INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 897738 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_897735_897851:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_897735_897851:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000463212:exon_897206_897858:KLHL17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 900397 C/T 1 23 15 38 10.9285760082067 7.87266782073475 3.05590818747195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.335254961525510 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 1150 750 1900 546.428800410335 393.633391036738 152.795409373598 A:T:G G A 10 0.524844521382317 1.87956887358445e-12 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 862 589 1451 409.584022568443 309.133423094185 100.450599474258 A:G A G 10 0.524844521382317 1.21912903011902e-07 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 981460 G/A 1 14 8 22 6.65217670064756 4.19875617105854 2.45342052958903 A:G G A 10 0.524844521382317 0.393951929399631 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_981344_981468:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_981344_981468:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000479707:exon_981344_981468:AGRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 982213 G/C 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 C:G G C 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982200_982337:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982200_982337:AGRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 983405 G/A 1 20 19 39 9.50310957235366 9.97204590626402 -0.46893633391036 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_983392_983745:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_983392_983745:AGRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 986737 T/C 1 24 27 51 11.4037314868244 14.1708020773226 -2.76707059049816 T:C T C 10 0.524844521382317 0.484440099085824 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_986633_986749:AGRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1022535 G/T 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 T:G G T 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000131591:ENST00000379339:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000428805:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000448924:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000294576:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000253892:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000465822:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000379325:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000421241:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000487177:exon_1022519_1023016:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000477196:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000467751:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000379334:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000379320:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000379319:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000434641:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000482816:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000457999:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000437760:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000462097:exon_1022519_1022584:C1orf159;ENSG00000131591:ENST00000473600:exon_1022521_1022584:C1orf159 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1164031 A/G 1 144 158 302 68.4223889209464 82.9254343784061 -14.5030454574597 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0951295344240256 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1178925 G/A 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000184163:ENST00000330388:exon_1178824_1178932:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000468365:exon_1178646_1178932:FAM132A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1190523 C/T 1 181 194 375 86.0031416298006 101.819837148169 -15.8166955183689 T:C C T 10 0.524844521382317 0.108912578307375 ENSG00000160087:ENST00000450390:exon_1189289_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000347370:exon_1189294_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000349431:exon_1189850_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000339385:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000348298:exon_1190304_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000400929:exon_1190365_1190867:UBE2J2;ENSG00000160087:ENST00000464036:exon_1190428_1190867:UBE2J2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1245176 C/T 1 33 16 49 15.6801307943835 8.39751234211707 7.28261845226647 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0445009389985171 ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000470520:exon_1245086_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000463758:exon_1244466_1245220:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1244834_1245194:PUSL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 56 53 109 26.6087068025902 27.8167596332628 -1.20805283067255 C:G C G 10 0.524844521382317 0.848204156422325 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1262276 C/T 1 14 15 29 6.65217670064756 7.87266782073475 -1.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.711938142382318 ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262216_1262412:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000488011:exon_1262216_1262412:GLTPD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1342572 C/A 1 342 325 667 162.503173687248 170.574469449253 -8.07129576200541 A:C C A 10 0.524844521382317 0.53530183225207 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 269 275 544 127.816823748157 144.332243380137 -16.5154196319804 T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.156877992412714 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1431050 G/A 1 37 45 82 17.5807527088543 23.6180034622043 -6.03725075334999 A:G G A 10 0.524844521382317 0.186426306846017 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1469412 C/T 1 51 33 84 24.2329294095018 17.3198692056165 6.91306020388538 T:C C T 10 0.524844521382317 0.155227950204830 ENSG00000197785:ENST00000378756:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378759:exon_1469306_1470064:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378755:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000339113:exon_1469306_1470065:ATAD3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 1551927 T/C 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 131 101 232 62.2453676989165 53.009296659614 9.23607103930246 A:G G A 10 0.524844521382317 0.236964920988348 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 2337194 C/T 1 33 33 66 15.6801307943835 17.3198692056165 -1.63973841123292 T:C C T 10 0.524844521382317 0.712823060545896 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2336236_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2336258_2337273:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2336277_2337267:PEX10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 2452321 C/T 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452162_2452345:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452162_2452345:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2452162_2452340:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452162_2452345:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452279_2452345:PANK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 178 197 375 84.5776751939476 103.394370712316 -18.8166955183689 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0556444938491995 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 2494561 G/A 1 82 89 171 38.96274924665 46.7111624030262 -7.7484131563762 A:G G A 10 0.524844521382317 0.251001828221047 ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2492933_2495188:TNFRSF14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 3407065 G/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:G G T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000162591:ENST00000294599:exon_3406484_3407153:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000485002:exon_3406484_3407153:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000356575:exon_3406490_3407153:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000494257:exon_3406876_3407153:MEGF6;ENSG00000162591:ENST00000452816:exon_3407021_3407157:MEGF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 3697566 G/C 1 70 70 140 33.2608835032378 36.7391164967622 -3.47823299352437 T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.555187252014057 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3696784_3697900:LRRC47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 3701663 T/C 1 19 30 49 9.02795409373598 15.7453356414695 -6.71738154773353 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0627401102217899 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 3800242 A/G 1 2 15 17 0.950310957235366 7.87266782073475 -6.92235686349939 A:G A G 10 0.524844521382317 0.000880895678343241 ENSG00000169598:ENST00000378209:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000491998:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000430539:exon_3800071_3801984:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000468793:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000477548:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000339350:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000378206:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000475969:exon_3800071_3801993:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000448632:exon_3800071_3800305:DFFB;ENSG00000169598:ENST00000461150:exon_3800071_3800364:DFFB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 6142308 T/C 1 23 19 42 10.9285760082067 9.97204590626402 0.956530101942688 T:C T C 10 0.524844521382317 0.877488592984835 ENSG00000069424:ENST00000378111:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000428161:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000389632:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000458166:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378087:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000435937:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6142255_6142334:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000472700:exon_6142255_6142334:KCNAB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 85 95 180 40.3882156825031 49.8602295313201 -9.47201384881705 A:G A G 10 0.524844521382317 0.179012672225479 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 6272813 C/T 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6272742_6273243:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6272742_6272896:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6272798_6272963:RNF207 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 6313938 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000158292:ENST00000377893:exon_6313778_6314207:GPR153 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 6314822 T/C 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 T:C T C 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000158292:ENST00000377893:exon_6314610_6315074:GPR153 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 6593365 G/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162408:ENST00000377705:exon_6593340_6593501:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000464383:exon_6593340_6593501:NOL9;ENSG00000162408:ENST00000462798:exon_6593340_6593445:NOL9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 16 12 28 7.60248765788293 6.2981342565878 1.30435340129513 C:G G C 10 0.524844521382317 0.706809371150625 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 7889947 A/G 1 1 11 12 0.475155478617683 5.77328973520549 -5.2981342565878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00232484596307326 ENSG00000049246:ENST00000377532:exon_7889894_7890221:PER3;ENSG00000049246:ENST00000361923:exon_7889897_7890221:PER3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 7913430 G/A 0 0 44 44 0 23.0931589408219 -23.0931589408219 A G A 10 0.524844521382317 6.0363249241176e-15 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7913367_7913572:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7913367_7913491:UTS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 7995090 G/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:G G T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000049249:ENST00000377507:exon_7995073_7995203:TNFRSF9;ENSG00000049249:ENST00000474475:exon_7995073_7995160:TNFRSF9;ENSG00000049249:ENST00000492571:exon_7995073_7995203:TNFRSF9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 8418644 C/A 1 22 5 27 10.453420529589 2.62422260691158 7.82919792267744 A:C C A 10 0.524844521382317 0.00306761227246144 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 8418650 T/C 1 24 5 29 11.4037314868244 2.62422260691158 8.77950887991281 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00116045345983049 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8418256_8418976:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8418256_8418976:RERE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 8421092 C/T 1 9 13 22 4.27639930755915 6.82297877797012 -2.54657947041097 T:C C T 10 0.524844521382317 0.293962750959165 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 8421203 T/C 1 19 16 35 9.02795409373598 8.39751234211707 0.630441751618907 T:C T C 10 0.524844521382317 0.867082324177013 ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 9324571 T/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000049239:ENST00000377403:exon_9323568_9331396:H6PD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 9776575 A/G 1 16 15 31 7.60248765788293 7.87266782073475 -0.270180162851826 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000479223:exon_9776334_9776677:PIK3CD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 54 49 103 25.6583958453549 25.7173815477335 -0.0589857023786458 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 43 60 103 20.4316855805604 31.490671282939 -11.0589857023786 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0301440105272912 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 9804697 C/T 1 60 43 103 28.509328717061 22.5683144194396 5.94101429762135 T:C C T 10 0.524844521382317 0.277814282739747 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 50 48 98 23.7577739308842 25.1925370263512 -1.43476309546706 A:G A G 10 0.524844521382317 0.839832413742068 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 9910773 C/A 1 22 13 35 10.453420529589 6.82297877797012 3.63044175161891 A:C C A 10 0.524844521382317 0.239649884557393 ENSG00000178585:ENST00000377263:exon_9908334_9910834:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000400904:exon_9910167_9910834:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000377258:exon_9910508_9910834:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000377256:exon_9910717_9910834:CTNNBIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 9931312 G/A 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000178585:ENST00000377263:exon_9931245_9931335:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000400904:exon_9931245_9931335:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000377258:exon_9931245_9931335:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000377256:exon_9931245_9931335:CTNNBIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 10221260 C/G 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 C:G C G 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10221200_10221344:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10221200_10221344:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10221200_10221344:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10221200_10221344:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000488228:exon_10221200_10221344:UBE4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 10463146 G/T 1 105 102 207 49.8913252548567 53.5341411809963 -3.64281592613961 T:G G T 10 0.524844521382317 0.626640196684703 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10463128_10463193:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10463128_10463193:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10463128_10463193:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10463128_10463193:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10463128_10463193:PGD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 88 90 178 41.8136821183561 47.2360069244085 -5.42232480605242 T:C C T 10 0.524844521382317 0.453087046900814 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 16 11 27 7.60248765788293 5.77328973520549 1.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.565137057094518 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 10708026 A/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 10708028 G/A 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10707858_10708196:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10707270_10708196:CASZ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 10713854 C/T 1 11 6 17 5.22671026479451 3.1490671282939 2.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.342500346550349 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 10720211 C/T 1 3 10 13 1.42546643585305 5.24844521382317 -3.82297877797012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0487982257626193 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10719759_10720593:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10719759_10720593:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10719759_10720593:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000492173:exon_10719759_10721455:CASZ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11087524 G/A 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000009724:ENST00000400897:exon_11086580_11087705:MASP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 423 351 774 200.99076745528 184.220427005193 16.7703404500867 T:G G T 10 0.524844521382317 0.23503045715103 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11128712 G/A 1 79 77 156 37.537282810797 40.4130281464384 -2.87574533564145 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.688726416520199 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11128702_11128763:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11128702_11128763:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11128702_11128763:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000490565:exon_11128702_11128981:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11128702_11128763:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11128711_11128763:EXOSC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11137661 A/G 1 39 29 68 18.5310636660896 15.2204911200872 3.31057254600245 A:G A G 10 0.524844521382317 0.467141997210521 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000470611:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000498576:exon_11137658_11137708:EXOSC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11147900 T/C 1 24 25 49 11.4037314868244 13.1211130345579 -1.71738154773353 T:C T C 10 0.524844521382317 0.669137920279147 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11147857_11147967:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11147857_11147967:EXOSC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11150682 C/T 1 16 25 41 7.60248765788293 13.1211130345579 -5.518625376675 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0877390638856194 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11150611_11150725:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11150611_11150725:EXOSC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11159823 T/C 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 T:C T C 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11182063 G/A 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11182036_11182183:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000376838:exon_11182036_11182183:MTOR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11333542 T/G 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 T:G T G 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000120942:ENST00000376810:exon_11333263_11334117:UBIAD1;ENSG00000120942:ENST00000400896:exon_11333263_11334117:UBIAD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11708736 T/C 1 11 20 31 5.22671026479451 10.4968904276463 -5.27018016285183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0713947315459997 ENSG00000116661:ENST00000354287:exon_11708424_11708885:FBXO2;ENSG00000116661:ENST00000376779:exon_11708450_11708885:FBXO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11854457 G/A 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 11907648 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000175206:ENST00000376480:exon_11907619_11907840:NPPA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 12012753 G/A 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12012680_12012792:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12012680_12012792:PLOD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 12164437 C/T 1 16 16 32 7.60248765788293 8.39751234211707 -0.795024684234143 T:C C T 10 0.524844521382317 0.860150442628282 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12164436_12164588:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12164436_12164588:TNFRSF8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 12186058 A/G 1 29 18 47 13.7795088799128 9.4472013848817 4.3323074950311 A:G A G 10 0.524844521382317 0.243027133807926 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12185956_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000479933:exon_12185991_12186109:TNFRSF8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 16258802 G/A 1 15 12 27 7.12733217926525 6.2981342565878 0.829197922677442 A:G G A 10 0.524844521382317 0.848089388772471 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 16265904 T/A 1 37 33 70 17.5807527088543 17.3198692056165 0.260883503237814 A:T T A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16265791_16266955:SPEN;ENSG00000065526:ENST00000487496:exon_16265791_16266039:SPEN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 32 28 60 15.2049753157659 14.6956465987049 0.509328717060981 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 5 16 21 2.37577739308842 8.39751234211707 -6.02173494902866 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0141312564148606 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 16525056 G/T 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000142632:ENST00000478117:exon_16524349_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000270747:exon_16524599_16525239:ARHGEF19;ENSG00000142632:ENST00000421561:exon_16524599_16525139:ARHGEF19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 16719900 C/T 1 94 75 169 44.6646149900622 39.3633391036738 5.30127588638843 T:C C T 10 0.524844521382317 0.441541644786123 ENSG00000055070:ENST00000401088:exon_16719723_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000471507:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000401089:exon_16719723_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000486763:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000434120:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000375590:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000475554:exon_16719723_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000472351:exon_16719723_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000492354:exon_16719726_16719977:C1orf144;ENSG00000055070:ENST00000472461:exon_16719726_16719977:C1orf144 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 17292223 G/A 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000058453:ENST00000375541:exon_17292218_17292387:CROCC;ENSG00000058453:ENST00000442953:exon_17292218_17292387:CROCC;ENSG00000058453:ENST00000445545:exon_17292218_17292387:CROCC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 40 25 65 19.0062191447073 13.1211130345579 5.8851061101494 T:C C T 10 0.524844521382317 0.171645302691704 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 17319011 G/A 1 14 17 31 6.65217670064756 8.92235686349939 -2.27018016285183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.473797754482654 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 17350504 G/A 1 108 108 216 51.3167916907098 56.6832083092902 -5.36641661858046 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.495848918534395 ENSG00000117118:ENST00000375499:exon_17350468_17350569:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000485515:exon_17350468_17350569:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000491274:exon_17350468_17350569:SDHB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 17380507 G/C 1 47 46 93 22.3323074950311 24.1428479835866 -1.81054048855548 C:G G C 10 0.524844521382317 0.755774187820207 ENSG00000117118:ENST00000375499:exon_17380443_17380665:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000466613:exon_17380443_17380526:SDHB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 17413121 A/C 1 18 3 21 8.5527986151183 1.57453356414695 6.97826505097134 A:C A C 10 0.524844521382317 0.00189548506629032 ENSG00000117115:ENST00000375486:exon_17413016_17413194:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000444885:exon_17413016_17413194:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000375481:exon_17413016_17413194:PADI2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 36 43 79 17.1055972302366 22.5683144194396 -5.46271718920304 A:G G A 10 0.524844521382317 0.259835029862430 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 19208316 G/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19208194_19208381:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19208194_19208381:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19208194_19208381:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19208194_19208381:ALDH4A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 19630672 C/T 1 146 127 273 69.3726998781817 66.6552542155543 2.71744566262747 T:C C T 10 0.524844521382317 0.762121706012493 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19630459_19630880:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19630464_19630880:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19630493_19630880:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19630660_19630880:AKR7A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 19950062 T/C 1 134 195 329 63.6708341347695 102.344681669552 -38.6738475347823 T:C T C 10 0.524844521382317 2.01013247957773e-05 ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 4 10 14 1.90062191447073 5.24844521382317 -3.34782329935244 A:C A C 10 0.524844521382317 0.106163918875083 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 21564690 G/A 1 17 4 21 8.07764313650061 2.09937808552927 5.97826505097134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00866023681819707 ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000526194:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000470394:exon_21564627_21564843:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000528294:exon_21564642_21564737:ECE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 22150120 C/T 1 14 3 17 6.65217670064756 1.57453356414695 5.07764313650061 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.0145390064507902 ENSG00000187942:ENST00000344642:exon_22148695_22151714:LDLRAD2;ENSG00000142798:ENST00000486901:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000374695:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000457597:exon_22150109_22150212:HSPG2;ENSG00000142798:ENST00000481644:exon_22150109_22150759:HSPG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 23419374 G/T 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:G G T 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 23419383 C/T 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 23419806 A/C 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 23885599 T/C 1 6 12 18 2.8509328717061 6.2981342565878 -3.44720138488171 T:C T C 10 0.524844521382317 0.154986439212099 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 23885893 C/T 1 310 308 618 147.298198371482 161.652112585754 -14.3539142142719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.259447660284578 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885618_23886285:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23885618_23885934:ID3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 24981439 A/G 1 32 37 69 15.2049753157659 19.4192472911457 -4.21427197537987 A:G A G 10 0.524844521382317 0.335959753110818 ENSG00000133226:ENST00000323848:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000447431:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000374389:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000479034:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000470243:exon_24981346_24981620:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000496882:exon_24981346_24981614:SRRM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 26162030 G/A 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000127423:ENST00000374298:exon_26160497_26162337:C1orf135 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 26189652 C/T 1 32 17 49 15.2049753157659 8.92235686349939 6.28261845226647 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0856516135318025 ENSG00000182749:ENST00000374296:exon_26187701_26190352:PAQR7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 21 7 28 9.97826505097134 3.67391164967622 6.30435340129512 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0217271342720107 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 63 35 98 29.934795152914 18.3695582483811 11.5652369045329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0199742998719183 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 132 114 246 62.7205231775342 59.8322754375841 2.88824773995002 C:G C G 10 0.524844521382317 0.74969760307773 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 27089555 C/T 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000117713:ENST00000324856:exon_27089464_27089776:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000457599:exon_27089464_27089776:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000374152:exon_27089464_27089776:ARID1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 27676925 G/A 1 25 37 62 11.8788869654421 19.4192472911457 -7.54036032570365 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0573279496681651 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27676463_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27676880_27676976:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27676463_27676976:SYTL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 27679954 G/A 1 40 36 76 19.0062191447073 18.8944027697634 0.111816374943913 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 28599116 A/G 1 12 17 29 5.7018657434122 8.92235686349939 -3.22049112008719 A:G A G 10 0.524844521382317 0.266620142972611 ENSG00000130766:ENST00000253063:exon_28599092_28599304:SESN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 28905336 A/G 1 21 15 36 9.97826505097134 7.87266782073475 2.10559723023659 A:G A G 10 0.524844521382317 0.509070758298691 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 28906984 T/G 1 36 28 64 17.1055972302366 14.6956465987049 2.40995063153171 T:G T G 10 0.524844521382317 0.617129185638796 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 29314069 A/G 1 9 14 23 4.27639930755915 7.34782329935244 -3.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.216326895269441 ENSG00000159023:ENST00000343067:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398863:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398861:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000356093:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000398865:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000358989:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000482464:exon_29313960_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373800:exon_29313960_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000349460:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000347529:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373798:exon_29313943_29314417:EPB41;ENSG00000159023:ENST00000373797:exon_29313943_29314417:EPB41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 17 16 33 8.07764313650061 8.39751234211707 -0.31986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 31501691 C/G 1 4 16 20 1.90062191447073 8.39751234211707 -6.49689042764634 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00566593225609313 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000526215:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525948:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000480602:exon_31501643_31501711:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000524516:exon_31501605_31501711:PUM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 97 111 208 46.0900814259153 58.2577418734372 -12.1676604475219 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0957935246234241 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 31902279 G/A 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 A:G G A 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31902244_31902385:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31902244_31902385:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31902244_31902385:SERINC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 32658847 C/T 1 18 8 26 8.5527986151183 4.19875617105854 4.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.115132819997145 ENSG00000084652:ENST00000373610:exon_32658809_32658901:TXLNA;ENSG00000084652:ENST00000373609:exon_32658809_32658901:TXLNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 32673215 G/A 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:G G A 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000160051:ENST00000291358:exon_32672841_32674288:IQCC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 33138261 A/G 1 106 110 216 50.3664807334744 57.7328973520549 -7.36641661858046 A:G A G 10 0.524844521382317 0.34028273179877 ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000492348:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000463378:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000460669:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000482190:exon_33138243_33138300:RBBP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 33612789 C/T 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000116525:ENST00000291416:exon_33611003_33613328:TRIM62;ENSG00000116525:ENST00000482586:exon_33612007_33613328:TRIM62 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 35452986 C/T 1 22 20 42 10.453420529589 10.4968904276463 -0.0434698980573121 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35451766_35455912:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35452581_35454536:ZMYM6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 35477551 T/C 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000163867:ENST00000487874:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000373340:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35477491_35477606:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000472971:exon_35477491_35477606:ZMYM6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 48 51 99 22.8074629736488 26.7670705904982 -3.95960761684938 A:G A G 10 0.524844521382317 0.481376667290836 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 35928309 G/A 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 A:T:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35928222_35928314:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35928222_35928314:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35928222_35928314:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000485551:exon_35928222_35928314:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35928222_35928314:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35928222_35928314:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000431916:exon_35928222_35928314:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000482929:exon_35928222_35928314:KIAA0319L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 36029419 A/G 1 27 32 59 12.8291979226774 16.7950246842341 -3.9658267615567 A:G A G 10 0.524844521382317 0.361658051659654 ENSG00000020129:ENST00000373253:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000356090:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000373243:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000397922:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000423723:exon_36029368_36029510:NCDN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 36643729 G/C 1 217 175 392 103.108738860037 91.8477912419055 11.2609476181318 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.266037399810054 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 36752433 C/T 1 90 97 187 42.7639930755915 50.9099185740847 -8.14592549849328 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.241910138984197 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 36752687 A/G 1 82 76 158 38.96274924665 39.8881836250561 -0.925434378406081 A:G A G 10 0.524844521382317 0.93654749617458 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 36769469 G/A 1 144 139 283 68.4223889209464 72.9533884721421 -4.53099955119569 A:G G A 10 0.524844521382317 0.592794978076119 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36769397_36770958:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36769397_36769749:THRAP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 36786303 A/G 1 19 10 29 9.02795409373598 5.24844521382317 3.77950887991281 A:G A G 10 0.524844521382317 0.193890918307861 ENSG00000214193:ENST00000505871:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000480549:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000426732:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000453908:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000312808:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000508854:exon_36785276_36786352:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000474766:exon_36785641_36786399:C1orf113 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 36898067 T/C 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000116885:ENST00000235532:exon_36898023_36898190:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000356637:exon_36898023_36898190:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000315643:exon_36898023_36898190:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000433045:exon_36898023_36898190:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000445843:exon_36898023_36898190:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000528112:exon_36898023_36898190:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000354267:exon_36898023_36898190:OSCP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 38006254 G/A 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000163877:ENST00000296215:exon_38005758_38006356:SNIP1;ENSG00000163877:ENST00000468040:exon_38006101_38006356:SNIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 52 29 81 24.7080848881195 15.2204911200872 9.48759376803233 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0445586589756268 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 25 13 38 11.8788869654421 6.82297877797012 5.05590818747196 A:G A G 10 0.524844521382317 0.106770225838190 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 32 34 66 15.2049753157659 17.8447137269988 -2.63973841123292 T:C C T 10 0.524844521382317 0.539475787852711 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40363029 A/G 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:G A G 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000116990:ENST00000397332:exon_40361098_40363642:MYCL1;ENSG00000116990:ENST00000334282:exon_40361105_40363642:MYCL1;ENSG00000116990:ENST00000372816:exon_40362899_40363642:MYCL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40525111 T/C 1 76 71 147 36.1118163749439 37.2639610181445 -1.15214464320059 T:C T C 10 0.524844521382317 0.86907283792233 ENSG00000131236:ENST00000372797:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372802:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000449311:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000421589:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000414893:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000414281:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000420216:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372792:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372798:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000340450:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372805:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000435719:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000430361:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372794:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000427843:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000417287:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000424977:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000446031:exon_40525006_40525130:CAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40703169 T/C 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40703525 T/C 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40768344 C/T 1 42 26 68 19.9565301019427 13.6459575559402 6.31057254600245 T:C C T 10 0.524844521382317 0.145017229534602 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000427563:exon_40768293_40768481:COL9A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40768855 G/A 1 54 42 96 25.6583958453549 22.0434698980573 3.61492594729757 A:G G A 10 0.524844521382317 0.476112510982916 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768803_40768857:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768803_40768857:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768803_40768857:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768803_40768857:COL9A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40773119 G/T 1 12 10 22 5.7018657434122 5.24844521382317 0.453420529589027 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40882469 G/A 1 226 246 472 107.385138167596 129.11175226005 -21.7266140924536 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0474737806807733 ENSG00000084070:ENST00000372718:exon_40882452_40882768:SMAP2;ENSG00000084070:ENST00000372708:exon_40882452_40882768:SMAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40929020 C/T 1 15 4 19 7.12733217926525 2.09937808552927 5.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0219757172151644 ENSG00000187801:ENST00000469416:exon_40928093_40929386:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000484445:exon_40928093_40929352:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000411995:exon_40928093_40929390:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000361584:exon_40928093_40929388:ZNF643;ENSG00000187801:ENST00000431552:exon_40928093_40929261:ZNF643 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 40980559 G/A 1 24 16 40 11.4037314868244 8.39751234211707 3.00621914470732 A:G G A 10 0.524844521382317 0.429012589605853 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000415550:exon_40980187_40980699:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 41976217 G/A 1 45 21 66 21.3819965377957 11.0217349490287 10.3602615887671 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0131293353832719 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 41976575 A/G 1 37 21 58 17.5807527088543 11.0217349490287 6.55901775982562 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0887032408423839 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 41976593 C/T 1 19 36 55 9.02795409373598 18.8944027697634 -9.86644867602743 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00973299553323991 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 41976665 G/A 1 27 18 45 12.8291979226774 9.4472013848817 3.38199653779574 A:G G A 10 0.524844521382317 0.371090172681409 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 41979162 C/T 1 23 10 33 10.9285760082067 5.24844521382317 5.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0550160349953435 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 41979163 G/A 1 11 23 34 5.22671026479451 12.0714239917933 -6.84471372699878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.024381940001903 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 42046812 C/T 1 15 7 22 7.12733217926525 3.67391164967622 3.45342052958903 T:C C T 10 0.524844521382317 0.199368685480053 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 42049032 G/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_42045408_42050989:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_42045408_42050989:HIVEP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 42 39 81 19.9565301019427 20.4689363339104 -0.512406231967674 T:C T C 10 0.524844521382317 0.911971663740031 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 43212926 G/A 1 13 7 20 6.17702122202988 3.67391164967622 2.50310957235366 A:G G A 10 0.524844521382317 0.371027109529449 ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43212046_43213083:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000462474:exon_43212924_43213083:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000472802:exon_43212924_43213247:LEPRE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 43394666 G/A 1 23 18 41 10.9285760082067 9.4472013848817 1.481374623325 A:G G A 10 0.524844521382317 0.754951921506181 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394603_43394704:SLC2A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 43394887 G/A 1 10 16 26 4.75155478617683 8.39751234211707 -3.64595755594024 A:G G A 10 0.524844521382317 0.172006972677125 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43394819_43394985:SLC2A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 43408966 G/A 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000415851:exon_43408897_43408992:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372500:exon_43408897_43408992:SLC2A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 43830442 G/A 1 99 92 191 47.0403923831506 48.2856959671732 -1.24530358402254 A:G G A 10 0.524844521382317 0.884906620942993 ENSG00000066322:ENST00000372458:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000413844:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000468865:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000464204:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000470968:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000487209:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000470769:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000497569:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000482302:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000497050:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000478481:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000479439:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000465321:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000479686:exon_43830409_43830465:ELOVL1;ENSG00000066322:ENST00000496932:exon_43830247_43830465:ELOVL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 43917098 C/G 1 9 26 35 4.27639930755915 13.6459575559402 -9.36955824838109 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00189577464280696 ENSG00000198198:ENST00000372442:exon_43916008_43918304:KIAA0467;ENSG00000198198:ENST00000460536:exon_43916008_43918321:KIAA0467;ENSG00000178922:ENST00000483618:exon_43916824_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372434:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000470662:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372430:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372425:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000403034:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000372426:exon_43917081_43917215:HYI;ENSG00000178922:ENST00000486909:exon_43916991_43917215:HYI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 44086831 C/T 0 0 13 13 0 6.82297877797012 -6.82297877797012 T C T 10 0.524844521382317 6.29310002248808e-05 ENSG00000142949:ENST00000359947:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000438120:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372413:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372414:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372412:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000422171:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000412568:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000429895:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000414879:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000372407:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000496447:exon_44086768_44086903:PTPRF;ENSG00000142949:ENST00000477970:exon_44086768_44086903:PTPRF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 44423931 G/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44423914_44423940:IPO13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 45270119 G/A 1 15 12 27 7.12733217926525 6.2981342565878 0.829197922677442 A:G G A 10 0.524844521382317 0.848089388772471 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 45472403 G/A 1 24 27 51 11.4037314868244 14.1708020773226 -2.76707059049816 A:G G A 10 0.524844521382317 0.484440099085824 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000466423:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000487488:exon_45472364_45472467:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000484564:exon_45472364_45472467:HECTD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 45810923 G/A 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000070759:ENST00000372084:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372086:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000341771:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000372083:exon_45809555_45811230:TESK2;ENSG00000070759:ENST00000486676:exon_45809556_45811230:TESK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 45974849 A/G 1 13 7 20 6.17702122202988 3.67391164967622 2.50310957235366 A:G A G 10 0.524844521382317 0.371027109529449 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45974468_45976739:MMACHC;ENSG00000132763:ENST00000474382:exon_45974805_45975180:MMACHC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46212000 A/G 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000197429:ENST00000359942:exon_46211792_46212133:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396478:exon_46211792_46212133:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396474:exon_46211792_46212133:IPP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46493460 T/G 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:G T G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46493403_46493535:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46493403_46493535:MAST2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 A:G A G 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46654946 G/A 1 32 28 60 15.2049753157659 14.6956465987049 0.509328717060981 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46654355_46655029:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46654914_46655029:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46654355_46655029:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46654914_46655029:POMGNT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46660295 T/C 1 11 6 17 5.22671026479451 3.1490671282939 2.07764313650061 T:C T C 10 0.524844521382317 0.342500346550349 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000477114:exon_46660225_46660323:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46660254_46660323:POMGNT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46663504 C/T 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000085998:ENST00000371984:exon_46663374_46663543:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371992:exon_46663374_46663543:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000396420:exon_46663374_46663543:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000371986:exon_46663374_46663543:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000497439:exon_46663374_46663543:POMGNT1;ENSG00000085998:ENST00000489985:exon_46663374_46663774:POMGNT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46739814 T/C 1 14 22 36 6.65217670064756 11.546579470411 -4.89440276976341 T:C T C 10 0.524844521382317 0.132216225720217 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46739810_46739888:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46739810_46739888:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46739810_46739888:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000459678:exon_46739810_46739888:RAD54L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46810763 C/A 1 46 26 72 21.8571520164134 13.6459575559402 8.21119446047318 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0588448543442989 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 76 70 146 36.1118163749439 36.7391164967622 -0.627300121818273 A:G A G 10 0.524844521382317 0.93410668133938 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 10 21 31 4.75155478617683 11.0217349490287 -6.27018016285183 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0298941548727311 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 47717245 C/T 1 20 10 30 9.50310957235366 5.24844521382317 4.25466435853049 T:C C T 10 0.524844521382317 0.144094251343473 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 47746678 G/C 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 C:G G C 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47746618_47746728:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000447475:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000418131:exon_47745913_47746881:STIL;ENSG00000123473:ENST00000436811:exon_47746618_47746729:STIL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 47799639 G/C 1 28 17 45 13.3043534012951 8.92235686349939 4.38199653779574 C:G G C 10 0.524844521382317 0.232461537929957 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 47842431 G/A 1 100 71 171 47.5155478617683 37.2639610181445 10.2515868436238 A:G G A 10 0.524844521382317 0.125724117243387 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47842376_47844511:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47842376_47844510:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47842376_47842882:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47842376_47842795:CMPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 51912760 T/G 1 13 9 22 6.17702122202988 4.72360069244085 1.45342052958903 T:G T G 10 0.524844521382317 0.67059722784726 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51912632_51912777:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51912632_51912777:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51912632_51912777:EPS15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 52271205 C/T 1 34 37 71 16.1552862730012 19.4192472911457 -3.2639610181445 T:C C T 10 0.524844521382317 0.476709577930282 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52271182_52271233:NRD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 52344245 T/G 1 37 31 68 17.5807527088543 16.2701801628518 1.31057254600245 T:G T G 10 0.524844521382317 0.808603494926336 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52343947_52344477:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52343947_52344477:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52343947_52344386:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000491410:exon_52343947_52344443:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000468722:exon_52343947_52344395:NRD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 52385605 T/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000169213:ENST00000371655:exon_52373628_52385786:RAB3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 53364875 C/T 1 33 25 58 15.6801307943835 13.1211130345579 2.55901775982562 T:C C T 10 0.524844521382317 0.514401828048988 ENSG00000121310:ENST00000460612:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000479183:exon_53363109_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000463923:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000371522:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000371520:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000358358:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000498544:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000476477:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000479593:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000487866:exon_53364846_53364896:ECHDC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 53442376 A/G 1 7 13 20 3.32608835032378 6.82297877797012 -3.49689042764634 A:G A G 10 0.524844521382317 0.124086328149616 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000408941:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371513:exon_53442355_53442441:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528809:exon_53442355_53442384:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000473584:exon_53442355_53442441:SCP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 53732274 C/T 1 12 8 20 5.7018657434122 4.19875617105854 1.50310957235366 T:C C T 10 0.524844521382317 0.655495661698291 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 54432019 G/A 1 47 37 84 22.3323074950311 19.4192472911457 2.91306020388538 A:G G A 10 0.524844521382317 0.585285811877891 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 82 75 157 38.96274924665 39.3633391036738 -0.400589857023768 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 248 186 434 117.838558697185 97.6210809771109 20.2174777200744 A:T:C:G C G 10 0.524844521382317 0.0545105308348235 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 107 68 175 50.8416362120921 35.6894274539976 15.1522087580945 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0230690587730170 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:T T A 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 55224751 C/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162396:ENST00000371279:exon_55222571_55224863:PARS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 13 14 27 6.17702122202988 7.34782329935244 -1.17080207732256 A:G G A 10 0.524844521382317 0.702665708426939 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 58999651 T/G 1 20 19 39 9.50310957235366 9.97204590626402 -0.46893633391036 T:G T G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_58999621_58999732:OMA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 25 32 57 11.8788869654421 16.7950246842341 -4.91613771879207 T:C T C 10 0.524844521382317 0.232448771242303 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 59004762 G/A 1 21 19 40 9.97826505097134 9.97204590626402 0.00621914470732143 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000453710:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000482274:exon_59004467_59004982:OMA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 62329993 A/G 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G A G 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62329910_62330305:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62329910_62330305:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62329910_62330305:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62329910_62330305:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62329910_62330305:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62329910_62330305:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62329910_62330305:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62329910_62330305:INADL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 63879797 T/C 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000088035:ENST00000371108:exon_63879732_63879817:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000431147:exon_63879732_63879817:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000405765:exon_63879732_63879817:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000423077:exon_63879732_63879817:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000263440:exon_63879732_63879817:ALG6;ENSG00000088035:ENST00000465969:exon_63879327_63879817:ALG6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 64034070 G/A 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G G A 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000203965:ENST00000371088:exon_64033981_64034190:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000448122:exon_64033981_64034190:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000460678:exon_64033981_64034190:EFCAB7;ENSG00000203965:ENST00000461039:exon_64033981_64036799:EFCAB7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 64059177 A/G 1 24 46 70 11.4037314868244 24.1428479835866 -12.7391164967622 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00258918110631541 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64058947_64059405:PGM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 64095111 A/G 1 54 41 95 25.6583958453549 21.518625376675 4.13977046867989 A:G A G 10 0.524844521382317 0.412742966972673 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 64097432 C/T 1 26 21 47 12.3540424440598 11.0217349490287 1.3323074950311 T:C C T 10 0.524844521382317 0.770933837568702 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64097328_64097453:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64097328_64097453:PGM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 64120039 G/A 1 29 46 75 13.7795088799128 24.1428479835866 -10.3633391036738 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0202231653750839 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000483707:exon_64120003_64120116:PGM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 T:C T C 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 67787322 C/G 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 C:G C G 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67787285_67787572:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67787285_67787572:IL12RB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 67795319 T/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67795270_67795412:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67795270_67795412:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000441640:exon_67795270_67795412:IL12RB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 26 44 70 12.3540424440598 23.0931589408219 -10.7391164967622 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0116251964983127 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 70819872 C/A 1 13 17 30 6.17702122202988 8.92235686349939 -2.74533564146951 A:C C A 10 0.524844521382317 0.362755487440991 ENSG00000118454:ENST00000370944:exon_70819662_70820405:ANKRD13C;ENSG00000118454:ENST00000262346:exon_70819662_70820417:ANKRD13C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 17 53 70 8.07764313650061 27.8167596332628 -19.7391164967622 T:C T C 10 0.524844521382317 1.84608367949340e-06 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 75190435 A/T 1 45 7 52 21.3819965377957 3.67391164967622 17.7080848881195 A:T A T 10 0.524844521382317 3.9250983982022e-07 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75190395_75190518:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75190395_75190518:CRYZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 76209139 C/T 1 14 1 15 6.65217670064756 0.524844521382317 6.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00117052065970385 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 113 197 310 53.6925690837982 103.394370712316 -49.7018016285183 A:G A G 10 0.524844521382317 1.91284140903633e-08 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 79093910 G/A 1 104 158 262 49.416169776239 82.9254343784061 -33.509264602167 A:G G A 10 0.524844521382317 4.07737011343020e-05 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 79094081 T/A 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 A:T T A 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 85016177 A/G 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85016115_85016213:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85016115_85016213:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000490879:exon_85016115_85016213:SPATA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 85031630 G/A 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000460286:exon_85031544_85031877:SPATA1;ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85031524_85031695:CTBS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 85035692 T/C 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85035614_85035822:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85035614_85035822:CTBS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 86818544 T/C 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 86818578 A/G 1 11 4 15 5.22671026479451 2.09937808552927 3.12733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 0.125251659640691 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 47 44 91 22.3323074950311 23.0931589408219 -0.760851445790845 T:C T C 10 0.524844521382317 0.916568382624822 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 37 43 80 17.5807527088543 22.5683144194396 -4.98756171058536 C:G G C 10 0.524844521382317 0.265794935859418 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 89655787 T/C 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000162654:ENST00000355754:exon_89655721_89656001:GBP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 89655994 C/T 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000162654:ENST00000355754:exon_89655721_89656001:GBP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 90399881 C/T 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000171492:ENST00000337338:exon_90398626_90402170:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000394593:exon_90398626_90401560:LRRC8D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 90482903 A/G 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90482876_90483023:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90482876_90483023:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90482876_90483023:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90482876_90483023:ZNF326 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:G T G 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 91403094 C/T 1 14 11 25 6.65217670064756 5.77328973520549 0.878886965442075 T:C C T 10 0.524844521382317 0.842073148287916 ENSG00000122482:ENST00000370440:exon_91403042_91403647:ZNF644;ENSG00000122482:ENST00000337393:exon_91403042_91403647:ZNF644 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 91980447 A/G 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G A G 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000097046:ENST00000430031:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000370415:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000234626:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000428239:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000486509:exon_91980376_91980554:CDC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 91981367 C/G 1 3 13 16 1.42546643585305 6.82297877797012 -5.39751234211707 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00998332017730332 ENSG00000097046:ENST00000430031:exon_91981351_91981433:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000370415:exon_91981351_91981433:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000234626:exon_91981351_91981433:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000428239:exon_91981351_91981433:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000486509:exon_91981351_91981433:CDC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 93306317 G/A 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.595138344988413 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 93646312 G/A 1 1 9 10 0.475155478617683 4.72360069244085 -4.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0086522953032472 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000448243:exon_93646273_93646409:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 T:C C T 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 13 7 20 6.17702122202988 3.67391164967622 2.50310957235366 C:G C G 10 0.524844521382317 0.371027109529449 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 97272456 A/G 1 11 4 15 5.22671026479451 2.09937808552927 3.12733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 0.125251659640691 ENSG00000117569:ENST00000482253:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000236228:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000370198:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000370197:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000426398:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000476419:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000394184:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000394176:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000459735:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000476783:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000492905:exon_97272422_97272514:PTBP2;ENSG00000117569:ENST00000462433:exon_97272367_97272514:PTBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 C:G G C 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 109338921 A/G 1 15 10 25 7.12733217926525 5.24844521382317 1.87888696544208 A:G A G 10 0.524844521382317 0.549576175229901 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 109439516 G/A 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000121957:ENST00000406462:exon_109439486_109439707:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000435987:exon_109439486_109439707:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000264126:exon_109439486_109439707:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000369987:exon_109439486_109439707:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000435475:exon_109439486_109439654:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000446797:exon_109439486_109439585:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000431112:exon_109439486_109439707:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000427626:exon_109439486_109439585:GPSM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 109479978 G/T 1 23 20 43 10.9285760082067 10.4968904276463 0.431685580560371 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369970:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000348264:exon_109479699_109480040:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000302500:exon_109479699_109480040:CLCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 109642866 G/A 1 7 20 27 3.32608835032378 10.4968904276463 -7.17080207732256 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0064200223461747 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 110201643 G/A 1 60 56 116 28.509328717061 29.3912931974098 -0.881964480348771 A:G G A 10 0.524844521382317 0.92599707360231 ENSG00000168765:ENST00000369836:exon_110201622_110201732:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000326729:exon_110201622_110201732:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000336075:exon_110201622_110201732:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000495742:exon_110201622_110201732:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000369833:exon_110201622_110204364:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000485640:exon_110201622_110201732:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000478397:exon_110201622_110201946:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000444299:exon_110201622_110201897:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000493171:exon_110201622_110201732:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000493395:exon_110201622_110201732:GSTM4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 110203823 C/T 1 96 85 181 45.6149259472976 44.6117843174969 1.00314162980063 T:C C T 10 0.524844521382317 0.940702491780198 ENSG00000168765:ENST00000369836:exon_110203787_110204322:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000336075:exon_110203787_110204322:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000495742:exon_110203787_110204322:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000369833:exon_110201622_110204364:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000485640:exon_110203787_110203967:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000493171:exon_110203787_110203960:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000493395:exon_110203787_110204322:GSTM4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 110203853 G/A 1 93 97 190 44.1894595114445 50.9099185740847 -6.72045906264022 A:G G A 10 0.524844521382317 0.345394685180822 ENSG00000168765:ENST00000369836:exon_110203787_110204322:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000336075:exon_110203787_110204322:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000495742:exon_110203787_110204322:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000369833:exon_110201622_110204364:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000485640:exon_110203787_110203967:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000493171:exon_110203787_110203960:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000493395:exon_110203787_110204322:GSTM4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 29 29 58 13.7795088799128 15.2204911200872 -1.44098224017439 T:C T C 10 0.524844521382317 0.792882208385485 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 19 19 38 9.02795409373598 9.97204590626402 -0.944091812528043 A:G G A 10 0.524844521382317 0.871260583668888 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 16 18 34 7.60248765788293 9.4472013848817 -1.84471372699878 A:C C A 10 0.524844521382317 0.60750186092226 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 110766466 G/A 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000116396:ENST00000489935:exon_110765586_110766705:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000469655:exon_110765586_110766522:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000438661:exon_110765586_110766522:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000369787:exon_110765586_110766522:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000413138:exon_110765586_110766522:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000459877:exon_110762338_110768800:KCNC4;ENSG00000116396:ENST00000463629:exon_110766460_110766522:KCNC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 110883569 A/T 1 13 21 34 6.17702122202988 11.0217349490287 -4.84471372699878 A:T A T 10 0.524844521382317 0.121470856261209 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 111490770 A/T 1 53 62 115 25.1832403667372 32.5403603257037 -7.35711995896645 A:T A T 10 0.524844521382317 0.191076885761291 ENSG00000121931:ENST00000369763:exon_111489807_111491021:C1orf103;ENSG00000121931:ENST00000494675:exon_111489813_111491021:C1orf103;ENSG00000121931:ENST00000443367:exon_111489813_111491021:C1orf103;ENSG00000121931:ENST00000485275:exon_111489844_111491021:C1orf103 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 111740584 A/G 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111740542_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111740542_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000473682:exon_111738538_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000463713:exon_111740542_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000477586:exon_111740542_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000473822:exon_111740541_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000488786:exon_111740542_111740611:DENND2D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 111957688 T/C 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 111957693 A/G 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 111998679 C/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:C C A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 112999464 G/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000143079:ENST00000271277:exon_112998553_113003786:CTTNBP2NL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 113000067 C/T 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000143079:ENST00000271277:exon_112998553_113003786:CTTNBP2NL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 113197104 C/T 1 101 88 189 47.990703340386 46.1863178816439 1.80438545874209 T:C C T 10 0.524844521382317 0.82720752564122 ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 T:C C T 10 0.524844521382317 0.692551486497706 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 24 19 43 11.4037314868244 9.97204590626402 1.43168558056037 A:G A G 10 0.524844521382317 0.760592071157294 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 28 33 61 13.3043534012951 17.3198692056165 -4.01551580432134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.308536864379986 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 104 87 191 49.416169776239 45.6614733602616 3.75469641597746 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.612446993368833 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 29 20 49 13.7795088799128 10.4968904276463 3.28261845226647 A:G A G 10 0.524844521382317 0.392083216890412 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 114454598 G/A 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 A:G G A 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000118655:ENST00000369563:exon_114453753_114456708:DCLRE1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 114515717 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000163349:ENST00000426820:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000468363:exon_114515646_114516270:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369554:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000443627:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000411639:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369555:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369558:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369561:exon_114515646_114516193:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000340480:exon_114515646_114520426:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000369553:exon_114515646_114516503:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000406344:exon_114515646_114520422:HIPK1;ENSG00000163349:ENST00000361587:exon_114515646_114520426:HIPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 114973429 T/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 116234008 A/G 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000173218:ENST00000355485:exon_116233740_116240845:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000369510:exon_116233740_116236312:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000310260:exon_116233740_116234475:VANGL1;ENSG00000173218:ENST00000369509:exon_116233740_116234475:VANGL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 116946469 C/T 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.533187956556707 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 117078729 A/G 1 103 86 189 48.9410142976214 45.1366288388793 3.80438545874209 A:G A G 10 0.524844521382317 0.610484494671264 ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117078587_117078850:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117078587_117078850:CD58 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 117113552 T/C 1 228 169 397 108.335449124832 88.6987241136116 19.6367250112202 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0500316566315036 ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117113525_117113661:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117113525_117113606:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117113525_117113648:CD58;ENSG00000116815:ENST00000235461:exon_117113525_117113661:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117113525_117113661:CD58 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 117617844 A/G 1 16 22 38 7.60248765788293 11.546579470411 -3.94409181252805 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.255314267474421 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 118491102 G/A 1 31 10 41 14.7298198371482 5.24844521382317 9.481374623325 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00280749476971716 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118491028_118491129:WDR3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 118495153 T/G 1 30 32 62 14.2546643585305 16.7950246842341 -2.54036032570365 T:G T G 10 0.524844521382317 0.527798183512304 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 144909956 G/A 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 C C 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 144921924 G/A 0 11 0 11 5.22671026479451 0 5.22671026479451 G G 10 0.524844521382317 0.00111114617361232 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144921835_144922065:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532801:exon_144921835_144922020:PDE4DIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 144930596 C/A 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 144930940 T/C 0 11 0 11 5.22671026479451 0 5.22671026479451 T T 10 0.524844521382317 0.00111114617361232 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 144931330 C/T 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144930584_144931708:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 144931727 G/A 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 G G 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144930584_144932365:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144930584_144932148:PDE4DIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 1 1 75 76 0.475155478617683 39.3633391036738 -38.8881836250561 T:C T C 10 0.524844521382317 2.33704820306060e-23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 37 37 0 19.4192472911457 -19.4192472911457 A:T G T 10 0.524844521382317 1.10388141397886e-12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 42 42 0 22.0434698980573 -22.0434698980573 A C A 10 0.524844521382317 2.67362889866563e-14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 91 0 91 43.2391485542092 0 43.2391485542092 G G 10 0.524844521382317 5.32531274131459e-26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 61 61 0 32.0155158043213 -32.0155158043213 C T C 10 0.524844521382317 1.93633371752163e-20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 106 106 0 55.6335192665256 -55.6335192665256 T C T 10 0.524844521382317 5.55377854009582e-35 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 145440096 G/A 1 71 54 125 33.7360389818555 28.3416041546451 5.39443482721038 A:G G A 10 0.524844521382317 0.37068270374996 ENSG00000117289:ENST00000369317:exon_145440038_145440140:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000425134:exon_145440038_145440140:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000488537:exon_145440038_145440788:TXNIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 145585425 G/A 1 22 10 32 10.453420529589 5.24844521382317 5.20497531576586 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0766928270827685 ENSG00000131788:ENST00000393045:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000369298:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000475261:exon_145585356_145586546:PIAS3;ENSG00000131788:ENST00000472114:exon_145584799_145586546:PIAS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 149916185 C/A 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000163113:ENST00000369135:exon_149912231_149916964:OTUD7B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150129593 G/A 1 106 122 228 50.3664807334744 64.0310316086427 -13.6645508751683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0734551418073145 ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150129566_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000485470:exon_150129211_150129680:PLEKHO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150130983 G/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150131342 G/A 1 498 470 968 236.627428351606 246.676925049689 -10.0494966980828 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.520002084477629 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150239478 T/G 1 142 145 287 67.472077963711 76.102455600436 -8.63037763672497 T:G T G 10 0.524844521382317 0.315450784052255 ENSG00000117362:ENST00000414276:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000452164:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000433443:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000369109:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000360244:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000461320:exon_150239475_150239654:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000236017:exon_150239475_150239602:APH1A;ENSG00000117362:ENST00000486308:exon_150239356_150239878:APH1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150300880 C/T 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000117360:ENST00000324862:exon_150300779_150300925:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000496202:exon_150300779_150300925:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000467329:exon_150300234_150300925:PRPF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150808889 C/G 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 C:G C G 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000143437:ENST00000358595:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000322733:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000342710:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000394700:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000368975:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000471844:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000354396:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000515192:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000505755:exon_150808756_150808969:ARNT;ENSG00000143437:ENST00000468970:exon_150808756_150808975:ARNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150935968 T/C 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C T C 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000143379:ENST00000497314:exon_150935450_150936217:SETDB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150939264 A/G 1 51 43 94 24.2329294095018 22.5683144194396 1.6646149900622 A:G A G 10 0.524844521382317 0.757540226382979 ENSG00000143418:ENST00000482825:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496901:exon_150939232_150939427:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150939232_150939338:LASS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 150999737 A/G 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G A G 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000143363:ENST00000467771:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000462440:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000475722:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000450884:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_150999709_150999803:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_150999709_150999803:PRUNE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151021096 T/G 1 11 18 29 5.22671026479451 9.4472013848817 -4.22049112008719 T:G T G 10 0.524844521382317 0.137576283488010 ENSG00000143443:ENST00000368926:exon_151020216_151021328:C1orf56;ENSG00000143443:ENST00000433087:exon_151021010_151021328:C1orf56;ENSG00000143443:ENST00000465135:exon_151021045_151021328:C1orf56 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151134535 G/A 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000163155:ENST00000368908:exon_151134212_151134576:LYSMD1;ENSG00000163155:ENST00000440902:exon_151134212_151134576:LYSMD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151139822 A/G 1 191 174 365 90.7546964159775 91.3229467205231 -0.568250304545685 A:G A G 10 0.524844521382317 0.958251625967334 ENSG00000163156:ENST00000461862:exon_151139802_151140455:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368905:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368902:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000497147:exon_151139802_151139890:SCNM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151149487 A/G 1 95 99 194 45.1397704686799 51.9596076168494 -6.81983714816949 A:G A G 10 0.524844521382317 0.350202644893309 ENSG00000163159:ENST00000491094:exon_151146867_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000368892:exon_151148780_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000354473:exon_151148938_151149540:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000496809:exon_151149207_151149507:VPS72 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151237908 G/A 1 44 45 89 20.9068410591781 23.6180034622043 -2.71116240302621 A:G G A 10 0.524844521382317 0.596490532648722 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000462970:exon_151237870_151238064:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000437736:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000491857:exon_151237720_151238085:PSMD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151239720 G/A 1 230 182 412 109.285760082067 95.5217028915817 13.7640571904854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.182972481600526 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151239649_151239955:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151239649_151239935:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151239649_151239942:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239649_151239936:PSMD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151262977 C/T 1 16 24 40 7.60248765788293 12.5962685131756 -4.99378085529268 T:C C T 10 0.524844521382317 0.153335490017634 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151262908_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151262847_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151262847_151263049:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000436614:exon_151262927_151263049:ZNF687 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151288496 A/G 1 35 25 60 16.6304417516189 13.1211130345579 3.50932871706098 A:G A G 10 0.524844521382317 0.438275700640332 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151372652 C/T 1 426 386 812 202.416233891133 202.589985253574 -0.173751362441379 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372457_151372663:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372457_151372663:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372457_151372663:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372457_151372661:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151372650_151372663:PSMB4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 52 45 97 24.7080848881195 23.6180034622043 1.09008142591525 A:C A C 10 0.524844521382317 0.839630540077156 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151735007 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151747970 A/G 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G A G 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000182134:ENST00000525790:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368827:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368825:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000440583:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368824:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368823:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368822:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000458431:exon_151747868_151748019:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000526413:exon_151747868_151748019:TDRKH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151748920 T/G 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:G T G 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000182134:ENST00000525790:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368827:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368825:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000440583:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368824:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368823:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368822:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000458431:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000526413:exon_151748915_151749075:TDRKH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151955625 C/T 1 66 39 105 31.3602615887671 20.4689363339104 10.8913252548567 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0397000154019027 ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 151955747 A/G 1 55 55 110 26.1335513239726 28.8664486760274 -2.73289735205486 A:G A G 10 0.524844521382317 0.633699800430653 ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000478574:exon_151955708_151955800:S100A10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 152009397 A/C 1 102 224 326 48.4658588190037 117.565172789639 -69.0993139706353 A:T:C A C 10 0.524844521382317 1.27855135319761e-14 ENSG00000163191:ENST00000271638:exon_152009389_152009511:S100A11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 152882610 A/G 1 6 18 24 2.8509328717061 9.4472013848817 -6.59626851317561 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00754230684725108 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 152883608 G/A 1 6 16 22 2.8509328717061 8.39751234211707 -5.54657947041097 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0192663043809849 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 152883680 A/G 1 10 17 27 4.75155478617683 8.92235686349939 -4.17080207732256 A:G A G 10 0.524844521382317 0.124543972637999 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 152883711 G/C 1 9 14 23 4.27639930755915 7.34782329935244 -3.07142399179329 C:G G C 10 0.524844521382317 0.216326895269441 ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153507105 A/T 1 1 9 10 0.475155478617683 4.72360069244085 -4.24844521382317 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0086522953032472 ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153507176 C/T 1 210 64 274 99.7826505097134 33.5900493684683 66.1926011412451 T:C C T 10 0.524844521382317 2.18176814552344e-16 ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153520138 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000188015:ENST00000368713:exon_153519805_153520322:S100A3;ENSG00000188015:ENST00000368712:exon_153519989_153520322:S100A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153520203 G/A 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000188015:ENST00000368713:exon_153519805_153520322:S100A3;ENSG00000188015:ENST00000368712:exon_153519989_153520322:S100A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153631198 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000143553:ENST00000368685:exon_153631130_153631362:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000474959:exon_153631188_153631660:SNAPIN;ENSG00000143553:ENST00000462880:exon_153631190_153631362:SNAPIN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153635675 C/G 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000143621:ENST00000480213:exon_153635495_153635752:ILF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153640968 C/T 1 44 35 79 20.9068410591781 18.3695582483811 2.53728281079696 T:C C T 10 0.524844521382317 0.575819267119754 ENSG00000143621:ENST00000361891:exon_153640929_153641033:ILF2;ENSG00000143621:ENST00000368684:exon_153640929_153641052:ILF2;ENSG00000143621:ENST00000368681:exon_153640929_153641033:ILF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 54 59 113 25.6583958453549 30.9658267615567 -5.30743091620182 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.346553467960062 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 C:G G C 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 155 154 309 73.6490991857409 80.8260562928768 -7.17695710713595 A:G A G 10 0.524844521382317 0.425529609104525 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 19 19 38 9.02795409373598 9.97204590626402 -0.944091812528043 T:C T C 10 0.524844521382317 0.871260583668888 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 154209584 T/C 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 T:C T C 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000143569:ENST00000343815:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000271877:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000428931:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000368505:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000433006:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000456955:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000412596:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000368504:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000437652:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000456325:exon_154209500_154209612:UBAP2L;ENSG00000143569:ENST00000361546:exon_154209500_154209612:UBAP2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 78 72 150 37.0621273321793 37.7888055395268 -0.72667820734754 T:C C T 10 0.524844521382317 0.934934211911864 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 16 18 34 7.60248765788293 9.4472013848817 -1.84471372699878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.60750186092226 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 40 16 56 19.0062191447073 8.39751234211707 10.6087068025903 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00469617861804292 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155030557 A/C 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 A:C A C 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155210498 T/C 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C T C 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000177628:ENST00000368373:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000327247:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000402928:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000427500:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000428024:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000484489:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000493842:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000473570:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000467918:exon_155210421_155210508:GBA;ENSG00000177628:ENST00000470104:exon_155210421_155210508:GBA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155220929 G/A 1 26 22 48 12.3540424440598 11.546579470411 0.807462973648786 A:G G A 10 0.524844521382317 0.885512669161484 ENSG00000160767:ENST00000350210:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368370:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000423573:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368366:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368368:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000361361:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000323361:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000491082:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000497941:exon_155220886_155220955:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000472550:exon_155220886_155220955:FAM189B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 118 134 252 56.0683464768866 70.3291658652305 -14.2608193883439 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0773200686616713 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155699032 G/T 1 86 76 162 40.8633711611207 39.8881836250561 0.975187536064652 T:G G T 10 0.524844521382317 0.937333267495018 ENSG00000132676:ENST00000471214:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000421487:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000497826:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000463575:exon_155698999_155699082:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000479151:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000466384:exon_155698999_155699052:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000462978:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000477394:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000475056:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000490249:exon_155698999_155699157:DAP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155838267 T/C 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000132718:ENST00000368324:exon_155837756_155838582:SYT11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155931630 G/A 1 43 34 77 20.4316855805604 17.8447137269988 2.58697185356159 A:G G A 10 0.524844521382317 0.570510780123423 ENSG00000116584:ENST00000313695:exon_155931452_155931700:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000361247:exon_155931452_155931700:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000368315:exon_155931452_155931700:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000435736:exon_155931452_155931700:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000368316:exon_155931452_155931700:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000313667:exon_155931452_155931700:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000470975:exon_155931452_155931748:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000474428:exon_155931452_155931700:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000462460:exon_155931452_155931700:ARHGEF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155935158 T/C 1 30 27 57 14.2546643585305 14.1708020773226 0.0838622812079333 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000116584:ENST00000313695:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000361247:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000368315:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000435736:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000368316:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000313667:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000462460:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000470874:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000471589:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000497907:exon_155935094_155935203:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000476273:exon_155935094_155935203:ARHGEF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 155988108 A/G 1 243 222 465 115.462781304097 116.515483746874 -1.05270244277739 A:G A G 10 0.524844521382317 0.926082493607868 ENSG00000163479:ENST00000295702:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000368312:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000488179:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000529008:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000484320:exon_155987923_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000532074:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000480176:exon_155987923_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000473699:exon_155987923_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000480567:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000531790:exon_155988043_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000368311:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000472898:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000531917:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000474377:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000466905:exon_155988061_155988159:SSR2;ENSG00000163479:ENST00000526212:exon_155988061_155988159:SSR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156011444 T/C 1 12 1 13 5.7018657434122 0.524844521382317 5.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00389453711171081 ENSG00000160803:ENST00000368309:exon_156011276_156011462:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000368307:exon_156011276_156011462:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000368308:exon_156011276_156011462:UBQLN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156011983 C/T 0 0 9 9 0 4.72360069244085 -4.72360069244085 T C T 10 0.524844521382317 0.00123458691590234 ENSG00000160803:ENST00000368309:exon_156011944_156012027:UBQLN4;ENSG00000160803:ENST00000459954:exon_156011944_156012329:UBQLN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 172 183 355 81.7267423222415 96.046547412964 -14.3198050907225 T:C T C 10 0.524844521382317 0.136724918454046 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156108574 A/G 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.184542335086170 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156437754 C/A 1 12 15 27 5.7018657434122 7.87266782073475 -2.17080207732256 A:C C A 10 0.524844521382317 0.444663614174346 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 18 19 37 8.5527986151183 9.97204590626402 -1.41924729114573 A:G G A 10 0.524844521382317 0.742558906962133 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156561651 G/C 1 81 155 236 38.4875937680323 81.3509008142591 -42.8633070462268 A:C:G G C 10 0.524844521382317 2.21931805436334e-08 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156561555_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156561554_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156561554_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368233:exon_156561570_156561778:APOA1BP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156563726 A/C 1 121 147 268 57.4938129127396 77.1521446432006 -19.658331730461 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0170148950807816 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156563813 G/A 1 63 55 118 29.934795152914 28.8664486760274 1.0683464768866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.854351089358151 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156563852 C/T 1 141 109 250 66.9969224850933 57.2080528306725 9.78886965442076 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.229034307750985 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156565218 C/T 1 165 152 317 78.4006539719177 79.7763672501122 -1.37571327819447 T:C C T 10 0.524844521382317 0.910479247683124 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156565050_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156565005_156565641:GPATCH4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156568252 A/G 1 73 68 141 34.6863499390909 35.6894274539976 -1.00307751490669 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.86657487157619 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000497287:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000506832:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531900:exon_156568213_156568286:GPATCH4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156571243 G/C 1 20 15 35 9.50310957235366 7.87266782073475 1.63044175161891 C:G G C 10 0.524844521382317 0.615385496008195 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156571201_156571282:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156571201_156571254:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000473910:exon_156571201_156571263:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531129:exon_156571201_156571271:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156571201_156571258:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000506832:exon_156571201_156571271:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000527691:exon_156571201_156571288:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000334588:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531900:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000525375:exon_156571201_156571271:GPATCH4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 20 20 0 10.4968904276463 -10.4968904276463 C:G A C 10 0.524844521382317 3.44123888985391e-07 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 157062739 C/G 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000253831:ENST00000454449:exon_157061836_157062919:ETV3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 157069154 A/G 1 1 18 19 0.475155478617683 9.4472013848817 -8.97204590626402 A:G A G 10 0.524844521382317 2.07164020861032e-05 ENSG00000253831:ENST00000454449:exon_157068933_157069170:ETV3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 157508882 C/T 1 18 10 28 8.5527986151183 5.24844521382317 3.30435340129513 T:C C T 10 0.524844521382317 0.257388498750569 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 157509025 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157508876_157509154:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157508876_157509154:FCRL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 157516802 A/G 1 15 9 24 7.12733217926525 4.72360069244085 2.40373148682439 A:G A G 10 0.524844521382317 0.414775891663106 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000481082:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368188:exon_157516733_157516987:FCRL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 214 269 483 101.683272424184 141.183176251843 -39.4999038276591 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000369963859465636 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 153 105 258 72.6987882285055 55.1086747451433 17.5901134833622 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0291306466892344 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 139 88 227 66.0466115278579 46.1863178816439 19.8602936462141 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0094051689877106 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 159035958 T/G 1 12 30 42 5.7018657434122 15.7453356414695 -10.0434698980573 T:G T G 10 0.524844521382317 0.00284979400908911 ENSG00000163568:ENST00000368130:exon_159035700_159036119:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000368129:exon_159035700_159036119:AIM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160302298 T/C 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 T:C T C 10 0.524844521382317 0.433796952873074 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160302238_160302347:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160302238_160302347:COPA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160318829 G/C 1 29 7 36 13.7795088799128 3.67391164967622 10.1055972302366 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000663891313230356 ENSG00000162736:ENST00000368065:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000437169:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000421914:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000438008:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000467837:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000491332:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160318789_160318912:NCSTN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160321065 A/G 1 21 17 38 9.97826505097134 8.92235686349939 1.05590818747195 A:G A G 10 0.524844521382317 0.748575149689197 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321012_160321162:NCSTN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160460392 G/A 1 25 22 47 11.8788869654421 11.546579470411 0.332307495031102 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162739:ENST00000368059:exon_160460365_160460475:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368057:exon_160460365_160460475:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368055:exon_160460365_160460475:SLAMF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160604473 G/A 1 461 425 886 219.046675642752 223.058921587485 -4.01224594473283 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.787972996268172 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160604403_160604687:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160604403_160604687:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160604403_160604687:SLAMF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160788067 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160788008_160788109:LY9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 14 25 39 6.65217670064756 13.1211130345579 -6.46893633391036 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0529615469721393 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 38 36 74 18.055908187472 18.8944027697634 -0.838494582291453 A:G A G 10 0.524844521382317 0.907491906097173 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 160968873 C/T 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160968833_160968881:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160968833_160968881:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160968833_160968881:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160968833_160968881:F11R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 161018422 C/G 1 327 328 655 155.375841507982 172.1490030134 -16.7731615054176 C:G C G 10 0.524844521382317 0.196724901311981 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 161088583 T/G 1 26 26 52 12.3540424440598 13.6459575559402 -1.29191511188048 T:G T G 10 0.524844521382317 0.781842383630529 ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000453609:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000486962:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000492411:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000478277:exon_161088576_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000496861:exon_161088010_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000491497:exon_161088171_161088671:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161088576_161088671:NIT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 161094190 A/G 1 18 29 47 8.5527986151183 15.2204911200872 -6.6676925049689 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0576721294595669 ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161093931_161095235:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000479728:exon_161093931_161094601:NIT1;ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000458050:exon_161094130_161094252:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000473679:exon_161094130_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161093928_161094316:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161093928_161094316:DEDD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 161145005 C/T 1 24 32 56 11.4037314868244 16.7950246842341 -5.39129319740975 T:C C T 10 0.524844521382317 0.180549101596511 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161144924_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161144783_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000493164:exon_161144697_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000496313:exon_161144785_161145018:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000487004:exon_161144842_161145018:B4GALT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 161199608 C/A 1 24 17 41 11.4037314868244 8.92235686349939 2.481374623325 A:C C A 10 0.524844521382317 0.532225835483175 ENSG00000158882:ENST00000367988:exon_161198746_161200397:TOMM40L;ENSG00000158882:ENST00000474486:exon_161198746_161200405:TOMM40L;ENSG00000158882:ENST00000367987:exon_161198746_161200408:TOMM40L;ENSG00000143257:ENST00000367983:exon_161199456_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000367980:exon_161199456_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000488651:exon_161199460_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000464422:exon_161199461_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000479324:exon_161199470_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000506018:exon_161199480_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000367982:exon_161199480_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000508387:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000504010:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000511676:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000502985:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000512340:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000510951:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000367981:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000502848:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000515621:exon_161199527_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000367984:exon_161199562_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000367985:exon_161199562_161199716:NR1I3;ENSG00000143257:ENST00000367979:exon_161199587_161199716:NR1I3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 161882125 A/G 1 30 35 65 14.2546643585305 18.3695582483811 -4.1148938898506 A:G A G 10 0.524844521382317 0.322492508042395 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161882086_161882170:ATF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 162546608 C/T 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000117143:ENST00000412525:exon_162546567_162546771:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367926:exon_162546567_162546771:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000271469:exon_162546567_162546771:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000414807:exon_162546567_162546771:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367925:exon_162546567_162546771:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367924:exon_162546567_162546771:UAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 162766387 A/G 1 16 17 33 7.60248765788293 8.92235686349939 -1.31986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.728380954880147 ENSG00000132196:ENST00000485405:exon_162766375_162766467:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000463037:exon_162766375_162766467:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000466176:exon_162766375_162766467:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000367917:exon_162766375_162766467:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000254521:exon_162766375_162766467:HSD17B7;ENSG00000132196:ENST00000367913:exon_162766375_162766467:HSD17B7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 163313568 A/C 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163313523_163313660:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163313523_163313613:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000531529:exon_163313523_163313605:NUF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 165649851 C/G 1 15 16 31 7.12733217926525 8.39751234211707 -1.27018016285183 C:G C G 10 0.524844521382317 0.720479372385213 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165649724_165649920:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165649724_165649872:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165649724_165649920:ALDH9A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G A G 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 166827495 C/G 1 12 11 23 5.7018657434122 5.77328973520549 -0.0714239917932904 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166827356_166827518:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166827356_166827518:TADA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 85 73 158 40.3882156825031 38.3136500609091 2.07456562159392 A:G G A 10 0.524844521382317 0.750747862767155 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 167944207 C/T 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000143164:ENST00000450548:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470919:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000455334:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167944068_167944253:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000491067:exon_167944068_167944253:DCAF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 168153149 T/C 1 63 65 128 29.934795152914 34.1148938898506 -4.18009873693657 T:C T C 10 0.524844521382317 0.479713391778267 ENSG00000143155:ENST00000367833:exon_168153140_168153319:TIPRL;ENSG00000143155:ENST00000401737:exon_168153140_168153319:TIPRL;ENSG00000143155:ENST00000367830:exon_168153140_168153319:TIPRL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 171483717 A/C 1 50 49 99 23.7577739308842 25.7173815477335 -1.95960761684938 A:C A C 10 0.524844521382317 0.762918458682009 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 24 29 53 11.4037314868244 15.2204911200872 -3.8167596332628 A:G A G 10 0.524844521382317 0.336257786199144 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 26 35 61 12.3540424440598 18.3695582483811 -6.01551580432133 A:G G A 10 0.524844521382317 0.126106688745431 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 173833483 A/C 1 124 104 228 58.9192793485927 54.583830223761 4.33544912483173 A:C A C 10 0.524844521382317 0.595996331275785 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 173834011 T/C 1 41 58 99 19.481374623325 30.4409822401744 -10.9596076168494 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0340608435433293 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 22 23 45 10.453420529589 12.0714239917933 -1.61800346220426 A:G G A 10 0.524844521382317 0.6566337577171 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 179310244 G/A 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 180062290 T/A 1 20 22 42 9.50310957235366 11.546579470411 -2.04346989805731 A:T T A 10 0.524844521382317 0.540723179616973 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180061749_180063751:CEP350 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 180165608 C/A 1 48 48 96 22.8074629736488 25.1925370263512 -2.38507405270243 A:C C A 10 0.524844521382317 0.682990864321853 ENSG00000116260:ENST00000392029:exon_180165397_180165734:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1;ENSG00000116260:ENST00000367600:exon_180165397_180165734:QSOX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 180804033 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000143324:ENST00000367590:exon_180804010_180804181:XPR1;ENSG00000143324:ENST00000367589:exon_180804010_180804181:XPR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 8 15 23 3.80124382894146 7.87266782073475 -4.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0980444399895555 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 181706685 C/T 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181706661_181706790:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181706661_181706790:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181706661_181706790:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181706661_181706790:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181706661_181706790:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181706661_181706790:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181706661_181706790:CACNA1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 181725110 T/C 1 19 8 27 9.02795409373598 4.19875617105854 4.82919792267744 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0816233984370558 ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181725092_181725229:CACNA1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 181741301 C/T 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181741202_181741367:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181741202_181741367:CACNA1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 27 52 79 12.8291979226774 27.2919151118805 -14.462717189203 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00144937716701820 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 182569445 G/A 1 65 39 104 30.8851061101494 20.4689363339104 10.416169776239 A:G G A 10 0.524844521382317 0.049076506953186 ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182567758_182569648:RGS16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 182827297 G/A 1 23 22 45 10.9285760082067 11.546579470411 -0.618003462204264 A:G G A 10 0.524844521382317 0.882226148319876 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182827239_182827375:DHX9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 34 33 67 16.1552862730012 17.3198692056165 -1.16458293261524 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807499828168291 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 183103848 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183103795_183103944:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183103825_183103944:LAMC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 15 4 19 7.12733217926525 2.09937808552927 5.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0219757172151644 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 183596703 G/A 1 106 125 231 50.3664807334744 65.6055651727896 -15.2390844393152 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0480250517013059 ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183595329_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183595352_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183595593_183596729:ARPC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 183599638 C/T 1 87 70 157 41.3385266397384 36.7391164967622 4.59941014297624 T:C C T 10 0.524844521382317 0.473151791457365 ENSG00000162704:ENST00000367534:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183599596_183599772:ARPC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 184787943 C/T 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184787772_184787959:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184787772_184787959:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184787772_184787959:FAM129A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 72 90 162 34.2111944604732 47.2360069244085 -13.0248124639353 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0410832862923210 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 197070313 G/A 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 A:G G A 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 197115595 C/T 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197115271_197115824:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197115271_197115824:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197115271_197115824:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197115271_197115824:ASPM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 198201701 G/T 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:G G T 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000151414:ENST00000367385:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000442588:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000391974:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000367383:exon_198201683_198201767:NEK7;ENSG00000151414:ENST00000417895:exon_198201683_198201767:NEK7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 198676063 A/C 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000081237:ENST00000367379:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000530727:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367367:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198675863_198676081:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000529828:exon_198675863_198676081:PTPRC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 198677386 G/A 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000530727:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367367:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198677262_198677390:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000529828:exon_198677262_198677390:PTPRC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 200534248 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200534197_200534381:KIF14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 200571136 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200571024_200571196:KIF14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 46 33 79 21.8571520164134 17.3198692056165 4.53728281079696 A:T A T 10 0.524844521382317 0.313460677187901 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 81 77 158 38.4875937680323 40.4130281464384 -1.92543437840608 A:G G A 10 0.524844521382317 0.811232702910495 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 19 22 41 9.02795409373598 11.546579470411 -2.518625376675 T:C T C 10 0.524844521382317 0.439415065816683 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 202705455 G/C 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 C:G G C 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202705341_202705520:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202705341_202705520:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202705341_202705520:KDM5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 202715284 G/A 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202715270_202715451:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000498276:exon_202715270_202715723:KDM5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 202718202 G/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202718073_202718267:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202718073_202718267:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202718073_202718267:KDM5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 202888947 T/C 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000117153:ENST00000367261:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000435533:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367260:exon_202888883_202889036:KLHL12;ENSG00000117153:ENST00000367258:exon_202888883_202889036:KLHL12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 203809482 C/T 1 35 38 73 16.6304417516189 19.944091812528 -3.31365006090914 T:C C T 10 0.524844521382317 0.482568362254026 ENSG00000058673:ENST00000453771:exon_203809434_203809502:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203809434_203809502:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203809434_203809502:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203809434_203809502:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203809434_203809502:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203809434_203809502:ZC3H11A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 204379452 T/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000158615:ENST00000367188:exon_204378620_204380919:PPP1R15B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 204438643 G/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:G G T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000133056:ENST00000367187:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000424712:exon_204437998_204439014:PIK3C2B;ENSG00000133056:ENST00000415899:exon_204438538_204439014:PIK3C2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 205069162 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000117222:ENST00000264515:exon_205069039_205069192:RBBP5;ENSG00000117222:ENST00000367164:exon_205069039_205069192:RBBP5;ENSG00000117222:ENST00000391939:exon_205069039_205069192:RBBP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 205632365 G/A 1 16 8 24 7.60248765788293 4.19875617105854 3.40373148682439 A:G G A 10 0.524844521382317 0.219804585617063 ENSG00000158715:ENST00000367145:exon_205631961_205632746:SLC45A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 205744138 G/T 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:G G T 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000117280:ENST00000367139:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000235932:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000528078:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000367140:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000446390:exon_205743961_205744361:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000414729:exon_205743961_205744587:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000492534:exon_205743961_205744279:RAB7L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 206647787 T/C 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 T:C T C 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206647674_206647814:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206647674_206647814:IKBKE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 206776480 C/T 1 69 56 125 32.7857280246201 29.3912931974098 3.39443482721038 T:C C T 10 0.524844521382317 0.591320173772335 ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000437518:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000461334:exon_206776437_206776558:LGTN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 206821286 G/A 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000143479:ENST00000391931:exon_206820733_206822541:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367109:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367105:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367108:exon_206820733_206822542:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000441486:exon_206820733_206821334:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367106:exon_206820733_206822459:DYRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 206905040 C/T 1 39 48 87 18.5310636660896 25.1925370263512 -6.66147336026157 T:C C T 10 0.524844521382317 0.163545446851782 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 28 23 51 13.3043534012951 12.0714239917933 1.23292940950183 A:G A G 10 0.524844521382317 0.780206773779193 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 25 32 57 11.8788869654421 16.7950246842341 -4.91613771879207 A:G A G 10 0.524844521382317 0.232448771242303 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 24 19 43 11.4037314868244 9.97204590626402 1.43168558056037 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.760592071157294 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 52 48 100 24.7080848881195 25.1925370263512 -0.484452138231696 C:G C G 10 0.524844521382317 0.92069198377217 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 210004199 C/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 C:G C G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210004148_210004388:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210004148_210004388:C1orf107 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 210015990 T/A 1 2 9 11 0.950310957235366 4.72360069244085 -3.77328973520549 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0314919893609911 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210015928_210016040:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000457820:exon_210015610_210017977:C1orf107 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 211451467 T/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 36 40 76 17.1055972302366 20.9937808552927 -3.88818362505609 T:C T C 10 0.524844521382317 0.421714408347958 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 26 9 35 12.3540424440598 4.72360069244085 7.63044175161891 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0105932264675463 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 212273603 C/T 1 27 21 48 12.8291979226774 11.0217349490287 1.80746297364879 T:C C T 10 0.524844521382317 0.665677360166854 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 212273639 C/T 1 17 22 39 8.07764313650061 11.546579470411 -3.46893633391036 T:C C T 10 0.524844521382317 0.336176624282279 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 212560366 G/C 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 C:G G C 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000065600:ENST00000261455:exon_212560233_212560442:TMEM206;ENSG00000065600:ENST00000467822:exon_212560233_212560442:TMEM206;ENSG00000065600:ENST00000471937:exon_212560233_212560442:TMEM206 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 116 125 241 55.1180355196512 65.6055651727896 -10.4875296531384 T:C T C 10 0.524844521382317 0.196978852689535 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 213124871 G/A 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 G G 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 ENSG00000143494:ENST00000427709:exon_213124681_213125160:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000366965:exon_213124681_213125160:VASH2;ENSG00000143494:ENST00000493155:exon_213124870_213125160:VASH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 213414285 A/G 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136643:ENST00000366960:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000366959:exon_213414045_213415640:RPS6KC1;ENSG00000136643:ENST00000490299:exon_213414045_213415640:RPS6KC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 22 20 42 10.453420529589 10.4968904276463 -0.0434698980573121 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214813782 A/G 1 15 12 27 7.12733217926525 6.2981342565878 0.829197922677442 A:G A G 10 0.524844521382317 0.848089388772471 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214813941 C/G 1 15 19 34 7.12733217926525 9.97204590626402 -2.84471372699878 C:G C G 10 0.524844521382317 0.391439920205275 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214814125 G/A 1 21 24 45 9.97826505097134 12.5962685131756 -2.61800346220426 A:G G A 10 0.524844521382317 0.458480647164994 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214814582 G/A 1 14 9 23 6.65217670064756 4.72360069244085 1.92857600820671 A:G G A 10 0.524844521382317 0.532398335432504 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214814733 T/G 1 23 12 35 10.9285760082067 6.2981342565878 4.63044175161891 T:G T G 10 0.524844521382317 0.129621671818285 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 21 11 32 9.97826505097134 5.77328973520549 4.20497531576586 A:G G A 10 0.524844521382317 0.158119016878846 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214814995 C/T 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 T:C C T 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214815916 T/C 1 8 12 20 3.80124382894146 6.2981342565878 -2.49689042764634 T:C T C 10 0.524844521382317 0.273827921303142 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214815974 A/C 1 5 15 20 2.37577739308842 7.87266782073475 -5.49689042764634 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0226256809064239 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214816142 T/G 1 21 7 28 9.97826505097134 3.67391164967622 6.30435340129512 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0217271342720107 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214816224 G/A 1 22 16 38 10.453420529589 8.39751234211707 2.05590818747195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.521170691333303 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214818215 G/A 1 36 27 63 17.1055972302366 14.1708020773226 2.93479515291403 A:G G A 10 0.524844521382317 0.52865783393892 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214818223 T/A 1 36 28 64 17.1055972302366 14.6956465987049 2.40995063153171 A:T T A 10 0.524844521382317 0.617129185638796 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214818846 A/G 1 16 28 44 7.60248765788293 14.6956465987049 -7.09315894082195 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0348412148084931 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214818945 A/C 1 30 25 55 14.2546643585305 13.1211130345579 1.13355132397257 A:C A C 10 0.524844521382317 0.7885860107291 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214819044 C/T 1 32 42 74 15.2049753157659 22.0434698980573 -6.83849458229146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.129947451339741 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214819328 G/A 1 58 49 107 27.5590177598256 25.7173815477335 1.84163621209208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.771822745959642 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214819587 A/G 1 55 37 92 26.1335513239726 19.4192472911457 6.71430403282684 A:G A G 10 0.524844521382317 0.175265803424693 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214819980 C/T 1 50 52 102 23.7577739308842 27.2919151118805 -3.53414118099633 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.489575500486146 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214820299 A/G 1 47 30 77 22.3323074950311 15.7453356414695 6.58697185356159 A:G A G 10 0.524844521382317 0.139288142880640 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214820494 G/A 1 56 47 103 26.6087068025902 24.6676925049689 1.94101429762135 A:G G A 10 0.524844521382317 0.767455166266974 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214820524 T/C 1 67 53 120 31.8354170673848 27.8167596332628 4.01865743412197 T:C T C 10 0.524844521382317 0.522473830321302 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214828589 C/T 1 55 57 112 26.1335513239726 29.9161377187921 -3.7825863948195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.508275953231958 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214828584_214828746:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214828491_214828746:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 74 53 127 35.1615054177085 27.8167596332628 7.34474578444575 A:G A G 10 0.524844521382317 0.213596901783457 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 217604492 C/T 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217600334_217604707:GPATCH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 28 29 57 13.3043534012951 15.2204911200872 -1.91613771879207 T:C C T 10 0.524844521382317 0.691144168843661 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 220162123 C/G 1 161 164 325 76.500032057447 86.0745015067 -9.57446944925302 C:G C G 10 0.524844521382317 0.291803038372209 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220161932_220162165:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220161932_220162165:EPRS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 220344453 T/C 1 12 4 16 5.7018657434122 2.09937808552927 3.60248765788293 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0825793217037308 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220344234_220344462:RAB3GAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 220928376 T/C 1 6 32 38 2.8509328717061 16.7950246842341 -13.944091812528 T:C T C 10 0.524844521382317 4.4237492989684e-06 ENSG00000117791:ENST00000469583:exon_220928289_220928402:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220928289_220928462:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220928314_220928462:MOSC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 222802376 A/G 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 A:G A G 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 222802803 T/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:G T G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 222803204 A/G 1 10 17 27 4.75155478617683 8.92235686349939 -4.17080207732256 A:G A G 10 0.524844521382317 0.124543972637999 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 223976870 T/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000143514:ENST00000391879:exon_223976710_223976876:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000447749:exon_223976710_223976876:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000391878:exon_223976710_223976876:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000343537:exon_223976710_223976876:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000360391:exon_223976710_223976876:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000483398:exon_223976710_223976876:TP53BP2;ENSG00000143514:ENST00000498843:exon_223976710_223976876:TP53BP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 224302047 C/T 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000143756:ENST00000366862:exon_224301789_224302098:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000424254:exon_224301813_224302098:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000523990:exon_224301821_224302098:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000483773:exon_224301873_224302098:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000519894:exon_224301920_224302098:FBXO28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 224495852 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224495693_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224495693_224495919:NVL;ENSG00000143748:ENST00000470903:exon_224495688_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000461466:exon_224495695_224495965:NVL;ENSG00000143748:ENST00000498767:exon_224495710_224495965:NVL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 225611661 C/T 1 24 11 35 11.4037314868244 5.77328973520549 5.63044175161891 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0631291440724101 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225611613_225611791:LBR;ENSG00000143815:ENST00000421383:exon_225611623_225611791:LBR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 226019633 T/C 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000143819:ENST00000445856:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000448202:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000467015:exon_226019480_226019864:EPHX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 226032928 G/A 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 A:G G A 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 226553690 T/C 1 152 194 346 72.2236327498878 101.819837148169 -29.5962043982817 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00147864344904303 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226553655_226553753:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226553655_226553753:PARP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 157 156 313 74.5994101429762 81.8757453356414 -7.2763351926652 A:G A G 10 0.524844521382317 0.428350490236032 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 138 101 239 65.5714560492403 53.009296659614 12.5621593896262 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.105792953658756 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 227069677 T/C 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 227152916 C/T 1 7 22 29 3.32608835032378 11.546579470411 -8.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00249073226876617 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227152863_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227152864_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227152864_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227152864_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227152810_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000489044:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227152863_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227152701_227153111:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227152701_227153111:ADCK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 227216662 T/C 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 C T C 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000143776:ENST00000366769:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366767:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000448940:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366766:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000334218:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366764:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366762:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000442054:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000366765:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000429440:exon_227216358_227216951:CDC42BPA;ENSG00000143776:ENST00000441725:exon_227216358_227216951:CDC42BPA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 48 42 90 22.8074629736488 22.0434698980573 0.763993075591472 T:C C T 10 0.524844521382317 0.916150623098627 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 34 28 62 16.1552862730012 14.6956465987049 1.45963967429635 A:G A G 10 0.524844521382317 0.799529618076043 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 228362682 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000181873:ENST00000366711:exon_228362393_228362730:C1orf69;ENSG00000181873:ENST00000484749:exon_228362393_228362730:C1orf69 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 229771038 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 230384937 T/C 1 15 19 34 7.12733217926525 9.97204590626402 -2.84471372699878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.391439920205275 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230384930_230385017:GALNT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 58 56 114 27.5590177598256 29.3912931974098 -1.83227543758414 T:C T C 10 0.524844521382317 0.778685661786286 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 230814668 A/G 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 A:G A G 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000135775:ENST00000494371:exon_230814659_230819174:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230814659_230814798:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230814659_230814798:COG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 230979247 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000119280:ENST00000366663:exon_230979100_230979642:C1orf198;ENSG00000119280:ENST00000470540:exon_230979100_230979642:C1orf198;ENSG00000119280:ENST00000427697:exon_230979100_230979603:C1orf198;ENSG00000119280:ENST00000523410:exon_230979100_230979642:C1orf198;ENSG00000119280:ENST00000456313:exon_230979100_230979642:C1orf198 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 10 24 34 4.75155478617683 12.5962685131756 -7.84471372699878 A:T T A 10 0.524844521382317 0.00910321440621117 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 231377150 C/T 1 22 11 33 10.453420529589 5.77328973520549 4.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.117742155361885 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 232942028 A/G 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000212916:ENST00000418460:exon_232940643_232946092:KIAA1383 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 232942251 A/G 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000212916:ENST00000418460:exon_232940643_232946092:KIAA1383 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 232942276 G/A 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000212916:ENST00000418460:exon_232940643_232946092:KIAA1383 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 234509586 G/A 1 16 19 35 7.60248765788293 9.97204590626402 -2.36955824838109 A:G G A 10 0.524844521382317 0.499305362167602 ENSG00000168275:ENST00000366613:exon_234509429_234509586:C1orf31;ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 14 15 29 6.65217670064756 7.87266782073475 -1.22049112008719 A:G A G 10 0.524844521382317 0.711938142382318 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 39 9 48 18.5310636660896 4.72360069244085 13.8074629736488 T:C C T 10 0.524844521382317 6.05692524196123e-05 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 1 47 2 49 22.3323074950311 1.04968904276463 21.2826184522665 A:G G A 10 0.524844521382317 2.31450576875221e-11 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 44 4 48 20.9068410591781 2.09937808552927 18.8074629736488 T:C C T 10 0.524844521382317 6.22791063464498e-09 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 43 8 51 20.4316855805604 4.19875617105854 16.2329294095018 A:G G A 10 0.524844521382317 3.31976019490394e-06 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 234546245 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000463793:exon_234546150_234546277:TARBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 43 56 99 20.4316855805604 29.3912931974098 -8.95960761684938 T:C T C 10 0.524844521382317 0.08663312576812 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 235324545 T/A 1 26 20 46 12.3540424440598 10.4968904276463 1.85715201641342 A:T:G T A 10 0.524844521382317 0.658717870168319 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324489_235324772:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324489_235324571:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324489_235324549:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324489_235324547:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324489_235324573:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324489_235324598:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324489_235324772:ARID4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 235600741 A/G 1 18 8 26 8.5527986151183 4.19875617105854 4.35404244405976 A:G A G 10 0.524844521382317 0.115132819997145 ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235600637_235600789:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235600637_235600789:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235600637_235600789:TBCE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236157128 C/G 0 0 10 10 0 5.24844521382317 -5.24844521382317 G C G 10 0.524844521382317 0.000586620736920706 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236156945_236157172:NID1;ENSG00000116962:ENST00000366595:exon_236156945_236157172:NID1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236175339 T/C 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 T T 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000116962:ENST00000264187:exon_236175221_236175343:NID1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 23 8 31 10.9285760082067 4.19875617105854 6.72981983714817 A:T T A 10 0.524844521382317 0.018392189144627 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 13 3 16 6.17702122202988 1.57453356414695 4.60248765788293 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0237583940442548 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 0 16 0 16 7.60248765788293 0 7.60248765788293 C C 10 0.524844521382317 3.99016046513400e-05 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236702209 C/T 1 17 6 23 8.07764313650061 3.1490671282939 4.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0579341542498876 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 18 5 23 8.5527986151183 2.62422260691158 5.92857600820671 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0195647809515236 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 25 8 33 11.8788869654421 4.19875617105854 7.68013079438354 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0082452712515917 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236706862 G/C 1 18 19 37 8.5527986151183 9.97204590626402 -1.41924729114573 C:G G C 10 0.524844521382317 0.742558906962133 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236706061_236706909:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 44 30 74 20.9068410591781 15.7453356414695 5.16150541770854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.245856957047118 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 22 23 45 10.453420529589 12.0714239917933 -1.61800346220426 T:C C T 10 0.524844521382317 0.6566337577171 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 29 32 61 13.7795088799128 16.7950246842341 -3.01551580432134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.445259838410939 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 46 44 90 21.8571520164134 23.0931589408219 -1.23600692440853 T:C T C 10 0.524844521382317 0.833180452151922 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236719135 T/C 1 61 46 107 28.9844841956787 24.1428479835866 4.84163621209208 T:C T C 10 0.524844521382317 0.384046958205671 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 48 48 96 22.8074629736488 25.1925370263512 -2.38507405270243 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.682990864321853 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 43 22 65 20.4316855805604 11.546579470411 8.8851061101494 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0339977288664354 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236721660 T/C 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236734896 T/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236734868_236734986:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236734868_236734986:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236746443 C/T 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236746313_236746496:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236746313_236746496:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236755837 C/T 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236755823_236755933:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236755823_236755933:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 236767330 A/G 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236767254_236767427:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366579:exon_236767254_236767427:HEATR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 241663825 G/A 1 42 68 110 19.9565301019427 35.6894274539976 -15.7328973520549 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.00296078685140834 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241663737_241663890:FH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 241676972 G/A 1 57 54 111 27.0838622812079 28.3416041546451 -1.25774187343718 A:G G A 10 0.524844521382317 0.849491687910092 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241676903_241677013:FH;ENSG00000091483:ENST00000497042:exon_241676903_241676976:FH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 241803317 C/G 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000054277:ENST00000366554:exon_241803184_241803663:OPN3;ENSG00000054277:ENST00000331838:exon_241803184_241803701:OPN3;ENSG00000054277:ENST00000469376:exon_241803184_241803642:OPN3;ENSG00000054277:ENST00000490673:exon_241803184_241803657:OPN3;ENSG00000054277:ENST00000478849:exon_241803184_241803512:OPN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 243493867 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000054282:ENST00000448231:exon_243493842_243493994:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000343783:exon_243493842_243493994:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243493842_243493994:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243493842_243493994:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000435549:exon_243493842_243493994:SDCCAG8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 245850095 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 4 15 19 1.90062191447073 7.87266782073475 -5.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0094965169246955 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 246922343 A/G 1 26 39 65 12.3540424440598 20.4689363339104 -8.1148938898506 A:G A G 10 0.524844521382317 0.04713537094619 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 246922390 A/G 1 61 36 97 28.9844841956787 18.8944027697634 10.0900814259153 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0421577929227729 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 38 32 70 18.055908187472 16.7950246842341 1.26088350323781 C:G G C 10 0.524844521382317 0.81141695407172 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 247264347 T/C 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000188295:ENST00000448299:exon_247263264_247264621:ZNF669;ENSG00000188295:ENST00000358785:exon_247263264_247264621:ZNF669;ENSG00000188295:ENST00000343381:exon_247263293_247264621:ZNF669;ENSG00000188295:ENST00000366501:exon_247264158_247264621:ZNF669 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 247319946 G/C 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000196418:ENST00000366499:exon_247319191_247321268:ZNF124;ENSG00000196418:ENST00000340684:exon_247319191_247320519:ZNF124 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 247464545 A/G 1 12 21 33 5.7018657434122 11.0217349490287 -5.31986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0803628498484152 ENSG00000162714:ENST00000462139:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000461277:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000294753:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000366498:exon_247463623_247464578:ZNF496 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 19 29 48 9.02795409373598 15.2204911200872 -6.19253702635121 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0830236028693157 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 860990 G/A 1 18 17 35 8.5527986151183 8.92235686349939 -0.369558248381093 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000107929:ENST00000316157:exon_860886_861010:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000448368:exon_860886_861010:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000263154:exon_860886_861010:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000440895:exon_860886_861010:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000469487:exon_860886_861655:LARP4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 931676 G/A 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.433796952873074 ENSG00000107929:ENST00000316157:exon_931581_931702:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000263154:exon_931581_931702:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000476529:exon_931581_931700:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000406525:exon_931581_931700:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000481118:exon_931581_931700:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000412411:exon_931581_931700:LARP4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 1779349 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000185736:ENST00000381312:exon_1779245_1779670:ADARB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 5498752 C/T 1 4 10 14 1.90062191447073 5.24844521382317 -3.34782329935244 T:C C T 10 0.524844521382317 0.106163918875083 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 5790616 A/G 1 6 13 19 2.8509328717061 6.82297877797012 -3.97204590626402 A:G A G 10 0.524844521382317 0.105404731313452 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5788142_5791990:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5788794_5791990:C10orf18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 5963427 C/T 1 15 14 29 7.12733217926525 7.34782329935244 -0.220491120087193 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000485558:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000475867:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000461504:exon_5963411_5963532:FBXO18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 6002407 T/C 1 18 5 23 8.5527986151183 2.62422260691158 5.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0195647809515236 ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 6139047 C/T 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000134453:ENST00000418869:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000379888:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000429138:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000432931:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000446108:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000418631:exon_6138873_6139151:RBM17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 7844255 T/C 1 343 422 765 162.978329165865 221.484388023338 -58.5060588574725 T:C T C 10 0.524844521382317 2.59107411131017e-05 ENSG00000165629:ENST00000356708:exon_7844233_7844388:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000493053:exon_7844233_7844388:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000335698:exon_7844233_7844388:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000460820:exon_7844249_7844374:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000473809:exon_7844233_7844388:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000480528:exon_7844206_7844388:ATP5C1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 11504686 C/T 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000148429:ENST00000277575:exon_11502509_11505848:USP6NL;ENSG00000148429:ENST00000379237:exon_11502511_11505848:USP6NL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 12200092 A/G 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000065665:ENST00000379033:exon_12199907_12200104:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12199907_12200104:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12199907_12200104:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000298428:exon_12199907_12200104:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000379041:exon_12199907_12200104:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000304267:exon_12199907_12200104:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000524434:exon_12199907_12200104:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000466451:exon_12199907_12200284:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000426560:exon_12199907_12200104:SEC61A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 12208767 A/G 1 33 32 65 15.6801307943835 16.7950246842341 -1.1148938898506 A:G A G 10 0.524844521382317 0.804838164054738 ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 12257819 T/C 1 68 75 143 32.3105725460024 39.3633391036738 -7.05276655767133 T:C T C 10 0.524844521382317 0.24225804867717 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12257739_12257834:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12257739_12257834:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12257739_12257834:CDC123 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 168 162 330 79.8261204077707 85.0248124639353 -5.1986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.581766239616852 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 13214636 C/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13214628_13214765:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13214625_13214765:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13214625_13214765:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13214628_13214765:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13214628_13214765:MCM10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 13234356 A/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:T A T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000065328:ENST00000378714:exon_13234255_13234365:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000484800:exon_13234255_13234365:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000361282:exon_13234255_13234365:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000448399:exon_13234255_13234365:MCM10;ENSG00000065328:ENST00000378694:exon_13234255_13234365:MCM10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 13340236 G/A 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13340187_13340245:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13340187_13340245:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13340187_13340245:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13340187_13340241:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13340187_13340241:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13340187_13340245:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000479604:exon_13340187_13340245:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000463730:exon_13340187_13340245:PHYH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 16 20 36 7.60248765788293 10.4968904276463 -2.89440276976341 T:C T C 10 0.524844521382317 0.4046295772343 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 14862042 A/G 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000185267:ENST00000378442:exon_14861249_14862157:CDNF;ENSG00000185267:ENST00000378441:exon_14861530_14862157:CDNF;ENSG00000185267:ENST00000467405:exon_14861884_14862157:CDNF;ENSG00000185267:ENST00000466269:exon_14861887_14862157:CDNF;ENSG00000185267:ENST00000465530:exon_14861979_14862157:CDNF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 15145361 G/A 1 64 75 139 30.4099506315317 39.3633391036738 -8.95338847214206 A:G G A 10 0.524844521382317 0.148564447373060 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 15145917 A/C 1 92 83 175 43.7143040328268 43.5620952747323 0.152208758094531 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 15177280 T/C 1 41 47 88 19.481374623325 24.6676925049689 -5.18631788164389 T:C T C 10 0.524844521382317 0.286737621639834 ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15177273_15177419:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000478580:exon_15177273_15177417:NMT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 15183463 C/T 1 27 37 64 12.8291979226774 19.4192472911457 -6.59004936846828 T:C C T 10 0.524844521382317 0.104789546104313 ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15183421_15183556:NMT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 22607271 T/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148444:ENST00000475460:exon_22607201_22607330:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000468179:exon_22607201_22607738:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000421135:exon_22607034_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000470045:exon_22606813_22607332:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000479958:exon_22607034_22607477:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000463688:exon_22607229_22607947:COMMD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 22607743 A/G 1 41 54 95 19.481374623325 28.3416041546451 -8.86022953132011 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0803304951217609 ENSG00000148444:ENST00000376836:exon_22607735_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000463409:exon_22607735_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000376787:exon_22607735_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000421135:exon_22607034_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000456711:exon_22607735_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000496071:exon_22607735_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000448361:exon_22607735_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000468469:exon_22607735_22607755:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000483684:exon_22607735_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000471350:exon_22607735_22607791:COMMD3;ENSG00000148444:ENST00000463688:exon_22607229_22607947:COMMD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 22830764 G/A 1 49 34 83 23.2826184522665 17.8447137269988 5.43790472526769 A:G G A 10 0.524844521382317 0.27173803011023 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22830733_22830976:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22830733_22830976:PIP4K2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 24908529 G/A 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G G A 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000107863:ENST00000396432:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000320481:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000486374:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000376410:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000445703:exon_24908402_24910298:ARHGAP21;ENSG00000107863:ENST00000446003:exon_24908402_24910298:ARHGAP21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 26463130 C/A 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000095777:ENST00000265944:exon_26462592_26463486:MYO3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 A:T A T 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 27317840 C/T 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 27389314 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27389014_27389405:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27389014_27389427:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27389014_27389421:ANKRD26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 34 39 73 16.1552862730012 20.4689363339104 -4.31365006090914 A:G G A 10 0.524844521382317 0.348953455356048 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 27437964 T/C 1 54 64 118 25.6583958453549 33.5900493684683 -7.9316535231134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.166546771112393 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000493741:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27437835_27437969:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27437835_27437969:YME1L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 27444329 T/C 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 27444344 T/G 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 T:G T G 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27443753_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27444299_27444541:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27444299_27444541:MASTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 27470427 G/A 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27470409_27470510:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27470409_27470510:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27470409_27470510:MASTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 31138165 G/A 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000183621:ENST00000331737:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000361310:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000413025:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000436087:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000442986:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000452305:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000444692:exon_31137460_31139296:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000430896:exon_31137460_31138220:ZNF438;ENSG00000183621:ENST00000375311:exon_31137460_31138372:ZNF438 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 32573963 T/C 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 T:C T C 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000479380:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32570787_32575943:EPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 32580119 A/G 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32580091_32581572:EPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 32580219 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32580091_32581572:EPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 33209266 G/T 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 T:G G T 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 34806052 G/A 1 8 9 17 3.80124382894146 4.72360069244085 -0.922356863499388 A:G G A 10 0.524844521382317 0.809125944455852 ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374776:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374773:exon_34805907_34806087:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000340077:exon_34805907_34806087:PARD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 38345335 G/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 38345455 A/G 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 A:G A G 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000189180:ENST00000374618:exon_38343303_38348991:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000458705:exon_38343306_38348981:ZNF33A;ENSG00000189180:ENST00000307441:exon_38343306_38345488:ZNF33A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 43089156 C/T 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 43089331 T/C 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C T C 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 50373832 G/A 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000204161:ENST00000374156:exon_50373811_50373841:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374151:exon_50373811_50373841:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374153:exon_50373811_50373841:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000474718:exon_50373811_50373841:C10orf128;ENSG00000204161:ENST00000374148:exon_50373811_50373841:C10orf128 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 50678317 C/G 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000465653:exon_50678228_50678327:ERCC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 50678722 G/C 1 9 16 25 4.27639930755915 8.39751234211707 -4.12111303455792 C:G G C 10 0.524844521382317 0.111345252115818 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 50960209 G/A 1 1 7 8 0.475155478617683 3.67391164967622 -3.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0313158759629617 ENSG00000197444:ENST00000374103:exon_50960179_50960294:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000419399:exon_50960179_50960294:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000432695:exon_50960179_50960294:OGDHL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 51584624 C/T 1 29 31 60 13.7795088799128 16.2701801628518 -2.49067128293902 T:C C T 10 0.524844521382317 0.521722870395062 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000498586:exon_51584616_51584817:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000431200:exon_51584616_51584947:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 51585348 G/A 1 74 78 152 35.1615054177085 40.9378726678207 -5.77636725011217 A:G G A 10 0.524844521382317 0.372002867547961 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51584616_51585466:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51584616_51585599:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51584616_51585463:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51584616_51585599:NCOA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:G A G 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 52103611 G/A 1 6 15 21 2.8509328717061 7.87266782073475 -5.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0302463165212927 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 22 15 37 10.453420529589 7.87266782073475 2.58075270885427 A:G A G 10 0.524844521382317 0.415690016228402 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 58118630 T/C 1 44 46 90 20.9068410591781 24.1428479835866 -3.23600692440853 T:C T C 10 0.524844521382317 0.527347357633652 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118566_58118708:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000467523:exon_58118566_58118708:ZWINT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 61552762 C/T 1 12 3 15 5.7018657434122 1.57453356414695 4.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0384636259591238 ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 64911911 A/G 1 22 27 49 10.453420529589 14.1708020773226 -3.71738154773353 A:G A G 10 0.524844521382317 0.318114918194783 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 29 39 68 13.7795088799128 20.4689363339104 -6.68942745399755 C:G C G 10 0.524844521382317 0.114805332607981 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 15 17 32 7.12733217926525 8.92235686349939 -1.79502468423414 A:G G A 10 0.524844521382317 0.59689936717842 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 64974537 A/T 1 5 12 17 2.37577739308842 6.2981342565878 -3.92235686349939 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0863600801774899 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64973233_64974911:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64973233_64974911:JMJD1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 65225244 G/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 C:G G C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 70 90 160 33.2608835032378 47.2360069244085 -13.9751234211707 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0322607861389503 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 70716026 C/T 1 70 48 118 33.2608835032378 25.1925370263512 8.0683464768866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.141249467533893 ENSG00000165732:ENST00000354185:exon_70715884_70716068:DDX21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 70737336 T/C 1 18 38 56 8.5527986151183 19.944091812528 -11.3912931974097 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00291706919365962 ENSG00000165732:ENST00000354185:exon_70737285_70737444:DDX21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 8 17 25 3.80124382894146 8.92235686349939 -5.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.045663265598688 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 70775329 G/A 1 24 20 44 11.4037314868244 10.4968904276463 0.906841059178054 A:G G A 10 0.524844521382317 0.880321279279752 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70775297_70776738:KIAA1279 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 71103597 C/G 1 7 14 21 3.32608835032378 7.34782329935244 -4.02173494902866 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0847282864109202 ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000464803:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000480047:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 71160828 C/T 1 100 65 165 47.5155478617683 34.1148938898506 13.4006539719177 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0423952611912494 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1;ENSG00000156515:ENST00000470050:exon_71160747_71160874:HK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 71160897 C/T 1 92 51 143 43.7143040328268 26.7670705904982 16.9472334423287 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00553838210369112 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 28 25 53 13.3043534012951 13.1211130345579 0.1832403667372 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 73887894 T/A 1 25 17 42 11.8788869654421 8.92235686349939 2.95653010194269 A:T T A 10 0.524844521382317 0.440310935423641 ENSG00000138303:ENST00000394919:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000342444:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317168:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000373101:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000534259:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000486689:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000530394:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000317126:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000394915:exon_73887840_73887925:ASCC1;ENSG00000138303:ENST00000525286:exon_73887840_73887925:ASCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 75558867 G/A 1 21 19 40 9.97826505097134 9.97204590626402 0.00621914470732143 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75558760_75559669:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75558760_75559248:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75558760_75559248:KIAA0913 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 76285163 T/C 1 53 62 115 25.1832403667372 32.5403603257037 -7.35711995896645 T:C T C 10 0.524844521382317 0.191076885761291 ENSG00000156110:ENST00000286621:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000467840:exon_76285122_76285184:ADK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 76468101 T/C 1 71 89 160 33.7360389818555 46.7111624030262 -12.9751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0474921649831898 ENSG00000156110:ENST00000286621:exon_76468079_76468233:ADK;ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_76468079_76469061:ADK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 79800415 T/G 1 919 1249 2168 436.667884849651 655.530807206514 -218.862922356863 A:T:C:G T G 10 0.524844521382317 5.1414246492758e-21 ENSG00000138326:ENST00000435275:exon_79800373_79800471:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000485708:exon_79800373_79800428:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000372360:exon_79800373_79800455:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000401656:exon_79800373_79800459:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000360830:exon_79800373_79800455:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000482069:exon_79800373_79800454:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000480662:exon_79800373_79800455:RPS24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 81 117 198 38.4875937680323 61.4068090017311 -22.9192152336988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00130881306088205 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 81928877 C/T 1 122 98 220 57.9689683913573 51.4347630954671 6.53420529589027 T:C C T 10 0.524844521382317 0.381248270087549 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000445524:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000437799:exon_81928836_81929114:ANXA11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 82276043 T/C 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000108219:ENST00000429989:exon_82275960_82276079:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000481124:exon_82275960_82276079:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372157:exon_82275960_82276079:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372164:exon_82275960_82276079:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372158:exon_82275960_82276079:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000341863:exon_82275960_82276079:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372156:exon_82275960_82276079:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000265450:exon_82275223_82276079:TSPAN14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 82280551 T/G 1 19 33 52 9.02795409373598 17.3198692056165 -8.29191511188048 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0256428744277548 ENSG00000108219:ENST00000429989:exon_82277661_82282387:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372160:exon_82280347_82281515:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372164:exon_82277661_82282387:TSPAN14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 85908565 C/T 1 102 119 221 48.4658588190037 62.4564980444957 -13.990639225492 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0687501336571712 ENSG00000165678:ENST00000372134:exon_85908486_85908594:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000339736:exon_85908486_85908594:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000436406:exon_85908486_85908594:GHITM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 86131059 A/G 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000107771:ENST00000359979:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86130770_86132225:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86130770_86132225:FAM190B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 86237331 G/A 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86237331_86237420:FAM190B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 T:C T C 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 88277457 C/T 1 30 27 57 14.2546643585305 14.1708020773226 0.0838622812079333 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88277328_88277848:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88277328_88277848:WAPAL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 90762896 G/A 1 40 22 62 19.0062191447073 11.546579470411 7.45963967429635 A:G G A 10 0.524844521382317 0.074197276172709 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90762786_90762951:FAS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 91099630 T/C 1 160 162 322 76.0248765788293 85.0248124639353 -8.99993588510605 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.315915844902871 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 91099657 A/G 1 191 165 356 90.7546964159775 86.5993460280823 4.15535038789517 A:G A G 10 0.524844521382317 0.671478616150416 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 91404734 C/A 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 A:C C A 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000152782:ENST00000307534:exon_91404357_91405215:PANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 91479414 A/T 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 A:T A T 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91479176_91479463:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91479176_91479463:KIF20B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 94409736 C/T 1 40 38 78 19.0062191447073 19.944091812528 -0.93787266782072 T:C C T 10 0.524844521382317 0.909837766451418 ENSG00000138160:ENST00000260731:exon_94409592_94409743:KIF11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 95266799 A/G 1 16 17 33 7.60248765788293 8.92235686349939 -1.31986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.728380954880147 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95266767_95266813:CEP55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 95276692 G/A 1 41 41 82 19.481374623325 21.518625376675 -2.03725075334999 A:G G A 10 0.524844521382317 0.660051939254403 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 95430585 T/G 1 19 12 31 9.02795409373598 6.2981342565878 2.72981983714817 T:G T G 10 0.524844521382317 0.371425597340827 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000460752:exon_95430527_95435061:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000483229:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000462771:exon_95430532_95430605:FRA10AC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 39 31 70 18.5310636660896 16.2701801628518 2.26088350323781 C:G G C 10 0.524844521382317 0.63314589864734 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 48 40 88 22.8074629736488 20.9937808552927 1.81368211835611 A:G A G 10 0.524844521382317 0.749270029637726 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 96106240 G/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96106182_96106313:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96106182_96106313:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96106233_96106313:NOC3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 96109021 C/T 1 7 12 19 3.32608835032378 6.2981342565878 -2.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.250211798338697 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96109007_96109135:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96109007_96109135:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96109007_96109135:NOC3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 15 8 23 7.12733217926525 4.19875617105854 2.92857600820671 A:C A C 10 0.524844521382317 0.29679434643917 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 1673 2063 3736 794.935115727384 1082.75424761172 -287.819131884336 A:T:C:G A G 10 0.524844521382317 4.49896253822029e-21 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 1148 1282 2430 545.4784894531 672.85067641213 -127.37218695903 A:T:G A G 10 0.524844521382317 2.42851199885117e-07 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 97987257 C/T 1 62 58 120 29.4596396742963 30.4409822401744 -0.981342565878037 T:C C T 10 0.524844521382317 0.855631608390826 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97987166_97987322:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97987166_97987322:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97987166_97987322:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97987166_97987322:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97987166_97987322:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97987166_97987322:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97987178_97987322:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393898:exon_97987166_97987322:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97987178_97987322:BLNK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 35 25 60 16.6304417516189 13.1211130345579 3.50932871706098 T:C C T 10 0.524844521382317 0.438275700640332 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 98386558 G/A 1 18 18 36 8.5527986151183 9.4472013848817 -0.89440276976341 A:G G A 10 0.524844521382317 0.86782104725156 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98386465_98386662:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98386465_98386662:PIK3AP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 98469507 C/A 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 A:C C A 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98469324_98469740:PIK3AP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99126249 G/A 1 57 34 91 27.0838622812079 17.8447137269988 9.23914855420916 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0586245367484868 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99126203_99126378:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99126203_99126317:RRP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 18 26 44 8.5527986151183 13.6459575559402 -5.09315894082195 T:C T C 10 0.524844521382317 0.133089348553804 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99130282 T/G 1 22 25 47 10.453420529589 13.1211130345579 -2.6676925049689 T:G T G 10 0.524844521382317 0.467464911358237 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99130212_99130317:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99130212_99130317:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99130212_99130317:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99130212_99130317:RRP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99148087 G/A 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99148009_99148136:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99148009_99148136:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99148009_99148136:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479317:exon_99147754_99148136:RRP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 6 16 22 2.8509328717061 8.39751234211707 -5.54657947041097 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0192663043809849 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99160152 A/G 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160062_99160291:RRP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99160155 C/T 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99160062_99160291:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99160062_99160291:RRP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99196957 T/C 1 82 63 145 38.96274924665 33.065204847086 5.89754439956404 T:C T C 10 0.524844521382317 0.360526727208022 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99196948_99197032:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99196948_99197032:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99196948_99197032:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99196948_99197032:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000461413:exon_99196948_99197040:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99196948_99197032:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000471049:exon_99196948_99197032:EXOSC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99227273 T/C 1 15 9 24 7.12733217926525 4.72360069244085 2.40373148682439 T:C T C 10 0.524844521382317 0.414775891663106 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99227262_99227282:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99227262_99227360:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480280:exon_99227262_99227309:MMS19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 99426857 A/G 1 9 15 24 4.27639930755915 7.87266782073475 -3.59626851317561 A:G A G 10 0.524844521382317 0.156455234273016 ENSG00000155252:ENST00000416867:exon_99426818_99426877:PI4K2A;ENSG00000155252:ENST00000370631:exon_99426818_99426877:PI4K2A;ENSG00000249967:ENST00000370649:exon_99426818_99426877:RP11-548K23.11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 100178012 C/T 1 34 17 51 16.1552862730012 8.92235686349939 7.23292940950184 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0491988396054341 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100177932_100178014:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000462743:exon_100177909_100178014:HPS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 101371011 G/T 1 65 60 125 30.8851061101494 31.490671282939 -0.605565172789621 T:G G T 10 0.524844521382317 0.928844103738167 ENSG00000155287:ENST00000370495:exon_101370282_101371123:SLC25A28;ENSG00000155287:ENST00000497217:exon_101370282_101371123:SLC25A28;ENSG00000155287:ENST00000434701:exon_101370282_101371123:SLC25A28;ENSG00000155287:ENST00000491157:exon_101370642_101371215:SLC25A28;ENSG00000155287:ENST00000496035:exon_101370743_101371123:SLC25A28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 102116323 A/T 1 45 44 89 21.3819965377957 23.0931589408219 -1.71116240302621 A:T A T 10 0.524844521382317 0.750769554868429 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 102710451 A/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000119906:ENST00000238961:exon_102710433_102710510:FAM178A;ENSG00000119906:ENST00000370269:exon_102710433_102710510:FAM178A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 103340144 A/G 1 18 21 39 8.5527986151183 11.0217349490287 -2.46893633391036 A:G A G 10 0.524844521382317 0.521874628920024 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103340005_103341982:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000415897:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000485369:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000429502:exon_103340005_103340173:POLL;ENSG00000166169:ENST00000470140:exon_103340009_103340173:POLL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 36 19 55 17.1055972302366 9.97204590626402 7.13355132397257 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0589640293798791 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 103384540 G/A 1 36 24 60 17.1055972302366 12.5962685131756 4.50932871706098 A:G G A 10 0.524844521382317 0.301062783772602 ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000470093:exon_103384502_103386656:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000457105:exon_103384504_103384567:FBXW4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 103432801 A/G 1 75 61 136 35.6366608963262 32.0155158043213 3.62114509200489 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.548948516065908 ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000457105:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000431477:exon_103432672_103432804:FBXW4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 103541595 A/T 1 88 106 194 41.8136821183561 55.6335192665256 -13.8198371481695 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0520748610040095 ENSG00000107833:ENST00000370110:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000474993:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000462391:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000468544:exon_103541484_103541611:NPM3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 103899877 A/G 1 35 26 61 16.6304417516189 13.6459575559402 2.98448419567867 A:G A G 10 0.524844521382317 0.521899867984904 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 103900729 G/A 1 34 32 66 16.1552862730012 16.7950246842341 -0.639738411232919 A:G G A 10 0.524844521382317 0.90236598876862 ENSG00000148840:ENST00000278070:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000413464:exon_103898857_103901761:PPRC1;ENSG00000148840:ENST00000412852:exon_103898857_103901761:PPRC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 103920475 T/C 1 143 121 264 67.9472334423287 63.5061870872604 4.44104635506833 T:C T C 10 0.524844521382317 0.62213070428313 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 104160390 G/A 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 A:G G A 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000077150:ENST00000473400:exon_104160335_104160581:NFKB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105154013 A/G 1 9 40 49 4.27639930755915 20.9937808552927 -16.7173815477335 A:G A G 10 0.524844521382317 1.08311047537994e-06 ENSG00000173915:ENST00000369825:exon_105153956_105154151:USMG5;ENSG00000173915:ENST00000337003:exon_105153956_105154151:USMG5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105174030 T/C 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 T:C T C 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105174027_105174087:PDCD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105174869 G/A 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105174762_105174908:PDCD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105182770 C/T 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105182745_105182894:PDCD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 18 30 48 8.5527986151183 15.7453356414695 -7.19253702635121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0427931324482701 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 65 72 137 30.8851061101494 37.7888055395268 -6.90369942937742 T:C T C 10 0.524844521382317 0.266098285773546 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105362179 G/A 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G G A 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105362735 G/A 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 A:G A G 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 112266722 C/T 1 77 52 129 36.5869718535616 27.2919151118805 9.29505674168111 T:C C T 10 0.524844521382317 0.112453403848389 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 112266822 G/A 1 54 36 90 25.6583958453549 18.8944027697634 6.76399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 0.170281811353924 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 112266823 C/T 1 56 37 93 26.6087068025902 19.4192472911457 7.18945951144452 T:C C T 10 0.524844521382317 0.146553800734623 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 112349422 T/C 1 55 68 123 26.1335513239726 35.6894274539976 -9.55587613002498 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0868861909765213 ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112349363_112349466:SMC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 120514169 G/A 1 6 12 18 2.8509328717061 6.2981342565878 -3.44720138488171 A:G G A 10 0.524844521382317 0.154986439212099 ENSG00000151893:ENST00000369156:exon_120514039_120514560:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000369151:exon_120513908_120514758:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000493518:exon_120513908_120514761:C10orf46;ENSG00000151893:ENST00000340214:exon_120513908_120514758:C10orf46 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 120795721 G/A 1 226 265 491 107.385138167596 139.083798166314 -31.6986599987176 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00438917603959324 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120794356_120795780:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120795334_120795780:EIF3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 120914603 G/A 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000183605:ENST00000490417:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000484960:exon_120914574_120914635:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000330036:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000466218:exon_120914574_120914689:SFXN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 120936553 T/G 1 53 55 108 25.1832403667372 28.8664486760274 -3.68320830929023 T:G T G 10 0.524844521382317 0.500924713944046 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120936552_120936665:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120936533_120936665:PRDX3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 121551581 A/C 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:C A C 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000198825:ENST00000453198:exon_121551381_121551596:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369081:exon_121551381_121551717:INPP5F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 121586629 T/C 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 121586882 A/G 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 A:G A G 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000198825:ENST00000361976:exon_121586143_121588652:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369080:exon_121586143_121587837:INPP5F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 10 14 24 4.75155478617683 7.34782329935244 -2.59626851317561 A:G A G 10 0.524844521382317 0.312817090933246 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 122645376 A/T 1 8 9 17 3.80124382894146 4.72360069244085 -0.922356863499388 A:T A T 10 0.524844521382317 0.809125944455852 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122645326_122645450:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122645326_122645450:WDR11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 122668181 T/C 1 71 47 118 33.7360389818555 24.6676925049689 9.0683464768866 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0977540484430519 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122668068_122669036:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122668070_122668225:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122668070_122668225:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122668068_122669032:WDR11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 123503187 T/C 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123499939_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123502626_123503373:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123502710_123503373:ATE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 126523333 C/T 1 15 10 25 7.12733217926525 5.24844521382317 1.87888696544208 T:C C T 10 0.524844521382317 0.549576175229901 ENSG00000165660:ENST00000298492:exon_126523071_126525239:FAM175B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 44 32 76 20.9068410591781 16.7950246842341 4.11181637494391 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.360369461113956 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 234 236 470 111.186381996538 123.863307046227 -12.676925049689 T:C T C 10 0.524844521382317 0.24842245487132 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 283 249 532 134.469000448804 130.686285824197 3.78271462460739 T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.761315046297766 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 217 175 392 103.108738860037 91.8477912419055 11.2609476181318 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.266037399810054 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 151 123 274 71.7484772712701 64.555876130025 7.19260114124515 A:G G A 10 0.524844521382317 0.397504311992892 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 154 166 320 73.1739437071232 87.1241905494646 -13.9502468423414 T:C T C 10 0.524844521382317 0.130608937597451 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129901946 T/G 1 174 181 355 82.6770532794769 94.9968583701994 -12.3198050907225 T:G T G 10 0.524844521382317 0.202185912592162 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129902099 G/A 1 128 106 234 60.8199012630634 55.6335192665256 5.18638199653783 A:G G A 10 0.524844521382317 0.513260518268095 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129902158 C/T 1 191 169 360 90.7546964159775 88.6987241136116 2.0559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 0.833062475720688 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 196 184 380 93.1304738090659 96.5713919343463 -3.44091812528045 A:G G A 10 0.524844521382317 0.757997525757346 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129902368 T/A 1 213 180 393 101.208116945566 94.4720138488171 6.73610309674943 A:T T A 10 0.524844521382317 0.511680013724251 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129902411 G/A 1 161 151 312 76.500032057447 79.2515227287299 -2.75149067128289 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.776978493521435 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129902938 G/C 1 139 99 238 66.0466115278579 51.9596076168494 14.0870039110086 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0693538815995533 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 182 162 344 86.4782971084183 85.0248124639353 1.45348464448297 T:C T C 10 0.524844521382317 0.914045470455766 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129903494 G/C 1 98 104 202 46.5652369045329 54.583830223761 -8.01859331922802 C:G G C 10 0.524844521382317 0.260655942372433 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129903592 G/A 1 98 79 177 46.5652369045329 41.462717189203 5.1025197153299 A:G G A 10 0.524844521382317 0.452688121599033 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129904200 C/G 1 112 96 208 53.2174136051805 50.3850740527024 2.83233955247807 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.728687378218197 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129904477 C/T 1 97 87 184 46.0900814259153 45.6614733602616 0.428608065653677 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 41 42 83 19.481374623325 22.0434698980573 -2.56209527473231 T:C C T 10 0.524844521382317 0.584487348679093 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129906903 C/T 1 39 37 76 18.5310636660896 19.4192472911457 -0.888183625056087 T:C C T 10 0.524844521382317 0.90868155545551 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 32 20 52 15.2049753157659 10.4968904276463 4.70808488811952 C:G G C 10 0.524844521382317 0.212662019280194 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 13 19 32 6.17702122202988 9.97204590626402 -3.79502468423414 C:G C G 10 0.524844521382317 0.215805568250847 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 134540331 T/C 1 13 8 21 6.17702122202988 4.19875617105854 1.97826505097134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.513299188922784 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000487614:exon_134540325_134540853:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000498337:exon_134540325_134540409:INPP5A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 91 82 173 43.2391485542092 43.03725075335 0.201897800859165 A:C C A 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 75 62 137 35.6366608963262 32.5403603257037 3.09630057062257 T:C T C 10 0.524844521382317 0.608888570947757 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 135113056 C/T 1 22 22 44 10.453420529589 11.546579470411 -1.09315894082195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.764651496950924 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 10 135122507 G/A 1 13 16 29 6.17702122202988 8.39751234211707 -2.22049112008719 A:G G A 10 0.524844521382317 0.45973512332539 ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135122327_135122644:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135122327_135122638:TUBGCP2;ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135121979_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122445_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122453_135122600:ZNF511 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 290891 T/C 1 14 17 31 6.65217670064756 8.92235686349939 -2.27018016285183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.473797754482654 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 290918 G/A 1 17 8 25 8.07764313650061 4.19875617105854 3.87888696544208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.160240193271769 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_290678_292095:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_290678_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_290658_291113:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_290678_291113:ATHL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 294101 G/A 1 76 72 148 36.1118163749439 37.7888055395268 -1.67698916458291 A:G G A 10 0.524844521382317 0.805313469570992 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294099_294196:ATHL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 294120 G/A 1 78 68 146 37.0621273321793 35.6894274539976 1.37269987818173 A:G G A 10 0.524844521382317 0.86848624119117 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294099_294196:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000397660:exon_294099_294196:ATHL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 97 55 152 46.0900814259153 28.8664486760274 17.2236327498878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00561740586798939 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 188 338 526 89.3292299801244 177.397448227223 -88.0682182470987 A:G A G 10 0.524844521382317 1.28517169845339e-14 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 460247 G/A 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000174915:ENST00000532614:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000308020:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000531520:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000528617:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000525727:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000525059:exon_460187_461051:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000527479:exon_460187_460288:PTDSS2;ENSG00000174915:ENST00000526878:exon_458674_460288:PTDSS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 210 222 432 99.7826505097134 116.515483746874 -16.7328332371609 T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.111916453526400 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 557584 G/A 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000185522:ENST00000329451:exon_557572_557640:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000441853:exon_557572_557640:C11orf35;ENSG00000185522:ENST00000486629:exon_557572_557640:C11orf35 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 608593 G/A 1 44 39 83 20.9068410591781 20.4689363339104 0.437904725267693 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 610277 T/C 1 33 31 64 15.6801307943835 16.2701801628518 -0.590049368468286 T:C T C 10 0.524844521382317 0.900983591621374 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610196_610347:PHRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 162 145 307 76.9751875360647 76.102455600436 0.872731935628693 T:C C T 10 0.524844521382317 0.954449918181473 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 653968 T/C 1 74 69 143 35.1615054177085 36.2142719753799 -1.05276655767133 T:C T C 10 0.524844521382317 0.86741420534539 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 674458 G/A 1 33 4 37 15.6801307943835 2.09937808552927 13.5807527088543 A:G G A 10 0.524844521382317 3.13170926329205e-06 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 674499 G/A 1 36 1 37 17.1055972302366 0.524844521382317 16.5807527088543 A:G G A 10 0.524844521382317 2.45299768530828e-09 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 29 11 40 13.7795088799128 5.77328973520549 8.00621914470732 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0112597776582501 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 801249 G/A 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_801218_801365:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_801218_801365:LRDD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 811853 C/T 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.433796952873074 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 822588 C/T 1 100 62 162 47.5155478617683 32.5403603257037 14.9751875360647 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0222378934345849 ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000531923:exon_822016_822606:PNPLA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 903039 G/A 1 28 12 40 13.3043534012951 6.2981342565878 7.00621914470732 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0271684561024926 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000531859:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534254:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528426:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533056:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533059:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000530939:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525225:exon_902971_903111:CHID1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 993964 C/T 1 31 55 86 14.7298198371482 28.8664486760274 -14.1366288388793 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00240344006646353 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 1775350 C/T 1 25 37 62 11.8788869654421 19.4192472911457 -7.54036032570365 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.0573279496681651 ENSG00000250644:ENST00000427721:exon_1775224_1775368:RP11-295K3.1;ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1775224_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1775224_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1775224_1775361:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000429746:exon_1775224_1775485:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000497544:exon_1775035_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1775254_1775368:CTSD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 1780205 A/G 1 55 54 109 26.1335513239726 28.3416041546451 -2.20805283067255 A:G A G 10 0.524844521382317 0.701831525591822 ENSG00000250644:ENST00000427721:exon_1780199_1780281:RP11-295K3.1;ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780199_1780317:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780199_1780317:CTSD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 1780867 G/A 1 33 34 67 15.6801307943835 17.8447137269988 -2.16458293261524 A:G G A 10 0.524844521382317 0.625975360493296 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1780746_1780869:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1780746_1780869:CTSD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 1782594 G/A 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1782539_1782698:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1782539_1782770:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000367196:exon_1782539_1782698:CTSD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 323 291 614 153.475219593512 152.729755722254 0.745463871257385 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.96778147761849 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 1972143 G/A 1 34 35 69 16.1552862730012 18.3695582483811 -2.21427197537987 A:G G A 10 0.524844521382317 0.630708810674804 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 1972212 C/T 1 57 54 111 27.0838622812079 28.3416041546451 -1.25774187343718 T:C C T 10 0.524844521382317 0.849491687910092 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 2417893 C/T 1 473 417 890 224.748541386164 218.860165416426 5.88837596973789 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.712029278364098 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 2417935 T/C 1 505 448 953 239.95351670193 235.130345579278 4.82317112265193 A:T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.770400358628687 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 2424445 C/A 1 90 69 159 42.7639930755915 36.2142719753799 6.5497211002116 A:C:G C A 10 0.524844521382317 0.303264907345802 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000437110:exon_2423841_2424473:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 2424527 G/A 1 99 85 184 47.0403923831506 44.6117843174969 2.42860806565368 A:G G A 10 0.524844521382317 0.767919353410004 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 2424541 C/G 1 75 84 159 35.6366608963262 44.0869397961146 -8.4502788997884 C:G C G 10 0.524844521382317 0.203784811408568 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 2424647 G/A 1 97 59 156 46.0900814259153 30.9658267615567 15.1242546643585 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0160731850678389 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 3714489 C/T 1 13 17 30 6.17702122202988 8.92235686349939 -2.74533564146951 T:C C T 10 0.524844521382317 0.362755487440991 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000429801:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000524563:exon_3714462_3714605:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000530345:exon_3714287_3714605:NUP98 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 3733905 C/T 1 14 24 38 6.65217670064756 12.5962685131756 -5.94409181252805 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0726331896169013 ENSG00000110713:ENST00000324932:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000355260:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000359171:exon_3733794_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397004:exon_3732783_3733958:NUP98;ENSG00000110713:ENST00000397007:exon_3733065_3733958:NUP98 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 3988876 T/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000167323:ENST00000525403:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000532610:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000532919:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000530554:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000524822:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000525055:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000528656:exon_3988782_3988912:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000532990:exon_3988782_3988912:STIM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 18 8 26 8.5527986151183 4.19875617105854 4.35404244405976 A:G A G 10 0.524844521382317 0.115132819997145 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 4411501 C/G 1 34 43 77 16.1552862730012 22.5683144194396 -6.41302814643841 C:G C G 10 0.524844521382317 0.170591026881587 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 4621485 C/G 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 C:G C G 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000167333:ENST00000300747:exon_4619902_4622056:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000531101:exon_4620010_4622056:TRIM68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 68 69 137 32.3105725460024 36.2142719753799 -3.90369942937743 A:C C A 10 0.524844521382317 0.549500936157942 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 24 11 35 11.4037314868244 5.77328973520549 5.63044175161891 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0631291440724101 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 151 177 328 71.7484772712701 92.8974802846701 -21.1490030134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0202015503960071 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 5719649 T/C 1 89 65 154 42.2888375969738 34.1148938898506 8.17394370712319 T:C T C 10 0.524844521382317 0.197234301888516 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 107 170 277 50.8416362120921 89.2235686349939 -38.3819324229018 T:C T C 10 0.524844521382317 4.27048610219658e-06 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 5730625 C/T 1 187 208 395 88.8540745015067 109.167660447522 -20.3135859460152 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0437970000327001 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5730283_5732093:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5730283_5732092:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5730283_5730677:TRIM22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6243804 A/G 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:G A G 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6243672_6243839:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6243672_6243839:FAM160A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6340416 G/A 1 6 27 33 2.8509328717061 14.1708020773226 -11.3198692056165 A:G G A 10 0.524844521382317 7.196505745979e-05 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 38 2 40 18.055908187472 1.04968904276463 17.0062191447073 A:T A T 10 0.524844521382317 5.97541226588096e-09 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6341684 C/G 1 3 16 19 1.42546643585305 8.39751234211707 -6.97204590626402 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00187175287119635 ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6413102 C/T 1 12 16 28 5.7018657434122 8.39751234211707 -2.69564659870487 T:C C T 10 0.524844521382317 0.347115703840086 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000530395:exon_6413020_6413272:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6412617_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6412614_6413386:SMPD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6520015 G/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:G G T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000179532:ENST00000473019:exon_6519953_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6519001_6520191:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000354685:exon_6518815_6520191:DNHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6588256 G/A 1 3 11 14 1.42546643585305 5.77328973520549 -4.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0291024169803525 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6588553 C/T 1 11 4 15 5.22671026479451 2.09937808552927 3.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.125251659640691 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6588155_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6588125_6589090:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525080:exon_6588155_6588582:DNHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6593198 C/T 1 26 31 57 12.3540424440598 16.2701801628518 -3.91613771879207 T:C C T 10 0.524844521382317 0.353421282088294 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6592866_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6591239_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6592866_6593249:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000532467:exon_6592866_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525889:exon_6592866_6593257:DNHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 40 24 64 19.0062191447073 12.5962685131756 6.40995063153172 A:G G A 10 0.524844521382317 0.132609132698514 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 79 50 129 37.537282810797 26.2422260691158 11.2950567416811 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0521742356377675 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 277 281 558 131.618067577098 147.481310508431 -15.8632429313329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.188837009516295 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 7570686 G/A 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000166387:ENST00000526873:exon_7570671_7570770:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528947:exon_7570671_7570770:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7570671_7570770:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000527790:exon_7570671_7570770:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000526046:exon_7570671_7570770:PPFIBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 7647039 C/T 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7647008_7647122:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529575:exon_7647008_7647122:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7647008_7647122:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7647008_7647122:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7647008_7647122:PPFIBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 7661018 G/C 1 12 14 26 5.7018657434122 7.34782329935244 -1.64595755594024 C:G G C 10 0.524844521382317 0.559962886005581 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7660963_7661101:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7660963_7661101:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7660963_7661101:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7660963_7661101:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7660963_7661101:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7660963_7661101:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532381:exon_7660963_7661042:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7660963_7661101:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7660963_7661101:PPFIBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 7673015 G/A 1 28 34 62 13.3043534012951 17.8447137269988 -4.54036032570365 A:G G A 10 0.524844521382317 0.255294583459991 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 7686754 C/G 1 2 77 79 0.950310957235366 40.4130281464384 -39.462717189203 T:C:G C G 10 0.524844521382317 1.89831371247728e-22 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 7689727 T/A 1 3 40 43 1.42546643585305 20.9937808552927 -19.5683144194396 A:T T A 10 0.524844521382317 2.62425506967384e-10 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7689709_7693754:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7689709_7689792:CYB5R2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 8009102 C/T 1 441 344 785 209.543566070398 180.546515355517 28.9970507148812 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0382546928718121 ENSG00000175390:ENST00000533626:exon_8008445_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000449102:exon_8008855_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000309828:exon_8008867_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000531329:exon_8008884_8009263:EIF3F;ENSG00000175390:ENST00000528653:exon_8008903_8009263:EIF3F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 8115515 G/A 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 10515037 G/A 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000533116:exon_10514914_10515249:AMPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 10515087 C/T 1 7 13 20 3.32608835032378 6.82297877797012 -3.49689042764634 T:C C T 10 0.524844521382317 0.124086328149616 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10514896_10515090:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000533116:exon_10514914_10515249:AMPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 10517213 T/C 1 12 15 27 5.7018657434122 7.87266782073475 -2.17080207732256 T:C T C 10 0.524844521382317 0.444663614174346 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10517117_10517280:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10517117_10517280:AMPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 10786175 C/T 1 21 16 37 9.97826505097134 8.39751234211707 1.58075270885427 T:C C T 10 0.524844521382317 0.62568102314945 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 10800287 G/T 1 65 37 102 30.8851061101494 19.4192472911457 11.4658588190037 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0286820846250689 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10800226_10801290:CTR9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 20 15 35 9.50310957235366 7.87266782073475 1.63044175161891 C:G G C 10 0.524844521382317 0.615385496008195 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 25 15 40 11.8788869654421 7.87266782073475 4.00621914470732 A:G G A 10 0.524844521382317 0.267582589906729 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 13410371 A/G 1 32 30 62 15.2049753157659 15.7453356414695 -0.540360325703652 A:G A G 10 0.524844521382317 0.899556830572128 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 14902031 A/G 1 28 15 43 13.3043534012951 7.87266782073475 5.43168558056037 A:G A G 10 0.524844521382317 0.125904606027864 ENSG00000186104:ENST00000532805:exon_14901926_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000530609:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000534686:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000334636:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000526489:exon_14901681_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000526276:exon_14901861_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000532641:exon_14901883_14902314:CYP2R1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 18124837 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18124804_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000533851:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530180:exon_18124780_18124893:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530736:exon_18124780_18124893:SAAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 18472528 G/C 0 0 14 14 0 7.34782329935244 -7.34782329935244 C G C 10 0.524844521382317 2.99020095317427e-05 ENSG00000166796:ENST00000396215:exon_18472510_18472792:LDHC;ENSG00000166796:ENST00000280704:exon_18472510_18472792:LDHC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 59 89 148 28.0341732384433 46.7111624030262 -18.6769891645829 T:G T G 10 0.524844521382317 0.00226020911087219 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 102 126 228 48.4658588190037 66.1304096941719 -17.6645508751683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0202347161979251 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 20529892 A/G 1 29 12 41 13.7795088799128 6.2981342565878 7.481374623325 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0193513683536360 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 16 50 66 7.60248765788293 26.2422260691158 -18.6397384112329 T:C T C 10 0.524844521382317 5.23517643174484e-06 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 32852172 G/A 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32852054_32852178:PRRG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 32874919 C/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 33564959 C/T 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000110427:ENST00000321505:exon_33563821_33565882:C11orf41;ENSG00000110427:ENST00000265654:exon_33563877_33565900:C11orf41;ENSG00000110427:ENST00000389726:exon_33563877_33565900:C11orf41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 33667424 G/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000110427:ENST00000321505:exon_33667232_33667582:C11orf41;ENSG00000110427:ENST00000389726:exon_33667232_33667582:C11orf41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 33689652 G/A 1 7 18 25 3.32608835032378 9.4472013848817 -6.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0159189909825359 ENSG00000110427:ENST00000321505:exon_33689419_33695648:C11orf41;ENSG00000110427:ENST00000389726:exon_33689419_33695648:C11orf41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 34969150 C/T 1 28 19 47 13.3043534012951 9.97204590626402 3.3323074950311 T:C C T 10 0.524844521382317 0.381795948985569 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 34988343 T/C 1 38 22 60 18.055908187472 11.546579470411 6.50932871706098 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0947156616605054 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34988187_34988361:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34988187_34988361:PDHX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 34991826 G/A 1 12 16 28 5.7018657434122 8.39751234211707 -2.69564659870487 A:G G A 10 0.524844521382317 0.347115703840086 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 80 174 254 38.0124382894146 91.3229467205231 -53.3105084311085 A:T:C C T 10 0.524844521382317 2.15979039312445e-11 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 44254001 G/A 1 10 14 24 4.75155478617683 7.34782329935244 -2.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.312817090933246 ENSG00000151348:ENST00000533608:exon_44253903_44254046:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000395673:exon_44253903_44254046:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000358681:exon_44253903_44254046:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000343631:exon_44253903_44254046:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000528159:exon_44253903_44254046:EXT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 45827350 A/G 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 A:G A G 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45825957_45827887:SLC35C1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 46403649 G/A 1 8 17 25 3.80124382894146 8.92235686349939 -5.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.045663265598688 ENSG00000110492:ENST00000405308:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000441869:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000490240:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405994:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000359803:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000533952:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395569:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395566:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000481047:exon_46403261_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000405098:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000430827:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000489525:exon_46403607_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000407067:exon_46403303_46403683:MDK;ENSG00000110492:ENST00000395565:exon_46403607_46403683:MDK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 46419411 G/A 1 41 47 88 19.481374623325 24.6676925049689 -5.18631788164389 A:G G A 10 0.524844521382317 0.286737621639834 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000452566:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46417965_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000526545:exon_46418934_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46419000_46419493:AMBRA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 46701765 C/T 1 25 16 41 11.8788869654421 8.39751234211707 3.481374623325 T:C C T 10 0.524844521382317 0.348311219954211 ENSG00000175220:ENST00000311956:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000443332:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000526423:exon_46701755_46701832:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000528837:exon_46701755_46701832:ARHGAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 46724289 C/G 1 13 17 30 6.17702122202988 8.92235686349939 -2.74533564146951 C:G C G 10 0.524844521382317 0.362755487440991 ENSG00000175213:ENST00000311764:exon_46724254_46724315:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000526410:exon_46724254_46724445:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000534481:exon_46724254_46724313:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000527008:exon_46724265_46724793:ZNF408 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 46726047 C/T 1 21 24 45 9.97826505097134 12.5962685131756 -2.61800346220426 T:C C T 10 0.524844521382317 0.458480647164994 ENSG00000175213:ENST00000311764:exon_46725903_46727462:ZNF408;ENSG00000175213:ENST00000527008:exon_46725903_46726072:ZNF408 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 46784697 A/C 1 31 30 61 14.7298198371482 15.7453356414695 -1.01551580432134 A:C A C 10 0.524844521382317 0.79926202921448 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526943:exon_46784696_46784729:CKAP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 80 82 162 38.0124382894146 43.03725075335 -5.02481246393535 T:C C T 10 0.524844521382317 0.432757318004122 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 47267079 C/T 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000134575:ENST00000256997:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534752:exon_47267025_47267127:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534448:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000527256:exon_47267025_47267123:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000533929:exon_47267025_47267123:ACP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 47381478 G/C 1 72 51 123 34.2111944604732 26.7670705904982 7.44412386997502 C:G G C 10 0.524844521382317 0.206114987165955 ENSG00000066336:ENST00000227163:exon_47381404_47381591:SPI1;ENSG00000066336:ENST00000378538:exon_47381404_47381591:SPI1;ENSG00000066336:ENST00000533968:exon_47381404_47381591:SPI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 47587243 C/G 1 88 96 184 41.8136821183561 50.3850740527024 -8.57139193434632 C:G C G 10 0.524844521382317 0.210291053323339 ENSG00000213619:ENST00000533507:exon_47586888_47587348:NDUFS3;ENSG00000110536:ENST00000527079:exon_47586888_47587348:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000426530:exon_47586982_47587538:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000534775:exon_47587010_47587538:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000526719:exon_47587151_47587538:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000326656:exon_47587151_47587348:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000326674:exon_47587153_47587348:PTPMT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 47593061 C/T 1 159 120 279 75.5497211002116 62.981342565878 12.5683785343336 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.134377757624034 ENSG00000213619:ENST00000533507:exon_47593023_47593295:NDUFS3;ENSG00000110536:ENST00000527079:exon_47593023_47593295:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000426530:exon_47593023_47593479:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000534775:exon_47593023_47593912:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000526719:exon_47593023_47593372:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000326656:exon_47593023_47593671:PTPMT1;ENSG00000110536:ENST00000326674:exon_47593023_47593321:PTPMT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 47833936 C/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000030066:ENST00000378460:exon_47833854_47833981:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000426372:exon_47833854_47833981:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000530326:exon_47833854_47833981:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000263764:exon_47833854_47833981:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000528071:exon_47833854_47833981:NUP160;ENSG00000030066:ENST00000528501:exon_47833616_47833981:NUP160 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 57077738 C/G 1 21 10 31 9.97826505097134 5.24844521382317 4.72981983714817 C:G C G 10 0.524844521382317 0.105743903071191 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 57080771 A/G 1 5 13 18 2.37577739308842 6.82297877797012 -4.4472013848817 A:G A G 10 0.524844521382317 0.056012196582109 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 57102096 A/G 1 74 91 165 35.1615054177085 47.7608514457908 -12.5993460280823 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0514756986125306 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57101937_57102122:SSRP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 57155001 G/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57154267_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57154288_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57154416_57155006:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57154916_57155006:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57154838_57155006:RP11-872D17.8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 57569667 C/T 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000198561:ENST00000524630:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529919:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399039:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361796:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000360682:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529526:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000426142:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399050:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361391:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361332:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532463:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529986:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000358694:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532787:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000533667:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532649:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528621:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530748:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000428599:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000527467:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528232:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000531014:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526772:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529873:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000525902:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532844:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526357:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530094:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000415361:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532245:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534579:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526938:exon_57569205_57569668:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000527599:exon_57569467_57569668:CTNND1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 58338120 G/A 1 93 92 185 44.1894595114445 48.2856959671732 -4.09623645572864 A:G G A 10 0.524844521382317 0.556666377515408 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58338029_58338191:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000529915:exon_58338029_58338186:LPXN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 58978684 G/A 1 11 1 12 5.22671026479451 0.524844521382317 4.7018657434122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00707113669134868 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 59577364 C/T 1 84 76 160 39.9130602038854 39.8881836250561 0.0248765788292857 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000166902:ENST00000300151:exon_59577328_59577393:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000534340:exon_59577328_59577393:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000525470:exon_59577328_59577495:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000531802:exon_59577007_59577393:MRPL16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 60154242 C/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000166927:ENST00000300184:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000358246:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000435979:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000534016:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000530614:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000528808:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000528215:exon_60154190_60154247:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000534310:exon_60153973_60154246:MS4A7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 58 59 117 27.5590177598256 30.9658267615567 -3.40680900173109 A:G G A 10 0.524844521382317 0.578850587591484 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 60615418 C/T 1 41 47 88 19.481374623325 24.6676925049689 -5.18631788164389 T:C C T 10 0.524844521382317 0.286737621639834 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60615397_60615526:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60615397_60615526:CCDC86 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 60617715 A/C 1 47 65 112 22.3323074950311 34.1148938898506 -11.7825863948195 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0292566036178247 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 60666070 G/A 1 141 112 253 66.9969224850933 58.7825863948195 8.2143360902738 A:G G A 10 0.524844521382317 0.314206595143485 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666013_60666098:PRPF19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 60689320 C/T 1 32 13 45 15.2049753157659 6.82297877797012 8.38199653779574 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0160008410486225 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 60711249 G/T 1 34 50 84 16.1552862730012 26.2422260691158 -10.0869397961146 T:G G T 10 0.524844521382317 0.028995217844368 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 60711251 G/A 1 48 34 82 22.8074629736488 17.8447137269988 4.96274924665001 A:G G A 10 0.524844521382317 0.319722882983383 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 61089037 T/C 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 T:C T C 10 0.524844521382317 0.818610293564444 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 61165280 G/A 1 16 9 25 7.60248765788293 4.72360069244085 2.87888696544208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.317512505067783 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 61165750 G/C 1 42 4 46 19.9565301019427 2.09937808552927 17.8571520164134 C:G G C 10 0.524844521382317 1.95380599812594e-08 ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165733_61166323:TMEM216 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 61607859 C/T 1 92 110 202 43.7143040328268 57.7328973520549 -14.018593319228 T:C C T 10 0.524844521382317 0.048815946857712 ENSG00000134824:ENST00000257261:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000522056:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000518606:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000278840:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000517312:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000521849:exon_61607806_61608003:FADS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 61732226 G/A 1 3669 3277 6946 1743.34545104828 1719.91549656985 23.4299544784265 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 0.580527123034706 ENSG00000167995:ENST00000449131:exon_61729727_61732987:BEST1;ENSG00000167996:ENST00000273550:exon_61731757_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000532829:exon_61732038_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000534180:exon_61732038_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000406545:exon_61732038_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000526640:exon_61732057_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000532601:exon_61732073_61732363:FTH1;ENSG00000167996:ENST00000534719:exon_61732219_61732584:FTH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 61897281 C/T 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 T:C C T 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 61897409 C/T 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 61897832 G/A 1 21 16 37 9.97826505097134 8.39751234211707 1.58075270885427 A:G G A 10 0.524844521382317 0.62568102314945 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 42 67 109 19.9565301019427 35.1645829326152 -15.2080528306726 A:C A C 10 0.524844521382317 0.00388499253201369 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62284469 G/A 1 42 65 107 19.9565301019427 34.1148938898506 -14.1583637879079 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00659708650371402 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 28 37 65 13.3043534012951 19.4192472911457 -6.1148938898506 T:C C T 10 0.524844521382317 0.137276867335609 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62287678 G/A 1 15 14 29 7.12733217926525 7.34782329935244 -0.220491120087193 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62287828 T/C 1 19 22 41 9.02795409373598 11.546579470411 -2.518625376675 T:C T C 10 0.524844521382317 0.439415065816683 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62289409 G/A 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62289508 C/T 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62290719 A/G 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 A:G A G 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62291129 T/C 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62292349 G/A 1 2 10 12 0.950310957235366 5.24844521382317 -4.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0177361814639833 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62292980 A/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62383981 A/C 1 117 125 242 55.5931909982689 65.6055651727896 -10.0123741745207 A:C A C 10 0.524844521382317 0.198751797118688 ENSG00000149541:ENST00000265471:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000531383:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000532585:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000534026:exon_62383978_62384268:B3GAT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62439569 G/A 1 132 142 274 62.7205231775342 74.527922036289 -11.8073988587549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.164147870895392 ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62520617 A/G 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G A G 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000185670:ENST00000394807:exon_62518435_62521187:ZBTB3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 62533985 G/A 1 85 83 168 40.3882156825031 43.5620952747323 -3.17387959222925 A:G G A 10 0.524844521382317 0.643509955638465 ENSG00000168002:ENST00000301788:exon_62533966_62534182:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000525455:exon_62533966_62534145:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000524819:exon_62533966_62534167:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000531944:exon_62533966_62534182:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000527435:exon_62533966_62534182:POLR2G;ENSG00000168002:ENST00000526368:exon_62533966_62534179:POLR2G HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 63742219 C/T 1 574 528 1102 272.73924472655 277.117907289863 -4.3786625633133 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.809348187359358 ENSG00000176340:ENST00000314133:exon_63742079_63742266:COX8A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 63986713 C/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:C C A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 415 330 745 197.189523626338 173.198692056165 23.9908315701739 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0846249124714799 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 105 112 217 49.8913252548567 58.7825863948195 -8.89126113996279 T:C T C 10 0.524844521382317 0.247878278540313 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 63994230 G/T 1 106 105 211 50.3664807334744 55.1086747451433 -4.74219401166888 T:G G T 10 0.524844521382317 0.535340464637987 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63994107_63994604:NUDT22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 63996730 G/A 1 89 65 154 42.2888375969738 34.1148938898506 8.17394370712319 A:G G A 10 0.524844521382317 0.197234301888516 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63996719_63996816:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63996719_63996816:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63996719_63996816:NUDT22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64026144 G/A 1 2 12 14 0.950310957235366 6.2981342565878 -5.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00545792910502031 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64025945_64026185:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64025945_64026185:PLCB3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 31 12 43 14.7298198371482 6.2981342565878 8.43168558056037 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0136033621277487 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 73 64 137 34.6863499390909 33.5900493684683 1.09630057062257 T:C T C 10 0.524844521382317 0.864596953326453 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64662834 C/A 1 15 13 28 7.12733217926525 6.82297877797012 0.304353401295125 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662762_64662914:ATG2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64665585 C/G 1 25 25 50 11.8788869654421 13.1211130345579 -1.24222606911585 C:G C G 10 0.524844521382317 0.777835451745786 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665558_64665642:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665558_64665642:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665558_64665642:ATG2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64699042 G/A 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 A:G G A 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000068971:ENST00000164133:exon_64699031_64699081:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000527441:exon_64699031_64699081:PPP2R5B;ENSG00000068971:ENST00000359279:exon_64699031_64699081:PPP2R5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64794979 C/T 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64794790_64795108:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64794880_64795108:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64794944_64795108:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64794958_64795096:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64794959_64795108:SNX15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 31 19 50 14.7298198371482 9.97204590626402 4.75777393088415 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.203237341910243 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 51 47 98 24.2329294095018 24.6676925049689 -0.434763095467062 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64888955 A/G 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 A:G A G 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000149806:ENST00000531357:exon_64888106_64889589:FAU;ENSG00000149806:ENST00000529259:exon_64888169_64889116:FAU;ENSG00000149806:ENST00000434372:exon_64888755_64889116:FAU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64895979 G/A 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 A:G G A 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64894753_64897387:SYVN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64898229 T/C 1 83 58 141 39.4379047252677 30.4409822401744 8.99692248509331 T:C T C 10 0.524844521382317 0.151478414683579 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 64978769 G/T 1 175 131 306 83.1522087580945 68.7546323010835 14.397576457011 T:G G T 10 0.524844521382317 0.108889173947169 ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64978731_64979477:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64978731_64979329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64978731_64979472:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64978731_64979476:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64978731_64979476:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64978731_64979458:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528165:exon_64978285_64979476:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530567:exon_64978731_64979477:CAPN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65088498 T/C 1 2 13 15 0.950310957235366 6.82297877797012 -5.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00299070456497236 ENSG00000149798:ENST00000279249:exon_65088015_65089900:CDC42EP2;ENSG00000149798:ENST00000533419:exon_65088015_65089092:CDC42EP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65113459 G/T 1 45 34 79 21.3819965377957 17.8447137269988 3.53728281079696 T:G G T 10 0.524844521382317 0.433276766049139 ENSG00000133884:ENST00000528416:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000252268:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000524666:exon_65113401_65116402:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532264:exon_65113401_65113500:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000530973:exon_65113137_65113590:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532052:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000531989:exon_65113401_65113529:DPF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65124408 A/G 1 10 2 12 4.75155478617683 1.04968904276463 3.7018657434122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0413693580129535 ENSG00000173825:ENST00000309880:exon_65123264_65125084:TIGD3;ENSG00000173825:ENST00000394262:exon_65123262_65124744:TIGD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65143993 C/T 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65142666_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65143665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65143699_65144115:SLC25A45 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65156866 G/A 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65156832_65156999:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65156832_65156999:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65156832_65156999:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000526201:exon_65156856_65156999:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000525156:exon_65156832_65156999:FRMD8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65164357 C/T 1 14 4 18 6.65217670064756 2.09937808552927 4.55279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0345389637529455 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65164270_65164408:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65164270_65164491:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000531151:exon_65164270_65164491:FRMD8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65271832 C/T 1 168 138 306 79.8261204077707 72.4285439507597 7.397576457011 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.423037990730648 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65273749 A/G 1 245 206 451 116.413092261332 108.117971404757 8.29512085657504 A:G A G 10 0.524844521382317 0.450780938084762 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65293714 G/A 1 66 54 120 31.3602615887671 28.3416041546451 3.01865743412197 A:G G A 10 0.524844521382317 0.647852095402278 ENSG00000142186:ENST00000270176:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000525364:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000420247:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000533862:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527630:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000349495:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000279270:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000417543:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000524944:exon_65293595_65293821:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527009:exon_65293595_65293821:SCYL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65547367 G/A 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 A:G G A 10 0.524844521382317 0.82739042401884 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 1650 1761 3411 784.006539719177 924.25120215426 -140.244662435083 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 1.56904733339048e-06 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 3 14 17 1.42546643585305 7.34782329935244 -5.92235686349939 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00575999753207545 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65628334 G/A 1 25 16 41 11.8788869654421 8.39751234211707 3.481374623325 A:G G A 10 0.524844521382317 0.348311219954211 ENSG00000172732:ENST00000529857:exon_65628146_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65627872_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65627876_65628359:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65628016_65628573:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65628331_65628359:MUS81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 25 6 31 11.8788869654421 3.1490671282939 8.72981983714817 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00178351690561887 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 28 6 34 13.3043534012951 3.1490671282939 10.1552862730012 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000428012599263712 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 28 35 63 13.3043534012951 18.3695582483811 -5.06520484708597 T:C C T 10 0.524844521382317 0.209382013686643 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 42 27 69 19.9565301019427 14.1708020773226 5.78572802462013 A:G G A 10 0.524844521382317 0.185122022383651 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 41 49 90 19.481374623325 25.7173815477335 -6.23600692440853 T:G G T 10 0.524844521382317 0.205731359670815 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 45 46 91 21.3819965377957 24.1428479835866 -2.76085144579084 A:G G A 10 0.524844521382317 0.60034668500944 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 105 109 214 49.8913252548567 57.2080528306725 -7.31672757581583 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.33809887540694 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 32 32 64 15.2049753157659 16.7950246842341 -1.59004936846829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.708919847168411 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 66260191 C/T 1 43 38 81 20.4316855805604 19.944091812528 0.487593768032326 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533799:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000525738:exon_66260187_66260381:DPP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 66288733 G/C 1 14 16 30 6.65217670064756 8.39751234211707 -1.74533564146951 C:G G C 10 0.524844521382317 0.585512927936858 ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 66297299 G/A 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000174483:ENST00000419755:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000526760:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000318312:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000335157:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000455748:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000529955:exon_66297290_66297423:BBS1;ENSG00000174483:ENST00000393994:exon_66297290_66297423:BBS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 66392984 A/G 1 25 24 49 11.8788869654421 12.5962685131756 -0.717381547733531 A:G A G 10 0.524844521382317 0.886757139632472 ENSG00000239306:ENST00000310137:exon_66391685_66393149:RBM14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 66995603 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000173120:ENST00000398645:exon_66995508_66995634:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000529006:exon_66995508_66995634:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000401583:exon_66995508_66995634:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000308783:exon_66995508_66995634:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000526258:exon_66995508_66995634:KDM2A;ENSG00000173120:ENST00000531696:exon_66995508_66995634:KDM2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 96 75 171 45.6149259472976 39.3633391036738 6.2515868436238 T:C C T 10 0.524844521382317 0.358636179157202 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67202156 C/T 1 103 69 172 48.9410142976214 36.2142719753799 12.7267423222415 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0562035532423725 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67202053_67202165:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67202380 A/C 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:C A C 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67202053_67202872:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67205978 G/A 1 9 10 19 4.27639930755915 5.24844521382317 -0.972045906264022 A:G G A 10 0.524844521382317 0.819117352050088 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67257823 C/A 1 225 222 447 106.909982688979 116.515483746874 -9.60550105789568 A:C C A 10 0.524844521382317 0.368557253128345 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257787_67257929:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257787_67258124:AIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67258478 C/A 1 498 373 871 236.627428351606 195.767006475604 40.8604218760019 A:C C A 10 0.524844521382317 0.00596603043097159 ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67258259_67258574:AIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67266120 C/T 1 30 28 58 14.2546643585305 14.6956465987049 -0.440982240174385 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000110697:ENST00000534749:exon_67266067_67266317:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000436757:exon_67266067_67266317:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000356404:exon_67266067_67266317:PITPNM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67351540 A/G 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G A G 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67352689 A/G 1 900 1043 1943 427.639930755915 547.412835801757 -119.772905045842 A:C:G A G 10 0.524844521382317 5.50173024500617e-08 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67351605_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67352609_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67352509_67352712:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67352266_67352712:GSTP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67812481 C/G 1 56 45 101 26.6087068025902 23.6180034622043 2.99070334038598 C:G C G 10 0.524844521382317 0.618615880271941 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000528981:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67812425_67812569:TCIRG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67815086 G/A 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.554370408525684 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 67925104 A/G 1 10 15 25 4.75155478617683 7.87266782073475 -3.12111303455792 A:G A G 10 0.524844521382317 0.233899195740004 ENSG00000110066:ENST00000304363:exon_67922330_67926638:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000424360:exon_67923507_67926638:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000441488:exon_67925047_67926638:SUV420H1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 68171013 T/C 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68170951_68171167:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68170951_68171167:LRP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 68192589 A/G 1 3 14 17 1.42546643585305 7.34782329935244 -5.92235686349939 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00575999753207545 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 68704480 G/A 1 26 13 39 12.3540424440598 6.82297877797012 5.53106366608964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0798365016275991 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 60 45 105 28.509328717061 23.6180034622043 4.89132525485672 A:G A G 10 0.524844521382317 0.379419984923178 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 70279272 C/T 1 20 27 47 9.50310957235366 14.1708020773226 -4.6676925049689 T:C C T 10 0.524844521382317 0.190094875054324 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279207_70279384:CTTN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 70279341 G/C 1 20 16 36 9.50310957235366 8.39751234211707 1.10559723023659 C:G G C 10 0.524844521382317 0.741507923506718 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279207_70279384:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279207_70279384:CTTN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 70281849 A/G 1 61 65 126 28.9844841956787 34.1148938898506 -5.13040969417194 A:G A G 10 0.524844521382317 0.373407881312121 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70281132_70282690:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70281132_70282681:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70281572_70281850:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70281572_70282087:CTTN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 71510615 G/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000158483:ENST00000346333:exon_71510607_71512280:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000426628:exon_71510607_71512273:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000510443:exon_71510607_71511770:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000359244:exon_71510607_71512282:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000528685:exon_71510607_71511145:FAM86C;ENSG00000158483:ENST00000393714:exon_71510607_71511145:FAM86C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 72004419 T/C 1 36 38 74 17.1055972302366 19.944091812528 -2.83849458229145 T:C T C 10 0.524844521382317 0.56109607743687 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72003474_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72004347_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72004347_72004659:CLPB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 72012940 C/T 1 17 5 22 8.07764313650061 2.62422260691158 5.45342052958903 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0303635933604656 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72012847_72013008:CLPB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 72145307 C/G 1 16 26 42 7.60248765788293 13.6459575559402 -6.04346989805731 T:C:G C G 10 0.524844521382317 0.065160476747431 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72145116_72145568:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72145116_72145571:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72145116_72145571:CLPB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 30 24 54 14.2546643585305 12.5962685131756 1.65839584535488 A:G G A 10 0.524844521382317 0.684579476813733 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 73570975 T/C 1 29 50 79 13.7795088799128 26.2422260691158 -12.462717189203 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00649229355433706 ENSG00000175581:ENST00000310614:exon_73570952_73571054:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000411840:exon_73570952_73571054:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000398483:exon_73570952_73571054:MRPL48 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 73759251 T/C 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 T T 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73759250_73759383:C2CD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 73759254 C/A 0 10 0 10 4.75155478617683 0 4.75155478617683 C C 10 0.524844521382317 0.00217263351343085 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73759250_73759383:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73759250_73759383:C2CD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 17 9 26 8.07764313650061 4.72360069244085 3.35404244405976 T:C T C 10 0.524844521382317 0.239123659159394 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 74556129 A/G 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000166435:ENST00000530562:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000340360:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000321448:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000398418:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000344880:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531849:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000531449:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000527087:exon_74556118_74556316:XRRA1;ENSG00000166435:ENST00000431210:exon_74556118_74556316:XRRA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 75153537 C/T 1 12 3 15 5.7018657434122 1.57453356414695 4.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0384636259591238 ENSG00000158555:ENST00000526177:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527820:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533784:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000529721:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000336898:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533805:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000376282:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443415:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443276:exon_75153408_75153626:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000531561:exon_75153408_75153742:GDPD5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 75277376 C/T 1 27 9 36 12.8291979226774 4.72360069244085 8.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00714182593306493 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277361_75277436:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277361_75277511:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 75282876 C/T 1 58 37 95 27.5590177598256 19.4192472911457 8.13977046867989 T:C C T 10 0.524844521382317 0.100695856963425 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 77378229 A/G 1 35 20 55 16.6304417516189 10.4968904276463 6.13355132397257 A:G A G 10 0.524844521382317 0.106097030786483 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 15 19 34 7.12733217926525 9.97204590626402 -2.84471372699878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.391439920205275 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 82550387 A/G 1 13 14 27 6.17702122202988 7.34782329935244 -1.17080207732256 A:G A G 10 0.524844521382317 0.702665708426939 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82550303_82551885:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000525772:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000524642:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000526918:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531283:exon_82550303_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532476:exon_82550324_82550467:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82550373_82550467:PRCP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 82564294 T/G 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 T:G T G 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534631:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000527444:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531128:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534396:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000529671:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000528082:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532809:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000533126:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534264:exon_82564236_82564320:PRCP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 82877268 T/C 1 23 9 32 10.9285760082067 4.72360069244085 6.20497531576586 T:C T C 10 0.524844521382317 0.032908882524131 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82876642_82877756:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530660:exon_82876642_82877756:PCF11;ENSG00000165494:ENST00000530304:exon_82876642_82877756:PCF11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 82880341 G/A 1 9 19 28 4.27639930755915 9.97204590626402 -5.69564659870487 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0368431822879296 ENSG00000165494:ENST00000298281:exon_82879470_82881037:PCF11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 93463678 G/A 1 24 20 44 11.4037314868244 10.4968904276463 0.906841059178054 A:G G A 10 0.524844521382317 0.880321279279752 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 93469908 A/C 1 127 116 243 60.3447457844457 60.8819644803488 -0.537218695903022 A:C A C 10 0.524844521382317 0.94888560029018 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000526015:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000393259:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529794:exon_93469307_93469972:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000527068:exon_93469860_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000448108:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000528734:exon_93469860_93470133:TAF1D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 93488481 A/C 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 A:C A C 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000182919:ENST00000528288:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000331239:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000528099:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000354421:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000530620:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000524485:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527363:exon_93488376_93488559:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000526335:exon_93488376_93488492:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000533154:exon_93488039_93488552:C11orf54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 93517874 C/G 1 16 11 27 7.60248765788293 5.77328973520549 1.82919792267744 C:G C G 10 0.524844521382317 0.565137057094518 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 93517886 G/C 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 C:G G C 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93517884_93517929:MED17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 93529634 T/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:T T A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525026:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000507258:exon_93529576_93529645:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93529576_93529706:MED17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 93540765 T/C 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525613:exon_93540684_93540801:MED17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 20 31 51 9.50310957235366 16.2701801628518 -6.76707059049816 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0679065225345176 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 96098229 T/C 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C T C 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96098144_96098314:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96098144_96098314:CCDC82 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 12 10 22 5.7018657434122 5.24844521382317 0.453420529589027 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 96117873 A/G 1 24 22 46 11.4037314868244 11.546579470411 -0.142847983586581 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96117126_96117925:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96117126_96118154:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96117126_96117933:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530203:exon_96117822_96117925:CCDC82 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 102272277 G/T 1 55 58 113 26.1335513239726 30.4409822401744 -4.30743091620182 T:G G T 10 0.524844521382317 0.451527421304426 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272270_102272423:TMEM123 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 104825649 C/T 1 43 42 85 20.4316855805604 22.0434698980573 -1.61178431749694 T:C C T 10 0.524844521382317 0.745558334173618 ENSG00000196954:ENST00000444739:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000393150:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000421898:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000533730:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000529183:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000524843:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531333:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000417440:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531546:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000416586:exon_104825474_104825728:CASP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 107686675 T/C 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 T:C T C 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000110660:ENST00000525815:exon_107686516_107686691:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000525071:exon_107686516_107686691:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000265836:exon_107686516_107686691:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000375682:exon_107686516_107686691:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000429869:exon_107686516_107686691:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000532513:exon_107686516_107686691:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000524991:exon_107686516_107686691:SLC35F2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 110007492 C/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000149289:ENST00000278590:exon_110007388_110008139:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000528673:exon_110007388_110008139:ZC3H12C;ENSG00000149289:ENST00000453089:exon_110006579_110008139:ZC3H12C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 110118459 T/C 1 41 34 75 19.481374623325 17.8447137269988 1.63666089632623 T:C T C 10 0.524844521382317 0.730003813917146 ENSG00000137710:ENST00000530749:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000528498:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000405097:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000528900:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000343115:exon_110118428_110118558:RDX;ENSG00000137710:ENST00000530131:exon_110118428_110118558:RDX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 26 13 39 12.3540424440598 6.82297877797012 5.53106366608964 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0798365016275991 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 111740955 T/C 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000529754:exon_111740951_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000526587:exon_111740955_111741093:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530723:exon_111740951_111741093:FDXACB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:G A G 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 79 69 148 37.537282810797 36.2142719753799 1.32301083541709 A:C A C 10 0.524844521382317 0.869399013305301 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 111896324 C/T 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111895538_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111896132_111896348:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111896164_111896475:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111896320_111896475:DLAT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 111904160 C/T 1 12 11 23 5.7018657434122 5.77328973520549 -0.0714239917932904 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111904128_111904254:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111904128_111904254:DLAT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 114271426 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000076053:ENST00000375490:exon_114271338_114271489:RBM7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 114311437 C/T 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000076043:ENST00000265881:exon_114311378_114311461:REXO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 15 17 32 7.12733217926525 8.92235686349939 -1.79502468423414 T:C C T 10 0.524844521382317 0.59689936717842 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 116633862 G/A 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 A:G G A 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 40 29 69 19.0062191447073 15.2204911200872 3.78572802462013 A:G A G 10 0.524844521382317 0.399725334804127 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 117232691 G/A 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117232551_117232709:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000375253:exon_117232551_117232709:CEP164 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 117859210 C/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 C:G C G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000531365:exon_117859097_117859217:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117857452_117859217:IL10RA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 117869670 A/G 1 16 11 27 7.60248765788293 5.77328973520549 1.82919792267744 A:G A G 10 0.524844521382317 0.565137057094518 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117869430_117872194:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117869430_117870513:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117869430_117870592:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117869430_117870503:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117869430_117870613:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117869430_117872196:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000525467:exon_117869430_117870174:IL10RA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118404804 G/A 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000149582:ENST00000411589:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000442938:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000359862:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526465:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354284:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000532762:exon_118404744_118404835:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526973:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354064:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533627:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533102:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524522:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000313236:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524725:exon_118404744_118404844:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526853:exon_118404744_118404844:TMEM25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118405068 A/G 1 8 12 20 3.80124382894146 6.2981342565878 -2.49689042764634 A:G A G 10 0.524844521382317 0.273827921303142 ENSG00000149582:ENST00000411589:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000442938:exon_118404984_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000359862:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526465:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354284:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526973:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354064:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533627:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533102:exon_118404984_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524522:exon_118404984_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000313236:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524725:exon_118404981_118405070:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526853:exon_118404984_118405070:TMEM25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118405305 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000149582:ENST00000411589:exon_118405222_118406550:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000359862:exon_118405222_118406547:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000354064:exon_118405222_118406543:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000533627:exon_118405222_118406543:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524522:exon_118405222_118406549:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000313236:exon_118405222_118406550:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000524725:exon_118405222_118406544:TMEM25;ENSG00000149582:ENST00000526853:exon_118405222_118405441:TMEM25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118430519 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000118096:ENST00000264021:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000264020:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530872:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000531939:exon_118430500_118431137:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000534156:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000534114:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000528378:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000533918:exon_118430500_118430579:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530185:exon_118430500_118430579:IFT46 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 48 50 98 22.8074629736488 26.2422260691158 -3.43476309546706 T:C T C 10 0.524844521382317 0.544189598044512 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118772357 C/T 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000392849:exon_118771328_118773617:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118771328_118773617:BCL9L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 45 21 66 21.3819965377957 11.0217349490287 10.3602615887671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0131293353832719 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118889016 G/A 1 2857 1749 4606 1357.51920241072 917.953067897672 439.566134513048 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 7.50638770760232e-39 ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118888992_118889040:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118888992_118889388:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118888992_118889400:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118888992_118889054:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118888072_118889401:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118888992_118889052:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000524864:exon_118888992_118889376:RPS25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 43 67 110 20.4316855805604 35.1645829326152 -14.7328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00547014684159662 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118899102 A/G 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.567300048342317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118917160 C/T 1 156 182 338 74.1242546643586 95.5217028915817 -21.3974482272231 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0220484013168406 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118917129_118917179:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118917129_118917179:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118917129_118917179:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118917129_118917179:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118917129_118917179:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118917129_118917179:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118917129_118917174:HYOU1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 179 113 292 85.0528306725653 59.3074309162018 25.7453997563634 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00275144239076414 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 118982046 G/A 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 A:G G A 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000172375:ENST00000336702:exon_118981973_118982084:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000425549:exon_118981973_118982084:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000529874:exon_118981973_118982084:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000525598:exon_118981973_118982084:C2CD2L;ENSG00000172375:ENST00000528586:exon_118981973_118982084:C2CD2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 119045300 T/G 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:G T G 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000524562:exon_119045162_119045749:NLRX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 119045520 G/A 1 15 10 25 7.12733217926525 5.24844521382317 1.87888696544208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.549576175229901 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119045162_119045983:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000524562:exon_119045162_119045749:NLRX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 16 30 46 7.60248765788293 15.7453356414695 -8.14284798358658 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0179290722792523 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 22 15 37 10.453420529589 7.87266782073475 2.58075270885427 A:G A G 10 0.524844521382317 0.415690016228402 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 61 29 90 28.9844841956787 15.2204911200872 13.7639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00414919580136170 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 119549291 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000110400:ENST00000341398:exon_119549125_119549475:PVRL1;ENSG00000110400:ENST00000264025:exon_119549125_119549475:PVRL1;ENSG00000110400:ENST00000340882:exon_119549125_119549475:PVRL1;ENSG00000110400:ENST00000524510:exon_119549125_119549475:PVRL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 120099679 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 120099791 C/T 1 11 4 15 5.22671026479451 2.09937808552927 3.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.125251659640691 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 121178074 C/T 1 72 89 161 34.2111944604732 46.7111624030262 -12.499967942553 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0579112316856517 ENSG00000109929:ENST00000264027:exon_121177766_121179403:SC5DL;ENSG00000109929:ENST00000392789:exon_121177766_121179342:SC5DL;ENSG00000109929:ENST00000527183:exon_121177766_121178552:SC5DL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 121456962 C/T 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121456931_121457038:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121456931_121457038:SORL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 A:T T A 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 123596703 A/C 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 A:C A C 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000166261:ENST00000336139:exon_123594885_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000530393:exon_123595488_123597699:ZNF202;ENSG00000166261:ENST00000529691:exon_123595488_123597699:ZNF202 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 124506967 C/T 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000110013:ENST00000263593:exon_124503009_124507098:SIAE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 124748196 G/A 1 13 2 15 6.17702122202988 1.04968904276463 5.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0084264544748068 ENSG00000154134:ENST00000397801:exon_124748194_124748332:ROBO3;ENSG00000154134:ENST00000527196:exon_124748194_124748332:ROBO3;ENSG00000154134:ENST00000527245:exon_124748194_124748332:ROBO3;ENSG00000154134:ENST00000529658:exon_124748194_124748332:ROBO3;ENSG00000154134:ENST00000525448:exon_124748194_124748332:ROBO3;ENSG00000154134:ENST00000526551:exon_124748194_124748332:ROBO3;ENSG00000154134:ENST00000525482:exon_124748194_124748332:ROBO3;ENSG00000154134:ENST00000534598:exon_124747415_124748306:ROBO3;ENSG00000154134:ENST00000525304:exon_124748193_124748332:ROBO3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 124955359 C/T 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000134955:ENST00000403796:exon_124955291_124955369:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000407458:exon_124955291_124955369:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000298280:exon_124955291_124955369:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000526405:exon_124955291_124955369:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000308074:exon_124955291_124955369:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000525837:exon_124955291_124955369:SLC37A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 26 22 48 12.3540424440598 11.546579470411 0.807462973648786 A:T T A 10 0.524844521382317 0.885512669161484 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125351472 A/T 1 48 67 115 22.8074629736488 35.1645829326152 -12.3571199589665 A:T A T 10 0.524844521382317 0.024677397271546 ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 42 34 76 19.9565301019427 17.8447137269988 2.11181637494391 A:G A G 10 0.524844521382317 0.647694397969219 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125465862 T/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000134910:ENST00000527606:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525652:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529886:exon_125465776_125465898:STT3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125476252 C/G 1 23 17 40 10.9285760082067 8.92235686349939 2.00621914470732 C:G C G 10 0.524844521382317 0.635407729912364 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526213:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000527456:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525431:exon_125476105_125476360:STT3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 68 51 119 32.3105725460024 26.7670705904982 5.54350195550428 A:G G A 10 0.524844521382317 0.314492288235072 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 112 75 187 53.2174136051805 39.3633391036738 13.8540745015067 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0478092700564761 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 97 78 175 46.0900814259153 40.9378726678207 5.15220875809453 C:G C G 10 0.524844521382317 0.449924590205602 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 A:C C A 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125766173 A/C 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 A:C A C 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125766204 G/C 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 G G 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125766207 C/T 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 24 11 35 11.4037314868244 5.77328973520549 5.63044175161891 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0631291440724101 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 126104933 G/A 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G G A 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000197798:ENST00000533050:exon_126104890_126104982:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000528985:exon_126104890_126104982:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000529731:exon_126104890_126104982:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000360194:exon_126104890_126104982:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000530043:exon_126104890_126104982:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000527247:exon_126104890_126104982:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000525338:exon_126104890_126104982:FAM118B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 126124205 C/A 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:C C A 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000197798:ENST00000533050:exon_126124200_126124328:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000525728:exon_126124200_126124272:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000528985:exon_126124200_126124328:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000529731:exon_126124200_126124328:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000360194:exon_126124200_126124328:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000525338:exon_126124200_126124328:FAM118B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 126145273 G/A 1 15 11 26 7.12733217926525 5.77328973520549 1.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.695987302704438 ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000442061:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532101:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532125:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534315:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000533395:exon_126145222_126145323:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000530642:exon_126143809_126145765:FOXRED1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 126278075 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000110080:ENST00000227495:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000531217:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000444328:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000356132:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530591:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534083:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528605:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000528858:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000392669:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526756:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000526727:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000449406:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000532243:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000534457:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000530531:exon_126277994_126278089:ST3GAL4;ENSG00000110080:ENST00000524860:exon_126277994_126278089:ST3GAL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 128651893 A/G 1 9 11 20 4.27639930755915 5.77328973520549 -1.49689042764634 A:G A G 10 0.524844521382317 0.512500587924667 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128651853_128651918:FLI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 130010313 G/A 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000084234:ENST00000533616:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000528499:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000263574:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000345598:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000338167:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000278756:exon_130010293_130010378:APLP2;ENSG00000084234:ENST00000533860:exon_130010293_130010378:APLP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 130784828 A/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G A G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000120451:ENST00000265909:exon_130784161_130786404:SNX19;ENSG00000120451:ENST00000533214:exon_130784161_130786344:SNX19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 134027850 C/T 1 14 21 35 6.65217670064756 11.0217349490287 -4.36955824838109 T:C C T 10 0.524844521382317 0.175273723709109 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134027823_134027962:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134027823_134027962:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134027823_134027962:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134027823_134027962:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525977:exon_134027823_134027962:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525432:exon_134027823_134027944:NCAPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 11 134093831 C/A 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 A:C C A 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134093757_134094426:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134093757_134094426:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134093757_134093885:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134093757_134094110:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000533155:exon_134093757_134093835:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525485:exon_134093757_134093894:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534227:exon_134093757_134093894:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000526422:exon_134093757_134094426:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000532445:exon_134093757_134093894:NCAPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 863517 G/A 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.131066746913676 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 968489 T/C 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_968411_968630:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_968411_968630:WNK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 990912 A/C 1 26 20 46 12.3540424440598 10.4968904276463 1.85715201641342 A:C A C 10 0.524844521382317 0.658717870168319 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_990858_990955:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_990858_990955:WNK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 994014 C/T 1 34 25 59 16.1552862730012 13.1211130345579 3.0341732384433 T:C C T 10 0.524844521382317 0.438067939344683 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_993815_995250:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_993815_995250:WNK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 998365 G/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:G G T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_998306_998389:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_998306_998389:WNK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 1017197 C/T 1 109 93 202 51.7919471693275 48.8105404885555 2.98140668077198 T:C C T 10 0.524844521382317 0.724762726168982 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_1017013_1017200:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_1017013_1017200:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_1017013_1017200:WNK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 1702645 G/A 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 2968748 A/G 1 29 27 56 13.7795088799128 14.1708020773226 -0.39129319740975 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 3765493 G/T 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3765477_3765572:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3765477_3765572:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3765477_3765572:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3765477_3765572:EFCAB4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 3806147 T/C 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000130038:ENST00000440314:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000333750:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000444507:exon_3805938_3806201:EFCAB4B;ENSG00000130038:ENST00000252322:exon_3805938_3806201:EFCAB4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 23 16 39 10.9285760082067 8.39751234211707 2.53106366608964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.428763254968036 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 25 31 56 11.8788869654421 16.2701801628518 -4.39129319740975 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.284506044074317 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 26 30 56 12.3540424440598 15.7453356414695 -3.39129319740975 A:G A G 10 0.524844521382317 0.422490708331258 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 36 41 77 17.1055972302366 21.518625376675 -4.41302814643841 A:G A G 10 0.524844521382317 0.361490431721780 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 32 45 77 15.2049753157659 23.6180034622043 -8.41302814643841 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0672615074613697 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 79 73 152 37.537282810797 38.3136500609091 -0.77636725011218 T:C C T 10 0.524844521382317 0.935342760984483 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6639961 A/G 1 107 79 186 50.8416362120921 41.462717189203 9.37891902288904 A:G A G 10 0.524844521382317 0.186282515158622 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 3872 4112 7984 1839.80201320767 2158.16067192409 -318.358658716418 A:C:G C G 10 0.524844521382317 1.08622803490199e-12 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4045 3900 7945 1922.00391100853 2046.89363339104 -124.889722382508 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.00515533724999395 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 3854 3636 7490 1831.24921459255 1908.3346797461 -77.085465153554 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.0748165800930191 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6647179 A/G 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 A:G A G 10 0.524844521382317 0.370589300195247 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6675322 G/A 1 50 46 96 23.7577739308842 24.1428479835866 -0.385074052702429 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6675267_6675502:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6675267_6675502:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6675267_6675490:NOP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6688050 G/A 1 108 144 252 51.3167916907098 75.5776110790536 -24.2608193883439 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.00241579294465658 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6688012_6688083:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6688012_6688083:CHD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 60 77 137 28.509328717061 40.4130281464384 -11.9036994293774 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0487669817226916 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6968685 C/A 1 50 43 93 23.7577739308842 22.5683144194396 1.18945951144452 A:C C A 10 0.524844521382317 0.836033732311187 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6968634_6968705:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6968634_6968705:USP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 6979203 C/G 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 C:G C G 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000111669:ENST00000482209:exon_6979200_6979301:TPI1;ENSG00000111669:ENST00000474253:exon_6979181_6979300:TPI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7015707 G/T 1 19 7 26 9.02795409373598 3.67391164967622 5.35404244405976 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0477771026383253 ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000457146:exon_7015573_7015782:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000486401:exon_7015573_7015919:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000431207:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7015573_7015826:LRRC23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7022039 C/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:T T A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7045568 A/G 1 24 30 54 11.4037314868244 15.7453356414695 -4.34160415464512 A:G A G 10 0.524844521382317 0.275942156181052 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7045545_7045622:ATN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7053365 C/A 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:C C A 10 0.524844521382317 0.783356128888731 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7060889 C/T 1 368 355 723 174.857216131307 186.319805090723 -11.4625889594152 T:C C T 10 0.524844521382317 0.412689550629022 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7060772_7060894:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7060772_7060894:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000447931:exon_7060772_7060894:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000318974:exon_7060772_7060894:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000456013:exon_7060772_7060894:PTPN6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7069126 C/T 1 743 707 1450 353.040520612939 371.065076617298 -18.0245560043596 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.343997611571329 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7069090_7069157:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7069090_7069157:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000447931:exon_7069090_7069157:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000318974:exon_7069090_7069157:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000456013:exon_7069090_7069157:PTPN6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7249598 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 62 0 62 29.4596396742963 0 29.4596396742963 G G 10 0.524844521382317 5.02360229677675e-18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 8205403 A/G 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 A:G A G 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000065970:ENST00000162391:exon_8205358_8208117:FOXJ2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 8756842 A/G 1 23 41 64 10.9285760082067 21.518625376675 -10.5900493684683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00847377538055913 ENSG00000111732:ENST00000229335:exon_8754762_8756933:AICDA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 9094993 C/T 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C C T 10 0.524844521382317 0.595138344988413 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 89 26 115 42.2888375969738 13.6459575559402 28.6428800410335 C:G C G 10 0.524844521382317 5.43599077541009e-08 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 195 54 249 92.6553183304482 28.3416041546451 64.3137141758031 A:T:C C T 10 0.524844521382317 5.03584736267053e-17 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 9885578 G/A 1 83 38 121 39.4379047252677 19.944091812528 19.4938129127396 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.000359239429300671 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9885545_9885860:CLECL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 10659584 C/T 0 804 1 805 382.025004808617 0.524844521382317 381.500160287235 A:C C A 10 0.524844521382317 4.2081523371325e-223 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 10862589 C/T 1 135 121 256 64.1459896133872 63.5061870872604 0.639802526126864 T:C C T 10 0.524844521382317 0.950176857143764 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10862507_10862713:CSDA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 12814330 T/C 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000183150:ENST00000332427:exon_12813995_12815404:GPR19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 14 17 31 6.65217670064756 8.92235686349939 -2.27018016285183 A:T A T 10 0.524844521382317 0.473797754482654 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 14631339 G/A 1 14 5 19 6.65217670064756 2.62422260691158 4.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0697160540587325 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14631251_14631406:ATF7IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 15776095 C/T 1 8 15 23 3.80124382894146 7.87266782073475 -4.07142399179329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0980444399895555 ENSG00000151491:ENST00000281172:exon_15776092_15776221:EPS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 25236322 C/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 C:G C G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 93 111 204 44.1894595114445 58.2577418734372 -14.0682823619927 T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.0498323326899416 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 27066530 T/A 1 25 23 48 11.8788869654421 12.0714239917933 -0.192537026351214 A:T T A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27066390_27066620:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27066390_27066620:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000261190:exon_27066479_27066620:C12orf11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 29464870 T/C 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C T C 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29464816_29464883:FAR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 31249855 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000013573:ENST00000407793:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000228264:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000350437:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000404673:exon_31249793_31249924:DDX11;ENSG00000013573:ENST00000251758:exon_31249793_31249924:DDX11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 31605173 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 32134943 A/G 1 16 14 30 7.60248765788293 7.34782329935244 0.254664358530491 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 32136918 C/A 1 24 31 55 11.4037314868244 16.2701801628518 -4.86644867602743 A:C C A 10 0.524844521382317 0.224258848606195 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 32138725 A/G 1 40 43 83 19.0062191447073 22.5683144194396 -3.56209527473231 A:G A G 10 0.524844521382317 0.443818263709458 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 42748965 T/A 1 48 53 101 22.8074629736488 27.8167596332628 -5.00929665961401 A:T T A 10 0.524844521382317 0.321274437744724 ENSG00000134283:ENST00000395580:exon_42748963_42749024:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000395568:exon_42748963_42749024:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000432191:exon_42748963_42749024:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000449194:exon_42748963_42749024:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000317560:exon_42748963_42749024:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000337898:exon_42748963_42749024:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000256678:exon_42748963_42749024:PPHLN1;ENSG00000134283:ENST00000358314:exon_42748963_42749024:PPHLN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 24 21 45 11.4037314868244 11.0217349490287 0.381996537795736 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 45567192 G/A 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000134297:ENST00000256692:exon_45566847_45568425:PLEKHA9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 48240127 C/T 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000111424:ENST00000395324:exon_48240118_48240234:VDR;ENSG00000111424:ENST00000229022:exon_48240118_48240234:VDR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 48468159 G/A 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 A:G G A 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000079387:ENST00000004980:exon_48468107_48468390:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000448372:exon_48468107_48468390:SENP1;ENSG00000079387:ENST00000339976:exon_48468107_48468390:SENP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 48527123 G/A 1 37 22 59 17.5807527088543 11.546579470411 6.0341732384433 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.119794322158166 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 18 19 37 8.5527986151183 9.97204590626402 -1.41924729114573 T:C C T 10 0.524844521382317 0.742558906962133 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 33 19 52 15.6801307943835 9.97204590626402 5.70808488811952 T:G G T 10 0.524844521382317 0.127172101786293 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49065727 T/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49065582_49065745:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000357861:exon_49065582_49065745:C12orf41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49086963 G/A 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49086752_49088219:CCNT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49227081 C/T 1 47 58 105 22.3323074950311 30.4409822401744 -8.10867474514328 T:C C T 10 0.524844521382317 0.118592537866975 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49227060_49227302:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49227060_49227302:DDX23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49390677 T/C 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 T:C T C 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000181418:ENST00000421952:exon_49388932_49392449:DDN;ENSG00000181418:ENST00000313194:exon_49388933_49392449:DDN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49390739 G/A 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000181418:ENST00000421952:exon_49388932_49392449:DDN;ENSG00000181418:ENST00000313194:exon_49388933_49392449:DDN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49391622 G/A 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000181418:ENST00000421952:exon_49388932_49392449:DDN;ENSG00000181418:ENST00000313194:exon_49388933_49392449:DDN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49666860 C/A 1 496 496 992 235.677117394371 260.322882605629 -24.6457652112584 A:C:G C A 10 0.524844521382317 0.119356673537634 ENSG00000167553:ENST00000301072:exon_49666036_49667114:TUBA1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49717533 A/C 1 55 16 71 26.1335513239726 8.39751234211707 17.7360389818555 A:C A C 10 0.524844521382317 2.19408406771538e-05 ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000456139:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000380327:exon_49717387_49717535:TROAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 49724144 C/T 1 20 25 45 9.50310957235366 13.1211130345579 -3.61800346220426 T:C C T 10 0.524844521382317 0.298919719871587 ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49723928_49724726:TROAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 50043687 A/G 1 26 23 49 12.3540424440598 12.0714239917933 0.282618452266469 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50043474_50043708:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50043474_50043708:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000293590:exon_50043474_50043708:FMNL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 50045987 A/G 1 39 40 79 18.5310636660896 20.9937808552927 -2.46271718920304 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.652561298898317 ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50045716_50045995:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50045716_50045995:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000293590:exon_50045716_50045995:FMNL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 118 127 245 56.0683464768866 66.6552542155543 -10.5869077386677 A:G G A 10 0.524844521382317 0.179632890941731 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 50189477 C/T 1 19 11 30 9.02795409373598 5.77328973520549 3.25466435853049 T:C C T 10 0.524844521382317 0.27466732949558 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 22 13 35 10.453420529589 6.82297877797012 3.63044175161891 A:T A T 10 0.524844521382317 0.239649884557393 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 50384469 A/G 1 51 48 99 24.2329294095018 25.1925370263512 -0.959607616849379 A:G A G 10 0.524844521382317 0.919912951572697 ENSG00000161800:ENST00000454520:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000434422:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000427314:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000312377:exon_50384467_50384575:RACGAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 51681903 T/C 1 17 19 36 8.07764313650061 9.97204590626402 -1.89440276976341 T:C T C 10 0.524844521382317 0.617406672512397 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 35 37 72 16.6304417516189 19.4192472911457 -2.78880553952682 T:C T C 10 0.524844521382317 0.555894500117118 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 52448157 G/A 1 16 9 25 7.60248765788293 4.72360069244085 2.87888696544208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.317512505067783 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 52448859 C/T 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000123358:ENST00000360284:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000478250:exon_52448111_52449745:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394825:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000243050:exon_52448111_52448988:NR4A1;ENSG00000123358:ENST00000394824:exon_52448111_52448988:NR4A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53585754 G/A 1 121 116 237 57.4938129127396 60.8819644803488 -3.38815156760912 A:G G A 10 0.524844521382317 0.696475513835381 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53585643_53585803:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53585643_53585803:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53585643_53585803:ITGB7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53586198 G/T 1 176 136 312 83.6273642367122 71.3788549079951 12.2485093287171 T:G G T 10 0.524844521382317 0.173788825020591 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53586114_53586322:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53586114_53586322:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53586114_53586322:ITGB7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53587468 T/G 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:G T G 10 0.524844521382317 0.274574826477275 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53680103 G/A 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.692551486497706 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53679708_53680696:ESPL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53680530 G/T 1 11 18 29 5.22671026479451 9.4472013848817 -4.22049112008719 T:G G T 10 0.524844521382317 0.137576283488010 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53679708_53680696:ESPL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53681883 A/T 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:T A T 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53681963 G/A 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 A:G G A 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 53703021 G/A 1 43 19 62 20.4316855805604 9.97204590626402 10.4596396742963 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0103891863513160 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53702941_53703065:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53702941_53703065:AAAS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 17 11 28 8.07764313650061 5.77328973520549 2.30435340129513 A:G A G 10 0.524844521382317 0.451258947468562 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 54448106 A/G 1 24 20 44 11.4037314868244 10.4968904276463 0.906841059178054 A:G A G 10 0.524844521382317 0.880321279279752 ENSG00000198353:ENST00000303406:exon_54447701_54448145:HOXC4;ENSG00000198353:ENST00000430889:exon_54447661_54448145:HOXC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 54577681 C/A 1 41 36 77 19.481374623325 18.8944027697634 0.586971853561593 A:C C A 10 0.524844521382317 0.909700936209183 ENSG00000123415:ENST00000509864:exon_54577440_54577717:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54577532_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000506595:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000514685:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000513838:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000243112:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54577549_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000401977:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000514196:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000504338:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000509078:exon_54577549_54578080:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000507904:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000503447:exon_54577201_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000504797:exon_54577438_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000506169:exon_54577454_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000503306:exon_54577479_54577743:SMUG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 54675113 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 54905815 C/G 1 29 33 62 13.7795088799128 17.3198692056165 -3.54036032570365 C:G C G 10 0.524844521382317 0.376539494662122 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 55354987 T/G 1 34 21 55 16.1552862730012 11.0217349490287 5.13355132397257 T:G T G 10 0.524844521382317 0.178697425321398 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 55368368 G/A 1 13 8 21 6.17702122202988 4.19875617105854 1.97826505097134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.513299188922784 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56120523 G/A 1 318 280 598 151.099442200423 146.956465987049 4.14297621337445 A:G G A 10 0.524844521382317 0.743403672478022 ENSG00000135404:ENST00000257857:exon_56120484_56120579:CD63;ENSG00000135404:ENST00000420846:exon_56120484_56120579:CD63 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56360876 G/A 1 34 49 83 16.1552862730012 25.7173815477335 -9.56209527473231 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0370701243232807 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56360556_56360908:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56360556_56360908:CDK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56398454 G/C 1 14 22 36 6.65217670064756 11.546579470411 -4.89440276976341 C:G G C 10 0.524844521382317 0.132216225720217 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 C:G C G 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56437917 T/A 1 6 12 18 2.8509328717061 6.2981342565878 -3.44720138488171 A:T T A 10 0.524844521382317 0.154986439212099 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56437903_56438005:RPS26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 208 161 369 98.8323395524781 84.499967942553 14.332371609925 A:G A G 10 0.524844521382317 0.144411487927263 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56531154 T/C 1 31 33 64 14.7298198371482 17.3198692056165 -2.59004936846829 T:C T C 10 0.524844521382317 0.533713882825387 ENSG00000139641:ENST00000394048:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000267113:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000402331:exon_56531002_56531157:ESYT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56578682 T/C 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000139613:ENST00000394023:exon_56578628_56578720:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000347471:exon_56578628_56578720:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000267064:exon_56578628_56578720:SMARCC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56601998 G/A 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000181852:ENST00000345093:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000448057:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000394013:exon_56601947_56602082:RNF41;ENSG00000181852:ENST00000352641:exon_56601947_56602082:RNF41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56649601 A/G 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000139645:ENST00000267116:exon_56649568_56649768:ANKRD52;ENSG00000139645:ENST00000417002:exon_56649568_56649768:ANKRD52;ENSG00000139645:ENST00000425794:exon_56649568_56649768:ANKRD52 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 56818898 G/A 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56818799_56818936:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56818799_56818936:TIMELESS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57106660 A/T 1 3067 2834 5901 1457.30185292043 1487.40937359749 -30.1075206770524 A:T:C:G A T 10 0.524844521382317 0.434219147070419 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57106570_57106692:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57106570_57106692:NACA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57623519 G/A 1 94 89 183 44.6646149900622 46.7111624030262 -2.046547412964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.767736680950585 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57623519_57623594:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57623519_57623594:SHMT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57626018 C/T 1 343 316 659 162.978329165865 165.850868756812 -2.87253959094687 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.845405917276072 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57625994_57626075:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57625994_57626075:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57625994_57626075:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57625994_57626075:SHMT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 47 3 50 22.3323074950311 1.57453356414695 20.7577739308842 A:G G A 10 0.524844521382317 1.82248557165794e-10 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 9 15 24 4.27639930755915 7.87266782073475 -3.59626851317561 T:C C T 10 0.524844521382317 0.156455234273016 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57871437 C/T 1 57 48 105 27.0838622812079 25.1925370263512 1.89132525485672 T:C C T 10 0.524844521382317 0.769659493123413 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57871242_57871463:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57871242_57871463:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57871242_57871463:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57871242_57871463:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57871242_57871463:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57871242_57871463:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57871242_57871463:ARHGAP9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57872983 A/C 1 26 24 50 12.3540424440598 12.5962685131756 -0.242226069115848 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57872874_57873207:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57872874_57873424:ARHGAP9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 32 36 68 15.2049753157659 18.8944027697634 -3.68942745399755 A:G G A 10 0.524844521382317 0.396710558758125 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57920368 T/C 1 11 13 24 5.22671026479451 6.82297877797012 -1.59626851317561 T:C T C 10 0.524844521382317 0.545534900498325 ENSG00000166987:ENST00000355673:exon_57920349_57921010:MBD6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 57994679 C/G 1 11 4 15 5.22671026479451 2.09937808552927 3.12733217926525 C:G C G 10 0.524844521382317 0.125251659640691 ENSG00000166908:ENST00000422156:exon_57994594_57994861:PIP4K2C;ENSG00000166908:ENST00000354947:exon_57994594_57994861:PIP4K2C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 58010163 A/G 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 A:G A G 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000240771:ENST00000333972:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000286494:exon_58010067_58010278:ARHGEF25;ENSG00000240771:ENST00000471370:exon_58010067_58010278:ARHGEF25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 251 243 494 119.264025133038 127.537218695903 -8.27319356286458 A:G A G 10 0.524844521382317 0.471166359033091 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 58123516 A/G 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 A:G A G 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58123422_58123550:AGAP2;ENSG00000135439:ENST00000328568:exon_58123422_58123550:AGAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 37 17 54 17.5807527088543 8.92235686349939 8.65839584535489 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.0201659886938546 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 46 37 83 21.8571520164134 19.4192472911457 2.43790472526769 T:C T C 10 0.524844521382317 0.660542962639245 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 34 28 62 16.1552862730012 14.6956465987049 1.45963967429635 T:C C T 10 0.524844521382317 0.799529618076043 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 64803798 A/C 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 A:C A C 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64803742_64803875:XPOT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 64890807 G/T 1 9 15 24 4.27639930755915 7.87266782073475 -3.59626851317561 T:G G T 10 0.524844521382317 0.156455234273016 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64890729_64890830:TBK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 107 136 243 50.8416362120921 71.3788549079951 -20.537218695903 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.00845201222804687 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 13 24 37 6.17702122202988 12.5962685131756 -6.41924729114573 A:T:G G T 10 0.524844521382317 0.0468414355119701 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 69252715 A/G 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000135678:ENST00000338356:exon_69252703_69252851:CPM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 69645064 T/G 1 58 88 146 27.5590177598256 46.1863178816439 -18.6273001218183 T:G T G 10 0.524844521382317 0.00211793844270420 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69644909_69645118:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69644909_69645118:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69644909_69645118:CPSF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 94 92 186 44.6646149900622 48.2856959671732 -3.62108097711096 A:G G A 10 0.524844521382317 0.607929740283965 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 72021551 C/T 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72021531_72021714:ZFC3H1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 42 48 90 19.9565301019427 25.1925370263512 -5.23600692440853 C:G C G 10 0.524844521382317 0.291855185026564 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 82752543 T/G 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:G T G 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 82792666 C/T 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 82792942 A/G 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G A G 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 88589256 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000139324:ENST00000266712:exon_88588615_88593655:TMTC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 90028901 T/C 1 11 14 25 5.22671026479451 7.34782329935244 -2.12111303455792 T:C T C 10 0.524844521382317 0.428460468329696 ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000393164:exon_90028774_90029028:ATP2B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 92539146 C/T 1 1 7 8 0.475155478617683 3.67391164967622 -3.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0313158759629617 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:G T G 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 94658920 C/T 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94658855_94659001:PLXNC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 94702598 G/A 1 3 12 15 1.42546643585305 6.2981342565878 -4.87266782073475 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.0171387439018236 ENSG00000173588:ENST00000339839:exon_94702058_94702693:CCDC41;ENSG00000173588:ENST00000397809:exon_94702058_94702693:CCDC41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 94972290 C/T 1 12 4 16 5.7018657434122 2.09937808552927 3.60248765788293 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0825793217037308 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94972170_94972305:TMCC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 94975843 T/C 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 100550947 A/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:T A T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000120853:ENST00000266746:exon_100550943_100551034:GOLGA2B;ENSG00000120853:ENST00000456437:exon_100550943_100551034:GOLGA2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 T:C C T 10 0.524844521382317 0.463486008093855 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 48 28 76 22.8074629736488 14.6956465987049 8.11181637494391 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0664754620151973 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 103352649 C/G 1 23 25 48 10.9285760082067 13.1211130345579 -2.19253702635121 C:G C G 10 0.524844521382317 0.564993307275273 ENSG00000139352:ENST00000266744:exon_103351452_103352780:ASCL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 104171742 C/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000111696:ENST00000447799:exon_104170822_104171859:NT5DC3;ENSG00000111696:ENST00000392876:exon_104166088_104171859:NT5DC3;ENSG00000111696:ENST00000339146:exon_104171607_104171832:NT5DC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 104328030 A/G 1 370 366 736 175.807527088543 192.093094825928 -16.2855677373853 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.237635065917666 ENSG00000166598:ENST00000299767:exon_104327734_104328065:HSP90B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 104378601 C/T 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104378527_104378698:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104378527_104378698:TDG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 104851162 C/T 1 17 25 42 8.07764313650061 13.1211130345579 -5.04346989805731 T:C C T 10 0.524844521382317 0.124982674019902 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 105380143 G/C 1 9 13 22 4.27639930755915 6.82297877797012 -2.54657947041097 C:G G C 10 0.524844521382317 0.293962750959165 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 105591569 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000136044:ENST00000258530:exon_105591543_105591731:APPL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 108918146 C/T 1 59 53 112 28.0341732384433 27.8167596332628 0.2174136051805 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108918093_108918283:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108918093_108918283:SART3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 108923950 A/G 1 73 39 112 34.6863499390909 20.4689363339104 14.2174136051805 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0078564481043618 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108923919_108924087:SART3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 108962663 C/G 1 319 282 601 151.574597679041 148.006155029813 3.56844264922751 C:G C G 10 0.524844521382317 0.775142207170284 ENSG00000136003:ENST00000311893:exon_108962607_108963158:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000392807:exon_108962607_108963158:ISCU;ENSG00000136003:ENST00000338291:exon_108962607_108963143:ISCU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 109017614 G/A 1 37 79 116 17.5807527088543 41.462717189203 -23.8819644803488 A:G G A 10 0.524844521382317 9.672207196429e-06 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 109017898 C/T 1 63 39 102 29.934795152914 20.4689363339104 9.46585881900367 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0738308362005915 ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 109181914 G/A 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G G A 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 109182049 T/C 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 109182771 G/C 1 9 11 20 4.27639930755915 5.77328973520549 -1.49689042764634 C:G G C 10 0.524844521382317 0.512500587924667 ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 109541374 C/G 1 25 41 66 11.8788869654421 21.518625376675 -9.63973841123292 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0190426593840941 ENSG00000076248:ENST00000242576:exon_109541238_109541416:UNG;ENSG00000076248:ENST00000336865:exon_109541238_109541416:UNG;ENSG00000076248:ENST00000446767:exon_109541238_109541416:UNG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 110013879 G/A 1 15 20 35 7.12733217926525 10.4968904276463 -3.36955824838109 A:G G A 10 0.524844521382317 0.310246399938527 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110013803_110013950:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110013803_110013950:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110013803_110013950:MVK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 110340852 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110340832_110341019:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110340832_110341019:TCHP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 110348893 C/T 1 13 2 15 6.17702122202988 1.04968904276463 5.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0084264544748068 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110348868_110349040:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110348868_110349040:TCHP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 110352361 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110352247_110352432:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110352247_110352432:TCHP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 110389074 A/T 1 12 28 40 5.7018657434122 14.6956465987049 -8.99378085529268 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0063616166285746 ENSG00000139436:ENST00000457474:exon_110389017_110389121:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000356259:exon_110388972_110389121:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000343646:exon_110388972_110389121:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000338373:exon_110389017_110389121:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000361006:exon_110388972_110389121:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000355312:exon_110388972_110389121:GIT2;ENSG00000139436:ENST00000320063:exon_110388972_110389121:GIT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 A:G A G 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 110974890 T/C 1 21 16 37 9.97826505097134 8.39751234211707 1.58075270885427 T:C T C 10 0.524844521382317 0.62568102314945 ENSG00000196850:ENST00000354300:exon_110972237_110974900:PPTC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 112843848 G/A 1 13 8 21 6.17702122202988 4.19875617105854 1.97826505097134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.513299188922784 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 2 21 23 0.950310957235366 11.0217349490287 -10.0714239917933 A:G G A 10 0.524844521382317 2.03064166970047e-05 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 15 8 23 7.12733217926525 4.19875617105854 2.92857600820671 C:G C G 10 0.524844521382317 0.29679434643917 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113403684 C/T 1 7 16 23 3.32608835032378 8.39751234211707 -5.07142399179329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.037721226567006 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113403549_113403834:OAS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113407773 G/A 1 40 41 81 19.0062191447073 21.518625376675 -2.51240623196767 A:G G A 10 0.524844521382317 0.580335796392865 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113407767_113411050:OAS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 48 58 106 22.8074629736488 30.4409822401744 -7.6335192665256 C:G C G 10 0.524844521382317 0.145262223064609 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113616980 G/T 1 45 30 75 21.3819965377957 15.7453356414695 5.63666089632623 T:G G T 10 0.524844521382317 0.204854829293055 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113616948_113617136:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113616948_113617136:DDX54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113616981 C/T 1 45 30 75 21.3819965377957 15.7453356414695 5.63666089632623 T:C C T 10 0.524844521382317 0.204854829293055 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113616948_113617136:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113616948_113617136:DDX54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113618826 G/A 1 50 34 84 23.7577739308842 17.8447137269988 5.91306020388538 A:G G A 10 0.524844521382317 0.229392538260400 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113618734_113618863:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113618734_113618863:DDX54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113629637 G/A 1 68 68 136 32.3105725460024 35.6894274539976 -3.37885490799511 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.60667399165573 ENSG00000139405:ENST00000266813:exon_113629115_113630166:C12orf52;ENSG00000139405:ENST00000436053:exon_113629115_113630119:C12orf52 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113737723 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000089060:ENST00000202831:exon_113736572_113737779:SLC24A6;ENSG00000089060:ENST00000377458:exon_113736572_113737779:SLC24A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113821981 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113821910_113822070:PLBD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 113826442 C/G 1 26 18 44 12.3540424440598 9.4472013848817 2.90684105917805 C:G C G 10 0.524844521382317 0.451075073738667 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 114358449 C/T 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 T:C C T 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114358416_114358495:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114358416_114358495:RBM19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 114374887 T/A 1 34 27 61 16.1552862730012 14.1708020773226 1.98448419567867 A:T T A 10 0.524844521382317 0.700895853553347 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114374812_114374941:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114374812_114374941:RBM19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 114377835 A/G 1 15 20 35 7.12733217926525 10.4968904276463 -3.36955824838109 A:G A G 10 0.524844521382317 0.310246399938527 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 114377877 T/C 1 15 8 23 7.12733217926525 4.19875617105854 2.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.29679434643917 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 114383651 C/T 1 10 19 29 4.75155478617683 9.97204590626402 -5.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0625786547301105 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114383633_114383729:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114383633_114383729:RBM19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 114386639 A/G 1 31 31 62 14.7298198371482 16.2701801628518 -1.54036032570365 A:G A G 10 0.524844521382317 0.704898403096877 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114386638_114386841:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114386638_114386841:RBM19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 114395651 T/C 1 46 47 93 21.8571520164134 24.6676925049689 -2.81054048855548 T:C T C 10 0.524844521382317 0.604133188822715 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 117584066 G/A 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 A:G G A 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000135108:ENST00000330622:exon_117581586_117584082:FBXO21;ENSG00000135108:ENST00000427718:exon_117581586_117584082:FBXO21;ENSG00000135108:ENST00000257563:exon_117581586_117584082:FBXO21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 118465820 T/C 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000111445:ENST00000229043:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000454402:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000392542:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000449641:exon_118465758_118465835:RFC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 118473027 T/G 1 11 18 29 5.22671026479451 9.4472013848817 -4.22049112008719 T:G T G 10 0.524844521382317 0.137576283488010 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 27 31 58 12.8291979226774 16.2701801628518 -3.44098224017438 T:C T C 10 0.524844521382317 0.430504950329701 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 12 4 16 5.7018657434122 2.09937808552927 3.60248765788293 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0825793217037308 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 120118143 G/T 1 30 42 72 14.2546643585305 22.0434698980573 -7.78880553952682 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0763706910974438 ENSG00000111725:ENST00000229328:exon_120118053_120119416:PRKAB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 120575608 T/C 1 51 38 89 24.2329294095018 19.944091812528 4.28883759697379 T:C T C 10 0.524844521382317 0.396542508721255 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120575349_120575618:GCN1L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 120576637 G/A 1 36 34 70 17.1055972302366 17.8447137269988 -0.739116496762186 A:G G A 10 0.524844521382317 0.905005895280187 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120576499_120576660:GCN1L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 120578663 G/A 1 36 32 68 17.1055972302366 16.7950246842341 0.310572546002447 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120578663_120578827:GCN1L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 120954490 C/T 1 11 16 27 5.22671026479451 8.39751234211707 -3.17080207732256 T:C C T 10 0.524844521382317 0.250651106877731 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120954370_120954591:COQ5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121132021 C/T 1 23 25 48 10.9285760082067 13.1211130345579 -2.19253702635121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.564993307275273 ENSG00000110917:ENST00000228506:exon_121131894_121132072:MLEC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121454257 T/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:T T A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121454133_121454300:C12orf43 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121471307 C/T 1 18 11 29 8.5527986151183 5.77328973520549 2.77950887991281 T:C C T 10 0.524844521382317 0.354681882687295 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121683002 G/A 1 18 8 26 8.5527986151183 4.19875617105854 4.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.115132819997145 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121682943_121683043:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121682943_121683043:CAMKK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121691130 G/A 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121773415 T/C 1 35 37 72 16.6304417516189 19.4192472911457 -2.78880553952682 T:C T C 10 0.524844521382317 0.555894500117118 ENSG00000089053:ENST00000261819:exon_121773336_121773526:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000441917:exon_121773336_121773526:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000344395:exon_121773336_121773526:ANAPC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 49 40 89 23.2826184522665 20.9937808552927 2.28883759697379 T:C C T 10 0.524844521382317 0.671804535154177 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121878707 C/A 1 31 12 43 14.7298198371482 6.2981342565878 8.43168558056037 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0136033621277487 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 81 58 139 38.4875937680323 30.4409822401744 8.04661152785794 A:G G A 10 0.524844521382317 0.175328675902531 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 54 43 97 25.6583958453549 22.5683144194396 3.09008142591525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.543653570390336 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 128 122 250 60.8199012630634 64.0310316086427 -3.21113034557924 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.704226603260943 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 122337698 C/T 1 54 40 94 25.6583958453549 20.9937808552927 4.66461499006221 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.354004186022656 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122337540_122337751:PSMD9;ENSG00000110801:ENST00000340175:exon_122337540_122337751:PSMD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 122618241 C/T 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 122862137 A/G 1 14 11 25 6.65217670064756 5.77328973520549 0.878886965442075 A:G A G 10 0.524844521382317 0.842073148287916 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122861936_122862507:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122861936_122862507:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122861936_122862507:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000450731:exon_122861936_122862507:CLIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 122958095 C/T 1 65 74 139 30.8851061101494 38.8384945822915 -7.95338847214206 T:C C T 10 0.524844521382317 0.202551897033531 ENSG00000033030:ENST00000336229:exon_122957437_122958822:ZCCHC8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 123011433 C/G 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 C:G C G 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000111011:ENST00000331738:exon_123011395_123011546:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000354654:exon_123011395_123011546:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000344591:exon_123011395_123011546:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000532695:exon_123011395_123011547:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000433877:exon_123011395_123011547:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000418773:exon_123011395_123011547:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000526560:exon_123011395_123011496:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527461:exon_123011395_123011506:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527399:exon_123011395_123011542:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000525387:exon_123011395_123011501:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000528279:exon_123011395_123011487:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527796:exon_123011395_123011534:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000525570:exon_123011395_123011496:RSRC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 123089955 C/T 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123089853_123089962:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000436959:exon_123089853_123089962:KNTC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 123793863 T/C 1 17 17 34 8.07764313650061 8.92235686349939 -0.844713726998776 T:C T C 10 0.524844521382317 0.864128654984718 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123793857_123793949:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123793857_123793949:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123793857_123793949:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123793857_123793949:SBNO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 123801856 T/C 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123801768_123801903:SBNO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 123950734 C/T 1 90 91 181 42.7639930755915 47.7608514457908 -4.99685837019937 T:C C T 10 0.524844521382317 0.457997816354805 ENSG00000184209:ENST00000438124:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000526639:exon_123950085_123951483:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000392420:exon_123950085_123950941:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000361485:exon_123950085_123950937:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000412157:exon_123950085_123950936:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000350887:exon_123950085_123950937:SNRNP35;ENSG00000184209:ENST00000526636:exon_123950559_123950820:SNRNP35 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124090655 C/T 1 12 11 23 5.7018657434122 5.77328973520549 -0.0714239917932904 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124090620_124090706:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124090620_124090706:DDX55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124097766 A/G 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 A:G A G 10 0.524844521382317 0.370589300195247 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124097717_124097799:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124097717_124097799:DDX55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 40 27 67 19.0062191447073 14.1708020773226 4.83541706738477 A:G A G 10 0.524844521382317 0.271286112625707 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 74 57 131 35.1615054177085 29.9161377187921 5.24536769891648 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.382304687566128 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124111620 G/A 1 33 21 54 15.6801307943835 11.0217349490287 4.65839584535488 A:G G A 10 0.524844521382317 0.221896530911092 ENSG00000111361:ENST00000228958:exon_124111591_124111703:EIF2B1;ENSG00000111361:ENST00000452159:exon_124111404_124111703:EIF2B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 A:G A G 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124144793 T/C 1 24 26 50 11.4037314868244 13.6459575559402 -2.24222606911585 T:C T C 10 0.524844521382317 0.572424165751215 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144713_124145620:GTF2H3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124156637 C/T 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000168778:ENST00000303372:exon_124156603_124156679:TCTN2;ENSG00000168778:ENST00000426174:exon_124156603_124156679:TCTN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124818984 G/A 1 46 40 86 21.8571520164134 20.9937808552927 0.863371161120742 A:G G A 10 0.524844521382317 0.914156776820088 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124818970_124819163:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000461081:exon_124818970_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000474079:exon_124818890_124819163:NCOR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124819747 C/T 1 59 54 113 28.0341732384433 28.3416041546451 -0.307430916201817 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124819681_124819826:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000461081:exon_124818970_124819826:NCOR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124821413 G/A 1 64 76 140 30.4099506315317 39.8881836250561 -9.47823299352437 A:G G A 10 0.524844521382317 0.127418161940510 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124821416 C/T 1 68 80 148 32.3105725460024 41.9875617105854 -9.67698916458291 T:C C T 10 0.524844521382317 0.118086699092041 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124827635 C/T 1 35 25 60 16.6304417516189 13.1211130345579 3.50932871706098 T:C C T 10 0.524844521382317 0.438275700640332 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124827551_124827772:NCOR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124846788 G/C 1 14 24 38 6.65217670064756 12.5962685131756 -5.94409181252805 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0726331896169013 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124846672_124846843:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124846672_124846843:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124846672_124846843:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124846672_124846843:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124846672_124846843:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124846672_124846840:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124846672_124846843:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124846672_124846843:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124846672_124846843:NCOR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 34 32 66 16.1552862730012 16.7950246842341 -0.639738411232919 A:T T A 10 0.524844521382317 0.90236598876862 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 19 9 28 9.02795409373598 4.72360069244085 4.30435340129513 T:C T C 10 0.524844521382317 0.129749466460062 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 1 19 8 27 9.02795409373598 4.19875617105854 4.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0816233984370558 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 125438712 C/A 1 30 26 56 14.2546643585305 13.6459575559402 0.60870680259025 A:C C A 10 0.524844521382317 0.89436653797937 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438633_125438757:DHX37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 125441611 G/A 1 23 22 45 10.9285760082067 11.546579470411 -0.618003462204264 A:G G A 10 0.524844521382317 0.882226148319876 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441575_125441681:DHX37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 125451405 T/G 1 19 11 30 9.02795409373598 5.77328973520549 3.25466435853049 T:G T G 10 0.524844521382317 0.27466732949558 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125451339_125451424:DHX37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 125467158 C/T 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125467057_125467169:DHX37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 125561118 C/A 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 125561151 A/G 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 A:G A G 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 72 72 144 34.2111944604732 37.7888055395268 -3.57761107905364 A:G A G 10 0.524844521382317 0.560205683317887 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 53 33 86 25.1832403667372 17.3198692056165 7.86337116112074 T:C C T 10 0.524844521382317 0.104948133524117 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 129373247 C/T 1 9 1 10 4.27639930755915 0.524844521382317 3.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0230108839750243 ENSG00000151948:ENST00000442111:exon_129373184_129373289:GLT1D1;ENSG00000151948:ENST00000281703:exon_129373184_129373289:GLT1D1;ENSG00000151948:ENST00000441390:exon_129373184_129373289:GLT1D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 131438971 G/T 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:G G T 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000111452:ENST00000261654:exon_131438452_131439076:GPR133 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 132335592 G/A 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000198598:ENST00000360564:exon_132335470_132336316:MMP17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 132404591 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132404524_132404681:ULK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 132549300 A/G 1 5 14 19 2.37577739308842 7.34782329935244 -4.97204590626402 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0358228143741496 ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132549213_132549431:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132549213_132549431:EP400 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 24 19 43 11.4037314868244 9.97204590626402 1.43168558056037 A:G G A 10 0.524844521382317 0.760592071157294 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 132636937 G/A 0 129 0 129 61.2950567416811 0 61.2950567416811 G G 10 0.524844521382317 7.86465958785937e-37 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132636827_132636986:NOC4L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 133294662 G/A 1 45 54 99 21.3819965377957 28.3416041546451 -6.95960761684938 A:G G A 10 0.524844521382317 0.190557901713545 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294573_133294706:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294573_133294706:PGAM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 133306780 A/G 1 55 66 121 26.1335513239726 34.6397384112329 -8.50618708726035 A:T:C:G A G 10 0.524844521382317 0.122893107456308 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 133378440 C/T 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133378353_133378555:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133378353_133378555:GOLGA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 12 133732624 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000090612:ENST00000248211:exon_133732089_133736047:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000426665:exon_133732089_133733554:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000402932:exon_133732533_133733497:ZNF268 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 20356941 T/A 1 108 86 194 51.3167916907098 45.1366288388793 6.18016285183051 A:T:C T A 10 0.524844521382317 0.388961376351679 ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 20411701 C/T 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20411593_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20411605_20411961:ZMYM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 20413021 T/C 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20412840_20413125:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20412840_20413125:ZMYM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 20425911 C/A 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 A:C C A 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 20425948 T/C 1 11 23 34 5.22671026479451 12.0714239917933 -6.84471372699878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.024381940001903 ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 20600760 A/G 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000121741:ENST00000382883:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382869:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000456228:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000418722:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382874:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382871:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000468677:exon_20600752_20600902:ZMYM2;ENSG00000121741:ENST00000382870:exon_20600659_20600902:ZMYM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 21306140 A/G 1 8 9 17 3.80124382894146 4.72360069244085 -0.922356863499388 A:G A G 10 0.524844521382317 0.809125944455852 ENSG00000150456:ENST00000473438:exon_21305980_21306260:N6AMT2;ENSG00000150456:ENST00000382758:exon_21305980_21306260:N6AMT2;ENSG00000150456:ENST00000382754:exon_21305980_21306260:N6AMT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 21549483 C/T 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000150457:ENST00000382592:exon_21547171_21549503:LATS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 21751005 G/C 1 16 16 32 7.60248765788293 8.39751234211707 -0.795024684234143 C:G G C 10 0.524844521382317 0.860150442628282 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 23909142 T/C 1 14 18 32 6.65217670064756 9.4472013848817 -2.79502468423414 T:C T C 10 0.524844521382317 0.3775047710159 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 23928912 C/T 1 19 26 45 9.02795409373598 13.6459575559402 -4.61800346220426 T:C C T 10 0.524844521382317 0.181214492608227 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000476776:exon_23928658_23929029:SACS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 24243200 T/C 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 24243214 C/T 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 135 91 226 64.1459896133872 47.7608514457908 16.3851381675964 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0328544631317055 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 25009288 C/T 1 75 69 144 35.6366608963262 36.2142719753799 -0.577611079053646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.933687724707066 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 25034161 G/A 1 12 14 26 5.7018657434122 7.34782329935244 -1.64595755594024 A:G G A 10 0.524844521382317 0.559962886005581 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25034110_25034274:PARP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 25074503 G/C 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 C:G G C 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25074454_25074520:PARP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 25479706 T/A 1 14 24 38 6.65217670064756 12.5962685131756 -5.94409181252805 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0726331896169013 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 25480616 T/A 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:T T A 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 56 50 106 26.6087068025902 26.2422260691158 0.3664807334744 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 26788151 C/T 1 49 53 102 23.2826184522665 27.8167596332628 -4.53414118099633 T:C C T 10 0.524844521382317 0.374221676601534 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 144 186 330 68.4223889209464 97.6210809771109 -29.1986920561646 C:G G C 10 0.524844521382317 0.00136610007560856 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 28009846 C/T 1 31 21 52 14.7298198371482 11.0217349490287 3.70808488811952 T:C C T 10 0.524844521382317 0.332915245330799 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 29252247 C/G 1 277 375 652 131.618067577098 196.816695518369 -65.1986279412707 C:G C G 10 0.524844521382317 3.21883215804834e-07 ENSG00000132963:ENST00000380842:exon_29252172_29253062:POMP;ENSG00000132963:ENST00000460403:exon_29252172_29253062:POMP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 31036681 A/G 1 134 82 216 63.6708341347695 43.03725075335 20.6335833814195 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00514527654892117 ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 33684850 C/T 1 10 15 25 4.75155478617683 7.87266782073475 -3.12111303455792 T:C C T 10 0.524844521382317 0.233899195740004 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33684823_33685044:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33684823_33685044:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33684823_33685044:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33684823_33685044:STARD13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 33684862 C/T 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33684823_33685044:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33684823_33685044:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33684823_33685044:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33684823_33685044:STARD13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 33700316 C/T 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33700218_33700377:STARD13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 39586241 C/T 1 86 67 153 40.8633711611207 35.1645829326152 5.6987882285055 T:C C T 10 0.524844521382317 0.373944284002777 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 76 31 107 36.1118163749439 16.2701801628518 19.8416362120921 A:G A G 10 0.524844521382317 0.000135784887869248 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 41827134 A/G 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 A:G A G 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000480434:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41827085_41827166:MTRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 41834644 C/G 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 C:G C G 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000480434:exon_41834629_41834722:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 41835039 T/C 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 41949694 C/T 1 19 7 26 9.02795409373598 3.67391164967622 5.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0477771026383253 ENSG00000172766:ENST00000379406:exon_41949541_41951166:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000497143:exon_41949541_41951166:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000477452:exon_41949541_41950318:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000469708:exon_41949541_41949948:NAA16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 42873915 A/G 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G A G 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42873499_42877999:AKAP11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 42876988 A/G 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 A:G A G 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000023516:ENST00000025301:exon_42873499_42877999:AKAP11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 43181024 T/C 1 27 14 41 12.8291979226774 7.34782329935244 5.481374623325 T:C T C 10 0.524844521382317 0.116817175394066 ENSG00000120659:ENST00000358545:exon_43180633_43181310:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000405262:exon_43180633_43182149:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43180633_43182144:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43180633_43182149:TNFSF11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 69 76 145 32.7857280246201 39.8881836250561 -7.10245560043596 A:T A T 10 0.524844521382317 0.245256543167590 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 45515395 G/A 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45513384_45515457:NUFIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 45594482 G/A 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 A:G G A 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000133114:ENST00000379151:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000497558:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000361121:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000357537:exon_45594465_45594563:KIAA1704 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 45915228 G/A 1 1922 1772 3694 913.248829903187 930.024491889466 -16.7756619862789 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 0.586711219183592 ENSG00000133112:ENST00000379056:exon_45915177_45915347:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000490277:exon_45915177_45915290:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000530705:exon_45915177_45915505:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000448968:exon_45915177_45915318:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000379060:exon_45915173_45915257:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000379055:exon_45914847_45915293:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000527226:exon_45915177_45915293:TPT1;ENSG00000133112:ENST00000442760:exon_45915177_45915318:TPT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 46103935 A/G 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46103926_46104053:COG3;ENSG00000136152:ENST00000486940:exon_46103926_46104053:COG3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 46559703 T/C 1 40 35 75 19.0062191447073 18.3695582483811 0.63666089632623 T:C T C 10 0.524844521382317 0.908425567428318 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46559432_46559896:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46559432_46559896:ZC3H13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 46708291 T/C 1 366 397 763 173.906905174072 208.36327498878 -34.4563698147078 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0136572511094607 ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46708262_46708385:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000435666:exon_46708262_46708385:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46708262_46708385:LCP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 47269075 A/C 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:C A C 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47269028_47269152:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47269028_47269175:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000443945:exon_47269028_47269150:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47269028_47269152:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47269028_47269152:LRCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 47308109 A/G 1 30 22 52 14.2546643585305 11.546579470411 2.70808488811952 A:G A G 10 0.524844521382317 0.489537780073659 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47308056_47308133:LRCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 47354101 C/T 1 226 202 428 107.385138167596 106.018593319228 1.36654484836833 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.92291434384098 ENSG00000139684:ENST00000378720:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000378697:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000412582:exon_47354070_47354168:ESD;ENSG00000139684:ENST00000471867:exon_47354070_47354166:ESD;ENSG00000139684:ENST00000495654:exon_47354089_47354168:ESD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 9 11 20 4.27639930755915 5.77328973520549 -1.49689042764634 A:T A T 10 0.524844521382317 0.512500587924667 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 49771900 C/T 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000102531:ENST00000492622:exon_49771861_49772010:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000484074:exon_49771861_49772010:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000337156:exon_49771861_49772010:FNDC3A;ENSG00000102531:ENST00000398316:exon_49771861_49772010:FNDC3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 50056903 A/T 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 A:T A T 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50056873_50057098:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50056873_50057098:SETDB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 A:G A G 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 161 119 280 76.500032057447 62.4564980444957 14.0435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0941740620775328 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 50108252 T/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136144:ENST00000258646:exon_50106082_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000378302:exon_50106090_50108398:RCBTB1;ENSG00000136144:ENST00000471984:exon_50108054_50108398:RCBTB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 50587140 G/C 1 26 54 80 12.3540424440598 28.3416041546451 -15.9875617105854 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000445105072779284 ENSG00000204977:ENST00000420995:exon_50586071_50588467:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000378182:exon_50586071_50592587:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000356017:exon_50586071_50587316:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000457662:exon_50586071_50587304:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000298772:exon_50586071_50587305:TRIM13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 60545126 T/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000139734:ENST00000400324:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400329:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400330:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000413168:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400327:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400326:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000377908:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400319:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000400320:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000267215:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000465066:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000267214:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000498416:exon_60544986_60545294:DIAPH3;ENSG00000139734:ENST00000453990:exon_60544986_60545294:DIAPH3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 75866322 A/G 1 1 22 23 0.475155478617683 11.546579470411 -11.0714239917933 A:G A G 10 0.524844521382317 1.33845953809514e-06 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75866238_75866407:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75866238_75866407:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75866238_75866407:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75866238_75866407:TBC1D4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 75884216 C/T 0 0 20 20 0 10.4968904276463 -10.4968904276463 T C T 10 0.524844521382317 3.44123888985391e-07 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000493487:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000413735:exon_75884171_75884287:TBC1D4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 75936334 T/G 0 0 10 10 0 5.24844521382317 -5.24844521382317 G T G 10 0.524844521382317 0.000586620736920706 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75936162_75936743:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75936162_75936743:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75936162_75936743:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75936162_75936743:TBC1D4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 76395464 C/T 1 19 11 30 9.02795409373598 5.77328973520549 3.25466435853049 T:C C T 10 0.524844521382317 0.27466732949558 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76395313_76395745:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000532377:exon_76395313_76395649:LMO7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 76409436 A/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377499:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000447038:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000485987:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000524651:exon_76409288_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525107:exon_76409369_76409475:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000525914:exon_76409369_76409475:LMO7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 T:C T C 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 77619537 C/T 1 71 62 133 33.7360389818555 32.5403603257037 1.19567865615184 T:C C T 10 0.524844521382317 0.862455459788274 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77618792_77619628:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77618792_77619628:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77619037_77619628:MYCBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 92346106 C/T 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 T C T 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000179399:ENST00000377067:exon_92345441_92346135:GPC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 95686955 C/T 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95686859_95686993:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95686859_95686993:ABCC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 95858978 T/C 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 95858996 T/C 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95858786_95859035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95858786_95859035:ABCC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 96506664 A/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000102595:ENST00000376747:exon_96506569_96506729:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376722:exon_96506569_96506729:UGGT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 99100547 T/C 1 32 5 37 15.2049753157659 2.62422260691158 12.5807527088543 T:C T C 10 0.524844521382317 1.93949575270305e-05 ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99100490_99102016:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99100490_99102023:FARP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 99 75 174 47.0403923831506 39.3633391036738 7.67705327947684 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.255442733780198 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 327 302 629 155.375841507982 158.50304545746 -3.12720394947738 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.810788199372384 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 100425260 A/G 1 21 24 45 9.97826505097134 12.5962685131756 -2.61800346220426 A:G A G 10 0.524844521382317 0.458480647164994 ENSG00000125246:ENST00000376360:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376355:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000444838:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000323941:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376354:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000339105:exon_100425078_100425264:CLYBL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 101287340 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000125247:ENST00000344945:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000376234:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000342624:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000328767:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000489713:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000462211:exon_101287278_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000478272:exon_101287059_101287449:TMTC4;ENSG00000125247:ENST00000496511:exon_101287319_101287449:TMTC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 T:C T C 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 29 24 53 13.7795088799128 12.5962685131756 1.1832403667372 T:C T C 10 0.524844521382317 0.78449876604811 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 103514976 A/G 1 81 70 151 38.4875937680323 36.7391164967622 1.74847727127014 A:G A G 10 0.524844521382317 0.807179839293175 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103514380_103515453:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103514380_103515266:ERCC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 170 153 323 80.7764313650061 80.3012117714945 0.475219593511625 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 108861048 C/T 1 15 10 25 7.12733217926525 5.24844521382317 1.87888696544208 T:C C T 10 0.524844521382317 0.549576175229901 ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 108862810 G/A 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 108863591 G/A 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 108863623 G/A 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 111176316 T/C 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 T:C T C 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 12 11 23 5.7018657434122 5.77328973520549 -0.0714239917932904 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 111287067 C/T 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 T:C C T 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111286893_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000424185:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111287019_111287123:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111287019_111287123:CARKD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 54 46 100 25.6583958453549 24.1428479835866 1.5155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.841413234133517 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 113845248 C/A 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 A:C C A 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000126226:ENST00000337344:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375479:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375477:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000431904:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000446345:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246505:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375459:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375457:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375462:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246506:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000351317:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000475433:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000484641:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000477095:exon_113845186_113845289:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000491548:exon_113845017_113845289:PCID2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 24 11 35 11.4037314868244 5.77328973520549 5.63044175161891 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0631291440724101 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 113899312 C/T 1 25 32 57 11.8788869654421 16.7950246842341 -4.91613771879207 T:C C T 10 0.524844521382317 0.232448771242303 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113899263_113899373:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000470067:exon_113899263_113899373:CUL4A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 T:C T C 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 21 8 29 9.97826505097134 4.19875617105854 5.77950887991281 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0395712872704 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 114154419 G/A 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 A:G G A 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114154273_114154464:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114154336_114154464:TMCO3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 114156093 C/T 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114156067_114156195:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114156067_114156195:TMCO3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 114175004 C/T 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 114524944 A/G 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G A G 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000183087:ENST00000480426:exon_114524931_114525159:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000357389:exon_114524931_114525159:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000355761:exon_114524931_114525159:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000450766:exon_114524931_114525159:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000327773:exon_114524931_114525159:GAS6;ENSG00000183087:ENST00000418959:exon_114524931_114525159:GAS6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 16 23 39 7.60248765788293 12.0714239917933 -4.46893633391036 T:C C T 10 0.524844521382317 0.199027828793427 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 29 35 64 13.7795088799128 18.3695582483811 -4.59004936846829 T:C T C 10 0.524844521382317 0.262165759284728 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 115070418 G/T 1 32 37 69 15.2049753157659 19.4192472911457 -4.21427197537987 T:G G T 10 0.524844521382317 0.335959753110818 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115070264_115071283:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115070264_115071283:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000480362:exon_115070264_115070424:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115070264_115071283:UPF3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 13 115090019 G/A 1 32 31 63 15.2049753157659 16.2701801628518 -1.06520484708597 A:G G A 10 0.524844521382317 0.802093555858814 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 20770036 T/C 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20769992_20770124:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20769992_20770124:TTC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 20823095 G/A 1 33 20 53 15.6801307943835 10.4968904276463 5.1832403667372 A:G G A 10 0.524844521382317 0.170160707342514 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527384:exon_20822801_20823106:PARP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 31 26 57 14.7298198371482 13.6459575559402 1.08386228120793 T:C T C 10 0.524844521382317 0.792484607547345 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 20 17 37 9.50310957235366 8.92235686349939 0.580752708854273 C:G G C 10 0.524844521382317 0.870899695467464 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 20841707 C/T 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20841666_20841742:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20841666_20841742:TEP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 51 45 96 24.2329294095018 23.6180034622043 0.614925947297571 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.918959225308689 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 20920250 T/C 1 16 13 29 7.60248765788293 6.82297877797012 0.779508879912808 T:C T C 10 0.524844521382317 0.853515641011775 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20920133_20920308:OSGEP;ENSG00000092094:ENST00000488532:exon_20920133_20920308:OSGEP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 360 303 663 171.055972302366 159.027889978842 12.0280823235238 A:T:C:G T G 10 0.524844521382317 0.351054567933619 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21829129 C/G 1 47 32 79 22.3323074950311 16.7950246842341 5.53728281079696 C:G C G 10 0.524844521382317 0.217665686639866 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21829005_21829131:SUPT16H HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21841524 A/G 1 33 31 64 15.6801307943835 16.2701801628518 -0.590049368468286 A:G A G 10 0.524844521382317 0.900983591621374 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21841497_21841589:SUPT16H HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21859686 C/T 1 38 33 71 18.055908187472 17.3198692056165 0.736038981855497 T:C C T 10 0.524844521382317 0.905743387650764 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21859622_21859801:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21859622_21859801:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21859622_21859801:CHD8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21945415 A/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21945281_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21945335_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21945341_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21945362_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000447695:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000457430:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000494242:exon_21945392_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455138:exon_21945397_21945443:TOX4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 60 52 112 28.509328717061 27.2919151118805 1.2174136051805 T:C T C 10 0.524844521382317 0.850279040597578 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 89 78 167 42.2888375969738 40.9378726678207 1.35096492915307 A:G G A 10 0.524844521382317 0.87695945873245 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 51 49 100 24.2329294095018 25.7173815477335 -1.4844521382317 A:G A G 10 0.524844521382317 0.765167401413565 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21990982 G/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000165821:ENST00000450879:exon_21990967_21993065:SALL2;ENSG00000165821:ENST00000327430:exon_21989234_21993788:SALL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 21991144 C/G 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000165821:ENST00000450879:exon_21990967_21993065:SALL2;ENSG00000165821:ENST00000327430:exon_21989234_21993788:SALL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24634106 G/A 1 109 94 203 51.7919471693275 49.3353850099378 2.45656215938966 A:G G A 10 0.524844521382317 0.778730676285793 ENSG00000213928:ENST00000396864:exon_24633823_24634164:IRF9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24647316 C/A 1 26 25 51 12.3540424440598 13.1211130345579 -0.767070590498165 A:C C A 10 0.524844521382317 0.88886715961801 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647297_24647428:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647297_24647428:REC8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24648962 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24650967 C/T 1 37 29 66 17.5807527088543 15.2204911200872 2.36026158876708 T:C C T 10 0.524844521382317 0.622646364041096 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24650917_24651049:IPO4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24702789 C/T 1 78 52 130 37.0621273321793 27.2919151118805 9.7702122202988 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.0951150043554467 ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 76 47 123 36.1118163749439 24.6676925049689 11.444123869975 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0465830199287849 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24737595 C/T 1 57 55 112 27.0838622812079 28.8664486760274 -1.7825863948195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.776838809975687 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24737575_24737626:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24737575_24737626:RABGGTA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24773306 C/T 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24773247_24773483:C14orf21;ENSG00000196943:ENST00000396802:exon_24773247_24773394:C14orf21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24806902 G/A 1 7 14 21 3.32608835032378 7.34782329935244 -4.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0847282864109202 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24806901_24806968:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24806901_24806968:RIPK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24808388 A/G 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24808221_24808530:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24808221_24808530:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000357715:exon_24808221_24808530:RIPK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24839165 C/T 1 33 2 35 15.6801307943835 1.04968904276463 14.6304417516189 T:C C T 10 0.524844521382317 1.29545159331703e-07 ENSG00000100968:ENST00000440487:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24838705_24839800:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000424781:exon_24838705_24839800:NFATC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 5 41 46 2.37577739308842 21.518625376675 -19.1428479835866 T:C T C 10 0.524844521382317 5.0399542438992e-09 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24898135 C/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C C T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000139899:ENST00000267406:exon_24897961_24898731:CBLN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24906295 G/A 1 23 20 43 10.9285760082067 10.4968904276463 0.431685580560371 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24906515 C/T 1 37 26 63 17.5807527088543 13.6459575559402 3.93479515291403 T:C C T 10 0.524844521382317 0.377484308759908 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24906534 G/A 1 34 25 59 16.1552862730012 13.1211130345579 3.0341732384433 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.438067939344683 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 132 150 282 62.7205231775342 78.7266782073475 -16.0061550298134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0566442259248016 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 202 168 370 95.981406680772 88.1738795922293 7.80752708854271 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.435085190430227 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 142 150 292 67.472077963711 78.7266782073475 -11.2546002436366 C:G C G 10 0.524844521382317 0.197465525168289 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 81 59 140 38.4875937680323 30.9658267615567 7.52176700647562 T:C C T 10 0.524844521382317 0.205723103910191 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24910846 C/T 1 14 3 17 6.65217670064756 1.57453356414695 5.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0145390064507902 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24910876 G/A 1 10 2 12 4.75155478617683 1.04968904276463 3.7018657434122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0413693580129535 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 64 44 108 30.4099506315317 23.0931589408219 7.31679169070977 T:G T G 10 0.524844521382317 0.177420295724316 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 64 43 107 30.4099506315317 22.5683144194396 7.84163621209208 A:T T A 10 0.524844521382317 0.146387250149015 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 24911452 T/C 1 27 31 58 12.8291979226774 16.2701801628518 -3.44098224017438 T:C T C 10 0.524844521382317 0.430504950329701 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24911384_24911466:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24911384_24911466:SDR39U1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 31099738 A/G 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 A:G A G 10 0.524844521382317 0.370589300195247 ENSG00000092108:ENST00000311943:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000463622:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000458591:exon_31099683_31099771:SCFD1;ENSG00000092108:ENST00000484733:exon_31099683_31099771:SCFD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 31344295 G/A 1 15 11 26 7.12733217926525 5.77328973520549 1.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.695987302704438 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31344262_31344309:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31344262_31344309:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31344262_31344309:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31344262_31344309:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31344262_31344309:COCH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 32 33 65 15.2049753157659 17.3198692056165 -2.1148938898506 T:C C T 10 0.524844521382317 0.62110878321819 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 34985506 G/C 1 52 47 99 24.7080848881195 24.6676925049689 0.0403923831506212 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 24 20 44 11.4037314868244 10.4968904276463 0.906841059178054 T:C C T 10 0.524844521382317 0.880321279279752 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 18 13 31 8.5527986151183 6.82297877797012 1.72981983714817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.592324700211678 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 10 15 25 4.75155478617683 7.87266782073475 -3.12111303455792 T:C T C 10 0.524844521382317 0.233899195740004 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 23 14 37 10.9285760082067 7.34782329935244 3.58075270885427 C:G C G 10 0.524844521382317 0.25370706790013 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 36789775 A/T 1 12 1 13 5.7018657434122 0.524844521382317 5.17702122202988 A:T A T 10 0.524844521382317 0.00389453711171081 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 36789795 G/A 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000151332:ENST00000416007:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000359527:exon_36789666_36789882:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000318473:exon_36789666_36789845:MBIP;ENSG00000151332:ENST00000396329:exon_36789666_36789882:MBIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 39650139 A/G 1 362 334 696 172.006283259601 175.298070141694 -3.29178688209262 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.819908292512597 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 39871017 T/C 1 22 7 29 10.453420529589 3.67391164967622 6.77950887991281 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0144334290396135 ENSG00000165355:ENST00000298097:exon_39870380_39871065:FBXO33 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 45374747 G/T 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:G G T 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000179476:ENST00000325192:exon_45374570_45376460:C14orf28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 45696037 T/G 1 11 5 16 5.22671026479451 2.62422260691158 2.60248765788293 T:G T G 10 0.524844521382317 0.219130803102002 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45695946_45696039:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696029_45696039:C14orf106 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 50067300 C/G 0 43 0 43 20.4316855805604 0 20.4316855805604 C C 10 0.524844521382317 1.53088123005077e-12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 50069183 T/G 1 41 36 77 19.481374623325 18.8944027697634 0.586971853561593 T:G T G 10 0.524844521382317 0.909700936209183 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50069088_50069186:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50069088_50069186:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50069088_50069186:PPIL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 50081243 T/C 1 80 76 156 38.0124382894146 39.8881836250561 -1.87574533564144 T:C T C 10 0.524844521382317 0.81006844965266 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50080974_50081389:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50080974_50081390:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50080974_50081390:PPIL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 31 40 71 14.7298198371482 20.9937808552927 -6.2639610181445 T:C T C 10 0.524844521382317 0.154000792441408 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 50267349 T/C 1 48 41 89 22.8074629736488 21.518625376675 1.28883759697379 T:C T C 10 0.524844521382317 0.832257435890246 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50267138_50267414:SDCCAG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 50298962 T/A 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 A:T T A 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 50360991 C/T 1 377 355 732 179.133615438867 186.319805090723 -7.18618965185601 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.604505698793701 ENSG00000165527:ENST00000298316:exon_50359974_50361490:ARF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 50801233 G/A 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G G A 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 51111485 T/C 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000151748:ENST00000324679:exon_51111462_51111732:SAV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 53 48 101 25.1832403667372 25.1925370263512 -0.00929665961401227 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 51716188 T/G 1 38 24 62 18.055908187472 12.5962685131756 5.45963967429635 T:G T G 10 0.524844521382317 0.203191328654011 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 52465255 T/A 1 109 120 229 51.7919471693275 62.981342565878 -11.1893953965506 A:T T A 10 0.524844521382317 0.145662429140420 ENSG00000087302:ENST00000261700:exon_52465212_52465298:C14orf166 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 53133134 A/G 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000197930:ENST00000395686:exon_53133093_53133213:ERO1L;ENSG00000197930:ENST00000359133:exon_53133093_53133213:ERO1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 53529669 A/T 1 24 31 55 11.4037314868244 16.2701801628518 -4.86644867602743 A:T A T 10 0.524844521382317 0.224258848606195 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395610:exon_53529661_53529923:DDHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 53619544 G/A 1 18 9 27 8.5527986151183 4.72360069244085 3.82919792267744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.177382710428329 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53618979_53620000:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53618979_53619922:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53618979_53619816:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395610:exon_53619424_53619816:DDHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 55619311 A/G 1 51 54 105 24.2329294095018 28.3416041546451 -4.10867474514328 A:G A G 10 0.524844521382317 0.435746915934443 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 55817156 G/A 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 13 17 30 6.17702122202988 8.92235686349939 -2.74533564146951 T:C T C 10 0.524844521382317 0.362755487440991 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 57676330 G/T 1 16 19 35 7.60248765788293 9.97204590626402 -2.36955824838109 T:G G T 10 0.524844521382317 0.499305362167602 ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57676285_57676500:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57676285_57676500:EXOC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 57741550 A/G 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 A:G A G 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 58953746 C/G 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 C:G C G 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000100578:ENST00000354386:exon_58953725_58953884:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000423743:exon_58953725_58953884:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000261244:exon_58953725_58953884:KIAA0586 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 60581863 G/A 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60581692_60582179:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60581692_60582179:C14orf135 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 60591199 A/T 1 18 22 40 8.5527986151183 11.546579470411 -2.99378085529268 A:T A T 10 0.524844521382317 0.34802327982474 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 61924237 G/C 1 8 18 26 3.80124382894146 9.4472013848817 -5.64595755594024 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0305375198276518 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 62194368 T/C 1 10 19 29 4.75155478617683 9.97204590626402 -5.22049112008719 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0625786547301105 ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62194171_62194373:HIF1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64520020 A/G 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64596537 A/G 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G A G 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64596500_64596619:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64596500_64596619:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64596500_64596619:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64596500_64596619:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64596500_64596619:SYNE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64634067 A/G 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 A:G A G 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64633951_64634105:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64633951_64634105:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64633951_64634105:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64633951_64634105:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64633951_64634105:SYNE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 A:C C A 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64656855 T/C 1 8 15 23 3.80124382894146 7.87266782073475 -4.07142399179329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0980444399895555 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64656789_64656955:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64656789_64656955:SYNE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 36 52 88 17.1055972302366 27.2919151118805 -10.1863178816439 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0326218886715161 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64687269 C/T 1 14 8 22 6.65217670064756 4.19875617105854 2.45342052958903 T:C C T 10 0.524844521382317 0.393951929399631 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64687155_64687355:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64687155_64687355:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64687155_64687355:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64687155_64687355:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64687155_64687355:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64687155_64687355:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64687155_64687355:SYNE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64688376 C/T 1 19 36 55 9.02795409373598 18.8944027697634 -9.86644867602743 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00973299553323991 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64688252_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64688252_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64688252_64688422:SYNE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64882380 A/G 1 24 48 72 11.4037314868244 25.1925370263512 -13.7888055395268 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00130662133249943 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64882357_64882457:MTHFD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 127 66 193 60.3447457844457 34.6397384112329 25.7050073732128 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000220453299962987 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 64935939 T/C 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000179841:ENST00000430028:exon_64934850_64941221:AKAP5;ENSG00000179841:ENST00000320636:exon_64934503_64936423:AKAP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 65527962 C/G 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 C:G C G 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000125954:ENST00000448390:exon_65527899_65529368:FNTB;ENSG00000125954:ENST00000246166:exon_65527899_65529316:FNTB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 66096300 T/A 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 A:T T A 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 67769177 A/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000072415:ENST00000261681:exon_67769127_67769288:MPP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 67850193 G/C 1 167 155 322 79.3509649291531 81.3509008142591 -1.99993588510607 C:G G C 10 0.524844521382317 0.823676379613153 ENSG00000134001:ENST00000256383:exon_67850032_67853233:EIF2S1;ENSG00000134001:ENST00000437108:exon_67850150_67850276:EIF2S1;ENSG00000134001:ENST00000466499:exon_67850032_67850839:EIF2S1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 68141105 C/T 1 97 71 168 46.0900814259153 37.2639610181445 8.82612040777074 T:C C T 10 0.524844521382317 0.189134543903891 ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68141092_68141548:VTI1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 68353913 T/G 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:G T G 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000182185:ENST00000487861:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000479335:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000403044:exon_68353738_68353930:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000471583:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000487270:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000344360:exon_68353738_68354043:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000488612:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000390683:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000402498:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000342389:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000474051:exon_68353738_68354267:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000497460:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000492236:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000478014:exon_68353819_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000469165:exon_68353847_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000460526:exon_68353847_68353921:RAD51L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 71199436 G/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000006432:ENST00000005198:exon_71199256_71200059:MAP3K9;ENSG00000006432:ENST00000381250:exon_71199256_71200059:MAP3K9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 71199452 G/A 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000006432:ENST00000005198:exon_71199256_71200059:MAP3K9;ENSG00000006432:ENST00000381250:exon_71199256_71200059:MAP3K9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 73491166 C/T 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.370589300195247 ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73490734_73491650:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73490734_73491650:ZFYVE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 73614748 G/A 1 11 3 14 5.22671026479451 1.57453356414695 3.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0616071016075417 ENSG00000080815:ENST00000324501:exon_73614675_73614814:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000357710:exon_73614675_73614802:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000394157:exon_73614675_73614814:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000261970:exon_73614675_73614814:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000344094:exon_73614675_73614814:PSEN1;ENSG00000080815:ENST00000394164:exon_73614675_73614802:PSEN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 73958576 C/T 1 56 60 116 26.6087068025902 31.490671282939 -4.88196448034877 T:C C T 10 0.524844521382317 0.402963277468279 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75152347 G/A 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000119682:ENST00000356357:exon_75152303_75152363:KIAA0317;ENSG00000119682:ENST00000469797:exon_75152303_75152363:KIAA0317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75248101 A/T 1 16 17 33 7.60248765788293 8.92235686349939 -1.31986920561646 A:T A T 10 0.524844521382317 0.728380954880147 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75269259 G/A 1 29 45 74 13.7795088799128 23.6180034622043 -9.83849458229146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0264566898069085 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75269259_75269379:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75269259_75269379:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75269259_75269379:YLPM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75279461 G/A 1 30 20 50 14.2546643585305 10.4968904276463 3.75777393088415 A:G G A 10 0.524844521382317 0.322925268532977 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75369064 T/C 1 155 132 287 73.6490991857409 69.2794768224658 4.36962236327503 T:C T C 10 0.524844521382317 0.636480280024999 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75368899_75370443:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75368899_75370443:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75368899_75370443:DLST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75475894 G/C 1 68 54 122 32.3105725460024 28.3416041546451 3.96896839135733 C:G G C 10 0.524844521382317 0.525920499514598 ENSG00000119718:ENST00000266126:exon_75475734_75476292:EIF2B2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 22 26 48 10.453420529589 13.6459575559402 -3.19253702635121 T:C T C 10 0.524844521382317 0.387747958498637 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75514138 C/A 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 A:C C A 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75515693 C/T 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75551321 T/G 1 34 27 61 16.1552862730012 14.1708020773226 1.98448419567867 T:G T G 10 0.524844521382317 0.700895853553347 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75548819_75551389:NEK9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75574087 C/T 1 14 8 22 6.65217670064756 4.19875617105854 2.45342052958903 T:C C T 10 0.524844521382317 0.393951929399631 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75574046_75574190:NEK9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 75904660 A/G 1 21 26 47 9.97826505097134 13.6459575559402 -3.6676925049689 A:G A G 10 0.524844521382317 0.308653432757187 ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 76368547 T/C 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 77493437 A/G 1 23 19 42 10.9285760082067 9.97204590626402 0.956530101942688 A:G A G 10 0.524844521382317 0.877488592984835 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 77580068 A/G 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G A G 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000198894:ENST00000361786:exon_77579768_77583629:KIAA1737 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 77901611 T/C 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000151445:ENST00000445370:exon_77901602_77901736:VIPAR;ENSG00000151445:ENST00000448935:exon_77901602_77901736:VIPAR;ENSG00000151445:ENST00000327028:exon_77901602_77901736:VIPAR;ENSG00000151445:ENST00000343765:exon_77901602_77901736:VIPAR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 43 78 121 20.4316855805604 40.9378726678207 -20.5061870872604 A:C A C 10 0.524844521382317 0.000240154259333048 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 78221364 T/G 1 29 22 51 13.7795088799128 11.546579470411 2.23292940950183 T:G T G 10 0.524844521382317 0.576615559792462 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78221310_78221463:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78221310_78221463:SNW1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 81938947 C/T 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000071537:ENST00000336735:exon_81937893_81943525:SEL1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 81952649 G/A 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000071537:ENST00000336735:exon_81952633_81952798:SEL1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 83159054 G/A 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 G G 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 88477413 C/T 1 60 56 116 28.509328717061 29.3912931974098 -0.881964480348771 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.92599707360231 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 88477882 A/C 1 60 50 110 28.509328717061 26.2422260691158 2.26710264794513 A:C A C 10 0.524844521382317 0.703089509726812 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 44 41 85 20.9068410591781 21.518625376675 -0.611784317496944 A:G A G 10 0.524844521382317 0.91386975547125 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 91666198 A/G 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 A:G A G 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91666101_91666249:C14orf159 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 92470147 G/A 1 23 15 38 10.9285760082067 7.87266782073475 3.05590818747195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.335254961525510 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 353 297 650 167.729883952042 155.878822850548 11.851061101494 T:C:G T G 10 0.524844521382317 0.366445232591498 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 93043720 C/T 1 21 15 36 9.97826505097134 7.87266782073475 2.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 0.509070758298691 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93043705_93043822:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93043705_93043822:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93043705_93043822:RIN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 29 19 48 13.7795088799128 9.97204590626402 3.80746297364879 A:G A G 10 0.524844521382317 0.312598278217653 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 93119232 G/C 1 93 99 192 44.1894595114445 51.9596076168494 -7.77014810540486 C:G G C 10 0.524844521382317 0.278615668200965 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 93125514 G/A 1 127 150 277 60.3447457844457 78.7266782073475 -18.3819324229018 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0301694384024846 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93125506_93125814:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93125506_93125814:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93125506_93125882:RIN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 261 213 474 124.015579919215 111.791883054434 12.2236968647818 T:C C T 10 0.524844521382317 0.269867113681417 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 94526719 G/A 1 248 192 440 117.838558697185 100.770148105405 17.0684105917805 A:G G A 10 0.524844521382317 0.104803343393698 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94526444_94526776:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94526444_94526959:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94526444_94526959:DDX24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 94528836 C/T 1 192 150 342 91.2298518945951 78.7266782073475 12.5031736872476 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.193739052812943 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94528443_94528967:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94528443_94528967:DDX24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 95562577 C/T 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000100697:ENST00000343455:exon_95562162_95563050:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000526495:exon_95562162_95563050:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000393063:exon_95562162_95563050:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000527414:exon_95562162_95563050:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000532939:exon_95561685_95563050:DICER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 95570180 C/T 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100697:ENST00000343455:exon_95569683_95570463:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000526495:exon_95569683_95570463:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000393063:exon_95569683_95570463:DICER1;ENSG00000100697:ENST00000527414:exon_95569683_95570463:DICER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 95660242 A/G 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G A G 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95660186_95660256:CLMN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 95884217 G/A 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G G A 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95883831_95884363:C14orf49 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 95912388 G/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 95912426 T/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 95999820 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 22 23 45 10.453420529589 12.0714239917933 -1.61800346220426 A:G A G 10 0.524844521382317 0.6566337577171 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 99876486 G/A 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 99927643 A/G 1 16 16 32 7.60248765788293 8.39751234211707 -0.795024684234143 A:G A G 10 0.524844521382317 0.860150442628282 ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000436070:exon_99927529_99927677:SETD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 100602266 C/G 1 85 187 272 40.3882156825031 98.1459254984933 -57.7577098159902 C:G C G 10 0.524844521382317 2.11906080119619e-12 ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100602242_100602305:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100602242_100602305:EVL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 231 119 350 109.760915560685 62.4564980444957 47.3044175161891 A:G G A 10 0.524844521382317 4.17726630210909e-07 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 100847707 A/G 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G A G 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100847247_100848083:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100847247_100848083:WDR25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102504838 C/T 1 22 17 39 10.453420529589 8.92235686349939 1.53106366608964 T:C C T 10 0.524844521382317 0.635279645808825 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102504797_102504943:DYNC1H1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102508056 C/A 1 23 33 56 10.9285760082067 17.3198692056165 -6.39129319740975 A:C C A 10 0.524844521382317 0.107676012743494 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102507911_102508071:DYNC1H1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 51 54 105 24.2329294095018 28.3416041546451 -4.10867474514328 T:C T C 10 0.524844521382317 0.435746915934443 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102548151 A/G 1 1763 1707 3470 837.699108802975 895.909597999615 -58.2104891966399 A:T:C:G A G 10 0.524844521382317 0.0486452181695158 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102547073_102548158:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102547073_102548158:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102547386_102548158:HSP90AA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102792386 T/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102792489 G/A 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102792631 G/A 1 14 19 33 6.65217670064756 9.97204590626402 -3.31986920561646 A:G G A 10 0.524844521382317 0.29637560445508 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102792322_102793224:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102792322_102793224:ZNF839 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102805187 G/A 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102805153_102805290:ZNF839 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102808157 G/A 1 24 15 39 11.4037314868244 7.87266782073475 3.53106366608964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.267207036169275 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102815042 C/T 1 118 129 247 56.0683464768866 67.7049432583189 -11.6365967814323 T:C C T 10 0.524844521382317 0.143104591558797 ENSG00000100865:ENST00000216756:exon_102814623_102815096:CINP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102900987 A/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G A G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102900572_102901548:TECPR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 102901201 A/G 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G A G 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000196663:ENST00000359520:exon_102900572_102901548:TECPR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 103934484 G/A 1 41 27 68 19.481374623325 14.1708020773226 5.31057254600245 A:G G A 10 0.524844521382317 0.224971426757683 ENSG00000075413:ENST00000416682:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000216288:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000335102:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000454698:exon_103934418_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000440884:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000429436:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000303622:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000411530:exon_103934370_103934523:MARK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 104038060 A/G 1 23 27 50 10.9285760082067 14.1708020773226 -3.24222606911585 A:G A G 10 0.524844521382317 0.396863325029014 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000477116:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000473127:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000497901:exon_104037960_104038157:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000476323:exon_104037960_104038157:C14orf153 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 104194196 C/G 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104194083_104194251:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000392675:exon_104193791_104194251:ZFYVE21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 40 47 87 19.0062191447073 24.6676925049689 -5.66147336026157 T:C C T 10 0.524844521382317 0.238653920952488 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 163 107 270 77.4503430146823 56.1583637879079 21.2919792267744 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0103764508609354 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105178851 C/T 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105178770_105178890:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105178770_105178894:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105178770_105178894:INF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105180633 G/A 1 34 29 63 16.1552862730012 15.2204911200872 0.934795152914031 A:G G A 10 0.524844521382317 0.899775143288907 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105181673 G/A 1 21 21 42 9.97826505097134 11.0217349490287 -1.04346989805731 A:G G A 10 0.524844521382317 0.759816463092589 ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105181618_105181676:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105181621_105181677:INF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 47 59 106 22.3323074950311 30.9658267615567 -8.6335192665256 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0986688204662663 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105833679 A/G 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G A G 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105833550_105833712:PACS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105850700 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105850690_105850800:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105850690_105850800:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105850690_105850800:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105850690_105850800:PACS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105935753 T/C 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 T:C T C 10 0.524844521382317 0.370589300195247 ENSG00000182979:ENST00000481206:exon_105935312_105935835:MTA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105935824 G/A 1 152 146 298 72.2236327498878 76.6273001218183 -4.40366737193045 A:G G A 10 0.524844521382317 0.64273164725367 ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000426567:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481206:exon_105935312_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000494981:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481635:exon_105935804_105936329:MTA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 105954682 C/G 1 381 596 977 181.034237353337 312.807334743861 -131.773097390524 A:C:G C G 10 0.524844521382317 3.11806410612218e-17 ENSG00000213145:ENST00000496700:exon_105952654_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000409393:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000392531:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000330233:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000460900:exon_105953534_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000461556:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000185347:ENST00000477724:exon_105954668_105954725:C14orf80 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 106174796 C/T 0 0 22 22 0 11.546579470411 -11.546579470411 T C T 10 0.524844521382317 7.76937894822849e-08 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 106329403 C/T 1 1 11 12 0.475155478617683 5.77328973520549 -5.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00232484596307326 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 106329478 G/A 1 4 18 22 1.90062191447073 9.4472013848817 -7.54657947041097 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00196860299297634 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 106329993 T/G 1 2 9 11 0.950310957235366 4.72360069244085 -3.77328973520549 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0314919893609911 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 14 106552514 G/A 0 0 219 219 0 114.940950182727 -114.940950182727 A G A 10 0.524844521382317 1.68665906140910e-71 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 22863001 A/G 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 A:G A G 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000153575:ENST00000283645:exon_22862935_22863123:TUBGCP5;ENSG00000153575:ENST00000453949:exon_22862935_22863123:TUBGCP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 22969232 G/A 1 23 19 42 10.9285760082067 9.97204590626402 0.956530101942688 A:G G A 10 0.524844521382317 0.877488592984835 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 25222119 C/A 0 119 0 119 56.5435019555043 0 56.5435019555043 C C 10 0.524844521382317 5.13071340921042e-34 ENSG00000128739:ENST00000400098:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000444203:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000400100:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000400097:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000390687:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000338094:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000346403:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000428674:exon_25222024_25222176:SNRPN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 25602024 T/C 1 65 67 132 30.8851061101494 35.1645829326152 -4.27947682246584 T:C T C 10 0.524844521382317 0.486099901714582 ENSG00000114062:ENST00000232165:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000397954:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000438097:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000428984:exon_25601838_25602043:UBE3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 29560979 C/T 1 158 155 313 75.0745656215939 81.3509008142591 -6.27633519266521 T:C C T 10 0.524844521382317 0.49723644176885 ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 34295396 G/A 1 12 10 22 5.7018657434122 5.24844521382317 0.453420529589027 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34295233_34295410:AVEN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 34393961 G/A 1 40 23 63 19.0062191447073 12.0714239917933 6.93479515291403 A:G G A 10 0.524844521382317 0.100312172550913 ENSG00000134153:ENST00000256545:exon_34393805_34394149:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000527822:exon_34393805_34394008:C15orf24;ENSG00000134153:ENST00000532113:exon_34393805_34394028:C15orf24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 35149048 G/A 1 67 46 113 31.8354170673848 24.1428479835866 7.69256908379818 A:G G A 10 0.524844521382317 0.158135951472176 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35147750_35149307:AQR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 35159799 A/G 1 26 21 47 12.3540424440598 11.0217349490287 1.3323074950311 A:G A G 10 0.524844521382317 0.770933837568702 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35159725_35159810:AQR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40265799 A/G 1 12 8 20 5.7018657434122 4.19875617105854 1.50310957235366 A:G A G 10 0.524844521382317 0.655495661698291 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40265838 G/A 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40265793_40265950:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40265793_40265950:EIF2AK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40313141 C/T 1 7 15 22 3.32608835032378 7.87266782073475 -4.54657947041097 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0569455679589466 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40313100_40313228:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40313100_40313228:EIF2AK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 60 67 127 28.509328717061 35.1645829326152 -6.65525421555426 A:G G A 10 0.524844521382317 0.248806496511206 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 954 970 1924 453.29832660127 509.099185740847 -55.8008591395779 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.0112713120422284 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40331126 A/T 1 183 150 333 86.953452587036 78.7266782073475 8.22677437968845 A:T A T 10 0.524844521382317 0.380279791417283 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40331077_40331149:SRP14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40453430 G/T 1 16 13 29 7.60248765788293 6.82297877797012 0.779508879912808 T:G G T 10 0.524844521382317 0.853515641011775 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40453210_40453456:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40453210_40453456:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40453227_40453456:BUB1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40477831 G/A 1 28 14 42 13.3043534012951 7.34782329935244 5.95653010194269 A:G G A 10 0.524844521382317 0.088052708023459 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40477752_40477843:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40477752_40477843:BUB1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40498503 T/C 1 19 9 28 9.02795409373598 4.72360069244085 4.30435340129513 T:C T C 10 0.524844521382317 0.129749466460062 ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40498385_40498659:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40498385_40498659:BUB1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40512906 A/G 1 76 65 141 36.1118163749439 34.1148938898506 1.99692248509331 A:G A G 10 0.524844521382317 0.80041089083199 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40512765_40513378:BUB1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40583876 T/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:G T G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40590134 G/A 1 1 12 13 0.475155478617683 6.2981342565878 -5.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00119588370228585 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40590078_40590160:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40590078_40590160:PLCB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40685850 A/G 1 52 51 103 24.7080848881195 26.7670705904982 -2.05898570237865 A:G A G 10 0.524844521382317 0.69430364112823 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40685670_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40685394_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40685670_40686488:C15orf23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40710476 C/T 1 36 18 54 17.1055972302366 9.4472013848817 7.65839584535489 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0408041162598297 ENSG00000128928:ENST00000249760:exon_40710329_40711063:IVD;ENSG00000128928:ENST00000479013:exon_40710329_40713505:IVD;ENSG00000128928:ENST00000487418:exon_40710329_40713512:IVD;ENSG00000128928:ENST00000497816:exon_40710329_40711356:IVD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40750779 C/T 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 T:C C T 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000140320:ENST00000416165:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000339351:exon_40750650_40752095:BAHD1;ENSG00000140320:ENST00000442618:exon_40750650_40752095:BAHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40764549 G/A 1 23 22 45 10.9285760082067 11.546579470411 -0.618003462204264 A:G G A 10 0.524844521382317 0.882226148319876 ENSG00000169105:ENST00000306243:exon_40763213_40765351:CHST14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.567300048342317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40915894 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000137812:ENST00000346991:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000399668:exon_40912838_40917838:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000260369:exon_40912838_40917664:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000533001:exon_40912838_40918240:CASC5;ENSG00000137812:ENST00000526913:exon_40915330_40917838:CASC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 40993318 T/C 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 T:C T C 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000051180:ENST00000527860:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000423169:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000267868:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000382642:exon_40993262_40993403:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000435604:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000450111:exon_40993262_40993373:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000532743:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000382643:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000525066:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000526763:exon_40993262_40993399:RAD51;ENSG00000051180:ENST00000531277:exon_40993262_40993399:RAD51 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41102100 A/C 1 53 30 83 25.1832403667372 15.7453356414695 9.43790472526769 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0472611523293612 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41102050_41102168:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41102050_41102168:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41102050_41102168:ZFYVE19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41105573 C/T 1 22 16 38 10.453420529589 8.39751234211707 2.05590818747195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.521170691333303 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105536_41105615:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105536_41105615:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105536_41105615:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000457207:exon_41105536_41105738:ZFYVE19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41105926 T/G 1 23 15 38 10.9285760082067 7.87266782073475 3.05590818747195 A:T:G T G 10 0.524844521382317 0.335254961525510 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41136764 G/C 1 26 15 41 12.3540424440598 7.87266782073475 4.481374623325 C:G G C 10 0.524844521382317 0.210465500710248 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41136688_41137227:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41136643_41137227:SPINT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41146082 G/A 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 G G 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41145909_41146127:SPINT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41624579 C/G 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 C:G C G 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000104147:ENST00000220514:exon_41624438_41624819:OIP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41688700 T/C 1 42 44 86 19.9565301019427 23.0931589408219 -3.13662883887926 T:C T C 10 0.524844521382317 0.518488390667974 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41750006 G/A 1 46 66 112 21.8571520164134 34.6397384112329 -12.7825863948195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0177408212527502 ENSG00000137815:ENST00000389629:exon_41749870_41750074:RTF1;ENSG00000137815:ENST00000389628:exon_41749870_41750074:RTF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 41819716 C/T 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41819621_41819803:RPAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 42041712 G/A 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000174197:ENST00000389936:exon_42041309_42042813:MGA;ENSG00000174197:ENST00000219905:exon_42041309_42042813:MGA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 42041723 A/G 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 A:G A G 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000174197:ENST00000389936:exon_42041309_42042813:MGA;ENSG00000174197:ENST00000219905:exon_42041309_42042813:MGA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 42115161 C/T 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000137802:ENST00000457542:exon_42115137_42115420:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000512970:exon_42115137_42115420:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000389931:exon_42115137_42115420:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000221214:exon_42115137_42115420:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000397324:exon_42115137_42115204:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000260357:exon_42115137_42115420:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505373:exon_42115137_42115420:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000456763:exon_42115137_42115420:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000514566:exon_42115137_42115204:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000505061:exon_42115137_42115420:MAPKBP1;ENSG00000137802:ENST00000512433:exon_42114848_42115420:MAPKBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 42139902 G/A 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42139847_42140353:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000342159:exon_42139847_42140164:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42139847_42140345:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000446407:exon_42139847_42140345:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42139847_42140345:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42139847_42140338:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42139847_42140341:PLA2G4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 69 63 132 32.7857280246201 33.065204847086 -0.279476822465838 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 42264540 A/G 1 41 29 70 19.481374623325 15.2204911200872 4.26088350323781 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.339342958719271 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42264457_42264776:EHD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 42631928 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42631867_42632110:GANC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 61 73 134 28.9844841956787 38.3136500609091 -9.32916586523048 A:G G A 10 0.524844521382317 0.119319860640702 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43020983 G/A 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43020850_43021008:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43020850_43021008:CDAN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43023161 C/T 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C C T 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43023123_43023269:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43023123_43023269:CDAN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43028592 G/A 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43028502_43028978:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43028500_43028978:CDAN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43452898 A/T 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 A:T A T 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000137842:ENST00000260403:exon_43452879_43452992:TMEM62 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43527871 C/T 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 T:C C T 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43527667_43528035:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43527667_43528035:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43527667_43528035:TGM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43531411 G/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43531361_43531464:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43531361_43531464:TGM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43533091 G/A 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43533050_43533188:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43533050_43533188:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43533050_43533188:TGM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43545728 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43545704_43545832:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43545704_43545832:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43545704_43545832:TGM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43707808 A/T 1 33 18 51 15.6801307943835 9.4472013848817 6.23292940950184 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0924351772923227 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000476454:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000411772:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43707792_43708007:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000434561:exon_43707792_43708007:TP53BP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 43749149 T/C 1 18 14 32 8.5527986151183 7.34782329935244 1.20497531576586 T:C T C 10 0.524844521382317 0.725627887468629 ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43748090_43749416:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43748090_43749416:TP53BP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 44087242 G/A 1 24 14 38 11.4037314868244 7.34782329935244 4.05590818747195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.198033176811266 ENSG00000184716:ENST00000319327:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000448553:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000457418:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000299969:exon_44086360_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000412697:exon_44086428_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000396823:exon_44086478_44087411:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000249714:exon_44086478_44087411:SERINC4;ENSG00000140264:ENST00000445816:exon_44086572_44088287:SERF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 44143308 A/G 1 9 14 23 4.27639930755915 7.34782329935244 -3.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.216326895269441 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44143285_44143443:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44143285_44143443:WDR76 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 45695072 G/C 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 C:G G C 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 48450982 T/C 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000104177:ENST00000267836:exon_48450966_48451119:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000324324:exon_48450966_48451119:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000454655:exon_48450966_48451119:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000396590:exon_48450966_48451119:MYEF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 49031120 A/G 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49030136_49031485:CEP152 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 49048128 A/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49048100_49048750:CEP152 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 5 17 22 2.37577739308842 8.92235686349939 -6.54657947041097 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00533277173236144 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 50867142 C/T 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 T:C C T 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52402010 T/A 1 40 8 48 19.0062191447073 4.19875617105854 14.8074629736488 A:T T A 10 0.524844521382317 1.48449841255994e-05 ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52401460_52402170:BCL2L10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52416739 G/A 1 17 6 23 8.07764313650061 3.1490671282939 4.92857600820671 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0579341542498876 ENSG00000069966:ENST00000261837:exon_52416670_52416836:GNB5;ENSG00000069966:ENST00000358784:exon_52416670_52416836:GNB5;ENSG00000069966:ENST00000396335:exon_52416670_52416836:GNB5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52605861 A/G 1 22 25 47 10.453420529589 13.1211130345579 -2.6676925049689 A:G A G 10 0.524844521382317 0.467464911358237 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52599480_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52599483_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52599485_52606045:MYO5A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52652174 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52652165_52652278:MYO5A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52901283 T/C 1 5 12 17 2.37577739308842 6.2981342565878 -3.92235686349939 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0863600801774899 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52901284 T/C 1 5 13 18 2.37577739308842 6.82297877797012 -4.4472013848817 T:C T C 10 0.524844521382317 0.056012196582109 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52901433 C/T 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52901638 T/C 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 52901977 G/A 1 11 3 14 5.22671026479451 1.57453356414695 3.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0616071016075417 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 55477604 A/G 1 55 46 101 26.1335513239726 24.1428479835866 1.99070334038599 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.765208566629644 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55477560_55477623:RSL24D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 55484930 T/C 1 56 36 92 26.6087068025902 18.8944027697634 7.71430403282684 T:C T C 10 0.524844521382317 0.117587130575870 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55484918_55485031:RSL24D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 22 23 45 10.453420529589 12.0714239917933 -1.61800346220426 A:G A G 10 0.524844521382317 0.6566337577171 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 58000981 C/T 1 12 11 23 5.7018657434122 5.77328973520549 -0.0714239917932904 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 59368167 G/A 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59368153_59368414:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59368153_59368414:RNF111 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 59399630 G/A 1 68 46 114 32.3105725460024 24.1428479835866 8.16772456241587 A:G G A 10 0.524844521382317 0.133940079750297 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59399521_59399649:CCNB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 59399632 G/A 1 67 47 114 31.8354170673848 24.6676925049689 7.16772456241587 A:G G A 10 0.524844521382317 0.189916623584139 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59399521_59399649:CCNB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 59408918 A/G 1 95 106 201 45.1397704686799 55.6335192665256 -10.4937487978457 A:G A G 10 0.524844521382317 0.138843122236577 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59408889_59409125:CCNB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 59409495 G/A 1 86 69 155 40.8633711611207 36.2142719753799 4.64909918574087 A:G G A 10 0.524844521382317 0.470097841078644 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59409427_59409567:CCNB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 59429565 G/C 1 57 51 108 27.0838622812079 26.7670705904982 0.316791690709767 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59428169_59429655:MYO1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 4 12 16 1.90062191447073 6.2981342565878 -4.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0420487835421222 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 60641346 A/G 1 48 45 93 22.8074629736488 23.6180034622043 -0.810540488555478 A:G A G 10 0.524844521382317 0.917430607103224 ENSG00000182718:ENST00000396024:exon_60641274_60641396:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000332680:exon_60641274_60641396:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000421017:exon_60641274_60641396:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000451270:exon_60641274_60641396:ANXA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 66 66 132 31.3602615887671 34.6397384112329 -3.27947682246584 T:G T G 10 0.524844521382317 0.601440955825308 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 60720700 T/C 1 33 36 69 15.6801307943835 18.8944027697634 -3.21427197537987 T:C T C 10 0.524844521382317 0.470713326336193 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60720628_60720886:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60720628_60720886:NARG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 149 112 261 70.7981663140348 58.7825863948195 12.0155799192153 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.137483474310572 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 63433800 G/A 1 168 117 285 79.8261204077707 61.4068090017311 18.4193114060397 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0325762322286645 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 63901256 G/C 1 93 85 178 44.1894595114445 44.6117843174969 -0.422324806052416 T:C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63900818_63901465:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63900818_63901465:HERC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 63908647 G/A 1 32 21 53 15.2049753157659 11.0217349490287 4.1832403667372 A:G G A 10 0.524844521382317 0.273067212327304 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63908629_63908881:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63908629_63908881:HERC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 63908695 G/A 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 A:G G A 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63908629_63908881:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63908629_63908881:HERC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 65459122 T/C 1 14 18 32 6.65217670064756 9.4472013848817 -2.79502468423414 T:C T C 10 0.524844521382317 0.3775047710159 ENSG00000166855:ENST00000300107:exon_65458969_65459123:CLPX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 30 22 52 14.2546643585305 11.546579470411 2.70808488811952 A:C C A 10 0.524844521382317 0.489537780073659 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 66793480 C/T 1 21 12 33 9.97826505097134 6.2981342565878 3.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.225009638406071 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 66793795 G/A 1 288 561 849 136.844777841893 294.43777649548 -157.592998653587 A:G G A 10 0.524844521382317 1.44759675306871e-27 ENSG00000174444:ENST00000307961:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000432669:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000436058:exon_66793713_66793842:RPL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 68480188 T/C 1 99 96 195 47.0403923831506 50.3850740527024 -3.34468166955181 T:C T C 10 0.524844521382317 0.667214339736401 ENSG00000033800:ENST00000249636:exon_68479880_68480402:PIAS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 68582068 C/G 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68581945_68588203:FEM1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 68582359 G/A 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 A:G G A 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68581945_68588203:FEM1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 25 5 30 11.8788869654421 2.62422260691158 9.25466435853049 T:C T C 10 0.524844521382317 0.000707221531816745 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 70957117 G/C 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 C:G G C 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000137831:ENST00000322954:exon_70957001_70957153:UACA;ENSG00000137831:ENST00000379983:exon_70957001_70957153:UACA;ENSG00000137831:ENST00000395362:exon_70957001_70957153:UACA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 70959392 T/C 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C T C 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000137831:ENST00000322954:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000379983:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000395362:exon_70959063_70961801:UACA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 70959591 T/C 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000137831:ENST00000322954:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000379983:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000395362:exon_70959063_70961801:UACA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 70961666 A/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000137831:ENST00000322954:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000379983:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000395362:exon_70959063_70961801:UACA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 72432583 A/G 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 A:G A G 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000166192:ENST00000340912:exon_72431918_72433304:SENP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 72637795 T/C 1 72 70 142 34.2111944604732 36.7391164967622 -2.52792203628901 T:C T C 10 0.524844521382317 0.675420708200628 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72637787_72637891:HEXA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 72638892 T/C 1 45 67 112 21.3819965377957 35.1645829326152 -13.7825863948195 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0103978451142779 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72638868_72639051:HEXA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 73023937 T/C 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000140463:ENST00000268057:exon_73023896_73024067:BBS4;ENSG00000140463:ENST00000395205:exon_73023896_73024067:BBS4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 73044863 G/A 1 39 28 67 18.5310636660896 14.6956465987049 3.83541706738476 A:G G A 10 0.524844521382317 0.392501274516418 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73043636_73045236:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73043710_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000456471:exon_73043710_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73044682_73045233:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73044764_73044958:ADPGK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 73067234 T/C 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 T:C T C 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000159322:ENST00000450412:exon_73067213_73067354:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000311669:exon_73067213_73067438:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000443764:exon_73067213_73067502:ADPGK;ENSG00000159322:ENST00000331065:exon_73067213_73067354:ADPGK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 74277146 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277000_74277212:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277000_74277212:STOML1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 74315687 A/G 1 76 84 160 36.1118163749439 44.0869397961146 -7.97512342117071 A:G A G 10 0.524844521382317 0.235000623106974 ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000395135:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000359928:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000395132:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74315169_74315749:PML HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 126 126 252 59.8695903058281 66.1304096941719 -6.26081938834387 C:G G C 10 0.524844521382317 0.449367485000280 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75093348 C/T 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.618425587093261 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75093890 A/C 1 419 383 802 199.090145540809 201.015451689427 -1.9253061486182 A:T:C A C 10 0.524844521382317 0.915540116386635 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093863_75093936:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093863_75093936:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093863_75093936:CSK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 19 10 29 9.02795409373598 5.24844521382317 3.77950887991281 A:G A G 10 0.524844521382317 0.193890918307861 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75131959 A/G 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131899_75132054:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131899_75132054:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131899_75132054:ULK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75499294 T/A 1 27 48 75 12.8291979226774 25.1925370263512 -12.3633391036738 A:T T A 10 0.524844521382317 0.00520957149528861 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 69 48 117 32.7857280246201 25.1925370263512 7.59319099826891 A:C C A 10 0.524844521382317 0.165967406972892 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 56 56 112 26.6087068025902 29.3912931974098 -2.7825863948195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.636607046860506 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75499927 G/A 1 49 75 124 23.2826184522665 39.3633391036738 -16.0807206514073 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.00395816958267649 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 75646936 T/C 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.274574826477275 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 76191802 G/A 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.692551486497706 ENSG00000140367:ENST00000338677:exon_76191768_76193380:UBE2Q2;ENSG00000140367:ENST00000267938:exon_76191768_76193419:UBE2Q2;ENSG00000140367:ENST00000426727:exon_76191768_76193380:UBE2Q2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 77241568 T/C 1 34 38 72 16.1552862730012 19.944091812528 -3.78880553952682 T:C T C 10 0.524844521382317 0.409470921956809 ENSG00000117906:ENST00000394885:exon_77241411_77242601:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000320963:exon_77241411_77242201:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000394883:exon_77241411_77242191:RCN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 49 56 105 23.2826184522665 29.3912931974098 -6.10867474514328 A:T T A 10 0.524844521382317 0.242125088868619 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 78567853 G/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000140403:ENST00000394855:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000343789:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000394852:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000446172:exon_78567840_78568070:DNAJA4;ENSG00000140403:ENST00000493321:exon_78567339_78568070:DNAJA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 78789488 C/T 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136381:ENST00000258886:exon_78789468_78789653:IREB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 267 278 545 126.866512790921 145.906776944284 -19.0402641533627 A:C A C 10 0.524844521382317 0.103330190298472 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 81592092 C/T 1 143 152 295 67.9472334423287 79.7763672501122 -11.8291338077835 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.179973022719342 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 81592682 T/C 1 175 168 343 83.1522087580945 88.1738795922293 -5.02167083413472 T:C T C 10 0.524844521382317 0.589286858475105 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 119 134 253 56.5435019555043 70.3291658652305 -13.7856639097262 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0891258224154569 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 128 134 262 60.8199012630634 70.3291658652305 -9.50926460216705 T:G T G 10 0.524844521382317 0.240645231292486 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 106 107 213 50.3664807334744 56.1583637879079 -5.79188305443351 A:G G A 10 0.524844521382317 0.450690968079293 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 38 33 71 18.055908187472 17.3198692056165 0.736038981855497 A:G G A 10 0.524844521382317 0.905743387650764 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 82444663 T/C 1 24 22 46 11.4037314868244 11.546579470411 -0.142847983586581 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 82456227 T/C 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82456194_82456325:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82456194_82456325:EFTUD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 82523207 C/A 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:C C A 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82523189_82523312:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82523189_82523312:EFTUD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 82533742 T/C 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82533611_82533744:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82533611_82533744:EFTUD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 13 24 37 6.17702122202988 12.5962685131756 -6.41924729114573 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0468414355119701 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 85188853 A/C 1 12 19 31 5.7018657434122 9.97204590626402 -4.27018016285183 A:C A C 10 0.524844521382317 0.150395529486482 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 85198606 C/T 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197696:ENST00000360476:exon_85198360_85198640:NMB;ENSG00000197696:ENST00000394588:exon_85198360_85198635:NMB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 85345533 C/T 1 34 18 52 16.1552862730012 9.4472013848817 6.70808488811952 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0709616277079431 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85345094_85349659:ZNF592 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 86123924 C/T 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 86124555 G/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 86124946 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 89020240 G/T 1 49 38 87 23.2826184522665 19.944091812528 3.33852663973843 T:G G T 10 0.524844521382317 0.520091769894989 ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89020220_89020285:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89020220_89020285:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000353598:exon_89020220_89020285:MRPS11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 307 251 558 145.872731935629 131.735974866962 14.1367570686671 A:G A G 10 0.524844521382317 0.235515425939389 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 241 196 437 114.512470346862 102.869526190934 11.6429441559275 A:G A G 10 0.524844521382317 0.270919183899537 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 89835954 C/T 1 14 15 29 6.65217670064756 7.87266782073475 -1.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.711938142382318 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89835919_89836095:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89835919_89836095:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89835919_89836095:FANCI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 89837139 G/T 1 20 17 37 9.50310957235366 8.92235686349939 0.580752708854273 T:G G T 10 0.524844521382317 0.870899695467464 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89837064_89837228:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89837064_89837228:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89837064_89837228:FANCI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 90168693 T/A 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:T T A 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 90432308 T/C 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000157823:ENST00000336418:exon_90432281_90432372:AP3S2;ENSG00000157823:ENST00000423566:exon_90432281_90432372:AP3S2;ENSG00000250021:ENST00000398333:exon_90432281_90432372:RP11-233C13.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 90611599 C/T 1 17 17 34 8.07764313650061 8.92235686349939 -0.844713726998776 T:C C T 10 0.524844521382317 0.864128654984718 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 90628594 C/T 1 246 153 399 116.88824773995 80.3012117714945 36.5870359684555 T:C C T 10 0.524844521382317 0.000245686638554597 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 90768271 C/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90768200_90768410:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90768200_90768410:SEMA4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 90771704 G/A 1 17 17 34 8.07764313650061 8.92235686349939 -0.844713726998776 A:G G A 10 0.524844521382317 0.864128654984718 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 90774259 G/C 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 C:G G C 10 0.524844521382317 0.439918569898636 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 91326099 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91326052_91326158:BLM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 91434277 C/T 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 T:C C T 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91434212_91434421:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91434212_91434421:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91434212_91434411:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91434212_91434421:FES HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 91436965 C/T 1 39 16 55 18.5310636660896 8.39751234211707 10.1335513239726 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00660892870240883 ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91436884_91437041:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91436884_91437041:FES HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 91462903 A/G 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 A:G A G 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000196547:ENST00000431652:exon_91462865_91463940:MAN2A2;ENSG00000196547:ENST00000360468:exon_91462865_91465814:MAN2A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 93162649 A/G 1 115 59 174 54.6428800410335 30.9658267615567 23.6770532794768 A:G A G 10 0.524844521382317 0.000336254869391834 ENSG00000185442:ENST00000327355:exon_93160678_93162689:FAM174B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 21 9 30 9.97826505097134 4.72360069244085 5.25466435853049 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0668269988343185 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 99926317 A/G 1 25 29 54 11.8788869654421 15.2204911200872 -3.34160415464512 A:G A G 10 0.524844521382317 0.414220944965565 ENSG00000168904:ENST00000301981:exon_99926235_99930934:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000331450:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000422500:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000447360:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000450058:exon_99926235_99926496:LRRC28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 100269781 G/A 1 3 10 13 1.42546643585305 5.24844521382317 -3.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0487982257626193 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 38 27 65 18.055908187472 14.1708020773226 3.8851061101494 A:C C A 10 0.524844521382317 0.385090066326939 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 29 27 56 13.7795088799128 14.1708020773226 -0.39129319740975 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 28 20 48 13.3043534012951 10.4968904276463 2.80746297364879 A:G G A 10 0.524844521382317 0.471157720032553 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 32 23 55 15.2049753157659 12.0714239917933 3.13355132397257 A:C C A 10 0.524844521382317 0.420678735144786 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 24 12 36 11.4037314868244 6.2981342565878 5.10559723023659 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0967205160666587 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 29 20 49 13.7795088799128 10.4968904276463 3.28261845226647 C:G C G 10 0.524844521382317 0.392083216890412 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101113950 A/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G A G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101114418 G/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 T:C T C 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101529594 G/A 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101529455_101529704:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101529455_101529603:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101529455_101529603:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101529455_101529603:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101529455_101529603:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101529455_101529603:LRRK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101591923 A/G 1 10 15 25 4.75155478617683 7.87266782073475 -3.12111303455792 A:G A G 10 0.524844521382317 0.233899195740004 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101591916_101592165:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101591916_101592165:LRRK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101606084 G/A 1 26 26 52 12.3540424440598 13.6459575559402 -1.29191511188048 A:G G A 10 0.524844521382317 0.781842383630529 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101606889 G/A 1 32 13 45 15.2049753157659 6.82297877797012 8.38199653779574 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0160008410486225 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101606890 C/A 1 32 13 45 15.2049753157659 6.82297877797012 8.38199653779574 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0160008410486225 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101606845_101606946:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101606845_101606946:LRRK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101718097 C/G 1 20 16 36 9.50310957235366 8.39751234211707 1.10559723023659 C:G C G 10 0.524844521382317 0.741507923506718 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101718106 G/A 1 16 21 37 7.60248765788293 11.0217349490287 -3.41924729114573 A:G G A 10 0.524844521382317 0.323500510661641 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101718190 C/T 1 20 20 40 9.50310957235366 10.4968904276463 -0.993780855292677 T:C C T 10 0.524844521382317 0.754730690348347 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101718529 T/C 1 9 14 23 4.27639930755915 7.34782329935244 -3.07142399179329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.216326895269441 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 15 101718950 T/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 171 135 306 81.2515868436238 70.8540103866128 10.397576457011 T:C C T 10 0.524844521382317 0.252318694047498 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 239186 G/A 1 29 32 61 13.7795088799128 16.7950246842341 -3.01551580432134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.445259838410939 ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_238968_240134:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000293872:exon_238968_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000426094:exon_238968_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_238970_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000490762:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000429378:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000468732:exon_238989_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000415507:exon_238992_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000464711:exon_239097_239338:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000442701:exon_239114_239338:LUC7L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 243006 G/A 1 23 16 39 10.9285760082067 8.39751234211707 2.53106366608964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.428763254968036 ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000293872:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000426094:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000490762:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000429378:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000415507:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000464711:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000419516:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397780:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000495349:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000418978:exon_242926_243014:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000430864:exon_242926_243014:LUC7L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 347184 A/G 1 24 43 67 11.4037314868244 22.5683144194396 -11.1645829326152 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0069077016473441 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347056_347226:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347056_347226:AXIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 348222 C/T 1 35 18 53 16.6304417516189 9.4472013848817 7.1832403667372 T:C C T 10 0.524844521382317 0.054024948406853 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_347722_348251:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000481769:exon_347844_348251:AXIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 190 168 358 90.2795409373598 88.1738795922293 2.10566134513053 A:G A G 10 0.524844521382317 0.832564366080415 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 T:C C T 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 774520 C/T 1 15 15 30 7.12733217926525 7.87266782073475 -0.745335641469509 T:C C T 10 0.524844521382317 0.855847162594056 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482152:exon_774322_774635:CCDC78 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 775089 C/T 1 14 20 34 6.65217670064756 10.4968904276463 -3.84471372699878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.229440518616100 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774911_775145:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_775078_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_775078_775145:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_775078_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_775078_775145:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000460023:exon_774907_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000439619:exon_774907_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000423653:exon_775078_775145:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000471861:exon_775001_775145:CCDC78 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 58 54 112 27.5590177598256 28.3416041546451 -0.7825863948195 A:G A G 10 0.524844521382317 0.924731287775423 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 836020 G/A 1 66 68 134 31.3602615887671 35.6894274539976 -4.32916586523047 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.489255421320437 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 836793 G/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 845797 G/C 1 17 14 31 8.07764313650061 7.34782329935244 0.729819837148174 C:G G C 10 0.524844521382317 0.858443645066449 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1004554 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1004357_1004666:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1004357_1004666:LMF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1400108 C/T 1 114 94 208 54.1677245624159 49.3353850099378 4.83233955247807 T:C C T 10 0.524844521382317 0.53233705171882 ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1400059_1400235:C16orf42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1400911 G/A 1 57 51 108 27.0838622812079 26.7670705904982 0.316791690709767 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1400808_1401001:C16orf42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1498413 G/A 1 14 20 34 6.65217670064756 10.4968904276463 -3.84471372699878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.229440518616100 ENSG00000103249:ENST00000448525:exon_1498356_1498485:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000428756:exon_1498356_1498485:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000262318:exon_1498356_1498485:CLCN7;ENSG00000103249:ENST00000382745:exon_1498356_1498485:CLCN7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 18 5 23 8.5527986151183 2.62422260691158 5.92857600820671 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0195647809515236 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 19 5 24 9.02795409373598 2.62422260691158 6.40373148682439 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0124762166225509 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1551442 C/T 1 24 19 43 11.4037314868244 9.97204590626402 1.43168558056037 T:C C T 10 0.524844521382317 0.760592071157294 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1551421_1551500:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1551421_1551500:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1551421_1551500:TELO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1551750 C/T 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 T:C C T 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1551664_1551774:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1551664_1551774:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1551664_1551774:TELO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1555527 T/A 1 14 5 19 6.65217670064756 2.62422260691158 4.02795409373598 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0697160540587325 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 40 37 77 19.0062191447073 19.4192472911457 -0.413028146438403 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1797050 C/T 1 22 18 40 10.453420529589 9.4472013848817 1.00621914470732 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.874475168298225 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1797030_1797276:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1797030_1797276:MAPK8IP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 30 50 80 14.2546643585305 26.2422260691158 -11.9875617105854 C:G G C 10 0.524844521382317 0.00959383652524344 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 195 225 420 92.6553183304482 118.090017311021 -25.4346989805731 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0144811461123241 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1838037 C/G 1 99 91 190 47.0403923831506 47.7608514457908 -0.720459062640224 C:G C G 10 0.524844521382317 0.94215925141642 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1869907 G/A 1 34 23 57 16.1552862730012 12.0714239917933 4.08386228120793 A:G G A 10 0.524844521382317 0.291789014765963 ENSG00000063854:ENST00000397356:exon_1869898_1870015:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000397353:exon_1869898_1870015:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000262303:exon_1869898_1870015:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000455446:exon_1869898_1870015:HAGH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 37 48 85 17.5807527088543 25.1925370263512 -7.61178431749694 T:C T C 10 0.524844521382317 0.103963281394182 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2025411 G/C 1 59 40 99 28.0341732384433 20.9937808552927 7.04039238315062 C:G G C 10 0.524844521382317 0.160401198694082 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2025602 A/G 1 74 37 111 35.1615054177085 19.4192472911457 15.7422581265628 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00306511250242802 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025530_2025711:TBL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2026292 T/C 1 53 44 97 25.1832403667372 23.0931589408219 2.09008142591525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.685637815059488 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026212_2026315:TBL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2026891 T/C 1 59 49 108 28.0341732384433 25.7173815477335 2.31679169070977 T:C T C 10 0.524844521382317 0.700372559905102 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026815_2026962:TBL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2028677 A/G 1 42 46 88 19.9565301019427 24.1428479835866 -4.18631788164389 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.394239705320608 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028553_2028751:TBL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 84 82 166 39.9130602038854 43.03725075335 -3.12419054946462 T:C T C 10 0.524844521382317 0.641654934591737 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2048813 C/T 1 47 39 86 22.3323074950311 20.4689363339104 1.86337116112074 T:C C T 10 0.524844521382317 0.746375838207938 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048703_2048853:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048703_2048853:ZNF598 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2049891 C/G 1 82 80 162 38.96274924665 41.9875617105854 -3.02481246393535 C:G C G 10 0.524844521382317 0.637918279307946 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2050221 T/C 1 73 49 122 34.6863499390909 25.7173815477335 8.96896839135733 T:C T C 10 0.524844521382317 0.122966771102372 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2086470 G/A 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 G G 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000065054:ENST00000432365:exon_2086325_2086504:SLC9A3R2;ENSG00000065054:ENST00000424542:exon_2086325_2086504:SLC9A3R2;ENSG00000065054:ENST00000191922:exon_2086325_2086504:SLC9A3R2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2138508 G/C 1 55 59 114 26.1335513239726 30.9658267615567 -4.83227543758413 C:G G C 10 0.524844521382317 0.398968655155748 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2147500 C/G 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 C:G C G 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2147320_2147504:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000487932:exon_2147320_2147504:PKD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2205010 G/A 1 14 16 30 6.65217670064756 8.39751234211707 -1.74533564146951 A:G G A 10 0.524844521382317 0.585512927936858 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2260854 A/G 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 A:G A G 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000182685:ENST00000328540:exon_2260784_2261317:C16orf79 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2290057 C/T 1 84 94 178 39.9130602038854 49.3353850099378 -9.42232480605242 T:C C T 10 0.524844521382317 0.176604830136652 ENSG00000167969:ENST00000301729:exon_2289396_2290146:DCI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2290162 C/T 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2373687 C/T 1 11 13 24 5.22671026479451 6.82297877797012 -1.59626851317561 T:C C T 10 0.524844521382317 0.545534900498325 ENSG00000167972:ENST00000301732:exon_2373524_2373689:ABCA3;ENSG00000167972:ENST00000382381:exon_2373524_2373689:ABCA3;ENSG00000167972:ENST00000436770:exon_2373524_2373689:ABCA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2378596 C/T 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000167972:ENST00000301732:exon_2378454_2378758:ABCA3;ENSG00000167972:ENST00000382381:exon_2378454_2378758:ABCA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2499297 G/A 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2499283_2499463:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2499283_2499463:CCNF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2499415 C/T 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2499283_2499463:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2499283_2499463:CCNF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2506801 T/G 1 38 26 64 18.055908187472 13.6459575559402 4.40995063153172 T:G T G 10 0.524844521382317 0.316889031649567 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2506546_2508859:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2506546_2508855:CCNF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2546356 T/C 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000162065:ENST00000293970:exon_2546035_2547114:TBC1D24;ENSG00000162065:ENST00000415175:exon_2546031_2547114:TBC1D24;ENSG00000162065:ENST00000434757:exon_2546031_2547114:TBC1D24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2580912 T/C 1 5 14 19 2.37577739308842 7.34782329935244 -4.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0358228143741496 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2581080 G/A 1 14 26 40 6.65217670064756 13.6459575559402 -6.99378085529268 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0382289956368284 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 87 87 174 41.3385266397384 45.6614733602616 -4.32294672052315 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.543932127030012 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 156 154 310 74.1242546643586 80.8260562928768 -6.70180162851825 A:G A G 10 0.524844521382317 0.460024658686283 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 189 167 356 89.8043854587421 87.6490350708469 2.15535038789515 A:G G A 10 0.524844521382317 0.832066382516575 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2814403 T/G 1 121 129 250 57.4938129127396 67.7049432583189 -10.2111303455792 T:G T G 10 0.524844521382317 0.205529736923359 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 716 723 1439 340.211322690261 379.462588959415 -39.2512662691541 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.0395006112857909 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2821525 G/A 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2821643 A/G 1 9 15 24 4.27639930755915 7.87266782073475 -3.59626851317561 A:G A G 10 0.524844521382317 0.156455234273016 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2871121 T/C 1 18 12 30 8.5527986151183 6.2981342565878 2.25466435853049 T:C T C 10 0.524844521382317 0.467363032646082 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2880482 A/T 1 42 25 67 19.9565301019427 13.1211130345579 6.83541706738476 A:T A T 10 0.524844521382317 0.111416170189406 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2880416_2880494:ZG16B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2881930 A/G 1 65 33 98 30.8851061101494 17.3198692056165 13.5652369045329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00619678737584176 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 62 106 168 29.4596396742963 55.6335192665256 -26.1738795922292 T:G G T 10 0.524844521382317 5.376534759768e-05 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 24 17 41 11.4037314868244 8.92235686349939 2.481374623325 C:G C G 10 0.524844521382317 0.532225835483175 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3024011 C/G 1 62 35 97 29.4596396742963 18.3695582483811 11.0900814259153 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0252786344191188 ENSG00000127564:ENST00000431515:exon_3024001_3024158:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000262300:exon_3024001_3024158:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000440027:exon_3024001_3024158:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000402679:exon_3024001_3024158:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000382240:exon_3024001_3024158:PKMYT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3025552 G/A 1 25 35 60 11.8788869654421 18.3695582483811 -6.49067128293902 A:G G A 10 0.524844521382317 0.120143776554861 ENSG00000127564:ENST00000431515:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000262300:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000440027:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000402679:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000382240:exon_3025320_3025813:PKMYT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3076393 C/T 1 53 52 105 25.1832403667372 27.2919151118805 -2.10867474514328 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.696848603105363 ENSG00000131652:ENST00000253952:exon_3076366_3076414:THOC6;ENSG00000131652:ENST00000326266:exon_3076366_3076414:THOC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3117426 C/T 1 11 14 25 5.22671026479451 7.34782329935244 -2.12111303455792 T:C C T 10 0.524844521382317 0.428460468329696 ENSG00000008517:ENST00000534507:exon_3117378_3117614:IL32;ENSG00000008517:ENST00000416912:exon_3117378_3117614:IL32;ENSG00000008517:ENST00000532086:exon_3117378_3117835:IL32;ENSG00000008517:ENST00000526464:exon_3117378_3117650:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534748:exon_3117378_3117887:IL32;ENSG00000008517:ENST00000532247:exon_3117378_3118666:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525377:exon_3117378_3117614:IL32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3119344 A/C 1 412 523 935 195.764057190485 274.493684682952 -78.7296274924664 A:C:G A C 10 0.524844521382317 2.60242458956440e-07 ENSG00000008517:ENST00000440815:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534507:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382213:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000416912:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382210:exon_3119282_3119356:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396890:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000325568:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396887:exon_3119282_3119376:IL32;ENSG00000008517:ENST00000531965:exon_3118991_3119377:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529699:exon_3118991_3119356:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529550:exon_3118991_3119369:IL32;ENSG00000008517:ENST00000528163:exon_3118991_3119441:IL32;ENSG00000008517:ENST00000533097:exon_3118991_3119553:IL32;ENSG00000008517:ENST00000444393:exon_3118991_3119541:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530890:exon_3118991_3119549:IL32;ENSG00000008517:ENST00000008180:exon_3118991_3119820:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530538:exon_3118991_3119384:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525003:exon_3118991_3119412:IL32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3119375 T/G 1 107 546 653 50.8416362120921 286.565108674745 -235.723472462653 T:G T G 10 0.524844521382317 1.18180603571150e-81 ENSG00000008517:ENST00000440815:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534507:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382213:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000416912:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396890:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000325568:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396887:exon_3119282_3119376:IL32;ENSG00000008517:ENST00000531965:exon_3118991_3119377:IL32;ENSG00000008517:ENST00000528163:exon_3118991_3119441:IL32;ENSG00000008517:ENST00000533097:exon_3118991_3119553:IL32;ENSG00000008517:ENST00000444393:exon_3118991_3119541:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530890:exon_3118991_3119549:IL32;ENSG00000008517:ENST00000008180:exon_3118991_3119820:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530538:exon_3118991_3119384:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525003:exon_3118991_3119412:IL32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3191356 G/A 1 14 14 28 6.65217670064756 7.34782329935244 -0.695646598704876 A:G G A 10 0.524844521382317 0.851171689520466 ENSG00000085644:ENST00000396878:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000332670:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000416391:exon_3190690_3192804:ZNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3282468 G/A 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000010539:ENST00000396870:exon_3282421_3282547:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000396868:exon_3282421_3282544:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000396871:exon_3282421_3282547:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000414144:exon_3282421_3282547:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000438090:exon_3282421_3282547:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000431561:exon_3282421_3282544:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000008311:exon_3282421_3282547:ZNF200;ENSG00000010539:ENST00000453093:exon_3282421_3282547:ZNF200 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3339435 G/C 1 11 30 41 5.22671026479451 15.7453356414695 -10.518625376675 C:G G C 10 0.524844521382317 0.00143043672337481 ENSG00000006194:ENST00000219069:exon_3339393_3341460:ZNF263 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3350078 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000140993:ENST00000426381:exon_3349106_3350614:TIGD7;ENSG00000140993:ENST00000396862:exon_3348832_3352009:TIGD7;ENSG00000140993:ENST00000268674:exon_3348965_3350614:TIGD7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3586166 C/T 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000103351:ENST00000341633:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000417763:exon_3586122_3586581:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000445795:exon_3586122_3587669:CLUAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3639645 T/C 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 3640578 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000188827:ENST00000294008:exon_3639003_3641311:SLX4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4390358 G/T 1 15 16 31 7.12733217926525 8.39751234211707 -1.27018016285183 T:G G T 10 0.524844521382317 0.720479372385213 ENSG00000217930:ENST00000318059:exon_4390252_4390406:PAM16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4411224 C/T 1 38 26 64 18.055908187472 13.6459575559402 4.40995063153172 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.316889031649567 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4411163_4411249:CORO7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 34 15 49 16.1552862730012 7.87266782073475 8.28261845226647 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0213432614305654 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 31 11 42 14.7298198371482 5.77328973520549 8.95653010194269 A:T A T 10 0.524844521382317 0.00783405473155465 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 17 18 35 8.07764313650061 9.4472013848817 -1.36955824838109 A:T T A 10 0.524844521382317 0.73571934593785 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4516392 G/A 1 92 70 162 43.7143040328268 36.7391164967622 6.97518753606465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.306476018583765 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4516154_4516403:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4516154_4516403:NMRAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4748011 C/T 1 21 14 35 9.97826505097134 7.34782329935244 2.63044175161891 T:C C T 10 0.524844521382317 0.401831493103041 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747978_4748063:ANKS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4748033 C/G 1 15 21 36 7.12733217926525 11.0217349490287 -3.89440276976341 C:G C G 10 0.524844521382317 0.242605520092621 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747978_4748063:ANKS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 15 23 38 7.12733217926525 12.0714239917933 -4.94409181252805 T:C C T 10 0.524844521382317 0.142845405128783 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4751124 A/G 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4750971_4751135:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4750971_4751135:ANKS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4802386 G/T 1 15 13 28 7.12733217926525 6.82297877797012 0.304353401295125 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000103199:ENST00000219478:exon_4800815_4803059:ZNF500 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4911062 C/T 1 12 18 30 5.7018657434122 9.4472013848817 -3.74533564146951 T:C C T 10 0.524844521382317 0.201690400601927 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4910665_4911103:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4910665_4911103:UBN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4924895 A/G 1 16 21 37 7.60248765788293 11.0217349490287 -3.41924729114573 A:G A G 10 0.524844521382317 0.323500510661641 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4924212_4925435:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4924212_4925435:UBN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 5130950 A/G 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5130947_5131057:ALG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 5132636 C/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C C T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5132560_5132674:ALG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8719543 G/T 1 30 28 58 14.2546643585305 14.6956465987049 -0.440982240174385 A:T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8719353_8719655:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8719353_8719655:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8719609 G/A 1 27 26 53 12.8291979226774 13.6459575559402 -0.816759633262798 A:G G A 10 0.524844521382317 0.890883608117675 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8719353_8719655:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8719353_8719655:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8722642 A/G 1 51 37 88 24.2329294095018 19.4192472911457 4.81368211835611 A:G A G 10 0.524844521382317 0.337251166792109 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8722732 T/C 1 25 29 54 11.8788869654421 15.2204911200872 -3.34160415464512 T:C T C 10 0.524844521382317 0.414220944965565 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 14 19 33 6.65217670064756 9.97204590626402 -3.31986920561646 A:G G A 10 0.524844521382317 0.29637560445508 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8735990 A/G 1 12 18 30 5.7018657434122 9.4472013848817 -3.74533564146951 A:G A G 10 0.524844521382317 0.201690400601927 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8735984_8736064:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8735984_8736064:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8736028 T/C 1 16 14 30 7.60248765788293 7.34782329935244 0.254664358530491 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8735984_8736064:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8735984_8736064:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8738499 G/A 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 A:G G A 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8738414_8738582:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8738414_8738582:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8738579 A/G 1 19 6 25 9.02795409373598 3.1490671282939 5.87888696544208 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0256872170689486 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8738414_8738582:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8738414_8738582:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8740015 A/C 1 15 10 25 7.12733217926525 5.24844521382317 1.87888696544208 A:C A C 10 0.524844521382317 0.549576175229901 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8739965_8740079:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8739965_8740072:C16orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 8953211 G/A 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 A:G G A 10 0.524844521382317 0.807464941586794 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 85 90 175 40.3882156825031 47.2360069244085 -6.84779124190547 A:G A G 10 0.524844521382317 0.325261125069289 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 10868997 G/A 1 18 7 25 8.5527986151183 3.67391164967622 4.87888696544208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0696668631520315 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 10989551 C/T 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10989526_10989621:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10989526_10989621:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10989526_10989621:CIITA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 23 15 38 10.9285760082067 7.87266782073475 3.05590818747195 T:G G T 10 0.524844521382317 0.335254961525510 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 11002927 A/G 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 A:G A G 10 0.524844521382317 0.692551486497706 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 11056378 C/T 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11056312_11056445:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11056312_11056445:CLEC16A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 54 71 125 25.6583958453549 37.2639610181445 -11.6055651727896 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0395145975187837 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 12009781 G/A 1 44 41 85 20.9068410591781 21.518625376675 -0.611784317496944 A:G G A 10 0.524844521382317 0.91386975547125 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 12060163 A/G 1 108 90 198 51.3167916907098 47.2360069244085 4.08078476630124 A:G A G 10 0.524844521382317 0.570063173658754 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12060052_12060198:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12060052_12060198:TNFRSF17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 12061677 G/C 1 145 137 282 68.897544399564 71.9036994293774 -3.00615502981339 C:G G C 10 0.524844521382317 0.721028204542466 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 16138322 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16138307_16138537:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16138307_16138537:ABCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 16139714 T/C 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 T:C T C 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16139693_16139870:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16139693_16139870:ABCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 T:C C T 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 19547503 C/T 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 19548116 G/A 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 19548290 G/A 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:G G A 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19547262_19548909:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19547262_19548909:AC012621.2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 19556169 A/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000103540:ENST00000396212:exon_19556119_19556220:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000381396:exon_19556119_19556220:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000396208:exon_19556119_19556220:AC012621.2;ENSG00000103540:ENST00000219827:exon_19556119_19556220:AC012621.2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 19726124 G/A 1 92 83 175 43.7143040328268 43.5620952747323 0.152208758094531 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 19 20 39 9.02795409373598 10.4968904276463 -1.46893633391036 A:C C A 10 0.524844521382317 0.7489542252078 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 20855309 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000005189:ENST00000261377:exon_20855256_20855348:AC004381.6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 21974134 C/A 1 111 98 209 52.7422581265628 51.4347630954671 1.30749503109575 A:C C A 10 0.524844521382317 0.889926266396661 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21974082_21974206:UQCRC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 23409440 G/A 1 15 13 28 7.12733217926525 6.82297877797012 0.304353401295125 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23409367_23409450:COG7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 A:T:C A T 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 24572946 A/C 1 23 14 37 10.9285760082067 7.34782329935244 3.58075270885427 A:C A C 10 0.524844521382317 0.25370706790013 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24572933_24573036:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24572933_24573036:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24572933_24573036:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24572933_24573036:RBBP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 202 207 409 95.981406680772 108.64281592614 -12.6614092453676 A:G A G 10 0.524844521382317 0.216016643056694 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 24942272 T/A 1 209 217 426 99.3074950310958 113.891261139963 -14.583766108867 A:T T A 10 0.524844521382317 0.159734734649407 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 24942328 C/T 1 231 176 407 109.760915560685 92.3726357632878 17.388279797397 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0914228534259086 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 24942472 C/T 1 224 205 429 106.434827210361 107.593126883375 -1.15829967301399 T:C C T 10 0.524844521382317 0.923030899640693 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 24965975 C/G 1 38 26 64 18.055908187472 13.6459575559402 4.40995063153172 C:G C G 10 0.524844521382317 0.316889031649567 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24965924_24966051:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24965924_24966051:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24965924_24966051:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24965924_24966051:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24965924_24966051:ARHGAP17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 24980078 C/T 1 30 33 63 14.2546643585305 17.3198692056165 -3.06520484708597 T:C C T 10 0.524844521382317 0.45185308975911 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24980024_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24979982_24980093:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24979982_24980093:ARHGAP17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 73 92 165 34.6863499390909 48.2856959671732 -13.5993460280823 T:C C T 10 0.524844521382317 0.035390898804597 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 A:G A G 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27373872 A/C 1 44 22 66 20.9068410591781 11.546579470411 9.36026158876708 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0258385120236493 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27373915 G/T 1 43 27 70 20.4316855805604 14.1708020773226 6.26088350323781 T:G G T 10 0.524844521382317 0.151185865297927 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27373972 T/C 1 39 29 68 18.5310636660896 15.2204911200872 3.31057254600245 T:C T C 10 0.524844521382317 0.467141997210521 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27374180 T/C 1 42 42 84 19.9565301019427 22.0434698980573 -2.08693979611463 T:C T C 10 0.524844521382317 0.663523630095005 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27374400 A/G 1 29 19 48 13.7795088799128 9.97204590626402 3.80746297364879 A:G A G 10 0.524844521382317 0.312598278217653 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27455886 A/G 1 83 76 159 39.4379047252677 39.8881836250561 -0.450278899788394 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000103522:ENST00000337929:exon_27455863_27456040:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395755:exon_27455863_27456040:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395754:exon_27455863_27456040:IL21R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27503810 T/A 1 14 14 28 6.65217670064756 7.34782329935244 -0.695646598704876 A:T T A 10 0.524844521382317 0.851171689520466 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27503659_27503836:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27503659_27503836:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27503659_27503836:GTF3C1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27544654 C/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27544612_27544708:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27544612_27544708:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27544612_27544708:GTF3C1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 27789278 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000047578:ENST00000261588:exon_27789202_27789290:KIAA0556 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28488943 T/C 1 24 40 64 11.4037314868244 20.9937808552927 -9.59004936846828 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.0173807748924469 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28488944 G/T 1 41 24 65 19.481374623325 12.5962685131756 6.8851061101494 T:G G T 10 0.524844521382317 0.105854877191998 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28506872 A/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28507858 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28508048 A/G 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 A:G A G 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28508069 C/T 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28508413 A/G 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 A:G A G 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28844448 C/A 1 101 109 210 47.990703340386 57.2080528306725 -9.21734949028657 A:C C A 10 0.524844521382317 0.213846117281644 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28844380_28844675:ATXN2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28845448 G/A 1 142 139 281 67.472077963711 72.9533884721421 -5.48131050843106 A:G G A 10 0.524844521382317 0.511984639908163 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28845386_28845532:ATXN2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28925731 G/A 1 29 37 66 13.7795088799128 19.4192472911457 -5.63973841123292 A:G G A 10 0.524844521382317 0.176356034995177 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28925557_28925907:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28925557_28925907:RABEP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 28986542 A/G 1 14 11 25 6.65217670064756 5.77328973520549 0.878886965442075 A:G A G 10 0.524844521382317 0.842073148287916 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000334536:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000352260:exon_28986096_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28986422_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28986509_28986713:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000434933:exon_28986122_28986713:SPNS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 29979430 T/C 1 99 116 215 47.0403923831506 60.8819644803488 -13.8415720971982 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0650459718194397 ENSG00000149932:ENST00000414689:exon_29979346_29979575:TMEM219;ENSG00000149932:ENST00000279396:exon_29979346_29979575:TMEM219 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 29994922 C/T 1 29 34 63 13.7795088799128 17.8447137269988 -4.06520484708597 T:C C T 10 0.524844521382317 0.315576559621082 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29994824_29994985:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29994824_29994985:TAOK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 29998470 G/C 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 C:G G C 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 30004789 T/C 1 37 39 76 17.5807527088543 20.4689363339104 -2.88818362505609 T:C T C 10 0.524844521382317 0.566170345938067 ENSG00000149929:ENST00000279392:exon_30004780_30004878:HIRIP3;ENSG00000149929:ENST00000352552:exon_30004780_30004878:HIRIP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 30785254 C/T 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 T:C C T 10 0.524844521382317 0.103595747645196 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 31475730 C/T 1 22 9 31 10.453420529589 4.72360069244085 5.72981983714817 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0471401600802982 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31475715_31476208:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31475715_31476208:ARMC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 31477460 G/A 1 26 22 48 12.3540424440598 11.546579470411 0.807462973648786 A:G G A 10 0.524844521382317 0.885512669161484 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 31485534 G/C 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 C:G G C 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000140682:ENST00000394863:exon_31485473_31485560:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000361773:exon_31485473_31485560:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000394858:exon_31485473_31485560:TGFB1I1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 31504944 C/T 1 29 21 50 13.7795088799128 11.0217349490287 2.75777393088415 T:C C T 10 0.524844521382317 0.480545330670102 ENSG00000140688:ENST00000327237:exon_31504924_31505108:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000452223:exon_31504924_31505108:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000430477:exon_31504871_31505108:C16orf58 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 31519676 A/T 1 11 5 16 5.22671026479451 2.62422260691158 2.60248765788293 A:T A T 10 0.524844521382317 0.219130803102002 ENSG00000140688:ENST00000327237:exon_31519395_31519734:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000452223:exon_31519599_31519694:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000430477:exon_31519395_31519706:C16orf58 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 31926619 G/A 1 97 65 162 46.0900814259153 34.1148938898506 11.9751875360646 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.0700767780112329 ENSG00000185947:ENST00000300870:exon_31925797_31928622:ZNF267;ENSG00000185947:ENST00000394846:exon_31925797_31928622:ZNF267 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 46696284 G/A 1 37 28 65 17.5807527088543 14.6956465987049 2.8851061101494 A:G G A 10 0.524844521382317 0.535200773482948 ENSG00000069329:ENST00000299138:exon_46696155_46696394:VPS35 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 47683064 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000102893:ENST00000455779:exon_47683011_47683115:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000299167:exon_47683011_47683115:PHKB;ENSG00000102893:ENST00000323584:exon_47683011_47683115:PHKB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 50353831 C/T 1 56 78 134 26.6087068025902 40.9378726678207 -14.3291658652305 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0151870129294941 ENSG00000166164:ENST00000394688:exon_50353798_50353941:BRD7;ENSG00000166164:ENST00000394689:exon_50353798_50353941:BRD7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 50707782 C/T 1 22 19 41 10.453420529589 9.97204590626402 0.481374623325005 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50705536_50707985:SNX20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 20 19 39 9.50310957235366 9.97204590626402 -0.46893633391036 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 53528079 T/C 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000166971:ENST00000394657:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000300245:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000425875:exon_53528050_53528157:AKTIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 56485470 C/T 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56485407_56485678:OGFOD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 56500132 C/T 1 25 17 42 11.8788869654421 8.92235686349939 2.95653010194269 T:C C T 10 0.524844521382317 0.440310935423641 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 56500176 T/A 1 28 17 45 13.3043534012951 8.92235686349939 4.38199653779574 A:T T A 10 0.524844521382317 0.232461537929957 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 56545175 T/C 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56545071_56545196:BBS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 56857753 G/A 1 15 14 29 7.12733217926525 7.34782329935244 -0.220491120087193 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56857619_56857758:NUP93 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57015084 C/G 1 15 9 24 7.12733217926525 4.72360069244085 2.40373148682439 C:G C G 10 0.524844521382317 0.414775891663106 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57015070_57015137:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57015070_57015137:CETP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57016086 G/A 1 15 15 30 7.12733217926525 7.87266782073475 -0.745335641469509 A:G G A 10 0.524844521382317 0.855847162594056 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57016127 G/A 1 22 19 41 10.453420529589 9.97204590626402 0.481374623325005 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57017552 G/A 1 32 45 77 15.2049753157659 23.6180034622043 -8.41302814643841 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0672615074613697 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57017504_57017757:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57017504_57017756:CETP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57060576 G/A 1 16 20 36 7.60248765788293 10.4968904276463 -2.89440276976341 A:G G A 10 0.524844521382317 0.4046295772343 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57060724 G/A 1 14 20 34 6.65217670064756 10.4968904276463 -3.84471372699878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.229440518616100 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57394356 C/T 1 347 406 753 164.878951080336 213.086875681221 -48.2079246008847 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.00045508747926518 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57394349_57394472:CCL22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57493629 G/C 1 37 36 73 17.5807527088543 18.8944027697634 -1.31365006090914 C:G G C 10 0.524844521382317 0.81502404027658 ENSG00000088682:ENST00000262507:exon_57493477_57493632:COQ9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57602001 G/A 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57608955 C/T 1 16 4 20 7.60248765788293 2.09937808552927 5.50310957235366 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0138529821356997 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57775624 C/T 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57775599_57775729:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57775599_57775729:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57775599_57775729:KATNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57788843 C/T 1 23 21 44 10.9285760082067 11.0217349490287 -0.0931589408219473 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57788842_57788909:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57788842_57788909:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57788842_57788909:KATNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 57789288 T/C 1 17 15 32 8.07764313650061 7.87266782073475 0.204975315765857 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57789257_57789406:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57789257_57789406:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57789257_57789406:KATNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 58589187 G/A 1 25 14 39 11.8788869654421 7.34782329935244 4.53106366608964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.152876544535080 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58589155_58589441:CNOT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 58750668 C/T 1 26 26 52 12.3540424440598 13.6459575559402 -1.29191511188048 T:C C T 10 0.524844521382317 0.781842383630529 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 58752466 C/T 1 26 19 45 12.3540424440598 9.97204590626402 2.38199653779574 T:C C T 10 0.524844521382317 0.55132909892401 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58752431_58752592:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58752431_58752588:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58752121_58752592:GOT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67183206 C/A 1 4 14 18 1.90062191447073 7.34782329935244 -5.44720138488171 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0157676899224219 ENSG00000237172:ENST00000449549:exon_67183180_67184388:B3GNT9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67210855 G/C 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 C:G G C 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000196123:ENST00000440525:exon_67209507_67210878:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67209509_67210878:KIAA0895L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67214346 C/T 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67213944_67214569:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000394016:exon_67213944_67214569:KIAA0895L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67241545 C/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000125122:ENST00000409509:exon_67241042_67241676:LRRC29;ENSG00000125122:ENST00000393992:exon_67241502_67241676:LRRC29;ENSG00000125122:ENST00000409037:exon_67241502_67241676:LRRC29;ENSG00000125122:ENST00000341546:exon_67241502_67241676:LRRC29 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67262689 T/A 1 1 7 8 0.475155478617683 3.67391164967622 -3.19875617105854 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0313158759629617 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67262775 C/T 1 120 60 180 57.018657434122 31.490671282939 25.5279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00013109572925841 ENSG00000168701:ENST00000304800:exon_67262700_67262784:TMEM208;ENSG00000168701:ENST00000404299:exon_67262741_67262784:TMEM208 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67264629 C/T 1 36 25 61 17.1055972302366 13.1211130345579 3.98448419567867 T:C C T 10 0.524844521382317 0.369676301756874 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67264504_67264694:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67264504_67264694:FHOD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 37 40 77 17.5807527088543 20.9937808552927 -3.4130281464384 A:C C A 10 0.524844521382317 0.493891389208386 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67268089 C/T 1 26 25 51 12.3540424440598 13.1211130345579 -0.767070590498165 T:C C T 10 0.524844521382317 0.88886715961801 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67267560_67268170:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67267560_67268170:FHOD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67683528 C/T 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67698929 C/T 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000124074:ENST00000243878:exon_67698899_67699071:C16orf48 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67709850 G/A 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 A:G G A 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000141098:ENST00000268797:exon_67708436_67709956:GFOD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 404 341 745 191.962813361544 178.97198179137 12.9908315701738 A:G A G 10 0.524844521382317 0.359119166582715 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 67981304 G/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000124067:ENST00000338335:exon_67981234_67981338:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000422611:exon_67981234_67981338:SLC12A4;ENSG00000124067:ENST00000316341:exon_67981234_67981338:SLC12A4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 59 41 100 28.0341732384433 21.518625376675 6.5155478617683 C:G G C 10 0.524844521382317 0.194982789103632 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 68293320 T/C 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000103066:ENST00000219345:exon_68293049_68294965:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000444212:exon_68293049_68294959:PLA2G15;ENSG00000103066:ENST00000413021:exon_68293049_68294959:PLA2G15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 68344696 C/T 1 13 8 21 6.17702122202988 4.19875617105854 1.97826505097134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.513299188922784 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68344638_68344848:SLC7A6OS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 68389621 C/T 1 2 9 11 0.950310957235366 4.72360069244085 -3.77328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0314919893609911 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 68893953 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_68893787_68894427:TMCO7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 69152319 C/T 1 148 189 337 70.3230108354171 99.1956145412579 -28.8726037058408 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00183976120592093 ENSG00000103044:ENST00000219322:exon_69152258_69152622:HAS3;ENSG00000103044:ENST00000393782:exon_69152258_69152365:HAS3;ENSG00000168802:ENST00000448552:exon_69151913_69154552:CHTF8;ENSG00000168802:ENST00000306585:exon_69151913_69154552:CHTF8;ENSG00000168802:ENST00000421300:exon_69151913_69154552:CHTF8;ENSG00000168802:ENST00000398233:exon_69151913_69154552:CHTF8;ENSG00000168802:ENST00000523421:exon_69152025_69152428:CHTF8;ENSG00000168802:ENST00000518041:exon_69152037_69152428:CHTF8;ENSG00000168802:ENST00000519534:exon_69152222_69152428:CHTF8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 69191012 G/A 1 34 36 70 16.1552862730012 18.8944027697634 -2.73911649676219 A:G G A 10 0.524844521382317 0.550560699061189 ENSG00000141076:ENST00000314423:exon_69190987_69191143:CIRH1A;ENSG00000141076:ENST00000453167:exon_69190987_69191143:CIRH1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 102 93 195 48.4658588190037 48.8105404885555 -0.344681669551804 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 69368841 G/A 1 30 19 49 14.2546643585305 9.97204590626402 4.28261845226647 A:G G A 10 0.524844521382317 0.253311905869154 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69368424_69369251:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69368424_69369251:COG8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 69369240 G/A 1 45 30 75 21.3819965377957 15.7453356414695 5.63666089632623 A:G G A 10 0.524844521382317 0.204854829293055 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69368424_69369251:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69368424_69369251:COG8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 69401085 G/T 1 31 43 74 14.7298198371482 22.5683144194396 -7.83849458229146 T:G G T 10 0.524844521382317 0.080342050567734 ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69400710_69401102:TERF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 69973297 C/T 1 26 23 49 12.3540424440598 12.0714239917933 0.282618452266469 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973244_69973316:WWP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 20 25 45 9.50310957235366 13.1211130345579 -3.61800346220426 A:G G A 10 0.524844521382317 0.298919719871587 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70164334 A/G 1 13 1 14 6.17702122202988 0.524844521382317 5.65217670064756 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00213797850171758 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70164326_70164447:PDPR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70190401 C/T 1 16 4 20 7.60248765788293 2.09937808552927 5.50310957235366 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.0138529821356997 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70285102 T/G 1 73 48 121 34.6863499390909 25.1925370263512 9.49381291273965 T:G T G 10 0.524844521382317 0.100941315456655 ENSG00000223496:ENST00000435634:exon_70284134_70285833:EXOSC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70287574 A/G 1 2 13 15 0.950310957235366 6.82297877797012 -5.87266782073475 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00299070456497236 ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70287569_70287703:AARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70303659 C/T 1 84 112 196 39.9130602038854 58.7825863948195 -18.8695261909341 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00799577686338801 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70351429 C/G 1 32 29 61 15.2049753157659 15.2204911200872 -0.0155158043213355 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000157349:ENST00000393657:exon_70351399_70351491:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000288071:exon_70351399_70351491:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000417604:exon_70351399_70351491:DDX19B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70506907 T/C 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C T C 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70506886_70507256:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70506886_70507256:FUK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70509610 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70509551_70509670:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70509551_70509670:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70509551_70509670:FUK;ENSG00000157353:ENST00000498702:exon_70509551_70509670:FUK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70512191 C/T 1 21 12 33 9.97826505097134 6.2981342565878 3.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.225009638406071 ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70512175_70512362:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70512175_70512362:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70512175_70512362:FUK;ENSG00000157353:ENST00000498702:exon_70512175_70512362:FUK;ENSG00000157353:ENST00000485034:exon_70511261_70512362:FUK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 21 30 51 9.97826505097134 15.7453356414695 -5.76707059049817 T:C C T 10 0.524844521382317 0.122939214831000 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 17 10 27 8.07764313650061 5.24844521382317 2.82919792267744 A:T A T 10 0.524844521382317 0.336756432357263 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 78 74 152 37.0621273321793 38.8384945822915 -1.77636725011217 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807710530436599 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 70729448 T/C 1 22 23 45 10.453420529589 12.0714239917933 -1.61800346220426 T:C T C 10 0.524844521382317 0.6566337577171 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70729447_70729526:VAC14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 71317533 T/C 1 23 15 38 10.9285760082067 7.87266782073475 3.05590818747195 T:C T C 10 0.524844521382317 0.335254961525510 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 71317763 T/C 1 16 29 45 7.60248765788293 15.2204911200872 -7.61800346220426 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0251079520487829 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 71483497 C/G 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 C:G C G 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000167377:ENST00000393539:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000497160:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000357254:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000417828:exon_71481513_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000428724:exon_71481513_71483788:ZNF23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 71895777 C/T 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000102984:ENST00000446827:exon_71895679_71895845:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000425432:exon_71895679_71895845:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000313565:exon_71895679_71895845:ZNF821 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 72042682 A/C 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 A:C A C 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000102967:ENST00000219240:exon_72042643_72042684:DHODH;ENSG00000102967:ENST00000378782:exon_72042643_72042684:DHODH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 18 13 31 8.5527986151183 6.82297877797012 1.72981983714817 C:G C G 10 0.524844521382317 0.592324700211678 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 7 14 21 3.32608835032378 7.34782329935244 -4.02173494902866 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0847282864109202 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 10 14 24 4.75155478617683 7.34782329935244 -2.59626851317561 T:C T C 10 0.524844521382317 0.312817090933246 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 26 15 41 12.3540424440598 7.87266782073475 4.481374623325 A:G G A 10 0.524844521382317 0.210465500710248 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 38 42 80 18.055908187472 22.0434698980573 -3.98756171058536 A:C C A 10 0.524844521382317 0.373514531024675 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 62 0 62 29.4596396742963 0 29.4596396742963 C C 10 0.524844521382317 5.02360229677675e-18 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 74487125 C/G 1 57 49 106 27.0838622812079 25.7173815477335 1.3664807334744 C:G C G 10 0.524844521382317 0.845973601917846 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74487069_74487232:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74487069_74487232:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74481328_74487232:GLG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 74491833 A/G 1 25 16 41 11.8788869654421 8.39751234211707 3.481374623325 A:G A G 10 0.524844521382317 0.348311219954211 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74491772_74491892:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74491772_74491892:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74491772_74491892:GLG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 74920191 G/A 1 19 10 29 9.02795409373598 5.24844521382317 3.77950887991281 A:G G A 10 0.524844521382317 0.193890918307861 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74920168_74920294:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74920168_74920294:WDR59 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 75204282 C/A 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:C C A 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000184517:ENST00000332307:exon_75203151_75206129:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000464850:exon_75203151_75205898:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000393430:exon_75203151_75206114:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000378686:exon_75203151_75206129:ZFP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 75269095 C/T 1 24 42 66 11.4037314868244 22.0434698980573 -10.6397384112329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00945947918284069 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 75481411 G/T 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 T:G G T 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000166822:ENST00000357613:exon_75476952_75481586:TMEM170A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 75646423 A/G 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G A G 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 75646511 G/C 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 C:G G C 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000065457:ENST00000307921:exon_75646141_75646759:ADAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 75661803 G/C 1 110 169 279 52.2671026479451 88.6987241136116 -36.4316214656664 C:G G C 10 0.524844521382317 1.43841145136549e-05 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75661628_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75661628_75661891:KARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 T:C T C 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 81030976 G/A 1 53 65 118 25.1832403667372 34.1148938898506 -8.9316535231134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.116780583631261 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81030919_81031034:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81030919_81031034:C16orf61 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 81050965 A/T 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 A:T A T 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81050931_81050990:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81050931_81050990:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81050931_81050990:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81050931_81050990:CENPN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 2 9 11 0.950310957235366 4.72360069244085 -3.77328973520549 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0314919893609911 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 81737633 C/T 1 15 9 24 7.12733217926525 4.72360069244085 2.40373148682439 T:C C T 10 0.524844521382317 0.414775891663106 ENSG00000153815:ENST00000398040:exon_81737544_81737690:AC099480.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 70 58 128 33.2608835032378 30.4409822401744 2.81990126306343 T:C T C 10 0.524844521382317 0.658510213345684 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 81968131 A/G 1 160 123 283 76.0248765788293 64.555876130025 11.4690004488043 A:G A G 10 0.524844521382317 0.190315994971977 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81968034_81968136:PLCG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 83933139 C/T 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 T:C C T 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83932730_83933277:MLYCD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 83999000 C/G 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 C:G C G 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000140961:ENST00000343939:exon_83998667_83999937:OSGIN1;ENSG00000140961:ENST00000361711:exon_83998667_83999937:OSGIN1;ENSG00000140961:ENST00000393306:exon_83998667_83999937:OSGIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84158248 G/C 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 C:G G C 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000103160:ENST00000219439:exon_84155746_84158333:HSDL1;ENSG00000103160:ENST00000434463:exon_84155888_84158333:HSDL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84212710 C/T 1 49 47 96 23.2826184522665 24.6676925049689 -1.38507405270243 T:C C T 10 0.524844521382317 0.83821970468444 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84212779 G/A 1 39 42 81 18.5310636660896 22.0434698980573 -3.51240623196767 A:G G A 10 0.524844521382317 0.438788478606255 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84212853 G/C 1 48 54 102 22.8074629736488 28.3416041546451 -5.53414118099633 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.277327900215484 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84212928 G/A 1 44 38 82 20.9068410591781 19.944091812528 0.962749246650009 A:G G A 10 0.524844521382317 0.912055743787258 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 49 47 96 23.2826184522665 24.6676925049689 -1.38507405270243 T:C C T 10 0.524844521382317 0.83821970468444 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 29 25 54 13.7795088799128 13.1211130345579 0.658395845354883 A:T A T 10 0.524844521382317 0.892317247071786 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84520325 T/C 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84520237_84520665:KIAA1609 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84522897 G/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 C:G G C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84522884_84523028:KIAA1609 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84529303 T/G 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 T:G T G 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84529289_84529519:KIAA1609 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 A:G A G 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84695301 C/T 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 35 52 87 16.6304417516189 27.2919151118805 -10.6614733602616 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.0240373346410248 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 106 106 212 50.3664807334744 55.6335192665256 -5.26703853305119 A:G A G 10 0.524844521382317 0.491944504839535 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 85011548 C/T 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85011530_85011611:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85011530_85011611:ZDHHC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 85100796 A/G 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000135709:ENST00000258180:exon_85100506_85101006:KIAA0513 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 85696618 C/T 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 T:C C T 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85696587_85696699:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85696587_85696699:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85696587_85696699:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85696587_85696699:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85696587_85696699:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85696587_85696699:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000479488:exon_85696587_85696959:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85695897_85697220:KIAA0182 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 85722496 A/C 1 15 5 20 7.12733217926525 2.62422260691158 4.50310957235366 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0463439224535587 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85722415_85722605:GINS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 85839515 C/G 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 C:G C G 10 0.524844521382317 0.835349552103723 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 86565826 C/G 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 C:G C G 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 87742973 C/G 1 49 50 99 23.2826184522665 26.2422260691158 -2.95960761684938 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.615091443016802 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87742871_87743273:KLHDC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 87743072 C/T 1 41 47 88 19.481374623325 24.6676925049689 -5.18631788164389 T:C C T 10 0.524844521382317 0.286737621639834 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87742871_87743273:KLHDC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88052161 C/A 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:C C A 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 299 315 614 142.071488106687 165.32602423543 -23.2545361287426 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0630340395091232 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88713473 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88767769 G/C 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 C:G G C 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88767670_88767826:RNF166 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 29 34 63 13.7795088799128 17.8447137269988 -4.06520484708597 C:G G C 10 0.524844521382317 0.315576559621082 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88779077 G/A 1 30 32 62 14.2546643585305 16.7950246842341 -2.54036032570365 A:G G A 10 0.524844521382317 0.527798183512304 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88780150 C/T 1 30 25 55 14.2546643585305 13.1211130345579 1.13355132397257 T:C C T 10 0.524844521382317 0.7885860107291 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780055_88780186:CTU2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88780923 C/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 C:G C G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88781140 C/T 1 35 28 63 16.6304417516189 14.6956465987049 1.93479515291403 T:C C T 10 0.524844521382317 0.705503423091482 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88871873 C/T 1 61 50 111 28.9844841956787 26.2422260691158 2.74225812656282 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.635345830177009 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 52 100 152 24.7080848881195 52.4844521382317 -27.7763672501122 A:G A G 10 0.524844521382317 6.5769516299925e-06 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88873790 C/T 1 56 69 125 26.6087068025902 36.2142719753799 -9.60556517278962 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0892351379356603 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88873689_88873890:CDT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 89 126 215 42.2888375969738 66.1304096941719 -23.8415720971981 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00128340593535520 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88876059 A/G 1 219 180 399 104.059049817273 94.4720138488171 9.58703596845552 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.341368798803658 ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88877004 A/G 1 10 18 28 4.75155478617683 9.4472013848817 -4.69564659870487 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0888810760764663 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 88958850 T/C 1 17 6 23 8.07764313650061 3.1490671282939 4.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0579341542498876 ENSG00000129993:ENST00000327483:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268679:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268683:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000448839:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000436887:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000360302:exon_88958652_88958893:CBFA2T3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 36 2 38 17.1055972302366 1.04968904276463 16.055908187472 T:C C T 10 0.524844521382317 2.04840411992879e-08 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 34 1 35 16.1552862730012 0.524844521382317 15.6304417516189 T:C T C 10 0.524844521382317 8.9366024462262e-09 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 31 0 31 14.7298198371482 0 14.7298198371482 G G 10 0.524844521382317 2.1897945488768e-09 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 33 3 36 15.6801307943835 1.57453356414695 14.1055972302366 T:C T C 10 0.524844521382317 7.15598961270806e-07 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 30 3 33 14.2546643585305 1.57453356414695 12.6801307943835 A:C C A 10 0.524844521382317 4.09564335093398e-06 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 22 17 39 10.453420529589 8.92235686349939 1.53106366608964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.635279645808825 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 30 47 77 14.2546643585305 24.6676925049689 -10.4130281464384 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0219044093408651 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89662875 G/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 C:G G C 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 90 55 145 42.7639930755915 28.8664486760274 13.897544399564 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0244447020847471 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89735871 C/T 1 12 15 27 5.7018657434122 7.87266782073475 -2.17080207732256 T:C C T 10 0.524844521382317 0.444663614174346 ENSG00000167523:ENST00000301031:exon_89735694_89737675:C16orf55;ENSG00000167523:ENST00000457689:exon_89735694_89737675:C16orf55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89764237 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000158792:ENST00000289805:exon_89762751_89764713:SPATA2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89789898 T/C 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 T:C T C 10 0.524844521382317 0.433796952873074 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89805977 G/A 1 25 17 42 11.8788869654421 8.92235686349939 2.95653010194269 A:G G A 10 0.524844521382317 0.440310935423641 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89836323 C/T 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89866043 T/C 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89866013_89866046:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000389302:exon_89866013_89866046:FANCA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89940232 A/C 1 92 80 172 43.7143040328268 41.9875617105854 1.72674232224148 A:C A C 10 0.524844521382317 0.819109684725447 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89939970_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000310554:exon_89940019_89940267:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89940019_89940267:TCF25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89967217 T/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 89970566 C/T 1 123 140 263 58.444123869975 73.4782329935244 -15.0341091235494 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0642430236459918 ENSG00000141002:ENST00000263346:exon_89970526_89970613:TCF25;ENSG00000141002:ENST00000263347:exon_89970526_89970613:TCF25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 16 90102835 A/G 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90102789_90102994:GAS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 648157 G/A 1 106 105 211 50.3664807334744 55.1086747451433 -4.74219401166888 A:G G A 10 0.524844521382317 0.535340464637987 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 648186 G/A 1 108 108 216 51.3167916907098 56.6832083092902 -5.36641661858046 A:G G A 10 0.524844521382317 0.495848918534395 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 649505 T/A 1 75 74 149 35.6366608963262 38.8384945822915 -3.20183368596523 A:T T A 10 0.524844521382317 0.623115750251185 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 649547 G/C 1 52 46 98 24.7080848881195 24.1428479835866 0.565236904532938 C:G G C 10 0.524844521382317 0.919850693466952 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 650739 A/G 1 42 52 94 19.9565301019427 27.2919151118805 -7.3353850099378 A:G A G 10 0.524844521382317 0.148058703778712 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 685752 G/A 1 23 19 42 10.9285760082067 9.97204590626402 0.956530101942688 A:G G A 10 0.524844521382317 0.877488592984835 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685696_685794:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 910445 G/A 1 32 19 51 15.2049753157659 9.97204590626402 5.23292940950184 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161508282645967 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_910405_910552:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_910405_910552:ABR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 163 176 339 77.4503430146823 92.3726357632878 -14.9222927486055 A:C C A 10 0.524844521382317 0.114670506288153 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 65 62 127 30.8851061101494 32.5403603257037 -1.65525421555425 T:C T C 10 0.524844521382317 0.79028206727701 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1386915 C/G 1 24 30 54 11.4037314868244 15.7453356414695 -4.34160415464512 C:G C G 10 0.524844521382317 0.275942156181052 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1386904_1387019:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1386904_1387019:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1386904_1387019:MYO1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1401279 G/A 1 13 7 20 6.17702122202988 3.67391164967622 2.50310957235366 A:G G A 10 0.524844521382317 0.371027109529449 ENSG00000132376:ENST00000397335:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000421807:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000406424:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000350761:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000320345:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000461552:exon_1401230_1401495:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000495339:exon_1401052_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000449479:exon_1401230_1401416:INPP5K HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1494568 G/A 1 49 33 82 23.2826184522665 17.3198692056165 5.96274924665001 A:G G A 10 0.524844521382317 0.223692774969212 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1538546 C/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1551231 C/T 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000167705:ENST00000301336:exon_1551129_1551251:RILP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1556958 G/A 1 316 368 684 150.149131243188 193.142783868693 -42.9936526255048 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00112254494314607 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1556836_1556977:PRPF8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1637164 C/T 1 27 28 55 12.8291979226774 14.6956465987049 -1.86644867602743 T:C C T 10 0.524844521382317 0.685976284263498 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1638918 G/A 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1638866_1639011:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1638866_1639011:WDR81 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1684575 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 7 19 26 3.32608835032378 9.97204590626402 -6.64595755594024 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0101624048212179 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 1792040 G/A 1 30 55 85 14.2546643585305 28.8664486760274 -14.6117843174969 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00156309740106348 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1791969_1792145:RPA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2186100 C/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2185941_2186153:SMG6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2203025 T/G 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 T:G T G 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 T:G T G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2203221 T/C 1 8 12 20 3.80124382894146 6.2981342565878 -2.49689042764634 T:C T C 10 0.524844521382317 0.273827921303142 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 A:G A G 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2224588 A/G 1 14 17 31 6.65217670064756 8.92235686349939 -2.27018016285183 A:G A G 10 0.524844521382317 0.473797754482654 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2224807 A/G 1 14 29 43 6.65217670064756 15.2204911200872 -8.56831441943963 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00934965539913569 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2275544 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2275484_2275548:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2275484_2275548:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2275484_2275548:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2275484_2275548:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2275484_2275548:SGSM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2275734 C/G 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 C:G C G 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2275637_2275782:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2275637_2275782:SGSM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2278920 C/T 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.370589300195247 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2278786_2279169:SGSM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2279144 C/T 1 9 14 23 4.27639930755915 7.34782329935244 -3.07142399179329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.216326895269441 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2278786_2279169:SGSM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2405559 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000127804:ENST00000263092:exon_2405498_2405625:METT10D;ENSG00000127804:ENST00000399834:exon_2405498_2405625:METT10D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 2604017 G/A 1 19 20 39 9.02795409373598 10.4968904276463 -1.46893633391036 A:G G A 10 0.524844521382317 0.7489542252078 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2603972_2604119:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2603972_2604119:KIAA0664 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3526637 C/T 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197417:ENST00000225519:exon_3526633_3526785:SHPK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3627619 C/T 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 23 21 44 10.9285760082067 11.0217349490287 -0.0931589408219473 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 14 14 28 6.65217670064756 7.34782329935244 -0.695646598704876 A:G A G 10 0.524844521382317 0.851171689520466 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3846802 A/G 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3846685_3846816:ATP2A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3848013 A/C 1 11 13 24 5.22671026479451 6.82297877797012 -1.59626851317561 A:C A C 10 0.524844521382317 0.545534900498325 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3924566 C/T 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3924423_3924614:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000414864:exon_3924423_3924614:ZZEF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3926110 C/G 1 16 6 22 7.60248765788293 3.1490671282939 4.45342052958903 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0854111218855252 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3926003_3926122:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3925940_3926122:ZZEF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3953083 T/C 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3953002_3953153:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3953002_3953153:ZZEF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 3967852 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3967655_3968123:ZZEF1;ENSG00000074755:ENST00000427773:exon_3967655_3968123:ZZEF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 4442801 T/C 1 116 93 209 55.1180355196512 48.8105404885555 6.30749503109575 T:C T C 10 0.524844521382317 0.406184803373063 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 4446227 T/G 1 56 58 114 26.6087068025902 30.4409822401744 -3.83227543758414 T:G T G 10 0.524844521382317 0.511887943242188 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 4448324 C/T 1 71 71 142 33.7360389818555 37.2639610181445 -3.52792203628901 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.557703857564503 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4448321_4448470:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4448321_4448470:MYBBP1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 4624340 G/A 1 57 29 86 27.0838622812079 15.2204911200872 11.8633711611207 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0125852966867556 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4624241_4624795:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4624241_4624794:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4624241_4624794:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4624241_4624794:ARRB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 4718776 G/A 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4718771_4718881:PLD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 4722785 G/A 1 10 18 28 4.75155478617683 9.4472013848817 -4.69564659870487 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0888810760764663 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 4722876 G/A 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 4790953 A/G 1 19 12 31 9.02795409373598 6.2981342565878 2.72981983714817 A:G A G 10 0.524844521382317 0.371425597340827 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4790875_4791085:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4790875_4791085:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4790875_4791085:MINK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 44 27 71 20.9068410591781 14.1708020773226 6.7360389818555 A:G G A 10 0.524844521382317 0.122568438594648 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 5286525 C/G 1 66 40 106 31.3602615887671 20.9937808552927 10.3664807334744 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.0513318967421692 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5286417_5286720:RABEP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 142 145 287 67.472077963711 76.102455600436 -8.63037763672497 A:G A G 10 0.524844521382317 0.315450784052255 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 125 121 246 59.3944348272104 63.5061870872604 -4.11175226004997 T:C C T 10 0.524844521382317 0.610043945255788 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 105 121 226 49.8913252548567 63.5061870872604 -13.6148618324036 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0722826713077083 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 19 14 33 9.02795409373598 7.34782329935244 1.68013079438354 T:C T C 10 0.524844521382317 0.604302645486145 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 5461871 A/G 1 30 15 45 14.2546643585305 7.87266782073475 6.38199653779574 A:G A G 10 0.524844521382317 0.072264504743041 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5461659_5463363:NLRP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 6524298 T/A 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6524108_6524318:KIAA0753 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 6663914 G/A 1 18 11 29 8.5527986151183 5.77328973520549 2.77950887991281 A:G G A 10 0.524844521382317 0.354681882687295 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 6674216 T/C 1 26 50 76 12.3540424440598 26.2422260691158 -13.8881836250561 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00175248545005228 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6673962_6674303:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6673962_6674303:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6673962_6674303:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6673962_6674360:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000431790:exon_6673962_6674303:XAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 6900116 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 217 245 462 103.108738860037 128.586907738668 -25.4781688786304 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.0197563299931384 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 6945525 C/T 1 21 19 40 9.97826505097134 9.97204590626402 0.00621914470732143 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6945315_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6945508_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6945517_6946082:SLC16A11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 6945562 G/C 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6945315_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6945508_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6945517_6946082:SLC16A11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 6946287 T/C 1 30 37 67 14.2546643585305 19.4192472911457 -5.16458293261524 T:C T C 10 0.524844521382317 0.222408175385752 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6946249_6946392:SLC16A11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7099811 G/A 1 12 4 16 5.7018657434122 2.09937808552927 3.60248765788293 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0825793217037308 ENSG00000132535:ENST00000399510:exon_7099792_7099894:DLG4;ENSG00000132535:ENST00000399506:exon_7099792_7099894:DLG4;ENSG00000132535:ENST00000302955:exon_7099792_7099894:DLG4;ENSG00000132535:ENST00000293813:exon_7099792_7099894:DLG4;ENSG00000132535:ENST00000380912:exon_7099792_7099894:DLG4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7133161 G/C 1 21 12 33 9.97826505097134 6.2981342565878 3.68013079438354 C:G G C 10 0.524844521382317 0.225009638406071 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 23 31 54 10.9285760082067 16.2701801628518 -5.34160415464512 A:G G A 10 0.524844521382317 0.172822578706914 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 7 13 20 3.32608835032378 6.82297877797012 -3.49689042764634 T:C C T 10 0.524844521382317 0.124086328149616 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 59 28 87 28.0341732384433 14.6956465987049 13.3385266397384 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00497309838375589 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7221385 G/A 1 30 25 55 14.2546643585305 13.1211130345579 1.13355132397257 A:G G A 10 0.524844521382317 0.7885860107291 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 55 62 117 26.1335513239726 32.5403603257037 -6.40680900173108 A:G A G 10 0.524844521382317 0.266636374693119 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7247241 G/A 1 118 85 203 56.0683464768866 44.6117843174969 11.4565621593897 A:G G A 10 0.524844521382317 0.121896472865764 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7247180_7247275:ACAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7359154 T/C 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000170175:ENST00000306071:exon_7359113_7359260:CHRNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7400137 T/C 1 32 57 89 15.2049753157659 29.9161377187921 -14.7111624030262 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00197028000547622 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7400083_7400364:POLR2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7402600 T/C 1 30 27 57 14.2546643585305 14.1708020773226 0.0838622812079333 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7402600_7402810:POLR2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7404107 T/C 1 40 36 76 19.0062191447073 18.8944027697634 0.111816374943913 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7403958_7404167:POLR2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7404991 T/C 1 68 61 129 32.3105725460024 32.0155158043213 0.295056741681115 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7404845_7405048:POLR2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7453505 C/A 1 15 12 27 7.12733217926525 6.2981342565878 0.829197922677442 A:C C A 10 0.524844521382317 0.848089388772471 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7453437_7453512:TNFSF12-TNFSF13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7483018 C/T 1 20 30 50 9.50310957235366 15.7453356414695 -6.24222606911585 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0891241808473158 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7482922_7483044:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7482957_7483044:CD68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 16 17 33 7.60248765788293 8.92235686349939 -1.31986920561646 A:C C A 10 0.524844521382317 0.728380954880147 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7490379 G/C 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 C G C 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490217_7490589:MPDU1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 115 154 269 54.6428800410335 80.8260562928768 -26.1831762518433 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00147226668156154 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7604852 C/T 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 T:C C T 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7604745_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7604777_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7604745_7604867:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000451908:exon_7604777_7604867:WRAP53 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7606350 T/C 1 30 13 43 14.2546643585305 6.82297877797012 7.43168558056037 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0313443930413857 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7606401 C/T 1 39 20 59 18.5310636660896 10.4968904276463 8.0341732384433 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0374487264067083 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7750908 C/T 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C C T 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 7752503 C/G 1 15 7 22 7.12733217926525 3.67391164967622 3.45342052958903 C:G C G 10 0.524844521382317 0.199368685480053 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8025162 C/T 1 15 18 33 7.12733217926525 9.4472013848817 -2.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.486957322619883 ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8024299_8025340:HES7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8044333 C/G 1 52 38 90 24.7080848881195 19.944091812528 4.76399307559148 C:G C G 10 0.524844521382317 0.342919773279806 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8043809_8044658:PER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8046121 T/C 1 25 17 42 11.8788869654421 8.92235686349939 2.95653010194269 T:C T C 10 0.524844521382317 0.440310935423641 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8045967_8046153:PER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 T:C T C 10 0.524844521382317 0.692551486497706 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 20 35 55 9.50310957235366 18.3695582483811 -8.86644867602743 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0209731745764830 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8076876 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8076954 C/G 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8138205 T/C 1 19 18 37 9.02795409373598 9.4472013848817 -0.419247291145727 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8138067_8138244:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8138067_8138244:C17orf68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8166498 G/A 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8166427_8166583:PFAS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8272571 G/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 C:G G C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000184619:ENST00000396267:exon_8271955_8273704:KRBA2;ENSG00000184619:ENST00000331336:exon_8271973_8273704:KRBA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8416901 C/T 1 16 16 32 7.60248765788293 8.39751234211707 -0.795024684234143 T:C C T 10 0.524844521382317 0.860150442628282 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8790936 C/T 1 26 16 42 12.3540424440598 8.39751234211707 3.95653010194269 T:C C T 10 0.524844521382317 0.279427529461582 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8790838_8791000:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8790838_8791000:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8790838_8791000:PIK3R5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 8791652 G/A 1 25 24 49 11.8788869654421 12.5962685131756 -0.717381547733531 A:G G A 10 0.524844521382317 0.886757139632472 ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 16 27 43 7.60248765788293 14.1708020773226 -6.56831441943963 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0478868489842253 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 10608477 A/G 1 33 31 64 15.6801307943835 16.2701801628518 -0.590049368468286 A:G A G 10 0.524844521382317 0.900983591621374 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10608227_10608844:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10608227_10608932:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000527582:exon_10608227_10609245:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10608244_10608844:C17orf48 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 15881327 C/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000214941:ENST00000399277:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000399280:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000491631:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486655:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486706:exon_15881089_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000460252:exon_15881205_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000475498:exon_15881239_15881477:ZSWIM7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 15968304 T/C 1 6 14 20 2.8509328717061 7.34782329935244 -4.49689042764634 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0705691660566987 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000470782:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_15968184_15968333:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_15968184_15968333:NCOR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 16001756 G/A 1 27 16 43 12.8291979226774 8.39751234211707 4.43168558056037 A:G G A 10 0.524844521382317 0.221609182316484 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395848:exon_16001681_16001810:NCOR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 16089995 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000437142:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000411510:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000436828:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000460276:exon_16089868_16090001:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000430577:exon_16089868_16090001:NCOR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 16285404 C/T 1 2671 2208 4879 1269.14028338783 1158.85670321216 110.283580175676 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.00161071283317925 ENSG00000170315:ENST00000302182:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395839:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395837:exon_16285216_16286054:UBB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 16321176 G/A 1 50 53 103 23.7577739308842 27.8167596332628 -4.05898570237865 A:G G A 10 0.524844521382317 0.431699329473637 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 53 59 112 25.1832403667372 30.9658267615567 -5.7825863948195 A:G A G 10 0.524844521382317 0.298340762742846 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 16 16 32 7.60248765788293 8.39751234211707 -0.795024684234143 T:C T C 10 0.524844521382317 0.860150442628282 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 T:G T G 10 0.524844521382317 0.164439911805120 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 17080575 C/T 1 27 25 52 12.8291979226774 13.1211130345579 -0.291915111880481 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000313485:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000414263:exon_17080564_17080726:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000462033:exon_17080566_17080726:MPRIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 17425631 C/T 1 8 9 17 3.80124382894146 4.72360069244085 -0.922356863499388 T:C C T 10 0.524844521382317 0.809125944455852 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000421096:exon_17425594_17425709:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000461404:exon_17425594_17425709:PEMT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 17696755 C/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:C C A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17696263_17696878:RAI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 17698254 G/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395774:exon_17696247_17699090:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000355970:exon_17696263_17699091:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17697562_17700505:RAI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 17700573 T/C 1 18 18 36 8.5527986151183 9.4472013848817 -0.89440276976341 T:C T C 10 0.524844521382317 0.86782104725156 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 17700792 C/T 1 23 25 48 10.9285760082067 13.1211130345579 -2.19253702635121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.564993307275273 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17700698_17701668:RAI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 18088094 C/T 1 55 50 105 26.1335513239726 26.2422260691158 -0.108674745143279 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 18111575 G/A 1 85 63 148 40.3882156825031 33.065204847086 7.32301083541709 A:G G A 10 0.524844521382317 0.249377464363671 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18111533_18111681:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18111533_18113268:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000490106:exon_18111533_18113268:ALKBH5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 130 135 265 61.7702122202988 70.8540103866128 -9.08379816631399 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.268799370927894 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 18148944 C/G 1 147 125 272 69.8478553567994 65.6055651727896 4.24229018400978 C:G C G 10 0.524844521382317 0.62747989878919 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 18217958 C/T 1 1 10 11 0.475155478617683 5.24844521382317 -4.77328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00449787765253531 ENSG00000177302:ENST00000412083:exon_18217913_18218030:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18217913_18218288:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000461127:exon_18217913_18218258:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000472959:exon_18217913_18218274:TOP3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 20 17 37 9.50310957235366 8.92235686349939 0.580752708854273 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.870899695467464 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 18575140 A/G 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 A A 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 19284071 G/C 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 C:G G C 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000443215:exon_19283921_19284246:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000412231:exon_19283921_19285124:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19283921_19284999:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000482850:exon_19283921_19284526:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 19285636 G/A 1 9 11 20 4.27639930755915 5.77328973520549 -1.49689042764634 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512500587924667 ENSG00000166484:ENST00000308406:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000299612:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000490660:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395604:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000395602:exon_19285094_19285779:MAPK7;ENSG00000166484:ENST00000457323:exon_19281842_19285779:MAPK7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 19812541 T/C 1 8 13 21 3.80124382894146 6.82297877797012 -3.02173494902866 T:C T C 10 0.524844521382317 0.197904266837508 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19812494_19812589:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19812494_19812589:AKAP10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 T:C C T 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 20108184 C/G 1 22 10 32 10.453420529589 5.24844521382317 5.20497531576586 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0766928270827685 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 24 25 49 11.4037314868244 13.1211130345579 -1.71738154773353 T:C C T 10 0.524844521382317 0.669137920279147 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 48 0 48 22.8074629736488 0 22.8074629736488 T T 10 0.524844521382317 5.30524461205064e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 40 0 40 19.0062191447073 0 19.0062191447073 T T 10 0.524844521382317 1.16780449016854e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 44 0 44 20.9068410591781 0 20.9068410591781 G G 10 0.524844521382317 7.7952893200203e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 1 46 1 47 21.8571520164134 0.524844521382317 21.3323074950311 A:G G A 10 0.524844521382317 3.91130252081596e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 44 0 44 20.9068410591781 0 20.9068410591781 C C 10 0.524844521382317 7.7952893200203e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 40 0 40 19.0062191447073 0 19.0062191447073 C C 10 0.524844521382317 1.16780449016854e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 55 0 55 26.1335513239726 0 26.1335513239726 C C 10 0.524844521382317 5.03555978000581e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 47 0 47 22.3323074950311 0 22.3323074950311 C C 10 0.524844521382317 1.03678711416411e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 31 0 31 14.7298198371482 0 14.7298198371482 C C 10 0.524844521382317 2.1897945488768e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 34 0 34 16.1552862730012 0 16.1552862730012 C C 10 0.524844521382317 3.13011112872469e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 36 0 36 17.1055972302366 0 17.1055972302366 G G 10 0.524844521382317 8.5711295648395e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 107 0 107 50.8416362120921 0 50.8416362120921 G G 10 0.524844521382317 1.29052843231243e-30 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 26687811 G/A 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 A:G G A 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26687758_26687870:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26687758_26687870:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26687758_26687870:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26687552_26687870:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26687758_26687870:TMEM199 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 26912923 C/T 1 56 49 105 26.6087068025902 25.7173815477335 0.891325254856717 T:C C T 10 0.524844521382317 0.922249483276053 ENSG00000076382:ENST00000321765:exon_26912882_26913016:SPAG5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 109 81 190 51.7919471693275 42.5124062319677 9.27954093735978 T:C C T 10 0.524844521382317 0.191163145947827 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 27225586 A/T 1 19 12 31 9.02795409373598 6.2981342565878 2.72981983714817 A:T A T 10 0.524844521382317 0.371425597340827 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27224801_27225910:DHRS13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 27425410 G/A 1 28 30 58 13.3043534012951 15.7453356414695 -2.44098224017439 A:G G A 10 0.524844521382317 0.599378874435858 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27425374_27425463:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000532143:exon_27425389_27425463:MYO18A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 27493512 G/A 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27492960_27494039:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27492960_27494039:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27492960_27494039:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27492960_27493958:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27492960_27493958:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27492960_27493958:MYO18A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 27530413 T/C 0 10 0 10 4.75155478617683 0 4.75155478617683 T T 10 0.524844521382317 0.00217263351343085 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 27889963 C/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 27889986 T/C 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 28846990 A/G 1 30 35 65 14.2546643585305 18.3695582483811 -4.1148938898506 A:G A G 10 0.524844521382317 0.322492508042395 ENSG00000108587:ENST00000225724:exon_28846957_28847039:GOSR1;ENSG00000108587:ENST00000451249:exon_28846957_28847039:GOSR1;ENSG00000108587:ENST00000414833:exon_28846957_28847039:GOSR1;ENSG00000108587:ENST00000467337:exon_28846957_28847039:GOSR1;ENSG00000108587:ENST00000494918:exon_28846957_28847039:GOSR1;ENSG00000108587:ENST00000477885:exon_28846717_28847039:GOSR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 56 41 97 26.6087068025902 21.518625376675 5.09008142591525 T:G T G 10 0.524844521382317 0.311142394384506 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 11 20 31 5.22671026479451 10.4968904276463 -5.27018016285183 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0713947315459997 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 29161845 G/A 0 10 0 10 4.75155478617683 0 4.75155478617683 G G 10 0.524844521382317 0.00217263351343085 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 29214387 T/C 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29214210_29214390:ATAD5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 29226228 T/C 1 15 13 28 7.12733217926525 6.82297877797012 0.304353401295125 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 33 28 61 15.6801307943835 14.6956465987049 0.984484195678665 A:G G A 10 0.524844521382317 0.898138048935445 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 30190348 A/G 1 218 161 379 103.583894338655 84.499967942553 19.0839263961019 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0507214617457299 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 30228590 C/T 1 15 11 26 7.12733217926525 5.77328973520549 1.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.695987302704438 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 30228656 G/A 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 30696296 G/A 1 8 12 20 3.80124382894146 6.2981342565878 -2.49689042764634 A:G G A 10 0.524844521382317 0.273827921303142 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 33288882 T/G 1 25 16 41 11.8788869654421 8.39751234211707 3.481374623325 T:G T G 10 0.524844521382317 0.348311219954211 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 33591403 A/G 1 29 3 32 13.7795088799128 1.57453356414695 12.2049753157659 A:G A G 10 0.524844521382317 7.29795201859294e-06 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33591202_33591922:SLFN5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 44 1 45 20.9068410591781 0.524844521382317 20.3819965377957 T:C C T 10 0.524844521382317 1.41277798407072e-11 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 20 17 37 9.50310957235366 8.92235686349939 0.580752708854273 A:G G A 10 0.524844521382317 0.870899695467464 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 33768383 T/A 1 27 15 42 12.8291979226774 7.87266782073475 4.95653010194269 A:T T A 10 0.524844521382317 0.163669221194965 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 460 210 670 218.571520164134 110.217349490287 108.354170673848 A:T:G G A 10 0.524844521382317 2.46996777620377e-17 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 116 34 150 55.1180355196512 17.8447137269988 37.2733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 4.02619458457551e-10 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 116 34 150 55.1180355196512 17.8447137269988 37.2733217926525 A:T T A 10 0.524844521382317 4.02619458457551e-10 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 35307672 G/A 1 123 92 215 58.444123869975 48.2856959671732 10.1584279028019 A:G G A 10 0.524844521382317 0.172388528078660 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35307514_35307705:AATF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 35376351 C/T 1 43 46 89 20.4316855805604 24.1428479835866 -3.71116240302621 T:C C T 10 0.524844521382317 0.45844950589139 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35376304_35376371:AATF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 36936846 C/T 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000141720:ENST00000269554:exon_36936705_36936857:PIP4K2B;ENSG00000141720:ENST00000311500:exon_36936705_36936857:PIP4K2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 37074869 C/T 1 67 72 139 31.8354170673848 37.7888055395268 -5.95338847214206 T:C C T 10 0.524844521382317 0.350262574012615 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 37331851 G/A 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37330054_37331910:CACNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 17 10 27 8.07764313650061 5.24844521382317 2.82919792267744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.336756432357263 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 37884037 C/G 1 4 12 16 1.90062191447073 6.2981342565878 -4.39751234211707 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0420487835421222 ENSG00000141736:ENST00000406381:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000269571:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000445658:exon_37883942_37884915:ERBB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 21 13 34 9.97826505097134 6.82297877797012 3.15528627300122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.306539571272256 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 T:C C T 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38175907 G/T 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38175926 C/T 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 T:C C T 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38282624 C/T 1 63 65 128 29.934795152914 34.1148938898506 -4.18009873693657 T:C C T 10 0.524844521382317 0.479713391778267 ENSG00000188895:ENST00000339569:exon_38282436_38282659:MSL1;ENSG00000188895:ENST00000398532:exon_38282436_38282659:MSL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38349923 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000108352:ENST00000264644:exon_38349916_38351906:RAPGEFL1;ENSG00000108352:ENST00000436615:exon_38349916_38351908:RAPGEFL1;ENSG00000108352:ENST00000456989:exon_38349916_38350040:RAPGEFL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38418816 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000171475:ENST00000323571:exon_38418777_38418893:WIPF2;ENSG00000171475:ENST00000494757:exon_38418777_38418893:WIPF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 18 13 31 8.5527986151183 6.82297877797012 1.72981983714817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.592324700211678 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38545824 C/A 1 167 140 307 79.3509649291531 73.4782329935244 5.87273193562869 A:C C A 10 0.524844521382317 0.529750744768744 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38544768_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38544795_38545899:TOP2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38547868 C/T 1 53 62 115 25.1832403667372 32.5403603257037 -7.35711995896645 T:C C T 10 0.524844521382317 0.191076885761291 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38547758_38547892:TOP2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 38548586 T/G 1 86 72 158 40.8633711611207 37.7888055395268 3.07456562159392 T:C:G T G 10 0.524844521382317 0.633705862043923 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38548466_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38548470_38548593:TOP2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 39471929 G/A 1 3 11 14 1.42546643585305 5.77328973520549 -4.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0291024169803525 ENSG00000186860:ENST00000334202:exon_39471173_39471947:KRTAP17-1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 39983644 A/C 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 A:C A C 10 0.524844521382317 0.208583822897317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 44 51 95 20.9068410591781 26.7670705904982 -5.86022953132011 C:G G C 10 0.524844521382317 0.258530190326977 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 50 52 102 23.7577739308842 27.2919151118805 -3.53414118099633 A:G G A 10 0.524844521382317 0.489575500486146 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40048613 A/G 1 72 81 153 34.2111944604732 42.5124062319677 -8.30121177149449 A:G A G 10 0.524844521382317 0.195317672766786 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40048532_40048700:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40048532_40048700:ACLY HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40062789 G/A 1 60 42 102 28.509328717061 22.0434698980573 6.46585881900367 A:G G A 10 0.524844521382317 0.234046581743631 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40062781_40062899:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40062781_40062899:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40062781_40062899:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40062781_40062899:ACLY HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40065774 T/G 1 49 42 91 23.2826184522665 22.0434698980573 1.23914855420916 T:C:G T G 10 0.524844521382317 0.834168935715359 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40065763_40065953:ACLY HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40142302 T/C 1 67 72 139 31.8354170673848 37.7888055395268 -5.95338847214206 T:C T C 10 0.524844521382317 0.350262574012615 ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000426588:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40142282_40142400:DNAJC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 37 13 50 17.5807527088543 6.82297877797012 10.7577739308842 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00260881315060614 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40280291 G/A 1 49 42 91 23.2826184522665 22.0434698980573 1.23914855420916 A:G G A 10 0.524844521382317 0.834168935715359 ENSG00000108774:ENST00000346213:exon_40280279_40280401:RAB5C;ENSG00000108774:ENST00000393860:exon_40280279_40280401:RAB5C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40344426 C/T 1 40 33 73 19.0062191447073 17.3198692056165 1.68634993909086 T:C C T 10 0.524844521382317 0.72625365178656 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40353722 A/G 1 27 29 56 12.8291979226774 15.2204911200872 -2.39129319740975 A:G A G 10 0.524844521382317 0.593021419825779 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40351186_40353882:STAT5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40353783 A/G 1 27 27 54 12.8291979226774 14.1708020773226 -1.34160415464511 A:G A G 10 0.524844521382317 0.785678157916196 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40351186_40353882:STAT5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 64 71 135 30.4099506315317 37.2639610181445 -6.85401038661279 T:C C T 10 0.524844521382317 0.26265534625821 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40653296 C/T 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000033627:ENST00000343619:exon_40653215_40653322:ATP6V0A1;ENSG00000033627:ENST00000393829:exon_40653215_40653322:ATP6V0A1;ENSG00000033627:ENST00000264649:exon_40653215_40653322:ATP6V0A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40692923 C/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 34 56 90 16.1552862730012 29.3912931974098 -13.2360069244085 A:C C A 10 0.524844521382317 0.00586215361562572 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 64 59 123 30.4099506315317 30.9658267615567 -0.555876130024988 A:G A G 10 0.524844521382317 0.928318227946542 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40849573 G/A 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40849572_40849817:CNTNAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 40963656 C/T 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.491888204316747 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41174025 A/C 1 31 23 54 14.7298198371482 12.0714239917933 2.65839584535488 A:C A C 10 0.524844521382317 0.498162030811838 ENSG00000108828:ENST00000355653:exon_41173953_41174459:VAT1;ENSG00000108828:ENST00000315674:exon_41173953_41174397:VAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41197659 G/C 1 12 14 26 5.7018657434122 7.34782329935244 -1.64595755594024 C:G G C 10 0.524844521382317 0.559962886005581 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41196312_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41196822_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41197646_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41197646_41197819:BRCA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41245381 T/C 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41341625 C/T 1 13 8 21 6.17702122202988 4.19875617105854 1.97826505097134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.513299188922784 ENSG00000188554:ENST00000389312:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000422280:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000341165:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000389311:exon_41341605_41341819:NBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41341735 T/C 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000188554:ENST00000389312:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000422280:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000341165:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000389311:exon_41341605_41341819:NBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 41611332 G/C 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 C:G G C 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000175832:ENST00000393664:exon_41611227_41611353:ETV4;ENSG00000175832:ENST00000319349:exon_41611227_41611353:ETV4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42155891 C/T 1 89 76 165 42.2888375969738 39.8881836250561 2.40065397191771 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.755355756648098 ENSG00000108840:ENST00000336057:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000393622:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000225983:exon_42155868_42156033:HDAC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 110 138 248 52.2671026479451 72.4285439507597 -20.1614413028146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0109254576544606 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42288661 G/A 1 73 52 125 34.6863499390909 27.2919151118805 7.39443482721038 A:G G A 10 0.524844521382317 0.209859773201304 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42288658_42288699:UBTF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42426574 G/A 1 279 179 458 132.568378534334 93.9471693274347 38.6212092068988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000307401834331557 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42426526_42426670:GRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42426587 C/T 1 182 289 471 86.4782971084183 151.68006667949 -65.2017695710713 T:C C T 10 0.524844521382317 2.11705645453533e-09 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42426526_42426670:GRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42427892 C/T 1 278 234 512 132.093223055716 122.813618003462 9.27960505225373 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.425884920290925 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42427810_42427945:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42427810_42427945:GRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 22 29 51 10.453420529589 15.2204911200872 -4.76707059049817 C:G G C 10 0.524844521382317 0.207454612663682 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42476878 G/A 1 29 19 48 13.7795088799128 9.97204590626402 3.80746297364879 A:G G A 10 0.524844521382317 0.312598278217653 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 42953409 A/G 1 23 24 47 10.9285760082067 12.5962685131756 -1.6676925049689 A:G A G 10 0.524844521382317 0.663026109767045 ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000262414:exon_42953302_42953468:EFTUD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 43011908 G/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43011875_43011985:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43011875_43011985:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000376982:exon_43011875_43011985:KIF18B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 43215102 A/G 1 4 10 14 1.90062191447073 5.24844521382317 -3.34782329935244 A:G A G 10 0.524844521382317 0.106163918875083 ENSG00000181513:ENST00000431281:exon_43215089_43215197:ACBD4;ENSG00000181513:ENST00000321854:exon_43215089_43215197:ACBD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 71 76 147 33.7360389818555 39.8881836250561 -6.15214464320059 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.322427731686765 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 28 31 59 13.3043534012951 16.2701801628518 -2.9658267615567 A:G G A 10 0.524844521382317 0.514915076109222 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 45219354 A/G 1 20 10 30 9.50310957235366 5.24844521382317 4.25466435853049 A:G A G 10 0.524844521382317 0.144094251343473 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45219219_45219388:CDC27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 43 45 88 20.4316855805604 23.6180034622043 -3.18631788164389 A:G G A 10 0.524844521382317 0.522955635515135 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 69 72 141 32.7857280246201 37.7888055395268 -5.00307751490669 T:C T C 10 0.524844521382317 0.400726181933638 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 45811210 A/G 1 37 31 68 17.5807527088543 16.2701801628518 1.31057254600245 A:G A G 10 0.524844521382317 0.808603494926336 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45810610_45811311:TBX21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 45890707 C/T 1 13 8 21 6.17702122202988 4.19875617105854 1.97826505097134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.513299188922784 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45890632_45890769:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45890632_45890769:OSBPL7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 45904420 C/T 1 22 37 59 10.453420529589 19.4192472911457 -8.9658267615567 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0258549535990199 ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000466016:exon_45904261_45904570:MRPL10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 38 24 62 18.055908187472 12.5962685131756 5.45963967429635 A:G G A 10 0.524844521382317 0.203191328654011 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 29 16 45 13.7795088799128 8.39751234211707 5.38199653779574 T:G G T 10 0.524844521382317 0.134932699455806 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 46058107 T/C 1 103 118 221 48.9410142976214 61.9316535231134 -12.9906392254921 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0920006107133148 ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46057959_46058164:CDK5RAP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 46620619 G/A 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000173917:ENST00000504772:exon_46620317_46621070:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000330070:exon_46620017_46621109:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000509853:exon_46620521_46621109:HOXB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 46620688 G/C 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 G G 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 ENSG00000173917:ENST00000504772:exon_46620317_46621070:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000330070:exon_46620017_46621109:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000509853:exon_46620521_46621109:HOXB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 48221079 G/A 1 54 66 120 25.6583958453549 34.6397384112329 -8.98134256587803 A:G G A 10 0.524844521382317 0.119865808665831 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 16 21 37 7.60248765788293 11.0217349490287 -3.41924729114573 T:C T C 10 0.524844521382317 0.323500510661641 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 48450523 C/G 1 29 14 43 13.7795088799128 7.34782329935244 6.43168558056037 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0657019894393955 ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 48450536 T/G 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 T:G T G 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 48453172 G/A 1 3 12 15 1.42546643585305 6.2981342565878 -4.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0171387439018236 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511711:exon_48453158_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48452546_48453344:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48453049_48453344:EME1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 48458241 C/T 1 3 14 17 1.42546643585305 7.34782329935244 -5.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00575999753207545 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48458124_48458786:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48458124_48458818:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48458124_48458820:EME1;ENSG00000154920:ENST00000507616:exon_48458124_48458818:EME1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 48562277 G/A 1 25 19 44 11.8788869654421 9.97204590626402 1.90684105917805 A:G G A 10 0.524844521382317 0.651378297792005 ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48562105_48563336:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48562105_48563335:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48562105_48562359:RSAD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 49043640 T/C 1 23 21 44 10.9285760082067 11.0217349490287 -0.0931589408219473 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49042436_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49042988_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49043005_49043748:SPAG9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 49245634 T/C 1 1267 1162 2429 602.021991408604 609.869333846252 -7.84734243764785 A:T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.760582600124083 ENSG00000011052:ENST00000376392:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393199:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393183:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000514264:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393185:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000513177:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000512737:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000426182:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000503064:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393190:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000011052:ENST00000445778:exon_49245603_49245704:NME2;ENSG00000243678:ENST00000393193:exon_49245603_49245704:NME1-NME2;ENSG00000243678:ENST00000393198:exon_49245603_49245704:NME1-NME2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 17 10 27 8.07764313650061 5.24844521382317 2.82919792267744 T:C T C 10 0.524844521382317 0.336756432357263 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 55183726 G/A 1 16 9 25 7.60248765788293 4.72360069244085 2.87888696544208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.317512505067783 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 55191921 G/A 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55191820_55191997:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55191820_55191997:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55191820_55191997:AKAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 56584508 T/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584484_56584680:MTMR4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 12 3 15 5.7018657434122 1.57453356414695 4.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0384636259591238 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 57288251 C/T 1 20 30 50 9.50310957235366 15.7453356414695 -6.24222606911585 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0891241808473158 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 45 47 92 21.3819965377957 24.6676925049689 -3.28569596717316 A:G G A 10 0.524844521382317 0.531665078703772 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 58121453 G/A 1 12 17 29 5.7018657434122 8.92235686349939 -3.22049112008719 A:G G A 10 0.524844521382317 0.266620142972611 ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58120562_58121495:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58120562_58121495:HEATR6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 59161911 T/C 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000141376:ENST00000360207:exon_59161828_59161927:BCAS3;ENSG00000141376:ENST00000408905:exon_59161828_59161925:BCAS3;ENSG00000141376:ENST00000390652:exon_59161828_59161925:BCAS3;ENSG00000141376:ENST00000407086:exon_59161828_59161925:BCAS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 8 9 17 3.80124382894146 4.72360069244085 -0.922356863499388 A:G A G 10 0.524844521382317 0.809125944455852 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 60040329 C/T 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60040113_60040332:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60040113_60040332:MED13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 60108809 T/C 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000108510:ENST00000262436:exon_60108805_60108999:MED13;ENSG00000108510:ENST00000397786:exon_60108805_60108999:MED13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 61843364 T/G 1 23 25 48 10.9285760082067 13.1211130345579 -2.19253702635121 T:G T G 10 0.524844521382317 0.564993307275273 ENSG00000108588:ENST00000225726:exon_61843272_61843554:CCDC47;ENSG00000108588:ENST00000403162:exon_61843272_61843554:CCDC47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 61843545 A/T 1 24 17 41 11.4037314868244 8.92235686349939 2.481374623325 A:T A T 10 0.524844521382317 0.532225835483175 ENSG00000108588:ENST00000225726:exon_61843272_61843554:CCDC47;ENSG00000108588:ENST00000403162:exon_61843272_61843554:CCDC47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 320 280 600 152.049753157659 146.956465987049 5.09328717060984 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.682940436270203 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 62223615 A/G 1 103 115 218 48.9410142976214 60.3571199589665 -11.4161056613451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.135569496594168 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 62476429 G/A 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 A:G G A 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 65822320 C/G 1 13 18 31 6.17702122202988 9.4472013848817 -3.27018016285183 C:G C G 10 0.524844521382317 0.28184751276817 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65821640_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65821652_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65821780_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65821780_65822453:BPTF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 65907663 C/G 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 C:G C G 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 65907708 G/A 1 12 17 29 5.7018657434122 8.92235686349939 -3.22049112008719 A:G G A 10 0.524844521382317 0.266620142972611 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 65988049 T/C 1 7 13 20 3.32608835032378 6.82297877797012 -3.49689042764634 T:C T C 10 0.524844521382317 0.124086328149616 ENSG00000186665:ENST00000449250:exon_65987218_65988219:C17orf58;ENSG00000186665:ENST00000334461:exon_65987218_65988219:C17orf58 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 165 175 340 78.4006539719177 91.8477912419055 -13.4471372699878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.157913695495868 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 91 114 205 43.2391485542092 59.8322754375841 -16.593126883375 A:T:G T A 10 0.524844521382317 0.0210186326549123 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 50 61 111 23.7577739308842 32.0155158043213 -8.25774187343718 A:C A C 10 0.524844521382317 0.128384825587969 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 70845819 C/T 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_70845773_70845943:SLC39A11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G A G 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 44 30 74 20.9068410591781 15.7453356414695 5.16150541770854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.245856957047118 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 71208827 G/A 1 12 11 23 5.7018657434122 5.77328973520549 -0.0714239917932904 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71208817_71208879:FAM104A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 71232044 C/T 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 5 12 17 2.37577739308842 6.2981342565878 -3.92235686349939 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0863600801774899 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 T:C T C 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 14 18 32 6.65217670064756 9.4472013848817 -2.79502468423414 C:G G C 10 0.524844521382317 0.3775047710159 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 A:G A G 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 72443192 G/T 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 G G 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 72745252 G/A 1 42 66 108 19.9565301019427 34.6397384112329 -14.6832083092902 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0050744252646532 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72744763_72745426:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72745190_72745426:SLC9A3R1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 72768021 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 72769739 A/G 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 A:G A G 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72769715_72769827:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72769715_72769824:NAT9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 84 57 141 39.9130602038854 29.9161377187921 9.9969224850933 T:C T C 10 0.524844521382317 0.108809812984232 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 8 15 23 3.80124382894146 7.87266782073475 -4.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0980444399895555 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 C:G G C 10 0.524844521382317 0.433796952873074 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73127683 T/C 1 58 56 114 27.5590177598256 29.3912931974098 -1.83227543758414 T:C T C 10 0.524844521382317 0.778685661786286 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127629_73127877:NT5C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73221439 C/T 1 26 19 45 12.3540424440598 9.97204590626402 2.38199653779574 T:C C T 10 0.524844521382317 0.55132909892401 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73221437_73221559:NUP85 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73230856 C/T 1 34 23 57 16.1552862730012 12.0714239917933 4.08386228120793 T:C C T 10 0.524844521382317 0.291789014765963 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73236010 G/A 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 A:G G A 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73235870_73236189:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73235870_73236189:GGA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73257986 C/T 1 39 42 81 18.5310636660896 22.0434698980573 -3.51240623196767 T:C C T 10 0.524844521382317 0.438788478606255 ENSG00000125445:ENST00000245539:exon_73257749_73258064:MRPS7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73487533 C/T 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73487384_73487536:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73487384_73487536:KIAA0195 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73513289 C/G 1 6 12 18 2.8509328717061 6.2981342565878 -3.44720138488171 C:G C G 10 0.524844521382317 0.154986439212099 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 54 20 74 25.6583958453549 10.4968904276463 15.1615054177085 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000412652915423348 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 12 10 22 5.7018657434122 5.24844521382317 0.453420529589027 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73760090 A/G 1 7 22 29 3.32608835032378 11.546579470411 -8.22049112008719 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00249073226876617 ENSG00000108479:ENST00000225614:exon_73759978_73760167:GALK1;ENSG00000108479:ENST00000437911:exon_73759978_73760167:GALK1;ENSG00000108479:ENST00000375188:exon_73759978_73760125:GALK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73872101 T/C 0 14 0 14 6.65217670064756 0 6.65217670064756 T T 10 0.524844521382317 0.000150247370579061 ENSG00000132481:ENST00000254816:exon_73871982_73872180:TRIM47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73887324 C/T 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73885041_73887428:TRIM65 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73888240 C/T 1 9 13 22 4.27639930755915 6.82297877797012 -2.54657947041097 T:C C T 10 0.524844521382317 0.293962750959165 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888092_73888266:TRIM65 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73888354 G/A 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 A:G G A 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73888348_73888581:TRIM65 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73916423 A/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:T A T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000188878:ENST00000337792:exon_73916355_73916510:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000319129:exon_73916355_73916510:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000389570:exon_73916355_73916510:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000427433:exon_73916355_73916510:FBF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73919538 G/A 1 1 7 8 0.475155478617683 3.67391164967622 -3.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0313158759629617 ENSG00000188878:ENST00000337792:exon_73919267_73919722:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000319129:exon_73919267_73919719:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000389570:exon_73919267_73919722:FBF1;ENSG00000188878:ENST00000427433:exon_73919267_73919722:FBF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 73945957 A/G 1 12 21 33 5.7018657434122 11.0217349490287 -5.31986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0803628498484152 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73945799_73945978:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73945799_73945978:ACOX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 34 34 68 16.1552862730012 17.8447137269988 -1.68942745399755 T:C C T 10 0.524844521382317 0.716613211005612 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 74774299 C/T 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000092931:ENST00000355954:exon_74774270_74775336:MFSD11;ENSG00000092931:ENST00000336509:exon_74774270_74775336:MFSD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 18 26 44 8.5527986151183 13.6459575559402 -5.09315894082195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.133089348553804 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 75192312 A/G 1 20 8 28 9.50310957235366 4.19875617105854 5.30435340129513 A:G A G 10 0.524844521382317 0.057157160112252 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75192284_75192393:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75192284_75192393:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75192284_75192393:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75192284_75192393:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75192284_75192393:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75192284_75192393:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75192284_75192393:SEC14L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 75398352 G/C 1 91 49 140 43.2391485542092 25.7173815477335 17.5217670064756 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.00299993082245036 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75398141_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75398134_75398785:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000407798:exon_75398140_75398550:SEPT9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 75484932 C/T 1 262 218 480 124.490735397833 114.416105661345 10.0746297364879 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.36112383606504 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75484809_75484946:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75484809_75484946:SEPT9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76109658 G/A 1 195 131 326 92.6553183304482 68.7546323010835 23.9006860293647 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.00905061877410108 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76109629_76109705:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76109629_76109705:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76109629_76109702:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76109629_76109705:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76109629_76109705:TMC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76115097 G/A 1 68 51 119 32.3105725460024 26.7670705904982 5.54350195550428 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 0.314492288235072 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76115052_76115127:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76115052_76115127:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76115052_76115127:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76115052_76115127:TMC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76130575 A/T 1 17 10 27 8.07764313650061 5.24844521382317 2.82919792267744 A:T A T 10 0.524844521382317 0.336756432357263 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76134828 C/A 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:C:G C A 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000167895:ENST00000301627:exon_76134690_76134885:TMC8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 141 117 258 66.9969224850933 61.4068090017311 5.59011348336222 T:C C T 10 0.524844521382317 0.493612597546001 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76198587 A/G 1 16 30 46 7.60248765788293 15.7453356414695 -8.14284798358658 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0179290722792523 ENSG00000183077:ENST00000409257:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000481282:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000327898:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000475701:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000424020:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000458315:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000472544:exon_76198580_76198684:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000484578:exon_76198580_76198684:AFMID HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76399860 C/T 1 44 48 92 20.9068410591781 25.1925370263512 -4.28569596717316 T:C C T 10 0.524844521382317 0.404186531956028 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76399649_76400170:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76399649_76400170:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000335081:exon_76399726_76400170:PGS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76697803 T/C 1 41 29 70 19.481374623325 15.2204911200872 4.26088350323781 T:C T C 10 0.524844521382317 0.339342958719271 ENSG00000108669:ENST00000446868:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000361101:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000392453:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000472366:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000262763:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000434577:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000486140:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000416418:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000490415:exon_76697754_76697833:CYTH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 33 37 70 15.6801307943835 19.4192472911457 -3.73911649676219 A:G G A 10 0.524844521382317 0.403157102407834 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76814782 G/A 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76814749_76814860:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76814749_76814860:USP36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76823425 G/T 0 14 0 14 6.65217670064756 0 6.65217670064756 G G 10 0.524844521382317 0.000150247370579061 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76823327_76823429:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76823327_76823429:USP36;ENSG00000055483:ENST00000432878:exon_76823158_76823429:USP36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76831414 G/A 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000432878:exon_76831362_76831583:USP36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76967805 G/A 1 5 131 136 2.37577739308842 68.7546323010835 -66.3788549079951 A:G G A 10 0.524844521382317 7.91149643067201e-36 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76968417 A/G 0 0 61 61 0 32.0155158043213 -32.0155158043213 G A G 10 0.524844521382317 1.93633371752163e-20 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 35 50 85 16.6304417516189 26.2422260691158 -9.61178431749694 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0391818179005058 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 77073941 T/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000167280:ENST00000311595:exon_77073745_77073946:ENGASE;ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77073745_77073946:ENGASE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 77083019 G/A 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77082015_77084681:ENGASE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 77770298 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77770296_77770339:CBX8;ENSG00000141570:ENST00000427800:exon_77770296_77770339:CBX8;ENSG00000141570:ENST00000413392:exon_77770296_77770339:CBX8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 8 15 23 3.80124382894146 7.87266782073475 -4.07142399179329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0980444399895555 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78187673 G/A 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 G G 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78187603_78187684:SGSH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78319136 G/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78320283 C/T 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78320388 C/T 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78321157 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78321713 C/T 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78321903 G/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78321904 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78337429 A/G 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78337409_78337590:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78337409_78337590:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78363847 G/A 1 41 38 79 19.481374623325 19.944091812528 -0.46271718920304 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78363812_78363996:RNF213 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G A G 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 78972902 C/T 1 32 27 59 15.2049753157659 14.1708020773226 1.0341732384433 T:C C T 10 0.524844521382317 0.796208933700152 ENSG00000176108:ENST00000325167:exon_78972898_78973932:CHMP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79165141 G/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:G G T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79166384 C/T 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 T:C C T 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79169641 G/A 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79170578 C/T 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79170501_79170626:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79170501_79170626:AZI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79171967 A/G 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79171915_79172097:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79171915_79172097:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79171906_79172097:AZI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79173184 T/C 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79173224 T/C 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79181024 T/C 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79180925_79181039:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79180925_79181039:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79180925_79181039:AZI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79193702 C/T 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79193680_79193873:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79193680_79193873:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79193680_79193873:AZI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79219621 G/A 1 76 69 145 36.1118163749439 36.2142719753799 -0.10245560043596 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79224985 C/T 1 17 14 31 8.07764313650061 7.34782329935244 0.729819837148174 T:C C T 10 0.524844521382317 0.858443645066449 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79478870 C/A 1 23 6 29 10.9285760082067 3.1490671282939 7.77950887991281 A:C C A 10 0.524844521382317 0.00447880244153504 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79478871 C/T 1 23 5 28 10.9285760082067 2.62422260691158 8.30435340129512 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00189288010462922 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79478916 G/T 1 15 5 20 7.12733217926525 2.62422260691158 4.50310957235366 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0463439224535587 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79508395 C/G 1 48 25 73 22.8074629736488 13.1211130345579 9.68634993909086 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.0256596111703573 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79508335_79508421:C17orf70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 29 22 51 13.7795088799128 11.546579470411 2.23292940950183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.576615559792462 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79580457 C/A 1 6 15 21 2.8509328717061 7.87266782073475 -5.02173494902866 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0302463165212927 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79580344_79580520:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79580344_79580520:NPLOC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79589242 G/A 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79589192_79589304:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79589192_79589304:NPLOC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 18 9 27 8.5527986151183 4.72360069244085 3.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.177382710428329 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79618059 C/T 1 18 32 50 8.5527986151183 16.7950246842341 -8.24222606911585 T:C C T 10 0.524844521382317 0.022932078455127 ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79632363 C/T 1 212 174 386 100.732961466949 91.3229467205231 9.41001474642566 T:C C T 10 0.524844521382317 0.359025433738266 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 40 18 58 19.0062191447073 9.4472013848817 9.55901775982562 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0123424504221283 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79639550 G/A 1 40 24 64 19.0062191447073 12.5962685131756 6.40995063153172 A:G G A 10 0.524844521382317 0.132609132698514 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79639708 C/T 1 35 33 68 16.6304417516189 17.3198692056165 -0.689427453997553 T:C C T 10 0.524844521382317 0.903706099655471 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79662067 A/G 1 39 30 69 18.5310636660896 15.7453356414695 2.78572802462013 A:G A G 10 0.524844521382317 0.547684859185628 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661954_79662097:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661954_79662097:HGS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79663880 T/C 1 64 63 127 30.4099506315317 33.065204847086 -2.65525421555425 T:C T C 10 0.524844521382317 0.657568718503638 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79663931 T/C 1 45 43 88 21.3819965377957 22.5683144194396 -1.18631788164389 T:C T C 10 0.524844521382317 0.83143026540821 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79663854_79664028:HGS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 115 69 184 54.6428800410335 36.2142719753799 18.4286080656537 T:G G T 10 0.524844521382317 0.00770762951380204 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79668552 C/T 1 124 69 193 58.9192793485927 36.2142719753799 22.7050073732128 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00113410261721674 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668538_79669143:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668538_79669149:HGS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 321 295 616 152.524908636276 154.829133807784 -2.30422517150726 T:C T C 10 0.524844521382317 0.871835492941469 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79673989 C/T 1 305 305 610 144.922420978393 160.077579021607 -15.1551580432134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.224058432994228 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79673936_79674070:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79673936_79674049:MRPL12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79952700 G/A 1 16 29 45 7.60248765788293 15.2204911200872 -7.61800346220426 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0251079520487829 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79952697_79952754:ASPSCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 34 38 72 16.1552862730012 19.944091812528 -3.78880553952682 T:C T C 10 0.524844521382317 0.409470921956809 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 79986156 C/T 1 16 11 27 7.60248765788293 5.77328973520549 1.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.565137057094518 ENSG00000169683:ENST00000306688:exon_79986110_79986187:LRRC45 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 74 79 153 35.1615054177085 41.462717189203 -6.30121177149449 A:G G A 10 0.524844521382317 0.331600745115878 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80019120 G/A 1 61 60 121 28.9844841956787 31.490671282939 -2.50618708726035 A:G G A 10 0.524844521382317 0.650404279305803 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 44 45 89 20.9068410591781 23.6180034622043 -2.71116240302621 T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.596490532648722 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80045086 G/C 1 61 46 107 28.9844841956787 24.1428479835866 4.84163621209208 C:G G C 10 0.524844521382317 0.384046958205671 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80059532 T/G 1 45 16 61 21.3819965377957 8.39751234211707 12.9844841956787 T:G T G 10 0.524844521382317 0.000781595538782155 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 88 117 205 41.8136821183561 61.4068090017311 -19.593126883375 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.00634917369426707 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80196762 G/A 1 142 121 263 67.472077963711 63.5061870872604 3.96589087645064 A:G G A 10 0.524844521382317 0.665704521759743 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80196578_80197354:SLC16A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 34 29 63 16.1552862730012 15.2204911200872 0.934795152914031 A:G G A 10 0.524844521382317 0.899775143288907 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 5 12 17 2.37577739308842 6.2981342565878 -3.92235686349939 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0863600801774899 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80391684 A/G 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80391534_80391698:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80391534_80391698:HEXDC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80402490 C/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 61 43 104 28.9844841956787 22.5683144194396 6.41616977623903 T:C T C 10 0.524844521382317 0.238675015062614 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80674763 C/T 1 31 29 60 14.7298198371482 15.2204911200872 -0.490671282939019 T:C C T 10 0.524844521382317 0.898083520792394 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80674582_80674772:FN3KRP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 80888472 C/T 1 26 21 47 12.3540424440598 11.0217349490287 1.3323074950311 T:C C T 10 0.524844521382317 0.770933837568702 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80888398_80888519:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80888398_80888519:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80888398_80888519:TBCD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 17 81043039 A/G 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:G A G 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81042814_81043199:METRNL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 334758 T/C 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000158270:ENST00000400256:exon_334742_335230:COLEC12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 346698 C/T 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.370589300195247 ENSG00000158270:ENST00000400256:exon_346295_347341:COLEC12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 346821 C/T 1 6 13 19 2.8509328717061 6.82297877797012 -3.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.105404731313452 ENSG00000158270:ENST00000400256:exon_346295_347341:COLEC12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 2763697 C/T 1 11 5 16 5.22671026479451 2.62422260691158 2.60248765788293 T:C C T 10 0.524844521382317 0.219130803102002 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2763635_2763787:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2763635_2763787:SMCHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 2892474 G/A 1 11 14 25 5.22671026479451 7.34782329935244 -2.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.428460468329696 ENSG00000132205:ENST00000254528:exon_2890559_2892484:EMILIN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 3457794 T/G 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 T:G T G 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 9117899 G/A 1 63 72 135 29.934795152914 37.7888055395268 -7.85401038661279 A:G G A 10 0.524844521382317 0.196086473499845 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 9517221 G/A 1 62 73 135 29.4596396742963 38.3136500609091 -8.85401038661279 A:G G A 10 0.524844521382317 0.142767481075324 ENSG00000017797:ENST00000019317:exon_9516843_9517301:RALBP1;ENSG00000017797:ENST00000458039:exon_9516843_9517301:RALBP1;ENSG00000017797:ENST00000383432:exon_9516843_9517301:RALBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 9550366 A/G 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9550276_9550396:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9550276_9550396:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9550276_9550396:PPP4R1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 9562042 C/T 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9561978_9562073:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9561978_9562073:PPP4R1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 11884563 A/C 1 37 23 60 17.5807527088543 12.0714239917933 5.50932871706098 A:C A C 10 0.524844521382317 0.157927113837502 ENSG00000141404:ENST00000334049:exon_11880988_11885684:GNAL;ENSG00000154889:ENST00000317235:exon_11883470_11884626:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11883689_11884626:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11884048_11884626:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11884069_11884626:MPPE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 11885772 G/A 1 20 22 42 9.50310957235366 11.546579470411 -2.04346989805731 A:G G A 10 0.524844521382317 0.540723179616973 ENSG00000154889:ENST00000317235:exon_11885675_11885815:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11885675_11885815:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11885675_11885815:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11885675_11885815:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11885675_11885815:MPPE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 170 158 328 80.7764313650061 82.9254343784061 -2.14900301339996 C:G C G 10 0.524844521382317 0.825139661924626 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 12329548 G/A 1 154 135 289 73.1739437071232 70.8540103866128 2.3199333205104 A:G G A 10 0.524844521382317 0.813857051246407 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 49 45 94 23.2826184522665 23.6180034622043 -0.335385009937795 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 64 66 130 30.4099506315317 34.6397384112329 -4.2297877797012 A:G A G 10 0.524844521382317 0.48291918245192 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 13681962 A/T 1 22 8 30 10.453420529589 4.19875617105854 6.25466435853049 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0271094054075027 ENSG00000177150:ENST00000322247:exon_13681604_13682104:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000457610:exon_13681604_13682111:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000402563:exon_13681604_13682104:C18orf19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 14105753 T/C 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000175322:ENST00000309305:exon_14104724_14106408:ZNF519 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 19 14 33 9.02795409373598 7.34782329935244 1.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.604302645486145 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 21112206 C/T 1 25 18 43 11.8788869654421 9.4472013848817 2.43168558056037 T:C C T 10 0.524844521382317 0.542028308247613 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 21119777 G/A 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 A:G G A 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21119775_21119965:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21119775_21119965:NPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 23872235 A/G 1 12 4 16 5.7018657434122 2.09937808552927 3.60248765788293 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0825793217037308 ENSG00000141384:ENST00000418698:exon_23872195_23872345:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000269142:exon_23872210_23872345:TAF4B;ENSG00000141384:ENST00000400466:exon_23872210_23872345:TAF4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 9 11 20 4.27639930755915 5.77328973520549 -1.49689042764634 T:C T C 10 0.524844521382317 0.512500587924667 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 33048554 C/T 1 40 33 73 19.0062191447073 17.3198692056165 1.68634993909086 T:C C T 10 0.524844521382317 0.72625365178656 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 25 31 56 11.8788869654421 16.2701801628518 -4.39129319740975 A:G A G 10 0.524844521382317 0.284506044074317 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 33709977 G/C 1 7 18 25 3.32608835032378 9.4472013848817 -6.12111303455792 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0159189909825359 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33709864_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33709884_33710034:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33709884_33710034:ELP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 33718326 A/C 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 A:C A C 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33718233_33718389:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33718233_33718389:ELP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 33725931 G/A 1 16 21 37 7.60248765788293 11.0217349490287 -3.41924729114573 A:G G A 10 0.524844521382317 0.323500510661641 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33725911_33726011:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33725911_33726011:ELP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 33726295 A/G 1 29 39 68 13.7795088799128 20.4689363339104 -6.68942745399755 A:G A G 10 0.524844521382317 0.114805332607981 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33726213_33726344:ELP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 50 57 107 23.7577739308842 29.9161377187921 -6.15836378790792 T:C C T 10 0.524844521382317 0.246252047519655 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 34320630 G/A 1 42 19 61 19.9565301019427 9.97204590626402 9.98448419567866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0103538849331172 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34320619_34320801:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34320619_34320801:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34320619_34320801:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34320619_34320801:FHOD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 34324091 G/A 1 21 6 27 9.97826505097134 3.1490671282939 6.82919792267744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0109174569892813 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34323995_34324156:FHOD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 43420177 G/A 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000197046:ENST00000389474:exon_43420176_43420206:SIGLEC15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 G A G 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 43568717 T/C 1 1 11 12 0.475155478617683 5.77328973520549 -5.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00232484596307326 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43568668_43568725:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43568668_43568725:PSTPIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 43795986 C/T 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 T:C C T 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000152242:ENST00000282059:exon_43795777_43796561:C18orf25;ENSG00000152242:ENST00000321319:exon_43795777_43796561:C18orf25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 45371686 T/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 46904937 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000141627:ENST00000418472:exon_46904937_46905070:DYM;ENSG00000141627:ENST00000269445:exon_46904937_46905070:DYM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 47017820 A/G 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G A G 10 0.524844521382317 0.164439911805120 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 47811374 G/A 1 95 82 177 45.1397704686799 43.03725075335 2.1025197153299 A:G G A 10 0.524844521382317 0.763949503873149 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47811372_47811617:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47811372_47811617:CXXC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 47911594 G/T 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 47911631 A/G 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G A G 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 47918536 C/T 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47918469_47918621:SKA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 12 20 32 5.7018657434122 10.4968904276463 -4.79502468423414 A:C A C 10 0.524844521382317 0.110639170955433 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 48458662 G/A 1 27 23 50 12.8291979226774 12.0714239917933 0.757773930884152 A:G G A 10 0.524844521382317 0.887900071837565 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 28 38 66 13.3043534012951 19.944091812528 -6.63973841123292 T:C T C 10 0.524844521382317 0.109786375637606 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 173 159 332 82.2018978008592 83.4502788997884 -1.24838109892923 T:C T C 10 0.524844521382317 0.912537178253395 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 96 85 181 45.6149259472976 44.6117843174969 1.00314162980063 T:C C T 10 0.524844521382317 0.940702491780198 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:C C A 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 56205472 G/T 1 10 2 12 4.75155478617683 1.04968904276463 3.7018657434122 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0413693580129535 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 56819930 T/C 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:C T C 10 0.524844521382317 0.293913347766002 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 57022822 T/C 1 37 36 73 17.5807527088543 18.8944027697634 -1.31365006090914 T:C T C 10 0.524844521382317 0.81502404027658 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57022736_57022890:LMAN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 60241403 G/A 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G G A 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61060701 T/C 1 10 19 29 4.75155478617683 9.97204590626402 -5.22049112008719 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0625786547301105 ENSG00000119541:ENST00000238497:exon_61060642_61060782:VPS4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61570503 C/G 1 1 37 38 0.475155478617683 19.4192472911457 -18.944091812528 C:G C G 10 0.524844521382317 2.2540427572134e-11 ENSG00000197632:ENST00000299502:exon_61570135_61571124:SERPINB2;ENSG00000197632:ENST00000457692:exon_61570135_61571113:SERPINB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61570529 C/G 0 0 32 32 0 16.7950246842341 -16.7950246842341 G C G 10 0.524844521382317 4.55767880402601e-11 ENSG00000197632:ENST00000299502:exon_61570135_61571124:SERPINB2;ENSG00000197632:ENST00000457692:exon_61570135_61571113:SERPINB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 24 65 89 11.4037314868244 34.1148938898506 -22.7111624030262 T:G T G 10 0.524844521382317 1.18584479330835e-06 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61582816 G/A 1 25 9 34 11.8788869654421 4.72360069244085 7.15528627300122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0155902199071621 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61585260 T/C 1 13 41 54 6.17702122202988 21.518625376675 -15.3416041546451 T:C T C 10 0.524844521382317 2.8433231380228e-05 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 27 22 49 12.8291979226774 11.546579470411 1.28261845226647 A:G G A 10 0.524844521382317 0.775691937901988 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61597349 A/G 1 67 74 141 31.8354170673848 38.8384945822915 -7.00307751490669 A:G A G 10 0.524844521382317 0.239261234129638 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61597279_61597421:SERPINB10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 220 124 344 104.53420529589 65.0807206514073 39.453484644483 T:C:G C T 10 0.524844521382317 1.882850735807e-05 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 43 57 100 20.4316855805604 29.9161377187921 -9.4844521382317 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0709747870887095 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 67687860 T/C 1 12 16 28 5.7018657434122 8.39751234211707 -2.69564659870487 T:C T C 10 0.524844521382317 0.347115703840086 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67687851_67688053:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67687851_67688053:RTTN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 43 35 78 20.4316855805604 18.3695582483811 2.06212733217928 A:G G A 10 0.524844521382317 0.652255670509995 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 72346869 A/G 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000215421:ENST00000299687:exon_72342919_72347662:ZNF407;ENSG00000215421:ENST00000309902:exon_72342919_72347662:ZNF407 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 20 16 36 9.50310957235366 8.39751234211707 1.10559723023659 A:G G A 10 0.524844521382317 0.741507923506718 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 74092213 G/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74090810_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74090965_74092259:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74090968_74092259:ZNF516 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 74154141 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000101493:ENST00000524431:exon_74153201_74155167:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000443185:exon_74153201_74155166:ZNF516;ENSG00000101493:ENST00000217537:exon_74153201_74155167:ZNF516 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77170479 G/A 1 9 19 28 4.27639930755915 9.97204590626402 -5.69564659870487 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0368431822879296 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77171061 T/G 1 19 24 43 9.02795409373598 12.5962685131756 -3.56831441943963 T:G T G 10 0.524844521382317 0.288904812000227 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77193678 C/T 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77193579_77193738:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77193579_77193738:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77193579_77193738:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77193579_77193738:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77193579_77193738:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77193579_77193738:NFATC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77227473 G/A 1 15 12 27 7.12733217926525 6.2981342565878 0.829197922677442 A:G G A 10 0.524844521382317 0.848089388772471 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77513721 T/C 1 36 40 76 17.1055972302366 20.9937808552927 -3.88818362505609 T:C T C 10 0.524844521382317 0.421714408347958 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77513804 G/T 1 28 29 57 13.3043534012951 15.2204911200872 -1.91613771879207 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.691144168843661 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 63 59 122 29.934795152914 30.9658267615567 -1.03103160864267 A:C A C 10 0.524844521382317 0.856688026466234 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77806070 A/G 1 123 84 207 58.444123869975 44.0869397961146 14.3571840738604 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0511276676337977 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77891039 T/A 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:T T A 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77890986_77891075:ADNP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77893565 A/G 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 A:G A G 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77893683 A/G 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 18 77894270 C/T 1 11 22 33 5.22671026479451 11.546579470411 -6.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0352694952203563 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 312264 G/A 1 16 14 30 7.60248765788293 7.34782329935244 0.254664358530491 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_312191_312272:MIER2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 313546 G/A 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 A:G G A 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_313492_313643:MIER2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 327893 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_327864_327989:MIER2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 334474 T/G 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:G T G 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_334400_334542:MIER2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 507731 C/T 1 23 21 44 10.9285760082067 11.0217349490287 -0.0931589408219473 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000141933:ENST00000388800:exon_507497_507844:C19orf20;ENSG00000141933:ENST00000359315:exon_507497_507844:C19orf20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 71 70 141 33.7360389818555 36.7391164967622 -3.00307751490669 T:C C T 10 0.524844521382317 0.614200684093929 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 579636 C/T 1 365 414 779 173.431749695454 217.285631852279 -43.8538821568249 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.00178675361165896 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 436 510 946 207.16778867731 267.670705904982 -60.5029172276719 A:T:C:G C G 10 0.524844521382317 9.18280768021732e-05 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 621063 A/G 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 A:G A G 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 652238 A/G 1 51 60 111 24.2329294095018 31.490671282939 -7.25774187343718 A:G A G 10 0.524844521382317 0.183536207549744 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_652233_652296:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_652233_652296:RNF126 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 804079 T/C 1 96 87 183 45.6149259472976 45.6614733602616 -0.0465474129640029 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804036_804208:PTBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 808373 C/T 1 154 152 306 73.1739437071232 79.7763672501122 -6.60242354298899 T:C C T 10 0.524844521382317 0.457301312247461 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808360_808452:PTBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 810852 C/T 1 262 179 441 124.490735397833 93.9471693274347 30.5435660703982 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00361145160378261 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_810694_812327:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_810694_812327:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_810694_812327:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_810694_812327:PTBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 55 73 128 26.1335513239726 38.3136500609091 -12.1800987369366 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0335735541040333 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 871135 A/G 1 38 20 58 18.055908187472 10.4968904276463 7.55901775982562 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0491365098669948 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871037_871253:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_871037_871253:MED16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 871987 G/A 1 56 50 106 26.6087068025902 26.2422260691158 0.3664807334744 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 15 13 28 7.12733217926525 6.82297877797012 0.304353401295125 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 59 69 128 28.0341732384433 36.2142719753799 -8.18009873693657 A:G A G 10 0.524844521382317 0.157144160741042 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 899444 C/T 1 96 112 208 45.6149259472976 58.7825863948195 -13.1676604475219 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.071121423833399 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_899440_899495:C19orf22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 929741 C/T 1 29 24 53 13.7795088799128 12.5962685131756 1.1832403667372 T:C C T 10 0.524844521382317 0.78449876604811 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 965031 C/T 1 81 59 140 38.4875937680323 30.9658267615567 7.52176700647562 T:C C T 10 0.524844521382317 0.205723103910191 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_964833_965080:ARID3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 966831 G/A 1 69 69 138 32.7857280246201 36.2142719753799 -3.42854395075975 A:G G A 10 0.524844521382317 0.609253052700857 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 971986 C/T 1 68 97 165 32.3105725460024 50.9099185740847 -18.5993460280823 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00387911047873203 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_971878_972781:ARID3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1010691 A/G 1 148 108 256 70.3230108354171 56.6832083092902 13.6398025261269 A:T:C:G A G 10 0.524844521382317 0.0912415331809035 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 99 53 152 47.0403923831506 27.8167596332628 19.2236327498878 T:G G T 10 0.524844521382317 0.00194330911539452 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 57 23 80 27.0838622812079 12.0714239917933 15.0124382894146 T:C T C 10 0.524844521382317 0.000722730877726576 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 60 24 84 28.509328717061 12.5962685131756 15.9130602038854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000617801533592443 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1074000 A/T 1 51 63 114 24.2329294095018 33.065204847086 -8.83227543758413 A:T A T 10 0.524844521382317 0.110662175939884 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1073947_1074013:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1073947_1074013:HMHA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 147 133 280 69.8478553567994 69.8043213438482 0.0435340129512412 A:C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1081617 A/G 1 87 96 183 41.3385266397384 50.3850740527024 -9.046547412964 A:G A G 10 0.524844521382317 0.183566248827504 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1083168 A/G 1 155 131 286 73.6490991857409 68.7546323010835 4.89446688465735 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.594263533215204 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1083142_1083352:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1083142_1083352:HMHA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1084321 G/C 1 119 109 228 56.5435019555043 57.2080528306725 -0.664550875168267 C:G G C 10 0.524844521382317 0.947195948847785 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1084237_1084345:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1084237_1084345:HMHA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 172 154 326 81.7267423222415 80.8260562928768 0.900686029364664 A:G A G 10 0.524844521382317 0.955792648380967 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 62 53 115 29.4596396742963 27.8167596332628 1.64288004103355 T:C C T 10 0.524844521382317 0.780087711923461 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1271547 C/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 606 605 1211 287.944220042316 317.530935436302 -29.5867153939859 A:T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.0896454613178888 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1279058 C/T 1 216 170 386 102.63358338142 89.2235686349939 13.4100147464257 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.185120795659862 ENSG00000228300:ENST00000409293:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000492647:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000513897:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000518332:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000530634:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000469144:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000485191:exon_1278776_1279221:C19orf24;ENSG00000226593:ENST00000416408:exon_1278776_1279242:AC004258.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1360575 G/A 1 26 12 38 12.3540424440598 6.2981342565878 6.05590818747196 A:G G A 10 0.524844521382317 0.052220812255966 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1430176 T/C 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.490004833487733 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1556783 T/C 1 2 11 13 0.950310957235366 5.77328973520549 -4.82297877797012 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0098834651021165 ENSG00000181588:ENST00000402693:exon_1554671_1556922:MEX3D;ENSG00000181588:ENST00000388824:exon_1555576_1556922:MEX3D;ENSG00000181588:ENST00000355663:exon_1555576_1556922:MEX3D;ENSG00000181588:ENST00000403287:exon_1555576_1556922:MEX3D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1578234 G/A 1 19 7 26 9.02795409373598 3.67391164967622 5.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0477771026383253 ENSG00000071655:ENST00000156825:exon_1576678_1578537:MBD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1827387 C/T 1 20 21 41 9.50310957235366 11.0217349490287 -1.518625376675 T:C C T 10 0.524844521382317 0.642919897074488 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 36 20 56 17.1055972302366 10.4968904276463 6.60870680259025 A:G A G 10 0.524844521382317 0.082731590633058 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1827735 C/T 1 22 23 45 10.453420529589 12.0714239917933 -1.61800346220426 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.6566337577171 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1912934 T/C 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1969882 G/T 1 39 24 63 18.5310636660896 12.5962685131756 5.93479515291403 T:G G T 10 0.524844521382317 0.164819149131869 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1969507_1969958:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1969507_1969958:CSNK1G2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 1979811 A/G 1 99 86 185 47.0403923831506 45.1366288388793 1.90376354427136 A:G A G 10 0.524844521382317 0.825319796768659 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979751_1979834:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979751_1979819:CSNK1G2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 145 98 243 68.897544399564 51.4347630954671 17.462781304097 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0287685983146875 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 130 103 233 61.7702122202988 54.0589857023786 7.71122651792015 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.325558735577202 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2138654 T/G 1 17 20 37 8.07764313650061 10.4968904276463 -2.41924729114573 T:G T G 10 0.524844521382317 0.510921362092342 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2138618_2138713:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2138618_2138713:AP3D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2229770 G/T 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 T:G G T 10 0.524844521382317 0.463486008093855 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2255311 C/G 0 0 12 12 0 6.2981342565878 -6.2981342565878 G C G 10 0.524844521382317 0.000132442964580686 ENSG00000167476:ENST00000300961:exon_2255205_2255346:JSRP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2271927 C/A 1 1403 1252 2655 666.643136500609 657.105340770661 9.53779572994847 A:T:C:G C A 10 0.524844521382317 0.71203733381226 ENSG00000104904:ENST00000322297:exon_2271781_2271953:OAZ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2417991 C/T 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C C T 10 0.524844521382317 0.794120955465075 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2418060 G/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000178297:ENST00000332578:exon_2418000_2418136:TMPRSS9;ENSG00000178297:ENST00000425079:exon_2418000_2418136:TMPRSS9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2917186 T/C 1 16 22 38 7.60248765788293 11.546579470411 -3.94409181252805 T:C T C 10 0.524844521382317 0.255314267474421 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2918176 C/T 1 11 22 33 5.22671026479451 11.546579470411 -6.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0352694952203563 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2933611 G/A 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000175691:ENST00000444249:exon_2933536_2934388:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000341064:exon_2933536_2934393:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2934282 T/C 1 1 17 18 0.475155478617683 8.92235686349939 -8.4472013848817 T:C T C 10 0.524844521382317 4.09606677279725e-05 ENSG00000175691:ENST00000444249:exon_2933536_2934388:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000341064:exon_2933536_2934393:ZNF77;ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2934590 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 19 12 31 9.02795409373598 6.2981342565878 2.72981983714817 T:C T C 10 0.524844521382317 0.371425597340827 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.433796952873074 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 44 40 84 20.9068410591781 20.9937808552927 -0.0869397961146241 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3162984 C/T 1 62 52 114 29.4596396742963 27.2919151118805 2.16772456241587 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.708381364601571 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 T:G G T 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3496833 G/A 1 33 32 65 15.6801307943835 16.7950246842341 -1.1148938898506 A:G G A 10 0.524844521382317 0.804838164054738 ENSG00000129932:ENST00000250937:exon_3496539_3496884:DOHH;ENSG00000129932:ENST00000427575:exon_3496539_3496884:DOHH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3534859 A/G 1 30 21 51 14.2546643585305 11.0217349490287 3.23292940950183 A:G A G 10 0.524844521382317 0.401977383354421 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3544820 G/C 1 53 39 92 25.1832403667372 20.4689363339104 4.71430403282684 C:G G C 10 0.524844521382317 0.348503631824415 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3547461 G/C 1 11 18 29 5.22671026479451 9.4472013848817 -4.22049112008719 C:G G C 10 0.524844521382317 0.137576283488010 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3547453_3547545:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3547453_3547545:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3547453_3547545:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3547453_3547545:C19orf28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3547955 C/T 1 35 37 72 16.6304417516189 19.4192472911457 -2.78880553952682 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.555894500117118 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3547846_3548028:C19orf28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3548168 T/C 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3548121_3548265:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3548121_3548265:C19orf28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3573792 G/A 1 89 83 172 42.2888375969738 43.5620952747323 -1.27325767775852 A:G G A 10 0.524844521382317 0.878758876529698 ENSG00000064961:ENST00000416526:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000470356:exon_3573690_3574267:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000333651:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000417382:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000453933:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000435022:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000402569:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000262949:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000488973:exon_3573690_3574584:HMG20B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3656439 G/A 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3656403_3656555:PIP5K1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3656457 G/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000186111:ENST00000335312:exon_3656403_3656555:PIP5K1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 24 24 48 11.4037314868244 12.5962685131756 -1.19253702635121 A:G A G 10 0.524844521382317 0.773644418870262 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 39 32 71 18.5310636660896 16.7950246842341 1.7360389818555 T:C C T 10 0.524844521382317 0.722380118515003 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 T:C C T 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3765267 C/T 1 103 68 171 48.9410142976214 35.6894274539976 13.2515868436238 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0463405262319441 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3765164_3765329:MRPL54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 126 165 291 59.8695903058281 86.5993460280823 -26.7297557222542 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0018314046081666 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4033462 T/C 1 15 14 29 7.12733217926525 7.34782329935244 -0.220491120087193 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4033418_4033578:PIAS4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 21 22 43 9.97826505097134 11.546579470411 -1.56831441943963 T:C T C 10 0.524844521382317 0.649939503415073 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4251084 G/A 1 27 18 45 12.8291979226774 9.4472013848817 3.38199653779574 A:G G A 10 0.524844521382317 0.371090172681409 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 21 18 39 9.97826505097134 9.4472013848817 0.531063666089638 T:C C T 10 0.524844521382317 0.874437983138576 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4262036 C/T 1 28 26 54 13.3043534012951 13.6459575559402 -0.341604154645117 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4261991_4262111:CCDC94 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4327210 G/C 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4327121_4327223:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4327121_4327223:STAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 30 30 60 14.2546643585305 15.7453356414695 -1.49067128293902 A:G A G 10 0.524844521382317 0.700753329114401 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4452388 G/A 1 47 35 82 22.3323074950311 18.3695582483811 3.96274924665001 A:G G A 10 0.524844521382317 0.439170814338157 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4452361_4452489:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4452361_4452489:UBXN6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 65 63 128 30.8851061101494 33.065204847086 -2.18009873693657 T:C C T 10 0.524844521382317 0.723859076462652 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4538124 C/T 1 10 1 11 4.75155478617683 0.524844521382317 4.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0127875069116162 ENSG00000171236:ENST00000306390:exon_4537227_4538963:LRG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4538831 G/A 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000171236:ENST00000306390:exon_4537227_4538963:LRG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4658047 A/G 1 222 188 410 105.484516253126 98.6707700198756 6.81374623325004 A:G A G 10 0.524844521382317 0.520479077191835 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 20 3 23 9.50310957235366 1.57453356414695 7.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.000661730016057734 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 31 11 42 14.7298198371482 5.77328973520549 8.95653010194269 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00783405473155465 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5110794 A/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000127663:ENST00000159111:exon_5110633_5110829:KDM4B;ENSG00000127663:ENST00000381759:exon_5110633_5110829:KDM4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5210782 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5210690_5210816:PTPRS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5623306 C/T 1 28 20 48 13.3043534012951 10.4968904276463 2.80746297364879 T:C C T 10 0.524844521382317 0.471157720032553 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5623150_5623405:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5623150_5623405:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5623150_5623405:SAFB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5691641 C/T 1 4231 3787 8018 2010.38283003142 1987.58620247483 22.7966275565825 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.614850725102518 ENSG00000130255:ENST00000347512:exon_5691543_5691674:RPL36;ENSG00000130255:ENST00000394580:exon_5691543_5691674:RPL36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5691994 T/C 1 240 128 368 114.037314868244 67.1800987369366 46.8572161313074 T:C T C 10 0.524844521382317 8.37060809645788e-07 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5691845_5692219:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5691846_5692219:LONP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5693620 C/T 1 220 156 376 104.53420529589 81.8757453356414 22.6584599602488 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0200951937126554 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5693563_5693780:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5693563_5693780:LONP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5693728 A/G 1 184 128 312 87.4286080656537 67.1800987369366 20.2485093287171 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.0232630737561112 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5693563_5693780:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5693563_5693780:LONP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5696434 G/A 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.249548155109633 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5699070 G/A 1 89 81 170 42.2888375969738 42.5124062319677 -0.223568634993882 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5699038_5699216:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5699038_5699216:LONP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 21 16 37 9.97826505097134 8.39751234211707 1.58075270885427 A:G G A 10 0.524844521382317 0.62568102314945 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5914605 A/G 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5914625 G/A 1 11 5 16 5.22671026479451 2.62422260691158 2.60248765788293 A:G G A 10 0.524844521382317 0.219130803102002 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 5915341 C/T 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5915232_5915887:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5915232_5915887:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5915232_5916219:CAPS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6040045 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000087903:ENST00000303657:exon_6039991_6040252:RFX2;ENSG00000087903:ENST00000359161:exon_6039991_6040252:RFX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6270615 G/A 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000130382:ENST00000252674:exon_6270590_6270770:MLLT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6374229 C/A 1 235 235 470 111.661537475156 123.338462524844 -11.676925049689 A:C C A 10 0.524844521382317 0.288317152866904 ENSG00000125652:ENST00000245812:exon_6374214_6374387:ALKBH7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6374813 T/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C T C 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6454440 C/T 1 56 57 113 26.6087068025902 29.9161377187921 -3.30743091620182 T:C C T 10 0.524844521382317 0.572375201418841 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454334_6454486:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454334_6454486:SLC25A23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6458240 G/C 1 17 35 52 8.07764313650061 18.3695582483811 -10.2919151118805 C:G G C 10 0.524844521382317 0.00508693260525252 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6466482 A/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000130545:ENST00000356762:exon_6466477_6466620:CRB3;ENSG00000130545:ENST00000308243:exon_6466477_6467225:CRB3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6468331 T/C 1 147 146 293 69.8478553567994 76.6273001218183 -6.77944476501888 T:C T C 10 0.524844521382317 0.447189580403 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 32 45 77 15.2049753157659 23.6180034622043 -8.41302814643841 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0672615074613697 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6477425 G/T 1 42 38 80 19.9565301019427 19.944091812528 0.0124382894146429 T:C:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477389_6477469:DENND1C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 110 142 252 52.2671026479451 74.527922036289 -22.2608193883439 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00544139957256137 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6755155 T/C 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:C T C 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6926378 T/C 1 4 13 17 1.90062191447073 6.82297877797012 -4.92235686349939 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0259038710039726 ENSG00000174837:ENST00000312053:exon_6926377_6926612:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000450315:exon_6926377_6926612:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381407:exon_6926377_6926612:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381404:exon_6926377_6926612:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000250572:exon_6926377_6926612:EMR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 6926560 G/C 1 4 21 25 1.90062191447073 11.0217349490287 -9.12111303455793 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000213074376548453 ENSG00000174837:ENST00000312053:exon_6926377_6926612:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000450315:exon_6926377_6926612:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381407:exon_6926377_6926612:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381404:exon_6926377_6926612:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000250572:exon_6926377_6926612:EMR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7083629 A/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000130544:ENST00000439035:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000414706:exon_7082889_7087979:ZNF557;ENSG00000130544:ENST00000252840:exon_7082889_7087979:ZNF557 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7141727 G/A 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G G A 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7141688_7141827:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7141688_7141827:INSR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7141775 G/A 1 7 16 23 3.32608835032378 8.39751234211707 -5.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.037721226567006 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7141688_7141827:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7141688_7141827:INSR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7142843 C/G 1 9 10 19 4.27639930755915 5.24844521382317 -0.972045906264022 C:G C G 10 0.524844521382317 0.819117352050088 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7142827_7143101:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7142827_7143101:INSR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7142921 C/T 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7142827_7143101:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7142827_7143101:INSR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7142999 C/T 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C C T 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7142827_7143101:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7142827_7143101:INSR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7163083 C/T 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7184392 C/T 1 19 26 45 9.02795409373598 13.6459575559402 -4.61800346220426 T:C C T 10 0.524844521382317 0.181214492608227 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7184327_7184648:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7184327_7184648:INSR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7528777 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7528704_7528841:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7528704_7528841:ARHGEF18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7531821 G/A 1 14 15 29 6.65217670064756 7.87266782073475 -1.22049112008719 A:G G A 10 0.524844521382317 0.711938142382318 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7531804_7531860:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7531804_7531860:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7531804_7531860:ARHGEF18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7532252 G/C 1 17 18 35 8.07764313650061 9.4472013848817 -1.36955824838109 C:G G C 10 0.524844521382317 0.73571934593785 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7532100_7532570:ARHGEF18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7747293 T/G 1 381 432 813 181.034237353337 226.732833237161 -45.6985958838237 T:G T G 10 0.524844521382317 0.00138642770460109 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 764 956 1720 363.01878566391 501.751362441495 -138.732576777585 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 2.43465167236430e-11 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7754222 G/A 1 1876 2075 3951 891.391677886773 1089.05238186831 -197.660703981534 A:T:G G A 10 0.524844521382317 3.36410539281286e-10 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7753663_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7753667_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7753667_7754316:FCER2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 7763248 G/A 1 1713 1805 3518 813.941334872091 947.344361095082 -133.403026222991 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 7.05077368712509e-06 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 127 113 240 60.3447457844457 59.3074309162018 1.03731486824393 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.897389573814934 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8367356 C/T 1 80 96 176 38.0124382894146 50.3850740527024 -12.3726357632878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0698420193472365 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8367709 C/T 1 63 62 125 29.934795152914 32.5403603257037 -2.60556517278962 T:C C T 10 0.524844521382317 0.65520395348206 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367661_8367722:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367661_8367864:CD320 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8368758 G/A 1 37 37 74 17.5807527088543 19.4192472911457 -1.83849458229145 A:G G A 10 0.524844521382317 0.727353437875293 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8368739_8368972:CD320 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8368794 C/A 1 35 30 65 16.6304417516189 15.7453356414695 0.885106110149398 A:C C A 10 0.524844521382317 0.901350571631621 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8368739_8368972:CD320 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8373176 C/T 1 21 4 25 9.97826505097134 2.09937808552927 7.87888696544208 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00196345877287144 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8381479 T/C 1 99 99 198 47.0403923831506 51.9596076168494 -4.91921523369876 T:C T C 10 0.524844521382317 0.522034546032625 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8381380_8381529:NDUFA7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8386998 T/C 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000233927:ENST00000445365:exon_8386540_8387376:RPS28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8466991 C/T 1 138 85 223 65.5714560492403 44.6117843174969 20.9596717317433 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.00484684983413512 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8466970_8467163:RAB11B;ENSG00000185236:ENST00000449488:exon_8466970_8467163:RAB11B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8576670 C/T 1 49 47 96 23.2826184522665 24.6676925049689 -1.38507405270243 T:C C T 10 0.524844521382317 0.83821970468444 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8576501_8576844:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8576501_8576844:ZNF414 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8578118 A/G 1 31 27 58 14.7298198371482 14.1708020773226 0.559017759825617 A:G A G 10 0.524844521382317 0.896320836164127 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 42 23 65 19.9565301019427 12.0714239917933 7.8851061101494 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0617459597550533 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 9267292 G/A 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 9271969 C/A 1 21 25 46 9.97826505097134 13.1211130345579 -3.14284798358658 A:C C A 10 0.524844521382317 0.378322049364377 ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 32 52 84 15.2049753157659 27.2919151118805 -12.0869397961146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00866812595182626 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 9640228 C/T 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000130818:ENST00000253115:exon_9638683_9640312:ZNF426 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 9940594 G/T 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 T:G G T 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 9940602 G/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:G G T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10225177 G/A 1 103 96 199 48.9410142976214 50.3850740527024 -1.44405975508108 A:G G A 10 0.524844521382317 0.88716521898014 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10226124 A/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:C A C 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10464674 A/G 1 35 29 64 16.6304417516189 15.2204911200872 1.40995063153171 A:G A G 10 0.524844521382317 0.802666399858901 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10468447 G/T 1 67 78 145 31.8354170673848 40.9378726678207 -9.10245560043596 T:G G T 10 0.524844521382317 0.135025474899622 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10468440_10468594:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10468440_10468594:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10468440_10468594:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10468440_10468577:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10468061_10468594:TYK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10472557 A/C 1 80 83 163 38.0124382894146 43.5620952747323 -5.54965698531766 A:C A C 10 0.524844521382317 0.389474231072655 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10472446_10472631:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10472446_10472631:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10472446_10472631:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10472446_10472631:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000533334:exon_10472446_10472581:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000531620:exon_10472446_10472631:TYK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10475376 C/T 1 40 39 79 19.0062191447073 20.4689363339104 -1.46271718920304 T:C C T 10 0.524844521382317 0.821926813188526 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475290_10475447:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475290_10475447:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475290_10475447:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475290_10475447:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525220:exon_10475290_10475447:TYK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10477206 G/A 1 23 35 58 10.9285760082067 18.3695582483811 -7.44098224017438 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0647824194851211 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 36 34 70 17.1055972302366 17.8447137269988 -0.739116496762186 A:C C A 10 0.524844521382317 0.905005895280187 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10659659 C/T 1 14 15 29 6.65217670064756 7.87266782073475 -1.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.711938142382318 ENSG00000130734:ENST00000309469:exon_10659580_10659710:ATG4D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 51 38 89 24.2329294095018 19.944091812528 4.28883759697379 A:G A G 10 0.524844521382317 0.396542508721255 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10664909 G/A 1 44 19 63 20.9068410591781 9.97204590626402 10.934795152914 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00756337642788344 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10664910 G/C 1 44 19 63 20.9068410591781 9.97204590626402 10.934795152914 C:G G C 10 0.524844521382317 0.00756337642788344 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10665984 G/A 1 16 22 38 7.60248765788293 11.546579470411 -3.94409181252805 A:G G A 10 0.524844521382317 0.255314267474421 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10665961_10666025:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10665961_10666025:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10665961_10666025:KRI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 12 15 27 5.7018657434122 7.87266782073475 -2.17080207732256 T:C C T 10 0.524844521382317 0.444663614174346 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10673456 C/T 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 T:C C T 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10673405_10673513:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10673405_10673513:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10673405_10673513:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10673405_10673513:KRI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 A:G G A 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10738431 G/A 1 9 14 23 4.27639930755915 7.34782329935244 -3.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.216326895269441 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10738398_10738471:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10738398_10738471:SLC44A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10746205 G/A 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10747211 G/A 1 53 58 111 25.1832403667372 30.4409822401744 -5.25774187343718 A:G G A 10 0.524844521382317 0.342418417316836 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10746999_10747261:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10746999_10747261:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000407327:exon_10747119_10747232:SLC44A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10781760 G/A 1 54 64 118 25.6583958453549 33.5900493684683 -7.9316535231134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.166546771112393 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10781650_10781879:ILF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10793333 G/T 1 104 96 200 49.416169776239 50.3850740527024 -0.968904276463391 T:G G T 10 0.524844521382317 0.9435817356044 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10793213_10793380:ILF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10795569 C/T 1 111 85 196 52.7422581265628 44.6117843174969 8.13047380906588 T:C C T 10 0.524844521382317 0.253161490734055 ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10795535_10796443:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10795092_10796443:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10795092_10796443:ILF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 10904480 C/T 1 25 21 46 11.8788869654421 11.0217349490287 0.857152016413419 T:C C T 10 0.524844521382317 0.882990864557683 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10904396_10904531:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10904396_10904531:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10904396_10904531:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10904396_10904531:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10904396_10904531:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10904396_10904531:DNM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11031582 G/A 1 95 127 222 45.1397704686799 66.6552542155543 -21.5154837468744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00465736956268909 ENSG00000142453:ENST00000327064:exon_11031510_11031622:CARM1;ENSG00000142453:ENST00000344150:exon_11031510_11031622:CARM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11034813 C/A 1 36 19 55 17.1055972302366 9.97204590626402 7.13355132397257 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0589640293798791 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11034837 A/G 1 40 17 57 19.0062191447073 8.92235686349939 10.0838622812079 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0077527710033086 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11097621 C/T 1 28 33 61 13.3043534012951 17.3198692056165 -4.01551580432134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.308536864379986 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11097581_11097679:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11097581_11097679:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11097581_11097679:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11097581_11097679:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11097581_11097679:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11097581_11097679:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11097581_11097679:SMARCA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 40 40 80 19.0062191447073 20.9937808552927 -1.98756171058535 T:C T C 10 0.524844521382317 0.656510906243428 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 15 12 27 7.12733217926525 6.2981342565878 0.829197922677442 A:G A G 10 0.524844521382317 0.848089388772471 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11227554 C/T 1 12 3 15 5.7018657434122 1.57453356414695 4.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0384636259591238 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11233941 A/G 1 11 17 28 5.22671026479451 8.92235686349939 -3.69564659870487 A:G A G 10 0.524844521382317 0.187089974666476 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11233850_11234020:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11233850_11234020:LDLR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11327608 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11327590_11327772:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11327590_11327772:DOCK6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11327626 A/G 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G A G 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11327590_11327772:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11327590_11327772:DOCK6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11332570 T/A 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:T T A 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11332527_11332696:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11332527_11332696:DOCK6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11557948 C/T 1 283 215 498 134.469000448804 112.841572097198 21.6274283516062 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0537185674202803 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11557889_11557975:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11557889_11557975:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11557889_11557975:PRKCSH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 11833871 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000197933:ENST00000341191:exon_11832135_11834157:ZNF823;ENSG00000197933:ENST00000431998:exon_11832808_11834157:ZNF823 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12383540 G/C 1 13 9 22 6.17702122202988 4.72360069244085 1.45342052958903 C:G G C 10 0.524844521382317 0.67059722784726 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12430395 T/C 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 T:C T C 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000188868:ENST00000293725:exon_12428291_12430647:ZNF563;ENSG00000188868:ENST00000318168:exon_12430244_12430647:ZNF563 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 39 67 106 18.5310636660896 35.1645829326152 -16.6335192665256 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00127286537820597 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12800851 G/A 1 9 15 24 4.27639930755915 7.87266782073475 -3.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.156455234273016 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800776_12800924:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800776_12801014:FBXW9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12805525 G/C 1 16 9 25 7.60248765788293 4.72360069244085 2.87888696544208 C:G G C 10 0.524844521382317 0.317512505067783 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12805408_12805536:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12805408_12805536:FBXW9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12807066 G/C 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 C:G G C 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12807187 C/T 1 14 19 33 6.65217670064756 9.97204590626402 -3.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.29637560445508 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12806987_12807457:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12806987_12807432:FBXW9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12812169 A/G 1 31 29 60 14.7298198371482 15.2204911200872 -0.490671282939019 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.898083520792394 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12813683 T/C 1 13 19 32 6.17702122202988 9.97204590626402 -3.79502468423414 T:C T C 10 0.524844521382317 0.215805568250847 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12813637_12813732:TNPO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12814544 A/G 1 18 23 41 8.5527986151183 12.0714239917933 -3.518625376675 A:G A G 10 0.524844521382317 0.278600075286401 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12814528_12814615:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12814528_12814615:TNPO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12816559 G/T 1 25 20 45 11.8788869654421 10.4968904276463 1.38199653779574 T:G G T 10 0.524844521382317 0.765909330497689 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12816496_12816582:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000420511:exon_12816496_12816582:TNPO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12921186 T/C 1 88 86 174 41.8136821183561 45.1366288388793 -3.32294672052316 T:C T C 10 0.524844521382317 0.649019167645323 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 96 69 165 45.6149259472976 36.2142719753799 9.4006539719177 A:G G A 10 0.524844521382317 0.160460190687471 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13033560 T/C 1 139 139 278 66.0466115278579 72.9533884721421 -6.9067769442841 T:C T C 10 0.524844521382317 0.435077691740539 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13033284_13033700:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13033294_13033700:FARSA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13039658 A/G 1 200 198 398 95.0310957235366 103.919215233699 -8.88811951016216 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.393602463553831 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13039569_13039661:FARSA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13051170 C/T 1 1464 1559 3023 695.627620696288 818.232608835032 -122.604988138744 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 8.7637666886178e-06 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13051057_13051266:CALR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 1054 1021 2075 500.813874463038 535.866256331346 -35.0523818683077 A:T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.123952159017894 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13063737 T/C 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 T:C T C 10 0.524844521382317 0.164439911805120 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13246606 C/T 1 31 33 64 14.7298198371482 17.3198692056165 -2.59004936846829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.533713882825387 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13246014_13246967:NACC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13264591 G/T 1 147 130 277 69.8478553567994 68.2297877797012 1.61806757709819 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.856989285013755 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13915670 T/C 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000132003:ENST00000254323:exon_13915606_13915962:ZSWIM4;ENSG00000132003:ENST00000440752:exon_13915606_13915962:ZSWIM4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 13923908 C/G 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 C:G C G 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000132003:ENST00000254323:exon_13923811_13923978:ZSWIM4;ENSG00000132003:ENST00000440752:exon_13923811_13923978:ZSWIM4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14023191 G/A 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14023136_14023251:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14023136_14023251:CC2D1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 22 23 45 10.453420529589 12.0714239917933 -1.61800346220426 T:C T C 10 0.524844521382317 0.6566337577171 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14065341 T/C 1 10 29 39 4.75155478617683 15.2204911200872 -10.4689363339104 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00105484809647346 ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14065338_14065473:DCAF15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14083897 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000132005:ENST00000254325:exon_14083555_14083939:RFX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14153293 T/C 1 31 26 57 14.7298198371482 13.6459575559402 1.08386228120793 T:C T C 10 0.524844521382317 0.792484607547345 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14153265_14153424:IL27RA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14231330 A/G 1 82 46 128 38.96274924665 24.1428479835866 14.8199012630634 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0100226783679010 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14512502 C/T 1 126 72 198 59.8695903058281 37.7888055395268 22.0807847663012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00169866601732079 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14518913 G/A 1 275 215 490 130.667756619863 112.841572097198 17.8261845226647 A:G G A 10 0.524844521382317 0.113353449719186 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14518904_14519531:CD97 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14518951 C/T 1 243 194 437 115.462781304097 101.819837148169 13.6429441559275 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.196167681450465 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14518904_14519531:CD97 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14520713 G/A 1 28 34 62 13.3043534012951 17.8447137269988 -4.54036032570365 A:G G A 10 0.524844521382317 0.255294583459991 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14554346 G/A 1 31 48 79 14.7298198371482 25.1925370263512 -10.462717189203 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0236530094335951 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14554282_14554433:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14554282_14554433:PKN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 254 215 469 120.689491568891 112.841572097198 7.84791947169334 A:G A G 10 0.524844521382317 0.488095795577195 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 188 153 341 89.3292299801244 80.3012117714945 9.02801820862992 A:G A G 10 0.524844521382317 0.329768133830414 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 32 22 54 15.2049753157659 11.546579470411 3.65839584535488 T:C C T 10 0.524844521382317 0.342584055726343 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14590279 G/C 1 21 30 51 9.97826505097134 15.7453356414695 -5.76707059049817 C:G G C 10 0.524844521382317 0.122939214831000 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14591211 C/T 1 20 17 37 9.50310957235366 8.92235686349939 0.580752708854273 T:C C T 10 0.524844521382317 0.870899695467464 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14591117_14591297:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14591117_14591297:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14591117_14591297:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14591117_14591297:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14591117_14591297:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14591117_14591297:GIPC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14675072 C/A 1 115 127 242 54.6428800410335 66.6552542155543 -12.0123741745207 A:C C A 10 0.524844521382317 0.122963867581806 ENSG00000099797:ENST00000215567:exon_14674994_14675099:TECR;ENSG00000099797:ENST00000436007:exon_14674994_14675099:TECR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 14676941 C/T 1 100 100 200 47.5155478617683 52.4844521382317 -4.96890427646339 T:C C T 10 0.524844521382317 0.524108055417943 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14676892_14677077:NDUFB7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 15367036 C/T 1 88 115 203 41.8136821183561 60.3571199589665 -18.5434378406103 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0093176269116864 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000371835:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000392878:exon_15366875_15367074:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000360016:exon_15366875_15367074:BRD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 15376452 T/C 1 35 43 78 16.6304417516189 22.5683144194396 -5.93787266782072 T:C T C 10 0.524844521382317 0.212138984076962 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15376165_15376454:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000371835:exon_15376165_15376454:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000392878:exon_15376165_15376454:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000360016:exon_15376165_15376454:BRD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 15473003 T/C 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 T:C T C 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15472921_15473062:AKAP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 15565692 C/T 1 60 81 141 28.509328717061 42.5124062319677 -14.0030775149067 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0224694769972412 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15565468_15565704:RASAL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 41 37 78 19.481374623325 19.4192472911457 0.0621273321792764 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 16319916 C/T 1 28 18 46 13.3043534012951 9.4472013848817 3.85715201641342 T:C C T 10 0.524844521382317 0.301917773941409 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16319841_16319988:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16319841_16319988:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000429941:exon_16319841_16319988:AP1M1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 38 34 72 18.055908187472 17.8447137269988 0.21119446047318 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 16772135 A/G 1 19 27 46 9.02795409373598 14.1708020773226 -5.14284798358658 A:G A G 10 0.524844521382317 0.141156697840691 ENSG00000072954:ENST00000187762:exon_16771938_16772152:TMEM38A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 16790859 C/T 1 19 15 34 9.02795409373598 7.87266782073475 1.15528627300122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.733885013169074 ENSG00000072954:ENST00000187762:exon_16790795_16790951:TMEM38A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 16798927 T/C 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.512655373125665 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17004049 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000160111:ENST00000443236:exon_17003758_17004150:CPAMD8;ENSG00000160111:ENST00000291440:exon_17003765_17004150:CPAMD8;ENSG00000160111:ENST00000388925:exon_17003765_17004150:CPAMD8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17283657 C/T 1 19 19 38 9.02795409373598 9.97204590626402 -0.944091812528043 T:C C T 10 0.524844521382317 0.871260583668888 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17283568_17283772:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17283568_17283772:MYO9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17286484 C/T 1 39 40 79 18.5310636660896 20.9937808552927 -2.46271718920304 T:C C T 10 0.524844521382317 0.652561298898317 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17286472_17286550:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17286472_17286550:MYO9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 95 69 164 45.1397704686799 36.2142719753799 8.92549849330002 T:C T C 10 0.524844521382317 0.183674773395536 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17305781 T/G 1 96 80 176 45.6149259472976 41.9875617105854 3.62736423671222 T:C:G T G 10 0.524844521382317 0.598067490921002 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 74 58 132 35.1615054177085 30.4409822401744 4.72052317753416 T:C C T 10 0.524844521382317 0.433589272590266 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 90 91 181 42.7639930755915 47.7608514457908 -4.99685837019937 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.457997816354805 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 68 69 137 32.3105725460024 36.2142719753799 -3.90369942937743 A:G A G 10 0.524844521382317 0.549500936157942 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17322800 T/C 1 293 230 523 139.220555234981 120.714239917933 18.5063153170482 T:C T C 10 0.524844521382317 0.105492892705770 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17322704_17324103:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17322704_17324103:MYO9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17337555 C/A 1 25 19 44 11.8788869654421 9.97204590626402 1.90684105917805 A:C C A 10 0.524844521382317 0.651378297792005 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17337557 G/T 1 18 27 45 8.5527986151183 14.1708020773226 -5.61800346220426 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.101749773232147 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17337928 C/T 1 22 13 35 10.453420529589 6.82297877797012 3.63044175161891 T:C C T 10 0.524844521382317 0.239649884557393 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 113 79 192 53.6925690837982 41.462717189203 12.2298518945951 A:G G A 10 0.524844521382317 0.082848415428211 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17393504 G/C 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 C:G G C 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17393465_17393570:ANKLE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17393530 T/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:T T A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17393465_17393570:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17393465_17393570:ANKLE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17394065 G/A 1 8 9 17 3.80124382894146 4.72360069244085 -0.922356863499388 A:G G A 10 0.524844521382317 0.809125944455852 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17394504 A/C 1 12 11 23 5.7018657434122 5.77328973520549 -0.0714239917932904 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394034_17394771:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394034_17394693:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394034_17394693:ANKLE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17394981 G/A 1 11 3 14 5.22671026479451 1.57453356414695 3.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0616071016075417 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17395003 A/G 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17395055 C/G 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 C:G C G 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 14 23 37 6.65217670064756 12.0714239917933 -5.41924729114573 A:C A C 10 0.524844521382317 0.098551851728366 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 20 27 47 9.50310957235366 14.1708020773226 -4.6676925049689 T:C T C 10 0.524844521382317 0.190094875054324 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 122 112 234 57.9689683913573 58.7825863948195 -0.813618003462174 A:G A G 10 0.524844521382317 0.94784342576824 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 57 55 112 27.0838622812079 28.8664486760274 -1.7825863948195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.776838809975687 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17837425 C/G 1 72 63 135 34.2111944604732 33.065204847086 1.14598961338721 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.863533837941804 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17837512 G/A 1 71 66 137 33.7360389818555 34.6397384112329 -0.903699429377426 A:G G A 10 0.524844521382317 0.931877086900255 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17837981 A/G 1 70 62 132 33.2608835032378 32.5403603257037 0.720523177534162 A:G A G 10 0.524844521382317 0.930695368782236 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 17881641 G/A 1 9 10 19 4.27639930755915 5.24844521382317 -0.972045906264022 A:G G A 10 0.524844521382317 0.819117352050088 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17881601_17881705:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17881601_17881705:FCHO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 95 114 209 45.1397704686799 59.8322754375841 -14.6925049689042 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0445399976601004 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18119870 G/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18119780_18119927:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18119780_18119927:ARRDC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 7 12 19 3.32608835032378 6.2981342565878 -2.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.250211798338697 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18234805 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18234749_18234958:MAST3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18279638 T/C 1 24 26 50 11.4037314868244 13.6459575559402 -2.24222606911585 T:C T C 10 0.524844521382317 0.572424165751215 ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000464016:exon_18279285_18279649:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000470732:exon_18279308_18279706:PIK3R2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 1261 1164 2425 599.171058536898 610.919022889017 -11.7479643521186 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.640067645758231 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18286008 G/C 1 1249 1175 2424 593.469192793486 616.692312624222 -23.2231198307363 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.349576528133884 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18288642 A/G 1 14 14 28 6.65217670064756 7.34782329935244 -0.695646598704876 A:G A G 10 0.524844521382317 0.851171689520466 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 47 35 82 22.3323074950311 18.3695582483811 3.96274924665001 T:C C T 10 0.524844521382317 0.439170814338157 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18420570 C/T 1 80 107 187 38.0124382894146 56.1583637879079 -18.1459254984933 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00832371021262956 ENSG00000130520:ENST00000252816:exon_18420488_18420671:LSM4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18466820 A/G 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000130517:ENST00000252813:exon_18466705_18466821:PGPEP1;ENSG00000130517:ENST00000269919:exon_18466705_18466821:PGPEP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18561420 C/T 1 27 13 40 12.8291979226774 6.82297877797012 6.00621914470732 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0591255478047045 ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18561287_18561785:ELL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18561473 G/A 1 23 23 46 10.9285760082067 12.0714239917933 -1.14284798358658 A:G G A 10 0.524844521382317 0.769255016655494 ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18561287_18561785:ELL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18870998 G/A 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000105662:ENST00000262813:exon_18870818_18871038:CRTC1;ENSG00000105662:ENST00000338797:exon_18870818_18871038:CRTC1;ENSG00000105662:ENST00000321949:exon_18870818_18871038:CRTC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 18965426 C/T 1 50 28 78 23.7577739308842 14.6956465987049 9.06212733217928 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0415579907663385 ENSG00000005007:ENST00000262803:exon_18965410_18965518:UPF1;ENSG00000005007:ENST00000418384:exon_18965410_18965518:UPF1;ENSG00000005007:ENST00000447615:exon_18965410_18965518:UPF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19038597 C/T 1 69 44 113 32.7857280246201 23.0931589408219 9.69256908379818 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0735289131306705 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19038575_19038663:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19038575_19038663:DDX49 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 43 31 74 20.4316855805604 16.2701801628518 4.16150541770854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.353511411693362 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19257410 G/A 1 82 63 145 38.96274924665 33.065204847086 5.89754439956404 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.360526727208022 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409447:exon_19257364_19257457:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19257364_19257457:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19257364_19257457:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19257364_19257457:AC002126.6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19258531 C/T 1 51 36 87 24.2329294095018 18.8944027697634 5.33852663973843 T:C C T 10 0.524844521382317 0.283352236813403 ENSG00000213999:ENST00000162023:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409224:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000424583:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000410050:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000414036:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000444486:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000421262:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000409447:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000213999:ENST00000475290:exon_19258507_19258641:MEF2B;ENSG00000064489:ENST00000502742:exon_19258507_19258641:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000354191:exon_19258507_19258641:AC002126.6;ENSG00000064489:ENST00000514819:exon_19258507_19258641:AC002126.6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19312510 G/A 1 90 95 185 42.7639930755915 49.8602295313201 -7.09623645572864 A:G G A 10 0.524844521382317 0.30351264599441 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000184162:ENST00000331552:exon_19312226_19312850:NR2C2AP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19312877 G/A 1 4 12 16 1.90062191447073 6.2981342565878 -4.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0420487835421222 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19313135 G/A 1 4 12 16 1.90062191447073 6.2981342565878 -4.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0420487835421222 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19390185 G/A 1 41 48 89 19.481374623325 25.1925370263512 -5.71116240302621 A:G G A 10 0.524844521382317 0.243675752831186 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19390022_19390199:SUGP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19416835 C/T 1 16 23 39 7.60248765788293 12.0714239917933 -4.46893633391036 T:C C T 10 0.524844521382317 0.199027828793427 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19416658_19416885:SUGP1;ENSG00000105705:ENST00000334782:exon_19416658_19416885:SUGP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 216 219 435 102.63358338142 114.940950182727 -12.3073668013079 C:G C G 10 0.524844521382317 0.249304701448663 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19822566 G/A 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19823669 A/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:T A T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19906131 T/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:G T G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000081665:ENST00000443905:exon_19904643_19906469:ZNF506;ENSG00000081665:ENST00000450683:exon_19903528_19906469:ZNF506 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 19906147 G/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000081665:ENST00000443905:exon_19904643_19906469:ZNF506;ENSG00000081665:ENST00000450683:exon_19903528_19906469:ZNF506 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 20044886 T/C 1 13 16 29 6.17702122202988 8.39751234211707 -2.22049112008719 T:C T C 10 0.524844521382317 0.45973512332539 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 20117685 G/A 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197124:ENST00000397165:exon_20115227_20118084:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000397162:exon_20115227_20118084:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000358523:exon_20115227_20118084:ZNF682 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 21240722 T/C 1 18 19 37 8.5527986151183 9.97204590626402 -1.41924729114573 T:C T C 10 0.524844521382317 0.742558906962133 ENSG00000118620:ENST00000261560:exon_21239437_21241653:ZNF430 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 21719401 T/C 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 21720616 T/C 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 21991663 A/G 1 17 15 32 8.07764313650061 7.87266782073475 0.204975315765857 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198521:ENST00000397148:exon_21990085_21992609:ZNF43;ENSG00000198521:ENST00000354959:exon_21990128_21992609:ZNF43 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 23837145 A/G 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 30106251 G/A 1 94 84 178 44.6646149900622 44.0869397961146 0.577675193947577 A:G G A 10 0.524844521382317 0.940339736698437 ENSG00000105171:ENST00000221770:exon_30106151_30106706:POP4;ENSG00000105171:ENST00000392279:exon_30106151_30106677:POP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 30165232 G/A 1 47 38 85 22.3323074950311 19.944091812528 2.38821568250306 A:G G A 10 0.524844521382317 0.664387899946329 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 19 22 41 9.02795409373598 11.546579470411 -2.518625376675 A:G G A 10 0.524844521382317 0.439415065816683 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 33096786 G/A 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 22 24 46 10.453420529589 12.5962685131756 -2.14284798358658 T:C C T 10 0.524844521382317 0.557247733939047 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 33117666 T/C 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C T C 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 16 12 28 7.60248765788293 6.2981342565878 1.30435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.706809371150625 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 33870157 A/T 1 51 58 109 24.2329294095018 30.4409822401744 -6.20805283067255 A:T A T 10 0.524844521382317 0.2503634717718 ENSG00000153879:ENST00000284000:exon_33870050_33873591:CEBPG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 33902621 C/T 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33902578_33902655:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33902578_33902655:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33902578_33902655:PEPD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 34842488 T/C 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000166398:ENST00000299505:exon_34842419_34842497:KIAA0355 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 34890491 A/G 1 1407 1370 2777 668.54375841508 719.036994293774 -50.4932358786942 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0574162155959343 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34890461_34890536:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34890461_34890536:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34890461_34890536:GPI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35434986 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35435069 A/G 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35435589 C/T 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35449082 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000180884:ENST00000404801:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000407202:exon_35447258_35450475:ZNF792;ENSG00000180884:ENST00000379189:exon_35449007_35449987:ZNF792 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35501006 C/T 1 44 63 107 20.9068410591781 33.065204847086 -12.1583637879079 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0200522998033735 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35510102 G/C 1 116 91 207 55.1180355196512 47.7608514457908 7.35718407386039 C:G G C 10 0.524844521382317 0.330050646237321 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 194 187 381 92.1801628518305 98.1459254984933 -5.96576264666277 T:G T G 10 0.524844521382317 0.572645026108804 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 29 19 48 13.7795088799128 9.97204590626402 3.80746297364879 A:G G A 10 0.524844521382317 0.312598278217653 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 423 402 825 200.99076745528 210.987497595691 -9.9967301404115 A:G A G 10 0.524844521382317 0.485964092635324 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35826959 A/G 1 326 334 660 154.900686029365 175.298070141694 -20.3973841123292 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.118957934618127 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35826939_35827244:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35826939_35827244:CD22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35836600 C/A 1 372 330 702 176.757838045778 173.198692056165 3.55914598961351 A:C C A 10 0.524844521382317 0.79152368478952 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 35837428 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 36109312 C/A 1 21 9 30 9.97826505097134 4.72360069244085 5.25466435853049 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0668269988343185 ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36109304_36109367:HAUS5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 36113851 C/T 1 18 23 41 8.5527986151183 12.0714239917933 -3.518625376675 T:C C T 10 0.524844521382317 0.278600075286401 ENSG00000249115:ENST00000505558:exon_36113778_36113895:HAUS5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 390 432 822 185.310636660896 226.732833237161 -41.4221965762645 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00416196725397912 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 36216448 G/A 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36216380_36216526:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36216380_36216526:AD000671.3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 36216701 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36216624_36216719:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36216624_36216719:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36216624_36216719:AD000671.3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 36219702 C/T 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 T:C C T 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36219675_36219790:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36219675_36219790:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36219675_36219790:AD000671.3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 36605114 G/A 1 156 138 294 74.1242546643586 72.4285439507597 1.69571071359881 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.861077129738357 ENSG00000105258:ENST00000221859:exon_36605079_36605153:POLR2I HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 93 90 183 44.1894595114445 47.2360069244085 -3.046547412964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.657748933331801 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 37039069 A/C 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 A:C A C 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 37117302 A/G 1 1 13 14 0.475155478617683 6.82297877797012 -6.34782329935244 A:G A G 10 0.524844521382317 0.000612653240282994 ENSG00000161298:ENST00000423582:exon_37117032_37118894:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000292928:exon_37117032_37119499:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000441040:exon_37117035_37118452:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000439428:exon_37117032_37119469:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000435416:exon_37117035_37119172:ZNF382;ENSG00000161298:ENST00000455093:exon_37117032_37119498:ZNF382 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 37310825 C/G 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000528994:exon_37310709_37311016:ZNF790 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 37310886 G/A 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37309224_37311016:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000528994:exon_37310709_37311016:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000525288:exon_37310839_37311016:ZNF790 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 37314685 A/G 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000197863:ENST00000356725:exon_37314569_37314692:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000528994:exon_37314569_37314692:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000525288:exon_37314569_37314692:ZNF790;ENSG00000197863:ENST00000527645:exon_37314569_37314692:ZNF790 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 37853864 A/G 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 37854574 A/G 1 21 26 47 9.97826505097134 13.6459575559402 -3.6676925049689 A:G A G 10 0.524844521382317 0.308653432757187 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 38055553 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 38055612 A/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:T A T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 38056538 T/C 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 38573149 G/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38571896_38573739:SIPA1L3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 38610504 G/A 1 12 21 33 5.7018657434122 11.0217349490287 -5.31986920561646 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0803628498484152 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38609946_38610522:SIPA1L3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 38689060 T/C 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38689029_38689172:SIPA1L3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 127 127 254 60.3447457844457 66.6552542155543 -6.3105084311085 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.451087954355421 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 67 61 128 31.8354170673848 32.0155158043213 -0.180098736936568 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39380548 C/T 1 15 28 43 7.12733217926525 14.6956465987049 -7.56831441943963 T:C C T 10 0.524844521382317 0.022161258256497 ENSG00000068903:ENST00000249396:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000392081:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000462654:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000479290:exon_39379727_39380784:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000402684:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000358931:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000456703:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000414941:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000420440:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000443898:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000407552:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000381766:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000491960:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000476771:exon_39380329_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000451193:exon_39380495_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000423526:exon_39380500_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000437828:exon_39380523_39380601:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000447739:exon_39380539_39380601:SIRT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39406918 G/A 1 31 28 59 14.7298198371482 14.6956465987049 0.034173238443298 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39406861_39406954:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39406861_39406954:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39406861_39406954:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39406861_39406954:FBXO17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39421274 T/C 1 14 19 33 6.65217670064756 9.97204590626402 -3.31986920561646 T:C T C 10 0.524844521382317 0.29637560445508 ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39421110_39421536:FBXO17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39421928 T/C 1 149 172 321 70.7981663140348 90.2732576777585 -19.4750913637237 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0335440461196512 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39421594_39421983:MRPS12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39422963 C/G 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 C:G C G 10 0.524844521382317 0.744219842559896 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39423001 T/C 1 217 205 422 103.108738860037 107.593126883375 -4.48438802333776 T:C T C 10 0.524844521382317 0.661327170965623 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39664372 C/G 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 C:G C G 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000130669:ENST00000358301:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000321944:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000360442:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000457838:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000435673:exon_39664216_39664650:PAK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39914247 C/A 1 47 36 83 22.3323074950311 18.8944027697634 3.43790472526769 A:C C A 10 0.524844521382317 0.509953067544697 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39924123 C/A 1 19 13 32 9.02795409373598 6.82297877797012 2.20497531576586 A:C C A 10 0.524844521382317 0.482276506766734 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39926562 C/T 1 1629 8 1637 774.028274668206 4.19875617105854 769.829518497147 T:C C T 10 0.524844521382317 0 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39964744 G/T 1 190 204 394 90.2795409373598 107.068282361993 -16.7887414246329 T:G G T 10 0.524844521382317 0.095946791027826 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39964603_39964761:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39964603_39964761:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39964603_39964761:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39964603_39964761:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39964603_39964761:SUPT5H HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39966922 G/A 1 317 289 606 150.624286721806 151.68006667949 -1.05577995768408 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.935214005401626 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39966896_39967306:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39966896_39967306:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39966896_39967306:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39966896_39967310:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39966896_39967306:SUPT5H HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 39972579 G/A 1 18 22 40 8.5527986151183 11.546579470411 -2.99378085529268 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34802327982474 ENSG00000105197:ENST00000314349:exon_39972523_39972673:TIMM50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 40541934 G/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 C:G G C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000128000:ENST00000434248:exon_40534167_40542533:ZNF780B;ENSG00000128000:ENST00000221355:exon_40539486_40542533:ZNF780B;ENSG00000128000:ENST00000412146:exon_40540228_40542533:ZNF780B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 40827858 G/C 1 51 43 94 24.2329294095018 22.5683144194396 1.6646149900622 C:G G C 10 0.524844521382317 0.757540226382979 ENSG00000160392:ENST00000357884:exon_40826973_40828283:C19orf47;ENSG00000160392:ENST00000392035:exon_40826973_40828283:C19orf47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41116397 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41122891 C/G 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 C:G C G 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41122795_41122926:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41122795_41122926:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41122795_41122926:LTBP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41128918 T/C 1 6 17 23 2.8509328717061 8.92235686349939 -6.07142399179329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0121225542609254 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41128855_41128926:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41128855_41128926:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41128855_41128926:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41128855_41128926:LTBP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41209477 C/T 1 12 8 20 5.7018657434122 4.19875617105854 1.50310957235366 T:C C T 10 0.524844521382317 0.655495661698291 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 18 28 46 8.5527986151183 14.6956465987049 -6.14284798358658 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0769861238537952 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41235120 A/G 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:G A G 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000086544:ENST00000263370:exon_41235107_41235320:ITPKC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 142 131 273 67.472077963711 68.7546323010835 -1.28255433737253 T:C T C 10 0.524844521382317 0.903591243545725 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41292601 A/T 1 103 78 181 48.9410142976214 40.9378726678207 8.00314162980063 A:T:C A T 10 0.524844521382317 0.264230453245259 ENSG00000167578:ENST00000357052:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000378307:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000419646:exon_41292570_41292665:RAB4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41306810 C/T 1 87 89 176 41.3385266397384 46.7111624030262 -5.37263576328778 T:C C T 10 0.524844521382317 0.450573465396355 ENSG00000171570:ENST00000303961:exon_41306244_41307320:EGLN2;ENSG00000171570:ENST00000406058:exon_41306181_41307320:EGLN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 41925140 C/T 1 96 85 181 45.6149259472976 44.6117843174969 1.00314162980063 T:C C T 10 0.524844521382317 0.940702491780198 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41925040_41925201:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41925040_41925201:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41925040_41925201:BCKDHA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 42092815 T/A 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 T T 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42092788_42093163:CEACAM21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 50 54 104 23.7577739308842 28.3416041546451 -4.58383022376096 T:C C T 10 0.524844521382317 0.378438199358049 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 63 90 153 29.934795152914 47.2360069244085 -17.3012117714945 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0057779124557174 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 42909617 C/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C C T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42909537_42909713:LIPE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 42911558 C/T 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42911326_42911620:LIPE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44055726 T/C 1 8 24 32 3.80124382894146 12.5962685131756 -8.79502468423414 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00217691470295179 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44055723_44055839:XRCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44096772 C/T 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44088521_44097519:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44096026_44097519:IRGQ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44098963 C/G 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 C:G C G 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44098961_44099492:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44098961_44099676:IRGQ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44351836 G/A 1 11 6 17 5.22671026479451 3.1490671282939 2.07764313650061 A:G G A 10 0.524844521382317 0.342500346550349 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44351613_44351840:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000324461:exon_44351091_44353307:ZNF230 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44418621 C/T 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44500671 C/T 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44514875 A/G 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:G A G 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44515264 A/G 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44570551 G/A 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 G G 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000178386:ENST00000434772:exon_44570217_44572142:ZNF223;ENSG00000178386:ENST00000269981:exon_44570217_44572142:ZNF223 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 T:G G T 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 11 19 30 5.22671026479451 9.97204590626402 -4.74533564146951 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0997596100052063 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 30 19 49 14.2546643585305 9.97204590626402 4.28261845226647 A:G A G 10 0.524844521382317 0.253311905869154 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 28 19 47 13.3043534012951 9.97204590626402 3.3323074950311 A:T A T 10 0.524844521382317 0.381795948985569 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 36 20 56 17.1055972302366 10.4968904276463 6.60870680259025 A:G A G 10 0.524844521382317 0.082731590633058 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 A:G G A 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44681141 A/T 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 A:T A T 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44732658 C/G 1 11 5 16 5.22671026479451 2.62422260691158 2.60248765788293 C:G C G 10 0.524844521382317 0.219130803102002 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44732599_44732725:ZNF227 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44739399 T/C 1 20 19 39 9.50310957235366 9.97204590626402 -0.46893633391036 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 24 24 48 11.4037314868244 12.5962685131756 -1.19253702635121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.773644418870262 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44981525 G/A 1 11 13 24 5.22671026479451 6.82297877797012 -1.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.545534900498325 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 44981832 T/C 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 T:C T C 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 113 86 199 53.6925690837982 45.1366288388793 8.55594024491892 T:C T C 10 0.524844521382317 0.228478128546052 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45396144 C/T 1 69 62 131 32.7857280246201 32.5403603257037 0.245367698916475 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45476422 T/C 1 9 13 22 4.27639930755915 6.82297877797012 -2.54657947041097 T:C T C 10 0.524844521382317 0.293962750959165 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45476344_45476467:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45476344_45476467:CLPTM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 19 13 32 9.02795409373598 6.82297877797012 2.20497531576586 A:G A G 10 0.524844521382317 0.482276506766734 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45495915 C/T 1 48 46 94 22.8074629736488 24.1428479835866 -1.3353850099378 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.836574141034732 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45561032 C/A 1 22 19 41 10.453420529589 9.97204590626402 0.481374623325005 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45561008_45561156:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45561008_45561156:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45561008_45561156:CLASRP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45579515 G/T 1 36 49 85 17.1055972302366 25.7173815477335 -8.61178431749694 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0651998943147636 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45579334_45579688:ZNF296 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 19 16 35 9.02795409373598 8.39751234211707 0.630441751618907 T:G T G 10 0.524844521382317 0.867082324177013 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 35 40 75 16.6304417516189 20.9937808552927 -4.36333910367377 A:C C A 10 0.524844521382317 0.355277931143357 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46025388 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46025469 A/C 1 186 155 341 88.3789190228891 81.3509008142591 7.02801820862992 A:C A C 10 0.524844521382317 0.448496246237958 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46025426_46025475:VASP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46177961 C/T 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000010310:ENST00000263281:exon_46177940_46178084:GIPR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46181392 G/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000010310:ENST00000263281:exon_46181346_46181484:GIPR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46269076 G/A 1 15 18 33 7.12733217926525 9.4472013848817 -2.31986920561646 A:G G A 10 0.524844521382317 0.486957322619883 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 36 38 74 17.1055972302366 19.944091812528 -2.83849458229145 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.56109607743687 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46330809 G/A 1 66 63 129 31.3602615887671 33.065204847086 -1.70494325831888 A:G G A 10 0.524844521382317 0.791777191523177 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46330768_46330881:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46330768_46330881:SYMPK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 69 60 129 32.7857280246201 31.490671282939 1.29505674168111 T:C T C 10 0.524844521382317 0.860251637701067 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 46520288 G/A 1 18 10 28 8.5527986151183 5.24844521382317 3.30435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.257388498750569 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46520249_46520327:CCDC61 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47226434 C/T 1 37 26 63 17.5807527088543 13.6459575559402 3.93479515291403 T:C C T 10 0.524844521382317 0.377484308759908 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47226371_47226541:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47226371_47226541:STRN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47226450 A/G 1 36 24 60 17.1055972302366 12.5962685131756 4.50932871706098 A:G A G 10 0.524844521382317 0.301062783772602 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47226371_47226541:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47226371_47226541:STRN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47240145 G/A 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47240080_47240158:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47240080_47240158:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000435164:exon_47240080_47240158:STRN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47823038 G/A 1 11 6 17 5.22671026479451 3.1490671282939 2.07764313650061 A:G G A 10 0.524844521382317 0.342500346550349 ENSG00000197405:ENST00000355085:exon_47823038_47825327:C5AR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47823649 C/G 1 10 19 29 4.75155478617683 9.97204590626402 -5.22049112008719 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0625786547301105 ENSG00000197405:ENST00000355085:exon_47823038_47825327:C5AR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47823871 G/T 1 26 17 43 12.3540424440598 8.92235686349939 3.43168558056037 T:G G T 10 0.524844521382317 0.359938456897175 ENSG00000197405:ENST00000355085:exon_47823038_47825327:C5AR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47865911 A/G 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 A:G A G 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47865733_47865950:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47865733_47865950:DHX34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47879279 G/A 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47879181_47879354:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47879181_47879354:DHX34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47880412 G/A 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 A:G G A 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000134815:ENST00000328771:exon_47880357_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000257252:exon_47880357_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000466298:exon_47880357_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000486327:exon_47879181_47880463:DHX34;ENSG00000134815:ENST00000460681:exon_47880357_47880463:DHX34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 47979915 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47979789_47979971:KPTN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48018093 T/A 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:T T A 10 0.524844521382317 0.766113750348865 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48183378 C/T 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48182578_48184533:GLTSCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48198204 C/T 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48198157_48198337:GLTSCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48602948 T/C 1 41 4 45 19.481374623325 2.09937808552927 17.3819965377957 T:C T C 10 0.524844521382317 3.45463466390111e-08 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48602928_48603117:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48602928_48603117:PLA2G4C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48608598 C/G 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 C:G C G 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48608590_48608701:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48608590_48608701:PLA2G4C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48626218 G/A 1 41 40 81 19.481374623325 20.9937808552927 -1.51240623196767 A:G G A 10 0.524844521382317 0.740128850612334 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48626191_48626273:LIG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48631258 G/A 1 29 26 55 13.7795088799128 13.6459575559402 0.133551323972567 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48631167_48631277:LIG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48668816 C/T 1 19 22 41 9.02795409373598 11.546579470411 -2.518625376675 T:C C T 10 0.524844521382317 0.439415065816683 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48668807_48668880:LIG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 48863386 C/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000161558:ENST00000436660:exon_48863329_48863433:TMEM143;ENSG00000161558:ENST00000293261:exon_48863329_48863433:TMEM143 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49119319 G/A 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.655359557772443 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49339098 T/C 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000087076:ENST00000263278:exon_49339062_49339100:HSD17B14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49340517 G/C 1 2 26 28 0.950310957235366 13.6459575559402 -12.6956465987049 C:G G C 10 0.524844521382317 8.22528081656767e-07 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49340355_49340808:PLEKHA4;ENSG00000105559:ENST00000355496:exon_49340355_49340808:PLEKHA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49357086 C/T 0 0 11 11 0 5.77328973520549 -5.77328973520549 T C T 10 0.524844521382317 0.000278736057018616 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49356939_49357088:PLEKHA4;ENSG00000105559:ENST00000355496:exon_49356939_49357088:PLEKHA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49376582 G/A 1 76 74 150 36.1118163749439 38.8384945822915 -2.72667820734754 A:G G A 10 0.524844521382317 0.683108501714594 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49377086 T/C 1 206 207 413 97.8820285952427 108.64281592614 -10.7607873308969 T:C T C 10 0.524844521382317 0.300955326717058 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 186 146 332 88.3789190228891 76.6273001218183 11.7516189010708 A:G G A 10 0.524844521382317 0.206399990249345 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49377492 A/C 1 276 168 444 131.142912098481 88.1738795922293 42.9690325062513 A:C A C 10 0.524844521382317 4.21414747276772e-05 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49377873 G/A 1 275 233 508 130.667756619863 122.28877348208 8.378983137783 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 0.477301069682156 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49377918 G/T 1 252 214 466 119.739180611656 112.316727575816 7.42245303584029 T:G G T 10 0.524844521382317 0.516179400866799 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 176 152 328 83.6273642367122 79.7763672501122 3.85099698660004 A:G A G 10 0.524844521382317 0.698878385362171 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 220 132 352 104.53420529589 69.2794768224658 35.2547284734244 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.000179126465945363 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 232 143 375 110.236071039302 75.0527665576713 35.1833044816311 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000285542062321505 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49391315 C/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:C C A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000104804:ENST00000221399:exon_49391207_49391518:TULP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49416456 G/A 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 C G C 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49472833 C/T 1 52 47 99 24.7080848881195 24.6676925049689 0.0403923831506212 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49471382_49472868:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49471387_49472868:GYS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 22 21 43 10.453420529589 11.0217349490287 -0.568314419439631 A:G G A 10 0.524844521382317 0.879788002022339 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49488848 C/T 1 19 15 34 9.02795409373598 7.87266782073475 1.15528627300122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.733885013169074 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49488718_49488862:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49488718_49488862:GYS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49490523 T/C 1 17 22 39 8.07764313650061 11.546579470411 -3.46893633391036 T:C T C 10 0.524844521382317 0.336176624282279 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49490451_49490642:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000457974:exon_49490451_49490642:GYS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49497155 A/G 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G A G 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49507542 A/G 1 47 32 79 22.3323074950311 16.7950246842341 5.53728281079696 A:G A G 10 0.524844521382317 0.217665686639866 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49838891 C/A 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 A:C C A 10 0.524844521382317 0.463486008093855 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 3 10 13 1.42546643585305 5.24844521382317 -3.82297877797012 A:T:G A T 10 0.524844521382317 0.0487982257626193 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49949949 A/T 1 61 42 103 28.9844841956787 22.0434698980573 6.94101429762135 A:T A T 10 0.524844521382317 0.199470287505276 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949808_49949951:PIH1D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49965173 A/T 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 A:T A T 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965141_49965293:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49965956 G/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965827_49966012:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49965827_49966012:ALDH16A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49967497 G/A 1 10 21 31 4.75155478617683 11.0217349490287 -6.27018016285183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0298941548727311 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967384_49967520:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967384_49967520:ALDH16A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 22 16 38 10.453420529589 8.39751234211707 2.05590818747195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.521170691333303 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49967996 G/A 1 7 18 25 3.32608835032378 9.4472013848817 -6.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0159189909825359 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49977929 A/G 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 A:G A G 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49977860_49977929:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000344019:exon_49977860_49977929:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49977860_49977929:FLT3LG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 49983673 C/T 1 14 14 28 6.65217670064756 7.34782329935244 -0.695646598704876 T:C C T 10 0.524844521382317 0.851171689520466 ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50099422 C/T 1 14 2 16 6.65217670064756 1.04968904276463 5.60248765788293 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00488831457416494 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50097954_50101270:PRR12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50163981 C/T 1 165 145 310 78.4006539719177 76.102455600436 2.29819837148175 T:C C T 10 0.524844521382317 0.8201648714162 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50163970_50164085:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50163970_50164101:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50163970_50164085:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50163970_50164085:IRF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50177038 C/T 1 77 66 143 36.5869718535616 34.6397384112329 1.94723344232867 T:C C T 10 0.524844521382317 0.801794903225118 ENSG00000126453:ENST00000441864:exon_50176955_50177172:BCL2L12;ENSG00000126453:ENST00000246785:exon_50176955_50177172:BCL2L12;ENSG00000126453:ENST00000246784:exon_50176955_50177172:BCL2L12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 22 24 46 10.453420529589 12.5962685131756 -2.14284798358658 A:G G A 10 0.524844521382317 0.557247733939047 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50321587 A/G 1 20 14 34 9.50310957235366 7.34782329935244 2.15528627300122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.496139604892809 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50321546_50321732:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50321546_50321732:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50321546_50321732:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50321546_50321732:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50321546_50321732:MED25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50339548 G/A 1 43 42 85 20.4316855805604 22.0434698980573 -1.61178431749694 A:G G A 10 0.524844521382317 0.745558334173618 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50339483_50339663:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50339483_50339618:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50339483_50339663:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50339483_50339663:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377070:exon_50339483_50339807:MED25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 69 51 120 32.7857280246201 26.7670705904982 6.01865743412196 T:G T G 10 0.524844521382317 0.274631021381933 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 25 32 57 11.8788869654421 16.7950246842341 -4.91613771879207 T:C T C 10 0.524844521382317 0.232448771242303 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50393080 G/A 1 183 363 546 86.953452587036 190.518561261781 -103.565108674745 A:T:G G A 10 0.524844521382317 6.01438320032518e-19 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50412113 C/T 1 159 156 315 75.5497211002116 81.8757453356414 -6.32602423542984 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.498556239204839 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50482480 C/T 1 47 42 89 22.3323074950311 22.0434698980573 0.288837596973789 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50482340_50482499:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50491733 G/A 1 45 23 68 21.3819965377957 12.0714239917933 9.31057254600245 A:G G A 10 0.524844521382317 0.02824292329168 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50491629_50491749:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50491735 T/C 1 45 27 72 21.3819965377957 14.1708020773226 7.21119446047318 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0986625510436357 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50491629_50491749:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50498078 C/T 1 45 30 75 21.3819965377957 15.7453356414695 5.63666089632623 T:C C T 10 0.524844521382317 0.204854829293055 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50498071_50498176:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50498138 G/A 1 34 21 55 16.1552862730012 11.0217349490287 5.13355132397257 A:G G A 10 0.524844521382317 0.178697425321398 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50498071_50498176:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50504056 T/C 1 16 19 35 7.60248765788293 9.97204590626402 -2.36955824838109 T:C T C 10 0.524844521382317 0.499305362167602 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50504047_50504111:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50510862 A/G 1 57 67 124 27.0838622812079 35.1645829326152 -8.08072065140731 A:G A G 10 0.524844521382317 0.151080918217767 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50510826_50511083:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50511060 G/T 1 48 65 113 22.8074629736488 34.1148938898506 -11.3074309162018 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.037919818975384 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50510826_50511083:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50512606 G/A 1 35 48 83 16.6304417516189 25.1925370263512 -8.56209527473231 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0622978410237307 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50512493_50512642:VRK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50547945 A/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50548191 C/T 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50548443 G/A 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 A:G G A 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50548626 A/G 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50548544_50548750:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50548687 T/C 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50548544_50548750:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50548918 C/T 1 14 9 23 6.65217670064756 4.72360069244085 1.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.532398335432504 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50548835_50549263:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50549461 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50549405_50549545:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50549661 C/T 1 21 8 29 9.97826505097134 4.19875617105854 5.77950887991281 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0395712872704 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50549627_50549729:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50549684 T/G 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 T:G T G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50549627_50549729:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50550127 A/G 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50549814_50550214:ZNF473 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50885823 G/A 1 118 118 236 56.0683464768866 61.9316535231134 -5.86330704622681 A:G G A 10 0.524844521382317 0.473546335295894 ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50885713_50886266:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50885713_50886218:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50885713_50885859:NR1H2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50905042 G/A 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 A:G G A 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50905074 G/A 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50905762 T/C 1 20 36 56 9.50310957235366 18.8944027697634 -9.39129319740975 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0153237046466878 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905711_50905792:POLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50916772 T/C 1 22 16 38 10.453420529589 8.39751234211707 2.05590818747195 T:C T C 10 0.524844521382317 0.521170691333303 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50916683_50916778:POLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 62 45 107 29.4596396742963 23.6180034622043 5.84163621209208 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.287223017606881 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 50984002 G/A 1 41 31 72 19.481374623325 16.2701801628518 3.21119446047318 A:G G A 10 0.524844521382317 0.48038142333699 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 312 337 649 148.248509328717 176.872603705841 -28.6240943771237 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.025070961890544 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 196 216 412 93.1304738090659 113.36641661858 -20.2359428095146 T:C:G C G 10 0.524844521382317 0.0484329006652347 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 198 267 465 94.0807847663012 140.133487209079 -46.0527024427774 A:G A G 10 0.524844521382317 2.25399233134755e-05 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 51728621 G/A 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000105383:ENST00000262262:exon_51728474_51728854:CD33 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 51729216 T/C 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 T T 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000105383:ENST00000262262:exon_51729059_51729337:CD33;ENSG00000105383:ENST00000421133:exon_51729059_51729337:CD33;ENSG00000105383:ENST00000436584:exon_51729059_51729337:CD33 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 51870706 T/G 1 2 10 12 0.950310957235366 5.24844521382317 -4.2981342565878 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0177361814639833 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 51875079 G/A 1 41 23 64 19.481374623325 12.0714239917933 7.40995063153171 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0789997627075996 ENSG00000105374:ENST00000221978:exon_51874874_51875089:NKG7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52448669 G/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000176024:ENST00000391794:exon_52447372_52449005:ZNF613;ENSG00000176024:ENST00000293471:exon_52447372_52449005:ZNF613 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52468998 A/G 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 12 18 30 5.7018657434122 9.4472013848817 -3.74533564146951 A:G A G 10 0.524844521382317 0.201690400601927 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52496149 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000197619:ENST00000376716:exon_52494588_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000354939:exon_52494748_52498090:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391793:exon_52496133_52496567:ZNF615 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52520183 T/C 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52521296 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000142556:ENST00000356322:exon_52521261_52521356:ZNF614;ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52521261_52521356:ZNF614 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52618671 G/A 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000204611:ENST00000330123:exon_52617654_52620277:ZNF616 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52619065 T/C 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 T:C T C 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000204611:ENST00000330123:exon_52617654_52620277:ZNF616 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52714579 C/A 1 135 106 241 64.1459896133872 55.6335192665256 8.51247034686162 A:C C A 10 0.524844521382317 0.302095251127042 ENSG00000105568:ENST00000454220:exon_52714513_52714591:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000322088:exon_52714513_52714745:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000490868:exon_52714513_52714736:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000468280:exon_52714513_52714947:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000462990:exon_52714513_52714745:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000473455:exon_52714513_52714747:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000444322:exon_52714513_52714745:PPP2R1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52869312 T/C 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C T C 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000167554:ENST00000403906:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000321287:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000327920:exon_52868951_52870111:ZNF610 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 52869534 G/A 1 10 2 12 4.75155478617683 1.04968904276463 3.7018657434122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0413693580129535 ENSG00000167554:ENST00000403906:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000321287:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000327920:exon_52868951_52870111:ZNF610 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53117462 G/A 1 29 22 51 13.7795088799128 11.546579470411 2.23292940950183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.576615559792462 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 28 27 55 13.3043534012951 14.1708020773226 -0.866448676027433 T:C C T 10 0.524844521382317 0.892813149631183 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 12 17 29 5.7018657434122 8.92235686349939 -3.22049112008719 A:C C A 10 0.524844521382317 0.266620142972611 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53269933 T/C 1 13 21 34 6.17702122202988 11.0217349490287 -4.84471372699878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.121470856261209 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53270257 C/T 1 13 14 27 6.17702122202988 7.34782329935244 -1.17080207732256 T:C C T 10 0.524844521382317 0.702665708426939 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53270623 G/C 1 15 16 31 7.12733217926525 8.39751234211707 -1.27018016285183 C:G G C 10 0.524844521382317 0.720479372385213 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53302942 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000198538:ENST00000360272:exon_53300659_53304955:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000438150:exon_53300661_53304940:ZNF28;ENSG00000198538:ENST00000457749:exon_53300662_53304955:ZNF28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53344619 G/A 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53344919 T/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:G T G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000204604:ENST00000243639:exon_53341786_53345404:ZNF468;ENSG00000204604:ENST00000396409:exon_53343932_53345404:ZNF468 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53384185 C/T 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53432603 G/T 1 14 4 18 6.65217670064756 2.09937808552927 4.55279861511829 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0345389637529455 ENSG00000221874:ENST00000313956:exon_53430388_53432667:ZNF321 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 T:C C T 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53454735 A/G 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53572917 G/A 1 10 16 26 4.75155478617683 8.39751234211707 -3.64595755594024 A:G G A 10 0.524844521382317 0.172006972677125 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53573142 G/A 1 11 14 25 5.22671026479451 7.34782329935244 -2.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.428460468329696 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53577436 T/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53577393_53577521:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000355147:exon_53577393_53577521:ZNF160 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53645291 T/C 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000197937:ENST00000334197:exon_53642648_53645809:ZNF347;ENSG00000197937:ENST00000452676:exon_53643171_53645809:ZNF347;ENSG00000197937:ENST00000391778:exon_53643171_53645809:ZNF347 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 53958798 G/T 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:G G T 10 0.524844521382317 0.618425587093261 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54080708 C/T 1 1 35 36 0.475155478617683 18.3695582483811 -17.8944027697634 T:C C T 10 0.524844521382317 1.78092603838496e-10 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54080698_54080944:ZNF331 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54376927 C/T 1 15 17 32 7.12733217926525 8.92235686349939 -1.79502468423414 T:C C T 10 0.524844521382317 0.59689936717842 ENSG00000179820:ENST00000421337:exon_54376782_54377510:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000336967:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391770:exon_54376782_54379691:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000448420:exon_54376782_54377348:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000439000:exon_54376782_54377561:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391771:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391769:exon_54376782_54379689:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391768:exon_54376782_54377873:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000414489:exon_54376782_54377223:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000415619:exon_54376784_54377098:MYADM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54610170 C/T 1 179 237 416 85.0528306725653 124.388151567609 -39.3353208950438 T:C C T 10 0.524844521382317 0.000123866643270760 ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54621656 G/A 1 90 65 155 42.7639930755915 34.1148938898506 8.64909918574087 A:G G A 10 0.524844521382317 0.172092847513767 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54621651_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445811:exon_54621628_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54621651_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54621651_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445124:exon_54621621_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000447810:exon_54621651_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54621651_54621835:PRPF31 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54696167 C/A 1 31 27 58 14.7298198371482 14.1708020773226 0.559017759825617 A:C C A 10 0.524844521382317 0.896320836164127 ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695967_54696206:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695967_54696224:TSEN34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 47 66 113 22.3323074950311 34.6397384112329 -12.3074309162018 A:T:G T G 10 0.524844521382317 0.0234696892225403 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 14 38 52 6.65217670064756 19.944091812528 -13.2919151118805 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000239703768325557 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 41 33 74 19.481374623325 17.3198692056165 2.16150541770854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.642993965015186 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 43 32 75 20.4316855805604 16.7950246842341 3.63666089632623 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.420344177392767 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 33 25 58 15.6801307943835 13.1211130345579 2.55901775982562 C:G C G 10 0.524844521382317 0.514401828048988 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54974068 G/A 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 54974113 C/A 1 14 16 30 6.65217670064756 8.39751234211707 -1.74533564146951 A:C C A 10 0.524844521382317 0.585512927936858 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55143200 G/T 1 66 48 114 31.3602615887671 25.1925370263512 6.16772456241587 A:T:G G T 10 0.524844521382317 0.261378628976542 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 72 45 117 34.2111944604732 23.6180034622043 10.5931909982689 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0520918870568772 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 83 62 145 39.4379047252677 32.5403603257037 6.89754439956404 T:G G T 10 0.524844521382317 0.279774439769117 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55143982 T/C 1 69 60 129 32.7857280246201 31.490671282939 1.29505674168111 T:C T C 10 0.524844521382317 0.860251637701067 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143915_55144211:LILRB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55144556 G/A 1 62 86 148 29.4596396742963 45.1366288388793 -15.6769891645829 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0106175780401043 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55145093 G/C 1 66 68 134 31.3602615887671 35.6894274539976 -4.32916586523047 C:G G C 10 0.524844521382317 0.489255421320437 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145089_55145139:LILRB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 198 92 290 94.0807847663012 48.2856959671732 45.7950887991281 T:C C T 10 0.524844521382317 5.15786563761152e-08 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55178148 G/A 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 A:G G A 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55556573 C/T 1 8 13 21 3.80124382894146 6.82297877797012 -3.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.197904266837508 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55555711_55556677:RDH13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55556637 G/A 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55555711_55556677:RDH13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55606944 G/A 1 31 25 56 14.7298198371482 13.1211130345579 1.60870680259025 A:G G A 10 0.524844521382317 0.690306340969539 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55606813_55606968:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55606813_55606971:PPP1R12C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55742176 T/C 1 154 147 301 73.1739437071232 77.1521446432006 -3.97820093607741 T:C T C 10 0.524844521382317 0.64492755362421 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55742142_55742252:PPP6R1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55899214 A/G 1 12 8 20 5.7018657434122 4.19875617105854 1.50310957235366 A:G A G 10 0.524844521382317 0.655495661698291 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55899434 G/A 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55899470 A/G 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G A G 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 55994894 C/T 1 19 13 32 9.02795409373598 6.82297877797012 2.20497531576586 T:C C T 10 0.524844521382317 0.482276506766734 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 52 40 92 24.7080848881195 20.9937808552927 3.71430403282684 A:G G A 10 0.524844521382317 0.466058786006988 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 56162712 G/C 1 31 29 60 14.7298198371482 15.2204911200872 -0.490671282939019 C:G G C 10 0.524844521382317 0.898083520792394 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 32 43 75 15.2049753157659 22.5683144194396 -7.36333910367377 T:C C T 10 0.524844521382317 0.105070871259535 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 56185320 T/A 1 268 207 475 127.341668269539 108.64281592614 18.6988523433995 A:T:G T A 10 0.524844521382317 0.0891894798627419 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56185300_56186081:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56185300_56186081:U2AF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 56599914 C/T 1 58 47 105 27.5590177598256 24.6676925049689 2.89132525485672 T:C C T 10 0.524844521382317 0.625481780833078 ENSG00000142409:ENST00000270459:exon_56598732_56600461:ZNF787 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 57132968 G/A 1 6 13 19 2.8509328717061 6.82297877797012 -3.97204590626402 A:G G A 10 0.524844521382317 0.105404731313452 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 57840547 A/G 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000178229:ENST00000321545:exon_57839072_57842144:ZNF543 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 2 10 12 0.950310957235366 5.24844521382317 -4.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0177361814639833 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 57946924 G/C 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 C:G G C 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57946693_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57946697_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000415248:exon_57946711_57946961:ZNF749 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 57956828 T/G 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:G T G 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57954659_57957191:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57954659_57956853:ZNF749 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58084911 C/T 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000083817:ENST00000196489:exon_58082935_58085069:ZNF416;ENSG00000083817:ENST00000359489:exon_58084378_58085069:ZNF416;ENSG00000083817:ENST00000428052:exon_58084378_58085069:ZNF416 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58132216 A/G 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 A:G A G 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58152361 T/A 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 A:T T A 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 12 21 33 5.7018657434122 11.0217349490287 -5.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0803628498484152 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 11 21 32 5.22671026479451 11.0217349490287 -5.79502468423414 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0504703187351058 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 10 22 32 4.75155478617683 11.546579470411 -6.79502468423414 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0203155310821518 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 11 17 28 5.22671026479451 8.92235686349939 -3.69564659870487 T:C C T 10 0.524844521382317 0.187089974666476 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 13 23 36 6.17702122202988 12.0714239917933 -5.89440276976341 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0650789883474745 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 14 15 29 6.65217670064756 7.87266782073475 -1.22049112008719 A:G A G 10 0.524844521382317 0.711938142382318 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58287931 T/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000083828:ENST00000396154:exon_58287911_58288037:ZNF586 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58453342 T/C 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000152454:ENST00000282308:exon_58452206_58454015:ZNF256 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58597611 G/C 1 21 4 25 9.97826505097134 2.09937808552927 7.87888696544208 C:G G C 10 0.524844521382317 0.00196345877287144 ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58597541_58597633:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58597541_58597633:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58597541_58597633:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58597541_58597633:ZSCAN18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 45 51 96 21.3819965377957 26.7670705904982 -5.38507405270243 A:G A G 10 0.524844521382317 0.306916388290338 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58858814 G/A 1 82 83 165 38.96274924665 43.5620952747323 -4.5993460280823 A:G G A 10 0.524844521382317 0.483857610191592 ENSG00000121410:ENST00000263100:exon_58858719_58859006:A1BG;ENSG00000121410:ENST00000453054:exon_58858719_58859006:A1BG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 12 18 30 5.7018657434122 9.4472013848817 -3.74533564146951 A:G A G 10 0.524844521382317 0.201690400601927 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58991781 C/T 1 16 12 28 7.60248765788293 6.2981342565878 1.30435340129513 T:C C T 10 0.524844521382317 0.706809371150625 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 58991874 G/A 1 14 17 31 6.65217670064756 8.92235686349939 -2.27018016285183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.473797754482654 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 A:G G A 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 19 59074653 T/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231061 T/C 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000035115:ENST00000403712:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000403657:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000473104:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000403658:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000479739:exon_230547_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000451005:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000472012:exon_231023_231159:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000431160:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000488979:exon_231023_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000471948:exon_230378_231191:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000481932:exon_230379_231191:SH3YL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 169 151 320 80.3012758863884 79.2515227287299 1.04975315765857 A:G A G 10 0.524844521382317 0.911017454007985 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 51 47 98 24.2329294095018 24.6676925049689 -0.434763095467062 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 3481531 T/C 1 47 41 88 22.3323074950311 21.518625376675 0.813682118356105 T:C T C 10 0.524844521382317 0.915166530742379 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3481463_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3481463_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3481466_3481872:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000452495:exon_3481486_3481566:TTC15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 99 124 223 47.0403923831506 65.0807206514073 -18.0403282682567 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0158205962957850 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 3597974 T/C 1 7 13 20 3.32608835032378 6.82297877797012 -3.49689042764634 T:C T C 10 0.524844521382317 0.124086328149616 ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 9634856 A/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000134330:ENST00000481367:exon_9634831_9634989:IAH1;ENSG00000151694:ENST00000310823:exon_9634766_9634896:ADAM17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 10263874 C/G 1 49 71 120 23.2826184522665 37.2639610181445 -13.981342565878 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0132630346253379 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498235:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10263863_10264244:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10263863_10263979:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000474701:exon_10263863_10263979:RRM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 441 298 739 209.543566070398 156.40366737193 53.1398986984678 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 9.2404877582565e-05 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 10583925 C/T 1 95 155 250 45.1397704686799 81.3509008142591 -36.2111303455792 T:C C T 10 0.524844521382317 4.58170201405213e-06 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10583828_10583962:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10583828_10583962:ODC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 10925113 C/T 1 272 238 510 129.24229018401 124.912996088991 4.32929409501835 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.722903405442834 ENSG00000143882:ENST00000381661:exon_10923300_10925236:ATP6V1C2;ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10925060_10925156:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10925060_10925156:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10925060_10925156:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10925060_10925156:PDIA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 122 136 258 57.9689683913573 71.3788549079951 -13.4098865166378 T:C C T 10 0.524844521382317 0.104919967680204 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 43 28 71 20.4316855805604 14.6956465987049 5.73603898185549 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.191766304108668 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 11955322 G/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000134324:ENST00000396099:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000256720:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000449576:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000425416:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000396097:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000404113:exon_11955214_11955366:LPIN1;ENSG00000134324:ENST00000453987:exon_11955214_11955366:LPIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 15307225 G/C 1 26 17 43 12.3540424440598 8.92235686349939 3.43168558056037 C:G G C 10 0.524844521382317 0.359938456897175 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15307032_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15307033_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15307038_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15307040_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000433283:exon_15307040_15307447:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000485694:exon_15307041_15307447:NBAS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 32 36 68 15.2049753157659 18.8944027697634 -3.68942745399755 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.396710558758125 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 15614404 T/C 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15614191_15614448:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15614191_15614448:NBAS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 15614419 A/C 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 A:C A C 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15614191_15614448:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15614191_15614448:NBAS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 17946310 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17946164_17946340:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17946164_17946340:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000534669:exon_17946164_17946411:GEN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 17961321 A/G 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 A:G A G 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961245_17961388:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961245_17961388:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000528873:exon_17961245_17961388:GEN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 17962450 A/G 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 A:G A G 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 20096846 C/G 1 42 41 83 19.9565301019427 21.518625376675 -1.56209527473231 C:G C G 10 0.524844521382317 0.742871612668413 ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20096404_20096887:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20096514_20096887:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000495698:exon_20096787_20096887:TTC32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 20838273 G/A 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20838196_20838275:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 40 32 72 19.0062191447073 16.7950246842341 2.21119446047318 T:C T C 10 0.524844521382317 0.638147075989301 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 25064193 G/A 1 13 21 34 6.17702122202988 11.0217349490287 -4.84471372699878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.121470856261209 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000427849:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000430440:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000435135:exon_25064128_25064255:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000479517:exon_25064128_25064255:ADCY3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 26502011 G/A 1 88 76 164 41.8136821183561 39.8881836250561 1.92549849330002 A:G G A 10 0.524844521382317 0.814666758850812 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502003_26502183:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502003_26502183:HADHB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27001224 C/G 1 19 12 31 9.02795409373598 6.2981342565878 2.72981983714817 C:G C G 10 0.524844521382317 0.371425597340827 ENSG00000213699:ENST00000429494:exon_27000910_27004008:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000344420:exon_27000910_27004099:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000416475:exon_27000910_27001784:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000433694:exon_27000910_27001784:C2orf18;ENSG00000213699:ENST00000414029:exon_27000910_27004015:C2orf18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27262944 G/A 1 70 97 167 33.2608835032378 50.9099185740847 -17.6490350708469 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00661702623911857 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000434544:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460665:exon_27262229_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000469445:exon_27262788_27263364:TMEM214 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27322606 T/C 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000138030:ENST00000260599:exon_27322533_27323619:KHK;ENSG00000138030:ENST00000260598:exon_27322533_27323640:KHK;ENSG00000138030:ENST00000490823:exon_27322533_27322769:KHK;ENSG00000138030:ENST00000464371:exon_27322533_27322837:KHK;ENSG00000138028:ENST00000440612:exon_27321757_27322708:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000402550:exon_27321757_27322708:CGREF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 84 56 140 39.9130602038854 29.3912931974098 10.5217670064756 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0761423359712423 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27430561 G/A 1 20 9 29 9.50310957235366 4.72360069244085 4.77950887991281 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0936805033763996 ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000445802:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000412471:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000401463:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000432106:exon_27430126_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000426119:exon_27430172_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000414408:exon_27430283_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27430343_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000430186:exon_27430403_27430658:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000442731:exon_27430438_27430658:SLC5A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27439751 G/T 1 162 201 363 76.9751875360647 105.493748797846 -28.5185612617811 T:G G T 10 0.524844521382317 0.00319738119069366 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439712_27440024:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439712_27440046:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439712_27440025:C2orf28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27445518 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27445387_27445528:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27445387_27445528:CAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27459364 T/C 1 26 19 45 12.3540424440598 9.97204590626402 2.38199653779574 T:C T C 10 0.524844521382317 0.55132909892401 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27459152_27459391:CAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27461304 G/A 1 30 24 54 14.2546643585305 12.5962685131756 1.65839584535488 A:G G A 10 0.524844521382317 0.684579476813733 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461299_27461500:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461299_27461500:CAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27462651 T/C 1 30 25 55 14.2546643585305 13.1211130345579 1.13355132397257 T:C T C 10 0.524844521382317 0.7885860107291 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462565_27463090:CAD;ENSG00000084774:ENST00000491461:exon_27462565_27462666:CAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 27822454 A/C 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 A:C A C 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27822450_27822545:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27822450_27822545:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27822450_27822545:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000494548:exon_27822450_27822545:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27822450_27822545:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27822450_27822545:ZNF512 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 29073249 T/C 1 27 24 51 12.8291979226774 12.5962685131756 0.232929409501835 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163806:ENST00000379579:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000334056:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000439646:exon_29072716_29073300:SPDYA;ENSG00000171103:ENST00000419999:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29073194_29073271:TRMT61B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 30 14 44 14.2546643585305 7.34782329935244 6.90684105917805 T:C T C 10 0.524844521382317 0.04855481047797 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 29092702 C/G 1 29 14 43 13.7795088799128 7.34782329935244 6.43168558056037 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0657019894393955 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 19 16 35 9.02795409373598 8.39751234211707 0.630441751618907 T:G G T 10 0.524844521382317 0.867082324177013 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 30 22 52 14.2546643585305 11.546579470411 2.70808488811952 A:G A G 10 0.524844521382317 0.489537780073659 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 106 103 209 50.3664807334744 54.0589857023786 -3.69250496890425 T:C T C 10 0.524844521382317 0.628189639254971 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 60 66 126 28.509328717061 34.6397384112329 -6.13040969417194 T:C T C 10 0.524844521382317 0.285366624467922 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 32822957 G/A 1 18 22 40 8.5527986151183 11.546579470411 -2.99378085529268 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34802327982474 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 32823018 C/A 1 34 29 63 16.1552862730012 15.2204911200872 0.934795152914031 A:C C A 10 0.524844521382317 0.899775143288907 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 33774761 T/C 1 33 14 47 15.6801307943835 7.34782329935244 8.3323074950311 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0185837896458111 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33774671_33774818:RASGRP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 33809826 T/G 1 103 92 195 48.9410142976214 48.2856959671732 0.655318330448189 T:G T G 10 0.524844521382317 0.942944568111538 ENSG00000119812:ENST00000238823:exon_33808725_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000395190:exon_33808728_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000441530:exon_33808728_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000474985:exon_33808729_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000403368:exon_33808737_33810764:FAM98A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 37227797 C/G 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37227729_37227956:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37227729_37227956:HEATR5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 37454998 A/G 1 75 68 143 35.6366608963262 35.6894274539976 -0.0527665576713261 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 37494591 A/G 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000452104:exon_37494573_37494679:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000443977:exon_37494573_37494679:PRKD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 37873069 T/A 1 78 94 172 37.0621273321793 49.3353850099378 -12.2732576777585 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0667686110316356 ENSG00000163171:ENST00000295324:exon_37869032_37873965:CDC42EP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 38298169 G/C 1 22 9 31 10.453420529589 4.72360069244085 5.72981983714817 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0471401600802982 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 38301803 C/G 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38301489_38302532:CYP1B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 38302390 G/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38301489_38302532:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000490576:exon_38302102_38302532:CYP1B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 T:G T G 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 39088255 T/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000479345:exon_39088141_39088979:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000355320:exon_39088141_39088979:DHX57 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 42508048 C/T 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42507990_42508113:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42507990_42508113:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42507990_42508113:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42507990_42508113:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42507990_42508113:EML4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 20 13 33 9.50310957235366 6.82297877797012 2.68013079438354 C:G G C 10 0.524844521382317 0.387107242437572 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 15 6 21 7.12733217926525 3.1490671282939 3.97826505097134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.124172769860965 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 43015684 G/A 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 A:T T A 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 43015717 G/A 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 43571347 G/A 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 A G A 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000486735:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000473004:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43570162_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000497770:exon_43571260_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43571261_43571376:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485353:exon_43571296_43571376:THADA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 43801712 A/G 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 A:G A G 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43801475_43801952:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 43801988 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 43802153 T/C 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402360:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000409142:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000404790:exon_43801475_43802166:THADA;ENSG00000115970:ENST00000403856:exon_43801475_43802166:THADA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 44001216 C/T 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 T:C C T 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44001178_44001285:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44001178_44001285:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44001182_44001285:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44001188_44001285:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44001188_44001285:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44001188_44001285:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44001203_44001285:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44001203_44001285:DYNC2LI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 44028013 A/T 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 A:T A T 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 46 34 80 21.8571520164134 17.8447137269988 4.01243828941464 T:C T C 10 0.524844521382317 0.433468696015540 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 44550528 T/C 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000260648:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409272:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000410081:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000378520:exon_44550401_44550550:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000378511:exon_44550401_44550550:PREPL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 A:C C A 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 46611697 C/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C C T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000116016:ENST00000263734:exon_46611648_46613836:EPAS1;ENSG00000116016:ENST00000443288:exon_46611648_46613836:EPAS1;ENSG00000116016:ENST00000466465:exon_46611648_46613835:EPAS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 46739157 A/G 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 46739720 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000250565:ENST00000306448:exon_46738986_46739951:ATP6V1E2;ENSG00000250565:ENST00000522587:exon_46739006_46739951:ATP6V1E2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 47710120 G/C 1 31 25 56 14.7298198371482 13.1211130345579 1.60870680259025 C:G G C 10 0.524844521382317 0.690306340969539 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47709918_47710367:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47709918_47710360:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47709918_47710162:MSH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 48707145 C/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000442041:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000443895:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000407194:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000405538:exon_48707063_48707155:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000455978:exon_48707063_48707155:KLRAQ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 48725670 G/C 1 15 18 33 7.12733217926525 9.4472013848817 -2.31986920561646 C:G G C 10 0.524844521382317 0.486957322619883 ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48725632_48725874:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48725632_48725874:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48725632_48725874:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48725632_48725874:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000443895:exon_48725632_48725874:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48725632_48725874:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000407194:exon_48725632_48725874:KLRAQ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 54093956 G/A 1 22 19 41 10.453420529589 9.97204590626402 0.481374623325005 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000476586:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000488687:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000466539:exon_54093884_54094017:PSME4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 54849508 A/G 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000389980:exon_54849437_54849624:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54849437_54849624:SPTBN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 58 42 100 27.5590177598256 22.0434698980573 5.5155478617683 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.27304554629933 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 55481801 A/G 1 36 52 88 17.1055972302366 27.2919151118805 -10.1863178816439 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0326218886715161 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55481790_55481961:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55481790_55481961:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55481790_55481961:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55481790_55481961:MTIF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 55561896 A/G 1 61 91 152 28.9844841956787 47.7608514457908 -18.7763672501122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00256726700180652 ENSG00000115355:ENST00000336838:exon_55561230_55562300:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000263630:exon_55561230_55562300:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000436346:exon_55561230_55562300:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000413716:exon_55561230_55562300:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000422883:exon_55561230_55562300:CCDC88A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 55771169 A/T 1 46 36 82 21.8571520164134 18.8944027697634 2.96274924665001 A:T A T 10 0.524844521382317 0.580675516255972 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 55872538 T/C 1 24 23 47 11.4037314868244 12.0714239917933 -0.667692504968898 T:C T C 10 0.524844521382317 0.884546185065466 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55871772_55872567:PNPT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 58688696 C/A 0 53 0 53 25.1832403667372 0 25.1832403667372 C C 10 0.524844521382317 1.89459182000088e-15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 61415361 T/C 1 158 160 318 75.0745656215939 83.9751234211707 -8.90055779957679 T:C T C 10 0.524844521382317 0.339865653476244 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 141 144 285 66.9969224850933 75.5776110790536 -8.58068859396033 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.313888531939809 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 A:G A G 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 61711211 C/T 1 80 79 159 38.0124382894146 41.462717189203 -3.45027889978839 T:C C T 10 0.524844521382317 0.633915905932374 ENSG00000082898:ENST00000401558:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000428210:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000481073:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000404992:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000406957:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000492182:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000461407:exon_61711072_61713097:XPO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 61713095 G/A 1 58 54 112 27.5590177598256 28.3416041546451 -0.7825863948195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.924731287775423 ENSG00000082898:ENST00000401558:exon_61712903_61713097:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000428210:exon_61712903_61713097:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000481073:exon_61712903_61713097:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000404992:exon_61712903_61713097:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000406957:exon_61712903_61713097:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000461407:exon_61711072_61713097:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000494468:exon_61712719_61713097:XPO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 62066927 A/G 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62066556_62067660:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000307507:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478822:exon_62066556_62067716:FAM161A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 62100188 A/G 1 168 162 330 79.8261204077707 85.0248124639353 -5.1986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.581766239616852 ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62100137_62100247:CCT4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 53 64 117 25.1832403667372 33.5900493684683 -8.40680900173108 A:G G A 10 0.524844521382317 0.138310760076730 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 67624779 C/T 1 13 17 30 6.17702122202988 8.92235686349939 -2.74533564146951 T:C C T 10 0.524844521382317 0.362755487440991 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67624451_67624803:ETAA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 67630476 T/C 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C T C 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 67631395 G/A 1 13 21 34 6.17702122202988 11.0217349490287 -4.84471372699878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.121470856261209 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 67631800 A/G 1 21 28 49 9.97826505097134 14.6956465987049 -4.71738154773353 A:G A G 10 0.524844521382317 0.198842918946795 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 123 119 242 58.444123869975 62.4564980444957 -4.0123741745207 T:G G T 10 0.524844521382317 0.607358902941419 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 412 261 673 195.764057190485 136.984420080785 58.7796371097007 C:G G C 10 0.524844521382317 5.99665895475585e-06 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 68622990 T/C 1 419 296 715 199.090145540809 155.353978329166 43.7361672116434 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.00111039920857330 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 69049956 G/A 1 31 1 32 14.7298198371482 0.524844521382317 14.2049753157659 A:G G A 10 0.524844521382317 6.21741573406207e-08 ENSG00000163219:ENST00000409202:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000295381:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000467265:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409030:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409220:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000482106:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497259:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000479844:exon_69049472_69050004:ARHGAP25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 70037756 G/A 1 7 23 30 3.32608835032378 12.0714239917933 -8.74533564146951 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00153168578940995 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70035038_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70037726_70037857:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000468815:exon_70037726_70038034:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000472124:exon_70037726_70037805:ANXA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 70057094 A/G 1 14 4 18 6.65217670064756 2.09937808552927 4.55279861511829 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0345389637529455 ENSG00000087338:ENST00000282570:exon_70056774_70057284:GMCL1;ENSG00000087338:ENST00000468386:exon_70056818_70057284:GMCL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 70387821 G/C 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 C:G G C 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000115998:ENST00000264434:exon_70387757_70387919:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000420306:exon_70387757_70387919:C2orf42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 70504327 C/T 1 7 14 21 3.32608835032378 7.34782329935244 -4.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0847282864109202 ENSG00000116005:ENST00000433351:exon_70503866_70508323:PCYOX1;ENSG00000116005:ENST00000264441:exon_70504152_70506235:PCYOX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 59 60 119 28.0341732384433 31.490671282939 -3.45649804449572 A:G G A 10 0.524844521382317 0.582027326017569 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 73477527 C/T 1 309 253 562 146.823042892864 132.785663909726 14.0373789831379 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.237330205342227 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 73746923 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73746902_73747143:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73746902_73747143:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000423048:exon_73746902_73747143:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73746902_73747143:ALMS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 74057995 T/C 1 41 38 79 19.481374623325 19.944091812528 -0.46271718920304 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124356:ENST00000339566:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000409707:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000452725:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000432295:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000424659:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394073:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394070:exon_74057972_74058186:STAMBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 75104383 G/A 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75104293_75104448:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75104293_75104448:HK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 19 10 29 9.02795409373598 5.24844521382317 3.77950887991281 T:C C T 10 0.524844521382317 0.193890918307861 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 12 18 30 5.7018657434122 9.4472013848817 -3.74533564146951 C:G C G 10 0.524844521382317 0.201690400601927 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 75185856 G/T 1 46 75 121 21.8571520164134 39.3633391036738 -17.5061870872604 T:G G T 10 0.524844521382317 0.00184897321323678 ENSG00000115350:ENST00000483063:exon_75185619_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000393918:exon_75185775_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000485527:exon_75185832_75186019:POLE4;ENSG00000115350:ENST00000459636:exon_75185833_75186019:POLE4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 43 23 66 20.4316855805604 12.0714239917933 8.36026158876708 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0479084389672506 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 85628745 C/T 1 118 79 197 56.0683464768866 41.462717189203 14.6056292876836 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0385926623935629 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85628652_85628794:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628652_85628806:CAPG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 85628983 C/T 1 62 50 112 29.4596396742963 26.2422260691158 3.2174136051805 T:C C T 10 0.524844521382317 0.571107229476661 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628908_85629281:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000415012:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000491267:exon_85628768_85629281:CAPG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 159 145 304 75.5497211002116 76.102455600436 -0.552734500224361 C:G C G 10 0.524844521382317 0.954272853214367 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 85786074 G/A 1 20 28 48 9.50310957235366 14.6956465987049 -5.19253702635121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.149172943846481 ENSG00000115486:ENST00000233838:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000430215:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000423570:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000428479:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000421496:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000481541:exon_85785707_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000496962:exon_85785848_85786198:GGCX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 441 355 796 209.543566070398 186.319805090723 23.2237609796757 A:G A G 10 0.524844521382317 0.102593146719616 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 65 46 111 30.8851061101494 24.1428479835866 6.74225812656282 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.217092826647115 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 86255165 C/T 1 19 14 33 9.02795409373598 7.34782329935244 1.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.604302645486145 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86255008_86255172:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86255008_86255172:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000471427:exon_86255089_86255172:POLR1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 86258559 T/C 1 18 9 27 8.5527986151183 4.72360069244085 3.82919792267744 T:C T C 10 0.524844521382317 0.177382710428329 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86258453_86258758:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86258544_86258758:POLR1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 86272758 G/A 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86272740_86272892:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86272740_86272892:POLR1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 86344237 A/G 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G A G 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409326:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409783:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000418628:exon_86344178_86344243:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86344178_86344282:PTCD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 86357774 A/G 1 13 19 32 6.17702122202988 9.97204590626402 -3.79502468423414 A:G A G 10 0.524844521382317 0.215805568250847 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86357771_86357860:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86357771_86357860:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000464541:exon_86357771_86358229:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000476215:exon_86357771_86357860:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000487043:exon_86357771_86357860:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000469585:exon_86357771_86357860:PTCD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 86360540 G/C 1 28 19 47 13.3043534012951 9.97204590626402 3.3323074950311 C:G G C 10 0.524844521382317 0.381795948985569 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86360469_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86360469_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000487043:exon_86360469_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000469585:exon_86360469_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000455260:exon_86360469_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000493430:exon_86360301_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000467273:exon_86360469_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000494323:exon_86360469_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000472044:exon_86360392_86360559:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000477520:exon_86360446_86360559:PTCD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 86385812 T/C 1 15 27 42 7.12733217926525 14.1708020773226 -7.04346989805731 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0310928872632177 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 86979093 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000153561:ENST00000283632:exon_86979019_86979153:RMND5A;ENSG00000153561:ENST00000466417:exon_86979019_86979153:RMND5A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 96944355 G/A 1 235 179 414 111.661537475156 93.9471693274347 17.7143681477208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0850173302399767 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944285_96944449:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944285_96944449:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944285_96944449:SNRNP200 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 98 113 211 46.5652369045329 59.3074309162018 -12.7421940116689 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0848047387549983 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 16 14 30 7.60248765788293 7.34782329935244 0.254664358530491 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 97009909 G/A 1 6 17 23 2.8509328717061 8.92235686349939 -6.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0121225542609254 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97009843_97009967:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97009843_97009967:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97009843_97009967:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97009843_97009967:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97009843_97009967:NCAPH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 19 15 34 9.02795409373598 7.87266782073475 1.15528627300122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.733885013169074 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 97493877 T/C 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000168763:ENST00000377060:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000424641:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000305510:exon_97493836_97493932:CNNM3;ENSG00000168763:ENST00000465224:exon_97493468_97494871:CNNM3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 51 60 111 24.2329294095018 31.490671282939 -7.25774187343718 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.183536207549744 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 98277090 T/C 1 28 28 56 13.3043534012951 14.6956465987049 -1.39129319740975 T:C T C 10 0.524844521382317 0.789354533109478 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98277034_98277109:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98277034_98277109:ACTR1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 99226173 T/A 1 2 9 11 0.950310957235366 4.72360069244085 -3.77328973520549 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0314919893609911 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99225042_99226502:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99226106_99226502:UNC50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 37 23 60 17.5807527088543 12.0714239917933 5.50932871706098 T:C T C 10 0.524844521382317 0.157927113837502 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 60 53 113 28.509328717061 27.8167596332628 0.692569083798183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.9251598049821 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 99797431 C/T 1 46 54 100 21.8571520164134 28.3416041546451 -6.4844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.229390572500846 ENSG00000158411:ENST00000289359:exon_99797294_99797521:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000409107:exon_99797294_99797513:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000438121:exon_99797170_99797498:MITD1;ENSG00000158411:ENST00000413710:exon_99797294_99797490:MITD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 99936138 T/C 1 38 35 73 18.055908187472 18.3695582483811 -0.313650060909136 A:T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000115514:ENST00000264255:exon_99935445_99936262:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000422767:exon_99935971_99936262:TXNDC9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 100020919 T/C 1 40 28 68 19.0062191447073 14.6956465987049 4.31057254600245 T:C T C 10 0.524844521382317 0.332023251992693 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100020907_100021140:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100020907_100021140:REV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 2 12 14 0.950310957235366 6.2981342565878 -5.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00545792910502031 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 100055112 C/A 1 22 16 38 10.453420529589 8.39751234211707 2.05590818747195 A:C C A 10 0.524844521382317 0.521170691333303 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000491752:exon_100055063_100055142:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 18 10 28 8.5527986151183 5.24844521382317 3.30435340129513 A:G A G 10 0.524844521382317 0.257388498750569 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 100081415 T/C 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100081384_100081447:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100081384_100081447:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100081384_100081447:REV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 16 9 25 7.60248765788293 4.72360069244085 2.87888696544208 C:G G C 10 0.524844521382317 0.317512505067783 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 101019031 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409046:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000420858:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000448989:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000421474:exon_101019026_101019117:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000418201:exon_101019026_101019117:CHST10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 101925026 T/C 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 T:C T C 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101924591_101925163:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101924591_101925158:RNF149 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 103335562 C/G 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000135953:ENST00000258436:exon_103332299_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000438943:exon_103333497_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000437075:exon_103334030_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000411991:exon_103335273_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000428085:exon_103335463_103335666:MFSD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 105885961 T/C 1 19 14 33 9.02795409373598 7.34782329935244 1.68013079438354 T:C T C 10 0.524844521382317 0.604302645486145 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105885729_105886162:TGFBRAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 105924423 C/T 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C C T 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105924071_105924775:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105924071_105924778:TGFBRAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 105959592 G/A 1 19 16 35 9.02795409373598 8.39751234211707 0.630441751618907 A:G G A 10 0.524844521382317 0.867082324177013 ENSG00000135974:ENST00000258457:exon_105959305_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000437250:exon_105959558_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000410049:exon_105959558_105959680:C2orf49 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 105977761 G/A 1 17 1 18 8.07764313650061 0.524844521382317 7.5527986151183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000189769807062067 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 109100697 C/T 1 20 11 31 9.50310957235366 5.77328973520549 3.72981983714817 T:C C T 10 0.524844521382317 0.20976291852805 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109100605_109100767:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109100605_109100767:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109100605_109100767:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109100605_109100767:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109100605_109100767:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000481729:exon_109100605_109101195:GCC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 110373197 G/A 1 9 1 10 4.27639930755915 0.524844521382317 3.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0230108839750243 ENSG00000198142:ENST00000356454:exon_110371911_110376563:ANKRD57 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 111598958 C/T 1 5 15 20 2.37577739308842 7.87266782073475 -5.49689042764634 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0226256809064239 ENSG00000153093:ENST00000389811:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000439055:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000283065:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000340561:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000422487:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000417074:exon_111598948_111598982:ACOXL;ENSG00000153093:ENST00000433706:exon_111598948_111598982:ACOXL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 111907691 T/C 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000153094:ENST00000308659:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357757:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393253:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000393256:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000428038:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000433098:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000437029:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452231:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000361493:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000431217:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000439718:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000422765:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000357682:exon_111907621_111907724:BCL2L11;ENSG00000153094:ENST00000452033:exon_111907526_111908532:BCL2L11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113310346 A/C 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 A:C A C 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113310222_113310393:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113310222_113310393:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113310222_113310393:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113310222_113310393:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113310222_113310381:POLR1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113404708 G/A 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000144136:ENST00000272542:exon_113404140_113404739:SLC20A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113514159 T/A 1 11 18 29 5.22671026479451 9.4472013848817 -4.22049112008719 A:T T A 10 0.524844521382317 0.137576283488010 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113513554_113514791:CKAP2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113514180 T/C 1 12 16 28 5.7018657434122 8.39751234211707 -2.69564659870487 T:C T C 10 0.524844521382317 0.347115703840086 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113513554_113514791:CKAP2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113537190 T/C 1 15 1 16 7.12733217926525 0.524844521382317 6.60248765788293 T:C T C 10 0.524844521382317 0.000639407243352267 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113537073_113537243:IL1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113537223 C/A 1 1 18 19 0.475155478617683 9.4472013848817 -8.97204590626402 A:C C A 10 0.524844521382317 2.07164020861032e-05 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113537073_113537243:IL1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113539224 G/A 0 26 0 26 12.3540424440598 0 12.3540424440598 G G 10 0.524844521382317 5.65375008660606e-08 ENSG00000115008:ENST00000263339:exon_113539181_113539403:IL1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113940280 G/A 1 32 61 93 15.2049753157659 32.0155158043213 -16.8105404885555 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00054961149301878 ENSG00000125637:ENST00000465917:exon_113939923_113940621:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 28 34 62 13.3043534012951 17.8447137269988 -4.54036032570365 C:G G C 10 0.524844521382317 0.255294583459991 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 58 67 125 27.5590177598256 35.1645829326152 -7.60556517278962 C:G C G 10 0.524844521382317 0.179971141195645 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 120003324 G/A 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000115107:ENST00000393108:exon_120003063_120003564:STEAP3;ENSG00000115107:ENST00000393110:exon_120003065_120003564:STEAP3;ENSG00000115107:ENST00000393106:exon_120003065_120003564:STEAP3;ENSG00000115107:ENST00000409811:exon_120003065_120003564:STEAP3;ENSG00000115107:ENST00000393107:exon_120003065_120003564:STEAP3;ENSG00000115107:ENST00000450943:exon_120003065_120003564:STEAP3;ENSG00000115107:ENST00000354888:exon_120003065_120003564:STEAP3;ENSG00000115107:ENST00000425223:exon_120003065_120003564:STEAP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 120078731 A/G 1 9 19 28 4.27639930755915 9.97204590626402 -5.69564659870487 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0368431822879296 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 128249590 G/T 1 19 36 55 9.02795409373598 18.8944027697634 -9.86644867602743 T:G G T 10 0.524844521382317 0.00973299553323991 ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000455721:exon_128249547_128249664:IWS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 18 22 40 8.5527986151183 11.546579470411 -2.99378085529268 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34802327982474 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 A:G G A 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 128945152 C/T 1 21 15 36 9.97826505097134 7.87266782073475 2.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 0.509070758298691 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000418197:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000465836:exon_128945023_128945188:UGGT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 130897234 C/T 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 T:C C T 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000152076:ENST00000496704:exon_130896860_130897263:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000409943:exon_130896860_130897263:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000310463:exon_130896860_130897263:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000392984:exon_130896862_130897263:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000498526:exon_130897000_130897520:CCDC74B;ENSG00000152076:ENST00000409488:exon_130897175_130897251:CCDC74B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 10 19 29 4.75155478617683 9.97204590626402 -5.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0625786547301105 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 130948224 T/C 1 784 635 1419 372.521895236264 333.276271077771 39.2456241584922 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.0381327261726406 ENSG00000152082:ENST00000425361:exon_130948042_130948286:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000457492:exon_130948042_130948268:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000281871:exon_130948042_130948300:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000409255:exon_130948042_130948285:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000455239:exon_130948042_130948302:MZT2B;ENSG00000152082:ENST00000480182:exon_130948042_130948300:MZT2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 131096717 C/T 1 70 58 128 33.2608835032378 30.4409822401744 2.81990126306343 T:C C T 10 0.524844521382317 0.658510213345684 ENSG00000136710:ENST00000259229:exon_131095814_131096805:CCDC115;ENSG00000136710:ENST00000442217:exon_131095816_131096805:CCDC115;ENSG00000136710:ENST00000465315:exon_131095820_131096805:CCDC115;ENSG00000136710:ENST00000437688:exon_131095843_131096805:CCDC115;ENSG00000136710:ENST00000409127:exon_131096069_131096805:CCDC115 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 131128498 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000072135:ENST00000175756:exon_131128448_131128537:PTPN18;ENSG00000072135:ENST00000347849:exon_131128448_131128537:PTPN18;ENSG00000072135:ENST00000409022:exon_131128448_131128537:PTPN18;ENSG00000072135:ENST00000490812:exon_131128448_131128537:PTPN18;ENSG00000072135:ENST00000462996:exon_131128448_131128537:PTPN18;ENSG00000072135:ENST00000490137:exon_131128242_131128537:PTPN18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 131130435 G/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000072135:ENST00000462321:exon_131130181_131130520:PTPN18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 22 15 37 10.453420529589 7.87266782073475 2.58075270885427 T:C C T 10 0.524844521382317 0.415690016228402 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 132290464 G/A 1 83 146 229 39.4379047252677 76.6273001218183 -37.1893953965506 A:G G A 10 0.524844521382317 8.30465258075992e-07 ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132290437_132290514:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290437_132290510:CCDC74A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 135908007 G/A 1 15 25 40 7.12733217926525 13.1211130345579 -5.99378085529268 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0803020061533743 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135907939_135908076:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135907939_135908076:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135907939_135908076:RAB3GAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 136664975 A/G 1 362 583 945 172.006283259601 305.984355965891 -133.97807270629 A:G A G 10 0.524844521382317 2.73995767393426e-18 ENSG00000115866:ENST00000264161:exon_136664247_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000478212:exon_136664394_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000489964:exon_136664814_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000422708:exon_136664830_136664977:DARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 143718195 G/A 1 24 25 49 11.4037314868244 13.1211130345579 -1.71738154773353 A:G G A 10 0.524844521382317 0.669137920279147 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000392874:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000375773:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143718193_143718339:KYNU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 77 77 154 36.5869718535616 40.4130281464384 -3.82605629287681 A:G A G 10 0.524844521382317 0.572483672873959 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 144899559 C/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000121964:ENST00000392869:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409214:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000344850:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000241391:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392867:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409298:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392871:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000415569:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000463875:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000491448:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000476958:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000482601:exon_144899449_144899622:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000437114:exon_144899449_144899622:GTDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 144966208 T/C 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000121964:ENST00000392869:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409214:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000344850:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000241391:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392867:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409298:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392871:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000415569:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000491448:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000437114:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000417450:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000484303:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000429978:exon_144966170_144966371:GTDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 105 117 222 49.8913252548567 61.4068090017311 -11.5154837468744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.122788682698295 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 53 50 103 25.1832403667372 26.2422260691158 -1.05898570237865 T:C T C 10 0.524844521382317 0.84422237654664 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 152321618 G/A 1 19 18 37 9.02795409373598 9.4472013848817 -0.419247291145727 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 14 16 30 6.65217670064756 8.39751234211707 -1.74533564146951 T:G G T 10 0.524844521382317 0.585512927936858 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 160139284 A/C 1 14 11 25 6.65217670064756 5.77328973520549 0.878886965442075 A:C A C 10 0.524844521382317 0.842073148287916 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160139183_160139604:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160139183_160139604:WDSUB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 37 34 71 17.5807527088543 17.8447137269988 -0.263961018144503 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 160639970 T/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000241399:ENST00000429078:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000241399:ENST00000259053:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000241399:ENST00000480212:exon_160639870_160639980:CD302;ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160639870_160639980:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160639870_160639980:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160639870_160639980:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160639870_160639980:RP11-357L2.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 160676427 C/A 1 13 16 29 6.17702122202988 8.39751234211707 -2.22049112008719 A:C C A 10 0.524844521382317 0.45973512332539 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160676237_160676431:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160676237_160676431:RP11-357L2.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 160690646 T/C 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 T:C T C 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160690555_160690722:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160690555_160690722:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160690555_160690722:RP11-357L2.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 162357875 A/G 0 14 0 14 6.65217670064756 0 6.65217670064756 A A 10 0.524844521382317 0.000150247370579061 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 163123704 C/T 1 81 88 169 38.4875937680323 46.1863178816439 -7.69872411361157 T:C C T 10 0.524844521382317 0.248362477698813 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123589_163123889:IFIH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 277 255 532 131.618067577098 133.835352952491 -2.21728537539263 T:C C T 10 0.524844521382317 0.862205945419257 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 163128883 G/A 1 136 129 265 64.6211450920049 67.7049432583189 -3.083798166314 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 0.712497033368808 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 55 37 92 26.1335513239726 19.4192472911457 6.71430403282684 C:G C G 10 0.524844521382317 0.175265803424693 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 34 55 89 16.1552862730012 28.8664486760274 -12.7111624030262 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.0077603815963084 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 39 36 75 18.5310636660896 18.8944027697634 -0.36333910367377 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 170403106 G/A 1 22 26 48 10.453420529589 13.6459575559402 -3.19253702635121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.387747958498637 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 170419809 A/C 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 A:C A C 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170419735_170419860:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170419735_170419860:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170419735_170419860:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170419735_170419860:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170419735_170419860:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000483355:exon_170419735_170419900:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000417376:exon_170419735_170419860:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000438035:exon_170419735_170419860:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000445210:exon_170419735_170419860:FASTKD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 170428176 A/G 1 21 13 34 9.97826505097134 6.82297877797012 3.15528627300122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.306539571272256 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000438035:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000445210:exon_170428163_170428681:FASTKD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 170428198 G/A 1 27 14 41 12.8291979226774 7.34782329935244 5.481374623325 A:G G A 10 0.524844521382317 0.116817175394066 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170428163_170428678:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000438035:exon_170428163_170428681:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000445210:exon_170428163_170428681:FASTKD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 292 305 597 138.745399756363 160.077579021607 -21.3321792652432 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0851810764649026 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 171822466 C/T 1 141 124 265 66.9969224850933 65.0807206514073 1.916201833686 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.853664910935733 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 172196009 C/T 1 8 13 21 3.80124382894146 6.82297877797012 -3.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.197904266837508 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460539:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172195841_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172195985_172196064:METTL8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 A:G A G 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 174946760 T/C 1 7 12 19 3.32608835032378 6.2981342565878 -2.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.250211798338697 ENSG00000138430:ENST00000284719:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000344357:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000409546:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000449400:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000392560:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000462000:exon_174946652_174946792:OLA1;ENSG00000138430:ENST00000429575:exon_174946738_174946792:OLA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 175213645 G/C 1 216 209 425 102.63358338142 109.692504968904 -7.0589215874847 C:G G C 10 0.524844521382317 0.496945283075376 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175212749_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175212750_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175212878_175213900:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175213124_175213900:CIR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 177191606 A/G 1 29 32 61 13.7795088799128 16.7950246842341 -3.01551580432134 A:G A G 10 0.524844521382317 0.445259838410939 ENSG00000128654:ENST00000420864:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000392529:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000249442:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000423461:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000443241:exon_177191553_177191629:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000452865:exon_177191553_177191629:MTX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 177195341 A/G 1 96 59 155 45.6149259472976 30.9658267615567 14.6490991857409 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0195677398429989 ENSG00000128654:ENST00000420864:exon_177195312_177195388:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000392529:exon_177195312_177195388:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000249442:exon_177195312_177195388:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000443241:exon_177195312_177195388:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000452865:exon_177195312_177195388:MTX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 178082594 T/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C T C 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 179325735 C/G 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 C:G C G 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000204311:ENST00000409117:exon_179325709_179326117:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000437056:exon_179325709_179326014:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000375129:exon_179325709_179326001:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000442710:exon_179325709_179325931:DFNB59 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 182780307 G/A 1 6 17 23 2.8509328717061 8.92235686349939 -6.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0121225542609254 ENSG00000138434:ENST00000431877:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000320370:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409001:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000261006:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000428267:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000454579:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000440623:exon_182779943_182781732:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000416081:exon_182779943_182781154:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000491720:exon_182779943_182783402:SSFA2;ENSG00000138434:ENST00000409136:exon_182779943_182781154:SSFA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 183584755 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000469118:exon_183584734_183584896:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183584734_183584896:DNAJC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 183817957 T/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:T T A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000061676:ENST00000361354:exon_183817841_183818059:NCKAP1;ENSG00000061676:ENST00000360982:exon_183817841_183818059:NCKAP1;ENSG00000061676:ENST00000456371:exon_183817841_183818059:NCKAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 187368733 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 190320083 C/A 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 A:C C A 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190320046_190320170:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190320046_190320170:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000472286:exon_190320046_190320347:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190320046_190320170:WDR75 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 190329873 A/G 1 30 32 62 14.2546643585305 16.7950246842341 -2.54036032570365 A:G A G 10 0.524844521382317 0.527798183512304 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190329805_190329980:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190329805_190329980:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190329805_190329980:WDR75 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 190531805 G/A 1 44 48 92 20.9068410591781 25.1925370263512 -4.28569596717316 A:G G A 10 0.524844521382317 0.404186531956028 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 190532159 T/C 1 34 52 86 16.1552862730012 27.2919151118805 -11.1366288388793 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0174157691217691 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 190660503 T/C 1 19 6 25 9.02795409373598 3.1490671282939 5.87888696544208 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0256872170689486 ENSG00000064933:ENST00000374827:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000434338:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000456115:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000392338:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409985:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000374826:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000421722:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424766:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000420421:exon_190660495_190660583:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424059:exon_190660495_190660677:PMS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 190670407 T/C 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000064933:ENST00000374827:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000434338:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000456115:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000392338:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409985:exon_190670378_190671780:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000374826:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000421722:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424766:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424307:exon_190670378_190670480:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424059:exon_190670378_190670480:PMS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 191839658 A/C 1 99 123 222 47.0403923831506 64.555876130025 -17.5154837468744 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0221133069678118 ENSG00000115415:ENST00000415035:exon_191839556_191839661:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000423282:exon_191839556_191839658:STAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 192546711 T/C 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000173559:ENST00000491331:exon_192546672_192547213:OBFC2A;ENSG00000173559:ENST00000307834:exon_192546672_192546743:OBFC2A;ENSG00000173559:ENST00000462712:exon_192546672_192546743:OBFC2A;ENSG00000173559:ENST00000307849:exon_192546672_192546743:OBFC2A;ENSG00000173559:ENST00000410026:exon_192546672_192546743:OBFC2A;ENSG00000173559:ENST00000451500:exon_192546672_192546743:OBFC2A;ENSG00000173559:ENST00000409510:exon_192546672_192546743:OBFC2A;ENSG00000173559:ENST00000425611:exon_192546672_192546743:OBFC2A;ENSG00000173559:ENST00000435931:exon_192546672_192546743:OBFC2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 23 19 42 10.9285760082067 9.97204590626402 0.956530101942688 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.877488592984835 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 31 21 52 14.7298198371482 11.0217349490287 3.70808488811952 A:T T A 10 0.524844521382317 0.332915245330799 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 197184321 C/T 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000138411:ENST00000409111:exon_197183276_197184628:HECW2;ENSG00000138411:ENST00000260983:exon_197183276_197184628:HECW2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 197637812 T/C 1 42 33 75 19.9565301019427 17.3198692056165 2.63666089632623 T:C T C 10 0.524844521382317 0.565050707913482 ENSG00000119041:ENST00000263956:exon_197637640_197637877:GTF3C3;ENSG00000119041:ENST00000416690:exon_197637731_197637877:GTF3C3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 198358148 T/C 1 44 63 107 20.9068410591781 33.065204847086 -12.1583637879079 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0200522998033735 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198358048_198358216:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198358048_198358216:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000482167:exon_198358044_198358216:HSPD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 75 91 166 35.6366608963262 47.7608514457908 -12.1241905494646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0623008926767106 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 201436154 A/C 1 25 19 44 11.8788869654421 9.97204590626402 1.90684105917805 A:C A C 10 0.524844521382317 0.651378297792005 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 11 75 86 5.22671026479451 39.3633391036738 -34.1366288388793 A:G G A 10 0.524844521382317 1.60155195630431e-14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 45 50 95 21.3819965377957 26.2422260691158 -4.86022953132011 A:G A G 10 0.524844521382317 0.355427222648518 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 202149589 G/C 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 C:G G C 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000064012:ENST00000392263:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392264:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000303385:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392266:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264274:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392259:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000432109:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264275:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000358485:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000339403:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000323492:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000444430:exon_202149539_202150040:CASP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 202149696 G/A 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G G A 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000064012:ENST00000392263:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392264:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000303385:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392266:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264274:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000392259:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000432109:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000264275:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000358485:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000339403:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000323492:exon_202149539_202150040:CASP8;ENSG00000064012:ENST00000444430:exon_202149539_202150040:CASP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 202248933 G/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202248834_202248939:TRAK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 202252539 G/A 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202252426_202252724:TRAK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 207169731 G/A 1 12 1 13 5.7018657434122 0.524844521382317 5.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00389453711171081 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 207170026 T/C 1 10 2 12 4.75155478617683 1.04968904276463 3.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0413693580129535 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 207170242 T/C 1 16 2 18 7.60248765788293 1.04968904276463 6.5527986151183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00161942441925943 ENSG00000204186:ENST00000374423:exon_207169441_207179148:ZDBF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 207459467 C/T 1 3 16 19 1.42546643585305 8.39751234211707 -6.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00187175287119635 ENSG00000114948:ENST00000264377:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000374415:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000374416:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000431817:exon_207459461_207459629:ADAM23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 207631461 G/A 1 21 13 34 9.97826505097134 6.82297877797012 3.15528627300122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.306539571272256 ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000418289:exon_207631368_207631789:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207631368_207632194:FASTKD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 207636977 A/G 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207636905_207637044:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207636905_207637044:FASTKD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 209106860 C/T 1 18 23 41 8.5527986151183 12.0714239917933 -3.518625376675 T:C C T 10 0.524844521382317 0.278600075286401 ENSG00000138413:ENST00000345146:exon_209106718_209106869:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000423977:exon_209106718_209106869:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000446179:exon_209106718_209106869:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000415913:exon_209106718_209106869:IDH1;ENSG00000138413:ENST00000441842:exon_209106718_209106869:IDH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 215632255 C/T 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215632206_215632378:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215632206_215632378:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215632206_215632378:BARD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 215632256 A/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215632206_215632378:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215632206_215632378:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215632206_215632378:BARD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 215645464 C/G 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 215645978 T/C 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 T:C T C 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000138376:ENST00000260947:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000449967:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000455743:exon_215645284_215646233:BARD1;ENSG00000138376:ENST00000471787:exon_215645621_215646233:BARD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 217315787 T/C 1 19 26 45 9.02795409373598 13.6459575559402 -4.61800346220426 T:C T C 10 0.524844521382317 0.181214492608227 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000486983:exon_217315569_217316324:SMARCAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 217329322 A/G 1 28 19 47 13.3043534012951 9.97204590626402 3.3323074950311 A:G A G 10 0.524844521382317 0.381795948985569 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217329320_217329390:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217329320_217329390:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217329320_217329390:SMARCAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 219146803 G/A 1 3 14 17 1.42546643585305 7.34782329935244 -5.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00575999753207545 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 219269183 A/G 1 80 74 154 38.0124382894146 38.8384945822915 -0.826056292876807 A:G A G 10 0.524844521382317 0.935747824428794 ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219269020_219269399:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219269020_219270664:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219269020_219269202:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219269020_219269202:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219269020_219269496:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219269020_219269310:CTDSP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 57 48 105 27.0838622812079 25.1925370263512 1.89132525485672 T:C T C 10 0.524844521382317 0.769659493123413 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 219618925 C/T 1 48 32 80 22.8074629736488 16.7950246842341 6.01243828941464 T:C C T 10 0.524844521382317 0.181510309787703 ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219618857_219620139:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219618857_219619416:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219618857_219620139:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000436668:exon_219618857_219618943:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000472527:exon_219618857_219619226:TTLL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 24 25 49 11.4037314868244 13.1211130345579 -1.71738154773353 A:G G A 10 0.524844521382317 0.669137920279147 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 117 83 200 55.5931909982689 43.5620952747323 12.0310957235366 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.089746180239973 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 126 104 230 59.8695903058281 54.583830223761 5.2857600820671 A:G A G 10 0.524844521382317 0.5094184113563 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 56 58 114 26.6087068025902 30.4409822401744 -3.83227543758414 A:G A G 10 0.524844521382317 0.511887943242188 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220045454 G/A 1 30 21 51 14.2546643585305 11.0217349490287 3.23292940950183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.401977383354421 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 45 58 103 21.3819965377957 30.4409822401744 -9.05898570237865 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0763728159842426 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 56 45 101 26.6087068025902 23.6180034622043 2.99070334038598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.618615880271941 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220083279 C/T 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220082847_220083712:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220082847_220083673:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220083177_220083395:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220082847_220085174:ATG9A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220085545 C/T 1 36 32 68 17.1055972302366 16.7950246842341 0.310572546002447 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085469_220085614:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085469_220085614:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085469_220085614:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085469_220085614:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085469_220085614:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085469_220085614:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085469_220085614:ATG9A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220085845 A/G 1 22 20 42 10.453420529589 10.4968904276463 -0.0434698980573121 A:T:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220089382 G/A 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220088828_220089576:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220088828_220089576:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220088828_220089576:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220088828_220089576:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220088828_220089576:ATG9A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220100503 G/A 1 55 41 96 26.1335513239726 21.518625376675 4.61492594729757 A:G G A 10 0.524844521382317 0.359422897784126 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000483188:exon_220100430_220100523:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100367_220100597:ANKZF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220100816 C/T 1 74 60 134 35.1615054177085 31.490671282939 3.67083413476953 T:C C T 10 0.524844521382317 0.545772983739618 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220115434 G/A 1 535 413 948 254.20818106046 216.760787330897 37.4473937295635 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.0160667403019927 ENSG00000127824:ENST00000248437:exon_220114433_220116045:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000392088:exon_220114433_220116045:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000472881:exon_220115402_220115702:TUBA4A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220479232 C/T 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 T:C C T 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220479198_220479268:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000413891:exon_220479198_220479593:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000495941:exon_220479198_220479442:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000447191:exon_220479198_220479268:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220479198_220479268:STK11IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 220479958 G/A 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220479816_220480063:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000447191:exon_220479816_220480063:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000494777:exon_220479528_220480063:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220479816_220480063:STK11IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 223386557 A/G 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223386486_223386665:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223386486_223386665:SGPP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 223386578 C/T 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223386486_223386665:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223386486_223386665:SGPP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 223423362 A/G 1 49 61 110 23.2826184522665 32.0155158043213 -8.73289735205486 A:G A G 10 0.524844521382317 0.104621481356944 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 223423491 C/G 1 73 47 120 34.6863499390909 24.6676925049689 10.018657434122 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0681538715812184 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 223436607 C/T 1 173 166 339 82.2018978008592 87.1241905494646 -4.92229274860544 T:C C T 10 0.524844521382317 0.624616570330839 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 224862842 A/G 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000135919:ENST00000409304:exon_224862832_224863059:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000258405:exon_224862832_224863059:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000409840:exon_224862832_224863059:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000447280:exon_224862832_224863059:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000457690:exon_224862832_224863059:SERPINE2;ENSG00000135919:ENST00000432738:exon_224862832_224863059:SERPINE2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 225630539 C/T 1 41 31 72 19.481374623325 16.2701801628518 3.21119446047318 T:C C T 10 0.524844521382317 0.48038142333699 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225629807_225630554:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225629807_225630554:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409802:exon_225629807_225630554:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225629807_225630554:DOCK10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 225672460 G/A 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000489831:exon_225671962_225672501:DOCK10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 225684166 A/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225684163_225684246:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225684163_225684246:DOCK10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 225739464 C/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C C T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225739383_225739468:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225739383_225739468:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225739383_225739468:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000492369:exon_225739383_225739468:DOCK10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 227779066 A/G 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000144468:ENST00000341329:exon_227778924_227779067:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000392062:exon_227778924_227779067:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000409053:exon_227778924_227779067:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000491490:exon_227778924_227779067:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000473218:exon_227778924_227779353:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000493526:exon_227778924_227779067:RHBDD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 227860232 C/T 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000144468:ENST00000341329:exon_227860147_227863931:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000392062:exon_227860147_227863917:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000491490:exon_227860147_227860471:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000493526:exon_227860147_227860617:RHBDD1;ENSG00000144468:ENST00000483268:exon_227860147_227860391:RHBDD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 24 29 53 11.4037314868244 15.2204911200872 -3.8167596332628 A:G A G 10 0.524844521382317 0.336257786199144 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 68 64 132 32.3105725460024 33.5900493684683 -1.27947682246584 A:G A G 10 0.524844521382317 0.861798466875105 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231050715 A/G 1 71 55 126 33.7360389818555 28.8664486760274 4.86959030582806 A:G A G 10 0.524844521382317 0.422379618229143 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231050710_231050859:SP110 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231067305 C/G 1 36 43 79 17.1055972302366 22.5683144194396 -5.46271718920304 C:G C G 10 0.524844521382317 0.259835029862430 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231067295_231067438:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231067295_231067444:SP110 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231118041 A/C 1 3 14 17 1.42546643585305 7.34782329935244 -5.92235686349939 A:C A C 10 0.524844521382317 0.00575999753207545 ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231120241 G/C 1 17 15 32 8.07764313650061 7.87266782073475 0.204975315765857 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231120167_231120247:SP140 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231222655 G/T 1 15 19 34 7.12733217926525 9.97204590626402 -2.84471372699878 T:G G T 10 0.524844521382317 0.391439920205275 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231775094 C/A 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231775371 C/T 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C C T 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000438398:exon_231774952_231775811:GPR55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231973363 G/A 1 6 33 39 2.8509328717061 17.3198692056165 -14.4689363339104 A:G G A 10 0.524844521382317 2.50223541208586e-06 ENSG00000173692:ENST00000488354:exon_231973278_231973836:PSMD1;ENSG00000135914:ENST00000258400:exon_231972944_231974123:HTR2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 231988327 C/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000135914:ENST00000258400:exon_231988127_231988844:HTR2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 232028396 A/G 1 50 43 93 23.7577739308842 22.5683144194396 1.18945951144452 A:G A G 10 0.524844521382317 0.836033732311187 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232028349_232028441:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000431051:exon_232028349_232028441:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000467792:exon_232028349_232028424:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000477120:exon_232027807_232028441:PSMD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 232263127 G/A 1 22 13 35 10.453420529589 6.82297877797012 3.63044175161891 A:G G A 10 0.524844521382317 0.239649884557393 ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 233660846 G/A 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000204120:ENST00000373566:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000373563:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409480:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409547:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000423659:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409196:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000409451:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000440945:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000414511:exon_233660772_233660931:GIGYF2;ENSG00000204120:ENST00000452341:exon_233660772_233660931:GIGYF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 234355365 G/A 1 15 9 24 7.12733217926525 4.72360069244085 2.40373148682439 A:G G A 10 0.524844521382317 0.414775891663106 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234355358_234355442:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234355358_234355442:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000490764:exon_234355358_234355442:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234355358_234355442:DGKD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 234367022 A/G 1 25 16 41 11.8788869654421 8.39751234211707 3.481374623325 A:G A G 10 0.524844521382317 0.348311219954211 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000471764:exon_234366885_234367043:DGKD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 234371351 G/A 1 35 27 62 16.6304417516189 14.1708020773226 2.45963967429635 A:G G A 10 0.524844521382317 0.611419948544764 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234371289_234371381:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234371289_234371381:DGKD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 234372918 G/T 1 23 35 58 10.9285760082067 18.3695582483811 -7.44098224017438 A:T:G G T 10 0.524844521382317 0.0647824194851211 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234372810_234372929:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234372810_234372929:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234372810_234372929:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000495901:exon_234372460_234372929:DGKD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 234377214 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 234394569 A/G 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 234756072 G/C 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 C:G G C 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234756043_234756107:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234756043_234756107:HJURP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 237489904 C/T 1 194 140 334 92.1801628518305 73.4782329935244 18.7019298583061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.042598962492252 ENSG00000144476:ENST00000272928:exon_237489083_237491001:CXCR7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 238002773 G/A 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 A:G G A 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000198612:ENST00000354371:exon_238002733_238002840:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000433954:exon_238002733_238002840:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000392008:exon_238002733_238002840:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000470452:exon_238002306_238002840:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000419015:exon_238002733_238002829:COPS8;ENSG00000198612:ENST00000409629:exon_238002733_238002840:COPS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 239162318 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000132326:ENST00000254657:exon_239161553_239162343:PER2;ENSG00000132326:ENST00000254658:exon_239161553_239162343:PER2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 239237974 T/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 53 25 78 25.1832403667372 13.1211130345579 12.0621273321793 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00636173626163637 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 51 48 99 24.2329294095018 25.1925370263512 -0.959607616849379 T:C T C 10 0.524844521382317 0.919912951572697 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 241500896 C/T 1 6 12 18 2.8509328717061 6.2981342565878 -3.44720138488171 T:C C T 10 0.524844521382317 0.154986439212099 ENSG00000188542:ENST00000343217:exon_241500747_241500936:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000405954:exon_241500747_241503431:DUSP28;ENSG00000188542:ENST00000438823:exon_241500747_241500936:DUSP28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 241513972 C/T 1 47 34 81 22.3323074950311 17.8447137269988 4.48759376803233 T:C C T 10 0.524844521382317 0.373588622970114 ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241513932_241514029:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241513932_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241513192_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241513971_241514045:RNPEPL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242036797 A/G 1 64 73 137 30.4099506315317 38.3136500609091 -7.90369942937743 A:G A G 10 0.524844521382317 0.199318616319517 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000493169:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000414146:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000460915:exon_242036341_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242036602_242036842:MTERFD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 18 13 31 8.5527986151183 6.82297877797012 1.72981983714817 A:G A G 10 0.524844521382317 0.592324700211678 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242077496 C/T 1 11 4 15 5.22671026479451 2.09937808552927 3.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.125251659640691 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000433589:exon_242077368_242077502:PASK;ENSG00000115687:ENST00000415234:exon_242077368_242077502:PASK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242092900 G/A 1 57 48 105 27.0838622812079 25.1925370263512 1.89132525485672 A:G G A 10 0.524844521382317 0.769659493123413 ENSG00000115685:ENST00000438799:exon_242092891_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000407025:exon_242092891_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000234038:exon_242092891_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000404405:exon_242092891_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000473017:exon_242092898_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000439916:exon_242092891_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000406106:exon_242092891_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000498170:exon_242092891_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000427172:exon_242092891_242093019:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000450367:exon_242092897_242093019:PPP1R7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242195719 C/G 1 108 93 201 51.3167916907098 48.8105404885555 2.5062512021543 C:G C G 10 0.524844521382317 0.777653036799283 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470710:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000435952:exon_242195599_242195814:HDLBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242203916 A/C,G 0 0 45 45 0 23.6180034622043 -23.6180034622043 C:G A G 10 0.524844521382317 2.86819285841096e-15 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000422933:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000428482:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000442714:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000452065:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000444092:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000430918:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000441124:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000426343:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000413241:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000423693:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000425989:exon_242203863_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000449864:exon_242203864_242204020:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000420451:exon_242203890_242204020:HDLBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242435082 G/T 1 86 79 165 40.8633711611207 41.462717189203 -0.599346028082302 T:G G T 10 0.524844521382317 0.938007775827504 ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242432089_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242434432_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242434434_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242434437_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000494699:exon_242434461_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000487962:exon_242434465_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242434664_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000478403:exon_242434863_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000470438:exon_242434905_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000465009:exon_242434953_242435116:STK25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242610172 A/G 1 61 46 107 28.9844841956787 24.1428479835866 4.84163621209208 A:G A G 10 0.524844521382317 0.384046958205671 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242609976_242610197:ATG4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242610794 G/T 1 87 50 137 41.3385266397384 26.2422260691158 15.0963005706226 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0101755481120938 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 29 37 66 13.7795088799128 19.4192472911457 -5.63973841123292 A:G A G 10 0.524844521382317 0.176356034995177 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 368905 A/G 1 31 30 61 14.7298198371482 15.7453356414695 -1.01551580432134 A:G A G 10 0.524844521382317 0.79926202921448 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_368655_368945:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_368655_368945:TRIB3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 83 31 114 39.4379047252677 16.2701801628518 23.1677245624159 A:T:C C T 10 0.524844521382317 1.24439009874128e-05 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 97 68 165 46.0900814259153 35.6894274539976 10.4006539719177 T:C C T 10 0.524844521382317 0.118794132564637 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 1108122 C/T 1 95 99 194 45.1397704686799 51.9596076168494 -6.81983714816949 T:C C T 10 0.524844521382317 0.350202644893309 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1108069_1108151:PSMF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 1291076 G/C 1 3 11 14 1.42546643585305 5.77328973520549 -4.34782329935244 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0291024169803525 ENSG00000125775:ENST00000381812:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000381808:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000360779:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000339987:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000467129:exon_1290619_1291139:SDCBP2;ENSG00000125775:ENST00000245974:exon_1290627_1291139:SDCBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 3785646 G/A 1 40 35 75 19.0062191447073 18.3695582483811 0.63666089632623 A:G G A 10 0.524844521382317 0.908425567428318 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3785468_3785884:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3785468_3786762:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3785468_3786762:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3785468_3785865:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3785468_3786757:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3785468_3786757:CDC25B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 20 13 33 9.50310957235366 6.82297877797012 2.68013079438354 T:C T C 10 0.524844521382317 0.387107242437572 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 28 10 38 13.3043534012951 5.24844521382317 8.05590818747195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0090785911818687 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 28 10 38 13.3043534012951 5.24844521382317 8.05590818747195 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0090785911818687 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 6017821 C/T 1 57 64 121 27.0838622812079 33.5900493684683 -6.50618708726035 T:C C T 10 0.524844521382317 0.238359387666962 ENSG00000088766:ENST00000378863:exon_6017720_6020699:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000452938:exon_6017720_6018037:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000378868:exon_6017720_6020695:CRLS1;ENSG00000088766:ENST00000478846:exon_6017720_6018037:CRLS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 6195753 T/C 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 T T 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 13415737 T/C 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000089123:ENST00000378157:exon_13415691_13415801:TASP1;ENSG00000089123:ENST00000337743:exon_13415691_13415801:TASP1;ENSG00000089123:ENST00000480436:exon_13415691_13415801:TASP1;ENSG00000089123:ENST00000465381:exon_13415691_13415801:TASP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 13756819 G/A 1 70 50 120 33.2608835032378 26.2422260691158 7.01865743412197 A:G G A 10 0.524844521382317 0.202311679822018 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13756519_13756916:ESF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 13763811 T/C 1 91 67 158 43.2391485542092 35.1645829326152 8.07456562159392 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.203441747412135 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 13767943 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13767796_13767998:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000469177:exon_13767798_13767998:C20orf7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 13782191 A/G 1 18 12 30 8.5527986151183 6.2981342565878 2.25466435853049 A:G A G 10 0.524844521382317 0.467363032646082 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000485738:exon_13782154_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000481249:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000464269:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479716:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000487478:exon_13782189_13782329:C20orf7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 A:G A G 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 18506558 T/C 1 56 27 83 26.6087068025902 14.1708020773226 12.4379047252677 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00795773280667303 ENSG00000101310:ENST00000450074:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18506432_18506576:SEC23B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 18523019 G/A 1 58 36 94 27.5590177598256 18.8944027697634 8.6646149900622 A:G G A 10 0.524844521382317 0.079320774653506 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18523012_18523046:SEC23B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 18534947 G/T 1 24 42 66 11.4037314868244 22.0434698980573 -10.6397384112329 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.00945947918284069 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18534879_18535034:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18534879_18535034:SEC23B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 16 6 22 7.60248765788293 3.1490671282939 4.45342052958903 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0854111218855252 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 21142724 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 T:C T C 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 21329041 A/G 1 51 34 85 24.2329294095018 17.8447137269988 6.38821568250306 A:G A G 10 0.524844521382317 0.192361546094391 ENSG00000088930:ENST00000377191:exon_21328979_21329068:XRN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 23345069 C/T 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000424216:exon_23345000_23345166:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 23350941 G/A 1 22 17 39 10.453420529589 8.92235686349939 1.53106366608964 A:G G A 10 0.524844521382317 0.635279645808825 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23350728_23353700:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23350728_23353682:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000477239:exon_23350728_23351058:GZF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 24950874 T/C 1 36 28 64 17.1055972302366 14.6956465987049 2.40995063153171 T:C T C 10 0.524844521382317 0.617129185638796 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24950833_24951007:C20orf3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 24994289 C/T 1 16 16 32 7.60248765788293 8.39751234211707 -0.795024684234143 T:C C T 10 0.524844521382317 0.860150442628282 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 24994614 C/T 1 12 14 26 5.7018657434122 7.34782329935244 -1.64595755594024 T:C C T 10 0.524844521382317 0.559962886005581 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994597_24994709:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994597_24994703:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994597_24994709:ACSS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 25011423 T/C 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_25011395_25011594:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_25011395_25011594:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_25011395_25011594:ACSS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 25297708 G/A 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25297684_25297714:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25297684_25297714:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25297684_25297714:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25297684_25297714:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25297684_25297714:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000471287:exon_25297684_25297714:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000450393:exon_25297684_25297714:ABHD12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 39 33 72 18.5310636660896 17.3198692056165 1.21119446047318 C:G G C 10 0.524844521382317 0.814134919546712 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 30382315 A/G 1 32 31 63 15.2049753157659 16.2701801628518 -1.06520484708597 A:G A G 10 0.524844521382317 0.802093555858814 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30382205_30382351:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30382205_30382351:TPX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 30789881 G/A 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000126003:ENST00000246229:exon_30789722_30790095:PLAGL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 31023500 C/T 1 32 45 77 15.2049753157659 23.6180034622043 -8.41302814643841 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0672615074613697 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 31024013 C/G 1 56 49 105 26.6087068025902 25.7173815477335 0.891325254856717 C:G C G 10 0.524844521382317 0.922249483276053 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 67 71 138 31.8354170673848 37.2639610181445 -5.42854395075974 T:C C T 10 0.524844521382317 0.394139188547563 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 T:C T C 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 31984683 G/A 1 34 1 35 16.1552862730012 0.524844521382317 15.6304417516189 A:G G A 10 0.524844521382317 8.9366024462262e-09 ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31984567_31984890:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31984567_31984890:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31984567_31984890:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31984567_31984742:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31984567_31984890:CDK5RAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 32379195 A/C 1 14 4 18 6.65217670064756 2.09937808552927 4.55279861511829 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0345389637529455 ENSG00000131061:ENST00000342427:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000375200:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000497876:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000483118:exon_32378794_32380075:ZNF341;ENSG00000131061:ENST00000493497:exon_32378794_32380075:ZNF341 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 32441367 T/C 1 124 162 286 58.9192793485927 85.0248124639353 -26.1055331153427 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00205646924328675 ENSG00000101421:ENST00000217402:exon_32441302_32442172:CHMP4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33147737 C/G 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000101460:ENST00000374837:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000397711:exon_33147540_33148086:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000360668:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A;ENSG00000101460:ENST00000476428:exon_33147540_33148149:MAP1LC3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33328339 G/A 1 32 24 56 15.2049753157659 12.5962685131756 2.60870680259025 A:G G A 10 0.524844521382317 0.506442600417644 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33328167_33331145:NCOA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33337751 T/C 1 16 11 27 7.60248765788293 5.77328973520549 1.82919792267744 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.565137057094518 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33337206_33338322:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33337206_33338322:NCOA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33345501 G/A 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 A:G G A 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33345023_33345907:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33345023_33345907:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33345023_33345907:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000397669:exon_33345362_33345907:NCOA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33364211 G/A 1 10 1 11 4.75155478617683 0.524844521382317 4.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0127875069116162 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33364096_33364258:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33364096_33364251:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33364096_33364251:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000397669:exon_33364096_33364251:NCOA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33657126 G/A 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33657099_33657215:TRPC4AP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33764554 A/G 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000101000:ENST00000374477:exon_33764501_33765165:PROCR;ENSG00000101000:ENST00000216968:exon_33764501_33765164:PROCR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 33981906 G/C 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 C:G G C 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000101019:ENST00000457259:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374380:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000424405:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491040:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33981895_33981999:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33981895_33981999:UQCC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 314 264 578 149.198820285952 138.558953644932 10.6398666410208 A:G A G 10 0.524844521382317 0.38206270260211 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 170 145 315 80.7764313650061 76.102455600436 4.67397576457016 T:C T C 10 0.524844521382317 0.611994427703167 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 34220129 G/A 1 198 54 252 94.0807847663012 28.3416041546451 65.7391806116561 A:G G A 10 0.524844521382317 1.41680138165602e-17 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220085_34220307:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220085_34220170:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220085_34220156:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220085_34220156:CPNE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 70 64 134 33.2608835032378 33.5900493684683 -0.329165865230472 A:T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 34502107 G/A 1 17 21 38 8.07764313650061 11.0217349490287 -2.94409181252805 A:G G A 10 0.524844521382317 0.417135363310687 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34501955_34502119:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34501955_34502119:PHF20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 34526799 G/A 1 22 28 50 10.453420529589 14.6956465987049 -4.24222606911585 A:G G A 10 0.524844521382317 0.258222174655692 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34526619_34527030:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34526619_34527030:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34526619_34527030:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000413965:exon_34526619_34527030:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000473943:exon_34526554_34527030:PHF20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 34828459 T/C 1 42 43 85 19.9565301019427 22.5683144194396 -2.61178431749694 T:C T C 10 0.524844521382317 0.588562546560456 ENSG00000131043:ENST00000397286:exon_34827743_34828547:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34827743_34828547:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34827743_34828547:C20orf4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 34843689 C/T 1 43 53 96 20.4316855805604 27.8167596332628 -7.38507405270243 T:C C T 10 0.524844521382317 0.152257024868651 ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34843500_34844855:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34843500_34844855:C20orf4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 35521290 G/A 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 A:G G A 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000101342:ENST00000217320:exon_35521265_35522638:C20orf118;ENSG00000101342:ENST00000436941:exon_35521265_35522638:C20orf118;ENSG00000101347:ENST00000262878:exon_35518632_35521469:SAMHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 35838463 A/G 1 150 124 274 71.2733217926525 65.0807206514073 6.19260114124515 A:G A G 10 0.524844521382317 0.468347793553845 ENSG00000118705:ENST00000456102:exon_35838450_35838553:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35838450_35838568:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35838450_35838568:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373632:exon_35838450_35838568:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35838450_35838568:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35838450_35838568:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373623:exon_35838450_35838568:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35838450_35838568:RPN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 36022334 A/G 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 A:G A G 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000197122:ENST00000445403:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373578:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000358208:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000360723:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373567:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373558:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000472968:exon_36022298_36022577:SRC;ENSG00000197122:ENST00000489153:exon_36022148_36022396:SRC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 36405761 T/C 1 18 31 49 8.5527986151183 16.2701801628518 -7.71738154773353 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0314637640226297 ENSG00000132792:ENST00000361383:exon_36405747_36405819:CTNNBL1;ENSG00000132792:ENST00000405275:exon_36405747_36405819:CTNNBL1;ENSG00000132792:ENST00000373473:exon_36405747_36405819:CTNNBL1;ENSG00000132792:ENST00000473857:exon_36405747_36405819:CTNNBL1;ENSG00000132792:ENST00000373469:exon_36405675_36405819:CTNNBL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 36641367 G/A 1 14 19 33 6.65217670064756 9.97204590626402 -3.31986920561646 A:G G A 10 0.524844521382317 0.29637560445508 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36639917_36642259:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36639917_36642305:TTI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 36668874 G/A 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000101413:ENST00000373433:exon_36668837_36668966:RPRD1B;ENSG00000101413:ENST00000495457:exon_36668837_36668966:RPRD1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 36770588 C/T 1 21 6 27 9.97826505097134 3.1490671282939 6.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0109174569892813 ENSG00000198959:ENST00000361475:exon_36770466_36770601:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000485572:exon_36770466_36770601:TGM2;ENSG00000198959:ENST00000468262:exon_36770466_36770601:TGM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 37383640 T/C 1 12 3 15 5.7018657434122 1.57453356414695 4.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0384636259591238 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37383600_37383817:ACTR5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 22 31 53 10.453420529589 16.2701801628518 -5.8167596332628 A:G G A 10 0.524844521382317 0.129996349348392 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 37464739 G/A 1 12 10 22 5.7018657434122 5.24844521382317 0.453420529589027 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000101445:ENST00000299824:exon_37464468_37464818:PPP1R16B;ENSG00000101445:ENST00000373331:exon_37464468_37464818:PPP1R16B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 37555116 G/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37554955_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37555069_37555568:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37555086_37555451:FAM83D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 40034097 A/G 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40030741_40034129:CHD6;ENSG00000124177:ENST00000480022:exon_40033163_40034129:CHD6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 40043913 C/T 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40043826_40044278:CHD6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 40045231 G/C 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 C:G G C 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40045228_40045434:CHD6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 40050095 T/C 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 42320881 C/T 1 43 54 97 20.4316855805604 28.3416041546451 -7.90991857408475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.126902539084813 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42320797_42320959:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42320797_42320959:MYBL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 42331457 A/G 1 108 139 247 51.3167916907098 72.9533884721421 -21.6365967814323 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00610866083788368 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 43252915 T/C 1 71 54 125 33.7360389818555 28.3416041546451 5.39443482721038 T:C T C 10 0.524844521382317 0.37068270374996 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43252843_43252970:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43252843_43252970:ADA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 43530216 C/T 1 150 94 244 71.2733217926525 49.3353850099378 21.9379367827147 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.00573632862939291 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 128 80 208 60.8199012630634 41.9875617105854 18.8323395524781 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0100520887973490 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 43572217 T/C 1 43 42 85 20.4316855805604 22.0434698980573 -1.61178431749694 T:C T C 10 0.524844521382317 0.745558334173618 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 28 36 64 13.3043534012951 18.8944027697634 -5.59004936846829 A:G G A 10 0.524844521382317 0.170252313562689 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 44420637 G/A 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 A:G G A 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 17 14 31 8.07764313650061 7.34782329935244 0.729819837148174 T:C T C 10 0.524844521382317 0.858443645066449 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 44569516 G/A 1 18 21 39 8.5527986151183 11.0217349490287 -2.46893633391036 A:G G A 10 0.524844521382317 0.521874628920024 ENSG00000100982:ENST00000372409:exon_44569448_44569578:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000443130:exon_44569448_44569578:PCIF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 44577991 G/T 1 42 34 76 19.9565301019427 17.8447137269988 2.11181637494391 T:G G T 10 0.524844521382317 0.647694397969219 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44577972_44578037:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44577972_44578037:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44577972_44578037:ZNF335 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 44596207 C/G 1 11 6 17 5.22671026479451 3.1490671282939 2.07764313650061 C:G C G 10 0.524844521382317 0.342500346550349 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000476822:exon_44596133_44596273:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000494955:exon_44595506_44596273:ZNF335 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 44691350 T/G 1 29 34 63 13.7795088799128 17.8447137269988 -4.06520484708597 T:G T G 10 0.524844521382317 0.315576559621082 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44689624_44691528:NCOA5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 44692170 T/G 1 32 22 54 15.2049753157659 11.546579470411 3.65839584535488 T:G T G 10 0.524844521382317 0.342584055726343 ENSG00000124160:ENST00000290231:exon_44691999_44692319:NCOA5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 46256424 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46256305_46256493:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000497292:exon_46256305_46256493:NCOA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47253043 G/A 1 51 30 81 24.2329294095018 15.7453356414695 8.48759376803233 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0744232003810007 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47685320 G/C 1 14 5 19 6.65217670064756 2.62422260691158 4.02795409373598 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0697160540587325 ENSG00000124207:ENST00000396192:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000417408:exon_47685252_47685359:CSE1L;ENSG00000124207:ENST00000262982:exon_47685252_47685359:CSE1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 11 17 28 5.22671026479451 8.92235686349939 -3.69564659870487 T:G G T 10 0.524844521382317 0.187089974666476 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 55 55 110 26.1335513239726 28.8664486760274 -2.73289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.633699800430653 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 32 24 56 15.2049753157659 12.5962685131756 2.60870680259025 A:G G A 10 0.524844521382317 0.506442600417644 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47865784 C/T 1 30 37 67 14.2546643585305 19.4192472911457 -5.16458293261524 T:C C T 10 0.524844521382317 0.222408175385752 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 C:G C G 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 10 17 27 4.75155478617683 8.92235686349939 -4.17080207732256 A:G A G 10 0.524844521382317 0.124543972637999 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 47896901 A/G 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G A G 10 0.524844521382317 0.744219842559896 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 36 31 67 17.1055972302366 16.2701801628518 0.835417067384764 A:G G A 10 0.524844521382317 0.902868141640228 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 30 39 69 14.2546643585305 20.4689363339104 -6.21427197537987 A:G G A 10 0.524844521382317 0.148436132170907 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 48524827 A/G 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48524692_48525129:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48524692_48525129:SPATA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 49195061 A/G 1 15 18 33 7.12733217926525 9.4472013848817 -2.31986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.486957322619883 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49194957_49195166:PTPN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 49493076 G/A 1 129 122 251 61.2950567416811 64.0310316086427 -2.73597486696156 A:G G A 10 0.524844521382317 0.752193290868117 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000445038:exon_49493023_49493109:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 49508683 G/A 1 77 65 142 36.5869718535616 34.1148938898506 2.47207796371099 A:G G A 10 0.524844521382317 0.736946295871112 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 49509175 C/T 1 77 65 142 36.5869718535616 34.1148938898506 2.47207796371099 T:C C T 10 0.524844521382317 0.736946295871112 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 49575039 G/A 1 27 18 45 12.8291979226774 9.4472013848817 3.38199653779574 A:G G A 10 0.524844521382317 0.371090172681409 ENSG00000000419:ENST00000371588:exon_49574900_49575087:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000466152:exon_49574900_49575087:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000371582:exon_49574900_49575092:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000449701:exon_49574900_49575087:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000371583:exon_49574900_49575087:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000371584:exon_49574900_49575058:DPM1;ENSG00000000419:ENST00000413082:exon_49574900_49575069:DPM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 50705121 G/C 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 G G 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50704931_50705182:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371523:exon_50704931_50705182:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50704931_50705182:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000533714:exon_50704931_50705182:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000456175:exon_50704931_50705182:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000395989:exon_50704931_50705182:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000467811:exon_50704804_50705182:ZFP64 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 54972459 A/G 1 23 30 53 10.9285760082067 15.7453356414695 -4.8167596332628 A:G A G 10 0.524844521382317 0.215927171350743 ENSG00000101138:ENST00000415828:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000451236:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000217109:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000428552:exon_54972263_54972519:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000452950:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000425890:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000493039:exon_54972263_54972540:CSTF1;ENSG00000101138:ENST00000490539:exon_54972263_54972540:CSTF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 55092245 C/T 1 118 114 232 56.0683464768866 59.8322754375841 -3.76392896069754 T:C C T 10 0.524844521382317 0.645637142686347 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477485:exon_55091991_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477573:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000124103:ENST00000481560:exon_55092243_55092257:C20orf106 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 55948719 C/T 1 36 22 58 17.1055972302366 11.546579470411 5.55901775982562 T:C C T 10 0.524844521382317 0.150327957933331 ENSG00000101146:ENST00000395841:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000371242:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000527947:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000492498:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000395840:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000462438:exon_55946190_55948794:RAE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 55982858 G/C 1 112 226 338 53.2174136051805 118.614861832404 -65.3974482272231 C:G G C 10 0.524844521382317 1.12673580660891e-12 ENSG00000132819:ENST00000356208:exon_55982599_55984389:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000344785:exon_55982599_55984389:RBM38;ENSG00000132819:ENST00000371219:exon_55982599_55982916:RBM38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 56064036 A/T 0 22 0 22 10.453420529589 0 10.453420529589 A A 10 0.524844521382317 7.70600391689836e-07 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 56185209 G/A 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 57269495 G/A 1 18 17 35 8.5527986151183 8.92235686349939 -0.369558248381093 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57269478_57269648:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000533788:exon_57269477_57269648:NPEPL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 57569134 G/A 1 7 17 24 3.32608835032378 8.92235686349939 -5.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0246557007727916 ENSG00000101158:ENST00000474543:exon_57568679_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57568679_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000486263:exon_57568978_57569294:TH1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 57571818 G/C 1 66 115 181 31.3602615887671 60.3571199589665 -28.9968583701994 C:G G C 10 0.524844521382317 1.90540691511564e-05 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 57572674 C/T 1 152 64 216 72.2236327498878 33.5900493684683 38.6335833814195 T:C C T 10 0.524844521382317 1.15274417136891e-07 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57572658_57572808:CTSZ;ENSG00000101160:ENST00000488395:exon_57572447_57572808:CTSZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 230 226 456 109.285760082067 118.614861832404 -9.32910175033653 A:G A G 10 0.524844521382317 0.398758237959238 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61443636 G/A 1 81 61 142 38.4875937680323 32.0155158043213 6.47207796371099 A:G G A 10 0.524844521382317 0.313336257435281 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61443870 C/G 1 131 136 267 62.2453676989165 71.3788549079951 -9.13348720907863 C:G C G 10 0.524844521382317 0.270462410875184 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61444356 G/A 1 123 116 239 58.444123869975 60.8819644803488 -2.43784061037375 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.79565723515942 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61444939 G/C 1 170 102 272 80.7764313650061 53.5341411809963 27.2422901840098 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.00101144314974137 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61464375 A/G 1 3 12 15 1.42546643585305 6.2981342565878 -4.87266782073475 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0171387439018236 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61464372_61464416:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61464372_61464416:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000469852:exon_61464372_61464416:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000490398:exon_61464372_61464416:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000481800:exon_61464372_61464416:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000472880:exon_61464197_61464416:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000469802:exon_61464202_61464416:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61464239_61464416:COL9A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61467701 G/A 0 0 13 13 0 6.82297877797012 -6.82297877797012 A G A 10 0.524844521382317 6.29310002248808e-05 ENSG00000092758:ENST00000472880:exon_61467273_61468011:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000469802:exon_61467539_61467884:COL9A3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61513649 G/T 1 2 9 11 0.950310957235366 4.72360069244085 -3.77328973520549 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0314919893609911 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61509090_61513766:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61509095_61513766:DIDO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61594032 G/C 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 C:G G C 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61593976_61594106:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61593976_61594106:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61593976_61594721:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61593976_61594089:SLC17A9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61595615 G/A 1 10 24 34 4.75155478617683 12.5962685131756 -7.84471372699878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00910321440621117 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61595645 C/G 1 6 19 25 2.8509328717061 9.97204590626402 -7.12111303455792 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.00464436517166263 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61596977 C/T 1 21 11 32 9.97826505097134 5.77328973520549 4.20497531576586 T:C C T 10 0.524844521382317 0.158119016878846 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61596962_61597077:SLC17A9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61833873 C/T 1 87 65 152 41.3385266397384 34.1148938898506 7.22363274988782 T:C C T 10 0.524844521382317 0.256009142645422 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61867454 A/G 0 16 0 16 7.60248765788293 0 7.60248765788293 A A 10 0.524844521382317 3.99016046513400e-05 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61867235_61867797:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61867235_61867797:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61867235_61867797:BIRC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61869789 A/G 0 10 0 10 4.75155478617683 0 4.75155478617683 A A 10 0.524844521382317 0.00217263351343085 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000395306:exon_61869554_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000426135:exon_61869560_61869829:BIRC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61869826 C/T 0 20 0 20 9.50310957235366 0 9.50310957235366 C C 10 0.524844521382317 2.85956041623882e-06 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61869748_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000395306:exon_61869554_61869829:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000426135:exon_61869560_61869829:BIRC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 61870546 C/T 0 23 0 23 10.9285760082067 0 10.9285760082067 C C 10 0.524844521382317 4.00584863725346e-07 ENSG00000101197:ENST00000342412:exon_61870514_61870585:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000217169:exon_61870514_61870585:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000370327:exon_61870514_61870585:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000395306:exon_61870514_61870585:BIRC7;ENSG00000101197:ENST00000426135:exon_61870514_61870585:BIRC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62126185 A/G 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62153190 C/T 1 1338 1010 2348 635.75803039046 530.09296659614 105.66506379432 A:T:C C T 10 0.524844521382317 1.28593375504345e-05 ENSG00000125534:ENST00000370179:exon_62153021_62153559:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000370177:exon_62152865_62153291:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000473620:exon_62153021_62153302:PPDPF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62191321 A/G 1 33 32 65 15.6801307943835 16.7950246842341 -1.1148938898506 A:G A G 10 0.524844521382317 0.804838164054738 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62192244 C/T 1 45 30 75 21.3819965377957 15.7453356414695 5.63666089632623 T:C C T 10 0.524844521382317 0.204854829293055 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000478861:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62194510 T/C 1 21 8 29 9.97826505097134 4.19875617105854 5.77950887991281 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0395712872704 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62194713 A/C 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 A:C A C 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62195087 A/G 1 17 11 28 8.07764313650061 5.77328973520549 2.30435340129513 A:G A G 10 0.524844521382317 0.451258947468562 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62195726 G/A 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62196253 C/A 1 5 15 20 2.37577739308842 7.87266782073475 -5.49689042764634 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0226256809064239 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62197370 G/A 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62193873_62197584:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62198686 G/A 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62198197_62199427:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62198197_62199105:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62198197_62198980:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62200860 A/G 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62200929 G/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62201884 G/A 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62201857_62201964:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62201857_62201964:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000479540:exon_62201479_62201964:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370082:exon_62201492_62201964:RP4-697K14.7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62316889 T/C 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62316876_62316950:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62316876_62316950:RTEL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62329655 C/T 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 T:C C T 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62329633_62330051:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62329633_62330051:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62329633_62330033:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000243509:ENST00000369996:exon_62329633_62330037:TNFRSF6B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62368974 G/A 1 17 10 27 8.07764313650061 5.24844521382317 2.82919792267744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.336756432357263 ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62368886_62369000:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62367133_62369000:ZGPAT;ENSG00000203896:ENST00000444951:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000490824:exon_62367670_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000465591:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000309546:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000487026:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000480139:exon_62368886_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000493265:exon_62368637_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000489212:exon_62368852_62369000:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000476183:exon_62368852_62369000:LIME1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62370214 A/G 1 46 43 89 21.8571520164134 22.5683144194396 -0.711162403026211 A:G A G 10 0.524844521382317 0.915687873197768 ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62369951_62370456:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62369951_62370456:ZGPAT;ENSG00000203896:ENST00000490824:exon_62369951_62370456:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000309546:exon_62369951_62370456:LIME1;ENSG00000125520:ENST00000476221:exon_62369951_62370284:SLC2A4RG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 20 62680627 G/A 1 1 23 24 0.475155478617683 12.0714239917933 -11.5962685131756 A:G G A 10 0.524844521382317 6.73422199725432e-07 ENSG00000203883:ENST00000340356:exon_62680512_62680994:SOX18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 38 28 66 18.055908187472 14.6956465987049 3.36026158876708 C:G G C 10 0.524844521382317 0.460237621444844 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 17203785 A/T 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 A:T A T 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000155313:ENST00000285681:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000285679:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000400183:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000453553:exon_17203720_17203948:USP25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 26965100 C/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:C C A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 55 48 103 26.1335513239726 25.1925370263512 0.941014297621354 A:G G A 10 0.524844521382317 0.921486031356124 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 64 58 122 30.4099506315317 30.4409822401744 -0.031031608642671 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 21 33 54 9.97826505097134 17.3198692056165 -7.34160415464512 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0556809980125386 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 26978950 A/G 1 93 106 199 44.1894595114445 55.6335192665256 -11.4440597550811 A:G A G 10 0.524844521382317 0.118199425998901 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26978761_26978967:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26978761_26978967:MRPL39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 27141357 G/A 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 A:G G A 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000154727:ENST00000354828:exon_27141315_27144771:GABPA;ENSG00000154727:ENST00000400075:exon_27141315_27144771:GABPA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 27141402 A/G 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000154727:ENST00000354828:exon_27141315_27144771:GABPA;ENSG00000154727:ENST00000400075:exon_27141315_27144771:GABPA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 30699085 T/C 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30698380_30699714:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30698380_30699714:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000382845:exon_30698380_30699714:BACH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 30714776 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000156273:ENST00000286800:exon_30714720_30718469:BACH1;ENSG00000156273:ENST00000399921:exon_30714720_30718469:BACH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 33068962 T/C 1 4 10 14 1.90062191447073 5.24844521382317 -3.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.106163918875083 ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33068882_33069063:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000467731:exon_33068882_33069049:SFRS15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 34117958 C/T 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000159086:ENST00000331923:exon_34117885_34118029:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000466846:exon_34117885_34118029:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000443785:exon_34117885_34118029:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000497873:exon_34117885_34118029:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000290178:exon_34117885_34118029:GCFC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 54 68 122 25.6583958453549 35.6894274539976 -10.0310316086427 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0704229482867806 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 34921771 A/G 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G A G 10 0.524844521382317 0.744219842559896 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 34922544 C/T 1 96 101 197 45.6149259472976 53.009296659614 -7.39437071231644 T:C C T 10 0.524844521382317 0.317982215669469 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34921782_34923769:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34921782_34923595:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34922117_34922545:SON HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 92 94 186 43.7143040328268 49.3353850099378 -5.62108097711096 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.420063547375388 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 126 145 271 59.8695903058281 76.102455600436 -16.2328652946079 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0515506672590337 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 13 51 64 6.17702122202988 26.7670705904982 -20.5900493684683 T:C T C 10 0.524844521382317 2.11653536513459e-07 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 35275835 C/A 1 159 207 366 75.5497211002116 108.64281592614 -33.093094825928 A:C C A 10 0.524844521382317 0.00054333675381509 ENSG00000241837:ENST00000431254:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000417181:exon_35275760_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35275760_35275960:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000429064:exon_35275761_35275943:ATP5O HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 35275914 A/C 1 314 264 578 149.198820285952 138.558953644932 10.6398666410208 A:C A C 10 0.524844521382317 0.38206270260211 ENSG00000241837:ENST00000431254:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35275757_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000417181:exon_35275760_35275943:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35275760_35275960:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000429064:exon_35275761_35275943:ATP5O HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 36042579 C/G 1 28 48 76 13.3043534012951 25.1925370263512 -11.8881836250561 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00786167725657694 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36041688_36043061:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36041688_36043061:CLIC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 36042749 T/C 1 59 43 102 28.0341732384433 22.5683144194396 5.46585881900367 T:C T C 10 0.524844521382317 0.321535936037805 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36041688_36043061:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36041688_36043061:CLIC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 37408403 G/A 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37406839_37408549:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000481477:exon_37408383_37408549:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37406839_37408549:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37408383_37408549:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000487297:exon_37408383_37408549:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000469482:exon_37408383_37408549:SETD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 37445012 C/A 1 100 141 241 47.5155478617683 74.0030775149067 -26.4875296531384 A:C C A 10 0.524844521382317 0.000763530089078018 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 37785284 A/G 1 36 29 65 17.1055972302366 15.2204911200872 1.8851061101494 A:G A G 10 0.524844521382317 0.709946385928617 ENSG00000159259:ENST00000314103:exon_37785182_37785613:CHAF1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 38302554 C/T 1 15 5 20 7.12733217926525 2.62422260691158 4.50310957235366 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0463439224535587 ENSG00000159267:ENST00000336648:exon_38302551_38302733:HLCS;ENSG00000159267:ENST00000399120:exon_38302551_38302733:HLCS;ENSG00000159267:ENST00000482273:exon_38302551_38302717:HLCS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 38309272 G/A 1 10 14 24 4.75155478617683 7.34782329935244 -2.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.312817090933246 ENSG00000159267:ENST00000336648:exon_38308749_38309692:HLCS;ENSG00000159267:ENST00000399120:exon_38308749_38309692:HLCS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 38437951 T/G 1 57 54 111 27.0838622812079 28.3416041546451 -1.25774187343718 T:G T G 10 0.524844521382317 0.849491687910092 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 38444822 T/A 1 24 31 55 11.4037314868244 16.2701801628518 -4.86644867602743 A:T T A 10 0.524844521382317 0.224258848606195 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38444734_38445111:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000479152:exon_38444734_38445023:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000430792:exon_38444734_38445297:PIGP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 38536365 A/C 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 A:C A C 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000411496:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000487711:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38536353_38536517:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000469939:exon_38536353_38536517:TTC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 19 30 49 9.02795409373598 15.7453356414695 -6.71738154773353 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0627401102217899 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 352 334 686 167.254728473424 175.298070141694 -8.04334166826945 A:G A G 10 0.524844521382317 0.541030927271777 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 42824733 G/A 1 484 430 914 229.975251650959 225.683144194396 4.29210745656229 A:G G A 10 0.524844521382317 0.791094049907592 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 43796716 G/A 1 1 21 22 0.475155478617683 11.0217349490287 -10.546579470411 A:G G A 10 0.524844521382317 2.65860874892147e-06 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43796650_43796792:TMPRSS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 1 2 56 58 0.950310957235366 29.3912931974098 -28.4409822401744 T:C T C 10 0.524844521382317 4.33553092282499e-16 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 1 21 22 0.475155478617683 11.0217349490287 -10.546579470411 T:C C T 10 0.524844521382317 2.65860874892147e-06 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 43974226 T/C 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43974172_43974252:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43974172_43974252:SLC37A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 44270229 C/T 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45220473 C/T 1 40 33 73 19.0062191447073 17.3198692056165 1.68634993909086 T:C C T 10 0.524844521382317 0.72625365178656 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45220398_45220495:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45220398_45220495:RRP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 41 44 85 19.481374623325 23.0931589408219 -3.61178431749694 T:C C T 10 0.524844521382317 0.448770996438109 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45544594 T/C 1 36 27 63 17.1055972302366 14.1708020773226 2.93479515291403 T:C T C 10 0.524844521382317 0.52865783393892 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45544461_45544608:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45544461_45546000:PWP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 45 52 97 21.3819965377957 27.2919151118805 -5.90991857408475 A:C C A 10 0.524844521382317 0.263408427903468 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45557205 C/T 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C C T 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45557059_45557259:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000488392:exon_45557059_45557457:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000470545:exon_45557059_45557448:C21orf33 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45560126 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 36 44 80 17.1055972302366 23.0931589408219 -5.98756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 0.217941208809357 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45750168 A/G 1 58 80 138 27.5590177598256 41.9875617105854 -14.4285439507597 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0167092752587575 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 45759045 C/T 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 T:C C T 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45759001_45759285:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45759001_45759285:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45759001_45759276:C21orf2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47581423 C/T 1 1 109 110 0.475155478617683 57.2080528306725 -56.7328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 3.46799811646894e-34 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47581508 C/A 0 109 0 109 51.7919471693275 0 51.7919471693275 C C 10 0.524844521382317 3.47838342050911e-31 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47685268 C/T 1 21 20 41 9.97826505097134 10.4968904276463 -0.518625376674995 T:C C T 10 0.524844521382317 0.877221735051787 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685235_47685437:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685235_47685437:MCM3AP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47703649 G/A 1 15 12 27 7.12733217926525 6.2981342565878 0.829197922677442 A:G G A 10 0.524844521382317 0.848089388772471 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47703529_47703752:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47703529_47703752:MCM3AP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47787002 T/C 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47808679 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47808657_47808799:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47808657_47808799:PCNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47821588 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47821465_47821635:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47821465_47821635:PCNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47836448 A/G 1 17 6 23 8.07764313650061 3.1490671282939 4.92857600820671 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0579341542498876 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47845862 T/C 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 T:C T C 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47845745_47845885:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47845745_47845885:PCNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 24 22 46 11.4037314868244 11.546579470411 -0.142847983586581 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 15 7 22 7.12733217926525 3.67391164967622 3.45342052958903 A:G A G 10 0.524844521382317 0.199368685480053 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 17589567 C/T 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 T:C C T 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 17619076 C/G 1 68 100 168 32.3105725460024 52.4844521382317 -20.1738795922292 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00194952056874649 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17618401_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17618410_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000477157:exon_17618412_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000399852:exon_17618469_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000486462:exon_17618472_17619247:CECR5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 20 26 46 9.50310957235366 13.6459575559402 -4.14284798358658 T:G T G 10 0.524844521382317 0.239689192830905 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 21 13 34 9.97826505097134 6.82297877797012 3.15528627300122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.306539571272256 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 18209804 A/G 1 18 25 43 8.5527986151183 13.1211130345579 -4.56831441943963 A:G A G 10 0.524844521382317 0.172207221811583 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 18301685 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000093100:ENST00000252134:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000441493:exon_18300077_18301895:MICAL3;ENSG00000093100:ENST00000425874:exon_18300077_18301895:MICAL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 19121872 G/A 1 45 30 75 21.3819965377957 15.7453356414695 5.63666089632623 A:G G A 10 0.524844521382317 0.204854829293055 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 19776106 G/A 1 21 14 35 9.97826505097134 7.34782329935244 2.63044175161891 A:G G A 10 0.524844521382317 0.401831493103041 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19770747_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19775938_19776483:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000405009:exon_19775941_19776149:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19775987_19776483:GNB1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:G T G 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 19906511 G/A 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19906383_19906527:TXNRD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 19907118 G/A 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 A:G G A 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 19951237 C/T 1 120 83 203 57.018657434122 43.5620952747323 13.4565621593897 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.0674233746957877 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 118 125 243 56.0683464768866 65.6055651727896 -9.53721869590303 A:G G A 10 0.524844521382317 0.223023450647438 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 20050883 G/A 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000183597:ENST00000401886:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000398042:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000399807:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000450019:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000327374:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000432883:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000430807:exon_20050861_20050944:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000401833:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000434168:exon_20050861_20050934:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000444651:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000485715:exon_20050861_20050906:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420290:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420446:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000447208:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000456048:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000490583:exon_20050861_20050965:C22orf25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 20101045 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000099899:ENST00000487668:exon_20100955_20101084:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000439169:exon_20100955_20101084:TRMT2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 20104101 C/T 1 43 30 73 20.4316855805604 15.7453356414695 4.68634993909086 T:C C T 10 0.524844521382317 0.292951178938444 ENSG00000099899:ENST00000252136:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000403707:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000405037:exon_20103561_20104156:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000404751:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000402382:exon_20103557_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000439169:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000494641:exon_20103581_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000464535:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000445045:exon_20103765_20104135:TRMT2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 20113777 T/C 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.249548155109633 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 20130626 C/T 1 18 16 34 8.5527986151183 8.39751234211707 0.155286273001224 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000099904:ENST00000334554:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000320602:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000405930:exon_20130279_20131279:ZDHHC8;ENSG00000099904:ENST00000480335:exon_20130553_20131103:ZDHHC8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 20230080 G/A 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000040608:ENST00000416372:exon_20228938_20230633:RTN4R;ENSG00000040608:ENST00000406414:exon_20228938_20230633:RTN4R;ENSG00000040608:ENST00000043402:exon_20228938_20230633:RTN4R;ENSG00000040608:ENST00000425986:exon_20228940_20230633:RTN4R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 20937482 G/A 1 38 47 85 18.055908187472 24.6676925049689 -6.61178431749694 A:G G A 10 0.524844521382317 0.159021014572676 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000478831:exon_20937400_20937514:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20937400_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20936381_20937534:MED15;ENSG00000099917:ENST00000476187:exon_20937400_20937534:MED15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 21337325 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000414985:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000493460:exon_21337316_21337378:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000443265:exon_21337316_21337378:LZTR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 22550510 T/G 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 T:G T G 10 0.524844521382317 0.797397833890785 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 22673305 C/T 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 T:C C T 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 23523630 C/A 1 17 8 25 8.07764313650061 4.19875617105854 3.87888696544208 A:C C A 10 0.524844521382317 0.160240193271769 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23522397_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23522552_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23523071_23524426:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23523071_23524426:BCR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 23627238 C/A 1 15 9 24 7.12733217926525 4.72360069244085 2.40373148682439 A:C C A 10 0.524844521382317 0.414775891663106 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000427791:exon_23627220_23627301:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 24095105 G/A 1 38 11 49 18.055908187472 5.77328973520549 12.2826184522665 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000466858165825718 ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24095082_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24094930_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000398465:exon_24094930_24095337:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24094937_24095385:VPREB3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 24095296 C/T 1 50 14 64 23.7577739308842 7.34782329935244 16.4099506315317 T:C C T 10 0.524844521382317 2.72857342964026e-05 ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24095082_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24094930_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000398465:exon_24094930_24095337:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24094937_24095385:VPREB3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 24108288 C/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 C:G C G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 448 442 890 212.869654420722 231.981278450984 -19.1116240302621 A:G G A 10 0.524844521382317 0.202307043386459 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 24447303 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000099991:ENST00000454754:exon_24447287_24447436:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24447287_24447436:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000445422:exon_24447287_24447436:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24447287_24447436:CABIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 24479193 C/G 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 C:G C G 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24479181_24479342:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24479181_24479342:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24479181_24479342:CABIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 25715848 C/T 1 64 34 98 30.4099506315317 17.8447137269988 12.5652369045329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0113516574018464 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 25750680 C/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:T:C C A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25750563_25750779:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25750563_25750779:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25750563_25750779:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25750563_25750779:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25750563_25750779:LRP5L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 25753387 C/T 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000100068:ENST00000467672:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402859:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000444995:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000402785:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000474163:exon_25753222_25753393:LRP5L;ENSG00000100068:ENST00000484509:exon_25753222_25753773:LRP5L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 26099498 T/C 1 17 17 34 8.07764313650061 8.92235686349939 -0.844713726998776 T:C T C 10 0.524844521382317 0.864128654984718 ENSG00000100077:ENST00000324198:exon_26099477_26099543:ADRBK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 21 28 49 9.97826505097134 14.6956465987049 -4.71738154773353 C:G C G 10 0.524844521382317 0.198842918946795 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 1 49 52 101 23.2826184522665 27.2919151118805 -4.00929665961401 A:G G A 10 0.524844521382317 0.427610798642074 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 29908025 G/A 1 38 31 69 18.055908187472 16.2701801628518 1.78572802462013 A:G G A 10 0.524844521382317 0.718376209648423 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 30163526 A/G 1 427 415 842 202.891389369751 217.810476373662 -14.9190870039109 A:G A G 10 0.524844521382317 0.317004118525795 ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 30200761 C/G 1 26 38 64 12.3540424440598 19.944091812528 -7.59004936846828 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0610121725379343 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30200627_30200813:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30200627_30200819:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30200627_30200819:ASCC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 30221120 C/T 1 25 20 45 11.8788869654421 10.4968904276463 1.38199653779574 T:C C T 10 0.524844521382317 0.765909330497689 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000431535:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495967:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000412689:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30221075_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000463203:exon_30221076_30221347:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495681:exon_30221076_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000462454:exon_30221092_30221246:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000453160:exon_30221097_30221246:ASCC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 30782089 A/G 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000099999:ENST00000382363:exon_30782059_30782130:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000215798:exon_30782059_30782130:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000473077:exon_30782059_30782130:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000431544:exon_30782059_30782130:RNF215 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 58 70 128 27.5590177598256 36.7391164967622 -9.18009873693657 T:C T C 10 0.524844521382317 0.111369139731559 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 31006860 A/G 1 15 5 20 7.12733217926525 2.62422260691158 4.50310957235366 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0463439224535587 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000423350:exon_31006858_31007101:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31006858_31007050:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31006858_31007050:TCN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 31019044 G/A 1 12 27 39 5.7018657434122 14.1708020773226 -8.46893633391036 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00939605354696981 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31018955_31019283:TCN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 31971258 T/C 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 T:C T C 10 0.524844521382317 0.433796952873074 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476010:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000484806:exon_31971217_31971378:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31971217_31971378:SFI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 31976299 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000484806:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000467357:exon_31976074_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31976258_31976350:SFI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 32007153 G/A 1 22 16 38 10.453420529589 8.39751234211707 2.05590818747195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.521170691333303 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000466991:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000491973:exon_32007129_32007289:SFI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 32014365 C/T 1 50 44 94 23.7577739308842 23.0931589408219 0.664614990062205 T:C C T 10 0.524844521382317 0.918045996806718 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32014300_32014537:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32014300_32014432:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32014300_32014572:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32014101_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32014300_32014534:SFI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 32266603 A/G 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100150:ENST00000382109:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400249:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000266091:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400246:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382105:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382112:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000382111:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000400248:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000448753:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000433147:exon_32266576_32266730:DEPDC5;ENSG00000100150:ENST00000494060:exon_32266576_32266730:DEPDC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 32352606 C/T 1 301 272 573 143.021799063923 142.75770981599 0.26408924793239 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 88 66 154 41.8136821183561 34.6397384112329 7.17394370712319 A:G G A 10 0.524844521382317 0.259312767538484 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 104 95 199 49.416169776239 49.8602295313201 -0.444059755081071 T:C:G C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 35777185 G/C 1 87 90 177 41.3385266397384 47.2360069244085 -5.8974802846701 T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.407870509024489 ENSG00000100292:ENST00000412893:exon_35776927_35777189:HMOX1;ENSG00000100292:ENST00000216117:exon_35776828_35777189:HMOX1;ENSG00000100292:ENST00000481190:exon_35777086_35777322:HMOX1;ENSG00000100292:ENST00000496457:exon_35777086_35777322:HMOX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 35806815 T/C 1 54 50 104 25.6583958453549 26.2422260691158 -0.583830223760962 T:C T C 10 0.524844521382317 0.922080124824527 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35806737_35806865:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000464908:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35806402_35806903:MCM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 35819180 G/A 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35817311_35820494:MCM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36537893 A/G 1 54 60 114 25.6583958453549 31.490671282939 -5.83227543758413 A:G A G 10 0.524844521382317 0.302469904013759 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36538053 G/A 1 33 26 59 15.6801307943835 13.6459575559402 2.0341732384433 A:G G A 10 0.524844521382317 0.605375830114875 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000534251:exon_36537911_36538106:APOL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 15 17 32 7.12733217926525 8.92235686349939 -1.79502468423414 A:G G A 10 0.524844521382317 0.59689936717842 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 38 34 72 18.055908187472 17.8447137269988 0.21119446047318 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 44 35 79 20.9068410591781 18.3695582483811 2.53728281079696 A:G G A 10 0.524844521382317 0.575819267119754 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 29 27 56 13.7795088799128 14.1708020773226 -0.39129319740975 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 26 35 61 12.3540424440598 18.3695582483811 -6.01551580432133 A:G G A 10 0.524844521382317 0.126106688745431 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36710271 C/T 1 73 61 134 34.6863499390909 32.0155158043213 2.67083413476953 T:C C T 10 0.524844521382317 0.666141224939325 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36710190_36710363:MYH9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36900806 A/G 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 A:G A G 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900562_36900813:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900562_36900813:FOXRED2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36912630 A/G 1 228 195 423 108.335449124832 102.344681669552 5.99076745527992 A:G A G 10 0.524844521382317 0.592357585880833 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 36922052 T/C 1 195 209 404 92.6553183304482 109.692504968904 -17.037186638456 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.0905466897604254 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 37273805 C/T 1 80 97 177 38.0124382894146 50.9099185740847 -12.8974802846701 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0596368936461995 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 37414528 G/A 1 33 26 59 15.6801307943835 13.6459575559402 2.0341732384433 A:G G A 10 0.524844521382317 0.605375830114875 ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37414179_37415508:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000413912:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000438203:exon_37414402_37414794:TST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 37524092 G/A 1 111 128 239 52.7422581265628 67.1800987369366 -14.4378406103738 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0695535702247106 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 37531436 G/A 1 8 16 24 3.80124382894146 8.39751234211707 -4.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0673884929405873 ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 38021070 C/T 1 65 27 92 30.8851061101494 14.1708020773226 16.7143040328268 T:C C T 10 0.524844521382317 0.000507220131579837 ENSG00000100083:ENST00000343632:exon_38020976_38021083:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000381756:exon_38020976_38021083:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000337437:exon_38020976_38021083:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000406772:exon_38020976_38021083:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000475445:exon_38019836_38021083:GGA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 38147834 A/C 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38147779_38147835:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38147779_38147835:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38147779_38147835:TRIOBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 798 847 1645 379.174071936911 444.543309610822 -65.3692376739114 A:T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.00132467835889386 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 38340246 C/T 1 8 18 26 3.80124382894146 9.4472013848817 -5.64595755594024 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0305375198276518 ENSG00000128346:ENST00000403305:exon_38339528_38340253:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000249079:exon_38339533_38340253:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000396889:exon_38339533_38340253:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000403026:exon_38340132_38340253:C22orf23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 38470837 C/G 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 C:G C G 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 38528958 C/T 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000184381:ENST00000332509:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000335539:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000402064:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000419848:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000425347:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000444151:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000429782:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000448094:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000335538:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000396860:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000451461:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000427114:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000427453:exon_38528838_38529020:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000452542:exon_38528838_38529020:PLA2G6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 38689222 C/T 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000213923:ENST00000495232:exon_38688915_38689325:CSNK1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 39137510 G/A 1 43 34 77 20.4316855805604 17.8447137269988 2.58697185356159 A:G G A 10 0.524844521382317 0.570510780123423 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000477262:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000469086:exon_39137499_39137576:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000464202:exon_39137499_39137576:SUN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 39262739 C/T 1 18 23 41 8.5527986151183 12.0714239917933 -3.518625376675 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.278600075286401 ENSG00000183741:ENST00000407418:exon_39257455_39263206:CBX6;ENSG00000183741:ENST00000216083:exon_39260234_39263152:CBX6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 39445550 A/G 1 13 14 27 6.17702122202988 7.34782329935244 -1.17080207732256 A:G A G 10 0.524844521382317 0.702665708426939 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 39448336 C/T 1 34 17 51 16.1552862730012 8.92235686349939 7.23292940950184 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0491988396054341 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448079_39448358:APOBEC3F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 475 456 931 225.698852343399 239.329101750337 -13.6302494069371 A:T:C:G A C 10 0.524844521382317 0.375761998589395 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 40762537 G/T 1 35 9 44 16.6304417516189 4.72360069244085 11.9068410591781 T:G G T 10 0.524844521382317 0.000381008181286104 ENSG00000239900:ENST00000216194:exon_40762440_40763008:ADSL;ENSG00000239900:ENST00000454266:exon_40762440_40762558:ADSL;ENSG00000239900:ENST00000342312:exon_40762440_40763000:ADSL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 40804923 G/A 1 6 19 25 2.8509328717061 9.97204590626402 -7.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00464436517166263 ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40804798_40805376:SGSM3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 40805011 C/T 1 66 55 121 31.3602615887671 28.8664486760274 2.49381291273965 T:C C T 10 0.524844521382317 0.715960540427238 ENSG00000100359:ENST00000248929:exon_40804937_40805022:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000454798:exon_40804937_40805022:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000485962:exon_40804937_40805022:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40804798_40805376:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000470518:exon_40804937_40805120:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000427834:exon_40804937_40805022:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000469719:exon_40804937_40805376:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000462457:exon_40804937_40805376:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000417424:exon_40804937_40805022:SGSM3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 41623324 G/T 1 64 51 115 30.4099506315317 26.7670705904982 3.64288004103355 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.514617113332383 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41623093_41623327:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41623093_41623814:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41623093_41623873:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41623093_41623327:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41623093_41623873:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41623093_41623327:L3MBTL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 38 28 66 18.055908187472 14.6956465987049 3.36026158876708 C:G C G 10 0.524844521382317 0.460237621444844 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 41753444 T/C 1 23 15 38 10.9285760082067 7.87266782073475 3.05590818747195 T:C T C 10 0.524844521382317 0.335254961525510 ENSG00000100403:ENST00000352645:exon_41753181_41756151:ZC3H7B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 49 45 94 23.2826184522665 23.6180034622043 -0.335385009937795 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 41980567 C/T 1 15 16 31 7.12733217926525 8.39751234211707 -1.27018016285183 T:C C T 10 0.524844521382317 0.720479372385213 ENSG00000100417:ENST00000216259:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000482178:exon_41980531_41981406:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000472620:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000485648:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000466645:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000478337:exon_41980010_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000414636:exon_41980531_41980607:PMM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42076330 G/A 1 231 235 466 109.760915560685 123.338462524844 -13.5775469641597 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.210744994312374 ENSG00000100138:ENST00000355257:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000215956:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000401959:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000463675:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000402458:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000488571:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000469028:exon_42076250_42076368:NHP2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 43 33 76 20.4316855805604 17.3198692056165 3.11181637494391 A:C C A 10 0.524844521382317 0.492916236734793 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 34 29 63 16.1552862730012 15.2204911200872 0.934795152914031 T:C C T 10 0.524844521382317 0.899775143288907 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42276825 G/A 1 75 71 146 35.6366608963262 37.2639610181445 -1.62730012181828 A:G G A 10 0.524844521382317 0.804100337436956 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42301434 C/T 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.293913347766002 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 68 67 135 32.3105725460024 35.1645829326152 -2.85401038661279 A:G A G 10 0.524844521382317 0.666794648860323 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 26 29 55 12.3540424440598 15.2204911200872 -2.86644867602743 T:C C T 10 0.524844521382317 0.500213450011489 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42486723 G/A 1 185 150 335 87.9037635442714 78.7266782073475 9.17708533692381 A:G G A 10 0.524844521382317 0.325127226488380 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42486738 C/T 1 137 166 303 65.0963005706226 87.1241905494646 -22.027889978842 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0132544084356303 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42486765 C/T 1 26 25 51 12.3540424440598 13.1211130345579 -0.767070590498165 T:C C T 10 0.524844521382317 0.88886715961801 ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42522613 G/C 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 G G 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 ENSG00000100197:ENST00000360124:exon_42522501_42522754:CYP2D6;ENSG00000100197:ENST00000360608:exon_42522501_42522754:CYP2D6;ENSG00000100197:ENST00000389970:exon_42522503_42522754:CYP2D6;ENSG00000100197:ENST00000413640:exon_42522503_42522754:CYP2D6;ENSG00000100197:ENST00000488442:exon_42522537_42522754:CYP2D6;ENSG00000100197:ENST00000359033:exon_42522558_42522754:CYP2D6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42610096 C/T 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 48 24 72 22.8074629736488 12.5962685131756 10.2111944604732 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.0178861224487836 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 42981890 G/A 1 22 15 37 10.453420529589 7.87266782073475 2.58075270885427 A:G G A 10 0.524844521382317 0.415690016228402 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 43010817 G/A 1 33 23 56 15.6801307943835 12.0714239917933 3.60870680259025 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.351946844714068 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_43010805_43010875:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_43010805_43010937:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_43010805_43010968:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000451060:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000339677:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000414913:exon_43010805_43010944:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000454057:exon_43010805_43010866:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000463133:exon_43010805_43010883:POLDIP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 43032742 C/T 1 72 53 125 34.2111944604732 27.8167596332628 6.39443482721038 T:C C T 10 0.524844521382317 0.282598454915921 ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43032721_43032825:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43032721_43032896:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43032721_43032852:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000466276:exon_43032721_43032852:CYB5R3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 58 38 96 27.5590177598256 19.944091812528 7.61492594729757 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.126080455574853 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 43558972 G/A 1 105 110 215 49.8913252548567 57.7328973520549 -7.84157209719815 A:G G A 10 0.524844521382317 0.305794881536648 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 43568451 C/A 1 19 10 29 9.02795409373598 5.24844521382317 3.77950887991281 A:C C A 10 0.524844521382317 0.193890918307861 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 43568512 C/T 1 17 5 22 8.07764313650061 2.62422260691158 5.45342052958903 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0303635933604656 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43568409_43568560:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43568409_43568560:TTLL12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 43575935 C/T 1 37 28 65 17.5807527088543 14.6956465987049 2.8851061101494 T:C C T 10 0.524844521382317 0.535200773482948 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43575847_43576006:TTLL12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 43579012 G/A 1 30 34 64 14.2546643585305 17.8447137269988 -3.59004936846829 A:G G A 10 0.524844521382317 0.383405236317595 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43578986_43579155:TTLL12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 44359246 A/G 1 28 18 46 13.3043534012951 9.4472013848817 3.85715201641342 A:G A G 10 0.524844521382317 0.301917773941409 ENSG00000100344:ENST00000406117:exon_44359166_44359276:PNPLA3;ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44359166_44359276:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44359166_44359276:SAMM50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 44 33 77 20.9068410591781 17.3198692056165 3.58697185356159 T:C T C 10 0.524844521382317 0.426887738418939 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 108 146 254 51.3167916907098 76.6273001218183 -25.3105084311085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00163878750073062 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 44514995 C/T 1 162 125 287 76.9751875360647 65.6055651727896 11.369622363275 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.193495385461136 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44514918_44515020:PARVB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 31 49 80 14.7298198371482 25.7173815477335 -10.9875617105854 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0181718260840467 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 5 14 19 2.37577739308842 7.34782329935244 -4.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0358228143741496 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 45577231 T/C 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000093000:ENST00000347635:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000432759:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000425733:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000355253:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000407019:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000493456:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000396096:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000440908:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000422489:exon_45577167_45577248:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000469163:exon_45577167_45577248:NUP50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46615750 C/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000186951:ENST00000396000:exon_46615709_46615911:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000262735:exon_46615709_46615911:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000407236:exon_46615709_46615911:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000402126:exon_46615709_46615911:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000493286:exon_46615709_46616554:PPARA;ENSG00000186951:ENST00000434345:exon_46615709_46615911:PPARA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46671196 G/A 1 3 18 21 1.42546643585305 9.4472013848817 -8.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000592585645195768 ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46671145_46671318:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000421359:exon_46671145_46671318:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000422713:exon_46671145_46671318:TTC38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46681173 C/G 1 8 12 20 3.80124382894146 6.2981342565878 -2.49689042764634 C:G C G 10 0.524844521382317 0.273827921303142 ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46681138_46681176:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000445282:exon_46681138_46681176:TTC38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46704243 C/T 1 31 19 50 14.7298198371482 9.97204590626402 4.75777393088415 T:C C T 10 0.524844521382317 0.203237341910243 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46704610 G/T 1 24 18 42 11.4037314868244 9.4472013848817 1.95653010194269 T:G G T 10 0.524844521382317 0.643622119541074 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46704676 A/G 1 23 18 41 10.9285760082067 9.4472013848817 1.481374623325 A:G A G 10 0.524844521382317 0.754951921506181 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46704690 G/A 1 16 22 38 7.60248765788293 11.546579470411 -3.94409181252805 A:G G A 10 0.524844521382317 0.255314267474421 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46722397 G/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46746188 C/T 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485175:exon_46746188_46746360:TRMU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46749755 C/T 1 19 8 27 9.02795409373598 4.19875617105854 4.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0816233984370558 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46749664_46749764:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46749664_46749764:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46749664_46749764:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46749664_46749764:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46749664_46749764:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46749664_46749764:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46749664_46749764:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46748726_46749764:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46749414_46751485:TRMU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46751394 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46749414_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46750607_46751969:TRMU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 46751466 C/T 1 16 23 39 7.60248765788293 12.0714239917933 -4.46893633391036 T:C C T 10 0.524844521382317 0.199027828793427 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46749414_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46750607_46751969:TRMU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 47083010 T/C 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 T:C T C 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 47116905 G/A 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47116799_47116912:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47116799_47116912:CERK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50171345 T/C 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 T:C T C 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50171326_50171461:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50171326_50171461:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50171326_50171461:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50171326_50171461:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50171326_50171461:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50171326_50171461:BRD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50279221 C/T 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50656357 A/G 1 31 55 86 14.7298198371482 28.8664486760274 -14.1366288388793 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00240344006646353 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50656347_50656546:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50656347_50656831:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50656347_50656528:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50656347_50656546:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50656347_50656546:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50656347_50656527:TUBGCP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50656534 C/T 1 89 83 172 42.2888375969738 43.5620952747323 -1.27325767775852 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.878758876529698 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50656347_50656546:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50656347_50656831:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50656347_50656546:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50656347_50656546:TUBGCP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 31 23 54 14.7298198371482 12.0714239917933 2.65839584535488 T:C T C 10 0.524844521382317 0.498162030811838 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50684256 T/C 1 78 62 140 37.0621273321793 32.5403603257037 4.52176700647563 T:C T C 10 0.524844521382317 0.448034905332368 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50684104_50684256:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 0 0 20 20 0 10.4968904276463 -10.4968904276463 C T C 10 0.524844521382317 3.44123888985391e-07 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50686767 G/C 1 15 2 17 7.12733217926525 1.04968904276463 6.07764313650061 C:G G C 10 0.524844521382317 0.00282030917203097 ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50686654_50686901:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496235:exon_50686654_50686801:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000475965:exon_50686654_50686884:HDAC10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 30 15 45 14.2546643585305 7.87266782073475 6.38199653779574 A:G G A 10 0.524844521382317 0.072264504743041 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 18 20 38 8.5527986151183 10.4968904276463 -1.94409181252804 T:C T C 10 0.524844521382317 0.626687508296695 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50716068 C/T 1 94 82 176 44.6646149900622 43.03725075335 1.62736423671221 T:C C T 10 0.524844521382317 0.821273792932711 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50720622 C/T 1 21 34 55 9.97826505097134 17.8447137269988 -7.86644867602743 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0420193219138339 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720613_50720742:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720613_50720991:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720613_50720742:PLXNB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50728062 T/C 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000414275:exon_50727946_50729026:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000432455:exon_50727946_50729026:PLXNB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 18 14 32 8.5527986151183 7.34782329935244 1.20497531576586 A:G G A 10 0.524844521382317 0.725627887468629 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50879447 T/G 1 46 35 81 21.8571520164134 18.3695582483811 3.48759376803233 T:G T G 10 0.524844521382317 0.504716808516826 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 72 54 126 34.2111944604732 28.3416041546451 5.86959030582807 T:C C T 10 0.524844521382317 0.326687605877221 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50942774 C/T 1 40 27 67 19.0062191447073 14.1708020773226 4.83541706738477 T:C C T 10 0.524844521382317 0.271286112625707 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50943004 C/A 1 28 13 41 13.3043534012951 6.82297877797012 6.481374623325 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0592585467600076 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50943010 G/A 1 29 12 41 13.7795088799128 6.2981342565878 7.481374623325 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0193513683536360 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50943101 A/G 1 46 21 67 21.8571520164134 11.0217349490287 10.8354170673848 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00971311388018831 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 49 31 80 23.2826184522665 16.2701801628518 7.01243828941464 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.118744809430865 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50944875 G/A 1 26 26 52 12.3540424440598 13.6459575559402 -1.29191511188048 A:G G A 10 0.524844521382317 0.781842383630529 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944714_50944931:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000507607:exon_50944825_50944931:LMF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50961536 C/T 1 75 73 148 35.6366608963262 38.3136500609091 -2.67698916458291 T:C C T 10 0.524844521382317 0.681207478009961 ENSG00000025770:ENST00000420993:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000361482:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000380768:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395701:exon_50961446_50961901:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000453005:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000299821:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000520939:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000522304:exon_50961509_50961595:NCAPH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 173 182 355 82.2018978008592 95.5217028915817 -13.3198050907225 T:G T G 10 0.524844521382317 0.167059764086269 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 92 89 181 43.7143040328268 46.7111624030262 -2.99685837019937 C:G C G 10 0.524844521382317 0.65615322938624 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50965579 G/A 1 16 6 22 7.60248765788293 3.1490671282939 4.45342052958903 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0854111218855252 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 50969104 T/C 1 32 28 60 15.2049753157659 14.6956465987049 0.509328717060981 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000177989:ENST00000463472:exon_50968968_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000469660:exon_50969067_50969487:ODF3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 51020034 A/G 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.232912177014055 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 51063610 C/T 1 27 19 46 12.8291979226774 9.97204590626402 2.85715201641342 T:C C T 10 0.524844521382317 0.461345236635833 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51063450_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51063456_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51063457_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51063461_51063892:ARSA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 35 27 62 16.6304417516189 14.1708020773226 2.45963967429635 C:G G C 10 0.524844521382317 0.611419948544764 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 51064416 T/C 1 30 12 42 14.2546643585305 6.2981342565878 7.95653010194269 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0193649712936738 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064364_51064491:ARSA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 22 51065600 G/A 1 33 17 50 15.6801307943835 8.92235686349939 6.75777393088415 A:G G A 10 0.524844521382317 0.065192358119594 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51065594_51065834:ARSA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 3170857 C/T 1 18 8 26 8.5527986151183 4.19875617105854 4.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.115132819997145 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000339437:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000465998:exon_3170698_3171180:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000420393:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000402675:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000413000:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000469632:exon_3170698_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000397779:exon_3170724_3170872:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000482311:exon_3170839_3170872:TRNT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 3182295 G/T 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 T:G G T 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3182194_3182332:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3182194_3182332:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3182194_3182332:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3182194_3182332:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000482311:exon_3182194_3182412:TRNT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 8 34 42 3.80124382894146 17.8447137269988 -14.0434698980573 A:G A G 10 0.524844521382317 1.48200146121328e-05 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 4810319 T/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:G T G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4810195_4810448:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000479831:exon_4809951_4810448:ITPR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 4817093 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4816926_4817126:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4816926_4817126:ITPR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 4842231 C/T 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000150995:ENST00000357086:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000456211:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000423119:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000354582:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000426160:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000356617:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000302640:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000443694:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000467545:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000493491:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000463980:exon_4842109_4842284:ITPR1;ENSG00000150995:ENST00000490572:exon_4842109_4842284:ITPR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 8590313 T/C 1 19 18 37 9.02795409373598 9.4472013848817 -0.419247291145727 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8590254_8590549:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 8590576 A/G 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 A:G A G 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 8809190 C/A 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000180914:ENST00000316793:exon_8808952_8810015:OXTR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 9005078 C/T 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000415439:exon_9005019_9005115:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000495087:exon_9005019_9005186:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000418463:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000421052:exon_9005019_9005154:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000413832:exon_9005019_9005277:RAD18;ENSG00000070950:ENST00000469793:exon_9005019_9005127:RAD18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 19 31 50 9.02795409373598 16.2701801628518 -7.24222606911585 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0469726960152109 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 13 16 29 6.17702122202988 8.39751234211707 -2.22049112008719 T:C T C 10 0.524844521382317 0.45973512332539 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 26 47 73 12.3540424440598 24.6676925049689 -12.3136500609091 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00463476953372062 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 97 122 219 46.0900814259153 64.0310316086427 -17.9409501827274 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0176888581829470 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 9934912 G/A 1 120 123 243 57.018657434122 64.555876130025 -7.53721869590302 A:G G A 10 0.524844521382317 0.336127917923008 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 9991429 G/A 1 48 37 85 22.8074629736488 19.4192472911457 3.38821568250306 A:G G A 10 0.524844521382317 0.515076828498101 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 A:G A G 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 16 14 30 7.60248765788293 7.34782329935244 0.254664358530491 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 11684957 C/T 1 13 2 15 6.17702122202988 1.04968904276463 5.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0084264544748068 ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11684911_11685398:VGLL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 12613866 T/C 1 24 17 41 11.4037314868244 8.92235686349939 2.481374623325 T:C T C 10 0.524844521382317 0.532225835483175 ENSG00000075975:ENST00000170447:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000411987:exon_12613568_12613872:MKRN2;ENSG00000075975:ENST00000448482:exon_12613568_12613872:MKRN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 12859004 A/C 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:C A C 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000144712:ENST00000295989:exon_12857873_12859375:CAND2;ENSG00000144712:ENST00000456430:exon_12857873_12859375:CAND2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 37 41 78 17.5807527088543 21.518625376675 -3.93787266782072 T:C C T 10 0.524844521382317 0.427651001614935 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 13361287 C/T 1 78 70 148 37.0621273321793 36.7391164967622 0.323010835417094 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13361263_13361479:NUP210 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 42 32 74 19.9565301019427 16.7950246842341 3.16150541770854 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.486733050784977 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 13368892 G/A 1 31 35 66 14.7298198371482 18.3695582483811 -3.63973841123292 A:G G A 10 0.524844521382317 0.390127771351223 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 13395475 G/C 1 16 9 25 7.60248765788293 4.72360069244085 2.87888696544208 C:G G C 10 0.524844521382317 0.317512505067783 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395415_13395607:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395415_13396194:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395415_13395607:NUP210 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 14180750 C/T 1 14 17 31 6.65217670064756 8.92235686349939 -2.27018016285183 T:C C T 10 0.524844521382317 0.473797754482654 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14180680_14180797:TMEM43 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 104 117 221 49.416169776239 61.4068090017311 -11.990639225492 T:G G T 10 0.524844521382317 0.121168754429647 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 14206353 A/C 1 11 17 28 5.22671026479451 8.92235686349939 -3.69564659870487 A:C A C 10 0.524844521382317 0.187089974666476 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14206313_14206433:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14206313_14206433:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14206313_14206433:XPC;ENSG00000154767:ENST00000477324:exon_14206313_14206433:XPC;ENSG00000154767:ENST00000455144:exon_14205866_14206433:XPC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 39 36 75 18.5310636660896 18.8944027697634 -0.36333910367377 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 15276541 A/G 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 A:G A G 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000131375:ENST00000253693:exon_15276532_15276652:CAPN7;ENSG00000131375:ENST00000415565:exon_15276532_15276652:CAPN7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 15624436 C/T 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 T:C C T 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000421993:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000414979:exon_15624385_15624496:HACL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 15737689 G/A 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000451422:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498524:exon_15737641_15737752:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000462657:exon_15737641_15737738:ANKRD28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 32 31 63 15.2049753157659 16.2701801628518 -1.06520484708597 C:G C G 10 0.524844521382317 0.802093555858814 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 16312564 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16312452_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16312436_16312578:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000486267:exon_16312452_16312702:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16312452_16312578:OXNAD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 16327855 T/G 1 8 3 11 3.80124382894146 1.57453356414695 2.22671026479451 T:G T G 10 0.524844521382317 0.232912177014055 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 16327909 C/T 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 16358584 T/C 1 264 275 539 125.441046355068 144.332243380137 -18.8911970250688 T:C T C 10 0.524844521382317 0.110490263583547 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16357352_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16357363_16358739:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16358037_16358739:RFTN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 184 171 355 87.4286080656537 89.7484131563762 -2.31980509072253 A:C A C 10 0.524844521382317 0.831729346576368 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 16364954 C/T 1 148 135 283 70.3230108354171 70.8540103866128 -0.530999551195691 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.95261991876409 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 16411668 G/A 1 75 96 171 35.6366608963262 50.3850740527024 -14.7484131563762 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0262255943239687 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16411583_16411786:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16411583_16411786:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16411583_16411786:RFTN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 17051328 T/C 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 17208267 T/C 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 T:C T C 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000131374:ENST00000450163:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000437885:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000253692:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000429383:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000414318:exon_17208259_17208420:TBC1D5;ENSG00000131374:ENST00000446818:exon_17208259_17208420:TBC1D5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 19992432 G/T 1 21 5 26 9.97826505097134 2.62422260691158 7.35404244405976 T:G G T 10 0.524844521382317 0.00493618554559597 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000443878:exon_19992298_19992436:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000412966:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_19992298_19992553:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000476544:exon_19992298_19992717:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000455772:exon_19992298_19992553:RAB5A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 20017627 C/G 1 19 9 28 9.02795409373598 4.72360069244085 4.30435340129513 C:G C G 10 0.524844521382317 0.129749466460062 ENSG00000144566:ENST00000273047:exon_20017539_20017661:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000446547:exon_20017539_20017661:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000422242:exon_20017539_20017661:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000469122:exon_20017539_20017661:RAB5A;ENSG00000144566:ENST00000473608:exon_20017539_20017661:RAB5A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 20212621 T/G 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 T:G T G 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000129810:ENST00000306698:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000429446:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522489:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000529155:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000452020:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000440105:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000442720:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000460637:exon_20212535_20212759:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000427162:exon_20212535_20212724:SGOL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 20216058 T/G 1 21 17 38 9.97826505097134 8.92235686349939 1.05590818747195 T:C:G T G 10 0.524844521382317 0.748575149689197 ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 25833228 T/C 1 24 17 41 11.4037314868244 8.92235686349939 2.481374623325 T:C T C 10 0.524844521382317 0.532225835483175 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25832481_25833488:OXSM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 25833320 A/G 1 18 22 40 8.5527986151183 11.546579470411 -2.99378085529268 A:G A G 10 0.524844521382317 0.34802327982474 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25832481_25833488:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000448177:exon_25833261_25833488:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000449808:exon_25833261_25833332:OXSM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 25835983 T/C 1 9 22 31 4.27639930755915 11.546579470411 -7.27018016285183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0109380393927171 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25835583_25836025:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000448177:exon_25835583_25836014:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000420173:exon_25835583_25836025:OXSM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 32586521 C/T 1 17 23 40 8.07764313650061 12.0714239917933 -3.99378085529268 T:C C T 10 0.524844521382317 0.210329016365285 ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000413350:exon_32586368_32586598:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000424991:exon_32586481_32586598:DYNC1LI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33055688 T/C 1 20 9 29 9.50310957235366 4.72360069244085 4.77950887991281 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0936805033763996 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33055548_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33055548_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33055548_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33055548_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000461475:exon_33055565_33055802:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000497796:exon_33055635_33055802:GLB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33138544 A/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G A G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33138503_33138722:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000482097:exon_33138503_33138610:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000485698:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000498537:exon_33138503_33138634:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000415454:exon_33138503_33138613:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000438227:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000440656:exon_33138503_33138638:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000436768:exon_33138503_33138694:GLB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33161898 C/T 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33161836_33161985:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33161836_33161985:CRTAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33458266 T/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000481761:exon_33458250_33458312:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000418410:exon_33458250_33458326:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000456378:exon_33458250_33458326:UBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33840298 G/A 1 5 16 21 2.37577739308842 8.39751234211707 -6.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0141312564148606 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33839557_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33839844_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000435909:exon_33840103_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000430877:exon_33840113_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000413073:exon_33840115_33840429:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000477798:exon_33840122_33840429:PDCD6IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 12 15 27 5.7018657434122 7.87266782073475 -2.17080207732256 A:G G A 10 0.524844521382317 0.444663614174346 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 50 40 90 23.7577739308842 20.9937808552927 2.76399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 0.598498012510704 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33907915 A/G 1 67 57 124 31.8354170673848 29.9161377187921 1.9192793485927 A:G A G 10 0.524844521382317 0.787525797535237 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 78 62 140 37.0621273321793 32.5403603257037 4.52176700647563 A:G A G 10 0.524844521382317 0.448034905332368 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 36896794 G/C 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 C:G G C 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000168016:ENST00000428977:exon_36896664_36899540:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000429976:exon_36896664_36899540:TRANK1;ENSG00000168016:ENST00000301807:exon_36896664_36899540:TRANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 37053550 G/A 1 19 15 34 9.02795409373598 7.87266782073475 1.15528627300122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.733885013169074 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053502_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000421440:exon_37053532_37053590:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000447829:exon_37053533_37053590:MLH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 37096607 T/C 1 29 30 59 13.7795088799128 15.7453356414695 -1.9658267615567 T:C T C 10 0.524844521382317 0.696113226567446 ENSG00000093167:ENST00000421307:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000452650:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000354379:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000336686:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000460646:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000421276:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000496479:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000396428:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000440230:exon_37096577_37096656:LRRFIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 37096637 A/G 1 28 35 63 13.3043534012951 18.3695582483811 -5.06520484708597 A:G A G 10 0.524844521382317 0.209382013686643 ENSG00000093167:ENST00000421307:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000452650:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000354379:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000336686:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000460646:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000421276:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000496479:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000396428:exon_37096577_37096656:LRRFIP2;ENSG00000093167:ENST00000440230:exon_37096577_37096656:LRRFIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 37366946 C/T 1 42 35 77 19.9565301019427 18.3695582483811 1.58697185356159 T:C C T 10 0.524844521382317 0.733637099435884 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 37367850 A/G 1 72 60 132 34.2111944604732 31.490671282939 2.72052317753416 A:G A G 10 0.524844521382317 0.663630908572897 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 C:G G C 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 38271881 C/T 1 8 9 17 3.80124382894146 4.72360069244085 -0.922356863499388 T:C C T 10 0.524844521382317 0.809125944455852 ENSG00000172939:ENST00000446845:exon_38271856_38271921:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000311806:exon_38271856_38271921:OXSR1;ENSG00000172939:ENST00000426620:exon_38271856_38272184:OXSR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 39107361 C/G 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 C:G C G 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000114742:ENST00000302313:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000423296:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000396258:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000418020:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000433841:exon_39107282_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000420940:exon_39107302_39107380:WDR48;ENSG00000114742:ENST00000441361:exon_39107302_39107380:WDR48 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 39139910 C/T 1 17 10 27 8.07764313650061 5.24844521382317 2.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.336756432357263 ENSG00000114745:ENST00000441302:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000319283:exon_39138150_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000453680:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000452389:exon_39138156_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000422110:exon_39138159_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000431601:exon_39138950_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000479927:exon_39139519_39139980:GORASP1;ENSG00000114745:ENST00000476334:exon_39139878_39139980:GORASP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 39184510 C/A 1 61 82 143 28.9844841956787 43.03725075335 -14.0527665576713 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0191115561505054 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 39436027 A/G 1 43 33 76 20.4316855805604 17.3198692056165 3.11181637494391 A:G A G 10 0.524844521382317 0.492916236734793 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39435901_39436067:SLC25A38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 39449295 T/G 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 T:G T G 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 39452701 A/G 1 19 14 33 9.02795409373598 7.34782329935244 1.68013079438354 A:G A G 10 0.524844521382317 0.604302645486145 ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 40529369 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000177873:ENST00000314686:exon_40528297_40529877:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000520737:exon_40528297_40530069:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000456778:exon_40528297_40530069:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000429348:exon_40528297_40530069:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000447116:exon_40528297_40530117:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000396201:exon_40528297_40530069:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000442066:exon_40529206_40530125:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000494154:exon_40528297_40529924:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000522736:exon_40528297_40529750:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000521353:exon_40528297_40529750:ZNF619;ENSG00000177873:ENST00000432264:exon_40528297_40529750:ZNF619 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 42236415 A/G 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 A:G A G 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000484786:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000449246:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42236296_42236433:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000427771:exon_42236296_42236433:TRAK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 42265099 A/G 1 23 34 57 10.9285760082067 17.8447137269988 -6.91613771879207 A:G A G 10 0.524844521382317 0.083872241495603 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 42610515 G/A 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 23 30 53 10.9285760082067 15.7453356414695 -4.8167596332628 T:C C T 10 0.524844521382317 0.215927171350743 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 24 33 57 11.4037314868244 17.3198692056165 -5.91613771879207 T:G T G 10 0.524844521382317 0.144040568411476 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 43602803 C/T 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43602712_43602894:ANO10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 44871509 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44871463_44871567:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44871463_44871567:KIF15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 45038707 C/T 1 48 61 109 22.8074629736488 32.0155158043213 -9.20805283067255 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0843213362741636 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45038579_45038744:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000482004:exon_45038579_45038744:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45038579_45038744:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000467846:exon_45038579_45038744:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45038579_45038744:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45038579_45038744:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000481405:exon_45038579_45038744:EXOSC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 70 80 150 33.2608835032378 41.9875617105854 -8.72667820734754 C:G G C 10 0.524844521382317 0.164775846537076 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 45559474 T/C 1 11 3 14 5.22671026479451 1.57453356414695 3.65217670064756 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0616071016075417 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45559395_45559564:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45559455_45559564:LARS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 45583409 G/T 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45583321_45583448:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45583321_45583448:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45583321_45583448:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000485461:exon_45583321_45583448:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000474585:exon_45583086_45583448:LARS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 45718602 G/A 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000144791:ENST00000273317:exon_45718414_45727830:LIMD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:T A T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 46965106 G/A 1 122 100 222 57.9689683913573 52.4844521382317 5.48451625312563 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.501685129368168 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46964533_46965158:CCDC12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 46966953 C/T 1 51 57 108 24.2329294095018 29.9161377187921 -5.68320830929023 T:C C T 10 0.524844521382317 0.290007087667982 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_46966410_46967025:CCDC12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47018214 T/C 1 25 14 39 11.8788869654421 7.34782329935244 4.53106366608964 T:C T C 10 0.524844521382317 0.152876544535080 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_47018127_47018238:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_47018127_47018249:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_47018127_47018235:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000460035:exon_47018127_47018247:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000492819:exon_47017497_47018270:CCDC12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47046437 A/G 1 27 23 50 12.8291979226774 12.0714239917933 0.757773930884152 A:G A G 10 0.524844521382317 0.887900071837565 ENSG00000160796:ENST00000445550:exon_47046241_47046586:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000486870:exon_47046109_47046586:NBEAL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47098506 G/A 1 47 33 80 22.3323074950311 17.3198692056165 5.01243828941464 A:G G A 10 0.524844521382317 0.313701535356191 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47098311_47098980:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47098311_47098980:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47098311_47098980:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47098311_47098980:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47098311_47098980:SETD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47385380 G/A 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.433796952873074 ENSG00000114648:ENST00000232766:exon_47385045_47388306:KLHL18;ENSG00000114648:ENST00000442272:exon_47385045_47386067:KLHL18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47449058 T/C 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 T:C T C 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448995_47449074:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448995_47449074:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448995_47449074:PTPN23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47452087 G/A 1 24 14 38 11.4037314868244 7.34782329935244 4.05590818747195 A:G G A 10 0.524844521382317 0.198033176811266 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A 1 92 42 134 43.7143040328268 22.0434698980573 21.6708341347695 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.000179053641672716 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47462200 T/C 1 15 6 21 7.12733217926525 3.1490671282939 3.97826505097134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.124172769860965 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47462044_47462262:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000339815:exon_47462182_47462262:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47462044_47462262:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47462080_47462262:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47462044_47462262:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47462044_47462262:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000416208:exon_47462044_47462262:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000465628:exon_47462109_47462262:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000468965:exon_47462144_47462262:SCAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47537515 G/A 1 58 65 123 27.5590177598256 34.1148938898506 -6.55587613002499 A:G G A 10 0.524844521382317 0.241845910882246 ENSG00000163832:ENST00000296149:exon_47537130_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000442215:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000450051:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000446787:exon_47537436_47537687:C3orf75 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47676777 C/T 1 30 32 62 14.2546643585305 16.7950246842341 -2.54036032570365 T:C C T 10 0.524844521382317 0.527798183512304 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47676680_47676834:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47676680_47676834:SMARCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 104 116 220 49.416169776239 60.8819644803488 -11.4657947041097 T:C C T 10 0.524844521382317 0.137345501055944 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 47969734 G/A 1 22 28 50 10.453420529589 14.6956465987049 -4.24222606911585 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.258222174655692 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000395730:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000482752:exon_47969718_47969792:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000423088:exon_47969718_47969840:MAP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 48473953 C/G 1 53 35 88 25.1832403667372 18.3695582483811 6.81368211835611 C:G C G 10 0.524844521382317 0.165279430936841 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 48491568 A/C 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 A:C A C 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000164053:ENST00000421175:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000454733:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48491443_48491576:ATRIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 48501819 G/A 1 14 15 29 6.65217670064756 7.87266782073475 -1.22049112008719 A:G G A 10 0.524844521382317 0.711938142382318 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 48501920 C/T 1 8 17 25 3.80124382894146 8.92235686349939 -5.12111303455792 T:C C T 10 0.524844521382317 0.045663265598688 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 48581056 C/T 1 18 8 26 8.5527986151183 4.19875617105854 4.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.115132819997145 ENSG00000114268:ENST00000232375:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000416568:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000417753:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000445633:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000383734:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000490115:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000452531:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000468162:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000412035:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000471890:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000496767:exon_48581013_48581079:PFKFB4;ENSG00000114268:ENST00000422701:exon_48581013_48581079:PFKFB4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49052422 G/A 1 128 126 254 60.8199012630634 66.1304096941719 -5.3105084311085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.530024476613529 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49052258_49052791:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49052258_49052858:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49052258_49053022:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49052258_49052798:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49052258_49052780:WDR6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49135653 G/A 1 339 290 629 161.077707251395 152.204911200872 8.87279605052262 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.497405625092897 ENSG00000172053:ENST00000482248:exon_49135625_49135913:QARS;ENSG00000172053:ENST00000453392:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000497635:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000445471:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000420147:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000459870:exon_49135425_49135913:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470113:exon_49135425_49135913:QARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49135961 C/G 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 C:G C G 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135786_49136125:QARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49151428 C/T 1 48 33 81 22.8074629736488 17.3198692056165 5.48759376803233 T:C C T 10 0.524844521382317 0.265822685673407 ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49151425_49151526:USP19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49200983 G/A 1 54 56 110 25.6583958453549 29.3912931974098 -3.73289735205487 A:G G A 10 0.524844521382317 0.504621652150566 ENSG00000177352:ENST00000321895:exon_49199968_49201693:CCDC71 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49210324 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000185909:ENST00000332780:exon_49210069_49210578:KLHDC8B;ENSG00000185909:ENST00000476495:exon_49210146_49210608:KLHDC8B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49455330 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000145020:ENST00000465925:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000427987:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000458307:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476226:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000273588:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000454938:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000395338:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476127:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000399379:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000473163:exon_49455251_49455406:AMT;ENSG00000145020:ENST00000430521:exon_49455328_49455406:AMT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49457183 C/G 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 C:G C G 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000145020:ENST00000465925:exon_49456404_49458578:AMT;ENSG00000145020:ENST00000427987:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000458307:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476226:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000273588:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000395338:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000476127:exon_49457143_49457451:AMT;ENSG00000145020:ENST00000495436:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000399379:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000430521:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000487589:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000461210:exon_49457143_49457221:AMT;ENSG00000145020:ENST00000478594:exon_49457143_49457775:AMT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49570200 C/T 1 14 19 33 6.65217670064756 9.97204590626402 -3.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.29637560445508 ENSG00000173402:ENST00000308775:exon_49568230_49573044:DAG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49714225 T/C 1 62 59 121 29.4596396742963 30.9658267615567 -1.50618708726035 T:C T C 10 0.524844521382317 0.785698525624152 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000449966:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000446089:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000442186:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463995:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447436:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000447541:exon_49714210_49714250:APEH;ENSG00000164062:ENST00000482301:exon_49714210_49714250:APEH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 14 19 33 6.65217670064756 9.97204590626402 -3.31986920561646 A:C C A 10 0.524844521382317 0.29637560445508 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49740104 C/T 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000432042:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49740066_49740186:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49740066_49740186:RNF123 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 49867127 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49867050_49867199:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49867050_49867207:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49867050_49867199:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000469027:exon_49867050_49867199:TRAIP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 50614965 G/A 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.370589300195247 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000482974:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000443894:exon_50614940_50615004:HEMK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 51430672 G/T 1 136 111 247 64.6211450920049 58.2577418734372 6.36340321856771 T:G G T 10 0.524844521382317 0.444731307883678 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 51457607 C/T 1 19 24 43 9.02795409373598 12.5962685131756 -3.56831441943963 T:C C T 10 0.524844521382317 0.288904812000227 ENSG00000145041:ENST00000423656:exon_51457188_51458451:VPRBP;ENSG00000145041:ENST00000273612:exon_51457188_51458451:VPRBP;ENSG00000145041:ENST00000335891:exon_51457188_51458404:VPRBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 51977512 C/T 1 25 30 55 11.8788869654421 15.7453356414695 -3.86644867602743 T:C C T 10 0.524844521382317 0.344957452445053 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51977373_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51977370_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51977370_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470601:exon_51977365_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470749:exon_51977315_51977554:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51977327_51977554:PARP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 51978193 G/A 1 15 22 37 7.12733217926525 11.546579470411 -4.41924729114573 A:G G A 10 0.524844521382317 0.187296096027869 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470601:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470749:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51978105_51978233:PARP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52003391 G/A 1 118 163 281 56.0683464768866 85.5496569853177 -29.4813105084311 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000509795613451804 ENSG00000114779:ENST00000483233:exon_52002526_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000487005:exon_52002532_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000395008:exon_52002546_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000361143:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000439982:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000315877:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000461108:exon_52003100_52004200:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000525795:exon_52003289_52003621:ABHD14B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52011906 T/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:G T G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000248487:ENST00000497864:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000494478:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000360889:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000452452:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000273596:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000474575:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000491470:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000114786:ENST00000486081:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52255287 C/A 1 26 33 59 12.3540424440598 17.3198692056165 -4.9658267615567 A:C C A 10 0.524844521382317 0.240496795679222 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 35 16 51 16.6304417516189 8.39751234211707 8.23292940950184 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0242697580546496 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52257828 G/A 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52264907 T/C 1 80 72 152 38.0124382894146 37.7888055395268 0.223632749887827 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52429398 A/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000114841:ENST00000486752:exon_52429324_52429482:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000420323:exon_52429324_52429482:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000273600:exon_52429324_52429482:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000488988:exon_52429324_52429482:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000490713:exon_52429324_52429482:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000487254:exon_52429324_52429425:DNAH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52433058 G/C 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 C:G G C 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000114841:ENST00000486752:exon_52432866_52433217:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000420323:exon_52432866_52433217:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000273600:exon_52432866_52433217:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000488988:exon_52432866_52433217:DNAH1;ENSG00000114841:ENST00000490713:exon_52432866_52433217:DNAH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52437206 G/A 1 42 33 75 19.9565301019427 17.3198692056165 2.63666089632623 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.565050707913482 ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000478368:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000466093:exon_52436795_52437314:BAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52440269 C/T 1 30 33 63 14.2546643585305 17.3198692056165 -3.06520484708597 T:C C T 10 0.524844521382317 0.45185308975911 ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52440269_52440392:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52440269_52440338:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000471532:exon_52440269_52440923:BAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52441251 A/G 1 11 18 29 5.22671026479451 9.4472013848817 -4.22049112008719 A:G A G 10 0.524844521382317 0.137576283488010 ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52441190_52441332:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52441190_52441332:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000471532:exon_52441190_52441332:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000490917:exon_52441189_52441332:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000470173:exon_52441195_52441332:BAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 1 7 8 0.475155478617683 3.67391164967622 -3.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0313158759629617 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 52 54 106 24.7080848881195 28.3416041546451 -3.6335192665256 T:C T C 10 0.524844521382317 0.497184855450757 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 128 127 255 60.8199012630634 66.6552542155543 -5.83535295249082 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490527608255532 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 53857803 A/C 1 25 25 50 11.8788869654421 13.1211130345579 -1.24222606911585 A:T:C A C 10 0.524844521382317 0.777835451745786 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53857333_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000481668:exon_53857571_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000467802:exon_53857658_53858094:CHDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 53857917 T/G 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:G T G 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000016391:ENST00000315251:exon_53857333_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000481668:exon_53857571_53858094:CHDH;ENSG00000016391:ENST00000467802:exon_53857658_53858094:CHDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 56653424 A/T 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000480884:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000476142:exon_56651129_56653555:CCDC66 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 25 27 52 11.8788869654421 14.1708020773226 -2.29191511188048 T:C T C 10 0.524844521382317 0.579560397579122 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 56680953 G/C 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56680550_56681251:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56680550_56681251:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56680550_56681251:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56680550_56681251:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56680550_56681251:C3orf63 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 56763316 G/A 1 18 7 25 8.5527986151183 3.67391164967622 4.87888696544208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0696668631520315 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 56763328 T/C 1 17 7 24 8.07764313650061 3.67391164967622 4.40373148682439 T:C T C 10 0.524844521382317 0.100317464348899 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 56763525 A/G 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 A:G A G 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 56763619 A/G 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 A:G A G 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 56766435 C/G 1 11 22 33 5.22671026479451 11.546579470411 -6.31986920561646 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0352694952203563 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56765621_56766452:ARHGEF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 58148958 G/A 1 31 26 57 14.7298198371482 13.6459575559402 1.08386228120793 A:G G A 10 0.524844521382317 0.792484607547345 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000475487:exon_58148881_58149239:FLNB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 46 62 108 21.8571520164134 32.5403603257037 -10.6832083092902 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0429599956667002 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 58191242 C/G 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 C:G C G 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 58302710 G/A 1 13 18 31 6.17702122202988 9.4472013848817 -3.27018016285183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.28184751276817 ENSG00000163684:ENST00000475412:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000445193:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000474660:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000477305:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000295959:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000466547:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000481972:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000461393:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000476007:exon_58302642_58302720:RPP14;ENSG00000163684:ENST00000463550:exon_58302642_58302720:RPP14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 58414382 C/T 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.533187956556707 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 63981283 A/G 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G A G 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000477516:exon_63981181_63981553:ATXN7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 64008036 T/C 1 82 77 159 38.96274924665 40.4130281464384 -1.4502788997884 T:C T C 10 0.524844521382317 0.873886182963136 ENSG00000163636:ENST00000295901:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000476464:exon_64007994_64009113:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000492933:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000394431:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000482510:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000475036:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000497323:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000478185:exon_64007994_64008199:PSMD6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 66420969 C/T 1 23 5 28 10.9285760082067 2.62422260691158 8.30435340129512 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00189288010462922 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66420953_66421026:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66420953_66421008:SLC25A26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 66431280 C/T 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 T:C C T 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66431001_66431285:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66431001_66431285:LRIG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 67451197 G/A 1 27 36 63 12.8291979226774 18.8944027697634 -6.06520484708597 A:G G A 10 0.524844521382317 0.131690782705215 ENSG00000172340:ENST00000493112:exon_67451155_67451275:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67451155_67451275:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000460567:exon_67451155_67451275:SUCLG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 8 16 24 3.80124382894146 8.39751234211707 -4.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0673884929405873 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 69153635 T/C 1 148 149 297 70.3230108354171 78.2018336859652 -7.87882285054813 T:C T C 10 0.524844521382317 0.383565420211576 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69153615_69155217:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69153615_69155217:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69153615_69155217:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69153615_69153640:ARL6IP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 31 22 53 14.7298198371482 11.546579470411 3.1832403667372 T:C C T 10 0.524844521382317 0.411501966938284 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 78700901 G/T 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78700882_78701079:ROBO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 78700929 C/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78700882_78701079:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78700882_78701079:ROBO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 78710289 T/A 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:T T A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78710180_78710411:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78710176_78710411:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78710176_78710411:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78710176_78710411:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78710180_78710411:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78710180_78710411:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78710180_78710411:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78710180_78710411:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000484514:exon_78709089_78710411:ROBO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 78717343 C/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000484514:exon_78717284_78717452:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495961:exon_78717284_78717452:ROBO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 81627175 T/C 1 6 29 35 2.8509328717061 15.2204911200872 -12.3695582483811 T:C T C 10 0.524844521382317 2.38944923491530e-05 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81627076_81627247:GBE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 88189341 T/C 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000175105:ENST00000309495:exon_88188254_88190198:ZNF654 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 14 3 17 6.65217670064756 1.57453356414695 5.07764313650061 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0145390064507902 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 14 11 25 6.65217670064756 5.77328973520549 0.878886965442075 T:C T C 10 0.524844521382317 0.842073148287916 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 97660106 A/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000080200:ENST00000182096:exon_97659992_97660150:CRYBG3;ENSG00000080200:ENST00000485253:exon_97659992_97660150:CRYBG3;ENSG00000080200:ENST00000389622:exon_97659992_97660150:CRYBG3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 18 11 29 8.5527986151183 5.77328973520549 2.77950887991281 T:C C T 10 0.524844521382317 0.354681882687295 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 98236067 C/T 1 16 11 27 7.60248765788293 5.77328973520549 1.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.565137057094518 ENSG00000080822:ENST00000506927:exon_98235896_98236189:CLDND1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 26 19 45 12.3540424440598 9.97204590626402 2.38199653779574 T:C T C 10 0.524844521382317 0.55132909892401 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 24 8 32 11.4037314868244 4.19875617105854 7.20497531576586 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0123661172194879 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 100287704 A/G 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 A:G A G 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000181458:ENST00000323523:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000403410:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000485260:exon_100287666_100287811:TMEM45A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 100287764 T/C 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000181458:ENST00000323523:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000403410:exon_100287666_100287811:TMEM45A;ENSG00000181458:ENST00000485260:exon_100287666_100287811:TMEM45A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 100467117 G/A 1 186 202 388 88.3789190228891 106.018593319228 -17.639674296339 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0752917168097581 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 100467413 A/G 1 352 367 719 167.254728473424 192.61793934731 -25.3632108738859 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0618415526708024 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 101484335 G/A 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000182504:ENST00000341893:exon_101483691_101489406:CEP97;ENSG00000182504:ENST00000327230:exon_101483691_101489405:CEP97;ENSG00000182504:ENST00000494050:exon_101483691_101484822:CEP97 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 18 19 37 8.5527986151183 9.97204590626402 -1.41924729114573 T:C C T 10 0.524844521382317 0.742558906962133 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 105572392 G/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105572258_105572508:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105572258_105572508:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105572258_105572508:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105572258_105572508:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000438603:exon_105572258_105572508:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000447441:exon_105572258_105572508:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000443752:exon_105572258_105572508:CBLB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 108279609 A/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:C A C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108279582_108279688:KIAA1524 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 108308166 G/A 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108308121_108308299:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108308121_108308299:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108308121_108308491:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000468953:exon_108308121_108308303:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000461666:exon_108308121_108308278:KIAA1524 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 108373022 G/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108372992_108373157:DZIP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 112080398 A/C 1 33 22 55 15.6801307943835 11.546579470411 4.13355132397257 A:C A C 10 0.524844521382317 0.282553241724288 ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112080390_112081659:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112080390_112080979:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112080390_112080979:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112080390_112081631:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112080390_112081656:CD200 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 113252049 G/C 1 13 9 22 6.17702122202988 4.72360069244085 1.45342052958903 C:G G C 10 0.524844521382317 0.67059722784726 ENSG00000072858:ENST00000264852:exon_113251143_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000393830:exon_113251218_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000491730:exon_113251402_113252090:SIDT1;ENSG00000072858:ENST00000483946:exon_113252024_113252090:SIDT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 119133106 T/C 1 13 18 31 6.17702122202988 9.4472013848817 -3.27018016285183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.28184751276817 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 119219573 A/G 1 53 43 96 25.1832403667372 22.5683144194396 2.61492594729757 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.610856747495155 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000469324:exon_119219221_119219707:C3orf1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 119236179 G/A 1 38 21 59 18.055908187472 11.0217349490287 7.0341732384433 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0691254615763291 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 119242443 C/T 1 17 21 38 8.07764313650061 11.0217349490287 -2.94409181252805 T:C C T 10 0.524844521382317 0.417135363310687 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 120469577 C/A 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 A:C C A 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000153767:ENST00000283875:exon_120469370_120469847:GTF2E1;ENSG00000153767:ENST00000492959:exon_120469370_120469765:GTF2E1;ENSG00000153767:ENST00000497393:exon_120469370_120469903:GTF2E1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 121206428 C/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:C C A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121206149_121209255:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121206149_121209255:POLQ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 65 51 116 30.8851061101494 26.7670705904982 4.11803551965123 T:C C T 10 0.524844521382317 0.458456340247968 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 69 40 109 32.7857280246201 20.9937808552927 11.7919471693275 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0270470464037341 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 122133830 T/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:G T G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000196981:ENST00000330689:exon_122130715_122134882:WDR5B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 42 8 50 19.9565301019427 4.19875617105854 15.7577739308842 C:G G C 10 0.524844521382317 5.48762680770373e-06 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 35 37 72 16.6304417516189 19.4192472911457 -2.78880553952682 A:G A G 10 0.524844521382317 0.555894500117118 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 27 36 63 12.8291979226774 18.8944027697634 -6.06520484708597 T:C C T 10 0.524844521382317 0.131690782705215 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 122354759 G/T 1 38 30 68 18.055908187472 15.7453356414695 2.31057254600245 T:G G T 10 0.524844521382317 0.627982014530761 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 122811250 C/T 1 22 11 33 10.453420529589 5.77328973520549 4.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.117742155361885 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000484644:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000393573:exon_122811202_122811289:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000495004:exon_122811202_122811289:PDIA5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 122849445 G/A 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122849327_122849463:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122849327_122849463:PDIA5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 12 16 28 5.7018657434122 8.39751234211707 -2.69564659870487 A:G G A 10 0.524844521382317 0.347115703840086 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 123633665 T/C 1 31 24 55 14.7298198371482 12.5962685131756 2.13355132397257 T:C T C 10 0.524844521382317 0.591616728142888 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123632572_123633979:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 123650176 C/G 1 13 7 20 6.17702122202988 3.67391164967622 2.50310957235366 C:G C G 10 0.524844521382317 0.371027109529449 ENSG00000175455:ENST00000479903:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000419247:exon_123650155_123650373:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000487498:exon_123650155_123650306:CCDC14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 124393226 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124393208_124393461:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124393211_124393465:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124393208_124393461:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124393211_124394274:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124393208_124393461:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000459915:exon_124393211_124393805:KALRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 124456742 G/C 1 62 52 114 29.4596396742963 27.2919151118805 2.16772456241587 C:G G C 10 0.524844521382317 0.708381364601571 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 124458926 A/G 1 32 40 72 15.2049753157659 20.9937808552927 -5.78880553952682 A:G A G 10 0.524844521382317 0.194443187725448 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000487622:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124458871_124459046:UMPS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 124462808 C/T 1 60 48 108 28.509328717061 25.1925370263512 3.31679169070977 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.563726281936867 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 124746251 C/A 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124746049_124746351:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124746049_124746351:HEG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 124748310 T/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124748039_124748332:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124748039_124748332:HEG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 124839470 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124839443_124839698:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465777:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000495105:exon_124839443_124839530:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479826:exon_124839443_124839530:SLC12A8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 33 25 58 15.6801307943835 13.1211130345579 2.55901775982562 T:C C T 10 0.524844521382317 0.514401828048988 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 126571550 C/G 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 C:G C G 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126571490_126571573:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126571490_126571573:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126571487_126571573:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126571490_126571573:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126571490_126571573:CHCHD6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 127295902 C/T 1 30 28 58 14.2546643585305 14.6956465987049 -0.440982240174385 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490290:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000469111:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490643:exon_127295833_127295919:TPRA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 127323902 G/C 1 36 27 63 17.1055972302366 14.1708020773226 2.93479515291403 C:G G C 10 0.524844521382317 0.52865783393892 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 127379909 C/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000114631:ENST00000342480:exon_127379221_127380002:PODXL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 127396042 G/C 1 34 41 75 16.1552862730012 21.518625376675 -5.36333910367377 C:G G C 10 0.524844521382317 0.247643254030276 ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127395379_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000478298:exon_127395810_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000474129:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000497162:exon_127396020_127396129:ABTB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 127396588 C/T 1 17 29 46 8.07764313650061 15.2204911200872 -7.14284798358658 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0387453293819137 ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127396308_127399028:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000478298:exon_127396308_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000474129:exon_127396308_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000497162:exon_127396519_127396686:ABTB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 127831744 G/A 1 89 73 162 42.2888375969738 38.3136500609091 3.97518753606465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.582017624792903 ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127831731_127831863:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127831731_127831863:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127831731_127831863:RUVBL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 149 169 318 70.7981663140348 88.6987241136116 -17.9005577995768 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0492436934659304 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 128615338 C/T 1 12 2 14 5.7018657434122 1.04968904276463 4.65217670064756 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0144338887716702 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128615279_128615379:ACAD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 128627844 G/A 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 128631620 G/A 1 59 58 117 28.0341732384433 30.4409822401744 -2.40680900173109 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.71138323579164 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128631350_128631957:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128631350_128631770:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128631350_128631857:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128631350_128631857:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128631350_128631947:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128631350_128631943:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000406840:exon_128631534_128631668:ACAD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 110 83 193 52.2671026479451 43.5620952747323 8.70500737321283 T:C C T 10 0.524844521382317 0.220851818941263 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 128993646 A/G 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.512655373125665 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 129214396 C/T 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:T:C C A 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000163913:ENST00000347300:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000296266:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000507564:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000512220:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000504021:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000349441:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000348417:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000431818:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000454840:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000506507:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000509522:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000507221:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000446384:exon_129214289_129214450:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000513932:exon_129214293_129214450:IFT122 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 129221593 C/T 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000163913:ENST00000347300:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000296266:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000507564:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000512220:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000504021:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000349441:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000348417:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000431818:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000454840:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000440957:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000506507:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000509522:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000511425:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000507221:exon_129221554_129221607:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000446384:exon_129221554_129221725:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000513932:exon_129221554_129221725:IFT122 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 132337505 G/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 C:G G C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000510100:exon_132337478_132337565:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000507705:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000487024:exon_132337478_132337616:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000481970:exon_132337094_132337616:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132337478_132337616:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132337478_132337616:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132337478_132337616:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132337478_132337616:NPHP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 132345648 C/A 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000487024:exon_132345535_132345918:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000481970:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132345535_132345661:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132345535_132345661:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132345535_132345661:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132345535_132345661:NPHP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 133327457 T/C 1 33 41 74 15.6801307943835 21.518625376675 -5.83849458229146 T:C T C 10 0.524844521382317 0.200388243095406 ENSG00000163781:ENST00000503338:exon_133327379_133327540:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000503464:exon_133327379_133327540:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133327379_133327540:TOPBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 133356790 G/A 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133356720_133357006:TOPBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 137880872 C/T 1 37 39 76 17.5807527088543 20.4689363339104 -2.88818362505609 T:C C T 10 0.524844521382317 0.566170345938067 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 137881029 C/T 1 20 17 37 9.50310957235366 8.92235686349939 0.580752708854273 T:C C T 10 0.524844521382317 0.870899695467464 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 138219391 A/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138219241_138219409:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138219241_138219409:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138219241_138219409:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138219241_138219409:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138219241_138219409:CEP70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 138347988 T/C 1 27 41 68 12.8291979226774 21.518625376675 -8.68942745399755 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0388144963373675 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 141162185 T/G 1 25 24 49 11.8788869654421 12.5962685131756 -0.717381547733531 T:G T G 10 0.524844521382317 0.886757139632472 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 141163936 G/A 1 52 55 107 24.7080848881195 28.8664486760274 -4.15836378790791 A:G G A 10 0.524844521382317 0.439753488401675 ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 141164107 T/C 1 49 34 83 23.2826184522665 17.8447137269988 5.43790472526769 T:C T C 10 0.524844521382317 0.27173803011023 ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 142840292 C/T 1 81 48 129 38.4875937680323 25.1925370263512 13.2950567416811 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.0216096707797232 ENSG00000175040:ENST00000309575:exon_142839486_142841800:CHST2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 143567018 C/T 1 20 29 49 9.50310957235366 15.2204911200872 -5.71738154773353 T:C C T 10 0.524844521382317 0.11587139270473 ENSG00000181804:ENST00000316549:exon_143566990_143567373:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000474727:exon_143566990_143567327:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000474151:exon_143566990_143567300:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000498717:exon_143566990_143567311:SLC9A9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 145788467 T/C 1 59 36 95 28.0341732384433 18.8944027697634 9.13977046867989 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0646000908138753 ENSG00000152952:ENST00000282903:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000461497:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000360060:exon_145787231_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000494950:exon_145787968_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000495700:exon_145788028_145788659:PLOD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 148763968 C/T 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148763867_148764046:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148763867_148764046:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148763867_148764046:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148763867_148764046:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000467858:exon_148763867_148764046:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000483382:exon_148763892_148763979:HLTF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 148782649 T/C 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C T C 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148782578_148782653:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148782578_148782653:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148782578_148782653:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148782578_148782653:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148782578_148782653:HLTF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 148789127 T/C 1 8 18 26 3.80124382894146 9.4472013848817 -5.64595755594024 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0305375198276518 ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148789039_148789230:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148789039_148789230:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148789039_148789230:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148789039_148789230:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148789039_148789230:HLTF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 148863151 A/G 1 12 10 22 5.7018657434122 5.24844521382317 0.453420529589027 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000462030:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148863141_148863333:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000486530:exon_148863141_148863333:HPS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 148871401 A/G 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 A:G A G 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148871281_148871435:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000462030:exon_148871281_148871922:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148871281_148871435:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000486530:exon_148871281_148871896:HPS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 148872987 G/A 1 13 1 14 6.17702122202988 0.524844521382317 5.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00213797850171758 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148872894_148873002:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148872894_148873002:HPS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 149459413 C/T 1 46 29 75 21.8571520164134 15.2204911200872 6.63666089632623 T:C C T 10 0.524844521382317 0.133722574119186 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 19 18 37 9.02795409373598 9.4472013848817 -0.419247291145727 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 150262318 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 155571460 T/C 1 16 18 34 7.60248765788293 9.4472013848817 -1.84471372699878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.60750186092226 ENSG00000169359:ENST00000392845:exon_155571012_155572167:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000359479:exon_155571012_155572218:SLC33A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 155652807 T/C 1 6 20 26 2.8509328717061 10.4968904276463 -7.64595755594024 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00283281103837597 ENSG00000163655:ENST00000496455:exon_155652705_155652835:GMPS;ENSG00000163655:ENST00000295920:exon_155652705_155652835:GMPS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 156395672 T/G 1 14 18 32 6.65217670064756 9.4472013848817 -2.79502468423414 T:G T G 10 0.524844521382317 0.3775047710159 ENSG00000163659:ENST00000486483:exon_156395446_156396403:TIPARP;ENSG00000163659:ENST00000295924:exon_156395446_156396403:TIPARP;ENSG00000163659:ENST00000461166:exon_156395446_156396403:TIPARP;ENSG00000163659:ENST00000473702:exon_156395446_156396403:TIPARP;ENSG00000163659:ENST00000481853:exon_156395446_156396403:TIPARP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 160156318 A/G 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:G A G 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 167750373 C/G 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 C:G C G 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167750308_167750640:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167750308_167750640:GOLIM4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 169700525 C/G 1 74 87 161 35.1615054177085 45.6614733602616 -10.499967942553 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0982346817713001 ENSG00000008952:ENST00000337002:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000460513:exon_169700425_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000480708:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000487736:exon_169700495_169700645:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000469515:exon_169700448_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000481435:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000497277:exon_169700495_169700647:SEC62 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 170805168 A/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000496492:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170805131_170805295:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170805131_170805295:TNIK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 19 27 46 9.02795409373598 14.1708020773226 -5.14284798358658 A:G G A 10 0.524844521382317 0.141156697840691 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 171320907 C/T 1 43 23 66 20.4316855805604 12.0714239917933 8.36026158876708 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0479084389672506 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171318195_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171318616_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171318620_171321092:PLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 171321023 C/T 1 44 19 63 20.9068410591781 9.97204590626402 10.934795152914 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00756337642788344 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171318195_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171318616_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171318620_171321092:PLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 171338237 T/G 1 9 10 19 4.27639930755915 5.24844521382317 -0.972045906264022 T:G T G 10 0.524844521382317 0.819117352050088 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171338176_171338310:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000467432:exon_171338176_171338310:PLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 171379901 G/A 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G G A 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000471075:exon_171379850_171379960:PLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 171395468 A/G 1 17 5 22 8.07764313650061 2.62422260691158 5.45342052958903 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0303635933604656 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171395356_171395484:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000471075:exon_171395356_171395643:PLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 171455697 G/C 1 12 3 15 5.7018657434122 1.57453356414695 4.12733217926525 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0384636259591238 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171455682_171455872:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171455682_171455872:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171455682_171455872:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171455682_171455872:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000498278:exon_171455682_171455872:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000475273:exon_171455682_171455722:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000440204:exon_171455682_171455872:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000418087:exon_171455682_171455872:PLD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 172480720 A/G 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 A:G A G 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000114346:ENST00000232458:exon_172480700_172480762:ECT2;ENSG00000114346:ENST00000392692:exon_172480700_172480762:ECT2;ENSG00000114346:ENST00000427830:exon_172480700_172480762:ECT2;ENSG00000114346:ENST00000417960:exon_172480700_172480762:ECT2;ENSG00000114346:ENST00000441497:exon_172480700_172480762:ECT2;ENSG00000114346:ENST00000444250:exon_172480700_172480762:ECT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 33 113 146 15.6801307943835 59.3074309162018 -43.6273001218183 T:C T C 10 0.524844521382317 2.00337953468743e-13 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 178785549 G/A 1 22 20 42 10.453420529589 10.4968904276463 -0.0434698980573121 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178785271_178785598:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178785271_178785597:ZMAT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 179069717 A/C 1 16 18 34 7.60248765788293 9.4472013848817 -1.84471372699878 A:C A C 10 0.524844521382317 0.60750186092226 ENSG00000171109:ENST00000471841:exon_179069688_179069823:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000280653:exon_179069688_179069823:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000357390:exon_179069688_179069823:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000467174:exon_179069688_179069823:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000263969:exon_179069688_179069823:MFN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 182614493 T/C 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000058063:ENST00000323116:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000433285:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000498086:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000490303:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000442545:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000466758:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000482070:exon_182614488_182614553:ATP11B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 182790249 G/A 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497959:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000490284:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000487634:exon_182790154_182790275:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000486226:exon_182790215_182790275:MCCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 87 100 187 41.3385266397384 52.4844521382317 -11.1459254984933 T:C C T 10 0.524844521382317 0.107437807829984 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 183602569 G/A 1 79 46 125 37.537282810797 24.1428479835866 13.3944348272104 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0195380443360358 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183602510_183602695:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183602510_183602676:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183602510_183602643:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183602510_183602696:PARL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 183904031 C/T 1 24 17 41 11.4037314868244 8.92235686349939 2.481374623325 T:C C T 10 0.524844521382317 0.532225835483175 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183903811_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000421340:exon_183903883_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000485921:exon_183903892_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000463685:exon_183903948_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000478288:exon_183903949_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183903962_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183903964_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000481116:exon_183903979_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000498136:exon_183903984_183904068:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466416:exon_183903987_183904068:ABCF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 184049766 C/T 1 188 172 360 89.3292299801244 90.2732576777585 -0.944027697634112 T:C C T 10 0.524844521382317 0.957925188359298 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184049734_184049874:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000478291:exon_184049516_184049893:EIF4G1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 184429411 A/C 1 28 24 52 13.3043534012951 12.5962685131756 0.708084888119517 A:C A C 10 0.524844521382317 0.890164813839361 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 186268924 C/T 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186268918_186269068:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186268918_186269068:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000446782:exon_186268918_186269068:TBCCD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 186272156 C/T 1 11 13 24 5.22671026479451 6.82297877797012 -1.59626851317561 T:C C T 10 0.524844521382317 0.545534900498325 ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000446782:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000479590:exon_186272043_186272264:TBCCD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 186276252 T/C 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186276206_186276361:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186276206_186276361:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000446782:exon_186276206_186276361:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000413695:exon_186276206_186276361:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000430560:exon_186276206_186276313:TBCCD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 70 105 175 33.2608835032378 55.1086747451433 -21.8477912419055 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00108325414140468 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 112 94 206 53.2174136051805 49.3353850099378 3.8820285952427 A:G G A 10 0.524844521382317 0.625498552267471 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 186761055 G/A 1 60 77 137 28.509328717061 40.4130281464384 -11.9036994293774 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0487669817226916 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186760804_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000464827:exon_186760896_186761098:ST6GAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 186791979 C/T 1 60 71 131 28.509328717061 37.2639610181445 -8.75463230108353 T:C C T 10 0.524844521382317 0.137017368909811 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000427315:exon_186791947_186791992:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000442023:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186791193_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186791947_186792121:ST6GAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 187088656 C/T 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 T:C T C 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 191093080 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:T T A 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 192516317 C/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000180611:ENST00000392452:exon_192514604_192517439:C3orf59;ENSG00000180611:ENST00000315470:exon_192514607_192517439:C3orf59 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 193334991 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000419435:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392436:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000487986:exon_193334967_193335074:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000434811:exon_193334967_193335074:OPA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 14 29 43 6.65217670064756 15.2204911200872 -8.56831441943963 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.00934965539913569 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 194369579 C/A 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 A:C C A 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 194369580 C/A 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 A:C C A 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000041802:ENST00000460584:exon_194369410_194369748:LSG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 194408716 G/C 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 195453329 C/T 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000423938:exon_195453241_195453443:MUC20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 195595405 G/A 1 15 11 26 7.12733217926525 5.77328973520549 1.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.695987302704438 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195595404_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195595088_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195595094_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195595096_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195595227_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195595377_195595580:TNK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 196388621 C/T 1 98 85 183 46.5652369045329 44.6117843174969 1.953452587036 T:C C T 10 0.524844521382317 0.824366424288429 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 196612193 A/G 1 15 10 25 7.12733217926525 5.24844521382317 1.87888696544208 A:G A G 10 0.524844521382317 0.549576175229901 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 T:C C T 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 196674265 G/A 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000119227:ENST00000412723:exon_196673214_196675556:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000413127:exon_196673608_196675444:PIGZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 196678838 G/A 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000119227:ENST00000412723:exon_196678692_196678902:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000443835:exon_196678692_196678902:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000238138:exon_196678409_196678902:PIGZ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 197427902 A/T 1 13 16 29 6.17702122202988 8.39751234211707 -2.22049112008719 A:T A T 10 0.524844521382317 0.45973512332539 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 197427920 G/A 1 19 14 33 9.02795409373598 7.34782329935244 1.68013079438354 A:G G A 10 0.524844521382317 0.604302645486145 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 197500364 C/T 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 T:C C T 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197500274_197500370:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197500274_197500370:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197500274_197500370:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197500274_197500370:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197500274_197500370:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197500274_197500370:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197500274_197500370:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197500274_197500370:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197500326_197500370:FYTTD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 3 197553870 A/G 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000186001:ENST00000443727:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197553749_197553885:LRCH3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 436170 G/T 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:G G T 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 438067 C/T 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 T:C C T 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000182903:ENST00000338977:exon_433777_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000511833:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000500625:exon_435484_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000503157:exon_437736_438221:ZNF721;ENSG00000182903:ENST00000505900:exon_437872_438221:ZNF721 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 38 33 71 18.055908187472 17.3198692056165 0.736038981855497 A:G A G 10 0.524844521382317 0.905743387650764 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1018847 G/A 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000127418:ENST00000398484:exon_1018693_1020679:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000510644:exon_1018693_1019775:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000504138:exon_1018693_1019135:FGFRL1;ENSG00000127418:ENST00000264748:exon_1018693_1020686:FGFRL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1090625 G/A 0 20 0 20 9.50310957235366 0 9.50310957235366 G G 10 0.524844521382317 2.85956041623882e-06 ENSG00000178222:ENST00000506730:exon_1090553_1090627:RNF212;ENSG00000178222:ENST00000382968:exon_1090553_1090627:RNF212;ENSG00000178222:ENST00000433731:exon_1090553_1090627:RNF212;ENSG00000178222:ENST00000511620:exon_1090553_1090627:RNF212;ENSG00000178222:ENST00000508428:exon_1090553_1090627:RNF212;ENSG00000178222:ENST00000510715:exon_1090553_1090627:RNF212;ENSG00000178222:ENST00000512552:exon_1090553_1090627:RNF212;ENSG00000178222:ENST00000333673:exon_1090553_1090627:RNF212;ENSG00000178222:ENST00000454487:exon_1090251_1090627:RNF212 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1244803 A/G 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 15 10 25 7.12733217926525 5.24844521382317 1.87888696544208 A:G A G 10 0.524844521382317 0.549576175229901 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1330759 T/C 1 47 27 74 22.3323074950311 14.1708020773226 8.16150541770855 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0626299690720672 ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1330649_1330778:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512289:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000506530:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503162:exon_1330649_1330782:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000515766:exon_1330649_1332405:MAEA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1346983 G/A 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G G A 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000163945:ENST00000511216:exon_1346818_1347201:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000296312:exon_1346818_1347201:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000389851:exon_1346818_1347201:KIAA1530;ENSG00000163945:ENST00000507531:exon_1346818_1347201:KIAA1530 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1389588 G/A 1 27 6 33 12.8291979226774 3.1490671282939 9.68013079438354 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000692551986511933 ENSG00000179979:ENST00000324803:exon_1388152_1389776:CRIPAK;ENSG00000179979:ENST00000382944:exon_1388967_1389640:CRIPAK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 163 117 280 77.4503430146823 61.4068090017311 16.0435340129512 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0556879951265608 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/G 1 117 136 253 55.5931909982689 71.3788549079951 -15.7856639097262 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.0508875429805879 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 121 97 218 57.4938129127396 50.9099185740847 6.5838943386549 A:G A G 10 0.524844521382317 0.378881281392222 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 22 24 46 10.453420529589 12.5962685131756 -2.14284798358658 T:C C T 10 0.524844521382317 0.557247733939047 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 1818594 C/T 1 33 56 89 15.6801307943835 29.3912931974098 -13.7111624030262 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0039999945961887 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1818454_1818641:LETM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2673892 G/A 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2673848_2674099:FAM193A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2702066 G/C 1 68 60 128 32.3105725460024 31.490671282939 0.819901263063429 C:G G C 10 0.524844521382317 0.929572642867865 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2701407_2702228:FAM193A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2744289 C/G 1 6 13 19 2.8509328717061 6.82297877797012 -3.97204590626402 C:G C G 10 0.524844521382317 0.105404731313452 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2746098 C/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C C T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2831380 G/A 1 33 15 48 15.6801307943835 7.87266782073475 7.80746297364879 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0293180338034502 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 33 14 47 15.6801307943835 7.34782329935244 8.3323074950311 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0185837896458111 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2896419 G/A 1 29 33 62 13.7795088799128 17.3198692056165 -3.54036032570365 A:G G A 10 0.524844521382317 0.376539494662122 ENSG00000087274:ENST00000508684:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000509039:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000508277:exon_2896309_2896460:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2896309_2896458:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000506157:exon_2896309_2896458:ADD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 77 74 151 36.5869718535616 38.8384945822915 -2.25152272872986 T:G G T 10 0.524844521382317 0.744772081448144 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 54 52 106 25.6583958453549 27.2919151118805 -1.6335192665256 T:C:G C G 10 0.524844521382317 0.771132208259045 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2935507 C/A 1 59 80 139 28.0341732384433 41.9875617105854 -13.9533884721421 A:C:G C A 10 0.524844521382317 0.0215191295926548 ENSG00000109736:ENST00000514800:exon_2935480_2935674:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000355443:exon_2935480_2935671:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000329687:exon_2935480_2936185:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000503596:exon_2935480_2935671:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000508221:exon_2935480_2935671:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507272:exon_2935480_2935724:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507555:exon_2935480_2935671:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000509676:exon_2935480_2935671:MFSD10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2948160 C/T 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 T:C C T 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2948139_2948274:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2948139_2948274:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2948139_2948274:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2948139_2948274:NOP14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 2948203 G/A 1 16 11 27 7.60248765788293 5.77328973520549 1.82919792267744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.565137057094518 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2948139_2948274:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2948139_2948274:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2948139_2948274:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2948139_2948274:NOP14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 3123074 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3122955_3123159:HTT;ENSG00000197386:ENST00000506137:exon_3122955_3123439:HTT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 3189547 C/A 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3189378_3189613:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3189378_3190820:HTT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 28 20 48 13.3043534012951 10.4968904276463 2.80746297364879 T:C T C 10 0.524844521382317 0.471157720032553 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 30 35 65 14.2546643585305 18.3695582483811 -4.1148938898506 A:G A G 10 0.524844521382317 0.322492508042395 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 4436517 A/T 1 6 17 23 2.8509328717061 8.92235686349939 -6.07142399179329 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0121225542609254 ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000503861:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512195:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000507908:exon_4436497_4436585:STX18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 4864876 C/T 1 22 16 38 10.453420529589 8.39751234211707 2.05590818747195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.521170691333303 ENSG00000163132:ENST00000382723:exon_4864428_4865663:MSX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6055825 G/A 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 ENSG00000152969:ENST00000409021:exon_6055777_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409371:exon_6055777_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000282924:exon_6055484_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000473053:exon_6055484_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409831:exon_6055486_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000429819:exon_6055486_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000410077:exon_6055529_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000418227:exon_6055702_6055875:JAKMIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6114610 C/T 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000152969:ENST00000409021:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409371:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000425341:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000282924:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000473053:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409831:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000410077:exon_6114449_6114724:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000418227:exon_6114449_6114724:JAKMIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6303205 C/T 1 10 2 12 4.75155478617683 1.04968904276463 3.7018657434122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0413693580129535 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6303327 C/T 1 3 10 13 1.42546643585305 5.24844521382317 -3.82297877797012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0487982257626193 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6303534 C/T 1 22 5 27 10.453420529589 2.62422260691158 7.82919792267744 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00306761227246144 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6303844 G/A 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6304249 A/G 1 11 5 16 5.22671026479451 2.62422260691158 2.60248765788293 A:G A G 10 0.524844521382317 0.219130803102002 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6594947 A/C 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:C A C 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6594900_6595077:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6594900_6595011:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6594900_6595077:MAN2B2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6596360 G/A 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6596261_6596459:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6596348_6596459:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6596261_6596459:MAN2B2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6606864 A/G 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 A:G A G 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6606782_6607056:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6606782_6607056:MAN2B2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6612964 C/T 1 17 14 31 8.07764313650061 7.34782329935244 0.729819837148174 T:C C T 10 0.524844521382317 0.858443645066449 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6612813_6613005:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6612813_6613005:MAN2B2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 6619204 G/A 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6619107_6624128:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000510427:exon_6619175_6619219:MAN2B2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 7062619 G/A 1 96 89 185 45.6149259472976 46.7111624030262 -1.09623645572864 A:G G A 10 0.524844521382317 0.883185761784975 ENSG00000109519:ENST00000264954:exon_7060633_7062935:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000429301:exon_7061782_7062935:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000504920:exon_7062256_7064193:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000509696:exon_7062415_7062935:GRPEL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 8221172 C/A 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 A:C C A 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8221062_8221257:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8221062_8221257:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8221062_8221257:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8221062_8221257:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8221062_8221257:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000512100:exon_8221062_8221199:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508641:exon_8221062_8221176:SH3TC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 8229634 G/C 1 20 22 42 9.50310957235366 11.546579470411 -2.04346989805731 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.540723179616973 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 19 21 40 9.02795409373598 11.0217349490287 -1.99378085529268 A:G A G 10 0.524844521382317 0.531894683283917 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 8237216 T/C 1 16 26 42 7.60248765788293 13.6459575559402 -6.04346989805731 T:C T C 10 0.524844521382317 0.065160476747431 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000511002:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508183:exon_8237160_8238156:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000513495:exon_8237160_8237317:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8237160_8239397:SH3TC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 8242508 C/T 1 66 49 115 31.3602615887671 25.7173815477335 5.64288004103355 T:C C T 10 0.524844521382317 0.305562757906426 ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8242425_8242830:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8242425_8242818:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8242425_8242818:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8242425_8242818:SH3TC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 8394094 G/A 1 5 13 18 2.37577739308842 6.82297877797012 -4.4472013848817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.056012196582109 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8394060_8394180:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000508302:exon_8394060_8394180:ACOX3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 8416586 T/G 1 15 17 32 7.12733217926525 8.92235686349939 -1.79502468423414 A:T:G T G 10 0.524844521382317 0.59689936717842 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000514423:exon_8416581_8416655:ACOX3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 8467263 G/A 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 A:G G A 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000155275:ENST00000513449:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000389737:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000429676:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000316290:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000532477:exon_8467105_8467288:C4orf23;ENSG00000155275:ENST00000285635:exon_8467105_8467288:C4orf23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 114 113 227 54.1677245624159 59.3074309162018 -5.13970635378595 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.506859162176775 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 10447254 G/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 10447679 C/T 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000178163:ENST00000326756:exon_10441498_10448163:ZNF518B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 17503382 C/T 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 22390167 C/T 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000152990:ENST00000334304:exon_22389007_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000499527:exon_22389023_22390570:GPR125;ENSG00000152990:ENST00000282943:exon_22389331_22390570:GPR125 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 25125703 C/G 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 C:G C G 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000109618:ENST00000382103:exon_25121636_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000302922:exon_25122624_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000358971:exon_25123877_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000514585:exon_25125472_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000503150:exon_25125703_25125847:SEPSECS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 25398292 G/A 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25398286_25398386:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25398286_25398386:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000503805:exon_25398286_25398386:ANAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 39 22 61 18.5310636660896 11.546579470411 6.98448419567867 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0947953728118025 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 25806279 T/C 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 T:C T C 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000091490:ENST00000399878:exon_25806163_25806374:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000264868:exon_25806163_25806374:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000502949:exon_25806163_25806374:SEL1L3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 37847310 C/T 1 13 25 38 6.17702122202988 13.1211130345579 -6.94409181252804 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0333673661280837 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37847254_37847351:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37847254_37847351:PGM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 16 26 42 7.60248765788293 13.6459575559402 -6.04346989805731 A:C A C 10 0.524844521382317 0.065160476747431 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38023279 G/C 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38023294 G/A 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000446803:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000454732:exon_38023207_38023339:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000510573:exon_38023207_38023339:TBC1D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 95 68 163 45.1397704686799 35.6894274539976 9.45034301468234 T:G T G 10 0.524844521382317 0.157868220565876 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38776303 T/C 1 56 35 91 26.6087068025902 18.3695582483811 8.23914855420916 T:C T C 10 0.524844521382317 0.093035790525681 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 126 99 225 59.8695903058281 51.9596076168494 7.90998268897868 A:T:G T G 10 0.524844521382317 0.316759862961753 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38777173 A/T 1 53 59 112 25.1832403667372 30.9658267615567 -5.7825863948195 A:T A T 10 0.524844521382317 0.298340762742846 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38777236 T/G 1 43 52 95 20.4316855805604 27.2919151118805 -6.86022953132011 T:G T G 10 0.524844521382317 0.181591357363243 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38800101 G/A 1 21 10 31 9.97826505097134 5.24844521382317 4.72981983714817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.105743903071191 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000505940:exon_38799970_38800519:TLR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38829832 T/C 1 23 17 40 10.9285760082067 8.92235686349939 2.00621914470732 T:C T C 10 0.524844521382317 0.635407729912364 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38830012 G/C 1 14 11 25 6.65217670064756 5.77328973520549 0.878886965442075 C:G G C 10 0.524844521382317 0.842073148287916 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38831005 G/A 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000174130:ENST00000381950:exon_38828223_38831160:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000440845:exon_38829949_38831094:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000436693:exon_38828704_38831158:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000508254:exon_38830644_38831158:TLR6;ENSG00000174130:ENST00000514655:exon_38830821_38831158:TLR6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38879949 G/A 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000197712:ENST00000510213:exon_38879692_38880047:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000358869:exon_38879692_38880047:FAM114A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 38995413 C/T 1 3 16 19 1.42546643585305 8.39751234211707 -6.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00187175287119635 ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 65 6 71 30.8851061101494 3.1490671282939 27.7360389818555 A:G A G 10 0.524844521382317 1.46020240412411e-12 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 41992677 C/G 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 C C 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_41992489_41992777:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_41992519_41992777:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_41992544_41992777:SLC30A9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 42022464 C/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:C C A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000014824:ENST00000264451:exon_42022433_42022532:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000513699:exon_42022433_42022532:SLC30A9;ENSG00000014824:ENST00000510460:exon_42022433_42022792:SLC30A9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 44682465 T/C 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000151806:ENST00000281543:exon_44682458_44682569:GUF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 47462210 A/C 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 A:C A C 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000169019:ENST00000306848:exon_47462161_47462316:COMMD8;ENSG00000169019:ENST00000381571:exon_47462161_47462316:COMMD8;ENSG00000169019:ENST00000509220:exon_47461864_47462316:COMMD8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 48517232 T/C 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C T C 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000075539:ENST00000503238:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000358350:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000264319:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000507873:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000512810:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000514617:exon_48517226_48517292:FRYL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 48542386 A/C 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:C A C 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000075539:ENST00000503238:exon_48542370_48542977:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000358350:exon_48542370_48542977:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000264319:exon_48542370_48542977:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000507873:exon_48542370_48542977:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000514617:exon_48542370_48542977:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000513401:exon_48542370_48542977:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000512297:exon_48542370_48542552:FRYL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 54327235 T/C 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.249548155109633 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 54327584 A/G 1 7 16 23 3.32608835032378 8.39751234211707 -5.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.037721226567006 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 13 7 20 6.17702122202988 3.67391164967622 2.50310957235366 T:C T C 10 0.524844521382317 0.371027109529449 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57215677 G/A 1 16 10 26 7.60248765788293 5.24844521382317 2.35404244405976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.433796952873074 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57237683 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57237617_57237809:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57237617_57237809:AASDH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57273840 C/G 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000510643:exon_57273816_57273882:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507724:exon_57273816_57273882:PPAT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57797100 G/T 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57797308 A/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57797982 C/A 1 11 6 17 5.22671026479451 3.1490671282939 2.07764313650061 A:C C A 10 0.524844521382317 0.342500346550349 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57829700 G/T 1 93 100 193 44.1894595114445 52.4844521382317 -8.29499262678717 T:G G T 10 0.524844521382317 0.248968002877336 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57829536_57829827:C4orf14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57834646 A/G 1 31 34 65 14.7298198371482 17.8447137269988 -3.1148938898506 A:G A G 10 0.524844521382317 0.45828984904324 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57834550_57834681:C4orf14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57845091 C/T 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000047315:ENST00000450656:exon_57844806_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57844806_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000495311:exon_57844806_57845127:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57845030_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57845035_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57845048_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000433463:exon_57845062_57845170:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000497845:exon_57845070_57845170:POLR2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57887084 C/T 1 37 46 83 17.5807527088543 24.1428479835866 -6.56209527473231 T:C C T 10 0.524844521382317 0.154495500280283 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57887065_57887161:POLR2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 57887150 C/T 1 49 38 87 23.2826184522665 19.944091812528 3.33852663973843 T:C C T 10 0.524844521382317 0.520091769894989 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57887065_57887161:POLR2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 68497597 C/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:C C A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000033178:ENST00000322244:exon_68497575_68497626:UBA6;ENSG00000033178:ENST00000505673:exon_68497575_68497626:UBA6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 71888240 C/T 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000156136:ENST00000286648:exon_71888084_71888277:DCK;ENSG00000156136:ENST00000503359:exon_71888084_71888277:DCK;ENSG00000156136:ENST00000504730:exon_71888084_71888277:DCK;ENSG00000156136:ENST00000504952:exon_71888084_71888277:DCK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 73930519 G/A 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000163626:ENST00000295890:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000449739:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000520291:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000533586:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000507544:exon_73930495_73930616:COX18;ENSG00000163626:ENST00000510031:exon_73930495_73930616:COX18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 49 39 88 23.2826184522665 20.4689363339104 2.81368211835611 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.594193349091679 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 73991006 T/C 1 20 14 34 9.50310957235366 7.34782329935244 2.15528627300122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.496139604892809 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000514252:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000254802:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000411811:exon_73990918_73991029:ANKRD17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 75937971 C/T 1 2 27 29 0.950310957235366 14.1708020773226 -13.2204911200872 T:C C T 10 0.524844521382317 4.31655658039357e-07 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 75938179 G/A 1 6 15 21 2.8509328717061 7.87266782073475 -5.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0302463165212927 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 75938236 A/G 1 3 15 18 1.42546643585305 7.87266782073475 -6.44720138488171 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00329559525490396 ENSG00000169116:ENST00000307428:exon_75937635_75938360:PARM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 34 33 67 16.1552862730012 17.3198692056165 -1.16458293261524 A:G G A 10 0.524844521382317 0.807499828168291 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 77053834 T/C 1 28 29 57 13.3043534012951 15.2204911200872 -1.91613771879207 T:C T C 10 0.524844521382317 0.691144168843661 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77053676_77053872:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514313:exon_77053473_77053872:NUP54 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 77871016 T/G 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 T:G T G 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000138758:ENST00000264893:exon_77870856_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000502584:exon_77870904_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510641:exon_77870919_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000505788:exon_77870962_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000512575:exon_77870989_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510515:exon_77870990_77871083:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000504637:exon_77871015_77871083:SEPT11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 78079772 G/A 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000138764:ENST00000316355:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000354403:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000502280:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000497512:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000395640:exon_78079450_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000512918:exon_78079686_78079823:CCNG2;ENSG00000138764:ENST00000509972:exon_78079579_78079823:CCNG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 79800080 G/A 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 A:G G A 10 0.524844521382317 0.716641471183947 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 84383810 C/T 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 T:C C T 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 84383901 G/A 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000163322:ENST00000321945:exon_84382092_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000475656:exon_84382098_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000506553:exon_84383162_84384055:FAM175A;ENSG00000163322:ENST00000504777:exon_84383228_84384055:FAM175A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 88295955 T/C 1 16 9 25 7.60248765788293 4.72360069244085 2.87888696544208 T:C T C 10 0.524844521382317 0.317512505067783 ENSG00000198189:ENST00000358290:exon_88295851_88295982:HSD17B11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 89198355 T/C 1 11 32 43 5.22671026479451 16.7950246842341 -11.5683144194396 T:C T C 10 0.524844521382317 0.000595683930220875 ENSG00000163644:ENST00000513546:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000508256:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000510548:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000511506:exon_89198295_89198719:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000506423:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000315194:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000514204:exon_89196297_89198395:PPM1K HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 89306659 T/C 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000380265:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000273960:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000504905:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000506714:exon_89306651_89306727:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000502870:exon_89306651_89306727:HERC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 89345760 C/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000138642:ENST00000511939:exon_89345747_89345854:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000438983:exon_89345747_89345854:HERC6;ENSG00000138642:ENST00000264346:exon_89345747_89345854:HERC6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 89397091 A/G 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G A G 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000138646:ENST00000264350:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000508159:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000510223:exon_89396992_89397181:HERC5;ENSG00000138646:ENST00000502913:exon_89396992_89397181:HERC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 95173779 T/C 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C T C 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95173767_95174158:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95173767_95174158:SMARCAD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 99982441 A/G 1 34 32 66 16.1552862730012 16.7950246842341 -0.639738411232919 A:G A G 10 0.524844521382317 0.90236598876862 ENSG00000164024:ENST00000296411:exon_99982305_99983964:METAP1;ENSG00000164024:ENST00000510133:exon_99982305_99982670:METAP1;ENSG00000164024:ENST00000514051:exon_99982305_99983175:METAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 102751076 G/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000153064:ENST00000504592:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000322953:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000444316:exon_102750965_102751363:BANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 103528817 T/G 1 57 68 125 27.0838622812079 35.6894274539976 -8.60556517278962 T:G T G 10 0.524844521382317 0.128495266131384 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103528806_103528908:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103528806_103528908:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103528806_103528908:NFKB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 103531778 T/C 1 69 60 129 32.7857280246201 31.490671282939 1.29505674168111 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.860251637701067 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103531732_103531856:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103531732_103531856:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103531732_103531856:NFKB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 103537619 C/T 1 174 134 308 82.6770532794769 70.3291658652305 12.3478874142464 T:C C T 10 0.524844521382317 0.170901206009024 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103537591_103538459:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103537591_103538072:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103537591_103538274:NFKB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 103590183 G/C 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 C:G G C 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103585842_103590206:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103590120_103590206:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103590120_103590206:MANBA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 103789810 C/A 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 104013796 T/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000164039:ENST00000296424:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000492366:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000464039:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000475058:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000432053:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000506521:exon_104013757_104013875:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000511354:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000504285:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000509245:exon_104013757_104013853:BDH2;ENSG00000164039:ENST00000513518:exon_104013533_104013853:BDH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 33 20 53 15.6801307943835 10.4968904276463 5.1832403667372 C:G C G 10 0.524844521382317 0.170160707342514 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 104062223 C/T 1 37 24 61 17.5807527088543 12.5962685131756 4.98448419567867 T:C C T 10 0.524844521382317 0.24840338403233 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 104081920 C/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C C T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104081782_104081936:CENPE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 106157870 A/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 106158189 G/A 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:G G A 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 106158216 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 106613211 G/C 1 25 23 48 11.8788869654421 12.0714239917933 -0.192537026351214 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000138785:ENST00000394735:exon_106613133_106613292:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000340139:exon_106613133_106613292:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000451321:exon_106613133_106613292:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000265150:exon_106613133_106613292:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000506967:exon_106613190_106613292:INTS12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 106888416 G/A 0 0 14 14 0 7.34782329935244 -7.34782329935244 A G A 10 0.524844521382317 2.99020095317427e-05 ENSG00000168743:ENST00000379987:exon_106888345_106888601:NPNT;ENSG00000168743:ENST00000453617:exon_106888345_106888601:NPNT;ENSG00000168743:ENST00000427316:exon_106888345_106888601:NPNT;ENSG00000168743:ENST00000514622:exon_106888345_106888601:NPNT;ENSG00000168743:ENST00000305572:exon_106888345_106888601:NPNT;ENSG00000168743:ENST00000506666:exon_106888345_106888601:NPNT;ENSG00000168743:ENST00000503451:exon_106888345_106888601:NPNT;ENSG00000168743:ENST00000514632:exon_106888345_106888601:NPNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 107249358 A/G 1 126 109 235 59.8695903058281 57.2080528306725 2.66153747515551 A:G A G 10 0.524844521382317 0.744348967304365 ENSG00000164022:ENST00000510207:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000442366:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000358008:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394701:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000432345:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394699:exon_107249233_107249400:AIMP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 108641300 T/C 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108641276_108641608:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108641276_108641378:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108641276_108641382:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108641160_108641369:PAPSS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 110612105 T/A 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:T T A 10 0.524844521382317 0.613976791497016 ENSG00000138794:ENST00000352981:exon_110612006_110612165:CASP6;ENSG00000138794:ENST00000265164:exon_110612006_110612165:CASP6;ENSG00000138794:ENST00000507550:exon_110612006_110612165:CASP6;ENSG00000138794:ENST00000505117:exon_110612006_110612165:CASP6;ENSG00000138794:ENST00000510324:exon_110612006_110612165:CASP6;ENSG00000138794:ENST00000513835:exon_110612013_110612165:CASP6;ENSG00000138794:ENST00000508203:exon_110612034_110612165:CASP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 113345147 A/G 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113345100_113345159:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113345100_113345159:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113345100_113345159:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113345100_113345159:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000515330:exon_113344882_113345159:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113345100_113345159:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509209:exon_113344944_113345159:ALPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 113352098 G/A 1 11 14 25 5.22671026479451 7.34782329935244 -2.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.428460468329696 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 16 12 28 7.60248765788293 6.2981342565878 1.30435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.706809371150625 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 20 7 27 9.50310957235366 3.67391164967622 5.82919792267744 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0323898576555053 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 20 7 27 9.50310957235366 3.67391164967622 5.82919792267744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0323898576555053 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 26 9 35 12.3540424440598 4.72360069244085 7.63044175161891 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0105932264675463 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 A:G A G 10 0.524844521382317 0.573240932810565 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 119718853 G/A 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 A:G G A 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119718838_119718965:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119718838_119718965:SEC24D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 122737965 G/C 1 150 199 349 71.2733217926525 104.444059755081 -33.1707379624286 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000394552820224393 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122737927_122738176:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122737927_122738066:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122737927_122737995:EXOSC9;ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122737599_122738841:CCNA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 122741807 C/T 1 41 39 80 19.481374623325 20.4689363339104 -0.987561710585357 T:C C T 10 0.524844521382317 0.824048909469794 ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122741697_122741920:CCNA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 123264654 T/C 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123264565_123264765:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123264565_123264765:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123264565_123264765:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000441681:exon_123264565_123264765:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123264565_123264765:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123264565_123264765:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000442707:exon_123264565_123264765:KIAA1109 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 123276961 G/A 1 8 12 20 3.80124382894146 6.2981342565878 -2.49689042764634 A:G G A 10 0.524844521382317 0.273827921303142 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123276951_123277145:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123276951_123277145:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123276951_123277145:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123276951_123277145:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123276951_123277145:KIAA1109 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 123843716 T/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123843084_123843737:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123843490_123843761:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123843179_123843729:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123843490_123843761:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000513517:exon_123838656_123843752:NUDT6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 129012638 A/G 1 21 8 29 9.97826505097134 4.19875617105854 5.77950887991281 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0395712872704 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 6 14 20 2.8509328717061 7.34782329935244 -4.49689042764634 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0705691660566987 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 129043286 C/T 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 T:C C T 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 129867228 C/T 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 129880770 G/A 1 12 4 16 5.7018657434122 2.09937808552927 3.60248765788293 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0825793217037308 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 129891583 C/T 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129891533_129891623:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129891533_129893527:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129891533_129891623:SCLT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 6 11 17 2.8509328717061 5.77328973520549 -2.92235686349939 A:T A T 10 0.524844521382317 0.223942010043343 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 17 11 28 8.07764313650061 5.77328973520549 2.30435340129513 A:G A G 10 0.524844521382317 0.451258947468562 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 139964455 C/T 1 5 14 19 2.37577739308842 7.34782329935244 -4.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0358228143741496 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 140058849 A/T 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:T A T 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000109381:ENST00000394235:exon_140058784_140059021:ELF2;ENSG00000109381:ENST00000379550:exon_140058784_140059021:ELF2;ENSG00000109381:ENST00000265495:exon_140058784_140059021:ELF2;ENSG00000109381:ENST00000511184:exon_140058784_140059021:ELF2;ENSG00000109381:ENST00000511006:exon_140057925_140059021:ELF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 140262082 C/A 1 11 4 15 5.22671026479451 2.09937808552927 3.12733217926525 A:C C A 10 0.524844521382317 0.125251659640691 ENSG00000164134:ENST00000296543:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000398947:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000482087:exon_140262066_140262227:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000480277:exon_140262066_140262223:NAA15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 142155072 T/A 1 111 125 236 52.7422581265628 65.6055651727896 -12.8633070462268 A:T T A 10 0.524844521382317 0.103083098457568 ENSG00000109445:ENST00000262990:exon_142154869_142155851:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000506302:exon_142154869_142155250:ZNF330 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 38 20 58 18.055908187472 10.4968904276463 7.55901775982562 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0491365098669948 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 148968049 A/G 1 28 32 60 13.3043534012951 16.7950246842341 -3.49067128293902 A:G A G 10 0.524844521382317 0.369527167615889 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148968043_148968202:ARHGAP10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 151773593 G/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151773037_151774095:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151773037_151774095:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000507224:exon_151773037_151774095:LRBA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 152682046 G/T 1 24 14 38 11.4037314868244 7.34782329935244 4.05590818747195 T:G G T 10 0.524844521382317 0.198033176811266 ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152681959_152682175:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152681959_152682151:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152681959_152682082:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515884:exon_152681959_152682105:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000511538:exon_152681959_152682122:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000512306:exon_152681959_152682137:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000508611:exon_152681959_152682142:PET112L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 153549629 C/T 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000170006:ENST00000304385:exon_153539784_153549713:TMEM154;ENSG00000170006:ENST00000379332:exon_153539784_153549713:TMEM154;ENSG00000170006:ENST00000510252:exon_153549401_153549713:TMEM154 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 156276289 C/T 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156276223_156276312:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276223_156276312:MAP9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 156289803 G/T 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:G G T 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156289738_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156289318_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156289654_156289961:MAP9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 37 43 80 17.5807527088543 22.5683144194396 -4.98756171058536 T:G G T 10 0.524844521382317 0.265794935859418 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 159640428 T/C 1 15 8 23 7.12733217926525 4.19875617105854 2.92857600820671 T:C T C 10 0.524844521382317 0.29679434643917 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159640332_159640438:PPID HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 164085470 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 164415930 C/T 1 60 89 149 28.509328717061 46.7111624030262 -18.2018336859652 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00306578754136896 ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164415613_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164415819_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164415820_164415988:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164415840_164415956:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164415860_164415956:C4orf43 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 165878567 G/C 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 C:G G C 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000250486:ENST00000513876:exon_165878100_165880274:C4orf39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 166021811 G/C 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 C:G G C 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 166231868 A/G 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000109466:ENST00000226725:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000514860:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506824:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000421009:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506541:exon_166231705_166231904:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000506761:exon_166231705_166231902:KLHL2;ENSG00000109466:ENST00000509028:exon_166231705_166231902:KLHL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 169176996 G/A 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 169201526 A/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169201486_169201741:DDX60 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 170634390 C/T 1 12 5 17 5.7018657434122 2.62422260691158 3.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.151838324857449 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 170634408 A/G 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 A:G A G 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 35 23 58 16.6304417516189 12.0714239917933 4.55901775982562 T:C C T 10 0.524844521382317 0.239799184002447 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 174253178 T/C 1 516 656 1172 245.180226966724 344.2980060268 -99.1177790600755 A:T:C T C 10 0.524844521382317 7.70805222708699e-09 ENSG00000164104:ENST00000296503:exon_174252846_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000446922:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000438704:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 174253422 T/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:T T A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 174537216 C/G 0 15 0 15 7.12733217926525 0 7.12733217926525 C C 10 0.524844521382317 7.73707070701479e-05 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 36 37 73 17.1055972302366 19.4192472911457 -2.31365006090914 A:G A G 10 0.524844521382317 0.63979784481401 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 184572218 G/A 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000182552:ENST00000326397:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000327570:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510968:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510702:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000512740:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000514322:exon_184572137_184572284:RWDD4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 184600601 A/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184600506_184600639:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184600506_184600639:C4orf41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 184614874 C/T 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 T:C C T 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184614742_184614890:C4orf41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 69 87 156 32.7857280246201 45.6614733602616 -12.8757453356414 T:C C T 10 0.524844521382317 0.044761358830068 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 185623558 C/T 1 14 8 22 6.65217670064756 4.19875617105854 2.45342052958903 T:C C T 10 0.524844521382317 0.393951929399631 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185623517_185623595:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185623517_185623595:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000508095:exon_185623243_185623635:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185623517_185623595:MLF1IP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 11 14 25 5.22671026479451 7.34782329935244 -2.12111303455792 T:C C T 10 0.524844521382317 0.428460468329696 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 186111639 T/C 1 36 31 67 17.1055972302366 16.2701801628518 0.835417067384764 T:C T C 10 0.524844521382317 0.902868141640228 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 186112111 G/A 1 19 15 34 9.02795409373598 7.87266782073475 1.15528627300122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.733885013169074 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 4 186318414 T/G 1 68 46 114 32.3105725460024 24.1428479835866 8.16772456241587 T:G T G 10 0.524844521382317 0.133940079750297 ENSG00000186352:ENST00000507479:exon_186318304_186318456:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186318304_186318456:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186318304_186318456:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511311:exon_186318304_186318861:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186318304_186318456:ANKRD37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 205574 G/A 1 41 35 76 19.481374623325 18.3695582483811 1.11181637494391 A:G G A 10 0.524844521382317 0.819305363734744 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 226160 A/C 1 84 89 173 39.9130602038854 46.7111624030262 -6.79810219914084 A:C A C 10 0.524844521382317 0.322568307163962 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 228362 T/C 1 62 60 122 29.4596396742963 31.490671282939 -2.03103160864267 T:C T C 10 0.524844521382317 0.717947509531769 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 233734 C/G 1 126 134 260 59.8695903058281 70.3291658652305 -10.4595755594024 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.214202212445177 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 235364 C/T 1 93 91 184 44.1894595114445 47.7608514457908 -3.57139193434632 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.606140464615787 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_235259_235379:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_235259_235639:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_234536_236714:SDHA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 256472 G/A 1 286 160 446 135.894466884657 83.9751234211707 51.9193434634867 A:G G A 10 0.524844521382317 7.46224243277389e-07 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 256509 G/A 1 255 152 407 121.164647047509 79.7763672501122 41.388279797397 A:G G A 10 0.524844521382317 3.66078103382224e-05 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 442586 G/C 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 442904 C/T 1 10 15 25 4.75155478617683 7.87266782073475 -3.12111303455792 T:C C T 10 0.524844521382317 0.233899195740004 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 446313 T/C 1 19 13 32 9.02795409373598 6.82297877797012 2.20497531576586 T:C T C 10 0.524844521382317 0.482276506766734 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_446265_446464:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000510441:exon_446265_446464:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_446265_446464:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000508022:exon_446265_446464:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_446264_446464:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_446264_446464:EXOC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 474974 C/T 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.184542335086170 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 865599 G/A 1 18 9 27 8.5527986151183 4.72360069244085 3.82919792267744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.177382710428329 ENSG00000028310:ENST00000497410:exon_865529_866616:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483234:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_865529_865691:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323547:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519112:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518250:exon_865529_865696:BRD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 1036435 G/A 0 0 9 9 0 4.72360069244085 -4.72360069244085 A G A 10 0.524844521382317 0.00123458691590234 ENSG00000145506:ENST00000296849:exon_1036372_1036499:NKD2;ENSG00000145506:ENST00000274150:exon_1036372_1036499:NKD2;ENSG00000145506:ENST00000523688:exon_1036372_1036499:NKD2;ENSG00000145506:ENST00000513296:exon_1035920_1036499:NKD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 1065399 C/T 1 25 16 41 11.8788869654421 8.39751234211707 3.481374623325 T:C C T 10 0.524844521382317 0.348311219954211 ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1065398_1065593:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000513223:exon_1065398_1065593:SLC12A7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 1331933 G/A 1 30 16 46 14.2546643585305 8.39751234211707 5.85715201641342 A:G G A 10 0.524844521382317 0.103690468636074 ENSG00000049656:ENST00000320895:exon_1331914_1331998:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000507807:exon_1331918_1331998:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000503042:exon_1330395_1331959:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000320927:exon_1331918_1331998:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000503151:exon_1331914_1331998:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000508765:exon_1331914_1331998:CLPTM1L;ENSG00000049656:ENST00000513250:exon_1331914_1331998:CLPTM1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 72 64 136 34.2111944604732 33.5900493684683 0.621145092004895 A:G G A 10 0.524844521382317 0.931785849933924 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 1479678 G/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 C:G G C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000153395:ENST00000513757:exon_1479591_1479790:LPCAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 1815950 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 1816045 C/T 1 109 95 204 51.7919471693275 49.8602295313201 1.93171763800734 T:C C T 10 0.524844521382317 0.833509876777655 ENSG00000145494:ENST00000274137:exon_1815965_1816719:NDUFS6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 5460570 A/G 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 5463370 C/T 1 15 16 31 7.12733217926525 8.39751234211707 -1.27018016285183 T:C C T 10 0.524844521382317 0.720479372385213 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 5463944 T/C 1 25 17 42 11.8788869654421 8.92235686349939 2.95653010194269 T:C T C 10 0.524844521382317 0.440310935423641 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 7866821 T/C 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C T C 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 7866967 G/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124279:ENST00000264669:exon_7866759_7868309:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000511261:exon_7866759_7867502:FASTKD3;ENSG00000124279:ENST00000507036:exon_7866759_7868283:FASTKD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 7889216 G/A 1 13 7 20 6.17702122202988 3.67391164967622 2.50310957235366 A:G G A 10 0.524844521382317 0.371027109529449 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000341013:exon_7889208_7889276:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000508101:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000509961:exon_7889208_7889388:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000512311:exon_7889208_7889388:MTRR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 10250430 G/A 1 18 10 28 8.5527986151183 5.24844521382317 3.30435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.257388498750569 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 10250443 T/C 1 25 25 50 11.8788869654421 13.1211130345579 -1.24222606911585 T:C T C 10 0.524844521382317 0.777835451745786 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 135 115 250 64.1459896133872 60.3571199589665 3.78886965442076 A:G A G 10 0.524844521382317 0.65779932830683 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 70 87 157 33.2608835032378 45.6614733602616 -12.4005898570238 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0548245518675863 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 10262740 C/A 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 A:C C A 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 10353992 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000145495:ENST00000449913:exon_10353815_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000502795:exon_10353823_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000511802:exon_10353827_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000503788:exon_10353828_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000274140:exon_10353879_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000397730:exon_10353879_10354029:MARCH6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 10354003 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000145495:ENST00000449913:exon_10353815_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000502795:exon_10353823_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000511802:exon_10353827_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000503788:exon_10353828_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000274140:exon_10353879_10354029:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000397730:exon_10353879_10354029:MARCH6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 T:C T C 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 32126441 G/A 1 65 81 146 30.8851061101494 42.5124062319677 -11.6273001218183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.056781818570471 ENSG00000113384:ENST00000265070:exon_32124810_32126742:GOLPH3;ENSG00000113384:ENST00000499354:exon_32124827_32126742:GOLPH3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 34949764 G/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000168724:ENST00000382021:exon_34949648_34949782:DNAJC21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 36972056 T/G 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:G T G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36972047_36972143:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36972047_36972143:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000505998:exon_36972047_36972143:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36972047_36972143:NIPBL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 36985831 G/A 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 37299049 C/T 1 10 22 32 4.75155478617683 11.546579470411 -6.79502468423414 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0203155310821518 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000502533:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37298970_37299080:NUP155 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 37328485 T/G 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 T:G T G 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37328460_37328522:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37328460_37328522:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37328460_37328522:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37328460_37328522:NUP155 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 37333727 A/G 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37333565_37333735:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37333565_37333735:NUP155 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 43039793 T/C 1 1 16 17 0.475155478617683 8.39751234211707 -7.92235686349939 T:C T C 10 0.524844521382317 8.08420362446779e-05 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 43656024 T/C 1 11 20 31 5.22671026479451 10.4968904276463 -5.27018016285183 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0713947315459997 ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43655942_43656175:NNT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 59284347 C/T 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000113448:ENST00000502484:exon_59284315_59284544:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000514231:exon_59284315_59284459:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000512069:exon_59284314_59284531:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000509368:exon_59282225_59284544:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000509355:exon_59283986_59284544:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000504624:exon_59284315_59284531:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000506024:exon_59284148_59284544:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000506510:exon_59284188_59284544:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000511382:exon_59284268_59284544:PDE4D;ENSG00000113448:ENST00000505507:exon_59284344_59284544:PDE4D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 61833044 A/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000068796:ENST00000509663:exon_61833036_61833076:KIF2A;ENSG00000086200:ENST00000424533:exon_61833036_61833116:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000325324:exon_61833036_61833116:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000409296:exon_61833036_61833116:IPO11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 74 94 168 35.1615054177085 49.3353850099378 -14.1738795922292 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0304715607394651 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 17 11 28 8.07764313650061 5.77328973520549 2.30435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.451258947468562 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 65084101 A/G 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 A:G A G 10 0.524844521382317 0.692551486497706 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506539:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65083945_65084311:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65083945_65084311:NLN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 65458247 G/A 1 15 14 29 7.12733217926525 7.34782329935244 -0.220491120087193 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000153914:ENST00000334121:exon_65458242_65458420:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000522912:exon_65458242_65458420:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000520953:exon_65458242_65458420:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000524111:exon_65458242_65458420:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000380918:exon_65458242_65458420:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000284041:exon_65458242_65458420:SREK1;ENSG00000153914:ENST00000520580:exon_65458242_65459750:SREK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:C T C 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 68398889 G/T 1 17 10 27 8.07764313650061 5.24844521382317 2.82919792267744 T:G G T 10 0.524844521382317 0.336756432357263 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68398889_68398955:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000380860:exon_68398889_68398955:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000504103:exon_68398889_68398955:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000502979:exon_68398889_68398955:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68398889_68398955:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68398889_68398955:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68398399_68398955:SLC30A5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 68419054 A/T 1 18 29 47 8.5527986151183 15.2204911200872 -6.6676925049689 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0576721294595669 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68419026_68419339:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68419026_68419252:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68419026_68419366:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68419026_68419247:SLC30A5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 68425303 A/G 1 40 57 97 19.0062191447073 29.9161377187921 -10.9099185740847 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0322708964068465 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68425274_68426896:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68425274_68426892:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000511158:exon_68425274_68425953:SLC30A5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 44 47 91 20.9068410591781 24.6676925049689 -3.76085144579084 T:G G T 10 0.524844521382317 0.463177546449437 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 111 86 197 52.7422581265628 45.1366288388793 7.60562928768356 A:G G A 10 0.524844521382317 0.285398643517196 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 68687792 G/A 1 22 20 42 10.453420529589 10.4968904276463 -0.0434698980573121 A:C:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000508320:exon_68687658_68687840:RAD17 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 70786830 G/T 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:G G T 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70786811_70786958:BDP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 70805984 G/A 1 9 15 24 4.27639930755915 7.87266782073475 -3.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.156455234273016 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 70828251 G/A 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70828135_70828254:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70828135_70828254:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70828135_70828254:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70828135_70828254:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70828201_70828254:BDP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 70945075 A/G 1 30 37 67 14.2546643585305 19.4192472911457 -5.16458293261524 A:G A G 10 0.524844521382317 0.222408175385752 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 23 38 61 10.9285760082067 19.944091812528 -9.01551580432133 T:C C T 10 0.524844521382317 0.028464974162551 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 72865334 A/G 1 7 16 23 3.32608835032378 8.39751234211707 -5.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.037721226567006 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72865322_72865500:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72865322_72865500:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72865322_72865500:UTP15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 73930751 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 74077474 C/T 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000198780:ENST00000389156:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000514215:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510496:exon_74073399_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000510609:exon_74073401_74077833:FAM169A;ENSG00000198780:ENST00000380515:exon_74076956_74077833:FAM169A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 26 17 43 12.3540424440598 8.92235686349939 3.43168558056037 T:C C T 10 0.524844521382317 0.359938456897175 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 77473165 A/G 1 17 22 39 8.07764313650061 11.546579470411 -3.46893633391036 A:G A G 10 0.524844521382317 0.336176624282279 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77473163_77473260:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77473163_77473260:AP3B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 77784738 A/G 1 11 5 16 5.22671026479451 2.62422260691158 2.60248765788293 A:G A G 10 0.524844521382317 0.219130803102002 ENSG00000145685:ENST00000274345:exon_77781038_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000380345:exon_77781040_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000515007:exon_77781054_77784976:LHFPL2;ENSG00000145685:ENST00000502722:exon_77784635_77784976:LHFPL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 81574182 C/T 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 82648977 T/G 1 28 30 58 13.3043534012951 15.7453356414695 -2.44098224017439 T:C:G T G 10 0.524844521382317 0.599378874435858 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 85913905 C/T 1 398 964 1362 189.111880489838 505.950118612554 -316.838238122716 A:T:C C T 10 0.524844521382317 1.52760517619563e-67 ENSG00000127184:ENST00000247655:exon_85913721_85913947:COX7C;ENSG00000127184:ENST00000509578:exon_85913773_85913947:COX7C;ENSG00000127184:ENST00000515763:exon_85913790_85913947:COX7C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 94224591 G/A 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94224584_94224677:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000506568:exon_94224584_94224677:MCTP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 94814011 C/A 1 38 31 69 18.055908187472 16.2701801628518 1.78572802462013 A:C C A 10 0.524844521382317 0.718376209648423 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94813994_94814146:TTC37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 94826655 C/A 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 94861118 G/C 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94861102_94861205:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000513232:exon_94861102_94861168:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000514952:exon_94861102_94861205:TTC37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 100 137 237 47.5155478617683 71.9036994293774 -24.3881515676091 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00174330951070945 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 96119708 A/T 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 A:T A T 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96119628_96119784:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96119628_96119784:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96119628_96119784:ERAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 96129543 C/T 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96129506_96129660:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96129506_96129660:ERAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 96139250 C/G 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 96244778 T/A 1 37 22 59 17.5807527088543 11.546579470411 6.0341732384433 A:T T A 10 0.524844521382317 0.119794322158166 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96244665_96244821:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96244665_96244821:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96244665_96244821:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96244665_96244821:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96244670_96244821:ERAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 96244793 A/G 1 45 25 70 21.3819965377957 13.1211130345579 8.26088350323781 A:G A G 10 0.524844521382317 0.055125661458648 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96244665_96244821:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96244665_96244821:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96244665_96244821:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96244665_96244821:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96244670_96244821:ERAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 99897866 G/A 1 21 14 35 9.97826505097134 7.34782329935244 2.63044175161891 A:G G A 10 0.524844521382317 0.401831493103041 ENSG00000174132:ENST00000312637:exon_99897758_99897892:FAM174A;ENSG00000174132:ENST00000505792:exon_99897756_99897892:FAM174A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 102345546 A/C 1 3 17 20 1.42546643585305 8.92235686349939 -7.49689042764634 A:C A C 10 0.524844521382317 0.00105619632994501 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000346918:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379787:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504691:exon_102345455_102345570:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102345455_102345570:PAM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 102423628 T/C 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000145723:ENST00000512248:exon_102421704_102423876:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000399004:exon_102422037_102423876:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000508629:exon_102423517_102423876:GIN1;ENSG00000145723:ENST00000507478:exon_102423519_102423876:GIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 108523293 A/T 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 A:T A T 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000151422:ENST00000281092:exon_108523134_108532542:FER;ENSG00000151422:ENST00000504143:exon_108523134_108523976:FER;ENSG00000151422:ENST00000438717:exon_108523134_108523373:FER;ENSG00000151422:ENST00000513777:exon_108523134_108523368:FER HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 110096939 G/A 1 18 29 47 8.5527986151183 15.2204911200872 -6.6676925049689 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0576721294595669 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509442:exon_110096904_110097147:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000502462:exon_110096904_110097355:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 112176936 G/C 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 C:G G C 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 112197046 C/T 1 18 13 31 8.5527986151183 6.82297877797012 1.72981983714817 T:C C T 10 0.524844521382317 0.592324700211678 ENSG00000153037:ENST00000503445:exon_112196885_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000505459:exon_112196919_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000506997:exon_112196992_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000282999:exon_112197002_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000512790:exon_112197002_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000515463:exon_112197007_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000515755:exon_112197023_112197114:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000445150:exon_112197029_112197114:SRP19 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 112227997 A/T 1 31 1 32 14.7298198371482 0.524844521382317 14.2049753157659 A:T A T 10 0.524844521382317 6.21741573406207e-08 ENSG00000153037:ENST00000506997:exon_112227300_112228648:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000512790:exon_112227300_112228776:SRP19;ENSG00000212643:ENST00000391338:exon_112227313_112228791:ZRSR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 115782528 G/A 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000092421:ENST00000343348:exon_115779312_115783507:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000257414:exon_115781446_115783507:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000515129:exon_115781830_115783507:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000513137:exon_115781830_115783507:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000503865:exon_115782160_115783507:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000282394:exon_115782197_115783507:SEMA6A;ENSG00000092421:ENST00000510263:exon_115782309_115783507:SEMA6A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 118451873 T/G 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 T:G T G 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000172869:ENST00000503802:exon_118451853_118452031:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118451853_118452031:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000514151:exon_118451853_118452031:DMXL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 114 144 258 54.1677245624159 75.5776110790536 -21.4098865166378 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.00872242055115991 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 118832244 C/G 1 24 35 59 11.4037314868244 18.3695582483811 -6.9658267615567 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.0893124835247405 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118832238_118832309:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000520216:exon_118832238_118832341:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118832236_118832341:HSD17B4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 118865612 C/T 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118865596_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118865589_118865675:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118865589_118865795:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118865589_118865675:HSD17B4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 121355961 G/A 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 122714044 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122714030_122714122:CEP120 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 122718736 G/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122718713_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122718719_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122718680_122718776:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122718680_122718776:CEP120 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 123976967 C/T 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168916:ENST00000513985:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000504926:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000306315:exon_123976945_123977098:ZNF608;ENSG00000168916:ENST00000395398:exon_123976945_123977098:ZNF608 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 125813422 A/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000155324:ENST00000513040:exon_125813384_125813479:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000506445:exon_125813384_125813479:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000285689:exon_125813384_125813479:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000515200:exon_125813384_125813479:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000514099:exon_125813384_125813479:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000513978:exon_125813384_125813479:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000502348:exon_125813384_125813479:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000509882:exon_125813384_125813475:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000511134:exon_125813384_125813479:GRAMD3;ENSG00000155324:ENST00000504859:exon_125813384_125813479:GRAMD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 126161748 G/A 1 47 45 92 22.3323074950311 23.6180034622043 -1.28569596717316 A:G G A 10 0.524844521382317 0.834894729789346 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126161680_126161799:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126161680_126161799:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126161680_126161799:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000512460:exon_126161680_126161801:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000484340:exon_126161680_126161799:LMNB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 18 31 49 8.5527986151183 16.2701801628518 -7.71738154773353 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0314637640226297 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 37 42 79 17.5807527088543 22.0434698980573 -4.46271718920304 T:C T C 10 0.524844521382317 0.367593228419838 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 132087697 G/A 1 58 68 126 27.5590177598256 35.6894274539976 -8.13040969417194 A:G G A 10 0.524844521382317 0.154107055110756 ENSG00000205089:ENST00000378731:exon_132087658_132087888:CCNI2;ENSG00000205089:ENST00000468733:exon_132087386_132087703:CCNI2;ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132086509_132087873:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481030:exon_132087151_132087870:SEPT8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 133900192 C/T 1 21 21 42 9.97826505097134 11.0217349490287 -1.04346989805731 T:C C T 10 0.524844521382317 0.759816463092589 ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133900184_133900300:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000470876:exon_133899862_133900300:PHF15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 134010400 C/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000113615:ENST00000398844:exon_134010305_134010465:SEC24A;ENSG00000113615:ENST00000322887:exon_134010305_134010465:SEC24A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 134223615 G/A 1 36 30 66 17.1055972302366 15.7453356414695 1.36026158876708 A:G G A 10 0.524844521382317 0.805688742543161 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 134229293 C/A 1 27 31 58 12.8291979226774 16.2701801628518 -3.44098224017438 A:C:G C A 10 0.524844521382317 0.430504950329701 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000511070:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506350:exon_134229182_134229345:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000505174:exon_134227868_134229345:TXNDC15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 237 194 431 112.611848432391 101.819837148169 10.7920112842214 A:G A G 10 0.524844521382317 0.31127270350408 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 138 130 268 65.5714560492403 68.2297877797012 -2.65833173046096 A:G A G 10 0.524844521382317 0.759996332199158 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 137217758 G/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000120729:ENST00000239926:exon_137217662_137217794:MYOT;ENSG00000120729:ENST00000421631:exon_137217662_137217794:MYOT;ENSG00000120729:ENST00000515645:exon_137217662_137217794:MYOT;ENSG00000120729:ENST00000503748:exon_137217662_137217794:MYOT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 137278682 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000031003:ENST00000033079:exon_137278564_137278727:FAM13B;ENSG00000031003:ENST00000425075:exon_137278564_137278727:FAM13B;ENSG00000031003:ENST00000420893:exon_137278564_137278727:FAM13B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 137781196 C/T 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000132563:ENST00000378339:exon_137781157_137781287:REEP2;ENSG00000132563:ENST00000254901:exon_137781157_137781287:REEP2;ENSG00000132563:ENST00000506158:exon_137781157_137781287:REEP2;ENSG00000132563:ENST00000507635:exon_137781157_137781287:REEP2;ENSG00000132563:ENST00000504163:exon_137781157_137781287:REEP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 137910971 C/T 1 51 63 114 24.2329294095018 33.065204847086 -8.83227543758413 T:C C T 10 0.524844521382317 0.110662175939884 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137910927_137911133:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137910927_137911090:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000504902:exon_137910927_137911029:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507115:exon_137910927_137911092:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000505110:exon_137910927_137911090:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000506477:exon_137910927_137911100:HSPA9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 30 51 81 14.2546643585305 26.7670705904982 -12.5124062319677 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00720184898589545 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 138378368 T/G 1 15 28 43 7.12733217926525 14.6956465987049 -7.56831441943963 T:G T G 10 0.524844521382317 0.022161258256497 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000503732:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505945:exon_138378309_138378371:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138378309_138378408:SIL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 138773090 A/G 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 A:G A G 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138773061_138773249:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515581:exon_138773061_138773247:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000515277:exon_138773061_138773247:DNAJC18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 138861146 C/G 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 C:G C G 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 139060114 G/A 1 65 57 122 30.8851061101494 29.9161377187921 0.968968391357329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.927825080181853 ENSG00000171604:ENST00000502295:exon_139059949_139060314:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504944:exon_139059949_139060415:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000302517:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000507139:exon_139059949_139060141:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504844:exon_139059949_139060591:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502336:exon_139059949_139060350:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000520967:exon_139059949_139060521:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511048:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000512816:exon_139059949_139060328:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000509238:exon_139059949_139060403:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502716:exon_139059949_139060651:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000503511:exon_139059949_139060358:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511457:exon_139059949_139060698:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511591:exon_139059949_139060132:CXXC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 139060486 G/A 1 105 91 196 49.8913252548567 47.7608514457908 2.13047380906588 A:G G A 10 0.524844521382317 0.775257575168553 ENSG00000171604:ENST00000302517:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504844:exon_139059949_139060591:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000520967:exon_139059949_139060521:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511048:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502716:exon_139059949_139060651:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511457:exon_139059949_139060698:CXXC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 139422349 G/A 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000158458:ENST00000289422:exon_139421955_139422732:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000361474:exon_139421955_139422879:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000394770:exon_139421955_139422879:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000289409:exon_139421955_139422654:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000358522:exon_139421955_139422654:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000378238:exon_139421955_139422654:NRG2;ENSG00000158458:ENST00000446269:exon_139421955_139422879:NRG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 139936835 G/A 1 51 47 98 24.2329294095018 24.6676925049689 -0.434763095467062 A:T:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 139946888 G/A 1 89 94 183 42.2888375969738 49.3353850099378 -7.046547412964 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.30110811131245 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 139946988 G/T 1 118 112 230 56.0683464768866 58.7825863948195 -2.71423991793291 A:T:G G T 10 0.524844521382317 0.741554582933374 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 139947135 T/C 1 104 94 198 49.416169776239 49.3353850099378 0.0807847663012424 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 139947612 G/A 1 126 124 250 59.8695903058281 65.0807206514073 -5.21113034557924 A:G G A 10 0.524844521382317 0.526896668356949 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000432254:exon_139947402_139947830:SLC35A4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 140051343 A/G 1 24 11 35 11.4037314868244 5.77328973520549 5.63044175161891 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0631291440724101 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048918_140051930:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140050854_140051929:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140050854_140051929:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140050854_140051951:WDR55 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 140070513 G/T 1 40 52 92 19.0062191447073 27.2919151118805 -8.28569596717316 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0946697372105192 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000507746:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512396:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000518126:exon_140070440_140070529:HARS;ENSG00000170445:ENST00000502888:exon_140070440_140070529:HARS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 140812418 G/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:G G T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000253159:ENST00000252085:exon_140810185_140812750:PCDHGA12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 140953669 G/C 1 35 26 61 16.6304417516189 13.6459575559402 2.98448419567867 C:G G C 10 0.524844521382317 0.521899867984904 ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140953547_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140953059_140953775:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140953059_140953775:DIAPH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 140958697 C/T 1 23 21 44 10.9285760082067 11.0217349490287 -0.0931589408219473 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140958655_140958763:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000523100:exon_140958655_140958763:DIAPH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 141019881 G/C 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 141026718 G/A 1 11 4 15 5.22671026479451 2.09937808552927 3.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.125251659640691 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522763:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522386:exon_141026702_141026797:FCHSD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 145890028 A/G 1 49 53 102 23.2826184522665 27.8167596332628 -4.53414118099633 A:G A G 10 0.524844521382317 0.374221676601534 ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145890004_145891524:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145890004_145890586:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145890004_145891071:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000511077:exon_145890004_145891068:TCERG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 147813013 G/A 1 32 41 73 15.2049753157659 21.518625376675 -6.31365006090914 A:G G A 10 0.524844521382317 0.159550378400412 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000505399:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000504447:exon_147812796_147813087:FBXO38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 148745664 T/C 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 T:C T C 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148745505_148745716:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148745505_148745716:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148745505_148745716:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148745505_148745716:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148742632_148745716:PCYOX1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 148930447 G/A 1 85 73 158 40.3882156825031 38.3136500609091 2.07456562159392 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.750747862767155 ENSG00000113712:ENST00000261798:exon_148930405_148930960:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000377843:exon_148930405_148931007:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000515768:exon_148930405_148930527:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000322237:exon_148930405_148930527:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000523203:exon_148930405_148930919:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000515748:exon_148930405_148930731:CSNK1A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 149782802 G/A 1 56 19 75 26.6087068025902 9.97204590626402 16.6366608963262 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000109021627589967 ENSG00000019582:ENST00000518797:exon_149782684_149782875:CD74;ENSG00000019582:ENST00000009530:exon_149782684_149782875:CD74;ENSG00000019582:ENST00000523208:exon_149782684_149782875:CD74 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 151054227 T/C 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 T:C T C 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000521327:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000522348:exon_151054173_151054235:SPARC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 18 20 38 8.5527986151183 10.4968904276463 -1.94409181252804 A:G G A 10 0.524844521382317 0.626687508296695 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 153413867 G/A 1 9 1 10 4.27639930755915 0.524844521382317 3.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0230108839750243 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522395:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518900:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000523705:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000519808:exon_153413838_153413937:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518102:exon_153413838_153413937:FAM114A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 153432733 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000037749:ENST00000439768:exon_153432480_153433612:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000436816:exon_153432480_153437014:MFAP3;ENSG00000037749:ENST00000322602:exon_153432480_153434593:MFAP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 154268902 C/T 1 34 36 70 16.1552862730012 18.8944027697634 -2.73911649676219 T:C C T 10 0.524844521382317 0.550560699061189 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154268881_154268977:GEMIN5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 154271948 G/A 1 28 29 57 13.3043534012951 15.2204911200872 -1.91613771879207 A:G G A 10 0.524844521382317 0.691144168843661 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154271947_154272109:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000522075:exon_154271947_154272210:GEMIN5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 11 11 22 5.22671026479451 5.77328973520549 -0.546579470410974 T:C C T 10 0.524844521382317 0.834273474833411 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 154300940 A/C 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154300903_154300985:GEMIN5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 154306972 T/C 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C T C 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154306945_154307110:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000523355:exon_154306946_154307110:GEMIN5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 156565975 G/A 1 50 35 85 23.7577739308842 18.3695582483811 5.38821568250306 A:G G A 10 0.524844521382317 0.277581142457340 ENSG00000155868:ENST00000286317:exon_156564423_156566459:MED7;ENSG00000155868:ENST00000420343:exon_156565453_156566459:MED7;ENSG00000155868:ENST00000524289:exon_156565857_156566459:MED7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 156747669 A/G 1 51 73 124 24.2329294095018 38.3136500609091 -14.0807206514073 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0117841598396077 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156747663_156747810:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156747663_156747810:CYFIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 157166495 T/C 1 35 35 70 16.6304417516189 18.3695582483811 -1.73911649676219 T:C T C 10 0.524844521382317 0.72029523081255 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157166329_157168456:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157166329_157166586:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157166329_157167443:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157166329_157166706:THG1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 159437621 C/G 1 102 118 220 48.4658588190037 61.9316535231134 -13.4657947041097 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0790090418320562 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159437507_159437865:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159437507_159437865:TTC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 159463719 C/T 1 51 54 105 24.2329294095018 28.3416041546451 -4.10867474514328 T:C C T 10 0.524844521382317 0.435746915934443 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159463698_159463810:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159463698_159463810:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522073:exon_159463513_159463810:TTC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 36 32 68 17.1055972302366 16.7950246842341 0.310572546002447 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 23 13 36 10.9285760082067 6.82297877797012 4.10559723023659 C:G C G 10 0.524844521382317 0.185100969713197 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 162886919 G/T 1 63 104 167 29.934795152914 54.583830223761 -24.6490350708469 T:C:G G T 10 0.524844521382317 0.000137137280380922 ENSG00000170584:ENST00000302764:exon_162886868_162887146:NUDCD2;ENSG00000170584:ENST00000517501:exon_162886868_162887061:NUDCD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 162887690 G/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162887372_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162887517_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162887556_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162887640_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162887640_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000521108:exon_162887659_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162887663_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000517936:exon_162887666_162887744:HMMR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 18 40 58 8.5527986151183 20.9937808552927 -12.4409822401744 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00138868565208019 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 169018056 A/G 1 27 10 37 12.8291979226774 5.24844521382317 7.58075270885427 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0132371457841797 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169018052_169018216:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000506574:exon_169018052_169018152:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000515224:exon_169018052_169018157:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000508247:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000513941:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000509785:exon_169018052_169018078:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000512028:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000513795:exon_169018052_169018228:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000503871:exon_169018052_169018228:CCDC99 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 17 15 32 8.07764313650061 7.87266782073475 0.204975315765857 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 169025501 T/C 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 T:C T C 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169025480_169025583:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169025480_169025583:CCDC99 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 25 36 61 11.8788869654421 18.8944027697634 -7.01551580432133 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0740588765521484 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 48 48 96 22.8074629736488 25.1925370263512 -2.38507405270243 T:C T C 10 0.524844521382317 0.682990864321853 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 32 30 62 15.2049753157659 15.7453356414695 -0.540360325703652 T:G G T 10 0.524844521382317 0.899556830572128 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 169469088 G/C 1 49 39 88 23.2826184522665 20.4689363339104 2.81368211835611 C:G G C 10 0.524844521382317 0.594193349091679 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169469017_169469136:DOCK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 169724551 T/A 1 23 15 38 10.9285760082067 7.87266782073475 3.05590818747195 A:T T A 10 0.524844521382317 0.335254961525510 ENSG00000043462:ENST00000046794:exon_169724538_169725231:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000519594:exon_169724538_169724731:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000522760:exon_169724538_169724733:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000522823:exon_169724538_169724819:LCP2;ENSG00000043462:ENST00000519149:exon_169724538_169724788:LCP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 171305038 A/G 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:G A G 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000072803:ENST00000296933:exon_171305015_171305133:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000265094:exon_171305015_171305133:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000393802:exon_171305015_171305133:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000523843:exon_171305015_171305133:FBXW11;ENSG00000072803:ENST00000522891:exon_171305015_171305133:FBXW11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 172517653 C/T 1 15 5 20 7.12733217926525 2.62422260691158 4.50310957235366 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0463439224535587 ENSG00000164463:ENST00000522692:exon_172517318_172519333:C5orf41;ENSG00000164463:ENST00000296953:exon_172517318_172518404:C5orf41;ENSG00000164463:ENST00000520420:exon_172517318_172518539:C5orf41;ENSG00000164463:ENST00000520464:exon_172517318_172518404:C5orf41;ENSG00000164463:ENST00000393776:exon_172517318_172518404:C5orf41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 172745093 G/T 1 22 17 39 10.453420529589 8.92235686349939 1.53106366608964 T:G G T 10 0.524844521382317 0.635279645808825 ENSG00000113739:ENST00000265087:exon_172741716_172745252:STC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 18 23 41 8.5527986151183 12.0714239917933 -3.518625376675 T:C C T 10 0.524844521382317 0.278600075286401 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 42 31 73 19.9565301019427 16.2701801628518 3.68634993909086 A:G G A 10 0.524844521382317 0.413640125249475 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 175774925 A/C 1 70 78 148 33.2608835032378 40.9378726678207 -7.67698916458291 A:C A C 10 0.524844521382317 0.217474242388815 ENSG00000122203:ENST00000298569:exon_175774924_175775066:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000393728:exon_175774924_175775066:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000393725:exon_175774924_175775066:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000432806:exon_175774924_175775066:KIAA1191;ENSG00000122203:ENST00000510164:exon_175774924_175775066:KIAA1191 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176025991 T/G 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:G T G 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000169258:ENST00000303991:exon_176022803_176026878:GPRIN1;ENSG00000169258:ENST00000335532:exon_176024595_176026835:GPRIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 23 19 42 10.9285760082067 9.97204590626402 0.956530101942688 A:G A G 10 0.524844521382317 0.877488592984835 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 T:G G T 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176395667 C/T 1 13 21 34 6.17702122202988 11.0217349490287 -4.84471372699878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.121470856261209 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176395556_176396292:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176395556_176395890:UIMC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 24 23 47 11.4037314868244 12.0714239917933 -0.667692504968898 A:G G A 10 0.524844521382317 0.884546185065466 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176639105 T/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176720870 C/T 1 19 21 40 9.02795409373598 11.0217349490287 -1.99378085529268 T:C C T 10 0.524844521382317 0.531894683283917 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 44 38 82 20.9068410591781 19.944091812528 0.962749246650009 C:G G C 10 0.524844521382317 0.912055743787258 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 42 46 88 19.9565301019427 24.1428479835866 -4.18631788164389 A:G A G 10 0.524844521382317 0.394239705320608 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 55 41 96 26.1335513239726 21.518625376675 4.61492594729757 T:C T C 10 0.524844521382317 0.359422897784126 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 18 17 35 8.5527986151183 8.92235686349939 -0.369558248381093 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176936590 T/C 1 30 29 59 14.2546643585305 15.2204911200872 -0.965826761556702 T:C T C 10 0.524844521382317 0.896435128189525 ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000509310:exon_176936476_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502380:exon_176935785_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936167_176936658:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510389:exon_176936503_176936658:DOK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176936819 C/G 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 C:G C G 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176936803_176936858:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510380:exon_176936803_176936847:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000506493:exon_176936759_176936830:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000502885:exon_176936759_176936827:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510898:exon_176936759_176936853:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000512660:exon_176936759_176936827:DOK3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 78 84 162 37.0621273321793 44.0869397961146 -7.02481246393535 A:G G A 10 0.524844521382317 0.271965583532730 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 177482617 G/A 1 26 1 27 12.3540424440598 0.524844521382317 11.8291979226774 A:G G A 10 0.524844521382317 7.60120571602885e-07 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 21 16 37 9.97826505097134 8.39751234211707 1.58075270885427 T:C C T 10 0.524844521382317 0.62568102314945 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 178140191 G/A 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 A:G G A 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 178311021 G/A 1 20 9 29 9.50310957235366 4.72360069244085 4.77950887991281 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0936805033763996 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B;ENSG00000178338:ENST00000522714:exon_178310866_178311519:ZNF354B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 44 46 90 20.9068410591781 24.1428479835866 -3.23600692440853 A:G G A 10 0.524844521382317 0.527347357633652 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179226518 G/A 1 105 86 191 49.8913252548567 45.1366288388793 4.75469641597746 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.514804761061771 ENSG00000161013:ENST00000518778:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520969:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000522293:exon_179226506_179226576:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520875:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518867:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518702:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520822:exon_179226506_179227068:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179226512_179226636:MGAT4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179228623 G/A 1 79 73 152 37.537282810797 38.3136500609091 -0.77636725011218 A:G G A 10 0.524844521382317 0.935342760984483 ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228554_179228692:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228334_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228554_179228719:MGAT4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179260183 C/T 1 222 245 467 105.484516253126 128.586907738668 -23.102391485542 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0330832514524656 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 317 289 606 150.624286721806 151.68006667949 -1.05577995768408 A:G G A 10 0.524844521382317 0.935214005401626 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179260661 G/A 1 240 218 458 114.037314868244 114.416105661345 -0.378790793101174 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260587_179260782:SQSTM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179290889 T/C 1 137 108 245 65.0963005706226 56.6832083092902 8.41309226133234 T:C T C 10 0.524844521382317 0.306120429271119 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179297262 T/C 1 55 48 103 26.1335513239726 25.1925370263512 0.941014297621354 T:C T C 10 0.524844521382317 0.921486031356124 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179297352 A/G 1 29 20 49 13.7795088799128 10.4968904276463 3.28261845226647 A:G A G 10 0.524844521382317 0.392083216890412 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179297459 G/A 1 32 31 63 15.2049753157659 16.2701801628518 -1.06520484708597 A:G G A 10 0.524844521382317 0.802093555858814 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179300131 T/C 1 23 18 41 10.9285760082067 9.4472013848817 1.481374623325 T:C T C 10 0.524844521382317 0.754951921506181 ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521669:exon_179300119_179300135:TBC1D9B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 179996111 C/T 1 9 10 19 4.27639930755915 5.24844521382317 -0.972045906264022 T:C C T 10 0.524844521382317 0.819117352050088 ENSG00000113300:ENST00000261951:exon_179996110_179996340:CNOT6;ENSG00000113300:ENST00000393356:exon_179996110_179996340:CNOT6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 73 74 147 34.6863499390909 38.8384945822915 -4.15214464320059 T:C C T 10 0.524844521382317 0.509589135120822 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 180485353 G/A 1 14 9 23 6.65217670064756 4.72360069244085 1.92857600820671 A:G G A 10 0.524844521382317 0.532398335432504 ENSG00000165810:ENST00000327705:exon_180485352_180485378:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000376842:exon_180485352_180485378:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000512570:exon_180485352_180485378:BTNL9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 18 7 25 8.5527986151183 3.67391164967622 4.87888696544208 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0696668631520315 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 180660447 G/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180660413_180660763:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180657744_180662803:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515834:exon_180659659_180660524:TRIM41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 17 13 30 8.07764313650061 6.82297877797012 1.25466435853049 C:G G C 10 0.524844521382317 0.716641471183947 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 180665123 G/A 1 2747 2972 5719 1305.25209976278 1559.83791754825 -254.585817785471 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 1.69737608398062e-11 ENSG00000204628:ENST00000511473:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000504325:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000514455:exon_180665099_180665663:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000507756:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000509148:exon_180665099_180665195:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502905:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000389599:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000376817:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000512805:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000504128:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000508682:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000509535:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000511900:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000512968:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000510199:exon_180665120_180665239:GNB2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 5 180687212 C/T 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000183718:ENST00000327767:exon_180687002_180688119:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000510796:exon_180687002_180687258:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000503005:exon_180687002_180687325:TRIM52;ENSG00000183718:ENST00000514805:exon_180687002_180688082:TRIM52 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 348195 G/A 0 84 1 85 39.9130602038854 0.524844521382317 39.3882156825031 C:G G C 10 0.524844521382317 1.71013596293980e-22 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 92 278 370 43.7143040328268 145.906776944284 -102.192472911457 A:G G A 10 0.524844521382317 3.3611121078371e-27 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 564085 G/T 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:G G T 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 7 13 20 3.32608835032378 6.82297877797012 -3.49689042764634 A:G A G 10 0.524844521382317 0.124086328149616 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 15 18 33 7.12733217926525 9.4472013848817 -2.31986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.486957322619883 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 3152769 C/G 1 29 30 59 13.7795088799128 15.7453356414695 -1.9658267615567 C:G C G 10 0.524844521382317 0.696113226567446 ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3152722_3152809:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3152722_3152903:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3152722_3153429:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3152722_3152879:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3152722_3153812:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3152722_3153296:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000464040:exon_3152722_3153280:BPHL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 3850630 G/C 1 37 35 72 17.5807527088543 18.3695582483811 -0.78880553952682 C:G G C 10 0.524844521382317 0.906267242240003 ENSG00000145945:ENST00000380274:exon_3849620_3851551:FAM50B;ENSG00000145945:ENST00000380272:exon_3850023_3851551:FAM50B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4052230 A/G 1 11 3 14 5.22671026479451 1.57453356414695 3.65217670064756 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0616071016075417 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4052191_4052328:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4052191_4052328:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000481109:exon_4052191_4052328:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000463634:exon_4052191_4052328:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000466185:exon_4052216_4052328:PRPF4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4119492 T/C 1 11 25 36 5.22671026479451 13.1211130345579 -7.89440276976341 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0113101802711145 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4117542_4119509:PECI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4126380 G/A 1 23 5 28 10.9285760082067 2.62422260691158 8.30435340129512 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00189288010462922 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4125484_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4126369_4126471:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4125484_4126471:PECI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4133922 G/C 1 30 29 59 14.2546643585305 15.2204911200872 -0.965826761556702 C:G G C 10 0.524844521382317 0.896435128189525 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4135805 G/T 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4135745_4135825:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4135745_4135824:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4135745_4135809:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4135745_4135807:PECI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4892576 T/C 1 14 12 26 6.65217670064756 6.2981342565878 0.354042444059758 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000153046:ENST00000328908:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000483019:exon_4891947_4892581:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397588:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000449732:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000343762:exon_4891947_4892613:CDYL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4996265 T/C 1 13 9 22 6.17702122202988 4.72360069244085 1.45342052958903 T:C T C 10 0.524844521382317 0.67059722784726 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4996185_4996319:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4996185_4996319:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4996185_4996319:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4996185_4996319:RPP40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4996611 T/G 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 T:G T G 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4996456_4996654:RPP40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 12 16 28 5.7018657434122 8.39751234211707 -2.69564659870487 A:G A G 10 0.524844521382317 0.347115703840086 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 4999011 A/G 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 7246798 A/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:C A C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000124782:ENST00000379933:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000379938:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000349384:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000492574:exon_7246657_7247454:RREB1;ENSG00000124782:ENST00000274670:exon_7246704_7246805:RREB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 7602857 C/T 1 4 10 14 1.90062191447073 5.24844521382317 -3.34782329935244 T:C C T 10 0.524844521382317 0.106163918875083 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7602856_7602977:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7602856_7602977:SNRNP48 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 7609117 T/C 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7609058_7612091:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7609058_7609439:SNRNP48 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 33 16 49 15.6801307943835 8.39751234211707 7.28261845226647 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0445009389985171 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 11191206 G/A 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11190197_11191438:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000505589:exon_11191091_11191438:NEDD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 11213832 T/C 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 T:C T C 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 12123049 G/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 12123538 G/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 12164612 C/G 1 46 56 102 21.8571520164134 29.3912931974098 -7.53414118099633 C:G C G 10 0.524844521382317 0.138239219245764 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 13307903 C/T 1 23 11 34 10.9285760082067 5.77328973520549 5.15528627300122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0866780366501089 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13307832_13307977:TBC1D7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 13321179 C/T 1 28 31 59 13.3043534012951 16.2701801628518 -2.9658267615567 T:C C T 10 0.524844521382317 0.514915076109222 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13321140_13321301:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000428109:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000416436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379291:exon_13321140_13321327:TBC1D7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 13321321 A/C 1 40 37 77 19.0062191447073 19.4192472911457 -0.413028146438403 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13321306_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000428109:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000416436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379291:exon_13321140_13321327:TBC1D7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 13592018 G/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124523:ENST00000379262:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000397350:exon_13591901_13592126:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13591901_13592126:SIRT5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 13711279 A/G 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G A G 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000010017:ENST00000011619:exon_13711167_13711796:RANBP9;ENSG00000010017:ENST00000283152:exon_13711167_13711953:RANBP9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 13791073 C/T 1 32 24 56 15.2049753157659 12.5962685131756 2.60870680259025 T:C C T 10 0.524844521382317 0.506442600417644 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13791020_13791096:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13791020_13791096:CCDC90A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 16327615 A/G 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 16328068 T/C 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C T C 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000124788:ENST00000244769:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000436367:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000450222:exon_16326625_16328701:ATXN1;ENSG00000124788:ENST00000379065:exon_16326625_16328574:ATXN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 17764731 G/C 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000137177:ENST00000378814:exon_17764386_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000502297:exon_17764386_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000259711:exon_17763924_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000378826:exon_17763926_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000378843:exon_17763926_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000399378:exon_17763928_17765177:KIF13A;ENSG00000137177:ENST00000378816:exon_17763928_17765177:KIF13A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 21065450 A/G 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 A:G A G 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 21595998 C/T 1 38 9 47 18.055908187472 4.72360069244085 13.3323074950311 T:C C T 10 0.524844521382317 9.66086259708264e-05 ENSG00000124766:ENST00000244745:exon_21593972_21598847:SOX4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 24781719 G/C 1 25 20 45 11.8788869654421 10.4968904276463 1.38199653779574 A:C:G G C 10 0.524844521382317 0.765909330497689 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 24781735 C/T 1 22 18 40 10.453420529589 9.4472013848817 1.00621914470732 T:C C T 10 0.524844521382317 0.874475168298225 ENSG00000112312:ENST00000356509:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000230056:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378054:exon_24781705_24781849:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000476555:exon_24781705_24781772:GMNN;ENSG00000112312:ENST00000378059:exon_24781705_24781849:GMNN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 24843097 A/C 1 39 43 82 18.5310636660896 22.5683144194396 -4.03725075334999 A:C A C 10 0.524844521382317 0.378801153357076 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000473070:exon_24843090_24843364:FAM65B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 24843527 C/T 1 45 30 75 21.3819965377957 15.7453356414695 5.63666089632623 T:C C T 10 0.524844521382317 0.204854829293055 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 26370762 G/T 1 35 1 36 16.6304417516189 0.524844521382317 16.1055972302366 T:G G T 10 0.524844521382317 4.68159118835052e-09 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26370719_26370831:BTN3A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 26468319 C/T 1 14 15 29 6.65217670064756 7.87266782073475 -1.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.711938142382318 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 191 183 374 90.7546964159775 96.046547412964 -5.29185099698654 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.604773530839267 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 26 32 58 12.3540424440598 16.7950246842341 -4.44098224017438 A:G A G 10 0.524844521382317 0.292878082431024 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 49 47 96 23.2826184522665 24.6676925049689 -1.38507405270243 A:G A G 10 0.524844521382317 0.83821970468444 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 27775986 C/T 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000196747:ENST00000358739:exon_27775899_27776429:HIST1H2AI HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 28251716 T/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:T T A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28251533_28251986:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28251553_28251986:PGBD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 28264717 C/T 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 T:C C T 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28264593_28264722:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28264593_28264722:PGBD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 46 14 60 21.8571520164134 7.34782329935244 14.509328717061 A:C C A 10 0.524844521382317 0.000143734358554094 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 96 49 145 45.6149259472976 25.7173815477335 19.897544399564 C:G G C 10 0.524844521382317 0.00111030019669864 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 88 39 127 41.8136821183561 20.4689363339104 21.3447457844457 A:G A G 10 0.524844521382317 0.000166998400093637 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 65 40 105 30.8851061101494 20.9937808552927 9.89132525485672 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0629187595462981 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 517 673 1190 245.655382445342 353.220362890299 -107.564980444957 A:T:G G A 10 0.524844521382317 4.74782087363299e-10 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 19 32 51 9.02795409373598 16.7950246842341 -7.76707059049816 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0348551048500502 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 18 31 49 8.5527986151183 16.2701801628518 -7.71738154773353 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0314637640226297 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 24 18 42 11.4037314868244 9.4472013848817 1.95653010194269 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.643622119541074 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 21 10 31 9.97826505097134 5.24844521382317 4.72981983714817 A:C A C 10 0.524844521382317 0.105743903071191 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 21 9 30 9.97826505097134 4.72360069244085 5.25466435853049 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0668269988343185 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29910679 G/A 1 2151 150 2301 1022.05943450664 78.7266782073475 943.332756299289 A:G G A 10 0.524844521382317 0 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 29911326 A/G 1 5 15 20 2.37577739308842 7.87266782073475 -5.49689042764634 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0226256809064239 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30036927 G/C 1 60 46 106 28.509328717061 24.1428479835866 4.3664807334744 C:G G C 10 0.524844521382317 0.436922059265383 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30036881_30038110:PPP1R11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 48 47 95 22.8074629736488 24.6676925049689 -1.86022953132011 T:C T C 10 0.524844521382317 0.758202594229378 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 41 56 97 19.481374623325 29.3912931974098 -9.90991857408475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0528953038343635 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30229013 A/G 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30229457 C/T 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 C C 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30229463 G/A 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 G G 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30230085 T/C 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30231071 G/A 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512655373125665 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30231108 G/T 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:G G T 10 0.524844521382317 0.394824033037 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30231224 G/A 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.369838454129304 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30297529 T/C 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000449040:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000428728:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30297088_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000420746:exon_30297306_30297547:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30297359_30297547:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30297359_30297547:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30309508 T/C 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000204599:ENST00000396551:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376656:exon_30309489_30311505:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396548:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000376659:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000396547:exon_30309489_30311506:TRIM39;ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30309489_30309673:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30309489_30309673:XXbac-BPG283O16.8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 48 17 65 22.8074629736488 8.92235686349939 13.8851061101494 T:G T G 10 0.524844521382317 0.000673756005165622 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 48 17 65 22.8074629736488 8.92235686349939 13.8851061101494 A:C C A 10 0.524844521382317 0.000673756005165622 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30314598 C/T 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 C C 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30457671 C/T 1 759 802 1561 360.643008270821 420.925306148618 -60.2822978777968 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.00234963024549222 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 768 866 1634 364.919407578381 454.515355517087 -89.5959479387059 A:G G A 10 0.524844521382317 1.01915141869320e-05 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 45 34 79 21.3819965377957 17.8447137269988 3.53728281079696 A:G G A 10 0.524844521382317 0.433276766049139 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30569951 G/A 1 51 42 93 24.2329294095018 22.0434698980573 2.18945951144452 A:G G A 10 0.524844521382317 0.678879522814148 ENSG00000204569:ENST00000376511:exon_30569713_30570468:PPP1R10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30585690 A/C 1 158 177 335 75.0745656215939 92.8974802846701 -17.8229146630762 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0554266417663474 ENSG00000204568:ENST00000259873:exon_30585486_30585720:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000492316:exon_30585620_30585720:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472267:exon_30585629_30585720:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000376508:exon_30585637_30585720:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472229:exon_30585637_30585720:MRPS18B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30622519 G/A 1 51 38 89 24.2329294095018 19.944091812528 4.28883759697379 A:G G A 10 0.524844521382317 0.396542508721255 ENSG00000204560:ENST00000376442:exon_30622483_30622656:DHX16;ENSG00000204560:ENST00000376437:exon_30622483_30622656:DHX16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30656398 T/C 1 65 92 157 30.8851061101494 48.2856959671732 -17.4005898570238 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00641881569450109 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30671452 T/C 1 40 43 83 19.0062191447073 22.5683144194396 -3.56209527473231 T:C T C 10 0.524844521382317 0.443818263709458 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30671398_30671598:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30671760 C/T 1 43 53 96 20.4316855805604 27.8167596332628 -7.38507405270243 T:C C T 10 0.524844521382317 0.152257024868651 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30671195_30671858:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30671969 G/C 1 36 52 88 17.1055972302366 27.2919151118805 -10.1863178816439 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0326218886715161 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30672718 G/A 1 25 43 68 11.8788869654421 22.5683144194396 -10.6894274539976 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0105098570987377 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30673113 G/T 1 35 15 50 16.6304417516189 7.87266782073475 8.75777393088415 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0154183093098398 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30673422 A/G 1 31 20 51 14.7298198371482 10.4968904276463 4.23292940950184 A:G A G 10 0.524844521382317 0.263322750768099 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30673489 G/C 1 22 33 55 10.453420529589 17.3198692056165 -6.86644867602743 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0784841540877836 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30676046 C/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 C:G C G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30675343_30676134:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30675343_30676134:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30680562 G/A 1 12 8 20 5.7018657434122 4.19875617105854 1.50310957235366 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.655495661698291 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30680608 C/T 1 12 14 26 5.7018657434122 7.34782329935244 -1.64595755594024 T:C C T 10 0.524844521382317 0.559962886005581 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30679651_30681131:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30679651_30681131:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30681749 C/T 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30681580_30681960:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30681580_30681960:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30681580_30681960:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30681580_30681960:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30681580_30681960:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000452213:exon_30681580_30681960:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000416571:exon_30681610_30681960:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000425072:exon_30681717_30681960:MDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30691490 G/A 1 2424 2137 4561 1151.77688016926 1121.59274219401 30.1841379752523 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.373746332280401 ENSG00000196230:ENST00000327892:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000422827:exon_30691488_30692174:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000444378:exon_30691434_30692174:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000330914:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000396389:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000396384:exon_30691117_30693203:TUBB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30697931 T/C 1 297 308 605 141.121177149452 161.652112585754 -20.5309354363018 A:T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.0952850462505772 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30697799_30697963:FLOT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30882689 C/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30882803 G/A 1 11 14 25 5.22671026479451 7.34782329935244 -2.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.428460468329696 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30893728 C/T 1 43 34 77 20.4316855805604 17.8447137269988 2.58697185356159 T:C C T 10 0.524844521382317 0.570510780123423 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893657_30893785:VARS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 52 33 85 24.7080848881195 17.3198692056165 7.38821568250306 A:G G A 10 0.524844521382317 0.128042534934267 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 64 52 116 30.4099506315317 27.2919151118805 3.11803551965123 A:T T A 10 0.524844521382317 0.57825713742422 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31116220 G/A 1 12 11 23 5.7018657434122 5.77328973520549 -0.0714239917932904 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 15 6 21 7.12733217926525 3.1490671282939 3.97826505097134 A:G G A 10 0.524844521382317 0.124172769860965 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31116502 C/T 1 31 20 51 14.7298198371482 10.4968904276463 4.23292940950184 T:C C T 10 0.524844521382317 0.263322750768099 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116395_31116505:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116395_31116505:CCHCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31118511 T/G 1 21 19 40 9.97826505097134 9.97204590626402 0.00621914470732143 T:G T G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 21 21 42 9.97826505097134 11.0217349490287 -1.04346989805731 C:G G C 10 0.524844521382317 0.759816463092589 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 26 28 54 12.3540424440598 14.6956465987049 -2.34160415464512 A:G G A 10 0.524844521382317 0.586420480746217 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 21 20 41 9.97826505097134 10.4968904276463 -0.518625376674995 T:C C T 10 0.524844521382317 0.877221735051787 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31170608 C/T 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.567300048342317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 3360 700 4060 1596.52240815541 367.391164967622 1229.13124318779 T:C:G T C 10 0.524844521382317 4.94065645841247e-324 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 3625 336 3961 1722.4386099891 176.347759184459 1546.09085080464 T:C:G C G 10 0.524844521382317 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31237333 T/A 0 24 0 24 11.4037314868244 0 11.4037314868244 T T 10 0.524844521382317 2.08410419081695e-07 ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31239363 C/T 0 62 0 62 29.4596396742963 0 29.4596396742963 C C 10 0.524844521382317 5.02360229677675e-18 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 2451 6 2457 1164.60607809194 3.1490671282939 1161.45701096365 A:T:C:G T G 10 0.524844521382317 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 2726 175 2901 1295.2738347118 91.8477912419055 1203.4260434699 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 264 2385 2649 125.441046355068 1251.75418349683 -1126.31313714176 C:G C G 10 0.524844521382317 0 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 29 17 46 13.7795088799128 8.92235686349939 4.85715201641342 T:C C T 10 0.524844521382317 0.183820478006571 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 37 5 42 17.5807527088543 2.62422260691158 14.9565301019427 T:C T C 10 0.524844521382317 1.34594978293127e-06 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 1362 368 1730 647.161761877284 193.142783868693 454.018978008592 A:C:G G A 10 0.524844521382317 2.34097495489657e-113 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31431780 T/G 1 78 72 150 37.0621273321793 37.7888055395268 -0.72667820734754 T:G T G 10 0.524844521382317 0.934934211911864 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 73 58 131 34.6863499390909 30.4409822401744 4.24536769891647 T:C C T 10 0.524844521382317 0.484682843614379 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31474820 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31474799_31475077:MICB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31477681 A/G 1 9 16 25 4.27639930755915 8.39751234211707 -4.12111303455792 A:G A G 10 0.524844521382317 0.111345252115818 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31477559_31478901:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31477559_31478901:MICB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 148 151 299 70.3230108354171 79.2515227287299 -8.92851189331277 T:C T C 10 0.524844521382317 0.324955704795739 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 219 212 431 104.059049817273 111.267038533051 -7.20798871577861 A:C C A 10 0.524844521382317 0.499745639073739 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31548451 A/G 1 236 239 475 112.136692953773 125.437840610374 -13.3011476566006 A:G A G 10 0.524844521382317 0.232339227082393 ENSG00000227507:ENST00000483972:exon_31548302_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000429299:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000446745:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31548401_31548940:LTB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31549556 T/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:G T G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31549336_31550183:LTB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31556922 C/T 1 12 17 29 5.7018657434122 8.92235686349939 -3.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.266620142972611 ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31557791 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376071:exon_31557752_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 31594771 A/G 1 48 32 80 22.8074629736488 16.7950246842341 6.01243828941464 A:G A G 10 0.524844521382317 0.181510309787703 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31594759_31594975:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31594759_31594924:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000464890:exon_31594759_31594851:BAT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32095955 A/G 1 81 64 145 38.4875937680323 33.5900493684683 4.89754439956404 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.454466593935394 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32095894_32096017:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32095903_32096030:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375192:exon_32095894_32096017:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32095894_32096017:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32095894_32095999:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32095894_32095995:ATF6B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32097551 T/G 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:G T G 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32147478 G/T 1 53 36 89 25.1832403667372 18.8944027697634 6.28883759697379 A:T:G G T 10 0.524844521382317 0.203056817540059 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000487940:exon_32147428_32147550:RNF5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32149260 C/T 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C C T 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000204305:ENST00000469940:exon_32149128_32149412:AGER HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32410210 T/C 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 T:C T C 10 0.524844521382317 0.692551486497706 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32410215 T/C 1 12 15 27 5.7018657434122 7.87266782073475 -2.17080207732256 T:C T C 10 0.524844521382317 0.444663614174346 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:C T C 10 0.524844521382317 0.567300048342317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 1785 1704 3489 848.152529332564 894.335064435468 -46.1825351029039 A:T:C:G A C 10 0.524844521382317 0.118895625106963 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 T:C T C 10 0.524844521382317 0.177001750415867 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 3914 3975 7889 1859.75854330961 2086.25697249471 -226.498429185098 T:G T G 10 0.524844521382317 3.45925549142313e-07 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32632832 A/T 1 1553 867 2420 737.916458293262 455.040200038469 282.876258254793 A:T A T 10 0.524844521382317 4.42765875513013e-31 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000529407:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 34 45 79 16.1552862730012 23.6180034622043 -7.46271718920304 T:C T C 10 0.524844521382317 0.114214680289908 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32810884 G/A 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.34980607938192 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32814942 C/T 1 224 191 415 106.434827210361 100.245303584023 6.18952362633846 T:C C T 10 0.524844521382317 0.555596659747497 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 295 303 598 140.170866192216 159.027889978842 -18.8570237866255 T:C T C 10 0.524844521382317 0.129748474030140 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32815488 G/A 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.613976791497016 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32816772 C/A 1 273 349 622 129.717445662627 183.170737962429 -53.4532922998012 A:C:G C A 10 0.524844521382317 1.99960515046419e-05 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32816429_32817919:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32816767_32816895:TAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 196 166 362 93.1304738090659 87.1241905494646 6.00628325960126 T:C T C 10 0.524844521382317 0.562741907759875 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 162 176 338 76.9751875360647 92.3726357632878 -15.3974482272231 A:G G A 10 0.524844521382317 0.102178006024225 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 30 28 58 14.2546643585305 14.6956465987049 -0.440982240174385 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32946034 T/C 1 174 178 352 82.6770532794769 93.4223248060524 -10.7452715265756 T:C T C 10 0.524844521382317 0.262547588667553 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32948031 G/A 1 15 16 31 7.12733217926525 8.39751234211707 -1.27018016285183 A:G G A 10 0.524844521382317 0.720479372385213 ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32947319_32948241:BRD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 35 35 70 16.6304417516189 18.3695582483811 -1.73911649676219 T:C C T 10 0.524844521382317 0.72029523081255 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 32975869 G/A 1 52 31 83 24.7080848881195 16.2701801628518 8.43790472526769 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0780716742138048 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975790_32976014:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975790_32975901:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000374813:exon_32975790_32975871:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32975838_32976181:HLA-DOA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33036980 G/C 1 1599 1534 3133 759.773610309675 805.111495800474 -45.3378854907991 A:T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.107410170763939 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33041299 C/T 1 337 356 693 160.127396294159 186.844649612105 -26.7172533179456 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0437953005282365 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33041248_33041446:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33041248_33041392:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33041248_33041378:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33041248_33041414:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33041248_33041549:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33041216_33041410:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000417724:exon_33041279_33041487:HLA-DPA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33162451 G/A 1 49 55 104 23.2826184522665 28.8664486760274 -5.58383022376096 A:G G A 10 0.524844521382317 0.281577128404514 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33161365_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33161365_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33161997_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483821:exon_33162441_33162606:RXRB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33163451 G/A 1 45 32 77 21.3819965377957 16.7950246842341 4.58697185356159 A:G G A 10 0.524844521382317 0.306748337628885 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33170149 T/C 1 62 76 138 29.4596396742963 39.8881836250561 -10.4285439507597 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0879190753795236 ENSG00000112473:ENST00000444757:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000445037:exon_33170040_33170204:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000463972:exon_33170032_33170204:SLC39A7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 67 58 125 31.8354170673848 30.4409822401744 1.39443482721038 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.857982879463051 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33281292 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33287183 T/C 1 183 150 333 86.953452587036 78.7266782073475 8.22677437968845 T:C T C 10 0.524844521382317 0.380279791417283 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33382818 G/A 1 70 52 122 33.2608835032378 27.2919151118805 5.96896839135733 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.318723636504022 ENSG00000112511:ENST00000487667:exon_33382732_33382858:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374512:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374516:exon_33382732_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000439397:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000495509:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000486845:exon_33382502_33382921:PHF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33385953 A/G 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000112514:ENST00000374500:exon_33385864_33386094:CUTA;ENSG00000112514:ENST00000440279:exon_33385646_33386065:CUTA;ENSG00000112514:ENST00000374485:exon_33385864_33386065:CUTA;ENSG00000112514:ENST00000492510:exon_33385864_33385964:CUTA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33648228 C/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33648106_33648231:ITPR3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33651129 C/T 1 12 3 15 5.7018657434122 1.57453356414695 4.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0384636259591238 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33650984_33651174:ITPR3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 44 28 72 20.9068410591781 14.6956465987049 6.21119446047318 A:G G A 10 0.524844521382317 0.157324715626547 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 33740592 C/T 1 12 2 14 5.7018657434122 1.04968904276463 4.65217670064756 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0144338887716702 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 23 18 41 10.9285760082067 9.4472013848817 1.481374623325 A:C C A 10 0.524844521382317 0.754951921506181 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 36334397 C/T 1 38 16 54 18.055908187472 8.39751234211707 9.65839584535489 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0092425094105497 ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36333971_36334539:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36333971_36334539:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36333972_36334539:ETV7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 36334426 G/T 1 34 6 40 16.1552862730012 3.1490671282939 13.0062191447073 T:G G T 10 0.524844521382317 2.17441755978310e-05 ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36333971_36334539:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36333971_36334539:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36333972_36334539:ETV7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 36341234 C/T 1 19 13 32 9.02795409373598 6.82297877797012 2.20497531576586 T:C C T 10 0.524844521382317 0.482276506766734 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36341230_36341355:ETV7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 36341294 C/T 1 12 16 28 5.7018657434122 8.39751234211707 -2.69564659870487 T:C C T 10 0.524844521382317 0.347115703840086 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36341230_36341355:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36341230_36341355:ETV7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 36355372 T/C 1 19 6 25 9.02795409373598 3.1490671282939 5.87888696544208 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0256872170689486 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36355313_36356164:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36355313_36356164:ETV7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 214 221 435 101.683272424184 115.990639225492 -14.3073668013079 A:C C A 10 0.524844521382317 0.178896216903510 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 9 18 27 4.27639930755915 9.4472013848817 -5.17080207732256 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0539771459392411 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 15 13 28 7.12733217926525 6.82297877797012 0.304353401295125 T:C:G C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 37139086 G/C 1 28 12 40 13.3043534012951 6.2981342565878 7.00621914470732 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0271684561024926 ENSG00000137193:ENST00000373507:exon_37138901_37139267:PIM1;ENSG00000137193:ENST00000373509:exon_37138901_37139267:PIM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 4 12 16 1.90062191447073 6.2981342565878 -4.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0420487835421222 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 41303592 T/C 0 20 0 20 9.50310957235366 0 9.50310957235366 T T 10 0.524844521382317 2.85956041623882e-06 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41303393_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41303527_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41303589_41303666:NCR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 41318438 A/G 1 10 2 12 4.75155478617683 1.04968904276463 3.7018657434122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0413693580129535 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41318416_41318596:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41318416_41318625:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41318416_41318602:NCR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 115 134 249 54.6428800410335 70.3291658652305 -15.6862858241969 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0491551081644828 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 92 82 174 43.7143040328268 43.03725075335 0.677053279476844 A:C A C 10 0.524844521382317 0.939608286830142 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42182080 T/C 1 25 25 50 11.8788869654421 13.1211130345579 -1.24222606911585 T:C T C 10 0.524844521382317 0.777835451745786 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42182018_42182082:MRPS10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42236429 T/C 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42235892_42237586:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42235892_42237586:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42235892_42237586:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42235892_42237586:TRERF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42532102 C/T 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000024048:ENST00000372903:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42531800_42532135:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372883:exon_42532058_42532135:UBR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42627434 G/A 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 A:G G A 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 A:T T A 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 52 49 101 24.7080848881195 25.7173815477335 -1.00929665961401 T:C C T 10 0.524844521382317 0.84285434122363 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42932715 C/T 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C C T 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42992724 C/G 1 32 34 66 15.2049753157659 17.8447137269988 -2.63973841123292 C:G C G 10 0.524844521382317 0.539475787852711 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 27 20 47 12.8291979226774 10.4968904276463 2.3323074950311 T:C T C 10 0.524844521382317 0.560169878726423 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 31 23 54 14.7298198371482 12.0714239917933 2.65839584535488 C:G C G 10 0.524844521382317 0.498162030811838 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 136 131 267 64.6211450920049 68.7546323010835 -4.13348720907862 A:G A G 10 0.524844521382317 0.624382513377214 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43005729 C/T 1 49 43 92 23.2826184522665 22.5683144194396 0.714304032826838 T:C C T 10 0.524844521382317 0.917110111638886 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43005355_43005749:CUL7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 25 34 59 11.8788869654421 17.8447137269988 -5.9658267615567 T:C C T 10 0.524844521382317 0.151011613527424 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43015940 G/A 1 12 4 16 5.7018657434122 2.09937808552927 3.60248765788293 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.0825793217037308 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43015886_43015991:CUL7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43156322 G/A 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G G A 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000112659:ENST00000252050:exon_43156261_43156453:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000515773:exon_43156261_43156453:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000451399:exon_43155451_43156696:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000354495:exon_43156261_43156453:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000372647:exon_43156261_43156453:CUL9;ENSG00000112659:ENST00000510282:exon_43155451_43156696:CUL9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43480825 C/T 1 54 47 101 25.6583958453549 24.6676925049689 0.990703340385988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.92070734418116 ENSG00000137207:ENST00000372422:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000510102:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000259737:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000504851:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000506469:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000509315:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000490447:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000503147:exon_43480499_43480930:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000503972:exon_43480807_43480836:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000514627:exon_43480807_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000460547:exon_43480204_43481371:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000512713:exon_43480807_43480969:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000455768:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000416380:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000372417:exon_43480807_43480938:YIPF3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 85 53 138 40.3882156825031 27.8167596332628 12.5714560492403 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0331716842475235 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 34 52 86 16.1552862730012 27.2919151118805 -11.1366288388793 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0174157691217691 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43582091 A/T 1 28 60 88 13.3043534012951 31.490671282939 -18.1863178816439 A:T A T 10 0.524844521382317 0.000104620598210253 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43590408 G/A 1 20 16 36 9.50310957235366 8.39751234211707 1.10559723023659 A:G G A 10 0.524844521382317 0.741507923506718 ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 29 39 68 13.7795088799128 20.4689363339104 -6.68942745399755 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.114805332607981 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 43970827 G/A 1 41 53 94 19.481374623325 27.8167596332628 -8.3353850099378 A:G G A 10 0.524844521382317 0.098138810806685 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 44222584 A/G 1 96 126 222 45.6149259472976 66.1304096941719 -20.5154837468744 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00705344225122298 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222443_44222810:SLC35B2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 46108916 C/G 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000001561:ENST00000321037:exon_46108789_46108959:ENPP4;ENSG00000001561:ENST00000371401:exon_46108789_46108959:ENPP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 47576937 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198087:ENST00000359314:exon_47576859_47577040:CD2AP;ENSG00000198087:ENST00000486693:exon_47576859_47577249:CD2AP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 49415448 C/T 1 19 7 26 9.02795409373598 3.67391164967622 5.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0477771026383253 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49415383_49415498:MUT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 52129514 G/A 1 114 120 234 54.1677245624159 62.981342565878 -8.81361800346217 A:G G A 10 0.524844521382317 0.265916647187225 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52128807_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000421471:exon_52129419_52129584:MCM3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 52268008 T/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:G T G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000170915:ENST00000512121:exon_52267960_52268347:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000442253:exon_52267960_52272575:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000361841:exon_52267960_52272574:PAQR8;ENSG00000170915:ENST00000360726:exon_52267960_52272489:PAQR8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 52357109 C/T 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000096093:ENST00000371068:exon_52357068_52357344:EFHC1;ENSG00000096093:ENST00000480623:exon_52357068_52357298:EFHC1;ENSG00000096093:ENST00000481466:exon_52357068_52357344:EFHC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 52546712 T/C 1 15 20 35 7.12733217926525 10.4968904276463 -3.36955824838109 T:C T C 10 0.524844521382317 0.310246399938527 ENSG00000096092:ENST00000211314:exon_52546611_52546712:TMEM14A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 56417545 T/C 1 3 7 10 1.42546643585305 3.67391164967622 -2.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.208583822897317 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 56492845 A/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000446842:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000439203:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000520645:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000518935:exon_56492797_56492959:DST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 17 0 17 8.07764313650061 0 8.07764313650061 G G 10 0.524844521382317 2.06066849715211e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 A A 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 11 11 0 5.77328973520549 -5.77328973520549 A G A 10 0.524844521382317 0.000278736057018616 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 C T C 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 66803591 A/G 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 A A 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 70672731 T/G 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:G T G 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000082293:ENST00000322773:exon_70672718_70672762:COL19A1;ENSG00000082293:ENST00000483745:exon_70672718_70672762:COL19A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 71269632 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000082269:ENST00000418814:exon_71269419_71270877:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000370479:exon_71269419_71270875:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505769:exon_71269419_71270735:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000457062:exon_71269419_71270727:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000361499:exon_71269419_71270362:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000194672:exon_71269419_71270874:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000442251:exon_71269419_71270873:FAM135A;ENSG00000082269:ENST00000505675:exon_71269419_71270874:FAM135A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 18 20 38 8.5527986151183 10.4968904276463 -1.94409181252804 A:G A G 10 0.524844521382317 0.626687508296695 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 71569962 C/T 1 33 23 56 15.6801307943835 12.0714239917933 3.60870680259025 T:C C T 10 0.524844521382317 0.351946844714068 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71569903_71570869:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71569903_71570869:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71569903_71571718:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71569903_71570207:SMAP1;ENSG00000112309:ENST00000230053:exon_71566382_71571452:B3GAT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 72006512 T/C 1 11 3 14 5.22671026479451 1.57453356414695 3.65217670064756 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0616071016075417 ENSG00000119900:ENST00000370435:exon_72006375_72006520:OGFRL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 17 12 29 8.07764313650061 6.2981342565878 1.77950887991281 T:C C T 10 0.524844521382317 0.579322019188849 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74161503 A/G 1 13 10 23 6.17702122202988 5.24844521382317 0.92857600820671 A:G A G 10 0.524844521382317 0.835349552103723 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74161801 G/T 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74161248_74161982:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74161248_74161999:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74161248_74161999:C6orf150 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 30 40 70 14.2546643585305 20.9937808552927 -6.73911649676219 A:G A G 10 0.524844521382317 0.119841511941802 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74229258 G/T 1 16 8 24 7.60248765788293 4.19875617105854 3.40373148682439 T:G G T 10 0.524844521382317 0.219804585617063 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74354175 C/T 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000119899:ENST00000355773:exon_74354130_74354326:SLC17A5;ENSG00000119899:ENST00000393019:exon_74354130_74354326:SLC17A5;ENSG00000119899:ENST00000481996:exon_74354130_74354186:SLC17A5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74497152 G/A 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 A:G G A 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74496957_74497175:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74496957_74497175:CD109 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74521947 C/T 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74521928_74521993:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74521928_74521993:CD109 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 74533192 T/G 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 T:G T G 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000156535:ENST00000422508:exon_74533182_74538040:CD109;ENSG00000156535:ENST00000287097:exon_74533182_74534789:CD109 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 80736148 A/G 1 5 14 19 2.37577739308842 7.34782329935244 -4.97204590626402 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0358228143741496 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80736098_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80736098_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80736095_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000515751:exon_80736095_80736231:TTK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 82882103 C/T 1 46 44 90 21.8571520164134 23.0931589408219 -1.23600692440853 T:C C T 10 0.524844521382317 0.833180452151922 ENSG00000005700:ENST00000306270:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000505222:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000508381:exon_82882097_82883295:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000445419:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000451512:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503400:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503631:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000510291:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000471036:exon_82882097_82882229:IBTK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 82943970 A/G 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000005700:ENST00000306270:exon_82943876_82943972:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000505222:exon_82943876_82943972:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503400:exon_82943876_82943972:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503631:exon_82943876_82943972:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000510291:exon_82943876_82943972:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000369751:exon_82943876_82943972:IBTK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 83074624 C/T 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000146242:ENST00000369750:exon_83074340_83080545:TPBG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 87964553 G/A 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000466062:exon_87964368_87964767:ZNF292 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 87968243 G/A 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 87969341 G/A 1 30 35 65 14.2546643585305 18.3695582483811 -4.1148938898506 A:G G A 10 0.524844521382317 0.322492508042395 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 87970734 A/G 1 51 62 113 24.2329294095018 32.5403603257037 -8.30743091620182 A:G A G 10 0.524844521382317 0.131680372981611 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 87971068 T/C 1 32 35 67 15.2049753157659 18.3695582483811 -3.16458293261524 T:C T C 10 0.524844521382317 0.464574990952113 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 88279282 T/C 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88279235_88279308:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88279235_88279308:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88279235_88279308:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000451155:exon_88279235_88279308:RARS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 88362943 C/T 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000135336:ENST00000392844:exon_88362834_88362967:ORC3;ENSG00000135336:ENST00000452292:exon_88362834_88362967:ORC3;ENSG00000135336:ENST00000257789:exon_88362834_88362967:ORC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 89793686 C/T 1 157 166 323 74.5994101429762 87.1241905494646 -12.5247804064884 T:C C T 10 0.524844521382317 0.164158844248253 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 96034844 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96034278_96034859:MANEA;ENSG00000172469:ENST00000369293:exon_96034278_96035257:MANEA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 96054262 G/A 1 8 18 26 3.80124382894146 9.4472013848817 -5.64595755594024 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0305375198276518 ENSG00000172469:ENST00000358812:exon_96053624_96057333:MANEA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 96997651 C/T 1 9 18 27 4.27639930755915 9.4472013848817 -5.17080207732256 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0539771459392411 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96997545_96997675:KIAA0776 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 97613163 T/C 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 T:C T C 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000146263:ENST00000275053:exon_97613122_97613333:MMS22L;ENSG00000146263:ENST00000369251:exon_97613122_97613333:MMS22L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 99817513 C/T 1 14 17 31 6.65217670064756 8.92235686349939 -2.27018016285183 T:C C T 10 0.524844521382317 0.473797754482654 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99817280_99817696:COQ3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 99817601 A/G 1 20 26 46 9.50310957235366 13.6459575559402 -4.14284798358658 A:G A G 10 0.524844521382317 0.239689192830905 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99817276_99817696:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99817280_99817696:COQ3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 99819379 T/C 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99819304_99819463:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369240:exon_99819304_99819463:COQ3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 99831613 C/T 1 1 15 16 0.475155478617683 7.87266782073475 -7.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.000159214330416052 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99831574_99831700:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99831574_99831700:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99831574_99831700:COQ3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 99893938 T/C 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 T:C T C 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000123552:ENST00000392738:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000500704:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000496518:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000327681:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000369233:exon_99893673_99894339:USP45;ENSG00000123552:ENST00000513344:exon_99893838_99894339:USP45 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 85 98 183 40.3882156825031 51.4347630954671 -11.046547412964 T:C C T 10 0.524844521382317 0.103968789377998 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 106555025 G/A 1 19 18 37 9.02795409373598 9.4472013848817 -0.419247291145727 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 106967185 A/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:C A C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106967006_106969328:AIM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 106967833 G/A 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:G G A 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106967006_106969328:AIM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 107100138 G/T 1 12 23 35 5.7018657434122 12.0714239917933 -6.36955824838109 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0409318289176349 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107100084_107100259:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107100084_107100259:QRSL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 107390730 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000178409:ENST00000369042:exon_107386386_107392154:BEND3;ENSG00000178409:ENST00000429433:exon_107386401_107392154:BEND3;ENSG00000178409:ENST00000339644:exon_107389803_107392154:BEND3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 108233929 G/A 1 9 2 11 4.27639930755915 1.04968904276463 3.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0690160807603609 ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000423697:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000429168:exon_108233920_108233978:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000484803:exon_108233920_108233978:SEC63 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 29 38 67 13.7795088799128 19.944091812528 -6.16458293261524 T:G G T 10 0.524844521382317 0.142860130617800 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 90 77 167 42.7639930755915 40.4130281464384 2.35096492915306 T:G G T 10 0.524844521382317 0.756818433293906 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 80 63 143 38.0124382894146 33.065204847086 4.94723344232868 A:G G A 10 0.524844521382317 0.451267855049497 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 17 35 52 8.07764313650061 18.3695582483811 -10.2919151118805 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00508693260525252 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 18 18 36 8.5527986151183 9.4472013848817 -0.89440276976341 T:C T C 10 0.524844521382317 0.86782104725156 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 111346808 G/A 1 9 14 23 4.27639930755915 7.34782329935244 -3.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.216326895269441 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111346606_111347303:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111346606_111347231:RPF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 111498724 C/T 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000112394:ENST00000368851:exon_111498415_111498868:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000368853:exon_111498415_111498868:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000419619:exon_111498415_111498868:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000439288:exon_111498415_111498915:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000465319:exon_111498415_111498915:SLC16A10;ENSG00000112394:ENST00000368850:exon_111498415_111498868:SLC16A10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 112021421 T/A 1 13 1 14 6.17702122202988 0.524844521382317 5.65217670064756 A:T T A 10 0.524844521382317 0.00213797850171758 ENSG00000010810:ENST00000354650:exon_112021307_112021471:FYN;ENSG00000010810:ENST00000368667:exon_112021307_112021471:FYN;ENSG00000010810:ENST00000496864:exon_112021307_112021471:FYN;ENSG00000010810:ENST00000476769:exon_112021307_112021471:FYN;ENSG00000010810:ENST00000495935:exon_112021138_112021471:FYN;ENSG00000010810:ENST00000467899:exon_112021390_112021471:FYN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 116600816 G/A 1 19 22 41 9.02795409373598 11.546579470411 -2.518625376675 A:G G A 10 0.524844521382317 0.439415065816683 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 116758318 T/G 1 18 43 61 8.5527986151183 22.5683144194396 -14.0155158043213 T:G T G 10 0.524844521382317 0.00043659072531341 ENSG00000111817:ENST00000452085:exon_116756750_116759445:DSE;ENSG00000111817:ENST00000331677:exon_116756750_116759442:DSE;ENSG00000111817:ENST00000359564:exon_116756750_116759440:DSE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 116977861 T/C 1 24 10 34 11.4037314868244 5.24844521382317 6.15528627300122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0390640795595463 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116977847_116978015:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116977847_116978015:ZUFSP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 127608727 C/T 1 21 25 46 9.97826505097134 13.1211130345579 -3.14284798358658 T:C C T 10 0.524844521382317 0.378322049364377 ENSG00000118518:ENST00000368314:exon_127607761_127609703:RNF146;ENSG00000118518:ENST00000356799:exon_127607761_127609712:RNF146;ENSG00000118518:ENST00000309649:exon_127607761_127609502:RNF146;ENSG00000118518:ENST00000433349:exon_127607761_127609502:RNF146 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 132781890 T/C 1 25 28 53 11.8788869654421 14.6956465987049 -2.8167596332628 T:C T C 10 0.524844521382317 0.49246843890553 ENSG00000079950:ENST00000434788:exon_132778663_132781989:STX7;ENSG00000079950:ENST00000367941:exon_132779054_132781989:STX7;ENSG00000079950:ENST00000309255:exon_132780881_132781989:STX7;ENSG00000079950:ENST00000448348:exon_132781712_132781989:STX7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 133078563 G/T 1 19 11 30 9.02795409373598 5.77328973520549 3.25466435853049 T:G G T 10 0.524844521382317 0.27466732949558 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000528801:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133078555_133078685:VNN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 10 19 29 4.75155478617683 9.97204590626402 -5.22049112008719 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0625786547301105 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 135787339 T/C 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000531788:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000327035:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000417892:exon_135786952_135787511:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000524469:exon_135786952_135787511:AHI1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 136597174 G/A 0 143 0 143 67.9472334423287 0 67.9472334423287 G G 10 0.524844521382317 1.32322374701858e-40 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 152 0 152 72.2236327498878 0 72.2236327498878 T T 10 0.524844521382317 3.37997565365274e-43 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 162 0 162 76.9751875360647 0 76.9751875360647 A A 10 0.524844521382317 4.83870924766976e-46 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 162 0 162 76.9751875360647 0 76.9751875360647 A A 10 0.524844521382317 4.83870924766976e-46 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 115 0 115 54.6428800410335 0 54.6428800410335 G G 10 0.524844521382317 6.91816823990747e-33 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 146 0 146 69.3726998781817 0 69.3726998781817 T T 10 0.524844521382317 1.79085301135531e-41 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 136599458 C/T 0 125 0 125 59.3944348272104 0 59.3944348272104 C C 10 0.524844521382317 1.04745833588153e-35 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 136980386 T/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136980357_136980516:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136980357_136980516:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136980357_136980516:MAP3K5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 138196066 T/G 1 44 26 70 20.9068410591781 13.6459575559402 7.26088350323781 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0936928432918133 ENSG00000118503:ENST00000420009:exon_138195982_138196172:TNFAIP3;ENSG00000118503:ENST00000237289:exon_138195982_138196172:TNFAIP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 138413269 A/G 1 14 6 20 6.65217670064756 3.1490671282939 3.50310957235366 A:G A G 10 0.524844521382317 0.177768189897055 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 138413333 G/C 1 17 16 33 8.07764313650061 8.39751234211707 -0.31986920561646 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 143074700 T/C 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C T C 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143072604_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143072605_143075068:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143072606_143075068:HIVEP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 143090734 T/C 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C T C 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000010818:ENST00000367604:exon_143090689_143096262:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000367603:exon_143090689_143096262:HIVEP2;ENSG00000010818:ENST00000012134:exon_143090689_143096262:HIVEP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 143823074 A/G 1 48 36 84 22.8074629736488 18.8944027697634 3.91306020388538 A:G A G 10 0.524844521382317 0.444760607755092 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 144183376 T/C 1 66 66 132 31.3602615887671 34.6397384112329 -3.27947682246584 T:C T C 10 0.524844521382317 0.601440955825308 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144183241_144183380:LTV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 145948826 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000112425:ENST00000367519:exon_145946441_145948829:EPM2A;ENSG00000112425:ENST00000392304:exon_145948626_145948829:EPM2A;ENSG00000112425:ENST00000324857:exon_145946448_145948829:EPM2A;ENSG00000112425:ENST00000435470:exon_145948624_145948829:EPM2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 146127029 T/C 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 T:C T C 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000118496:ENST00000237281:exon_146125508_146127557:FBXO30 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 149262510 C/T 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 T:C C T 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000111962:ENST00000367463:exon_149262415_149262570:UST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 149395144 C/T 1 17 14 31 8.07764313650061 7.34782329935244 0.729819837148174 T:C C T 10 0.524844521382317 0.858443645066449 ENSG00000111962:ENST00000367463:exon_149394969_149398126:UST;ENSG00000111962:ENST00000466695:exon_149394969_149395386:UST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 149795706 G/T 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000178199:ENST00000416573:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000389942:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409806:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000409948:exon_149795375_149795749:ZC3H12D;ENSG00000178199:ENST00000462655:exon_149795375_149795749:ZC3H12D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 151336090 C/G 1 22 23 45 10.453420529589 12.0714239917933 -1.61800346220426 C:G C G 10 0.524844521382317 0.6566337577171 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336016_151336116:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336016_151336116:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336016_151336116:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336016_151336116:MTHFD1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 33 31 64 15.6801307943835 16.2701801628518 -0.590049368468286 C:G G C 10 0.524844521382317 0.900983591621374 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 151766807 C/T 1 20 13 33 9.50310957235366 6.82297877797012 2.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.387107242437572 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 151789598 G/A 1 20 13 33 9.50310957235366 6.82297877797012 2.68013079438354 A:G G A 10 0.524844521382317 0.387107242437572 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211;ENSG00000146476:ENST00000494826:exon_151789478_151789677:C6orf211 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 153294223 C/T 1 27 21 48 12.8291979226774 11.0217349490287 1.80746297364879 T:C C T 10 0.524844521382317 0.665677360166854 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153294181_153294271:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153294181_153294271:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000477822:exon_153293407_153295120:FBXO5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 153296370 G/A 1 35 33 68 16.6304417516189 17.3198692056165 -0.689427453997553 A:G G A 10 0.524844521382317 0.903706099655471 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 153603515 G/T 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:G G T 10 0.524844521382317 0.151956249002583 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 153603782 G/A 0 7979 18 7997 3791.26556389049 9.4472013848817 3781.81836250561 T:C:G G T 10 0.524844521382317 4.94065645841247e-324 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 155575607 G/A 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155575553_155575707:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155575553_155575707:TIAM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 155577823 C/T 1 32 23 55 15.2049753157659 12.0714239917933 3.13355132397257 T:C C T 10 0.524844521382317 0.420678735144786 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 155577967 G/A 1 25 27 52 11.8788869654421 14.1708020773226 -2.29191511188048 A:G G A 10 0.524844521382317 0.579560397579122 ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155577618_155578854:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000318981:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456144:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000367174:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000360366:exon_155577618_155578857:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000529824:exon_155577618_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155577618_155579221:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000528391:exon_155577594_155578324:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000456877:exon_155577618_155578334:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000275246:exon_155577618_155578354:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155577618_155579216:TIAM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 31 29 60 14.7298198371482 15.2204911200872 -0.490671282939019 T:C C T 10 0.524844521382317 0.898083520792394 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 19 15 34 9.02795409373598 7.87266782073475 1.15528627300122 A:C A C 10 0.524844521382317 0.733885013169074 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 157527482 A/C 1 37 48 85 17.5807527088543 25.1925370263512 -7.61178431749694 A:C A C 10 0.524844521382317 0.103963281394182 ENSG00000049618:ENST00000350026:exon_157527301_157530284:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000346085:exon_157527301_157529495:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000367148:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000275248:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000414678:exon_157527301_157530401:ARID1B;ENSG00000049618:ENST00000445852:exon_157527301_157529204:ARID1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 158330765 G/A 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000130340:ENST00000392185:exon_158330697_158330822:SNX9;ENSG00000130340:ENST00000252631:exon_158330697_158330822:SNX9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 85 80 165 40.3882156825031 41.9875617105854 -1.59934602808229 T:C C T 10 0.524844521382317 0.815507468285916 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 160494315 C/T 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160494245_160494501:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160494245_160494501:IGF2R HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 166572045 C/T 1 130 75 205 61.7702122202988 39.3633391036738 22.406873116625 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00201746230284681 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 139 71 210 66.0466115278579 37.2639610181445 28.7826505097134 A:T:C C T 10 0.524844521382317 7.46004321962052e-05 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 166580188 G/A 1 101 57 158 47.990703340386 29.9161377187921 18.0745656215939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00406198107552779 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166580080_166580344:T HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 166720830 C/T 1 57 19 76 27.0838622812079 9.97204590626402 17.1118163749439 T:C C T 10 0.524844521382317 7.43230596578705e-05 ENSG00000176381:ENST00000322583:exon_166719168_166721871:PRR18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 166721211 G/T 1 38 47 85 18.055908187472 24.6676925049689 -6.61178431749694 T:G G T 10 0.524844521382317 0.159021014572676 ENSG00000176381:ENST00000322583:exon_166719168_166721871:PRR18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 166738072 C/T 1 100 141 241 47.5155478617683 74.0030775149067 -26.4875296531384 T:C C T 10 0.524844521382317 0.000763530089078018 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166738025_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166738025_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166737849_166738083:SFT2D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 166743706 G/A 1 50 34 84 23.7577739308842 17.8447137269988 5.91306020388538 A:G G A 10 0.524844521382317 0.229392538260400 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166743649_166743735:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166743649_166743735:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166743649_166743735:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166743649_166743735:SFT2D1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 167040463 A/G 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 A:G A G 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000071242:ENST00000265678:exon_167040409_167040731:RPS6KA2;ENSG00000071242:ENST00000366863:exon_167040409_167040725:RPS6KA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 351 938 1289 166.779572994807 492.304161056613 -325.524588061807 A:T:C:G A G 10 0.524844521382317 1.34565049956703e-75 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 168349011 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 168349121 T/G 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 T:G T G 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000511637:exon_168348973_168349158:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000509296:exon_168348709_168349158:MLLT4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 170059580 C/A 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170059547_170059614:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170059547_170059614:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170059547_170059614:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170059547_170059614:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170059547_170059614:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170059547_170059614:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170059547_170059614:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170059547_170059614:WDR27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 170162537 C/T 1 3 12 15 1.42546643585305 6.2981342565878 -4.87266782073475 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0171387439018236 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170162525_170162627:C6orf70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 170168222 T/C 1 9 4 13 4.27639930755915 2.09937808552927 2.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.274574826477275 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170167111_170168267:C6orf70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 170639604 G/C 1 8 16 24 3.80124382894146 8.39751234211707 -4.59626851317561 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0673884929405873 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170639537_170639638:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170639537_170639638:FAM120B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 38 46 84 18.055908187472 24.1428479835866 -6.08693979611462 A:T A T 10 0.524844521382317 0.191277785989875 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 188 163 351 89.3292299801244 85.5496569853177 3.77957299480674 C:G G C 10 0.524844521382317 0.708485046925788 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 6 170892759 T/A 1 27 37 64 12.8291979226774 19.4192472911457 -6.59004936846828 A:T T A 10 0.524844521382317 0.104789546104313 ENSG00000071994:ENST00000392090:exon_170892593_170892835:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000167218:exon_170892593_170892835:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170892593_170892835:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170892593_170892835:PDCD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 810139 C/G 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 C:G C G 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 893125 A/G 1 4 11 15 1.90062191447073 5.77328973520549 -3.87266782073475 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0673337384606321 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_893046_893222:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_893046_893255:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_891884_893255:SUN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 1511273 C/T 1 41 30 71 19.481374623325 15.7453356414695 3.73603898185549 T:C C T 10 0.524844521382317 0.406769349612138 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1511207_1511277:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1511207_1511277:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000493446:exon_1511207_1511277:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000483196:exon_1511207_1511277:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000479671:exon_1511207_1511397:INTS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 1523735 G/A 1 14 14 28 6.65217670064756 7.34782329935244 -0.695646598704876 A:G G A 10 0.524844521382317 0.851171689520466 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1523639_1523806:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1523639_1523806:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1523639_1523806:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000468115:exon_1523639_1523806:INTS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 1533513 A/G 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G A G 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1533390_1533547:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1533390_1533547:INTS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2290643 C/T 1 47 39 86 22.3323074950311 20.4689363339104 1.86337116112074 T:C C T 10 0.524844521382317 0.746375838207938 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2419944 G/T 1 336 287 623 159.652240815541 150.630377636725 9.02186317881652 T:G G T 10 0.524844521382317 0.47064860594906 ENSG00000106263:ENST00000360876:exon_2419839_2420378:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000397011:exon_2419914_2420380:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000314800:exon_2419914_2420077:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000475415:exon_2419839_2420375:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000468611:exon_2419914_2420375:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000465670:exon_2419029_2420375:EIF3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2472730 G/A 1 46 50 96 21.8571520164134 26.2422260691158 -4.38507405270243 A:G G A 10 0.524844521382317 0.413863619721950 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 120 89 209 57.018657434122 46.7111624030262 10.3074950310958 T:C T C 10 0.524844521382317 0.166018019303701 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 54 37 91 25.6583958453549 19.4192472911457 6.23914855420916 T:C T C 10 0.524844521382317 0.208351125185063 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 95 70 165 45.1397704686799 36.7391164967622 8.40065397191771 T:C T C 10 0.524844521382317 0.212285770047989 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2951824 A/G 1 49 44 93 23.2826184522665 23.0931589408219 0.189459511444522 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2951806_2951930:CARD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 33 19 52 15.6801307943835 9.97204590626402 5.70808488811952 A:T:C T C 10 0.524844521382317 0.127172101786293 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2959172 G/A 1 39 29 68 18.5310636660896 15.2204911200872 3.31057254600245 A:G G A 10 0.524844521382317 0.467141997210521 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2959006_2959246:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2959006_2959246:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2959114_2959246:CARD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 2969689 T/G 1 27 16 43 12.8291979226774 8.39751234211707 4.43168558056037 T:G T G 10 0.524844521382317 0.221609182316484 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2969626_2969708:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000355508:exon_2969626_2969694:CARD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 4794999 C/T 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 T:C C T 10 0.524844521382317 0.151956249002583 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4794868_4795014:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4794868_4795014:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4794868_4795014:KIAA0415 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 4798757 G/A 1 13 16 29 6.17702122202988 8.39751234211707 -2.22049112008719 A:G G A 10 0.524844521382317 0.45973512332539 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4798682_4798848:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4798682_4798848:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000496023:exon_4797640_4798848:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4798682_4798848:KIAA0415 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 4801861 C/T 1 17 21 38 8.07764313650061 11.0217349490287 -2.94409181252805 T:C C T 10 0.524844521382317 0.417135363310687 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4801815_4802171:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4801815_4811074:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4801815_4801891:KIAA0415 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 4823971 C/T 1 22 6 28 10.453420529589 3.1490671282939 7.30435340129512 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00702098221826894 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 4825307 T/A 1 29 19 48 13.7795088799128 9.97204590626402 3.80746297364879 A:T T A 10 0.524844521382317 0.312598278217653 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 4825314 C/T 1 28 20 48 13.3043534012951 10.4968904276463 2.80746297364879 T:C C T 10 0.524844521382317 0.471157720032553 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5254173 G/A 1 36 28 64 17.1055972302366 14.6956465987049 2.40995063153171 A:G G A 10 0.524844521382317 0.617129185638796 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000485854:exon_5254166_5254333:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000496867:exon_5254166_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000475309:exon_5253817_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5253900_5254335:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5254120_5254335:WIPI2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5410501 C/T 1 10 14 24 4.75155478617683 7.34782329935244 -2.59626851317561 T:C C T 10 0.524844521382317 0.312817090933246 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5410916 G/C 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 C:G G C 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5427517 G/A 1 6 10 16 2.8509328717061 5.24844521382317 -2.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.317320401681921 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5540769 A/C 1 2 8 10 0.950310957235366 4.19875617105854 -3.24844521382317 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0552185889205734 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5541657 G/A 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5568762 G/C 1 32 26 58 15.2049753157659 13.6459575559402 1.55901775982562 T:C:G G C 10 0.524844521382317 0.695782077398055 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000480301:exon_5568698_5569294:ACTB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 31 25 56 14.7298198371482 13.1211130345579 1.60870680259025 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.690306340969539 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 277 226 503 131.618067577098 118.614861832404 13.0032057446946 T:C T C 10 0.524844521382317 0.264370696102670 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 5792601 T/C 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 T:C T C 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000011275:ENST00000425013:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000447067:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000435728:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389902:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389900:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000458425:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000411812:exon_5792477_5792610:RNF216 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 6026864 G/A 1 27 19 46 12.8291979226774 9.97204590626402 2.85715201641342 A:G G A 10 0.524844521382317 0.461345236635833 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 6026988 G/A 1 19 30 49 9.02795409373598 15.7453356414695 -6.71738154773353 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0627401102217899 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 T:C T C 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 6193464 T/G 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 T:G T G 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193387_6193513:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 6194266 G/C 1 23 17 40 10.9285760082067 8.92235686349939 2.00621914470732 C:G G C 10 0.524844521382317 0.635407729912364 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 6370305 C/G 1 25 12 37 11.8788869654421 6.2981342565878 5.58075270885427 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0714196215699095 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 6370406 C/T 1 21 12 33 9.97826505097134 6.2981342565878 3.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.225009638406071 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 6732315 A/C 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000164631:ENST00000405858:exon_6728064_6732334:ZNF12;ENSG00000164631:ENST00000404360:exon_6732233_6732334:ZNF12;ENSG00000164631:ENST00000330442:exon_6728067_6732334:ZNF12;ENSG00000164631:ENST00000342651:exon_6732233_6732334:ZNF12;ENSG00000164631:ENST00000399476:exon_6732233_6732334:ZNF12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 7646720 A/G 1 75 91 166 35.6366608963262 47.7608514457908 -12.1241905494646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0623008926767106 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 32 13 45 15.2049753157659 6.82297877797012 8.38199653779574 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0160008410486225 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 17338887 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17338246_17338953:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17338307_17338953:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17338307_17338953:AHR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 17379110 G/A 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 A:G G A 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000106546:ENST00000242057:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000463496:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000401808:exon_17378610_17379852:AHR;ENSG00000106546:ENST00000492120:exon_17378610_17379151:AHR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 17838333 G/A 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000071189:ENST00000417048:exon_17838313_17838381:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409389:exon_17838313_17838381:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000428135:exon_17838313_17838381:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000242044:exon_17838313_17838381:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409076:exon_17838313_17838381:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000496855:exon_17838313_17838381:SNX13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 20193979 T/G 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 T:G T G 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20193816_20194004:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20193816_20194004:MACC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 20197918 T/G 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:G T G 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 20198917 G/T 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 T:G G T 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 20199093 T/C 1 8 4 12 3.80124382894146 2.09937808552927 1.7018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.394824033037 ENSG00000183742:ENST00000400331:exon_20197827_20199868:MACC1;ENSG00000183742:ENST00000332878:exon_20197827_20199868:MACC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 A:G G A 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 24745969 C/T 1 76 70 146 36.1118163749439 36.7391164967622 -0.627300121818273 T:C C T 10 0.524844521382317 0.93410668133938 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24745803_24745995:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24745803_24745995:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24745803_24745995:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24745803_24745995:DFNA5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 30065960 G/A 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000106080:ENST00000222803:exon_30065928_30066300:FKBP14;ENSG00000106080:ENST00000419018:exon_30065928_30066278:FKBP14;ENSG00000106080:ENST00000412494:exon_30065928_30066035:FKBP14;ENSG00000106080:ENST00000479939:exon_30065928_30066252:FKBP14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 30066091 G/C 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000106080:ENST00000222803:exon_30065928_30066300:FKBP14;ENSG00000106080:ENST00000419018:exon_30065928_30066278:FKBP14;ENSG00000106080:ENST00000479939:exon_30065928_30066252:FKBP14 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 32598656 C/T 1 7 11 18 3.32608835032378 5.77328973520549 -2.44720138488171 T:C C T 10 0.524844521382317 0.345634627073847 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000404479:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32598541_32599076:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32598541_32599076:AVL9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 32612837 T/C 1 18 20 38 8.5527986151183 10.4968904276463 -1.94409181252804 T:C T C 10 0.524844521382317 0.626687508296695 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000329714:exon_32612811_32613030:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000446718:exon_32612811_32613030:AVL9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 33015974 G/A 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000122642:ENST00000242209:exon_33015966_33016111:FKBP9;ENSG00000122642:ENST00000469202:exon_33015966_33016116:FKBP9;ENSG00000122642:ENST00000494374:exon_33015966_33016111:FKBP9;ENSG00000122642:ENST00000485309:exon_33015966_33016017:FKBP9;ENSG00000122642:ENST00000472007:exon_33015966_33016111:FKBP9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 33102267 C/T 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33102180_33102408:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33102180_33102409:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33102180_33102409:NT5C3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 35709842 C/T 1 18 5 23 8.5527986151183 2.62422260691158 5.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0195647809515236 ENSG00000122557:ENST00000396081:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000311350:exon_35709825_35709938:HERPUD2;ENSG00000122557:ENST00000413517:exon_35709825_35709938:HERPUD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 37272769 C/T 1 8 9 17 3.80124382894146 4.72360069244085 -0.922356863499388 T:C C T 10 0.524844521382317 0.809125944455852 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37272700_37272799:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37272710_37272799:ELMO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 16 17 33 7.60248765788293 8.92235686349939 -1.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.728380954880147 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 37936530 T/C 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000086288:ENST00000199447:exon_37936472_37936709:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000440017:exon_37936472_37936694:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000476435:exon_37936419_37936709:TXNDC3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 37988589 C/T 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000086289:ENST00000476620:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000425345:exon_37988442_37988650:EPDR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 38402517 C/T 1 10 1 11 4.75155478617683 0.524844521382317 4.22671026479451 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0127875069116162 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 38796570 G/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38796438_38796582:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38796438_38796582:VPS41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 88 103 191 41.8136821183561 54.0589857023786 -12.2453035840225 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0820194548324367 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 43917789 C/T 1 31 36 67 14.7298198371482 18.8944027697634 -4.16458293261524 T:C C T 10 0.524844521382317 0.32928630943923 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 44005528 C/T 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.77773533420984 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 164 141 305 77.9254984933 74.0030775149067 3.92242097839332 T:C T C 10 0.524844521382317 0.688275652487432 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 47 30 77 22.3323074950311 15.7453356414695 6.58697185356159 T:G G T 10 0.524844521382317 0.139288142880640 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 44121936 C/A 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 A:C C A 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44121850_44122063:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44121850_44122139:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44121850_44122089:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44121850_44122084:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44121850_44122113:POLM;ENSG00000122678:ENST00000434229:exon_44121850_44122082:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492605:exon_44121850_44122077:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492312:exon_44121850_44122083:POLM;ENSG00000122678:ENST00000492321:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000497300:exon_44121850_44122076:POLM;ENSG00000122678:ENST00000445616:exon_44121850_44122099:POLM;ENSG00000122678:ENST00000414235:exon_44121850_44122110:POLM;ENSG00000122678:ENST00000452049:exon_44121850_44122129:POLM;ENSG00000122678:ENST00000483644:exon_44121850_44122081:POLM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 44530193 T/G 1 35 39 74 16.6304417516189 20.4689363339104 -3.83849458229145 T:G T G 10 0.524844521382317 0.41565552910025 ENSG00000015676:ENST00000355451:exon_44530008_44530479:NUDCD3;ENSG00000015676:ENST00000464812:exon_44530008_44530205:NUDCD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 20 13 33 9.50310957235366 6.82297877797012 2.68013079438354 A:G A G 10 0.524844521382317 0.387107242437572 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 254 152 406 120.689491568891 79.7763672501122 40.9131243187793 A:G G A 10 0.524844521382317 4.43950564387e-05 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 45009723 G/A 1 239 175 414 113.562159389626 91.8477912419055 21.7143681477208 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.0342876067790106 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45009639_45009753:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009639_45009753:MYO1G HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 45016621 C/T 1 74 72 146 35.1615054177085 37.7888055395268 -2.62730012181827 T:C C T 10 0.524844521382317 0.679292414923644 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45016462_45016670:MYO1G HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 45104124 G/A 1 24 21 45 11.4037314868244 11.0217349490287 0.381996537795736 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 242 257 499 114.987625825479 134.885041995255 -19.8974161697762 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0803654569726562 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 64863392 C/T 1 9 16 25 4.27639930755915 8.39751234211707 -4.12111303455792 T:C C T 10 0.524844521382317 0.111345252115818 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 15 14 29 7.12733217926525 7.34782329935244 -0.220491120087193 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 18 30 48 8.5527986151183 15.7453356414695 -7.19253702635121 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0427931324482701 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 124 105 229 58.9192793485927 55.1086747451433 3.81060460344941 A:G A G 10 0.524844521382317 0.643485674035462 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 65439879 G/C 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 C:G G C 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65439282_65441147:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000489482:exon_65439513_65439993:GUSB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 T:C T C 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 66459256 T/C 1 36 51 87 17.1055972302366 26.7670705904982 -9.66147336026157 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0413456229738238 ENSG00000126524:ENST00000246868:exon_66459199_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000414306:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000454667:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000490953:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000463579:exon_66459207_66459353:SBDS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 23 20 43 10.9285760082067 10.4968904276463 0.431685580560371 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 70228020 G/T 1 5 19 24 2.37577739308842 9.97204590626402 -7.59626851317561 T:G G T 10 0.524844521382317 0.00189179272599482 ENSG00000158321:ENST00000406775:exon_70227856_70228327:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000342771:exon_70227856_70228327:AUTS2;ENSG00000158321:ENST00000416482:exon_70227856_70228327:AUTS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 72301284 T/C 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 T:C T C 10 0.524844521382317 1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 19 24 43 9.02795409373598 12.5962685131756 -3.56831441943963 C:G G C 10 0.524844521382317 0.288904812000227 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73151643 C/T 1 19 7 26 9.02795409373598 3.67391164967622 5.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0477771026383253 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73249165 T/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:T T A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000165171:ENST00000297873:exon_73248920_73249332:WBSCR27;ENSG00000165171:ENST00000434654:exon_73248926_73249332:WBSCR27 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73521469 G/A 1 16 23 39 7.60248765788293 12.0714239917933 -4.46893633391036 A:G G A 10 0.524844521382317 0.199027828793427 ENSG00000106683:ENST00000418310:exon_73521340_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000336180:exon_73521340_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000435201:exon_73521401_73521523:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000483414:exon_73521340_73521523:LIMK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73638035 A/G 1 9 3 12 4.27639930755915 1.57453356414695 2.7018657434122 A:G A G 10 0.524844521382317 0.151956249002583 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73668615 G/A 1 42 26 68 19.9565301019427 13.6459575559402 6.31057254600245 A:G G A 10 0.524844521382317 0.145017229534602 ENSG00000049541:ENST00000352131:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000055077:exon_73668601_73668774:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000493156:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000470266:exon_73668601_73668639:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000494019:exon_73668601_73668697:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000480432:exon_73668601_73668737:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000479105:exon_73668601_73668667:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000463194:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000473493:exon_73668601_73668706:RFC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73752812 C/T 1 24 17 41 11.4037314868244 8.92235686349939 2.481374623325 T:C C T 10 0.524844521382317 0.532225835483175 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73753025 G/A 1 49 26 75 23.2826184522665 13.6459575559402 9.63666089632623 A:G G A 10 0.524844521382317 0.02788124429667 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73753133 C/T 1 40 24 64 19.0062191447073 12.5962685131756 6.40995063153172 T:C C T 10 0.524844521382317 0.132609132698514 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73771780 T/C 1 25 10 35 11.8788869654421 5.24844521382317 6.63044175161891 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0274734943856512 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73771610_73771807:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73771610_73771807:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73771610_73771807:CLIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 73790826 C/T 1 25 18 43 11.8788869654421 9.4472013848817 2.43168558056037 T:C C T 10 0.524844521382317 0.542028308247613 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73790217_73791152:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000487091:exon_73790400_73791152:CLIP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 75583325 A/G 1 19 14 33 9.02795409373598 7.34782329935244 1.68013079438354 A:G A G 10 0.524844521382317 0.604302645486145 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 75614953 T/C 1 71 53 124 33.7360389818555 27.8167596332628 5.9192793485927 T:C T C 10 0.524844521382317 0.32271944437839 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 97 73 170 46.0900814259153 38.3136500609091 7.77643136500611 A:G G A 10 0.524844521382317 0.249612130163492 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 75615562 G/A 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 A:G G A 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615477_75616173:POR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 24 21 45 11.4037314868244 11.0217349490287 0.381996537795736 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 43 51 94 20.4316855805604 26.7670705904982 -6.3353850099378 A:G G A 10 0.524844521382317 0.215266423311971 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 76131695 A/G 1 22 30 52 10.453420529589 15.7453356414695 -5.29191511188048 A:G A G 10 0.524844521382317 0.165013629198802 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 76922490 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000135205:ENST00000285871:exon_76922269_76922517:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000431197:exon_76922269_76922517:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000415740:exon_76922269_76922517:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000461259:exon_76922269_76922517:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000474733:exon_76922269_76922517:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000478101:exon_76922269_76922517:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000488998:exon_76922370_76922517:CCDC146 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 76941168 G/A 1 7 12 19 3.32608835032378 6.2981342565878 -2.97204590626402 A:G G A 10 0.524844521382317 0.250211798338697 ENSG00000186088:ENST00000491796:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000482866:exon_76940069_76941519:PION;ENSG00000186088:ENST00000441833:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000474686:exon_76941158_76941257:PION HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 76984572 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000334003:exon_76984530_76984747:PION;ENSG00000186088:ENST00000434084:exon_76984530_76984601:PION HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 77379002 A/G 1 47 29 76 22.3323074950311 15.2204911200872 7.11181637494391 A:G A G 10 0.524844521382317 0.108673401124408 ENSG00000187257:ENST00000334955:exon_77378741_77379381:RSBN1L;ENSG00000187257:ENST00000445288:exon_77378741_77379381:RSBN1L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 58 47 105 27.5590177598256 24.6676925049689 2.89132525485672 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.625481780833078 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 89982132 T/C 1 17 15 32 8.07764313650061 7.87266782073475 0.204975315765857 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 16 22 38 7.60248765788293 11.546579470411 -3.94409181252805 T:G T G 10 0.524844521382317 0.255314267474421 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 89984417 A/G 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 A:G A G 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000474503:exon_89984400_89984544:GTPBP10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 35 17 52 16.6304417516189 8.92235686349939 7.70808488811952 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0368276741800767 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 20 24 44 9.50310957235366 12.5962685131756 -3.09315894082195 A:C C A 10 0.524844521382317 0.368570122421189 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 92734983 A/G 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G A G 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 92760738 T/G 1 53 54 107 25.1832403667372 28.3416041546451 -3.15836378790791 T:G T G 10 0.524844521382317 0.562349924511276 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 92762681 A/G 1 20 26 46 9.50310957235366 13.6459575559402 -4.14284798358658 A:G A G 10 0.524844521382317 0.239689192830905 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 17 20 37 8.07764313650061 10.4968904276463 -2.41924729114573 T:C C T 10 0.524844521382317 0.510921362092342 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 T:C T C 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 42 17 59 19.9565301019427 8.92235686349939 11.0341732384433 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00397173055250116 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 97599510 G/A 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512655373125665 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 47 23 70 22.3323074950311 12.0714239917933 10.2608835032378 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0162161881753657 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 97937105 G/T 1 27 24 51 12.8291979226774 12.5962685131756 0.232929409501835 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97937001_97937208:BAIAP2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 98645517 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000198742:ENST00000468960:exon_98645278_98645710:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000482799:exon_98645278_98645863:SMURF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99691393 G/A 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.369838454129304 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 71 50 121 33.7360389818555 26.2422260691158 7.49381291273965 A:T A T 10 0.524844521382317 0.202363387715674 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 77 57 134 36.5869718535616 29.9161377187921 6.67083413476952 A:G A G 10 0.524844521382317 0.261598237815941 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99725631 G/A 1 3 14 17 1.42546643585305 7.34782329935244 -5.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00575999753207545 ENSG00000214309:ENST00000398075:exon_99724991_99726118:MBLAC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 105 109 214 49.8913252548567 57.2080528306725 -7.31672757581583 A:G G A 10 0.524844521382317 0.33809887540694 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G A G 10 0.524844521382317 0.184542335086170 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99817650 G/A 1 27 26 53 12.8291979226774 13.6459575559402 -0.816759633262798 A:G G A 10 0.524844521382317 0.890883608117675 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99816240_99817651:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817336_99817651:PVRIG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99818436 G/A 1 56 67 123 26.6087068025902 35.1645829326152 -8.55587613002499 A:G G A 10 0.524844521382317 0.125685648416604 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99818383_99818443:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99818383_99818443:PVRIG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99956582 A/T 1 30 24 54 14.2546643585305 12.5962685131756 1.65839584535488 A:T A T 10 0.524844521382317 0.684579476813733 ENSG00000121716:ENST00000310771:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000444874:exon_99956522_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422752:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000420688:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000452089:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000457519:exon_99956313_99956631:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000448382:exon_99956522_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000443526:exon_99956313_99956631:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000419749:exon_99956313_99956631:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422808:exon_99956313_99956631:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000438028:exon_99956556_99956631:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000431140:exon_99956522_99956637:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000444073:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000413850:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000456998:exon_99956522_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000438231:exon_99956313_99956612:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000427221:exon_99956313_99956702:PILRB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 99956632 G/C 1 36 34 70 17.1055972302366 17.8447137269988 -0.739116496762186 C:G G C 10 0.524844521382317 0.905005895280187 ENSG00000121716:ENST00000310771:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000444874:exon_99956522_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000422752:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000420688:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000452089:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000448382:exon_99956522_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000431140:exon_99956522_99956637:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000444073:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000413850:exon_99956313_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000456998:exon_99956522_99956702:PILRB;ENSG00000121716:ENST00000427221:exon_99956313_99956702:PILRB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 100030649 C/T 1 60 65 125 28.509328717061 34.1148938898506 -5.60556517278962 T:C C T 10 0.524844521382317 0.325694162544359 ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100030542_100030760:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100030542_100030760:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100030542_100030760:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000471065:exon_100030611_100030760:MEPCE HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 100033148 A/G 1 156 136 292 74.1242546643586 71.3788549079951 2.74539975636345 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.769726375789449 ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000476185:exon_100032906_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100032982_100033156:C7orf47 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 100151719 G/A 1 22 26 48 10.453420529589 13.6459575559402 -3.19253702635121 A:G G A 10 0.524844521382317 0.387747958498637 ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100151716_100151881:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100151716_100151881:AGFG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 100175472 G/A 1 55 23 78 26.1335513239726 12.0714239917933 14.0621273321793 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00140106479904032 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 100212798 C/T 1 30 24 54 14.2546643585305 12.5962685131756 1.65839584535488 T:C C T 10 0.524844521382317 0.684579476813733 ENSG00000106330:ENST00000223054:exon_100212775_100212949:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000462372:exon_100212775_100213007:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000379527:exon_100212775_100212996:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393950:exon_100212775_100213007:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000424091:exon_100212775_100213007:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393953:exon_100212775_100212996:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000413493:exon_100212775_100212996:MOSPD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 102109349 T/C 1 37 31 68 17.5807527088543 16.2701801628518 1.31057254600245 T:C T C 10 0.524844521382317 0.808603494926336 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102109302_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 103844599 T/A 1 10 21 31 4.75155478617683 11.0217349490287 -6.27018016285183 A:T T A 10 0.524844521382317 0.0298941548727311 ENSG00000164815:ENST00000297431:exon_103844590_103844682:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000422497:exon_103844590_103844682:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000447452:exon_103844590_103844682:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000485726:exon_103844590_103844682:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000448563:exon_103844590_103844682:ORC5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 105182995 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000135249:ENST00000257700:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000467392:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000493041:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000497979:exon_105182939_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000477285:exon_105182855_105183003:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000493258:exon_105182687_105183096:RINT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 5 12 17 2.37577739308842 6.2981342565878 -3.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0863600801774899 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 107217020 G/A 1 22 25 47 10.453420529589 13.1211130345579 -2.6676925049689 A:G G A 10 0.524844521382317 0.467464911358237 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107216854_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000471763:exon_107216811_107217636:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107216811_107217037:DUS4L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 108119692 C/T 1 15 11 26 7.12733217926525 5.77328973520549 1.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.695987302704438 ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453085:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000481225:exon_108119628_108119756:PNPLA8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 23 28 51 10.9285760082067 14.6956465987049 -3.76707059049817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.327313311616106 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 17 18 35 8.07764313650061 9.4472013848817 -1.36955824838109 T:G T G 10 0.524844521382317 0.73571934593785 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 19 16 35 9.02795409373598 8.39751234211707 0.630441751618907 A:G G A 10 0.524844521382317 0.867082324177013 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 112407236 C/T 1 16 16 32 7.60248765788293 8.39751234211707 -0.795024684234143 T:C C T 10 0.524844521382317 0.860150442628282 ENSG00000146802:ENST00000312814:exon_112405787_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000454074:exon_112407140_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000447395:exon_112407191_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000418785:exon_112407230_112407799:TMEM168 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 115890187 A/G 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 A:G A G 10 0.524844521382317 0.613976791497016 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 116759743 G/A 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 A:G G A 10 0.524844521382317 0.692551486497706 ENSG00000004866:ENST00000393446:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000265437:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393451:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000438863:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000323984:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393449:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000446490:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000421345:exon_116759615_116759773:ST7;ENSG00000004866:ENST00000432298:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000422922:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000449366:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000487459:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393443:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000465133:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000477742:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393447:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393444:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000420755:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000490039:exon_116759615_116759774:ST7;ENSG00000004866:ENST00000489293:exon_116759740_116759774:ST7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 124464037 T/G 1 70 55 125 33.2608835032378 28.8664486760274 4.39443482721038 T:G T G 10 0.524844521382317 0.473984411786698 ENSG00000128513:ENST00000357628:exon_124462440_124464128:POT1;ENSG00000128513:ENST00000430927:exon_124463851_124464128:POT1;ENSG00000128513:ENST00000440969:exon_124462441_124464128:POT1;ENSG00000128513:ENST00000393329:exon_124462441_124464128:POT1;ENSG00000128513:ENST00000393326:exon_124462441_124464128:POT1;ENSG00000128513:ENST00000436534:exon_124464025_124464128:POT1;ENSG00000128513:ENST00000451720:exon_124463314_124464128:POT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 127222521 G/A 1 26 36 62 12.3540424440598 18.8944027697634 -6.54036032570365 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0998200563152857 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 127224286 A/G 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 A:G A G 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 127950815 C/T 1 32 21 53 15.2049753157659 11.0217349490287 4.1832403667372 T:C C T 10 0.524844521382317 0.273067212327304 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127950437_127950984:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000481788:exon_127950450_127950984:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127950533_127950984:RBM28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 128140982 T/C 1 22 12 34 10.453420529589 6.2981342565878 4.15528627300122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.171793638032549 ENSG00000165055:ENST00000262432:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000482555:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000480046:exon_128140957_128141022:METTL2B;ENSG00000165055:ENST00000481392:exon_128140957_128141022:METTL2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 26 25 51 12.3540424440598 13.1211130345579 -0.767070590498165 A:G A G 10 0.524844521382317 0.88886715961801 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 128582267 C/T 1 52 58 110 24.7080848881195 30.4409822401744 -5.73289735205487 T:C C T 10 0.524844521382317 0.294186295682984 ENSG00000128604:ENST00000489702:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000488569:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000477535:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000453794:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000479582:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000464557:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473787:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000467002:exon_128582125_128582313:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128582125_128582330:IRF5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 128582309 C/T 1 82 102 184 38.96274924665 53.5341411809963 -14.5713919343463 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0323960557174364 ENSG00000128604:ENST00000489702:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000488569:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000477535:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000453794:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000479582:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000464557:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473787:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000467002:exon_128582125_128582313:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128582125_128582330:IRF5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 128587740 C/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 128852187 G/A 1 20 9 29 9.50310957235366 4.72360069244085 4.77950887991281 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0936805033763996 ENSG00000128602:ENST00000249373:exon_128851865_128853386:SMO HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 129395022 C/T 1 9 11 20 4.27639930755915 5.77328973520549 -1.49689042764634 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512500587924667 ENSG00000106459:ENST00000353868:exon_129394858_129396920:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393232:exon_129394858_129396920:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393231:exon_129394858_129396920:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000223190:exon_129394858_129395855:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000311967:exon_129394858_129395855:NRF1;ENSG00000106459:ENST00000393230:exon_129394858_129396922:NRF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 129962414 C/T 1 2 11 13 0.950310957235366 5.77328973520549 -4.82297877797012 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0098834651021165 ENSG00000128510:ENST00000222482:exon_129962329_129964019:CPA4;ENSG00000128510:ENST00000493259:exon_129962329_129962961:CPA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 130144943 G/C 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130144780_130146127:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000437945:exon_130144780_130145194:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130144780_130145139:MEST HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 131128450 T/C 1 22 18 40 10.453420529589 9.4472013848817 1.00621914470732 T:C T C 10 0.524844521382317 0.874475168298225 ENSG00000128585:ENST00000421797:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000352689:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000388758:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000494785:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000458153:exon_131128240_131128461:MKLN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 133749340 G/A 1 18 25 43 8.5527986151183 13.1211130345579 -4.56831441943963 A:G G A 10 0.524844521382317 0.172207221811583 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 18 11 29 8.5527986151183 5.77328973520549 2.77950887991281 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.354681882687295 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 29 19 48 13.7795088799128 9.97204590626402 3.80746297364879 A:C A C 10 0.524844521382317 0.312598278217653 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 134893682 C/T 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C C T 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134893543_134893750:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134893543_134893750:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134893543_134893750:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134893543_134893750:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134893649_134893750:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134893543_134893750:WDR91 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 135047703 T/C 1 7 16 23 3.32608835032378 8.39751234211707 -5.07142399179329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.037721226567006 ENSG00000080802:ENST00000451834:exon_135046549_135047938:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000423368:exon_135046550_135047938:CNOT4;ENSG00000080802:ENST00000361528:exon_135047637_135047938:CNOT4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 135304273 G/C 1 24 27 51 11.4037314868244 14.1708020773226 -2.76707059049816 C:G G C 10 0.524844521382317 0.484440099085824 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135304171_135304438:NUP205 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 138266463 T/C 1 14 14 28 6.65217670064756 7.34782329935244 -0.695646598704876 T:C T C 10 0.524844521382317 0.851171689520466 ENSG00000122779:ENST00000343526:exon_138266442_138266516:TRIM24;ENSG00000122779:ENST00000415680:exon_138266442_138266516:TRIM24 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 A:G G A 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 138738204 G/A 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 138738274 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138738197_138738327:ZC3HAV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 138764804 G/A 1 16 12 28 7.60248765788293 6.2981342565878 1.30435340129513 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.706809371150625 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 138764878 C/G 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 C:G C G 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 139281572 G/A 1 21 37 58 9.97826505097134 19.4192472911457 -9.44098224017438 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0172138892689750 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139281463_139281744:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139281463_139281744:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139281463_139281744:HIPK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 27 16 43 12.8291979226774 8.39751234211707 4.43168558056037 C:G G C 10 0.524844521382317 0.221609182316484 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 139741573 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139741444_139741639:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139741444_139741639:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139741444_139741639:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000493262:exon_139741179_139741639:PARP12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 140380884 G/T 1 27 22 49 12.8291979226774 11.546579470411 1.28261845226647 T:G G T 10 0.524844521382317 0.775691937901988 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000498423:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000473512:exon_140380842_140380937:ADCK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 140394587 C/T 1 38 49 87 18.055908187472 25.7173815477335 -7.66147336026157 T:C C T 10 0.524844521382317 0.107735340104414 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140394463_140394921:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000473512:exon_140394463_140394881:ADCK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 142494327 G/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 142494785 C/A 1 12 1 13 5.7018657434122 0.524844521382317 5.17702122202988 A:C C A 10 0.524844521382317 0.00389453711171081 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 142494796 G/A 1 13 2 15 6.17702122202988 1.04968904276463 5.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0084264544748068 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 142991337 T/G 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:G T G 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000392923:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_142991323_142991417:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000481483:exon_142991323_142991574:CASP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 143002171 C/T 1 20 17 37 9.50310957235366 8.92235686349939 0.580752708854273 T:C C T 10 0.524844521382317 0.870899695467464 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_143002033_143004789:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_143002033_143002915:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000472067:exon_143002033_143003662:CASP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 143079940 C/T 1 149 161 310 70.7981663140348 84.499967942553 -13.7018016285183 T:C C T 10 0.524844521382317 0.124757573555917 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449630:exon_143079894_143080018:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079894_143080328:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000477373:exon_143079894_143080333:ZYX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 143080250 T/G 1 130 130 260 61.7702122202988 68.2297877797012 -6.45957555940242 T:G T G 10 0.524844521382317 0.456258694182314 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079894_143080328:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000477373:exon_143079894_143080333:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000436448:exon_143079943_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000446634:exon_143080093_143080415:ZYX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 143085637 T/C 1 158 126 284 75.0745656215939 66.1304096941719 8.94415592742199 T:C T C 10 0.524844521382317 0.312503511797443 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000446634:exon_143085582_143085751:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000497119:exon_143085582_143085690:ZYX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 148496375 C/T 1 40 41 81 19.0062191447073 21.518625376675 -2.51240623196767 T:C C T 10 0.524844521382317 0.580335796392865 ENSG00000055130:ENST00000409469:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000325222:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000433865:exon_148496367_148496480:CUL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 148506363 T/G 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 T:G T G 10 0.524844521382317 0.567300048342317 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 148708965 G/T 1 93 117 210 44.1894595114445 61.4068090017311 -17.2173494902866 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0187077719325198 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148708938_148709096:PDIA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 148712118 G/A 1 59 68 127 28.0341732384433 35.6894274539976 -7.65525421555425 A:G G A 10 0.524844521382317 0.183185311983522 ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148711996_148712134:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148711996_148712134:PDIA4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 148876581 C/T 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000197024:ENST00000420008:exon_148875740_148880116:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000426851:exon_148875740_148879894:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000475153:exon_148875740_148877557:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000483892:exon_148875740_148876975:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000491174:exon_148875740_148877030:ZNF398;ENSG00000197024:ENST00000335901:exon_148875740_148880116:ZNF398 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 149152828 G/C 1 27 20 47 12.8291979226774 10.4968904276463 2.3323074950311 C:G G C 10 0.524844521382317 0.560169878726423 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 149152860 G/A 1 29 19 48 13.7795088799128 9.97204590626402 3.80746297364879 A:G G A 10 0.524844521382317 0.312598278217653 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 149191568 C/T 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 T:C C T 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000181220:ENST00000340622:exon_149191295_149191594:ZNF746;ENSG00000181220:ENST00000458143:exon_149191295_149191594:ZNF746;ENSG00000181220:ENST00000461958:exon_149191295_149191595:ZNF746 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 149576735 C/T 1 37 43 80 17.5807527088543 22.5683144194396 -4.98756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 0.265794935859418 ENSG00000171130:ENST00000421974:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000456496:exon_149576424_149577782:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000425642:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000307445:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000429743:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000479613:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000471877:exon_149576424_149577783:ATP6V0E2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 17 33 50 8.07764313650061 17.3198692056165 -9.24222606911585 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0103372751444362 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 21 21 42 9.97826505097134 11.0217349490287 -1.04346989805731 A:G A G 10 0.524844521382317 0.759816463092589 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150066900 A/G 1 34 38 72 16.1552862730012 19.944091812528 -3.78880553952682 A:G A G 10 0.524844521382317 0.409470921956809 ENSG00000214022:ENST00000487455:exon_150066760_150067133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000473391:exon_150066760_150067691:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000495535:exon_150066760_150067223:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150066765_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000469309:exon_150066760_150067500:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150066733_150066957:REPIN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 28 22 50 13.3043534012951 11.546579470411 1.75777393088415 A:G A G 10 0.524844521382317 0.672288973573754 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 22 28 50 10.453420529589 14.6956465987049 -4.24222606911585 A:G G A 10 0.524844521382317 0.258222174655692 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150164234 A/G 1 14 5 19 6.65217670064756 2.62422260691158 4.02795409373598 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0697160540587325 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150163759_150164422:GIMAP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150164342 C/T 1 1 9 10 0.475155478617683 4.72360069244085 -4.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0086522953032472 ENSG00000171115:ENST00000307271:exon_150163759_150164422:GIMAP8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 7 14 21 3.32608835032378 7.34782329935244 -4.02173494902866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0847282864109202 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150269903 G/C 1 22 48 70 10.453420529589 25.1925370263512 -14.7391164967622 C:G G C 10 0.524844521382317 0.000453383832141278 ENSG00000133574:ENST00000255945:exon_150269217_150271041:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000461940:exon_150269217_150270602:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000412660:exon_150269566_150270148:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000494750:exon_150269217_150270026:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000466938:exon_150269564_150270308:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000430830:exon_150269217_150271040:GIMAP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150324976 T/C 1 24 20 44 11.4037314868244 10.4968904276463 0.906841059178054 T:C T C 10 0.524844521382317 0.880321279279752 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150325177 C/T 1 16 14 30 7.60248765788293 7.34782329935244 0.254664358530491 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150389593 T/C 1 47 41 88 22.3323074950311 21.518625376675 0.813682118356105 T:C T C 10 0.524844521382317 0.915166530742379 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 36 43 79 17.1055972302366 22.5683144194396 -5.46271718920304 C:G G C 10 0.524844521382317 0.259835029862430 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150439554 G/A 1 3 37 40 1.42546643585305 19.4192472911457 -17.9937808552927 A:G G A 10 0.524844521382317 1.93029165861164e-09 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150501516 A/G 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000002933:ENST00000484928:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000004103:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000494349:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000461345:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475536:exon_150501450_150501573:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475007:exon_150501450_150501573:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000474166:exon_150501450_150501769:TMEM176A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150741191 A/G 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 A:G A G 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150741058_150741308:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150741058_150741308:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150741058_150741308:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150741058_150741308:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150741058_150741233:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150741058_150741308:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150741058_150741308:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150741058_150741308:ABCB8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150765065 T/C 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150764961_150765141:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150764961_150765141:SLC4A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150773385 C/T 1 73 62 135 34.6863499390909 32.5403603257037 2.14598961338721 T:C C T 10 0.524844521382317 0.731014338209078 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150773374_150773613:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150773374_150773614:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150773374_150773609:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150773374_150773609:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150773374_150773610:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773374_150773611:SLC4A2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150835238 C/A 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 A:C C A 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000133612:ENST00000335355:exon_150835230_150835400:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397238:exon_150835230_150835400:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000485904:exon_150835230_150835373:AGAP3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 150931019 A/G 1 51 71 122 24.2329294095018 37.2639610181445 -13.0310316086427 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0185276265725261 ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 151800228 C/T 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000178234:ENST00000482812:exon_151800197_151800362:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000430044:exon_151800197_151800363:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000446096:exon_151800197_151800241:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000447778:exon_151800197_151800363:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000443352:exon_151800197_151800363:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000423337:exon_151800197_151800259:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000434507:exon_151800197_151800363:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000415421:exon_151800197_151801977:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000320311:exon_151800197_151800363:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000422997:exon_151800197_151800386:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000419245:exon_151800197_151800337:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000447796:exon_151800197_151800257:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000452146:exon_151800197_151800363:GALNT11 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 151845989 C/T 1 21 15 36 9.97826505097134 7.87266782073475 2.10559723023659 T:C C T 10 0.524844521382317 0.509070758298691 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151845118_151846237:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151845118_151846237:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151845118_151846237:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151845118_151846237:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151845118_151846237:MLL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 154767634 A/C 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 A:C A C 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000475066:exon_154767406_154768041:PAXIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 156469096 C/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 156469133 C/G 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 C:G C G 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000105982:ENST00000317955:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000405335:exon_156469113_156469789:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000311822:exon_156468989_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392747:exon_156469113_156469824:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000343665:exon_156469113_156469818:RNF32;ENSG00000105982:ENST00000392743:exon_156469113_156469818:RNF32 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 156755711 G/A 1 7 8 15 3.32608835032378 4.19875617105854 -0.872667820734755 A:G G A 10 0.524844521382317 0.797397833890785 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156755702_156755869:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000475176:exon_156755702_156756046:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000472491:exon_156755702_156755869:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000469271:exon_156755702_156756819:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000489850:exon_156755702_156756169:NOM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 10 9 19 4.75155478617683 4.72360069244085 0.0279540937359783 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 16 14 30 7.60248765788293 7.34782329935244 0.254664358530491 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 11 19 30 5.22671026479451 9.97204590626402 -4.74533564146951 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0997596100052063 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 11 15 26 5.22671026479451 7.87266782073475 -2.64595755594024 T:C T C 10 0.524844521382317 0.330500715640706 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 32 31 63 15.2049753157659 16.2701801628518 -1.06520484708597 A:G A G 10 0.524844521382317 0.802093555858814 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 39 37 76 18.5310636660896 19.4192472911457 -0.888183625056087 A:G G A 10 0.524844521382317 0.90868155545551 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 37 37 74 17.5807527088543 19.4192472911457 -1.83849458229145 C:G G C 10 0.524844521382317 0.727353437875293 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 28 17 45 13.3043534012951 8.92235686349939 4.38199653779574 T:C T C 10 0.524844521382317 0.232461537929957 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 17 11 28 8.07764313650061 5.77328973520549 2.30435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.451258947468562 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 21 12 33 9.97826505097134 6.2981342565878 3.68013079438354 A:G A G 10 0.524844521382317 0.225009638406071 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158540933 G/A 1 22 19 41 10.453420529589 9.97204590626402 0.481374623325005 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158540885_158540971:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158552234 G/A 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158552177_158552272:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158552177_158552272:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158555848 C/T 1 11 20 31 5.22671026479451 10.4968904276463 -5.27018016285183 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0713947315459997 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158555774_158555856:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158555774_158555856:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158555774_158555856:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158555774_158555856:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158590648 G/A 1 7 6 13 3.32608835032378 3.1490671282939 0.177021222029879 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000483958:exon_158590633_158590767:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000497111:exon_158590633_158590767:ESYT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 7 158706999 G/A 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:G G A 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158706924_158707012:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158706924_158707012:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158706924_158707012:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000467220:exon_158706924_158707012:WDR60 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 401330 C/T 1 9 8 17 4.27639930755915 4.19875617105854 0.0776431365006118 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_401269_401453:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_401269_401453:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_401269_401453:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_401269_401453:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_401269_401453:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524015:exon_401269_401380:FBXO25 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 1513989 A/G 1 6 21 27 2.8509328717061 11.0217349490287 -8.17080207732256 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00171277118899323 ENSG00000198010:ENST00000421627:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000356067:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000357934:exon_1513849_1514060:DLGAP2;ENSG00000198010:ENST00000520901:exon_1513849_1514060:DLGAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 6272399 G/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6272286_6272404:MCPH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 6302033 A/G 1 28 32 60 13.3043534012951 16.7950246842341 -3.49067128293902 A:G A G 10 0.524844521382317 0.369527167615889 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 6302106 C/A 1 29 37 66 13.7795088799128 19.4192472911457 -5.63973841123292 A:C C A 10 0.524844521382317 0.176356034995177 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 33 27 60 15.6801307943835 14.1708020773226 1.50932871706098 T:C C T 10 0.524844521382317 0.796270935482562 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 20 10 30 9.50310957235366 5.24844521382317 4.25466435853049 T:C C T 10 0.524844521382317 0.144094251343473 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 28 17 45 13.3043534012951 8.92235686349939 4.38199653779574 A:C C A 10 0.524844521382317 0.232461537929957 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 24 22 46 11.4037314868244 11.546579470411 -0.142847983586581 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 8185301 G/A 1 22 10 32 10.453420529589 5.24844521382317 5.20497531576586 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0766928270827685 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8185226_8185977:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8185226_8185977:AC068353.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 8748849 T/G 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:G T G 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8747571_8751155:MFHAS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 10623214 G/C 1 59 69 128 28.0341732384433 36.2142719753799 -8.18009873693657 C:G G C 10 0.524844521382317 0.157144160741042 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 10623361 C/G 1 34 30 64 16.1552862730012 15.7453356414695 0.409950631531714 C:G C G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10623333_10623426:PINX1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 11660362 T/C 1 124 150 274 58.9192793485927 78.7266782073475 -19.8073988587549 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0182009581698933 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 11683622 T/C 1 141 114 255 66.9969224850933 59.8322754375841 7.16464704750917 T:C T C 10 0.524844521382317 0.380556442026116 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/G 1 18 9 27 8.5527986151183 4.72360069244085 3.82919792267744 T:G T G 10 0.524844521382317 0.177382710428329 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17794792 G/A 1 16 25 41 7.60248765788293 13.1211130345579 -5.518625376675 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0877390638856194 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518936:exon_17794643_17794830:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17794685_17794888:PCM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17814167 T/C 1 25 24 49 11.8788869654421 12.5962685131756 -0.717381547733531 T:C T C 10 0.524844521382317 0.886757139632472 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814113_17814286:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814113_17814286:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814113_17814286:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814113_17814286:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814113_17814286:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814113_17814286:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814113_17814286:PCM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17817553 G/T 1 39 32 71 18.5310636660896 16.7950246842341 1.7360389818555 T:G G T 10 0.524844521382317 0.722380118515003 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17817926 A/G 1 27 15 42 12.8291979226774 7.87266782073475 4.95653010194269 A:G A G 10 0.524844521382317 0.163669221194965 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17817824_17817953:PCM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17817934 C/T 1 27 16 43 12.8291979226774 8.39751234211707 4.43168558056037 T:C C T 10 0.524844521382317 0.221609182316484 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817824_17817953:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17817824_17817953:PCM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17820714 A/T 1 8 16 24 3.80124382894146 8.39751234211707 -4.59626851317561 A:T A T 10 0.524844521382317 0.0673884929405873 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17824567 T/C 1 30 17 47 14.2546643585305 8.92235686349939 5.3323074950311 T:C T C 10 0.524844521382317 0.143884603987315 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17824489_17824679:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17824489_17824679:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17824489_17824679:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17824489_17824679:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17824489_17824679:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17824489_17824679:PCM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17883128 G/A 1 193 158 351 91.7050073732128 82.9254343784061 8.77957299480674 A:G G A 10 0.524844521382317 0.363780910936225 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523247:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000400012:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000522275:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519802:exon_17883053_17883167:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523896:exon_17883053_17883167:PCM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 17916924 G/A 1 96 110 206 45.6149259472976 57.7328973520549 -12.1179714047573 A:G G A 10 0.524844521382317 0.094307973274284 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17916850_17916973:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17916850_17916973:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17916850_17916973:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17916850_17916973:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17916850_17916973:ASAH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 20068099 G/A 1 17 5 22 8.07764313650061 2.62422260691158 5.45342052958903 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0303635933604656 ENSG00000147416:ENST00000276390:exon_20068080_20068157:ATP6V1B2;ENSG00000147416:ENST00000523482:exon_20068080_20068157:ATP6V1B2;ENSG00000147416:ENST00000523478:exon_20068080_20068157:ATP6V1B2;ENSG00000147416:ENST00000520830:exon_20068080_20068157:ATP6V1B2;ENSG00000147416:ENST00000519667:exon_20068080_20068157:ATP6V1B2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 22424595 T/A 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 A:T T A 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000120896:ENST00000240123:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000434297:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000517535:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523740:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000522315:exon_22424574_22424625:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000519453:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523900:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000518912:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000428103:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523965:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000521554:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000522721:exon_22424574_22424691:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000443610:exon_22424574_22424688:SORBS3;ENSG00000120896:ENST00000523348:exon_22424551_22424688:SORBS3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 22864475 G/A 1 42 20 62 19.9565301019427 10.4968904276463 9.45963967429635 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0213201761754525 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22864241_22865259:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22864241_22865259:RHOBTB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 22874892 A/G 1 43 53 96 20.4316855805604 27.8167596332628 -7.38507405270243 A:G A G 10 0.524844521382317 0.152257024868651 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22874765_22875954:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22874765_22877705:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22874765_22877712:RHOBTB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 36 56 92 17.1055972302366 29.3912931974098 -12.2856959671732 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0119274121018028 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 22888274 G/C 1 11 3 14 5.22671026479451 1.57453356414695 3.65217670064756 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0616071016075417 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22888272_22888385:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22888272_22888385:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22888272_22888385:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000518531:exon_22888272_22888385:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22888272_22888385:TNFRSF10B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 21 40 61 9.97826505097134 20.9937808552927 -11.0155158043213 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0066050269228968 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 25323777 T/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25323691_25323841:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25323691_25323841:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25323691_25323841:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000519087:exon_25323691_25323841:CDCA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 36 23 59 17.1055972302366 12.0714239917933 5.0341732384433 A:G G A 10 0.524844521382317 0.195405188592783 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 20 18 38 9.50310957235366 9.4472013848817 0.0559081874719567 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27255079 G/A 1 57 67 124 27.0838622812079 35.1645829326152 -8.08072065140731 A:G G A 10 0.524844521382317 0.151080918217767 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 66 57 123 31.3602615887671 29.9161377187921 1.44412386997501 A:G A G 10 0.524844521382317 0.856823313469298 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27279881 C/T 1 48 31 79 22.8074629736488 16.2701801628518 6.53728281079696 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.144840464958341 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27279821_27279902:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521000:exon_27279793_27279900:PTK2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27312040 C/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 269 202 471 127.816823748157 106.018593319228 21.7982304289287 A:G A G 10 0.524844521382317 0.047199507482098 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 273 196 469 129.717445662627 102.869526190934 26.8479194716933 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0141920188964387 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27358505 A/G 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 A A 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000120915:ENST00000521400:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518328:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000520623:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000517536:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000380476:exon_27358481_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000458037:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000415449:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000518379:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000520666:exon_27358445_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000521684:exon_27358443_27358527:EPHX2;ENSG00000120915:ENST00000523827:exon_27358443_27358527:EPHX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 32 21 53 15.2049753157659 11.0217349490287 4.1832403667372 C:G C G 10 0.524844521382317 0.273067212327304 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 28206695 C/T 1 15 18 33 7.12733217926525 9.4472013848817 -2.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.486957322619883 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28206642_28206745:FBXO16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 28206719 G/A 1 17 12 29 8.07764313650061 6.2981342565878 1.77950887991281 A:G G A 10 0.524844521382317 0.579322019188849 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28206642_28206745:FBXO16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 29195971 G/A 1 39 23 62 18.5310636660896 12.0714239917933 6.45963967429635 A:G G A 10 0.524844521382317 0.126380478398625 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29195799_29196018:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29195799_29196018:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29195799_29196018:DUSP4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 29927321 A/G 1 90 77 167 42.7639930755915 40.4130281464384 2.35096492915306 A:G A G 10 0.524844521382317 0.756818433293906 ENSG00000133872:ENST00000256255:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518174:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521265:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000520303:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000523127:exon_29927158_29927551:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518340:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518296:exon_29927158_29927465:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522794:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522055:exon_29927309_29927575:TMEM66 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 29931408 A/G 1 55 56 111 26.1335513239726 29.3912931974098 -3.25774187343718 A:G A G 10 0.524844521382317 0.569075538818837 ENSG00000133872:ENST00000256255:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518174:exon_29931393_29931567:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521265:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522794:exon_29931393_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522055:exon_29931393_29931504:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000523761:exon_29931393_29931544:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000517569:exon_29931210_29931571:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521083:exon_29931395_29931571:TMEM66 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 30623937 A/G 1 7 12 19 3.32608835032378 6.2981342565878 -2.97204590626402 A:G A G 10 0.524844521382317 0.250211798338697 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 30999280 G/T 1 15 9 24 7.12733217926525 4.72360069244085 2.40373148682439 T:G G T 10 0.524844521382317 0.414775891663106 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 37728019 T/G 1 19 21 40 9.02795409373598 11.0217349490287 -1.99378085529268 T:G T G 10 0.524844521382317 0.531894683283917 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 37729605 C/T 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 37729970 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 37730017 G/A 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 A:G G A 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37728796_37730697:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37728796_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 37963239 C/T 1 17 16 33 8.07764313650061 8.39751234211707 -0.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 37985897 A/G 1 16 11 27 7.60248765788293 5.77328973520549 1.82919792267744 A:G A G 10 0.524844521382317 0.565137057094518 ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000428278:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000521652:exon_37985809_37985976:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000524247:exon_37985858_37985976:ASH2L HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 38205385 G/A 1 48 36 84 22.8074629736488 18.8944027697634 3.91306020388538 A:G G A 10 0.524844521382317 0.444760607755092 ENSG00000147548:ENST00000433384:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000317025:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000527502:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000316985:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000419340:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000529223:exon_38205015_38205733:WHSC1L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 64 0 64 30.4099506315317 0 30.4099506315317 T T 10 0.524844521382317 1.35663359214126e-18 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 38704196 A/C 1 10 3 13 4.75155478617683 1.57453356414695 3.17702122202988 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0974591034582752 ENSG00000147526:ENST00000522548:exon_38703987_38704337:TACC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 38854663 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000168615:ENST00000466936:exon_38854388_38854679:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000481513:exon_38854505_38854679:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000487273:exon_38854505_38854679:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000481873:exon_38854545_38854679:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000468065:exon_38854545_38854679:ADAM9;ENSG00000168615:ENST00000379917:exon_38854545_38854679:ADAM9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 41355126 G/A 1 32 30 62 15.2049753157659 15.7453356414695 -0.540360325703652 A:G G A 10 0.524844521382317 0.899556830572128 ENSG00000147533:ENST00000518270:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000520817:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000276530:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000405786:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000523420:exon_41355028_41355180:GOLGA7;ENSG00000147533:ENST00000357743:exon_41355028_41355180:GOLGA7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 41530181 G/A 1 25 13 38 11.8788869654421 6.82297877797012 5.05590818747196 A:G G A 10 0.524844521382317 0.106770225838190 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41529872_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41530034_41530430:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41529872_41530430:ANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 41542093 G/A 1 8 13 21 3.80124382894146 6.82297877797012 -3.02173494902866 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.197904266837508 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41542062_41542208:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41542062_41542208:ANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 41543675 G/A 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41543670_41543801:ANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 41553997 G/A 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41553881_41554105:ANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 41554015 C/T 1 15 5 20 7.12733217926525 2.62422260691158 4.50310957235366 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0463439224535587 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41553881_41554105:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41553881_41554105:ANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 41554244 G/C 1 7 12 19 3.32608835032378 6.2981342565878 -2.97204590626402 C:G G C 10 0.524844521382317 0.250211798338697 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41554194_41554291:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41554194_41554291:ANK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 42183529 G/A 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 A:G G A 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000104365:ENST00000520810:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000416505:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000517890:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520835:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000518679:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000342222:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520201:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000521661:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000520655:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523517:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000519938:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000522133:exon_42183488_42183986:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523018:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000523599:exon_42182156_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000521225:exon_42183488_42183615:IKBKB;ENSG00000104365:ENST00000522103:exon_42183128_42183615:IKBKB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 53537316 A/G 1 19 17 36 9.02795409373598 8.92235686349939 0.10559723023659 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000519912:exon_53537277_53537347:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53537277_53537347:RB1CC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 53555069 A/G 1 23 25 48 10.9285760082067 13.1211130345579 -2.19253702635121 A:G A G 10 0.524844521382317 0.564993307275273 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53554911_53555151:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000522957:exon_53554911_53555151:RB1CC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 53586706 A/G 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 A:G A G 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53586405_53586834:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53586405_53586834:RB1CC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 54656244 G/A 1 13 11 24 6.17702122202988 5.77328973520549 0.403731486824393 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000047249:ENST00000355221:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000518072:exon_54656137_54656275:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000520188:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000359530:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000440871:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000523899:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000396774:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000524164:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000523426:exon_54656147_54656250:ATP6V1H HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 55059962 C/A 1 98 103 201 46.5652369045329 54.0589857023786 -7.49374879784571 A:C C A 10 0.524844521382317 0.290581846993561 ENSG00000137547:ENST00000260102:exon_55059942_55060461:MRPL15;ENSG00000137547:ENST00000522521:exon_55059942_55060418:MRPL15 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 56711713 A/G 1 19 19 38 9.02795409373598 9.97204590626402 -0.944091812528043 A:G A G 10 0.524844521382317 0.871260583668888 ENSG00000137574:ENST00000260129:exon_56711473_56711779:TGS1;ENSG00000137574:ENST00000523948:exon_56711473_56711779:TGS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 56866452 G/A 1 43 60 103 20.4316855805604 31.490671282939 -11.0589857023786 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0301440105272912 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 59508134 T/C 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523177:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59508119_59508218:NSMAF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 59513865 T/G 1 17 16 33 8.07764313650061 8.39751234211707 -0.31986920561646 T:G T G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59513844_59513907:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59513844_59513907:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519858:exon_59513727_59513907:NSMAF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 59851884 G/C 1 16 4 20 7.60248765788293 2.09937808552927 5.50310957235366 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0138529821356997 ENSG00000198846:ENST00000361421:exon_59851861_59852103:TOX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 61766022 G/A 1 7 10 17 3.32608835032378 5.24844521382317 -1.92235686349939 A:G G A 10 0.524844521382317 0.467655009238033 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61765388_61766059:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61765388_61766059:CHD7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 61778288 C/T 1 29 33 62 13.7795088799128 17.3198692056165 -3.54036032570365 T:C C T 10 0.524844521382317 0.376539494662122 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61777575_61779465:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61777575_61779463:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61777575_61779033:CHD7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 11 13 24 5.22671026479451 6.82297877797012 -1.59626851317561 T:C T C 10 0.524844521382317 0.545534900498325 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 67341714 G/C 1 63 41 104 29.934795152914 21.518625376675 8.41616977623903 C:G G C 10 0.524844521382317 0.115834890787869 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 67342257 G/A 1 87 69 156 41.3385266397384 36.2142719753799 5.12425466435855 A:G G A 10 0.524844521382317 0.423783532577406 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 67380528 T/C 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000147576:ENST00000396623:exon_67380504_67381142:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000415254:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000424777:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000447940:exon_67380504_67381038:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000435418:exon_67380504_67381038:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000276576:exon_67380504_67381042:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000426810:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000496501:exon_67380504_67380769:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000419955:exon_67380504_67381044:ADHFE1;ENSG00000147576:ENST00000466739:exon_67380504_67380899:ADHFE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 67592101 A/G 1 9 14 23 4.27639930755915 7.34782329935244 -3.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.216326895269441 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 67971452 T/C 1 51 58 109 24.2329294095018 30.4409822401744 -6.20805283067255 T:C T C 10 0.524844521382317 0.2503634717718 ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 68115478 C/T 1 8 11 19 3.80124382894146 5.77328973520549 -1.97204590626402 T:C C T 10 0.524844521382317 0.491888204316747 ENSG00000066777:ENST00000520381:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000522878:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000517743:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518789:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518230:exon_68115318_68115486:ARFGEF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 70744598 G/C 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 70744812 G/A 1 10 14 24 4.75155478617683 7.34782329935244 -2.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.312817090933246 ENSG00000137571:ENST00000260126:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000524945:exon_70744002_70745625:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000526750:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000530307:exon_70744002_70744950:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000532388:exon_70744002_70745404:SLCO5A1;ENSG00000137571:ENST00000528658:exon_70744002_70745404:SLCO5A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 71508553 T/C 1 68 50 118 32.3105725460024 26.2422260691158 6.0683464768866 T:C T C 10 0.524844521382317 0.270245294149244 ENSG00000067167:ENST00000521425:exon_71508498_71508556:TRAM1;ENSG00000067167:ENST00000262213:exon_71508498_71508556:TRAM1;ENSG00000067167:ENST00000520700:exon_71508498_71508556:TRAM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 71550832 T/C 1 27 19 46 12.8291979226774 9.97204590626402 2.85715201641342 T:C T C 10 0.524844521382317 0.461345236635833 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000517601:exon_71550786_71550864:LACTB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 72966002 G/A 1 17 10 27 8.07764313650061 5.24844521382317 2.82919792267744 A:G G A 10 0.524844521382317 0.336756432357263 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 73921406 C/T 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000147601:ENST00000276603:exon_73921099_73921440:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000276602:exon_73921099_73921440:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000518874:exon_73921112_73921440:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000518695:exon_73921329_73924740:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000379182:exon_73921323_73921622:TERF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 74893419 C/G 1 93 79 172 44.1894595114445 41.462717189203 2.72674232224148 C:G C G 10 0.524844521382317 0.703077430039519 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 178 116 294 84.5776751939476 60.8819644803488 23.6957107135988 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0059907528286733 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 97 96 193 46.0900814259153 50.3850740527024 -4.29499262678718 C:G C G 10 0.524844521382317 0.564480185774677 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 80942321 C/G 1 50 58 108 23.7577739308842 30.4409822401744 -6.68320830929023 C:G C G 10 0.524844521382317 0.210983111901708 ENSG00000147586:ENST00000276585:exon_80942271_80942506:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000521605:exon_80942271_80942524:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000518271:exon_80942289_80942467:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000522987:exon_80942289_80942489:MRPS28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 87479047 A/G 1 21 36 57 9.97826505097134 18.8944027697634 -8.91613771879207 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0233560324386721 ENSG00000123124:ENST00000517970:exon_87479023_87480732:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000349423:exon_87479023_87479705:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000341922:exon_87479023_87479705:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000265428:exon_87479023_87479705:WWP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 87540872 G/A 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87540754_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523001:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517771:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523469:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000522240:exon_87540764_87540905:CPNE3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 87567193 C/T 1 14 19 33 6.65217670064756 9.97204590626402 -3.31986920561646 T:C C T 10 0.524844521382317 0.29637560445508 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87567079_87567212:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517354:exon_87567079_87567207:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87567079_87567212:CPNE3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 90926879 T/C 1 4 14 18 1.90062191447073 7.34782329935244 -5.44720138488171 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0157676899224219 ENSG00000164823:ENST00000297438:exon_90926783_90926974:OSGIN2;ENSG00000164823:ENST00000451899:exon_90926783_90926974:OSGIN2;ENSG00000164823:ENST00000421531:exon_90926783_90926974:OSGIN2;ENSG00000164823:ENST00000520659:exon_90926783_90926974:OSGIN2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 90967686 T/C 1 22 32 54 10.453420529589 16.7950246842341 -6.34160415464512 T:C T C 10 0.524844521382317 0.101462056794142 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 92033502 T/C 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 T:C T C 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000155099:ENST00000285419:exon_92033484_92033632:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518359:exon_92033484_92033632:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000520014:exon_92033484_92033650:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518869:exon_92033484_92033632:TMEM55A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 92083424 A/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000155100:ENST00000285420:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000404789:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000522894:exon_92083366_92083517:OTUD6B;ENSG00000155100:ENST00000524027:exon_92083366_92083517:OTUD6B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 95419698 A/G 1 5 5 10 2.37577739308842 2.62422260691158 -0.248445213823169 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95419667_95419948:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000463267:exon_95419667_95419948:RAD54B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 95531419 T/C 1 25 17 42 11.8788869654421 8.92235686349939 2.95653010194269 T:C T C 10 0.524844521382317 0.440310935423641 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 95538468 T/C 1 24 22 46 11.4037314868244 11.546579470411 -0.142847983586581 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 95538987 T/C 1 11 19 30 5.22671026479451 9.97204590626402 -4.74533564146951 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0997596100052063 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 T:C T C 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 96059283 C/T 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000156170:ENST00000523378:exon_96059222_96059318:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000396113:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000396111:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000396124:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000518258:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000286687:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000523337:exon_96059222_96059315:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000517976:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000454358:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000520757:exon_96059222_96059355:C8orf38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 97263180 T/G 1 13 17 30 6.17702122202988 8.92235686349939 -2.74533564146951 T:G T G 10 0.524844521382317 0.362755487440991 ENSG00000156469:ENST00000523821:exon_97263134_97263323:MTERFD1;ENSG00000156469:ENST00000522822:exon_97263134_97263323:MTERFD1;ENSG00000156469:ENST00000524341:exon_97263134_97263323:MTERFD1;ENSG00000156469:ENST00000287025:exon_97263134_97263323:MTERFD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 98289641 A/G 1 12 4 16 5.7018657434122 2.09937808552927 3.60248765788293 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0825793217037308 ENSG00000180543:ENST00000322128:exon_98285717_98290176:TSPYL5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 98788033 G/C 1 5 7 12 2.37577739308842 3.67391164967622 -1.2981342565878 C:G G C 10 0.524844521382317 0.567300048342317 ENSG00000104341:ENST00000445593:exon_98787285_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000220781:exon_98787285_98788336:LAPTM4B;ENSG00000104341:ENST00000378722:exon_98787935_98788336:LAPTM4B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 99146809 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99146700_99146887:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99146700_99146887:POP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 99168383 T/C 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 T:C T C 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000517435:exon_99168186_99168640:POP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 99169923 C/T 1 18 15 33 8.5527986151183 7.87266782073475 0.68013079438354 T:C C T 10 0.524844521382317 0.862946290554676 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 99169956 T/C 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 T:C T C 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 101154066 G/A 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G G A 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000156509:ENST00000428847:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000428185:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000388828:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000517806:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000520987:exon_101152911_101154396:FBXO43 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 101196929 A/G 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101196856_101196961:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101196856_101196961:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101196856_101196961:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101196856_101196961:SPAG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 101199471 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101199348_101199478:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101199348_101199478:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101199348_101199478:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101199348_101199478:SPAG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 101232557 T/C 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101232507_101232659:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101232507_101232659:SPAG1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 109247281 G/A 1 279 193 472 132.568378534334 101.294992626787 31.2733859075464 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0042291149602363 ENSG00000104408:ENST00000220849:exon_109247227_109247331:EIF3E;ENSG00000104408:ENST00000519030:exon_109247227_109247331:EIF3E;ENSG00000104408:ENST00000521614:exon_109247227_109247331:EIF3E;ENSG00000104408:ENST00000522445:exon_109247227_109247331:EIF3E;ENSG00000104408:ENST00000521440:exon_109247227_109247331:EIF3E;ENSG00000104408:ENST00000518442:exon_109246513_109247331:EIF3E;ENSG00000104408:ENST00000518100:exon_109247260_109247331:EIF3E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 46 43 89 21.8571520164134 22.5683144194396 -0.711162403026211 T:C C T 10 0.524844521382317 0.915687873197768 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 120575184 G/A 1 8 8 16 3.80124382894146 4.19875617105854 -0.397512342117071 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136960:ENST00000259486:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000427067:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000523861:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522167:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522826:exon_120575097_120575253:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000075322:exon_120575097_120575253:ENPP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 120594802 A/G 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136960:ENST00000259486:exon_120594658_120594842:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000427067:exon_120594658_120594842:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522167:exon_120594670_120594842:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000522826:exon_120594658_120594842:ENPP2;ENSG00000136960:ENST00000075322:exon_120594658_120594842:ENPP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 120744349 T/C 1 17 27 44 8.07764313650061 14.1708020773226 -6.09315894082195 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0710264319108842 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 123963901 C/T 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 T:C C T 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 123964813 A/G 1 17 19 36 8.07764313650061 9.97204590626402 -1.89440276976341 A:G A G 10 0.524844521382317 0.617406672512397 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 123965365 G/A 1 19 16 35 9.02795409373598 8.39751234211707 0.630441751618907 A:G G A 10 0.524844521382317 0.867082324177013 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 123966141 G/A 1 12 8 20 5.7018657434122 4.19875617105854 1.50310957235366 A:G G A 10 0.524844521382317 0.655495661698291 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 C:G G C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 124031537 T/C 1 30 25 55 14.2546643585305 13.1211130345579 1.13355132397257 T:C T C 10 0.524844521382317 0.7885860107291 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000519018:exon_124031435_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000523036:exon_124031435_124031545:DERL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 124138855 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000378080:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518577:exon_124138748_124138927:WDR67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 124164171 G/A 1 3 8 11 1.42546643585305 4.19875617105854 -2.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.130997551545916 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124164046_124164390:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124164046_124164390:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124164046_124164194:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124164046_124164204:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124164046_124164393:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124164046_124164390:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124164046_124164393:WDR67 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 125463458 G/A 1 11 13 24 5.22671026479451 6.82297877797012 -1.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.545534900498325 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 128751201 G/A 1 310 247 557 147.298198371482 129.636596781432 17.6616015900494 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.13768537831217 ENSG00000136997:ENST00000259523:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000528568:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000377970:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000454617:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000524013:exon_128750497_128751265:MYC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 131124559 T/C 1 10 4 14 4.75155478617683 2.09937808552927 2.65217670064756 T:C T C 10 0.524844521382317 0.187089108085109 ENSG00000153317:ENST00000524124:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000357668:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000521075:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000518721:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000343135:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000519483:exon_131124340_131124568:ASAP1;ENSG00000153317:ENST00000520189:exon_131124340_131124660:ASAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 135602542 C/T 1 16 15 31 7.60248765788293 7.87266782073475 -0.270180162851826 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141461062 G/A 1 6 9 15 2.8509328717061 4.72360069244085 -1.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.439918569898636 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141461185 A/G 1 5 14 19 2.37577739308842 7.34782329935244 -4.97204590626402 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0358228143741496 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141461266 A/G 1 7 5 12 3.32608835032378 2.62422260691158 0.701865743412196 A:G A G 10 0.524844521382317 0.77773533420984 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141460889_141461482:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141460889_141461482:TRAPPC9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141525327 A/G 1 33 19 52 15.6801307943835 9.97204590626402 5.70808488811952 A:G A G 10 0.524844521382317 0.127172101786293 ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141525225_141527236:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519533:exon_141525225_141526566:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141525225_141525864:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141525225_141525640:CHRAC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141551407 G/A 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141551263_141551457:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000520412:exon_141551263_141551556:EIF2C2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141559358 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141566311 C/T 1 4 8 12 1.90062191447073 4.19875617105854 -2.2981342565878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.249548155109633 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141566266_141566385:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000521325:exon_141566266_141566337:EIF2C2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 10 5 15 4.75155478617683 2.62422260691158 2.12733217926525 A:G G A 10 0.524844521382317 0.310764004973947 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 141745394 G/A 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 A:G G A 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000169398:ENST00000522684:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519654:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519465:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000517887:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521059:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395218:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000354438:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395214:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000395221:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000523539:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000340930:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519993:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000519419:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000524202:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521986:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000521029:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000518509:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000342207:exon_141745350_141745554:PTK2;ENSG00000169398:ENST00000520917:exon_141745144_141745554:PTK2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 142204293 C/T 1 93 46 139 44.1894595114445 24.1428479835866 20.0466115278579 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.00064541365370163 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 142204351 A/G 1 64 59 123 30.4099506315317 30.9658267615567 -0.555876130024988 A:G A G 10 0.524844521382317 0.928318227946542 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 142228716 G/A 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G G A 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000022567:ENST00000519067:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000517878:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000024061:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000433583:exon_142228110_142229128:SLC45A4;ENSG00000022567:ENST00000425766:exon_142228110_142229128:SLC45A4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144358819 T/G 1 44 22 66 20.9068410591781 11.546579470411 9.36026158876708 T:G T G 10 0.524844521382317 0.0258385120236493 ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144358983 G/A 1 50 20 70 23.7577739308842 10.4968904276463 13.2608835032378 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00167651946092303 ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144403449 G/A 1 14 3 17 6.65217670064756 1.57453356414695 5.07764313650061 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0145390064507902 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144590053 G/A 1 19 19 38 9.02795409373598 9.97204590626402 -0.944091812528043 A:G G A 10 0.524844521382317 0.871260583668888 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144589916_144590069:ZC3H3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 50 20 70 23.7577739308842 10.4968904276463 13.2608835032378 T:C T C 10 0.524844521382317 0.00167651946092303 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144620342 T/C 1 34 32 66 16.1552862730012 16.7950246842341 -0.639738411232919 T:C T C 10 0.524844521382317 0.90236598876862 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144621015 C/T 1 18 14 32 8.5527986151183 7.34782329935244 1.20497531576586 T:C C T 10 0.524844521382317 0.725627887468629 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 28 14 42 13.3043534012951 7.34782329935244 5.95653010194269 T:G T G 10 0.524844521382317 0.088052708023459 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144644405 G/A 1 54 36 90 25.6583958453549 18.8944027697634 6.76399307559148 A:G G A 10 0.524844521382317 0.170281811353924 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144682028 C/T 1 27 25 52 12.8291979226774 13.1211130345579 -0.291915111880481 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 35 24 59 16.6304417516189 12.5962685131756 4.0341732384433 T:C T C 10 0.524844521382317 0.300782793384336 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144732671 C/T 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000183309:ENST00000526926:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000458270:exon_144732068_144734546:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000532796:exon_144731830_144736872:ZNF623;ENSG00000183309:ENST00000328466:exon_144731954_144733759:ZNF623 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144874554 T/C 1 80 54 134 38.0124382894146 28.3416041546451 9.67083413476953 T:C T C 10 0.524844521382317 0.100502822907218 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874390_144874575:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874390_144874575:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874390_144874575:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874390_144874571:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874390_144874575:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874390_144874575:SCRIB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144877216 C/T 1 42 40 82 19.9565301019427 20.9937808552927 -1.03725075334999 T:C C T 10 0.524844521382317 0.825953526036792 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144877208_144877282:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144877208_144877282:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144877208_144877282:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144877208_144877282:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144877208_144877282:SCRIB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144885580 A/G 1 29 36 65 13.7795088799128 18.8944027697634 -5.1148938898506 A:G A G 10 0.524844521382317 0.215927824100594 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144889172 A/G 1 11 13 24 5.22671026479451 6.82297877797012 -1.59626851317561 A:G A G 10 0.524844521382317 0.545534900498325 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531942:exon_144889094_144889183:SCRIB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144894496 G/A 1 12 10 22 5.7018657434122 5.24844521382317 0.453420529589027 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144894436_144894554:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144894436_144894554:SCRIB HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 144998163 C/T 1 15 12 27 7.12733217926525 6.2981342565878 0.829197922677442 T:C C T 10 0.524844521382317 0.848089388772471 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145617910 A/G 1 14 16 30 6.65217670064756 8.39751234211707 -1.74533564146951 A:G A G 10 0.524844521382317 0.585512927936858 ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145617660_145617912:ADCK5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145618739 G/T 1 80 101 181 38.0124382894146 53.009296659614 -14.9968583701994 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0306263638374187 ENSG00000071894:ENST00000531480:exon_145618667_145618805:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000531727:exon_145618667_145618805:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145618667_145618805:CPSF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145619413 C/T 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000071894:ENST00000532725:exon_145618882_145619452:CPSF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145619489 G/A 1 76 40 116 36.1118163749439 20.9937808552927 15.1180355196512 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.00515718005239395 ENSG00000071894:ENST00000531480:exon_145619449_145619515:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145619449_145619515:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000526271:exon_145619449_145619770:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000532935:exon_145619449_145619515:CPSF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145649531 C/T 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145649000_145650434:VPS28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145649622 G/A 1 201 170 371 95.5062512021543 89.2235686349939 6.28268256716041 A:G G A 10 0.524844521382317 0.532954294474909 ENSG00000160948:ENST00000529182:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145649000_145650434:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526054:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000292510:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000377348:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526204:exon_145649598_145650202:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530983:exon_145649598_145650202:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000528142:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530836:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000527797:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000532861:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000533806:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531032:exon_145649598_145649651:VPS28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145652344 G/C 1 38 42 80 18.055908187472 22.0434698980573 -3.98756171058536 C:G G C 10 0.524844521382317 0.373514531024675 ENSG00000160948:ENST00000529182:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526054:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000292510:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000377348:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526204:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530983:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000528142:exon_145651409_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530836:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530804:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000532861:exon_145652292_145652381:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000533806:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531032:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531924:exon_145652292_145652677:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526734:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530790:exon_145652292_145652674:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000524521:exon_145651854_145652362:VPS28 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145659553 G/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145659361_145659662:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145659361_145659662:NFKBIL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145660237 C/T 1 11 2 13 5.22671026479451 1.04968904276463 4.17702122202988 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0245424343793570 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145660194_145660272:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145660194_145660272:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145660194_145660272:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145660194_145660272:NFKBIL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145665407 C/T 1 7 3 10 3.32608835032378 1.57453356414695 1.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.34980607938192 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145665404_145665593:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145665404_145665456:NFKBIL2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 1 20 19 39 9.50310957235366 9.97204590626402 -0.46893633391036 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145692473 G/A 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G G A 10 0.524844521382317 0.369838454129304 ENSG00000167702:ENST00000301332:exon_145692342_145692493:KIFC2;ENSG00000167702:ENST00000301331:exon_145692342_145692493:KIFC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145736086 C/A 1 18 30 48 8.5527986151183 15.7453356414695 -7.19253702635121 A:C C A 10 0.524844521382317 0.0427931324482701 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145738827 C/T 1 16 7 23 7.60248765788293 3.67391164967622 3.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.142485578518459 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145738601_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145738770_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145738773_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145738601_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534626:exon_145738800_145738864:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000533600:exon_145738604_145738864:RECQL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 13 5 18 6.17702122202988 2.62422260691158 3.5527986151183 C:G C G 10 0.524844521382317 0.103595747645196 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145999035 T/C 1 13 9 22 6.17702122202988 4.72360069244085 1.45342052958903 T:C T C 10 0.524844521382317 0.67059722784726 ENSG00000196378:ENST00000527190:exon_145997611_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000343459:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000429371:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000527740:exon_145998505_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000449516:exon_145998508_145999990:ZNF34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 145999080 G/A 1 9 15 24 4.27639930755915 7.87266782073475 -3.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.156455234273016 ENSG00000196378:ENST00000527190:exon_145997611_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000343459:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000429371:exon_145998499_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000527740:exon_145998505_145999990:ZNF34;ENSG00000196378:ENST00000449516:exon_145998508_145999990:ZNF34 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 146015749 C/T 1 4151 3732 7883 1972.370391742 1958.71975379881 13.6506379431953 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.760774773983815 ENSG00000161016:ENST00000534781:exon_146015740_146016257:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000531975:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529163:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000526668:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528296:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000394920:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000527914:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000262584:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000534813:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529920:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000533397:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000532702:exon_146015740_146015855:RPL8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 146032714 A/T 1 7 9 16 3.32608835032378 4.72360069244085 -1.39751234211707 A:T A T 10 0.524844521382317 0.618425587093261 ENSG00000197363:ENST00000359971:exon_146032576_146034529:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000533965:exon_146032576_146033871:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000530879:exon_146032576_146034362:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000533944:exon_146032576_146032732:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000531720:exon_146032576_146033871:ZNF517;ENSG00000197363:ENST00000529429:exon_146032576_146033861:ZNF517;ENSG00000204752:ENST00000377296:exon_146032252_146032811:AF235103.1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 146107641 C/T 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C C T 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000196150:ENST00000292579:exon_146102336_146108221:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000417550:exon_146106524_146108221:ZNF250;ENSG00000196150:ENST00000394912:exon_146107496_146108221:ZNF250 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 8 10 18 3.80124382894146 5.24844521382317 -1.4472013848817 A:C C A 10 0.524844521382317 0.638287729376977 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 328144 G/A 1 7 2 9 3.32608835032378 1.04968904276463 2.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.184542335086170 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_328022_328171:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_328022_328171:DOCK8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 368030 T/C 1 5 4 9 2.37577739308842 2.09937808552927 0.276399307559148 T:C T C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_368018_370300:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_368018_368135:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_368018_368300:DOCK8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 399233 A/G 1 16 23 39 7.60248765788293 12.0714239917933 -4.46893633391036 A:G A G 10 0.524844521382317 0.199027828793427 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 399255 G/A 1 26 30 56 12.3540424440598 15.7453356414695 -3.39129319740975 A:G G A 10 0.524844521382317 0.422490708331258 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 429824 C/A 1 28 19 47 13.3043534012951 9.97204590626402 3.3323074950311 A:C C A 10 0.524844521382317 0.381795948985569 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_429702_429854:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_429702_429854:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_429702_429854:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_429702_429854:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_429702_429854:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_429702_429854:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_429702_429854:DOCK8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 449874 G/C 1 14 14 28 6.65217670064756 7.34782329935244 -0.695646598704876 C:G G C 10 0.524844521382317 0.851171689520466 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 449876 A/G 1 14 13 27 6.65217670064756 6.82297877797012 -0.170802077322558 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 2029196 G/A 1 21 19 40 9.97826505097134 9.97204590626402 0.00621914470732143 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 2039569 G/A 1 12 18 30 5.7018657434122 9.4472013848817 -3.74533564146951 A:G G A 10 0.524844521382317 0.201690400601927 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2039466_2039574:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000491574:exon_2039466_2039857:SMARCA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 4793178 C/A 1 18 12 30 8.5527986151183 6.2981342565878 2.25466435853049 A:C:G C A 10 0.524844521382317 0.467363032646082 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4792869_4793227:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381732:exon_4792976_4793227:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000442869:exon_4792980_4793227:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000473230:exon_4793087_4793227:RCL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 56 62 118 26.6087068025902 32.5403603257037 -5.9316535231134 A:G A G 10 0.524844521382317 0.310650180871113 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 5457092 G/A 1 26 27 53 12.3540424440598 14.1708020773226 -1.8167596332628 A:G G A 10 0.524844521382317 0.6805960417719 ENSG00000120217:ENST00000381577:exon_5457079_5457420:CD274;ENSG00000120217:ENST00000498261:exon_5457079_5457420:CD274 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 5920440 C/T 1 23 36 59 10.9285760082067 18.8944027697634 -7.9658267615567 T:C C T 10 0.524844521382317 0.049632619204141 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5919008_5923309:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5919022_5923309:KIAA2026 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 5924711 G/T 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5924658_5924845:KIAA2026;ENSG00000183354:ENST00000381461:exon_5924658_5924845:KIAA2026 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 6007767 C/A 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_6007195_6008003:KIAA2026 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 6533010 C/G 1 46 38 84 21.8571520164134 19.944091812528 1.91306020388538 C:G C G 10 0.524844521382317 0.743408164274874 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 6606627 G/A 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6606592_6606669:GLDC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 6606639 A/G 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6606592_6606669:GLDC HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 7 16 23 3.32608835032378 8.39751234211707 -5.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.037721226567006 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 119 87 206 56.5435019555043 45.6614733602616 10.8820285952427 A:C C A 10 0.524844521382317 0.142808638819654 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 143 113 256 67.9472334423287 59.3074309162018 8.63980252612686 T:G G T 10 0.524844521382317 0.287923716157026 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 17135115 C/T 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C C T 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17135038_17135423:CNTLN HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 33466219 A/C 1 19 18 37 9.02795409373598 9.4472013848817 -0.419247291145727 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33466069_33466223:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33466069_33466223:NOL6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 33473859 C/T 1 8 6 14 3.80124382894146 3.1490671282939 0.652176700647563 T:C C T 10 0.524844521382317 0.794120955465075 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33473787_33473941:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000353159:exon_33473787_33473928:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33473787_33473928:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33473787_33473928:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000464829:exon_33473787_33473900:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33473787_33473941:NOL6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 34656767 C/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:C C A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000137070:ENST00000441545:exon_34656736_34656905:IL11RA;ENSG00000137070:ENST00000318041:exon_34656736_34656905:IL11RA;ENSG00000137070:ENST00000378817:exon_34656736_34656905:IL11RA;ENSG00000137070:ENST00000478308:exon_34656736_34656817:IL11RA;ENSG00000137070:ENST00000478802:exon_34656736_34656905:IL11RA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 35107888 C/G 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 C:G C G 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35107378_35108271:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378554:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000408010:exon_35107378_35108346:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000488109:exon_35107766_35108346:KIAA1539 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 35608962 C/T 1 29 26 55 13.7795088799128 13.6459575559402 0.133551323972567 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35608859_35610029:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35608859_35610038:TESK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 35612978 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000137101:ENST00000396757:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000396759:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000259633:exon_35612845_35612990:CD72;ENSG00000137101:ENST00000490239:exon_35612845_35612990:CD72 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 11 5 16 5.22671026479451 2.62422260691158 2.60248765788293 A:G G A 10 0.524844521382317 0.219130803102002 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 35748669 G/A 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000070610:ENST00000378103:exon_35748343_35749225:GBA2;ENSG00000070610:ENST00000378094:exon_35748343_35749215:GBA2;ENSG00000070610:ENST00000489025:exon_35748343_35748970:GBA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 35842480 A/G 1 16 17 33 7.60248765788293 8.92235686349939 -1.31986920561646 A:G A G 10 0.524844521382317 0.728380954880147 ENSG00000137103:ENST00000377996:exon_35842389_35842714:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000439587:exon_35842389_35842714:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000450762:exon_35842389_35842714:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377991:exon_35842389_35842714:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000358856:exon_35842389_35842714:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000464519:exon_35842391_35842697:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377988:exon_35842389_35842714:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000490199:exon_35842389_35842663:TMEM8B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 35845998 G/C 1 18 27 45 8.5527986151183 14.1708020773226 -5.61800346220426 C:G G C 10 0.524844521382317 0.101749773232147 ENSG00000137103:ENST00000377996:exon_35845972_35846065:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000439587:exon_35845972_35846065:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000450762:exon_35845972_35846065:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377991:exon_35845972_35846065:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000358856:exon_35845972_35846065:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000473947:exon_35845972_35846065:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000377988:exon_35845972_35846065:TMEM8B;ENSG00000137103:ENST00000490199:exon_35845972_35846268:TMEM8B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37002806 A/G 1 2 26 28 0.950310957235366 13.6459575559402 -12.6956465987049 A:G A G 10 0.524844521382317 8.22528081656767e-07 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37006494 C/T 1 29 59 88 13.7795088799128 30.9658267615567 -17.1863178816439 T:C C T 10 0.524844521382317 0.000253146257677599 ENSG00000196092:ENST00000358127:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377853:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377840:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377852:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523241:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520154:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520281:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000446742:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522003:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523145:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523493:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000414447:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377847:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377849:exon_37006470_37006534:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000432188:exon_37006470_37006534:PAX5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37126682 G/A 1 79 74 153 37.537282810797 38.8384945822915 -1.30121177149449 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.871510108916395 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000322831:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37126309_37126939:ZCCHC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37126922 A/G 1 46 53 99 21.8571520164134 27.8167596332628 -5.95960761684938 A:G A G 10 0.524844521382317 0.268248875912669 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000322831:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37126309_37126939:ZCCHC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37304280 T/C 1 32 18 50 15.2049753157659 9.4472013848817 5.75777393088415 T:C T C 10 0.524844521382317 0.119364531739315 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37304185_37304310:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37304185_37304310:ZCCHC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37305603 C/A 1 23 26 49 10.9285760082067 13.6459575559402 -2.71738154773353 A:C:G C A 10 0.524844521382317 0.476111608237205 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37305541_37305711:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37305541_37305711:ZCCHC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37349428 G/A 1 23 27 50 10.9285760082067 14.1708020773226 -3.24222606911585 A:G G A 10 0.524844521382317 0.396863325029014 ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37349354_37349449:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37349354_37349449:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000488607:exon_37349354_37349449:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000463625:exon_37349354_37349445:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000497924:exon_37349354_37349449:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000481507:exon_37349354_37349449:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000496099:exon_37349354_37349449:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000470185:exon_37349354_37349449:ZCCHC7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37426524 C/T 1 13 4 17 6.17702122202988 2.09937808552927 4.07764313650061 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0537214037230151 ENSG00000137106:ENST00000487399:exon_37425919_37426647:GRHPR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 216 218 434 102.63358338142 114.416105661345 -11.7825222799256 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.269055585740932 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 35 20 55 16.6304417516189 10.4968904276463 6.13355132397257 T:G G T 10 0.524844521382317 0.106097030786483 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 25 21 46 11.8788869654421 11.0217349490287 0.857152016413419 T:C C T 10 0.524844521382317 0.882990864557683 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 49 30 79 23.2826184522665 15.7453356414695 7.53728281079696 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0922202692119357 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 109 65 174 51.7919471693275 34.1148938898506 17.6770532794768 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00777076947279822 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37521777 G/A 1 2 10 12 0.950310957235366 5.24844521382317 -4.2981342565878 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0177361814639833 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37521566_37521835:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37521566_37521835:FBXO10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37537373 A/G 1 11 8 19 5.22671026479451 4.19875617105854 1.02795409373598 A:G A G 10 0.524844521382317 0.655359557772443 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37537381 C/T 1 11 7 18 5.22671026479451 3.67391164967622 1.55279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.49049256654354 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37537557 G/A 1 5 13 18 2.37577739308842 6.82297877797012 -4.4472013848817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.056012196582109 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 37592452 G/A 1 257 177 434 122.114958004745 92.8974802846701 29.2174777200744 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.00526387114779687 ENSG00000175768:ENST00000321301:exon_37592409_37592568:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000377773:exon_37592307_37592594:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000401811:exon_37592250_37592636:TOMM5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 38395928 C/T 1 29 27 56 13.7795088799128 14.1708020773226 -0.39129319740975 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 38396002 C/T 1 35 38 73 16.6304417516189 19.944091812528 -3.31365006090914 T:C C T 10 0.524844521382317 0.482568362254026 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 38396303 C/T 1 40 53 93 19.0062191447073 27.8167596332628 -8.81054048855547 T:C C T 10 0.524844521382317 0.07722870258623 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 71549957 A/G 0 11 0 11 5.22671026479451 0 5.22671026479451 A A 10 0.524844521382317 0.00111114617361232 ENSG00000107242:ENST00000377290:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000265382:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000419747:exon_71549806_71549961:PIP5K1B;ENSG00000107242:ENST00000478500:exon_71549806_71549961:PIP5K1B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 71835842 C/A 1 20 10 30 9.50310957235366 5.24844521382317 4.25466435853049 A:C C A 10 0.524844521382317 0.144094251343473 ENSG00000119139:ENST00000423935:exon_71835803_71836012:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71835803_71836412:TJP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 71863070 T/C 1 36 10 46 17.1055972302366 5.24844521382317 11.8571520164134 T:C T C 10 0.524844521382317 0.000527719447281487 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 74975136 T/C 1 61 20 81 28.9844841956787 10.4968904276463 18.4875937680323 T:C T C 10 0.524844521382317 3.01227996797036e-05 ENSG00000107372:ENST00000437241:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000237937:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000456474:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376960:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376962:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000488164:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000343431:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000471197:exon_74975026_74975201:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376956:exon_74975026_74975137:ZFAND5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 3 10 13 1.42546643585305 5.24844521382317 -3.82297877797012 A:C A C 10 0.524844521382317 0.0487982257626193 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 86592688 T/G 1 94 192 286 44.6646149900622 100.770148105405 -56.1055331153427 T:G T G 10 0.524844521382317 2.84302935152416e-11 ENSG00000165119:ENST00000376281:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000376264:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000376263:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000376268:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000351839:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000435158:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000360384:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000376258:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000457156:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000472778:exon_86592604_86592701:HNRNPK;ENSG00000165119:ENST00000483135:exon_86592604_86592701:HNRNPK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 88651420 G/A 1 16 20 36 7.60248765788293 10.4968904276463 -2.89440276976341 A:G G A 10 0.524844521382317 0.4046295772343 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88651263_88651728:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88651263_88651422:GOLM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 90262235 G/A 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:G G A 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90262220_90262318:DAPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 90266627 C/T 1 19 7 26 9.02795409373598 3.67391164967622 5.35404244405976 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0477771026383253 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90266442_90266639:DAPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 73 86 159 34.6863499390909 45.1366288388793 -10.4502788997884 A:G G A 10 0.524844521382317 0.111992051995504 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 91994347 C/T 1 69 55 124 32.7857280246201 28.8664486760274 3.9192793485927 T:C C T 10 0.524844521382317 0.529326944711183 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 93639973 G/C 1 8 1 9 3.80124382894146 0.524844521382317 3.27639930755915 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0411517104004749 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 93640009 G/A 1 7 1 8 3.32608835032378 0.524844521382317 2.80124382894146 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0730162936639628 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93639853_93640062:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93639853_93640062:SYK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 T:C C T 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 94800570 C/T 1 17 14 31 8.07764313650061 7.34782329935244 0.729819837148174 T:C C T 10 0.524844521382317 0.858443645066449 ENSG00000090054:ENST00000262554:exon_94800530_94800647:SPTLC1;ENSG00000090054:ENST00000415466:exon_94800530_94800647:SPTLC1;ENSG00000090054:ENST00000469778:exon_94800530_94800740:SPTLC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 94800584 C/T 1 18 17 35 8.5527986151183 8.92235686349939 -0.369558248381093 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000090054:ENST00000262554:exon_94800530_94800647:SPTLC1;ENSG00000090054:ENST00000415466:exon_94800530_94800647:SPTLC1;ENSG00000090054:ENST00000469778:exon_94800530_94800740:SPTLC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 94809474 T/C 1 9 5 14 4.27639930755915 2.62422260691158 1.65217670064756 T:C T C 10 0.524844521382317 0.432049119583174 ENSG00000090054:ENST00000262554:exon_94809454_94809550:SPTLC1;ENSG00000090054:ENST00000415466:exon_94809454_94809550:SPTLC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 11 12 23 5.22671026479451 6.2981342565878 -1.07142399179329 A:C C A 10 0.524844521382317 0.681460694259686 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 95768324 C/T 1 4 6 10 1.90062191447073 3.1490671282939 -1.24844521382317 T:C C T 10 0.524844521382317 0.533187956556707 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95768306_95768462:FGD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 95841858 G/T 1 116 80 196 55.1180355196512 41.9875617105854 13.1304738090659 T:G G T 10 0.524844521382317 0.0630487058607242 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95841753_95841884:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95841753_95841884:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95841753_95841884:SUSD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 99521099 G/T 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:G G T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99520366_99522759:ZNF510 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 99521211 C/T 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99520366_99522759:ZNF510 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 99521920 G/C 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 C:G G C 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99520366_99522759:ZNF510 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 99581811 C/T 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 100190780 A/G 1 4 9 13 1.90062191447073 4.72360069244085 -2.82297877797012 A:G A G 10 0.524844521382317 0.164439911805120 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100190742_100190954:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100190742_100190954:TDRD7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 100420976 G/A 1 10 2 12 4.75155478617683 1.04968904276463 3.7018657434122 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0413693580129535 ENSG00000136937:ENST00000375147:exon_100420922_100421025:NCBP1;ENSG00000136937:ENST00000375132:exon_100420922_100421025:NCBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 12 6 18 5.7018657434122 3.1490671282939 2.55279861511829 T:C C T 10 0.524844521382317 0.248323479281954 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 100819192 C/T 1 43 50 93 20.4316855805604 26.2422260691158 -5.81054048855548 T:C C T 10 0.524844521382317 0.253614811726483 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 100894541 G/A 1 4 14 18 1.90062191447073 7.34782329935244 -5.44720138488171 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0157676899224219 ENSG00000106789:ENST00000343933:exon_100894467_100894583:CORO2A;ENSG00000106789:ENST00000375077:exon_100894467_100894583:CORO2A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 101984147 G/C 1 26 25 51 12.3540424440598 13.1211130345579 -0.767070590498165 C:G G C 10 0.524844521382317 0.88886715961801 ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 19 18 37 9.02795409373598 9.4472013848817 -0.419247291145727 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 106882441 A/G 1 23 26 49 10.9285760082067 13.6459575559402 -2.71738154773353 A:G A G 10 0.524844521382317 0.476111608237205 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106882308_106882443:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106882308_106882443:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106882308_106882443:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106882308_106882443:SMC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 106888978 C/T 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C C T 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 106901506 A/G 1 34 29 63 16.1552862730012 15.2204911200872 0.934795152914031 A:G A G 10 0.524844521382317 0.899775143288907 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106901420_106903690:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106901420_106903698:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106901420_106901932:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106901420_106901933:SMC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 12 34 46 5.7018657434122 17.8447137269988 -12.1428479835866 A:G G A 10 0.524844521382317 0.000328315856085402 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 111663754 G/A 1 9 11 20 4.27639930755915 5.77328973520549 -1.49689042764634 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512500587924667 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111663705_111663810:IKBKAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 111663793 C/T 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111663705_111663810:IKBKAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 112898576 C/T 1 18 26 44 8.5527986151183 13.6459575559402 -5.09315894082195 T:C C T 10 0.524844521382317 0.133089348553804 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000471798:exon_112898407_112898614:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 112899034 C/T 1 34 27 61 16.1552862730012 14.1708020773226 1.98448419567867 T:C C T 10 0.524844521382317 0.700895853553347 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 114146832 C/T 1 25 27 52 11.8788869654421 14.1708020773226 -2.29191511188048 T:C C T 10 0.524844521382317 0.579560397579122 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114146802_114146849:KIAA0368 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 32 21 53 15.2049753157659 11.0217349490287 4.1832403667372 T:C T C 10 0.524844521382317 0.273067212327304 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 114182353 C/T 1 16 14 30 7.60248765788293 7.34782329935244 0.254664358530491 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114182297_114182400:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114182297_114182400:KIAA0368 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 114184477 C/T 1 13 15 28 6.17702122202988 7.87266782073475 -1.69564659870487 T:C C T 10 0.524844521382317 0.573240932810565 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184414_114184480:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184414_114184480:KIAA0368 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 103 72 175 48.9410142976214 37.7888055395268 11.1522087580945 T:C:G T C 10 0.524844521382317 0.096076411159621 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 132 111 243 62.7205231775342 58.2577418734372 4.46278130409698 T:C C T 10 0.524844521382317 0.607468161648842 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 115060182 C/T 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:C C T 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_115060112_115060196:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_115060121_115060196:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000374255:exon_115060121_115060196:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000343327:exon_115060112_115060196:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000210227:exon_115060121_115060196:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000450374:exon_115060112_115060196:ROD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 13 17 30 6.17702122202988 8.92235686349939 -2.74533564146951 A:G A G 10 0.524844521382317 0.362755487440991 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 116152891 A/G 1 8 7 15 3.80124382894146 3.67391164967622 0.127332179265245 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 116152940 G/A 1 11 10 21 5.22671026479451 5.24844521382317 -0.021734949028656 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000464749:exon_116152908_116153213:ALAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 116153817 C/T 1 14 7 21 6.65217670064756 3.67391164967622 2.97826505097134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.274425958972586 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000448137:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482001:exon_116153807_116153903:ALAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 116153900 A/G 1 7 4 11 3.32608835032378 2.09937808552927 1.22671026479451 A:G A G 10 0.524844521382317 0.554370408525684 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000448137:exon_116153807_116153903:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482001:exon_116153807_116153903:ALAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 116154422 G/A 1 3 12 15 1.42546643585305 6.2981342565878 -4.87266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0171387439018236 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116154399_116154449:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116154399_116154615:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116154399_116154449:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116154399_116154449:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000448137:exon_116154399_116154449:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482001:exon_116154399_116154835:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000452726:exon_116154412_116154449:ALAD HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 117118245 T/C 1 30 26 56 14.2546643585305 13.6459575559402 0.60870680259025 T:C T C 10 0.524844521382317 0.89436653797937 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117118205_117118416:AKNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 117118379 C/T 1 43 40 83 20.4316855805604 20.9937808552927 -0.562095274732307 T:C C T 10 0.524844521382317 0.912930998454434 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117118205_117118416:AKNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 117120333 G/A 1 19 33 52 9.02795409373598 17.3198692056165 -8.29191511188048 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0256428744277548 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000490767:exon_117120201_117120617:AKNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 24 8 32 11.4037314868244 4.19875617105854 7.20497531576586 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0123661172194879 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 123182202 C/T 1 16 18 34 7.60248765788293 9.4472013848817 -1.84471372699878 T:C C T 10 0.524844521382317 0.60750186092226 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 123205912 C/G 1 14 10 24 6.65217670064756 5.24844521382317 1.40373148682439 A:C:G C G 10 0.524844521382317 0.68399385582614 ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 10 12 22 4.75155478617683 6.2981342565878 -1.54657947041097 A:G A G 10 0.524844521382317 0.529783952880351 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 13 6 19 6.17702122202988 3.1490671282939 3.02795409373598 C:G C G 10 0.524844521382317 0.177001750415867 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 225 195 420 106.909982688979 102.344681669552 4.56530101942688 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.660524542210695 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 123850675 C/T 1 4 4 8 1.90062191447073 2.09937808552927 -0.198756171058536 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123850574_123850821:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123850574_123850821:CEP110 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 125075629 A/T 1 23 21 44 10.9285760082067 11.0217349490287 -0.0931589408219473 A:T A T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148187:ENST00000344641:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000297908:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373729:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000470366:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000489572:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373723:exon_125075506_125075665:MRRF;ENSG00000148187:ENST00000373730:exon_125075506_125075665:MRRF HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 125582399 A/G 1 34 30 64 16.1552862730012 15.7453356414695 0.409950631531714 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000136940:ENST00000259467:exon_125580623_125582915:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394286:exon_125580623_125582915:PDCL HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 125621347 A/G 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 A:G A G 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125620948_125621381:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125620948_125621381:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125620948_125621381:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125620948_125621381:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125620948_125621381:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125620948_125621381:RC3H2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 2 7 9 0.950310957235366 3.67391164967622 -2.72360069244085 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0953785163954262 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 125673051 T/G 1 5 6 11 2.37577739308842 3.1490671282939 -0.773289735205486 T:G T G 10 0.524844521382317 0.766113750348865 ENSG00000186130:ENST00000373659:exon_125670335_125674360:ZBTB6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 125898732 T/C 1 53 33 86 25.1832403667372 17.3198692056165 7.86337116112074 T:C T C 10 0.524844521382317 0.104948133524117 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125898660_125898794:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000492885:exon_125898660_125898782:STRBP HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 126783433 G/C 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 C:G G C 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000106689:ENST00000373615:exon_126783378_126783583:LHX2;ENSG00000106689:ENST00000446480:exon_126783378_126783583:LHX2;ENSG00000106689:ENST00000488674:exon_126783378_126783583:LHX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 127101924 C/T 1 115 152 267 54.6428800410335 79.7763672501122 -25.1334872090786 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.00215661260650848 ENSG00000119408:ENST00000373603:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373600:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373601:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000320246:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000454453:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000394199:exon_127101850_127101944:NEK6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 127650631 A/C 1 3 5 8 1.42546643585305 2.62422260691158 -1.19875617105854 A:C A C 10 0.524844521382317 0.490004833487733 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127650532_127650675:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127650532_127650675:GOLGA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 127661645 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127661608_127661757:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127661608_127661757:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000485337:exon_127661608_127661712:GOLGA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 127975654 C/T 1 35 11 46 16.6304417516189 5.77328973520549 10.8571520164134 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00162386733803661 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130191186 C/T 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C C T 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130191111_130191199:ZNF79 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130206762 C/T 1 27 8 35 12.8291979226774 4.19875617105854 8.63044175161891 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00358327278379636 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130210946 A/G 1 4 7 11 1.90062191447073 3.67391164967622 -1.77328973520549 A:G A G 10 0.524844521382317 0.369838454129304 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 9 9 18 4.27639930755915 4.72360069244085 -0.447201384881705 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 23 7 30 10.9285760082067 3.67391164967622 7.25466435853049 A:G A G 10 0.524844521382317 0.00950264883150437 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130550198 C/G 1 17 4 21 8.07764313650061 2.09937808552927 5.97826505097134 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00866023681819707 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130616621 G/A 1 7 7 14 3.32608835032378 3.67391164967622 -0.347823299352438 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130616568_130617035:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130616568_130616915:ENG HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 111 71 182 52.7422581265628 37.2639610181445 15.4782971084183 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0257085655544326 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130698043 A/G 1 111 59 170 52.7422581265628 30.9658267615567 21.7764313650061 A:G A G 10 0.524844521382317 0.000908280187492427 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130698851 G/A 1 62 88 150 29.4596396742963 46.1863178816439 -16.7266782073475 A:G G A 10 0.524844521382317 0.00685392942246328 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130698832_130699802:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000373110:exon_130698313_130698934:DPM2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 8 15 23 3.80124382894146 7.87266782073475 -4.07142399179329 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0980444399895555 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130825847 G/A 1 15 15 30 7.12733217926525 7.87266782073475 -0.745335641469509 A:G G A 10 0.524844521382317 0.855847162594056 ENSG00000171169:ENST00000373078:exon_130823512_130826179:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000470245:exon_130825653_130826021:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000488519:exon_130824269_130826179:NAIF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130829403 T/G 1 10 6 16 4.75155478617683 3.1490671282939 1.60248765788293 T:G T G 10 0.524844521382317 0.463486008093855 ENSG00000171169:ENST00000373078:exon_130828870_130829600:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000496649:exon_130828426_130829445:NAIF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130885201 A/T 1 15 7 22 7.12733217926525 3.67391164967622 3.45342052958903 A:T A T 10 0.524844521382317 0.199368685480053 ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130942770 C/T 1 49 27 76 23.2826184522665 14.1708020773226 9.11181637494391 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.0387360782783156 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130942727_130942802:CIZ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 130943027 C/T 1 41 37 78 19.481374623325 19.4192472911457 0.0621273321792764 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130943000_130943077:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130943000_130943093:CIZ1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131085196 G/A 1 65 63 128 30.8851061101494 33.065204847086 -2.18009873693657 A:G G A 10 0.524844521382317 0.723859076462652 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131084815_131085207:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131085131_131085207:COQ4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131191056 G/T 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 T:G G T 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131191036_131191112:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131191036_131191112:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131191036_131191112:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131191036_131191112:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131191036_131191112:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131191036_131191112:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000483893:exon_131191036_131191102:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000487001:exon_131191036_131191112:CERCAM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131196695 C/T 1 10 13 23 4.75155478617683 6.82297877797012 -2.07142399179329 T:C C T 10 0.524844521382317 0.410982853589752 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131196704 G/A 1 10 14 24 4.75155478617683 7.34782329935244 -2.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.312817090933246 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 12 13 25 5.7018657434122 6.82297877797012 -1.12111303455792 A:G A G 10 0.524844521382317 0.692551486497706 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131370244 T/G 1 70 71 141 33.2608835032378 37.2639610181445 -4.00307751490669 T:G T G 10 0.524844521382317 0.501470048727014 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131370131_131370328:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131370131_131370328:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131370131_131370328:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131370131_131370328:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131370131_131370328:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000461855:exon_131370131_131370268:SPTAN1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131482892 C/T 1 63 42 105 29.934795152914 22.0434698980573 7.89132525485672 T:C C T 10 0.524844521382317 0.142476322441472 ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131482673_131483197:PKN3;ENSG00000160447:ENST00000483521:exon_131482835_131483019:PKN3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131483690 A/G 1 98 116 214 46.5652369045329 60.8819644803488 -14.3167275758158 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.0551390171718379 ENSG00000160446:ENST00000372663:exon_131483148_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000372667:exon_131483149_131483781:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000467312:exon_131483159_131483759:ZDHHC12;ENSG00000160446:ENST00000452105:exon_131483676_131483809:ZDHHC12 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 T:G G T 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131550655 A/G 1 3 6 9 1.42546643585305 3.1490671282939 -1.72360069244085 A:G A G 10 0.524844521382317 0.324303250712613 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131550613_131550686:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000475097:exon_131550613_131550686:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131550613_131550686:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131550613_131550686:TBC1D13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 12 7 19 5.7018657434122 3.67391164967622 2.02795409373598 T:C T C 10 0.524844521382317 0.370589300195247 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131689361 G/A 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 A G A 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000175287:ENST00000372592:exon_131689317_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000421063:exon_131689317_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000428610:exon_131689317_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000412476:exon_131689317_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000308941:exon_131689317_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000419552:exon_131689317_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000353176:exon_131689317_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000426694:exon_131689317_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000451000:exon_131689147_131689475:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000424503:exon_131689325_131689475:PHYHD1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 69 45 114 32.7857280246201 23.6180034622043 9.16772456241586 A:C A C 10 0.524844521382317 0.09161740579981 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131777137 G/A 1 5 13 18 2.37577739308842 6.82297877797012 -4.4472013848817 A:G G A 10 0.524844521382317 0.056012196582109 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131777050_131777183:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131777050_131777183:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131777050_131777183:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131777050_131777183:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131777050_131777183:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000455407:exon_131777050_131777183:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000483980:exon_131777050_131777183:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000425236:exon_131777050_131777183:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416230:exon_131777050_131777183:SH3GLB2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131832594 G/A 1 9 7 16 4.27639930755915 3.67391164967622 0.602487657882929 A:G G A 10 0.524844521382317 0.807464941586794 ENSG00000148343:ENST00000439290:exon_131832526_131834350:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000445183:exon_131832526_131834350:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000358369:exon_131832526_131834361:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000413435:exon_131832526_131834350:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000406926:exon_131832526_131834350:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000277475:exon_131832526_131834350:FAM73B;ENSG00000148343:ENST00000483458:exon_131832526_131834350:FAM73B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 131866523 C/G 1 8 2 10 3.80124382894146 1.04968904276463 2.75155478617683 C:G C G 10 0.524844521382317 0.113715016102277 ENSG00000095321:ENST00000351352:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000372536:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000440434:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000318080:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000458362:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000415948:exon_131866467_131866585:CRAT;ENSG00000095321:ENST00000441796:exon_131866476_131866585:CRAT HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 132620364 T/C 1 8 5 13 3.80124382894146 2.62422260691158 1.17702122202988 T:C T C 10 0.524844521382317 0.58722276353256 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000494971:exon_132620329_132620391:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132620329_132620391:USP20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 132631680 T/C 1 6 4 10 2.8509328717061 2.09937808552927 0.75155478617683 T:C T C 10 0.524844521382317 0.756929313741282 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132631589_132631704:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132631589_132631704:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132631589_132631704:USP20;ENSG00000136878:ENST00000491731:exon_132631589_132631704:USP20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 132637608 A/G 1 7 20 27 3.32608835032378 10.4968904276463 -7.17080207732256 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0064200223461747 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 202 194 396 95.981406680772 101.819837148169 -5.83843046739753 T:C C T 10 0.524844521382317 0.580044158690745 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 100 105 205 47.5155478617683 55.1086747451433 -7.59312688337498 A:G A G 10 0.524844521382317 0.294905791098882 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 132848699 G/C 1 5 9 14 2.37577739308842 4.72360069244085 -2.34782329935244 C:G G C 10 0.524844521382317 0.28552173692119 ENSG00000148358:ENST00000372406:exon_132848699_132848755:GPR107;ENSG00000148358:ENST00000475101:exon_132848699_132848755:GPR107;ENSG00000148358:ENST00000347136:exon_132848699_132848755:GPR107;ENSG00000148358:ENST00000372410:exon_132848699_132848755:GPR107;ENSG00000148358:ENST00000493417:exon_132848699_132848755:GPR107;ENSG00000148358:ENST00000455412:exon_132848699_132848755:GPR107;ENSG00000148358:ENST00000462907:exon_132848699_132848755:GPR107 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 133364757 T/C 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 T:C T C 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000130707:ENST00000334909:exon_133364720_133364851:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000352480:exon_133364720_133364851:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372394:exon_133364720_133364851:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000344866:exon_133364720_133364851:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372393:exon_133364720_133364851:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000413709:exon_133364720_133364851:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000493984:exon_133364720_133364791:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000492400:exon_133364720_133364816:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000470849:exon_133364720_133364808:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372386:exon_133364720_133364851:ASS1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 133760677 C/T 1 34 30 64 16.1552862730012 15.7453356414695 0.409950631531714 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 12 12 24 5.7018657434122 6.2981342565878 -0.596268513175607 T:C C T 10 0.524844521382317 0.840462980575682 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134073807 A/G 1 58 59 117 27.5590177598256 30.9658267615567 -3.40680900173109 A:T:G A G 10 0.524844521382317 0.578850587591484 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000531600:exon_134072603_134074035:NUP214 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134346315 T/C 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 T:C T C 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134346175_134346370:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134346175_134346370:BAT2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134350323 C/G 1 14 17 31 6.65217670064756 8.92235686349939 -2.27018016285183 C:G C G 10 0.524844521382317 0.473797754482654 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 19 11 30 9.02795409373598 5.77328973520549 3.25466435853049 T:C C T 10 0.524844521382317 0.27466732949558 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134350561 C/T 1 26 20 46 12.3540424440598 10.4968904276463 1.85715201641342 T:C C T 10 0.524844521382317 0.658717870168319 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134351065 G/T 1 12 16 28 5.7018657434122 8.39751234211707 -2.69564659870487 T:G G T 10 0.524844521382317 0.347115703840086 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134351343 C/T 1 5 11 16 2.37577739308842 5.77328973520549 -3.39751234211707 T:C C T 10 0.524844521382317 0.131066746913676 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134351317_134351922:BAT2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134358108 A/G 1 16 18 34 7.60248765788293 9.4472013848817 -1.84471372699878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.60750186092226 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134358097_134358294:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000451855:exon_134358097_134358294:BAT2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 40 37 77 19.0062191447073 19.4192472911457 -0.413028146438403 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134385436 A/G 1 3 9 12 1.42546643585305 4.72360069244085 -3.2981342565878 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0806371385683381 ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000448212:exon_134385290_134385449:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134385290_134385802:POMT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134386744 T/C 1 10 8 18 4.75155478617683 4.19875617105854 0.552798615118295 T:C T C 10 0.524844521382317 0.818610293564444 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134387488 T/C 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 T:C T C 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134398430 G/A 1 15 35 50 7.12733217926525 18.3695582483811 -11.2422260691158 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.00163144757334019 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134398319_134399185:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372220:exon_134398319_134399193:POMT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 11 18 29 5.22671026479451 9.4472013848817 -4.22049112008719 T:C C T 10 0.524844521382317 0.137576283488010 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 134458054 C/G 1 30 36 66 14.2546643585305 18.8944027697634 -4.63973841123292 C:G C G 10 0.524844521382317 0.268941166530498 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134457992_134458089:RAPGEF1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 77 43 120 36.5869718535616 22.5683144194396 14.018657434122 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0104545894298741 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 135203803 G/A 1 8 16 24 3.80124382894146 8.39751234211707 -4.59626851317561 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0673884929405873 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 135493797 C/T 1 19 9 28 9.02795409373598 4.72360069244085 4.30435340129513 T:C C T 10 0.524844521382317 0.129749466460062 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135493717_135493828:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135493717_135493828:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135493717_135493828:DDX31 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 135759367 C/T 1 11 9 20 5.22671026479451 4.72360069244085 0.503109572353661 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000165698:ENST00000372136:exon_135759298_135759478:C9orf9;ENSG00000165698:ENST00000356311:exon_135759298_135759478:C9orf9;ENSG00000165698:ENST00000350499:exon_135759298_135759478:C9orf9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 135772606 T/C 1 7 14 21 3.32608835032378 7.34782329935244 -4.02173494902866 T:C T C 10 0.524844521382317 0.0847282864109202 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135772571_135772732:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135772571_135772732:TSC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 136277903 G/A 1 37 26 63 17.5807527088543 13.6459575559402 3.93479515291403 A:G G A 10 0.524844521382317 0.377484308759908 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277898_136278041:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277898_136278041:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277898_136278041:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277898_136278041:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136277898_136278041:REXO4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 136340200 T/G 1 17 19 36 8.07764313650061 9.97204590626402 -1.89440276976341 T:G T G 10 0.524844521382317 0.617406672512397 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 136341414 C/T 1 13 13 26 6.17702122202988 6.82297877797012 -0.645957555940241 T:C C T 10 0.524844521382317 0.846066920328117 ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136341359_136341458:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136341359_136341458:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136341359_136341458:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000432868:exon_136341359_136341458:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000414172:exon_136341355_136341536:SLC2A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 136633669 G/A 1 17 25 42 8.07764313650061 13.1211130345579 -5.04346989805731 A:G G A 10 0.524844521382317 0.124982674019902 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 136907017 C/T 1 6 2 8 2.8509328717061 1.04968904276463 1.80124382894146 T:C C T 10 0.524844521382317 0.293913347766002 ENSG00000169925:ENST00000303407:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000371834:exon_136906882_136907073:BRD3;ENSG00000169925:ENST00000357885:exon_136906882_136907073:BRD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 137713948 C/T 1 3 17 20 1.42546643585305 8.92235686349939 -7.49689042764634 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00105619632994501 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137713943_137713996:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137713943_137713996:COL5A1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 138377900 C/T 1 6 7 13 2.8509328717061 3.67391164967622 -0.822978777970121 T:C C T 10 0.524844521382317 0.783356128888731 ENSG00000196422:ENST00000356818:exon_138376295_138380739:KIAA0649 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 138395423 A/G 1 147 153 300 69.8478553567994 80.3012117714945 -10.4533564146951 A:C:G A G 10 0.524844521382317 0.247586614534177 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000488610:exon_138395388_138395806:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000485333:exon_138395388_138395822:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000462948:exon_138395388_138395440:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472852:exon_138395388_138395801:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000453385:exon_138395388_138395856:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000472946:exon_138395388_138395832:MRPS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 138395969 A/G 1 239 256 495 113.562159389626 134.360197473873 -20.7980380842469 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0649605762096048 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 138852904 C/G 1 28 50 78 13.3043534012951 26.2422260691158 -12.9378726678207 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00429654801999218 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138852871_138853226:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000478485:exon_138852871_138853058:UBAC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 138905094 G/A 1 6 3 9 2.8509328717061 1.57453356414695 1.27639930755915 A:G G A 10 0.524844521382317 0.512655373125665 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138905045_138905142:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138905045_138905142:NACC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139100846 C/T 1 15 8 23 7.12733217926525 4.19875617105854 2.92857600820671 T:C C T 10 0.524844521382317 0.29679434643917 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139256495 G/T 1 12 80 92 5.7018657434122 41.9875617105854 -36.2856959671732 T:G G T 10 0.524844521382317 3.38018953512180e-15 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139257473 G/A 1 25 101 126 11.8788869654421 53.009296659614 -41.1304096941719 A:G G A 10 0.524844521382317 6.34493673443571e-14 ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139257441_139257580:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139257441_139258853:CARD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139265088 C/T 0 16 0 16 7.60248765788293 0 7.60248765788293 C C 10 0.524844521382317 3.99016046513400e-05 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139264974_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000485975:exon_139264202_139265153:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139264974_139265153:CARD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139266405 G/A 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 G G 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139266496 C/T 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139270876 G/A 1 43 43 86 20.4316855805604 22.5683144194396 -2.13662883887926 A:G G A 10 0.524844521382317 0.666927644391783 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 52 35 87 24.7080848881195 18.3695582483811 6.33852663973843 A:G A G 10 0.524844521382317 0.197726484630729 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 22 13 35 10.453420529589 6.82297877797012 3.63044175161891 T:C T C 10 0.524844521382317 0.239649884557393 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 26 12 38 12.3540424440598 6.2981342565878 6.05590818747196 T:C C T 10 0.524844521382317 0.052220812255966 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 18 16 34 8.5527986151183 8.39751234211707 0.155286273001224 A:C A C 10 0.524844521382317 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 C:G G C 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139279173 G/A 1 15 4 19 7.12733217926525 2.09937808552927 5.02795409373598 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0219757172151644 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139279172_139279266:SNAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 9 12 21 4.27639930755915 6.2981342565878 -2.02173494902866 A:G A G 10 0.524844521382317 0.392064281065116 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139301583 T/C 1 6 8 14 2.8509328717061 4.19875617105854 -1.34782329935244 T:C T C 10 0.524844521382317 0.595138344988413 ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139301398_139301660:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139301960 G/A 1 34 21 55 16.1552862730012 11.0217349490287 5.13355132397257 A:G G A 10 0.524844521382317 0.178697425321398 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 56 69 125 26.6087068025902 36.2142719753799 -9.60556517278962 T:C:G C T 10 0.524844521382317 0.0892351379356603 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139326959 G/A 1 12 9 21 5.7018657434122 4.72360069244085 0.978265050971344 A:G G A 10 0.524844521382317 0.82776559005242 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139326931_139327038:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139326931_139327038:INPP5E HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139350552 C/A 1 16 16 32 7.60248765788293 8.39751234211707 -0.795024684234143 A:C C A 10 0.524844521382317 0.860150442628282 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139350505_139350618:SEC16A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 13 14 27 6.17702122202988 7.34782329935244 -1.17080207732256 T:C C T 10 0.524844521382317 0.702665708426939 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139370147 G/A 1 19 9 28 9.02795409373598 4.72360069244085 4.30435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.129749466460062 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139369650_139370940:SEC16A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139371786 A/C 1 5 8 13 2.37577739308842 4.19875617105854 -1.82297877797012 A:C A C 10 0.524844521382317 0.407748327331287 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139390655 C/T 1 22 25 47 10.453420529589 13.1211130345579 -2.6676925049689 T:C C T 10 0.524844521382317 0.467464911358237 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139390853 C/T 1 31 28 59 14.7298198371482 14.6956465987049 0.034173238443298 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139390982 C/T 1 46 44 90 21.8571520164134 23.0931589408219 -1.23600692440853 T:C C T 10 0.524844521382317 0.833180452151922 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139391414 A/G 1 16 19 35 7.60248765788293 9.97204590626402 -2.36955824838109 A:G A G 10 0.524844521382317 0.499305362167602 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139391636 G/A 1 20 8 28 9.50310957235366 4.19875617105854 5.30435340129513 A:G G A 10 0.524844521382317 0.057157160112252 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139396480 G/A 1 10 10 20 4.75155478617683 5.24844521382317 -0.496890427646338 A:C:G G A 10 0.524844521382317 0.82739042401884 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139396453_139396540:NOTCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139397707 G/A 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G G A 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139397634_139397782:NOTCH1;ENSG00000148400:ENST00000494783:exon_139397634_139397782:NOTCH1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139568232 G/A 1 26 15 41 12.3540424440598 7.87266782073475 4.481374623325 A:G G A 10 0.524844521382317 0.210465500710248 ENSG00000169692:ENST00000371694:exon_139567595_139568379:AGPAT2;ENSG00000169692:ENST00000371696:exon_139567595_139568379:AGPAT2;ENSG00000169692:ENST00000472820:exon_139568161_139568379:AGPAT2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139617662 T/C 1 5 10 15 2.37577739308842 5.24844521382317 -2.87266782073475 T:C T C 10 0.524844521382317 0.195407863939997 ENSG00000165716:ENST00000371692:exon_139617414_139618502:FAM69B;ENSG00000165716:ENST00000371691:exon_139617414_139618502:FAM69B HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139837125 G/A 1 89 55 144 42.2888375969738 28.8664486760274 13.4223889209464 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0297091369830545 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836999_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836999_139837178:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000491246:exon_139836999_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139836999_139837395:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000428398:exon_139837103_139837147:FBXW5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139887332 G/A 1 10 7 17 4.75155478617683 3.67391164967622 1.07764313650061 A:G G A 10 0.524844521382317 0.63632266744172 ENSG00000148362:ENST00000468484:exon_139887092_139887632:C9orf142;ENSG00000148362:ENST00000481187:exon_139886894_139887426:C9orf142;ENSG00000148362:ENST00000488678:exon_139887092_139887695:C9orf142;ENSG00000148362:ENST00000493968:exon_139887092_139887426:C9orf142;ENSG00000148362:ENST00000492564:exon_139887213_139887426:C9orf142;ENSG00000148362:ENST00000498095:exon_139887309_139887695:C9orf142 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139925927 G/C 1 2 6 8 0.950310957235366 3.1490671282939 -2.19875617105854 C:G G C 10 0.524844521382317 0.161779670202183 ENSG00000180549:ENST00000314412:exon_139924626_139926177:FUT7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139943112 A/G 1 5 3 8 2.37577739308842 1.57453356414695 0.801243828941465 A:G A G 10 0.524844521382317 0.729252985069814 ENSG00000054179:ENST00000355097:exon_139942550_139943312:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000460614:exon_139942559_139943312:ENTPD2;ENSG00000054179:ENST00000312665:exon_139943049_139943312:ENTPD2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 139981627 A/G 1 13 4 17 6.17702122202988 2.09937808552927 4.07764313650061 A:G A G 10 0.524844521382317 0.0537214037230151 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139981400_139981670:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139981533_139981670:MAN1B1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 380 209 589 180.55908187472 109.692504968904 70.8665769058153 A:T:G G A 10 0.524844521382317 4.01164177933415e-09 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140075323 G/A 1 13 12 25 6.17702122202988 6.2981342565878 -0.121113034557924 A:G G A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140075240_140075381:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140075240_140075381:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000471131:exon_140075298_140075381:ANAPC2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140108422 C/T 1 1 8 9 0.475155478617683 4.19875617105854 -3.72360069244085 T:C C T 10 0.524844521382317 0.0165296951595347 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140108419_140108520:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140108419_140108520:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140108419_140108520:NDOR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140110737 A/G 1 13 16 29 6.17702122202988 8.39751234211707 -2.22049112008719 A:G A G 10 0.524844521382317 0.45973512332539 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140110724_140111461:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140110724_140111461:NDOR1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140138011 C/T 1 432 422 854 205.267166762839 221.484388023338 -16.2172212604987 T:C C T 10 0.524844521382317 0.272986951334949 ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140136948_140138159:TUBB2C HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140150476 C/T 1 23 24 47 10.9285760082067 12.5962685131756 -1.6676925049689 T:C C T 10 0.524844521382317 0.663026109767045 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140150359_140150522:COBRA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140267455 C/A 1 11 18 29 5.22671026479451 9.4472013848817 -4.22049112008719 A:C C A 10 0.524844521382317 0.137576283488010 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140446806 C/T 1 348 342 690 165.354106558954 179.496826312752 -14.1427197537987 A:T:C C T 10 0.524844521382317 0.286009273880402 ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140508258 A/G 1 6 6 12 2.8509328717061 3.1490671282939 -0.298134256587804 A:G A G 10 0.524844521382317 1 ENSG00000197070:ENST00000466367:exon_140508067_140508663:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000491911:exon_140508067_140508666:ARRDC1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . 9 140611121 A/T 1 21 18 39 9.97826505097134 9.4472013848817 0.531063666089638 A:T A T 10 0.524844521382317 0.874437983138576 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 221812 C/T 1 131 111 242 62.2453676989165 58.2577418734372 3.98762582547929 T:C C T 10 0.524844521382317 0.652417828409821 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 228149 G/C 1 57 31 88 27.0838622812079 16.2701801628518 10.8136821183561 C:G G C 10 0.524844521382317 0.0245368458558899 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_228086_228294:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_228086_228294:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_228086_228294:GTPBP6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 295069 A/G 1 10 11 21 4.75155478617683 5.77328973520549 -1.02173494902866 A:G A G 10 0.524844521382317 0.669227507041707 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 295079 C/T 1 12 10 22 5.7018657434122 5.24844521382317 0.453420529589027 T:C C T 10 0.524844521382317 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 295189 C/G 1 9 1 10 4.27639930755915 0.524844521382317 3.75155478617683 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0230108839750243 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 306267 C/T 1 8 12 20 3.80124382894146 6.2981342565878 -2.49689042764634 T:C C T 10 0.524844521382317 0.273827921303142 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_306251_306407:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_306251_306407:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_306251_306407:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_306251_306364:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000484364:exon_306251_306361:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477636:exon_306251_306407:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_305631_306407:PPP2R3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1505597 C/T 1 1516 1057 2573 720.335705584407 554.760659101109 165.575046483298 A:T:C:G C T 10 0.524844521382317 6.05675042745611e-11 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1505045_1505652:SLC25A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 1876 1955 3831 891.391677886773 1026.07103930243 -134.679361415656 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 1.34485316624153e-05 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1508465 G/A 1 1594 1372 2966 757.397832916587 720.086683336539 37.3111495800479 A:T:C:G G A 10 0.524844521382317 0.173688214116198 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1522325 C/T 1 135 113 248 64.1459896133872 59.3074309162018 4.8385586971854 T:C C T 10 0.524844521382317 0.567373924581454 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1522034_1522382:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1522034_1522382:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1522034_1522382:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 110 90 200 52.2671026479451 47.2360069244085 5.03109572353661 T:C C T 10 0.524844521382317 0.480101005333877 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1536964 C/T 1 41 41 82 19.481374623325 21.518625376675 -2.03725075334999 T:C C T 10 0.524844521382317 0.660051939254403 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1537002 C/G 1 45 44 89 21.3819965377957 23.0931589408219 -1.71116240302621 C:G C G 10 0.524844521382317 0.750769554868429 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 44 47 91 20.9068410591781 24.6676925049689 -3.76085144579084 T:C C T 10 0.524844521382317 0.463177546449437 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1546792 G/A 1 100 72 172 47.5155478617683 37.7888055395268 9.72674232224148 A:G G A 10 0.524844521382317 0.147064900108922 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1546842 A/G 1 94 103 197 44.6646149900622 54.0589857023786 -9.39437071231644 A:G A G 10 0.524844521382317 0.199046283511226 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 107 93 200 50.8416362120921 48.8105404885555 2.03109572353661 A:G A G 10 0.524844521382317 0.777638911848856 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 27 26 53 12.8291979226774 13.6459575559402 -0.816759633262798 T:C T C 10 0.524844521382317 0.890883608117675 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1585311 C/G 1 16 32 48 7.60248765788293 16.7950246842341 -9.19253702635121 C:G C G 10 0.524844521382317 0.00890933310513837 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1712853 C/T 1 36 41 77 17.1055972302366 21.518625376675 -4.41302814643841 T:C C T 10 0.524844521382317 0.361490431721780 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 32 34 66 15.2049753157659 17.8447137269988 -2.63973841123292 T:C C T 10 0.524844521382317 0.539475787852711 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 2139187 G/A 1 31 13 44 14.7298198371482 6.82297877797012 7.90684105917805 A:T:G G A 10 0.524844521382317 0.0224894113397288 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 2326851 C/A 1 6 5 11 2.8509328717061 2.62422260691158 0.226710264794514 A:C C A 10 0.524844521382317 1 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000444280:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000441131:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000478825:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000430536:exon_2326786_2326854:DHRSX HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 7175283 G/A 1 10 1 11 4.75155478617683 0.524844521382317 4.22671026479451 A:G G A 10 0.524844521382317 0.0127875069116162 ENSG00000101846:ENST00000217961:exon_7175283_7175404:STS HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 11786778 A/G 1 140 16 156 66.5217670064756 8.39751234211707 58.1242546643586 A:G A G 10 0.524844521382317 1.49934813284409e-23 ENSG00000005302:ENST00000312196:exon_11786692_11786801:MSL3;ENSG00000005302:ENST00000398527:exon_11786692_11786801:MSL3;ENSG00000005302:ENST00000361672:exon_11786692_11786801:MSL3;ENSG00000005302:ENST00000468149:exon_11786692_11786801:MSL3;ENSG00000005302:ENST00000380693:exon_11786692_11786801:MSL3;ENSG00000005302:ENST00000487782:exon_11786692_11786803:MSL3;ENSG00000005302:ENST00000380691:exon_11786692_11786803:MSL3;ENSG00000005302:ENST00000467141:exon_11786692_11787221:MSL3;ENSG00000005302:ENST00000473380:exon_11786432_11786801:MSL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 12809661 G/A 0 28 0 28 13.3043534012951 0 13.3043534012951 G G 10 0.524844521382317 1.53771360996459e-08 ENSG00000101911:ENST00000380663:exon_12809474_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000380668:exon_12809489_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000398491:exon_12809525_12809738:PRPS2;ENSG00000101911:ENST00000489404:exon_12809607_12809738:PRPS2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 13397397 C/T 1 349 1 350 165.829262037571 0.524844521382317 165.304417516189 T:C C T 10 0.524844521382317 3.34924539303952e-96 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 15841045 C/T 1 42 75 117 19.9565301019427 39.3633391036738 -19.4068090017311 T:C C T 10 0.524844521382317 0.000392239161352409 ENSG00000169249:ENST00000307771:exon_15840854_15841383:ZRSR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 18912442 C/T 0 0 24 24 0 12.5962685131756 -12.5962685131756 T C T 10 0.524844521382317 1.75411388669209e-08 ENSG00000044446:ENST00000379942:exon_18912322_18912522:PHKA2;ENSG00000044446:ENST00000481718:exon_18912322_18914752:PHKA2;ENSG00000044446:ENST00000469485:exon_18912322_18912522:PHKA2;ENSG00000044446:ENST00000473597:exon_18912322_18912522:PHKA2;ENSG00000044446:ENST00000473739:exon_18912200_18912522:PHKA2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 20154458 C/T 1 9 6 15 4.27639930755915 3.1490671282939 1.12733217926525 T:C C T 10 0.524844521382317 0.613976791497016 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 37699812 C/G 0 32 0 32 15.2049753157659 0 15.2049753157659 C C 10 0.524844521382317 1.14453551206967e-09 ENSG00000165169:ENST00000378578:exon_37698089_37699904:DYNLT3;ENSG00000165169:ENST00000432389:exon_37699796_37699904:DYNLT3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 40450602 G/A 1 67 6 73 31.8354170673848 3.1490671282939 28.6863499390909 A:G G A 10 0.524844521382317 4.63879974596538e-13 ENSG00000182220:ENST00000378438:exon_40450486_40450617:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000436783:exon_40450486_40450617:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000486558:exon_40450486_40450617:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000447485:exon_40450486_40450617:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000423649:exon_40450486_40450617:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000487051:exon_40450486_40450683:ATP6AP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 40506331 G/A 1 53 3 56 25.1832403667372 1.57453356414695 23.6087068025903 A:G G A 10 0.524844521382317 5.05858392412967e-12 ENSG00000185753:ENST00000378426:exon_40506259_40506806:CXorf38;ENSG00000185753:ENST00000327877:exon_40506259_40506393:CXorf38;ENSG00000185753:ENST00000378421:exon_40506259_40506393:CXorf38;ENSG00000185753:ENST00000378418:exon_40506259_40506393:CXorf38 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 41055609 G/A 0 0 12 12 0 6.2981342565878 -6.2981342565878 A G A 10 0.524844521382317 0.000132442964580686 ENSG00000124486:ENST00000378308:exon_41055504_41055612:USP9X;ENSG00000124486:ENST00000324545:exon_41055504_41055612:USP9X;ENSG00000124486:ENST00000453805:exon_41055504_41055612:USP9X;ENSG00000124486:ENST00000462850:exon_41055504_41055612:USP9X HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 41060458 C/T 1 32 3 35 15.2049753157659 1.57453356414695 13.6304417516189 T:C C T 10 0.524844521382317 1.28224828135827e-06 ENSG00000124486:ENST00000378308:exon_41060313_41060533:USP9X;ENSG00000124486:ENST00000324545:exon_41060313_41060533:USP9X;ENSG00000124486:ENST00000453805:exon_41060313_41060533:USP9X HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 44922880 A/G 1 4 5 9 1.90062191447073 2.62422260691158 -0.723600692440852 A:G A G 10 0.524844521382317 0.744219842559896 ENSG00000147050:ENST00000382899:exon_44922667_44923062:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000334516:exon_44922667_44923062:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000377967:exon_44922667_44923062:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000451692:exon_44922667_44922921:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000414389:exon_44922667_44923062:KDM6A;ENSG00000147050:ENST00000433797:exon_44922667_44923062:KDM6A HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 46466343 C/T 0 0 25 25 0 13.1211130345579 -13.1211130345579 T C T 10 0.524844521382317 8.33476823381103e-09 ENSG00000065923:ENST00000328306:exon_46464753_46466638:SLC9A7;ENSG00000065923:ENST00000464933:exon_46466343_46466638:SLC9A7 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 47061860 A/G 1 281 43 324 133.518689491569 22.5683144194396 110.950375072129 A:G A G 10 0.524844521382317 4.84895916674637e-39 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47061757_47061903:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47061757_47061903:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47061757_47061903:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47061757_47061903:UBA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 47070261 G/A 1 592 100 692 281.292043341668 52.4844521382317 228.807591203437 A:G G A 10 0.524844521382317 9.53038574612052e-76 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47070241_47070315:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47070241_47070315:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000431324:exon_47070241_47070315:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47070241_47070315:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47070241_47070315:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377269:exon_47070241_47070315:UBA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 47084037 A/G 1 88 14 102 41.8136821183561 7.34782329935244 34.4658588190037 A:G A G 10 0.524844521382317 8.58928210484711e-13 ENSG00000102225:ENST00000457458:exon_47084017_47084142:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000276052:exon_47084017_47084142:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000357227:exon_47084017_47084142:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000519758:exon_47084017_47084130:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000520893:exon_47084017_47084139:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000517426:exon_47084017_47084142:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000522234:exon_47084017_47084142:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000518391:exon_47084017_47084142:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000428400:exon_47084017_47084142:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000518022:exon_47084017_47084142:CDK16;ENSG00000102225:ENST00000523034:exon_47084017_47084142:CDK16 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 47429050 G/A 0 73 0 73 34.6863499390909 0 34.6863499390909 G G 10 0.524844521382317 3.85889871869555e-21 ENSG00000078061:ENST00000377045:exon_47428938_47429056:ARAF;ENSG00000078061:ENST00000290277:exon_47428938_47429056:ARAF;ENSG00000078061:ENST00000469505:exon_47428858_47429056:ARAF HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 48326112 C/T 0 0 52 52 0 27.2919151118805 -27.2919151118805 T C T 10 0.524844521382317 1.56840615478773e-17 ENSG00000017483:ENST00000376876:exon_48326097_48326172:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000317669:exon_48326097_48326172:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000453124:exon_48326097_48326172:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000440085:exon_48326097_48326172:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000441948:exon_48326097_48326172:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000413668:exon_48326097_48326172:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000416711:exon_48326097_48326172:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000488083:exon_48326097_48326172:SLC38A5;ENSG00000017483:ENST00000429543:exon_48326097_48326172:SLC38A5 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 48759204 C/T 0 0 9 9 0 4.72360069244085 -4.72360069244085 T C T 10 0.524844521382317 0.00123458691590234 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 48839478 G/A 0 0 113 113 0 59.3074309162018 -59.3074309162018 A G A 10 0.524844521382317 3.03695772028392e-37 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48839391_48839504:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48839391_48839504:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48839391_48839504:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48839391_48839504:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48839391_48839504:GRIPAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 48847444 G/A 0 39 0 39 18.5310636660896 0 18.5310636660896 G G 10 0.524844521382317 2.30412972848725e-11 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 48896755 G/A 0 21 0 21 9.97826505097134 0 9.97826505097134 G G 10 0.524844521382317 1.48372543138855e-06 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48896632_48896935:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48896632_48896870:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48896632_48896935:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000336239:exon_48896632_48896935:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000487451:exon_48896632_48896870:TFE3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 48970655 C/T 0 0 104 104 0 54.583830223761 -54.583830223761 T C T 10 0.524844521382317 2.45989786637600e-34 ENSG00000068394:ENST00000156109:exon_48970334_48970693:GPKOW;ENSG00000068394:ENST00000327905:exon_48970346_48970693:GPKOW HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 48972351 G/A 1 1 100 101 0.475155478617683 52.4844521382317 -52.009296659614 A:G G A 10 0.524844521382317 2.58108117233034e-31 ENSG00000068394:ENST00000156109:exon_48972245_48972368:GPKOW;ENSG00000068394:ENST00000327905:exon_48972245_48972368:GPKOW HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 49032001 C/G 0 107 0 107 50.8416362120921 0 50.8416362120921 C C 10 0.524844521382317 1.29052843231243e-30 ENSG00000012211:ENST00000376317:exon_49031151_49032614:PRICKLE3;ENSG00000012211:ENST00000453382:exon_49031970_49032614:PRICKLE3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 49126714 C/T 0 0 9 9 0 4.72360069244085 -4.72360069244085 T C T 10 0.524844521382317 0.00123458691590234 ENSG00000049769:ENST00000055335:exon_49126317_49127336:PPP1R3F;ENSG00000049769:ENST00000376190:exon_49126525_49127336:PPP1R3F HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 49137916 T/C 0 0 12 12 0 6.2981342565878 -6.2981342565878 C T C 10 0.524844521382317 0.000132442964580686 ENSG00000049769:ENST00000466508:exon_49137869_49137924:PPP1R3F;ENSG00000049769:ENST00000438316:exon_49137869_49137924:PPP1R3F;ENSG00000049769:ENST00000055335:exon_49137869_49137924:PPP1R3F;ENSG00000049769:ENST00000495799:exon_49137869_49137924:PPP1R3F;ENSG00000049769:ENST00000376190:exon_49137869_49137924:PPP1R3F;ENSG00000049769:ENST00000471261:exon_49137869_49137924:PPP1R3F;ENSG00000049769:ENST00000376188:exon_49137239_49137924:PPP1R3F HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 53247092 C/G 1 13 4 17 6.17702122202988 2.09937808552927 4.07764313650061 C:G C G 10 0.524844521382317 0.0537214037230151 ENSG00000126012:ENST00000375401:exon_53246978_53247148:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000404049:exon_53246978_53247148:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000375379:exon_53246978_53247148:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000375383:exon_53246978_53247148:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000429877:exon_53246992_53247148:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000495519:exon_53247011_53247148:KDM5C;ENSG00000126012:ENST00000467093:exon_53247035_53247148:KDM5C HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 53439035 C/T 1 12 27 39 5.7018657434122 14.1708020773226 -8.46893633391036 T:C C T 10 0.524844521382317 0.00939605354696981 ENSG00000072501:ENST00000322213:exon_53438945_53439203:SMC1A;ENSG00000072501:ENST00000375340:exon_53438945_53439203:SMC1A;ENSG00000072501:ENST00000463684:exon_53438945_53439203:SMC1A HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 54471028 A/G 0 0 113 113 0 59.3074309162018 -59.3074309162018 G A G 10 0.524844521382317 3.03695772028392e-37 ENSG00000158526:ENST00000375151:exon_54470849_54471920:TSR2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 54581088 T/C 0 0 30 30 0 15.7453356414695 -15.7453356414695 C T C 10 0.524844521382317 2.01870209348630e-10 ENSG00000130119:ENST00000396246:exon_54580998_54581125:GNL3L;ENSG00000130119:ENST00000336470:exon_54580998_54581125:GNL3L;ENSG00000130119:ENST00000360845:exon_54580998_54581125:GNL3L;ENSG00000130119:ENST00000396243:exon_54580998_54581125:GNL3L HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 1 1 128 129 0.475155478617683 67.1800987369366 -66.7049432583189 T:C C T 10 0.524844521382317 2.94193103918662e-40 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 68382242 A/G 0 65 0 65 30.8851061101494 0 30.8851061101494 A A 10 0.524844521382317 7.05712081317103e-19 ENSG00000181191:ENST00000374583:exon_68380697_68383388:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000361478:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000396010:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374571:exon_68380734_68382983:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000477231:exon_68382169_68382977:PJA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 70767795 T/C 0 14 0 14 6.65217670064756 0 6.65217670064756 T T 10 0.524844521382317 0.000150247370579061 ENSG00000147162:ENST00000373719:exon_70767757_70767873:OGT;ENSG00000147162:ENST00000488174:exon_70764417_70767873:OGT;ENSG00000147162:ENST00000373701:exon_70767757_70767873:OGT;ENSG00000147162:ENST00000455587:exon_70767757_70767873:OGT;ENSG00000147162:ENST00000415630:exon_70767604_70767873:OGT HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 71401614 C/A 0 11 0 11 5.22671026479451 0 5.22671026479451 C C 10 0.524844521382317 0.00111114617361232 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71401203_71401678:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71401526_71401678:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71401526_71401678:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71401529_71401678:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71401577_71401678:PIN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 71416721 C/T 0 0 51 51 0 26.7670705904982 -26.7670705904982 T C T 10 0.524844521382317 3.30082725627097e-17 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71416635_71416951:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000439980:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000496835:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000446576:exon_71416635_71417204:PIN4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 73069363 C/G 0 0 14 14 0 7.34782329935244 -7.34782329935244 G C G 10 0.524844521382317 2.99020095317427e-05 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 73069372 G/T 0 0 10 10 0 5.24844521382317 -5.24844521382317 T G T 10 0.524844521382317 0.000586620736920706 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 73072346 C/A 0 0 68 68 0 35.6894274539976 -35.6894274539976 A C A 10 0.524844521382317 1.05884013739803e-22 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 96354707 T/C 0 0 9 9 0 4.72360069244085 -4.72360069244085 C T C 10 0.524844521382317 0.00123458691590234 ENSG00000147202:ENST00000373061:exon_96354693_96354794:DIAPH2;ENSG00000147202:ENST00000355827:exon_96354693_96354794:DIAPH2;ENSG00000147202:ENST00000373054:exon_96354693_96354794:DIAPH2;ENSG00000147202:ENST00000373049:exon_96354693_96354794:DIAPH2;ENSG00000147202:ENST00000324765:exon_96354693_96354794:DIAPH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 100087831 C/T 0 47 1 48 22.3323074950311 0.524844521382317 21.8074629736488 A:C C A 10 0.524844521382317 2.05965109955475e-12 ENSG00000101811:ENST00000372972:exon_100087723_100087898:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000415585:exon_100087723_100087898:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000458320:exon_100087723_100087898:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000486615:exon_100087723_100087898:CSTF2;ENSG00000101811:ENST00000475126:exon_100087723_100087898:CSTF2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 100608191 G/A 1 1 269 270 0.475155478617683 141.183176251843 -140.708020773226 A:G G A 10 0.524844521382317 1.66595233413692e-85 ENSG00000010671:ENST00000372880:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372869:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372855:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372859:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372860:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000395179:exon_100608182_100608203:BTK;ENSG00000010671:ENST00000308731:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000443591:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000470069:exon_100608031_100608339:BTK HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 100609032 C/T 0 0 20 20 0 10.4968904276463 -10.4968904276463 T C T 10 0.524844521382317 3.44123888985391e-07 ENSG00000010671:ENST00000488970:exon_100608858_100609209:BTK HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 100668296 C/T 0 0 132 132 0 69.2794768224658 -69.2794768224658 T C T 10 0.524844521382317 2.19946890737464e-43 ENSG00000126945:ENST00000455741:exon_100666924_100669106:HNRNPH2;ENSG00000126945:ENST00000457902:exon_100667397_100668825:HNRNPH2;ENSG00000126945:ENST00000316594:exon_100666924_100669121:HNRNPH2;ENSG00000126945:ENST00000395130:exon_100666947_100668813:HNRNPH2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 100880973 T/A 1 2 88 90 0.950310957235366 46.1863178816439 -45.2360069244085 A:T T A 10 0.524844521382317 4.10244682161194e-26 ENSG00000102401:ENST00000341189:exon_100879824_100882833:ARMCX3;ENSG00000102401:ENST00000471229:exon_100879824_100881474:ARMCX3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 101138581 G/A 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 G G 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 ENSG00000166432:ENST00000372782:exon_101137262_101139793:ZMAT1;ENSG00000166432:ENST00000494068:exon_101137630_101139793:ZMAT1;ENSG00000166432:ENST00000458570:exon_101138032_101139793:ZMAT1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 102842041 T/C 0 0 377 377 0 197.866384561133 -197.866384561133 C:G T C 10 0.524844521382317 1.46917794370417e-122 ENSG00000133142:ENST00000372629:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000414064:exon_102841578_102842653:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000468024:exon_102841577_102842446:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472484:exon_102841577_102842657:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000415568:exon_102841582_102842430:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000472745:exon_102841577_102842622:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000494801:exon_102841582_102842454:TCEAL4;ENSG00000133142:ENST00000452632:exon_102841878_102842251:TCEAL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 102864251 C/G 0 0 169 169 0 88.6987241136116 -88.6987241136116 A:G C G 10 0.524844521382317 2.42795284747525e-55 ENSG00000196507:ENST00000372628:exon_102863971_102864855:TCEAL3;ENSG00000196507:ENST00000372627:exon_102863966_102864855:TCEAL3;ENSG00000196507:ENST00000243286:exon_102863966_102864854:TCEAL3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 108926108 A/G 0 11 0 11 5.22671026479451 0 5.22671026479451 A A 10 0.524844521382317 0.00111114617361232 ENSG00000068366:ENST00000348502:exon_108925948_108926125:ACSL4;ENSG00000068366:ENST00000469796:exon_108925948_108926125:ACSL4;ENSG00000068366:ENST00000340800:exon_108925948_108926125:ACSL4;ENSG00000068366:ENST00000372078:exon_108925948_108926125:ACSL4;ENSG00000068366:ENST00000505855:exon_108925948_108926125:ACSL4;ENSG00000068366:ENST00000502391:exon_108926042_108926125:ACSL4;ENSG00000068366:ENST00000508092:exon_108926093_108926125:ACSL4;ENSG00000068366:ENST00000504980:exon_108926098_108926125:ACSL4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 118724537 C/A 0 55 1 56 26.1335513239726 0.524844521382317 25.6087068025903 T:C C T 10 0.524844521382317 1.23964941554969e-14 ENSG00000186416:ENST00000371527:exon_118722300_118725272:NKRF;ENSG00000186416:ENST00000304449:exon_118722300_118725272:NKRF HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 118763406 C/T 1 313 130 443 148.723664807335 68.2297877797012 80.4938770276336 T:C C T 10 0.524844521382317 9.46287469966064e-15 ENSG00000125354:ENST00000360156:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394616:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000520510:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000525360:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394617:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000354228:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000460411:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000489216:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000354416:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000371492:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394612:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394610:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000343984:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000467310:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000481072:exon_118762779_118763471:SEPT6 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 118972303 C/G 0 12 0 12 5.7018657434122 0 5.7018657434122 C C 10 0.524844521382317 0.000569328853818109 ENSG00000125351:ENST00000478840:exon_118972229_118972490:UPF3B HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 119005587 T/C 0 141 0 141 66.9969224850933 0 66.9969224850933 T T 10 0.524844521382317 5.05110738633903e-40 ENSG00000125352:ENST00000371442:exon_119004497_119005791:RNF113A;ENSG00000125356:ENST00000371437:exon_119005450_119005976:NDUFA1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 119575713 T/A 1 1 29 30 0.475155478617683 15.2204911200872 -14.7453356414695 A:T T A 10 0.524844521382317 1.08808039233378e-08 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119575585_119575749:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119575585_119575749:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000486593:exon_119575585_119575749:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119575585_119575749:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119575585_119575749:LAMP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 0 42 0 42 19.9565301019427 0 19.9565301019427 T T 10 0.524844521382317 3.01005198841613e-12 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 123041041 A/G 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 G A G 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000101966:ENST00000468691:exon_123040838_123041101:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000371199:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000434753:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000355640:exon_123040838_123047815:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000531762:exon_123040838_123047815:XIAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 123041043 A/G 0 0 8 8 0 4.19875617105854 -4.19875617105854 G A G 10 0.524844521382317 0.00259827987145173 ENSG00000101966:ENST00000468691:exon_123040838_123041101:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000371199:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000434753:exon_123040838_123047829:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000355640:exon_123040838_123047815:XIAP;ENSG00000101966:ENST00000531762:exon_123040838_123047815:XIAP HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 129206293 G/A 0 10 0 10 4.75155478617683 0 4.75155478617683 G G 10 0.524844521382317 0.00217263351343085 ENSG00000102034:ENST00000335997:exon_129206201_129206392:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000455513:exon_129206201_129206392:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000308167:exon_129206201_129206392:ELF4;ENSG00000102034:ENST00000527455:exon_129206201_129206392:ELF4 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 129271132 T/C 1 69 1 70 32.7857280246201 0.524844521382317 32.2608835032378 T:C T C 10 0.524844521382317 1.69729570596121e-18 ENSG00000156709:ENST00000460436:exon_129271053_129272015:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129271053_129271160:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129271053_129271160:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000346424:exon_129271053_129271160:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129271053_129271160:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000440263:exon_129271053_129272015:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129271053_129271160:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000533719:exon_129271053_129271160:AIFM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 129272617 G/A 0 68 0 68 32.3105725460024 0 32.3105725460024 G G 10 0.524844521382317 9.96990183011114e-20 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129272568_129272676:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129272568_129272676:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129272568_129272676:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129272568_129272676:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000533719:exon_129272568_129272676:AIFM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 0 0 64 64 0 33.5900493684683 -33.5900493684683 G A G 10 0.524844521382317 2.0772436080668e-21 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 134185997 T/A 0 45 0 45 21.3819965377957 0 21.3819965377957 T T 10 0.524844521382317 3.97422256165771e-13 ENSG00000203950:ENST00000518153:exon_134185947_134186120:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000370775:exon_134184962_134186205:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000520964:exon_134185947_134186226:FAM127B;ENSG00000203950:ENST00000522309:exon_134185947_134186171:FAM127B HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 134713861 C/T 0 39 0 39 18.5310636660896 0 18.5310636660896 C C 10 0.524844521382317 2.30412972848725e-11 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 152018832 T/G 0 0 69 69 0 36.2142719753799 -36.2142719753799 G T G 10 0.524844521382317 5.03113692264974e-23 ENSG00000147383:ENST00000370274:exon_152018809_152018967:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000440023:exon_152018809_152018967:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000432467:exon_152018809_152018967:NSDHL HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153051356 C/T 1 236 2 238 112.136692953773 1.04968904276463 111.087003911009 T:C C T 10 0.524844521382317 5.63344364958263e-63 ENSG00000067829:ENST00000370092:exon_153051221_153051727:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000217901:exon_153051221_153051428:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000454076:exon_153051222_153051464:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000424541:exon_153051222_153051428:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000370093:exon_153051222_153051904:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000490525:exon_153051224_153051428:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000427365:exon_153051253_153051727:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000393771:exon_153051327_153051464:IDH3G HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153051851 C/T 1 180 1 181 85.5279861511829 0.524844521382317 85.0031416298006 T:C C T 10 0.524844521382317 4.31951863988039e-49 ENSG00000067829:ENST00000370092:exon_153051810_153051904:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000217901:exon_153051810_153051904:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000454076:exon_153051810_153051904:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000424541:exon_153051810_153051904:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000370093:exon_153051222_153051904:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000427365:exon_153051810_153051904:IDH3G;ENSG00000067829:ENST00000393771:exon_153051810_153051904:IDH3G HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153277280 G/A 1 1 127 128 0.475155478617683 66.6552542155543 -66.1800987369366 A:G G A 10 0.524844521382317 6.1438506743138e-40 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153275951_153277368:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153275957_153277368:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153275960_153277368:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000455690:exon_153277014_153277368:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153277139_153277368:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153277182_153277368:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000437278:exon_153277278_153277368:IRAK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153278829 G/A 1 98 1 99 46.5652369045329 0.524844521382317 46.0403923831506 A:G G A 10 0.524844521382317 1.95979206626098e-26 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000444254:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000443220:exon_153278494_153278884:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000467236:exon_153278787_153278884:IRAK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153284198 C/T 0 34 0 34 16.1552862730012 0 16.1552862730012 C C 10 0.524844521382317 3.13011112872469e-10 ENSG00000184216:ENST00000369980:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369974:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393682:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000369973:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000393687:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000429936:exon_153284050_153284238:IRAK1;ENSG00000184216:ENST00000463031:exon_153284050_153284396:IRAK1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153297825 G/A 0 66 0 66 31.3602615887671 0 31.3602615887671 G G 10 0.524844521382317 3.67336893214331e-19 ENSG00000169057:ENST00000303391:exon_153297658_153298008:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000453960:exon_153297658_153298008:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000407218:exon_153297658_153298008:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000369964:exon_153297658_153298008:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000486506:exon_153297658_153298008:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000369957:exon_153297658_153298008:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000496908:exon_153297824_153298008:MECP2;ENSG00000169057:ENST00000464075:exon_153297824_153298008:MECP2 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153578135 C/T 1 5 516 521 2.37577739308842 270.819773033276 -268.443995640187 T:C:G C T 10 0.524844521382317 2.22769470974082e-157 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369856:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000498491:exon_153578017_153578235:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000462590:exon_153578017_153578723:FLNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153580676 C/G 0 0 337 337 0 176.872603705841 -176.872603705841 T:G C G 10 0.524844521382317 1.24063707456613e-109 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369856:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000444578:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000474358:exon_153580549_153580815:FLNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153589848 G/A 0 113 0 113 53.6925690837982 0 53.6925690837982 G G 10 0.524844521382317 2.54751622764906e-32 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153589676_153589938:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153589676_153589938:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153589676_153589938:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153589676_153589938:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153589676_153589938:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153589676_153589938:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153589676_153589938:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153589676_153589938:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153589676_153589938:FLNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153596078 G/A 0 0 74 74 0 38.8384945822915 -38.8384945822915 A G A 10 0.524844521382317 1.21855417612798e-24 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153596009_153596106:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153596009_153596106:FLNA HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153631126 C/T 0 110 0 110 52.2671026479451 0 52.2671026479451 C C 10 0.524844521382317 1.80778704998771e-31 ENSG00000013563:ENST00000393638:exon_153629579_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369809:exon_153629579_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000014935:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369808:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369807:exon_153630099_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000309585:exon_153630102_153631182:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000497242:exon_153630828_153631531:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000447892:exon_153631063_153631182:DNASE1L1 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153693811 C/T 0 8 0 8 3.80124382894146 0 3.80124382894146 C C 10 0.524844521382317 0.00835593098635516 ENSG00000130827:ENST00000369682:exon_153693767_153693863:PLXNA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153694334 C/G 0 9 0 9 4.27639930755915 0 4.27639930755915 C C 10 0.524844521382317 0.0042564585595902 ENSG00000130827:ENST00000369682:exon_153694278_153694423:PLXNA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153696247 G/C 0 10 0 10 4.75155478617683 0 4.75155478617683 G G 10 0.524844521382317 0.00217263351343085 ENSG00000130827:ENST00000369682:exon_153696110_153696344:PLXNA3 HGDP00471_parsed_pileup.txt . X 153706264 C/G 0 99 0 99 47.0403923831506 0 47.0403923831506 C C 10 0.524844521382317 2.53115395984639e-28 ENSG00000196976:ENST00000407062:exon_153706028_153706750:LAGE3;ENSG00000196976:ENST00000357360:exon_153706108_153706397:LAGE3