INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 883570 G/A 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 A:G G A 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_883511_883612:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_883511_883612:NOC2L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 1005 739 1744 471.604279086186 392.218346025182 79.3859330610041 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.000135642252095118 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 949851 G/C 1 566 608 1174 265.600021853514 322.691142602586 -57.0911207490718 C:G G C 10 0.530742010859516 0.000854620080327304 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 1139202 T/C 1 34 18 52 15.9547716307765 9.55335619547129 6.40141543530517 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0946350092323363 ENSG00000186891:ENST00000328596:exon_1138888_1139340:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1138891_1139348:TNFRSF18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 25 8 33 11.7314497285121 4.24593608687613 7.48551364163597 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00879554351041542 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 218 254 472 102.298241632626 134.808470758317 -32.5102291256916 A:C:G G C 10 0.530742010859516 0.0031220629935179 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 12 6 18 5.63109586968581 3.1844520651571 2.44664380452871 A:C C A 10 0.530742010859516 0.34554633606434 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 113 91 204 53.0261527728747 48.297522988216 4.72862978465874 A:G G A 10 0.530742010859516 0.528290854585478 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 8 17 25 3.75406391312387 9.02261418461177 -5.2685502714879 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0438949573338673 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 3807388 G/A 1 8 2 10 3.75406391312387 1.06148402171903 2.69257989140484 A:G G A 10 0.530742010859516 0.116019943610998 ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 34 23 57 15.9547716307765 12.2070662497689 3.74770538100759 T:C T C 10 0.530742010859516 0.354298030307512 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 18 12 30 8.44664380452871 6.36890413031419 2.07773967421452 A:G A G 10 0.530742010859516 0.470863171171006 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 55 54 109 25.8091894027266 28.6600685864139 -2.85087918368724 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.631645758156776 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 10473199 C/T 1 22 13 35 10.3236757610906 6.89964614117371 3.42402961991694 A:T:C C T 10 0.530742010859516 0.309821722177357 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 10523133 T/A 1 45 36 81 21.1166095113218 19.1067123909426 2.0098971203792 A:T T A 10 0.530742010859516 0.738639309443135 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10523115_10523266:DFFA;ENSG00000160049:ENST00000476658:exon_10523045_10523266:DFFA;ENSG00000160049:ENST00000377036:exon_10522525_10523266:DFFA;ENSG00000160049:ENST00000475098:exon_10522578_10523266:DFFA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C C T 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 12034805 T/C 1 29 18 47 13.608481685074 9.55335619547129 4.05512548960275 T:C T C 10 0.530742010859516 0.24633180269825 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 12089836 C/T 1 42 31 73 19.7088355439003 16.453002336645 3.25583320725533 T:C C T 10 0.530742010859516 0.48282338957878 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089822_12089912:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089822_12089951:MIIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 18 14 32 8.44664380452871 7.43038815203322 1.01625565249549 A:G G A 10 0.530742010859516 0.859783970906506 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 14105378 A/T 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:T A T 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 14108712 C/T 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 16060340 T/C 1 13 22 35 6.10035385882629 11.6763242389094 -5.57597038008306 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0637122433903858 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16060292_16061262:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16060292_16061264:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16060292_16061264:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16060292_16060610:PLEKHM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 16060480 C/T 1 6 35 41 2.8155479348429 18.5759703800831 -15.7604224452402 T:C C T 10 0.530742010859516 4.1253673016145e-07 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16060292_16061262:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16060292_16061264:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16060292_16061264:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16060292_16060610:PLEKHM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 16767286 C/G 1 10 11 21 4.69257989140484 5.83816211945468 -1.14558222804984 C:G C G 10 0.530742010859516 0.666093004046952 ENSG00000157191:ENST00000337132:exon_16767167_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000504551:exon_16767216_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000263498:exon_16767219_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000406746:exon_16767219_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000443293:exon_16767219_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000443980:exon_16767231_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000486390:exon_16767231_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000504858:exon_16767232_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000508680:exon_16767237_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000492095:exon_16767238_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000459640:exon_16767251_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000496239:exon_16767253_16767348:NECAP2;ENSG00000157191:ENST00000513161:exon_16767267_16767348:NECAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:T T A 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 9 9 18 4.22332190226436 4.77667809773564 -0.553356195471288 T:C C T 10 0.530742010859516 0.817532500175034 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 22 19 41 10.3236757610906 10.0840982063308 0.239577554759844 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 19634964 C/G 1 3 9 12 1.40777396742145 4.77667809773564 -3.36890413031419 C:G C G 10 0.530742010859516 0.0791514340802245 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634949_19634999:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 19665998 G/A 1 419 380 799 196.619097449863 201.681964126616 -5.06286667675329 A:G G A 10 0.530742010859516 0.723139926903868 ENSG00000077549:ENST00000264203:exon_19665270_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375144:exon_19665273_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401084:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375145:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401082:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375142:exon_19665317_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000433834:exon_19665853_19666111:CAPZB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:C A C 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 340 239 579 159.547716307765 126.847340595424 32.7003757123402 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00676285029844684 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 19 17 36 8.9159017936692 9.02261418461177 -0.106712390942576 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 T:C T C 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 1710 1944 3654 802.431161430228 1031.7624691109 -229.331307680671 A:C:G A G 10 0.530742010859516 3.34777176157070e-14 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 1694 1903 3597 794.92303360398 1010.00204666566 -215.079013061679 A:T:C:G A G 10 0.530742010859516 7.26973752018935e-13 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 A:T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 27121140 C/T 1 1 8 9 0.469257989140484 4.24593608687613 -3.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0156759284921385 ENSG00000060642:ENST00000078527:exon_27120604_27121725:PIGV;ENSG00000060642:ENST00000374145:exon_27120604_27121725:PIGV HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 27180247 C/T 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 T:C C T 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000204160:ENST00000374142:exon_27180217_27182207:ZDHHC18;ENSG00000204160:ENST00000374141:exon_27180217_27180454:ZDHHC18;ENSG00000204160:ENST00000488397:exon_27180217_27180316:ZDHHC18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 27268079 A/G 1 75 65 140 35.1943491855363 34.4982307058685 0.69611847966776 A:G A G 10 0.530742010859516 0.932666319315488 ENSG00000090273:ENST00000435827:exon_27267948_27268151:NUDC;ENSG00000090273:ENST00000321265:exon_27267948_27268151:NUDC;ENSG00000090273:ENST00000452707:exon_27267948_27268151:NUDC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 463 357 820 217.266448972044 189.474897876847 27.7915510951969 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0542710368911774 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 32 18 50 15.0162556524955 9.55335619547129 5.4628994570242 A:G A G 10 0.530742010859516 0.155849456484145 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 53 22 75 24.8706734244457 11.6763242389094 13.1943491855363 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.00243584160900961 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 28906984 T/G 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 T:G T G 10 0.530742010859516 1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 31206719 T/C 1 162 193 355 76.0197942407584 102.433208095887 -26.4134138551282 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00561961415606864 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 20 22 42 9.38515978280968 11.6763242389094 -2.29116445609967 T:C T C 10 0.530742010859516 0.537470994620003 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 32110446 C/G 1 6 11 17 2.8155479348429 5.83816211945468 -3.02261418461177 C:G C G 10 0.530742010859516 0.153137089832863 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32110442_32110488:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32110442_32110497:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000440872:exon_32110442_32110477:PEF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 32669457 A/G 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 33138261 A/G 1 30 53 83 14.0777396742145 28.1293265755543 -14.0515869013398 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00275711585383751 ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000492348:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000463378:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000460669:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000482190:exon_33138243_33138300:RBBP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 33502376 G/A 0 12 0 12 5.63109586968581 0 5.63109586968581 G G 10 0.530742010859516 0.000613585276984697 ENSG00000004455:ENST00000373449:exon_33502337_33502471:AK2;ENSG00000004455:ENST00000467905:exon_33502337_33502487:AK2;ENSG00000004455:ENST00000354858:exon_33502337_33502593:AK2;ENSG00000004455:ENST00000480134:exon_33502337_33502478:AK2;ENSG00000004455:ENST00000398192:exon_33502337_33502467:AK2;ENSG00000004455:ENST00000487289:exon_33502337_33502445:AK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 14 12 26 6.56961184796678 6.36890413031419 0.200707717652584 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 36029419 A/G 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 A:G A G 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000020129:ENST00000373253:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000356090:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000373243:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000397922:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000423723:exon_36029368_36029510:NCDN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 24 14 38 11.2621917393716 7.43038815203322 3.83180358733839 A:G G A 10 0.530742010859516 0.255819752075894 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 36752433 C/T 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 36752687 A/G 1 9 5 14 4.22332190226436 2.65371005429758 1.56961184796678 A:G A G 10 0.530742010859516 0.436312573490878 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 220 189 409 103.236757610906 100.310240052449 2.92651755845796 C:G G C 10 0.530742010859516 0.804410707586933 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 39311617 T/G 1 14 14 28 6.56961184796678 7.43038815203322 -0.860776304066448 T:G T G 10 0.530742010859516 0.850388610583438 ENSG00000116954:ENST00000373001:exon_39311611_39311759:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000474456:exon_39311611_39313746:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000411897:exon_39311611_39311759:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000493015:exon_39311611_39311759:RRAGC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 40031009 G/A 1 30 31 61 14.0777396742145 16.453002336645 -2.37526266243048 A:G G A 10 0.530742010859516 0.608342444782757 ENSG00000090621:ENST00000441204:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372862:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372858:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372857:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372856:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000421687:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000527718:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000525669:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000470443:exon_40030778_40031050:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000513632:exon_40030971_40031050:PABPC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 40980757 A/G 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 41976217 G/A 1 21 15 36 9.85441777195016 7.96113016289274 1.89328760905742 A:G G A 10 0.530742010859516 0.617394163079153 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 41976529 C/T 1 9 11 20 4.22332190226436 5.83816211945468 -1.61484021719032 T:C C T 10 0.530742010859516 0.507952296287165 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 43824865 C/T 1 7 13 20 3.28480592398339 6.89964614117371 -3.61484021719032 T:C C T 10 0.530742010859516 0.119943905438940 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43824684_43825067:CDC20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 44684736 G/A 1 43 30 73 20.1780935330408 15.9222603257855 4.25583320725533 A:G G A 10 0.530742010859516 0.349193247690354 ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000437511:exon_44684728_44684786:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000488433:exon_44684728_44684913:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000483741:exon_44684728_44684913:DMAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 45120735 A/G 1 10 10 20 4.69257989140484 5.30742010859516 -0.61484021719032 A:G A G 10 0.530742010859516 0.825566833685384 ENSG00000126106:ENST00000372242:exon_45120612_45120881:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372237:exon_45118919_45120881:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000476724:exon_45118919_45120881:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000468117:exon_45118919_45120788:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372235:exon_45120137_45120791:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000420706:exon_45120568_45120788:TMEM53 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 45232619 G/A 1 63 48 111 29.5632533158505 25.4756165212568 4.08763679459372 A:G G A 10 0.530742010859516 0.448503865160833 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45232498_45232621:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45232498_45232621:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45232498_45232621:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45232498_45232621:KIF2C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 65 55 120 30.5017692941315 29.1908105972734 1.31095869685808 A:T:G A G 10 0.530742010859516 0.855071643815493 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 45795027 C/T 1 16 14 30 7.50812782624774 7.43038815203322 0.07773967421452 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000132781:ENST00000529984:exon_45794835_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000485271:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000488731:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000531105:exon_45794918_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45794944_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45794945_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000529892:exon_45794946_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45794948_45795109:MUTYH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 40 33 73 18.7703195656194 17.514486358364 1.25583320725533 A:G A G 10 0.530742010859516 0.815147373992121 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 43 32 75 20.1780935330408 16.9837443475045 3.1943491855363 T:C C T 10 0.530742010859516 0.489123240215544 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46083226 C/T 1 118 100 218 55.3724427185771 53.0742010859516 2.29824163262551 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.786238270078905 ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46083135_46083263:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46083135_46083263:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46083135_46083263:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46083135_46083263:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46083135_46083263:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46083135_46083263:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46083135_46083263:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46083135_46083263:NASP;ENSG00000132780:ENST00000472408:exon_46082909_46083263:NASP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 32 40 72 15.0162556524955 21.2296804343806 -6.21342478188515 A:G A G 10 0.530742010859516 0.156908352213367 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 43 49 92 20.1780935330408 26.0063585321163 -5.82826499907547 T:C T C 10 0.530742010859516 0.250660616448793 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46501599 G/A 1 46 48 94 21.5858675004623 25.4756165212568 -3.8897490207945 A:G G A 10 0.530742010859516 0.469711704764126 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000468212:exon_46501486_46501896:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46501171_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46501567_46501795:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 15 4 19 7.03886983710726 2.12296804343806 4.9159017936692 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0357597390109032 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46827337 T/C 1 13 18 31 6.10035385882629 9.55335619547129 -3.453002336645 T:C T C 10 0.530742010859516 0.280124629415815 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 27 33 60 12.6699657067931 17.514486358364 -4.84452065157096 T:C C T 10 0.530742010859516 0.244453454849814 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 52498561 G/A 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G G A 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 52876825 C/T 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52876787_52876872:PRPF38A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 52991569 T/C 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 T:C T C 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371541:exon_52991235_52991602:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 54432019 G/A 1 26 32 58 12.2007077176526 16.9837443475045 -4.78303662985193 A:G G A 10 0.530742010859516 0.236793487770611 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 54513031 G/A 1 9 12 21 4.22332190226436 6.36890413031419 -2.14558222804984 A:G G A 10 0.530742010859516 0.387253302097606 ENSG00000116209:ENST00000371348:exon_54512940_54513686:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000234831:exon_54512940_54513045:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000371341:exon_54512940_54513045:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000371338:exon_54512940_54513045:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000420738:exon_54512940_54513045:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000452421:exon_54512940_54513045:TMEM59;ENSG00000116209:ENST00000371337:exon_54512940_54513045:TMEM59 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 89 78 167 41.7639610335031 41.3978768470422 0.366084186460832 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 55203285 C/T 1 12 6 18 5.63109586968581 3.1844520651571 2.44664380452871 T:C C T 10 0.530742010859516 0.34554633606434 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55203255_55203337:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55203255_55203337:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55203255_55203337:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55203255_55203337:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55203255_55203337:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486091:exon_55202362_55203337:TTC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G G A 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 58999651 T/G 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 T:G T G 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_58999621_58999732:OMA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 63944441 T/C 1 14 10 24 6.56961184796678 5.30742010859516 1.26219173937162 T:C T C 10 0.530742010859516 0.685182392195028 ENSG00000142856:ENST00000489099:exon_63944435_63944504:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000271002:exon_63944435_63944504:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000371092:exon_63944435_63944504:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000432712:exon_63944435_63944504:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000283568:exon_63944435_63944504:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000476508:exon_63944435_63944504:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000460394:exon_63944435_63944504:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000489863:exon_63944435_63944504:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000460251:exon_63944435_63944504:ITGB3BP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 63974241 A/G 1 15 12 27 7.03886983710726 6.36890413031419 0.669965706793068 A:G A G 10 0.530742010859516 0.848986971115746 ENSG00000142856:ENST00000489099:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000271002:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000371092:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000432712:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000283568:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000460394:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000462285:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000465781:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000460251:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000478138:exon_63974199_63974241:ITGB3BP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 64120039 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000483707:exon_64120003_64120116:PGM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 67861520 C/A 1 13 6 19 6.10035385882629 3.1844520651571 2.9159017936692 A:C C A 10 0.530742010859516 0.25039820154784 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 79102727 G/A 1 2 10 12 0.938515978280968 5.30742010859516 -4.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0170869766127310 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 79107287 G/A 1 9 27 36 4.22332190226436 14.3300342932069 -10.1067123909426 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.000725712484698839 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79107120_79107294:IFI44L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 22 11 33 10.3236757610906 5.83816211945468 4.48551364163597 T:C T C 10 0.530742010859516 0.161947283390806 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 87805822 T/A 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 A:T T A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000143013:ENST00000370544:exon_87805730_87805885:LMO4;ENSG00000143013:ENST00000370542:exon_87805730_87805885:LMO4;ENSG00000143013:ENST00000489303:exon_87805730_87805885:LMO4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 89448607 C/T 1 31 1 32 14.546997663355 0.530742010859516 14.0162556524955 T:C C T 10 0.530742010859516 6.65568611100592e-08 ENSG00000213516:ENST00000321792:exon_89445139_89449749:RBMXL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 93299193 G/A 1 488 529 1017 228.997898700556 280.762523744684 -51.7646250441278 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.00120439607786142 ENSG00000122406:ENST00000432788:exon_93298025_93299217:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000370321:exon_93299102_93299217:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000470843:exon_93299102_93299217:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000490963:exon_93299102_93299217:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000315741:exon_93299102_93299217:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000461952:exon_93298319_93299217:RPL5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 93720153 G/T 1 17 16 33 7.97738581538823 8.49187217375226 -0.514486358364028 T:G G T 10 0.530742010859516 0.863566015067668 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93720074_93720171:CCDC18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 93730432 G/A 1 23 10 33 10.7929337502311 5.30742010859516 5.48551364163597 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.0795484779755619 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93730258_93730504:CCDC18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 93744055 G/A 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 A:G G A 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93744020_93744164:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93744020_93744270:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93744020_93744287:CCDC18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 99225627 G/A 1 8 1 9 3.75406391312387 0.530742010859516 3.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0422661471759058 ENSG00000162627:ENST00000529992:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000306121:exon_99225610_99226056:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000439833:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000351590:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000415097:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000528824:exon_99225610_99226056:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000370189:exon_99225610_99226056:SNX7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 107867503 A/G 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 A:G A G 10 0.530742010859516 0.796007939511377 ENSG00000162631:ENST00000370076:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370071:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370073:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370070:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370061:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370072:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370062:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370064:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370074:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370068:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000294649:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370067:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370066:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000370065:exon_107866904_107867544:NTNG1;ENSG00000162631:ENST00000477948:exon_107866904_107867544:NTNG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 109238329 G/A 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000134186:ENST00000370025:exon_109238324_109238392:PRPF38B;ENSG00000134186:ENST00000370022:exon_109238324_109238392:PRPF38B;ENSG00000134186:ENST00000467302:exon_109238324_109238392:PRPF38B;ENSG00000134186:ENST00000370021:exon_109238324_109238392:PRPF38B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 109642866 G/A 1 9 11 20 4.22332190226436 5.83816211945468 -1.61484021719032 A:G G A 10 0.530742010859516 0.507952296287165 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 C:G G C 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 112309123 C/A 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:C C A 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 112309331 T/C 1 16 14 30 7.50812782624774 7.43038815203322 0.07773967421452 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 3 11 14 1.40777396742145 5.83816211945468 -4.43038815203322 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0284599459437032 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 116931628 C/A 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:C C A 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000491156:exon_116931524_116931641:ATP1A1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 116947051 G/A 1 599 575 1174 281.08553549515 305.176656244222 -24.0911207490718 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.160535322301552 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116947038_116947394:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116947038_116947396:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116947038_116947396:ATP1A1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 118495153 T/G 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 T:G T G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 31 0 31 14.546997663355 0 14.546997663355 G G 10 0.530742010859516 5.30925016088125e-09 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 13 13 0 6.89964614117371 -6.89964614117371 C T C 10 0.530742010859516 5.34997531455705e-05 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 60 60 0 31.844520651571 -31.844520651571 T C T 10 0.530742010859516 1.92619616777039e-20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 145460213 G/A 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000121851:ENST00000369314:exon_145460097_145460263:POLR3GL;ENSG00000121851:ENST00000369313:exon_145460097_145460263:POLR3GL;ENSG00000121851:ENST00000471706:exon_145460097_145460263:POLR3GL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 12 8 20 5.63109586968581 4.24593608687613 1.38515978280968 A:G G A 10 0.530742010859516 0.655918359081295 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 147119308 T/C 1 8 17 25 3.75406391312387 9.02261418461177 -5.2685502714879 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0438949573338673 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 149871738 G/C 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000178096:ENST00000369153:exon_149871396_149872044:BOLA1;ENSG00000178096:ENST00000369152:exon_149871563_149872345:BOLA1;ENSG00000178096:ENST00000476344:exon_149871676_149872351:BOLA1;ENSG00000178096:ENST00000369150:exon_149871396_149872101:BOLA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 150129593 G/A 1 75 55 130 35.1943491855363 29.1908105972734 6.00353858826292 A:G G A 10 0.530742010859516 0.333768221357539 ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150129566_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000485470:exon_150129211_150129680:PLEKHO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 150131342 G/A 1 406 357 763 190.518743591036 189.474897876847 1.04384571418927 A:G G A 10 0.530742010859516 0.942212642520058 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 150280550 G/A 1 372 399 771 174.56397196026 211.766062332947 -37.2020903726868 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.00756092764040626 ENSG00000187145:ENST00000309092:exon_150280482_150281414:MRPS21;ENSG00000187145:ENST00000369084:exon_150280482_150281414:MRPS21 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 150300880 C/T 1 2 8 10 0.938515978280968 4.24593608687613 -3.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0536315808592461 ENSG00000117360:ENST00000324862:exon_150300779_150300925:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000496202:exon_150300779_150300925:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000467329:exon_150300234_150300925:PRPF3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 150727539 G/A 0 0 9 9 0 4.77667809773564 -4.77667809773564 A G A 10 0.530742010859516 0.00110332911129439 ENSG00000163131:ENST00000368985:exon_150727477_150727626:CTSS;ENSG00000163131:ENST00000480760:exon_150727477_150727626:CTSS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 151089888 A/C 1 7 1 8 3.28480592398339 0.530742010859516 2.75406391312387 A:C A C 10 0.530742010859516 0.074454966322071 ENSG00000143458:ENST00000368918:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368917:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368916:exon_151089868_151089992:GABPB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 425 376 801 199.434645384706 199.558996083178 -0.124350698472313 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 151372131 G/A 1 41 36 77 19.2395775547598 19.1067123909426 0.132865163817268 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 41 38 79 19.2395775547598 20.1681964126616 -0.928618857901764 A:G G A 10 0.530742010859516 0.910347958380485 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 19 15 34 8.9159017936692 7.96113016289274 0.954771630776456 A:C A C 10 0.530742010859516 0.86395168298299 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 151732552 T/C 1 89 85 174 41.7639610335031 45.1130709230589 -3.34910988955578 T:C T C 10 0.530742010859516 0.648770061844504 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151732119_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151732123_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151732351_151732657:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000495867:exon_151732360_151732657:MRPL9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 152009469 G/C 1 10 18 28 4.69257989140484 9.55335619547129 -4.86077630406645 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0869693005494588 ENSG00000163191:ENST00000271638:exon_152009389_152009511:S100A11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 153516358 G/A 1 64 56 120 30.032511304991 29.7215526081329 0.31095869685808 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153516089_153516415:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153516097_153516399:S100A4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 154192860 G/A 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000143612:ENST00000350592:exon_154192818_154193100:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368521:exon_154192818_154193082:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000362076:exon_154192818_154193095:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368519:exon_154192818_154193061:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368518:exon_154192818_154193009:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368516:exon_154192818_154193104:C1orf43 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 154898899 C/T 1 40 30 70 18.7703195656194 15.9222603257855 2.84805923983388 T:C C T 10 0.530742010859516 0.550014167646225 ENSG00000163344:ENST00000368467:exon_154898830_154898959:PMVK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 154965113 G/T 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000160688:ENST00000368434:exon_154965041_154965138:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000405236:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000295530:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000477609:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000481758:exon_154965065_154965262:FLAD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 155181989 G/A 1 35 44 79 16.4240296199169 23.3526484778187 -6.92861885790176 A:G G A 10 0.530742010859516 0.142364949339844 ENSG00000173171:ENST00000368376:exon_155181918_155182010:MTX1;ENSG00000173171:ENST00000424959:exon_155181918_155182010:MTX1;ENSG00000173171:ENST00000481771:exon_155180339_155182010:MTX1;ENSG00000173171:ENST00000495589:exon_155181918_155182010:MTX1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 19 25 44 8.9159017936692 13.2685502714879 -4.3526484778187 T:C C T 10 0.530742010859516 0.226883675564502 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 155699118 T/C 1 61 55 116 28.6247373375695 29.1908105972734 -0.566073259703856 T:C T C 10 0.530742010859516 0.92614350350619 ENSG00000132676:ENST00000471214:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000421487:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000497826:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000479151:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000462978:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000477394:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000475056:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000490249:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000497433:exon_155699088_155699157:DAP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 38 31 69 17.8318035873384 16.453002336645 1.3788012506934 A:G G A 10 0.530742010859516 0.809715978060955 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 156697188 T/C 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 T:C T C 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 157494106 C/T 1 25 21 46 11.7314497285121 11.1455822280498 0.585867500462264 T:C C T 10 0.530742010859516 0.88375950285739 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 157494217 A/G 1 19 14 33 8.9159017936692 7.43038815203322 1.48551364163597 A:G A G 10 0.530742010859516 0.727858688111211 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 158815472 A/G 1 43 38 81 20.1780935330408 20.1681964126616 0.00989712037920398 A:T:C:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158815377_158815793:MNDA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 26 26 52 12.2007077176526 13.7992922823474 -1.59858456469483 A:G A G 10 0.530742010859516 0.678830738465867 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 159043041 C/T 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000163568:ENST00000368130:exon_159043028_159043309:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000481829:exon_159043028_159043055:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000411768:exon_159043028_159043309:AIM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 161140517 A/C 1 16 12 28 7.50812782624774 6.36890413031419 1.13922369593355 A:C A C 10 0.530742010859516 0.708660470046962 ENSG00000143224:ENST00000352210:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000432542:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000435935:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000367999:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000497522:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000495483:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000462866:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000466452:exon_161140051_161140559:PPOX HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 161681087 A/G 1 4 12 16 1.87703195656194 6.36890413031419 -4.49187217375226 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0415595366775679 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000465403:exon_161680998_161681262:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 161772014 C/T 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161771842_161772062:ATF6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 167381360 A/G 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000143190:ENST00000367866:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000367865:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000271411:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000429375:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000367862:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000420254:exon_167381196_167381541:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000443275:exon_167381196_167381541:POU2F1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 167382299 C/T 1 9 10 19 4.22332190226436 5.30742010859516 -1.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.651962958706861 ENSG00000143190:ENST00000367866:exon_167382263_167382351:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000367865:exon_167382263_167382351:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000271411:exon_167382263_167382351:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000429375:exon_167382263_167382351:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000367862:exon_167382263_167382351:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000420254:exon_167382263_167382351:POU2F1;ENSG00000143190:ENST00000443275:exon_167382263_167382351:POU2F1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 42 34 76 19.7088355439003 18.0452283692235 1.66360717467678 A:G G A 10 0.530742010859516 0.731422565036202 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 168153149 T/C 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000143155:ENST00000367833:exon_168153140_168153319:TIPRL;ENSG00000143155:ENST00000401737:exon_168153140_168153319:TIPRL;ENSG00000143155:ENST00000367830:exon_168153140_168153319:TIPRL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 169677679 A/G 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 169761884 C/T 1 51 43 94 23.9321574461647 22.8219064669592 1.1102509792055 T:C C T 10 0.530742010859516 0.837003396710843 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 171483718 G/T 1 51 45 96 23.9321574461647 23.8833904886782 0.048766957486464 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171483675_171483784:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171483675_171483769:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171483675_171483784:BAT2L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 173834580 A/T 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 A:T A T 10 0.530742010859516 1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 180063108 T/C 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000417046:exon_180062849_180063751:CEP350 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 181019202 C/T 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181019147_181019481:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181019147_181020409:MR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 23 18 41 10.7929337502311 9.55335619547129 1.23957755475984 A:G G A 10 0.530742010859516 0.755736700399185 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 184764351 G/A 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G G A 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 197070815 T/C 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 13 7 20 6.10035385882629 3.71519407601661 2.38515978280968 A:G A G 10 0.530742010859516 0.371592770079109 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 201974712 G/C 1 24 33 57 11.2621917393716 17.514486358364 -6.25229461899241 C:G G C 10 0.530742010859516 0.111215712446372 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201974686_201975275:RNPEP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:C C A 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 206905040 C/T 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 T:C C T 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 206905043 C/T 1 12 7 19 5.63109586968581 3.71519407601661 1.9159017936692 T:C C T 10 0.530742010859516 0.492140981990386 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 207085289 G/C 1 46 40 86 21.5858675004623 21.2296804343806 0.356187066081624 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000162894:ENST00000420007:exon_207085075_207085297:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000367091:exon_207085075_207085297:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000442471:exon_207085075_207085297:FAIM3;ENSG00000162894:ENST00000463473:exon_207085075_207085297:FAIM3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 10 9 19 4.69257989140484 4.77667809773564 -0.084098206330804 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 50 55 105 23.4628994570242 29.1908105972734 -5.72791114024918 A:C A C 10 0.530742010859516 0.282665722170493 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 212273639 C/T 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C C T 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 214803925 A/C 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:C A C 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214803877_214804005:CENPF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 39 40 79 18.3010615764789 21.2296804343806 -2.92861885790176 A:G A G 10 0.530742010859516 0.573315057308231 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:G G A 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 214814804 A/G 1 8 2 10 3.75406391312387 1.06148402171903 2.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.116019943610998 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 214828589 C/T 1 9 14 23 4.22332190226436 7.43038815203322 -3.20706624976887 T:C C T 10 0.530742010859516 0.212202113058778 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214828584_214828746:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214828491_214828746:CENPF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 17 16 33 7.97738581538823 8.49187217375226 -0.514486358364028 A:G A G 10 0.530742010859516 0.863566015067668 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 217793225 C/T 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 T:C C T 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217793125_217793841:GPATCH2;ENSG00000092978:ENST00000366934:exon_217793125_217793841:GPATCH2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:G T G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 226552834 C/T 1 41 46 87 19.2395775547598 24.4141324995377 -5.17455494477789 T:C C T 10 0.530742010859516 0.283725313271208 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226552703_226552855:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226552703_226552855:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226552789_226552855:PARP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 226567811 C/T 1 12 13 25 5.63109586968581 6.89964614117371 -1.2685502714879 T:C C T 10 0.530742010859516 0.690401884163373 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226567623_226567865:PARP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 27 20 47 12.6699657067931 10.6148402171903 2.05512548960275 A:G A G 10 0.530742010859516 0.562999003613506 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 16 18 34 7.50812782624774 9.55335619547129 -2.04522836922354 A:G G A 10 0.530742010859516 0.497093284622034 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 50 33 83 23.4628994570242 17.514486358364 5.94841309866017 A:G G A 10 0.530742010859516 0.226227932352260 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 227921717 C/T 1 11 8 19 5.16183788054532 4.24593608687613 0.915901793669196 T:C C T 10 0.530742010859516 0.819237521224916 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227920582_227922078:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227921608_227921733:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227921608_227921733:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000480590:exon_227921608_227921733:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000465251:exon_227921608_227922072:JMJD4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 T:C T C 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:T T A 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 233086456 T/C 1 9 13 22 4.22332190226436 6.89964614117371 -2.67632423890935 T:C T C 10 0.530742010859516 0.289347566198005 ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 C C 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 G G 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 C C 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 10 3 13 4.69257989140484 1.59222603257855 3.10035385882629 A:G G A 10 0.530742010859516 0.100208582951158 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 234743492 C/T 1 15 18 33 7.03886983710726 9.55335619547129 -2.51448635836403 T:C C T 10 0.530742010859516 0.389598753821416 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 234743528 G/A 1 11 19 30 5.16183788054532 10.0840982063308 -4.92226032578548 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.0981951764755982 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 T:C T C 10 0.530742010859516 0.796007939511377 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 235324545 T/A 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:T T A 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324489_235324772:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324489_235324571:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324489_235324549:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324489_235324547:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324489_235324573:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324489_235324598:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324489_235324772:ARID4B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 30 46 76 14.0777396742145 24.4141324995377 -10.3363928253232 A:G A G 10 0.530742010859516 0.021030828252666 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 16 9 25 7.50812782624774 4.77667809773564 2.7314497285121 T:C T C 10 0.530742010859516 0.319678398805541 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 236385276 C/T 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236385224_236385310:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000264181:exon_236385224_236385310:ERO1LB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 19 13 32 8.9159017936692 6.89964614117371 2.01625565249549 T:C T C 10 0.530742010859516 0.595906631158956 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 236719135 T/C 1 13 7 20 6.10035385882629 3.71519407601661 2.38515978280968 T:C T C 10 0.530742010859516 0.371592770079109 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 242042578 A/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G A G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 T:C C T 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 245027469 G/A 1 19 28 47 8.9159017936692 14.8607763040664 -5.94487451039725 A:G G A 10 0.530742010859516 0.106966674415218 ENSG00000153187:ENST00000427948:exon_245027286_245027609:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000444376:exon_245026976_245027844:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000283179:exon_245026919_245027773:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000476241:exon_245026976_245027793:HNRNPU HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 T:C T C 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 246922343 A/G 1 17 8 25 7.97738581538823 4.24593608687613 3.7314497285121 A:G A G 10 0.530742010859516 0.162030927973593 ENSG00000143653:ENST00000366510:exon_246922336_246922453:SCCPDH;ENSG00000143653:ENST00000366509:exon_246922336_246922453:SCCPDH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 1 247463983 G/A 1 9 5 14 4.22332190226436 2.65371005429758 1.56961184796678 A:G G A 10 0.530742010859516 0.436312573490878 ENSG00000162714:ENST00000462139:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000461277:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000294753:exon_247460714_247464578:ZNF496;ENSG00000162714:ENST00000366498:exon_247463623_247464578:ZNF496 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 1065457 T/A 1 9 14 23 4.22332190226436 7.43038815203322 -3.20706624976887 A:T T A 10 0.530742010859516 0.212202113058778 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4;ENSG00000148377:ENST00000277517:exon_1064847_1065774:IDI2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3150898 C/T 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3155353 C/T 1 4 10 14 1.87703195656194 5.30742010859516 -3.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.104987115908570 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155311_3155380:PFKP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3155662 C/T 1 9 13 22 4.22332190226436 6.89964614117371 -2.67632423890935 T:C C T 10 0.530742010859516 0.289347566198005 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 17 13 30 7.97738581538823 6.89964614117371 1.07773967421452 T:C C T 10 0.530742010859516 0.718793218928822 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 13 16 29 6.10035385882629 8.49187217375226 -2.39151831492596 T:C C T 10 0.530742010859516 0.457592678941988 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3180227 T/C 1 78 116 194 36.6021231529578 61.5660732597039 -24.9639501067461 T:C T C 10 0.530742010859516 0.000397463100059539 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 46 46 92 21.5858675004623 24.4141324995377 -2.82826499907547 T:C C T 10 0.530742010859516 0.601881494107175 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3180316 T/C 1 37 41 78 17.3625455981979 21.7604224452402 -4.39787684704225 T:C T C 10 0.530742010859516 0.364290512039647 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 6060057 G/A 1 9 4 13 4.22332190226436 2.12296804343806 2.10035385882629 A:G G A 10 0.530742010859516 0.278656458173804 ENSG00000134460:ENST00000379959:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000397240:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000379954:exon_6060016_6060082:IL2RA;ENSG00000134460:ENST00000256876:exon_6060016_6060082:IL2RA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 12867598 C/G 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 C:G C G 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000183049:ENST00000378847:exon_12867572_12867689:CAMK1D;ENSG00000183049:ENST00000378845:exon_12867572_12868142:CAMK1D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 13330402 T/C 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 T:C T C 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13330360_13330541:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000453759:exon_13330360_13330541:PHYH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 13375906 T/C 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 T:C T C 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000319684:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000378614:exon_13375817_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000413411:exon_13375877_13375971:SEPHS1;ENSG00000086475:ENST00000425947:exon_13375901_13375971:SEPHS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 15145917 A/C 1 70 76 146 32.8480592398339 40.3363928253232 -7.48833358548934 A:C A C 10 0.530742010859516 0.214993556372072 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 15183463 C/T 1 4 10 14 1.87703195656194 5.30742010859516 -3.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.104987115908570 ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15183421_15183556:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15183421_15183556:NMT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 23409733 A/G 1 28 19 47 13.1392236959336 10.0840982063308 3.05512548960275 A:G A G 10 0.530742010859516 0.38518988876799 ENSG00000148450:ENST00000376510:exon_23409687_23410942:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000277598:exon_23409687_23409791:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000376513:exon_23409687_23409899:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000472663:exon_23409687_23409883:MSRB2;ENSG00000148450:ENST00000468633:exon_23409687_23409822:MSRB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27009259 A/G 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000148459:ENST00000376215:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000376203:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000396343:exon_27009147_27009288:PDSS1;ENSG00000148459:ENST00000473224:exon_27009064_27009288:PDSS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27037496 A/G 1 28 18 46 13.1392236959336 9.55335619547129 3.58586750046226 A:G A G 10 0.530742010859516 0.305017995539971 ENSG00000136754:ENST00000376138:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376170:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376166:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376160:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376142:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000359188:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376139:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000346832:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376134:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000355394:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376137:exon_27035525_27037674:ABI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27306604 C/T 1 11 7 18 5.16183788054532 3.71519407601661 1.44664380452871 T:C C T 10 0.530742010859516 0.63827752360053 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27306431_27306721:ANKRD26 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27317840 C/T 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C C T 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 22 18 40 10.3236757610906 9.55335619547129 0.77031956561936 T:C T C 10 0.530742010859516 0.874806684373545 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 17 13 30 7.97738581538823 6.89964614117371 1.07773967421452 T:C T C 10 0.530742010859516 0.718793218928822 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 27826951 G/A 1 17 17 34 7.97738581538823 9.02261418461177 -1.04522836922354 A:G G A 10 0.530742010859516 0.734373661118405 ENSG00000099246:ENST00000356940:exon_27826805_27829092:RAB18;ENSG00000099246:ENST00000375802:exon_27826805_27827069:RAB18;ENSG00000099246:ENST00000465772:exon_27826805_27827418:RAB18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 52026532 G/A 0 37 0 37 17.3625455981979 0 17.3625455981979 G G 10 0.530742010859516 9.5970361597979e-11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 3 7 10 1.40777396742145 3.71519407601661 -2.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 0.205910355285428 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 64975376 A/G 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 A:G A G 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000469152:exon_64975313_64975456:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000489372:exon_64975313_64975376:JMJD1C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 70716026 C/T 1 61 48 109 28.6247373375695 25.4756165212568 3.14912081631276 T:C C T 10 0.530742010859516 0.565978740124875 ENSG00000165732:ENST00000354185:exon_70715884_70716068:DDX21 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 71160828 C/T 1 15 23 38 7.03886983710726 12.2070662497689 -5.16819641266161 T:C C T 10 0.530742010859516 0.10482129283173 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1;ENSG00000156515:ENST00000470050:exon_71160747_71160874:HK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 71160897 C/T 1 18 30 48 8.44664380452871 15.9222603257855 -7.47561652125677 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0417798563493891 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 71874809 G/C 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 C:G G C 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 71876464 G/A 1 11 3 14 5.16183788054532 1.59222603257855 3.56961184796678 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0638641251547832 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 73511040 G/A 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73507316_73511047:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000470317:exon_73510673_73511047:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73510979_73511047:C10orf54 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 73992862 C/G 1 63 64 127 29.5632533158505 33.967488695009 -4.40423537915853 C:G C G 10 0.530742010859516 0.477116725167317 ENSG00000166295:ENST00000478193:exon_73992759_73993373:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000299381:exon_73992759_73993587:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000470481:exon_73992759_73993584:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000468144:exon_73992759_73992969:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000496924:exon_73992759_73993223:ANAPC16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 75541904 A/G 1 98 51 149 45.9872829357674 27.0678425538353 18.9194403819321 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00227894000101111 ENSG00000172586:ENST00000372837:exon_75541805_75541957:CHCHD1;ENSG00000172586:ENST00000372833:exon_75541821_75541957:CHCHD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 76285163 T/C 1 30 19 49 14.0777396742145 10.0840982063308 3.99364146788372 T:C T C 10 0.530742010859516 0.316413054395375 ENSG00000156110:ENST00000286621:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000467840:exon_76285122_76285184:ADK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 79742026 G/A 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000148606:ENST00000480092:exon_79741912_79742076:POLR3A;ENSG00000148606:ENST00000372371:exon_79741912_79742076:POLR3A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 79795367 T/C 1 3936 3910 7846 1846.99944525694 2075.20126246071 -228.201817203763 A:T:C:G T C 10 0.530742010859516 2.63460880020721e-07 ENSG00000138326:ENST00000440692:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000435275:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000485708:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000478655:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000372360:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000401656:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000464716:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000476545:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000360830:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000466129:exon_79795269_79795844:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000475468:exon_79795269_79795412:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000482069:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000465692:exon_79795269_79795478:RPS24;ENSG00000138326:ENST00000467106:exon_79795269_79795448:RPS24 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 85908565 C/T 1 28 27 55 13.1392236959336 14.3300342932069 -1.19081059727338 T:C C T 10 0.530742010859516 0.787890302645002 ENSG00000165678:ENST00000372134:exon_85908486_85908594:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000339736:exon_85908486_85908594:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000436406:exon_85908486_85908594:GHITM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 89514557 C/T 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 T:C C T 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000138138:ENST00000308448:exon_89511269_89514564:ATAD1;ENSG00000138138:ENST00000328142:exon_89512874_89514564:ATAD1;ENSG00000138138:ENST00000400215:exon_89512875_89514564:ATAD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 91163085 A/T 1 47 35 82 22.0551254896027 18.5759703800831 3.47915510951969 A:T A T 10 0.530742010859516 0.507054859544788 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 10 12 22 4.69257989140484 6.36890413031419 -1.67632423890935 A:G G A 10 0.530742010859516 0.525900865788529 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 14 19 33 6.56961184796678 10.0840982063308 -3.51448635836403 A:T T A 10 0.530742010859516 0.227769584508208 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 10 9 19 4.69257989140484 4.77667809773564 -0.084098206330804 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 14 12 26 6.56961184796678 6.36890413031419 0.200707717652584 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 A:G A G 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 91518638 T/C 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91518463_91518639:KIF20B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 96106240 G/C 1 3 9 12 1.40777396742145 4.77667809773564 -3.36890413031419 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0791514340802245 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96106182_96106313:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96106182_96106313:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96106233_96106313:NOC3L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 192 163 355 90.0975339149729 86.5109477701011 3.58658614487182 T:C T C 10 0.530742010859516 0.710086650835747 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 97607266 G/A 1 21 27 48 9.85441777195016 14.3300342932069 -4.47561652125677 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.247044679817303 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97607203_97607463:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97607203_97607463:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97607203_97607288:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97607203_97607463:ENTPD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 100182186 G/A 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100182126_100182270:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100182126_100182270:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100182126_100182270:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100182126_100182266:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100182126_100182266:HPS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 103368654 T/C 1 18 30 48 8.44664380452871 15.9222603257855 -7.47561652125677 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0417798563493891 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 103371041 C/G 1 33 41 74 15.485513641636 21.7604224452402 -6.27490880360418 C:G C G 10 0.530742010859516 0.162295758963037 ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103370423_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000470093:exon_103370423_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103370426_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103370426_103371167:FBXW4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 103384540 G/A 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000470093:exon_103384502_103386656:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000457105:exon_103384504_103384567:FBXW4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 103432801 A/G 1 20 8 28 9.38515978280968 4.24593608687613 5.13922369593355 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.0586370170361993 ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000457105:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000431477:exon_103432672_103432804:FBXW4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 8 11 19 3.75406391312387 5.83816211945468 -2.0840982063308 A:G G A 10 0.530742010859516 0.366013294263512 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 105154013 A/G 1 3 16 19 1.40777396742145 8.49187217375226 -7.0840982063308 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00183636113841223 ENSG00000173915:ENST00000369825:exon_105153956_105154151:USMG5;ENSG00000173915:ENST00000337003:exon_105153956_105154151:USMG5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 13 17 30 6.10035385882629 9.02261418461177 -2.92226032578548 T:C T C 10 0.530742010859516 0.360753726230159 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 105657316 G/C 1 25 12 37 11.7314497285121 6.36890413031419 5.36254559819791 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0985763678967155 ENSG00000107960:ENST00000224950:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000369764:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000466828:exon_105657306_105657477:OBFC1;ENSG00000107960:ENST00000472951:exon_105657306_105657477:OBFC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 22 25 47 10.3236757610906 13.2685502714879 -2.94487451039725 A:G G A 10 0.530742010859516 0.465354631396792 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 201 156 357 94.3208558172373 82.7957536940845 11.5251021231528 A:C C A 10 0.530742010859516 0.223189102853392 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 112349422 T/C 1 46 40 86 21.5858675004623 21.2296804343806 0.356187066081624 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112349363_112349466:SMC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 112641053 A/G 1 18 24 42 8.44664380452871 12.7378082606284 -4.29116445609967 A:G A G 10 0.530742010859516 0.216516263233629 ENSG00000150593:ENST00000280154:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000445683:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000393104:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000467574:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000483670:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000444997:exon_112641033_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000492932:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000452838:exon_112640991_112641293:PDCD4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 112645088 G/A 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 A:G G A 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000150593:ENST00000280154:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000445683:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000393104:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000467574:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000483670:exon_112645011_112645097:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000444997:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000492932:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000452838:exon_112645011_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000481353:exon_112644529_112645124:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000462577:exon_112645011_112645124:PDCD4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 120795626 A/T 1 97 77 174 45.518024946627 40.8671348361827 4.65089011044422 A:T:G A T 10 0.530742010859516 0.495046838063769 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120794356_120795780:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120795334_120795780:EIF3A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 120931929 G/A 1 10 6 16 4.69257989140484 3.1844520651571 1.50812782624774 A:G G A 10 0.530742010859516 0.617940633683685 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120931894_120931997:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120931894_120931997:PRDX3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 121551647 A/G 1 14 9 23 6.56961184796678 4.77667809773564 1.79293375023113 A:G A G 10 0.530742010859516 0.533738323924712 ENSG00000198825:ENST00000369081:exon_121551381_121551717:INPP5F HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 127516195 G/A 1 14 6 20 6.56961184796678 3.1844520651571 3.38515978280968 A:G G A 10 0.530742010859516 0.178184035682023 ENSG00000107949:ENST00000278100:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000368759:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000392718:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000463330:exon_127516127_127516207:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000478798:exon_127516127_127516207:BCCIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 T:C T C 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 16 3 19 7.50812782624774 1.59222603257855 5.9159017936692 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00942868510884647 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 17 2 19 7.97738581538823 1.06148402171903 6.9159017936692 C:G C G 10 0.530742010859516 0.00103549307109715 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 134145155 C/T 1 11 1 12 5.16183788054532 0.530742010859516 4.63109586968581 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00746138085009563 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 11 2 13 5.16183788054532 1.06148402171903 4.10035385882629 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0256582468175808 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 18 9 27 8.44664380452871 4.77667809773564 3.66996570679307 T:G G T 10 0.530742010859516 0.179826969924766 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 7 12 19 3.28480592398339 6.36890413031419 -3.0840982063308 A:G A G 10 0.530742010859516 0.173584815126562 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 60 51 111 28.155479348429 27.0678425538353 1.08763679459372 A:C C A 10 0.530742010859516 0.849790960245715 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 39 24 63 18.3010615764789 12.7378082606284 5.56325331585049 T:C T C 10 0.530742010859516 0.167170905957842 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 209425 G/C 1 3 10 13 1.40777396742145 5.30742010859516 -3.89964614117371 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0477959817043024 ENSG00000177963:ENST00000526104:exon_209407_210000:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000325207:exon_209407_210000:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000531209:exon_209407_209551:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000526982:exon_209407_210000:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000532373:exon_209271_209788:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000530889:exon_209407_209811:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527696:exon_209069_210000:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527468:exon_209407_209738:RIC8A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 218904 G/A 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529937:exon_218778_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_218778_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_218832_219041:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_218832_219041:SIRT3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 610277 T/C 1 3 8 11 1.40777396742145 4.24593608687613 -2.83816211945468 T:C T C 10 0.530742010859516 0.128925499785697 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610196_610347:PHRF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 26 20 46 12.2007077176526 10.6148402171903 1.58586750046226 T:C C T 10 0.530742010859516 0.660822184375524 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 674546 T/C 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 T:C T C 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_674536_674783:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 6 17 23 2.8155479348429 9.02261418461177 -6.20706624976887 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0112835374802497 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 338 331 669 158.609200329484 175.6756055945 -17.0664052650162 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.188029044831993 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 903039 G/A 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000531859:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534254:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528426:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533056:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000533059:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000530939:exon_902962_903111:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000525225:exon_902971_903111:CHID1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 993964 C/T 1 3 9 12 1.40777396742145 4.77667809773564 -3.36890413031419 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0791514340802245 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 1298304 T/C 1 42 36 78 19.7088355439003 19.1067123909426 0.602123152957752 T:C T C 10 0.530742010859516 0.910195330764873 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1295601_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1295602_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1295603_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1296883_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1298302_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1298047_1298483:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527938:exon_1298243_1298483:TOLLIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 T:C C T 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 1901356 C/T 1 192 199 391 90.0975339149729 105.617660161044 -15.5201262460708 T:C C T 10 0.530742010859516 0.116556553891870 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1901317_1901454:LSP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 1977651 C/A 1 156 180 336 73.2042463059155 95.5335619547129 -22.3293156487974 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0160727479617654 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 2946340 C/T 1 10 8 18 4.69257989140484 4.24593608687613 0.446643804528712 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2946240_2946476:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2946240_2946476:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2946240_2946457:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2946240_2946476:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000441077:exon_2946240_2946476:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449603:exon_2946240_2946413:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000495518:exon_2946240_2946470:SLC22A18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 4148436 A/C 1 19 6 25 8.9159017936692 3.1844520651571 5.7314497285121 A:C A C 10 0.530742010859516 0.0262295830382206 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4148265_4148486:RRM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 T:C C T 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 5664684 T/G 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:G T G 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 11 10 21 5.16183788054532 5.30742010859516 -0.145582228049836 A:C C A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 39 30 69 18.3010615764789 15.9222603257855 2.3788012506934 A:G G A 10 0.530742010859516 0.630023564292483 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 5719649 T/C 1 19 18 37 8.9159017936692 9.55335619547129 -0.637454401802092 T:C T C 10 0.530742010859516 0.870218875970268 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 22 29 51 10.3236757610906 15.391518314926 -5.06784255383532 T:C T C 10 0.530742010859516 0.162900629111591 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 5730625 C/T 1 23 15 38 10.7929337502311 7.96113016289274 2.83180358733839 T:C C T 10 0.530742010859516 0.417695660704977 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5730283_5732093:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5730283_5732092:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5730283_5730677:TRIM22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6340416 G/A 1 24 53 77 11.2621917393716 28.1293265755543 -16.8671348361827 A:G G A 10 0.530742010859516 0.000134077269279102 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6415463 G/A 1 15 12 27 7.03886983710726 6.36890413031419 0.669965706793068 A:G G A 10 0.530742010859516 0.848986971115746 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6415428_6416221:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6415428_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531303:exon_6415408_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000526280:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531336:exon_6415126_6415603:SMPD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6503335 G/T 1 9 26 35 4.22332190226436 13.7992922823474 -9.57597038008306 T:G G T 10 0.530742010859516 0.00183684635542604 ENSG00000132286:ENST00000254616:exon_6503275_6505909:FXC1;ENSG00000132286:ENST00000464330:exon_6503275_6503519:FXC1;ENSG00000132286:ENST00000528908:exon_6503275_6503515:FXC1;ENSG00000132286:ENST00000530751:exon_6503275_6504028:FXC1;ENSG00000132286:ENST00000472836:exon_6503275_6503519:FXC1;ENSG00000132286:ENST00000531462:exon_6503275_6503519:FXC1;ENSG00000132286:ENST00000533379:exon_6503275_6503519:FXC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 7 21 28 3.28480592398339 11.1455822280498 -7.86077630406645 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00375352567712601 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 18 7 25 8.44664380452871 3.71519407601661 4.7314497285121 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0707891324711815 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 46 39 85 21.5858675004623 20.6989384235211 0.88692907694114 A:G G A 10 0.530742010859516 0.913589020502196 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 52 50 102 24.4014154353052 26.5371005429758 -2.13568510767063 T:C C T 10 0.530742010859516 0.692350607149474 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 347 336 683 162.832522231748 178.329315648797 -15.4967934170494 T:C C T 10 0.530742010859516 0.234965401365893 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 379 359 738 177.848777884243 190.536381898566 -12.6876040143228 A:G A G 10 0.530742010859516 0.356642413243971 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 7686754 C/G 1 21 13 34 9.85441777195016 6.89964614117371 2.95477163077646 C:G C G 10 0.530742010859516 0.390740321812299 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 7689727 T/A 1 13 4 17 6.10035385882629 2.12296804343806 3.97738581538823 A:T T A 10 0.530742010859516 0.0859308617300951 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7689709_7693754:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7689709_7689792:CYB5R2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 13410371 A/G 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 A:G A G 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 17809639 C/T 1 39 34 73 18.3010615764789 18.0452283692235 0.255833207255332 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 17809724 T/C 1 25 20 45 11.7314497285121 10.6148402171903 1.11660951132178 T:C T C 10 0.530742010859516 0.767260657141718 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17809702_17809960:SERGEF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 18108512 T/C 1 14 4 18 6.56961184796678 2.12296804343806 4.44664380452871 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0558034579733929 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 20529892 A/G 1 11 3 14 5.16183788054532 1.59222603257855 3.56961184796678 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0638641251547832 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 39 33 72 18.3010615764789 17.514486358364 0.786575218114848 T:C T C 10 0.530742010859516 0.906269818903988 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 10 17 27 4.69257989140484 9.02261418461177 -4.33003429320693 T:G T G 10 0.530742010859516 0.122085718128404 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 0 0 13 13 0 6.89964614117371 -6.89964614117371 T C T 10 0.530742010859516 5.34997531455705e-05 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 24 32 56 11.2621917393716 16.9837443475045 -5.7215526081329 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.141167049730041 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 16 36 52 7.50812782624774 19.1067123909426 -11.5985845646948 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00129880478857960 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 46341946 C/T 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:C C T 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46341815_46342079:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46341815_46342080:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46341815_46342080:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46341815_46342079:CREB3L1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 47179463 C/T 1 13 11 24 6.10035385882629 5.83816211945468 0.262191739371616 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000149179:ENST00000528488:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000278460:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527234:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000378618:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000395460:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000378615:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000525895:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527784:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000527268:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000534249:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000526827:exon_47179364_47179473:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000525953:exon_47179364_47179530:C11orf49;ENSG00000149179:ENST00000534581:exon_47179364_47179473:C11orf49 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 31 20 51 14.546997663355 10.6148402171903 3.93215744616468 T:C C T 10 0.530742010859516 0.326258695753339 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 57101000 G/C 1 14 5 19 6.56961184796678 2.65371005429758 3.9159017936692 C:G G C 10 0.530742010859516 0.105437071261094 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57100909_57101014:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57100099_57101014:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57100909_57101014:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57100909_57101014:SSRP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 57102096 A/G 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G A G 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000149136:ENST00000278412:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000293880:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000526696:exon_57101937_57102122:SSRP1;ENSG00000149136:ENST00000529002:exon_57101937_57102122:SSRP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 58338120 G/A 1 13 12 25 6.10035385882629 6.36890413031419 -0.2685502714879 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58338029_58338191:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58338029_58338186:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000529915:exon_58338029_58338186:LPXN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 59577364 C/T 1 29 27 56 13.608481685074 14.3300342932069 -0.721552608132896 T:C C T 10 0.530742010859516 0.893880020071883 ENSG00000166902:ENST00000300151:exon_59577328_59577393:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000534340:exon_59577328_59577393:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000525470:exon_59577328_59577495:MRPL16;ENSG00000166902:ENST00000531802:exon_59577007_59577393:MRPL16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 60154242 C/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:C C A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000166927:ENST00000300184:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000358246:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000435979:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000534016:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000530614:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000528808:exon_60154190_60154246:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000528215:exon_60154190_60154247:MS4A7;ENSG00000166927:ENST00000534310:exon_60153973_60154246:MS4A7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 11 10 21 5.16183788054532 5.30742010859516 -0.145582228049836 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 60615418 C/T 1 8 14 22 3.75406391312387 7.43038815203322 -3.67632423890935 T:C C T 10 0.530742010859516 0.136600125045471 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60615397_60615526:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60615397_60615526:CCDC86 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 60617715 A/C 1 18 19 37 8.44664380452871 10.0840982063308 -1.63745440180209 A:C A C 10 0.530742010859516 0.62389627643294 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 60689445 T/C 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 60711249 G/T 1 9 10 19 4.22332190226436 5.30742010859516 -1.0840982063308 T:G G T 10 0.530742010859516 0.651962958706861 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 61607859 C/T 1 20 9 29 9.38515978280968 4.77667809773564 4.60848168507404 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0959015891398473 ENSG00000134824:ENST00000257261:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000522056:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000518606:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000278840:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000517312:exon_61607806_61608003:FADS2;ENSG00000134824:ENST00000521849:exon_61607806_61608003:FADS2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 800 401 1201 375.406391312387 212.827546354666 162.578844957721 T:C:G G C 10 0.530742010859516 2.44942727725922e-21 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 62383981 A/C 1 56 57 113 26.2784473918671 30.2522946189924 -3.97384722712531 A:C A C 10 0.530742010859516 0.509587800224109 ENSG00000149541:ENST00000265471:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000531383:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000532585:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000534026:exon_62383978_62384268:B3GAT3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 149 135 284 69.9194403819321 71.6501714660347 -1.73073108410254 T:C C T 10 0.530742010859516 0.858540106791816 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 100 88 188 46.9257989140484 46.7052969556374 0.220501958410992 A:T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 63994230 G/T 1 72 52 124 33.7865752181148 27.5985845646948 6.18799065342002 T:G G T 10 0.530742010859516 0.281082808860832 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63994107_63994604:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63994107_63994604:NUDT22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 64622018 G/A 1 54 55 109 25.3399314135861 29.1908105972734 -3.85087918368724 A:G G A 10 0.530742010859516 0.502040114419439 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64619114_64622329:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64620203_64622329:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64620203_64622329:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000488711:exon_64621764_64622329:EHD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 64622869 G/C 1 16 20 36 7.50812782624774 10.6148402171903 -3.10671239094258 C:G G C 10 0.530742010859516 0.320123781383837 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 64627492 G/C 1 18 19 37 8.44664380452871 10.0840982063308 -1.63745440180209 C:G G C 10 0.530742010859516 0.62389627643294 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64627396_64627517:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64627396_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64627098_64627808:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000455148:exon_64627417_64627808:EHD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 23 33 56 10.7929337502311 17.514486358364 -6.7215526081329 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0816923322147786 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 64893365 T/A 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 A:T T A 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000149792:ENST00000524482:exon_64893198_64894828:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000528529:exon_64893198_64893774:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000534078:exon_64893198_64893476:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526319:exon_64893198_64893414:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000279242:exon_64893198_64894843:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000533943:exon_64893198_64893650:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000532671:exon_64893198_64894835:MRPL49 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65268198 G/A 1 936 949 1885 439.225477835493 503.674168305681 -64.4486904701876 A:T:C:G G A 10 0.530742010859516 0.00312925132817324 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65270976 G/A 1 97 84 181 45.518024946627 44.5823289121993 0.935696034427608 A:G G A 10 0.530742010859516 0.940669017537536 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65271832 C/T 1 95 93 188 44.579508968346 49.359007009935 -4.77949804158901 T:C C T 10 0.530742010859516 0.511045936029405 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65294524 G/A 1 2 14 16 0.938515978280968 7.43038815203322 -6.49187217375226 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00155459488130027 ENSG00000142186:ENST00000270176:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000525364:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000420247:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000533862:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527630:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000349495:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000279270:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000417543:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000524944:exon_65294433_65294588:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527009:exon_65294433_65294588:SCYL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65348583 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65348529_65348597:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65348529_65348597:EHBP1L1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65349849 A/T 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 A:T A T 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65359778 G/T 1 160 1 161 75.0812782624774 0.530742010859516 74.5505362516179 T:G G T 10 0.530742010859516 1.32551323776965e-42 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65359674_65360121:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529099:exon_65359674_65359933:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529596:exon_65359674_65359949:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533364:exon_65359674_65359842:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000527214:exon_65359674_65359933:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000529056:exon_65359674_65359951:EHBP1L1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65417434 G/A 1 56 39 95 26.2784473918671 20.6989384235211 5.57950896834598 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.259985966338624 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000531339:exon_65417421_65417522:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65417421_65417522:SIPA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65418048 G/A 1 144 155 299 67.5731504362297 82.265011683225 -14.6918612469953 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.0929383902171559 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65418040_65418401:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65418040_65418351:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65418040_65418389:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65418040_65418058:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000528699:exon_65418040_65418389:SIPA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65685317 G/A 1 13 8 21 6.10035385882629 4.24593608687613 1.85441777195016 A:G G A 10 0.530742010859516 0.514112372853973 ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 42 32 74 19.7088355439003 16.9837443475045 2.72509119639582 T:C C T 10 0.530742010859516 0.561596310941584 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65733685 C/T 1 44 47 91 20.6473515221813 24.9448745103973 -4.29752298821596 T:C C T 10 0.530742010859516 0.401243394156112 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733547_65733689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733547_65734027:SART1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 65766092 C/T 1 12 9 21 5.63109586968581 4.77667809773564 0.854417771950164 T:C C T 10 0.530742010859516 0.828106270585171 ENSG00000175376:ENST00000526451:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000312234:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000525767:exon_65765860_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529964:exon_65765904_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000533544:exon_65765964_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000527249:exon_65766038_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529973:exon_65766085_65766214:EIF1AD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 25 15 40 11.7314497285121 7.96113016289274 3.77031956561936 T:C C T 10 0.530742010859516 0.268735112362051 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 66262944 C/T 1 24 25 49 11.2621917393716 13.2685502714879 -2.00635853211628 T:C C T 10 0.530742010859516 0.570825667807040 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66262836_66262960:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66262836_66262960:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66262836_66262960:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66262836_66262960:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66262836_66262960:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526667:exon_66262798_66262960:DPP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 66610645 G/C 1 25 12 37 11.7314497285121 6.36890413031419 5.36254559819791 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0985763678967155 ENSG00000173715:ENST00000360962:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000346672:exon_66610640_66610799:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000527634:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000528340:exon_66610640_66610793:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532565:exon_66610640_66610761:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000525449:exon_66610640_66610795:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000532727:exon_66610640_66610763:C11orf80;ENSG00000173715:ENST00000531415:exon_66610640_66610744:C11orf80;ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66610306_66611332:RCE1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67120529 G/T 1 121 175 296 56.7802166859986 92.8798519004153 -36.0996352144167 T:G G T 10 0.530742010859516 3.27058533287789e-05 ENSG00000175482:ENST00000529704:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000533429:exon_67120162_67120549:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000530584:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000312419:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000532830:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000534515:exon_67119024_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000528087:exon_67119036_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000531239:exon_67120459_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000524743:exon_67120459_67120631:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000525255:exon_67119995_67120548:POLD4;ENSG00000175482:ENST00000529000:exon_67120364_67120582:POLD4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67174151 C/T 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 T:C C T 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67174098_67174163:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67174098_67174209:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67174098_67174163:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67174098_67174163:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67173066_67176604:TBC1D10C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67196049 G/A 1 9 3 12 4.22332190226436 1.59222603257855 2.63109586968581 A:G G A 10 0.530742010859516 0.155115621481203 ENSG00000175634:ENST00000530623:exon_67195931_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524934:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524814:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000420069:exon_67195969_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67195972_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67195975_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67195976_67196711:RPS6KB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67200819 C/T 1 36 27 63 16.8932876090574 14.3300342932069 2.56325331585049 T:C C T 10 0.530742010859516 0.531080609363684 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67257823 C/A 1 78 88 166 36.6021231529578 46.7052969556374 -10.1031738026797 A:C C A 10 0.530742010859516 0.120305726335491 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257787_67257929:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257787_67257928:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257787_67258124:AIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67353970 T/C 1 1344 862 2206 630.68273740481 457.499613360903 173.183124043908 T:C:G T C 10 0.530742010859516 1.20095034950034e-13 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 15 11 26 7.03886983710726 5.83816211945468 1.20070771765258 T:C C T 10 0.530742010859516 0.69751824451787 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67397251 G/C 1 3 7 10 1.40777396742145 3.71519407601661 -2.30742010859516 C:G G C 10 0.530742010859516 0.205910355285428 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67397189_67397401:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67397189_67397392:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67396390_67397392:NUDT8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 67812452 C/T 1 11 4 15 5.16183788054532 2.12296804343806 3.03886983710726 T:C C T 10 0.530742010859516 0.12884907544869 ENSG00000110719:ENST00000265686:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000532635:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000525724:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000528981:exon_67812425_67812569:TCIRG1;ENSG00000110719:ENST00000533005:exon_67812425_67812569:TCIRG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 9 8 17 4.22332190226436 4.24593608687613 -0.022614184611772 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 69462856 C/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000110092:ENST00000227507:exon_69462762_69462910:CCND1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 70281279 C/A 1 24 25 49 11.2621917393716 13.2685502714879 -2.00635853211628 A:C C A 10 0.530742010859516 0.570825667807040 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70281132_70282690:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70281132_70282681:CTTN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 70282332 C/T 1 115 137 252 53.9646687511557 72.7116554877537 -18.746986736598 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0194271042023358 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70281132_70282690:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70281132_70282681:CTTN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 17 19 36 7.97738581538823 10.0840982063308 -2.10671239094258 A:G G A 10 0.530742010859516 0.507892798432598 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 14 15 29 6.56961184796678 7.96113016289274 -1.39151831492596 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.710650929425754 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71152329 G/A 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527316:exon_71152273_71152486:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000534701:exon_71152273_71152393:DHCR7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 C:G G C 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C T C 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71195379 C/T 1 18 11 29 8.44664380452871 5.83816211945468 2.60848168507404 T:C C T 10 0.530742010859516 0.358118407723114 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71195358_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524450:exon_71195358_71195438:NADSYN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71701751 A/G 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 A:G A G 10 0.530742010859516 0.796007939511377 ENSG00000137522:ENST00000361756:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530655:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000393713:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000490867:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000528683:exon_71701643_71701842:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000526549:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000525243:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530137:exon_71701643_71701763:RNF121 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71717300 C/T 1 13 15 28 6.10035385882629 7.96113016289274 -1.86077630406645 T:C C T 10 0.530742010859516 0.571174046060559 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71717081_71717309:NUMA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71945332 A/G 1 11 6 17 5.16183788054532 3.1844520651571 1.97738581538823 A:G A G 10 0.530742010859516 0.467310697914147 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71945325_71945438:INPPL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 71948536 C/G 1 17 18 35 7.97738581538823 9.55335619547129 -1.57597038008306 C:G C G 10 0.530742010859516 0.615197128905741 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71948168_71948840:INPPL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 72004419 T/C 1 39 29 68 18.3010615764789 15.391518314926 2.90954326155291 A:T:C T C 10 0.530742010859516 0.544004856647692 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72003474_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72004347_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72004347_72004659:CLPB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 72012940 C/T 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72012847_72013008:CLPB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 73106562 C/T 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106489_73108518:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106489_73108518:RELT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 73570975 T/C 1 26 27 53 12.2007077176526 14.3300342932069 -2.12932657555435 T:C T C 10 0.530742010859516 0.584066635179051 ENSG00000175581:ENST00000310614:exon_73570952_73571054:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000411840:exon_73570952_73571054:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000398483:exon_73570952_73571054:MRPL48 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 11 10 21 5.16183788054532 5.30742010859516 -0.145582228049836 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 A:G G A 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 16 17 33 7.50812782624774 9.02261418461177 -1.51448635836403 T:G G T 10 0.530742010859516 0.606034924478049 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 93463678 G/A 1 10 15 25 4.69257989140484 7.96113016289274 -3.2685502714879 A:G G A 10 0.530742010859516 0.230326542779026 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 93540765 T/C 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93540684_93540801:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525613:exon_93540684_93540801:MED17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 94704159 T/C 1 70 52 122 32.8480592398339 27.5985845646948 5.24947467513905 T:C T C 10 0.530742010859516 0.365010742450989 ENSG00000150316:ENST00000279839:exon_94704141_94704229:CWC15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 102195501 A/G 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:G A G 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102195187_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102192568_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102195192_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102195186_102196093:BIRC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 21 25 46 9.85441777195016 13.2685502714879 -3.41413249953774 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.375718865856979 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 102272277 G/T 1 26 18 44 12.2007077176526 9.55335619547129 2.6473515221813 T:G G T 10 0.530742010859516 0.453425705244587 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272270_102272423:TMEM123 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 104899901 T/C 1 35 34 69 16.4240296199169 18.0452283692235 -1.6211987493066 T:C T C 10 0.530742010859516 0.718704036250042 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104899851_104899994:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104899851_104899994:CASP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 104972136 G/T 0 31 0 31 14.546997663355 0 14.546997663355 G G 10 0.530742010859516 5.30925016088125e-09 ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104972135_104972158:CASP1;ENSG00000204397:ENST00000525374:exon_104972135_104972158:CARD16;ENSG00000255221:ENST00000375707:exon_104972135_104972158:CARD17;ENSG00000255221:ENST00000393135:exon_104972135_104972158:CARD17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 16 14 30 7.50812782624774 7.43038815203322 0.07773967421452 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 11 15 26 5.16183788054532 7.96113016289274 -2.79929228234742 T:C T C 10 0.530742010859516 0.327177533704281 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 112104245 T/C 1 23 12 35 10.7929337502311 6.36890413031419 4.42402961991694 T:C T C 10 0.530742010859516 0.174814722474268 ENSG00000150787:ENST00000280362:exon_112104155_112104696:PTS;ENSG00000150787:ENST00000528679:exon_112104155_112104632:PTS;ENSG00000150787:ENST00000525803:exon_112104155_112104533:PTS;ENSG00000150787:ENST00000524931:exon_112104155_112104533:PTS;ENSG00000150787:ENST00000527635:exon_112104155_112104400:PTS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 8 14 22 3.75406391312387 7.43038815203322 -3.67632423890935 A:G A G 10 0.530742010859516 0.136600125045471 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 118889016 G/A 1 146 143 289 68.5116664145107 75.8961075529108 -7.38444113840012 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.409389092172132 ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118888992_118889040:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118888992_118889388:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118888992_118889400:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118888992_118889054:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118888072_118889401:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118888992_118889052:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000524864:exon_118888992_118889376:RPS25 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 T:C:G T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 118949277 C/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 C:G C G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 11 119207024 C/T 1 5 9 14 2.34628994570242 4.77667809773564 -2.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.284091899937015 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26;ENSG00000245385:ENST00000501918:exon_119206959_119207203:RP11-334E6.10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C T C 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 6 9 15 2.8155479348429 4.77667809773564 -1.96113016289274 A:G A G 10 0.530742010859516 0.438937968640093 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 14 11 25 6.56961184796678 5.83816211945468 0.7314497285121 A:G G A 10 0.530742010859516 0.842799633797048 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 7076648 T/C 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:C T C 10 0.530742010859516 0.77948262403828 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 7080101 T/C 1 31 44 75 14.546997663355 23.3526484778187 -8.8056508144637 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0487342763942176 ENSG00000126749:ENST00000439543:exon_7080087_7080209:EMG1;ENSG00000126749:ENST00000261406:exon_7080087_7080209:EMG1;ENSG00000126749:ENST00000451846:exon_7080087_7080209:EMG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 50 0 50 23.4628994570242 0 23.4628994570242 G G 10 0.530742010859516 1.96869098953841e-14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 8756892 A/G 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:G A G 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000111732:ENST00000229335:exon_8754762_8756933:AICDA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 9885578 G/A 1 112 37 149 52.5568947837342 19.6374544018021 32.9194403819321 A:G G A 10 0.530742010859516 3.73039363283662e-08 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9885545_9885860:CLECL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 7 11 18 3.28480592398339 5.83816211945468 -2.55335619547129 T:C T C 10 0.530742010859516 0.246521713034617 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 10659584 C/T 0 260 0 260 122.007077176526 0 122.007077176526 C C 10 0.530742010859516 4.26446783357559e-72 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 10659799 T/C 0 205 0 205 96.1978877737992 0 96.1978877737992 T T 10 0.530742010859516 4.22818982129311e-57 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 28 29 57 13.1392236959336 15.391518314926 -2.25229461899241 A:G G A 10 0.530742010859516 0.59655465538297 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 14631339 G/A 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14631251_14631406:ATF7IP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 6 21 27 2.8155479348429 11.1455822280498 -8.33003429320693 T:G T G 10 0.530742010859516 0.00156460030322389 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 11 7 18 5.16183788054532 3.71519407601661 1.44664380452871 T:C C T 10 0.530742010859516 0.63827752360053 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 C:G C G 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 17 13 30 7.97738581538823 6.89964614117371 1.07773967421452 C:G G C 10 0.530742010859516 0.718793218928822 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 25259950 A/G 1 97 77 174 45.518024946627 40.8671348361827 4.65089011044422 A:G A G 10 0.530742010859516 0.495046838063769 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25259877_25259984:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25259877_25259984:LRMP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 28515383 C/G 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28515371_28515448:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28515371_28515448:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28515371_28515448:CCDC91 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 18 12 30 8.44664380452871 6.36890413031419 2.07773967421452 A:G A G 10 0.530742010859516 0.470863171171006 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 31435635 A/G 1 9 5 14 4.22332190226436 2.65371005429758 1.56961184796678 A:G A G 10 0.530742010859516 0.436312573490878 ENSG00000139146:ENST00000448582:exon_31433529_31435805:FAM60A;ENSG00000139146:ENST00000337682:exon_31433529_31435805:FAM60A;ENSG00000139146:ENST00000395766:exon_31435232_31435805:FAM60A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 31604928 G/C 1 29 14 43 13.608481685074 7.43038815203322 6.17809353304081 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0667692270498517 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 31605044 G/T 1 9 15 24 4.22332190226436 7.96113016289274 -3.73780826062838 T:G G T 10 0.530742010859516 0.152967902735682 ENSG00000170456:ENST00000389082:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000306833:exon_31604874_31605410:DENND5B;ENSG00000170456:ENST00000354285:exon_31604874_31605410:DENND5B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 32138534 T/A 1 9 8 17 4.22332190226436 4.24593608687613 -0.022614184611772 A:T T A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 42706822 T/C 1 116 101 217 54.4339267402961 53.6049430968111 0.828983643485032 T:C T C 10 0.530742010859516 0.94581604724147 ENSG00000139168:ENST00000266529:exon_42705888_42707000:ZCRB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 42711691 G/T 1 32 30 62 15.0162556524955 15.9222603257855 -0.906004673289992 T:G G T 10 0.530742010859516 0.898896820884524 ENSG00000139168:ENST00000266529:exon_42711589_42711700:ZCRB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 44180295 G/A 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000198001:ENST00000448290:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000431837:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000440781:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000356669:exon_44180202_44180360:IRAK4;ENSG00000198001:ENST00000446056:exon_44180202_44180360:IRAK4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 48527123 G/A 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 G G 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 49717533 A/C 1 37 20 57 17.3625455981979 10.6148402171903 6.74770538100759 A:C A C 10 0.530742010859516 0.0842916435727968 ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000456139:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000380327:exon_49717387_49717535:TROAP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 49957260 A/G 1 12 4 16 5.63109586968581 2.12296804343806 3.50812782624774 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0856474633351484 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49957221_49957329:MCRS1;ENSG00000187778:ENST00000357123:exon_49957221_49957329:MCRS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 50152193 G/A 1 47 36 83 22.0551254896027 19.1067123909426 2.94841309866017 A:G G A 10 0.530742010859516 0.582736430651583 ENSG00000139644:ENST00000267115:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000395006:exon_50152166_50152263:TMBIM6;ENSG00000139644:ENST00000423828:exon_50152166_50152263:TMBIM6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 50384469 A/G 1 9 11 20 4.22332190226436 5.83816211945468 -1.61484021719032 A:G A G 10 0.530742010859516 0.507952296287165 ENSG00000161800:ENST00000454520:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000434422:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000427314:exon_50384467_50384575:RACGAP1;ENSG00000161800:ENST00000312377:exon_50384467_50384575:RACGAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 50524472 C/T 1 23 19 42 10.7929337502311 10.0840982063308 0.708835543900328 T:C C T 10 0.530742010859516 0.877972770022112 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50523608_50524477:LASS5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 50571275 T/C 1 16 9 25 7.50812782624774 4.77667809773564 2.7314497285121 T:C T C 10 0.530742010859516 0.319678398805541 ENSG00000050405:ENST00000394943:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000341247:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000420992:exon_50569573_50571852:LIMA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 51681903 T/C 1 6 10 16 2.8155479348429 5.30742010859516 -2.49187217375226 T:C T C 10 0.530742010859516 0.223009840929929 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 53686073 G/T 1 5 9 14 2.34628994570242 4.77667809773564 -2.43038815203322 T:G G T 10 0.530742010859516 0.284091899937015 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53686062_53686177:ESPL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 53686703 G/A 1 11 12 23 5.16183788054532 6.36890413031419 -1.20706624976887 A:G G A 10 0.530742010859516 0.678835837482447 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53686590_53686754:ESPL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 53693532 A/G 1 9 4 13 4.22332190226436 2.12296804343806 2.10035385882629 A:G A G 10 0.530742010859516 0.278656458173804 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693470_53693737:C12orf10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 53693533 A/C 1 9 4 13 4.22332190226436 2.12296804343806 2.10035385882629 A:C A C 10 0.530742010859516 0.278656458173804 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693470_53693737:C12orf10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 53700848 C/T 1 148 132 280 69.4501823927916 70.0579454334561 -0.60776304066448 T:C C T 10 0.530742010859516 0.952313959106367 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53700750_53700965:C12orf10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 53700860 A/G 1 161 140 301 75.5505362516179 74.3038815203322 1.24665473128569 A:G A G 10 0.530742010859516 0.908125373140337 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53700750_53700965:C12orf10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 53703021 G/A 1 13 21 34 6.10035385882629 11.1455822280498 -5.04522836922354 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0880901903974396 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53702941_53703065:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53702941_53703065:AAAS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 53900640 A/G 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000139574:ENST00000267017:exon_53900474_53900677:NPFF;ENSG00000139574:ENST00000448979:exon_53900474_53900677:NPFF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 73 103 176 34.2558332072553 54.6664271185302 -20.4105939112748 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00243021475294448 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 56295734 A/G 1 60 53 113 28.155479348429 28.1293265755543 0.026152772874692 A:T:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000170473:ENST00000408946:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000398213:exon_56295197_56296139:WIBG;ENSG00000170473:ENST00000302533:exon_56295198_56296139:WIBG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 56345408 T/G 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 T:G T G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000065357:ENST00000331886:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394145:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394147:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000402956:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000412897:exon_56345407_56345567:DGKA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 185 109 294 86.8127279909895 57.8508791836872 28.9618488073023 A:G A G 10 0.530742010859516 0.000687443513949889 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 56531154 T/C 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000139641:ENST00000394048:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000267113:exon_56531002_56531157:ESYT1;ENSG00000139641:ENST00000402331:exon_56531002_56531157:ESYT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:G G A 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 571 527 1098 267.946311799216 279.701039722965 -11.7547279237486 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.486845130437782 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 57638375 A/G 1 14 14 28 6.56961184796678 7.43038815203322 -0.860776304066448 A:G A G 10 0.530742010859516 0.850388610583438 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57638320_57638405:STAC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 57868243 G/A 1 27 21 48 12.6699657067931 11.1455822280498 1.52438347874323 A:G G A 10 0.530742010859516 0.772769303482633 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57868206_57868259:ARHGAP9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 57906577 T/C 1 22 28 50 10.3236757610906 14.8607763040664 -4.5371005429758 T:C T C 10 0.530742010859516 0.205409377616344 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57906534_57906747:MARS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 9 11 20 4.22332190226436 5.83816211945468 -1.61484021719032 A:G G A 10 0.530742010859516 0.507952296287165 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 58143088 C/T 1 61 57 118 28.6247373375695 30.2522946189924 -1.62755728142289 T:C C T 10 0.530742010859516 0.782572518880638 ENSG00000135446:ENST00000257904:exon_58142965_58143100:CDK4;ENSG00000135446:ENST00000312990:exon_58142965_58143100:CDK4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 58144781 T/C 1 56 59 115 26.2784473918671 31.3137786407114 -5.03533124884434 T:C T C 10 0.530742010859516 0.351849066498016 ENSG00000135446:ENST00000257904:exon_58144706_58144873:CDK4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 9 9 18 4.22332190226436 4.77667809773564 -0.553356195471288 T:C T C 10 0.530742010859516 0.817532500175034 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 62784650 T/C 1 12 3 15 5.63109586968581 1.59222603257855 4.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 0.040233234138817 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62784644_62784759:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62784644_62784759:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62784644_62784759:USP15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 64587684 C/G 1 1 10 11 0.469257989140484 5.30742010859516 -4.83816211945468 C:G C G 10 0.530742010859516 0.004206919993513 ENSG00000174206:ENST00000311915:exon_64587627_64588438:C12orf66;ENSG00000174206:ENST00000398055:exon_64586421_64588438:C12orf66 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 64841925 C/T 1 35 27 62 16.4240296199169 14.3300342932069 2.09399532671001 T:C C T 10 0.530742010859516 0.613289641077215 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64841885_64842461:XPOT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 66641975 A/G 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000090376:ENST00000261233:exon_66641475_66648392:IRAK3;ENSG00000090376:ENST00000457197:exon_66641475_66648392:IRAK3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 67700127 G/A 1 19 26 45 8.9159017936692 13.7992922823474 -4.88339048867822 A:G G A 10 0.530742010859516 0.178447363027911 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67698884_67700377:CAND1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 114 103 217 53.4954107620152 54.6664271185302 -1.17101635651498 A:G G A 10 0.530742010859516 0.891928966516625 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 68052178 G/T 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 T:G G T 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 70188941 A/G 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000127328:ENST00000378815:exon_70188921_70190424:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000247833:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000417413:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000483530:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000362025:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325555:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000378809:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325596:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000526994:exon_70188921_70189124:RAB3IP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 72312268 G/A 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72312231_72312328:TBC1D15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 A:G A G 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 80190582 A/G 1 38 31 69 17.8318035873384 16.453002336645 1.3788012506934 A:G A G 10 0.530742010859516 0.809715978060955 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 39 30 69 18.3010615764789 15.9222603257855 2.3788012506934 C:G C G 10 0.530742010859516 0.630023564292483 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 88500552 A/C 1 25 11 36 11.7314497285121 5.83816211945468 5.89328760905742 A:C A C 10 0.530742010859516 0.0648760640789124 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500452_88500682:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500452_88500682:CEP290 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 19 5 24 8.9159017936692 2.65371005429758 6.26219173937162 T:G T G 10 0.530742010859516 0.0127145005117936 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 96252833 A/G 1 136 120 256 63.8190865231058 63.6890413031419 0.130045219963904 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000139343:ENST00000266735:exon_96252709_96252854:SNRPF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 0 0 10 10 0 5.30742010859516 -5.30742010859516 A G A 10 0.530742010859516 0.000517746000126161 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 T:C C T 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 120574408 G/A 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 A:G G A 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120574306_120574536:GCN1L1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 120954490 C/T 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120954370_120954591:COQ5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 121877723 T/C 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 T:C T C 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121877660_121877878:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121877660_121877878:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121877660_121877884:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121877660_121877878:KDM2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 39 31 70 18.3010615764789 16.453002336645 1.84805923983388 T:C C T 10 0.530742010859516 0.71994144524827 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 122720423 G/A 1 9 9 18 4.22332190226436 4.77667809773564 -0.553356195471288 A:G G A 10 0.530742010859516 0.817532500175034 ENSG00000139719:ENST00000267199:exon_122720333_122720470:VPS33A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 122958095 C/T 1 28 25 53 13.1392236959336 13.2685502714879 -0.129326575554348 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000033030:ENST00000336229:exon_122957437_122958822:ZCCHC8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 122991437 A/G 1 21 37 58 9.85441777195016 19.6374544018021 -9.78303662985193 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0119532426099752 ENSG00000111011:ENST00000331738:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000354654:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000344591:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000392442:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000532695:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000433877:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527173:exon_122991381_122991470:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000418773:exon_122991418_122991446:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000531389:exon_122991425_122991800:RSRC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 123801856 T/C 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C T C 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123801768_123801903:SBNO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 124102329 C/G 1 12 1 13 5.63109586968581 0.530742010859516 5.10035385882629 C:G C G 10 0.530742010859516 0.00415285976509833 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124102305_124102419:DDX55;ENSG00000111364:ENST00000354291:exon_124102305_124102419:DDX55 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 124104642 C/T 1 34 28 62 15.9547716307765 14.8607763040664 1.09399532671001 T:C C T 10 0.530742010859516 0.800566896152041 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 125284748 A/G 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:G A G 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125284670_125284788:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125284670_125284788:SCARB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 125398319 G/A 1 450 405 855 211.166095113218 214.950514398104 -3.78441928488618 A:T:C:G G A 10 0.530742010859516 0.810479360400962 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 13 9 22 6.10035385882629 4.77667809773564 1.32367576109065 A:G A G 10 0.530742010859516 0.671417745104305 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 5 14 19 2.34628994570242 7.43038815203322 -5.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0217224755025344 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 132626097 C/G 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626043_132626151:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626043_132626151:DDX51 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 132626427 C/T 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C C T 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 132633439 C/T 1 19 7 26 8.9159017936692 3.71519407601661 5.20070771765258 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0487930696503959 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132633329_132633440:NOC4L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:C T C 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 133272521 T/C 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133272470_133272632:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133272470_133272632:PGAM5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 12 133306780 A/G 1 9 10 19 4.22332190226436 5.30742010859516 -1.0840982063308 A:G A G 10 0.530742010859516 0.651962958706861 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 20411702 G/A 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20411593_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20411605_20411961:ZMYM5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 21306140 A/G 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:G A G 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000150456:ENST00000473438:exon_21305980_21306260:N6AMT2;ENSG00000150456:ENST00000382758:exon_21305980_21306260:N6AMT2;ENSG00000150456:ENST00000382754:exon_21305980_21306260:N6AMT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 208 1 209 97.6056617412207 0.530742010859516 97.0749197303612 T:C:G T C 10 0.530742010859516 7.49534022534671e-56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 22088527 A/G 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 A:G A G 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000165487:ENST00000382374:exon_22088492_22088557:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000480341:exon_22088492_22088557:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000469058:exon_22088492_22088557:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000476895:exon_22088492_22088557:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000468222:exon_22088492_22088557:EFHA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 23911820 A/G 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 A:G A G 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 24330696 G/A 1 21 22 43 9.85441777195016 11.6763242389094 -1.82190646695919 A:G G A 10 0.530742010859516 0.647543844169158 ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24330684_24330757:MIPEP;ENSG00000027001:ENST00000433710:exon_24330684_24330757:MIPEP;ENSG00000027001:ENST00000464194:exon_24330684_24330969:MIPEP;ENSG00000027001:ENST00000382155:exon_24330684_24330757:MIPEP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 24411772 T/C 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 T:C T C 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24411691_24411895:MIPEP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 66 73 139 30.9710272832719 38.7441667927447 -7.77313950947272 T:C:G C G 10 0.530742010859516 0.202539550716838 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 T:G G T 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 26788114 A/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G A G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26786905_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26786906_26789729:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26786912_26789729:RNF6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 28197314 T/C 1 219 258 477 102.767499621766 136.931438801755 -34.1639391799891 A:T:C T C 10 0.530742010859516 0.00179597564413058 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 153 143 296 71.7964723384941 75.8961075529108 -4.09963521441674 A:G G A 10 0.530742010859516 0.641691532847467 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 31036681 A/G 1 77 34 111 36.1328651638173 18.0452283692235 18.0876367945937 A:G A G 10 0.530742010859516 0.000569886159730975 ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 33016660 C/T 1 4 13 17 1.87703195656194 6.89964614117371 -5.02261418461177 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0256214099084431 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000446957:exon_33016525_33016685:N4BP2L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 36878564 C/T 1 30 36 66 14.0777396742145 19.1067123909426 -5.02897271672806 T:C C T 10 0.530742010859516 0.220080597350676 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36875775_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36877856_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36878459_36878769:SPG20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 36878708 C/A 1 16 19 35 7.50812782624774 10.0840982063308 -2.57597038008306 A:C C A 10 0.530742010859516 0.401755628038042 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36875775_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36877856_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36878459_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36878588_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36878594_36878769:SPG20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 38933460 A/C 1 10 17 27 4.69257989140484 9.02261418461177 -4.33003429320693 A:C A C 10 0.530742010859516 0.122085718128404 ENSG00000120686:ENST00000379649:exon_38933438_38933470:UFM1;ENSG00000120686:ENST00000448101:exon_38933438_38933523:UFM1;ENSG00000120686:ENST00000239878:exon_38933438_38933470:UFM1;ENSG00000120686:ENST00000437952:exon_38933438_38933918:UFM1;ENSG00000120686:ENST00000379641:exon_38933438_38933470:UFM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 41323397 C/T 1 26 35 61 12.2007077176526 18.5759703800831 -6.37526266243048 T:C C T 10 0.530742010859516 0.123178528729193 ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41323274_41323749:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41323274_41323417:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41323274_41323417:MRPS31 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 41635803 C/T 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 T:C C T 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000120688:ENST00000379487:exon_41635410_41635811:WBP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 43181024 T/C 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C T C 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000120659:ENST00000358545:exon_43180633_43181310:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000405262:exon_43180633_43182149:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43180633_43182144:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43180633_43182149:TNFSF11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 43469157 G/A 1 5 21 26 2.34628994570242 11.1455822280498 -8.79929228234742 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.000576412132868809 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 43469211 G/A 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43469145_43469244:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43469145_43469244:EPSTI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 45594482 G/A 1 7 11 18 3.28480592398339 5.83816211945468 -2.55335619547129 A:G G A 10 0.530742010859516 0.246521713034617 ENSG00000133114:ENST00000379151:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000497558:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000361121:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000357537:exon_45594465_45594563:KIAA1704 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 45841502 G/A 1 33 32 65 15.485513641636 16.9837443475045 -1.49823070586854 A:G G A 10 0.530742010859516 0.71148492078146 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 46577381 T/C 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46577274_46577471:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000470308:exon_46577274_46577471:ZC3H13 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 50064999 A/G 1 14 10 24 6.56961184796678 5.30742010859516 1.26219173937162 A:G A G 10 0.530742010859516 0.685182392195028 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50064958_50065046:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50064958_50065046:SETDB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 179 200 379 83.9971800561466 106.148402171903 -22.1512221157566 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0235227688920956 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 50205153 C/T 1 4 11 15 1.87703195656194 5.83816211945468 -3.96113016289274 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0665477231595873 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 53035897 T/A 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 A:T T A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53035193_53036061:CKAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 53036553 A/G 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G A G 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53036498_53036702:CKAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 53250409 G/A 1 92 79 171 43.1717350009245 41.9286188579018 1.24311614302276 A:G G A 10 0.530742010859516 0.878387751473996 ENSG00000165416:ENST00000343788:exon_53250365_53250455:SUGT1;ENSG00000165416:ENST00000310528:exon_53250365_53250455:SUGT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 73335555 T/C 1 13 12 25 6.10035385882629 6.36890413031419 -0.2685502714879 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73335501_73335659:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73335501_73335659:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73335501_73335659:DIS3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 86 141 227 40.3561870660816 74.8346235311918 -34.4784364651101 T:C C T 10 0.530742010859516 5.27322533368826e-06 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 99947829 T/C 1 21 19 40 9.85441777195016 10.0840982063308 -0.22968043438064 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 103418892 G/A 1 20 21 41 9.38515978280968 11.1455822280498 -1.76042244524016 A:G G A 10 0.530742010859516 0.640039370000344 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 111298323 C/T 1 17 10 27 7.97738581538823 5.30742010859516 2.66996570679307 T:C C T 10 0.530742010859516 0.339565067535051 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 113975768 T/C 1 10 13 23 4.69257989140484 6.89964614117371 -2.20706624976887 T:C T C 10 0.530742010859516 0.406857310619905 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 70 114 184 32.8480592398339 60.5045892379848 -27.6565299981509 A:T:C:G T C 10 0.530742010859516 4.4813683222797e-05 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 13 115070418 G/T 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:G G T 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115070264_115071283:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115070264_115071283:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000480362:exon_115070264_115070424:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115070264_115071283:UPF3A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 43 26 69 20.1780935330408 13.7992922823474 6.3788012506934 A:G G A 10 0.530742010859516 0.147453322212178 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 9 8 17 4.22332190226436 4.24593608687613 -0.022614184611772 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 20916282 G/A 1 45 16 61 21.1166095113218 8.49187217375226 12.6247373375695 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00119332504123769 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916265_20916330:OSGEP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 20944569 G/A 1 52 11 63 24.4014154353052 5.83816211945468 18.5632533158505 A:G G A 10 0.530742010859516 1.5068017676183e-06 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20944543_20945253:PNP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21829129 C/G 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 C:G C G 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21829005_21829131:SUPT16H HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21829404 T/C 1 7 10 17 3.28480592398339 5.30742010859516 -2.02261418461177 T:C T C 10 0.530742010859516 0.342925565397055 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21831052 T/C 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:C:G T C 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 8 1 9 3.75406391312387 0.530742010859516 3.22332190226436 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0422661471759058 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 A A 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 T T 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 12 6 18 5.63109586968581 3.1844520651571 2.44664380452871 T:C T C 10 0.530742010859516 0.34554633606434 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 25 14 39 11.7314497285121 7.43038815203322 4.30106157647888 A:G G A 10 0.530742010859516 0.199770101838532 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 56 38 94 26.2784473918671 20.1681964126616 6.1102509792055 T:C T C 10 0.530742010859516 0.216340226123340 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 23237212 G/A 1 12 11 23 5.63109586968581 5.83816211945468 -0.207066249768868 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23237167_23237831:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000442110:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23237167_23237380:OXA1L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 T:C T C 10 0.530742010859516 0.796007939511377 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 23566913 C/G 1 47 29 76 22.0551254896027 15.391518314926 6.66360717467678 C:G C G 10 0.530742010859516 0.135862124184583 ENSG00000179933:ENST00000319074:exon_23566867_23569671:C14orf119 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24030810 G/T 1 26 18 44 12.2007077176526 9.55335619547129 2.6473515221813 T:G G T 10 0.530742010859516 0.453425705244587 ENSG00000213983:ENST00000308724:exon_24030721_24030844:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000397120:exon_24030721_24030844:AP1G2;ENSG00000213983:ENST00000460049:exon_24030721_24030844:AP1G2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 1 10 3 13 4.69257989140484 1.59222603257855 3.10035385882629 A:G G A 10 0.530742010859516 0.100208582951158 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24458236 G/A 1 17 18 35 7.97738581538823 9.55335619547129 -1.57597038008306 A:G G A 10 0.530742010859516 0.615197128905741 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24566261 G/A 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:G G A 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24566101_24566346:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24566101_24566346:PCK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24572013 G/A 1 20 10 30 9.38515978280968 5.30742010859516 4.07773967421452 A:G G A 10 0.530742010859516 0.147123291936050 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24571962_24572099:PCK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24572812 G/A 1 61 25 86 28.6247373375695 13.2685502714879 15.3561870660816 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00106724496503720 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 9 13 22 4.22332190226436 6.89964614117371 -2.67632423890935 C:G G C 10 0.530742010859516 0.289347566198005 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C T C 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24663924 A/G 1 10 11 21 4.69257989140484 5.83816211945468 -1.14558222804984 A:G A G 10 0.530742010859516 0.666093004046952 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24663881_24664242:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24663881_24664614:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24663881_24664242:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24663881_24664036:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000396854:exon_24663881_24664242:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528895:exon_24663881_24664242:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530563:exon_24663881_24664036:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000530468:exon_24663881_24664242:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000525592:exon_24663881_24664242:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528010:exon_24663881_24664257:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24663881_24664242:RP11-468E2.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 87 99 186 40.8254450552221 52.5434590750921 -11.71801401987 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0911000066651013 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24680809 C/T 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 T:C C T 10 0.530742010859516 0.78264401969771 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 21 18 39 9.85441777195016 9.55335619547129 0.301061576478876 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 19 20 39 8.9159017936692 10.6148402171903 -1.69893842352112 T:C T C 10 0.530742010859516 0.632166507351227 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24760764 G/A 1 29 5 34 13.608481685074 2.65371005429758 10.9547716307765 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.000104114913598158 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24805463 G/T 1 8 2 10 3.75406391312387 1.06148402171903 2.69257989140484 T:G G T 10 0.530742010859516 0.116019943610998 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 43 79 122 20.1780935330408 41.9286188579018 -21.750525324861 T:C C T 10 0.530742010859516 8.47679260659946e-05 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 59 67 126 27.6862213592886 35.5597147275876 -7.87349336829902 T:C T C 10 0.530742010859516 0.180480898408500 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 41 53 94 19.2395775547598 28.1293265755543 -8.8897490207945 C:G C G 10 0.530742010859516 0.0784793041113938 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24909731 C/T 1 11 16 27 5.16183788054532 8.49187217375226 -3.33003429320693 T:C C T 10 0.530742010859516 0.247671119671072 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24910973 T/G 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:G T G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 24910974 T/A 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:T T A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 31355201 T/G 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 T:G T G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 21 18 39 9.85441777195016 9.55335619547129 0.301061576478876 A:T A T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 10 5 15 4.69257989140484 2.65371005429758 2.03886983710726 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.315511031428908 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C C T 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 1 15 16 0.469257989140484 7.96113016289274 -7.49187217375226 T:C T C 10 0.530742010859516 0.000145209530771708 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 491 573 1064 230.405672667978 304.115172222503 -73.709499554525 A:G G A 10 0.530742010859516 6.17954281977557e-06 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 35871302 C/T 1 13 8 21 6.10035385882629 4.24593608687613 1.85441777195016 T:C C T 10 0.530742010859516 0.514112372853973 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 A:G G A 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 50251369 A/G 1 14 17 31 6.56961184796678 9.02261418461177 -2.453002336645 A:G A G 10 0.530742010859516 0.472281772022753 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50249997_50251431:SDCCAG1;ENSG00000165525:ENST00000382135:exon_50250532_50251431:SDCCAG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 50298962 T/A 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:T T A 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 51227000 A/G 1 20 13 33 9.38515978280968 6.89964614117371 2.48551364163597 A:G A G 10 0.530742010859516 0.48604866739603 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 53194365 A/G 1 23 16 39 10.7929337502311 8.49187217375226 2.30106157647888 A:G A G 10 0.530742010859516 0.522673801359898 ENSG00000100519:ENST00000445930:exon_53194217_53195305:PSMC6;ENSG00000100519:ENST00000216407:exon_53194217_53194711:PSMC6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 55422317 G/A 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55422279_55422412:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55422279_55422412:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55422279_55422412:WDHD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 55611920 C/A 1 135 143 278 63.3498285339653 75.8961075529108 -12.5462790189455 A:C C A 10 0.530742010859516 0.133443840376476 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55611834_55612147:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55611834_55612126:LGALS3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 55618524 C/G 1 30 17 47 14.0777396742145 9.02261418461177 5.05512548960275 C:G C G 10 0.530742010859516 0.146634775041996 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55618413_55618659:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55618413_55618659:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55618413_55618659:DLGAP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 58979242 C/T 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C C T 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000100578:ENST00000354386:exon_58979240_58979345:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000423743:exon_58979240_58979345:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000261244:exon_58979240_58979345:KIAA0586 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 59939727 T/C 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 67850193 G/C 1 99 103 202 46.4565409249079 54.6664271185302 -8.20988619362224 C:G G C 10 0.530742010859516 0.259661356013289 ENSG00000134001:ENST00000256383:exon_67850032_67853233:EIF2S1;ENSG00000134001:ENST00000437108:exon_67850150_67850276:EIF2S1;ENSG00000134001:ENST00000466499:exon_67850032_67850839:EIF2S1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 8 17 25 3.75406391312387 9.02261418461177 -5.2685502714879 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0438949573338673 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 75601663 G/A 1 82 43 125 38.4791551095197 22.8219064669592 15.6572486425605 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00532287481629566 ENSG00000170348:ENST00000303575:exon_75598173_75601709:TMED10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 76012864 A/G 1 117 94 211 54.9031847294366 49.8897490207945 5.01343570864213 A:G A G 10 0.530742010859516 0.534855941377847 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 76012939 C/G 1 202 126 328 94.7901138063778 66.873493368299 27.9166204380788 C:G C G 10 0.530742010859516 0.00229531432026730 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 77797452 A/G 1 45 61 106 21.1166095113218 32.3752626624305 -11.2586531511087 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0320087019615975 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77797412_77797830:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77797412_77797939:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77797412_77797830:GSTZ1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 77928525 A/G 1 33 21 54 15.485513641636 11.1455822280498 4.33993141358614 A:G A G 10 0.530742010859516 0.275827047840183 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 77928546 C/T 1 32 22 54 15.0162556524955 11.6763242389094 3.33993141358614 T:C C T 10 0.530742010859516 0.41416334629023 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77928503_77928585:AHSA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 77934431 G/A 1 35 28 63 16.4240296199169 14.8607763040664 1.56325331585049 A:G G A 10 0.530742010859516 0.707167766911863 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77934426_77934527:AHSA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 77978621 A/C 1 68 33 101 31.9095432615529 17.514486358364 14.3950569031889 A:C A C 10 0.530742010859516 0.00499461955048655 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_77973272_77978746:SPTLC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 78140256 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 78174485 G/T 1 86 85 171 40.3561870660816 45.1130709230589 -4.75688385697723 T:G G T 10 0.530742010859516 0.490824720029584 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 92588043 G/A 1 65 40 105 30.5017692941315 21.2296804343806 9.27208885975082 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0782078284887949 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 9 1 10 4.22332190226436 0.530742010859516 3.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0238276980671328 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 93693321 T/C 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93693289_93695553:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93693289_93695553:UBR7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 94401102 C/T 1 8 11 19 3.75406391312387 5.83816211945468 -2.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.366013294263512 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94400499_94401138:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94400513_94401138:ASB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 94528572 C/T 1 31 23 54 14.546997663355 12.2070662497689 2.33993141358614 T:C C T 10 0.530742010859516 0.586405186038505 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94528443_94528967:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94528443_94528967:DDX24 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 95663003 A/G 1 9 4 13 4.22332190226436 2.12296804343806 2.10035385882629 A:G A G 10 0.530742010859516 0.278656458173804 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95662835_95663031:CLMN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 99870572 A/G 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:G A G 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99870562_99870647:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000446066:exon_99870562_99870647:SETD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 100563868 G/A 1 40 35 75 18.7703195656194 18.5759703800831 0.1943491855363 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100563818_100563995:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100563818_100563995:EVL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 104029378 C/G 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 C:G C G 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 120 91 211 56.3109586968581 48.297522988216 8.01343570864212 T:C T C 10 0.530742010859516 0.300840243545669 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 105181111 G/A 1 2 10 12 0.938515978280968 5.30742010859516 -4.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0170869766127310 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 105181673 G/A 1 12 4 16 5.63109586968581 2.12296804343806 3.50812782624774 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0856474633351484 ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105181618_105181676:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105181621_105181677:INF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 16 12 28 7.50812782624774 6.36890413031419 1.13922369593355 T:C T C 10 0.530742010859516 0.708660470046962 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 105639445 G/A 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G G A 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000183828:ENST00000339418:exon_105639275_105639598:NUDT14;ENSG00000183828:ENST00000392568:exon_105639276_105639598:NUDT14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 105935824 G/A 1 28 36 64 13.1392236959336 19.1067123909426 -5.96748869500902 A:G G A 10 0.530742010859516 0.167827744168884 ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000426567:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481206:exon_105935312_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000494981:exon_105935804_105935835:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000481635:exon_105935804_105936329:MTA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 105954682 C/G 1 475 404 879 222.89754484173 214.419772387244 8.47777245448546 C:G C G 10 0.530742010859516 0.588748210203465 ENSG00000213145:ENST00000496700:exon_105952654_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000409393:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000392531:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000330233:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000460900:exon_105953534_105954853:CRIP1;ENSG00000213145:ENST00000461556:exon_105954668_105954725:CRIP1;ENSG00000185347:ENST00000477724:exon_105954668_105954725:C14orf80 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 106135198 A/G 1 8 1 9 3.75406391312387 0.530742010859516 3.22332190226436 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0422661471759058 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 106209340 T/C 1 25 2109 2134 11.7314497285121 1119.33490090272 -1107.60345117421 A:T:C T C 10 0.530742010859516 0 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 14 106329417 C/T 1 865 11 876 405.908160606519 5.83816211945468 400.069998487064 T:C C T 10 0.530742010859516 1.64544348228781e-217 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 28357086 C/T 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000128731:ENST00000261609:exon_28356186_28357181:HERC2;ENSG00000128731:ENST00000429795:exon_28356186_28357181:HERC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 29561146 T/A 1 32 52 84 15.0162556524955 27.5985845646948 -12.5823289121993 A:T T A 10 0.530742010859516 0.00620769377108197 ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 34517842 G/C 1 16 25 41 7.50812782624774 13.2685502714879 -5.76042244524016 C:G G C 10 0.530742010859516 0.084835469382162 ENSG00000128463:ENST00000267750:exon_34517737_34517851:TMEM85;ENSG00000128463:ENST00000249209:exon_34517737_34517851:TMEM85;ENSG00000128463:ENST00000416323:exon_34517737_34518061:TMEM85 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 38776495 A/G 1 10 11 21 4.69257989140484 5.83816211945468 -1.14558222804984 A:G A G 10 0.530742010859516 0.666093004046952 ENSG00000171262:ENST00000397609:exon_38776456_38779911:FAM98B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 134 98 232 62.8805705448249 52.0127170642326 10.8678534805923 T:G T G 10 0.530742010859516 0.167111740348188 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 106 51 157 49.7413468488913 27.0678425538353 22.673504295056 T:C C T 10 0.530742010859516 0.000295223663605733 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.53092560297019 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 41105573 C/T 1 9 10 19 4.22332190226436 5.30742010859516 -1.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.651962958706861 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105536_41105615:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105536_41105615:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105536_41105615:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000457207:exon_41105536_41105738:ZFYVE19 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 41105926 T/G 1 19 10 29 8.9159017936692 5.30742010859516 3.60848168507404 T:G T G 10 0.530742010859516 0.197003695907232 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 41688700 T/C 1 42 24 66 19.7088355439003 12.7378082606284 6.97102728327194 T:C T C 10 0.530742010859516 0.108185841078106 ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 45047573 C/T 1 3 7 10 1.40777396742145 3.71519407601661 -2.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.205910355285428 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 52605861 A/G 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:G A G 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52599480_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52599483_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52599485_52606045:MYO5A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 55477604 A/G 1 19 17 36 8.9159017936692 9.02261418461177 -0.106712390942576 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55477560_55477623:RSL24D1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 55647492 C/T 1 38 49 87 17.8318035873384 26.0063585321163 -8.17455494477789 A:T:C C T 10 0.530742010859516 0.0858535786672988 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55647484_55647845:PIGB;ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 59397443 G/A 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 A:G G A 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59397277_59397491:CCNB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 24 19 43 11.2621917393716 10.0840982063308 1.17809353304081 T:G T G 10 0.530742010859516 0.76166637186299 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 41 40 81 19.2395775547598 21.2296804343806 -1.9901028796208 A:G G A 10 0.530742010859516 0.658204879249162 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 42 49 91 19.7088355439003 26.0063585321163 -6.29752298821596 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.207656926652091 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 63880967 G/A 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000140455:ENST00000380324:exon_63880901_63881014:USP3;ENSG00000140455:ENST00000268049:exon_63880901_63881014:USP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 63882944 C/T 1 18 12 30 8.44664380452871 6.36890413031419 2.07773967421452 T:C C T 10 0.530742010859516 0.470863171171006 ENSG00000140455:ENST00000380324:exon_63882860_63883659:USP3;ENSG00000140455:ENST00000268049:exon_63882860_63883643:USP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 63901256 G/C 1 54 52 106 25.3399314135861 27.5985845646948 -2.2586531511087 T:C:G G C 10 0.530742010859516 0.697525719449124 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63900818_63901465:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63900818_63901465:HERC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 65108479 T/C 1 11 10 21 5.16183788054532 5.30742010859516 -0.145582228049836 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 8 16 24 3.75406391312387 8.49187217375226 -4.73780826062838 A:T A T 10 0.530742010859516 0.0650116997860802 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 65262542 T/C 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 T:C T C 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000090487:ENST00000204566:exon_65262452_65262560:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000416889:exon_65262452_65262560:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000433215:exon_65262452_65262560:SPG21 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 65871698 G/T 1 33 30 63 15.485513641636 15.9222603257855 -0.436746684149508 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000138614:ENST00000395644:exon_65871095_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000420799:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000442903:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000313182:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000431261:exon_65871403_65871997:C15orf44 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 28 29 57 13.1392236959336 15.391518314926 -2.25229461899241 A:C C A 10 0.530742010859516 0.59655465538297 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 68480086 A/G 1 52 36 88 24.4014154353052 19.1067123909426 5.29470304436259 A:G A G 10 0.530742010859516 0.285997066690942 ENSG00000033800:ENST00000249636:exon_68479880_68480402:PIAS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 68486353 T/C 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 T:C T C 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000129007:ENST00000478113:exon_68483043_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000395465:exon_68483131_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000448060:exon_68484395_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000395463:exon_68486141_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467188:exon_68486142_68486450:CALML4;ENSG00000129007:ENST00000467889:exon_68486142_68486450:CALML4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 68583382 C/T 1 6 19 25 2.8155479348429 10.0840982063308 -7.2685502714879 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00427873987178629 ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68581945_68588203:FEM1B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 72637795 T/C 1 86 96 182 40.3561870660816 50.9512330425135 -10.5950459764319 T:C T C 10 0.530742010859516 0.119264180070123 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72637787_72637891:HEXA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 72638892 T/C 1 21 31 52 9.85441777195016 16.453002336645 -6.59858456469483 T:C T C 10 0.530742010859516 0.071642268035773 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72638868_72639051:HEXA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 74276228 A/G 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74275547_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74275561_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74275561_74276471:STOML1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 74743796 G/A 1 24 33 57 11.2621917393716 17.514486358364 -6.25229461899241 A:G G A 10 0.530742010859516 0.111215712446372 ENSG00000138629:ENST00000361351:exon_74743777_74743861:UBL7;ENSG00000138629:ENST00000395081:exon_74743777_74743861:UBL7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 75094704 G/A 1 283 260 543 132.800010926757 137.992922823474 -5.19291189671716 A:G G A 10 0.530742010859516 0.667356616409038 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75094672_75095539:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75094672_75095537:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75094672_75095537:CSK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 75137868 C/A 1 16 21 37 7.50812782624774 11.1455822280498 -3.63745440180209 A:C C A 10 0.530742010859516 0.251629965402401 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75137814_75137934:SCAMP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 41 37 78 19.2395775547598 19.6374544018021 -0.397876847042248 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 A:G A G 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 75499927 G/A 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 A:G G A 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 30 27 57 14.0777396742145 14.3300342932069 -0.252294618992412 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 76508889 A/G 1 100 116 216 46.9257989140484 61.5660732597039 -14.6402743456555 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0480784355165294 ENSG00000140374:ENST00000267950:exon_76508633_76508938:ETFA;ENSG00000140374:ENST00000433983:exon_76508633_76508938:ETFA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 78841220 T/C 1 725 694 1419 340.212042126851 368.334955536504 -28.1229134096532 T:C T C 10 0.530742010859516 0.136421955590263 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78841132_78841560:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78841132_78841604:PSMA4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 34 46 80 15.9547716307765 24.4141324995377 -8.45936086876128 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0724353316141223 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 79603726 G/A 1 16 14 30 7.50812782624774 7.43038815203322 0.07773967421452 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79603404_79603759:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79603485_79603759:TMED3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 81592092 C/T 1 22 22 44 10.3236757610906 11.6763242389094 -1.3526484778187 T:C C T 10 0.530742010859516 0.76313456343339 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 81592682 T/C 1 32 47 79 15.0162556524955 24.9448745103973 -9.92861885790176 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0315866461870989 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 55 64 119 25.8091894027266 33.967488695009 -8.1582992922824 A:G A G 10 0.530742010859516 0.142116091567769 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 87 80 167 40.8254450552221 42.4593608687613 -1.63391581353918 A:G A G 10 0.530742010859516 0.816410414902704 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 65 62 127 30.5017692941315 32.90600467329 -2.40423537915853 T:C T C 10 0.530742010859516 0.722298906898741 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 90628591 G/A 1 95 68 163 44.579508968346 36.0904567384471 8.48905222989889 A:G G A 10 0.530742010859516 0.209130153269593 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 93162649 A/G 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000185442:ENST00000327355:exon_93160678_93162689:FAM174B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 99926317 A/G 1 9 20 29 4.22332190226436 10.6148402171903 -6.39151831492596 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0240064077489873 ENSG00000168904:ENST00000301981:exon_99926235_99930934:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000331450:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000422500:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000447360:exon_99926235_99926496:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000450058:exon_99926235_99926496:LRRC28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 101814845 G/A 1 34 11 45 15.9547716307765 5.83816211945468 10.1166095113218 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00253031812903979 ENSG00000131871:ENST00000398226:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000531964:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000526049:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000526043:exon_101814797_101815566:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000528346:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000527833:exon_101814373_101814886:AC023024.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 15 102187087 A/C 1 19 23 42 8.9159017936692 12.2070662497689 -3.29116445609967 A:C A C 10 0.530742010859516 0.354570448842788 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102186928_102187102:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102186928_102187102:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102186928_102187102:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102186872_102187102:TM2D3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 107162 C/G 1 147 115 262 68.9809244036511 61.0353312488443 7.9455931548068 C:G C G 10 0.530742010859516 0.353209947158571 ENSG00000161981:ENST00000293861:exon_107086_107669:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000383018:exon_107086_107668:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000397876:exon_107086_107372:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_107086_107444:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000481947:exon_107086_107453:SNRNP25 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 39 41 80 18.3010615764789 21.7604224452402 -3.45936086876128 T:C C T 10 0.530742010859516 0.50177259960806 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 419086 G/C 1 136 49 185 63.8190865231058 26.0063585321163 37.8127279909895 C:G G C 10 0.530742010859516 1.42391384977218e-08 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 424288 G/A 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 A:G G A 10 0.530742010859516 0.796007939511377 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 A:G A G 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 717544 G/C 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 C:G G C 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 722563 G/A 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 A:G G A 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 778820 G/A 1 9 12 21 4.22332190226436 6.36890413031419 -2.14558222804984 A:G G A 10 0.530742010859516 0.387253302097606 ENSG00000103253:ENST00000341413:exon_778794_779715:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389701:exon_778794_778868:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389703:exon_778794_778895:HAGHL;ENSG00000103253:ENST00000389702:exon_778794_779168:HAGHL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 780510 C/T 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 780517 T/C 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 784765 C/T 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C C T 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_784737_784871:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_784737_784871:NARFL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 836199 G/A 1 11 10 21 5.16183788054532 5.30742010859516 -0.145582228049836 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 836342 G/A 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G G A 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 846031 C/T 1 8 17 25 3.75406391312387 9.02261418461177 -5.2685502714879 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0438949573338673 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845947_846077:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845947_846077:CHTF18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 848013 G/A 1 27 24 51 12.6699657067931 12.7378082606284 -0.067842553835316 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 1555591 C/T 1 11 2 13 5.16183788054532 1.06148402171903 4.10035385882629 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0256582468175808 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 11 12 23 5.16183788054532 6.36890413031419 -1.20706624976887 T:C T C 10 0.530742010859516 0.678835837482447 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 66 70 136 30.9710272832719 37.1519407601661 -6.18091347689418 A:T T A 10 0.530742010859516 0.303184411716200 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 14 9 23 6.56961184796678 4.77667809773564 1.79293375023113 A:C C A 10 0.530742010859516 0.533738323924712 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2014289 G/A 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533186:exon_2014277_2014357:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2014277_2014368:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013654_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014277_2014366:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2014277_2014539:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 A:C A C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2025354 G/A 1 4 12 16 1.87703195656194 6.36890413031419 -4.49187217375226 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0415595366775679 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2025411 G/C 1 11 12 23 5.16183788054532 6.36890413031419 -1.20706624976887 C:G G C 10 0.530742010859516 0.678835837482447 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025346_2025439:TBL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2026292 T/C 1 18 21 39 8.44664380452871 11.1455822280498 -2.69893842352112 T:C T C 10 0.530742010859516 0.424639611079918 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026212_2026315:TBL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2026891 T/C 1 29 30 59 13.608481685074 15.9222603257855 -2.31377864071144 T:C T C 10 0.530742010859516 0.602532776639523 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2026815_2026962:TBL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 62 59 121 29.09399532671 31.3137786407114 -2.21978331400144 A:C A C 10 0.530742010859516 0.71605861606567 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2028677 A/G 1 53 53 106 24.8706734244457 28.1293265755543 -3.2586531511087 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.559845146801026 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028553_2028751:TBL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2036048 T/C 1 136 58 194 63.8190865231058 30.7830366298519 33.0360498932539 T:C T C 10 0.530742010859516 1.66690272566391e-06 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2049842 T/C 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2049891 C/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 C:G C G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2096337 C/T 1 3 7 10 1.40777396742145 3.71519407601661 -2.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.205910355285428 ENSG00000065057:ENST00000219066:exon_2096129_2096367:NTHL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2138508 G/C 1 49 42 91 22.9936414678837 22.2911644560997 0.702477011784044 C:G G C 10 0.530742010859516 0.916626102289286 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2301520 G/C 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000167969:ENST00000301729:exon_2301516_2301615:DCI HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2580912 T/C 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C T C 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2581080 G/A 1 18 15 33 8.44664380452871 7.96113016289274 0.485513641635972 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G A G 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 2813350 G/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:G G T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 0 14 0 14 6.56961184796678 0 6.56961184796678 C C 10 0.530742010859516 0.000165829298855852 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 37 19 56 17.3625455981979 10.0840982063308 7.2784473918671 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0603327077266534 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 4411224 C/T 1 10 6 16 4.69257989140484 3.1844520651571 1.50812782624774 T:C C T 10 0.530742010859516 0.617940633683685 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4411163_4411249:CORO7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 4414373 C/T 1 14 9 23 6.56961184796678 4.77667809773564 1.79293375023113 T:C C T 10 0.530742010859516 0.533738323924712 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4414277_4414414:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4414277_4414414:CORO7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 10721426 C/T 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000153060:ENST00000283025:exon_10721358_10721656:TEKT5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 117 108 225 54.9031847294366 57.3201371728277 -2.4169524433911 A:G A G 10 0.530742010859516 0.789411823668613 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 11647492 T/C 1 14 10 24 6.56961184796678 5.30742010859516 1.26219173937162 T:C T C 10 0.530742010859516 0.685182392195028 ENSG00000189067:ENST00000339430:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000413364:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000381810:exon_11647389_11647545:LITAF;ENSG00000189067:ENST00000405528:exon_11647389_11647545:LITAF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 12061677 G/C 1 369 227 596 173.156197992839 120.47843646511 52.6777615277285 C:G G C 10 0.530742010859516 1.56396457866802e-05 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 14742400 T/G 1 10 13 23 4.69257989140484 6.89964614117371 -2.20706624976887 T:G T G 10 0.530742010859516 0.406857310619905 ENSG00000103429:ENST00000261658:exon_14742245_14742449:BFAR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 10 4 14 4.69257989140484 2.12296804343806 2.56961184796678 A:G A G 10 0.530742010859516 0.191069727442096 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 70 66 136 32.8480592398339 35.0289727167281 -2.18091347689418 A:G A G 10 0.530742010859516 0.73156828827912 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 69 61 130 32.3788012506934 32.3752626624305 0.00353858826292708 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 15 10 25 7.03886983710726 5.30742010859516 1.7314497285121 T:G T G 10 0.530742010859516 0.551412457611138 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 21 8 29 9.85441777195016 4.24593608687613 5.60848168507404 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0408533296914353 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 19725540 T/C 1 15 24 39 7.03886983710726 12.7378082606284 -5.69893842352112 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0776505071141694 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 27375029 T/C 1 10 5 15 4.69257989140484 2.65371005429758 2.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 0.315511031428908 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 27375159 T/C 1 18 13 31 8.44664380452871 6.89964614117371 1.546997663355 T:C T C 10 0.530742010859516 0.595494221120277 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 27455886 A/G 1 13 18 31 6.10035385882629 9.55335619547129 -3.453002336645 A:G A G 10 0.530742010859516 0.280124629415815 ENSG00000103522:ENST00000337929:exon_27455863_27456040:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395755:exon_27455863_27456040:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395754:exon_27455863_27456040:IL21R HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 28488943 T/C 1 24 24 48 11.2621917393716 12.7378082606284 -1.47561652125677 T:C T C 10 0.530742010859516 0.668036956608804 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 28844448 C/A 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 A:C C A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28844380_28844675:ATXN2L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 28845448 G/A 1 5 13 18 2.34628994570242 6.89964614117371 -4.55335619547129 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0349231622526171 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28845386_28845532:ATXN2L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 28925731 G/A 1 13 6 19 6.10035385882629 3.1844520651571 2.9159017936692 A:G G A 10 0.530742010859516 0.25039820154784 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28925557_28925907:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28925557_28925907:RABEP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 28948783 C/T 1 156 147 303 73.2042463059155 78.0190755963489 -4.81482929043335 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.604577355816279 ENSG00000177455:ENST00000380673:exon_28948776_28948844:CD19;ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28948776_28948844:CD19 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 29827807 T/C 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:C T C 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000185928:ENST00000320330:exon_29827285_29828328:C16orf53 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 30004789 T/C 1 24 25 49 11.2621917393716 13.2685502714879 -2.00635853211628 T:C T C 10 0.530742010859516 0.570825667807040 ENSG00000149929:ENST00000279392:exon_30004780_30004878:HIRIP3;ENSG00000149929:ENST00000352552:exon_30004780_30004878:HIRIP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 31477442 T/C 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 31477460 G/A 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 31477795 G/C 1 11 12 23 5.16183788054532 6.36890413031419 -1.20706624976887 C:G G C 10 0.530742010859516 0.678835837482447 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 31501376 G/T 1 39 33 72 18.3010615764789 17.514486358364 0.786575218114848 T:G G T 10 0.530742010859516 0.906269818903988 ENSG00000140688:ENST00000327237:exon_31500810_31502253:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000452223:exon_31500815_31502253:C16orf58;ENSG00000140688:ENST00000436843:exon_31500815_31502253:C16orf58 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 46705743 C/T 1 8 12 20 3.75406391312387 6.36890413031419 -2.61484021719032 T:C C T 10 0.530742010859516 0.268606212218767 ENSG00000069329:ENST00000299138:exon_46705617_46705772:VPS35 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 48385533 G/A 1 22 26 48 10.3236757610906 13.7992922823474 -3.47561652125677 A:G G A 10 0.530742010859516 0.385790712937223 ENSG00000102910:ENST00000285737:exon_48385492_48389415:LONP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 48396190 C/T 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000196470:ENST00000356721:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000394725:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000380006:exon_48394442_48397793:SIAH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 50813910 C/T 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:C C T 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50813576_50813955:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50813576_50813955:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50813576_50813955:CYLD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 50827518 C/T 1 22 16 38 10.3236757610906 8.49187217375226 1.83180358733839 T:C C T 10 0.530742010859516 0.627133830990491 ENSG00000083799:ENST00000427738:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000311559:exon_50827457_50827575:CYLD;ENSG00000083799:ENST00000398568:exon_50827457_50827575:CYLD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 57015084 C/G 1 16 2 18 7.50812782624774 1.06148402171903 6.44664380452871 C:G C G 10 0.530742010859516 0.00178864911385670 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57015070_57015137:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57015070_57015137:CETP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 57016086 G/A 1 21 6 27 9.85441777195016 3.1844520651571 6.66996570679307 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0112923037175008 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 57016127 G/A 1 25 5 30 11.7314497285121 2.65371005429758 9.07773967421452 A:G G A 10 0.530742010859516 0.000756872305669235 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 57493629 G/C 1 19 7 26 8.9159017936692 3.71519407601661 5.20070771765258 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0487930696503959 ENSG00000088682:ENST00000262507:exon_57493477_57493632:COQ9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 57608955 C/T 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 58043911 G/A 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000103005:ENST00000219281:exon_58043833_58044016:C16orf57;ENSG00000103005:ENST00000423271:exon_58043833_58044016:C16orf57 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 67262689 T/A 0 0 8 8 0 4.24593608687613 -4.24593608687613 A T A 10 0.530742010859516 0.00235122072895402 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 67262775 C/T 1 116 62 178 54.4339267402961 32.90600467329 21.5279220670062 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00120409808243349 ENSG00000168701:ENST00000304800:exon_67262700_67262784:TMEM208;ENSG00000168701:ENST00000404299:exon_67262741_67262784:TMEM208 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 67264629 C/T 1 8 14 22 3.75406391312387 7.43038815203322 -3.67632423890935 T:C C T 10 0.530742010859516 0.136600125045471 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67264504_67264694:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67264504_67264694:FHOD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 20 16 36 9.38515978280968 8.49187217375226 0.893287609057424 A:C C A 10 0.530742010859516 0.86782286402883 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 67579659 C/T 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67579567_67579763:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67579567_67579763:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67579567_67579763:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67579567_67579763:FAM65A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 67691752 G/T 1 51 49 100 23.9321574461647 26.0063585321163 -2.0742010859516 T:G G T 10 0.530742010859516 0.68972852902485 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 67693292 G/A 1 15 29 44 7.03886983710726 15.391518314926 -8.3526484778187 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0148375363851073 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67693278_67693322:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67693278_67693322:ACD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 180 180 360 84.4664380452871 95.5335619547129 -11.0671239094258 A:G A G 10 0.530742010859516 0.24577282414671 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 68055495 G/C 1 52 63 115 24.4014154353052 33.4367466841495 -9.03533124884434 C:G G C 10 0.530742010859516 0.093415243016473 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 69354963 A/G 1 10 6 16 4.69257989140484 3.1844520651571 1.50812782624774 A:G A G 10 0.530742010859516 0.617940633683685 ENSG00000132612:ENST00000254950:exon_69354954_69355173:VPS4A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 69362947 T/C 1 64 40 104 30.032511304991 21.2296804343806 8.80283087061034 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0946645663013271 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69360816_69363082:COG8;ENSG00000213380:ENST00000288022:exon_69362524_69363082:COG8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 69364899 G/A 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69364716_69364998:COG8;ENSG00000213380:ENST00000401849:exon_69364742_69364998:COG8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 69788771 G/A 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69788751_69788829:NOB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 70285715 G/A 0 28 0 28 13.1392236959336 0 13.1392236959336 G G 10 0.530742010859516 2.04335461689038e-08 ENSG00000223496:ENST00000435634:exon_70284134_70285833:EXOSC6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 70358574 C/A 1 6 9 15 2.8155479348429 4.77667809773564 -1.96113016289274 A:C C A 10 0.530742010859516 0.438937968640093 ENSG00000157349:ENST00000451014:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000355992:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000393657:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000288071:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000417604:exon_70358488_70358590:DDX19B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 70517850 C/T 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70517756_70517872:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70517756_70517872:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70517756_70517872:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70517756_70517872:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70517756_70517872:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70517756_70517872:COG4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 71894383 A/G 1 9 5 14 4.22332190226436 2.65371005429758 1.56961184796678 A:G A G 10 0.530742010859516 0.436312573490878 ENSG00000102984:ENST00000446827:exon_71893589_71894575:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000425432:exon_71893589_71894575:ZNF821;ENSG00000102984:ENST00000313565:exon_71893589_71894575:ZNF821 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 15 0 15 7.03886983710726 0 7.03886983710726 C C 10 0.530742010859516 8.64690076971965e-05 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 74920191 G/A 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74920168_74920294:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74920168_74920294:WDR59 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 74946072 G/C 1 3 13 16 1.40777396742145 6.89964614117371 -5.49187217375226 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0097522347618812 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 75269534 C/T 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C C T 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 12 17 29 5.63109586968581 9.02261418461177 -3.39151831492596 T:C T C 10 0.530742010859516 0.264260063282327 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 81929527 C/G 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 C:G C G 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 4 13 17 1.87703195656194 6.89964614117371 -5.02261418461177 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0256214099084431 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 205 237 442 96.1978877737992 125.785856573705 -29.5879687999061 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0049139923972895 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 88729501 C/T 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88729419_88729518:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88729419_88729518:MVD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 17 21 38 7.97738581538823 11.1455822280498 -3.16819641266161 A:G A G 10 0.530742010859516 0.331987679344178 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 89167476 T/C 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 22 15 37 10.3236757610906 7.96113016289274 2.36254559819791 A:G G A 10 0.530742010859516 0.511169927441844 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 89351106 G/C 1 25 30 55 11.7314497285121 15.9222603257855 -4.19081059727338 C:G G C 10 0.530742010859516 0.281155306428854 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 89627671 C/T 1 1558 1811 3369 731.103947080874 961.173781666584 -230.069834585709 A:T:C C T 10 0.530742010859516 2.41789234201774e-15 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 16 89806465 T/C 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C T C 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89806402_89806507:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89806402_89806507:FANCA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 32 29 61 15.0162556524955 15.391518314926 -0.375262662430476 A:C C A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 1538302 C/A 1 7 14 21 3.28480592398339 7.43038815203322 -4.14558222804984 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0814681249897115 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 1961667 G/A 1 12 8 20 5.63109586968581 4.24593608687613 1.38515978280968 A:G G A 10 0.530742010859516 0.655918359081295 ENSG00000177374:ENST00000399849:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000322941:exon_1959965_1962980:HIC1;ENSG00000177374:ENST00000416386:exon_1959965_1962980:HIC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 2224588 A/G 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 A:G A G 10 0.530742010859516 1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 2238152 T/C 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C T C 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2237766_2238190:TSR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 2585113 C/T 1 62 47 109 29.09399532671 24.9448745103973 4.14912081631276 A:T:C C T 10 0.530742010859516 0.443980318503532 ENSG00000007168:ENST00000397195:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000451360:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000006951:exon_2585023_2585201:PAFAH1B1;ENSG00000007168:ENST00000397193:exon_2585023_2588909:PAFAH1B1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 T:C T C 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 4442801 T/C 1 47 46 93 22.0551254896027 24.4141324995377 -2.35900700993499 T:C T C 10 0.530742010859516 0.67803394528036 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 4442818 G/A 1 54 47 101 25.3399314135861 24.9448745103973 0.395056903188884 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 4446227 T/G 1 13 13 26 6.10035385882629 6.89964614117371 -0.799292282347416 T:G T G 10 0.530742010859516 0.84505329999096 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 4575740 A/G 1 35 33 68 16.4240296199169 17.514486358364 -1.09045673844709 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.809016517264538 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4575409_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 4575910 G/A 1 16 22 38 7.50812782624774 11.6763242389094 -4.16819641266161 A:G G A 10 0.530742010859516 0.195233641361163 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4575409_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 4576620 C/T 1 18 22 40 8.44664380452871 11.6763242389094 -3.22968043438064 T:C C T 10 0.530742010859516 0.343465406332665 ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4576545_4576751:PELP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 27 12 39 12.6699657067931 6.36890413031419 6.30106157647888 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0532436429229909 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 17 25 42 7.97738581538823 13.2685502714879 -5.29116445609967 A:G A G 10 0.530742010859516 0.121807694621256 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 6 12 18 2.8155479348429 6.36890413031419 -3.55335619547129 A:G A G 10 0.530742010859516 0.103109047159225 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 5241493 C/G 1 38 28 66 17.8318035873384 14.8607763040664 2.97102728327194 C:G C G 10 0.530742010859516 0.537842943784906 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:C T C 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 132 126 258 61.9420545665439 66.873493368299 -4.93143880175514 T:C T C 10 0.530742010859516 0.574628496905116 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 15 9 24 7.03886983710726 4.77667809773564 2.26219173937162 A:T T A 10 0.530742010859516 0.416585330003095 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 6544354 C/G 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 C:G C G 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6544078_6544547:TXNDC17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 6544465 G/A 1 46 59 105 21.5858675004623 31.3137786407114 -9.72791114024918 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0630756306167986 ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6544078_6544547:TXNDC17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 95 95 190 44.579508968346 50.420491031654 -5.84098206330805 T:C T C 10 0.530742010859516 0.424139496618124 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 7220841 T/G 1 12 8 20 5.63109586968581 4.24593608687613 1.38515978280968 T:G T G 10 0.530742010859516 0.655918359081295 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7220780_7220892:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7220780_7220892:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7220780_7220892:NEURL4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 7339903 C/G 1 13 9 22 6.10035385882629 4.77667809773564 1.32367576109065 C:G C G 10 0.530742010859516 0.671417745104305 ENSG00000181284:ENST00000323206:exon_7339513_7340998:TMEM102;ENSG00000181284:ENST00000396568:exon_7339513_7340842:TMEM102 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 7416875 G/A 1 19 27 46 8.9159017936692 14.3300342932069 -5.41413249953774 A:G G A 10 0.530742010859516 0.138864698783121 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7416340_7417933:POLR2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 7606350 T/C 1 23 10 33 10.7929337502311 5.30742010859516 5.48551364163597 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0795484779755619 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:C C A 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 C:G C G 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 145 83 228 68.0424084253702 44.0515869013398 23.9908215240304 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00142090864120890 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 9153871 C/T 1 69 38 107 32.3788012506934 20.1681964126616 12.2106048380318 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0198264915143367 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9153789_9153962:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9153789_9153962:STX8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 9153925 G/A 1 46 33 79 21.5858675004623 17.514486358364 4.07138114209824 A:G G A 10 0.530742010859516 0.369736605816371 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9153789_9153962:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9153789_9153962:STX8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 51 44 95 23.9321574461647 23.3526484778187 0.57950896834598 A:G G A 10 0.530742010859516 0.918546200568614 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 9471711 T/G 1 16 9 25 7.50812782624774 4.77667809773564 2.7314497285121 T:G T G 10 0.530742010859516 0.319678398805541 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9471688_9471787:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9471688_9471787:STX8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 12899963 T/C 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12899257_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000491478:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000492559:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000457438:exon_12899864_12900002:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000407336:exon_12899735_12900002:ELAC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 15881327 C/T 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000214941:ENST00000399277:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000399280:exon_15879874_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000491631:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486655:exon_15881041_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000486706:exon_15881089_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000460252:exon_15881205_15881477:ZSWIM7;ENSG00000214941:ENST00000475498:exon_15881239_15881477:ZSWIM7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 A:C A C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 16336828 G/A 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 23 23 46 10.7929337502311 12.2070662497689 -1.41413249953774 C:G C G 10 0.530742010859516 0.768065213938398 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 9 5 14 4.22332190226436 2.65371005429758 1.56961184796678 C:G G C 10 0.530742010859516 0.436312573490878 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 18010536 C/T 1 30 24 54 14.0777396742145 12.7378082606284 1.33993141358614 T:C C T 10 0.530742010859516 0.785679923783618 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_18010468_18011285:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_18010468_18011285:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_18010468_18011285:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000497744:exon_18010468_18011255:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000482564:exon_18010468_18011283:DRG2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 96 116 212 45.0487669574865 61.5660732597039 -16.5173063022174 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0274320443431366 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 9 13 22 4.22332190226436 6.89964614117371 -2.67632423890935 A:G G A 10 0.530742010859516 0.289347566198005 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 A:T A T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 T:C C T 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 C C 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 17 0 17 7.97738581538823 0 7.97738581538823 G G 10 0.530742010859516 2.36328709302609e-05 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 4 14 18 1.87703195656194 7.43038815203322 -5.55335619547129 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00932147609371555 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 26686416 G/A 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 A:G G A 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26686338_26686427:TMEM199 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 26874393 C/T 1 35 41 76 16.4240296199169 21.7604224452402 -5.33639282532322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.250550215485381 ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26873725_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000484980:exon_26873726_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26873726_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000470125:exon_26873729_26874867:UNC119 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 27401063 C/T 1 17 18 35 7.97738581538823 9.55335619547129 -1.57597038008306 T:C C T 10 0.530742010859516 0.615197128905741 ENSG00000196535:ENST00000529578:exon_27400537_27401932:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27400537_27401932:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27400537_27401932:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27400537_27401932:MYO18A;ENSG00000221995:ENST00000408971:exon_27400870_27401217:TIAF1;ENSG00000221995:ENST00000511177:exon_27400873_27401217:TIAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 28511782 C/T 1 36 32 68 16.8932876090574 16.9837443475045 -0.090456738447088 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 29631775 C/G 1 41 24 65 19.2395775547598 12.7378082606284 6.50176929413146 C:G C G 10 0.530742010859516 0.135277340584068 ENSG00000185862:ENST00000330927:exon_29630790_29632648:EVI2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:G G A 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 30179314 G/A 1 55 60 115 25.8091894027266 31.844520651571 -6.03533124884434 A:G G A 10 0.530742010859516 0.263801536635184 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30178883_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30178890_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30178890_30179327:C17orf79 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 33288882 T/G 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 T:G T G 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 33328416 A/G 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:G A G 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33328276_33328422:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000262327:exon_33328276_33328422:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000474860:exon_33328276_33328422:LIG3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 36474601 A/G 1 6 9 15 2.8155479348429 4.77667809773564 -1.96113016289274 A:G A G 10 0.530742010859516 0.438937968640093 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36474586_36474634:MRPL45 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 36894839 G/A 1 8 15 23 3.75406391312387 7.96113016289274 -4.20706624976887 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0949549088678605 ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 38545824 C/A 1 32 23 55 15.0162556524955 12.2070662497689 2.80918940272662 A:T:C C A 10 0.530742010859516 0.500464658642317 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38544768_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38544795_38545899:TOP2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 38547868 C/T 1 44 30 74 20.6473515221813 15.9222603257855 4.72509119639582 T:C C T 10 0.530742010859516 0.295621423078257 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38547758_38547892:TOP2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 38548586 T/G 1 46 50 96 21.5858675004623 26.5371005429758 -4.95123304251354 T:G T G 10 0.530742010859516 0.3574857563156 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38548466_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38548470_38548593:TOP2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 15 16 31 7.03886983710726 8.49187217375226 -1.453002336645 A:C:G G C 10 0.530742010859516 0.719585525875506 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 16 5 21 7.50812782624774 2.65371005429758 4.85441777195016 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0468381055513234 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 17 6 23 7.97738581538823 3.1844520651571 4.79293375023113 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0585870990813324 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 25 13 38 11.7314497285121 6.89964614117371 4.83180358733839 C:G G C 10 0.530742010859516 0.143194923512548 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40125648 G/A 1 20 18 38 9.38515978280968 9.55335619547129 -0.168196412661608 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40125771 C/T 1 19 29 48 8.9159017936692 15.391518314926 -6.47561652125677 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0815973634875209 ENSG00000173786:ENST00000393892:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000310262:exon_40125493_40127192:CNP;ENSG00000173786:ENST00000472031:exon_40125493_40126246:CNP;ENSG00000173786:ENST00000393888:exon_40125493_40127194:CNP;ENSG00000173786:ENST00000486438:exon_40125493_40125980:CNP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40255812 C/T 1 11 2 13 5.16183788054532 1.06148402171903 4.10035385882629 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0256582468175808 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40255626_40255816:DHX58 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40344643 T/G 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:G T G 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40353722 A/G 1 3 8 11 1.40777396742145 4.24593608687613 -2.83816211945468 A:G A G 10 0.530742010859516 0.128925499785697 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40351186_40353882:STAT5B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40458441 C/T 1 9 14 23 4.22332190226436 7.43038815203322 -3.20706624976887 T:C C T 10 0.530742010859516 0.212202113058778 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40458259_40458465:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40458259_40458465:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40458132_40458465:STAT5A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 11 11 22 5.16183788054532 5.83816211945468 -0.676324238909352 T:C C T 10 0.530742010859516 0.832742756726426 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40467781 G/A 1 29 32 61 13.608481685074 16.9837443475045 -3.37526266243048 A:G G A 10 0.530742010859516 0.441898426263473 ENSG00000168610:ENST00000264657:exon_40465342_40467818:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000389272:exon_40465343_40467818:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000462286:exon_40467182_40467818:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000491272:exon_40467529_40467818:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000404395:exon_40467577_40467818:STAT3;ENSG00000168610:ENST00000462269:exon_40467615_40467818:STAT3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40705467 A/T 1 2 8 10 0.938515978280968 4.24593608687613 -3.30742010859516 A:T A T 10 0.530742010859516 0.0536315808592461 ENSG00000108786:ENST00000225929:exon_40705457_40705636:HSD17B1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 17 8 25 7.97738581538823 4.24593608687613 3.7314497285121 A:G G A 10 0.530742010859516 0.162030927973593 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 41197659 G/C 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41196312_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41196822_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41197646_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41197646_41197819:BRCA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 41245381 T/C 1 13 3 16 6.10035385882629 1.59222603257855 4.50812782624774 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0250951577400398 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 42152789 C/T 1 30 28 58 14.0777396742145 14.8607763040664 -0.783036629851928 T:C C T 10 0.530742010859516 0.895607405540627 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152678_42152819:G6PC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 28 24 52 13.1392236959336 12.7378082606284 0.401415435305168 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 42426574 G/A 1 65 21 86 30.5017692941315 11.1455822280498 19.3561870660816 A:G G A 10 0.530742010859516 2.01890961757151e-05 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42426526_42426670:GRN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 42477282 T/C 1 25 36 61 11.7314497285121 19.1067123909426 -7.37526266243048 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0717776559198168 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 43111688 G/A 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 43175834 G/A 1 15 11 26 7.03886983710726 5.83816211945468 1.20070771765258 A:G G A 10 0.530742010859516 0.69751824451787 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 43181079 C/T 1 22 17 39 10.3236757610906 9.02261418461177 1.30106157647888 T:C C T 10 0.530742010859516 0.74943590392522 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43181077_43181244:NMT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 103 70 173 48.3335728814698 37.1519407601661 11.1816321213037 A:G G A 10 0.530742010859516 0.093879792708024 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 43319770 C/T 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43319708_43319832:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43319708_43319832:FMNL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 9 10 19 4.22332190226436 5.30742010859516 -1.0840982063308 T:C T C 10 0.530742010859516 0.651962958706861 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 45822289 G/A 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G G A 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45822114_45823485:TBX21 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 45901547 C/T 1 31 29 60 14.546997663355 15.391518314926 -0.84452065157096 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.897278799970262 ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45900638_45901824:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45900827_45901824:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45900856_45901824:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45900949_45901824:MRPL10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 T:C T C 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 46929908 T/C 1 11 16 27 5.16183788054532 8.49187217375226 -3.33003429320693 T:C T C 10 0.530742010859516 0.247671119671072 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 35 33 68 16.4240296199169 17.514486358364 -1.09045673844709 C:G C G 10 0.530742010859516 0.809016517264538 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 T:C C T 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 19 9 28 8.9159017936692 4.77667809773564 4.13922369593355 T:C C T 10 0.530742010859516 0.132131396679065 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 48632593 A/G 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G A G 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48632593_48632673:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48632593_48632673:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48632593_48632673:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48632593_48632673:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48632593_48632673:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48632593_48632673:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48632593_48632673:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48632593_48632673:SPATA20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 48827888 A/T 1 161 145 306 75.5505362516179 76.9575915746298 -1.40705532301189 A:T A T 10 0.530742010859516 0.908828966456261 ENSG00000108848:ENST00000505658:exon_48827862_48833574:LUC7L3;ENSG00000108848:ENST00000393227:exon_48827862_48828002:LUC7L3;ENSG00000108848:ENST00000240304:exon_48827862_48828055:LUC7L3;ENSG00000108848:ENST00000508482:exon_48827862_48828002:LUC7L3;ENSG00000108848:ENST00000504065:exon_48827862_48828208:LUC7L3;ENSG00000108848:ENST00000513969:exon_48827862_48828002:LUC7L3;ENSG00000108848:ENST00000503728:exon_48827862_48828002:LUC7L3;ENSG00000108848:ENST00000512549:exon_48827862_48827911:LUC7L3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C T C 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 55075768 G/A 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55075746_55075859:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55075735_55075859:SCPEP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 56769979 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000108384:ENST00000461271:exon_56769934_56770046:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000337432:exon_56769934_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487921:exon_56769937_56769993:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000476741:exon_56769963_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000475762:exon_56769963_56771011:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000486827:exon_56769967_56771172:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000487525:exon_56769967_56770149:RAD51C;ENSG00000108384:ENST00000482007:exon_56769976_56770149:RAD51C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 57292240 T/C 1 15 14 29 7.03886983710726 7.43038815203322 -0.391518314925964 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57292166_57292608:C17orf71 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 58525018 C/T 1 23 11 34 10.7929337502311 5.83816211945468 4.95477163077646 T:C C T 10 0.530742010859516 0.120776251844877 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 267 272 539 125.291883100509 144.361826953788 -19.0699438532791 T:C C T 10 0.530742010859516 0.101171814645331 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 61910514 A/G 1 64 55 119 30.032511304991 29.1908105972734 0.841700707717596 A:G A G 10 0.530742010859516 0.92691654289201 ENSG00000108604:ENST00000450364:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000448276:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000225742:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000323347:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000228253:exon_61910429_61910530:SMARCD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 62476429 G/A 1 10 10 20 4.69257989140484 5.30742010859516 -0.61484021719032 A:G G A 10 0.530742010859516 0.825566833685384 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 65907663 C/G 1 4 10 14 1.87703195656194 5.30742010859516 -3.43038815203322 C:G C G 10 0.530742010859516 0.104987115908570 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 65907708 G/A 1 9 4 13 4.22332190226436 2.12296804343806 2.10035385882629 A:G G A 10 0.530742010859516 0.278656458173804 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 66039312 A/T 1 67 42 109 31.4402852724124 22.2911644560997 9.14912081631276 A:T A T 10 0.530742010859516 0.0843343249812133 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 39 68 107 18.3010615764789 36.0904567384471 -17.7893951619682 A:G A G 10 0.530742010859516 0.000642726317204032 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 5 10 15 2.34628994570242 5.30742010859516 -2.96113016289274 A:G G A 10 0.530742010859516 0.194326171864357 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 72480288 G/A 1 44 60 104 20.6473515221813 31.844520651571 -11.1971691293897 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0305009909823459 ENSG00000167851:ENST00000361933:exon_72480140_72480927:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000360141:exon_72480140_72480933:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000392625:exon_72480140_72480929:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000310828:exon_72480140_72480306:CD300A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 73125173 A/G 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G A G 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 73221439 C/T 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73221437_73221559:NUP85 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 73230796 T/C 1 29 26 55 13.608481685074 13.7992922823474 -0.19081059727338 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 73263012 C/T 1 23 14 37 10.7929337502311 7.43038815203322 3.36254559819791 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.323726975338337 ENSG00000125457:ENST00000245551:exon_73262313_73263048:MIF4GD;ENSG00000125457:ENST00000325102:exon_73263000_73263035:MIF4GD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 73279624 A/G 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:G A G 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73279504_73279674:SLC25A19 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 73518203 G/C 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 C:G G C 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 74039945 T/C 1 1 10 11 0.469257989140484 5.30742010859516 -4.83816211945468 T:C T C 10 0.530742010859516 0.004206919993513 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74039910_74040039:SRP68 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 74039976 A/G 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:G A G 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74039910_74040039:SRP68 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 53 55 108 24.8706734244457 29.1908105972734 -4.32013717282773 A:G G A 10 0.530742010859516 0.440898258431804 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 72 87 159 33.7865752181148 46.1745549447779 -12.387979726663 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0562278346633592 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 76967805 G/A 1 190 3 193 89.159017936692 1.59222603257855 87.5667919041134 A:G G A 10 0.530742010859516 7.65587691946564e-48 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 76968417 A/G 1 42 1 43 19.7088355439003 0.530742010859516 19.1780935330408 A:G A G 10 0.530742010859516 6.66568468680588e-11 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 78111941 C/T 1 32 35 67 15.0162556524955 18.5759703800831 -3.55971472758757 T:C C T 10 0.530742010859516 0.394159595930844 ENSG00000141543:ENST00000269349:exon_78111941_78112079:EIF4A3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 78367225 A/C 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 A:C A C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78367145_78369112:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78367145_78370085:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78367145_78370085:RNF213 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79202687 A/C 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:C A C 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 166 194 360 77.8968261973203 102.963950106746 -25.0671239094258 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0082760013808507 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79826935 G/A 1 191 183 374 89.6282759258324 97.1257879872914 -7.49751206145899 A:G G A 10 0.530742010859516 0.437699061783218 ENSG00000141522:ENST00000269321:exon_79825598_79826951:ARHGDIA;ENSG00000141522:ENST00000400721:exon_79826924_79826951:ARHGDIA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79871981 A/G 1 10 14 24 4.69257989140484 7.43038815203322 -2.73780826062838 A:G A G 10 0.530742010859516 0.308839595377037 ENSG00000187531:ENST00000328666:exon_79871963_79872043:SIRT7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79892586 A/G 1 22 32 54 10.3236757610906 16.9837443475045 -6.66006858641386 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0766195714900485 ENSG00000183010:ENST00000337943:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000402252:exon_79892529_79892621:PYCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79892943 G/A 1 33 16 49 15.485513641636 8.49187217375226 6.99364146788372 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0461633294226629 ENSG00000183010:ENST00000337943:exon_79892802_79893023:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79892802_79893023:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79892802_79893023:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79892802_79893023:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79892802_79893023:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000402252:exon_79892802_79893023:PYCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79952700 G/A 1 10 6 16 4.69257989140484 3.1844520651571 1.50812782624774 A:G G A 10 0.530742010859516 0.617940633683685 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79952697_79952754:ASPSCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79974680 C/G 1 40 27 67 18.7703195656194 14.3300342932069 4.44028527241243 C:G C G 10 0.530742010859516 0.327597938471543 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 79991333 G/A 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G G A 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991316_79991475:RAC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 12 20 32 5.63109586968581 10.6148402171903 -4.98374434750451 A:G G A 10 0.530742010859516 0.109483713909064 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 80019219 C/T 1 11 14 25 5.16183788054532 7.43038815203322 -2.2685502714879 T:C C T 10 0.530742010859516 0.425011090688417 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 80195578 C/T 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C C T 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80195014_80195769:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80195014_80195769:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80195014_80195769:SLC16A3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 80196816 C/T 1 53 17 70 24.8706734244457 9.02261418461177 15.8480592398339 T:C C T 10 0.530742010859516 0.000161101339599571 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80196578_80197354:SLC16A3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 13 20 33 6.10035385882629 10.6148402171903 -4.51448635836403 A:G G A 10 0.530742010859516 0.12028644109450 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 80352234 G/A 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G G A 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 80441645 G/A 1 14 22 36 6.56961184796678 11.6763242389094 -5.10671239094258 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0964105370865987 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80441592_80441655:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80441592_80441655:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80441592_80441655:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80441592_80441655:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80441592_80441655:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80441592_80441655:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80441592_80441655:NARF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 18 14 32 8.44664380452871 7.43038815203322 1.01625565249549 T:C T C 10 0.530742010859516 0.859783970906506 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 17 81052326 T/C 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 T:C T C 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81052001_81052585:METRNL;ENSG00000176845:ENST00000400683:exon_81052001_81052481:METRNL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 658001 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000176912:ENST00000323813:exon_657842_658340:C18orf56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 659675 C/T 1 15 9 24 7.03886983710726 4.77667809773564 2.26219173937162 T:C C T 10 0.530742010859516 0.416585330003095 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_659641_659714:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_659641_659714:TYMS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 83 70 153 38.9484130986602 37.1519407601661 1.79647233849405 T:C C T 10 0.530742010859516 0.808239195060053 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 9255889 C/T 1 138 164 302 64.7576025013868 87.0416897809606 -22.2840872795738 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0111012721177944 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255875_9255900:ANKRD12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 146 162 308 68.5116664145107 85.9802057592416 -17.4685393447309 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0520822092840884 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 9256230 G/A 1 126 99 225 59.126506631701 52.5434590750921 6.5830475566089 A:G G A 10 0.530742010859516 0.38608582194536 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 11851804 G/A 1 8 13 21 3.75406391312387 6.89964614117371 -3.14558222804984 A:G G A 10 0.530742010859516 0.193285718012212 ENSG00000255112:ENST00000526991:exon_11851439_11854448:CHMP1B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 7 22 29 3.28480592398339 11.6763242389094 -8.39151831492596 C:G G C 10 0.530742010859516 0.00232232915165478 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 90 89 179 42.2332190226436 47.2360389664969 -5.00281994385336 C:G C G 10 0.530742010859516 0.455161699999322 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 11 2 13 5.16183788054532 1.06148402171903 4.10035385882629 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0256582468175808 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 12 5 17 5.63109586968581 2.65371005429758 2.97738581538823 T:C C T 10 0.530742010859516 0.223478369982475 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 13731594 A/G 1 19 12 31 8.9159017936692 6.36890413031419 2.546997663355 A:G A G 10 0.530742010859516 0.375473627042048 ENSG00000101654:ENST00000383314:exon_13731475_13731933:RNMT;ENSG00000101654:ENST00000262173:exon_13731473_13731933:RNMT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 5 13 18 2.34628994570242 6.89964614117371 -4.55335619547129 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0349231622526171 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 32886610 G/A 1 5 11 16 2.34628994570242 5.83816211945468 -3.49187217375226 A:G G A 10 0.530742010859516 0.130339318751546 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 32887591 A/G 1 7 12 19 3.28480592398339 6.36890413031419 -3.0840982063308 A:G A G 10 0.530742010859516 0.173584815126562 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 17 12 29 7.97738581538823 6.36890413031419 1.60848168507404 A:G A G 10 0.530742010859516 0.58207060910907 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 33726295 A/G 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G A G 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33726213_33726344:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33726213_33726344:ELP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 33750046 C/T 1 69 71 140 32.3788012506934 37.6826827710256 -5.30388152033224 T:C C T 10 0.530742010859516 0.397409699098603 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33750026_33750159:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33750026_33750159:ELP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 43685185 T/C 1 11 7 18 5.16183788054532 3.71519407601661 1.44664380452871 T:C T C 10 0.530742010859516 0.63827752360053 ENSG00000152240:ENST00000282058:exon_43685160_43685334:HAUS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 45372137 T/C 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 T:C T C 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000175387:ENST00000262160:exon_45372034_45372171:SMAD2;ENSG00000175387:ENST00000356825:exon_45372034_45372171:SMAD2;ENSG00000175387:ENST00000402690:exon_45372034_45372171:SMAD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 47008765 C/A 1 26 10 36 12.2007077176526 5.30742010859516 6.89328760905742 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0285696013083571 ENSG00000177576:ENST00000318240:exon_47008030_47008780:C18orf32 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 47008766 A/T 1 26 9 35 12.2007077176526 4.77667809773564 7.42402961991694 A:T A T 10 0.530742010859516 0.0164689852711672 ENSG00000177576:ENST00000318240:exon_47008030_47008780:C18orf32 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 48458662 G/A 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 41 34 75 19.2395775547598 18.0452283692235 1.1943491855363 T:C T C 10 0.530742010859516 0.817748447278653 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 25 25 50 11.7314497285121 13.2685502714879 -1.5371005429758 T:C T C 10 0.530742010859516 0.67351975217574 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 29 28 57 13.608481685074 14.8607763040664 -1.25229461899241 T:C C T 10 0.530742010859516 0.791311215123067 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 55269713 G/A 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 A:G G A 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55269587_55269718:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55269587_55269718:NARS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 57006091 C/A 1 20 7 27 9.38515978280968 3.71519407601661 5.66996570679307 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0332721639374529 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57005992_57006185:LMAN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 59972793 C/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:C C A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000134444:ENST00000398130:exon_59972647_59974355:KIAA1468;ENSG00000134444:ENST00000256858:exon_59972647_59974354:KIAA1468 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 61597418 C/T 1 4 14 18 1.87703195656194 7.43038815203322 -5.55335619547129 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00932147609371555 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61597279_61597421:SERPINB10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 T:C C T 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 61600410 G/A 1 7 12 19 3.28480592398339 6.36890413031419 -3.0840982063308 A:G G A 10 0.530742010859516 0.173584815126562 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 71816106 G/A 1 5 17 22 2.34628994570242 9.02261418461177 -6.67632423890935 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00485519737901712 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 27 14 41 12.6699657067931 7.43038815203322 5.23957755475984 A:G G A 10 0.530742010859516 0.117846174802978 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 18 25 43 8.44664380452871 13.2685502714879 -4.82190646695919 A:C A C 10 0.530742010859516 0.168917224562374 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 18 77805949 A/C 1 44 34 78 20.6473515221813 18.0452283692235 2.60212315295775 A:C A C 10 0.530742010859516 0.572630321692815 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 8 12 20 3.75406391312387 6.36890413031419 -2.61484021719032 T:C C T 10 0.530742010859516 0.268606212218767 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 579636 C/T 1 72 84 156 33.7865752181148 44.5823289121993 -10.7957536940845 A:T:C C T 10 0.530742010859516 0.0919273213465358 ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 580388 C/G 1 95 99 194 44.579508968346 52.5434590750921 -7.96395010674611 C:G C G 10 0.530742010859516 0.280562349944418 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 619039 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 621561 C/A 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 A:C C A 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 651742 G/A 1 13 5 18 6.10035385882629 2.65371005429758 3.44664380452871 A:G G A 10 0.530742010859516 0.154800993660354 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 804555 G/A 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804532_804702:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804532_804702:PTBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 868057 C/T 1 103 86 189 48.3335728814698 45.6438129339184 2.68975994755147 T:C C T 10 0.530742010859516 0.716005116259143 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 56 33 89 26.2784473918671 17.514486358364 8.76396103350308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0707530703330276 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 868258 G/A 1 77 77 154 36.1328651638173 40.8671348361827 -4.73426967236546 A:G G A 10 0.530742010859516 0.467907695891695 ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 875389 G/A 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 A:G G A 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_875244_875454:MED16 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 901507 A/G 1 11 4 15 5.16183788054532 2.12296804343806 3.03886983710726 A:G A G 10 0.530742010859516 0.12884907544869 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_901422_901546:C19orf22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 965031 C/T 1 19 13 32 8.9159017936692 6.89964614117371 2.01625565249549 T:C C T 10 0.530742010859516 0.595906631158956 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_964833_965080:ARID3A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 9 10 19 4.22332190226436 5.30742010859516 -1.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.651962958706861 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 966831 G/A 1 16 16 32 7.50812782624774 8.49187217375226 -0.983744347504512 A:G G A 10 0.530742010859516 0.727627568390899 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 971986 C/T 1 49 55 104 22.9936414678837 29.1908105972734 -6.19716912938966 T:C C T 10 0.530742010859516 0.239019128107987 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_971878_972781:ARID3A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 984554 C/G 1 34 18 52 15.9547716307765 9.55335619547129 6.40141543530517 C:G C G 10 0.530742010859516 0.0946350092323363 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1011894 G/A 1 9 9 18 4.22332190226436 4.77667809773564 -0.553356195471288 A:G G A 10 0.530742010859516 0.817532500175034 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1011891_1011991:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1011891_1011991:C19orf6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1036444 G/A 1 41 39 80 19.2395775547598 20.6989384235211 -1.45936086876128 A:G G A 10 0.530742010859516 0.82290686583084 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1084321 G/C 1 37 41 78 17.3625455981979 21.7604224452402 -4.39787684704225 C:G G C 10 0.530742010859516 0.364290512039647 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1084237_1084345:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1084237_1084345:HMHA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 54 53 107 25.3399314135861 28.1293265755543 -2.78939516196821 A:G A G 10 0.530742010859516 0.628600822058098 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 19 11 30 8.9159017936692 5.83816211945468 3.07773967421452 T:C C T 10 0.530742010859516 0.278378850083011 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1106262 C/T 1 786 670 1456 368.83677946442 355.597147275876 13.2396321885447 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.494872712871651 ENSG00000167468:ENST00000354171:exon_1106241_1106265:GPX4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1278793 C/T 1 131 85 216 61.4727965774034 45.1130709230589 16.3597256543445 A:T:C C T 10 0.530742010859516 0.02893618972617 ENSG00000228300:ENST00000409293:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000492647:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000513897:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000518332:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000530634:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000469144:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000485191:exon_1278776_1279221:C19orf24;ENSG00000226593:ENST00000416408:exon_1278776_1279242:AC004258.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 28 33 61 13.1392236959336 17.514486358364 -4.37526266243048 T:C C T 10 0.530742010859516 0.304920238839123 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1390968 C/T 1 39 60 99 18.3010615764789 31.844520651571 -13.5434590750921 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00850472957307686 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1390870_1391049:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1390870_1391049:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1390870_1391049:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1390870_1391049:NDUFS7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1429991 G/T 1 31 30 61 14.546997663355 15.9222603257855 -1.37526266243048 A:T:G G T 10 0.530742010859516 0.797831481366764 ENSG00000071626:ENST00000233078:exon_1429966_1429995:DAZAP1;ENSG00000071626:ENST00000395533:exon_1429966_1429995:DAZAP1;ENSG00000071626:ENST00000336761:exon_1429966_1429995:DAZAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 1979811 A/G 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:G A G 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000133275:ENST00000255641:exon_1979751_1979834:CSNK1G2;ENSG00000133275:ENST00000313975:exon_1979751_1979819:CSNK1G2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 2046379 C/T 1 8 11 19 3.75406391312387 5.83816211945468 -2.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.366013294263512 ENSG00000099875:ENST00000309340:exon_2046366_2046467:MKNK2;ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2046366_2046467:MKNK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 2073411 C/T 1 15 13 28 7.03886983710726 6.89964614117371 0.139223695933552 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2071037_2073423:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2073140_2073423:MOBKL2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 3155902 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3155821_3155950:GNA15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 3162909 C/T 1 8 1 9 3.75406391312387 0.530742010859516 3.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0422661471759058 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 11 17 28 5.16183788054532 9.02261418461177 -3.86077630406645 T:C T C 10 0.530742010859516 0.184567835501249 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 3496833 G/A 1 10 6 16 4.69257989140484 3.1844520651571 1.50812782624774 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.617940633683685 ENSG00000129932:ENST00000250937:exon_3496539_3496884:DOHH;ENSG00000129932:ENST00000427575:exon_3496539_3496884:DOHH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 3534859 A/G 1 12 12 24 5.63109586968581 6.36890413031419 -0.737808260628384 A:G A G 10 0.530742010859516 0.839201084427724 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 3544820 G/C 1 16 18 34 7.50812782624774 9.55335619547129 -2.04522836922354 C:G G C 10 0.530742010859516 0.497093284622034 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 3544867 C/T 1 15 14 29 7.03886983710726 7.43038815203322 -0.391518314925964 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 3547955 C/T 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3547846_3548028:C19orf28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 253 342 595 118.722271252542 181.513767713954 -62.791496461412 A:G G A 10 0.530742010859516 2.61565959631919e-07 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 349 505 854 163.771038210029 268.024715484056 -104.253677274027 A:G A G 10 0.530742010859516 9.97361802368109e-13 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4251036 C/T 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 10 8 18 4.69257989140484 4.24593608687613 0.446643804528712 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4353024 C/T 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4355134 C/T 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 T:C C T 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4355094_4355170:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4355094_4355170:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4355094_4355170:MPND HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4409756 A/G 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 A:G A G 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 14 6 20 6.56961184796678 3.1844520651571 3.38515978280968 T:C C T 10 0.530742010859516 0.178184035682023 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4493708 A/G 1 32 24 56 15.0162556524955 12.7378082606284 2.2784473918671 A:G A G 10 0.530742010859516 0.593496392999229 ENSG00000167674:ENST00000429822:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000301284:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000398364:exon_4493700_4493859:AC011498.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4658047 A/G 1 86 85 171 40.3561870660816 45.1130709230589 -4.75688385697723 A:G A G 10 0.530742010859516 0.490824720029584 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4816241 G/A 1 27 40 67 12.6699657067931 21.2296804343806 -8.55971472758757 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0378352576807497 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4847868 G/A 1 12 8 20 5.63109586968581 4.24593608687613 1.38515978280968 A:G G A 10 0.530742010859516 0.655918359081295 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 12 12 24 5.63109586968581 6.36890413031419 -0.737808260628384 T:C T C 10 0.530742010859516 0.839201084427724 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 5210782 G/A 1 1 10 11 0.469257989140484 5.30742010859516 -4.83816211945468 A:G G A 10 0.530742010859516 0.004206919993513 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5210690_5210816:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5210690_5210816:PTPRS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 5273571 T/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:G T G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000105426:ENST00000355005:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000262963:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000348075:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000355322:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000356037:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000357368:exon_5273453_5273594:PTPRS;ENSG00000105426:ENST00000353284:exon_5273453_5273594:PTPRS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 5594000 C/T 1 14 9 23 6.56961184796678 4.77667809773564 1.79293375023113 T:C C T 10 0.530742010859516 0.533738323924712 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5593902_5594189:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5593902_5594189:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5593902_5594189:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5593902_5594189:SAFB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 5654449 G/A 1 54 33 87 25.3399314135861 17.514486358364 7.82544505522211 A:G G A 10 0.530742010859516 0.106848261389762 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5654379_5654467:SAFB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 5679741 G/A 1 141 121 262 66.1653764688082 64.2197833140014 1.94559315480682 A:G G A 10 0.530742010859516 0.852738638943521 ENSG00000174917:ENST00000309324:exon_5679597_5679774:C19orf70 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 5692166 G/A 1 173 154 327 81.1816321213037 81.7342696723655 -0.552637551061721 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.955873847500802 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5691845_5692219:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5691846_5692219:LONP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 5696068 C/G 1 32 21 53 15.0162556524955 11.1455822280498 3.87067342444565 C:G C G 10 0.530742010859516 0.335849696545084 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 12 14 26 5.63109586968581 7.43038815203322 -1.79929228234742 A:G G A 10 0.530742010859516 0.557319505160064 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 6364500 G/A 1 38 47 85 17.8318035873384 24.9448745103973 -7.11307092305886 A:G G A 10 0.530742010859516 0.128966989637277 ENSG00000125656:ENST00000245816:exon_6364463_6364650:CLPP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 6415176 C/T 0 101 0 101 47.3950569031889 0 47.3950569031889 C C 10 0.530742010859516 3.24265280869307e-28 ENSG00000088247:ENST00000398148:exon_6415152_6415312:KHSRP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 6534841 G/A 1 24 11 35 11.2621917393716 5.83816211945468 5.42402961991694 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0890112146107674 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 6731057 T/C 1 34 31 65 15.9547716307765 16.453002336645 -0.49823070586854 T:C T C 10 0.530742010859516 0.90189094734076 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 6937658 C/T 1 2 15 17 0.938515978280968 7.96113016289274 -7.02261418461177 T:C C T 10 0.530742010859516 0.000841053171386064 ENSG00000174837:ENST00000312053:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000450315:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381407:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381404:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000250572:exon_6937555_6937659:EMR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7685843 G/A 1 21 19 40 9.85441777195016 10.0840982063308 -0.22968043438064 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7709583 G/A 1 32 15 47 15.0162556524955 7.96113016289274 7.05512548960275 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0412288493940151 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7709500_7709638:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7709500_7709638:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7709500_7709638:STXBP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 50 38 88 23.4628994570242 20.1681964126616 3.29470304436259 T:C T C 10 0.530742010859516 0.522384200935190 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 A:G G A 10 0.530742010859516 0.75852273700248 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7712306 C/T 1 46 26 72 21.5858675004623 13.7992922823474 7.78657521811485 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0761733149382113 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 7 1 8 3.28480592398339 0.530742010859516 2.75406391312387 C:G G C 10 0.530742010859516 0.074454966322071 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 624 828 1452 292.816985223662 439.454384991679 -146.637399768017 A:T:C:G G A 10 0.530742010859516 1.34569670687508e-14 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7754222 G/A 1 1040 861 1901 488.028308706103 456.968871350043 31.0594373560601 A:G G A 10 0.530742010859516 0.154313639684855 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7753663_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7753667_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7753667_7754316:FCER2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7987659 C/T 1 18 22 40 8.44664380452871 11.6763242389094 -3.22968043438064 T:C C T 10 0.530742010859516 0.343465406332665 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7987330_7988134:SNAPC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7992052 A/C 1 27 30 57 12.6699657067931 15.9222603257855 -3.25229461899241 A:C A C 10 0.530742010859516 0.426959563090937 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 7992126 G/A 1 25 19 44 11.7314497285121 10.0840982063308 1.6473515221813 A:G G A 10 0.530742010859516 0.653092364570116 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 8319455 C/T 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:C C T 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 70 80 150 32.8480592398339 42.4593608687613 -9.6113016289274 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.120548643459495 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 8367356 C/T 1 73 58 131 34.2558332072553 30.7830366298519 3.47279657740341 T:C C T 10 0.530742010859516 0.599617089423919 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 8373152 T/C 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 T:C T C 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 8381479 T/C 1 27 27 54 12.6699657067931 14.3300342932069 -1.66006858641386 T:C T C 10 0.530742010859516 0.683976294998197 ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8381380_8381529:NDUFA7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 8551094 T/C 1 219 191 410 102.767499621766 101.371724074168 1.39577554759843 T:C T C 10 0.530742010859516 0.92119249911517 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 9 17 26 4.22332190226436 9.02261418461177 -4.79929228234742 A:T A T 10 0.530742010859516 0.0758785877818065 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 9949152 G/A 1 65 71 136 30.5017692941315 37.6826827710256 -7.18091347689418 A:G G A 10 0.530742010859516 0.229567412159652 ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 C:G C G 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 463 481 944 217.266448972044 255.286907223427 -38.0204582513831 A:T:G A G 10 0.530742010859516 0.0144149627656474 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 274 238 512 128.576689024493 126.316598584565 2.26009043992781 A:G A G 10 0.530742010859516 0.859482051622346 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10369181 C/T 1 89 69 158 41.7639610335031 36.6211987493066 5.14276228419648 T:C C T 10 0.530742010859516 0.426354107059354 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10369089_10369198:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10369089_10369198:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369089_10369198:MRPL4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10370490 T/A 1 258 250 508 121.068561198245 132.685502714879 -11.6169415166341 A:T T A 10 0.530742010859516 0.306841271983073 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10385540 A/T 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:T A T 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10385441_10385704:ICAM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10450285 G/A 1 24 16 40 11.2621917393716 8.49187217375226 2.77031956561936 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.430183511802966 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10450215_10450345:ICAM3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:C C A 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 C:G G C 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10665984 G/A 1 2 8 10 0.938515978280968 4.24593608687613 -3.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0536315808592461 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10665961_10666025:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10665961_10666025:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10665961_10666025:KRI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 A:G A G 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 10798197 C/T 1 12 13 25 5.63109586968581 6.89964614117371 -1.2685502714879 T:C C T 10 0.530742010859516 0.690401884163373 ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10798022_10798384:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10798022_10798384:ILF3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 12 11 23 5.63109586968581 5.83816211945468 -0.207066249768868 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 11218199 C/T 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.53092560297019 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 8 21 29 3.75406391312387 11.1455822280498 -7.39151831492596 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0081066847767949 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 12779170 G/A 1 562 484 1046 263.722989896952 256.879133256006 6.84385664094629 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.68719538287723 ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12778881_12779239:C19orf56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 12790506 C/G 1 24 29 53 11.2621917393716 15.391518314926 -4.12932657555435 C:G C G 10 0.530742010859516 0.272996889143752 ENSG00000095059:ENST00000351660:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000210060:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000393273:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000441196:exon_12790437_12790533:DHPS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 12792377 G/A 1 24 19 43 11.2621917393716 10.0840982063308 1.17809353304081 A:G G A 10 0.530742010859516 0.76166637186299 ENSG00000095059:ENST00000351660:exon_12792374_12792682:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000425834:exon_12792374_12792682:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000210060:exon_12792374_12792682:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000393273:exon_12792374_12792682:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000441196:exon_12792374_12792682:DHPS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 12800851 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800776_12800924:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800776_12801014:FBXW9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 12813683 T/C 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12813637_12813732:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12813637_12813732:TNPO2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 12917520 A/G 1 14 15 29 6.56961184796678 7.96113016289274 -1.39151831492596 A:G A G 10 0.530742010859516 0.710650929425754 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12917428_12917614:RNASEH2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 12920935 G/A 1 53 48 101 24.8706734244457 25.4756165212568 -0.604943096811116 A:G G A 10 0.530742010859516 0.920860130065845 ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12920885_12921022:RNASEH2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 13033560 T/C 1 126 164 290 59.126506631701 87.0416897809606 -27.9151831492596 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00117783105373209 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13033284_13033700:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13033294_13033700:FARSA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14231243 C/T 1 14 22 36 6.56961184796678 11.6763242389094 -5.10671239094258 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0964105370865987 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14231325 C/G 1 8 22 30 3.75406391312387 11.6763242389094 -7.92226032578548 C:G C G 10 0.530742010859516 0.00518332811361235 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14512502 C/T 1 12 9 21 5.63109586968581 4.77667809773564 0.854417771950164 T:C C T 10 0.530742010859516 0.828106270585171 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14518913 G/A 1 130 111 241 61.0035385882629 58.9123632054063 2.09117538285664 A:G G A 10 0.530742010859516 0.79667254971989 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14518904_14519531:CD97 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14518951 C/T 1 143 123 266 67.1038924470892 65.2812673357205 1.82262511136874 T:C C T 10 0.530742010859516 0.85387589487974 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14518904_14519531:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14518904_14519531:CD97 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14520713 G/A 1 6 11 17 2.8155479348429 5.83816211945468 -3.02261418461177 A:G G A 10 0.530742010859516 0.153137089832863 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14580329 T/C 1 86 59 145 40.3561870660816 31.3137786407114 9.04240842537018 T:C T C 10 0.530742010859516 0.135111438748857 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14582584 C/T 1 225 190 415 105.583047556609 100.840982063308 4.74206549330086 A:T:C C T 10 0.530742010859516 0.658211391141985 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14590236 C/T 1 12 7 19 5.63109586968581 3.71519407601661 1.9159017936692 T:C C T 10 0.530742010859516 0.492140981990386 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14590279 G/C 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 A:G G A 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14675072 C/A 1 44 46 90 20.6473515221813 24.4141324995377 -3.76678097735644 A:C C A 10 0.530742010859516 0.460365714666128 ENSG00000099797:ENST00000215567:exon_14674994_14675099:TECR;ENSG00000099797:ENST00000436007:exon_14674994_14675099:TECR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14676893 A/G 1 2 19 21 0.938515978280968 10.0840982063308 -9.14558222804984 A:T:C:G A G 10 0.530742010859516 6.95700175873232e-05 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14676892_14677077:NDUFB7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 14676941 C/T 1 86 90 176 40.3561870660816 47.7667809773564 -7.41059391127482 T:C C T 10 0.530742010859516 0.290376762372105 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14676892_14677077:NDUFB7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 20 16 36 9.38515978280968 8.49187217375226 0.893287609057424 A:G G A 10 0.530742010859516 0.86782286402883 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 15512393 G/A 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:G G A 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000011243:ENST00000397410:exon_15511961_15512414:AKAP8L;ENSG00000011243:ENST00000263378:exon_15511961_15512414:AKAP8L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 15562565 C/T 1 61 54 115 28.6247373375695 28.6600685864139 -0.03533124884434 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15562438_15562749:RASAL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 15562591 G/A 1 56 58 114 26.2784473918671 30.7830366298519 -4.50458923798482 A:G G A 10 0.530742010859516 0.400314867420709 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15562438_15562749:RASAL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 15562792 C/T 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.158671044656390 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 15565055 T/C 1 14 23 37 6.56961184796678 12.2070662497689 -5.63745440180209 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0706006672668108 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15564960_15565078:RASAL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17312992 C/T 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C T C 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17317955 A/G 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 A:G A G 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17317922_17318053:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17317922_17318053:MYO9B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17321628 T/C 1 18 18 36 8.44664380452871 9.55335619547129 -1.10671239094258 T:C T C 10 0.530742010859516 0.740751686819976 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17321524_17321661:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17321524_17321657:MYO9B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 74 52 126 34.7250911963958 27.5985845646948 7.12650663170098 A:G G A 10 0.530742010859516 0.21237652316212 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17622614 C/T 1 34 15 49 15.9547716307765 7.96113016289274 7.99364146788372 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0223246579189378 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17622432_17622769:PGLS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17631905 G/C 1 171 120 291 80.2431161430228 63.6890413031419 16.5540748398808 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0527287503539529 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17631753_17632095:PGLS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 T:C C T 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17837981 A/G 1 11 4 15 5.16183788054532 2.12296804343806 3.03886983710726 A:G A G 10 0.530742010859516 0.12884907544869 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 17973329 A/G 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.353006242686502 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 46 48 94 21.5858675004623 25.4756165212568 -3.8897490207945 T:G T G 10 0.530742010859516 0.469711704764126 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 18279638 T/C 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C T C 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18279536_18279706:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000464016:exon_18279285_18279649:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000470732:exon_18279308_18279706:PIK3R2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 18288498 G/C 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 C:G G C 10 0.530742010859516 1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 5 14 19 2.34628994570242 7.43038815203322 -5.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0217224755025344 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 18679351 C/T 1 15 16 31 7.03886983710726 8.49187217375226 -1.453002336645 T:C C T 10 0.530742010859516 0.719585525875506 ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19032680 T/C 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 T:C T C 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19032652_19032773:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19032652_19032773:DDX49 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19038598 G/A 1 29 29 58 13.608481685074 15.391518314926 -1.78303662985193 A:G G A 10 0.530742010859516 0.69379701146526 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19038575_19038663:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19038575_19038663:DDX49 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19162971 A/G 1 7 19 26 3.28480592398339 10.0840982063308 -6.79929228234742 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00955434677079856 ENSG00000105676:ENST00000392335:exon_19162431_19163004:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000269932:exon_19162431_19163004:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000392336:exon_19162431_19163004:ARMC6;ENSG00000105676:ENST00000379532:exon_19162509_19163004:ARMC6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19230868 A/G 1 15 20 35 7.03886983710726 10.6148402171903 -3.57597038008306 A:G A G 10 0.530742010859516 0.239841750921707 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19230429_19230992:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19230429_19230992:TMEM161A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19232368 C/T 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 T:C C T 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000064545:ENST00000450333:exon_19232334_19232477:TMEM161A;ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19232334_19232477:TMEM161A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G G A 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19735043 G/A 1 14 9 23 6.56961184796678 4.77667809773564 1.79293375023113 A:G G A 10 0.530742010859516 0.533738323924712 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19734468_19735378:LPAR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19737680 C/T 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 108 110 218 50.6798628271723 58.3816211945468 -7.70175836737449 C:G C G 10 0.530742010859516 0.309082590804512 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19744939 C/T 1 20 14 34 9.38515978280968 7.43038815203322 1.95477163077646 T:C C T 10 0.530742010859516 0.60701016639997 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19744612_19744999:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19744612_19744999:GMIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 19822566 G/A 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 A:G G A 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 C:G C G 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 21720616 T/C 1 13 6 19 6.10035385882629 3.1844520651571 2.9159017936692 T:C T C 10 0.530742010859516 0.25039820154784 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 23542697 G/C 1 13 15 28 6.10035385882629 7.96113016289274 -1.86077630406645 C:G G C 10 0.530742010859516 0.571174046060559 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 23837321 A/C 1 7 11 18 3.28480592398339 5.83816211945468 -2.55335619547129 A:C A C 10 0.530742010859516 0.246521713034617 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 23837365 A/C 1 11 6 17 5.16183788054532 3.1844520651571 1.97738581538823 A:C A C 10 0.530742010859516 0.467310697914147 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 23926708 A/G 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:G A G 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:T T A 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 A:C A C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 A:G A G 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:C C A 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 T:C C T 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 33870157 A/T 1 21 14 35 9.85441777195016 7.43038815203322 2.42402961991694 A:T A T 10 0.530742010859516 0.498984806141757 ENSG00000153879:ENST00000284000:exon_33870050_33873591:CEBPG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 6 12 18 2.8155479348429 6.36890413031419 -3.55335619547129 A:G A G 10 0.530742010859516 0.103109047159225 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 59 81 140 27.6862213592886 42.9901028796208 -15.3038815203322 A:T:G A G 10 0.530742010859516 0.0108748015911809 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 3 8 11 1.40777396742145 4.24593608687613 -2.83816211945468 T:C T C 10 0.530742010859516 0.128925499785697 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 14 11 25 6.56961184796678 5.83816211945468 0.7314497285121 T:G T G 10 0.530742010859516 0.842799633797048 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 98 76 174 45.9872829357674 40.3363928253232 5.65089011044422 T:C T C 10 0.530742010859516 0.404260892371014 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 35828635 C/T 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.158671044656390 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 35831986 C/T 1 51 39 90 23.9321574461647 20.6989384235211 3.23321902264356 T:C C T 10 0.530742010859516 0.527326068833378 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35831784_35832041:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35831784_35832041:CD22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 273 278 551 128.107431035352 147.546279018945 -19.4388479835933 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.104737181790984 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 36244987 C/T 1 27 31 58 12.6699657067931 16.453002336645 -3.78303662985193 T:C C T 10 0.530742010859516 0.357845641339961 ENSG00000188223:ENST00000301159:exon_36244918_36245058:LIN37 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 36394272 T/C 1 56 43 99 26.2784473918671 22.8219064669592 3.45654092490792 T:C T C 10 0.530742010859516 0.545988196440097 ENSG00000126264:ENST00000246551:exon_36394253_36394318:HCST;ENSG00000126264:ENST00000437550:exon_36394253_36394318:HCST HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 36394678 T/C 1 67 38 105 31.4402852724124 20.1681964126616 11.2720888597508 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0311218743320890 ENSG00000126264:ENST00000246551:exon_36394674_36394805:HCST;ENSG00000126264:ENST00000437550:exon_36394674_36394805:HCST HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 10 8 18 4.69257989140484 4.24593608687613 0.446643804528712 A:C A C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 36640770 G/A 1 400 250 650 187.703195656194 132.685502714879 55.0176929413146 A:T:G G A 10 0.530742010859516 1.48241512468766e-05 ENSG00000126247:ENST00000457326:exon_36640715_36641254:CAPNS1;ENSG00000126247:ENST00000246533:exon_36640715_36641254:CAPNS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 60 61 121 28.155479348429 32.3752626624305 -4.21978331400143 T:C T C 10 0.530742010859516 0.466835828971155 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 13 25 38 6.10035385882629 13.2685502714879 -7.16819641266161 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0225178867546813 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39214844 C/T 1 14 13 27 6.56961184796678 6.89964614117371 -0.330034293206932 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39214797_39214979:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39214797_39214979:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39214797_39214979:ACTN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39216369 C/T 1 39 45 84 18.3010615764789 23.8833904886782 -5.58232891219934 T:C C T 10 0.530742010859516 0.230764189599099 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39216364_39216543:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39216364_39216543:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39216364_39216391:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39216364_39216543:ACTN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39329055 G/A 1 411 488 899 192.865033536739 259.002101299444 -66.1370677627048 A:G G A 10 0.530742010859516 1.16081380108187e-05 ENSG00000104824:ENST00000221419:exon_39329037_39329238:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388750:exon_39329037_39329238:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388749:exon_39329037_39329238:HNRNPL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39334654 G/A 1 14 27 41 6.56961184796678 14.3300342932069 -7.76042244524016 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0182200145612655 ENSG00000104824:ENST00000221419:exon_39334648_39334744:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388750:exon_39334648_39334744:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388749:exon_39334648_39334744:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000423415:exon_39334648_39334744:HNRNPL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39398245 C/T 1 44 34 78 20.6473515221813 18.0452283692235 2.60212315295775 T:C C T 10 0.530742010859516 0.572630321692815 ENSG00000104825:ENST00000313582:exon_39398039_39398299:NFKBIB;ENSG00000104825:ENST00000392079:exon_39398039_39399531:NFKBIB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39421928 T/C 1 46 55 101 21.5858675004623 29.1908105972734 -7.60494309681112 T:C T C 10 0.530742010859516 0.135575191553705 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39421594_39421983:MRPS12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39423001 T/C 1 70 71 141 32.8480592398339 37.6826827710256 -4.83462353119176 T:C T C 10 0.530742010859516 0.447868211705256 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39899364 G/C 1 17 16 33 7.97738581538823 8.49187217375226 -0.514486358364028 C:G G C 10 0.530742010859516 0.863566015067668 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39915650 C/T 1 25 21 46 11.7314497285121 11.1455822280498 0.585867500462264 T:C C T 10 0.530742010859516 0.88375950285739 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 39972579 G/A 1 12 6 18 5.63109586968581 3.1844520651571 2.44664380452871 A:G G A 10 0.530742010859516 0.34554633606434 ENSG00000105197:ENST00000314349:exon_39972523_39972673:TIMM50 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 40587735 G/A 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000197782:ENST00000450241:exon_40587726_40587821:ZNF780A;ENSG00000197782:ENST00000414720:exon_40587726_40587821:ZNF780A;ENSG00000197782:ENST00000443072:exon_40587726_40587821:ZNF780A;ENSG00000197782:ENST00000455521:exon_40587726_40587824:ZNF780A;ENSG00000197782:ENST00000340963:exon_40587726_40587821:ZNF780A;ENSG00000197782:ENST00000392041:exon_40587726_40587821:ZNF780A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 40739522 C/T 1 22 14 36 10.3236757610906 7.43038815203322 2.89328760905742 T:C C T 10 0.530742010859516 0.404566051476356 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 20 22 42 9.38515978280968 11.6763242389094 -2.29116445609967 A:G A G 10 0.530742010859516 0.537470994620003 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 6 9 15 2.8155479348429 4.77667809773564 -1.96113016289274 A:G G A 10 0.530742010859516 0.438937968640093 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 155 140 295 72.734988316775 74.3038815203322 -1.56889320355722 T:C T C 10 0.530742010859516 0.861268331303337 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41292601 A/T 1 53 54 107 24.8706734244457 28.6600685864139 -3.78939516196821 A:T A T 10 0.530742010859516 0.498225758669528 ENSG00000167578:ENST00000357052:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000378307:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000419646:exon_41292570_41292665:RAB4B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41858659 G/A 1 44 41 85 20.6473515221813 21.7604224452402 -1.11307092305886 A:G G A 10 0.530742010859516 0.828603903238739 ENSG00000105329:ENST00000221930:exon_41858595_41859816:TGFB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 18 15 33 8.44664380452871 7.96113016289274 0.485513641635972 A:T:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41916547 C/T 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 T:C C T 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41916542_41916721:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41916542_41916721:BCKDHA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41920010 T/C 1 10 15 25 4.69257989140484 7.96113016289274 -3.2685502714879 T:C T C 10 0.530742010859516 0.230326542779026 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41919954_41920062:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41919954_41920062:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41919954_41920062:BCKDHA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 19 13 32 8.9159017936692 6.89964614117371 2.01625565249549 T:C C T 10 0.530742010859516 0.595906631158956 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 43 48 91 20.1780935330408 25.4756165212568 -5.29752298821596 A:G A G 10 0.530742010859516 0.293901077783692 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 41939253 C/T 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 T:C C T 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 42585344 C/T 1 8 16 24 3.75406391312387 8.49187217375226 -4.73780826062838 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0650116997860802 ENSG00000105732:ENST00000222339:exon_42582739_42585717:ZNF574;ENSG00000105732:ENST00000359044:exon_42582739_42585717:ZNF574 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44047825 T/G 1 21 3 24 9.85441777195016 1.59222603257855 8.26219173937162 T:G T G 10 0.530742010859516 0.000677565564071298 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44047764_44047839:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44047764_44047839:XRCC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44096772 C/T 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000167378:ENST00000422989:exon_44088521_44097519:IRGQ;ENSG00000167378:ENST00000300809:exon_44096026_44097519:IRGQ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44352639 G/A 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000159882:ENST00000324461:exon_44351091_44353307:ZNF230 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 5 12 17 2.34628994570242 6.36890413031419 -4.02261418461177 A:G A G 10 0.530742010859516 0.055331757696956 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44536815 G/A 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000159885:ENST00000391960:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000187879:exon_44535970_44537260:ZNF222;ENSG00000159885:ENST00000251272:exon_44535970_44537260:ZNF222 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 10 10 20 4.69257989140484 5.30742010859516 -0.61484021719032 A:G A G 10 0.530742010859516 0.825566833685384 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 13 8 21 6.10035385882629 4.24593608687613 1.85441777195016 A:T A T 10 0.530742010859516 0.514112372853973 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 7 17 24 3.28480592398339 9.02261418461177 -5.73780826062838 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0233654752960438 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44674204 T/C 1 3 10 13 1.40777396742145 5.30742010859516 -3.89964614117371 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0477959817043024 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44674188_44674248:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000413984:exon_44674188_44674248:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44674188_44674248:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000300823:exon_44674188_44674248:ZNF226 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44680345 T/C 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44680489 G/A 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G G A 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44680990 C/T 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44740602 G/A 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 44740713 C/T 1 11 11 22 5.16183788054532 5.83816211945468 -0.676324238909352 T:C C T 10 0.530742010859516 0.832742756726426 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 20 16 36 9.38515978280968 8.49187217375226 0.893287609057424 A:T:C T C 10 0.530742010859516 0.86782286402883 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45495915 C/T 1 13 27 40 6.10035385882629 14.3300342932069 -8.22968043438064 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0107005206546506 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45496105 G/A 1 35 29 64 16.4240296199169 15.391518314926 1.03251130499098 A:G G A 10 0.530742010859516 0.803942100201889 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45579515 G/T 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:G G T 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45579334_45579688:ZNF296 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45668213 C/G 1 70 58 128 32.8480592398339 30.7830366298519 2.06502260998195 C:G C G 10 0.530742010859516 0.724214055007532 ENSG00000007255:ENST00000006275:exon_45668111_45668228:TRAPPC6A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 25 6 31 11.7314497285121 3.1844520651571 8.546997663355 T:C:G T G 10 0.530742010859516 0.00191058355076626 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45860917 C/T 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45860888_45860957:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45860888_45860957:ERCC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 A:C C A 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 45923632 G/A 1 11 17 28 5.16183788054532 9.02261418461177 -3.86077630406645 A:G G A 10 0.530742010859516 0.184567835501249 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 46215605 G/A 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000177051:ENST00000317683:exon_46213887_46216831:FBXO46 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 16 9 25 7.50812782624774 4.77667809773564 2.7314497285121 T:C T C 10 0.530742010859516 0.319678398805541 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 46387860 C/T 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:C C T 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 C:G C G 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 47225265 G/A 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47225243_47225329:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47225243_47225329:STRN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 47278859 C/G 1 40 65 105 18.7703195656194 34.4982307058685 -15.7279111402492 C:G C G 10 0.530742010859516 0.00232972382244998 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 47278988 C/T 1 58 67 125 27.2169633701481 35.5597147275876 -8.3427513574395 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.151481044113995 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 48254339 C/T 1 192 153 345 90.0975339149729 81.2035276615059 8.89400625346698 T:C C T 10 0.530742010859516 0.359213800217233 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254165_48254364:GLTSCR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 48551546 A/T 1 22 30 52 10.3236757610906 15.9222603257855 -5.59858456469483 A:T A T 10 0.530742010859516 0.127901594521028 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48551104_48551645:PLA2G4C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 48953774 C/T 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48953570_48953783:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48953570_48953783:GRWD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 48977479 C/T 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 T:C C T 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48977439_48977532:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48977439_48977587:CYTH2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 49340772 C/G 1 11 2 13 5.16183788054532 1.06148402171903 4.10035385882629 C:G C G 10 0.530742010859516 0.0256582468175808 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49340355_49340808:PLEKHA4;ENSG00000105559:ENST00000355496:exon_49340355_49340808:PLEKHA4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 49416446 A/G 1 15 18 33 7.03886983710726 9.55335619547129 -2.51448635836403 A:G A G 10 0.530742010859516 0.389598753821416 ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49416268_49416453:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49416268_49416453:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000452087:exon_49416268_49416453:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49416268_49416453:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000424608:exon_49416268_49416453:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000465524:exon_49416268_49416453:NUCB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 49425576 C/T 1 29 14 43 13.608481685074 7.43038815203322 6.17809353304081 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0667692270498517 ENSG00000104805:ENST00000405315:exon_49425575_49426528:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000407032:exon_49425575_49425722:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000485798:exon_49425575_49426201:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000263273:exon_49425575_49426522:NUCB1;ENSG00000104805:ENST00000492367:exon_49425575_49426525:NUCB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 49472833 C/T 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 T:C C T 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49471382_49472868:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49471387_49472868:GYS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 49514275 G/A 1 100 88 188 46.9257989140484 46.7052969556374 0.220501958410992 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49514256_49514350:RUVBL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 49949589 A/T 1 10 8 18 4.69257989140484 4.24593608687613 0.446643804528712 A:T A T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 49967402 G/A 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:G G A 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967384_49967520:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967384_49967520:ALDH16A1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 10 6 16 4.69257989140484 3.1844520651571 1.50812782624774 T:G T G 10 0.530742010859516 0.617940633683685 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 4 11 15 1.87703195656194 5.83816211945468 -3.96113016289274 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0665477231595873 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50393080 G/A 1 129 200 329 60.5342805991224 106.148402171903 -45.6141215727808 A:G G A 10 0.530742010859516 5.68364537557261e-07 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 1 23 10 33 10.7929337502311 5.30742010859516 5.48551364163597 C:G C G 10 0.530742010859516 0.0795484779755619 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50412650 C/T 1 14 11 25 6.56961184796678 5.83816211945468 0.7314497285121 T:C C T 10 0.530742010859516 0.842799633797048 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 19 28 47 8.9159017936692 14.8607763040664 -5.94487451039725 T:C T C 10 0.530742010859516 0.106966674415218 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50550256 G/A 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G A G 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50905347 G/A 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905256_50905381:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905256_50905381:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905256_50905381:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905256_50905381:POLD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50916772 T/C 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50916683_50916778:POLD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 28 11 39 13.1392236959336 5.83816211945468 7.30106157647888 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0236595919723323 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 227 296 523 106.52156353489 157.099635214417 -50.5780716795269 T:C:G C T 10 0.530742010859516 1.11405418173859e-05 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 193 264 457 90.5667919041134 140.115890866912 -49.5490989627988 A:G G A 10 0.530742010859516 4.0322157566613e-06 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 33 55 88 15.485513641636 29.1908105972734 -13.7052969556374 C:G C G 10 0.530742010859516 0.0037790533238054 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 51323501 A/G 1 45 68 113 21.1166095113218 36.0904567384471 -14.9738472271253 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00602494079495348 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 51869563 C/G 1 62 61 123 29.09399532671 32.3752626624305 -3.28126733572046 C:G C G 10 0.530742010859516 0.58819826874321 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51869524_51869672:ETFB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 52618044 C/T 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C C T 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000204611:ENST00000330123:exon_52617654_52620277:ZNF616 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 52714579 C/A 1 22 21 43 10.3236757610906 11.1455822280498 -0.821906466959188 A:C C A 10 0.530742010859516 0.878917650914021 ENSG00000105568:ENST00000454220:exon_52714513_52714591:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000322088:exon_52714513_52714745:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000490868:exon_52714513_52714736:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000468280:exon_52714513_52714947:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000462990:exon_52714513_52714745:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000473455:exon_52714513_52714747:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000444322:exon_52714513_52714745:PPP2R1A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 54376927 C/T 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C C T 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000179820:ENST00000421337:exon_54376782_54377510:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000336967:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391770:exon_54376782_54379691:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000448420:exon_54376782_54377348:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000439000:exon_54376782_54377561:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391771:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391769:exon_54376782_54379689:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391768:exon_54376782_54377873:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000414489:exon_54376782_54377223:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000415619:exon_54376784_54377098:MYADM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 54621656 G/A 1 15 14 29 7.03886983710726 7.43038815203322 -0.391518314925964 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54621651_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445811:exon_54621628_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54621651_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54621651_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445124:exon_54621621_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000447810:exon_54621651_54621835:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54621651_54621835:PRPF31 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 12 21 33 5.63109586968581 11.1455822280498 -5.51448635836403 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0570131083543354 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 54696167 C/A 1 21 17 38 9.85441777195016 9.02261418461177 0.831803587338392 A:C C A 10 0.530742010859516 0.871431582608768 ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695967_54696206:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695967_54696224:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695967_54696224:TSEN34 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 19 30 49 8.9159017936692 15.9222603257855 -7.00635853211628 T:G T G 10 0.530742010859516 0.0616688472509851 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 8 14 22 3.75406391312387 7.43038815203322 -3.67632423890935 C:G C G 10 0.530742010859516 0.136600125045471 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 62 21 83 29.09399532671 11.1455822280498 17.9484130986602 T:C C T 10 0.530742010859516 6.22608985006337e-05 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 55742176 T/C 1 27 14 41 12.6699657067931 7.43038815203322 5.23957755475984 T:C T C 10 0.530742010859516 0.117846174802978 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55742142_55742252:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55742142_55742252:PPP6R1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 55751238 A/C 1 12 20 32 5.63109586968581 10.6148402171903 -4.98374434750451 A:C A C 10 0.530742010859516 0.109483713909064 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55751194_55751279:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55751194_55751279:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55751194_55751279:PPP6R1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 55899214 A/G 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 0.53092560297019 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 55899434 G/A 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 55967743 G/C 1 34 31 65 15.9547716307765 16.453002336645 -0.49823070586854 C:G G C 10 0.530742010859516 0.90189094734076 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55967716_55967856:ISOC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 40 21 61 18.7703195656194 11.1455822280498 7.62473733756952 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0545101026731373 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 56162712 G/C 1 16 21 37 7.50812782624774 11.1455822280498 -3.63745440180209 C:G G C 10 0.530742010859516 0.251629965402401 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 23 18 41 10.7929337502311 9.55335619547129 1.23957755475984 T:C C T 10 0.530742010859516 0.755736700399185 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 56185320 T/A 1 63 61 124 29.5632533158505 32.3752626624305 -2.81200934657998 A:T T A 10 0.530742010859516 0.653113648085697 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56185300_56186081:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56185300_56186081:U2AF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 56200285 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000063245:ENST00000085079:exon_56200236_56200360:EPN1;ENSG00000063245:ENST00000270460:exon_56200236_56200360:EPN1;ENSG00000063245:ENST00000411543:exon_56200236_56200360:EPN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 56733304 T/C 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C T C 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000131848:ENST00000254165:exon_56732681_56733695:ZSCAN5A;ENSG00000131848:ENST00000391713:exon_56732681_56733695:ZSCAN5A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58132216 A/G 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G A G 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58152756 T/C 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C T C 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 14 6 20 6.56961184796678 3.1844520651571 3.38515978280968 T:C T C 10 0.530742010859516 0.178184035682023 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58231807 A/G 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:G A G 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231782_58231850:ZNF671 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58232263 A/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G A G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 19 19 38 8.9159017936692 10.0840982063308 -1.16819641266161 A:G A G 10 0.530742010859516 0.746791049271264 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58858814 G/A 1 13 25 38 6.10035385882629 13.2685502714879 -7.16819641266161 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0225178867546813 ENSG00000121410:ENST00000263100:exon_58858719_58859006:A1BG;ENSG00000121410:ENST00000453054:exon_58858719_58859006:A1BG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 1 6 9 15 2.8155479348429 4.77667809773564 -1.96113016289274 A:C A C 10 0.530742010859516 0.438937968640093 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 58991781 C/T 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 19 59010593 A/G 1 5 9 14 2.34628994570242 4.77667809773564 -2.43038815203322 A:G A G 10 0.530742010859516 0.284091899937015 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 264985 G/T 1 43 24 67 20.1780935330408 12.7378082606284 7.44028527241243 T:G G T 10 0.530742010859516 0.0858637820364794 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_264869_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_264872_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_264893_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_264900_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_264900_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_264916_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_264919_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_264926_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000480874:exon_264936_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_264963_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_264965_265007:ACP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 82 72 154 38.4791551095197 38.2134247818852 0.265730327634536 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 3391452 C/A 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:C C A 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 T T 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 3502690 T/C 1 22 11 33 10.3236757610906 5.83816211945468 4.48551364163597 T:C T C 10 0.530742010859516 0.161947283390806 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 9588338 T/C 1 28 23 51 13.1392236959336 12.2070662497689 0.932157446164684 T:C T C 10 0.530742010859516 0.888649963666829 ENSG00000119203:ENST00000238112:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000427001:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000460593:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000489629:exon_9588327_9588479:CPSF3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 78 87 165 36.6021231529578 46.1745549447779 -9.57243179182014 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.138955780090701 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 24 26 50 11.2621917393716 13.7992922823474 -2.5371005429758 T:C C T 10 0.530742010859516 0.48237380718594 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 14 10 24 6.56961184796678 5.30742010859516 1.26219173937162 T:C C T 10 0.530742010859516 0.685182392195028 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 15330494 G/A 1 12 8 20 5.63109586968581 4.24593608687613 1.38515978280968 A:G G A 10 0.530742010859516 0.655918359081295 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15330388_15330527:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15330388_15330527:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15330388_15330527:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15330388_15330527:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000433283:exon_15330388_15330527:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000423602:exon_15330388_15330521:NBAS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 15372562 C/T 1 11 7 18 5.16183788054532 3.71519407601661 1.44664380452871 T:C C T 10 0.530742010859516 0.63827752360053 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 15378808 C/G 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15378592_15378810:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15378592_15378810:NBAS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 17962928 A/G 1 14 8 22 6.56961184796678 4.24593608687613 2.32367576109065 A:G A G 10 0.530742010859516 0.39515096925501 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 24300424 G/A 1 21 18 39 9.85441777195016 9.55335619547129 0.301061576478876 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000115129:ENST00000335934:exon_24300303_24300631:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000238721:exon_24300305_24300631:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000313482:exon_24300306_24300631:TP53I3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 T:C T C 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 27260469 G/A 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 27262944 G/A 1 26 28 54 12.2007077176526 14.8607763040664 -2.66006858641386 A:G G A 10 0.530742010859516 0.497350292866822 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000456401:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000444135:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000434544:exon_27262898_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460665:exon_27262229_27263066:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000469445:exon_27262788_27263364:TMEM214 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 27322606 T/C 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 A:T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000138030:ENST00000260599:exon_27322533_27323619:KHK;ENSG00000138030:ENST00000260598:exon_27322533_27323640:KHK;ENSG00000138030:ENST00000490823:exon_27322533_27322769:KHK;ENSG00000138030:ENST00000464371:exon_27322533_27322837:KHK;ENSG00000138028:ENST00000440612:exon_27321757_27322708:CGREF1;ENSG00000138028:ENST00000402550:exon_27321757_27322708:CGREF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 14 9 23 6.56961184796678 4.77667809773564 1.79293375023113 T:G G T 10 0.530742010859516 0.533738323924712 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 27439401 T/C 1 69 67 136 32.3788012506934 35.5597147275876 -3.18091347689418 T:C T C 10 0.530742010859516 0.606832643423101 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439391_27439488:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439391_27439488:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439242_27439488:C2orf28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G A G 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 27865325 A/G 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27865296_27865386:ZNF512;ENSG00000198522:ENST00000515877:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000503738:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000424214:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000407583:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000461249:exon_27865296_27865386:GPN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 27883958 C/T 1 2 10 12 0.938515978280968 5.30742010859516 -4.36890413031419 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0170869766127310 ENSG00000119760:ENST00000337768:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000406540:exon_27883851_27885148:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000405491:exon_27883851_27884468:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000404798:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000464789:exon_27883629_27884468:SUPT7L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 29129418 A/G 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 12 16 28 5.63109586968581 8.49187217375226 -2.86077630406645 T:C T C 10 0.530742010859516 0.344453418961431 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 33787815 C/T 1 55 28 83 25.8091894027266 14.8607763040664 10.9484130986602 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0203565354173446 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33787796_33789817:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33787796_33789817:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33787796_33789798:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33787796_33789672:RASGRP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 33809835 C/A 1 24 21 45 11.2621917393716 11.1455822280498 0.11660951132178 A:C C A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000119812:ENST00000238823:exon_33808725_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000395190:exon_33808728_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000441530:exon_33808728_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000474985:exon_33808729_33810511:FAM98A;ENSG00000119812:ENST00000403368:exon_33808737_33810764:FAM98A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 37215860 A/G 1 7 1 8 3.28480592398339 0.530742010859516 2.75406391312387 A:G A G 10 0.530742010859516 0.074454966322071 ENSG00000008869:ENST00000425467:exon_37215789_37216002:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37215789_37216002:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37215789_37216002:HEATR5B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 67 60 127 31.4402852724124 31.844520651571 -0.404235379158532 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 37454998 A/G 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37454687_37456179:CEBPZ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:G G A 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 42990522 C/T 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:C C T 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 43518843 A/G 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43518835_43519361:THADA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 12 15 27 5.63109586968581 7.96113016289274 -2.33003429320693 T:C T C 10 0.530742010859516 0.441876209223122 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 10 7 17 4.69257989140484 3.71519407601661 0.977385815388228 T:C T C 10 0.530742010859516 0.809001678476656 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 47287957 C/T 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47287908_47288095:TTC7A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 14 11 25 6.56961184796678 5.83816211945468 0.7314497285121 A:G A G 10 0.530742010859516 0.842799633797048 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 48030651 T/C 1 12 8 20 5.63109586968581 4.24593608687613 1.38515978280968 T:C T C 10 0.530742010859516 0.655918359081295 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48030559_48030824:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48030559_48030824:MSH6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 55462523 G/A 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 55470115 C/T 1 14 5 19 6.56961184796678 2.65371005429758 3.9159017936692 T:C C T 10 0.530742010859516 0.105437071261094 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55470076_55470216:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55470076_55470216:MTIF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 58350340 T/C 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58350236_58350368:VRK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 62106028 A/G 1 16 29 45 7.50812782624774 15.391518314926 -7.88339048867822 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0240874344380114 ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62106004_62106146:CCT4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G G A 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 64800184 T/C 1 19 22 41 8.9159017936692 11.6763242389094 -2.76042244524016 T:C T C 10 0.530742010859516 0.435415355527369 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64800080_64800202:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64800080_64800202:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64800080_64800202:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64800080_64800202:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64800080_64800202:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409183:exon_64800080_64800202:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000487769:exon_64800080_64800202:AFTPH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 4 19 23 1.87703195656194 10.0840982063308 -8.20706624976887 A:G G A 10 0.530742010859516 0.000585092578030342 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 67631800 A/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G A G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 68607947 G/T 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:G G T 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607855_68608036:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607855_68608036:PLEK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 18 17 35 8.44664380452871 9.02261418461177 -0.57597038008306 C:G G C 10 0.530742010859516 0.866987920675362 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 68622990 T/C 1 25 20 45 11.7314497285121 10.6148402171903 1.11660951132178 T:C T C 10 0.530742010859516 0.767260657141718 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 69049956 G/A 1 7 25 32 3.28480592398339 13.2685502714879 -9.98374434750451 A:G G A 10 0.530742010859516 0.000526484881608304 ENSG00000163219:ENST00000409202:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000295381:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000467265:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409030:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409220:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000482106:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497259:exon_69049472_69050004:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000479844:exon_69049472_69050004:ARHGAP25 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 71305456 C/T 1 156 68 224 73.2042463059155 36.0904567384471 37.1137895674684 T:C C T 10 0.530742010859516 5.79634138309911e-07 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 71305660 C/T 1 78 23 101 36.6021231529578 12.2070662497689 24.3950569031889 T:C C T 10 0.530742010859516 6.6612216359127e-07 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 71305661 C/A 1 82 27 109 38.4791551095197 14.3300342932069 24.1491208163128 A:C C A 10 0.530742010859516 2.85290360229078e-06 ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:C A C 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 7 15 22 3.28480592398339 7.96113016289274 -4.67632423890935 T:G G T 10 0.530742010859516 0.0544756353537649 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 11 15 26 5.16183788054532 7.96113016289274 -2.79929228234742 A:G G A 10 0.530742010859516 0.327177533704281 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 73466786 C/T 1 13 11 24 6.10035385882629 5.83816211945468 0.262191739371616 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000135624:ENST00000471927:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000469844:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473197:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000492253:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73466771_73467275:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73466771_73466924:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000482064:exon_73466771_73466924:CCT7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 73477527 C/T 1 180 162 342 84.4664380452871 85.9802057592416 -1.51376771395446 A:T:C C T 10 0.530742010859516 0.871074972590734 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 73830399 C/G 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 C:G C G 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73830368_73830431:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73830368_73830431:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73830368_73830986:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73830368_73830431:ALMS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 9 5 14 4.22332190226436 2.65371005429758 1.56961184796678 A:G A G 10 0.530742010859516 0.436312573490878 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 74057995 T/C 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000124356:ENST00000339566:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000409707:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000452725:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000432295:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000424659:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394073:exon_74057972_74058186:STAMBP;ENSG00000124356:ENST00000394070:exon_74057972_74058186:STAMBP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 123 81 204 57.7187326642795 42.9901028796208 14.7286297846587 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0417965448622139 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 14 7 21 6.56961184796678 3.71519407601661 2.85441777195016 A:T T A 10 0.530742010859516 0.275274657227659 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 75893101 G/C 1 15 20 35 7.03886983710726 10.6148402171903 -3.57597038008306 C:G G C 10 0.530742010859516 0.239841750921707 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000427862:exon_75893055_75893179:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75893055_75893179:C2orf3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 85836668 C/T 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C C T 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000168887:ENST00000306336:exon_85836558_85836709:C2orf68;ENSG00000168887:ENST00000420686:exon_85836558_85836709:C2orf68;ENSG00000168887:ENST00000423181:exon_85836558_85836709:C2orf68 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 86385668 T/C 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:C T C 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 86385812 T/C 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C T C 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 86389114 G/A 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:G G A 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86389099_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86389075_86389202:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86389099_86389202:IMMT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 86831407 C/T 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C C T 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000239305:ENST00000237455:exon_86830516_86832541:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000472030:exon_86830523_86832541:RNF103 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 96919521 C/T 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000135956:ENST00000258439:exon_96916312_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000432959:exon_96917398_96919853:TMEM127 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 17 14 31 7.97738581538823 7.43038815203322 0.546997663355004 A:G G A 10 0.530742010859516 0.85964976592811 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 4 18 22 1.87703195656194 9.55335619547129 -7.67632423890935 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00103518030936863 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 99804642 T/C 1 5 11 16 2.34628994570242 5.83816211945468 -3.49187217375226 T:C T C 10 0.530742010859516 0.130339318751546 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99804640_99804720:MRPL30 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 12 13 25 5.63109586968581 6.89964614117371 -1.2685502714879 A:G G A 10 0.530742010859516 0.690401884163373 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 99980014 A/G 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 0.53092560297019 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 101620766 C/G 1 10 7 17 4.69257989140484 3.71519407601661 0.977385815388228 C:G C G 10 0.530742010859516 0.809001678476656 ENSG00000071082:ENST00000409000:exon_101620620_101621066:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000419276:exon_101620620_101620823:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000409711:exon_101620620_101622829:RPL31 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 101898412 G/C 1 9 1 10 4.22332190226436 0.530742010859516 3.69257989140484 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0238276980671328 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 105665808 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000135972:ENST00000258455:exon_105665629_105665808:MRPS9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 109400084 C/T 1 65 80 145 30.5017692941315 42.4593608687613 -11.9575915746298 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0552917777775881 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109400052_109402267:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109400052_109400561:RANBP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 111413449 T/C 1 9 2 11 4.22332190226436 1.06148402171903 3.16183788054532 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0709255332758363 ENSG00000169679:ENST00000409311:exon_111413316_111413493:BUB1;ENSG00000169679:ENST00000302759:exon_111413316_111413493:BUB1;ENSG00000169679:ENST00000466333:exon_111413316_111413493:BUB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 113346512 A/C 1 50 65 115 23.4628994570242 34.4982307058685 -11.0353312488443 A:C A C 10 0.530742010859516 0.0401636757343647 ENSG00000125611:ENST00000324913:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000454841:exon_113346443_113346617:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000409719:exon_113343777_113346852:CHCHD5;ENSG00000125611:ENST00000469030:exon_113346443_113346617:CHCHD5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 118577278 G/A 1 112 90 202 52.5568947837342 47.7667809773564 4.79011380637777 A:G G A 10 0.530742010859516 0.526125132794217 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118577225_118577368:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118577225_118577368:DDX18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 118583100 G/A 1 8 11 19 3.75406391312387 5.83816211945468 -2.0840982063308 A:G G A 10 0.530742010859516 0.366013294263512 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583023_118583175:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000461443:exon_118583023_118583559:DDX18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 22 18 40 10.3236757610906 9.55335619547129 0.77031956561936 T:C T C 10 0.530742010859516 0.874806684373545 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 120078731 A/G 1 12 4 16 5.63109586968581 2.12296804343806 3.50812782624774 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0856474633351484 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 9 4 13 4.22332190226436 2.12296804343806 2.10035385882629 T:C T C 10 0.530742010859516 0.278656458173804 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 120734635 A/T 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:T A T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000088179:ENST00000263708:exon_120734560_120741394:PTPN4;ENSG00000088179:ENST00000430976:exon_120734560_120735037:PTPN4;ENSG00000088179:ENST00000441089:exon_120734533_120734659:PTPN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 18 13 31 8.44664380452871 6.89964614117371 1.546997663355 A:G A G 10 0.530742010859516 0.595494221120277 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 128249590 G/T 1 7 10 17 3.28480592398339 5.30742010859516 -2.02261418461177 T:C:G G T 10 0.530742010859516 0.342925565397055 ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000455721:exon_128249547_128249664:IWS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 128262732 G/C 1 8 17 25 3.75406391312387 9.02261418461177 -5.2685502714879 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0438949573338673 ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128262260_128263328:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128262260_128263115:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000495369:exon_128262574_128263328:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000409725:exon_128262616_128263328:IWS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 128945152 C/T 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000418197:exon_128945023_128945188:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000465836:exon_128945023_128945188:UGGT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 132287230 C/T 1 17 6 23 7.97738581538823 3.1844520651571 4.79293375023113 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0585870990813324 ENSG00000163040:ENST00000465939:exon_132287220_132287753:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132287220_132287264:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000454549:exon_132287220_132287264:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132287220_132287264:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000468650:exon_132287220_132287264:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000478665:exon_132287220_132287322:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132286754_132287264:CCDC74A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 132290464 G/A 1 49 21 70 22.9936414678837 11.1455822280498 11.8480592398339 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00550446493249249 ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132290437_132290514:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290437_132290510:CCDC74A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 135893440 T/C 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 T:C T C 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 44 24 68 20.6473515221813 12.7378082606284 7.90954326155291 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0676477344198423 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 160104988 T/C 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C T C 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 160105007 A/G 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 163123704 C/T 1 72 79 151 33.7865752181148 41.9286188579018 -8.14204363978692 T:C C T 10 0.530742010859516 0.192579343900367 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123589_163123889:IFIH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 36 32 68 16.8932876090574 16.9837443475045 -0.090456738447088 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 163128883 G/A 1 46 41 87 21.5858675004623 21.7604224452402 -0.174554944777892 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 169732622 C/G 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 C:G C G 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000152253:ENST00000479309:exon_169732582_169732686:SPC25;ENSG00000152253:ENST00000282074:exon_169732582_169732686:SPC25 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 169952233 T/C 1 33 6 39 15.485513641636 3.1844520651571 12.3010615764789 T:C T C 10 0.530742010859516 6.7953322217027e-05 ENSG00000073737:ENST00000419279:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000327239:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000357546:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000428522:exon_169952054_169952672:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000421653:exon_169952054_169952277:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000432060:exon_169952054_169952430:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000436483:exon_169952054_169952677:DHRS9;ENSG00000073737:ENST00000412271:exon_169952054_169952677:DHRS9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 170460536 A/C 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:C A C 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530152:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000462903:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000418888:exon_170460536_170460612:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000414307:exon_170460536_170460612:PPIG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 170493480 G/A 1 212 207 419 99.4826936977826 109.86359624792 -10.3809025501372 A:G G A 10 0.530742010859516 0.327646424620467 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 171822466 C/T 1 18 21 39 8.44664380452871 11.1455822280498 -2.69893842352112 T:C C T 10 0.530742010859516 0.424639611079918 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 172373843 G/C 0 7751 0 7751 3637.21867382789 0 3637.21867382789 G G 10 0.530742010859516 4.94065645841247e-324 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 175216365 G/A 1 18 19 37 8.44664380452871 10.0840982063308 -1.63745440180209 A:G G A 10 0.530742010859516 0.62389627643294 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175216347_175216453:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175216347_175216453:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175216347_175216453:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175216347_175216453:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000464393:exon_175216347_175216691:CIR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 175939367 A/G 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 A:G A G 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000115966:ENST00000264110:exon_175936978_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000345739:exon_175936978_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000426833:exon_175936978_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000409437:exon_175936993_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000409635:exon_175939008_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000487334:exon_175939122_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000428760:exon_175939202_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000392544:exon_175939233_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000417080:exon_175939233_175939595:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000456655:exon_175939233_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000421438:exon_175939233_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000429579:exon_175939233_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000415955:exon_175939233_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000409499:exon_175939233_175939563:ATF2;ENSG00000115966:ENST00000392543:exon_175939233_175939563:ATF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 62 63 125 29.09399532671 33.4367466841495 -4.3427513574395 A:T A T 10 0.530742010859516 0.473701543252842 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 181927573 C/T 1 27 26 53 12.6699657067931 13.7992922823474 -1.12932657555435 T:C C T 10 0.530742010859516 0.784355536909884 ENSG00000170035:ENST00000410114:exon_181927518_181927756:UBE2E3;ENSG00000170035:ENST00000392415:exon_181927518_181928150:UBE2E3;ENSG00000170035:ENST00000410062:exon_181927518_181928168:UBE2E3;ENSG00000170035:ENST00000305934:exon_181927518_181928152:UBE2E3;ENSG00000170035:ENST00000409247:exon_181927518_181928168:UBE2E3;ENSG00000170035:ENST00000463105:exon_181927518_181927647:UBE2E3;ENSG00000170035:ENST00000485597:exon_181927518_181927768:UBE2E3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 182395345 G/A 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182395251_182395376:ITGA4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 21 6 27 9.85441777195016 3.1844520651571 6.66996570679307 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0112923037175008 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 185801988 C/G 0 0 19 19 0 10.0840982063308 -10.0840982063308 G C G 10 0.530742010859516 5.71244234195419e-07 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 190531615 T/C 1 10 9 19 4.69257989140484 4.77667809773564 -0.084098206330804 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 190532214 G/A 1 14 15 29 6.56961184796678 7.96113016289274 -1.39151831492596 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.710650929425754 ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 191064751 T/C 1 12 11 23 5.63109586968581 5.83816211945468 -0.207066249768868 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 191841606 T/C 1 273 235 508 128.107431035352 124.724372551986 3.38305848336587 T:C T C 10 0.530742010859516 0.789739641275091 ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191841566_191841751:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191841566_191841751:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000423282:exon_191841566_191841648:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392322:exon_191841566_191841751:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000452281:exon_191841566_191841751:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392323:exon_191841566_191841751:STAT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 197004439 A/G 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197004344_197004523:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197004344_197004523:STK17B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:T T A 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 197597220 A/G 1 8 2 10 3.75406391312387 1.06148402171903 2.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.116019943610998 ENSG00000144395:ENST00000389175:exon_197597170_197597530:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000272831:exon_197597170_197597530:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000431807:exon_197597170_197597530:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000424427:exon_197597170_197597516:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000409270:exon_197597170_197597522:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000448409:exon_197597170_197597517:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000483877:exon_197597150_197597475:CCDC150 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 198353801 G/A 1 235 217 452 110.275627448014 115.171016356515 -4.89538890850123 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.671527248270627 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198353726_198353971:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198353726_198353971:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000491249:exon_198353726_198353971:HSPD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 198358148 T/C 1 30 15 45 14.0777396742145 7.96113016289274 6.11660951132178 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0737810933426575 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198358048_198358216:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198358048_198358216:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000482167:exon_198358044_198358216:HSPD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 201436555 A/G 1 26 20 46 12.2007077176526 10.6148402171903 1.58586750046226 A:G A G 10 0.530742010859516 0.660822184375524 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 5 71 76 2.34628994570242 37.6826827710256 -35.3363928253232 A:G G A 10 0.530742010859516 6.70813713013199e-18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 22 33 55 10.3236757610906 17.514486358364 -7.19081059727338 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0584991817404203 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 207459467 C/T 1 8 2 10 3.75406391312387 1.06148402171903 2.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.116019943610998 ENSG00000114948:ENST00000264377:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000374415:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000374416:exon_207459461_207459629:ADAM23;ENSG00000114948:ENST00000431817:exon_207459461_207459629:ADAM23 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 219266385 G/A 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000494067:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000496785:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000431127:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219266287_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219265890_219266435:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219266287_219266435:CTDSP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 9 24 33 4.22332190226436 12.7378082606284 -8.51448635836403 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00447140571115786 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 50 42 92 23.4628994570242 22.2911644560997 1.17173500092453 T:C T C 10 0.530742010859516 0.835113860379044 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 219533378 T/C 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 T:C T C 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 20 10 30 9.38515978280968 5.30742010859516 4.07773967421452 A:G G A 10 0.530742010859516 0.147123291936050 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 21 10 31 9.85441777195016 5.30742010859516 4.546997663355 A:G A G 10 0.530742010859516 0.108573848204212 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 14 14 28 6.56961184796678 7.43038815203322 -0.860776304066448 A:G A G 10 0.530742010859516 0.850388610583438 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:G A G 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220047369 G/T 1 16 12 28 7.50812782624774 6.36890413031419 1.13922369593355 T:G G T 10 0.530742010859516 0.708660470046962 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220047370 A/T 1 16 12 28 7.50812782624774 6.36890413031419 1.13922369593355 A:T A T 10 0.530742010859516 0.708660470046962 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220074658 T/C 1 34 11 45 15.9547716307765 5.83816211945468 10.1166095113218 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00253031812903979 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220074490_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000487380:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000485773:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000497882:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000295750:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000443805:exon_220074498_220074768:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220074494_220074768:ATG9A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220085845 A/G 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 A:G A G 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220100503 G/A 1 24 12 36 11.2621917393716 6.36890413031419 4.89328760905742 A:G G A 10 0.530742010859516 0.132025770173196 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100430_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000483188:exon_220100430_220100523:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100367_220100597:ANKZF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220100816 C/T 1 49 23 72 22.9936414678837 12.2070662497689 10.7865752181148 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0126832663299130 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220100732_220100817:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000460966:exon_220100732_220101373:ANKZF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 220115434 G/A 1 240 223 463 112.621917393716 118.355468421672 -5.73355102795591 A:G G A 10 0.530742010859516 0.60865832877774 ENSG00000127824:ENST00000248437:exon_220114433_220116045:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000392088:exon_220114433_220116045:TUBA4A;ENSG00000127824:ENST00000472881:exon_220115402_220115702:TUBA4A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 223423491 C/G 1 41 72 113 19.2395775547598 38.2134247818852 -18.9738472271253 C:G C G 10 0.530742010859516 0.000437644598175545 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 110 126 236 51.6183788054532 66.873493368299 -15.2551145628458 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0502956670172583 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 231036866 G/A 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000135899:ENST00000477068:exon_231036782_231036890:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231036782_231036890:SP110;ENSG00000135899:ENST00000483067:exon_231036782_231037028:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231036782_231036890:SP110 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 156 151 307 73.2042463059155 80.1420436397869 -6.93779733387142 A:G A G 10 0.530742010859516 0.45732366958271 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 29 38 67 13.608481685074 20.1681964126616 -6.55971472758757 T:C C T 10 0.530742010859516 0.112912946988371 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 231326081 T/C 1 35 25 60 16.4240296199169 13.2685502714879 3.15547934842904 T:C T C 10 0.530742010859516 0.440043355322883 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000466710:exon_231325977_231326129:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231326056_231326129:SP100 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 231326148 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 T:C C T 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 231740407 A/G 1 10 7 17 4.69257989140484 3.71519407601661 0.977385815388228 A:G A G 10 0.530742010859516 0.809001678476656 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231740336_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231740335_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231740335_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231740335_231740445:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000335005:exon_231740335_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231740335_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231740335_231740523:ITM2C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 232028396 A/G 1 47 33 80 22.0551254896027 17.514486358364 4.54063913123872 A:G A G 10 0.530742010859516 0.316165221351199 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232028349_232028441:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000431051:exon_232028349_232028441:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000467792:exon_232028349_232028424:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000477120:exon_232027807_232028441:PSMD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 11 5 16 5.16183788054532 2.65371005429758 2.50812782624774 T:C T C 10 0.530742010859516 0.316563144276864 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 239079279 G/A 1 25 22 47 11.7314497285121 11.6763242389094 0.055125489602748 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000132323:ENST00000254654:exon_239079042_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000465131:exon_239079043_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000463129:exon_239079043_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000466468:exon_239079050_239079317:ILKAP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242038942 T/G 1 5 11 16 2.34628994570242 5.83816211945468 -3.49187217375226 T:G T G 10 0.530742010859516 0.130339318751546 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000495694:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000401626:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242038811_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000475860:exon_242038583_242039309:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000434791:exon_242038814_242039309:MTERFD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 49 31 80 22.9936414678837 16.453002336645 6.54063913123872 A:C A C 10 0.530742010859516 0.147085435549258 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 20 10 30 9.38515978280968 5.30742010859516 4.07773967421452 A:G G A 10 0.530742010859516 0.147123291936050 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242435082 G/T 1 41 46 87 19.2395775547598 24.4141324995377 -5.17455494477789 T:G G T 10 0.530742010859516 0.283725313271208 ENSG00000115694:ENST00000316586:exon_242432089_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000403346:exon_242434432_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000401869:exon_242434434_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405883:exon_242434437_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000494699:exon_242434461_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000487962:exon_242434465_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000405585:exon_242434664_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000478403:exon_242434863_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000470438:exon_242434905_242435116:STK25;ENSG00000115694:ENST00000465009:exon_242434953_242435116:STK25 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 16 13 29 7.50812782624774 6.89964614117371 0.608481685074036 A:G A G 10 0.530742010859516 0.85457258194616 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242610172 A/G 1 16 12 28 7.50812782624774 6.36890413031419 1.13922369593355 A:G A G 10 0.530742010859516 0.708660470046962 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242609976_242610197:ATG4B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242610794 G/T 1 29 32 61 13.608481685074 16.9837443475045 -3.37526266243048 T:G G T 10 0.530742010859516 0.441898426263473 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 35 29 64 16.4240296199169 15.391518314926 1.03251130499098 A:G A G 10 0.530742010859516 0.803942100201889 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 2 242707213 G/A 1 17 12 29 7.97738581538823 6.36890413031419 1.60848168507404 A:G G A 10 0.530742010859516 0.58207060910907 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000486953:exon_242707128_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242707125_242707363:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242707125_242708231:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000468064:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000445308:exon_242707125_242707377:D2HGDH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 400219 C/T 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 C C 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 ENSG00000125826:ENST00000382214:exon_400202_400375:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000356286:exon_400202_400375:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000415942:exon_400202_400375:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000420170:exon_400202_400375:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000353660:exon_400202_400375:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400244:exon_400202_400375:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400243:exon_400202_400285:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000382181:exon_400202_400375:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000414880:exon_400202_400286:RBCK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 825678 T/C 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C T C 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 1551485 C/T 1 1 8 9 0.469257989140484 4.24593608687613 -3.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0156759284921385 ENSG00000101307:ENST00000381605:exon_1551451_1551783:SIRPB1;ENSG00000101307:ENST00000262929:exon_1551451_1551783:SIRPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 1551486 G/A 1 8 1 9 3.75406391312387 0.530742010859516 3.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0422661471759058 ENSG00000101307:ENST00000381605:exon_1551451_1551783:SIRPB1;ENSG00000101307:ENST00000262929:exon_1551451_1551783:SIRPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 2633563 C/T 1 11 3 14 5.16183788054532 1.59222603257855 3.56961184796678 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0638641251547832 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2633488_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633488_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633488_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633488_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633292_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633488_2633577:NOP56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 2635157 C/T 1 18 10 28 8.44664380452871 5.30742010859516 3.13922369593355 T:C C T 10 0.530742010859516 0.260435357884811 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 100 72 172 46.9257989140484 38.2134247818852 8.71237413216325 T:C T C 10 0.530742010859516 0.194369562333547 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 665 510 1175 312.056562778422 270.678425538353 41.3781372400687 T:C:G T C 10 0.530742010859516 0.0165075125957630 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 A:T:C C T 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 A:G A G 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 13782191 A/G 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 A:G A G 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000485738:exon_13782154_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000481249:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000464269:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479716:exon_13782132_13782329:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000487478:exon_13782189_13782329:C20orf7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 17610535 C/T 1 14 12 26 6.56961184796678 6.36890413031419 0.200707717652584 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17610468_17610606:RRBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 24944447 G/A 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 A:G G A 10 0.530742010859516 0.796007939511377 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24943581_24944658:C20orf3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 25282899 C/T 1 14 14 28 6.56961184796678 7.43038815203322 -0.860776304066448 T:C C T 10 0.530742010859516 0.850388610583438 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 25282944 A/G 1 8 13 21 3.75406391312387 6.89964614117371 -3.14558222804984 A:G A G 10 0.530742010859516 0.193285718012212 ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25282855_25282982:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25282855_25282982:ABHD12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 18 17 35 8.44664380452871 9.02261418461177 -0.57597038008306 C:G G C 10 0.530742010859516 0.866987920675362 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 30382315 A/G 1 25 17 42 11.7314497285121 9.02261418461177 2.70883554390033 A:G A G 10 0.530742010859516 0.442078727106759 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30382205_30382351:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30382205_30382351:TPX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 T:C C T 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 31967273 A/G 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000498525:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000496381:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000471264:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473791:exon_31967267_31967394:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 34091675 G/A 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 199 205 404 93.3823398389563 108.802112226201 -15.4197723872445 A:G A G 10 0.530742010859516 0.134723085430950 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 34843689 C/T 1 11 12 23 5.16183788054532 6.36890413031419 -1.20706624976887 T:C C T 10 0.530742010859516 0.678835837482447 ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34843500_34844855:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34843500_34844855:C20orf4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 35383233 T/C 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C T C 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000149636:ENST00000373745:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000426836:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000448110:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373733:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373750:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000480153:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373740:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000473615:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373734:exon_35383166_35383253:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000449595:exon_35383166_35383253:DSN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 42331457 A/G 1 8 33 41 3.75406391312387 17.514486358364 -13.7604224452402 A:G A G 10 0.530742010859516 1.32856588020154e-05 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 42680175 T/C 1 13 16 29 6.10035385882629 8.49187217375226 -2.39151831492596 T:C T C 10 0.530742010859516 0.457592678941988 ENSG00000124191:ENST00000341197:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000442881:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000423191:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372992:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372999:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000358131:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000348077:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000421416:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000435864:exon_42679946_42680185:TOX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 68 50 118 31.9095432615529 26.5371005429758 5.37244271857711 T:C C T 10 0.530742010859516 0.356593795211791 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 22 15 37 10.3236757610906 7.96113016289274 2.36254559819791 A:C A C 10 0.530742010859516 0.511169927441844 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 43530216 C/T 1 38 37 75 17.8318035873384 19.6374544018021 -1.8056508144637 T:C C T 10 0.530742010859516 0.728984370389203 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 43572217 T/C 1 18 6 24 8.44664380452871 3.1844520651571 5.26219173937162 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0394128718512755 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 44574432 C/G 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 C:G C G 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000100982:ENST00000372409:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000443130:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000479348:exon_44574350_44574522:PCIF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 44577991 G/T 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 T:G G T 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44577972_44578037:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44577972_44578037:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44577972_44578037:ZNF335 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 44578674 T/A 1 9 1 10 4.22332190226436 0.530742010859516 3.69257989140484 A:T T A 10 0.530742010859516 0.0238276980671328 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578605_44578708:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578605_44578708:ZNF335 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 48522330 G/A 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G G A 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 7 1 8 3.28480592398339 0.530742010859516 2.75406391312387 A:G G A 10 0.530742010859516 0.074454966322071 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 49493171 G/A 1 37 35 72 17.3625455981979 18.5759703800831 -1.21342478188515 A:G G A 10 0.530742010859516 0.813849905671193 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 49493195 A/G 1 47 56 103 22.0551254896027 29.7215526081329 -7.66642711853015 A:G A G 10 0.530742010859516 0.139090143357705 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 49508683 G/A 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 A:G G A 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 49509184 G/A 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G G A 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 55088404 A/G 1 21 32 53 9.85441777195016 16.9837443475045 -7.12932657555435 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0542878314916606 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55088371_55088484:C20orf43 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 55949770 G/A 1 24 19 43 11.2621917393716 10.0840982063308 1.17809353304081 A:G G A 10 0.530742010859516 0.76166637186299 ENSG00000101146:ENST00000395841:exon_55949663_55949857:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000371242:exon_55949663_55949857:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000527947:exon_55949663_55950162:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000492498:exon_55949663_55949857:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000395840:exon_55949663_55949857:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000462438:exon_55949663_55949857:RAE1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 56063440 G/A 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G G A 10 0.530742010859516 0.77948262403828 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 56185209 G/A 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 72 70 142 33.7865752181148 37.1519407601661 -3.36536554205127 A:G A G 10 0.530742010859516 0.614146263425608 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 57571818 G/C 1 105 107 212 49.2720888597508 56.7893951619682 -7.51730630221739 C:G G C 10 0.530742010859516 0.302963122496289 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 25 23 48 11.7314497285121 12.2070662497689 -0.475616521256768 A:C C A 10 0.530742010859516 0.886355053514055 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 58519926 G/A 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000196227:ENST00000358293:exon_58518995_58523735:C20orf177;ENSG00000196227:ENST00000360816:exon_58518995_58523735:C20orf177;ENSG00000196227:ENST00000469084:exon_58519451_58520055:C20orf177 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 60713332 A/G 1 174 195 369 81.6508901104442 103.494692117606 -21.8438020071614 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.0248058255989721 ENSG00000101182:ENST00000370873:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000442551:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000395567:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000484488:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000370861:exon_60713227_60713346:PSMA7;ENSG00000101182:ENST00000486193:exon_60713227_60713346:PSMA7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 61444356 G/A 1 29 30 59 13.608481685074 15.9222603257855 -2.31377864071144 A:G G A 10 0.530742010859516 0.602532776639523 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 61833801 G/A 1 14 7 21 6.56961184796678 3.71519407601661 2.85441777195016 A:G G A 10 0.530742010859516 0.275274657227659 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 61833873 C/T 1 14 9 23 6.56961184796678 4.77667809773564 1.79293375023113 T:C C T 10 0.530742010859516 0.533738323924712 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 62153190 C/T 1 218 186 404 102.298241632626 98.71801401987 3.58022761275555 T:C C T 10 0.530742010859516 0.72745603864568 ENSG00000125534:ENST00000370179:exon_62153021_62153559:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000370177:exon_62152865_62153291:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000473620:exon_62153021_62153302:PPDPF HGDP00476_parsed_pileup.txt . 20 62329655 C/T 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C C T 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62329633_62330051:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62329633_62330051:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62329633_62330033:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62329633_62330037:RTEL1;ENSG00000243509:ENST00000369996:exon_62329633_62330037:TNFRSF6B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 27264121 G/A 1 7 1 8 3.28480592398339 0.530742010859516 2.75406391312387 A:G G A 10 0.530742010859516 0.074454966322071 ENSG00000142192:ENST00000346798:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000354192:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000348990:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000357903:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000358918:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000359726:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000452232:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000440126:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000448388:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000439274:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000456209:exon_27264030_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000464867:exon_27264034_27264180:APP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 33642837 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000159055:ENST00000290130:exon_33642718_33642840:C21orf45;ENSG00000159055:ENST00000486363:exon_33642718_33642889:C21orf45 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:G T G 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 34721527 G/A 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 A:G G A 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34721397_34721596:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34721397_34721596:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34721397_34721596:IFNAR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 34721782 C/T 1 10 9 19 4.69257989140484 4.77667809773564 -0.084098206330804 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34721695_34721849:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34721695_34721849:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34721695_34721849:IFNAR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 34897131 C/T 1 15 14 29 7.03886983710726 7.43038815203322 -0.391518314925964 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000460305:exon_34897076_34897135:GART;ENSG00000159131:ENST00000467575:exon_34897076_34897307:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34896316_34897307:GART HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 34903085 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000361093:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000366093:exon_34903065_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000466882:exon_34903065_34903588:GART;ENSG00000159131:ENST00000497313:exon_34903016_34903190:GART;ENSG00000159131:ENST00000430874:exon_34903065_34903190:GART HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 34921942 A/G 1 304 274 578 142.654428698707 145.423310975507 -2.76888227680024 A:G A G 10 0.530742010859516 0.834987465381178 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34921782_34923769:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34921782_34923595:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 236 221 457 110.744885437154 117.293984399953 -6.54909896279881 A:G A G 10 0.530742010859516 0.542711104750631 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 35757787 C/T 1 7 14 21 3.28480592398339 7.43038815203322 -4.14558222804984 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0814681249897115 ENSG00000205670:ENST00000481710:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399292:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000489469:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000495363:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000474455:exon_35757776_35758931:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399295:exon_35757776_35757942:FAM165B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 36081794 G/T 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36081655_36081836:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36081655_36081836:CLIC6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 36088638 G/A 1 12 7 19 5.63109586968581 3.71519407601661 1.9159017936692 A:G G A 10 0.530742010859516 0.492140981990386 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36088619_36090525:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36088619_36090525:CLIC6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 37788576 C/T 1 6 10 16 2.8155479348429 5.30742010859516 -2.49187217375226 T:C C T 10 0.530742010859516 0.223009840929929 ENSG00000159259:ENST00000314103:exon_37788573_37789125:CHAF1B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 38444835 A/C 1 4 14 18 1.87703195656194 7.43038815203322 -5.55335619547129 A:C A C 10 0.530742010859516 0.00932147609371555 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38444734_38445111:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000479152:exon_38444734_38445023:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000430792:exon_38444734_38445297:PIGP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 10 5 15 4.69257989140484 2.65371005429758 2.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 0.315511031428908 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 10 5 15 4.69257989140484 2.65371005429758 2.03886983710726 A:G G A 10 0.530742010859516 0.315511031428908 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 16 7 23 7.50812782624774 3.71519407601661 3.79293375023113 C:G G C 10 0.530742010859516 0.143647341684462 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 17 16 33 7.97738581538823 8.49187217375226 -0.514486358364028 A:G A G 10 0.530742010859516 0.863566015067668 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 C:G G C 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 43 36 79 20.1780935330408 19.1067123909426 1.07138114209824 T:C C T 10 0.530742010859516 0.822737876234289 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 159 248 407 74.612020273337 131.62401869316 -57.011998419823 A:G A G 10 0.530742010859516 1.64578673435898e-08 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 42824733 G/A 1 399 232 631 187.233937667053 123.132146519408 64.1017911476454 A:T:C:G G A 10 0.530742010859516 3.02229720462233e-07 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 44270229 C/T 1 3 9 12 1.40777396742145 4.77667809773564 -3.36890413031419 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0791514340802245 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 44323720 C/T 1 34 3 37 15.9547716307765 1.59222603257855 14.3625455981979 T:C C T 10 0.530742010859516 4.75659018134007e-07 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 51 40 91 23.9321574461647 21.2296804343806 2.70247701178404 T:C T C 10 0.530742010859516 0.60057854617168 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 45739281 C/T 1 11 8 19 5.16183788054532 4.24593608687613 0.915901793669196 T:C C T 10 0.530742010859516 0.819237521224916 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45739234_45740030:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45739234_45739298:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000474114:exon_45739234_45741758:PFKL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 45742848 C/T 1 16 15 31 7.50812782624774 7.96113016289274 -0.453002336644996 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000474114:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000498841:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000460020:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000467315:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000460521:exon_45742845_45742932:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000495274:exon_45742845_45742932:PFKL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 46313442 G/T 1 20 5 25 9.38515978280968 2.65371005429758 6.7314497285121 T:G G T 10 0.530742010859516 0.00808122481560882 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46313319_46313942:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46313319_46313459:ITGB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 46363653 G/A 1 12 7 19 5.63109586968581 3.71519407601661 1.9159017936692 A:G G A 10 0.530742010859516 0.492140981990386 ENSG00000160256:ENST00000291634:exon_46363599_46363752:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000397826:exon_46363599_46363707:C21orf70;ENSG00000160256:ENST00000458015:exon_46363599_46363707:C21orf70 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 47665025 G/A 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:G G A 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47664721_47665111:MCM3AP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 0 0 8 8 0 4.24593608687613 -4.24593608687613 A G A 10 0.530742010859516 0.00235122072895402 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 17619076 C/G 1 23 28 51 10.7929337502311 14.8607763040664 -4.06784255383532 C:G C G 10 0.530742010859516 0.264724064872067 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17618401_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17618410_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000477157:exon_17618412_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000399852:exon_17618469_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000486462:exon_17618472_17619247:CECR5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 18226612 A/G 1 62 70 132 29.09399532671 37.1519407601661 -8.05794543345611 A:G A G 10 0.530742010859516 0.163872046178162 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 18226764 T/C 1 86 75 161 40.3561870660816 39.8056508144637 0.55053625161792 T:C:G T C 10 0.530742010859516 0.9372757044466 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 168 202 370 78.8353421756013 107.209886193622 -28.3745440180209 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00348590303035751 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 19495030 G/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:G G T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000093009:ENST00000407835:exon_19494909_19495040:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000444382:exon_19494909_19495040:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000437685:exon_19494909_19495040:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000263201:exon_19494909_19495040:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000404724:exon_19494909_19495040:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000435353:exon_19494909_19495040:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000471470:exon_19494909_19495040:CDC45 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 18 12 30 8.44664380452871 6.36890413031419 2.07773967421452 T:C C T 10 0.530742010859516 0.470863171171006 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 57 55 112 26.7477053810076 29.1908105972734 -2.44310521626579 A:G G A 10 0.530742010859516 0.705107328976196 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 20103953 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000099899:ENST00000252136:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000403707:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000405037:exon_20103561_20104156:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000404751:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000402382:exon_20103557_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000439169:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000468917:exon_20103561_20104073:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000494641:exon_20103581_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000464535:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000445045:exon_20103765_20104135:TRMT2A;ENSG00000099901:ENST00000432879:exon_20103461_20103953:RANBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 20800781 A/G 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G A G 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 8 11 19 3.75406391312387 5.83816211945468 -2.0840982063308 A:G A G 10 0.530742010859516 0.366013294263512 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 21982809 G/T 1 20 22 42 9.38515978280968 11.6763242389094 -2.29116445609967 T:G G T 10 0.530742010859516 0.537470994620003 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 22550503 G/A 1 1 12 13 0.469257989140484 6.36890413031419 -5.89964614117371 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00110526924381814 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 22677127 A/T 1 2 1329 1331 0.938515978280968 705.356132432297 -704.417616454016 A:T:G A T 10 0.530742010859516 0 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 22677300 A/G 0 0 655 655 0 347.636017112983 -347.636017112983 T:C:G A G 10 0.530742010859516 5.95178566552624e-216 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 23261995 G/A 0 32 0 32 15.0162556524955 0 15.0162556524955 G G 10 0.530742010859516 2.70800657859858e-09 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 24096578 G/A 1 34 21 55 15.9547716307765 11.1455822280498 4.80918940272662 A:G G A 10 0.530742010859516 0.224425427938942 ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24096502_24096655:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24096502_24096655:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000398465:exon_24096502_24096596:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24096502_24096655:VPREB3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 54 32 86 25.3399314135861 16.9837443475045 8.35618706608162 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0834270713209205 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 24237221 C/G 1 7 12 19 3.28480592398339 6.36890413031419 -3.0840982063308 C:G C G 10 0.530742010859516 0.173584815126562 ENSG00000240972:ENST00000465752:exon_24236959_24237414:MIF;ENSG00000218537:ENST00000406213:exon_24236613_24237719:AP000350.4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 24573577 C/T 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 T:C C T 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24573472_24573785:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24573472_24573785:CABIN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 24921765 G/A 1 9 4 13 4.22332190226436 2.12296804343806 2.10035385882629 A:G G A 10 0.530742010859516 0.278656458173804 ENSG00000100024:ENST00000415388:exon_24921679_24922636:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000326010:exon_24921679_24922553:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000413389:exon_24921679_24922552:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000498140:exon_24921679_24924358:UPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 29630337 G/A 0 0 12 12 0 6.36890413031419 -6.36890413031419 A G A 10 0.530742010859516 0.000114009253723231 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29630294_29630338:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29630294_29630338:EMID1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 29656165 T/C 1 14 21 35 6.56961184796678 11.1455822280498 -4.57597038008306 T:C T C 10 0.530742010859516 0.130078319026674 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29655841_29656226:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29655893_29656226:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29656045_29656226:RHBDD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 29659960 C/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000496342:exon_29659824_29660390:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000414672:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000406335:exon_29659946_29660207:RHBDD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 29661637 G/A 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29661468_29661657:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000413137:exon_29661468_29661657:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000414672:exon_29661468_29661657:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000406335:exon_29661468_29661657:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000493894:exon_29661024_29661657:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000488106:exon_29661435_29661657:RHBDD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 29695311 T/C 1 213 174 387 99.9519516869231 92.3491098895558 7.6028417973673 T:C T C 10 0.530742010859516 0.445363586851014 ENSG00000182944:ENST00000397938:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000332050:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000406548:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000331029:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000405024:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000414183:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000451900:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000332035:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000354516:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000479135:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000469669:exon_29695224_29695321:EWSR1;ENSG00000182944:ENST00000490315:exon_29694723_29695841:EWSR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 29724792 T/C 1 29 31 60 13.608481685074 16.453002336645 -2.84452065157096 T:C T C 10 0.530742010859516 0.518385723200983 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29723669_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29724727_29724884:AP1B1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 30074189 T/C 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000186575:ENST00000413209:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000447429:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000397822:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000347330:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000338641:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000403435:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361452:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000403999:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000334961:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000353887:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000432151:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000397789:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361676:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361166:exon_30074185_30074312:NF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 30134381 C/T 1 8 11 19 3.75406391312387 5.83816211945468 -2.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.366013294263512 ENSG00000100319:ENST00000344318:exon_30134319_30134430:ZMAT5;ENSG00000100319:ENST00000397781:exon_30134319_30134430:ZMAT5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 32352791 G/A 1 50 51 101 23.4628994570242 27.0678425538353 -3.60494309681112 A:G G A 10 0.530742010859516 0.486632947938256 ENSG00000128245:ENST00000248975:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000397492:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000471374:exon_32352126_32353590:YWHAH;ENSG00000128245:ENST00000427094:exon_32352126_32353589:YWHAH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 32791096 T/C 1 15 16 31 7.03886983710726 8.49187217375226 -1.453002336645 T:C T C 10 0.530742010859516 0.719585525875506 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32791013_32791201:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32791013_32791201:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32791013_32791201:C22orf28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 32894362 C/T 1 221 203 424 103.706015600047 107.740628204482 -4.03461260443478 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.697396808890398 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32894131_32894818:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32894131_32894816:FBXO7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36623672 G/A 1 41 26 67 19.2395775547598 13.7992922823474 5.44028527241243 A:G G A 10 0.530742010859516 0.220738603230736 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36623931 C/T 1 31 24 55 14.546997663355 12.7378082606284 1.80918940272662 T:C C T 10 0.530742010859516 0.68616959688042 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36624310 G/A 1 13 5 18 6.10035385882629 2.65371005429758 3.44664380452871 A:G G A 10 0.530742010859516 0.154800993660354 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000529194:exon_36624078_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000454728:exon_36624241_36624326:APOL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 3 7 10 1.40777396742145 3.71519407601661 -2.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.205910355285428 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:C C A 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36678782 C/T 1 93 63 156 43.640992990065 33.4367466841495 10.2042463059155 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.108753881758864 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36678699_36678831:MYH9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36684980 G/A 1 90 56 146 42.2332190226436 29.7215526081329 12.5116664145107 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0384120311732534 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684773_36684985:MYH9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36691691 T/C 1 20 10 30 9.38515978280968 5.30742010859516 4.07773967421452 T:C T C 10 0.530742010859516 0.147123291936050 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36691551_36691763:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000459960:exon_36691558_36691763:MYH9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 T:C T C 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36912630 A/G 1 126 125 251 59.126506631701 66.3427513574395 -7.21624472573851 A:G A G 10 0.530742010859516 0.376261510694158 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 36922052 T/C 1 24 21 45 11.2621917393716 11.1455822280498 0.11660951132178 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 17 13 30 7.97738581538823 6.89964614117371 1.07773967421452 A:G G A 10 0.530742010859516 0.718793218928822 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 37273805 C/T 1 12 16 28 5.63109586968581 8.49187217375226 -2.86077630406645 T:C C T 10 0.530742010859516 0.344453418961431 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 110 129 239 51.6183788054532 68.4657194008776 -16.8473405954243 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0322882783180561 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 38028073 A/G 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100083:ENST00000343632:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000381756:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000325180:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000337437:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000406772:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000460957:exon_38028003_38028172:GGA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 122 117 239 57.249474675139 62.0968152705634 -4.84734059542432 T:C C T 10 0.530742010859516 0.559855486458846 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 17 12 29 7.97738581538823 6.36890413031419 1.60848168507404 A:G A G 10 0.530742010859516 0.58207060910907 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 38692685 C/T 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000213923:ENST00000413574:exon_38692211_38692692:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000405675:exon_38692212_38693161:CSNK1E;ENSG00000213923:ENST00000498529:exon_38692632_38692692:CSNK1E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 7 11 18 3.28480592398339 5.83816211945468 -2.55335619547129 T:C T C 10 0.530742010859516 0.246521713034617 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 39477566 A/G 1 9 19 28 4.22332190226436 10.0840982063308 -5.86077630406645 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0356512820649896 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 39483078 G/A 1 121 103 224 56.7802166859986 54.6664271185302 2.11378956746842 A:G G A 10 0.530742010859516 0.789267418572166 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39483016_39483131:APOBEC3G HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 103 121 224 48.3335728814698 64.2197833140014 -15.8862104325316 A:C A C 10 0.530742010859516 0.0377568111507181 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 39928528 G/T 1 18 9 27 8.44664380452871 4.77667809773564 3.66996570679307 T:G G T 10 0.530742010859516 0.179826969924766 ENSG00000187051:ENST00000334678:exon_39928400_39928528:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000420879:exon_39928400_39928528:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000459956:exon_39928400_39928743:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000491966:exon_39928400_39928528:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000472291:exon_39927734_39928528:RPS19BP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 40814594 C/T 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 40815089 G/C 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 C:G G C 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 41173101 G/A 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000402844:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000447566:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000430221:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000427084:exon_41173064_41173139:SLC25A17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 41648966 A/G 1 12 7 19 5.63109586968581 3.71519407601661 1.9159017936692 A:G A G 10 0.530742010859516 0.492140981990386 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41648876_41649036:RANGAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 41652030 G/C 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41652025_41652109:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000446258:exon_41652025_41652109:RANGAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 14 14 28 6.56961184796678 7.43038815203322 -0.860776304066448 A:C C A 10 0.530742010859516 0.850388610583438 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 15 14 29 7.03886983710726 7.43038815203322 -0.391518314925964 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 9 15 24 4.22332190226436 7.96113016289274 -3.73780826062838 C:G G C 10 0.530742010859516 0.152967902735682 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 37 24 61 17.3625455981979 12.7378082606284 4.62473733756952 A:G A G 10 0.530742010859516 0.250469911682219 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 42910142 C/T 1 167 80 247 78.3660841864608 42.4593608687613 35.9067233176995 T:C C T 10 0.530742010859516 3.91570167334029e-06 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42910112_42910310:RRP7A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 42912029 G/T 1 39 21 60 18.3010615764789 11.1455822280498 7.15547934842904 T:G G T 10 0.530742010859516 0.0703722945770522 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000416699:exon_42912017_42912142:RRP7A;ENSG00000189306:ENST00000483303:exon_42912017_42912302:RRP7A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 42981890 G/A 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 43024271 G/C 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000100243:ENST00000352397:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396309:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000361740:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000396303:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407623:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000414587:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000407332:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000470741:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000402438:exon_43024158_43024287:CYB5R3;ENSG00000100243:ENST00000438270:exon_43024158_43024287:CYB5R3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 18 12 30 8.44664380452871 6.36890413031419 2.07773967421452 T:C C T 10 0.530742010859516 0.470863171171006 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 39 24 63 18.3010615764789 12.7378082606284 5.56325331585049 C:G G C 10 0.530742010859516 0.167170905957842 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 43533105 C/G 1 14 8 22 6.56961184796678 4.24593608687613 2.32367576109065 C:G C G 10 0.530742010859516 0.39515096925501 ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43533087_43533304:MCAT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 43558972 G/A 1 14 24 38 6.56961184796678 12.7378082606284 -6.16819641266161 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0511134002182132 ENSG00000100300:ENST00000337554:exon_43558809_43559248:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000396265:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000361449:exon_43558809_43559247:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000329563:exon_43558809_43559216:TSPO;ENSG00000100300:ENST00000445018:exon_43558809_43558997:TSPO HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 114 138 252 53.4954107620152 73.2423974986132 -19.746986736598 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0137396322453923 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 44489850 C/G 1 21 5 26 9.85441777195016 2.65371005429758 7.20070771765258 C:G C G 10 0.530742010859516 0.00509675844262558 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 25 6 31 11.7314497285121 3.1844520651571 8.546997663355 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00191058355076626 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 44564507 C/T 1 234 206 440 109.806369458873 109.33285423706 0.47351522181296 T:C:G C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44564482_44564803:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44564482_44565064:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477438:exon_44564482_44564807:PARVB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 46704337 C/T 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C C T 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 46752813 G/A 1 21 12 33 9.85441777195016 6.36890413031419 3.48551364163597 A:G G A 10 0.530742010859516 0.295299730825511 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46752739_46753232:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46752739_46753237:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46752739_46753081:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46752739_46753236:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46752739_46753235:TRMU HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50297888 T/C 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:C T C 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50297827_50297902:ALG12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50313810 C/T 1 10 14 24 4.69257989140484 7.43038815203322 -2.73780826062838 T:C C T 10 0.530742010859516 0.308839595377037 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313804_50313895:CRELD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 35 37 72 16.4240296199169 19.6374544018021 -3.21342478188515 T:C T C 10 0.530742010859516 0.479750916597542 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 154 115 269 72.2657303276345 61.0353312488443 11.2303990787902 C:G G C 10 0.530742010859516 0.179125794265826 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50716068 C/T 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:G G A 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50751529 G/C 1 21 18 39 9.85441777195016 9.55335619547129 0.301061576478876 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50751428_50751537:FAM116B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 22 15 37 10.3236757610906 7.96113016289274 2.36254559819791 A:G A G 10 0.530742010859516 0.511169927441844 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50942818 C/T 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 T:C C T 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 63 76 139 29.5632533158505 40.3363928253232 -10.7731395094727 T:G T G 10 0.530742010859516 0.0741657491115797 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 5021403 C/T 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 T:C C T 10 0.530742010859516 0.796007939511377 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5020801_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000457655:exon_5021097_5021483:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5021122_5021483:BHLHE40 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 8590313 T/C 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 T T 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8590254_8590549:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 22 16 38 10.3236757610906 8.49187217375226 1.83180358733839 A:G G A 10 0.530742010859516 0.627133830990491 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 9425944 G/C 1 28 29 57 13.1392236959336 15.391518314926 -2.25229461899241 C:G G C 10 0.530742010859516 0.59655465538297 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 9426224 G/A 1 49 51 100 22.9936414678837 27.0678425538353 -4.0742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.424463528071695 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 9825746 C/A 1 16 27 43 7.50812782624774 14.3300342932069 -6.82190646695919 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0460876594960367 ENSG00000171148:ENST00000301964:exon_9825712_9825897:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000492103:exon_9825712_9825897:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000440161:exon_9825712_9825897:TADA3;ENSG00000171148:ENST00000343450:exon_9824812_9825897:TADA3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 9876919 G/A 1 38 36 74 17.8318035873384 19.1067123909426 -1.27490880360418 A:G G A 10 0.530742010859516 0.8161886505452 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9876778_9877016:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 9877127 T/C 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 T:C T C 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 C:G G C 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:G T G 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 38 31 69 17.8318035873384 16.453002336645 1.3788012506934 T:C:G T C 10 0.530742010859516 0.809715978060955 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 26 17 43 12.2007077176526 9.02261418461177 3.17809353304081 T:C C T 10 0.530742010859516 0.362089913082578 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 14223074 C/T 1 40 37 77 18.7703195656194 19.6374544018021 -0.867134836182732 T:C C T 10 0.530742010859516 0.909219125136155 ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14223060_14223170:LSM3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 14711532 C/A 1 17 17 34 7.97738581538823 9.02261418461177 -1.04522836922354 A:C C A 10 0.530742010859516 0.734373661118405 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14711441_14711593:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14711441_14711593:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14711441_14711593:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14711441_14711593:C3orf19 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 15610070 C/T 1 7 12 19 3.28480592398339 6.36890413031419 -3.0840982063308 T:C C T 10 0.530742010859516 0.173584815126562 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000435217:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15609939_15610093:HACL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 25835983 T/C 1 10 16 26 4.69257989140484 8.49187217375226 -3.79929228234742 T:C T C 10 0.530742010859516 0.168973011216428 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25835583_25836025:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000448177:exon_25835583_25836014:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000420173:exon_25835583_25836025:OXSM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 31666442 C/T 1 13 7 20 6.10035385882629 3.71519407601661 2.38515978280968 T:C C T 10 0.530742010859516 0.371592770079109 ENSG00000163527:ENST00000295770:exon_31666406_31666577:STT3B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 32571147 G/A 1 45 29 74 21.1166095113218 15.391518314926 5.72509119639582 A:G G A 10 0.530742010859516 0.200834214958966 ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000432458:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000472985:exon_32571122_32571152:DYNC1LI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 37396643 C/G 1 8 7 15 3.75406391312387 3.71519407601661 0.03886983710726 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37396592_37396678:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37396592_37396678:GOLGA4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 38167151 G/A 1 41 29 70 19.2395775547598 15.391518314926 3.84805923983388 A:G G A 10 0.530742010859516 0.402476125046814 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38164207_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469600:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38167055_38167201:ACAA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 20 5 25 9.38515978280968 2.65371005429758 6.7314497285121 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00808122481560882 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 625 535 1160 293.286243212803 283.946975809841 9.33926740296147 A:G G A 10 0.530742010859516 0.596499858979129 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 44893288 A/C 1 13 10 23 6.10035385882629 5.30742010859516 0.792933750231132 A:C A C 10 0.530742010859516 0.835891241282002 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44893279_44893444:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44893279_44893444:KIF15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 46966953 C/T 1 32 24 56 15.0162556524955 12.7378082606284 2.2784473918671 T:C C T 10 0.530742010859516 0.593496392999229 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_46966946_46967025:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_46966410_46967025:CCDC12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 46982510 C/T 1 19 22 41 8.9159017936692 11.6763242389094 -2.76042244524016 T:C C T 10 0.530742010859516 0.435415355527369 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_46982488_46982555:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000460035:exon_46982105_46982555:CCDC12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 47018214 T/C 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_47018127_47018238:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_47018127_47018249:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_47018127_47018235:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000460035:exon_47018127_47018247:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000492819:exon_47017497_47018270:CCDC12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A 1 28 10 38 13.1392236959336 5.30742010859516 7.83180358733839 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.0137605629583765 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 47891226 C/T 1 73 78 151 34.2558332072553 41.3978768470422 -7.14204363978691 T:C C T 10 0.530742010859516 0.254325984537563 ENSG00000132153:ENST00000445061:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000395745:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000348968:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000446256:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000443212:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000457607:exon_47891120_47891259:DHX30 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 48473953 C/G 1 31 33 64 14.546997663355 17.514486358364 -2.96748869500902 C:G C G 10 0.530742010859516 0.531522904372937 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 48501819 G/A 1 3 7 10 1.40777396742145 3.71519407601661 -2.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.205910355285428 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 48501920 C/T 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 T:C C T 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 48509036 T/C 1 66 48 114 30.9710272832719 25.4756165212568 5.49541076201518 T:C T C 10 0.530742010859516 0.348104968736729 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 13 11 24 6.10035385882629 5.83816211945468 0.262191739371616 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 49050646 T/C 1 11 17 28 5.16183788054532 9.02261418461177 -3.86077630406645 T:C T C 10 0.530742010859516 0.184567835501249 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49049068_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49049068_49051726:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49049068_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49048854_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49049068_49051726:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49049068_49051549:WDR6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 49053219 A/G 1 275 196 471 129.045947013633 104.025434128465 25.020512885168 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0210000866638372 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000354294:exon_49053187_49053261:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49052958_49053773:DALRD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 49054692 T/C 1 10 4 14 4.69257989140484 2.12296804343806 2.56961184796678 T:C T C 10 0.530742010859516 0.191069727442096 ENSG00000178149:ENST00000441576:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000460505:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000341949:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498498:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000498794:exon_49052924_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000440857:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000313778:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000395462:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000467457:exon_49054661_49054789:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000484831:exon_49054661_49054946:DALRD3;ENSG00000178149:ENST00000420952:exon_49054661_49054789:DALRD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 49760039 T/C 1 16 11 27 7.50812782624774 5.83816211945468 1.66996570679307 T:C T C 10 0.530742010859516 0.567442005651981 ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49760029_49760187:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49760029_49760187:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308388:exon_49760029_49760187:GMPPB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 50099512 A/G 1 24 24 48 11.2621917393716 12.7378082606284 -1.47561652125677 A:G A G 10 0.530742010859516 0.668036956608804 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50099395_50099541:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50099395_50099541:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50099395_50099541:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50099395_50099541:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000441115:exon_50099395_50099541:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50099395_50099541:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50098895_50099541:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000434592:exon_50099395_50099541:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000438912:exon_50099395_50099541:RBM6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 27 29 56 12.6699657067931 15.391518314926 -2.7215526081329 A:G G A 10 0.530742010859516 0.504547115613738 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:T T A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 51697137 T/C 1 13 8 21 6.10035385882629 4.24593608687613 1.85441777195016 T:C T C 10 0.530742010859516 0.514112372853973 ENSG00000164080:ENST00000487093:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000409535:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000296477:exon_51696442_51697610:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000432863:exon_51696442_51697473:RAD54L2;ENSG00000164080:ENST00000461680:exon_51696442_51697610:RAD54L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 52326821 G/A 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 A:G G A 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000168237:ENST00000486393:exon_52326276_52327491:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000358709:exon_52326276_52327208:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000340877:exon_52326276_52327021:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000354773:exon_52326276_52327491:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000436784:exon_52326276_52327492:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000477382:exon_52326276_52327021:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000411757:exon_52326276_52329272:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000489173:exon_52326276_52327190:GLYCTK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 52558567 G/A 1 54 92 146 25.3399314135861 48.8282649990755 -23.4883335854893 A:G G A 10 0.530742010859516 0.000121069253430223 ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52558386_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000463947:exon_52558401_52558627:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000479024:exon_52558403_52558627:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52558403_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52558405_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000462261:exon_52558417_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52558486_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52558486_52558747:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000469616:exon_52558539_52558747:NT5DC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 22 26 48 10.3236757610906 13.7992922823474 -3.47561652125677 A:G G A 10 0.530742010859516 0.385790712937223 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 111 100 211 52.0876367945937 53.0742010859516 -0.98656429135788 A:G G A 10 0.530742010859516 0.890565170478024 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 27 25 52 12.6699657067931 13.2685502714879 -0.598584564694832 A:G G A 10 0.530742010859516 0.890246307356327 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 15 47 62 7.03886983710726 24.9448745103973 -17.90600467329 T:C C T 10 0.530742010859516 4.91560994268248e-06 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 14 7 21 6.56961184796678 3.71519407601661 2.85441777195016 T:C C T 10 0.530742010859516 0.275274657227659 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 58178478 C/T 1 13 2 15 6.10035385882629 1.06148402171903 5.03886983710726 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00898976873595271 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58177984_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58178354_58179166:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58178354_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000450710:exon_58178354_58179166:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58178355_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000477209:exon_58178355_58178530:DNASE1L3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 9 4 13 4.22332190226436 2.12296804343806 2.10035385882629 T:C C T 10 0.530742010859516 0.278656458173804 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 81627175 T/C 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 T:C T C 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81627076_81627247:GBE1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 81720076 G/A 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:G G A 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000477426:exon_81719989_81720133:GBE1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 87299075 A/C 1 4 11 15 1.87703195656194 5.83816211945468 -3.96113016289274 A:C A C 10 0.530742010859516 0.0665477231595873 ENSG00000083937:ENST00000471660:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000263780:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000494980:exon_87299025_87299127:CHMP2B;ENSG00000083937:ENST00000472024:exon_87299025_87299127:CHMP2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 97983699 C/A 0 0 8 8 0 4.24593608687613 -4.24593608687613 A C A 10 0.530742010859516 0.00235122072895402 ENSG00000230301:ENST00000383696:exon_97983088_97984200:OR5H6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 22 23 45 10.3236757610906 12.2070662497689 -1.88339048867822 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.654706456239354 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 112718352 G/T 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000163607:ENST00000383678:exon_112718293_112718411:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000383677:exon_112718293_112718411:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000471627:exon_112718293_112718411:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000295864:exon_112718293_112718411:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000485330:exon_112718293_112718411:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000305485:exon_112718293_112718411:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000488781:exon_112718293_112718411:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000467752:exon_112718293_112718411:GTPBP8;ENSG00000163607:ENST00000473129:exon_112718293_112718411:GTPBP8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 112724619 A/G 1 16 17 33 7.50812782624774 9.02261418461177 -1.51448635836403 A:G A G 10 0.530742010859516 0.606034924478049 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 112724661 T/C 1 26 11 37 12.2007077176526 5.83816211945468 6.36254559819791 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0467955052880676 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 119219573 A/G 1 12 8 20 5.63109586968581 4.24593608687613 1.38515978280968 A:G A G 10 0.530742010859516 0.655918359081295 ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000469324:exon_119219221_119219707:C3orf1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 119236179 G/A 1 11 3 14 5.16183788054532 1.59222603257855 3.56961184796678 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0638641251547832 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 119242443 C/T 1 10 12 22 4.69257989140484 6.36890413031419 -1.67632423890935 T:C C T 10 0.530742010859516 0.525900865788529 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 86 76 162 40.3561870660816 40.3363928253232 0.019794240758408 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 121377156 G/A 1 20 11 31 9.38515978280968 5.83816211945468 3.546997663355 A:G G A 10 0.530742010859516 0.213552011036275 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000487290:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000481314:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000497391:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000488033:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000468693:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000491824:exon_121377111_121377194:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000479994:exon_121376829_121377194:HCLS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 112 118 230 52.5568947837342 62.6275572814229 -10.0706624976887 A:G G A 10 0.530742010859516 0.186959661855447 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 121409895 T/C 1 14 12 26 6.56961184796678 6.36890413031419 0.200707717652584 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121409517_121411428:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121409517_121411428:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121409517_121411428:GOLGB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 14 10 24 6.56961184796678 5.30742010859516 1.26219173937162 T:C C T 10 0.530742010859516 0.685182392195028 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 121491408 T/C 1 28 27 55 13.1392236959336 14.3300342932069 -1.19081059727338 T:C T C 10 0.530742010859516 0.787890302645002 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121491404_121491560:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121491404_121491560:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121491404_121491560:IQCB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 121838391 A/G 1 13 10 23 6.10035385882629 5.30742010859516 0.792933750231132 A:G A G 10 0.530742010859516 0.835891241282002 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 5 11 16 2.34628994570242 5.83816211945468 -3.49187217375226 T:C T C 10 0.530742010859516 0.130339318751546 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 122459513 C/T 1 12 9 21 5.63109586968581 4.77667809773564 0.854417771950164 T:C C T 10 0.530742010859516 0.828106270585171 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 12 6 18 5.63109586968581 3.1844520651571 2.44664380452871 A:G G A 10 0.530742010859516 0.34554633606434 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 123633665 T/C 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 T:C T C 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000175455:ENST00000310351:exon_123632300_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000485727:exon_123632564_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409657:exon_123632572_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000495381:exon_123632572_123633979:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000489746:exon_123632574_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000433542:exon_123633166_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000409697:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000488653:exon_123633469_123634565:CCDC14;ENSG00000175455:ENST00000483247:exon_123633509_123634136:CCDC14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 124826789 G/A 1 27 48 75 12.6699657067931 25.4756165212568 -12.8056508144637 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00359284365364559 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124826620_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124826321_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000485954:exon_124826689_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479231:exon_124826725_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465777:exon_124826789_124826970:SLC12A8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 125648343 G/A 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000189366:ENST00000340333:exon_125648118_125648410:ALG1L;ENSG00000189366:ENST00000437882:exon_125648118_125648410:ALG1L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 127340583 C/T 1 69 43 112 32.3788012506934 22.8219064669592 9.55689478373421 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0725769507787528 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127340506_127341276:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127340506_127340672:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127340506_127340672:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127340506_127340950:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468414:exon_127340506_127340619:MCM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 128344378 T/C 1 130 109 239 61.0035385882629 57.8508791836872 3.15265940457568 T:C T C 10 0.530742010859516 0.697817760576967 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344377_128344496:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344377_128344496:RPN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 128356699 C/T 1 15 16 31 7.03886983710726 8.49187217375226 -1.453002336645 T:C C T 10 0.530742010859516 0.719585525875506 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 13 15 28 6.10035385882629 7.96113016289274 -1.86077630406645 T:C C T 10 0.530742010859516 0.571174046060559 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 C:G C G 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 128984583 C/T 1 20 20 40 9.38515978280968 10.6148402171903 -1.22968043438064 T:C C T 10 0.530742010859516 0.752518681653478 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 130398298 C/G 1 23 15 38 10.7929337502311 7.96113016289274 2.83180358733839 C:G C G 10 0.530742010859516 0.417695660704977 ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130397779_130398329:PIK3R4;ENSG00000196455:ENST00000511760:exon_130397854_130398329:PIK3R4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 133191385 C/A 1 80 30 110 37.5406391312387 15.9222603257855 21.6183788054532 A:C C A 10 0.530742010859516 3.24117540326773e-05 ENSG00000170819:ENST00000302334:exon_133191189_133191409:BFSP2;ENSG00000170819:ENST00000510039:exon_133191189_133191409:BFSP2;ENSG00000170819:ENST00000503047:exon_133191186_133191409:BFSP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 136019925 C/G 1 11 4 15 5.16183788054532 2.12296804343806 3.03886983710726 C:G C G 10 0.530742010859516 0.12884907544869 ENSG00000114054:ENST00000251654:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000490504:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000483687:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000468777:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000462637:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000466072:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000484181:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000482086:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000471595:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000469217:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000474833:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000475214:exon_136019872_136019953:PCCB;ENSG00000114054:ENST00000473073:exon_136019872_136019953:PCCB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 137880872 C/T 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 137881029 C/T 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 141724328 T/C 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 T:C T C 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000114126:ENST00000489671:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000486111:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000495310:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000467072:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000310282:exon_141724283_141724377:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000487734:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000397991:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000317104:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000467667:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000497579:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000464782:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000488107:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000475734:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000471095:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000494358:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000467634:exon_141724283_141724386:TFDP2;ENSG00000114126:ENST00000476617:exon_141724283_141724386:TFDP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 143567018 C/T 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000181804:ENST00000316549:exon_143566990_143567373:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000474727:exon_143566990_143567327:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000474151:exon_143566990_143567300:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000498717:exon_143566990_143567311:SLC9A9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 28 40 68 13.1392236959336 21.2296804343806 -8.09045673844709 T:C C T 10 0.530742010859516 0.052304900732791 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 1 3 11 14 1.40777396742145 5.83816211945468 -4.43038815203322 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0284599459437032 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 167728202 T/A 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 A:T T A 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167726465_167728206:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167728023_167728206:GOLIM4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 183899832 C/T 1 65 69 134 30.5017692941315 36.6211987493066 -6.11942945517514 T:C C T 10 0.530742010859516 0.299901936411704 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000432591:exon_183899700_183899842:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000476434:exon_183899700_183899868:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000463935:exon_183899700_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000480260:exon_183899407_183899835:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000442686:exon_183899803_183899835:AP2M1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 183908990 G/A 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183908911_183909043:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183908911_183909043:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183908911_183909043:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000468892:exon_183908911_183909043:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466742:exon_183908911_183909043:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480562:exon_183908911_183909043:ABCF3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 183963000 A/G 1 23 26 49 10.7929337502311 13.7992922823474 -3.00635853211628 A:G A G 10 0.530742010859516 0.394939271572005 ENSG00000214160:ENST00000411922:exon_183962986_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000397676:exon_183962986_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000445626:exon_183962986_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000458439:exon_183962986_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000418734:exon_183962986_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000455059:exon_183962986_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000446569:exon_183962986_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000423996:exon_183962986_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000477959:exon_183962986_183963130:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000461415:exon_183962547_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000488976:exon_183962566_183963146:ALG3;ENSG00000214160:ENST00000482048:exon_183962855_183963146:ALG3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 183975304 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183975261_183975544:ECE2;ENSG00000145194:ENST00000351385:exon_183975261_183975544:ECE2;ENSG00000145194:ENST00000402825:exon_183975261_183975544:ECE2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 14 14 28 6.56961184796678 7.43038815203322 -0.860776304066448 T:C T C 10 0.530742010859516 0.850388610583438 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 184429265 C/A 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 A:C C A 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 184429411 A/C 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:C A C 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 186508008 C/T 1 136 141 277 63.8190865231058 74.8346235311918 -11.0155370080859 T:C:G C T 10 0.530742010859516 0.185991306032532 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186507931_186508044:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186507681_186508195:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186507931_186508044:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186507931_186508044:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186507931_186508044:RFC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 6 15 21 2.8155479348429 7.96113016289274 -5.14558222804984 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0284838448196345 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 15 17 32 7.03886983710726 9.02261418461177 -1.98374434750451 T:C T C 10 0.530742010859516 0.485769329269364 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 196678838 G/A 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000119227:ENST00000412723:exon_196678692_196678902:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000443835:exon_196678692_196678902:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000238138:exon_196678409_196678902:PIGZ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 197241286 G/C 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000161267:ENST00000392378:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000358186:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000392379:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000441275:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000479425:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000446746:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000477015:exon_197241135_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000434143:exon_197241134_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000483920:exon_197241134_197241287:BDH1;ENSG00000161267:ENST00000432819:exon_197241137_197241287:BDH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 19 7 26 8.9159017936692 3.71519407601661 5.20070771765258 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0487930696503959 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 11 5 16 5.16183788054532 2.65371005429758 2.50812782624774 T:C C T 10 0.530742010859516 0.316563144276864 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 858914 T/C 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 T:C T C 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_858910_859032:GAK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 10 7 17 4.69257989140484 3.71519407601661 0.977385815388228 A:G A G 10 0.530742010859516 0.809001678476656 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 951681 T/C 1 10 9 19 4.69257989140484 4.77667809773564 -0.084098206330804 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_951612_951867:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 1389588 G/A 1 11 2 13 5.16183788054532 1.06148402171903 4.10035385882629 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0256582468175808 ENSG00000179979:ENST00000324803:exon_1388152_1389776:CRIPAK;ENSG00000179979:ENST00000382944:exon_1388967_1389640:CRIPAK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 16 17 33 7.50812782624774 9.02261418461177 -1.51448635836403 A:G G A 10 0.530742010859516 0.606034924478049 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 1730164 C/T 1 55 43 98 25.8091894027266 22.8219064669592 2.98728293576743 T:C C T 10 0.530742010859516 0.613069692885818 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/T 1 50 31 81 23.4628994570242 16.453002336645 7.0098971203792 T:C C T 10 0.530742010859516 0.120825321364035 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 56 31 87 26.2784473918671 16.453002336645 9.82544505522211 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0407627416360603 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 27 13 40 12.6699657067931 6.89964614117371 5.77031956561936 A:G G A 10 0.530742010859516 0.080910793018156 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 1742616 A/G 1 72 90 162 33.7865752181148 47.7667809773564 -13.9802057592416 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.0332364137307499 ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1742553_1742713:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1742553_1742713:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470808:exon_1742553_1743021:TACC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 2743983 G/A 1 64 64 128 30.032511304991 33.967488695009 -3.93497739001805 A:G G A 10 0.530742010859516 0.535501015239658 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 C:G C G 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 2933288 C/T 1 46 50 96 21.5858675004623 26.5371005429758 -4.95123304251354 T:C C T 10 0.530742010859516 0.3574857563156 ENSG00000109736:ENST00000514800:exon_2933282_2933390:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000355443:exon_2933282_2933390:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000514031:exon_2933282_2933613:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000329687:exon_2933282_2933390:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000503596:exon_2933282_2933390:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000508221:exon_2933282_2933390:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000507272:exon_2933282_2933390:MFSD10;ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 2954057 A/T 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 A:T A T 10 0.530742010859516 0.796007939511377 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2954002_2954124:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2954002_2954124:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2954002_2954124:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2954002_2954124:NOP14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 47 49 96 22.0551254896027 26.0063585321163 -3.95123304251354 A:G A G 10 0.530742010859516 0.474313341772128 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 27 11 38 12.6699657067931 5.83816211945468 6.83180358733839 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0334263596861414 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 68 77 145 31.9095432615529 40.8671348361827 -8.95759157462982 A:C C A 10 0.530742010859516 0.156993321268519 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 6718596 T/G 1 21 21 42 9.85441777195016 11.1455822280498 -1.29116445609967 T:C:G T G 10 0.530742010859516 0.757959103827425 ENSG00000186222:ENST00000320776:exon_6717842_6719387:CNO HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 7062894 C/T 1 50 51 101 23.4628994570242 27.0678425538353 -3.60494309681112 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486632947938256 ENSG00000109519:ENST00000264954:exon_7060633_7062935:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000429301:exon_7061782_7062935:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000504920:exon_7062256_7064193:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000509696:exon_7062415_7062935:GRPEL1;ENSG00000109519:ENST00000514056:exon_7062865_7062935:GRPEL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C T C 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 8238151 C/T 1 16 16 32 7.50812782624774 8.49187217375226 -0.983744347504512 T:C C T 10 0.530742010859516 0.727627568390899 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8238005_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000511002:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508183:exon_8237160_8238156:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8237160_8239397:SH3TC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 8372686 G/A 1 16 6 22 7.50812782624774 3.1844520651571 4.32367576109065 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0860562081251773 ENSG00000087008:ENST00000512411:exon_8372635_8372721:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000515797:exon_8372635_8372721:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8372635_8372721:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8372635_8372721:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8372635_8372721:ACOX3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 10079055 A/G 1 80 92 172 37.5406391312387 48.8282649990755 -11.2876258678368 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0927049587326872 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10078928_10079072:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10078928_10079072:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382451:exon_10078928_10079072:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10078928_10079072:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10078928_10079072:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000443592:exon_10078928_10079072:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000502702:exon_10078928_10079072:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000515743:exon_10078928_10079072:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000502962:exon_10078928_10079072:WDR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 15 13 28 7.03886983710726 6.89964614117371 0.139223695933552 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 13582673 C/T 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 T:C C T 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13582644_13582678:BOD1L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 25125703 C/G 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 C:G C G 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000109618:ENST00000382103:exon_25121636_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000302922:exon_25122624_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000358971:exon_25123877_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000514585:exon_25125472_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000503150:exon_25125703_25125847:SEPSECS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 25417088 A/G 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:G A G 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25416774_25418220:ANAPC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 37851856 A/C 1 7 10 17 3.28480592398339 5.30742010859516 -2.02261418461177 A:C A C 10 0.530742010859516 0.342925565397055 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37851805_37851994:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37851805_37851994:PGM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 37857342 G/C 1 18 17 35 8.44664380452871 9.02261418461177 -0.57597038008306 C:G G C 10 0.530742010859516 0.866987920675362 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 38774755 C/A 1 93 70 163 43.640992990065 37.1519407601661 6.4890522298989 A:C C A 10 0.530742010859516 0.346381265042128 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 T:C T C 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 39900045 G/A 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000121892:ENST00000303538:exon_39900009_39900148:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000412404:exon_39900009_39900148:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000399797:exon_39900009_39900148:PDS5A;ENSG00000121892:ENST00000503396:exon_39899634_39900148:PDS5A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 48853853 A/G 1 21 12 33 9.85441777195016 6.36890413031419 3.48551364163597 A:G A G 10 0.530742010859516 0.295299730825511 ENSG00000109180:ENST00000509122:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000425583:exon_48853823_48854037:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000505922:exon_48853824_48853993:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000512981:exon_48853823_48854521:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000264312:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000396448:exon_48853823_48854037:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000512236:exon_48853823_48853958:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000381473:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000511102:exon_48853823_48853962:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000444354:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000509246:exon_48853823_48853966:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000506801:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000503016:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000510824:exon_48853823_48853916:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000508293:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000513391:exon_48853823_48853992:OCIAD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 48853854 A/G 1 21 10 31 9.85441777195016 5.30742010859516 4.546997663355 A:G A G 10 0.530742010859516 0.108573848204212 ENSG00000109180:ENST00000509122:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000425583:exon_48853823_48854037:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000505922:exon_48853824_48853993:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000512981:exon_48853823_48854521:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000264312:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000396448:exon_48853823_48854037:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000512236:exon_48853823_48853958:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000381473:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000511102:exon_48853823_48853962:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000444354:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000509246:exon_48853823_48853966:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000506801:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000503016:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000510824:exon_48853823_48853916:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000508293:exon_48853823_48853992:OCIAD1;ENSG00000109180:ENST00000513391:exon_48853823_48853992:OCIAD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 54011526 A/G 1 12 20 32 5.63109586968581 10.6148402171903 -4.98374434750451 A:G A G 10 0.530742010859516 0.109483713909064 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 69433714 C/T 1 13 1 14 6.10035385882629 0.530742010859516 5.56961184796678 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00230525942319379 ENSG00000197888:ENST00000317746:exon_69433479_69434245:UGT2B17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C T C 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 76731674 A/G 1 6 9 15 2.8155479348429 4.77667809773564 -1.96113016289274 A:G A G 10 0.530742010859516 0.438937968640093 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76731585_76731692:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76731585_76731692:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76731585_76731688:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76731585_76731692:USO1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 9 18 27 4.22332190226436 9.55335619547129 -5.33003429320693 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0523373075972136 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 84191031 A/G 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 A:G A G 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 84374692 A/G 1 16 10 26 7.50812782624774 5.30742010859516 2.20070771765258 A:G A G 10 0.530742010859516 0.43619312164521 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 89183736 C/A 1 40 28 68 18.7703195656194 14.8607763040664 3.90954326155291 A:C C A 10 0.530742010859516 0.395399468229759 ENSG00000163644:ENST00000513546:exon_89183023_89183878:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89183315_89183878:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000508256:exon_89183729_89183878:PPM1K HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 89198355 T/C 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 T:C T C 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000163644:ENST00000513546:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000508256:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000510548:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000511506:exon_89198295_89198719:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000506423:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000315194:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000514204:exon_89196297_89198395:PPM1K HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 103517489 G/A 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G G A 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000109320:ENST00000226574:exon_103517295_103517489:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000394820:exon_103517295_103517489:NFKB1;ENSG00000109320:ENST00000505458:exon_103517295_103517489:NFKB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 103555992 A/G 1 6 9 15 2.8155479348429 4.77667809773564 -1.96113016289274 A:G A G 10 0.530742010859516 0.438937968640093 ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 12 13 25 5.63109586968581 6.89964614117371 -1.2685502714879 T:C C T 10 0.530742010859516 0.690401884163373 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 113362249 A/G 1 18 15 33 8.44664380452871 7.96113016289274 0.485513641635972 A:T:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113362073_113362261:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113362073_113362261:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113362073_113362261:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113362073_113362261:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113362073_113362261:ALPK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 113565835 G/A 1 90 70 160 42.2332190226436 37.1519407601661 5.08127826247744 A:G G A 10 0.530742010859516 0.429543032919556 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000512589:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000508577:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000513553:exon_113565824_113565855:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113565824_113566027:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505216:exon_113565824_113565924:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000507443:exon_113565460_113566027:LARP7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 122617745 G/A 1 9 9 18 4.22332190226436 4.77667809773564 -0.553356195471288 A:G G A 10 0.530742010859516 0.817532500175034 ENSG00000164111:ENST00000296511:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000512232:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000501272:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000506395:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000515017:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000511552:exon_122617736_122618130:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513428:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513523:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513728:exon_122617736_122617779:ANXA5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 129043204 C/G 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 C:G C G 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 599 3 602 281.08553549515 1.59222603257855 279.493309462571 A:G G A 10 0.530742010859516 6.24929522901039e-159 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 148968049 A/G 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 A:G A G 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148968043_148968202:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148968043_148968202:ARHGAP10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 159631991 G/T 1 17 6 23 7.97738581538823 3.1844520651571 4.79293375023113 T:G G T 10 0.530742010859516 0.0585870990813324 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 169911504 T/G 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 T:G T G 10 0.530742010859516 0.398583870551881 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 14 8 22 6.56961184796678 4.24593608687613 2.32367576109065 T:G G T 10 0.530742010859516 0.39515096925501 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 T:C C T 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 170674892 G/A 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170674827_170674986:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170674827_170674986:C4orf27 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 174253178 T/C 1 401 573 974 188.172453645334 304.115172222503 -115.942718577169 T:C T C 10 0.530742010859516 1.1879391408007e-13 ENSG00000164104:ENST00000296503:exon_174252846_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000446922:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000438704:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:G A G 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00476_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 7 14 21 3.28480592398339 7.43038815203322 -4.14558222804984 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0814681249897115 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 16 20 36 7.50812782624774 10.6148402171903 -3.10671239094258 A:G G A 10 0.530742010859516 0.320123781383837 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 205574 G/A 1 17 13 30 7.97738581538823 6.89964614117371 1.07773967421452 A:G G A 10 0.530742010859516 0.718793218928822 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 235364 C/T 1 14 16 30 6.56961184796678 8.49187217375226 -1.92226032578548 T:C C T 10 0.530742010859516 0.583995688461342 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_235259_235379:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_235259_235639:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_234536_236714:SDHA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 240563 C/T 1 37 24 61 17.3625455981979 12.7378082606284 4.62473733756952 T:C C T 10 0.530742010859516 0.250469911682219 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_240473_240591:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_240559_240591:SDHA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 256509 G/A 1 145 125 270 68.0424084253702 66.3427513574395 1.69965706793069 A:G G A 10 0.530742010859516 0.855019387698656 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 17 13 30 7.97738581538823 6.89964614117371 1.07773967421452 C:G G C 10 0.530742010859516 0.718793218928822 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 453888 G/A 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 A:G G A 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 1463806 G/A 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1461955_1463950:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1461538_1463950:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1461544_1463950:LPCAT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 1816045 C/T 1 108 106 214 50.6798628271723 56.2586531511087 -5.57879032393642 T:C C T 10 0.530742010859516 0.451967039343169 ENSG00000145494:ENST00000274137:exon_1815965_1816719:NDUFS6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 6600022 C/T 1 50 50 100 23.4628994570242 26.5371005429758 -3.0742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.549229715218629 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 10254817 A/G 1 17 15 32 7.97738581538823 7.96113016289274 0.016255652495488 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10254786_10254950:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10254786_10254835:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10254786_10255142:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10254786_10254950:CCT5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 10256161 T/C 1 15 14 29 7.03886983710726 7.43038815203322 -0.391518314925964 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10256067_10256265:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10256067_10256265:CCT5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 16465400 C/T 1 23 22 45 10.7929337502311 11.6763242389094 -0.88339048867822 T:C C T 10 0.530742010859516 0.881529387823647 ENSG00000173545:ENST00000308683:exon_16465150_16465901:ZNF622 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 17353999 T/A 0 457 0 457 214.450901037201 0 214.450901037201 T T 10 0.530742010859516 2.32944881303022e-126 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 17354033 C/T 0 43 0 43 20.1780935330408 0 20.1780935330408 C C 10 0.530742010859516 1.84760838389580e-12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 A:G A G 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 32395291 T/C 1 4 15 19 1.87703195656194 7.96113016289274 -6.0840982063308 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00545956490535103 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32395265_32395410:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32395265_32395410:ZFR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 37 24 61 17.3625455981979 12.7378082606284 4.62473733756952 A:G G A 10 0.530742010859516 0.250469911682219 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 33751626 C/G 1 38 23 61 17.8318035873384 12.2070662497689 5.62473733756952 C:G C G 10 0.530742010859516 0.159698464713664 ENSG00000151388:ENST00000504830:exon_33751509_33751653:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000352040:exon_33751509_33751653:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000504582:exon_33751509_33751653:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000515401:exon_33751303_33751653:ADAMTS12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 33891937 G/A 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 A:G G A 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000151388:ENST00000504830:exon_33891835_33892297:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000352040:exon_33891835_33892046:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000515401:exon_33891835_33892124:ADAMTS12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 42801268 C/T 0 22 0 22 10.3236757610906 0 10.3236757610906 C C 10 0.530742010859516 9.45032976559925e-07 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000507920:exon_42800921_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000509276:exon_42801030_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000514218:exon_42801036_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000513303:exon_42801207_42801433:SEPP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 52096889 C/A 1 10 8 18 4.69257989140484 4.24593608687613 0.446643804528712 A:C C A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000152684:ENST00000274311:exon_52095719_52096954:PELO;ENSG00000152684:ENST00000381463:exon_52095956_52096954:PELO HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 69 86 155 32.3788012506934 45.6438129339184 -13.265011683225 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0362162505175446 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 27 39 66 12.6699657067931 20.6989384235211 -8.02897271672806 A:C:G C G 10 0.530742010859516 0.0492285429044324 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 64267595 T/C 1 16 26 42 7.50812782624774 13.7992922823474 -6.29116445609967 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0628479864910665 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64267530_64267639:CWC27 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 64881936 A/G 1 6 12 18 2.8155479348429 6.36890413031419 -3.55335619547129 A:G A G 10 0.530742010859516 0.103109047159225 ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 64956673 A/G 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 A:G A G 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000113597:ENST00000399438:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000512009:exon_64956526_64960211:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000438419:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000231526:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000505553:exon_64956526_64956724:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000520525:exon_64956526_64956914:C5orf44;ENSG00000113597:ENST00000509234:exon_64956526_64956724:C5orf44 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 65118738 C/T 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65118609_65119153:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65118609_65119156:NLN;ENSG00000123213:ENST00000515595:exon_65118609_65119065:NLN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 29 20 49 13.608481685074 10.6148402171903 2.99364146788372 T:C T C 10 0.530742010859516 0.474609385246408 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 44 35 79 20.6473515221813 18.5759703800831 2.07138114209824 A:G G A 10 0.530742010859516 0.654054706380581 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 68687792 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000508320:exon_68687658_68687840:RAD17 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 10 9 19 4.69257989140484 4.77667809773564 -0.084098206330804 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 A:T T A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 14 8 22 6.56961184796678 4.24593608687613 2.32367576109065 C:G C G 10 0.530742010859516 0.39515096925501 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 71516687 G/T 1 12 14 26 5.63109586968581 7.43038815203322 -1.79929228234742 T:G G T 10 0.530742010859516 0.557319505160064 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71515236_71516975:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71515238_71516975:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71515355_71516975:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71515356_71516975:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71516411_71516975:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71516664_71516975:MRPS27 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 A:T A T 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 0 0 513 513 0 272.270651570932 -272.270651570932 G A G 10 0.530742010859516 2.71762418511556e-169 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 72874907 A/C 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 A:C A C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72874842_72874975:UTP15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 76343999 T/C 1 3 7 10 1.40777396742145 3.71519407601661 -2.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 0.205910355285428 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76343986_76344097:AGGF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 12 19 31 5.63109586968581 10.0840982063308 -4.453002336645 A:C C A 10 0.530742010859516 0.148846812738497 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C C T 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 80149981 A/G 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80149949_80150135:MSH3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 10 9 19 4.69257989140484 4.77667809773564 -0.084098206330804 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 81572359 A/C 1 8 6 14 3.75406391312387 3.1844520651571 0.569611847966776 A:C A C 10 0.530742010859516 0.796007939511377 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 96248476 G/A 1 15 5 20 7.03886983710726 2.65371005429758 4.38515978280968 A:G G A 10 0.530742010859516 0.070745638899293 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96248341_96248502:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96248341_96248502:ERAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 10 12 22 4.69257989140484 6.36890413031419 -1.67632423890935 A:G G A 10 0.530742010859516 0.525900865788529 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 96503378 T/C 1 48 35 83 22.5243834787432 18.5759703800831 3.94841309866017 T:C T C 10 0.530742010859516 0.441666368422636 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511012:exon_96503171_96503423:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 96503523 C/T 1 22 22 44 10.3236757610906 11.6763242389094 -1.3526484778187 T:C C T 10 0.530742010859516 0.76313456343339 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 112222787 C/T 1 75 64 139 35.1943491855363 33.967488695009 1.22686049052727 T:C C T 10 0.530742010859516 0.865296557866026 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000497856:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000261482:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000474542:exon_112222712_112222880:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112222712_112222880:REEP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 3 11 14 1.40777396742145 5.83816211945468 -4.43038815203322 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0284599459437032 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 118728953 G/C 1 25 26 51 11.7314497285121 13.7992922823474 -2.06784255383532 C:G G C 10 0.530742010859516 0.577543501428116 ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 118877660 A/G 1 51 42 93 23.9321574461647 22.2911644560997 1.64099299006501 A:G A G 10 0.530742010859516 0.756245658211053 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 118877677 C/T 1 44 42 86 20.6473515221813 22.2911644560997 -1.64381293391838 T:C C T 10 0.530742010859516 0.746671160676261 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 125944131 G/C 1 12 16 28 5.63109586968581 8.49187217375226 -2.86077630406645 C:G G C 10 0.530742010859516 0.344453418961431 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125944056_125944176:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125944056_125944176:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000511371:exon_125944049_125944176:PHAX HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 126140540 G/A 1 2 8 10 0.938515978280968 4.24593608687613 -3.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0536315808592461 ENSG00000113368:ENST00000460265:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000261366:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000504788:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000472034:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000492190:exon_126140468_126140606:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000395354:exon_126140468_126140624:LMNB1;ENSG00000113368:ENST00000463908:exon_126140468_126140624:LMNB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 130500842 A/G 1 452 427 879 212.104611091499 226.626838637013 -14.5222275455145 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.327317798164324 ENSG00000169567:ENST00000304043:exon_130500788_130501178:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000511475:exon_130500788_130500933:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508495:exon_130500788_130500994:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513345:exon_130500753_130501026:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000504202:exon_130500753_130500913:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508488:exon_130500788_130501018:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506908:exon_130500788_130501034:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513012:exon_130500753_130500949:HINT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 131977963 T/C 1 38 46 84 17.8318035873384 24.4141324995377 -6.58232891219934 T:C T C 10 0.530742010859516 0.156505216628160 ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131977870_131978168:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131977870_131979752:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131977870_131978168:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131977870_131979581:RAD50 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 18 16 34 8.44664380452871 8.49187217375226 -0.045228369223544 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 143 134 277 67.1038924470892 71.1194294551752 -4.01553700808594 A:G A G 10 0.530742010859516 0.630693413657138 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 76 64 140 35.6636071746768 33.967488695009 1.69611847966776 A:G A G 10 0.530742010859516 0.799895747107138 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 137522106 A/G 1 21 13 34 9.85441777195016 6.89964614117371 2.95477163077646 A:G A G 10 0.530742010859516 0.390740321812299 ENSG00000112984:ENST00000394894:exon_137521983_137522120:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000508792:exon_137521983_137522120:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000502338:exon_137521983_137522120:KIF20A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 14 32 46 6.56961184796678 16.9837443475045 -10.4141324995377 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0027357513372065 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 137910987 A/C 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 A:C A C 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137910927_137911133:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137910927_137911090:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000504902:exon_137910927_137911029:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507115:exon_137910927_137911092:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000505110:exon_137910927_137911090:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000506477:exon_137910927_137911100:HSPA9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 138266546 G/A 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000044115:ENST00000521724:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000302763:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000518825:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000355078:exon_138266519_138266624:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000521387:exon_138266519_138266763:CTNNA1;ENSG00000044115:ENST00000520520:exon_138266519_138266624:CTNNA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 139060114 G/A 1 10 1 11 4.69257989140484 0.530742010859516 4.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0133615124651987 ENSG00000171604:ENST00000502295:exon_139059949_139060314:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504944:exon_139059949_139060415:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000302517:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000507139:exon_139059949_139060141:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504844:exon_139059949_139060591:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502336:exon_139059949_139060350:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000520967:exon_139059949_139060521:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511048:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000512816:exon_139059949_139060328:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000509238:exon_139059949_139060403:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502716:exon_139059949_139060651:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000503511:exon_139059949_139060358:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511457:exon_139059949_139060698:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511591:exon_139059949_139060132:CXXC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 139060486 G/A 1 23 9 32 10.7929337502311 4.77667809773564 6.01625565249549 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0343759337465895 ENSG00000171604:ENST00000302517:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000504844:exon_139059949_139060591:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000520967:exon_139059949_139060521:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511048:exon_139059949_139061032:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000502716:exon_139059949_139060651:CXXC5;ENSG00000171604:ENST00000511457:exon_139059949_139060698:CXXC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 139936835 G/A 1 17 10 27 7.97738581538823 5.30742010859516 2.66996570679307 A:G G A 10 0.530742010859516 0.339565067535051 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 140903792 G/A 1 14 2 16 6.56961184796678 1.06148402171903 5.50812782624774 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00527314050424029 ENSG00000131504:ENST00000476339:exon_140903710_140904322:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000448451:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000468119:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140903710_140903796:DIAPH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 141007732 C/T 1 12 6 18 5.63109586968581 3.1844520651571 2.44664380452871 T:C C T 10 0.530742010859516 0.34554633606434 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141007681_141007754:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141007681_141007754:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000459727:exon_141007681_141007754:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000467533:exon_141007681_141007754:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000492407:exon_141007681_141008206:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523088:exon_141007681_141007754:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000519474:exon_141007681_141007754:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000476739:exon_141007466_141007754:HDAC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 A:C C A 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 141024202 G/A 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141024140_141024257:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518499:exon_141024197_141024257:FCHSD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 145872524 C/G 1 15 10 25 7.03886983710726 5.30742010859516 1.7314497285121 C:G C G 10 0.530742010859516 0.551412457611138 ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000515203:exon_145872483_145872528:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000505285:exon_145872432_145872601:TCERG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 148930447 G/A 1 12 7 19 5.63109586968581 3.71519407601661 1.9159017936692 A:G G A 10 0.530742010859516 0.492140981990386 ENSG00000113712:ENST00000261798:exon_148930405_148930960:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000377843:exon_148930405_148931007:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000515768:exon_148930405_148930527:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000322237:exon_148930405_148930527:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000523203:exon_148930405_148930919:CSNK1A1;ENSG00000113712:ENST00000515748:exon_148930405_148930731:CSNK1A1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 149374399 C/T 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 T:C C T 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000164296:ENST00000296736:exon_149372681_149375992:TIGD6;ENSG00000164296:ENST00000515406:exon_149374291_149375992:TIGD6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 T:C T C 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 3683 3688 7371 1728.2771740044 1957.3765360499 -229.099362045493 A:T:C:G C T 10 0.530742010859516 9.57177895559857e-08 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 150483158 A/G 1 382 430 812 179.256551851665 228.219064669592 -48.962512817927 A:T:G A G 10 0.530742010859516 0.000639917407935625 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150483131_150483253:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000522664:exon_150483131_150483253:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150483131_150483253:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150483131_150483253:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150483131_150483253:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150483131_150483253:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150483131_150483253:ANXA6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 30 24 54 14.0777396742145 12.7378082606284 1.33993141358614 T:C T C 10 0.530742010859516 0.785679923783618 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 157166495 T/C 1 48 58 106 22.5243834787432 30.7830366298519 -8.2586531511087 T:C T C 10 0.530742010859516 0.119438859755270 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157166329_157168456:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157166329_157166586:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157166329_157167443:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157166329_157166706:THG1L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 159437621 C/G 1 36 40 76 16.8932876090574 21.2296804343806 -4.33639282532322 C:G C G 10 0.530742010859516 0.358219560993405 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159437507_159437865:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159437507_159437865:TTC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 159463719 C/T 1 15 13 28 7.03886983710726 6.89964614117371 0.139223695933552 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159463698_159463810:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159463698_159463810:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522073:exon_159463513_159463810:TTC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 162884013 T/C 1 13 19 32 6.10035385882629 10.0840982063308 -3.98374434750451 T:C T C 10 0.530742010859516 0.214428312828723 ENSG00000170584:ENST00000302764:exon_162883935_162884086:NUDCD2;ENSG00000170584:ENST00000519395:exon_162883970_162884086:NUDCD2;ENSG00000170584:ENST00000521797:exon_162883994_162884086:NUDCD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 167933756 T/C 1 34 16 50 15.9547716307765 8.49187217375226 7.4628994570242 A:T:C T C 10 0.530742010859516 0.0461958514045667 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167933727_167933836:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167933727_167933836:RARS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 8 15 23 3.75406391312387 7.96113016289274 -4.20706624976887 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0949549088678605 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 T:C C T 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 169504743 T/C 1 12 20 32 5.63109586968581 10.6148402171903 -4.98374434750451 T:C T C 10 0.530742010859516 0.109483713909064 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 11 11 22 5.16183788054532 5.83816211945468 -0.676324238909352 A:G A G 10 0.530742010859516 0.832742756726426 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 A:G A G 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 35 29 64 16.4240296199169 15.391518314926 1.03251130499098 C:G G C 10 0.530742010859516 0.803942100201889 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 18 20 38 8.44664380452871 10.6148402171903 -2.16819641266161 A:T:G A G 10 0.530742010859516 0.518201366421327 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 20 14 34 9.38515978280968 7.43038815203322 1.95477163077646 T:C T C 10 0.530742010859516 0.60701016639997 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 9 5 14 4.22332190226436 2.65371005429758 1.56961184796678 T:C C T 10 0.530742010859516 0.436312573490878 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 176923436 C/T 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000505074:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355572:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393546:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000506161:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000463411:exon_176923418_176923524:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000506537:exon_176923418_176923878:PDLIM7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 177020713 T/C 1 51 54 105 23.9321574461647 28.6600685864139 -4.72791114024918 T:C T C 10 0.530742010859516 0.37952056608372 ENSG00000184840:ENST00000332598:exon_177020651_177020776:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000505521:exon_177020651_177021116:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000507723:exon_177020651_177021286:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000513799:exon_177020651_177020776:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000510499:exon_177020223_177020776:TMED9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 177020752 C/T 1 47 43 90 22.0551254896027 22.8219064669592 -0.76678097735644 T:C C T 10 0.530742010859516 0.916045207387586 ENSG00000184840:ENST00000332598:exon_177020651_177020776:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000505521:exon_177020651_177021116:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000507723:exon_177020651_177021286:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000513799:exon_177020651_177020776:TMED9;ENSG00000184840:ENST00000510499:exon_177020223_177020776:TMED9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 177483184 A/G 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 A A 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 177548555 G/A 1 11 17 28 5.16183788054532 9.02261418461177 -3.86077630406645 A:G G A 10 0.530742010859516 0.184567835501249 ENSG00000145911:ENST00000274605:exon_177548475_177553088:N4BP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 179036433 G/A 1 8 12 20 3.75406391312387 6.36890413031419 -2.61484021719032 A:G G A 10 0.530742010859516 0.268606212218767 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 179228623 G/A 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228554_179228692:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228334_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228554_179228719:MGAT4B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 53 47 100 24.8706734244457 24.9448745103973 -0.0742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 9 17 26 4.22332190226436 9.02261418461177 -4.79929228234742 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0758785877818065 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 180218820 C/A 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 A:C C A 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 5 180651689 C/T 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 T:C C T 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000358801:exon_180651500_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000421508:exon_180651496_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 345906 G/A 1 28 16 44 13.1392236959336 8.49187217375226 4.6473515221813 A:G G A 10 0.530742010859516 0.175958002950069 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_345854_345928:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_345854_345928:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_345854_345928:DUSP22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 348195 G/A 1 19 16 35 8.9159017936692 8.49187217375226 0.42402961991694 A:C:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 105 48 153 49.2720888597508 25.4756165212568 23.7964723384941 A:G G A 10 0.530742010859516 0.000125222684218713 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 3152760 T/C 1 11 6 17 5.16183788054532 3.1844520651571 1.97738581538823 T:C T C 10 0.530742010859516 0.467310697914147 ENSG00000137274:ENST00000434640:exon_3152722_3152809:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000424847:exon_3152722_3152903:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000430655:exon_3152722_3153429:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380375:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380368:exon_3152722_3153428:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000433912:exon_3152722_3152879:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000380379:exon_3152722_3153812:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000490918:exon_3152722_3153296:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000488487:exon_3152722_3152767:BPHL;ENSG00000137274:ENST00000464040:exon_3152722_3153280:BPHL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 3850849 C/T 0 0 16 16 0 8.49187217375226 -8.49187217375226 T C T 10 0.530742010859516 5.52823891626306e-06 ENSG00000145945:ENST00000380274:exon_3849620_3851551:FAM50B;ENSG00000145945:ENST00000380272:exon_3850023_3851551:FAM50B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 60 50 110 28.155479348429 26.5371005429758 1.61837880545324 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.77525885361509 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 4996644 T/C 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4996456_4996654:RPP40 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 5260936 A/C 1 21 24 45 9.85441777195016 12.7378082606284 -2.88339048867822 A:C A C 10 0.530742010859516 0.455751006750714 ENSG00000214113:ENST00000468929:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000330636:exon_5260881_5261172:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000464010:exon_5260881_5260966:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000480566:exon_5260881_5260975:LYRM4;ENSG00000214113:ENST00000455814:exon_5260881_5260954:LYRM4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 8413890 A/G 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 A:G A G 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 14 7 21 6.56961184796678 3.71519407601661 2.85441777195016 A:G G A 10 0.530742010859516 0.275274657227659 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 12164612 C/G 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 C:G C G 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 13791073 C/T 1 28 17 45 13.1392236959336 9.02261418461177 4.11660951132178 T:C C T 10 0.530742010859516 0.235115382980705 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13791020_13791096:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13791020_13791096:CCDC90A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 20109842 T/C 1 18 6 24 8.44664380452871 3.1844520651571 5.26219173937162 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0394128718512755 ENSG00000172197:ENST00000324607:exon_20109829_20109980:MBOAT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 A:G G A 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 22287745 C/T 1 2 41 43 0.938515978280968 21.7604224452402 -20.8219064669592 T:C C T 10 0.530742010859516 1.04245680210506e-11 ENSG00000172179:ENST00000306482:exon_22287480_22287822:PRL;ENSG00000172179:ENST00000438606:exon_22287480_22287822:PRL;ENSG00000172179:ENST00000397199:exon_22287480_22287822:PRL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 34 22 56 15.9547716307765 11.6763242389094 4.2784473918671 A:G G A 10 0.530742010859516 0.285034181474728 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 26045929 T/C 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000196532:ENST00000360577:exon_26045612_26047022:HIST1H3C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 26104280 T/C 1 40 56 96 18.7703195656194 29.7215526081329 -10.9512330425135 A:T:C T C 10 0.530742010859516 0.0312359088394515 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 26124430 C/T 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000180573:ENST00000377791:exon_26124373_26124969:HIST1H2AC;ENSG00000180573:ENST00000314088:exon_26124418_26124977:HIST1H2AC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 26545418 C/T 1 10 13 23 4.69257989140484 6.89964614117371 -2.20706624976887 T:C C T 10 0.530742010859516 0.406857310619905 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 A:G A G 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 27775674 A/G 1 11 8 19 5.16183788054532 4.24593608687613 0.915901793669196 A:G A G 10 0.530742010859516 0.819237521224916 ENSG00000185130:ENST00000377401:exon_27775257_27775709:HIST1H2BL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 30029343 G/T 1 22 27 49 10.3236757610906 14.3300342932069 -4.00635853211628 T:G G T 10 0.530742010859516 0.256340518156607 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30026676_30030110:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30029031_30029446:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30029292_30029446:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30029292_30029446:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30029292_30029446:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30029292_30029446:ZNRD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 30036927 G/C 1 10 2 12 4.69257989140484 1.06148402171903 3.63109586968581 C:G G C 10 0.530742010859516 0.042862170540714 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30036881_30038110:PPP1R11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 30457766 G/A 1 150 113 263 70.3886983710726 59.9738472271253 10.4148511439473 A:G G A 10 0.530742010859516 0.216567205552864 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 96 117 213 45.0487669574865 62.0968152705634 -17.0480483130769 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0196408219565428 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 12 13 25 5.63109586968581 6.89964614117371 -1.2685502714879 A:G G A 10 0.530742010859516 0.690401884163373 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 11 15 26 5.16183788054532 7.96113016289274 -2.79929228234742 A:G G A 10 0.530742010859516 0.327177533704281 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 93 60 153 43.640992990065 31.844520651571 11.7964723384941 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0622462886537671 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 92 64 156 43.1717350009245 33.967488695009 9.2042463059155 C:G G C 10 0.530742010859516 0.149019946738651 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31110789 T/C 1 78 58 136 36.6021231529578 30.7830366298519 5.81908652310582 T:C T C 10 0.530742010859516 0.344964826239544 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 23 19 42 10.7929337502311 10.0840982063308 0.708835543900328 T:C T C 10 0.530742010859516 0.877972770022112 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31112737 C/A 1 15 13 28 7.03886983710726 6.89964614117371 0.139223695933552 A:C C A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 26 11 37 12.2007077176526 5.83816211945468 6.36254559819791 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0467955052880676 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 19 9 28 8.9159017936692 4.77667809773564 4.13922369593355 A:G G A 10 0.530742010859516 0.132131396679065 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31113239 C/G 1 10 27 37 4.69257989140484 14.3300342932069 -9.63745440180209 C:G C G 10 0.530742010859516 0.00156451665107171 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31113225_31113270:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 A:G G A 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 11 4 15 5.16183788054532 2.12296804343806 3.03886983710726 C:G C G 10 0.530742010859516 0.12884907544869 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 T:C T C 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31236900 G/A 1 335 580 915 157.201426362062 307.830366298519 -150.628939936457 A:T:C:G G A 10 0.530742010859516 1.65977759406868e-23 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31236526_31236950:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31236526_31236950:HLA-C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31238868 C/T 1 30 4 34 14.0777396742145 2.12296804343806 11.9547716307765 T:C C T 10 0.530742010859516 1.86226266460710e-05 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31238850_31239108:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31238850_31239125:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31238850_31239125:HLA-C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31239543 C/T 1 4 10 14 1.87703195656194 5.30742010859516 -3.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.104987115908570 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31322470 C/G 1 24 12 36 11.2621917393716 6.36890413031419 4.89328760905742 C:G C G 10 0.530742010859516 0.132025770173196 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31322885 T/A 1 2212 2138 4350 1037.99867197875 1134.72641921765 -96.7277472388946 A:T T A 10 0.530742010859516 0.00336692339683193 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31322888 A/G 1 2052 2180 4232 962.917393716273 1157.01758367374 -194.100189957472 A:T:C:G A G 10 0.530742010859516 2.45959457816706e-09 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1933 1044 2977 907.075693008556 554.094659337335 352.981033671221 T:C:G C T 10 0.530742010859516 4.21842848478887e-39 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31323184 C/T 1 1325 1721 3046 621.766835611141 913.407000689227 -291.640165078086 T:C:G C T 10 0.530742010859516 3.77678069823807e-26 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31549407 C/T 1 119 105 224 55.8417007077176 55.7279111402492 0.113789567468416 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000227507:ENST00000483972:exon_31549336_31549407:LTB;ENSG00000227507:ENST00000429299:exon_31549336_31549407:LTB;ENSG00000227507:ENST00000446745:exon_31549336_31549407:LTB;ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31549336_31550183:LTB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31590898 C/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 13 14 27 6.10035385882629 7.43038815203322 -1.33003429320693 A:G G A 10 0.530742010859516 0.700960869465827 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 40 27 67 18.7703195656194 14.3300342932069 4.44028527241243 A:G A G 10 0.530742010859516 0.327597938471543 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 92 88 180 43.1717350009245 46.7052969556374 -3.53356195471288 T:C C T 10 0.530742010859516 0.602054281734634 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 C:G G C 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 A:G A G 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 28 42 70 13.1392236959336 22.2911644560997 -9.15194076016612 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0310288756652334 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 17 21 38 7.97738581538823 11.1455822280498 -3.16819641266161 A:C C A 10 0.530742010859516 0.331987679344178 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 22 11 33 10.3236757610906 5.83816211945468 4.48551364163597 T:C C T 10 0.530742010859516 0.161947283390806 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 11 10 21 5.16183788054532 5.30742010859516 -0.145582228049836 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31731933 G/A 1 11 8 19 5.16183788054532 4.24593608687613 0.915901793669196 A:G G A 10 0.530742010859516 0.819237521224916 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 27 15 42 12.6699657067931 7.96113016289274 4.70883554390033 A:G G A 10 0.530742010859516 0.165181198909722 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31750509 G/A 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31750498_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31750498_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000474643:exon_31750307_31750622:VARS;ENSG00000204394:ENST00000461328:exon_31750189_31750622:VARS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31938412 G/T 1 9 12 21 4.22332190226436 6.36890413031419 -2.14558222804984 T:G G T 10 0.530742010859516 0.387253302097606 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 31938451 T/C 1 8 11 19 3.75406391312387 5.83816211945468 -2.0840982063308 T:C T C 10 0.530742010859516 0.366013294263512 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 0 11 0 11 5.16183788054532 0 5.16183788054532 G G 10 0.530742010859516 0.00118423490807728 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 32 17 49 15.0162556524955 9.02261418461177 5.99364146788372 A:G A G 10 0.530742010859516 0.114467688046052 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32148911 G/C 1 24 22 46 11.2621917393716 11.6763242389094 -0.414132499537736 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000204305:ENST00000469940:exon_32148745_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000488669:exon_32148745_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000473619:exon_32148745_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375067:exon_32148745_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375055:exon_32148745_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000484849:exon_32148745_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375076:exon_32148745_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375065:exon_32148745_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375070:exon_32148747_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375069:exon_32148747_32149016:AGER;ENSG00000204305:ENST00000375059:exon_32148747_32149016:AGER HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 30 36 66 14.0777396742145 19.1067123909426 -5.02897271672806 T:C T C 10 0.530742010859516 0.220080597350676 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32714143 G/A 0 13 0 13 6.10035385882629 0 6.10035385882629 G G 10 0.530742010859516 0.000318645736308562 ENSG00000237541:ENST00000374940:exon_32714017_32714191:HLA-DQA2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32784676 C/T 1 32 26 58 15.0162556524955 13.7992922823474 1.21696337014807 T:C C T 10 0.530742010859516 0.793419013992302 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32797809 C/T 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797707_32797866:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797707_32797866:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32800224 C/A 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 A:C C A 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 6 10 16 2.8155479348429 5.30742010859516 -2.49187217375226 T:C C T 10 0.530742010859516 0.223009840929929 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32814942 C/T 1 80 71 151 37.5406391312387 37.6826827710256 -0.14204363978692 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 98 93 191 45.9872829357674 49.359007009935 -3.37172407416755 T:C T C 10 0.530742010859516 0.663729127318133 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32816772 C/A 1 68 74 142 31.9095432615529 39.2749088036042 -7.36536554205127 A:C C A 10 0.530742010859516 0.239146273513439 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32816429_32817919:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32816767_32816895:TAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 17 29 46 7.97738581538823 15.391518314926 -7.41413249953774 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0375340440490833 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 121 107 228 56.7802166859986 56.7893951619682 -0.00917847596964805 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 160 133 293 75.0812782624774 70.5886874443156 4.49259081816182 A:T:C:G G A 10 0.530742010859516 0.6396814748657 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32916555 G/A 1 201 296 497 94.3208558172373 157.099635214417 -62.7787793971794 A:G G A 10 0.530742010859516 2.12467949519245e-08 ENSG00000204257:ENST00000480785:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395305:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000395303:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000477541:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000374843:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000532100:exon_32916390_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000341486:exon_32916391_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000473725:exon_32916518_32916645:HLA-DMA;ENSG00000204257:ENST00000464392:exon_32916548_32916645:HLA-DMA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32917042 A/C 1 9 10 19 4.22332190226436 5.30742010859516 -1.0840982063308 A:C A C 10 0.530742010859516 0.651962958706861 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 71 95 166 33.3173172289744 50.420491031654 -17.1031738026797 T:C T C 10 0.530742010859516 0.00814966382884453 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 1067 862 1929 500.698274412896 457.499613360903 43.1986610519936 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0497777498920527 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33037474 A/G 1 355 297 652 166.586586144872 157.630377225276 8.95620891959558 A:G A G 10 0.530742010859516 0.504786708194624 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33037639 G/A 1 244 6 250 114.498949350278 3.1844520651571 111.314497285121 A:G G A 10 0.530742010859516 4.82866029590879e-58 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33037640 C/T 1 246 7 253 115.437465328559 3.71519407601661 111.722271252542 T:C C T 10 0.530742010859516 1.77902545487675e-57 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 804 235 1039 377.283423268949 124.724372551986 252.559050716963 T:C T C 10 0.530742010859516 4.92147132968831e-59 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 916 322 1238 429.840318052683 170.898927496764 258.941390555919 T:C C T 10 0.530742010859516 1.64276828248463e-51 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 802 369 1171 376.344907290668 195.843802007161 180.501105283507 A:T:C T C 10 0.530742010859516 8.7724128268554e-27 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33053609 G/A 1 1309 1057 2366 614.258707784894 560.994305478508 53.2644023063851 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.0289959164010806 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33163451 G/A 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 A:G G A 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33173666 G/C 1 45 41 86 21.1166095113218 21.7604224452402 -0.643812933918376 C:G G C 10 0.530742010859516 0.914258117747078 ENSG00000204228:ENST00000374662:exon_33173605_33173689:HSD17B8;ENSG00000204228:ENST00000469186:exon_33173605_33173689:HSD17B8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33258619 C/A 1 85 49 134 39.8869290769411 26.0063585321163 13.8805705448249 A:C:G C A 10 0.530742010859516 0.0191208512953436 ENSG00000204220:ENST00000395131:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374606:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374610:exon_33258493_33258639:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374607:exon_33258493_33258698:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 48 37 85 22.5243834787432 19.6374544018021 2.88692907694114 C:G G C 10 0.530742010859516 0.587319469016982 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 33373341 C/T 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33372629_33373408:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33372629_33373408:KIFC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 12 14 26 5.63109586968581 7.43038815203322 -1.79929228234742 T:C C T 10 0.530742010859516 0.557319505160064 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 51 53 104 23.9321574461647 28.1293265755543 -4.19716912938966 T:C T C 10 0.530742010859516 0.432721114667264 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.353006242686502 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 T:C C T 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 41250466 T/A 1 12 28 40 5.63109586968581 14.8607763040664 -9.22968043438064 A:T T A 10 0.530742010859516 0.00396703441019042 ENSG00000124731:ENST00000244709:exon_41250133_41250489:TREM1;ENSG00000124731:ENST00000334475:exon_41250133_41250489:TREM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 79 59 138 37.0713811420982 31.3137786407114 5.75760250138679 T:C T C 10 0.530742010859516 0.34868513254625 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 41655698 G/A 1 14 15 29 6.56961184796678 7.96113016289274 -1.39151831492596 A:G G A 10 0.530742010859516 0.710650929425754 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000494822:exon_41655491_41655938:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41655648_41655766:TFEB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 41658524 C/T 1 21 18 39 9.85441777195016 9.55335619547129 0.301061576478876 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658401_41658655:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658401_41658655:TFEB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:C C T 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:T T A 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42713223 T/G 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 T:G T G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42713274 G/A 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:G G A 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42713307 G/A 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:G G A 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42713779 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42978678 C/T 1 17 8 25 7.97738581538823 4.24593608687613 3.7314497285121 T:C C T 10 0.530742010859516 0.162030927973593 ENSG00000112640:ENST00000485511:exon_42978619_42978735:PPP2R5D;ENSG00000112640:ENST00000394110:exon_42978619_42978735:PPP2R5D;ENSG00000112640:ENST00000472118:exon_42978619_42978735:PPP2R5D;ENSG00000112640:ENST00000230402:exon_42978619_42978735:PPP2R5D;ENSG00000112640:ENST00000461010:exon_42978619_42978735:PPP2R5D;ENSG00000112640:ENST00000470467:exon_42978619_42978735:PPP2R5D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 17 11 28 7.97738581538823 5.83816211945468 2.13922369593355 T:C T C 10 0.530742010859516 0.454218431442092 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 17 9 26 7.97738581538823 4.77667809773564 3.20070771765258 C:G C G 10 0.530742010859516 0.241501974585846 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 92 106 198 43.1717350009245 56.2586531511087 -13.0869181501842 A:C:G A G 10 0.530742010859516 0.0643311536148183 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 43008691 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008653_43008813:CUL7;ENSG00000137171:ENST00000467906:exon_43008515_43008862:KLC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 281 230 511 131.861494948476 122.070662497689 9.79083245078732 A:G G A 10 0.530742010859516 0.399851348459362 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 44223292 C/T 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 T:C C T 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 44232920 A/G 1 21 20 41 9.85441777195016 10.6148402171903 -0.760422445240156 A:G A G 10 0.530742010859516 0.87617002566582 ENSG00000146232:ENST00000275015:exon_44232719_44233500:NFKBIE;ENSG00000146232:ENST00000477930:exon_44232719_44233500:NFKBIE HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 9 17 26 4.22332190226436 9.02261418461177 -4.79929228234742 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0758785877818065 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 21 13 34 9.85441777195016 6.89964614117371 2.95477163077646 A:T T A 10 0.530742010859516 0.390740321812299 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 52137169 G/A 1 28 32 60 13.1392236959336 16.9837443475045 -3.84452065157096 A:G G A 10 0.530742010859516 0.365654187994418 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52137099_52137249:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52137099_52137249:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52137099_52137249:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000421471:exon_52137099_52137249:MCM3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 56484758 C/T 1 15 5 20 7.03886983710726 2.65371005429758 4.38515978280968 T:C C T 10 0.530742010859516 0.070745638899293 ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 G G 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 8 8 16 3.75406391312387 4.24593608687613 -0.491872173752256 A:G A G 10 0.530742010859516 0.808460239037292 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C C T 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:G A G 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 80746196 T/C 1 4 8 12 1.87703195656194 4.24593608687613 -2.36890413031419 T:C T C 10 0.530742010859516 0.247464678046888 ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80746192_80746316:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80746192_80746316:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80746192_80746316:TTK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 83880099 G/A 1 4 10 14 1.87703195656194 5.30742010859516 -3.43038815203322 A:G G A 10 0.530742010859516 0.104987115908570 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 49 44 93 22.9936414678837 23.3526484778187 -0.359007009934988 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 99825348 T/C 1 10 7 17 4.69257989140484 3.71519407601661 0.977385815388228 T:C T C 10 0.530742010859516 0.809001678476656 ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99825262_99825361:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99825262_99825361:COQ3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 18 15 33 8.44664380452871 7.96113016289274 0.485513641635972 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 23 20 43 10.7929337502311 10.6148402171903 0.178093533040812 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 21 12 33 9.85441777195016 6.36890413031419 3.48551364163597 A:G G A 10 0.530742010859516 0.295299730825511 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 6 6 12 2.8155479348429 3.1844520651571 -0.368904130314192 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 110146497 G/A 1 26 33 59 12.2007077176526 17.514486358364 -5.31377864071144 A:G G A 10 0.530742010859516 0.192119705804479 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 118791804 T/C 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118791700_118791807:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118791700_118791807:C6orf204 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 118803021 T/G 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 T:C:G T G 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118802942_118803096:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118802942_118803096:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118802966_118803096:C6orf204 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 118803091 C/G 1 21 11 32 9.85441777195016 5.83816211945468 4.01625565249549 C:G C G 10 0.530742010859516 0.161814025615923 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118802942_118803096:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118802942_118803096:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118802966_118803096:C6orf204 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 132793484 A/G 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:G A G 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000079950:ENST00000434788:exon_132793455_132793514:STX7;ENSG00000079950:ENST00000367941:exon_132793421_132793514:STX7;ENSG00000079950:ENST00000448348:exon_132793421_132793514:STX7;ENSG00000079950:ENST00000367937:exon_132793421_132793514:STX7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 133138600 G/A 1 16 24 40 7.50812782624774 12.7378082606284 -5.22968043438064 A:G G A 10 0.530742010859516 0.113295163467159 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 136560948 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000146410:ENST00000451457:exon_136560604_136560958:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000367784:exon_136560604_136560958:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000420702:exon_136560604_136560958:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000275229:exon_136560604_136560958:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000532282:exon_136560604_136560958:FAM54A;ENSG00000146410:ENST00000418509:exon_136560608_136560958:FAM54A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 136597174 G/A 0 102 0 102 47.8643148923294 0 47.8643148923294 G G 10 0.530742010859516 1.64476660215889e-28 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 116 0 116 54.4339267402961 0 54.4339267402961 T T 10 0.530742010859516 1.50756754445362e-32 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 122 0 122 57.249474675139 0 57.249474675139 A A 10 0.530742010859516 3.08443247765176e-34 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 122 0 122 57.249474675139 0 57.249474675139 A A 10 0.530742010859516 3.08443247765176e-34 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 G G 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 T T 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 136599458 C/T 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 C C 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 139233903 G/A 1 17 13 30 7.97738581538823 6.89964614117371 1.07773967421452 A:G G A 10 0.530742010859516 0.718793218928822 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000478483:exon_139233902_139234008:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000484164:exon_139233812_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000492787:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000530370:exon_139233902_139233974:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529423:exon_139233902_139234087:REPS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 143823074 A/G 1 15 17 32 7.03886983710726 9.02261418461177 -1.98374434750451 A:G A G 10 0.530742010859516 0.485769329269364 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 149262510 C/T 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000111962:ENST00000367463:exon_149262415_149262570:UST HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 73 55 128 34.2558332072553 29.1908105972734 5.06502260998196 C:G G C 10 0.530742010859516 0.37748442896585 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 152443744 G/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:G G T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 153296370 G/A 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 153603782 G/A 0 7950 3 7953 3730.60101366685 1.59222603257855 3729.00878763427 T:C:G G T 10 0.530742010859516 4.94065645841247e-324 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 155581523 G/A 1 9 8 17 4.22332190226436 4.24593608687613 -0.022614184611772 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000146426:ENST00000528928:exon_155581412_155581751:TIAM2;ENSG00000146426:ENST00000462408:exon_155581407_155581751:TIAM2;ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155581407_155581534:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155581407_155581534:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155581407_155581702:TFB1M HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 159058891 T/C 1 12 16 28 5.63109586968581 8.49187217375226 -2.86077630406645 T:C T C 10 0.530742010859516 0.344453418961431 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159058803_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367088:exon_159057506_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159058252_159058926:DYNLT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 A:G A G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 160189590 G/A 1 31 35 66 14.546997663355 18.5759703800831 -4.02897271672806 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.326822899026883 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160189543_160189660:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000467951:exon_160189543_160189660:ACAT2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 160212005 A/G 1 10 20 30 4.69257989140484 10.6148402171903 -5.92226032578548 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0424702406918103 ENSG00000112110:ENST00000476826:exon_160211972_160212158:MRPL18;ENSG00000112110:ENST00000479638:exon_160211972_160212158:MRPL18;ENSG00000112110:ENST00000367034:exon_160211972_160212158:MRPL18;ENSG00000112110:ENST00000480842:exon_160211972_160212158:MRPL18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 161557662 G/A 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000026652:ENST00000320285:exon_161551057_161557666:AGPAT4;ENSG00000026652:ENST00000457520:exon_161557107_161557666:AGPAT4;ENSG00000026652:ENST00000366911:exon_161557107_161557666:AGPAT4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 166572045 C/T 1 12 15 27 5.63109586968581 7.96113016289274 -2.33003429320693 T:C C T 10 0.530742010859516 0.441876209223122 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 320 462 782 150.162556524955 245.202809017096 -95.0402524921415 A:G A G 10 0.530742010859516 1.03417698442314e-11 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 11 3 14 5.16183788054532 1.59222603257855 3.56961184796678 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0638641251547832 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 11 3 14 5.16183788054532 1.59222603257855 3.56961184796678 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0638641251547832 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 33 26 59 15.485513641636 13.7992922823474 1.68622135928856 A:T A T 10 0.530742010859516 0.69706433224183 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 1513227 G/A 1 15 17 32 7.03886983710726 9.02261418461177 -1.98374434750451 A:G G A 10 0.530742010859516 0.485769329269364 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1513202_1513329:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1513202_1513329:INTS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 2290643 C/T 1 60 47 107 28.155479348429 24.9448745103973 3.21060483803179 T:C C T 10 0.530742010859516 0.562079886228452 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 2304028 G/A 1 15 9 24 7.03886983710726 4.77667809773564 2.26219173937162 A:G G A 10 0.530742010859516 0.416585330003095 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2303933_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000479689:exon_2303933_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435060:exon_2304001_2304093:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000457286:exon_2304028_2304093:SNX8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 2317738 G/A 1 16 20 36 7.50812782624774 10.6148402171903 -3.10671239094258 A:G G A 10 0.530742010859516 0.320123781383837 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435060:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000457286:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435336:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000494722:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000447136:exon_2317735_2317940:SNX8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 2419944 G/T 1 280 273 553 131.392236959336 144.892568964648 -13.5003320053123 T:G G T 10 0.530742010859516 0.250382532311883 ENSG00000106263:ENST00000360876:exon_2419839_2420378:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000397011:exon_2419914_2420380:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000314800:exon_2419914_2420077:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000475415:exon_2419839_2420375:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000468611:exon_2419914_2420375:EIF3B;ENSG00000106263:ENST00000465670:exon_2419029_2420375:EIF3B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 2577960 G/A 1 32 24 56 15.0162556524955 12.7378082606284 2.2784473918671 A:G G A 10 0.530742010859516 0.593496392999229 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 40 41 81 18.7703195656194 21.7604224452402 -2.9901028796208 T:C T C 10 0.530742010859516 0.506872377186768 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 4825314 C/T 1 7 9 16 3.28480592398339 4.77667809773564 -1.49187217375226 T:C C T 10 0.530742010859516 0.466295397647597 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 5567484 G/A 1 3525 3856 7381 1654.13441172021 2046.54119387429 -392.406782154088 A:T:C:G G A 10 0.530742010859516 6.28664100806902e-20 ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5566782_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000464611:exon_5567364_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567372_5567522:ACTB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 6194562 C/A 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:C C A 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 7646720 A/G 1 93 98 191 43.640992990065 52.0127170642326 -8.37172407416755 A:G A G 10 0.530742010859516 0.246071459256689 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 17 19 36 7.97738581538823 10.0840982063308 -2.10671239094258 A:G A G 10 0.530742010859516 0.507892798432598 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 19744417 T/C 1 5 15 20 2.34628994570242 7.96113016289274 -5.61484021719032 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0133351031025539 ENSG00000105849:ENST00000222567:exon_19744402_19744543:TWISTNB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 23240268 A/T 1 36 32 68 16.8932876090574 16.9837443475045 -0.090456738447088 A:T A T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239787_23240628:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239787_23240574:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239787_23240625:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239787_23240324:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239787_23240586:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239787_23240630:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239787_23240443:NUPL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 23340618 C/T 1 43 36 79 20.1780935330408 19.1067123909426 1.07138114209824 T:C C T 10 0.530742010859516 0.822737876234289 ENSG00000156928:ENST00000466681:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000287543:exon_23340458_23340636:C7orf30;ENSG00000156928:ENST00000481564:exon_23340458_23340814:C7orf30 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 24742423 C/A 1 94 103 197 44.1102509792055 54.6664271185302 -10.5561761393247 A:C C A 10 0.530742010859516 0.134413498189334 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 27809339 G/A 1 13 14 27 6.10035385882629 7.43038815203322 -1.33003429320693 A:G G A 10 0.530742010859516 0.700960869465827 ENSG00000106052:ENST00000265393:exon_27809295_27809453:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000433216:exon_27809298_27809453:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000409980:exon_27809295_27809453:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000416801:exon_27809295_27809450:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000396319:exon_27809295_27809453:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000494033:exon_27809297_27809453:TAX1BP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 30544346 T/G 1 14 9 23 6.56961184796678 4.77667809773564 1.79293375023113 T:G T G 10 0.530742010859516 0.533738323924712 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 10 14 24 4.69257989140484 7.43038815203322 -2.73780826062838 A:G G A 10 0.530742010859516 0.308839595377037 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 21 22 43 9.85441777195016 11.6763242389094 -1.82190646695919 C:G G C 10 0.530742010859516 0.647543844169158 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 40133979 T/C 1 2 8 10 0.938515978280968 4.24593608687613 -3.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0536315808592461 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40133729_40136733:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40133729_40135154:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000465643:exon_40133729_40135131:CDK13 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 43680203 C/T 1 29 31 60 13.608481685074 16.453002336645 -2.84452065157096 T:C C T 10 0.530742010859516 0.518385723200983 ENSG00000106603:ENST00000415076:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000446330:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000446564:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000438444:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000490251:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000310564:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000395879:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000488813:exon_43680172_43680668:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000395880:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000223336:exon_43680172_43680248:C7orf44;ENSG00000106603:ENST00000415798:exon_43680172_43680248:C7orf44 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 167 133 300 78.3660841864608 70.5886874443156 7.7773967421452 A:G A G 10 0.530742010859516 0.385799380625976 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 43906544 C/T 1 160 144 304 75.0812782624774 76.4268495637703 -1.34557130129286 T:C C T 10 0.530742010859516 0.908537903144057 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 43916413 G/A 1 3 16 19 1.40777396742145 8.49187217375226 -7.0840982063308 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00183636113841223 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 43916782 G/A 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 83 68 151 38.9484130986602 36.0904567384471 2.85795636021308 T:C T C 10 0.530742010859516 0.683772181231882 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 44112873 G/T 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 44530193 T/G 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:G T G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000015676:ENST00000355451:exon_44530008_44530479:NUDCD3;ENSG00000015676:ENST00000464812:exon_44530008_44530205:NUDCD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 11 13 24 5.16183788054532 6.89964614117371 -1.73780826062838 A:G G A 10 0.530742010859516 0.542286562202578 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 44747499 G/A 1 9 12 21 4.22332190226436 6.36890413031419 -2.14558222804984 A:G G A 10 0.530742010859516 0.387253302097606 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 44804062 G/C 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 C:G G C 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000480964:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000492558:exon_44804018_44804085:ZMIZ2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 44836306 A/G 1 25 12 37 11.7314497285121 6.36890413031419 5.36254559819791 A:T:G A G 10 0.530742010859516 0.0985763678967155 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 19 9 28 8.9159017936692 4.77667809773564 4.13922369593355 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.132131396679065 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 31 35 66 14.546997663355 18.5759703800831 -4.02897271672806 A:G G A 10 0.530742010859516 0.326822899026883 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 64291991 T/A 1 9 17 26 4.22332190226436 9.02261418461177 -4.79929228234742 A:T T A 10 0.530742010859516 0.0758785877818065 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 65546829 G/A 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:G G A 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000487982:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000496336:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65546790_65546984:ASL HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 72717554 C/T 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 T:C C T 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72716514_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717227_72717737:NSUN5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 72717686 C/T 1 43 44 87 20.1780935330408 23.3526484778187 -3.17455494477789 T:C C T 10 0.530742010859516 0.520348853661108 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72716514_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717227_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717597_72717737:NSUN5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 73112225 G/A 1 132 156 288 61.9420545665439 82.7957536940845 -20.8536991275406 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0153738876221612 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73112162_73112542:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73112162_73112541:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73112162_73112541:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73112162_73112486:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000430270:exon_73112162_73112434:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423497:exon_73112162_73112538:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000430446:exon_73112162_73112486:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000442099:exon_73112162_73112482:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000453316:exon_73112162_73112472:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000471215:exon_73112162_73112466:WBSCR22 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 73634371 T/G 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 T:G T G 10 0.530742010859516 1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 73668615 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000049541:ENST00000352131:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000055077:exon_73668601_73668774:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000493156:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000470266:exon_73668601_73668639:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000494019:exon_73668601_73668697:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000480432:exon_73668601_73668737:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000479105:exon_73668601_73668667:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000463194:exon_73668601_73668719:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000473493:exon_73668601_73668706:RFC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 75517337 C/T 1 11 20 31 5.16183788054532 10.6148402171903 -5.453002336645 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0702398292519052 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75517310_75518244:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75517310_75518202:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75517310_75518223:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468304:exon_75517310_75517901:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75517310_75517586:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75517310_75517475:RHBDD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 75615006 C/T 1 15 9 24 7.03886983710726 4.77667809773564 2.26219173937162 T:C C T 10 0.530742010859516 0.416585330003095 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75614897_75615031:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75614897_75615167:POR;ENSG00000127948:ENST00000496888:exon_75614897_75615063:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75614888_75615167:POR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 75616577 G/A 1 58 67 125 27.2169633701481 35.5597147275876 -8.3427513574395 A:G G A 10 0.530742010859516 0.151481044113995 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 75621799 C/T 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.594128026909914 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 75694155 C/T 1 65 84 149 30.5017692941315 44.5823289121993 -14.0805596180679 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0215807388992211 ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75694120_75694271:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75694120_75694271:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75694120_75694271:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000424167:exon_75694120_75694491:MDH2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 75931984 C/T 1 35 43 78 16.4240296199169 22.8219064669592 -6.39787684704225 T:C C T 10 0.530742010859516 0.173109481195181 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 75931999 T/C 1 37 47 84 17.3625455981979 24.9448745103973 -7.58232891219934 T:C T C 10 0.530742010859516 0.101886463031535 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75931990_75932073:HSPB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 A:G G A 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 76132805 C/G 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 C:G C G 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76132743_76132904:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000465488:exon_76132684_76132904:DTX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 76240773 T/C 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000146707:ENST00000454656:exon_76240771_76240908:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000310842:exon_76240771_76240908:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000441393:exon_76240771_76240944:POMZP3;ENSG00000146707:ENST00000424818:exon_76240771_76240908:POMZP3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 77379234 C/T 1 10 14 24 4.69257989140484 7.43038815203322 -2.73780826062838 T:C C T 10 0.530742010859516 0.308839595377037 ENSG00000187257:ENST00000334955:exon_77378741_77379381:RSBN1L;ENSG00000187257:ENST00000445288:exon_77378741_77379381:RSBN1L HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 99091458 C/T 1 65 58 123 30.5017692941315 30.7830366298519 -0.281267335720468 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 99693078 G/A 1 129 110 239 60.5342805991224 58.3816211945468 2.15265940457568 A:G G A 10 0.530742010859516 0.795761521285258 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 99818180 C/G 1 15 9 24 7.03886983710726 4.77667809773564 2.26219173937162 C:G C G 10 0.530742010859516 0.416585330003095 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99818170_99818296:PVRIG HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 100033148 A/G 1 65 39 104 30.5017692941315 20.6989384235211 9.80283087061034 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0616128666538214 ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000476185:exon_100032906_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100032982_100033156:C7orf47 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 100074969 T/C 1 15 16 31 7.03886983710726 8.49187217375226 -1.453002336645 T:C T C 10 0.530742010859516 0.719585525875506 ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100074900_100075125:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100074900_100075930:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100074900_100075082:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100074900_100075930:TSC22D4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 100210597 A/C 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:C A C 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000106330:ENST00000223054:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000462372:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000490309:exon_100210353_100210892:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000493970:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000379527:exon_100210353_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393950:exon_100210133_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000424091:exon_100210179_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000393953:exon_100210487_100210619:MOSPD3;ENSG00000106330:ENST00000497456:exon_100210438_100210619:MOSPD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 100850144 G/A 1 12 2 14 5.63109586968581 1.06148402171903 4.56961184796678 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0152384618165256 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100850060_100850185:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100850060_100850185:PLOD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 100867240 G/A 1 210 230 440 98.5441777195016 122.070662497689 -23.526484778187 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.0248253551369068 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100867218_100867471:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000485387:exon_100867218_100867471:ZNHIT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 100888322 T/C 1 17 16 33 7.97738581538823 8.49187217375226 -0.514486358364028 T:C T C 10 0.530742010859516 0.863566015067668 ENSG00000214253:ENST00000449367:exon_100888241_100888356:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000442303:exon_100888179_100888329:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000223136:exon_100888241_100888366:FIS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 148 34 182 69.4501823927916 18.0452283692235 51.4049540235681 T:C C T 10 0.530742010859516 2.00714112267262e-15 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 102939019 T/C 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 T:C T C 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102939015_102939155:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102939015_102939155:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102939015_102939155:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000456433:exon_102939015_102939155:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000443722:exon_102939015_102939155:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102939015_102939155:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000498530:exon_102939015_102939155:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102939015_102939155:PMPCB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 104752700 T/C 1 9 8 17 4.22332190226436 4.24593608687613 -0.022614184611772 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104752272_104754532:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104752272_104752725:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104752272_104754531:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104752272_104752797:MLL5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 108119692 C/T 1 15 6 21 7.03886983710726 3.1844520651571 3.85441777195016 T:C C T 10 0.530742010859516 0.124742802362819 ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453085:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000481225:exon_108119628_108119756:PNPLA8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 112112892 G/A 1 5 18 23 2.34628994570242 9.55335619547129 -7.20706624976887 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00288573726220212 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112821_112112916:IFRD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 128409225 A/G 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:G A G 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000128595:ENST00000249364:exon_128409117_128411528:CALU;ENSG00000128595:ENST00000449187:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000479257:exon_128409117_128409990:CALU;ENSG00000128595:ENST00000342367:exon_128409117_128410630:CALU;ENSG00000128595:ENST00000493278:exon_128409117_128409250:CALU HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 128582309 C/T 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000128604:ENST00000489702:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000488569:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000477535:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000453794:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000479582:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000464557:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473787:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000467002:exon_128582125_128582313:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128582125_128582330:IRF5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 25 18 43 11.7314497285121 9.55335619547129 2.17809353304081 A:G G A 10 0.530742010859516 0.543875586699709 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 128615897 C/A 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 A:T:C C A 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128615873_128615989:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128615873_128615989:TNPO3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 130038845 A/G 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 A:G A G 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000106477:ENST00000223208:exon_130036375_130038880:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000485736:exon_130037349_130038880:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000484549:exon_130038570_130038880:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000343969:exon_130038580_130038880:TSGA14 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 131128450 T/C 1 16 6 22 7.50812782624774 3.1844520651571 4.32367576109065 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0860562081251773 ENSG00000128585:ENST00000421797:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000352689:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000388758:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000494785:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000458153:exon_131128240_131128461:MKLN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 5 11 16 2.34628994570242 5.83816211945468 -3.49187217375226 A:G G A 10 0.530742010859516 0.130339318751546 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 C C 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 7 1 8 3.28480592398339 0.530742010859516 2.75406391312387 A:G A G 10 0.530742010859516 0.074454966322071 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 10 17 27 4.69257989140484 9.02261418461177 -4.33003429320693 T:C T C 10 0.530742010859516 0.122085718128404 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 137686374 G/A 1 7 3 10 3.28480592398339 1.59222603257855 1.69257989140484 A:G G A 10 0.530742010859516 0.353006242686502 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137686350_137686803:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137686350_137686813:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000452463:exon_137686350_137686793:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000417785:exon_137686350_137686788:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000468127:exon_137686350_137686793:CREB3L2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 5 10 15 2.34628994570242 5.30742010859516 -2.96113016289274 A:G G A 10 0.530742010859516 0.194326171864357 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 139657513 A/G 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 A:G A G 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000469630:exon_139657433_139657563:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000494876:exon_139657380_139657563:TBXAS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:G G A 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 7 2 9 3.28480592398339 1.06148402171903 2.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.187115833333649 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 140374049 T/C 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C T C 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140373619_140374063:ADCK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 140380908 C/T 1 6 9 15 2.8155479348429 4.77667809773564 -1.96113016289274 T:C C T 10 0.530742010859516 0.438937968640093 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000498423:exon_140380842_140380937:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000473512:exon_140380842_140380937:ADCK2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 29 24 53 13.608481685074 12.7378082606284 0.870673424445652 A:G G A 10 0.530742010859516 0.89081407012529 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 36 37 73 16.8932876090574 19.6374544018021 -2.74416679274467 T:C T C 10 0.530742010859516 0.558521225233514 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 143080250 T/G 1 22 16 38 10.3236757610906 8.49187217375226 1.83180358733839 T:G T G 10 0.530742010859516 0.627133830990491 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079894_143080328:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000477373:exon_143079894_143080333:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000436448:exon_143079943_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000446634:exon_143080093_143080415:ZYX HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 148496375 C/T 1 25 22 47 11.7314497285121 11.6763242389094 0.055125489602748 A:T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000055130:ENST00000409469:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000325222:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000433865:exon_148496367_148496480:CUL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 148708965 G/T 1 12 14 26 5.63109586968581 7.43038815203322 -1.79929228234742 T:G G T 10 0.530742010859516 0.557319505160064 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148708938_148709096:PDIA4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 148767905 G/A 1 4 5 9 1.87703195656194 2.65371005429758 -0.776678097735644 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.742703088081866 ENSG00000197362:ENST00000316286:exon_148766735_148769565:ZNF786;ENSG00000197362:ENST00000491431:exon_148767055_148769565:ZNF786;ENSG00000197362:ENST00000451334:exon_148767055_148769565:ZNF786 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150389593 T/C 1 6 8 14 2.8155479348429 4.24593608687613 -1.43038815203322 T:C T C 10 0.530742010859516 0.594128026909914 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 15 9 24 7.03886983710726 4.77667809773564 2.26219173937162 C:G G C 10 0.530742010859516 0.416585330003095 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 12 13 25 5.63109586968581 6.89964614117371 -1.2685502714879 A:G A G 10 0.530742010859516 0.690401884163373 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150418045 G/A 1 14 8 22 6.56961184796678 4.24593608687613 2.32367576109065 A:G G A 10 0.530742010859516 0.39515096925501 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150439554 G/A 1 24 27 51 11.2621917393716 14.3300342932069 -3.06784255383532 A:T:G G A 10 0.530742010859516 0.403220455992067 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150439650 G/A 1 30 25 55 14.0777396742145 13.2685502714879 0.80918940272662 A:G G A 10 0.530742010859516 0.892885831375704 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150439737 C/T 1 32 29 61 15.0162556524955 15.391518314926 -0.375262662430476 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150439824 G/A 1 33 18 51 15.485513641636 9.55335619547129 5.93215744616468 A:G G A 10 0.530742010859516 0.122001462368306 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 21 53 74 9.85441777195016 28.1293265755543 -18.2749088036042 T:C C T 10 0.530742010859516 2.04229350217285e-05 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150768849 C/T 1 1 9 10 0.469257989140484 4.77667809773564 -4.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.00814709125222511 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482697:exon_150768816_150768924:SLC4A2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150771893 C/T 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 T:C C T 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150771126_150771928:SLC4A2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 150772384 C/T 1 5 9 14 2.34628994570242 4.77667809773564 -2.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.284091899937015 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150772342_150772399:SLC4A2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 13 21 34 6.10035385882629 11.1455822280498 -5.04522836922354 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0880901903974396 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 156761818 G/A 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000485661:exon_156761781_156761890:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156761449_156761890:NOM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 7 16 23 3.28480592398339 8.49187217375226 -5.20706624976887 C:G G C 10 0.530742010859516 0.0359102670797866 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 8 16 24 3.75406391312387 8.49187217375226 -4.73780826062838 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0650116997860802 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 157000621 T/C 1 3 7 10 1.40777396742145 3.71519407601661 -2.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 0.205910355285428 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000397_157000629:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000397_157000629:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000469336:exon_157000397_157000629:UBE3C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 7 157049663 G/C 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 C:G G C 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157049608_157049738:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000470408:exon_157049608_157049738:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000474153:exon_157049381_157049738:UBE3C HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 6302110 G/A 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 A:G G A 10 0.530742010859516 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 T:C C T 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 6302971 C/T 1 8 14 22 3.75406391312387 7.43038815203322 -3.67632423890935 T:C C T 10 0.530742010859516 0.136600125045471 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 8175645 G/A 1 36 59 95 16.8932876090574 31.3137786407114 -14.420491031654 A:G G A 10 0.530742010859516 0.00377828263834173 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 11 6 17 5.16183788054532 3.1844520651571 1.97738581538823 T:C C T 10 0.530742010859516 0.467310697914147 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 8176770 C/T 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:C C T 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 8654898 C/T 1 6 10 16 2.8155479348429 5.30742010859516 -2.49187217375226 T:C C T 10 0.530742010859516 0.223009840929929 ENSG00000147324:ENST00000276282:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000521881:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520715:exon_8654875_8655001:MFHAS1;ENSG00000147324:ENST00000520091:exon_8654875_8655001:MFHAS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 8887566 A/G 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 A:G A G 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000104626:ENST00000523898:exon_8887302_8890848:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000250263:exon_8887302_8890848:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000519292:exon_8887302_8887591:ERI1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 10623138 T/A 1 38 52 90 17.8318035873384 27.5985845646948 -9.76678097735644 A:T:C T A 10 0.530742010859516 0.0444721156777335 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 10690409 T/C 1 9 6 15 4.22332190226436 3.1844520651571 1.03886983710726 T:C T C 10 0.530742010859516 0.617514886583833 ENSG00000254093:ENST00000354846:exon_10690402_10690494:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10690402_10690494:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10690402_10690494:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10690402_10690494:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000523559:exon_10690402_10690494:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000517607:exon_10690402_10690494:PINX1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 13 17 30 6.10035385882629 9.02261418461177 -2.92226032578548 T:C T C 10 0.530742010859516 0.360753726230159 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 11660362 T/C 1 26 12 38 12.2007077176526 6.36890413031419 5.83180358733839 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0728141473368956 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 11696061 G/A 1 395 362 757 185.356905710491 192.128607931145 -6.77170222065359 A:G G A 10 0.530742010859516 0.635999979067008 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11695897_11696818:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11695897_11696719:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11695897_11696292:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11695897_11696348:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11695897_11696414:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11695897_11696469:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11695897_11696349:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11695897_11696476:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11695897_11696623:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11695897_11696122:FDFT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 17817553 G/T 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 17829941 G/T 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:G G T 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523540:exon_17829838_17830151:PCM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 17829994 C/T 1 6 3 9 2.8155479348429 1.59222603257855 1.22332190226436 T:C C T 10 0.530742010859516 0.515212840412894 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523540:exon_17829838_17830151:PCM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 17869318 A/G 1 51 46 97 23.9321574461647 24.4141324995377 -0.481975053373052 A:G A G 10 0.530742010859516 0.91943475621916 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17869176_17869336:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17869176_17869336:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17869176_17869336:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17869176_17869336:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17869176_17869336:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17869176_17869336:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523247:exon_17869254_17869336:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000400012:exon_17869263_17869336:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000522275:exon_17869176_17869336:PCM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:T:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 13 13 26 6.10035385882629 6.89964614117371 -0.799292282347416 T:C T C 10 0.530742010859516 0.84505329999096 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 22105502 T/C 1 7 1 8 3.28480592398339 0.530742010859516 2.75406391312387 T:C T C 10 0.530742010859516 0.074454966322071 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000519237:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22105370_22105521:POLR3D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 22473224 T/C 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:C T C 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 22473281 C/G 1 9 5 14 4.22332190226436 2.65371005429758 1.56961184796678 C:G C G 10 0.530742010859516 0.436312573490878 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 22473347 C/T 1 8 9 17 3.75406391312387 4.77667809773564 -1.02261418461177 T:C C T 10 0.530742010859516 0.636182742058728 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 22481449 A/G 1 13 16 29 6.10035385882629 8.49187217375226 -2.39151831492596 A:G A G 10 0.530742010859516 0.457592678941988 ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 22874892 A/G 1 7 15 22 3.28480592398339 7.96113016289274 -4.67632423890935 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0544756353537649 ENSG00000008853:ENST00000519685:exon_22874765_22875954:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000522948:exon_22874765_22877705:RHOBTB2;ENSG00000008853:ENST00000251822:exon_22874765_22877712:RHOBTB2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 23429329 T/C 1 6 5 11 2.8155479348429 2.65371005429758 0.161837880545324 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 26510792 T/C 1 2 8 10 0.938515978280968 4.24593608687613 -3.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 0.0536315808592461 ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26510748_26510913:DPYSL2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 16 13 29 7.50812782624774 6.89964614117371 0.608481685074036 C:G C G 10 0.530742010859516 0.85457258194616 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 30 24 54 14.0777396742145 12.7378082606284 1.33993141358614 A:C A C 10 0.530742010859516 0.785679923783618 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 70 36 106 32.8480592398339 19.1067123909426 13.7413468488913 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00835053450063046 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 79 50 129 37.0713811420982 26.5371005429758 10.5342805991224 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0644224271131787 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 29927321 A/G 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 A:G A G 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000133872:ENST00000256255:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518174:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521265:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000520303:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000523127:exon_29927158_29927551:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518340:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518296:exon_29927158_29927465:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522794:exon_29927158_29927575:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000522055:exon_29927309_29927575:TMEM66 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 30038030 A/T 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:T A T 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000104671:ENST00000221114:exon_30038004_30038146:DCTN6;ENSG00000104671:ENST00000522141:exon_30038004_30038146:DCTN6;ENSG00000104671:ENST00000520829:exon_30038004_30038537:DCTN6;ENSG00000104671:ENST00000523666:exon_30038004_30038146:DCTN6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 30706333 T/A 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 A:T T A 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000133863:ENST00000256246:exon_30699520_30706608:TEX15;ENSG00000133863:ENST00000523186:exon_30706243_30706832:TEX15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 38184343 C/T 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000147548:ENST00000433384:exon_38184248_38184374:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000317025:exon_38184248_38184374:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000446459:exon_38184248_38184374:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000527502:exon_38184248_38184374:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000316985:exon_38184248_38184374:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000419340:exon_38184248_38184374:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000528627:exon_38184248_38184353:WHSC1L1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 38458696 T/C 0 26 0 26 12.2007077176526 0 12.2007077176526 T T 10 0.530742010859516 7.31646159741064e-08 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 38677932 A/G 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 38704196 A/C 1 7 6 13 3.28480592398339 3.1844520651571 0.100353858826292 A:C A C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000147526:ENST00000522548:exon_38703987_38704337:TACC1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 54656244 G/A 1 12 6 18 5.63109586968581 3.1844520651571 2.44664380452871 A:G G A 10 0.530742010859516 0.34554633606434 ENSG00000047249:ENST00000355221:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000518072:exon_54656137_54656275:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000520188:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000359530:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000440871:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000523899:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000396774:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000524164:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000523426:exon_54656147_54656250:ATP6V1H HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 61707572 T/C 1 29 62 91 13.608481685074 32.90600467329 -19.297522988216 T:C T C 10 0.530742010859516 5.38141199444932e-05 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527900:exon_61707545_61707686:CHD7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 61707678 G/A 1 26 25 51 12.2007077176526 13.2685502714879 -1.06784255383532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.78070177392219 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527900:exon_61707545_61707686:CHD7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 67341996 C/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 C:G C G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 67547324 T/C 1 2 6 8 0.938515978280968 3.1844520651571 -2.24593608687613 T:C T C 10 0.530742010859516 0.158671044656390 ENSG00000175073:ENST00000310421:exon_67540722_67547607:VCPIP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 67592165 G/A 1 9 3 12 4.22332190226436 1.59222603257855 2.63109586968581 A:G G A 10 0.530742010859516 0.155115621481203 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 67971452 T/C 1 15 17 32 7.03886983710726 9.02261418461177 -1.98374434750451 T:C T C 10 0.530742010859516 0.485769329269364 ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 5 7 12 2.34628994570242 3.71519407601661 -1.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.565702257850693 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 74893419 C/G 1 27 23 50 12.6699657067931 12.2070662497689 0.4628994570242 C:G C G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000517439:exon_74893390_74893601:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000519551:exon_74893390_74893716:TMEM70 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 119 85 204 55.8417007077176 45.1130709230589 10.7286297846587 A:G A G 10 0.530742010859516 0.140843055081576 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 36 68 104 16.8932876090574 36.0904567384471 -19.1971691293897 C:G C G 10 0.530742010859516 0.000169405567563523 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 77896391 C/T 1 16 10 26 7.50812782624774 5.30742010859516 2.20070771765258 T:C C T 10 0.530742010859516 0.43619312164521 ENSG00000164751:ENST00000357039:exon_77892494_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000419564:exon_77892496_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000520103:exon_77895170_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000522527:exon_77895193_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000518986:exon_77895876_77896431:PEX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 80942321 C/G 1 24 24 48 11.2621917393716 12.7378082606284 -1.47561652125677 C:G C G 10 0.530742010859516 0.668036956608804 ENSG00000147586:ENST00000276585:exon_80942271_80942506:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000521605:exon_80942271_80942524:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000518271:exon_80942289_80942467:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000522987:exon_80942289_80942489:MRPS28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 87497176 G/A 1 12 12 24 5.63109586968581 6.36890413031419 -0.737808260628384 A:G G A 10 0.530742010859516 0.839201084427724 ENSG00000176623:ENST00000519789:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519639:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000520719:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518390:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87497101_87497190:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87496920_87497190:FAM82B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 3 8 11 1.40777396742145 4.24593608687613 -2.83816211945468 T:G T G 10 0.530742010859516 0.128925499785697 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 87558846 G/C 1 14 10 24 6.56961184796678 5.30742010859516 1.26219173937162 C:G G C 10 0.530742010859516 0.685182392195028 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87558823_87558909:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87558823_87558909:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517391:exon_87558823_87558909:CPNE3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 90960084 C/T 1 26 21 47 12.2007077176526 11.1455822280498 1.05512548960275 T:C C T 10 0.530742010859516 0.77255065232336 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90960052_90960120:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90960052_90960120:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90960052_90960120:NBN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 90967686 T/C 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 96059283 C/T 1 11 9 20 5.16183788054532 4.77667809773564 0.38515978280968 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000156170:ENST00000523378:exon_96059222_96059318:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000396113:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000396111:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000396124:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000518258:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000286687:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000523337:exon_96059222_96059315:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000517976:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000454358:exon_96059222_96059355:C8orf38;ENSG00000156170:ENST00000520757:exon_96059222_96059355:C8orf38 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 98699751 C/A 1 26 36 62 12.2007077176526 19.1067123909426 -6.90600467328999 A:C C A 10 0.530742010859516 0.0973956346331422 ENSG00000147649:ENST00000336273:exon_98699657_98699833:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519934:exon_98699657_98699833:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000522313:exon_98699657_98699833:MTDH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 98712042 G/A 1 41 26 67 19.2395775547598 13.7992922823474 5.44028527241243 A:G G A 10 0.530742010859516 0.220738603230736 ENSG00000147649:ENST00000336273:exon_98711982_98712080:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000521933:exon_98711982_98712080:MTDH HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 101153024 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000156509:ENST00000428847:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000428185:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000388828:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000517806:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000520987:exon_101152911_101154396:FBXO43 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 101153242 C/A 1 8 5 13 3.75406391312387 2.65371005429758 1.10035385882629 A:C C A 10 0.530742010859516 0.590467730356806 ENSG00000156509:ENST00000428847:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000428185:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000388828:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000517806:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000520987:exon_101152911_101154396:FBXO43 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 7 4 11 3.28480592398339 2.12296804343806 1.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.557291684504548 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 16 7 23 7.50812782624774 3.71519407601661 3.79293375023113 A:G G A 10 0.530742010859516 0.143647341684462 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 7 8 15 3.28480592398339 4.24593608687613 -0.96113016289274 A:G G A 10 0.530742010859516 0.796999081781673 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 104427742 G/A 1 9 9 18 4.22332190226436 4.77667809773564 -0.553356195471288 A:G G A 10 0.530742010859516 0.817532500175034 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104426942_104427744:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104427593_104427744:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104427607_104427744:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521999:exon_104427613_104427744:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104427617_104427744:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104427640_104427744:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104427640_104427744:DCAF13 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 89 78 167 41.7639610335031 41.3978768470422 0.366084186460832 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 124346460 T/C 1 7 5 12 3.28480592398339 2.65371005429758 0.631095869685808 T:C T C 10 0.530742010859516 0.77948262403828 ENSG00000156802:ENST00000517666:exon_124346440_124346562:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000287394:exon_124346440_124346562:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521903:exon_124346440_124346562:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000519124:exon_124346440_124346562:ATAD2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 128751201 G/A 1 21 24 45 9.85441777195016 12.7378082606284 -2.88339048867822 A:G G A 10 0.530742010859516 0.455751006750714 ENSG00000136997:ENST00000259523:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000528568:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000377970:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000454617:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000524013:exon_128750497_128751265:MYC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 130859076 A/G 1 13 26 39 6.10035385882629 13.7992922823474 -7.69893842352112 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0155955273472274 ENSG00000153310:ENST00000522746:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000523509:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000401979:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000519110:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000523288:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000358017:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000522250:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000519824:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000517654:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000519540:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000522941:exon_130859050_130859120:FAM49B;ENSG00000153310:ENST00000520887:exon_130859050_130859563:FAM49B HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 142204293 C/T 1 25 26 51 11.7314497285121 13.7992922823474 -2.06784255383532 T:C C T 10 0.530742010859516 0.577543501428116 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 1 3 9 12 1.40777396742145 4.77667809773564 -3.36890413031419 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0791514340802245 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 760 833 1593 356.636071746768 442.108095045977 -85.472023299209 A:G G A 10 0.530742010859516 1.94520671118699e-05 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 144682028 C/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 144874554 T/C 1 18 20 38 8.44664380452871 10.6148402171903 -2.16819641266161 T:C T C 10 0.530742010859516 0.518201366421327 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874390_144874575:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874390_144874575:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874390_144874575:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874390_144874571:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874390_144874575:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874390_144874575:SCRIB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 144877216 C/T 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144877208_144877282:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144877208_144877282:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144877208_144877282:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144877208_144877282:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144877208_144877282:SCRIB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 144885580 A/G 1 10 6 16 4.69257989140484 3.1844520651571 1.50812782624774 A:G A G 10 0.530742010859516 0.617940633683685 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144885553_144885741:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144885553_144885741:SCRIB HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 145268000 G/A 1 4 9 13 1.87703195656194 4.77667809773564 -2.89964614117371 A:G G A 10 0.530742010859516 0.162804352237763 ENSG00000179832:ENST00000423230:exon_145267897_145268370:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000356585:exon_145267901_145268024:HEATR7A HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 145652344 G/C 1 17 10 27 7.97738581538823 5.30742010859516 2.66996570679307 C:G G C 10 0.530742010859516 0.339565067535051 ENSG00000160948:ENST00000529182:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526054:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000292510:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000377348:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526204:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530983:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000528142:exon_145651409_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530836:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530804:exon_145652292_145652366:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000532861:exon_145652292_145652381:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000533806:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531032:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531924:exon_145652292_145652677:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526734:exon_145652292_145652362:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530790:exon_145652292_145652674:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000524521:exon_145651854_145652362:VPS28 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 1 8 4 12 3.75406391312387 2.12296804343806 1.63109586968581 A:G G A 10 0.530742010859516 0.398583870551881 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 2838473 T/C 1 17 8 25 7.97738581538823 4.24593608687613 3.7314497285121 T:C T C 10 0.530742010859516 0.162030927973593 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2838426_2838517:KIAA0020 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 26 23 49 12.2007077176526 12.2070662497689 -0.00635853211628401 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 6533010 C/G 1 21 32 53 9.85441777195016 16.9837443475045 -7.12932657555435 C:G C G 10 0.530742010859516 0.0542878314916606 ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 61 52 113 28.6247373375695 27.5985845646948 1.02615277287469 A:C C A 10 0.530742010859516 0.924964859617295 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 81 79 160 38.0098971203792 41.9286188579018 -3.91872173752256 A:T:G G T 10 0.530742010859516 0.579421695675074 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 19380238 C/T 1 6 2 8 2.8155479348429 1.06148402171903 1.75406391312387 T:C C T 10 0.530742010859516 0.296481502360064 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19380188_19380252:RPS6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 32542204 A/G 1 19 22 41 8.9159017936692 11.6763242389094 -2.76042244524016 A:G A G 10 0.530742010859516 0.435415355527369 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32540542_32544324:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32540824_32544324:TOPORS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 33276531 C/T 1 40 36 76 18.7703195656194 19.1067123909426 -0.336392825323216 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000086065:ENST00000223500:exon_33276454_33276562:CHMP5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 33367549 T/C 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C T C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000086102:ENST00000379540:exon_33367513_33367617:NFX1;ENSG00000086102:ENST00000463421:exon_33367513_33367576:NFX1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 33463848 C/T 1 2 7 9 0.938515978280968 3.71519407601661 -2.77667809773564 T:C C T 10 0.530742010859516 0.0930763769119256 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33463829_33463918:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379470:exon_33463829_33463918:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33463829_33463918:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33463829_33463918:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33463829_33463918:NOL6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 35732769 A/G 1 13 3 16 6.10035385882629 1.59222603257855 4.50812782624774 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0250951577400398 ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35732332_35732898:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35732595_35732898:CREB3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 36674842 C/T 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36674831_36674934:MELK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 37425938 C/T 1 86 54 140 40.3561870660816 28.6600685864139 11.6961184796678 T:C C T 10 0.530742010859516 0.051371096662364 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37425919_37425991:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000493368:exon_37425919_37425991:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37425919_37425991:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37425919_37425991:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000487399:exon_37425919_37426647:GRHPR HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 9 8 17 4.22332190226436 4.24593608687613 -0.022614184611772 T:G G T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 10 7 17 4.69257989140484 3.71519407601661 0.977385815388228 T:C C T 10 0.530742010859516 0.809001678476656 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 37501807 G/A 1 59 57 116 27.6862213592886 30.2522946189924 -2.56607325970386 A:G G A 10 0.530742010859516 0.642974042414006 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37501710_37501841:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37501710_37501841:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37501710_37501841:POLR1E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 66 61 127 30.9710272832719 32.3752626624305 -1.40423537915853 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.858971698923456 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 10 4 14 4.69257989140484 2.12296804343806 2.56961184796678 T:C C T 10 0.530742010859516 0.191069727442096 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 3 5 8 1.40777396742145 2.65371005429758 -1.24593608687613 T:C C T 10 0.530742010859516 0.486982300625547 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 38396631 G/C 1 7 7 14 3.28480592398339 3.71519407601661 -0.430388152033224 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 72933774 A/G 1 9 1 10 4.22332190226436 0.530742010859516 3.69257989140484 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0238276980671328 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72933710_72933879:SMC5 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 80880450 A/G 1 14 14 28 6.56961184796678 7.43038815203322 -0.860776304066448 A:G A G 10 0.530742010859516 0.850388610583438 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80880288_80880459:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80880288_80880459:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80880288_80880459:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80880288_80880459:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80880288_80880459:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80880288_80880459:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80880288_80880459:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80880288_80880459:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80880381_80880459:CEP78 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 4 10 14 1.87703195656194 5.30742010859516 -3.43038815203322 A:C C A 10 0.530742010859516 0.104987115908570 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 88650332 C/G 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 C:G C G 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88650283_88650540:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88650283_88650540:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88650283_88650540:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88650310_88650540:GOLM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 88651420 G/A 1 5 8 13 2.34628994570242 4.24593608687613 -1.89964614117371 A:G G A 10 0.530742010859516 0.406091620528696 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88651263_88651728:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88651263_88651422:GOLM1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 88916274 T/C 1 13 8 21 6.10035385882629 4.24593608687613 1.85441777195016 T:C T C 10 0.530742010859516 0.514112372853973 ENSG00000083223:ENST00000277141:exon_88916191_88916516:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375960:exon_88916191_88916516:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375961:exon_88916191_88916516:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375957:exon_88916191_88916516:ZCCHC6;ENSG00000083223:ENST00000375963:exon_88916191_88916516:ZCCHC6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 91953423 G/A 1 8 10 18 3.75406391312387 5.30742010859516 -1.55335619547129 A:G G A 10 0.530742010859516 0.488186536607533 ENSG00000187742:ENST00000375807:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000395669:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000339901:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000534113:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000425851:exon_91953373_91953495:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000440898:exon_91953373_91953425:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000477484:exon_91953373_91953495:SECISBP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 91973048 C/T 1 7 13 20 3.28480592398339 6.89964614117371 -3.61484021719032 T:C C T 10 0.530742010859516 0.119943905438940 ENSG00000187742:ENST00000375807:exon_91972914_91973106:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000395669:exon_91972914_91973106:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000339901:exon_91972914_91973106:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000534113:exon_91972914_91973106:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000496597:exon_91972914_91973068:SECISBP2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 93641175 C/T 0 9 0 9 4.22332190226436 0 4.22332190226436 C C 10 0.530742010859516 0.00444490393320186 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 95019042 C/T 1 4 7 11 1.87703195656194 3.71519407601661 -1.83816211945468 T:C C T 10 0.530742010859516 0.367470403589724 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95018962_95019082:IARS;ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 95072500 C/T 1 9 8 17 4.22332190226436 4.24593608687613 -0.022614184611772 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95072453_95072543:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000432670:exon_95072453_95072543:NOL8 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 95887320 G/T 1 5 6 11 2.34628994570242 3.1844520651571 -0.838162119454676 T:G G T 10 0.530742010859516 0.765036098409714 ENSG00000131669:ENST00000375446:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000489274:exon_95887181_95888472:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000470314:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000461162:exon_95887181_95887344:NINJ1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 100823068 G/A 1 10 7 17 4.69257989140484 3.71519407601661 0.977385815388228 A:G G A 10 0.530742010859516 0.809001678476656 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 12 10 22 5.63109586968581 5.30742010859516 0.323675761090648 C:G G C 10 0.530742010859516 1 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 12 27 39 5.63109586968581 14.3300342932069 -8.69893842352112 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0059718042214082 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 106888978 C/T 1 16 13 29 7.50812782624774 6.89964614117371 0.608481685074036 T:C C T 10 0.530742010859516 0.85457258194616 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 106901506 A/G 1 22 14 36 10.3236757610906 7.43038815203322 2.89328760905742 A:G A G 10 0.530742010859516 0.404566051476356 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106901420_106903690:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106901420_106903698:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106901420_106901932:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106901420_106901933:SMC2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 114982463 T/C 1 14 11 25 6.56961184796678 5.83816211945468 0.7314497285121 T:C T C 10 0.530742010859516 0.842799633797048 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 114982549 C/T 1 15 14 29 7.03886983710726 7.43038815203322 -0.391518314925964 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000119314:ENST00000374257:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000458258:exon_114980715_114986263:ROD1;ENSG00000119314:ENST00000334318:exon_114981096_114982653:ROD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 115931593 G/A 1 17 24 41 7.97738581538823 12.7378082606284 -4.76042244524016 A:G G A 10 0.530742010859516 0.159298973720240 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 115932012 G/T 1 15 10 25 7.03886983710726 5.30742010859516 1.7314497285121 T:G G T 10 0.530742010859516 0.551412457611138 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 115933978 G/A 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 G G 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115933861_115933986:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115933861_115933986:FKBP15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 115933980 C/A 0 8 0 8 3.75406391312387 0 3.75406391312387 C C 10 0.530742010859516 0.0086472642935023 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115933861_115933986:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115933861_115933986:FKBP15 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 116136155 G/A 1 16 17 33 7.50812782624774 9.02261418461177 -1.51448635836403 A:G G A 10 0.530742010859516 0.606034924478049 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 19 17 36 8.9159017936692 9.02261418461177 -0.106712390942576 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 116346236 G/A 1 1 7 8 0.469257989140484 3.71519407601661 -3.24593608687613 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0299215593983393 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 117103900 T/C 1 5 3 8 2.34628994570242 1.59222603257855 0.754063913123872 T:C T C 10 0.530742010859516 0.730673800229385 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 7 10 17 3.28480592398339 5.30742010859516 -2.02261418461177 A:G A G 10 0.530742010859516 0.342925565397055 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 117108971 C/T 1 6 7 13 2.8155479348429 3.71519407601661 -0.899646141173708 T:C C T 10 0.530742010859516 0.78264401969771 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117108949_117109054:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117108949_117109064:AKNA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 117390573 C/G 1 9 3 12 4.22332190226436 1.59222603257855 2.63109586968581 C:G C G 10 0.530742010859516 0.155115621481203 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 13 29 42 6.10035385882629 15.391518314926 -9.29116445609967 A:G A G 10 0.530742010859516 0.00490808346440245 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 49 33 82 22.9936414678837 17.514486358364 5.47915510951969 A:G G A 10 0.530742010859516 0.268456911534368 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 3 6 9 1.40777396742145 3.1844520651571 -1.77667809773564 A:G G A 10 0.530742010859516 0.321206865619226 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 26 36 62 12.2007077176526 19.1067123909426 -6.90600467328999 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0973956346331422 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 127975654 C/T 1 10 8 18 4.69257989140484 4.24593608687613 0.446643804528712 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 127975775 G/A 1 10 13 23 4.69257989140484 6.89964614117371 -2.20706624976887 A:G G A 10 0.530742010859516 0.406857310619905 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 85 80 165 39.8869290769411 42.4593608687613 -2.57243179182014 A:G A G 10 0.530742010859516 0.697222384900521 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 128099784 C/T 1 5 4 9 2.34628994570242 2.12296804343806 0.223321902264356 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000265956:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000431329:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128099500_128099870:GAPVD1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 128201271 C/T 1 46 54 100 21.5858675004623 28.6600685864139 -7.0742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.161827419206133 ENSG00000119487:ENST00000373511:exon_128199672_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000524515:exon_128199672_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000483937:exon_128200748_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000444226:exon_128200748_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128200934_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496658:exon_128200986_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128201092_128201291:MAPKAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 A:G G A 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 130630240 G/T 1 6 4 10 2.8155479348429 2.12296804343806 0.69257989140484 T:G G T 10 0.530742010859516 0.75852273700248 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 130670652 A/G 1 37 30 67 17.3625455981979 15.9222603257855 1.44028527241243 A:G A G 10 0.530742010859516 0.806878477515293 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130670165_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130670166_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000474282:exon_130670604_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130670597_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130670623_130670860:ST6GALNAC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 131019555 A/G 1 14 8 22 6.56961184796678 4.24593608687613 2.32367576109065 A:G A G 10 0.530742010859516 0.39515096925501 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131018108_131019560:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131018111_131019560:GOLGA2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 55 35 90 25.8091894027266 18.5759703800831 7.23321902264356 C:G C G 10 0.530742010859516 0.139497096871624 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 56 21 77 26.2784473918671 11.1455822280498 15.1328651638173 A:G A G 10 0.530742010859516 0.000539321021978408 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 9 7 16 4.22332190226436 3.71519407601661 0.508127826247744 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 134073807 A/G 1 10 8 18 4.69257989140484 4.24593608687613 0.446643804528712 A:G A G 10 0.530742010859516 1 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000531600:exon_134072603_134074035:NUP214 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 135145007 G/A 1 7 15 22 3.28480592398339 7.96113016289274 -4.67632423890935 A:G G A 10 0.530742010859516 0.0544756353537649 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135145002_135145089:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135145002_135145089:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135145002_135145089:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135145002_135145089:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135145002_135145089:SETX HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 135765261 C/T 1 5 5 10 2.34628994570242 2.65371005429758 -0.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000165698:ENST00000372136:exon_135763677_135765418:C9orf9;ENSG00000165698:ENST00000356311:exon_135763677_135765418:C9orf9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 18 10 28 8.44664380452871 5.30742010859516 3.13922369593355 C:G G C 10 0.530742010859516 0.260435357884811 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 20 12 32 9.38515978280968 6.36890413031419 3.01625565249549 A:G G A 10 0.530742010859516 0.376158343595467 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 136199092 C/T 1 16 9 25 7.50812782624774 4.77667809773564 2.7314497285121 T:C C T 10 0.530742010859516 0.319678398805541 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136197552_136199184:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136198642_136199184:SURF6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 136279935 C/T 1 3 8 11 1.40777396742145 4.24593608687613 -2.83816211945468 T:C C T 10 0.530742010859516 0.128925499785697 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 136633606 G/A 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 A:G G A 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139272017 G/A 1 22 22 44 10.3236757610906 11.6763242389094 -1.3526484778187 A:G G A 10 0.530742010859516 0.76313456343339 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 19 15 34 8.9159017936692 7.96113016289274 0.954771630776456 A:G A G 10 0.530742010859516 0.86395168298299 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 8 3 11 3.75406391312387 1.59222603257855 2.16183788054532 T:C T C 10 0.530742010859516 0.236271704504762 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139273288 C/T 1 4 6 10 1.87703195656194 3.1844520651571 -1.30742010859516 T:C C T 10 0.530742010859516 0.53092560297019 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139311580 C/T 1 20 16 36 9.38515978280968 8.49187217375226 0.893287609057424 T:C C T 10 0.530742010859516 0.86782286402883 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139324740 C/T 1 4 4 8 1.87703195656194 2.12296804343806 -0.245936086876128 T:C C T 10 0.530742010859516 1 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139731969 C/T 1 5 9 14 2.34628994570242 4.77667809773564 -2.43038815203322 T:C C T 10 0.530742010859516 0.284091899937015 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139731798_139732068:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139731798_139732067:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139731798_139732114:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139731798_139732042:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139729623_139732114:C9orf86 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139732331 G/C 1 9 14 23 4.22332190226436 7.43038815203322 -3.20706624976887 T:C:G G C 10 0.530742010859516 0.212202113058778 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139732314_139732432:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139732314_139732467:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139732314_139732467:C9orf86 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139734634 G/A 1 44 32 76 20.6473515221813 16.9837443475045 3.66360717467678 A:G G A 10 0.530742010859516 0.422889181710817 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139734606_139734664:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139734606_139734664:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139734606_139734664:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139734606_139734664:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139734606_139734637:C9orf86 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 139743890 T/C 1 58 47 105 27.2169633701481 24.9448745103973 2.27208885975082 T:C T C 10 0.530742010859516 0.696280629364372 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139743563_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139743543_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139743546_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139743877_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139743878_139744042:PHPT1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 148 146 294 69.4501823927916 77.4883335854893 -8.0381511926977 A:C:G G A 10 0.530742010859516 0.350487527161393 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . 9 140138011 C/T 1 321 273 594 150.631814514095 144.892568964648 5.7392455494475 T:C C T 10 0.530742010859516 0.651259269707744 ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140136948_140138159:TUBB2C HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 104 76 180 48.8028308706103 40.3363928253232 8.46643804528712 A:G G A 10 0.530742010859516 0.232071060117776 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 224044 G/A 1 35 29 64 16.4240296199169 15.391518314926 1.03251130499098 A:G G A 10 0.530742010859516 0.803942100201889 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_224027_224179:GTPBP6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 295129 G/A 1 10 3 13 4.69257989140484 1.59222603257855 3.10035385882629 A:G G A 10 0.530742010859516 0.100208582951158 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 20 6 26 9.38515978280968 3.1844520651571 6.20070771765258 A:G A G 10 0.530742010859516 0.0172865146708574 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 2139187 G/A 1 14 15 29 6.56961184796678 7.96113016289274 -1.39151831492596 A:G G A 10 0.530742010859516 0.710650929425754 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 2656274 G/A 1 124 164 288 58.18799065342 87.0416897809606 -28.8536991275406 A:G G A 10 0.530742010859516 0.000740650669932557 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 12906714 A/G 1 1 33 34 0.469257989140484 17.514486358364 -17.0452283692235 A:G A G 10 0.530742010859516 2.65519823689897e-10 ENSG00000196664:ENST00000380659:exon_12903631_12908499:TLR7 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 15415581 A/G 1 22 1 23 10.3236757610906 0.530742010859516 9.79293375023113 A:G A G 10 0.530742010859516 1.97457263470758e-05 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000492432:exon_15415571_15415653:PIR;ENSG00000087842:ENST00000484433:exon_15415571_15415653:PIR HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 19606793 C/T 0 0 23 23 0 12.2070662497689 -12.2070662497689 T C T 10 0.530742010859516 2.76992831988561e-08 ENSG00000147010:ENST00000379702:exon_19606761_19606920:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000397821:exon_19606761_19606920:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379716:exon_19606761_19606920:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000397804:exon_19606761_19606920:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379698:exon_19606761_19606920:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379726:exon_19606761_19606920:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379697:exon_19606396_19606920:SH3KBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 19626077 C/T 0 0 32 32 0 16.9837443475045 -16.9837443475045 T C T 10 0.530742010859516 3.05614255152853e-11 ENSG00000147010:ENST00000379702:exon_19626056_19626163:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000397821:exon_19626056_19626163:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379716:exon_19626056_19626163:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000397804:exon_19626056_19626163:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379698:exon_19626056_19626163:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379726:exon_19626056_19626163:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000379697:exon_19626056_19626163:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000494961:exon_19626056_19626163:SH3KBP1;ENSG00000147010:ENST00000477102:exon_19626056_19626163:SH3KBP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 23722902 C/A 0 0 19 19 0 10.0840982063308 -10.0840982063308 A C A 10 0.530742010859516 5.71244234195419e-07 ENSG00000123130:ENST00000379303:exon_23722811_23722961:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000336430:exon_23722811_23722961:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000379297:exon_23722811_23722961:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000379295:exon_23722811_23722961:ACOT9;ENSG00000123130:ENST00000494361:exon_23722811_23722961:ACOT9 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 23874484 A/C 0 13 0 13 6.10035385882629 0 6.10035385882629 A A 10 0.530742010859516 0.000318645736308562 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23874419_23874499:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23874419_23874499:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23874419_23874499:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23874419_23874499:APOO HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 38664340 G/A 0 0 18 18 0 9.55335619547129 -9.55335619547129 A G A 10 0.530742010859516 1.21733512782966e-06 ENSG00000165175:ENST00000457894:exon_38663936_38665781:MID1IP1;ENSG00000165175:ENST00000378474:exon_38663936_38665686:MID1IP1;ENSG00000165175:ENST00000336949:exon_38663936_38665790:MID1IP1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 46332335 A/G 0 0 8 8 0 4.24593608687613 -4.24593608687613 G A G 10 0.530742010859516 0.00235122072895402 ENSG00000147121:ENST00000344302:exon_46332185_46334074:ZNF673;ENSG00000147121:ENST00000298190:exon_46332185_46333104:ZNF673;ENSG00000147121:ENST00000487081:exon_46332188_46333029:ZNF673;ENSG00000147121:ENST00000397212:exon_46332185_46334073:ZNF673 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 47041414 C/T 0 0 33 33 0 17.514486358364 -17.514486358364 T C T 10 0.530742010859516 1.43411930825695e-11 ENSG00000182872:ENST00000377604:exon_47041350_47041441:RBM10;ENSG00000182872:ENST00000329236:exon_47041350_47041441:RBM10;ENSG00000182872:ENST00000345781:exon_47041350_47041441:RBM10 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 47061860 A/G 1 32 5 37 15.0162556524955 2.65371005429758 12.3625455981979 A:G A G 10 0.530742010859516 2.26768167512071e-05 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47061757_47061903:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47061757_47061903:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47061757_47061903:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47061757_47061903:UBA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 47429050 G/A 0 13 0 13 6.10035385882629 0 6.10035385882629 G G 10 0.530742010859516 0.000318645736308562 ENSG00000078061:ENST00000377045:exon_47428938_47429056:ARAF;ENSG00000078061:ENST00000290277:exon_47428938_47429056:ARAF;ENSG00000078061:ENST00000469505:exon_47428858_47429056:ARAF HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 0 0 16 16 0 8.49187217375226 -8.49187217375226 T C T 10 0.530742010859516 5.52823891626306e-06 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 55026850 T/G 0 0 11 11 0 5.83816211945468 -5.83816211945468 G T G 10 0.530742010859516 0.000242956446904731 ENSG00000169188:ENST00000374987:exon_55026790_55027012:APEX2;ENSG00000169188:ENST00000471758:exon_55026826_55027012:APEX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 68381912 G/A 0 0 13 13 0 6.89964614117371 -6.89964614117371 A G A 10 0.530742010859516 5.34997531455705e-05 ENSG00000181191:ENST00000374584:exon_68380697_68382224:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374583:exon_68380697_68383388:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000361478:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000396010:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374571:exon_68380734_68382983:PJA1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 71416721 C/T 0 0 52 52 0 27.5985845646948 -27.5985845646948 T C T 10 0.530742010859516 8.19232385990107e-18 ENSG00000102309:ENST00000373662:exon_71416635_71416951:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000218432:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000423432:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000373669:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000475071:exon_71416635_71418187:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000439980:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000496835:exon_71416635_71416754:PIN4;ENSG00000102309:ENST00000446576:exon_71416635_71417204:PIN4 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 73042607 C/T 0 64 0 64 30.032511304991 0 30.032511304991 C C 10 0.530742010859516 4.94635215074065e-18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 73045740 A/C 0 0 38 38 0 20.1681964126616 -20.1681964126616 C A C 10 0.530742010859516 3.26319975101511e-13 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 73046557 G/T 0 66 0 66 30.9710272832719 0 30.9710272832719 G G 10 0.530742010859516 1.27541777967139e-18 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 73062694 A/T 0 11 0 11 5.16183788054532 0 5.16183788054532 A A 10 0.530742010859516 0.00118423490807728 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 100603563 C/T 0 0 28 28 0 14.8607763040664 -14.8607763040664 T C T 10 0.530742010859516 6.30270393246872e-10 ENSG00000126953:ENST00000372902:exon_100603521_100604184:TIMM8A;ENSG00000126953:ENST00000480575:exon_100603521_100603737:TIMM8A HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 100608191 G/A 0 0 228 228 0 121.00917847597 -121.00917847597 A:T:C G A 10 0.530742010859516 1.20742998006582e-75 ENSG00000010671:ENST00000372880:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372869:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372855:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372859:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372860:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000395179:exon_100608182_100608203:BTK;ENSG00000010671:ENST00000308731:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000443591:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000470069:exon_100608031_100608339:BTK HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 100911165 A/G 0 25 0 25 11.7314497285121 0 11.7314497285121 A A 10 0.530742010859516 1.38560042782823e-07 ENSG00000184867:ENST00000328766:exon_100910267_100912701:ARMCX2;ENSG00000184867:ENST00000330154:exon_100910267_100912701:ARMCX2;ENSG00000184867:ENST00000356824:exon_100910453_100912701:ARMCX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 102564811 T/C 0 0 14 14 0 7.43038815203322 -7.43038815203322 C T C 10 0.530742010859516 2.51051865806027e-05 ENSG00000133134:ENST00000372677:exon_102564274_102564909:BEX2;ENSG00000133134:ENST00000372674:exon_102564430_102564909:BEX2;ENSG00000133134:ENST00000449185:exon_102564600_102564909:BEX2 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 102864251 C/G 0 112 0 112 52.5568947837342 0 52.5568947837342 C C 10 0.530742010859516 2.07108193050430e-31 ENSG00000196507:ENST00000372628:exon_102863971_102864855:TCEAL3;ENSG00000196507:ENST00000372627:exon_102863966_102864855:TCEAL3;ENSG00000196507:ENST00000243286:exon_102863966_102864854:TCEAL3 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 107393449 G/A 0 11 0 11 5.16183788054532 0 5.16183788054532 G G 10 0.530742010859516 0.00118423490807728 ENSG00000101844:ENST00000372232:exon_107393382_107393527:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000345734:exon_107393382_107393527:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000372254:exon_107393382_107393527:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000372246:exon_107393382_107393527:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000343524:exon_107393382_107393527:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000394892:exon_107393382_107393527:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000474825:exon_107393262_107393527:ATG4A;ENSG00000101844:ENST00000489247:exon_107393298_107393527:ATG4A HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 117815031 G/A 0 19 0 19 8.9159017936692 0 8.9159017936692 G G 10 0.530742010859516 6.49757443210872e-06 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117815021_117815211:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117815021_117815211:DOCK11 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 118763406 C/T 0 120 0 120 56.3109586968581 0 56.3109586968581 C C 10 0.530742010859516 1.12250899706843e-33 ENSG00000125354:ENST00000360156:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394616:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000520510:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000525360:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394617:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000354228:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000460411:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000489216:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000354416:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000371492:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394612:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000394610:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000343984:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000467310:exon_118763281_118763471:SEPT6;ENSG00000125354:ENST00000481072:exon_118762779_118763471:SEPT6 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 134713861 C/T 0 10 0 10 4.69257989140484 0 4.69257989140484 C C 10 0.530742010859516 0.00229126014054286 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 135593167 G/A 0 0 82 82 0 43.5208448904803 -43.5208448904803 A G A 10 0.530742010859516 1.13699189747094e-27 ENSG00000102241:ENST00000218364:exon_135592967_135594505:HTATSF1;ENSG00000102241:ENST00000415377:exon_135592967_135593831:HTATSF1 HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 152037647 G/A 0 0 162 162 0 85.9802057592416 -85.9802057592416 A G A 10 0.530742010859516 5.87072029212326e-54 ENSG00000147383:ENST00000370274:exon_152037328_152038273:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000440023:exon_152037328_152037907:NSDHL HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 153580676 C/G 0 71 1 72 33.3173172289744 0.530742010859516 32.7865752181148 A:C C A 10 0.530742010859516 1.20202425333824e-18 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369856:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000444578:exon_153580549_153580815:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000474358:exon_153580549_153580815:FLNA HGDP00476_parsed_pileup.txt . X 153581932 A/G 0 30 0 30 14.0777396742145 0 14.0777396742145 A A 10 0.530742010859516 1.04262728753935e-08 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000415241:exon_153581922_153581966:FLNA