955822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0484978208188634	ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40835922	A/C	1	12	5	17	5.88578984418104	2.54758756492456	3.33820227925648	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.144694391340598	ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40835839_40835940:CNTNAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40836262	A/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40849573	G/A	1	17	10	27	8.33820227925648	5.09517512984913	3.24302714940735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.250108755096081	ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40849572_40849817:CNTNAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	40963656	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	42155891	C/T	1	66	39	105	32.3718441429957	19.8711830064116	12.5006611365841	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0147420746239897	ENSG00000108840:ENST00000336057:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000393622:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000225983:exon_42155868_42156033:HDAC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	42254011	C/G	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	42272165	G/A	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000087152:ENST00000454077:exon_42272136_42272207:ATXN7L3;ENSG00000087152:ENST00000389384:exon_42272136_42272207:ATXN7L3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	42288661	G/A	1	45	38	83	22.0717119156789	19.3616654934267	2.71004642225222	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.584133552781559	ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42288658_42288699:UBTF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	42427892	C/T	1	217	218	435	106.434699682274	111.074817830711	-4.64011814843714	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.666262107355828	ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42427810_42427945:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42427810_42427945:GRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	43003484	T/C	1	6	15	21	2.94289492209052	7.64276269477369	-4.69986777268317	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0488848967390049	ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	43183028	G/A	1	190	146	336	93.1916725328665	74.3895568957973	18.8021156370692	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0433863582968881	ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	43213503	C/G	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000181513:ENST00000431281:exon_43213475_43213599:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000321854:exon_43213475_43213599:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000428033:exon_43213475_43213599:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000398322:exon_43213014_43213599:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000376955:exon_43213475_43213599:ACBD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	45735975	G/A	1	54	65	119	26.4860542988147	33.1186383440193	-6.63258404520464	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.234187091009267	ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	45750468	T/C	1	96	108	204	47.0863187534484	55.0278914023706	-7.94157264892225	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.293527545797881	ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	45759767	C/T	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.774904040787699	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	45891142	G/A	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45890953_45891200:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45890953_45891200:OSBPL7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	45916018	C/G	1	50	43	93	24.5241243507543	21.9092530583513	2.61487129240309	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.605500014697563	ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915897_45916062:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915897_45916062:SCRN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	45994154	G/A	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	46002744	G/T	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	46189382	T/C	1	18	8	26	8.82868476627157	4.0761401038793	4.75254466239226	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0768854939145154	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	46262171	C/T	1	37	21	58	18.1478520195582	10.6998677726832	7.44798424687504	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.065061203370373	ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	47000251	C/T	1	47	41	88	23.0526768897091	20.8902180323814	2.16245885732766	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.670845325655464	ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	47118779	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000159217:ENST00000290341:exon_47118740_47118862:IGF2BP1;ENSG00000159217:ENST00000431824:exon_47118740_47118862:IGF2BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	47778793	C/T	1	79	59	138	38.7481164741919	30.0615332661099	8.68658320808201	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.148106645116644	ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48221079	G/A	1	78	84	162	38.2576339871768	42.7994710907327	-4.54183710355591	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.480630999328305	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48433958	T/C	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48435649	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48435568_48435901:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48435568_48435901:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48435568_48435678:XYLT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48437456	C/G	1	22	19	41	10.7906147143319	9.68083274671335	1.10978196761857	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.756996336009118	ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48456183	G/A	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48458180	G/A	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48458124_48458786:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48458124_48458818:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48458124_48458820:EME1;ENSG00000154920:ENST00000507616:exon_48458124_48458818:EME1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48539035	T/C	1	16	6	22	7.84771979224139	3.05710507790948	4.79061471433191	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0534075122332023	ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48625928	C/G	1	19	6	25	9.31916725328665	3.05710507790948	6.26206217537718	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0150702956802832	ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505085:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000502911:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505456:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508598:exon_48625915_48625942:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515526:exon_48625644_48626064:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511845:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505336:exon_48625915_48626175:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512416:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48625915_48625979:SPATA20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48628092	A/G	1	42	11	53	20.6002644546337	5.60469264283404	14.9955718117996	A:G	A	G	10	0.509517512984913	2.64266550205337e-05	ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	48628470	T/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	49043640	T/C	1	24	31	55	11.7715796883621	15.7950429025323	-4.02346321417021	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.284379944811137	ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49042436_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49042988_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49043005_49043748:SPAG9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	49197883	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49197715_49198226:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49197715_49198226:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49197715_49198226:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357791:exon_49197715_49198226:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49197715_49198095:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49197715_49198226:SPAG9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	49248997	C/T	1	1206	989	2195	591.521879340195	503.912820342079	87.609058998116	A:T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.000185972862302815	ENSG00000011052:ENST00000376392:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393199:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393183:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000514264:exon_49248848_49249028:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393185:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000513177:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000512737:exon_49248848_49249108:NME2;ENSG00000011052:ENST00000426182:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000503064:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393190:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000445778:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000243678:ENST00000393193:exon_49248848_49249105:NME1-NME2;ENSG00000243678:ENST00000393198:exon_49248848_49249103:NME1-NME2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	49338275	G/A	1	26	24	50	12.7525446623923	12.2284203116379	0.52412435075435	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.888737440394932	ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	53851228	C/T	1	5	13	18	2.45241243507544	6.62372766880387	-4.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0593928969289689	ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	54969229	C/T	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54965270_54969590:TRIM25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	54990797	T/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54990753_54991409:TRIM25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	55183203	T/C	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	55183726	G/A	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	55191876	C/T	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55191820_55191997:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55191820_55191997:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55191820_55191997:AKAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	57288251	C/T	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	57968208	A/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000108423:ENST00000325752:exon_57968192_57968402:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000340993:exon_57968192_57968402:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000394239:exon_57968192_57968402:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000376094:exon_57968192_57968402:TUBD1;ENSG00000108423:ENST00000346141:exon_57968192_57968402:TUBD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	58125708	C/T	1	6	17	23	2.94289492209052	8.66179772074352	-5.718902798653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0206563045334984	ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58125625_58125749:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58125625_58125749:HEATR6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	58525018	C/T	1	14	18	32	6.86675481821122	9.17131523372843	-2.30456041551722	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.480992424821392	ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	59760996	A/G	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	60111225	A/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60111148_60111345:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60111148_60111345:MED13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	61883966	C/T	1	27	22	49	13.2430271494074	11.2093852856681	2.03364186373926	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.57161404905055	ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61883895_61884014:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61883895_61884014:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61883895_61884014:DDX42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	61908316	G/A	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.103192530786195	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	61908556	C/T	1	371	351	722	181.969002682597	178.840647057704	3.12835562489281	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.823361871972936	ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	61910514	A/G	1	128	122	250	62.7817583379311	62.1611365841594	0.620621753771751	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.9496393887117	ENSG00000108604:ENST00000450364:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000448276:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000225742:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000323347:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000228253:exon_61910429_61910530:SMARCD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	62007498	A/G	1	197	155	352	96.6250499419721	78.9752145126615	17.6498354293106	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0620901019622505	ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	62223615	A/G	1	231	253	484	113.301454500485	128.907930785183	-15.6064762846979	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.15892441199779	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	62476429	G/A	1	18	28	46	8.82868476627157	14.2664903635776	-5.437805597306	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139518785562104	ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	65362552	T/A	1	24	26	50	11.7715796883621	13.2474553376077	-1.47587564924565	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.777602321563524	ENSG00000197170:ENST00000356126:exon_65362528_65362743:PSMD12;ENSG00000197170:ENST00000357146:exon_65362528_65362721:PSMD12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	65907663	C/G	1	22	17	39	10.7906147143319	8.66179772074352	2.12881699358839	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.525347987196032	ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	65908769	C/T	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	65914911	T/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65914830_65914954:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65914830_65914954:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65914830_65914954:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65914830_65914954:BPTF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	65919092	G/A	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65918956_65919106:BPTF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	65924524	A/G	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65924471_65924717:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65924471_65924717:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65924471_65924717:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65924471_65924717:BPTF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	66039350	A/G	1	145	167	312	71.1199606171876	85.0894246684805	-13.9694640512929	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.126167793707485	ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	66246444	A/G	1	62	36	98	30.4099141949354	18.3426304674569	12.0672837274785	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0152648195959609	ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	67080496	A/G	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000154262:ENST00000284425:exon_67080402_67080496:ABCA6;ENSG00000154262:ENST00000446604:exon_67080402_67080496:ABCA6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	67146186	C/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000154263:ENST00000522787:exon_67146125_67146203:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000521538:exon_67146125_67146204:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000269081:exon_67146125_67146204:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000522406:exon_67146125_67146204:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000416101:exon_67146125_67146204:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000524231:exon_67146129_67146593:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000519732:exon_67146125_67146204:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000518929:exon_67146125_67146204:ABCA10;ENSG00000154263:ENST00000523419:exon_67146125_67146204:ABCA10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	67260926	A/G	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000154265:ENST00000392677:exon_67260876_67261046:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000320086:exon_67260876_67261046:ABCA5;ENSG00000154265:ENST00000392676:exon_67260876_67261046:ABCA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	67513003	C/A	1	18	4	22	8.82868476627157	2.03807005193965	6.79061471433191	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.00449186101551913	ENSG00000108984:ENST00000359094:exon_67512996_67513044:MAP2K6;ENSG00000108984:ENST00000435374:exon_67512996_67513044:MAP2K6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	70943990	T/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_70943891_70944014:SLC39A11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	71201675	T/C	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.218410376640568	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	71232166	T/C	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	71232605	G/A	1	9	15	24	4.41434238313578	7.64276269477369	-3.22842031163791	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.222587013753191	ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	71232687	T/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	71232730	A/G	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	71232881	G/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	71233130	A/G	1	3	9	12	1.47144746104526	4.58565761686422	-3.11421015581896	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0867923369694881	ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	71241322	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71241307_71241483:C17orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	72436770	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000420926:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392629:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392628:exon_72435884_72436966:GPRC5C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	72439967	G/A	1	12	2	14	5.88578984418104	1.01903502596983	4.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0131570880979608	ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000420926:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000262616:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392629:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392628:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000482723:exon_72439224_72440051:GPRC5C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	72443192	G/T	1	2	15	17	0.980964974030174	7.64276269477369	-6.66179772074352	T:C:G	G	T	10	0.509517512984913	0.00109285761061674	ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	72462879	C/G	1	67	53	120	32.8623266300108	27.0044281882004	5.85789844181044	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.315392514347684	ENSG00000167851:ENST00000361933:exon_72462522_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000360141:exon_72462555_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000392625:exon_72462797_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000310828:exon_72462814_72462882:CD300A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73230856	C/T	1	52	39	91	25.5050893247845	19.8711830064116	5.63390631837292	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.25007371701413	ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73235938	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73235870_73236189:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73235870_73236189:GGA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73236010	G/A	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73235870_73236189:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73235870_73236189:GGA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73238402	C/T	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180400712281148	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73257986	C/T	1	45	50	95	22.0717119156789	25.4758756492457	-3.40416373356674	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.538384919479408	ENSG00000125445:ENST00000245539:exon_73257749_73258064:MRPS7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73512884	T/G	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73512827_73512991:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73512827_73512991:TSEN54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73513289	C/G	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73624439	C/A	1	23	17	40	11.281097201347	8.66179772074352	2.61929948060348	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.432944076740435	ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73624298_73624522:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73624298_73624522:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000443199:exon_73624298_73624522:RECQL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73625059	G/A	1	22	32	54	10.7906147143319	16.3045604155172	-5.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.136992323132609	ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73760144	C/T	1	14	16	30	6.86675481821122	8.15228020775861	-1.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.716389941789618	ENSG00000108479:ENST00000225614:exon_73759978_73760167:GALK1;ENSG00000108479:ENST00000437911:exon_73759978_73760167:GALK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73774877	G/A	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.848425091361672	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73816026	A/G	1	3	9	12	1.47144746104526	4.58565761686422	-3.11421015581896	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0867923369694881	ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73816001_73816189:UNK;ENSG00000178932:ENST00000326348:exon_73815663_73816134:AC087289.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	73831594	G/A	1	29	31	60	14.2239921234375	15.7950429025323	-1.57105077909478	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.700493201950742	ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73831490_73831610:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73831490_73831610:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73831490_73831610:UNC13D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74060168	T/C	1	24	34	58	11.7715796883621	17.323595441487	-5.55201575312496	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.150714094702722	ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74060057_74060252:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74060057_74060252:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74060057_74060252:SRP68
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74077637	G/A	1	90	66	156	44.1434238313578	33.6281558570043	10.5152679743536	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0933057454726975	ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74081457	C/G	1	24	30	54	11.7715796883621	15.2855253895474	-3.5139457011853	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.344882973845490	ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467929:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467586:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000411744:exon_74081395_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000494787:exon_74081191_74081490:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000460476:exon_74081450_74081490:EXOC7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74266322	T/C	1	201	200	401	98.5869798900325	101.903502596983	-3.31652270695011	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.764499162138463	ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74324895	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74324798_74324943:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74324798_74324943:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74324798_74324943:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000488339:exon_74324798_74324945:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000435555:exon_74324798_74324943:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000472686:exon_74324798_74325067:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000436498:exon_74324795_74324943:PRPSAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74383475	T/C	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000176170:ENST00000323374:exon_74382887_74383941:SPHK1;ENSG00000176170:ENST00000392496:exon_74382887_74383941:SPHK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74557698	G/A	1	4	12	16	1.96192994806035	6.11421015581896	-4.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0454122101177686	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74733099	G/A	1	141	173	314	69.1580306691273	88.1465297463899	-18.9884990772627	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0365928281631609	ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	74771185	C/T	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000092931:ENST00000355954:exon_74771079_74771253:MFSD11;ENSG00000092931:ENST00000336509:exon_74771079_74771253:MFSD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	75484932	C/T	1	199	183	382	97.6060149160023	93.2417048762391	4.36431003976323	A:T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.682341217361843	ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75484809_75484946:SEPT9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	75494746	A/G	1	82	40	122	40.2195639352371	20.3807005193965	19.8388634158406	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000371909050830053	ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	75494780	A/T	1	140	81	221	68.6675481821122	41.270918551778	27.3966296303342	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.000262227710578703	ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	75495397	T/C	1	217	200	417	106.434699682274	101.903502596983	4.53119708529128	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.659749539445273	ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76395430	C/T	1	10	20	30	4.90482487015087	10.1903502596983	-5.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.066896011304131	ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76420005	C/T	1	45	40	85	22.0717119156789	20.3807005193965	1.69101139628239	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.745638303637344	ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76419778_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76419778_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76419783_76420234:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000374939:exon_76419783_76420234:DNAH17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76423151	C/T	1	11	20	31	5.39530735716596	10.1903502596983	-4.7950429025323	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.105361649920956	ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76423007_76423189:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76423007_76423189:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76423007_76423214:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000374939:exon_76423007_76423189:DNAH17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76449478	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76449425_76449547:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76449425_76449547:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76449425_76449547:DNAH17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76454682	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76454647_76454762:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76454647_76454762:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76454647_76454762:DNAH17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76471366	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76471360_76471551:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76471360_76471551:DNAH17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76495095	C/T	1	75	2	77	36.7861865261315	1.01903502596983	35.7671515001617	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	8.36425594398417e-20	ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76495090_76495194:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76495090_76495194:DNAH17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76798453	C/T	1	24	21	45	11.7715796883621	10.6998677726832	1.07171191567891	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.767850096057718	ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76798406_76798617:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76798406_76798617:USP36
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76799860	T/C	1	34	26	60	16.676404558513	13.2474553376077	3.42894922090522	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.438857733223645	ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76799898	A/G	1	31	24	55	15.2049570974677	12.2284203116379	2.97653678582979	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.500492484991641	ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76803197	C/T	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76967773	A/T	1	16	10	26	7.84771979224139	5.09517512984913	2.75254466239226	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.329230577261424	ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76968417	A/G	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76988785	G/A	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	76989715	T/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	77073941	T/C	1	1	10	11	0.490482487015087	5.09517512984913	-4.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00551240836678135	ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77073745_77073946:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77073745_77073946:ENGASE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	77076440	G/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77076289_77076446:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77076289_77076446:ENGASE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	77078109	A/G	1	10	12	22	4.90482487015087	6.11421015581896	-1.20938528566809	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.672962537607921	ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77077980_77078145:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77077980_77078145:ENGASE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	77080732	G/A	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77080620_77080768:ENGASE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	77768654	C/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78091405	G/A	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78093133	G/A	1	3	14	17	1.47144746104526	7.13324518178878	-5.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00661256511793458	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78093071_78093678:GAA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78175483	T/C	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.581964647177154	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78184393	C/T	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.112356383277526	ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78292945	G/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78333907	C/G	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78333861_78334006:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78333861_78334006:RNF213
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78333998	A/G	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78333861_78334006:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78333861_78334006:RNF213
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78337058	G/C	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78336902_78337114:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78336902_78337114:RNF213
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78353464	G/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78353420_78353514:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78353420_78353514:RNF213
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	78896529	C/T	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78896524_78896627:RPTOR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79165141	G/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79166384	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79169641	G/A	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79170578	C/T	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79173224	T/C	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79176071	G/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79176040_79176198:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79176040_79176198:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79176040_79176198:AZI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79219621	G/A	1	44	27	71	21.5812294286638	13.7569728505926	7.82425657807118	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0745025575074583	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79225000	A/G	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.112356383277526	ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79225330	C/A	1	17	18	35	8.33820227925648	9.17131523372843	-0.833112954471956	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.866252155786725	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225293_79225412:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79225413	C/G	1	2	31	33	0.980964974030174	15.7950429025323	-14.8140779285021	C:G	C	G	10	0.509517512984913	4.44641119189684e-08	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79226264	T/C	1	35	43	78	17.166887045528	21.9092530583513	-4.74236601282321	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.308861364755214	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79255998	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79255989_79256132:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79255989_79256132:SLC38A10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79516190	T/C	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.774904040787699	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79634774	A/T	1	25	16	41	12.2620621753772	8.15228020775861	4.10978196761857	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.214414867597439	ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79634813	T/C	1	19	16	35	9.31916725328665	8.15228020775861	1.16688704552805	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.737500987101035	ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79637367	C/G	1	33	32	65	16.1859220714979	16.3045604155172	-0.118638344019345	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79638805	C/T	1	33	35	68	16.1859220714979	17.833112954472	-1.64719088297408	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.717184372117756	ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79638774_79638856:CCDC137
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79660539	G/A	1	29	22	51	14.2239921234375	11.2093852856681	3.01460683776944	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.405417088730572	ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79660533_79660611:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79660533_79660611:HGS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79663931	T/C	1	16	30	46	7.84771979224139	15.2855253895474	-7.437805597306	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0378286130559504	ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79846318	C/G	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.500048331019766	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79872224	C/T	1	39	30	69	19.1288169935884	15.2855253895474	3.843291604041	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.399852080022969	ENSG00000187531:ENST00000328666:exon_79872170_79872406:SIRT7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79952700	G/A	1	11	17	28	5.39530735716596	8.66179772074352	-3.26649036357756	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.258164543515238	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79952697_79952754:ASPSCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79968710	C/T	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79968678_79968744:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79968678_79968744:ASPSCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79974670	C/T	1	10	4	14	4.90482487015087	2.03807005193965	2.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180671884464811	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79974731	T/C	1	29	23	52	14.2239921234375	11.718902798653	2.50508932478452	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.579468383594275	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79986156	C/T	1	15	15	30	7.35723730522631	7.64276269477369	-0.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000169683:ENST00000306688:exon_79986110_79986187:LRRC45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	79994561	C/G	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.190933578495351	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80006957	A/C	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80008246	T/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80017836	G/A	1	137	190	327	67.1961007210669	96.8083274671335	-29.6122267460665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00108316048634730	ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80037528	A/G	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80039509	C/T	1	68	61	129	33.3528091170259	31.0805682920797	2.27224082494622	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.725034953257046	ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80040895	T/C	1	58	55	113	28.447984246875	28.0234632141702	0.424521032704831	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80040790_80040991:FASN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80045086	G/C	1	35	23	58	17.166887045528	11.718902798653	5.44798424687505	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.188676541160130	ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80193897	G/A	1	22	13	35	10.7906147143319	6.62372766880387	4.16688704552805	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.178202301062041	ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80191563_80194107:SLC16A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80194008	G/A	1	27	20	47	13.2430271494074	10.1903502596983	3.05267688970909	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.38575279318474	ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80191563_80194107:SLC16A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80350331	G/A	1	26	27	53	12.7525446623923	13.7569728505926	-1.00442818820039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.785658801468792	ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80352233	C/T	1	12	14	26	5.88578984418104	7.13324518178878	-1.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.69695410034444	ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80352234	G/A	1	15	12	27	7.35723730522631	6.11421015581896	1.24302714940735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.702512858193323	ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80352303	G/A	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80401902	C/G	1	49	26	75	24.0336418637393	13.2474553376077	10.7861865261315	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0148492841194984	ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80402041	G/A	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80402490	C/T	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.482132183542689	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80684909	C/T	1	20	30	50	9.80964974030174	15.2855253895474	-5.47587564924565	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.156545549340854	ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684709_80685892:FN3KRP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80881588	G/A	1	43	59	102	21.0907469416487	30.0615332661099	-8.97078632446112	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0917832481067565	ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80881528_80881609:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80881528_80881609:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80881528_80881609:TBCD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80899281	G/A	1	34	40	74	16.676404558513	20.3807005193965	-3.70429596088356	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.416941055774656	ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	80992932	A/C	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80992911_80992975:B3GNTL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	17	81006629	C/T	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006545_81006661:B3GNTL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	658001	G/A	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	670888	T/C	1	20	4	24	9.80964974030174	2.03807005193965	7.77157968836209	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00161305411388320	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	673016	C/T	1	239	260	499	117.225314396606	132.474553376077	-15.2492389794716	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.179246143574400	ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	693826	T/A	1	18	11	29	8.82868476627157	5.60469264283404	3.22399212343752	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.267449151143263	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	693828	A/C	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	A:C:G	A	C	10	0.509517512984913	0.364216682224569	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	9119489	A/T	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9119472_9119588:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9119472_9119523:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9119472_9119564:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000465096:exon_9119471_9119588:NDUFV2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	9255982	A/G	1	180	174	354	88.2868476627157	88.6560472593749	-0.3691995966592	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	9396324	G/A	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.190933578495351	ENSG00000128791:ENST00000262120:exon_9396278_9396544:TWSG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	9547785	T/A	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9546789_9547950:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9546789_9547950:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9546793_9547950:PPP4R1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	12329536	C/G	1	114	111	225	55.9150035197199	56.5564439413253	-0.641440421605424	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.946914405668923	ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	12348285	T/C	1	42	33	75	20.6002644546337	16.8140779285021	3.78618652613152	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.41963209205037	ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	12351342	C/T	1	38	32	70	18.6383345065733	16.3045604155172	2.33377409105609	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.633139350099399	ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	12718593	A/G	1	73	94	167	35.8052215521014	47.8946462205818	-12.0894246684805	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.063453014286852	ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	13645161	A/C	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000168675:ENST00000361205:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399848:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000359446:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000399847:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000361303:exon_13645126_13652753:C18orf1;ENSG00000168675:ENST00000435606:exon_13645126_13652753:C18orf1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	13681915	T/C	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000177150:ENST00000322247:exon_13681604_13682104:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000457610:exon_13681604_13682111:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000402563:exon_13681604_13682104:C18orf19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	19153494	C/T	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	21047495	A/C	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.103192530786195	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	21100240	C/T	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	21110234	T/G	1	62	54	116	30.4099141949354	27.5139457011853	2.8959684937501	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.642679567475688	ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21110193_21110261:C18orf8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	21112206	C/T	1	30	24	54	14.7144746104526	12.2284203116379	2.4860542988147	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.586574359744793	ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	21119777	G/A	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21119775_21119965:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21119775_21119965:NPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	21120444	T/C	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	21710321	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000168234:ENST00000304621:exon_21710277_21710381:TTC39C;ENSG00000168234:ENST00000317571:exon_21710277_21710381:TTC39C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	23618532	T/C	1	17	10	27	8.33820227925648	5.09517512984913	3.24302714940735	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.250108755096081	ENSG00000141380:ENST00000415083:exon_23618519_23618623:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269137:exon_23618519_23618623:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269138:exon_23618519_23618623:SS18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	23854692	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23854627_23854788:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23854627_23854788:TAF4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	29126064	A/G	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	32833766	A/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000186814:ENST00000333206:exon_32832819_32834345:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000420878:exon_32833423_32834187:ZSCAN30;ENSG00000186814:ENST00000360932:exon_32833423_32834285:ZSCAN30
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	32917644	T/C	1	13	12	25	6.37627233119613	6.11421015581896	0.262062175377175	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	32920513	G/A	1	18	17	35	8.82868476627157	8.66179772074352	0.166887045528044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32920195_32920697:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32920195_32920697:ZNF24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	33557466	A/G	1	31	19	50	15.2049570974677	9.68083274671335	5.52412435075435	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.122254746081498	ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	33694120	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33694060_33694437:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33694060_33694437:SLC39A6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	33718326	A/C	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	33725931	G/A	1	16	25	41	7.84771979224139	12.7379378246228	-4.89021803238143	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.159192167561288	ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	33750046	C/T	1	62	77	139	30.4099141949354	39.2328484998383	-8.8229343049029	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.149165733648667	ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	43565380	A/G	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	43565399	C/A	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	43568717	T/C	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	43685185	T/C	1	65	48	113	31.8813616559807	24.4568406232758	7.42452103270483	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.187567463591213	ENSG00000152240:ENST00000282058:exon_43685160_43685334:HAUS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	46570403	C/T	1	80	89	169	39.238598961207	45.3470586556573	-6.1084596944503	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.356757492198525	ENSG00000141627:ENST00000442713:exon_46570172_46570574:DYM;ENSG00000141627:ENST00000418472:exon_46570172_46570574:DYM;ENSG00000141627:ENST00000269445:exon_46570190_46570574:DYM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	46904937	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000141627:ENST00000418472:exon_46904937_46905070:DYM;ENSG00000141627:ENST00000269445:exon_46904937_46905070:DYM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	47008765	C/A	1	123	52	175	60.3293459028557	26.4949106752155	33.8344352276402	A:C:G	C	A	10	0.509517512984913	2.92767993024273e-07	ENSG00000177576:ENST00000318240:exon_47008030_47008780:C18orf32
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	47008766	A/T	1	122	51	173	59.8388634158406	25.9853931622306	33.8534702536101	A:T	A	T	10	0.509517512984913	2.47753375455645e-07	ENSG00000177576:ENST00000318240:exon_47008030_47008780:C18orf32
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	47017820	A/G	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	47340423	C/A	1	10	28	38	4.90482487015087	14.2664903635776	-9.36166549342669	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0029898062754297	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	48703215	A/C	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000176624:ENST00000406189:exon_48700920_48703946:MEX3C;ENSG00000176624:ENST00000336573:exon_48700922_48703946:MEX3C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	54293658	T/C	1	162	164	326	79.4581628964441	83.5608721295257	-4.10270923308164	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.658012613515629	ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	55268866	C/T	1	84	82	166	41.2005289092673	41.7804360647629	-0.579907155495562	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.93827888483771	ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56196451	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56202120	G/A	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56202394	C/T	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56202768	C/A	1	17	12	29	8.33820227925648	6.11421015581896	2.22399212343752	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.460635236646915	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56202982	A/T	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:T	A	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56203411	G/C	1	25	15	40	12.2620621753772	7.64276269477369	4.61929948060348	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.156839441077429	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56203447	A/G	1	23	10	33	11.281097201347	5.09517512984913	6.18592207149787	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.036161248917988	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56203891	G/T	1	19	12	31	9.31916725328665	6.11421015581896	3.2049570974677	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.283751645573885	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56203898	T/G	1	21	11	32	10.3001322273168	5.60469264283404	4.69543958448278	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.112240762271142	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56204250	A/C	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	A:C:G	A	C	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56204644	T/G	1	4	11	15	1.96192994806035	5.60469264283404	-3.64276269477369	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0719999094721795	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56204747	G/A	1	13	13	26	6.37627233119613	6.62372766880387	-0.247455337607738	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56204926	C/T	1	21	10	31	10.3001322273168	5.09517512984913	5.2049570974677	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0723276004372384	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	56819930	T/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	57022754	T/C	1	20	9	29	9.80964974030174	4.58565761686422	5.22399212343752	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0627808957285707	ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57022736_57022890:LMAN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	57026361	A/G	1	8	14	22	3.9238598961207	7.13324518178878	-3.20938528566809	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.203086029135577	ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57026263_57026503:LMAN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	60985530	A/G	1	33	23	56	16.1859220714979	11.718902798653	4.46701927284487	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.28490019657137	ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	61585260	T/C	1	8	20	28	3.9238598961207	10.1903502596983	-6.26649036357756	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0221456897184144	ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	61597349	A/G	1	25	27	52	12.2620621753772	13.7569728505926	-1.49491067521548	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.680587313441794	ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61597279_61597421:SERPINB10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	61654297	A/G	1	22	33	55	10.7906147143319	16.8140779285021	-6.02346321417022	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.107609118173535	ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	67715288	A/G	1	11	3	14	5.39530735716596	1.52855253895474	3.86675481821122	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.057993110530478	ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67715207_67715424:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67715207_67715424:RTTN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	74090931	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090810_74090963:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090810_74090963:ZNF516
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	74091235	G/C	1	9	1	10	4.41434238313578	0.509517512984913	3.90482487015087	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0217074557551410	ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	74091448	G/C	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	74091457	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	74728823	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000197971:ENST00000382582:exon_74728788_74729051:MBP;ENSG00000197971:ENST00000355994:exon_74728788_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397875:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397866:exon_74728788_74729018:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397865:exon_74728788_74729042:MBP;ENSG00000197971:ENST00000527041:exon_74728788_74729021:MBP;ENSG00000197971:ENST00000359645:exon_74728788_74728998:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397869:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000354542:exon_74728788_74729217:MBP;ENSG00000197971:ENST00000526111:exon_74728788_74728869:MBP;ENSG00000197971:ENST00000529144:exon_74728788_74728869:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397868:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000473302:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000483025:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000493623:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000484548:exon_74728788_74728998:MBP;ENSG00000197971:ENST00000467108:exon_74728788_74729014:MBP;ENSG00000197971:ENST00000459948:exon_74728788_74729017:MBP;ENSG00000197971:ENST00000482445:exon_74728788_74729011:MBP;ENSG00000197971:ENST00000498683:exon_74728788_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397863:exon_74724735_74729224:MBP;ENSG00000197971:ENST00000397860:exon_74724735_74729224:MBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	77067171	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77066986_77067234:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000490210:exon_77066986_77067234:ATP9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	77246406	T/G	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	77246445	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	18	77513721	T/C	1	25	26	51	12.2620621753772	13.2474553376077	-0.985393162230563	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.888799947862546	ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	307282	T/C	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_307119_307536:MIER2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	312264	G/A	1	16	6	22	7.84771979224139	3.05710507790948	4.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0534075122332023	ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_312191_312272:MIER2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	334474	T/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_334400_334542:MIER2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	571513	G/A	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_571325_571579:BSG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	579636	C/T	1	261	496	757	128.015929110938	252.720686440517	-124.704757329579	T:C	C	T	10	0.509517512984913	9.18143035355025e-20	ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	580388	C/G	1	290	571	861	142.239921234375	290.934499914385	-148.69457868001	A:T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	2.15339943306249e-24	ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	620009	G/A	1	4	15	19	1.96192994806035	7.64276269477369	-5.68083274671335	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0105294628979665	ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_619958_620080:POLRMT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	621063	A/G	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	622687	G/A	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622582_622752:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622582_622752:POLRMT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	871987	G/A	1	26	26	52	12.7525446623923	13.2474553376077	-0.494910675215475	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.890880168575511	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	877082	G/A	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_876974_877180:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_876974_877180:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_876974_877180:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_876974_877180:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_876974_877180:MED16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	879952	A/G	1	21	6	27	10.3001322273168	3.05710507790948	7.24302714940735	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00616040020798849	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	880078	G/T	1	9	16	25	4.41434238313578	8.15228020775861	-3.73793782462282	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.162388493015305	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	880081	G/A	1	16	10	26	7.84771979224139	5.09517512984913	2.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.329230577261424	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	965031	C/T	1	62	49	111	30.4099141949354	24.9663581362607	5.44355605867466	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.342527037685557	ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_964833_965080:ARID3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	966831	G/A	1	38	54	92	18.6383345065733	27.5139457011853	-8.87561119461199	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0758064412964891	ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	971986	C/T	1	62	74	136	30.4099141949354	37.7042959608836	-7.29438176594817	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.230016119063209	ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_971878_972781:ARID3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1036456	C/G	1	180	143	323	88.2868476627157	72.8610043568426	15.4258433058731	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0948677695642474	ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1036468	A/G	1	175	133	308	85.8344352276402	67.7658292269934	18.0686060006468	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0402661891925562	ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1036575	G/A	1	12	5	17	5.88578984418104	2.54758756492456	3.33820227925648	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.144694391340598	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1037563	A/G	0	20	0	20	9.80964974030174	0	9.80964974030174	A	A		10	0.509517512984913	2.03987320056560e-06	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1037584	C/T	1	15	1	16	7.35723730522631	0.509517512984913	6.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000536114215102794	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1037941	G/T	1	152	35	187	74.5533380262932	17.833112954472	56.7202250718213	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1.19748318195261e-17	ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1052086	G/A	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1051941_1052125:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1051941_1052125:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1051941_1052125:ABCA7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1055191	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1055096_1055350:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000530092:exon_1055096_1055350:ABCA7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1056065	A/G	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056065_1056242:ABCA7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1057863	A/T	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.787003666689933	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1064193	G/A	1	28	10	38	13.7335096364224	5.09517512984913	8.63833450657331	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00539586884022519	ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1068734	T/C	1	31	14	45	15.2049570974677	7.13324518178878	8.07171191567892	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0169499531939748	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1068738	G/A	1	37	15	52	18.1478520195582	7.64276269477369	10.5050893247845	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00346785120317174	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1106210	G/A	1	27	56	83	13.2430271494074	28.5329807271551	-15.2899535777478	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000890504065944015	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1106477	G/C	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.804187903583641	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1114405	G/T	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1114230_1114421:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1114230_1114421:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1114230_1114421:SBNO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1271547	C/T	1	10	12	22	4.90482487015087	6.11421015581896	-1.20938528566809	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.672962537607921	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1272040	T/C	1	774	685	1459	379.633444949677	349.019496394665	30.613948555012	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.110245162402495	ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1370742	G/C	1	24	21	45	11.7715796883621	10.6998677726832	1.07171191567891	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.767850096057718	ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1370641_1371077:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1370641_1371077:MUM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1390968	C/T	1	113	75	188	55.4245210327048	38.2138134738685	17.2107075588364	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0129989105650913	ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1390870_1391049:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1390870_1391049:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1390870_1391049:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1390870_1391049:NDUFS7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1429947	C/T	1	4	11	15	1.96192994806035	5.60469264283404	-3.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0719999094721795	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1578240	G/A	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000071655:ENST00000156825:exon_1576678_1578537:MBD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1611856	G/A	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.180400712281148	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1619350	C/T	1	75	58	133	36.7861865261315	29.552015753125	7.23417077300657	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.225056351566870	ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1819125	T/C	1	21	12	33	10.3001322273168	6.11421015581896	4.18592207149787	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.165267760206332	ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1827565	A/G	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1828544	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1854557	A/G	1	20	14	34	9.80964974030174	7.13324518178878	2.67640455851296	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.394457678652606	ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1912817	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1912900	A/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1912934	T/C	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1924157	G/A	1	13	11	24	6.37627233119613	5.60469264283404	0.771579688362088	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.83951915689104	ENSG00000227500:ENST00000316097:exon_1924107_1926012:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000414057:exon_1924107_1925015:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000409472:exon_1924107_1926011:SCAMP4;ENSG00000227500:ENST00000472442:exon_1924107_1926005:SCAMP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1979386	C/T	1	34	37	71	16.676404558513	18.8521479804418	-2.17574342192882	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.636185018640214	ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979318_1979402:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979318_1979402:CSNK1G2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	1997363	A/G	1	16	25	41	7.84771979224139	12.7379378246228	-4.89021803238143	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.159192167561288	ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2073354	C/A	1	50	57	107	24.5241243507543	29.04249824014	-4.51837388938569	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.386266756086145	ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2071037_2073423:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2073140_2073423:MOBKL2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2078409	A/G	1	52	48	100	25.5050893247845	24.4568406232758	1.0482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.842238577674175	ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2078488	T/C	1	60	56	116	29.4289492209052	28.5329807271551	0.895968493750093	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.92608063580213	ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2097986	T/C	1	11	3	14	5.39530735716596	1.52855253895474	3.86675481821122	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.057993110530478	ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2110746	G/A	1	66	62	128	32.3718441429957	31.5900858050646	0.781758337931137	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.929657744666085	ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2138654	T/G	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2223327	G/A	1	28	28	56	13.7335096364224	14.2664903635776	-0.532980727155127	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.894610793773664	ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2223280_2223485:DOT1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2226772	G/C	1	46	41	87	22.562194402694	20.8902180323814	1.67197637031257	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.748530606872298	ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2339166	C/T	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2339068_2339207:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2339068_2339207:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2339068_2339207:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2339068_2339207:AC004410.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2344034	C/A	1	16	18	34	7.84771979224139	9.17131523372843	-1.32359544148704	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.732552886508093	ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2343963_2344037:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2343963_2344037:AC004410.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2426105	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000099800:ENST00000215570:exon_2425630_2427044:TIMM13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2434053	G/A	1	66	49	115	32.3718441429957	24.9663581362607	7.405486006735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.191489998688081	ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2762585	A/C	1	28	14	42	13.7335096364224	7.13324518178878	6.60026445463365	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0451459874266247	ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2810618	T/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2933480	C/T	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2994903	T/C	1	13	17	30	6.37627233119613	8.66179772074352	-2.28552538954739	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.467013421950797	ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	2994921	G/A	1	13	20	33	6.37627233119613	10.1903502596983	-3.81407792850213	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.223320051652451	ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3054196	G/C	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.344641246232424	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3452644	G/T	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000141905:ENST00000443272:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000395111:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000346156:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000341919:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000343825:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000269778:exon_3452480_3452664:NFIC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3544952	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3548168	T/C	1	15	17	32	7.35723730522631	8.66179772074352	-1.30456041551722	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.724820906305913	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3548121_3548265:C19orf28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3641792	T/C	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3641703_3641807:PIP5K1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3752874	A/C,G	0	0	20	20	0	10.1903502596983	-10.1903502596983	T:C:G	A	G	10	0.509517512984913	6.49336931999849e-07	ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3753769	C/T	1	20	20	40	9.80964974030174	10.1903502596983	-0.38070051939652	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3754338	A/C	1	18	9	27	8.82868476627157	4.58565761686422	4.24302714940735	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.123899416681013	ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3754193_3754338:APBA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3765267	C/T	1	97	101	198	47.5768012404634	51.4612688114762	-3.88446757101277	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.618947504886393	ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3765164_3765329:MRPL54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3976549	C/T	1	3829	3638	7467	1878.05744278077	1853.62471223911	24.4327305416548	A:T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.578501296797426	ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3976055_3976745:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3976055_3976745:EEF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	3983184	A/G	1	876	840	1716	429.662658625216	427.994710907327	1.66794771788932	A:T:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.942267301262902	ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4102449	G/A	0	229	0	229	112.320489526455	0	112.320489526455	G	G		10	0.509517512984913	9.0379701017817e-68	ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4102374_4103202:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4102374_4102451:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4102374_4102502:MAP2K2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4233095	T/C	0	34	0	34	16.676404558513	0	16.676404558513	T	T		10	0.509517512984913	1.40795148564170e-10	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4233096	G/A	0	34	0	34	16.676404558513	0	16.676404558513	G	G		10	0.509517512984913	1.40795148564170e-10	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4233107	C/T	1	32	2	34	15.6954395844828	1.01903502596983	14.676404558513	T:C	C	T	10	0.509517512984913	8.06119321557035e-08	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4234856	T/A	1	18	14	32	8.82868476627157	7.13324518178878	1.69543958448278	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.598757235104772	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4251069	T/C	1	28	35	63	13.7335096364224	17.833112954472	-4.09960331804952	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.315789624211907	ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4325433	G/A	1	32	13	45	15.6954395844828	6.62372766880387	9.07171191567891	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00704441023012646	ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4361582	G/A	1	29	19	48	14.2239921234375	9.68083274671335	4.54315937672418	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.197283641732197	ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4360370_4361793:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4360370_4361793:SH3GL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4433412	A/G	1	15	15	30	7.35723730522631	7.64276269477369	-0.28552538954739	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4433067_4433536:CHAF1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4454083	C/T	1	55	59	114	26.9765367858298	30.0615332661099	-3.08499648028008	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.575377788705751	ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4454104	G/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4658047	A/G	1	231	169	400	113.301454500485	86.1084596944503	27.1929948060348	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00687409315005025	ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4702085	A/G	1	19	10	29	9.31916725328665	5.09517512984913	4.22399212343752	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.138099592722369	ENSG00000142002:ENST00000357909:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000381797:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262960:exon_4702039_4702167:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262959:exon_4702039_4702167:DPP9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4704164	G/A	1	8	18	26	3.9238598961207	9.17131523372843	-5.24745533760774	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0488563641808063	ENSG00000142002:ENST00000357909:exon_4704143_4704316:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000381797:exon_4704143_4704239:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262960:exon_4704143_4704316:DPP9;ENSG00000142002:ENST00000262959:exon_4704143_4704316:DPP9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4816719	G/A	1	25	27	52	12.2620621753772	13.7569728505926	-1.49491067521548	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.680587313441794	ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4818167	G/A	1	20	17	37	9.80964974030174	8.66179772074352	1.14785201955822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.744501464766585	ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4839393	C/T	1	90	84	174	44.1434238313578	42.7994710907327	1.34395274062513	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.879559168925184	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4838346_4839548:PLIN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4859937	T/C	1	75	38	113	36.7861865261315	19.3616654934267	17.4245210327048	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00127565067056536	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4910889	G/T	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4910888_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4910566_4911050:UHRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4910924	C/T	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4910888_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4910566_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4910898_4911050:UHRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4929413	T/C	1	15	2	17	7.35723730522631	1.01903502596983	6.33820227925648	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0024177257597633	ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	4929473	A/G	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	5131091	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5131087_5131556:KDM4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	5594000	C/T	1	42	38	80	20.6002644546337	19.3616654934267	1.23859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.823523034649234	ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5593902_5594189:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5593902_5594189:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5593902_5594189:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5593902_5594189:SAFB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	5696068	C/G	1	75	69	144	36.7861865261315	35.156708395959	1.62947813017253	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.80304357518086	ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	5783905	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	5785209	T/C	0	32	0	32	15.6954395844828	0	15.6954395844828	T	T		10	0.509517512984913	5.51566975848331e-10	ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5785151_5785286:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5785155_5785286:DUS3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	5786815	G/A	1	15	22	37	7.35723730522631	11.2093852856681	-3.85214798044178	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.249934710989812	ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	5914605	A/G	1	16	19	35	7.84771979224139	9.68083274671335	-1.83311295447195	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.613187650868945	ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	5914625	G/A	1	11	19	30	5.39530735716596	9.68083274671335	-4.28552538954739	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.144013561824245	ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6230692	G/A	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.848425091361672	ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6230581_6230724:MLLT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6458240	G/C	1	12	1	13	5.88578984418104	0.509517512984913	5.37627233119613	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00348710510277128	ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6468331	T/C	1	105	100	205	51.5006611365841	50.9517512984913	0.548909838092833	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.944445730980625	ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6468452	C/A	1	54	43	97	26.4860542988147	21.9092530583513	4.57680124046344	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.362627284912786	ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6664955	G/A	1	17	33	50	8.33820227925648	16.8140779285021	-8.47587564924565	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0226579847473305	ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6664568_6665361:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000366236:exon_6664568_6665361:TNFSF14;ENSG00000125735:ENST00000326176:exon_6664568_6665361:TNFSF14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6734003	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6755007	T/C	1	16	20	36	7.84771979224139	10.1903502596983	-2.34263046745687	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.506012988700997	ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6760974	T/C	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.264915529576399	ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6760649_6760998:SH2D3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	6763718	A/G	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6763691_6763827:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6763691_6763827:SH2D3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7083761	A/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7163140	T/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7163154	G/A	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7166376	C/T	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7166388	G/A	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7532252	G/C	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7532100_7532570:ARHGEF18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7600845	A/C	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7600819_7600906:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7600675_7600906:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7600675_7600906:PNPLA6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7694393	G/A	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7703565	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7703605	C/T	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.303085077368447	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7707369	G/A	1	72	80	152	35.3147390650863	40.761401038793	-5.44666197370677	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.417321926536675	ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7707315_7707422:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7707315_7707422:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7707315_7707422:STXBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7711221	T/C	1	80	62	142	39.238598961207	31.5900858050646	7.64851315614236	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.208687695718044	ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7712364	A/G	1	114	115	229	55.9150035197199	58.594513993265	-2.67951047354508	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.741337514142081	ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7747445	G/A	1	318	455	773	155.973430870798	231.830468408135	-75.8570375373377	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	5.08634958486731e-08	ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7754222	G/A	1	548	635	1183	268.784402884268	323.54362074542	-54.759217861152	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00151750384379189	ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7753663_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7753667_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7753667_7754316:FCER2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7755056	G/A	1	678	521	1199	332.547126196229	265.45862426514	67.0885019310893	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000107311943566660	ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7755045_7755151:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7755045_7755151:FCER2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7755285	A/G	1	10	2	12	4.90482487015087	1.01903502596983	3.88578984418104	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0389831260229786	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	7763248	G/A	1	1565	1413	2978	767.605092178611	719.948245847682	47.6568463309291	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0816614051868017	ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8028544	A/G	1	156	160	316	76.5152679743536	81.5228020775861	-5.0075341032325	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.574312273283755	ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8038724	G/A	1	52	57	109	25.5050893247845	29.04249824014	-3.53740891535552	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.504269461275342	ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8038609_8038762:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8038609_8038762:ELAVL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8319419	G/T	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8319455	C/T	1	16	18	34	7.84771979224139	9.17131523372843	-1.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.732552886508093	ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8367359	G/C	1	74	49	123	36.2957040391164	24.9663581362607	11.3293459028557	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0469112735674988	ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8367709	C/T	1	38	24	62	18.6383345065733	12.2284203116379	6.4099141949354	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.126868363099528	ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367661_8367722:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367661_8367864:CD320
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8369896	A/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8373152	T/C	1	12	15	27	5.88578984418104	7.64276269477369	-1.75697285059265	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.566049825319431	ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8385811	A/G	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344641246232424	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8386998	T/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000233927:ENST00000445365:exon_8386540_8387376:RPS28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8466991	C/T	1	123	85	208	60.3293459028557	43.3089886037176	17.0203572991381	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0184146153073254	ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8466970_8467163:RAB11B;ENSG00000185236:ENST00000449488:exon_8466970_8467163:RAB11B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8468349	C/T	1	84	81	165	41.2005289092673	41.270918551778	-0.0703896425106478	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8550911	G/C	1	211	176	387	103.491804760183	89.6750822853447	13.8167224748387	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.169830238292596	ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8553630	C/T	1	387	326	713	189.816722474839	166.102709233082	23.714013241757	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0783210406414743	ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8553575_8553885:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8553575_8553885:HNRNPM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8578000	G/A	1	13	8	21	6.37627233119613	4.0761401038793	2.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.385136200083102	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8578118	A/G	1	18	14	32	8.82868476627157	7.13324518178878	1.69543958448278	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.598757235104772	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8578199	T/C	1	20	11	31	9.80964974030174	5.60469264283404	4.2049570974677	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.151896927870573	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	8587553	T/C	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000142347:ENST00000446661:exon_8587518_8587713:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000305795:exon_8587518_8587617:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000338257:exon_8587518_8587713:MYO1F
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	9267292	G/A	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	9271969	C/A	1	18	7	25	8.82868476627157	3.56662259089439	5.26206217537718	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0442204327617449	ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	9639179	C/T	1	14	15	29	6.86675481821122	7.64276269477369	-0.776007876562477	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.853530678106061	ENSG00000130818:ENST00000253115:exon_9638683_9640312:ZNF426
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	9640228	C/T	1	10	2	12	4.90482487015087	1.01903502596983	3.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0389831260229786	ENSG00000130818:ENST00000253115:exon_9638683_9640312:ZNF426
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	9721401	A/T	1	16	14	30	7.84771979224139	7.13324518178878	0.71447461045261	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.856318725452094	ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	9949152	G/A	1	223	206	429	109.377594604364	104.960607674892	4.41698692947233	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.699323079860066	ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10204575	G/C	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.202562406596383	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10221151	C/G	1	26	35	61	12.7525446623923	17.833112954472	-5.08056829207969	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.202492140892798	ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10224526	C/T	1	15	38	53	7.35723730522631	19.3616654934267	-12.0044281882004	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00133759504732129	ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10225138	G/A	1	57	33	90	27.95750175986	16.8140779285021	11.1434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0201998628728415	ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10225777	A/G	1	508	475	983	249.165103403664	242.020818667834	7.14428473583052	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.655264625752992	ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10226256	A/G	1	406	367	773	199.135889728125	186.992927265463	12.1429624626623	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.38810639669685	ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10229297	C/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000130811:ENST00000453552:exon_10229275_10229403:EIF3G
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10334663	T/G	1	24	11	35	11.7715796883621	5.60469264283404	6.16688704552805	T:C:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0422283995357171	ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10370490	T/A	1	314	315	629	154.011500922737	160.498016590248	-6.48651566751028	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.632287918038777	ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10385417	C/T	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.623377837269659	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10385540	A/T	1	107	89	196	52.4816261106143	45.3470586556573	7.13456745495705	A:T:G	A	T	10	0.509517512984913	0.317905759012474	ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10385441_10385704:ICAM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10404867	G/T	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000105376:ENST00000221980:exon_10404716_10404994:ICAM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10444603	C/G	1	711	816	1527	348.733048267727	415.766290595689	-67.0332423279621	A:T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.000602068836185669	ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10445165	C/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10450285	G/A	1	92	76	168	45.124388805388	38.7233309868534	6.40105781853462	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.354551884021944	ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10450215_10450345:ICAM3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10461708	A/G	1	22	17	39	10.7906147143319	8.66179772074352	2.12881699358839	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.525347987196032	ENSG00000105397:ENST00000529422:exon_10461464_10461969:TYK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10463679	G/A	1	94	84	178	46.1053537794182	42.7994710907327	3.30588268868549	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.653126165004547	ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530220:exon_10463602_10463932:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000527481:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10463602_10463774:TYK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10475649	C/T	1	24	19	43	11.7715796883621	9.68083274671335	2.09074694164874	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.545539155211247	ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10610236	A/G	1	22	20	42	10.7906147143319	10.1903502596983	0.600264454633654	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.878542192032311	ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10610071_10610756:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10610071_10610756:KEAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10742831	C/T	1	35	46	81	17.166887045528	23.437805597306	-6.27091855177795	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.182544882077461	ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742720_10742832:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742720_10742832:SLC44A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	10798197	C/T	1	115	105	220	56.405486006735	53.4993388634159	2.90614714331914	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.736105801179594	ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10798022_10798384:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10798022_10798384:ILF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11105608	T/C	1	49	70	119	24.0336418637393	35.6662259089439	-11.6325840452046	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0349463478885151	ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11215846	T/C	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11319491	G/A	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11319362_11319505:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11319362_11319505:DOCK6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11323858	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11323852_11324004:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11323852_11324004:DOCK6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11325229	C/T	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11325229_11325325:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11325229_11325325:DOCK6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11326119	A/G	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11326063_11326147:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11326063_11326147:DOCK6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11332820	C/T	1	10	2	12	4.90482487015087	1.01903502596983	3.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0389831260229786	ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11332785_11332924:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11332785_11332924:DOCK6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11489049	G/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000187266:ENST00000222139:exon_11488475_11489271:EPOR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	11598240	G/A	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12059543	G/A	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12060786	A/G	1	14	30	44	6.86675481821122	15.2855253895474	-8.41877057133617	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0149065288107120	ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12383540	G/C	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12384580	T/C	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12760200	G/A	1	380	345	725	186.383345065733	175.783541979795	10.5998030859381	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.435585759427562	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12760155_12760242:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12760155_12760242:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12760155_12760242:MAN2B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12772165	G/A	1	79	65	144	38.7481164741919	33.1186383440193	5.62947813017253	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.360225410673619	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12779170	G/A	1	446	431	877	218.755189208729	219.602048096497	-0.84685888776869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.973061415352643	ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12778881_12779239:C19orf56
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12800597	T/C	1	7	14	21	3.43337740910561	7.13324518178878	-3.69986777268317	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.127823723210135	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800575_12800688:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800575_12800688:FBXW9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12805431	T/C	1	15	9	24	7.35723730522631	4.58565761686422	2.77157968836209	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.309571402085472	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12805525	G/C	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12807066	G/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12807187	C/T	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12812169	A/G	1	41	29	70	20.1097819676186	14.7760078765625	5.33377409105609	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.232073620992907	ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12813683	T/C	1	24	24	48	11.7715796883621	12.2284203116379	-0.456840623275824	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12813637_12813732:TNPO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12816559	G/T	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000420511:exon_12816496_12816582:TNPO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12826024	C/A	1	2	10	12	0.980964974030174	5.09517512984913	-4.11421015581896	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0202598385065556	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12917520	A/G	1	54	25	79	26.4860542988147	12.7379378246228	13.7481164741919	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00220244777688364	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12917428_12917614:RNASEH2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12920935	G/A	1	64	33	97	31.3908791689656	16.8140779285021	14.5768012404634	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00312869335258352	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12920885_12921022:RNASEH2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12921186	T/C	1	59	38	97	28.9384667338901	19.3616654934267	9.57680124046344	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0539845589405711	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12921196	T/A	1	60	37	97	29.4289492209052	18.8521479804418	10.5768012404634	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.0330545051249641	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	12989560	G/A	1	26	28	54	12.7525446623923	14.2664903635776	-1.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.685921034682845	ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	13008607	G/T	1	28	18	46	13.7335096364224	9.17131523372843	4.562194402694	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.187576840948389	ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	13010516	G/A	1	88	63	151	43.1624588573277	32.0996033180495	11.0628555392781	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0737251963424353	ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	13067792	G/C	1	132	141	273	64.7436882859915	71.8419693308727	-7.09828104488125	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.397310747582465	ENSG00000179271:ENST00000316939:exon_13067677_13068050:GADD45GIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	13873698	G/C	1	29	24	53	14.2239921234375	12.2284203116379	1.99557181179961	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.680633459948215	ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13873404_13874106:CCDC130
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	13875421	C/T	1	14	18	32	6.86675481821122	9.17131523372843	-2.30456041551722	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.480992424821392	ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13875337_13875534:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13875360_13875534:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13875360_13875534:MRI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	13883099	A/G	1	41	22	63	20.1097819676186	11.2093852856681	8.90039668195048	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0313995823615252	ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	13885309	C/T	1	220	170	390	107.906147143319	86.6179772074352	21.2881699358839	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0333140908539465	ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	13885484	A/G	1	690	676	1366	338.43291604041	344.433838777801	-6.00092273739114	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.745478284749264	ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14023191	G/A	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14023136_14023251:CC2D1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14029627	A/C	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14029559_14029630:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14029559_14029630:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14029559_14029630:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14029559_14029630:CC2D1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14030689	T/C	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14142705	C/T	1	3	11	14	1.47144746104526	5.60469264283404	-4.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0321870224179764	ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14142262_14142784:IL27RA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14512256	C/T	1	53	67	120	25.9955718117996	34.1376733699892	-8.14210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.144583823628548	ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512198_14512375:CD97
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14580195	G/A	1	193	205	398	94.6631199939118	104.451090161907	-9.78797016799537	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.340926661882184	ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14580246	C/T	1	143	136	279	70.1389956431574	69.2943817659482	0.84461387720927	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.95227530093211	ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14582584	C/T	1	168	166	334	82.4010578185346	84.5799071554956	-2.17884933696095	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.826859892957316	ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14629150	G/A	1	20	27	47	9.80964974030174	13.7569728505926	-3.94732311029091	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.307170195569264	ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14629162	G/A	1	23	14	37	11.281097201347	7.13324518178878	4.14785201955822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.190700238472531	ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14629171	C/T	1	22	13	35	10.7906147143319	6.62372766880387	4.16688704552805	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.178202301062041	ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	14847013	G/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000127507:ENST00000353005:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000353876:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392967:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000346057:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392965:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000315576:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000360222:exon_14843205_14847056:EMR2;ENSG00000127507:ENST00000392964:exon_14843205_14847056:EMR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	15226084	G/A	1	41	52	93	20.1097819676186	26.4949106752155	-6.38512870759691	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.213188777898882	ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15225795_15226732:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15225798_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15225827_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000269733:exon_15225965_15226133:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226083_15226241:ILVBL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	15227030	G/A	1	28	22	50	13.7335096364224	11.2093852856681	2.52412435075435	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.483871757529487	ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	15350594	G/A	1	28	31	59	13.7335096364224	15.7950429025323	-2.06153326610987	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.605100357886613	ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	15367036	C/T	1	104	103	207	51.010178649569	52.480303837446	-1.47012518787699	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.889466705023545	ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000371835:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000392878:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000360016:exon_15366875_15367074:BRD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	15484752	G/A	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15484597_15484876:AKAP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	15565046	G/A	1	51	49	100	25.0146068377694	24.9663581362607	0.048248701508701	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15564960_15565078:RASAL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	16238279	C/T	1	71	45	116	34.8242565780712	22.9282880843211	11.8959684937501	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0322698069687558	ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	16268266	G/A	1	203	166	369	99.5679448640627	84.5799071554956	14.9880377085671	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.130944277830450	ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16268210_16269344:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16268020_16269344:HSH2D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	16620472	G/A	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000105072:ENST00000221671:exon_16620310_16620799:C19orf44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	16686889	C/T	1	22	24	46	10.7906147143319	12.2284203116379	-1.437805597306	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.768453449487112	ENSG00000105085:ENST00000263390:exon_16685718_16688493:MED26;ENSG00000105085:ENST00000453758:exon_16686841_16688059:MED26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	16790859	C/T	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000072954:ENST00000187762:exon_16790795_16790951:TMEM38A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	16980566	C/T	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000127511:ENST00000379803:exon_16980271_16980886:SIN3B;ENSG00000127511:ENST00000248054:exon_16980271_16980886:SIN3B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17212992	C/T	1	18	15	33	8.82868476627157	7.64276269477369	1.18592207149787	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.729903150514543	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17212466_17213367:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17212466_17213367:MYO9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17305781	T/G	1	32	43	75	15.6954395844828	21.9092530583513	-6.21381347386847	T:C:G	T	G	10	0.509517512984913	0.166254637755406	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17312992	C/T	1	53	32	85	25.9955718117996	16.3045604155172	9.69101139628239	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0390848178305909	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17316782	T/C	1	42	46	88	20.6002644546337	23.437805597306	-2.83754114267234	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.594417946527115	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17317955	A/G	1	58	43	101	28.447984246875	21.9092530583513	6.53873118852379	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.197414093102030	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17321487	A/G	1	20	7	27	9.80964974030174	3.56662259089439	6.24302714940735	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0197338258149335	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17322415	C/T	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.227496299270201	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17322564	C/T	1	46	56	102	22.562194402694	28.5329807271551	-5.97078632446112	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.275931180412308	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17322460_17322583:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17322456_17322595:MYO9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17330061	G/A	1	25	15	40	12.2620621753772	7.64276269477369	4.61929948060348	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.156839441077429	ENSG00000053501:ENST00000263897:exon_17330022_17330196:USE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17337555	C/A	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17412049	C/A	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17412218	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000127220:ENST00000247706:exon_17411665_17412433:ABHD8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17450357	G/A	1	13	24	37	6.37627233119613	12.2284203116379	-5.85214798044178	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.069380370380613	ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17450243_17450408:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17450243_17450408:GTPBP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17452490	A/T	1	33	38	71	16.1859220714979	19.3616654934267	-3.17574342192882	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.477840780621355	ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17452287_17453539:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17452287_17453539:GTPBP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17622614	C/T	1	47	28	75	23.0526768897091	14.2664903635776	8.78618652613153	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0491495841572926	ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17622432_17622769:PGLS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17628587	A/G	1	104	101	205	51.010178649569	51.4612688114762	-0.45109016190716	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17654181	C/T	1	37	24	61	18.1478520195582	12.2284203116379	5.91943170792031	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.158475924356849	ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17654126_17654242:FAM129C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17660300	G/A	1	35	46	81	17.166887045528	23.437805597306	-6.27091855177795	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.182544882077461	ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17664418	G/A	1	27	23	50	13.2430271494074	11.718902798653	1.52412435075435	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.674615869531795	ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17837090	C/T	1	21	17	38	10.3001322273168	8.66179772074352	1.6383345065733	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.62948546500411	ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17837512	G/A	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17954215	G/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105639:ENST00000527031:exon_17954189_17954300:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000458235:exon_17954189_17954300:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000527670:exon_17954189_17954300:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000534444:exon_17954189_17954300:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000428406:exon_17954189_17954300:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000526008:exon_17954189_17954300:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000437493:exon_17954189_17954300:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000427000:exon_17954189_17954300:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000528293:exon_17954189_17954300:JAK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	17954597	C/G	1	9	2	11	4.41434238313578	1.01903502596983	3.39530735716596	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.065955266796108	ENSG00000105639:ENST00000527031:exon_17954586_17954709:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000458235:exon_17954586_17954709:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000527670:exon_17954586_17954709:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000534444:exon_17954586_17954709:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000428406:exon_17954586_17954709:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000526008:exon_17954586_17954709:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000427000:exon_17954586_17954709:JAK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18047283	T/G	1	145	184	329	71.1199606171876	93.751222389224	-22.6312617720364	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0130477025532764	ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18234441	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234390_18234465:MAST3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18245512	C/T	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245389_18245521:MAST3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18245764	C/T	1	13	6	19	6.37627233119613	3.05710507790948	3.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.168530333768717	ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18245627_18245792:MAST3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18255359	G/A	1	3	9	12	1.47144746104526	4.58565761686422	-3.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0867923369694881	ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18255276_18255503:MAST3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18257750	C/T	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18257691_18257827:MAST3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18288069	A/G	1	852	703	1555	417.891078936854	358.190811628394	59.7002673084603	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00253363126273043	ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18420570	C/T	1	65	78	143	31.8813616559807	39.7423660128232	-7.86100435684256	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.209591622624553	ENSG00000130520:ENST00000252816:exon_18420488_18420671:LSM4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18538742	A/C	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18542201	C/T	1	26	9	35	12.7525446623923	4.58565761686422	8.16688704552805	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00629932212653531	ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18542163_18542228:SSBP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18546678	T/C	1	24	33	57	11.7715796883621	16.8140779285021	-5.04249824014004	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.187945322206216	ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18547209	G/A	1	18	19	37	8.82868476627157	9.68083274671335	-0.85214798044178	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.869819021756582	ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18547140_18547289:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18547140_18547289:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18547140_18547289:ISYNA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18547264	C/T	1	21	19	40	10.3001322273168	9.68083274671335	0.61929948060348	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.875534708687596	ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18547140_18547289:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18547140_18547289:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18547140_18547289:ISYNA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18561420	C/T	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18561287_18561785:ELL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18561473	G/A	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18561287_18561785:ELL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18572616	C/A	1	17	8	25	8.33820227925648	4.0761401038793	4.26206217537717	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.109340228515106	ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18572388_18572662:ELL;ENSG00000105656:ENST00000392395:exon_18572388_18572662:ELL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18652521	G/A	1	192	201	393	94.1726375068967	102.413020109968	-8.2403826030708	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.419713418499730	ENSG00000105701:ENST00000222308:exon_18652489_18652805:FKBP8;ENSG00000105701:ENST00000453489:exon_18652489_18652805:FKBP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	18965426	C/T	1	23	19	42	11.281097201347	9.68083274671335	1.60026445463366	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.646500103260762	ENSG00000005007:ENST00000262803:exon_18965410_18965518:UPF1;ENSG00000005007:ENST00000418384:exon_18965410_18965518:UPF1;ENSG00000005007:ENST00000447615:exon_18965410_18965518:UPF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19023853	T/C	1	170	177	347	83.3820227925648	90.1845997983296	-6.8025770057648	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.485319524905943	ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19135502	A/G	1	20	25	45	9.80964974030174	12.7379378246228	-2.92828808432109	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.456451955455906	ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19135428_19136265:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19136299	T/C	1	47	35	82	23.0526768897091	17.833112954472	5.21956393523714	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.270224213547309	ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19230816	T/C	1	35	19	54	17.166887045528	9.68083274671335	7.4860542988147	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0557002991524429	ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19230868	A/G	1	18	15	33	8.82868476627157	7.64276269477369	1.18592207149787	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.729903150514543	ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19312537	T/C	1	203	177	380	99.5679448640627	90.1845997983296	9.38334506573307	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.355776089615967	ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000184162:ENST00000331552:exon_19312226_19312850:NR2C2AP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19449686	G/T	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000129933:ENST00000392313:exon_19449654_19449748:MAU2;ENSG00000129933:ENST00000262815:exon_19449654_19449748:MAU2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19606634	G/A	1	14	12	26	6.86675481821122	6.11421015581896	0.752544662392262	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.845747407952092	ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19648346	G/C	1	15	10	25	7.35723730522631	5.09517512984913	2.26206217537718	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.426470603476087	ENSG00000250067:ENST00000458210:exon_19648121_19648387:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000514277:exon_19648121_19648390:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000436027:exon_19648128_19648393:YJEFN3;ENSG00000250067:ENST00000397179:exon_19648128_19648393:YJEFN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19740729	C/G	1	149	139	288	73.081890565248	70.8229343049029	2.25895626034506	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.813760222972306	ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	19906131	T/G	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.112356383277526	ENSG00000081665:ENST00000443905:exon_19904643_19906469:ZNF506;ENSG00000081665:ENST00000450683:exon_19903528_19906469:ZNF506
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	20044570	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20044546_20044692:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	21991663	A/G	1	2	10	12	0.980964974030174	5.09517512984913	-4.11421015581896	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0202598385065556	ENSG00000198521:ENST00000397148:exon_21990085_21992609:ZNF43;ENSG00000198521:ENST00000354959:exon_21990128_21992609:ZNF43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	23542697	G/C	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	23543834	C/T	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	23837321	A/C	1	22	16	38	10.7906147143319	8.15228020775861	2.63833450657331	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.420908759660315	ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	30164797	A/G	1	39	44	83	19.1288169935884	22.4187705713362	-3.28995357774778	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.510745430488431	ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33106621	C/T	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33110204	T/C	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33117657	C/T	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33117666	T/C	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33183352	G/C	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33467357	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33467576	G/A	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33870157	A/T	1	33	52	85	16.1859220714979	26.4949106752155	-10.3089886037176	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.0295767514147303	ENSG00000153879:ENST00000284000:exon_33870050_33873591:CEBPG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	33870605	C/T	1	61	47	108	29.9194317079203	23.9473231102909	5.9721085976294	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289720292581108	ENSG00000153879:ENST00000284000:exon_33870050_33873591:CEBPG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	34706531	A/G	1	67	70	137	32.8623266300108	35.6662259089439	-2.80389927893308	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.669507488275388	ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	34895649	C/T	1	20	18	38	9.80964974030174	9.17131523372843	0.638334506573306	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.872297020058223	ENSG00000126249:ENST00000246535:exon_34895554_34895720:PDCD2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35506729	G/A	1	64	19	83	31.3908791689656	9.68083274671335	21.7100464222522	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1.39029121554203e-06	ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35510102	G/C	1	62	31	93	30.4099141949354	15.7950429025323	14.6148712924031	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00251783316404362	ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35516949	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35648365	T/G	1	153	133	286	75.0438205133083	67.7658292269934	7.27799128631489	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.407893431061495	ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35649281	A/G	1	252	269	521	123.601586727802	137.060210992942	-13.4586242651397	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.254563176817662	ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35660450	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35660546	T/C	1	383	342	725	187.854792526778	174.25498944084	13.5998030859381	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.31611178783989	ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35741456	T/C	1	32	23	55	15.6954395844828	11.718902798653	3.97653678582979	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.345256051473414	ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35829256	G/A	1	188	83	271	92.2107075588364	42.2899535777478	49.9207539810886	A:G	G	A	10	0.509517512984913	8.4662584071968e-10	ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35829071_35829334:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35829071_35829334:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35829071_35829334:CD22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35831986	C/T	1	442	477	919	216.793259260668	243.039853693804	-26.246594433135	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0862177510613228	ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35831784_35832041:CD22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35837428	G/A	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.324346196468135	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	35941535	G/A	1	42	41	83	20.6002644546337	20.8902180323814	-0.289953577747781	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000126262:ENST00000246549:exon_35940617_35941609:FFAR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36038390	A/G	1	56	68	124	27.4670192728449	34.6471908829741	-7.18017161012921	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.209139427271522	ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36109849	C/T	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36109789_36109951:HAUS5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36109850	G/A	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36109789_36109951:HAUS5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36111168	C/A	1	15	15	30	7.35723730522631	7.64276269477369	-0.28552538954739	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36111097_36111229:HAUS5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36258664	A/G	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.642296381993564	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36276369	G/T	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36276311_36276385:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36276311_36276385:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000378944:exon_36276311_36276385:ARHGAP33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36278470	C/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36278070_36279724:ARHGAP33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36279349	C/T	1	23	17	40	11.281097201347	8.66179772074352	2.61929948060348	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.432944076740435	ENSG00000004777:ENST00000314737:exon_36278070_36279724:ARHGAP33;ENSG00000004777:ENST00000007510:exon_36278070_36279724:ARHGAP33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36435759	T/C	1	15	5	20	7.35723730522631	2.54758756492456	4.80964974030174	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0421132759377614	ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36435450_36436084:LRFN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36581404	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36581347_36581422:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36581347_36581422:WDR62
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36595436	A/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36605582	C/T	1	159	146	305	77.9867154353988	74.3895568957973	3.59715853960154	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.688895560928496	ENSG00000105258:ENST00000221859:exon_36605561_36605615:POLR2I
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	36727365	G/A	1	37	28	65	18.1478520195582	14.2664903635776	3.88136165598065	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.385567747345515	ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	37853375	T/C	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	37854235	G/T	1	31	29	60	15.2049570974677	14.7760078765625	0.428949220905221	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	37854580	C/T	1	20	34	54	9.80964974030174	17.323595441487	-7.5139457011853	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0420102056939708	ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	38573149	G/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38571896_38573739:SIPA1L3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	38798086	T/C	1	59	66	125	28.9384667338901	33.6281558570043	-4.68968912311412	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.421535897114781	ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	38800165	C/T	1	55	46	101	26.9765367858298	23.437805597306	3.53873118852379	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.488100853708107	ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	38896244	C/A	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38896159_38896275:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38896159_38896275:FAM98C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	38899548	G/A	1	22	13	35	10.7906147143319	6.62372766880387	4.16688704552805	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.178202301062041	ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39306509	G/A	1	432	392	824	211.888434390518	199.730865090086	12.1575693004317	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.403178817239962	ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39306497_39306647:ECH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39322087	T/G	1	168	171	339	82.4010578185346	87.1274947204201	-4.72643690188551	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.625119389401302	ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39329517	C/T	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.473518684740505	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39416898	G/A	1	26	17	43	12.7525446623923	8.66179772074352	4.09074694164874	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.225654893466098	ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39421274	T/C	1	14	24	38	6.86675481821122	12.2284203116379	-5.36166549342669	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.103795042786148	ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39421110_39421536:FBXO17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39421928	T/C	1	116	138	254	56.8959684937501	70.313416791918	-13.4174482981679	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.102576884087992	ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39421594_39421983:MRPS12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39423001	T/C	1	138	136	274	67.686583208082	69.2943817659482	-1.60779855786616	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.856349806264645	ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39914308	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39914748	G/A	1	36	40	76	17.6573695325431	20.3807005193965	-2.72333098685339	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.56723133152269	ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39915637	G/A	1	28	24	52	13.7335096364224	12.2284203116379	1.50508932478452	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.781796812318336	ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39915758	C/G	1	37	29	66	18.1478520195582	14.7760078765625	3.37184414299574	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.460618660424323	ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39926509	A/C	1	4434	3472	7906	2174.7993474249	1769.04480508362	405.754542341278	A:T:C:G	A	C	10	0.509517512984913	6.16985256381354e-20	ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39926521	G/A	1	4262	3369	7631	2090.4363596583	1716.56450124617	373.871858412129	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	1.02878265327497e-17	ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39926548	G/A	1	3116	3730	6846	1528.34342953901	1900.50032343373	-372.156893894714	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	2.46709952199385e-19	ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	39963828	T/A	0	0	9	9	0	4.58565761686422	-4.58565761686422	A	T	A	10	0.509517512984913	0.00164290157940605	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	40030654	G/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	40486136	G/A	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.482132183542689	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	40486171	C/T	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	40521106	G/A	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000187187:ENST00000347077:exon_40519572_40523514:ZNF546;ENSG00000187187:ENST00000392042:exon_40520823_40521666:ZNF546;ENSG00000187187:ENST00000444043:exon_40520950_40521410:ZNF546
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	40719076	T/C	1	27	16	43	13.2430271494074	8.15228020775861	5.09074694164874	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.129236673408955	ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	40928944	A/G	1	19	23	42	9.31916725328665	11.718902798653	-2.39973554536634	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.537708485716917	ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	40929363	T/C	1	42	40	82	20.6002644546337	20.3807005193965	0.219563935237133	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41128918	T/C	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128855_41128926:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128855_41128926:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128855_41128926:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128855_41128926:LTBP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41173372	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105245:ENST00000252891:exon_41171810_41174043:NUMBL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41209477	C/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41220529	C/T	1	15	7	22	7.35723730522631	3.56662259089439	3.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.135346882910936	ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41220436_41220540:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41220436_41220540:ADCK4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41263403	A/G	1	191	134	325	93.6821550198816	68.2753467399783	25.4068082799033	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00545765119716787	ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41271104	T/C	1	189	160	349	92.7011900458514	81.5228020775861	11.1783879682654	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.239101963627061	ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41281700	C/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000213054:ENST00000263369:exon_41281657_41281790:MIA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41785020	A/G	1	88	98	186	43.1624588573277	49.9327162725215	-6.77025741519382	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.340677112457122	ENSG00000105323:ENST00000352456:exon_41784982_41785081:HNRNPUL1;ENSG00000105323:ENST00000392006:exon_41784982_41785081:HNRNPUL1;ENSG00000105323:ENST00000263367:exon_41784982_41785081:HNRNPUL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41822617	C/T	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000142039:ENST00000269967:exon_41822289_41822744:CCDC97
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41939248	C/T	1	18	19	37	8.82868476627157	9.68083274671335	-0.85214798044178	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.869819021756582	ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	41939297	C/G	1	9	17	26	4.41434238313578	8.66179772074352	-4.24745533760774	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.116679632873408	ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42085873	A/G	1	3	9	12	1.47144746104526	4.58565761686422	-3.11421015581896	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0867923369694881	ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42092815	T/A	0	10	0	10	4.90482487015087	0	4.90482487015087	T	T		10	0.509517512984913	0.00198502447144214	ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42092788_42093163:CEACAM21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42585344	C/T	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105732:ENST00000222339:exon_42582739_42585717:ZNF574;ENSG00000105732:ENST00000359044:exon_42582739_42585717:ZNF574
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42703833	A/G	1	13	16	29	6.37627233119613	8.15228020775861	-1.77600787656248	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.579398877321146	ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42719311	T/C	1	11	18	29	5.39530735716596	9.17131523372843	-3.77600787656248	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.194206386621495	ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42719300_42719404:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42719285_42719404:DEDD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42795554	T/C	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42794385_42795618:CIC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42906914	G/T	1	11	13	24	5.39530735716596	6.62372766880387	-1.22842031163791	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.685634010557098	ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42906759_42907183:LIPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42910416	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42910313_42910540:LIPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	42911558	C/T	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42911326_42911620:LIPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	43979589	G/T	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	43991204	G/A	1	1	11	12	0.490482487015087	5.60469264283404	-5.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00291655716474975	ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43991176_43991275:PHLDB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44098963	C/G	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44098961_44099492:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44098961_44099676:IRGQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44153003	C/T	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44237834	C/T	1	22	22	44	10.7906147143319	11.2093852856681	-0.418770571336172	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105771:ENST00000270066:exon_44237778_44237885:C19orf61
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44417575	A/G	1	25	17	42	12.2620621753772	8.66179772074352	3.60026445463365	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.283619813190237	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44418077	C/T	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44418343	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44418544	A/G	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44418621	C/T	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44418693	T/C	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44418776	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44500671	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44515352	T/G	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44515514	C/A	1	5	12	17	2.45241243507544	6.11421015581896	-3.66179772074352	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0909197869947799	ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44536123	A/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44536815	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44570957	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44674204	T/C	1	40	21	61	19.6192994806035	10.6998677726832	8.91943170792031	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0286685921137963	ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44674188_44674248:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000413984:exon_44674188_44674248:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44674188_44674248:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000300823:exon_44674188_44674248:ZNF226
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44680345	T/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44732658	C/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44739399	T/C	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44740713	C/T	1	15	19	34	7.35723730522631	9.68083274671335	-2.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.493953241174159	ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44792969	G/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000433015:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44790501_44793349:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000359844:exon_44792291_44793353:ZNF235
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44802969	T/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:T	T	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000159917:ENST00000391957:exon_44802961_44803056:ZNF235;ENSG00000159917:ENST00000291182:exon_44802961_44803056:ZNF235
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	44981516	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	45476422	T/C	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45476344_45476467:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45476344_45476467:CLPTM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	45490570	A/G	1	17	13	30	8.33820227925648	6.62372766880387	1.71447461045261	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.586721038583829	ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	45490636	T/C	1	27	26	53	13.2430271494074	13.2474553376077	-0.00442818820038759	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	45495915	C/T	1	55	32	87	26.9765367858298	16.3045604155172	10.6719763703126	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0241120729391364	ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	45575142	C/T	1	26	33	59	12.7525446623923	16.8140779285021	-4.06153326610987	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.300554699394871	ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	45579515	G/T	1	27	20	47	13.2430271494074	10.1903502596983	3.05267688970909	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.38575279318474	ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45579334_45579688:ZNF296
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	45909946	G/C	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45909467_45909976:CD3EAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	45992120	C/T	1	15	7	22	7.35723730522631	3.56662259089439	3.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.135346882910936	ENSG00000125744:ENST00000344680:exon_45992106_45992244:RTN2;ENSG00000125744:ENST00000245923:exon_45992106_45992244:RTN2;ENSG00000125744:ENST00000430715:exon_45992106_45992244:RTN2;ENSG00000213889:ENST00000401705:exon_45992035_45992237:PPM1N
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46029187	T/C	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.171917444065472	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46133251	C/T	1	65	14	79	31.8813616559807	7.13324518178878	24.7481164741919	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.12483181027327e-08	ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46133256	G/A	1	63	15	78	30.9003966819505	7.64276269477369	23.2576339871768	A:G	G	A	10	0.509517512984913	7.73098546233966e-08	ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46172777	C/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000010310:ENST00000263281:exon_46172735_46172850:GIPR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46180150	A/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46181466	C/G	1	29	23	52	14.2239921234375	11.718902798653	2.50508932478452	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.579468383594275	ENSG00000010310:ENST00000263281:exon_46181346_46181484:GIPR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46206262	G/A	1	36	32	68	17.6573695325431	16.3045604155172	1.35280911702592	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.808686533715203	ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46206336	C/T	1	58	49	107	28.447984246875	24.9663581362607	3.48162611061431	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.562026588925659	ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46216276	G/A	1	6	19	25	2.94289492209052	9.68083274671335	-6.73793782462282	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0083407956817305	ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46216642	G/T	1	8	17	25	3.9238598961207	8.66179772074352	-4.73793782462283	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0712556060461796	ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46268714	C/T	1	15	9	24	7.35723730522631	4.58565761686422	2.77157968836209	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.309571402085472	ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46268715	G/A	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46268806	G/A	1	23	7	30	11.281097201347	3.56662259089439	7.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00546088837923888	ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46268902	C/T	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46280895	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46281828	C/T	1	13	16	29	6.37627233119613	8.15228020775861	-1.77600787656248	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.579398877321146	ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46281751_46281899:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46281751_46281899:DMPK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46289503	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000185800:ENST00000270223:exon_46288852_46290129:DMWD;ENSG00000185800:ENST00000377735:exon_46288852_46290129:DMWD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46294136	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	46511421	C/T	1	8	17	25	3.9238598961207	8.66179772074352	-4.73793782462283	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0712556060461796	ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46511398_46511559:CCDC61
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47124626	C/T	1	17	24	41	8.33820227925648	12.2284203116379	-3.89021803238143	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.274300665161299	ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47124714	T/G	1	7	18	25	3.43337740910561	9.17131523372843	-5.73793782462282	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0266370371488721	ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47127020	G/A	1	7	13	20	3.43337740910561	6.62372766880387	-3.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.182340866714798	ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47126715_47127494:PTGIR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47127324	C/G	1	5	14	19	2.45241243507544	7.13324518178878	-4.68083274671335	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0382353432713789	ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47126715_47127494:PTGIR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47137459	C/T	1	18	7	25	8.82868476627157	3.56662259089439	5.26206217537718	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0442204327617449	ENSG00000167414:ENST00000300873:exon_47137333_47137461:GNG8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47197230	C/G	1	54	37	91	26.4860542988147	18.8521479804418	7.63390631837292	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.116381423972082	ENSG00000105287:ENST00000454760:exon_47197132_47197390:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000449438:exon_47197132_47197390:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000433867:exon_47197132_47197390:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000291281:exon_47197132_47197390:PRKD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47204341	G/A	1	49	48	97	24.0336418637393	24.4568406232758	-0.423198759536561	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105287:ENST00000454760:exon_47204292_47204369:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000449438:exon_47204292_47204369:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000433867:exon_47204292_47204369:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000291281:exon_47204292_47204369:PRKD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47424899	C/T	1	14	6	20	6.86675481821122	3.05710507790948	3.80964974030174	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.116630612949195	ENSG00000160007:ENST00000317082:exon_47421933_47425613:GRLF1;ENSG00000160007:ENST00000404338:exon_47421933_47425613:GRLF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47569826	G/A	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47567449_47571126:ZC3H4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47569842	G/C	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000130749:ENST00000253048:exon_47567449_47571126:ZC3H4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47769839	A/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47770015	A/C	1	21	13	34	10.3001322273168	6.62372766880387	3.67640455851296	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.232353878025532	ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47774706	C/T	1	21	27	48	10.3001322273168	13.7569728505926	-3.45684062327582	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.386644300426596	ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	47774772	T/C	1	23	17	40	11.281097201347	8.66179772074352	2.61929948060348	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.432944076740435	ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48205456	C/T	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48204585_48206534:GLTSCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48248834	T/C	1	769	527	1296	377.181032514602	268.515729343049	108.665303171553	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1.52002244032982e-09	ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48248864	C/A	1	728	985	1713	357.071250546983	501.874750290139	-144.803499743156	A:T:C	C	A	10	0.509517512984913	2.57189039140305e-12	ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48248907	G/C	1	1012	749	1761	496.368276859268	381.6286172257	114.739659633568	A:C:G	G	C	10	0.509517512984913	4.62112563036339e-08	ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48254799	T/C	1	390	287	677	191.288169935884	146.23152622667	45.0566437092139	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.000535103451843682	ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48254777_48254847:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254777_48254847:GLTSCR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48259200	A/G	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.623377837269659	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48259787	C/T	1	891	1119	2010	437.019895930443	570.150097030118	-133.130201099675	T:C	C	T	10	0.509517512984913	2.82688535877671e-09	ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000422743:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000325566:exon_48259785_48259861:GLTSCR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48558159	G/A	1	7	17	24	3.43337740910561	8.66179772074352	-5.22842031163791	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0402116433714956	ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48558135_48558306:PLA2G4C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48602933	T/C	1	14	34	48	6.86675481821122	17.323595441487	-10.4568406232758	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00343312435687827	ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48602948	T/C	1	31	15	46	15.2049570974677	7.64276269477369	7.562194402694	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0271247378328142	ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48621036	C/G	1	35	26	61	17.166887045528	13.2474553376077	3.91943170792031	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.370290475774054	ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48626218	G/A	1	39	38	77	19.1288169935884	19.3616654934267	-0.232848499838298	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48626191_48626273:LIG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	48654553	G/T	1	14	14	28	6.86675481821122	7.13324518178878	-0.266490363577564	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49376920	C/T	1	139	114	253	68.1770656950971	58.0849964802801	10.092069214817	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.209055571170899	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49377424	G/A	1	164	134	298	80.4391278704743	68.2753467399783	12.1637811304959	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.16458340564619	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49377436	G/C	1	179	136	315	87.7963651757006	69.2943817659482	18.5019834097524	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0371865502662525	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49378875	G/A	1	87	69	156	42.6719763703126	35.156708395959	7.51526797435358	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.23100483847159	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49378994	A/G	1	67	75	142	32.8623266300108	38.2138134738685	-5.35148684385765	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.40149812581822	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49379167	C/T	1	126	104	230	61.800793363901	52.989821350431	8.81097201347001	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.262337298161251	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49379182	G/C	1	146	137	283	71.6104431042027	69.8038992789331	1.80654382526963	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.858518006599536	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49407675	A/G	1	62	67	129	30.4099141949354	34.1376733699892	-3.72775917505378	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.538215340278315	ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000452087:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000443560:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000411700:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000451312:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49407604_49407711:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000424608:exon_49407604_49407711:NUCB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49425576	C/T	1	58	50	108	28.447984246875	25.4758756492457	2.97210859762939	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.630579985862561	ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49425575_49426528:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49425575_49425722:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000485798:exon_49425575_49426201:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49425575_49426522:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000492367:exon_49425575_49426525:NUCB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49459098	C/T	1	11	22	33	5.39530735716596	11.2093852856681	-5.81407792850213	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0543260550919145	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49459104	A/G	1	21	11	32	10.3001322273168	5.60469264283404	4.69543958448278	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.112240762271142	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49469087	T/C	1	1439	1660	3099	705.80429881471	845.799071554956	-139.994772740245	T:C	T	C	10	0.509517512984913	5.27723912557749e-07	ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49485548	G/A	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49497155	A/G	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.648753385524008	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49507542	A/G	1	55	49	104	26.9765367858298	24.9663581362607	2.01017864956905	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.696409399503487	ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49513273	C/T	1	169	168	337	82.8915403055497	85.5989421814654	-2.70740187591568	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.785449280600771	ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49838891	C/A	1	13	8	21	6.37627233119613	4.0761401038793	2.30013222731683	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.385136200083102	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49842250	G/T	1	8	16	24	3.9238598961207	8.15228020775861	-4.22842031163791	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.102540060456308	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49949652	G/A	1	105	74	179	51.5006611365841	37.7042959608836	13.7963651757006	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0433379278795918	ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49950298	C/T	1	106	84	190	51.9911436235992	42.7994710907327	9.19167253286653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.191840443113396	ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49950356	C/G	1	87	79	166	42.6719763703126	40.2518835258081	2.42009284450445	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.756298711949723	ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49954803	C/T	1	126	80	206	61.800793363901	40.761401038793	21.0393923251079	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0033868779628379	ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49954807	T/G	1	124	78	202	60.8198283898708	39.7423660128232	21.0774623770476	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.00307270281594263	ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49967981	T/G	1	29	12	41	14.2239921234375	6.11421015581896	8.10978196761857	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0121141804997066	ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49969085	C/T	1	20	12	32	9.80964974030174	6.11421015581896	3.69543958448278	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.217990537202958	ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49983673	C/T	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49994470	T/A	1	28	22	50	13.7335096364224	11.2093852856681	2.52412435075435	A:T:G	T	A	10	0.509517512984913	0.483871757529487	ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	49994476	T/C	1	29	25	54	14.2239921234375	12.7379378246228	1.4860542988147	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.785768149186664	ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50017724	C/T	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000104870:ENST00000221466:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000426395:exon_50017468_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000415900:exon_50017697_50017743:FCGRT;ENSG00000104870:ENST00000452439:exon_50017468_50017743:FCGRT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50170313	C/T	1	46	68	114	22.562194402694	34.6471908829741	-12.0849964802801	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0245841126048745	ENSG00000126453:ENST00000441864:exon_50170279_50170418:BCL2L12;ENSG00000126453:ENST00000246785:exon_50170276_50170418:BCL2L12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50249905	T/C	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000126467:ENST00000246801:exon_50249727_50250055:TSKS;ENSG00000126467:ENST00000358830:exon_50249727_50250055:TSKS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50310562	A/G	1	22	11	33	10.7906147143319	5.60469264283404	5.18592207149787	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0819396205938907	ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000445575:exon_50310562_50310631:FUZ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50358133	T/G	1	37	29	66	18.1478520195582	14.7760078765625	3.37184414299574	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.460618660424323	ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50361874	A/G	1	101	74	175	49.5387311885238	37.7042959608836	11.8344352276402	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0818436724830998	ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50361806_50361910:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50361806_50361910:PTOV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50363246	G/A	1	143	114	257	70.1389956431574	58.0849964802801	12.0539991628774	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.134755483755974	ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50363243_50363440:PTOV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50384494	C/T	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180400712281148	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50387750	G/C	1	61	44	105	29.9194317079203	22.4187705713362	7.50066113658414	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.171486260790297	ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50393269	A/G	1	416	205	621	204.040714598276	104.451090161907	99.589624436369	A:G	A	G	10	0.509517512984913	7.89807786091466e-16	ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50863023	A/G	1	27	3	30	13.2430271494074	1.52855253895474	11.7144746104526	A:G	A	G	10	0.509517512984913	9.29257856658874e-06	ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50865535	A/G	1	19	6	25	9.31916725328665	3.05710507790948	6.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0150702956802832	ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50865429_50865570:NAPSA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50881882	C/T	1	60	34	94	29.4289492209052	17.323595441487	12.1053537794182	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0131600266130328	ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50881779_50882053:NR1H2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50885823	G/A	1	69	58	127	33.843291604041	29.552015753125	4.29127585091605	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.478166140985194	ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50885713_50886266:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50885713_50886218:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50885713_50885859:NR1H2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50905042	G/A	1	15	12	27	7.35723730522631	6.11421015581896	1.24302714940735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.702512858193323	ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50905074	G/A	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50905762	T/C	1	26	14	40	12.7525446623923	7.13324518178878	5.61929948060348	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0828780684568382	ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905711_50905792:POLD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	50926264	T/C	1	89	41	130	43.6529413443427	20.8902180323814	22.7627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	6.78777086950972e-05	ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	51323473	C/G	1	37	69	106	18.1478520195582	35.156708395959	-17.0088563764008	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.00123767442284638	ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	51323501	A/G	1	42	82	124	20.6002644546337	41.7804360647629	-21.1801716101292	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000145125807689391	ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	51728641	A/G	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000105383:ENST00000262262:exon_51728474_51728854:CD33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	52469438	G/A	1	12	16	28	5.88578984418104	8.15228020775861	-2.26649036357756	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.451877020800592	ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	52471872	A/G	1	13	10	23	6.37627233119613	5.09517512984913	1.281097201347	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.6789219768712	ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	52658510	T/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000196267:ENST00000322146:exon_52658125_52660793:ZNF836;ENSG00000196267:ENST00000457013:exon_52658125_52660793:ZNF836
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	52729030	C/T	1	363	292	655	178.045142786477	148.779113791595	29.266028994882	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0233598929043117	ENSG00000105568:ENST00000391791:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000322088:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000423369:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000436460:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000462990:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000444322:exon_52728970_52729061:PPP2R1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	52793328	G/A	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53086124	C/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53208161	A/C	0	12	0	12	5.88578984418104	0	5.88578984418104	A	A		10	0.509517512984913	0.000499989724588711	ENSG00000213020:ENST00000319783:exon_53207472_53210117:ZNF611
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53270543	A/G	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53270623	G/C	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53270729	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53432603	G/T	1	10	7	17	4.90482487015087	3.56662259089439	1.33820227925648	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.630132706769099	ENSG00000221874:ENST00000313956:exon_53430388_53432667:ZNF321
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53572494	G/T	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53912209	G/T	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000196417:ENST00000396408:exon_53910951_53915260:ZNF765
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	53959568	G/C	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54610170	C/T	1	371	304	675	181.969002682597	154.893323947414	27.0756787351837	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0376538547361504	ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54611734	A/G	1	4	15	19	1.96192994806035	7.64276269477369	-5.68083274671335	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0105294628979665	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54660566	G/A	1	24	43	67	11.7715796883621	21.9092530583513	-10.1376733699892	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0143251029818867	ENSG00000105617:ENST00000222224:exon_54660501_54660763:LENG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54677897	G/A	1	26	27	53	12.7525446623923	13.7569728505926	-1.00442818820039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.785658801468792	ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54711258	T/G	1	68	81	149	33.3528091170259	41.270918551778	-7.91810943475204	A:T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.218951812915455	ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54965860	G/A	1	29	26	55	14.2239921234375	13.2474553376077	0.976536785829785	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.892885814847412	ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54966579	C/G	1	44	48	92	21.5812294286638	24.4568406232758	-2.875611194612	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.602450956823041	ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54966702	C/T	1	39	56	95	19.1288169935884	28.5329807271551	-9.40416373356673	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0642172102798032	ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54973451	C/T	1	8	14	22	3.9238598961207	7.13324518178878	-3.20938528566809	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.203086029135577	ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	54974068	G/A	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55142739	A/C	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142713_55142757:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55143083	T/C	1	55	37	92	26.9765367858298	18.8521479804418	8.124388805388	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0957208997704488	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55143452	T/C	1	33	26	59	16.1859220714979	13.2474553376077	2.93846673389013	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.515430822528257	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55143491	G/T	1	34	31	65	16.676404558513	15.7950429025323	0.881361655980655	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.901445645722089	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55143686	T/C	1	35	32	67	17.166887045528	16.3045604155172	0.862326630010831	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.902930158740332	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55143982	T/C	1	19	26	45	9.31916725328665	13.2474553376077	-3.92828808432108	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.296665812621704	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143915_55144211:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55144169	G/A	1	31	12	43	15.2049570974677	6.11421015581896	9.09074694164874	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00575626677363625	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143915_55144211:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55144556	G/A	1	28	23	51	13.7335096364224	11.718902798653	2.01460683776944	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.579381789110776	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55145093	G/C	1	24	24	48	11.7715796883621	12.2284203116379	-0.456840623275824	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145089_55145139:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55145454	G/A	1	10	7	17	4.90482487015087	3.56662259089439	1.33820227925648	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.630132706769099	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145422_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145425_55145472:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145422_55145634:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145422_55145472:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55148331	C/T	1	108	21	129	52.9721085976294	10.6998677726832	42.2722408249462	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.31241779618808e-14	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55175009	G/T	1	17	10	27	8.33820227925648	5.09517512984913	3.24302714940735	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.250108755096081	ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174990_55175025:LILRB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55175336	C/T	1	41	17	58	20.1097819676186	8.66179772074352	11.447984246875	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00348550669127761	ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55175212_55175413:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175292_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175212_55175496:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175212_55175496:LILRB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55175740	C/T	1	20	17	37	9.80964974030174	8.66179772074352	1.14785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.744501464766585	ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55176262	A/G	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55441902	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000167634:ENST00000340844:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000328092:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000446217:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000448121:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000427260:exon_55441867_55442034:NLRP7;ENSG00000167634:ENST00000399724:exon_55441882_55441965:NLRP7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55512137	C/A	1	5	12	17	2.45241243507544	6.11421015581896	-3.66179772074352	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0909197869947799	ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55512316	T/G	1	2	17	19	0.980964974030174	8.66179772074352	-7.68083274671335	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.000324393580146501	ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55512128_55512508:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55512128_55512501:NLRP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55559715	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55559697_55559909:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55559697_55559909:RDH13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55614812	G/A	1	26	16	42	12.7525446623923	8.15228020775861	4.60026445463365	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.167355504594337	ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55739689	G/A	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55994894	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	55995401	T/C	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	56104136	T/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	57133333	T/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	57910208	G/A	1	13	12	25	6.37627233119613	6.11421015581896	0.262062175377175	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000188785:ENST00000366197:exon_57909798_57912785:ZNF548;ENSG00000188785:ENST00000336128:exon_57909798_57911257:ZNF548
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	57956828	T/G	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57954659_57957191:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57954659_57956853:ZNF749
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58117413	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000183647:ENST00000332854:exon_58117054_58119637:ZNF530
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58152361	T/A	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58152795	C/T	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58152817	G/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58153000	T/C	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58153009	C/T	1	7	12	19	3.43337740910561	6.11421015581896	-2.68083274671335	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.255611251188563	ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58153577	T/C	1	10	4	14	4.90482487015087	2.03807005193965	2.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180671884464811	ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58231807	A/G	1	6	15	21	2.94289492209052	7.64276269477369	-4.69986777268317	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0488848967390049	ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58772356	G/A	1	15	19	34	7.35723730522631	9.68083274671335	-2.32359544148704	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.493953241174159	ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58774071	A/G	1	27	21	48	13.2430271494074	10.6998677726832	2.54315937672418	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.474743472802699	ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58988733	C/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58988546_58988927:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58988546_58988927:ZNF446
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58991585	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	58991900	G/A	1	13	12	25	6.37627233119613	6.11421015581896	0.262062175377175	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	59061099	C/G	1	21	11	32	10.3001322273168	5.60469264283404	4.69543958448278	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.112240762271142	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	59074429	C/T	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	19	59074661	G/A	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231061	T/C	1	14	12	26	6.86675481821122	6.11421015581896	0.752544662392262	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.845747407952092	ENSG00000035115:ENST00000403712:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000403657:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000473104:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000403658:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000479739:exon_230547_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000451005:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000472012:exon_231023_231159:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000431160:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000488979:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000471948:exon_230378_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000481932:exon_230379_231191:SH3YL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	264985	G/T	1	127	134	261	62.2912758509161	68.2753467399783	-5.98407088906229	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.495942044002511	ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_264869_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_264872_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_264893_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_264900_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_264900_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_264916_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_264919_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_264926_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000480874:exon_264936_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_264963_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_264965_265007:ACP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	277003	A/G	1	186	154	340	91.2297425848062	78.4656969996766	12.7640455851296	A:T:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.175136935867965	ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	3391452	C/A	1	31	17	48	15.2049570974677	8.66179772074352	6.54315937672418	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0616672214862123	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	3391826	C/T	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	3392295	A/G	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	3469463	G/C	1	52	69	121	25.5050893247845	35.156708395959	-9.65161907117447	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0842617134595595	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	3483205	C/T	1	92	79	171	45.124388805388	40.2518835258081	4.87250527957988	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.491424100944096	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	3597974	T/C	1	26	24	50	12.7525446623923	12.2284203116379	0.52412435075435	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.888737440394932	ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	3628383	C/A	1	22	42	64	10.7906147143319	21.3997355453663	-10.6091208310344	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.00847514008034876	ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	9588338	T/C	1	69	73	142	33.843291604041	37.1947784478986	-3.35148684385764	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.614796315357736	ENSG00000119203:ENST00000238112:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000427001:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000460593:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000489629:exon_9588327_9588479:CPSF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	9667930	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000151694:ENST00000310823:exon_9667915_9668083:ADAM17;ENSG00000151694:ENST00000497134:exon_9667915_9668083:ADAM17;ENSG00000151694:ENST00000478059:exon_9667630_9668083:ADAM17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	10729257	T/C	1	49	41	90	24.0336418637393	20.8902180323814	3.14342383135783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.528464143877239	ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10729169_10729416:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10729169_10729416:NOL10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	10933249	C/T	1	112	116	228	54.9340385456897	59.1040315062499	-4.16999296056017	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.596604291877409	ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	10942687	C/T	1	52	37	89	25.5050893247845	18.8521479804418	6.65294134434274	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.168948685830139	ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	15372562	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	15378808	C/G	1	24	32	56	11.7715796883621	16.3045604155172	-4.53298072715513	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.232264536627763	ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	15506766	G/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15506704_15506817:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15506704_15506817:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15506704_15506817:NBAS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	17962376	T/G	1	14	5	19	6.86675481821122	2.54758756492456	4.31916725328665	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0644684770411915	ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	17962928	A/G	1	21	19	40	10.3001322273168	9.68083274671335	0.61929948060348	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.875534708687596	ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	18736438	G/C	1	25	31	56	12.2620621753772	15.7950429025323	-3.53298072715513	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.353213903754009	ENSG00000240857:ENST00000381249:exon_18735989_18737074:RDH14;ENSG00000240857:ENST00000468071:exon_18736388_18737074:RDH14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	20135283	T/C	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000118965:ENST00000345530:exon_20135232_20135364:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000281405:exon_20135232_20135364:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000416055:exon_20135232_20135364:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000445063:exon_20135232_20135364:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000414212:exon_20135228_20135364:WDR35;ENSG00000118965:ENST00000453014:exon_20134793_20135364:WDR35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	20403855	C/T	1	54	2	56	26.4860542988147	1.01903502596983	25.4670192728449	T:C	C	T	10	0.509517512984913	6.72644529467608e-14	ENSG00000115884:ENST00000254351:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000381150:exon_20403574_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000403076:exon_20403723_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000482879:exon_20403763_20404052:SDC1;ENSG00000115884:ENST00000429035:exon_20403579_20404052:SDC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	20824498	C/T	1	12	18	30	5.88578984418104	9.17131523372843	-3.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.274405948978326	ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	20838273	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20838196_20838275:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	25042846	A/G	1	72	69	141	35.3147390650863	35.156708395959	0.158030669127271	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000138092:ENST00000380834:exon_25042223_25045245:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000473706:exon_25042223_25045245:CENPO;ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25042038_25042983:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25042041_25042983:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25042041_25042983:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25042041_25042983:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000498288:exon_25042238_25042983:ADCY3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	25046090	T/C	1	47	42	89	23.0526768897091	21.3997355453663	1.65294134434274	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.751330389169057	ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	25050977	T/C	1	23	22	45	11.281097201347	11.2093852856681	0.0717119156789163	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	25469502	C/T	1	8	14	22	3.9238598961207	7.13324518178878	-3.20938528566809	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.203086029135577	ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	26502152	C/T	1	62	62	124	30.4099141949354	31.5900858050646	-1.18017161012921	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.857747320236369	ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502003_26502183:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502003_26502183:HADHB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	26502880	A/G	1	79	73	152	38.7481164741919	37.1947784478986	1.55333802629323	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.80832493073388	ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	26502941	C/T	1	64	68	132	31.3908791689656	34.6471908829741	-3.25631171400852	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.601914274220779	ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	26507042	T/C	1	42	68	110	20.6002644546337	34.6471908829741	-14.0469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00753792411602345	ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26506985_26507072:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26506985_26507072:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26506985_26507072:HADHB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27260469	G/A	1	42	34	76	20.6002644546337	17.323595441487	3.27666901314661	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.492084013403774	ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27261375	G/C	1	39	47	86	19.1288169935884	23.9473231102909	-4.81850611670252	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.332088965084688	ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27261352_27261400:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27261352_27261400:TMEM214
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27290525	A/G	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27293150	G/T	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27292960_27293490:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27292960_27293488:AGBL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27424636	G/A	1	22	19	41	10.7906147143319	9.68083274671335	1.10978196761857	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.756996336009118	ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27435374	G/A	1	19	12	31	9.31916725328665	6.11421015581896	3.2049570974677	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.283751645573885	ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27435331_27435390:SLC5A6;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27435238_27435475:C2orf28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27454944	G/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27454848_27455092:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27454848_27455092:CAD;ENSG00000084774:ENST00000464159:exon_27454848_27455092:CAD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27460968	A/G	1	23	20	43	11.281097201347	10.1903502596983	1.09074694164874	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.7626051935177	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27551086	A/G	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27589810	T/C	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000115211:ENST00000475582:exon_27588425_27591600:EIF2B4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	27887034	C/A	1	13	17	30	6.37627233119613	8.66179772074352	-2.28552538954739	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.467013421950797	ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	29073249	T/C	1	24	23	47	11.7715796883621	11.718902798653	0.0526768897090903	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000163806:ENST00000379579:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000334056:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000439646:exon_29072716_29073300:SPDYA;ENSG00000171103:ENST00000419999:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29073194_29073271:TRMT61B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	29092679	T/C	1	12	19	31	5.88578984418104	9.68083274671335	-3.7950429025323	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.209090362166922	ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	29092850	G/T	1	13	21	34	6.37627233119613	10.6998677726832	-4.32359544148704	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.169838425256551	ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	29152456	A/G	1	47	55	102	23.0526768897091	28.0234632141702	-4.97078632446112	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.372860887885643	ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	29169612	T/C	1	152	170	322	74.5533380262932	86.6179772074352	-12.064639181142	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.181406725276634	ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	29356669	A/G	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000115295:ENST00000426642:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401605:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000401617:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000415891:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000404424:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000402240:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000456385:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000320081:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000530644:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000379543:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000450018:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000449202:exon_29356521_29356682:CLIP4;ENSG00000115295:ENST00000438819:exon_29356521_29356682:CLIP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	30381505	T/C	1	48	55	103	23.5431593767242	28.0234632141702	-4.48030383744604	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.430606167045606	ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	33783905	C/T	1	50	80	130	24.5241243507543	40.761401038793	-16.2372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00485786442584334	ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33783739_33784097:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33783739_33784097:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33783739_33784097:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33783739_33784097:RASGRP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	37208681	G/A	1	26	24	50	12.7525446623923	12.2284203116379	0.52412435075435	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.888737440394932	ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37208040_37208937:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37208153_37208937:HEATR5B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	37227797	C/G	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37227729_37227956:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37227729_37227956:HEATR5B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	37366780	G/C	1	24	37	61	11.7715796883621	18.8521479804418	-7.08056829207969	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0737989433909315	ENSG00000055332:ENST00000233057:exon_37366774_37366900:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000395127:exon_37366774_37366900:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000343510:exon_37366774_37366900:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000405334:exon_37366774_37366900:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000379156:exon_37366774_37366900:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000496059:exon_37366774_37366900:EIF2AK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	38525597	A/C	1	22	13	35	10.7906147143319	6.62372766880387	4.16688704552805	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.178202301062041	ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000477642:exon_38525073_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000489896:exon_38525360_38525717:ATL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	38526420	G/A	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38526398_38526469:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38526398_38526469:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38526398_38526469:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38526398_38526469:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38526398_38526469:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38526398_38526469:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38526398_38526469:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000477642:exon_38526398_38526469:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000489896:exon_38526398_38526469:ATL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	38536626	T/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	39070253	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39070147_39070352:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39070147_39070352:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39070147_39070352:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39070147_39070352:DHX57
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	39082382	G/A	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39082199_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39081196_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39082199_39082417:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	42990010	C/A	1	32	23	55	15.6954395844828	11.718902798653	3.97653678582979	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.345256051473414	ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	42991231	A/G	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	42996907	C/T	1	22	28	50	10.7906147143319	14.2664903635776	-3.47587564924565	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.396304888430672	ENSG00000162882:ENST00000406007:exon_42996853_42997033:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_42996853_42996998:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_42996853_42996998:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_42996851_42996998:HAAO
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	43015684	G/A	1	22	7	29	10.7906147143319	3.56662259089439	7.22399212343752	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00845561148080782	ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	43015717	G/A	1	19	4	23	9.31916725328665	2.03807005193965	7.281097201347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00270162241391416	ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	43015719	T/C	1	19	3	22	9.31916725328665	1.52855253895474	7.79061471433192	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.000893548935383166	ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	43451430	C/T	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	43801712	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	43801988	C/T	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	43802153	T/C	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	43805739	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000474159:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43805652_43805746:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43805652_43805746:THADA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	44550528	T/C	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000260648:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409272:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000410081:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000378520:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000378511:exon_44550401_44550550:PREPL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	45640334	T/C	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	47251469	G/C	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	47251474	G/A	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	47389470	T/A	1	307	378	685	150.578123513632	192.597619908297	-42.0194963946654	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.00149651880639829	ENSG00000143933:ENST00000272298:exon_47389425_47389531:CALM2;ENSG00000143933:ENST00000460218:exon_47389425_47389531:CALM2;ENSG00000143933:ENST00000482532:exon_47389425_47389531:CALM2;ENSG00000143933:ENST00000456319:exon_47389425_47389531:CALM2;ENSG00000143933:ENST00000409563:exon_47389425_47389531:CALM2;ENSG00000143933:ENST00000484408:exon_47389425_47389531:CALM2;ENSG00000143933:ENST00000489742:exon_47389425_47389531:CALM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	48030651	T/C	1	64	30	94	31.3908791689656	15.2855253895474	16.1053537794182	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.000895819938721182	ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48030559_48030824:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48030559_48030824:MSH6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	48030838	A/T	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.601138673885629	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	48737165	G/C	1	19	16	35	9.31916725328665	8.15228020775861	1.16688704552805	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.737500987101035	ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48737154_48737252:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48737154_48737252:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48737154_48737252:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48737154_48737252:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000443895:exon_48737154_48737252:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48737154_48737252:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000407194:exon_48737154_48737252:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000476199:exon_48737154_48737252:KLRAQ1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	54035508	G/C	1	23	26	49	11.281097201347	13.2474553376077	-1.96635813626074	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.66863426075168	ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	54115904	A/G	1	21	17	38	10.3001322273168	8.66179772074352	1.6383345065733	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.62948546500411	ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	54120025	A/T	1	13	18	31	6.37627233119613	9.17131523372843	-2.7950429025323	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.370586090979266	ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	54844790	C/T	1	15	6	21	7.35723730522631	3.05710507790948	4.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0794791301761176	ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54844745_54844825:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000389980:exon_54844745_54844825:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54844745_54844825:SPTBN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	55404794	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000162994:ENST00000428621:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000494539:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000407122:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000402516:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000401408:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000406437:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000406076:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000411884:exon_55404738_55404917:C2orf63
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	55470115	C/T	1	39	31	70	19.1288169935884	15.7950429025323	3.33377409105609	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.473856471968276	ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	55490819	G/T	1	19	13	32	9.31916725328665	6.62372766880387	2.69543958448279	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.379864034731394	ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	55771169	A/T	1	46	38	84	22.562194402694	19.3616654934267	3.20052890926731	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.513804380578602	ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	55844445	T/C	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.190933578495351	ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	55872538	T/C	1	18	21	39	8.82868476627157	10.6998677726832	-1.87118300641161	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.631727462430124	ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55871772_55872567:PNPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	55883317	G/T	1	13	11	24	6.37627233119613	5.60469264283404	0.771579688362088	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.83951915689104	ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	55912120	T/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55912078_55912183:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000429805:exon_55912078_55912183:PNPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	61468761	T/C	1	15	8	23	7.35723730522631	4.0761401038793	3.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.211944052448733	ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000463046:exon_61468695_61468790:USP34;ENSG00000115464:ENST00000453734:exon_61468695_61468790:USP34
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	64327544	G/T	1	7	13	20	3.43337740910561	6.62372766880387	-3.19035025969826	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.182340866714798	ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64327532_64327633:PELI1;ENSG00000197329:ENST00000466177:exon_64327532_64327633:PELI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	64779019	A/G	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	64779509	G/A	1	20	27	47	9.80964974030174	13.7569728505926	-3.94732311029091	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.307170195569264	ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	65217089	G/C	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	65298839	A/G	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	71361161	T/G	1	15	28	43	7.35723730522631	14.2664903635776	-6.90925305835126	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0461991585509087	ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71361078_71361235:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71361078_71361235:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71361078_71361235:MPHOSPH10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	71376471	G/A	1	80	86	166	39.238598961207	43.8185061167025	-4.57990715549555	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.485767774422195	ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376353_71376583:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376353_71376583:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71375236_71376583:MPHOSPH10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	71651029	G/A	1	29	31	60	14.2239921234375	15.7950429025323	-1.57105077909478	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.700493201950742	ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71649944_71651168:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71649944_71651168:ZNF638
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	71654175	G/A	1	46	51	97	22.562194402694	25.9853931622306	-3.42319875953656	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.542575191370606	ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	71654450	A/G	1	56	53	109	27.4670192728449	27.0044281882004	0.462591084644483	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	71658541	C/T	1	50	59	109	24.5241243507543	30.0615332661099	-5.53740891535552	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.293779422130214	ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000472758:exon_71658457_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000488126:exon_71658153_71658558:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000460310:exon_71658313_71658558:ZNF638
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	73466786	C/T	1	134	96	230	65.7246532600217	48.9136812465516	16.81097201347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.029355842694783	ENSG00000135624:ENST00000471927:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000469844:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473197:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000492253:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73466771_73467275:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000482064:exon_73466771_73466924:CCT7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	73477527	C/T	1	260	247	507	127.525446623923	125.850825707274	1.6746209166491	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.894052281695832	ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	73487635	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000163013:ENST00000295133:exon_73487517_73487675:FBXO41;ENSG00000163013:ENST00000521871:exon_73487517_73487675:FBXO41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	73800269	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73799389_73800551:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73799389_73800707:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73799389_73800551:ALMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	73829372	C/T	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73829312_73829495:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73829312_73829495:ALMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	74057995	T/C	1	57	58	115	27.95750175986	29.552015753125	-1.594513993265	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.780356300426253	ENSG00000124356:ENST00000339566:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000409707:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000452725:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000432295:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000424659:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394073:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394070:exon_74057972_74058186:STAMBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	74682512	C/T	1	12	1	13	5.88578984418104	0.509517512984913	5.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00348710510277128	ENSG00000115274:ENST00000471577:exon_74682235_74682725:INO80B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	74690039	G/A	1	56	53	109	27.4670192728449	27.0044281882004	0.462591084644483	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	74690378	C/T	1	57	37	94	27.95750175986	18.8521479804418	9.10535377941818	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0636244065272165	ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	74699778	C/A	1	264	128	392	129.487376571983	65.2182416620689	64.2691349099141	A:T:C	C	A	10	0.509517512984913	6.83792703725372e-11	ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	74710491	C/T	1	22	8	30	10.7906147143319	4.0761401038793	6.71447461045261	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0166911000101224	ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	75907351	T/C	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75907319_75907440:C2orf3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	75921441	G/C	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000486016:exon_75921367_75921605:C2orf3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85571432	C/T	1	3	12	15	1.47144746104526	6.11421015581896	-4.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0192037741522380	ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85571362_85571471:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85571362_85571444:RETSAT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85573188	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85573098_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85572636_85573217:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85573098_85573476:RETSAT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85625222	T/G	1	39	63	102	19.1288169935884	32.0996033180495	-12.9707863244611	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0129065109221185	ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85769711	C/G	1	86	95	181	42.1814938832975	48.4041637335667	-6.22266985026925	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.372763212133611	ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85769975	A/G	1	19	20	39	9.31916725328665	10.1903502596983	-0.871183006411606	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.873119535755642	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85806266	C/T	1	506	387	893	248.184138429634	197.183277525161	51.0008609044727	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000636366946458296	ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85808737	A/G	1	479	355	834	234.941111280227	180.878717109644	54.0623941705826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000181233402782318	ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85808871	C/T	1	453	381	834	222.188566617834	194.126172447252	28.0623941705826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0524858674297629	ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85818886	C/T	1	77	39	116	37.7671515001617	19.8711830064116	17.8959684937501	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00106416089618462	ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	85824251	T/C	1	487	374	861	238.864971176347	190.559549856357	48.3054213199899	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.00105612418804271	ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	86305404	T/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86305237_86305407:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86305237_86305407:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000486964:exon_86305164_86305407:POLR1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	86385668	T/C	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	88879131	T/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88879036_88879158:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000478003:exon_88879036_88879487:EIF2AK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89160048	A/G	1	3	22	25	1.47144746104526	11.2093852856681	-9.73793782462283	A:G	A	G	10	0.509517512984913	6.84611958270638e-05	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89160399	T/C	1	4112	55	4167	2016.86398660604	28.0234632141702	1988.84052339187	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89160733	G/T	0	60	0	60	29.4289492209052	0	29.4289492209052	G	G		10	0.509517512984913	2.96251399122074e-18	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89161039	T/C	1	783	21	804	384.047787332813	10.6998677726832	373.34791956013	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	3.25466191924442e-195	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89197169	A/T	0	0	41	41	0	20.8902180323814	-20.8902180323814	T	A	T	10	0.509517512984913	2.06806276194692e-13	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89197171	T/A	0	0	37	37	0	18.8521479804418	-18.8521479804418	A:G	T	A	10	0.509517512984913	3.57330176374325e-12	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89197194	C/T	0	0	31	31	0	15.7950429025323	-15.7950429025323	T	C	T	10	0.509517512984913	2.56642550317231e-10	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89197214	T/C	0	0	47	47	0	23.9473231102909	-23.9473231102909	C	T	C	10	0.509517512984913	2.87941820468284e-15	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89247012	C/G	0	0	2843	2843	0	1448.55828941611	-1448.55828941611	A:T:G	C	G	10	0.509517512984913	0	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89247125	A/G	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.324346196468135	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89442250	C/T	0	0	3480	3480	0	1773.1209451875	-1773.1209451875	A:T	C	T	10	0.509517512984913	0	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	89442255	G/A	1	5	3503	3508	2.45241243507544	1784.83984798615	-1782.38743555107	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	96078419	A/C	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.482132183542689	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	96685021	A/G	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.791058057425968	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	96873982	C/G	1	15	24	39	7.35723730522631	12.2284203116379	-4.87118300641161	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.148872323082175	ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96873883_96874556:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96873883_96874573:STARD7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	96944553	G/A	1	99	117	216	48.5577662144936	59.6135490192348	-11.0557828047412	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.134864330796984	ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	96952833	A/G	1	25	24	49	12.2620621753772	12.2284203116379	0.0336418637392626	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	96993757	C/T	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.190933578495351	ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	96993884	A/G	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	97020049	T/C	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	97030247	T/C	1	9	31	40	4.41434238313578	15.7950429025323	-11.3807005193965	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.000363465307905517	ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	99778985	T/C	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	99779131	T/C	1	18	23	41	8.82868476627157	11.718902798653	-2.89021803238143	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.435423128360254	ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	99812070	G/A	1	64	60	124	31.3908791689656	30.5710507790948	0.819828389870789	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.928520358285181	ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	99936138	T/C	1	28	25	53	13.7335096364224	12.7379378246228	0.995571811799611	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.890898753312047	ENSG00000115514:ENST00000264255:exon_99935445_99936262:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000422767:exon_99935971_99936262:TXNDC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	99995804	T/C	1	135	117	252	66.2151357470367	59.6135490192348	6.60158672780192	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.413407013926469	ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	100019496	A/G	1	22	25	47	10.7906147143319	12.7379378246228	-1.94732311029091	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.662119201393094	ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	100081415	T/C	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100081384_100081447:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100081384_100081447:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100081384_100081447:REV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	101009908	G/A	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	101019031	G/A	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409046:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000420858:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000448989:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000421474:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000418201:exon_101019026_101019117:CHST10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	101182973	C/T	1	36	33	69	17.6573695325431	16.8140779285021	0.843291604041003	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.904351539838357	ENSG00000115539:ENST00000264254:exon_101182965_101183091:PDCL3;ENSG00000115539:ENST00000393429:exon_101182965_101183091:PDCL3;ENSG00000115539:ENST00000416255:exon_101182965_101183091:PDCL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	101620766	C/G	1	25	10	35	12.2620621753772	5.09517512984913	7.16688704552804	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0173533717451777	ENSG00000071082:ENST00000409000:exon_101620620_101621066:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000419276:exon_101620620_101620823:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000409711:exon_101620620_101622829:RPL31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	101624346	G/A	1	18	2	20	8.82868476627157	1.01903502596983	7.80964974030174	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000420268218989025	ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101622395_101624492:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101624079_101624735:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101624079_101624735:TBC1D8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	101635538	C/T	1	44	4	48	21.5812294286638	2.03807005193965	19.5431593767242	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.96184618618052e-09	ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	105885961	T/C	1	11	3	14	5.39530735716596	1.52855253895474	3.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.057993110530478	ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	105959592	G/A	1	21	19	40	10.3001322273168	9.68083274671335	0.61929948060348	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.875534708687596	ENSG00000135974:ENST00000258457:exon_105959305_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000437250:exon_105959558_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000410049:exon_105959558_105959680:C2orf49
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	105977761	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	109400267	C/T	1	189	155	344	92.7011900458514	78.9752145126615	13.7259755331899	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.145461161256121	ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109400052_109402267:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109400052_109400561:RANBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	113090047	T/C	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113088582_113097634:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113088582_113097640:ZC3H6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	113940630	G/A	1	33	22	55	16.1859220714979	11.2093852856681	4.97653678582978	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.224524905623429	ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	114220055	T/C	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	118575215	C/G	1	105	91	196	51.5006611365841	46.3660936816271	5.13456745495705	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.475690193221051	ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	118577278	G/A	1	74	62	136	36.2957040391164	31.5900858050646	4.70561823405183	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.440910797391604	ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118577225_118577368:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118577225_118577368:DDX18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	118583100	G/A	1	24	29	53	11.7715796883621	14.7760078765625	-3.00442818820039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.414186298545304	ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000461443:exon_118583023_118583559:DDX18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	118735590	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000125633:ENST00000376300:exon_118735570_118735606:CCDC93;ENSG00000125633:ENST00000319432:exon_118735570_118735603:CCDC93;ENSG00000125633:ENST00000460781:exon_118735570_118735606:CCDC93
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	120078731	A/G	1	32	44	76	15.6954395844828	22.4187705713362	-6.72333098685339	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.136090325050878	ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	120734635	A/T	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000088179:ENST00000263708:exon_120734560_120741394:PTPN4;ENSG00000088179:ENST00000430976:exon_120734560_120735037:PTPN4;ENSG00000088179:ENST00000441089:exon_120734533_120734659:PTPN4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	122513326	A/G	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000211460:ENST00000389682:exon_122513109_122513421:TSN;ENSG00000211460:ENST00000467324:exon_122513235_122513529:TSN;ENSG00000211460:ENST00000498545:exon_122513236_122513421:TSN;ENSG00000211460:ENST00000483698:exon_122513236_122513419:TSN;ENSG00000211460:ENST00000490717:exon_122513236_122513529:TSN;ENSG00000211460:ENST00000478165:exon_122513236_122513529:TSN;ENSG00000211460:ENST00000490104:exon_122513239_122513421:TSN;ENSG00000211460:ENST00000495112:exon_122513261_122513421:TSN;ENSG00000211460:ENST00000481818:exon_122513279_122513529:TSN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	128261033	C/G	1	42	31	73	20.6002644546337	15.7950429025323	4.80522155210135	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.292564352754117	ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128260963_128261152:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128260963_128261152:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000455721:exon_128260963_128261152:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000497888:exon_128260963_128261152:IWS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	128396807	A/G	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000072163:ENST00000426981:exon_128395956_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000469300:exon_128396000_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000494613:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409286:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409754:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000476932:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000324938:exon_128396001_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000484252:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000466410:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409455:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410109:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409808:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410011:exon_128396003_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000324864:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000355119:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000342067:exon_128396005_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000410038:exon_128396045_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000413578:exon_128396558_128397003:LIMS2;ENSG00000072163:ENST00000409254:exon_128396772_128397003:LIMS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	128608184	C/T	1	21	23	44	10.3001322273168	11.718902798653	-1.41877057133617	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.763445474056447	ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	128744457	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128744359_128744536:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128744359_128744536:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128744359_128744533:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000409388:exon_128744359_128744536:SAP130
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	130948224	T/C	1	676	586	1262	331.566161222199	298.577262609159	32.9888986130399	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0672003731854985	ENSG00000152082:ENST00000425361:exon_130948042_130948286:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000457492:exon_130948042_130948268:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000281871:exon_130948042_130948300:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000409255:exon_130948042_130948285:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000455239:exon_130948042_130948302:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000480182:exon_130948042_130948300:MZT2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	132241704	C/T	1	261	166	427	128.015929110938	84.5799071554956	43.4360219554422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	2.96619514504452e-05	ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	132241731	T/C	1	405	253	658	198.64540724111	128.907930785183	69.7374764559272	T:C	T	C	10	0.509517512984913	5.35697956108055e-08	ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	132290948	C/T	1	74	98	172	36.2957040391164	49.9327162725215	-13.637012233405	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0394832833650909	ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290842_132291239:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290842_132291239:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290842_132291239:CCDC74A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	135711516	C/T	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	135711657	G/A	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	136409574	A/C	1	11	6	17	5.39530735716596	3.05710507790948	2.33820227925648	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.333809869270413	ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	136624155	G/A	1	36	28	64	17.6573695325431	14.2664903635776	3.39087916896557	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.453634382624069	ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136624133_136624298:MCM6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	136664975	A/G	1	149	215	364	73.081890565248	109.546265291756	-36.4643747265083	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000153081590671626	ENSG00000115866:ENST00000264161:exon_136664247_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000478212:exon_136664394_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000489964:exon_136664814_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000422708:exon_136664830_136664977:DARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	143798189	A/G	1	190	186	376	93.1916725328665	94.7702574151938	-1.57858488232728	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.877161689278928	ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	144966208	T/C	1	13	18	31	6.37627233119613	9.17131523372843	-2.7950429025323	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.370586090979266	ENSG00000121964:ENST00000392869:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409214:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000344850:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000241391:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392867:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409298:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392871:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000415569:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000491448:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000437114:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000417450:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000484303:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000429978:exon_144966170_144966371:GTDC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	148716428	T/C	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	152118275	A/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000184898:ENST00000331426:exon_152118239_152118393:RBM43;ENSG00000184898:ENST00000409092:exon_152118239_152118292:RBM43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	152311570	G/A	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152311409_152311673:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000414861:exon_152311409_152311624:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152311409_152311673:RIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	152320118	G/A	1	22	18	40	10.7906147143319	9.17131523372843	1.61929948060348	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.638286099975098	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	152322095	A/T	1	20	14	34	9.80964974030174	7.13324518178878	2.67640455851296	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.394457678652606	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	152331418	C/G	1	23	15	38	11.281097201347	7.64276269477369	3.63833450657331	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.259152502858008	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	153520719	T/C	1	66	61	127	32.3718441429957	31.0805682920797	1.29127585091605	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.85930635420007	ENSG00000196504:ENST00000410080:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000440252:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000359961:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000356402:exon_153520652_153520766:PRPF40A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	158272468	C/T	1	232	201	433	113.7919369875	102.413020109968	11.3789168775327	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.290334057253813	ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158271131_158272655:CYTIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	158272507	C/T	1	260	200	460	127.525446623923	101.903502596983	25.62194402694	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0173636866733581	ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158271131_158272655:CYTIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160105007	A/G	1	19	16	35	9.31916725328665	8.15228020775861	1.16688704552805	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.737500987101035	ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160114315	G/A	1	11	6	17	5.39530735716596	3.05710507790948	2.33820227925648	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.333809869270413	ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160114269_160114375:WDSUB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160139350	G/A	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160139183_160139604:WDSUB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160604812	C/T	1	21	12	33	10.3001322273168	6.11421015581896	4.18592207149787	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.165267760206332	ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160663678	T/C	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.139060646007699	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160690646	T/C	1	12	19	31	5.88578984418104	9.68083274671335	-3.7950429025323	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.209090362166922	ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160690555_160690722:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160690555_160690722:RP11-357L2.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160710922	T/C	1	13	3	16	6.37627233119613	1.52855253895474	4.84771979224139	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0216334111655343	ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160711045	G/C	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	160743040	T/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160742931_160743041:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160742931_160743041:RP11-357L2.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	162088034	C/T	1	71	67	138	34.8242565780712	34.1376733699892	0.686583208082006	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.932291890014059	ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162087482_162088062:TANK;ENSG00000136560:ENST00000439442:exon_162087697_162088062:TANK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	170403030	T/C	1	26	33	59	12.7525446623923	16.8140779285021	-4.06153326610987	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.300554699394871	ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	170403106	G/A	1	34	23	57	16.676404558513	11.718902798653	4.95750175985996	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.232906235773298	ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	170411693	T/C	1	14	17	31	6.86675481821122	8.66179772074352	-1.7950429025323	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.591606875195905	ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	170493863	A/G	1	210	208	418	103.001322273168	105.979642700862	-2.97832042769363	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.806800088828799	ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	170917648	A/G	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170917589_170917696:UBR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	173460640	T/C	1	10	3	13	4.90482487015087	1.52855253895474	3.37627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0930441887974304	ENSG00000152256:ENST00000282077:exon_173460557_173461193:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000392571:exon_173460557_173460697:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000410055:exon_173460557_173460751:PDK1;ENSG00000152256:ENST00000466437:exon_173460557_173460690:PDK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	174946760	T/C	1	18	18	36	8.82868476627157	9.17131523372843	-0.342630467456868	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000138430:ENST00000284719:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000344357:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000409546:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000449400:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000392560:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000462000:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000429575:exon_174946738_174946792:OLA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	175213645	G/C	1	118	124	242	57.8769334677803	63.1801716101292	-5.30323814234894	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.520469749769199	ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175212749_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175212750_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175212878_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175213124_175213900:CIR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	175436576	A/C	1	40	31	71	19.6192994806035	15.7950429025323	3.82425657807118	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.406653688030739	ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	178082594	T/C	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.239422942006238	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	179325735	C/G	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000204311:ENST00000409117:exon_179325709_179326117:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000437056:exon_179325709_179326014:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000375129:exon_179325709_179326001:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000442710:exon_179325709_179325931:DFNB59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	180810358	C/T	1	56	60	116	27.4670192728449	30.5710507790948	-3.10403150624991	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.578570737263235	ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	182374534	A/G	1	20	9	29	9.80964974030174	4.58565761686422	5.22399212343752	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0627808957285707	ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	182399097	T/C	1	27	19	46	13.2430271494074	9.68083274671335	3.562194402694	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.306028163779747	ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	185801755	A/G	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	190617643	A/G	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000128694:ENST00000264151:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000519810:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000524043:exon_190617575_190617705:OSGEPL1;ENSG00000128694:ENST00000522700:exon_190617575_190617705:OSGEPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	190640434	G/A	1	74	100	174	36.2957040391164	50.9517512984913	-14.6560472593749	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0278183804502884	ENSG00000128699:ENST00000392350:exon_190640291_190640442:ORMDL1;ENSG00000128699:ENST00000325795:exon_190640291_190640442:ORMDL1;ENSG00000128699:ENST00000392349:exon_190640291_190640442:ORMDL1;ENSG00000128699:ENST00000409519:exon_190639451_190640442:ORMDL1;ENSG00000128699:ENST00000442547:exon_190640291_190640442:ORMDL1;ENSG00000128699:ENST00000458355:exon_190640291_190640442:ORMDL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	190719179	T/C	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000064933:ENST00000434338:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000456115:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000392338:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000421722:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424307:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424059:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409593:exon_190718965_190719854:PMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	190719499	G/A	1	17	13	30	8.33820227925648	6.62372766880387	1.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.586721038583829	ENSG00000064933:ENST00000434338:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000456115:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000392338:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000421722:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424307:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424059:exon_190718965_190719854:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409593:exon_190718965_190719854:PMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	190732559	T/C	1	27	20	47	13.2430271494074	10.1903502596983	3.05267688970909	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.38575279318474	ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409593:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000483293:exon_190732525_190732655:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000452382:exon_190732525_190732655:PMS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	191064753	C/T	1	22	28	50	10.7906147143319	14.2664903635776	-3.47587564924565	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.396304888430672	ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	191161622	T/C	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	191235901	A/C	1	30	40	70	14.7144746104526	20.3807005193965	-5.66622590894391	A:C:G	A	C	10	0.509517512984913	0.189509594965503	ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	191839658	A/C	1	86	98	184	42.1814938832975	49.9327162725215	-7.75122238922399	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.268980082064908	ENSG00000115415:ENST00000415035:exon_191839556_191839661:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000423282:exon_191839556_191839658:STAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	191874667	A/G	1	106	81	187	51.9911436235992	41.270918551778	10.7202250718213	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.124642927763463	ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392322:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000452281:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392323:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000424722:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000454414:exon_191874602_191874730:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000432058:exon_191874602_191874730:STAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	198353801	G/A	1	824	733	1557	404.157569300432	373.476337017941	30.6812322824905	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.122079039437726	ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198353726_198353971:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198353726_198353971:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000491249:exon_198353726_198353971:HSPD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	198363504	A/G	1	131	106	237	64.2532057989764	54.0088563764008	10.2443494225756	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.193961784037115	ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	201371768	G/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000468413:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000478816:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000458583:exon_201371580_201371814:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000447556:exon_201371580_201371814:KCTD18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	201437328	C/A	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	201736112	T/C	1	46	13	59	22.562194402694	6.62372766880387	15.9384667338901	T:C	T	C	10	0.509517512984913	3.56594988784250e-05	ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	201736166	A/C	1	46	12	58	22.562194402694	6.11421015581896	16.447984246875	A:C	A	C	10	0.509517512984913	9.96911318865457e-06	ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	201768238	C/T	1	30	24	54	14.7144746104526	12.2284203116379	2.4860542988147	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.586574359744793	ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	201785837	G/A	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000115942:ENST00000234296:exon_201785716_201785862:ORC2;ENSG00000115942:ENST00000464147:exon_201785716_201785862:ORC2;ENSG00000115942:ENST00000487853:exon_201785716_201786461:ORC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	201928671	G/T	1	111	1	112	54.4435560586747	0.509517512984913	53.9340385456897	T:G	G	T	10	0.509517512984913	3.25923914051001e-31	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202006096	G/A	1	26	82	108	12.7525446623923	41.7804360647629	-29.0278914023706	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1.87640466658744e-08	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202010101	C/A	1	31	35	66	15.2049570974677	17.833112954472	-2.62815585700426	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.540120111016193	ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000355558:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000342795:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000439154:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000462763:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202010101_202010155:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202010101_202010155:CFLAR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202025442	G/C	1	81	82	163	39.729081448222	41.7804360647629	-2.05135461654082	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.754678248685224	ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202025621	A/G	1	101	84	185	49.5387311885238	42.7994710907327	6.7392600977911	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.33948927498002	ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202065255	C/T	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000003400:ENST00000374650:exon_202065166_202065451:CASP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202137623	A/C	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:T:C	A	C	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000064012:ENST00000303385:exon_202137621_202137665:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392259:exon_202137621_202137665:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000432109:exon_202137621_202137665:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000471383:exon_202137361_202137642:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392258:exon_202137621_202137665:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000358485:exon_202137621_202137665:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000413726:exon_202137621_202137665:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000339403:exon_202137621_202137665:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000455604:exon_202137621_202137665:CASP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202245244	A/G	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202252539	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202252426_202252724:TRAK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	202490774	A/G	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000155755:ENST00000409444:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000409883:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000435876:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000426684:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000495329:exon_202490749_202491046:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000286196:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000471318:exon_202490749_202490870:ALS2CR4;ENSG00000155755:ENST00000409099:exon_202490749_202490870:ALS2CR4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	204154552	C/T	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000302927:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431075:exon_204154488_204154599:CYP20A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	207631461	G/A	1	18	10	28	8.82868476627157	5.09517512984913	3.73350963642244	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.187163218330294	ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000418289:exon_207631368_207631789:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207631368_207632194:FASTKD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	207636977	A/G	1	15	19	34	7.35723730522631	9.68083274671335	-2.32359544148704	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.493953241174159	ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207636905_207637044:FASTKD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	208434927	T/C	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000118260:ENST00000430624:exon_208434903_208435045:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000236996:exon_208434903_208435045:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000432329:exon_208434903_208435045:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000353267:exon_208434903_208435045:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000445803:exon_208434903_208435045:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000421139:exon_208434903_208435045:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000374397:exon_208434903_208434982:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000480189:exon_208434903_208435045:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000448277:exon_208434903_208435045:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000457101:exon_208434903_208435012:CREB1;ENSG00000118260:ENST00000418081:exon_208434903_208435045:CREB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	213886748	C/T	1	8	14	22	3.9238598961207	7.13324518178878	-3.20938528566809	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.203086029135577	ENSG00000030419:ENST00000457361:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000374327:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000342002:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000434687:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000451136:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000374319:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000453575:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000412444:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000413091:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000439848:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000374326:exon_213886717_213886854:IKZF2;ENSG00000030419:ENST00000431520:exon_213886717_213886854:IKZF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	214160817	G/A	1	20	14	34	9.80964974030174	7.13324518178878	2.67640455851296	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.394457678652606	ENSG00000144451:ENST00000331683:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000406979:exon_214160764_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000420497:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000440779:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000452556:exon_214160788_214160852:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000272898:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000447990:exon_214160788_214160834:SPAG16;ENSG00000144451:ENST00000414961:exon_214160788_214160834:SPAG16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	219103580	A/G	1	4	14	18	1.96192994806035	7.13324518178878	-5.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0173423926517503	ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	219140288	G/C	1	13	8	21	6.37627233119613	4.0761401038793	2.30013222731683	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.385136200083102	ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	219146868	T/C	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	219266423	C/A	1	34	23	57	16.676404558513	11.718902798653	4.95750175985996	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.232906235773298	ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	219527866	T/C	1	30	40	70	14.7144746104526	20.3807005193965	-5.66622590894391	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.189509594965503	ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	219528995	T/C	1	43	40	83	21.0907469416487	20.3807005193965	0.710046422252223	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.912854666883915	ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	219533378	T/C	1	16	22	38	7.84771979224139	11.2093852856681	-3.36166549342669	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.330832380517956	ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	219619080	A/T	1	27	27	54	13.2430271494074	13.7569728505926	-0.5139457011853	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.892792650810575	ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219618954_219619416:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219618857_219620139:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219618857_219619416:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219618857_219620139:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417855:exon_219618954_219619139:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000472527:exon_219618857_219619226:TTLL4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	220045454	G/A	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	220087441	T/C	1	28	21	49	13.7335096364224	10.6998677726832	3.03364186373926	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.395811892156300	ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220087367_220087460:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220087367_220087615:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000429920:exon_220087367_220087615:ATG9A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	220250769	T/C	1	77	82	159	37.7671515001617	41.7804360647629	-4.01328456460116	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.527036368559314	ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000457935:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000521459:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000434339:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000430206:exon_220250704_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000520694:exon_220250760_220250820:DNPEP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	220404220	G/A	1	33	29	62	16.1859220714979	14.7760078765625	1.40991419493539	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.79977425088429	ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	220404648	C/T	1	35	27	62	17.166887045528	13.7569728505926	3.4099141949354	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.446386335211526	ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	220404726	G/A	1	35	17	52	17.166887045528	8.66179772074352	8.50508932478452	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0185881414542756	ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	220405230	G/A	1	30	9	39	14.7144746104526	4.58565761686422	10.1288169935884	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00114955067910843	ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	220406722	T/C	1	21	16	37	10.3001322273168	8.15228020775861	2.14785201955822	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.514219390998328	ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	223423362	A/G	1	67	62	129	32.8623266300108	31.5900858050646	1.27224082494622	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.860405519820994	ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	223436607	C/T	1	246	223	469	120.658691805711	113.622405395636	7.0362864100758	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.51834618571644	ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	224743373	C/T	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	224824484	C/T	1	78	87	165	38.2576339871768	44.3280236296874	-6.07038964251064	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.351188803545522	ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	227779066	A/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000144468:ENST00000341329:exon_227778924_227779067:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000392062:exon_227778924_227779067:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000409053:exon_227778924_227779067:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000491490:exon_227778924_227779067:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000473218:exon_227778924_227779353:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000493526:exon_227778924_227779067:RHBDD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	227860232	C/T	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000144468:ENST00000341329:exon_227860147_227863931:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000392062:exon_227860147_227863917:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000491490:exon_227860147_227860471:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000493526:exon_227860147_227860617:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000483268:exon_227860147_227860391:RHBDD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231042276	A/G	1	93	102	195	45.6148712924031	51.9707863244611	-6.35591503205803	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.390213283091619	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231050715	A/G	1	123	112	235	60.3293459028557	57.0659614543103	3.26338444854544	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.695687069460993	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231050710_231050859:SP110
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231077110	C/T	1	62	56	118	30.4099141949354	28.5329807271551	1.87693346778027	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.782579889791983	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231118041	A/C	1	6	25	31	2.94289492209052	12.7379378246228	-9.7950429025323	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.000444700857397098	ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231120241	G/C	1	19	23	42	9.31916725328665	11.718902798653	-2.39973554536634	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.537708485716917	ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231120167_231120247:SP140
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231222655	G/T	1	10	14	24	4.90482487015087	7.13324518178878	-2.22842031163791	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.417429937527804	ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231256812	A/G	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231256802_231256944:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231256802_231256944:SP140L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	231258150	C/T	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231258129_231258176:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231258129_231258176:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231258129_231258176:SP140L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	232146802	A/G	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232146772_232146846:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232146772_232146846:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232146772_232146846:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000481520:exon_232146772_232146846:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232146772_232146846:ARMC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	232196597	G/A	1	7	18	25	3.43337740910561	9.17131523372843	-5.73793782462282	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0266370371488721	ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	232952286	A/G	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000144535:ENST00000273009:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000360410:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409401:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000445090:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_232952197_232952431:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000464554:exon_232952197_232952554:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000470087:exon_232952197_232952431:DIS3L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	233677147	G/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000482952:exon_233677101_233677201:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000474312:exon_233677101_233677201:GIGYF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	234756072	G/C	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234756043_234756107:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234756043_234756107:HJURP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	235404648	C/A	1	34	19	53	16.676404558513	9.68083274671335	6.99557181179961	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0730938036418683	ENSG00000188042:ENST00000390645:exon_235401685_235405697:ARL4C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238002773	G/A	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000198612:ENST00000354371:exon_238002733_238002840:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000433954:exon_238002733_238002840:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000392008:exon_238002733_238002840:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000470452:exon_238002306_238002840:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000419015:exon_238002733_238002829:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000409629:exon_238002733_238002840:COPS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238671328	A/G	1	99	141	240	48.5577662144936	71.8419693308727	-23.2842031163791	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0029144943167195	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238671609	A/G	1	102	73	175	50.0292136755389	37.1947784478986	12.8344352276402	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0585028423598818	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238671940	C/T	1	201	198	399	98.5869798900325	100.884467571013	-2.29748768098028	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.841317021704852	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238672144	G/T	1	167	155	322	81.9105753315195	78.9752145126615	2.93536081885802	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.780541515081424	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238672253	A/G	1	145	121	266	71.1199606171876	61.6516190711745	9.46834154601314	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.269630504376807	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238672290	C/T	1	171	139	310	83.8725052795799	70.8229343049029	13.049570974677	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.140083187590861	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238672703	C/G	1	130	147	277	63.7627233119613	74.8990744087822	-11.1363510968209	A:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.186450211544124	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238896627	T/C	1	25	15	40	12.2620621753772	7.64276269477369	4.61929948060348	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.156839441077429	ENSG00000184182:ENST00000440223:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000441728:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000512459:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000518380:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434002:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000272930:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433568:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000448502:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409633:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000470484:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000455999:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000417231:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000445676:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439338:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439780:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000454786:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433241:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409953:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409332:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434655:exon_238896605_238896634:UBE2F
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	238991938	T/C	1	12	20	32	5.88578984418104	10.1903502596983	-4.30456041551722	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.157124566902514	ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238991889_238991995:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238991889_238991944:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238991887_238991995:SCLY
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	239079347	G/T	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	241513972	C/T	1	18	21	39	8.82868476627157	10.6998677726832	-1.87118300641161	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.631727462430124	ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241513932_241514029:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241513932_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241513192_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241513971_241514045:RNPEPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	241531479	A/G	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391982:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241531350_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241529301_241531567:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000432084:exon_241531350_241531567:CAPN10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	241536053	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000142330:ENST00000483602:exon_241535736_241536119:CAPN10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	241536126	A/G	1	17	22	39	8.33820227925648	11.2093852856681	-2.87118300641161	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.423991835898429	ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	241538061	T/C	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	241569492	G/A	1	13	1	14	6.37627233119613	0.509517512984913	5.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00187544127023971	ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	241570249	A/C	1	9	18	27	4.41434238313578	9.17131523372843	-4.75697285059265	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.082656024899039	ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242038942	T/G	1	42	26	68	20.6002644546337	13.2474553376077	7.35280911702591	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0889608137687301	ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000495694:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000401626:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000475860:exon_242038583_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000434791:exon_242038814_242039309:MTERFD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242054403	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242052722_242054592:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242053050_242054592:PASK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242062162	C/T	1	31	25	56	15.2049570974677	12.7379378246228	2.46701927284487	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.593342378491199	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242065781	G/A	1	30	29	59	14.7144746104526	14.7760078765625	-0.0615332661098673	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242066250	C/T	1	21	21	42	10.3001322273168	10.6998677726832	-0.399735545366347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242066314	T/C	1	24	25	49	11.7715796883621	12.7379378246228	-0.966358136260737	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.886578458405135	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242174923	C/T	1	204	185	389	100.058427351078	94.2607399022089	5.79768744886886	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.577108494360928	ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242174536_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470482:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000479894:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000483086:exon_242174905_242175044:HDLBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242195719	C/G	1	66	60	126	32.3718441429957	30.5710507790948	1.80079336390096	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.789499753807772	ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470710:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000435952:exon_242195599_242195814:HDLBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242435082	G/T	1	77	78	155	37.7671515001617	39.7423660128232	-1.97521451266151	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.809643727413887	ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242432089_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242434432_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242434434_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242434437_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000494699:exon_242434461_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000487962:exon_242434465_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242434664_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000478403:exon_242434863_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000470438:exon_242434905_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000465009:exon_242434953_242435116:STK25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242572846	A/G	1	43	31	74	21.0907469416487	15.7950429025323	5.29570403911644	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.245336870928401	ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242610172	A/G	1	45	29	74	22.0717119156789	14.7760078765625	7.29570403911644	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.103328678757617	ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242609976_242610197:ATG4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242610794	G/T	1	41	40	81	20.1097819676186	20.3807005193965	-0.270918551777953	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242618050	A/G	1	59	54	113	28.9384667338901	27.5139457011853	1.42452103270483	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.850861776238072	ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242689702	G/A	1	11	16	27	5.39530735716596	8.15228020775861	-2.75697285059265	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.337997616727118	ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242689566_242689709:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242689566_242689709:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242689566_242689709:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242689566_242689709:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242689566_242689709:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000467427:exon_242689566_242689709:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000486953:exon_242689566_242689709:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242689232_242689709:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242689514_242689709:D2HGDH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	2	242690745	C/T	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	257733	A/G	1	14	10	24	6.86675481821122	5.09517512984913	1.77157968836209	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.54303205531595	ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	279483	T/C	1	38	30	68	18.6383345065733	15.2855253895474	3.35280911702592	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.467354612476931	ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	368905	A/G	1	19	21	40	9.31916725328665	10.6998677726832	-1.38070051939652	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.752396006614917	ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	377226	C/T	1	27	31	58	13.2430271494074	15.7950429025323	-2.55201575312495	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.514550560910101	ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	391025	T/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	825678	T/C	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	1099523	T/G	1	92	71	163	45.124388805388	36.1757434219288	8.94864538345919	T:C:G	T	G	10	0.509517512984913	0.182775076995758	ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	2464256	T/C	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000088876:ENST00000278772:exon_2462463_2465302:ZNF343;ENSG00000088876:ENST00000465019:exon_2462463_2465302:ZNF343
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	2775193	G/A	1	129	22	151	63.2722408249462	11.2093852856681	52.0628555392781	A:G	G	A	10	0.509517512984913	7.57714080502239e-19	ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2775183_2775285:CPXM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	2776905	G/T	1	23	86	109	11.281097201347	43.8185061167025	-32.5374089153555	T:G	G	T	10	0.509517512984913	2.4848035896796e-10	ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2776893_2777089:CPXM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	2845855	G/A	1	47	41	88	23.0526768897091	20.8902180323814	2.16245885732766	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.670845325655464	ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2845794_2845963:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2845794_2845963:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2845794_2845963:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2845794_2845963:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2845794_2845963:PTPRA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	3785646	G/A	1	18	24	42	8.82868476627157	12.2284203116379	-3.39973554536635	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.354816492678567	ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3785468_3785884:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3785468_3786762:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3785468_3786762:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3785468_3785865:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3785468_3786757:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3785468_3786757:CDC25B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	3838441	C/G	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3838282_3838456:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000441852:exon_3838282_3838581:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000358134:exon_3838282_3838456:MAVS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	3841990	C/T	1	10	7	17	4.90482487015087	3.56662259089439	1.33820227925648	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.630132706769099	ENSG00000088888:ENST00000428216:exon_3841979_3842151:MAVS;ENSG00000088888:ENST00000416600:exon_3841979_3842151:MAVS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	4680251	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000171867:ENST00000420824:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000455665:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379440:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000531860:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000430350:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000525336:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000424424:exon_4679862_4680613:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000444805:exon_4680216_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379436:exon_4679857_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000457586:exon_4679857_4680517:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000431433:exon_4679857_4680516:PRNP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5086939	A/T	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000089063:ENST00000379283:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000342308:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379299:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000202834:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379286:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379279:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000492419:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379277:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379298:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379276:exon_5086834_5086956:C20orf30
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5099473	G/T	1	250	222	472	122.620621753772	113.112887882651	9.50773387112108	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.382257336226667	ENSG00000132646:ENST00000379143:exon_5099415_5099512:PCNA;ENSG00000132646:ENST00000379160:exon_5099415_5099512:PCNA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5753579	C/T	1	28	26	54	13.7335096364224	13.2474553376077	0.486054298814699	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5843812	T/C	1	12	14	26	5.88578984418104	7.13324518178878	-1.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.69695410034444	ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5844121	C/T	1	15	8	23	7.35723730522631	4.0761401038793	3.281097201347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.211944052448733	ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5844122	A/G	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5923203	T/C	1	44	30	74	21.5812294286638	15.2855253895474	6.29570403911644	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.162994834460197	ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5923204	T/C	1	41	30	71	20.1097819676186	15.2855253895474	4.82425657807118	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.285763100734402	ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5943956	G/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378883:exon_5943920_5944005:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5943920_5944005:MCM8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	5953833	A/G	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	6195753	T/C	0	18	0	18	8.82868476627157	0	8.82868476627157	T	T		10	0.509517512984913	8.05541567602468e-06	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	17640898	A/T	1	33	37	70	16.1859220714979	18.8521479804418	-2.66622590894391	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.551535359739475	ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17640625_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17639241_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17639241_17641152:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17639250_17641152:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17640625_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000398782:exon_17640251_17641173:RRBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	17968923	T/C	1	12	14	26	5.88578984418104	7.13324518178878	-1.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.69695410034444	ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	17970587	A/G	1	21	14	35	10.3001322273168	7.13324518178878	3.16688704552804	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.313581243470769	ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17970582_17971765:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17970582_17971765:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377704:exon_17970582_17971765:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17970582_17971759:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000463219:exon_17970582_17971052:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17970582_17970874:C20orf72
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	18295730	C/T	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000360010:exon_18295713_18295750:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000434018:exon_18295713_18295923:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000425686:exon_18295713_18296032:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	18296076	G/A	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	20032998	T/C	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	23350790	C/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23350728_23353700:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23350728_23353682:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000477239:exon_23350728_23351058:GZF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	23618395	T/C	1	51	88	139	25.0146068377694	44.8375411426723	-19.8229343049029	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.000878449780117153	ENSG00000101439:ENST00000398411:exon_23618257_23618582:CST3;ENSG00000101439:ENST00000376925:exon_23618257_23618663:CST3;ENSG00000101439:ENST00000398409:exon_23618257_23618569:CST3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	25260931	A/G	1	13	17	30	6.37627233119613	8.66179772074352	-2.28552538954739	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.467013421950797	ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25260902_25261048:PYGB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	25264814	T/C	1	30	25	55	14.7144746104526	12.7379378246228	1.97653678582978	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.686176017405794	ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25264740_25264887:PYGB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	25276297	G/A	1	35	38	73	17.166887045528	19.3616654934267	-2.19477844789865	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.640709830004845	ENSG00000100994:ENST00000216962:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000428458:exon_25276240_25276306:PYGB;ENSG00000100994:ENST00000471359:exon_25276240_25276306:PYGB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	25282944	A/G	1	32	25	57	15.6954395844828	12.7379378246228	2.95750175985996	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.508124996976959	ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	25288632	G/A	1	16	25	41	7.84771979224139	12.7379378246228	-4.89021803238143	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.159192167561288	ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	30381758	G/C	1	43	29	72	21.0907469416487	14.7760078765625	6.31473906508626	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.15715724575722	ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	30382315	A/G	1	47	40	87	23.0526768897091	20.3807005193965	2.67197637031257	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.59306933340839	ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30382205_30382351:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30382205_30382351:TPX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	30745599	G/A	1	13	15	28	6.37627233119613	7.64276269477369	-1.26649036357756	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.707147525454052	ENSG00000101337:ENST00000398022:exon_30745597_30745772:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000375795:exon_30745597_30745772:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000421148:exon_30745597_30745772:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000217315:exon_30745597_30745772:TM9SF4;ENSG00000101337:ENST00000413032:exon_30745597_30745772:TM9SF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	30915461	T/C	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	31024488	C/T	1	81	47	128	39.729081448222	23.9473231102909	15.7817583379311	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.00594905999559591	ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	31967273	A/G	1	32	24	56	15.6954395844828	12.2284203116379	3.46701927284487	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.422884120210198	ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000498525:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000496381:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000471264:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473791:exon_31967267_31967394:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	32212525	A/G	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	32264720	C/T	1	33	20	53	16.1859220714979	10.1903502596983	5.99557181179961	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.129952887067754	ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32263489_32264785:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32263489_32264785:E2F1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	32265331	C/T	1	25	22	47	12.2620621753772	11.2093852856681	1.05267688970909	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.77276891537452	ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32265232_32265346:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32265232_32265345:E2F1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	32295541	C/T	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	32379195	A/C	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.239422942006238	ENSG00000131061:ENST00000342427:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000375200:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000497876:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000483118:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000493497:exon_32378794_32380075:ZNF341
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	32678369	T/C	1	30	167	197	14.7144746104526	85.0894246684805	-70.3749500580279	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	1.25048902438285e-25	ENSG00000125977:ENST00000374980:exon_32678323_32678408:EIF2S2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	33037242	A/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000078747:ENST00000374864:exon_33037216_33037285:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000262650:exon_33037216_33037285:ITCH;ENSG00000078747:ENST00000483727:exon_33037216_33037285:ITCH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	33328316	C/T	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33328167_33331145:NCOA6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	33330857	A/G	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33328167_33331145:NCOA6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	33470694	C/T	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000131069:ENST00000490046:exon_33470597_33470793:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481971:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000488172:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000336325:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000497927:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481284:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000475459:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000461051:exon_33470597_33470799:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000360596:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000484354:exon_33470621_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000374693:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480274:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000477932:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000493805:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000473172:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480978:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000467019:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000253382:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000476922:exon_33470597_33470792:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000464399:exon_33470630_33470792:ACSS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	33971914	C/T	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	33981906	G/C	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000101019:ENST00000457259:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374380:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000424405:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491040:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33981895_33981999:UQCC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	34067989	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	34091675	G/A	1	15	22	37	7.35723730522631	11.2093852856681	-3.85214798044178	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.249934710989812	ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	34144746	A/G	1	259	252	511	127.034964136908	128.398413272198	-1.36344913529054	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.929502409855406	ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	34828122	T/C	1	22	26	48	10.7906147143319	13.2474553376077	-2.45684062327582	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.564122342437876	ENSG00000131043:ENST00000397286:exon_34827743_34828547:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34827743_34828547:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34827743_34828547:C20orf4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	34843689	C/T	1	28	19	47	13.7335096364224	9.68083274671335	4.05267688970909	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.24697288273901	ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34843500_34844855:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34843500_34844855:C20orf4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	37383640	T/C	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37383600_37383817:ACTR5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	37400490	G/A	1	30	19	49	14.7144746104526	9.68083274671335	5.03364186373926	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.156043211104239	ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	37464739	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37464468_37464818:PPP1R16B;ENSG00000101445:ENST00000373331:exon_37464468_37464818:PPP1R16B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	37534665	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37534612_37534737:PPP1R16B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	40034097	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	40043913	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40043826_40044278:CHD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	40049311	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	42225114	G/A	1	13	11	24	6.37627233119613	5.60469264283404	0.771579688362088	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.83951915689104	ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	42310426	C/T	1	23	33	56	11.281097201347	16.8140779285021	-5.53298072715513	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.143899982123774	ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42310424_42310495:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42310424_42310495:MYBL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	42826350	A/C	1	49	39	88	24.0336418637393	19.8711830064116	4.16245885732766	A:C:G	A	C	10	0.509517512984913	0.39508426863116	ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	43264927	C/T	1	18	24	42	8.82868476627157	12.2284203116379	-3.39973554536635	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.354816492678567	ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43264868_43264929:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43264868_43264929:ADA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	43530216	C/T	1	123	72	195	60.3293459028557	36.6852609349137	23.644084967942	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000730944866503358	ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	43530234	A/C	1	111	67	178	54.4435560586747	34.1376733699892	20.3058826886855	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.00262070050130959	ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	43572217	T/C	1	55	56	111	26.9765367858298	28.5329807271551	-1.55644394132534	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.776686380131968	ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44052992	G/A	1	15	21	36	7.35723730522631	10.6998677726832	-3.34263046745687	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.317870325106883	ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44054349	T/C	1	18	20	38	8.82868476627157	10.1903502596983	-1.36166549342669	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.746270992340417	ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44422626	G/A	1	43	36	79	21.0907469416487	18.3426304674569	2.74811647419187	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.574612526231533	ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44422560_44422656:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44422560_44422656:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44422560_44422656:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44422560_44422656:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44422560_44422656:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000456939:exon_44422560_44422656:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000415790:exon_44422560_44422656:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000435014:exon_44422604_44422656:DNTTIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44569516	G/A	1	16	17	33	7.84771979224139	8.66179772074352	-0.81407792850213	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.862380924985109	ENSG00000100982:ENST00000372409:exon_44569448_44569578:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000443130:exon_44569448_44569578:PCIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44574459	C/T	1	16	13	29	7.84771979224139	6.62372766880387	1.22399212343752	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.712533292455687	ENSG00000100982:ENST00000372409:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000443130:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000479348:exon_44574350_44574522:PCIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44578991	G/A	1	30	22	52	14.7144746104526	11.2093852856681	3.50508932478452	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.405546373800075	ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578858_44579012:ZNF335
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44691350	T/G	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44746946	G/C	1	29	27	56	14.2239921234375	13.7569728505926	0.467019272844873	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	44979108	C/G	1	108	135	243	52.9721085976294	68.7848642529633	-15.8127556553339	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0465422568683337	ENSG00000080189:ENST00000317734:exon_44978167_44979163:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000243896:exon_44978167_44979163:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372227:exon_44978167_44979163:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000493599:exon_44978167_44979529:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372229:exon_44978167_44979163:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372230:exon_44978167_44979163:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372225:exon_44978377_44979163:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000372223:exon_44978377_44979163:SLC35C2;ENSG00000080189:ENST00000480329:exon_44978994_44979529:SLC35C2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	45315346	C/T	1	41	49	90	20.1097819676186	24.9663581362607	-4.85657616864217	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.34294471916778	ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	45853082	G/A	1	41	34	75	20.1097819676186	17.323595441487	2.78618652613152	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.564439191688515	ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	45905197	C/T	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000446994:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45905058_45905539:ZMYND8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	45910854	T/C	1	10	12	22	4.90482487015087	6.11421015581896	-1.20938528566809	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.672962537607921	ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000446994:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45910846_45910961:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45910846_45910961:ZMYND8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	46268493	A/G	1	34	25	59	16.676404558513	12.7379378246228	3.93846673389013	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.362244148568101	ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	46295208	C/T	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000196562:ENST00000359930:exon_46295004_46295232:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000361612:exon_46295004_46295232:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000447361:exon_46295004_46295232:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000484875:exon_46295004_46295232:SULF2;ENSG00000196562:ENST00000467815:exon_46295004_46295232:SULF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	47253196	G/A	1	33	25	58	16.1859220714979	12.7379378246228	3.44798424687504	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.431030303716018	ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	47741041	C/T	1	37	39	76	18.1478520195582	19.8711830064116	-1.72333098685339	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.73144423097702	ENSG00000124214:ENST00000396163:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000433926:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371828:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000340954:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371856:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000360426:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000347458:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371805:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371802:exon_47740912_47741142:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371792:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371830:exon_47740912_47741124:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000437404:exon_47740912_47741142:STAU1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	47865672	C/T	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	48522330	G/A	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	48522585	G/A	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	49195061	A/G	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49194957_49195166:PTPN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	49508320	T/C	1	48	48	96	23.5431593767242	24.4568406232758	-0.913681246551647	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.918773140303043	ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	49508881	T/C	1	36	18	54	17.6573695325431	9.17131523372843	8.4860542988147	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0284767003249128	ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	50769379	C/T	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	50769549	A/G	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	50803444	C/T	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	50803573	G/A	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	52611552	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52611551_52611595:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52611551_52611595:BCAS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	52612549	C/T	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52612431_52612589:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52612431_52612589:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52612431_52612589:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52612431_52612589:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52612431_52612589:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52612431_52612589:BCAS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	52645240	C/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52645080_52645289:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52644931_52645511:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000411563:exon_52644411_52645511:BCAS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	54941268	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000124098:ENST00000371384:exon_54941127_54943719:C20orf108
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	55059188	C/T	1	76	70	146	37.2766690131466	35.6662259089439	1.61044310420271	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.804401874204765	ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55059167_55059245:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55059167_55059245:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55059167_55059245:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55059167_55059245:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55059167_55059245:C20orf43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	56179586	G/A	1	29	21	50	14.2239921234375	10.6998677726832	3.52412435075435	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.326621997934511	ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56178902_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56178906_56179825:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56179111_56179825:ZBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	57269495	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57269478_57269648:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000533788:exon_57269477_57269648:NPEPL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	57569134	G/A	1	29	32	61	14.2239921234375	16.3045604155172	-2.08056829207969	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.610813898203114	ENSG00000101158:ENST00000474543:exon_57568679_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57568679_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000486263:exon_57568978_57569294:TH1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	57572614	T/C	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	57572674	C/T	1	368	115	483	180.497555221552	58.594513993265	121.903041228287	T:C	C	T	10	0.509517512984913	6.47893502880834e-30	ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57572658_57572808:CTSZ;ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	60572663	C/A	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130699:ENST00000474089:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60572606_60572725:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60572606_60572725:TAF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	60713332	A/G	1	410	410	820	201.097819676186	208.902180323814	-7.80436064762864	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.6003937639512	ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	60883273	A/C	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	60962624	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	60963403	C/T	1	3920	3764	7684	1922.69134909914	1917.82391887521	4.86743022392852	A:T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.918210430208554	ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60963365_60963420:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60963365_60963420:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	61441797	A/G	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.754351765499807	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	61444356	G/A	1	92	72	164	45.124388805388	36.6852609349137	8.43912787047427	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.211334163349179	ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	61472073	C/A	1	32	8	40	15.6954395844828	4.0761401038793	11.6192994806035	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.000201052238823482	ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	61490763	C/T	1	18	19	37	8.82868476627157	9.68083274671335	-0.85214798044178	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.869819021756582	ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61490716_61490878:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61490716_61490878:TCFL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	61596977	C/T	1	27	26	53	13.2430271494074	13.2474553376077	-0.00442818820038759	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61596962_61597077:SLC17A9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62153190	C/T	1	311	261	572	152.540053461692	132.984070889062	19.5559825726298	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.103052503341642	ENSG00000125534:ENST00000370179:exon_62153021_62153559:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000370177:exon_62152865_62153291:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000473620:exon_62153021_62153302:PPDPF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62195087	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62316889	T/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62316876_62316950:RTEL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62321655	G/A	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000425905:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62321647_62321794:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62321647_62321794:RTEL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62324542	G/C	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324496_62324636:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324496_62324636:RTEL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62329655	C/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62329633_62330051:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62329633_62330051:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62329633_62330033:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000243509:ENST00000369996:exon_62329633_62330037:TNFRSF6B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62368974	G/A	1	16	15	31	7.84771979224139	7.64276269477369	0.204957097467697	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62368886_62369000:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62367133_62369000:ZGPAT;ENSG00000203896:ENST00000444951:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000490824:exon_62367670_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000465591:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000309546:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000487026:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000480139:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000493265:exon_62368637_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000489212:exon_62368852_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000476183:exon_62368852_62369000:LIME1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62370214	A/G	1	43	55	98	21.0907469416487	28.0234632141702	-6.93271627252147	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.188801756359672	ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62369951_62370456:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62369951_62370456:ZGPAT;ENSG00000203896:ENST00000490824:exon_62369951_62370456:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000309546:exon_62369951_62370456:LIME1;ENSG00000125520:ENST00000476221:exon_62369951_62370284:SLC2A4RG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62574006	A/G	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.112356383277526	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62591525	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	20	62607160	C/T	1	39	67	106	19.1288169935884	34.1376733699892	-15.0088563764008	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00461095431418652	ENSG00000130590:ENST00000369886:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000498830:exon_62607045_62607185:SAMD10;ENSG00000130590:ENST00000478694:exon_62607045_62607185:SAMD10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	26965071	G/A	1	22	9	31	10.7906147143319	4.58565761686422	6.2049570974677	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0303488828259817	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	26965148	G/A	1	96	100	196	47.0863187534484	50.9517512984913	-3.86543254504295	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.61718115683128	ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	26965205	T/C	1	121	134	255	59.3483809288255	68.2753467399783	-8.92696581115282	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.286974554579471	ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	26969703	T/C	1	38	42	80	18.6383345065733	21.3997355453663	-2.76140103879304	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.576861871877945	ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	26976222	C/T	1	89	56	145	43.6529413443427	28.5329807271551	15.1199606171876	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0126092985124545	ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	26976237	C/T	1	96	54	150	47.0863187534484	27.5139457011853	19.5723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00140140159116763	ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	26978950	A/G	1	140	102	242	68.6675481821122	51.9707863244611	16.6967618576511	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0337784032840846	ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26978761_26978967:MRPL39
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	33642837	G/A	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000159055:ENST00000290130:exon_33642718_33642840:C21orf45;ENSG00000159055:ENST00000486363:exon_33642718_33642889:C21orf45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	33982185	C/T	1	66	59	125	32.3718441429957	30.0615332661099	2.31031087688588	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.720792279483336	ENSG00000159079:ENST00000431216:exon_33982148_33982315:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000440966:exon_33982148_33982315:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000382549:exon_33982148_33982315:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000290155:exon_33982148_33982315:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000300260:exon_33982148_33982315:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000458138:exon_33982148_33982264:C21orf59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	33984566	G/A	1	26	25	51	12.7525446623923	12.7379378246228	0.0146068377694366	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000159079:ENST00000440966:exon_33984415_33984662:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000382549:exon_33984415_33984896:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000290155:exon_33984415_33985176:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000300260:exon_33984415_33984913:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000458138:exon_33984415_33984865:C21orf59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	33984580	T/G	1	32	29	61	15.6954395844828	14.7760078765625	0.919431707920307	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.898267294342906	ENSG00000159079:ENST00000440966:exon_33984415_33984662:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000382549:exon_33984415_33984896:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000290155:exon_33984415_33985176:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000300260:exon_33984415_33984913:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000458138:exon_33984415_33984865:C21orf59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	34614255	T/G	1	25	33	58	12.2620621753772	16.8140779285021	-4.55201575312496	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.240127538227422	ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	34617213	T/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	34926043	G/A	1	48	50	98	23.5431593767242	25.4758756492457	-1.93271627252147	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.76200985252601	ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	34926260	C/T	1	62	60	122	30.4099141949354	30.5710507790948	-0.161136584159383	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	34945721	T/C	1	13	43	56	6.37627233119613	21.9092530583513	-15.5329807271551	T:C	T	C	10	0.509517512984913	3.94655820972635e-05	ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	35281393	A/G	1	362	446	808	177.554660299461	227.244810791271	-49.6901504918097	A:T:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000489449397923926	ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	36042584	G/A	1	15	18	33	7.35723730522631	9.17131523372843	-1.81407792850213	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.602827681047108	ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36041688_36043061:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36041688_36043061:CLIC6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	37416111	A/G	1	19	12	31	9.31916725328665	6.11421015581896	3.2049570974677	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.283751645573885	ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37416080_37416254:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000481477:exon_37416080_37416254:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37416080_37416254:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37416080_37416254:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399205:exon_37415984_37416254:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399208:exon_37415984_37416254:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399201:exon_37415984_37416254:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399207:exon_37415996_37416254:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000414900:exon_37416057_37416254:SETD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	37444937	G/A	1	89	84	173	43.6529413443427	42.7994710907327	0.853470253610048	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.939431524872358	ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	38444835	A/C	1	13	40	53	6.37627233119613	20.3807005193965	-14.0044281882004	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.000149605051843824	ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38444734_38445111:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000479152:exon_38444734_38445023:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000430792:exon_38444734_38445297:PIGP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	38538429	C/A	1	18	14	32	8.82868476627157	7.13324518178878	1.69543958448278	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.598757235104772	ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38537852_38538917:TTC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	42749081	T/C	1	20	29	49	9.80964974030174	14.7760078765625	-4.96635813626074	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.197990645518916	ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000436410:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000435611:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000418103:exon_42748763_42749082:MX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	42778878	G/C	1	37	63	100	18.1478520195582	32.0996033180495	-13.9517512984913	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00663132417837617	ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000481838:exon_42778671_42778925:MX2;ENSG00000183486:ENST00000398632:exon_42778671_42778925:MX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	42812891	C/T	1	174	219	393	85.3439527406251	111.584335343696	-26.2403826030708	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00864386510310488	ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	42817930	G/A	1	367	428	795	180.007072734537	218.073495557543	-38.0664228230058	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00701043748379931	ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	42821113	T/C	1	500	433	933	245.241243507544	220.621083122467	24.6201603850762	A:T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.108668982660493	ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	43803167	T/C	1	68	1	69	33.3528091170259	0.509517512984913	32.843291604041	T:C	T	C	10	0.509517512984913	4.52239133533065e-19	ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	43974249	T/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43974172_43974252:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43974172_43974252:SLC37A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	44273858	G/A	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44273679_44273862:WDR4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	44323461	G/A	1	28	19	47	13.7335096364224	9.68083274671335	4.05267688970909	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.24697288273901	ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	44845888	A/G	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45096206	G/A	1	17	24	41	8.33820227925648	12.2284203116379	-3.89021803238143	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.274300665161299	ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45096153_45096217:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45096153_45096217:RRP1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45168884	G/A	1	62	75	137	30.4099141949354	38.2138134738685	-7.80389927893308	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.199990834433581	ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45523416	C/T	1	11	19	30	5.39530735716596	9.68083274671335	-4.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.144013561824245	ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45544594	T/C	1	91	62	153	44.6339063183729	31.5900858050646	13.0438205133083	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0356705493727595	ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45547913	C/A	1	30	31	61	14.7144746104526	15.7950429025323	-1.08056829207969	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.799191518420947	ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45739281	C/T	1	72	73	145	35.3147390650863	37.1947784478986	-1.88003938281238	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.8033575177783	ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45739234_45740030:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000474114:exon_45739234_45741758:PFKL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45742848	C/T	1	56	82	138	27.4670192728449	41.7804360647629	-14.313416791918	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.016873627366384	ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000474114:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000498841:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000460020:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000467315:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000460521:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000495274:exon_45742845_45742932:PFKL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45750168	A/G	1	36	36	72	17.6573695325431	18.3426304674569	-0.685260934913735	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.906516204643348	ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45750713	C/T	1	31	23	54	15.2049570974677	11.718902798653	3.4860542988147	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.414397416022210	ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45750706_45750802:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45750706_45750802:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45750706_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45750346_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45750706_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45750346_45751897:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45750706_45750802:C21orf2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45815307	T/C	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000142185:ENST00000300482:exon_45815297_45815434:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397928:exon_45815297_45815434:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397932:exon_45815297_45815434:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000300481:exon_45815297_45815434:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000498430:exon_45815297_45815434:TRPM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45817713	G/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000142185:ENST00000300482:exon_45817630_45817759:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397928:exon_45817630_45817759:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397932:exon_45817630_45817759:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000300481:exon_45817630_45817759:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000498430:exon_45817630_45817759:TRPM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	45845568	C/A	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000142185:ENST00000300482:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397928:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000397932:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000300481:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000498430:exon_45845553_45845710:TRPM2;ENSG00000142185:ENST00000490982:exon_45845439_45845710:TRPM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	46932318	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000182871:ENST00000400337:exon_46932102_46933634:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000400347:exon_46932102_46932478:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000355480:exon_46932102_46933634:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000359759:exon_46932102_46933633:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000342220:exon_46932102_46933634:COL18A1;ENSG00000182871:ENST00000473212:exon_46932102_46932481:COL18A1;ENSG00000173638:ENST00000468508:exon_46932276_46933472:SLC19A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	46957794	T/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47581423	C/T	0	0	13	13	0	6.62372766880387	-6.62372766880387	T	C	T	10	0.509517512984913	9.50835894238671e-05	ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47614443	A/G	1	36	41	77	17.6573695325431	20.8902180323814	-3.2328484998383	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.495051170447798	ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47642609	G/A	1	9	15	24	4.41434238313578	7.64276269477369	-3.22842031163791	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.222587013753191	ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47642577_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47642544_47642652:LSS;ENSG00000160285:ENST00000450351:exon_47642544_47642652:LSS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47665025	G/A	1	19	15	34	9.31916725328665	7.64276269477369	1.67640455851296	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.609816610836836	ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47664721_47665111:MCM3AP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47685268	C/T	1	15	12	27	7.35723730522631	6.11421015581896	1.24302714940735	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.702512858193323	ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685235_47685437:MCM3AP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47821588	A/G	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47831309	G/A	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47831509	A/G	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47831522	G/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47831618	C/T	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47831103_47831981:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47831103_47831981:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47836122	T/C	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47836206	A/C	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47836216	A/G	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47836395	T/G	1	18	10	28	8.82868476627157	5.09517512984913	3.73350963642244	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.187163218330294	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47836426	T/C	1	16	11	27	7.84771979224139	5.60469264283404	2.24302714940735	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.444316864047377	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47836448	A/G	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47836547	T/C	1	19	7	26	9.31916725328665	3.56662259089439	5.75254466239226	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.029702627804958	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47841941	A/G	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47841884_47842038:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47841884_47842038:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47845862	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47845745_47845885:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47845745_47845885:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47848459	G/A	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47848309_47848504:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47848309_47848504:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	47850484	G/C	1	11	12	23	5.39530735716596	6.11421015581896	-0.718902798652999	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.836405124181301	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	21	48083338	G/A	1	13	16	29	6.37627233119613	8.15228020775861	-1.77600787656248	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.579398877321146	ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000486520:exon_48083295_48083466:PRMT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	17625926	C/A	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17625914_17626007:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17625914_17626007:CECR5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	17669306	T/C	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	18095617	C/T	1	53	48	101	25.9955718117996	24.4568406232758	1.53873118852379	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.766435739157488	ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18095578_18095644:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18095578_18095644:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18095578_18095644:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18095578_18095644:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000481365:exon_18095578_18095644:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000484653:exon_18095578_18095644:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18095380_18095644:ATP6V1E1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	18166021	A/G	1	30	19	49	14.7144746104526	9.68083274671335	5.03364186373926	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.156043211104239	ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	18166077	A/C	1	28	15	43	13.7335096364224	7.64276269477369	6.09074694164874	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0680926015639895	ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	19026613	A/G	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000070413:ENST00000263196:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000389262:exon_19023799_19026634:DGCR2;ENSG00000070413:ENST00000467659:exon_19025350_19026634:DGCR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	19420109	T/C	1	53	28	81	25.9955718117996	14.2664903635776	11.729081448222	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0102702514126156	ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19419425_19420130:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19420102_19420382:MRPL40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	19423250	G/A	1	143	146	289	70.1389956431574	74.3895568957973	-4.25056125263986	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.638084124105002	ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	19950329	G/A	1	118	93	211	57.8769334677803	47.3851287075969	10.4918047601834	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.168329424546136	ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	20049244	C/T	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000183597:ENST00000462579:exon_20049053_20049325:C22orf25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	21213380	C/T	1	31	26	57	15.2049570974677	13.2474553376077	1.95750175985996	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.691447229369019	ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	21337325	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000414985:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000493460:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000443265:exon_21337316_21337378:LZTR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	21350054	C/T	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000415354:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000495142:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000491432:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000439171:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000452988:exon_21350052_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000463909:exon_21349378_21350161:LZTR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	21354158	C/G	1	76	78	154	37.2766690131466	39.7423660128232	-2.4656969996766	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.747280521333833	ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21353393_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354061_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354062_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354063_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354066_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354091_21354721:THAP7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	23223278	A/T	1	1	8	9	0.490482487015087	4.0761401038793	-3.58565761686422	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.0193172128390594	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	23631801	T/C	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24224974	G/A	1	11	13	24	5.39530735716596	6.62372766880387	-1.22842031163791	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.685634010557098	ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24224946_24225140:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24224946_24225139:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24224946_24225138:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24224946_24226211:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24224946_24225329:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000482576:exon_24224946_24225139:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000472526:exon_24224946_24225056:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473357:exon_24224946_24225494:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000421180:exon_24224946_24225056:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24224946_24225056:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000502845:exon_24224946_24225056:AP000350.10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24227053	A/G	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24226836_24227120:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24226836_24227738:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24226836_24227740:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24226836_24227054:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000486907:exon_24226836_24227723:SLC2A11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24227054	G/T	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24226836_24227120:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24226836_24227738:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24226836_24227740:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24226836_24227723:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24226836_24227054:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000486907:exon_24226836_24227723:SLC2A11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24237221	C/G	1	4	21	25	1.96192994806035	10.6998677726832	-8.73793782462283	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.000437964241575371	ENSG00000240972:ENST00000465752:exon_24236959_24237414:MIF;ENSG00000218537:ENST00000406213:exon_24236613_24237719:AP000350.4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24509662	G/A	1	14	19	33	6.86675481821122	9.68083274671335	-2.81407792850213	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.385252830298031	ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24509533_24509715:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24509533_24509715:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24509533_24509715:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24509533_24509715:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000467937:exon_24509533_24509715:CABIN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24562790	C/G	1	20	21	41	9.80964974030174	10.6998677726832	-0.890218032381433	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.876185377477144	ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24562607_24563281:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24562607_24563281:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24562607_24563281:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24562607_24563281:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24562607_24563281:CABIN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24921765	G/A	1	13	21	34	6.37627233119613	10.6998677726832	-4.32359544148704	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.169838425256551	ENSG00000100024:ENST00000415388:exon_24921679_24922636:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000326010:exon_24921679_24922553:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000413389:exon_24921679_24922552:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000498140:exon_24921679_24924358:UPB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24950924	G/A	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000138867:ENST00000407471:exon_24950917_24951150:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000435822:exon_24950917_24951284:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000398245:exon_24950917_24951139:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000447813:exon_24950917_24951057:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000402766:exon_24950917_24951093:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000407973:exon_24950917_24951104:C22orf13;ENSG00000138867:ENST00000468170:exon_24950917_24951092:C22orf13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24964128	T/C	1	643	545	1188	315.380239150701	277.687044576778	37.6931945739234	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.0295101725888773	ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	24981990	G/A	1	3	11	14	1.47144746104526	5.60469264283404	-4.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0321870224179764	ENSG00000178026:ENST00000318753:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000446942:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000491910:exon_24981603_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000404045:exon_24981617_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000460524:exon_24981630_24982379:C22orf36
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	25753231	G/A	1	13	15	28	6.37627233119613	7.64276269477369	-1.26649036357756	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.707147525454052	ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	25753387	C/T	1	6	13	19	2.94289492209052	6.62372766880387	-3.68083274671335	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.109606452148716	ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	25755880	C/T	1	9	1	10	4.41434238313578	0.509517512984913	3.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0217074557551410	ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25755794_25758524:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25755794_25756190:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25755794_25756190:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25755794_25756190:LRP5L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	25755885	C/T	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25755794_25758524:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25755794_25756190:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25755794_25756190:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25755794_25756190:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25755883_25756192:LRP5L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	26114261	G/A	1	27	35	62	13.2430271494074	17.833112954472	-4.5900858050646	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.255266973393373	ENSG00000100077:ENST00000324198:exon_26114212_26114348:ADRBK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	26937450	C/T	1	16	18	34	7.84771979224139	9.17131523372843	-1.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.732552886508093	ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000442495:exon_26937172_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000454778:exon_26937237_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000440953:exon_26937405_26937684:TPST2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	29660140	G/C	1	16	11	27	7.84771979224139	5.60469264283404	2.24302714940735	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.444316864047377	ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000496342:exon_29659824_29660390:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000414672:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000406335:exon_29659946_29660207:RHBDD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	29669850	A/G	1	28	53	81	13.7335096364224	27.0044281882004	-13.270918551778	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00364270608332098	ENSG00000182944:ENST00000444626:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000397938:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000332050:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000436425:exon_29669727_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000447973:exon_29669727_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000406548:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000485037:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000437155:exon_29669727_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000331029:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000483415:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000405024:exon_29669727_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000414183:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000451900:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000333395:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000332035:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000455726:exon_29669730_29669853:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000354516:exon_29669730_29669853:EWSR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	29694917	A/G	1	14	17	31	6.86675481821122	8.66179772074352	-1.7950429025323	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.591606875195905	ENSG00000182944:ENST00000483629:exon_29694723_29695270:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000490315:exon_29694723_29695841:EWSR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	29886043	A/C	1	24	4	28	11.7715796883621	2.03807005193965	9.73350963642244	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.000192701136435703	ENSG00000100285:ENST00000310624:exon_29884838_29887379:NEFH;ENSG00000100285:ENST00000328842:exon_29886042_29886692:NEFH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	29966518	G/T	1	38	39	77	18.6383345065733	19.8711830064116	-1.2328484998383	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.820163306594828	ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29966394_29966521:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000473475:exon_29966434_29966521:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000437094:exon_29966394_29966521:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000415100:exon_29966394_29966521:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000455496:exon_29966394_29966521:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000496944:exon_29966394_29966521:NIPSNAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	30074189	T/C	1	21	7	28	10.3001322273168	3.56662259089439	6.73350963642244	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0129784473200070	ENSG00000186575:ENST00000413209:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000447429:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000397822:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000347330:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000338641:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000403435:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361452:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000403999:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000334961:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000353887:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000432151:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000397789:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361676:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361166:exon_30074185_30074312:NF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	30163526	A/G	1	577	532	1109	283.008395007705	271.063316907974	11.9450780997315	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.489722954409561	ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	30184950	A/G	1	86	72	158	42.1814938832975	36.6852609349137	5.49623294838375	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.426297665682845	ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	30700607	T/G	1	23	26	49	11.281097201347	13.2474553376077	-1.96635813626074	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.66863426075168	ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	30733111	C/A	1	38	26	64	18.6383345065733	13.2474553376077	5.39087916896557	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.211074830583067	ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	30771458	T/C	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	30776095	C/T	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000099999:ENST00000382363:exon_30776051_30776194:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000215798:exon_30776051_30776194:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000463319:exon_30776051_30776194:RNF215
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	30823196	T/C	1	36	38	74	17.6573695325431	19.3616654934267	-1.70429596088356	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.728074510388297	ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31006860	A/G	1	4	24	28	1.96192994806035	12.2284203116379	-10.2664903635776	A:G	A	G	10	0.509517512984913	8.16464944623978e-05	ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000423350:exon_31006858_31007101:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31006858_31007050:TCN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31011350	C/T	1	12	5	17	5.88578984418104	2.54758756492456	3.33820227925648	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.144694391340598	ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011288_31011460:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011288_31011460:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011288_31011460:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011288_31011460:TCN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31011610	G/C	1	23	3	26	11.281097201347	1.52855253895474	9.75254466239226	C:G	G	C	10	0.509517512984913	9.41644633357045e-05	ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011588_31011774:TCN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31333631	T/C	1	22	15	37	10.7906147143319	7.64276269477369	3.14785201955822	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.327260400458979	ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31491332	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31621792	G/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000182541:ENST00000462625:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000444929:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31621706_31621805:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000331728:exon_31621706_31621805:LIMK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31663875	G/A	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000182541:ENST00000444929:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000331728:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000333611:exon_31663762_31663893:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31663762_31663893:LIMK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31838085	G/A	1	30	27	57	14.7144746104526	13.7569728505926	0.95750175985996	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.894770752909179	ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	31998612	G/A	1	13	13	26	6.37627233119613	6.62372766880387	-0.247455337607738	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	32011225	T/C	1	51	32	83	25.0146068377694	16.3045604155172	8.71004642225222	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0618670820361394	ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	32266603	A/G	1	2	11	13	0.980964974030174	5.60469264283404	-4.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0114904474112339	ENSG00000100150:ENST00000382109:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400249:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000266091:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400246:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382105:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382112:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382111:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400248:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000448753:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000433147:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000494060:exon_32266576_32266730:DEPDC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	32435511	G/A	0	270	0	270	132.430271494073	0	132.430271494073	G	G		10	0.509517512984913	8.65236985436734e-80	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	32788248	T/A	1	92	81	173	45.124388805388	41.270918551778	3.85347025361006	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.594751391449377	ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32788227_32788346:C22orf28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	32795626	T/C	1	75	73	148	36.7861865261315	37.1947784478986	-0.408591921767126	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	32802680	A/G	1	35	41	76	17.166887045528	20.8902180323814	-3.72333098685339	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.422986161112032	ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32802649_32802748:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32802649_32802687:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32802649_32802748:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32802649_32802748:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32802649_32802748:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32802649_32802748:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000487704:exon_32802649_32802748:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000454663:exon_32802649_32802748:C22orf28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	36556729	T/C	1	32	18	50	15.6954395844828	9.17131523372843	6.52412435075435	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0673273051300069	ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36556717_36556819:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36556717_36556977:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36556717_36556837:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36556717_36556837:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36556717_36556803:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36556717_36556802:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000531195:exon_36556717_36556802:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487783:exon_36556717_36556803:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000530895:exon_36556717_36556803:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000472303:exon_36556717_36556803:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000531095:exon_36556717_36556831:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000347595:exon_36556717_36556831:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000533061:exon_36556717_36556803:APOL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	36623671	C/T	1	57	58	115	27.95750175986	29.552015753125	-1.594513993265	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.780356300426253	ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	36623980	C/T	1	55	51	106	26.9765367858298	25.9853931622306	0.991143623599225	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.922671594853232	ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	36684331	C/T	1	360	288	648	176.573695325431	146.741043739655	29.8326515857764	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0203796543707157	ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	36710191	G/A	1	111	113	224	54.4435560586747	57.5754789672952	-3.13192290862051	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.688877729074704	ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36710190_36710363:MYH9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	36914967	G/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	36921659	G/C	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.258617102120622	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	36922067	G/A	1	123	108	231	60.3293459028557	55.0278914023706	5.3014545004851	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.510735914738705	ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37260117	C/T	1	18	28	46	8.82868476627157	14.2664903635776	-5.437805597306	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.139518785562104	ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37260087_37260171:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37260087_37260171:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37260087_37260171:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37260087_37260171:NCF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37273742	G/A	1	71	63	134	34.8242565780712	32.0996033180495	2.72465326002166	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.666269954233297	ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37326443	G/C	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37326417_37326552:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37326417_37326552:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37326417_37326552:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000421539:exon_37326417_37326552:CSF2RB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37333793	C/T	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000100368:ENST00000403662:exon_37333419_37336491:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000262825:exon_37333419_37336481:CSF2RB;ENSG00000100368:ENST00000406230:exon_37333419_37334653:CSF2RB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37414528	G/A	1	34	24	58	16.676404558513	12.2284203116379	4.44798424687504	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.293421178264149	ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37414179_37415508:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000413912:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000438203:exon_37414402_37414794:TST
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37531436	G/A	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37602611	C/G	1	19	7	26	9.31916725328665	3.56662259089439	5.75254466239226	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.029702627804958	ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37603051	C/T	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37603390	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37603744	C/T	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37699377	T/C	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	ENSG00000100055:ENST00000248901:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000422721:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000443914:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000417357:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000462927:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000427572:exon_37699295_37699443:CYTH4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	37709536	T/C	1	20	9	29	9.80964974030174	4.58565761686422	5.22399212343752	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0627808957285707	ENSG00000100055:ENST00000248901:exon_37709480_37711382:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000422721:exon_37709480_37711389:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000443914:exon_37709480_37711389:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000404204:exon_37709480_37711363:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000462927:exon_37709480_37711382:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000427572:exon_37709480_37709569:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000446506:exon_37709480_37709679:CYTH4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38028664	C/T	1	96	90	186	47.0863187534484	45.8565761686422	1.22974258480618	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.883537690395444	ENSG00000100083:ENST00000343632:exon_38028608_38029571:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000381756:exon_38028608_38028718:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000325180:exon_38028608_38029571:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000337437:exon_38028608_38029570:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000406772:exon_38028608_38029570:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000460957:exon_38028608_38028684:GGA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38039128	A/G	1	52	44	96	25.5050893247845	22.4187705713362	3.08631875344835	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.541936033054375	ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039105_38039181:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039105_38039181:SH3BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38039708	T/C	1	78	76	154	38.2576339871768	38.7233309868534	-0.465696999676595	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000471650:exon_38039462_38039795:SH3BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38046718	A/G	1	23	47	70	11.281097201347	23.9473231102909	-12.6662259089439	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00263878413020393	ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38151170	G/A	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38151108_38151197:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000331103:exon_38151108_38151517:TRIOBP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38204089	C/T	1	25	8	33	12.2620621753772	4.0761401038793	8.18592207149787	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00478678937300146	ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38203912_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38203919_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38203923_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000415371:exon_38203930_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000478203:exon_38203941_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000426858:exon_38203945_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000451984:exon_38204021_38204170:GCAT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38205989	T/C	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38205956_38206164:GCAT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38212762	A/G	1	29	25	54	14.2239921234375	12.7379378246228	1.4860542988147	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.785768149186664	ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38273749	T/C	1	358	389	747	175.592730351401	198.202312551131	-22.60958219973	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.099679832042641	ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	38882027	C/T	1	109	92	201	53.4625910846445	46.875611194612	6.5869798900325	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.359956575937727	ENSG00000100201:ENST00000396821:exon_38879445_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000532271:exon_38879445_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000381633:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415456:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000415748:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000444597:exon_38879469_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000216019:exon_38881686_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000403230:exon_38881883_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000404499:exon_38881883_38882445:DDX17;ENSG00000100201:ENST00000431312:exon_38881940_38882445:DDX17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39069181	T/C	1	16	16	32	7.84771979224139	8.15228020775861	-0.304560415517216	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39095849	G/C	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000100221:ENST00000216039:exon_39095808_39096672:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000427389:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000412832:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000417712:exon_39095806_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000456626:exon_39095808_39096623:JOSD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39134715	T/C	1	31	42	73	15.2049570974677	21.3997355453663	-6.19477844789865	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.160681465143247	ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39135933	G/A	1	61	47	108	29.9194317079203	23.9473231102909	5.9721085976294	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289720292581108	ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000477262:exon_39135727_39135948:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000469086:exon_39135727_39135948:SUN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39381840	C/T	1	42	14	56	20.6002644546337	7.13324518178878	13.4670192728449	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000268113373714321	ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000335760:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39381817_39382096:APOBEC3B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39382414	T/C	1	51	36	87	25.0146068377694	18.3426304674569	6.67197637031257	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.164005456005171	ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000335760:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39382303_39382417:APOBEC3B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39425505	G/A	1	27	30	57	13.2430271494074	15.2855253895474	-2.04249824014004	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.59913770109504	ENSG00000243811:ENST00000216099:exon_39425368_39425524:APOBEC3D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39441251	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39441189_39441547:APOBEC3F
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39441577	G/C	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39477566	A/G	1	107	127	234	52.4816261106143	64.7087241490839	-12.2270980384696	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.116637807288623	ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39710664	C/T	1	18	16	34	8.82868476627157	8.15228020775861	0.676404558512958	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.865000507651962	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39713453	C/G	1	15	16	31	7.35723730522631	8.15228020775861	-0.795042902532303	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.858159256514081	ENSG00000100316:ENST00000484615:exon_39713056_39713634:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000460589:exon_39713401_39713634:RPL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39714394	T/C	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000100316:ENST00000461967:exon_39713860_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000498462:exon_39714117_39714597:RPL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39714580	G/A	1	946	1039	1985	463.996432716272	529.388695991325	-65.3922632750524	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00350867723224876	ENSG00000100316:ENST00000401609:exon_39714405_39714619:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000216146:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000465618:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000495832:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000437815:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000402527:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000453303:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000427905:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000420536:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000484615:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000460589:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000461967:exon_39713860_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000498462:exon_39714117_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000459859:exon_39714405_39714597:RPL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39883736	G/C	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000128268:ENST00000341184:exon_39883352_39888199:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000429786:exon_39883352_39888199:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000429402:exon_39883352_39883835:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000439236:exon_39883352_39885213:MGAT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39884906	C/G	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000128268:ENST00000341184:exon_39883352_39888199:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000429786:exon_39883352_39888199:MGAT3;ENSG00000128268:ENST00000439236:exon_39883352_39885213:MGAT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	39917515	A/C	1	342	354	696	167.74501055916	180.369199596659	-12.6241890374994	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.34342903208293	ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	40814594	C/T	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	40814636	C/T	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	40815089	G/C	1	10	16	26	4.90482487015087	8.15228020775861	-3.24745533760774	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.240919067564399	ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	40815256	C/T	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	41175065	T/C	1	43	33	76	21.0907469416487	16.8140779285021	4.27666901314661	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.359468204365555	ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000402844:exon_41175013_41176198:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000447566:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000430221:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000427084:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000458600:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000443810:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000412879:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000426396:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434193:exon_41175038_41175129:SLC25A17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	41246855	T/C	1	9	115	124	4.41434238313578	58.594513993265	-54.1801716101292	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1.23565600646531e-25	ENSG00000100380:ENST00000216218:exon_41246827_41246884:ST13;ENSG00000100380:ENST00000411695:exon_41246827_41246884:ST13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	41569822	G/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	41574087	C/T	1	12	19	31	5.88578984418104	9.68083274671335	-3.7950429025323	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.209090362166922	ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41572777_41576081:EP300
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	42456373	A/G	1	30	37	67	14.7144746104526	18.8521479804418	-4.13767336998917	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.330163501254698	ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42454358_42456417:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42455800_42456417:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42455806_42456417:NAGA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	42463814	C/T	1	11	18	29	5.39530735716596	9.17131523372843	-3.77600787656248	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.194206386621495	ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	42609858	G/T	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	42912029	G/T	1	35	37	72	17.166887045528	18.8521479804418	-1.68526093491374	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.724580036619648	ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	42981890	G/A	1	23	20	43	11.281097201347	10.1903502596983	1.09074694164874	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.7626051935177	ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	43010817	G/A	1	21	19	40	10.3001322273168	9.68083274671335	0.61929948060348	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.875534708687596	ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_43010805_43010875:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_43010805_43010937:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_43010805_43010968:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_43010805_43010866:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_43010805_43010883:POLDIP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	43088971	C/T	1	46	35	81	22.562194402694	17.833112954472	4.72908144822205	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.318146741728862	ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	43089849	T/C	1	20	16	36	9.80964974030174	8.15228020775861	1.65736953254313	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.620024668135095	ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	43193603	G/A	1	66	55	121	32.3718441429957	28.0234632141702	4.34838092882553	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.467312583264004	ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43192508_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43192538_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43193420_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43193556_43193611:ARFGAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	43203137	C/T	1	20	26	46	9.80964974030174	13.2474553376077	-3.437805597306	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.376533097076339	ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43203080_43203169:ARFGAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	43230266	G/A	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43230248_43230331:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43230248_43230331:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43230248_43230331:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43230248_43230331:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43230248_43230331:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43230248_43230331:ARFGAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44359246	A/G	1	27	21	48	13.2430271494074	10.6998677726832	2.54315937672418	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.474743472802699	ENSG00000100344:ENST00000406117:exon_44359166_44359276:PNPLA3;ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44359166_44359276:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44359166_44359276:SAMM50
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44368204	A/G	1	42	36	78	20.6002644546337	18.3426304674569	2.25763398717678	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.651360661700279	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44372632	C/T	1	62	70	132	30.4099141949354	35.6662259089439	-5.25631171400851	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.38447966808102	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44379822	T/C	1	79	56	135	38.7481164741919	28.5329807271551	10.2151357470367	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.085132634628685	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44386281	C/T	1	236	204	440	115.753866935561	103.941572648922	11.8122942866383	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.272844248689131	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44489896	T/C	1	90	105	195	44.1434238313578	53.4993388634159	-9.35591503205804	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.197278154614832	ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44514941	C/T	1	132	96	228	64.7436882859915	48.9136812465516	15.8300070394398	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0398475852060389	ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44514918_44515020:PARVB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44543766	C/T	1	93	89	182	45.6148712924031	45.3470586556573	0.267812636745838	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44543741_44543802:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44543743_44543802:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44543741_44543802:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44543741_44543802:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44543733_44543802:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44543741_44543802:PARVB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	44586522	C/T	1	38	23	61	18.6383345065733	11.718902798653	6.91943170792031	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0952217721388864	ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	45128232	T/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	45132704	T/C	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45132652_45132754:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	45132785	T/C	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45132652_45132789:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45132652_45133095:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	45598922	G/T	1	21	18	39	10.3001322273168	9.17131523372843	1.12881699358839	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.750979189113534	ENSG00000100364:ENST00000336156:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000528169:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000391627:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000251993:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000423262:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000443310:exon_45598871_45599065:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000488038:exon_45598871_45599065:C22orf9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	45723807	G/C	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	45728370	G/A	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46671196	G/A	1	1	13	14	0.490482487015087	6.62372766880387	-6.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000804365858647233	ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46671145_46671318:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000421359:exon_46671145_46671318:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000422713:exon_46671145_46671318:TTC38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46704243	C/T	1	15	15	30	7.35723730522631	7.64276269477369	-0.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46704337	C/T	1	19	10	29	9.31916725328665	5.09517512984913	4.22399212343752	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.138099592722369	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46704590	G/A	1	24	14	38	11.7715796883621	7.13324518178878	4.63833450657331	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.146057457351567	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46704676	A/G	1	22	12	34	10.7906147143319	6.11421015581896	4.67640455851296	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.123738258699209	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46709881	G/A	1	13	11	24	6.37627233119613	5.60469264283404	0.771579688362088	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.83951915689104	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46709787_46709910:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46709787_46709910:GTSE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46719100	C/G	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46719087_46719159:GTSE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46746261	C/T	1	6	17	23	2.94289492209052	8.66179772074352	-5.718902798653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0206563045334984	ENSG00000100416:ENST00000486620:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46746247_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000424260:exon_46746243_46746265:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46746247_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000496831:exon_46746243_46746317:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485175:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000463785:exon_46746242_46746360:TRMU
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	46752813	G/A	1	36	37	73	17.6573695325431	18.8521479804418	-1.19477844789865	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.815519129966494	ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46752739_46753232:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46752739_46753237:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46752739_46753081:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46752739_46753236:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46752739_46753235:TRMU
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	47083010	T/C	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	47083012	T/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	47116905	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47116799_47116912:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47116799_47116912:CERK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50637597	G/C	1	102	91	193	50.0292136755389	46.3660936816271	3.66311999391179	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.614839816093594	ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50657879	G/A	1	48	39	87	23.5431593767242	19.8711830064116	3.67197637031257	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.454245235969693	ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50657717_50657885:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50657717_50658220:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50657717_50657885:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50657717_50657885:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50657717_50657885:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50657717_50657885:TUBGCP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50658424	T/C	1	49	34	83	24.0336418637393	17.323595441487	6.71004642225222	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.153951528085182	ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50686403	G/A	1	55	48	103	26.9765367858298	24.4568406232758	2.51969616255396	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.624008593444844	ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496235:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000471375:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000475965:exon_50685567_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000476310:exon_50686319_50686574:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470378:exon_50686337_50686721:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50686319_50686574:MAPK12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50694297	A/G	1	33	32	65	16.1859220714979	16.3045604155172	-0.118638344019345	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50695355	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50695217_50695393:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50695217_50695393:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50695028_50695536:MAPK12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50699668	A/G	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50704661	T/C	1	11	18	29	5.39530735716596	9.17131523372843	-3.77600787656248	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.194206386621495	ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50716167	G/A	1	47	37	84	23.0526768897091	18.8521479804418	4.20052890926731	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.383827316350412	ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50719251	A/G	1	53	35	88	25.9955718117996	17.833112954472	8.16245885732766	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0882760396811989	ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50720295	G/A	1	27	27	54	13.2430271494074	13.7569728505926	-0.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.892792650810575	ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50720283_50720363:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000492578:exon_50719995_50720435:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000427829:exon_50720283_50720510:PLXNB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50720622	C/T	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50728947	G/A	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50728816_50729018:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50728828_50729018:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000425954:exon_50728529_50729026:PLXNB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50877166	G/C	1	27	31	58	13.2430271494074	15.7950429025323	-2.55201575312495	A:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.514550560910101	ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50879447	T/G	1	23	19	42	11.281097201347	9.68083274671335	1.60026445463366	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.646500103260762	ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50895053	G/A	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.848425091361672	ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50898758	G/A	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50898701_50898837:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50898701_50898837:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50898701_50898837:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50898701_50898837:SBF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50904240	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50904192_50904269:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50904192_50904269:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50904192_50904269:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50904192_50904269:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50904192_50904269:SBF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50906108	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50905961_50906119:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50905961_50906122:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50905961_50906119:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50905961_50906122:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50905961_50906119:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000399627:exon_50905961_50906352:SBF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50942039	G/A	1	46	37	83	22.562194402694	18.8521479804418	3.71004642225222	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.443360929292152	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50962036	T/C	1	110	95	205	53.9530735716596	48.4041637335667	5.54890983809284	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.443253966748137	ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50962208	T/G	1	130	106	236	63.7627233119613	54.0088563764008	9.75386693556053	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.216239472351945	ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50962230	C/T	1	132	108	240	64.7436882859915	55.0278914023706	9.71579688362088	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.220188427987605	ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50962754	C/T	1	61	59	120	29.9194317079203	30.0615332661099	-0.142101558189559	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50962782	C/G	1	57	51	108	27.95750175986	25.9853931622306	1.9721085976294	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.772953895437062	ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50987843	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	22	50988193	A/G	1	12	3	15	5.88578984418104	1.52855253895474	4.35723730522631	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0356395914459271	ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	4358138	C/T	1	16	16	32	7.84771979224139	8.15228020775861	-0.304560415517216	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000170364:ENST00000358065:exon_4357896_4359251:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000413809:exon_4357896_4358949:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000425046:exon_4357896_4358949:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000307483:exon_4357896_4358948:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000425863:exon_4357896_4358949:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000358950:exon_4357896_4358220:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000406657:exon_4357896_4358948:SETMAR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	4829732	A/G	1	14	14	28	6.86675481821122	7.13324518178878	-0.266490363577564	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4829631_4829823:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4829631_4829823:ITPR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	4842231	C/T	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000467545:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000490572:exon_4842109_4842284:ITPR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	4856180	T/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	4856234	G/A	1	16	20	36	7.84771979224139	10.1903502596983	-2.34263046745687	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.506012988700997	ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4856107_4856246:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000472205:exon_4856107_4856246:ITPR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	5024771	T/C	1	109	94	203	53.4625910846445	47.8946462205818	5.56794486406267	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.440948637347443	ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	8590313	T/C	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8590254_8590549:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	9005078	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	9406836	T/C	1	14	25	39	6.86675481821122	12.7379378246228	-5.87118300641161	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0770214162246687	ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	9422210	T/C	1	19	4	23	9.31916725328665	2.03807005193965	7.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00270162241391416	ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	9425911	G/A	1	32	27	59	15.6954395844828	13.7569728505926	1.93846673389013	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.696468630772133	ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	9876919	G/A	1	85	85	170	41.6910113962824	43.3089886037176	-1.6179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.818364235324337	ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9876778_9877016:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	9877127	T/C	1	9	16	25	4.41434238313578	8.15228020775861	-3.73793782462282	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.162388493015305	ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	9974794	G/A	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000163702:ENST00000383812:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000466046:exon_9974637_9975277:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000295981:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000451231:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000483582:exon_9974504_9975314:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000494365:exon_9974637_9975300:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000498214:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000403601:exon_9974637_9975305:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000416074:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000451271:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000455057:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000413608:exon_9974637_9975300:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000461995:exon_9974637_9974832:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000497387:exon_9974637_9975304:IL17RC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	9991101	C/G	1	23	22	45	11.281097201347	11.2093852856681	0.0717119156789163	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	10142949	C/T	1	61	32	93	29.9194317079203	16.3045604155172	13.6148712924031	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00496212867909137	ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	10183685	G/A	1	25	29	54	12.2620621753772	14.7760078765625	-2.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500139310571228	ENSG00000134086:ENST00000256474:exon_10182692_10183871:VHL;ENSG00000134086:ENST00000442695:exon_10183319_10183871:VHL;ENSG00000134086:ENST00000345392:exon_10183472_10183871:VHL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	10291140	C/T	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10290879_10291298:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10290879_10291298:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10291056_10291298:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10291056_10291298:TATDN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	10311939	C/T	1	13	4	17	6.37627233119613	2.03807005193965	4.33820227925648	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0497263576814836	ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	10312543	G/A	1	8	19	27	3.9238598961207	9.68083274671335	-5.75697285059265	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0330840074379835	ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	11606490	G/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000451674:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424529:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11606240_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11606322_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11606326_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11606366_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11606389_11606493:VGLL4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	11887991	C/G	1	23	18	41	11.281097201347	9.17131523372843	2.10978196761857	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.535763623400263	ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	12544779	G/A	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000154743:ENST00000446004:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000314571:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000454502:exon_12544761_12544968:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000402228:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000284995:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000473755:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000383797:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000444864:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000415684:exon_12544761_12545283:TSEN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	12545091	T/C	1	11	6	17	5.39530735716596	3.05710507790948	2.33820227925648	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.333809869270413	ENSG00000154743:ENST00000446004:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000314571:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000402228:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000284995:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000473755:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000383797:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000444864:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000415684:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000490981:exon_12544945_12545283:TSEN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	12877704	G/A	1	1071	5905	6976	525.306743593158	3008.70091417591	-2483.39417058275	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0	ENSG00000144713:ENST00000429711:exon_12875984_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12876445_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000273223:exon_12877546_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12877549_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12877559_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12877601_12877722:RPL32
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	12881757	C/T	1	53	33	86	25.9955718117996	16.8140779285021	9.18149388329748	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0521315547277587	ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	13364876	G/T	1	19	17	36	9.31916725328665	8.66179772074352	0.657369532543132	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.868798049474732	ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	13367406	C/T	1	21	15	36	10.3001322273168	7.64276269477369	2.65736953254313	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.408107531503021	ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13367295_13367431:NUP210
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	14180706	C/T	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14180680_14180797:TMEM43
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	14193889	C/T	1	27	29	56	13.2430271494074	14.7760078765625	-1.53298072715513	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.691004220632705	ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14193835_14193916:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14193835_14193916:XPC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	14223074	C/T	1	176	159	335	86.3249177146553	81.0132845646012	5.31163315005415	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.584904218378895	ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14223060_14223170:LSM3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	14708976	A/C	1	56	31	87	27.4670192728449	15.7950429025323	11.6719763703126	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0134090353494821	ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14708931_14709025:C3orf19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	14711532	C/A	1	9	33	42	4.41434238313578	16.8140779285021	-12.3997355453663	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.000140877062505630	ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14711441_14711593:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14711441_14711593:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14711441_14711593:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14711441_14711593:C3orf19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	14712721	T/C	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	15301247	G/A	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.110011912016315	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	15686243	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000169814:ENST00000449107:exon_15685823_15687089:BTD;ENSG00000169814:ENST00000303498:exon_15685823_15687329:BTD;ENSG00000169814:ENST00000437172:exon_15685823_15687222:BTD;ENSG00000169814:ENST00000383778:exon_15685823_15687324:BTD
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	15737689	G/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	16364954	C/T	1	180	143	323	88.2868476627157	72.8610043568426	15.4258433058731	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0948677695642474	ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	17208267	T/C	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000131374:ENST00000450163:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000437885:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000253692:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000429383:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000414318:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000446818:exon_17208259_17208420:TBC1D5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	20215962	T/C	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	25656699	C/A	1	128	75	203	62.7817583379311	38.2138134738685	24.5679448640627	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.000561158236064217	ENSG00000077097:ENST00000413971:exon_25656696_25656779:TOP2B;ENSG00000077097:ENST00000435706:exon_25656696_25656779:TOP2B;ENSG00000077097:ENST00000264331:exon_25656696_25656779:TOP2B;ENSG00000077097:ENST00000475717:exon_25656696_25656779:TOP2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	25833228	T/C	1	14	19	33	6.86675481821122	9.68083274671335	-2.81407792850213	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.385252830298031	ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25832481_25833488:OXSM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	27424718	A/G	1	15	13	28	7.35723730522631	6.62372766880387	0.733509636422436	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.851310323683977	ENSG00000033867:ENST00000419036:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000295736:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000428386:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000425128:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000349751:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000435667:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000388777:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000454389:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000440156:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000457377:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000438530:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437179:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000446700:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000455077:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000445684:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000465487:exon_27424644_27424741:SLC4A7;ENSG00000033867:ENST00000437266:exon_27424644_27424741:SLC4A7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	28379503	T/G	1	15	17	32	7.35723730522631	8.66179772074352	-1.30456041551722	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.724820906305913	ENSG00000163512:ENST00000479665:exon_28379428_28379527:AZI2;ENSG00000163512:ENST00000295748:exon_28379428_28379527:AZI2;ENSG00000163512:ENST00000463512:exon_28379428_28379527:AZI2;ENSG00000163512:ENST00000334100:exon_28379428_28379527:AZI2;ENSG00000163512:ENST00000420543:exon_28379428_28379527:AZI2;ENSG00000163512:ENST00000457172:exon_28379428_28379527:AZI2;ENSG00000163512:ENST00000414162:exon_28379428_28379527:AZI2;ENSG00000163512:ENST00000462936:exon_28379428_28379527:AZI2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	32571147	G/A	1	48	64	112	23.5431593767242	32.6091208310344	-9.06596145431025	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0895410553528126	ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000432458:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000472985:exon_32571122_32571152:DYNC1LI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	33458266	T/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	33840298	G/A	1	14	6	20	6.86675481821122	3.05710507790948	3.80964974030174	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.116630612949195	ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33839557_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33839844_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000435909:exon_33840103_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000430877:exon_33840113_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000413073:exon_33840115_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000477798:exon_33840122_33840429:PDCD6IP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	33840330	C/T	1	14	13	27	6.86675481821122	6.62372766880387	0.243027149407349	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33839557_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33839844_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000435909:exon_33840103_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000430877:exon_33840113_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000413073:exon_33840115_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000477798:exon_33840122_33840429:PDCD6IP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	33887008	G/A	1	24	33	57	11.7715796883621	16.8140779285021	-5.04249824014004	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.187945322206216	ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33886911_33887080:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000462070:exon_33886911_33887080:PDCD6IP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	36872587	C/T	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000168016:ENST00000428977:exon_36872364_36875410:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000429976:exon_36872364_36875410:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000301807:exon_36872364_36875410:TRANK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	36873229	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000168016:ENST00000428977:exon_36872364_36875410:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000429976:exon_36872364_36875410:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000301807:exon_36872364_36875410:TRANK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	37396643	C/G	1	24	29	53	11.7715796883621	14.7760078765625	-3.00442818820039	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.414186298545304	ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37396592_37396678:GOLGA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	38043904	T/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000484717:exon_38043193_38043971:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000412008:exon_38043887_38044036:VILL;ENSG00000136059:ENST00000463080:exon_38043887_38044066:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38042398_38045890:VILL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	38565704	C/T	1	26	14	40	12.7525446623923	7.13324518178878	5.61929948060348	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0828780684568382	ENSG00000157036:ENST00000412107:exon_38565392_38565904:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000436414:exon_38565392_38566359:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000287675:exon_38565392_38567442:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000431472:exon_38565392_38565908:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000447573:exon_38565392_38566309:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000422077:exon_38565392_38566190:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000454803:exon_38565392_38565894:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000438992:exon_38565392_38566059:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000457367:exon_38565392_38566612:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000483749:exon_38565392_38565737:EXOG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	39139657	C/T	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	39139755	C/T	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	39180099	T/C	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	39184510	C/A	1	29	27	56	14.2239921234375	13.7569728505926	0.467019272844873	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	39184959	C/T	1	17	16	33	8.33820227925648	8.15228020775861	0.18592207149787	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	40498845	C/T	1	30	23	53	14.7144746104526	11.718902798653	2.99557181179961	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.492508314983154	ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	41266971	C/G	1	46	48	94	22.562194402694	24.4568406232758	-1.89464622058182	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.757192044392421	ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41266825_41267063:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41266825_41267063:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41266825_41267063:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41266825_41267063:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41266825_41267063:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41266825_41267063:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41266825_41267063:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000488914:exon_41266825_41267047:CTNNB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	42235345	G/A	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42235316_42235390:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42235316_42235390:TRAK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	42242539	G/A	1	16	6	22	7.84771979224139	3.05710507790948	4.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0534075122332023	ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42242310_42242546:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42242310_42242546:TRAK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	42251263	C/T	1	12	14	26	5.88578984418104	7.13324518178878	-1.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.69695410034444	ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	42610374	A/G	1	17	24	41	8.33820227925648	12.2284203116379	-3.89021803238143	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.274300665161299	ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	43389239	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000163788:ENST00000454177:exon_43388831_43390330:SNRK;ENSG00000163788:ENST00000429705:exon_43388831_43392635:SNRK;ENSG00000163788:ENST00000296088:exon_43388831_43392630:SNRK;ENSG00000163788:ENST00000437827:exon_43388831_43390245:SNRK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	43602803	C/T	1	7	17	24	3.43337740910561	8.66179772074352	-5.22842031163791	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0402116433714956	ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43602712_43602894:ANO10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	43618280	T/C	1	14	11	25	6.86675481821122	5.60469264283404	1.26206217537718	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.691382994021232	ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43618184_43618753:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43618184_43618753:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43618184_43618753:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43618184_43618753:ANO10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	44449163	G/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000179152:ENST00000417237:exon_44448934_44449282:C3orf23;ENSG00000179152:ENST00000342649:exon_44448934_44450943:C3orf23;ENSG00000179152:ENST00000446666:exon_44448934_44450943:C3orf23;ENSG00000179152:ENST00000519084:exon_44448934_44450943:C3orf23;ENSG00000179152:ENST00000532426:exon_44448934_44450943:C3orf23;ENSG00000179152:ENST00000481443:exon_44448934_44449243:C3orf23;ENSG00000179152:ENST00000412611:exon_44448934_44450943:C3orf23;ENSG00000179152:ENST00000431657:exon_44448934_44450366:C3orf23;ENSG00000179152:ENST00000469246:exon_44448934_44449232:C3orf23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	45052775	G/C	1	169	114	283	82.8915403055497	58.0849964802801	24.8065438252696	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00351016515446441	ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	45779136	A/T	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	47539959	G/A	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.227496299270201	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	47676777	C/T	1	40	38	78	19.6192994806035	19.3616654934267	0.257633987176789	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47676680_47676834:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47676680_47676834:SMARCC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	47956424	C/T	1	50	80	130	24.5241243507543	40.761401038793	-16.2372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00485786442584334	ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	47969734	G/A	1	17	21	38	8.33820227925648	10.6998677726832	-2.3616654934267	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517270941700297	ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000395730:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000482752:exon_47969718_47969792:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000423088:exon_47969718_47969840:MAP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	48310174	G/A	1	41	24	65	20.1097819676186	12.2284203116379	7.88136165598065	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0620393609124564	ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	48473953	C/G	1	44	25	69	21.5812294286638	12.7379378246228	8.843291604041	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0400198168953667	ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	48491568	A/C	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000164053:ENST00000421175:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000454733:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48491443_48491576:ATRIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	48501819	G/A	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	48501920	C/T	1	4	12	16	1.96192994806035	6.11421015581896	-4.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0454122101177686	ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	48677114	C/G	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000008300:ENST00000164024:exon_48677107_48677992:CELSR3;ENSG00000008300:ENST00000461362:exon_48677107_48677992:CELSR3;ENSG00000008300:ENST00000498057:exon_48677107_48678957:CELSR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49052453	G/A	1	100	99	199	49.0482487015087	50.4422337855064	-1.39398508399769	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.887293141618914	ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49052258_49052791:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49052258_49052858:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49052258_49053022:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49052258_49052798:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49052258_49052780:WDR6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49135932	G/C	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000172053:ENST00000497635:exon_49135786_49135957:QARS;ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135786_49136125:QARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49151494	A/G	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.848425091361672	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49151425_49151526:USP19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49153490	C/T	1	11	19	30	5.39530735716596	9.68083274671335	-4.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.144013561824245	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49153480_49153502:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000306026:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000464931:exon_49153481_49153595:USP19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49154326	G/A	1	10	7	17	4.90482487015087	3.56662259089439	1.33820227925648	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.630132706769099	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000306026:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000464931:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000479073:exon_49154167_49154376:USP19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49714225	T/C	1	74	52	126	36.2957040391164	26.4949106752155	9.80079336390096	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0902686665686875	ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49721532	G/A	1	20	40	60	9.80964974030174	20.3807005193965	-10.5710507790948	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00656604799211562	ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721380_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721381_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721409_49721622:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721482_49721622:MST1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49721798	C/A	1	26	37	63	12.7525446623923	18.8521479804418	-6.09960331804952	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.131791305738593	ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49740104	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49740066_49740186:RNF123
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49751585	C/T	1	15	7	22	7.35723730522631	3.56662259089439	3.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.135346882910936	ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49845292	C/T	1	68	54	122	33.3528091170259	27.5139457011853	5.83886341584061	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.319442396379998	ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49845169_49845360:UBA7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49848072	T/G	1	41	44	85	20.1097819676186	22.4187705713362	-2.30898860371761	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.664831784387041	ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49847950_49848105:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000460516:exon_49847893_49848105:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000460703:exon_49847959_49848105:UBA7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49866539	C/T	1	18	10	28	8.82868476627157	5.09517512984913	3.73350963642244	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.187163218330294	ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	49866584	T/G	1	16	14	30	7.84771979224139	7.13324518178878	0.71447461045261	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.856318725452094	ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	50334802	C/A	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000450489:exon_50334636_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000442620:exon_50334724_50335514:NAT6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	50374568	T/C	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000068028:ENST00000478619:exon_50373808_50375442:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000488024:exon_50374001_50375003:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000494145:exon_50374231_50375442:RASSF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	50614965	G/A	1	4	11	15	1.96192994806035	5.60469264283404	-3.64276269477369	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0719999094721795	ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000482974:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000443894:exon_50614940_50615004:HEMK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	50684566	G/A	1	13	11	24	6.37627233119613	5.60469264283404	0.771579688362088	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.83951915689104	ENSG00000114738:ENST00000446044:exon_50684554_50684634:MAPKAPK3;ENSG00000114738:ENST00000430409:exon_50684554_50684635:MAPKAPK3;ENSG00000114738:ENST00000357955:exon_50684554_50684634:MAPKAPK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	51430207	G/A	1	25	20	45	12.2620621753772	10.1903502596983	2.07171191567891	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.554737482560303	ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	51430657	A/C	1	78	50	128	38.2576339871768	25.4758756492457	12.7817583379311	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0268156111925729	ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	51696509	C/T	1	10	3	13	4.90482487015087	1.52855253895474	3.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0930441887974304	ENSG00000164080:ENST00000487093:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000409535:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000296477:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000432863:exon_51696442_51697473:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000461680:exon_51696442_51697610:RAD54L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	51737852	C/T	1	53	60	113	25.9955718117996	30.5710507790948	-4.57547896729517	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.398656895053833	ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	51737965	G/A	1	40	45	85	19.6192994806035	22.9282880843211	-3.30898860371761	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.515677291623892	ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	51737995	T/C	1	63	38	101	30.9003966819505	19.3616654934267	11.5387311885238	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0221568721573491	ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	51977512	C/T	1	16	21	37	7.84771979224139	10.6998677726832	-2.85214798044178	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.411868674227362	ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51977373_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51977370_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51977370_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470601:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470749:exon_51977315_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51977327_51977554:PARP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	52237970	C/T	1	64	97	161	31.3908791689656	49.4231987595366	-18.032319590571	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0045131136908163	ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	52437206	G/A	1	41	40	81	20.1097819676186	20.3807005193965	-0.270918551777953	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000478368:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000466093:exon_52436795_52437314:BAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	52440269	C/T	1	32	21	53	15.6954395844828	10.6998677726832	4.99557181179961	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.215915875661112	ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52440269_52440392:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52440269_52440338:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000471532:exon_52440269_52440923:BAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	52563199	A/T	1	40	39	79	19.6192994806035	19.8711830064116	-0.251883525808125	A:T	A	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000489316:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000471522:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000487779:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000490681:exon_52563166_52563350:NT5DC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	52643307	A/G	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	52720080	A/C	1	34	38	72	16.676404558513	19.3616654934267	-2.68526093491374	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.556946702827113	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	52727257	G/A	1	188	203	391	92.2107075588364	103.432055135937	-11.221347577101	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.265957041464578	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	52727736	A/G	1	385	352	737	188.835757500809	179.350164570689	9.48559293011914	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.5072564425596	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727648_52727795:GNL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53259850	C/T	1	499	534	1033	244.750761020528	272.082351933944	-27.3315909134151	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0928419777253672	ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53264485	A/G	1	289	290	579	141.74943874736	147.760078765625	-6.01064001826461	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.618243145079249	ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53267155	G/A	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53266776_53267290:TKT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53267281	G/A	1	167	189	356	81.9105753315195	96.2988099541486	-14.388234622629	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.137653850034526	ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53267172_53267290:TKT;ENSG00000163931:ENST00000494523:exon_53267172_53269035:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53266776_53267290:TKT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53269046	T/C	1	194	170	364	95.1536024809269	86.6179772074352	8.53562527349168	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.373425852469134	ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53269163	G/A	1	110	84	194	53.9530735716596	42.7994710907327	11.1536024809269	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.114374105278189	ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53326669	T/C	1	1	9	10	0.490482487015087	4.58565761686422	-4.09517512984913	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0103558957396217	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53883722	C/G	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53899276	C/T	1	90	40	130	44.1434238313578	20.3807005193965	23.7627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	3.11529918611272e-05	ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53905308	T/C	1	70	36	106	34.3337740910561	18.3426304674569	15.9911436235992	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00183187771697545	ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53906513	G/A	1	18	27	45	8.82868476627157	13.7569728505926	-4.92828808432108	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.179089779093011	ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53906411_53906551:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53906411_53906551:ACTR8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53920922	T/G	1	188	170	358	92.2107075588364	86.6179772074352	5.59273035140116	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.561359718857763	ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53920878_53920961:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53920878_53920961:RP11-884K10.5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	53925849	C/T	1	87	54	141	42.6719763703126	27.5139457011853	15.1580306691273	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0113709398998778	ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	56597954	C/T	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000439445:exon_56597934_56598167:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000460838:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000459746:exon_56597680_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000472582:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422788:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000469966:exon_56597712_56598184:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000473322:exon_56597544_56598153:CCDC66
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	56658871	T/C	1	23	29	52	11.281097201347	14.7760078765625	-3.49491067521548	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.336249710848700	ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	56763328	T/C	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	56763525	A/G	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	56763619	A/G	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	56766435	C/G	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56765621_56766452:ARHGEF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	57232504	T/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000163666:ENST00000495160:exon_57232419_57232520:HESX1;ENSG00000163666:ENST00000295934:exon_57232419_57232520:HESX1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	57898928	C/T	1	17	8	25	8.33820227925648	4.0761401038793	4.26206217537717	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.109340228515106	ENSG00000163681:ENST00000295951:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000295952:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416870:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000428312:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000449503:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416658:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000442599:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000417128:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000438794:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000495364:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000494088:exon_57898885_57899002:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000476471:exon_57898885_57899002:SLMAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	58178390	G/A	1	55	107	162	26.9765367858298	54.5183738893857	-27.5418371035559	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1.85118601779944e-05	ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58177984_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58178354_58179166:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58178354_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000450710:exon_58178354_58179166:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58178355_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000477209:exon_58178355_58178530:DNASE1L3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	58302710	G/A	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000163684:ENST00000475412:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000445193:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000474660:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000477305:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000295959:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000466547:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000481972:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000461393:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000476007:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000463550:exon_58302642_58302720:RPP14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	58382846	C/T	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383715:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000484288:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58382766_58382927:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58382766_58382927:PXK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	58410554	C/T	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.239422942006238	ENSG00000168297:ENST00000356151:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000468776:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000302779:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000383716:exon_58410479_58410878:PXK;ENSG00000168297:ENST00000463280:exon_58410479_58411748:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479241:exon_58410479_58411746:PXK;ENSG00000168297:ENST00000477308:exon_58410479_58410785:PXK;ENSG00000168297:ENST00000479134:exon_58410479_58411601:PXK;ENSG00000168297:ENST00000493474:exon_58410479_58410902:PXK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	58416535	C/T	1	52	54	106	25.5050893247845	27.5139457011853	-2.00885637640078	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.699028712647994	ENSG00000168291:ENST00000302746:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000383714:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000469364:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000479945:exon_58416384_58417520:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000474765:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000461692:exon_58416384_58416669:PDHB;ENSG00000168291:ENST00000480626:exon_58416384_58416669:PDHB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	63982082	G/A	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	64008036	T/C	1	83	81	164	40.7100464222522	41.270918551778	-0.560872129525734	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.937918377987303	ENSG00000163636:ENST00000295901:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000476464:exon_64007994_64009113:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000492933:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000394431:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000482510:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000475036:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000497323:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000478185:exon_64007994_64008199:PSMD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	66420969	C/T	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66420953_66421008:SLC25A26
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	66433676	A/G	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66433406_66433825:LRIG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	81698119	C/T	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	81720076	G/A	1	31	19	50	15.2049570974677	9.68083274671335	5.52412435075435	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.122254746081498	ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000477426:exon_81719989_81720133:GBE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	97686389	C/G	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97686006_97686476:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97686006_97686476:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97686006_97686476:MINA;ENSG00000170854:ENST00000514314:exon_97686006_97686467:MINA;ENSG00000170854:ENST00000330299:exon_97686006_97686476:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506099:exon_97686101_97686476:MINA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	98304467	T/C	1	16	24	40	7.84771979224139	12.2284203116379	-4.38070051939652	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.205573186077484	ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	98307696	T/G	1	12	24	36	5.88578984418104	12.2284203116379	-6.34263046745687	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0442484271514157	ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	100084432	G/A	1	52	46	98	25.5050893247845	23.437805597306	2.06728372747853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.687502757441925	ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	101044786	A/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000138468:ENST00000394095:exon_101043049_101044924:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394094:exon_101043117_101044924:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000314261:exon_101043117_101044924:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394091:exon_101043117_101044924:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000358203:exon_101043117_101044924:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000394085:exon_101044384_101044924:SENP7;ENSG00000138468:ENST00000348610:exon_101044711_101044924:SENP7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	101283792	C/G	1	27	54	81	13.2430271494074	27.5139457011853	-14.2709185517779	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.00171497177016672	ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	108279609	A/C	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108279582_108279688:KIAA1524
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	112080398	A/C	1	27	16	43	13.2430271494074	8.15228020775861	5.09074694164874	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.129236673408955	ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112080390_112081659:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112080390_112080979:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112080390_112080979:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112080390_112081631:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112080390_112081656:CD200
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	112256630	A/G	1	64	63	127	31.3908791689656	32.0996033180495	-0.708724149083949	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.929413221238832	ENSG00000144848:ENST00000283290:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000402314:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000495756:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000467275:exon_112256378_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000496423:exon_112256582_112256737:ATG3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	112299732	A/G	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000138459:ENST00000492406:exon_112299393_112300173:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000460713:exon_112299393_112300173:SLC35A5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	112729544	T/C	1	26	24	50	12.7525446623923	12.2284203116379	0.52412435075435	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.888737440394932	ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112729490_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000464816:exon_112729351_112729551:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000496206:exon_112729505_112729551:C3orf17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	112738404	G/A	1	15	12	27	7.35723730522631	6.11421015581896	1.24302714940735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.702512858193323	ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112738389_112738686:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112738389_112738580:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112738389_112738555:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112738389_112738553:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112738389_112738501:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112738389_112738505:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112738389_112738511:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112738389_112738708:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112738389_112738511:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112738389_112738517:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112738389_112738513:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112738389_112738518:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000496206:exon_112738389_112738491:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000460410:exon_112738389_112738679:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000494164:exon_112738389_112738698:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000491121:exon_112738389_112738568:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000494575:exon_112738389_112738518:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000494891:exon_112738389_112738450:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000470663:exon_112738389_112738528:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000496340:exon_112738389_112738518:C3orf17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	113164193	A/T	1	12	14	26	5.88578984418104	7.13324518178878	-1.24745533760774	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.69695410034444	ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113161565_113164207:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000467618:exon_113164101_113164207:SPICE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119121090	C/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119120669_119121244:ARHGAP31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119121132	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119120669_119121244:ARHGAP31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119128397	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119128343_119128623:ARHGAP31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119128398	G/A	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119128343_119128623:ARHGAP31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119135154	C/G	1	26	29	55	12.7525446623923	14.7760078765625	-2.02346321417022	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.592907286061167	ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119219573	A/G	1	38	21	59	18.6383345065733	10.6998677726832	7.93846673389013	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0498950700876959	ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000469324:exon_119219221_119219707:C3orf1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119222456	G/C	1	28	28	56	13.7335096364224	14.2664903635776	-0.532980727155127	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.894610793773664	ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119236179	G/A	1	61	36	97	29.9194317079203	18.3426304674569	11.5768012404634	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0194714395148359	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119242443	C/T	1	12	62	74	5.88578984418104	31.5900858050646	-25.7042959608836	T:C	C	T	10	0.509517512984913	6.63679720789152e-10	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119305379	T/A	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:T	T	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119316828	G/T	1	29	70	99	14.2239921234375	35.6662259089439	-21.4422337855064	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1.82794963702625e-05	ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119316689_119316833:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119316722_119316833:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119316732_119316833:PLA1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119327653	T/C	1	43	21	64	21.0907469416487	10.6998677726832	10.3908791689656	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0118237296069127	ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119331874	C/T	1	30	14	44	14.7144746104526	7.13324518178878	7.58122942866383	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0236974315442460	ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	119331892	C/G	1	32	18	50	15.6954395844828	9.17131523372843	6.52412435075435	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0673273051300069	ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121151812	G/C	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121151765_121151883:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121151765_121151880:POLQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121154974	T/C	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121186422	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121186366_121186487:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121186366_121186487:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000474243:exon_121186366_121186487:POLQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121353254	T/C	1	329	290	619	161.368738227964	147.760078765625	13.6086594623389	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.277969804634332	ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121377156	G/A	1	228	146	374	111.83000703944	74.3895568957973	37.4404501436425	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000123565846106917	ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000487290:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000481314:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000497391:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000488033:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000468693:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000491824:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000479994:exon_121376829_121377194:HCLS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121383297	G/A	1	142	126	268	69.6485131561424	64.199206636099	5.44930652004332	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.541317270238467	ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121409895	T/C	1	37	26	63	18.1478520195582	13.2474553376077	4.90039668195048	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.256750299001745	ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121409517_121411428:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121409517_121411428:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121409517_121411428:GOLGB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121414061	C/T	1	34	30	64	16.676404558513	15.2855253895474	1.39087916896557	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.802877590251029	ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121417641	C/T	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000426235:exon_121415847_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000489400:exon_121415874_121417776:GOLGB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121491408	T/C	1	57	57	114	27.95750175986	29.04249824014	-1.08499648028008	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.851910844120984	ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121491404_121491560:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121491404_121491560:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121491404_121491560:IQCB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121500699	C/T	1	60	47	107	29.4289492209052	23.9473231102909	5.48162611061431	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.333622397280391	ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121659860	C/T	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000163406:ENST00000489711:exon_121659678_121662949:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000295605:exon_121659678_121660099:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000436799:exon_121659678_121660457:SLC15A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121712051	A/C	1	8	13	21	3.9238598961207	6.62372766880387	-2.69986777268317	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.278819956820526	ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	121712434	A/G	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000145103:ENST00000273691:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000344209:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000393631:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000462014:exon_121711997_121712817:ILDR1;ENSG00000145103:ENST00000460554:exon_121711996_121712798:ILDR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	122290579	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122290525_122294050:DTX3L;ENSG00000163840:ENST00000383661:exon_122290525_122290594:DTX3L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	122354037	A/G	1	49	76	125	24.0336418637393	38.7233309868534	-14.6896891231141	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00932219188426375	ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	122354716	C/T	1	51	81	132	25.0146068377694	41.270918551778	-16.2563117140085	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00519019761830101	ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	122354895	T/C	1	33	46	79	16.1859220714979	23.437805597306	-7.25188352580813	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.115155054509597	ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	122437578	G/A	1	76	51	127	37.2766690131466	25.9853931622306	11.2912758509161	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0506004274977104	ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000474669:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398157:exon_122437206_122437805:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000475640:exon_122437231_122437805:PARP14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	122811250	C/T	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000484644:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000393573:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000495004:exon_122811202_122811289:PDIA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	122864436	G/A	1	31	18	49	15.2049570974677	9.17131523372843	6.03364186373926	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0881997326915735	ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	124731485	C/G	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	124731626	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	124746049	A/G	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	125648343	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	126157242	A/T	1	4	11	15	1.96192994806035	5.60469264283404	-3.64276269477369	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.0719999094721795	ENSG00000070476:ENST00000514463:exon_126156444_126157304:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000389709:exon_126156444_126157304:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000515545:exon_126156462_126157304:ZXDC;ENSG00000070476:ENST00000435595:exon_126156467_126157304:ZXDC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	126676271	G/A	1	11	40	51	5.39530735716596	20.3807005193965	-14.9853931622306	A:G	G	A	10	0.509517512984913	2.93896474843397e-05	ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126676259_126676676:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126676259_126676776:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126676268_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504084:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504973:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000510044:exon_126676259_126676394:CHCHD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	127394820	C/T	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000114626:ENST00000483857:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127394813_127394903:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475265:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000493365:exon_127394813_127395278:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000479280:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000467179:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127394813_127394957:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127394329_127395274:ABTB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	127872506	C/T	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127872046_127872757:RUVBL1;ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127872297_127872666:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127872344_127872666:EEFSEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	127981037	A/G	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127980971_127981067:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127980971_127981067:EEFSEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	127983495	T/C	1	2	14	16	0.980964974030174	7.13324518178878	-6.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00198899022078186	ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127983460_127983624:EEFSEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	128344378	T/C	1	218	147	365	106.925182169289	74.8990744087822	32.0261077605068	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.000794476864080525	ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344377_128344496:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344377_128344496:RPN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	128356699	C/T	1	102	85	187	50.0292136755389	43.3089886037176	6.72022507182128	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.342137530301504	ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	128971761	T/A	1	56	28	84	27.4670192728449	14.2664903635776	13.2005289092673	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.00434102865788389	ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128971719_128971798:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513965:exon_128971466_128971941:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128971466_128971798:COPG;ENSG00000181789:ENST00000504350:exon_128971719_128971798:COPG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	128984583	C/T	1	75	101	176	36.7861865261315	51.4612688114762	-14.6750822853447	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0287015332189204	ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	129155451	C/T	1	56	59	115	27.4670192728449	30.0615332661099	-2.59451399326499	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.642073709094444	ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	130732991	G/T	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000034533:ENST00000514044:exon_130732719_130733231:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000264992:exon_130732719_130733231:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000507978:exon_130732826_130733231:ASTE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	130743812	G/A	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000034533:ENST00000514044:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000264992:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000507978:exon_130742849_130744175:ASTE1;ENSG00000034533:ENST00000446270:exon_130743068_130744175:ASTE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	132242032	G/A	1	16	16	32	7.84771979224139	8.15228020775861	-0.304560415517216	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000138246:ENST00000260818:exon_132242001_132242043:DNAJC13;ENSG00000138246:ENST00000463038:exon_132242001_132242043:DNAJC13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	132337505	G/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000510100:exon_132337478_132337565:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000507705:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000487024:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000481970:exon_132337094_132337616:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132337478_132337616:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132337478_132337616:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132337478_132337616:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132337478_132337616:NPHP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	133191385	C/A	1	62	26	88	30.4099141949354	13.2474553376077	17.1624588573277	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.000251234256150445	ENSG00000170819:ENST00000302334:exon_133191189_133191409:BFSP2;ENSG00000170819:ENST00000510039:exon_133191189_133191409:BFSP2;ENSG00000170819:ENST00000503047:exon_133191186_133191409:BFSP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	133327457	T/C	1	28	37	65	13.7335096364224	18.8521479804418	-5.11863834401935	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.216456894689530	ENSG00000163781:ENST00000503338:exon_133327379_133327540:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000503464:exon_133327379_133327540:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133327379_133327540:TOPBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	134277148	A/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134276984_134277189:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134276984_134277189:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134276984_134277189:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504929:exon_134276984_134277185:CEP63
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	136019925	C/G	1	34	16	50	16.676404558513	8.15228020775861	8.52412435075435	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0162665064906351	ENSG00000114054:ENST00000251654:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000490504:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000483687:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000468777:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000462637:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000466072:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000484181:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000482086:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000471595:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000469217:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000474833:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000475214:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000473073:exon_136019872_136019953:PCCB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	137880743	G/A	1	15	5	20	7.35723730522631	2.54758756492456	4.80964974030174	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0421132759377614	ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	137880767	G/A	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	137880872	C/T	1	13	29	42	6.37627233119613	14.7760078765625	-8.39973554536635	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0126291597666339	ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	137988953	G/A	1	7	15	22	3.43337740910561	7.64276269477369	-4.20938528566809	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0881853706966197	ENSG00000114098:ENST00000481646:exon_137988882_137988974:ARMC8;ENSG00000114098:ENST00000469044:exon_137988882_137988974:ARMC8;ENSG00000114098:ENST00000491704:exon_137988882_137988974:ARMC8;ENSG00000114098:ENST00000461822:exon_137988882_137988974:ARMC8;ENSG00000114098:ENST00000485396:exon_137988882_137988974:ARMC8;ENSG00000114098:ENST00000393058:exon_137988882_137988974:ARMC8;ENSG00000114098:ENST00000460495:exon_137988882_137988974:ARMC8;ENSG00000114098:ENST00000466762:exon_137988882_137988974:ARMC8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	138347957	G/A	1	28	24	52	13.7335096364224	12.2284203116379	1.50508932478452	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.781796812318336	ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	138347988	T/C	1	34	27	61	16.676404558513	13.7569728505926	2.91943170792031	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.522432544371911	ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	139065874	A/G	1	51	29	80	25.0146068377694	14.7760078765625	10.238598961207	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0249440236604672	ENSG00000175110:ENST00000495075:exon_139065720_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000310776:exon_139065720_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000498505:exon_139065723_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000480938:exon_139065720_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000465056:exon_139065723_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000465373:exon_139065693_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000466690:exon_139065720_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000486705:exon_139065720_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000478464:exon_139065720_139065886:MRPS22;ENSG00000175110:ENST00000483545:exon_139065808_139065886:MRPS22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	142840078	G/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000175040:ENST00000309575:exon_142839486_142841800:CHST2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	142840787	G/A	1	20	14	34	9.80964974030174	7.13324518178878	2.67640455851296	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.394457678652606	ENSG00000175040:ENST00000309575:exon_142839486_142841800:CHST2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	148703992	G/A	0	12	0	12	5.88578984418104	0	5.88578984418104	G	G		10	0.509517512984913	0.000499989724588711	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	148704081	G/A	0	20	0	20	9.80964974030174	0	9.80964974030174	G	G		10	0.509517512984913	2.03987320056560e-06	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	148781294	C/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148781218_148781311:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148781218_148781311:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148781218_148781311:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148781218_148781311:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148781218_148781311:HLTF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	149589942	G/A	0	0	12	12	0	6.11421015581896	-6.11421015581896	A	G	A	10	0.509517512984913	0.000193857256764689	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	149678534	C/T	1	5	11	16	2.45241243507544	5.60469264283404	-3.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.136942032485751	ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	154002684	A/G	1	19	6	25	9.31916725328665	3.05710507790948	6.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0150702956802832	ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154002603_154002776:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154002603_154002776:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154002603_154002776:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000479934:exon_154002603_154002776:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154002603_154002776:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000469977:exon_154002603_154002776:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481332:exon_154002570_154002776:DHX36
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	156432530	C/G	0	23	0	23	11.281097201347	0	11.281097201347	C	C		10	0.509517512984913	2.60552736724736e-07	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	156877707	A/T	1	9	2	11	4.41434238313578	1.01903502596983	3.39530735716596	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.065955266796108	ENSG00000163660:ENST00000461804:exon_156877581_156878549:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000295926:exon_156877581_156878002:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000475298:exon_156877581_156877944:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000470121:exon_156877581_156877883:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000476367:exon_156877581_156877899:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000477127:exon_156877581_156877967:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000417607:exon_156877581_156878482:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000479596:exon_156877581_156877924:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000465947:exon_156877581_156877925:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000295925:exon_156877581_156878482:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000471044:exon_156877581_156877947:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000466101:exon_156877581_156877926:CCNL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	158320703	C/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	158322934	T/A	1	22	12	34	10.7906147143319	6.11421015581896	4.67640455851296	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.123738258699209	ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158322886_158324249:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158322886_158322981:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158322886_158324252:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158322886_158323186:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158322886_158324245:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158322886_158323181:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158322886_158325041:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158322886_158323181:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158322886_158323181:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158322886_158323188:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158322886_158323007:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158322886_158323190:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158322886_158323181:MLF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	158386891	G/A	1	15	12	27	7.35723730522631	6.11421015581896	1.24302714940735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.702512858193323	ENSG00000079257:ENST00000482640:exon_158386785_158386921:LXN;ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158386785_158386921:LXN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	158408936	A/G	1	44	44	88	21.5812294286638	22.4187705713362	-0.837541142672343	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.915215651187917	ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158408928_158408981:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158408928_158408981:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158408928_158408981:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158408928_158408981:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158408928_158408981:GFM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	169700525	C/G	1	189	246	435	92.7011900458514	125.341308194289	-32.6401181484372	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0018071478615289	ENSG00000008952:ENST00000337002:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000460513:exon_169700425_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000480708:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000487736:exon_169700495_169700645:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000469515:exon_169700448_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000481435:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000497277:exon_169700495_169700647:SEC62
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	170805245	A/T	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170805131_170805295:TNIK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	170811667	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170811628_170811757:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170811628_170811757:TNIK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	170893070	G/A	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170893041_170893119:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000468757:exon_170893041_170893119:TNIK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	174951756	T/C	1	4	39	43	1.96192994806035	19.8711830064116	-17.9092530583513	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1.09295549857910e-08	ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	178785549	G/A	1	20	21	41	9.80964974030174	10.6998677726832	-0.890218032381433	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.876185377477144	ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178785271_178785598:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178785271_178785597:ZMAT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	179066687	G/A	1	18	18	36	8.82868476627157	9.17131523372843	-0.342630467456868	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000171109:ENST00000471841:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000280653:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000357390:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000467174:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000263969:exon_179066549_179066751:MFN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	179298999	C/T	1	44	43	87	21.5812294286638	21.9092530583513	-0.328023629687429	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	180334778	A/G	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344641246232424	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	180630500	C/T	1	51	62	113	25.0146068377694	31.5900858050646	-6.57547896729517	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.222543283977525	ENSG00000114416:ENST00000357559:exon_180630090_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392639:exon_180630090_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000305586:exon_180630270_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000475315:exon_180630279_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000491674:exon_180630326_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392637:exon_180630452_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445400:exon_180630452_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000491062:exon_180630459_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000468861:exon_180630459_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000479176:exon_180630459_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445140:exon_180630460_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000472339:exon_180630466_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000484958:exon_180630473_180630524:FXR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	180693935	G/T	1	239	208	447	117.225314396606	105.979642700862	11.2456716957439	A:T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.298129479496017	ENSG00000114416:ENST00000357559:exon_180693910_180694950:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392639:exon_180693910_180694950:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000305586:exon_180693910_180694943:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000475315:exon_180693910_180694367:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392637:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445400:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000491062:exon_180693910_180694206:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000468861:exon_180693910_180694333:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445140:exon_180693910_180694943:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000472339:exon_180693910_180694341:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000480918:exon_180693910_180694166:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000454764:exon_180693910_180694948:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000482125:exon_180693910_180694070:FXR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	182871962	C/T	1	59	49	108	28.9384667338901	24.9663581362607	3.9721085976294	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500698479657131	ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	183904031	C/T	1	23	22	45	11.281097201347	11.2093852856681	0.0717119156789163	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	183976108	T/C	1	29	21	50	14.2239921234375	10.6998677726832	3.52412435075435	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.326621997934511	ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	184049766	C/T	1	194	175	369	95.1536024809269	89.1655647723598	5.98803770856711	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.566880093799781	ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000478291:exon_184049516_184049893:EIF4G1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	184429411	A/C	1	15	4	19	7.35723730522631	2.03807005193965	5.31916725328665	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0196131994431373	ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	184700356	A/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184700354_184700435:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000488255:exon_184700206_184700435:VPS8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	186274445	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186274198_186274564:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186274198_186274564:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000446782:exon_186274198_186274564:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000413695:exon_186274379_186274564:TBCCD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	186505516	G/A	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000156976:ENST00000396527:exon_186505284_186505559:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000485101:exon_186503953_186507683:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000468362:exon_186505284_186506157:EIF4A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	186509517	G/A	1	76	49	125	37.2766690131466	24.9663581362607	12.3103108768859	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0314717273254152	ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	186761055	G/A	1	38	13	51	18.6383345065733	6.62372766880387	12.0146068377694	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000691839157834737	ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186760804_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000464827:exon_186760896_186761098:ST6GAL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	193855827	T/C	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000114315:ENST00000232424:exon_193855472_193856521:HES1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	194387300	C/T	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	194408704	A/G	1	14	5	19	6.86675481821122	2.54758756492456	4.31916725328665	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0644684770411915	ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	195615376	A/G	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000438207:exon_195615297_195615455:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468819:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000447060:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000433111:exon_195615297_195615477:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000427576:exon_195615297_195615477:TNK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	195794993	A/G	1	13	18	31	6.37627233119613	9.17131523372843	-2.7950429025323	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.370586090979266	ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195794903_195795001:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195794903_195795001:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195794903_195795001:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000491658:exon_195794903_195795001:TFRC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196210808	T/C	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.139060646007699	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196281208	T/C	1	19	35	54	9.31916725328665	17.833112954472	-8.5139457011853	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0209709671060387	ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196281263	C/T	1	52	26	78	25.5050893247845	13.2474553376077	12.2576339871768	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00626902635735743	ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196544948	T/C	1	22	34	56	10.7906147143319	17.323595441487	-6.53298072715513	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0837792491957367	ENSG00000180370:ENST00000327134:exon_196544928_196545027:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000426668:exon_196544928_196545027:PAK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196613075	C/T	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196666104	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000114503:ENST00000463783:exon_196662278_196666303:NCBP2;ENSG00000114503:ENST00000482976:exon_196665774_196666303:NCBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196678838	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000119227:ENST00000412723:exon_196678692_196678902:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000443835:exon_196678692_196678902:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000238138:exon_196678409_196678902:PIGZ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196742290	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196742236_196742387:MFI2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196746629	T/C	1	20	8	28	9.80964974030174	4.0761401038793	5.73350963642244	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0366222720522495	ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	196754668	C/T	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196754627_196754781:MFI2;ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196754627_196754781:MFI2;ENSG00000163975:ENST00000439320:exon_196754627_196754781:MFI2;ENSG00000163975:ENST00000473501:exon_196754627_196756165:MFI2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	197427557	A/G	1	11	16	27	5.39530735716596	8.15228020775861	-2.75697285059265	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.337997616727118	ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	197427706	C/T	1	18	30	48	8.82868476627157	15.2855253895474	-6.45684062327582	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0821541540893155	ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	197495334	G/A	1	22	20	42	10.7906147143319	10.1903502596983	0.600264454633654	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.878542192032311	ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	3	197566214	C/T	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	86798	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	87300	A/T	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	155777	G/A	0	0	8	8	0	4.0761401038793	-4.0761401038793	A	G	A	10	0.509517512984913	0.00334956216154465	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	520853	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	663908	A/G	1	12	16	28	5.88578984418104	8.15228020775861	-2.26649036357756	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.451877020800592	ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	667117	T/C	1	1483	1447	2930	727.385528243374	737.271841289169	-9.88631304579508	A:T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.725541469790908	ENSG00000169020:ENST00000515202:exon_667092_667190:ATP5I;ENSG00000169020:ENST00000304312:exon_667092_667190:ATP5I;ENSG00000169020:ENST00000506525:exon_667092_667190:ATP5I;ENSG00000169020:ENST00000505852:exon_667092_667190:ATP5I;ENSG00000169020:ENST00000515116:exon_667092_667312:ATP5I
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	673807	G/A	1	33	23	56	16.1859220714979	11.718902798653	4.46701927284487	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.28490019657137	ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_673703_673807:MYL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	860192	A/G	1	28	27	55	13.7335096364224	13.7569728505926	-0.0234632141702136	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	876497	G/A	1	18	26	44	8.82868476627157	13.2474553376077	-4.41877057133617	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.227457157510854	ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_876485_876607:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_876485_876607:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_876485_876607:GAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	887691	G/A	1	20	16	36	9.80964974030174	8.15228020775861	1.65736953254313	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.620024668135095	ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_887662_887797:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_887662_887797:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_887662_887797:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504435:exon_887662_888615:GAK;ENSG00000178950:ENST00000505819:exon_887662_887797:GAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	944254	G/A	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000507319:exon_944212_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_944212_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504744:exon_944212_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513682:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504505:exon_944209_944279:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514546:exon_944209_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_944212_944306:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000502513:exon_944239_944306:TMEM175
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	946226	T/C	1	7	13	20	3.43337740910561	6.62372766880387	-3.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.182340866714798	ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1165748	T/C	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000159674:ENST00000290902:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000431380:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000503765:exon_1165640_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000504909:exon_1165640_1166086:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000512888:exon_1165314_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000512150:exon_1165542_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000515004:exon_1165667_1165862:SPON2;ENSG00000159674:ENST00000502483:exon_1165677_1165862:SPON2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1330759	T/C	1	20	15	35	9.80964974030174	7.64276269477369	2.16688704552805	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.502292925561721	ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1374695	C/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000511563:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000512728:exon_1374668_1374776:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000503548:exon_1374668_1374776:KIAA1530
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1377615	A/G	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000511563:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000512728:exon_1377554_1377728:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000503548:exon_1377554_1381837:KIAA1530
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1389557	G/A	1	18	8	26	8.82868476627157	4.0761401038793	4.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0768854939145154	ENSG00000179979:ENST00000324803:exon_1388152_1389776:CRIPAK;ENSG00000179979:ENST00000382944:exon_1388967_1389640:CRIPAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1389588	G/A	1	23	11	34	11.281097201347	5.60469264283404	5.67640455851296	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0591403634455354	ENSG00000179979:ENST00000324803:exon_1388152_1389776:CRIPAK;ENSG00000179979:ENST00000382944:exon_1388967_1389640:CRIPAK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1818594	C/T	1	50	57	107	24.5241243507543	29.04249824014	-4.51837388938569	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.386266756086145	ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1818454_1818641:LETM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1902597	C/G	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000508355:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000514045:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000515806:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382889:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000436793:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000420906:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000503128:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000509115:exon_1902346_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000398261:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000512700:exon_1902377_1902978:WHSC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1920270	A/G	1	25	19	44	12.2620621753772	9.68083274671335	2.58122942866383	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.454996754949152	ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000508355:exon_1919868_1920914:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000514045:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382889:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000420906:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000503128:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000398261:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000511904:exon_1920159_1920350:WHSC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	1976712	C/T	1	33	48	81	16.1859220714979	24.4568406232758	-8.27091855177795	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0751170551799313	ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000482415:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382888:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000350915:exon_1976590_1976731:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000515695:exon_1976514_1976731:WHSC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2010537	C/G	1	16	19	35	7.84771979224139	9.68083274671335	-1.83311295447195	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.613187650868945	ENSG00000185049:ENST00000382882:exon_2010477_2011837:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000333877:exon_2010477_2010910:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000411638:exon_2010477_2011837:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000431323:exon_2010477_2010724:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000421397:exon_2010477_2010575:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000411649:exon_2010477_2010562:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000443203:exon_2010477_2010699:WHSC2;ENSG00000185049:ENST00000458616:exon_2010477_2010669:WHSC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2242266	C/T	1	14	4	18	6.86675481821122	2.03807005193965	4.82868476627157	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0314172198636778	ENSG00000214367:ENST00000506763:exon_2241765_2242820:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2241765_2242820:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2241765_2242820:HAUS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2664957	G/C	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2664836_2665015:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2664836_2665015:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2664836_2665015:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2664836_2665015:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2664836_2665015:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2664836_2665015:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2664836_2665015:FAM193A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2744091	C/T	1	122	117	239	59.8388634158406	59.6135490192348	0.225314396605796	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2744289	C/G	1	17	17	34	8.33820227925648	8.66179772074352	-0.323595441487043	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2831383	T/G	1	30	28	58	14.7144746104526	14.2664903635776	0.447984246875047	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2934067	C/T	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.505009524526088	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2934308	G/A	1	12	5	17	5.88578984418104	2.54758756492456	3.33820227925648	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.144694391340598	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	2941393	G/A	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	3213832	G/A	1	10	18	28	4.90482487015087	9.17131523372843	-4.26649036357756	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.130521566482645	ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3213656_3213869:HTT;ENSG00000197386:ENST00000509751:exon_3213639_3213869:HTT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	3215835	T/C	1	32	18	50	15.6954395844828	9.17131523372843	6.52412435075435	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0673273051300069	ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	3227419	A/G	1	32	28	60	15.6954395844828	14.2664903635776	1.42894922090522	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.796524354206091	ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	3514695	A/G	1	111	118	229	54.4435560586747	60.1230665322197	-5.67951047354507	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.467662865999065	ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	3519762	A/G	1	70	40	110	34.3337740910561	20.3807005193965	13.9530735716596	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00971035452502339	ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	4436517	A/T	1	16	22	38	7.84771979224139	11.2093852856681	-3.36166549342669	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.330832380517956	ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000503861:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512195:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000507908:exon_4436497_4436585:STX18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	4543541	T/C	1	12	19	31	5.88578984418104	9.68083274671335	-3.7950429025323	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.209090362166922	ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4543524_4543737:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4543524_4543755:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512780:exon_4543524_4543758:STX18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	5749904	T/C	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	5749961	G/C	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	5750003	A/G	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	5754592	G/A	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000514919:exon_5754402_5754779:EVC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	5803735	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5803677_5803821:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5803677_5803821:EVC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	5803745	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5803677_5803821:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5803677_5803821:EVC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	5812778	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5812680_5816032:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5812680_5815889:EVC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	6606864	A/G	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	6619204	G/A	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6619107_6624128:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000510427:exon_6619175_6619219:MAN2B2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	6621722	G/T	1	8	13	21	3.9238598961207	6.62372766880387	-2.69986777268317	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.278819956820526	ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6621654_6621771:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6621654_6621771:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6619107_6624128:MAN2B2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	6882675	T/C	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000170871:ENST00000425103:exon_6882514_6885897:KIAA0232;ENSG00000170871:ENST00000307659:exon_6882514_6885891:KIAA0232
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8224615	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8224567_8224697:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8224567_8224697:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8224567_8224697:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8224567_8224697:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8224567_8224697:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508641:exon_8224567_8224659:SH3TC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8228731	T/C	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8228894	T/C	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000514274:exon_8228707_8229196:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508438:exon_8228688_8229000:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8229218	A/G	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8229326	T/C	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8242466	A/G	1	25	34	59	12.2620621753772	17.323595441487	-5.06153326610987	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.195292439009494	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8242425_8242471:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8242425_8242830:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8242425_8242818:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8242425_8242818:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8242425_8242818:SH3TC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8375342	G/A	1	14	26	40	6.86675481821122	13.2474553376077	-6.38070051939652	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0565460725064916	ENSG00000087008:ENST00000512411:exon_8375288_8375542:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000515797:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8375288_8375355:ACOX3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8394094	G/A	1	22	10	32	10.7906147143319	5.09517512984913	5.69543958448278	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0514207061432888	ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000508302:exon_8394060_8394180:ACOX3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	8467263	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000155275:ENST00000513449:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000389737:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000429676:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000316290:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000532477:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000285635:exon_8467105_8467288:C4orf23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	17590505	C/T	1	196	201	397	96.1345674549571	102.413020109968	-6.27845265501045	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.547072093929316	ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17590442_17590600:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000513105:exon_17590442_17590600:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17590442_17590600:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000503467:exon_17590442_17590600:LAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	17600132	C/T	1	202	220	422	99.0774623770476	112.093852856681	-13.0163904796333	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.205992125489865	ENSG00000002549:ENST00000226299:exon_17600079_17600181:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000504614:exon_17600079_17600181:LAP3;ENSG00000002549:ENST00000503467:exon_17600079_17600181:LAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	17805379	G/A	1	15	22	37	7.35723730522631	11.2093852856681	-3.85214798044178	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.249934710989812	ENSG00000163257:ENST00000382247:exon_17802278_17806394:DCAF16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	24578097	C/T	1	67	88	155	32.8623266300108	44.8375411426723	-11.9752145126615	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0642939549322677	ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	25125613	T/C	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000109618:ENST00000382103:exon_25121636_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000302922:exon_25122624_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000358971:exon_25123877_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000514585:exon_25125472_25125847:SEPSECS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	25419283	T/C	1	35	42	77	17.166887045528	21.3997355453663	-4.2328484998383	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.362784900017014	ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	27019451	C/G	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000109689:ENST00000412829:exon_27019333_27019606:STIM2;ENSG00000109689:ENST00000382009:exon_27019333_27019606:STIM2;ENSG00000109689:ENST00000467087:exon_27019333_27019606:STIM2;ENSG00000109689:ENST00000467011:exon_27019333_27019606:STIM2;ENSG00000109689:ENST00000465503:exon_27019333_27019606:STIM2;ENSG00000109689:ENST00000237364:exon_27019333_27019606:STIM2;ENSG00000109689:ENST00000473519:exon_27019333_27019606:STIM2;ENSG00000109689:ENST00000477474:exon_27019333_27019606:STIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	37836302	T/C	1	13	10	23	6.37627233119613	5.09517512984913	1.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.6789219768712	ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	37847310	C/T	1	15	16	31	7.35723730522631	8.15228020775861	-0.795042902532303	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.858159256514081	ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37847254_37847351:PGM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	37851856	A/C	1	28	34	62	13.7335096364224	17.323595441487	-3.59008580506461	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.376549485995117	ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	37857342	G/C	1	27	10	37	13.2430271494074	5.09517512984913	8.14785201955822	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.00803058366331499	ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38016372	G/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38016130_38016594:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38016130_38016594:TBC1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38023279	G/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38023294	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38776107	T/G	1	23	31	54	11.281097201347	15.7950429025323	-4.5139457011853	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.224198221243685	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38776303	T/C	1	13	26	39	6.37627233119613	13.2474553376077	-6.87118300641161	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0361336889289514	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38776491	T/G	1	77	90	167	37.7671515001617	45.8565761686422	-8.08942466848047	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.216374009628054	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38777173	A/T	1	26	30	56	12.7525446623923	15.2855253895474	-2.53298072715513	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.50749609094596	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38777236	T/G	1	27	30	57	13.2430271494074	15.2855253895474	-2.04249824014004	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.59913770109504	ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38799710	T/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38800101	G/A	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000505940:exon_38799970_38800519:TLR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38829163	A/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	38995413	C/T	1	34	14	48	16.676404558513	7.13324518178878	9.54315937672417	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00591897396540203	ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	39116911	T/C	1	31	29	60	15.2049570974677	14.7760078765625	0.428949220905221	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	39122697	C/T	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39122630_39123829:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39122630_39123828:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39122630_39122825:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39122630_39123826:KLHL5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	41992677	C/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_41992489_41992777:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_41992519_41992777:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_41992544_41992777:SLC30A9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	42022464	C/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42022433_42022532:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42022433_42022532:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_42022433_42022792:SLC30A9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	44682465	T/C	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	54011526	A/G	1	22	26	48	10.7906147143319	13.2474553376077	-2.45684062327582	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.564122342437876	ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	54011603	C/T	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	56756531	T/C	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	56770633	A/T	1	28	21	49	13.7335096364224	10.6998677726832	3.03364186373926	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.395811892156300	ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56770509_56771179:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56770509_56771200:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56770509_56771200:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56770509_56771173:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000506936:exon_56770509_56770743:EXOC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	56876006	A/C	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56875901_56876069:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56875901_56876069:CEP135
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	57361553	A/G	1	64	39	103	31.3908791689656	19.8711830064116	11.519696162554	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0235500581962279	ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	57796970	A/G	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	57797127	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	57876955	G/A	1	47	42	89	23.0526768897091	21.3997355453663	1.65294134434274	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.751330389169057	ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	68374597	C/T	1	24	14	38	11.7715796883621	7.13324518178878	4.63833450657331	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.146057457351567	ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	68374626	C/T	1	15	19	34	7.35723730522631	9.68083274671335	-2.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.493953241174159	ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	68380215	G/A	0	10	0	10	4.90482487015087	0	4.90482487015087	G	G		10	0.509517512984913	0.00198502447144214	ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	68384008	C/T	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68383874_68384086:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68383874_68384086:CENPC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	73942810	A/G	1	35	29	64	17.166887045528	14.7760078765625	2.39087916896557	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.617516561701598	ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	73956736	G/A	1	27	27	54	13.2430271494074	13.7569728505926	-0.5139457011853	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.892792650810575	ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	73991006	T/C	1	17	10	27	8.33820227925648	5.09517512984913	3.24302714940735	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.250108755096081	ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000514252:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000254802:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000411811:exon_73990918_73991029:ANKRD17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	74477529	A/G	1	3	21	24	1.47144746104526	10.6998677726832	-9.22842031163791	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000123662830841933	ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74477448_74477546:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74477448_74477546:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74477448_74477546:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000512591:exon_74477448_74477546:RASSF6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	76857302	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	77036556	T/G	1	36	33	69	17.6573695325431	16.8140779285021	0.843291604041003	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.904351539838357	ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77035812_77036647:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508604:exon_77035812_77036647:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77035817_77036647:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77035818_77036647:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77035818_77036647:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77036240_77036647:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508465:exon_77036257_77036647:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77036359_77036647:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77036454_77036647:NUP54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	77053803	C/T	1	21	26	47	10.3001322273168	13.2474553376077	-2.94732311029091	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.466153003590598	ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	77069474	G/A	1	19	12	31	9.31916725328665	6.11421015581896	3.2049570974677	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.283751645573885	ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77069461_77069569:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77069461_77069668:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77069461_77069655:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77069461_77069655:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77069461_77069558:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77069461_77069550:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77069461_77069550:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77069461_77069655:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000504173:exon_77069461_77069597:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77069461_77069530:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77069461_77069587:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77069461_77069551:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77069461_77069550:NUP54
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	77082799	G/C	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000138760:ENST00000264896:exon_77079890_77082904:SCARB2;ENSG00000138760:ENST00000452464:exon_77082439_77082904:SCARB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	79800080	G/A	1	14	16	30	6.86675481821122	8.15228020775861	-1.28552538954739	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.716389941789618	ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	80828555	G/A	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000163297:ENST00000403729:exon_80822303_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000482406:exon_80827916_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000491345:exon_80828324_80828621:ANTXR2;ENSG00000163297:ENST00000404191:exon_80828507_80828621:ANTXR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	83776087	A/G	1	57	28	85	27.95750175986	14.2664903635776	13.6910113962824	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0032234426511144	ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000264405:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000507828:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000512664:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000510167:exon_83776056_83776182:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503226:exon_83776059_83776182:SEC31A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	84350870	A/G	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84350677_84350899:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84350677_84350899:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84350677_84350899:HELQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	86915848	T/C	1	18	4	22	8.82868476627157	2.03807005193965	6.79061471433191	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00449186101551913	ENSG00000138639:ENST00000395184:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000318116:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000395183:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000514229:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000264343:exon_86915736_86916810:ARHGAP24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	86915923	G/A	1	19	5	24	9.31916725328665	2.54758756492456	6.77157968836209	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00683818195403182	ENSG00000138639:ENST00000395184:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000318116:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000395183:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000514229:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000264343:exon_86915736_86916810:ARHGAP24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	86916043	G/A	1	14	6	20	6.86675481821122	3.05710507790948	3.80964974030174	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.116630612949195	ENSG00000138639:ENST00000395184:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000318116:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000395183:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000514229:exon_86915736_86916810:ARHGAP24;ENSG00000138639:ENST00000264343:exon_86915736_86916810:ARHGAP24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	88293887	G/A	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507518:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000502576:exon_88293861_88293967:HSD17B11;ENSG00000198189:ENST00000507286:exon_88293861_88293967:HSD17B11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	88295955	T/C	1	11	6	17	5.39530735716596	3.05710507790948	2.33820227925648	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.333809869270413	ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88295851_88295982:HSD17B11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	88344063	G/C	1	8	14	22	3.9238598961207	7.13324518178878	-3.20938528566809	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.203086029135577	ENSG00000170502:ENST00000302174:exon_88343734_88344164:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000358033:exon_88343738_88344164:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000514345:exon_88343746_88344164:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000514227:exon_88343833_88344164:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000440591:exon_88343961_88344164:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000502933:exon_88344034_88344164:NUDT9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	89306659	T/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000273960:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000504905:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000502870:exon_89306651_89306727:HERC6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	95197520	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	99363278	G/A	1	36	38	74	17.6573695325431	19.3616654934267	-1.70429596088356	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.728074510388297	ENSG00000138698:ENST00000380158:exon_99363141_99363524:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000408927:exon_99363141_99365012:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000453712:exon_99363141_99363817:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000408900:exon_99363141_99363485:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000339360:exon_99363141_99363485:RAP1GDS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	103528817	T/G	1	53	69	122	25.9955718117996	35.156708395959	-9.16113658415938	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.103370444888422	ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103528806_103528908:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103528806_103528908:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103528806_103528908:NFKB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	103555992	A/G	1	21	19	40	10.3001322273168	9.68083274671335	0.61929948060348	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.875534708687596	ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	103557077	G/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103557022_103557164:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000508141:exon_103557063_103557164:MANBA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	104030207	C/T	1	19	27	46	9.31916725328665	13.7569728505926	-4.437805597306	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.23785161492042	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104029960_104030246:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104029960_104030246:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104029960_104030246:CENPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	104060947	C/G	1	3	11	14	1.47144746104526	5.60469264283404	-4.13324518178878	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0321870224179764	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104060946_104061236:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104060946_104061236:CENPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	104061993	C/G	1	23	18	41	11.281097201347	9.17131523372843	2.10978196761857	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.535763623400263	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	104067127	G/A	1	9	14	23	4.41434238313578	7.13324518178878	-2.718902798653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.300147215812102	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	104067195	T/C	1	17	12	29	8.33820227925648	6.11421015581896	2.22399212343752	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.460635236646915	ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	107133919	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000145348:ENST00000273980:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000510927:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000361687:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000394706:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000467183:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000432496:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000394708:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000514689:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000515705:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000511011:exon_107133907_107133992:TBCK;ENSG00000145348:ENST00000506615:exon_107133907_107133992:TBCK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	108641317	G/A	1	13	12	25	6.37627233119613	6.11421015581896	0.262062175377175	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	108911051	T/C	1	24	20	44	11.7715796883621	10.1903502596983	1.58122942866383	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.654190035525763	ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108910870_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108910912_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108910940_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000511742:exon_108911011_108911220:HADH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	108931039	T/C	1	46	56	102	22.562194402694	28.5329807271551	-5.97078632446112	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.275931180412308	ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108930915_108931043:HADH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	108955542	C/T	1	76	70	146	37.2766690131466	35.6662259089439	1.61044310420271	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.804401874204765	ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108955395_108956327:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000510728:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000515462:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000514776:exon_108955395_108955648:HADH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	109088713	C/G	1	12	1	13	5.88578984418104	0.509517512984913	5.37627233119613	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.00348710510277128	ENSG00000138795:ENST00000265165:exon_109088711_109089578:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000379951:exon_109088711_109089578:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000438313:exon_109088711_109088954:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000506680:exon_109088711_109088923:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000504775:exon_109088711_109088750:LEF1;ENSG00000138795:ENST00000415535:exon_109088711_109089578:LEF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	109546278	T/C	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.573555054768089	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	110603784	T/C	1	43	45	88	21.0907469416487	22.9282880843211	-1.83754114267234	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.74941310300425	ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	113352098	G/A	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	113352397	G/A	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	113352628	A/G	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	113352899	G/A	1	5	14	19	2.45241243507544	7.13324518178878	-4.68083274671335	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0382353432713789	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	113353285	T/C	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	113359703	A/G	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	113362316	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	119631160	C/T	1	34	18	52	16.676404558513	9.17131523372843	7.50508932478452	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0382381924753711	ENSG00000145388:ENST00000388822:exon_119631153_119632201:METTL14;ENSG00000145388:ENST00000506780:exon_119631153_119631758:METTL14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	119736796	A/C	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	119745884	G/A	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119745775_119745904:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119745775_119745904:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119745775_119745904:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119745775_119745904:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119745775_119745904:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119745775_119745904:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119745775_119745904:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119745775_119745904:SEC24D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	122617745	G/A	1	115	64	179	56.405486006735	32.6091208310344	23.7963651757006	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000413365538450977	ENSG00000164111:ENST00000296511:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000512232:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000501272:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000506395:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000515017:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000511552:exon_122617736_122618130:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513428:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513523:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513728:exon_122617736_122617779:ANXA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	122737965	G/C	1	306	284	590	150.087641026617	144.702973687715	5.38466733890135	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.680560660940496	ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122737927_122738176:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122737927_122738066:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122737927_122737995:EXOSC9;ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122737599_122738841:CCNA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	122741807	C/T	1	36	23	59	17.6573695325431	11.718902798653	5.93846673389013	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.151500881154868	ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122741697_122741920:CCNA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	129880770	G/A	1	17	14	31	8.33820227925648	7.13324518178878	1.2049570974677	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.721617530563431	ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	140036029	G/A	0	505	0	505	247.693655942619	0	247.693655942619	G	G		10	0.509517512984913	1.44422289273676e-148	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	140262082	C/A	1	14	17	31	6.86675481821122	8.66179772074352	-1.7950429025323	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.591606875195905	ENSG00000164134:ENST00000296543:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000398947:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000482087:exon_140262066_140262227:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000480277:exon_140262066_140262223:NAA15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	142155072	T/A	1	91	70	161	44.6339063183729	35.6662259089439	8.96768040942901	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.180063728106593	ENSG00000109445:ENST00000262990:exon_142154869_142155851:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000506302:exon_142154869_142155250:ZNF330
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	144442735	C/T	1	28	22	50	13.7335096364224	11.2093852856681	2.52412435075435	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.483871757529487	ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	146030326	A/T	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000164163:ENST00000296577:exon_146030284_146030401:ABCE1;ENSG00000164163:ENST00000455563:exon_146030284_146030401:ABCE1;ENSG00000164163:ENST00000502586:exon_146030284_146030401:ABCE1;ENSG00000164163:ENST00000507193:exon_146030284_146030401:ABCE1;ENSG00000164163:ENST00000504292:exon_146030284_146030401:ABCE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	146560393	C/T	1	18	17	35	8.82868476627157	8.66179772074352	0.166887045528044	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000151611:ENST00000281317:exon_146560227_146560730:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000506919:exon_146560227_146560730:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000511969:exon_146560245_146560730:MMAA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	148944539	C/T	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.239422942006238	ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	151773455	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151773037_151774095:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151773037_151774095:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000507224:exon_151773037_151774095:LRBA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	152682046	G/T	1	20	21	41	9.80964974030174	10.6998677726832	-0.890218032381433	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.876185377477144	ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152681959_152682175:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152681959_152682151:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152681959_152682082:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515884:exon_152681959_152682105:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000511538:exon_152681959_152682122:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000512306:exon_152681959_152682137:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000508611:exon_152681959_152682142:PET112L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	154513627	A/G	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	154513722	C/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154513627_154513736:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154513627_154513736:KIAA0922
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	154514965	T/C	1	8	15	23	3.9238598961207	7.64276269477369	-3.718902798653	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.145439852017206	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	154519856	C/T	1	41	31	72	20.1097819676186	15.7950429025323	4.31473906508626	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.346255227873207	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154519742_154519884:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154519742_154519884:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154519742_154519884:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154519742_154519884:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154519742_154519884:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154519742_154519884:KIAA0922
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	156617994	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000164116:ENST00000506455:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511108:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000357469:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000512983:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511507:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515602:exon_156617908_156618001:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000455639:exon_156617958_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000509901:exon_156617908_156618212:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000443668:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000296518:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515201:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000513574:exon_156617908_156618274:GUCY1A3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	160277141	G/A	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000109756:ENST00000264431:exon_160277005_160277310:RAPGEF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	164085425	T/C	1	4	13	17	1.96192994806035	6.62372766880387	-4.66179772074352	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0282411534392039	ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	169142892	G/T	1	12	8	20	5.88578984418104	4.0761401038793	1.80964974030174	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.505009524526088	ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169142881_169143032:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000393739:exon_169142881_169143032:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000511317:exon_169142881_169143032:DDX60
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	169146726	T/C	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169146680_169146827:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000393739:exon_169146680_169146827:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000511317:exon_169146680_169146827:DDX60
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	169928842	G/T	1	18	6	24	8.82868476627157	3.05710507790948	5.77157968836209	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0232323340630925	ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	169931268	G/A	1	16	5	21	7.84771979224139	2.54758756492456	5.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0271669342424189	ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	169931274	G/A	1	14	2	16	6.86675481821122	1.01903502596983	5.84771979224139	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00428332020606953	ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	170634408	A/G	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	170663194	T/C	1	19	17	36	9.31916725328665	8.66179772074352	0.657369532543132	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.868798049474732	ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	174253422	T/A	1	12	14	26	5.88578984418104	7.13324518178878	-1.24745533760774	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.69695410034444	ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	174253423	A/G	1	14	11	25	6.86675481821122	5.60469264283404	1.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.691382994021232	ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	174254614	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	184577036	T/G	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000182552:ENST00000326397:exon_184577034_184577114:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000327570:exon_184577034_184577114:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510702:exon_184577034_184577114:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000514322:exon_184577034_184577114:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000506467:exon_184577034_184577249:RWDD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	184612553	G/C	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184612469_184612624:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184612469_184612624:C4orf41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	184629643	A/G	1	23	18	41	11.281097201347	9.17131523372843	2.10978196761857	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.535763623400263	ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000511955:exon_184629560_184629727:C4orf41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	185615764	C/A	1	21	16	37	10.3001322273168	8.15228020775861	2.14785201955822	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.514219390998328	ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	185615768	T/G	1	21	16	37	10.3001322273168	8.15228020775861	2.14785201955822	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.514219390998328	ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	186097045	C/T	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	186111639	T/C	1	22	19	41	10.7906147143319	9.68083274671335	1.10978196761857	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.756996336009118	ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	186112363	A/G	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	186272564	C/T	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.388745519579610	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	186272616	A/C	1	41	32	73	20.1097819676186	16.3045604155172	3.80522155210135	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.41324352328607	ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186272599_186272763:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186272599_186272763:SNX25
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	186299260	A/G	1	23	26	49	11.281097201347	13.2474553376077	-1.96635813626074	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.66863426075168	ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	186327022	C/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000109775:ENST00000510206:exon_186326934_186327322:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510755:exon_186326934_186327113:UFSP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	4	186392879	C/G	1	15	9	24	7.35723730522631	4.58565761686422	2.77157968836209	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.309571402085472	ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186392828_186392913:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186392828_186392898:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510481:exon_186392828_186392906:CCDC110;ENSG00000249679:ENST00000512874:exon_186392670_186392914:RP11-279O9.4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	240563	C/T	1	157	132	289	77.0057504613687	67.2563117140085	9.74943874736014	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.263813993897883	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_240559_240591:SDHA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	256509	G/A	1	182	143	325	89.2678126367458	72.8610043568426	16.4068082799033	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0756916201818206	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	376809	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000063438:ENST00000505113:exon_376725_376831:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_376725_376831:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_376725_376831:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000514523:exon_376725_376831:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000510400:exon_376725_376831:AHRR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	453888	G/A	1	30	27	57	14.7144746104526	13.7569728505926	0.95750175985996	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.894770752909179	ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	474974	C/T	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.288210295768078	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	476510	G/A	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.535123382758391	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	1463806	G/A	1	63	53	116	30.9003966819505	27.0044281882004	3.89596849375009	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.515927384230796	ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1461955_1463950:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1461538_1463950:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1461544_1463950:LPCAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	1466919	G/A	1	31	55	86	15.2049570974677	28.0234632141702	-12.8185061167025	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00671396148450553	ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	1494909	C/T	1	29	15	44	14.2239921234375	7.64276269477369	6.58122942866383	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0505542303928888	ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	1815950	T/C	1	14	12	26	6.86675481821122	6.11421015581896	0.752544662392262	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.845747407952092	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	5464533	C/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	5465063	A/C	1	15	16	31	7.35723730522631	8.15228020775861	-0.795042902532303	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.858159256514081	ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	6600064	G/T	1	150	166	316	73.572373052263	84.5799071554956	-11.0075341032325	T:C:G	G	T	10	0.509517512984913	0.216409674330948	ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	6748659	T/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000112941:ENST00000230859:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000511764:exon_6748577_6748703:PAPD7;ENSG00000112941:ENST00000514697:exon_6748577_6748703:PAPD7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	10261839	T/C	1	217	117	334	106.434699682274	59.6135490192348	46.8211506630391	T:C	T	C	10	0.509517512984913	3.02525594613495e-07	ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10261672_10262313:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10261672_10261857:CCT5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	10353992	C/T	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000145495:ENST00000449913:exon_10353815_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000502795:exon_10353823_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000511802:exon_10353827_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000503788:exon_10353828_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000274140:exon_10353879_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000397730:exon_10353879_10354029:MARCH6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	10354003	C/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000145495:ENST00000449913:exon_10353815_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000502795:exon_10353823_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000511802:exon_10353827_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000503788:exon_10353828_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000274140:exon_10353879_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000397730:exon_10353879_10354029:MARCH6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	10405735	G/A	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.190933578495351	ENSG00000145495:ENST00000449913:exon_10405670_10405789:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000511802:exon_10405670_10405789:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000503788:exon_10405670_10405789:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000274140:exon_10405670_10405789:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000397730:exon_10405670_10405789:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000510792:exon_10405670_10405789:MARCH6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	14397238	T/C	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	17353999	T/A	0	485	0	485	237.884006202317	0	237.884006202317	T	T		10	0.509517512984913	1.12891237976956e-142	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	17354033	C/T	0	81	0	81	39.729081448222	0	39.729081448222	C	C		10	0.509517512984913	1.99216861222938e-24	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	31409426	C/T	1	25	21	46	12.2620621753772	10.6998677726832	1.562194402694	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.661409503864399	ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409357_31409439:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409357_31409439:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409357_31409439:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409357_31409439:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409357_31409439:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409357_31409439:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31409357_31409658:DROSHA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	32126441	G/A	1	38	46	84	18.6383345065733	23.437805597306	-4.79947109073269	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.326478072527078	ENSG00000113384:ENST00000265070:exon_32124810_32126742:GOLPH3;ENSG00000113384:ENST00000499354:exon_32124827_32126742:GOLPH3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	33467818	A/G	1	353	347	700	173.140317916326	176.802577005765	-3.66225908943909	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.791385212119144	ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33467665_33468038:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33467665_33469644:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33467665_33468196:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33467665_33468190:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33467665_33467943:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33467665_33468167:TARS;ENSG00000113407:ENST00000503422:exon_33467665_33468196:TARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	37721219	T/C	1	10	16	26	4.90482487015087	8.15228020775861	-3.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.240919067564399	ENSG00000082068:ENST00000265107:exon_37721217_37721317:WDR70;ENSG00000082068:ENST00000511906:exon_37721217_37725152:WDR70
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	41917390	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000205765:ENST00000381647:exon_41917118_41921738:C5orf51;ENSG00000205765:ENST00000443403:exon_41917325_41917401:C5orf51
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	54603822	T/C	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	56527090	A/G	1	50	36	86	24.5241243507543	18.3426304674569	6.18149388329748	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.196382227896150	ENSG00000062194:ENST00000424459:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000454432:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000514387:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000506184:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000511209:exon_56526925_56527148:GPBP1;ENSG00000062194:ENST00000264779:exon_56526925_56527148:GPBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	61847073	G/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000086200:ENST00000424533:exon_61847050_61847163:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000325324:exon_61847050_61847163:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000409296:exon_61847050_61847163:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000511713:exon_61847050_61847163:IPO11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	64020241	T/C	1	123	117	240	60.3293459028557	59.6135490192348	0.715796883620882	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.948577901918312	ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	64097145	C/G	1	43	41	84	21.0907469416487	20.8902180323814	0.200528909267309	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	64881936	A/G	1	40	36	76	19.6192994806035	18.3426304674569	1.27666901314661	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.818953877414615	ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	65084101	A/G	1	11	17	28	5.39530735716596	8.66179772074352	-3.26649036357756	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.258164543515238	ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506539:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65083945_65084311:NLN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	68463014	G/T	1	16	21	37	7.84771979224139	10.6998677726832	-2.85214798044178	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.411868674227362	ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	68531253	C/T	1	47	41	88	23.0526768897091	20.8902180323814	2.16245885732766	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.670845325655464	ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	68588029	T/C	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68588015_68588189:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68588015_68588189:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68588015_68588189:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000511257:exon_68588015_68588189:CCDC125
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	68616225	G/C	1	11	5	16	5.39530735716596	2.54758756492456	2.84771979224139	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.211441030609945	ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68616064_68616410:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000453797:exon_68616064_68616367:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000383374:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000512045:exon_68616064_68616407:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000513172:exon_68616064_68616407:CCDC125
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	70786830	G/T	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70786811_70786958:BDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	70805984	G/A	1	26	16	42	12.7525446623923	8.15228020775861	4.60026445463365	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.167355504594337	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	70806457	G/A	1	24	18	42	11.7715796883621	9.17131523372843	2.60026445463365	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.444285661776372	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	70806649	T/A	1	19	20	39	9.31916725328665	10.1903502596983	-0.871183006411606	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.873119535755642	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	70806711	C/G	1	15	18	33	7.35723730522631	9.17131523372843	-1.81407792850213	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.602827681047108	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	70828251	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70828135_70828254:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70828135_70828254:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70828135_70828254:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70828135_70828254:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70828201_70828254:BDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	70840912	G/T	1	1	9	10	0.490482487015087	4.58565761686422	-4.09517512984913	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0103558957396217	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70840866_70841046:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70840866_70841046:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70840866_70841304:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70840866_70841046:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70840866_70841046:BDP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	72798845	A/G	1	2	1712	1714	0.980964974030174	872.293982230171	-871.313017256141	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0	ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	74675142	T/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:T	T	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000113163:ENST00000508809:exon_74674857_74675298:COL4A3BP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	74998598	G/A	1	13	16	29	6.37627233119613	8.15228020775861	-1.77600787656248	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.579398877321146	ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	75001590	T/A	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75001064_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75001398_75001612:POC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	76734084	C/T	1	22	23	45	10.7906147143319	11.718902798653	-0.928288084321084	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.881715558303643	ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	80024783	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80024670_80024784:MSH3;ENSG00000113318:ENST00000512258:exon_80024670_80024784:MSH3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	80168937	G/A	1	28	17	45	13.7335096364224	8.66179772074352	5.07171191567891	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.138334227063926	ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	80604391	T/C	1	79	62	141	38.7481164741919	31.5900858050646	7.15803066912727	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.239003622454495	ENSG00000131732:ENST00000507402:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000254037:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000407610:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000506458:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000380199:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000438268:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000504502:exon_80604380_80604530:ZCCHC9;ENSG00000131732:ENST00000505860:exon_80604226_80604530:ZCCHC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	80736444	A/G	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000145687:ENST00000320672:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000509053:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000514493:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504985:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000512923:exon_80736357_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000510060:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000505980:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000515395:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000380182:exon_80736377_80736455:SSBP2;ENSG00000145687:ENST00000504136:exon_80736377_80736455:SSBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	82648977	T/G	1	17	26	43	8.33820227925648	13.2474553376077	-4.90925305835126	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.169265719213925	ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	86708640	C/A	1	27	17	44	13.2430271494074	8.66179772074352	4.58122942866383	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.177601491172458	ENSG00000134480:ENST00000256897:exon_86708495_86708836:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000504878:exon_86708252_86708721:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000448765:exon_86708495_86708685:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000513499:exon_86708495_86708706:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000510020:exon_86708495_86708688:CCNH;ENSG00000134480:ENST00000505230:exon_86708495_86708667:CCNH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	89820984	T/C	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000176018:ENST00000500869:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000315948:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000509384:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000176018:ENST00000453259:exon_89820852_89821117:AC027323.1;ENSG00000254085:ENST00000517526:exon_89820852_89821117:LYSMD3;ENSG00000254085:ENST00000520100:exon_89820852_89821117:LYSMD3;ENSG00000254085:ENST00000426853:exon_89820852_89821117:LYSMD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	90667244	A/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000113369:ENST00000265138:exon_90664541_90667273:ARRDC3;ENSG00000113369:ENST00000511391:exon_90666615_90667273:ARRDC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	94278129	T/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000503301:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000507214:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000514780:exon_94278052_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512568:exon_94278054_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000510732:exon_94278089_94278131:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000513695:exon_94278098_94278131:MCTP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	94852866	G/A	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94852850_94853026:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000507805:exon_94852850_94853026:TTC37
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	94865765	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	95234377	C/T	1	27	3	30	13.2430271494074	1.52855253895474	11.7144746104526	T:C	C	T	10	0.509517512984913	9.29257856658874e-06	ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	95234392	A/C	1	23	3	26	11.281097201347	1.52855253895474	9.75254466239226	A:C	A	C	10	0.509517512984913	9.41644633357045e-05	ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96118852	G/C	1	14	10	24	6.86675481821122	5.09517512984913	1.77157968836209	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.54303205531595	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96121524	C/T	1	38	21	59	18.6383345065733	10.6998677726832	7.93846673389013	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0498950700876959	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96124330	T/C	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96126308	A/G	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96126215_96126346:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96126215_96126329:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96126288_96126346:ERAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96129512	A/G	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96130836	T/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96130745_96130865:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96130745_96130865:ERAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96139250	C/G	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96512865	T/A	1	13	14	27	6.37627233119613	7.13324518178878	-0.756972850592651	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.848425091361672	ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	96512871	T/A	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96512820_96512995:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96512708_96512995:RIOK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	98199204	C/T	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000153922:ENST00000514344:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000284049:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000505657:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000511067:exon_98199112_98199290:CHD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	99897866	G/A	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000174132:ENST00000312637:exon_99897758_99897892:FAM174A;ENSG00000174132:ENST00000505792:exon_99897756_99897892:FAM174A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	102345546	A/C	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	102423579	A/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000145723:ENST00000512248:exon_102421704_102423876:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000399004:exon_102422037_102423876:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000508629:exon_102423517_102423876:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000507478:exon_102423519_102423876:GIN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	102520400	A/C	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507966:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511724:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511022:exon_102520373_102520445:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000510672:exon_102519944_102520445:PPIP5K2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	102891695	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000112874:ENST00000230792:exon_102891632_102891799:NUDT12;ENSG00000112874:ENST00000507423:exon_102891632_102891799:NUDT12;ENSG00000112874:ENST00000515407:exon_102891632_102891790:NUDT12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	110083970	A/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	112175770	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	112177801	A/C	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	112926755	G/A	1	16	10	26	7.84771979224139	5.09517512984913	2.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.329230577261424	ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112926738_112926941:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112926738_112926941:YTHDC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	118451873	T/G	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000172869:ENST00000503802:exon_118451853_118452031:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118451853_118452031:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000514151:exon_118451853_118452031:DMXL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	118691784	T/C	1	87	80	167	42.6719763703126	40.761401038793	1.91057533151953	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.816497969857265	ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118690009_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118691718_118691816:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118691730_118691816:TNFAIP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	118728953	G/C	1	177	149	326	86.8154002016704	75.918109434752	10.8972907669184	A:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.244701894801573	ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	118877660	A/G	1	120	81	201	58.8578984418104	41.270918551778	17.5869798900325	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0134963066816358	ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	118877677	C/T	1	116	81	197	56.8959684937501	41.270918551778	15.6250499419721	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0271303276409731	ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	121311049	G/A	1	16	5	21	7.84771979224139	2.54758756492456	5.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0271669342424189	ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121311010_121311082:SRFBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	121355961	G/A	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	122682348	A/G	1	15	6	21	7.35723730522631	3.05710507790948	4.30013222731683	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0794791301761176	ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	122714044	T/C	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122714030_122714122:CEP120
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	125936654	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125935960_125936750:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125936617_125936750:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000456348:exon_125936633_125936750:PHAX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	126887569	G/A	1	9	17	26	4.41434238313578	8.66179772074352	-4.24745533760774	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.116679632873408	ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	131819798	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	131892979	G/A	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131892630_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131892630_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131892630_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131892630_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000453394:exon_131892923_131893145:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000423956:exon_131892923_131893145:RAD50
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	131930642	C/T	1	30	17	47	14.7144746104526	8.66179772074352	6.05267688970909	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0814819087737381	ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000453394:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000423956:exon_131930561_131930736:RAD50
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	132073168	C/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000131437:ENST00000378746:exon_132073106_132073330:KIF3A;ENSG00000131437:ENST00000378735:exon_132073106_132073264:KIF3A;ENSG00000131437:ENST00000450914:exon_132073106_132073265:KIF3A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	132159134	C/T	1	1	9	10	0.490482487015087	4.58565761686422	-4.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0103558957396217	ENSG00000164403:ENST00000378679:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000440998:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000319854:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000378676:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000355404:exon_132158942_132159214:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000488072:exon_132158975_132159214:SHROOM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	132159351	C/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000164403:ENST00000378679:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000440998:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000319854:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000378676:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000355404:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000488072:exon_132159315_132159497:SHROOM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	132334252	A/G	1	18	29	47	8.82868476627157	14.7760078765625	-5.94732311029091	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.107587495040156	ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	133900192	C/T	1	15	23	38	7.35723730522631	11.718902798653	-4.36166549342669	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.194058844877546	ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000470876:exon_133899862_133900300:PHF15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	134229293	C/A	1	32	25	57	15.6954395844828	12.7379378246228	2.95750175985996	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.508124996976959	ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000511070:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506350:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000505174:exon_134227868_134229345:TXNDC15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	134670656	A/G	1	175	187	362	85.8344352276402	95.2797749281787	-9.4453397005385	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344049049561788	ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	134670765	A/G	1	115	115	230	56.405486006735	58.594513993265	-2.18902798652999	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.792163279885734	ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	137665323	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	137754695	T/C	1	11	15	26	5.39530735716596	7.64276269477369	-2.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.435416403978507	ENSG00000120733:ENST00000314358:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000510866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000394866:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000507996:exon_137754642_137754921:KDM3B;ENSG00000120733:ENST00000508386:exon_137754642_137754921:KDM3B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	137910987	A/C	1	58	61	119	28.447984246875	31.0805682920797	-2.63258404520465	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.64753374188667	ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137910927_137911133:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137910927_137911090:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000504902:exon_137910927_137911029:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507115:exon_137910927_137911092:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000505110:exon_137910927_137911090:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000506477:exon_137910927_137911100:HSPA9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	138147949	T/G	1	19	23	42	9.31916725328665	11.718902798653	-2.39973554536634	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.537708485716917	ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518910:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000519309:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518245:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520158:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518585:exon_138147872_138147991:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518919:exon_138147648_138147991:CTNNA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	138253446	C/T	1	29	20	49	14.2239921234375	10.1903502596983	4.03364186373926	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.257082266142737	ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138253431_138253587:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138253431_138253587:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138253431_138253587:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138253431_138253587:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520400:exon_138253431_138253507:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000522013:exon_138253431_138253468:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000523298:exon_138253431_138253482:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000517533:exon_138253431_138253508:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000523685:exon_138253431_138253536:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000522052:exon_138253431_138253543:CTNNA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	138266546	G/A	1	71	48	119	34.8242565780712	24.4568406232758	10.3674159547954	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0663209683440059	ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	139682653	G/T	1	54	52	106	26.4860542988147	26.4949106752155	-0.00885637640077519	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000113068:ENST00000261813:exon_139682626_139682706:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000510217:exon_139682626_139682698:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000524074:exon_139682626_139682668:PFDN1;ENSG00000113068:ENST00000507185:exon_139682626_139682671:PFDN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	139936835	G/A	1	69	73	142	33.843291604041	37.1947784478986	-3.35148684385764	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.614796315357736	ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	139940015	G/A	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000358580:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139939898_139940089:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511201:exon_139939986_139940089:APBB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	139941318	A/G	1	11	6	17	5.39530735716596	3.05710507790948	2.33820227925648	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.333809869270413	ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	139941413	C/G	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139941172_139941812:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139941172_139941434:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511463:exon_139941228_139941580:APBB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	140048209	T/C	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	140699057	G/C	1	123	183	306	60.3293459028557	93.2417048762391	-32.9123589733834	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.000192019088405807	ENSG00000178913:ENST00000313368:exon_140698058_140700351:TAF7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	140903792	G/A	1	57	54	111	27.95750175986	27.5139457011853	0.443556058674659	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000131504:ENST00000476339:exon_140903710_140904322:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000448451:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000468119:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140903710_140903796:DIAPH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	140963703	G/A	1	17	16	33	8.33820227925648	8.15228020775861	0.18592207149787	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000523100:exon_140963691_140963792:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000524301:exon_140963691_140963792:DIAPH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141019110	C/A	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141019569	G/C	1	16	16	32	7.84771979224139	8.15228020775861	-0.304560415517216	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141019830	C/G	1	21	25	46	10.3001322273168	12.7379378246228	-2.437805597306	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.555812495792938	ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141024234	T/C	1	17	23	40	8.33820227925648	11.718902798653	-3.38070051939652	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.343130626071081	ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518499:exon_141024197_141024257:FCHSD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141307833	T/C	1	28	37	65	13.7335096364224	18.8521479804418	-5.11863834401935	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.216456894689530	ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141307716_141307863:KIAA0141
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141312988	T/C	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000081791:ENST00000506775:exon_141312824_141313447:KIAA0141
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141318032	A/G	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.324346196468135	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141318368	C/T	1	30	17	47	14.7144746104526	8.66179772074352	6.05267688970909	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0814819087737381	ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141318086_141321612:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000509110:exon_141318086_141318513:KIAA0141
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	141391532	G/A	1	10	7	17	4.90482487015087	3.56662259089439	1.33820227925648	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.630132706769099	ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	147805120	T/C	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	147813013	G/A	1	17	20	37	8.33820227925648	10.1903502596983	-1.85214798044178	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.622791636127096	ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000505399:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000504447:exon_147812796_147813087:FBXO38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149212800	G/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149212578_149213341:PPARGC1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149212802	C/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149212219_149213341:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149212578_149213341:PPARGC1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149216256	C/T	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000411868:exon_149215826_149216636:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149215826_149216636:PPARGC1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149374932	T/C	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149740772	A/G	1	11	19	30	5.39530735716596	9.68083274671335	-4.28552538954739	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.144013561824245	ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149740719_149740774:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515516:exon_149740719_149740774:TCOF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149756088	C/T	1	27	28	55	13.2430271494074	14.2664903635776	-1.02346321417021	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.789288531871596	ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755986_149756183:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755986_149756183:TCOF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149778612	C/T	1	19	23	42	9.31916725328665	11.718902798653	-2.39973554536634	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.537708485716917	ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149778585_149778633:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149778585_149778633:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149778585_149778633:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149778585_149778633:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149778585_149778633:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149778585_149778633:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149778585_149778633:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149778585_149778633:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515516:exon_149778585_149778633:TCOF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149825159	G/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000164587:ENST00000519855:exon_149824987_149825248:RPS14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	149827189	G/C	1	3983	3093	7076	1953.59174578109	1575.93766766234	377.654078118756	A:T:C:G	G	C	10	0.509517512984913	2.57709573719168e-19	ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	150029700	G/A	1	15	17	32	7.35723730522631	8.66179772074352	-1.30456041551722	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.724820906305913	ENSG00000171992:ENST00000394243:exon_150027506_150033794:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000522122:exon_150027506_150031896:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000314840:exon_150027506_150031896:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000307662:exon_150027506_150029865:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000519664:exon_150027506_150031899:SYNPO
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	150425500	C/T	1	145	126	271	71.1199606171876	64.199206636099	6.92075398108858	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.429702563398612	ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521423:exon_150425482_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	150436503	G/C	1	148	134	282	72.5914080782329	68.2753467399783	4.31606133825453	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.63390003350643	ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150436327_150436518:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150436327_150436518:TNIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	150483095	A/G	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	150502519	G/T	1	707	517	1224	346.771118319667	263.4205542132	83.3505641064665	T:C:G	G	T	10	0.509517512984913	2.00820529125013e-06	ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150502478_150502572:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150502478_150502572:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150502478_150502572:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150502478_150502572:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150502478_150502572:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520054:exon_150502478_150502572:ANXA6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	150567017	A/G	1	38	23	61	18.6383345065733	11.718902798653	6.91943170792031	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0952217721388864	ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150566947_150567020:CCDC69
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	150647040	C/T	1	94	67	161	46.1053537794182	34.1376733699892	11.967680409429	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0695057775881883	ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	151043103	G/C	1	38	47	85	18.6383345065733	23.9473231102909	-5.3089886037176	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.278298474719268	ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	154268902	C/T	1	25	37	62	12.2620621753772	18.8521479804418	-6.59008580506461	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0997239304312742	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154268881_154268977:GEMIN5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	154271948	G/A	1	28	17	45	13.7335096364224	8.66179772074352	5.07171191567891	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.138334227063926	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154271947_154272109:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000522075:exon_154271947_154272210:GEMIN5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	154291409	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	154300940	A/C	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154300903_154300985:GEMIN5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	154306972	T/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154306945_154307110:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000523355:exon_154306946_154307110:GEMIN5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	154320784	A/G	1	169	134	303	82.8915403055497	68.2753467399783	14.6161935655714	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0958139889541762	ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154320777_154320825:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154320777_154320825:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154320655_154320825:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154320777_154320825:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154320777_154320825:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154320737_154320825:MRPL22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	154336698	C/A	1	282	159	441	138.316061338255	81.0132845646012	57.3027767736534	A:C	C	A	10	0.509517512984913	4.78293259445928e-08	ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154336695_154336772:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154336695_154336772:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154336695_154336772:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154336695_154336772:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154336695_154336772:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154336695_154336772:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154334759_154336772:MRPL22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	156723692	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156723679_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519002:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519252:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520419:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156723679_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522423:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156723679_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517850:exon_156723681_156723782:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156723681_156723782:CYFIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	156747669	A/G	1	55	51	106	26.9765367858298	25.9853931622306	0.991143623599225	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.922671594853232	ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	156918850	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000135074:ENST00000517951:exon_156918843_156918920:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000517374:exon_156918843_156918920:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000257527:exon_156918843_156918920:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000394020:exon_156918843_156918920:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000517905:exon_156918843_156918920:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000432888:exon_156918843_156918920:ADAM19;ENSG00000135074:ENST00000430702:exon_156918843_156918920:ADAM19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	157166495	T/C	1	58	44	102	28.447984246875	22.4187705713362	6.02921367553887	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.236601320420498	ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157166329_157168456:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157166329_157166586:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157166329_157167443:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157166329_157166706:THG1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	159840598	T/A	1	71	47	118	34.8242565780712	23.9473231102909	10.8769334677803	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.0527639014453161	ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159840463_159840627:SLU7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	159912418	C/G	1	15	15	30	7.35723730522631	7.64276269477369	-0.28552538954739	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169021610	C/T	1	25	10	35	12.2620621753772	5.09517512984913	7.16688704552804	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0173533717451777	ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169028481	T/C	1	55	36	91	26.9765367858298	18.3426304674569	8.63390631837292	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0749593021556088	ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169031150	T/C	1	23	19	42	11.281097201347	9.68083274671335	1.60026445463366	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.646500103260762	ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169031218	G/T	1	17	11	28	8.33820227925648	5.60469264283404	2.73350963642244	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.347388221006843	ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169101345	C/T	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169101301_169101449:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169101301_169101449:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000522138:exon_169101301_169101449:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169101301_169101449:DOCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169504743	T/C	1	65	68	133	31.8813616559807	34.6471908829741	-2.76582922699343	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.664955723752048	ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169685163	C/T	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000043462:ENST00000046794:exon_169685041_169685170:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000521416:exon_169685041_169685170:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000523369:exon_169685041_169685502:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000520344:exon_169685041_169685170:LCP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169724551	T/A	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000043462:ENST00000046794:exon_169724538_169725231:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000519594:exon_169724538_169724731:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000522760:exon_169724538_169724733:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000522823:exon_169724538_169724819:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000519149:exon_169724538_169724788:LCP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	169805866	G/A	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000145936:ENST00000274629:exon_169805168_169805977:KCNMB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	171481606	A/G	1	78	60	138	38.2576339871768	30.5710507790948	7.68658320808201	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.202051136851401	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	171523436	G/A	1	48	52	100	23.5431593767242	26.4949106752155	-2.9517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.617246082610263	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171523430_171523564:STK10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	171533629	A/G	1	28	30	58	13.7335096364224	15.2855253895474	-1.55201575312495	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.695855915207732	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	171533656	C/T	1	23	31	54	11.281097201347	15.7950429025323	-4.5139457011853	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.224198221243685	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	171533782	T/C	1	30	15	45	14.7144746104526	7.64276269477369	7.07171191567892	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0371923882447882	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	173317826	A/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000113742:ENST00000265085:exon_173315283_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000326629:exon_173315331_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000520867:exon_173316343_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000334035:exon_173316343_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000519835:exon_173316534_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000518141:exon_173317669_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000522344:exon_173317677_173317861:CPEB4;ENSG00000113742:ENST00000519152:exon_173317680_173317861:CPEB4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	175923638	T/G	1	10	18	28	4.90482487015087	9.17131523372843	-4.26649036357756	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.130521566482645	ENSG00000113194:ENST00000261942:exon_175923487_175923664:FAF2;ENSG00000113194:ENST00000504983:exon_175923487_175923664:FAF2;ENSG00000113194:ENST00000513627:exon_175923487_175923987:FAF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	175956535	C/T	1	21	24	45	10.3001322273168	12.2284203116379	-1.92828808432109	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.655214756079902	ENSG00000146083:ENST00000274811:exon_175956524_175956645:RNF44;ENSG00000146083:ENST00000434253:exon_175956524_175956809:RNF44;ENSG00000146083:ENST00000506378:exon_175956524_175956645:RNF44;ENSG00000146083:ENST00000513029:exon_175956524_175956645:RNF44;ENSG00000146083:ENST00000515051:exon_175956524_175956809:RNF44;ENSG00000146083:ENST00000508478:exon_175956489_175956645:RNF44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176081907	C/T	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000048140:ENST00000310032:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000405525:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000514705:exon_176079744_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000508164:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000504168:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000503045:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000515708:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000507471:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000414405:exon_176081380_176082021:TSPAN17
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176522562	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000160867:ENST00000292408:exon_176522534_176522724:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000393648:exon_176522534_176522724:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000502906:exon_176522534_176522724:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000292410:exon_176522534_176522724:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000393637:exon_176522534_176522724:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000377207:exon_176522534_176522724:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000511076:exon_176522534_176522724:FGFR4;ENSG00000160867:ENST00000483872:exon_176522534_176522580:FGFR4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176639105	T/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176734657	C/T	1	26	27	53	12.7525446623923	13.7569728505926	-1.00442818820039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.785658801468792	ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734206_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734209_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734215_176734704:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734436_176734704:MXD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176734855	G/C	1	17	12	29	8.33820227925648	6.11421015581896	2.22399212343752	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.460635236646915	ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176764147	G/A	1	195	163	358	95.644084967942	83.0513546165408	12.5927303514011	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.186664390779207	ENSG00000169223:ENST00000303127:exon_176764137_176764251:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000515209:exon_176764137_176764251:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000502560:exon_176764137_176764251:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000502721:exon_176763912_176764251:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000513877:exon_176764139_176764251:LMAN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176916516	C/T	1	30	24	54	14.7144746104526	12.2284203116379	2.4860542988147	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.586574359744793	ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176918080	G/A	0	38	0	38	18.6383345065733	0	18.6383345065733	G	G		10	0.509517512984913	9.20075755214283e-12	ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000505074:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355572:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393546:exon_176918011_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000506161:exon_176918026_176918147:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000504318:exon_176918073_176918421:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000503346:exon_176918074_176918147:PDLIM7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176923436	C/T	1	62	41	103	30.4099141949354	20.8902180323814	9.51969616255396	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.061773542208857	ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000505074:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355572:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393546:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000506161:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000463411:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000506537:exon_176923418_176923878:PDLIM7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176936590	T/C	1	38	32	70	18.6383345065733	16.3045604155172	2.33377409105609	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.633139350099399	ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000509310:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502380:exon_176935785_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936167_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510389:exon_176936503_176936658:DOK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176936819	C/G	1	10	13	23	4.90482487015087	6.62372766880387	-1.718902798653	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.535123382758391	ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936803_176936858:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510380:exon_176936803_176936847:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000506493:exon_176936759_176936830:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502885:exon_176936759_176936827:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936759_176936853:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936759_176936827:DOK3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	176940384	G/A	1	80	87	167	39.238598961207	44.3280236296874	-5.08942466848047	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.43993309635559	ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	177035964	T/C	1	15	16	31	7.35723730522631	8.15228020775861	-0.795042902532303	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.858159256514081	ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	177482786	C/T	0	1841	0	1841	902.978258594775	0	902.978258594775	C	C		10	0.509517512984913	0	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	177482813	G/A	0	339	0	339	166.273563098114	0	166.273563098114	G	G		10	0.509517512984913	6.15485831048878e-100	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	177482814	C/A	0	331	0	331	162.349703201994	0	162.349703201994	C	C		10	0.509517512984913	1.40804192567067e-97	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	177482871	G/A	1	3660	3	3663	1795.16590247522	1.52855253895474	1793.63734993626	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	177573248	G/T	1	12	21	33	5.88578984418104	10.6998677726832	-4.81407792850213	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.116534180786067	ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177573115_177573280:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177573115_177573280:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177573115_177573280:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177573115_177573280:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177573115_177573280:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507937:exon_177572971_177574636:RMND5B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	177633889	G/C	1	505	514	1019	247.693655942619	261.892001674245	-14.1983457316263	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.380412161101275	ENSG00000197451:ENST00000358344:exon_177633733_177633891:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000506339:exon_177633733_177633891:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000355836:exon_177633733_177633891:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000514633:exon_177633733_177633891:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000515193:exon_177633733_177633891:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000506259:exon_177633733_177633891:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000504898:exon_177633733_177633891:HNRNPAB;ENSG00000197451:ENST00000406003:exon_177633733_177633891:HNRNPAB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	177652392	T/C	1	28	11	39	13.7335096364224	5.60469264283404	8.12881699358839	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00997233908157915	ENSG00000175309:ENST00000308158:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000481436:exon_177652356_177653080:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000489262:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000493197:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000494126:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000510913:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000514424:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000323594:exon_177652356_177652430:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000506001:exon_177652356_177652430:AGXT2L2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	178140335	T/C	1	3	9	12	1.47144746104526	4.58565761686422	-3.11421015581896	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0867923369694881	ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179036357	G/A	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	G	G		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179044887	A/G	1	345	321	666	169.216458020205	163.555121668157	5.66133635204795	A:T:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.670020169139257	ENSG00000169045:ENST00000511300:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000393432:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502904:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000442819:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000356731:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000515481:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000514332:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000329433:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510678:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510411:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519033:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502632:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519958:exon_179044800_179044912:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000504549:exon_179044800_179045061:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000514731:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000521173:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523921:exon_179044800_179044933:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000503105:exon_179044818_179044912:HNRNPH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179045068	G/A	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.171917444065472	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179045270	T/C	1	559	447	1006	274.179710241434	227.754328304256	46.4253819371775	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00369722717435784	ENSG00000169045:ENST00000511300:exon_179045146_179046408:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000393432:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502904:exon_179045146_179045900:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000442819:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000356731:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000515481:exon_179045146_179047033:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000514332:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000329433:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510678:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510411:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502632:exon_179045146_179045454:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519958:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000504549:exon_179045146_179045516:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000514731:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000521173:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523921:exon_179045146_179045302:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000504779:exon_179045146_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000520415:exon_179045145_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000518548:exon_179045162_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000508103:exon_179045206_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000506721:exon_179045209_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523137:exon_179045219_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000505811:exon_179045225_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510431:exon_179045237_179045324:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519056:exon_179045240_179045324:HNRNPH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179137077	G/A	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.455825155299284	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179226518	G/A	1	52	48	100	25.5050893247845	24.4568406232758	1.0482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.842238577674175	ENSG00000161013:ENST00000518778:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520969:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000522293:exon_179226506_179226576:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520875:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518867:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518702:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520822:exon_179226506_179227068:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179226512_179226636:MGAT4B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179249935	G/A	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000161011:ENST00000504627:exon_179249889_179250053:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179249485_179250053:SQSTM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179260153	C/T	1	203	167	370	99.5679448640627	85.0894246684805	14.4785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.145315965479302	ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179260232	G/A	1	271	200	471	132.920753981089	101.903502596983	31.017251384106	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00425892210261567	ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179264379	G/A	1	53	61	114	25.9955718117996	31.0805682920797	-5.08499648028008	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.350336332209576	ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179297262	T/C	1	18	13	31	8.82868476627157	6.62372766880387	2.2049570974677	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.475629809894747	ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179297304	G/A	1	15	7	22	7.35723730522631	3.56662259089439	3.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.135346882910936	ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179297352	A/G	1	7	12	19	3.43337740910561	6.11421015581896	-2.68083274671335	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.255611251188563	ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179300131	T/C	1	6	14	20	2.94289492209052	7.13324518178878	-4.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0737409706371382	ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521669:exon_179300119_179300135:TBC1D9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179318572	C/T	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179318379_179318586:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179318379_179318586:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179318412_179318586:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179318379_179318586:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522029:exon_179318379_179318586:TBC1D9B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179393867	T/C	1	3	19	22	1.47144746104526	9.68083274671335	-8.20938528566808	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.000397625717545336	ENSG00000113269:ENST00000522208:exon_179393806_179394010:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000521389:exon_179393806_179394010:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000393383:exon_179393806_179394010:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000261947:exon_179393806_179394010:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000520911:exon_179393806_179394010:RNF130
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179407196	C/T	1	1	11	12	0.490482487015087	5.60469264283404	-5.11421015581896	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00291655716474975	ENSG00000113269:ENST00000522208:exon_179407129_179407200:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000521389:exon_179407129_179407200:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000393383:exon_179407129_179407200:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000261947:exon_179407129_179407200:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000520911:exon_179407129_179407200:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000522885:exon_179407151_179407200:RNF130;ENSG00000113269:ENST00000519708:exon_179407129_179407518:RNF130
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	179996111	C/T	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000113300:ENST00000261951:exon_179996110_179996340:CNOT6;ENSG00000113300:ENST00000393356:exon_179996110_179996340:CNOT6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	180218668	A/G	1	94	72	166	46.1053537794182	36.6852609349137	9.42009284450445	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.162150785900671	ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	180219304	C/T	1	40	52	92	19.6192994806035	26.4949106752155	-6.875611194612	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.175041599996298	ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	180219528	C/T	1	21	31	52	10.3001322273168	15.7950429025323	-5.49491067521548	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.164822211037056	ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000504671:exon_180219373_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506889:exon_180219511_180220097:MGAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	180219980	C/G	1	14	14	28	6.86675481821122	7.13324518178878	-0.266490363577564	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000504671:exon_180219373_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506889:exon_180219511_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514283:exon_180219590_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000512695:exon_180219625_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506269:exon_180219638_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514438:exon_180219658_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000502678:exon_180219662_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000513431:exon_180219686_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000507384:exon_180219870_180220097:MGAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	180651231	G/A	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	180657749	A/G	1	23	20	43	11.281097201347	10.1903502596983	1.09074694164874	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.7626051935177	ENSG00000146063:ENST00000515499:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180657744_180657839:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515834:exon_180651691_180657839:TRIM41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	180660594	G/A	1	11	2	13	5.39530735716596	1.01903502596983	4.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0227648071906430	ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180660413_180660763:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	5	180687212	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000183718:ENST00000327767:exon_180687002_180688119:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000510796:exon_180687002_180687258:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000503005:exon_180687002_180687325:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000514805:exon_180687002_180688082:TRIM52
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	350829	G/A	1	66	187	253	32.3718441429957	95.2797749281787	-62.907930785183	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	9.96599377948328e-16	ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	397290	T/C	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000137265:ENST00000495137:exon_397108_397546:IRF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	599209	T/C	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_599080_599225:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_599080_599225:EXOC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	1742794	A/G	1	35	26	61	17.166887045528	13.2474553376077	3.91943170792031	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.370290475774054	ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	2834235	C/T	1	34	60	94	16.676404558513	30.5710507790948	-13.8946462205818	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00508438219239828	ENSG00000021355:ENST00000380739:exon_2832566_2834246:SERPINB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	3077141	T/C	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000137275:ENST00000259808:exon_3076998_3077221:RIPK1;ENSG00000137275:ENST00000380409:exon_3077058_3077221:RIPK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	3850630	G/C	0	15	0	15	7.35723730522631	0	7.35723730522631	G	G		10	0.509517512984913	6.3368183847151e-05	ENSG00000145945:ENST00000380274:exon_3849620_3851551:FAM50B;ENSG00000145945:ENST00000380272:exon_3850023_3851551:FAM50B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	4116262	G/A	1	78	84	162	38.2576339871768	42.7994710907327	-4.54183710355591	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.480630999328305	ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	4996611	T/G	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4996456_4996654:RPP40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	4998963	A/G	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	4999011	A/G	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	5260936	A/C	1	64	57	121	31.3908791689656	29.04249824014	2.34838092882553	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.716360061769176	ENSG00000214113:ENST00000468929:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000330636:exon_5260881_5261172:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000464010:exon_5260881_5260966:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000480566:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000455814:exon_5260881_5260954:LYRM4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	5368905	G/A	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.112356383277526	ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5368783_5369415:FARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	5404783	T/G	1	28	20	48	13.7335096364224	10.1903502596983	3.54315937672418	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.316537820148549	ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5404775_5404934:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5404775_5404934:FARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	5431340	A/G	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	7247344	C/A	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7247244_7247454:RREB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	7310259	A/G	1	31	30	61	15.2049570974677	15.2855253895474	-0.0805682920796915	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	8413890	A/G	1	12	14	26	5.88578984418104	7.13324518178878	-1.24745533760774	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.69695410034444	ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	10702805	G/T	1	34	44	78	16.676404558513	22.4187705713362	-5.74236601282322	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.213350144413742	ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702798_10702872:PAK1IP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	11193860	G/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11193824_11193925:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11193824_11193925:NEDD9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	12294258	A/G	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12294174_12294329:EDN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	13307903	C/T	1	15	15	30	7.35723730522631	7.64276269477369	-0.28552538954739	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13307832_13307977:TBC1D7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	13592018	G/A	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13591901_13592126:SIRT5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	13791073	C/T	1	49	46	95	24.0336418637393	23.437805597306	0.595836266433267	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.918629797968201	ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13791020_13791096:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13791020_13791096:CCDC90A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	15523152	C/T	1	41	29	70	20.1097819676186	14.7760078765625	5.33377409105609	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.232073620992907	ENSG00000047579:ENST00000344537:exon_15523032_15523450:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000462989:exon_15523038_15523450:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000510395:exon_15523041_15523450:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000355917:exon_15523041_15523450:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000397306:exon_15523041_15523450:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000515875:exon_15523068_15523450:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000513680:exon_15523074_15523450:DTNBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	15663118	T/C	1	20	16	36	9.80964974030174	8.15228020775861	1.65736953254313	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.620024668135095	ENSG00000047579:ENST00000344537:exon_15663045_15663273:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000510395:exon_15663045_15663238:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000355917:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000397306:exon_15663045_15663271:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000515875:exon_15663045_15663261:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000513680:exon_15663045_15663289:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000511762:exon_15663045_15663251:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000338950:exon_15663045_15663206:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000506844:exon_15663045_15663151:DTNBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	18134078	C/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000137364:ENST00000309983:exon_18134035_18134120:TPMT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	24503590	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000112294:ENST00000357578:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000491546:exon_24503491_24503661:ALDH5A1;ENSG00000112294:ENST00000348925:exon_24503491_24503661:ALDH5A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	24653273	G/C	1	21	23	44	10.3001322273168	11.718902798653	-1.41877057133617	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.763445474056447	ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	24843527	C/T	1	14	20	34	6.86675481821122	10.1903502596983	-3.32359544148704	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.304187764558665	ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	25600827	T/C	1	15	8	23	7.35723730522631	4.0761401038793	3.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.211944052448733	ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25600542_25600948:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	25605091	G/A	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25605040_25605121:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25605040_25605121:LRRC16A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	25969599	G/T	1	29	11	40	14.2239921234375	5.60469264283404	8.61929948060348	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.00680413081185949	ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25969553_25969648:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25969553_25969648:TRIM38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	25969600	A/T	1	30	11	41	14.7144746104526	5.60469264283404	9.10978196761857	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.00460686887206068	ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25969553_25969648:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25969553_25969648:TRIM38
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26104187	C/T	1	65	103	168	31.8813616559807	52.480303837446	-20.5989421814654	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00151742626686656	ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26184082	C/G	1	9	9	18	4.41434238313578	4.58565761686422	-0.171315233728434	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26234883	A/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26252148	C/T	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197459:ENST00000356350:exon_26251879_26252303:HIST1H2BH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26285560	A/G	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26370605	T/C	1	44	30	74	21.5812294286638	15.2855253895474	6.29570403911644	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.162994834460197	ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26370707	T/C	1	21	27	48	10.3001322273168	13.7569728505926	-3.45684062327582	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.386644300426596	ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26370748	G/A	1	37	30	67	18.1478520195582	15.2855253895474	2.86232663001083	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.541808742494316	ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26370719_26370831:BTN3A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	26468502	C/A	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	28244361	C/A	1	9	14	23	4.41434238313578	7.13324518178878	-2.718902798653	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.300147215812102	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	28270047	C/G	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	30673262	T/C	1	38	19	57	18.6383345065733	9.68083274671335	8.95750175985996	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0234623366149447	ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	30882689	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	30882803	G/A	1	6	11	17	2.94289492209052	5.60469264283404	-2.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.230278583276833	ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	30893728	C/T	1	38	37	75	18.6383345065733	18.8521479804418	-0.213813473868473	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893657_30893785:VARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	30893941	G/A	1	47	38	85	23.0526768897091	19.3616654934267	3.6910113962824	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.44887854004994	ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31111174	C/A	1	35	16	51	17.166887045528	8.15228020775861	9.01460683776944	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.0117047186397790	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31111180	T/C	1	35	17	52	17.166887045528	8.66179772074352	8.50508932478452	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0185881414542756	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31116246	G/A	1	17	7	24	8.33820227925648	3.56662259089439	4.77157968836209	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0650587674028206	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31118565	C/G	1	31	19	50	15.2049570974677	9.68083274671335	5.52412435075435	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.122254746081498	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31122502	C/T	1	16	25	41	7.84771979224139	12.7379378246228	-4.89021803238143	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.159192167561288	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31129616	A/G	1	14	7	21	6.86675481821122	3.56662259089439	3.30013222731683	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.190933578495351	ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31129642	A/C,G	0	0	15	15	0	7.64276269477369	-7.64276269477369	C:G	A	G	10	0.509517512984913	2.2874551020833e-05	ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31130502	T/C	1	23	24	47	11.281097201347	12.2284203116379	-0.94732311029091	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.884221782888761	ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31237275	G/A	1	1599	1665	3264	784.281496737124	848.34665911988	-64.0651623827559	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0250379360369766	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237270_31237320:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237270_31237302:HLA-C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31238868	C/T	1	556	389	945	272.708262780388	198.202312551131	74.5059502292573	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.19990358757990e-06	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31238850_31239108:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31238850_31239125:HLA-C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31239449	C/G	1	279	310	589	136.844613877209	157.950429025323	-21.1058151481137	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0835465258882267	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31239506	C/G	1	261	197	458	128.015929110938	100.374950058028	27.6409790529099	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0101194603701407	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31431757	A/G	1	32	42	74	15.6954395844828	21.3997355453663	-5.70429596088356	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.201629702348856	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31473546	A/G	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31473561	A/G	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31474000	G/A	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31477681	A/G	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31477559_31478901:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31477559_31478901:MICB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31498737	G/A	1	37	17	54	18.1478520195582	8.66179772074352	9.4860542988147	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0135264481503249	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31503118	G/A	1	22	15	37	10.7906147143319	7.64276269477369	3.14785201955822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.327260400458979	ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31540556	T/C	1	108	148	256	52.9721085976294	75.4085919217671	-22.4364833241377	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00584579538215950	ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31555130	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000204482:ENST00000464526:exon_31554977_31556686:LST1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31555657	A/G	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000204482:ENST00000464526:exon_31554977_31556686:LST1;ENSG00000204482:ENST00000488959:exon_31555328_31556686:LST1;ENSG00000204482:ENST00000460834:exon_31555593_31555743:LST1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31557791	G/A	1	18	20	38	8.82868476627157	10.1903502596983	-1.36166549342669	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.746270992340417	ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557752_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31594771	A/G	1	45	26	71	22.0717119156789	13.2474553376077	8.82425657807118	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0430142200392014	ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31594759_31594924:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000464890:exon_31594759_31594851:BAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31595730	C/T	1	41	25	66	20.1097819676186	12.7379378246228	7.37184414299574	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.084158865890753	ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31595542_31595821:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31595835	C/T	1	52	42	94	25.5050893247845	21.3997355453663	4.10535377941818	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.410950783057577	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31601344	T/C	1	93	108	201	45.6148712924031	55.0278914023706	-9.4130201099675	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.204053595340888	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31605199	G/C	1	24	22	46	11.7715796883621	11.2093852856681	0.562194402694002	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.883967105723158	ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31610686	A/G	1	37	37	74	18.1478520195582	18.8521479804418	-0.704295960883563	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.907745525412377	ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31762843	G/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31762844	G/T	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31762608_31763027:VARS;ENSG00000204394:ENST00000440048:exon_31762608_31763276:VARS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	31936466	C/A	1	60	43	103	29.4289492209052	21.9092530583513	7.51969616255396	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.140755100914639	ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936400_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936463_31936573:SKIV2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32085655	T/C	1	45	53	98	22.0717119156789	27.0044281882004	-4.93271627252147	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.363301997405756	ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32085636_32085815:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32085636_32085815:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375192:exon_32085636_32085664:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32085636_32085815:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000453203:exon_32085636_32085668:ATF6B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32095955	A/G	1	108	96	204	52.9721085976294	48.9136812465516	4.05842735107775	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.576198248045774	ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32095894_32096017:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32095903_32096030:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375192:exon_32095894_32096017:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32095894_32096017:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32095894_32095999:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32095894_32095995:ATF6B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32134319	A/C	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000221988:ENST00000428388:exon_32133915_32134397:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000445576:exon_32133915_32134397:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000422437:exon_32134275_32134397:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000421600:exon_32133915_32134397:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000502898:exon_32134275_32134397:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000509239:exon_32134275_32134397:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000361782:exon_32134275_32134397:PPT2;ENSG00000221988:ENST00000448406:exon_32134275_32134397:PPT2;ENSG00000241404:ENST00000333845:exon_32134275_32134397:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000395512:exon_32134275_32134397:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000432129:exon_32134275_32134397:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000466239:exon_32133013_32134397:EGFL8;ENSG00000241404:ENST00000482938:exon_32134275_32134397:EGFL8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32159535	C/T	1	381	333	714	186.873827552748	169.669331823976	17.2044957287721	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.203223928342532	ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159486_32159685:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159486_32159647:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159486_32159685:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159486_32159685:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159486_32159685:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000403803:exon_32159486_32159647:GPSM3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32407709	C/A	1	862	859	1721	422.795903807005	437.67554365404	-14.8796398470353	A:C:G	C	A	10	0.509517512984913	0.484459516708892	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32410941	T/C	1	19	5	24	9.31916725328665	2.54758756492456	6.77157968836209	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00683818195403182	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32410987	A/G	1	3863	3538	7401	1894.73384733928	1802.67296094062	92.0608863986588	A:T:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.032421348573954	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32411035	A/C	1	2843	2532	5375	1394.44171058389	1290.0983428778	104.343367706093	A:T:C:G	A	C	10	0.509517512984913	0.00454113727976354	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32411523	T/C	1	12	15	27	5.88578984418104	7.64276269477369	-1.75697285059265	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.566049825319431	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32411646	T/G	1	4875	3076	7951	2391.10212419855	1567.27586994159	823.826254256957	A:T:C:G	T	G	10	0.509517512984913	6.33055370610961e-77	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32411726	G/A	1	16	5	21	7.84771979224139	2.54758756492456	5.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0271669342424189	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32714067	G/A	0	40	0	40	19.6192994806035	0	19.6192994806035	G	G		10	0.509517512984913	2.35522956545575e-12	ENSG00000237541:ENST00000374940:exon_32714017_32714191:HLA-DQA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32782112	C/T	1	25	19	44	12.2620621753772	9.68083274671335	2.58122942866383	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.454996754949152	ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32782097_32782378:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32782097_32782378:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32782097_32782378:XXbac-BPG246D15.9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32782387	G/A	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32784676	C/T	1	39	29	68	19.1288169935884	14.7760078765625	4.35280911702592	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.332268674498927	ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32796653	C/A	1	64	70	134	31.3908791689656	35.6662259089439	-4.27534673997834	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.489874010990332	ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32796685	A/G	1	70	84	154	34.3337740910561	42.7994710907327	-8.4656969996766	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.197052254877495	ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32796751	T/C	1	77	88	165	37.7671515001617	44.8375411426723	-7.07038964251064	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.276671143561094	ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32793192_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32796683_32796811:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32796721_32796811:TAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32797297	T/C	1	48	58	106	23.5431593767242	29.552015753125	-6.00885637640078	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.245682168086897	ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32797809	C/T	1	68	63	131	33.3528091170259	32.0996033180495	1.2532057989764	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.861480835880433	ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797707_32797866:XXbac-BPG246D15.9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32800224	C/A	1	62	78	140	30.4099141949354	39.7423660128232	-9.33245181788782	A:C:G	C	A	10	0.509517512984913	0.127971699817589	ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32800412	C/T	1	99	66	165	48.5577662144936	33.6281558570043	14.9296103574894	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0236561607373362	ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32904981	G/A	1	200	145	345	98.0964974030174	73.8800393828124	24.216458020205	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00967713634034646	ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32908593	C/T	1	90	86	176	44.1434238313578	43.8185061167025	0.324917714655314	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32908530_32908761:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32908530_32908798:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32908530_32908847:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32908530_32908817:HLA-DMB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32917544	C/T	1	270	286	556	132.430271494073	145.722008713685	-13.2917372196116	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.270149533822579	ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32917388_32917564:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32917388_32918580:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000456800:exon_32917388_32917666:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000422832:exon_32917434_32917666:HLA-DMA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32975257	C/T	1	19	8	27	9.31916725328665	4.0761401038793	5.24302714940735	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0533785325312663	ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32977315	A/G	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32977232_32977356:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32977232_32977359:HLA-DOA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	32977325	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32977232_32977389:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32977232_32977337:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32977232_32977356:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32977232_32977359:HLA-DOA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	33179605	G/A	1	48	40	88	23.5431593767242	20.3807005193965	3.16245885732766	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.523717935685591	ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	33239423	C/G	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33238914_33239653:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33239363_33239671:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33239363_33239662:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000436044:exon_33239363_33239662:VPS52
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	33248414	T/G	1	18	13	31	8.82868476627157	6.62372766880387	2.2049570974677	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.475629809894747	ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33248205_33248764:WDR46
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	33382818	G/A	1	45	41	86	22.0717119156789	20.8902180323814	1.18149388329748	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.829792471183329	ENSG00000112511:ENST00000487667:exon_33382732_33382858:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374512:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374516:exon_33382732_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000439397:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000495509:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000486845:exon_33382502_33382921:PHF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	33406556	A/G	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000197283:ENST00000479510:exon_33406552_33406886:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000293748:exon_33406552_33406696:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000395072:exon_33406552_33406696:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000418600:exon_33406552_33406696:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000449372:exon_33406552_33406696:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000496374:exon_33406552_33406696:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000428982:exon_33406552_33406696:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000440474:exon_33406552_33406696:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000495633:exon_33406552_33406696:SYNGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	33411299	C/T	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000197283:ENST00000293748:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000395072:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000418600:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000449372:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000496374:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000428982:exon_33410666_33411737:SYNGAP1;ENSG00000197283:ENST00000440474:exon_33410666_33411737:SYNGAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	33541971	T/C	1	13	13	26	6.37627233119613	6.62372766880387	-0.247455337607738	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000030110:ENST00000374460:exon_33541811_33541991:BAK1;ENSG00000030110:ENST00000374467:exon_33541811_33541991:BAK1;ENSG00000030110:ENST00000360661:exon_33541811_33541997:BAK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	34214322	C/G	1	56	46	102	27.4670192728449	23.437805597306	4.02921367553888	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.430415284922718	ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	34214348	C/T	1	61	50	111	29.9194317079203	25.4758756492457	4.44355605867466	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.447756851325679	ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	34855748	G/C	1	50	39	89	24.5241243507543	19.8711830064116	4.65294134434274	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.341397584594485	ENSG00000064995:ENST00000361288:exon_34855564_34855866:TAF11;ENSG00000064995:ENST00000420584:exon_34855564_34855819:TAF11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	35803192	C/A	1	16	13	29	7.84771979224139	6.62372766880387	1.22399212343752	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.712533292455687	ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	36355372	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36355313_36356164:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36355313_36356164:ETV7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	36446975	G/C	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	36651889	C/T	1	300	282	582	147.144746104526	143.683938661745	3.46080744278063	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.803579225319667	ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	36651971	C/A	1	211	233	444	103.491804760183	118.717580525485	-15.2257757653014	A:T:C	C	A	10	0.509517512984913	0.154504962296410	ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	36653477	C/T	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.642296381993564	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	36988364	C/T	1	24	21	45	11.7715796883621	10.6998677726832	1.07171191567891	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.767850096057718	ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	37348920	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	37349033	G/A	1	20	19	39	9.80964974030174	9.68083274671335	0.128816993588394	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	38670837	G/A	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	41658889	C/T	1	46	69	115	22.562194402694	35.156708395959	-12.594513993265	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0196862397214475	ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42182080	T/C	1	33	21	54	16.1859220714979	10.6998677726832	5.4860542988147	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.172936857524065	ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42182018_42182082:MRPS10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42185564	A/C	1	18	30	48	8.82868476627157	15.2855253895474	-6.45684062327582	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0821541540893155	ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42203982	G/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42203943_42204149:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42203943_42204149:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42203943_42204149:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42203943_42204149:TRERF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42713770	T/G	1	27	28	55	13.2430271494074	14.2664903635776	-1.02346321417021	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.789288531871596	ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42906384	G/T	1	189	136	325	92.7011900458514	69.2943817659482	23.4068082799033	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0106001446502184	ENSG00000137161:ENST00000372836:exon_42906306_42907025:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000394142:exon_42906306_42907007:CNPY3;ENSG00000137161:ENST00000336842:exon_42906306_42906445:CNPY3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42932200	G/T	1	41	18	59	20.1097819676186	9.17131523372843	10.9384667338901	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0057721331224416	ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42932202	C/T	1	40	20	60	19.6192994806035	10.1903502596983	9.42894922090522	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0193591159369831	ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42932715	C/T	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.103192530786195	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42946490	C/A	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42946007_42946958:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42946007_42946888:PEX6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42992808	T/C	1	47	41	88	23.0526768897091	20.8902180323814	2.16245885732766	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.670845325655464	ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	42992825	C/G	1	46	39	85	22.562194402694	19.8711830064116	2.6910113962824	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.58867078859769	ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43017728	C/A	1	13	12	25	6.37627233119613	6.11421015581896	0.262062175377175	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43017701_43017897:CUL7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43172178	C/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43172098_43172277:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43172098_43172277:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43172098_43172277:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43172098_43172277:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000512408:exon_43171894_43172277:CUL9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43472947	G/A	1	19	11	30	9.31916725328665	5.60469264283404	3.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.202937463755726	ENSG00000137221:ENST00000259751:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372454:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372452:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372449:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372445:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000436109:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372444:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000483640:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000454762:exon_43471361_43474291:TJAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43473464	C/T	1	27	21	48	13.2430271494074	10.6998677726832	2.54315937672418	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.474743472802699	ENSG00000137221:ENST00000259751:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372454:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372452:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372449:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372445:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000436109:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000372444:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000483640:exon_43472499_43474291:TJAP1;ENSG00000137221:ENST00000454762:exon_43471361_43474291:TJAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43492578	G/A	1	78	54	132	38.2576339871768	27.5139457011853	10.7436882859915	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0673922175732538	ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43496662	A/C	1	30	48	78	14.7144746104526	24.4568406232758	-9.74236601282321	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0310582931995272	ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43581897	C/T	1	31	25	56	15.2049570974677	12.7379378246228	2.46701927284487	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.593342378491199	ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43582091	A/T	1	24	34	58	11.7715796883621	17.323595441487	-5.55201575312496	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.150714094702722	ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43590408	G/A	1	16	18	34	7.84771979224139	9.17131523372843	-1.32359544148704	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.732552886508093	ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43639463	C/G	1	152	152	304	74.5533380262932	77.4466619737068	-2.89332394741353	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.774318026876322	ENSG00000172426:ENST00000372165:exon_43638526_43640336:RSPH9;ENSG00000172426:ENST00000372163:exon_43638526_43640336:RSPH9;ENSG00000096080:ENST00000372133:exon_43639040_43639643:MRPS18A;ENSG00000096080:ENST00000372118:exon_43639042_43639643:MRPS18A;ENSG00000096080:ENST00000372116:exon_43639247_43639643:MRPS18A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43747450	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000112715:ENST00000480614:exon_43746626_43754221:VEGFA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43968814	A/G	1	22	33	55	10.7906147143319	16.8140779285021	-6.02346321417022	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.107609118173535	ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43970538	A/C	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	43970539	C/T	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	44081510	C/T	1	233	157	390	114.282419474515	79.9942495386313	34.2881699358839	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000557649084249301	ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	44219710	A/C	1	8	34	42	3.9238598961207	17.323595441487	-13.3997355453663	A:C	A	C	10	0.509517512984913	3.34718105401575e-05	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	44269193	C/T	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	44387314	A/G	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44387186_44387334:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44387186_44387334:CDC5L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	49403282	T/C	1	8	13	21	3.9238598961207	6.62372766880387	-2.69986777268317	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.278819956820526	ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	49415448	C/T	1	20	15	35	9.80964974030174	7.64276269477369	2.16688704552805	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.502292925561721	ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49415383_49415498:MUT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	49425521	C/T	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	49459978	A/G	1	2	9	11	0.980964974030174	4.58565761686422	-3.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0353326891625868	ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49459857_49460820:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49459857_49460820:CENPQ
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	54173413	A/G	1	25	16	41	12.2620621753772	8.15228020775861	4.10978196761857	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.214414867597439	ENSG00000137251:ENST00000486436:exon_54173395_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54173395_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000339741:exon_54173203_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54173253_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370865:exon_54173349_54173703:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54173371_54173703:TINAG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	54191686	C/T	1	13	8	21	6.37627233119613	4.0761401038793	2.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.385136200083102	ENSG00000137251:ENST00000370869:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000339741:exon_54191596_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000259782:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370865:exon_54191600_54191714:TINAG;ENSG00000137251:ENST00000370864:exon_54191600_54191804:TINAG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	57244780	G/A	0	11	0	11	5.39530735716596	0	5.39530735716596	G	G		10	0.509517512984913	0.000996066032871514	ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	57246884	A/G	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	A	A		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	57393125	A/G	0	0	10	10	0	5.09517512984913	-5.09517512984913	G	A	G	10	0.509517512984913	0.000805814452588094	ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	57467175	A/G	0	0	10	10	0	5.09517512984913	-5.09517512984913	G	A	G	10	0.509517512984913	0.000805814452588094	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	57472431	G/T	0	11	0	11	5.39530735716596	0	5.39530735716596	G	G		10	0.509517512984913	0.000996066032871514	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57472359_57472441:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57472359_57472441:PRIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	57512476	G/A	0	0	24	24	0	12.2284203116379	-12.2284203116379	A	G	A	10	0.509517512984913	3.75806360003306e-08	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	57512529	C/A	0	18	0	18	8.82868476627157	0	8.82868476627157	C	C		10	0.509517512984913	8.05541567602468e-06	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	57512565	T/C	0	0	12	12	0	6.11421015581896	-6.11421015581896	C	T	C	10	0.509517512984913	0.000193857256764689	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	70639419	C/G	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000082293:ENST00000322773:exon_70639317_70639592:COL19A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	70672731	T/G	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000082293:ENST00000322773:exon_70672718_70672762:COL19A1;ENSG00000082293:ENST00000483745:exon_70672718_70672762:COL19A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	71269632	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71269419_71270877:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71269419_71270875:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71269419_71270735:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71269419_71270727:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71269419_71270362:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71269419_71270874:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000442251:exon_71269419_71270873:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505675:exon_71269419_71270874:FAM135A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	71298388	T/C	1	70	58	128	34.3337740910561	29.552015753125	4.78175833793114	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.426722622957414	ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71298318_71299272:C6orf57
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	74135016	C/T	1	28	30	58	13.7335096364224	15.2855253895474	-1.55201575312495	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.695855915207732	ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	74155346	G/T	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	74228049	A/G	1	58	56	114	28.447984246875	28.5329807271551	-0.0849964802800827	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	74229258	G/T	1	9	19	28	4.41434238313578	9.68083274671335	-5.26649036357756	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0577845206608332	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	76369054	A/G	1	16	8	24	7.84771979224139	4.0761401038793	3.77157968836209	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.153367642666690	ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000436928:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000485497:exon_76368978_76369123:SENP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	76388322	A/G	1	33	31	64	16.1859220714979	15.7950429025323	0.390879168965569	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000476060:exon_76386320_76388408:SENP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	76564921	G/A	1	20	5	25	9.80964974030174	2.54758756492456	7.26206217537718	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00423856709311032	ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76564856_76565000:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76564856_76565000:MYO6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	76596570	T/C	1	50	49	99	24.5241243507543	24.9663581362607	-0.442233785506389	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76596561_76596711:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76596561_76596711:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76596561_76596711:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76596561_76596711:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76596561_76596711:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76596561_76596711:MYO6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	80736148	A/G	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80736098_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80736098_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80736095_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000515751:exon_80736095_80736231:TTK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	80877498	T/C	1	9	15	24	4.41434238313578	7.64276269477369	-3.22842031163791	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.222587013753191	ENSG00000083123:ENST00000369760:exon_80877395_80877528:BCKDHB;ENSG00000083123:ENST00000320393:exon_80877395_80877528:BCKDHB;ENSG00000083123:ENST00000356489:exon_80877395_80877528:BCKDHB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	86195098	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000135318:ENST00000369651:exon_86194953_86195150:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000369647:exon_86194953_86195150:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000257770:exon_86194953_86195150:NT5E;ENSG00000135318:ENST00000416334:exon_86194953_86195150:NT5E
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	87968310	A/G	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	87968565	A/G	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	87969341	G/A	1	67	36	103	32.8623266300108	18.3426304674569	14.519696162554	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00419936226950605	ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	87969480	G/A	1	40	58	98	19.6192994806035	29.552015753125	-9.93271627252147	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0543701264574616	ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	87969737	C/T	1	30	46	76	14.7144746104526	23.437805597306	-8.72333098685339	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0508903086567336	ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	89793894	G/C	1	103	104	207	50.519696162554	52.989821350431	-2.47012518787699	A:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.781039560845953	ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	90362818	G/C	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90362711_90362874:MDN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	90371202	G/A	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	97339078	A/G	1	111	109	220	54.4435560586747	55.5374089153555	-1.09385285668085	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.892910903816967	ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	97339228	T/G	1	122	129	251	59.8388634158406	65.7277591750538	-5.88889575921316	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.487518793886914	ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	99817513	C/T	1	37	28	65	18.1478520195582	14.2664903635776	3.88136165598065	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.385567747345515	ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99817280_99817696:COQ3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	99828072	A/G	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99828065_99828217:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99828065_99828217:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99828065_99828217:COQ3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	99831613	C/T	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99831574_99831700:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99831574_99831700:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99831574_99831700:COQ3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	100957344	T/C	1	67	55	122	32.8623266300108	28.0234632141702	4.83886341584061	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.41541688230506	ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	100966006	C/T	1	22	26	48	10.7906147143319	13.2474553376077	-2.45684062327582	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.564122342437876	ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100965867_100966018:ASCC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	105776792	G/A	1	18	3	21	8.82868476627157	1.52855253895474	7.30013222731683	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00154778749540789	ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	106547206	T/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000450060:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000481163:exon_106547175_106547584:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106547175_106547427:PRDM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	106634569	C/T	1	11	3	14	5.39530735716596	1.52855253895474	3.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.057993110530478	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	106727570	T/C	1	14	13	27	6.86675481821122	6.62372766880387	0.243027149407349	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000057663:ENST00000369076:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000343245:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000369070:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000476518:exon_106727536_106727698:ATG5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	108194017	A/G	1	24	46	70	11.7715796883621	23.437805597306	-11.6662259089439	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00574694054282843	ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108194012_108194116:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000437345:exon_108194012_108194116:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000459782:exon_108194012_108194116:SEC63
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	109764535	G/T	1	36	35	71	17.6573695325431	17.833112954472	-0.175743421928821	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	109767930	G/T	1	91	87	178	44.6339063183729	44.3280236296874	0.305882688685486	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	109768295	G/A	1	73	89	162	35.8052215521014	45.3470586556573	-9.54183710355591	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.136180426944635	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	109768869	C/T	1	13	22	35	6.37627233119613	11.2093852856681	-4.83311295447195	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.127527522397077	ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	109775436	T/C	1	20	18	38	9.80964974030174	9.17131523372843	0.638334506573306	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.872297020058223	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	109786980	T/C	1	17	18	35	8.33820227925648	9.17131523372843	-0.833112954471956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.866252155786725	ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	112392575	A/G	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000074935:ENST00000368658:exon_112391861_112392773:TUBE1;ENSG00000074935:ENST00000368662:exon_112391980_112392773:TUBE1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	116600453	C/T	1	16	21	37	7.84771979224139	10.6998677726832	-2.85214798044178	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.411868674227362	ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	116720466	G/T	1	2	12	14	0.980964974030174	6.11421015581896	-5.13324518178878	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.00645519038344213	ENSG00000111817:ENST00000430252:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000452085:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000331677:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000359564:exon_116720361_116720829:DSE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	116973182	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	116977861	T/C	1	20	11	31	9.80964974030174	5.60469264283404	4.2049570974677	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.151896927870573	ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116977847_116978015:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116977847_116978015:ZUFSP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	118802950	G/A	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118802942_118803096:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118802942_118803096:C6orf204
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	118887215	T/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	118887333	T/C	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000476150:exon_118887218_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000462101:exon_118887255_118887479:C6orf204
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	126249914	T/G	1	9	14	23	4.41434238313578	7.13324518178878	-2.718902798653	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.300147215812102	ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	133044139	C/A	0	0	16	16	0	8.15228020775861	-8.15228020775861	A	C	A	10	0.509517512984913	1.12195666740517e-05	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	133045040	C/T	0	12	0	12	5.88578984418104	0	5.88578984418104	C	C		10	0.509517512984913	0.000499989724588711	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	133078865	A/G	1	9	20	29	4.41434238313578	10.1903502596983	-5.77600787656248	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0399014742740411	ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133078810_133079022:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133078810_133079147:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133078810_133079033:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133078810_133079022:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133078810_133079109:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133078810_133078898:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133078810_133079022:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133078810_133079022:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133078810_133079022:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000528801:exon_133078810_133079022:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133078810_133079043:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133078810_133078898:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133078810_133079043:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133078810_133079012:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133078810_133079041:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133078810_133078898:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532012:exon_133078810_133079041:VNN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	133135886	A/G	1	2300	1136	3436	1128.1097201347	578.811894750861	549.297825383839	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	5.84088440614944e-80	ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	133138010	T/C	1	32	22	54	15.6954395844828	11.2093852856681	4.4860542988147	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.276100749145927	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	133138703	A/G	1	7	59	66	3.43337740910561	30.0615332661099	-26.6281558570043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	8.1353510849383e-12	ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133138619_133138703:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133138619_133138703:RPS12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	135287533	A/G	1	31	47	78	15.2049570974677	23.9473231102909	-8.74236601282321	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0539204082174763	ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	135524373	G/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000118513:ENST00000341911:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000367812:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000463282:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000525477:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000533837:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000339290:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000442647:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000316528:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000367814:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000527615:exon_135524355_135524904:MYB;ENSG00000118513:ENST00000525369:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000528140:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000528774:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000534121:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000525940:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000528345:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000534044:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000533624:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000529262:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000528015:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000526187:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000533384:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000531634:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000531737:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000525002:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000524588:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000526565:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000528343:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000438901:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000525514:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000531519:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000526320:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000526889:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000533808:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000529586:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000531845:exon_135524355_135524462:MYB;ENSG00000118513:ENST00000529297:exon_135524355_135524462:MYB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	136597262	T/C	0	184	0	184	90.248777610776	0	90.248777610776	T	T		10	0.509517512984913	1.53823348000101e-54	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	136597281	A/T	0	197	0	197	96.6250499419721	0	96.6250499419721	A	A		10	0.509517512984913	2.27561118390358e-58	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	136597288	A/C	0	193	0	193	94.6631199939118	0	94.6631199939118	A	A		10	0.509517512984913	3.42504066863026e-57	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	136599393	G/C	0	54	0	54	26.4860542988147	0	26.4860542988147	G	G		10	0.509517512984913	1.73335006460194e-16	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	136599404	T/C	0	59	0	59	28.9384667338901	0	28.9384667338901	T	T		10	0.509517512984913	5.83520525395473e-18	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	136904783	G/A	1	21	33	54	10.3001322273168	16.8140779285021	-6.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.078462043054815	ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136904693_136904878:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000463140:exon_136904693_136904878:MAP3K5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	136934321	T/C	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136934258_136934394:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136934258_136934394:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136934258_136934394:MAP3K5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	136980386	T/C	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136980357_136980516:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136980357_136980516:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136980357_136980516:MAP3K5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	138196066	T/G	1	34	28	62	16.676404558513	14.2664903635776	2.40991419493539	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.611865636678741	ENSG00000118503:ENST00000420009:exon_138195982_138196172:TNFAIP3;ENSG00000118503:ENST00000237289:exon_138195982_138196172:TNFAIP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	139097232	C/T	1	24	27	51	11.7715796883621	13.7569728505926	-1.98539316223056	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.674795330117832	ENSG00000024862:ENST00000026464:exon_139097216_139097415:CCDC28A;ENSG00000024862:ENST00000332797:exon_139097216_139097415:CCDC28A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	143074700	T/C	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	143749615	T/A	1	33	31	64	16.1859220714979	15.7950429025323	0.390879168965569	A:T	T	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000189007:ENST00000367594:exon_143747078_143749643:ADAT2;ENSG00000189007:ENST00000237283:exon_143748126_143749643:ADAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	143823074	A/G	1	88	80	168	43.1624588573277	40.761401038793	2.40105781853462	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.757716989239083	ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	144178951	A/G	1	49	42	91	24.0336418637393	21.3997355453663	2.63390631837292	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.601477687885626	ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144178889_144179144:LTV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	144183376	T/C	1	85	74	159	41.6910113962824	37.7042959608836	3.98671543539884	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.57887423880753	ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144183241_144183380:LTV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	145119064	G/A	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000152818:ENST00000367545:exon_145118960_145119126:UTRN;ENSG00000152818:ENST00000367526:exon_145118960_145119126:UTRN;ENSG00000152818:ENST00000367524:exon_145118960_145119126:UTRN;ENSG00000152818:ENST00000432686:exon_145118881_145119126:UTRN;ENSG00000152818:ENST00000417142:exon_145118881_145119126:UTRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	149721690	G/A	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000177688:ENST00000326669:exon_149721495_149722177:SUMO4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	149772190	G/A	1	5	11	16	2.45241243507544	5.60469264283404	-3.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.136942032485751	ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149770857_149772201:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149770878_149772211:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149771792_149772615:ZC3H12D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	151270230	C/T	1	18	20	38	8.82868476627157	10.1903502596983	-1.36166549342669	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.746270992340417	ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151270167_151270269:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151270167_151270269:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151270167_151270269:MTHFD1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	151687554	G/T	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	151726300	G/C	1	37	41	78	18.1478520195582	20.8902180323814	-2.74236601282322	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.572123968636348	ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	151766500	T/C	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	151766807	C/T	1	14	11	25	6.86675481821122	5.60469264283404	1.26206217537718	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.691382994021232	ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	151789598	G/A	1	16	16	32	7.84771979224139	8.15228020775861	-0.304560415517216	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211;ENSG00000146476:ENST00000494826:exon_151789478_151789677:C6orf211
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	153296370	G/A	1	25	19	44	12.2620621753772	9.68083274671335	2.58122942866383	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.454996754949152	ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	159058891	T/C	1	98	117	215	48.0672837274785	59.6135490192348	-11.5462652917563	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.117166863504243	ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159058803_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367088:exon_159057506_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159058252_159058926:DYNLT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	159184507	C/T	1	21	14	35	10.3001322273168	7.13324518178878	3.16688704552804	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.313581243470769	ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	159185563	T/A	1	18	21	39	8.82868476627157	10.6998677726832	-1.87118300641161	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.631727462430124	ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	160113867	C/A	1	12	12	24	5.88578984418104	6.11421015581896	-0.228420311637912	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	160113872	A/G	1	12	13	25	5.88578984418104	6.62372766880387	-0.737937824622825	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.842754230648848	ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	160176277	C/T	1	53	47	100	25.9955718117996	23.9473231102909	2.0482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.69055380699986	ENSG00000146457:ENST00000358372:exon_160176060_160177351:WTAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	160189590	G/A	1	92	76	168	45.124388805388	38.7233309868534	6.40105781853462	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.354551884021944	ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160189543_160189660:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000467951:exon_160189543_160189660:ACAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	160212005	A/G	1	62	77	139	30.4099141949354	39.2328484998383	-8.8229343049029	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.149165733648667	ENSG00000112110:ENST00000476826:exon_160211972_160212158:MRPL18;ENSG00000112110:ENST00000479638:exon_160211972_160212158:MRPL18;ENSG00000112110:ENST00000367034:exon_160211972_160212158:MRPL18;ENSG00000112110:ENST00000480842:exon_160211972_160212158:MRPL18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	160493834	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160493797_160493916:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160493797_160493916:IGF2R
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	160494281	A/G	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160494245_160494501:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160494245_160494501:IGF2R
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	166572005	T/C	1	4	35	39	1.96192994806035	17.833112954472	-15.8711830064116	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1.25558470968095e-07	ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	166579270	C/T	1	63	18	81	30.9003966819505	9.17131523372843	21.729081448222	T:C	C	T	10	0.509517512984913	9.92254867916954e-07	ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	166580257	G/A	1	3	37	40	1.47144746104526	18.8521479804418	-17.3807005193965	A:G	G	A	10	0.509517512984913	6.51670735762363e-09	ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166580080_166580344:T
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	166736362	C/T	1	193	214	407	94.6631199939118	109.036747778771	-14.3736277848596	A:T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.165039511931599	ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	167453435	A/T	1	34	30	64	16.676404558513	15.2855253895474	1.39087916896557	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.802877590251029	ENSG00000213066:ENST00000366847:exon_167453392_167455906:FGFR1OP;ENSG00000213066:ENST00000349556:exon_167453392_167453805:FGFR1OP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	168311805	G/A	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000423229:exon_168311781_168311842:MLLT4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	6	170627651	G/A	1	16	11	27	7.84771979224139	5.60469264283404	2.24302714940735	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.444316864047377	ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	618938	A/G	1	20	19	39	9.80964974030174	9.68083274671335	0.128816993588394	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	751025	T/C	1	17	32	49	8.33820227925648	16.3045604155172	-7.96635813626074	A:T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0310362960759548	ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000417852:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000488474:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000456696:exon_750967_751164:PRKAR1B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	814788	G/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	881594	A/C	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000427969:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450538:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000407944:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457378:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000435699:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000439679:exon_881583_881723:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457598:exon_881583_881672:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000421580:exon_881583_881656:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000340926:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000403868:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000467483:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000469755:exon_881583_881710:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000450881:exon_881583_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000493681:exon_881453_881767:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000477950:exon_881549_881767:SUN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	930611	C/T	1	24	39	63	11.7715796883621	19.8711830064116	-8.09960331804952	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0440202306939942	ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	943711	T/C	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000105963:ENST00000481406:exon_943594_943909:ADAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	1049758	C/T	1	183	154	337	89.7582951237609	78.4656969996766	11.2925981240843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.230745130410663	ENSG00000146540:ENST00000425726:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000397100:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000357429:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000397098:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000412051:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000488073:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000444428:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000491163:exon_1049586_1049779:C7orf50
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	1535892	G/A	1	8	9	17	3.9238598961207	4.58565761686422	-0.661797720743521	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.81154613661853	ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1535792_1535900:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1535792_1535900:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1535792_1535900:INTS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	1538737	C/G	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1538611_1538797:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1538611_1538797:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1538611_1538797:INTS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	1542616	C/T	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1542537_1542827:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1542537_1542827:INTS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2257612	G/A	1	40	38	78	19.6192994806035	19.3616654934267	0.257633987176789	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2290522	C/T	1	105	88	193	51.5006611365841	44.8375411426723	6.66311999391179	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.349925139912522	ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2290643	C/T	1	59	64	123	28.9384667338901	32.6091208310344	-3.6706540971443	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.528715089654046	ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2420107	G/A	1	361	375	736	177.064177812446	191.069067369342	-14.004889556896	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.302251118929284	ENSG00000106263:ENST00000360876:exon_2419839_2420378:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000397011:exon_2419914_2420380:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000475415:exon_2419839_2420375:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000468611:exon_2419914_2420375:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000465670:exon_2419029_2420375:EIF3B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2577960	G/A	1	40	26	66	19.6192994806035	13.2474553376077	6.37184414299574	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139194790724528	ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2581047	G/A	1	12	4	16	5.88578984418104	2.03807005193965	3.84771979224139	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0776581322871055	ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2580932_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2580932_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2580932_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2579178_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2580932_2581118:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2581002_2581118:C7orf27
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2770983	G/A	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000146535:ENST00000275364:exon_2767746_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407904:exon_2768195_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000491117:exon_2768195_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407653:exon_2768200_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000496740:exon_2769458_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000396960:exon_2769458_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000471281:exon_2770657_2771384:GNA12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2946461	T/C	1	74	62	136	36.2957040391164	31.5900858050646	4.70561823405183	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.440910797391604	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2969669	C/G	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.264915529576399	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2969626_2969708:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2969626_2969694:CARD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2969698	G/T	1	13	13	26	6.37627233119613	6.62372766880387	-0.247455337607738	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2969626_2969708:CARD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	2976752	C/T	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2976671_2976868:CARD11
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	4802035	A/G	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4801815_4802171:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4801815_4811074:FOXK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	4815403	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	5254173	G/A	1	25	25	50	12.2620621753772	12.7379378246228	-0.475875649245651	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000485854:exon_5254166_5254333:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000496867:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000475309:exon_5253817_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5253900_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5254120_5254335:WIPI2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	5363981	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5363845_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5363845_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000455076:exon_5363853_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000497663:exon_5363878_5363986:TNRC18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	5391702	C/G	1	22	26	48	10.7906147143319	13.2474553376077	-2.45684062327582	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.564122342437876	ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5391450_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5390919_5391725:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5391633_5391725:TNRC18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	5541009	C/A	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	5567677	C/T	1	3818	3463	7281	1872.6621354236	1764.45914746675	108.202987956849	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0113432161390753	ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000464611:exon_5567635_5567729:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567635_5568350:ACTB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	5568366	A/G	1	129	125	254	63.2722408249462	63.6896891231141	-0.417448298167898	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	5643479	C/T	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.574476905075842	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	5792601	T/C	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000011275:ENST00000425013:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000447067:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000435728:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389902:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389900:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000458425:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000411812:exon_5792477_5792610:RNF216
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6026864	G/A	1	15	8	23	7.35723730522631	4.0761401038793	3.281097201347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.211944052448733	ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6026988	G/A	1	14	17	31	6.86675481821122	8.66179772074352	-1.7950429025323	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.591606875195905	ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6057598	C/A	1	75	61	136	36.7861865261315	31.0805682920797	5.70561823405183	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.346146641126349	ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6057445_6057676:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6057445_6057676:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6057445_6057676:AIMP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6066461	T/C	1	50	41	91	24.5241243507543	20.8902180323814	3.63390631837292	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.464552195192172	ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6066359_6066592:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000490523:exon_6066359_6066592:EIF2AK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6189750	C/T	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6189780	T/C	1	7	4	11	3.43337740910561	2.03807005193965	1.39530735716596	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.549644903416313	ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6370305	C/G	1	13	11	24	6.37627233119613	5.60469264283404	0.771579688362088	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.83951915689104	ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6370406	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	6776956	A/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	7274159	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000106392:ENST00000429911:exon_7273934_7274170:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000419721:exon_7273934_7274170:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000436587:exon_7273934_7274170:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000476068:exon_7273934_7274928:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000223122:exon_7273889_7274170:C1GALT1;ENSG00000106392:ENST00000402468:exon_7273951_7274170:C1GALT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	7646687	A/G	1	62	47	109	30.4099141949354	23.9473231102909	6.46259108464449	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.250211274143139	ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	12728495	A/G	1	19	9	28	9.31916725328665	4.58565761686422	4.73350963642244	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0887528602091906	ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	17854532	G/T	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000071189:ENST00000417048:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409389:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000428135:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000242044:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409076:exon_17854457_17854567:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000496855:exon_17854457_17854567:SNX13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	19744417	T/C	1	25	43	68	12.2620621753772	21.9092530583513	-9.64719088297408	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0210007561619237	ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	20193979	T/G	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.239422942006238	ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20193816_20194004:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20193816_20194004:MACC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	20197911	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	20197918	T/G	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	20198917	G/T	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	20201458	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20201371_20201493:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20201371_20201493:MACC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	21940823	A/G	1	66	27	93	32.3718441429957	13.7569728505926	18.6148712924031	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000105798429772206	ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	23164701	C/T	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164667_23164821:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000477076:exon_23164599_23164791:KLHL7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	23213734	T/C	1	1	8	9	0.490482487015087	4.0761401038793	-3.58565761686422	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0193172128390594	ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23213634_23214921:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23213634_23214921:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23213634_23215040:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23213634_23215007:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000469845:exon_23213634_23213811:KLHL7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	23313738	C/A	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000136235:ENST00000258733:exon_23313684_23314727:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000381990:exon_23313684_23314726:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000425903:exon_23313684_23314723:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000453162:exon_23313684_23314723:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000435486:exon_23313684_23314723:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000463011:exon_23313684_23313871:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000478451:exon_23313684_23314348:GPNMB;ENSG00000136235:ENST00000468723:exon_23313684_23314169:GPNMB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	23340618	C/T	1	140	118	258	68.6675481821122	60.1230665322197	8.54448164989245	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.290575241912918	ENSG00000156928:ENST00000466681:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000287543:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000481564:exon_23340458_23340814:C7orf30
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	23352453	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000136231:ENST00000258729:exon_23352354_23352467:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000421467:exon_23352354_23352467:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000417854:exon_23352350_23352467:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000435131:exon_23352354_23352467:IGF2BP3;ENSG00000136231:ENST00000498363:exon_23352354_23352467:IGF2BP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	24705275	G/A	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24705207_24705306:MPP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	24758795	T/C	1	57	47	104	27.95750175986	23.9473231102909	4.01017864956905	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.435008907846168	ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	24854765	G/A	1	14	16	30	6.86675481821122	8.15228020775861	-1.28552538954739	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.716389941789618	ENSG00000070882:ENST00000313367:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000353930:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000352860:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409863:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396431:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409452:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409759:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409555:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000396429:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000409069:exon_24854678_24854822:OSBPL3;ENSG00000070882:ENST00000486214:exon_24854732_24854822:OSBPL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	26236235	T/C	1	1230	1283	2513	603.293459028557	653.710969159643	-50.4175101310864	A:T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.0460028131682515	ENSG00000122566:ENST00000354667:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000360787:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000463181:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000409814:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000356674:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000490912:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000495810:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	26765596	C/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000005020:ENST00000345317:exon_26765542_26765605:SKAP2;ENSG00000005020:ENST00000489977:exon_26765542_26765605:SKAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	27797682	G/A	1	44	41	85	21.5812294286638	20.8902180323814	0.691011396282395	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.913899193114614	ENSG00000106052:ENST00000418691:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000422800:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000265393:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000433216:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000409980:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000416801:exon_27797650_27797752:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000490455:exon_27797650_27797970:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000396319:exon_27797650_27797752:TAX1BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	27809339	G/A	1	57	51	108	27.95750175986	25.9853931622306	1.9721085976294	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.772953895437062	ENSG00000106052:ENST00000265393:exon_27809295_27809453:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000433216:exon_27809298_27809453:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000409980:exon_27809295_27809453:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000416801:exon_27809295_27809450:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000396319:exon_27809295_27809453:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000494033:exon_27809297_27809453:TAX1BP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	30536681	A/G	1	176	128	304	86.3249177146553	65.2182416620689	21.1066760525865	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0159464241291101	ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30536237_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30536237_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000497601:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000433390:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30536249_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000426081:exon_30536400_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30536593_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30536618_30536851:GGCT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	32529936	G/C	1	51	65	116	25.0146068377694	33.1186383440193	-8.10403150624991	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.138034632782227	ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	32598656	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	32613020	A/G	1	30	36	66	14.7144746104526	18.3426304674569	-3.62815585700426	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.390864929541609	ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	32623477	C/G	1	14	21	35	6.86675481821122	10.6998677726832	-3.83311295447196	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.236924406593258	ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32623404_32628333:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32623404_32625778:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32623404_32623519:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32623404_32628323:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000470500:exon_32623404_32623779:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000467779:exon_32623404_32623818:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000497020:exon_32623404_32623714:AVL9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	38796570	G/A	1	16	20	36	7.84771979224139	10.1903502596983	-2.34263046745687	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.506012988700997	ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	38860809	G/T	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000413141:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000265745:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000414632:exon_38860803_38860865:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000418457:exon_38860803_38860865:VPS41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	43622806	T/C	1	44	30	74	21.5812294286638	15.2855253895474	6.29570403911644	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.162994834460197	ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	43830888	T/C	1	94	77	171	46.1053537794182	39.2328484998383	6.87250527957988	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.320175042771309	ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	43906544	C/T	1	143	130	273	70.1389956431574	66.2372766880387	3.90171895511875	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.671862082466085	ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	43916413	G/A	1	25	15	40	12.2620621753772	7.64276269477369	4.61929948060348	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.156839441077429	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	43916727	T/G	1	17	14	31	8.33820227925648	7.13324518178878	1.2049570974677	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.721617530563431	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	43917256	C/A	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	44005528	C/T	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	44099664	T/C	1	112	106	218	54.9340385456897	54.0088563764008	0.925182169288966	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.946016087469643	ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	44112873	G/T	1	17	18	35	8.33820227925648	9.17131523372843	-0.833112954471956	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.866252155786725	ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	44530193	T/G	1	35	28	63	17.166887045528	14.2664903635776	2.90039668195048	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.529150638661668	ENSG00000015676:ENST00000355451:exon_44530008_44530479:NUDCD3;ENSG00000015676:ENST00000464812:exon_44530008_44530205:NUDCD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	44608766	C/T	1	61	86	147	29.9194317079203	43.8185061167025	-13.8990744087822	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0256128712720187	ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000448192:exon_44608729_44608802:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44608729_44608802:DDX56
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	44611981	C/T	1	73	86	159	35.8052215521014	43.8185061167025	-8.01328456460116	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.205581527837163	ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44611946_44612036:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44611946_44612036:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44611946_44612036:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44611946_44612036:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44611946_44612036:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44611946_44612036:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44611946_44612036:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44611946_44612036:DDX56
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	44836314	A/G	1	30	28	58	14.7144746104526	14.2664903635776	0.447984246875047	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	48004962	C/T	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	48018376	G/A	1	24	33	57	11.7715796883621	16.8140779285021	-5.04249824014004	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.187945322206216	ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48018286_48018413:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48018286_48018413:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48018286_48018413:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48018286_48018413:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432627:exon_48018286_48018441:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000433977:exon_48018286_48018492:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000445133:exon_48018286_48018413:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000446009:exon_48018286_48018413:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000468868:exon_48018286_48018413:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000441837:exon_48018286_48018799:HUS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	48146639	A/G	1	14	23	37	6.86675481821122	11.718902798653	-4.85214798044178	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.138313322175768	ENSG00000183696:ENST00000331803:exon_48146470_48146679:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000457596:exon_48146470_48146679:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000341253:exon_48146470_48146679:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000395564:exon_48146470_48146679:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000395560:exon_48146470_48146679:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000444999:exon_48146470_48146679:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000482015:exon_48146470_48146679:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000417464:exon_48146470_48146679:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000495446:exon_48144243_48146679:UPP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	50513309	C/T	1	8	18	26	3.9238598961207	9.17131523372843	-5.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0488563641808063	ENSG00000132436:ENST00000395556:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000356889:exon_50511831_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451252:exon_50511834_50515055:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000451735:exon_50511834_50515078:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000433017:exon_50512175_50514995:FIGNL1;ENSG00000132436:ENST00000419119:exon_50512840_50514995:FIGNL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	64291991	T/A	1	35	38	73	17.166887045528	19.3616654934267	-2.19477844789865	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.640709830004845	ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	64863392	C/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	64864607	G/A	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	64864800	A/G	1	5	13	18	2.45241243507544	6.62372766880387	-4.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0593928969289689	ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	66774604	G/C	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000472361:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66774551_66774702:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000495164:exon_66774551_66774705:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66774551_66774702:STAG3L4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	72300332	G/A	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.16029643697287	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	73097948	G/C	1	24	23	47	11.7715796883621	11.718902798653	0.0526768897090903	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	73634371	T/G	1	9	19	28	4.41434238313578	9.68083274671335	-5.26649036357756	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0577845206608332	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	73634887	A/G	1	25	18	43	12.2620621753772	9.17131523372843	3.09074694164874	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.36412664614043	ENSG00000086730:ENST00000490586:exon_73634788_73634949:LAT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	73654360	T/G	1	35	38	73	17.166887045528	19.3616654934267	-2.19477844789865	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.640709830004845	ENSG00000049541:ENST00000352131:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000055077:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000493156:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000497430:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000470266:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000494019:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000480432:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000479105:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000491206:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000463194:exon_73654268_73654425:RFC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	73668612	G/A	1	37	34	71	18.1478520195582	17.323595441487	0.824256578071175	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.905714165851707	ENSG00000049541:ENST00000352131:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000055077:exon_73668601_73668774:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000493156:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000470266:exon_73668601_73668639:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000494019:exon_73668601_73668697:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000480432:exon_73668601_73668737:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000479105:exon_73668601_73668667:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000463194:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000473493:exon_73668601_73668706:RFC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	75583325	A/G	1	19	16	35	9.31916725328665	8.15228020775861	1.16688704552805	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.737500987101035	ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	75617320	G/A	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.726958585521877	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	75958912	G/A	1	37	40	77	18.1478520195582	20.3807005193965	-2.2328484998383	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.649294253234291	ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	76111835	G/A	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	76132805	C/G	1	14	8	22	6.86675481821122	4.0761401038793	2.79061471433191	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.288210295768078	ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000465488:exon_76132684_76132904:DTX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	76240762	A/G	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.289775626167224	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	76240773	T/C	1	13	8	21	6.37627233119613	4.0761401038793	2.30013222731683	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.385136200083102	ENSG00000146707:ENST00000454656:exon_76240771_76240908:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000310842:exon_76240771_76240908:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000441393:exon_76240771_76240944:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000424818:exon_76240771_76240908:POMZP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	76825986	G/A	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000127951:ENST00000248598:exon_76822688_76826302:FGL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	76941168	G/A	1	5	14	19	2.45241243507544	7.13324518178878	-4.68083274671335	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0382353432713789	ENSG00000186088:ENST00000491796:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000482866:exon_76940069_76941519:PION;ENSG00000186088:ENST00000441833:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000474686:exon_76941158_76941257:PION
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	77212895	T/C	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77212872_77212967:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000460731:exon_77212872_77213138:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000433369:exon_77212872_77212967:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77212872_77212967:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000418110:exon_77212872_77212967:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000522115:exon_77212872_77212967:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000440186:exon_77212872_77212967:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000447995:exon_77212870_77212967:PTPN12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	77256713	A/G	1	32	19	51	15.6954395844828	9.68083274671335	6.01460683776944	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0949084168335352	ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	77379002	A/G	1	36	41	77	17.6573695325431	20.8902180323814	-3.2328484998383	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.495051170447798	ENSG00000187257:ENST00000334955:exon_77378741_77379381:RSBN1L;ENSG00000187257:ENST00000445288:exon_77378741_77379381:RSBN1L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	77423574	G/A	1	36	35	71	17.6573695325431	17.833112954472	-0.175743421928821	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	89982132	T/C	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	89984409	A/G	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000474503:exon_89984400_89984544:GTPBP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91503228	C/T	1	23	12	35	11.281097201347	6.11421015581896	5.16688704552805	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0915549609393538	ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91503417	C/T	1	27	16	43	13.2430271494074	8.15228020775861	5.09074694164874	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.129236673408955	ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91503524	C/T	1	26	22	48	12.7525446623923	11.2093852856681	1.54315937672418	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.668204743201523	ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91503847	G/A	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000456229:exon_91503629_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000442961:exon_91503632_91504078:MTERF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91630620	G/T	1	78	74	152	38.2576339871768	37.7042959608836	0.553338026293225	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.935553251893213	ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91632013	T/C	1	10	16	26	4.90482487015087	8.15228020775861	-3.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.240919067564399	ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91691601	C/T	1	19	14	33	9.31916725328665	7.13324518178878	2.18592207149787	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.489468972263295	ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91713972	C/T	1	19	17	36	9.31916725328665	8.66179772074352	0.657369532543132	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.868798049474732	ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91726927	A/C	1	23	21	44	11.281097201347	10.6998677726832	0.581229428663828	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.881345604651725	ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	91743150	A/G	1	43	42	85	21.0907469416487	21.3997355453663	-0.308988603717605	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	92028039	C/A	1	21	22	43	10.3001322273168	11.2093852856681	-0.909253058351259	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.879043188605605	ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	92760738	T/G	1	58	44	102	28.447984246875	22.4187705713362	6.02921367553887	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.236601320420498	ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	92762681	A/G	1	17	17	34	8.33820227925648	8.66179772074352	-0.323595441487043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	92764068	C/T	1	14	11	25	6.86675481821122	5.60469264283404	1.26206217537718	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.691382994021232	ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	92764982	C/T	1	17	12	29	8.33820227925648	6.11421015581896	2.22399212343752	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.460635236646915	ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	92985252	T/C	1	8	12	20	3.9238598961207	6.11421015581896	-2.19035025969826	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.375838660756910	ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	95034775	G/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	97498470	G/C	1	70	51	121	34.3337740910561	25.9853931622306	8.34838092882553	A:C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.145572113597033	ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000495255:exon_97498220_97498496:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437657:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000448127:exon_97498220_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000451771:exon_97498371_97498491:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000414884:exon_97498384_97498491:ASNS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	97599510	G/A	1	16	13	29	7.84771979224139	6.62372766880387	1.22399212343752	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.712533292455687	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	97599515	T/C	1	19	13	32	9.31916725328665	6.62372766880387	2.69543958448279	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.379864034731394	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	98609987	G/A	1	33	30	63	16.1859220714979	15.2855253895474	0.900396681950481	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.899893152951549	ENSG00000196367:ENST00000359863:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000355540:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000446306:exon_98609694_98610866:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000456197:exon_98609694_98610866:TRRAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	98645517	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198742:ENST00000468960:exon_98645278_98645710:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000482799:exon_98645278_98645863:SMURF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99022785	G/A	1	11	5	16	5.39530735716596	2.54758756492456	2.84771979224139	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.211441030609945	ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99022418_99023239:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99022418_99023239:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99022418_99023239:RP5-900K19.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99096332	C/G	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000160908:ENST00000481881:exon_99095485_99096465:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000485576:exon_99096107_99096465:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000464401:exon_99096208_99096465:ZNF394
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99654600	A/G	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99661597	A/G	1	16	10	26	7.84771979224139	5.09517512984913	2.75254466239226	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.329230577261424	ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99661411_99662659:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99661411_99661602:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000379635:exon_99661411_99662659:ZSCAN21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99691393	G/A	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.218410376640568	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99704796	A/T	1	55	53	108	26.9765367858298	27.0044281882004	-0.0278914023706029	A:T:G	A	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99707712	A/G	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000106290:ENST00000487115:exon_99707700_99707897:TAF6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99717361	C/G	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99717318_99717464:TAF6;ENSG00000166997:ENST00000262932:exon_99717236_99717485:CNPY4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99751557	G/A	1	336	347	683	164.802115637069	176.802577005765	-12.0004613686956	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.358707443423923	ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99751490_99751826:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474141:exon_99751490_99751826:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99751473_99751826:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99751490_99751826:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99751023_99751633:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99751490_99751832:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99751473_99751826:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99751490_99751826:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488338:exon_99751490_99751826:C7orf59
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99798478	C/T	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000066923:ENST00000426455:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000394018:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000339784:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000379577:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000317296:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000496157:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000491498:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000440830:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000476057:exon_99798392_99798569:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000479359:exon_99798392_99798592:STAG3;ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99798283_99800226:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99798283_99800226:GATS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99950508	G/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000121716:ENST00000310771:exon_99950384_99950537:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000444874:exon_99950187_99950537:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422752:exon_99950384_99950537:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000420688:exon_99950187_99950746:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000452089:exon_99950187_99950537:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000493091:exon_99950187_99950746:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000457519:exon_99950187_99950537:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000448382:exon_99950187_99950746:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000443526:exon_99950187_99950537:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000419749:exon_99950384_99950537:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422808:exon_99950187_99950537:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000438028:exon_99950187_99950537:PILRB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	99997478	G/A	1	38	14	52	18.6383345065733	7.13324518178878	11.5050893247845	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00132093051484298	ENSG00000085514:ENST00000198536:exon_99997408_99997719:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000453419:exon_99997446_99997719:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000394000:exon_99997408_99997651:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000350573:exon_99997408_99997719:PILRA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100028187	C/T	1	18	12	30	8.82868476627157	6.11421015581896	2.71447461045261	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.364216682224569	ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100028484	T/C	1	20	15	35	9.80964974030174	7.64276269477369	2.16688704552805	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.502292925561721	ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100064719	A/G	1	127	116	243	62.2912758509161	59.1040315062499	3.18724434466614	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.7005859232433	ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100072031	T/C	1	72	64	136	35.3147390650863	32.6091208310344	2.70561823405183	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.668629316411072	ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100071411_100072063:TSC22D4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100151719	G/A	1	22	11	33	10.7906147143319	5.60469264283404	5.18592207149787	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0819396205938907	ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100151716_100151881:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100151716_100151881:AGFG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100160264	T/C	1	19	12	31	9.31916725328665	6.11421015581896	3.2049570974677	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.283751645573885	ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000429987:exon_100160217_100160305:AGFG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100175472	G/A	1	66	16	82	32.3718441429957	8.15228020775861	24.2195639352371	A:G	G	A	10	0.509517512984913	4.65472819558529e-08	ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100179955	G/A	1	33	37	70	16.1859220714979	18.8521479804418	-2.66622590894391	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.551535359739475	ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100179938_100180082:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100179938_100179973:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100179938_100180082:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100179938_100180082:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000470184:exon_100179664_100180076:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000485583:exon_100179761_100180082:LRCH4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100210597	A/C	1	6	12	18	2.94289492209052	6.11421015581896	-3.17131523372843	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.16029643697287	ENSG00000106330:ENST00000223054:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000462372:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000490309:exon_100210353_100210892:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000493970:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000379527:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393950:exon_100210133_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000424091:exon_100210179_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393953:exon_100210487_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000497456:exon_100210438_100210619:MOSPD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100280624	G/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100285888	C/T	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100285827_100287071:GIGYF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100454700	G/T	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100454490_100454798:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100454490_100454798:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100454490_100454798:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100454490_100454798:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100454490_100454798:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100453063_100454798:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100454241_100454798:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100454416_100456564:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000497958:exon_100454652_100454798:SLC12A9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100463999	C/T	1	50	41	91	24.5241243507543	20.8902180323814	3.63390631837292	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.464552195192172	ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100463341_100464630:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100463341_100464631:SLC12A9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100468284	A/G	1	87	72	159	42.6719763703126	36.6852609349137	5.98671543539884	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.382991390765177	ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100481823	A/C	1	51	47	98	25.0146068377694	23.9473231102909	1.06728372747853	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.84061944140319	ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481691_100481860:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481691_100481860:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481691_100481860:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481691_100481860:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000423692:exon_100481691_100481860:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481691_100481860:SRRT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100482050	G/C	1	70	74	144	34.3337740910561	37.7042959608836	-3.37052186982747	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.617236838934531	ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100482140	C/T	1	192	180	372	94.1726375068967	91.7131523372843	2.45948516961236	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.835712656747928	ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100482934	C/T	1	86	80	166	42.1814938832975	40.761401038793	1.42009284450445	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.876689874334474	ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100482834_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100482837_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100482837_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100482834_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000460194:exon_100482837_100483208:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100482834_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000449389:exon_100482916_100482991:SRRT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100483888	C/T	1	128	110	238	62.7817583379311	56.0469264283404	6.73483190959071	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.399672750211726	ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100483868_100484056:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100483868_100484056:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100483868_100484056:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100483868_100484056:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100483868_100484056:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000449389:exon_100483868_100484056:SRRT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100484893	C/T	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.581964647177154	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100486110	C/T	1	219	212	431	107.415664656304	108.017712752802	-0.602048096497498	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.961609408831603	ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100487748	C/T	1	4	10	14	1.96192994806035	5.09517512984913	-3.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.112356383277526	ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100487615_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100487615_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100487615_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100487616_100488709:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100487616_100487956:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100487618_100487956:ACHE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100490077	G/A	1	13	6	19	6.37627233119613	3.05710507790948	3.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.168530333768717	ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100489955_100490175:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100489955_100490264:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100489955_100490439:ACHE
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100730992	C/T	1	4	11	15	1.96192994806035	5.60469264283404	-3.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0719999094721795	ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56;ENSG00000169871:ENST00000412507:exon_100730593_100731409:TRIM56
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100731112	C/T	1	9	6	15	4.41434238313578	3.05710507790948	1.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.608233857673691	ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56;ENSG00000169871:ENST00000412507:exon_100730593_100731409:TRIM56
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100850144	G/A	1	22	11	33	10.7906147143319	5.60469264283404	5.18592207149787	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0819396205938907	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850060_100850185:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100850060_100850185:PLOD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100850908	G/A	1	18	10	28	8.82868476627157	5.09517512984913	3.73350963642244	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.187163218330294	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850859_100851005:PLOD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100853714	G/A	1	22	22	44	10.7906147143319	11.2093852856681	-0.418770571336172	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000487563:exon_100853374_100853720:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000460132:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000440925:exon_100853612_100853725:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000466881:exon_100853637_100853725:PLOD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100855823	G/A	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100855877	G/A	1	14	15	29	6.86675481821122	7.64276269477369	-0.776007876562477	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.853530678106061	ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100855825_100855936:PLOD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100861452	T/C	1	18	10	28	8.82868476627157	5.09517512984913	3.73350963642244	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.187163218330294	ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100861475	C/T	1	76	59	135	37.2766690131466	30.0615332661099	7.21513574703675	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.228597551740324	ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000492315:exon_100861462_100861498:ZNHIT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100867240	G/A	1	209	200	409	102.510839786153	101.903502596983	0.607337189170579	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.960595219831097	ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100867218_100867471:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000485387:exon_100867218_100867471:ZNHIT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	100888322	T/C	1	46	60	106	22.562194402694	30.5710507790948	-8.00885637640078	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.121370038470824	ENSG00000214253:ENST00000449367:exon_100888241_100888356:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000442303:exon_100888179_100888329:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000223136:exon_100888241_100888366:FIS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	101944171	G/T	1	12	26	38	5.88578984418104	13.2474553376077	-7.36166549342669	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0219911160616398	ENSG00000160999:ENST00000444095:exon_101943806_101944563:SH2B2;ENSG00000160999:ENST00000306803:exon_101943835_101944563:SH2B2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	102020870	A/G	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.351554313902114	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	102036877	T/G	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000128563:ENST00000496391:exon_102036424_102036984:PRKRIP1;ENSG00000128563:ENST00000397912:exon_102036810_102036984:PRKRIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	102087202	T/C	1	22	20	42	10.7906147143319	10.1903502596983	0.600264454633654	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.878542192032311	ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	102106306	A/G	1	19	13	32	9.31916725328665	6.62372766880387	2.69543958448279	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.379864034731394	ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000464107:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000476270:exon_102105979_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102106264_102106498:LRWD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	102112705	G/T	1	17	14	31	8.33820227925648	7.13324518178878	1.2049570974677	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.721617530563431	ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112665_102112756:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112665_102112756:LRWD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	102113191	C/T	1	42	50	92	20.6002644546337	25.4758756492457	-4.875611194612	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.348197664309894	ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102113139_102113251:LRWD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	102114087	C/T	1	26	47	73	12.7525446623923	23.9473231102909	-11.1947784478986	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00973449344548725	ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	103844599	T/A	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000164815:ENST00000297431:exon_103844590_103844682:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000422497:exon_103844590_103844682:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000447452:exon_103844590_103844682:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000485726:exon_103844590_103844682:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000448563:exon_103844590_103844682:ORC5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	105177041	A/T	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000135249:ENST00000257700:exon_105177012_105177196:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000467392:exon_105177012_105177059:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000482041:exon_105177012_105177196:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000497979:exon_105177012_105177059:RINT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	107569517	A/G	1	9	13	22	4.41434238313578	6.62372766880387	-2.20938528566809	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.397671659769065	ENSG00000091136:ENST00000472714:exon_107569509_107570422:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000393561:exon_107569509_107569650:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000412968:exon_107569509_107569650:LAMB1;ENSG00000091136:ENST00000222399:exon_107569509_107569650:LAMB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	108112834	G/A	1	22	22	44	10.7906147143319	11.2093852856681	-0.418770571336172	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108110866_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108111999_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108112069_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108112071_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108112071_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108112105_108113119:PNPLA8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	108137932	C/T	1	6	17	23	2.94289492209052	8.66179772074352	-5.718902798653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0206563045334984	ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453085:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000483879:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000476592:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000462466:exon_108137927_108138021:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000489738:exon_108137925_108138021:PNPLA8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	108212353	G/A	1	18	11	29	8.82868476627157	5.60469264283404	3.22399212343752	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.267449151143263	ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	111161468	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000184903:ENST00000405709:exon_111161369_111161505:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000331762:exon_111161369_111161505:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000452895:exon_111161369_111161505:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000415362:exon_111161369_111161503:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000447215:exon_111161369_111161505:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000437687:exon_111161369_111161503:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000492938:exon_111161369_111161505:IMMP2L;ENSG00000184903:ENST00000452753:exon_111161369_111161505:IMMP2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	112407236	C/T	1	26	12	38	12.7525446623923	6.11421015581896	6.63833450657331	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0347609002828426	ENSG00000146802:ENST00000312814:exon_112405787_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000454074:exon_112407140_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000447395:exon_112407191_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000418785:exon_112407230_112407799:TMEM168
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	115897392	G/C	1	47	46	93	23.0526768897091	23.437805597306	-0.385128707596905	C:G	G	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	120428799	C/A	1	21	12	33	10.3001322273168	6.11421015581896	4.18592207149787	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.165267760206332	ENSG00000106025:ENST00000222747:exon_120427376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000450414:exon_120428376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000415871:exon_120428428_120428951:TSPAN12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	128582267	C/T	1	32	56	88	15.6954395844828	28.5329807271551	-12.8375411426723	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00737515235473371	ENSG00000128604:ENST00000489702:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000488569:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000477535:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000453794:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000479582:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000464557:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473787:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000467002:exon_128582125_128582313:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128582125_128582330:IRF5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	128582309	C/T	1	53	116	169	25.9955718117996	59.1040315062499	-33.1084596944503	T:C	C	T	10	0.509517512984913	2.90290999440063e-07	ENSG00000128604:ENST00000489702:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000488569:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000477535:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000453794:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000479582:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000464557:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473787:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000467002:exon_128582125_128582313:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128582125_128582330:IRF5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	128587740	C/T	1	4	11	15	1.96192994806035	5.60469264283404	-3.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0719999094721795	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	128607384	G/A	1	44	59	103	21.5812294286638	30.0615332661099	-8.48030383744604	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.114404010430737	ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	128615897	C/A	1	18	24	42	8.82868476627157	12.2284203116379	-3.39973554536635	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.354816492678567	ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128615873_128615989:TNPO3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	129664312	T/C	1	17	24	41	8.33820227925648	12.2284203116379	-3.89021803238143	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.274300665161299	ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	133749164	G/A	1	16	14	30	7.84771979224139	7.13324518178878	0.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.856318725452094	ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	134135610	G/A	1	45	28	73	22.0717119156789	14.2664903635776	7.80522155210135	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0786955508124817	ENSG00000085662:ENST00000285930:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000434222:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000465351:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000498771:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000458165:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000487438:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000489022:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000491741:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000497983:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000484592:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000467829:exon_134135538_134135654:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000426422:exon_134135538_134135709:AKR1B1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	135279315	A/C	1	9	2	11	4.41434238313578	1.01903502596983	3.39530735716596	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.065955266796108	ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135279295_135279477:NUP205
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	135635404	A/G	1	15	8	23	7.35723730522631	4.0761401038793	3.281097201347	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.211944052448733	ENSG00000105887:ENST00000393085:exon_135635347_135635430:MTPN;ENSG00000105887:ENST00000356707:exon_135635347_135635430:MTPN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	138738204	G/A	1	10	4	14	4.90482487015087	2.03807005193965	2.86675481821122	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.180671884464811	ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139316360	C/T	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139316348_139316471:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139316348_139316471:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139316348_139316471:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139316348_139316471:HIPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139415775	G/C	1	10	8	18	4.90482487015087	4.0761401038793	0.828684766271566	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.81513336080211	ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139415868	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139661802	G/A	1	13	26	39	6.37627233119613	13.2474553376077	-6.87118300641161	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0361336889289514	ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000469630:exon_139661718_139662850:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000494876:exon_139661718_139662035:TBXAS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139724358	G/A	1	28	35	63	13.7335096364224	17.833112954472	-4.09960331804952	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.315789624211907	ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139724555	C/T	1	15	24	39	7.35723730522631	12.2284203116379	-4.87118300641161	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.148872323082175	ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139726176	G/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139727135	G/A	1	13	12	25	6.37627233119613	6.11421015581896	0.262062175377175	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139741573	G/A	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139741444_139741639:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139741444_139741639:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139741444_139741639:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000493262:exon_139741179_139741639:PARP12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	139746763	A/G	1	10	3	13	4.90482487015087	1.52855253895474	3.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0930441887974304	ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139746684_139746807:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000493262:exon_139746684_139746807:PARP12
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	140373326	A/G	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	140373502	C/T	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	140374049	T/C	1	11	3	14	5.39530735716596	1.52855253895474	3.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.057993110530478	ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140373619_140374063:ADCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	140374431	C/T	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140374411_140374557:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140374411_140374557:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140374411_140374557:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000498423:exon_140374284_140374557:ADCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	140380884	G/T	1	15	12	27	7.35723730522631	6.11421015581896	1.24302714940735	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.702512858193323	ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000498423:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000473512:exon_140380842_140380937:ADCK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	142495126	G/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	142495127	G/T	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.171917444065472	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	142495156	T/G	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.303085077368447	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	142498813	G/A	1	21	45	66	10.3001322273168	22.9282880843211	-12.6281558570043	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00195290198742092	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	142499071	T/C	1	12	14	26	5.88578984418104	7.13324518178878	-1.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.69695410034444	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	143001870	G/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_143001767_143001876:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000350623:exon_143001767_143001876:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_143001767_143001876:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000472067:exon_143001767_143001876:CASP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	143002171	C/T	1	9	11	20	4.41434238313578	5.60469264283404	-1.19035025969826	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.658646754336375	ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_143002033_143004789:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_143002033_143002915:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000472067:exon_143002033_143003662:CASP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	144077171	G/A	1	4	15	19	1.96192994806035	7.64276269477369	-5.68083274671335	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0105294628979665	ENSG00000050327:ENST00000056217:exon_144076992_144077725:ARHGEF5;ENSG00000050327:ENST00000344879:exon_144076992_144077721:ARHGEF5;ENSG00000050327:ENST00000474817:exon_144076992_144077724:ARHGEF5;ENSG00000050327:ENST00000471847:exon_144076992_144077725:ARHGEF5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	148496375	C/T	1	80	77	157	39.238598961207	39.2328484998383	0.0057504613686632	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000055130:ENST00000409469:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000325222:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000433865:exon_148496367_148496480:CUL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	148506363	T/G	1	10	14	24	4.90482487015087	7.13324518178878	-2.22842031163791	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.417429937527804	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	148700849	C/T	1	207	273	480	101.529874812123	139.098281044881	-37.5684062327582	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.000609659780882648	ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	148708965	G/T	1	130	120	250	63.7627233119613	61.1421015581896	2.62062175377175	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.752147631143839	ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148708938_148709096:PDIA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	148712118	G/A	1	59	68	127	28.9384667338901	34.6471908829741	-5.70872414908395	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.329565353826335	ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148711996_148712134:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148711996_148712134:PDIA4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	148978636	C/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000204946:ENST00000434415:exon_148978596_148982082:ZNF783
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	149129893	C/G	1	17	13	30	8.33820227925648	6.62372766880387	1.71447461045261	T:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.586721038583829	ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	149430746	A/G	1	16	9	25	7.84771979224139	4.58565761686422	3.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.231638601158395	ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149430295_149431136:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149430295_149431660:KRBA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	149576735	C/T	1	24	34	58	11.7715796883621	17.323595441487	-5.55201575312496	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.150714094702722	ENSG00000171130:ENST00000421974:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000456496:exon_149576424_149577782:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000425642:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000307445:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000429743:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000479613:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000471877:exon_149576424_149577783:ATP6V0E2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150034184	T/C	1	16	11	27	7.84771979224139	5.60469264283404	2.24302714940735	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.444316864047377	ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150034378	A/G	1	15	9	24	7.35723730522631	4.58565761686422	2.77157968836209	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.309571402085472	ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150068371	T/C	1	37	42	79	18.1478520195582	21.3997355453663	-3.25188352580813	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500439825297124	ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150094851	A/G	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150094853	G/A	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150171710	T/C	1	3	24	27	1.47144746104526	12.2284203116379	-10.7569728505926	T:C	T	C	10	0.509517512984913	2.07152378236373e-05	ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150171100_150171726:GIMAP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150174416	C/T	1	16	5	21	7.84771979224139	2.54758756492456	5.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0271669342424189	ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150174180_150176480:GIMAP8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150389593	T/C	1	56	45	101	27.4670192728449	22.9282880843211	4.53873118852379	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.372567917233755	ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150389677	G/C	1	37	45	82	18.1478520195582	22.9282880843211	-4.78043606476287	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.320739507969316	ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150389856	A/G	1	41	36	77	20.1097819676186	18.3426304674569	1.7671515001617	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.733032123989427	ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150417677	G/A	1	25	7	32	12.2620621753772	3.56662259089439	8.69543958448278	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00222380256075949	ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150439650	G/A	1	24	34	58	11.7715796883621	17.323595441487	-5.55201575312496	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.150714094702722	ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150761680	C/A	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150763655	T/A	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150763604_150763848:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150763604_150763848:SLC4A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150771423	G/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150771126_150771928:SLC4A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150771893	C/T	1	17	23	40	8.33820227925648	11.718902798653	-3.38070051939652	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.343130626071081	ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150771126_150771928:SLC4A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150772384	C/T	1	15	11	26	7.35723730522631	5.60469264283404	1.75254466239226	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.559070639223353	ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150772342_150772399:SLC4A2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150815630	C/T	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000133612:ENST00000463381:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335355:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000428334:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397232:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000473312:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000479901:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397238:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335367:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000467724:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000468796:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000480106:exon_150815561_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000498559:exon_150815381_150815719:AGAP3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150905101	G/C	1	5	15	20	2.45241243507544	7.64276269477369	-5.19035025969826	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0242916211695007	ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150904923_150905193:ABCF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150931268	C/G	1	38	35	73	18.6383345065733	17.833112954472	0.805221552101354	A:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.907021999881215	ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150934975	C/G	1	48	37	85	23.5431593767242	18.8521479804418	4.69101139628239	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.330043011118779	ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	150936219	C/T	1	5	11	16	2.45241243507544	5.60469264283404	-3.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.136942032485751	ENSG00000082014:ENST00000496530:exon_150935850_150936242:SMARCD3;ENSG00000082014:ENST00000392811:exon_150936059_150936242:SMARCD3;ENSG00000082014:ENST00000262188:exon_150936059_150936242:SMARCD3;ENSG00000082014:ENST00000347683:exon_150936059_150936242:SMARCD3;ENSG00000082014:ENST00000469154:exon_150936060_150936242:SMARCD3;ENSG00000082014:ENST00000356800:exon_150936062_150936242:SMARCD3;ENSG00000082014:ENST00000472789:exon_150936067_150936832:SMARCD3;ENSG00000082014:ENST00000470588:exon_150936094_150936242:SMARCD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	151064064	C/T	1	24	23	47	11.7715796883621	11.718902798653	0.0526768897090903	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	151845989	C/T	1	10	6	16	4.90482487015087	3.05710507790948	1.84771979224139	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.455825155299284	ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151845118_151846237:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151845118_151846237:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151845118_151846237:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151845118_151846237:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151845118_151846237:MLL3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	154767634	A/C	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000475066:exon_154767406_154768041:PAXIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	154774962	T/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154774929_154775042:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154774929_154775042:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154774929_154775042:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154774929_154775042:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154774929_154775042:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154774929_154775042:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000475066:exon_154774929_154775454:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000419436:exon_154774929_154775042:PAXIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	156761818	G/A	1	22	12	34	10.7906147143319	6.11421015581896	4.67640455851296	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.123738258699209	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	156762224	G/C	1	22	19	41	10.7906147143319	9.68083274671335	1.10978196761857	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.756996336009118	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	156762248	G/A	1	23	23	46	11.281097201347	11.718902798653	-0.437805597305996	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	157000176	T/C	1	18	17	35	8.82868476627157	8.66179772074352	0.166887045528044	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	158528233	A/G	1	21	9	30	10.3001322273168	4.58565761686422	5.71447461045261	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0438904046360645	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	158528254	G/A	1	31	7	38	15.2049570974677	3.56662259089439	11.6383345065733	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000128179012340989	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	158528269	C/G	1	35	8	43	17.166887045528	4.0761401038793	13.0907469416487	C:G	C	G	10	0.509517512984913	4.74608310046582e-05	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	158534372	G/A	1	20	10	30	9.80964974030174	5.09517512984913	4.71447461045261	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.100561877913583	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	158534381	G/C	1	17	10	27	8.33820227925648	5.09517512984913	3.24302714940735	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.250108755096081	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	158536267	T/C	1	18	14	32	8.82868476627157	7.13324518178878	1.69543958448278	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.598757235104772	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	158536345	A/G	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	7	158734813	C/T	0	8	0	8	3.9238598961207	0	3.9238598961207	C	C		10	0.509517512984913	0.00789183197843022	ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158734616_158734839:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158734616_158734839:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158734616_158734839:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000467220:exon_158734616_158734839:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000454771:exon_158734616_158734839:WDR60
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	618647	T/G	1	39	56	95	19.1288169935884	28.5329807271551	-9.40416373356673	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.0642172102798032	ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	618777	G/A	1	61	34	95	29.9194317079203	17.323595441487	12.5958362664333	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0101771739864324	ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	623748	C/T	1	79	66	145	38.7481164741919	33.6281558570043	5.11996061718762	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.407251529687903	ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	1719494	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	ENSG00000182372:ENST00000331222:exon_1719098_1719763:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000520991:exon_1719098_1719733:CLN8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	6272399	G/T	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6272286_6272404:MCPH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	6299641	G/A	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6299588_6299677:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6299588_6299677:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6299588_6299677:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6299588_6299677:MCPH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	6302671	C/T	1	26	11	37	12.7525446623923	5.60469264283404	7.14785201955822	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0208965444278764	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	6302971	C/T	1	24	36	60	11.7715796883621	18.3426304674569	-6.57105077909478	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0944181528346641	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	6390027	A/G	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.218410376640568	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8175868	C/T	1	18	14	32	8.82868476627157	7.13324518178878	1.69543958448278	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.598757235104772	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8176051	G/A	1	21	8	29	10.3001322273168	4.0761401038793	6.22399212343752	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0248508913979050	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8176540	C/T	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8234077	G/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8234714	C/T	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8654898	C/T	1	26	22	48	12.7525446623923	11.2093852856681	1.54315937672418	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.668204743201523	ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000521881:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520715:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520091:exon_8654875_8655001:MFHAS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8869181	T/C	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000104626:ENST00000523898:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000250263:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000519292:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520684:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520332:exon_8869173_8869262:ERI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8869199	T/G	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000104626:ENST00000523898:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000250263:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000519292:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520684:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520332:exon_8869173_8869262:ERI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	8887367	G/C	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000104626:ENST00000523898:exon_8887302_8890848:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000250263:exon_8887302_8890848:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000519292:exon_8887302_8887591:ERI1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	9413893	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000522110:exon_9413442_9416341:TNKS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	9413971	A/C	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000173273:ENST00000520408:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000310430:exon_9413424_9414122:TNKS;ENSG00000173273:ENST00000522110:exon_9413442_9416341:TNKS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	9627791	A/G	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	11180288	G/C	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000104643:ENST00000221086:exon_11180134_11185646:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000530200:exon_11180134_11182036:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000526292:exon_11180134_11180566:MTMR9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	11660362	T/C	1	187	151	338	91.7202250718213	76.9371444607219	14.7830806110994	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.114608961948009	ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	11683622	T/C	1	151	175	326	74.0628555392781	89.1655647723598	-15.1027092330816	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0967150620826888	ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	11683653	T/C	1	173	185	358	84.8534702536101	94.2607399022089	-9.40726964859884	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.341380470486425	ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	11704650	C/T	1	14	11	25	6.86675481821122	5.60469264283404	1.26206217537718	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.691382994021232	ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526481:exon_11704615_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530624:exon_11704561_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11704602_11704677:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530290:exon_11704626_11704677:CTSB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	11705282	G/A	1	10	20	30	4.90482487015087	10.1903502596983	-5.28552538954739	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.066896011304131	ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11705188_11705299:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526481:exon_11705188_11705340:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530290:exon_11705188_11705331:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11705188_11705331:CTSB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	11705637	T/C	1	21	13	34	10.3001322273168	6.62372766880387	3.67640455851296	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.232353878025532	ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11705576_11706212:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530624:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530290:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11705576_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11705583_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11705598_11705661:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11705613_11705661:CTSB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	12586753	A/G	1	9	12	21	4.41434238313578	6.11421015581896	-1.69986777268317	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.517009848590153	ENSG00000154359:ENST00000398246:exon_12586683_12586841:LONRF1;ENSG00000154359:ENST00000284538:exon_12586683_12586841:LONRF1;ENSG00000154359:ENST00000524526:exon_12586683_12586841:LONRF1;ENSG00000154359:ENST00000526680:exon_12586683_12586841:LONRF1;ENSG00000154359:ENST00000525024:exon_12586683_12586896:LONRF1;ENSG00000154359:ENST00000533751:exon_12586683_12586841:LONRF1;ENSG00000154359:ENST00000526610:exon_12586683_12586841:LONRF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	17094849	T/C	1	38	34	72	18.6383345065733	17.323595441487	1.31473906508626	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.814025103796652	ENSG00000198791:ENST00000361272:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000439921:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000523917:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000519954:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000519918:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000522062:exon_17094721_17095104:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000524358:exon_17094751_17094882:CNOT7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	17794792	G/A	1	13	20	33	6.37627233119613	10.1903502596983	-3.81407792850213	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.223320051652451	ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518936:exon_17794643_17794830:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17794685_17794888:PCM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	17817553	G/T	1	25	28	53	12.2620621753772	14.2664903635776	-2.00442818820039	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.586388472211134	ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	17820758	G/T	1	22	17	39	10.7906147143319	8.66179772074352	2.12881699358839	T:C:G	G	T	10	0.509517512984913	0.525347987196032	ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	17918934	A/G	1	55	47	102	26.9765367858298	23.9473231102909	3.02921367553888	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.554372400814737	ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000521542:exon_17918886_17919383:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518746:exon_17918909_17918967:ASAH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	17927327	T/C	1	52	52	104	25.5050893247845	26.4949106752155	-0.989821350430951	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.921934639238043	ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	17928811	C/T	1	45	56	101	22.0717119156789	28.5329807271551	-6.46126881147621	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.232225449396089	ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	17942204	C/T	1	4	9	13	1.96192994806035	4.58565761686422	-2.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.172212987139949	ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17942185_17942477:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17942185_17942494:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520051:exon_17942096_17942453:ASAH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	21766900	G/A	1	21	15	36	10.3001322273168	7.64276269477369	2.65736953254313	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.408107531503021	ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	21862551	A/G	1	26	25	51	12.7525446623923	12.7379378246228	0.0146068377694366	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	22106564	G/A	1	35	37	72	17.166887045528	18.8521479804418	-1.68526093491374	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.724580036619648	ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22106557_22106822:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22106557_22106822:POLR3D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	22428708	A/G	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22428423_22428734:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517962:exon_22428457_22428734:SORBS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	22442661	A/G	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000120913:ENST00000456545:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000308354:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397760:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000339162:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000381194:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000452226:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000397761:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000436754:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000426493:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000429812:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409141:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000265810:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000409417:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000416159:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000448520:exon_22442530_22442675:PDLIM2;ENSG00000120913:ENST00000491330:exon_22442530_22442675:PDLIM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	22473224	T/C	1	38	32	70	18.6383345065733	16.3045604155172	2.33377409105609	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.633139350099399	ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	22473281	C/G	1	41	38	79	20.1097819676186	19.3616654934267	0.748116474191875	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.910651156334062	ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	22481449	A/G	1	42	28	70	20.6002644546337	14.2664903635776	6.33377409105609	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.151243549494373	ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	22874892	A/G	1	17	14	31	8.33820227925648	7.13324518178878	1.2049570974677	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.721617530563431	ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22874765_22875954:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22874765_22877705:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22874765_22877712:RHOBTB2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	23116325	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000147457:ENST00000397677:exon_23116245_23116343:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000313219:exon_23116245_23116343:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000517325:exon_23116245_23116343:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000442460:exon_23116245_23116343:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000519503:exon_23116245_23116343:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000523091:exon_23116245_23116343:CHMP7;ENSG00000147457:ENST00000520102:exon_23116245_23116343:CHMP7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	23290451	C/T	1	12	15	27	5.88578984418104	7.64276269477369	-1.75697285059265	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.566049825319431	ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23286665_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522255:exon_23290159_23290667:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23290439_23290667:ENTPD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	23292985	A/G	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000197217:ENST00000518471:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000521321:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23292905_23292990:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522913:exon_23292905_23292990:ENTPD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	23294656	T/C	1	13	3	16	6.37627233119613	1.52855253895474	4.84771979224139	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0216334111655343	ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000522913:exon_23294447_23294666:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27255080	A/G	1	56	39	95	27.4670192728449	19.8711830064116	7.59583626643327	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.124602790914549	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27255128	T/C	1	55	32	87	26.9765367858298	16.3045604155172	10.6719763703126	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0241120729391364	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27255146	G/A	1	63	32	95	30.9003966819505	16.3045604155172	14.5958362664333	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00281311132620141	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27255263	A/G	1	67	39	106	32.8623266300108	19.8711830064116	12.9911436235992	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0115798075996275	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27308585	A/C	1	170	173	343	83.3820227925648	88.1465297463899	-4.76450695382515	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.627104406027935	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27311703	T/C	1	145	131	276	71.1199606171876	66.7467942010236	4.37316641616401	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.630193614114368	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27315876	A/G	1	332	224	556	162.840185689009	114.131922908621	48.7082627803884	A:G	A	G	10	0.509517512984913	3.73191765479226e-05	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27315900	A/G	1	359	242	601	176.083212838416	123.303238142349	52.7799746960673	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1.75626833780288e-05	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27358505	A/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518328:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000520623:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27358481_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000520666:exon_27358445_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521684:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000523827:exon_27358443_27358527:EPHX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27401964	A/C	1	22	4	26	10.7906147143319	2.03807005193965	8.75254466239226	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.000563906724069218	ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27401961_27403081:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521780:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27401961_27402430:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27401961_27402436:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27401961_27402409:EPHX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27667969	C/G	1	16	24	40	7.84771979224139	12.2284203116379	-4.38070051939652	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.205573186077484	ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	27886903	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000189233:ENST00000413272:exon_27886783_27886919:C8orf80;ENSG00000189233:ENST00000341513:exon_27886783_27886919:C8orf80
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	28321153	A/G	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.103192530786195	ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28321129_28321182:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000517436:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000517673:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518016:exon_28321129_28321335:FBXO16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	28321174	G/A	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28321129_28321182:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000517436:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000517673:exon_28321129_28321335:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518016:exon_28321129_28321335:FBXO16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	28384979	T/G	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	30999280	G/T	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	31024654	T/C	1	19	18	37	9.31916725328665	9.17131523372843	0.14785201955822	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	37623842	C/T	1	28	32	60	13.7335096364224	16.3045604155172	-2.57105077909478	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.521322739558746	ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000520073:exon_37623798_37624259:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523358:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523187:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000518036:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523994:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37623798_37623873:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523521:exon_37623798_37623873:PROSC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	37728017	A/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	37728019	T/G	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	37963239	C/T	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	38103239	T/A	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.171917444065472	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	41530164	A/G	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.335103331122344	ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41530034_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41529872_41530430:ANK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	41547748	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41547745_41547864:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41547745_41547803:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41547745_41547864:ANK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	53537316	A/G	1	16	15	31	7.84771979224139	7.64276269477369	0.204957097467697	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	53555069	A/G	1	21	22	43	10.3001322273168	11.2093852856681	-0.909253058351259	A:C:G	A	G	10	0.509517512984913	0.879043188605605	ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	54965220	G/A	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000120992:ENST00000316963:exon_54965215_54965316:LYPLA1;ENSG00000120992:ENST00000343231:exon_54965215_54965316:LYPLA1;ENSG00000120992:ENST00000521171:exon_54965215_54965316:LYPLA1;ENSG00000120992:ENST00000519272:exon_54965215_54965316:LYPLA1;ENSG00000120992:ENST00000520718:exon_54965215_54965458:LYPLA1;ENSG00000120992:ENST00000518546:exon_54965215_54965316:LYPLA1;ENSG00000120992:ENST00000519891:exon_54965215_54965316:LYPLA1;ENSG00000120992:ENST00000521352:exon_54965214_54965316:LYPLA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	56686224	T/C	1	13	8	21	6.37627233119613	4.0761401038793	2.30013222731683	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.385136200083102	ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56685701_56686278:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56686029_56686278:TGS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	56698935	A/G	1	45	46	91	22.0717119156789	23.437805597306	-1.36609368162708	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.834106480871803	ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56698797_56699619:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56698797_56699619:TGS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	56708701	T/C	1	10	9	19	4.90482487015087	4.58565761686422	0.319167253286653	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56708537_56708711:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56708537_56708711:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000519494:exon_56708537_56708711:TGS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	56723557	T/G	1	13	13	26	6.37627233119613	6.62372766880387	-0.247455337607738	T:G	T	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56723440_56723656:TGS1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	56866452	G/A	1	50	60	110	24.5241243507543	30.5710507790948	-6.04692642834043	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.254092110424946	ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	59508134	T/C	1	7	11	18	3.43337740910561	5.60469264283404	-2.17131523372843	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.351554313902114	ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523177:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59508119_59508218:NSMAF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	61749400	C/T	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61749376_61749571:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61749376_61749571:CHD7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	61778288	C/T	1	24	19	43	11.7715796883621	9.68083274671335	2.09074694164874	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.545539155211247	ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61777575_61779465:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61777575_61779463:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61777575_61779033:CHD7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	67592152	T/C	1	11	14	25	5.39530735716596	7.13324518178878	-1.73793782462282	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.551370177868751	ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	71508553	T/C	1	22	33	55	10.7906147143319	16.8140779285021	-6.02346321417022	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.107609118173535	ENSG00000067167:ENST00000521425:exon_71508498_71508556:TRAM1;ENSG00000067167:ENST00000262213:exon_71508498_71508556:TRAM1;ENSG00000067167:ENST00000520700:exon_71508498_71508556:TRAM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	74204898	G/A	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	74893419	C/G	1	82	83	165	40.2195639352371	42.2899535777478	-2.07038964251065	A:C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.75606746732709	ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	74893821	A/G	1	177	77	254	86.8154002016704	39.2328484998383	47.5825517018321	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1.65668879775017e-09	ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	74893850	C/G	1	110	81	191	53.9530735716596	41.270918551778	12.6821550198816	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0704269601380115	ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	80942321	C/G	1	64	83	147	31.3908791689656	42.2899535777478	-10.8990744087822	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0829007505020957	ENSG00000147586:ENST00000276585:exon_80942271_80942506:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000521605:exon_80942271_80942524:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000518271:exon_80942289_80942467:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000522987:exon_80942289_80942489:MRPS28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	86389403	T/C	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	86393069	T/C	1	19	4	23	9.31916725328665	2.03807005193965	7.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00270162241391416	ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86392899_86393693:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86392899_86393115:CA2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	87519315	T/G	1	37	42	79	18.1478520195582	21.3997355453663	-3.25188352580813	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.500439825297124	ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	87540872	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87540754_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523001:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517771:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523469:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000522240:exon_87540764_87540905:CPNE3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	90770315	C/T	1	10	11	21	4.90482487015087	5.60469264283404	-0.699867772683173	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.829230428176545	ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	90937198	G/C	1	26	24	50	12.7525446623923	12.2284203116379	0.52412435075435	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.888737440394932	ENSG00000164823:ENST00000297438:exon_90936731_90940096:OSGIN2;ENSG00000164823:ENST00000451899:exon_90936731_90940116:OSGIN2;ENSG00000164823:ENST00000421531:exon_90936731_90940096:OSGIN2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	94746698	G/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	95531419	T/C	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	95538468	T/C	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	97270825	T/C	1	26	21	47	12.7525446623923	10.6998677726832	2.05267688970909	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.563413221735493	ENSG00000156469:ENST00000523821:exon_97270585_97270928:MTERFD1;ENSG00000156469:ENST00000287025:exon_97270585_97270928:MTERFD1;ENSG00000156469:ENST00000517720:exon_97270716_97270928:MTERFD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	99101380	A/C	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000177459:ENST00000318528:exon_99101304_99102257:C8orf47
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	99146809	C/T	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.264915529576399	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99146700_99146887:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99146700_99146887:POP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	99153088	A/C	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	A:C	A	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	100899793	G/A	1	1621	1458	3079	795.072111451456	742.876533932003	52.195577519453	A:T:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0608464177278187	ENSG00000164919:ENST00000522934:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520517:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520468:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000297564:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000520271:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000517682:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000524245:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000522940:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000518171:exon_100899718_100899846:COX6C;ENSG00000164919:ENST00000523016:exon_100899289_100899846:COX6C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	101199471	C/T	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101199348_101199478:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101199348_101199478:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101199348_101199478:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101199348_101199478:SPAG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	101232557	T/C	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101232507_101232659:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101232507_101232659:SPAG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	101534774	T/C	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000186106:ENST00000335659:exon_101533000_101534999:ANKRD46;ENSG00000186106:ENST00000519597:exon_101533000_101534999:ANKRD46;ENSG00000186106:ENST00000395975:exon_101533002_101534999:ANKRD46;ENSG00000186106:ENST00000520311:exon_101533004_101534999:ANKRD46;ENSG00000186106:ENST00000519316:exon_101534742_101534999:ANKRD46
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	104427541	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104426942_104427744:DCAF13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	104432545	A/G	1	76	48	124	37.2766690131466	24.4568406232758	12.8198283898708	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.024414247309764	ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	107719290	C/T	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000497705:exon_107718610_107719918:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107718609_107719373:OXR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	110539186	G/A	1	11	36	47	5.39530735716596	18.3426304674569	-12.9473231102909	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.000187761545439426	ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	110542337	T/C	1	15	14	29	7.35723730522631	7.13324518178878	0.223992123437523	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110542309_110542559:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110542309_110543500:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110542309_110542489:PKHD1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	117783975	C/T	1	68	69	137	33.3528091170259	35.156708395959	-1.80389927893308	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.797891532205338	ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	120744349	T/C	1	9	22	31	4.41434238313578	11.2093852856681	-6.7950429025323	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0183923780006351	ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	123966159	G/C	1	10	17	27	4.90482487015087	8.66179772074352	-3.75697285059265	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.178644105608033	ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	124027628	T/C	1	84	79	163	41.2005289092673	40.2518835258081	0.94864538345918	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.937592127557224	ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	124031541	T/C	1	40	34	74	19.6192994806035	17.323595441487	2.29570403911644	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.64258433301022	ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	124164171	G/A	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124164046_124164390:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124164046_124164390:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124164046_124164194:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124164046_124164204:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124164046_124164393:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124164046_124164390:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124164046_124164393:WDR67
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	124440174	A/G	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000522194:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124440164_124440263:WDYHV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	124448736	A/G	1	11	9	20	5.39530735716596	4.58565761686422	0.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.824440326743688	ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	124448804	T/A	1	17	4	21	8.33820227925648	2.03807005193965	6.30013222731683	A:T	T	A	10	0.509517512984913	0.00740887385196366	ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	124449466	C/T	1	18	4	22	8.82868476627157	2.03807005193965	6.79061471433191	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00449186101551913	ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	133856436	T/C	1	8	14	22	3.9238598961207	7.13324518178878	-3.20938528566809	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.203086029135577	ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133856401_133856563:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133856401_133856563:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133856401_133856563:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133856401_133856563:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000477051:exon_133856401_133856563:PHF20L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	135602542	C/T	1	19	9	28	9.31916725328665	4.58565761686422	4.73350963642244	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0887528602091906	ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	141294011	C/T	1	7	21	28	3.43337740910561	10.6998677726832	-7.26649036357756	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00724953272786615	ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141293988_141294120:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141293988_141294120:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141293988_141294120:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141293988_141294120:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141293988_141294120:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_141293988_141294120:TRAPPC9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	141525327	A/G	1	31	23	54	15.2049570974677	11.718902798653	3.4860542988147	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.414397416022210	ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141525225_141527236:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519533:exon_141525225_141526566:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141525225_141525864:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141525225_141525640:CHRAC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	141551407	G/A	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	141559358	G/A	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	141568622	G/A	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	142170884	C/T	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142170731_142170886:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521477:exon_142170731_142170886:DENND3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	142204293	C/T	1	55	60	115	26.9765367858298	30.5710507790948	-3.59451399326499	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.515167037065266	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	142204326	C/G	1	59	46	105	28.9384667338901	23.437805597306	5.50066113658414	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.329049028428835	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	142204351	A/G	1	30	37	67	14.7144746104526	18.8521479804418	-4.13767336998917	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.330163501254698	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	143808951	C/T	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000130193:ENST00000336138:exon_143808621_143809277:C8orf55;ENSG00000130193:ENST00000443814:exon_143808765_143809118:C8orf55
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144403485	G/C	1	11	7	18	5.39530735716596	3.56662259089439	1.82868476627157	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.482132183542689	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144406705	C/T	1	21	15	36	10.3001322273168	7.64276269477369	2.65736953254313	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.408107531503021	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144464060	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000158106:ENST00000289013:exon_144463977_144464138:RHPN1;ENSG00000158106:ENST00000522335:exon_144463977_144464138:RHPN1;ENSG00000158106:ENST00000422773:exon_144463977_144464138:RHPN1;ENSG00000158106:ENST00000522899:exon_144463977_144464138:RHPN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144658711	G/A	1	2	32	34	0.980964974030174	16.3045604155172	-15.323595441487	A:G	G	A	10	0.509517512984913	2.31604039976412e-08	ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144660257	G/T	0	12	0	12	5.88578984418104	0	5.88578984418104	G	G		10	0.509517512984913	0.000499989724588711	ENSG00000147813:ENST00000462059:exon_144659986_144660491:NAPRT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144662353	G/A	1	812	943	1755	398.271779456251	480.475014744773	-82.2032352885223	A:G	G	A	10	0.509517512984913	8.94206130556068e-05	ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144671244	C/A	1	3	7	10	1.47144746104526	3.56662259089439	-2.09517512984913	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.218410376640568	ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144671685	G/C	1	17	21	38	8.33820227925648	10.6998677726832	-2.3616654934267	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.517270941700297	ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144671922	G/A	1	10	10	20	4.90482487015087	5.09517512984913	-0.19035025969826	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144681777	G/T	1	4	4	8	1.96192994806035	2.03807005193965	-0.0761401038793039	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144885580	A/G	1	20	28	48	9.80964974030174	14.2664903635776	-4.45684062327582	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.247899174946953	ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144889172	A/G	1	12	10	22	5.88578984418104	5.09517512984913	0.790614714331914	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.83248103141106	ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531942:exon_144889094_144889183:SCRIB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144894496	G/A	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144894436_144894554:SCRIB
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144992388	G/A	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144993596	G/A	1	14	10	24	6.86675481821122	5.09517512984913	1.77157968836209	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.54303205531595	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144994023	G/A	1	8	15	23	3.9238598961207	7.64276269477369	-3.718902798653	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.145439852017206	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144994044	G/A	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.264915529576399	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144994916	C/T	1	14	12	26	6.86675481821122	6.11421015581896	0.752544662392262	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.845747407952092	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144995013	G/A	1	14	14	28	6.86675481821122	7.13324518178878	-0.266490363577564	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144995169	G/C	1	26	19	45	12.7525446623923	9.68083274671335	3.07171191567892	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.375204172860233	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144995253	C/T	1	46	22	68	22.562194402694	11.2093852856681	11.3528091170259	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.00719488138674452	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144995658	G/A	1	15	17	32	7.35723730522631	8.66179772074352	-1.30456041551722	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.724820906305913	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144995977	C/T	1	9	8	17	4.41434238313578	4.0761401038793	0.338202279256479	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144997353	C/T	1	46	26	72	22.562194402694	13.2474553376077	9.31473906508627	T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.0332948324175313	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144997520	G/A	1	21	16	37	10.3001322273168	8.15228020775861	2.14785201955822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.514219390998328	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	144997641	C/T	1	26	27	53	12.7525446623923	13.7569728505926	-1.00442818820039	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.785658801468792	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145002043	C/T	1	6	5	11	2.94289492209052	2.54758756492456	0.395307357165957	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_145002022_145002160:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_145002022_145002160:PLEC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145059173	T/C	1	43	21	64	21.0907469416487	10.6998677726832	10.3908791689656	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0118237296069127	ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059151_145059496:PARP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145059188	G/C	1	43	24	67	21.0907469416487	12.2284203116379	8.86232663001083	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0370817968512117	ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058712_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313059:exon_145058896_145059496:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059151_145059496:PARP10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145268000	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000179832:ENST00000423230:exon_145267897_145268370:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000356585:exon_145267901_145268024:HEATR7A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145512914	C/T	1	24	30	54	11.7715796883621	15.2855253895474	-3.5139457011853	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.344882973845490	ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145580535	C/G	1	25	22	47	12.2620621753772	11.2093852856681	1.05267688970909	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.77276891537452	ENSG00000182325:ENST00000524492:exon_145580468_145581633:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000455319:exon_145580468_145580575:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000331890:exon_145580468_145580575:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530142:exon_145580468_145580575:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000526524:exon_145580468_145580575:FBXL6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145581377	C/G	1	18	18	36	8.82868476627157	9.17131523372843	-0.342630467456868	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000182325:ENST00000524492:exon_145580468_145581633:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000455319:exon_145581288_145581446:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000331890:exon_145581288_145581446:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530142:exon_145581288_145582889:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000529279:exon_145581288_145581586:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530687:exon_145581090_145581446:FBXL6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145618739	G/T	1	86	91	177	42.1814938832975	46.3660936816271	-4.1845997983296	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.548103232914299	ENSG00000071894:ENST00000531480:exon_145618667_145618805:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000531727:exon_145618667_145618805:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145618667_145618805:CPSF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145649531	C/T	1	9	10	19	4.41434238313578	5.09517512984913	-0.680832746713347	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.821033698547823	ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145649000_145650434:VPS28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145652344	G/C	1	45	67	112	22.0717119156789	34.1376733699892	-12.0659614543103	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0233702734554336	ENSG00000160948:ENST00000529182:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526054:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000292510:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000377348:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526204:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530983:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000528142:exon_145651409_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530836:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530804:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000532861:exon_145652292_145652381:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000533806:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531032:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531924:exon_145652292_145652677:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526734:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530790:exon_145652292_145652674:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000524521:exon_145651854_145652362:VPS28
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145659553	G/A	1	8	4	12	3.9238598961207	2.03807005193965	1.88578984418104	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.388745519579610	ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145659361_145659662:NFKBIL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145663814	A/G	1	2	7	9	0.980964974030174	3.56662259089439	-2.58565761686422	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.103192530786195	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145663929	G/A	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145663854_145663943:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145663854_145663943:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145663854_145663943:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145663854_145663943:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145663854_145663945:NFKBIL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145665761	G/A	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665734_145665859:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665734_145665812:NFKBIL2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145689915	G/A	1	15	4	19	7.35723730522631	2.03807005193965	5.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0196131994431373	ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	145999080	G/A	1	2	6	8	0.980964974030174	3.05710507790948	-2.0761401038793	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.171917444065472	ENSG00000196378:ENST00000527190:exon_145997611_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000343459:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000429371:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000527740:exon_145998505_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000449516:exon_145998508_145999990:ZNF34
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	146017553	C/T	1	9	14	23	4.41434238313578	7.13324518178878	-2.718902798653	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.300147215812102	ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146017377_146017736:RPL8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	146032685	G/C	1	11	6	17	5.39530735716596	3.05710507790948	2.33820227925648	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.333809869270413	ENSG00000197363:ENST00000359971:exon_146032576_146034529:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000533965:exon_146032576_146033871:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000530879:exon_146032576_146034362:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000533944:exon_146032576_146032732:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000528012:exon_146032576_146032712:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000531720:exon_146032576_146033871:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000529429:exon_146032576_146033861:ZNF517;ENSG00000204752:ENST00000377296:exon_146032252_146032811:AF235103.1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	146156247	C/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	146278038	G/A	1	22	26	48	10.7906147143319	13.2474553376077	-2.45684062327582	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.564122342437876	ENSG00000182307:ENST00000331434:exon_146277972_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000444534:exon_146277972_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000524395:exon_146277851_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000534350:exon_146277853_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000530455:exon_146277853_146278283:C8orf33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	8	146278127	C/T	1	31	45	76	15.2049570974677	22.9282880843211	-7.72333098685339	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0852213265773979	ENSG00000182307:ENST00000331434:exon_146277972_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000444534:exon_146277972_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000524395:exon_146277851_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000534350:exon_146277853_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000530455:exon_146277853_146278283:C8orf33
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	368030	T/C	1	8	11	19	3.9238598961207	5.60469264283404	-1.68083274671335	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.496643759679211	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_368018_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_368018_368300:DOCK8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	377111	G/C	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.574476905075842	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_376977_377211:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_376977_377211:DOCK8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	390512	C/T	1	2	9	11	0.980964974030174	4.58565761686422	-3.60469264283404	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0353326891625868	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	399233	A/G	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	399255	G/A	1	10	7	17	4.90482487015087	3.56662259089439	1.33820227925648	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.630132706769099	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	441927	A/G	1	34	23	57	16.676404558513	11.718902798653	4.95750175985996	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.232906235773298	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_441875_442009:DOCK8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	464118	C/T	1	5	7	12	2.45241243507544	3.56662259089439	-1.11421015581896	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.574476905075842	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	4860300	A/G	1	55	67	122	26.9765367858298	34.1376733699892	-7.16113658415939	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.205539090868986	ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	5077517	T/C	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5077453_5077580:JAK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	5089688	T/C	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5089674_5089863:JAK2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	5335470	C/T	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	ENSG00000107018:ENST00000223862:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000487557:exon_5334969_5335597:RLN1;ENSG00000107018:ENST00000223858:exon_5334969_5335597:RLN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	5968416	A/G	1	46	56	102	22.562194402694	28.5329807271551	-5.97078632446112	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.275931180412308	ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	6012734	A/C	1	15	20	35	7.35723730522631	10.1903502596983	-2.83311295447195	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.398982697637708	ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	6477791	C/T	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6477622_6477808:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6477622_6477808:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000484159:exon_6477622_6477808:UHRF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	6533010	C/G	1	43	65	108	21.0907469416487	33.1186383440193	-12.0278914023706	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.0210150200949612	ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	6606645	G/A	1	11	2	13	5.39530735716596	1.01903502596983	4.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0227648071906430	ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6606592_6606669:GLDC
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	7799749	C/T	1	155	132	287	76.0247854873385	67.2563117140085	8.76847377332997	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.315732585377118	ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	15453138	G/A	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000164975:ENST00000380821:exon_15453039_15453203:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000467062:exon_15453039_15453203:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380807:exon_15453039_15453203:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000490969:exon_15453039_15453203:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380799:exon_15453039_15453575:SNAPC3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	17135115	C/T	1	3	5	8	1.47144746104526	2.54758756492456	-1.0761401038793	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.500048331019766	ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17135038_17135423:CNTLN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	19058743	G/C	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000147874:ENST00000380502:exon_19057959_19058999:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000428731:exon_19057959_19058999:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000380496:exon_19056616_19058999:HAUS6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	19058821	A/G	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000147874:ENST00000380502:exon_19057959_19058999:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000428731:exon_19057959_19058999:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000380496:exon_19056616_19058999:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000415524:exon_19058762_19058999:HAUS6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	19346941	A/C	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.508525453939377	ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380427:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000361024:exon_19346554_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380424:exon_19346726_19347084:DENND4C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	20953049	A/G	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	21816758	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	26842506	G/A	1	15	18	33	7.35723730522631	9.17131523372843	-1.81407792850213	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.602827681047108	ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26840683_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26842264_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26842392_26842645:C9orf82
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	26861106	C/T	1	4	8	12	1.96192994806035	4.0761401038793	-2.11421015581896	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.258617102120622	ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26861064_26861137:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26861064_26861137:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000495958:exon_26861087_26861137:C9orf82
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	26923258	G/A	1	27	27	54	13.2430271494074	13.7569728505926	-0.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.892792650810575	ENSG00000137055:ENST00000397292:exon_26923176_26923345:PLAA;ENSG00000137055:ENST00000520884:exon_26923176_26923345:PLAA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	32425898	T/C	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379921:exon_32425836_32425943:ACO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	32425910	A/G	1	6	2	8	2.94289492209052	1.01903502596983	1.9238598961207	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.289775626167224	ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379921:exon_32425836_32425943:ACO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	32425976	G/A	1	7	5	12	3.43337740910561	2.54758756492456	0.885789844181044	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.774904040787699	ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32425836_32425995:ACO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	32448905	C/T	1	16	14	30	7.84771979224139	7.13324518178878	0.71447461045261	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.856318725452094	ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32448894_32449079:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32448894_32449079:ACO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	32448959	T/G	1	14	9	23	6.86675481821122	4.58565761686422	2.281097201347	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.406846674264837	ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32448894_32449079:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32448894_32449079:ACO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	32450043	T/C	1	18	24	42	8.82868476627157	12.2284203116379	-3.39973554536635	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.354816492678567	ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	32570989	A/G	1	85	85	170	41.6910113962824	43.3089886037176	-1.6179772074352	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.818364235324337	ENSG00000165264:ENST00000379847:exon_32570958_32571050:NDUFB6;ENSG00000165264:ENST00000350021:exon_32570958_32571050:NDUFB6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	33056939	T/C	1	32	24	56	15.6954395844828	12.2284203116379	3.46701927284487	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.422884120210198	ENSG00000122692:ENST00000397149:exon_33056835_33056962:SMU1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	33255901	T/C	1	109	136	245	53.4625910846445	69.2943817659482	-15.8317906813037	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0474367205888255	ENSG00000107262:ENST00000493917:exon_33255863_33255925:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379701:exon_33255863_33255925:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379707:exon_33255863_33255925:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000379704:exon_33255863_33255925:AL161445.1;ENSG00000107262:ENST00000468274:exon_33255862_33255925:AL161445.1;ENSG00000254882:ENST00000472232:exon_33255863_33255925:BAG1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	33467218	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33467112_33467260:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000353159:exon_33467112_33467260:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33467112_33467260:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33467112_33467260:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33467112_33467260:NOL6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	33472311	G/A	1	7	9	16	3.43337740910561	4.58565761686422	-1.15228020775861	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.623377837269659	ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33472204_33472410:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000353159:exon_33472204_33472410:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33472204_33472410:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33472204_33472410:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000464829:exon_33472204_33472410:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33472204_33472410:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000496319:exon_33472204_33472410:NOL6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	33817964	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	33943505	G/A	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33943418_33943587:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33943418_33943587:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33943418_33943587:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33943418_33943587:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33943418_33943587:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33943418_33943587:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33943418_33943587:UBAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35398978	G/A	1	7	14	21	3.43337740910561	7.13324518178878	-3.69986777268317	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.127823723210135	ENSG00000198722:ENST00000396787:exon_35398879_35399031:UNC13B;ENSG00000198722:ENST00000378495:exon_35398879_35399031:UNC13B;ENSG00000198722:ENST00000378496:exon_35398879_35399031:UNC13B;ENSG00000198722:ENST00000481299:exon_35398879_35399031:UNC13B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35399002	C/T	1	12	7	19	5.88578984418104	3.56662259089439	2.31916725328665	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.360953127556275	ENSG00000198722:ENST00000396787:exon_35398879_35399031:UNC13B;ENSG00000198722:ENST00000378495:exon_35398879_35399031:UNC13B;ENSG00000198722:ENST00000378496:exon_35398879_35399031:UNC13B;ENSG00000198722:ENST00000481299:exon_35398879_35399031:UNC13B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35612978	G/A	1	13	9	22	6.37627233119613	4.58565761686422	1.79061471433191	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.525140284093691	ENSG00000137101:ENST00000396757:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000396759:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000259633:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000490239:exon_35612845_35612990:CD72
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35660901	C/T	1	84	41	125	41.2005289092673	20.8902180323814	20.3103108768859	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000310807382297596	ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35660091_35660964:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35661057	C/G	1	95	50	145	46.5958362664333	25.4758756492457	21.1199606171876	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.00045571538348041	ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35661088	G/A	1	100	49	149	49.0482487015087	24.9663581362607	24.081890565248	A:G	G	A	10	0.509517512984913	7.5503804539284e-05	ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35683148	C/T	0	9	0	9	4.41434238313578	0	4.41434238313578	C	C		10	0.509517512984913	0.00395726759981203	ENSG00000198467:ENST00000360958:exon_35682927_35683238:TPM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35685009	G/A	1	4	7	11	1.96192994806035	3.56662259089439	-1.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.379381318563715	ENSG00000198467:ENST00000471212:exon_35684485_35685136:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000486018:exon_35684748_35685336:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000378309:exon_35684788_35685136:TPM2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35732769	A/G	1	30	31	61	14.7144746104526	15.7950429025323	-1.08056829207969	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.799191518420947	ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35732332_35732898:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35732595_35732898:CREB3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	35749845	G/C	1	2	9	11	0.980964974030174	4.58565761686422	-3.60469264283404	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.0353326891625868	ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35749734_35749868:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35749734_35749868:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000496906:exon_35749734_35749868:RGP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	36651864	C/T	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36651743_36651874:MELK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	36657267	C/T	1	6	7	13	2.94289492209052	3.56662259089439	-0.623727668803869	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.787003666689933	ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36657238_36657360:MELK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	36674842	C/T	1	24	28	52	11.7715796883621	14.2664903635776	-2.49491067521548	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.492458191163607	ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36674831_36674934:MELK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	37006494	C/T	1	45	52	97	22.0717119156789	26.4949106752155	-4.42319875953656	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416735676597932	ENSG00000196092:ENST00000358127:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377853:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377840:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377852:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523241:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520154:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520281:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000446742:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522003:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523145:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523493:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000414447:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377847:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377849:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000432188:exon_37006470_37006534:PAX5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	37592452	G/A	1	369	357	726	180.988037708567	181.897752135614	-0.909714427046822	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.970393086520763	ENSG00000175768:ENST00000321301:exon_37592409_37592568:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000377773:exon_37592307_37592594:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000401811:exon_37592250_37592636:TOMM5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	37888101	C/T	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.473518684740505	ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	71555952	A/G	1	7	7	14	3.43337740910561	3.56662259089439	-0.133245181788782	A:G	A	G	10	0.509517512984913	1	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	71862975	C/T	1	26	22	48	12.7525446623923	11.2093852856681	1.54315937672418	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.668204743201523	ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	71862987	G/A	1	28	19	47	13.7335096364224	9.68083274671335	4.05267688970909	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.24697288273901	ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	74975136	T/C	1	25	5	30	12.2620621753772	2.54758756492456	9.71447461045261	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00034794694041431	ENSG00000107372:ENST00000437241:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000237937:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000456474:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376960:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376962:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000488164:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000343431:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000471197:exon_74975026_74975201:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376956:exon_74975026_74975137:ZFAND5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	80881589	A/C	1	43	40	83	21.0907469416487	20.3807005193965	0.710046422252223	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.912854666883915	ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80881358_80881769:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80881358_80881991:CEP78
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	86284178	C/A	1	38	27	65	18.6383345065733	13.7569728505926	4.88136165598066	A:T:C	C	A	10	0.509517512984913	0.264287738669464	ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	86570534	G/C	1	12	15	27	5.88578984418104	7.64276269477369	-1.75697285059265	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.566049825319431	ENSG00000165118:ENST00000376344:exon_86570296_86570555:C9orf64;ENSG00000165118:ENST00000314700:exon_86570296_86570555:C9orf64;ENSG00000165118:ENST00000376340:exon_86570296_86570555:C9orf64
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	88636887	G/A	1	37	36	73	18.1478520195582	18.3426304674569	-0.194778447898649	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	88651370	T/C	1	6	20	26	2.94289492209052	10.1903502596983	-7.24745533760774	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.00522199894269276	ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88651263_88651728:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88651263_88651422:GOLM1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	91978397	C/T	1	7	1	8	3.43337740910561	0.509517512984913	2.9238598961207	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0707088726237696	ENSG00000187764:ENST00000492386:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000420101:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000469653:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000475255:exon_91978345_91980569:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_91978345_91978442:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000455551:exon_91978345_91978442:SEMA4D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	92006275	G/A	1	10	12	22	4.90482487015087	6.11421015581896	-1.20938528566809	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.672962537607921	ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92006179_92006330:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92006179_92006330:SEMA4D
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	95738781	C/A	1	8	7	15	3.9238598961207	3.56662259089439	0.357237305226305	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	95768324	C/T	1	12	9	21	5.88578984418104	4.58565761686422	1.30013222731683	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.664840623783404	ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95768306_95768462:FGD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	95782667	C/T	1	21	14	35	10.3001322273168	7.13324518178878	3.16688704552804	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.313581243470769	ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	95841847	G/A	1	27	30	57	13.2430271494074	15.2855253895474	-2.04249824014004	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.59913770109504	ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95841753_95841884:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95841753_95841884:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95841753_95841884:SUSD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	95875381	G/C	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	98766860	C/T	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000182150:ENST00000479391:exon_98766802_98767137:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000407474:exon_98766802_98766983:C9orf102;ENSG00000182150:ENST00000320486:exon_98766802_98766983:C9orf102
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	99250463	C/T	1	8	23	31	3.9238598961207	11.718902798653	-7.7950429025323	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.006243620895514	ENSG00000130956:ENST00000375251:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99250371_99250556:HABP4;ENSG00000130956:ENST00000466976:exon_99250371_99250556:HABP4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	99417000	C/T	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000158122:ENST00000446045:exon_99416987_99417055:C9orf21;ENSG00000158122:ENST00000375234:exon_99416987_99417055:C9orf21;ENSG00000158122:ENST00000411939:exon_99416987_99417030:C9orf21;ENSG00000158122:ENST00000375233:exon_99416987_99417055:C9orf21;ENSG00000158122:ENST00000464512:exon_99416987_99417254:C9orf21
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	100190780	A/G	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.139060646007699	ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	100326321	C/T	1	10	2	12	4.90482487015087	1.01903502596983	3.88578984418104	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0389831260229786	ENSG00000136842:ENST00000259365:exon_100326320_100326450:TMOD1;ENSG00000136842:ENST00000395211:exon_100326320_100326450:TMOD1;ENSG00000136842:ENST00000375175:exon_100326320_100326450:TMOD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	101984147	G/C	1	10	16	26	4.90482487015087	8.15228020775861	-3.24745533760774	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.240919067564399	ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	103054951	T/C	1	9	5	14	4.41434238313578	2.54758756492456	1.86675481821122	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.425144589490545	ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	103064530	G/A	1	21	27	48	10.3001322273168	13.7569728505926	-3.45684062327582	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.386644300426596	ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	103065884	C/T	1	6	3	9	2.94289492209052	1.52855253895474	1.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.508525453939377	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	106888978	C/T	1	27	13	40	13.2430271494074	6.62372766880387	6.61929948060348	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0398714331376041	ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	106901506	A/G	1	28	32	60	13.7335096364224	16.3045604155172	-2.57105077909478	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.521322739558746	ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106901420_106903690:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106901420_106903698:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106901420_106901932:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106901420_106901933:SMC2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	108536246	G/C	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000095209:ENST00000374692:exon_108536146_108538893:TMEM38B;ENSG00000095209:ENST00000374688:exon_108536146_108538893:TMEM38B;ENSG00000095209:ENST00000435034:exon_108536146_108536360:TMEM38B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	113006420	A/G	1	1171	977	2148	574.354992294667	497.79861018626	76.5563821084069	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.000958105460453885	ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	114174415	T/C	1	12	11	23	5.88578984418104	5.60469264283404	0.281097201347001	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	114337042	T/C	1	13	10	23	6.37627233119613	5.09517512984913	1.281097201347	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.6789219768712	ENSG00000106853:ENST00000466771:exon_114337014_114337122:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114337014_114337122:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114337014_114337122:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114337014_114337122:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114337014_114337122:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114337014_114337122:PTGR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	114359624	C/A	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	114982463	T/C	1	67	61	128	32.8623266300108	31.0805682920797	1.78175833793113	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.791134672822782	ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	114982549	C/T	1	52	54	106	25.5050893247845	27.5139457011853	-2.00885637640078	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.699028712647994	ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	115931703	G/A	1	56	51	107	27.4670192728449	25.9853931622306	1.48162611061431	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.846776663299963	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	115931784	C/A	1	39	37	76	19.1288169935884	18.8521479804418	0.276669013146613	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	115950706	A/C	1	2	8	10	0.980964974030174	4.0761401038793	-3.09517512984913	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0608382612445699	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	115968797	C/T	1	7	6	13	3.43337740910561	3.05710507790948	0.376272331196131	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115968789_115968858:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000493847:exon_115968291_115968858:FKBP15
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	116136155	G/A	1	22	32	54	10.7906147143319	16.3045604155172	-5.5139457011853	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.136992323132609	ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	116136198	C/T	1	27	22	49	13.2430271494074	11.2093852856681	2.03364186373926	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.57161404905055	ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	116279880	T/C	1	1	7	8	0.490482487015087	3.56662259089439	-3.0761401038793	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0357282685863877	ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000413285:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317613:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000394646:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374136:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000496113:exon_116279821_116279904:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000460000:exon_116279648_116279904:RGS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	116346118	G/A	1	16	7	23	7.84771979224139	3.56662259089439	4.281097201347	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.094495059157444	ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	116346236	G/A	1	8	6	14	3.9238598961207	3.05710507790948	0.866754818211218	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.791058057425968	ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	116346515	G/A	1	25	16	41	12.2620621753772	8.15228020775861	4.10978196761857	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.214414867597439	ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000474719:exon_116346484_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000467805:exon_116346462_116346707:RGS3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	117103900	T/C	1	29	33	62	14.2239921234375	16.8140779285021	-2.59008580506461	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.527830862073319	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	117108971	C/T	1	45	48	93	22.0717119156789	24.4568406232758	-2.38512870759691	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.678549268190582	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117108949_117109054:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117108949_117109064:AKNA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	117118245	T/C	1	31	23	54	15.2049570974677	11.718902798653	3.4860542988147	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.414397416022210	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117118205_117118416:AKNA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	117118379	C/T	1	37	35	72	18.1478520195582	17.833112954472	0.314739065086265	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117118205_117118416:AKNA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	123220829	A/G	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	123291036	C/G	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	123671520	G/A	1	186	173	359	91.2297425848062	88.1465297463899	3.08321283841624	A:C:G	G	A	10	0.509517512984913	0.751744904924247	ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	125075629	A/T	1	50	27	77	24.5241243507543	13.7569728505926	10.7671515001617	A:T	A	T	10	0.509517512984913	0.0162630842489247	ENSG00000148187:ENST00000344641:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000297908:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373729:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000470366:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000489572:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373723:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373730:exon_125075506_125075665:MRRF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	125588941	C/A	1	18	11	29	8.82868476627157	5.60469264283404	3.22399212343752	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.267449151143263	ENSG00000136940:ENST00000436632:exon_125588895_125588965:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000259467:exon_125588895_125589071:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394286:exon_125588895_125589071:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394285:exon_125588895_125589031:PDCL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	125652757	G/A	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	127969830	C/T	1	6	4	10	2.94289492209052	2.03807005193965	0.90482487015087	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.754351765499807	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	127975654	C/T	1	23	55	78	11.281097201347	28.0234632141702	-16.7423660128232	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.000154592364215597	ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	127996046	A/G	1	81	154	235	39.729081448222	78.4656969996766	-38.7366155514545	A:G	A	G	10	0.509517512984913	4.11175294213422e-07	ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	127996242	G/A	1	63	92	155	30.9003966819505	46.875611194612	-15.9752145126615	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0125087827991661	ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	127999222	G/A	1	1356	1170	2526	665.094252392458	596.135490192348	68.9587622001097	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00639258154866862	ENSG00000044574:ENST00000324460:exon_127997132_127999433:HSPA5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130162230	C/G	1	5	4	9	2.45241243507544	2.03807005193965	0.414342383135783	C:G	C	G	10	0.509517512984913	1	ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373352:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130162186_130162285:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130162186_130162285:SLC2A8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130164993	C/T	1	10	5	15	4.90482487015087	2.54758756492456	2.35723730522631	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.303085077368447	ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000476835:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419917:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373360:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373355:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000419132:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000439597:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000423934:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130164836_130165032:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000484617:exon_130164643_130165032:SLC2A8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130167770	G/A	1	5	12	17	2.45241243507544	6.11421015581896	-3.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0909197869947799	ENSG00000136856:ENST00000373371:exon_130167699_130167844:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000451404:exon_130167699_130167834:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373352:exon_130167699_130167844:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373354:exon_130167699_130167844:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000373350:exon_130167699_130167844:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000430147:exon_130167699_130167844:SLC2A8;ENSG00000136856:ENST00000477027:exon_130167699_130167844:SLC2A8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130206405	C/T	1	5	11	16	2.45241243507544	5.60469264283404	-3.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.136942032485751	ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130206669	C/T	1	8	5	13	3.9238598961207	2.54758756492456	1.37627233119613	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.581964647177154	ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130494294	G/A	1	16	12	28	7.84771979224139	6.11421015581896	1.73350963642244	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.573555054768089	ENSG00000160404:ENST00000336067:exon_130493803_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000373284:exon_130493803_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000373281:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463577:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000472723:exon_130493806_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463256:exon_130494059_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000496460:exon_130494123_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000494135:exon_130494191_130494557:TOR2A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130509439	A/G	1	20	11	31	9.80964974030174	5.60469264283404	4.2049570974677	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.151896927870573	ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130509426_130509550:SH2D3C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130513469	A/G	1	19	12	31	9.31916725328665	6.11421015581896	3.2049570974677	A:T:G	A	G	10	0.509517512984913	0.283751645573885	ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000471939:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000414380:exon_130513451_130513579:SH2D3C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130536629	G/T	1	21	21	42	10.3001322273168	10.6998677726832	-0.399735545366347	T:G	G	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130635074	G/A	1	11	8	19	5.39530735716596	4.0761401038793	1.31916725328665	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.648753385524008	ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130634969_130635132:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130634969_130636719:AK1;ENSG00000106992:ENST00000373156:exon_130634969_130635132:AK1;ENSG00000106992:ENST00000223836:exon_130634969_130635132:AK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130670652	A/G	1	103	80	183	50.519696162554	40.761401038793	9.75829512376092	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.160177755342670	ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130670165_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130670166_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000474282:exon_130670604_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130670597_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130670623_130670860:ST6GALNAC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130674948	G/T	1	33	22	55	16.1859220714979	11.2093852856681	4.97653678582978	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.224524905623429	ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130674666_130674959:ST6GALNAC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130677094	G/A	1	15	15	30	7.35723730522631	7.64276269477369	-0.28552538954739	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130676935_130677145:ST6GALNAC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	130825847	G/A	1	12	1	13	5.88578984418104	0.509517512984913	5.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00348710510277128	ENSG00000171169:ENST00000373078:exon_130823512_130826179:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000470245:exon_130825653_130826021:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000488519:exon_130824269_130826179:NAIF1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131346710	C/A	1	18	17	35	8.82868476627157	8.66179772074352	0.166887045528044	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131346561_131346804:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131346561_131346804:SPTAN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131356538	G/A	1	25	27	52	12.2620621753772	13.7569728505926	-1.49491067521548	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.680587313441794	ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131356454_131356652:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131356454_131356652:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131356454_131356652:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131356454_131356652:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131356454_131356652:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131355263_131356652:SPTAN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131395571	G/A	1	164	130	294	80.4391278704743	66.2372766880387	14.2018511824356	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.102455144598871	ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131395488_131395937:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131395488_131395937:SPTAN1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131399202	G/A	1	21	15	36	10.3001322273168	7.64276269477369	2.65736953254313	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.408107531503021	ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131399197_131399306:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131399197_131399307:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131399197_131399306:WDR34
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131403096	A/G	1	20	13	33	9.80964974030174	6.62372766880387	3.18592207149787	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.299102501813151	ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131480651	A/G	1	17	8	25	8.33820227925648	4.0761401038793	4.26206217537717	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.109340228515106	ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131480604_131480666:PKN3;ENSG00000160447:ENST00000485301:exon_131480604_131480666:PKN3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131515547	G/T	1	9	7	16	4.41434238313578	3.56662259089439	0.847719792241392	T:C:G	G	T	10	0.509517512984913	0.804187903583641	ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131584631	C/T	1	96	74	170	47.0863187534484	37.7042959608836	9.38202279256479	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.167229919940319	ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131585069	A/G	1	20	5	25	9.80964974030174	2.54758756492456	7.26206217537718	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.00423856709311032	ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131588888	G/C	1	24	26	50	11.7715796883621	13.2474553376077	-1.47587564924565	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.777602321563524	ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131671014	C/T	1	4	5	9	1.96192994806035	2.54758756492456	-0.585657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.749585111595803	ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131755518	G/A	1	15	21	36	7.35723730522631	10.6998677726832	-3.34263046745687	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.317870325106883	ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131755476_131755682:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000411887:exon_131755476_131755682:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131755476_131755682:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000477069:exon_131755476_131755682:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000467044:exon_131755374_131755682:NUP188
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131768801	C/G	1	41	26	67	20.1097819676186	13.2474553376077	6.86232663001083	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.111703500391275	ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131768781_131769374:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131768781_131769375:NUP188
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131804785	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000148343:ENST00000474534:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000439290:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000445183:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000358369:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000413435:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000421332:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000406926:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000277475:exon_131804583_131804793:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000450073:exon_131804583_131804785:FAM73B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131823611	T/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000148343:ENST00000439290:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000445183:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000358369:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000413435:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000421332:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000406926:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000277475:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000474639:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000494608:exon_131823510_131823625:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000495975:exon_131823576_131823625:FAM73B
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	131904771	C/A	1	44	37	81	21.5812294286638	18.8521479804418	2.72908144822205	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.579450149110069	ENSG00000119383:ENST00000358994:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000393370:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000524946:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000337738:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000348141:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000405725:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000347048:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000357197:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000452489:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000355007:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000417728:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000411917:exon_131904724_131905261:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000423100:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000436883:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000414510:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432124:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435305:exon_131904724_131905219:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000419582:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000432651:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000435132:exon_131904724_131904831:PPP2R4;ENSG00000119383:ENST00000434095:exon_131904724_131904831:PPP2R4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	132585058	G/A	1	50	46	96	24.5241243507543	23.437805597306	1.08631875344835	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.838951822180089	ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	132590431	C/G	1	92	36	128	45.124388805388	18.3426304674569	26.7817583379311	C:G	C	G	10	0.509517512984913	2.01634377569973e-06	ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	132591509	A/G	1	66	48	114	32.3718441429957	24.4568406232758	7.91500351971992	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.159742320864342	ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	132597021	C/T	1	44	39	83	21.5812294286638	19.8711830064116	1.71004642225222	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.742648226440179	ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	132623868	T/C	1	7	2	9	3.43337740910561	1.01903502596983	2.41434238313578	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.180400712281148	ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132623822_132623891:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132623822_132623891:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132623822_132623891:USP20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	132631680	T/C	1	2	9	11	0.980964974030174	4.58565761686422	-3.60469264283404	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0353326891625868	ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132631589_132631704:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132631589_132631704:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132631589_132631704:USP20;ENSG00000136878:ENST00000491731:exon_132631589_132631704:USP20
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	132662786	C/T	1	150	137	287	73.572373052263	69.8038992789331	3.76847377332997	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.679602489810001	ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	132719666	G/A	1	112	83	195	54.9340385456897	42.2899535777478	12.644084967942	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0734571291517801	ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132719639_132719743:FNBP1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	133755528	A/G	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133755455_133755544:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133755455_133755544:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133755455_133755544:ABL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	133760029	C/G	1	11	5	16	5.39530735716596	2.54758756492456	2.84771979224139	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.211441030609945	ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134020092	C/T	1	6	10	16	2.94289492209052	5.09517512984913	-2.15228020775861	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.324346196468135	ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134073807	A/G	1	18	19	37	8.82868476627157	9.68083274671335	-0.85214798044178	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.869819021756582	ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000531600:exon_134072603_134074035:NUP214
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134334662	G/A	1	7	3	10	3.43337740910561	1.52855253895474	1.90482487015087	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.344641246232424	ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134334551_134334743:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134334551_134334743:BAT2L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134346315	T/C	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134346175_134346370:BAT2L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134358111	C/T	1	13	19	32	6.37627233119613	9.68083274671335	-3.30456041551721	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.289722368345706	ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134358097_134358294:BAT2L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134388668	C/T	1	8	3	11	3.9238598961207	1.52855253895474	2.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.227496299270201	ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134388626_134388718:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134388626_134388718:POMT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134394337	C/T	1	11	16	27	5.39530735716596	8.15228020775861	-2.75697285059265	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.337997616727118	ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372220:exon_134394224_134394344:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000467848:exon_134394155_134394344:POMT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134397540	C/T	1	10	15	25	4.90482487015087	7.64276269477369	-2.73793782462282	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.319809805674329	ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372220:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000494883:exon_134397434_134397920:POMT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	134406027	G/A	1	12	6	18	5.88578984418104	3.05710507790948	2.82868476627157	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.239422942006238	ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134405873_134406032:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134405873_134406032:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134405873_134406074:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134405873_134406074:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134405873_134406032:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134405873_134406032:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134405873_134406032:UCK1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	135470219	G/A	1	33	28	61	16.1859220714979	14.2664903635776	1.91943170792031	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.701259437167947	ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	135763816	C/T	1	8	8	16	3.9238598961207	4.0761401038793	-0.152280207758608	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000165698:ENST00000372136:exon_135763677_135765418:C9orf9;ENSG00000165698:ENST00000356311:exon_135763677_135765418:C9orf9;ENSG00000165698:ENST00000350499:exon_135763677_135763824:C9orf9
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	135974100	G/A	1	69	54	123	33.843291604041	27.5139457011853	6.32934590285571	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.279354163638089	ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	135983504	T/C	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135983375_135983793:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372062:exon_135983375_135983793:RALGDS
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136199092	C/T	1	36	40	76	17.6573695325431	20.3807005193965	-2.72333098685339	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.56723133152269	ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136197552_136199184:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136198642_136199184:SURF6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136230585	A/G	1	38	33	71	18.6383345065733	16.8140779285021	1.82425657807118	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.722300118582287	ENSG00000148248:ENST00000371989:exon_136228325_136230635:SURF4;ENSG00000148248:ENST00000465565:exon_136230329_136230635:SURF4;ENSG00000148248:ENST00000467910:exon_136230431_136230635:SURF4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136277482	T/C	1	29	25	54	14.2239921234375	12.7379378246228	1.4860542988147	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.785768149186664	ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277419_136277612:REXO4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136279935	C/T	1	29	33	62	14.2239921234375	16.8140779285021	-2.59008580506461	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.527830862073319	ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136341414	C/T	1	11	11	22	5.39530735716596	5.60469264283404	-0.209385285668086	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1	ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136341359_136341458:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136341359_136341458:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136341359_136341458:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000432868:exon_136341359_136341458:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000414172:exon_136341355_136341536:SLC2A6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136640116	G/A	1	11	10	21	5.39530735716596	5.09517512984913	0.300132227316827	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136640057_136640173:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136640057_136640173:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136640057_136640173:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136640057_136640173:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136640057_136640173:VAV2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136643994	T/C	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136643884_136644011:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136643884_136644011:VAV2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136662928	A/G	1	5	6	11	2.45241243507544	3.05710507790948	-0.604692642834043	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.7705361912286	ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136662832_136662931:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136662832_136662931:VAV2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	136907005	G/A	1	9	4	13	4.41434238313578	2.03807005193965	2.37627233119613	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.267983564831145	ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136906882_136907073:BRD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	137005023	C/T	1	8	10	18	3.9238598961207	5.09517512984913	-1.17131523372843	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.642296381993564	ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	137017126	A/G	1	10	12	22	4.90482487015087	6.11421015581896	-1.20938528566809	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.672962537607921	ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137017105_137017151:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137017105_137017151:WDR5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	138395969	A/G	1	133	118	251	65.2341707730066	60.1230665322197	5.11110424078684	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.528439253627873	ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	138837014	G/T	1	51	38	89	25.0146068377694	19.3616654934267	5.65294134434275	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.244690162675042	ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138836874_138837096:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000465873:exon_138836874_138837519:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000471163:exon_138836874_138837096:UBAC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	138852938	G/A	1	19	27	46	9.31916725328665	13.7569728505926	-4.437805597306	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.23785161492042	ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138852871_138853226:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000478485:exon_138852871_138853058:UBAC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139270806	G/A	1	59	53	112	28.9384667338901	27.0044281882004	1.93403854568975	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.776947024037131	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139272460	C/T	1	20	25	45	9.80964974030174	12.7379378246228	-2.92828808432109	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.456451955455906	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139275204	A/C	1	5	15	20	2.45241243507544	7.64276269477369	-5.19035025969826	A:C	A	C	10	0.509517512984913	0.0242916211695007	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139275294	G/C	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.293617974329767	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139289825	A/G	1	5	8	13	2.45241243507544	4.0761401038793	-1.62372766880387	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.416017801627938	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139298593	A/G	1	28	28	56	13.7335096364224	14.2664903635776	-0.532980727155127	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.894610793773664	ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139351917	C/T	1	19	8	27	9.31916725328665	4.0761401038793	5.24302714940735	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0533785325312663	ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139351896_139352036:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139351896_139352036:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139351896_139352036:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139351896_139352036:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139351896_139352036:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139351896_139352036:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139351896_139352036:SEC16A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139369236	A/G	1	16	5	21	7.84771979224139	2.54758756492456	5.30013222731683	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.0271669342424189	ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139391737	C/G	1	11	3	14	5.39530735716596	1.52855253895474	3.86675481821122	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.057993110530478	ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139731969	C/T	1	41	28	69	20.1097819676186	14.2664903635776	5.843291604041	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.185276951193353	ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139732331	G/C	1	49	40	89	24.0336418637393	20.3807005193965	3.65294134434274	C:G	G	C	10	0.509517512984913	0.459467694101233	ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139732314_139732432:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139743890	T/C	1	182	200	382	89.2678126367458	101.903502596983	-12.6356899602368	T:C:G	T	C	10	0.509517512984913	0.201019427888117	ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139743563_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139743543_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139743546_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139743877_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139743878_139744042:PHPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139744484	G/A	1	254	308	562	124.582551701832	156.931393999353	-32.3488422975211	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	0.00688336336279133	ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139744465_139745012:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139744231_139744589:PHPT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139752899	T/G	1	5	3	8	2.45241243507544	1.52855253895474	0.923859896120696	T:G	T	G	10	0.509517512984913	0.726958585521877	ENSG00000177943:ENST00000485732:exon_139752852_139752998:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000317446:exon_139752852_139752998:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000445819:exon_139752852_139752998:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000392881:exon_139752852_139752998:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000413647:exon_139752852_139752998:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000479475:exon_139752431_139752998:MAMDC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139753735	T/C	1	3	10	13	1.47144746104526	5.09517512984913	-3.62372766880387	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.0532492620840978	ENSG00000177943:ENST00000485732:exon_139753661_139753769:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000317446:exon_139753661_139753769:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000445819:exon_139753661_139753769:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000392881:exon_139753661_139753769:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000413647:exon_139753661_139753769:MAMDC4;ENSG00000177943:ENST00000479475:exon_139753661_139754516:MAMDC4
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139811046	C/T	1	5	10	15	2.45241243507544	5.09517512984913	-2.64276269477369	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.202562406596383	ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139810993_139811067:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139810993_139811067:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139810993_139811067:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000482854:exon_139810993_139811067:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000469701:exon_139810993_139811129:TRAF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139820421	G/A	1	38	24	62	18.6383345065733	12.2284203116379	6.4099141949354	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.126868363099528	ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139835922	G/A	1	7	10	17	3.43337740910561	5.09517512984913	-1.66179772074352	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.473518684740505	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139836000	C/T	1	55	57	112	26.9765367858298	29.04249824014	-2.06596145431025	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.70648673678376	ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139835989_139836136:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139835989_139836136:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139835989_139836136:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139835989_139836136:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139835989_139836136:FBXW5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139836139	G/A	1	3	8	11	1.47144746104526	4.0761401038793	-2.60469264283404	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139060646007699	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139837369	C/T	1	39	51	90	19.1288169935884	25.9853931622306	-6.85657616864217	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.17035010558693	ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139837221_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139837221_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000491246:exon_139837221_139837455:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000428398:exon_139837221_139837425:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000443788:exon_139837359_139837395:FBXW5
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	139973820	C/T	1	6	8	14	2.94289492209052	4.0761401038793	-1.13324518178878	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.601138673885629	ENSG00000197355:ENST00000409858:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000360271:exon_139973708_139973901:UAP1L1;ENSG00000197355:ENST00000474787:exon_139973708_139975326:UAP1L1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140006202	G/A	1	294	393	687	144.201851182436	200.240382603071	-56.0385314206352	A:T:G	G	A	10	0.509517512984913	2.19109853669794e-05	ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140007770	T/C	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	T:C	T	C	10	0.509517512984913	0.293617974329767	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140100224	A/G	1	16	8	24	7.84771979224139	4.0761401038793	3.77157968836209	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.153367642666690	ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140100317	C/G	1	8	2	10	3.9238598961207	1.01903502596983	2.90482487015087	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.110011912016315	ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140108857	T/C	1	6	6	12	2.94289492209052	3.05710507790948	-0.114210155818956	T:C	T	C	10	0.509517512984913	1	ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140108656_140108865:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140108656_140108865:NDOR1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140135784	C/A	1	39	25	64	19.1288169935884	12.7379378246228	6.39087916896557	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.133064631420067	ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140135665_140135869:TUBB2C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140138011	C/T	1	335	326	661	164.311633150054	166.102709233082	-1.79107608302749	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.907114381811238	ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140136948_140138159:TUBB2C
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140150039	G/T	1	28	43	71	13.7335096364224	21.9092530583513	-8.17574342192882	T:G	G	T	10	0.509517512984913	0.0575233665282909	ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140149625_140150063:COBRA1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140173531	G/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:G	G	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000198113:ENST00000357503:exon_140173105_140177093:C9orf167
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140267455	C/A	1	5	5	10	2.45241243507544	2.54758756492456	-0.0951751298491299	A:C	C	A	10	0.509517512984913	1	ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140328077	C/T	1	3	6	9	1.47144746104526	3.05710507790948	-1.58565761686422	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.335103331122344	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140346865	G/A	1	40	26	66	19.6192994806035	13.2474553376077	6.37184414299574	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.139194790724528	ENSG00000165802:ENST00000339554:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371474:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000265663:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371475:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000437259:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371482:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371473:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000392812:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000371472:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000484316:exon_140346817_140346887:NELF;ENSG00000165802:ENST00000482448:exon_140346817_140346887:NELF
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140446806	C/T	1	242	263	505	118.696761857651	134.003105915032	-15.3063440573811	A:T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.181808810168139	ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140468828	C/T	1	8	18	26	3.9238598961207	9.17131523372843	-5.24745533760774	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0488563641808063	ENSG00000148399:ENST00000479650:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000277540:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000475100:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000472113:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000485189:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000467768:exon_140468660_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000477690:exon_140468660_140469821:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000470855:exon_140468659_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000481839:exon_140468667_140468832:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000476303:exon_140468716_140468832:WDR85
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140470497	C/T	1	9	2	11	4.41434238313578	1.01903502596983	3.39530735716596	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.065955266796108	ENSG00000148399:ENST00000472113:exon_140470161_140470619:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000476303:exon_140470161_140470619:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000491359:exon_140469905_140470619:WDR85
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140508255	C/T	1	4	6	10	1.96192994806035	3.05710507790948	-1.09517512984913	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.541700480242972	ENSG00000197070:ENST00000466367:exon_140508067_140508663:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000491911:exon_140508067_140508666:ARRDC1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140671147	C/T	1	58	14	72	28.447984246875	7.13324518178878	21.3147390650863	T:C	C	T	10	0.509517512984913	3.33262022078193e-07	ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140671070_140671296:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140671070_140671296:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140671070_140671296:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140671070_140671296:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140671070_140671296:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140671070_140671296:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140671070_140671296:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000462942:exon_140671070_140671296:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000465566:exon_140671070_140671233:EHMT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140672294	C/T	1	8	1	9	3.9238598961207	0.509517512984913	3.41434238313578	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.0393683470073758	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	9	140707590	C/T	1	58	16	74	28.447984246875	8.15228020775861	20.2957040391164	T:C	C	T	10	0.509517512984913	1.84778136591117e-06	ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140707458_140707625:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140707458_140707625:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140707458_140707625:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140707458_140707625:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000462942:exon_140707458_140707625:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000486164:exon_140707458_140707625:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000488242:exon_140707458_140707625:EHMT1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	221705	G/A	1	194	161	355	95.1536024809269	82.032319590571	13.1212828903559	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.1677888197112	ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	223989	A/G	1	5	9	14	2.45241243507544	4.58565761686422	-2.13324518178878	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.293617974329767	
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	224135	C/T	1	48	49	97	23.5431593767242	24.9663581362607	-1.42319875953656	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.839199463721912	ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_224027_224179:GTPBP6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1471069	G/A	1	50	58	108	24.5241243507543	29.552015753125	-5.02789140237061	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.337801028645091	ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1470993_1471125:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1470993_1471125:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000432757:exon_1470993_1471125:IL3RA
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1505597	C/T	1	834	785	1619	409.062394170583	399.971247693157	9.09114647742592	A:T:C:G	C	T	10	0.509517512984913	0.654645537419761	ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1505045_1505652:SLC25A6
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1522325	C/T	1	127	133	260	62.2912758509161	67.7658292269934	-5.47455337607738	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.535151444022704	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1522034_1522382:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1522034_1522382:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1522034_1522382:ASMTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1531648	C/T	1	75	71	146	36.7861865261315	36.1757434219288	0.610443104202702	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.934210368209368	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1536964	C/T	1	49	41	90	24.0336418637393	20.8902180323814	3.14342383135783	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.528464143877239	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1537002	C/G	1	56	45	101	27.4670192728449	22.9282880843211	4.53873118852379	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.372567917233755	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1537881	C/T	1	62	46	108	30.4099141949354	23.437805597306	6.9721085976294	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.210691200128517	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1546792	G/A	1	76	72	148	37.2766690131466	36.6852609349137	0.591408078232881	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.93466663853095	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1546876	A/G	1	97	75	172	47.5768012404634	38.2138134738685	9.36298776659496	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.169750212661432	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1546993	C/A	1	82	83	165	40.2195639352371	42.2899535777478	-2.07038964251065	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.75606746732709	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1585311	C/G	1	9	3	12	4.41434238313578	1.52855253895474	2.88578984418104	C:G	C	G	10	0.509517512984913	0.146871689115496	ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1712853	C/T	1	23	35	58	11.281097201347	17.833112954472	-6.55201575312495	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.089100782649955	ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1712949	G/A	1	29	26	55	14.2239921234375	13.2474553376077	0.976536785829785	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.892885814847412	ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	1713021	C/T	1	36	25	61	17.6573695325431	12.7379378246228	4.91943170792031	T:C	C	T	10	0.509517512984913	0.249012136472630	ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	2326851	C/A	1	6	9	15	2.94289492209052	4.58565761686422	-1.64276269477369	A:C	C	A	10	0.509517512984913	0.446955104391855	ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000444280:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000441131:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000478825:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000430536:exon_2326786_2326854:DHRSX
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	2408545	G/A	1	19	6	25	9.31916725328665	3.05710507790948	6.26206217537718	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.0150702956802832	ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	2408659	G/A	1	7	8	15	3.43337740910561	4.0761401038793	-0.642762694773695	A:G	G	A	10	0.509517512984913	0.800388289490205	ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	46480446	A/G	1	13	7	20	6.37627233119613	3.56662259089439	2.80964974030174	A:G	A	G	10	0.509517512984913	0.264915529576399	ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46480412_46480494:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000464933:exon_46480412_46480494:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000491894:exon_46480412_46480451:SLC9A7
HGDP00467_parsed_pileup.txt	.	X	155127898	C/G	0	0	12	12	0	6.11421015581896	-6.11421015581896	G	C	G	10	0.509517512984913	0.000193857256764689	ENSG00000124333:ENST00000286448:exon_155127776_155127913:VAMP7;ENSG00000124333:ENST00000479687:exon_155127776_155127913:VAMP7;ENSG00000124333:ENST00000488344:exon_155127776_155127913:VAMP7;ENSG00000124333:ENST00000463317:exon_155127776_155127913:VAMP7;ENSG00000124333:ENST00000262640:exon_155127776_155127913:VAMP7;ENSG00000124333:ENST00000460621:exon_155127776_155127913:VAMP7;ENSG00000124333:ENST00000369427:exon_155127776_155127913:VAMP7